JP7433236B2 - 抗葉酸受容体１抗体及びその使用 - Google Patents

抗葉酸受容体１抗体及びその使用 Download PDF

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Description

関連出願の相互参照
この出願は、2018年3月13日に出願された米国仮出願第62/642,213号に対する優先権を主張し、その開示は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
発明の分野
本発明は、抗葉酸受容体1(FOLR1)モノクローナル抗体、該抗体をコードする核酸及び発現ベクター、該ベクターを含有する組換え細胞、並びに該抗体を含む組成物に関する。該抗体を作製する方法、及びがんを含む疾患を処置するために抗体を使用する方法も提供される。
電子的に提出した配列表への言及
この出願は、ファイル名が「689204-11WO Sequence Listing」、作成日が2019年3月6日の、64kbのサイズを有するASCIIフォーマットの配列表として、EFS-Webにより電子的に提出される配列表を含む。EFS-Webにより提出される配列表は本明細書の一部であり、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
葉酸受容体α(FRα)又は葉酸結合タンパク質(FBP)としても知られる葉酸受容体1(FOLR1)は、葉酸の活性形態、5-メチルテトラヒドロ葉酸(5-MTF)、及びその誘導体に対して高い親和性を有し、これらを細胞へと輸送する細胞表面のグリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)-アンカー膜タンパク質である(Salazar及びRatnam、Cancer Metastasis Rev 2007; 26:141～52頁)。FOLR1は、ある特定の固形腫瘍、例えば、卵巣がん、肺がん及び乳がんにおいて過剰発現されるため、腫瘍学の標的となっている(Toffoliら、Int J Cancer 1997; 74:193～198頁及びBoogerdら、Oncotarget 2016; 7:17442～17454頁)が、その発現は、限られた正常なヒト組織では低レベルである(Weitmanら、Cancer Res 1992; 52:3396～3401頁)。この観察と一致して、これまでにFOLR1標的小分子及び大分子に関して行われた第1相臨床試験によって良好な薬物耐性が明らかとなった(Cheungら、Oncotarget 2016; 7:52553～52574頁)。したがって、FOLR1は、腫瘍関連/腫瘍特異的抗原であり、抗FOLR1モノクローナル抗体(mAb)を潜在的な抗がん治療薬として使用することができる。
一般的な一態様では、本発明は、FOLR1に特異的に結合する単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。
a.それぞれ、配列番号38、39、40、62、63及び64;
b.それぞれ、配列番号17、18、19、41、42及び43;
c.それぞれ、配列番号20、21、22、44、45及び46;
d.それぞれ、配列番号23、24、25、47、48及び49;
e.それぞれ、配列番号26、27、28、50、51及び52;
f.それぞれ、配列番号29、30、31、53、54及び55;
g.それぞれ、配列番号32、33、34、56、57及び58;又は
h.それぞれ、配列番号35、36、37、59、60及び61;
のポリペプチド配列を有する重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2、及びLCDR3を含み、FOLR1、好ましくはヒトFOLR1に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片が提供される。
a.それぞれ、配列番号86、87、88、110、111及び112;
b.それぞれ、配列番号65、66、67、89、90及び91;
c.それぞれ、配列番号68、69、70、92、93及び94;
d.それぞれ、配列番号71、72、73、95、96及び97;
e.それぞれ、配列番号74、75、76、98、99及び100;
f.それぞれ、配列番号77、78、79、101、102及び103;
g.それぞれ、配列番号80、81、82、104、105及び106;又は
h.それぞれ、配列番号83、84、85、107、108及び109;
のポリペプチド配列を有する重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2、及びLCDR3を含み、FOLR1、好ましくはヒトFOLR1に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片が提供される。
ある特定の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号15、1、3、5、7、9、11若しくは13と少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、若しくは少なくとも99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、又は配列番号16、2、4、6、8、10、12若しくは14と少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、若しくは少なくとも99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
ある特定の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は:
a. 配列番号15のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号16のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
b. 配列番号1のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号2のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
c. 配列番号3のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号4のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
d. 配列番号5のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号6のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
e. 配列番号7のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号8のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
f. 配列番号9のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号10のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
g. 配列番号11のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号12のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;又は
h. 配列番号13のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号14のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
を含む。
ある特定の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、キメラである。
ある特定の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、ヒトの又はヒト化されたものである。ある特定の実施形態では、ヒト化モノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、
(1)配列番号113のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(2)配列番号113のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(3)配列番号114のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(4)配列番号114のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(5)配列番号115のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(6)配列番号115のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(7)配列番号116のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(8)配列番号116のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(9)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号121のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(10)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号122のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(11)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号123のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(12)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号121のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(13)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号122のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(14)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号123のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(15)配列番号124のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号126のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(16)配列番号124のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号127のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(17)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(18)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(19)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(20)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(21)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(22)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(23)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(24)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(25)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(26)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(27)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;又は
(28)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域
を含む。
ある特定の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、FOLR1に結合し、エフェクター媒介性腫瘍細胞溶解を誘導することが可能である。
本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする単離された核酸も提供される。
本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする単離された核酸を含むベクターも提供される。
本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする単離された核酸を含むベクターを含む宿主細胞も提供される。
ある特定の実施形態では、本発明の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物が提供される。
それを必要とする対象において、がんを処置する方法であって、本発明の医薬組成物を対象に投与するステップを含む方法も提供される。がんは、任意の液状がん(liquid cancer)又は固形がんであってもよく、例えば、以下に限定されないが、肺がん、胃がん、結腸がん、肝細胞癌、腎細胞癌、膀胱尿路上皮癌、転移性黒色腫、乳がん、卵巣がん、子宮頸がん、頭頚部がん、膵臓がん、神経膠腫、神経膠芽腫、及び他の固形腫瘍、並びに非ホジキンリンパ腫(NHL)、急性リンパ性白血病(ALL)、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、多発性骨髄腫(MM)、急性骨髄性白血病(AML)、及び他の液状腫瘍から選択され得る。
本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片を生産する方法も提供される。この方法は、当該モノクローナル抗体又はその抗原結合断片を産生する条件下で、当該モノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする核酸を含む細胞を培養するステップ、及び細胞又は培養物から当該モノクローナル抗体又はその抗原結合断片を回収するステップを含む。
本発明のモノクローナル抗体又は抗原結合断片を含む医薬組成物を生産する方法も提供される。この方法は、当該モノクローナル抗体又は抗原結合断片を薬学的に許容される担体と配合して、医薬組成物を得るステップを含む。
対象におけるFOLR1のレベルを決定する方法も提供される。この方法は、(a)対象から試料を得るステップ;(b)試料を本発明の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片と接触させるステップ;及び(c)対象におけるFOLR1のレベルを決定するステップを含む。試料は、例えば、組織試料又は血液試料であってもよい。組織試料は、例えば、がん組織試料であってもよい。
前述の概要、及び本出願の好ましい実施形態についての以下の詳細な説明は、添付の図面と併せて読まれるとより理解されるであろう。しかしながら、本出願は、図面に示されるまさにその実施形態に限定されないことが理解されるべきである。
図1A～1Bは、FACS分析によって実証されるように、ヒトFOLR1を安定的に発現するCHO細胞への精製したマウス抗FOLR1 mAbの結合を示す。 図2A～2Cは、ELISAアッセイにおける、固定したFOLR1細胞外ドメインへの抗FOLR1キメラmAbの用量依存的結合についての結果を示す。 図3A～3Dは、FACSアッセイにおける、SK-OV-3細胞への抗FOLR1キメラmAbの用量依存的結合についての結果を示す。 図3A-3Cの続きである。 図4A～4Cは、ELISAアッセイにおける、固定したFOLR1細胞外ドメインへのヒト化F5 mAbの用量依存的結合についての結果を示す。 図4A-4Bの続きである。 図5A～5Bは、ELISAアッセイにおける、固定したFOLR1細胞外ドメインへのヒト化F10 mAbの用量依存的結合についての結果を示す。 図6A～6Bは、ELISAアッセイにおける、固定したFOLR1細胞外ドメインへのヒト化F17 mAbの用量依存的結合についての結果を示す。 図7A～7Dは、ELISAアッセイにおける、固定したFOLR1細胞外ドメインへのヒト化F20 mAbの用量依存的結合についての結果を示す。 図7A-7Cの続きである。 図8A～8Jは、SK-OV-3細胞へのヒト化mAbの用量依存的結合についての結果を示す。図8Aは、ヒト化F5 mAbについてのデータであり;図8B～8Dは、ヒト化F10 mAbについてのデータであり;図8Eは、ヒト化F17 mAbについてのデータであり;図8F～8Jは、ヒト化F20 mAbについてのデータである。 図8A-8Bの続きである。 図8C-8Eの続きである。 図8F-8Hの続きである。 図9は、4つのヒト化抗FOLR1 mAbの抗体依存的細胞傷害(ADCC)活性についての結果を示す。
様々な刊行物、文献及び特許が背景技術及び本明細書の全体を通して引用又は記載され、これらの参照文献のそれぞれは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。本明細書に含まれている文書、作用、材料、デバイス、物品などについての議論は、本発明に関する背景を提供することを目的とする。このような議論は、これらの事項のいずれか又はすべてが、開示されるか又は特許請求される任意の発明に関して先行技術の一部を形成することを認めるものではない。
別途定義されていない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語及び科学用語は、この発明が関与する技術分野の当業者に通常理解されるものと同じ意味を有する。そうでなければ、本明細書で使用される特定の用語は、本明細書に示す意味を有する。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形の「a」、「an」、及び「the」は、別途この文脈で明確に示されていない限り、複数の対象を含む。
別途記載されていない限り、任意の数値、例えば、本明細書に記載の濃度又は濃度範囲は、すべての例で、用語「約」で修飾されているものと理解されるべきである。よって、数値は、通常は、記載された値の±10%を含む。例えば、1mg/mLの濃度は、0.9mg/mL～1.1mg/mLを含む。同様に、1%～10%(w/v)の濃度範囲は、0.9%(w/v)から11%(w/v)までを含む。本明細書で使用する場合、数値範囲の使用は、文脈が別途明確に示していない限り、そのような範囲内の整数及びその値の分数を含む、可能性のあるすべての下位範囲、その範囲内のすべての個々の数値を明確に含む。
別途示されていない限り、一連の要素に先行する用語「少なくとも」は、その連続したあらゆる要素を指すものと理解されるべきである。当業者であれば、単なる慣用の実験を使用して、本明細書に記載の本発明の具体的実施形態の多くの均等物を認識するか、又は確認することができるであろう。このような均等物は、本発明に包含されることが意図される。
本明細書で使用する場合、用語「含む(comprises)」、「含むこと(comprising)」、「含む(includes)」、「含むこと(including)」、「有する(has)」、「有すること(having)」、「含有する(contains)」若しくは「含有すること(containing)」、又はその任意の他の変形は、記載された整数又は整数の群の包含を意味するが、任意の他の整数又は整数の群の除外を意味するものではなく、非排他的又はオープンエンドであることを意図するものである。例えば、要素の列挙を含む組成物、混合物、プロセス、方法、物品、又は装置は、これらの要素のみに必ずしも限定されるものではなく、明示的に列挙されていないか又はこのような組成物、混合物、プロセス、方法、物品、若しくは装置に固有の他の要素を含み得る。さらに、明示的にその逆が述べられていない限り、「又は(or)」は、包括的な又はを指し、排他的な又はを指すものではない。例えば、条件A又はBは、以下のうちのいずれか1つを満たす:Aが真であり(又は存在し)Bが偽である(又は存在しない);Aが偽であり(又は存在しない)Bが真である(又は存在する);及びAとBの両方が真である(又は存在する)。
本明細書で使用する場合、複数の記載された要素間の接続的用語「及び/又は」は、個々の選択肢及び組み合わせた選択肢の両方を包含するものと理解される。例えば、2つの要素が「及び/又は」により接続される場合、第1の選択肢は、第2の要素なしでの第1の要素の適用性を指す。第2の選択肢は、第1の要素なしでの第2の要素の適用性を指す。第3の選択肢は、第1及び第2の要素の一緒の適用性を指す。これらの選択肢のいずれか1つは、その意味の範囲内にあると理解され、したがって、本明細書で使用される用語「及び/又は」の要件を満たす。この選択肢の1つ以上の同時適用も、この意味に含まれると理解され、したがって、用語「及び/又は」の要件を満たす。
本明細書で使用する場合、本明細書及び特許請求の範囲の全体を通して使用される用語「からなる(consists of)」、又はその変形、例えば、「からなる(consist of)」若しくは「からなる(consisting of)」は、任意の記載された整数又は整数の群の包含を示すが、さらなる整数又は整数の群を特定の方法、構造、又は組成物に追加することはできない。
本明細書で使用する場合、本明細書及び特許請求の範囲の全体を通して使用される、用語「から本質的になる(consists essentially of)」、又はその変形、例えば、「から本質的になる(consist essentially of)」若しくは「から本質的になる(consisting essentially of)」は、任意の記載された整数又は整数の群の包含、及び特定の方法、構造又は組成物の基本的な又は新規な特性を実質的に変えない任意の記載された整数又は整数の群の任意選択の包含を示す。M.P.E.P.§2111.03を参照のこと。
本明細書で使用する場合、「対象」は、任意の動物、好ましくは哺乳動物、最も好ましくはヒトを意味する。用語「哺乳動物」は、本明細書で使用する場合、任意の哺乳動物を包含する。哺乳動物の例としては、これらに限定されないが、ウシ、ウマ、ヒツジ、ブタ、ネコ、イヌ、マウス、ラット、ウサギ、モルモット、サル、ヒトなど、より好ましくはヒトが挙げられる。
用語「右」、「左」、「下」、及び「上」は、言及される図面中の方向を示す。
好ましい発明の構成要素の寸法又は特徴に言及する場合に本明細書で使用する用語「約(about)」、「およそ(approximately)」、「全般的に(generally)」、「実質的に(substantially)」などの用語は、記載された寸法/特徴が、厳密な境界又はパラメータではなく、当業者に理解されるように、機能的に同じか又は同様のそれらの軽微な変化を除外するものではないことも理解されるべきである。少なくとも、数値パラメータを含むこのような言及は、当技術分野で許容される数学的及び工業的原理(例えば、丸め誤差、測定誤差又は他の系統誤差、製作公差など)を使用した場合に少なくとも最下位桁を変化させないばらつきを含む。
2つ以上の核酸又はポリペプチド配列(例えば、抗FOLR1抗体及びそれらをコードするポリヌクレオチド、FOLR1ポリペプチド及びそれらをコードするFOLR1ポリヌクレオチド)の文脈における、用語「同一の」又は「同一性」パーセントは、以下の配列比較アルゴリズムのうちの1つを使用するか又は目視検査によって測定して最大一致となるように比較及びアライメントされた場合に、同じであるか、又は同じであるアミノ酸残基若しくはヌクレオチドを特定のパーセンテージで有する、2つ以上の配列又は部分配列を指す。
配列比較では、通常は、1つの配列が、試験配列が比較される参照配列として機能する。配列比較アルゴリズムを使用する場合、試験配列及び参照配列がコンピュータに入力され、必要に応じて部分配列座標が指定され、配列アルゴリズムプログラムパラメータが指定される。次いで、配列比較アルゴリズムによって、指定されたプログラムパラメータに基づいて、参照配列と比較した試験配列に関する配列同一性パーセントが計算される。
比較のために最適な配列アラインメントは、例えば、Smith及びWaterman、Adv. Appl. Math. 2:482(1981)のローカルホモロジーアルゴリズムによって、Needleman及びWunsch、J. Mol. Biol. 48:443(1970)のホモロジーアラインメントアルゴリズムによって、Pearson及びLipman、Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 85:2444(1988)の類似性検索法によって、これらのアルゴリズム(Wisconsin Genetics Software Package、Genetics Computer Group、575 Science Dr., Madison、WIのGAP、BESTFIT、FASTA、及びTFASTA)のコンピュータ上での実行によって、又は目視検査(全般的に、Current Protocols in Molecular Biology、F.M. Ausubelら編、Current Protocols、Greene Publishing Associates, Inc.とJohn Wiley & Sons, Inc.の合弁事業、(1995補遺)(Ausubel)を参照のこと)によって行うことができる。
配列同一性パーセント及び配列類似性を決定するのに好適なアルゴリズム例は、Altschulら(1990)J. Mol. Biol. 215:403～410頁及びAltschulら(1997)Nucleic Acids Res. 25:3389～3402頁にそれぞれ記載される、BLAST及びBLAST2.0アルゴリズムである。BLAST分析を実施するためのソフトウェアは、米国立生物工学情報センター(National Center for Biotechnology Information)を通じて公的に利用可能である。このアルゴリズムはまず、データベース配列中の同じ長さのワードと整列させた場合、ある正の値の閾値スコアTと一致するか又はそれを満たすかのいずれかである、クエリー配列中の長さWの短いワードを特定することによって、高スコア配列対(HSP)を特定することを伴う。Tは、隣接ワードスコア閾値と呼ばれる(Altschulら、上掲)。これらの初期隣接ワードヒットは、それらを含有するより長いHSPを見出すための検索を開始するためのシードとして作用する。次いで、このワードヒットは、累積アラインメントスコアが増加し得る限り、各配列に沿って両方向に伸長される。
累積スコアは、ヌクレオチド配列については、パラメータM(一致する残基の対に関するリワードスコア;常に0より大きい)及びN(ミスマッチの残基に関するペナルティスコア;常に0より小さい)を使用して計算される。アミノ酸配列については、スコアリングマトリックスを使用して、累積スコアを計算する。累積アラインメントスコアがその最大達成値から量X下降するか;累積スコアが1つ以上の負のスコアリングの残基アラインメントの蓄積のために、0以下になるか;又はいずれかの配列の末端に達するかした場合、それぞれの方向でのワードヒットの伸長が停止される。BLASTアルゴリズムパラメータW、T及びXは、アラインメントの感度及び速度を決定する。BLASTNプログラム(ヌクレオチド配列について)は、ワード長(W)を11、期待値(E)を10、M=5、N=-4、及び両鎖の比較をデフォルトとして使用する。アミノ酸配列については、BLASTPプログラムは、ワード長(W)を3、期待値(E)を10、及びBLOSUM62スコアリングマトリックス(Henikoff及びHenikoff、Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10915頁(1989)を参照のこと)をデフォルトとして使用する。
配列同一性パーセントを計算することに加えて、BLASTアルゴリズムはまた、2つの配列間の類似性の統計分析も実施する(例えば、Karlin及びAltschul、Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 90:5873～5787頁(1993)を参照のこと)。BLASTアルゴリズムによって提供される類似性の1つの尺度は、2つのヌクレオチド又はアミノ酸配列間の一致が偶然に生じる確率の指標を提供する最小和確率(P(N))である。例えば、試験核酸と参照核酸との比較における最小和確率が約0.1未満、より好ましくは約0.01未満、最も好ましくは約0.001未満である場合、その核酸は参照配列と類似すると考えられる。
2つの核酸配列又はポリペプチドが実質的に同一であることのさらなる指標は、第1の核酸によってコードされるポリペプチドが、以下に記載されるように、第2の核酸によってコードされるポリペプチドと免疫学的に交差反応性であることである。よって、ポリペプチドは、典型的には、例えば、2つのペプチドが保存的置換によってのみ異なる場合に、第2のポリペプチドと実質的に同一である。2つの核酸配列が実質的に同一であることの別の指標は、2つの分子が、ストリンジェントな条件下で互いにハイブリダイズすることである。
抗体
本発明は、全般的に、単離された抗FOLR1抗体、これらの抗体をコードする核酸及び発現ベクター、このベクターを含有する組換え細胞、並びにこれらの抗体を含む組成物に関する。これらの抗体を作製する方法、及びがんを含む疾患を処置するためにこれらの抗体を使用する方法も提供される。本発明の抗体は、以下に限定されないが、FOLR1への高親和性結合、FOLR1への高い特異性、並びに単独又は他の抗がん治療と組み合わせて投与した場合に、それを必要とする対象及び動物モデルにおける腫瘍成長を阻害する能力を含む、1つ以上の望ましい機能的特性を有する。
全般的態様では、本発明は、FOLR1に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。
本明細書で使用する場合、用語「抗体」は、広義の意味で使用され、免疫グロブリン又は抗体分子を含み、モノクローナル若しくはポリクローナルである、ヒトの、ヒト化された、複合体の及びキメラの抗体及び抗体断片を含む。一般的に、抗体は、特定の抗原への結合特異性を示すタンパク質又はペプチド鎖である。抗体構造は周知である。免疫グロブリンは、重鎖定常ドメインアミノ酸配列に応じて5つの主要なクラス(すなわち、IgA、IgD、IgE、IgG及びIgM)に割り当てることができる。IgA及びIgGは、アイソタイプIgA1、IgA2、IgG1、IgG2、IgG3及びIgG4にさらに細分類される。したがって、本発明の抗体は、5つの主要なクラス又は対応するサブクラスのいずれかのものであり得る。好ましくは、本発明の抗体は、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4である。脊椎動物種の抗体軽鎖は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づき、2つの明確に異なるタイプ、すなわち、カッパ及びラムダのうちの一方に割り当てることができる。したがって、本発明の抗体は、カッパ又はラムダ軽鎖定常ドメインを含有し得る。特定の実施形態によれば、本発明の抗体は、ラット又はヒト抗体由来の重鎖及び/又は軽鎖定常領域を含む。重鎖及び軽鎖定常ドメインに加えて、抗体は、軽鎖可変領域及び重鎖可変領域から構成される抗原結合領域を含み、その軽鎖可変領域及び重鎖可変領域のそれぞれが3つのドメイン(すなわち、相補性決定領域1～3;CDR1、CDR2、及びCDR3)を含む。軽鎖可変領域のドメインは、代わりに、LCDR1、LCDR2、及びLCDR3と称され、重鎖可変領域のドメインは、代わりに、HCDR1、HCDR2、及びHCDR3と称される。
本明細書で使用する場合、用語「単離された抗体」は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指す(例えば、FOLR1に特異的に結合する単離された抗体は、FOLR1に結合しない抗体を実質的に含まない)。さらに、単離された抗体は、他の細胞材料及び/又は化学物質を実質的に含まない。
本明細書で使用する場合、用語「モノクローナル抗体」は、実質的に均質な抗体の集団から得られる抗体を指し、すなわち、その集団を構成する個々の抗体は、わずかな量で存在し得る天然に存在する可能性のある突然変異を除いて、同一である。本発明のモノクローナル抗体は、ハイブリドーマ法、ファージディスプレイ技法、単一リンパ球遺伝子クローニング技法によって、又は組換えDNA法によって、作製することができる。例えば、モノクローナル抗体は、ヒト重鎖導入遺伝子及び軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有するトランスジェニック非ヒト動物、例えば、トランスジェニックマウス又はラットから得られるB細胞を含むハイブリドーマによって産生させることができる。
本明細書で使用する場合、用語「抗原結合断片」は、例えば、ダイアボディ、Fab、Fab'、F(ab')2、Fv断片、ジスルフィド安定化Fv断片(dsFv)、(dsFv)2、二重特異性dsFv(dsFv-dsFv')、ジスルフィド安定化ダイアボディ(dsダイアボディ)、単鎖抗体分子(scFv)、単一ドメイン抗体(sdab)、scFv二量体(二価のダイアボディ)、1つ以上のCDRを含む抗体の一部から形成された多重特異性抗体、ラクダ化単一ドメイン抗体、ナノボディ、ドメイン抗体、二価ドメイン抗体、又は抗原に結合するが完全な抗体構造を含まない任意の他の抗体断片などの、抗体断片を指す。抗原結合断片は、親抗体又は親抗体断片が結合するのと同じ抗原に結合することが可能である。特定の実施形態によれば、抗原結合断片は、軽鎖可変領域、軽鎖定常領域、及び重鎖のFdセグメントを含む。他の特定の実施形態によれば、抗原結合断片は、Fab及びF(ab')を含む。
本明細書で使用する場合、用語「単鎖抗体」は、約15～約20アミノ酸の短いペプチドによって連結した重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含む、この分野の従来の単鎖抗体を指す。本明細書で使用する場合、用語「単一ドメイン抗体」は、重鎖可変領域及び重鎖定常領域を含むか又は重鎖可変領域のみを含む、この分野の従来の単一ドメイン抗体を指す。
本明細書で使用する場合、用語「ヒト抗体」は、ヒトによって産生される抗体又は当技術分野で公知の任意の技法を使用して作製されるヒトによって産生される抗体に対応するアミノ酸配列を有する抗体を指す。ヒト抗体のこの定義は、インタクトな若しくは完全長の抗体、その断片、並びに/又は少なくとも1つのヒト重鎖及び/若しくは軽鎖ポリペプチドを含む抗体を含む。
本明細書で使用する場合、用語「ヒト化抗体」は、抗体の抗原結合特性は保持されるが、ヒトの身体におけるその抗原性は低下するように、ヒト抗体のものに対する配列相同性を増加させるよう改変されている、非ヒト抗体を指す。
本明細書で使用する場合、用語「キメラ抗体」は、免疫グロブリン分子のアミノ酸配列が2つ以上の生物種に由来する抗体を指す。軽鎖と重鎖の両方の可変領域が、所望の特異性、親和性、及び能力を有する哺乳動物のうちの1種(例えば、マウス、ラット、ウサギなど)に由来する抗体の可変領域に対応する場合が多く、一方、定常領域は、その種における免疫応答の誘発を回避するために、哺乳動物の別の種(通常、ヒト)に由来する抗体の配列に対応する。
本明細書で使用する場合、用語「多重特異性抗体」は、複数の免疫グロブリン可変ドメイン配列を含む抗体を指し、この複数のうち第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第1のエピトープに対する結合特異性を有し、この複数のうち第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列は、第2のエピトープに対する結合特異性を有する。一実施形態では、第1及び第2のエピトープは、同じ抗原上、例えば、同じタンパク質(又は多量体タンパク質の同じサブユニット)上にある。一実施形態では、第1及び第2のエピトープは、重複しているか又は実質的に重複している。一実施形態では、第1及び第2のエピトープは、重複していないか又は実質的に重複していない。一実施形態では、第1及び第2のエピトープは、異なる抗原上、例えば、異なるタンパク質(又は多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。一実施形態では、多重特異性抗体は、第3、第4、又は第5の免疫グロブリン可変ドメインを含む。一実施形態では、多重特異性抗体は、二重特異性抗体分子、三重特異性抗体分子、又は四重特異性抗体分子である。
本明細書で使用する場合、用語「二重特異性抗体」は、たった2つのエピトープ又は2つの抗原に結合する多重特異性抗体を指す。二重特異性抗体は、第1のエピトープに対する結合特異性を有する第1の免疫グロブリン可変ドメイン配列と、第2のエピトープに対する結合特異性を有する第2の免疫グロブリン可変ドメイン配列とによって特徴付けられる。一実施形態では、第1及び第2のエピトープは、同じ抗原上、例えば、同じタンパク質(又は多量体タンパク質の同じサブユニット)上にある。一実施形態では、第1及び第2のエピトープは、重複しているか又は実質的に重複している。一実施形態では、第1及び第2のエピトープは、異なる抗原上、例えば、異なるタンパク質(又は多量体タンパク質の異なるサブユニット)上にある。一実施形態では、二重特異性抗体は、第1のエピトープに対する結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列及び軽鎖可変ドメイン配列と、第2のエピトープに対する結合特異性を有する重鎖可変ドメイン配列及び軽鎖可変ドメイン配列とを含む。一実施形態では、二重特異性抗体は、第1のエピトープに対する結合特異性を有する半抗体、又はその断片、及び第2のエピトープに対する結合特異性を有する半抗体、又はその断片を含む。一実施形態では、二重特異性抗体は、第1のエピトープに対する結合特異性を有するscFv、若しくはその断片、又は第2のエピトープに対する結合特異性を有するscFv、若しくはその断片を含む。一実施形態では、第1のエピトープは、FOLR1上に位置し、第2のエピトープは、PD-1、PD-L1、LAG-3、TIM-3、CTLA-4、EGFR、HER-2、CD19、CD20、CD33、CD47、CD73、アペリン、DLL3、クローディン18.2、TIP-1、CD3及び/又は他の腫瘍関連免疫サプレッサー若しくは表面抗原上に位置する。
本明細書で使用する場合、用語「FOLR1」は、葉酸受容体α(FRα)又は葉酸結合タンパク質(FBP)としても知られる葉酸受容体1(FOLR1)を指し、葉酸の活性形態、5-メチルテトラヒドロ葉酸(5-MTF)、及びその誘導体に対して高い親和性を有し、これらを細胞へと輸送する細胞表面のグリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)-アンカー膜タンパク質である(Salazar及びRatnam、Cancer Metastasis Rev 2007; 26:141～52頁)。
FOLR1は、ある特定の固形腫瘍、例えば、卵巣がん、肺がん及び乳がんにおいて過剰発現されるため、腫瘍学の標的となっている(Toffoliら、Int J Cancer 1997; 74:193～198頁及びBoogerdら、Oncotarget 2016; 7:17442～17454頁)が、その発現は、限られた正常なヒト組織では低レベルである(Weitmanら、Cancer Res 1992; 52:3396～3401頁)。この観察と一致して、これまでにFOLR1標的小分子及び大分子に関して行われた第1相臨床試験によって良好な薬物耐性が明らかとなった(Cheungら、Oncotarget 2016; 7:52553～52574頁)。したがって、FOLR1は、腫瘍関連/腫瘍特異的抗原であり、抗FOLR1モノクローナル抗体(mAb)は、潜在的な抗がん治療薬であり得る。さらに、FOLR1は、治療用分子をがん細胞に対して特異的に標的化するために使用することができる。ヒトFOLR1の例示的アミノ酸配列は、GenBankアクセッション番号NP_057937(配列番号135)に示される。
本明細書で使用する場合、「FOLR1に特異的に結合する」抗体は、1×10-7M以下、好ましくは1×10-8M以下、より好ましくは5×10-9M以下、1×10-9M以下、5×10-10M以下、又は1×10-10M以下のKDで、FOLR1、好ましくはヒトFOLR1に結合する抗体を指す。用語「KD」は、解離定数を指し、これはKaに対するKdの比率(すなわち、Kd/Ka)から得られ、モル濃度(M)として表される。抗体に対するKD値は、本開示に鑑みて、当技術分野における方法を使用して決定することができる。例えば、抗体のKDは、表面プラズモン共鳴を使用して、例えば、バイオセンサーシステム、例えば、Biacore(登録商標)システムを使用して、又はバイオレイヤー干渉法、例えば、Octet RED96システムを使用して、決定することができる。
抗体のKD値が小さいほど、抗体が標的抗原に結合する親和性は高くなる。
特定の態様によれば、本発明は、
a.それぞれ、配列番号38、39、40、62、63及び64;
b.それぞれ、配列番号17、18、19、41、42及び43;
c.それぞれ、配列番号20、21、22、44、45及び46;
d.それぞれ、配列番号23、24、25、47、48及び49;
e.それぞれ、配列番号26、27、28、50、51及び52;
f.それぞれ、配列番号29、30、31、53、54及び55;
g.それぞれ、配列番号32、33、34、56、57及び58;又は
h.それぞれ、配列番号35、36、37、59、60及び61;
のポリペプチド配列を有する重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2、及びLCDR3を含み、FOLR1、好ましくはヒトFOLR1に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。
特定の態様によれば、本発明は、
a.それぞれ、配列番号86、87、88、110、111及び112;
b.それぞれ、配列番号65、66、67、89、90及び91;
c.それぞれ、配列番号68、69、70、92、93及び94;
d.それぞれ、配列番号71、72、73、95、96及び97;
e.それぞれ、配列番号74、75、76、98、99及び100;
f.それぞれ、配列番号77、78、79、101、102及び103;
g.それぞれ、配列番号80、81、82、104、105及び106;又は
h.それぞれ、配列番号83、84、85、107、108及び109;
のポリペプチド配列を有する重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2、及びLCDR3を含み、FOLR1、好ましくはヒトFOLR1に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。
別の特定の態様によれば、本発明は、配列番号15、1、3、5、7、9、11若しくは13のうちの1つと少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%若しくはそれより多くの割合、例えば、95%、96%、97%、98%、若しくは99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、又は配列番号16、2、4、6、8、10、12若しくは14のうちの1つと少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%若しくはそれより多くの割合、例えば、95%、96%、97%、98%、若しくは99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。好ましい一実施形態によれば、本発明の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、それぞれ、配列番号15、1、3、5、7、9、11若しくは13と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号16、2、4、6、8、10、12若しくは14と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
別の特定の態様によれば、本発明は、
a.配列番号15のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号16のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
b.配列番号1のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号2のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
c.配列番号3のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号4のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
d.配列番号5のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号6のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
e.配列番号7のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号8のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
f.配列番号9のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号10のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
g.配列番号11のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号12のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;又は
h.配列番号13のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号14のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域
を含む、本発明の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号38、39、40、62、63及び64のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号15と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号16と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号15のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号16のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号17、18、19、41、42及び43のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号1と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号2と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号1のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号2のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号20、21、22、44、45及び46のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号3と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号4と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号3のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号4のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号23、24、25、47、48、及び49のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号5と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号6と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号5のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号6のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号26、27、28、50、51、及び52のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号7と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、若しくは99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号8と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、若しくは99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号7のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号8のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号29、30、31、53、54、及び55のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号9と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号10と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号9のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号10のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号32、33、34、56、57、及び58のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号11と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号12と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号11のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号12のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号35、36、37、59、60、及び61のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号13と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号14と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号13のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号14のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号86、87、88、110、111、及び112のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号15と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号16と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号15のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号16のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号65、66、67、89、90、及び91のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号1と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号2と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号1のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号2のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号68、69、70、92、93、及び94のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号3と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号4と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号3のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号4のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号71、72、73、95、96、及び97のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号5と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号6と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号5のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号6のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号74、75、76、98、99、及び100のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号7と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号8と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号7のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号8のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号77、78、79、101、102及び103のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号9と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号10と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号9のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号10のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号80、81、82、104、105、及び106のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号11と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号12と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号11のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号12のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、それぞれ、配列番号83、84、85、107、108、及び109のポリペプチド配列を有するHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。別の実施形態では、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号13と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号14と少なくとも85%、好ましくは90%、より好ましくは95%又はそれより多くの割合で、例えば、95%、96%、97%、98%、又は99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。好ましくは、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、配列番号13のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号14のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む。
別の特定の態様によれば、本発明は、キメラである、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。
別の特定の態様によれば、本発明は、ヒトの又はヒト化されたものである、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片に関する。
別の特定の態様によれば、ヒト化モノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、
(1)配列番号113のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(2)配列番号113のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(3)配列番号114のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(4)配列番号114のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(5)配列番号115のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(6)配列番号115のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(7)配列番号116のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(8)配列番号116のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(9)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号121のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(10)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号122のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(11)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号123のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(12)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号121のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(13)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号122のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(14)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号123のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(15)配列番号124のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号126のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(16)配列番号124のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号127のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(17)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(18)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(19)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(20)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(21)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(22)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(23)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(24)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(25)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(26)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(27)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;又は
(28)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域.
を含む。
別の一般的態様では、本発明は、本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする、単離された核酸に関する。タンパク質のコード配列を、タンパク質のアミノ酸配列を変化させることなく、変化させる(例えば、置換、欠失、挿入など)ことができることは当業者によって認識されるであろう。したがって、本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする核酸配列は、タンパク質のアミノ酸配列を変化させることなく変更され得ることは、当業者によって理解されるであろう。
別の一般的態様では、本発明は、本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする単離された核酸を含むベクターに関する。本開示を鑑みて、当業者に公知の任意のベクター、例えば、プラスミド、コスミド、ファージベクター又はウイルスベクターを使用することができる。一部の実施形態では、ベクターは、組換え発現ベクター、例えば、プラスミドである。ベクターは、発現ベクターの従来の機能を確立するための任意の要素、例えば、プロモーター、リボソーム結合エレメント、ターミネーター、エンハンサー、選択マーカー、及び複製起点を含むことができる。プロモーターは、構成性、誘導性又は抑制性プロモーターであってもよい。核酸を細胞に送達することが可能な多くの発現ベクターが、当技術分野で公知であり、本明細書において、細胞における抗体又はその抗原結合断片の生産に使用することができる。本発明の実施形態によれば、従来のクローニング技法又は人工遺伝子合成を使用して組換え発現ベクターを生成することができる。このような技法は、本開示に鑑みて、当業者に周知である。
別の一般的態様では、本発明は、本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする単離された核酸を含む宿主細胞に関する。本開示に鑑みて、当業者に公知の任意の宿主細胞を、本発明の抗体又はその抗原結合断片の組換え発現に使用することができる。一部の実施形態では、宿主細胞は、大腸菌(E. coli)TG1若しくはBL21細胞(例えば、scFv又はFab抗体の発現用)、CHO-DG44若しくはCHO-K1細胞又はHEK293細胞(例えば、完全長IgG抗体の発現用)である。特定の実施形態によれば、従来の方法、例えば、化学的トランスフェクション、熱ショック、又はエレクトロポレーションによって、組換え発現ベクターは宿主細胞に形質転換され、組換え核酸が有効に発現されるように組換え発現ベクターが宿主細胞のゲノムに安定して組み込まれる。
別の一般的態様では、本発明は、本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片を生産する方法であって、本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片を産生する条件下で、モノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする核酸を含む細胞を培養するステップ、及び細胞又は細胞培養物から(例えば、上清から)、抗体又はその抗原結合断片を回収するステップを含む方法に関する。当技術分野で公知であり、本明細書に記載される従来の技法に従って、発現された抗体又はその抗原結合断片を細胞から採取し、精製することができる。
医薬組成物
別の一般的態様では、本発明は、本発明の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物に関する。用語「医薬組成物」は、本明細書で使用する場合、本発明の抗体を、薬学的に許容される担体と一緒に含む生産物を意味する。本発明の抗体及びこれらを含む組成物は、本明細書で言及した治療適用のための医薬の製造においても有用である。
本明細書で使用する場合、用語「担体」は、任意の賦形剤、希釈剤、充填剤、塩、緩衝剤、安定剤、相溶剤、油、脂質、ベシクルを含む脂質、マイクロスフェア、リポソーム封入、又は医薬製剤において使用するための当技術分野で周知の他の材料を指す。担体、賦形剤又は希釈剤の特徴は、特定の適用のための投与経路に依存することが理解されよう。本明細書で使用する場合、用語「薬学的に許容される担体」は、本発明による組成物の有効性又は本発明による組成物の生物学的活性を妨げない非毒性材料を指す。特定の実施形態によれば、本開示に鑑みて、抗体医薬組成物において使用するのに好適な任意の薬学的に許容される担体を、本発明において使用することができる。
薬学的に活性な成分の薬学的に許容される担体との製剤化は、例えば、Remington: The Science and Practice of Pharmacy(例えば、第21版(2005)、その後の任意の版)にあるように、当技術分野で公知である。追加の成分の非限定例として、緩衝剤、希釈剤、溶媒、張性調節剤、防腐剤、安定剤、及びキレート剤が挙げられる。1つ以上の薬学的に許容される担体を、本発明の医薬組成物の製剤化において使用することができる。
本発明の一実施形態では、医薬組成物は、液体製剤である。液体製剤の好ましい例は、水性製剤、すなわち、水を含む製剤である。液体製剤は、溶液、懸濁液、エマルション、マイクロエマルション、ゲルなどを含むことができる。水性製剤は、典型的には、少なくとも50%w/wの水、又は少なくとも60%、70%、75%、80%、85%、90%、又は少なくとも95%w/wの水を含む。
一実施形態では、医薬組成物は、例えば、注射デバイス(例えば、シリンジ又は輸液ポンプ)を介して注射することができる注射剤として製剤化することができる。注射は、例えば、皮下、筋肉内、腹腔内、硝子体内、又は静脈内に送達することができる。
別の実施形態では、医薬組成物は、固体製剤、例えば、凍結乾燥又は噴霧乾燥組成物であり、これはそのまま使用してもよく、又は、医師若しくは患者が使用前に溶媒、及び/若しくは希釈剤を添加して使用してもよい。固体剤形としては、錠剤、例えば、圧縮錠剤、及び/又はコーティングされた錠剤、並びにカプセル(例えば、ハード又はソフトゼラチンカプセル)を挙げることができる。医薬組成物はまた、例えば、サッシェ、糖衣錠、粉末、顆粒、トローチ剤、又は再構築用の粉末の形態であってもよい。
剤形は、即時放出(この場合、水溶性又は分散性担体を含み得る)であってもよく、又は、遅延放出、持続放出、若しくは修正放出(これらの場合は、胃腸管又は皮下における剤形の溶解速度を調節する非水溶性ポリマーを含み得る)であってもよい。
他の実施形態では、医薬組成物は、鼻腔内、頬内、又は舌下送達され得る。
水性製剤のpHは、pH3～pH10の間であり得る。本発明の一実施形態では、製剤のpHは、約7.0～約9.5である。本発明の別の実施形態では、製剤のpHは、約3.0～約7.0である。
本発明の別の実施形態では、医薬組成物は、緩衝剤を含む。緩衝剤の非限定例として、アルギニン、アスパラギン酸、ビシン、クエン酸塩、リン酸水素二ナトリウム、フマル酸、グリシン、グリシルグリシン、ヒスチジン、リシン、マレイン酸、リンゴ酸、酢酸ナトリウム、炭酸ナトリウム、リン酸二水素ナトリウム、リン酸ナトリウム、コハク酸塩、酒石酸、トリシン、及びトリス(ヒドロキシメチル)-アミノメタン、並びにこれらの混合物が挙げられる。緩衝剤は、個々に又は全体で、約0.01mg/ml～約50mg/ml、例えば、約0.1mg/ml～約20mg/mlの濃度で存在してもよい。これらの具体的な緩衝剤の各々を含む医薬組成物は、本発明の代替的な実施形態を構成する。
本発明の別の実施形態では、医薬組成物は、防腐剤を含む。防腐剤の非限定例として、塩化ベンゼトニウム、安息香酸、ベンジルアルコール、ブロノポール、ブチル4-ヒドロキシベンゾエート、クロロブタノール、クロロクレゾール、クロロヘキシジン、クロルフェネシン、o-クレゾール、m-クレゾール、p-クレゾール、エチル4-ヒドロキシベンゾエート、イミド尿素、メチル4-ヒドロキシベンゾエート、フェノール、2-フェノキシエタノール、2-フェニルエタノール、プロピル4-ヒドロキシベンゾエート、デヒドロ酢酸ナトリウム、チオメロサール、及びこれらの混合物が挙げられる。防腐剤は、個々に又は全体で、約0.01mg/ml～約50mg/ml、例えば、約0.1mg/ml～約20mg/mlの濃度で存在してもよい。これらの具体的な防腐剤の各々を含む医薬組成物は、本発明の代替的な実施形態を構成する。
本発明の別の実施形態では、医薬組成物は、等張剤を含む。この実施形態の非限定例として、塩(例えば、塩化ナトリウム)、アミノ酸(例えば、グリシン、ヒスチジン、アルギニン、リシン、イソロイシン、アスパラギン酸、トリプトファン、及びトレオニン)、アルジトール(例えば、グリセロール、1,2-プロパンジオールプロピレングリコール)、1,3-プロパンジオール、及び1,3-ブタンジオール)、ポリエチレングリコール(例えば、PEG400)、及びこれらの混合物が挙げられる。等張剤の別の例としては、糖が挙げられる。糖の非限定例は、単糖類、二糖類、若しくは多糖類、又は水溶性グルカンであってもよく、例えば、フルクトース、グルコース、マンノース、ソルボース、キシロース、マルトース、ラクトース、ショ糖、トレハロース、デキストラン、プルラン、デキストリン、シクロデキストリン、アルファ及びベータ-HPCD、可溶性デンプン、ヒドロキシエチルデンプン、並びにカルボキシメチルセルロースナトリウムを含む。等張剤の別の例は糖アルコールであり、用語「糖アルコール」は、少なくとも1つの-OH基を有するC(4～8)炭化水素として定義される。糖アルコールの非限定例として、マンニトール、ソルビトール、イノシトール、ガラクチトール、ズルシトール、キシリトール、及びアラビトールが挙げられる。等張剤は、個々に又は全体で、約0.01mg/ml～約50mg/ml、例えば、約0.1mg/ml～約20mg/mlの濃度で存在してもよい。これらの具体的な等張剤の各々を含む医薬組成物は、本発明の代替的な実施形態を構成する。
本発明の別の実施形態では、医薬組成物は、キレート剤を含む。キレート剤の非限定例として、クエン酸、アスパラギン酸、エチレンジアミン四酢酸(EDTA)の塩、及びこれらの混合物が挙げられる。キレート剤は、個々に又は全体で、約0.01mg/ml～約50mg/ml、例えば、約0.1mg/ml～約20mg/mlの濃度で存在してもよい。これらの具体的なキレート剤の各々を含む医薬組成物は、本発明の代替的な実施形態を構成する。
本発明の別の実施形態では、医薬組成物は、安定剤を含む。安定剤の非限定例として、1つ以上の凝集阻害剤、1つ以上の酸化阻害剤、1つ以上の界面活性剤、及び/又は1つ以上のプロテアーゼ阻害剤が挙げられる。
本発明の別の実施形態では、医薬組成物は、安定剤を含み、前記安定剤は、カルボキシ/ヒドロキシセルロース及びその誘導体(例えば、HPC、HPC-SL、HPC-L及びHPMC)、シクロデキストリン、2-メチルチオエタノール、ポリエチレングリコール(例えば、PEG3350)、ポリビニルアルコール(PVA)、ポリビニルピロリドン、塩(例えば、塩化ナトリウム)、硫黄含有物質、例えば、モノチオグリセロール)、又はチオグリコール酸である。安定剤は、個々に又は全体で、約0.01mg/ml～約50mg/ml、例えば、約0.1mg/ml～約20mg/mlの濃度で存在してもよい。これらの具体的な安定剤の各々を含む医薬組成物は、本発明の代替的な実施形態を構成する。
本発明のさらなる実施形態では、医薬組成物は、1つ以上の界面活性剤、好ましくは界面活性剤、少なくとも1つの界面活性剤、又は2つの異なる界面活性剤を含む。用語「界面活性剤」は、水溶性(親水性)部分と、脂溶性(親油性)部分とから構成される任意の分子又はイオンを指す。界面活性剤は、例えば、アニオン性界面活性剤、カチオン性界面活性剤、非イオン性界面活性剤、及び/又は双極性イオン界面活性剤からなる群から選択することができる。界面活性剤は、個々に又は全体で、約0.1mg/ml～約20mg/mlの濃度で存在してもよい。これらの具体的な界面活性剤の各々を含む医薬組成物は、本発明の代替的な実施形態を構成する。
本発明のさらなる実施形態では、医薬組成物は、1つ以上のプロテアーゼ阻害剤、例えば、EDTA、及び/又は塩酸(HCl)ベンズアミジンなどを含む。プロテアーゼ阻害剤は、個々に又は全体で、約0.1mg/ml～約20mg/mmlの濃度で存在してもよい。これらの具体的なプロテアーゼ阻害剤の各々を含む医薬組成物は、本発明の代替的な実施形態を構成する。
別の一般的態様では、本発明は、本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片を含む医薬組成物を生産する方法であって、モノクローナル抗体又はその抗原結合断片を薬学的に許容される担体と配合して、医薬組成物を得るステップを含む方法に関する。
使用方法
別の一般的態様では、本発明は、対象において、がん細胞表面のFOLR1を標的とする方法であって、FOLR1に特異的に結合する単離されたモノクローナル抗体若しくはその抗原結合断片又は本発明の医薬組成物を対象に投与するステップを含む方法に関する。FOLR1へのモノクローナル抗体又はその抗原結合断片の結合は、補体依存性細胞傷害(CDC)、抗体依存性ファゴサイトーシス(ADPC)、及び/若しくは抗体依存性細胞傷害(ADCC)又は標的がん細胞の死滅をもたらす他の作用を媒介し得る。モノクローナル抗体又はその抗原結合断片は、例えば、コンジュゲート薬物を動員する役割を果たす、及び/又は標的がん細胞の死滅を媒介する別のモノクローナル抗体と共に二重特異性抗体を形成することができる。
FOLR1に結合する抗体及びその抗原結合断片の機能的活性は、当技術分野で公知の方法及び本明細書に記載される方法によって特徴付けることができる。FOLR1に結合する抗体及びその抗原結合断片を特徴付けるための方法として、以下に限定されないが、Biacore、ELISA、及びOctetRed分析を含む親和性及び特異性アッセイ;がん細胞又は組換えによりFOLR1を発現する細胞上のFOLR1への抗体の結合をFACSによって検出するための結合アッセイが挙げられる。特定の実施形態によれば、FOLR1に結合する抗体及びその抗原結合断片を特徴付けるための方法として、以下に記載されるものが挙げられる。
別の一般的態様では、本発明は、それを必要とする対象において、がんを処置する方法であって、FOLR1に特異的に結合する単離されたモノクローナル抗体若しくはその抗原結合断片又は本発明の医薬組成物を対象に投与するステップを含む方法に関する。がんは、例えば、以下に限定されないが、肺がん、胃がん、結腸がん、肝細胞癌、腎細胞癌、膀胱尿路上皮癌、転移性黒色腫、乳がん、卵巣がん、子宮頸がん、頭頚部がん、膵臓がん、神経膠腫、神経膠芽腫、及び他の固形腫瘍、並びに非ホジキンリンパ腫(NHL)、急性リンパ性白血病(ALL)、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、多発性骨髄腫(MM)、急性骨髄性白血病(AML)、及び他の液状腫瘍から選択され得る。
本発明の実施形態によれば、医薬組成物は、治療有効量の抗FOLR1抗体又はその抗原結合断片を含む。本明細書で使用する場合、用語「治療有効量」は、対象において、所望の生物学的又は医学的応答を誘発する、有効成分又は構成成分の量を指す。治療有効量は、記載された目的に関連して、経験的且つ慣用方法で決定することができる。
抗FOLR1抗体又はその抗原結合断片に関連して本明細書で使用する場合、治療有効量は、それを必要とする対象において、免疫応答をモジュレートする抗FOLR1抗体又はその抗原結合断片の量を意味する。
特定の実施形態によれば、治療有効量は、以下の効果のうちの1つ、2つ、3つ、4つ、又はそれを超えるものを達成するのに十分な治療の量を指す:(i)処置される疾患、障害若しくは状態、又はそれに伴う症状の重症度を低減又は改善すること、(ii)処置される疾患、障害若しくは状態、又はそれに伴う症状の期間を短縮すること、(iii)処置される疾患、障害若しくは状態、又はそれに伴う症状の進行を予防すること、(iv)処置される疾患、障害若しくは状態、又はそれに伴う症状の退縮を生じること、(v)処置される疾患、障害若しくは状態、又はそれに伴う症状の進展又は発症を予防すること、(vi)処置される疾患、障害若しくは状態、又はそれに伴う症状の再発を予防すること、(vii)処置される疾患、障害、若しくは状態、又はそれに伴う症状を有する対象の入院を減少させること、(viii)処置される疾患、障害若しくは状態、又はそれに伴う症状を有する対象の入院期間を短縮させること、(ix)処置される疾患、障害若しくは状態、又はそれに伴う症状を有する対象の生存率を高めること、(xi)対象における、処置される疾患、障害若しくは状態、又はそれに伴う症状を阻害若しくは低減すること、並びに/あるいは(xii)別の治療の予防的又は治療効果を強化又は改善すること。
治療有効量又は治療有効投与量は、様々な因子、例えば、処置される疾患、障害又は状態、投与の手段、標的部位、対象の生理学的状態(例えば、年齢、体重、健康を含む)、対象がヒトであるか又は動物であるか、投与される他の医薬、及び処置が予防的であるか又は治療的であるかに応じて変動し得る。処置投与量は、安全性及び有効性を最適化するよう最適に用量設定される。
特定の実施形態によれば、本明細書に記載の組成物は、対象への意図した投与経路に好適となるように製剤化される。例えば、本明細書に記載の組成物は、静脈内、皮下、又は筋肉内投与に好適となるよう製剤化することができる。
本明細書で使用する場合、用語「処置(治療)する(treat)」、「処置(治療)すること(treating)」、及び「処置(治療)(treatment)」はいずれも、がんに関連した少なくとも1つの測定可能な物理的パラメータの改善又は好転を指すことを意図し、これは対象において必ずしも認識されるとは限らないが、対象において認識可能な場合もある。用語「処置する(treat)」、「処置すること(treating)」、及び「処置(treatment)」はまた、疾患、障害、又は状態の退縮を生じること、その進行を予防すること、又は少なくともその進行速度を低下させることを指してもよい。特定の実施形態では、「処置する(treat)」、「処置すること(treating)」、及び「処置(treatment)」は、疾患、障害、又は状態、例えば、腫瘍又はより好ましくはがんに伴う1つ以上の症状の緩和、進展若しくは発症の予防、又はその期間の短縮を指す。特定の実施形態では、「処置する(treat)」、「処置すること(treating)」、及び「処置(treatment)」は、疾患、障害、又は状態の再発の予防を指す。特定の実施形態では、「処置する(treat)」、「処置すること(treating)」、及び「処置(treatment)」は、疾患、障害、又は状態を有する対象の生存率の向上を指す。特定の実施形態では、「処置する(treat)」、「処置すること(treating)」、及び「処置(treatment)」は、対象における疾患、障害、又は状態の消失を指す。
特定の実施形態によれば、がんの処置において使用される組成物が提供される。がん療法では、組成物は、以下に限定されないが、化学療法、抗CD20 mAb、抗CD47 mAb、抗TIM-3 mAb、抗LAG-3 mAb、抗CD73 mAb、抗アペリン mAb、抗CTLA-4 mAb、抗PD-L1 mAb、抗PD-1 mAb、PD-1/PD-L1療法、他のがん免疫薬、抗血管新生薬、放射線療法、抗体-薬物コンジュゲート(ADC)、標的療法、又は他の抗がん薬を含む別の処置と組み合わせて使用され得る。抗FOLR1抗体を、PD-1、PD-L1、LAG3、TIM-3、CTLA-4、EGFR、HER-2、CD19、CD20、CD33、CD73、CD47、CD3、アペリン、DLL-3、TIP-1、CLDN18.2、及び/又はFOLR1と特異的腫瘍関連抗原の両方を発現するがん/腫瘍を処置するための他の腫瘍表面抗原に対するパートナーmAbと共に使用して二重特異性抗体を構築することができる。
本明細書で使用する場合、対象への2つ以上の治療の施行の文脈における、用語「組み合わせて」は、2つ以上の治療の使用を指す。用語「組み合わせて」の使用は、治療が対象に施行される順序を限定するものではない。例えば、第1の治療(例えば、本明細書に記載の組成物)を、対象への第2の治療の施行前に(例えば、5分、15分、30分、45分、1時間、2時間、4時間、6時間、12時間、16時間、24時間、48時間、72時間、96時間、1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、8週間、又は12週間前に)、施行と同時に、又は施行後に(例えば、5分、15分、30分、45分、1時間、2時間、4時間、6時間、12時間、16時間、24時間、48時間、72時間、96時間、1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、8週間、又は12週間後に)施行することができる。
別の一般的態様では、本発明は、対象におけるFOLR1のレベルを決定する方法に関する。この方法は、(a)対象から試料を得るステップ;(b)試料を本発明のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片と接触させるステップ;及び(c)対象におけるFOLR1のレベルを決定するステップを含む。
本明細書で使用する場合、「試料」は、対象から単離された生体試料を指し、以下に限定されないが、全血、血清、血漿、血液細胞、内皮細胞、組織生検(例えば、がん組織)、リンパ液、腹水液、間質液、骨髄、脳脊髄液、唾液、粘液、痰、汗、尿、又は任意の他の分泌物、排せつ物、又は他の体液を挙げることができる。「血液試料」は、全血又は血液細胞、血清、及び血漿を含むその任意の画分を指す。
ある特定の実施形態では、対象におけるFOLR1のレベルは、以下に限定されないが、ウエスタンブロットアッセイ、ELISAアッセイ、及び/又は免疫組織化学(IHC)から選択されるアッセイを利用して決定することができる。相対的なタンパク質レベルは、ウエスタンブロット分析及び免疫組織化学(IHC)を利用して決定することができ、絶対的なタンパク質レベルは、ELISAアッセイを利用して決定することができる。FOLR1の相対的レベルを決定する場合、FOLR1のレベルは、少なくとも2つの試料間、例えば、同じ対象由来の異なる時点における試料間、同じ対象の異なる組織由来の試料間、及び/又は異なる対象由来の試料間で決定することができる。あるいは、FOLR1の絶対的レベルを、例えば、ELISAアッセイによって決定する場合、試料中のFOLR1の絶対的レベルは、試料を試験する前に、ELISAアッセイについての標準を作成することによって決定することができる。当業者であれば、本発明の抗体又はその抗原結合断片を利用して、対象由来の試料中のFOLR1のレベルを決定するために、どの分析技法を利用するかを理解するであろう。
対象由来の試料中のFOLR1のレベルを決定する方法を利用することによって、疾患における異常な(上昇した、低減した、又は不十分な)FOLR1のレベルの診断、及び適切な治療上の決定が導かれ得る。このような疾患として、例えば、がんが挙げられる。さらに、対象におけるFOLR1のレベルをモニターすることによって、上記に示す疾患を発症するリスクを、特定の疾患におけるFOLR1のレベルについての知識に基づき及び/又は特定の疾患の進行中に決定することができる。
実施形態
本発明は、以下の非限定的実施形態を提供する。
実施形態1は、
a.それぞれ、配列番号38、39、40、62、63及び64;
b.それぞれ、配列番号17、18、19、41、42及び43;
c.それぞれ、配列番号20、21、22、44、45及び46;
d.それぞれ、配列番号23、24、25、47、48及び49;
e.それぞれ、配列番号26、27、28、50、51及び52;
f.それぞれ、配列番号29、30、31、53、54及び55;
g.それぞれ、配列番号32、33、34、56、57及び58;又は
h.それぞれ、配列番号35、36、37、59、60及び61;
のポリペプチド配列を有する重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2、及びLCDR3を含み、FOLR1、好ましくはヒトFOLR1に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片である。
実施形態2は、
a.それぞれ、配列番号86、87、88、110、111及び112;
b.それぞれ、配列番号65、66、67、89、90及び91;
c.それぞれ、配列番号68、69、70、92、93及び94;
d.それぞれ、配列番号71、72、73、95、96及び97;
e.それぞれ、配列番号74、75、76、98、99及び100;
f.それぞれ、配列番号77、78、79、101、102及び103;
g.それぞれ、配列番号80、81、82、104、105及び106;又は
h.それぞれ、配列番号83、84、85、107、108及び109;
のポリペプチド配列を有する重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2、及びLCDR3を含み、FOLR1、好ましくはヒトFOLR1に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片である。
実施形態3は、配列番号15、1、3、5、7、9、11若しくは13と少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、若しくは少なくとも99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、又は配列番号16、2、4、6、8、10、12若しくは14と少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、若しくは少なくとも99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む、実施形態1又は2の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片である。
実施形態4は、
a.配列番号15のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号16のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
b.配列番号1のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号2のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
c.配列番号3のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号4のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
d.配列番号5のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号6のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
e.配列番号7のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号8のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
f.配列番号9のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号10のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
g.配列番号11のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号12のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
h.配列番号13のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号14のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
を含む、実施形態1～3の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片である。
実施形態5は、キメラである、実施形態1～4のいずれか1つの単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片である。
実施形態6は、ヒトの又はヒト化されたものである、実施形態1～5のいずれか1つの単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片である。
実施形態7は、ヒト化モノクローナル抗体又はその抗原結合断片が、
(1)配列番号113のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(2)配列番号113のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(3)配列番号114のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(4)配列番号114のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(5)配列番号115のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(6)配列番号115のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(7)配列番号116のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(8)配列番号116のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(9)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号121のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(10)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号122のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(11)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号123のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(12)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号121のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(13)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号122のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(14)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号123のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(15)配列番号124のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号126のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(16)配列番号124のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号127のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(17)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(18)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(19)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(20)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(21)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(22)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(23)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(24)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(25)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(26)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(27)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;又は
(28)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域
を含む、実施形態6のいずれか1つの単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片である。
実施形態8は、FOLR1に結合すること及びエフェクター媒介性腫瘍細胞溶解を誘導することが可能である、実施形態1～7のいずれか1つの単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片である。
実施形態9は、実施形態1～8のいずれか1つのモノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする単離された核酸である。
実施形態10は、実施形態9の単離された核酸を含むベクターである。
実施形態11は、実施形態10のベクターを含む宿主細胞である。
実施形態12は、実施形態1～8のいずれか1つの単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物である。
実施形態13は、それを必要とする対象において、がんを処置する方法であって、実施形態12の医薬組成物を対象に投与するステップを含む方法である。
実施形態14は、それを必要とする対象において、がん細胞表面のFOLR1を標的とする方法であって、実施形態12の医薬組成物を対象に投与するステップを含む方法である。
実施形態15は、実施形態1～8のいずれか1つのモノクローナル抗体又はその抗原結合断片を生産する方法であって、前記モノクローナル抗体又はその抗原結合断片を産生する条件下で、前記モノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする核酸を含む細胞を培養するステップ、及び細胞又は培養物から前記モノクローナル抗体又はその抗原結合断片を回収するステップを含む、方法である。
実施形態16は、実施形態1～8のいずれか1つのモノクローナル抗体又は抗原結合断片を含む医薬組成物を生産する方法であって、前記モノクローナル抗体又はその抗原結合断片を薬学的に許容される担体と配合して、医薬組成物を得るステップを含む、方法である。
実施形態17は、対象におけるFOLR1のレベルを決定する方法であって、
a.対象から試料を得るステップ;
b.試料を実施形態1～8のいずれか1つの単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片と接触させるステップ;及び
c.対象におけるFOLR1のレベルを決定するステップ
を含む方法である。
実施形態18は、試料が、組織試料である、実施形態17の方法である。
実施形態19は、組織試料が、がん組織試料である、実施形態18の方法である。
実施形態20は、試料が、血液試料である、実施形態17の方法である。
[実施例]
[実施例1]
抗FOLR1モノクローナル抗体の特定
ヒトFcとC末端で融合したヒトFOLR1(Arg25～Met233)を含む融合タンパク質(huFOLR1-huFc)でマウスを免疫化した。血漿力価をELISAによって決定した。安楽死させた後、リンパ節及び脾臓を回収し、ハイブリドーマを作製した。ハイブリドーマを96ウェル組織培養プレート中で増殖させ、個々のウェルに由来する上清を、全長ヒトFOLR1を安定的に発現するCHO細胞を使用するELISA及びFACSによってスクリーニングした。上位の陽性クローンを単離し、シークエンシングした。
抗FOLR1モノクローナル抗体についての重鎖及び軽鎖可変領域の配列を表1及び2に提供し、抗FOLR1モノクローナル抗体についてのCDR領域を表3～6に提供する。
Figure 0007433236000001
Figure 0007433236000002
Figure 0007433236000003
Figure 0007433236000004
Figure 0007433236000005
Figure 0007433236000006
Figure 0007433236000007
Figure 0007433236000008
[実施例2]
ハイブリドーマ上清からのmAbの生産及び精製
プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用して、ハイブリドーマ培地/陽性クローンの上清からマウス抗FOLR1 mAbを精製した。
[実施例3]
精製した抗FOLR1マウス抗体のFACS結合分析
全長ヒトFOLR1で安定的にトランスフェクトしたCHO細胞を、96ウェルプレートに移し(ウェル当たり200,000個の細胞)、FACS緩衝液(1xPBS、pH6.8 + 2%のFBS)で1回洗浄し、ハイブリドーマ上清由来の精製したマウス抗FOLR1 mAbのいずれかの様々な濃度と共に、氷上で15分間インキュベートした。次いで、細胞を1,000rpmで5分間遠心分離し、FACS緩衝液で3回洗浄した。その細胞を、PEコンジュゲートヤギ抗マウスIgGポリクローナル抗体と共にインキュベートし、氷上でさらに15分間インキュベートした。次いで、細胞をFACS緩衝液で3回洗浄し、次いで、生存/死滅細胞ゲーティングのために、0.1μg/mlのPI(ヨウ化プロピジウム)を含有するFACS緩衝液中に再懸濁した。次いで、細胞をFACS Caliber機器にかけ、データをFlowjoソフトウェアによって分析した。ヒトFOLR1を安定的に発現するCHO細胞への精製したマウス抗FOLR1 mAbの結合についての結果を図1A～1Bに示す。MFIは、平均蛍光強度である。
[実施例4]
トランスフェクトした293E細胞の培養培地からの抗FOLR1キメラmAbの生産及び精製
組換え抗FOLR1キメラmAbを得るために、ヒトIgG1重鎖及びカッパ軽鎖の定常領域にそれぞれ融合したマウス可変領域(VH及びVL)を含有する発現ベクターを、293E細胞へと一過性トランスフェクトした。トランスフェクトした細胞の懸濁液中に産生された組換え抗体を、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製した。
[実施例5]
精製した抗FOLR1キメラmAbのELISA結合アッセイ
固定したヒトFOLR1に結合する能力について、精製したキメラmAbをELISAアッセイにおいて試験した。カーボネートコーティング緩衝液中のヒトFOLR1の組換え細胞外ドメイン(Novoprotein、カタログ番号C784)を、室温で1時間、96ウェルプレート上にコーティングした。プレートをTBST中5%のBSAによって室温で1時間ブロッキングする。個々のプレートの各ウェルにおいて、様々な濃度のmAbを室温で1時間インキュベートした。プレートを洗浄し、FOLR1への結合を、室温で1時間インキュベートして、セイヨウワサビペルオキシダーゼにコンジュゲートした抗ヒトIgG(hIgG-HRP)(ThermoFisher Scientific、カタログ番号H10007)によって検出した。次いで、洗浄後に、One-step Detection Solution(ThermoFisher Scientific、カタログ番号34028)を使用してELISAを発色させ、450nmでの吸光度として測定した。結果を図2A～2Cに示す。
[実施例6]
精製した抗FOLR1キメラmAbのFACS結合分析
FOLR1を発現することが知られている細胞への抗FOLR1キメラmAbの結合を評価するために、SK-OV-3(ATCC(登録商標) HTB-77(商標))を96ウェル非結合U底プレート(Greiner Bio-One、カタログ番号650901)上にプレーティングした(ウェル当たり80,000個の細胞)。一部の実験では、ウェル当たり90,000個の細胞を使用した。様々な濃度のmAbを含有するFACS緩衝液(0.1%のBSA及び0.05%のアジ化ナトリウムを含むHBSS)50μL中で、細胞を氷上にて15分間インキュベートした。洗浄後、Alexa Fluor(登録商標) 488(Invitrogen、カタログ番号H10120)にコンジュゲートしたF(ab')2-ヤギ抗ヒトIgG Fcを3.5μg/mLで含有するFACS緩衝液50μL中で、細胞を暗所にて氷上で15分間インキュベートし、再度洗浄した。Attune NxTフローサイトメーターを使用して細胞を分析した。SK-OV-3細胞への抗FOLR1キメラmAbの結合についての結果を図3A～3Dに示す。MFIは、平均蛍光強度である。
[実施例7]
抗FOLR1キメラmAbに関するBiacoreアッセイ
抗FOLR1キメラmAbとFOLR1の相互作用を表面プラズモン共鳴(SPR)(Biacore 8k、GE Healthcare)によって測定した。簡潔には、抗FOLR1 mAbを、10μL/mlの注入流速にて、HBS-P緩衝液(0.01MのHEPES pH 7.4、0.15MのNaCl、0.05%v/vのSurfactant P20)中でプロテインAセンサーチップ(GE Healthcare、カタログ番号29-1275-56)に固定した。様々な濃度の組換えFOLR1(Novoprotein、カタログ番号C784)をHBS-P緩衝液中30μL/分の流速でロードした。抗原のローディング後に、10mMのグリシン-HCL(pH1.5)で表面を再生した。Biacore 8k評価ソフトウェア(GE Healthcare)を使用する1:1結合モデルで、センサーグラムをフィッティングした。抗FOLR1 mAbに関する結合親和性についての結果を表7に示す。
Figure 0007433236000009
[実施例8]
抗FOLR1 mAbのヒト化
マウス抗FOLR1 mAbをヒト化して、ヒト患者に使用した場合の免疫原性の可能性を低減させた。重鎖及び軽鎖(VH及びVL)の可変領域の配列をProtein Data Bank (PDB)データベースのヒト抗体配列と比較し、相同性モデルを構築した。マウスmAbの重鎖と軽鎖の両方のCDRを、抗原結合に必要と思われる適正な構造を維持する可能性が最も高いヒトフレームワークへと移植した。必要な場合は、ヒト残基からマウス残基への復帰突然変異又は他の突然変異を設計した。ヒト化VH及びVL領域の配列を表8に示す。ヒト化VH及びVL領域をヒトIgG1重鎖及びカッパ軽鎖の定常領域にそれぞれ融合させた。mAb配列に対応する構築物を、CHO細胞における一過性トランスフェクションのために使用し、精製したmAbを固定したFOLR1細胞外ドメインに結合する能力について、ELISAで分析した。アッセイバックグランドを超える非特異的結合が存在しないことを確認するために、アイソタイプ対照をこのアッセイで試験した。ヒト化F5クローンについての結果を図4A～4Cに示し;ヒト化F10クローンについての結果を図5A～5Bに示し;ヒト化F17クローンについての結果を図6A～6Bに示し;ヒト化F20クローンについての結果を図7A～7Dに示す。
ヒト化抗FOLR1 mAbを、SK-OV-3細胞に結合する能力について、FACS分析を使用して試験した。データを図8A～8Jに示す。
mAbの抗体依存性細胞傷害(ADCC)を製造業者によって提供されたプロトコールに従って、ADCC Reporter Bioassay Core Kit(Promega、カタログ番号G7010)を使用して測定した。簡潔には、ウェル当たり約12,500個のSK-OV-3細胞を、ハーフエリア96ウェルマイクロプレート(Corning-Costar、カタログ番号3696)におけるADCC Assay Buffer中の種々の濃度の試験抗体と混合した。次いで、ウェル当たり約37,500個のADCC Bioassay Effector細胞を最終体積が37.5μLとなるまで添加し、混合した。振盪せずに、プレートを37℃で6時間インキュベートした。ルシフェラーゼ活性を測定するために、12.5μLのアッセイミックスを各ウェルから取り除き、25μLのBio-Glo Luciferase Assay Reagentを添加した。プレートを、振盪させながら、室温で10分間インキュベートした。ウェル当たり30μLの混合物を白色プレート(BRAND、カタログ番号781621)に移し、EnVision 2102マルチモードプレートリーダーでルミネセンスを測定した。4つのヒト化mAbのADCC活性についての結果を図9に示す。RLUは相対発光単位(relative light unit)である。
Figure 0007433236000010
Figure 0007433236000011
以下、本発明の実施形態を示す。
［１］a.それぞれ、配列番号38、39、40、62、63及び64;
b.それぞれ、配列番号17、18、19、41、42及び43;
c.それぞれ、配列番号20、21、22、44、45及び46;
d.それぞれ、配列番号23、24、25、47、48及び49;
e.それぞれ、配列番号26、27、28、50、51及び52;
f.それぞれ、配列番号29、30、31、53、54及び55;
g.それぞれ、配列番号32、33、34、56、57及び58;又は
h.それぞれ、配列番号35、36、37、59、60及び61;
のポリペプチド配列を有する重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2、及びLCDR3を含み、FOLR1、好ましくはヒトFOLR1に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
［２］a.それぞれ、配列番号86、87、88、110、111及び112;
b.それぞれ、配列番号65、66、67、89、90及び91;
c.それぞれ、配列番号68、69、70、92、93及び94;
d.それぞれ、配列番号71、72、73、95、96及び97;
e.それぞれ、配列番号74、75、76、98、99及び100;
f.それぞれ、配列番号77、78、79、101、102及び103;
g.それぞれ、配列番号80、81、82、104、105及び106;又は
h.それぞれ、配列番号83、84、85、107、108及び109;
のポリペプチド配列を有する重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2、及びLCDR3を含み、FOLR1、好ましくはヒトFOLR1に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
［３］配列番号15、1、3、5、7、9、11若しくは137と少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、若しくは少なくとも99%同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、又は配列番号16、2、4、6、8、10、12若しくは14と少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、若しくは少なくとも99%同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む、［1］又は［2］に記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
［４］a.配列番号15のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号16のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
b.配列番号1のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号2のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
c.配列番号3のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号4のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
d.配列番号5のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号6のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
e.配列番号7のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号8のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
f.配列番号9のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号10のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
g.配列番号11のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号12のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;又は
h.配列番号13のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号14のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域
を含む、［1］～［3］のいずれか一に記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
［５］キメラである、［1］～［4］のいずれか一に記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
［６］ヒトの又はヒト化されたものである、［1］～［5］のいずれか一に記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
［７］ヒト化モノクローナル抗体又はその抗原結合断片が、
(1)配列番号113のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(2)配列番号113のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(3)配列番号114のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(4)配列番号114のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(5)配列番号115のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(6)配列番号115のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(7)配列番号116のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号117のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(8)配列番号116のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号118のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(9)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号121のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(10)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号122のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(11)配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号123のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(12)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号121のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(13)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号122のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(14)配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号123のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(15)配列番号124のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号126のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(16)配列番号124のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号127のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(17)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(18)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(19)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(20)配列番号128のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(21)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(22)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(23)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(24)配列番号129のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(25)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号131のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(26)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号132のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
(27)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号133のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;又は
(28)配列番号130のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号134のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域
を含む、［6］に記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
［８］FOLR1に結合すること及びエフェクター媒介性腫瘍細胞溶解を誘導することが可能である、［1］～［7］のいずれか一に記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
［９］［1］～［8］のいずれか一に記載のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片をコードする単離された核酸。
［１０］［9］に記載の単離された核酸を含むベクター。
［１１］［10］に記載のベクターを含む宿主細胞。
［１２］［1］～［8］のいずれか一に記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
［１３］それを必要とする対象において、がんを処置する方法であって、［12］に記載の医薬組成物を対象に投与するステップを含む方法。
［１４］それを必要とする対象において、がん細胞表面のFOLR1を標的とする方法であって、［12］に記載の医薬組成物を対象に投与するステップを含む方法。
［１５］［1］～［8］のいずれか一に記載のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片を生産する方法であって、前記モノクローナル抗体又は抗原結合断片を産生する条件下で、前記モノクローナル抗体又は抗原結合断片をコードする核酸を含む細胞を培養するステップ、及び細胞又は培養物から前記抗体又は抗原結合断片を回収するステップを含む、方法。
［１６］［1］～［8］のいずれか一に記載のモノクローナル抗体又は抗原結合断片を含む医薬組成物を生産する方法であって、前記モノクローナル抗体又はその抗原結合断片を、薬学的に許容される担体と配合して、医薬組成物を得るステップを含む、方法。
［１７］対象におけるFOLR1のレベルを決定する方法であって、
a.対象から試料を得るステップ;
b.試料を［1］～［8］のいずれか一に記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片と接触させるステップ;及び
c.対象におけるFOLR1のレベルを決定するステップ
を含む方法。
［１８］試料が、組織試料である、［17］に記載の方法。
［１９］組織試料が、がん組織試料である、［18］に記載の方法。
［２０］試料が、血液試料である、［17］に記載の方法。
上記の実施形態に対し、その広義の発明概念から逸脱することなく、変更がなされ得ることは当業者であれば認識するであろう。したがって、この発明は、開示された特定の実施形態に限定されず、本明細書によって定義した本発明の趣旨及び範囲内の改変を包含することを意図するものとして理解される。

Claims (15)

  1. それぞれ配列番号29、30、31、53、54及び55、又はそれぞれ配列番号77、78、79、101、102及び103のポリペプチド配列を有する重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、LCDR2、及びLCDR3を含み、FOLR1に特異的に結合する、単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
  2. 配列番号120、9若しくは119と少なくとも95％、少なくとも96％、少なくとも97％、少なくとも98％若しくは少なくとも99％同一であるポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、又は配列番号122、10、121若しくは123と少なくとも95％、少なくとも96％、少なくとも97％、少なくとも98％若しくは少なくとも99％同一であるポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域を含む、請求項１記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
  3. a.配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号122のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
    b.配列番号9のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号10のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
    c.配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号121のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
    d.配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号122のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
    e.配列番号119のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号123のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
    f.配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号121のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;又は
    g.配列番号120のポリペプチド配列を有する重鎖可変領域、及び配列番号123のポリペプチド配列を有する軽鎖可変領域;
    を含む、請求項１又は２記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
  4. FOLR1が、ヒトFOLR1である、請求項１～３のいずれか１項記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
  5. キメラ、又はヒト化されたものである、請求項１～４のいずれか１項記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
  6. FOLR1に結合すること及びエフェクター媒介性腫瘍細胞溶解を誘導することが可能である、請求項１～５のいずれか１項記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片。
  7. 請求項１～６のいずれか１項記載のモノクローナル抗体又はその抗原結合断片を含む二重特異性抗体。
  8. 請求項１～７のいずれか１項記載のモノクローナル抗体若しくはその抗原結合断片又は二重特異性抗体をコードする単離された核酸。
  9. 請求項８記載の単離された核酸を含むベクター。
  10. 請求項９記載のベクターを含む宿主細胞。
  11. 請求項１～７のいずれか１項記載の単離されたモノクローナル抗体若しくはその抗原結合断片又は二重特異性抗体と薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物。
  12. それを必要とする対象において、癌細胞表面のFOLR1を標的とするか、又は癌を処置するための、請求項１１記載の医薬組成物。
  13. 請求項１～７のいずれか１項記載のモノクローナル抗体若しくはその抗原結合断片又は二重特異性抗体を生産する方法であって、前記モノクローナル抗体若しくはその抗原結合断片又は二重特異性抗体を産生する条件下で、前記モノクローナル抗体若しくはその抗原結合断片又は二重特異性抗体をコードする核酸を含む細胞を培養するステップ、及び前記細胞又は培養物から前記モノクローナル抗体若しくはその抗原結合断片又は二重特異性抗体を回収するステップを含む、前記方法。
  14. 請求項１～７のいずれか１項記載のモノクローナル抗体若しくはその抗原結合断片又は二重特異性抗体を含む医薬組成物を生産する方法であって、前記モノクローナル抗体若しくはその抗原結合断片又は二重特異性抗体を、薬学的に許容される担体と配合して、医薬組成物を得るステップを含む、前記方法。
  15. 対象におけるFOLR1のレベルを決定する方法であって、
    a.前記対象からの試料を請求項１～６のいずれか１項記載の単離されたモノクローナル抗体又はその抗原結合断片と接触させるステップ;及び
    b.前記対象におけるFOLR1のレベルを決定するステップ
    を含み、
    場合により、前記試料が、組織試料又は血液試料であり、前記組織試料が、場合により癌組織試料である、
    前記方法。
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