JP6949027B2 - ジカウイルスワクチン - Google Patents
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Description
本明細書に記載のように、ジカウイルスは、対象の感染時には、種々の症状の内のいずれかを引き起こす可能性があり、通常、軽度の発熱;顔、頸部、躯幹、上腕の発疹(皮疹);頭痛;光への感受性;非炎症性関節痛;結膜炎;食欲不振;下痢;腹痛;および/または眩暈を特徴とする。妊娠中のジカウイルス感染は、胎児/新生児における小頭症と関連がある。また、ギラン・バレー症候群またはその症状の発症とも確度の高い関連性がある。ジカウイルスに曝露されたまたはジカウイルスに曝露されたと疑われる対象のジカウイルス感染の診断は、ウイルス特異的抗体の存在の検出および/またはPCRまたはリアルタイムPCRによるジカウイルス検出などの分子検査を必要とする。
配列番号1
典型的なプロタミンの形
PRRRRSSSRP VRRRRRPRVS RRRRRRGGRR RR
以下で提供されるのは、本明細書に記載の方法、組成物、および/またはワクチンで使用され得るジカウイルスのゲノムの核酸配列の例である。
配列番号2
KU321639.1 ジカウイルス株 ZikaSPH2015、Brazil、全ゲノム
GTTGTTACTGTTGCTGACTCAGACTGCGACAGTTCGAGTTTGAAGCGAAAGCTAGCAACAGTATCAACAGGTTTTATTTGGATTTGGAAACGAGAGTTTCTGGTCATGAAAAACCCAAAAAAGAAATCCGGAGGATTCCGGATTGTCAATATGCTAAAACGCGGAGTAGCCCGTGTGAGCCCCTTTGGGGGCTTGAAGAGGCTGCCAGCCGGACTTCTGCTGGGTCATGGGCCCATCAGGATGGTCTTGGCAATTCTAGCCTTTTTGAGATTCACGGCAATCAAGCCATCACTGGGTCTCATCAATAGATGGGGTTCAGTGGGGAAAAAAGAGGCTATGGAAATAATAAAGAAGTTCAAGAAAGATCTGGCTGCCATGCTGAGAATAATCAATGCTAGGAAGGAGAAGAAGAGACGGGGCGCAGATACTAGTGTCGGAATTGTTGGCCTCCTGCTGACCACAGCTATGGCAGCGGAGGTCACTAGACGTGGGAGTGCATACTATATGTACTTGGACAGAAACGATGCTGGGGAGGCCATATCTTTTCCAACCACATTGGGGATGAATAAGTGTTATATACAGATCATGGATCTTGGACACATGTGTGATGCCACCATGAGCTATGAATGCCCTATGCTGGATGAGGGGGTGGAACCAGATGACGTCGATTGTTGGTGCAACACGACGTCAACTTGGGTTGTGTACGGAACCTGCCATCACAAAAAAGGTGAAGCACGGAGATCTAGAAGAGCTGTGACGCTCCCCTCCCATTCCACTAGGAAGCTGCAAACGCGGTCGCAAACCTGGTTGGAATCAAGAGAATACACAAAGCACTTGATTAGAGTCGAAAATTGGATATTCAGGAACCCTGGCTTCGCGTTAGCAGCAGCTGCCATCGCTTGGCTTTTGGGAAGCTCAACGAGCCAAAAAGTCATATACTTGGTCATGATACTGCTGATTGCCCCGGCATACAGCATCAGGTGCATAGGAGTCAGCAATAGGGACTTTGTGGAAGGTATGTCAGGTGGGACTTGGGTTGATATTGTCTTGGAACATGGAGGTTGTGTCACCGTAATGGCACAGGACAAACCGACTGTCGACATAGAGCTGGTTACAACAACAGTCAGCAACATGGCGGAGGTAAGATCCTACTGCTATGAGGCATCAATATCAGACATGGCTTCGGACAGCCGCTGCCCAACACAAGGTGAAGCCTACCTTGACAAGCAATCAGACACTCAATATGTCTGCAAAAGAACGTTAGTGGACAGAGGCTGGGGAAATGGATGTGGACTTTTTGGCAAAGGGAGTCTGGTGACATGCGCTAAGTTTGCATGCTCCAAGAAAATGACCGGGAAGAGCATCCAGCCAGAGAATCTGGAGTACCGGATAATGCTGTCAGTTCATGGCTCCCAGCACAGTGGGATGATCGTTAATGACACAGGACATGAAACTGATGAGAATAGAGCGAAGGTTGAGATAACGCCCAATTCACCAAGAGCCGAAGCCACCCTGGGGGGTTTTGGAAGCCTAGGACTTGATTGTGAACCGAGGACAGGCCTTGACTTTTCAGATTTGTATTACTTGACTATGAATAACAAGCACTGGTTGGTTCACAAGGAGTGGTTCCACGACATTCCATTACCTTGGCACGCTGGGGCAGACACCGGAACTCCACACTGGAACAACAAAGAAGCACTGGTAGAGTTCAAGGACGCACATGCCAAAAGGCAAACTGTCGTGGTTCTAGGGAGTCAAGAAGGAGCAGTTCACACGGCCCTTGCTGGAGCTCTGGAGGCTGAGATGGATGGTGCAAAGGGAAGGCTGTCCTCTGGCCACTTGAAATGTCGCCTGAAAATGGATAAACTTAGATTGAAGGGCGTGTCATACTCCTTGTGTACCGCAGCGTTCACATTCACCAAGATCCCGGCTGAAACACTGCACGGGACAGTCACAGTGGAGGTACAGTACGCAGGGACAGATGGACCTTGCAAGGTTCCAGCTCAGATGGCGGTGGACATGCAAACTCTGACCCCAGTTGGGAGGTTGATAACCGCTAACCCCGTAATCACTGAAAGCACTGAGAACTCTAAGATGATGCTGGAACTTGATCCACCATTTGGGGACTCTTACATTGTCATAGGAGTCGGGGAGAAGAAGATCACCCACCACTGGCACAGGAGTGGCAGCACCATTGGAAAAGCATTTGAAGCCACTGTGAGAGGTGCCAAGAGAATGGCAGTCTTGGGAGACACAGCCTGGGACTTTGGATCAGTTGGAGGCGCTCTCAACTCATTGGGCAAGGGCATCCATCAAATTTTTGGAGCAGCTTTCAAATCATTGTTTGGAGGAATGTCCTGGTTCTCACAAATTCTCATTGGAACGTTGCTGATGTGGTTGGGTCTGAACACAAAGAATGGATCTATTTCCCTTATGTGCTTGGCCTTAGGGGGAGTGTTGATCTTCTTATCCACAGCCGTCTCTGCTGATGTGGGGTGCTCGGTGGACTTCTCAAAGAAGGAGACGAGATGCGGTACAGGGGTGTTCGTCTATAACGACGTTGAAGCCTGGAGGGACAGGTACAAGTACCATCCTGACTCCCCCCGTAGATTGGCAGCAGCAGTCAAGCAAGCCTGGGAAGATGGTATCTGCGGGATCTCCTCTGTTTCAAGAATGGAAAACATCATGTGGAGATCAGTAGAAGGGGAGCTCAACGCAATCCTGGAAGAGAATGGAGTTCAACTGACGGTCGTTGTGGGATCTGTAAAAAACCCCATGTGGAGAGGTCCACAGAGATTGCCCGTGCCTGTGAACGAGCTGCCCCACGGCTGGAAGGCTTGGGGGAAATCGCACTTCGTCAGAGCAGCAAAGACAAATAACAGCTTTGTCGTGGATGGTGACACACTGAAGGAATGCCCACTCAAACATAGAGCATGGAACAGCTTTCTTGTGGAGGATCATGGGTTCGGGGTATTTCACACTAGTGTCTGGCTCAAGGTTAGAGAAGATTATTCATTAGAGTGTGATCCAGCCGTTATTGGAACAGCTGTTAAGGGAAAGGAGGCTGTACACAGTGATCTAGGCTACTGGATTGAGAGTGAGAAGAATGACACATGGAGGCTGAAGAGGGCCCATCTGATCGAGATGAAAACATGTGAATGGCCAAAGTCCCACACATTGTGGACAGATGGAATAGAAGAGAGTGATCTGATCATACCCAAGTCTTTAGCTGGGCCACTCAGCCATCACAATACCAGAGAGGGCTACAGGACCCAAATGAAAGGGCCATGGCACAGTGAAGAGCTTGAAATTCGGTTTGAGGAATGCCCAGGCACTAAGGTCCACGTGGAGGAAACATGTGGAACAAGAGGACCATCTCTGAGATCAACCACTGCAAGCGGAAGGGTGATCGAGGAATGGTGCTGCAGGGAGTGCACAATGCCCCCACTGTCGTTCCGGGCTAAAGATGGCTGTTGGTATGGAATGGAGATAAGGCCCAGGAAAGAACCAGAAAGCAACTTAGTAAGGTCAATGGTGACTGCAGGATCAACTGATCACATGGATCACTTCTCCCTTGGAGTGCTTGTGATTCTGCTCATGGTGCAGGAAGGGCTGAAGAAGAGAATGACCACAAAGATCATCATAAGCACATCAATGGCAGTGCTGGTAGCTATGATCCTGGGAGGATTTTCAATGAGTGACCTGGCTAAGCTTGCAATTTTGATGGGTGCCACCTTCGCGGAAATGAACACTGGAGGAGATGTAGCTCATCTGGCGCTGATAGCGGCATTCAAAGTCAGACCAGCGTTGCTGGTATCTTTCATCTTCAGAGCTAATTGGACACCCCGTGAAAGCATGCTGCTGGCCTTGGCCTCGTGTCTTTTGCAAACTGCGATCTCCGCCTTGGAAGGCGACCTGATGGTTCTCATCAATGGTTTTGCTTTGGCCTGGTTGGCAATACGAGCGATGGTTGTTCCACGCACTGATAACATCACCTTGGCAATCCTGGCTGCTCTGACACCACTGGCCCGGGGCACACTGCTTGTGGCGTGGAGAGCAGGCCTTGCTACTTGCGGGGGGTTTATGCTCCTCTCTCTGAAGGGAAAAGGCAGTGTGAAGAAGAACTTACCATTTGTCATGGCCCTGGGACTAACCGCTGTGAGGCTGGTCGACCCCATCAACGTGGTGGGGCTGCTGTTGCTCACAAGGAGTGGGAAGCGGAGCTGGCCCCCTAGCGAAGTACTCACAGCTGTTGGCCTGATATGCGCATTGGCTGGAGGGTTCGCCAAGGCAGATATAGAGATGGCTGGGCCCATGGCCGCGGTCGGTCTGCTAATTGTCAGTTACGTGGTCTCAGGAAAGAGTGTGGACATGTACATTGAAAGAGCAGGTGACATCACATGGGAAAAAGATGCGGAAGTCACTGGAAACAGTCCCCGGCTCGATGTGGCGCTAGATGAGAGTGGTGATTTCTCCCTGGTGGAGGATGACGGTCCCCCCATGAGAGAGATCATACTCAAGGTGGTCCTGATGACCATCTGTGGCATGAACCCAATAGCCATACCCTTTGCAGCTGGAGCGTGGTACGTATACGTGAAGACTGGAAAAAGGAGTGGTGCTCTATGGGATGTGCCTGCTCCCAAGGAAGTAAAAAAGGGGGAGACCACAGATGGAGTGTACAGAGTAATGACTCGTAGACTGCTAGGTTCAACACAAGTTGGAGTGGGAGTTATGCAAGAGGGGGTCTTTCACACTATGTGGCACGTCACAAAAGGATCCGCGCTGAGAAGCGGTGAAGGGAGACTTGATCCATACTGGGGAGATGTCAAGCAGGATCTGGTGTCATACTGTGGTCCATGGAAGCTAGATGCCGCCTGGGACGGGCACAGCGAGGTGCAGCTCTTGGCCGTGCCCCCCGGAGAGAGAGCGAGGAACATCCAGACTCTGCCCGGAATATTTAAGACAAAGGATGGGGACATTGGAGCGGTTGCGCTGGATTA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配列番号3
KU497555.1 ジカウイルス分離株 Brazil−ZKV2015、Brazil、全ゲノム
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配列番号4
KU501215.1 ジカウイルス株 PRVABC59、Puerto Rico、全ゲノム
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CACCTGGGCTGAGAACATTAAAAACACAGTCAACATGGTGCGCAGGATCATAGGTGATGAAGAAAAGTACATGGACTACCTATCCACCCAAGTTCGCTACTTGGGTGAAGAAGGGTCTACACCTGGAGTGCTGTAAGCACCAATCTTAATGTTGTCAGGCCTGCTAGTCAGCCACAGCTTGGGGAAAGCTGTGCAGCCTGTGACCCCCCCAGGAGAAGCTGGGAAACCAAGCCTATAGTCAGGCCGAGAACGCCATGGCACGGAAGAAGCCATGCTGCCTGTGAGCCCCTCAGAGGACACTGAGTCAAAAAACCCCACGCGCTTGGAGGCGCAGGATGGGAAAAGAAGGTGGCGACCTTCCCCACCCTTCAATCTGGGGCCTGAACTGGAGATCAGCTGTGGATCTCCAGAAGAGGGACTAGTGGTTAGAGGA
配列番号5
KU509998.1 ジカウイルス株 Haiti/1225/2014、Haiti、全ゲノム
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配列番号6
KU527068.1 ジカウイルス株 Natal RGN,Brazil:Rio Grande do Norte、Natal、全ゲノム
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GGGAGGAAGAGACTCCTGTTGAGTGCTTCGAGCCTTCGATGCTGAAGAAGAAGCAGCTAACTGTCTTAGACTTGCATCCTGGAGCTGGGAAAACCAGGAGAGTTCTTCCTGAAATAGTCCGTGAAGCCATAAAAACAAGACTCCGTACTGTGATCTTAGCTCCAACCAGGGTTGTCGCTGCTGAAATGGAGGAAGCCCTTAGAGGGCTTCCAGTGCGTTATATGACAACAGCAGTCAATGTCACCCACTCTGGAACAGAAATCGTCGACTTAATGTGCCATGCCACCTTCACTTCACGTCTACTACAGCCAATCAGAGTCCCCAACTATAATCTGTATATTATGGATGAGGCCCACTTCACAGATCCCTCAAGTATAGCAGCAAGAGGATACATTTCAACAAGGGTTGAGATGGGCGAGGCGGCTGCCATCTTCATGACCGCCACGCCACCAGGAACCCGTGACGCATTTCCGGACTCCAACTCACCAATTATGGACACCGAAGTGGAAGTCCCAGAGAGAGCCTGGAGCTCAGGCTTTGATTGGGTGACGGATCATTCTGGAAAAACAGTTTGGTTTGTTCCAAGCGTGAGGAACGGCAATGAGATCGCAGCTTGTCTGACAAAGGCTGGAAAACGGGTCATACAGCTCAGCAGAAAGACTTTTGAGACAGAGTTCCAGAAAACAAAACATCAAGAGTGGGACTTTGTCGTGACAACTGACATTTCAGAGATGGGCGCCAACTTTAAAGCTGACCGTGTCATAGATTCCAGGAGATGCCTAAAGCCGGTCATACTTGATGGCGAGAGAGTCATTTTGGCTGGACCCATGCCTGTCACACATGCCAGCGCTGCCCAGAGGAGGGGGCGCATAGGCAGGAATCCCAACAAACCTGGAGATGAGTATCTGTATGGAGGTGGGTGCGCAGAGACTGACGAAGACCATGCACACTGGCTTGAAGCAAGAATGCTCCTTGACAATATTTACCTCCAAGATGGCCTCATAGCCTCGCTCTATCGACCTGAGGCCGACAAAGTAGCAGCCATTGAGGGAGAGTTCAAGCTTAGGACGGAGCAAAGGAAGACCTTTGTGGAACTCATGAAAAGAGGAGATCTTCCTGTTTGGCTGGCCTATCAGGTTGCATCTGCCGGAATAACCTACACAGATAGAAGATGGTGCTTTGATGGCACGACCAACAACACCATAATGGAAGACAGTGTGCCGGCAGAGGTGTGGACCAGACACGGAGAGAAAAGAGTGCTCAAACCGAGGTGGATGGACGCCAGAGTTTGTTCAGATCATGCGGCCCTGAAGTCATTCAAGGAGTTTGCCGCTGGGAAAAGAGGAGCGGCTTTTGGAGTGATGGAAGCCCTGGGAACACTGCCAGGACACATGACAGAGAGATTCCAGGAAGCCATTGACAACCTCGCTGTGCTCATGCGGGCAGAGACTGGAAGCAGGCCTTACAAAGCCGCGGCGGCCCAATTGCCGGAGACCCTAGAGACCATTATGCTTTTGGGGTTGCTGGGAACAGTCTCGCTGGGAATCTTTTTCGTCTTGATGAGGAACAAGGGCATAGGGAAGATGGGCTTTGGAATGGTGACTCTTGGGGCCAGCGCATGGCTCATGTGGCTCTCGGAAATTGAGCCAGCCAGAATTGCATGTGTCCTCATTGTTGTGTTCCTATTGCTGGTGGTGCTCATACCTGAGCCAGAAAAGCAAAGATCTCCCCAGGACAACCAAATGGCAATCATCATCATGGTAGCAGTAGGTCTTCTGGGCTTGATTACCGCCAATGAACTCGGATGGTTGGAGAGAACAAAGAGTGACCTAAGCCATCTAATGGGAAGGAGAGAGGAGGGAGCAACCATAGGATTCTCAATGGACATTGACCTGCGGCCAGCCTCAGCTTGGGCCATCTATGCTGCCTTGACAACTTTCATTACCCCAGCCGTCCAACATGCAGTGACCACTTCATACAACAACTACTCCTTAATGGCGATGGCCACGCAAGCTGGAGTGTTGTTTGGTATGGGCAAAGGGATGCCATTCTACGCATGGGACTTTGGAGTCCCGCTGCTAATGATAGGTTGCTACTCACAATTAACACCCCTGACCCTAATAGTGGCCATCATTTTGCTCGTGGCGCACTACATGTACTTGATCCCAGGGCTGCAGGCAGCAGCTGCGCGTGCTGCCCAGAAGAGAACGGCAGCTGGCATCATGAAGAACCCTGTTGTGGATGGAATAGTGGTGACTGACATTGACACAATGACAATTGACCCCCAAGTGGAGAAAAAGATGGGACAGGTGCTACTCATAGCAGTAGCAGTCTCCAGCGCCATACTGTCGCGGACCGCCTGGGGGTGGGGGGAGGCTGGGGCCCTGATCACAGCCGCAACTTCCACTTTGTGGGAAGGCTCTCCGAACAAGTACTGGAACTCCTCTACAGCCACTTCACTGTGTAACATTTTTAGGGGAAGTTACTTGGCTGGAGCTTCTCTAATCTACATAGTAACAAGAAACGCTGGCTTGGTCAAGAGACGTGGGGGTGGAACAGGAGAGACCCTGGGAGAGAAATGGAAGGCCCGCTTGAACCAGATGTCGGCCCTGGAGTTCTACTCCTACAAAAAGTCAGGCATCACCGAGGTGTGCAGAGAAGAGGCCCGCCGCGCCCTCAAGGATGGTGTGGCAACGGGAGGCCATGCTGTGTCCCGAGGAAGTGCAAAGCTGAGATGGTTGGTGGAGCGGGGATACCTGCAGCCCTATGGAAAGGTCATTGATCTTGGATGTGGCAGAGGGGGCTGGAGTTACTACGCCGCCACCATCCGCAAAGTTCAAGAAGTGAAAGGATACACAAAAGGAGGCCCTGGTCATGAAGAACCCGTGTTGGTGCAAAGCTATGGGTGGAACATAGTCCGTCTTAAGAGTGGGGTGGACGTCTTTCATATGGCGGCTGAGCCGTGTGACACGTTGCTGTGTGACATAGGTGAGTCATCATCTAGTCCTGAAGTGGAAGAAGCACGGACGCTCAGAGTCCTCTCCATGGTGGGGGATTGGCTTGAAAAAAGACCAGGAGCCTTTTGTATAAAAGTGTTGTGCCCATACACCAGCACTATGATGGAAACCCTGGAGCGACTGCAGCGTAGGTATGGGGGAGGACTGGTCAGAGTGCCACTCTCCCGCAACTCTACACATGAGATGTACTGGGTCTCTGGAGCGAAAAGCAACACCATAAAAAGTGTGTCCACCACGAGCCAGCTCCTCTTGGGGCGCATGGACGGGCCTAGGAGGCCAGTGAAATATGAGGAGGATGTGAATCTCGGCTCTGGCACGCGGGCTGTGGTAAGCTGCGCTGAAGCTCCCAACATGAAGATCATTGGTAACCGCATTGAAAGGATCCGCAGTGAGCACGCGGAAACGTGGTTCTTTGACGAGAACCACCCATATAGGACATGGGCTTACCATGGAAGCTATGAGGCCCCCACACAAGGGTCAGCGTCCTCTCTAATAAACGGGGTTGTCAGGCTCCTGTCAAAACCCTGGGATGTGGTGACTGGAGTCACAGGAATAGCCATGACCGACACCACACCGTATGGTCAGCAAAGAGTTTTCAAGGAAAAAGTGGACACTAGGGTGCCAGACCCCCAAGAAGGCACTCGTCAGGTTATGAGCATGGTCTCTTCCTGGTTGTGGAAAGAGCTAGGCAAACACAAACGGCCACGAGTCTGTACCAAAGAAGAGTTCATCAACAAGGTTCGTAGCAATGCAGCATTAGGGGCAATATTTGAAGAGGAAAAAGAGTGGAAGACTGCAGTGGAAGCTGTGAACGATCCAAGGTTCTGGGCTCTAGTGGACAAGGAAAGAGAGCACCACCTGAGAGGAGAGTGCCAGAGTTGTGTGTACAACATGATGGGAAAAAGAGAAAAGAAACAAGGGGAATTTGGAAAGGCCAAGGGCAGCCGCGCCATCTGGTATATGTGGCTAGGGGCTAGATTTCTAGAGTTCGAAGCCCTTGGATTCTTGAACGAGGATCACTGGATGGGGAGAGAGAACTCAGGAGGTGGTGTTGAAGGGCTGGGATTACAAAGACTCGGATATGTCCTAGAAGAGATGAGTCGCATACCAGGAGGAAGGATGTATGCAGATGACACTGCTGGCTGGGACACCCGCATCAGCAGGTTCGATCTGGAGAATGAAGCTCTAATCACCAACCAAATGGAGAAAGGGCATAGGGCCTTGGCATTGGCCATAATCAAGTACACATACCAAAACAAAGTGGTAAAGGTCCTTAGACCAGCTGAAAAAGGGAAAACAGTTATGGACATTATTTCGAGACAAGACCAAAGGGGGAGCGGACAAGTTGTCACTTACGCTCTTAACACATTTACCAACCTAGTGGTGCAACTCATTCGGAATATGGAGGCTGAGGAAGTTCTAGAGATGCAAGACTTGTGGCTGCTGCGGAGGTCAGAGAAAGTGACCAACTGGTTGCAGAGCAACGGATGGGATAGGCTCAAACGAATGGCAGTCAGTGGAGATGATTGCGTTGTGAAGCCAATTGATGATAGGTTTGCACATGCCCTCAGGTTCTTGAATGATATGGGAAAAGTTAGGAAGGACACACAAGAGTGGAAACCCTCAACTGGATGGGACAACTGGGAAGAAGTTCCGTTTTGCTCCCACCACTTCAACAAGCTCCATCTCAAGGACGGGAGGTCCATTGTGGTTCCCTGCCGCCACCAAGATGAACTGATTGGCCGGGCCCGCGTCTCTCCAGGGGCGGGATGGAGCATCCGGGAGACTGCTTGCCTAGCAAAATCATATGCGCAAATGTGGCAGCTCCTTTATTTCCACAGAAGGGACCTCCGACTGATGGCCAATGCCATTTGTTCATCTGTGCCAGTTGACTGGGTTCCAACTGGGAGAACTACCTGGTCAATCCATGGAAAGGGAGAATGGATGACCACTGAAGACATGCTTGTGGTGTGGAACAGAGTG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配列番号7
KU681081.3 ジカウイルス分離株 Zika virus/H.sapiens−tc/THA/2014/SV0127− 14、Thailand、全ゲノム
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配列番号8
KU681082.3 ジカウイルス分離株 Zika virus/H.sapiens−tc/PHL/2012/CPC−0740、Philippines、全ゲノム
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CTACCTGGGCTGAGAACATCAAAAATACAGTCAACATGATGCGCAGGATCATAGGTGATGAAGAAAAGTACATGGACTACCTATCCACCCAGGTTCGCTACTTGGGTGAAGAAGGGTCCACACCTGGAGTGCTGTAAGCACCAATCTTAGTGTTGTCAGGCCTGCTAGTCAGCCACAGCTTGGGGAAAGCTGTGCAGCCTGTGACCCCCCCAGGAGAAGCTGGGAAACCAAGCCTATAGTCAGGCCGAGAACGCCATGGCACGGAAGAAGCCATGCTGCCTGTGAGCCCCTCAGAGGACACTGAGTCAAAAAACCCCACGCGCTTGGAGGCGCAGGATGGGAAAAGAAGGTGGCGACCTTCCCCACCCTTCAATCTGGGGCCTGAACTGGAGATCAGCTGTGGATCTCCAGAAGAGGGACTAGTGGTTAGAGGAGACCCCCCGGAAAACGCAAAACAGCATATTGACGCTGGGAAAGACCAGAGACTCCATGAGTTTCCACCACGCTGGCCGCCAGGCACAGATCGCCGAATAGCGGCGGCCGGTGTGGGGAAATCCATGGGTCT
配列番号9
KU707826.1 ジカウイルス分離株 SSABR1,Brazil、全ゲノム
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配列番号10
KU744693.1 ジカウイルス分離株 VE_Ganxian,China、全ゲノム
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配列番号11
LC002520.1 ジカウイルスゲノムRNA、株:MR766−NIID、Uganda、全ゲノム
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配列番号12
AY632535.2 NC_012532.1 ジカウイルス株 MR 766、Uganda、全ゲノム
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配列番号13
KJ776791.1、ジカウイルス株 H/PF/2013 ポリタンパク質遺伝子、全コード領域
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CCCTATTTGGGAAAAAGGGAAGACTTGTGGTGTGGATCTCTCATAGGGCACAGACCGCGCACCACCTGGGCTGAGAACATTAAAAACACAGTCAACATGGTGCGCAGGATCATAGGTGATG
AAGAAAAGTACATGGACTACCTATCCACCCAAGTTCGCTACTTGGGTGAAGAAGGGTCTACACCTGGAGTGCTGTAAGCACCAATCTTAGTGTTGTCAGGCCTGCTAGTCAGCCACAGCTTGGGGAAAGCTGTGCAGCCTGTGACCCCCCCAGGAGAAGCTGGGAAACCAAGCCTATAGTCAGGCCGAGAACGCCATGGCACGGAAGAAGCCATGCTGCCTGTGAGCCCCTCAGAGGACACTGAGTCAAAAAACCCCACGCGCTTGGAGGCGCAGGATGGGAAAAGAAGGTGGCGACCTTCCCCACCCTTCAATCTGGGGCCTGAACTGGAGATCAGCTGTGGATCTCCAGAAGAGGGACTAGTGGTTAGAGGAG
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配列番号15
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配列番号16
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配列番号17
ArD128000.AHL43502.1.−/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号18
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配列番号19
ArD158084.AHL43504.1.−/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号20
isol−ARB13565.AHF49783.1.Central_African_Republic/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号21
isol−ARB7701.AHF49785.1.Central_African_Republic/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号22
isol−ArD_41519.AEN75266.1.Senegal/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号23
MR766−NIID.BAP47441.1.Uganda/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号24
LC002520.1/326−829ジカウイルスゲノムRNA、株:MR766−NIID、Uganda、フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号25
isol−MR_766.AEN75263.1.Uganda/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号26
ArD7117.AHL43501.1.−/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号27
AY632535.2/326−825 NC_012532.1 Zika virus strain MR 766、Uganda、フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号28
MR_766.AAV34151.1.Uganda/291−790フラビウイルス外皮糖タンパク質E.|Q32ZE1|Q32ZE1_9FL
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配列番号29
MR_766.YP_009227198.1.Uganda/1−500外被タンパク質E[ジカウイルス]
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配列番号30
KU681081.3/308−811 ジカウイルス分離株 Zika virus/H.sapiens−tc/THA/2014/SV0127− 14,Thailand、フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号31
isol−Zika_virus%H.sapiens−tc%THA%2014%SV0127−_14.AMD61710.1.Thailand/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号32
CK−ISL_2014.AIC06934.1.Cook_Islands/1−504フラビウイルス外皮糖タンパク質E.(断片)OS=Zika virus GN=E PE=4 SV=1
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配列番号33
Natal_RGN.AMB18850.1.Brazil:_Rio_Grande_do_Norte,_Natal/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号34
isol−Si323.AMC37200.1.Colombia/1−504フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号35
KU707826.1/317−820 ジカウイルス分離株 SSABR1、Brazil、フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号36
KU509998.1/326−829 ジカウイルス株 Haiti/1225/2014、Haiti、フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号37
isol−GDZ16001.AML82110.1.China/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号38
BeH819015.AMA12085.1.Brazil/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号39
MRS_OPY_Martinique_PaRi_2015.AMC33116.1.Martinique/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号40
KU501215.1/308−811 ジカウイルス株 PRVABC59,Puerto Rico、フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号41
Haiti%1225%2014.AMB37295.1.Haiti/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号42
KU527068.1/308−811 ジカウイルス株 Natal RGN、Brazil:Rio Grande do Norte、Natal
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配列番号43
isol−Z1106027.ALX35662.1.Suriname/5−508フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号44
isol−FLR.AMM39804.1.Colombia:_Barranquilla/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号45
PLCal_ZV_isol−From_Vero_E6_cells.AHL37808.1.Canada/254−757フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号46
BeH818995.AMA12084.1.Brazil/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E.[ジカウイルス]
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配列番号47
H/PF/2013.AHZ13508.1.French_Polynesia/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号48
PRVABC59.AMC13911.1.Puerto_Rico/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
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配列番号49
KU321639.1/326−829 ジカウイルス株 ZikaSPH2015,Brazil、フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDIVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号50
ZikaSPH2015.ALU33341.1.Brazil/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDIVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号51
103344.AMC13912.1.Guatemala/291−794 ポリタンパク質[Zika virus].103344.AMC13912.1.Guatemalaフラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEIRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号52
isol−Brazil−ZKV2015.AMD16557.1.Brazil/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGTQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号53
KU497555.1/308−811 ジカウイルス分離株 Brazil−ZKV2015、フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGTQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号54
isol−ZJ03.AMM39806.1.China/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGARRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号55
isol−FSS13025.AFD30972.1.Cambodia/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLVWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号56
isol−Z1106032.ALX35660.1.Suriname/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E[ジカウイルス]
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNAKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号57
isol−Z1106033.ALX35659.1.Suriname/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E[ジカウイルス]
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNAKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号58
isol−BeH828305.AMK49165.1.Brazil/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDTQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号59
isol−GD01.AMK79468.1.China/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNGTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号60
isol−Z1106031.ALX35661.1.Suriname/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVLAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号61
ACD75819.1.Micronesia/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPAVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLVWLGLNTKNGSISLTCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号62
KU681082.3/308−811 ジカウイルス分離株 Zika virus/H.sapiens−tc/PHL/2012/CPC−0740、Philippines、フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLVWLGLNTKNGSISLTCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号63
isol−Zika_virus%H.sapiens−tc%PHL%2012%CPC−0740.AMD61711.1.Philippines/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLVWLGLNTKNGSISLTCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号64
isol−BeH823339.AMK49164.2.Brazil/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVSTTVSNMAEVRSYCYEATISDIASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTAVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号65
isol−P6−740.AEN75264.1.Malaysia/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDXGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGDKKITHHWXRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLVWLGLNTKNGSISLTCLALGGVLIFLSTAVSA
配列番号66
KU744693.1/326−829 ジカウイルス分離株 VE_Ganxian、China、フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTAMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMLVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLAHKEWFHDIPLPWHAGAATGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETVDGTVTVEGQYGGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIIGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSG
配列番号67
isol−VE_Ganxian.AMK79469.1.China/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTAMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMLVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLAHKEWFHDIPLPWHAGAATGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETVDGTVTVEGQYGGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIIGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSG
配列番号68
ArD157995.AHL43503.1.−/291−794フラビウイルス外皮糖タンパク質E
ISCIGVSNRDLVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTEMAQDKPTVDIELVTMTVSNMAEVRSYCYEASLSDMASASRCPTQGEPSLDKQSDTQSVCKRTLGDRGWGNGCGIFGKGSLVTCSKFTCCKKMPGKSIQPENLEYRIMLPVHGSQHSGMIVNDIGHETDENRAKVEVTPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLFSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKVPAETLHGTVTVEVQSAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGDKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGVFNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLVWLGLNTKNGSISLTCLALGGVMIFLSTAVSA
配列番号69
MR_766.ABI54475.1.Uganda/291−788フラビウイルス外皮糖タンパク質E
IRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFTCSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDENRAKVEVTPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLFSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKVPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGDKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGVFNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLVWLGLNTKNGSISLTCLALGGVMIFLSTAVSA
配列番号70
5’−(dIdC)13−3’
dIdC dIdC dIdC dIdC dIdC dIdC dIdC dIdC dIdC dIdC dIdC dIdC dIdC
配列番号71
KLKペプチド
KLKLLLLLKLK
配列番号72
ZIKV配列 配列決定時のままのH/PF/2013
CAGACTGCGACAGTTCGAGTTTGAAGCGAAAGCTAGCAACAGTATCAACAGGTTTTATTTTGGATTTGGAAACGAGAGTTTCTGGTCATGAAAAACCCAAAAAAGAAATCCGGAGGATTCCGGATTGTCAATATGCTAAAACGCGGAGTAGCCCGTGTGAGCCCCTTTGGGGGCTTGAAGAGGCTGCCAGCCGGACTTCTGCTGGGTCATGGGCCCATCAGGATGGTCTTGGCGATTCTAGCCTTTTTGAGATTCACGGCAATCAAGCCATCACTGGGTCTCATCAATAGATGGGGTTCAGTGGGGAAAAAAGAGGCTATGGAAATAATAAAGAAGTTCAAGAAAGATCTGGCTGCCATGCTGAGAATAATCAATGCTAGGAAGGAGAAGAAGAGACGAGGCGCAGATACTAGTGTCGGAATTGTTGGCCTCCTGCTGACCACAGCTATGGCAGCGGAGGTCACTAGACGTGGGAGTGCATACTATATGTACTTGGACAGAAACGACGCTGGGGAGGCCATATCTTTTCCAACCACATTGGGGATGAATAAGTGTTATATACAGATCATGGATCTTGGACACATGTGTGATGCCACCATGAGCTATGAATGCCCTATGCTGGATGAGGGGGTGGAACCAGATGACGTCGATTGTTGGTGCAACACGACGTCAACTTGGGTTGTGTACGGAACCTGCCATCACAAAAAAGGTGAAGCACGGAGATCTAGAAGAGCTGTGACGCTCCCCTCCCATTCCACTAGGAAGCTGCAAACGCGGTCGCAAACCTGGTTGGAATCAAGAGAATACACAAAGCACTTGATTAGAGTCGAAAATTGGATATTCAGGAACCCTGGCTTCGCGTTAGCAGCAGCTGCCATCGCTTGGCTTTTGGGAAGCTCAACGAGCCAAAAAGTCATATACTTGGTCATGATACTGCTGATTGCCCCGGCATACAGCATCAGGTGCATAGGAGTCAGCAATAGGGACTTTGTGGAAGGTATGTCAGGTGGGACTTGGGTTGATGTTGTCTTGGAACATGGAGGTTGTGTCACCGTAATGGCACAGGACAAACCGACTGTCGACATAGAGCTGGTTACAACAACAGTCAGCAACATGGCGGAGGTAAGATCCTACTGCTATGAGGCATCAATATCGGACATGGCTTCGGACAGCCGCTGCCCAACACAAGGTGAAGCCTACCTTGACAAGCAATCAGACACTCAATATGTCTGCAAAAGAACGTTAGTGGACAGAGGCTGGGGAAATGGATGTGGACTTTTTGGCAAAGGGAGCCTGGTGACATGCGCTAAGTTTGCATGCTCCAAGAAAATGACCGGGAAGAGCATCCAGCCAGAGAATCTGGAGTACCGGATAATGCTGTCAGTTCATGGCTCCCAGCACAGTGGGATGATCGTTAATGACACAGGACATGAAACTGATGAGAATAGAGCGAAGGTTGAGATAACGCCCAATTCACCAAGAGCCGAAGCCACCCTGGGGGGTTTTGGAAGCCTAGGACTTGATTGTGAACCGAGGACAGGCCTTGACTTTTCAGATTTGTATTACTTGACTATGAATAACAAGCACTGGTTGGTTCACAAGGAGTGGTTCCACGACATTCCATTACCTTGGCACGCTGGGGCAGACACCGGAACTCCACACTGGAACAACAAAGAAGCACTGGTAGAGTTCAAGGACGCACATGCCAAAAGGCAAACTGTCGTGGTTCTAGGGAGTCAAGAAGGAGCAGTTCACACGGCCCTTGCTGGAGCTCTGGAGGCTGAGATGGATGGTGCAAAGGGAAGGCTGTCCTCTGGCCACTTGAAATGTCGCCTGAAAATGGATAAACTTAGATTGAAGGGCGTGTCATACTCCTTGTGTACCGCAGCGTTCACATTCACCAAGATCCCGGCTGAAACACTGCACGGGACAGTCACAGTGGAGGTACAGTACGCAGGGACAGATGGACCTTGCAAGGTTCCAGCTCAGATGGCGGTGGACATGCAAACTCTGACCCCAGTTGGGAGGTTGATAACCGCTAACCCCGTAATCACTGAAAGCACTGAGAACTCTAAGATGATGCTGGAACTTGATCCACCATTTGGGGACTCTTACATTGTCATAGGAGTCGGGGAGAAGAAGATCACCCACCACTGGCACAGGAGTGGCAGCACCATTGGAAAAGCATTTGAAGCCACTGTGAGAGGTGCCAAGAGAATGGCAGTCTTGGGAGACACAGCCTGGGACTTTGGATCAGTTGGAGGCGCTCTCAACTCATTGGGCAAGGGCATCCATCAAATTTTTGGAGCAGCTTTCAAATCATTGTTTGGAGGAATGTCCTGGTTCTCACAAATTCTCATTGGAACGTTGCTGATGTGGTTGGGTCTGAACACAAAGAATGGATCTATTTCCCTTATGTGCTTGGCCTTAGGGGGAGTGTTGATCTTCTTATCCACAGCTGTCTCTGCTGATGTGGGGTGCTCGGTGGACTTCTCAAAGAAGGAGACGAGATGCGGTACAGGGGTGTTCGTCTATAACGACGTTGAAGCCTGGAGGGACAGGTACAAGTACCATCCTGACTCCCCCCGTAGATTGGCAGCAGCAGTCAAGCAAGCCTGGGAAGATGGTATCTGTGGGATCTCCTCTGTTTCAAGAATGGAAAACATCATGTGGAGATCAGTAGAAGGGGAGCTCAACGCAATCCTGGAAGAGAATGGAGTTCAACTGACGGTCGTTGTGGGATCTGTAAAAAACCCCATGTGGAGAGGTCCACAGAGATTGCCCGTGCCTGTGAACGAGCTGCCCCACGGCTGGAAGGCTTGGGGGAAATCGTACTTCGTCAGAGCAGCAAAGACAAATAACAGCTTTGTCGTGGATGGTGACACACTGAAGGAATGCCCACTCAAACATAGAGCATGGAACAGCTTTCTTGTGGAGGATCATGGGTTCGGGGTATTTCACACTAGTGTCTGGCTCAAGGTTAGAGAAGATTATTCATTAGAGTGTGATCCAGCCGTTATTGGAACAGCTGTTAAGGGAAAGGAGGCTGTACACAGTGATCTAGGCTACTGGATTGAGAGTGAGAAGAATGACACATGGAGGCTGAAGAGGGCCCATCTGATCGAGATGAAAACATGTGAATGGCCAAAGTCCCACACATTGTGGACAGATGGAATAGAAGAGAGTGATCTGATCATACCCAAGTCTTTAGCTGGGCCACTCAGCCATCACAATACCAGAGAGGGCTACAGGACCCAAATGAAAGGGCCATGGCACAGTGAAGAGCTTGAAATTCGGTTTGAGGAATGCCCAGGCACTAAGGTCCACGTGGAGGAAACATGTGGAACAAGAGGACCATCTCTGAGATCAACCACTGCAAGCGGAAGGGTGATCGAGGAATGGTGCTGCAGGGAGTGCACAATGCCCCCACTGTCGTTCCGGGCTAAAGATGGCTGTTGGTATGGAATGGAGATAAGGCCCAGGAAAGAACCAGAAAGTAACTTAGTAAGGTCAATGGTGACTGCAGGATCAACTGATCACATGGATCACTTCTCCCTTGGAGTGCTTGTGATTCTGCTCATGGTGCAGGAAGGGCTGAAGAAGAGAATGACCACAAAGATCATCATAAGCACATCGATGGCAGTGCTGGTAGCTATGATCCTGGGAGGATTTTCAATGAGTGACCTGGCTAAGCTTGCAATTTTGATGGGTGCCACCTTCGCGGAAATGAACACTGGAGGAGATGTAGCTCATCTGGCGCTGATAGCGGCATTCAAAGTCAGACCAGCGTTGCTGGTATCTTTCATCTTCAGAGCTAATTGGACACCCCGTGAAAGCATGCTGCTGGCCTTGGCCTCGTGTCTTTTGCAAACTGCGATCTCCGCCTTGGAAGGCGACCTGATGGTTCTCATCAATGGTTTTGCTTTGGCCTGGTTGGCAATACGAGCGATGGTTGTTCCACGCACTGATAACATCACCTTGGCAATCCTGGCTGCTCTGACACCACTGGCCCGGGGCACACTGCTTGTGGCGTGGAGAGCAGGCCTTGCTACTTGCGGGGGGTTTATGCTCCTCTCTCTGAAGGGAAAAGGCAGTGTGAAGAAGAACTTACCATTTGTCATGGCCCTGGGACTAACCGCTGTGAGGCTGGTCGACCCCATCAACGTGGTGGGACTGCTGTTGCTCACAAGGAGTGGGAAGCGGAGCTGGCCCCCTAGCGAAGTACTCACAGCTGTTGGCCTGATATGCGCATTGGCTGGAGGGTTCGCCAAGGCAGATATAGAGATGGCTGGGCCCATGGCCGCGGTCGGTCTGCTAATTGTCAGTTACGTGGTCTCAGGAAAGAGTGTGGACATGTACATTGAAAGAGCAGGTGACATCACATGGGAAAAAGATGCGGAAGTCACTGGAAACAGTCCCCGGCTCGATGTGGCGCTAGATGAGAGTGGTGATTTCTCCCTGGTGGAGGATGACGGTCCCCCCATGAGAGAGATCATACTCAAGGTGGTCCTGATGACCATCTGTGGCATGAACCCAATAGCCATACCCTTTGCAGCTGGAGCGTGGTACGTATACGTGAAGACTGGAAAAAGGAGTGGTGCTCTATGGGATGTGCCTGCTCCCAAGGAAGTAAAAAAGGGGGAGACCACAGATGGAGTGTACAGAGTAATGACTCGTAGACTGCTAGGTTCAACACAAGTTGGAGTGGGAGTTATGCAAGAGGGGGTCTTTCACACTATGTGGCACGTCACAAAAGGATCCGCGCTGAGAAGCGGTGAAGGGAGACTTGATCCATACTGGGGAGATGTCAAGCAGGATCTGGTGTCATACTGTGGTCCATGGAAGCTAGATGCCGCCTGGGACGGGCACAGCGAGGTGCAGCTCTTGGCCGTGCCCCCCGGAGAGAGAGCGAGGAACATCCAGACTCTGCCCGGAATATTTAAGACAAAGGATGGGGACATTGGAGCGGTTGCGCTGGATTACCCAGCAGGAACTTCAGGATCTCCAATCCTAGACAAGTGTGGGAGAGTGATAGGACTTTATGGCAATGGGGTCGTGATCAAAAATGGGAGTTATGTTAGTGCCATCACCCAAGGGAGGAGGGAGGAAGAGACTCCTGTT
GAGTGCTTCGAGCCTTCGATGCTGAAGAAGAAGCAGCTAACTGTCTTAGACTTGCATCCTGGAGCTGGGAAAACCAGGAGAGTTCTTCCTGAAATAGTCCGTGAAGCCATAAAAACAAGACTCCGTACTGTGATCTTAGCTCCAACCAGGGTTGTCGCTGCTGAAATGGAGGAAGCCCTTAGAGGGCTTCCAGTGCGTTATATGACAACAGCAGTCAATGTCACCCACTCTGGAACAGAAATCGTCGACTTAATGTGCCATGCCACCTTCACTTCACGTCTACTACAGCCAATCAGAGTCCCCAACTATAATCTGTATATTATGGATGAGGCCCACTTCACAGATCCCTCAAGTATAGCAGCAAGAGGATACATTTCAACAAGGGTTGAGATGGGCGAGGCGGCTGCCATCTTCATGACCGCCACGCCACCAGGAACCCGTGACGCATTTCCGGACTCCAACTCACCAATTATGGACACCGAAGTGGAAGTCCCAGAGAGAGCCTGGAGCTCAGGCTTTGATTGGGTGACGGATCATTCTGGAAAAACAGTTTGGTTTGTTCCAAGCGTGAGGAACGGCAATGAGATCGCAGCTTGTCTGACAAAGGCTGGAAAACGGGTCATACAGCTCAGCAGAAAGACTTTTGAGACAGAGTTCCAGAAAACAAAACATCAAGAGTGGGACTTTGTCGTGACAACTGACATTTCAGAGATGGGCGCCAACTTTAAAGCTGACCGTGTCATAGATTCCAGGAGATGCCTAAAGCCGGTCATACTTGATGGCGAGAGAGTCATTCTGGCTGGACCCATGCCTGTCACACATGCCAGCGCTGCCCAGAGGAGGGGGCGCATAGGCAGGAATCCCAACAAACCTGGAGATGAGTATCTGTATGGAGGTGGGTGCGCAGAGACTGACGAAGACCATGCACACTGGCTTGAAGCAAGAATGCTCCTTGACAATATTTACCTCCAAGATGGCCTCATAGCCTCGCTCTATCGACCTGAGGCCGACAAAGTAGCAGCCATTGAGGGAGAGTTCAAGCTTAGGACGGAGCAAAGGAAGACCTTTGTGGAACTCATGAAAAGAGGAGATCTTCCTGTTTGGCTGGCCTATCAGGTTGCATCTGCCGGAATAACCTACACAGATAGAAGATGGTGCTTTGATGGCACGACCAACAACACCATAATGGAAGACAGTGTGCCGGCAGAGGTGTGGACCAGACACGGAGAGAAAAGAGTGCTCAAACCGAGGTGGATGGACGCCAGAGTTTGTTCAGATCATGCGGCCCTGAAGTCATTCAAGGAGTTTGCCGCTGGGAAAAGAGGAGCGGCTTTTGGAGTGATGGAAGCCCTGGGAACACTGCCAGGACACATGACAGAGAGATTCCAGGAAGCCATTGACAACCTCGCTGTGCTCATGCGGGCAGAGACTGGAAGCAGGCCTTACAAAGCCGCGGCGGCCCAATTGCCGGAGACCCTAGAGACCATTATGCTTTTGGGGTTGCTGGGAACAGTCTCGCTGGGAATCTTTTTCGTCTTGATGAGGAACAAGGGCATAGGGAAGATGGGCTTTGGAATGGTGACTCTTGGGGCCAGCGCATGGCTCATGTGGCTCTCGGAAATTGAGCCAGCCAGAATTGCATGTGTCCTCATTGTTGTGTTCCTATTGCTGGTGGTGCTCATACCTGAGCCAGAAAAGCAAAGATCTCCCCAGGACAACCAAATGGCAATCATCATCATGGTAGCAGTAGGTCTTCTGGGCTTGATTACCGCCAATGAACTCGGATGGTTGGAGAGAACAAAGAGTGACCTAAGCCATCTAATGGGAAGGAGAGAGGAGGGGGCAACCATAGGATTCTCAATGGACATTGACCTGCGGCCAGCCTCAGCTTGGGCCATCTATGCTGCCTTGACAACTTTCATTACCCCAGCCGTCCAACATGCAGTGACCACTTCATACAACAACTACTCCTTAATGGCGATGGCCACGCAAGCTGGAGTGTTGTTTGGTATGGGCAAAGGGATGCCATTCTACGCATGGGACTTTGGAGTCCCGCTGCTAATGATAGGTTGCTACTCACAATTAACACCCCTGACCCTAATAGTGGCCATCATTTTGCTCGTGGCGCACTACATGTACTTGATCCCAGGGCTGCAGGCAGCAGCTGCGCGTGCTGCCCAGAAGAGAACGGCAGCTGGCATCATGAAGAACCCTGTTGTGGATGGAATAGTGGTGACTGACATTGACACAATGACAATTGACCCCCAAGTGGAGAAAAAGATGGGACAGGTGCTACTCATAGCAGTAGCCGTCTCCAGCGCCATACTGTCGCGGACCGCCTGGGGGTGGGGGGAGGCTGGGGCCCTGATCACAGCGGCAACTTCCACTTTGTGGGAAGGCTCTCCGAACAAGTACTGGAACTCCTCTACAGCCACTTCACTGTGTAACATTTTTAGGGGAAGTTACTTGGCTGGAGCTTCTCTAATCTACACAGTAACAAGAAACGCTGGCTTGGTCAAGAGACGTGGGGGTGGAACAGGAGAGACCCTGGGAGAGAAATGGAAGGCCCGCTTGAACCAGATGTCGGCCCTGGAGTTCTACTCCTACAAAAAGTCAGGCATCACCGAGGTGTGCAGAGAAGAGGCCCGCCGCGCCCTCAAGGACGGTGTGGCAACGGGAGGCCATGCTGTGTCCCGAGGAAGTGCAAAGCTGAGATGGTTGGTGGAGCGGGGATACCTGCAGCCCTATGGAAAGGTCATTGATCTTGGATGTGGCAGAGGGGGCTGGAGTTACTACGCCGCCACCATCCGCAAAGTTCAAGAAGTGAAAGGATACACAAAAGGAGGCCCTGGTCATGAAGAACCCATGTTGGTGCAAAGCTATGGGTGGAACATAGTCCGTCTTAAGAGTGGGGTGGACGTCTTTCATATGGCGGCTGAGCCGTGTGACACGTTGCTGTGTGACATAGGTGAGTCATCATCTAGTCCTGAAGTGGAAGAAGCACGGACGCTCAGAGTCCTCTCCATGGTGGGGGATTGGCTTGAAAAAAGACCAGGAGCCTTTTGTATAAAAGTGTTGTGCCCATACACCAGCACTATGATGGAAACCCTGGAGCGACTGCAGCGTAGGTATGGGGGAGGACTGGTCAGAGTGCCACTCTCCCGCAACTCTACACATGAGATGTACTGGGTCTCTGGAGCGAAAAGCAACACCATAAAAAGTGTGTCCACCACGAGCCAGCTCCTCTTGGGGCGCATGGACGGGCCCAGGAGGCCAGTGAAATATGAGGAGGATGTGAATCTCGGCTCTGGCACGCGGGCTGTGGTAAGCTGCGCTGAAGCTCCCAACATGAAGATCATTGGTAACCGCATTGAAAGGATCCGCAGTGAGCACGCGGAAACGTGGTTCTTTGACGAGAACCACCCATATAGGACATGGGCTTACCATGGAAGCTATGAGGCCCCCACACAAGGGTCAGCGTCCTCTCTAATAAACGGGGTTGTCAGGCTCCTGTCAAAACCCTGGGATGTGGTGACTGGAGTCACAGGAATAGCCATGACCGACACCACACCGTATGGTCAGCAAAGAGTTTTCAAGGAAAAAGTGGACACTAGGGTGCCAGACCCCCAAGAAGGCACTCGTCAGGTTATGAGCATGGTCTCTTCCTGGTTGTGGAAAGAGCTAGGCAAACACAAACGGCCACGAGTCTGTACCAAAGAAGAGTTCATCAACAAGGTTCGTAGCAATGCAGCATTAGGGGCAATATTTGAAGAGGAAAAAGAGTGGAAGACTGCAGTGGAAGCTGTGAACGATCCAAGGTTCTGGGCTCTAGTGGACAAGGAAAGAGAGCACCACCTGAGAGGAGAGTGCCAGAGTTGTGTGTACAACATGATGGGAAAAAGAGAAAAGAAACAAGGGGAATTTGGAAAGGCCAAGGGCAGCCGCGCCATCTGGTATATGTGGCTAGGGGCTAGATTTCTAGAGTTCGAAGCCCTTGGATTCTTGAACGAGGATCACTGGATGGGGAGAGAGAACTCAGGAGGTGGTGTTGAAGGGCTGGGATTACAAAGACTCGGATATGTCCTAGAAGAGATGAGTCGCATACCAGGAGGAAGGATGTATGCAGATGACACTGCTGGCTGGGACACCCGCATCAGCAGGTTTGATCTGGAGAATGAAGCTCTAATCACCAACCAAATGGAGAAAGGGCACAGGGCCTTGGCATTGGCCATAATCAAGTACACATACCAAAACAAAGTGGTAAAGGTCCTTAGACCAGCTGAAAAAGGGAAGACAGTTATGGACATTATTTCGAGACAAGACCAAAGGGGGAGCGGACAAGTTGTCACTTACGCTCTTAACACATTTACCAACCTAGTGGTGCAACTCATTCGGAATATGGAGGCTGAGGAAGTTCTAGAGATGCAAGACTTGTGGCTGCTGCGGAGGTCAGAGAAAGTGACCAACTGGTTGCAGAGCAACGGATGGGATAGGCTCAAACGAATGGCAGTCAGTGGAGATGATTGCGTTGTGAAGCCAATTGATGATAGGTTTGCACATGCCCTCAGGTTCTTGAATGATATGGGAAAAGTTAGGAAGGACACACAAGAGTGGAAACCCTCAACTGGATGGGACAACTGGGAAGAAGTTCCGTTTTGCTCCCACCACTTCAACAAGCTCCATCTCAAGGACGGGAGGTCCATTGTGGTTCCCTGCCGCCACCAAGATGAACTGATTGGCCGGGCCCGCGTCTCTCCAGGGGCGGGATGGAGCATCCGGGAGACTGCTTGCCTAGCAAAATCATATGCGCAAATGTGGCAGCTCCTTTATTTCCACAGAAGGGACCTCCGACTGATGGCCAATGCCATTTGTTCATCTGTGCCAGTTGACTGGGTTCCAACTGGGAGAACTACCTGGTCAATCCATGGAAAGGGAGAATGGATGACCACTGAAGACATGCTTGTGGTGTGGAACAGAGTGTGGATTGAGGAGAACGACCACATGGAAGACAAGACCCCAGTTACGAAATGGACAGACATTCCCTATTTGGGAAAAAGGGAAGACTTGTGGTGTGGATCTCTCATAGGGCACAGACCGCGCACCACCTGGGCTGAGAACATT
AAAAACACAGTCAACATGGTGCGCAGGATCATAGGTGATGAAGAAAAGTACATGGACTACCTATCCACCCAAGTTCGCTACTTGGGTGAAGAAGGGTCTACACCTGGAGTGCTGTAAGCACCAATCTTAGTGTTGTCAGGCCTGCTAGTCAGCCACAGCTTGGGGAAAGCTGTGCAGCCTGTGACCCCCCCAGGAGAAGCTGGGAAACCAAGCCTATAGTCAGGCCGAGAACGCCATGGCACGGAAGAAGCCATGCTGCCTGTGAGCCCCTCAGAGGACACTGAGTCAAAAAACCCCACGCGCTTGGAGGCGCAGGATGGGAAAAGAAGGTGGCGACCTTCCCCACCCTTCAATCTGGGGCCTGAACTGGAGATCAGCTGTGGATCTCCAGAAGAGGGACTAGTGGTTAGAGGAGACCCCCCGGAAAACGCAAAACAGCATATTGACGCTGGGAAAGACCAGAGACTCCATGAGTTTCCACCACGCTGGCCGCCAGGCACAGATCGCCGAATAGCGGCGGCCGGTGTGGGG
配列番号73
AHZ13508.1,ポリネシアでの爆発的感染由来ジカウイルスポリプロテイン(H/PF/2013)
MKNPKKKSGGFRIVNMLKRGVARVSPFGGLKRLPAGLLLGHGPIRMVLAILAFLRFTAIKPSLGLINRWGSVGKKEAMEIIKKFKKDLAAMLRIINARKEKKRRGADTSVGIVGLLLTTAMAAEVTRRGSAYYMYLDRNDAGEAISFPTTLGMNKCYIQIMDLGHMCDATMSYECPMLDEGVEPDDVDCWCNTTSTWVVYGTCHHKKGEARRSRRAVTLPSHSTRKLQTRSQTWLESREYTKHLIRVENWIFRNPGFALAAAAIAWLLGSSTSQKVIYLVMILLIAPAYSIRCIGVSNRDFVEGMSGGTWVDVVLEHGGCVTVMAQDKPTVDIELVTTTVSNMAEVRSYCYEASISDMASDSRCPTQGEAYLDKQSDTQYVCKRTLVDRGWGNGCGLFGKGSLVTCAKFACSKKMTGKSIQPENLEYRIMLSVHGSQHSGMIVNDTGHETDENRAKVEITPNSPRAEATLGGFGSLGLDCEPRTGLDFSDLYYLTMNNKHWLVHKEWFHDIPLPWHAGADTGTPHWNNKEALVEFKDAHAKRQTVVVLGSQEGAVHTALAGALEAEMDGAKGRLSSGHLKCRLKMDKLRLKGVSYSLCTAAFTFTKIPAETLHGTVTVEVQYAGTDGPCKVPAQMAVDMQTLTPVGRLITANPVITESTENSKMMLELDPPFGDSYIVIGVGEKKITHHWHRSGSTIGKAFEATVRGAKRMAVLGDTAWDFGSVGGALNSLGKGIHQIFGAAFKSLFGGMSWFSQILIGTLLMWLGLNTKNGSISLMCLALGGVLIFLSTAVSADVGCSVDFSKKETRCGTGVFVYNDVEAWRDRYKYHPDSPRRLAAAVKQAWEDGICGISSVSRMENIMWRSVEGELNAILEENGVQLTVVVGSVKNPMWRGPQRLPVPVNELPHGWKAWGKSYFVRAAKTNNSFVVDGDTLKECPLKHRAWNSFLVEDHGFGVFHTSVWLKVREDYSLECDPAVIGTAVKGKEAVHSDLGYWIESEKNDTWRLKRAHLIEMKTCEWPKSHTLWTDGIEESDLIIPKSLAGPLSHHNTREGYRTQMKGPWHSEELEIRFEECPGTKVHVEETCGTRGPSLRSTTASGRVIEEWCCRECTMPPLSFRAKDGCWYGMEIRPRKEPESNLVRSMVTAGSTDHMDHFSLGVLVILLMVQEGLKKRMTTKIIISTSMAVLVAMILGGFSMSDLAKLAILMGATFAEMNTGGDVAHLALIAAFKVRPALLVSFIFRANWTPRESMLLALASCLLQTAISALEGDLMVLINGFALAWLAIRAMVVPRTDNITLAILAALTPLARGTLLVAWRAGLATCGGFMLLSLKGKGSVKKNLPFVMALGLTAVRLVDPINVVGLLLLTRSGKRSWPPSEVLTAVGLICALAGGFAKADIEMAGPMAAVGLLIVSYVVSGKSVDMYIERAGDITWEKDAEVTGNSPRLDVALDESGDFSLVEDDGPPMREIILKVVLMTICGMNPIAIPFAAGAWYVYVKTGKRSGALWDVPAPKEVKKGETTDGVYRVMTRRLLGSTQVGVGVMQEGVFHTMWHVTKGSALRSGEGRLDPYWGDVKQDLVSYCGPWKLDAAWDGHSEVQLLAVPPGERARNIQTLPGIFKTKDGDIGAVALDYPAGTSGSPILDKCGRVIGLYGNGVVIKNGSYVSAITQGRREEETPVECFEPSMLKKKQLTVLDLHPGAGKTRRVLPEIVREAIKTRLRTVILAPTRVVAAEMEEALRGLPVRYMTTAVNVTHSGTEIVDLMCHATFTSRLLQPIRVPNYNLYIMDEAHFTDPSSIAARGYISTRVEMGEAAAIFMTATPPGTRDAFPDSNSPIMDTEVEVPERAWSSGFDWVTDHSGKTVWFVPSVRNGNEIAACLTKAGKRVIQLSRKTFETEFQKTKHQEWDFVVTTDISEMGANFKADRVIDSRRCLKPVILDGERVILAGPMPVTHASAAQRRGRIGRNPNKPGDEYLYGGGCAETDEDHAHWLEARMLLDNIYLQDGLIASLYRPEADKVAAIEGEFKLRTEQRKTFVELMKRGDLPVWLAYQVASAGITYTDRRWCFDGTTNNTIMEDSVPAEVWTRHGEKRVLKPRWMDARVCSDHAALKSFKEFAAGKRGAAFGVMEALGTLPGHMTERFQEAIDNLAVLMRAETGSRPYKAAAAQLPETLETIMLLGLLGTVSLGIFFVLMRNKGIGKMGFGMVTLGASAWLMWLSEIEPARIACVLIVVFLLLVVLIPEPEKQRSPQDNQMAIIIMVAVGLLGLITANELGWLERTKSDLSHLMGRREEGATIGFSMDIDLRPASAWAIYAALTTFITPAVQHAVTTSYNNYSLMAMATQAGVLFGMGKGMPFYAWDFGVPLLMIGCYSQLTPLTLIVAIILLVAHYMYLIPGLQAAAARAAQKRTAAGIMKNPVVDGIVVTDIDTMTIDPQVEKKMGQVLLIAVAVSSAILSRTAWGWGEAGALITAATSTLWEGSPNKYWNSSTATSLCNIFRGSYLAGASLIYTVTRNAGLVKRRGGGTGETLGEKWKARLNQMSALEFYSYKKSGITEVCREEARRALKDGVATGGHAVSRGSAKLRWLVERGYLQPYGKVIDLGCGRGGWSYYAATIRKVQEVKGYTKGGPGHEEPMLVQSYGWNIVRLKSGVDVFHMAAEPCDTLLCDIGESSSSPEVEEARTLRVLSMVGDWLEKRPGAFCIKVLCPYTSTMMETLERLQRRYGGGLVRVPLSRNSTHEMYWVSGAKSNTIKSVSTTSQLLLGRMDGPRRPVKYEEDVNLGSGTRAVVSCAEAPNMKIIGNRIERIRSEHAETWFFDENHPYRTWAYHGSYEAPTQGSASSLINGVVRLLSKPWDVVTGVTGIAMTDTTPYGQQRVFKEKVDTRVPDPQEGTRQVMSMVSSWLWKELGKHKRPRVCTKEEFINKVRSNAALGAIFEEEKEWKTAVEAVNDPRFWALVDKEREHHLRGECQSCVYNMMGKREKKQGEFGKAKGSRAIWYMWLGARFLEFEALGFLNEDHWMGRENSGGGVEGLGLQRLGYVLEEMSRIPGGRMYADDTAGWDTRISRFDLENEALITNQMEKGHRALALAIIKYTYQNKVVKVLRPAEKGKTVMDIISRQDQRGSGQVVTYALNTFTNLVVQLIRNMEAEEVLEMQDLWLLRRSEKVTNWLQSNGWDRLKRMAVSGDDCVVKPIDDRFAHALRFLNDMGKVRKDTQEWKPSTGWDNWEEVPFCSHHFNKLHLKDGRSIVVPCRHQDELIGRARVSPGAGWSIRETACLAKSYAQMWQLLYFHRRDLRLMANAICSSVPVDWVPTGRTTWSIHGKGEWMTTEDMLVVWNRVWIEENDHMEDKTPVTKWTDIPYLGKREDLWCGSLIGHRPRTTWAENIKNTVNMVRRIIGDEEKYMDYLSTQVRYLGEEGSTPGVL
配列番号74
9320_Zika_PF_1F
ttaggatccGTTGTTGATCTGTGTGAAT
配列番号75
9321_Zika_PF_1R
taactcgagCGTACACAACCCAAGTT
配列番号76
9322_Zika_PF_2F
ttaggatccTCACTAGACGTGGGAGTG
配列番号77
9323_Zika_PF_2R
taactcgagAAGCCATGTCYGATATTGAT
配列番号78
9324_Zika_PF_3F
ttaggatccGCATACAGCATCAGGTG
配列番号79
9325_Zika_PF_3R
taactcgagTGTGGAGTTCCGGTGTCT
配列番号80
9326_Zika_PF_4F
ttaggatccGAATAGAGCGAARGTTGAGATA
配列番号81
9327_Zika_PF_4R
taactcgAGTGGTGGGTGATCTTCTTCT
配列番号82
9328_Zika_PF_5F
ttaggatcCAGTCACAGTGGAGGTACAGTAC
配列番号83
9329_Zika_PF_5R
taactcgagCRCAGATACCATCTTCCC
配列番号84
9330_Zika_PF_6F
ttaggatCCCTTATGTGCTTGGCCTTAG
配列番号85
9331_Zika_PF_6R
taactcgagTCTTCAGCCTCCATGTG
配列番号86
9332_Zika_PF_7F
ttaggatccAATGCCCACTCAAACATAGA
配列番号87
9333_Zika_PF_7R
taactcgagTCATTCTCTTCTTCAGCCCTT
配列番号88
9334_Zika_PF_8F
ttaggatccAAGGGTGATCGAGGAAT
配列番号89
9335_Zika_PF_8R
taactcgagTTCCCTTCAGAGAGAGGAGC
配列番号90
9336_Zika_PF_9F
ttaggatccTCTTTTGCAAACTGCGATC
配列番号91
9337_Zika_PF_9R
taactcgagTCCAGCTGCAAAGGGTAT
配列番号92
9338_Zika_PF_10F
ttaggatccGTGTGGACATGTACATTGA
配列番号93
9339_Zika_PF_10R
taactcgagCCCATTGCCATAAAGTC
配列番号94
9340_Zika_PF_11F
ttaggatccTCATACTGTGGTCCATGGA
配列番号95
9341_Zika_PF_11R
taactcgagGCCCATCTCAACCCTTG
配列番号96
9342_Zika_PF_12F
ttaggatccTAGAGGGCTTCCAGTGC
配列番号97
9343_Zika_PF_12R
taactcgAGATACTCATCTCCAGGTTTGTTG
配列番号98
9344_Zika_PF_13F
ttaggatccGAAAACAAAACATCAAGAGTG
配列番号99
9345_Zika_PF_13R
taactcgagGAATCTCTCTGTCATGTGTCCT
配列番号100
9346_Zika_PF_14F
ttaggatccTTGATGGCACGACCAAC
配列番号101
9347_Zika_PF_14R
ttaggatccGTTGTTGATCTGTGTGAAT
配列番号102
9348_Zika_PF_15F
taactcgagCAGGTCAATGTCCATTG
配列番号103
9349_Zika_PF_15R
ttaggatccTGTTGTGTTCCTATTGCTGGT
配列番号104
9350_Zika_PF_16F
taactcgaGTGATCAGRGCCCCAGC
配列番号105
9351_Zika_PF_16R
ttaggatccTGCTGCCCAGAAGAGAA
配列番号106
9352_Zika_PF_17F
taactcgaGCACCAACAYGGGTTCTT
配列番号107
9353_Zika_PF_17R
ttaggatcCTCAAGGACGGTGTGGC
配列番号108
9354_Zika_PF_18F
taactcgagCAATGATCTTCATGTTGGG
配列番号109
9355_Zika_PF_18R
ttaggatccTATGGGGGAGGACTGGT
配列番号110
9356_Zika_PF_19F
taactcGAGCCCAGAACCTTGGATC
配列番号111
9357_Zika_PF_19R
ttaggatcCAGACCCCCAAGAAGGC
配列番号112
9358_Zika_PF_20F
taactcgagCCCCTTTGGTCTTGTCT
配列番号113
9359_Zika_PF_20R
ttaggatccAGGAAGGATGTATGCAGATG
配列番号114
9360_Zika_PF_21F
taactcgagACATTTGCGCATATGATTTTG
配列番号115
9361_Zika_PF_21R
ttaggatccAGGAAGGACACACAAGAGT
配列番号116
9362_Zika_PF_22F
taactcgagACAGGCTGCACAGCTTT
配列番号117
9363_Zika_PF_22R
ttaggatccTCTCTCATAGGGCACAGAC
実施例1:ヒトおよび動物のワクチンとしての適用に好適するジカ原薬の製造法
材料および方法:
ジカVの製造のために、JEVプロセスプラットフォーム(Srivastava et al.,Vaccine 19(2001)4557−4565;米国特許第6,309,650B1号)を基準として用いた。特定のプロセスステップの小さい変更をジカVの特性に適応させて、純度を改善した。プロセスステップの短い概要を下記に示す(図9AおよびBも参照されたい)。簡単に説明すると、ジカウイルスのための精製プロセスにおける硫酸プロタミン(PS)の予想外の、新しい精製特性を評価した。図10に示すように、非感染性ウイルス粒子凝集体、HCPおよびその他のLMW不純物は、SEC−HPLCの凝集体の肩部の除去により示されるようにPS沈殿により除去され、また、PS処理により感染性ウイルス力価の低下はなかった。ジカ精製プロトコルのさらなる最適化は、下記に提示される。
上流:
・ローラーボトルベースベロ細胞増殖(25x850cm2 CellBind処理)
・5%CO2、35℃、MEM+2mMのL−グルタミン+10%FBS
・0.01のMOIでジカVリサーチマスターシードバンク(rMSB)を用いて感染
・血清なしでウイルス産生
・5%CO2、35℃、MEM+2mMのL−グルタミン
・複数回採取(2、3、5および7日目)し、再フィードする
・ハーベストの無菌濾過および2〜8℃で次の処理まで貯蔵
下流:
・ハーベストのプールおよび限外濾過による濃縮(100kDa)
・必要に応じて(−80℃)で貯蔵するために、濃縮ハーベストの安定化(トリス/10%ショ糖)
・硫酸プロタミン(2mg/mL)によるhcDNAの除去
・ショ糖勾配精製(最適化3層勾配液)
・ホルムアルデヒド不活化(0.02%、22%、10日間)、メタ重亜硫酸Naによる中和
・DS抗原標的含量に希釈および水酸化アルミニウムと共に処方(0.5mg Al/mL)
ベロ細胞を、10%ウシ胎仔血清(FBS)を含むイーグル最小必須培地(EMEM)中で増殖させた。ローラーボトル培養液のベロ細胞単層を0.01の細胞当たりプラーク形成単位(pfu)の感染多重度(moi)でジカウイルス株H/PF/2013に感染させた。ウイルス吸着の2時間後、培養液をPBSで3回洗浄し、FBS不含EMEMを加え、5%CO2下、+35℃でインキュベートした。ウイルス力価が目的の水準に達するまで、感染ベロ細胞培養液をインキュベートした。
現在のJEV採取プロセスは、感染後の3、5、7および9日目に採取するように計画されている。JEVプロセスを模倣するために、ローラーボトルを、感染培地(2%FBS+2mMのL−グルタミンを含むMEM)中、0.01のMOIで2時間、ZIKVバンクP4−FBSに感染させた。接種材料を除去後、細胞をPBSで2回洗浄し、200mLの生産培地(MEM+2mMのL−グルタミン)を加えた。
特に断りのない限り、精製プロセスは室温(18〜22℃)で実施した。ウイルス精製を、濾過、混合したハーベストの、100kDaカットオフ値のTFF限外濾過モジュールを使って濃縮し、細胞培地成分を除去し、バッチ容積を減らすことから開始した。濃縮後、プールした濾過採取物質を最終濃度の25mMのトリスpH7.5および10%ショ糖(w/w)に、両成分のストック溶液を使って調節した(図11のPS処理の前の異なるハーベストのSEC−HPLCを参照)。これは、必要に応じて、濃縮ハーベストの−65℃未満での凍結を可能とした。
個々に30xに濃縮した2、3、5および7日目採取試料を、PS処理前(図11)およびPS処理後(図12)SEC−HPLCおよびプラークアッセイで分析した。SEC−HPLCを使って、ピーク面積として表される相対的合計ジカV含量(活性+不活性)を測定した。一方、相対的ジカVピーク純度は、合計ウイルスピークに対するウイルスモノマー集団の相対的含量として与えられる。プラークアッセイは、各試料中の合計活性ウイルス粒子含量を示す。実験結果は表4にまとめている。SEC−HPLCによるウイルスピーク回収は、12〜36%に過ぎず、PS処理後のピーク純度は、90%を超える範囲であった(ウイルスの凝集は検出されていない)。プラークアッセイによる活性ウイルス粒子の回収は、全て100%を超え(130〜700%、アッセイの変動範囲内)、PS処理中に活性ウイルス粒子は失われないことを示す。これらの結果は、PS処理中、非感染性(未成熟および/または凝集ウイルス)粒子のみが、除去されることを示す。
PS処理ハーベストを2つの部分に分割し、2つの遠心分離ボトルに加えた。ショ糖密度勾配遠心分離(SGC)をジカV物質の最終濃度および仕上げに使用した。ジカV PS処理濃縮ハーベストを異なる密度を有する3層のショ糖からなる溶液の上に加えた。3つのショ糖層は、線形ショ糖勾配の形成を示し、ChikV(図15D)で示されるように、ウイルス粒子の残留混入物からの分離を完全に行える予備的調査に基づいて選択した。最適ショ糖溶液量は、実験的に決定した。100mLボトル規模での遠心分離に対する個別層の体積を、表5に示す。
このステップでの重要なパラメーターは、最終ホルマリン濃度、温度、混合および新規容器への移送である。最大pfu/mL(プラークアッセイにより測定される)の予備的合格基準をホルムアルデヒド処理前の希釈プールに対し設定した。
A)残留PSの観点で、JEVと比較して、ジカV SGPプールの遥かに高い純度(残留PS<2μg/mL)。したがって、3倍希釈ジカV不活化試料は、<<1μg/mLの残留PSであった。市販のJEV SGPプールは、平均で約120μg/mL(152μg/mLまであり得る)を含んでいる。不活化溶液への平均希釈の約14倍により、約11μg/mlまでの残留PS含量となる。より高い量の残留PSにより、ホルマリンとの架橋/反応に起因して、ウイルス沈殿を生じるということであろう。
B)ジカV不活化試料は、約10%のショ糖を含む(約30〜35%のショ糖含有SGPプールの3倍希釈)。ショ糖が、ホルマリンによる処理の間、ウイルス性ジカV粒子の安定化効果を有する可能性がある。
マウス効力アッセイで使用するジカV原薬の調製のために、Ixiaroに比べて5倍多い抗原含量(合計ウイルス粒子またはSECピーク面積で表して)を目標とした。抗原含量の判定基準は、SEC−HPLCとした。簡単に説明すると、25℃、1ml/分のPBS+250mMのNaCl、pH7.4で平衡化したSuperose 6 10/300 Increase column(GE Healthcare)を使って、採取試料中のダウンストリームプロセス全体にわたるジカVを、214nmの検出波長で検出した。現在のJEVプロセスでは、NIV中の抗原含量は、特異的ELISAにより測定される。ELISAとSEC−HPLCとにより決定された抗原含量の間で良好な相関が観察された。平均的には、市販のNIV試料中の抗原含量は、約5.2mAUのJEVピーク面積に相当する33AU/mLの範囲である(図21参照)。
214nm検出波長でのジカV NIVの代表的SEC−HPLC溶出プロファイルを図16に示す。BSA(50μg/mL)を試料に加えて、非特異的表面吸着によるHPLCガラスバイアル中での損失を最小限にした。ジカVモノマー含有量を約98%、多量体含量を約2%と推定した。
濃縮ジカVハーベストプールのDNA除去法の直接比較を実施した。1つの一定分量をPSで処理し(2mg/mL、室温で15分)、もう一つの一定分量をベンゾナーゼで処理した(50U/mL、2mMのMgCl2、室温で4時間、2〜8℃で48時間)。両試料をこの報告書で記載のようにショ糖勾配によりさらに精製した。興味深いことに、ベンゾナーゼ処理試料は、処理ジカVハーベストのショ糖勾配遠心分離後、何ら純粋な画分を生成しなかった。特異的ウイルスバンドが検出された画分では、収集画分全体にわたり、多量の宿主細胞タンパク質が検出された。PS処理物質は、予測通り、純粋なジカV含有画分を生じた。この知見は、PSは、沈殿によるDNA除去に効果的であるのみならず、加えて、DNA(断片)とウイルス粒子との相互作用の妨害により勾配液中のウイルス粒子の回収を改善することを示唆し得る。ベンゾナーゼ処理は、DNAを除去せず、DNAの断片化を生ずるのみである。残留DNA断片は、さらにウイルス粒子および残留HCPと相互作用し、相互汚染およびショ糖勾配中で同時精製を生じる。また、プールしたSGP画分をSEC−HPLCにより分析した。大きなピークが検出されたが、SDS−PAGEは、この試料がHCPで大きく汚染されていることを確証した。大きなピークは、UV吸光度を変化させるHCPの大きなウイルス粒子の相互作用の可能性があるために、SEC−HPLC分析後、UV214および280nmで検出可能であろう。
マウスのワクチン接種
ワクチン接種の前に、10匹の6週齢雌CD1マウス群を顔面静脈経由で採血し、免疫前血清を調製した。1回の200μLの腹腔内ワクチン接種を投与した。漸減用量(IXIARO中のタンパク質量と等価の、12μg、3μg、1μg、0.33μg、0.11μg0.037μgおよび0.012μg)の不活化ジカウイルスを、0.7%の最終濃度水酸化アルミニウム(Al(OH)3)と共に処方した。ワクチン接種の3週後、血液を収集し、免疫血清を調製した。全ての動物実験をオーストリア法(BGB1 Nr.501/1989)に従って実施し、「Magistratsabteilung 58」により承認された。
12ウエルプレートをPRNTに使用した。各ウエルに、4x105ベロ細胞含有1mLの培地を播種し、5%CO2下、35℃で一晩インキュベートした。それぞれの投与群由来の加熱不活化血清のプールを3回繰り返して試験した。標的ウイルス(H/PF/2013(配列番号13)またはMR766(配列番号11))を100pfu/165μLに希釈した。等体積の標的ウイルスおよび血清希釈物を、5%CO2下、35℃で1時間インキュベートした。細胞培地をベロ細胞から吸引し、330μLの標的ウイルス/血清希釈物の混合物をそれぞれのウエルに加え、プレートを前後に5回震盪した後、5%CO2下、35℃で2時間インキュベートした。それぞれのウエルに、1mLのEMEMおよび栄養素含有2%メチルセルロース溶液を加え、その後、プレートを5%CO2下、35℃で5日間インキュベートした後、クリスタルバイオレット/5%ホルムアルデヒドで細胞を1時間染色し、その後、脱イオン水で3回洗浄した。プレートを空気乾燥させて、各ウエル中のプラークの数を手作業でカウントした。
37ng(IXIARO(登録商標)中のタンパク質量に等価な投与量)までの不活化ジカウイルスワクチン(H/PF/2013)で免疫したマウス由来の血清で、アジア系(H/PF/2013)およびアフリカ系(MR766)の両系統のジカウイルスに対する中和が観察された(それぞれ図19および図20)。110ng(IXIARO(登録商標)中のタンパク質の量に等価な投与量)までのワクチン接種投与量を有する1:20血清希釈で、完全抑制が認められた。アジア系(H/PF/2013)およびアフリカ系(MR766)の両系統のジカウイルスの中和は、等価であり、これは、不活化ジカウイルスワクチン(H/PF/2013)の異なるジカウイルス株間で高い交差中和を示す。
不活化JEVワクチンIXIARO(登録商標)の製造のための既存の製造プラットフォームを、不活化ジカVワクチン候補(アジア系株H/PF/2013)の製造の実現性調査のためのベースとして用いた。ローラーボトル中で培養したベロ細胞上でウイルスを産生した。ウイルスをPS処理とそれに続く最適化ショ糖勾配により精製した。不活化をホルマリン処理(0.02%、22℃で10日間)により実施した。マウスでの予備的なワクチン接種調査のために、市販のJEVワクチンであるIXIARO(登録商標)に比べて、推定5倍大きいウイルス粒子含量を有するミョウバン配合DPを調製した。DSの不純物プロファイルは、市販JEVワクチンのIXIARO(登録商標)の規格値として定義の全ての基準に適合した。アジア系(H/PF/2013)およびアフリカ系(MR766)の両系統のジカウイルスの中和は、等価であり、これは、不活化ジカウイルスワクチン(H/PF/2013)の異なるジカウイルス株間で高い交差中和を示す。
A1.不活化ジカウイルス粒子を含むジカウイルスワクチンであって、ジカウイルス粒子がジカウイルスワクチンを投与された対象を、少なくとも70%の確率で抗体陽転させることができるワクチン。
A2.A1に記載のジカウイルスワクチンであって、ジカウイルス粒子がジカウイルスワクチンを投与された対象を、少なくとも80%、85%、90%、または95%の確率で抗体陽転させることができるワクチン。
A3.A1またはA2のワクチンであって、ジカウイルス粒子が、配列番号2〜13または72の内のいずれか1つの核酸配列で示されるDNA配列に対応するRNAゲノムを有するか、または配列番号2〜13または72の内のいずれか1つに少なくとも88%同一であり、毒性ジカウイルスをパックできるバリアント核酸配列を有するワクチン。
A4.A1〜A3のいずれか1項に記載のワクチンであって、ジカウイルス粒子が、配列番号14〜69の内のいずれか1つで示されるアミノ酸配列または配列番号14〜69の内のいずれか1つに少なくとも95%同一であり、毒性ジカウイルスをパックできるバリアントアミノ酸配列から選択されるEタンパク質を有するワクチン。
A5.A1〜A4のいずれか1項に記載のワクチンであって、ジカウイルスが、化学的不活化、熱失活、pH不活化、またはUV不活化により不活化されるワクチン。
A6.A5に記載のワクチンであって、化学的不活化が、ジカウイルスを化学的不活化剤と接触させて、プラークアッセイによる測定で、ジカウイルスを完全に不活化することを含むワクチン。
A7.A6に記載のワクチンであって、化学的不活化が、ジカウイルスをホルムアルデヒドと接触させることを含むワクチン。
A8.A7に記載のワクチンであって、ホルムアルデヒド不活化が、ジカウイルスとホルムアルデヒドとを、2〜10日間接触させることを含むワクチン。
A9.A5〜A8のいずれか1項に記載のワクチンであって、化学的活性化が、約+4℃または約+22℃で実施されるワクチン。
A10.A1〜A9のいずれか1項に記載のワクチンであって、さらにアジュバントを含むワクチン。
A11.A10に記載のワクチンであって、アジュバントがアルミニウム塩のアジュバントであるワクチン。
A12.A11に記載のワクチンであって、アルミニウム塩のアジュバントが水酸化アルミニウムまたはリン酸アルミニウム塩であるワクチン。
A13.A10〜A12のいずれか1項に記載のワクチンであって、ペプチドおよびデオキシイノシン含有免疫賦活性オリゴデオキシ核酸分子(I−ODN)を含むアジュバントを含むまたはさらに含むワクチン。
A14.A13に記載のワクチンであって、ペプチドが配列KLKL5KLK(配列番号71)を含み、I−ODNがオリゴ−d(IC)13(配列番号70)を含むワクチン。
A15.A1〜A14のいずれか1項に記載のワクチンであって、1種または複数種の薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含むワクチン。
A16.A1〜A15のいずれか1項に記載のワクチンであって、HPLCにより検出するには少なすぎる量、すなわち、1μg/ml未満、特に100ng/ml未満の量の、硫酸プロタミンまたはPSの断片または分解生成物を含むワクチン。
A17.A16に記載のワクチンであって、前記硫酸プロタミンまたはPSの断片または分解生成物が、質量分析または別の高感度法により検出できるワクチン。
B2.B1に記載のキットであって、第2のワクチンをさらに含むキット。
B3.B2に記載のキットであって、第2のワクチンが、ウエストナイルウイルスワクチン、日本脳炎ウイルスワクチン、黄熱病ウイルスワクチン、デング熱ウイルスワクチンまたはチクングニアウイルスワクチンであるキット。
C2.C1に記載の方法であって、第2の投与量の治療有効量のジカウイルスワクチンを投与することをさらに含む方法。
C3.C1またはC2に記載の方法であって、第2の投与量のジカウイルスワクチンが第1の投与量のジカウイルスワクチンの約7日後に投与される方法。
C4.C1またはC2に記載の方法であって、第2の投与量のジカウイルスワクチンが第1の投与量のジカウイルスワクチンの約14日後に投与される方法。
C5.C1またはC2に記載の方法であって、第2の投与量のジカウイルスワクチンが第1の投与量のジカウイルスワクチンの約28日後に投与される方法。
C6.C1〜C5のいずれか1項に記載の方法であって、投与が、ジカウイルス中和抗体の産生をもたらす方法。
(i)ベロ細胞上のジカウイルスを継代培養し、それにより、ジカウイルスを含む培養上清を生成すること;
(ii)(i)の培地を採取すること;
(iii)(ii)の採取培地を沈殿させて、それにより、ジカウイルス上清を生成すること;および
(iv)(iii)のジカウイルス上清中のジカウイルスを至適に不活化して、それにより、不活化ジカウイルスを生成すること、を含む方法。
D2.D1に記載の方法であって、ステップ(iii)の前に、(ii)の培地を濃縮することをさらに含む方法。
D3.D1またはD2に記載の方法であって、(iii)の沈殿生成が、(ii)の培地を硫酸プロタミンまたは安息香酸プロタミンと接触させることを含む方法。
D4.D1〜D3のいずれか1項に記載の方法であって、(v)(iv)の不活化ジカウイルスを透析し、それにより、透析ジカウイルスを生成することをさらに含む方法。
D5.D4の方法であって、(vi)(v)の透析ジカウイルスを濾過することをさらに含む方法。
D6.D1〜D5のいずれか1項に記載の方法であって、不活化が、化学的不活化、熱失活、pH不活化、またはUV不活化による方法。
D7.D6に記載の方法であって、化学的不活化が、ジカウイルスを化学的不活化剤と少なくとも4日間接触させることを含む方法。
D8.D6またはD7に記載の方法であって、化学的不活化剤が、ホルムアルデヒドを含む方法。
D9.D6〜D8のいずれか1項に記載の方法であって、化学活性化が、約+4℃または約+22℃で実施される方法。
D10.D8またはD9に記載の方法であって、ホルムアルデヒドを中和することをさらに含む方法。
D11.D10に記載の方法であって、中和がメタ重亜硫酸ナトリウムで実施される方法。
E2.E1に記載の使用であって、不活化ジカウイルスワクチンが第1の投与量の治療有効量でそれを必要としている対象に投与される使用。
E3.E2に記載の使用であって、不活化ジカウイルスワクチンが第2の投与量の治療有効量で対象に投与される使用。
E4.E3に記載の使用であって、第2の投与量の不活化ジカウイルスワクチンが第1の投与量のジカウイルスワクチンの約7日後に投与される使用。
E5.E3に記載の使用であって、第2の投与量のジカウイルスワクチンが第1の投与量のジカウイルスワクチンの約14日後に投与される使用。
E6.E3に記載の使用であって、第2の投与量のジカウイルスワクチンが第1の投与量のジカウイルスワクチンの約28日後に投与される使用。
E7.E1〜E6のいずれか1項に記載の使用であって、ワクチン投与が、ジカウイルス中和抗体の産生をもたらす使用。
F2.F1に記載の医薬組成物であって、不活化ジカウイルスワクチンが第1の投与量の治療有効量でそれを必要としている対象に投与される医薬組成物。
F3.F2に記載の使用であって、不活化ジカウイルスワクチンが第2の投与量の治療有効量で対象に投与される使用。
F4.F3に記載の使用であって、第2の投与量の不活化ジカウイルスワクチンが第1の投与量のジカウイルスワクチンの約7日後に投与される使用。
F5.F3に記載の使用であって、第2の投与量のジカウイルスワクチンが第1の投与量のジカウイルスワクチンの約14日後に投与される使用。
F6.F3に記載の使用であって、第2の投与量のジカウイルスワクチンが第1の投与量のジカウイルスワクチンの約28日後に投与される使用。
F7.F1〜F6のいずれか1項に記載の使用であって、ワクチン投与が、ジカウイルス中和抗体の産生をもたらす使用。
G2.G1に記載の使用であって、前記最適化ショ糖勾配遠心分離が、10%±1%(w/w)ショ糖溶液中のウイルス含有画分、および3つのさらなる層の異なる密度を有するショ糖溶液、すなわち、15%±1%(w/w)ショ糖を含む第1のショ糖溶液、35%±1%(w/w)ショ糖を含む第2のショ糖溶液、および50%±1%(w/w)ショ糖を含む第3のショ糖溶液を含む使用。
G3.感染性ジカウイルス粒子の精製プロセスであって、
a)ウイルス粒子および不純物を含む粗ハーベスト(a)を用意するステップであって、不純物が細胞基材上の前記ウイルス粒子の増殖から生成するステップ;
b)プロタミン、好ましくはプロタミン塩、より好ましくは硫酸プロタミン、さらにより好ましくは組換え硫酸プロタミンを含む試薬を用いて沈殿させることにより、粗ハーベスト(a)から不純物を低減させて、ウイルス調製物(b)を得るステップ;
c)最適化されるショ糖密度勾配遠心分離によりウイルス調製物(b)をさらに精製するステップであって、最適化ショ糖勾配が、プロタミンがウイルス画分から完全にまたはほぼ完全に分離されるように用意され、プロタミン濃度が、このステップによって、最終原薬中のプロタミン濃度が1μg/mL未満、好ましくは0.5μg/mL未満、より好ましくは0.1μg/mL未満、最も好ましくは0.05μg/mL未満となる程度まで低減されるステップ、を含むプロセス。
G4.G3に記載のプロセスであって、前記最適化ショ糖密度勾配遠心分離が、10%±1%(w/w)ショ糖溶液中のウイルス含有画分、および3つの層の異なる密度を有するショ糖、すなわち、15%±1%(w/w)ショ糖を含む第1のショ糖溶液、35%±1%(w/w)ショ糖を含む第2のショ糖溶液、および50%±1%(w/w)ショ糖を含む第3のショ糖溶液を含むプロセス。
G5.G3〜G4のいずれか1項に記載のプロセスであって、
(d)リガンド活性化コアおよび細孔を含む不活性シェルを含む固相マトリックスをカラム中に充填し、細孔の分画分子量によりウイルス粒子がリガンド活性化コア中に入るのが排除され、細孔の分画分子量より小さい分子がリガンド活性化コア中に入ることができ、その結果、ウイルス粒子が収集される精製ステップを追加して含むプロセス。
G6.G3〜G5のいずれか1項に記載のプロセスであって、ジカウイルス調製物(c)の残留宿主細胞DNA含量が、10ng/mL未満であり、最終ウイルス調製物(c)の残留宿主細胞タンパク質含量が100ng/mL未満であるプロセス。
G7.G3〜G6のいずれか1項に記載のステップであって、ジカウイルス粒子および不純物を含む前記粗ハーベスト(a)が、ステップ(b)の前に、1つまたは複数の予備精製ステップに供されるプロセス。
G8.G7に記載のプロセスであって、1つまたは複数の予備精製ステップが、
a)細孔径が0.2μm以下のフィルターを使った濾過;および/または
b)酵素処理による宿主細胞ゲノムDNAの消化;および/または
c)細孔径が300kDa以上、好ましくは100kDa以上の細孔径を有する中空繊維膜を用いた限外濾過/透析濾過、を含むプロセス。
G9.G3〜G8のいずれか1項に記載のプロセスであって、硫酸プロタミンの濃度が、0.5〜3mg/ml、より好ましくは1〜2mg/ml、より好ましくは1.2〜1.8mg/ml、より好ましくは1.4〜1.6mg/ml、最も好ましくは1.6mg/mlまたは2mg/mlであるプロセス。
G10.G3〜G9のいずれか1項に記載のプロセスであって、ウイルス調製物(c)中の、またはいずれかの最終ウイルス調製物中の感染性ジカウイルス粒子の濃縮が、粗ハーベスト(a)中の合計ウイルス生成物に対して、少なくとも50%〜95%の範囲、好ましくは少なくとも80%であるプロセス。
G11.G7〜G10のいずれか1項に記載のプロセスであって、G8〜G11のいずれか1項のステップ(b)の前の1つまたは複数の予備精製ステップが、1μm以下、好ましくは0.2μmの細孔径を有するフィルターを使って実施されるプロセス。
G12.G3〜G11のいずれか1項に記載のプロセスであって、ジカウイルス調製物(c)の残留不純物が、10%未満であるプロセス。
G13.G3〜G12のいずれか1項に記載のプロセスであって、ジカウイルスが、EB66細胞株、ベロ細胞株、ベロ−αHis細胞株、ヒーラ細胞株、ヒーラ−S3細胞株、293細胞株、PC12細胞株、CHO細胞株、3T3細胞株、PerC6細胞株、MDSK細胞株、ニワトリ胎仔線維芽細胞株、アヒル細胞株、および二倍体鳥類細胞株、からなる群より選択される細胞株中で増殖するプロセス。
G14.G13に記載のプロセスであって、前記細胞株が、ベロ細胞株であるプロセス。
G15.G3〜G14のいずれか1項に記載のプロセスであって、前記感染性ジカウイルス粒子が、生ウイルス、生減弱ウイルス、キメラウイルス、改変生ウイルスまたは組換え生ウイルスである感染性ウイルス粒子であるプロセス。
G16.G3〜G15のいずれか1項に記載のプロセスであって、前記ジカウイルスが、好ましくはアジア系統の株であるプロセス。
G17.G3〜G16のいずれか1項に記載のプロセスであって、最終ウイルス調製物(c)または(d)を生じる前記プロセスが、不活化ステップの前に行われ、ウイルスが好ましくはホルムアルデヒドにより不活化されるプロセス。
G18.ウイルス感染に対する免疫化のための組成物の製造のためのG3〜G17のいずれか1項に記載のプロセスの使用。
G19.G18に記載の使用であって、前記ウイルス感染がジカウイルスに起因する感染である使用。
(a)ジカウイルス粒子および不純物を含む粗ハーベスト(a)を用意するステップであって、不純物が細胞基材上の前記ウイルス粒子の増殖から生成するステップ;
(b)プロタミン、好ましくはプロタミン塩、より好ましくは硫酸プロタミン、さらにより好ましくは組換え硫酸プロタミンを含む試薬を用いて沈殿させることにより、粗ハーベスト(a)から不純物を低減させて、ウイルス調製物(b)を得るステップ;
(c)最適化されるショ糖密度勾配遠心分離によりウイルス調製物(b)をさらに精製するステップであって、最適化ショ糖勾配が、プロタミンがウイルス画分から完全にまたはほぼ完全に分離されるように用意され、プロタミン濃度が、このステップによって、最終原薬中のプロタミン濃度が1μg/mL未満、好ましくは0.5μg/mL未満、より好ましくは0.1μg/mL未満、最も好ましくは0.05μg/mL未満となる程度まで低減されるステップ、を含むプロセス。
Q2.Q2に記載のプロセスであって、ウイルス粒子がジカウイルス由来であるプロセス。
Q3.Q1またはQ2に記載のプロセスであって、
(d)リガンド活性化コアおよび細孔を含む不活性シェルを含む固相マトリックスをカラム中に充填し、細孔の分画分子量によりウイルス粒子がリガンド活性化コア中に入るのが排除され、細孔の分画分子量より小さい分子がリガンド活性化コア中に入ることができ、その結果、ウイルス粒子が収集されるステップをさらに含むプロセス。
Q4.Q1〜Q3のいずれか1項に記載のプロセスであって、ウイルス調製物(c)の残留宿主細胞DNAが、10ng/mL未満であり、最終ウイルス調製物(c)の残留宿主細胞タンパク質が100ng/mL未満であるプロセス。
Q5.Q1〜Q4のいずれか1項に記載のプロセスであって、ウイルス粒子および不純物を含む粗ハーベスト(a)が、ステップ(b)の前に、1つまたは複数の予備精製ステップに供されるプロセス。
Q6.Q5に記載のプロセスであって、1つまたは複数の予備精製ステップが、
(a)細孔径が0.2μm以下のフィルターを使った濾過;および/または
(b)酵素処理による宿主細胞ゲノムDNAの消化;および/または
(c)細孔径が300kDa以上、好ましくは100kDa以上の細孔径を有する中空繊維膜を用いた限外濾過/透析濾過、を含むプロセス。
Q7.Q1〜Q6のいずれか1項に記載のプロセスであって、硫酸プロタミンの濃度が、0.5〜3mg/ml、より好ましくは1〜2mg/ml、より好ましくは1.2〜1.8mg/ml、より好ましくは1.4〜1.6mg/ml、最も好ましくは1.6mg/mlまたは2mg/mlであるプロセス。
Q8.Q1〜Q7のいずれか1項に記載のプロセスであって、ウイルス調製物(c)中の、またはいずれかの最終ウイルス調製物中の感染性ウイルス粒子の濃縮が、粗ハーベスト(a)中の合計ウイルス生成物に対して、少なくとも50%〜95%の範囲、好ましくは少なくとも80%であるプロセス。
Q9.Q5〜Q8のいずれか1項に記載のプロセスであって、Q5〜Q8のいずれか1項のステップ(b)の前の1つまたは複数の予備精製ステップが、1μm以下、好ましくは0.2μmの細孔径を有するフィルターを使って実施されるプロセス。
Q10.Q1〜Q9のいずれか1項に記載のプロセスであって、ウイルス調製物(c)の残留不純物が、10%未満であるプロセス。
Q11.Q1〜Q10のいずれか1項に記載のプロセスであって、ウイルスが、EB66細胞株、ベロ細胞株、ベロ−αHis細胞株、ヒーラ細胞株、ヒーラ−S3細胞株、293細胞株、PC12細胞株、CHO細胞株、3T3細胞株、PerC6細胞株、MDSK細胞株、ニワトリ胎仔線維芽細胞株、アヒル細胞株、および二倍体鳥類細胞株、からなる群より選択される細胞株中で増殖するプロセス。
Q12.Q11に記載のプロセスであって、前記細胞株が、ベロ細胞株であるプロセス。
Q13.Q1〜Q12のいずれか1項に記載のプロセスであって、感染性ウイルス粒子が、生ウイルス、減弱生ウイルス、キメラウイルス、改変生ウイルスまたは組換え生ウイルスである感染性ジカウイルス粒子であるプロセス。
Q14.Q1〜Q13のいずれか1項に記載のプロセスであって、ジカウイルスが、アジア系統の株またはその免疫原性バリアントであるプロセス。
Q15.Q1〜Q14のいずれか1項に記載のプロセスであって、最終ウイルス調製物(c)または(d)を生じる前記プロセスが、不活化ステップの前に行われ、ウイルスが好ましくはホルムアルデヒドにより不活化されるプロセス。
Q16.ウイルス感染に対する免疫化のための組成物の製造のためのQ1〜Q15のいずれか1項に記載のプロセスの使用。
Q17.Q16に記載の使用であって、ウイルス感染に対する免疫化のための組成物が、ジカウイルスに起因する感染である使用。
Q18.Q1〜Q17のいずれか1項に記載のプロセスにより得ることができるまたは得られたウイルス粒子を含む、例えば、ジカウイルス感染などの感染を処置および/または予防するための組成物。
Q19.ベロ細胞上で増殖した不活化ジカウイルス粒子を含むウイルスワクチンであって、ジカウイルス粒子がジカウイルスワクチンを投与された対象を、少なくとも70%の確率で抗体陽転させることができ、少量の、好ましくは検出限界以下の硫酸プロタミンを含むワクチン。
Q20.Q19に記載のジカウイルスワクチンであって、ジカウイルス粒子がジカウイルスワクチンを投与された対象を、少なくとも80%、85%、90%、または95%の確率、好ましくは80%の確率で抗体陽転させることができるワクチン。
Q21.Q19またはQ20のワクチンであって、ジカウイルス粒子が、配列番号2〜13の内のいずれか1つの核酸配列で示されるDNA配列に対応するRNAゲノムを有するか、または配列番号2〜13の内のいずれか1つに少なくとも88%同一であり、毒性ジカウイルスをパックできるバリアント核酸配列を有するワクチン。
Q22.Q19、Q20およびQ21のいずれか1項に記載のワクチンであって、ジカウイルスが、配列番号14〜69または72の内のいずれか1つで示されるアミノ酸配列または配列番号14〜69または72の内のいずれか1つに少なくとも95%同一であり、毒性ジカウイルスをパックできるバリアントアミノ酸配列から選択されるEタンパク質を有するワクチン。
Q23.Q19、Q20〜Q22のいずれか1項に記載のワクチンであって、ベロ細胞上で培養することにより得られたジカウイルスが、硫酸プロタミン沈殿およびショ糖勾配遠心分離により精製されるワクチン。
Q24.Q23に記載のワクチンであって、ショ糖勾配遠心分離が最適化ショ糖勾配遠心分離であるワクチン。
Q25.Q24に記載のワクチンであって、前記最適化ショ糖勾配遠心分離が、10%(w/w)ショ糖溶液中のウイルス含有画分、および3つの層の異なる密度を有するショ糖、すなわち、15%(w/w)ショ糖溶液を含む第1のショ糖溶液、35%±1%(w/w)ショ糖溶液を含む第2のショ糖溶液、および50%(w/w)ショ糖溶液を含む第3のショ糖溶液を含むワクチン。
Q26.Q19、Q20〜Q25のいずれか1項に記載のワクチンであって、ジカウイルスが、化学的不活化、熱失活、pH不活化、またはUV不活化により不活化されるワクチン。
Q27.Q26に記載のワクチンであって、化学的不活化が、プラークアッセイにより測定して、ジカウイルスを完全に不活化するのに必要であるよりも長い時間、ジカウイルスを化学的不活化剤と接触させることを含むワクチン。
Q28.Q27に記載のワクチンであって、化学的不活化が、ジカウイルスをホルムアルデヒドと接触させることを含むワクチン。
Q29.Q28に記載のワクチンであって、ホルムアルデヒド不活化が、ジカウイルスとホルムアルデヒドとを、2〜10日間接触させることを含むワクチン。
Q30.Q27〜Q29のいずれか1項に記載のワクチンであって、化学的活性化が、約+4℃または約+22℃で実施されるワクチン。
Q31.Q19〜Q30のいずれか1項に記載のワクチンであって、さらにアジュバントを含むワクチン。
Q32.Q31に記載のワクチンであって、アジュバントがアルミニウム塩のアジュバントであるワクチン。
Q33.Q32に記載のワクチンであって、アルミニウム塩のアジュバントが水酸化アルミニウムまたはリン酸アルミニウム塩であるワクチン。
Q34.Q32に記載のワクチンであって、アルミニウム塩のアジュバントが、ジカウイルス、好ましくは不活化ジカウイルスを含む最終医薬組成物を基準にして、1.25ppb未満のCuを含む水酸化アルミニウムであるワクチン。
Q35.Q19〜Q34のいずれか1項に記載のワクチンであって、1種または複数種の薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含むワクチン。
R2.感染性ジカウイルス粒子の精製プロセスであって、
(a)ジカウイルス粒子および不純物を含む粗ハーベスト(a)を用意するステップであって、不純物が細胞基材上の前記ウイルス粒子の増殖から生成するステップ;
(b)プロタミン、好ましくはプロタミン塩、より好ましくは硫酸プロタミン、さらにより好ましくは組換え硫酸プロタミンを含む試薬を用いて沈殿させることにより、粗ハーベスト(a)から不純物を低減させて、ウイルス調製物(b)を得るステップであって、ウイルス調製物(b)中の感染性ウイルス粒子の濃縮が、粗ハーベスト(a)中の合計ウイルス生成物を基準にして、少なくとも50%〜95%の範囲、好ましくは少なくとも80%であるステップを含むプロセス。
R3.R1に記載の使用またはR2に記載のプロセスであって、ウイルス粒子がジカウイルス由来である使用またはプロセス。
R4.感染性ジカウイルス粒子の精製プロセスであって、
(a)ジカウイルス粒子および不純物を含む粗ハーベスト(a)を用意するステップであって、不純物が細胞基材上の前記ウイルス粒子の増殖から生成するステップ;
(b)プロタミン、好ましくはプロタミン塩、より好ましくは硫酸プロタミン、さらにより好ましくは組換え硫酸プロタミンを含む試薬を用いて沈殿させることにより、粗ハーベスト(a)から不純物を低減させて、ウイルス調製物(b)を得るステップ;
(c)(i)ショ糖密度勾配遠心分離、(ii)カラム中に充填されたリガンド活性化コアおよび細孔を含む不活性シェルを含む固相マトリックスであって、細孔の分画分子量によりウイルス粒子がリガンド活性化コア中に入るのが排除され、細孔の分画分子量より小さい分子がリガンド活性化コア中に入ることができ、その結果、ウイルス粒子が収集される固相マトリックス、および/または(iii)感染性ウイルス粒子を含むウイルス調製物(c)を得るためのサイズ排除クロマトグラフィーであって、ウイルス調製物(c)の残留宿主細胞DNAが100ng/mL未満であり、残留宿主細胞タンパク質および最終ウイルス調製物(c)の残留感染性ウイルス粒子凝集体が1μg/mL未満であるサイズ排除クロマトグラフィーなどの1種または複数のサイズ排除方法により、ウイルス調製物(b)をさらに精製するステップ、を含むプロセス。
R5.R4に記載のプロセスであって、ウイルス調製物(c)の残留宿主細胞DNAが、10ng/mL未満であり、最終ウイルス調製物(c)の残留宿主細胞タンパク質が100ng/mL未満であるプロセス。
R6.R2〜R5のいずれか1項に記載のプロセスであって、ウイルス粒子および不純物を含む粗ハーベスト(a)が、ステップ(b)の前に、1つまたは複数の予備精製ステップに供されるプロセス。
R7.R6に記載のプロセスであって、1つまたは複数の予備精製ステップが、
(a)細孔径が0.2μm以下のフィルターを使った濾過;および/または
(b)酵素処理による宿主細胞ゲノムDNAの消化;および/または
(c)細孔径が300kDa以上、好ましくは100kDa以上の細孔径を有する中空繊維膜を用いた限外濾過/透析濾過、を含むプロセス。
R8.R2〜R7のいずれか1項に記載のプロセスであって、硫酸プロタミンの濃度が、0.5〜3mg/ml、より好ましくは1〜2mg/ml、より好ましくは1.2〜1.8mg/ml、より好ましくは1.4〜1.6mg/ml、最も好ましくは1.6mg/mlであるプロセス。
R9.R2〜R8のいずれか1項に記載のプロセスであって、ウイルス調製物(c)中の、またはいずれかの最終ウイルス調製物中の感染性ウイルス粒子の濃縮が、粗ハーベスト(a)中の合計ウイルス生成物に対して、少なくとも50%〜95%の範囲、好ましくは少なくとも80%であるプロセス。
R10.R6〜R9のいずれか1項に記載のプロセスであって、R6〜R9のいずれか1項のステップ(b)の前の1つまたは複数の予備精製ステップが、1μm以下、好ましくは0.2μmの細孔径を有するフィルターを使って実施されるプロセス。
R11.R2〜R10のいずれか1項に記載のプロセスであって、ウイルス調製物(c)の残留不純物が、10%未満であるプロセス。
R12.R2〜R11のいずれか1項に記載のプロセスであって、ウイルスが、EB66細胞株、ベロ細胞株、ベロ−αHis細胞株、ヒーラ細胞株、ヒーラ−S3細胞株、293細胞株、PC12細胞株、CHO細胞株、3T3細胞株、PerC6細胞株、MDSK細胞株、ニワトリ胎仔線維芽細胞株、アヒル細胞株、および二倍体鳥類細胞株、からなる群より選択される細胞株中で増殖するプロセス。
R13.R12に記載のプロセスであって、前記細胞株が、ベロ細胞株であるプロセス。
R14.R2〜R13のいずれか1項に記載のプロセスであって、ジカウイルスが、生ウイルス、減弱生ウイルス、キメラウイルス、改変生ウイルスまたは組換え生ウイルスであるプロセス。
R15.R2〜R14のいずれか1項に記載のプロセスであって、ジカウイルスが、アジア系統の株またはその免疫原性バリアントであるプロセス。
R16.R2〜R15のいずれか1項に記載のプロセスであって、最終ウイルス調製物(c)を生じる前記プロセスが、不活化ステップの前に行われ、ウイルスが好ましくはホルムアルデヒドにより不活化されるプロセス。
R17.ウイルス感染に対する免疫化のための組成物の製造のためのR1〜R16のいずれか1項に記載のプロセスの使用。
R18.R17に記載の使用であって、ウイルス感染に対する免疫化のための組成物が、ジカウイルスに起因する感染である使用。
R19.R2〜R16のいずれか1項に記載のプロセスにより得ることができるまたは得られたウイルス粒子を含む、感染を処置および/または予防するための組成物。
本件出願は、以下の構成の発明を提供する。
(構成1)
不活化ジカウイルス粒子を含むウイルスワクチンであって、前記ジカウイルス粒子が、前記ジカウイルスワクチンを投与されている対象の少なくとも70%に有効防御免疫状態を付与できる、ジカウイルスワクチン。
(構成2)
前記ジカウイルス粒子が、前記ジカウイルスワクチンを投与されているワクチン接種した対象の少なくとも75%、80%、90%、95%、96%、97%、98%、または少なくとも99%に、好ましくは少なくとも対象の80%に有効防御免疫状態を付与できる、構成1に記載のジカウイルス。
(構成3)
前記ジカウイルス粒子が、配列番号2〜13または72の内のいずれか1つの核酸配列で示されるDNA配列に対応するRNAゲノムを有するか、または配列番号2〜13または72の内のいずれか1つに少なくとも88%同一であり、毒性ジカウイルスをパックできるバリアント核酸配列を有する、構成1または2に記載のワクチン。
(構成4)
前記ジカウイルス粒子が、配列番号14〜69の内のいずれか1つで示されるアミノ酸配列または配列番号14〜69の内のいずれか1つに少なくとも95%同一であり、毒性ジカウイルスをパックできるバリアントアミノ酸配列から選択されるEタンパク質を有する、構成1〜3のいずれか1項に記載のワクチン。
(構成5)
前記ジカウイルスが、化学的不活化、熱失活、pH不活化、またはUV不活化により不活化される、構成1〜4のいずれか1項に記載のワクチン。
(構成6)
前記化学的不活化が、プラークアッセイにより測定して、前記ジカウイルスを完全に不活化するのに必要であるよりも長い時間、前記ジカウイルスを化学的不活化剤と接触させることを含む、構成5に記載のワクチン。
(構成7)
前記化学的不活化が、前記ジカウイルスをホルムアルデヒドと接触させることを含む、構成6に記載のワクチン。
(構成8)
前記ホルムアルデヒド不活性化が、前記ジカウイルスとホルムアルデヒドとを、2〜10日間接触させることを含む、構成7に記載のワクチン。
(構成9)
前記化学的活性化が、約+4℃または約+22℃で実施される、構成5〜8のいずれか1項に記載のワクチン。
(構成10)
アジュバントをさらに含む、構成1〜9のいずれか1項に記載のワクチン。
(構成11)
前記アジュバントがアルミニウム塩のアジュバントである、構成10に記載のワクチン。
(構成12)
前記アルミニウム塩のアジュバントが水酸化アルミニウムまたはリン酸アルミニウム塩である、構成11に記載のワクチン。
(構成13)
前記ワクチンが、ペプチドおよびデオキシイノシン含有免疫賦活性オリゴデオキシ核酸分子(I−ODN)を含むアジュバントを含むまたはさらに含む、構成10〜12のいずれか1項に記載のワクチン。
(構成14)
前記ペプチドが配列KLKL5KLK(配列番号71)を含み、I−ODNがオリゴ−d(IC)13(配列番号70)を含む、構成13に記載のワクチン。
(構成15)
1種または複数の薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含む、構成1〜14のいずれか1項に記載のワクチン。
(構成16)
前記ワクチンが、HPLCにより検出するには少なすぎる量、すなわち、1μg/ml未満、特に100ng/ml未満の量の、硫酸プロタミンまたはPSの断片または分解生成物を含む、構成1〜15のいずれか1項に記載のワクチン。
(構成17)
前記硫酸プロタミンまたはPSの断片または分解生成物が、質量分析または別の高感度法により検出できる、構成16に記載のワクチン。
Claims (17)
- 少なくとも、配列番号73のアミノ酸配列によって定義されるジカウイルス株H/PF/2013の全ポリタンパク質、または配列番号73で示される配列と少なくとも95%、96%、97%、98%、もしくは少なくとも99%の配列同一性を有するポリタンパク質のためのコード配列を含む不活化硫酸プロタミン沈殿ジカウイルスを含むジカウイルスワクチンであって、該ジカウイルスワクチンが、硫酸プロタミン(PS)又はPSの断片を含み、該PS又はPSの断片が1μg/mL未満の量で存在する、前記ジカウイルスワクチン。
- 前記ジカウイルスが、配列番号72で示されるDNA配列に対応するRNAゲノム、または配列番号72に少なくとも88%同一であり、かつ毒性ジカウイルスをパックできるバリアント核酸配列を含む、請求項1に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記ジカウイルスが、配列番号47のアミノ酸配列、または配列番号47に少なくとも95%同一であり、かつ毒性ジカウイルスをパックできるバリアントアミノ酸配列で定義されるジカウイルス株H/PF/2013のEタンパク質を含む、請求項1又は2に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記ジカウイルスが、化学的不活化、熱失活、pH不活化、またはUV不活化により不活化される、請求項1〜3のいずれか1項に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記化学的不活化が、プラークアッセイにより測定して、前記ジカウイルスを完全に不活化するのに必要であるよりも長い時間、前記ジカウイルスを化学的不活化剤と接触させることを含む、請求項4に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記化学的不活化が、前記ジカウイルスをホルムアルデヒドと接触させることを含む、請求項4に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記ホルムアルデヒド不活性化が、前記ジカウイルスをホルムアルデヒドと、2〜10日間接触させることを含む、請求項6に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記化学的不活化が、約+4℃または約+22℃で実施される、請求項4〜7のいずれか1項に記載のジカウイルスワクチン。
- アジュバントをさらに含む、請求項1〜8のいずれか1項に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記アジュバントがアルミニウム塩のアジュバントである、請求項9に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記アルミニウム塩のアジュバントが、前記ジカウイルスを含む最終組成物を基準にして1.25ppb未満のCuを含む水酸化アルミニウムである、請求項10に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記ジカウイルスワクチンが、ペプチドおよびデオキシイノシン含有免疫賦活性オリゴデオキシ核酸分子(I−ODN)を含むアジュバントを含むまたはさらに含む、請求項9〜11のいずれか1項に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記ペプチドが配列KLKL5KLK(配列番号71)を含み、かつ前記I−ODNがオリゴ−d(IC)13(配列番号70)を含む、請求項12に記載のジカウイルスワクチン。
- 1種または複数の薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含む、請求項1〜13のいずれか1項に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記ジカウイルスワクチンが、100ng/mL未満の量の、硫酸プロタミンまたはPSの断片を含む、請求項1〜14のいずれか1項に記載のジカウイルスワクチン。
- 前記硫酸プロタミンまたはPSの断片が、質量分析および/または別の高感度法により検出できる、請求項15に記載のジカウイルスワクチン。
- 請求項1〜16のいずれか一項に記載の不活化硫酸プロタミン沈殿ジカウイルスを含むジカウイルスワクチンを製造するための方法であって、該方法が、下記ステップを含む感染性ジカウイルス粒子の精製プロセスを含む、前記方法:
a)ジカウイルス粒子および不純物を含む粗ハーベスト(a)を用意するステップであって、該不純物が細胞基材上の該ジカウイルス粒子の増殖から生成される、前記ステップ;
b)プロタミン塩、好ましくは硫酸プロタミンを含む試薬を用いて沈殿させることにより、該粗ハーベスト(a)から不純物を低減させて、ウイルス調製物(b)を得るステップ;及び
c)最適化ショ糖密度勾配での遠心分離により該ウイルス調製物(b)をさらに精製して該感染性ジカウイルス粒子を含むウイルス調製物(c)を得るステップであって、該プロタミンをウイルス画分から完全にまたはほぼ完全に分離できるように、該最適化ショ糖勾配が提供され、かつ該プロタミン濃度が、このステップによって、最終原薬中のプロタミン濃度が質量分析または別の高感度法で測定したときに1μg/mL未満、好ましくは900、800、700、600、500、400、300または200ng/mL未満、好ましくは100ng/mL未満となる程度まで低減され、該最適化ショ糖密度勾配が、10%±1%(w/w)ショ糖溶液中のジカウイルス含有画分、および異なる密度を有するショ糖溶液の3つのさらなる層を含み、該ショ糖溶液の3つのさらなる層が、15%±1%(w/w)ショ糖を含む第1のショ糖溶液、35%±1%(w/w)ショ糖を含む第2のショ糖溶液、および50%±1%(w/w)ショ糖を含む第3のショ糖溶液を含む、前記ステップ。
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