JP7174627B2 - インテグリン結合ペプチド及びその使用 - Google Patents
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- 前記ペプチドが、アミノ酸配列SGLTEWLRWFNS又は前記配列の変異体を含み、前記変異体が:
- 前記配列の5~12個の連続アミノ酸からなり、前記5~12個の連続アミノ酸が少なくとも前記配列の7~9位のアミノ酸を含み、
- 前記配列の1、2、4、5、6、7、8、9、11及び12位のアミノ酸から選択される前記5~12個の連続アミノ酸のアミノ酸の、他のアミノ酸による3個以下の置換を有し、又は、
- 前記ペプチドが、アミノ酸配列SFATWTPNFERN又は前記配列の変異体を含み、前記変異体が、前記配列の5~12個の連続アミノ酸からなり、アミノ酸の他のアミノ酸による3個以下の置換を有する、
ペプチドを提供する。
- 前記配列の6~16個の連続アミノ酸からなり、前記6~16個の連続アミノ酸が少なくとも前記配列の5~10位のアミノ酸を含み、
- 前記配列の1、2、3、4、5、7、8、10、11、12、13、14、15及び16位のアミノ酸から選択される前記6~16個の連続アミノ酸のアミノ酸の、他のアミノ酸による3個以下の置換を有する、
単離又は組換えインテグリンアルファ5(ITGA5)結合ペプチドを提供する。
- 本発明によるペプチドをコードしている核酸配列を含む核酸分子を提供する工程と;
- 前記核酸分子で宿主細胞を形質転換する工程と;
- 前記ペプチドを発現させる条件下で前記宿主細胞を培養する工程と;
- 前記細胞から前記ペプチドを回収する工程と
を含む、方法を提供する。
本発明者らは、ITGA11が肝線維症及び肝硬変症及び膵臓がんにおいて発現されること、星状細胞でのITGA11発現がTGFβ1による活性化後にCCl-4誘導性肝線維症において増加されることを見出した。更に、配列SGLTEWLRWFNS又はSFATWTPNFERNを有するペプチド及びその変異体がITGA11に対して高親和性で結合することも見出した。また、この配列の少なくとも5個の連続アミノ酸を有するペプチドSGLTEWLRWFNSのより短い変異体が結合能力を維持すること、又は更に結合能力を増加させることもわかった。本発明によるこのようなATGA11結合ペプチドは、インテグリンのαサブユニット(α11)に結合するが、多くのインテグリンに存在するβ1には結合しないという利点を有する。したがって、本発明によるATGA11結合ペプチドは、α11β1インテグリンに高度に特異的である。ITGA11は腫瘍及び線維性疾患において筋線維芽細胞により高度に発現されるので、本発明によるITGA11結合ペプチドを使用するITGA11の標的化は、腫瘍細胞及び繊維性組織細胞を標的とする最適な方法である。
- 前記配列の5~12個の連続アミノ酸からなり、前記5~12個の連続アミノ酸が少なくとも前記配列の7~9位のアミノ酸を含み、
- 前記配列の1、2、4、5、6、7、8、9、11及び12位のアミノ酸から選択される前記5~12個の連続アミノ酸のアミノ酸の、他のアミノ酸による3個以下の置換を有する、
単離又は組換えインテグリンアルファ11(ITGA11)結合ペプチドを提供する。前記ペプチドは、好ましくは、配列MSLRWFNSGSVRPATTILFPからなることはない。
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの1位及び/又は12位のセリンが、トレオニン、アスパラギン、グルタミン、アラニン、バリン、イソロイシン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの2位のグリシンが、プロリン、アラニン、システイン、セリン、トレオニン、アスパラギン、アスパラギン酸及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの4位のトレオニンが、セリン、アスパラギン、グルタミン、アラニン、バリン、イソロイシン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの5位のグルタミン酸が、アスパラギン酸、アラニン、バリン、イソロイシン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの6位及び/又は9位のトリプトファンが、アラニン、バリン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン及びチロシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの7位のロイシンが、アルギニン、リジン、ヒスチジン、アラニン、バリン及びイソロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの8位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン、アラニン、バリン、イソロイシン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの11位のアスパラギンが、プロリン、アラニン、システイン、グリシン、セリン、トレオニン、アスパラギン酸及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられている。
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの1位及び/又は12位のセリンが、トレオニン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの2位のグリシンが、プロリン、アラニン、システイン、セリン、トレオニン、アスパラギン及びアスパラギン酸からなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの4位のトレオニンが、セリン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの5位のグルタミン酸が、アスパラギン酸及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの6位及び/又は9位のトリプトファンが、アラニン、フェニルアラニン及びチロシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの7位のロイシンが、アラニン、バリン、イソロイシン及びメチオニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの8位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの11位のアスパラギンが、トレオニン、セリン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられている。
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの1位及び/又は12位のセリンが、トレオニン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの2位のグリシンが、プロリン、アラニン、システイン、セリン、トレオニン、アスパラギン及びアスパラギン酸からなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの4位のトレオニンが、セリン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの5位のグルタミン酸が、アスパラギン酸及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの6位及び/又は9位のトリプトファンが、アラニン、フェニルアラニン及びチロシンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの7位のロイシンが、アラニン、バリン、イソロイシン及びメチオニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの8位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの11位のアスパラギンが、トレオニン、セリン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられている。
- 前記配列の6~12個の連続アミノ酸からなり、前記6~12個の連続アミノ酸が少なくとも前記配列の6~9位のアミノ酸を含み、
- 任意選択により、前記6~12個の連続アミノ酸のアミノ酸の3個以下の置換、好ましくは1又は2個の置換、より好ましくは1個の置換を有し、それにより、前記アミノ酸置換が、
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの1位及び/又は12位のセリンの、トレオニン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンによる置換、
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの2位のグリシンの、プロリン、アラニン、システイン、セリン、トレオニン、アスパラギン及びアスパラギン酸からなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンによる置換、
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの4位のトレオニンの、セリン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンによる置換、
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの5位のグルタミン酸の、アスパラギン酸及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンによる置換、
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの6位及び/又は9位のトリプトファンの、アラニン、フェニルアラニン及びチロシンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンによる置換、
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの7位のロイシンの、アラニン、バリン、イソロイシン及びメチオニンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンによる置換、
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの8位のアルギニンの、リジン、ヒスチジン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンによる置換、
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの11位のアスパラギンの、トレオニン、セリン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンによる置換
からなる群から選択される、
単離又は組換えインテグリンアルファ11(ITGA11)結合ペプチドを提供する。
- 前記配列の1位のセリンが、トレオニン、アスパラギン、グルタミン、アラニン、バリン、イソロイシン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の2位及び/又は9位のフェニルアラニンが、アラニン、バリン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、チロシン及びトリプトファンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の3位のアラニンが、バリン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、チロシン及びトリプトファンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、
- 前記配列の4位及び/又は6位のトレオニンが、セリン、アスパラギン、グルタミン、アラニン、バリン、イソロイシン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の5位のトリプトファンが、アラニン、バリン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン及びチロシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の7位のプロリンが、アラニン、システイン、グリシン、セリン、スレオニン、アスパラギン及びアスパラギン酸からなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の8位及び/又は12位のアスパラギンが、トレオニン、セリン、グルタミン、アラニン、バリン、イソロイシン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の10位のグルタミン酸が、アスパラギン酸、アラニン、バリン、イソロイシン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の11位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン、アラニン、バリン、イソロイシン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられている。
- 前記配列の1位のセリンが、トレオニン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の2位及び/又は9位のフェニルアラニンが、チロシン、トリプトファン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の3位のアラニンが、バリン、イソロイシン、ロイシン及びメチオニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の4位及び/又は6位のトレオニンが、セリン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の5位のトリプトファンが、アラニン、フェニルアラニン及びチロシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の8位及び/又は12位のアスパラギンが、トレオニン、セリン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の10位のグルタミン酸が、アスパラギン酸及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の11位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられている。
- 前記配列の1位のセリンが、トレオニン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の2位及び/又は9位のフェニルアラニンが、チロシン、トリプトファン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の3位のアラニンが、バリン、イソロイシン、ロイシン及びメチオニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の4位及び/又は6位のトレオニンが、セリン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の5位のトリプトファンが、アラニン、フェニルアラニン及びチロシンからなる群から選択されるアミノ酸と置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の8位及び/又は12位のアスパラギンが、トレオニン、セリン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の10位のグルタミン酸が、アスパラギン酸及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の11位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられている。
- 前記配列の6~16個の連続アミノ酸からなり、前記配列の6~16個の連続アミノ酸が少なくとも前記配列の5~10位のアミノ酸を含み、
- 前記配列の1、2、3、4、5、7、8、10、11、12、13、14、15及び16位のアミノ酸から選択される前記6~16個の連続アミノ酸のアミノ酸の、他のアミノ酸による3個以下の置換を有する、
単離又は組換えインテグリンアルファ5(ITGA5)結合ペプチドを提供する。
- 前記配列の4位及び/又は7位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン、アラニン、バリン、イソロイシン及びロイシンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の5位及び/又は10位のチロシンが、アラニン、バリン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン及びトリプトファンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、
- 前記配列の8位のイソロイシンが、アラニン、バリン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、チロシン及びトリプトファンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられている。
- 前記配列の4位及び/又は7位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の5位及び/又は10位のチロシンが、アラニン、フェニルアラニン及びトリプトファンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられており、
- 前記配列の8位のイソロイシンが、アラニン、バリン、ロイシン及びメチオニンからなる群から選択されるアミノ酸により、又は対応する非天然アミノ酸により置き換えられている。
- 前記配列の4位及び/又は7位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、及び/又は
- 前記配列の5位及び/又は10位のチロシンが、アラニン、フェニルアラニン及びトリプトファンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられており、
- 前記配列の8位のイソロイシンが、アラニン、バリン、ロイシン及びメチオニンからなる群から選択されるアミノ酸により置き換えられている。
- 前記配列の6~16個の連続アミノ酸からなり、前記6~16個の連続アミノ酸が少なくとも前記配列の5~10位のアミノ酸を含み、
- 任意選択により前記配列の5~10位の前記アミノ酸のアミノ酸の3個以下の置換、好ましくは1又は2個の置換、より好ましくは1個の置換を有し、それにより、前記アミノ酸置換が次からなる群から選択される:
- 前記配列の4位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンにより置き換えられており、
- 前記配列の7位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンにより置き換えられており、
- 前記配列の5位のチロシンが、アラニン、フェニルアラニン及びトリプトファンからなる群より選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンにより置き換えられており、
- 前記配列の10位のチロシンが、アラニン、フェニルアラニン及びトリプトファンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンにより置き換えられており、
- 前記配列の8位のイソロイシンが、アラニン、バリン、ロイシン及びメチオニンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンにより置き換えられている、
単離又は組換えインテグリンアルファ5(ITGA5)結合ペプチドを提供する。
- 前記配列の6~16個の連続アミノ酸からなり、前記6~16個の連続アミノ酸が少なくとも前記配列の5~10位のアミノ酸を含み、
- 任意選択により前記配列の5~10位の前記アミノ酸のアミノ酸の1又は2個の置換、より好ましくは1個の置換を有し、それにより、前記アミノ酸置換が次からなる群から選択される:
- 前記配列の5位のチロシンが、アラニン、フェニルアラニン及びトリプトファンからなる群より選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンにより置き換えられており、
- 前記配列の8位のイソロイシンが、アラニン、バリン、ロイシン及びメチオニンからなる群から選択されるアミノ酸、好ましくはアラニンにより置き換えられている、
単離又は組換えインテグリンアルファ5(ITGA5)結合ペプチドを提供する。
1)セリン、トレオニン、アスパラギン、グルタミン;
2)アスパラギン酸、グルタミン酸;
3)ヒスチジン、アルギニン、リジン;
4)イソロイシン、ロイシン、メチオニン、アラニン、バリン、及び、
5)フェニルアラニン、チロシン、トリプトファン。
ジン、ヒドロキシリジン及びアロ-ヒドロキシリジンからなる群から選択される。メチオニンに関する好ましい非天然アミノ酸置換基は、メチオニンスルホキシドである。フェニルアラニンに関する好ましい非天然アミノ酸置換基は、p-アミノ-L-フェニルアラニン、3-ベンゾチエニルアラニンp-ブロモフェニルアラニン、p-アシル-L-フェニルアラニン、2-フルオロフェニルアラニン、3-フルオロフェニルアラニン及び4-フルオロフェニルアラニンからなる群から選択される。プロリンに関する好ましい非天然アミノ酸置換基は、3-ヒドロキシプロリン、4-ヒドロキシプロリン及び1-アセチル-4-ヒドロキシ-L-プロリンからなる群から選択される。セリンに関する好ましい非天然アミノ酸置換基は、ホモセリン、イソセリン及び3-フェニルセリンからなる群から選択される。スレオニンに関する好ましい非天然アミノ酸置換基は、D-チロキシン及びアロ-トレオニンからなる群から選択される。トリプトファンに関する好ましい非天然アミノ酸置換基は、5-ヒドロキシ-トリプトファン、5-メトキシ-トリプトファン及び5-フルオロ-トリプトファンからなる群から選択される。チロシンに関する好ましい非天然アミノ酸置換基は、O-メチル-L-チロシン、O-4-アリル-L-チロシン及び3-クロロ-チロシンからなる群より選択される。バリンに関する好ましい非天然アミノ酸置換基は、ノルバリン、N-メチルバリン及び3-フルオロ-バリンからなる群から選択される。
- 本発明によるペプチドをコードしている核酸配列を含む核酸分子を提供する工程と、
- 前記核酸分子で宿主細胞を形質転換する工程と、
- 前記ポリペプチドを発現させる条件下で、前記宿主細胞を培養する工程と、
- 前記細胞から前記ペプチドを回収する工程と
を含む本発明によるペプチドを調製するための方法を提供する。
ロレリン、ドロロキシフェン、エピチオスタノール、エチニルエストラジオール、アナストロゾール、レトロゾール、エキセメスタン、ボロゾール、ホルメスタン、フルタミド、フィナステリド、デュタステリド、エプテリステリド、チオテパ、カルボコン、インプロスルファン、ブスルファン、ニムスチン、ミトブロニトール、メルファラン、ダカルバジン、ラニムスチン、エストラムスチン、カルマスティン、ロムスチン、ストレプトゾシン、エトグルシド、カルボプラチン、シスプラチン、ミボプラチン、ネダプラチン、オキサリプラチン、アルトレタミン、アンバムスチン、ジブロスピジウム、フォテムスチン、プレドニマスチン、プミテパ、リボムスチン、テモゾロミド、トレオスルファン、トロホスファミド、ジノスタチンスチマラマー、アドゼレシン、システムスチン、ビゼレシン、メルカプトプリン、6-メルカプトプリンリボシド、チオイノシン、メトトレザト、エノシタビン、シタラビン、シタラビン、アンシタビン、フルオロウラシル、ドキシフルリジン、カルモフール、ガロシタビン(gallocitabine)、エミッテフール(emmitefur)、アミノプテリン、ブトシン(butocine)、ホリナートカルシウム、レボホリナートカルシウム、クラドリビン、エミテフール、フルダラビン、ゲムシタビン、ペントスタチン、ピリトレキシム、イドクスウリジン、ミトグアゾン、チアゾフリン(thiazophrine)、アンバムスチン、アクチノマイシンD、アクチノマイシンC、マイトマイシンC、クロモマイシンA3、ブレオマイシン、硫酸ブレオマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ピラルビシン、エピルビシン、ネオカルチノスタチン、ミトラマイシン、ザルコマイシ、カルジノフィリン、ミトタン、ゾルビシン、ミトキサントロン、イダルビシン、エトポシド、エトポシドリン酸塩、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、テニポシド、パクリタキセル、ドセタセル、ビノレルビン、ピシバニール、クレスチン、シゾフィラン、レンチナン、ウベニメクス、インターフェロン、インターロイキン、マクロファージコロニー刺激因子、果粒球コロニー刺激因子、エリトロポイエチン及びリンフォトキシンからなる群から選択されるものを含む。
材料及び方法
材料
ペプチドファージディスプレーPh.D.12(商標)ライブラリーは、最初はNew England Biolabs社より入手した。大腸菌(E. coli) ER2738宿主株は、New England Biolabs社から購入した。標的タンパク質rhインテグリンα11β1及び対照タンパク質rhインテグリンα4/β1は、R&D systems社から購入した。
ER2738宿主細胞は一晩培養し、それらを新たに使用した。コーティング緩衝液(0.1M NaHCO3)中の標的タンパク質α11β1(50~100μg/mL)の100μLを96ウェルプレートで一晩4℃にてインキュベートした。次いで、各ウェルを300μLのブロッキング緩衝液0.1M NaHCO3(pH8.6)、5mg/mLのBSA、0.02% NaN3、0.1μg/mLのストレプトアビジンで、37℃にて2時間ブロックした。次いで、ブロックしたウェルを、0.1%~0.3%のTween-20を含むPBST中の2%スキムミルクで6回洗浄した。その後、予めサブトラクトされたファージをウェルに移し、37℃で1時間インキュベートした。ウェルをPBST(0.1~0.3%Tween20)中の2%ミルクで10回洗浄した。結合ファージを酸性溶出緩衝液で溶出し、1MのTris-HCl(pH9.1)で中和した。
簡単に述べると、1μLの溶出液を100μLのLB培地で希釈し、連続希釈液を調製した。希釈液をまず試験管中の200μLの対数中期の宿主細胞と混合し、次いで混合物を3mLの予め加温したアガローストップ(Agarose Top)(45℃)に添加し、素早くボルテックスし、予め加温したLB/IPTG/Xgalプレートに注ぎ入れ、アガローストップを均一に広げた。室温で約5分間冷却した後、プレートを上下逆にし、次いで37℃で一晩インキュベートした。最後に、プレートを詳しく調べ、約100プラークを有するプレート上の青色プラーク(ファージベクターを有する)をカウントした。1mL当たりのpfu(プラーク形成単位)は、各数値に希釈係数を乗じることにより決定した。
1回目又は2回目のスクリーニングの溶出液の残りは、20mLのER2738細胞培養物を感染させ、37℃で4.5時間インキュベートすることにより増幅させた。細胞上清中に含有される増幅したファージを1/6容量のPEG/NaClを加えることにより沈澱させ、4℃で一晩インキュベートした。沈殿したファージをLB/IPTG/X-galプレートで滴定し、次回のスクリーニングのために保存した。
各クローンについて、20mLのLB培地にER2738と共に接種し、わずかに混濁するまで37℃でインキュベートした。ファージの単一プラークを各培養物に接種し、次いで、激しく通気しながら37℃で4.5時間インキュベートした。培養物を新しい遠心チューブに移し、10,000rpmで10分間遠心分離した。上清の上方80%を新しいチューブに移し、PEG/NaClで2回沈澱させた。次いで、ペレットを250μLのTBSに懸濁した。96ウェルのELISAプレートを、コーティングバッファー中の1μg/mL標的の100μLでコーティングし、4℃で一晩インキュベートした。次いで、プレートを洗浄緩衝液(TBS中0.1%Tween)で1回洗浄した。全ウェルを250μLのブロッキング緩衝液で1~2時間4℃でブロックした。次いで、プレートを洗浄緩衝液で6回洗浄し、ペーパータオルで押さえて過剰の緩衝液を除去した。その後、1ウェルあたり100μLのファージビリオンを添加した。競合ファージELISAにおいて、競合抗原を洗浄緩衝液中のファージと混合し、ウェルに添加し、室温で1~2時間攪拌しながらインキュベートした。プレートを洗浄緩衝液で6回洗浄した。HRP結合抗M13抗体(GE healthcare社、ブロッキング緩衝液中1:5000)を各ウェルに添加し、室温で1時間攪拌しながらインキュベートした。次いで、プレートを洗浄緩衝液で6回洗浄した。100μLのHRP基質溶液(21mLのOPDストック溶液に30% H2O2の36μLを新たに加えた、100mLの50mMクエン酸ナトリウム中22mg OPD(Sigma社)、pH4.0)を各ウェルに加え、室温で10~60分間インキュベートした。プレートは、490nmでマイクロプレートリーダーを使用して読み取った。
単一プラークは、2mLのER2738細胞培養物に感染させ、37℃で4.5時間インキュベートすることにより増幅させた。500μLのファージ含有上清を新しいチューブに移し、200μLのPEG/NaClを加え、混合した。チューブを最高速度で10分間遠心分離し、上清を廃棄した。ペレットを100μLのヨウ化物緩衝液中に完全に懸濁させ、250μLのエタノールを加え、10分間室温でインキュベートした。次いで、チューブを10分間遠心分離し、上清を廃棄した。ペレットを70%エタノールで洗浄し、短時間真空下で乾燥させた。ペレットを30μLのTE緩衝液に懸濁し、再懸濁した鋳型の5μLをDNA配列決定に使用した。配列は、プロフェッショナルソフトウェア(Vector社 NTI(登録商標)、バージョン10)を用いて翻訳した。
ペプチド及びペプチド-PEG(6)-FITCは、Chinapeptides社(Shanghai, China)により95%を超える純度でカスタム合成された。ペプチドの合成の成功は、質量分析により確認した。
精製したITGA11受容体(α11β1;100μg/mL-ストック;R&D systems社)を、1×PBSで5μg/mLに希釈した。96ウェルのELISA White Maxisorbプレート(Nunc社)を、50μLの5μg/mL ITGA11(又は対照としてのα5β1)受容体で一晩4℃にてコーティングした。次いで、200μLのブロッキング緩衝液(5% BSAを含有する1×PBS)でウェルを3~4時間ブロックした。ウェルを200μLの洗浄緩衝液(0.5% BSA及び0.05% Tween20を含有する1×PBS)で3回洗浄した。FITCと結合させたペプチドを洗浄緩衝液で異なる濃度に希釈し、次いでプレートに添加し、37℃で1時間インキュベートした。更に、ペプチドの結合は、10倍高い量の非標識ペプチドとの同時インキュベーションによりブロックした。続いて、ウェルを洗浄緩衝液で3回洗浄した。次いで、1×PBSの100μLを添加し、蛍光プレートリーダーを用いてプレートを485nm/520nmで読み取った。
ヒト肝星状細胞(LX2、15,000細胞/ウェル)を、permanox Lab-Tek 8ウェルチャンバースライド(Nunc社)中で一晩培養した。一晩インキュベートした後、細胞を0.5%BSA含有培地で3回洗浄し、次いで、FITC標識ペプチド(20μM)を添加し、断続的に振盪しながら室温で2時間インキュベートした。次いで、細胞を0.5% BSA含有培地及び2×PBSで3回洗浄した。その後、細胞を4%パラホルムアルデヒド(1×PBSで調製したもの)で20分間固定化し、1×PBSで3回洗浄した。次いで細胞を、DAPI(vector labs社)を含むマウント培地でマウントし、蛍光顕微鏡(Nikon社 E600)下で視覚化した。ファロイジン染色については、固定後の細胞を、TRITC結合ファロイジン(0.1%トリトンX100を含有する1×PBSで調製した1:1000)と共に10分間インキュベートした。次いで、細胞をPBSで3回洗浄し、DAPI含有マウント培地でマウントした。
すべての動物実験は、ユトレヒト大学の倫理委員会によって承認された。C57/BL6マウス(7~8週齢)は、Harlan社(Zeist、The Netherlands)からを入手し、12/12明暗サイクルで適切な食物及び水を供給しながら維持した。CC14は、4週間(軽度の線維症)及び8週間(進行した線維症)、マウスに腹腔内投与した(週に2回;オリーブ油で調製した1.0mL/kg)。最後に投与した24時間後に動物を安楽死させ、各肝臓葉から切片を切り出し、エッペンドルフチューブに回収し、RNA単離のため液体窒素中で急速凍結させた。健常の対照マウスにはオリーブ油を与えた。肝線維症に対するAXI-1ペプチドの効果を評価するため、0日目に単回投与のCC14(1mL/kg)を動物に注射した。続いて、1日目及び2日目に、マウスにペプチド(200μg/kg/d、i.p)又はビヒクル(PBS)を注射した。4日目にマウスを安楽死させ、肝臓サンプルを免疫組織化学分析及び遺伝子発現試験用に処理した。
肝星状LX2細胞(80,000細胞/ウェル)を12ウェルプレートにプレーティングし、37℃/5% CO2で一晩インキュベートした。次いで、細胞を0.5%血清含有培地で一晩飢餓状態にし、次いで、5ng/mLのTGFβで24時間活性化した。続いて、細胞を1×PBSで洗浄し、200μLのRNA溶解緩衝液で溶解させた。全RNAは、製造元の指示に従い、SV Total RNA Isolation System(Promega社)を使用して単離した。RNA濃度はUV分光光度計(Nanodrop technologies社)を使用して定量した。iScript cDNA合成キット(Biorad社)を使用し、1μgのRNAを逆転写した。リアルタイムPCR反応は、製造元の指示に従い、2×SYBR green PCRマスターミックス(Bioline社)を使用して20ng cDNAで実施し、Biorad CFX384 Real-Time PCR検出システムにより分析した。最後に、閾値サイクル(Ct)を計算し、相対遺伝子発現をハウスキーピング遺伝子としてのGAPDH(マウスに関して)で正規化した。
ITGA 11ヒトフォワード:CAGCTCGCTGGAGAGATACG; リバース:TTACAGGACGTGTTCGCCTC; GAPDHヒトフォワード:TCCAAAATCAAGTGGGGCGA; リバース:TGATGACCCTTTTGGCTCCC; a-smaヒトフォワード:GAACCCTGTGTCCTGCATCA; リバース:TTGGAGTTCCACCTCGAAGC; ITGA11マウスフォワード:TTGGGCTACTACAACCGCAG; リバース:CTTGTTGGTGCCTTCCAAGC; GAPDHマウスフォワード:ACAGTCCATGCCATCACTGC; リバース:GATCCACGACGGACACATTG; α-smaマウスフォワード:ACTACTGCCGAGCGTGAGAT; リバース:CCAATGAAAGATGGCTGGAA。
ペプチドマイクロアレイは、PEGリンカーを使用してN末端でペプチドをガラススライドに結合させることによって調製した。各ペプチドを異なる位置で3回提示させ、人為産物とエラーを回避した。結合試験については、ペプチドアレイはTBST中の3% BSAで2時間ブロックした。次いで、アレイスライドをTBSTで5回洗浄し、続いて37℃で1時間、標的受容体(α11β1、PBSに溶解した10μg/mL)と共にインキュベートした。スライドをTBSTで洗浄し、次いでITGA11に対する一次抗体(1μg/mL)と共に37℃で1時間インキュベートした。次いでスライドを洗浄し、蛍光色素標識二次抗体と共に30分間インキュベートした。スライドをTBST及び水で洗浄し、次いで乾燥させ、マイクロアレイスキャナーでスキャンしてペプチドの結合を検出した。ImageJソフトウェアを使用して照らされたスポットを分析した。非特異的結合を決定するために、ペプチドアレイを、受容体インキュベーション工程を行うことなく、一次抗体及び二次抗体のみとインキュベートした。次いで、非特異的結合のシグナルを全結合から差し引き、特異的結合を算出した。
免疫組織化学的染色を実施例2に記載したように実施した。
PSCはトリプシン-EDTA溶液を使用してトリプシン処理し、細胞数を4×104細胞/mLに希釈した。細胞を37℃で30分間インキュベートし、受容体を回復させた。次いで、異なる濃度のAXI-I-FITCを、細胞を含有する2%FBSに添加し、4℃で60分間インキュベートした。その後、細胞を4℃で10分間、1500rpmで遠心分離した。上清を除去し、細胞をPBSで3回洗浄し、次いで4℃で1時間、0.5%ホルムアルデヒドで固定し、フローサイトメトリーで蛍光について測定した。
肝星状細胞及び肝線維症におけるITGA11発現
本発明者らは、肝線維症において最も重要な細胞型であって、細胞外マトリックスの産生を担う肝星状細胞におけるITGA11の発現を調べた。本発明者らは、TGFβ1による星状細胞の活性化がITGA11遺伝子発現を有意に増加させることを見出した(図1A)。これらのデータは、星状細胞活性化マーカーα-SMAの発現レベルの増加に裏付けられている。更に本発明者らは、マウスにおけるCC14誘導性肝線維症モデルにおけるITGA11の発現を調べた。本発明者らは、ITGA11の発現レベルが、CC14の4週間(軽度の線維症)及び8週間(進行した線維症)の処置後に、線維化の進行に伴って有意に増強されることを見出した(図1B)。このデータは、ITGA11が肝線維症の重要なバイオマーカーであることを示唆している。放射性同位元素又は造影剤で標識されたITGA11に対するリガンドの助けを借りてMRI、SPECT、PET、CT、光音響又は他の種類の技術等の画像処理技術を使用するITGA11の検出により、肝線維症の診断に適用することができ、肝線維症の進行を決定することができる。
α4β1受容体から取り去った後のα11β1受容体に結合したファージを溶出させ、増幅させた。無作為に40クローンをピックアップし、ファージELISAアッセイを使用してα11β1及びα4β1受容体への結合について調べた(図3)。クローン番号11、13、14、16、19、20、21、22、24、25、27、28、29、30、31及び38は、α4β1及び非コーティングウェルと比べてα11β1への高い結合を示した。DNA配列決定データから、クローン番号11、13、14、16、19、20、21、22、24、25、28、29、30、31及び38は単一配列(5'-tctggtctgactgagtggttgaggtggtttaattcg-3')又はアミノ酸配列(AXI-I:SGLTEWLRWFNS)の結果となり、クローン27はDNA配列(5'-agattgcgacgtggactccgaattttgagaggaat-3')又はアミノ酸配列(AXI-II:SFATWTPNFERN)の結果となったことが示された。
ペプチドがITGA11受容体に特異的に結合するかどうかを決定するため、本研究者らは固定化ヒトITGA11(α11β1)受容体へのFITC標識AXI-1ペプチドの結合を実施した。本発明者らは、結合が10倍過剰の非標識ペプチドによってブロックされることから、AXI-I-FITCがITGA11受容体に特異的に結合することを見出した(図4A)。更に、ペプチドは他のインテグリン受容体(すなわち、α5β1)への結合が非常に低く、これは空のウェルへの結合と類似していることがわかった。β1受容体は、α11β1及びα5β1の両方に共通の共受容体であり、α5β1へのペプチド結合はないが、α11β1への高結合は、ペプチドがα11により好ましく結合されることを示している。更に、本発明者らは、マウスα11β1受容体に対するAXI-1の結合を調べたところ、ペプチドはヒトに対する結合親和性と同様の結合親和性を有し、マウスITGA11受容体とヒトITGA11受容体との間に約80%の相同性があることを見出した。固定化受容体への結合を確認した後、本発明者らは、ITGAII発現肝星状細胞に対するペプチドの結合を試験した。本発明者らは、AXI-IとAXI-IIは両方とも星状細胞に結合するが、AXI-Iの結合がAXI-IIよりも明らかに強いことを見出した(図4B)。
ペプチド結合に関与するアミノ酸及び最も効率的な結合ペプチドを確認するため、AXI-1ペプチド(SGLTEWLRWFNS)に対するアラニン置換及びより短いペプチドを用いたペプチドマイクロアレイを開発した(図7)。
様々な濃度のAXI-I-PEG-FITCを、懸濁したPSCと共に4℃で1時間インキュベートし、洗浄し、0.5%ホルムアルデヒドで固定し、フローサイトメトリーで測定した。結果は、AXI-I-PEG-FITCのPSCへの結合が濃度の増加と共に増加し、20μM濃度でプラトーに達したことを示している(図6)。全結合の50%、すなわち解離定数(kd)値は約1uMであった。ペプチドはPEG鎖及びフルオロフォアで修飾されているので、立体障害に起因するペプチドの結合親和性の低下が生じる場合がある。
本発明者らは、LX2細胞におけるAXI-1ペプチドの阻害効果を調べた。TGFβ1によるLX2細胞の活性化は、コラーゲン-1の発現を誘導した。興味深いことに、AXI-1の濃度増加による処置は、コラーゲン-Iの発現を阻害した(図8A)。反対に、スクランブルしたペプチドは、コラーゲン染色の低下を示さなかった。
材料及び方法
ITGA5ペプチド選択
ITGA5へのペプチド模倣体結合を選択するため、ヒトフィブロネクチン-IIIドメイン9-10(Uniprot番号P02751)由来の配列からの12アミノ酸オーバーラッピングペプチド(8オーバーラップ)をドットとして細胞膜に提示させた(図11)。ペプチドは、安定的リンカーを使用してそのC末端部位に結合させた。システインがセリンと交換されて安定性が向上し、またシステインが一般にエピトープを形成しないからである。ペプチド提示細胞膜をメタノール中に1分間浸漬し、トリス緩衝食塩水(TBS)ですすぎ、3回洗浄した。次いで、この膜を室温で3時間、0.05% tween-20を含有するTBS(TBST)中の3% BSAでブロックした。次いで、膜をTBSTで10分間洗浄し、3% BSAを含むTBST中の5μg/mL α5β1ヒト組換えタンパク質(R&D systems社)と室温で1時間、次いで4℃で一晩インキュベートした。続いて、この膜をTBSTで3回洗浄した。その後、膜への結合受容体をPVDF膜に移した。これを達成するために、まず、PVDF膜をメタノールに1分間浸漬し、次いで、5%脱脂脂肪乳で2時間ブロックした。次いで、膜を一次抗α5インテグリン抗体(Sigma-Aldrich社)と共に5%スキムミルク中で一晩インキュベートした。膜をTBSTで3回洗浄し、次いで抗ウサギHRP二次抗体(Dako社)と共にインキュベートし、洗浄し、化学発光検出キットで発色させた。
GLDSPTGIDFSDITANSFTVHWIAPRATITGYRIRHHPEHFSGRPREDRVPHSRN
SITLT
NLTPGTEYWSIVALNGREESPLLIGQQST
マウスFNIII-9 (P11276)
AVPPPTDLRFTNIGPDTMRVTWAPPPSIELTNLLVRYSPVKNEEDVAELSISPSDNAWLTNLLPGTEYLVSVSSVYEQHESIPLRGRQKT
部分的ヒトFNIII-10配列
TVRYYRITYGETGGNSPVQEFTVPGSKSTATISGLKPGVDYTITVYAVTGRGDSPASSKPISI
精製したヒト組換えα5β1又はα11β1受容体(PBS中5μg/mL)は、4℃で一晩インキュベートすることにより96ウェルELISAプレート(White Maxisorb-Nunc)上にコーティングした。次いで、ウェルをブロッキング緩衝液(5%(w/v)BSA、150mM NaCl、25mM Tris)で室温にて2時間ブロックした。次いで、ウェルを200μLの洗浄緩衝液(150mM NaCl、25mM Tris塩基、0.005% Tween20、0.5% BSA)で3回洗浄した。その後、PEG(6)-FITCと結合させたペプチドを、洗浄緩衝液中で異なる濃度に希釈した。この競合試験については、ウェルを10倍高い量の非標識ペプチドと共インキュベートした。プレートを37℃で60分間インキュベートした。次いで、ウェルを洗浄緩衝液で3回洗浄し、続いて蛍光プレートリーダー(Perkin Elmer社)を使用してプレートをフルオレセインシグナルEx/Em 485nm/520nmに対して読み取った。
ペプチドマイクロアレイは、PEGリンカーを使用してN末端でペプチドをガラススライドに結合させることによって調製した。各ペプチドを異なる位置で3回提示させ、人為産物とエラーを回避した。結合試験については、ペプチドアレイはTBST中の3% BSAで2時間ブロックした。次いで、アレイスライドをTBSTで5回洗浄し、続いて37℃で1時間、標的受容体(α5β1、PBSに溶解した10μg/mL)と共にインキュベートした。スライドをTBSTで洗浄し、次いでITGA5に対する一次抗体(1μg/mL)と共に37℃で1時間インキュベートした。次いでスライドを洗浄し、蛍光色素標識二次抗体と共に30分間インキュベートした。スライドをTBST及び水で洗浄し、次いで乾燥させ、マイクロアレイスキャナーでスキャンしてペプチドの結合を検出した。ImageJソフトウェアを使用して照らされたスポットを分析した。非特異的結合を決定するために、ペプチドアレイを、受容体インキュベーション工程を行うことなく、一次抗体及び二次抗体のみとインキュベートした。次いで、非特異的結合のシグナルを全結合から差し引き、特異的結合を算出した。
ヒト初代膵星状細胞(PSC)をScienCell社(Carlsbad、CA)から入手し、ペニシリン/ストレプトマイシンを補充した、メーカーによって提供された指定の培地中で培養した。細胞を9継代未満で使用し、Poly-L-リジンをコーティングしたプレートに播種した。
ヒト膵臓標本、ヒト肝硬変及び腎臓線維症標本は、オランダのエンスヘーデ(Enschede)所在のLaboratory Pathology East Netherlands(LabPON)の病理部から入手した。倫理承認は、LabPONの地方医学倫理委員会(local Medical Ethical Committee)から得た。サンプルは、ミクロトーム(Leica Microsystems社、Nussloch、Germany)を使用して2μmの切片に切断した。その切片を脱パラフィン処理し、次いでDako抗原回収バッファー中で、一晩80℃でインキュベートし抗原に暴露させた。内因性ペルオキシダーゼ活性は、メタノールで調製した3%のH2O2でブロックした。次いで切片をPBSで洗浄し、一次抗体(抗ITGA11、抗ITGA5、又は抗SMA又は抗CD31)と1時間室温でインキュベートした。次いで、切片を西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)結合二次抗体と室温で1時間インキュベートした。その後、Alexa488又はAlexa594結合三次抗体と1時間インキュベートした後、これらを1×PBSで3回洗浄した。核は、DAPIを含有するマウント培地(Sigma社)で対比染色した。
ITGA5結合ペプチドの選択
インテグリンα5のITGA5はフィブロネクチン(FN)の公知の受容体であり、ITGA5に対するペプチドリガンドを選択するために、ヒトFN-IIIドメイン-9及び10由来のオーバーラッピング配列(8アミノ酸オーバーラップを有する12アミノ酸長)を設計し、細胞性膜に提示した。FNのドメイン9及び10は、ドッキング実験(Nagaeら、2012 J. Cell Biol. 131~140頁)に示されているように、これらのドメインがα5β1受容体への結合を担っていることが報告されているので、ペプチドの設計において選択した。相互作用試験をヒト組換えインテグリンα5β1受容体に対して行い、結合タンパク質を別の膜に移し、ITGA5を抗体で検出した。多くの配列がヒトドメイン及びマウスドメイン由来のα5β1受容体に結合すると思われたが、ヒトFN-IIIドメイン10由来の2つの配列で以下のような最も強固な結合が得られた。
配列1. ITANSFTVHWIA - 弱い
配列2. VALNGREESPLL- 非常に弱い
ヒトFN-IIIドメイン10由来
配列3. TTVRYYRITYGE- 強い
配列4. YYRITYGETGGN - 非常に強い
配列5. GDSPASSKPISI - 中程度
マウスFN-IIIドメイン9由来
配列6. SIELTNLLVRYS - 中程度
配列7. TNLLVRYSPVKN - 中程度
ペプチド結合に関与するアミノ酸及び最も効率的な結合ペプチドを確認するため、アラニン置換及びより短いペプチドを用いてペプチドマイクロアレイを開発した。更に、配列RYYRITYC(AV3-Cys)を有するペプチドを開発した。AV3(RYYRITY)については、ペプチドマイクロアレイをα5β1受容体とインキュベートし、これを抗α5抗体により捕捉し、次いで蛍光色素標識した二次抗体により捕捉した。結合結果からは、Y3の置き換えにより結合はなくなり、一方、R1、R4及びY7の置き換えによりAV3ペプチドの結合が低下したことが明らかである。T6の置き換えは、インキュベーションする抗体に対するペプチドの非特異的結合を誘導した(図13)。Tabel 2(表2)は、ITGA5結合ペプチドの配列を示す。
ヒト皮膚線維芽細胞(BJhtert)のTGFβ1による活性化は、8、24及び48時間でITGA5の遺伝子発現レベルを誘導した(図10)。更に、膵星状細胞のTGFβ又はpanc-1腫瘍細胞馴化培地による活性化は、24時間後にITGA5発現レベルも誘導した。
TGFβによるPSCの活性化は、α-SMA発現の増加によって示したように、これらの細胞の筋線維芽細胞への活性化及び分化をもたらした。興味深いことに、AV3ペプチドによる処置は、20μMでα-SMA発現を有意に阻害し、AV3ペプチドの抗線維症効果を示した(図14A)。更に、PSCをTGFβ1とインキュベーションすると、免疫組織化学染色で示したように、α-SMA、Col-1a1及びビメンチン等の線維性マーカーの発現が増強された。AV3-cysペプチドによる処置は、これらのバイオマーカーの発現を明らかに阻害し、AV3-cysペプチドがPSCの活性化及び分化を阻害し得ることを示唆している。反対に、スクランブルされたAV3-cysは、いかなる阻害効果も示さなかった(図14B)。加えて、本発明者らは、ヒト皮膚線維芽細胞の移動に対するAV3及びその変異体の効果を試験した。本発明者らは、AV3-cysペプチドが線維芽細胞の移動を有意に阻害するが、そのスクランブルされたバージョンはいかなる効果も示さなかったことを確認した(図15A)。更に、異なるペプチドのバージョンについて、線維芽細胞の移動に対するそれらの効果を試験した。AV3.3のみが移動に対して約30%の低下を示したが、他のバージョンではほとんど又は全く効果を示さなかった(図15B)。
本発明者らは、正常な膵臓及び膵臓腫瘍におけるITGA5の発現を試験した。本発明者らは、正常なヒト膵臓はITGA5の染色を示さないが、膵臓腫瘍は間質領域でITGA5の強い染色を示すことを確認した(図9A)。ITGA5のα-SMA(筋線維芽細胞マーカー)及びCD31染色(内皮細胞マーカー)との共局在化により、ITGA5はα-SMAと完全に一致するが、CD31とはわずかにしか 一致しないことが明らかになり、ITGA5が筋線維芽細胞及び腫瘍脈管構造で高度に発現されることが示唆された(図9B)。
材料及び方法
マイクロスケール熱泳動
蛍光標識ペプチド(AV3-PEG(6)-5FAM又はAXI-I-PEG(6)-FITC)(1μM)を、異なる濃度のヒト組換え受容体(すなわち、α5β1、α11β1又はαvβ3)と10分間エッペンドルフチューブ内でインキュベートした。ペプチドと受容体のこの混合物をNT.115(商標)親水性ガラスキャピラリーに充填した。最良の熱泳動設定を確認するため、ペプチドの標的受容体への結合は、低度(20%)、中度(40%)及び高度(80%)MSTパワーで試験し、また他のすべての結合実験も同じMST設定を使用して実施した。最後に、解離定数(Kd)値を、3回の実験の平均から算出した。
すべての実験は、オランダの法律下の動物倫理規定に基づいて実施され、プロトコルは地方動物倫理委員会により承認された。オスのSCIDマウス(約20g)は、Charles River社(Germany)から入手した。ヒト膵星状細胞(PSC)と組み合わせたヒト膵臓腫瘍細胞(Panc-1)をマウスの側腹部に同時注入し、腫瘍を約200mm3のサイズまで増殖させた。800CW(AV3-800CW)(1nmol)と結合させたAV3ペプチドを、単独で、又は50倍過剰の非標識AV3(ブロッカーとして)と共に、腫瘍担持マウスに静脈内注射した。動物を麻酔下でPearl光学画像解析装置(LICOR社)を用いて3時間スキャンし、ペプチドの分布を試験した。
ヒト皮膚線維芽細胞はScienCell社(Carlsbad、CA)から購入し、2% FBSを含むペニシリン及びストレプトマイシンを補充した線維芽細胞培地(カタログ番号2301、ScienCell社)で培養した。7×104細胞を12ウェルプレートに播種し、24時間後、培地をFCS非含有の培地と交換し、次いで、ヒト組換えTGFβ(5ng/mL)を、異なる濃度のAV3(1、5、20μM)及びスクランブルされたAV3(sAV3; 5及び20μM)ペプチドと共に、又は非存在で添加した。48時間後、細胞を溶解緩衝液で溶解させ、α-SMA及びβ-アクチン発現を分析するためのウェスタンブロット分析を実施した。
ペプチドAV3及びAXI-Iの特異性
蛍光標識ペプチド(AV3-PEG(6)-5FAM及びAXI-I-PEG(6)-FITC)を、マイクロスケール熱泳動(MST)を使用し、α5β1及びα11β1受容体に対するそれらの結合親和性について試験した。MSTは、ペプチドを溶液相で受容体と相互作用させる。またこれらのペプチドは、インテグリンファミリーavβ3の無関係な受容体にも曝露し、MST分析を実施した。
線維芽細胞の活性化及び分化のマーカーであるα-SMAを、異なる濃度のAV3(1、5、20μM)及びスクランブルされたAV3(sAV3、5及び20μM)ペプチドの存在下又は非存在下で、ヒト組換え体TGFβ(5ng/mL)との活性化の48時間後に分析した。
ヒト膵腫瘍細胞における800CW色素(AV3-800CW)で標識したAV3ペプチドの分布を分析した。ヒト膵星状細胞(PSC)と組み合わせたヒト膵臓腫瘍細胞(Panc-1)をSCIDマウスの側腹部に同時注入し、約200mm3の大きさまで増殖させた。AV3-800CW(1nmol)を、腫瘍担持マウスに単独で(図18A)又は50倍過剰の非標識AV3と共に(図18B)静脈内注射した。
Claims (19)
- 8~12個のアミノ酸からなり、アミノ酸配列SGLTEWLRWFNS又は前記配列の変異体を含む、単離又は組換えインテグリンアルファ11(ITGA11)結合ペプチドであって、前記変異体が、
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの8~12個の連続アミノ酸からなり、前記8~12個の連続アミノ酸が、少なくとも配列LTEWLRWFを含むか、又は
- 前記配列の1、2、4、5、6、7、8、9、11及び12位のアミノ酸から選択される或るアミノ酸の、他のアミノ酸による1個の置換を有するアミノ酸配列SGLTEWLRWFNSからなる、
ペプチド。 - 前記ITGA11結合ペプチドが、以下の配列:
LTEWLRWF、
LTEWLRWFN、
LTEWLRWFNS、
GLTEWLRWF、
GLTEWLRWFN、
GLTEWLRWFNS、
SGLTEWLRWF、
SGLTEWLRWFN、及び
SGLTEWLRWFNS
から選択されるアミノ酸配列からなる、請求項1に記載のペプチド。 - - 前記配列SGLTEWLRWFNSの1位の若しくは12位のセリンが、トレオニン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、若しくは対応する非天然アミノ酸により置き換えられ、又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの2位のグリシンが、プロリン、アラニン、システイン、セリン、トレオニン、アスパラギン及びアスパラギン酸からなる群から選択されるアミノ酸により、若しくは対応する非天然アミノ酸により置き換えられ、又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの4位のトレオニンが、セリン、アスパラギン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、若しくは対応する非天然アミノ酸により置き換えられ、又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの5位のグルタミン酸が、アスパラギン酸及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、若しくは対応する非天然アミノ酸により置き換えられ、又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの6位の及び/若しくは9位のトリプトファンが、アラニン、フェニルアラニン及びチロシンからなる群から選択されるアミノ酸により、若しくは対応する非天然アミノ酸により置き換えられ、又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの7位のロイシンが、アラニン、バリン、イソロイシン及びメチオニンからなる群から選択されるアミノ酸により、若しくは対応する非天然アミノ酸により置き換えられ、又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの8位のアルギニンが、リジン、ヒスチジン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、若しくは対応する非天然アミノ酸により置き換えられ、又は
- 前記配列SGLTEWLRWFNSの11位のアスパラギンが、トレオニン、セリン、グルタミン及びアラニンからなる群から選択されるアミノ酸により、若しくは対応する非天然アミノ酸により置き換えられる、請求項1に記載のペプチド。 - 前記ペプチドが、α11β1インテグリン及び/又はITGA11阻害活性を有し、好ましくは、前記阻害活性が、α11β1インテグリン及び/又はITGA11の、線維芽細胞、星状細胞、筋線維芽細胞、周皮細胞及び/又は間葉系起源の他の細胞への結合の阻害を含む、請求項1から3のいずれか一項に記載のペプチド。
- 請求項1から4のいずれか一項に記載の2つのペプチドを含む、二量体ペプチド。
- 前記二量体ペプチドの前記2つのペプチドの各々が、システイン残基を含む、請求項5に記載の二量体ペプチド。
- 請求項1から6のいずれか一項に記載のペプチド又は二量体ペプチドを含む、化合物。
- 標識、リンカー、N末端修飾、C末端修飾、環化、二環化、及びそれらの組合せからなる群から選択される少なくとも1つのさらなる部分を含む、請求項7に記載の化合物。
- 前記化合物が、ナノ粒子、微粒子、ナノカプセル、ナノ複合体、ポリプレックス、カーボンナノチューブ、量子ドット、マイクロカプセル、リポソーム、ミクロスフェア、ヒドロゲル、ポリマー、ミセル、デンドリマー、脂質複合体、血清アルブミン、抗体、抗体フラグメント、シクロデキストリン及びデキストランからなる群から選択される担体に結合した又はその中にカプセル化された前記ペプチド又は二量体ペプチドを含む、請求項7又は8に記載の化合物。
- 請求項1から4のいずれか一項に記載のペプチドをコードする核酸配列を含む、核酸分子。
- 請求項1から6のいずれか一項に記載のペプチド若しくは二量体ペプチド若しくはその薬学的に許容される塩、請求項7から9のいずれか一項に記載の化合物、又は請求項10に記載の核酸分子と、少なくとも1つの薬学的に許容される担体、希釈剤及び/又は賦形剤とを含む、医薬品組成物。
- 治療剤、予防剤又は診断剤としての使用のための、請求項1から6のいずれか一項に記載のペプチド若しくは二量体ペプチド、請求項7から9のいずれか一項に記載の化合物、又は請求項10に記載の核酸分子。
- 線維症若しくは線維症関連疾患、炎症性疾患又はがんの処置又は予防における使用のための、請求項1から6のいずれか一項に記載のペプチド若しくは二量体ペプチド、請求項7から9のいずれか一項に記載の化合物、又は請求項10に記載の核酸分子。
- 画像化剤又は標的化剤としての、請求項1から6のいずれか一項に記載のペプチド又は二量体ペプチドの使用。
- インテグリンアルファ11(ITGA11)を発現する組織を画像化するインビトロでの方法であって、請求項1から6のいずれか一項に記載のペプチド又は二量体ペプチドと前記組織とを接触させることによる、方法。
- 前記組織が、α11β1インテグリンを発現する、請求項15に記載の方法。
- 請求項1から6のいずれか一項に記載のペプチド又は二量体ペプチドを含む、インテグリンアルファ11(ITGA11)を発現する組織の画像化剤。
- 前記組織が、α11β1インテグリンを発現する、請求項17に記載の剤。
- 環式又は二環式ペプチドである、請求項1から4のいずれか一項に記載のペプチド。
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