JPH03147792A - 新規dna及び該dnaを含有するプラスミド - Google Patents

新規dna及び該dnaを含有するプラスミド

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JPH03147792A
JPH03147792A JP28287389A JP28287389A JPH03147792A JP H03147792 A JPH03147792 A JP H03147792A JP 28287389 A JP28287389 A JP 28287389A JP 28287389 A JP28287389 A JP 28287389A JP H03147792 A JPH03147792 A JP H03147792A
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plasmid
promoter
base sequence
dna
dna fragment
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JP28287389A
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Kazuhisa Hatakeyama
和久 畠山
Yasurou Kurunushi
泰朗 久留主
Hideaki Yugawa
英明 湯川
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Original Assignee
Mitsubishi Petrochemical Co Ltd
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 本発明は新規なりNAに関し、更に詳しくは、コリネ型
細菌細胞内でプロモーターとして機能する新規なりNA
、及び該DNAを含有するコリネ型細菌細胞内で自律増
殖可能なプラスミドに関する。
ブレビバクテリウム属細菌を含むコリネ型細菌は、アミ
ノ酸、有機酸、プリンヌクレオチド等を゛生産する工業
的に有用な微生物であるが、組換えDNA技術の導入に
よる苗株の育種改良は、エシェリヒア・コリ(Esch
erichia coli)等に比べて遅れている。特
に、挿入された有用遺伝子の発現のために必要なプロモ
ーターの構造についてはこれまで明らかにされておらず
、コリネ型細菌を宿主として用いて有用遺伝子を発現さ
せようとする場合にはかなり問題となっている。
一般に、プロモーターの構造に関しては、エシェリヒア
・コリ及びバチルス・サブチリス(Bacilus 5
ubtiris)由来のプロモーターが最もよく知られ
ており、該プロモーターの特徴的な塩基配列は既に報告
されている。それらは転写産物であるメツセンジャーR
NAの開始点から上流のlO塩基付近及び35塩基対付
近に見られる塩基配列であり、RNAポリメラーゼの種
類に依存して、例えば以下に示す配列となっている。
コリネ型細菌では、前述のようにプロモーターの構造に
関する知見が極めて少なく、まt;、上記エシェリヒア
・コリ及びバチルス・サブチリスのプロモーターがコリ
ネ型細菌内で効率良く発現するかについては未だ不明で
ある。
従って、本発明の主たる目的は、有用遺伝子をコリネ型
細菌内で確実に発現せしめるような新規プロモーターを
創製することである。
以上の問題点に対して、本発明者らは鋭意研究した結果
、今回TAGACAで示される塩基配列(a)と、該塩
基配列(a)の15〜20塩基対下流のTATAATで
示される塩基配列(b)とを有することを特徴とするコ
リネ型細菌細胞内でプロモーターとして機能するDNA
断片(c)を創製し、このDNA断片(c)を、コリネ
型細菌内で自律増殖可能なプロモーター検出用ベクター
プラスミドに組み込み、該ベクタープラスミドをコリネ
型細菌内に導入することにより上記DNA断片(c)が
コリネ型細菌内でプロモーターとして機能することを見
い出し、本発明を完成するに至った。
かくして、本発明により提供されるTAGACAで示さ
れる塩基配列(a)と、該塩基配列(a)の15〜20
塩基対下流のTATAATで示される塩基配列(b)を
有するコリネ型細菌内でプロモーターとして機能するD
NA断片(c)は、全長が50〜lOO塩基対より構成
され、両末端に制限酵素の認識部位を有し、その塩基配
列は、TAGACAで示される配列(a)の15〜20
塩基対、好ましくは17〜18塩基対下流にTATAA
Tで示される配列(b)を有する限り特に制限されるも
のではなく、上記した塩基配列(a)及び塩基配列(b
)並びにその位置関係以外の部分はいかなる配列を有し
ていても良い。このDNA断片(c)は、通常用いられ
るDNA合或合成、例えば、ベックマン社製S yst
em −I Plusを用いて合成することができる。
一方、上記DNA断片(c)が組み込まれる「コリネ型
細菌内で自律増殖可能なプロモーター検出用ベクタープ
ラスミド」としては、例えば、コリネ型細菌内で自律増
殖可能なりNA断片(e)と、プロモーターが欠失して
いる発現されるべき遺伝子を含むDNA断片(d)とも
保有するプラスミドが包含される。
コリネ型細菌内で自律増殖可能なりNA断片(e)は、
コリネ型細菌内で自律増殖可能なものである限り特に制
限はなく、要はプラスミドの複製開始点を有するDNA
断片であればよく、複製開始点以外のDNAを含有する
ものであっても特に問題はない。このDNA断片(e)
の具体例としては、例えば、ブレビバクテリウム・スタ
チオニス(Brevibacterium 5tati
onis) I F Ol 2144(FERM  B
P−2515)由来のpBY503プラスミドを制限酵
素K pn Iで切り出すことによって得られる約6k
bのDNA断片が挙げられる。
また、プロモーターが欠失している発現されるべき遺伝
子を含むDNA断片(d)としては、コリネ型細菌、エ
シェリヒア属細菌、シュードモナス属mW等の微生物起
源のものであってもよく、或いは動物又は植物起源のも
のであってもよい。
また、発現されるべき遺伝子産物は、酵素、ペプチド、
蛋白質等である。具体的には、例えば、エシェリヒア・
コリのトランポゾンTn9由来のクロラムフェニコール
アセチルトランスフェラーゼ(cAT)遺伝子を、プロ
モーター機能の評価として用いるDNA断片(d)とし
て挙げることができる。
なおプロモーター検出用ベクタープラスミドには、必要
に応じて、選択マーカーとなる抗生物質耐性を発現する
遺伝子等を更に挿入することができる。
以上に述べた本発明のDNA断片(c)と、発現される
べき遺伝子を含むDNA断片(d)及びコリネ型細菌内
で自律増殖可能なりNA断片(e)等から、コリネ型細
菌内で自律増殖可能なプラスミドは、例えば、以下に述
べる方法で構築することができる。
基本プラスミドとして、コリネ型細菌内で機能するカナ
マイシン耐性遺伝子を担うプラスミドp)(SG298
 (宝酒造製)を用いる。このプラスミドI)HSG2
98を制限酵素HindllIによって開裂させ、その
部位に前記したプロモーター機能の評価に用いることが
できるDNA断片(d)を連結酵素処理により結合させ
る。次に、このプラスミドを制限酵素Kpnlによって
開裂させ、さの部位に前記したコリネ型m苗内で自律増
殖可能なりNA断片(e)を連結酵素処理により結合さ
せ、プロモーター検出用ベクタープラスミドが創製でき
る。さらに、このプロモーター検出用プラスミドベクタ
ーを制限酵素BamHIによって開裂させ、その部位に
前記した合皮DNA断片(c)を連結酵素処理によって
結合させ、本発明のプラスミドを溝築することができる
得られるプラスミドが導入される宿主としては、コリネ
型細菌、殊にブレビバクテリウム・7ラバムBrevi
bacterium flavum  M J −23
3(F ERM  BP−1497)由来菌株を挙げる
ことができる。
本発明のプラスミドの導入に際して、ブレビバクテリウ
ム・フラバムMJ−233由来菌株を宿主として用いる
場合には、本菌株が保有するプラスミドpBY502(
特開昭63−36787号明細書参照)の存在により形
質転換が困難になる場合があるので、そのような場合に
は、本菌株より上記プラスミドpBY502を除去する
ことが望ましい。そのようなプラスミドを除去する方法
としては、例えば、継代培養を繰り返すことにより自然
に失わすことも可能であるし、人為的に除去することも
可能である[Bact、 Rev、、 36.361〜
405 (1972)参照1゜ プラスミドを人為的に除去する方法の一例を具体的に示
せば以下のとおりである。
宿主ブレビバクテリウム・フラバムMJ−233の生育
を不完全に阻害する濃度のアクリジンオレンジ(濃度:
0.2〜50周/m12)もしくはエチジウムプロミド
(濃度二〇、2〜50趨/+112)等を含む培地に、
1ffIQ当り約lO細胞になるように植菌し、生育を
不完全に阻害しながら、約24時間35℃で培養する。
培養液を希釈後寒天培地に塗布し、35℃で約2日培養
する。出現したコ口二一から各々独立にプラスミド抽出
操作を行ない、プラスミドが除去されている株を選択す
る。
この操作によりpBY502が除去されたブレビバクテ
リウム・7ラバムIVfJ−233由来株が得られる。
また、本発明プラスミドの上記の如きコリネ型細菌内へ
の導入は、それ自体既知の方法、例えば、Ca1vin
、 N、M、 and Hanawalt、 P、C,
、Journal ofBacteriology、 
 170 、2796 (1988);1oo、 K、
、 N15hida、 T、 and Izaki、 
K、、 Agricultural and Biol
ogical Chemistry、 52 s 29
3(1988)等の文献に記載の方法により、例えば宿
主微生物にパルス波を通電することにより行なうことが
できる。
次に実施例により本発明をさらに具体的に説明する。し
かしながら、下記の実施例は本発明について具体的な認
識を得る一助としてのみ挙げたものであり、これによっ
て本発明の範囲は何ら限定されるものではない。
実施例1 プロモーター検出用ベクタープラスミドpP R3の遺
戒 (A)プラスミドpBY503の調整ニブラスミドpB
Y503は、ブレビバクテリウム・スタチオニス(Br
evibacterium 5tationis)IF
O12144[昭和63年7月18日工業技術院微生物
工業技術研究所に寄託(微工研条寄第2515号)]か
ら新たに分離された分子量的lOメガダルトンのプラス
ミドであり、特開平1−95785号明細書に記載のプ
ラスミドである。
プラスミドpBY503は次のようにして調製しtこ 
半合成培地A培地[尿素2 g % (N H4)2 
S O47g、に!HPO40,5g、KHzPO40
,5g。
M g S○、Q、5g、FeSO4−7HjO5mg
、MnS 044〜6 H2o  6 Q、酵母エキス
2.5g。
カザミノ酸5gs ビチオン200pg、塩酸チアミン
200μg1グルコース20g1純水!(N112で、
ブレビバクテリウム・スタチオニスIF012144を
対数増殖期後期まで培養し、菌体を集めた。得られた菌
体を10■/−の濃度でリゾチームを含む緩衝液[25
mMトリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、l O
mM EDTA。
50mMグルコース] 20−に懸濁し、37℃で1時
間反応させた。反応液にアルカリ−5DS液(0,2N
  NaOH,1%(v/v)SDSI 40+n12
を添加し、緩やかに混和して室温にて15分間静置した
次に、この反応液に酢酸カリウム溶液[5M酢酸カリウ
ム溶液60m12、酢酸11.5m+2、純水28.5
−の混合液130−を添加し、充分混和してから氷水中
に15分間静置した。
溶曹物全量を遠心管に移し、4℃で10分間、15、o
oOXgの遠心分離にかけ、上澄液を得た。
これに等量のフェノール−クロロホルム液(フェノール
/クロロホルムl/1混和液)を加え懸濁後、遠心管に
移し、室温下で5分間、15.000×gの遠心分離に
かけ、水層を回収した。氷層に2倍量のエタノールを加
え、−20℃で1時間静置後、4℃で10分間、15.
ooOXgの遠心分離にかけ、沈澱を回収した。
沈澱を減圧乾燥後、TE緩衝液[トリスlomM。
EDTA、 ・1mM、H(12にてpH−8,0に調
整]2−に溶解した。溶解液に塩化セシウム溶液[5倍
濃度のTE緩衝液工O〇−に塩化セシウム170gを溶
解]15m12とlO■/−エチジウムブロマイド溶液
l−を加えて、密度を1.392g/−に合わせた。こ
の溶液を12℃で42時間、116、oooXgの遠心
分離を行なった。
プラスミドpBY503は紫外線照射により遠心管内で
下方のバンドとして見い出される。このバンドを注射器
で遠心管の側面から抜きとることにより、プラスミドp
BY503を含む分画液を得た。
次いでこの分画液を等量のイソアミルアルコールで4回
処理してエチジウムブロマイドを抽出除去し、その後T
E緩衝液に対して透析を行なった。
このようにして得られたプラスミドpBY503を含む
透析液に3M酢酸ナトリウム溶液を最終濃度30mMに
添加した後、2@量のエタノールを加え、−20°C1
時間靜置した。この溶液を15゜000Xgの遠心分離
にかけてDNAを沈降させ、プラスミドpBY503を
約50μg得た。
(B)プラスミドpH5G298とプロモーターの欠失
したクロラムフェニコール耐性遺伝子の準備ニ グラスミドpH5G298は、エシェリヒア・コリ内で
複製し、カナマイシン耐性を発現する分子量的1.7メ
ガダルトンのプラスミドであり、市販品として宝酒造よ
り購入可能である。
一方、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラー
ゼ(cAT)GanBlockは、プロモーターの欠失
したトランスポゾンTn9由来のCAT遺伝子を有する
分子量的0.5メガダルトンのDNA断片であり、市販
品としてファルマシアジャパンより購入可能である。
(c)グラスミドpH5G298catの遺戒ニブラス
ミド、)H3G298(宝酒造製)2μgに制限酵素H
1ndlI[(l units)を37℃で30分間反
応させ、プラスミドDNAを部分分解した。
このDNA分解物とCA T G enB 1ockを
混合し、制限酵素を不活化するために6560で10分
間加熱処理した後、該失活溶液中の成分が最終濃度とし
て各々50mM)リス緩衝液pH7,6,10mMMg
CQ、、10mMジチオスレイトール、1mMATP及
びT4リガーゼ1unitになるように各成分を強化し
、16℃で15時間保温した。この溶液を用いてエシェ
リヒア・コリJM109コンピテントセル(宝酒造製)
を形質転換した。
形質転換株は30℃g/−(最終濃度)のクロラムフェ
ニコール、lOOμg/−(最終11&)IPTG(イ
ソグロピルーβ−D−ガラクトピラノシド)、100μ
g/m12(最終濃度)X−gaQ(5−7’ロモー4
−クロロ−3インドリル−β−D−ガラクトピラノシド
)を含むL培地(トリプトンl Og s酵母エキス5
g、NaCQ5g1純水II2、pH7,2)で37℃
にて24時間培養し、生育様として得られた。これら生
育様の、プラスミドをアルカリ−3DS法[T 、 M
aniatis* E 。
F 、F ritsch、  J 、  Saa+br
ook;  “Mo1ecufar  cloning
  (1982)90〜91参照]により抽出した。
CA T GenB 1ockが正しく挿入されている
ことを制限酵素Hindll[、EcoRIおよびK 
pn Iによって切断されるDNA断片の大きさによっ
て確認し、このプラスミドをpH5G298catと命
名した。
(D)プロモーター検出用ベクタープラスミドpp R
3の遺戒: 上記(c)項で得たプラスミドpH3G298catO
,5μgに制限酵素K pn I  (5units)
を37 ’01時間反応させ、プラスミドDNAを完全
に分解した。
前記(A)項で調製したプラスミドpBY503 0.
5qに制限酵素K pn I (5units)を37
00で1時間反応させ、プラスミドDNAを完全に分解
した。
両者のプラスミドDNA分解物を混合し、制限酵素を不
活化するt;めに65℃で10分間加熱処理した後、該
失活溶液中の成分が最終濃度として各々5011Mトリ
ス緩衝液pH7,6、lOmMMgCa、、10mMジ
チオスレイトール、1mMATP及びT4リガーゼ1u
nitになるように各成分を強化し、16℃で15時間
保温した。この溶液を用いてエシェリヒア・コリJM1
09コンピテントセル(宝酒造製)を形質転換した。
形質転換株は50Iig/ml!(最終濃度)のカナマ
イシン、100μg/m12 (最終濃度)IPTG(
イングロビルーβ−D−ガラクトピラノシド)、100
μg/mQ(最終濃度)X−gaQ(5−プロモー4−
クロロ−3インドリル−β−D−ガラクトピラノシド)
を含むL培地(トリプトン10g1酵母エキス5 g、
 NaCff 5 g−純水112.pH7゜2)で3
7℃にて24時間培養し、生育様として得られた。これ
ら生育様のうち、白いコロニーで生育して来たものを選
択し、各々プラスミドをアルカリ−3DS法[T 、 
Maniatis、 E 、 F 、 F ritsc
h、  J 、 Sambrook; “Mo1ecu
lar cloning(1982)90〜91参照]
により抽出した。
(E)複合プラスミドのコリネ型細菌への形質転換: 形質転換には電気パルス法を用いた。ブレビバクテリウ
ム・7ラバム(Brevibacterium fla
vum)MJ−233(FERM  BP−1497)
プラスミド除去様を100−の前記A培地で対数増殖期
初期まで培養し、ペニシリンGを1ユニット/−になる
ように添加し、さらに2時間振盪培養し、遠心分離によ
り菌体を集め、菌体を20m12のパルス用溶液[27
2mM 5ucrose、7mM KH,Po。
1 mM MgC(h : pH7−4]にて洗浄する
。さらに菌体を遠心分離にて集め、5m+2のパルス用
溶液tこ懸濁し、0.75−の細胞と前記(D)項で得
られたDNA#液50−を混合し、水中にて20分間静
置する。シーンパルサー(バイオラド社製)を用いて、
2500ポルト、25μFDに認定し、パルスを印加後
水中に20分間静置する。全量を3m12の前記A培地
に移し30°Cにて1時間培養後、カナマイシン50s
/md(最終濃度)を含む前記A寒天培地に種薯し30
℃で2〜3日間培養する。
出現しt;カナマイシン耐性株より、上記(A)項に記
載の方法を用いてプラスミドを得た。このプラスミドを
各種制限酵素で切断し分子量を測定した。その結果を下
記表1に示す。
表   1 BamHI      1    6.1(9,4)K
pnI       2    3.9(6,0)、2
.2(3,4)S ac I       1    
 6.1(9,4)上記制限酵素により特徴づけられる
プラスミドを“pPR3”と命名した。
実施例2 合成プロモーターのpPR3への導入:プロモーターは
DNA合成装置(B E CKMAN  S yste
m I P 1us)を用いて合成した(その両末端が
BamHI断片になるようにした)。そのDNA断片の
塩基配列を下記に示す。
n          rm GATCCCGAAACTAGACAAGAACCCA
AAAATGATTTATAATTTAGGGCTTT
GATCTGTTCTTGGGTTTTTACTAAA
TATTAAATCC丁AG実施例1で調製したプラス
ミドpPR30,5周に制限酵素B amHI (5u
nits)を37℃で1時間反応させ、プラスミドDN
Aを完全に分解した。
上記合成プロモーターDNAとプラスミドDNA解物を
混合し、制限酵素を不活化するために65℃で10分間
加熱処理した後、該失活溶液中の成分が最終濃度として
各々50ffIMトリス緩衝液pH7,6、l OmM
  MgC(1,,1,0mMジチオスレイトール、1
mM  ATP及びT4リガーゼ1unitsになるよ
うに各成分を強化し、16℃で15時間保温した。この
溶液を用いてエシェリヒア・コリHBIOIコンピテン
トセル(宝酒造製)を形質転換した。
形質転換株は50/4r/d(最終濃度)のカナマイシ
ンを含むL培地(トリプトン10)、酵母エキス5I、
NaCα51.純水112 、 pH7,2)で37℃
にて24時間培養し、生育株として得られた。これら生
育株のプラスミドをアルカリ−5DS法[T、 Man
iatis、 E、F 、 F ritsch、 J 
S ambrook ;  “Mo1ecular a
toning  (1982)90〜91参照]により
抽出した。
得られたプラスミドは実施例1の(E)項に記載の方法
に従い、ブレビバクテリウム・フラバムMJ−233株
(FERM  BP−1497)プラスミド除去様へ形
質転換し、実施例1の(A)項に記載の方法を用いてプ
ラスミドを抽出した。
このグラスミドの制限酵素B amHI SK I’n
 I sS ac I等の制限酵素による切断パターン
によってpPR3に合+ff1DNAが組み込まれてい
ることを確認し、このプラスミドを“pPR3BT2”
と命名した。
実施例3 合成プロモーター強度の測定: 実施例2でpP R3に挿入したプロモーターの強度を
、りaラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(
cAT)の活性を測定することによって調べた。
pP R3を保有するブレビバクテリウム フラバムM
J−233株とpPR3BT2を保有するブレビバクテ
リウム・フラバムMJ−233株をそれぞれ、実施例1
の(A)項に記載の半合成培地Aにカナマイシンを50
μg/l1112加えた培地10m12の入った試験管
で一晩前培養し、その培養液を上記の培地100−の入
った三角フラスコで約6時間培養後集菌し、活性測定に
用いt;。CATの活性はW、V、Shawらの方法[
J 、 B acteriologyJan、 (19
68) 28〜36参照]により測定した。その結果、
pPR3BT2を有するMJ−233株は、プロモータ
ーの挿入されていないpPR3を有するMJ−233株
の約14倍のCAT活性をもっていI;。

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1、TAGACAで示される塩基配列(a)と、該塩基
    配列(a)の15〜20塩基対下流のTATAATで示
    される塩基配列(b)とを有することを特徴とするコリ
    ネ型細菌細胞内でプロモーターとして機能するDNA断
    片(c)。 2、請求項1記載のDNA断片(c)と、DNA断片(
    c)の下流に直接接続されている発現されるべき遺伝子
    を含むDNA断片(d)とを保有することを特徴とする
    コリネ型細菌細胞内で自律増殖可能なプラスミド。 3、コリネ型細菌細胞内で自律増殖可能なプラスミドp
    BY503由来のものである請求項2記載のプラスミド
    。 4、遺伝子(d)が酵素、蛋白質又はペプチドをコード
    する遺伝子である請求項2記載のプラスミド。
JP28287389A 1989-11-01 1989-11-01 新規dna及び該dnaを含有するプラスミド Pending JPH03147792A (ja)

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