WO2023243495A1 - Gタンパク質共役型受容体の解析方法 - Google Patents
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Definitions
- the present invention relates to a method for analyzing G protein-coupled receptors.
- Cells as members of living organisms, recognize changes in the surrounding physiological conditions and change their behavior. Individual living organisms take adaptive actions by using their senses to detect changes in the external environment. The basis of biological mechanisms is that each living unit responds appropriately to endogenous semiochemical substances such as hormones and neurotransmitters, or exogenous semiochemical substances such as tastants. Receptor proteins possessed by individual tissue cells are responsible for these chemoreceptions. In recent years, many organisms lacking specific receptor genes have been created, and the necessity of receptors in physiological functions has been demonstrated. In addition, various drugs targeting receptors are in practical use as modulators of physiological functions. On the other hand, there are still many receptors whose functions are unknown.
- GPCR G-protein-coupled receptor
- Non-Patent Document 1 As of November 2017, 134 GPCRs are targeted by approved drugs in the United States (Non-Patent Document 1). In addition, it has been shown that receptors that were thought to be involved only in sensation are actually expressed in tissues other than sensory tissues and are involved in specific physiological functions within the body.
- VN1R vomeronasal 1 receptor
- Non-Patent Document 2 the vomeronasal 1 receptor
- Only one case of functional analysis in cultured cells has been reported for VN1R1 in humans, and this report shows that it recognizes low-molecular volatile compounds (Non-Patent Document 2).
- a large-scale study in Sweden investigated what kind of differences in characteristics are caused by genetic polymorphisms in VN1R1, and the results showed that there are differences in female sexual characteristics. A potential function has been suggested (Non-Patent Document 3).
- VN1R2-5 there are no reports on functional analysis such as identification of substances recognized.
- TAS1R taste 1 receptor
- TAS1R2 taste receptor
- TAS1R3 TAS1R3
- Class C type GPCRs including metabotropic glutamate receptors, function by forming dimers, and TAS1R is no exception.
- HEK293 cells respond to tastants when TAS1R3 is coexpressed with either TAS1R1 or TAS1R2.
- the TAS1R1/TAS1R3 complex and the TAS1R2/TAS1R3 complex accept umami and sweet substances, respectively. It has been reported that by expressing the TAS1R2/TAS1R3 complex in cultured cells and performing screening, a substance that functions as an allosteric modulator for the complex and enhances sweetness has been identified (Non-Patent Document 4). Similarly, if the TAS1R1/TAS1R3 complex is expressed, it is also possible to obtain an evaluation result that inosinic acid, which enhances umami, enhances the activity of the complex (Non-Patent Document 5). If these TAS1R proteins could be obtained in a more stable form or expressed in larger amounts on the membranes of cultured cells, it would be possible to efficiently identify materials that enhance umami and sweetness.
- TAS2R (taste 2 receptor), which is also a taste receptor, is a gene family discovered as a bitter taste receptor expressed on the tongue, and there are 25 types of genes in the human genome. It is classified as a Class A type GPCR and has been shown to recognize various bitter substances, but the functions of human TAS2R41, TAS2R42, TAS2R45, TAS2R48, and TAS2R60 have not been successfully analyzed, and it is unclear what substances they recognize. It is unclear whether they will do so.
- Patent Document 1 discloses that TAS2R is made into a fusion protein with G protein as a device for efficient functional analysis in order to enable evaluation of bitterness and identification of bitterness modulating substances using TAS2R. There is.
- TAS2R is not limited to the tongue, but is also observed in the respiratory system, circulatory system, and nervous system, and it has been shown to play a variety of physiological actions in addition to receiving bitter taste on the tongue (Non-Patent Document 6). . In addition, expression is also observed in cancerous tissue cells such as ovarian cancer and prostate cancer.
- Trace amine associated receptor is a GPCR of the Class A family, and consists of six types of genes in humans.
- TAAR1 which was first discovered, has been shown to be responsible for the recognition of neurotransmitters in the brain. Therefore, the relationship between TAAR1 and schizophrenia, depression, addiction, and Parkinson's disease has been investigated, and efforts are being made to use its agonist for the treatment of neurogenic pain (Patent Document 2).
- Patent Document 2 On the other hand, other TAARs other than TAAR1 are highly expressed in the olfactory epithelium, recognize volatile amines selectively and with high sensitivity, and have been shown to play a role in producing the sensation of smell.
- Mrgpr Mas-related G-protein-coupled receptor
- Rhpr is a GPCR of the Class A family, and there are 10 types of genes in humans. Its expression is recognized in the sensory nervous system such as the peripheral skin and its associated tissues, and recognition of agonists causes the sensation of itching and pain (Non-Patent Document 8). Furthermore, based on the fact that MrgprB4-expressing sensory neurons are involved in pleasant tactile sensations in mice, an effort to search for a pleasant emotion-enhancing agent targeting MrgprB4 has been disclosed (Patent Document 3).
- MrgprE and MrgprF are also expressed in various tissues other than sensory nerves, such as the ileum, and play a variety of physiological functions, but there are few reports of agonists (non-patent Reference 9).
- GPCRs whose functions have not been successfully analyzed and it is unclear what kind of molecules they recognize as ligands are generally expressed as GPR (G-protein-coupled receptor) X (X is an arbitrary number).
- GPR G-protein-coupled receptor
- X is an arbitrary number.
- Patent Document 1 Japanese Patent No. 6924590 (Patent Document 2) Japanese Patent Publication No. 2019-517524 (Patent Document 3) Japanese Patent Application Publication No. 2019-118340 (Non-patent Document 1) Sriram K, Game PA. Mol Pharmacol. 93 (4):251-258 (2016) (Non-patent document 2) Shirokova E, et al. FASEB J. 22(5):1416-25 (2008) (Non-patent document 3) Henningsson, S., Hovey, D., Vass, K. et al.
- Non-patent document 4 Servant G, Tachdjian C, Tang XQ, Werner S, Zhang F, Li X, Kamdar P, Petrovic G, Ditschun T, Java A, House P, Brune N, DuBois GE, Zoller M, Karanewsky DS . Proc Natl Acad Sci U S A. 107(10):4746-51 (2010) (Non-patent document 5) Nelson, G., Chandrashekar, J., Hoon, M. et al. Nature 416, 199-202 (2002) (Non-patent document 6) Tuzim K., Korolczuk A.
- Non-patent Document 7 Liberles SD Curr Opin Neurobiol. 34:1-7 (2015) (Non-patent document 8) Liu Q, et al. Cell 139(7):1353-1365 (2009) (Non-patent Document 9) Juan M. et al. Neuroscience Letters, Volume 748, 2021
- the present invention provides the following 1) to 13).
- 1) A method for expressing a GPCR polypeptide comprising: Consists of an amino acid sequence in which at least one amino acid residue that differs from the consensus amino acid sequence in the amino acid sequence of the target GPCR (excluding olfactory receptors) is changed to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position.
- the consensus amino acid sequence is an amino acid sequence derived from an alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of a GPCR encoded by an ortholog of the GPCR of interest in a vertebrate.
- a method for expressing a GPCR polypeptide comprising: Expressing in cells a GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence in which at least one amino acid residue that differs from the consensus amino acid sequence in the amino acid sequence of the GPCR of interest is changed to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position. including; The GPCR polypeptide has at least one amino acid residue different from the consensus amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 143 in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 36 of human TAAR6, and the amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position. consisting of an amino acid sequence modified based on Method.
- a method for measuring the response of a GPCR of interest comprising: 1) or 2) measuring the response of the GPCR polypeptide expressed by the method described above; method including.
- a method for searching for a target GPCR ligand comprising: Measuring the response of a GPCR polypeptide expressed by the method described in 1) or 2) in the presence of a test substance, and selecting a test substance to which the GPCR polypeptide responded; method including.
- a method for evaluating and/or selecting a control agent for recognition of a target GPCR ligand comprising: 1) or 2) adding a test substance and a ligand of the GPCR of interest to the GPCR polypeptide expressed by the method described above, and measuring the response of the GPCR polypeptide to the ligand; method including. 6) A taste evaluation method, adding a test substance to the GPCR polypeptide expressed by the method described in 1) or 2), and measuring the response of the GPCR polypeptide to the test substance; and the GPCR polypeptide is a taste receptor polypeptide.
- a method for evaluating and/or selecting an odor inhibitor for a target GPCR ligand comprising: 1) or 2) adding a test substance and a ligand of the GPCR of interest to the GPCR polypeptide expressed by the method described above, and measuring the response of the GPCR polypeptide to the ligand; and the GPCR polypeptide is a trace amine-related receptor polypeptide.
- Method. 8 A method for evaluating and/or selecting an odor inhibitor for a target GPCR ligand, comprising: adding a test substance to the GPCR polypeptide expressed by the method described in 1) or 2), and measuring the response of the GPCR polypeptide to the test substance; and the GPCR polypeptide is a trace amine-related receptor polypeptide.
- a modified GPCR polypeptide comprising: Consists of an amino acid sequence in which at least one amino acid residue that differs from the consensus amino acid sequence in the amino acid sequence of the target GPCR (excluding olfactory receptors) is modified to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position.
- the consensus amino acid sequence is an amino acid sequence derived from an alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of a GPCR encoded by an ortholog of the GPCR of interest in a vertebrate. Modified GPCR polypeptide.
- a modified GPCR polypeptide comprising: An amino acid sequence in which at least one amino acid residue different from the consensus amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 143 in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 36 of human TAAR6 is modified to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position. Consisting of Modified GPCR polypeptide. 11) A polynucleotide encoding the modified GPCR polypeptide described in 9) or 10). 12) A vector or DNA fragment containing the polynucleotide described in 11). 13) A transformed cell containing the vector or DNA fragment described in 12).
- G-protein-coupled receptor has a 7-transmembrane structure and changes to an activated structure upon binding a ligand. Basically, it is a general term for receptors that transmit signals through interaction with intracellular G proteins. GPCRs include vomeronasal receptors, taste receptors, trace amine-related receptors, Mas-related G protein-coupled receptors, as well as GPRX (X is any number) whose ligand is unknown. It is not limited to.
- vomeronasal receptor refers to VN1R (vomeronasal 1 receptor).
- VN1R vomeronasal 1 receptor
- the term "taste receptor” refers to a receptor that receives taste molecules in a living body, and includes umami or sweet receptors belonging to the TAS1R (taste 1 receptor) family that accept umami or sweet molecules, and bitter taste receptors. It includes bitter taste receptors belonging to the TAS2R (taste 2 receptor) family that accept molecules.
- TAS1R taste 1 receptor
- TAS2R taste 2 receptor
- TAS1R genes in the human genome there are three types of TAS1R genes in the human genome. Among these, TASR1 and TAS1R3 form a complex and function as an umami substance receptor, and TAS1R2 and TAS1R3 form a complex and function as a sweet substance receptor. Furthermore, there are 25 types of TAS2R genes in the human genome.
- trace amine associated receptor refers to TAAR (trace amine associated receptor).
- TAAR trace amine associated receptor
- Mrpgr Mas-related G-protein coupled receptor
- MAS is a G protein-coupled receptor that binds angiotensin.
- Mrpgr genes there are 10 types of Mrpgr genes in the human genome (MAS1, MASL1, MrgprD, MrgprE, MrgprF, MrgprG, MrgprX1-4).
- olfactory receptor refers to olfactory receptor or odorant receptor. Approximately 400 olfactory receptor genes have been predicted in the human genome based on criteria such as overall sequence homology, predicted seven transmembrane regions, and presence or absence of conserved partial amino acid sequences. .
- GPCR polypeptide refers to GPCR or a polypeptide having a function equivalent to that, and a polypeptide having a function equivalent to GPCR is a polypeptide that can be expressed on a cell membrane like a GPCR.
- the phrase "functionally expressed" in a cell means that the expressed GPCR polypeptide functions as a receptor for the corresponding ligand in the cell.
- agonist refers to a substance that binds to and activates a receptor.
- antagonist refers to a substance that binds to a receptor but does not activate the receptor or suppresses the response of the receptor to an agonist.
- receptor agonism refers to binding to and activating a receptor.
- olfactory cross-adaptation or olfactory cross-adaptation
- olfactory cross-adaptation in which a person receives the odor of a substance different from the causative agent of the target odor in advance and becomes accustomed to that odor.
- olfactory cross-adaptation is a phenomenon based on receptor agonism (International Publication No. 2016/194788).
- odor cross-adaptation receptors for a target odor-causing substance respond to a different odor-causing substance prior to responding to the target odor-causing substance, and then desensitize to a different odor-causing substance. Even if an individual is exposed to the causative agent of the target odor, only a low response can be produced, resulting in a decrease in the intensity or alteration of the target odor perceived by the individual.
- the mechanism of odor cross-adaptation caused by such receptor behavior is also referred to herein as "olfactory cross-adaptation by receptor agonism.”
- suppression by receptor antagonism of a target odor refers to suppressing the response of a receptor to a substance having a target odor using an antagonist, and as a result suppressing the target odor recognized by an individual. means.
- nucleotide sequences and amino acid sequences are calculated by the Lipman-Pearson method (Science, 1985, 227: 1435-41). Specifically, analysis is performed using the homology analysis (Search homology) program of genetic information processing software Genetyx-Win (Ver. 5.1.1; software development) with Unit size to compare (ktup) set to 2. Calculated by
- amino acid residue refers to the 20 types of amino acid residues that make up proteins, alanine (Ala or A), arginine (Arg or R), asparagine (Asn or N), aspartic acid (Asp or D), cysteine (Cys or C), glutamine (Gln or Q), glutamic acid (Glu or E), glycine (Gly or G), histidine (His or H), isoleucine (Ile or I), leucine (Leu or L ), lysine (Lys or K), methionine (Met or M), phenylalanine (Phe or F), proline (Pro or P), serine (Ser or S), threonine (Thr or T), tryptophan (Trp or W) , tyrosine (Tyr or Y) and valine (Val or V).
- amino acid modifications may be expressed as [original amino acid, position, modified amino acid] using the officially recognized IUPAC one-letter amino acid abbreviation.
- modification of histidine at position 43 to arginine is designated as "H43R.”
- corresponding position on an amino acid sequence refers to alignment of the target sequence and the reference sequence (in the present invention, the amino acid sequence of the original GPCR) so as to provide maximum homology. It can be determined by Alignment of amino acid sequences can be performed using known algorithms and procedures are known to those skilled in the art. For example, alignment can be performed using the Clustal W multiple alignment program (Thompson, J.D. et al., 1994, Nucleic Acids Res. 22:4673-4680) with default settings. Alternatively, Clustal W2 or Clustal omega, which are revised versions of Clustal W, can also be used. Clustal W, Clustal W2 and Clustal omega are available on the Clustal website [www. clustal.
- a position of the target sequence aligned to an arbitrary position of the reference sequence by the above alignment is considered to be a "corresponding position" to the arbitrary position.
- amino acid sequence alignment can further fine-tune the amino acid sequence alignment obtained above to optimize it.
- Such optimal alignment is preferably determined by taking into consideration the similarity of amino acid sequences, the frequency of inserted gaps, and the like.
- Amino acid sequence similarity here refers to the ratio (%) of the number of positions where identical or similar amino acid residues exist in both sequences to the total number of amino acid residues when two amino acid sequences are aligned.
- Similar amino acid residues refer to amino acid residues among the 20 types of amino acids constituting proteins that have similar properties to each other in terms of polarity and charge and that cause so-called conservative substitutions.
- amino acid sequence alignment obtained above can be further fine-tuned to optimize it, for example, based on highly conserved amino acids or amino acid motifs among GPCRs.
- operable linkage between a control region such as a promoter and a gene means that the gene and the control region are linked so that the gene can be expressed under the control of the control region. means. Procedures for "operably linking" genes and control regions are well known to those skilled in the art.
- upstream and downstream with respect to a gene refer to upstream and downstream of the gene in the transcription direction.
- a gene located downstream of a promoter means that the gene is located on the 3' side of the promoter in the DNA sense strand
- upstream of the gene means that the gene is located on the 5' side of the promoter on the DNA sense strand. means the area on the side.
- homolog refers to homologous genes derived from a common ancestor.
- Ortholog is also called “ortholog” and refers to a homologue that diverged during speciation, exists in different biological species, and has the same or similar functions.
- the ortholog used in the present invention may be a GPCR gene of a different biological species from the biological species from which the GPCR of interest is derived, which includes the same name as the GPCR gene of interest, among homologous genes of the GPCR gene of interest.
- an ortholog is a GPCR gene that has a high degree of homology to the GPCR gene of interest in the certain biological species, preferably the highest homology. It can be a GPCR gene with a sex. Alternatively, it may be a GPCR gene that is known to be an ortholog of the GPCR gene of interest in the certain biological species. In another example, the ortholog used in the present invention may be a GPCR gene among the above-mentioned orthologs for which phylogenetic tree analysis suggests that the gene may have diverged during speciation.
- GPCRs G protein-coupled receptors
- the present inventors have diligently studied methods that can efficiently express GPCRs. As a result, the present inventors found that the membrane expression of GPCRs in cultured cells could be improved compared to the original GPCRs by consensus formation of GPCRs. Until now, there is no known example of consensus on GPCRs other than olfactory receptors.
- the present invention provides a method that can efficiently express GPCR. Use of such GPCRs can contribute to elucidation of GPCR functions and identification of function-regulating agents.
- the present inventor converted the amino acid sequence of a human GPCR into a consensus amino acid sequence derived from the amino acid sequence of the human GPCR and the amino acid sequence of a GPCR encoded by a specific ortholog of the human GPCR.
- the resulting GPCR polypeptide was expressed in cells, it was found that the membrane expression of the GPCR polypeptide in cells was increased compared to the human GPCR before modification (Table 7, Figure 1 ). That is, the GPCR polypeptide has improved stability during expression compared to human GPCR before modification.
- a GPCR before modification is referred to as an "original GPCR”
- modifying the amino acid sequence of a GPCR based on a consensus amino acid sequence is referred to as “consensusizing”
- a GPCR that has been made into a consensus is referred to as a “consensus GPCR.” ” or “modified GPCR polypeptide.”
- the invention provides methods for expressing GPCR polypeptides. Since the expression method of the present invention makes it possible to improve GPCR expression (eg, increase expression, stabilize expression), the method is preferably a method for improving expression of a GPCR polypeptide. This method involves injecting into cells a GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence in which at least one amino acid residue different from the consensus amino acid sequence in the amino acid sequence of the GPCR of interest is modified to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position. wherein the consensus amino acid sequence is an amino acid sequence derived from an alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of a GPCR encoded by an orthologue of the GPCR of interest in a vertebrate. be.
- the target GPCR is not particularly limited and may be a GPCR of any biological species, preferably a mammalian GPCR, and more preferably a human GPCR.
- the target GPCR may be a GPCR whose function can be analyzed using cultured cells using conventional methods, or an inefficient GPCR, but the method of the present invention can be performed using cultured cells using conventional methods. Functional analysis is more suitably applied to inefficient GPCRs.
- the GPCR encoded by an ortholog of the GPCR of interest in a vertebrate is preferably a GPCR selected from GPCRs encoded by an ortholog of the GPCR of interest in mammals, birds, reptiles, amphibians, and fish. More preferably, it is a GPCR selected from GPCRs encoded by orthologs of the GPCR of interest in mammals, birds, reptiles, and amphibians, and even more preferably a GPCR encoded by orthologs of the GPCR of interest in mammals.
- the ortholog is not particularly limited, but the more homologous it is to the target GPCR gene, the more preferable it is.
- mammals refers to biological species belonging to the phylum Mammalia of vertebrates, and approximately 5,500 species are known to exist. Mammals include humans, chimpanzees, bonobos, gorillas, Sumatran orangutans, northern white gibbons, drills, gelada baboons, rhesus macaques, Anubis baboons, sooty mangabeys, green monkeys, gray red colobus, Angora colobus, garnet galagos, gray rat lemurs, and cockerels.
- Birds include, but are not limited to, chickens, ducks, ducks, geese, turkeys, ostriches, pheasants, pigeons, parrots, canaries, white pine, hummingbirds, bluebirds, quail, flycatchers, and the like.
- Reptiles (Reptilia) refer to biological species belonging to the vertebrate phylum Reptilia.
- Reptiles include, but are not limited to, turtles, lizards, crocodiles, iguanas, chameleons, geckos, snakes, and the like.
- Amphibia refers to biological species belonging to the vertebrate phylum Amphibia.
- Amphibians include, but are not limited to, frogs, newts, salamanders, and the like.
- Fish is a general term referring to species belonging to the vertebrate phylum Hagfish, Lamprey, Chondrichthyes, and Osteichthyes.
- Examples of fish include, but are not limited to, hagfish, lamprey, shark, ray, tuna, bonito, salmon, trout, cod, sea bream, flounder, yellowtail, horse mackerel, and mackerel.
- the ortholog of the GPCR of interest in a vertebrate is a gene that has the same name as the GPCR gene of interest among GPCR genes possessed by biological species belonging to vertebrates.
- Such an ortholog can be selected, for example, by the following procedure. Using the amino acid sequence of the GPCR of interest as a query sequence, a database search is performed against a known database using NCBI's BLAST or the like. From the resulting homologous gene group (e.g., top 500 genes, preferably top 250 genes, more preferably top 100 genes, even more preferably top 50 genes), select genes that have the same name as the target GPCR gene. .
- a gene encoding a GPCR having a certain amino acid sequence identity, for example, 65% or more amino acid sequence identity with the GPCR of interest is selected.
- a plurality of genes derived from the same biological species are selected as orthologs, only one gene having the highest homology to the target GPCR gene may be selected.
- the target GPCR is a human GPCR and multiple genes of a species other than humans are selected as orthologs, select the gene of the species that has the highest homology to the target human GPCR gene. good.
- a gene with a high degree of homology to the GPCR gene of interest in the certain biological species may be used as an ortholog. Genes with homology may be selected. Alternatively, a gene known to be an ortholog of the GPCR gene of interest in the certain biological species may be selected.
- the number of types of GPCRs encoded by orthologs of the target GPCR in vertebrates is at least 2 types, preferably at least 5 types, more preferably at least 11 types, and still more preferably at least The number of types is 15, more preferably at least 30, and even more preferably 100.
- the upper limit of the number of types is the total number of orthologs of the target GPCR in vertebrates, and the number of types is preferably 500 or less, more preferably 400 or less, and still more preferably 300 or less in terms of the number of receptors. It is below the type.
- the number of types of GPCRs encoded by orthologs of the GPCR of interest in vertebrates is, in terms of the number of receptors, for example, from 2 types to all types of orthologs of the GPCR of interest in vertebrates, and from 5 types to all types of orthologs of the GPCR of interest in vertebrates. All types of orthologs, 11 types - All types of orthologs of the target GPCR in vertebrates, 5 to 500 types, 5 to 400 types, 5 to 300 types, 11 to 500 types, 11 to 400 types, 11 to 300 types, There may be 15 to 300 types, 30 to 300 types, or 100 to 300 types.
- the "consensus amino acid sequence” is an amino acid sequence derived from the alignment of the amino acid sequence of a GPCR of interest and the amino acid sequence of a GPCR encoded by an ortholog of the GPCR of interest in vertebrates.
- the "consensus amino acid sequence” refers to the following criteria (i) to (iii) based on the alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of the GPCR encoded by the ortholog of the GPCR of interest in vertebrates. This is an amino acid sequence consisting of consensus residues identified according to the following.
- the consensus residue closest to the N-terminus is the consensus residue at a position corresponding to the N-terminus of the target GPCR. If it is not a methionine residue, go back one amino acid position to the N-terminus from the consensus residue position in the alignment, and select the most frequently occurring amino acid residue as the consensus residue until a methionine residue appears. If two or more types of amino acid residues are identified and appear most frequently, the amino acid residue with the smallest molecular weight among the amino acid residues is identified as the consensus residue.
- frequency of appearance refers to the number of occurrences of a specific amino acid residue at each amino acid position in an alignment of amino acid sequences expressed as a percentage of the number of amino acid sequences subjected to the alignment. Alignment of amino acid sequences can be performed using known algorithms.
- Criteria (i) (ii) are based on the amino acid residues in the GPCR of interest at certain amino acid positions in the alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of the GPCR encoded by the ortholog of the GPCR of interest in vertebrates. This is the standard when . At this time, if there is one type of amino acid residue that is different from the amino acid residue of the target GPCR and has an appearance frequency of 50% or more, the amino acid residue that has an appearance frequency of 50% or more is identified as the consensus residue at the position.
- Criteria (i) (i-ii) are based on the amino acid residues in the GPCR of interest at certain amino acid positions in the alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of the GPCR encoded by the ortholog of the GPCR of interest in vertebrates. This is the standard when . At this time, if there are two types of amino acid residues with an appearance frequency of 50%, one of the two types of amino acid residues is always the amino acid residue of the target GPCR, and the amino acid residue of the target GPCR is Identify consensus residues.
- Criteria (i) are based on the amino acid residues in the GPCR of interest at certain amino acid positions in the alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of the GPCR encoded by the ortholog of the GPCR of interest in vertebrates. This is the standard when . At this time, if no amino acid residue exists with an appearance frequency of 40% or more, it is determined that there is no consensus residue at that position. On the other hand, if the frequency of occurrence of no amino acid residue is less than 40%, if the above occurrence of no amino acid residue is less than 40%, if the above criterion (ii) is met, the consensus residue at the position is identified according to the criterion, and if it is not applicable, the criterion (ii) is identified. iv) to identify the amino acid residue of the GPCR of interest as the consensus residue at the position.
- Criteria (i) (i-iv) are the amino acid residues in the GPCR of interest at certain amino acid positions in the alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of the GPCR encoded by the ortholog of the GPCR of interest in vertebrates. This is the standard when there is no such thing. At this time, if there is an amino acid residue with an appearance frequency of 60% or more, the amino acid residue with the highest appearance frequency is identified as the consensus residue at the position, and if two or more types of amino acids with the highest appearance frequency exist, , the amino acid residue with the smallest molecular weight among the most frequently occurring amino acids is identified as the consensus residue.
- the one type of amino acid residue is identified as the consensus residue at the position, and if there are two or more types of amino acid residues that appear most frequently, Among them, the amino acid residue with the smallest molecular weight may be identified as the consensus residue at the position.
- the length of the consensus amino acid sequence of the target may be a methionine residue, and the consensus residue on the N-terminal side of the methionine residue may be changed to none. That is, the N-terminal structure of the GPCR of interest may be maintained as it is.
- the amino acid residue of the GPCR of interest is identified as the consensus residue at the position according to criteria (iv). That is, it is determined that there is no amino acid residue at that position.
- Criterion (ii) is when a consensus residue is identified at each amino acid position in the alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of the GPCR encoded by the ortholog of the GPCR of interest in vertebrates according to criterion (i) above.
- the consensus residue located closest to the N-terminus among the consensus residues is a consensus residue at a position corresponding to the N-terminus of the target GPCR or the C-terminus thereof, and is not a methionine residue. be.
- the consensus residue at the position closest to the N-terminus is The consensus residue on the N-terminal side of the consensus residue consisting of a methionine residue is changed to no consensus residue.
- the terminal consensus residue may be changed to a consensus residue consisting of a methionine residue.
- the most N-terminal consensus residue among the consensus residues before the change is asparagine, serine, or threonine involved in sugar chain modification and/or membrane translocation, from the viewpoint of maintaining the structure of the GPCR, Among the consensus residues before the change, the consensus residue closest to the N-terminus is not changed, and the amino acid residue of the target GPCR that is closer to the N-terminus than the position corresponding to the consensus residue is used as a consensus residue. good. That is, the N-terminal structure of the GPCR of interest may be maintained as it is.
- Criterion (iii) is when a consensus residue is identified at each amino acid position in the alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of the GPCR encoded by the ortholog of the GPCR of interest in vertebrates according to criterion (i) above. This is a standard when the most N-terminal consensus residue is a consensus residue at a position corresponding to the N-terminal side of the target GPCR and is not a methionine residue. At this time, the N-terminal consensus residue position is N The alignment is confirmed by going back one amino acid position to the terminal side, and the most frequently occurring amino acid residue is identified as the consensus residue until the methionine residue appears, and the most frequently occurring amino acid residue is identified as the 2nd amino acid residue. If more than one type of amino acid residue exists, the amino acid residue with the smallest molecular weight among the amino acid residues is identified as the consensus residue.
- the amino acid sequence consisting of the consensus residues thus identified is the consensus amino acid sequence.
- the GPCR polypeptide used in the present invention is derived from an amino acid sequence in which at least one amino acid residue different from the consensus amino acid sequence in the amino acid sequence of the GPCR of interest is changed to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position.
- This is a modified GPCR polypeptide.
- “modification” is a concept that includes any of substitution, deletion, addition, and insertion. Differences between the amino acid sequence of the target GPCR and the consensus amino acid sequence can be found, for example, by aligning the amino acid sequences using a known algorithm and comparing both amino acid sequences.
- the amino acid residue at a certain amino acid position in the amino acid sequence of the GPCR of interest is different from the amino acid residue at the corresponding position in the consensus amino acid sequence. If so, the amino acid residues of the GPCR of interest may be replaced with amino acid residues of the consensus amino acid sequence.
- the amino acid sequence of the target GPCR is compared with the consensus amino acid sequence, and if an amino acid residue does not exist in the consensus amino acid sequence at a position corresponding to a certain amino acid position in the target GPCR's amino acid sequence, the amino acid sequence of the target GPCR is What is necessary is to delete the amino acid residue at the position.
- the amino acid sequence of the target GPCR and the consensus amino acid sequence are compared, and if an amino acid residue exists in the consensus amino acid sequence at a position corresponding to a position where no amino acid residue exists in the target GPCR's amino acid sequence, the target GPCR The amino acid residue of the consensus amino acid sequence may be inserted into the amino acid position.
- compare the amino acid sequence of the target GPCR with the consensus amino acid sequence and if the consensus amino acid sequence has a longer N-terminus than the amino acid sequence of the target GPCR, add the consensus amino acid sequence to the N-terminus of the target GPCR. It is only necessary to add the N-terminal portion that exists only in the N-terminal portion.
- the number of amino acid residues to be modified in the amino acid sequence of the GPCR of interest is at least 1, preferably at least 5, and more preferably at least 10, and the number of amino acid residues to be modified in the amino acid sequence of the GPCR of interest is at least 1, preferably at least 5, and more preferably at least 10. It is further preferred that all of the different amino acid residues be modified to the amino acid residues of the consensus amino acid sequence at their corresponding positions (ie, the amino acid sequence of the GPCR of interest is modified to the consensus amino acid sequence).
- the number of amino acid residues that are altered in the amino acid sequence of the GPCR of interest is preferably at least 10%, more preferably at least 30%, still more preferably at least 50%, even more preferably may be at least 70%, more preferably at least 90%, even more preferably 100% (ie, the amino acid sequence of the GPCR of interest is modified to a consensus amino acid sequence).
- the N-terminus of the consensus amino acid sequence is longer than the amino acid sequence of the target GPCR, the N-terminus that exists only in the consensus amino acid sequence can be integrated into the N-terminus of the amino acid sequence of the target GPCR, regardless of the number of amino acid residues.
- the N-terminus of the consensus amino acid sequence is shorter than the amino acid sequence of the target GPCR, regardless of the number of amino acid residues, the N-terminal part that exists only in the amino acid sequence of the target GPCR is Preferably, the modification is carried out by deletion as a whole. If the C-terminus of the consensus amino acid sequence is longer than the amino acid sequence of the target GPCR, the C-terminal part that exists only in the consensus amino acid sequence is added as a unit to the C-terminus of the amino acid sequence of the target GPCR, regardless of the number of amino acid residues. It is preferable to modify it by doing so.
- the C-terminal portion that exists only in the amino acid sequence of the GPCR of interest can be extracted from the C-terminus of the amino acid sequence of the GPCR of interest, regardless of the number of amino acid residues.
- the modification is carried out by deletion as a whole.
- the GPCR polypeptide used in the present invention has one to several amino acid positions (for example, 1 to 10, 1 to Also included in the invention are polypeptides containing substitutions, deletions, additions or insertions of 5, 1 to 3 amino acid residues.
- the GPCR polypeptide is represented by SEQ ID NO. (3) in the amino acid sequence shown by SEQ ID NO. (2) of GPCR (1) in Tables 1-1 and 1-2 below. It consists of an amino acid sequence in which at least one amino acid residue that differs from the consensus amino acid sequence is changed to the corresponding amino acid residue of the consensus amino acid sequence.
- the GPCR polypeptide is a GPCR polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in any of SEQ ID NOs: 108 to 214 and 275 to 312 in (3) of Tables 1-1 and 1-2 below, or This is a combination of a GPCR polypeptide consisting of the amino acid sequence shown by SEQ ID NO: 112 or 113 in (3) of 1-1 and a GPCR polypeptide consisting of the amino acid sequence shown by SEQ ID NO: 114.
- GPCR polypeptides consisting of the amino acid sequences shown by any of SEQ ID NOs: 108-112, 114-120, 138-145, 167, 183, 187, 192, and 209 have lower membrane expression than the original GPCR. Highly improved.
- No. GPCRs 1 to 145 (1) are human GPCRs, and have Accession No. is Accession No. in GenBank. shows.
- a GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence modified to the amino acid residue of the consensus amino acid sequence is a vomeronasal receptor polypeptide.
- the vomeronasal receptor polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 108 to 111 in (3) is No.
- a GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence with modified amino acid residues forms an umami receptor complex. Also, No. In the amino acid sequence shown in SEQ ID NO. (2) of the GPCR in (1) of 6, at least one amino acid residue different from the consensus amino acid sequence shown in SEQ ID NO. A GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence with modified amino acid residues, and No. In the amino acid sequence shown by SEQ ID NO. (2) of the GPCR in (1) of 7, at least one amino acid residue different from the consensus amino acid sequence shown by SEQ ID NO. A GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence with modified amino acid residues forms a sweet taste receptor complex. On the other hand, No. In the amino acid sequence shown by SEQ ID NO.
- GPCR 8 to 30 (1) at least one amino acid residue different from the consensus amino acid sequence shown by SEQ ID NO.
- a GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence modified to the amino acid residue of the consensus amino acid sequence is a bitter taste receptor polypeptide.
- the taste receptor polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 112 to 137 in (3) is No. From the amino acid sequence of the taste receptor in (1) shown in any one of SEQ ID NOs: 5 to 30 in (2) and the amino acid sequence of the taste receptor encoded by the ortholog of the taste receptor in vertebrates. It is a consensus taste receptor consisting of a derived consensus amino acid sequence.
- the trace amine-related receptor polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in any of SEQ ID NOs: 138 to 143 in (3) is No. 31-36, encoded by the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 31-36 (2) of the trace amine-related receptor polypeptide of (1) and the orthologue of the trace amine-related receptor polypeptide in vertebrates.
- the trace amine-related receptor polypeptide consisting of the amino acid sequence shown by SEQ ID NO: 143 is based on the consensus obtained by maintaining the N-terminal structure of the target trace amine-related receptor polypeptide in accordance with the above criterion (ii). It is a consensus trace amine-related receptor consisting of an amino acid sequence.
- a GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence modified to the amino acid residue of the consensus amino acid sequence is a Mas-related G protein-coupled receptor polypeptide.
- the Mas-related G protein-coupled receptor polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in any one of SEQ ID NOs: 144 to 153 in (3) is No.
- GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence modified to the amino acid residue of the consensus amino acid sequence is a GPR polypeptide.
- the GPR polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in any of SEQ ID NOs: 154 to 214 and 275 in (3) is No.
- Consensus amino acids derived from the amino acid sequence of GPR shown in any of SEQ ID NOs: 47-107 and 237 of (2) of GPR 47-108 (1) and the amino acid sequence of GPR encoded by the orthologue of the GPR in vertebrates It is a consensus GPR consisting of a sequence.
- GPCR polypeptides consisting of amino acid sequences modified with amino acid residues of the consensus amino acid sequence include vomeronasal receptor polypeptides, taste receptor polypeptides, trace amine-related receptor polypeptides, and Mas-related G protein-coupled receptor polypeptides. peptides, GPR polypeptides, and other GPCR polypeptides other than olfactory receptor polypeptides.
- the GPCR polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in any of SEQ ID NOs: 276 to 312 in (3) is No. From the consensus amino acid sequence derived from the amino acid sequence shown in any of SEQ ID NOs: 238 to 274 of (2) of the GPCR of (1) of 109 to 145 and the amino acid sequence of the GPCR encoded by the ortholog of the GPCR in vertebrates. It is a consensus GPCR.
- “Expression” of the GPCR polypeptide of the present invention means that a translation product is produced from the polynucleotide encoding the polypeptide, and that the translation product is functionally localized in the cell membrane, which is the site of its action.
- the GPCR polypeptide of the present invention may be expressed in cells by techniques known in the art.
- a GPCR polypeptide can be prepared by introducing a vector containing a polynucleotide encoding the polypeptide into a host cell, or by inserting a DNA fragment containing a polynucleotide encoding the polypeptide into the genome of a host cell. By introducing it, it can be expressed in the cell membrane of the cell.
- the GPCR polypeptide is expressed in the cell membrane of a host cell by transforming the host cell with a vector containing a polynucleotide encoding the polypeptide.
- the host cell may be any cell that can functionally express the foreign GPCR. Examples of specific cells include human embryonic kidney cells (HEK293 cells), Chinese hamster cells (CHO cells), monkey cells (COS cells), isolated olfactory nerve cells, Xenopus oocytes, insect cells, and yeast. or bacteria, but is not limited thereto.
- Polynucleotides encoding GPCR polypeptides can be obtained using various mutagenesis techniques known in the art. For example, in a polynucleotide encoding a GPCR polypeptide of interest, the nucleotide sequence encoding the amino acid residue to be modified is replaced with the nucleotide sequence encoding the modified amino acid residue. It can be obtained by modification.
- Introduction of a desired mutation into a polynucleotide encoding the amino acid sequence of a GPCR of interest can be performed using various site-directed mutagenesis methods well known to those skilled in the art.
- the site-directed mutagenesis method can be performed by any method such as inverse PCR method or annealing method.
- Commercially available site-directed mutagenesis kits for example, Stratagene's QuickChange II Site-Directed Mutagenesis Kit, QuickChange Multi Site-Directed Mutagen) esis Kit, etc. can also be used.
- a polynucleotide encoding a GPCR polypeptide can also be obtained by genome editing using artificial DNA nucleases or programmable nucleases, DNA synthesis based on the nucleotide sequence, etc.
- a polynucleotide encoding a GPCR polypeptide may include single-stranded or double-stranded DNA, cDNA, RNA, or other artificial nucleic acids.
- the DNA, cDNA and RNA may be chemically synthesized.
- the polynucleotide may also include an untranslated region (UTR) nucleotide sequence in addition to the open reading frame (ORF).
- UTR untranslated region
- ORF open reading frame
- the codons of the polynucleotide may be optimized depending on the type of cell for expressing the GPCR. Information on codons used by various organisms is available from Codon Usage Database ([www.kazusa.or.jp/codon/]).
- a polynucleotide encoding a GPCR polypeptide consists of a base sequence shown by any of SEQ ID NOs: 215-234 and 313-317.
- the polynucleotides encode GPCR polypeptides consisting of the amino acid sequences shown in SEQ ID NOs: 108-112, 114-120, 138-145, 167, 183, 187, 192 and 209, respectively.
- the obtained polynucleotide encoding the GPCR polypeptide can be incorporated into a vector or a DNA fragment.
- the vector is an expression vector.
- the vector is an expression vector capable of introducing a GPCR polynucleotide into a host cell and expressing the polynucleotide within the host cell.
- the vector may be a vector capable of autonomous propagation and replication outside the chromosome, such as a plasmid, or a vector that is integrated into the chromosome.
- a specific example of a vector includes, but is not limited to, pME18S.
- the vector preferably includes a polynucleotide encoding a GPCR polypeptide and a control region operably linked thereto.
- the control region is a sequence for expressing a polynucleotide encoding the introduced GPCR polypeptide in a host cell into which the vector has been introduced, and includes, for example, an expression control region such as a promoter or terminator, a transcription start point, etc. Examples include.
- the type of control region can be appropriately selected depending on the type of vector. If necessary, the vector or DNA fragment may further have a drug resistance gene such as ampicillin as a selection marker.
- the control region and selection marker gene may be used as originally contained in the vector, or may be integrated into the vector together with or separately from the polynucleotide encoding the GPCR polypeptide.
- DNA fragments containing polynucleotides encoding GPCR polypeptides include PCR-amplified DNA fragments and restriction enzyme-cleaved DNA fragments.
- the DNA fragment may be an expression cassette comprising the polynucleotide and a control region operably linked thereto. Examples of control regions that can be used are similar to those for vectors.
- a polynucleotide encoding an RTP (receptor-transporting protein) (herein also referred to as an RTP gene) is preferably used together with a polynucleotide encoding the GPCR polypeptide.
- RTP receptor-transporting protein
- a polynucleotide encoding a REEP receptor expression enhancing protein
- a vector containing the RTP gene or REEP gene and a polynucleotide encoding a GPCR polypeptide may be constructed and introduced into a host cell, or a vector containing the RTP gene or REEP gene and a polynucleotide encoding a GPCR polypeptide may be constructed. Each vector containing a polynucleotide may be introduced into a host cell.
- RTPs include RTP1S, RTP3 and RTP4, and examples of RTP1S include human RTP1S.
- RTP1S Human RTP1S is registered as AY562235 in GenBank, and is a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 236, encoded by a gene having the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 235.
- REEP include REEP1 and REEP2, an example of REEP1 is human REEP1, and an example of REEP2 is human REEP2.
- transformation methods commonly used for mammalian cells such as electroporation, lipofection, and particle gun methods, can be used.
- Transformed cells into which the desired vector or DNA fragment has been introduced can be selected using a selection marker.
- introduction of the target vector or DNA fragment can also be confirmed by examining the DNA sequence of the cell.
- the GPCR polypeptide of the present invention is produced from the polynucleotide encoding the GPCR polypeptide of the present invention contained in the vector or DNA fragment introduced into the cell in the above procedure, and is incorporated into the cell membrane.
- a GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention is expressed in the cell membrane of a transformed cell that has been genetically engineered to express the GPCR polypeptide.
- Cell membrane expression (amount) of the GPCR polypeptide of the present invention can be measured, for example, by a flow cytometry method using a tag such as a FLAG tag fused to the GPCR polypeptide in advance and using an antibody that specifically recognizes the tag. It can be measured by a known method.
- the invention provides a method for measuring the response of a GPCR of interest.
- the method includes measuring the response of a GPCR polypeptide expressed by the GPCR polypeptide expression method of the present invention. According to the response measurement method of the present invention, it is possible to improve the response measurement efficiency of the target GPCR, and it is possible to measure the response of the target GPCR, which has conventionally been unable to be functionally analyzed due to insufficient expression in the cell membrane of cultured cells. Make it.
- the GPCR polypeptide used in the response measurement method of the present invention may be any GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention.
- the GPCR polypeptide is as described above.
- Specific examples of the GPCR polypeptide preferably include a GPCR polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in any of SEQ ID NOs: 108 to 214 and 275 to 312, or a GPCR polypeptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 112 or 113.
- Examples include a combination of a polypeptide and a GPCR polypeptide consisting of the amino acid sequence shown by SEQ ID NO: 114.
- the GPCR polypeptide can be used in any form as long as it does not lose responsiveness to the ligand.
- the GPCR polypeptide can be used in a transformed cell expressing the GPCR polypeptide or a culture thereof, a membrane of the transformed cell having the GPCR polypeptide, an artificial lipid bilayer membrane having the GPCR polypeptide, etc. It can be used in any form.
- a transformed cell expressing the GPCR polypeptide or a culture thereof is used as the GPCR polypeptide.
- the response of a GPCR polypeptide may be measured by any method known in the art as a method for measuring a GPCR response.
- it may be carried out by a method of directly or indirectly measuring the amount of intracellular cAMP.
- a G protein-coupled receptor when activated by a ligand, it couples with the intracellular G protein ⁇ subunit classified into the Gs family or the G protein ⁇ subunit classified into the Gi family to produce adenylate. It is known that activating or inhibiting cyclase changes the amount of intracellular cAMP.
- G protein-coupled receptors when activated by a ligand, they also couple with proteins belonging to the Gq family, such as G ⁇ q, G ⁇ 16, and G ⁇ 15, within cells, and can also increase the amount of calcium ions within the cells. Therefore, the response of a GPCR polypeptide can be measured by using the amount of intracellular calcium ions or the behavior of downstream molecules activated through them as indicators. Examples of methods for measuring the amount of cAMP include ELISA method and reporter gene assay. Examples of methods for measuring calcium ion concentration include calcium imaging method and TGF ⁇ shedding assay. TGF ⁇ shedding assay is also effective for measuring the signal when GPCR is coupled with G ⁇ 12 and G ⁇ 13 in cells.
- G ⁇ 15 G ⁇ 15/i3, G ⁇ 15/gust
- G ⁇ i3 G ⁇ 15/gust
- signals originating from activated taste receptors can be transferred to the original intracellular state. This can be detected not as a decrease in the amount of cAMP but as an increase in intracellular calcium ion concentration.
- a GPCR polypeptide may be purified from cells in which the GPCR polypeptide is expressed according to the present invention, and then its binding property with a ligand may be evaluated. The binding of a purified GPCR polypeptide to a ligand may be evaluated by any method known in the art. Examples include a method of measuring the amount of heat generated from a GPCR polypeptide under conditions of addition of a ligand, and a method of evaluating changes in thermal stability of a GPCR polypeptide.
- the GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention can be expressed more efficiently on cultured cell membranes than the original GPCR, and the response of the GPCR polypeptide is higher than that of the original GPCR. Therefore, the ligand of the original GPCR can be searched for using the GPCR polypeptide. Therefore, in another aspect, the present invention provides a method for searching for a ligand for a GPCR of interest. The method includes measuring the response of a GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention in the presence of a test substance, and selecting a test substance to which the GPCR polypeptide responded.
- the ligand search method of the present invention it is possible to improve the efficiency of ligand search for a target GPCR, and it becomes possible to search for a ligand for a target GPCR, which has conventionally been unable to be functionally analyzed due to insufficient expression on the cell membrane of cultured cells. do.
- test substance used in the ligand search method of the present invention is not particularly limited as long as it is a substance for which it is desired to confirm whether it is a ligand of the target GPCR.
- the test substance may be a naturally occurring substance, an artificially synthesized substance such as by chemical or biological methods, or a compound, composition or mixture. good.
- the GPCR polypeptide and its form used in the ligand search method of the present invention are the same as the GPCR polypeptide and its form used in the response measurement method of the present invention.
- a test substance is applied to the GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention.
- Means for applying a test substance to a GPCR polypeptide include, but are not particularly limited to, a method of adding a test substance to a medium in which cells expressing the GPCR polypeptide are cultured.
- the response of the GPCR polypeptide to the test substance is measured.
- a technique similar to the response measuring method of the present invention can be used.
- test substance is evaluated based on the measured GPCR polypeptide response.
- a test substance that elicits a response of the GPCR polypeptide can be determined to be a ligand of the GPCR polypeptide, ie, a ligand of the original GPCR. Therefore, in the ligand search method of the present invention, the test substance to which the GPCR polypeptide responded is selected as the original GPCR ligand.
- the response of a GPCR polypeptide to a test substance can be evaluated by comparing the response of a GPCR polypeptide to which the test substance has been added (test group) with the response of the GPCR polypeptide in a control group.
- Control groups include the GPCR polypeptide to which no test substance has been added, the GPCR polypeptide to which a control substance has been added, the GPCR polypeptide to which a lower concentration of the test substance has been added, and the GPCR polypeptide before adding the test substance. Polypeptides, etc. can be mentioned. If the response in the test group is higher compared to the control group, the GPCR polypeptide is evaluated to have responded to the test substance, and the test substance is selected as a ligand of the original GPCR.
- the response of a GPCR polypeptide in the presence and absence of a test substance is measured, and then the response in the presence of a test substance is determined in the absence of a test substance. It is determined whether the response is higher than that in the presence of the target. If the response is higher in the presence of the test substance, the test substance is selected as a ligand.
- the response intensity of the GPCR polypeptide in the presence of the test substance is preferably 120% or more, more preferably 150% or more, and still more preferably 200% or more compared to the absence of the test substance. If so, the test substance is selected as a ligand of the original GPCR. In another preferred embodiment, if the response intensity of the GPCR polypeptide in the presence of the test substance is statistically significantly increased compared to the absence of the test substance, then the test substance selected as a GPCR ligand.
- the GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention can be expressed more efficiently on cultured cell membranes than the original GPCR, and the response of the GPCR polypeptide is similar to that of the original GPCR. Therefore, the GPCR polypeptide can be used to evaluate and/or select a substance that controls the recognition of a ligand in the original GPCR. Therefore, in another aspect, the present invention provides a method for evaluating and/or selecting a regulator of recognition of a ligand of a GPCR of interest. The method includes adding a test substance and a target ligand to a GPCR polypeptide expressed by the expression method of the invention, and measuring the response of the GPCR polypeptide to the ligand.
- vomeronasal receptors are thought to function as pheromone receptors, so when using a vomeronasal receptor polypeptide as a GPCR polypeptide, the ligand preferably includes a pheromone substance.
- the ligand when a taste receptor polypeptide is used as the GPCR polypeptide, the ligand preferably includes a taste substance (a bitter substance, an umami substance, or a sweet substance).
- a ligand selected by the ligand search method of the present invention is preferable. According to the method for evaluating and/or selecting a control agent of the present invention, it is possible to efficiently evaluate or select a substance that can selectively suppress or enhance recognition of a target ligand.
- control agent of the present invention can be a method carried out in vitro or ex vivo.
- test substance used in the method for evaluating and/or selecting a control agent of the present invention is not particularly limited as long as it is a substance desired to be used as a control agent for target ligand recognition.
- the test substance may be a naturally occurring substance, a substance artificially synthesized by chemical or biological methods, or a compound, composition, or mixture. good.
- the GPCR polypeptide and its form used in the method for evaluating and/or selecting a control agent of the present invention are the same as the GPCR polypeptide and its form used in the response measurement method of the present invention.
- a test substance and a target ligand are applied to the GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention.
- Means for applying a test substance and a target ligand to a GPCR polypeptide include, but are not particularly limited to, a method of adding a test substance and a target ligand to a medium in which cells expressing the GPCR polypeptide are cultured.
- the response of the GPCR polypeptide to the ligand is measured.
- a technique similar to the response measuring method of the present invention can be used.
- a test substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the ligand is detected.
- the detected test substance is selected as an inhibitor of recognition of the ligand.
- a test substance that enhances the response of the GPCR polypeptide to the ligand is detected based on the measured response.
- the detected test substance is selected as an enhancer of recognition of the ligand.
- a test substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the ligand is selected as an inhibitor of recognition of the ligand.
- a test substance that enhances the response of the GPCR polypeptide to the ligand is selected as an enhancer of recognition of the ligand.
- the effect of the test substance on the response of the GPCR polypeptide to the ligand is, for example, the response of the GPCR polypeptide to which the test substance has been added (test group) to the ligand, and the response of the control group to the ligand.
- control groups include the GPCR polypeptide without the test substance added, the GPCR polypeptide with the control substance added, the GPCR polypeptide with a lower concentration of the test substance added, and the GPCR polypeptide before adding the test substance.
- examples include the GPCR polypeptide, cells in which the GPCR polypeptide is not expressed, and the like.
- the method for evaluating and/or selecting an inhibitor of the present invention includes measuring the activity of the GPCR polypeptide toward the ligand in the presence and absence of a test substance.
- the test substance is used as a substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the target ligand, i.e., suppresses the response of the original GPCR to the ligand.
- the response of the GPCR polypeptide in the test group is suppressed to preferably 60% or less, more preferably 50% or less, even more preferably 25% or less compared to the control group, then the test substance is It can be identified as a substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the ligand, ie, a substance that suppresses the response of the original GPCR to the ligand.
- the test substance can be replaced with a substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the ligand. That is, it can be identified as a substance that suppresses the original GPCR response to the ligand.
- the test substance could be used as a substance that enhances the response of the GPCR polypeptide to the target ligand, i.e., the response of the original GPCR to the ligand. It can be identified as an enhancing substance.
- the response of the GPCR polypeptide in the test group is enhanced by preferably 120% or more, more preferably 150% or more, even more preferably 200% or more compared to the control group, then the test substance is It can be identified as a substance that enhances the response of the GPCR polypeptide to the ligand, ie, a substance that enhances the response of the original GPCR to the ligand.
- the test substance can be replaced with a substance that enhances the response of the GPCR polypeptide to the ligand. That is, it can be identified as a substance that enhances the response of the original GPCR to the ligand.
- the GPCR polypeptide is a vomeronasal receptor polypeptide expressed by the expression method of the present invention
- the ligand of the GPCR of interest is a pheromone substance.
- a pheromone suppressor or a pheromone enhancer is evaluated and/or selected as a regulator of ligand recognition.
- the GPCR polypeptide is an umami receptor polypeptide (a combination of consensus TAS1R1 and consensus TAS1R3) expressed by the expression method of the present invention.
- the target GPCR ligand is an umami substance, and an umami suppressor or an umami enhancer is evaluated and/or selected as an agent for controlling ligand recognition.
- the GPCR polypeptide is a sweet taste receptor polypeptide (a combination of consensus TAS1R2 and consensus TAS1R3) expressed by the expression method of the present invention.
- the target GPCR ligand is a sweet substance, and a sweet taste suppressor or a sweet taste enhancer is evaluated and/or selected as a control agent for ligand recognition.
- the GPCR polypeptide is a bitter taste receptor polypeptide expressed by the expression method of the present invention
- the target GPCR ligand is a bitter taste substance.
- a bitter taste suppressor or bitter taste enhancer is evaluated and/or selected as a regulator of ligand recognition.
- the test substance identified by the above procedure is a substance that can control the recognition of a target ligand by an individual by controlling the GPCR response to the target ligand. Therefore, the test substance identified by the above procedure can be selected as a regulator of recognition of the ligand.
- a substance selected as a regulator of recognition of a target ligand by the method for evaluating and/or selecting a regulator of the present invention can control recognition of the ligand by controlling the response of GPCR to the ligand.
- the substance selected by the method for evaluating and/or selecting a ligand recognition control agent of the present invention may be an active ingredient of the ligand recognition control agent.
- the substance selected by the method for evaluating and/or selecting a ligand recognition controlling agent of the present invention may be added to a compound or composition for controlling the recognition of the ligand. It can be included as an ingredient.
- the substance selected by the method for evaluating and/or selecting a ligand recognition control agent of the present invention is a compound or compound for producing a ligand recognition control agent or for controlling the ligand recognition. It can be used for the production of compositions. According to the substance, recognition of a target ligand can be suppressed or enhanced.
- the GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention can be expressed more efficiently on cultured cell membranes than the original GPCR, and the response of the GPCR polypeptide is similar to that of the original GPCR. Therefore, the taste of the test substance can be evaluated using a taste receptor polypeptide as the GPCR polypeptide. Accordingly, in another aspect, the present invention provides a method for evaluating taste. The method includes adding a test substance to a GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention, and measuring the response of the GPCR polypeptide to the test substance, and the method includes the steps of: This is a method that is a body polypeptide. According to the taste evaluation method of the present invention, the taste of a test substance can be evaluated efficiently.
- test substance used in the taste evaluation method of the present invention is not particularly limited as long as it is a substance for which it is desired to confirm the presence or degree of taste (for example, umami, sweetness, or bitterness).
- the test substance may be a naturally occurring substance, an artificially synthesized substance such as by chemical or biological methods, or a compound, composition or mixture. good.
- the GPCR polypeptide and its form used in the taste evaluation method of the present invention are It is similar to
- a test substance is applied to the GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention.
- Means for applying a test substance to a GPCR polypeptide include, but are not particularly limited to, a method of adding a test substance to a medium in which cells expressing the GPCR polypeptide are cultured.
- the taste evaluation method of the present invention following the addition of a test substance to a GPCR polypeptide, the response of the GPCR polypeptide to the test substance is measured.
- a technique similar to the response measuring method of the present invention can be used.
- test substance is evaluated based on the measured GPCR polypeptide response.
- a test substance that causes a response of the GPCR polypeptide can be evaluated as a substance that exhibits a taste (eg, umami, sweetness, or bitterness). The greater the response intensity evoked by a test substance, the greater the degree of taste of the test substance (eg, more umami, more sweet, or more bitter) is evaluated.
- the response of a GPCR polypeptide to a test substance can be evaluated by comparing the response of a GPCR polypeptide to which the test substance has been added (test group) with the response of the GPCR polypeptide in a control group.
- Control groups include the GPCR polypeptide to which no test substance has been added, the GPCR polypeptide to which a control substance has been added, the GPCR polypeptide to which a lower concentration of the test substance has been added, and the GPCR polypeptide before adding the test substance. Polypeptides, etc. can be mentioned. If the response in the test group is higher compared to the control group, the test substance is evaluated as a tastant substance.
- the response of a GPCR polypeptide in the presence and absence of a test substance is measured, and then the response in the presence of a test substance is determined in the absence of a test substance. It is determined whether the response is higher than that in the presence of the target. If the response in the presence of the test substance is higher, the test substance is rated as a tastant substance.
- the response intensity of the GPCR polypeptide in the presence of the test substance is preferably 120% or more, more preferably 150% or more, and still more preferably 200% or more compared to the absence of the test substance. If so, the test substance is evaluated as a substance that exhibits taste. In another preferred embodiment, if the response intensity of the GPCR polypeptide in the presence of the test substance is statistically significantly increased compared to the absence of the test substance, then the test substance has no taste. It is evaluated that the substance exhibits
- the GPCR polypeptide is an umami receptor polypeptide (a combination of consensus TAS1R1 and consensus TAS1R3) expressed by the expression method of the present invention, and the taste to be evaluated is umami. It is.
- the GPCR polypeptide is a sweet taste receptor polypeptide (a combination of consensus TAS1R2 and consensus TAS1R3) expressed by the expression method of the present invention; is sweet.
- the GPCR polypeptide is a bitter taste receptor polypeptide expressed by the expression method of the present invention, and the taste to be evaluated is bitter.
- the GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention can be expressed more efficiently on cultured cell membranes than the original GPCR, and the response of the GPCR polypeptide is similar to that of the original GPCR. Therefore, we used a trace amine-related receptor polypeptide as the GPCR polypeptide to generate a substance that suppresses the odor recognition of the ligand (odorant, specifically, amine) in the original GPCR. can be evaluated and/or selected.
- a substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide causes a change in the ligand response of the GPCR polypeptide, ie, a change in the original GPCR's ligand response, resulting in a change in the ligand response based on receptor antagonism. Odors can be selectively suppressed.
- a substance that enhances the response of the GPCR polypeptide causes a change in the ligand response of the GPCR polypeptide, i.e., a change in the ligand response of the original GPCR, resulting in odor cross-over due to receptor agonism.
- Ligand odor can be selectively suppressed based on adaptation.
- the present invention provides a method for evaluating and/or selecting an odor suppressant for a target GPCR ligand.
- the method includes measuring the response of the GPCR polypeptide after addition of a test substance, and the GPCR polypeptide is a trace amine-related receptor polypeptide. Based on the measured response, a test substance that suppresses or enhances the response of the GPCR polypeptide is detected. The detected test substance is selected as an odor suppressor of the target ligand.
- a test substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide is selected as an odor suppressor of the ligand based on receptor antagonism
- a test substance that enhances the response of the GPCR polypeptide is selected as an odor suppressor based on receptor antagonism.
- a ligand selected by the ligand search method of the present invention is preferable.
- the odor suppressant evaluation and/or selection method of the present invention it is possible to efficiently evaluate or select a substance that can selectively suppress the odor of a target ligand, and the target ligand is Even in the case of a GPCR ligand whose function could not be analyzed due to insufficient expression in the cell membrane, it is possible to evaluate or select a substance that can selectively suppress the odor of the ligand.
- Evaluation and/or selection of the odor suppressant of the present invention can be performed in vitro or ex vivo.
- test substance used in the odor suppressant evaluation and/or selection method of the present invention is not particularly limited as long as it is a substance desired to be used as a target ligand odor suppressant.
- the test substance may be a naturally occurring substance, a substance artificially synthesized by chemical or biological methods, or a compound, composition, or mixture. good.
- the GPCR polypeptide and its form used in the odor suppressant evaluation and/or selection method of the present invention as long as the GPCR polypeptide is a trace amine-related receptor polypeptide, it can be used in the response measurement method of the present invention.
- the GPCR polypeptide used and its form are similar.
- a test substance is applied to a GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention.
- Means for applying a test substance to a GPCR polypeptide include, but are not particularly limited to, a method of adding a test substance to a medium in which cells expressing the GPCR polypeptide are cultured.
- the response of the GPCR polypeptide to the test substance is measured.
- a technique similar to the response measuring method of the present invention can be used.
- the method for evaluating and/or selecting an odor suppressant of the present invention includes adding a test substance and a target ligand to a GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention, and measuring the response of the GPCR polypeptide.
- a method for applying a ligand to a GPCR polypeptide a method similar to that for applying a test substance can be used.
- a test substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the ligand is then detected based on the measured response. The detected test substance is selected as an odor suppressor of the ligand.
- the test substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the ligand is selected as a suppressor of the odor of the ligand based on receptor antagonism.
- the effect of the test substance on the response of the GPCR polypeptide to the ligand is, for example, the response of the GPCR polypeptide to which the test substance has been added (test group) to the ligand, and the response of the control group to the ligand. It can be evaluated by comparing with Examples of control groups include the GPCR polypeptide without the test substance added, the GPCR polypeptide with the control substance added, the GPCR polypeptide with a lower concentration of the test substance added, and the GPCR polypeptide before adding the test substance.
- the method for evaluating and/or selecting an odor suppressant of the present invention in the first embodiment includes measuring the activity of the olfactory GPCR polypeptide toward the ligand in the presence and absence of a test substance. including.
- the test substance is used as a substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the target ligand, i.e., suppresses the response of the original GPCR to the ligand.
- the response of the GPCR polypeptide in the test group is suppressed to preferably 60% or less, more preferably 50% or less, even more preferably 25% or less compared to the control group, then the test substance is It can be identified as a substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the ligand, ie, a substance that suppresses the response of the original GPCR to the ligand.
- the test substance can be replaced with a substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the ligand. That is, it can be identified as a substance that suppresses the original GPCR response to the ligand.
- the method for evaluating and/or selecting an odor suppressant of the present invention includes adding a test substance to a GPCR polypeptide expressed by the expression method of the present invention, and measuring the response of the peptide.
- a test substance that enhances the response of the GPCR polypeptide to the target ligand is then detected based on the measured response.
- the detected test substance is selected as an odor suppressor of the ligand.
- a test substance that enhances the response of the GPCR polypeptide can weaken the response of the GPCR when it is later exposed to the target ligand by first enhancing the response of the GPCR.
- recognition of the odor of the ligand by an individual can be suppressed based on odor cross-adaptation. Therefore, in said second embodiment, a suppressor of the ligand's odor is selected that is based on odor cross-adaptation by receptor agonism.
- the effect of the test substance on the GPCR polypeptide can be evaluated, for example, by comparing the response of the GPCR polypeptide to which the test substance has been added (test group) with the response in the control group.
- control groups include those mentioned above.
- the method for evaluating and/or selecting an odor suppressant of the present invention in the second embodiment includes measuring the activity of the GPCR polypeptide in the presence and absence of a test substance.
- the evaluation and/or selection method of the odor suppressant of the present invention in the second embodiment is such that in the presence of a test substance, cells in which the GPCR polypeptide is expressed and cells in which the GPCR polypeptide is not expressed react against the ligand. including measuring responses.
- the test substance is used as a substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the target ligand, i.e., suppresses the response of the original GPCR to the ligand.
- the response of the GPCR polypeptide in the test group is enhanced by preferably 120% or more, more preferably 150% or more, and even more preferably 200% compared to the control group, then the test substance is , can be identified as a substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the ligand, ie, a substance that suppresses the response of the original GPCR to the ligand.
- the test substance may be replaced with a substance that suppresses the response of the GPCR polypeptide to the ligand. That is, it can be identified as a substance that suppresses the original GPCR response to the ligand.
- the test substance identified by the above procedure is a substance that can suppress the recognition of the odor of a target ligand by an individual by suppressing the GPCR response to the target ligand. Therefore, the test substances identified by the above procedure can be selected as suppressors of the odor of the ligand.
- a substance selected as an odor suppressor of a target ligand by the odor suppressant evaluation and/or selection method of the present invention can suppress the odor of the target ligand by suppressing the GPCR response to the ligand.
- the substance selected by the ligand odor suppressant evaluation and/or selection method of the present invention may be an active ingredient of the ligand odor suppressant.
- the substance selected by the method for evaluating and/or selecting a ligand odor suppressor of the present invention may be added to a compound or composition for suppressing the odor of the ligand. It can be included as an ingredient.
- the substance selected by the method for evaluating and/or selecting a ligand odor suppressor of the present invention is a compound or compound for producing a ligand odor suppressant or for suppressing the ligand odor. It can be used for the production of compositions.
- the odor of the target ligand can be deodorized.
- compositions, manufacturing methods, uses, or methods are further disclosed herein.
- present invention is not limited to these embodiments.
- a method for expressing a GPCR polypeptide comprising: Consists of an amino acid sequence in which at least one amino acid residue that differs from the consensus amino acid sequence in the amino acid sequence of the target GPCR (excluding olfactory receptors) is changed to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position.
- the consensus amino acid sequence is an amino acid sequence derived from an alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of a GPCR encoded by an ortholog of the GPCR of interest in a vertebrate.
- a method for functionalizing a target GPCR comprising: Consists of an amino acid sequence in which at least one amino acid residue that differs from the consensus amino acid sequence in the amino acid sequence of the target GPCR (excluding olfactory receptors) is changed to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position.
- the consensus amino acid sequence is an amino acid sequence derived from an alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of a GPCR encoded by an ortholog of the GPCR of interest in a vertebrate.
- the ortholog is an ortholog selected from orthologs in mammals, birds, reptiles, amphibians, and fish, preferably an ortholog selected from orthologs in mammals, birds, reptiles, and amphibians, and more preferably an ortholog in mammals.
- the consensus residue closest to the N-terminus is the consensus residue at a position corresponding to the N-terminus of the target GPCR. If it is not a methionine residue, go back one amino acid position to the N-terminus from the consensus residue position in the alignment, and select the most frequently occurring amino acid residue as the consensus residue until a methionine residue appears.
- the alignment includes at least 2, preferably at least 5, and more preferably at least 11 GPCRs encoded by the amino acid sequence of the GPCR of interest and orthologs of the GPCR of interest in the vertebrate.
- the GPCR polypeptide preferably has the consensus amino acid shown by SEQ ID NO. (3) in the amino acid sequence shown by SEQ ID NO.
- GPCR polypeptide preferably consists of an amino acid sequence represented by any one of SEQ ID NOs: 108-142, 144-214, and 275-312.
- a method for expressing a GPCR polypeptide comprising: Expressing in cells a GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence in which at least one amino acid residue that differs from the consensus amino acid sequence in the amino acid sequence of the GPCR of interest is changed to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position.
- the GPCR polypeptide has at least one amino acid residue different from the consensus amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 143 in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 36 of human TAAR6, and the amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position. consisting of an amino acid sequence modified based on the base, preferably consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 143, Method. [12] The method described in [11], which is a method for improving expression of a GPCR polypeptide.
- a method for functionalizing a target GPCR comprising: Expressing in cells a GPCR polypeptide consisting of an amino acid sequence in which at least one amino acid residue that differs from the consensus amino acid sequence in the amino acid sequence of the GPCR of interest is changed to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position. including;
- the GPCR polypeptide has at least one amino acid residue different from the consensus amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 143 in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 36 of human TAAR6, and the amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position. consisting of an amino acid sequence modified based on the base, preferably consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 143, Method.
- a method for measuring the response of a target GPCR comprising: Measuring the response of the GPCR polypeptide expressed by the method according to any one of [1] to [16], method including.
- a method for searching for a target GPCR ligand comprising: Measuring the response of a GPCR polypeptide expressed by the method according to any one of [1] to [16] in the presence of a test substance, and selecting a test substance to which the GPCR polypeptide responded; method including. [19] The method according to [18], preferably further comprising measuring the response of the GPCR polypeptide in the absence of a test substance.
- test substance is preferably selected that increases the response of the GPCR polypeptide in the presence of the test substance to 120% or more of the response in the absence of the test substance.
- a test substance is selected that statistically significantly increases the response of the GPCR polypeptide in the presence of the test substance compared to the response in the absence of the test substance, [19] Method described.
- [22] A method for evaluating and/or selecting an agent for controlling recognition of a target GPCR ligand, comprising: [1] to [16] adding a test substance and a ligand for the GPCR of interest to the GPCR polypeptide expressed by the method described in any one of [16], and measuring the response of the GPCR polypeptide to the ligand. , method including. [23] The method according to [22], wherein the ligand is selected by the method according to any one of [18] to [21]. [24] Any one of [22] or [23], further comprising identifying a test substance that regulates, preferably suppresses or enhances, the response of the GPCR polypeptide based on the measured response. Method described.
- a taste evaluation method comprising: adding a test substance to the GPCR polypeptide expressed by the method according to any one of [1] to [16], and measuring the response of the GPCR polypeptide to the test substance; and the GPCR polypeptide is a taste receptor polypeptide.
- Method preferably further comprising measuring the response of the GPCR polypeptide to which the test substance is not added.
- a test substance that increases the response of the GPCR polypeptide to which the test substance is added to 120% or more of the response of the GPCR polypeptide to which the test substance is not added is a substance that exhibits taste.
- a test substance that statistically significantly increases the response of the GPCR polypeptide to which the test substance is added compared to the response of the GPCR polypeptide to which the test substance is not added is added to the test substance.
- the method described in [28] which evaluates the substance as exhibiting the following.
- a method for evaluating and/or selecting an odor inhibitor for a target GPCR ligand comprising: [1] to [16] adding a test substance and a ligand for the GPCR of interest to the GPCR polypeptide expressed by the method described in any one of [16], and measuring the response of the GPCR polypeptide to the ligand.
- the GPCR polypeptide is a trace amine-related receptor polypeptide.
- a method for evaluating and/or selecting an odor inhibitor for a target GPCR ligand comprising: adding a test substance to the GPCR polypeptide expressed by the method according to any one of [1] to [16], and measuring the response of the GPCR polypeptide to the test substance; and the GPCR polypeptide is a trace amine-related receptor polypeptide.
- Method. [38] The method according to [37], wherein the ligand is selected by the method according to any one of [18] to [21].
- the method according to [37] or [38] further comprising identifying a test substance that enhances the response of the GPCR polypeptide based on the measured response.
- the response of the GPCR polypeptide is measured by intracellular cAMP amount measurement by ELISA or reporter gene assay, calcium ion amount measurement by calcium imaging or TGF ⁇ shedding assay, or two-electrode membrane potential using Xenopus oocytes.
- a modified GPCR polypeptide Consists of an amino acid sequence in which at least one amino acid residue that differs from the consensus amino acid sequence in the amino acid sequence of the target GPCR (excluding olfactory receptors) is modified to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position.
- the consensus amino acid sequence is an amino acid sequence derived from an alignment of the amino acid sequence of the GPCR of interest and the amino acid sequence of a GPCR encoded by an ortholog of the GPCR of interest in a vertebrate. Modified GPCR polypeptide.
- the ortholog is an ortholog selected from orthologs in mammals, birds, reptiles, amphibians, and fish, preferably an ortholog selected from orthologs in mammals, birds, reptiles, and amphibians, and more preferably an ortholog in mammals.
- the consensus residue closest to the N-terminus is the consensus residue at a position corresponding to the N-terminus of the target GPCR. If it is not a methionine residue, go back one amino acid position to the N-terminus from the consensus residue position in the alignment, and select the most frequently occurring amino acid residue as the consensus residue until a methionine residue appears.
- the alignment includes at least 2, preferably at least 5, more preferably at least 11 GPCRs encoded by the amino acid sequence of the GPCR of interest and orthologues of the GPCR of interest in the vertebrate.
- the modified GPCR polypeptide according to any one of [43] to [45], which is an alignment with the amino acid sequences of GPCRs of various species, more preferably at least 15 species, more preferably at least 30 species, still more preferably at least 100 species. peptide.
- the modified GPCR polypeptide according to any one of [43] to [46], wherein the GPCR of interest is a human GPCR.
- the GPCR of interest is a vomeronasal receptor, a taste receptor, a trace amine-related receptor, a Mas-related G protein-coupled receptor, or a GPR.
- a modified GPCR polypeptide An amino acid sequence in which at least one amino acid residue different from the consensus amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 143 in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 36 of human TAAR6 is modified to an amino acid residue in the consensus amino acid sequence at the corresponding position.
- Modified GPCR polypeptide [52] A polynucleotide encoding the modified GPCR polypeptide according to any one of [43] to [51]. [53] The polynucleotide according to [52], which consists of the base sequence shown by any of SEQ ID NOs: 215-234 and 313-317. [54] A vector or DNA fragment comprising the polynucleotide described in [52] or [53]. [55] A transformed cell containing the vector or DNA fragment described in [54]. [56] Preferably, the transformed cell according to [55], further comprising a vector or DNA fragment containing a polynucleotide encoding RTP1S. [57] The transformed cell according to [55] or [56], wherein the cell is a HEK293 cell.
- Example 1 Construction and Analysis of Consensus Receptor 1 Construction of Receptor Gene
- a search for homologous gene candidates for the target receptor gene was performed using NCBI BLAST.
- Ortholog groups were identified for the obtained gene groups. Specifically, when a human receptor (GPCR) is the target receptor, to identify orthologs, genes with the same name as the target receptor are selected as orthologs from the top homologous genes searched by BLAST. Selected.
- GPCR human receptor
- TAAR1 a human trace amine-related receptor
- the amino acid sequence of human TAAR1 (NP_612200.1) was used as a query sequence, and 249 genes containing TAAR1 in their names were selected from among the 250 genes with the highest homology searched by BLAST. was identified as an ortholog. Alignment analysis and consensus amino acid identification were performed on the amino acid sequences of a total of 250 genes (Tables 3-1 to 3-4), including these 249 genes and human TAAR1, as described below. Ortholog groups were similarly identified for human TAAR2, TAAR5, TAAR6, TAAR8, and TAAR9.
- the identified orthologs are orthologs of primates and mammals of orders other than primates
- the identified orthologs are orthologs of primates, mammals of orders other than primates, and orthologs of birds.
- TAAR1 is the target receptor
- the identified orthologs are orthologs of primates, mammals of orders other than primates, and orthologs of birds.
- VN1R human vomeronasal receptor
- NP_065684.1 the amino acid sequence of human VN1R1
- the name vomeronasal type-1 receptor 1 is found among the 250 genes with the highest homology. Twenty-two genes were identified.
- VN1R is a receptor gene family with great diversity among homologous genes, and among these homologous genes, seven genes with 65% or more amino acid identity with human VN1R1 were identified as orthologs. Alignment analysis and consensus amino acid identification were performed on the amino acid sequences of a total of eight genes, including these seven genes plus human VN1R1, as described below.
- Ortholog groups were similarly identified for human VN1R2, VN1R4, and VN1R5.
- VN1R1, VN1R2, VN1R4, or VN1R5 is the receptor of interest
- the ortholog identified was a mammalian (primate) ortholog.
- TAS1R1 which is a human taste receptor (umami receptor)
- TAS1R1 was selected from among the 250 genes with the highest homology searched by BLAST. We identified 249 genes as orthologs.
- TAS2R8 which is a human taste receptor (bitter taste receptor)
- the amino acid sequence of human TAS2R8 (NP_076407.1) was used as the query sequence, and TAS2R8 was selected as the name from among the 250 genes with the highest homology searched by BLAST.
- TAS2R8 was selected as the name from among the 250 genes with the highest homology searched by BLAST.
- 90 genes as orthologs. Alignment analysis and consensus amino acid identification were performed on the amino acid sequences of a total of 91 genes, including human TAS2R8 and these 90 genes, as described below.
- the identified ortholog is a primate ortholog
- human TAS2R8, TAS2R16, TAS2R38, TAS2R42, or TAS2R46 is the receptor of interest
- the identified ortholog is a primate ortholog.
- They were orthologs of mammals of orders other than primates.
- MrgprE which is a human Mas-related G protein-coupled receptor
- MrgprE was used as the query sequence, and MrgprE was selected as the name from among the 250 genes with the highest homology searched by BLAST.
- GPR3 which is a human GPR
- the amino acid sequence of human GPR3 (NP_005272.1) is used as a query sequence
- 234 genes whose names include GPR3 are selected as orthologs from among the 250 genes with the highest homology searched by BLAST. Identified. Alignment analysis and consensus amino acid identification were performed on the amino acid sequences of a total of 235 genes, including human GPR3 and these 234 genes, as described below.
- Ortholog groups were similarly identified for human GPRs other than GPR3, GPR17, GPR31, GPR50, GPR65, GPR68, and GPR42 listed in Table 4.
- genes containing "GPR42” in the name and genes containing "free fatty acid receptor 3" in the name were identified as orthologs.
- GPCR genes highly homologous to the GPR42 gene were identified as orthologs.
- ADGRB1 the amino acid sequence of human ADGRB1 (NP_001693.2) was used as the query sequence, and 234 genes containing ADGRB1 in the name were selected from among the 250 genes with the highest homology searched by BLAST. identified as an ortholog. Alignment analysis and consensus amino acid identification were performed on the amino acid sequences of a total of 235 genes, including human ADGRB1 and these 234 genes, as described below.
- ortholog groups were similarly identified for human ADGRB2, ADGRB3, and ADGRD1.
- ADGRA1 a gene containing "ADGRA1" in its name and a gene containing "GPR123" in its name (a GPCR gene highly homologous to the ADGRA1 gene) were identified as orthologs.
- the gene includes "adhesion G protein-coupled receptor D2" or “G-protein coupled receptor 144" in the name, and in the case of human ADGRE1, the gene includes "adhesion G protein-coupled receptor D2" in the name.
- the name is “adhesion G protein- In the case of human ADGRE5, the gene containing "adhesion G protein-coupled receptor E5" or "CD97 antigen” in the name, and in the case of human ADGRF1, the gene containing "adhesion G-pr otein coupled receptor F1 ” or “adhesion G-protein coupled receptor F1 isoform 1 precursor”, and in the case of human ADGRF3, the name should include “adhesion G-protein coupled receptor F3” or “G- The gene containing “protein coupled receptor 113” was introduced into human In the case of ADGRF4, the gene with the name “adhesion G-protein coupled receptor F4" or “G-protein coupled receptor 115" is used, and in the case of human ADGRF5, the gene with the name "adhesion G-protein coupled receptor F4" or "G-protein coupled receptor 115" is used.
- the gene containing "coupled receptor 116" should be named “adhesion G-protein coupled receptor G1" or “adhesion G-protein coupled receptor G1 isof orm b precursor” in the name in the case of human ADGRG2.
- the gene containing "adhesion G-protein coupled receptor G2" or “G-protein coupled receptor 64” is named “adhesion G-protein coupled receptor G2" or "G-protein coupled receptor 64".
- G4 or “G-protein coupled receptor 112”
- the gene includes "adhesion G-protein coupled receptor G5" or “G-protein coupled receptor 114" in the name
- the gene in the case of human ADGRG6, the gene includes "adhesion G-protein coupled receptor G5" in the name.
- n coupled receptor G6 or In the case of human ADGRG7, the gene containing "G-protein coupled receptor 126" should be named “adhesion G-protein coupled receptor G7" or "adhesion G-protein coupled receptor”. or G7 isoform 2 precursor” of human ADGRL1.
- the amino acid residue in the standard amino acid sequence was not modified.
- the amino acid residue of the standard amino acid sequence is Modified by deletion. For example, since a deletion exists at a position corresponding to the C-terminal amino acid position, as in TAAR1, with an appearance frequency of 40% or more, the amino acid residue of the reference amino acid sequence was modified to be deleted.
- deletions have been observed at positions corresponding to the starting methionine position in human sequences, such as TAAR1, TAAR2, MAS1L, GPR135, and ADGRG4, with an occurrence frequency of 40% or more.
- the first methionine in the amino acid sequence after modification by the above procedure was selected as the starting methionine, and the amino acid sequence before it was deleted.
- the reference amino acid sequence is deleted. It was modified to insert the most conserved amino acid at the position.
- the amino acid with the smallest molecular weight was modified to be inserted.
- TAS2R1 there is an amino acid that appears more than 60% of the time on the N-terminal side of the position corresponding to the N-terminal amino acid position of the standard amino acid sequence. Added.
- TMHMM Transmembrane Hidden Markov Model
- the various designed receptors must have a seven-transmembrane structure. No. of Table 4 Regarding GPCRs 1 to 5, 7 to 13, 31 to 38, 60, 76, 80, 85, and 102, the DNA sequences encoding the various designed receptor polypeptides were modified to include the base sequence codons corresponding to their amino acid sequences. It was optimized for expression in cultured cells and obtained by DNA synthesis. EcoRI and XhoI sites were added to both ends of this base sequence, and it was recombined into the EcoRI and XhoI sites created downstream of the Flag-Rho tag sequence on the pME18S vector.
- the gene encoding human RTP1S which translocates GPCR proteins produced in cultured cells onto the cell membrane, was inserted into the EcoRI and XhoI sites of another pME18S vector to create a pME18S-RTP1S vector.
- HEK293 cells suspended in DMEM were seeded at 3.3 x 10 5 cells in each well of a 6-well dish, and 24 hours later, a reaction solution with the composition shown in Table 5 was added. was prepared, allowed to stand for 20 minutes in a clean bench, and then added to each well of a 6-well dish.
- the receptor gene is No. 4 in Table 4. These are the genes of GPCRs 1-4, 8-13, 31-38, 60, 76, 80, 85 and 102.
- the cells were cultured for 24 hours in an incubator maintained at 37° C. and 5% CO 2 . As a control, cells that did not express the receptor (mock) were prepared.
- HEK293 cells suspended in DMEM were seeded at 3.3 x 10 5 cells in each well of a 6-well dish, and 24 hours later, a reaction solution with the composition shown in Table 6 was added. was prepared, allowed to stand for 20 minutes in a clean bench, and then added to each well of a 6-well dish. The cells were cultured for 24 hours in an incubator maintained at 37° C. and 5% CO 2 . As a control, cells that did not express the receptor (mock) were prepared.
- Anti-FLAG antibody (Cosmo Bio) was allowed to act as a primary antibody on the cells collected using Cellstripper for 1 hour on ice. After washing the cells, PE (phycoerythrin)-conjugated anti-mouse IgG (Abcam Inc.) was applied as a secondary antibody for 30 minutes on ice. After washing, 0.25 ⁇ g of 7-AAD (7-Aminoactinomycin D, Fujifilm Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) was added, and the mean PE signal of a cell population that was negative for 7-AAD was measured using a flow cytometry system (BD). was measured as an indicator of the amount of receptor on the cell membrane.
- 7-AAD 7-AAD
- the average value of the PE signal was determined in the same manner as above, using cells that expressed the FLAG-M2 acetylcholine receptor as a positive control (PC) and cells that did not express the receptor as a negative control (NC). Standardization was performed with the PE signal of NC as 0% and the PE signal of PC as 100%, and PE signals (%) of various receptors were calculated as the amount of membrane expression (Cell surface expression).
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Abstract
Gタンパク質共役型受容体(GPCR)を発現かつ機能させることができる手法の提供。GPCRポリペプチドの発現方法であって、目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1つをこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、方法。
Description
本発明は、Gタンパク質共役型受容体の解析方法に関する。
細胞は生体の構成員として、周囲の生理状況の変化を認識し挙動を変化する。生物個体は、外界の環境変化を察知する感覚を利用して適応行動をとる。ホルモンや神経伝達物質といった内因性の情報化学物質、もしくは味物質など外因性の情報化学物質に対して、個々の生命単位が適切に応答することが生体メカニズムの根幹をなしている。これら化学受容を担うのは、個々の組織細胞がもつ受容体タンパク質である。近年、特定の受容体遺伝子を欠損させた生物個体が数多く作製され、生理機能における受容体の必要性が実証されてきた。また、受容体を標的分子とした様々な薬剤が、生理機能を調整するものとして実用されている。その一方で、未だ機能が不明な受容体が数多く存在している。
生物がもつ代表的な受容体はGタンパク質共役型受容体(G-protein-coupled receptor:GPCR)である。これは7回膜貫通型の構造を特徴としており、アゴニストを結合することで活性化型の構造に推移し、基本的には細胞内のGタンパク質との相互作用を経てシグナルを伝達する。ヒトでは約800種類のGPCRが存在し、そのうち約半数は感覚に関連する体内の生理機能には直接関与しないものとして知られていた。嗅覚受容体、鋤鼻受容体を除くヒトGPCRの情報はデータベース(G protein-coupled receptors(IUPHAR/BPS Guide to PHARMACOLOGY, http://www.guidetopharmacology.org/GRAC/FamilyDisplayForward?familyId=694))から取得することができる。2017年11月時点で、134のGPCRがアメリカにおける承認薬の標的分子とされる(非特許文献1)。加えて、感覚のみに関与すると考えられていた受容体も、実際には感覚組織以外の組織でも発現し、体内の特定の生理機能に関与することが示されてきている。
例えば、鋤鼻受容体(vomeronasal 1 receptor:VN1R)は、ClassAファミリーのGPCRであり、ヒトには5種類の遺伝子が存在する。マウスにおける相同遺伝子の解析より、鼻腔内にて発現しフェロモンの認識を担っていることが予測されている(非特許文献2)。ヒトにおいてVN1R1に関して1例のみ、培養細胞での機能解析が報告されており、この報告では低分子の揮発性化合物を認識することが示されている(非特許文献2)。また、スウェーデンでの大規模調査において、VN1R1の遺伝的多型によりどのような性質の違いが生じるのかが調査された結果、女性の性的な特性に違いが認められることが示され、VN1R1の潜在的な機能が示唆されている(非特許文献3)。その他のVN1R2~5に関しては、認識する物質の特定など機能解析の報告例はない。
味覚受容体であるTAS1R(taste 1 receptor)は、舌に発現するGPCRとして発見された遺伝子ファミリーであり、ヒトのゲノムには3種類の遺伝子TAS1R1、TAS1R2、TAS1R3が存在し、いずれもClass CタイプのGPCRに分類される。舌の味らいにおいて、TAS1R1、TAS1R2は異なる味細胞に発現し、いずれもTAS1R3を共発現している。代謝型グルタミン酸受容体をはじめとするClass CタイプのGPCRは二量体を形成して機能することが知られているがTAS1Rも例外ではない。TAS1R3をTAS1R1、TAS1R2のいずれかと共発現させたときに、HEK293細胞は味物質に対して応答する。TAS1R1/TAS1R3複合体、TAS1R2/TAS1R3複合体はそれぞれうま味、甘味物質を受容する。TAS1R2/TAS1R3複合体を培養細胞に発現させてスクリーニングを行うことで、当該複合体に対してアロステリックモジュレーターとして機能し、甘味を増強させる物質の特定が報告されている(非特許文献4)。同様に、TAS1R1/TAS1R3複合体を発現させれば、うま味を増強するイノシン酸が、当該複合体の活性を高めるという評価結果を得ることも可能である(非特許文献5)。これらTAS1Rタンパク質をより安定なものとして獲得する、あるいはより多量に培養細胞の膜上に発現させることができれば、うま味や甘味を高める素材の特定を効率よく行うことが可能になる。
同じく味覚受容体であるTAS2R(taste 2 receptor)は、舌に発現する苦味受容体として発見された遺伝子ファミリーであり、ヒトのゲノムには25種類の遺伝子が存在する。Class AタイプのGPCRに分類され、様々な苦味物質を認識することが示されているが、ヒトTAS2R41、TAS2R42、TAS2R45、TAS2R48及びTAS2R60は機能解析に成功しておらず、どのような物質を認識するのかは不明である。特許文献1には、TAS2Rを利用して苦味評価や苦味調節物質の特定を可能にするために、TAS2Rを効率よく機能解析するための工夫としてGタンパク質との融合タンパク質とすることが開示されている。TAS2Rの発現は舌上に限定されず、呼吸器、循環器、神経系にも認められ、舌において苦味を受容する以外に様々な生理作用を担うことが示されている(非特許文献6)。加えて、卵巣がん、前立腺がん等、がん化した組織細胞にも発現が認められる。
微量アミン関連受容体(trace amine associated receptor:TAAR)は、ClassAファミリーのGPCRであり、ヒトでは6種類の遺伝子からなる。最初に発見されたTAAR1については、脳において神経伝達物質の認識を担っていることが示されている。そのことからTAAR1は統合失調症、うつ病、中毒、パーキンソン病との関わりが検討されており、そのアゴニストを神経性疼痛の治療に利用しようとする取り組みがある(特許文献2)。一方でTAAR1を除く他のTAARは、嗅上皮において高発現し、揮発性アミンを選択的かつ高感度に認識し、においの感覚を生み出す役割が示されている(非特許文献7)。
Mas関連Gタンパク質共役型受容体(Mas-related G-protein-coupled receptor:Mrgpr)はClassAファミリーのGPCRであり、ヒトには10種類の遺伝子が存在する。その発現は末梢の皮膚などの知覚神経系およびその関連組織に認められ、アゴニストを認識することで掻痒や痛みを感知させる(非特許文献8)。また、マウスにおいて、MrgprB4を発現する知覚神経細胞が快い触覚に関与することを踏まえて、MrgprB4を標的とした快感情向上剤の探索の取り組みが開示されている(特許文献3)。より近年ではMrgprのうちMrgprEとMrgprFは回腸など、知覚神経以外の様々な組織にも発現し、多様な生理機能を担っていることが示唆されているが、アゴニストの報告例は乏しい(非特許文献9)。
一般的にGPCRの機能解析は、培養細胞に発現させる方法が簡便であり最も広く用いられている。その解析法については非常に多岐に渡る工夫がなされてきた。それでもなお、未だ機能解析に成功していないものは多い。機能解析に成功しておらず、どのような分子をリガンドとして認識するのかが不明なGPCRは総じてGPR(G-protein-coupled receptor)X(Xは任意の数字)と表記される。これらGPR群についてリガンドの同定が立ち遅れた原因の一つは、目的とするGPCRを培養細胞に発現させようとしても、本来の組織細胞とは異なる培養細胞には、そのGPCRを安定的にかつ細胞膜上に発現させる因子が不足していることが挙げられる。
(特許文献1)特許第6924590号公報
(特許文献2)特表2019-517524号公報
(特許文献3)特開2019-118340号公報
(非特許文献1)Sriram K, Insel PA. Mol Pharmacol. 93(4):251-258 (2018)
(非特許文献2)Shirokova E, et al. FASEB J. 22(5):1416-25 (2008)
(非特許文献3)Henningsson, S., Hovey, D., Vass, K. et al. Transl Psychiatry 7, e1102 (2017)
(非特許文献4)Servant G, Tachdjian C, Tang XQ, Werner S, Zhang F, Li X, Kamdar P, Petrovic G, Ditschun T, Java A, Brust P, Brune N, DuBois GE, Zoller M, Karanewsky DS. Proc Natl Acad Sci U S A. 107(10):4746-51 (2010)
(非特許文献5)Nelson, G., Chandrashekar, J., Hoon, M. et al. Nature 416, 199-202 (2002)
(非特許文献6)Tuzim K., Korolczuk A. J Transl Med 19, 440 (2021)
(非特許文献7)Liberles S.D. Curr Opin Neurobiol. 34:1-7 (2015)
(非特許文献8)Liu Q, et al. Cell 139(7):1353-1365 (2009)
(非特許文献9)Juan M. et al. Neuroscience Letters, Volume 748, 2021
(特許文献2)特表2019-517524号公報
(特許文献3)特開2019-118340号公報
(非特許文献1)Sriram K, Insel PA. Mol Pharmacol. 93(4):251-258 (2018)
(非特許文献2)Shirokova E, et al. FASEB J. 22(5):1416-25 (2008)
(非特許文献3)Henningsson, S., Hovey, D., Vass, K. et al. Transl Psychiatry 7, e1102 (2017)
(非特許文献4)Servant G, Tachdjian C, Tang XQ, Werner S, Zhang F, Li X, Kamdar P, Petrovic G, Ditschun T, Java A, Brust P, Brune N, DuBois GE, Zoller M, Karanewsky DS. Proc Natl Acad Sci U S A. 107(10):4746-51 (2010)
(非特許文献5)Nelson, G., Chandrashekar, J., Hoon, M. et al. Nature 416, 199-202 (2002)
(非特許文献6)Tuzim K., Korolczuk A. J Transl Med 19, 440 (2021)
(非特許文献7)Liberles S.D. Curr Opin Neurobiol. 34:1-7 (2015)
(非特許文献8)Liu Q, et al. Cell 139(7):1353-1365 (2009)
(非特許文献9)Juan M. et al. Neuroscience Letters, Volume 748, 2021
本発明は、以下の1)~13)を提供する。
1)GPCRポリペプチドの発現方法であって、
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
方法。
2)GPCRポリペプチドの発現方法であって、
目的のGPCRのアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該GPCRポリペプチドが、ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、
方法。
3)目的のGPCRの応答の測定方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
4)目的のGPCRのリガンドの探索方法であって、
試験物質存在下で、1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、及び
該GPCRポリペプチドが応答した試験物質を選択すること、
を含む方法。
5)目的のGPCRのリガンドの認識の制御剤の評価及び/又は選択方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び目的のGPCRのリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
6)味の評価方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが味覚受容体ポリペプチドである、
方法。
7)目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び目的のGPCRのリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである、
方法。
8)目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである、
方法。
9)改変GPCRポリペプチドであって、
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
改変GPCRポリペプチド。
10)改変GPCRポリペプチドであって、
ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、
改変GPCRポリペプチド。
11)9)又は10)記載の改変GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
12)11)記載のポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片。
13)12)記載のベクター又はDNA断片を含有する形質転換細胞。
1)GPCRポリペプチドの発現方法であって、
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
方法。
2)GPCRポリペプチドの発現方法であって、
目的のGPCRのアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該GPCRポリペプチドが、ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、
方法。
3)目的のGPCRの応答の測定方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
4)目的のGPCRのリガンドの探索方法であって、
試験物質存在下で、1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、及び
該GPCRポリペプチドが応答した試験物質を選択すること、
を含む方法。
5)目的のGPCRのリガンドの認識の制御剤の評価及び/又は選択方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び目的のGPCRのリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
6)味の評価方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが味覚受容体ポリペプチドである、
方法。
7)目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び目的のGPCRのリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである、
方法。
8)目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
1)又は2)記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである、
方法。
9)改変GPCRポリペプチドであって、
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
改変GPCRポリペプチド。
10)改変GPCRポリペプチドであって、
ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、
改変GPCRポリペプチド。
11)9)又は10)記載の改変GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
12)11)記載のポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片。
13)12)記載のベクター又はDNA断片を含有する形質転換細胞。
本明細書中で引用された全ての特許文献、非特許文献、及びその他の刊行物は、その全体が本明細書中において参考として援用される。
本明細書において、「Gタンパク質共役型受容体(G-protein-coupled receptor:GPCR)」とは、7回膜貫通型の構造を有し、リガンドを結合することで活性化型の構造に推移し、基本的には細胞内のGタンパク質との相互作用を経てシグナルを伝達する受容体の総称である。GPCRとしては、鋤鼻受容体、味覚受容体、微量アミン関連受容体、Mas関連Gタンパク質共役型受容体等の他、リガンドが不明なGPRX(Xは任意の数字)等が挙げられるが、これらに限定されるものではない。
本明細書において、「鋤鼻受容体」とは、VN1R(vomeronasal 1 receptor)をいう。例えば、ヒトのゲノムには5種類のVN1R遺伝子が存在する。
本明細書において、「味覚受容体」とは、生体において味分子を受容する受容体をいい、うま味分子又は甘味分子を受容するTAS1R(taste 1 receptor)ファミリーに属するうま味又は甘味受容体と、苦味分子を受容するTAS2R(taste 2 receptor)ファミリーに属する苦味受容体を包含する。例えば、ヒトのゲノムには3種類のTAS1R遺伝子が存在する。このうち、TASR1とTAS1R3は複合体を形成してうま味物質受容体として機能し、TAS1R2とTAS1R3は複合体を形成して甘味物質受容体として機能する。また、ヒトのゲノムには25種類のTAS2R遺伝子が存在する。
本発明において、「微量アミン関連受容体」とは、TAAR(trace amine associated receptor)をいう。例えば、ヒトのゲノムには6種類のTAAR遺伝子が存在する。
本明細書において、「Mas関連Gタンパク質共役型受容体」とは、Mrpgr(Mas-related G-protein-coupled receptor)をいう。MASとはアンギオテンシンに結合するGタンパク質共役型受容体である。例えば、ヒトのゲノムには10種類のMrpgr遺伝子が存在する(MAS1、MASL1、MrgprD、MrgprE、MrgprF、MrgprG、MrgprX1-4)。
本明細書において、「嗅覚受容体」とは、Olfactory receptorもしくはOdorant receptorをいう。全体的な配列の相同性、7回膜貫通領域が予測されること、保存された部分アミノ酸配列を有するか否か等の基準により、ヒトゲノム中に約400の嗅覚受容体遺伝子が予測されている。
本明細書において、「GPCRポリペプチド」とは、GPCR又はそれと同等の機能を有するポリペプチドをいい、GPCRと同等の機能を有するポリペプチドとは、GPCRと同様に、細胞膜上に発現することができ、リガンドの結合によって活性化し、且つ活性化されると、共役するGタンパク質αサブユニットのGDP/GTP交換を促進する機能など、細胞内にシグナルを伝達する機能を有するポリペプチドをいう。
本明細書において、細胞でGPCRポリペプチドが「機能的に発現する」とは、発現された該GPCRポリペプチドが、該細胞において対応するリガンドの受容体として機能することをいう。
本明細書において「アゴニスト」とは、受容体に結合し、活性化させる物質をいう。一方、本明細書において「アンタゴニスト」とは、受容体に結合するが、受容体を活性化しないか、又はアゴニストに対する受容体の応答を抑制する物質をいう。
本明細書において、「受容体アゴニズム」とは、受容体に結合して、その受容体を活性化することをいう。
本明細書において、標的においに関する「においの交差順応(又は嗅覚の交差順応)」とは、該標的においの原因物質とは別の物質のにおいを予め受容し、そのにおいに慣れることによって、該標的においの原因物質に対する嗅覚感受性が低下又は変化する現象を指す。本発明者らは、以前、「においの交差順応」が、受容体アゴニズムに基づく現象であることを明らかにした(国際公開公報第2016/194788号)。すなわち、「においの交差順応」においては、標的においの原因物質に対する受容体が、該標的においの原因物質への応答に先だって異なるにおいの原因物質に応答し、次いで脱感作することにより、後から該標的においの原因物質に曝されても低い応答しかできず、その結果、個体に認識される標的においの強度の低下又は変質が生じる。こうした受容体の挙動により引き起こされるにおいの交差順応の仕組みを、本明細書において「受容体アゴニズムによるにおいの交差順応」とも呼ぶ。
本明細書において、標的においの「受容体アンタゴニズムによる抑制」とは、標的においを有する物質に対する受容体の応答を、アンタゴニストにより抑制し、結果的に個体に認識される標的においを抑制することをいう。
本明細書において、ヌクレオチド配列及びアミノ酸配列の同一性は、リップマン-パーソン法(Lipman-Pearson法;Science,1985,227:1435-41)によって計算される。具体的には、遺伝情報処理ソフトウェアGenetyx-Win(Ver.5.1.1;ソフトウェア開発)のホモロジー解析(Search homology)プログラムを用いて、Unit size to compare(ktup)を2として解析を行うことにより算出される。
本明細書において、「アミノ酸残基」とは、タンパク質を構成する20種のアミノ酸残基、アラニン(Ala又はA)、アルギニン(Arg又はR)、アスパラギン(Asn又はN)、アスパラギン酸(Asp又はD)、システイン(Cys又はC)、グルタミン(Gln又はQ)、グルタミン酸(Glu又はE)、グリシン(Gly又はG)、ヒスチジン(His又はH)、イソロイシン(Ile又はI)、ロイシン(Leu又はL)、リシン(Lys又はK)、メチオニン(Met又はM)、フェニルアラニン(Phe又はF)、プロリン(Pro又はP)、セリン(Ser又はS)、トレオニン(Thr又はT)、トリプトファン(Trp又はW)、チロシン(Tyr又はY)及びバリン(Val又はV)を意味する。
本明細書において、アミノ酸の改変は、公認されているIUPACの1文字のアミノ酸略記により、[元のアミノ酸、位置、改変されたアミノ酸]で表記されることがある。例えば、43位のヒスチジンのアルギニンへの改変は、「H43R」と示される。
本明細書において、アミノ酸配列上の「相当する位置」は、目的配列と基準配列(本発明においてはオリジナルのGPCRのアミノ酸配列)とを、最大の相同性を与えるように整列(アラインメント)させることにより決定することができる。アミノ酸配列のアラインメントは、公知のアルゴリズムを用いて実行することができ、その手順は当業者に公知である。例えば、アラインメントは、Clustal Wマルチプルアラインメントプログラム(Thompson,J.D.et al,1994,Nucleic Acids Res.22:4673-4680)をデフォルト設定で用いることにより、行うことができる。あるいは、Clustal Wの改訂版であるClustal W2やClustal omegaを使用することもできる。Clustal W、Clustal W2及びClustal omegaは、例えば、University College Dublinが運営するClustalのウェブサイト[www.clustal.org]、欧州バイオインフォマティクス研究所(European Bioinformatics Institute:EBI[www.ebi.ac.uk/index.html])や、国立遺伝学研究所が運営する日本DNAデータバンク(DDBJ[www.ddbj.nig.ac.jp/searches-j.html])のウェブサイト上で利用することができる。上述のアラインメントにより基準配列の任意の位置にアラインされた目的配列の位置は、当該任意の位置に「相当する位置」とみなされる。
当業者であれば、上記で得られたアミノ酸配列のアラインメントを、最適化するようにさらに微調整することができる。そのような最適アラインメントは、アミノ酸配列の類似性や挿入されるギャップの頻度等を考慮して決定するのが好ましい。ここでアミノ酸配列の類似性とは、2つのアミノ酸配列をアラインメントしたときにその両方の配列に同一又は類似のアミノ酸残基が存在する位置の数の全長アミノ酸残基数に対する割合(%)をいう。類似のアミノ酸残基とは、タンパク質を構成する20種のアミノ酸のうち、極性や電荷の点で互いに類似した性質を有しており、いわゆる保存的置換を生じるようなアミノ酸残基を意味する。そのような類似のアミノ酸残基からなるグループは当業者にはよく知られており、例えば、アルギニンとリシン又はグルタミン;グルタミン酸とアスパラギン酸又はグルタミン;セリンとトレオニン又はアラニン;グルタミンとアスパラギン又はアルギニン;ロイシンとイソロイシン等がそれぞれ挙げられるが、これらに限定されない。
加えて、上記で得られたアミノ酸配列のアラインメントは、例えば、GPCR間で高度に保存されたアミノ酸もしくはアミノ酸モチーフを基準に、最適化するようにさらに微調整することができる。
加えて、上記で得られたアミノ酸配列のアラインメントは、例えば、GPCR間で高度に保存されたアミノ酸もしくはアミノ酸モチーフを基準に、最適化するようにさらに微調整することができる。
本明細書において、プロモーター等の制御領域と遺伝子の「作動可能な連結」とは、遺伝子と制御領域とが、該遺伝子が該制御領域の制御の下で発現し得るように連結されていることをいう。遺伝子と制御領域との「作動可能な連結」の手順は当業者に周知である。
本明細書において、遺伝子に関する「上流」及び「下流」とは、該遺伝子の転写方向の上流及び下流をいう。例えば、「プロモーターの下流に配置された遺伝子」とは、DNAセンス鎖においてプロモーターの3’側に該遺伝子が存在することを意味し、遺伝子の上流とは、DNAセンス鎖における該遺伝子の5’側の領域を意味する。
本明細書において、「ホモログ」とは、共通の祖先に由来する相同遺伝子を指す。「オルソログ」とは、「オーソログ」とも呼ばれ、種分化の際に分岐したホモログを指し、異なる生物種に存在し、同一又は類似の機能を有する。一例において、本発明で用いるオルソログは、目的のGPCR遺伝子の相同遺伝子のうち、目的のGPCR遺伝子と同一の名称を含む目的のGPCRが由来する生物種とは異なる生物種のGPCR遺伝子であり得る。ある生物種のGPCRの命名法が目的のGPCRが由来する生物種における命名法と異なる場合、オルソログは、該ある生物種における目的のGPCR遺伝子と高い相同性を有するGPCR遺伝子、好ましくは最も高い相同性を有するGPCR遺伝子であり得る。あるいは、該ある生物種における目的のGPCR遺伝子のオルソログであることが知られているGPCR遺伝子であり得る。別の一例において、本発明で用いるオルソログは、上記オルソログのうち、系統樹解析により種分化の際に分岐した可能性が示唆されるGPCR遺伝子であり得る。
Gタンパク質共役型受容体(GPCR)の解析にあたり、GPCRを効率よく発現させる方法が求められている。
本発明者は、GPCRを効率よく発現させることができる手法について鋭意検討した。その結果、本発明者は、GPCRのコンセンサス化により、GPCRの培養細胞での膜発現をオリジナルのGPCRに比べて向上できることを見出した。嗅覚受容体を除くGPCRをコンセンサス化した例はこれまで知られていない。
本発明は、GPCRを効率よく発現させることができる手法を提供する。斯かるGPCRを用いることで、GPCRの機能の解明や機能制御剤の特定に資することができる。
後述の実施例に示すとおり、本発明者は、ヒトGPCRのアミノ酸配列を、該ヒトGPCRのアミノ酸配列と該ヒトGPCRの特定のオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列とから導き出されるコンセンサスアミノ酸配列に基づいて改変し、得られたGPCRポリペプチドを細胞に発現させたところ、該GPCRポリペプチドの細胞での膜発現が改変前のヒトGPCRに比べて増加することを見出した(表7、図1)。すなわち、該GPCRポリペプチドは、改変前のヒトGPCRに比べて発現時の安定性が向上している。本明細書において、改変前のGPCRを「オリジナルのGPCR」と称し、GPCRのアミノ酸配列をコンセンサスアミノ酸配列に基づいて改変することを「コンセンサス化する」と称し、コンセンサス化されたGPCRを「コンセンサスGPCR」あるいは「改変GPCRポリペプチド」と称することがある。
よって、GPCRの上記コンセンサス化は、GPCR、特にこれまで培養細胞での膜発現が不十分なために機能解析が非効率であったGPCRを細胞の細胞膜に発現させるのに有用である。したがって、一態様において本発明は、GPCRポリペプチドの発現方法を提供する。本発明の発現方法は、GPCRの発現向上(例えば、発現増加、発現安定化)を可能とするので、当該方法は、好ましくは、GPCRポリペプチドの発現向上方法である。当該方法は、目的のGPCRのアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、方法である。
本発明の発現方法において、目的のGPCRは、特に制限されず、いずれの生物種のGPCRであってもよく、哺乳類のGPCRが好ましく、ヒトGPCRがより好ましい。目的のGPCRとしては、従来法による培養細胞を用いた機能解析が可能なGPCRであっても、非効率なGPCRであってもよいが、本発明の方法は、従来法による培養細胞を用いての機能解析が非効率なGPCRにより好適に適用される。
本発明の発現方法において、脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRは、好ましくは哺乳類、鳥類、爬虫類、両生類及び魚類における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRから選択されるGPCRであり、より好ましくは哺乳類、鳥類、爬虫類及び両生類における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRから選択されるGPCRであり、さらに好ましくは哺乳類における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRである。該オルソログとしては、特に制限されないが、目的のGPCR遺伝子との相同性が高いオルソログ程好ましい。ここで、哺乳類(Mammals)とは、脊椎動物門哺乳網に属する生物種を指し、約5500種が現存することが知られている。哺乳類としては、ヒト、チンパンジー、ボノボ、ゴリラ、スマトラオランウータン、キタホウジロテナガザル、ドリル、ゲラダヒヒ、アカゲザル、アヌビスヒヒ、スーティーマンガベイ、グリーンモンキー、ハイアカコロブス、アンゴラコロブス、ガーネットガラゴ、ハイイロネズミキツネザル、コクレルシファカ、フィリピンメガネザル、マウス、ラット、ウサギ、ネコ、イヌ、キツネ、タヌキ、イタチ、トラ、チーター、クマ、アシカ、アザラシ、オットセイ、ウマ、サイ、ラクダ、ブタ、イノシシ、ウシ、ヤギ、ヒツジ、シカ、キリン、カバ、ゾウ、センザンコウ、モグラ、コウモリなどが挙げられるが、これらに限定されるものではない。鳥類(Aves)とは、脊椎動物門鳥網に属する生物種を指す。鳥類としては、ニワトリ、カモ、アヒル、ガチョウ、シチメンチョウ、ダチョウ、キジ、ハト、オウム、カナリア、ジュウシマツ、ハチドリ、マイコドリ、ウズラ、ヒタキなどが挙げられるが、これらに限定されるものではない。爬虫類(Reptilia)とは、脊椎動物門爬虫網に属する生物種を指す。爬虫類としては、カメ、トカゲ、ワニ、イグアナ、カメレオン、ヤモリ、ヘビなどが挙げられるが、これらに限定されるものではない。両生類(Amphibia)とは、脊椎動物門両生網に属する生物種を指す。両生類としては、カエル、イモリ、サンショウウオなどが挙げられるが、これらに限定されるものではない。魚類(Fish)とは、脊椎動物門ヌタウナギ類、ヤツメウナギ類、軟骨魚綱及び硬骨魚綱に属する生物種を指す総称である。魚類としては、ヌタウナギ、ヤツメウナギ、サメ、エイ、マグロ、カツオ、サケ、マス、タラ、タイ、ヒラメ、ブリ、アジ、サバなどが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
本実施形態の好ましい一例において、脊椎動物における目的のGPCRのオルソログは、脊椎動物に属する生物種が有するGPCR遺伝子のうち、目的のGPCR遺伝子と同じ名称を含む遺伝子である。斯かるオルソログは、例えば、以下の手順で選択することができる。目的のGPCRのアミノ酸配列をquery配列とし、NCBIのBLASTなどで公知のデータベースに対してデータベース検索を行う。その結果得られた相同遺伝子群(例えば、上位500遺伝子、好ましくは上位250遺伝子、より好ましくは上位100遺伝子、さらに好ましくは上位50遺伝子)から、目的のGPCR遺伝子と同じ名称を含む遺伝子を選択する。さらに好ましくは、目的のGPCRと一定のアミノ酸配列同一性、例えば65%以上のアミノ酸配列同一性を有するGPCRをコードする遺伝子を選択する。
尚、オルソログとして、同一生物種に由来する遺伝子が複数選択される場合、目的のGPCR遺伝子と最も相同性が高い1遺伝子のみを選択してもよい。例えば、目的のGPCRがヒトGPCRであり、オルソログとして、ヒト以外のある生物種の遺伝子が複数選択される場合、目的のヒトGPCR遺伝子と最も相同性が高い該ある生物種の遺伝子を選択すればよい。また、ある生物種のGPCRの命名法が目的のGPCRが由来する生物種における命名法と異なる場合、オルソログとして、該ある生物種における目的のGPCR遺伝子と高い相同性を有する遺伝子、好ましくは最も高い相同性を有する遺伝子を選択してもよい。あるいは、該ある生物種における目的のGPCR遺伝子のオルソログであることが知られている遺伝子を選択してもよい。
尚、オルソログとして、同一生物種に由来する遺伝子が複数選択される場合、目的のGPCR遺伝子と最も相同性が高い1遺伝子のみを選択してもよい。例えば、目的のGPCRがヒトGPCRであり、オルソログとして、ヒト以外のある生物種の遺伝子が複数選択される場合、目的のヒトGPCR遺伝子と最も相同性が高い該ある生物種の遺伝子を選択すればよい。また、ある生物種のGPCRの命名法が目的のGPCRが由来する生物種における命名法と異なる場合、オルソログとして、該ある生物種における目的のGPCR遺伝子と高い相同性を有する遺伝子、好ましくは最も高い相同性を有する遺伝子を選択してもよい。あるいは、該ある生物種における目的のGPCR遺伝子のオルソログであることが知られている遺伝子を選択してもよい。
脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRの種類数は、受容体数として、少なくとも2種類であり、好ましくは少なくとも5種類であり、より好ましくは少なくとも11種類であり、さらに好ましくは少なくとも15種類であり、さらに好ましくは少なくとも30種類であり、さらに好ましくは100種類である。一方、種類数の上限は、脊椎動物における目的のGPCRのオルソログの全種類数であり、該種類数は、受容体数として、好ましくは500種類以下、より好ましくは400種類以下、さらに好ましくは300種類以下である。脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRの種類数は、受容体数として、例えば、2種類~脊椎動物における目的のGPCRのオルソログの全種類、5種類~脊椎動物における目的のGPCRのオルソログの全種類、11種類~脊椎動物における目的のGPCRのオルソログの全種類、5~500種類、5~400種類、5~300種類、11~500種類、11~400種類、11~300種類、15~300種類、30~300種類、100~300種類であり得る。
本発明の発現方法において、「コンセンサスアミノ酸配列」とは、目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である。具体的には、「コンセンサスアミノ酸配列」とは、目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから以下の(i)~(iii)の基準に従い同定したコンセンサス残基からなるアミノ酸配列である。
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的のGPCRのアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的のGPCRのアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。
ここで、「出現頻度」とは、アミノ酸配列のアラインメントの各アミノ酸位置における特定のアミノ酸残基の出現数をアラインメントに供したアミノ酸配列数に対する百分率で示したものである。アミノ酸配列のアラインメントは、公知のアルゴリズムにより実行することができる。
基準(i)の(i-i)は、目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントのあるアミノ酸位置において、目的のGPCRにアミノ酸残基が存在する場合の基準である。このとき、目的のGPCRのアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在すれば、該出現頻度50%以上のアミノ酸残基を該位置のコンセンサス残基と同定する。一方、目的のGPCRのアミノ酸残基以外のアミノ酸残基の出現頻度がいずれも50%未満であれば、基準(i-v)に従い、該目的のGPCRのアミノ酸残基を該位置のコンセンサス残基と同定する。
基準(i)の(i-ii)は、目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントのあるアミノ酸位置において、目的のGPCRにアミノ酸残基が存在する場合の基準である。このとき、出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在すると、2種のうち片方のアミノ酸残基は必ず目的のGPCRのアミノ酸残基であり、該目的のGPCRのアミノ酸残基を該位置のコンセンサス残基と同定する。
基準(i)の(i-iii)は、目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントのあるアミノ酸位置において、目的のGPCRにアミノ酸残基が存在する場合の基準である。このとき、出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しなければ、該位置にはコンセンサス残基なしと同定する。一方、アミノ酸残基なしの出現頻度が40%未満であれば、上記基準(i-i)に該当するときは、該基準に従って該位置のコンセンサス残基を同定し、該当しないときは、基準(i-v)に従って該目的のGPCRのアミノ酸残基を該位置のコンセンサス残基と同定する。
基準(i)の(i-iv)は、目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントのあるアミノ酸位置において、目的のGPCRにアミノ酸残基が存在しない場合の基準である。このとき、出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在すれば、最も出現頻度が高いアミノ酸残基を該位置のコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸が2種以上存在する場合は、最も出現頻度が高いアミノ酸のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。例えば、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が1種であれば、該1種のアミノ酸残基を該位置のコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上あれば、そのうちの最も分子量が小さいアミノ酸残基を該位置のコンセンサス残基と同定すればよい。尚、該変更によりコンセンサスアミノ酸配列の全長が目的のGPCRのアミノ酸配列の全長よりN末端側に10%以上長くなる場合には、GPCRの構造の維持の観点から、該コンセンサスアミノ酸配列において該目的のGPCRのN末端に相当する位置のコンセンサス残基をメチオニン残基とし、該メチオニン残基よりN末端側のコンセンサス残基をなしに変更してもよい。すなわち、該目的のGPCRのN末端構造をそのまま維持してもよい。一方、アミノ酸残基ありの出現頻度が60%未満であれば、基準(i-v)に従い、該目的のGPCRのアミノ酸残基を該位置のコンセンサス残基と同定する。すなわち、該位置にはアミノ酸残基なしと同定する。
目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントのあるアミノ酸位置において、上記(i)の(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、目的のGPCRのアミノ酸残基を該位置のコンセンサス残基と同定する。このとき、目的のGPCRにアミノ酸残基が存在しなければ、コンセンサスアミノ酸配列の該位置にはアミノ酸残基なしと同定すればよい。
基準(ii)は、上記基準(i)に従って目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントの各アミノ酸位置においてコンセンサス残基を同定したときに、コンセンサス残基のうち最もN末端側に位置するコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合の基準である。このとき、N末端のコンセンサス残基がメチオニン残基となるように、言い換えれば、GPCRポリペプチドの翻訳の開始アミノ酸がメチオニン残基となるように、コンセンサス残基のうち最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する。例えば、N末端からコンセンサス残基を1残基ずつ確認していき、メチオニン残基でなければ、その位置にはコンセンサス残基なしと同定し、初めてメチオニン残基が出現するまでこれを繰り返せばよい。尚、該変更によりコンセンサスアミノ酸配列の全長が目的のGPCRのアミノ酸配列の全長より10%以上短くなる場合には、GPCRのヘリックス構造の維持の観点から、該変更前のコンセンサス残基のうち最もN末端側のコンセンサス残基をメチオニン残基からなるコンセンサス残基に変更してもよい。このとき、該変更前のコンセンサス残基のうち最もN末端側のコンセンサス残基が、糖鎖修飾及び/又は膜移行に関わるアスパラギン、セリン又はスレオニンであれば、GPCRの構造の維持の観点から、該変更前のコンセンサス残基のうち最もN末端側のコンセンサス残基は変更せず、該コンセンサス残基に相当する位置よりもN末端側の該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基としてもよい。すなわち、該目的のGPCRのN末端構造をそのまま維持してもよい。
基準(iii)は、上記基準(i)に従って目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントの各アミノ酸位置においてコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合の基準である。このとき、N末端のコンセンサス残基がメチオニン残基となるように、言い換えれば、GPCRポリペプチドの翻訳の開始アミノ酸がメチオニン残基となるように、最もN末端側のコンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡ってアラインメントを確認し、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。
斯くして同定されたコンセンサス残基からなるアミノ酸配列が、コンセンサスアミノ酸配列である。本発明で用いられるGPCRポリペプチドは、目的のGPCRのアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる改変GPCRポリペプチドである。ここで、「改変」とは、置換、欠失、付加、挿入のいずれをも含む概念である。目的のGPCRのアミノ酸配列とコンセンサスアミノ酸配列の違いは、例えば、公知のアルゴリズムによりアミノ酸配列のアラインメントをとって両アミノ酸配列を比較することで見出すことができる。例えば、目的のGPCRのアミノ酸配列とコンセンサスアミノ酸配列を比較し、目的のGPCRのアミノ酸配列のあるアミノ酸位置のアミノ酸残基が、コンセンサスアミノ酸配列のこれに相当する位置のアミノ酸残基と異なるアミノ酸残基であれば、目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基で置換すればよい。あるいは、目的のGPCRのアミノ酸配列とコンセンサスアミノ酸配列を比較し、コンセンサスアミノ酸配列において目的のGPCRのアミノ酸配列のあるアミノ酸位置に相当する位置にアミノ酸残基が存在しなければ、目的のGPCRの該アミノ酸位置のアミノ酸残基を欠失させればよい。あるいは、目的のGPCRのアミノ酸配列とコンセンサスアミノ酸配列を比較し、目的のGPCRのアミノ酸配列においてアミノ酸残基が存在しない位置に相当する位置にコンセンサスアミノ酸配列ではアミノ酸残基が存在すれば、目的のGPCRの該アミノ酸位置にコンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基を挿入すればよい。尚、目的のGPCRのアミノ酸配列とコンセンサスアミノ酸配列を比較し、コンセンサスアミノ酸配列の方が目的のGPCRのアミノ酸配列に比べN末端が長ければ、目的のGPCRのアミノ酸配列のN末端にコンセンサスアミノ酸配列にのみ存在するN末端部を付加すればよい。あるいは、目的のGPCRのアミノ酸配列とコンセンサスアミノ酸配列を比較し、コンセンサスアミノ酸配列の方が目的のGPCRのアミノ酸配列に比べC末端が長ければ、目的のGPCRのアミノ酸配列のC末端にコンセンサスアミノ酸配列にのみ存在するC末端部を付加すればよい。
目的のGPCRのアミノ酸配列において改変されるアミノ酸残基数は、少なくとも1個であり、好ましくは少なくとも5個であり、より好ましくは少なくとも10個であり、目的のGPCRのアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の全てがこれらに相当する位置のコンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変される(すなわち、目的のGPCRのアミノ酸配列がコンセンサスアミノ酸配列に改変される)のがさらに好ましい。
あるいは、目的のGPCRのアミノ酸配列において改変されるアミノ酸残基数は、コンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基数の好ましくは少なくとも10%、より好ましくは少なくとも30%、さらに好ましくは少なくとも50%、さらに好ましくは少なくとも70%、さらに好ましくは少なくとも90%、さらに好ましくは100%(すなわち、目的のGPCRのアミノ酸配列がコンセンサスアミノ酸配列に改変される)の数であり得る。
尚、目的のGPCRのアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のN末端が長ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的のGPCRのアミノ酸配列のN末端にコンセンサスアミノ酸配列にのみ存在するN末端部を一体として付加して改変するのが好ましい。目的のGPCRのアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のN末端が短ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的のGPCRのアミノ酸配列のN末端から目的のGPCRのアミノ酸配列にのみ存在するN末端部を一体として欠失させて改変するのが好ましい。目的のGPCRのアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のC末端が長ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的のGPCRのアミノ酸配列のC末端にコンセンサスアミノ酸配列にのみ存在するC末端部を一体として付加して改変するのが好ましい。目的のGPCRのアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のC末端が短ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的のGPCRのアミノ酸配列のC末端から目的のGPCRのアミノ酸配列にのみ存在するC末端部を一体として欠失させて改変するのが好ましい。
本発明で用いられるGPCRポリペプチドとしては、その機能が損なわれない限り、上記のコンセンサスアミノ酸配列に基づく改変の対象アミノ酸位置以外のアミノ酸位置に1~数個(例えば、1~10個、1~5個、1~3個)のアミノ酸残基の置換、欠失、付加又は挿入を含むポリペプチドも本発明に含まれる。
あるいは、目的のGPCRのアミノ酸配列において改変されるアミノ酸残基数は、コンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基数の好ましくは少なくとも10%、より好ましくは少なくとも30%、さらに好ましくは少なくとも50%、さらに好ましくは少なくとも70%、さらに好ましくは少なくとも90%、さらに好ましくは100%(すなわち、目的のGPCRのアミノ酸配列がコンセンサスアミノ酸配列に改変される)の数であり得る。
尚、目的のGPCRのアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のN末端が長ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的のGPCRのアミノ酸配列のN末端にコンセンサスアミノ酸配列にのみ存在するN末端部を一体として付加して改変するのが好ましい。目的のGPCRのアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のN末端が短ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的のGPCRのアミノ酸配列のN末端から目的のGPCRのアミノ酸配列にのみ存在するN末端部を一体として欠失させて改変するのが好ましい。目的のGPCRのアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のC末端が長ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的のGPCRのアミノ酸配列のC末端にコンセンサスアミノ酸配列にのみ存在するC末端部を一体として付加して改変するのが好ましい。目的のGPCRのアミノ酸配列に比べコンセンサスアミノ酸配列のC末端が短ければ、アミノ酸残基数にかかわらず、目的のGPCRのアミノ酸配列のC末端から目的のGPCRのアミノ酸配列にのみ存在するC末端部を一体として欠失させて改変するのが好ましい。
本発明で用いられるGPCRポリペプチドとしては、その機能が損なわれない限り、上記のコンセンサスアミノ酸配列に基づく改変の対象アミノ酸位置以外のアミノ酸位置に1~数個(例えば、1~10個、1~5個、1~3個)のアミノ酸残基の置換、欠失、付加又は挿入を含むポリペプチドも本発明に含まれる。
本実施形態の好ましい一例において、GPCRポリペプチドは、下記表1-1及び1-2の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる。より好ましくは、該GPCRポリペプチドは、下記表1-1及び1-2の(3)の配列番号108~214及び275~312のいずれかで示されるアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチド、又は下記表1-1の(3)の配列番号112若しくは113で示されるアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドと配列番号114で示されるアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドとの組み合わせである。尚、配列番号108~112、114~120、138~145、167、183、187、192及び209のいずれかで示されるアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、オリジナルのGPCRに比べて、膜発現が高度に向上している。表1-1及び1-2において、No.1~145の(1)のGPCRはヒトGPCRであり、Accession No.とは、GenBankにおけるAccession No.を示す。
上記表1-1のNo.1~4の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、鋤鼻受容体ポリペプチドである。上記表1-1において、(3)の配列番号108~111のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる鋤鼻受容体ポリペプチドは、No.1~4の(1)の鋤鼻受容体の(2)の配列番号1~4のいずれかで示されるアミノ酸配列及び脊椎動物における該鋤鼻受容体のオルソログにコードされる鋤鼻受容体のアミノ酸配列から導き出されるコンセンサスアミノ酸配列からなるコンセンサス鋤鼻受容体である。
上記表1-1のNo.5~30の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、味覚受容体ポリペプチドである。このうち、No.5の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドと、No.7の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、うま味受容体複合体を形成する。また、No.6の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドと、No.7の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、甘味受容体複合体を形成する。一方、No.8~30の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、苦味受容体ポリペプチドである。上記表1-1において、(3)の配列番号112~137のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる味覚受容体ポリペプチドは、No.5~30の(1)の味覚受容体の(2)の配列番号5~30のいずれかで示されるアミノ酸配列及び脊椎動物における該味覚受容体のオルソログにコードされる味覚受容体のアミノ酸配列から導き出されるコンセンサスアミノ酸配列からなるコンセンサス味覚受容体である。
上記表1-1のNo.31~36の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、微量アミン関連受容体ポリペプチドである。上記表1-1において、(3)の配列番号138~143のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる微量アミン関連受容体ポリペプチドは、No.31~36の(1)の微量アミン関連受容体ポリペプチドの(2)の配列番号31~36のいずれかで示されるアミノ酸配列及び脊椎動物における該微量アミン関連受容体ポリペプチドのオルソログにコードされる微量アミン関連受容体ポリペプチドのアミノ酸配列から導き出されるコンセンサスアミノ酸配列からなるコンセンサス微量アミン関連受容体ポリペプチドである。そのうち、配列番号143で示されるアミノ酸配列からなる微量アミン関連受容体ポリペプチドは、上記基準(ii)において、目的の微量アミン関連受容体ポリペプチドのN末端構造をそのまま維持して得られたコンセンサスアミノ酸配列からなるコンセンサス微量アミン関連受容体である。
上記表1-1のNo.37~46の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、Mas関連Gタンパク質共役型受容体ポリペプチドである。上記表1-1において、(3)の配列番号144~153のいずれかで示されるアミノ酸配列からなるMas関連Gタンパク質共役型受容体ポリペプチドは、No.37~46の(1)のGPCRの(2)の配列番号37~46のいずれかで示されるアミノ酸配列及び脊椎動物における該Mas関連Gタンパク質共役型受容体のオルソログにコードされるMas関連Gタンパク質共役型受容体のアミノ酸配列から導き出されるコンセンサスアミノ酸配列からなるコンセンサスMas関連Gタンパク質共役型受容体である。
上記表1-1及び1-2のNo.47~108の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、GPRポリペプチドである。上記表1-1及び1-2において、(3)の配列番号154~214及び275のいずれかで示されるアミノ酸配列からなるGPRポリペプチドは、No.47~108の(1)のGPRの(2)の配列番号47~107及び237のいずれかで示されるアミノ酸配列及び脊椎動物における該GPRのオルソログにコードされるGPRのアミノ酸配列から導き出されるコンセンサスアミノ酸配列からなるコンセンサスGPRである。
上記表1-2のNo.109~145の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、鋤鼻受容体ポリペプチド、味覚受容体ポリペプチド、微量アミン関連受容体ポリペプチド、Mas関連Gタンパク質共役型受容体ポリペプチド、GPRポリペプチド、及び嗅覚受容体ポリペプチド以外のその他のGPCRポリペプチドである。上記表1-2において、(3)の配列番号276~312のいずれかで示されるアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドは、No.109~145の(1)のGPCRの(2)の配列番号238~274のいずれかで示されるアミノ酸配列及び脊椎動物における該GPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列から導き出されるコンセンサスアミノ酸配列からなるコンセンサスGPCRである。
本発明のGPCRポリペプチドの「発現」とは、当該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドから、翻訳産物が産生され、且つ翻訳産物が機能的な状態でその作用部位である細胞膜に局在することをいう。本発明のGPCRポリペプチドは、当技術分野で公知の手法により、細胞に発現させればよい。例えば、GPCRポリペプチドは、該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するベクターを宿主となる細胞に導入するか、又は該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むDNA断片を宿主となる細胞のゲノムに導入することで、該細胞の細胞膜に発現させることができる。好ましくは、GPCRポリペプチドは、該ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するベクターを用いて宿主細胞を形質転換することで、該宿主細胞の細胞膜に発現される。宿主細胞は、外来のGPCRを機能的に発現できる細胞であればよい。具体的な細胞の例としては、ヒト胚性腎臓細胞(HEK293細胞)、チャイニーズハムスター細胞(CHO細胞)、サル細胞(COS細胞)、単離嗅神経細胞、アフリカツメガエル卵母細胞、昆虫細胞、酵母または細菌等が挙げられるが、これに限定されない。
GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、当技術分野で公知の各種の変異導入技術を使用して得ることができる。例えば、GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、目的のGPCRのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドにおいて、改変すべきアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列を、改変後のアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列に改変することにより得ることができる。
目的のGPCRのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドへの目的の変異の導入は、当業者に周知の様々な部位特異的変異導入法を用いて行うことができる。部位特異的変異導入法は、例えば、インバースPCR法やアニーリング法などの任意の手法により行うことができる。市販の部位特異的変異導入用キット(例えば、Stratagene社のQuickChange II Site-Directed Mutagenesis Kitや、QuickChange Multi Site-Directed Mutagenesis Kit等)を使用することもできる。
あるいは、GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、人工DNA切断酵素(artificial DNA nucleases又はProgrammable nuclease)を用いたゲノム編集、そのヌクレオチド配列に基づいたDNA合成などによっても取得することができる。
GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、一本鎖又は二本鎖のDNA、cDNA、RNAもしくは他の人工核酸を含み得る。該DNA、cDNA及びRNAは、化学合成されていてもよい。また該ポリヌクレオチドは、オープンリーディングフレーム(ORF)に加えて、非翻訳領域(UTR)のヌクレオチド配列を含んでいてもよい。また該ポリヌクレオチドは、GPCRの発現用細胞の種にあわせて、コドンが最適化されていてもよい。各種生物が使用するコドンの情報は、Codon Usage Database([www.kazusa.or.jp/codon/])から入手可能である。
好ましい一例において、GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、配列番号215~234及び313~317のいずれかで示される塩基配列からなる。該ポリヌクレオチドは、それぞれ、配列番号108~112、114~120、138~145、167、183、187、192及び209で示されるアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドをコードする。
得られたGPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドは、ベクター又はDNA断片に組み込むことができる。好ましくは、該ベクターは発現ベクターである。また好ましくは、該ベクターは、GPCRポリヌクレオチドを宿主細胞に導入することができ、かつ宿主細胞内で該ポリヌクレオチドを発現することができる発現ベクターである。好ましくは、該ベクターは、プラスミド等の染色体外で自立増殖及び複製可能なベクターであってもよく、又は染色体内に組み込まれるベクターであってもよい。具体的なベクターの例としては、pME18Sが挙げられるが、これに限定されない。
該ベクターは、好ましくは、GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、及びこれと作動可能に連結された制御領域を含む。該制御領域は、該ベクターが導入された宿主細胞内で、導入されたGPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現させるための配列であり、例えば、プロモーターやターミネーター等の発現調節領域、転写開始点などが挙げられる。該制御領域の種類は、ベクターの種類に応じて適宜選択することができる。必要に応じて、該ベクター又はDNA断片はさらに、アンピシリン等の薬剤耐性遺伝子を選択マーカーとして有していてもよい。該制御領域及び選択マーカー遺伝子は、該ベクターに元々含まれているものを使用してもよく、又はGPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと一緒に又は別々に該ベクターに組み込まれてもよい。
GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するDNA断片の例としては、PCR増幅DNA断片及び制限酵素切断DNA断片が挙げられる。好ましくは、該DNA断片は、該ポリヌクレオチド、及びこれと作動可能に連結された制御領域を含む発現カセットであり得る。使用できる制御領域の例は、ベクターの場合と同様である。
好適には、GPCRポリペプチドの細胞膜発現を促進するために、GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとともに、RTP(receptor-transporting protein)をコードするポリヌクレオチド(本明細書において、RTP遺伝子ともいう)を細胞に導入する。あるいは、好適には、GPCRポリペプチドの細胞膜発現を促進するために、GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとともに、REEP(receptor expression enhancing protein)をコードするポリヌクレオチド(本明細書において、REEP遺伝子ともいう)を細胞に導入する。例えば、RTP遺伝子もしくはREEP遺伝子とGPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとを含むベクターを構築し、それを宿主細胞に導入してもよく、又はRTP遺伝子もしくはREEP遺伝子を含むベクターとGPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むベクターをそれぞれ宿主細胞に導入してもよい。RTPの例としてはRTP1S、RTP3及びRTP4が挙げられ、RTP1Sの例としては、ヒトRTP1Sが挙げられる。ヒトRTP1Sは、GenBankにAY562235として登録されており、配列番号235のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされる、配列番号236のアミノ酸配列からなるポリペプチドである。REEPの例としてはREEP1及びREEP2が挙げられ、REEP1の例としては、ヒトREEP1が、REEP2の例としては、ヒトREEP2が挙げられる。
宿主細胞へのベクター又はDNA断片の導入には、哺乳動物細胞に関して一般的な形質転換法、例えばエレクトロポレーション法、リポフェクション法、パーティクル・ガン法などを用いることができる。目的のベクター又はDNA断片が導入された形質転換細胞は、選択マーカーを利用して選択することができる。あるいは、細胞のDNAの配列を調べることで目的のベクター又はDNA断片の導入を確認することもできる。
上記手順で細胞に導入されたベクター又はDNA断片に含まれる本発明のGPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチドから該GPCRポリペプチドが産生され、細胞膜に組み込まれる。よって、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドは、該GPCRポリペプチドを発現するように遺伝的に操作された形質転換細胞の細胞膜に発現される。
本発明のGPCRポリペプチドの細胞膜発現(量)は、例えば、該GPCRポリペプチドに予めFLAGタグなどのタグを融合させておき、該タグを特異的に認識する抗体を用いてフローサイトメトリー法などの公知の手法により測定することができる。
本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドは、オリジナルのGPCRに比して培養細胞膜上で効率よく発現することができる。また、該GPCRポリペプチドの応答は、オリジナルのGPCRの応答を反映していると考えられる。したがって、別の一態様において本発明は、目的のGPCRの応答の測定方法を提供する。当該方法は、本発明のGPCRポリペプチドの発現方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、を含む。本発明の応答測定方法によれば、目的のGPCRの応答測定効率を改善でき、従来培養細胞の細胞膜での発現が不十分なために機能解析ができなかった目的のGPCRの応答の測定を可能にする。
本発明の応答測定方法に使用されるGPCRポリペプチドは、本発明の発現方法で発現されたGPCRポリペプチドであればよい。該GPCRポリペプチドについては、上述のとおりである。該GPCRポリペプチドの具体例としては、好ましくは、配列番号108~214及び275~312のいずれかで示されるアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチド、又は配列番号112若しくは113で示されるアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドと配列番号114で示されるアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドとの組み合わせが挙げられる。該GPCRポリペプチドは、リガンドに対する応答性を失わない限り、任意の形態で使用され得る。例えば、該GPCRポリペプチドは、該GPCRポリペプチドを発現する形質転換細胞又はその培養物、該GPCRポリペプチドを有する該形質転換細胞の膜、該GPCRポリペプチドを有する人工脂質二重膜、などの形態で使用され得る。好ましくは、該GPCRポリペプチドとして、該GPCRポリペプチドを発現する形質転換細胞又はその培養物が使用される。
本発明の応答測定方法において、GPCRポリペプチドの応答の測定は、GPCRの応答を測定する方法として当該分野で知られている任意の方法によって行えばよい。例えば、直接的若しくは間接的に細胞内cAMP量を測定する方法によって行えばよい。例えば、Gタンパク質共役型受容体は、リガンドによって活性化されると、細胞内のGsファミリーに分類されるGタンパク質αサブユニットもしくはGiファミリーに分類されるGタンパク質αサブユニットと共役してアデニル酸シクラーゼを活性化もしくは抑制することで、細胞内cAMP量を変動させることが知られている。一方で、Gタンパク質共役型受容体はリガンドにより活性化されると、細胞内でGαq、Gα16、Gα15などGqファミリーに属するタンパク質とも共役し、細胞内でカルシウムイオン量を増加させることもできる。したがって、細胞内カルシムイオン量、もしくはそれらを介して活性化する下流分子の挙動を指標にすることで、GPCRポリペプチドの応答を測定することができる。cAMP量を測定する方法としては、ELISA法やレポータージーンアッセイ等が挙げられる。カルシウムイオン濃度を測定する方法は、カルシウムイメージング法やTGFα shedding assayが挙げられる。TGFα shedding assayはGPCRが細胞内でGα12、Gα13と共役した場合、そのシグナルを測定するためにも有効である。また、cAMP量を介して活性化する下流分子の挙動を指標とした方法の例として、アフリカツメガエル卵母細胞において、cAMPシグナルにより活性化する嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子CFTRを介した細胞膜内外の電位変化を測定する二電極膜電位固定法も有効である。目的のGPCRと共役しやすいGタンパク質αサブユニットと、他の任意のGタンパク質αサブユニットとのキメラタンパク質を利用することで、上記の任意の応答測定方法を用いることができる。例えば、味覚受容体は様々なGタンパク質αサブユニットの中で、Giファミリーに属するものと効率よく共役できる。このことを踏まえて、Gαi3やGαgustのC末端側5アミノ酸をもつGα15(Gα15/i3、Gα15/gust)を利用することで、活性化した味覚受容体を由来とするシグナルを、本来の細胞内cAMP量の低下ではなく細胞内カルシウムイオン濃度の上昇として検出することができる。また、本発明に従いGPCRポリペプチドを細胞に発現させた細胞から該GPCRポリペプチドを精製した上で、リガンドとの結合性を評価してもよい。精製GPCRポリペプチドのリガンドとの結合性を評価する方法は、当該分野で知られている任意の方法によって行えばよい。例えば、リガンド添加条件でのGPCRポリペプチドから生じる熱量を測定する方法、及びGPCRポリペプチドの熱安定性の変化を評価する方法が挙げられる。
上述したように、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドは、オリジナルのGPCRに比して培養細胞膜上で効率よく発現することができ、該GPCRポリペプチドの応答はオリジナルのGPCRの応答を反映していると考えられるので、該GPCRポリペプチドを用いてオリジナルのGPCRのリガンドを探索することができる。したがって、別の一態様において本発明は、目的のGPCRのリガンドの探索方法を提供する。当該方法は、試験物質存在下で、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、及び該GPCRポリペプチドが応答した試験物質を選択すること、を含む。本発明のリガンド探索方法によれば、目的のGPCRのリガンド探索効率を改善でき、従来培養細胞の細胞膜での発現が十分でないために機能解析ができなかった目的のGPCRのリガンドの探索を可能にする。
本発明のリガンド探索方法に使用される試験物質は、目的のGPCRのリガンドであるか否かの確認を所望する物質であれば、特に制限されない。試験物質は、天然に存在する物質であっても、化学的もしくは生物学的方法などで人工的に合成した物質であってもよく、又は化合物であっても、組成物もしくは混合物であってもよい。
本発明のリガンド探索方法に使用されるGPCRポリペプチド及びその形態については、本発明の応答測定方法に使用されるGPCRポリペプチド及びその形態と同様である。
本発明のリガンド探索方法においては、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質が適用される。GPCRポリペプチドに試験物質を適用する手段としては、該GPCRポリペプチドを発現する細胞を培養する培地に試験物質を添加する方法などが挙げられるが、特に限定されない。
本発明のリガンド探索方法においては、GPCRポリペプチドへの試験物質の添加に続いて、該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答が測定される。応答を測定する方法としては、本発明の応答測定方法と同様の手法を使用できる。
次いで、測定されたGPCRポリペプチドの応答に基づいて、試験物質を評価する。該GPCRポリペプチドの応答を引き起こす試験物質は、該GPCRポリペプチドのリガンド、すなわちオリジナルのGPCRのリガンドと判定することができる。したがって、本発明のリガンド探索方法においては、該GPCRポリペプチドが応答した試験物質がオリジナルのGPCRのリガンドとして選択される。
好適には、試験物質に対するGPCRポリペプチドの応答は、試験物質を添加したGPCRポリペプチド(試験群)の応答を、対照群における該GPCRポリペプチドの応答と比較することによって評価することができる。対照群としては、試験物質を添加していない該GPCRポリペプチド、対照物質を添加した該GPCRポリペプチド、より低濃度の試験物質を添加した該GPCRポリペプチド、試験物質を添加する前の該GPCRポリペプチド、などを挙げることができる。試験群における応答が対照群と比べてより高い場合、該GPCRポリペプチドは該試験物質に応答したと評価され、該試験物質はオリジナルのGPCRのリガンドとして選択される。
したがって、本発明のリガンド探索方法の一実施形態においては、試験物質の存在下及び非存在下でのGPCRポリペプチドの応答が測定され、次いで、試験物質の存在下での応答が、試験物質非存在下での応答に比べて高いか否かが判定される。試験物質の存在下での応答がより高い場合、該試験物質はリガンドとして選択される。好ましい実施形態においては、試験物質の存在下でのGPCRポリペプチドの応答強度が、試験物質非存在下と比較して、好ましくは120%以上、より好ましくは150%以上、さらに好ましくは200%以上であれば、該試験物質はオリジナルのGPCRのリガンドとして選択される。別の好ましい実施形態においては、試験物質の存在下でのGPCRポリペプチドの応答強度が、試験物質非存在下と比較して統計学的に有意に増加していれば、該試験物質はオリジナルのGPCRのリガンドとして選択される。
また、上述したように、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドは、オリジナルのGPCRに比して培養細胞膜上で効率よく発現することができ、該GPCRポリペプチドの応答はオリジナルのGPCRの応答を反映していると考えられるので、該GPCRポリペプチドを用いてオリジナルのGPCRにおけるリガンドの認識を制御する物質を評価及び/又は選択することができる。したがって、別の一態様において本発明は、目的のGPCRのリガンドの認識の制御剤の評価及び/又は選択方法を提供する。当該方法は、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び標的のリガンドを添加すること、及び該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、を含む。一例において、鋤鼻受容体は、フェロモン受容体として機能すると考えられているので、GPCRポリペプチドとして鋤鼻受容体ポリペプチドを用いる場合、リガンドとしては、好ましくはフェロモン物質が挙げられる。また、別の一例において、GPCRポリペプチドとして味覚受容体ポリペプチドを用いる場合、リガンドとしては、好ましくは味物質(苦味物質、うま味物質、又は甘味物質)が挙げられる。目的のGPCRのリガンドとしては、本発明のリガンドの探索方法により選択されたリガンドが好ましい。本発明の制御剤の評価及び/又は選択方法によれば、標的のリガンドの認識を選択的に抑制又は増強することができる物質を効率よく評価又は選択することができる。
本発明の制御剤の評価及び/又は選択は、in vitro又はex vivoで行われる方法であり得る。
本発明の制御剤の評価及び/又は選択方法に使用される試験物質は、標的のリガンドの認識の制御剤として使用することを所望する物質であれば、特に制限されない。試験物質は、天然に存在する物質であっても、化学的若しくは生物学的方法等で人工的に合成した物質であってもよく、又は化合物であっても、組成物若しくは混合物であってもよい。
本発明の制御剤の評価及び/又は選択方法に使用されるGPCRポリペプチド及びその形態については、本発明の応答測定方法に使用されるGPCRポリペプチド及びその形態と同様である。
本発明の制御剤の評価及び/又は選択方法においては、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び標的のリガンドが適用される。GPCRポリペプチドに試験物質及び標的のリガンドを適用する手段としては、該GPCRポリペプチドを発現する細胞を培養する培地に試験物質及び標的のリガンドを添加する方法などが挙げられるが、特に限定されない。
本発明の制御剤の評価及び/又は選択方法においては、GPCRポリペプチドへの試験物質及び標的のリガンドの添加に続いて、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答が測定される。応答を測定する方法としては、本発明の応答測定方法と同様の手法を使用できる。
次いで、測定した応答に基づいて、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する試験物質を検出する。検出された試験物質は、該リガンドの認識の抑制剤として選択される。あるいは、測定した応答に基づいて、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を増強する試験物質を検出する。検出された試験物質は、該リガンドの認識の増強剤として選択される。
該GPCRポリペプチドの該リガンドに対する応答を抑制する試験物質は、該リガンドの認識の抑制剤として選択される。あるいは、該GPCRポリペプチドの該リガンドに対する応答を増強する試験物質は、該リガンドの認識の増強剤として選択される。該GPCRポリペプチドの該リガンドへの応答に対して該試験物質が及ぼす作用は、例えば、試験物質を添加した該GPCRポリペプチド(試験群)の該リガンドに対する応答を、対照群における該リガンドに対する応答と比較することによって評価することができる。対照群の例としては、試験物質を添加していない該GPCRポリペプチド、対照物質を添加した該GPCRポリペプチド、より低濃度の試験物質を添加した該GPCRポリペプチド、試験物質を添加する前の該GPCRポリペプチド、該GPCRポリペプチドが発現していない細胞、などを挙げることができる。好ましくは、本発明の抑制剤の評価及び/又は選択方法は、試験物質の存在下及び非存在下で、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの活性を測定することを含む。
例えば、試験群における応答が、対照群よりも抑制されていた場合、該試験物質を、標的のリガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を抑制する物質として同定することができる。例えば、試験群における該GPCRポリペプチドの応答が、対照群と比較して好ましくは60%以下、より好ましくは50%以下、さらに好ましくは25%以下に抑制されていれば、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を抑制する物質として同定することができる。あるいは、試験群における該GPCRポリペプチドの応答が、対照群と比較して統計学的に有意に抑制されていれば、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を抑制する物質として同定することができる。
あるいは、例えば、試験群における応答が、対照群よりも増強されていた場合、該試験物質を、標的のリガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を増強する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を増強する物質として同定することができる。例えば、試験群における該GPCRポリペプチドの応答が、対照群と比較して好ましくは120%以上、より好ましくは150%以上、さらに好ましくは200%以上に増強されていれば、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を増強する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を増強する物質として同定することができる。あるいは、試験群における該GPCRポリペプチドの応答が、対照群と比較して統計学的に有意に増強されていれば、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を増強する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を増強する物質として同定することができる。
本発明の制御剤の評価及び/又は選択方法の一実施形態においては、GPCRポリペプチドは本発明の発現方法により発現された鋤鼻受容体ポリペプチドであり、目的のGPCRのリガンドはフェロモン物質であり、リガンド認識の制御剤として、フェロモン抑制剤又はフェロモン増強剤が評価及び/又は選択される。本発明の制御剤の評価及び/又は選択方法の別の一実施形態においては、GPCRポリペプチドは本発明の発現方法により発現されたうま味受容体ポリペプチド(コンセンサスTAS1R1とコンセンサスTAS1R3との組み合わせ)であり、目的のGPCRのリガンドはうま味物質であり、リガンド認識の制御剤として、うま味抑制剤又はうま味増強剤が評価及び/又は選択される。本発明の制御剤の評価及び/又は選択方法の別の一実施形態においては、GPCRポリペプチドは本発明の発現方法により発現された甘味受容体ポリペプチド(コンセンサスTAS1R2とコンセンサスTAS1R3との組み合わせ)であり、目的のGPCRのリガンドは甘味物質であり、リガンド認識の制御剤として、甘味抑制剤又は甘味増強剤が評価及び/又は選択される。本発明の制御剤の評価及び/又は選択方法の別の一実施形態においては、GPCRポリペプチドは本発明の発現方法により発現された苦味受容体ポリペプチドであり、目的のGPCRのリガンドは苦味物質であり、リガンド認識の制御剤として、苦味抑制剤又は苦味増強剤が評価及び/又は選択される。
上記の手順で同定された試験物質は、標的のリガンドに対するGPCRの応答を制御することによって、個体による該リガンドの認識を制御することができる物質である。したがって、上記手順で同定された試験物質は、該リガンドの認識の制御剤として選択することができる。本発明の制御剤の評価及び/又は選択方法によって標的のリガンドの認識の制御剤として選択された物質は、該リガンドに対するGPCRの応答制御によって、該リガンドの認識を制御することができる。
したがって、一実施形態において、本発明のリガンドの認識の制御剤の評価及び/又は選択方法によって選択された物質は、該リガンドの認識の制御剤の有効成分であり得る。あるいは、本発明のリガンドの認識の制御剤の評価及び/又は選択方法によって選択された物質は、該リガンドの認識を制御するための化合物又は組成物に、該リガンドの認識を制御するための有効成分として含有され得る。またあるいは、本発明のリガンドの認識の制御剤の評価及び/又は選択方法によって選択された物質は、該リガンドの認識の制御剤の製造のため、又は該リガンドの認識を制御するための化合物若しくは組成物の製造のために使用することができる。該物質によれば、標的のリガンドの認識を抑制又は増強することができる。
また、上述したように、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドは、オリジナルのGPCRに比して培養細胞膜上で効率よく発現することができ、該GPCRポリペプチドの応答はオリジナルのGPCRの応答を反映していると考えられるので、該GPCRポリペプチドとして味覚受容体ポリペプチドを用いて試験物質の味を評価することができる。したがって、別の一態様において本発明は、味の評価方法を提供する。当該方法は、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、を含み、該GPCRポリペプチドが味覚受容体ポリペプチドである方法である。本発明の味評価方法によれば、試験物質の味を効率よく評価することができる。
本発明の味評価方法に使用される試験物質は、味(例えば、うま味、甘味、又は苦味)の有無又は程度の確認を所望する物質であれば、特に制限されない。試験物質は、天然に存在する物質であっても、化学的もしくは生物学的方法などで人工的に合成した物質であってもよく、又は化合物であっても、組成物もしくは混合物であってもよい。
本発明の味評価方法に使用されるGPCRポリペプチド及びその形態については、該GPCRポリペプチドが味覚受容体ポリペプチドである限りにおいて、本発明の応答測定方法に使用されるGPCRポリペプチド及びその形態と同様である。
本発明の味評価方法においては、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質が適用される。GPCRポリペプチドに試験物質を適用する手段としては、該GPCRポリペプチドを発現する細胞を培養する培地に試験物質を添加する方法などが挙げられるが、特に限定されない。
本発明の味評価方法においては、GPCRポリペプチドへの試験物質の添加に続いて、該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答が測定される。応答を測定する方法としては、本発明の応答測定方法と同様の手法を使用できる。
次いで、測定されたGPCRポリペプチドの応答に基づいて、試験物質を評価する。該GPCRポリペプチドの応答を引き起こす試験物質は、味(例えば、うま味、甘味、又は苦味)を呈する物質であると評価することができる。試験物質が引き起こす応答強度が大きい程、該試験物質の味の程度は大きい(例えば、よりうま味が強い、より甘味が強い、又はより苦味が強い)と評価される。
好適には、試験物質に対するGPCRポリペプチドの応答は、試験物質を添加したGPCRポリペプチド(試験群)の応答を、対照群における該GPCRポリペプチドの応答と比較することによって評価することができる。対照群としては、試験物質を添加していない該GPCRポリペプチド、対照物質を添加した該GPCRポリペプチド、より低濃度の試験物質を添加した該GPCRポリペプチド、試験物質を添加する前の該GPCRポリペプチド、などを挙げることができる。試験群における応答が対照群と比べてより高い場合、該試験物質は味を呈する物質であると評価される。
したがって、本発明の味評価方法の一実施形態においては、試験物質の存在下及び非存在下でのGPCRポリペプチドの応答が測定され、次いで、試験物質の存在下での応答が、試験物質非存在下での応答に比べて高いか否かが判定される。試験物質の存在下での応答がより高い場合、該試験物質は味を呈する物質であると評価される。好ましい実施形態においては、試験物質の存在下でのGPCRポリペプチドの応答強度が、試験物質非存在下と比較して、好ましくは120%以上、より好ましくは150%以上、さらに好ましくは200%以上であれば、該試験物質は味を呈する物質であると評価される。別の好ましい実施形態においては、試験物質の存在下でのGPCRポリペプチドの応答強度が、試験物質非存在下と比較して統計学的に有意に増加していれば、該試験物質は味を呈する物質であると評価される。
本発明の味評価方法の一実施形態においては、GPCRポリペプチドは本発明の発現方法により発現されたうま味受容体ポリペプチド(コンセンサスTAS1R1とコンセンサスTAS1R3との組み合わせ)であり、評価対象の味はうま味である。本発明の味評価方法の別の一実施形態においては、GPCRポリペプチドは本発明の発現方法により発現された甘味受容体ポリペプチド(コンセンサスTAS1R2とコンセンサスTAS1R3との組み合わせ)であり、評価対象の味は甘味である。本発明の味評価方法の別の一実施形態においては、GPCRポリペプチドは本発明の発現方法により発現された苦味受容体ポリペプチドであり、評価対象の味は苦味である。
また、上述したように、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドは、オリジナルのGPCRに比して培養細胞膜上で効率よく発現することができ、該GPCRポリペプチドの応答はオリジナルのGPCRの応答を反映していると考えられるので、該GPCRポリペプチドとして微量アミン関連受容体ポリペプチドを用いてオリジナルのGPCRにおけるリガンド(におい物質、具体的にはアミン)のにおい認識を抑制する物質を評価及び/又は選択することができる。該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質は、該GPCRポリペプチドのリガンド応答に変化を生じさせ、すなわちオリジナルのGPCRのリガンド応答に変化を生じさせ、結果として、受容体アンタゴニズムに基づいてリガンドのにおいを選択的に抑制することができる。一方、該GPCRポリペプチドの応答を増強する物質は、該GPCRポリペプチドのリガンド応答に変化を生じさせ、すなわちオリジナルのGPCRのリガンド応答に変化を生じさせ、結果として、受容体アゴニズムによるにおいの交差順応に基づいてリガンドのにおいを選択的に抑制することができる。
したがって、別の一態様において本発明は、目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法を提供する。当該方法は、試験物質添加後の該GPCRポリペプチドの応答を測定することを含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである方法である。測定された応答に基づいて、該GPCRポリペプチドの応答を抑制又は増強する試験物質が検出される。検出された試験物質は、標的のリガンドのにおいの抑制剤として選択される。すなわち、該GPCRポリペプチドの応答を抑制する試験物質は、受容体アンタゴニズムに基づく該リガンドのにおいの抑制剤として選択され、該GPCRポリペプチドの応答を増強する試験物質は、受容体アゴニズムによるにおいの交差順応に基づく該リガンドのにおいの抑制剤として選択される。目的のGPCRのリガンドとしては、本発明のリガンドの探索方法により選択されたリガンドが好ましい。本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法によれば、標的のリガンドのにおいを選択的に抑制することができる物質を効率よく評価又は選択することができ、標的のリガンドが従来培養細胞の細胞膜での発現が十分でないために機能解析ができなかったGPCRのリガンドである場合でも、該リガンドのにおいを選択的に抑制することができる物質を評価又は選択することができる。
本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択は、in vitro又はex vivoで行われる方法であり得る。
本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法に使用される試験物質は、標的のリガンドのにおいの抑制剤として使用することを所望する物質であれば、特に制限されない。試験物質は、天然に存在する物質であっても、化学的若しくは生物学的方法等で人工的に合成した物質であってもよく、又は化合物であっても、組成物若しくは混合物であってもよい。
本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法に使用されるGPCRポリペプチド及びその形態については、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである限りにおいて、本発明の応答測定方法に使用されるGPCRポリペプチド及びその形態と同様である。
本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法においては、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質が適用される。GPCRポリペプチドに試験物質を適用する手段としては、該GPCRポリペプチドを発現する細胞を培養する培地に試験物質を添加する方法などが挙げられるが、特に限定されない。
本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法においては、GPCRポリペプチドへの試験物質の添加に続いて、該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答が測定される。応答を測定する方法としては、本発明の応答測定方法と同様の手法を使用できる。
第一の実施形態において、本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法は、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び標的のリガンドを添加すること、及び該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、を含む。GPCRポリペプチドにリガンドを適用する方法としては、試験物質を適用する方法と同様の手法を使用できる。次いで、測定した応答に基づいて、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する試験物質を検出する。検出された試験物質は、該リガンドのにおいの抑制剤として選択される。
該第一の実施形態においては、該GPCRポリペプチドの該リガンドに対する応答を抑制する試験物質は、受容体アンタゴニズムに基づく該リガンドのにおいの抑制剤として選択される。該GPCRポリペプチドの該リガンドへの応答に対して該試験物質が及ぼす作用は、例えば、試験物質を添加した該GPCRポリペプチド(試験群)の該リガンドに対する応答を、対照群における該リガンドに対する応答と比較することによって評価することができる。対照群の例としては、試験物質を添加していない該GPCRポリペプチド、対照物質を添加した該GPCRポリペプチド、より低濃度の試験物質を添加した該GPCRポリペプチド、試験物質を添加する前の該GPCRポリペプチド、該GPCRポリペプチドが発現していない細胞、などを挙げることができる。好ましくは、該第一の実施形態における本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法は、試験物質の存在下及び非存在下で、該リガンドに対する該嗅GPCRポリペプチドの活性を測定することを含む。
例えば、試験群における応答が、対照群よりも抑制されていた場合、該試験物質を、標的のリガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を抑制する物質として同定することができる。例えば、試験群における該GPCRポリペプチドの応答が、対照群と比較して好ましくは60%以下、より好ましくは50%以下、さらに好ましくは25%以下に抑制されていれば、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を抑制する物質として同定することができる。あるいは、試験群における該GPCRポリペプチドの応答が、対照群と比較して統計学的に有意に抑制されていれば、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を抑制する物質として同定することができる。
第二の実施形態において、本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法は、本発明の発現方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、を含む。次いで、測定した応答に基づいて、標的のリガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を増強する試験物質を検出する。検出された試験物質は、該リガンドのにおいの抑制剤として選択される。
該GPCRポリペプチドの応答を増強する試験物質は、先にGPCRの応答を増強させておくことで、後で標的のリガンドに曝露されたときの該GPCRの応答を弱めることができる。結果、におい交差順応に基づいて、個体による該リガンドのにおいの認識を抑制することができる。したがって、該第二の実施形態では、受容体アゴニズムによるにおいの交差順応に基づくリガンドのにおいの抑制剤が選択される。
該GPCRポリペプチドに対する試験物質の作用は、例えば、試験物質を添加した該GPCRポリペプチド(試験群)の応答を、対照群における応答と比較することによって評価することができる。対照群の例としては、上述したものが挙げられる。好ましくは、該第二の実施形態における本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法は、試験物質の存在下および非存在下での該GPCRポリペプチドの活性を測定することを含む。また好ましくは、該第二の実施形態における本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法は、試験物質の存在下で、該GPCRポリペプチドが発現した細胞及び未発現の細胞の該リガンドに対する応答を測定することを含む。
例えば、試験群における応答が対照群と比べて増強されていた場合、該試験物質を、標的のリガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を抑制する物質として同定することができる。例えば、試験群における該GPCR体ポリペプチドの応答が、対照群と比較して、好ましくは120%以上、より好ましくは150%以上、さらに好ましくは200%に増強されていれば、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を抑制する物質として同定することができる。あるいは、試験群における該GPCRポリペプチドの応答が、対照群と比較して統計学的に有意に増強されていれば、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質、すなわち該リガンドに対するオリジナルのGPCRの応答を抑制する物質として同定することができる。
上記の手順で同定された試験物質は、標的のリガンドに対するGPCRの応答を抑制することによって、個体による該リガンドのにおいの認識を抑制することができる物質である。したがって、上記手順で同定された試験物質は、該リガンドのにおいの抑制剤として選択することができる。本発明のにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法によって標的のリガンドのにおいの抑制剤として選択された物質は、該リガンドに対するGPCRの応答抑制によって、該リガンドのにおいを抑制することができる。
したがって、一実施形態において、本発明のリガンドのにおい抑制剤の評価及び/又は選択方法によって選択された物質は、該リガンドのにおいの抑制剤の有効成分であり得る。あるいは、本発明のリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法によって選択された物質は、該リガンドのにおいを抑制するための化合物又は組成物に、該リガンドのにおいを抑制するための有効成分として含有され得る。またあるいは、本発明のリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法によって選択された物質は、該リガンドのにおいの抑制剤の製造のため、又は該リガンドのにおいを抑制するための化合物若しくは組成物の製造のために使用することができる。該物質によれば、従来の消臭剤または芳香剤を用いる消臭方法において生じていた芳香剤の強いにおいに基づく不快感等や、他のにおいをも抑えてしまうという問題を生じることがなく、標的のリガンドのにおいを消臭することができる。
本発明の例示的実施形態として、さらに以下の組成物、製造方法、用途あるいは方法を本明細書に開示する。ただし、本発明はこれらの実施形態に限定されない。
〔1〕GPCRポリペプチドの発現方法であって、
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
方法。
〔2〕GPCRポリペプチドの発現向上方法である、〔1〕記載の方法。
〔3〕目的のGPCRの機能化方法であって、
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
方法。
〔4〕前記オルソログが、哺乳類、鳥類、爬虫類、両生類及び魚類におけるオルソログから選択されるオルソログ、好ましくは哺乳類、鳥類、爬虫類及び両生類におけるオルソログから選択されるオルソログ、より好ましくは哺乳類におけるオルソログである、〔1〕~〔3〕のいずれか1項記載の方法。
〔5〕前記コンセンサスアミノ酸配列が、前記アラインメントから以下の(i)~(iii)の基準に従い同定したコンセンサス残基からなるアミノ酸配列である、〔1〕~〔4〕のいずれか1項記載の方法:
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的のGPCRのアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。
〔6〕前記アラインメントが、前記目的のGPCRのアミノ酸配列と、前記脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRであって、少なくとも2種、好ましくは少なくとも5種、より好ましくは少なくとも11種、さらに好ましくは少なくとも15種、さらに好ましくは少なくとも30種、さらに好ましくは少なくとも100種のGPCRのアミノ酸配列とのアラインメントである、〔1〕~〔5〕のいずれか1項記載の方法。
〔7〕前記目的のGPCRがヒトGPCRである、〔1〕~〔6〕のいずれか1項記載の方法。
〔8〕前記目的のGPCRが、鋤鼻受容体、味覚受容体、微量アミン関連受容体、Mas関連Gタンパク質共役型受容体、又はGPRである、〔1〕~〔7〕のいずれか1項記載の方法。
〔9〕前記GPCRポリペプチドが、好ましくは下記表2-1及び2-2の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、〔1〕~〔8〕のいずれか1項記載の方法。
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
方法。
〔2〕GPCRポリペプチドの発現向上方法である、〔1〕記載の方法。
〔3〕目的のGPCRの機能化方法であって、
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
方法。
〔4〕前記オルソログが、哺乳類、鳥類、爬虫類、両生類及び魚類におけるオルソログから選択されるオルソログ、好ましくは哺乳類、鳥類、爬虫類及び両生類におけるオルソログから選択されるオルソログ、より好ましくは哺乳類におけるオルソログである、〔1〕~〔3〕のいずれか1項記載の方法。
〔5〕前記コンセンサスアミノ酸配列が、前記アラインメントから以下の(i)~(iii)の基準に従い同定したコンセンサス残基からなるアミノ酸配列である、〔1〕~〔4〕のいずれか1項記載の方法:
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的のGPCRのアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。
〔6〕前記アラインメントが、前記目的のGPCRのアミノ酸配列と、前記脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRであって、少なくとも2種、好ましくは少なくとも5種、より好ましくは少なくとも11種、さらに好ましくは少なくとも15種、さらに好ましくは少なくとも30種、さらに好ましくは少なくとも100種のGPCRのアミノ酸配列とのアラインメントである、〔1〕~〔5〕のいずれか1項記載の方法。
〔7〕前記目的のGPCRがヒトGPCRである、〔1〕~〔6〕のいずれか1項記載の方法。
〔8〕前記目的のGPCRが、鋤鼻受容体、味覚受容体、微量アミン関連受容体、Mas関連Gタンパク質共役型受容体、又はGPRである、〔1〕~〔7〕のいずれか1項記載の方法。
〔9〕前記GPCRポリペプチドが、好ましくは下記表2-1及び2-2の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、〔1〕~〔8〕のいずれか1項記載の方法。
〔10〕前記GPCRポリペプチドが、好ましくは配列番号108~142、144~214及び275~312のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる、〔9〕記載の方法。
〔11〕GPCRポリペプチドの発現方法であって、
目的のGPCRのアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該GPCRポリペプチドが、ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号143で示されるアミノ酸配列からなるものである、
方法。
〔12〕GPCRポリペプチドの発現向上方法である、〔11〕記載の方法。
〔13〕目的のGPCRの機能化方法であって、
目的のGPCRのアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該GPCRポリペプチドが、ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号143で示されるアミノ酸配列からなるものである、
方法。
〔14〕前記GPCRポリペプチドが前記細胞の細胞膜に発現するものである、〔1〕~〔13〕のいずれか1項記載の方法。
〔15〕好ましくは、RTP1Sを前記細胞に発現させることをさらに含む、〔1〕~〔14〕のいずれか1項記載の方法。
〔16〕前記細胞がHEK293細胞である、〔1〕~〔15〕のいずれか1項記載の方法。
〔11〕GPCRポリペプチドの発現方法であって、
目的のGPCRのアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該GPCRポリペプチドが、ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号143で示されるアミノ酸配列からなるものである、
方法。
〔12〕GPCRポリペプチドの発現向上方法である、〔11〕記載の方法。
〔13〕目的のGPCRの機能化方法であって、
目的のGPCRのアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該GPCRポリペプチドが、ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号143で示されるアミノ酸配列からなるものである、
方法。
〔14〕前記GPCRポリペプチドが前記細胞の細胞膜に発現するものである、〔1〕~〔13〕のいずれか1項記載の方法。
〔15〕好ましくは、RTP1Sを前記細胞に発現させることをさらに含む、〔1〕~〔14〕のいずれか1項記載の方法。
〔16〕前記細胞がHEK293細胞である、〔1〕~〔15〕のいずれか1項記載の方法。
〔17〕目的のGPCRの応答の測定方法であって、
〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
〔18〕目的のGPCRのリガンドの探索方法であって、
試験物質存在下で、〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、及び
該GPCRポリペプチドが応答した試験物質を選択すること
、を含む方法。
〔19〕好ましくは、試験物質非存在下での前記GPCRポリペプチドの応答を測定することをさらに含む、〔18〕記載の方法。
〔20〕好ましくは、前記試験物質存在下での前記GPCRポリペプチドの応答を、前記試験物質非存在下での応答の120%以上に増加させる試験物質を選択する、〔19〕記載の方法。
〔21〕好ましくは、前記試験物質存在下での前記GPCRポリペプチドの応答を、前記試験物質非存在下での応答と比べて統計学的に有意に増加させる試験物質を選択する、〔19〕記載の方法。
〔22〕目的のGPCRのリガンドの認識の制御剤の評価及び/又は選択方法であって、
〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び目的のGPCRのリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
〔23〕前記リガンドが〔18〕~〔21〕のいずれか1項記載の方法により選択されたリガンドである、〔22〕記載の方法。
〔24〕測定された応答に基づいて前記GPCRポリペプチドの応答を制御する試験物質、好ましくは抑制又は増強する試験物質を同定することをさらに含む、〔22〕又は〔23〕のいずれか1項記載の方法。
〔25〕前記試験物質を添加しなかった前記GPCRポリペプチドの前記リガンドに対する応答を測定することをさらに含む、〔22〕~〔24〕のいずれか1項記載の方法。
〔26〕前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの前記リガンドに対する応答が、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの該リガンドに対する応答よりも抑制されていたときに、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質として同定するか、前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの前記リガンドに対する応答が、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの該リガンドに対する応答よりも増強されていたときに、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を増強する物質として同定することをさらに含む、〔25〕記載の方法。
〔27〕味の評価方法であって、
〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが味覚受容体ポリペプチドである、
方法。
〔28〕好ましくは、前記試験物質を添加しなかった前記GPCRポリペプチドの応答を測定することをさらに含む、〔27〕記載の方法。
〔29〕好ましくは、前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの応答を、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの応答の120%以上に増加させる試験物質を、味を呈する物質と評価する、〔28〕記載の方法。
〔30〕好ましくは、前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの応答を、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの応答と比べて統計学的に有意に増加させる試験物質を、味を呈する物質と評価する、〔28〕記載の方法。
〔31〕好ましくは、前記味がうま味、甘味、又は苦味である、〔27〕~〔30〕のいずれか1項記載の方法。
〔32〕目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び目的のGPCRのリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである、
方法。
〔33〕前記リガンドが〔18〕~〔21〕のいずれか1項記載の方法により選択されたリガンドである、〔32〕記載の方法。
〔34〕測定された応答に基づいて前記GPCRポリペプチドの応答を抑制する試験物質を同定することをさらに含む、〔32〕又は〔33〕記載の方法。
〔35〕前記試験物質を添加しなかった前記GPCRポリペプチドの前記リガンドに対する応答を測定することをさらに含む、〔32〕~〔34〕のいずれか1項記載の方法。
〔36〕前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの前記リガンドに対する応答が、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの該リガンドに対する応答よりも抑制されていたときに、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質として同定することをさらに含む、〔35〕記載の方法。
〔37〕目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである、
方法。
〔38〕前記リガンドが〔18〕~〔21〕のいずれか1項記載の方法により選択されたリガンドである、〔37〕記載の方法。
〔39〕測定された応答に基づいて前記GPCRポリペプチドの応答を増強する試験物質を同定することをさらに含む、〔37〕又は〔38〕記載の方法。
〔40〕前記試験物質を添加しなかった前記GPCRポリペプチドの応答を測定することをさらに含む、〔37〕~〔39〕のいずれか1項記載の方法。
〔41〕前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの応答が、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの応答よりも増強されていたときに、該試験物質を、前記リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質として同定することをさらに含む、〔40〕記載の方法。
〔42〕好ましくは、前記GPCRポリペプチドの応答が、ELISAもしくはレポータージーンアッセイによる細胞内cAMP量測定、カルシウムイメージングもしくはTGFα shedding assayによるカルシウムイオン量測定、又はアフリカツメガエル卵母細胞を用いた二電極膜電位固定法による細胞膜内外の電位変化測定により測定される、〔17〕~〔41〕のいずれか1項記載の方法。
〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
〔18〕目的のGPCRのリガンドの探索方法であって、
試験物質存在下で、〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、及び
該GPCRポリペプチドが応答した試験物質を選択すること
、を含む方法。
〔19〕好ましくは、試験物質非存在下での前記GPCRポリペプチドの応答を測定することをさらに含む、〔18〕記載の方法。
〔20〕好ましくは、前記試験物質存在下での前記GPCRポリペプチドの応答を、前記試験物質非存在下での応答の120%以上に増加させる試験物質を選択する、〔19〕記載の方法。
〔21〕好ましくは、前記試験物質存在下での前記GPCRポリペプチドの応答を、前記試験物質非存在下での応答と比べて統計学的に有意に増加させる試験物質を選択する、〔19〕記載の方法。
〔22〕目的のGPCRのリガンドの認識の制御剤の評価及び/又は選択方法であって、
〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び目的のGPCRのリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。
〔23〕前記リガンドが〔18〕~〔21〕のいずれか1項記載の方法により選択されたリガンドである、〔22〕記載の方法。
〔24〕測定された応答に基づいて前記GPCRポリペプチドの応答を制御する試験物質、好ましくは抑制又は増強する試験物質を同定することをさらに含む、〔22〕又は〔23〕のいずれか1項記載の方法。
〔25〕前記試験物質を添加しなかった前記GPCRポリペプチドの前記リガンドに対する応答を測定することをさらに含む、〔22〕~〔24〕のいずれか1項記載の方法。
〔26〕前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの前記リガンドに対する応答が、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの該リガンドに対する応答よりも抑制されていたときに、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質として同定するか、前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの前記リガンドに対する応答が、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの該リガンドに対する応答よりも増強されていたときに、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を増強する物質として同定することをさらに含む、〔25〕記載の方法。
〔27〕味の評価方法であって、
〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが味覚受容体ポリペプチドである、
方法。
〔28〕好ましくは、前記試験物質を添加しなかった前記GPCRポリペプチドの応答を測定することをさらに含む、〔27〕記載の方法。
〔29〕好ましくは、前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの応答を、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの応答の120%以上に増加させる試験物質を、味を呈する物質と評価する、〔28〕記載の方法。
〔30〕好ましくは、前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの応答を、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの応答と比べて統計学的に有意に増加させる試験物質を、味を呈する物質と評価する、〔28〕記載の方法。
〔31〕好ましくは、前記味がうま味、甘味、又は苦味である、〔27〕~〔30〕のいずれか1項記載の方法。
〔32〕目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び目的のGPCRのリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである、
方法。
〔33〕前記リガンドが〔18〕~〔21〕のいずれか1項記載の方法により選択されたリガンドである、〔32〕記載の方法。
〔34〕測定された応答に基づいて前記GPCRポリペプチドの応答を抑制する試験物質を同定することをさらに含む、〔32〕又は〔33〕記載の方法。
〔35〕前記試験物質を添加しなかった前記GPCRポリペプチドの前記リガンドに対する応答を測定することをさらに含む、〔32〕~〔34〕のいずれか1項記載の方法。
〔36〕前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの前記リガンドに対する応答が、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの該リガンドに対する応答よりも抑制されていたときに、該試験物質を、該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質として同定することをさらに含む、〔35〕記載の方法。
〔37〕目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
〔1〕~〔16〕のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである、
方法。
〔38〕前記リガンドが〔18〕~〔21〕のいずれか1項記載の方法により選択されたリガンドである、〔37〕記載の方法。
〔39〕測定された応答に基づいて前記GPCRポリペプチドの応答を増強する試験物質を同定することをさらに含む、〔37〕又は〔38〕記載の方法。
〔40〕前記試験物質を添加しなかった前記GPCRポリペプチドの応答を測定することをさらに含む、〔37〕~〔39〕のいずれか1項記載の方法。
〔41〕前記試験物質を添加した前記GPCRポリペプチドの応答が、該試験物質を添加しなかった該GPCRポリペプチドの応答よりも増強されていたときに、該試験物質を、前記リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を抑制する物質として同定することをさらに含む、〔40〕記載の方法。
〔42〕好ましくは、前記GPCRポリペプチドの応答が、ELISAもしくはレポータージーンアッセイによる細胞内cAMP量測定、カルシウムイメージングもしくはTGFα shedding assayによるカルシウムイオン量測定、又はアフリカツメガエル卵母細胞を用いた二電極膜電位固定法による細胞膜内外の電位変化測定により測定される、〔17〕~〔41〕のいずれか1項記載の方法。
〔43〕改変GPCRポリペプチドであって、
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
改変GPCRポリペプチド。
〔44〕前記オルソログが、哺乳類、鳥類、爬虫類、両生類及び魚類におけるオルソログから選択されるオルソログ、好ましくは哺乳類、鳥類、爬虫類及び両生類におけるオルソログから選択されるオルソログ、より好ましくは哺乳類におけるオルソログである、〔43〕記載の改変GPCRポリペプチド。
〔45〕前記コンセンサスアミノ酸配列が、前記アラインメントから以下の(i)~(iii)の基準に従い同定したコンセンサス残基からなるアミノ酸配列である、〔43〕又は〔44〕記載の改変GPCRポリペプチド:
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的のGPCRのアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。
〔46〕前記アラインメントが、前記目的のGPCRのアミノ酸配列と、前記脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRであって、少なくとも2種、好ましくは少なくとも5種、より好ましくは少なくとも11種、さらに好ましくは少なくとも15種、さらに好ましくは少なくとも30種、さらに好ましくは少なくとも100種のGPCRのアミノ酸配列とのアラインメントである、〔43〕~〔45〕のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチド。
〔47〕前記目的のGPCRがヒトGPCRである、〔43〕~〔46〕のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチド。
〔48〕前記目的のGPCRが、鋤鼻受容体、味覚受容体、微量アミン関連受容体、Mas関連Gタンパク質共役型受容体、又はGPRである、〔43〕~〔47〕のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチド。
〔49〕好ましくは、上記表2-1及び2-2の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、〔43〕~〔48〕のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチド。
〔50〕好ましくは、配列番号108~142、144~214及び275~312のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる、〔49〕記載の改変GPCRポリペプチド。
〔51〕改変GPCRポリペプチドであって、
ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号143で示されるアミノ酸配列からなるものである、
改変GPCRポリペプチド。
〔52〕〔43〕~〔51〕のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
〔53〕配列番号215~234及び313~317のいずれかで示される塩基配列からなる、〔52〕記載のポリヌクレオチド。
〔54〕〔52〕又は〔53〕記載のポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片。
〔55〕〔54〕記載のベクター又はDNA断片を含有する形質転換細胞。
〔56〕好ましくは、RTP1Sをコードするポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片をさらに含む、〔55〕記載の形質転換細胞。
〔57〕前記細胞がHEK293細胞である、〔55〕又は〔56〕記載の形質転換細胞。
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
改変GPCRポリペプチド。
〔44〕前記オルソログが、哺乳類、鳥類、爬虫類、両生類及び魚類におけるオルソログから選択されるオルソログ、好ましくは哺乳類、鳥類、爬虫類及び両生類におけるオルソログから選択されるオルソログ、より好ましくは哺乳類におけるオルソログである、〔43〕記載の改変GPCRポリペプチド。
〔45〕前記コンセンサスアミノ酸配列が、前記アラインメントから以下の(i)~(iii)の基準に従い同定したコンセンサス残基からなるアミノ酸配列である、〔43〕又は〔44〕記載の改変GPCRポリペプチド:
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的のGPCRのアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。
〔46〕前記アラインメントが、前記目的のGPCRのアミノ酸配列と、前記脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRであって、少なくとも2種、好ましくは少なくとも5種、より好ましくは少なくとも11種、さらに好ましくは少なくとも15種、さらに好ましくは少なくとも30種、さらに好ましくは少なくとも100種のGPCRのアミノ酸配列とのアラインメントである、〔43〕~〔45〕のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチド。
〔47〕前記目的のGPCRがヒトGPCRである、〔43〕~〔46〕のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチド。
〔48〕前記目的のGPCRが、鋤鼻受容体、味覚受容体、微量アミン関連受容体、Mas関連Gタンパク質共役型受容体、又はGPRである、〔43〕~〔47〕のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチド。
〔49〕好ましくは、上記表2-1及び2-2の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、〔43〕~〔48〕のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチド。
〔50〕好ましくは、配列番号108~142、144~214及び275~312のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる、〔49〕記載の改変GPCRポリペプチド。
〔51〕改変GPCRポリペプチドであって、
ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、好ましくは配列番号143で示されるアミノ酸配列からなるものである、
改変GPCRポリペプチド。
〔52〕〔43〕~〔51〕のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
〔53〕配列番号215~234及び313~317のいずれかで示される塩基配列からなる、〔52〕記載のポリヌクレオチド。
〔54〕〔52〕又は〔53〕記載のポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片。
〔55〕〔54〕記載のベクター又はDNA断片を含有する形質転換細胞。
〔56〕好ましくは、RTP1Sをコードするポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片をさらに含む、〔55〕記載の形質転換細胞。
〔57〕前記細胞がHEK293細胞である、〔55〕又は〔56〕記載の形質転換細胞。
以下、実施例を示し、本発明をより具体的に説明する。
実施例1 コンセンサス受容体の作製及び解析
1)受容体遺伝子の作製
コンセンサス受容体をデザインするにあたり、目的の受容体遺伝子の相同遺伝子候補の検索はNCBI BLASTを用いて行った。得られた遺伝子群についてオルソログ群を特定した。
具体的には、ヒト受容体(GPCR)を目的の受容体とするとき、オルソログの特定では、BLASTにより検索された相同性上位の遺伝子から、目的の受容体と同じ名称をもつ遺伝子をオルソログとして選択した。
例えばヒト微量アミン関連受容体であるTAAR1の場合、ヒトTAAR1(NP_612200.1)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にTAAR1を含む249遺伝子をオルソログとして特定した。これら249遺伝子にヒトTAAR1を加えた計250遺伝子(表3-1~4)のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトTAAR2、TAAR5、TAAR6、TAAR8及びTAAR9についても、同様にしてオルソログ群を特定した。ヒトTAAR6、TAAR8又はTAAR9を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ及び霊長目以外の目の哺乳類のオルソログであり、TAAR2又はTAAR5を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ、霊長目以外の目の哺乳類のオルソログ及び鳥類のオルソログであり、TAAR1を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ、霊長目以外の目の哺乳類のオルソログ、鳥類のオルソログ、爬虫類のオルソログ及び両生類のオルソログであった。
例えばヒト鋤鼻受容体であるVN1R1の場合、ヒトVN1R1(NP_065684.1)のアミノ酸配列をquery配列として、BLAST検索を行うと、相同性上位の250遺伝子の中に名称にvomeronasal type-1 receptor 1を含む遺伝子は22個特定された。VN1Rは、相同遺伝子間の多様性が大きい受容体遺伝子ファミリーであり、それら相同遺伝子のうちヒトVN1R1と65%以上のアミノ酸同一性をもつ7遺伝子をオルソログとして特定した。これら7遺伝子にヒトVN1R1を加えた計8遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトVN1R2、VN1R4及びVN1R5についても、同様にしてオルソログ群を特定した。VN1R1、VN1R2、VN1R4又はVN1R5を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは哺乳類(霊長目)のオルソログであった。
例えばヒト味覚受容体(うま味受容体)であるTAS1R1の場合、ヒトTAS1R1(NP_619642.2)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にTAS1R1を含む249遺伝子をオルソログとして特定した。これら249遺伝子にヒトTAS1R1を加えた計250遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトTAS1R2及びTAS1R3についても、同様にしてオルソログ群を特定した。TAS1R1、TAS1R2又はTAS1R3を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ、霊長目以外の目の哺乳類のオルソログ、鳥類のオルソログ、爬虫類のオルソログ、両生類のオルソログ及び魚類のオルソログであった。
例えばヒト味覚受容体(苦味受容体)であるTAS2R8の場合、ヒトTAS2R8(NP_076407.1)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にTAS2R8を含む90遺伝子をオルソログとして特定した。これら90遺伝子にヒトTAS2R8を加えた計91遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトTAS2R16、TAS2R38、TAS2R42、TAS2R45、TAS2R46、TAS2R31、TAS2R1、TAS2R3、TAS2R4、TAS2R5、TAS2R7、TAS2R9、TAS2R10、TAS2R13、TAS2R14、TAS2R20、TAS2R30、TAS2R39、TAS2R40、TAS2R43、TAS2R50及びTAS2R60についても、同様にしてオルソログ群を特定した。ヒトTAS2R45を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログであり、ヒトTAS2R8、TAS2R16、TAS2R38、TAS2R42又はTAS2R46を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ及び霊長目以外の目の哺乳類のオルソログであった。
例えばヒトMas関連Gタンパク質共役型受容体であるMrgprEの場合、ヒトMrgprE(NP_001034254.2)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にMrgprEを含む72遺伝子をオルソログとして特定した。これら72遺伝子にヒトMrgprEを加えた計73遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトMrgprF、MAS1、MAS1L、MRGPRD、MRGPRG、MRGPRX1、MRGPRX2、MRGPRX3及びMRGPRX4についても、同様にしてオルソログ群を特定した。ヒトMrgprE又はMrgprFを目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ及び霊長目以外の目の哺乳類のオルソログであった。
例えば、ヒトGPRであるGPR3の場合、ヒトGPR3(NP_005272.1)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にGPR3を含む234遺伝子をオルソログとして特定した。これら234遺伝子にヒトGPR3を加えた計235遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。表4に記載のGPR3、GPR17、GPR31、GPR50、GPR65、GPR68及びGPR42以外のヒトGPRについても、同様にしてオルソログ群を特定した。尚、ヒトGPR17の場合は名称にオルソログとして知られる「uracil nucleotide/cysteinyl leukotriene receptor」を含む遺伝子をオルソログとして特定した。同様に、ヒトGPR31の場合は名称に「12-(S)-hydroxy-5,8,10,14-eicosatetraenoic acid receptor」を含む遺伝子を、ヒトGPR50の場合は名称に「melatonin-related receptor」を含む遺伝子を、ヒトGPR65の場合は名称に「psychosine receptor」を含む遺伝子を、ヒトGPR68の場合は名称に「ovarian cancer G-protein coupled receptor 1」を含む遺伝子を、それぞれオルソログとして特定した。また、ヒトGPR42の場合は名称に「GPR42」を含む遺伝子及び名称に「free fatty acid receptor 3」を含む遺伝子(GPR42遺伝子と相同性が高いGPCR遺伝子)をオルソログとして特定した。
上記以外のヒトGPCRのうち、ADGRB1の場合、ヒトADGRB1(NP_001693.2)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にADGRB1を含む234遺伝子をオルソログとして特定した。これら234遺伝子にヒトADGRB1を加えた計235遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトADGRB2、ADGRB3及びADGRD1についても、同様にしてオルソログ群を特定した。また、ヒトADGRA1の場合は名称に「ADGRA1」を含む遺伝子及び名称に「GPR123」を含む遺伝子(ADGRA1遺伝子と相同性が高いGPCR遺伝子)をオルソログとして特定した。同様に、ヒトADGRA2の場合は名称に「ADGRA2」を含む遺伝子及び名称に「GPR124」を含む遺伝子を、ヒトADGRA3の場合は名称に「ADGRA3」を含む遺伝子及び名称に「GPR125」を含む遺伝子を、それぞれオルソログとして特定した。また、ヒトADGRC1の場合は名称に「EGF LAG seven-pass G-type receptor 1」を含む遺伝子(ADGRC1遺伝子と相同性が高いGPCR遺伝子)をオルソログとして特定した。同様に、ヒトADGRC2の場合は名称に「cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 2」を含む遺伝子を、ヒトADGRC3の場合は名称に「cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 3」を含む遺伝子を、ヒトADGRD2の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor D2」又は「G-protein coupled receptor 144」を含む遺伝子を、ヒトADGRE1の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor E1」又は「adhesion G protein-coupled receptor E1 isoform 2 precursor」を含む遺伝子を、ヒトADGRE2の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor E2」を含む遺伝子を、ヒトADGRE3の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor E3」を含む遺伝子を、ヒトADGRE5の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor E5」又は「CD97 antigen」を含む遺伝子を、ヒトADGRF1の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor F1」又は「adhesion G-protein coupled receptor F1 isoform 1 precursor」を含む遺伝子を、ヒトADGRF3の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor F3」又は「G-protein coupled receptor 113」を含む遺伝子を、ヒトADGRF4の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor F4」又は「G-protein coupled receptor 115」を含む遺伝子を、ヒトADGRF5の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor F5」又は「G-protein coupled receptor 116」を含む遺伝子を、ヒトADGRG1の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G1」又は「adhesion G-protein coupled receptor G1 isoform b precursor」を含む遺伝子を、ヒトADGRG2の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G2」又は「G-protein coupled receptor 64」を含む遺伝子を、ヒトADGRG4の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G4」又は「G-protein coupled receptor 112」を含む遺伝子を、ヒトADGRG5の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G5」又は「G-protein coupled receptor 114」を含む遺伝子を、ヒトADGRG6の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G6」又は「G-protein coupled receptor 126」を含む遺伝子を、ヒトADGRG7の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G7」又は「adhesion G-protein coupled receptor G7 isoform 2 precursor」を含む遺伝子を、ヒトADGRL1の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor L1」又は「adhesion G protein-coupled receptor L1 isoform 1 precursor」を含む遺伝子を、ヒトADGRL2の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor L2」又は「latrophilin and seven transmembrane domain-containing protein」を含む遺伝子を、ヒトADGRL3の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor L3」又は「latrophilin-3」を含む遺伝子を、ヒトADGRL4の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor L4」又は「latrophilin-2 isoform」を含む遺伝子を、ヒトChrm-4/M4Rの場合は名称に「M4R」を含む遺伝子を、ヒトF2RL1の場合は名称に「proteinase-activated receptor 2」を含む遺伝子を、ヒトGRM5の場合は名称に「metabotropic glutamate receptor 5」を含む遺伝子を、ヒトAPLNRの場合は名称に「apelin receptor」を含む遺伝子を、ヒトCALCRLの場合は名称に「calcitonin gene-related peptide type 1」を含む遺伝子を、ヒトGLP2Rの場合は名称に「glucagon-like peptide 2 receptor」を含む遺伝子を、ヒトMC4Rの場合は名称に「MC4R」、「Melanocortin receptor 4」、「Melanocortin-4 receptor」又は「Melanocortin 4 receptor」を含む遺伝子を、ヒトCCR6の場合は名称に「C-C chemokine receptor type 6」を含む遺伝子を、それぞれオルソログとして特定した。
表4に、各ヒトGPCRについて、該ヒトGPCRの遺伝子と特定したオルソログの合計数を参照遺伝子数として示す。
1)受容体遺伝子の作製
コンセンサス受容体をデザインするにあたり、目的の受容体遺伝子の相同遺伝子候補の検索はNCBI BLASTを用いて行った。得られた遺伝子群についてオルソログ群を特定した。
具体的には、ヒト受容体(GPCR)を目的の受容体とするとき、オルソログの特定では、BLASTにより検索された相同性上位の遺伝子から、目的の受容体と同じ名称をもつ遺伝子をオルソログとして選択した。
例えばヒト微量アミン関連受容体であるTAAR1の場合、ヒトTAAR1(NP_612200.1)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にTAAR1を含む249遺伝子をオルソログとして特定した。これら249遺伝子にヒトTAAR1を加えた計250遺伝子(表3-1~4)のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトTAAR2、TAAR5、TAAR6、TAAR8及びTAAR9についても、同様にしてオルソログ群を特定した。ヒトTAAR6、TAAR8又はTAAR9を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ及び霊長目以外の目の哺乳類のオルソログであり、TAAR2又はTAAR5を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ、霊長目以外の目の哺乳類のオルソログ及び鳥類のオルソログであり、TAAR1を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ、霊長目以外の目の哺乳類のオルソログ、鳥類のオルソログ、爬虫類のオルソログ及び両生類のオルソログであった。
例えばヒト鋤鼻受容体であるVN1R1の場合、ヒトVN1R1(NP_065684.1)のアミノ酸配列をquery配列として、BLAST検索を行うと、相同性上位の250遺伝子の中に名称にvomeronasal type-1 receptor 1を含む遺伝子は22個特定された。VN1Rは、相同遺伝子間の多様性が大きい受容体遺伝子ファミリーであり、それら相同遺伝子のうちヒトVN1R1と65%以上のアミノ酸同一性をもつ7遺伝子をオルソログとして特定した。これら7遺伝子にヒトVN1R1を加えた計8遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトVN1R2、VN1R4及びVN1R5についても、同様にしてオルソログ群を特定した。VN1R1、VN1R2、VN1R4又はVN1R5を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは哺乳類(霊長目)のオルソログであった。
例えばヒト味覚受容体(うま味受容体)であるTAS1R1の場合、ヒトTAS1R1(NP_619642.2)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にTAS1R1を含む249遺伝子をオルソログとして特定した。これら249遺伝子にヒトTAS1R1を加えた計250遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトTAS1R2及びTAS1R3についても、同様にしてオルソログ群を特定した。TAS1R1、TAS1R2又はTAS1R3を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ、霊長目以外の目の哺乳類のオルソログ、鳥類のオルソログ、爬虫類のオルソログ、両生類のオルソログ及び魚類のオルソログであった。
例えばヒト味覚受容体(苦味受容体)であるTAS2R8の場合、ヒトTAS2R8(NP_076407.1)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にTAS2R8を含む90遺伝子をオルソログとして特定した。これら90遺伝子にヒトTAS2R8を加えた計91遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトTAS2R16、TAS2R38、TAS2R42、TAS2R45、TAS2R46、TAS2R31、TAS2R1、TAS2R3、TAS2R4、TAS2R5、TAS2R7、TAS2R9、TAS2R10、TAS2R13、TAS2R14、TAS2R20、TAS2R30、TAS2R39、TAS2R40、TAS2R43、TAS2R50及びTAS2R60についても、同様にしてオルソログ群を特定した。ヒトTAS2R45を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログであり、ヒトTAS2R8、TAS2R16、TAS2R38、TAS2R42又はTAS2R46を目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ及び霊長目以外の目の哺乳類のオルソログであった。
例えばヒトMas関連Gタンパク質共役型受容体であるMrgprEの場合、ヒトMrgprE(NP_001034254.2)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にMrgprEを含む72遺伝子をオルソログとして特定した。これら72遺伝子にヒトMrgprEを加えた計73遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトMrgprF、MAS1、MAS1L、MRGPRD、MRGPRG、MRGPRX1、MRGPRX2、MRGPRX3及びMRGPRX4についても、同様にしてオルソログ群を特定した。ヒトMrgprE又はMrgprFを目的の受容体とするとき、特定したオルソログは霊長目のオルソログ及び霊長目以外の目の哺乳類のオルソログであった。
例えば、ヒトGPRであるGPR3の場合、ヒトGPR3(NP_005272.1)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にGPR3を含む234遺伝子をオルソログとして特定した。これら234遺伝子にヒトGPR3を加えた計235遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。表4に記載のGPR3、GPR17、GPR31、GPR50、GPR65、GPR68及びGPR42以外のヒトGPRについても、同様にしてオルソログ群を特定した。尚、ヒトGPR17の場合は名称にオルソログとして知られる「uracil nucleotide/cysteinyl leukotriene receptor」を含む遺伝子をオルソログとして特定した。同様に、ヒトGPR31の場合は名称に「12-(S)-hydroxy-5,8,10,14-eicosatetraenoic acid receptor」を含む遺伝子を、ヒトGPR50の場合は名称に「melatonin-related receptor」を含む遺伝子を、ヒトGPR65の場合は名称に「psychosine receptor」を含む遺伝子を、ヒトGPR68の場合は名称に「ovarian cancer G-protein coupled receptor 1」を含む遺伝子を、それぞれオルソログとして特定した。また、ヒトGPR42の場合は名称に「GPR42」を含む遺伝子及び名称に「free fatty acid receptor 3」を含む遺伝子(GPR42遺伝子と相同性が高いGPCR遺伝子)をオルソログとして特定した。
上記以外のヒトGPCRのうち、ADGRB1の場合、ヒトADGRB1(NP_001693.2)のアミノ酸配列をquery配列とし、BLASTにより検索された相同性上位の250遺伝子の中から、名称にADGRB1を含む234遺伝子をオルソログとして特定した。これら234遺伝子にヒトADGRB1を加えた計235遺伝子のアミノ酸配列について以下に述べるようにアラインメント解析及びコンセンサスアミノ酸の特定を行った。ヒトADGRB2、ADGRB3及びADGRD1についても、同様にしてオルソログ群を特定した。また、ヒトADGRA1の場合は名称に「ADGRA1」を含む遺伝子及び名称に「GPR123」を含む遺伝子(ADGRA1遺伝子と相同性が高いGPCR遺伝子)をオルソログとして特定した。同様に、ヒトADGRA2の場合は名称に「ADGRA2」を含む遺伝子及び名称に「GPR124」を含む遺伝子を、ヒトADGRA3の場合は名称に「ADGRA3」を含む遺伝子及び名称に「GPR125」を含む遺伝子を、それぞれオルソログとして特定した。また、ヒトADGRC1の場合は名称に「EGF LAG seven-pass G-type receptor 1」を含む遺伝子(ADGRC1遺伝子と相同性が高いGPCR遺伝子)をオルソログとして特定した。同様に、ヒトADGRC2の場合は名称に「cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 2」を含む遺伝子を、ヒトADGRC3の場合は名称に「cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 3」を含む遺伝子を、ヒトADGRD2の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor D2」又は「G-protein coupled receptor 144」を含む遺伝子を、ヒトADGRE1の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor E1」又は「adhesion G protein-coupled receptor E1 isoform 2 precursor」を含む遺伝子を、ヒトADGRE2の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor E2」を含む遺伝子を、ヒトADGRE3の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor E3」を含む遺伝子を、ヒトADGRE5の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor E5」又は「CD97 antigen」を含む遺伝子を、ヒトADGRF1の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor F1」又は「adhesion G-protein coupled receptor F1 isoform 1 precursor」を含む遺伝子を、ヒトADGRF3の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor F3」又は「G-protein coupled receptor 113」を含む遺伝子を、ヒトADGRF4の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor F4」又は「G-protein coupled receptor 115」を含む遺伝子を、ヒトADGRF5の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor F5」又は「G-protein coupled receptor 116」を含む遺伝子を、ヒトADGRG1の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G1」又は「adhesion G-protein coupled receptor G1 isoform b precursor」を含む遺伝子を、ヒトADGRG2の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G2」又は「G-protein coupled receptor 64」を含む遺伝子を、ヒトADGRG4の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G4」又は「G-protein coupled receptor 112」を含む遺伝子を、ヒトADGRG5の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G5」又は「G-protein coupled receptor 114」を含む遺伝子を、ヒトADGRG6の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G6」又は「G-protein coupled receptor 126」を含む遺伝子を、ヒトADGRG7の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor G7」又は「adhesion G-protein coupled receptor G7 isoform 2 precursor」を含む遺伝子を、ヒトADGRL1の場合は名称に「adhesion G protein-coupled receptor L1」又は「adhesion G protein-coupled receptor L1 isoform 1 precursor」を含む遺伝子を、ヒトADGRL2の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor L2」又は「latrophilin and seven transmembrane domain-containing protein」を含む遺伝子を、ヒトADGRL3の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor L3」又は「latrophilin-3」を含む遺伝子を、ヒトADGRL4の場合は名称に「adhesion G-protein coupled receptor L4」又は「latrophilin-2 isoform」を含む遺伝子を、ヒトChrm-4/M4Rの場合は名称に「M4R」を含む遺伝子を、ヒトF2RL1の場合は名称に「proteinase-activated receptor 2」を含む遺伝子を、ヒトGRM5の場合は名称に「metabotropic glutamate receptor 5」を含む遺伝子を、ヒトAPLNRの場合は名称に「apelin receptor」を含む遺伝子を、ヒトCALCRLの場合は名称に「calcitonin gene-related peptide type 1」を含む遺伝子を、ヒトGLP2Rの場合は名称に「glucagon-like peptide 2 receptor」を含む遺伝子を、ヒトMC4Rの場合は名称に「MC4R」、「Melanocortin receptor 4」、「Melanocortin-4 receptor」又は「Melanocortin 4 receptor」を含む遺伝子を、ヒトCCR6の場合は名称に「C-C chemokine receptor type 6」を含む遺伝子を、それぞれオルソログとして特定した。
表4に、各ヒトGPCRについて、該ヒトGPCRの遺伝子と特定したオルソログの合計数を参照遺伝子数として示す。
表4のNo.1~145のGPCRに関して、特定した遺伝子群についてのアラインメント解析はClustalWを用いて行った。アラインメント結果に基づき、Jalviewを用いてコンセンサス受容体の設計を行った。該アラインメントにおいて、基準となる目的の受容体のオリジナルの受容体アミノ酸配列の各アミノ酸位置に相当する位置に該基準アミノ酸配列のアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度が50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合に該基準アミノ酸配列のアミノ酸残基を該アミノ酸残基に改変した。尚、基準となる目的の受容体のオリジナルの受容体アミノ酸配列の各アミノ酸位置に相当する位置に該基準アミノ酸配列のアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度が50%のアミノ酸残基が1種存在する場合であっても、該基準アミノ酸配列のアミノ酸残基の出現頻度も50%の場合には該基準アミノ酸配列のアミノ酸残基を改変しなかった。該アラインメントにおいて、基準となる目的の受容体のオリジナルの受容体アミノ酸配列の各アミノ酸位置に相当する位置に出現頻度が40%以上で欠失が存在する場合に該基準アミノ酸配列のアミノ酸残基を欠失に改変した。例えばTAAR1のようにC末端のアミノ酸位置に相当する位置に出現頻度が40%以上で欠失が存在することから、該基準アミノ酸配列のアミノ酸残基を欠失に改変した。さらに例えばTAAR1、TAAR2、MAS1L、GPR135、ADGRG4のようにヒトの配列における開始メチオニン位置に相当する位置に出現頻度40%以上で欠失が認められることから、該基準アミノ酸配列のアミノ酸残基を欠失に改変し、さらに上記手順による改変後アミノ酸配列において最初のメチオニンを開始メチオニンとして選択し、それ以前のアミノ酸配列を削除した。ただし、この方法においてTAAR6は最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更した場合、その結果として生じるコンセンサス受容体のアミノ酸配列の全長がオリジナルの受容体のアミノ酸配列の全長より10%以上短くなったためこの方法に従わず、代わりにオリジナルの受容体のN末端構造をそのまま維持した。具体的には、最もN末端側のコンセンサス残基アスパラギンが糖鎖修飾及び膜移行に重要なアミノ酸残基であったため、該コンセンサス残基は変更せず、該コンセンサス残基に相当する位置よりもN末端側のオリジナルの受容体のN末端構造をそのまま維持した。一方で、該アラインメントにおいて、基準となる目的の受容体のオリジナルの受容体アミノ酸配列の欠失位置に相当する位置に出現頻度が60%以上でアミノ酸が存在する場合に該基準アミノ酸配列の欠失位置に最も保存性の高いアミノ酸を挿入するよう改変した。最も保存性の高いアミノ酸が2種以上ある場合は、最も分子量が小さいアミノ酸を挿入するように改変した。例えばTAS2R1のようにN末端のアミノ酸位置に相当する位置よりもN末端側に出現頻度が60%以上でアミノ酸が存在することから、該基準アミノ酸配列のN末端よりN末端側にアミノ酸残基を付加した。
設計における受容体のトポロジーの確認は、TMHMM(Transmembrane Hidden Markov Model)を使用した。デザインした各種受容体は7回膜貫通型の構造を有する必要がある。
表4のNo.1~5、7~13、31~38、60、76、80、85及び102のGPCRに関して、デザインした各種受容体ポリペプチドをコードするDNA配列は、そのアミノ酸配列に対応する塩基配列コドンをヒト培養細胞での発現用に最適化した上でDNA合成により獲得した。この塩基配列の両末端にはEcoRI、XhoIサイトを付加しており、pME18Sベクター上のFlag-Rhoタグ配列の下流に作製したEcoRI、XhoIサイトへと組換えた。培養細胞内で作られたGPCRタンパク質を細胞膜上へ移行するヒトRTP1Sをコードする遺伝子を、別のpME18SベクターのEcoRI、XhoIサイトへ組込み、pME18S-RTP1Sベクターを作製した。
設計における受容体のトポロジーの確認は、TMHMM(Transmembrane Hidden Markov Model)を使用した。デザインした各種受容体は7回膜貫通型の構造を有する必要がある。
表4のNo.1~5、7~13、31~38、60、76、80、85及び102のGPCRに関して、デザインした各種受容体ポリペプチドをコードするDNA配列は、そのアミノ酸配列に対応する塩基配列コドンをヒト培養細胞での発現用に最適化した上でDNA合成により獲得した。この塩基配列の両末端にはEcoRI、XhoIサイトを付加しており、pME18Sベクター上のFlag-Rhoタグ配列の下流に作製したEcoRI、XhoIサイトへと組換えた。培養細胞内で作られたGPCRタンパク質を細胞膜上へ移行するヒトRTP1Sをコードする遺伝子を、別のpME18SベクターのEcoRI、XhoIサイトへ組込み、pME18S-RTP1Sベクターを作製した。
2)受容体遺伝子で形質転換した培養細胞の作製1
Flowcytometry法のために、6 well dishのそれぞれのwellに、DMEM(Nacalai)で懸濁させたHEK293細胞を3.3×105cellsで播種して24時間後に、表5に示す組成の反応液を調製し、クリーンベンチ内で20分静置した後、6 well dishの各ウェルに添加した。ここで、受容体遺伝子とは、表4のNo.1~4、8~13、31~38、60、76、80、85及び102のGPCRの遺伝子である。37℃、5%CO2を保持したインキュベータ内で24時間培養した。対照として、受容体を発現させない細胞(mock)を用意した。
Flowcytometry法のために、6 well dishのそれぞれのwellに、DMEM(Nacalai)で懸濁させたHEK293細胞を3.3×105cellsで播種して24時間後に、表5に示す組成の反応液を調製し、クリーンベンチ内で20分静置した後、6 well dishの各ウェルに添加した。ここで、受容体遺伝子とは、表4のNo.1~4、8~13、31~38、60、76、80、85及び102のGPCRの遺伝子である。37℃、5%CO2を保持したインキュベータ内で24時間培養した。対照として、受容体を発現させない細胞(mock)を用意した。
3)受容体遺伝子で形質転換した培養細胞の作製2
Flowcytometry法のために、6 well dishのそれぞれのwellに、DMEM(Nacalai)で懸濁させたHEK293細胞を3.3×105cellsで播種して24時間後に、表6に示す組成の反応液を調製し、クリーンベンチ内で20分静置した後、6 well dishの各ウェルに添加した。37℃、5%CO2を保持したインキュベータ内で24時間培養した。対照として、受容体を発現させない細胞(mock)を用意した。
Flowcytometry法のために、6 well dishのそれぞれのwellに、DMEM(Nacalai)で懸濁させたHEK293細胞を3.3×105cellsで播種して24時間後に、表6に示す組成の反応液を調製し、クリーンベンチ内で20分静置した後、6 well dishの各ウェルに添加した。37℃、5%CO2を保持したインキュベータ内で24時間培養した。対照として、受容体を発現させない細胞(mock)を用意した。
4)細胞膜上の受容体タンパク量の測定(Flowcytometry法)
Cellstripperを用いて回収した細胞に一次抗体として抗FLAG抗体(コスモバイオ社)を1時間氷上で作用させた。細胞を洗浄後、二次抗体としてPE(phycoerythrin)-conjugated anti-mouse IgG(アブカム株式会社)を30分間氷上で作用させた。洗浄後0.25μgの7-AAD(7-Aminoactinomycin D、富士フイルム和光純薬株式会社)を添加してフローサイトメトリーシステム(BD)により7-AADが陰性である細胞集団のPEシグナルの平均値を、細胞膜上の受容体量の指標として測定した。各実験回で、FLAG-M2アセチルコリン受容体を発現させた細胞を陽性コントロール(PC)として、受容体を発現させない細胞を陰性コントロール(NC)として上記と同様にPEシグナルの平均値を求めた。NCのPEシグナルを0%、PCのPEシグナルを100%として基準化を行い、各種受容体のPEシグナル(%)を膜発現量(Cell surface expression)として算出した。
Cellstripperを用いて回収した細胞に一次抗体として抗FLAG抗体(コスモバイオ社)を1時間氷上で作用させた。細胞を洗浄後、二次抗体としてPE(phycoerythrin)-conjugated anti-mouse IgG(アブカム株式会社)を30分間氷上で作用させた。洗浄後0.25μgの7-AAD(7-Aminoactinomycin D、富士フイルム和光純薬株式会社)を添加してフローサイトメトリーシステム(BD)により7-AADが陰性である細胞集団のPEシグナルの平均値を、細胞膜上の受容体量の指標として測定した。各実験回で、FLAG-M2アセチルコリン受容体を発現させた細胞を陽性コントロール(PC)として、受容体を発現させない細胞を陰性コントロール(NC)として上記と同様にPEシグナルの平均値を求めた。NCのPEシグナルを0%、PCのPEシグナルを100%として基準化を行い、各種受容体のPEシグナル(%)を膜発現量(Cell surface expression)として算出した。
5)結果
Flowcytometry法(上記2)及び4))を用いて各受容体のHEK293細胞上での発現量を解析した。表7に示すように、3回の実験の平均値を比較した結果、膜発現量解析を行った受容体全て、具体的にはVN1R1、VN1R2、VN1R4、VN1R5、TAS2R8、TAS2R16、TAS2R38、TAS2R42、TAS2R45、TAS2R46、TAAR1、TAAR2、TAAR5、TAAR6、TAAR8、TAAR9、MrgprE、MrgprF、GPR31、GPR65、GPR82、GPR88及びGPR171について、コンセンサス化方法による膜発現量の増加が認められた。
Flowcytometry法(上記2)及び4))を用いて各受容体のHEK293細胞上での発現量を解析した。表7に示すように、3回の実験の平均値を比較した結果、膜発現量解析を行った受容体全て、具体的にはVN1R1、VN1R2、VN1R4、VN1R5、TAS2R8、TAS2R16、TAS2R38、TAS2R42、TAS2R45、TAS2R46、TAAR1、TAAR2、TAAR5、TAAR6、TAAR8、TAAR9、MrgprE、MrgprF、GPR31、GPR65、GPR82、GPR88及びGPR171について、コンセンサス化方法による膜発現量の増加が認められた。
Flowcytometry法(上記3)及び4))を用いて、TAS1R1のオリジナル受容体とTAS1R3のオリジナル受容体、TAS1R1のコンセンサス受容体とTAS1R3のコンセンサス受容体、TAS1R1のオリジナル受容体とTAS1R3のコンセンサス受容体、あるいはTAS1R1のコンセンサス受容体とTAS1R3のオリジナル受容体の組み合わせのHEK293細胞上での発現量を解析した。図1に示すように、TAS1R1とTAS1R3の二つのオリジナル受容体をHEK293細胞に共発現させた時と比べて、いずれかをコンセンサス化した受容体を発現させると、TAS1R1の膜発現量が増加することが明らかになった。特にTAS1R1とTAS1R3の双方をコンセンサス化した時が最も多量に発現した。
上記実施例のオリジナルGPCRのAccession No.とアミノ酸配列及びコンセンサスGPCRのアミノ酸配列を下記表8-1及び8-2に示す。また、配列番号108~112、114~120、138~145、167、183、187、192及び209で示されるアミノ酸配列からなるコンセンサスGPCRをコードするDNA配列を配列番号215~234及び313~317に示す。
Claims (24)
- Gタンパク質共役型受容体(GPCR)ポリペプチドの発現方法であって、
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
方法。 - 前記コンセンサスアミノ酸配列が、前記アラインメントから以下の(i)~(iii)の基準に従い同定したコンセンサス残基からなるアミノ酸配列である、請求項1記載の方法:
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的のGPCRのアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。 - 前記目的のGPCRがヒトGPCRである、請求項1又は2記載の方法。
- 前記GPCRポリペプチドが、配列番号108~142、144~214及び275~312のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる、請求項4記載の方法。
- GPCRポリペプチドの発現方法であって、
目的のGPCRのアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなるGPCRポリペプチドを細胞に発現させることを含み、
該GPCRポリペプチドが、ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、
方法。 - 前記GPCRポリペプチドが、配列番号143で示されるアミノ酸配列からなる、請求項6記載の方法。
- 目的のGPCRの応答の測定方法であって、
請求項1~7のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。 - 目的のGPCRのリガンドの探索方法であって、
試験物質存在下で、請求項1~7のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドの応答を測定すること、及び
該GPCRポリペプチドが応答した試験物質を選択すること、
を含む方法。 - 目的のGPCRのリガンドの認識の制御剤の評価及び/又は選択方法であって、
請求項1~7のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び目的のGPCRのリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含む方法。 - 味の評価方法であって、
請求項1~7のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが味覚受容体ポリペプチドである、
方法。 - 目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
請求項1~7のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質及び目的のGPCRのリガンドを添加すること、及び
該リガンドに対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである、
方法。 - 目的のGPCRのリガンドのにおいの抑制剤の評価及び/又は選択方法であって、
請求項1~7のいずれか1項記載の方法により発現されたGPCRポリペプチドに試験物質を添加すること、及び
該試験物質に対する該GPCRポリペプチドの応答を測定すること、
を含み、該GPCRポリペプチドが微量アミン関連受容体ポリペプチドである、
方法。 - 前記GPCRポリペプチドの応答が、ELISAもしくはレポータージーンアッセイによる細胞内cAMP量測定、カルシウムイメージングもしくはTGFα shedding assayによるカルシウムイオン量測定、又はアフリカツメガエル卵母細胞を用いた二電極膜電位固定法による細胞膜内外の電位変化測定により測定される、請求項8~13のいずれか1項記載の方法。
- 改変GPCRポリペプチドであって、
目的のGPCR(但し、嗅覚受容体を除く)のアミノ酸配列においてコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなり、
該コンセンサスアミノ酸配列が、該目的のGPCRのアミノ酸配列及び脊椎動物における該目的のGPCRのオルソログにコードされるGPCRのアミノ酸配列のアラインメントから導き出されるアミノ酸配列である、
改変GPCRポリペプチド。 - 前記コンセンサスアミノ酸配列が、前記アラインメントから以下の(i)~(iii)の基準に従い同定したコンセンサス残基からなるアミノ酸配列である、請求項15記載の改変GPCRポリペプチド:
(i)該アラインメントの各アミノ酸位置において、
(i-i)該目的のGPCRのアミノ酸残基と異なり且つ出現頻度50%以上のアミノ酸残基が1種存在する場合、該アミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-ii)出現頻度50%のアミノ酸残基が2種存在する場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-iii)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在し且つ出現頻度40%以上でアミノ酸残基が存在しない場合、コンセンサス残基なしと同定する、
(i-iv)該目的のGPCRにアミノ酸残基が存在せず且つ出現頻度60%以上でアミノ酸残基が存在する場合、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(i-v)上記(i-i)~(i-iv)のいずれにも該当しない場合、該目的のGPCRのアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する、
(ii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端又はそれよりもC末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、最もN末端に近い位置のメチオニン残基からなるコンセンサス残基よりN末端側のコンセンサス残基をコンセンサス残基なしに変更する、
(iii)上記(i)の基準に従いコンセンサス残基を同定したときに、最もN末端側のコンセンサス残基が該目的のGPCRのN末端よりもN末端側に相当する位置のコンセンサス残基であり且つメチオニン残基でない場合、該アラインメントの該コンセンサス残基の位置よりN末端側にアミノ酸位置を1つずつ遡り、メチオニン残基が出現するまで、最も出現頻度が高いアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定し、最も出現頻度が高いアミノ酸残基が2種以上存在する場合は、該アミノ酸残基のうち最も分子量が小さいアミノ酸残基をコンセンサス残基と同定する。 - 前記目的のGPCRがヒトGPCRである、請求項15又は16記載の改変GPCRポリペプチド。
- 前記GPCRポリペプチドが、上記表1及び2の(1)のGPCRの(2)の配列番号で示されるアミノ酸配列において(3)の配列番号で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、請求項15~17のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチド。
- 配列番号108~142、144~214及び275~312のいずれかで示されるアミノ酸配列からなる、請求項18記載の改変GPCRポリペプチド。
- 改変GPCRポリペプチドであって、
ヒトTAAR6の配列番号36で示されるアミノ酸配列において配列番号143で示されるコンセンサスアミノ酸配列と異なるアミノ酸残基の少なくとも1個をこれに相当する位置の該コンセンサスアミノ酸配列のアミノ酸残基に改変したアミノ酸配列からなる、
改変GPCRポリペプチド。 - 配列番号143で示されるアミノ酸配列からなる、請求項20記載の改変GPCRポリペプチド。
- 請求項15~21のいずれか1項記載の改変GPCRポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
- 請求項22記載のポリヌクレオチドを含むベクター又はDNA断片。
- 請求項23記載のベクター又はDNA断片を含有する形質転換細胞。
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