JPH03108487A - ペクチンリアーゼ発現系 - Google Patents
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Abstract
め要約のデータは記録されません。
Description
ス・ニガー(匙月月山四用 1■」)の幾つかのペクチ
ンリアーゼをコードするDNA配列及び/又はそのプロ
モーター、シグナル及びターミネータ−配列を含んで成
る新規なりNA分子を提供する。この新規なりNA分子
は、アスペルギルス(八spergillus)におけ
るペクチンリアーゼの過剰生産のため、及び/又は糸状
真菌及び他の真菌において外来遺伝子を発現せしめるハ
イブリドベクターの作製のために有用である。今や、他
のペクチンリアーゼが夾雑していない単一ペタチンリア
ーゼを製造することが可能である。
多くのポリペプチド発現系が知られているが、既知の系
に比べて有利な新規な系の必要性が常に存在する。
主及び真核性酵母宿主、例えばサツカロミセス・セレビ
シェ−(Saccharom ces cerevis
iae)が非常に広範に使用されており、これらのため
の非常に多数の異る発現バイブリド系、はとんどの場合
プラスミド、が開発されている。大腸菌宿主の欠点は、
それらが、生成したポリペプチドをグリコジル化するこ
とができないこと、及び分泌の欠如のために外来ペプチ
ドが宿主細胞内に蓄積しそして更なる増殖を妨害するこ
とである。酵母宿主はグリコジル化を行うが、しかしな
がら大腸菌と同様に、それらはポリペプチドを極少量し
た培地中に分泌しない。酵母はべりブラズム空間にのみ
分泌を行う。
ル化及び培地中への分泌を行うことができるが、しかし
ながらその培養は非常に緩慢でありそして高価であり、
さらに発癌性遺伝子が目的ペプチドと一緒に単離され目
的ポリペプチドから発癌性遺伝子を除去できない危険性
がある。
ーロスポラ・クラッサ(籾肛並匹胆crassa) 、
アスペルギルス・ニドランス(ハ匹り紅旦旦n1dul
ans) 及ヒアスベルギルス・ニガー(匙Bコ匡■弛
恒1虹)が研究されている。これらの真菌類はすでに
広く工業的目的のために知られているが、しかしながら
主として適切な形質転換系が存在しないため、遺伝子工
学技術におけるそれらの用途は遅れたままである。サツ
カロミセス・セレビシェ−とは異り、糸状真菌は外来遺
伝子の導入及び表現型選択のために使用し得るプラスミ
ドを含有しない。しかしながら、糸状真菌を選択マーカ
ー遺伝子を含有する外来プラスミドにより形質転換する
ことが可能である。糸状真菌のために今まで記載されて
いるすべてのベクターは、酵母用ベクターとは異って自
律複製せず、真菌染色体に組み込まれる。この現象は非
常に低頻度においてのみ起こる。他方、有利なことには
、組込み(in tegra tive)形質転換は非
選択的条件下においてさえ形質転換体を有糸分裂的に非
常に安定なものとする。100コピーを超える安定な組
込みが報告されている。
カーとしてニューロスポラ・クラッサのqa−2遺伝子
を含有していた。この遺伝子は酵素力タボリック・デヒ
ドロキナーゼをコードしており、そしてN、クラソサの
aro変異株の機能的補完のために使用することができ
る(Case、 M、H。
、R,及びG11es、 N、lI。
i、 USA 76、5259−5263 )。aro
変異株は芳香族アミノ酸の補完を伴わない最少培地上で
増殖することができない。
染色体への該プラスミドの単一コピーの組込みにより起
った。安定な組込体(i n Legran t)の3
0%が組込まれたqa−2遺伝子を細菌プラスミド配列
になおリンクしたままに保持した(Case、 M、E
。
ng of Microorganismsfor C
hemicals (llollander、 A、、
DeMoss、 DlKaplan、 S、+ Ko
nisky+ J、、 Savage、 D、及びWo
lfe+11.3.i集) 、87−100頁、Ple
nom) a この観察は選択配列を伴う非−選択性D
NA配列の同時形質転換(cotransformat
ion)を実行可能な課題にした。
アスペルギルス・ニドランスにおいて、負の選択系及び
正の選択系の両者が同定されている。N、クラッサから
の異種性DNA又は同種性DNAを用いて、d遺伝子を
含有するプラスミドを用いる形質転換によるA、ニドラ
ンスm−変種株の機能的補完が得られた(Ballan
ce等、BBRC112,284,1983; Ti1
burn等、Gene 26.205゜1983)。他
の系において、厚又は鉦訃座における変異が適切なプラ
スミドによる形質転換によって機能的に補完された(Y
elton等、PNAS l、 1470゜1984;
Yelton et Timberlake、 J、
Ce11.Biochem。
ne等、EMBOJ、土。
mdS遺伝子(これにより形質転換されたA。
ることが可能となる)を用いて開発されている(Til
burn等、Gene 26.205.1983; W
ernars等、Curr、Genet、 9+ 36
1.1985; Kelly、 J、M、等、EMBO
J、 4.475.1985)。
ーは一層重要な生物である。これは、例えば食品工業で
使用するための酵素の製造において広く使用されている
。A、ニガーは、それが種々の加水分解酵素、例えばグ
ルコアミラーゼ、αアミラーゼ、ペクチナーゼ、セルラ
ーゼ、β−グルカナーゼ、β−ガラクトシダーゼ、ナリ
ンジナーゼ、ベントサナーゼ、酸性プロテアーゼ及びリ
グナーゼ(グルコアミラーゼ及びペクチナーゼ複合体が
最も重要な酵素である)を分泌する点において、その分
泌能力によりA、ニドランスと異る。
分裂組換えによって変異を導入することはできない。し
かしながら、古典的な変異及び選択法により加水分解酵
素の分泌における高度な菌株の改良が達成されている。
ナル配列を伴うアルコール及びアルデヒドデヒドロゲナ
ーゼ(Wo 86106097)並びにグルコアミラー
ゼ(Boel等、EHB(I J、 3.1581.1
984)の遺伝子のみが特徴付けられており、そしてそ
れぞれA、ニガー及びA、ニドランスを用いる形質転換
実験において使用されている。
ニドランスから得られる異種性amds遺伝子(Kel
ly及びHynes、 EMBO3,4、475,19
85)及び肛飢遺伝子(Buxton等、Gene 3
7.207.1985; EP184438; Wo
86106097)が使用されている。
最も重要な生物である。ペクチンは、α−1,4−グリ
コシド結合したD−ガラクチュロン酸ポリマーから成る
高分子量(20000〜40000 D)のポリガラク
チュロニドであり、そして高等植物細胞の構成成分とし
て天然に存在し、そこでそれらはセルロース分子に結合
しておりそして主として一次細胞壁(primary
cell wall)及び中間ラメラ(middle
lamella)中に存在する。最も豊富なペクチン源
はレモン及びオレンジの外皮であり、これらは約30%
の該ポリサッカライドを含有する。
の炭水化物ポリマー基質をα−1,4−グリコシド結合
の加水分解により(ポリガラクチュロナーゼ)又はペク
チン分子からのα−4,5不飽和ガラクチユロン酸残基
のトランスエリミネーションにより(種々のペクチンリ
アーゼ)分解する。ペクチンリアーゼの組織的名称はペ
クチントランスエリミナーゼ(EC4,2,2,10)
である。
構成的には発現されない。ペクチン又はその分解生成物
を用いる誘導条件下で、他の炭素源、例えばグルコース
又はシュークロースが制限される場合、A、ニガーはP
LIを包含する上記の酵素を発現する。表面培養におい
て、ペクチン分解酵素は外細胞壁に結合したままである
傾向を有する。培地中のペクチン及びCa” 6度の増
加が完全な分泌を導く。
て果汁の清澄化のために使用される。
により、A、ニガーから2種類の異るペクチンリアーゼ
PLI及びP 1.、 IIが精製されそして部分的に
特徴付けられている。PLrはマンノースの4個の残基
を含有し、他方PLIIはそれぞれマンノース及びグル
コースの2個ずつの残基を含有する。これらの酵素は異
る分子量(PL I : 37.5kD、 PLII
: 36kD)を有する。
配列が決定されそして開示されている。本発明は、該蛋
白質の適切な部分をコードするDNAプローブの合成を
可能にするペクチンリアーゼI(PLI)の部分的構造
決定に基いている。DNAプローブを用いることにより
、A、ニガーの遺伝子ライブラリーから、最終的にはプ
レ配列及びプロ配列と共に、PLIをコードするDNA
をスクリーニングしそして単離することが可能であった
。
分のハイブリダイゼーションにより、本発明の対象であ
る更なるPL遺伝子が検出された。
領域を伴うPLI構造遺伝子はそのN−末端において、
A、ニガーN400から得られたPLD遺伝子と同じで
ある。従って、後者は本発明の部分ではない。本発明の
PLAは、すでに精製されているPLIIと称するPL
混合物の一部分のようである。
遺伝子を凪りと称する。
の誘導体をコードするDNA配列を含んで成る組換DN
A分子、例えば前記ペクチンリアーゼの構造遺伝子並び
に対応する制御配列、例えばプロモーター、シグナル及
びターミネータ−配列、並びに対応するDNAを含んで
成るハイブリドベクター、例えば同種性又は異種性ポリ
ペプチドをコードするDNAを含むハイブリドベクター
該ヘクターにより形質転換されDNA配列、特に糸状真
菌宿主、例えばアスペルギルス宿主、該組換DNA分子
及び該宿主の製造方法、並びに新規発現系の製造のため
の組換DNA分子の使用である。
の製造である。
アーゼ遺伝子のプロモーター、シグナル配列、構造遺伝
子及びターミネーター、をコートするDNA配列を含ん
で成る。この新規なペクチンリアーゼはPLA、 PL
B、 PLC,PLE及びPLF と称される。
場合によってはこれらの蛋白質のシグナル配列並びに場
合によってはこれらのターミネータ−1をコードするD
NA配列を含んで成るハイブリドベクターの作製である
。これらのハイブリドベクターは特定の蛋白質をコード
する遺伝子の導入のため、並びに糸状真菌、例えばアス
ペルギルス、ペニシリウム(Penicillium)
及びセファロスポリウム(江匝旺並匹丘二)の形質転換
のために使用される。
換を行うことができ、この場合プラスミドの一方は本発
明の新規なハイブリドベクターの群から選択され、そし
て他の一つは糸状真菌の変異した株と関連して機能する
特に構成された選択プラスミドである。
クチンリアーゼの過剰生産(0νerproducLi
on) 、及び他のPL、を夾雑しない単一PL。
はその制御のもとてその構造遺伝子が発現され得る任意
の蛋白質の製造に関する。
り明らかになろう。
PLB PLC,PLE又はPLFの発現系又はその
誘導体をコードするDNA配列を含んで成る組換DNA
分子に関する。
できそしてプロモーター、シグナル配列、構造遺伝子及
びターミネータ−を含んで成るDNA分子を意味する。
る場合、フランキング配列を含有するより大きな誘導体
、該DNA配列の断片、変異体、が意図される。
ノムから切り出すことができそして第1図〜第3図、第
5図及び第6図に与えられたDNA配列を含んで成り、
例えば、核酸の断片化、該断片の適当な制限酵素、例え
ばEcoRI 、 BamHI又は1lindllIに
よる処理、適当なベクター、例えばλファージ及びpB
R322への連結、例えば大腸菌へのクローニング、及
び同じ制限酵素による再度の切り出しにより得られたA
、ニガーN400のゲノムライブラリー中に見出すこと
ができるものである。
図、第5図及び第6図に示すプラスミドpGW820.
pGW830. pGW840. pGW850.
pGW86Q及びpGW880の挿入部である。
スミドの2個の制限部位間に延び、そしてプロモーター
、シグナル、構造及びターミネータ−機能を維持してい
るものである。
規PLの構造遺伝子又はターミネータ−配列、あるいは
これらの組み合わせを含むものである。
もたらすリンカ−を含有することができる。
含まれ、そして約2000まで、好ましくは1000−
14000までのヌクレオチドを含んで成る。
0)及びP st I (2420)制限部位間の配列
上に位置する。プロモーター配列のために、TATAA
ボックスがRNAポリメラーゼ認識部位として重要であ
る。止佳A上でTATAAボックスは1221位(第1
0図)に、爪B上で951位(第11図)に、そして正
性C上で1261位(第12図)に位置する。TATA
Aボックスの近くからシグナル配列の開始までの短いプ
ロモーターがポリペプチドの非誘導発現のために特に興
味深い。ペクチンにより誘導される発蛸しく必要であれ
ば、プロモーターの強さを制御するためにTATAAボ
ックスの上流の配列が必要である。これらの配列に適当
なリンカ−を付加することができる。
なわち、それに付加された構造遺伝子、例えばPLをコ
ードする構造遺伝子又は任意の外来遺伝子の発現は培地
へのペクチン又はペクチン分解生成物の添加により誘導
される。ペクチンの非存在下及び十分なグルコースの存
在下ではこのプロモーターは機能しない。上流の制御配
列が存在しなければこのプロモーターは構成的となる。
と成熟蛋白質のコード配列の始まりの間に延びる。PL
A及びPLBにおいてシグナル配列は約20アミノ酸を
含有し、LiCにおいて約18アミノ酸を含有する。対
応するコード領域はPiLAにおいて131位のATG
コドンがら1000位のPstl開裂部位に延び、ルd
Bにおいて1134位から少なくとも1191位に延び
、そしてP壮Cにおいて1368位から1422位に延
びる。
、PLA、 PLB及びPLCの構造遺伝子は幾つかの
イントロンを含有する。さらに、構造遺伝子は適当なリ
ンカ−を含有することができる。
、そして前記配列中の制限部位の1つにまで延びること
ができる。ターミネータ−断片は少なくとも300bp
を含有し、そして適当なリンカ−を含有することができ
る。
きDNAの制限部位に適合するDNA配列を有する。こ
れらはあらかじめ定められた制限部位を含有することが
できる。
るもの、例えばプロモーター、プロモーターヒシグ″f
、Li)シ<は構造配列、ジグプールと構造配列、又は
イントロンを含まない構造遺伝子等、を含有するもので
ある。
体である。本発明はさらに、類似の又は同一の疎水性プ
ロフィールを有するシグナル配列の自然変異体又は合成
変異体、例えば極性アミノ酸であるリジン(Kδ°)、
チロシン(Yδ−)及びアルギニン(Rσ゛)のコドン
が類似の電荷を有する他のアミノ酸のコドンにより交換
されており、そして疎水性アミノ酸アラニン(A)、ロ
イシン(L)及びスレオニン(T)が他の疎水性アミノ
酸のコドンにより置き換えられているものを包含する。
ドンで置き換えることができそしてこの逆も可能であり
、負に荷電したチロシンのコドンをグルタミン酸又はア
スパラギン酸のコドンにより置き換えることができ、そ
して/又は非極性疎水性のアラニンのコドンを、スレオ
ニン、プロリン、バリン、イソロイシン、ロイシン、メ
チオニン又はフェニルアラニンのコドンのいずれが1つ
により置き換えることができる、等である。
は少数個の、例えば約30個までのヌクレオチドが1個
又は複数個の他のヌクレオチドに置き換えられており、
新たなコドンは同じアミノ酸をコードしている。
類似しており、無制限の数のヌクレオチドが他のヌクレ
オチドにより置き換えられていてそれらがコードしてい
るアミノ酸配列の変化を伴わないという意味において遺
伝子コードの意味内で縮重しているものである。このよ
うな縮重DNA配列は、それらの制限部位が異る故に有
用である。
DNA分子は特に組換ベクター、あるいはこの様なりN
A配列を挿入部として含有するいわゆるハイブリドベク
ターである。これらは宿主、例えば細菌、真菌又は動物
細胞でのクローニングのために使用できる。この様なハ
イブリドベクターは遺伝子工学の分野において有用な任
意のベクター、例えばファージ、コスミド、プラスミド
又は染色体DNAに由来し、例えばファージλの誘導体
、例えばNM989、又はファージM13の誘導体、飼
犬ばBamHI消化により線状化されたM13mρ8フ
ァージDNA (参考文献15)、細菌プラスミド、例
えばpBR332,pUN121. pHc18 、又
は酵母プラスミド、例えば酵母2μプラスミド、又はさ
らに、例えばアスペルギルスから、例えばA、ニガーに
由来する染色体DNA、例えばEP 184438によ
り提供されるもの、あるいは欠陥ファージ又はプラスミ
ドの複製を可能にするヘルパーファージ又はヘルパープ
ラスミドの存在下での欠陥ファージ又は欠陥プラスミド
、例えば、M13KO7ヘルパーフアージの存在下での
M13(+)KSベクターである。
その誘導体に加えて複製部位、及び場合によってはDN
A誘導体のタイプに依存して、発現制御配列、例えばエ
ンハンサ−配列、上流活性化部位、プロモーター及びシ
グナル配列及び/又は構造遺伝子であって対応するA、
ニガー由来配列とは異るものを含有する。この様なエン
ハンサ−配列はフィザルム・ポリセファルム(ハ■肛堕
止IT四且1□匡りの染色体外リボゾームDNAから誘
導することができ(PCT/EP 8500278)
、あるいはこれは酸性スホファターゼPH05遺伝子(
EP出願N(I86111820,6)、又はPH05
,trp、 pH05GAPDIIバイブリド(BP出
願Nα111820.6)又は類似のプロモーターから
の上流活性化部位であることができる。
タ−配列に連結される構造遺伝子は、イントロンを含む
か又は含まないペクチンリアーゼPLA、 PLB、
PLC,PLE及びPLFをコードする遺伝子のほかに
、さらに同種性の他のペクチンリアーゼ遺伝子、例えば
PLD(又はPL I)遺伝子、又は他のアスペルギル
ス遺伝子、及び異種性構造遺伝子であり、これらの構造
遺伝子はウィルス、原核細胞又は真核細胞に由来し、そ
してゲノムDNA又はmRNAルートを介して調製され
るcDNAに由来することができあるいは化学的に合成
されてもよく、広範囲の種類の有用なポリペプチド、例
えばグリコジル化されたポリペプチドであって特に高等
真核生物、特に呻乳頚、例えば動物又は特にヒト由来の
もの、例えば栄養の製造のためにそして化学における酵
素を行うために使用することができる酵素又はヒト及び
動物の疾患の治療のためもしくはその予防のため有用で
あり且つ価値があるポリペプチド、例えばホルモン、免
疫調節性、抗ウイルス性又は抗−腫瘍性を存するポリペ
プチド、抗体、ウィルス抗原、ワクチン、凝血因子、食
品等をコードするものである。
えばセクレチン、チモシン、レラキシン、カルシトニン
、黄体形成ホルモン、副甲状腺ホルモン、アドレノコル
チコトロピン、メラノサイト刺激ホルモン、β−リボト
ロピン、ウロガステロン又はインシュリン、増殖因子、
例えば上皮増殖因子、インシュリン様増殖因子(IGF
) 、例えばIGF−1及びIGF−It、マスト細胞
増殖因子、神経増殖因子、ダリア由来神経細胞増殖因子
、又は形質転換増殖因子(TGF) 、例えばTGFβ
、成長ホルモン、例えばヒト又はウシ成長ホルモン、イ
ンターロイキン、例えばインターロイキン−1もしくは
−2、ヒトマクロファージ遊走阻止因子(MIF)、イ
ンターフェロン、例えばヒトα−インターフェロン、例
エバインターフェロン−αA、αB。
フェロン又はバイブリドインターフェロン、例えばαA
−αD〜もしくはαβ−αD−バイブリドインターフェ
ロン、特にバイブリドインターフェロンBDBB、プロ
テイナーゼ阻害剤、例えばα、−アンチトリプシン、S
LP I等、肝炎ウィルス抗原、例えば肝炎Bウィルス
表面抗原又はコア抗原、又は肝炎Aウィルス抗原、又は
肝炎非A−非B抗原、プラスミノーゲン活性化因子、例
えば組織プラスミノーゲン活性化因子又はウロキナーゼ
、l[!壊死因子、ソマトスタチン、レニン、β−エン
ドルフィン、免疫グロブリン、例えば免疫グロブリンD
、E又はGの軽鎖及び/又は重鎖、ヒト−マウスバイブ
リド免疫グロブリン、免疫グロブリン結合因子、例えば
免疫グロブリンE結合因子、カルシトニン、ヒトカルシ
トニン−関連ペプチド、血液凝固因子、例えばファクタ
ー■又は■0、エリスロボイエチン、ニグリン、例えば
ニグリンC、ヒルジン、デスルファトヒルジン、例えば
デスルファトヒルジン変形体HVI、 HV2又はPA
。
ンキナーゼ、β−ラクタマーゼ、グルコースイソメラー
ゼ、をコードする遺伝子である。好ましい遺伝子は、ヒ
トα−インターフェロン又はバイブリドインターフェロ
ン、ヒト組繊プラスミノーゲン活性化因子(L−PA)
、肝炎Bウィルス表面抗原(HBVsAg)、インシュ
リン様増殖因子I及び■、ニグリンC及びデスルファト
ヒルジン、例えば変形体HVIをコードする遺伝子であ
る。本発明のハイブリドベクターにおいて、存在するプ
ロモーター及び/又はシグナル配列はポリペプチドの効
果的な発現を保証するようにポリペプチドコード配列に
作用可能に(operably)連結される。
クローン化されるべき宿主に依存して選択マーカーを含
有することができる。マーカーの表現型発現に基く形質
転換体の選択を促進する任意のマーカー遺伝子を使用す
ることができる。適当なマーカーは特に、抗生物質耐性
、例えばテトラサイクリン又はアンピシリンに対する耐
性を発現するもの、又は栄養要求酵母変異株の場合には
宿主の欠陥を補完する遺伝子である。対応する遺伝子は
例えば抗生物質シクロヘキシミドに対する耐性を付与し
、又は栄養要求変異株において原栄養性、例えば面、
皿、 h i s 3又はtrpl遺伝子を付与する。
生成物について栄養要求性である場合には、自律複製セ
グメントと関連する構造遺伝子をマーカーとして使用す
ることも可能である。
カー遺伝子、例えばA、ニガー又はA。
トランスフェラーゼをコードするaU、B遺伝子(EP
184348)、又はN、クラッサ血遺伝子(26)と
相同なA、ニドランスDNA断片である。
遺伝子が本発明のプロモーター及びシグナル配列に作用
可能に連結されているハイブリドベクターである。この
様な好ましいハイブリドベクターは例えばplJc19
/pelA−IFN AM119である。
3(+) KS/pelA−IFN AM119である
。
に異種性構造遺伝子が本発明のプロモーター配列に作用
可能に直接連結されている。この様な好ましいハイブリ
ドベクターは例えばM13(十)KS/pelAΔ、、
−IFN AM119である。
さらなる類似のDNA又はmRNAのためにDNA遺伝
子バンク又はn+RNAをスクリーニングするために使
用することができる。
ドする組換DNA分子の調製方法に関し、この方法はペ
クチンリアーゼ発現系又はその誘導体をコードするDN
A配列を含有するDNA分子により形質転換されDNA
配列を培養し、そして所望のDNA分子又はその誘導体
を単離するか、あるいは生体外合成により調製する、こ
とを特徴とする。
子を欠く宿主からの形質転換体すなわち選択マーカーと
共に目的のDNA分子を含有する宿主の負の又は正の選
択を可能にするように化学物質が補充されているか又は
除去されている常用の栄養培地中で行われる。
ば細菌、例えば大腸菌、真菌、例えばサツカロミセス・
セレビシェ−1又は特に糸状真菌、例えばアスペルギル
ス、例えばA、ニドランス、A、オリゼー(A、 肛
H並)、A、カルボナリウス(A、 carbona
rius) 、A、アワモリ(A、 awa−触ユ)
及び特にA、ニガーを使用することができる。好ましい
宿主は、後でさらに記載するように、ハエA遺伝子を欠
く新規な変異株であるA、ニガーAn8である。宿主の
形質転換は常法に従って行われる。
する糸状真菌から、特にゲノムライブラリーから、又は
さらにmRNAを介して得られる。
る。
6又はN400のゲノムDNAを例えば5au3A 1
又はMbolにより部分消化し、そしてこの高分子量D
NA断片を座qな宿主ベクター、例えば大腸菌プラスミ
ドp(lN121又はλベクター、例えばEMBL4中
でクローニングすることにより調製することができる。
ノムライブラリー源として使用することができ、そして
同様に、他の適当なベクターを断片の受容体として使用
することができる。
リーを好結果にスクリーニングするために、ハイブリダ
イズするDNAプローブが必要である。目的のPLの配
列が知られていればこのプローブは合成りNAプローブ
であることができ、あるいはこれは既知のPL遺伝子又
はその部分であることができる。EP 8810139
7.3に記載されているようにPLI遺伝子を見出すた
め第一のアプローチが用いられた。本発明においては第
二のアプローチを用いた。PLI遺伝子の全DNA配列
が入手可能となっているので、完全な遺伝子又は少なく
とも約14bpを有するその任意の断片をスクリーニン
グのために用いることができ、このスクリーニングには
PL系をコードするa+RNAのスクリーニングも含ま
れる。
業界において知られている方法によりT ′JzPAT
P及びT4キナーゼを用いて5′を放射能ラベルする。
伝子ライブラリーのフィルターレプリカ上でのラベルさ
れたDNAプローブとのハイブリダイゼーションにより
同定される。
ション応答を示すクローンを単離しそして増幅する。
温度を選択することにより、そしてPLI (又はPL
D)に由来する異るDNAプローブの使用の組み合わせ
により高ストリンジェント又は低ストリンジェントであ
ることができる。例えば、完全な1.6kbp Bam
1l I / P st T断片、649bpBamH
I / X ha I断片(N−末端断片)及び244
bpχho■/PstI断片(C−末端断片) (p
cG3B11又はpGWa4o (第4図)からの〕へ
の種々のハイブリダイゼーション応答を測定することに
より、その相同性の程度に基いて異るクラスに分けるこ
とができる(第2表又は第4表)。5種類のλ−ベクタ
ー(λ−PL113 、 λ−PL122 、 λ
−PL109 。
、制限酵素処理し、そしてpBR322中に調製された
これらの−Lk」−遺伝子のサブクローンがそれぞれプ
ラスミドpGW820. pGW830. pGW85
0. pGW860及びpGWsao (第1図〜第3
図、第5図及び第6図)を導いた。これらのクローンの
5種類の遺伝子をそれぞれル江AI L’佳B、化1
.C,ル江E及び止=lFと称する。
(II)及び(■)(第10図、第11図及び第12図
)に示す。
及びイントロン内部配列のコンピューターサーチ(Bo
el E、等、(24)、及びMount S、M(2
5) )は、PiLDと同様に、シ=IA及びル佳B中
の4個のイントロン(第10図及び第11図)、並びに
1C中の3個のイントロン(第12図)を予想させる。
850. pGW860及びpGWsaoを用いて本発
明の他の組換DNA分子を調製する。この様な他のDN
A分子は常法に従って、常用の制限酵素、リンカ−1連
結、増幅及び単離法を用いることにより調製される。
る。
nd11部位にサブクローニングする。p!3i^遺伝
子を含有する得られたプラスミドpGW822の3.3
kbp BamHI −HlndI[[断片をベクター
ptlc19のBamHI及び旧nd111部位にクロ
ーニングしてpUC19/pelAと称するベクターを
得る。Jl!LLへの構造遺伝子を、5a11及びPs
tlN、:よる消化によって切り出す。銀lAプロモー
ター、シグナル及びターミネータ−配列を含有する残り
の断片のシグナル配列とターミネータ−配列との間に、
適当なリンカ−を用いてインターフェロンバイブリドB
DBBをコードする遺伝子を連結する。
AM119と称しく第11図)、このものは凪Aのプ
ロモーター及びシグナル配列、IFN BDBB遺伝子
並びに正佳Aターミネータ−を含有し、pUC19の旧
nd n[−BamHI断片に付加されている。このプ
ラスミドを、pCG59D7と共にウリジン要求性A、
ニガー変異株An8(DSM 3917)に同時形質転
換する。アルギニン及びバクトーアガーを含有する最少
培地中で形質転換体を選択し、そしてインターフェロン
の発現について分析する。
を除去することができる。得られるプラスミドをH13
(+) KS/pelAΔ、、−IFN AM119
と称し、このものはと江Aのプロモーター配列、IFN
BDBB遺伝子及び凪Aのターミネータ−を含有し、
ブルースクリプト(Bluescript)H13(+
)KSベクターのHind m Bamtl I断片
に付加されている。このプラスミドをpcc59D7と
共にウリジン要求性A、ニガー変異株An8(DSM
3917)に同時形質転換する。アルギニン及びバクト
ーアガーを含有する最少培地中で形質転換体を選択し、
そしてインターフェロンの発現について分析する。
たな制限部位を含有する変異体を調製することができる
(M、J、Zoller及びM、Sn+ith、 Me
thodsEnzymol、100.468(I983
)の総説; D、Botstein及びり、5hort
le、 5cience 229.1193(I98
5); 又はK。
1.5103(I983)を参照のこと〕。
配列を構造遺伝子の末端に連結することができる。
例えばテトラサイタリンに対する耐性により同定される
。
えばII B 101株中で増幅され、形質転換されそ
して常法により選択される。増幅されたプラスミドDN
Aは常法により、特にBirnboim及びDoly(
23)により記載されている方法により細菌から単離さ
れる。
プラスミドを作製することができる。
も調製することができる。生体外合成は、PL発現系の
小さい断片、例えばPL、のプロモーター又はシグナル
配列をコードするDNA配列あるいはその変異体の調製
のために特に適用できる。
、PL構造遺伝子、他の異種性構造遺伝子及び/又はP
Lターミネータ−を含有する本発明のDNA分子は糸状
菌、例えばアスペルギルス、ペニシリウム又はセファロ
スポリウム、例えばA。
アワモリ及び特にA、ニガーを形質転換するためにも使
用することができる。
、本発明のDNA分子は選択マーカーを担持し、又は別
の方法として、菌をこのようなマーカーを含有する第二
のベクターと共に同時形質転換する。他の系として、こ
の様な選択マーカーは発現可能な構造遺伝子であり、そ
の発現されたポリペプチド(酵素)が形質転換体に対し
て毒性の化合物に対する耐性を提供し、又はそれがこの
ような必須のポリペプチドを欠(変異体の酵素系を補完
する。この様なマーカー遺伝子は例えば既知のエヒ二亀
、肛匹、肛r4 、4工匹、憇並又は皿遺伝子である。
て、A、ニドランスのm及びN、クランサのmに関連し
そしてそれらと同様の機能を有する、すなわち酵素オロ
チジン−5′−ホスフェートデカルボキシラーゼを生産
するmと称する新規なマーカー遺伝子を、A、ニガーの
ゲノムライブラリーから単離した。この酵素は、オロチ
ジン−5′ホスフエートのウリジンM(ウリジン−5′
−ホスフェート)への、及びフルオロ−オロチン酸の毒
性フルオロ−ウリジンへの脱炭酸を触媒する。
の部分を含有するpDJB2 (24)の1.1kb
Hind[I[断片とのハイブリダイゼーションにより
同定した。
ボキシラーゼをコードする他の任意の且11遺伝子のD
NAを使用することができる。大腸菌B75183/
pcG59D7 と称する陽性クローンから紅u遺伝子
を含有するプラスミドpcG59[17を単離し、そし
てA、ニガーpyrA−変異体の形質転換のために使用
した。このようなpyrA−変異株はオロチジン−5′
−ホスフェートデカルボキシラーゼ遺伝子を欠き、そし
てそれ故に対応する酵素を製造することができない。こ
の様な変異株はA、ニガーN756の分生胞子を変異性
UV照射により処理し、フルオロ−オロチン酸及びウリ
ジンの存在下で生存するコロニーを選択することにより
得た。
下で生存するコロニーは除去される。残りのウリジン要
求変異株は、形質転換可能なその能力に従って2種類の
補完グループ損工^及びツェBに属し、これはそれぞれ
変異株An8及びAnlOにより代表される。これらを
そのプロトプラストの形で形質転換条件下でd含有プラ
スミドルCG59Dフにより処理する。An8のみが形
質転換され、そしてその消化されたDNAとpUN12
1のDNAとのハイブリダイゼーション能力により証明
されるIA遺伝子を含有することが見出された。
質転換されDNA配列及びその製造方法に関する。この
様な形質転換体は例えば細菌、例えば大腸菌、又は糸状
菌、例えばアスペルギルス、ペニシリウム又はセファロ
スポリウム、そして特にA、ニドランス、A、オリゼー
、A、カルボナリウム、A、アワモリ又は特にA、ニガ
ー、例えばA、ニガーAn8である。本発明はさらに、
この様な形質転換体の製造方法に関し、この方法は宿主
を形質転換条件下で本発明の組換DNA分子、特にハイ
ブリドベクターにより、場合によっては選択マーカー遺
34処理し、そして形質転換体を選択することを特徴と
する。
を発現するハイブリドベクターの製造のための、組換D
NA又はその誘導体の使用に関する。
現せしめることを特徴とするポリペプチド製造方法に関
する。必要な場合にはポリペプチドが常法に従って単離
される。ベクターの構成に依存して、生成物は発現され
、あるいはシグナル配列が存在する場合には発現されそ
して分泌される。
列を培養することによって適当な宿主、例えばアスペル
ギルスの種において有用な同種性又は異種性蛋白質を生
産せしめることを特徴とする。
ていないことを意味する単一ポリペプチドPL八、 P
LB、 PLC,PLD、 PLE又はPLFを製造す
ることが可能である。例えば、PLA、 PLB、 P
LC,PLD。
プチドの製造のための1つの方法は、いずれのペクチン
リアーゼPLも発現することができない宿主を、PLA
、 PLB、 PLC,PLD、 PLE又はPLFの
生成物を発現するDNA発現ベクターにより形質転換す
ることを特徴とする。
ない宿主は、対応する遺伝子を有しない微生物、例えば
PL−アスペルギルスの株、非アスペルギルス糸状菌又
は他の任意の真核性又は原核性微生物、あるいはそのP
Lの生産が適切に条件調節された培地中で抑制されるア
スペルギルスの株である。例えば、単一PL遺伝子がグ
ルコアミラーゼプロモーターの制御のもとでA、ニガー
又はA、アワモリにおいて、PI+05プロモーターの
もとでS、セレビシェ−において、あるいはPLプロモ
ーターの制御のもとてPL−A、ニガーの株において発
現され得る。
の範囲を減縮するものではない。
エチル)−(グリコールエーテル)N、N、N’ 、N
’−四酢酸キロ塩基対 低融点 ミリオスモル ポリエチレングリコール リボ核酸 分当り回転数 ドデシル硫酸ナトリウム テトラサイタリン トリス(ヒドロキシメチル)−アミノエタン ユニット ボルト 11直履工劣■L」畿王 1111八 B/g BamHI 、
Bgl II 、 旧ndIII 、 Mbo
I 。
gCj2z、500mM NaCl2. 0.1%BS
A、0.1%ゼチランを含有。
使用される5×制限酵素緩衝液; 500mMTris
−IIC1(pH7,2)、 25mM MgCl z
250mM NaCl2 、 0.05% BSA
O,05%ゼチランを含有。
ラノシド(23,8mg/ml)。
キス(BBL)、 0.8%NaCl!、、 1
ml/ I Tris−HCj! (pH7,5)。
5%にH2PO。
リウム・N20(大腸菌用)、 1 mM MgSO4,1mMチアミン−)ICA。
ン(BBL) 、 10 g酵母エキス、5g Na
C1゜ TBEil衝液 11当り10.8 g Tris、
5.5 g硼酸、4dの0.5M EDTA(pH8
,0)。
8,0)、 1mMEDTA (pH8,0)。
0.1mMEDTA (pH8,0)。
ブロモ−4−クロロ−3−インド ツルーβ−ガラクトシド S S CO,15M NaCi 、 0.015M
クエン酸ナトリウム A、ニガー用最少培地 If中1.5g Kll□POa、 0.515 KC
l、。
Cβ10.0gグルコース、微量のFeSO4Mg5O
a+ ZnC122,Na011によりpl+6.5に
調整。
)、0.1%酵母エキ ス(BBL) 、0.05%酵母由来リボ核酸ナトリウ
ム塩(ICII、 C1eveland。
0tnリボフラビン、10mgパントテン酸、2■ビオ
チン、l0mg p−アミノ安息香酸、 100mg
ニコチンアミド、50■ピリドキシン−肛!。
L)の添加により固化し、上層のためには0.7%寒天
(BBL)又はアガロース(Seakem)を使用する
。
2.7g NazHPO4+8.5g NaC1゜ PSB 1101n Tris−flcj2(pH
7,6)、 100mMNa(f!。
7,6)、 100mM NaC1。
扛) A、 ニガーN593 c工≦」1へ+mじ【八
人。ニガーN756 ペクチナーゼ複合酵素の高生産
性のために選択された。
N756のウリジン要求変異株 大腸菌(E、coli)NM539 mete、 ■E、 hsdM” 、 hsdR赳ケ、
(P2cox3) 大腸菌MHI araD139.Δ里×74.幻
壮U。
ニ【八・大腸菌JM103 大腸菌JM109 大腸菌CJ236 大腸菌MVL190 Δお朽−程1.封戊、灸ばA・U郁・ 緬^l担KBI稍可R4、F ’ + LraD36
゜月1AB、暉5clq、ZΔM15 Δ吐匹−但1AB) 、息瓜A1.亜卦II…A96.
川工、罫R17,s且144゜relAl、 λ
−+(F’+ ↓JコaD36゜辺1AB、里1
’ 、ZΔ旧5〕 け吋−1,uy、−1+止、−1,息佳A−1; p
cJ105(Cm’); 810 −RADMuta
−Gene ?113生体外変異誘発キット 〔Δ(迅−胆ΔB)l貝住、 ■E。
’)(F’:地D36.但1AB、υ2c 1 qZ、
115)] 。MV1190株はBTORAD MUT
A−GENE M13生体外変異誘発キットの手引きに
記載され ている。
るλ置換ベクターである(Frischauf等、参考
文献2)。このベクターはλアームと非必須スタッファ
−(5tuffer)領域との間に多重クローニング領
域を含有する。これは、外来DNA挿入体が挿入される
場合に該ベクターアームへの該スタッファ−の再連結が
減少するように、多重制限酵素消化が行われることを可
能にする。このベクターはまた組換体の直接選択をもた
らすためにΣL±表現型を用いる(Zissler等、
参考文献20)。
.3に記載されており、pBR322中にクローン化さ
れたA、ニガーN756のP佳D(PL I )遺伝子
を含有する。
.3に記載されており、正佳D (+’L I )遺伝
子のN−末端EcoRI断片を含有する。
.3に記載されており、Jl!iLD (PL l )
遺伝子のC末端EcoRI断片を含有する。
る耐性のための遺伝子(amp’ )及びテトラサイク
リンに対する耐性のための遺伝子(Let” )を有す
る。このプラスミドは幾つかのユニーククローニング部
位を有し、その幾つかは該amp遺伝子又はtet遺伝
子中に存在し、その結果クローン化DNAの挿入が抗生
物質感受性細菌を導く。
)により記載されている。
載されている。
ander等、文献21)は単鎖D N Aバタテリオ
ファージM13の誘導体であり、そして多能なポリリン
カ一部位におけるDNA断片のクローニングを可能にす
ることによるDNA配列決定及び同じ制限断片の可能な
両方向でのクローニングを容易にするように設計されて
いる。これらのベクターにクローニングされた配列は配
列決定反応のための、並びに標準的オリゴデオキシリボ
ニクレオチドプライマー及び大腸菌DNAポリメラーゼ
■のKleno−断片を用いる単鎖プローブの製造のた
めの鋳型として容易に用いることができる。このベクタ
ーDNAは大iA菌1ac−オペロンプロモーター及び
β−ガラクトシダーゼの最初の145アミノ酸の遺伝情
報を担持する。多重制限部位を含有するポリリンカー部
位はIacZ配列に挿入されている。このポリリンカー
は1acZリーデイングフレームを保持しており、そし
てこのベクターはLacZα宿主株に対立遺伝子補完を
与え、IPTG及びX−galを含有するプレート上に
青色のプラークをもたらす。このリーディングフレーム
を破壊するか又は1acZαペプチドの発現を妨害する
挿入部を含有する組換ファージは無色のプラークとして
示される。
されており、そして大腸菌BJ5183/ pCG 5
9D7 (DSM3968)から得ることができる。こ
のプラスミドはm遺伝子を含んで成り、そしてA、ニガ
ーpyrA変異株の同時形質転換のために使用される。
RATAGENE、 サンジエゴ、 CA、米国) M13ファージの複製起点を含有するdsDNAベクタ
ーである。ヘルパーファージ、例えばM13KO?(参
考文献29)又はR408(参考文献9)の存在下で、
このベクターの(+)−鎖は複製され、パッケージされ
、そして培地に遊離される。
−の最少培地に10”胞子/dの最終胞子密度になるよ
うに接種し、そしてニュー・プランスウィック(Ne賀
Brunswick) ロータリーシェーカーを用い
て28°C、300rpmにて24時間11のエルシン
マイヤーフラスコ中で振とうする。ミラクロス(Myr
acloth)を有するブフナー漏斗を用いる濾過によ
り菌糸を収得し、冷無菌塩溶液により洗浄し、液体窒素
中で凍結し、そして−60°Cで貯蔵するか又は直接使
用する。このゲノムライブラリーの調製のためのDNA
の単離のために使用される方法はYe I ton等(
参考文献l)により記載されている方法に基く。この方
法によるDNAの収量は約50〜too n/ g菌糸
である。
でIgずつブラウン(Broun)マイクロ−ディスメ
ンプラーター中で粉砕する。粉砕した菌糸を、200戚
の抽出11衝液(50mM EDTA pt18.2.
0.2%5O5) 及び200μlのジエチルピロカー
ボネートを収容する1fの無菌エルレンマイヤーフラス
コに移す。この混合物を徐々に室温に加熱し、そして次
に時々撹拌しながら68゛Cに20分間加熱する。懸濁
液を室温に冷却し、そして12,0OOX gにて15
分間遠心分離する。1716容量の8M酢酸カリウム溶
液(pH4,2)を上清に加え、そしてこの混合物を氷
上に1時間置く。遠心分離(20分間i16.000X
g;4°C)により沈澱を除去する。0.6容量のイソ
プロパツールと共に氷上で15分間インキュベートする
ことにより上清から核酸を沈澱せしめる。
によりペレットを集め、70%エタノールで洗浄しそし
て短時間乾燥する。ベレットを20n/dのRNアーゼ
A(ベーリンガー・マンハイム)を含有するladのT
E中に懸濁し、そして37°Cにて15分間インキュベ
ートする。DNAを、ヌクレアーゼを含有しないプロナ
ーが(最終濃度1■/成) (Kochlight。
る。TE緩衝液中プロナーゼストック溶液は20■/d
の酵素を含有し、これを37°Cにて1時間インキュベ
ートしてヌクレアーゼを消化する。
2−のlO■/Id臭化エチジウムを添加し、そしてこ
の溶液をベックマンS−410−ター中で33.00O
rpmにて60時間遠心するか、又はベックマン50T
iローター中でクイックシールチューブを用いて45
、00Orpmにて40時間遠心分離する。チューブの
側壁穿孔によりDNAバンドを集める。水−及びNaC
l−飽和イツブロバノールでの複数回の抽出により臭化
エチジウムを除去する。5容量のTEを添加し、そして
DNAをTE飽和フェノール、フェノール/クロロホル
ム/イソアミルアルコール25:24:1、及びクロロ
ホルム/イソアミルアルコール24:1により抽出する
。0.1容量の3M酢酸ナトリウム(pi(5,2)及
び2.5容量のエタノールの添加並びに−20°Cにて
一夜のインキュベーションによりDNAを沈澱せしめる
。沈澱を遠心分離(I時間; 30,0OOX g ;
4°C)により集め、70%エタノールにより洗浄し
、乾燥し、そして400μlの低濃度TEに溶解する。
I i4 j、fを試験するため、InずつのA、ニ
ガーN400 DNAを、減少する量のMbo I (
0,5〜O,0OIU)を含む適切な緩衝液中で10μ
lの容量で37°Cにて1時間消化する。IIJlの0
.25M EDTAの添加により反応を停止し、そして
サンプルを、1gg / ml臭化エチジウムを含有す
るTBE中0.6%アガロースゲルに負荷する。便利な
マーカーは、49.22.8.13.6.9.82.3
kbp及び見えない0.45kbpの断片を与えるBg
l■消化λDNA並びにλDNAの混合物である。高収
量の目的とする13.6〜23kbp断片を与えるのに
必要なMbolの濃度は0.02U/i DN八である
。従って、全容2d中20OnのDNAが消化され、そ
して酵素添加の直後に同じ量の20個口に分けられる。
Lnのサンプルをゲル上で泳動して適当な消化について
試験する。結果が陽性である場合、EDTAを最終濃度
25mMに加えて反応を停止せしめ、酵素を65°Cに
て10分間熱失活せしめ、サンプルをプールし、そして
DNAを沈澱せしめ、洗浄し、乾燥しそして400μl
のTEに溶解する。
センターウェル120X 1.5 mm)上で一夜分離
する。BglIIにより消化されたλDN八をマーカー
として用いて4°C及び40V(3V/Ω)での電気泳
動により部分消化DNA断片のサイズを決定する。
出し、そして無菌透析チューブ内で2dのTBE中テ1
00vニテ2〜3時間、DNAをゲルから電気溶出する
。電流を30秒間逆転せしめ、そしてDNAを含有する
緩衝液を集める。次に、断片をエタノール沈澱により濃
縮しそして1004の低濃度TE中に溶解する。
ーEMBLd中に作製する。9〜24kbpのクローニ
ング容量を有するこのベクターはFr1schauf等
(参考文献2)及びKarn等(参考文献3)により記
載されており、そしてプロメガ・バイオチク社(Pro
mega Biotech、Inc)により販売されて
いる。
本発明者等はクローニングのため13.6kbpの最少
断片長を用いた。
HIにより適切な緩衝液中で100#の容量で37゛c
にて2時間消化する。酵素を65°Cにて1o分間不活
性化する。
トの5allを加え、そして37°Cにてさらに2時間
インキュベートする。EDTAを25mMとなるように
添加しそして酵素を不活性化(65°C,10分間)し
た後、溶液を同容〒のフェノール(TE飽和)、フェノ
ール/クロロホルム/イソアミルアルコール(25:2
4:l)、及びクロロホルム/イソアミルアルコールに
より抽出する。小Bam1l I / S al Iポ
リリンカー断片を除去するため、0.1容量の3M酢酸
ナトリウム(pH5,2)の添加の後0.6容量のイソ
プロパツールによりDNAを沈澱せしめる。氷上に15
分間置きそして12,000Xg及び4°Cにて15分
間遠心分離した後、沈澱を70%エタノールにより十分
に洗浄し、乾燥しそして40IJ1の低濃度TEに溶解
する。
クターのCOS部位がアニールされることが必須である
。 100mM Tris−)ICl3 (pH7,5
)及びlO+++MMgCQ z中のベクターを65°
Cにて10分間加熱しそして次に42°Cにて1時間ア
ニールせしめる。試験連結から、約1:1 (重量比)
のベクタ一対断片の比率が最も多くの組換体を与えるこ
とが見出される。連結を50mM Tris−IICf
f (pH7,5)、 10mMMgCQ zllom
M DTT及び1mM ATP中で、9.5 pgのベ
クター及び10■のDNA断片を用いて全容100μ!
で行う。次に、DNAリガーゼ(BRL)を0.5tl
/ff DNAの濃度で加え、そして連結混合物を14
゛Cにて一夜インキユベートする。連結について試験す
るため、連結されたDNAのサンプルをアガロースゲル
上で泳動せしめる。0.5硝量のベクターを5I!lの
容量中で断片の添加を伴わないで連結する。
て20Illの低濃度TEに溶解した後にパッケージン
グを行う。生体外パンケージングは、プロメガ・パッカ
ジーン(Promega Packagene)エクス
トラクトを用いて製造者の指示に従って、DNAのパッ
ケージII4に1Oplずつ用いて行う。エクストラク
トと共に提供される高分子量λ。■857Sam7の内
1蛸を別にパッケージして対照とする。
(PSB)を添加し、そして5111のクロロホルムを
添加する。組換えファージストックは4°Cにて貯蔵す
ることができる。得られたライブラリーは、2回の別々
の連結実験により作製されたものである。
mM MgSO4及びIn+MCaCj2.を含有する
LC培地で1、0の光学濃度(600nm)に増殖せし
める。次に、この培養物の0.2 urlのアリコート
をPSB中ファージ稀釈シリーズ0.1 dに加える。
dの0.6%LC上層寒天(45°C)を加え、この混
合物をLC寒天プレート上にプレートし、そしてこれら
を37°Cにて一夜インキユベートする。ファージ懸濁
液d当すファージ形成ユニット(pfu)の数として示
されるタイトレージョンの結果は、例1.4に従って調
製された2個のファージストックにっき12 X 10
’及び4.2 X 10’pfu/ railである。
ド(それぞれ17%及び40%)を差引いた後、組換え
体の絶対数は6X10’であり、これはゲノムの長さの
200倍を超える。
の80μ!の部分を用いて大腸菌NM539細胞に感染
せしめ、これをLC上層アガロース中でLC寒天プレー
ト上にプレートし、そして37°Cにて一夜インキユヘ
ートする。このプレートをプレート当り5dのPSBと
共に穏やかに振とぅすることによりファージをアガロー
スから溶出する。
間)細菌を除去し、そしてクロロホルムを0.5%の最
終濃度になるように加える。次に、およそ同じ程度に増
幅された両ファージストックを混合しく40紙ストック
)、タイトレージョンしく8 X10’pfu/ml)
そして4℃にて貯蔵する。
−から稈1.D遺伝子を単離するため、2.5×104
のファージを液化したLC上層アガロースと混合し、そ
して5枚のLC寒天プレート上にプレートする。プレー
トを37°Cにて一夜インキユベートシ、そして4°C
にて2時間冷却する。Benton及びDavis(参
考文献4)のプラークハイブリダイゼーション法に従っ
て、各プレートから2枚のレプリカを作る。第一フィル
ター(Sch Ieicher及び5chiill B
A85又はMillipore HATP 085)を
プレートの上に1分間置き、第二レプリカを2分間置き
、そしてレプリカの位置をインディアインクを用いて印
す。
(LM NaC1、0,5M Na0H)を収容した皿
に1分間置き、そして100Idの再生溶液(0,5M
Tris−)ICf(pH7,5)、 1.5MN
aCf)中に1分間置く。
0,15M NaC1,0,015Mクエン酸ナトリウ
ム(pH7、0) )を収容する皿に移す。手袋をはめ
た手でフィルターを穏やかにこすって細菌破片を除去し
、3xsscを入れた新たな皿に移し、そして室温にて
穏やかに200分間置うする。フィルターをワットマン
3MMペーパー上にプロットしそして10分間室温にて
乾燥する。フィルターをワットマン3MMペーパー上オ
ーブン中で80°Cにて2時間乾燥する。次に、これら
を6xssc中で0.5時間室温にて洗浄し、そして次
に50mM Tris−)1(、i!、(pH7,5)
、 10mM EDTA、 LM NaC1
,0,5%SOS、 0.1%ピロリン酸ナトリウム
、10×デンハート〔50×デンハ一トー1%BSA
(ベーリンガー・フラクション■)、1%ポリビニルピ
ロリドン−40,1%フィコール400〕から成る予熱
(56°C) したプレハイブリダイゼーション混合物
50m1に移す。このプレハイブリダイゼーション混合
物に0.1 mg / mlの変性したサケ精子DNA
(Maniatis等、327頁、参考文献5)及び0
、01 mg / mlのpoly rAを新たに加
える。
やかに振とうしながら行う。ハイブリダイゼーションに
使用したプローブはpPL35−5のニック・トランス
レーションされた3、5kbp EcoRI断片であり
、このものはA、ニガーN756株の耐り遺伝子のC−
末端領域を含有する(大腸菌BJ5183/pcG3B
11.05M3916. EP 88101397.3
から入手可能である)。この断片を低融点アガロースゲ
ルからあらかじめ単離し、そして0.3肩の断片をニッ
ク・トランスレーションする(Maniatis等、p
pto9−112 ;参文献5)。ニック・トランスレ
ーションされたDNAを沸騰浴中で10分間変性せしめ
、氷上で冷却し、そして501dの予熱したプレハイブ
リダイゼーション混合物に添加する。プレハイブリダイ
ズ処理されたフィルターを1枚ずつハイブリダイゼーシ
ョン混合物に移す。ハイブリダイゼーションは56°C
にて一夜、穏やかに振とうしながら行う。フィルターを
、0.5!の4 X5SC,0,1%x sosにより
2×30分間、そして2 X5SC,0,1%SDSに
より2×30分間洗浄する。フィルターを3MMペーパ
ー上にプロットし、そして1時間空気乾燥する。これら
を3MMペーパー上にはり付け、そして放射性インクに
より標識した後、フィルターをサランダップで包み、そ
してコニカX−線フィルム及びコダックX−Omati
cカセントを通常の増強スクリーンと共に用いて一70
°Cにて一夜オートラジオグラフィー処理する。こうし
て、スクリーニングした5枚のプレートから44個の陽
性シグナルが得られる。インクマーカーを用いて正しく
オートラジオグラム上にプレートを注意深く置くことに
より、無菌パスツールピペットを用いて陽性プラークを
拾い上げる。陽性プラークを含む寒天片を0.1 dの
PSB中に分配する。時々渦動しながら室温にて1時間
、ファージを寒天から拡散せしめる。5分間遠心するこ
とにより寒天及び細菌細胞片を除去し、10μlのクロ
ロホルムを加え、そしてファージストックを4 ’Cに
て貯蔵する。
ージが高密度でプレートされるので、これらを低密度(
±100ファージ/プレート;10’[釈のファージス
トック0.1d)でプレートし、そしてレプリカプレー
ト、ハイブリダイゼーション及び陽性プラークの拾い上
げの全工程を反復することにより、陽性プラークを2回
精製しなければならない。
ず、例1.5に記載したようにして精製されたクローン
からのファージストックにより大腸菌)JM539を感
染せしめそしてこの細胞をLC上層寒天中でLC寒天プ
レート上にプレートすることにより増幅する。これによ
り指示細菌が全面で溶解しているプレートが得られる。
に振とうしながらファージを溶出する。溶出されたファ
ージを収得し、遠心分離により細胞片を除去し、そして
クロロホルムを1%となるように加える。得られるプレ
ート細胞溶解物を4°Cにて貯蔵する。
ーを有する。
らの小規模単離法(Maniatis等、65−68頁
、参考文献5)が常に消化性DNAを提供するとは限ら
ないので、ファージを250dの細胞溶解物から単離す
る。これらは、宿主大腸菌NM539をLC+0.2%
マルトース、10mM MgSO4,1mM CaC1
z中で0.3の0.0.600まで増幅せしめそして次
に約10”pfuのプレート細胞溶解物を添加すること
により調製される。さらに培養する場合、細胞は4時間
以内に溶解する。
るようにRNアーゼ及びDNアーゼを加え、そして細胞
熔解物を室温にて1時間放置する。細胞破片を遠心分!
(20分間、室温、10.000 X g )により除
去する。14.8 gのNaCl及び25gのPEG6
000を上清中に溶解しテIMNaCj2及び25%(
V/V)PEG ノ最終濃度とする。ファージを氷上で
1時間又は4°Cにて一夜沈澱せしめ、そして遠心分離
(20分間110.000x g ; 4°C)により
収得する。ペレットを3 mflのλ稀釈液(LDB:
101M Tris−11Cffi (pH7,5)
20mM MgCf 2+ 100mM Na(/!
)中に懸濁する。2.5gのCsClを4−のファージ
懸濁液に溶解し、そしてこの混合物を5IR1のベック
マン・クイックシール・チューブにピペットにより移し
、次にこのチューブにLDB中同じ濃度のCsClによ
り満たす。チューブをシールし、そしてベックマンνT
i6s、 z ローター中で50.00Orpm及び4
°Cにて一夜遠心する。通常の電灯の下で見ることがで
きる濁ったファージバンドをチューブの側壁に窄孔して
取り出す。無菌チューブ中で22のlosM Tris
−IICP(pH7,5)、 10a+MMgCj2
z、 50mMNaClニ対して4°Cにて4時間透
析することによりCsClを除去する。緩衝液を1置溝
たす。ファージを無菌グライナ(Greinet)チュ
ーブ中に集め、容量を透析緩衝液によりlitに調整し
、5oIiの10%SOS。
及び25Il!(7120mg/d ヌクレアーゼ不合
プロナーゼを加え、そしてチューブを37°Cにて1時
間インキュベートする。容量をTEにより3JIiに増
加し、そしてこの溶液を等容量のTE飽和フェノール、
フェノール/クロロホルム/イソアミルアルコール(2
5:24:1)及びクロロホルム/イソアミルアルコー
ル(24:1)により抽出する。0.1容量の3M酢酸
ナトリウム(pH5,2)及び2.5容量のエタノール
を添加した後・DNAを一20°Cにて一夜沈澱せしめ
、そして遠心分離(20,000x g 、 4°c
にて1時間)により集める。ペレットを70%エタノー
ルで洗浄し、乾燥し、そして200 ulの低濃度TE
中に溶解する。
解物である。
に用いる。1■のファージDNAを10ユニツトのEc
oRI又はBglI[により2oll!の容量において
37°Cにて2時間、供給者が推奨する緩衝液中で消化
する。マーカーとしてl1indll[で消化したIn
のλc 1857 SamI DNA(λXtlind
I[I)並びに対照としての1肛4 DNA及びEco
RIで消化したpcG3B11ONAを用いて、サンプ
ルを0.6%アガロースゲル上で分離する。ポラロイド
667を用いて[JVlランスイルミネーター上でゲル
を写真にとる(4s。
icher & 5chjillBA85フイルターに
Sou thern (I975)の方法に従ってMa
niatis、 382 386頁(参考文献5)に
より記載されているようにして移す。フィルターを、全
遺伝子をカバーする限江り遺伝子の32Pラベル化(ニ
ック・トランスレーション)断片のrl 合物(!:ハ
イブリダイズせしめる。これらの断片はpPL29−5
の2.9kbp EcoRI断片及びpPL35−5の
3.5kbp EcoRI断片である。ハイブリダイゼ
ーション及び洗浄の条件は例2.1に記載したそれらと
同じである。
することにより写真及びオートラジオダラムからバンド
の長さを計算する。クローンの制限地図を第1図に示す
。クローンλ−PL4 、−14及び−40は、pcG
3B11中に見出される2、9kbp及び3.5kbp
のEcoRIハイブリダイズ断片の両者を含有する。λ
−PL5 、−6 、−10及び−33は他のハイブリ
ダイズEcoRI断片と共に3,5kbp EcoR1
回片を含有する。クローンλ−PL26及び−28は2
.9kbp EcoRI断片を他のハイブリダイズ断片
と共に含有し、他方λ−PL9は小1.2kbpハイブ
リダイズEcoRI断片のみを含有する。全構造喝佳り
遺伝子を含有するpcG3B11の完全な5.0kbp
B gl ■断片はクローンλ−PL4 、−14及
び−40のみに存在する。クローンλ−PL5 、−6
、−10.−14゜=33及び−40中には存在する
がpcG3B11中には存在しない3.7kbpハイブ
リダイズ・バンドは5.5kbp断片中の店佳り遺伝子
の下流に位置する。幾つかのハイブリダイズBglI[
断片はなおベクターの1、2 kbpの右アームを含有
する。すべてのクローンはまた同一の非ハイブリダイズ
断片を含有する。
ンはすべてのクローンにおいて同一であるから、これら
は同じ遺伝子、すなわちA、ニガーN400株の耐り遺
伝子から生ずると結論付けられる。
されるゲノムの長さから、平均挿入部長さ1.5kbp
を有する25,000クローンにつき少なくとも12個
のP壮Dクローンが見出されると期待される。分析され
た10個のクローンの内わずか2個が同一であるからラ
イブラリーは予想以上に複雑である(例3を参照のこと
)。
子を含有するλ−PL4及びpcG3B11の5.0k
bp Bglll断片をプラスミドpBR322(クロ
ーニングベクターを参照のこと)のBamHI部位にサ
ブクローニングする。4nのλ−PL4及び2jrgの
pcG3B11を20m中でIOUのBglIIを用い
て37°Cにて2時間、完全消化する。TBE+ 1
pg/d臭化エチジウム中1%低融点LMPアガロース
(BRL)上で50Vにて断片を分離する。5.0kb
pの断片をゲルから切り出し、0、4 jlli!のT
Eで稀釈し、等容量のフェノールを加え、そしてこの混
合物を65°Cにて10分間加熱してアガロースを溶融
せしめる。エッペンドルフ5414S机上遠心機中で1
2000rpmにて5分間の遠心分離の後、水相をフェ
ノール/クロロホルム及びクロロホルムで抽出し、エタ
ノール沈澱せしめ、洗浄し、乾燥し、そして最後に10
J11の低濃度TE中に溶解する。
、参照文献5)により調製されそしてCsC1勾配遠心
により精製された1鱈のpBR322DNAを5UのB
am)I Iにより37°Cにて2時間、2oJ11の
容量中で消化する。2Iのl0XCIP 緩衝液及び0
.02ユニツトのCIPを添加し、そしてインキュベー
ションをさらに30分間続ける。EDTAを最終濃度2
5mMに添加し、そしてこの混合物を65°Cにて10
分間加熱する。
和フェノールで3回、フェノール/クロロホルムで1回
、及びクロロホルムで1回抽出する。
に?容量する。
、20μlの容量において、例1.4に記載した条件下
で連結する。この連結混合物の半分を用いて、CaCl
z法(Maniatis等、参考文献5.250頁)
により調製した大腸菌MHIコンピテント細胞を形質転
換する。細胞を、50n/Il!アンピシリンを含有す
るLC寒天プレート上に置き、そして37゛cにて一夜
インキユベートする。コロニーをまず20μg/dのT
cを含有するLCプレート上にストリ−りし、そして次
にLC+ ampmp−レート上トリークすることによ
り、形質転換体をテトラサイタリン感受性について試験
する。形質転換体を5dのLC+ amp中で37°C
にて一夜増殖せしめ、そしてアルカリ溶解ミニプレツブ
法(Maniatis等、参考文献5.368頁)を用
いて1.51の培養物からDNAを単離する。
り消化し、そして断片を1%アガロースゲル上で分析す
る。5.0kbp B gl II断片を反対方向に含
有する、λ−PL4由来の2つのプラスミドをpGW8
40及びpGW841と称する。pCG3B 11由来
の他のプラスミドをpGW870及びpGW871と称
する。これらを有するMHI細胞をグリセロール上に一
70°Cにて保持する。これらのクローンの0.52の
培養物からのプラスミドDNAを大規模に単離しくMa
niatis等、参考文献5.86頁)、CsC1遠心
により精製し、フェノール抽出し、エタノール沈澱せし
め、そして400Iの低濃度TEに溶解する。収量は約
500汀である。これらのプラスミドを制限地図の作成
に付す。プラスミドpGW840のマツプを第2図に示
す。これはpGW870と区別できない。さらに、反応
方向に断片を含有するプラスミドpGW841とpGW
871は区別できず、A、ニガーN400株及びN75
6株からの耐り遺伝子が同一であることが示される。
容量中で37°Cにて4時間、HHAB/g緩衝液中で
BamH[(BRL)又は旧nd m (BRL)を用
いて消化する。消化されたサンプルを0.6%アガロー
スゲル上で40Vにて18時間電気泳動的に分離する。
載したようにして乾熱する。(プレ)−ハイブリダイゼ
ーション溶液は例2.1に記載したものと同じである。
ハイブリダイゼーション温度と同一である。耐り遺伝子
のコード領域を含有するpGW840のニック・トラン
スレーションされた1、6kbp BamHI/Pst
l断片をプローブとして用いた。ハイブリダイゼーショ
ンを異る温度(52’C、60°C及び68°C)にお
いて16時間及び40時間行う。3つの異る温度におい
て次の2種類の洗浄条件を用いる:2X30分間、5
X5SC,0,1%SDS、次に2×30分間、3XS
SC,0,1%SDS 、 これに対して4×30分間
、5XSSC,0,1%SO5、68°Cにためには、
2xssc。
,0,1%SOSによる2回の洗浄も含める。68°C
において、0.2XSSC洗浄を用いてホモロガス(h
omoragous)ハイブリダイゼーションのみ起こ
る。より高い塩濃度の使用が幾つかの他の弱いシグナル
の出現をもたらす。52℃においてはバックグラウンド
が高く、そしてハイブリダイゼーションは弱い。[ヘテ
ロロガスJ (heterologous) Aイブリ
ダイゼーションのために見出される最良の条件は、5x
sscと3XSSCの組合わせ洗浄を用いて60°Cに
て40時間である。これは、5xsscと3XSSCと
の組合わせの代りに4XSSCと2XSSCの組合わせ
を用いることにより一層最適化することができる。
t I断片を用いてプローブする場合にA、ニガー皿の
これらのゲノムプロットで見られるシグナルを第1表に
まとめる。
st IによりプローブされたA、ニガー顯のゲノム
DNAのハイブリダイゼーションシグナル 輿11−イブ−1−のスフ1−ニング N400λライブラリーからの2.5X10’のファー
ジを5枚のプレート上に置き、そして例2.1に記載し
たようにして各プレートから3枚のニトロセルロースレ
プリカを作る。(プレ)ハイブリダイゼーション緩衝液
も例2.1に記載した通りである。
、pGW840の1.6kbp BamHI / P
st I断片とハイブリダイズせしめ、そしてその温度
で30分間4xssc。
0,1%SDSにより2回、例3.1に記載したように
して洗浄する。これらの条件をヘテロロガス条件と称す
る。各プレートからの第二のレプリカを68°Cにて同
じ断片とハイブリダイズせしめ、2 X5SC,0,1
%SOSにより30分間ずつ2回、そして0.2 X
SSC。
浄する。これらの条件をホモロガス条件と称する。
pGW840の0.35kbp BaIII)l 1断
片とハイブリダイズせしめる。この断片は前記1.6k
bp Bam1l I /Pstl断片に直接隣接した
mlDのプロモーター領域中に位置する。ヘテロロガス
条件下でノ\イブリダイズするがホモロガス条件下では
ハイブリダイズしないか(又は非常に弱くハイブリダイ
ズする)29個のプラークが得られる。これらをλ−P
L101〜λ−PL129と命名する。ホモロガス条件
下及びヘテロロガス条件下でBamHI / P st
lプローブと強くハイブリダイズする19個のプラー
クを得る。
して止1Dクローンであると考える。これらの内2個(
λ−PL145及びλ−PL146)は0.358am
ll lプローブと弱くのみハイブリダイズし、そして
それ故におそらくプロモーター領域の部分のみを含有す
る。
amll 1プローブのみとハイブリダイズする唯一の
クローン(λ−PL149)が得られる。
1.6kbp BamHI / P st lプローブ
とへテロロガス条件下でハイブリダイズせしめることに
より2回精製する。第二のスクリーニング実験において
23個のは佳Dクローン及び25個の他のクローンをさ
らに得る (λ−PL151〜λ−PL19B)。
分をプローブとして用いることにより、単離されたクロ
ーンの分類を記載する。λ−PL101〜−130及び
−145が含まれ、他方λ−PL4は陽性対象として使
用する。クローンをプレートしそして1枚のみレプリカ
を作り、これを6個の部分に分ける。これは、レプリカ
間のハイブリダイゼーションシグナルの差異を排除する
ことを意味する。レプリカの別々の部分を下記の3zP
ラベル化プローブと、ホモロガス条件下及びヘテロロガ
ス条件下でハイブリダイズせしめる。
I / P st T断片 2、pGIIJ840からの649bp Ban+HI
/ Xho I断片(耐りのN−末端コード部分) 3、 pGW840からの244bp Xho I
/ P st I断片卵重りのC−末端コード部分) λ−PL4 、−’130及び−145並びにλ−PL
101はこれらのプローブと、ホモロガス条件及びヘテ
ロロガス条件下で強くハイブリダイズし、LiDクロー
ンと予想される。後者のクローンλ−PL101は例3
.2においてフィルターの縁の部分に位置し、そしてそ
れ故に第一のスクリーニングにおいては止10としてス
コアーされない。上記のクローンはクラスI (ル壮[
1)クローンとして分類される。λ−PL112 、−
126及び−127はこの実験において陰性と除去され
る。他のすべてのクローンは他の2つのクラスに分ける
ことができる。クラス■は全体プローブとのみならずN
−末端プローブともへテロロガス条件下でハイブリダイ
ズする。ブローフトして全体は江り遺伝子を用いる場合
ホモロガスハイプリダイゼーションは弱い、クラス■プ
ローブはN−末端プローブとは全くハイブリダイズせず
、そして、さらにホモロガス条件下で全体プローブとハ
イブリダイズしない。C−末端プローブはクラス■クロ
ーン及びクラス■クローンの両者とハイブリダイズしな
い。これらの実験から、本発明者等は単離されたクロー
ン間に少なくとも2つの関連する遺伝子が存在すると結
論する。
。
−122゜124 、−125 、−128及び−12
9が属する。
107、−108、−110、−111,−116゜−
118、−120、−121及び−123である。
熔解物、及びこれらの細胞溶解物からの大規模ファージ
DNA調製物を例2.2に記載したようにして調製する
。これを24クローンについて行い、その内の3クロー
ンはは佳Dクローン(λ−PL4゜130、−145)
である。1つのクローンDNAはDNA単離の間に失わ
れる(λ−PL124)。これらのクローンから単離さ
れたDNAを合計2011!中1nのサンプルとして1
0ユニツトの酵素により消化する。すべてのクローンを
EcoRI 、 BamHI 、 Hindm 、Ec
oRI/BamHI 、BamHI/Hindlll
、EcoRI/HindI[[、及び1EcoRI /
BaIIIHI / l1ind IIIにより消化
する。断片を0.6%アガロースゲル上で分離し、そし
て例2.3に記載されているようにしてニトロセルロー
スフィルターに移す。例3.1に記載したようにして、
プロットをヘテロロガス条件下でpGW840の1.6
kbp Baa+HI / P s口断片とハイブリダ
イズせしめる。2つのクローンはハイブリダイスしない
(λ−PL112及びλ−PL129)。写真及びオー
トラジオグラムの両者からのハンドの長さを計算する。
全なマツプを導くには多過ぎる断片を含有する。
ことができ、そして他のハイブリダイズしないバンドの
データーを組み合わせることによりどのクローンが同じ
遺伝子に由来するかを帰属せしめることができる。残っ
た18のクラス■及びクラス■コロニーに間に5個の遺
伝子が存在することが明らかである。これらを正佳A、
部佳B、 倶佳c。
ンの帰属を第2表にまとめる。
ダイズするバンドの比較(バンドの長さkbp) (部分)は、ハイブリダイズするバンドがこれらのクロ
ーン中に部分的にのみ存在することを意味する。
ゲノムDNAプロットからのハイブリダイズする断片の
長さの比較を第3表に示す。これらのデーターから、ゲ
ノムプロット中のすべてのハイブリダイズするバンドが
、単離されたクローン中に存在すること、及びこれらの
ハイブリダイゼーション条件下で他の関連遺伝子は単離
できないことが結論付けられる。プラークハイブリダイ
ゼーションの結果(例3.3)が示すところによれば、
部分的クローンを考慮しなければ、すべての遺伝子が試
験されたプローブとの特異的ハイブリダイゼーションパ
ターンを示す。これを第4表にまとめる。
ブラークハイプリダイゼーション及びヘテロロガスプラ
ークハイプリダイゼーションにおける、種々のは佳Dプ
ローブとの種々の遺伝子のシグナル強度の比較を示す。
ロガスpelD遺伝子は少なくとも10+印とハイブリ
ダイズする;士非常に弱いハイブリダイゼーション;−
ハイブリダイズせず。
イズする断片を、EcoRI 、 Bam1l I又は
旧nd■により消化されそして次に脱リン酸化されたベ
クターpBR322にサブクローニングする。LMPア
ガロースゲルからの断片の単fil!、ベクターの調製
、連結、大腸菌Mlllの形質転換、ミニプレツブDN
A単離及び大規模プラスミド単離はすべて例2.4に記
載した標準的方法を用いて行う。
連結する。形質転換された大腸菌MHI細胞をLC+
50躍/zfAmp上にプレートする。形質転換体をテ
トラサイクリン感受性について試験スる。
レツブDNAを適切な酵素で消化して正しい挿入につい
て試験しそして断片の方向を決定する。
有する細胞を一70°Cにてグリセロール上で貯蔵する
。
W820. −830 、 −850 、 −860及
び−880を大規模に単離し、そして制限酵素地図の作
成にかける。これらのプラスミドの地図を第1図〜第6
図に示す。
化物のサザンプロットをヘテロロガス条件下でpGW8
40の1.6kbp BamHI / P st I断
片とハイブリダイズせしめ、そして同じプロットを同じ
プラスミドのN−末端断片とへテロロガス条件下でハイ
ブリダイズせしめる。この断片はpGW820及び−8
30のマツピングのためには649kb BamHI
/XhoI断片であり、そしてpGW850及び−86
0のためには766bp BamHI / EcoRI
断片である。
50. pGW860及びpchsgoは大腸菌HB1
01中にクローン化され、そして1988年2月1日に
、Deutsche Samaelung fijrM
ikroorganisgmen; Grisebac
hstr、 8.3400+ Gijt−tingen
に寄託された。これらはそれぞれDSM No。
を有する。
の定 例2.4に記載したようにしてLMPアガロースゲル電
気泳動の後にρGW840からの適当な制限断片を単離
する。BRL M13クローニング/ジデオキシ配列決
定指示手引(参考文献6;26頁及び27頁)に従って
、前記の断片をM13mp18RFベクター及びM13
np19RF < ’) ターニ連結する。大腸菌JM
103 (7)形質転換、最少X−gal指示プレート
上でのブレーティング、及び組換ファージがらの単tJ
(D N Aの単離を前記手引(29〜34頁)の指示
に従って行う。少数のクローンを、BRL手引の38〜
74頁に記載されているSangerジデオキシチエイ
ンターミネーション法を用いて配列決定する。
列ハ、A、ニガーN756に由来しそしてプラスミドp
cG3B11(EP 88101397.3)中に存在
するPL■遺伝子の対応する配列と同一である。−45
7位のBamHIから+100位までの決定された配列
はプロモーター配列の457ヌクレオチド、シグナル配
列をコードする57ヌクレオチド及び成熟PLD蛋白質
の最初の13個のN−末端アミノ酸をコードする43ヌ
クレオチドを含んで成る。
1中のN756 mlDの同じ制限地図並びに完全に同
一のN末端配列データーから、同遺伝子は同一であるこ
とが予想される。従って、PLD蛋白質は以前のPLI
蛋白質と同一であることが予想される。
pGW830及びpGW850の断片をM13mp1
8RF及びM13mp19RF (例4.1を参照のこ
と)に、又はプラスミドpEMBL18及びpEMBL
19 (Dense等、参考文献7.8)にサブクロー
ニングする。ヘルパーファージR408(Russel
l等、参考文献9)の感染によりプラスミドクローンの
単鎖DNAを得る。Hen1−koff (参考文献2
8)の方法によりpGW850からエキソヌクレアーゼ
■除去クローンを調製した。2佳C遺伝子を含有するp
GW850からの3.0kb Sma I −BglI
I断片をpEMB19にサブクローニングする。このク
ローン50河をSmal及び5aclで消化し、そして
フェノール/クロロホルム抽出及びエタノール沈澱の後
、エキソヌクレアーゼ■により消化する。サンプルを種
々の時間間隔で採取し、NaC1及びEDTAの添加並
びに70°Cにて10時間のインキュベーションにより
エキソヌクレアーゼ■を不活性化する。突出した5sD
N^末端をSLヌクレアーゼで除去しそして接着末端を
T4 DNAポリメラーゼにより平滑化する。自己連結
及びこれらの除去クローンによる大腸j[JM103の
形質転換の後、ヘルパーファージR408の感染により
単鎖DNAを得る。
5位のClal部位まで配列決定する(第1図を参照の
こと)。
配列決定する(第2図を参照のこと) 。pGW850
は0位のEcoR1部位から3168位までを配列決定
する(第3図を参照のこと)。
図に示す。幾つかのオリゴヌクレオチドハCaru t
hers (参考文献10)のホスホルアミダイト法に
より、アプライド・バイオシステム(モデル380B)
オリゴヌクレオチド合成機を用いて合成する。これらを
配列決定プライマーとして使用し、そしてこれらの位置
を第7図及び第8図に示す。
方向に示す。3175bp(7)配列はpGW820中
(7)1000位のPvu11部位の第一ヌクレオチド
から始まりそしてpGW820中の4175位のCla
l部位の最終ヌクレオチドで本名る。
列、構造部分の1355残基及びターミネータ−領域の
360ヌクレオチドから成る。
LAのアミノ酸配列(例6.3を参照のこと)は20個
のアミノ酸のシグナル配列に先行される。
六 大 大P壮り遺
伝子のシグナル配列との相同性を星印で示す。さらに、
成熟蛋白質の最近の5残基はB佳A及びは江りと同じア
ミノ酸配列を示す。
3′の方向に示す。2774bpはpGW830中のX
ho1部位の第一ヌクレオチドから始まりそして第二の
XhoI部位の最終ヌクレオチドで終る。
、構造部分の1373残基及びターミネータ−領域の2
68残基から成る。匹」遺伝子は少なくとも20個のア
ミノ酸のシグナル配列をコードしている。
、構造部分の1340残基及びターミネータ−令頁域の
461から成る。P壮C1ff伝子は18個のアミノ酸
のシグナル配列をコードしている。
E−LEU−GLN−LED−LEDPiLB★大 庄A★六大 庄り大大 pelc CYS−LELI−ASN−ALA−AL
A−LEU−ALA−5ER−ALA凪B
大
大 大PJLLへ
大
大 大胆D ★
大 大 *
大餌へ、ル壮B、及び耐り遺伝子の
シグナル配列との相同性を各位置において星印で示す。
通配列及びイントロン内部配列(Ballance。
遺伝子中に4個のイントロンが存在することが予想され
る。これらの−LJ」−遺伝子のコード配列内に存在す
るイントロンの位置は、各遺伝子は潜在的に5個のイン
トロン位置を有するが1個の異るイントロンを欠いてい
ると言う意味で保存的(conserved)である。
トロンが予想される。これらの内1個はP壮O及びセリ
、A中のイントロン(イントロン5)の位置に相当する
位置に見出される。
を第6表aにまとめる。
トロンの位置0位置は第10図、第11図及び第12図
中のコード配列並びにP壮り配列に関する。
エクソンの長さはこれらの事例において同じである。第
13図に、PLA、 PLB、 PLC及びPLDの整
頓された推定アミノ酸配列を示す。p!3iA +pe
lB及びと佳りのコード領域のN−末端部分において、
ヌクレオチド配列相同性に基いて約80%の相同性が観
察され、そしてアミノ酸配列相同性に基いて80%を超
える相同性が観察される。この%は胆ICについては非
常に低い。成熟蛋白質の残基285(第13図中の残基
305に相当する)の後の匹」。
く失われそしてC−末端の近傍でのみもとにもどる。
シング部位の共通配列(第6表b)を除き、イントロン
中に相同性は見出されない。
の推定アミノ酸配列は最初の2つの蛋白質については合
計359残基、PLCについては360そしてPLDに
ついては354を示す。N−グリコジル化部位について
は、4種類すべての蛋白質に109位(成熟蛋白質にお
ける)(P L Cについては、これは整頓されていな
い配列中の105位に相当する。)に1個の潜在的なグ
リコジル化部位が存在する。PLBにおいては第二の潜
在的部位が232位に存在し、他方PLCにおいては他
の2個の潜在的グリコジル化部位が残基255位及び3
29位に存在する。
め、そしてプラスミドDNAを、Maniatis等(
参考文献5;90〜910)により記載されていルヨう
にして500 dの一夜培養物から回収する。
57に、2.2gのCsCβ及び1戚の臭化エチジウム
(水中10■/mりを加える。この溶液をクイック・シ
ール・チューブに取り、そして供給者(ヘックマン)が
推奨するようにして満たしそしてシールする。遠心をV
Ti 65.20−ターにおいて20°Cにて16時間
45.00Orpmで行う。紫外線の下で見える2個の
蛍光バンドの内、プラスミドDNAを含有する低い方の
ハンドを、チューブの側壁に穿孔することにより単離す
る。DNA溶液(約1m1)を水飽和ブタノールで5回
抽出して臭化エチジウムを除去する。次に、DNAをエ
タノールで沈澱せしめ、TEに再懸濁し、フェノール/
クロロホルム及びクロロホルムで1回抽出し、再度温蔵
せしめ、そして−20°Cで貯蔵する。
カルボキシラーゼ遺転子憧■A)を担持するプラスミド
pGW613を用いて形質転換体を選択する(Goos
en等、参考文献12)。例3,5に記載されているブ
ラスミドpGW820. pGW830. pGW84
0. pGGa2O3pGW860及びpGW880を
同時形質転換プラスミドとして使用する。
l ff1A)をGoosen等(参考文献12)に
より記載されているようにウリジンの存在下で、酵母に
おけるように毒性類似体5−フルオロオロチン酸に対す
る正の選択により得た(Boeke等、参考文献13)
。
リジン(Janssen Chimica)及び5抛門
グルコースを補充した液体最少培地にA、ニガーN59
3の分生胞子106個/dを接種し、そしてNew B
runswick回転シェーカー中で30″Cにて20
時間インキュベートする。ミラクロス(Miraclo
th)を通しての濾過により菌糸を集め、1.33Mソ
ルビトール、10mM Trisllc l (pl+
7.5) 、50mM CaCl zの組成を有し、1
.7IIlO3111に調整された等張(STS)最少
培地(STC)により洗浄する。1gの菌糸を20mf
lのSTCに再懸濁する。フィルター除菌したノボチー
ム(Novozym)234(ノボ・インダストリーズ
、デンマーク)250mgを添加しそしてこの混合物を
30°Cにて95rpn+のシェーカー中でインキュベ
ートすることにより菌糸からプロトプラストを2時間以
内に放出せしめる。
プロトプラストを残留菌糸から分離し、そして遠心分離
してベレット化しそしてSTCに再懸濁することにより
精製する。
t!lニ取り、次ニコれを1 pgノpGW613及び
プラスミドpGW820. pGW830. pGW8
50. pGW860又はpGW880のいずれかlO
が(20μl未満の容量)と共にインキュベートする。
のpGW631を用いる。プラスミドDNAをプロトプ
ラストに加えた後、50μlのPCT(I0mM Tr
is−HCj2(pH7,5)、 50mM CaC
/2z、 25%PEG 6000)を加え、そしてイ
ンキュヘーション混合物を20分間氷上に置く。
さらに5分間室温にてインキュベートする。最後に、4
11dlのSTCを加え、そして混合する。この最終形
質転換溶液のldのアリコートを、0.95Mシューク
ロースにより安定化された(I.7m0siに調整)液
化した等張MM上層寒天4 mflと混合する。このプ
ロトプラスト混合物をすぐに、同し等張最少培地を含有
する寒天プレート上にプレートし、そしてこれらを30
°Cにてインキュベートする。適切な対照実験は、プラ
スミドDNAを用いないで同様に処理したプラスミド及
び2.5+wMウリジンを含有する非−安定化最上培地
上でのプロトプラストを含む。
成する形質転換体が出現する(50〜150個の形質転
換体/npGW613)。他方、多数のおそらく失敗の
形質転換体が出現する。次に、個々の形質転換体の胞子
を取り、そして50mMグルコース最少培地上で別々に
プレートしてシグナルコロニーを得、これを用いて更な
る形質転換分析のために胞子を増加せしめる。
少培地上で培養し、DNAを抽出し、そして同時形質転
換プラスミドDNAの存在について分析する。植物RN
Aを単離するのに使用される方法(Slater等、参
考文献14)をわずかに変更して真菌DNAを単離する
。菌糸を塩水で洗浄し、液体窒素中で凍結し、そしてマ
イクロ膜破砕機(ブラウン)を用いて0.5gを破砕す
る。菌糸の粉末を新しく調製した抽出緩衝液により抽出
する。
イソプロピルナフタレンスルホン酸(TNS) 20m
g/戚をldのp−アミノサリチル酸(PAS) (I
20mg/m2)及び0.5 mlの5XRNB緩衝液
(5xRNBは12中に121.1gのTris 、
73.04 gのNaCl及び95.1gのEGTA
を含有する; pH8,5)と混合する。
55°Cにて10分間平衡化する。次に、この温緩衝液
を菌糸粉末に加え、そしてこの懸濁液をポルテックスミ
キサーを用いて十分に1分間撹拌する。次に、1 mf
lのクロロホルムを加え、そして1分間混合する。
を分離し、そして等容量のフェノール/クロロホルム(
I: 1)によりもう−度、そして次にクロロホルムに
より2回抽出する。
心分離(I0分間、10,0OOXg)により集め、無
菌蒸留水に再溶解しそしてそれをエタノールで再度沈澱
せしめることにより2回洗浄する。最終溶液にRNアー
ゼA (20n/ml)を添加することによりRNAを
除去する。この方法が高分子DNA(I00〜200k
bp)を約300屑DN八/g菌糸の収率で提供し、そ
して実質的にManiatis等(参考文献5゜93頁
)の方法に従ってCsC1/臭化エチジウム密度勾配遠
心によりさらに精製する。
転換体についてはEcoRIと共に、胆B (pGW8
30)形質転換体についてはl1indlnと共に、そ
してP壮り形質転換体についてはEcoRI又はBgl
l[と共に、37°Cにて2時間インキュベートするこ
とにより染色体DNA (2μg)の消化物を調製する
。すべての場合において、最初に20Uの制限酵素を使
用し、次に再度20Uの制限酵素を添加することにより
さらに2時間インキュヘーションを延長する。消化は、
BRLにより提供される適切な反応緩衝液中で行う。
セルロースにプロットし、そして本質的にManiat
is等(参考文献5.382〜386頁)により記載さ
れているようにして、対応する〔α−32P〕ラヘル化
ゾローブを用いてハイブリダイズせしめる。
p」し1八)70% ; ρGW830 (2旦I
B)70% ; pGW840 (耐D)15%;
pGWa!5o (s壮C) 60%。
pGW830. pGGa2O31: 10)及びpG
W840(I: 3)の質量比が、観察される多くの場
合において、同時形質転換プラスミドの多コピー染色体
組み込みを導く。
5.2に記載した多数の多コピー形質転換体を分析した
。pelA形質転換体A15の分析を詳細な例として記
載する。
凹↓A株A15のDNAを単離し、例3.1に記載した
ようにしてサザンプロットのハイブリダイゼーションに
より分析する。p!iLAプローブとして7.5kbp
EcoRI断片を使用する(第3図aを参照のこと)
。このゲノムプロットにおいて、7.2kbの強いハン
ドが、タイプI及び/又はタイ10組込み現象(Hin
nen等、参考文献14aを参照のこと)から生ずる形
質転換された株A15中に見出される。
これは再配置(rearangemen t)のタイ1
0組込み(integration)現象の境界断片を
代表するものである。
93のオートラジオグラムにおける7、4kb Eco
RIハントの光学密度をウルトロスキャン(II l
troscan)XL (LKB)を用いてスキャンニ
ングする。両菌株に単一コピーとして存在するピルベー
トキナーゼ遺伝子トハイブリダイズする第二プローブヲ
用いて得られた濃度をスキャンニングすることにより、
N593と形質転換体A15との間のDNAfA度のわ
ずかな差異に関して値を補正する。これらのデーターか
ら、部壮へ形質転換体A15中には壓佳A遺伝子の約1
9個の完全なコピーが存在することが算出される。
ブとして用いて、形質転換されたA15株のサザンプロ
ットを解析した場合、ルlA遺伝子の組込み(inte
gration)は四辻B遺伝子座では起っていないこ
とが示される。同様に、適切な対応するプローブを用い
て、形質転換されたuiBa B 13、pelc株C
16及び耐り株DI2を解析した場合、約10 、15
及び1oのコピー数が与えられる。
50mMグルコース又は1%(W/V)のリンゴペクチ
ン(Brown Ribbon、 d、e、72.
8 %、 0bipektin AG+B15c
hofszel I)を含有する最少培地(250d)
に形質転換体A15の胞子又は野性型株N400の胞子
を10’胞子/dの胞子密度で移し、そして30°Cに
て30時間の増殖の後収得する。培地のサンプル(2d
)をさらに集め、22の10mMリン酸緩衝液(pH
7,0)に対して4°Cにて透析し、そして−20°C
で貯蔵する。
。クロロホルム抽出の後、1/3容■の8MLiC1の
添加によって水相からRNAを沈澱せしめる。溶液を十
分に混合し、0°Cにて一夜インキユヘートする。MS
E 5uper−旧7゜、遠心分離機を用いる遠心分M
(300rpm、 30分間)によりRNAを集め、
そして次に冷(−20°C) 2M LiCff1によ
り1回、そして冷(−20°C)96%エタノールによ
り1回洗浄する。最後に、このRNAを蒸留水に約1■
/ mlの濃度で溶解する。この調製物はDNAを実質
的に含有せず、菌糸g当り1〜2■のRNAの取計で得
られる。lkのRNAをManiatis等(参考文献
5.202〜203頁)に従って変性ホルムアルデヒド
1%アガロースゲル上で泳動せしめ、この場合分子量マ
ーカーとして1IindIII消化λDNA又はBRL
からのRNAラダー(ladder)を使用する。ゲル
を製造者により推奨されるようにしてニドラン(Nyt
ran)(Schleicher & 5chuell
)上にプロットし、そして乾熱し、そして7.4kbp
EcoRI川−A DN^プローブと68°Cにて1
6時間ハイブリダイズせしめる。ハイブリダイゼーショ
ン及び洗浄方法は例3.2に従うホモロガス条件下での
DNAハイブリダイゼーションについて記載した通りで
ある。
導性mRNAを産生ずる。2つのオートラジオグラムの
光学密度のスキャンニングが示すところによれば、A1
5形質転換体と野性型株との間で15〜20倍の強度差
があり、これはサザンプロット分析から計算されたコピ
ー数の増加に相関する。
D12を、ポリガラクチュロナーゼの製造のために、t
lerllersd6rfer等(27)により記載さ
れている方法と同様の二段階培養法により増殖せしめる
。シュガービートシロップ(4%)及びN)14NO3
(I%)を含有する前培養培地(PCM) (pH4,
5)への106胞子/dの接種により液体培養物の表面
に菌糸層が形成される。30°Cにて5日間の増殖期間
の後、30dの培地に増殖した菌糸を塩水で洗浄しそし
て50dの主培養培地(MCM)に移す。この培養物を
30°Cにて1100rpの回転振とう機中で増殖せし
める。培地!当りのMCMの組成はグルコース(5%)
、ペクチン(d、e、72.8%、0.1%)、 NH
JOi(0,75%)、 Ku、po4(0,5%)
、 Fe50. ’ 7HzO(0,03%)、 Mg
5O,’ 7HzO(0,03%)、 CaC1zco
、03%)。
。サンプルを種々の時点で24時間にわたり採取し、そ
してSDSポリアクリルアミド電気泳動により分析する
。LiDの発現は7時間以内の培養ですでに最高である
。この蛋白質は比較のため使用したpHと同じ様に泳動
する。
mlの蒸留水に再懸濁し、そして標準的方法(Lae
mm l i等、参考文献15)を用いて5DS−ポリ
アクリルアミドゲル電気泳動にかける。分^Uされた蛋
白質をニトロセルロースに移行せしめる(Towbin
等、参考文献16)。プロットを室温にて5時間、0.
35M NaC1を含有する10n+M Tris11
c/2緩衝液(pH7,5)中1%BS八溶液へ飽和せ
しめる。次に室温ニア16時間、150mM NaC1
0,5%B5Am、 1%トリトンXl00.0.5
%デオキソコレート及び0.1%SOSを含有する同し
緩衝液50mj!中で、van Hoodehoven
(I975)に従って精製された2種類のペクチンリア
ーゼに対して生じさせたポリクローナル抗体(0,1%
)と共にインキュベートした。次に、プロットを200
dのPBSで5回洗浄した後、50成当り30.Jの二
次抗体としてのヤギの抗−ラビット IgG−HRP(
シグマ)と共にインキュベートし、そして再びPBSに
より5回洗浄する。最後に、基質として4−クロロ−1
−ナフトールを用いてプロットを染色する。40mgの
基質を0、5 dの96%エタノールに溶解し、そして
次に1oadの50mM Tris−HCj! (pH
7,5)及び30Iの30%過酸化水素と混合し、そし
て次にプロ・ノドに加える。
ーの胞子密度で、0.01%トリトン−X100及び炭
素源としてのリンゴペクチン(I%、 d、e。
天で固化した最少培地の上面に置いた無菌濾紙(Sch
le 1cher& 5chuell)上に接種する
。30“Cにて72時間インキュベートして個々のコロ
ニー(2〜4mm)を生じさせる。この濾紙を他の無菌
ペトリ皿に移し、そし培地を含む皿を、蒸留水中ルテニ
ウムレッド(ruthenium red) (0,1
%−/v)5mf以上により染色し、2時間インキュベ
ートしそして次に蒸留水で数回洗浄して未吸着色素を除
去する。この操作は、細菌ペクテートリアーゼ酵素活性
を特徴付けるためにポリガラクチュロネートについてR
4ed及びCo11ier(参考文献17)により記載
されている方法に本質的に従って行う。PLA蛋白質を
過剰生産(overproduce)する形質転換体は
、個々のコロニーの周囲のハローの直径が親株N400
に比べて大きくなることにより検出される。
トリ皿中で完全培地上で28°Cにて3日間増殖せしめ
ることにより分生胞子を生成せしめる。
1中に胞子を懸濁することにより分生胞子を収得する。
で20分間激しく撹拌する。1%(−/ν)のリンゴペ
クチン(Brown Ribbon、 d、e、72.
8%; 0bipektin AG+B15chofz
el l)を含有する最少培地(参考文献)に、106
胞子/dの胞子密度で接種し、この場合lNのシリコー
ン処理エルシンマイヤーフラスコ中250mj!の培地
を用いる。200rpmのガレンカンブ(Ga l l
enkamp)回転振とう機を用いて30°Cにて40
時間増殖せしめる。培養後、菌糸を、ブフナー漏斗を用
いてミラクロス(Miracloth)を通しての濾過
により除去する。培養上清(参考文献21)を蒸留水(
参考文献21)により稀釈し、濾液のpH(pH3,7
)をIN NaOHによりp)16.0とし、そして次
にワットマンl濾紙を用いて再び濾過する。
ウム緩衝液(pH6,0)によりあらかじめ平衡化され
たDEAE−5epharose Fast Flow
(ファルマシア)カラム(I0cm X 2.6 cm
)に適用する。280nmでの吸光度が<0.10.
0.の稙に達するまで、カラムを同じ緩衝液で溶出処理
する。次に、20mMリン酸ナトリウム緩衝液(I50
d) とLM NaC1を含有する20mMリン酸ナト
リウム緩衝液(I5(b++ff1) とから成る直
線グラジェントを適用することにより、ペクチンリアー
ゼ活性をカラムから溶出する。
n)ペクチン(d、e、72.8%)を用いてvan
Houdenhoven(参考文献18.11頁)によ
り記載されている方法を用いて、活性ペクチンリアーゼ
の存在について両分を測定する。塩グラジェント中0.
43M NaC1の濃度付近で活性が現われる。次に、
活性画分をプールし、そして11の20ffiMピペラ
ジンー11i緩衝液(pH5,5)に対して2回透析す
る(サンプルサイズ: 45.5d)。
3つの部分に分け、これらを、ファルマシアFPLC系
と組み合わせた標準的ファルマシアMONOQカラムを
用いて3回の別個の操作において陰イオン交換クロマト
グラフィーにかける。カラムを20mMピペラジン−+
+clll衝液(pl+5.5 )によりあらかじめ平
衡化する。酵素サンプルを負荷した後、カラムを同じ緩
衝液でld1分の流速により、ベースライン吸光が再び
達成されるまで溶出操作する。次に、直線塩グラジェン
トを適用する。
C42の最終濃度が達成される。
5dに稀釈し、そして同じクロマトグラフィー操作を反
復する。
)を25mMピペラジン緩衝液(pt+5.0)に対し
て透析し、そしてldずつを、同じ緩衝液によりあらか
じめ平衡化したMONOQカラム(ファルマシア)に注
入する。注入の後、ポリバッファー(polybuff
er)TM74の5%溶液(蒸留水中;4NHCj2を
用いてpH3,0にセットしたもの)を用いてグラジェ
ントを形成する。活性酵素(3,2’+1)がpH3,
2付近に現われる。調製物を50mMリン酸緩衝液(p
H6,0)に対して十分に透析しそして一20°Cにて
貯蔵する。精製の結果を第7表aに要約し、そしてA、
ニガーN400株により生産されたペクチンリアーゼに
ついての類似の精製のデーター(第7表b)と比較する
。
ーゼAの精製過程 DEAEセファロース 45.5 39.8
4.9(2×) 囲1 A、ニガーN400株からのペクチンリアーゼの精製過
程0E八εセフアロース 43・、0 10.1 0.9 (2×) 蛋白質濃度はBCA蛋白質測定試薬(Pierce)を
用いて、製造者の指示に従って測定した。
されたA、ニガーN592の全活性は精製後約10倍増
加しており、そして比活性は約3倍上昇している。
ゼ(PL八)を、11のミリボラ(Millipore
)濾過した蒸留水に対して3回透析し、そして凍結乾燥
する。l1unkapiller(参考文献19)によ
り記載されている方法に従って、120A PTI+ア
ナライザーにオン−ライン連結されたアプライド・バイ
オシステムズ・モデル470Aプロテイン・シーケンサ
−を用いてアミノ酸配列を決定する。この酵素について
、下記のN−末端アミノ酸配列が決定される。
LA−GLU−GLY−PHE−ALAGLU−?−V
AL−THR−GLY−GLY−GLY−ASP−AL
Aこうして決定されたアミノ酸配列はpelA遺伝子の
ヌクレオチド配列(例4.2を参照のこと)に基くそれ
と正確に対応する。
者を例6.1に記載したようにして培養し、そして例6
.2の方法に従って培養濾液から酵素を精製する。こう
して得られた2種類の酵素調製物を、vanHoude
nhoven (参考文献18)に従って精製されたペ
クチンリアーゼ■と比較した。
泳動は、各場合において2〜5μgの蛋白質を用いる3
つのすべての場合において、同一分子量の単一バンドを
もたらす。
ectric Focussing 1982を参照の
こと)を用いて等電点沈澱を行った。FSBE −30
00装置及び対応する電源装置ECPS 3000/1
50(ファルマシア)を使用した。得られたPLAは等
電点沈澱において均一であり、そしてvan tlou
denhoven(参考文献18)により3.75であ
るとして報告されているPLnよりも低い(0,2pH
ユニツト)等電点を有する。
において不均一である。主バンドは位置的にPLA蛋白
質に相当する。2個の弱いバンドは陰極方向にわずかに
シフトしている。従って、A、ニガー多コピー形質転換
体A15においては、N400に見られる少い酵素形を
欠いている。
、PLA及びPLnの動力学パラメーターの直接比較(
PLI[のパラメーターはvan Houden−ho
ven (参考文献18)により確立されている〕は、
両酵素について同一のに、値及び■。X値を示す。
DI2をまず30h+j!中で例5.5の方法に従って
増殖せしめる。30°CにてPCM中での5日間の増殖
の後、菌糸マットを、0.1M塩化ナトリウムを含有す
る201IIMリン酸ナトリウム緩衝液(pH6,0)
に移す。この菌糸を150 mll中で、回転振とう機
上で20Orpmにて2時間振とうすることによりほと
んどのペクチンリアーゼが培地中に放出される。
を含有する20mMリン酸ナトリウム緩衝液(pH6,
0)によりあらかじめ平衡化されたDEAE−Seph
arose Fast Flow(ファルマシア)カラ
ム (25cm x 1.25cm)に酵素液を通用す
る。 280硝mにおける吸光が<0.1の値に達す
るまで同じ緩衝液によりカラムを溶出処理する。20m
Mリン酸ナトリウム緩衝液(pH6,0)中での塩化ナ
トリウム直線グラジェント(0,2〜0.7 M)(合
計容量800mff1)を適用することによりカラムか
らペクチンリアーゼ活性を溶出せしめる。例5.6に記
載したように5DS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動
及びウェスタンブロッティング(Towbin等、参考
文献16)によりペクチンリアーゼDの存在について両
分をスクリーニングする。ペクチンリアーゼDを含有す
る両分をプールし、そして0.5 M塩化ナトリウムを
含有するリン酸ナトリウム緩衝液(pH6,0)に対し
て透析し、そしてFPLC系と組み合わせた標準ファル
マシアMONOQカラムを用いるイオン交換クロマトグ
ラフィーにかける。負荷した後、カラムを同じ緩衝液で
洗浄し、次に20mMリン酸ナトリウム緩衝’t& (
pH6,0)生塩化ナトリウム直線グラジェント50m
fを適用する。活性画分を集め、そして1Inlのアリ
コートを、0.2M塩化ナトリウムを含有する20mM
リン酸ナトリウム緩衝液(pH6,0)により平衡化さ
れた、FPLC系に連結された100mff1のスフェ
ロース(Superose) 12ゲル浸透カラムに
適用する。GPCカラムから得られた活性酵素画分(各
1d)をSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動により
分析することにより、得られたペクチンリアーゼの純度
をチエツクする。
アーゼDの精製過程 例6.2に従って精製された500硝のペクチンリアー
ゼDを、ミリポア濾過された蒸留水1!に対して3回蒸
留し、そして凍結乾燥する。l1unkapi11er
(参考文献19)により記載されている方法に従って
、120A PTHアナライザーとオン−ライン連結さ
れたアプライド・バイオシステムス・モデル47〇八プ
ロテイン・シーケンサ−を用いてアミノ酸配列を決定す
る。
RO−VAL−GLY−PIIE−ALA−5ER−5
ER−ALA−THR−GLY−GLY−GLY−へS
P−へLA−THR決定されたアミノ酸配列はP壮り遺
伝子のヌクレオチド配列に基くそれと正確に一致する。
13を例5.3に従ってその多コピー性について分析す
る。例5.4に記載した方法に従って行われたナサンブ
ロ7ト分析が示すところによれば、約1.6kbの長さ
のペクチン−誘導性TIIRNΔが生産される。1%(
w/v)の柑橘類ペクチン(d、e、72.8%)及び
1%の小麦糠を含有する最少培地中での30°Cにて3
5時間の増殖を用いて、例5.4に記載したようにして
酵素を製造する。酵母はまた、4%(−/V)シュガー
・ビート・シロップ及び1%N114N03を含有する
培地を用いても製造される。
IによりpHを6.0に調製し、そしてワンドマン1濾
紙を用いて再び濾過する。次に、稀釈された濾液(21
)を、50d酢酸ナトリウム緩衝液p++5.0により
あらかしめ平衡化したεDTA−セファロース・ファス
ト・フロー(ファルマシア)カラム(9cm X 3.
2 cm )に適用する。ブラウン・リボンペクチン(
d、e、72.8%)又は高度にエステル化されたペク
チン(d、e、94%)を用いてvan )Ioude
nhoνen(参考文献18 、11頁)により記載さ
れている方法により測定できるペクチンリアーゼ活性の
一部は溶出液中に存在する。ペクチンリアーゼ活性の大
部分は塩グラジェントを適用することができる。この活
性は塩グラジェントにおいて現われ、そして例6に記載
した5DS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動での見か
け分子量及び溶出挙動に基いてPLAと同一であること
が見出される。
対して透析し、そして20mM酢酸ナトリウム緩衝’1
Ffi、 (pH4,5)によりあらかじめ平衡化され
たMONOSカラム(ファルマシア)に適用する。同じ
緩衝液中0〜1. OM塩化ナトリウムグラジェントを
適用することによりカラムから酵素を溶出する。
をプールし、そして次に蒸留水によりほぼ4倍に稀釈す
る。酵素の再クロマトグラフィーにより、5DS−ポリ
アクリルアミドゲル電気泳動に基いて純粋なPLB蛋白
質を含有する両分が得られる。
て組B形質転換体B13がら精製された酵素の性質を決
定しそしてペクチンリアーゼA及びDと比較する。
泳動は、39.7kDaの見かけ分子量を有する単一バ
ンドをもたらす。同じ条件下で、PLA及びPLDの見
かけ分子量はそれぞれ49.1kDa及び52.3kD
aである。
の等電点は6.0である。サンプルはおよそ、5.0の
pIに相当する位置に適用される。
により試験する場合、PLI及びPLI[に対して調製
されたポリクローナル抗体と反応する。こうしてPLO
,A及びBはそれらの見かけ分子量の値により容易に区
別することができる。
る。この酵素はペクチンリアーゼ反応を触媒し、そして
種々のマツキルヘン緩衝液(μ−〇、5)で試験した場
合、広いp■範囲(pH5〜9.5)にわたって活性で
ある。(νa n Ho u d e n b oνe
n、参考文献18)。最適pHが広い(pH7,5〜8
.5)。pH6,0において活性はpH8,0における
活性の約55%であり、そしてpH9,5においてなお
85%である。
及びブラウンリボン・リンゴペクチン(d、e、72.
8%、 0bipektin AG、 B15chof
fzell)のように低い程度のエステル化を有するペ
クチンの両者を基質として使用することができる。しか
しながら、高度にエステル化されたペクチンを用いて最
高の活性が得られる。この酵素はポリガラクチュロネー
トと反応しない。
混合物にEDTAを添加する( 3 mMの最終濃度を
用いる)ことにより阻害することができ、酵素は過剰の
Ca”イオンの添加により再活性化される。従って、献
BはCa”−依存性ペクチンリアーゼをコードしている
。25°Cにおいて、この酵素は6500のおよそのタ
ーンオーバー数及び2.5111FIのに、値を有する
(高度にエステル化されたペクチンを基質として使用す
る場合)。これらの値は、pH8,0(μm0.5)の
マツキルベン緩衝液を用いてvan l1oudenh
oven (参考文献18)の方法に従って決定される
。
I断片をpBR322の旧nd[11部位にサブクロー
ニングする。アンピシリン耐性形質転換体プラスミドD
NAをl1ind[[及び5all制限酵素消化により
分析する。時計まわり方向に耐A挿入部を含有する1つ
のクローンをpGW822と称する。旭Aの誘導性プロ
モーターを使用してA、ニガーで外来遺伝子を発現せし
める。
する。プロモーター及び耐へシグナル配列はlkbBa
mll I P st I断片上に存在する。ヌクレ
オチド位置1420のPstI開裂部位(第10図)は
シグナル配列の3′末端と一致し、そしてこれを外来蛋
白質のコード配列へのフレーム内融合のために用いるこ
とができる。P壮Aの転写終止シグナルは1.3kbS
al I HindI[[断片上に存在する。
ローニング プラスミドpGW822の3.3kb BamHI −
H1ndIII断片は匹↓へ遺伝子を含有する。この断
片を、Bam1l I及び旧ndl[Iにより切断され
たベクターpHc19(ファルマシア)にクローニング
する。精製された断片を連結する。連結混合物を用いて
、Ca”で処理されたコンピテントJMIO9細胞を形
質転換する。
dI[I断片の好結果のクローニングを、X−Ga1及
びIPTGの存在下、アンピシリンプレート上で選択す
る(T、 ManiaLis等、”Mo1ecular
Cloning、 A Laboratory Ma
nual’。
atory、 1982+ 52頁)。
ロニーのプラスミドDNAをBaIIII I / H
ind■二重消化により分析する。正しい挿入部を有す
る1つの形質転換体をpLIc19/pelAと称する
。
etΔを得る。
化する。
。
Tris−11Cffi (pH7,5)。
ポリメラーゼ1 (BRL)との、室温にて30分間の
反応によりフィルインする。EDTAを12.5mMの
最終濃度に添加することにより反応を停止せしめる。D
NAをエタノール沈澱せしめる。線状D N A 断片
をPstlニより消化する。フェノール/クロロホルム
挿出の後、DNAをエタノールで沈澱せしめる。
’ −TGTGATCTGCC−3’(II) 3
’ −ACGTACACTAGACGGAGT−5
’で表わされるオリゴデオキシヌクレオチドリンカーを
、線状化されたプラスミドのPst1部位に連結する。
PstI部位の3′のくぼんだ末端を満たしそしてイン
ターフェロンBDBBのコード配列へのインフレーム融
合を達成する。(I)はインターフェロンBDBB遺伝
子のDelI制御部位までの5′−末端ヌクレオチド配
列を示す。200pmo eずつのオリゴヌクレオチド
(I)及び(II)をリン酸化し、そしてアリールせし
める。Pstlにより切断したp[Ic19/pelA
プラスミド及び100倍モル過剰の二本鎖リンカ−DN
Aを60mM Tris−HCj!(pH7,5)、
10mM Mg(/!z、1mM ATP、 5mM
DTT及び400ユニツトのT4 DNAリガーゼ中
で15°Cにて1時間連結する。DNAリガーゼを85
°Cにて10分間不活性化する。10mM EDTA、
300mM酢酸ナトリウム(pH6,0)及び0.5
4容量のイソプロパツールの存在下での沈澱により過剰
のリンカ−を除去する。
ゲル上で単離する。この断片はル壮Aプロモーター及び
シグナル配列(Bamtl I (Ps口]/リンカ
−)並びに史江Aターミネータ−((Sall)平滑−
t+1ndlI[)をベクターpUC19中に含んで成
る。
l19 (BP205404)は、酵母酸性ホスファタ
ーゼ(鷹)の制御されるプロモーターの制御のもとにα
−インターフェロンBDBBの遺伝子を含有する。この
プラスミドDNAをBamHI及び旧ndH[を消化し
、PH05プロモーター、IFN BDBBのコード配
列及びP)105転写停止配列を含有する1、3kb
BamHI −11indI[[断片を単離する。断片
をDE52クロマトグラフィー及びエタノール沈澱によ
り断片を精製し、そしてさらにTaqlにより消化する
。Taql制限断片の接着末端を、0.1mMずつのd
CTP及びdGTP 、 60mM TrisHC1
(pH7,5) 、 10mM MgCl 2の存在
下、室温にて30分間のKlenow DNAポリメラ
ーゼI (BRL) との反応によりフィルインする。
り反応を停止する。DNA断片をエタノール沈澱せしめ
そしてDdelによりさらに消化する。DNA断片を分
取用0.8%アガロースゲル上で分離する。549bp
Dde I −(Taql)平滑断片をゲルから電気
溶出し、そしてDE52イオン交換クロマトグラフィー
及びエタノール沈澱により精製する。DNAを水中に約
0.1pmo l / alの濃度で再懸濁する。
(Taq I ]平滑断片及び0.1pmoffiの5
kbベクタ一断片を10j11の60mMTris−H
Cjl!(pH7,5)、 10IIIM MgC1
z、 3.5mM^TP。
ーゼ(バイオラプス)中で15°Cにて16時間連結す
る。連結混合物の1 piのアリコートを用いて、Ca
t +処理されたコンピテントHB101細胞を形質
転換する。
ミドDNAを調製し、そしてEcoRI 、 P v
uII、C1al、及びEcoRI /旧ndlI[消
化により分析する。予想通りの制限パターンを有するク
ローンを選択する。稈壮Aシグナル配列とインターフェ
ロ7 BDBBの成熟コード配列との正しいインフレー
ム(in frame)融合をDNA配列決定により確
認する。
pelA−IFN AM119と称する。
スミドpUC18/pelA−IFN AM119が得
られる。
P 88101397.3)に開示されている)をプラ
スミドpCG59D7により形質転換してウリジン・プ
ロトプラストを得る。形質転換プラスミドと共に非選択
性プラスミドpUC19/pelA−IFN AM11
9を加えて同時形質転換の際に同時組込み体(co i
n tegran t)を得る。
を形成するまで28°Cにて4日間増殖せしめる。2X
10”個の分生胞子を用いて、1g/lのアルギニン及
びウリジンを採光した最少培地20(I++1に接種す
る。
ラクロスを通しての濾過により菌糸を集排し、10 m
flの0.8M KCQ 、 50mM CaCQ 2
で2回洗浄し、そして20In1の0.8M KC42
、50mM CaCi 2+ 0.5mg/ mlのノ
ボチーム(Noνozym)234 (ノボ社)中に再
懸濁する。
濾過して菌糸破片を除去する。プロトプラストを、室温
での穏やかな遠心分離(I0分間、2000rpm)に
よりペレット化し、そして10dの0.8MKCe 、
50mM CaCI!、2により2回洗浄する。最後
に、プロトプラストを200〜500μlの0.8M
KCffi、 50iMcacffzに再懸濁してlX
l0”/mρの濃度とする。
アリコートを5鱈のρCG59D7及び10J1gのp
UC19/pel八−IFN 4M119 DNA並び
に50μlのPCT (I0mMTris−HCffi
(pt17.5)、 50mM CaCf !+ 2
5%PEG 6000)と共にインキュベートする。イ
ンキュベーション混合物を氷上に20分間置き、さらに
2dのPCTを添加し、そしてこの混合物を室温にてさ
らに5分間インキュベートする。4dの0.8M KC
j2.50mMcacffizを添加し、そして最終形
質転換溶液の1 mlのアリコートをQ、8M Kcl
l、により安定化され、液化された最少寒天培地〔最少
培地+1g/lアルギニン+10g/fバクトーアガ−
(デイフコ)〕と混合する。この混合物を即座に同じ培
地の寒天プレート上に注ぎ、そして28°Cにてインキ
ュベートする。
らく失敗の形質転換体のハックグラウンド増殖の上に、
安定な形質転換体が旺盛に増殖しそして胞子を形成する
コロニーとして出現する。
換体を拾い、そしてインターフェロンの発現について分
析する。インターフェロン活性は、ヒトCCL −23
細胞及びチャレンジウィルスとしての水泡性口内炎ウィ
ルス(VSV)を用いてAr+ns trong(J、
八、Armstrong、 Appl、Microb
iol、 21+ 732(I971))の方法
に従って測定する。
ロー・セット(Pectin Slow 5et)L
(IInipectin、 SA、 Redon、
フランス) 3 g / 1 、 N114CQ2g/
L KH2PO40,5g/l、 NaCff1 O
,5/lMg5On ’ 78zO0,5g / l、
CazSO4・2Hz00.5g// 1 、 pH
7,0) 50mf中で前培養する。この前培養物を2
50rp111及び28°Cにて72時間インキュベー
トする。10%の前培養物を用いて50In1の主培養
培地(大豆粉20 g / f、ペクチン・スローセッ
ト5g/l)に接種する。培養物を25Orpm及び2
8°Cにて72〜96時間増殖せしめる。種々の時点(
20時間毎)にサンプルを採取し、遠心分離により細胞
をペレット化し、そして超音波処理により破砕する。
うにしてインターフェロン活性について試験する。
NプラスミドM13(+)KS /pelAΔ、、−I
FN 4M119の2.8kb発現カセットは誘導性P
壮AプロモーターバイブリドインターフェロンBDBB
のコート配列及び2壮A転写ターミネータ−をブルース
クリプト(Bluescript N13(+)KSヘ
クツタ−上含んで成る。
宿主細胞中に位置する。プラスミドM13(+)KS/
pel八Δ、、−へFN 4M119 は pUC
18/pelA −IFNAM119(例9.2.1を
参照のこと)に由来する。凪Aシグナル配列(ss)を
部位特定変異誘発によりプールアウトする (第15図
を参照のこと)。シグナル配列を有しないこの構成物か
ら発現されるバイブリドインターフェロンはサイドシル
中に存在すると予想される。
(例9゜2.1を参照のこと)をBamtl I及び旧
ndll[により消化する。2.8kb BamHI
−Hlndn[断片は止佳Aプロモータ、シグナル配列
、IFN BDBBコード配列及びト佳Aターミネータ
−を含有する。BamHI −H1ndIII断片を単
離し、そしてBan+)l I及び旧ndIIlにより
切断されたブルースクリプトM13(+)にS (S
tra tagene) ヘクターに連結する。この連
結混合物のアリコートを使用して、Ca 2 +処理コ
ンピテントJM109細胞を形質転換する。M13(+
)KSへの2.5kb BamHI −旧ndlll断
片の好結果のクローニングをX−Ga1及びIPTGの
存在下、アンピシリンプレート上で選択する。白色のア
ンピシリン耐性コロニー12個ヲ拾う。これらのコロニ
ーのプラスミドDNAをBam111/BglIに重油
化により分析する。正しい挿入部を有する1つの形質転
換体をM13(+)KS /uuAIFN AM119
と称する。
1L thi−1,relA−1; pcJ105(C
m’); nro−RADMuta−Gene M13
インビトロ変異誘発キット)を形質転換する。この株は
DNAへのウラシルの導入を許容する。CJ236を、
100■/!のアンピシリンを含有するLB培地10m
1中で増殖せしめる。
においてファージM13KO7(Mead等、参考文献
29)により超感染(superinfect)する。
りを加え、そして培養物を37°Cにて振とう機上で5
〜6時間インキュベートする。プラスミドM13(+)
KS /ρelA−IFN AM119のル住A−IF
N AM119挿入部に関する非コード鎖が合成され、
パッケージされ、そして培地中に放出される。Kunk
el等(参考文献30)に従って培養上清から単鎖DN
Aを調製する。
M119を用部位特定除去変異誘発を非コード単鎖正性
A−IFNAM119鋳型上で行って正佳Aシグナル配
列をプールアウトする (第15図)。
配列の部分(第10図におけるヌクレオチド位置134
3〜1363)及び成熟IFN BDBBのアミノ酸1
〜7をコードする21ヌクレオチドから成る。
を20alの50mM Tris−tlcL!(p)1
7.5)、 10mM MgCl!、z。
のT4ポリヌクレオチドキナーゼ(ベーリンガー)を用
いてリン酸化する。37°Cにて1時間の後、65°C
にて10分間加熱することにより反応を停止せしめる。
酸化された変異原オリゴデオキシリボヌクレオチドプラ
イマー及び10pIIIoI2のユニバーサルM13配
列決定プライマーと共に3011!の20mM Tri
s −)Ic l (pH7,5) 。
DTT中で80°Cにて5分間インキュベートする。
ールされた混合物に、l Ilノの緩衝液(0,2M
Tris −HCI! (pH7,5) 。
dNTP混合物、0.5 Jtlの20mM ATP、
l ttlの0.2台otr、0.5IllのT4
DNNクリガーゼバイオラプス、4000/111)
及び1.2μ!のKlenow DNAポリメラーゼ(
BRL、 5[1/m)を含有する酵素−dNTP(d
ATP、 dGTP、 dCTP、 dTTP)溶液1
0μlを加える。この混合物を15°Cにて16時間イ
ンキュベートする。65°Cにて10分間インキユヘー
トすることにより反応を停止せしめる。
ス(repair−minus)株大腸菌MV1190
(Δ(Iac−稈1^B)+ thi、■E、Δ(
srl −recA)306: TnlO(tetつ
(F’ : traD36. 稈IAB、 Iac
rqZΔ旧5)]のコンピテント細胞0.2戚を形質
転換する。
M13 イア −ヒドロ変異誘発キットの手引に記載
されている。12個のアンピシリン耐性コロニーを拾う
。プラスミドを調製しそして5cal消化により分析す
る。
1部位を除去する。正しいプラスミドをブルースクリプ
ト(Bluescript) ベクター中の5ca1部
位において線状化する。1つのプラスミドをさらに分析
する。凪AプロモーターとATCを含むIFNBDBB
のコード配列との間の正しい連結部をDNA配列決定に
より確認する。1つの正しい構成物をM13(+)KS
/pelAΔss−IFN AM119 と称する。
N AM119及びpCG59D7を用いて例8.2.
2に従ってA、ニガーAn8変異体を同時形質転換する
。形質転換体を例8.2.3に記載したようにして培養
する。種々の時間(20時間毎)にサンプルを採取し、
遠心分離により細胞をペレット化し、そして超音波によ
り破砕する。細胞抽出物をインターフェロン活性につい
て試験する(前掲)。インターフェロン活性の大部分が
細胞内に見出される。
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地図を示す。 第2図は凪A遺伝子を含有するpGW830の制限地図
を示す。 第3図はmlC遺伝子を含有するpGW850の制限地
図を示す。 第4図は凪り遺伝子を含有するpGW840の制限地図
を示す。 第5図は凪E遺伝子を含有するpGW1380の制限地
図を示す。 第6図は凪E遺伝子を含有するpGW860の制限地図
を示す。 第7図は凪A遺伝子の配列決定法を示す。図中、Be
jA遺伝子を棒で示し、非コード領域を白で示し、そし
て斜線部分はコード領域を示す。ssシグナル配列;1
〜5:イントロンの位置。制限部位の位置を線で示し、
線の下の番号はpGW820 (第1図)上の位置を示
し、酵素名の後の番号は決定された配列(第10図)上
の位置を示す。生成したサブクローンを二重矢印(−〉
)で示し、5’−3’方向におけるnl−n13及び3
’−5’方向におけるr1〜r14は遺伝子の方向に関
する。ユニバーサル配列決定プライマーを用いて決定さ
れた配列を1木矢(□)で示す。ぬりつぶした小さい箱
は特に合成したプライマーを示し、配列及びその方向を
矢印で示す。A : HR576、B : 1lR56
36,C:HR5803,ロ : I(l’1576
4. E : llR5767F : lII?
5763. G :HR5804,H: HR576
3゜ 第8図は脈8遺伝子の配列決定法を示す。図中、止壮B
遺伝子を棒で示し、白い部分は非コード領域を示し、そ
して斜線部分はコード領域を示す。 SSはシグナル配列を示し;1〜5はイントロン部位を
示す。制限部位の位置を線上に示し、線の下の番号はp
GW830 (第2図)上の位置を示し、線上の番号は
決定された配列(第11図)上の位置を示す。生成した
サブクローンを二重矢印(−〉)で示し、5’−3’方
向におけるn1〜n13及び3’−5’方向におけるr
1〜r12は遺伝子の方向に関する。ユニバーサル配列
決定プライマーにより決定された配列を1本鎖(□)で
示す。ぬりつぶされた小さい箱は特に合成されたブライ
マーを示し、配列及び方向を矢印で示す。A : HR
5767゜B : HR5770,C: HR5826
,D : llR5827E : H1?5828F
: HR5B29゜点線を伴う矢印は延長されたKle
now配列決定法(Gibco BRL Focus
LLI、 l 4)により決定された配列に関する。 *は、爪B配列上の内部M13配列決定プライマー開始
部位(I7塩基中14)を示す。 第9図は匹耳遺伝子の配列決定を示す。図中、pelG
遺伝子を棒で示す。遺伝子の方向は左から右であり、1
368位のATGから2708位の終止コドンまでであ
る。示される制限酵素部位の位置の番号付与はpGWa
so (第3図)上の位置の番号付与とは逆であるが、
配列(第12図)中に示される番号付与に一致する。生
成したサブクローンを二重矢印(−〉)で示し、5 r
3 +方向におけるn1〜n17、及び3’−5’
方向におけるrl−rl2は遺伝子の方向に関する。決
定され・た配列の長さを棒で示す。エキソヌクレアーゼ
■クローンを実線の矢印e1〜e14(→)により示す
。 第1O図はPLAをコードする遺伝子を含有する、式(
[)により示されるDNA分子pelAの配列を示す。 第11図はPLBをコードする遺伝子を含有する、式(
It)により示されるDNA分子ル壮Bの配列を示す。 第12図はPLCをコートする遺伝子を含有する、式(
[[)により示されるDNA分子P壮cの配列を示す。 第13図は、PLO,PLA及びPLC間のアミノ酸配
列のレヘルでの相同性を示す。囲みの中は相同のアミノ
酸を示す。ダッシュ印は配列を合わせるために挿入され
ている。 第14図はバイブリドインターフェロンBDBBをコー
ドする遺伝子を含有するベクターpUC19/ρelA
IFN AM119の作製を示す。 第15図は、プールアウトされたシグナル配列を伴うプ
ラスミドP壮へ−IFN AM119上の耐へ−IFN
融合の部分の非コード鎖と、P壮Aシグナル配列を除去
する変異のために使用されたオリゴヌクレオチドブライ
マーとを並べて示す。 Figure 1: pelA、を含有マるプラスミ
ドpG〜V 820の1」限地図本〜−掃 P g IA A ニガー N400 DNA アンピシリン 耐性遺伝子 (ρ8R322)且釘△
コード領誠 矢印は遺伝子の方向 埜−一一畢 p eIB A、ニガー トj400 DNA アンピシリン 耐性遺伝子 且鮒旦コード領誠 矢印(よ遺伝子の方向 Fxaure 3: elcを含有するプラスミド GW850の制限地図 墜−一一畢 p A、ニガー アンピシリン 400 NA 耐性遺伝子 Fi詐re 5: pe旧を含有するプラスミ!:pGW880の制限地図
性−−キ p elE A ニガー 〜400 DNA アンピシリン ご性遺伝子 以転旦コードC列 Figure 4: pelDを含有するプラスミドpGW840の制限地図
e LD アンピシリン 耐性遺伝子 且耐qニード領誠 矢印(よ遺伝子の方向 Figute 6: pelFを含有するプラスミド
pGW860のF:I Vn R’J2JeLF pelD遺伝子とハイブリダイズする且斂旦の最小断片
、矢印は遺伝子の方向 く 2≧ トく yigur* 10 (Yの6) (現く Pi露υr@I+ (%のぢ) 2410 430 450 470 510 丁子TC丁AGCAGACCATGACGCGTACG
CAACATAGACCGCTCCATGTTAC丁G
ACTGCGACτGT1ur@12 式 !I
l:店10(7ら ) 0 3゜ 0 0 0 +10 90 10 30 50 2フ0 90 10 30 50 70 90 10 30 50 70 90 10 30 70 90 (就く ) ×く 一一< ・ Figure 12 (王の6) 3010 030 050 CAATCAA 070 090 ATATG丁丁ACAAAA 110 GAAACATACAACAGAAGGAATATGT
CAGTGGTCATTGAACATTACAAA31
30 3150 ハ左囚り口= PLD、PLA、PLB及びPLC間の相同性とマ^ ) 0 0 0 +10 +50 〈続く ) Figur@+3 (′+−?3 ) 310 40 20 30 60
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、ペクチンリアーゼPLA、PLB、PLC、PLE
又はPLF発現系又はその誘導体をコードするDNA配
列を含んで成る組換DNA分子。 2、PL発現系のいずれかの、プロモーター、シグナル
配列、構造遺伝子もしくはターミネーター又はこれらの
断片の任意の組み合わせを含んで成る請求項1に記載の
組換DNA分子。 3、式( I )のDNA配列又はその誘導体を含んで成
る請求項1に記載の組換DNA分子。 4、式(II)のDNA配列又はその誘導体を含んで成る
請求項1に記載の組換DNA分子。 5、式(III)のDNA配列又はその誘導体を含んで成
る請求項1に記載の組換DNA分子。 6、pGW820である請求項1に記載の組換DNA分
子。 7、pGW830である請求項1に記載の組換DNA分
子。 8、pGW850である請求項1に記載の組換DNA分
子。 9、pGW880である請求項1に記載の組換DNA分
子。 10、pGW860である請求項1に記載の組換DNA
分子。 11、プラスミドpGW820、pGW830、pGW
850、pGW880もしくはpGW860の2個の制
限部位の間に延びそしてプロモーター機能、シグナル機
能、構造機能もしくはターミネーター機能を保持してい
る断片又はこれらの断片の組み合わせを含んで成る請求
項1に記載の組換DNA分子。 12、¥pel¥Aのプロモーター配列を含んで成る請
求項1に記載の組換DNA分子。13、¥pel¥A、
¥pel¥B、¥pel¥C、¥pel¥E又は¥pe
l¥Fのプロモーター配列を含んで成る請求項1に記載
の組換DNA分子。 14、¥pel¥A、¥pel¥B、¥pel¥C、¥
pel¥E又は¥pel¥Fのシグナル配列を含んで成
る請求項1に記載の組換DNA分子。 15、¥pel¥A、¥pel¥B、¥pel¥C、¥
pel¥E又は¥pel¥FのPLI構造遺伝子を含ん
で成る請求項1に記載の組換DNA分子。 16、イントロンを含有しない¥pel¥A、¥pel
¥B、¥pel¥C、¥pel¥E又は¥pel¥Fの
構造遺伝子を含ん成る請求項1に記載の組換DNA分子
。 17、¥pel¥A、¥pel¥B、¥pel¥C、¥
pel¥E又は¥pel¥Fのターミネーターを含んで
成る請求項1に記載の組換DNA分子。 18、アスペルギルス・ニガー(¥Aspergill
us¥¥niger¥)に対して異種性である構造遺伝
子を含んで成る組換ハイブリドベクターである請求項1
に記載の組換DNA分子。 19、ハイブリドインターフェロンBDBBをコードす
る異種性構造遺伝子を含んで成るハイブリドベクターで
ある請求項1に記載の組換DNA分子。 20、ハイブリドベクターpUC19/pelA−IF
NAM119である請求項1に記載の組換DNA分子。 21、ハイブリドベクターM13(+)pelAΔ_s
_s−IFNAM119である請求項1に記載の組換D
NA分子。 22、ハイブリドベクターM13(+)KS/pelA
−IFNAM119である請求項1に記載の組換DNA
分子。 23、請求項1の組換DNA分子の製造方法であって、
ペクチンリアーゼPLA、PLB、PLC、PLEもし
くはPLF発現系又はその誘導体をコードするDNA配
列を含有するDNA分子により形質転換された宿主を培
養しそして所望の組換DNA分子を単するか、あるいは
生体外合成により調製する、ことを含んで成る方法。 24、請求項1に記載の組換DNA分子を含有する形質
転換された宿主。 25、大腸菌(¥Escherichiacoli¥)
HB101/pGW820(DSM4388)である請
求項24に記載の形質転換された宿主。 26、大腸菌(¥Escherichiacoli¥)
HB101/pGW830(DSM4389)である請
求項24に記載の形質転換された宿主。 27、大腸菌(¥Escherichiacoli¥)
HB101/pGW850(DSM4390)である請
求項24に記載の形質転換された宿主。 28、大腸菌(¥Escherichiacoli¥)
HB101/pGW860(DSM4391)である請
求項24に記載の形質転換された宿主。 29、大腸菌(¥Escherichiacoli¥)
HB101/pGW880(DSM4392)である請
求項24に記載の形質転換された宿主。 30、請求項1に記載の組換DNA分子と選択マーカー
プラスミドpCG59D7とにより形質転換されたアス
ペルギルス・ニガー(¥Aspergillusnig
er¥)An8(DSM3917)である請求項24に
記載の形質転換された宿主。 31、プラスミドpUC19/pelA−IFNAM1
19と選択マーカープラスミドpCG59D7とにより
形質転換されたアスペルギルス・ニガー(¥Asper
gillus¥niger¥)An8(DSM3917
)である請求項24に記載の形質転換された宿主。 32、M13(+)KS/pelAΔ_s_s−IFN
AM119と選択マーカープラスミドpCG59D7と
により形質転換されたアスペルギルス・ニガー(¥As
pergillusniger¥)An8(DSM39
17)である請求項24に記載の形質転換された宿主。 33、M13(+)KS/pelA−IFNAM119
と選択マーカープラスミドpCG59D7とにより形質
転換されたアスペルギルス・ニガー(¥Aspergi
llusniger¥)An8(DSM3917)であ
る請求項24に記載の形質転換された宿主。34、請求
項24に記載の形質転換された宿主の製造方法であって
、場合によっては選択マーカー遺伝子と共に、請求項1
に記載の組換DNA分子により宿主を処理することを含
んで成る方法。 35、請求項1の組換DNA分子と選択マーカープラス
ミドpCG59D7とによりアスペルギルス・ニガー(
¥Aspergillusniger¥)An8を同時
形質転換する、請求項34に記載の方法。 36、請求項1に記載のハイブリドベクターを適当な宿
主中で発現せしめることを特徴とするポリペプチドの製
造方法。 37、請求項18に記載のハイブリドベクターを適当な
宿主中で発現せしめることを特徴とするポリペプチドの
製造方法。 38、ペクチンリアーゼPLA、PLB、PLC、PL
E又はPLFをアスペルギルス(Aspergillu
s)の種において過剰生産せしめるための、該ペクチン
リアーゼの発現のための発現ハイブリドベクターにより
形質転換されたアスペルギルス宿主を培養することを特
徴とする請求項36に記載の方法。 39、ハイブリドインターフェロンBDBBをアスペル
ギルス(Aspergillus)の種において製造す
るための、該ハイブリドインターフェロン発現用の発現
ハイブリドベクターにより形質転換されたアスペルギル
ス宿主を培養することを特徴とする請求項37に記載の
方法。 40、純粋な形のペクチンリアーゼPLA、PLB、P
LC、PLE又はPLF。
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