JPH03295463A - 蛍光式電気泳動パターン読み取り装置 - Google Patents

蛍光式電気泳動パターン読み取り装置

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JPH03295463A
JPH03295463A JP2098302A JP9830290A JPH03295463A JP H03295463 A JPH03295463 A JP H03295463A JP 2098302 A JP2098302 A JP 2098302A JP 9830290 A JP9830290 A JP 9830290A JP H03295463 A JPH03295463 A JP H03295463A
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fluorescence
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三島 浩通
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Naganori Nasu
永典 奈須
Keigi Koga
恵義 古賀
Shigero Nakajima
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 〔産業上の利用分野〕 本発明は、蛍光式電気泳動パターン読み取り装置に関し
、特に、電気泳動パターン読み取り用の蛍光励起光源を
小型化、軽量化、tJs電力化、長寿命化することがで
き、電気泳動パターンの読み取り感度を向上させた蛍光
式電気泳動パターン読み取り装置に関するものである。
〔従来の技術〕
蛍光法による電気泳動パターン読み取り装置は、危険で
高価な放射性アイソトープを必要としない利点を有して
いる。
一般に、DNAシーケンシング(遺伝子の塩基配列決定
)を含む種々の遺伝子構造解析、アミノ酸等の蛋白の質
量分析、高分子の構造分析を行うために、蛍光法による
電気泳動分析法が用いられる。このような電気泳動分析
法は、蛍光物質で標識した試料の断片に対してゲルを用
いて電気泳動を行い、電気泳動で展開された試料の断片
の分布パターンの解析を行うことにより、試料の分析を
行う方法である。
電気泳動パターン読み取り装置の代表例として、DNA
シーケンシング装置を例として説明する。
DNAシーケンシング装置を用いて、DNAシーケンシ
ングを行う場合、構造を決定しようとするDNAの試料
は、まず、制限酵素によって各塩基の部所に特異的な化
学反応の反応率をコントロールして試料を断片化し、蛍
光物質で標識してフラグメント(断片)とする。このフ
ラグメントは、種々の長さを持ち、かつ、切断端にアデ
ニン、シトシン、グアニン、チミン(Adenin、 
Cytosine。
Guanine、 Th1m1ne :以下、A、C,
G、Tと略称する)の4種のいずれかの特定の塩基を有
する断片である。フラグメント化されたA、C,G、T
の各々のDNAの試料は、電気泳動によりその断片の長
さに対応して分離できるので、電気泳動を行い、各断片
を分離した後、レーザ光を照射し、各断片に標識されて
いる蛍光物質を励起し、その蛍光物質から発する蛍光の
強度分布を測定することにより、各々の塩基の配列を読
み取り、DNAの構造を決定する。
第21図は、電気泳動を行ったDNA断片の分布例を示
す図である。DNA断片の持つ長さの相違(分子量の差
)により電気泳動される距離が異なるために、各々のD
NA断片が時間の経過と共に同一分子量のDNA断片毎
に集まり、第21図に示すような電気泳動パターン70
が形成される。
この電気泳動パターン70は、各々の分子量に対応して
、各々のバンド66が展開されて形成されるものであり
、全体としては、各々の塩基のレーン71.72.73
.74に展開されたバンド66を有するパターンとなる
。A、C,G、Tの各塩基のDNA断片には必ず1塩基
以上の分子量差が生ずるため、電気泳動される距離が、
各々の塩基のレーン71.72.73.74のバンド毎
にすべて異なる。したがって。
A、C,G、Tの各塩基のレーン71〜74における各
バンド66が原理的にレーンのバンドと横一列に並ぶこ
とはない。DNAシーケンシングでは、バンド66の順
番をA、C,G、Tの各塩基のレーン71〜74に対し
て下から順にたどるパターン読み取りを行い、DNAの
配列を解析する。
電気泳動法による分析法は、上述のように、各々のDN
Aの塩基の配列を解析するDNAシーケンシング装置に
利用されるが、また、電気泳動法による分析法は、他の
試料に対して電気泳動を行う場合も同様に利用できる。
この場合、解析すべき試料に対して電気泳動を行う。解
析すべき試料に電気泳動を行うと、試料は各々の分子量
に対応して分離され、それぞれにバンドが形成されるの
で、形成されたバンドの分布を読み取り、試料の分子量
の差が判定できる。また、電気泳動による試料の断片の
泳動距離の測定、所定位置のバンドの有無の判定により
、分子量の推定や所定の分子の有無が判定できる。
このような電気泳動を行う場合、ベースとなるゲルに蛍
光物質を標識した試料に注入し、ゲルに電気泳動を行う
と、電気泳動を行った後のゲルには、試料の各々の分子
量の相違により分布するバン1−分布ができるので、こ
のバンド分布を測定する。バンド分布の測定は、蛍光物
質に励起を起こす励起光となるレーザ光やランプなどの
光を発光して、この光を電気泳動を行ったゲルに照射し
、ゲルから励起された蛍光を光電変換素子で検出するこ
とによって、バンドの分布パターンを測定する。ゲルと
しては、例えば、ポリアクリルアミドゲルや、アガロー
スゲルなどが用いられる。
この種の蛍光検出法による電気泳動装置の一例として、
特開昭61−62843号公報に記載された電気泳動装
置がある。
次に、このような蛍光検出法による電気泳動装置につい
て具体的に説明する。
第17図は、従来の蛍光式電気泳動装置の外部を示す斜
視図である。第17図を参照すると、電気泳動装置は、
試料の電気泳動を行い、蛍光の分布を計測する泳動計測
装置51と、計測したデータを基にデータ処理を行うデ
ータ処理装置52、それら相互を接続するケーブル53
から構成されている。
泳動計測装置51には扉51aがあり、扉51aを問い
て、D N A断片の電気泳動を行うベースとなるゲル
の注入を行い、更に電気泳動を行う試料の所定量を注入
する1、扉51aを閉じて、操作表示パネル51bの泳
動開始スイッチを押すと電気泳動が開始される。電気泳
動が開始されると、泳動計測装置51では、操作表示パ
ネル51bにあるモニタに動作状態が表示される。計測
されたデータは、データ処理装置52に転送され、予め
プログラムされている所定のデータ処理が行われる。な
お、データ処理装置52は、計算機本体54と、利用者
からの指令などを入力するためのキーボード55、処理
状態や結果を表示するデイスプレィ装置56、処理の結
果を記録するプリンタ57から構成されている。
第18図は、泳動計測装置の内部の構成を示すブロック
図である。泳動計測装置(51;第17図)の構成は、
第19図に示すように、電気泳動装置部63および信号
処理装置部64から構成されており、この2つ部分がま
とめられて、泳動計測装置の全体の装置を構成している
。電気泳動装置部63は、電気泳動を行う泳動部5と、
泳動部5に電圧を印加するための第1電極2aおよび第
2電極2bと、泳動部5および各電極2a、2bを支え
るための支持板3と、泳動部5に電圧を印加するための
電気泳動用電源装置4と、蛍光物質を励起するための光
を発光する光源11と、光源11からの光を導くための
光ファイバ12と、蛍光物質から発生した蛍光13を集
光して受光する光学系の集光器14と、特定波長の光を
選択的に通す光学フィルタ15と、受光した光を電気信
号に変換するための光センサ16とから構成されている
。また、信号処理装置部64は、光センサ16からの電
気信号を受けて増幅する増幅器17と、電気信号のアナ
ログ信号をディジタルデータに変換するアナログ・ディ
ジタル変換回路18と、ディジタル変換したデータに対
して加算平均処理等の前処理を行う信号処理部19と、
前処理したデータを外部のデータ処理装置へ送出するイ
ンターフェース処理を行うインタフェース20と、電気
泳動装置部および信号処理系の全体を制御するための制
御回路10とから構成されている。この信号処理装置6
4から出力されるディジタル信号○TJ Tは、データ
処理装置(52;第17図)に送られ、解析処理などの
データ処理が行われる。
次に、このように構成された電気泳動装置の動作を説明
する。
第17図および第18図を参照する。泳動計測装[51
にある扉51aを開き、内部にある泳動部5にゲルを注
入し、更に蛍光物質で標識したDNA断片の試料を注入
する。操作パネル51bのスイッチを操作して、電気泳
動開始を指示すると、電気泳動用電源装置4からの電圧
が電極2a、2bにより泳動部5に供給さ九て電気泳動
が開始される。
電気泳動によって、蛍光物質で標識された試料は、例え
ば、第21図に示すように、各々の試料のレーン71.
72.73.74において電気泳動され、試料に含まれ
る分子の分子量毎に集まり、それぞれにバンド66を作
る。分子量の軽い分子はど泳動速度が速いため、同一時
間内に泳動される距離は大きい。これらのバンド66の
検出は、第]、98図に示すように、光源からの光を光
ファイバ12に通して導き、泳動部5の横方向からゲル
に対して光路61上で照射することにより、ゲル中でバ
ンド66に集まっている標識の蛍光物質が蛍光13を発
する。
なお、泳動部5は、その正面図を第19a図に、その縦
断面図を第19b図に示すように、ポリアクリルアミド
などのゲル5aと、該ゲル5aを両側から挾んで支える
ためのガラスの支持板5b。
5cとから構成されている。泳動部5のゲル5aに上部
から例えばDNA断片の試料を注入し、第1電極2aお
よび第2電極2b(第18図)に泳動電圧を印加して、
電気泳動を行う。光源から照射された光、例えばレーザ
光は、光ファイバ12からゲル5a中の光路61を通り
、光路61上の蛍光物質を照射する。これにより、光路
61上に存在する蛍光物質が励起されて蛍光13を発す
る。蛍光13はレンズの組合せで構成される光学系の集
光器14に到達し、集光された後に光学フィルタ15で
選択され、光センサ16において電気信号に変換される
光センサ16により得られた電気信号は、増幅器17に
より希望するレベルの信号に増幅され、アナログ・ディ
ジタル変換回路18によりアナログ・ディジタル変換さ
れ、信号処理部19へ送られる。信号処理部19では、
信号対雑音比(S/N比)を向上させるために加算平均
処理等の信号処理が行われる。このようにして信号処理
されたディジタル信号のデータは、インタフェース20
により、データ処理装置52に送出される。
第20a図および第20b図は、泳動計測装置51から
送出されるDNA断片の蛍光強度パターン信号の例を説
明する図である。例えば、第20a図に示されるように
、電気泳動が行われた泳動部5に対して光路61でレー
ザ光が照射されると、光路61上に存在するゲルの蛍光
物質が励起されて、蛍光を発するので、この蛍光を、レ
ーン毎に所定の検出位置で電気泳動方向62の方向に時
間の経過と共に検出する。これにより、各レーンのバン
ド66が光路61上の位置を通過する時に、蛍光が検出
されることになり、1つのレーンにおける蛍光強度のパ
ターン信号が、第20b図に示すように、検出される。
このため、バンド66が光路61上の位置を通過すると
きに、蛍光強度のピークが得られる。したがって、第2
0b図に示す蛍光強度パターン信号は、電気泳動方向6
2の方向におけるバンド66の蛍光強度パターン信号と
なっている。
データ処理装置52では、計算機本体54により泳動計
測装置51から送出されるDNA断片の蛍光強度パター
ン信号のデータを受けて、蛍光強度パターンのデータか
ら分子量の比較やDNAの塩基配列を決定するデータ処
理を行う。データ処理を行い決定された塩基等の並びは
、記号化して出力され、デイスプレィ装置i56により
画面表示し、またはプリンタ57により印刷出力される
。また、データ処理された結果のデータは、必要に応じ
て磁気記憶媒体に記録される。
〔発明が解決しようとする課題〕
ところで、上述したように、蛍光検出法による電気泳動
装置においては、光源からの光を泳動部に対して横方向
に入射している。このような横方向からの光入射では、
光源からの励起光は、直接的にゲルに光照射が行なわれ
るため、ゲルの支持板のガラスには励起光が当たらず、
励起光の散乱光は発生せず、ゲルの支持板のガラスを通
して蛍光を受光する感度が高いという利点を有している
しかし、泳動部のゲルとして、例えばアガロースゲルを
用いる場合には、ゲル中における励起光の散乱度が大き
く、光路61の全てに渡って、励起光の光ビームのスポ
ット径と強度を均一の維持することが困難である。更に
、電気泳動の前のゲルの注入において、電気泳動には関
係しない泳動部の両端部分に気泡などができた場合に、
それが屁起光の光路上であると、励起光を入射すること
が困難となり、また、大きな散乱を生じることになる。
さらに、横方向からの光入射では、光路上にある蛍光物
質が、全て同時に蛍光を発光するため、蛍光を集光して
受光する光センサとして、高価な1次元状の光センサ(
ラインセンサ)を用いなければならないという問題があ
る。
また、電気泳動パターン読み取り装置において、蛍光物
質の励起に用いる励起光の光源としては、白熱ランプや
、ガスレーザ、色素レーザなどの光源が用いられている
。しかし、これらの光源は、電気光の変換効率が低く、
発熱量が多く、光源の電源装置が大型で、重量も大きく
、電気泳動パターン聞み取り装置の構成を小型化するこ
とが困難となっているという問題がある。
本発明は、これらの問題を解決するためになされ、たも
のである。
本発明の目的は、電気泳動パターン読み取り用の蛍光励
起光源を小型化、軽量化、小電力化、長寿命化すること
ができ、パターンの読み取り感度を向上させた蛍光式電
気泳動パターン読み取り装置を提供することにある。
〔課題を解決するための手段〕
上記目的を達成するため、本発明の蛍光式電気泳動パタ
ーン読み取り装置は、電気泳動を行うベースのゲルおよ
び該ゲルを支持するゲル支持体からなる着脱自在な泳動
部ユニットと、該泳動部ユニットを装着して蛍光物質で
s諏した試料を与えたゲルに泳動電圧を印加して電気泳
動を行う電気泳動ユニットと、電気泳動を行った後の泳
動部ユニットを装着し、泳動部ユニットのゲルに対して
、光源からの照射米殻走査してゲルの厚み方向に照射し
、照射光の光軸とは異なる方向に受光面を設定して受光
経路の空間的位置関係により、ゲル内の試料の蛍光物質
から発生した蛍光を、照射光によりゲル支持板から発生
する散乱光から分離して、電気泳動パターンを読み取る
読み取りユニットとを備えたことを特徴とする。
〔作用〕
前記手段によれば、蛍光式電気泳動パターン読み取り装
置には、泳動部ユニットと、電気泳動ユニットと、読み
取りユニットとが備えられる。
泳動部ユニットは、電気泳動を行うベースのゲルおよび
該ゲルを支持するゲル支持体から構成され、着脱自在と
なっている。電気泳動ユニットは、この泳動部ユニット
を装着して蛍光物質で擦識した試料を与えたゲルに泳動
電圧を印加して電気泳動を行う。また、読み取りユニッ
トは、電気泳動を行った後の泳動部ユニットを装着し、
泳動部ユニットのゲルに対して、光源からの照射光を走
査してゲルの厚み方向に照射し、照射光の光軸とは異な
る方向に受光面を設定して受光経路の空間的位置関係に
より、ゲル内の試料の蛍光物質から発生した蛍光を、照
射光によりゲル支持板から発生する散乱光から分離して
、電気泳動パターンを読み取る。
読み取りユニットにおいては、電気泳動パターンを読み
取るための光学系を、光源からの照射光を走査してゲル
の厚み方向に照射し、照射光の光軸とは異なる方向に受
光面を設定して受光経路の空間的位置関係により、ゲル
内の試料の蛍光物質から発生した蛍光を、照射光により
ゲル支持板から発生する散乱光から分離する構成とする
ことにより、試料断片の#A識に用いた蛍光物質を励起
する光源としては、光量の大きな光源を必要とせず、半
導体レーザを用いることができる。これにより、光源を
小型、軽量、高効率化として、装置の構成を小型化する
。また、光源からの照射光は走査してゲルの厚み方向に
照射する構成とするので、集光部は、高価な一次元状の
光センサを用いる必要がなく、光ファイバアレイなどで
検出する蛍光を導入し、スポット光を受光する光センサ
で十分に電気泳動パターンの蛍光を検出できる7この場
合、励起光となる照射光はゲルの厚み方向に走査して照
射するため、照射光がゲル表面またはゲル支持板表面か
ら散乱光となり、検出する蛍光のノイズ分となるが、ゲ
ル表面またはゲル支持板表面から発生する散乱光とゲル
内から発生する蛍光とを光学レンズ系または光学ミラー
系を用いて受光経路の空間的位置関係の相違により分離
する。これにより、安価に横入射方式と同等の信号対雑
音比を得る。さらに、照射光をゲル上に走査して照射す
る場合、スキャンスポットの移動速度変化による検出感
度の変化が、歪として電気泳動パターンの検出信号に生
じないように、スキャンミラーの回転速度を制御して、
ゲル上でスキャンスポットの移動速度が一定となるよう
に制御する。これは。
スキャンミラーを駆動するミラードライバの駆動制御信
号として、これを補正する関数電気信号を発生してスキ
ャンミラーのミラードライバに加えることにより行う。
このようにして、蛍光物質を励起するための光源として
、半導体レーザを用いることにより供給電力に対する光
出力、すなわちレーザ光の発振効率を向上させ、同じレ
ベルの光出力であればレーザ発振部の体積や駆動電源部
の体積が大幅に小さくできる。これにより、装置を小型
、軽量にすることができる。また、半導体レーザでは、
すべて固体化で構成されており、信頼性が高く装置の長
寿命化が可能である。半導体レーザで発振するレーザ光
の波長が、試料の標識物質として用いる蛍光物質の蛍光
の励起光として、波長が適合しない場合には、蛍光を発
する光学ロンド、非線形光学物質を用いて、発振したレ
ーザ光の波長を、試料の標識物質として用いる蛍光物質
に蛍光を励起するために適切な光の波長に変換する。
ゲル支持体から発生する励起光の散乱光とゲルから発生
する蛍光は、ゲル支持体の厚さ分だけ離れた位置から発
する光なので、光学レンズ系または光学ミラー系を用い
て、受光経路の空間的位置関係により別の位置に結像さ
せて分離し、集光することができる。これにより非常に
安価でありながら、励起光を横方向から入射する方式と
同レベルの信号対雑音比を実現することができる。また
、ゲルの厚み方向に照射する照射光のスポット光をスキ
ャンする場合、振動ミラーなど等角速度でスキャンする
と、ゲル上ではスポット光の移動速度が等速とはならな
いが、振動ミラーの回転角速度制御によりゲル上に於て
移動速度が等速となるように、回転角速度の補正制御を
行うことにより歪のない電気泳動パターンを得ることが
できる。
これにより、電気泳動パターン読み取り用の蛍光励起光
源を小型化、軽量化、小電力化、長寿命化することがで
き、パターンの読み取り感度を向上させることができる
〔実施例〕
以下、本発明の一実施例を図面を用いて具体的に説明す
る。
第1図は、本発明の一実施例にかかる蛍光式電気泳動パ
ターン読み取り装置の全体構成を説明する概略図である
。第1図に示すように、蛍光式電気泳動パターン読み取
り装置は、電気泳動ユニット1と読み取りユニット6と
が分離されて全体の装置が構成される。電気泳動ユニッ
ト1は、電気泳動を行うベースとなるゲルと該ゲルをガ
ラス板などで挟み込んで支持するゲル支持体とからなる
泳動部(泳動部ユニット;この実施例では泳動部が着脱
自在となっており、これを、泳動部ユニットともいう)
5と、泳動部ユニット5が装着され該泳動部ユニット5
に電気泳動電圧を加える第1電極2a及び第2電極2b
と、この第1電極2a及び第2電極2bを支えると共に
泳動部5を支える支持板3と、電気泳動電圧を供給する
電気泳動用電源装置4とから構成される。泳動部ユニッ
ト5は、前述したように、泳動試料を展開するポリアク
リルアミドなどのゲルと、該ゲルを両側から挾んで支持
するガラス板などのゲル支持体から構成される(第19
a図、第19b図参照)。電気泳動ユニット1において
、泳動部(泳動部ユニット)5が装着され、泳動部5の
ゲルの上部から電気泳動する断片化した試料が供給され
、電気泳動用電源装置4から第1電極2aおよび第2電
極2bに泳動電圧が印加され、電気泳動が行われる。
電気泳動ユニット1で電気泳動を行った後の泳動部5は
取り外し、次に、読み取りユニット6に装着して、電気
泳動パターンの読み取りを行う。
読み取りユニット6は、電気泳動を行った泳動部5を、
そのままの状態で(または泳動部5からゲルのみを取り
出した状態で)装着して、電気泳動パターンを読み取っ
て、データ処理を行う。読み取りユニット6は、第1図
に示すように、計測部本体フを主要部として構成され、
データ処理装置8およびイメージプリンタ9等が付加さ
れて構成される。データ処理装置8およびイメージプリ
ンタ9は、計測部本体フで読み取った電気泳動パターン
データに対して、データ処理、イメージ処理、判定処理
を行い、読み取った電気泳動パターンデータを加工して
出力する。計測部本体7には、電気泳動ユニット1にお
いて既に電気泳動を行った泳動部(ゲル及びゲル支持体
からなる泳動部ユニット)5を装着して、読取る読み取
り台が本体上部の蓋7aの直下に設けられている。電気
泳動ユニット1から取り外した泳動部5は、計測部本体
7において、本体上部の蓋7aを開けて読み取り台に装
着される。泳動部5の読み取り対象のゲルを装着し、蓋
7aを閉じて、計測部本体7の操作表示パネル7bの読
み取り開始スイッチを押下すると、計測部本体7が泳動
部5のゲルの電気泳動パターンの読み取りを開始する。
電気泳動パターンの読み取りが開始されると、計測部本
体7に内蔵する光源からの光が走査され、装着した泳動
部5のゲルに励起光を照射し、蛍光物質を励起させ、こ
れにより発光した蛍光を受光して、蛍光物質の分布を計
測する。データ処理装置8は計測部本体7で計測した読
み取りデータを基にデータ処理を行い、また、計測部本
体7の制御を行う。データ処理されたデータは、イメー
ジプリンタ9などにより可視化される。
第2図は、計測部本体の要部の構成を示すブロック図で
あり、また、第3図は、計測部本体に装着する泳動部の
装着位置を説明する図である。第2図および第3図を参
照して説明する。
電気泳動パターン読み取り装置を用いて、試料の電気泳
動分析を行う場合、前述したように、まず、電気泳動ユ
ニット1を用いて、蛍光色素(蛍光物質)により標識し
た試料(DNAフラグメント)の電気泳動を行う。所定
時間の電気泳動の終了の後、泳動部5を電気泳動ユニッ
ト1から取り外す。取り外した泳動部5のゲルは、その
ままの泳動部5の状態で、あるいはゲル支持体のガラス
を外した状態で、第3図に示すように、読み取りユニッ
ト6の計測部本体7の上部の蓋7aを開き、内部の読み
取り台7cの上部に載置する。そして、蓋7aを閉じて
、読み取りユニットへのセットが完了する。このとき、
電気泳動を行ったゲルが蛍光色素で標識されていない試
料の場合には、ここで色素をつける処理を施ようにして
もよい。また。
また、ゲルの乾燥等の処理も行う。
次に、電気泳動パターンの読み取り開始を指示する操作
を行う。読み取り開始の操作は、操作表示パネル7bの
読み取り開始スイッチの押圧による開始指示により、ま
たはデータ処理装置8からの読み取り開始指示により行
う。データ処理装置8によって読み取り動作を開始する
場合には、計測部本体7における泳動部ユニットの装着
状態が制御信号線を通してデータ処理装置8の側に送ら
れ、その状態に応じてデータ処理装置8が読み取りユニ
ット7の動作を制御して行う。この場合には、動作時の
読み取り速度などのパラメータ設定も予めデータ処理装
置8の側に登録しておくことにより、読み取り開始の操
作が自動的に行われるので、操作者のスイッチ操作負担
が軽減される。
読み取られた蛍光色素の分布データは、データ処理装置
8に送られる。データ処理装置8では、蛍光強度のピー
ク検出処理、泳動距離を求める処理などの予めプログラ
ムしである所望の処理を行う。データ処理した結果のデ
ータは、必要に応じてイメージプリンタ9により、蛍光
強度を濃淡画像で印刷出力し、または蛍光強度を等高線
形式または色や濃度で区分けした画像として印刷出力す
る。蛍光強度に応じた濃淡画像で印刷出力した画像は、
従来から用いられている放射性物質で標識して電気泳動
を行った放射性Xフィルム像と同じ画像となる。また、
必要に応じて、データ処理した結果のデータは、磁気的
または光学的記録装置にディジタルデータとして記憶さ
れる。
第2図の計測部本体の構成を示すブロック図において、
光源21から発光されたレーザビーム31は、ミラード
ライバ30で駆動される振動ミラー22により図面の表
裏方向にスキャンされ、読み取り対象の泳動部5のゲル
に加えられる。振動ミラー22によりスキャンされるレ
ーザビーム31のスポット光は、移動しながら、泳動部
5のゲルを厚み方向に照射する。これにより、スキャン
されたレーザビーム31のスポット光が照射された泳動
部5のゲルからは蛍光13が発するので、これを集光器
23を通して受光する。集光器23は、後述するように
、蛍光13を受光するため受光経路の光軸が泳動部5を
照射するスポット光の光軸とは異なるように、また、光
学レンズ系により受光の光学経路の空間的位置関係を構
成して、泳動部5の照射面から発する散乱光からの検呂
感度を高めて、蛍光13を受光する。集光器23で受光
した光は、光電変換部24により電気信号に変換されて
増幅器25により増幅される。なお、ゲルを透過したレ
ーザビーム31が、迷光として悪影響を与えないように
、泳動部5のレーザビーム31の照射面と反対側には、
光トラップ32が設けられいる。
このように集光器23、光電変換部24を通して、検出
する蛍光13の受光感度を高くし、更に受光した蛍光1
3を電気信号に変換し、変換した電気信号を増幅器25
に入力する。増幅器25において増幅された電気信号は
、アナログ・ディジタル変換回路26に入力されて、デ
ィジタルデータに変換される。
ディジタルデータに変換された蛍光の検出信号はメモリ
28に記憶され、メモリ28に記憶されたデータがイン
タフェース29を通してデータ処理装置8に送られる。
このような一連の信号処理の全体の制御は、制御回路2
7が行う。
第4a図、第4b図、第4C図および第4d図は、計測
部本体に装着された泳動部ユニットの読み取り走査を説
明する図である。
第4a図〜第4d図を参照して、計測部本体に装着され
た泳動部(泳動ユニット)5に対する読み取り操作につ
いて説明すると、計測部本体7に対して、読み取り対象
の泳動5が装着され、読み取り開始の操作がなされると
、装着された泳動部5が、読み取り台7cの上で左右に
移動して、ゲルの電気旅行パターンの読み取りが行われ
る。まず、最初に泳動部5は、第4a図に示すような状
態の位置にセットされる。第4a図において、矢印40
は光源からのレーザビームがスキャンされる走査方向で
あり、第1の走査方向(主走査方向)である。読み取り
開始の操作がなされると、泳動部5は、第4b図に示す
ように、読み取り台7Cの左端まで移動して、主走査方
向にレーザビームのスキャンが開始される。泳動部5が
左端の位置から所定の速度で右側に移動しながら読み取
られる。泳動部5の読み取りが開始され、泳動部5が所
定の速度で右に移動し、第4C図に示すように、泳動部
5が右端まで移動すると、読み取りが終了する。読み取
り台7cにおいて、泳動部5を移動させるステージの矢
印41の移動方向が第2の走査方向(副走査方向)とな
る。このようにして結果的に、泳動部5のゲルの蛍光物
質の分布が2次元的に分布画像として読み取られる。
このような泳動部5の相対移動による2次元的な読み取
り動作において、読み取り光のレーザビームの走査は、
第4d図に示すように、主走査方向(矢印40の走査方
向)と副走査方向(矢印41の移動方向)とにより、泳
動部5の面を走査して読み取られることと等価となり、
主走査方向を電気泳動と同方向として読み取りを行う。
次に、このような構成の電気泳動パターン読み取り装置
の計測部本体(第2図)の各部の構成を詳細に説明する
第5図は、計測部本体の光源として半導体レーザを用い
る場合の光源装置の要部の構成を示すブロック図である
光源21となるレーザ光の光源装置は、第5図に示すよ
うに、光源用電源21aと、光軸を同一とした光路上に
配設される半導体レーザ21b、第1の光学レンズ21
c、第2の光学レンズ21d、光学ロッド21e、第3
の光学レンズ21f、非線形光学結晶21g、および出
力カップラ21hから構成されている。光源用電源21
aから供給される電流によって半導体レーザ21bが発
振してレーザ光を発光する。発光したレーザ光は第1の
光学レンズ21cおよび第2の光学レンズ21dで集光
され、光学ロッド21eに入射される。光学ロッド21
eは、ネオジウムを拡散させたイツトリウム、アルミニ
ウム。
ガーネット結晶のロッド(以下、YAGロッドという)
により構成された光学ロッドであり、入射れたレーザ光
によ励起され蛍光を発光する。ここでの半導体レーザ2
1aの発振波長は、YAGロッドの光の吸収帯である約
807nm中心の波長となっている。このようなレーザ
光が入射されたYAGロッド(光学ロッド21e)は励
起状態となり、蛍光を発する状態となって、波長110
64nの光を発生する。この光学ロッド21eからの光
は第3の光学レンズ21fにおいて、再び、集光されて
、非線形光学結晶21.gに入射される。非線形光学結
晶21gは、ここではKTP (KTiOPO,)が用
いられる。このため、非線形光学結晶21gから波長1
064 n mの光の第2高調波の]−/2波長の波長
532nmの光が発生する。そして、ここで発生した波
長532nmの光のみを出力カップラ21hにより取り
出し、レーザ光源装置の光源21から出力するレーザビ
ームの照射光とする。
半導体レーザの発振効率は、通常の場合、ガスレーザ等
の1桁上であり、レーザ発振器の駆動電源装置の体積2
重量は約1o分の]以下となる。
また、レーザ発振器自体も、ガスレーザの共振部の長さ
の10分の1以下程度であり、大幅に小型化、軽量化が
可能である。また5すべで固体素子で構成されているた
め機械的な振動に強く、寿命もガスレーザや色素レーザ
と比較して数倍長い特徴を持っている。通常のガスレー
ザの寿命が2〜5千時間であるのに対して、半導体レー
ザの寿命は4〜5万時間と非常に長い。このため、光源
として半導体レーザを用いる構成とすることにより、装
置本体の構造を小型化、軽量化することができる。
ところで、電気泳動パターンの読み取りのために、泳動
部のゲルに照射する照射光を半導体レーザのレーザ光と
する場合、レーザ光の成分が単一波長の光となっており
、標識物質の蛍光物質の励起光として適切でない場合に
は、十分に標識物質の蛍光物質から蛍光が得られない場
合がある。すなわち、例えば、試料のDNAフラグメン
トの標識物質の蛍光物質に蛍光励起を起こさせる光の波
長成分と、光源から発する光の波長が適合していないと
、電気泳動したパターンから発光する蛍光が弱く、読み
取りが困難となる場合がある。これに対しては、この実
施例では、半導体レーザで発振したレーザ光の波長を、
光学ロッドおよび非線形光学結晶を用い、発振したレー
ザ光の波長を変換することにより、標識物質の蛍光物質
に蛍光励起を起こさせるために適切な光の波長成分とし
ている。また、泳動部にゲルに照射するレーザ光の波長
により、十分に蛍光を発光する蛍光物質の標識物質を選
択して用いるようにしてもよい。この例の光源装置にお
いて出力する波長532nmの励起光波長に対しては、
それに適した標識物質の蛍光色素として、ローダミンX
、テトラメチルローダミンなどのローダミン類などが使
用できる。
第6図は、振動ミラーを用いてゲル面をレーザビームで
スキャンする光走査機構を説明する図であり、また、第
7図は振動ミラーの回転角とレーザビームのスポット光
の移動距離の関係を説明する図である。
光源21.ミラー22.および泳動部5の配置位置が、
第6図に示すような位置関係にあるため、例えば、振動
ミラー22がミラードライバ30により等角速度で振動
するように駆動された場合、泳動部5においては、両端
部での光スポットの移動速度が中央部(X=O)の付近
よりも速くなってしまう。そのため、泳動部5の試料か
ら検出される蛍光の検出感度に、中央部と端部とでは差
が生することになる。このため、ここでは、泳動部5の
ゲル上でレーザのスポット光の移動速度が等速となるよ
うに、振動ミラーを駆動する速度を補正制御する。すな
わち、スポット光の位置Xに対するミラーの角度θの関
係は、第7図に示すような関係となり、振動ミラーの回
転中心と泳動部5の中央部との距離Zを用いて、次式で
表される。
θ= t a n−’X、/ Z ここで、Zは振動ミラー22の回転中心から泳動部5の
ゲルまでの距離であり、又は振動ミラー22の回転中心
から泳動部5のゲルの面に垂線を下ろした点を原点とす
るゲルの面方向の距離である。
この種の光走査機構における回転角と移動距離との間の
補正方法には、fθレンズを用いる方法があるが、fθ
レンズは高価であり、また、fθレンズを装着するため
装置が大きくなるので、ここでは、光走査機構の振動ミ
ラー回転角と移動距離との間の補正を、ミラードライバ
30に、振動ミラー22の回転角速度を可変制御する制
御回路を備え、振動ミラー22の回転駆動速度を補正制
御することにより行う。
第8図は、振動ミラーを回転駆動制御するミラ−ドライ
バの制御回路の要部構成を示すブロック図である。振動
ミラーのアクチエエータとしては直線モータを用いてお
り、振動ミラーの回転角制御は、回転角対応に比例した
電圧を印加することによって制御できる。ゲルの照射面
においてレーザのスポット光が等速で移動するためには
、照射面の距離Xと時間tが比例関係となるように制御
すればよい。振動ミラーの回転角θとスポットの移動距
離Xとの関係は、第7図に示すような関係となっている
ので、第7図のグラフの横軸を時間軸、縦軸を電圧軸に
対応させた電圧波形の信号を発生させ、これを振動ミラ
ーを駆動する駆動制御信号とする。このような駆動制御
信号の発生は。
ミラードライバ30における制御回路により行い、発生
した駆動制御信号を振動ミラー22に供給して、振動ミ
ラー22の駆動制御を行う。
ミラードライバ30は、第8図に示すように、関数波形
を記憶した読み出し専用メモリ30aと、読み出した関
数データを電圧信号に変換するデジタル・アナログ変換
回路30bと、変換された電圧信号を増幅して駆動制御
信号として出力するトライバ30cと、メモリに対し時
系列的に読み呂しアドレスを与えるカウンタ30dと、
カウンタにクロック信号を与える発振回路30eから構
成されている。
計測部本体の制御回路27からの指示により発振回路3
0eが動作し、発振回路30eからのクロック信号が、
カウンタ30dに入力される。カウンタ30dはクロッ
ク信号をカウントし、読み出し専用メモリ30aに供給
する読み出しアドレスを時系列的に発生する。カウンタ
30dにより発生された読み出しアドレスが時系列的に
読み出し専用メモリ30aに供給されると、読み出し専
用メモリ30aから予め記憶されている関数データが順
次に読み出される。読み出し専用メモリ30aには、予
め振動ミラーの回転角に関する関数データ(第7図)が
書き込んであり、このような関数データが時系列的に読
み出される。この例では、関数データのビット数は、1
2ビツトとしている。読み出された関数データは、ディ
ジタル・アナログ変換回路30bにおいて振動ミラーの
回転角を制御するアナログ信号の電圧信号に変換される
。この電圧信号は、ドライバ30cにおいて、ステップ
状のノイズをフィルタリングし、更に電力増幅して、駆
動制御信号として、振動ミラー22に供給される。これ
により、泳動部におけるレーザ光のスポット光の移動速
度(スキャン速度)が一定となるように、所望の回転角
速度で振動ミラーを振動させることができる。
また、ここでのスキャン速度は、対数的にほぼ等分とな
るように、0,5.1.2.5.10.20.50゜1
00、200Hzで可変できるようにしである。これは
、電気泳動する試料に標識した蛍光物質の量や蛍光物質
の量子収率の差に応じて、読み取り速度を変えられるよ
うにし、効率的に読み取りを行うためである。この場合
のスキャン速度の指定は、操作表示パネル7bまたは、
データ処理装置8から指定することが可能であり、制御
回路27からミラードライバ30に指示が送られ、カウ
ンタ30dおよび発振回路30eを制御して、所望のス
キャン速度で振動ミラー22を駆動させる。
このようにして、振動ミラー22の駆動制御により、光
源21からのレーザ光がスキャンされ、泳動部5におい
ては一定速度で移動するスポット光として照射される。
これにより、レーザ光の照射光により照射された部分に
ある泳動部5のゲルの蛍光物質が励起され、蛍光13を
発する(第2図)。
第9図は、ゲルから発生する蛍光を受光するための集光
器および光電変換部の要部の構成を光路を中心に示す図
である。
前述したように泳動部のゲル5aは、ガラスのゲル支持
体5b、5cに挾まれて支持されている。
ここでのゲル支持体5b、5cとして、この例の泳動部
5では、ゲル支持体5b、5cに硼素e酸ガラスを使用
している。この他にゲル支持体5b。
5cには、石英ガラスや各種光学ガラスなどが利用され
る。
泳動部5では、スキャンされ移動するレーザビーム31
の照射光が照射されると、このレーザビーム31の照射
光はゲル支持体5b、Scを厚み方向に透過し、ゲル5
aに到達する。ゲル5aについてもその厚み方向にレー
ザビーム31の照射光が進行する。ゲル支持板5b、5
cおよびゲル5aの厚みは、それぞれ約5ffll!お
よび約0.35mとなっており、ゲル支持板5b、5c
およびゲル5aの厚み方向に照射されるレーザビーム3
1の照射光は、泳動部5のどの位置においてもゲルに到
達する光の強度は概ね等しい。また、ゲル5aおよびゲ
ル支持体5b、5cの照射光の入射面で発生する光散乱
によるレーザビーム31の広がりや強度減少も、厚み方
向に照射光を入射しているため、大幅に少なくなる。な
お、ゲルを透過したレーザビーム31は、迷光として悪
影響を与えないように光トラップ32に入り減衰させら
れる。
このようにスキャンされ、ゲルSa内から発生する蛍光
13は、励起光による散乱光などと共に集光器23で集
められる。ゲル支持体5b、5cにおいて発生する散乱
光は受光経路の空間的位置関係により幾何光学的に分離
し、ゲルからの蛍光を光電変換部24に送る。光電変換
部24においては、ゲル内において発生する散乱光と蛍
光を光学フィルタを用いて分離し、光電子増倍管で電気
信号に変換される。集光器23および光電変換部24の
光学系の詳細な構成を第9図に示す。
第9図を参照すると、泳動部5からの蛍光13およびゲ
ル支持体5b、5cから発生する励起光の散乱光は、シ
リンドリカルレンズ23aに到達し、散乱光および蛍光
が、第9図に示すように、シリンドリカルレンズ23a
の反対側に結像する6図中A点はゲル5aからの蛍光1
3およびゲル5aの表面で発生する励起光の散乱光に対
する焦点である。
また、ゲル支持体5b、5cの表面において発生する励
起光の散乱光は、焦点A′点に結像する。
ここで光ファイバアレイ23bは、ゲル5aからの蛍光
を受光するようにその結像点Aの位置に配設することで
、受光経路の空間的位置関係により幾何光学的に分離さ
れ、ゲル支持体からの散乱光を分離することができる。
このように照射光を厚み方向に照射する方法では、ゲル
と、ゲル支持体であるガラスの屈折率が1.4前後と比
較的近いことと、ゲルとゲル支持体のガラスの境界面が
非常に密着していることにより、この境界面において発
生する散乱光は非常に少ない。したがって、A点で受光
する光は、ゲル5aの表面で発生ずる励起光の散乱光は
少なく、ゲル5aからの蛍光13のみが大きく受光され
る。
また、ゲル支持体5b、5cの何れか、または両方を取
り外してゲル5aに対して直接に照射光をスキャンさせ
る場合には、上述のようなゲル支持体において発生する
量とほぼ同じの量の散乱光がゲル表面から発生するが、
この場合には、計測部本体7の読み取り台フCのゲルの
載置ガラスを厚みにより、ゲル支持体のガラスと同様な
効果があるので、検出感度が低下することなく、ゲル面
からの蛍光が確実に検出できる。なお、特にこの時点に
おいて、ゲル5aに対して色素を着色する処理などを行
うためにゲル支持体5b、Scの取り除きが必要のない
場合には、ゲル支持体5b。
5cをつけたままで、ゲル5aの読み取りを行う方が信
号対雑音比を向上させることができる。
光ファイバアレイ23aにより集光された蛍光は、光フ
アイバ内を導かれ、光電変換部24に入力される。光電
変換部24に入力された蛍光は、第1のレンズ24a、
絞り24b、第2のレンズ24Cを用いて並行光成分の
みを取り出し、光学フィルタ24dに入射する。そして
、光学フィルタ24dにより散乱光の成分を除いて、更
に第3のレンズ24eで集光して光電子像倍管24fに
導ぎ、検出された蛍光を電気信号に変換する。このよう
に、光電変換部24では、光学フィルタ24dの波長分
離性能を向上するために入射する光を、第2のレンズ2
4cにより並行光成分のみとし、光学フィルタ24dに
直角に入射させる。そして、光学フィルタ24dにより
ゲル内に於て発生する励起光の散乱光を分離して。
信号対雑音比を向上させ、第3のレンズ24eで集光し
て光電子像倍管24fに導く。
このように集光器23、光電変換部24を通して、検出
する蛍光の受光感度を高くし、更に受光した蛍光を電気
信号に変換し、変換した電気信号を増幅器25に入力す
る。増幅器25において増幅された電気信号は、アナロ
グ・ディジタル変換回路26に入力されて、ディジタル
データに変換される6デイジタルデータに変換された蛍
光検出信号はメモリ28に記憶され、メモリ28に記憶
されたデータがインタフェース回路29を通してデータ
処理装置8に送られる。このような一連の信号処理の全
体の制御は、制御回路27が行う。
次に、本実施例にかかる電気泳動パターン読み取り装置
装置における各部の構成要素の変形例について説明する
上述した実施例の説明において、計測部本体フにおける
光走査構構として、読み取り走査のためのレーザビーム
のスキャン方法を振動ミラー22を用いるスキャン方法
としているが、これに替えて、回転多面体ミラーを用い
るスキャン方法9ロ転する回折格子を用いたスキャン方
法、または音響光学効果による回折を用いたスキャン方
法などが利用できる。この場合、回転多面体ミラーを用
いるスキャン方法、屈折および干渉などの光学的性質を
利用するスキャン方法など、スキャンするレーザ光の光
軸の方向を変える光走査機構ならば、どのような機構を
用いるようにしてもよい。
また、本実施例では、蛍光物質で標識した試料に励起光
を与えるための光源21として、半導体レーザを使用し
、発振したレーザ光によりYAGロッド21eを励起し
、YAGロッド21eから発生する11064nの蛍光
を得て、更に非線形光学結晶21gで第2高調波の波長
の約532nmのレーザ光を得る光源装置(第5図)を
用いているが、これに替えて、例えば、第10図に示す
ように、半導体レーザ21bからの発振されたレーザ光
を第1の光学レンズ21cおよび第2の光学レンズ21
dにより集光した後、直接的に非線形光学結晶21gに
入射して、高調波のレーザ光を得るようにしてもよい。
この場合、非線形光学結晶21gの光変換の効率が悪く
なるが、例えば、非線形光学結晶の2次高調波では、入
力パルス強度のべき乗に比例した出力が得られるため、
パルス励起にしてパルスのピーク値を高くすることによ
り、変換効率を高くすることにより対応できる。すなわ
ち、平均パワーが同じである場合、連続光励起よりもパ
ルス励起にしてパルスのピーク値を高くする方が効率が
よく、これにより、光源装置を第10図に示すような構
成とし、半導体レーザをパルス励起して用いることによ
り、同等なレーザ光を発光する光源装置を得ることがで
きる。また、照射光がパルス性のレーザ光である場合、
ゲルからの検出される蛍光を受光する側の処理で、照射
光のパルス周期よりも長い時間だけ受光信号を蓄積また
は積分することにより、同様の蛍光の検出出力を得るこ
とができる。ここでの半導体レーザ21bは、約830
nm中心の発振波長を持つ半導体レーザを用い、非線形
光学結晶21gとしてKTP (KTio p o4)
を用いているが、これに替えて、非線形光学結晶21g
にLiNb○、を用い、その第2高調波として波長41
5nmのレーザ光を得るような構成とすることができる
。なお、非線形光学結晶21gとしてL x N b 
O3を用いることにより、波長340〜430nm前後
まで第2高調波を得ることが可能である。
波長340〜430nm前後までのレーザ光を励起光と
して照射する場合には、試料の標識に用いる蛍光色素と
しては、ルシファーイエローや、ユーロピウムの錯体[
Eu−(β−NTA)3; NTAはナフトイルトリフ
ルオロアセトン]、ポルフィリンとその誘導体などが使
用できる。
また、その他に、このような非線形光学物質として、β
−BaB204を用いることができる。
なお、光源装置に用いる光学ロッドとしては、前述のY
AGロッド(イツトリウム、アルミニウム、ガーネット
の結晶)の他に、ネオジウムを拡散したイツトリウム、
リチウム、フッ素の結晶の光学ロッドなどを用いること
できる。
第11図は、集光器の他の実施例の要部の構成を説明す
る図である。第11図に示す集光器の構成は、泳動部5
からの蛍光13とゲル支持体5b。
5cからの散乱光を幾何光学的に分離するのに凹面シリ
ンドリカルミラー23cを用いる構成となっている。光
源からのレーザビーム31は、第9図に示した集光器の
構成と同様に、図の表面から裏面への方向にスキャンし
ているものとする。ゲル内から発生する蛍光13は、凹
面シリンドリカルミラー230によりスキャン方向に長
く集光される。集光された光は、光ファイバアレイ23
dに導かれて、光電変換部24に供給さ才しる。この場
合、凹面シリンドリカルミラー23cでは、検出すべき
蛍光は焦点へ1点に集光され、光ファイバアレイ23d
に導かれるが、ゲル支持体5b、5eからの散乱光は、
焦点A1点から離れた点(図示せず)に集光するため幾
何光学的に、蛍光を散乱光から分離することができる。
このような凹面ミラーを用いた方法では、反射が1回の
みであるため光の損失が少ないという特徴を持つ。
第12図および第13図は、光走査機構の他の実施例を
説明する図である。第12図に他の実施例にかかる光走
査機構の全体の概略の構成を示し、第13図に光走査機
構のセンサヘッド部の構成を示す。
第12図において、5は泳動部であり、この泳動部5の
ゲル5aに対して蛍光を励起させる励起光を照射し、ゲ
ル5aからの蛍光を検出する。このため、ガイドレール
を兼ねたヘッド駆動機構のシャフト32.センサヘッド
34が設けられる。センサヘッド34は、光源からの光
を導きゲルに照射する光照射部とゲルから受光した蛍光
を集光する集光部とが一体に構成されており、光ファイ
バ33aにより光源からの照射光の供給を受け、光ファ
イバ33bにより検出した蛍光を出力する。センサヘッ
ド34はシャフト32に移動自在に装着されており、シ
ャフト32の回転によりセンサヘッド34がシャフト上
を摺動しながら左右に移動する。これにより、泳動部5
に対して、照射光をスキャンし、泳動部5のゲルからの
蛍光を検出する。なお、シャフト32は泳動部5の光照
射面に対して平行に配設されており、センサヘッド34
の照射光の出口および受光口が泳動部5に対面するよう
に配設される。
第13図は、センサヘッド34の構成を示す図である。
センサヘッド34の構成は、図示するように、光入力用
の光ファイバ33aから導入される光源の光が、端部が
凸レンズ仕上げとなっている光源ファイバ34eに導か
れて、凸レンズ部の端部から泳動部5に照射される。こ
の光源ファイバ34cの凸レンズ部の光出力端は、泳動
部5内のゲル5aにおいて焦点を結ぶように調整しであ
る。これにより、レーザビーム31のスポット光がゲル
5aに照射される。ゲル5a内から発生した蛍光13は
、円形の凸レンズ34aで集光される。凸レンズ34a
の集光点Bには、集光ファイバ34bの受光口が設定さ
れており、集光ファイバ34bにより集光した蛍光が、
光出力用の光ファイバ33bに導かれて、光電変換部2
4へ供給される。なお、ゲル支持体5b。
5cからの散乱光は、前述の実施例の場合ど同様に、受
光経路の空間的位置関係により幾何光学的に別の位置に
結像するので、蛍光からは分離されて、集光ファイバ3
4bからは集光されない。
第14図は、センサヘッド34の他の変形例の構成を示
す図である。この例のセンサヘッド34の構成は、図示
するように、蛍光の集光用の凸レンズに替えて円形の凹
面ミラー34dを蛍光の集光に用いる構成としたもので
ある。光入力用の光ファイバ33aから導入される光源
の光が、端部が凸レンズ仕上げとなっている光源ファイ
バ34cに導かれて、凸レンズ部の端部から泳動部5に
照射される。
これにより、レーザビーム31のスポット光がゲル5a
に照射される。この光照射によってゲル5a内から発生
した蛍光13は、円形の凹面ミラー34dにより集光さ
れる。凹面ミラー34dの集光点B′には、集光ファイ
バ34bの受光口が設定されており、集光ファイバ34
bにより集光した蛍光が、光出力用の光ファイバ33b
に導かれて、光電変換部24へ供給される。なお、ゲル
支持体5b、5cからの散乱光は、前述の場合と同様に
、受光経路の空間的位置関係により幾何光学的に別の位
置に結像するので、蛍光からは分離されて、集光ファイ
バ34bからは集光されない。
このような構成の光走査機構においては、センサヘッド
34は、シャフト32の回転により一定の移動速度で左
右に移動させて走査することができるので、前述のよう
な泳動部5の中央部と両端とで移動速度に差が生ずるこ
とがなく、このため、泳動部5の試料から検出される蛍
光の検出感度に差が生ずることはない。
また、前述の実施例のように、光走査機構として、振動
ミラーまたは回転多面体ミラーを用いるような構成の場
合には、ミラーの回転角速度と泳動部の走査面の移動速
度とが比例関係になく、泳動部5の試料から検出される
蛍光の検出感度に、中央部と端部とで差が生ずることに
なる。このため、前述の実施例の場合には、振動ミラー
のミラードライバに回転角速度の補正制御回路を設ける
構成としたが、これに替えて、蛍光の検出感度特性を補
正することにより、検出された蛍光の電気信号をデータ
処理する場合に、データ処理の段階で補正を行うように
してもよい。すなわち、この場合には、等速度(回転角
速度)でミラーをスキャンし、読み取られた蛍光の強度
を、第15図に示すような関数の特性により、各々の蛍
光の検出位置Xに対応して重み付けを行い、読み取られ
た蛍光の強度を補正する。
以上に説明した実施例における電気泳動パターン読み取
り装置では、泳動部5を電気泳動ユニット、1から取り
外し、泳動部5を読み取りユニット6に装着し、読み取
りユニット6において泳動部5の蛍光標識した電気泳動
パターンを読み取る装置構成となっているが、特に、電
気泳動ユニット1において泳動部5に対して電気泳動を
行いながら、同時に、蛍光物質の分布を読み取れるよう
に、読み取りユニットを構成してもよい。この場合の読
み取りユニットは縦型となり、電気泳動ユニットの全体
が装着できる構造とする。この場合にも読み取りユニッ
トは、光走査機構が泳動部のゲルに対して、光源からの
照射光を走査してゲルの厚み方向に照射し、集光器では
、照射光の光軸とは異なる方向に受光面を設定して受光
経路の空間的位置関係により、ゲル内の試料の蛍光物質
から発生した蛍光を、照射光によりゲル支持板から発生
する散乱光から分離して、電気泳動パターンを読み取る
ことになる。
第16図は、泳動部に対して電気泳動を行いながら同時
に蛍光の分布の読み取るを行う変形例の電気泳動パター
ン読み取り装置の構成を示すブロック図ある。
第16図に示す電気泳動パターン読み取り装置のブロッ
ク図において、各部の要素は、第1図および第2図によ
り説明したものとを同様な要素であり、同じ参照番号を
付けて示している。
この例における読み取りユニットにおいては、泳動部ユ
ニットが装着される電気泳動ユニットの全体が、当該読
み取りユニットに装着される構成となる。この読み取り
ユニットは、全体の構成が電気泳動読み取り処理部45
および信号処理部46とに分けられて構成されている。
電気泳動ユニット1が装着される電気泳動読み取り処理
部45は、この電気泳動ユニット1の泳動部5に対して
、蛍光の励起光を照射する光源21.光源21からの光
をスキャンさせるための振動ミラー22.振動ミラー2
2を駆動するミラードライバ30.泳動部5のゲルから
発生する蛍光13を集光するための集光器23.および
、光電変換部24から構成される。それぞれの構成要素
については、前述の第2図における要素と同様なもので
あり、また、同様に動作するものなので、詳細な説明は
省略する。
電気泳動読み取り処理部45からの電気信号に対する信
号処理を行う電気信号処理部46は、電気信号を増幅す
る増幅器25.増幅器25により増幅された電気信号を
ディジタルデータに変換するアナログ・ディジタル変換
回路26.ディジタルデータに変換された蛍光の検出信
号を一時的に記憶するメモリ28.メモリ28に記憶さ
れたデータを送呂するインタフェース29.および、一
連の信号処理の全体の制御を行う制御回路27から構成
される。これらの各々の構成要素は、前述の第2図にお
ける要素と同様なものであり、また、同様に動作するも
のなので、詳細な説明は省略する。
このように構成された電気泳動パターン読み取り装置に
おいては、読み取りユニットに、泳動部5を装備した電
気泳動ユニット1の全体が装着され、電気泳動ユニット
1においてゲルの電気泳動を行いながら、電気泳動され
た泳動パターンの蛍光を読み取ることになる。
このように構成された変形例の電気泳動パターン読み取
り装置(第16図)においては、電気泳動を行っている
ゲルの側面よりレーザビームを入射する横入射方式の電
気泳動パターン読み取り装置(従来例:第18図)と異
なり、ゲルの厚み方向に光を照射するため、ゲルにより
散乱の影響を受けにくく、また、レーザビームを横入射
する場合のように、ゲルの厚み約0.35mnの中心位
置に光ファイバ12(第]、8図)の光入射口を合わせ
るような位置合せの困難性はなく、セツティングが容易
である特徴も持っている。この場合においても、光源、
光走査機構、集光器などにおいて、前述のような各々の
構成要素の変形例の別異の例を適用できる。
以上、本発明を実施例にもとづき具体的に説明したが、
本発明は、前記実施例に限定されるものではなく、その
要旨を逸脱しない範囲において種々変更可能であること
は言うまでもない。
〔発明の効果〕
以上、説明したように、本発明によれば、蛍光式電気泳
動パターン装置の光源として、半導体レーザを用いるこ
とができ、装置構成が大幅に小型化、軽量化され、かつ
小電力化が可能である。また、ゲルに照射する光をゲル
の厚み方向に照射して集光する集光器においても、装置
構成が大型化されずに、ゲル支持体からの散乱光を確実
に分離することができるので、信号対雑音比を大幅に向
上することが可能である。
【図面の簡単な説明】
第1図は、本発明の一実施例にかかる蛍光式電気泳動パ
ターン読み取り装置の全体の構成を説明する概略構成図
、 第2図は、計測部本体の要部の構成を示すブロック図、 第3図は、計測部本体に装着する泳動部ユニットの装着
位置を説明する図、 第4a図、第4b図、第4c図、および第4d図は、計
測部本体に装着された泳動部ユニットの読み取り走査を
説明する図、 第5図は、計測部本体の光源として半導体レーザを用い
る場合の光源装置の要部の構成を示すブロック図、 第6図は、振動ミラーを用いてゲル面をレーザビームで
スキャンする光走査機構を説明する図、第7図は、振動
ミラーの回転角とレーザビームのスポット光の移動距離
の関係を説明する図、第8図は、振動ミラーを回転駆動
制御するミラードライバの制御回路の要部構成を示すブ
ロック図である。 第9図は、集光器および光電変換部の光学系の詳細な構
成を示す図、 第10図は、計測部本体の光源として半導体レーザを用
いる場合の光源装置の変形例の要部の構成を示ずブロッ
ク図。 第11図は、集光器の他の実施例の要部の構成を説明す
る図、 第12図は、光走査機構の他の実施例の全体の概略の構
成を示す図、 第13図は、光走査機構の他の実施例におけるセンサヘ
ッド部の構成の一例を示す図、第14図は、光走査機構
の他の実施例におけるセンサヘッド部の構成の別の例を
示す図、である。 第15図は、等角速度でミラーをスキャンする光走査機
構によるスキャン補正を信号処理により行う別の実施例
を説明する図、 第16図は、泳動部に対して電気泳動を行いながら同時
に蛍光の分布の読み取るを行う変形例の電気泳動パター
ン読み取り装置の構成を示すブロック図、 ある。 第17図は、従来の蛍光式電気泳動装置の外観を示す斜
視図。 第18図は、泳動計測装置の内部の構成を示すブロック
図。 第19a図および第19b図は、蛍光法による電気泳動
パターン検出の動作原理を示す泳動部の正面図および縦
断面図、 第20a図および第20b図は、泳動計測装置から送呂
されるDNA断片の蛍光強度パターン信号の例を説明す
る図、 第21図は、電気泳動を行ったDNA断片の分布例を示
す図である。 図中、1・・・電気泳動ユニット、2a・・・第1電極
、2b・・・第2電極、3・・・支持板、4・・・電気
泳動用電源装置、5・・・泳動部ユニット(泳動部)、
6・・・読み取りユニット、7・・・計測部本体、8・
・・データ処理装置、9・・・イメージプリンタ、10
・・・制御回路、11・・・光源、12・・・光ファイ
バ、13・・・蛍光、14・・・集光器、15・・・光
学フィルタ、16・・・光センサ、17・・・増幅器、
18・・・アナログ・ディジタル変換回路、19・・信
号処理部、20・・・インタフェース、21・・・光源
、22・・・振動ミラー、23・・・集光器、24・・
・光電変換部、25・・増幅器、26・・・アナログ・
ディジタル変換回路、27・・・制御回路、28・・・
記憶回路、29・・・インタフェース、30・・・ミラ
ードライバ、31・・・レーザビーム、32・・・光ト
ラップ、45・・・電気泳動読み取り処理部、46・・
・信号処理部、51・・・泳動計測装置、51a・・・
扉、51b・・・操作パネル、52・・・データ処理装
置、53・・ケーブル、54・・・計算機本体、55・
・・キーボード、56・・・デイスプレィ、57・・・
プリンタ、63・・・電気泳動部装置、64・・・信号
処理装置、61・光路、62・・走査線、66・・・バ
ンド、71.72.73.47・・・レーン。

Claims (11)

    【特許請求の範囲】
  1. (1)電気泳動を行うベースのゲルおよび該ゲルを支持
    するゲル支持体からなる着脱自在な泳動部ユニットと、
    該泳動部ユニットを装着して蛍光物質で標識した試料を
    与えたゲルに泳動電圧を印加して電気泳動を行う電気泳
    動ユニットと、電気泳動を行った後の泳動部ユニットを
    装着し、泳動部ユニットのゲルに対して、光源からの照
    射光を走査してゲルの厚み方向に照射し、照射光の光軸
    とは異なる方向に受光面を設定して受光経路の空間的位
    置関係により、ゲル内の試料の蛍光物質から発生した蛍
    光を、照射光によりゲル支持板から発生する散乱光から
    分離して、電気泳動パターンを読み取る読み取りユニッ
    トとを備えたことを特徴とする蛍光式電気泳動パターン
    読み取り装置。
  2. (2)読み取りユニットは、半導体レーザ発振器と、光
    の波長を変換する光波長変換手段とを有する光源装置を
    光源として備え、半導体レーザ発振器から発振したレー
    ザ光の第1の波長の光を光波長変換手段に加え、光波長
    変換手段により第1の波長の光を第2の波長の光に変換
    し、波長変換した光をゲルの厚み方向に照射する照射光
    として用いることを特徴する請求項1に記載の蛍光式電
    気泳動パターン読取り装置。
  3. (3)請求項2に記載の蛍光式電気泳動パターン読み取
    り装置において、光波長変換手段は、レーザ光を入射し
    、入射された光で励起され、蛍光を発生する光学ロッド
    であることを特徴とする蛍光式電気泳動パターン読み取
    り装置。
  4. (4)請求項2に記載の蛍光式電気泳動パターン読み取
    り装置において、光波長変換手段は、レーザ光を入射し
    、入射された光の高調波を発生する非線形光学物質であ
    ることを特徴とする蛍光式電気泳動パターン読み取り装
    置。
  5. (5)読み取りユニットは、光源と、光源から発光され
    た光を走査してゲルの厚み方向に照射光として照射する
    光走査機構と、ゲル内の試料の蛍光物質から発生した蛍
    光を集光して受光する集光器とを備え、該集光器は、照
    射光によりゲル支持体から発生する散乱光と、ゲル内に
    分布する蛍光物質で標識した試料から発生する蛍光とを
    、受光経路の空間的位置関係により分離する光学系を有
    することを特徴とする請求項1に記載の蛍光式電気泳動
    パターン読み取り装置。
  6. (6)読み取りユニットは、照射光を発光する光源と、
    装着した泳動部ユニットのゲルに対して照射する照射光
    を一次元的に走査する光走査機構と、ゲル内の試料の蛍
    光物質から発生した蛍光を集光して受光する光学レンズ
    系および光ファイバアレイを有する集光器とを備え、光
    走査機構により照射光を一次元的に走査して、ゲルの厚
    み方向に光を照射し、照射した光によりゲル内に分布す
    る蛍光物質で標識した試料から発生する蛍光を、集光器
    の光学レンズ系および光ファイバアレイにより、照射光
    の散乱光から分離して受光することを特徴とした請求項
    1に記載の蛍光式電気泳動パターン読み取り装置。
  7. (7)読み取りユニットは、照射光を発光する光源と、
    装着した泳動部ユニットのゲルに対して照射する照射光
    を一次元的に走査する光走査機構と、ゲル内の試料の蛍
    光物質から発生した蛍光を集光して受光する光学ミラー
    系および光ファイバアレイを有する集光器とを備え、光
    走査機構により照射光を一次元的に走査して、ゲルの厚
    み方向に光を照射し、照射した光によりゲル内に分布す
    る蛍光物質で標識した試料から発生する蛍光を、集光器
    の光学ミラー系および光ファイバアレイにより照射光の
    散乱光から分離して受光することを特徴とした請求項1
    に記載の蛍光式電気泳動パターン読み取り装置。
  8. (8)読み取りユニットは、装着した泳動部ユニットの
    ゲルに対して照射する照射光を一次元的に走査する光走
    査機構とゲル内の試料の蛍光物質から発生した蛍光を受
    光する集光器が一体に構成されたセンサヘッドを有し、
    センサヘッドの走査により、光源からスポット光とした
    照射光を1次元的に走査してゲルに照射し、集光器が走
    査されたスポット光の照射光による蛍光を、受光口の配
    設空間位置関係により照射光によるゲルの支持体から発
    生する散乱光とゲル内に分布する蛍光物質で標識した試
    料から発生する蛍光とを分離し、光ファイバアレイによ
    り受光した蛍光を集光して光電変換部に導出することを
    特徴とした蛍光式電気泳動パターン読み取り装置。
  9. (9)請求項5に記載の蛍光式電気泳動パターン読み取
    り装置において、光走査機構は、振動ミラーと、該振動
    ミラーを駆動制御信号により駆動制御するミラードライ
    バとを備え、ミラードライバに、ゲル上を走査して照射
    するスポット光の移動走査速度がゲル上で等速となる駆
    動制御信号を発生する制御回路を備えることを特徴とす
    る蛍光式電気泳動パターン読み取り装置。
  10. (10)読み取りユニットは、装着した泳動部ユニット
    のゲルに対して照射する照射光を一次元的に走査する光
    走査機構と、ゲル内の試料の蛍光物質から発生した蛍光
    を集光して受光する集光器と、ゲル上の照射光のスポッ
    ト光の移動速度変化による受光する蛍光の強度を補正す
    る補正処理手段とを備え、光走査機構により照射光を一
    次元的に走査してゲルの厚み方向に光を照射し、照射し
    た光によりゲル内に分布する蛍光物質で標識した試料か
    ら発生する蛍光を、集光器により照射光の散乱光から分
    離して受光し、補正処理手段によりゲル上に照射される
    スポット光の移動速度変化により受光する蛍光強度を補
    正して読み取ることを特徴とした請求項1に記載の蛍光
    式電気泳動パターン読み取り装置。
  11. (11)電気泳動を行うベースのゲルおよび該ゲルを支
    持する光学的に透明なゲル支持体からなる着脱自在な泳
    動部ユニットと、泳動部ユニットを装着し、蛍光物質で
    標識した試料を与えたゲルに泳動電圧を印加して電気泳
    動を行う電気泳動ユニットと、電気泳動ユニットに泳動
    部ユニットを装着し電気泳動を行いながら、泳動部ユニ
    ットのゲルに対して、ゲルの厚み方向に光を照射し、ゲ
    ル内の試料の蛍光物質から発生した蛍光を受光して、電
    気泳動パターンを読み取る読み取りユニットとを備えた
    ことを特徴とする蛍光式電気泳動パターン読み取り装置
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