JPH04368397A - ポリペプチド - Google Patents
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Landscapes
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
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- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【0001】
【産業上の利用分野】本発明はヒトTNF転換体として
新規なポリペプチドを提供することに係り、ポリペプチ
ド自身、それを含む医薬組成物、その製造方法、その遺
伝子組換えDNA、プラスミド及び形質転換微生物細胞
などに関する。
新規なポリペプチドを提供することに係り、ポリペプチ
ド自身、それを含む医薬組成物、その製造方法、その遺
伝子組換えDNA、プラスミド及び形質転換微生物細胞
などに関する。
【0002】
【従来の技術】TNF(腫瘍壊死因子)は、1975年
にCarswellらにより予めBacillus
Calmette Guerin(BCG)に感染さ
れエンドトキシンで処理したマウスの血清中に存在する
ことが見出された生理活性物質であり〔Proc.Na
tl.Acad.Sci.USA 72 3666
(1975)〕、1984年にPennicaらにより
ヒトTNFのcDNAがクローニングされヒトTNF蛋
白質の全一次構造(アミノ酸配列)が明らかにされた〔
Nature 312, 724(1984)〕。 TNFは腫瘍細胞に対する細胞傷害活性、移植腫瘍に対
する出血性壊死、増殖の抑制など特異的な抗腫瘍作用を
有するが、最近では高脂血症、血圧低下、発熱などの副
作用も生じうることが報告されており、薬効、副作用な
どでより優れたものを見出すべく研究、開発がなされて
いる。例えば特開昭61−40221、同63−119
692、特開平1−277488各号公報では遺伝子操
作技術によりヒトTNF蛋白質中の特定のアミノ酸を欠
失したり、他のアミノ酸に置換したり或は付加したりし
てヒトTNF変換体を提供している。
にCarswellらにより予めBacillus
Calmette Guerin(BCG)に感染さ
れエンドトキシンで処理したマウスの血清中に存在する
ことが見出された生理活性物質であり〔Proc.Na
tl.Acad.Sci.USA 72 3666
(1975)〕、1984年にPennicaらにより
ヒトTNFのcDNAがクローニングされヒトTNF蛋
白質の全一次構造(アミノ酸配列)が明らかにされた〔
Nature 312, 724(1984)〕。 TNFは腫瘍細胞に対する細胞傷害活性、移植腫瘍に対
する出血性壊死、増殖の抑制など特異的な抗腫瘍作用を
有するが、最近では高脂血症、血圧低下、発熱などの副
作用も生じうることが報告されており、薬効、副作用な
どでより優れたものを見出すべく研究、開発がなされて
いる。例えば特開昭61−40221、同63−119
692、特開平1−277488各号公報では遺伝子操
作技術によりヒトTNF蛋白質中の特定のアミノ酸を欠
失したり、他のアミノ酸に置換したり或は付加したりし
てヒトTNF変換体を提供している。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】しかしながら、十分満
足な薬理作用を有するヒトTNF変換体は、いまだ得ら
れていない。本発明の目的は、ヒトTNF又はその変換
体と同様の抗腫瘍作用を有し、一方それらで認められた
癌転移の亢進作用を示さない新規なヒトTNF転換体、
それらに関連するポリペプチドとそれらの製造方法、プ
ラスミド、微生物細胞など、及び用途を提供することに
ある。
足な薬理作用を有するヒトTNF変換体は、いまだ得ら
れていない。本発明の目的は、ヒトTNF又はその変換
体と同様の抗腫瘍作用を有し、一方それらで認められた
癌転移の亢進作用を示さない新規なヒトTNF転換体、
それらに関連するポリペプチドとそれらの製造方法、プ
ラスミド、微生物細胞など、及び用途を提供することに
ある。
【0004】
【課題を解決するための手段】本発明を概説すれば、本
発明は、配列表の配列番号1で示した1番目のSerか
ら155番目のLeuまでで表わされるアミノ酸配列を
有する腫瘍壊死因子ポリペプチド又はその変換体におい
て、前記配列番号1の1番目のSerから8番目のAs
pまでのアミノ酸配列あるいはそれに対応する前記変換
体のアミノ酸配列がラミニンの細胞接着性ペプチド配列
を少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個のアミノ酸
を含むアミノ酸配列により置換されていることを特徴と
するポリペプチドに関する。また本発明は、当該ポリペ
プチドをコードするDNAを含む組換えプラスミド、こ
の組換えプラスミドにより形質転換された微生物細胞、
この微生物細胞によるポリペプチドの製造方法、医薬組
成物、前記アミノ酸配列のN末端にメチオニンの結合し
たポリペプチドに関し、更に配列表の配列番号7で示し
た1番目のTから465番目のGまでで表わされる塩基
配列を有するDNA又はその変異導入DNAにおいて、
前記配列番号7の1〜3番目のTCAから22〜24番
目のGACまでの塩基配列あるいはそれらに対応する前
記変異導入DNAの塩基配列がラミニンの細胞接着性ペ
プチド配列を少なくとも1個含み、かつ5個〜30個の
アミノ酸を含むアミノ酸配列をコードする塩基配列によ
り置換されているDNAに関する。
発明は、配列表の配列番号1で示した1番目のSerか
ら155番目のLeuまでで表わされるアミノ酸配列を
有する腫瘍壊死因子ポリペプチド又はその変換体におい
て、前記配列番号1の1番目のSerから8番目のAs
pまでのアミノ酸配列あるいはそれに対応する前記変換
体のアミノ酸配列がラミニンの細胞接着性ペプチド配列
を少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個のアミノ酸
を含むアミノ酸配列により置換されていることを特徴と
するポリペプチドに関する。また本発明は、当該ポリペ
プチドをコードするDNAを含む組換えプラスミド、こ
の組換えプラスミドにより形質転換された微生物細胞、
この微生物細胞によるポリペプチドの製造方法、医薬組
成物、前記アミノ酸配列のN末端にメチオニンの結合し
たポリペプチドに関し、更に配列表の配列番号7で示し
た1番目のTから465番目のGまでで表わされる塩基
配列を有するDNA又はその変異導入DNAにおいて、
前記配列番号7の1〜3番目のTCAから22〜24番
目のGACまでの塩基配列あるいはそれらに対応する前
記変異導入DNAの塩基配列がラミニンの細胞接着性ペ
プチド配列を少なくとも1個含み、かつ5個〜30個の
アミノ酸を含むアミノ酸配列をコードする塩基配列によ
り置換されているDNAに関する。
【0005】本発明者らは、ヒトTNF又はその変換体
が有するアミノ酸配列の一定のアミノ酸配列領域におい
て、ラミニンの細胞接着性ペプチド配列を有するアミノ
酸配列を存在せしめたところ、ヒトTNF又はその変換
体に比し抗腫瘍活性がほぼ同程度であり、一方ヒトTN
F又はその変換体が癌の転移を亢進するのに対しほとん
ど亢進しない新規ヒトTNF転換体ポリペプチドが得ら
れることを見出し、その知見に基づいて発明を完成した
。配列表の配列番号1で示した1番目のSerから15
5番目のLeuまでで表わされるアミノ酸配列を有する
腫瘍壊死因子ポリペプチドとは、ヒトTNFを意味する
。
が有するアミノ酸配列の一定のアミノ酸配列領域におい
て、ラミニンの細胞接着性ペプチド配列を有するアミノ
酸配列を存在せしめたところ、ヒトTNF又はその変換
体に比し抗腫瘍活性がほぼ同程度であり、一方ヒトTN
F又はその変換体が癌の転移を亢進するのに対しほとん
ど亢進しない新規ヒトTNF転換体ポリペプチドが得ら
れることを見出し、その知見に基づいて発明を完成した
。配列表の配列番号1で示した1番目のSerから15
5番目のLeuまでで表わされるアミノ酸配列を有する
腫瘍壊死因子ポリペプチドとは、ヒトTNFを意味する
。
【0006】また本発明においてヒトTNFの変換体と
は、配列表の配列番号1で示したアミノ酸配列において
1個又は2個以上のアミノ酸を適宜付加、欠失、置換の
改変を単独又は複合処理したものであって、ヒトTNF
と同様の抗腫瘍作用を有するものである。したがって、
本発明におけるヒトTNF変換体に関してヒトTNFの
配列番号1の1番目のSerから8番目のAspまでの
アミノ酸配列に対応するアミノ酸配列とは、ヒトTNF
変換体において前述のSerからAspまでのアミノ酸
配列自身が改変されていなければそれに該当し、そのア
ミノ酸配列が改変されていれば改変後のアミノ酸配列が
それに該当する。この改変にはアミノ酸の欠失も含まれ
るので前述の1番目のSerから8番目のAspまでの
アミノ酸配列が部分的あるいは全部欠失したものも含ま
れる。
は、配列表の配列番号1で示したアミノ酸配列において
1個又は2個以上のアミノ酸を適宜付加、欠失、置換の
改変を単独又は複合処理したものであって、ヒトTNF
と同様の抗腫瘍作用を有するものである。したがって、
本発明におけるヒトTNF変換体に関してヒトTNFの
配列番号1の1番目のSerから8番目のAspまでの
アミノ酸配列に対応するアミノ酸配列とは、ヒトTNF
変換体において前述のSerからAspまでのアミノ酸
配列自身が改変されていなければそれに該当し、そのア
ミノ酸配列が改変されていれば改変後のアミノ酸配列が
それに該当する。この改変にはアミノ酸の欠失も含まれ
るので前述の1番目のSerから8番目のAspまでの
アミノ酸配列が部分的あるいは全部欠失したものも含ま
れる。
【0007】ヒトTNF変換体としては具体的には例え
ば下記のものが挙げられるが、本発明においてはこれら
以外のものを決して排除するものではない。
ば下記のものが挙げられるが、本発明においてはこれら
以外のものを決して排除するものではない。
【0008】(1)特開昭63−141999号公報に
記載:N末端に、Val−Argを付加し、更に29A
rg−30Argを29Asn−30Thrに変換した
もの。 (2)特開昭63−119692号公報に記載:(A)
32Asnを32Tyr、32His、32Asp又は
32Serにそれぞれ変換したもの。 (B)115Proを115Leu、115Ser、1
15Asp又は115Clyにそれぞれ変換したもの。 (C)117Tyrを117Hisに変換したもの。 (3)特開平1−277488号公報に記載:1Ser
〜8Aspを欠失し、9LysのN末端にArg−Ly
s−Argを付加したもの。 (4)特開平2−163094号公報に記載:1Ser
〜8Aspを欠失し、9LysのN末端にArg−Ly
s−Argを付加し更に154Alaを154Pheに
変換したもの。 (5)特開平2−142493号公報に記載:1Ser
〜8Aspを欠失し、9LysのN末端にArg−Ly
s−Argを付加し更に154Alaを154Trpに
変換したもの。 (6)特開昭63−270697号公報に記載:100
Gln〜107Alaを欠失したもの。1Serから2
個〜8個のアミノ酸残基を欠失したもの。 (7)特願平2−193935号明細書に記載:68P
roを68Asp、68Met又は68Tyrにそれぞ
れ変換したもの。
記載:N末端に、Val−Argを付加し、更に29A
rg−30Argを29Asn−30Thrに変換した
もの。 (2)特開昭63−119692号公報に記載:(A)
32Asnを32Tyr、32His、32Asp又は
32Serにそれぞれ変換したもの。 (B)115Proを115Leu、115Ser、1
15Asp又は115Clyにそれぞれ変換したもの。 (C)117Tyrを117Hisに変換したもの。 (3)特開平1−277488号公報に記載:1Ser
〜8Aspを欠失し、9LysのN末端にArg−Ly
s−Argを付加したもの。 (4)特開平2−163094号公報に記載:1Ser
〜8Aspを欠失し、9LysのN末端にArg−Ly
s−Argを付加し更に154Alaを154Pheに
変換したもの。 (5)特開平2−142493号公報に記載:1Ser
〜8Aspを欠失し、9LysのN末端にArg−Ly
s−Argを付加し更に154Alaを154Trpに
変換したもの。 (6)特開昭63−270697号公報に記載:100
Gln〜107Alaを欠失したもの。1Serから2
個〜8個のアミノ酸残基を欠失したもの。 (7)特願平2−193935号明細書に記載:68P
roを68Asp、68Met又は68Tyrにそれぞ
れ変換したもの。
【0009】本明細書全般を通じてアミノ酸、ポリペプ
チド、塩基、それらの配列を表わすとき下記のリストの
ものを用いる。
チド、塩基、それらの配列を表わすとき下記のリストの
ものを用いる。
【0010】アミノ酸:
記号 Ala Cys
Asp Glu 意味 アラニン システイン アスパラギン
酸 グルタミン酸 記号 Phe Gly
His Ile Ly
s 意味 フェニルアラニン グリシン ヒスチ
ジン イソロイシン リジン 記号 Leu Met A
sn Pro Gln 意味 ロイシン メチオニン アスパラギン
プロリン グルタミン 記号 Arg Ser Thr
Val Trp 意味 アルギニン セリン スレオニン
バリン トリプトファン 記号 Tyr 意味 チロシン 塩基: 記号 A又はa C又はc G又はg T
又はt U意味 アデニン シトシン グ
アニン チミン ウラシル
Asp Glu 意味 アラニン システイン アスパラギン
酸 グルタミン酸 記号 Phe Gly
His Ile Ly
s 意味 フェニルアラニン グリシン ヒスチ
ジン イソロイシン リジン 記号 Leu Met A
sn Pro Gln 意味 ロイシン メチオニン アスパラギン
プロリン グルタミン 記号 Arg Ser Thr
Val Trp 意味 アルギニン セリン スレオニン
バリン トリプトファン 記号 Tyr 意味 チロシン 塩基: 記号 A又はa C又はc G又はg T
又はt U意味 アデニン シトシン グ
アニン チミン ウラシル
【0011】また本明細書で使用した略号は次のとおり
意味する。 dATP:デオキシアデノシン三リン酸(Deoxy
adenosine triphosphate)
dGTP:デオキシグアノシン三リン酸(Deoxy
guanosine triphosphate)
dCTP:デオキシシチジン三リン酸(Deoxy
cytidine triphosphate)TT
P:チミジン三リン酸(Thymidine tri
phosphate) ATP:アデノシン三リン酸(Adenosine
triphosphate) SDS:ドデシル硫酸ナトリウム(Sodium d
odecyl sulfate) BPB:ブロモフェノールブルー(Bromophen
ol Blue) DTT:ジチオスレイトール(Dithiothrei
tol) BSA:牛血清アルブミン(Bovine seru
m albumin) PMSF:フェニルメチルスルホニルフルオライド(P
henylmethylsulfonyl Fluo
ride) EDTA:エチレンジアミン四酢酸(E
thylenediaminetetraacetic
Acid) CPG樹脂:Controlled−Pore Gl
ass樹脂
意味する。 dATP:デオキシアデノシン三リン酸(Deoxy
adenosine triphosphate)
dGTP:デオキシグアノシン三リン酸(Deoxy
guanosine triphosphate)
dCTP:デオキシシチジン三リン酸(Deoxy
cytidine triphosphate)TT
P:チミジン三リン酸(Thymidine tri
phosphate) ATP:アデノシン三リン酸(Adenosine
triphosphate) SDS:ドデシル硫酸ナトリウム(Sodium d
odecyl sulfate) BPB:ブロモフェノールブルー(Bromophen
ol Blue) DTT:ジチオスレイトール(Dithiothrei
tol) BSA:牛血清アルブミン(Bovine seru
m albumin) PMSF:フェニルメチルスルホニルフルオライド(P
henylmethylsulfonyl Fluo
ride) EDTA:エチレンジアミン四酢酸(E
thylenediaminetetraacetic
Acid) CPG樹脂:Controlled−Pore Gl
ass樹脂
【0012】前記ラミニンの細胞接着性ペプチド配列を
有するアミノ酸配列に関しては当該細胞接着性ペプチド
配列のみから構成されてもよいが、当該細胞接着性ペプ
チド配列と1個又は2個以上のアミノ酸とから構成され
ていてもよく、またそこにおいては当該ラミニンの細胞
接着性ペプチド配列を1個又は2個以上有することがで
きる。またラミニンの細胞接着性ペプチド配列を有する
アミノ酸配列の構成アミノ酸の数は5個〜30個である
。そして具体的には例えば配列表の配列番号2〜6でそ
れぞれ示したアミノ酸配列あるいはその他が挙げられる
が、なかでも配列番号2、3又は4で示したアミノ酸配
列が望ましい。
有するアミノ酸配列に関しては当該細胞接着性ペプチド
配列のみから構成されてもよいが、当該細胞接着性ペプ
チド配列と1個又は2個以上のアミノ酸とから構成され
ていてもよく、またそこにおいては当該ラミニンの細胞
接着性ペプチド配列を1個又は2個以上有することがで
きる。またラミニンの細胞接着性ペプチド配列を有する
アミノ酸配列の構成アミノ酸の数は5個〜30個である
。そして具体的には例えば配列表の配列番号2〜6でそ
れぞれ示したアミノ酸配列あるいはその他が挙げられる
が、なかでも配列番号2、3又は4で示したアミノ酸配
列が望ましい。
【0013】ラミニンの細胞接着性ペプチド配列として
は配列表の配列番号2で示したアミノ酸配列において3
番目のTyrから7番目のArgまでで表わされるアミ
ノ酸配列であるものが望ましい。
は配列表の配列番号2で示したアミノ酸配列において3
番目のTyrから7番目のArgまでで表わされるアミ
ノ酸配列であるものが望ましい。
【0014】更に本発明におけるポリペプチドのラミニ
ンの細胞接着性ペプチド配列を有するアミノ酸配列のア
ミノ酸配列に関しては、配列番号1の9番目のLysか
ら155番目のLeuまでのヒトTNFのアミノ酸配列
あるいはその68番目のProが他のアミノ酸望ましく
はAsp又はMetで置換されたアミノ酸配列が望まし
い。
ンの細胞接着性ペプチド配列を有するアミノ酸配列のア
ミノ酸配列に関しては、配列番号1の9番目のLysか
ら155番目のLeuまでのヒトTNFのアミノ酸配列
あるいはその68番目のProが他のアミノ酸望ましく
はAsp又はMetで置換されたアミノ酸配列が望まし
い。
【0015】本発明のポリペプチドにおいて、一定の位
置にラミニンの細胞接着性ペプチド配列を含み、かつ、
5個〜30個のアミノ酸を含むアミノ酸配列は、いわゆ
るラミニンの細胞接着性ペプチドと称されるアミノ酸配
列の種類、抗腫瘍活性、癌の転移程度、副作用、遺伝子
組換え技術の適用性などを考慮して適宜決められる。
置にラミニンの細胞接着性ペプチド配列を含み、かつ、
5個〜30個のアミノ酸を含むアミノ酸配列は、いわゆ
るラミニンの細胞接着性ペプチドと称されるアミノ酸配
列の種類、抗腫瘍活性、癌の転移程度、副作用、遺伝子
組換え技術の適用性などを考慮して適宜決められる。
【0016】配列表の配列番号7で示した1番目のTか
ら465番目のGまでで表わされる塩基配列を有するD
NAとは、ヒトTNFのアミノ酸配列をコードするDN
Aの1形態である。
ら465番目のGまでで表わされる塩基配列を有するD
NAとは、ヒトTNFのアミノ酸配列をコードするDN
Aの1形態である。
【0017】ヒトTNFのアミノ酸配列をコードするD
NAの変異導入DNAとは、配列表の配列番号7で示し
た塩基配列において1組又は2組以上のコドンを適宜付
加、欠失、置換の改変を単独又は複合処理したものであ
って、前述のヒトTNF変換体のアミノ酸配列をコード
するDNAである。したがって、その改変は配列番号7
で示した1番目のTから465番目のGまでで表わされ
る塩基配列の全域に及ぶので、1番目のTから24番目
のCまでの塩基配列だけでなく、25番目のAから46
5番目のGまでの塩基配列にも及ぶ。
NAの変異導入DNAとは、配列表の配列番号7で示し
た塩基配列において1組又は2組以上のコドンを適宜付
加、欠失、置換の改変を単独又は複合処理したものであ
って、前述のヒトTNF変換体のアミノ酸配列をコード
するDNAである。したがって、その改変は配列番号7
で示した1番目のTから465番目のGまでで表わされ
る塩基配列の全域に及ぶので、1番目のTから24番目
のCまでの塩基配列だけでなく、25番目のAから46
5番目のGまでの塩基配列にも及ぶ。
【0018】次に本発明についてその実施態様を詳しく
記載するが、本発明に係る遺伝子操作技術については多
くの文献により記載されている方法や手段を適宜調整し
乍ら適用する。その文献を参考までに以下に列挙する。
記載するが、本発明に係る遺伝子操作技術については多
くの文献により記載されている方法や手段を適宜調整し
乍ら適用する。その文献を参考までに以下に列挙する。
【0019】T.Maniatis et al,
(1982):MolecularCloning,A
Laboratory Manuanl(以下、
Molecular Cloningと略記する)C
old Spring Harbor Labo
ratory、R.Wu et al.(1983
):Methods in Enzymology
, 100及び101、R.Wu etal,(1
987):Methods in Enzymol
ogy,153,154及び155
(1982):MolecularCloning,A
Laboratory Manuanl(以下、
Molecular Cloningと略記する)C
old Spring Harbor Labo
ratory、R.Wu et al.(1983
):Methods in Enzymology
, 100及び101、R.Wu etal,(1
987):Methods in Enzymol
ogy,153,154及び155
【0020】本発明のポリペプチドは種々の方法、手段
、機械を用いて製造することができるが、代表的な製造
方法を下記する。
、機械を用いて製造することができるが、代表的な製造
方法を下記する。
【0021】(1)ヒトTNF遺伝子の取得ヒトTNF
遺伝子の塩基配列及びアミノ酸配列は前述のとおり、P
ennicaらにより明らかにされており、その塩基配
列を適宜変更してヒトTNF遺伝子配列をデザインする
。その配列は配列番号7のDNA鎖を上鎖(コーディン
グ鎖)とし、それに対応したコンプリメンタリー配列鎖
を下鎖としたDNA二本鎖をデザインしたものである。 その際、宿主細胞(大腸菌など)に適したコドンを選択
するのが望ましく、また後述のDNA断片の連結による
クローン化並びに変換体作製のための遺伝子改変が容易
に実施できるように適当な位置に適当な制限酵素切断部
位を配置するのが望ましい。もちろんヒトTNF遺伝子
の上流には翻訳開始コドン(ATG)を、下流には翻訳
終止コドン(TAA、TGA又はTAG)をそれぞれ読
み取り枠に合致させるように設置する必要があり、また
翻訳開始コドンの上流並びに翻訳終止コドンの下流にそ
れぞれ適当な制限酵素切断部位を設置してベクターへの
適用性、クローン化の簡便性を図るのが好ましい。
遺伝子の塩基配列及びアミノ酸配列は前述のとおり、P
ennicaらにより明らかにされており、その塩基配
列を適宜変更してヒトTNF遺伝子配列をデザインする
。その配列は配列番号7のDNA鎖を上鎖(コーディン
グ鎖)とし、それに対応したコンプリメンタリー配列鎖
を下鎖としたDNA二本鎖をデザインしたものである。 その際、宿主細胞(大腸菌など)に適したコドンを選択
するのが望ましく、また後述のDNA断片の連結による
クローン化並びに変換体作製のための遺伝子改変が容易
に実施できるように適当な位置に適当な制限酵素切断部
位を配置するのが望ましい。もちろんヒトTNF遺伝子
の上流には翻訳開始コドン(ATG)を、下流には翻訳
終止コドン(TAA、TGA又はTAG)をそれぞれ読
み取り枠に合致させるように設置する必要があり、また
翻訳開始コドンの上流並びに翻訳終止コドンの下流にそ
れぞれ適当な制限酵素切断部位を設置してベクターへの
適用性、クローン化の簡便性を図るのが好ましい。
【0022】ここでは前述のDNA二本鎖に基づき作成
され、その上鎖は、1番目のTに5′−ATG−3′を
上流方向に接続し、かつ465番目のGに5′−TAA
TGA−3′を下流方向に接続するものであって474
個の塩基を含む(以下コーディング474U鎖)。した
がって下鎖はこのコーディング474U鎖に相補したも
のとして上鎖の下段に記載すれば、Tから始まりTに終
了する474個の塩基を含む(以下コンプリメンタリー
配列鎖474L鎖)。
され、その上鎖は、1番目のTに5′−ATG−3′を
上流方向に接続し、かつ465番目のGに5′−TAA
TGA−3′を下流方向に接続するものであって474
個の塩基を含む(以下コーディング474U鎖)。した
がって下鎖はこのコーディング474U鎖に相補したも
のとして上鎖の下段に記載すれば、Tから始まりTに終
了する474個の塩基を含む(以下コンプリメンタリー
配列鎖474L鎖)。
【0023】ヒトTNF遺伝子は上鎖・下鎖それぞれに
ついて幾つかのオリゴヌクレオチドに分けて化学合成し
、ブロックごとに順次適切に連結する方法により作製で
きる。例えばこのコーデング474U鎖及びコンプリメ
ンタリー配列鎖474L鎖からなるDNA二本鎖に基づ
いて調整したDNA二本鎖においては、ヒトTNF遺伝
子の各鎖を約50塩基程度ずつ10本のオリゴヌクレオ
チドに分け、合計20本化学合成する。
ついて幾つかのオリゴヌクレオチドに分けて化学合成し
、ブロックごとに順次適切に連結する方法により作製で
きる。例えばこのコーデング474U鎖及びコンプリメ
ンタリー配列鎖474L鎖からなるDNA二本鎖に基づ
いて調整したDNA二本鎖においては、ヒトTNF遺伝
子の各鎖を約50塩基程度ずつ10本のオリゴヌクレオ
チドに分け、合計20本化学合成する。
【0024】その合成方法としてはジエステル法〔H.
G.Khorana,“SomeRecent De
velopments in Chemistry
ofPhosphate Esters of
Biological Interest”.Joh
n Wiley and Sons,Inc.,
New York(1961)〕、トリエステル法〔
R.L.Letsinger etal,J.Am.
Chem.Soc.,89,4801(1967)〕及
びホスファイト法〔M.D.Matteucci e
t al.TetrahedronLett.,21
,719(1980)〕が挙げられるが、全自動DNA
合成機を用いたホスファイト法が操作性などから好んで
用いられる。
G.Khorana,“SomeRecent De
velopments in Chemistry
ofPhosphate Esters of
Biological Interest”.Joh
n Wiley and Sons,Inc.,
New York(1961)〕、トリエステル法〔
R.L.Letsinger etal,J.Am.
Chem.Soc.,89,4801(1967)〕及
びホスファイト法〔M.D.Matteucci e
t al.TetrahedronLett.,21
,719(1980)〕が挙げられるが、全自動DNA
合成機を用いたホスファイト法が操作性などから好んで
用いられる。
【0025】合成されたオリゴヌクレオチドは例えば逆
相クロマトカラムを用いた高速液体クロマトグラフイー
、ポリアクリルアミドゲルを用いた電気泳動などの通常
の精製方法により精製される。その後、オリゴヌクレオ
チドは例えばT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いてリ
ン酸化し、アニール化した後、T4DNAリガーゼを用
いて連結する。ここではオリゴヌクレオチドを幾つかの
ブロックに分け、所望のヒトTNF遺伝子配列が得られ
るように順次連結し、制限酵素で切断又はT4DNAポ
リメラーゼによる平滑化後、電気泳動等により精製する
。得られたDNA断片について例えばpUC8、同9、
同18、同19〔J.Messinget al,G
ene,19,259(1982)〕のようなプラスミ
ドベクターに組込み、常法によりコンピテントセルを形
質転換してクローン化する。得られたクローンより公知
の方法に従ってプラスミドDNAを抽出精製し、ベクタ
ーに挿入されたDNA断片の塩基配列が目的の遺伝子配
列を達成したか否かを点検する。達成できたヒトTNF
遺伝子の各部分について、それぞれを含むプラスミドベ
クターより制限酵素を用いて切り出し、再度前記ベクタ
ーに連結後組込むことにより目的の完全長のヒトTNF
遺伝子を有するプラスミドベクターを得る。かくして得
られたプラスミドベクターを制限酵素で切断後、ゲル電
気泳動法によって分離精製することにより所望のヒトT
NF遺伝子を得ることができる。
相クロマトカラムを用いた高速液体クロマトグラフイー
、ポリアクリルアミドゲルを用いた電気泳動などの通常
の精製方法により精製される。その後、オリゴヌクレオ
チドは例えばT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いてリ
ン酸化し、アニール化した後、T4DNAリガーゼを用
いて連結する。ここではオリゴヌクレオチドを幾つかの
ブロックに分け、所望のヒトTNF遺伝子配列が得られ
るように順次連結し、制限酵素で切断又はT4DNAポ
リメラーゼによる平滑化後、電気泳動等により精製する
。得られたDNA断片について例えばpUC8、同9、
同18、同19〔J.Messinget al,G
ene,19,259(1982)〕のようなプラスミ
ドベクターに組込み、常法によりコンピテントセルを形
質転換してクローン化する。得られたクローンより公知
の方法に従ってプラスミドDNAを抽出精製し、ベクタ
ーに挿入されたDNA断片の塩基配列が目的の遺伝子配
列を達成したか否かを点検する。達成できたヒトTNF
遺伝子の各部分について、それぞれを含むプラスミドベ
クターより制限酵素を用いて切り出し、再度前記ベクタ
ーに連結後組込むことにより目的の完全長のヒトTNF
遺伝子を有するプラスミドベクターを得る。かくして得
られたプラスミドベクターを制限酵素で切断後、ゲル電
気泳動法によって分離精製することにより所望のヒトT
NF遺伝子を得ることができる。
【0026】一方、前述の方法に対してはTNFを発現
しているヒト細胞由来のmRNAよりヒトTNFをコー
ドするcDNAを作製し、そのcDNAを使用する方法
を適宜組合せてもよい。
しているヒト細胞由来のmRNAよりヒトTNFをコー
ドするcDNAを作製し、そのcDNAを使用する方法
を適宜組合せてもよい。
【0027】(2)ヒトTNF発現ベクターの構築前記
(1)で得られたヒトTNF遺伝子を適切に発現ベクタ
ーに挿入して、ヒトTNF発現ベクターを構築する。発
現ベクターは翻訳開始コドン(ATG)の上流に転写プ
ロモーター領域並びに翻訳シグナルであるSD(シャイ
ン・ダルガーノ)配列を有し、翻訳終止コドン(TAA
、TGA又はTAG)の下流に転写ターミネーター領域
を有する必要がある。また転写プロモーターとしては、
trpプロモーター、lacプロモーター、tacプロ
モーター、PLプロモーター、PH05プロモーター、
ADCIプロモーターなどが使用でき、転写ターミネー
ターとしてはtrpターミネーター、rrnBターミネ
ーター、ADCIターミネーターなどが使用できる。こ
のような発現ベクターは例えば、pKK223−3(フ
ァルマシア)、pPL−lambda(同左)、pDR
720(同左)などの市販品の中から容易に入手できる
が、これらを改良して発現性あるいは取扱性をより高度
化したものを使用してもよい。
(1)で得られたヒトTNF遺伝子を適切に発現ベクタ
ーに挿入して、ヒトTNF発現ベクターを構築する。発
現ベクターは翻訳開始コドン(ATG)の上流に転写プ
ロモーター領域並びに翻訳シグナルであるSD(シャイ
ン・ダルガーノ)配列を有し、翻訳終止コドン(TAA
、TGA又はTAG)の下流に転写ターミネーター領域
を有する必要がある。また転写プロモーターとしては、
trpプロモーター、lacプロモーター、tacプロ
モーター、PLプロモーター、PH05プロモーター、
ADCIプロモーターなどが使用でき、転写ターミネー
ターとしてはtrpターミネーター、rrnBターミネ
ーター、ADCIターミネーターなどが使用できる。こ
のような発現ベクターは例えば、pKK223−3(フ
ァルマシア)、pPL−lambda(同左)、pDR
720(同左)などの市販品の中から容易に入手できる
が、これらを改良して発現性あるいは取扱性をより高度
化したものを使用してもよい。
【0028】(3)ヒトTNF変換体又は同転換体発現
ベクターの構築 ヒトTNF変換体又は同転換体ポリペプチドをコードす
るDNAの作製方法としては例えば次の方法が挙げられ
る。
ベクターの構築 ヒトTNF変換体又は同転換体ポリペプチドをコードす
るDNAの作製方法としては例えば次の方法が挙げられ
る。
【0029】(A)前記(1)ヒトTNF遺伝子の取得
で記載した方法に準じて化学的に合成したオリゴヌクレ
オチドを適切に連結することにより作製する。この方法
によればアミノ酸、ポリペプチドなどの置換、付加又は
欠失の改変は自在である。
で記載した方法に準じて化学的に合成したオリゴヌクレ
オチドを適切に連結することにより作製する。この方法
によればアミノ酸、ポリペプチドなどの置換、付加又は
欠失の改変は自在である。
【0030】(B)前記(1)で作製したヒトTNF遺
伝子を適当な制限酵素で切断し、遺伝子内の特定領域を
除去した後、変異を導入した塩基配列を有する合成オリ
ゴヌクレオチド(例:上下鎖をアニール化して連結した
二本鎖DNA断片)又は適当な他の遺伝子を組込む。こ
の方法によっても前記(A)の場合と同様、改変を自在
に行うことができる。
伝子を適当な制限酵素で切断し、遺伝子内の特定領域を
除去した後、変異を導入した塩基配列を有する合成オリ
ゴヌクレオチド(例:上下鎖をアニール化して連結した
二本鎖DNA断片)又は適当な他の遺伝子を組込む。こ
の方法によっても前記(A)の場合と同様、改変を自在
に行うことができる。
【0031】(C)変異を導入した塩基配列を有する合
成オリゴヌクレオチドをプライマーとして用いDNA鎖
を延長することにより、変異導入を行う〔部異特異的変
異法(T.A.Kunkel et al,Met
hods in Enzymology,154,
367(1987))〕。この方法は10塩基対を越え
る比較的長いDNA鎖の付加及び挿入には適用し難いが
、その他の改変には前記(A)の場合と同様、自在に行
うことができる。特に任意のアミノ酸を置換することに
適している。
成オリゴヌクレオチドをプライマーとして用いDNA鎖
を延長することにより、変異導入を行う〔部異特異的変
異法(T.A.Kunkel et al,Met
hods in Enzymology,154,
367(1987))〕。この方法は10塩基対を越え
る比較的長いDNA鎖の付加及び挿入には適用し難いが
、その他の改変には前記(A)の場合と同様、自在に行
うことができる。特に任意のアミノ酸を置換することに
適している。
【0032】本発明では一般に(C)の部位特異的変異
法及び制限酵素切断部位を利用する(B)の方法を適宜
組合せて使用するが、以下にその方法について説明する
。
法及び制限酵素切断部位を利用する(B)の方法を適宜
組合せて使用するが、以下にその方法について説明する
。
【0033】■ 部位特異的変異法により変換体又は
転換体ポリペプチドをコードするDNAを作製した後、
発現ベクター内に適切に挿入する。
転換体ポリペプチドをコードするDNAを作製した後、
発現ベクター内に適切に挿入する。
【0034】まず部位特異的変異法を行うに当り、鋳型
DNAを作製する。前記(1)で得られたヒトTNF遺
伝子を、Messingら〔Mthods inEn
zymology,153,3(1987)〕によって
開発された一本鎖プラスミドDNA調製用プラスミドベ
クター(pUC118、puC119など)に連結し、
大腸菌株に導入する。得られた形質転換体の中より目的
のプラスミドを有するクローンを選択する。
DNAを作製する。前記(1)で得られたヒトTNF遺
伝子を、Messingら〔Mthods inEn
zymology,153,3(1987)〕によって
開発された一本鎖プラスミドDNA調製用プラスミドベ
クター(pUC118、puC119など)に連結し、
大腸菌株に導入する。得られた形質転換体の中より目的
のプラスミドを有するクローンを選択する。
【0035】このプラスミドをdut−及びung−変
異大腸菌株(CJ236株など)に導入し、遺伝子内に
ウラシルを取り込ませ、大腸菌株にM13K07などの
変異型ヘルパーファージを感染させて目的の一本鎖プラ
スミドDNAを取得する。
異大腸菌株(CJ236株など)に導入し、遺伝子内に
ウラシルを取り込ませ、大腸菌株にM13K07などの
変異型ヘルパーファージを感染させて目的の一本鎖プラ
スミドDNAを取得する。
【0036】一方、本発明に係る変異導入部位及びその
前後の塩基配列を有する約15〜50塩基のオリゴヌク
レオチド・プライマーを化学合成する。このプライマー
と前述の工程で得られるウラシル導入一本鎖プラスミド
DNAとをアニール化した後、例えばT4DNAポリメ
ラーゼ及びT4DNAリガーゼを用いて、二本鎖化する
。鋳型であるウラシルを含むDNA鎖を不活性化し変異
導入頻度を高めるため、二本鎖となったプラスミドをu
ng+の大腸菌株に導入する。
前後の塩基配列を有する約15〜50塩基のオリゴヌク
レオチド・プライマーを化学合成する。このプライマー
と前述の工程で得られるウラシル導入一本鎖プラスミド
DNAとをアニール化した後、例えばT4DNAポリメ
ラーゼ及びT4DNAリガーゼを用いて、二本鎖化する
。鋳型であるウラシルを含むDNA鎖を不活性化し変異
導入頻度を高めるため、二本鎖となったプラスミドをu
ng+の大腸菌株に導入する。
【0037】前述のプライマーをプローブとして用いコ
ロニー・ハイブリダイゼーションを行い、目的の変換体
又は転換体ポリペプチドをコードするDNAを含むプラ
スミドを有するクローンを、得られた形質転換体中より
選択する。
ロニー・ハイブリダイゼーションを行い、目的の変換体
又は転換体ポリペプチドをコードするDNAを含むプラ
スミドを有するクローンを、得られた形質転換体中より
選択する。
【0038】前述で得られるプラスミドから制限酵素切
断処理によりヒトTNF変換体又は同転換体ポリペプチ
ドをコードするDNA断片を切り出し、前記(2)の場
合と同様に、発現ベクターに挿入して、目的のヒトTN
F変換体又は同転換体発現ベクターを構築することがで
きる。
断処理によりヒトTNF変換体又は同転換体ポリペプチ
ドをコードするDNA断片を切り出し、前記(2)の場
合と同様に、発現ベクターに挿入して、目的のヒトTN
F変換体又は同転換体発現ベクターを構築することがで
きる。
【0039】■ 適当な制限酵素切断により変異を導
入したい部分を切り出し、変換デザインに従って化学合
成等により作製したDNA断片で置換することにより変
換体又は転換体ポリペプチドの発現ベクターを構築する
。
入したい部分を切り出し、変換デザインに従って化学合
成等により作製したDNA断片で置換することにより変
換体又は転換体ポリペプチドの発現ベクターを構築する
。
【0040】ヒトTNFのN末端近傍のアミノ酸配列を
修飾するには、N末端近傍に適当な制限酵素切断部位が
存在するのが好ましい。そこで、まず部位特異的変異法
によりヒトTNFのN末端近傍に適当な制限酵素切断部
位を導入する。この制限酵素切断部位とその上流に位置
する翻訳開始コドンの前後に設置された制限酵素切断部
位の2種類の切断部位の使用は更に好ましい。
修飾するには、N末端近傍に適当な制限酵素切断部位が
存在するのが好ましい。そこで、まず部位特異的変異法
によりヒトTNFのN末端近傍に適当な制限酵素切断部
位を導入する。この制限酵素切断部位とその上流に位置
する翻訳開始コドンの前後に設置された制限酵素切断部
位の2種類の切断部位の使用は更に好ましい。
【0041】一方、本発明に係る変換デザインに従って
前記(1)の場合と同様にして、上鎖及び下鎖に対応す
るオリゴヌクレオチドを化学合成する。もちろん、その
両末端には発現ベクターへの組込みを考慮して上記の制
限酵素切断部位を設置しておく必要がある。このオリゴ
ヌクレオチド(上鎖及び下鎖)を例えばT4ポリヌクレ
オチドキナーゼを用いてリン酸化後アニール化すること
により二本鎖DNA断片とする。上記の2種類の制限酵
素で切断したヒトTNFの大部分を含む(N末部分を欠
失)発現用プラスミドベクター内にこの二本鎖DNA断
片を例えばT4DNAリガーゼを用いて挿入連結して、
目的とするN末端近傍のアミノ酸配列を修飾したヒトT
NF転換体の発現ベクターを構築することができる。
前記(1)の場合と同様にして、上鎖及び下鎖に対応す
るオリゴヌクレオチドを化学合成する。もちろん、その
両末端には発現ベクターへの組込みを考慮して上記の制
限酵素切断部位を設置しておく必要がある。このオリゴ
ヌクレオチド(上鎖及び下鎖)を例えばT4ポリヌクレ
オチドキナーゼを用いてリン酸化後アニール化すること
により二本鎖DNA断片とする。上記の2種類の制限酵
素で切断したヒトTNFの大部分を含む(N末部分を欠
失)発現用プラスミドベクター内にこの二本鎖DNA断
片を例えばT4DNAリガーゼを用いて挿入連結して、
目的とするN末端近傍のアミノ酸配列を修飾したヒトT
NF転換体の発現ベクターを構築することができる。
【0042】また、変換体又は転換体ポリペプチドをコ
ードする遺伝子内の適当な制限酵素切断部位を利用して
それぞれの発現ベクター間で組換えを行うことにより、
更に新規な変換体又は転換体ポリペプチドの発現ベクタ
ーを構築することができる。
ードする遺伝子内の適当な制限酵素切断部位を利用して
それぞれの発現ベクター間で組換えを行うことにより、
更に新規な変換体又は転換体ポリペプチドの発現ベクタ
ーを構築することができる。
【0043】発現ベクターを大腸菌株のような宿主細胞
へ導入することについては、例えば塩化カルシウム法に
より作製した大腸菌株のコンピテントセルを用いる公知
の方法〔Molecular Cloning,T.
Maniatis et al,(1982)〕に
従って行う。宿主細胞としては大腸菌、枯草菌、酵母な
どの微生物細胞が使用できるが、なかでも大腸菌として
はJM83、JM103、HB101などのE.col
i K−12株の変異種が挙げられる。
へ導入することについては、例えば塩化カルシウム法に
より作製した大腸菌株のコンピテントセルを用いる公知
の方法〔Molecular Cloning,T.
Maniatis et al,(1982)〕に
従って行う。宿主細胞としては大腸菌、枯草菌、酵母な
どの微生物細胞が使用できるが、なかでも大腸菌として
はJM83、JM103、HB101などのE.col
i K−12株の変異種が挙げられる。
【0044】(4)ヒトTNF転換体ポリペプチドの取
得 本発明においては前記(3)で記載の形質転換された微
生物細胞を培養し、目的のヒトTNF転換体ポリペプチ
ドを培養物中に産生、蓄積させて分離する。微生物細胞
、特に大腸菌の培養方法としては従来から知られている
方法、例えば大腸菌が要求する栄養素を含んだ培養液に
大腸菌を接種し、通常32〜37℃で約12〜24時間
振とう又はかくはんすることにより短時間に大量に培養
する方法が使用できる。培地は例えばL培地、M9培地
、M9CA培地など〔前記Molecular Cl
oning参照〕が使用でき、必要に応じてアンピシリ
ンなどの抗生物質を添加したり、転写プロモーターの効
率を高めるために培養開始時あるいは培養中にlacプ
ロモーター及びtacプロモーター使用の際はイソプロ
ピル−β−D−チオガラクトピラノシド等の薬剤を、t
rpプロモーター使用の際は3−β−インドールアクリ
ル酸等の薬剤を添加することもできる。
得 本発明においては前記(3)で記載の形質転換された微
生物細胞を培養し、目的のヒトTNF転換体ポリペプチ
ドを培養物中に産生、蓄積させて分離する。微生物細胞
、特に大腸菌の培養方法としては従来から知られている
方法、例えば大腸菌が要求する栄養素を含んだ培養液に
大腸菌を接種し、通常32〜37℃で約12〜24時間
振とう又はかくはんすることにより短時間に大量に培養
する方法が使用できる。培地は例えばL培地、M9培地
、M9CA培地など〔前記Molecular Cl
oning参照〕が使用でき、必要に応じてアンピシリ
ンなどの抗生物質を添加したり、転写プロモーターの効
率を高めるために培養開始時あるいは培養中にlacプ
ロモーター及びtacプロモーター使用の際はイソプロ
ピル−β−D−チオガラクトピラノシド等の薬剤を、t
rpプロモーター使用の際は3−β−インドールアクリ
ル酸等の薬剤を添加することもできる。
【0045】本発明のヒトTNF転換体ポリペプチドは
培養後、通常、微生物細胞の集合体をトリスバッファー
に懸濁させた状態で超音波処理することにより破砕処理
を施し、遠心分離操作を行い菌体残渣を除去することに
より得られる。更に、かくして得られたものは核酸・エ
ンドトキシン除去剤処理、フィルターによるろ過、陰イ
オン交換クロマトグラフィー、その他従来からの蛋白質
の分離精製方法を組合せることにより、一層精製程度を
高めることができる。本発明のヒトTNF転換体遺伝子
は前述の方法を適宜適用することにより、直接製造した
り、一旦ヒトTNF遺伝子を作製後製造したり、あるい
はヒトTNF遺伝子次いでその変換体変異遺伝子を作製
後製造したりすることができる。
培養後、通常、微生物細胞の集合体をトリスバッファー
に懸濁させた状態で超音波処理することにより破砕処理
を施し、遠心分離操作を行い菌体残渣を除去することに
より得られる。更に、かくして得られたものは核酸・エ
ンドトキシン除去剤処理、フィルターによるろ過、陰イ
オン交換クロマトグラフィー、その他従来からの蛋白質
の分離精製方法を組合せることにより、一層精製程度を
高めることができる。本発明のヒトTNF転換体遺伝子
は前述の方法を適宜適用することにより、直接製造した
り、一旦ヒトTNF遺伝子を作製後製造したり、あるい
はヒトTNF遺伝子次いでその変換体変異遺伝子を作製
後製造したりすることができる。
【0046】本発明のヒトTNF転換体ポリペプチドは
、ヒトTNF又はその変換体の持つ抗腫瘍作用と同様の
作用を有し、しかもヒトTNF又はその変換体に比し同
程度の抗腫瘍活性を示し、一方それらで認められた癌の
転移亢進作用をほとんど示さないことより抗腫瘍剤、医
薬の活性成分として有効である。本発明のヒトTNF転
換体ポリペプチドとしては、具体的には後述するF42
36、F4146、F4419、F4422、F442
3、F4603、F4604などが挙げられ、なかでも
F4236、F4146、F4419、F4603が望
ましく、F4236、F4146、F4419がより望
ましい。その医薬組成物の製剤に当っては薬理上許容さ
れる担体又は希釈剤とともに医薬組成物に製剤化するこ
とができる。本発明の医薬組成物の剤型としては、外用
剤、経口投与剤、注射剤などが挙げられ、それぞれの剤
型にあった投与方法で投与される。
、ヒトTNF又はその変換体の持つ抗腫瘍作用と同様の
作用を有し、しかもヒトTNF又はその変換体に比し同
程度の抗腫瘍活性を示し、一方それらで認められた癌の
転移亢進作用をほとんど示さないことより抗腫瘍剤、医
薬の活性成分として有効である。本発明のヒトTNF転
換体ポリペプチドとしては、具体的には後述するF42
36、F4146、F4419、F4422、F442
3、F4603、F4604などが挙げられ、なかでも
F4236、F4146、F4419、F4603が望
ましく、F4236、F4146、F4419がより望
ましい。その医薬組成物の製剤に当っては薬理上許容さ
れる担体又は希釈剤とともに医薬組成物に製剤化するこ
とができる。本発明の医薬組成物の剤型としては、外用
剤、経口投与剤、注射剤などが挙げられ、それぞれの剤
型にあった投与方法で投与される。
【0047】
【実施例】実施例1(ヒトTNF遺伝子のデザイン)既
に報告されている〔Pennicaら、前出〕ヒトTN
F構造遺伝子のアミノ酸配列を基に、ヒトTNF遺伝子
の塩基配列について遺伝子構築及び変換体作製の便宜上
、配列表の配列番号7のDNA鎖次にコーディング47
4U鎖及びコンプリメンタリー配列鎖474L鎖のDN
A二本鎖、更にそれを若干調整したDNA二本鎖の塩基
配列をデザインした。ここでは適当な間隔で制限酵素切
断部位を組込み、またプラスミドベクターと容易に連結
できるように翻訳開始コドン(ATG)の上流に制限酵
素EcoR Iによる切断部位を、翻訳終止コドン(
TAA及びTGA)の下流には制限酵素Hind I
IIによる切断部位をそれぞれ設けた。
に報告されている〔Pennicaら、前出〕ヒトTN
F構造遺伝子のアミノ酸配列を基に、ヒトTNF遺伝子
の塩基配列について遺伝子構築及び変換体作製の便宜上
、配列表の配列番号7のDNA鎖次にコーディング47
4U鎖及びコンプリメンタリー配列鎖474L鎖のDN
A二本鎖、更にそれを若干調整したDNA二本鎖の塩基
配列をデザインした。ここでは適当な間隔で制限酵素切
断部位を組込み、またプラスミドベクターと容易に連結
できるように翻訳開始コドン(ATG)の上流に制限酵
素EcoR Iによる切断部位を、翻訳終止コドン(
TAA及びTGA)の下流には制限酵素Hind I
IIによる切断部位をそれぞれ設けた。
【0048】実施例2(オリゴヌクレオチドの化学合成
) 前記実施例1でデザインされたDNAは、自動DNA合
成機(アプライド・バイオシステムズ,モデル381A
)を用いて、ホスファイト法にて化学合成した。合成は
前述した塩基配列を有するU−1〜10及びL−1〜1
0の20本のオリゴヌクレオチドに分割して行った。
) 前記実施例1でデザインされたDNAは、自動DNA合
成機(アプライド・バイオシステムズ,モデル381A
)を用いて、ホスファイト法にて化学合成した。合成は
前述した塩基配列を有するU−1〜10及びL−1〜1
0の20本のオリゴヌクレオチドに分割して行った。
【0049】これらオリゴヌクレオチドを、配列表の配
列番号7のDNA鎖に基づいて以下に説明する。 名 前 塩基数
内 容U−1
27 配列番号7の1番目のTから19
番目のAまでの配列を有
し、しかも1番目のTに対し上流方向に5
′−ATG−3
′更に5′−AATTC−3′を接続した配列を有
する。 U−2 50 配列番号7の20番目
のGから69番目のGまでの配列を
有する。 U−3 49 配列番号7の70番目
のCから118番目のGまでの配列
を有する。 U−4 50 配列番号7の119番
目のAから168番目のCまでの配
列を有する。 U−5 50 配列番号7の169番
目のTから218番目のTまでの配
列を有する。 U−6 52 配列番号7の219番
目のCから270番目のCまでの配
列を有する。 U−7 48 配列番号7の271番
目のCから318番目のCまでの配
列を有する。 U−8 49 配列番号7の319番
目のGから367番目のCまでの配
列を有する。 U−9 51 配列番号7の368番
目のAから418番目のCまでの配
列を有する。 U−10 53 配列番号7の419番目
のTから465番目のGまでの
配列を有し、更に下流方向に5′−
TAATGA−3′を
有する。
列番号7のDNA鎖に基づいて以下に説明する。 名 前 塩基数
内 容U−1
27 配列番号7の1番目のTから19
番目のAまでの配列を有
し、しかも1番目のTに対し上流方向に5
′−ATG−3
′更に5′−AATTC−3′を接続した配列を有
する。 U−2 50 配列番号7の20番目
のGから69番目のGまでの配列を
有する。 U−3 49 配列番号7の70番目
のCから118番目のGまでの配列
を有する。 U−4 50 配列番号7の119番
目のAから168番目のCまでの配
列を有する。 U−5 50 配列番号7の169番
目のTから218番目のTまでの配
列を有する。 U−6 52 配列番号7の219番
目のCから270番目のCまでの配
列を有する。 U−7 48 配列番号7の271番
目のCから318番目のCまでの配
列を有する。 U−8 49 配列番号7の319番
目のGから367番目のCまでの配
列を有する。 U−9 51 配列番号7の368番
目のAから418番目のCまでの配
列を有する。 U−10 53 配列番号7の419番目
のTから465番目のGまでの
配列を有し、更に下流方向に5′−
TAATGA−3′を
有する。
【0050】配列番号7のDNA鎖に対応した下鎖(コ
ンプリメンタリー配列鎖)を配列番号7に基づいて説明
するが、下鎖の流れ方向の説明、即ち上流、下流、5′
−及び3′−は上鎖のそれと全く逆になる。 名 前 塩基数
内 容L一1
29 配列番号7の25番目のAから1
番目のTまでの配列に相
補した配列を有し、しかも1番目のTに相
補するAに対し
、下流方向に5′−CATG−3′を接続した配列
を有す る。 L−2 52 配列番号7の77番目
のGから26番目のAまでの配列に
相補した配列を有する。 L−3 50 配列番号7の127番
目のGから78番目のGまでの配列
に相補した配列を有する。 L−4 50 配列番号7の177番
目のGから128番目のAまでの配
列に相補した配列を有する。 L−5 49 配列番号7の226番
目のCから178番目のGまでの配
列に相補した配列を有する。 L−6 49 配列番号7の275番
目のTから227番目のAまでの配
列に相補した配列を有する。 L−7 51 配列番号7の326番
目のCから276番目のCまでの配
列に相補した配列を有する。 L−8 49 配列番号7の375番
目のGから327番目のCまでの配
列に相補した配列を有する。 L−9 51 配列番号7の426番
目のTから376番目のAまでの配
列に相補した配列を有する。 L−10 49 配列番号7の465
番目のGから427番目のGまでの
配列に相補した配列を有し、し
かも465番目のGに相補
するCに対し、上流方向に5′ーTCA
TTA−3′更に
5′−AGCT−3′を接続した配列を有する。
ンプリメンタリー配列鎖)を配列番号7に基づいて説明
するが、下鎖の流れ方向の説明、即ち上流、下流、5′
−及び3′−は上鎖のそれと全く逆になる。 名 前 塩基数
内 容L一1
29 配列番号7の25番目のAから1
番目のTまでの配列に相
補した配列を有し、しかも1番目のTに相
補するAに対し
、下流方向に5′−CATG−3′を接続した配列
を有す る。 L−2 52 配列番号7の77番目
のGから26番目のAまでの配列に
相補した配列を有する。 L−3 50 配列番号7の127番
目のGから78番目のGまでの配列
に相補した配列を有する。 L−4 50 配列番号7の177番
目のGから128番目のAまでの配
列に相補した配列を有する。 L−5 49 配列番号7の226番
目のCから178番目のGまでの配
列に相補した配列を有する。 L−6 49 配列番号7の275番
目のTから227番目のAまでの配
列に相補した配列を有する。 L−7 51 配列番号7の326番
目のCから276番目のCまでの配
列に相補した配列を有する。 L−8 49 配列番号7の375番
目のGから327番目のCまでの配
列に相補した配列を有する。 L−9 51 配列番号7の426番
目のTから376番目のAまでの配
列に相補した配列を有する。 L−10 49 配列番号7の465
番目のGから427番目のGまでの
配列に相補した配列を有し、し
かも465番目のGに相補
するCに対し、上流方向に5′ーTCA
TTA−3′更に
5′−AGCT−3′を接続した配列を有する。
【0051】合成されたオリゴヌクレオチドのCPG樹
脂(フナコシ社販売)からの切り出し及び保護基脱離は
、アプライド・バイオシステムズ社のマニュアルに従っ
た。各オリゴヌクレオチドの分離精製は逆相クロマトカ
ラムを用いたHPLC(高速液体クロマトグラフィー)
又は7Mウレアを含むポリアクリルアミドゲル電気泳動
(ゲル濃度10〜20%)により行った。
脂(フナコシ社販売)からの切り出し及び保護基脱離は
、アプライド・バイオシステムズ社のマニュアルに従っ
た。各オリゴヌクレオチドの分離精製は逆相クロマトカ
ラムを用いたHPLC(高速液体クロマトグラフィー)
又は7Mウレアを含むポリアクリルアミドゲル電気泳動
(ゲル濃度10〜20%)により行った。
【0052】HPLC法については、ヌクレオジル5C
18カラム(φ4.6×150mm:ケムコ社販売)を
用いた逆相クロマトグラフィーによって、アセトニトリ
ルを含むトリエチルアミノ酢酸(100mM)バッファ
ー(pH7.0)で溶出することにより分離精製した。 上記溶出は、アセトニトリルの直線濃度勾配を5〜35
%(30分)とし、約15分のピークを回収した。
18カラム(φ4.6×150mm:ケムコ社販売)を
用いた逆相クロマトグラフィーによって、アセトニトリ
ルを含むトリエチルアミノ酢酸(100mM)バッファ
ー(pH7.0)で溶出することにより分離精製した。 上記溶出は、アセトニトリルの直線濃度勾配を5〜35
%(30分)とし、約15分のピークを回収した。
【0053】ポリアクリルアミドゲル電気泳動法に関し
ては、各合成オリゴヌクレオチド試料を電気泳動により
分離し、紫外線シャドウイング法による泳動パターンの
観察結果より目的の大きさのバンド部分を切り出し、そ
のポリアクリルアミドゲル断片を約1〜2mm3の大き
さに切り刻み、約2mlの溶出バッファー(0.5MN
H4OAc及び1mM EDTA)を加え、37℃で
一晩振とうした。各オリゴヌクレオチドを含む溶出バッ
ファーを回収し、フェノール抽出(50%フェノール/
50%クロロホルム溶液使用)、イソブタノール抽出を
行い、エタノール沈殿操作により各オリゴヌクレオチド
の精製試料とした。
ては、各合成オリゴヌクレオチド試料を電気泳動により
分離し、紫外線シャドウイング法による泳動パターンの
観察結果より目的の大きさのバンド部分を切り出し、そ
のポリアクリルアミドゲル断片を約1〜2mm3の大き
さに切り刻み、約2mlの溶出バッファー(0.5MN
H4OAc及び1mM EDTA)を加え、37℃で
一晩振とうした。各オリゴヌクレオチドを含む溶出バッ
ファーを回収し、フェノール抽出(50%フェノール/
50%クロロホルム溶液使用)、イソブタノール抽出を
行い、エタノール沈殿操作により各オリゴヌクレオチド
の精製試料とした。
【0054】合成・精製したオリゴヌクレオチドの一部
について、マキサム・ギルバード法〔A.M.Maxa
m et al,Methods in En
zymology,65 499(1980)〕によ
り、目的の塩基配列を有していることを確認した。
について、マキサム・ギルバード法〔A.M.Maxa
m et al,Methods in En
zymology,65 499(1980)〕によ
り、目的の塩基配列を有していることを確認した。
【0055】以下(実施例3、4、5、6、7、8、9
、10及び11)の遺伝子組換えに係わる操作において
、制限酵素及び他の関連酵素の反応条件等は、主にMo
lecular Cloning(前出)記載の方法
に準じた。なお、上記酵素等は主に宝酒造より入手して
おり、宝酒造のマニュアルも参考にした。
、10及び11)の遺伝子組換えに係わる操作において
、制限酵素及び他の関連酵素の反応条件等は、主にMo
lecular Cloning(前出)記載の方法
に準じた。なお、上記酵素等は主に宝酒造より入手して
おり、宝酒造のマニュアルも参考にした。
【0056】実施例3(合成オリゴヌクレオチドの連結
によるヒトTNF遺伝子の構築) (1)まず図1に従ってヒトTNF遺伝子の構築を試み
た。前記実施例2で得られた合成オリゴヌクレオチドを
3つのグループ(U及びL−1〜4、U及びL−5〜7
並びにU及びL−8〜10)に分けてクローニングを行
った。すなわち、U−2、3、4、6、7、9及び10
並びにL−1、2、3、5、6、8及び9の各オリゴヌ
クレオチド(1〜2μg)の5′末端を2〜5ユニット
のT4ポリヌクレオチドキナーゼ(宝酒造)を用いて、
それぞれ別々にリン酸化した。リン酸化反応は10μl
の水溶液中(50mMトリス−HClpH7.6、10
mMMgCl2、0.1mMスペルミジン、0.1mM
EDTA、10mM DTT及び1mM ATP)
、37℃で1時間行い、反応終了後、70℃で10分間
処理することによりT4ポリヌクレオチドキナーゼを失
活させた。新たに、1〜2μgのU−1、5及び8並び
にL−4、7及び10の各オリゴヌクレオチドをそれぞ
れ別々に含む上記と同組成の水溶液10μlを用意し、
それぞれU及びLの同じ番号同士で各オリゴヌクレオチ
ド(U−1〜10及びL−1〜10)水溶液を混合し(
20μl)、100℃で5分間煮沸後徐冷することによ
りアニール化した。次に、得られた10本のアニーリン
グ体(二本鎖DNA断片)を、各グループごとに連結反
応のための水溶液(66mMトリス−HCl pH7
.6、6.6mM MgCl2、10mM DTT
、1mMATP及び100μg/ml BSA)に添
加し(総液量120〜160μl)、40℃に加温後徐
冷によるアニール化の後、700ユニットのT4DNA
リガーゼ(宝酒造)を加えて、16℃で15時間連結反
応を行った。
によるヒトTNF遺伝子の構築) (1)まず図1に従ってヒトTNF遺伝子の構築を試み
た。前記実施例2で得られた合成オリゴヌクレオチドを
3つのグループ(U及びL−1〜4、U及びL−5〜7
並びにU及びL−8〜10)に分けてクローニングを行
った。すなわち、U−2、3、4、6、7、9及び10
並びにL−1、2、3、5、6、8及び9の各オリゴヌ
クレオチド(1〜2μg)の5′末端を2〜5ユニット
のT4ポリヌクレオチドキナーゼ(宝酒造)を用いて、
それぞれ別々にリン酸化した。リン酸化反応は10μl
の水溶液中(50mMトリス−HClpH7.6、10
mMMgCl2、0.1mMスペルミジン、0.1mM
EDTA、10mM DTT及び1mM ATP)
、37℃で1時間行い、反応終了後、70℃で10分間
処理することによりT4ポリヌクレオチドキナーゼを失
活させた。新たに、1〜2μgのU−1、5及び8並び
にL−4、7及び10の各オリゴヌクレオチドをそれぞ
れ別々に含む上記と同組成の水溶液10μlを用意し、
それぞれU及びLの同じ番号同士で各オリゴヌクレオチ
ド(U−1〜10及びL−1〜10)水溶液を混合し(
20μl)、100℃で5分間煮沸後徐冷することによ
りアニール化した。次に、得られた10本のアニーリン
グ体(二本鎖DNA断片)を、各グループごとに連結反
応のための水溶液(66mMトリス−HCl pH7
.6、6.6mM MgCl2、10mM DTT
、1mMATP及び100μg/ml BSA)に添
加し(総液量120〜160μl)、40℃に加温後徐
冷によるアニール化の後、700ユニットのT4DNA
リガーゼ(宝酒造)を加えて、16℃で15時間連結反
応を行った。
【0057】反応終了後、各反応液をポリアクリルアミ
ドゲル電気泳動(ゲル濃度6%)により分離し、エチジ
ウムブロマイド染色法による泳動パターンの観察結果よ
り目的の大きさ(176bp、150bp及び153b
p)のバンド部分を切り出し、エレクトロ・エリューシ
ョン法により目的とする3本のDNA断片を回収した。 更に、回収した各試料に対してフェノール抽出(50%
フェノール/50%クロロホルム溶液使用)、イソブタ
ノール抽出を行い、エタノール沈殿操作により目的のD
NAを精製した。上記方法に準じて、精製した3本の二
本鎖DNA断片をそれぞれ別々にその5′末端をT4ポ
リヌクレオチドキナーゼを用いてリン酸化し、連結反応
のための水溶液中にて混合の後、40℃の加温によりア
ニール化を行い、T4DNAリガーゼを加えて連結した
。エタノール沈殿操作によりこの連結DNAを回収し、
1mM DTT及び100μg/mlBSAを含む5
0μlのハイ・ソルトバッファー(50mMトリス−H
Cl pH7.5、100mM NaCl、10m
M MgCl2)に溶解させ、15ユニットの制限酵
素EcoR I(宝酒造)及び15ユニットの制限酵
素Hind III(宝酒造)を添加して、37℃で
2時間切断反応を行った。反応終了後、上記方法に準じ
て、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(ゲル濃度4%)
により目的とするDNA断片(約480bp)を分離精
製した。
ドゲル電気泳動(ゲル濃度6%)により分離し、エチジ
ウムブロマイド染色法による泳動パターンの観察結果よ
り目的の大きさ(176bp、150bp及び153b
p)のバンド部分を切り出し、エレクトロ・エリューシ
ョン法により目的とする3本のDNA断片を回収した。 更に、回収した各試料に対してフェノール抽出(50%
フェノール/50%クロロホルム溶液使用)、イソブタ
ノール抽出を行い、エタノール沈殿操作により目的のD
NAを精製した。上記方法に準じて、精製した3本の二
本鎖DNA断片をそれぞれ別々にその5′末端をT4ポ
リヌクレオチドキナーゼを用いてリン酸化し、連結反応
のための水溶液中にて混合の後、40℃の加温によりア
ニール化を行い、T4DNAリガーゼを加えて連結した
。エタノール沈殿操作によりこの連結DNAを回収し、
1mM DTT及び100μg/mlBSAを含む5
0μlのハイ・ソルトバッファー(50mMトリス−H
Cl pH7.5、100mM NaCl、10m
M MgCl2)に溶解させ、15ユニットの制限酵
素EcoR I(宝酒造)及び15ユニットの制限酵
素Hind III(宝酒造)を添加して、37℃で
2時間切断反応を行った。反応終了後、上記方法に準じ
て、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(ゲル濃度4%)
により目的とするDNA断片(約480bp)を分離精
製した。
【0058】一方、プラスミドベクターpUC9(九州
大学遺伝情報実験施設より分与)の5μgを、前記の方
法に準じて、制限酵素EcoR I及びHindII
Iで切断し、アガロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)
により約2.7KbpのDNA断片を分離精製した。先
に精製した約480bpのDNA断片(ヒトTNF遺伝
子を含む)とこのpUC9断片を、前記の方法に準じて
、20μlの連結反応液中にて混合し、350ユニット
のT4DNAリガーゼを添加し、16℃で3時間連結反
応を行った。塩化カルシウム法〔Molecular
Cloning参照〕により作製したE.coli
K−12 JM83株(九州大学遺伝情報実験施設
により分与)のコンピテントセルを、上記連結反応液に
より常法に従って形質転換した〔Molecular
Cloning参照〕。
大学遺伝情報実験施設より分与)の5μgを、前記の方
法に準じて、制限酵素EcoR I及びHindII
Iで切断し、アガロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)
により約2.7KbpのDNA断片を分離精製した。先
に精製した約480bpのDNA断片(ヒトTNF遺伝
子を含む)とこのpUC9断片を、前記の方法に準じて
、20μlの連結反応液中にて混合し、350ユニット
のT4DNAリガーゼを添加し、16℃で3時間連結反
応を行った。塩化カルシウム法〔Molecular
Cloning参照〕により作製したE.coli
K−12 JM83株(九州大学遺伝情報実験施設
により分与)のコンピテントセルを、上記連結反応液に
より常法に従って形質転換した〔Molecular
Cloning参照〕。
【0059】得られたアンピシリン耐性クローンより、
公知の方法を用いてプラスミドを調製し、前記の方法に
準じて、制限酵素(EcoR I及びHind I
II)処理後、アガロースゲル電気泳動によりその泳動
パターンを解析することにより、ヒトTNF遺伝子のp
UC9ベクターへの挿入を調べた。その結果、約250
bpの遺伝子の挿入が確認でき、そのクローンについて
挿入された遺伝子の塩基配列をジデオキシ法〔F.Sa
nger,Science,214, 1205(1
981)〕により調べたところ、EcoR I部位か
ら下流に約130bpとHind III部位から上
流に約90bpの目的とするヒトTNF遺伝子の塩基配
列を有する遺伝子断片であることが確認された。このク
ローン及びプラスミドをそれぞれpUA41/JM83
及びpUA41と命名した。
公知の方法を用いてプラスミドを調製し、前記の方法に
準じて、制限酵素(EcoR I及びHind I
II)処理後、アガロースゲル電気泳動によりその泳動
パターンを解析することにより、ヒトTNF遺伝子のp
UC9ベクターへの挿入を調べた。その結果、約250
bpの遺伝子の挿入が確認でき、そのクローンについて
挿入された遺伝子の塩基配列をジデオキシ法〔F.Sa
nger,Science,214, 1205(1
981)〕により調べたところ、EcoR I部位か
ら下流に約130bpとHind III部位から上
流に約90bpの目的とするヒトTNF遺伝子の塩基配
列を有する遺伝子断片であることが確認された。このク
ローン及びプラスミドをそれぞれpUA41/JM83
及びpUA41と命名した。
【0060】(2)引き続き、図2に従ってヒトTNF
遺伝子の構築を試みた。前記(1)工程でのクローニン
グでヒトTNF遺伝子の塩基配列において未達成な領域
周辺を2つのグループ(U及びL−3〜6並びにU及び
L−6〜9)に分け、前記(1)工程と同様にして、各
オリゴヌクレオチドをリン酸化し、アニール化した後、
T4DNAリガーゼにより連結した。前記方法に準じて
、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(ゲル濃度6%)に
より分離精製し、得られた2本のDNA断片(201b
p及び200bp)をそれぞれ別々に100μlの67
mMトリス−HCl(pH8.8)、6.7mM M
gCl2、16.6mM(NH4)2SO4、6.7μ
M EDTA、1mM DTT、200μg/ml
BSA及び各330μMデオキシリボヌクレオチド三リ
ン酸など(dATP、dGTP、dCTP及びTTP)
水溶液にて溶解し、2〜5ユニットのT4DNAポリメ
ラーゼ(宝酒造)を添加し、37℃で30分間反応する
ことによりDNA断片の両末端を平滑化した。反応終了
後、68℃で10分間処理することによりT4DNAポ
リメラーゼを失活させ、エタノール沈殿により目的の2
本のDNA断片を回収した。
遺伝子の構築を試みた。前記(1)工程でのクローニン
グでヒトTNF遺伝子の塩基配列において未達成な領域
周辺を2つのグループ(U及びL−3〜6並びにU及び
L−6〜9)に分け、前記(1)工程と同様にして、各
オリゴヌクレオチドをリン酸化し、アニール化した後、
T4DNAリガーゼにより連結した。前記方法に準じて
、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(ゲル濃度6%)に
より分離精製し、得られた2本のDNA断片(201b
p及び200bp)をそれぞれ別々に100μlの67
mMトリス−HCl(pH8.8)、6.7mM M
gCl2、16.6mM(NH4)2SO4、6.7μ
M EDTA、1mM DTT、200μg/ml
BSA及び各330μMデオキシリボヌクレオチド三リ
ン酸など(dATP、dGTP、dCTP及びTTP)
水溶液にて溶解し、2〜5ユニットのT4DNAポリメ
ラーゼ(宝酒造)を添加し、37℃で30分間反応する
ことによりDNA断片の両末端を平滑化した。反応終了
後、68℃で10分間処理することによりT4DNAポ
リメラーゼを失活させ、エタノール沈殿により目的の2
本のDNA断片を回収した。
【0061】一方、5μgのpUC9ベクターを1mM
DTT及び100μg/ml BSAを含む50
μlのミディアム・ソルトバッファー(10mMトリス
−HCl、pH7.5、50mM NaCl及び10
mM MgCl2)に溶解させ、15ユニットの制限
酵素HincII(宝酒造)を添加し、37℃で2時間
の反応後、エタノール沈殿により回収した。得られた切
断・開環したpUC9ベクターに、先に平滑化後回収し
た2本のDNA断片をそれぞれ別々に、前記方法に準じ
て、T4DNAリガーゼを用いて組込み、E.coli
K−12JM83株を形質転換した。得られたそれぞれ
のクローンについて、前記(1)工程と同様にして、挿
入されたDNAの塩基配列を調べ、目的の塩基配列であ
ることを確認した。これらのクローンをそれぞれpUA
42/JM83及びpUA43/JM83と命名し、プ
ラスミドをpUA42及びpUA43と命名した。
DTT及び100μg/ml BSAを含む50
μlのミディアム・ソルトバッファー(10mMトリス
−HCl、pH7.5、50mM NaCl及び10
mM MgCl2)に溶解させ、15ユニットの制限
酵素HincII(宝酒造)を添加し、37℃で2時間
の反応後、エタノール沈殿により回収した。得られた切
断・開環したpUC9ベクターに、先に平滑化後回収し
た2本のDNA断片をそれぞれ別々に、前記方法に準じ
て、T4DNAリガーゼを用いて組込み、E.coli
K−12JM83株を形質転換した。得られたそれぞれ
のクローンについて、前記(1)工程と同様にして、挿
入されたDNAの塩基配列を調べ、目的の塩基配列であ
ることを確認した。これらのクローンをそれぞれpUA
42/JM83及びpUA43/JM83と命名し、プ
ラスミドをpUA42及びpUA43と命名した。
【0062】上記(1)工程で得られたpUA41を制
限酵素EcoR I(ハイ・ソルトバッファー)及び
Sac I(宝酒造:ロウ・ソルトバッファー)、制
限酵素Hae II(宝酒造)及びHind II
I(ミディアム・ソルトバッファー)で、上記(2)工
程で得られたpUA42を制限酵素Sac I(ロウ
・ソルトバッファー)及びHpa I(宝酒造:KC
lバッファー)で並びにpUA43を制限酵素Hpa
I及びHae II(KClバッファー)で、前記
方法に準じて、それぞれ切断した。ロウ・ソルトバッフ
ァー(10mMトリス−HClpH7.5及び10mM
MgCl2)とハイ・ソルトバッファー又はKCl
バッファー(20mMトリス−HCl pH8.5、
100mM KCl及び10mM MgCl2)の
組合せについては、切断反応を2回に分け、反応の間に
エタノール沈殿操作を行うことにより対応した。pUA
41からのEcoR I−Sac I DNA断
片(127bp)及びHae II−Hind I
IIDNA断片(80bp)、pUA42からのSac
I−HpaI DNA断片(147bp)並びに
pUA43からのHpa I−Hae II D
NA断片(126bp)を、前記方法に準じて、それぞ
れポリアクリルアミドゲル電気泳動(ゲル濃度6%)に
より分離精製した。
限酵素EcoR I(ハイ・ソルトバッファー)及び
Sac I(宝酒造:ロウ・ソルトバッファー)、制
限酵素Hae II(宝酒造)及びHind II
I(ミディアム・ソルトバッファー)で、上記(2)工
程で得られたpUA42を制限酵素Sac I(ロウ
・ソルトバッファー)及びHpa I(宝酒造:KC
lバッファー)で並びにpUA43を制限酵素Hpa
I及びHae II(KClバッファー)で、前記
方法に準じて、それぞれ切断した。ロウ・ソルトバッフ
ァー(10mMトリス−HClpH7.5及び10mM
MgCl2)とハイ・ソルトバッファー又はKCl
バッファー(20mMトリス−HCl pH8.5、
100mM KCl及び10mM MgCl2)の
組合せについては、切断反応を2回に分け、反応の間に
エタノール沈殿操作を行うことにより対応した。pUA
41からのEcoR I−Sac I DNA断
片(127bp)及びHae II−Hind I
IIDNA断片(80bp)、pUA42からのSac
I−HpaI DNA断片(147bp)並びに
pUA43からのHpa I−Hae II D
NA断片(126bp)を、前記方法に準じて、それぞ
れポリアクリルアミドゲル電気泳動(ゲル濃度6%)に
より分離精製した。
【0063】一方、5μgのpUC19プラスミドベク
ター(九州大学遺伝情報実験施設より分与)を、前記の
方法に準じて、制限酵素EcoR I及びHind
IIIで切断し、約2.7kbpのDNA断片をアガ
ロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)により分離精製し
た。 先に精製した4本のDNA断片を図示(図2)したよう
に順次添加し、前記方法に準じて、T4DNAリガーゼ
を用いて連結して行き、最後に上記の精製pUC19ベ
クター(約2.7Kbp断片)に組込み、JM83株を
形質転換した。この形質転換体に含まれるプラスミドに
ついて、前記方法に準じて、挿入された遺伝子の塩基配
列を調べたところ、目的とする完全長(約480bp)
のヒトTNF遺伝子を含むプラスミドベクター(約3.
2Kbp)を有するクローンであることが確認できた。 このクローンをpUA44/JM83と命名し、プラス
ミドをpUA44と命名した。
ター(九州大学遺伝情報実験施設より分与)を、前記の
方法に準じて、制限酵素EcoR I及びHind
IIIで切断し、約2.7kbpのDNA断片をアガ
ロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)により分離精製し
た。 先に精製した4本のDNA断片を図示(図2)したよう
に順次添加し、前記方法に準じて、T4DNAリガーゼ
を用いて連結して行き、最後に上記の精製pUC19ベ
クター(約2.7Kbp断片)に組込み、JM83株を
形質転換した。この形質転換体に含まれるプラスミドに
ついて、前記方法に準じて、挿入された遺伝子の塩基配
列を調べたところ、目的とする完全長(約480bp)
のヒトTNF遺伝子を含むプラスミドベクター(約3.
2Kbp)を有するクローンであることが確認できた。 このクローンをpUA44/JM83と命名し、プラス
ミドをpUA44と命名した。
【0064】実施例4(ヒトTNF発現ベクターの構築
) (1)大腸菌tacプロモーターを有する発現ベクター
pKK223−3(ファルマシア社より入手)をより扱
いやすくする目的で以下の改良を試みた。 i)発現ベクターを低分子量化する。 ii)制限酵素BamH Iの切断部位を唯一とする
。 iii)tacプロモーターの方向をアンピシリン耐性
遺伝子の方向と逆向きにする。
) (1)大腸菌tacプロモーターを有する発現ベクター
pKK223−3(ファルマシア社より入手)をより扱
いやすくする目的で以下の改良を試みた。 i)発現ベクターを低分子量化する。 ii)制限酵素BamH Iの切断部位を唯一とする
。 iii)tacプロモーターの方向をアンピシリン耐性
遺伝子の方向と逆向きにする。
【0065】図3にその方法を図示した。プラスミドベ
クターpBR322(九州大学遺伝情報実験施設より分
与)の5μgを、実施例3の方法に準じて、制限酵素E
coR I及びHind IIIで切断後、その両
末端をT4DNAポリメラーゼを用いて平滑化した。実
施例3の方法に準じて、アガロースゲル電気泳動(ゲル
濃度1%)により約4.4KbpのDNA断片を分離精
製し、その開環部位に100ngのノンフォスフォリレ
ーテッドBgl IIリンカー(制限酵素Bgl
II切断部位を含む10bpの二本鎖DNA断片:カタ
ログNo.4721 Aタカラ・バイオテクノロジー
・カタログ1991 Vol.1、宝酒造より入手)
をT4DNAリガーゼを用いて挿入連結した。前記実施
例3の方法に準じて得た形質転換体の中より、そのプラ
スミドについて制限酵素による切断の可否を調べること
により、目的の制限酵素EcoR I及びHind
III切断部位を欠き、制限酵素Bgl II切断
部位を新生したプラスミドpBR9333(約4.4K
bp)を有するクローンを得た。
クターpBR322(九州大学遺伝情報実験施設より分
与)の5μgを、実施例3の方法に準じて、制限酵素E
coR I及びHind IIIで切断後、その両
末端をT4DNAポリメラーゼを用いて平滑化した。実
施例3の方法に準じて、アガロースゲル電気泳動(ゲル
濃度1%)により約4.4KbpのDNA断片を分離精
製し、その開環部位に100ngのノンフォスフォリレ
ーテッドBgl IIリンカー(制限酵素Bgl
II切断部位を含む10bpの二本鎖DNA断片:カタ
ログNo.4721 Aタカラ・バイオテクノロジー
・カタログ1991 Vol.1、宝酒造より入手)
をT4DNAリガーゼを用いて挿入連結した。前記実施
例3の方法に準じて得た形質転換体の中より、そのプラ
スミドについて制限酵素による切断の可否を調べること
により、目的の制限酵素EcoR I及びHind
III切断部位を欠き、制限酵素Bgl II切断
部位を新生したプラスミドpBR9333(約4.4K
bp)を有するクローンを得た。
【0066】上記で得たプラスミドpBR9333の5
μgを、実施例3の方法に準じて、ハイ・ソルトバッフ
ァーに溶解し、制限酵素Bgl II(宝酒造)及び
PvuII(宝酒造)で切断し、複製起点を含む約2.
3KbpのDNA断片をアガロースゲル電気泳動(ゲル
濃度1%)により分離精製した。一方、発現ベクターp
KK223−3(約4.6Kbp)の5μgを上記の場
合と同様、ハイ・ソルトバッファーに溶解し、制限酵素
BamH I(宝酒造)及びSca I(宝酒造)
で切断した。制限酵素BamH Iによる切断反応は
、添加酵素量を通常の約1/2とし、反応時間を5〜3
0分間とする部分切断により行った。切断処理後、ta
cプロモーター及びrrnBT1T2ターミネーター等
を含む約1.1KbpのDNA断片を上記の場合と同様
、アガロースゲル電気泳動により分離精製した。先に精
製した複製起点を含む約2.3KbpのDNA断片に上
記の約1.1KbpのDNA断片を前記に準じてT4D
NAリガーゼを用いて挿入連結し、実施例3の方法に準
じて、塩化カルシウム法により作製したE.coli
K−12 JM103株(九州大学遺伝情報実験施
設)のコンピテントセルに導入した。得られた形質転換
体の中より、目的とするtacプロモーター等を含む発
現ベクター(約3.4Kbp)を有するクローンを選択
し、この発現ベクターをpKK101と命名した。
μgを、実施例3の方法に準じて、ハイ・ソルトバッフ
ァーに溶解し、制限酵素Bgl II(宝酒造)及び
PvuII(宝酒造)で切断し、複製起点を含む約2.
3KbpのDNA断片をアガロースゲル電気泳動(ゲル
濃度1%)により分離精製した。一方、発現ベクターp
KK223−3(約4.6Kbp)の5μgを上記の場
合と同様、ハイ・ソルトバッファーに溶解し、制限酵素
BamH I(宝酒造)及びSca I(宝酒造)
で切断した。制限酵素BamH Iによる切断反応は
、添加酵素量を通常の約1/2とし、反応時間を5〜3
0分間とする部分切断により行った。切断処理後、ta
cプロモーター及びrrnBT1T2ターミネーター等
を含む約1.1KbpのDNA断片を上記の場合と同様
、アガロースゲル電気泳動により分離精製した。先に精
製した複製起点を含む約2.3KbpのDNA断片に上
記の約1.1KbpのDNA断片を前記に準じてT4D
NAリガーゼを用いて挿入連結し、実施例3の方法に準
じて、塩化カルシウム法により作製したE.coli
K−12 JM103株(九州大学遺伝情報実験施
設)のコンピテントセルに導入した。得られた形質転換
体の中より、目的とするtacプロモーター等を含む発
現ベクター(約3.4Kbp)を有するクローンを選択
し、この発現ベクターをpKK101と命名した。
【0067】(2)図4に従って、次の工程を説明する
。前記(1)工程で得た発現ベクターpKK101の5
μgを、前記方法に準じて、制限酵素EcoR I及
びHind IIIで切断し、複製起点及び転写調節
領域等を含む約3.4KbpのDNA断片をアガロース
ゲル電気泳動(ゲル濃度1%)により分離精製した。ま
た、前記実施例3で得られたヒトTNF遺伝子を含むプ
ラスミドpUA44(約3.2Kbp)を、同様にして
、制限酵素EcoR I及びHind IIIで切
断し、ヒトTNF遺伝子全域を含む約480bpのDN
A断片をアガロースゲル電気泳動により分離精製した。 このヒトTNF遺伝子全域を含むDNA断片を、先に発
現ベクターpKK101より精製した約3.4Kbpの
DNA断片に、前記方法に準じて、T4DNAリガーゼ
を用いて挿入連結し、前記の方法に準じてE.coli
K−12 JM103株に導入した。得られた形
質転換体の中より目的のヒトTNF発現ベクター(約3
.9Kbp)を有するクローンを選択し、この発現ベク
ターをpKF4102と命名した。
。前記(1)工程で得た発現ベクターpKK101の5
μgを、前記方法に準じて、制限酵素EcoR I及
びHind IIIで切断し、複製起点及び転写調節
領域等を含む約3.4KbpのDNA断片をアガロース
ゲル電気泳動(ゲル濃度1%)により分離精製した。ま
た、前記実施例3で得られたヒトTNF遺伝子を含むプ
ラスミドpUA44(約3.2Kbp)を、同様にして
、制限酵素EcoR I及びHind IIIで切
断し、ヒトTNF遺伝子全域を含む約480bpのDN
A断片をアガロースゲル電気泳動により分離精製した。 このヒトTNF遺伝子全域を含むDNA断片を、先に発
現ベクターpKK101より精製した約3.4Kbpの
DNA断片に、前記方法に準じて、T4DNAリガーゼ
を用いて挿入連結し、前記の方法に準じてE.coli
K−12 JM103株に導入した。得られた形
質転換体の中より目的のヒトTNF発現ベクター(約3
.9Kbp)を有するクローンを選択し、この発現ベク
ターをpKF4102と命名した。
【0068】実施例5(プラスミドpUC119−F4
104の構築) (1)図5に従って説明する。前記実施例3で得られた
プラスミドpUA44を、前記方法に準じ、制限酵素E
coR I及びHind IIIで切断し、ヒトT
NF遺伝子(全域を含む約480bp)のDNA断片を
アガロースゲル電気泳動により分離精製した。一方、M
essingら〔Methods in Enzy
mology,153,3(1987)〕によって開発
された一本鎖プラスミドDNA調製用プラスミドベクタ
ーpUC119(宝酒造より入手)を、同様にして、制
限酵素EcoRI及びHind IIIで切断し、I
G領域を含む約3.2KbpのDNA断片をアガロース
ゲル電気泳動により分離精製した。このIG領域(M1
3ファージDNAのintergenic regi
on)の存在により、プラスミドpUC119は、ヘル
パーファージM13K07感染後優先的に一本鎖DNA
となりファージ粒子に包み込まれ菌体外に放出される。 上記で精製したヒトTNF遺伝子全域を含む約480b
pのDNA断片とIG領域を含む約3.2KbpのpU
C119断片を前記に準じてT4DNAリガーゼを用い
て連結し、前記実施例3の方法に準じてE.coli
K−12 JM83株に導入した。得られた形質転
換体の中より、目的のプラスミド(約3.7Kbp)を
有するクローンを選択し、このクローンをpUC119
−hTNF/JM83と命名し、プラスミドをpUC1
19−hTNFと命名した。
104の構築) (1)図5に従って説明する。前記実施例3で得られた
プラスミドpUA44を、前記方法に準じ、制限酵素E
coR I及びHind IIIで切断し、ヒトT
NF遺伝子(全域を含む約480bp)のDNA断片を
アガロースゲル電気泳動により分離精製した。一方、M
essingら〔Methods in Enzy
mology,153,3(1987)〕によって開発
された一本鎖プラスミドDNA調製用プラスミドベクタ
ーpUC119(宝酒造より入手)を、同様にして、制
限酵素EcoRI及びHind IIIで切断し、I
G領域を含む約3.2KbpのDNA断片をアガロース
ゲル電気泳動により分離精製した。このIG領域(M1
3ファージDNAのintergenic regi
on)の存在により、プラスミドpUC119は、ヘル
パーファージM13K07感染後優先的に一本鎖DNA
となりファージ粒子に包み込まれ菌体外に放出される。 上記で精製したヒトTNF遺伝子全域を含む約480b
pのDNA断片とIG領域を含む約3.2KbpのpU
C119断片を前記に準じてT4DNAリガーゼを用い
て連結し、前記実施例3の方法に準じてE.coli
K−12 JM83株に導入した。得られた形質転
換体の中より、目的のプラスミド(約3.7Kbp)を
有するクローンを選択し、このクローンをpUC119
−hTNF/JM83と命名し、プラスミドをpUC1
19−hTNFと命名した。
【0069】上記で得たプラスミドpUC119−hT
NFを、そのDNA内にウラシルを取り込ませ保持する
ために、前記実施例3の方法に準じて、塩化カルシウム
法により作製した大腸菌CJ236株(dut−,un
g−)のコンピテントセルに導入した。CJ236株は
デオキシウリジン三リン酸分解酵素遺伝子に欠失変異(
dut−)を持つため競合反応が生じ、チミンの替わり
に一部ウラシルを取り込んだDNAを作ることができ、
更に ung−変異によりウラシルN−グリコシラー
ゼが欠損しており、そのウラシルをDNA中に保持して
おくことができる。このCJ236株はバイオ・ラドよ
り入手した。上記導入により得られたクローン(pUC
119−hTNF/CJ236)をヘルパーファージM
13K07(宝酒造より入手)の感染後、100μg/
mlアンピシリン、70μg/mlカナマイシン及び3
0μg/mlクロラムフェニコールを含む2×YTブロ
ース(1.6%トリプトン、1%酵母エキス及び0.5
%NaCl pH7.6)にて培養することにより、
目的のウラシルを導入した一本鎖プラスミドDNA(約
3.7Kbases)をファージ粒子に包み込んだ形で
菌体外に放出させた。放出させたファージ粒子を培養上
清より回収し、一本鎖ファージDNAの調製方法に準じ
て、目的の一本鎖プラスミドDNAを調製した。
NFを、そのDNA内にウラシルを取り込ませ保持する
ために、前記実施例3の方法に準じて、塩化カルシウム
法により作製した大腸菌CJ236株(dut−,un
g−)のコンピテントセルに導入した。CJ236株は
デオキシウリジン三リン酸分解酵素遺伝子に欠失変異(
dut−)を持つため競合反応が生じ、チミンの替わり
に一部ウラシルを取り込んだDNAを作ることができ、
更に ung−変異によりウラシルN−グリコシラー
ゼが欠損しており、そのウラシルをDNA中に保持して
おくことができる。このCJ236株はバイオ・ラドよ
り入手した。上記導入により得られたクローン(pUC
119−hTNF/CJ236)をヘルパーファージM
13K07(宝酒造より入手)の感染後、100μg/
mlアンピシリン、70μg/mlカナマイシン及び3
0μg/mlクロラムフェニコールを含む2×YTブロ
ース(1.6%トリプトン、1%酵母エキス及び0.5
%NaCl pH7.6)にて培養することにより、
目的のウラシルを導入した一本鎖プラスミドDNA(約
3.7Kbases)をファージ粒子に包み込んだ形で
菌体外に放出させた。放出させたファージ粒子を培養上
清より回収し、一本鎖ファージDNAの調製方法に準じ
て、目的の一本鎖プラスミドDNAを調製した。
【0070】(2)次に図6に従って説明する。コーデ
ィング鎖オリゴヌクレオチドを用いて、ヒトTNF遺伝
子に対し変異導入を行うために、プライマー4104を
デザインした。プライマー4104(塩基数16)配列
表の配列番号7の5番目のCから20番目のGまでの塩
基配列を有するが、 13番目のAがGに置換された
ものである。このオリゴヌクレオチドの化学合成及び精
製は、前記実施例2の方法に準じて行った。
ィング鎖オリゴヌクレオチドを用いて、ヒトTNF遺伝
子に対し変異導入を行うために、プライマー4104を
デザインした。プライマー4104(塩基数16)配列
表の配列番号7の5番目のCから20番目のGまでの塩
基配列を有するが、 13番目のAがGに置換された
ものである。このオリゴヌクレオチドの化学合成及び精
製は、前記実施例2の方法に準じて行った。
【0071】ヒトTNF遺伝子への部位特異的変異導入
は、バイオ・ラドのシステム(Muta−GeneTM
in vitro mutagenesis
kit)に準じて行った。すなわち、上記で作製した
約0.5μgのプライマーの5′末端を前記方法に準じ
てT4ポリヌクレオチドキナーゼによりリン酸化した一
部と、先に調製したウラシル導入一本鎖プラスミドDN
A(pUC 119−hTNF)の約200ngとの
間で、10μlのアニーリング・バッファー(20mM
トリス−HCl pH7.4, 2mM MgC
l2及び50mM NaCl)中にてアニーリング(
約70℃に加温後徐冷)を行った。アニーリング終了後
、10倍シンセシス・バッファー(5mM各デオキシリ
ボヌクレオチド三リン酸など(dATP、dGTP、d
CTP及びTTP)、10mMATP、100mMトリ
ス−HCl pH7.4、50mM MgCl2及
び20mM DTT)を1/10容量加え、1ユニッ
トのT4DNAポリメラーゼ及び2〜4ユニットのT4
DNAリガーゼを用いて二本鎖化反応(37℃、90分
間)を行った。TEバッファー(10mM トリス−
HCl pH7.5及び1mM EDTA)を約8
容量加え、凍結することにより反応を停止した。前記実
施例3の方法に準じて、塩化カルシウム法により作製し
たE.coli K−12 TG1株(ung+:
アマシャム社)のコンピテントセルに、上記反応液を処
理し二本鎖DNAを導入した。
は、バイオ・ラドのシステム(Muta−GeneTM
in vitro mutagenesis
kit)に準じて行った。すなわち、上記で作製した
約0.5μgのプライマーの5′末端を前記方法に準じ
てT4ポリヌクレオチドキナーゼによりリン酸化した一
部と、先に調製したウラシル導入一本鎖プラスミドDN
A(pUC 119−hTNF)の約200ngとの
間で、10μlのアニーリング・バッファー(20mM
トリス−HCl pH7.4, 2mM MgC
l2及び50mM NaCl)中にてアニーリング(
約70℃に加温後徐冷)を行った。アニーリング終了後
、10倍シンセシス・バッファー(5mM各デオキシリ
ボヌクレオチド三リン酸など(dATP、dGTP、d
CTP及びTTP)、10mMATP、100mMトリ
ス−HCl pH7.4、50mM MgCl2及
び20mM DTT)を1/10容量加え、1ユニッ
トのT4DNAポリメラーゼ及び2〜4ユニットのT4
DNAリガーゼを用いて二本鎖化反応(37℃、90分
間)を行った。TEバッファー(10mM トリス−
HCl pH7.5及び1mM EDTA)を約8
容量加え、凍結することにより反応を停止した。前記実
施例3の方法に準じて、塩化カルシウム法により作製し
たE.coli K−12 TG1株(ung+:
アマシャム社)のコンピテントセルに、上記反応液を処
理し二本鎖DNAを導入した。
【0072】ung+株にヘテロ二本鎖DNAを導入す
ることにより、鋳型であるウラシルを含むDNA鎖は不
活性化され複製の対象とならない。(そのため変異の導
入頻度は50%を上回る高効率なものとなる。)得られ
た形質転換体の中より、変異導入のために使用したプラ
イマーをプローブとしたコロニー・ハイブリダイゼーシ
ョン法を用いて、目的の変換体DNAを含むプラスミド
(約3.7Kbp)を有するクローンを選択した。選択
されたクローンについて、そのプラスミドの変異導入部
位周辺の塩基配列をジデオキシ法〔F.Sanger:
前出〕により調べ、デザイン通りの変換体DNAに変異
していることを確認した。このプラスミドをpUC11
9−F4104と命名した。pUC119−F4104
の変異導入は配列表の配列番号7の配列における13番
目のAのGへの変換であり、その結果、制限酵素 X
ho I切断部位を生成した。
ることにより、鋳型であるウラシルを含むDNA鎖は不
活性化され複製の対象とならない。(そのため変異の導
入頻度は50%を上回る高効率なものとなる。)得られ
た形質転換体の中より、変異導入のために使用したプラ
イマーをプローブとしたコロニー・ハイブリダイゼーシ
ョン法を用いて、目的の変換体DNAを含むプラスミド
(約3.7Kbp)を有するクローンを選択した。選択
されたクローンについて、そのプラスミドの変異導入部
位周辺の塩基配列をジデオキシ法〔F.Sanger:
前出〕により調べ、デザイン通りの変換体DNAに変異
していることを確認した。このプラスミドをpUC11
9−F4104と命名した。pUC119−F4104
の変異導入は配列表の配列番号7の配列における13番
目のAのGへの変換であり、その結果、制限酵素 X
ho I切断部位を生成した。
【0073】実施例6(ヒトTNF転換体発現ベクター
pKF4146の構築) 前記実施例5で得られた制限酵素 Xho I切断
部位を有するプラスミドpUC119−F4104を用
いて、その制限酵素 Xho I切断部位のN末端
側に化学合成オリゴヌクレオチド(アニーリングにより
二本鎖化したもの)を連結することにより、N末端付加
型ヒトTNF転換体ポリペプチド(F4146と命名)
の発現ベクター(pKF4146と命名)を構築した。 その構築方法を図7に従って説明する。
pKF4146の構築) 前記実施例5で得られた制限酵素 Xho I切断
部位を有するプラスミドpUC119−F4104を用
いて、その制限酵素 Xho I切断部位のN末端
側に化学合成オリゴヌクレオチド(アニーリングにより
二本鎖化したもの)を連結することにより、N末端付加
型ヒトTNF転換体ポリペプチド(F4146と命名)
の発現ベクター(pKF4146と命名)を構築した。 その構築方法を図7に従って説明する。
【0074】プラスミドpUC119−F4104(約
3.7Kbp)の5μgを、前記実施例3の方法に準じ
て、ハイ・ソルトバッファーに溶解し、制限酵素Xho
I (宝酒造)及びHind IIIで切断し、N
末部分を欠失したF4104遺伝子を含む約460bp
のDNA断片をアガロース電気泳動(ゲル濃度1%)に
より分離精製した。また、F4104のN末部分に付加
する目的でデザインしたオリゴペプチドをコードするオ
リゴヌクレオチドの上鎖(U−4146)及び下鎖(L
−4146)を前記実施例2の方法に準じて化学合成し
、精製した。上鎖(U−4146)は配列表の配列番号
8で示した配列を有する。また下鎖(L−4146)は
この上鎖に相補するものであるが、配列番号8の1番目
〜4番目の5′−AATT−3′に相補する塩基配列は
有さず、一方配列番号8の43番目のCに相補するGに
対し上流方向に5′−TCGA−3′を接続する塩基配
列を有する。精製後得られた2本のオリゴヌクレオチド
(各1μg)を、前記実施例3の方法に準じて、その5
′末端をT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いてリン酸
化の後、アニール化により二本鎖DNA断片(43bp
)とした。一方、前記実施例4の方法に準じてプラスミ
ドベクターpKK101を制限酵素EcoRI及びHi
nd IIIで切断し、複製起点及び転写調節領域等
を含む約3.4KbpのDNA断片を分離精製した。
3.7Kbp)の5μgを、前記実施例3の方法に準じ
て、ハイ・ソルトバッファーに溶解し、制限酵素Xho
I (宝酒造)及びHind IIIで切断し、N
末部分を欠失したF4104遺伝子を含む約460bp
のDNA断片をアガロース電気泳動(ゲル濃度1%)に
より分離精製した。また、F4104のN末部分に付加
する目的でデザインしたオリゴペプチドをコードするオ
リゴヌクレオチドの上鎖(U−4146)及び下鎖(L
−4146)を前記実施例2の方法に準じて化学合成し
、精製した。上鎖(U−4146)は配列表の配列番号
8で示した配列を有する。また下鎖(L−4146)は
この上鎖に相補するものであるが、配列番号8の1番目
〜4番目の5′−AATT−3′に相補する塩基配列は
有さず、一方配列番号8の43番目のCに相補するGに
対し上流方向に5′−TCGA−3′を接続する塩基配
列を有する。精製後得られた2本のオリゴヌクレオチド
(各1μg)を、前記実施例3の方法に準じて、その5
′末端をT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いてリン酸
化の後、アニール化により二本鎖DNA断片(43bp
)とした。一方、前記実施例4の方法に準じてプラスミ
ドベクターpKK101を制限酵素EcoRI及びHi
nd IIIで切断し、複製起点及び転写調節領域等
を含む約3.4KbpのDNA断片を分離精製した。
【0075】上記方法に従って得られた3本のDNA断
片を、前記実施例3の方法に準じて、T4DNAリガー
ゼを用いて連結し、E.coli K−12 JM
103株のコンピテントセルに導入した。得られた形質
転換体の中より、目的のF4146発現ベクターpKF
4146(約3.9Kbp)を有するクローンを、制限
酵素EcoR I、Xho I及びHind I
IIによる切断パターンの確認並びに転換体ポリペプチ
ドのN末端付加部位周辺の塩基配列を調べることにより
選択した。
片を、前記実施例3の方法に準じて、T4DNAリガー
ゼを用いて連結し、E.coli K−12 JM
103株のコンピテントセルに導入した。得られた形質
転換体の中より、目的のF4146発現ベクターpKF
4146(約3.9Kbp)を有するクローンを、制限
酵素EcoR I、Xho I及びHind I
IIによる切断パターンの確認並びに転換体ポリペプチ
ドのN末端付加部位周辺の塩基配列を調べることにより
選択した。
【0076】上記方法に従って構築した転換体発現ベク
ターは、発現誘導により、以下に示す変換を有する新規
生理活性ポリペプチドを大腸菌内に生産する。ベクター
pKF4146:配列表の配列番号1で示した1番目な
いし8番目のアミノ酸配列が配列表の配列番号3で示し
たアミノ酸配列で置換されたポリペプチドF4146を
コードする。
ターは、発現誘導により、以下に示す変換を有する新規
生理活性ポリペプチドを大腸菌内に生産する。ベクター
pKF4146:配列表の配列番号1で示した1番目な
いし8番目のアミノ酸配列が配列表の配列番号3で示し
たアミノ酸配列で置換されたポリペプチドF4146を
コードする。
【0077】実施例7(ヒトTNF転換体発現ベクター
pKF4422及びpKF4423の構築)前記実施例
6で得られたヒトTNF転換体発現ベクターpKF41
46(約3.9Khp)の5μgを、前記実施例3の方
法に準じて、ハイ・ソルトバッファーに溶解し、制限酵
素Bgl II及びHind IIIで切断し、N
末部分を欠失したF4146遺伝子を含む約470bP
のDNA断片をアガロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%
)により分離精製した。また、F4146のN末部分に
付加する目的でデザインしたオリゴペプチドをコードす
るオリゴヌクレオチドの上鎖(U−4422又はU−4
423)及び下鎖(L−4422又はL−4423)を
デザインした。
pKF4422及びpKF4423の構築)前記実施例
6で得られたヒトTNF転換体発現ベクターpKF41
46(約3.9Khp)の5μgを、前記実施例3の方
法に準じて、ハイ・ソルトバッファーに溶解し、制限酵
素Bgl II及びHind IIIで切断し、N
末部分を欠失したF4146遺伝子を含む約470bP
のDNA断片をアガロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%
)により分離精製した。また、F4146のN末部分に
付加する目的でデザインしたオリゴペプチドをコードす
るオリゴヌクレオチドの上鎖(U−4422又はU−4
423)及び下鎖(L−4422又はL−4423)を
デザインした。
【0078】
U−4422(配列表の配列番号9、塩基数21)L−
4422(塩基数21) U−4422に相補するものであるが、配列番号9の1
番目〜4番目の5′−AATT−3′に相補する塩基配
列は有さず、一方配列番号9の21番目のAに相補する
Tに対し上流方向に5′−GATC−3′を接続する塩
基配列を有する。
4422(塩基数21) U−4422に相補するものであるが、配列番号9の1
番目〜4番目の5′−AATT−3′に相補する塩基配
列は有さず、一方配列番号9の21番目のAに相補する
Tに対し上流方向に5′−GATC−3′を接続する塩
基配列を有する。
【0079】
U−4423(配列表の配列番号10、塩基数36)L
−4423(塩基数36) U−4423に相補するものであるが、配列番号10の
1番目〜4番目の5′−AATT−3′に相補する塩基
配列は有さず、一方配列番号10の36番目のAに相補
するTに対し上流方向に5′−GATC−3′を接続す
る塩基配列を有する。
−4423(塩基数36) U−4423に相補するものであるが、配列番号10の
1番目〜4番目の5′−AATT−3′に相補する塩基
配列は有さず、一方配列番号10の36番目のAに相補
するTに対し上流方向に5′−GATC−3′を接続す
る塩基配列を有する。
【0080】これらのオリゴヌクレオチドを前記実施例
2の方法に準じて化学合成し、精製した。精製後得られ
たそれぞれの上・下2本のオリゴヌクレオチド(各1μ
g)を、前記実施例3の方法に準じて、その5′末端を
T4ポリヌクレオチドキナーゼを用いてリン酸化の後、
アニール化により二本鎖DNA断片(21bp又は36
bp)とした。
2の方法に準じて化学合成し、精製した。精製後得られ
たそれぞれの上・下2本のオリゴヌクレオチド(各1μ
g)を、前記実施例3の方法に準じて、その5′末端を
T4ポリヌクレオチドキナーゼを用いてリン酸化の後、
アニール化により二本鎖DNA断片(21bp又は36
bp)とした。
【0081】一方、前記実施例4の方法に準じて、プラ
スミドベクターpKK101を制限酵素EcoR I
及びHind IIIで切断し、複製起点及び転写調
節領域等を含む約3.4KbpのDNA断片を分離精製
した。
スミドベクターpKK101を制限酵素EcoR I
及びHind IIIで切断し、複製起点及び転写調
節領域等を含む約3.4KbpのDNA断片を分離精製
した。
【0082】上記方法に従って得られた3種類のDNA
断片をそれぞれ、前記実施例3の方法に準じて、T4D
NAリガーゼを用いて連結し、E.coli K−1
2 JM103株のコンピテントセルに導入した。得
られた形質転換体の中より、目的のF4422発現ベク
ターpKF4422(約3.9Kbp)又はF4423
発現ベクターpKF4423(約3.9Kbp)を有す
るクローンを制限酵素EcoR I、Bgl II
及びHind IIIによる切断パターンの確認並び
に転換体ポリペプチドのN末端付加部位周辺の塩基配列
を調べることにより選択した。
断片をそれぞれ、前記実施例3の方法に準じて、T4D
NAリガーゼを用いて連結し、E.coli K−1
2 JM103株のコンピテントセルに導入した。得
られた形質転換体の中より、目的のF4422発現ベク
ターpKF4422(約3.9Kbp)又はF4423
発現ベクターpKF4423(約3.9Kbp)を有す
るクローンを制限酵素EcoR I、Bgl II
及びHind IIIによる切断パターンの確認並び
に転換体ポリペプチドのN末端付加部位周辺の塩基配列
を調べることにより選択した。
【0083】上記方法に従って構築した転換体発現ベク
ターは、発現誘導により、以下に示す変換を有する新規
生理活性ポリペプチドを大腸菌内に生産する。ベクター
pKF4422:配列表の配列番号1で示した1番目〜
8番目のアミノ酸配列が配列表の配列番号5で示したア
ミノ酸配列で置換されたポリペプチドF4422をコー
ドする。ベクターpKF4423:配列表の配列番号1
で示した1番目〜8番目のアミノ酸配列が配列表の配列
番号6で示したアミノ酸配列で置換されたポリペプチド
F4423をコードする。
ターは、発現誘導により、以下に示す変換を有する新規
生理活性ポリペプチドを大腸菌内に生産する。ベクター
pKF4422:配列表の配列番号1で示した1番目〜
8番目のアミノ酸配列が配列表の配列番号5で示したア
ミノ酸配列で置換されたポリペプチドF4422をコー
ドする。ベクターpKF4423:配列表の配列番号1
で示した1番目〜8番目のアミノ酸配列が配列表の配列
番号6で示したアミノ酸配列で置換されたポリペプチド
F4423をコードする。
【0084】実施例8(ヒトTNF転換体発現ベクター
pKF4236の構築) (1)trp プロモーターを有する発現ベクターの
構築方法を図8〜図11に従って説明する。転写プロモ
ーターとしてtrpプロモーターを有し、翻訳開始シグ
ナル(SD配列)をタンデムに2つ並べ、転写ターミネ
ーターとして rrnBT1T2ターミネーターを有
するプラスミドベクター(pSK407と命名)を図8
〜図10に示した方法に従って構築した。プラスミドベ
クターpGF101(約4.3Kbp、大阪大学薬学部
より分与)の5μgを、前記方法に準じて、ミディアム
・ソルトバッファーに溶解し、10ユニットの制限酵素
ClaI(宝酒造)を添加することにより切断した。こ
の切断されたDNA断片を、前記実施例3の方法に準じ
て、T4DNAポリメラーゼを用いて平滑化し、エタノ
ール沈殿操作後、NaClを添加しNaCl濃度を17
5mMとしたハイ・ソルトバッファーに溶解し、15ユ
ニットの制限酵素Sal I(宝酒造)を添加するこ
とにより切断した。前記実施例3の方法に準じて、アガ
ロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)により約4.0K
bpのDNA断片を分離精製した。
pKF4236の構築) (1)trp プロモーターを有する発現ベクターの
構築方法を図8〜図11に従って説明する。転写プロモ
ーターとしてtrpプロモーターを有し、翻訳開始シグ
ナル(SD配列)をタンデムに2つ並べ、転写ターミネ
ーターとして rrnBT1T2ターミネーターを有
するプラスミドベクター(pSK407と命名)を図8
〜図10に示した方法に従って構築した。プラスミドベ
クターpGF101(約4.3Kbp、大阪大学薬学部
より分与)の5μgを、前記方法に準じて、ミディアム
・ソルトバッファーに溶解し、10ユニットの制限酵素
ClaI(宝酒造)を添加することにより切断した。こ
の切断されたDNA断片を、前記実施例3の方法に準じ
て、T4DNAポリメラーゼを用いて平滑化し、エタノ
ール沈殿操作後、NaClを添加しNaCl濃度を17
5mMとしたハイ・ソルトバッファーに溶解し、15ユ
ニットの制限酵素Sal I(宝酒造)を添加するこ
とにより切断した。前記実施例3の方法に準じて、アガ
ロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)により約4.0K
bpのDNA断片を分離精製した。
【0085】一方、Casadaban ら〔J.B
aderiol.,143,971(1980)〕によ
って開発されプラスミドpMC1403(約9.9Kb
p、京都大学ウィルス研究所より分与)の5μgを、前
記方法に準じて、制限酵素EcoR Iにより切断後
、上記方法と同様に、平滑化及び制限酵素Sal I
切断を行い、アガロースゲル電気泳動により約6.2K
bpのDNA断片を分離精製した。前記実施例3の方法
に準じて、先に精製したDNA断片との間でT4DNA
リガーゼを用いて連結反応を行い、塩化カルシウム法に
より作製したE.coli K−12 HB101
株(京都大学ウィルス研究所より分与)のコンピテント
セルに導入した。得られた形質転換体の中より、目的の
trpプロモーター並びに制限酵素EcoR I及び
BamH I切断部位を含む約10.2Kbpのプラ
スミドベクター(pSK101と命名)を有するクロー
ンを選択した。
aderiol.,143,971(1980)〕によ
って開発されプラスミドpMC1403(約9.9Kb
p、京都大学ウィルス研究所より分与)の5μgを、前
記方法に準じて、制限酵素EcoR Iにより切断後
、上記方法と同様に、平滑化及び制限酵素Sal I
切断を行い、アガロースゲル電気泳動により約6.2K
bpのDNA断片を分離精製した。前記実施例3の方法
に準じて、先に精製したDNA断片との間でT4DNA
リガーゼを用いて連結反応を行い、塩化カルシウム法に
より作製したE.coli K−12 HB101
株(京都大学ウィルス研究所より分与)のコンピテント
セルに導入した。得られた形質転換体の中より、目的の
trpプロモーター並びに制限酵素EcoR I及び
BamH I切断部位を含む約10.2Kbpのプラ
スミドベクター(pSK101と命名)を有するクロー
ンを選択した。
【0086】上記で得られたプラスミドベクターpSK
101の5μgを2本のチューブにそれぞれ別々に、前
記方法に準じて、ハイ・ソルトバッファーに溶解し、制
限酵素EcoR I及びSal I並びに制限酵素
BamH I及びSal Iを添加することにより
切断し、アガロースゲル電気泳動により約4.0Kbp
及び約6.2KbpのDNA断片をそれぞれ分離精製し
た。一方、ポータブル翻訳開始部位オリゴヌクレオチド
(SD−ATGリンカーと略し、翻訳開始シグナルSD
配列及び翻訳開始コドンATGを含む塩基数21のオリ
ゴヌクレオチド:カタログNo.27−4878−01
及び27−4898−01ファルマシア・モレキュラー
・バイオロジカルズ1985 May、ファルマシア
社より入手)の上下鎖(各100ng)を、前記実施例
3の方法に準じて、その5′末端のリン酸化及びアニー
ル化に供し、二本鎖DNA断片(21bp)とした。上
記で得られた3本のDNA断片を、前記方法に準じて、
T4DNAリガーゼを用いて連結し、E.coli
K−12HB101株のコンピテントセルに導入した。 得られた形質転換体の中より、目的とするSD−ATG
リンカーがtrpプロモーターの下流かつ制限酵素Ba
mH I切断部位の直前に挿入された約10.2Kb
pのプラスミドベクター(pSK211と命名)を有す
るクローンを選択した。このプラスミドベクターは、t
rpプロモーターの下流にタンデムに並んだ2つのSD
配列を持つことになる。
101の5μgを2本のチューブにそれぞれ別々に、前
記方法に準じて、ハイ・ソルトバッファーに溶解し、制
限酵素EcoR I及びSal I並びに制限酵素
BamH I及びSal Iを添加することにより
切断し、アガロースゲル電気泳動により約4.0Kbp
及び約6.2KbpのDNA断片をそれぞれ分離精製し
た。一方、ポータブル翻訳開始部位オリゴヌクレオチド
(SD−ATGリンカーと略し、翻訳開始シグナルSD
配列及び翻訳開始コドンATGを含む塩基数21のオリ
ゴヌクレオチド:カタログNo.27−4878−01
及び27−4898−01ファルマシア・モレキュラー
・バイオロジカルズ1985 May、ファルマシア
社より入手)の上下鎖(各100ng)を、前記実施例
3の方法に準じて、その5′末端のリン酸化及びアニー
ル化に供し、二本鎖DNA断片(21bp)とした。上
記で得られた3本のDNA断片を、前記方法に準じて、
T4DNAリガーゼを用いて連結し、E.coli
K−12HB101株のコンピテントセルに導入した。 得られた形質転換体の中より、目的とするSD−ATG
リンカーがtrpプロモーターの下流かつ制限酵素Ba
mH I切断部位の直前に挿入された約10.2Kb
pのプラスミドベクター(pSK211と命名)を有す
るクローンを選択した。このプラスミドベクターは、t
rpプロモーターの下流にタンデムに並んだ2つのSD
配列を持つことになる。
【0087】このプラスミドベクターの制限酵素Sal
I切断部位を消失し、その近傍に制限酵素Hind
III切断部位を新生する目的で以下の操作を行っ
た。 プラスミドベクターpSK211の5μgを前記方法に
準じて、制限酵素Sal Iにて切断後、T4DNA
ポリメラーゼを用いて平滑化した。エタノール沈殿操作
により回収したDNA断片を制限酵素BamH Iで
切断し、アガロースゲル電気泳動により約4.0Kbp
のDNA断片を分離精製した。一方、tacプロモータ
ーを有するプラスミドベクターpKK223−3(ファ
ルマシア社)及びSD−ATGリンカー等を用い、前記
のpSK211を構築した方法に準じた組換えにより構
築したプラスミドベクターpGFK503−1(約5.
7Kbp)の5μgを、前記方法に準じて制限酵素Hi
nd IIIにて切断後、T4DNAポリメラーゼを
用いて平滑化した。エタノール沈殿操作により回収した
DNA断片を制限酵素BamH Iで切断し、アガロ
ースゲル電気泳動により約1.1KbpのDNA断片を
分離精製した。上記で精製した2本のDNA断片を、前
記方法に準じて、T4DNAリガーゼを用いて連結し、
E.coli K−12 HB101株のコンピテ
ントセルに導入した。得られた形質転換体の中より、目
的の制限酵素Sal I切断部位を欠きHind
III切断部位を新生したtrpプロモーターを含む約
5.1Kbpのプラスミドベクター(pSK301と命
名)を有するクローンを選択した。
I切断部位を消失し、その近傍に制限酵素Hind
III切断部位を新生する目的で以下の操作を行っ
た。 プラスミドベクターpSK211の5μgを前記方法に
準じて、制限酵素Sal Iにて切断後、T4DNA
ポリメラーゼを用いて平滑化した。エタノール沈殿操作
により回収したDNA断片を制限酵素BamH Iで
切断し、アガロースゲル電気泳動により約4.0Kbp
のDNA断片を分離精製した。一方、tacプロモータ
ーを有するプラスミドベクターpKK223−3(ファ
ルマシア社)及びSD−ATGリンカー等を用い、前記
のpSK211を構築した方法に準じた組換えにより構
築したプラスミドベクターpGFK503−1(約5.
7Kbp)の5μgを、前記方法に準じて制限酵素Hi
nd IIIにて切断後、T4DNAポリメラーゼを
用いて平滑化した。エタノール沈殿操作により回収した
DNA断片を制限酵素BamH Iで切断し、アガロ
ースゲル電気泳動により約1.1KbpのDNA断片を
分離精製した。上記で精製した2本のDNA断片を、前
記方法に準じて、T4DNAリガーゼを用いて連結し、
E.coli K−12 HB101株のコンピテ
ントセルに導入した。得られた形質転換体の中より、目
的の制限酵素Sal I切断部位を欠きHind
III切断部位を新生したtrpプロモーターを含む約
5.1Kbpのプラスミドベクター(pSK301と命
名)を有するクローンを選択した。
【0088】このプラスミドベクターpSK301の5
μgを、前記方法に準じて、ロウ・ソルトバッファーに
溶解し、5ユニットの制限酵素Bal I(宝酒造)
を添加して切断反応を行った。反応終了後、反応液のN
aCl濃度を50mMとして制限酵素Hind II
Iによる切断を行い、約4.3KbpのDNA断片をア
ガロースゲル電気泳動により分離精製した。一方、プラ
スミドベクターpKK223−3の5μgを、前記方法
に準じて、ハイ・ソルトバッファーに溶解し、制限酵素
Hind III及びSca Iで切断し、約0.
8KbpのDNA断片をアガロースゲル電気泳動により
分離精製した。上記で精製した2本のDNA断片を、前
記方法に準じて、T4DNAリガーゼを用いて連結し、
E.coli K−12HB101株のコンピテント
セルに導入した。得られた形質転換体の中より、目的と
するrrnBT1T2ターミネーターがtrpプロモー
ターの下流に配置されたプラスミドベクターpSK40
7(約5.1Kbp)を有するクローンを選択した。
μgを、前記方法に準じて、ロウ・ソルトバッファーに
溶解し、5ユニットの制限酵素Bal I(宝酒造)
を添加して切断反応を行った。反応終了後、反応液のN
aCl濃度を50mMとして制限酵素Hind II
Iによる切断を行い、約4.3KbpのDNA断片をア
ガロースゲル電気泳動により分離精製した。一方、プラ
スミドベクターpKK223−3の5μgを、前記方法
に準じて、ハイ・ソルトバッファーに溶解し、制限酵素
Hind III及びSca Iで切断し、約0.
8KbpのDNA断片をアガロースゲル電気泳動により
分離精製した。上記で精製した2本のDNA断片を、前
記方法に準じて、T4DNAリガーゼを用いて連結し、
E.coli K−12HB101株のコンピテント
セルに導入した。得られた形質転換体の中より、目的と
するrrnBT1T2ターミネーターがtrpプロモー
ターの下流に配置されたプラスミドベクターpSK40
7(約5.1Kbp)を有するクローンを選択した。
【0089】次に、上記方法に従って構築し得られたプ
ラスミドベクターpSK407の転写及び翻訳シグナル
制御下でのTNF変換体発現ベクターをデザインした。 コードされる変換体ポリペプチド(F4113と命名)
は、ヒトTNFのN末端にオリゴペプチドAsp−Pr
o−Gly−Arg−Gly−Asp−Ser−Pro
を付加し、5番目のThrをAlaに変換したポリペプ
チドである。付加するオリゴペプチドのアミノ酸配列に
従って2本のオリゴヌクレオチド(U−4113及びL
−4113)をデザインした。
ラスミドベクターpSK407の転写及び翻訳シグナル
制御下でのTNF変換体発現ベクターをデザインした。 コードされる変換体ポリペプチド(F4113と命名)
は、ヒトTNFのN末端にオリゴペプチドAsp−Pr
o−Gly−Arg−Gly−Asp−Ser−Pro
を付加し、5番目のThrをAlaに変換したポリペプ
チドである。付加するオリゴペプチドのアミノ酸配列に
従って2本のオリゴヌクレオチド(U−4113及びL
−4113)をデザインした。
【0090】
U−4113(配列表の配列番号11、塩基数32)L
−4113(塩基数32) U−4113に相補するものであるが、配列番号11の
1番目〜4番目の5′−GATC−3′に相補する塩基
配列は有さず、一方配列番号11の32番目のCに相補
するGに対し上流方向に5′−TCGA−3′を接続す
る塩基配列を有する。
−4113(塩基数32) U−4113に相補するものであるが、配列番号11の
1番目〜4番目の5′−GATC−3′に相補する塩基
配列は有さず、一方配列番号11の32番目のCに相補
するGに対し上流方向に5′−TCGA−3′を接続す
る塩基配列を有する。
【0091】前記実施例2の方法に準じて化学合成し、
精製することにより作製し、得られたオリゴヌクレオチ
ド(各1μg)を前記実施例3の方法に準じて、その5
′末端をT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いてリン酸
化の後、アニール化により二本鎖DNA断片(32bp
)とした。また、trpプロモーター及びrrnBT1
T2ターミネーター等を有するプラスミドベクターpS
K407(約5.1Kbp)の5μgを、前記実施例3
の方法に準じて、ハイ・ソルトバッファーに溶解し制限
酵素BamH I及びHind IIIで切断し、
複製起点及び転写調節領域等を含む約4.0KbpのD
NA断片をアガロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)に
より分離精製した。一方、前記実施例5で得られたプラ
スミドpUC119−F4104(約3.7Kbp)の
5μgを、実施例6の方法と同様に、制限酵素Xho
I及びHind IIIで切断し、N末端部分を欠
失したF4104遺伝子を含む約460bpのDNA断
片を分離精製した(図11)。
精製することにより作製し、得られたオリゴヌクレオチ
ド(各1μg)を前記実施例3の方法に準じて、その5
′末端をT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いてリン酸
化の後、アニール化により二本鎖DNA断片(32bp
)とした。また、trpプロモーター及びrrnBT1
T2ターミネーター等を有するプラスミドベクターpS
K407(約5.1Kbp)の5μgを、前記実施例3
の方法に準じて、ハイ・ソルトバッファーに溶解し制限
酵素BamH I及びHind IIIで切断し、
複製起点及び転写調節領域等を含む約4.0KbpのD
NA断片をアガロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)に
より分離精製した。一方、前記実施例5で得られたプラ
スミドpUC119−F4104(約3.7Kbp)の
5μgを、実施例6の方法と同様に、制限酵素Xho
I及びHind IIIで切断し、N末端部分を欠
失したF4104遺伝子を含む約460bpのDNA断
片を分離精製した(図11)。
【0092】上記方法に従って得られた3本のDNA断
片を、前記実施例3の方法に準じて、T4DNAリガー
ゼを用いて連結し、E.coli K−12 HB
101株のコンピテントセルに導入した。得られた形質
転換体の中より、目的の約4.5KbpのF4113発
現ベクター(pKF4113と命名)を有するクローン
を、制限酵素BamH I、Xho I及びHin
d IIIによる切断パターンの確認並びに変換体ポ
リペプチドのN末端付加部位周辺の塩基配列を調べるこ
とにより選択した。
片を、前記実施例3の方法に準じて、T4DNAリガー
ゼを用いて連結し、E.coli K−12 HB
101株のコンピテントセルに導入した。得られた形質
転換体の中より、目的の約4.5KbpのF4113発
現ベクター(pKF4113と命名)を有するクローン
を、制限酵素BamH I、Xho I及びHin
d IIIによる切断パターンの確認並びに変換体ポ
リペプチドのN末端付加部位周辺の塩基配列を調べるこ
とにより選択した。
【0093】(2)前記実施例6で得られた発現ベクタ
ーpKF4146の転写プロモーター(tacプロモー
ター)を前記(1)項で構築した発現ベクターpKF4
113に含まれるtrpプロモーターに置換する。また
、この置換はN末端アミノ酸配列の変換も伴う。図12
に従って、この置換方法を説明する。
ーpKF4146の転写プロモーター(tacプロモー
ター)を前記(1)項で構築した発現ベクターpKF4
113に含まれるtrpプロモーターに置換する。また
、この置換はN末端アミノ酸配列の変換も伴う。図12
に従って、この置換方法を説明する。
【0094】プラスミドpKF4146(約3.9Kb
p)の5μgを1mM DTT及び100μg/ml
BSAを含む50μlのSma Iバッファー(10
mMトリス−HCl pH8.0、20mM KC
l及び10mM MgCl2)に溶解させ、15ユニ
ットの制限酵素 Sma I(宝酒造)を添加して
、37℃で2時間切断反応を行った。反応終了後、エタ
ノール沈殿操作によりDNA断片を回収し、50μlの
ミディアム・ソルトバッファーに再度溶解した。15ユ
ニットの制限酵素Hind IIIによる37℃、2
時間の切断反応の後、約490bpのDNA断片をアガ
ロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)により分離精製し
た。一方、前記(1)項の構築により得られたtrpプ
ロモーターを有するプラスミドpKF4113(約4.
5Kbp)の5μgを、上記方法と同様にして、制限酵
素Sma I及びHind IIIにより切断し、
trpプロモーターを含む約4.0KbpのDNA断片
をアガロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)により分離
精製した。このようにして得られた二本のDNA断片を
、前記実施例3の方法に準じて、T4DNAリガーゼを
用いて連結し、E.coli K−12HB101株
のコンピテントセルに導入した。得られた形質転換体の
中より、目的とするtrpプロモーターによる転換体ポ
リペプチド発現ベクター(約4.5Kbp)を有するク
ローンを、制限酵素による切断パターンの確認及び転換
体ポリペプチドのN末端付加部位周辺の塩基配列を調べ
ることにより選択した。この選択により、再生されるは
ずの制限酵素 Sma Iを、Proをコードする
3塩基対5′−CCC−3′ 3′−GGG−5′ を欠失することにより再生しないクローンを得た。この
発現ベクターをpKF4236と命名した。
p)の5μgを1mM DTT及び100μg/ml
BSAを含む50μlのSma Iバッファー(10
mMトリス−HCl pH8.0、20mM KC
l及び10mM MgCl2)に溶解させ、15ユニ
ットの制限酵素 Sma I(宝酒造)を添加して
、37℃で2時間切断反応を行った。反応終了後、エタ
ノール沈殿操作によりDNA断片を回収し、50μlの
ミディアム・ソルトバッファーに再度溶解した。15ユ
ニットの制限酵素Hind IIIによる37℃、2
時間の切断反応の後、約490bpのDNA断片をアガ
ロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)により分離精製し
た。一方、前記(1)項の構築により得られたtrpプ
ロモーターを有するプラスミドpKF4113(約4.
5Kbp)の5μgを、上記方法と同様にして、制限酵
素Sma I及びHind IIIにより切断し、
trpプロモーターを含む約4.0KbpのDNA断片
をアガロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)により分離
精製した。このようにして得られた二本のDNA断片を
、前記実施例3の方法に準じて、T4DNAリガーゼを
用いて連結し、E.coli K−12HB101株
のコンピテントセルに導入した。得られた形質転換体の
中より、目的とするtrpプロモーターによる転換体ポ
リペプチド発現ベクター(約4.5Kbp)を有するク
ローンを、制限酵素による切断パターンの確認及び転換
体ポリペプチドのN末端付加部位周辺の塩基配列を調べ
ることにより選択した。この選択により、再生されるは
ずの制限酵素 Sma Iを、Proをコードする
3塩基対5′−CCC−3′ 3′−GGG−5′ を欠失することにより再生しないクローンを得た。この
発現ベクターをpKF4236と命名した。
【0095】上記方法に従って構築した転換体発現ベク
ターは、発現誘導により、以下に示す変換を有する新規
生理活性ポリペプチドを大腸菌内に生産する。ベクター
pKF4236:配列表の配列番号1で示した1番目〜
8番目のアミノ酸配列 が配列表の配列番号2で示し
たアミノ酸配列で置換されたポリペプチドF4236
をコードする。
ターは、発現誘導により、以下に示す変換を有する新規
生理活性ポリペプチドを大腸菌内に生産する。ベクター
pKF4236:配列表の配列番号1で示した1番目〜
8番目のアミノ酸配列 が配列表の配列番号2で示し
たアミノ酸配列で置換されたポリペプチドF4236
をコードする。
【0096】実施例9(ヒトTNF転換体発現ベクター
pKF4419の構築)配列表の配列番号12で示した
プライマー4419を用い、前記実施例5(1)及び(
2)の方法に準じて目的の変異導入DNAを含むプラス
ミド(約3.7Kbp)を得た。ジデオキシ法によりデ
ザイン通りの転換体DNAに変異していることを確認し
、このプラスミドをpUC119−F4419と命名し
た。
pKF4419の構築)配列表の配列番号12で示した
プライマー4419を用い、前記実施例5(1)及び(
2)の方法に準じて目的の変異導入DNAを含むプラス
ミド(約3.7Kbp)を得た。ジデオキシ法によりデ
ザイン通りの転換体DNAに変異していることを確認し
、このプラスミドをpUC119−F4419と命名し
た。
【0097】変異導入により得られた目的のヒトTNF
転換体遺伝子を、実施例4のヒトTNF発現ベクターの
構築方法に準じて、tacプロモーターを有する発現ベ
クターpKK101に組込みヒトTNF転換体発現ベク
ターを構築した。ヒトTNF転換体遺伝子(約480b
p)は、上記で得られた約3.7Kbpのプラスミドp
UC119−F4419より、前記方法に準じて、制限
酵素EcoR I及びHind IIIによる切断
後分離精製した。目的とするヒトTNF転換体発現ベク
ター(pKF4419)は、ヒトTNF発現ベクター(
pKF4102)と同様、宿主としてE.coli
K−12 JM103株を用いて取得した。
転換体遺伝子を、実施例4のヒトTNF発現ベクターの
構築方法に準じて、tacプロモーターを有する発現ベ
クターpKK101に組込みヒトTNF転換体発現ベク
ターを構築した。ヒトTNF転換体遺伝子(約480b
p)は、上記で得られた約3.7Kbpのプラスミドp
UC119−F4419より、前記方法に準じて、制限
酵素EcoR I及びHind IIIによる切断
後分離精製した。目的とするヒトTNF転換体発現ベク
ター(pKF4419)は、ヒトTNF発現ベクター(
pKF4102)と同様、宿主としてE.coli
K−12 JM103株を用いて取得した。
【0098】上記転換体発現ベクターは、発現誘導によ
り、以下に示す変換を有する新規生理活性ポリペプチド
を大腸菌内に生産する。ベクターpKF4419:配列
表の配列番号1で示した1番目〜8番目のアミノ酸配列
が配列表の配列番号4で示したアミノ酸配列で置換され
たポリペプチドF4419をコードする。
り、以下に示す変換を有する新規生理活性ポリペプチド
を大腸菌内に生産する。ベクターpKF4419:配列
表の配列番号1で示した1番目〜8番目のアミノ酸配列
が配列表の配列番号4で示したアミノ酸配列で置換され
たポリペプチドF4419をコードする。
【0099】実施例10(ヒトTNF変換体発現ベクタ
ーpKF4291及びpKF4292の構築)プライマ
ー4291及び同4292をデザインした。プライマー
4291及び同4292(塩基数21)配列表の配列番
号7の193番目のCから213番目のTまでの塩基配
列を有するが、202番目〜204番目の5′−CCA
−3′が、プライマー4291の場合5′−GAT−3
′により、プライマー4292の場合5′−ATG−3
′によりそれぞれ置換されたものである。
ーpKF4291及びpKF4292の構築)プライマ
ー4291及び同4292をデザインした。プライマー
4291及び同4292(塩基数21)配列表の配列番
号7の193番目のCから213番目のTまでの塩基配
列を有するが、202番目〜204番目の5′−CCA
−3′が、プライマー4291の場合5′−GAT−3
′により、プライマー4292の場合5′−ATG−3
′によりそれぞれ置換されたものである。
【0100】これらプライマー4291或は同4292
を用い、前記実施例5(1)及び(2)の方法に準じて
目的の変異導入DNAを含むプラスミド(約3.7Kb
p)を得た。ジデオキシ法によりデザイン通りの変換体
DNAに変異していることを確認し、このプラスミドを
pUC119−F4291或はpUC119−F429
2と命名した。変異導入により得られた目的のヒトTN
F変換体遺伝子を実施例4のヒトTNF発現ベクターの
構築方法に準じて、tacプロモーターを有する発現ベ
クターpKK101に組込みヒトTNF変換体発現ベク
ターを構築した。ヒトTNF変換体遺伝子(約480b
p)は、上記で得られた約3.7Kbpのプラスミドp
UC119−F4291あるいはpuC119−F42
92より、前記の方法に準じて、制限酵素EcoRI及
びHind IIIによる切断後分離精製した。目的
とするヒトTNF変換体発現ベクター(pKF4291
或はpKF4292)は、ヒトTNF発現ベクター(p
KF4102)と同様、宿主としてE.coli K
−12 JM103株を用いて取得した。
を用い、前記実施例5(1)及び(2)の方法に準じて
目的の変異導入DNAを含むプラスミド(約3.7Kb
p)を得た。ジデオキシ法によりデザイン通りの変換体
DNAに変異していることを確認し、このプラスミドを
pUC119−F4291或はpUC119−F429
2と命名した。変異導入により得られた目的のヒトTN
F変換体遺伝子を実施例4のヒトTNF発現ベクターの
構築方法に準じて、tacプロモーターを有する発現ベ
クターpKK101に組込みヒトTNF変換体発現ベク
ターを構築した。ヒトTNF変換体遺伝子(約480b
p)は、上記で得られた約3.7Kbpのプラスミドp
UC119−F4291あるいはpuC119−F42
92より、前記の方法に準じて、制限酵素EcoRI及
びHind IIIによる切断後分離精製した。目的
とするヒトTNF変換体発現ベクター(pKF4291
或はpKF4292)は、ヒトTNF発現ベクター(p
KF4102)と同様、宿主としてE.coli K
−12 JM103株を用いて取得した。
【0101】実施例11(ヒトTNF転換体発現ベクタ
ーpKF4603及びpKF4604の構築)前記実施
例8で得られたヒトTNF転換体発現ベクターpKF4
236(約4.5Kbp)5μgを、前記実施例3の方
法に準じて、ミディアム・ソルトバッファーに溶解し制
限酵素Sac I及びHind IIIで切断し、
複製起点及び転写調節領域等を含む約4.1KbpのD
NA断片をアガロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)に
より分離精製した。一方、前記実施例10で得られたヒ
トTNF変換体発現ベクターpKF4291又はpKF
4292各5μgを、前記と同様にして、制限酵素Sa
c I及びHind IIIで切断し、N末部分を
欠失したF4291又はF4292遺伝子を含む約36
0bpのDNA断片を分離精製した。
ーpKF4603及びpKF4604の構築)前記実施
例8で得られたヒトTNF転換体発現ベクターpKF4
236(約4.5Kbp)5μgを、前記実施例3の方
法に準じて、ミディアム・ソルトバッファーに溶解し制
限酵素Sac I及びHind IIIで切断し、
複製起点及び転写調節領域等を含む約4.1KbpのD
NA断片をアガロースゲル電気泳動(ゲル濃度1%)に
より分離精製した。一方、前記実施例10で得られたヒ
トTNF変換体発現ベクターpKF4291又はpKF
4292各5μgを、前記と同様にして、制限酵素Sa
c I及びHind IIIで切断し、N末部分を
欠失したF4291又はF4292遺伝子を含む約36
0bpのDNA断片を分離精製した。
【0102】上記方法に従って得られた2本のDNA断
片を、前記実施例3の方法に準じてT4DNAリガーゼ
を用いて連結し、E.coli K−12 HB1
01株のコンピテントセルに導入した。得られた形質転
換体の中より、目的のF4603又はF4604発現ベ
クターpKF4603又はpKF4604(約4.5K
bp)を有するクローンを、制限酵素Sac I及び
Hind IIIによる切断パターンの確認並びに変
換体ポリペプチド由来の変換部位周辺の塩基配列を調べ
ることにより選択した。
片を、前記実施例3の方法に準じてT4DNAリガーゼ
を用いて連結し、E.coli K−12 HB1
01株のコンピテントセルに導入した。得られた形質転
換体の中より、目的のF4603又はF4604発現ベ
クターpKF4603又はpKF4604(約4.5K
bp)を有するクローンを、制限酵素Sac I及び
Hind IIIによる切断パターンの確認並びに変
換体ポリペプチド由来の変換部位周辺の塩基配列を調べ
ることにより選択した。
【0103】上記方法に従って構築した転換体発現ベク
ターは、発現誘導により、以下に示す変換を有する新規
生理活性ポリペプチドを大腸菌内に生産するベクターp
KF4603:配列表の配列番号1で示した1番目〜8
番目のアミノ酸配列が配列表の配列番号2で示したアミ
ノ酸配列で置換され、68番目のProがAspに変換
されたポリペプチドF4603をコードする。ベクター
pKF4604:配列表の配列番号1で示した1番目〜
8番目のアミノ酸配列が配列表の配列番号2で示したア
ミノ酸配列で置換され、68番目のProがMetに変
換されたポリペプチドF4604をコードする。
ターは、発現誘導により、以下に示す変換を有する新規
生理活性ポリペプチドを大腸菌内に生産するベクターp
KF4603:配列表の配列番号1で示した1番目〜8
番目のアミノ酸配列が配列表の配列番号2で示したアミ
ノ酸配列で置換され、68番目のProがAspに変換
されたポリペプチドF4603をコードする。ベクター
pKF4604:配列表の配列番号1で示した1番目〜
8番目のアミノ酸配列が配列表の配列番号2で示したア
ミノ酸配列で置換され、68番目のProがMetに変
換されたポリペプチドF4604をコードする。
【0104】実施例12(ヒトTNF及び同転換体ポリ
ペプチドの大腸菌による発現及び精製)実施例4で得ら
れたヒトTNF発現ベクター(pKF4102)並びに
実施例6、7及び9で得られたヒトTNF転換体発現ベ
クター(pKF4419、pKF4146、pKF44
22及びpKF4423)を有するE.coli K
−12 JM103株を、25〜50μg/mlアン
ピシリン及び0.001%ビタミンB1を含むM9培地
(0.6%Na2HPO4、0.3%KH2PO4、0
.05%NaCl、0.1%NH4Cl、2mM M
gSO4、0.2%グルコース及び0.1mM Ca
Cl2)20mlに接種し、37℃、18時間振とう培
養を行った。この培養液20mlを上記培地1リットル
中に加え、37℃、2〜3時間振とう培養を行った。次
いで、イソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシド
(IPTG)を最終濃度1mMとなるように添加し、更
に37℃、18時間振とう培養を続けた。
ペプチドの大腸菌による発現及び精製)実施例4で得ら
れたヒトTNF発現ベクター(pKF4102)並びに
実施例6、7及び9で得られたヒトTNF転換体発現ベ
クター(pKF4419、pKF4146、pKF44
22及びpKF4423)を有するE.coli K
−12 JM103株を、25〜50μg/mlアン
ピシリン及び0.001%ビタミンB1を含むM9培地
(0.6%Na2HPO4、0.3%KH2PO4、0
.05%NaCl、0.1%NH4Cl、2mM M
gSO4、0.2%グルコース及び0.1mM Ca
Cl2)20mlに接種し、37℃、18時間振とう培
養を行った。この培養液20mlを上記培地1リットル
中に加え、37℃、2〜3時間振とう培養を行った。次
いで、イソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシド
(IPTG)を最終濃度1mMとなるように添加し、更
に37℃、18時間振とう培養を続けた。
【0105】実施例8及び11で得られたヒトTNF転
換体発現ベクター(pKF4236及びpKF4603
)を有するE.coli K−12 HB101株
については、25〜50μg/mlアンピシリン、0.
001%ビタミンB1及び5μg/mlトリプトファン
を含むM9CA培地(0.6% Na2HPO4、0
.3%KH2PO4、0.05%NaCl、0.1%N
H4Cl、2mM MgSO4、0.2%グルコース
及び0.1mM CaCl2及び0.2%カザミノ酸
)20mlに接種し、37℃、18時間振とう培養を行
った。 5μg/mlトリプトファンを含まない上記培地1リッ
トル中にこの培養液20mlを加え、37℃、18時間
振とう培養を行った。
換体発現ベクター(pKF4236及びpKF4603
)を有するE.coli K−12 HB101株
については、25〜50μg/mlアンピシリン、0.
001%ビタミンB1及び5μg/mlトリプトファン
を含むM9CA培地(0.6% Na2HPO4、0
.3%KH2PO4、0.05%NaCl、0.1%N
H4Cl、2mM MgSO4、0.2%グルコース
及び0.1mM CaCl2及び0.2%カザミノ酸
)20mlに接種し、37℃、18時間振とう培養を行
った。 5μg/mlトリプトファンを含まない上記培地1リッ
トル中にこの培養液20mlを加え、37℃、18時間
振とう培養を行った。
【0106】遠心分離操作による大腸菌菌体の回収後、
TPバッファー(10mMトリス−HCl pH8.
0及び100μM PMSF)を用いて菌体の洗浄を
行った。洗浄後、菌体グラム当たり10容量(ml)の
TPバッファーに菌体を懸濁させ、超音波発生装置(ヒ
ート・システムズ;モデル W−225)を用いて菌
体を超音波破砕処理した。得られた懸濁液を遠心分離す
ることにより、菌体残渣を除去し上清画分を回収した。 この超音波破砕処理以降の精製工程は、主に低温下(0
℃〜4℃)で行った。
TPバッファー(10mMトリス−HCl pH8.
0及び100μM PMSF)を用いて菌体の洗浄を
行った。洗浄後、菌体グラム当たり10容量(ml)の
TPバッファーに菌体を懸濁させ、超音波発生装置(ヒ
ート・システムズ;モデル W−225)を用いて菌
体を超音波破砕処理した。得られた懸濁液を遠心分離す
ることにより、菌体残渣を除去し上清画分を回収した。 この超音波破砕処理以降の精製工程は、主に低温下(0
℃〜4℃)で行った。
【0107】この上清を0.45μmフィルターにてろ
過した後、セパビーズFP−DA13(三菱化成)を用
いた陰イオン交換クロマトグラフィー(カラムサイズ:
φ2.5×1.5cm及び流速:0.5ml/分)で分
画し、後記SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動及
びL929細胞を用いた実施例13の方法に準じて活性
の有無を検定することによって活性画分を得た。溶出に
はNaClを含むTPバッファーを用い、NaCl濃度
を0.05Mから0.1M、0.2M、0.5Mへと段
階的に上げ、ヒトTNF(1)は0.1M NaCl
で、ヒトTNF(2)、ヒトTNF転換体F4419、
同F4422及び同F4603は0.2MNaClで並
びにヒトTNF転換体F4146及び同F4236は0
.5MNaCl でそれぞれ溶出した。更に大腸菌菌
体由来のエンドトキシン等を除去するために、核酸・エ
ンドトキシン除去剤C−9(栗田工業製造、大日本製薬
販売)処理を添付マニュアルに準じて行った。かくして
、ヒトTNF及び同転換体ポリペプチドの一段階精製試
料を得た。この試料を使用して、後記実施例13、14
及び15の抗腫瘍活性の評価及び実験的肺転移に及ぼす
効果の評価を行った。なお、転換体ポリペプチドF44
23については使用した宿主大腸菌E.coli K
−12 JM103株中での不安定性のためか、活性
画分を得ることができなかった。しかしながら他の宿主
を使用すれば活性画分を得られる可能性がある。
過した後、セパビーズFP−DA13(三菱化成)を用
いた陰イオン交換クロマトグラフィー(カラムサイズ:
φ2.5×1.5cm及び流速:0.5ml/分)で分
画し、後記SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動及
びL929細胞を用いた実施例13の方法に準じて活性
の有無を検定することによって活性画分を得た。溶出に
はNaClを含むTPバッファーを用い、NaCl濃度
を0.05Mから0.1M、0.2M、0.5Mへと段
階的に上げ、ヒトTNF(1)は0.1M NaCl
で、ヒトTNF(2)、ヒトTNF転換体F4419、
同F4422及び同F4603は0.2MNaClで並
びにヒトTNF転換体F4146及び同F4236は0
.5MNaCl でそれぞれ溶出した。更に大腸菌菌
体由来のエンドトキシン等を除去するために、核酸・エ
ンドトキシン除去剤C−9(栗田工業製造、大日本製薬
販売)処理を添付マニュアルに準じて行った。かくして
、ヒトTNF及び同転換体ポリペプチドの一段階精製試
料を得た。この試料を使用して、後記実施例13、14
及び15の抗腫瘍活性の評価及び実験的肺転移に及ぼす
効果の評価を行った。なお、転換体ポリペプチドF44
23については使用した宿主大腸菌E.coli K
−12 JM103株中での不安定性のためか、活性
画分を得ることができなかった。しかしながら他の宿主
を使用すれば活性画分を得られる可能性がある。
【0108】上記試料を0.20μmフィルターにてろ
過した後、FPLCシステムによる制御下のモノQ(登
録商標)(HR10/10及びHR5/5)プレパック
カラム(ファルマシアLKBバイオテクノロジー社製)
を用いた陰イオン交換クロマトグラフィーで、NaCl
を含むTPQバッファー(20mMトリス−HClpH
8.0及び10μM PMSF)によって溶出し、分
画を後記SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動及び
L929細胞を用いた実施例13の方法に準じて活性の
有無を検定することによって活性画分を得た。溶出方法
は、FPLCシステムの制御下で下記プログラムに従っ
て行った。第3ステップは、精製純度を上げるためにS
DS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動において単一バ
ンドとなるまで数回繰り返した。
過した後、FPLCシステムによる制御下のモノQ(登
録商標)(HR10/10及びHR5/5)プレパック
カラム(ファルマシアLKBバイオテクノロジー社製)
を用いた陰イオン交換クロマトグラフィーで、NaCl
を含むTPQバッファー(20mMトリス−HClpH
8.0及び10μM PMSF)によって溶出し、分
画を後記SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動及び
L929細胞を用いた実施例13の方法に準じて活性の
有無を検定することによって活性画分を得た。溶出方法
は、FPLCシステムの制御下で下記プログラムに従っ
て行った。第3ステップは、精製純度を上げるためにS
DS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動において単一バ
ンドとなるまで数回繰り返した。
【0109】第1ステップ:モノQ(登録商標)(HR
10/10)カラム使用 (流速:4ml/分) 0〜5分;0−0.2M NaCl直線濃度勾配5〜
16分;0.2M NaCl 16〜20分;0.2−0.5M NaCl直線濃度
勾配 20〜24分;0.5M NaCl 上記方法に従った活性画分の分画結果(NaCl濃度及
び保持時間)は、ヒトTNF(1)が0.2M、6.6
分、ヒトTNF(2)が0.2M、5.6分、ヒトTN
F転換体F4146が0.2M、6.5分、同F423
6が0.2M、6.4分、同F4419が0.2M、5
.4分及び同F4603が0.2M、7.6分であった
。
10/10)カラム使用 (流速:4ml/分) 0〜5分;0−0.2M NaCl直線濃度勾配5〜
16分;0.2M NaCl 16〜20分;0.2−0.5M NaCl直線濃度
勾配 20〜24分;0.5M NaCl 上記方法に従った活性画分の分画結果(NaCl濃度及
び保持時間)は、ヒトTNF(1)が0.2M、6.6
分、ヒトTNF(2)が0.2M、5.6分、ヒトTN
F転換体F4146が0.2M、6.5分、同F423
6が0.2M、6.4分、同F4419が0.2M、5
.4分及び同F4603が0.2M、7.6分であった
。
【0110】第2ステップ:モノQ(登録商標)(HR
5/5)カラム使用 (流速:1ml/分) 0〜2.5分;0−0.2M NaCl直線濃度勾配
2.5〜8分;0.2M NaCl 8〜10分;0.2−0.5M NaCl直線濃度勾
配10〜12分;0.5M NaCl 上記方法に従った活性画分の分画結果( NaCl
濃度及び保持時間)は、ヒトTNF(1)が0.2M
、3.7分、ヒトTNF(2)が0.2M、4.1分、
ヒトTNF転換体F4146が0.2M、4.1分、同
F4236が0.2M、3.8分、同F4419が0.
2M、3.8分及び同F4603が0.2M、5.7分
であった。
5/5)カラム使用 (流速:1ml/分) 0〜2.5分;0−0.2M NaCl直線濃度勾配
2.5〜8分;0.2M NaCl 8〜10分;0.2−0.5M NaCl直線濃度勾
配10〜12分;0.5M NaCl 上記方法に従った活性画分の分画結果( NaCl
濃度及び保持時間)は、ヒトTNF(1)が0.2M
、3.7分、ヒトTNF(2)が0.2M、4.1分、
ヒトTNF転換体F4146が0.2M、4.1分、同
F4236が0.2M、3.8分、同F4419が0.
2M、3.8分及び同F4603が0.2M、5.7分
であった。
【0111】第3ステップ:モノQ(登録商標)(HR
5/5)カラム使用 (流速:1ml/分) 0〜6分;0−0.15M NaCl直線濃度勾配6
〜11分;0.15,0.2M NaCl直線濃度勾
配 11〜13分;0.2−0.5M NaCl直線濃度
勾配 13〜15分;0.5M NaCl 上記方法に従った活性画分の分画結果( NaCl
濃度及び保持時間)は、ヒトTNF(1)が0.16
M、6.5分、ヒトTNF(2)が0.16M、6.5
分、ヒトTNF転換体F4146が0.17M、7.1
分、同F4236が0.17M、6.7分、同F441
9が0.16M、6.3分及び同F4603が0.23
M、10.8分であった。
5/5)カラム使用 (流速:1ml/分) 0〜6分;0−0.15M NaCl直線濃度勾配6
〜11分;0.15,0.2M NaCl直線濃度勾
配 11〜13分;0.2−0.5M NaCl直線濃度
勾配 13〜15分;0.5M NaCl 上記方法に従った活性画分の分画結果( NaCl
濃度及び保持時間)は、ヒトTNF(1)が0.16
M、6.5分、ヒトTNF(2)が0.16M、6.5
分、ヒトTNF転換体F4146が0.17M、7.1
分、同F4236が0.17M、6.7分、同F441
9が0.16M、6.3分及び同F4603が0.23
M、10.8分であった。
【0112】かくしてヒトTNF及び同転換体ポリペプ
チドの精製試料を得た。この試料を使用して後記実施例
13の抗腫瘍活性の評価を行った。なお、転換体ポリペ
プチドF4422については精製過程でN末端部分の欠
失が認められたため、精製を途中で中止した。
チドの精製試料を得た。この試料を使用して後記実施例
13の抗腫瘍活性の評価を行った。なお、転換体ポリペ
プチドF4422については精製過程でN末端部分の欠
失が認められたため、精製を途中で中止した。
【0113】上記精製の過程及び精製試料についてSD
S−ポリアクリルアミドゲル電気泳動を行い、ヒトTN
F及び同転換体ポリペプチドの発現及び精製の確認をし
た。各試料を10mM DTTを含有するLaemm
li′s サンプル・バッファー(62.5mMトリ
ス−HCl pH6.8、2%SDS、0.01%B
PB及び10%グリセロール)に加え、Laemmli
〔Nature,227,680(1970)〕の方法
に準じ、15%の分離用ゲルを用いて電気泳動を行った
。電気泳動終了後、分離用ゲル中の蛋白質をクマシー・
ブリリアント・ブルーで染色することにより確認した。 図13及び14にその結果の一部を示した。活性画分を
得ることのできたヒトTNF及び同転換体ポリペプチド
のそれぞれの発現ベクターによる発現量はほぼ同程度で
あり、得られた染色ゲルをクロマト・スキャナー(島津
、CS−920型)にかけてその発現効率を算出したと
ころ、大腸菌総菌体蛋白質の約20%であった。また、
最終精製試料は、得られた染色ゲルにおいて単一バンド
であった。その泳動位置より、ヒトTNF及び同転換体
ポリペプチドの分子量を算出し表1に示した。
S−ポリアクリルアミドゲル電気泳動を行い、ヒトTN
F及び同転換体ポリペプチドの発現及び精製の確認をし
た。各試料を10mM DTTを含有するLaemm
li′s サンプル・バッファー(62.5mMトリ
ス−HCl pH6.8、2%SDS、0.01%B
PB及び10%グリセロール)に加え、Laemmli
〔Nature,227,680(1970)〕の方法
に準じ、15%の分離用ゲルを用いて電気泳動を行った
。電気泳動終了後、分離用ゲル中の蛋白質をクマシー・
ブリリアント・ブルーで染色することにより確認した。 図13及び14にその結果の一部を示した。活性画分を
得ることのできたヒトTNF及び同転換体ポリペプチド
のそれぞれの発現ベクターによる発現量はほぼ同程度で
あり、得られた染色ゲルをクロマト・スキャナー(島津
、CS−920型)にかけてその発現効率を算出したと
ころ、大腸菌総菌体蛋白質の約20%であった。また、
最終精製試料は、得られた染色ゲルにおいて単一バンド
であった。その泳動位置より、ヒトTNF及び同転換体
ポリペプチドの分子量を算出し表1に示した。
【0114】なお、蛋白質の物性の一つとして、ヒトT
NF及び同転換体ポリペプチドの等電点をアンフォライ
ン(LKB社製)を用いた等電点ゲル電気泳動法により
測定し、得られた結果を表1に示した。
NF及び同転換体ポリペプチドの等電点をアンフォライ
ン(LKB社製)を用いた等電点ゲル電気泳動法により
測定し、得られた結果を表1に示した。
【0115】
【表1】
【0116】
実施例13(in vitro抗腫瘍活性の評価)実
施例12で得られたヒトTNF及び同転換体ポリペプチ
ドの一段階精製試料及び精製試料について、マウス由来
結合組織細胞L929(ATCC CCL1)に対す
る細胞傷害活性をAggarwalら〔J. Bio
l.chem.,260,2345(1985)〕の方
法に準じて求めた。すなわち、96ウエルの組織培養用
のマイクロプレート(コーニング社製)に3×104細
胞/0.1ml/ウエルでL929細胞を植え、5%炭
酸ガス存在下37℃で一晩培養した。培地としては、1
0%のウシ胎児血清を含むDulbeccoによって修
飾されたイーグルのミニマム・エッセンシャル培地(D
ME培地、シグマ社製)を用いた。翌日、最終濃度1μ
g/mlのアクチノマイシンDを添加した上記培地に培
地を交換し、この培地にて段階希釈した試料を各ウエル
に処理した(総培地量0.1ml)。更に20時間の培
養後、0.5%クリスタル・バイオレット溶液(0.5
%クリスタル・バイオレット/20%メタノール)にて
プレートに付着した生細胞を染色(室温、15分間)し
た。1mM CaCl2及び1mM MgCl2を
含むリン酸バッファーPBS(10mM Na・Kリ
ン酸塩pH7.4、0.8%NaCl及び0.02%K
Cl)で充分洗浄した後、30%エタノールを含む0.
01N塩酸溶液0.1mlを用いてプレートに残ったク
リスタル・バイオレットを抽出し、その吸光度(492
nm)をEIAリーダー(バイオ・ラド社製、モデル2
550)で測定した。この吸光度は生存細胞数に比例す
る。 そこで、試料無処理ウエルの吸光度の50%の値に相当
する吸光度を示すウエルにおける試料の最終希釈率を求
め、この試料希釈率の逆数をその試料の1ml当りのユ
ニット数〔ユニット/ml〕と定義する。
施例12で得られたヒトTNF及び同転換体ポリペプチ
ドの一段階精製試料及び精製試料について、マウス由来
結合組織細胞L929(ATCC CCL1)に対す
る細胞傷害活性をAggarwalら〔J. Bio
l.chem.,260,2345(1985)〕の方
法に準じて求めた。すなわち、96ウエルの組織培養用
のマイクロプレート(コーニング社製)に3×104細
胞/0.1ml/ウエルでL929細胞を植え、5%炭
酸ガス存在下37℃で一晩培養した。培地としては、1
0%のウシ胎児血清を含むDulbeccoによって修
飾されたイーグルのミニマム・エッセンシャル培地(D
ME培地、シグマ社製)を用いた。翌日、最終濃度1μ
g/mlのアクチノマイシンDを添加した上記培地に培
地を交換し、この培地にて段階希釈した試料を各ウエル
に処理した(総培地量0.1ml)。更に20時間の培
養後、0.5%クリスタル・バイオレット溶液(0.5
%クリスタル・バイオレット/20%メタノール)にて
プレートに付着した生細胞を染色(室温、15分間)し
た。1mM CaCl2及び1mM MgCl2を
含むリン酸バッファーPBS(10mM Na・Kリ
ン酸塩pH7.4、0.8%NaCl及び0.02%K
Cl)で充分洗浄した後、30%エタノールを含む0.
01N塩酸溶液0.1mlを用いてプレートに残ったク
リスタル・バイオレットを抽出し、その吸光度(492
nm)をEIAリーダー(バイオ・ラド社製、モデル2
550)で測定した。この吸光度は生存細胞数に比例す
る。 そこで、試料無処理ウエルの吸光度の50%の値に相当
する吸光度を示すウエルにおける試料の最終希釈率を求
め、この試料希釈率の逆数をその試料の1ml当りのユ
ニット数〔ユニット/ml〕と定義する。
【0117】上記方法に準じて求めたL929細胞傷害
活性(ユニット/ml)から各試料の比活性(ユニット
/mg・蛋白)を算出するために、各試料の蛋白定量を
行った。定量はBradford法〔Anal.Bio
chem.,72,248(1976)〕に準じ、標準
試料としてウシ血清アルブミンを用いて蛋白濃度(mg
/ml)を求めた。これらの結果より、ヒトTNF及び
同転換体ポリペプチド試料について算出した比活性を表
2に示した。
活性(ユニット/ml)から各試料の比活性(ユニット
/mg・蛋白)を算出するために、各試料の蛋白定量を
行った。定量はBradford法〔Anal.Bio
chem.,72,248(1976)〕に準じ、標準
試料としてウシ血清アルブミンを用いて蛋白濃度(mg
/ml)を求めた。これらの結果より、ヒトTNF及び
同転換体ポリペプチド試料について算出した比活性を表
2に示した。
【0118】
【表2】
【0119】上記表2から、本発明のヒトTNF転換体
ポリペプチドは、ヒトTNFと同様、マウス由来結合組
織細胞L929に対する細胞傷害活性作用を有すること
がわかる。
ポリペプチドは、ヒトTNFと同様、マウス由来結合組
織細胞L929に対する細胞傷害活性作用を有すること
がわかる。
【0120】
実施例14(in vivo抗腫瘍活性の評価)実施
例12で得られたヒトTNF及び同転換体ポリペプチド
の一段階精製試料について、マウス可移植線維芽肉腫M
ethA腫瘍に対する抗腫瘍治療活性を求めた。試験は
、生理食塩水に懸濁した1×106細胞/0.2mlの
MethA腫瘍細胞(佐々木研究所より分与)をBAL
B/cマウス(雄、5週令、チャールズ・リバー)の背
中部皮下に移植し、8日後腫瘍径が6〜10mmに達し
たのを確認し、生理食塩水にて段階希釈した試料(0.
2ml/マウス)を尾静脈より投与することにより行っ
た。致死量を最高投与量とし、数段階の希釈により各投
与試料を作製した。
例12で得られたヒトTNF及び同転換体ポリペプチド
の一段階精製試料について、マウス可移植線維芽肉腫M
ethA腫瘍に対する抗腫瘍治療活性を求めた。試験は
、生理食塩水に懸濁した1×106細胞/0.2mlの
MethA腫瘍細胞(佐々木研究所より分与)をBAL
B/cマウス(雄、5週令、チャールズ・リバー)の背
中部皮下に移植し、8日後腫瘍径が6〜10mmに達し
たのを確認し、生理食塩水にて段階希釈した試料(0.
2ml/マウス)を尾静脈より投与することにより行っ
た。致死量を最高投与量とし、数段階の希釈により各投
与試料を作製した。
【0121】投与後約2週間、腫瘍増殖等の観察を続け
た。腫瘍増殖については、腫瘍容積(腫瘍塊の長径×短
径2/2)を計測し、試料投与日(0日)の腫瘍容積に
対する腫瘍容積率を求め、この値が2又は5となる試料
投与日からの日数(D2又はD5)を算定する。そして
、コントロール群(生理食塩水投与)に対する比率を算
出し、D2%コントロール値及びD5%コントロール値
を求めた。その値が大きい程、腫瘍増殖能が低下してお
り高い抗腫瘍活性を示すことを意味する。上記に準じて
得られた結果を表3及び表4に掲載した。
た。腫瘍増殖については、腫瘍容積(腫瘍塊の長径×短
径2/2)を計測し、試料投与日(0日)の腫瘍容積に
対する腫瘍容積率を求め、この値が2又は5となる試料
投与日からの日数(D2又はD5)を算定する。そして
、コントロール群(生理食塩水投与)に対する比率を算
出し、D2%コントロール値及びD5%コントロール値
を求めた。その値が大きい程、腫瘍増殖能が低下してお
り高い抗腫瘍活性を示すことを意味する。上記に準じて
得られた結果を表3及び表4に掲載した。
【0122】
【表3】
【0123】
【表4】
【0124】表3及び表4からヒトTNF転換体ポリペ
プチドは、ヒトTNFと同様、マウス移植MethA腫
瘍に対する抗腫瘍治療活性作用を有することがわかる。
プチドは、ヒトTNFと同様、マウス移植MethA腫
瘍に対する抗腫瘍治療活性作用を有することがわかる。
【0125】実施例15(腫瘍の肺転移に及ぼす効果)
B16F10マウス悪性黒色腫細胞(千葉大 医学部
より分与)を以下の方法でクローン化することにより、
肺に対して高転移性を示すクローンを樹立した。すなわ
ち、イーグルのミニマム・エッセンシャル培地(MEM
培地、日水製薬社製)に懸濁した2×104細胞/0.
2mlのB16F10細胞をC57BL/6 NCr
jマウス(雌、6週令、チャールズ・リバー)の尾静脈
内に注入し、14日後に肺を摘出した。DME培地で洗
浄後、肺表面に形成された直径1mm程度の転移結節の
1つを26G注射針付シリンジ(テルモ社製)を用いて
吸引し、1mlのDME培地に懸濁した後、10%のウ
シ胎児血清を含むDME培地含有軟寒天上で、5%炭酸
ガス存在下37℃で培養することによりコロニー形成を
行った。このコロニー形成法は、「組織培養の技術」(
ページ35〜36、1984年、日本組織培養学会編、
朝倉書店)記載の方法に準じた。10〜12日後、コロ
ニーの径が1〜2mmに達したところでパスツールピペ
ットを用いてコロニーを吸引し、10%のウシ胎児血清
を含むDME培地中にて培養した。培養後、増殖した細
胞を再びMEM培地を用いて2×104細胞/0.2m
lの細胞濃度に調製し、上記の場合と同様、同マウスの
尾静脈内に注入した。14日後に肺を摘出し、前回と同
様にして、転移結節の1つを単離・培養した。このよう
な操作を5回繰り返し、肺に高転移性を示すクローン(
B16F10/L5と命名)を獲得した。
B16F10マウス悪性黒色腫細胞(千葉大 医学部
より分与)を以下の方法でクローン化することにより、
肺に対して高転移性を示すクローンを樹立した。すなわ
ち、イーグルのミニマム・エッセンシャル培地(MEM
培地、日水製薬社製)に懸濁した2×104細胞/0.
2mlのB16F10細胞をC57BL/6 NCr
jマウス(雌、6週令、チャールズ・リバー)の尾静脈
内に注入し、14日後に肺を摘出した。DME培地で洗
浄後、肺表面に形成された直径1mm程度の転移結節の
1つを26G注射針付シリンジ(テルモ社製)を用いて
吸引し、1mlのDME培地に懸濁した後、10%のウ
シ胎児血清を含むDME培地含有軟寒天上で、5%炭酸
ガス存在下37℃で培養することによりコロニー形成を
行った。このコロニー形成法は、「組織培養の技術」(
ページ35〜36、1984年、日本組織培養学会編、
朝倉書店)記載の方法に準じた。10〜12日後、コロ
ニーの径が1〜2mmに達したところでパスツールピペ
ットを用いてコロニーを吸引し、10%のウシ胎児血清
を含むDME培地中にて培養した。培養後、増殖した細
胞を再びMEM培地を用いて2×104細胞/0.2m
lの細胞濃度に調製し、上記の場合と同様、同マウスの
尾静脈内に注入した。14日後に肺を摘出し、前回と同
様にして、転移結節の1つを単離・培養した。このよう
な操作を5回繰り返し、肺に高転移性を示すクローン(
B16F10/L5と命名)を獲得した。
【0126】10%のウシ胎児血清を含むDME培地中
で直径10cmの組織培養用ディッシュ(コーニング(
登録商標)、岩城硝子社製)を用いて培養した対数増殖
期のB16F10/L5細胞を、ディッシュ付着状態で
リン酸バッファーPBSを用いて1回洗浄し、MEM培
地5mlを加えピペッティングを行うことにより細胞懸
濁液とした。遠心分離操作により細胞を集め、2mlの
MEM培地に再懸濁した。一方、実施例12で得られた
ヒトTNF及び同転換体ポリペプチドの一段階精製試料
を、所定の濃度(実施例14の抗腫瘍治療試験において
、治療効果を示した投与量を本試験の投与量として使用
した。)になるようにMEM培地で希釈し、その溶液中
に先に調製したB16F10/L5細胞懸濁液を添加す
ることにより、2×104細胞/0.2mlの各一段階
精製試料を含む細胞懸濁液を調製した。この細胞懸濁液
をC57BL/6NCrjマウス(雌、6週令)の尾静
脈より投与した(0.2ml/マウス)。コントロール
群はB16F10/L5細胞のみを投与した。投与14
日後に肺を摘出し、肺表面の転移結節数を計測した。 上記に準じて得られた結果を表5及び表6に掲載した。
で直径10cmの組織培養用ディッシュ(コーニング(
登録商標)、岩城硝子社製)を用いて培養した対数増殖
期のB16F10/L5細胞を、ディッシュ付着状態で
リン酸バッファーPBSを用いて1回洗浄し、MEM培
地5mlを加えピペッティングを行うことにより細胞懸
濁液とした。遠心分離操作により細胞を集め、2mlの
MEM培地に再懸濁した。一方、実施例12で得られた
ヒトTNF及び同転換体ポリペプチドの一段階精製試料
を、所定の濃度(実施例14の抗腫瘍治療試験において
、治療効果を示した投与量を本試験の投与量として使用
した。)になるようにMEM培地で希釈し、その溶液中
に先に調製したB16F10/L5細胞懸濁液を添加す
ることにより、2×104細胞/0.2mlの各一段階
精製試料を含む細胞懸濁液を調製した。この細胞懸濁液
をC57BL/6NCrjマウス(雌、6週令)の尾静
脈より投与した(0.2ml/マウス)。コントロール
群はB16F10/L5細胞のみを投与した。投与14
日後に肺を摘出し、肺表面の転移結節数を計測した。 上記に準じて得られた結果を表5及び表6に掲載した。
【0127】
【表5】
【0128】
【表6】
【0129】表5及び表6から、ヒトTNF及び同変換
体ポリペプチドが実験的肺転移を亢進する作用を有する
のに対し、そのN末端近傍にTyr−Ile−Gly−
Ser−Arg配列を導入した本発明のヒトTNF転換
体ポリペプチドは実験的肺転移を亢進しないことがわか
る。
体ポリペプチドが実験的肺転移を亢進する作用を有する
のに対し、そのN末端近傍にTyr−Ile−Gly−
Ser−Arg配列を導入した本発明のヒトTNF転換
体ポリペプチドは実験的肺転移を亢進しないことがわか
る。
【0130】
【発明の効果】本発明によれば、ヒトTNF又はその変
換体において、配列表の配列番号1の1番目のSerか
ら8番目のAspまでのアミノ酸配列あるいはそれに対
応するヒトTNF変換体のアミノ酸配列がラミニンの細
胞接着性ペプチド配列を少なくとも1個含み、かつ、5
個〜30個のアミノ酸を含むアミノ酸配列により置換さ
れることにより、ヒトTNF又はその変換体と同様の抗
腫瘍活性作用を有し、一方それらで認められた癌転移の
亢進作用を示さない新規なヒトTNF転換体が提供され
る。
換体において、配列表の配列番号1の1番目のSerか
ら8番目のAspまでのアミノ酸配列あるいはそれに対
応するヒトTNF変換体のアミノ酸配列がラミニンの細
胞接着性ペプチド配列を少なくとも1個含み、かつ、5
個〜30個のアミノ酸を含むアミノ酸配列により置換さ
れることにより、ヒトTNF又はその変換体と同様の抗
腫瘍活性作用を有し、一方それらで認められた癌転移の
亢進作用を示さない新規なヒトTNF転換体が提供され
る。
配列番号 :1
配列の長さ:155
配列の型 :アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
配 列
配列番号 :2
配列の長さ:15
配列の型 :アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
配 列
配列番号 :3
配列の長さ:17
配列の型 :アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
配 列
配列番号 :4
配列の長さ:11
配列の型 :アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
配 列
配列番号 :5
配列の長さ:13
配列の型 :アミノ酸
トポロジー:直鎖伏
配列の種類:ペプチド
配 列
配列番号 :6
配列の長さ:18
配列の型 :アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
配 列
配列番号 :7
配列の長さ:465
配列の型 :核 酸
鎖の数 :一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸合成DNA
配 列
配列番号 :8
配列の長さ:43
配列の型 :核酸
鎖の数 :1本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
配 列
配列番号 :9
配列の長さ:21
配列の型 :核酸
鎖の数 :1本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配 列
配列番号 :10
配列の長さ:36
配列の型 :核酸
鎖の数 :1本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配 列
配列番号 :11
配列の長さ:32
配列の型 :核酸
鎖の数 :1本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配 列
配列番号 :12
配列の長さ:27
配列の型 :核酸
鎖の数 :1本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配 列
【図1】合成オリゴヌクレオチドの連結によるヒトTN
F遺伝子の構築過程を示す工程図である。
F遺伝子の構築過程を示す工程図である。
【図2】合成オリゴヌクレオチドの連結によるヒトTN
F遺伝子の構築過程を示す工程図である。
F遺伝子の構築過程を示す工程図である。
【図3】ヒトTNF発現型プラスミドベクターの構築過
程を示す工程図である。
程を示す工程図である。
【図4】ヒトTNF発現ベクターの構築過程を示す工程
図である。
図である。
【図5】部位特異的変異法によるヒトTNF変換体遺伝
子の作製過程を示す工程図である。
子の作製過程を示す工程図である。
【図6】部位特異的変異法によるヒトTNF転換体遺伝
子の作製過程を示す工程図である。
子の作製過程を示す工程図である。
【図7】制限酵素切断部位を利用する遺伝子組換えによ
るヒトTNF転換体発現ベクターの構築過程を示す工程
図である。
るヒトTNF転換体発現ベクターの構築過程を示す工程
図である。
【図8】制限酵素切断部位を利用する遺伝子組換えによ
るヒトTNF転換体発現型プラスミドベクターの構築過
程を示す工程図である。
るヒトTNF転換体発現型プラスミドベクターの構築過
程を示す工程図である。
【図9】制限酵素切断部位を利用する遺伝子組換えによ
るヒトTNF転換体発現型プラスミドベクターの構築過
程を示す工程図である。
るヒトTNF転換体発現型プラスミドベクターの構築過
程を示す工程図である。
【図10】制限酵素切断部位を利用する遺伝子組換えに
よるヒトTNF転換体発現型プラスミドベクターの構築
過程を示す工程図である。
よるヒトTNF転換体発現型プラスミドベクターの構築
過程を示す工程図である。
【図11】制限酵素切断部位を利用する遺伝子組換えに
よるヒトTNF転換体発現ベクターの構築過程を示す工
程図である。
よるヒトTNF転換体発現ベクターの構築過程を示す工
程図である。
【図12】制限酵素切断部位を利用する遺伝子組換えに
よるヒトTNF転換体発現ベクターの構築過程を示す工
程図である。
よるヒトTNF転換体発現ベクターの構築過程を示す工
程図である。
【図13】大腸菌により発現されたヒトTNF及び同転
換体ポリペプチドの精製試料の電気泳動結果を示す図で
ある。
換体ポリペプチドの精製試料の電気泳動結果を示す図で
ある。
【図14】大腸菌により発現されたヒトTNF転換体ポ
リペプチドの精製試料の電気泳動結果を示す図である。
リペプチドの精製試料の電気泳動結果を示す図である。
Claims (19)
- 【請求項1】 配列表の配列番号1で示した1番目の
Serから155番目のLeuまでで表わされるアミノ
酸配列を有する腫瘍壊死因子ポリペプチド又はその変換
体において、前記配列番号1の1番目のSerから8番
目のAspまでのアミノ酸配列あるいはそれに対応する
前記変換体のアミノ酸配列がラミニンの細胞接着性ペプ
チド配列を少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個の
アミノ酸を含むアミノ酸配列により置換されていること
を特徴とするポリペプチド。 - 【請求項2】 前記ラミニンの細胞接着性ペプチド配
列が配列表の配列番号2で示したアミノ酸配列において
3番目のTyrから7番目のArgまでで表わされるア
ミノ酸配列である請求項1記載のポリペプチド。 - 【請求項3】 ラミニンの細胞接着性ペプチド配列を
少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個のアミノ酸を
含むアミノ酸配列が配列表の配列番号2、3、4、5又
は6でそれぞれ示したアミノ酸配列である請求項1記載
のポリペプチド。 - 【請求項4】 ラミニンの細胞接着性ペプチド配列を
少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個のアミノ酸を
含むアミノ酸配列が配列表の配列番号2、3又は4でそ
れぞれ示したアミノ酸配列である請求項1記載のポリペ
プチド。 - 【請求項5】 前記腫瘍壊死因子ポリペプチドあるい
はその変換体が、配列番号1で示した9番目のLysか
ら155番目のLeuまでで表わされるアミノ酸配列あ
るいは当該アミノ酸配列の68番目のProが他のアミ
ノ酸により置換されたアミノ酸配列を有する請求項1又
は3記載のポリペプチド。 - 【請求項6】 他のアミノ酸がAsp又はMetであ
る請求項5記載のポリペプチド。 - 【請求項7】 配列表の配列番号1で示した1番目の
Serから155番目のLeuまでで表わされるアミノ
酸配列を有する腫瘍壊死因子ポリペプチド又はその変換
体において、前記配列番号1の1番目のSerから8番
目のAspまでのアミノ酸配列あるいはそれに対応する
前記変換体のアミノ酸配列がラミニンの細胞接着性ペプ
チド配列を少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個の
アミノ酸を含むアミノ酸配列により置換されているポリ
ペブチドをコードするDNAを含むことを特徴とする組
換えプラスミド。 - 【請求項8】 前記組換えプラスミドがpKF414
6、pKF4236、pKF4419、pKF4422
、pKF4423、pKF4603又はpKF4604
である請求項7記載の組換えプラスミド。 - 【請求項9】 配列表の配列番号1で示した1番目の
Serから155番目のLeuまでで表わされるアミノ
酸配列を有する腫瘍壊死因子ポリペプチド又はその変換
体において、前記配列番号1の1番目のSerから8番
目のAspまでのアミノ酸配列あるいはそれに対応する
前記変換体のアミノ酸配列がラミニンの細胞接着性ペプ
チド配列を少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個の
アミノ酸を含むアミノ酸配列により置換されているポリ
ペプチドをコードするDNAを含む組換えプラスミドに
より形質転換された組換え微生物細胞。 - 【請求項10】 前記組換え微生物細胞が大腸菌であ
る請求項9記載の組換え微生物細胞。 - 【請求項11】 配列表の配列番号1で示した1番目
のSerから155番目のLeuまでで表わされるアミ
ノ酸配列を有する腫瘍壊死因子ポリペプチド又はその変
換体において、前記配列番号1の1番目のSerから8
番目のAspまでのアミノ酸配列あるいはそれに対応す
る前記変換体のアミノ酸配列がラミニンの細胞接着性ペ
プチド配列を少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個
のアミノ酸を含むアミノ酸配列により置換されているポ
リペプチドをコードするDNAを含む組換えプラスミド
により形質転換された組換え微生物細胞を培地中で培養
し、当該アミノ酸配列を有するポリペプチドを産生し分
離することを特徴とするポリペプチドの製造方法。 - 【請求項12】 配列表の配列番号1で示した1番目
のSerから155番目のLeuまでで表わされるアミ
ノ酸配列を有する腫瘍壊死因子ポリペプチド又はその変
換体において、前記配列番号1の1番目のSerから8
番目のAspまでのアミノ酸配列あるいはそれに対応す
る前記変換体のアミノ酸配列がラミニンの細胞接着性ペ
プチド配列を少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個
のアミノ酸を含むアミノ酸配列により置換されているポ
リペプチドを有効成分として含有することを特徴とする
医薬組成物。 - 【請求項13】 前記ラミニンの細胞接着性ペプチド
配列が配列表の配列番号2で示したアミノ酸配列におい
て3番目のTyrから7番目のArgまでで表わされる
アミノ酸配列であるポリペプチドを含有する請求項12
記載の医薬組成物。 - 【請求項14】 ラミニンの細胞接着性ペプチド配列
を少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個のアミノ酸
を含むアミノ酸配列が配列表の配列番号2、3、4、5
又は6でそれぞれ示したアミノ酸配列であるポリペプチ
ドを含有する請求項12記載の医薬組成物。 - 【請求項15】 ラミニンの細胞接着性ペプチド配列
を少なくとも1個含み、かつ、5個〜30個のアミノ酸
を含むアミノ酸配列が配列表の配列番号2、3又は4で
それぞれ示したアミノ酸配列であるポリペプチドを含有
する請求項12記載の医薬組成物。 - 【請求項16】 前記腫瘍壊死因子ポリペプチドある
いはその変換体が配列番号1で示した9番目のLysか
ら155番目のLeuまでで表わされるアミノ酸配列あ
るいは当該アミノ酸配列の68番目のProが他のアミ
ノ酸により置換されたアミノ酸配列を有するポリペプチ
ドを含有する請求項12又は14記載の医薬組成物。 - 【請求項17】 他のアミノ酸がAsp又はMetで
あるポリペプチドを含有する請求項16記載の医薬組成
物。 - 【請求項18】 配列表の配列番号1で示した1番目
のSerから155番目のLeuまでで表わされるアミ
ノ酸配列を有する腫瘍壊死因子ポリペプチド又はその変
換体において、前記配列番号1の1番目のSerから8
番目のAspまでのアミノ酸配列あるいはそれに対応す
る前記変換体のアミノ酸配列がラミニンの細胞接着性ペ
プチド配列を有するアミノ酸配列を少なくとも1個含み
、かつ、5個〜30個のアミノ酸を含むアミノ酸配列に
より置換されており、更にそのN末端にMetを有する
ことを特徴とするポリペプチド。 - 【請求項19】 配列表の配列番号7で示した1番目
のTから465番目のGまでで表わされる塩基配列を有
する腫瘍壊死因子ポリペプチドのDNA又はその変異導
入DNAにおいて、前記配列番号7の1〜3番目のTC
Aから22〜24番目のGACまでの塩基配列あるいは
それらに対応する前記変異導入DNAの塩基配列がラミ
ニンの細胞接着性ペプチド配列を少なくとも1個含み、
かつ、5個〜30個のアミノ酸を含むアミノ酸配列をコ
ードする塩基配列により置換されていることを特徴とす
るDNA。
Priority Applications (6)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP3240130A JPH04368397A (ja) | 1991-06-17 | 1991-06-17 | ポリペプチド |
JP3311284A JPH05255393A (ja) | 1990-09-21 | 1991-09-19 | ポリペプチド |
EP91116065A EP0479071B1 (en) | 1990-09-21 | 1991-09-20 | Polypeptide |
DE69120626T DE69120626T2 (de) | 1990-09-21 | 1991-09-20 | Polypeptid |
US07/763,512 US5247070A (en) | 1990-09-21 | 1991-09-20 | N-terminal muteins of tumor necrosis factor |
AT91116065T ATE140008T1 (de) | 1990-09-21 | 1991-09-20 | Polypeptid |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP3240130A JPH04368397A (ja) | 1991-06-17 | 1991-06-17 | ポリペプチド |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH04368397A true JPH04368397A (ja) | 1992-12-21 |
Family
ID=17054947
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP3240130A Pending JPH04368397A (ja) | 1990-09-21 | 1991-06-17 | ポリペプチド |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JPH04368397A (ja) |
-
1991
- 1991-06-17 JP JP3240130A patent/JPH04368397A/ja active Pending
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