JP7397917B2 - 嗅覚受容体の発現方法及び応答測定方法 - Google Patents
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Description
1)嗅覚受容体ポリペプチドの発現方法であって、
目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列及び下記(a)~(d)のいずれかの嗅覚受容体:
(a)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体;
(b)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体及び該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(c)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(d)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体と、脊椎動物にオルソログが11種以上存在する該目的の嗅覚受容体のパラログのうち該目的の嗅覚受容体と最も相同性の高いパラログの脊椎動物におけるオルソログにコードされる嗅覚受容体とからなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体、及び該パラログにコードされる嗅覚受容体、
のアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
方法。
2)嗅覚受容体ポリペプチドの発現方法であって、
目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR7E24の配列番号96で示されるアミノ酸配列において配列番号210で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるか、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR9K2の配列番号484で示されるアミノ酸配列において配列番号642で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるか、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR5I1の配列番号850で示されるアミノ酸配列において配列番号900で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、
方法。
3)目的の嗅覚受容体の応答の測定方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現された嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
4)目的の嗅覚受容体のリガンドの探索方法であって、
試験物質存在下で、1)又は2)記載の方法により発現された嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、及び
該嗅覚受容体ポリペプチドが応答した試験物質を選択すること、
を含む方法。
5)目的の嗅覚受容体のリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現された嗅覚受容体ポリペプチドに試験物質及び目的の嗅覚受容体のリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
6)目的の嗅覚受容体のリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現された嗅覚受容体ポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
7)目的の嗅覚受容体のリガンドのにおいの増強剤の評価及び/又は選択方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現された嗅覚受容体ポリペプチドに試験物質及び目的の嗅覚受容体のリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
8)改変嗅覚受容体ポリペプチドであって、
目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列及び下記(a)~(d)のいずれかの嗅覚受容体:
(a)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体;
(b)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体及び該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(c)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(d)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体と、脊椎動物にオルソログが11種以上存在する該目的の嗅覚受容体のパラログのうち該目的の嗅覚受容体と最も相同性の高いパラログの脊椎動物におけるオルソログにコードされる嗅覚受容体とからなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体、及び該パラログにコードされる嗅覚受容体、
のアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
改変嗅覚受容体ポリペプチド。
9)改変嗅覚受容体ポリペプチドであって、
ヒト嗅覚受容体OR7E24の配列番号96で示されるアミノ酸配列において配列番号210で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるか、
ヒト嗅覚受容体OR9K2の配列番号484で示されるアミノ酸配列において配列番号642で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるか、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR5I1の配列番号850で示されるアミノ酸配列において配列番号900で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、
改変嗅覚受容体ポリペプチド。
10)8)又は9)記載の改変嗅覚受容体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
11)10)記載のポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片。
12)11)記載のベクター又はDNA断片を含有する形質転換細胞。
加えて、上記で得られたアミノ酸配列のアラインメントは、例えば、嗅覚受容体間で高度に保存されたアミノ酸もしくはアミノ酸モチーフを基準に、最適化するようにさらに微調整することができる。この目的に使用される嗅覚受容体間で高度に保存されたアミノ酸の例としては、各嗅覚受容体において、膜貫通領域を構成するアミノ酸の中で最も保存性が高いアミノ酸が挙げられる。加えて分子内でジスルフィド結合を形成するシステインが挙げられる。また、嗅覚受容体間で高度に保存されたアミノ酸モチーフの例としては、第一細胞内ループに位置するLHTPMY、第三膜貫通領域の後半から第二細胞内ループの前半にかけて位置するMAYDRYVAIC、第五膜貫通領域の後半に位置するSY、第六膜貫通領域の前半に位置するKAFSTCASH、第七膜貫通領域に位置するPMLNPFIYなどが挙げられる。
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列及び下記(a)~(d)のいずれかの嗅覚受容体:
(a)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体;
(b)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体及び該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(c)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(d)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体と、脊椎動物にオルソログが11種以上存在する該目的の嗅覚受容体のパラログのうち該目的の嗅覚受容体と最も相同性の高いパラログの脊椎動物におけるオルソログにコードされる嗅覚受容体とからなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体、及び該パラログにコードされる嗅覚受容体、
のアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、方法である。
本実施形態のより好ましい一例において、(a)の目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログは、該目に属する生物種が有する嗅覚受容体遺伝子であって、目的の嗅覚受容体遺伝子と同じ名称を含む遺伝子のうち、系統樹解析により種分化の際に分岐した可能性が示唆される遺伝子である。斯かるオルソログは、例えば、以下の手順で選択することができる。目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列をquery配列とし、検索対象生物名を目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目として、NCBIのBLASTなどでデータベース検索を行う。その結果得られた相同遺伝子群(例えば、上位500遺伝子、好ましくは上位250遺伝子、より好ましくは上位100遺伝子、さらに好ましくは上位50遺伝子)を用いて公知の手法により系統樹を作成し、目的の嗅覚受容体と同じ名称を含む遺伝子をなるべく多く含みかつそれ以外の遺伝子をなるべく含まないクレードを特定する。その後、特定したクレードに含まれる遺伝子を選択する。
尚、オルソログとして、同一生物種に由来する遺伝子が複数選択される場合、目的の嗅覚受容体遺伝子と最も相同性が高い1遺伝子のみを選択してもよい。また、ある生物種の嗅覚受容体の命名法が目的の嗅覚受容体が由来する生物種における命名法と異なる場合、オルソログとして、該ある生物種における目的の嗅覚受容体遺伝子と高い相同性を有する遺伝子、好ましくは最も高い相同性を有する遺伝子を選択してもよい。あるいは、該ある生物種における目的の嗅覚受容体遺伝子のオルソログであることが知られている遺伝子を選択してもよい。
本実施形態のより好ましい一例において、(b)の目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログは、該目に属する生物種が有する嗅覚受容体遺伝子であって、目的の嗅覚受容体遺伝子と同じ名称を含む遺伝子のうち、系統樹解析により種分化の際に分岐した可能性が示唆される遺伝子である。斯かるオルソログは、上記(a)の場合と同様に選択することができる。
尚、オルソログとして、同一生物種に由来する遺伝子が複数選択される場合、目的の嗅覚受容体遺伝子と最も相同性が高い1遺伝子のみを選択してもよい。例えば、目的の嗅覚受容体がヒト嗅覚受容体であり、オルソログとして、ヒト以外のある生物種の遺伝子が複数選択される場合、目的のヒト嗅覚受容体遺伝子と最も相同性が高い該ある生物種の遺伝子を選択すればよい。また、ある生物種の嗅覚受容体の命名法が目的の嗅覚受容体が由来する生物種における命名法と異なる場合、オルソログとして、該ある生物種における目的の嗅覚受容体遺伝子と高い相同性を有する遺伝子、好ましくは最も高い相同性を有する遺伝子を選択してもよい。あるいは、該ある生物種における目的の嗅覚受容体遺伝子のオルソログであることが知られている遺伝子を選択してもよい。
尚、オルソログとして、同一生物種に由来する遺伝子が複数選択される場合、目的の嗅覚受容体遺伝子と最も相同性が高い1遺伝子のみを選択してもよい。例えば、目的の嗅覚受容体がヒト嗅覚受容体であり、オルソログとして、ヒト以外のある生物種の遺伝子が複数選択される場合、目的のヒト嗅覚受容体遺伝子と最も相同性が高い該ある生物種の遺伝子を選択すればよい。また、ある生物種の嗅覚受容体の命名法が目的の嗅覚受容体が由来する生物種における命名法と異なる場合、オルソログとして、該ある生物種における目的の嗅覚受容体遺伝子と高い相同性を有する遺伝子、好ましくは最も高い相同性を有する遺伝子を選択してもよい。あるいは、該ある生物種における目的の嗅覚受容体遺伝子のオルソログであることが知られている遺伝子を選択してもよい。
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的の嗅覚受容体のアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的の嗅覚受容体にアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的の嗅覚受容体にアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的の嗅覚受容体のN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的の嗅覚受容体のN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。
あるいは、目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列において改変されるアミノ酸残基数は、コンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基数の好ましくは少なくとも10%、より好ましくは少なくとも30%、さらに好ましくは少なくとも50%、さらに好ましくは少なくとも70%、さらに好ましくは少なくとも90%、さらに好ましくは100%(すなわち、目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列がコンセンサスアミノ酸配列に改変される)の数であり得る。
尚、目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のN末端が長ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列のN末端にコンセンサスアミノ酸配列にのみ存在するN末端部を一体として付加して改変するのが好ましい。目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のN末端が短ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列のN末端から目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列にのみ存在するN末端部を一体として欠失させて改変するのが好ましい。目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のC末端が長ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列のC末端にコンセンサスアミノ酸配列にのみ存在するC末端部を一体として付加して改変するのが好ましい。目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のC末端が短ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列のC末端から目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列にのみ存在するC末端部を一体として欠失させて改変するのが好ましい。
本発明で用いられる嗅覚受容体ポリペプチドとしては、その機能が損なわれない限り、上記のコンセンサスアミノ酸配列に基づく改変の対象アミノ酸位置以外のアミノ酸位置に1~数個(例えば、1~10個、1~5個、1~3個)のアミノ酸残基の置換、欠失、付加又は挿入を含むポリペプチドも本発明に含まれる。
後述の実施例に示すとおり、いずれも硫黄化合物であるメチルメルカプタン、ジメチルスルフィド、ジメチルジスルフィド又はジメチルトリスルフィドの存在下で、本発明の発現方法により発現されたコンセンサス嗅覚受容体の応答を測定したところ、コンセンサスOR2T29、コンセンサスOR4K17、コンセンサスOR2T27、コンセンサスOR2T5、コンセンサスOR2T4、コンセンサスOR11H2、コンセンサスOR6B3、コンセンサスOR12D3、コンセンサスOR2T11、コンセンサスOR2T1、コンセンサスOR4C15、コンセンサスOR4E2及びコンセンサスOR2L13は、金属イオン存在下でメチルメルカプタンに応答した(図10)。コンセンサスOR4K17、コンセンサスOR11H2、コンセンサスOR4C15及びコンセンサスOR4E2は、金属イオン存在下でジメチルスルフィドに応答した(図10)。コンセンサスOR2T29、コンセンサスOR4K17、コンセンサスOR2T27、コンセンサスOR2T5、コンセンサスOR2T4、コンセンサスOR11H2、コンセンサスOR6B3、コンセンサスOR12D3、コンセンサスOR2T11、コンセンサスOR2T1、コンセンサスOR4C15、コンセンサスOR4E2及びコンセンサスOR2L13は、金属イオン存在下でジメチルジスルフィドに応答した(図10)。また、コンセンサスOR2T29、コンセンサスOR2T4、コンセンサスOR11H2、コンセンサスOR6B3、コンセンサスOR12D3、コンセンサスOR6B1、コンセンサスOR2T11、コンセンサスOR2T1、コンセンサスOR4C15、コンセンサスOR4E2及びコンセンサスOR2L13は、金属イオン存在下でジメチルトリスルフィドに応答した(図10)。上記の各コンセンサス嗅覚受容体の応答を引き起こす各硫黄化合物は、該各コンセンサス嗅覚受容体のリガンド、すなわち該各コンセンサス嗅覚受容体が由来するオリジナルの嗅覚受容体のリガンドである。
目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列及び下記(a)~(d)のいずれかの嗅覚受容体:
(a)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体;
(b)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体及び該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(c)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(d)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体と、脊椎動物にオルソログが11種以上存在する該目的の嗅覚受容体のパラログのうち該目的の嗅覚受容体と最も相同性の高いパラログの脊椎動物におけるオルソログにコードされる嗅覚受容体とからなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体、及び該パラログにコードされる嗅覚受容体、
のアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
方法。
〔2〕嗅覚受容体ポリペプチドの発現向上方法である、〔1〕記載の方法。
〔3〕目的の嗅覚受容体の機能化方法であって、
目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列及び下記(a)~(d)のいずれかの嗅覚受容体:
(a)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体;
(b)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体及び該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(c)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(d)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体と、脊椎動物にオルソログが11種以上存在する該目的の嗅覚受容体のパラログのうち該目的の嗅覚受容体と最も相同性の高いパラログの脊椎動物におけるオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体、及び該パラログにコードされる嗅覚受容体、
のアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
方法。
〔4〕前記コンセンサスアミノ酸配列が、前記目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列及び前記(a)~(d)のいずれかの嗅覚受容体のアミノ酸配列のアラインメントから以下の(i)~(iii)の基準に従い同定したコンセンサス残基からなるアミノ酸配列である、〔1〕~〔3〕のいずれか1項記載の方法:
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的の嗅覚受容体のアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的の嗅覚受容体にアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的の嗅覚受容体にアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的の嗅覚受容体のN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的の嗅覚受容体のN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。
〔5〕前記(a)の嗅覚受容体が、前記目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される好ましくは少なくとも15種の嗅覚受容体である、〔1〕~〔4〕のいずれか1項記載の方法。
〔6〕前記(b)の嗅覚受容体が、前記目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体及び該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される好ましくは少なくとも25種の嗅覚受容体、より好ましくは少なくとも35種の嗅覚受容体であり、
該目的の嗅覚受容体をコードする遺伝子と最も高い相同性を有するパラログにコードされる嗅覚受容体を含む、〔1〕~〔4〕のいずれか1項記載の方法。
〔7〕前記(c)の嗅覚受容体が、前記脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される好ましくは少なくとも15種の嗅覚受容体、より好ましくは少なくとも30種の嗅覚受容体であり、
該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種、好ましくは5種、より好ましくは10種含む、〔1〕~〔4〕のいずれか1項記載の方法。
〔8〕前記(d)の嗅覚受容体が、前記脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体と、前記脊椎動物にオルソログが11種以上存在する前記目的の嗅覚受容体のパラログのうち該目的の嗅覚受容体と最も相同性の高いパラログの脊椎動物におけるオルソログにコードされる嗅覚受容体とからなる群より選択される好ましくは少なくとも30種の嗅覚受容体、より好ましくは少なくとも60種の嗅覚受容体、及び該パラログにコードされる嗅覚受容体であり、
該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種、好ましくは5種、より好ましくは10種含む、〔1〕~〔4〕のいずれか1項記載の方法。
〔9〕前記アラインメントが、好ましくは前記目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列及び前記(c)の嗅覚受容体のアラインメントである、〔1〕~〔8〕のいずれか1項記載の方法。
〔10〕前記目的の嗅覚受容体がヒト嗅覚受容体である、〔1〕~〔9〕のいずれか1項記載の方法。
〔11〕前記嗅覚受容体ポリペプチドが、好ましくは下記表2-1~2-5の(1)の嗅覚受容体の(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、より好ましくは下記表2-1~2-5の(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列からなる、〔1〕~〔8〕のいずれか1項記載の方法。
〔13〕嗅覚受容体ポリペプチドの発現方法であって、
目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR7E24の配列番号96で示されるアミノ酸配列において配列番号210で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号210で示されるアミノ酸配列からなるものであるか、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR9K2の配列番号484で示されるアミノ酸配列において配列番号642で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号642で示されるアミノ酸配列からなるものであるか、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR5I1の配列番号850で示されるアミノ酸配列において配列番号900で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるものである、
方法。
〔14〕嗅覚受容体ポリペプチドの発現向上方法である、〔13〕記載の方法。
〔15〕目的の嗅覚受容体の機能化方法であって、
目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR7E24の配列番号96で示されるアミノ酸配列において配列番号210で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号210で示されるアミノ酸配列からなるものであるか、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR9K2の配列番号484で示されるアミノ酸配列において配列番号642で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号642で示されるアミノ酸配列からなるものであるか、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR5I1の配列番号850で示されるアミノ酸配列において配列番号900で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるものである、
方法。
〔16〕前記嗅覚受容体ポリペプチドが前記細胞の細胞膜に発現するものである、〔1〕~〔15〕のいずれか1項記載の方法。
〔17〕好ましくは、RTP1Sを前記細胞に発現させることをさらに含む、〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法。
〔18〕前記細胞がHEK293細胞である、〔1〕~〔17〕のいずれか1項記載の方法。
〔1〕~〔18〕のいずれか1項記載の方法により発現された嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
〔20〕目的の嗅覚受容体のリガンドの探索方法であって、
試験物質存在下で、〔1〕~〔18〕のいずれか1項記載の方法により発現された嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、及び
該嗅覚受容体ポリペプチドが応答した試験物質を選択すること、
を含む方法。
〔21〕好ましくは、試験物質非存在下での前記嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定することをさらに含む、〔20〕記載の方法。
〔22〕好ましくは、前記試験物質存在下での前記嗅覚受容体ポリペプチドの応答を、前記試験物質非存在下での応答の120%以上に増加させる試験物質を選択する、〔21〕記載の方法。
〔23〕好ましくは、前記試験物質存在下での前記嗅覚受容体ポリペプチドの応答を、前記試験物質非存在下での応答と比べて統計学的に有意に増加させる試験物質を選択する、〔21〕記載の方法。
〔24〕目的の嗅覚受容体のリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
〔1〕~〔18〕のいずれか1項記載の方法により発現された嗅覚受容体ポリペプチドに試験物質及び目的の嗅覚受容体のリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
〔25〕前記リガンドが〔20〕~〔23〕のいずれか1項記載の方法により選択されたリガンドである、〔24〕記載の方法。
〔26〕測定された応答に基づいて前記嗅覚受容体ポリペプチドの応答を抑制する試験物質を同定することをさらに含む、〔24〕又は〔25〕記載の方法。
〔27〕前記試験物質を添加しなかった前記嗅覚受容体ポリペプチドの前記リガンドに対する応答を測定することをさらに含む、〔24〕~〔26〕のいずれか1項記載の方法。
〔28〕前記試験物質を添加した前記嗅覚受容体ポリペプチドの前記リガンドに対する応答が、該試験物質を添加しなかった該嗅覚受容体ポリペプチドの該リガンドに対する応答よりも抑制されていたときに、該試験物質を、該リガンドに対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を抑制する物質として同定することをさらに含む、〔27〕記載の方法。
〔29〕目的の嗅覚受容体のリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
〔1〕~〔18〕のいずれか1項記載の方法により発現された嗅覚受容体ポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
〔30〕前記リガンドが〔20〕~〔23〕のいずれか1項記載の方法により選択されたリガンドである、〔29〕記載の方法。
〔31〕測定された応答に基づいて前記嗅覚受容体ポリペプチドの応答を増強する試験物質を同定することをさらに含む、〔29〕又は〔30〕記載の方法。
〔32〕前記試験物質を添加しなかった前記嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定することをさらに含む、〔29〕~〔31〕のいずれか1項記載の方法。
〔33〕前記試験物質を添加した前記嗅覚受容体ポリペプチドの応答が、該試験物質を添加しなかった該嗅覚受容体ポリペプチドの応答よりも増強されていたときに、該試験物質を、前記リガンドに対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を抑制する物質として同定することをさらに含む、〔32〕記載の方法。
〔34〕目的の嗅覚受容体のリガンドのにおいの増強剤の評価及び/又は選択方法であって、
〔1〕~〔18〕のいずれか1項記載の方法により発現された嗅覚受容体ポリペプチドに試験物質及び目的の嗅覚受容体のリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
〔35〕前記リガンドが〔20〕~〔23〕のいずれか1項記載の方法により選択されたリガンドである、〔34〕記載の方法。
〔36〕測定された応答に基づいて前記嗅覚受容体ポリペプチドの応答を増強する試験物質を同定することをさらに含む、〔34〕又は〔35〕記載の方法。
〔37〕前記試験物質を添加しなかった前記嗅覚受容体ポリペプチドの前記リガンドに対する応答を測定することをさらに含む、〔34〕~〔36〕のいずれか1項記載の方法。
〔38〕前記試験物質を添加した前記嗅覚受容体ポリペプチドの前記リガンドに対する応答が、該試験物質を添加しなかった該嗅覚受容体ポリペプチドの該リガンドに対する応答よりも増強されていたときに、該試験物質を、該リガンドに対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を増強する物質として同定することをさらに含む、〔37〕記載の方法。
〔39〕好ましくは、前記嗅覚受容体ポリペプチドの応答が、ELISAもしくはレポータージーンアッセイによる細胞内cAMP量測定、カルシウムイメージングもしくはTGFα shedding assayによるカルシウムイオン量測定、又はアフリカツメガエル卵母細胞を用いた二電極膜電位固定法による細胞膜内外の電位変化測定により測定される、〔19〕~〔38〕のいずれか1項記載の方法。
目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列及び下記(a)~(d)のいずれかの嗅覚受容体:
(a)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体;
(b)該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体及び該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(c)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体;
(d)脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体と、脊椎動物にオルソログが11種以上存在する該目的の嗅覚受容体のパラログのうち該目的の嗅覚受容体と最も相同性の高いパラログの脊椎動物におけるオルソログにコードされる嗅覚受容体とからなる群より選択される少なくとも11種の嗅覚受容体であって、該11種の嗅覚受容体に該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種含む嗅覚受容体、及び該パラログにコードされる嗅覚受容体、
のアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
改変嗅覚受容体ポリペプチド。
〔41〕前記コンセンサスアミノ酸配列が、前記目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列及び前記(a)~(d)のいずれかの嗅覚受容体のアミノ酸配列のアラインメントから以下の(i)~(iii)の基準に従い同定したコンセンサス残基からなるアミノ酸配列である、〔40〕記載の改変嗅覚受容体ポリペプチド:
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的の嗅覚受容体のアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的の嗅覚受容体にアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的の嗅覚受容体にアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的の嗅覚受容体のアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的の嗅覚受容体のN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的の嗅覚受容体のN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。
〔42〕前記(a)の嗅覚受容体が、前記目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される好ましくは少なくとも15種の嗅覚受容体である、〔40〕又は〔41〕記載の改変嗅覚受容体ポリペプチド。
〔43〕前記(b)の嗅覚受容体が、前記目的の嗅覚受容体の由来の生物種と同じ目における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体及び該目的の嗅覚受容体のパラログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される好ましくは少なくとも25種の嗅覚受容体、より好ましくは少なくとも35種の嗅覚受容体であり、
該目的の嗅覚受容体をコードする遺伝子と最も高い相同性を有するパラログにコードされる嗅覚受容体を含む、〔40〕又は〔41〕記載の改変嗅覚受容体ポリペプチド。
〔44〕前記(c)の嗅覚受容体が、前記脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体からなる群より選択される好ましくは少なくとも15種の嗅覚受容体、より好ましくは少なくとも30種の嗅覚受容体であり、
該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種、好ましくは5種、より好ましくは10種含む、〔40〕又は〔41〕記載の改変嗅覚受容体ポリペプチド。
〔45〕前記(d)の嗅覚受容体が、前記脊椎動物における該目的の嗅覚受容体のオルソログにコードされる嗅覚受容体と、前記脊椎動物にオルソログが11種以上存在する前記目的の嗅覚受容体のパラログのうち該目的の嗅覚受容体と最も相同性の高いパラログの脊椎動物におけるオルソログにコードされる嗅覚受容体とからなる群より選択される好ましくは少なくとも30種の嗅覚受容体、より好ましくは少なくとも60種の嗅覚受容体、及び該パラログにコードされる嗅覚受容体であり、
該目的の嗅覚受容体の由来の生物種と異なる目の脊椎動物のオルソログにコードされる嗅覚受容体を少なくとも1種、好ましくは5種、より好ましくは10種含む、〔40〕又は〔41〕記載の改変嗅覚受容体ポリペプチド。
〔46〕前記アラインメントが、好ましくは前記目的の嗅覚受容体のアミノ酸配列及び前記(c)の嗅覚受容体のアラインメントである、〔40〕~〔45〕のいずれか1項記載の改変嗅覚受容体ポリペプチド。
〔47〕前記目的の嗅覚受容体がヒト嗅覚受容体である、〔40〕~〔46〕のいずれか1項記載の改変嗅覚受容体ポリペプチド。
〔48〕好ましくは、上記表2-1~2-5の(1)の嗅覚受容体の(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、より好ましくは、上記表2-1~2-5の(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列からなる、〔40〕~〔45〕のいずれか1項記載の改変嗅覚受容体ポリペプチド。
〔49〕好ましくは、配列番号97~209、485~641、及び851~899のいずれかで示されるアミノ酸配列からなり、より好ましくは、配列番号99~104、109~118、121、123、125~130、133、136、138、140~146、149~209、485~641、及び851~899のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる、〔48〕記載の改変嗅覚受容体ポリペプチド。
〔50〕改変嗅覚受容体ポリペプチドであって、
ヒト嗅覚受容体OR7E24の配列番号96で示されるアミノ酸配列において配列番号210で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号210で示されるアミノ酸配列からなるものであるか、
ヒト嗅覚受容体OR9K2の配列番号484で示されるアミノ酸配列において配列番号642で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号642で示されるアミノ酸配列からなるものであるか、
該嗅覚受容体ポリペプチドが、ヒト嗅覚受容体OR5I1の配列番号850で示されるアミノ酸配列において配列番号900で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるものである、
改変嗅覚受容体ポリペプチド。
〔51〕〔40〕~〔50〕のいずれか1項記載の改変嗅覚受容体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
〔52〕配列番号211~324、643~800、及び901~950のいずれかで示される塩基配列からなり、好ましくは配列番号213~218、223~232、235、237、239~244、247、250、252、254~260、263~324、643~800、及び901~950のいずれかで示される塩基配列からなる、〔51〕記載のポリヌクレオチド。
〔53〕〔51〕又は〔52〕記載のポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片。
〔54〕〔53〕記載のベクター又はDNA断片を含有する形質転換細胞。
〔55〕好ましくは、RTP1Sをコードするポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片をさらに含む、〔54〕記載の形質転換細胞。
〔56〕前記細胞がHEK293細胞である、〔54〕又は〔55〕記載の形質転換細胞。
1)嗅覚受容体遺伝子の作製
コンセンサス嗅覚受容体をデザインするにあたり、目的の嗅覚受容体遺伝子の相同遺伝子候補の検索はNCBI BLASTを用いて行った。得られた遺伝子群についてオルソログ群もしくはオルソログ及びパラログ群を特定した。
具体的には、ヒト嗅覚受容体を目的の嗅覚受容体とするとき、(a)の霊長類のオルソログの特定は、BLASTにより検索された霊長類の候補遺伝子について系統樹解析を行うことで実施した。例えばヒトOR2A25に(a)の方法を適用する場合、ヒトOR2A25(NP_001004488.1)のアミノ酸配列をquery配列とし、検索対象生物名を霊長類としたBLAST検索によって得られた相同遺伝子について系統樹解析を行い、ヒトOR2A25を含み他生物種のOR2A25が多く網羅され、かつOR2A25以外の遺伝子をできる限り含まないクレードを選択し、そのクレードに含まれる全18遺伝子のうちヒトOR2A25を除く17遺伝子を霊長類オルソログとして特定した。結果としてこれら17遺伝子は、ヒトOR2A25とのアミノ酸相同性は82%以上を示した。次いで、これら18遺伝子のアミノ酸配列(表3)について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。
ヒト嗅覚受容体を目的の嗅覚受容体とするとき、(b)の霊長類のオルソログ及びパラログの特定では、上記(a)の霊長類オルソログ特定の際の系統樹解析の結果、特定した霊長類オルソログのクレードと隣接し、目的の嗅覚受容体遺伝子と最も相同性が高い目的の嗅覚受容体の由来の生物種の遺伝子が含まれるクレードを特定した。特定したクレード群に含まれる遺伝子をパラログとして選択した。なお、これらパラログのうち、BLASTにより検索される霊長類遺伝子における目的の嗅覚受容体遺伝子と相同な遺伝子の上位50位に含まれないパラログは除外した。例えばヒトOR2A25に(b)の方法を適用する場合、上記(a)の系統樹解析の結果において選択した18遺伝子と最も近接するクレードを選択した。このクレードには20遺伝子が属しており、ヒトの嗅覚受容体遺伝子としてOR2A7及びヒトOR2A4が含まれていた。これら20遺伝子はヒトOR2A25との相同性が高い霊長類遺伝子群の上位50遺伝子に含まれていた。このようにしてパラログを含む20遺伝子を選択し、(a)で用いた18遺伝子に加えた計38遺伝子のアミノ酸配列(表3)について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸配列の特定を行った。
ヒト嗅覚受容体を目的の嗅覚受容体とするとき、(c)のオルソログの特定では、BLASTにより検索された相同性上位の遺伝子から、目的の嗅覚受容体と同じ名称をもつ遺伝子をオルソログとして選択した。例えばヒトOR2A25に(c)の方法を適用する場合、ヒトOR2A25(NP_001004488.1)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にOR2A25を含む67遺伝子を選択した。加えて異なる嗅覚受容体名称体系が用いられているMus musculus及びRattus norvegicusの遺伝子に関しては、該検索結果上位250遺伝子に含まれていた遺伝子のうち、最も相同性が高い遺伝子を1つずつ選択した。これら69遺伝子をオルソログとして特定した。これら69遺伝子にヒトOR2A25を加えた計70遺伝子のアミノ酸配列(表3)について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。
OR2T11、OR2W1、OR4Q3、OR4S2、OR6Y1、OR7D4、OR7A17、及びOR11H4の各ヒト嗅覚受容体を目的の嗅覚受容体とする場合についても、同様にしてオルソログ群もしくはオルソログとパラログ群を特定した。特定したオルソログ群もしくはオルソログとパラログ群にオリジナルのヒト嗅覚受容体遺伝子を加え、これら遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。
設計における嗅覚受容体のトポロジーの確認は、TMHMM(Transmembrane Hidden Markov Model)を使用した。デザインした各種嗅覚受容体ポリペプチドをコードするDNA配列は、そのアミノ酸配列に対応する塩基配列コドンをヒト培養細胞での発現用に最適化した上でDNA合成により獲得した。この塩基配列の両末端にはEcoRI、XhoIサイトを付加しており、pME18Sベクター上のFlag-Rhoタグ配列の下流に作製したEcoRI、XhoIサイトへと組換えた。培養細胞内で作られた嗅覚受容体タンパク質を細胞膜上へ移行するヒトRTP1Sをコードする遺伝子を、別のpME18SベクターのEcoRI、XhoIサイトへ組込み、pME18S-RTP1Sベクターを作製した。
ルシフェラーゼアッセイのために、表4に示す組成の反応液を調製し、クリーンベンチ内で20分静置した後、96ウェルプレート(BD)の各ウェルに添加した。次いで、DMEM(Nacalai)で懸濁させたHEK293細胞を100μLずつ各ウェルに2×105細胞/cm2で播種し、37℃、5%CO2を保持したインキュベータ内で24時間培養した。対照として、嗅覚受容体を発現させない細胞(mock)を用意した。
Flowcytometry法のために、6 well dishのそれぞれのwellに、3.3×105cellsを播種して24時間後に、表5に示す組成の反応液を調製し、クリーンベンチ内で20分静置した後、6 well dishの各ウェルに添加した。37℃、5%CO2を保持したインキュベータ内で24時間培養した。図3に示す実験において、OR7A17及びOR7D4のオリジナルの受容体に関しては42時間培養した。対照として、受容体を発現させない細胞(mock)を用意した。
Cellstripperを用いて回収した細胞に一次抗体として抗FLAG抗体(コスモバイオ社)を1時間氷上で作用させた。細胞を洗浄後、二次抗体としてPE(phycoerythrin)-conjugated anti-mouse IgG(アブカム株式会社)を30分間氷上で作用させた。洗浄後0.25μgの7-AAD(7-Aminoactinomycin D、富士フイルム和光純薬株式会社)を添加してフローサイトメトリーシステム(BD)により7-AADが陰性である細胞集団のPEシグナルの平均値を、細胞膜上の受容体量の指標として測定した。各実験回で、FLAG-M2アセチルコリン受容体を発現させた細胞を陽性コントロール(PC)として、受容体を発現させない細胞を陰性コントロール(NC)として上記と同様にPEシグナルの平均値を求めた。NCのPEシグナルを0%、PCのPEシグナルを100%として基準化を行い、各種嗅覚受容体のPEシグナル(%)を膜発現量(Cell surface expression)として図示した。
上記2)で作製した培養物から、培地を取り除き、新しい培地で調製した所定の濃度の試験物質溶液を75μL添加した。細胞をCO2インキュベータ内で4時間培養し、ルシフェラーゼ遺伝子を細胞内で十分に発現させた。ルシフェラーゼ活性は、Dual-GloTMluciferase assay system(Promega)を用いて、製品の操作マニュアルに従って測定した。96ウェルプレートの各ウェルにおいて、試験物質刺激により誘導されたホタルルシフェラーゼ由来の発光値をウミシイタケルシフェラーゼ由来の発光値で除した値をシグナルとして算出し解析に用いた。各トランスフェクション条件でのシグナルに対して、刺激を行わない条件のシグナルを0%、30μMホルスコリンで刺激した時のシグナルを100%として基準化を行い、Response(%)として解析に用いた。
(i)嗅覚受容体のコンセンサス化
はじめに、既にリガンドと対応付けられている嗅覚受容体を9種類(OR2A25、OR2T11、OR2W1、OR4Q3、OR4S2、OR6Y1、OR7D4、OR7A17、OR11H4)選択し、コンセンサス化をテストした。リガンドが既知の受容体を選択することは、もし膜発現量が実験的に検出できない範囲で向上した場合にも、リガンド応答性を指標に推し量る手段をとることができる点で重要である。
次に、選択した嗅覚受容体に対し、進化的にどの程度の範囲の相同遺伝子を対象にコンセンサスアミノ酸を決定するのかについて、次の3種類を選択した。(a)Primate ortholog=霊長類オルソログ、(b)Primate ortholog/paralog=霊長類のオルソログ及び最も近縁のパラログ、(c)Ortholog=オルソログ。
表6に、各嗅覚受容体について、コンセンサス嗅覚受容体の作製のために導入したアミノ酸置換数、参照遺伝子数(オリジナルの嗅覚受容体遺伝子と、特定した霊長類オルソログ、霊長類のオルソログ及び最も近縁のパラログ、あるいはオルソログとの合計数)とそれらのうち最小の相同性を示す。(c)の参照遺伝子数の括弧内の数は、参照遺伝子数のうち霊長類のオルソログの数を表す。前記9種の嗅覚受容体に対してコンセンサス嗅覚受容体をデザインした結果、(a)の方法ではオリジナルのヒト嗅覚受容体(平均307アミノ酸)に導入した置換は平均9.3アミノ酸であるが、(b)や(c)ではそれぞれ平均27.1、19.9アミノ酸と増加し、より多様な遺伝子の中でのコンセンサスが反映されたことになる。いずれの方法においても、コンセンサスアミノ酸を決定するために用いた相同遺伝子の数は、膜発現増加が認められなかったOR7A17のPrimate orthologの7遺伝子を除いて、非特許文献2の10遺伝子と比べて多数である。
Flowcytometry法を用いた解析の結果、9種類全ての嗅覚受容体が、3種類いずれかのコンセンサス化方法で膜発現量を顕著に増加させた(図1及び表7)。言い換えれば、3種類のコンセンサス化を全て適用すれば確率の上では100%の嗅覚受容体について膜発現量を増加させられる可能性を示した。オリジナルのヒト嗅覚受容体と比べて、膜発現量の平均値に増加が生じた嗅覚受容体の数は、(a)Primate orthologの方法で7個(約78%)、(b)Primate ortholog/paralogの方法で8個(約89%)、(c)Orthologの方法で9個(100%)であり、非特許文献2で応答解析に成功した割合3個中1個(約33%)よりも汎用性が高い可能性が見出された。なお、膜発現量の増加を示したコンセンサス嗅覚受容体群は必ずしも共通するアミノ酸部位にコンセンサス化が導入されたわけではなかったことから、受容体の種類によってコンセンサス化するべきアミノ酸部位は異なることが判明した。
次に、膜発現量の向上がにおい応答性の高感度化に繋がるのかを検証するため、各受容体についてリガンド応答性を測定した(図1)。結果として分かったことは次の2つである。コンセンサス化により膜発現量が向上するとほぼ全てのケースで応答性は高まる。膜発現量の向上度合いと応答性の上昇度合いは単純な比例関係にはなく、膜発現量がわずかでも向上すれば応答性は十分に向上することがある。後者は例えば、2T11、6Y1、11H4のように、コンセンサス化による膜発現量の増加に伴いリガンド応答性の上昇が認められるケースがある一方で、2W1のように、コンセンサス化によってオリジナルのヒト受容体と比して膜発現量が増加しても、リガンド応答性については上昇が認められないケースがあった。オリジナルのヒトOR2W1はそれ自体が十分な膜発現量を示し、膜発現量がそれ以上増加しても発生する細胞内シグナルに増幅の余地がないのかもしれない。そして2A25の(b)Primate ortholog/paralogsのコンセンサス受容体や7D4の(c)Orthologのコンセンサス受容体のように、オリジナルのヒト受容体と比べて膜発現量の増加がわずかであっても、十分にリガンド応答性が上昇する例が認められた。
コンセンサス化のようにアミノ酸改変を導入するアプローチには、オリジナルの嗅覚受容体のリガンド結合部位を変化させ、その結果、本来のにおい応答性を観察させなくなる懸念があった。
そこで、今回選択した9種類の嗅覚受容体のうち、アゴニストが複数判明していた5種類の受容体2A25、2T11、2W1、11H4、7D4について、2種類のアゴニストへの親和性の序列が(a)、(b)又は(c)のコンセンサス化によって変化するか否かを調べた(図2)。いずれのコンセンサス化によってもオリジナルの受容体と同じ親和性の序列を維持していることが明らかになった。例えば2A25はGeranyl formateと比べてGeraniolに対してより低濃度から応答するが、その応答選択性は3パターンのコンセンサス受容体でも維持されていることが判明した。
一方で、7A17について、オリジナルのヒト受容体では匂い物質#4と比べて#6がより大きな応答を引き起こしたが、(c)Orthologの方法によるコンセンサス化を適用した場合、その序列が逆転する傾向が認められるなど、応答選択性が完全に同一にはならない例も複数判明した。しかし、このような膜発現量の増加に伴うリガンド選択性の変化は、先行研究において報告されているような妥当なものと考えられる。例えば、Zhuangらによる報告(J Biol Chem. 2007 May 18;282(20):15284-93)では、同じ嗅覚受容体について培養細胞膜上の発現量を変化させた際のリガンド選択性の変化を解析した結果、変化が認められたことを報告している。その変化の妥当性について、嗅覚受容体を含むGタンパク質共役型受容体では、膜発現量の増加に伴い細胞内シグナルが増幅される場合、特に微弱にしかアゴニスト活性をもたないリガンドに対する応答検出が顕著に高感度化するという先行知見を引用して議論されている。重要なことに、嗅神経細胞上には嗅覚受容体は高発現していることから、培養細胞膜上においても高発現条件下にある嗅覚受容体が示すリガンド選択性が、生理的な嗅覚受容体の性質を反映するものだと考察されている。
以上の検討は、これまでリガンドが特定されるなど、培養細胞の膜上に発現させられ機能解析が可能な嗅覚受容体について実施した検討である。本発明によるコンセンサス化が、実際にこれまで解析されていなかった嗅覚受容体に対してどれ程有効なのかを検証した。
非特許文献2及びErikssonらによる報告(Flavour 1:22(2012))では、個々のにおいについて感じ方の異なる集団について、比較ゲノム解析を実施することにより、当該におい物質への感受性を担う嗅覚受容体の候補を報告している。言い換えれば、これら報告は嗅覚受容体のリガンド候補物質を特定したものであるが、それにも関わらずリガンド候補物質への応答性を実証することができていない嗅覚受容体を34種類(表10のヒト嗅覚受容体)残している。そして、応答測定に成功しない理由として、これら34種類の嗅覚受容体はそもそも偽陽性すなわち正しいリガンド物質を特定できていなかった可能性と共に、正しいリガンド物質を特定できているが培養細胞での膜発現が非効率であるために応答を検出できなかった可能性が指摘されている。そこで、これら34種類の嗅覚受容体について、上記(a)~(c)の3パターンのコンセンサス化のうち、11H1以外の嗅覚受容体には(c)Orthologの方法によるコンセンサス化を適用し、11H1には(d)の方法によるコンセンサス化を適用した。
図5、図6で新たに特定されたヒト嗅覚受容体それぞれについて、(c)のコンセンサス化を適用した上で個人差が報告されるアミノ酸配列を導入し、官能評価での個人差に符合する応答性が得られるかを検証した(図7)。
例えば、OR10A2は、NP_001004460.1で登録されるアミノ酸配列の出現頻度が集団の68%であるのに対して、H43R、H207R、K258Tの3変異を有するアミノ酸配列が32%で出現することが報告されている(出現頻度は1000 genomes project phase 3 allele frequenciesより)。なお、3か所の変異のうち、H207Rは(c)の方法で同定されるコンセンサスアミノ酸でもある。集団に認められるこれら二種類のアミノ酸配列型は、それぞれパクチーの主要香気成分((E)-2-decenal、(E)-2-dodecenal)に対する応答性に変化をもたらし、その結果としてヒトがパクチーの香りを不快な石鹸様として感じるか否かの違いをもたらしていると予想される。実験の結果、予想通りH43R、H207R、K258Tの変異型では、上記香気成分に対する応答性が顕著に低いことが判明した。上記香気成分に対する応答性が10A2よりも低かった嗅覚受容体10A4にも集団の31%に出現するR262Q変異型が報告されるが、この変異型は上記香気成分に応答性の変化をもたらさなかった。したがって、パクチーの香りの感じ方の個人差を説明する受容体として、コンセンサス化方法の適用により初めて、10A2を特定することが可能になった。
同様に6B2に関しても、R122CかつC179Rの変異型が集団(非特許文献2での試験参加者)の1%に認められ、この集団は非特許文献2によれば、低濃度のイソブチルアルデヒドのにおいを強く感じることができない。この官能評価での個人差に符合して、コンセンサス嗅覚受容体6B2にR122CかつC179Rの変異を導入すると、イソブチルアルデヒドへの応答性が顕著に低下することが確認された。
5C1に関しては、N5Kの変異型が集団(1000 genomes project phase 3 allele frequencies)の1%に認められ、この集団は非特許文献2によれば、低濃度のシトラールのにおいを強く感じることができない。この官能評価での個人差に符合して、コンセンサス嗅覚受容体5C1にN5Kの変異を導入すると、シトラールへの応答性が顕著に低下することが確認された。
以上より、本発明のコンセンサス化方法は、ヒトの嗅覚を推し量るうえで極めて有効であることが判明した。
嗅覚受容体遺伝子ファミリーは非常に多様性に富んだ遺伝子群であり、異なるファミリー間の嗅覚受容体同士の相同性は40%を下回る。したがって、個々の嗅覚受容体はまるで異なるGタンパク質共役型受容体とも考えられる。そこで、本発明のコンセンサス化方法の嗅覚受容体全般に対する有効性、すなわち、本発明のコンセンサス化方法の適用可能範囲を明確にするべくさらなる検証を行った。上記の実施例1の9種類及び実施例2の34種類以外の嗅覚受容体群について検証を行った。具体的には、対象とする嗅覚受容体(図8及び表12の58種類のヒト嗅覚受容体)に対して、(c)Orthologもしくは(d)の方法によるコンセンサス化を適用した。OR2T7及びOR4F5以外の嗅覚受容体には(c)のコンセンサス化を適用し、OR2T7及びOR4F5には(d)のコンセンサス化を適用した。
(c)のコンセンサス化を適用した嗅覚受容体のうち、OR7E24については、最もN末端側のコンセンサス残基が基準となるオリジナルのヒトOR7E24のN末端よりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基ではないため、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更すると、その結果として生じるコンセンサス受容体のアミノ酸配列の全長がオリジナルのヒトOR7E24のアミノ酸配列の全長より10%以上短くなるので、この方法に代えて最もN末端に近いコンセンサス残基をメチオニンに置換した。
ヒトOR2T7を目的の嗅覚受容体としたとき、ヒトOR2T7(NP_001372981.1)のアミノ酸配列をquery配列とした以外は実施例1の(c)の場合と同様にしてオルソログ群の特定を試みたが、オルソログ群として5遺伝子しか選択されなかった。そこでヒトOR2T7のアミノ酸配列をquery配列として検索された相同性上位の250遺伝子の中から、ヒトOR2T7と最も相同性が高いパラログであるヒトOR2T27に着目し、オルソログ群を特定したところ、100遺伝子がオルソログ群として選択された。これら105遺伝子にヒトOR2T7及びヒトOR2T27を加えた計107遺伝子のアミノ酸配列について実施例1と同様にしてアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行い、嗅覚受容体をコンセンサス化した。
上記の実施例1の9種類、実施例2の34種類、及び実施例4の58種類以外の嗅覚受容体群についてコンセンサス化方法の適用可能性の検証を行った。具体的には、対象とする嗅覚受容体(表14及び15の156種類のヒト嗅覚受容体)に対して、(c)Orthologもしくは(d)の方法によるコンセンサス化を適用した。OR1D4、OR3A3、OR11H2、OR51A2及びOR52E6以外の嗅覚受容体には(c)のコンセンサス化を適用し、OR1D4、OR3A3、OR11H2、OR51A2及びOR52E6には(d)のコンセンサス化を適用した。
(c)のコンセンサス化を適用した嗅覚受容体のうち、OR9K2については、コンセンサス受容体のアミノ酸配列の全長がオリジナルのヒト嗅覚受容体のアミノ酸配列の全長よりN末端側に10%以上長くなるので、コンセンサス受容体のアミノ酸配列においてオリジナルのヒト嗅覚受容体のN末端構造をそのまま維持した。
(c)もしくは(d)の方法によって、膜発現量が増加した例を表14及び15に示す(n=3)。表16に、コンセンサス嗅覚受容体の作製のために使用した参照遺伝子数(オリジナルの嗅覚受容体遺伝子と、特定したオルソログあるいはオルソログとパラログとの合計数)を示す。表14及び15の結果より、本発明のコンセンサス化方法により、極めて多数の嗅覚受容体の膜発現量を増加できることが明らかになった。
上記の実施例1の9種類、実施例2の34種類、実施例4の58種類、及び実施例5の156種類以外の嗅覚受容体群についてコンセンサス化方法の適用可能性の検証を行った。具体的には、対象とする嗅覚受容体(表17の50種類のヒト嗅覚受容体)に対して、(c)Orthologもしくは(d)の方法によるコンセンサス化を適用した。OR8H2以外の嗅覚受容体には(c)のコンセンサス化を適用し、OR8H2には(d)のコンセンサス化を適用した。
(c)のコンセンサス化を適用した嗅覚受容体のうち、OR5I1については、最もN末端側のコンセンサス残基が基準となるオリジナルのヒトOR5I1のN末端よりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基ではないため、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更すると、その結果として生じるコンセンサス受容体のアミノ酸配列の全長がオリジナルのヒトOR5I1のアミノ酸配列の全長より10%以上短くなるので、この方法に代えて最もN末端に近いコンセンサス残基をメチオニンに置換した。
(c)もしくは(d)の方法によって、膜発現量が増加した例を表17に示す(n=3)。表18に、コンセンサス嗅覚受容体の作製のために使用した参照遺伝子数(オリジナルの嗅覚受容体遺伝子と、特定したオルソログあるいはオルソログとパラログとの合計数)を示す。表17の結果より、本発明のコンセンサス化方法により、極めて多数の嗅覚受容体の膜発現量を増加できることが明らかになった。
ムスク受容体として詳細な解析がなされているOR5AN1に対して(c)Orthologの方法によるコンセンサス化を適用した。ところが、コンセンサス化によっても膜発現量に増加は認められなかった(図9A,B)。一方で、オリジナルのOR5AN1とコンセンサスOR5AN1との間で既知のアゴニストに対する応答性を比較すると、コンセンサス化による応答性の上昇が認められた(図9C,Dのにおい物質#1-8)。用いたにおい物質は表19に示す。におい物質#7と#8は、オリジナルのOR5AN1に応答を引き起こさなかったが、コンセンサスOR5AN1に応答を引き起こした。この結果は、一見コンセンサス化によってリガンド選択性がオリジナルのものから変化してしまった可能性を思わせるが、その可能性は低いと考えられる。なぜならにおい物質#7と#8は、Sato-Akuharaらによる報告(J Neurosci. 36(16):4482-4491(2016))においてオリジナルのOR5AN1に弱いながらも応答を引き起こせることが示されている。したがって、オリジナルのOR5AN1からにおい物質#7と#8に対する応答が認められなかった原因は、本評価系が先行研究のものと比べて低感度であるためだと考えられる。これに対し、コンセンサス化によって応答が認められた結果は、リガンド選択性に異常が生じたことを示すものではなく、本来のアゴニストに対する応答感度の上昇を示すものと考えられる。におい物質#9-21には、OR5AN1アゴニストと化学構造もしくは匂いの質が類似する物質が含まれており、さらにSato-Akuharaらによる報告においてOR5AN1を活性化しない物質が含まれている。これらについて応答測定を行った結果、オリジナルのOR5AN1が認識しない物質に対してはコンセンサスOR5AN1も応答しないことが示され、コンセンサス化によってリガンド選択性が大きく変化しないことがさらに支持された。膜発現量が増加しないにも関わらず応答性を上昇させるコンセンサス化の例はOR5AN1に限定的なものではなく、図1のOR4S2(Primate ortholog/paralog)、OR7A17(Primate ortholog)に関しても認められている。これらコンセンサス化は、受容体タンパクの活性化型構造への移行効率や、Gタンパク質との共役効率などを高めている等の可能性が考えられる。以上より、本発明のコンセンサス化法は、膜発現量を増加させなかったとしても、嗅覚受容体の機能を高感度に解析するために有効な場合があることが示された。
マウスの嗅覚受容体の解析にもコンセンサス化が有効であることを確認した。古くから解析されてきた代表的なマウス嗅覚受容体としてM71(Olfr151,MOR171-2)に注目し、(c)Orthologの方法によるコンセンサス化を適用した。すなわち、M71のアミノ酸配列と相同性が高い249遺伝子を選択し、コンセンサスアミノ酸配列の決定を行った。コンセンサス化したM71を、ヒト嗅覚受容体と同様にpME18SベクターのFLAGタグ、Rhoタグの下流に挿入し、HEK293細胞にトランスフェクションした。そして、24時間後に細胞膜上に発現するタンパク量を測定した(n=3)。その結果、オリジナルのM71の膜発現量(Cell surface expression(%))が0.78±0.07(平均±SEM)であったのに対して、コンセンサス化M71では3.20±0.19と増加が認められた。したがって、コンセンサス化はヒト以外の生物種の嗅覚受容体にも有効であることが示された。
1)嗅覚受容体発現細胞の作製
上記実施例にて作製したコンセンサス嗅覚受容体について、上記表4に示す組成の反応液を調製し、クリーンベンチ内で20分静置した後、96ウェルプレート(BD)の各ウェルに添加した。尚、OR4S2についてはオリジナルの嗅覚受容体を用いた。また、OR11H2、OR4E2については、表20に示す組成を用いた。次いで、DMEM(Nacalai)で懸濁させたHEK293細胞を100μLずつ各ウェルに2×105細胞/cm2で播種し、37℃、5%CO2を保持したインキュベータ内で24時間培養した。対照として、嗅覚受容体を発現させない細胞(Mock)を用意した。
上記1)で作製した培養物から、培地を取り除き、新しい培地で調製した試験物質溶液(メチルメルカプタン(MeSH)(CAS:74-93-1、東京化成工業)、ジメチルスルフィド(DMS)(CAS:75-18-3、富士フイルム和光純薬)、ジメチルジスルフィド(DMDS)(CAS:624-92-0、東京化成工業)、濃度範囲0μM、1μM、3μM、10μM、30μM、100μM、300μM、又はジメチルトリスルフィド(DMTS)(CAS:3658-80-8、東京化成工業)、濃度範囲0μM、0.1μM、0.3μM、1μM、3μM、10μM、30μM)を75μL添加した。銅イオン添加条件においては、上記におい物質に加えて塩化銅(II)(富士フイルム和光純薬)を30μM含むように調整したものを試験物質溶液とした。細胞をCO2インキュベータ内で4時間培養し、ルシフェラーゼ遺伝子を細胞内で十分に発現させた。ルシフェラーゼ活性は、Dual-GloTMluciferase assay system(Promega)を用いて、製品の操作マニュアルに従って測定した。96ウェルプレートの各ウェルにおいて、試験物質刺激により誘導されたホタルルシフェラーゼ由来の発光値をウミシイタケルシフェラーゼ由来の発光値で除した値(fluc/hRluc)をシグナルとして算出し解析に用いた。各トランスフェクション条件でのシグナルに対して、におい物質による刺激を行わない条件のシグナル値(fluc/hRluc)を0%、10μMホルスコリンで刺激した時のシグナル値(fluc/hRluc)を100%として基準化を行い、Response(%)として解析に用いた。
試験した嗅覚受容体のうち、銅イオン存在下で、メチルメルカプタン、ジメチルスルフィド、ジメチルジスルフィド又はジメチルトリスルフィドに応答した嗅覚受容体を図10に示す。図10には個々の嗅覚受容体について各濃度のメチルメルカプタン、ジメチルスルフィド、ジメチルジスルフィド又はジメチルトリスルフィドに対する応答値を示す。各嗅覚受容体は、OR4S2を除いて、コンセンサス嗅覚受容体である。試験した最高濃度300μM(DMTSは30μM)に対する各嗅覚受容体の応答値(Response(%))と、受容体を発現させないMock条件の細胞の応答値(Response(%))との間には統計学上有意な差が認められた(Student’s t-test、P<0.05)。なお、各嗅覚受容体において、におい物質による刺激を行わない条件のシグナル値(fluc/hRluc)と、最高濃度300μM(DMTSは30μM)で刺激した条件のシグナル値(fluc/hRluc)を比較しても同じ統計学手法における有意差が認められた。表21~24中の数値は、Response(%)値をシグモイド曲線に回帰することにより算出されたEC50(μM)である。図10に挙げられているが、表21~24でEC50(μM)の記載がない嗅覚受容体は、メチルメルカプタン、ジメチルスルフィド、ジメチルジスルフィド又はジメチルトリスルフィドに応答できる受容体であるものの、今回試験した濃度範囲ではシグモイド曲線に回帰するために十分なデータが得られず、EC50が算出されなかったことを意味する。したがって、コンセンサスOR2T29、コンセンサスOR4K17、コンセンサスOR2T27、コンセンサスOR2T5、コンセンサスOR2T4、コンセンサスOR11H2、コンセンサスOR6B3、コンセンサスOR12D3、コンセンサスOR2T11、OR4S2、コンセンサスOR2T1、コンセンサスOR4C15、コンセンサスOR4E2及びコンセンサスOR2L13は、メチルメルカプタンに応答した。なかでも、コンセンサスOR2T29、コンセンサスOR2T5、コンセンサスOR2T4、コンセンサスOR2T11、コンセンサスOR2T1及びコンセンサスOR4E2については、メチルメルカプタンに対する用量依存的な応答も確認した。また、コンセンサスOR4K17、コンセンサスOR11H2、OR4S2、コンセンサスOR4C15及びコンセンサスOR4E2は、ジメチルスルフィドに用量依存的に応答した。また、コンセンサスOR2T29、コンセンサスOR4K17、コンセンサスOR2T27、コンセンサスOR2T5、コンセンサスOR2T4、コンセンサスOR11H2、コンセンサスOR6B3、コンセンサスOR12D3、コンセンサスOR2T11、OR4S2、コンセンサスOR2T1、コンセンサスOR4C15、コンセンサスOR4E2及びコンセンサスOR2L13は、ジメチルジスルフィドに応答した。なかでも、コンセンサスOR4K17、コンセンサスOR6B3、コンセンサスOR2T11、OR4S2、コンセンサスOR4C15及びコンセンサスOR4E2については、ジメチルジスルフィドに対する用量依存的な応答も確認した。さらに、コンセンサスOR2T29、コンセンサスOR2T4、コンセンサスOR11H2、コンセンサスOR6B3、コンセンサスOR12D3、コンセンサスOR6B1、コンセンサスOR2T11、OR4S2、コンセンサスOR2T1、コンセンサスOR4C15、コンセンサスOR4E2及びコンセンサスOR2L13は、ジメチルトリスルフィドに応答した。なかでも、コンセンサスOR2T11、OR4S2及びコンセンサスOR4E2については、ジメチルトリスルフィド対する用量依存的な応答も確認した。例えば、OR2T11及びOR2T1が金属イオン存在下でメチルメルカプタンに応答することは知られており(特許第6122181号公報)、コンセンサスOR2T11及びコンセンサスOR2T1がメチルメルカプタンに応答するとの結果は斯かる知見と整合するものである。よって、コンセンサスOR2T29、コンセンサスOR4K17、コンセンサスOR2T27、コンセンサスOR2T5、コンセンサスOR2T4、コンセンサスOR11H2、コンセンサスOR6B3、コンセンサスOR12D3、コンセンサスOR6B1、コンセンサスOR2T11、OR4S2、コンセンサスOR2T1、コンセンサスOR4C15、コンセンサスOR4E2及びコンセンサスOR2L13がメチルメルカプタン、ジメチルスルフィド、ジメチルジスルフィド及びジメチルトリスルフィドからなる群より選択される少なくとも1種の硫黄化合物に応答することが判明した。
Claims (14)
- 前記嗅覚受容体ポリペプチドが、配列番号97、99~104、106、107、109~119、121、122、124~131、133、134、136、137、139~144、146、148~167、169~178、180~210、485、486、488~524、526~589、591~598、600~627、629~642、851~885及び887~900のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる、請求項1記載の方法。
- 目的の嗅覚受容体の応答の測定方法であって、
上記表1-1~1-5の(1)の目的の嗅覚受容体の(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させること、及び
該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法(但し、人間を手術又は治療する方法を除く)。 - 目的の嗅覚受容体のリガンドの探索方法であって、
上記表1-1~1-5の(1)の目的の嗅覚受容体の(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させること、
試験物質存在下で、該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、及び
該嗅覚受容体ポリペプチドが応答した試験物質を選択すること、
を含む方法(但し、人間を手術又は治療する方法を除く)。 - 目的の嗅覚受容体のリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
上記表1-1~1-5の(1)の目的の嗅覚受容体の(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させること、
該嗅覚受容体ポリペプチドに試験物質及び目的の嗅覚受容体のリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法(但し、人間を手術又は治療する方法を除く)。 - 目的の嗅覚受容体のリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
上記表1-1~1-5の(1)の目的の嗅覚受容体の(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させること、
該嗅覚受容体ポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法(但し、人間を手術又は治療する方法を除く)。 - 目的の嗅覚受容体のリガンドのにおいの増強剤の評価及び/又は選択方法であって、
上記表1-1~1-5の(1)の目的の嗅覚受容体の(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる嗅覚受容体ポリペプチドを細胞に発現させること、
該嗅覚受容体ポリペプチドに試験物質及び目的の嗅覚受容体のリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該嗅覚受容体ポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法(但し、人間を手術又は治療する方法を除く)。 - 前記嗅覚受容体ポリペプチドが、配列番号97、99~104、106、107、109~119、121、122、124~131、133、134、136、137、139~144、146、148~167、169~178、180~210、485、486、488~524、526~589、591~598、600~627、629~642、851~885及び887~900のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる、請求項3~7のいずれか1項記載の方法。
- 前記嗅覚受容体ポリペプチドの応答が、ELISAもしくはレポータージーンアッセイによる細胞内cAMP量測定、カルシウムイメージングもしくはTGFα shedding assayによるカルシウムイオン量測定、又はアフリカツメガエル卵母細胞を用いた二電極膜電位固定法による細胞膜内外の電位変化測定により測定される、請求項3~7のいずれか1項記載の方法。
- 改変嗅覚受容体ポリペプチドであって、
上記表1-1~1-5の(1)の目的の嗅覚受容体の(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、
改変嗅覚受容体ポリペプチド。 - 配列番号97、99~104、106、107、109~119、121、122、124~131、133、134、136、137、139~144、146、148~167、169~178、180~210、485、486、488~524、526~589、591~598、600~627、629~642、851~885及び887~900のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる、請求項10記載の改変嗅覚受容体ポリペプチド。
- 請求項10又は11記載の改変嗅覚受容体ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
- 請求項12記載のポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片。
- 請求項13記載のベクター又はDNA断片を含有する形質転換細胞。
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