JP7293121B2 - Pd-l1に対する抗体 - Google Patents
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Description
本発明は、新規の抗体および医学におけるその使用に関する。特に、本発明は、ヒトPD-L1に結合することができかつヒトCD3に結合することができる二重特異性抗体に関する。ヒトPD-L1に結合することができる新規の抗体クラスも提供される。本発明はさらに、本発明の抗体の使用に関し、かつ本発明の抗体を産生するための方法、核酸構築物、および宿主細胞に関する。
プログラム死リガンド1(PD-L1、PDL1、CD274、B7H1、B7-H1)は33kDa 1回膜貫通I型膜タンパク質である。選択的スプライシングに基づいて3種類のPD-L1アイソフォームが述べられている。PD-L1は免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリーに属し、1つのIg様C2型ドメインと1つのIg様V型ドメインを含有する。新鮮に単離されたT細胞およびB細胞は、ごくわずかな量のPD-L1を発現し、CD14+単球のほんの一部(約16%)しかPD-L1を構成的に発現しない(Rietz and Chen, 2004 Am J Transplant 4: 8-14(非特許文献1))。インターフェロン-γ(IFN-γ)が腫瘍細胞上のPD-L1をアップレギュレートすることが知られている(Abiko et al., 2015 Br J Cancer 112:1501-1509(非特許文献2); Dong et al., 2002 Nature Medicine 8(8): 793-800(非特許文献3))。
ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体であって、
ヒトPD-L1とヒトPD-1との結合を阻害し、かつ、
(i)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体[511]と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体[547]とは競合しない、または
(ii)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体[547]と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体[511]とは競合しない、
前記抗体。
[本発明1002]
ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体[338]と競合する、本発明1001の抗体。
[本発明1003]
前記本発明のいずれかの抗体とヒトPD-L1との結合が、SEQ ID NO:53に示したVH配列およびSEQ ID NO:57に示したVL配列を含む抗体[476]によって置換されない、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1004]
前記本発明のいずれかの抗体とヒトPD-L1との結合が、SEQ ID NO:106に示したVH配列およびSEQ ID NO:110に示したVL配列を含む抗体[625]の結合によってブロックされない、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1005]
前記本発明のいずれかの抗体とヒトPD-L1との結合が、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体[547]によってブロックされる、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1006]
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体[338]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体[511]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体[547]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、
本発明1001の抗体。
[本発明1007]
本発明1001~1004および1006のいずれかの抗体と、SEQ ID NO:94における位置113に対応する位置にあるアミノ酸残基(R113)、位置123に対応する位置にあるアミノ酸残基(Y123)、および位置125に対応する位置にあるアミノ酸残基(R125)のいずれか1つまたは複数がアラニンで置換されている変異体PD-L1との結合が、SEQ ID NO:94に示したアミノ酸配列を有する野生型PD-L1との結合と比較して低減しており、該抗体の結合の変化倍率がアラニン変異体全てにわたる結合の変化倍率の平均 - 1.5×SDよりも小さい場合に結合の低減が判定され、SDが変異体PDL1に対する該抗体の変化倍率計算値全ての標準偏差であり、かつ結合の変化倍率が実施例13に示した通りに算出される[338]、本発明1001~1004および1006のいずれかの抗体。
[本発明1008]
本発明1001~1002、および1006のいずれかの抗体が、PD-L1(SEQ ID NO:94)上のエピトープに結合し、該エピトープが、SEQ ID NO:94の位置113におけるアミノ酸残基(R113)、位置123におけるアミノ酸残基(Y123)、および/または位置125におけるアミノ酸残基(R125)を含む、本発明1001~1002、および1006のいずれかの抗体。
[本発明1009]
本発明1001、1003、1004、および1006のいずれかの抗体と、SEQ ID NO:94における位置19に対応する位置にあるアミノ酸残基(F19)、位置42に対応する位置にあるアミノ酸残基(F42)、位置45に対応する位置にあるアミノ酸残基(E45)、位置46に対応する位置にあるアミノ酸残基(K46)、位置94に対応する位置にあるアミノ酸残基(L94)、および位置116に対応する位置にあるアミノ酸残基(I116)のいずれか1つまたは複数がアラニンで置換されている変異体PD-L1との結合が、SEQ ID NO:94に示したアミノ酸配列を有する野生型PD-L1と比較して低減しており、該抗体の結合の変化倍率がアラニン変異体全てにわたる結合の変化倍率の平均 - 1.5×SDよりも小さい場合に結合の低減が判定され、SDが変異体PDL1に対する該抗体の変化倍率計算値全ての標準偏差であり、かつ結合の変化倍率が実施例13に示した通りに算出される[511]、本発明1001、1003、1004、および1006のいずれかの抗体。
[本発明1010]
本発明1001、1003、1004、および1006のいずれかの抗体が、PD-L1(SEQ ID NO:94)上のエピトープに結合し、該エピトープが、SEQ ID NO:94の位置45におけるアミノ酸残基(E45)、位置46におけるアミノ酸残基(K46)、および/または位置94におけるアミノ酸残基(L94)からなる群より選択される1つまたは複数のアミノ酸残基を含む、本発明1001、1003、1004、および1006のいずれかの抗体。
[本発明1011]
本発明1001、1005、および1006のいずれかの抗体と、SEQ ID NO:94における位置58に対応する位置にあるアミノ酸残基(E58)および位置113に対応する位置にあるアミノ酸残基(R113)のいずれか1つまたは複数がアラニンで置換されている変異体PD-L1との結合が、SEQ ID NO:94に示したアミノ酸配列を有する野生型PD-L1と比較して低減しており、該抗体の結合の変化倍率がアラニン変異体全てにわたる結合の変化倍率の平均 - 1.5×SDよりも小さい場合に結合の低減が判定され、SDが変異体PDL1に対する該抗体の変化倍率計算値全ての標準偏差であり、かつ結合の変化倍率が実施例13に示した通りに算出される[547]、本発明1001、1005、および1006のいずれかの抗体。
[本発明1012]
本発明1001、1005、および1006のいずれかの抗体が、PD-L1(SEQ ID NO:94)上のエピトープに結合し、該エピトープが、SEQ ID NO:94の位置58におけるアミノ酸残基(E58)および/または位置113におけるアミノ酸残基(R113)を含む、本発明1001、1005、および1006のいずれかの抗体。
[本発明1013]
ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、CDR1配列、CDR2配列、およびCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、CDR1配列、CDR2配列、およびCDR3配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含み、VH CDR3配列が、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:11、および SEQ ID NO:21に示した配列からなる群より選択される、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1014]
ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[338]、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[511]、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、 SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1、配列 DDNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[547]
を含む、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1015]
ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:8、およびSEQ ID NO:18に示した配列からなる群より選択されるVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、または100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列を含む、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1016]
ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:15、およびSEQ ID NO:22に示した配列からなる群より選択されるVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、または100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列を含む、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1017]
ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[338]、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[511]、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[547]
を含む、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1018]
前記VH配列および前記VL配列がそれぞれ、3つのCDR配列、それぞれCDR1、CDR2、およびCDR3、ならびに4つのフレームワーク配列、それぞれFR1、FR2、FR3、およびFR4を含み、かつ、VHの各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列が、該VH配列の該各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、または少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有し、かつVH CDR配列が変異しておらず、かつVLの各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列が、該VL配列の該各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、または少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有し、かつVL CDR配列が変異していない、本発明1017の抗体。
[本発明1019]
抗体依存性細胞障害(ADCC)を介して、腺がんの上皮細胞の用量依存的溶解、例えば、MDA-MB-231の用量依存的溶解を誘導することができる、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1020]
細胞溶解の結果として前記上皮細胞の培養物中の細胞数を少なくとも5%、例えば、少なくとも6%、7%、8%、9%、または少なくとも10%低減することができる、本発明1019の抗体。
[本発明1021]
ADCCが、 51 Cr放出アッセイ法、例えば、実施例14に開示されるアッセイ法においてインビトロで測定される、本発明1019または1020の抗体。
[本発明1022]
ADCCが、本発明1019または1020の抗体とエフェクター細胞、例えば末梢血単核球(PBMC)とを含む組成物と共に前記上皮細胞を37℃、5%CO 2 で4時間インキュベートすることによってインビトロで測定され、該組成物中の抗体の量が0.1~1μg/mLの範囲内であり、かつエフェクター細胞と上皮細胞の比が100:1である、本発明1019または1020の抗体。
[本発明1023]
上皮細胞の前記溶解が、ADCCの代わりとしてのルシフェラーゼレポーターアッセイ法、例えば、実施例14に開示されるルミネセンスADCCレポーターバイオアッセイ法においてインビトロで測定される、本発明1019または1020の抗体。
[本発明1024]
ADCCが、
(i)前記上皮細胞の培養物を、本発明1023の抗体とFcγRIIIa(CD16)およびホタルルシフェラーゼを安定発現するジャーカットヒトT細胞(エフェクター細胞)とを含む組成物と、1:1のエフェクター細胞:上皮細胞比で接触させ、
(ii)該上皮細胞の培養物および該エフェクター細胞を15分間室温に調節し、
(iii)該上皮細胞の培養物および該エフェクター細胞をルシフェラーゼ基質と共にインキュベートし、かつ
(iv)該細胞培養物におけるルシフェラーゼ生成を測定する
ことによって、インビトロで測定され、
該組成物中の抗体の量が0.5~250ng/mLの範囲内であり、かつエフェクター細胞と上皮細胞の比が1:1である、本発明1023の抗体。
[本発明1025]
前記上皮細胞のADCCが、ルシフェラーゼレポーターアッセイ法、例えば、本発明1023または1024において定義されたレポーターアッセイ法において測定され、次いで、本発明1019、1020、1023、および1024のいずれかの抗体を含む試験組成物と共に該上皮細胞の培養物をインキュベートした後に観察されたADCCが、参照抗体を含む組成物と共に該上皮細胞の培養物をインキュベートした後に観察されたADCCの少なくとも1.5倍であり、ADCCが相対発光量(RLU)として測定され、該試験組成物中の抗体濃度と参照抗体を含む該組成物中の抗体濃度が同じでありかつ20~250ng/mlの範囲内であり、かつ該参照抗体が、
(a)SEQ ID NO:74に示したVH配列およびSEQ ID NO:78に示したVL配列を含む抗体;ならびに
(b)SEQ ID NO:81に示したVH配列およびSEQ ID NO:85に示したVL配列を含む抗体
より選択される、本発明1019、1020、1023、および1024のいずれかの抗体。
[本発明1026]
ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列[338]、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列[511]、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列[547]
を含む、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1027]
ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体であって、
(i)SEQ ID NO:33に示したCDR1配列、SEQ ID NO:34に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:35に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:37に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、SEQ ID NO:38に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[321]、または
(ii)SEQ ID NO:47に示したCDR1配列、SEQ ID NO:48に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:49に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:51に示した配列を有するCDR1、配列 DVIを有するCDR2、およびSEQ ID NO:52に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[421]、または
(iii)SEQ ID NO:54に示したCDR1配列、SEQ ID NO:55に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:56に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:58に示した配列を有するCDR1、配列 RDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:59に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[476]、または
(iv)SEQ ID NO:61に示したCDR1配列、SEQ ID NO:62に示したCDR2配列、および SEQ ID NO:63に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:65に示した配列を有するCDR1、配列 DDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:66に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[516]、または
(v)SEQ ID NO:107に示したCDR1配列、SEQ ID NO:108に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:109に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:111に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、SEQ ID NO:113に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[625]、
(vi)SEQ ID NO:68に示したCDR1配列、SEQ ID NO:69に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:70に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:72に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:73に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[632]
を含む、該抗体。
[本発明1028]
(i)SEQ ID NO:32に示したVH配列およびSEQ ID NO:36に示したVL配列[321]、または
(ii)SEQ ID NO:46に示したVH配列およびSEQ ID NO:50に示したVL配列[421]、または
(iii)SEQ ID NO:53に示したVH配列およびSEQ ID NO:57に示したVL配列[476]、または
(iv)SEQ ID NO:60に示したVH配列およびSEQ ID NO:64に示したVL配列[516]、または
SEQ ID NO:106に示したVH配列およびSEQ ID NO:110に示したVL配列[625]、
(v)SEQ ID NO:67に示したVH配列およびSEQ ID NO:71に示したVL配列[632]
を含む、本発明1027の抗体。
[本発明1029]
一価である、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1030]
前記本発明のいずれかの抗体が、ヒトPD-L1に結合することができる2つの抗原結合領域を有する二価抗体であり、かつ、該2つの抗原結合領域が同一の可変領域配列を有する、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1031]
前記本発明のいずれかの抗体が、二価二重特異性抗体であり、ヒトPD-L1に結合することができる(第1の)前記抗原結合領域に加えて、第2の抗原にまたは異なるヒトPD-L1エピトープに結合することができる(第2の)抗原結合領域を含み、該第2の抗原がヒトCD3εでない、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1032]
ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域と、ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる抗原結合領域とを含む二重特異性抗体であって、
ヒトPD-L1に結合することができる該抗原結合領域が、前記本発明のいずれかに示した特徴を有する、該二重特異性抗体。
[本発明1033]
ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)を含む、本発明1032の二重特異性抗体。
[本発明1034]
(i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域[338]、ならびに、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域[338]、ならびに、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1配列、配列DDNを有するCDR2配列、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3配列を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域[547]、ならびに、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域
を含む、本発明1032または1033の二重特異性抗体。
[本発明1035]
ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、SEQ ID NO:25に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列を含む、本発明1032~1034のいずれかの二重特異性抗体。
[本発明1036]
(i)前記二重特異性抗体が、SEQ ID NO:25に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列を含むことができる抗原結合領域を有する抗体と比較して、ヒトCD3ε結合についてのより低い親和性を有し、好ましくは、該親和性が、少なくとも1/2倍、例えば、少なくとも1/5倍、例えば、少なくとも1/10倍、例えば、少なくとも1/25倍、例えば、少なくとも1/50倍であり、かつ
(ii)該二重特異性抗体が、例えば、本明細書中の実施例11に記載の通りにアッセイした場合に、PBMCまたは精製したT細胞をエフェクター細胞として使用した場合のMDA-MB-231細胞、PC-3細胞、および/またはHELA細胞の濃度依存性細胞障害を媒介することができる、
本発明1032の二重特異性抗体。
[本発明1037]
ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:99に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(ii)SEQ ID NO:100に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iii)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:101に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iv)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:102に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(v)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:103に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(vi)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:104に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(vii)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:105に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、本発明1036の二重特異性抗体。
[本発明1038]
ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:39に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:40に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:41に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(iv)SEQ ID NO:42に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(v)SEQ ID NO:43に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(vi)SEQ ID NO:44に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(vii)SEQ ID NO:45に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列
を含む、本発明1036または1037の二重特異性抗体。
[本発明1039]
ヒトPD-L1に結合することができる第1の抗原結合領域と、第2の抗原にまたは異なるヒトPD-L1エピトープに結合することができる第2の抗原結合領域とを含む多重特異性抗体であって、
ヒトPD-L1に結合することができる該抗原結合領域が本発明1001~1031のいずれかに示した特徴を有する、該多重特異性抗体。
[本発明1040]
ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、CDR1配列、CDR2配列、およびCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、CDR1配列、CDR2配列、およびCDR3配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含み、VH CDR3配列が、SEQ ID NO:4[338]、SEQ ID NO:11[511]、およびSEQ ID NO:21[547]に示した配列からなる群より選択される、本発明1039の多重特異性抗体。
[本発明1041]
ヒトPD-L1に結合することができる前記第1の抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[338]、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[511]、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1、配列DDNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[547]
を含む、本発明1040の多重特異性抗体。
[本発明1042]
ヒトPD-L1に結合することができる前記第1の抗原結合領域が、SEQ ID NO:1[338]、SEQ ID NO:8[511]、およびSEQ ID NO:18[547]に示した配列からなる群より選択されるVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、または100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列を含む、本発明1040または1041の多重特異性抗体。
[本発明1043]
ヒトPD-L1に結合することができる前記第1の抗原結合領域が、SEQ ID NO:5[338]、SEQ ID NO:15[511]、およびSEQ ID NO:22[547]に示した配列からなる群より選択されるVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、または100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列を含む、本発明1040~1042のいずれかの多重特異性抗体。
[本発明1044]
ヒトPD-L1に結合することができる前記第1の抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[338]、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[511]、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[547]
を含む、本発明1040~1043のいずれかの多重特異性抗体。
[本発明1045]
前記VH配列および前記VL配列がそれぞれ、3つのCDR配列、それぞれCDR1、CDR2、およびCDR3、ならびに、4つのフレームワーク配列、それぞれFR1、FR2、FR3、およびFR4を含み、かつ、VHの各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列が、該VH配列の該各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、または少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有し、かつVH CDR配列が変異しておらず、かつVLの各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列が、該VL配列の該各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、または少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有し、かつVL CDR配列が変異していない、本発明1040~1044のいずれかの多重特異性抗体。
[本発明1046]
ヒトPD-L1に結合することができる前記第1の抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列[338]、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列[511]、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列[547]
を含む、本発明1040~1045のいずれかの多重特異性抗体。
[本発明1047]
ヒトPD-L1に結合することができる第1の抗原結合領域と、第2の抗原にまたは異なるヒトPD-L1エピトープに結合することができる第2の抗原結合領域とを含む多重特異性抗体であって、
(i)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体とは競合しない、または
(ii)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体とは競合しない、
該多重特異性抗体。
[本発明1048]
ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体と競合する、本発明1047の多重特異性抗体。
[本発明1049]
ヒトPD-L1に結合することができる第1の抗原結合領域と、第2の抗原にまたは異なるヒトPD-L1エピトープに結合することができる第2の抗原結合領域とを含む多重特異性抗体であって、
該抗体とヒトPD-L1との結合が、SEQ ID NO:53に示したVH配列およびSEQ ID NO:57に示したVL配列を含む抗体によって置換されない、該多重特異性抗体。
[本発明1050]
ヒトPD-L1とヒトPD-1との結合を阻害する、本発明1049の多重特異性抗体。
[本発明1051]
ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と競合する、本発明1049または1050の多重特異性抗体。
[本発明1052]
本発明1049~1051のいずれかの多重特異性抗体とヒトPD-L1との結合が、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体によってブロックされる、本発明1049~1051のいずれかの多重特異性抗体。
[本発明1053]
ヒトPD-L1に結合することができる第1の抗原結合領域と、第2の抗原にまたは異なるヒトPD-L1エピトープに結合することができる第2の抗原結合領域とを含む多重特異性抗体であって、
該第1の抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体[338]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体[511]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体[547]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、
該多重特異性抗体。
[本発明1054]
二重特異性である、本発明1040~1053のいずれかの多重特異性抗体。
[本発明1055]
二価である、本発明1054の多重特異性抗体。
[本発明1056]
本発明1040~1055のいずれかの多重特異性抗体が第2の抗原に結合することができ、かつ該第2の抗原がヒトCD3εではない、本発明1040~1055のいずれかの多重特異性抗体。
[本発明1057]
完全長抗体である、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1058]
完全長IgG1抗体である、本発明1057の抗体。
[本発明1059]
抗体断片である、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1060]
本発明1032~1059のいずれかの抗体が、抗原結合領域をそれぞれが含む2つの半分子を含み、
(i)ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む半分子がキメラであり、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる抗原結合領域を含む半分子が、存在する場合にはキメラである、
本発明1032~1059のいずれかの抗体。
[本発明1061]
(i)ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域がヒト化されており、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる前記抗原結合領域が、存在する場合にはヒト化されている、
前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1062]
(i)ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域がヒトであり、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる前記抗原結合領域が、存在する場合にはヒトである、
前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1063]
前記抗原結合領域のそれぞれが重鎖可変領域(VH)および軽鎖可変領域(VL)を含み、かつ該可変領域がそれぞれ、3つのCDR配列、それぞれCDR1、CDR2、およびCDR3、ならびに、4つのフレームワーク配列、それぞれFR1、FR2、FR3、およびFR4を含む、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1064]
2つの重鎖定常領域(CH)と2つの鎖定常領域(CL)とを含む、本発明1063の抗体。
[本発明1065]
前記本発明のいずれかの抗体が第1の重鎖および第2の重鎖を含み、該第1の重鎖および該第2の重鎖のそれぞれが、少なくとも、ヒンジ領域、CH2、およびCH3領域を含み、該第1の重鎖において、T366、L368、K370、D399、F405、Y407、およびK409(EUナンバリングに従う)からなる群より選択される位置に対応する位置にあるアミノ酸の少なくとも1つが置換されており、かつ該第2の重鎖において、T366、L368、K370、D399、F405、Y407、およびK409(EUナンバリングに従う)からなる群より選択される位置に対応する位置にあるアミノ酸の少なくとも1つが置換されており、かつ、該第1の重鎖および該第2の重鎖が同じ位置において置換されていない、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1066]
(i)前記第1の重鎖において、F405(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がLであり、かつ、前記第2の重鎖において、K409(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がRであるか、または(ii)前記第1の重鎖において、K409(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がRであり、かつ、前記第2の重鎖において、F405(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がLである、本発明1065の抗体。
[本発明1067]
前記本発明のいずれかの抗体が第1の重鎖および第2の重鎖を含み、かつ
該抗体が、改変されていない第1の重鎖および第2の重鎖を含む以外は同一の抗体と比べてより少ない程度まで、Fcを介したエフェクター機能を誘導するように、一方の重鎖または両方の重鎖が改変されている、
前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1068]
前記Fcを介したエフェクター機能が、Fcを介したCD69発現を判定することによって測定されるか、Fcγ受容体への結合によって測定されるか、C1qへの結合によって測定されるか、またはFcを介したFcR架橋結合の誘導によって測定される、本発明1067の抗体。
[本発明1069]
本発明1067または1068の抗体が、野生型抗体と比較した場合に、Fcを介したCD69発現を少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも99%、または100%低減するように、重鎖定常配列および軽鎖定常配列が改変されており、
該Fcを介したCD69発現が、PBMCに基づく機能アッセイ法において測定される、
本発明1067または1068の抗体。
[本発明1070]
前記本発明のいずれかの抗体が第1の重鎖および第2の重鎖を含み、該第1の重鎖および該第2の重鎖の少なくとも1つにおいて、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234、L235、D265、N297、およびP331に対応する位置にある1つまたは複数のアミノ酸が、それぞれL、L、D、N、およびPでない、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1071]
前記第1の重鎖および前記第2の重鎖において、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234およびL235に対応する位置が、それぞれFおよびEである、本発明1070の抗体。
[本発明1072]
本発明1071の抗体が、第1の重鎖および第2の重鎖を含む二重特異性抗体であり、かつ該第1の重鎖および該第2の重鎖の両方の、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234およびL235に対応する位置が、それぞれFおよびEであり、かつ、(i)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであるか、または(ii)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLである、本発明1071の抗体。
[本発明1073]
前記第1の重鎖および前記第2の重鎖おいて、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234、L235、およびD265に対応する位置が、それぞれF、E、およびAである、本発明1070の抗体。
[本発明1074]
本発明1073の抗体が、第1の重鎖および第2の重鎖を含む二重特異性抗体であり、かつ該第1の重鎖および該第2の重鎖の両方の、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234、L235、およびD265に対応する位置が、それぞれF、E、およびAであり、かつ、(i)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであるか、または(ii)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLである、本発明1073の抗体。
[本発明1075]
ヒトPD-L2に結合しない、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1076]
本明細書中の実施例8に記載の通りに測定した場合に、約10 -8 Mまたはそれ未満、例えば、約10 -9 Mまたはそれ未満、例えば、約10 -10 Mまたはそれ未満のK D でヒトPD-L1に結合する、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1077]
本明細書中の実施例11に記載の通りにアッセイした場合に、精製したT細胞をエフェクター細胞として使用した場合のMDA-MB-231細胞、PC-3細胞、および/またはHELA細胞の濃度依存性細胞障害を媒介する、前記本発明のいずれかの抗体。
[本発明1078]
(i)本発明1001~1031のいずれかにおいて定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体の重鎖配列をコードする核酸配列、および/または
(ii)本発明1001~1031のいずれかにおいて定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体の軽鎖配列をコードする核酸配列
を含む、核酸構築物。
[本発明1079]
(i)本発明1033~1038のいずれかにおいて定義されたヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含む抗体の重鎖配列をコードする核酸配列、および
(ii)本発明1033~1038のいずれかにおいて定義されたヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含む抗体の軽鎖配列をコードする核酸配列
をさらに含む、本発明1073の核酸構築物。
[本発明1080]
本発明1078または1079において定義された核酸構築物を含む、発現ベクター。
[本発明1081]
本発明1078もしくは1079において定義された核酸構築物または本発明1080において定義された発現ベクターを含む、宿主細胞。
[本発明1082]
チャイニーズハムスター卵巣細胞などの哺乳動物細胞である、本発明1081の宿主細胞。
[本発明1083]
本発明1001~1077のいずれかの抗体と、薬学的に許容される担体とを含む、薬学的組成物。
[本発明1084]
医薬として使用するための、本発明1001~1077のいずれかの抗体または本発明1083の薬学的組成物。
[本発明1085]
がんの治療において使用するための、本発明1001~1080のいずれかの抗体または本発明1070の薬学的組成物。
[本発明1086]
固形腫瘍の存在を特徴とするがん疾患の治療において使用するための、本発明1001~1077のいずれかの抗体または本発明1070の薬学的組成物。
[本発明1087]
黒色腫、卵巣がん、肺がん、結腸がん、および頭頸部がんからなる群より選択されるがん疾患の治療において使用するための、本発明1001~1078のいずれかの抗体または本発明1070の薬学的組成物。
[本発明1088]
それを必要とする対象に、本発明1001~1075のいずれかの抗体または本発明1083の薬学的組成物を投与する工程を含む、疾患を治療する方法。
[本発明1089]
がん、例えば、固形腫瘍の存在を特徴とするがん疾患、または黒色腫、卵巣がん、肺がん、結腸がん、および頭頸部がんからなる群より選択されるがん疾患を治療するための医薬などの医薬を製造するための、本発明1001~1077のいずれかの抗体の使用。
[本発明1090]
1種類または複数種類のさらなる治療用物質との組み合わせ、例えば、化学療法剤との組み合わせを含む、本発明1083~1089のいずれかの方法または使用。
[本発明1091]
(a)本発明1001~1013のいずれかにおいて定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む第1の抗体を産生する宿主細胞を培養し、かつ培養物から該第1の抗体を精製する工程;
(b)異なるPD-L1エピトープにまたは異なる抗原に結合することができる抗原結合領域、例えば、本発明1014~1019のいずれかにおいて定義されたヒトCD3ε結合領域を含む第2の抗体を産生する宿主細胞を培養し、かつ該培養物から該第2の抗体を精製する工程;
(c)ヒンジ領域におけるシステインがジスルフィド結合異性化を受けることを可能にするのに十分な還元条件下で、該第1の抗体を該第2の抗体と一緒にインキュベートする工程;および
(d)二重特異性抗体を得る工程
を含む、本発明1001~1077のいずれかの抗体を産生するための方法。
[本発明1092]
本発明1001~1077のいずれかにおいて定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域に結合する、抗イディオタイプ抗体。
本発明のこれらの局面および他の局面が下記でさらに詳細に説明される。
定義
「免疫グロブリン」という用語は、一対が低分子量の軽鎖(L)、一対が重鎖(H)の二対のポリペプチド鎖からなり、4本全てがジスルフィド結合で相互接続されている、構造上関連する糖タンパク質のクラスをいう。免疫グロブリンの構造ははっきりと特徴決定されている。例えば、Fundamental Immunology Ch. 7(Paul, W., ed., 2nd ed. Raven Press, N.Y. (1989))を参照されたい。簡単に述べると、それぞれの重鎖は、典型的には、重鎖可変領域(本明細書ではVHまたはVHと略す)と重鎖定常領域(本明細書ではCHまたはCHと略す)で構成される。重鎖定常領域は、典型的には、3つのドメイン、CH1、CH2、およびCH3で構成される。ヒンジ領域は重鎖のCH1ドメインとCH2ドメインの間にある領域であり、可動性が高い。ヒンジ領域におけるジスルフィド結合は、IgG分子にある2本の重鎖間の相互作用の一部である。それぞれの軽鎖は、典型的には、軽鎖可変領域(本明細書ではVLまたはVLと略す)と軽鎖定常領域(本明細書ではCLまたはCLと略す)で構成される。軽鎖定常領域は、典型的には、1つのドメインCLで構成される。VH領域およびVL領域は、相補性決定領域(CDR)とも呼ばれる超可変性領域(または配列が著しく変化し得る、かつ/もしくは構造が規定されたループの形をとり得る超可変領域)にさらに細分することができ、超可変性領域には、フレームワーク領域(FR)と呼ばれる、超可変性領域より保存された領域が点在している。それぞれのVHおよびVLは、典型的には、3つのCDRと4つのFRで構成され、アミノ末端からカルボキシ末端に向かって以下の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4で並べられている(Chothia and Lesk J. Mol. Biol. 196, 901-917(1987)も参照されたい)。特別の定めのない限り、または文脈と相反しない限り、本明細書におけるCDR配列は、IMGT規則に従い、DomainGapAlign バージョン4.9.2(2016-09-26)を用いて特定される(Lefranc MP., Nucleic Acids Research 1999;27:209-212およびEhrenmann F., Kaas Q. and Lefranc M.-P. Nucleic Acids Res., 38, D301-307 (2010);インターネットhttpアドレスhttp://www.imgt.org/も参照されたい)。特別の定めのない限り、または文脈と相反しない限り、本発明における定常領域のアミノ酸位置についての記載はEUナンバリングに従う(Edelman et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 1969 May;63(1):78-85; Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition. 1991 NIH Publication No. 91-3242)。例えば、本明細書においてSEQ ID NO:93は、EUナンバリングに従って、IgG1m(f)重鎖定常領域のアミノ酸位置118-447を示す。
前記のように、第1の局面において、本発明は、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域、およびヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる抗原結合領域を含む二重特異性抗体に関し、前記二重特異性抗体がヒトPD-L1とヒトPD-1との結合を阻害する。従って、このような二重特異性抗体は2つの異なる抗原結合領域を含み、1つの抗原結合領域はPD-L1に対する結合特異性を有し、1つの抗原結合領域はCD3に対する結合特異性を有する。
(i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1、配列DDNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列
を含む。
SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも95%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも95%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも97%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも97%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも95%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも95%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも97%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも97%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも95%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも95%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも97%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも97%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列
を含む。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列
を含む。
(i)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体とは競合しない、または
(ii)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体とは競合しない。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができるか、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができるか、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる。
(i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域、ならびに、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域、ならびに、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1、配列DDNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域、ならびに、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域
を含む。
(i)前記二重特異性抗体が、SEQ ID NO:25に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列を含むことができる抗原結合領域を有する抗体と比較して、ヒトCD3ε結合についてのより低い親和性を有し、好ましくは、前記親和性が、少なくとも1/2倍、例えば、少なくとも1/5倍、例えば、少なくとも1/10倍、例えば、少なくとも1/25倍、例えば、少なくとも1/50倍であり、かつ
(ii)前記二重特異性抗体が、PBMCまたは精製したT細胞をエフェクター細胞として使用した場合のMDA-MB-231細胞、PC-3細胞、および/またはHELA細胞の濃度依存性細胞障害を媒介することができる。
(i)前記ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域が、SEQ ID NO:25に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列を含むことができる抗原結合領域を有する抗体と比較して、ヒトCD3ε結合についてのより低い親和性を有し、好ましくは、前記親和性が、少なくとも1/2倍、例えば、少なくとも1/5倍、例えば、少なくとも1/10倍、例えば、少なくとも1/25倍、例えば、少なくとも1/50倍であり、かつ
(ii)前記ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域が、PBMCまたは精製したT細胞をエフェクター細胞として使用した場合のMDA-MB-231細胞、PC-3細胞、および/またはHELA細胞の濃度依存性細胞障害を媒介することができる。
(i)SEQ ID NO:99に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(ii)SEQ ID NO:100に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iii)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:101に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iv)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:102に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(v)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:103に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(vi)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:104に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(vii)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:105に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)SEQ ID NO:39に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:40に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:41に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(iv)SEQ ID NO:42に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(v)SEQ ID NO:43に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(vi)SEQ ID NO:44に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(vii)SEQ ID NO:45に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列
を含む。
さらなる局面において、本発明は、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む、新規の抗PD-L1抗体を提供する。本発明のこの局面の抗体は単一特異性でも多重特異性でもよく、多重特異性であれば、前記多重特異性抗体は、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含んでもよいかまたは含まなくてもよい。
(i)前記上皮細胞の培養物を、前記抗体とFcγRIIIa(CD16)およびホタルルシフェラーゼを安定発現するジャーカットヒトT細胞(エフェクター細胞)とを含む組成物と、1:1のエフェクター細胞:上皮細胞比で接触させ、
(ii)上皮細胞の培養物およびエフェクター細胞を15分間室温に調節し、
(iii)上皮細胞の培養物およびエフェクター細胞をルシフェラーゼ基質と共にインキュベートし、かつ
(iv)前記細胞培養物におけるルシフェラーゼ生成を測定する
ことによって、インビトロで測定されてもよく、前記組成物中の抗体の量は0.5~250ng/mLの範囲内であり、かつエフェクター細胞と上皮細胞の比は1:1である。
(a)SEQ ID NO:74に示したVH配列およびSEQ ID NO:78に示したVL配列を含む抗体;ならびに
(b)SEQ ID NO:81に示したVH配列およびSEQ ID NO:85に示したVL配列を含む抗体
より選択されてもよい。
(i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1、配列DDNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列
を含む。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列
を含む。
(i)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体とは競合しない、または
(ii)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体とは競合しない。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができるか、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができるか、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる。
(i)SEQ ID NO:33に示したCDR1配列、SEQ ID NO:34に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:35に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:37に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、SEQ ID NO:38に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(ii)SEQ ID NO:47に示したCDR1配列、SEQ ID NO:48に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:49に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:51に示した配列を有するCDR1、配列DVIを有するCDR2、およびSEQ ID NO:52に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iii)SEQ ID NO:54に示したCDR1配列、SEQ ID NO:55に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:56に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:58に示した配列を有するCDR1、配列RDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:59に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iv)SEQ ID NO:61に示したCDR1配列、SEQ ID NO:62に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:63に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:65に示した配列を有するCDR1、配列DDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:66に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VH)、または
(v)SEQ ID NO:107に示したCDR1配列、SEQ ID NO:108に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:109に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:111に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、SEQ ID NO:113に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、
(vi)SEQ ID NO:68に示したCDR1配列、SEQ ID NO:69に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:70に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:72に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:73に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)SEQ ID NO:32に示したVH配列およびSEQ ID NO:36に示したVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:46に示したVH配列およびSEQ ID NO:50に示したVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:53に示したVH配列およびSEQ ID NO:57に示したVL配列、または
(iv)SEQ ID NO:60に示したVH配列およびSEQ ID NO:64に示したVL配列、または
(v)SEQ ID NO:106に示したVH配列およびSEQ ID NO:110に示したVL配列、または
(v)SEQ ID NO:67に示したVH配列およびSEQ ID NO:71に示したVL配列
を含む。
(i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1、配列DDNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、
(iv)SEQ ID NO:33に示したCDR1配列、SEQ ID NO:34に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:35に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:37に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、SEQ ID NO:38に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(v)SEQ ID NO:47に示したCDR1配列、SEQ ID NO:48に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:49に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:51に示した配列を有するCDR1、配列DVIを有するCDR2、およびSEQ ID NO:52に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(vi)SEQ ID NO:54に示したCDR1配列、SEQ ID NO:55に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:56に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:58に示した配列を有するCDR1、配列RDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:59に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(vii)SEQ ID NO:61に示したCDR1配列、SEQ ID NO:62に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:63に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:65に示した配列を有するCDR1、配列DDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:66に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(viii)SEQ ID NO:68に示したCDR1配列、SEQ ID NO:69に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:70に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:72に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:73に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列
を含む。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列、または
(iv)SEQ ID NO:32に示したVH配列およびSEQ ID NO:36に示したVL配列、または
(v)SEQ ID NO:46に示したVH配列およびSEQ ID NO:50に示したVL配列、または
(vi)SEQ ID NO:53に示したVH配列およびSEQ ID NO:57に示したVL配列、または
(v)SEQ ID NO:106に示したVH配列およびSEQ ID NO:110に示したVL配列、または
(vii)SEQ ID NO:60に示したVH配列およびSEQ ID NO:64に示したVL配列、または
(viii)SEQ ID NO:67に示したVH配列およびSEQ ID NO:71に示したVL配列
を含む。
(i)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体とは競合しない、または
(ii)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列および SEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体とは競合しない。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができるか、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができるか、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる。
(i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1、配列DDNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列
を含む。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列
を含む。
(i)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体とは競合しない、または
(ii)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体とは競合しない。
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができるか、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができるか、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる。
1つの態様において、本発明による抗体は、本明細書中の実施例8に記載の通りに測定した場合に、約10-8Mまたはそれ未満、例えば、約10-9Mまたはそれ未満、例えば、約10-10Mまたはそれ未満のKDでヒトPD-L1に結合する。
前記のように、様々な抗体形式が当技術分野において説明されている。本発明の抗体は、原則的に、任意のアイソタイプの抗体でよい。アイソタイプの選択は、典型的には、望ましい、Fcを介したエフェクター機能、例えば、ADCC誘導、またはFcを介したエフェクター機能を欠く抗体(「不活性(inert)」抗体)に要求される要件によって左右される。例示的なアイソタイプはIgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4である。ヒト軽鎖定常領域、κまたはλのいずれかが用いられ得る。本発明の抗体のエフェクター機能は、様々な治療的使用のためにアイソタイプスイッチ、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgD、IgA、IgE、またはIgM抗体へのアイソタイプスイッチによって変えられてもよい。1つの態様において、本発明の抗体の両重鎖は、IgG1アイソタイプの重鎖、例えば、IgG1,κである。任意で、重鎖は、本明細書中の他の箇所に記載の通りにヒンジおよび/またはCH3領域において改変されてもよい。
(i)ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む半分子はキメラであり、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる抗原結合領域を含む半分子は、存在する場合にはキメラである。
(i)ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む半分子はヒト化されており、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる抗原結合領域を含む半分子は、存在する場合にはヒト化されている。
(i)ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む半分子はヒトであり、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる抗原結合領域を含む半分子は、存在する場合にはヒトである。
二重特異性抗体の多くの異なる形式および使用が当技術分野において公知であり、Kontermann; Drug Discov Today, 2015 Jul;20(7):838-47およびMAbs, 2012 Mar-Apr;4(2):182-97によって概説された。
(i)位置368に、Phe、Leu、およびMet以外のアミノ酸、例えば、Gly、Ala、Val、Ile、Ser、Thr、Lys、Arg、His、Asp、Asn、Glu、Gln、Pro、Trp、Tyr、もしくはCysを有するか、または
(ii)位置370にTrpを有するか、または
(iii)位置399にAsp、Cys、Pro、Glu、もしくはGln以外のアミノ酸、例えば、Phe、Leu、Met、Gly、Ala、Val、Ile、Ser、Thr、Lys、Arg、His、Asn、Trp、Tyr、もしくはCysを有するか、または
(iv)位置366に、Lys、Arg、Ser、Thr、もしくはTrp以外のアミノ酸、例えば、Phe、Leu、Met、Ala、Val、Gly、Ile、Asn、His、Asp、Glu、Gln、Pro、Tyr、もしくはCysを有する。
(i)位置368に、Lys、Gln、Ala、Asp、Glu、Gly、His、Ile、Asn、Arg、Ser、Thr、Val、もしくはTrpを有するか、または
(ii)位置370にTrpを有するか、または
(iii)位置399に、Ala、Gly、Ile、Leu、Met、Asn、Ser、Thr、Trp、Phe、His、Lys、Arg、もしくはTyrを有するか、または
(iv)位置366に、Ala、Asp、Glu、His、Asn、Val、Gln、Phe、Gly、Ile、Leu、Met、もしくはTyrを有する。
(i)位置368に、Asp、Glu、Gly、Asn、Arg、Ser、Thr、Val、もしくはTrpを有するか、または
(ii)位置370にTrpを有するか、または
(iii)位置399に、Phe、His、Lys、Arg、もしくはTyrを有するか、または
(iv)位置366に、Ala、Asp、Glu、His、Asn、Val、Glnを有する。
本発明の二重特異性抗体の調製では、ハイブリッドハイブリドーマおよび化学結合法(Marvin and Zhu (2005) Acta Pharmacol Sin 26:649)などの従来法を使用することができる。異なる重鎖および軽鎖からなる2種類の抗体を宿主細胞において同時発現させると、望ましい二重特異性抗体の他に、可能性のある抗体産物の混合物が生じる。次いで、望ましい二重特異性抗体を、例えば、アフィニティクロマトグラフィーまたは同様の方法によって単離することができる。
(a)Fc領域を含む第1の抗体を提供する工程であって、前記Fc領域が第1のCH3領域を含む、工程;
(b)第2のFc領域を含む第2の抗体を提供する工程であって、前記Fc領域が第2のCH3領域を含み、第1の抗体が、本発明によるPD-L1抗体であり、第2の抗体が、異なるPD-L1エピトープもしくは異なる抗原、例えば、ヒトCD3に結合することができる抗体であるか、または逆も同じであり、前記第1のCH3領域および第2のCH3領域の配列が異なり、かつ前記第1のCH3領域と第2のCH3領域との間のヘテロ二量体相互作用が前記第1のCH3領域および第2のCH3領域のホモ二量体相互作用のそれぞれより強くなるような配列である、工程;
(c)還元条件下で、前記第1の抗体を前記第2の抗体と一緒にインキュベートする工程;ならびに
(d)前記二重特異性抗体、例えば、二重特異性PD-L1×CD3抗体を得る工程
を含む、WO2011131746およびWO2013060867(Genmab)に記載の方法を含む。
(a)本明細書において定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む第1の抗体を産生する宿主細胞を培養し、かつ培養物から前記第1の抗体を精製する工程;
(b)異なるPD-L1エピトープにまたは異なる抗原に結合することができる抗原結合領域、例えば、本明細書において定義されたヒトCD3ε結合領域を含む第2の抗体を産生する宿主細胞を培養し、培養物から前記第2の抗体を精製する工程;
(c)ヒンジ領域におけるシステインがジスルフィド結合異性化を受けることを可能にするのに十分な還元条件下で、前記第1の抗体を前記第2の抗体と一緒にインキュベートする工程;ならびに
(d)前記二重特異性抗体を得る工程
を含む、本発明による抗体を産生するための方法が提供される。
(a)第1の抗体重鎖の第1のFc配列および第1の抗原結合領域を含む第1のポリペプチドをコードする第1の核酸構築物を提供する工程であって、前記第1のFc配列が第1のCH3領域を含む、工程、
(b)第2の抗体重鎖の第2のFc配列および第2の抗原結合領域を含む第2のポリペプチドをコードする第2の核酸構築物を提供する工程であって、前記第2のFc配列が第2のCH3領域を含み、
前記第1のCH3領域および第2のCH3領域の配列が異なり、かつ前記第1のCH3領域と第2のCH3領域との間のヘテロ二量体相互作用が前記第1のCH3領域および第2のCH3領域のホモ二量体相互作用のそれぞれより強くなるような配列であり、前記第1のホモ二量体タンパク質が位置409にLys、Leu、またはMet以外のアミノ酸を有し、前記第2のホモ二量体タンパク質が、位置366、368、370、399、405、および407からなる群より選択される位置にアミノ酸置換を有し、
任意で、前記第1の核酸構築物および第2の核酸構築物が、前記第1の抗体および第2の抗体の軽鎖配列をコードする、工程、
(c)前記第1の核酸構築物および第2の核酸構築物を宿主細胞において同時発現させる工程、ならびに
(d)細胞培養物から前記ヘテロ二量体タンパク質を得る工程
を含む、二重特異性抗体を産生するための方法に関する。
さらなる局面において、本発明は、本発明による抗体の組換え産生のための材料および方法に関する。プロモーター、エンハンサーなどを含む適切な発現ベクター、および抗体を産生するための適切な宿主細胞が当技術分野において周知である。
(i)本明細書において定義された、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体の重鎖配列をコードする核酸配列、および/または
(ii)本明細書において定義された、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体の軽鎖配列をコードする核酸配列
を含む、核酸構築物が提供される。
(i)本明細書において定義された、異なるPD-L1エピトープまたは異なる抗原、例えば、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含む抗体の重鎖配列をコードする核酸配列、および
(ii)本明細書において定義された、異なるPD-L1エピトープまたは異なる抗原、例えば、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含む抗体の軽鎖配列をコードする核酸配列
をさらに含む。
一部の態様において、本発明による抗体は、抗原結合領域に加えて、2つの重鎖のFc配列からなるFc領域を含む。
(i)IgG1-huCD3-H1L1-FEALに由来する半分子抗体、ならびに、IgG1-PDL1-338-FEAR、IgG1-PDL1-511-FEAR、もしくはIgG1-PDL1-547-FEARに由来する半分子抗体、または
(ii)IgG1-huCD3-H1L1-FEARに由来する半分子抗体、ならびに、IgG1-PDL1-338-FEAL、IgG1-PDL1-511-FEAL、もしくはIgG1-PDL1-547-FEALに由来する半分子抗体および半分子抗体
を含む。
さらなる局面において、本発明は、1つまたは複数の治療的部分、例えば、サイトカイン、免疫抑制剤、免疫刺激分子、および/または放射性同位体と連結または結合体化された抗体を提供する。このような結合体は本明細書において「免疫結合体」または「薬物結合体」と呼ばれる。1つまたは複数の細胞毒を含む免疫結合体は「免疫毒素」と呼ばれる。
さらなる局面において、本発明は、本明細書において開示される態様のいずれか1つに従う抗体、および薬学的に許容される担体を含む薬学的組成物に関する。
1つの局面において、本発明は、医薬として使用するための、本明細書において開示される態様のいずれか1つに従う抗体または本明細書において開示される薬学的組成物に関する。
(a)PD-L1発現腫瘍細胞を含むがんに罹患している対象を選択する工程、および
(b)本発明の抗体または本発明の薬学的組成物を対象に投与する工程
を含む、がんを治療するための方法に関する。
1. ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体であって、
ヒトPD-L1とヒトPD-1との結合を阻害し、かつ、
(i)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体[511]と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体[547]とは競合しない、または
(ii)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体[547]と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体[511]とは競合しない、
前記抗体。
2. ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体[338]と競合する、項目1に記載の抗体。
3. 前記項目のいずれかに記載の抗体とヒトPD-L1との結合が、SEQ ID NO:53に示したVH配列およびSEQ ID NO:57に示したVL配列を含む抗体[476]によって置換されない、前記項目のいずれかに記載の抗体。
4. 前記項目のいずれかに記載の抗体とヒトPD-L1との結合が、SEQ ID NO:106に示したVH配列およびSEQ ID NO:110に示したVL配列を含む抗体[625]の結合によってブロックされない、前記項目のいずれかに記載の抗体。
5. 前記項目のいずれかに記載の抗体とヒトPD-L1との結合が、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体[547]によってブロックされる、前記項目のいずれかに記載の抗体。
6. (i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体[338]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体[511]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体[547]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、
項目1に記載の抗体。
7. 項目1~4および6のいずれかに記載の抗体と、SEQ ID NO:94における位置113に対応する位置にあるアミノ酸残基(R113)、位置123に対応する位置にあるアミノ酸残基(Y123)、および位置125に対応する位置にあるアミノ酸残基(R125)のいずれか1つまたは複数がアラニンで置換されている変異体PD-L1との結合が、SEQ ID NO:94に示したアミノ酸配列を有する野生型PD-L1との結合と比較して低減しており、該抗体の結合の変化倍率がアラニン変異体全てにわたる結合の変化倍率の平均 - 1.5×SDよりも小さい場合に結合の低減が判定され、SDが変異体PDL1に対する該抗体の変化倍率計算値全ての標準偏差であり、かつ結合の変化倍率が実施例13に示した通りに算出される[338]、項目1~4および6のいずれかに記載の抗体。
8. 項目1~2、および6のいずれかに記載の抗体が、PD-L1(SEQ ID NO:94)上のエピトープに結合し、該エピトープが、SEQ ID NO:94の位置113におけるアミノ酸残基(R113)、位置123におけるアミノ酸残基(Y123)、および/または位置125におけるアミノ酸残基(R125)を含む、項目1~2、および6のいずれかに記載の抗体。
9. 項目1、3、4、および6のいずれかに記載の抗体と、SEQ ID NO:94における位置19に対応する位置にあるアミノ酸残基(F19)、位置42に対応する位置にあるアミノ酸残基(F42)、位置45に対応する位置にあるアミノ酸残基(E45)、位置46に対応する位置にあるアミノ酸残基(K46)、位置94に対応する位置にあるアミノ酸残基(L94)、および位置116に対応する位置にあるアミノ酸残基(I116)のいずれか1つまたは複数がアラニンで置換されている変異体PD-L1との結合が、SEQ ID NO:94に示したアミノ酸配列を有する野生型PD-L1と比較して低減しており、該抗体の結合の変化倍率がアラニン変異体全てにわたる結合の変化倍率の平均 - 1.5×SDよりも小さい場合に結合の低減が判定され、SDが変異体PDL1に対する該抗体の変化倍率計算値全ての標準偏差であり、かつ結合の変化倍率が実施例13に示した通りに算出される[511]、項目1、3、4、および6のいずれかに記載の抗体。
10. 項目1、3、4、および6のいずれかに記載の抗体が、PD-L1(SEQ ID NO:94)上のエピトープに結合し、該エピトープが、SEQ ID NO:94の位置45におけるアミノ酸残基(E45)、位置46におけるアミノ酸残基(K46)、および/または位置94におけるアミノ酸残基(L94)からなる群より選択される1つまたは複数のアミノ酸残基を含む、項目1、3、4、および6のいずれかに記載の抗体。
11. 項目1、5、および6のいずれかに記載の抗体と、SEQ ID NO:94における位置58に対応する位置にあるアミノ酸残基(E58)および位置113に対応する位置にあるアミノ酸残基(R113)のいずれか1つまたは複数がアラニンで置換されている変異体PD-L1との結合が、SEQ ID NO:94に示したアミノ酸配列を有する野生型PD-L1と比較して低減しており、該抗体の結合の変化倍率がアラニン変異体全てにわたる結合の変化倍率の平均 - 1.5×SDよりも小さい場合に結合の低減が判定され、SDが変異体PDL1に対する該抗体の変化倍率計算値全ての標準偏差であり、かつ結合の変化倍率が実施例13に示した通りに算出される[547]、項目1、5、および6のいずれかに記載の抗体。
12. 項目1、5、および6のいずれかに記載の抗体が、PD-L1(SEQ ID NO:94)上のエピトープに結合し、該エピトープが、SEQ ID NO:94の位置58におけるアミノ酸残基(E58)および/または位置113におけるアミノ酸残基(R113)を含む、項目1、5、および6のいずれかに記載の抗体。
13. ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、CDR1配列、CDR2配列、およびCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、CDR1配列、CDR2配列、およびCDR3配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含み、VH CDR3配列が、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:11、および SEQ ID NO:21に示した配列からなる群より選択される、前記項目のいずれかに記載の抗体。
14. ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[338]、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[511]、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、 SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1、配列 DDNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[547]
を含む、前記項目のいずれかに記載の抗体。
15. ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:8、およびSEQ ID NO:18に示した配列からなる群より選択されるVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、または100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列を含む、前記項目のいずれかに記載の抗体。
16. ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:15、およびSEQ ID NO:22に示した配列からなる群より選択されるVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、または100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列を含む、前記項目のいずれかに記載の抗体。
17. ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[338]、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[511]、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[547]
を含む、前記項目のいずれかに記載の抗体。
18. 前記VH配列および前記VL配列がそれぞれ、3つのCDR配列、それぞれCDR1、CDR2、およびCDR3、ならびに4つのフレームワーク配列、それぞれFR1、FR2、FR3、およびFR4を含み、かつ、VHの各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列が、該VH配列の該各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、または少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有し、かつVH CDR配列が変異しておらず、かつVLの各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列が、該VL配列の該各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、または少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有し、かつVL CDR配列が変異していない、項目17に記載の抗体。
19. 抗体依存性細胞障害(ADCC)を介して、腺がんの上皮細胞の用量依存的溶解、例えば、MDA-MB-231の用量依存的溶解を誘導することができる、前記項目のいずれかに記載の抗体。
20. 細胞溶解の結果として前記上皮細胞の培養物中の細胞数を少なくとも5%、例えば、少なくとも6%、7%、8%、9%、または少なくとも10%低減することができる、項目19に記載の抗体。
21. ADCCが、51Cr放出アッセイ法、例えば、実施例14に開示されるアッセイ法においてインビトロで測定される、項目19または20に記載の抗体。
22. ADCCが、項目19または20に記載の抗体とエフェクター細胞、例えば末梢血単核球(PBMC)とを含む組成物と共に前記上皮細胞を37℃、5%CO2で4時間インキュベートすることによってインビトロで測定され、該組成物中の抗体の量が0.1~1μg/mLの範囲内であり、かつエフェクター細胞と上皮細胞の比が100:1である、項目19または20に記載の抗体。
23. 上皮細胞の前記溶解が、ADCCの代わりとしてのルシフェラーゼレポーターアッセイ法、例えば、実施例14に開示されるルミネセンスADCCレポーターバイオアッセイ法においてインビトロで測定される、項目19または20に記載の抗体。
24. ADCCが、
(i)前記上皮細胞の培養物を、項目23に記載の抗体とFcγRIIIa(CD16)およびホタルルシフェラーゼを安定発現するジャーカットヒトT細胞(エフェクター細胞)とを含む組成物と、1:1のエフェクター細胞:上皮細胞比で接触させ、
(ii)該上皮細胞の培養物および該エフェクター細胞を15分間室温に調節し、
(iii)該上皮細胞の培養物および該エフェクター細胞をルシフェラーゼ基質と共にインキュベートし、かつ
(iv)該細胞培養物におけるルシフェラーゼ生成を測定する
ことによって、インビトロで測定され、
該組成物中の抗体の量が0.5~250ng/mLの範囲内であり、かつエフェクター細胞と上皮細胞の比が1:1である、項目23に記載の抗体。
25. 前記上皮細胞のADCCが、ルシフェラーゼレポーターアッセイ法、例えば、項目23または24において定義されたレポーターアッセイ法において測定され、次いで、項目19、20、23、および24のいずれかに記載の抗体を含む試験組成物と共に該上皮細胞の培養物をインキュベートした後に観察されたADCCが、参照抗体を含む組成物と共に該上皮細胞の培養物をインキュベートした後に観察されたADCCの少なくとも1.5倍であり、ADCCが相対発光量(RLU)として測定され、該試験組成物中の抗体濃度と参照抗体を含む該組成物中の抗体濃度が同じでありかつ20~250ng/mlの範囲内であり、かつ該参照抗体が、
(a)SEQ ID NO:74に示したVH配列およびSEQ ID NO:78に示したVL配列を含む抗体;ならびに
(b)SEQ ID NO:81に示したVH配列およびSEQ ID NO:85に示したVL配列を含む抗体
より選択される、項目19、20、23、および24のいずれかに記載の抗体。
26. ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列[338]、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列[511]、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列[547]
を含む、前記項目のいずれかに記載の抗体。
27. ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体であって、
(i)SEQ ID NO:33に示したCDR1配列、SEQ ID NO:34に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:35に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:37に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、SEQ ID NO:38に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[321]、または
(ii)SEQ ID NO:47に示したCDR1配列、SEQ ID NO:48に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:49に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:51に示した配列を有するCDR1、配列 DVIを有するCDR2、およびSEQ ID NO:52に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[421]、または
(iii)SEQ ID NO:54に示したCDR1配列、SEQ ID NO:55に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:56に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:58に示した配列を有するCDR1、配列 RDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:59に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[476]、または
(iv)SEQ ID NO:61に示したCDR1配列、SEQ ID NO:62に示したCDR2配列、および SEQ ID NO:63に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:65に示した配列を有するCDR1、配列 DDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:66に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[516]、または
(v)SEQ ID NO:107に示したCDR1配列、SEQ ID NO:108に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:109に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:111に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、SEQ ID NO:113に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[625]、または
(vi)SEQ ID NO:68に示したCDR1配列、SEQ ID NO:69に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:70に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:72に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:73に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[632]
を含む、該抗体。
28. (i)SEQ ID NO:32に示したVH配列およびSEQ ID NO:36に示したVL配列[321]、または
(ii)SEQ ID NO:46に示したVH配列およびSEQ ID NO:50に示したVL配列[421]、または
(iii)SEQ ID NO:53に示したVH配列およびSEQ ID NO:57に示したVL配列[476]、または
(iv)SEQ ID NO:60に示したVH配列およびSEQ ID NO:64に示したVL配列[516]、または
(v)SEQ ID NO:106に示したVH配列およびSEQ ID NO:110に示したVL配列[625]、または
(vi)SEQ ID NO:67に示したVH配列およびSEQ ID NO:71に示したVL配列[632]
を含む、項目27に記載の抗体。
29. 一価である、前記項目のいずれかに記載の抗体。
30. 前記項目のいずれかに記載の抗体が、ヒトPD-L1に結合することができる2つの抗原結合領域を有する二価抗体であり、かつ、該2つの抗原結合領域が同一の可変領域配列を有する、前記項目のいずれかに記載の抗体。
31. 前記項目のいずれかに記載の抗体が、二価二重特異性抗体であり、ヒトPD-L1に結合することができる(第1の)前記抗原結合領域に加えて、第2の抗原にまたは異なるヒトPD-L1エピトープに結合することができる(第2の)抗原結合領域を含み、該第2の抗原がヒトCD3εでない、前記項目のいずれかに記載の抗体。
32. ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域と、ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる抗原結合領域とを含む二重特異性抗体であって、
ヒトPD-L1に結合することができる該抗原結合領域が、前記項目のいずれかに示した特徴を有する、該二重特異性抗体。
33. ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)を含む、項目32に記載の二重特異性抗体。
34. (i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域[338]、ならびに、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域[338]、ならびに、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1配列、配列DDNを有するCDR2配列、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3配列を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域[547]、ならびに、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域
を含む、項目32または33に記載の二重特異性抗体。
35. ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、SEQ ID NO:25に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列を含む、項目32~34のいずれかに記載の二重特異性抗体。
36. (i)前記二重特異性抗体が、SEQ ID NO:25に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列を含むことができる抗原結合領域を有する抗体と比較して、ヒトCD3ε結合についてのより低い親和性を有し、好ましくは、該親和性が、少なくとも1/2倍、例えば、少なくとも1/5倍、例えば、少なくとも1/10倍、例えば、少なくとも1/25倍、例えば、少なくとも1/50倍であり、かつ
(ii)該二重特異性抗体が、例えば、本明細書中の実施例11に記載の通りにアッセイした場合に、PBMCまたは精製したT細胞をエフェクター細胞として使用した場合のMDA-MB-231細胞、PC-3細胞、および/またはHELA細胞の濃度依存性細胞障害を媒介することができる、
項目32に記載の二重特異性抗体。
37. ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:99に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(ii)SEQ ID NO:100に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iii)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:101に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iv)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:102に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(v)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:103に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(vi)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:104に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(vii)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:105に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、項目36に記載の二重特異性抗体。
38. ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:39に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:40に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:41に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(iv)SEQ ID NO:42に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(v)SEQ ID NO:43に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(vi)SEQ ID NO:44に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(vii)SEQ ID NO:45に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列
を含む、項目36または37に記載の二重特異性抗体。
39. ヒトPD-L1に結合することができる第1の抗原結合領域と、第2の抗原にまたは異なるヒトPD-L1エピトープに結合することができる第2の抗原結合領域とを含む多重特異性抗体であって、
ヒトPD-L1に結合することができる該抗原結合領域が項目1~31のいずれかに示した特徴を有する、該多重特異性抗体。
40. ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、CDR1配列、CDR2配列、およびCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、CDR1配列、CDR2配列、およびCDR3配列を含む軽鎖可変領域(VL)を含み、VH CDR3配列が、SEQ ID NO:4[338]、SEQ ID NO:11[511]、およびSEQ ID NO:21[547]に示した配列からなる群より選択される、項目39に記載の多重特異性抗体。
41. ヒトPD-L1に結合することができる前記第1の抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:2に示したCDR1配列、SEQ ID NO:3に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:4に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:6に示した配列を有するCDR1、配列KASを有するCDR2、およびSEQ ID NO:7に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[338]、または
(ii)SEQ ID NO:9に示したCDR1配列、SEQ ID NO:10に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:11に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:16に示した配列を有するCDR1、配列EDSを有するCDR2、およびSEQ ID NO:17に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[511]、または
(iii)SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1、配列DDNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)[547]
を含む、項目40に記載の多重特異性抗体。
42. ヒトPD-L1に結合することができる前記第1の抗原結合領域が、SEQ ID NO:1[338]、SEQ ID NO:8[511]、およびSEQ ID NO:18[547]に示した配列からなる群より選択されるVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、または100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列を含む、項目40または41に記載の多重特異性抗体。
43. ヒトPD-L1に結合することができる前記第1の抗原結合領域が、SEQ ID NO:5[338]、SEQ ID NO:15[511]、およびSEQ ID NO:22[547]に示した配列からなる群より選択されるVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、または100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列を含む、項目40~42のいずれかに記載の多重特異性抗体。
44. ヒトPD-L1に結合することができる前記第1の抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:5に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[338]、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:15に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[511]、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[547]
を含む、項目40~43のいずれかに記載の多重特異性抗体。
45. 前記VH配列および前記VL配列がそれぞれ、3つのCDR配列、それぞれCDR1、CDR2、およびCDR3、ならびに、4つのフレームワーク配列、それぞれFR1、FR2、FR3、およびFR4を含み、かつ、VHの各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列が、該VH配列の該各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、または少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有し、かつVH CDR配列が変異しておらず、かつVLの各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列が、該VL配列の該各組み合わされたFR1、FR2、FR3、およびFR4フレームワーク配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、または少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有し、かつVL CDR配列が変異していない、項目40~44のいずれかに記載の多重特異性抗体。
46. ヒトPD-L1に結合することができる前記第1の抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列[338]、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列[511]、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列[547]
を含む、項目40~45のいずれかに記載の多重特異性抗体。
47. ヒトPD-L1に結合することができる第1の抗原結合領域と、第2の抗原にまたは異なるヒトPD-L1エピトープに結合することができる第2の抗原結合領域とを含む多重特異性抗体であって、
(i)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体とは競合しない、または
(ii)ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と競合するが、ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体とは競合しない、
該多重特異性抗体。
48. ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体と競合する、項目47に記載の多重特異性抗体。
49. ヒトPD-L1に結合することができる第1の抗原結合領域と、第2の抗原にまたは異なるヒトPD-L1エピトープに結合することができる第2の抗原結合領域とを含む多重特異性抗体であって、
該抗体とヒトPD-L1との結合が、SEQ ID NO:53に示したVH配列およびSEQ ID NO:57に示したVL配列を含む抗体によって置換されない、該多重特異性抗体。
50. ヒトPD-L1とヒトPD-1との結合を阻害する、項目49に記載の多重特異性抗体。
51. ヒトPD-L1との結合について、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体と競合する、項目49または50に記載の多重特異性抗体。
52. 項目49~51のいずれかに記載の多重特異性抗体とヒトPD-L1との結合が、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体によってブロックされる、項目49~51のいずれかに記載の多重特異性抗体。
53. ヒトPD-L1に結合することができる第1の抗原結合領域と、第2の抗原にまたは異なるヒトPD-L1エピトープに結合することができる第2の抗原結合領域とを含む多重特異性抗体であって、
該第1の抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:1に示したVH配列およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を含む抗体[338]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、または
(ii)SEQ ID NO:8に示したVH配列およびSEQ ID NO:15に示したVL配列を含む抗体[511]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、または
(iii)SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列を含む抗体[547]と同じヒトPD-L1エピトープに結合することができる、
該多重特異性抗体。
54. 二重特異性である、項目40~53のいずれかに記載の多重特異性抗体。
55. 二価である、項目54に記載の多重特異性抗体。
56. 項目40~55のいずれかに記載の多重特異性抗体が第2の抗原に結合することができ、かつ該第2の抗原がヒトCD3εではない、項目40~55のいずれかに記載の多重特異性抗体。
57. 完全長抗体である、前記項目のいずれかに記載の抗体。
58. 完全長IgG1抗体である、項目57に記載の抗体。
59. 抗体断片である、前記項目のいずれかに記載の抗体。
60. 項目32~59のいずれかに記載の抗体が、抗原結合領域をそれぞれが含む2つの半分子を含み、
(i)ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む半分子がキメラであり、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる抗原結合領域を含む半分子が、存在する場合にはキメラである、
項目32~59のいずれかに記載の抗体。
61. (i)ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域がヒト化されており、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる前記抗原結合領域が、存在する場合にはヒト化されている、
前記項目のいずれかに記載の抗体。
62. (i)ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域がヒトであり、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる前記抗原結合領域が、存在する場合にはヒトである、
前記項目のいずれかに記載の抗体。
63. 前記抗原結合領域のそれぞれが重鎖可変領域(VH)および軽鎖可変領域(VL)を含み、かつ該可変領域がそれぞれ、3つのCDR配列、それぞれCDR1、CDR2、およびCDR3、ならびに、4つのフレームワーク配列、それぞれFR1、FR2、FR3、およびFR4を含む、前記項目のいずれかに記載の抗体。
64. 2つの重鎖定常領域(CH)と2つの鎖定常領域(CL)とを含む、項目63に記載の抗体。
65. 前記項目のいずれかに記載の抗体が第1の重鎖および第2の重鎖を含み、該第1の重鎖および該第2の重鎖のそれぞれが、少なくとも、ヒンジ領域、CH2、およびCH3領域を含み、該第1の重鎖において、T366、L368、K370、D399、F405、Y407、およびK409(EUナンバリングに従う)からなる群より選択される位置に対応する位置にあるアミノ酸の少なくとも1つが置換されており、かつ該第2の重鎖において、T366、L368、K370、D399、F405、Y407、およびK409(EUナンバリングに従う)からなる群より選択される位置に対応する位置にあるアミノ酸の少なくとも1つが置換されており、かつ、該第1の重鎖および該第2の重鎖が同じ位置において置換されていない、前記項目のいずれかに記載の抗体。
66. (i)前記第1の重鎖において、F405(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がLであり、かつ、前記第2の重鎖において、K409(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がRであるか、または(ii)前記第1の重鎖において、K409(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がRであり、かつ、前記第2の重鎖において、F405(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がLである、項目65に記載の抗体。
67. 前記項目のいずれかに記載の抗体が第1の重鎖および第2の重鎖を含み、かつ
該抗体が、改変されていない第1の重鎖および第2の重鎖を含む以外は同一の抗体と比べてより少ない程度まで、Fcを介したエフェクター機能を誘導するように、一方の重鎖または両方の重鎖が改変されている、
前記項目のいずれかに記載の抗体。
68. 前記Fcを介したエフェクター機能が、Fcを介したCD69発現を判定することによって測定されるか、Fcγ受容体への結合によって測定されるか、C1qへの結合によって測定されるか、またはFcを介したFcR架橋結合の誘導によって測定される、項目67に記載の抗体。
69. 項目67または68に記載の抗体が、野生型抗体と比較した場合に、Fcを介したCD69発現を少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも99%、または100%低減するように、重鎖定常配列および軽鎖定常配列が改変されており、
該Fcを介したCD69発現が、PBMCに基づく機能アッセイ法において測定される、
項目67または68に記載の抗体。
70. 前記項目のいずれかに記載の抗体が第1の重鎖および第2の重鎖を含み、該第1の重鎖および該第2の重鎖の少なくとも1つにおいて、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234、L235、D265、N297、およびP331に対応する位置にある1つまたは複数のアミノ酸が、それぞれL、L、D、N、およびPでない、前記項目のいずれかに記載の抗体。
71. 前記第1の重鎖および前記第2の重鎖において、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234およびL235に対応する位置が、それぞれFおよびEである、項目70に記載の抗体。
72. 項目71に記載の抗体が、第1の重鎖および第2の重鎖を含む二重特異性抗体であり、かつ該第1の重鎖および該第2の重鎖の両方の、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234およびL235に対応する位置が、それぞれFおよびEであり、かつ、(i)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであるか、または(ii)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLである、項目71に記載の抗体。
73. 前記第1の重鎖および前記第2の重鎖おいて、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234、L235、およびD265に対応する位置が、それぞれF、E、およびAである、項目70に記載の抗体。
74. 項目73に記載の抗体が、第1の重鎖および第2の重鎖を含む二重特異性抗体であり、かつ該第1の重鎖および該第2の重鎖の両方の、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234、L235、およびD265に対応する位置が、それぞれF、E、およびAであり、かつ、(i)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであるか、または(ii)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLである、項目73に記載の抗体。
75. ヒトPD-L2に結合しない、前記項目のいずれかに記載の抗体。
76. 本明細書中の実施例8に記載の通りに測定した場合に、約10-8Mまたはそれ未満、例えば、約10-9Mまたはそれ未満、例えば、約10-10Mまたはそれ未満のKDでヒトPD-L1に結合する、前記項目のいずれかに記載の抗体。
77. 本明細書中の実施例11に記載の通りにアッセイした場合に、精製したT細胞をエフェクター細胞として使用した場合のMDA-MB-231細胞、PC-3細胞、および/またはHELA細胞の濃度依存性細胞障害を媒介する、前記項目のいずれかに記載の抗体。
78. (i)項目1~31のいずれかにおいて定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体の重鎖配列をコードする核酸配列、および/または
(ii)項目1~31のいずれかにおいて定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体の軽鎖配列をコードする核酸配列
を含む、核酸構築物。
79. (i)項目33~38のいずれかにおいて定義されたヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含む抗体の重鎖配列をコードする核酸配列、および
(ii)項目33~38のいずれかにおいて定義されたヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含む抗体の軽鎖配列をコードする核酸配列
をさらに含む、項目73に記載の核酸構築物。
80. 項目78または79において定義された核酸構築物を含む、発現ベクター。
81. 項目78もしくは79において定義された核酸構築物または項目80において定義された発現ベクターを含む、宿主細胞。
82. チャイニーズハムスター卵巣細胞などの哺乳動物細胞である、項目81に記載の宿主細胞。
83. 項目1~77のいずれかに記載の抗体と、薬学的に許容される担体とを含む、薬学的組成物。
84. 医薬として使用するための、項目1~77のいずれかに記載の抗体または項目83に記載の薬学的組成物。
85. がんの治療において使用するための、項目1~80のいずれかに記載の抗体または項目70に記載の薬学的組成物。
86. 固形腫瘍の存在を特徴とするがん疾患の治療において使用するための、項目1~77のいずれかに記載の抗体または項目70に記載の薬学的組成物。
87. 黒色腫、卵巣がん、肺がん、結腸がん、および頭頸部がんからなる群より選択されるがん疾患の治療において使用するための、項目1~78のいずれかに記載の抗体または項目70に記載の薬学的組成物。
88. それを必要とする対象に、項目1~75のいずれかに記載の抗体または項目83に記載の薬学的組成物を投与する工程を含む、疾患を治療する方法。
89. がん、例えば、固形腫瘍の存在を特徴とするがん疾患、または黒色腫、卵巣がん、肺がん、結腸がん、および頭頸部がんからなる群より選択されるがん疾患を治療するための医薬などの医薬を製造するための、項目1~77のいずれかに記載の抗体の使用。
90. 1種類または複数種類のさらなる治療用物質との組み合わせ、例えば、化学療法剤との組み合わせを含む、項目83~89のいずれかに記載の方法または使用。
91. (a)項目1~13のいずれかにおいて定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む第1の抗体を産生する宿主細胞を培養し、かつ培養物から該第1の抗体を精製する工程;
(b)異なるPD-L1エピトープにまたは異なる抗原に結合することができる抗原結合領域、例えば、項目14~19のいずれかにおいて定義されたヒトCD3ε結合領域を含む第2の抗体を産生する宿主細胞を培養し、かつ該培養物から該第2の抗体を精製する工程;
(c)ヒンジ領域におけるシステインがジスルフィド結合異性化を受けることを可能にするのに十分な還元条件下で、該第1の抗体を該第2の抗体と一緒にインキュベートする工程;および
(d)二重特異性抗体を得る工程
を含む、項目1~77のいずれかに記載の抗体を産生するための方法。
92. 項目1~77のいずれかにおいて定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域に結合する、抗イディオタイプ抗体。
OmniRat動物の免疫化およびハイブリドーマ作製
免疫化およびハイブリドーマ作製はAldevron GmbH(Freiburg, Germany)で行った。ヒトPD-L1のアミノ酸19-238をコードするcDNAを、Aldevronが知的財産権をもつ発現プラスミドにクローニングした。DNAでコーティングした金粒子をパーティクルボンバードメント(「遺伝子銃」)用の携帯型装置を用いて皮内適用することで、OmniRat動物群(完全ヒトイディオタイプを有する多様な抗体レパートリーを発現するトランスジェニックラット; Ligand Pharmaceuticals Inc., San Diego, USA)を免疫化した。一過的にトランスフェクトされたHEK細胞上での細胞表面発現を、GenentechのMPDL3280Aをベースとする抗PD-L1抗体を用いて確認した。一連の免疫化の後に血清試料を収集し、前述した発現プラスミドを一過的にトランスフェクトしたHEK細胞に対するフローサイトメトリーで試験した。抗体産生細胞を単離し、標準的な手順に従ってマウスミエローマ細胞(Ag8)と融合させた。PD-L1特異的抗体を産生するハイブリドーマを、上記で説明したものと同じアッセイ法でスクリーニングによって特定した。陽性ハイブリドーマ細胞の細胞ペレットを、RNA保護剤(RNAlater, ThermoFisher Scientific, カタログ番号AM7020)を用いて調製し、前記抗体の可変ドメインを配列決定するためにさらに処理した。
0.2~5×106個のハイブリドーマ細胞から全RNAを調製し、SMART RACE cDNA Amplification kit(Clontech)を使用し、製造業者の説明書に従って全RNAから5’-RACE-相補的DNA(cDNA)を調製した。VHコード領域およびVLコード領域をPCR増幅し、ライゲーション非依存性クローニング(Aslanidis, C. and P.J. de Jong, Nucleic Acids Res 1990;18(20): 6069-74)によってpOMTG1f-FEAR-LIC(ヒトIgG1)およびpEFC33D-κ(ヒトκ)またはpOMTL-LIC(ヒトλ)発現ベクターに直接、インフレームでクローニングした。これらのプラスミドでは抗体配列はCMVプロモーターを用いて発現される。各抗体について、8つのVLクローンおよび8つのVHクローンを配列決定した。CDR配列をIMGT定義に従って定義した[Lefranc MP. et al., Nucleic Acids Research, 27, 209-212, 1999; Brochet X. Nucl. Acids Res. 36, W503-508 (2008)]。さらなる研究および発現のために正しいオープンリーディングフレーム(ORF)のあるクローンを選択した。ハイブリドーマ培養物ごとに発見された重鎖および軽鎖の全ての組み合わせのLEE PCR産物をExpiFectamineを用いてExpi293F細胞において一過的に同時発現させた。ハイブリドーマごとに、均一用量反応スクリーニング(homogeneous dose-response screen)において最良の結合を示したHC/LCペアをリード候補として選択した。
直鎖発現エレメント(linear expression element: LEE)を、CMVプロモーターとHCコード領域またはLCコード領域と発現プラスミドに由来するエレメントを含有するポリAシグナルとを含有する断片を増幅することによって生成した。このために、Accuprime Taq DNAポリメラーゼ(Life Technologies)とプライマーCMVPf(BsaI)2およびTkpA(BsaI)rを使用し、45秒94℃、30秒55℃、および2分(LC)または3分(HC)68℃の35サイクルを行い、DNAテンプレートとして50×希釈プラスミドミニプレップ(miniprep)材料を用いて前記領域を増幅した。
AbのLEE発現のために、1.11μlのHC LEE PCR反応混合物と1.11μlのLC PCR反応混合物を混合し、Expi293F細胞において、125μlの総体積でトランスフェクション試薬としてExpiFectamin 293を用いて製造業者(Thermo Fisher Scientific, USA)の説明書に従い、容器として96ウェルプレートを用いてトランスフェクトした。
抗体をIgG1,κ(338の場合)またはIgG1,λ(511および547の場合)として発現させた。抗体の重鎖および軽鎖を両方ともコードするプラスミドDNA混合物を、Expi293F発現プラットフォーム(Thermo Fisher Scientific, USA)を用いて、本質的に製造業者により説明された通りに一過的に発現させた。
PDL1、PDL1mm、またはPDL1MfをトランスフェクトしたCHO細胞を用いた均一用量反応スクリーニングにおいて結合について抗体を試験した(実施例2も参照されたい)。トランスフェクトされていないCHO細胞を陰性対照として使用した。
培養上清を0.2μmデッドエンド(dead-end)フィルターで濾過し、5mL MabSelect SuReカラム(GE Healthcare)にロードし、0.1Mクエン酸ナトリウム-NaOH, pH3で溶出させた。溶出液を2M Tris-HCl,pH9ですぐに中和し、8.7mM Na2HPO4、1.8mM NaH2PO4、140.3mM NaCl, pH7.4(B.BraunまたはGE Healthcare)に対して一晩透析した。または、精製後に溶出液をHiPrep Desaltingカラムにロードし、前記抗体を、8.7mM Na2HPO4、1.8mM NaH2PO4、140.3mM NaCl, pH7.4(B.BraunまたはGE Healthcare)緩衝液と交換した。透析または緩衝液交換の後に試料を0.2μmデッドエンドフィルターで滅菌濾過した。純度をLabChip GXII(Caliper Life Sciences, MA)を用いてCE-SDSによって求め、IgG濃度をNanodrop ND-1000分光光度計(Isogen Life Science, Maarssen, The Netherlands)を用いて測定した。精製された抗体を4℃で保管した。
PD-L1のための発現構築物
完全長PD-L1を発現するために以下のコドン最適化構築物:ヒト(Homo sapiens)PD-L1(Genbankアクセッション番号NP_054862)、マカク・ファシキュラリス(Macaca fascicularis)PD-L1(Genbankアクセッション番号XP_005581836)、ハツカネズミ(Mus musculus)PD-L1(Genbankアクセッション番号NP_068693)を作製した。
同様に、完全長ヒトPD-L2を発現させるために以下のコドン最適化構築物:ヒトPD-L2(Genbankアクセッション番号NP_079515)を作製した。
完全ヒトPD-L1のコード配列を含有するpMAベクター、完全カニクイザルのコード配列を含有するpMAベクター、および完全マウスのコード配列を含有するpMAベクターをCHO-S細胞に一過的にトランスフェクトした。
PDLoneECDHisCタグをHEK-293F細胞において発現させた。Hisタグがあると、固定化金属アフィニティクロマトグラフィーによる精製が可能になる。このプロセスでは、クロマトグラフィー樹脂上に固定されたキレート剤はCo2+カチオンによって荷電している。Hisタグ化タンパク質を含有する上清をバッチ形式で(すなわち、溶液中で)樹脂とインキュベートする。Hisタグ化タンパク質は樹脂ビーズに強く結合するのに対して、培養上清中に存在する他のタンパク質は結合しないか、またはHisタグ化タンパク質と比較して弱く結合する。インキュベーション後に、ビーズを上清から回収し、カラムの中に詰める。弱く結合しているタンパク質を除去するためにカラムを洗浄する。次いで、強く結合しているHisタグ化タンパク質を、HisとCo2+との結合と競合するイミダゾールを含有する緩衝液を用いて溶出させる。溶離剤を脱塩カラム上の緩衝液交換によってタンパク質から除去する。
ヒト化抗体IgG1-huCD3-H1L1の作製はWO2015001085の実施例1に記載されている。抗体huCD3-H1L1-FEALは、本明細書において上記で説明したように以下の置換:L234F、L235E、D265A、およびF405Lを有する、その変種である。
二重特異性IgG1抗体を、管理された還元条件下でのFabアーム交換によって作製した。この方法の基盤は、WO2011/131746に記載の通りに特定のアッセイ条件下でヘテロ二量体形成を促進する相補的CH3ドメインの使用である。相補的CH3ドメインを有する抗体ペアを生成するために、F405LおよびK409R(EUナンバリング)変異を関連抗体に導入した。
IgG1-huCD3-H1L1-FEAL(SEQ ID NO:25に示したVH配列、およびSEQ ID NO:29に示したVL配列を有する)
bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALxb12-FEARは、第2のアームとして、gp120特異的抗体である抗体b12(Barbas, CF. J Mol Biol. 1993 Apr 5;230(3):812-23)を用いた二重特異性抗体である。
IgG1-338-FEAR(SEQ ID NO:1に示したVH配列、およびSEQ ID NO:5に示したVL配列を有する)
IgG1-338-F405L
bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx338-FEAR
bsIgG1-b12-FEALx338-FEAR
IgG1-511-F405L-LC33S
bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx511-LC33S-FEAR
bsIgG1-b12-FEALx511-LC33S-FEAR
IgG1-547-F405L
bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx547-FEAR
bsIgG1-b12-FEALx547-FEAR
IgG1-516-FEAR(SEQ ID NO:60に示したVH配列、およびSEQ ID NO:64に示したVL配列を有する)
IgG1-MPDL3280A-K409R
IgG1-MEDI4736-F405L
PD-L1抗体ならびにCD3×PD-L1二重特異性抗体およびb12×PD-L1二重特異性抗体と、ヒト腫瘍細胞株SK-MES-1(肺扁平上皮がん;ATCC;カタログ番号HTB-58)、MDA-MB-231(乳房腺がん;ATCC;カタログ番号HTB-26)、PC-3(前立腺腺がん;ATCC;カタログ番号CRL-1435)およびHELA(子宮頸部腺がん;ATCC;カタログ番号CCL-2)との結合をフローサイトメトリーによって分析した。
・SK-MES-1: 約30,000個のABC/細胞、
・MDA-MB-231: 約21,000個のABC/細胞、
・PC-3: 約6,000個のABC/細胞、
・HELA細胞: 約2,000個のABC/細胞
を有すると判定された。
図1は、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx338-FEAR(A)、bsIgG1-b12-FEALx338-FEAR(D)、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx547-FEAR(B)、およびbsIgG1-b12-FEALx547-FEAR(E)が、MDA-MB-231細胞に対して、単一特異性二価PD-L1抗体IgG1-338-FEARおよびIgG1-547-FEARよりも高い最大結合で用量依存的結合を示したことを示す。bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx511-LC33S-FEAR(C)およびbsIgG1-b12-FEALx511-LC33S-FEAR(F)の最大結合は二価単一特異性PD-L1抗体IgG1-511-LC33S-FEARより小さかった。
図2は、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx338-FEAR(A)、bsIgG1-b12-FEALx338-FEAR(D)、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx547-FEAR(B)、およびbsIgG1-b12-FEALx547-FEAR(E)がPC3細胞に対して用量依存的結合を示したことを示す。bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx511-LC33S-FEAR(C)およびbsIgG1-b12-FEALx511-LC33S-FEAR(F)の最大結合は二価単一特異性PD-L1抗体IgG1-511-LC33S-FEARより小さかった。
図3は、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx338-FEAR(A)およびbsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx547-FEAR(B)がHELA細胞に対して用量依存的結合を示したことを示す。単一特異性二価PD-L1抗体IgG1-338-FEARおよびIgG1-547-FEARの最大結合は、使用した濃度範囲で測定することができなかった。(C)bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx511-LC33S-FEARおよびIgG1-511-LC33S-FEARはHELA細胞に結合しなかった。
図4は、bsIgG1-b12-FEALx338-FEAR(A)およびbsIgG1-b12-FEALx547-FEAR(B)が、SK-MES-1細胞に対して、単一特異性二価PD-L1抗体IgG1-338-FEARおよびIgG1-547-FEARよりも高い最大結合で用量依存的結合を示したことを示す。bsIgG1-b12-FEALx511-LC33S-FEAR(C)の最大結合は二価単一特異性PD-L1抗体IgG1-511-LC33S-FEARよりも小さかった。
PD-L1には特異的結合し、ヒトPD-L2には特異的結合しないことを示すために、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx338-FEARおよびIgG1-338-FEAR、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx547-FEARおよびIgG1-547-FEAR、ならびにbsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx511-LC33S-FEARおよびIgG1-511-LC33S-FEARとヒトPD-L2発現CHO細胞の結合を上記で説明した方法を用いてフローサイトメトリーによって測定した。PE結合PD-L2特異的抗体(Mylteni, クローン MIH18; カタログ番号130-098-651)を陽性対照として使用した。試験した抗体はどれもCHO-PD-L2細胞に結合しなかった。
カニクイザルPD-L1発現CHO細胞との結合を、上記で説明した方法を用いてフローサイトメトリーによって測定した。図5は、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx338-FEAR(A)、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx547-FEAR(B)、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx511-LC33S-FEAR(C)、bsIgG1-b12-FEALx338-FEAR(D)、bsIgG1-b12-FEALx547-FEAR(E)、およびbsIgG1-b12-FEALx511-LC33S-FEAR(F)がカニクイザルPD-L1発現CHO細胞に対して用量依存的結合を示し、最大結合が単一特異性二価PD-L1抗体IgG1-338-FEAR、IgG1-547-FEAR、およびIgG1-511-LC33S-FEARより高かったことを示す。
第1の実験セットでは、組換え発現ヒトPD-L1タンパク質に対する親和性を、バイオレイヤー干渉法(BLI)を用いてOctet HTX機器(ForteBio)において測定した。抗ヒトIgG Fc Capture(AHC)バイオセンサー(ForteBio)を抗体(1μg/ml)と一緒に900s間ロードした。ベースライン(100s)後、Sample Diluent(ForteBio)中でのPDLoneECDHisCタグの会合(1000s)および解離(2000s)を2.67μg/ml~0.14μg/ml(100nM~1.56nM)の濃度範囲を用いて2倍希釈段階で測定した。この実験は30℃、1000rpmで震盪しながら行った。データを、Data Analysis Software v9.0.0.12(ForteBio)によって1:1モデルと、グローバルフルフィット(global full fit)と1000sの会合時間および200sまたは1000sの解離時間とを用いて分析した。緩衝液参照を差し引くことによってデータトレースを補正し、Y軸をベースラインの最後の10sに合わせ、インターステップコレクション(interstep correction)ならびにサビツキー・ゴーレイフィルタリング(Savitzky-Golay filtering)を適用した。応答(response)<0.05nmのデータトレースを分析から除外した。デフォルトとして、1000sの解離時間を用いたフィットを使用した。IgG1-511-FEAR-LC33SについてはR2値およびフィットの目視検査に基づいて200sの解離時間を使用した。
・抗体を用いたAHCバイオセンサーのローディング時間は600sであった。
・ベースラインは300sであった。
・PDLoneECD-HisCタグ(ヒトPD-L1、理論分子量29kDa)に加えて、カニクイザルPD-L1/B7-H1タンパク質(Acro Biosystems、カタログ番号PD1-C52H4-100、理論分子量27.1kDa)を抗原として使用した。
・抗原の濃度範囲は0.156~10nM(1回目の実験)または0.39~25nM(第2回目および3回目の実験)であった。
抗体クロスブロック試験をバイオレイヤー干渉法(BLI)を用いてOctet HTX機器(ForteBio)機器で行った。抗体(10mM酢酸ナトリウム緩衝液pH6.0(ForteBio)中で20μg/ml)を、Amine-Reactive 2nd Generation(AR2G)バイオセンサー(ForteBio)上に、製造業者の説明書に従って固定化した。Sample Diluent(ForteBio)中でのベースライン(50s)後に、固定化抗体を含有するバイオセンサーをPDLoneECDHisCタグ(100nMまたは2.7μg/ml)と一緒に500s間ロードし、この後に、第2の抗体(10μg/ml)の会合応答を500s間、追跡した。10mMグリシンpH2.5とSample Diluentに3×5s、交互に曝露することによってバイオセンサーを再生した。この実験を、ベースライン段階から開始して新たな第2の抗体セットを用いて繰り返した。各バイオセンサーを6回使用した。この実験を1000rpmのシェーカー速度を用いて30℃で行った。データをData Analysis Software v9.0.0.12(ForteBio)を用いて分析した。Y軸を会合段階に合わせ、サビツキー・ゴーレイフィルタリングを適用した。固定化抗体からのPDLoneECDHisCタグの解離を補正するために第2の抗体の会合応答から平均緩衝液応答を差し引いた。補正された会合応答をマトリックス形式でプロットした。0.1nm以上の応答を非ブロッキング抗体ペアとみなし(結果を、図6にある表中の装飾のない数字で示した)、0.1未満の応答をブロッキング抗体ペアとみなした(結果を、図6にある表中の太字の数字で示した)。一部の抗体ペアは置換挙動を示した(結果を、図6にある表中の星印(*)で示した)。代表的なグラフを、置換抗体ペアについては図(A)、ブロッキング抗体ペアについては図(B)、非ブロッキング抗体ペアについては図(C)に示した。
PD-1およびPD-L1の相互作用に対する二価PD-L1抗体および一価PD-L1抗体の効果を、Promega(Madison,USA)が開発したPD-1/PD-L1遮断バイオアッセイ法において測定した。これは、2種類の遺伝子操作された細胞株:ヒトPD-1と、NFAT応答エレメント(NFAT-RE)によって動かされるルシフェラーゼレポーターとを発現するジャーカットT細胞であるPD-1エフェクター細胞、およびヒトPD-L1と、抗原非依存的にコグネイトTCRを活性化するように設計された操作された細胞表面タンパク質とを発現するCHO-K1細胞であるPD-L1 aAPC/CHO-K1細胞からなる生物発光細胞アッセイ法である。2種類の細胞タイプが同時培養されると、PD-1/PD-L1相互作用によって、TCRシグナル伝達、および、NFAT-REを介したルミネセンスが阻害される。PD-1/PD-L1相互作用をブロックする抗体を添加すると阻害シグナルが放出されて、TCR活性化、および、NFAT-REを介したルミネセンスが生じる。
誘導倍率 = RLU(誘導 - バックグラウンド)/RLU(抗体なし対照 - バックグラウンド)
RLUは相対光量(relative light unit)である。
標的細胞として腫瘍細胞株を使用し、かつ精製したT細胞または末梢血単核球(PBMC)をエフェクター細胞として使用する、インビトロ細胞障害アッセイ法において、CD3×PD-L1二重特異性抗体を試験した。RosetteSep human T cell enrichment cocktail(Cat: 15021C.1, Stemcell Technologies, France)を使用し、製造業者の説明書に従って、ドナーバフィーコート(Sanquin, Amsterdam, The Netherlands)からT細胞を単離した。Ficoll勾配(Lonza; リンパ球分離培地、カタログ番号17-829E)を使用し、製造業者の説明書に従って40mLのバフィーコート(Sanquin)からPBMCを単離した。
生細胞% = (試料の吸光度 - スタウロスポリン処理標的細胞の吸光度)/(未処理標的細胞の吸光度 - スタウロスポリン処理標的細胞の吸光度)×100
図8は、精製したT細胞(A)およびPBMC(B)をエフェクター細胞として使用した両方の場合とも、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx338-FEAR、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx547-FEAR、およびbsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx511-LC33S-FEARが、比較的高いレベルのPD-L1を発現するMDA-MB-231細胞において濃度依存性細胞障害を誘導したことを示す。
図9は、精製したT細胞(A)およびPBMC(B)をエフェクター細胞として使用した両方の場合とも、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx338-FEAR、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx547-FEAR、およびbsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx511-LC33S-FEARが、PC-3細胞において濃度依存性細胞障害を誘導したことを示す。bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx511-LC33S-FEARは、中レベルのPD-L1を発現するPC-3細胞での細胞障害誘導の効率が最も低かった。
図10は、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx547-FEARが、エフェクター細胞としてT細胞を使用した場合に、ある1つのドナーについてはPBMCを使用した場合でも、低レベルのPD-L1を発現するHELA細胞において細胞障害を誘導することができたことを示す。bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx338-FEARはHELA細胞において細胞障害を少なくしか誘導することができず、bsIgG1-huCD3-H1L1-FEALx511-LC33S-FEARはHELA細胞において細胞障害を誘導しなかった。
標的細胞としてMDA-MB-231細胞を使用し、かつ、精製したT細胞をエフェクター細胞として使用する、T細胞の活性化および増殖を測定するためのインビトロアッセイ法において、CD3×PD-L1二重特異性抗体を試験した。IgG1-b12(Fcγ受容体およびC1qと相互作用することができるFc領域を有する)を陰性対照として使用した。Ficoll勾配(Lonza; リンパ球分離培地、カタログ番号17-829E)を使用し、製造業者の説明書に従って40mLのバフィーコート(Sanquin)からPBMCを単離した。RosetteSep human T cell enrichment cocktail(Stemcell Technologies, France; カタログ番号15021C.1)を使用し、精製したPBMCからT細胞を製造業者の説明書に従って単離した。MDA-MB-231細胞を、0.07μM CellTrace CFSE(ThermoFisher Scientific,カタログ番号C34554)で、製造業者の説明書に従って標識し、平底96ウェルプレート(Greiner-bio-one、TheNetherlands、カタログ番号655180)に播種し(細胞5,000個/ウェル)、ウェルに37℃で4時間付着させた。T細胞を腫瘍細胞にE:T比=8:1で添加し、そのため、細胞40,000個/ウェルになった。抗体の段階希釈液を添加し(10000~1.5ng/mLの最終濃度;3倍希釈)、プレートを37℃で4日間インキュベートした。
ライブラリー設計
PD-L1(Uniprot Q9NZQ7)1残基アラニンライブラリーを合成した(Geneart)。この場合、ヒトPD-L1の細胞外ドメインにある全てのアミノ酸残基を、アラニンまたはシステインを既に含んでいる位置を除いて個々にアラニンに変異させた。抗原の構造が破壊される機会を最小にするためにシステインを変異させなかった。ライブラリーを、CMV/TK-ポリA発現カセット、Amp耐性遺伝子、およびpBR322複製起点を含有するpMAC発現ベクターにクローニングした。
野生型PD-L1およびアラニン変異体をFreeStyle HEK293細胞において製造業者(Thermo Scientific)の説明書に従って個々に発現させた。トランスフェクションの1日後に細胞を採取した。約100,000個の細胞を、FACS緩衝液に溶解した関心対象のAlexa488結合抗体20μLとインキュベートした(表3)。細胞を室温で1時間インキュベートした。その後に、150μLのFACS緩衝液を添加し、細胞を遠心分離で洗浄した。細胞を20μLの新鮮FACS緩衝液(PBS[Ca++、Mg++、およびフェノールレッドを含まない]/1%BSA画分V/0.02%NaN3)に懸濁し、iQueスクリーナーを用いたフローサイトメトリーによる分析まで4℃で保管した。
試料ごとに、細胞1個あたりの抗体結合の平均を、ゲーティングされていない(ungated)細胞集団の蛍光強度の幾何平均(gMFI)として決定した。gMFIは、PD-L1変異体に対する前記抗体の親和性の影響と、細胞1個あたりのPD-L1変異体の発現レベルの影響を受ける。特定のアラニン変異は変異体PD-L1の表面発現レベルに影響を及ぼすことができることを理由に、各PD-L1変異体の発現差を全体として補正することを目的として、データを、以下の式:
を用いて、非クロスブロッキングPD-L1特異的対照抗体(IgG1-625-FEAR-A488; SEQ ID NO:106に示した重鎖可変領域(VH)およびSEQ ID NO:110に示した軽鎖可変領域(VL)を含む)の結合強度に対して標準化した。
・抗体338の結合が少なくともヒトPD-L1のaaR113、Y123、およびR125に依存すること、
・抗体511の結合が、少なくとも、ヒトPD-L1のaaF19、F42、E45、K46、L94、およびI116に依存する。アミノ酸E45、K46、およびL94が前記抗体の結合に直接関与し、F19、F42、およびI116が、埋められた側鎖により前記抗体の結合に間接的に関与すること、
・抗体547の結合が少なくともヒトPD-L1のaaE58およびR113に依存すること、
・抗体MEDI4736の結合は少なくともヒトPD-L1のaaR113およびR125に依存すること、
・抗体MPDL3280Aの結合が少なくともヒトPD-L1のaaR125およびI126に依存し、I126は、埋められた側鎖により前記抗体の結合に間接的に関与し得ること
が分かる。
51 Cr放出アッセイ法において測定したADCC
MDA-MB-231細胞(ATCC,カタログ番号HTB-26)を採取し(7×106個の細胞を得た)、洗浄し(PBS、1500rpm、5分を2回)、10% cosmic calf serum(CCS)(HyClone, Logan, UT, USA))を加えたRPMI1640培地2mL中に収集し、これに200μCi51Cr(クロム-51; Amersham Biosciences Europe GmbH, Roosendaal, The Netherlands)を添加した。混合物を震盪しながら37℃で1時間インキュベートした。洗浄(PBS、1500rpm、5分を2回)後、細胞をRPMI1640培地/10%CCSに再懸濁し、トリパンブルー排除によって計数した。細胞を細胞1×105個/mLの濃度になるように調整した。
ADCCの代わりとして、PD-L1抗体がFcγRIIIa(CD16)架橋を誘導する能力も、MDA-MB-231細胞においてLuminescent ADCC Reporter BioAssay (Promega, カタログ番号G7018)を使用し、製造業者の推奨に従って測定した。エフェクター細胞として、このキットは、高親和性FcγRIIIa(V158)と、ホタルルシフェラーゼの発現を動かす活性化T細胞核内因子(NFAT)応答エレメントとを安定発現するように操作されたジャーカットヒトT細胞を備える。簡単に述べると、MDA-MB-231細胞(細胞12,500個/ウェル)を、Culture OptiPlates(Perkin Elmer)の中に入っているADCC Assay Buffer[RPMI-1640培地[(Lonza, カタログ番号BE12-115F)。3.5%Low IgG Serumを加えた]に播種し、抗体濃度シリーズ(3.5倍希釈で0.5~250ng/mLの最終濃度)と、解凍したADCC Bioassay Effector Cellsとを含有する75μLの総体積中で37℃/5%CO2で6時間インキュベートした。プレートを調節して15分間、室温(RT)にし、75μLのBio Gloアッセイルシフェラーゼ試薬を添加し、プレートをRTで5分間インキュベートした。ルシフェラーゼ生成を、EnVision Multilabel Reader(Perkin Elmer)でルミネセンスを読み取ることによって定量した。標的細胞と抗体(エフェクター細胞なし)しか添加していないウェルからバックグラウンドレベルを測定した。陰性対照として、標的とエフェクター細胞しか含有しないウェル(抗体なし)を使用した。
Claims (66)
- ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体であって、
該抗体が、ヒトPD-L1とヒトPD-1との結合を阻害し、
ヒトPD-L1に結合することができる該抗原結合領域が、SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1、配列 DDNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)を含む、
前記抗体。 - ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、または100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列を含む、請求項1に記載の抗体。
- ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、または100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列を含む、請求項1または2に記載の抗体。
- ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、
SEQ ID NO:18に示したVH配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVH配列、および、SEQ ID NO:22に示したVL配列との少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも97%、少なくとも99%、もしくは100%のアミノ酸配列同一性を有するVL配列[547]
を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の抗体。 - 抗体依存性細胞障害(ADCC)を介して、腺がんの上皮細胞の用量依存的溶解を誘導することができる、請求項1~4のいずれか一項に記載の抗体。
- 前記上皮細胞が、MDA-MB-231細胞である、請求項5に記載の抗体。
- ADCCが、51Cr放出アッセイ法においてインビトロで測定される、請求項5または6に記載の抗体。
- ADCCが、請求項5または6に記載の抗体とエフェクター細胞とを含む組成物と共に前記上皮細胞を37℃、5%CO2で4時間インキュベートすることによってインビトロで測定され、該組成物中の抗体の量が0.1~1μg/mLの範囲内であり、かつエフェクター細胞数と上皮細胞数の比が100:1である、請求項5または6に記載の抗体。
- 前記エフェクター細胞が、末梢血単核球(PBMC)である、請求項8に記載の抗体。
- 上皮細胞の前記溶解が、ADCCの代わりとしてルシフェラーゼレポーターアッセイ法においてインビトロで測定される、請求項5または6に記載の抗体。
- 前記ルシフェラーゼレポーターアッセイ法が、ルミネセンスADCCレポーターバイオアッセイ法である、請求項10に記載の抗体。
- ADCCが、
(i)前記上皮細胞の培養物を、請求項10または11に記載の抗体とFcγRIIIa(CD16)およびホタルルシフェラーゼを安定発現するジャーカットヒトT細胞(エフェクター細胞)とを含む組成物と、1:1のエフェクター細胞数:上皮細胞数の比で接触させ、
(ii)該上皮細胞の培養物および該エフェクター細胞を15分間室温に調節し、
(iii)該上皮細胞の培養物および該エフェクター細胞をルシフェラーゼ基質と共にインキュベートし、かつ
(iv)該上皮細胞の培養物におけるルシフェラーゼ生成を測定する
ことによって、インビトロで測定され、
該組成物中の抗体の量が0.5~250ng/mLの範囲内であり、かつエフェクター細胞数と上皮細胞数の比が1:1である、請求項10または11に記載の抗体。 - 前記上皮細胞のADCCが、ルシフェラーゼレポーターアッセイ法において測定され、次いで、請求項5、6、および10~12のいずれか一項に記載の抗体を含む試験組成物と共に該上皮細胞の培養物をインキュベートした後に観察されたADCCが、参照抗体を含む組成物と共に該上皮細胞の培養物をインキュベートした後に観察されたADCCの少なくとも1.5倍であり、ADCCが相対発光量(RLU)として測定され、該試験組成物中の抗体濃度と参照抗体を含む該組成物中の抗体濃度が同じでありかつ20~250ng/mlの範囲内であり、かつ該参照抗体が、
(a)SEQ ID NO:74に示したVH配列およびSEQ ID NO:78に示したVL配列を含む抗体;ならびに
(b)SEQ ID NO:81に示したVH配列およびSEQ ID NO:85に示したVL配列を含む抗体
より選択される、請求項5、6、および10~12のいずれか一項に記載の抗体。 - 前記ルシフェラーゼレポーターアッセイ法が、請求項10~12のいずれか一項において定義されたレポーターアッセイ法である、請求項13に記載の抗体。
- ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域が、SEQ ID NO:18に示したVH配列およびSEQ ID NO:22に示したVL配列[547]を含む、請求項1~14のいずれか一項に記載の抗体。
- 一価である、請求項1~15のいずれか一項に記載の抗体。
- 請求項1~15のいずれか一項に記載の抗体が、ヒトPD-L1に結合することができる2つの抗原結合領域を有する二価抗体であり、かつ、該2つの抗原結合領域が同一の重鎖および軽鎖可変領域配列を有する、請求項1~15のいずれか一項に記載の抗体。
- 請求項1~15のいずれか一項に記載の抗体が、二価二重特異性抗体であり、ヒトPD-L1に結合することができる(第1の)前記抗原結合領域に加えて、第2の抗原に結合することができる(第2の)抗原結合領域を含み、該第2の抗原がヒトCD3εでない、請求項1~15のいずれか一項に記載の抗体。
- ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域と、ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる抗原結合領域とを含む二重特異性抗体である、請求項1~15のいずれか一項に記載の抗体。
- ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)を含む、請求項19に記載の抗体。
- SEQ ID NO:19に示したCDR1配列、SEQ ID NO:20に示したCDR2配列、およびSEQ ID NO:21に示したCDR3配列を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:23に示した配列を有するCDR1配列、配列DDNを有するCDR2配列、およびSEQ ID NO:24に示した配列を有するCDR3配列を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域[547]、ならびに、(a)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)と、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)とを含む、ヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含む、請求項19または20に記載の抗体。
- ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、SEQ ID NO:25に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列を含む、請求項19~21のいずれか一項に記載の抗体。
- (i)前記抗体が、SEQ ID NO:25に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列を含む抗原結合領域を有する抗体と比較して、ヒトCD3ε結合についてのより低い親和性を有し、かつ
(ii)該抗体が、PBMCまたは精製したT細胞をエフェクター細胞として使用した場合のMDA-MB-231細胞、PC-3細胞、および/またはHELA細胞の濃度依存性細胞障害を媒介することができる、
請求項19に記載の抗体。 - 前記親和性が、SEQ ID NO:25に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列を含む抗原結合領域を有する抗体と比較して、少なくとも1/2倍、少なくとも1/5倍、少なくとも1/10倍、少なくとも1/25倍、または少なくとも1/50倍である、請求項23に記載の抗体。
- ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:99に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(ii)SEQ ID NO:100に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:28に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iii)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:101に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(iv)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:102に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(v)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:103に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(vi)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:104に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)、または
(vii)SEQ ID NO:26に示した配列を有するCDR1、SEQ ID NO:27に示した配列を有するCDR2、およびSEQ ID NO:105に示した配列を有するCDR3を含む重鎖可変領域(VH)、ならびに、SEQ ID NO:30に示した配列を有するCDR1、配列GTNを有するCDR2、およびSEQ ID NO:31に示した配列を有するCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)
を含む、請求項23または24に記載の抗体。 - ヒトCD3εに結合することができる前記抗原結合領域が、
(i)SEQ ID NO:39に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(ii)SEQ ID NO:40に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(iii)SEQ ID NO:41に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(iv)SEQ ID NO:42に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(v)SEQ ID NO:43に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(vi)SEQ ID NO:44に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列、または
(vii)SEQ ID NO:45に示したVH配列およびSEQ ID NO:29に示したVL配列
を含む、請求項23~25のいずれか一項に記載の抗体。 - 前記ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域(第1の抗原結合領域)と、第2の抗原に結合することができる第2の抗原結合領域とを含む多重特異性抗体である、請求項1~15のいずれか一項記載の抗体。
- 請求項27に記載の抗体が第2の抗原に結合することができ、かつ該第2の抗原がヒトCD3εではない、請求項27に記載の抗体。
- 完全長抗体である、請求項1~15および19~27のいずれか一項に記載の抗体。
- 完全長IgG1抗体である、請求項29に記載の抗体。
- 抗体断片である、請求項1~15および19~27のいずれか一項に記載の抗体。
- 請求項19~27および29~31のいずれか一項に記載の抗体が、抗原結合領域をそれぞれが含む2つの半分子を含み、
(i)ヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む半分子がキメラであり、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる抗原結合領域を含む半分子が、存在する場合にはキメラである、
請求項19~27および29~31のいずれか一項に記載の抗体。 - (i)ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域がヒト化されており、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる前記抗原結合領域が、存在する場合にはヒト化されている、
請求項1~15、19~27、および29~31のいずれか一項に記載の抗体。 - (i)ヒトPD-L1に結合することができる前記抗原結合領域がヒトのものであり、かつ/または
(ii)ヒトCD3ε(イプシロン)に結合することができる前記抗原結合領域が、存在する場合にはヒトのものである、
請求項1~15、19~27、および29~31のいずれか一項に記載の抗体。 - 前記抗原結合領域のそれぞれが重鎖可変領域(VH)および軽鎖可変領域(VL)を含み、かつ該可変領域がそれぞれ、3つのCDR配列、それぞれCDR1、CDR2、およびCDR3、ならびに、4つのフレームワーク配列、それぞれFR1、FR2、FR3、およびFR4を含む、請求項1~15、19~27、および29~34のいずれか一項に記載の抗体。
- 2つの重鎖定常領域(CH)と2つの軽鎖定常領域(CL)とを含む、請求項35に記載の抗体。
- 請求項1~15、19~27、および29~36のいずれか一項に記載の抗体が第1の重鎖および第2の重鎖を含み、該第1の重鎖および該第2の重鎖のそれぞれが、少なくとも、ヒンジ領域、CH2、およびCH3領域を含み、該第1の重鎖において、T366、L368、K370、D399、F405、Y407、およびK409(EUナンバリングに従う)からなる群より選択される位置に対応する位置にあるアミノ酸の少なくとも1つが置換されており、かつ該第2の重鎖において、T366、L368、K370、D399、F405、Y407、およびK409(EUナンバリングに従う)からなる群より選択される位置に対応する位置にあるアミノ酸の少なくとも1つが置換されており、かつ、該第1の重鎖および該第2の重鎖が同じ位置において置換されていない、請求項1~15、19~27、および29~36のいずれか一項に記載の抗体。
- (i)前記第1の重鎖において、F405(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がLであり、かつ、前記第2の重鎖において、K409(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がRであるか、または(ii)前記第1の重鎖において、K409(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がRであり、かつ、前記第2の重鎖において、F405(EUナンバリングに従う)に対応する位置にあるアミノ酸がLである、請求項37に記載の抗体。
- 請求項1~15、19~27、および29~38のいずれか一項に記載の抗体が第1の重鎖および第2の重鎖を含み、かつ
該抗体が、改変されていない第1の重鎖および第2の重鎖を含む以外は同一の抗体と比べてより少ない程度まで、Fcを介したエフェクター機能を誘導するように、一方の重鎖または両方の重鎖が改変されている、
請求項1~15、19~27、および29~38のいずれか一項に記載の抗体。 - 前記Fcを介したエフェクター機能が、Fcを介したCD69発現を判定することによって測定されるか、Fcγ受容体への結合によって測定されるか、C1qへの結合によって測定されるか、またはFcを介したFcR架橋結合の誘導によって測定される、請求項39に記載の抗体。
- 請求項39または40に記載の抗体が、野生型抗体と比較した場合に、Fcを介したCD69発現を少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも99%、または100%低減するように、重鎖定常配列および軽鎖定常配列が改変されており、
該Fcを介したCD69発現が、PBMCに基づく機能アッセイ法において測定される、
請求項39または40に記載の抗体。 - 請求項1~15、19~27、および29~41のいずれか一項に記載の抗体が第1の重鎖および第2の重鎖を含み、該第1の重鎖および該第2の重鎖の少なくとも1つにおいて、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234、L235、D265、N297、およびP331に対応する位置にある1つまたは複数のアミノ酸が、それぞれL、L、D、N、およびPでない、請求項1~15、19~27、および29~41のいずれか一項に記載の抗体。
- 前記第1の重鎖および前記第2の重鎖において、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234およびL235に対応する位置が、それぞれFおよびEである、請求項42に記載の抗体。
- 請求項43に記載の抗体が、第1の重鎖および第2の重鎖を含む二重特異性抗体であり、かつ該第1の重鎖および該第2の重鎖の両方の、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234およびL235に対応する位置が、それぞれFおよびEであり、かつ、(i)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであるか、または(ii)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLである、請求項43に記載の抗体。
- 前記第1の重鎖および前記第2の重鎖において、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234、L235、およびD265に対応する位置が、それぞれF、E、およびAである、請求項42に記載の抗体。
- 請求項45に記載の抗体が、第1の重鎖および第2の重鎖を含む二重特異性抗体であり、かつ該第1の重鎖および該第2の重鎖の両方の、EUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖における位置L234、L235、およびD265に対応する位置が、それぞれF、E、およびAであり、かつ、(i)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであるか、または(ii)第1の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるK409に対応する位置がRであり、かつ第2の重鎖のEUナンバリングに従うヒトIgG1重鎖におけるF405に対応する位置がLである、請求項45に記載の抗体。
- ヒトPD-L2に結合しない、請求項1~15、19~27、および29~46のいずれか一項に記載の抗体。
- 10-8Mもしくはそれ未満、10-9Mもしくはそれ未満、または10-10Mもしくはそれ未満のKDでヒトPD-L1に結合する、請求項1~15、19~27、および29~47のいずれか一項に記載の抗体。
- 精製したT細胞をエフェクター細胞として使用した場合のMDA-MB-231細胞、PC-3細胞、および/またはHELA細胞の濃度依存性細胞障害を媒介する、請求項1~15、19~27、および29~48のいずれか一項に記載の抗体。
- (i)請求項1~18のいずれか一項において定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体の重鎖配列をコードする核酸配列、および
(ii)請求項1~18のいずれか一項において定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む抗体の軽鎖配列をコードする核酸配列
を含む、核酸構築物。 - (i)請求項20~26のいずれか一項において定義されたヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含む抗体の重鎖配列をコードする核酸配列、および
(ii)請求項20~26のいずれか一項において定義されたヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含む抗体の軽鎖配列をコードする核酸配列
をさらに含む、請求項50に記載の核酸構築物。 - 請求項50または51において定義された核酸構築物を含む、発現ベクター。
- 請求項50もしくは51において定義された核酸構築物または請求項52において定義された発現ベクターを含む、宿主細胞。
- 哺乳動物細胞である、請求項53に記載の宿主細胞。
- チャイニーズハムスター卵巣細胞である、請求項54に記載の宿主細胞。
- 請求項1~49のいずれか一項に記載の抗体と、薬学的に許容される担体とを含む、薬学的組成物。
- 医薬として使用するための、請求項1~49のいずれか一項に記載の抗体または請求項56に記載の薬学的組成物。
- がんの治療において使用するための、請求項1~49のいずれか一項に記載の抗体または請求項56に記載の薬学的組成物。
- 固形腫瘍の存在を特徴とするがん疾患の治療において使用するための、請求項1~49のいずれか一項に記載の抗体または請求項56に記載の薬学的組成物。
- 黒色腫、卵巣がん、肺がん、結腸がん、および頭頸部がんからなる群より選択されるがん疾患の治療において使用するための、請求項1~49のいずれか一項に記載の抗体または請求項56に記載の薬学的組成物。
- がんを治療するための医薬を製造するための、請求項1~49のいずれか一項に記載の抗体の使用。
- がんが、固形腫瘍の存在を特徴とするがん疾患、または黒色腫、卵巣がん、肺がん、結腸がん、および頭頸部がんからなる群より選択されるがん疾患である、請求項61に記載の使用。
- 1種類または複数種類のさらなる治療用物質と組み合わせて用いられることを特徴とする、請求項56~60のいずれか一項に記載の抗体または薬学的組成物。
- 前記1種類または複数種類のさらなる治療用物質が、化学療法剤である、請求項63に記載の抗体または薬学的組成物。
- (a)請求項1~15のいずれか一項において定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む第1の抗体を産生する宿主細胞を培養し、かつ培養物から該第1の抗体を精製する工程;
(b)異なる抗原に結合することができる抗原結合領域を含む第2の抗体を産生する宿主細胞を培養し、かつ該培養物から該第2の抗体を精製する工程;
(c)ヒンジ領域におけるシステインがジスルフィド結合異性化を受けることを可能にするのに十分な還元条件下で、該第1の抗体を該第2の抗体と一緒にインキュベートする工程;および
(d)二重特異性抗体を得る工程
を含む、請求項18、27~31、35~49のいずれか一項に記載の抗体を産生するための方法。 - (a)請求項1~15のいずれか一項において定義されたヒトPD-L1に結合することができる抗原結合領域を含む第1の抗体を産生する宿主細胞を培養し、かつ培養物から該第1の抗体を精製する工程;
(b)請求項20~26のいずれか一項において定義されたヒトCD3εに結合することができる抗原結合領域を含む第2の抗体を産生する宿主細胞を培養し、かつ該培養物から該第2の抗体を精製する工程;
(c)ヒンジ領域におけるシステインがジスルフィド結合異性化を受けることを可能にするのに十分な還元条件下で、該第1の抗体を該第2の抗体と一緒にインキュベートする工程;および
(d)二重特異性抗体を得る工程
を含む、請求項19~27および29~49のいずれか一項に記載の抗体を産生するための方法。
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