JP2000050869A - グルコノバクター属細菌由来プラスミド及びベクター - Google Patents
グルコノバクター属細菌由来プラスミド及びベクターInfo
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Abstract
有用な新規なプラスミド及び該プラスミドを利用したシ
ャトルベクターを提供する。 【解決手段】 大きさが約5.6kbであるグルコノバ
クター オキシダンスIFO3171株由来の内在性プ
ラスミド又はその一部とエシェリヒア属細菌で自律複製
可能なプラスミド又はその一部を連結し、グルコノバク
ター属細菌及びエシェリヒア属細菌で自律複製可能なシ
ャトルベクターを構築する。。
Description
bであるグルコノバクター オキシダンスIFO3171株由
来の内在性プラスミドpAG5、及び該プラスミドとエシェ
リヒア属細菌由来のプラスミドから構築されるシャトル
ベクターに関するものである。本シャトルベクターは、
グルコノバクター属細菌における遺伝子組換え操作に有
用である。
トールからD−キシルロースやキシリトールを生産する
等、産業上有用な微生物である。この菌からさらに優良
な菌株の育種を行うためには、遺伝子組換え技術を用い
るのが一つの有効な手段である。グルコノバクター属細
菌を用いて遺伝子組換えを行うためには、目的菌の宿主
−ベクター系を開発することがまず必要となる。また一
方で、グルコノバクター属細菌の遺伝子組換え操作を行
う際に、グルコノバクター属細菌のみならず他の宿主細
胞、例えば大腸菌(エシェリヒア コリ(Escherichia c
oli))内でも複製可能なプラスミドベクター(以下、
「シャトルベクター」という。)を得ることができれば
大変便利である。
のプラスミドあるいはそれを用いたベクターとしては、
発酵工学第61巻15-18頁(1983年)、特開昭59-1628
83号公報、欧州特許出願公開EP 0381027号、WO 95/2322
0号国際公開パンフレット等に報告されている。特に、
発酵工学第61巻15-18頁(1983年)には、グルコノ
バクター オキシダンス(Gluconobacter oxydans)IFO
3171株が大きな(約26メガダルトン)一種類のプラスミ
ドを有していると報告している。
クター属細菌の遺伝子組換え操作に有用な新規なプラス
ミド及び該プラスミドを利用したシャトルベクターを提
供することを課題とする。
を解決するために鋭意検討を行った結果、グルコノバク
ター オキシダンスIFO3171株が新規の内在性プラスミ
ドを保有していることを見出し、本発明を完成するに至
ったものである。
6kbであるグルコノバクター オキシダンスIFO3
171株由来の内在性プラスミド、またはその誘導体で
あってグルコノバクター属細菌で自律複製可能なプラス
ミド。(2)配列番号1に示す塩基配列を有する(1)
記載のプラスミド、(3)前記(1)又は(2)に記載
のプラスミド又はその一部とエシェリヒア属細菌で自律
複製可能なプラスミド又はその一部から構築され、グル
コノバクター属細菌及びエシェリヒア属細菌で自律複製
可能なシャトルベクター、(4)エシェリヒア属細菌で
自律複製可能なプラスミドがpUC18である(3)に
記載のシャトルベクター、および(5)pSG8または
pSG6のいずれかである(4)に記載のシャトルベク
ター、である。
本発明の新規プラスミドは、グルコノバクター オキシ
ダンスIFO3171株から調製することができる。I
FO3171株は、(財)発酵研究所(〒532-8686日本
国大阪市淀川区十三本町2-17-85)から何人も取得する
ことができる。
培養し、得られた菌体から通常のプラスミドDNAの調
製法、例えばアルカリリシス法(Nucl. Acids Res. 7,
1513(1979))によって細胞質のDNA画分を調製すれ
ば、本発明のプラスミドが得られる。さらに、前記DN
A画分を、EtBr−CsCl平衡密度勾配遠心法、ア
ガロースゲル電気泳動等によって精製してもよい。
発明のプラスミドは、大きさが約5.6kbであり、pA
G5と命名された。pAG5は、その大きさから、発酵工学第
61巻15-18頁(1983年)に報告されているグルコノ
バクター オキシダンスIFO3171株由来のプラスミド
(約26メガダルトン)とは明らかに異なる新規なプラス
ミドである。pAG5の制限酵素地図を図1に、塩基配列を
配列表の配列番号1に示す。尚、配列番号1に示した塩
基配列は、pAG5の制限酵素HindIII認識部位を5’末端
として示したものである。
す塩基配列を有するものの他、その誘導体であってグル
コノバクター属細菌で自律複製可能なプラスミドも含ま
れる。前記誘導体としては、pAG5からその複製に関わる
領域以外の部分が除かれたものであってもよいし、pAG5
又はその一部に他のDNA配列が挿入されたものであっ
てもよい。
で自律複製可能なプラスミドを連結することにより、こ
れらの細菌で自律複製可能なシャトルベクターが得られ
る。グルコノバクター属細菌以外の細菌としては、エシ
ェリヒア属細菌等が、具体的にはエシェリヒア コリが
挙げられる。
全体を用いてもよく、その一部であってもよい。一部を
用いる場合は、pAG5の複製に関わる領域が含まれている
必要があるが、複製に不要な領域は除いてもよい。複製
に必要な領域は、pAG5を制限酵素で切断して得られる断
片を、エシェリヒア コリで自律複製可能なプラスミド
に連結し、得られる組換えプラスミドでグルコノバクタ
ー オキシダンスを形質転換し、形質転換株中に前記組
換えプラスミドが保持されることを確認することによっ
て決定することができる。そのような領域を有するpAG5
の部分断片の一例としては、pAG5をHindIII及びEcoRIで
切断して得られる2つの断片のうち、長い方の断片が挙
げられる。
スミドとしては特に制限されず、エシェリヒア コリを
用いた遺伝子組換え操作に通常用いられているプラスミ
ドベクターが挙げられる。具体的には、pUC18、pUC19、
pBR322、pHSG299、pHSG298、pHSG399、pHSG398、RSF101
0、pMW119、pMW118、pMW219、pMW218等が挙げられる。
これらのプラスミドも、全体を用いてもよく、その一部
を用いてもよい。一部を用いる場合は、プラスミドの複
製に関わる領域が含まれている必要があるが、不要な領
域は除いてもよい。通常用いられているエシェリヒア
コリ用のベクターでは、複製に必要な領域又は不要な領
域はよく知られているものが多い。
性遺伝子などのマーカー遺伝子を保持することが好まし
い。薬剤耐性遺伝子としては、アンピシリン耐性遺伝
子、クロラムフェニコール耐性遺伝子等が挙げられる。
これらの薬剤耐性遺伝子は、通常用いられているエシェ
リヒア コリ用のベクターに含まれており、複製に必要
な領域とともにそのままシャトルベクターの構築に用い
ることができる。例えばpUC18は、アンピシリン耐性遺
伝子を有している。
ーニング部位、好ましくはマルチクローニング部位を有
していることが望ましい。上記のようなエシェリヒア
コリ用のプラスミドベクターはマルチクローニング部位
を有しているものが多く、これをそのまま本発明のシャ
トルベクターに用いることができる。
pSG8およびpSG6が挙げられる。pSG8は、制限酵素HindII
Iで切断したpAG5と、同じくHindIIIで切断したpUC18を
連結することにより得られる。またpSG6は、pAG5をHind
IIIおよびEcoRIで切断して得られる断片のうち長い方の
断片と、pUC18をHindIIIおよびEcoRIで切断して得られ
る断片のうち長い方の断片とを連結することによって得
られる。これらのシャトルベクターは、エシェリヒア属
細菌及びグルコノバクター属細菌で自律複製可能であ
る。したがって、エシェリヒア属細菌を用いてシャトル
ベクターへのDNA断片の挿入等の操作を行うことがで
き、得られる組換えベクターでグルコノバクター属細菌
を形質転換することによって、目的遺伝子の導入等を行
うことができる。尚、pSG8はSacI、BamHI、XbaI、Sal
I、PstI部位が、pSG6はEcoRI、HindIII部位が、それぞ
れクローニング部位として使用することができる。
ノバクター属細菌を形質転換するには、通常の形質転換
法、例えば電気パルス法等を用いることができる。グル
コノバクター属細菌としては、グルコノバクター オキ
シダンスが好ましいものとして挙げられる。
説明する。
地(酵母エキス0.5%、バクトペプトン0.3%、グルコー
ス3%、pH6.5)で培養し、遠心分離によって菌体を集め
た。この菌体より通常のアルカリリシス法(Nucl. Acid
s Res. 7, 1513(1979))によって細胞質のDNA画分を
抽出し、アガロースゲル電気泳動にって分離精製した。
その結果、約5kbの新規なプラスミドが見い出され、pAG
5と命名した。
により作成した制限酵素地図を図1に示す。
n)法によって、pAG5の塩基配列を決定した。シーケン
ス反応は、 Dye Terminator Cycle SequencingKit(ABI
社製)を用いて説明書に従って行った。また、電気泳動
は、DNA Sequencer 373(ABI社製)を用いて行った。決
定された塩基配列を、配列表の配列番号1に示す。
シェリヒア コリのベクタープラスミドpUC18(アンピ
シリン耐性遺伝子を含む)のHindIII切断物を混合し、
DNAリガーゼで連結した。これを用いてエシェリヒア
コリJM109株をコンピテントセル法により形質転換し
た。アンピシリン耐性を示す形質転換株の中からpAG5と
pUC18のキメラプラスミド(約8.3kb)を持つ株を選択
し、該キメラプラスミドをpSG8と命名した。
切断した。この切断物と、エシェリヒア コリのベクタ
ープラスミドpUC18のHindIIIとEcoRI切断物を混合し、
DNAリガーゼで連結した。これを用いてエシェリヒア
コリJM109株をコンピテントセル法により形質転換し
た。アンピシリン耐性を示す形質転換株の中から、pAG5
の一部とpUC18のキメラプラスミド(約6.4kb)を持つ株
を選択し、該プラスミドをpSG6と命名した。pSG8、pSG6
の構築の概要を図2に示す。
JM109株は、プライベートナンバーAJ13485が付与され、
平成10年7月21日に通商産業省工業技術院生命工学
工業技術研究所の特許微生物寄託センター(郵便番号30
5-8566日本国茨城県つくば市東一丁目1番3号)に寄託
され、受託番号FERM P-16903がが付されている。
ノバクター オキシダンスATCC621株の形質転換 グルコノバクター オキシダンスATCC621株をYPG培
地で培養した。遠心分離により集めた菌体を10%シュク
ロース溶液で洗浄した後、再度10%シュクロース溶液
に懸濁し、上記のキメラプラスミドpSG8又はpSG6と混合
して(100μg/ml)、電気パルス法により形質転換を行
った。形質転換は、島津細胞融合装置SSH−10(島
津製作所製)を用いて、1400Vの電気パルスを7回印加
することにより行った。pSG8、pSG6のいずれのプラスミ
ドを用いた場合もアンピシリン耐性株が得られた。これ
らの株よりアルカリリシス法でプラスミドを分離し、ア
ガロースゲル電気泳動で解析したところ、導入したプラ
スミドが形質転換株中に保持されていたことが確認され
た。
由来の新規プラスミド及び該プラスミドを用いたシャト
ルベクターが提供される。該シャトルベクターは、グル
コノバクター属細菌及びエシェリヒア コリの細胞内で
自律複製できるため、ベクターDNAの組換え操作及び
グルコノバクター属細菌への遺伝子導入に有用である。
字は塩基番号を示す。
構築手順の概要を示す図。
Claims (5)
- 【請求項1】 大きさが約5.6kbであるグルコノバ
クター オキシダンスIFO3171株由来の内在性プ
ラスミド、またはその誘導体であってグルコノバクター
属細菌で自律複製可能なプラスミド。 - 【請求項2】 配列番号1に示す塩基配列を有する請求
項1記載のプラスミド。 - 【請求項3】 請求項1又は2記載のプラスミド又はそ
の一部とエシェリヒア属細菌で自律複製可能なプラスミ
ド又はその一部から構築され、グルコノバクター属細菌
及びエシェリヒア属細菌で自律複製可能なシャトルベク
ター。 - 【請求項4】 エシェリヒア属細菌で自律複製可能なプ
ラスミドがpUC18である請求項3記載のシャトルベ
クター。 - 【請求項5】 pSG8またはpSG6のいずれかであ
る請求項4記載のシャトルベクター。
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