JP6943764B2 - Il−17a結合ポリペプチド - Google Patents
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Description
i)EX2DX4AX6X7EIX10X11LPNL X16X17X18QX20X21AFIX25 X26LX28X29
(ただし、互いに独立に、
X2は、A、H、M、Yから選択され;
X4は、A、D、E、F、K、L、M、N、Q、R、S、Yから選択され;
X6は、A、Q、Wから選択され;
X7は、F、I、L、M、V、W、Yから選択され;
X10は、A、Wから選択され;
X11は、A、D、E、F、G、L、M、N、Q、S、T、Yから選択され;
X16は、N、Tから選択され;
X17は、H、W、Yから選択され;
X18は、A、D、E、H、Vから選択され;
X20は、A、G、Q、S、Wから選択され;
X21は、A、D、E、F、H、K、N、R、T、V、W、Yから選択され;
X25は、A、D、E、G、H、I、L、M、N、Q、R、S、T、Vから選択され;
X26は、K、Sから選択され;
X28は、I、L、N、Rから選択され;
X29は、D、Rから選択される)と
ii)i)に規定した配列と少なくとも89%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列からなるIL-17A結合ポリペプチドが提供される。
X2が、A、H、Mから選択され;
X4が、A、D、E、F、L、M、N、Q、R、Yから選択され;
X11が、A、D、E、F、G、L、M、N、S、T、Yから選択され;
X18が、A、D、E、Vから選択され;
X20が、A、G、Q、Wから選択され;
X21が、E、F、H、N、R、T、V、W、Yから選択され;
X25が、A、D、E、G、H、I、L、N、Q、R、S、T、Vから選択され;
X28が、I、N、Rから選択されるポリペプチドが提供される。
X16がTであり;
X17がWであり;
X21が、E、F、H、W、T、Yから選択され;
X25が、A、D、E、G、H、I、L、N、Q、R、S、Tから選択され;
X26がKであり;
X29がDであるポリペプチドが提供される。
I.X2がAである;
II.X4がD、E、Qから選択される;
III.X6がAである;
IV.X7がFとVから選択される;
V.X16がTである;
VI.X17がWである;
VII.X18がAとDから選択される;
VIII.X20がWである;
IX.X26がKである;
X.X28がRである;
XI.X29がDである
のうちの少なくとも6個を満たす。
iii)K-[BM]-DPSQS XaXbLLXc EAKKL XdXeXfQ
(ただし[BM]は、
X29がDであり;
XaがAとSから選択され、
XbがNとEから選択され;
XcがA、S、Cから選択され;
XdがE、N、Sから選択され;
XeがD、E、Sから選択され;
XfがAとSから選択されるという条件での、本明細書に規定したIL-17A結合モチーフである)と、
iv)iii)に規定した配列と少なくとも85%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列結合モジュール(BMod)を含むことができる。
v)K-[BM]-QPEQS XaXbLLXc EAKKL XdXeXfQ,
(ただし[BM]は、
X29がRであり;
XaがAとSから選択され、
XbがNとEから選択され;
XcがA、S、Cから選択され;
XdがE、N、Sから選択され;
XeがD、E、Sから選択され;
XfがAとSから選択されるという条件での、本明細書に規定したIL-17A結合モチーフである)と、
vi)v)に規定した配列と少なくとも85%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列結合モジュール(BMod)を含むことができる。
vii)YA-[BMod]-AP
(ただし[BMod]は、上に規定したIL-17A結合モジュールである)と、
viii)vii)に規定した配列と少なくとも86%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含むIL-17A結合ポリペプチドが提供される。
ix)FA-[BMod]-AP
(ただし[BMod]は、上に規定したIL-17A結合モジュールである)と、
x)ix)に規定した配列と少なくとも86%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含むIL-17A結合ポリペプチドが提供される。
xi)FN-[BMod]-AP
(ただし[BMod]は、上に規定したIL-17A結合モジュールである)と、
xii)xi)に規定した配列と少なくとも86%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含むIL-17A結合ポリペプチドが提供される。
配列番号:
1250 ADNNFNK-[BM]-DPSQSANLLSEAKKLNESQAPK;
1251 ADNKFNK-[BM]-DPSQSANLLAEAKKLNDAQAPK;
1252 ADNKFNK-[BM]-DPSVSKEILAEAKKLNDAQAPK;
1253 ADAQQNNFNK-[BM]-DPSQSTNVLGEAKKLNESQAPK;
1254 AQHDE-[BM]-DPSQSANVLGEAQKLNDSQAPK;
1255 VDNKFNK-[BM]-DPSQSANLLAEAKKLNDAQAPK;
1256 AEAKYAK-[BM]-DPSESSELLSEAKKLNKSQAPK;
1257 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLNDAQAPK;
1258 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLNDSQAPK;
1259 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK;
1260 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAP;
1261 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDAQAPK;
1262 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDAQAP;
1263 AEAKFAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK;
1264 AEAKFAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAP;
1265 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLNDAQAPK;
1266 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSESQAPK;
1267 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSESQAP;
1268 AEAKFAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSESQAPK;
1269 AEAKFAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSESQAP;
1270 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSEAQAPK;
1271 AEAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLSESQAPK;
1272 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLESSQAPK;
1273 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLESSQAP;
1274 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLESAQAPK;
1275 AEAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLESSQAPK;
1276 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSDSQAPK;
1277 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSDSQAP;
1278 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSDSQAPK;
1279 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSDAQAPK;
1280 AEAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLSDSQAPK;
1281 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK;
1282 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSESQAPK;
1283 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSEAQAPK;
1284 VDAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLSESQAPK;
1285 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLESSQAPK;
1286 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLESAQAPK;
1287 VDAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLESSQAPK;
1288 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSDSQAPK;
1289 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSDSQAPK;
1290 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSDAQAPK;
1291 VDAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLSDSQAPK;
1292 VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLNKAQAPK;
1293 AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLNKAQAPK;
1294 ADAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK;
ただし[BM]は、上に規定した1つのIL-17A結合モチーフである。
xiii)VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK
(ただし[BM]は、上に規定したIL-17A結合モチーフである)と、
xiv)xiii)に規定した配列と少なくとも86%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含んでいる。
xv)AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK
(ただし[BM]は、上に規定したIL-17A結合モチーフである)と、
xvi)xv)に規定した配列と少なくとも86%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含んでいる。
- T細胞調節因子、例えばCD3、CD4、CD6、CD28、T細胞受容体α(TCRα)、T細胞受容体β(TCRβ)、細胞障害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)、プログラム細胞死タンパク質1(PD-1)、プログラム細胞死リガンド1(PD-L1)、プログラム細胞死リガンド2(PD-L2)、B7ホモログ3(B7-H3)、B7ホモログ4(B7-H4)、ヘルペスウイルス侵入メディエータ(HVEM)/Bリンパ球・Tリンパ球減弱因子(BTLA)、キラー抑制受容体(KIR)、リンパ球活性化遺伝子3(LAG3)、ガレクチン-9(Gal9)/T細胞免疫グロブリンムチン-3(TIM3)、アデノシン/α2-アドレナリン作動性受容体(A2aR);
- NK細胞リクルート因子、例えばCD16、ナチュラルキラー細胞レクチン様受容体遺伝子2D産物(NKG2D)、リンパ球機能関連抗原1(LFA1)、天然の細胞障害性受容体であるNKp30、NKp40;
- 炎症関連因子、例えば
・サイトカインとその受容体、例えば腫瘍壊死因子(TNF);腫瘍壊死因子リガンドスーパーファミリー(TNFSF)のメンバーであるTNFSF11/RANKL、TNFSF12/TWEAK、TNFSF13、TNFSF13B/BAFF/BLys、TNFSF14、TNFSF15;インターロイキン(IL)類のIL-1α、IL-1β、IL-2、IL-5、IL-6、IL-10、IL-12、IL-17B、IL-17C、IL-17D、IL-17E、IL-17F、IL-18、IL-22、IL-23、IL-26、IL-32、IL-33、IL-34;インターフェロン類のINFα、INFγ;顆粒球コロニー刺激因子(GCSF)、顆粒球マクロファージ-コロニー刺激因子(GM-CSF);
・炎症性ケモカインとその受容体、例えばIL-8/ CXCL8、ENA-78/CXCL5、GROα/CXCL1、CTAP-III/CXCL7、IP-10/CXCL10、Mig/CXCL9、PF4/CXCL4、GCP-2/CXCL6、MCP-1/CCL2、MIP-1α/CCL3、MIP-3α/CCL20、RANTES/CCL5、リンホタクチン/XCL1、フラクタルキン/CX3CL1である。
- T細胞調節因子、例えばCD3、CD4、CD6、CD28、T細胞受容体α(TCRα)、T細胞受容体β(TCRβ)、細胞障害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)、プログラム細胞死タンパク質1(PD-1)、プログラム細胞死リガンド1(PD-L1)、プログラム細胞死リガンド2(PD-L2)、B7ホモログ3(B7-H3)、B7ホモログ4(B7-H4)、ヘルペスウイルス侵入メディエータ(HVEM)/Bリンパ球・Tリンパ球減弱因子(BTLA)、キラー抑制受容体(KIR)、リンパ球活性化遺伝子3(LAG3)、ガレクチン-9(Gal9)/T細胞免疫グロブリンムチン-3(TIM3)、アデノシン/α2-アドレナリン作動性受容体(A2aR);
- NK細胞リクルート因子、例えばCD16、ナチュラルキラー細胞レクチン様受容体遺伝子2D産物(NKG2D)、リンパ球機能関連抗原1(LFA1)、天然の細胞障害性受容体であるNKp30、NKp40;
- 炎症関連因子、例えば
・サイトカインとその受容体、例えば腫瘍壊死因子(TNF);腫瘍壊死因子リガンドスーパーファミリー(TNFSF)のメンバーであるTNFSF11/RANKL、TNFSF12/TWEAK、TNFSF13、TNFSF13B/BAFF/BLys、TNFSF14、TNFSF15;インターロイキン(IL)類のIL-1α、IL-1β、IL-2、IL-5、IL-6、IL-10、IL-12、IL-17B、IL-17C、IL-17D、IL-17E、IL-17F、IL-18、IL-22、IL-23、IL-26、IL-32、IL-33、IL-34;インターフェロン類のINFα、INFγ;顆粒球コロニー刺激因子(GCSF)、顆粒球マクロファージ-コロニー刺激因子(GM-CSF);
・炎症性ケモカインとその受容体、例えばIL-8/ CXCL8、ENA-78/CXCL5、GROα/CXCL1、CTAP-III/CXCL7、IP-10/CXCL10、Mig/CXCL9、PF4/CXCL4、GCP-2/CXCL6、MCP-1/CCL2、MIP-1α/CCL3、MIP-3α/CCL20、RANTES/CCL5、リンホタクチン/XCL1、フラクタルキン/CX3CL1からなるグループからなされる。
- アミノ酸および/またはアミノ酸誘導体を段階的にカップリングさせて、保護された反応性側鎖を有する第1の特徴によるポリペプチドを形成し、
- そのポリペプチドの保護された反応性側鎖から保護基を除去し、
- 水溶液中でそのポリペプチドを折り畳ませることを含んでいる。
- 被験体を、またはその被験体から単離したサンプルを、本明細書に記載したIL-17A結合ポリペプチド、融合タンパク質、共役体、複合体、組成物のいずれかと接触させる工程と、
- その被験体内で結合した、または上記サンプルに結合したIL-17A結合ポリペプチド、融合タンパク質、共役体、複合体、組成物の量に対応する値を取得する工程を含んでいる。
以下の実施例には、ファージ提示技術に基づいてインターロイキン17A(IL-17A)を標的とする新規なZ変異体分子を開発したことを開示する。本明細書に記載したIL-17A結合ポリペプチドの配列を決定し、そのアミノ酸配列を、図1に、配列番号1〜1222の識別子を付けてリストにしてある。実施例ではさらに、IL-17A結合ポリペプチドの特徴づけと、そのポリペプチドのインビトロおよび生体内での機能について記載する。
材料と方法
標的タンパク質のビオチニル化:No-Weigh EZ-Link Sulfo-NHS-LC-Biotin(Thermo Scentific社、カタログ番号21327)を20倍のモル数過剰にして用い、ヒトIL-17A(hIL-17A: Peprotech社、カタログ番号200-17;配列番号1226)とマウスIL-17A(mIL-17A:Peprotech社、カタログ番号210-17;配列番号1227)を製造者が推奨するようにして室温(RT)で30分間ビオチニル化した。その後にリン酸緩衝食塩水(PBS、10 mMのリン酸塩、137 mMのNaCl、2.68 mMのKCl、pH 7.4)へと緩衝液を交換する作業は、透析カセット(Slide-a-lyzer 3.5 K、3500 MWCO、Thermo Scentific社、カタログ番号66333)を製造者の指示に従って用いて実施した。
この実施例では、Hisタグを有するZ変異体およびABDと融合したZ変異体のサブクローニングと作製の一般的手続きを記述する。これらは、以下の特徴づけ実験全体で使用される。
Hisタグを有するZ変異体のサブクローニング:各Z変異体のDNAをライブラリベクターpAY02592から増幅した。N末端にHis6タグを有するモノマーZ変異体分子を構成するため、(本質的に、別の標的に結合するZ変異体に関してWO2009/077175に記載されているような)標準的な分子生物学の技術を用いたサブクローニング戦略を適用した。Z遺伝子フラグメントを発現ベクターpAY01448にサブクローニングすると、コードされた配列MGSSHHHHHHLQ-[Z#####]-VDが得られた。
正常なヒト皮膚線維芽細胞(NHDF)は、IL-17Aで刺激するとIL-6を産生し(ChangとDong、2007年、Cell Research 第17巻:435〜440ページ)、上清に放出されるIL-6の量は、添加したIL-17Aの濃度と相関する。したがってIL-17Aをブロックすると、定量できる上清中のIL-6が低下する。この実施例では、アッセイを利用してIL-17A結合Z変異体Z06260 (配列番号1200)、Z06282(配列番号1206)、Z06455(配列番号1214)の阻止能力を、単独で、またはABDとの融合体(PP013;配列番号1224)として評価した。
His 6 タグ付きZ変異体を用いたNHDFアッセイ:NHDF細胞(Lonza社、カタログ番号CC-2511)を、増殖促進因子(Lonza社、カタログ番号CC-5034)を補足した線維芽細胞基本培地(Lonza社、カタログ番号CC-3132)の中で培養した。実験の前日、96ウエル培養プレート(Greiner社、カタログ番号655180)のウエル1つにつき100μl の中に105個の細胞を播種した。実験当日、IL-17A特異的Z変異体であるHis6-Z06260、His6-Z06282、His6-Z06455の希釈液を別の96ウエルのプレートに調製した。これらZ変異体を、0.031 nM hIL-17Aを含む培地の中で3130 nMから0.2 nMまで3倍ステップで滴定した。hIL-17A(0.002〜31 nM)の標準曲線と、0.031 nM hIL-17A含有培地を含むか、培地だけを含む対照も準備した。一晩培養したNHDF細胞を含むプレート内の培地を廃棄した。試験サンプル、標準曲線サンプル、対照を、細胞含有プレートに移した。NHDF細胞を37℃で18〜24時間刺激した後、上清中のIL-6含量を、下記のIL-6特異的ELISAを利用して定量した。
100-[(ABSIL-17Aブロッカー - ABSバックグラウンド) / (ABS最大IL-6産生 - ABSバックグラウンド)]×100
この実施例では、成熟ライブラリを設計して構築した。このライブラリを用いてさらに別のIL-17A結合Z変異体を選択した。成熟ライブラリからの選択により、親和性が増大したZ変異体が得られることが通常は予想される(Orlova他、(2006年) Cancer Res 第66巻(8):4339〜4348ページ)。この研究では、スプリット-プールDNA合成を利用してランダム化された1本鎖リンカーを生成させた。すると合成中に所定のコドンを望む位置に組み込むことが可能になる。
ライブラリの設計:ライブラリは、実施例1に記載したようにして同定されたIL-17A結合Z変異体の配列に基づいていた。新しいライブラリでは、Z分子足場内の13個の可変位置が、配列番号1200〜1216に規定されているZ変異体配列に従い、いくつかのアミノ酸残基へと変化した。スプリット-プール合成を利用してDNAリンカーを生成させた。このDNAリンカーはDNA 2.0社(メンロ・パーク、カリフォルニア州、アメリカ合衆国)から注文されたもので、以下の147 bpの配列:5’- AA ATA AAT CTC GAG GTA GAT GCC AAA TAC GCC AAA GAA NNN NNN NNN GCG NNN NNN GAG ATC NNN NNN TTA CCT AAC TTA ACC NNN NNN CAA NNN NNN GCC TTC ATC NNN AAA TTA NNN GAT GAC CCA AGC CAG AGC TCA TTA TTT A-3’(配列番号1248;ランダム化されたコドンをNNNと表記)を含んでおり、この配列には、対応するアミノ酸配列内の一部ランダム化ヘリックス1と2のためのコード配列が含まれるとともに、XhoIとSacIのための制限部位が隣接している。Z分子足場に13個の可変Z位置(9、10、11、13、14、17、18、24、25、27、28、32、35)を含む新しいライブラリにおけるアミノ酸残基の理論的分布を表4に与える。得られた理論的ライブラリのサイズは、6.1×109個の変異体である。
ライブラリの構築:結合特性が確認された一群のIL-17A結合Z変異体(実施例1と実施例3)に基づいて新しいライブラリを設計した。設計したライブラリの理論的サイズは6.1×109個のZ変異体であった。大腸菌ER2738細胞の形質転換後に滴定によりライブラリの実際のサイズを求めたところ、4.5×109個の形質転換体であった。
材料と方法
IL-17A結合Z変異体のファージ提示選択:標的タンパク質であるhIL-17AとmIL-17Aを実施例1に記載したようにしてビオチニル化した。実施例4に記載したようにして構築したZ変異体分子の新しいライブラリを用いたファージ提示選択を、本質的に実施例1に記載したようにしてhIL-17AとmIL-17Aに対して4サイクルで実施したが、以下のような変更点がある。変更点1:選択用緩衝液として、PBST 0.1%を用いた。選択時、ウシ胎仔血清(FCS、Gibco社、カタログ番号10108-165)とヒト血清アルブミン(HSA、Albucult、Novozymes社、カタログ番号230-005)を選択用緩衝液に添加して最終濃度をそれぞれ10%と1.5μMにした。変更点2:ファージストックをSAビーズとともにインキュベートすることにより、サイクル1で事前選択工程を実施した。変更点3:選択に用いたすべての試験管とビーズを、3%BSAと0.1%トゥイーンを補足したPBSであらかじめブロックした。変更点4:選択の時間は、サイクル1、2、3、4のそれぞれにおいて140分間、70分間、60分間、50分間であった。
成熟したIL-17A結合Z変異体のファージ提示選択:それぞれが4サイクルを含む合計で24の並行トラックで選択を実施した。異なる選択トラックは、標的濃度、標的種の出所(ヒトIL-17AまたはマウスIL-17A)、選択時間、洗浄条件、溶離用緩衝液のpHが異なっていた。ヒトIL-17Aだけを用い、pH 2.2で溶離した選択トラックに由来するクローンは、ELIZAスクリーニングで最高の性能を示した。
この実施例では、本質的に実施例4に記載したようにして第2の成熟ライブラリを構築した。このライブラリを用いて追加のIL-17A結合Z変異体を選択した。
ライブラリの設計:ライブラリは、実施例5で選択されて特徴づけられたIL-17A結合Z変異体の配列に基づいていた。この新しいライブラリでは、実施例4と実施例5に記載した成熟ライブラリで変化したZ分子足場内の13個の位置が、EC50分析において最高性能を示した37種類の変異体(表6)のZ変異体配列に基づく戦略に従っていくつかのアミノ酸残基へと変更された。スプリット-プール合成を利用してDNAリンカーを生成させた。このDNAリンカーはDNA 2.0社から注文されたものであり、アミノ酸配列の一部ランダム化ヘリックス1と2をコードしている以下の147 bp:5’- AA ATA AAT CTC GAG GTA GAT GCC/GCA AAA TAC GCC AAA GAA/GAG NNN NNN NNN GCG NNN NNN GAG ATC/ATT NNN NNN TTA/CTG CCT/CCC AAC TTA/CTC ACC NNN NNN CAA/CAG NNN NNN GCC TTC ATC NNN AAA TTA NNN GAT GAC CCA AGC CAG AGC TCA TTA TTT A -3’(配列番号1249;ランダム化されたコドンをNNNと表記)を含んでいて、制限部位XhoIとSacIが隣接している。Z分子足場内に6個の可変アミノ酸位置(11、14、18、25、28、32)と7個の定常アミノ酸位置(9、10、13、17、24、27、35)を含む新しいライブラリにおけるアミノ酸残基の理論的分布を表7に与える。得られた理論的ライブラリのサイズは、3.9×106個の変異体である。
ライブラリの構築:結合特性が検証された一群のIL-17A結合Z変異体(実施例5)に基づいて新しいライブラリを設計した。設計したライブラリの理論的サイズは3.9×106個のZ変異体であった。大腸菌ER2738細胞の形質転換後に滴定によりライブラリの実際のサイズを求めたところ、1.4×109個の形質転換体であった。
材料と方法
IL-17A結合Z変異体のファージ提示選択:実施例1に記載したようにして標的タンパク質hIL-17Aをビオチニル化した。実施例6に記載したようにして構築したZ変異体分子の第2の成熟ライブラリを用い、本質的に実施例5に記載したようにしてファージ提示選択をhIL-17Aに対して実施したが、以下のような変更点がある。変更点1:溶液中または固相で室温にて選択を実施した。変更点2:選択の時間は、サイクル1では60分間、または10分間、または1分間、サイクル2、3、4では30分間、または4分間、または10秒間であった。溶液中での選択の後に、実施例1に記載したようにして標的-ファージ複合体をSAビーズに捕獲した。変更点3:固相での選択中、標的をSAビーズに捕獲した後に選択を実施した。
第2の成熟ライブラリからのIL-17A結合Z変異体のファージ提示選択:それぞれが4サイクルを含む合計で16の並行トラックで選択を実施した。選択トラックは、標的濃度、選択時間、洗浄条件と、選択を溶液中で実施したか固相上で実施したかが異なっていた。
材料と方法
N末端にHis6タグを有するZ変異体のサブクローニングと作製を実施例2に記載されているようにして実施した。His6-Z10532(配列番号1)の部位特異的突然変異誘発によって追加の変異体His6-Z15167(配列番号4)を1つ作製すると、位置25のDがAに置換された。His6-Z15167の作製は、他のZ変異体に関して上に記載したようにして実施した。
CD分析:His6タグを有するIL-17A結合Z変異体で求めたCDスペクトルから、それぞれが、20℃でαヘリックス構造を有することがわかった。融点(Tm)を求める可変温度測定の結果を表10に示す。90℃まで加熱する前と後に測定したスペクトルを重ねると、すべてのIL-17A結合Z変異体で可逆的折り畳みが見られた。
IL-17Aは、受容体結合部位が2つあるホモ二量体サイトカインである。本開示のIL-17A結合Z-ABD-Zポリペプチドの2つの部分を含むポリペプチドは、そのような部分を1つ含むポリペプチドよりもIL-17Aをより効果的に阻止すると考えられていた。この実施例では、アルブミン結合ドメイン変異体PP013(配列番号1224)と融合した2つのZ変異体を含むポリペプチド(一般式はZ-[L1]-ABD-[L2]-Zであり、[L1]と[L2]は、Z部分とABD部分を隔てるリンカーである)のサブクローニングと作製の一般的手続きを記述する。
[L1]リンカーと[L2] リンカーの長さが異なるZ-[L1]-ABD-[L2]-Zポリペプチドのサブクローニング:Z06282(配列番号1206)、Z10241(配列番号11)、Z10532(配列番号1)のDNAを、PCRにより、Pfu Turbo DNAポリメラーゼ(Agilent Technologies社、カタログ番号600254)と適切なプライマー対を用いてライブラリベクターpAY02592から増幅した。その後の3つのクローニング工程においてT4 DNAリガーゼ(Fermentas社、カタログ番号EL0011)を用い、各部分をコードしているDNAを発現ベクターpET26b(+)(Novagen社、マディソン、ウィスコンシン州)に連結することにより、Z-[L1]-ABD-[L2]-Zコンストラクトを生成させた。ハイブリダイズしたリンカーをコードしていて、反復数の異なる(GGGGS)nを持ち、制限酵素部位が隣接したDNAにより、それら3つの部分をコードしているDNAを分離した。発現ベクターによってコードされるコンストラクトは、Z#####-[GAP-(G4S)n-TS]-PP013-[GT-(G4S)n-PR]-Z#####であった。ただしそれぞれのnは、個別に1〜4である。それ以外の具体的なことは表13に示してある。
培養と精製:ABDが融合したIL-17A結合Z変異体を可溶性遺伝子産物として大腸菌の中で発現させた。最終的な各タンパク質調製物のSDS-PAGE分析から、これらが望むIL-17A結合Z変異体を優勢に含んでいることがわかった。各Z-ABD-Zポリペプチドが正確には何であるかとその分子量は、HPLC-MS分析によって確認した。
限外濾過を利用したサンプルの連続的濃縮によって生理緩衝液中の3種類のZ-ABD-Zポリペプチドの溶解度を調べた後、280 nmで吸光度を読み取ることによる濃度測定とサンプルの目視を実施した。
Z-ABD-ZポリペプチドであるZAZ3363(配列番号1244)、ZAZ3364(配列番号1245)、ZAZ3422(配列番号1247)をPBS、pH 7.4の中で2.5 mg/mlに希釈した。揺動バケットロータ遠心分離装置で4000 gにて10分間遠心分離することにより、3 kDa にカットオフがある12個のAmicon Ultra遠心分離フィルタユニット(Millipore社、カタログ番号UFC800324)をPBSであらかじめすすいだ。濃縮装置を空にし、4 mlの各Z-ABD-Zポリペプチドを3つの異なる遠心分離フィルタユニットからなる第1のセットに添加した。遠心分離を20℃にて4000 gで13〜16分間実施すると、約1 mlの濃縮液が得られた。20μlのサンプルを各濃縮液(UFサンプル1)から取り出してさらに分析し、そのサンプルの残った体積を、3つの遠心分離フィルタユニットからなる第2のセットに移した。遠心分離とサンプルの取り出しを、回転時間をそれぞれ8〜10分間、7分間、13分間にして3回繰り返した(UFサンプル2、3、4のそれぞれについて)。UFサンプル1〜4をそれぞれ3、6、12、24回希釈し、NanoDrop(登録商標)ND-1000分光測光器を用いて吸光度を読み取った。理論上の消光係数1 Abs280=0.612 mg/ml(3つのZ-ABD-Zポリペプチドすべてで同じ)を用いて濃度を計算した。希釈していない濾液の吸光度の読み取りも実施した。
各遠心分離工程の後に280 nmで吸光度を読み取ることによって求めた濃度を表15に示す。濃縮液の目視で凝集体は検出されなかった。そこでZAZ3363、ZAZ3364、ZAZ3422の溶解度は、PBS、pH 7.4の中で少なくとも60 mg/mlであることが明確になった。希釈していない濾液の吸光度の読み取り値から、濃度は0 mg/mlに非常に近いことがわかった。
材料と方法
Z-ABD-ZポリペプチドZAZ3363(配列番号1244)、ZAZ3364(配列番号1245)、ZAZ3365(配列番号1246)と、hIL-17A、カニクイザルIL-17A(cIL-17A、配列番号1229;Evitria社、特注)との間の相互作用と、ZAZ3220(配列番号1236)と、hIL-17A、アカゲザルIL-17A(rmIL-17A、配列番号1230;Cusabio社、カタログ番号 CSB-EP011597MOV)との間の相互作用をBiacore 2000で分析した。HSAをCM5チップ表面のカルボキシル化デキストラン層上のフローセル内に固定化した。固定化は、アミンカップリング化学を製造者のプロトコルに従って利用するとともに、HBS-EPをランニング緩衝液として使用して実施した。表面へのHSA固定化のレベルは、それぞれ953 RU(ZAZ3363、ZAZ3364、ZAZ3365のために使用)と493 RU(ZAZ3220のために使用)であった。ブランクとして使用するため、分析物の注入中にチップ上の1つのフローセル表面の活性化と脱活性化を行なった。この結合実験では、HBS-EPをランニング緩衝液として使用し、流速は30μl/mlであった。ZAZ3363、ZAZ3364、ZAZ3365をHBS-EPランニング緩衝液の中で希釈して最終濃度を200 nMにし、5分間かけて注入した後、IL-17A変異体を注入した。ZAZ3220をHBS-EPランニング緩衝液の中で希釈して最終濃度を500 nMにし、4分間かけて注入した後、IL-17A変異体を注入した。hIL-17AとcIL-17AのそれぞれをHBS-EPランニング緩衝液の中で希釈して最終濃度を2.5、10、40 nMにし、HSAに捕獲されたZAZ3363、ZAZ3364、ZAZ3365を有する表面に5分間かけて注入した。10分間解離させた後、10 mM HClを2回注入して表面を再生させた。hIL-17AとrmIL-17AをHBS-EPランニング緩衝液の中で希釈して最終濃度を、それぞれ、0.1、0.3、0.9、2.7、8.1 nMと、2.7、8.1、24.3、72、216 nMにし、HSAに捕獲されたZAZ3220を有する表面に6分間かけて注入した。5分間解離させた後、10 mM HClを2回注入して表面を再生させた。BiaEvaluationソフトウエアを用いて結果を分析した。
hIL-17AとcIL-17AのZAZ3363、ZAZ3364、ZAZ3365に対する結合と、hIL-17AとrmIL-17AのZAZ3220に対する結合を、Z-ABD-ZポリペプチドをHSA含有表面に注入してからIL-17A変異体を注入することにより、Biacore装置で調べた。調べたすべてのZ変異体が、調べたIL-17A変異体に結合すること、すなわちZAZ3363、ZAZ3364、ZAZ3365がヒトとカニクイザルのIL-17Aに結合すること(図6)と、ZAZ3220がヒトとアカゲザルのIL-17Aに結合することがわかった。
この実施例では、2種類のZ-ABD-Zポリペプチドの特異性を、IL-17Aファミリーの一群のタンパク質と相互作用する可能性、他のインターロイキンと相互作用する可能性、他の豊富な血漿タンパク質と相互作用する可能性を分析することによって調べた。分析タンパク質の同じ集合について、ABD変異体PEP07843と相互作用する可能性も分析した。
ZAZ3363(配列番号1244)またはZAZ3422(配列番号1247)と、それぞれ24種類または12種類の異なるタンパク質の集合(表16に具体的に提示)との相互作用をBiacore 2000装置で分析した。HSAとABD変異体PEP07843(配列番号1225、N末端にGSS延長部を有するPP013(配列番号1224)に対応)をCM5チップ表面に固定化し、ブランク表面を実施例11に記載したようにして準備した。表面へのリガンド固定化のレベルは、ZAZ3363のランで使用したチップでは、HSAとPEP07843それぞれについて1315 RUと99 RUであり、ZAZ3422のランで使用したチップでは、HSAとPEP07843それぞれについて791 RUと100 RUであった。この結合実験では、HBS-EPをランニング緩衝液として使用し、流速は30μl/mlであった。ZAZ3363とZAZ3422をHBS-EPの中で、または500 mM NaClを補足したHBS-EPの中で希釈して最終濃度を200 nMにし、7分間かけて注入した後、分析物を注入した。分析物、すなわち24種類または12種類の異なるタンパク質の集合のそれぞれをHBS-EPの中で、または500 mM NaClを補足したHBS-EPの中で希釈して最終濃度を0.4〜250 nMにし、5分間かけて注入した。7分間(ZAZ3363)または10分間(ZAZ3422)解離させた後、10 mM NaOHを4回(ZAZ3363)または5回(ZAZ3422)注入し、次いで10 mM HClを2回注入して表面を再生させた。BiaEvaluationソフトウエアを用いて結果を分析した。
高親和性相互作用の速度論的パラメータを正確に求める上でSPRには技術的制約があり、2つの二量体標的間の親和性をSPRによって求めるのは非常に複雑な作業であるため、HSAとの複合体になったZ-ABD-ZポリペプチドのIL-17Aに対する結合と、Z-ABD-ZポリペプチドだけのHSAに対する結合と、IL-17Aとの複合体になったZ-ABD-ZポリペプチドのHSAに対する結合をさらに分析するのに結合平衡除外アッセイ(KinExA(登録商標))技術を利用するのが適切であった。KinExA(登録商標)では、溶液相の中の改変されていない分子間の平衡結合親和性と反応速度を測定する(DarlingとBrault、2004年、Assay and Drug Dev Tech 第2巻(6):647〜657ページ)。
最初の一群のKinExA(登録商標)測定では、HSAとの複合体になったそれぞれのZ-ABD-ZポリペプチドZAZ3220、ZAZ3363、ZAZ3422は、例外的に大きな親和性でIL-17Aに結合し、KD値はピコモル未満からフェムトモルの範囲であることがわかった。これらのZ-ABD-Zポリペプチドと二量体IL-17Aの間に1価の結合を仮定して計算で求めた速度論的パラメータを表17に示す。
材料と方法
NHDFアッセイにおける、IL-17Aが誘導するIL-6産生の阻止:NHDF細胞(Lonza社、カタログ番号CC-2511)を、増殖促進因子(Lonza社、カタログ番号CC-5034)を供給した線維芽細胞基本培地(Lonza社、カタログ番号CC-3132)の中で培養した。実験の前日、ウエル1つにつき5000個の細胞をハーフエリア96ウエル培養プレートの100μlの中に播種した。実験当日、Z部分とABD部分の間の長さが異なるリンカーを有するIL-17A特異的Z-ABD-Zポリペプチド(ZAZ3174(配列番号1233)、ZAZ3175(配列番号1234)、ZAZ3176(配列番号1235)、ZAZ3220(配列番号1236)、ZAZ3221(配列番号1237)、ZAZ3234(配列番号1238)、ZAZ3235(配列番号1239)、ZAZ3236(配列番号1240)、ZAZ3237 (配列番号1241)、ZAZ3269(配列番号1242)、ZAZ3270(配列番号1243))の希釈液を別の96ウエルのプレートに調製した。これらZ-ABD-Zポリペプチドを、0.9 nM hIL-17Aと8μM HSAを含む培地の中で190 nMから0.003 nMまで3倍ステップで滴定した。標準IL-17A曲線(6.2〜0.0001 nM)と、0.9 nM hIL-17A含有培地か培地だけを含む対照も準備した。一晩培養したNHDF細胞を含むプレート内の培地を廃棄し、100μl/ウエルのサンプルを細胞プレートに移し、37℃のインキュベータ内に18〜24時間入れておいた。翌日、上清中のIL-6の含量を、実施例3に記載したようにしてIL-6特異的ELISAを利用して定量した。追加のZ-ABD-Zポリペプチド(ZAZ3363(配列番号1244)、ZAZ3364(配列番号1245)、ZAZ3365(配列番号1246)、ZAZ3422(配列番号1247))をその後のNHDFアッセイで本質的に上述のようにして分析したが、そのときATCCからのNHDF細胞系(カタログ番号PSC-201-012)を用いた。これらZ-ABD-Zポリペプチドを40℃で2〜4週間インキュベートした後の阻止能力も分析した。
IL-17Aが誘導するIL-6産生をZ-ABD-Zポリペプチドが阻止する能力をNHDFアッセイで調べた。第1に、His6-Z10241とZAZ3220(Z10241を含む)の抑制曲線を表示した図7Aに示されているように、Z-ABD-Z形態は、モノマーHis6-Z形態と比べて阻止能力を顕著に増大させることがわかった。ZAZ3220の曲線の形が示唆しているのは、ZAZ3220の一対一抑制効果でこの細胞アッセイの検出限界に到達しているため、Z-ABD-Zポリペプチドは、この実験から評価できるよりもはるかに大きな抑制効果を有するらしいことである。ホモ二量体IL-17Aに結合することによって得られる強い親和効果が原因で、ZAZ3220の力価がアッセイの限界まで増大したと考えられる。第2に、異なる長さのリンカーを有するZ-ABD-ZポリペプチドでZ変異体Z06282(配列番号1206)とZ12876(配列番号1218)を含んでいるものの比較から、リンカーの長さは阻止能力にわずかな効果しか持たないことが明らかになった。異なる長さのリンカーを有する一群のZ06282含有Z-ABD-Zポリペプチドを図7Bに示してある。その後のNHDFアッセイで追加のZ-ABD-ZポリペプチドZAZ3363、ZAZ3364、ZAZ3365、ZAZ3422を分析し、それらZ-ABD-Zポリペプチドを40℃で2〜4週間インキュベートした後にも分析した。IL-17A抑制能力は、40℃で4週間インキュベートした後でさえ保持された。さまざまなZ-ABD-ZポリペプチドがIL-17Aを抑制する能力を反映しているIC50の計算値を表19にまとめてある。これらのIC50値は、現在臨床開発中のIL-17A抑制モノクローナル抗体であるセクキヌマブAIN457(WO2006/013107とWO2012/125680)で報告されているhIL-6産生無効化活性(IC50=2.1±0.1 nM)の1/3未満である。
ヒトIL-17Aは、マウスIL-17A受容体に結合することと、マウスIL-17A受容体を刺激することができるため、マウスKC(CXCL1)ケモカインの上昇とその後の分泌につながる。
KCマウスモデルにおけるhIL-17Aの生体内無効化:用量を変化させる実験を実施し、ヒトIL-17AがマウスKCを誘導する最適用量を明らかにした。これらの実験から、150μg/kgの用量のヒトIL-17Aが、IL-17Aを投与してから2時間後に回収したマウス血清に適切なレベルのKCを誘導することが明らかになった。ZAZ3174(配列番号1233)と ZAZ3220(配列番号1236)をこのモデルで2つの異なる場合について分析した。第1の実験では、ヒトIL-17A を皮下注射する9時間前に、ZAZ3174を3通りの異なる用量0.25、2.5、25 mg/kgでマウスに皮下投与した。ヒトIL-17Aを投与してから2時間後にマウスを安楽死させ、市販のキット(KC Quantikine; R&D Systems社、カタログ番号D1700)を製造者の指示に従って使用してKCレベルをELISAによって求めた。第2の実験では、ヒトIL-17A を皮下注射する9時間前に、ZAZ3220を3通りの異なる用量0.05、0.1、0.4 mg/kgでマウスに皮下投与した。ヒトIL-17Aを投与してから2時間後にマウスを安楽死させ、KCレベルを上述のようにELISAによって求めた。
KCマウスモデルにおけるhIL-17Aの生体内無効化:調べたZ-ABD-Zポリペプチドは、ヒトIL-17AがマウスIL-17受容体を刺激する能力を阻止するため、用量に依存してマウスKCの上昇を抑制することにつながる。上記の条件下での用量2.5 mg/kgのZAZ3174は、図8Aに示されているように、KCの誘導を完全に阻止した。第2の実験から、親和性成熟Z変異体を含むZ-ABD-ZポリペプチドZAZ3220が、IL-17Aによって誘導されるKC応答を用量0.4 mg/kgで完全に阻止することが明らかになった(図8B)。これは、ZAZ3174と比べて生体内阻止効果が6倍増大していることに対応する。0.1 mg/kgのZAZ3220で72%抑制が得られた。
この実施例では、2つの異なるZ-ABD-Zポリペプチドをラットに皮下注射(s.c)および/または静脈内(i.v)注射した後の薬物動態パラメータを求めた2つの別々の実験について記述する。
第1の実験では、PBSの中で製剤化したZAZ3220(配列番号1236)を、57ナノモル/kgに対応する1.2 mg/kgの用量でスプラーグ・ドーリー(SD)雄ラット(Charles River、ドイツ国)に静脈内投与した(n=3)。投与後0.08時間、8時間、24時間、48時間、72時間、120時間、168時間、240時間、336時間、408時間、504時間の時点で、血液サンプルを各ラットの尾の静脈から回収した。
Z-ABD-ZポリペプチドZAZ3220とZAZ3363を1.2 mg/kgの用量でSDラットに1回投与した後の平均血清濃度-時間プロファイルをそれぞれ図9Aと図9Bに示す。2コンパートメント分析を利用して計算した薬物動態パラメータを表20にまとめてある。推定される半減期(t1/2)は、ZAZ3220とZAZ3363の両方とも静脈内投与の後に約49時間であった。皮下投与したZAZ3363のt1/2は45時間であり、生物学的利用能は45%と計算された。
目への局所投与は、眼科疾患、例えばぶどう膜炎、ドライアイ疾患において有利である。局所投与により、薬の極度に大きな局所濃度が可能になり、全身性副作用のリスクが最小になる。この実施例では、Z変異体分子を目に局所的に投与する可能性をウサギで調べた。Z変異体分子と対照IgGの濃度は、繰り返して局所投与した後に、前室(眼房水)と、硝子体液と、血清で測定した。
Z変異体の作製:Z06282(配列番号1206)由来のAEから出発したZ変異体Z10199(配列番号1217)を、タグなしだがC末端にアミン酸残基VDを付加してサブクローニングした。発現を本質的に実施例2に記載したようにして実施し、精製をアニオン交換と逆相クロマトグラフィによって行なった。サンプルの緩衝液をPBS pH 7.2に交換し、EndoTrap(登録商標)赤10カラム((Hyglos社)を用いて内毒素を除去した。
図10は、Z10199とZAZ3174の両方が局所投与後に目に浸透したことを示しており、眼房水と硝子体液に小さなnM濃度で存在していた。逆に、対照IgG抗体は、眼房水と硝子体液のどちらにも検出されなかった。血清サンプルは、Z変異体とIgGの両方に対して陰性であると見なすことができた。したがって本開示のZ変異体分子は、抗体が利用できないこの別の投与経路によって送達できるため、局所効果を実現して全身曝露を回避することができる。
材料と方法
試験項目:ZAZ3363(配列番号1244)を、1)OAF1:0.12 Mケノデオキシコール酸ナトリウム(Sigma社、カタログ番号C8261)と0.12 M没食子酸プロピル(Sigma社、カタログ番号P3130)、pH 7.4;または2)OAF2:50 mg/mlカプリン酸ナトリウム(Sigma社、カタログ番号C4151);または3)OAF3:50 mMリン酸ナトリウム(PBS)、pH 7.0の中で、50 mg/ml(OAF1とOAF2)または100 mg/ml(PBS)の濃度に製剤化した。
NHDF細胞アッセイにおいて、製剤化したZAZ3363の活性:それぞれOAF1とOAF2の中で製剤化したZAZ3363の活性を、PBS中の製剤と比較した。図11は、PBSで製剤化したZAZ3363と比較したOAF1の滴定曲線(図11A)と、PBSで製剤化したZAZ3363と比較したOAF2の滴定曲線(図11B)を示している。この実験から、2つの製剤中のZAZ3363の活性はPBSと同じであること、すなわちZAZ3363の活性は賦形剤の違いの影響を受けなかったことがわかった。
材料と方法
複合体と対照抗体の作製:IL-17AとTNFを標的とする2つの異なる複合体と、TNFに対する親和性を有する抗体を構成した。「Ada」と表記する抗体は、市販のモノクローナル抗体アダリムマブと同じCDR配列と特異性を有する抗体であり、この抗体を、重鎖(HC)と軽鎖(LC)の配列HCAda(配列番号1231)とLCAda(配列番号1232)を用いて構成した。IL-17A標的Z変異体Z14253(配列番号1219)部分を、遺伝子操作により、可撓性のある15残基(GGGGS)3リンカーを通じてHCAdaまたはLCAdaのC末端に融合すると、複合体HCAda-Z14253とLCAda-Z14253がそれぞれ得られた。構成した複合体の模式図を図13Aに示す。遺伝子合成、クローニング、CHO細胞内での一過的遺伝子発現による産生、プロテインAアフィニティクロマトグラフィを利用した精製は、Evitria社(スイス国)が実施した。
NHDFアッセイにおける、IL-17Aによって誘導されるIL-6産生の阻止:2つの複合体HCAda-Z14253とLCAda-Z14253が、IL-17Aが誘導するIL-6の産生を阻止する能力をNHDFアッセイで調べた。NHDFアッセイの結果を図13Bに示す。HCAda-Z14253とLCAda-Z14253の両方とも、IL-17Aを阻止する能力はZAZ3363と似ている。予想通り、Adaまたは陰性対照Z04726-PP013では抑制は見られなかった。
この実施例では、Z-ABD-ZポリペプチドであるZAZ3363を投与したカニクイザルで10日間にわたって実施した反復投与研究を記述する。結果を用いてカニクイザルにおけるZAZ3363の半減期を推定した。
1日目と10日目に投与した後のZAZ3363の平均血漿濃度-時間プロファイルをそれぞれ図14Aと図14Bに示す。ZAZ3363は単回投与として投与されて十分に薬物動態が評価されたのではないという事実にもかかわらず、多数回投与後に入手できる結果から、単回投与後の濃度-時間プロファイルを予測することが可能になる。血漿濃度は2コンパートメントの挙動に従って2つの相で低下した。このことと第2の反復投与研究(データは示さず)から推定された第2相のt1/2は約4〜7.5日であり、これはサルのアルブミンで報告されているt1/2と一致している(Deo他、1974年、J Nutr 第104巻:858〜864ページ)。有意な性差は観察されなかった。
材料と方法
カプセルの調製:ZAZ3363(配列番号1244)をOAF1の中で100 mg/mlの濃度にして製剤化した(実施例18参照)。この製剤を凍結乾燥させ、硬カプセルに充填した後、腸溶コーティングした(Catalent Pharma Solutions社が実施、ベインハイム、フランス国)。それぞれのカプセルは約25 mgのZAZ3363を含んでいた。
ZAZ3363について、個別のイヌでの血清濃度-時間プロファイルを図15に示す。結果から、3匹のイヌすべてでZAZ3363が腸から取り込まれたが、個体間でいくらか違いがあることがわかった。ZAZ3363の血清濃度は最大で2〜30 nMに達した。循環系に入るとZAZ3363の血清レベルは少なくとも96時間後まで安定した状態に留まる。これは、ZAZ3363内のABD部分PP013(配列番号1223)がイヌのアルブミンと相互作用することに帰せられる。PP013がイヌアルブミンに結合する能力は、以前に明らかにされている(WO2012/004384)。
1.IL-17A結合モチーフBMを含んでいて、そのモチーフが、
i)EX2DX4AX6X7EIX10X11LPNL X16X17X18QX20X21AFIX25 X26LX28X29
(ただし、互いに独立に、
X2は、A、H、M、Yから選択され;
X4は、A、D、E、F、K、L、M、N、Q、R、S、Yから選択され;
X6は、A、Q、Wから選択され;
X7は、F、I、L、M、V、W、Yから選択され;
X10は、A、Wから選択され;
X11は、A、D、E、F、G、L、M、N、Q、S、T、Yから選択され;
X16は、N、Tから選択され;
X17は、H、W、Yから選択され;
X18は、A、D、E、H、Vから選択され;
X20は、A、G、Q、S、Wから選択され;
X21は、A、D、E、F、H、K、N、R、T、V、W、Yから選択され;
X25は、A、D、E、G、H、I、L、M、N、Q、R、S、T、Vから選択され;
X26は、K、Sから選択され;
X28は、I、L、N、Rから選択され;
X29は、D、Rから選択される)と
ii)i)に規定した配列と少なくとも89%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列からなるIL-17A結合ポリペプチド。
X2が、A、H、Mから選択され;
X4が、A、D、E、F、L、M、N、Q、R、Yから選択され;
X11が、A、D、E、F、G、L、M、N、S、T、Yから選択され;
X18が、A、D、E、Vから選択され;
X20が、A、G、Q、Wから選択され;
X21が、E、F、H、N、R、T、V、W、Yから選択され;
X25が、A、D、E、G、H、I、L、N、Q、R、S、T、Vから選択され;
X28が、I、N、Rから選択される、項1に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
X16がTであり;
X17がWであり;
X21が、E、F、H、W、T、Yから選択され;
X25が、A、D、E、G、H、I、L、N、Q、R、S、Tから選択され;
X26がKであり;
X29がDである、項2に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
I.X2がAである;
II.X4がD、E、Qから選択される;
III.X6がAである;
IV.X7がFとVから選択される;
V.X16がTである;
VI.X17がWである;
VII.X18がAとDから選択される;
VIII.X20がWである;
IX.X26がKである;
X.X28がRである;
XI.X29がDである
のうちの少なくとも6個を満たす、項1〜3のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
(ただし[BM]は、
X29がDであり;
XaがAとSから選択され、
XbがNとEから選択され;
XcがA、S、Cから選択され;
XdがE、N、Sから選択され;
XeがD、E、Sから選択され;
XfがAとSから選択されるという条件での、請求項1〜23のいずれか1項に記載のIL-17A結合モチーフである)と、
iv)iii)に規定した配列と少なくとも85%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列結合モジュールBModを含む、項1〜27のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
(ただし[BM]は、
X29がRであり;
XaがAとSから選択され、
XbがNとEから選択され;
XcがA、S、Cから選択され;
XdがE、N、Sから選択され;
XeがD、E、Sから選択され;
XfがAとSから選択されるという条件での、項1〜23のいずれか1項に記載のIL-17A結合モチーフである)と、
vi)v)に規定した配列と少なくとも85%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列結合モジュールBModを含む、項1〜27のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
(ただし[BMod]は、項28〜87のいずれか1項に記載のIL-17A結合モジュールである)と、
viii)vii)に規定した配列と少なくとも86%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含む、項1〜87のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
(ただし[BMod]は、項28〜87のいずれか1項に記載のIL-17A結合モジュールである)と、
x)ix)に規定した配列と少なくとも86%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含む、項1〜87のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
(ただし[BMod]は、項28〜87のいずれか1項に記載のIL-17A結合モジュールである)と、
xii)xi)に規定した配列と少なくとも86%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含む、項1〜87のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
以下の:
ADNNFNK-[BM]-DPSQSANLLSEAKKLNESQAPK;
ADNKFNK-[BM]-DPSQSANLLAEAKKLNDAQAPK;
ADNKFNK-[BM]-DPSVSKEILAEAKKLNDAQAPK;
ADAQQNNFNK-[BM]-DPSQSTNVLGEAKKLNESQAPK;
AQHDE-[BM]-DPSQSANVLGEAQKLNDSQAPK;
VDNKFNK-[BM]-DPSQSANLLAEAKKLNDAQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSESSELLSEAKKLNKSQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLNDAQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLNDSQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAP;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDAQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDAQAP;
AEAKFAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK;
AEAKFAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAP;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLNDAQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSESQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSESQAP;
AEAKFAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSESQAPK;
AEAKFAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSESQAP;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSEAQAPK;
AEAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLSESQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLESSQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLESSQAP;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLESAQAPK;
AEAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLESSQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSDSQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSDSQAP;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSDSQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSDAQAPK;
AEAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLSDSQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSESQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSEAQAPK;
VDAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLSESQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLESSQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLESAQAPK;
VDAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLESSQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLSDSQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSDSQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLSDAQAPK;
VDAKYAK-[BM]-QPEQSSELLSEAKKLSDSQAPK;
VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLNKAQAPK;
AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLAEAKKLNKAQAPK;
ADAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK;から選択されたアミノ酸配列を含む(ただし[BM]は、項1〜23のいずれか1項に記載のIL-17A結合モチーフである)、項1〜90のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
(ただし[BM]は、項1〜23のいずれか1項に記載のIL-17A結合モチーフである)と、
xiv)xiii)に規定した配列と少なくとも86%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含む、項1〜91のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
(ただし[BM]は、項1〜23のいずれか1項に記載のIL-17A結合モチーフである)と、
xvi)xv)に規定した配列と少なくとも86%一致するアミノ酸配列か選択されたアミノ酸配列を含む、項1〜91のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
- 望む生物活性を有するポリペプチドからなる第2の部分を含む融合タンパク質または共役体。
n=1〜7、
m=0〜7、
n+m≦8、
p=1〜10である)、項154に記載のIL-17A結合ポリペプチド、融合タンパク質、共役体、複合体。
- 前記発現ベクターから前記ポリペプチドの発現を許容する条件下で項170に記載の宿主細胞を培養し、
- そのポリペプチドを単離することを含む方法。
- その被験体を、またはその被験体から単離したサンプルを、項1〜167のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド、融合タンパク質、共役体、複合体、または項172または173に記載の組成物と接触させる工程と、
- 前記被験体または前記サンプルに結合したIL-17A結合ポリペプチド、融合タンパク質、共役体、複合体、組成物の量に対応する値を取得する工程を含む方法。
Claims (16)
- IL-17A結合モチーフBMを含んでいて、そのモチーフが、
i)EX2DX4AX6X7EIX10X11LPNL X16X17X18QX20X21AFIX25X26LX28X29
(ただし、互いに独立に、
X2は、A、M、Yから選択され;
X4は、A、D、E、F、L、M、N、Q、R、Yから選択され;
X6は、A、Q、Wから選択され;
X7は、F、I、L、M、V、W、Yから選択され;
X10は、A、Wから選択され;
X11は、A、D、E、F、G、L、M、N、S、Yから選択され;
X16は、N、Tから選択され;
X17は、H、W、Yから選択され;
X18は、A、D、E、Hから選択され;
X20は、A、G、Q、S、Wから選択され;
X21は、E、F、H、N、R、V、W、Yから選択され;
X25は、A、D、E、G、H、I、L、N、Q、R、S、T、Vから選択され;
X26は、K、Sから選択され;
X28は、I、L、N、Rから選択され;
X29は、Dである)、及び
ii)i)に規定した配列と少なくとも96%一致するアミノ酸配列
から選択されたアミノ酸配列からなる、IL-17A結合ポリペプチド。 - 配列i)において、
X2が、A、Mから選択され;
X 18が、A、D、Eから選択され;
X20が、A、G、Q、Wから選択され;
X 28が、I、N、Rから選択される、請求項1に記載のIL-17A結合ポリペプチド。 - 配列i)において、
X16がTであり;
X17がWであり;
X21が、E、F、H、W、Yから選択され;
X25が、A、D、E、G、H、I、L、N、Q、R、S、Tから選択され;
X26がKである、請求項2に記載のIL-17A結合ポリペプチド。 - 配列i)が、配列番号1-79、81-95、97-134、136-139、141-166、168-192、194、197-203、205-228、230-262、264-296、298-302、304-314、316-322、325-327、330-342、344-369、371-391、393-396、398-414、416-437、439-446、448-464、467-473、475-479、481-489、491-502、504、506-517、519-575、577-589、591-604、606-618、620-638、640-645、647-659、661-671、673-692、694-730、732-748、750-774、776-817、819-847、849-853、856-866、868、869、871-896、898-905、907-913、915-919、921-936、938-950、952-955、957-971、973-979、981-1010、1012-1019、1021-1027、1029-1032、1034、1036-1048、1050-1058、1060-1081、1083-1088、1090-1092、1094-1097、1101-1105、1108-1110、1112-1115、1118、1120-1124、1127-1129、1131-1136、1138、1139、1143、1144、1146、1148、1150、1154、1155、1158、1160、1162、1165-1168、1170-1181、1184、1185、1189-1192、1194、1198、1199、1201-1207、1213及び1214からなるグループから選択された配列中の位置8〜位置36の配列である、請求項1〜3のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
- iii)K-[BM]-DPSQS XaXbLLXc EAKKL XdXeXfQ
(ただし[BM]は、請求項1〜4のいずれか1項に記載のIL-17A結合モチーフBMのアミノ酸配列であり、
X aはAとSから選択され、
XbはNとEから選択され;
XcはA、S、Cから選択され;
XdはE、N、Sから選択され;
XeはD、E、Sから選択され;
XfはAとSから選択される)と、
iv)iii)に規定した配列と少なくとも89%一致するアミノ酸配列
から選択されたIL-17A結合モジュールBModを含む、請求項1〜4のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。 - 前記配列iii)が、配列番号1-79、81-95、97-134、136-139、141-166、168-192、194、197-203、205-228、230-262、264-296、298-302、304-314、316-322、325-327、330-342、344-369、371-391、393-396、398-414、416-437、439-446、448-464、467-473、475-479、481-489、491-502、504、506-517、519-575、577-589、591-604、606-618、620-638、640-645、647-659、661-671、673-692、694-730、732-748、750-774、776-817、819-847、849-853、856-866、868、869、871-896、898-905、907-913、915-919、921-936、938-950、952-955、957-971、973-979、981-1010、1012-1019、1021-1027、1029-1032、1034、1036-1048、1050-1058、1060-1081、1083-1088、1090-1092、1094-1097、1101-1105、1108-1110、1112-1115、1118、1120-1124、1127-1129、1131-1136、1138、1139、1143、1144、1146、1148、1150、1154、1155、1158、1160、1162、1165-1168、1170-1181、1184、1185、1189-1192、1194、1198、1199、1201-1207、1213及び1214からなるグループから選択された配列中の位置7〜位置55の配列である、請求項5に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
- vii)YA-[BMod]-AP
(ただし[BMod]は、請求項5または6に記載のIL-17A結合モジュールBModのアミノ酸配列である)と、
viii)vii)に規定した配列と少なくとも90%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含む、請求項1〜6のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。 - xiii)VDAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK
(ただし[BM]は、請求項1〜4のいずれか1項に記載のIL-17A結合モチーフBMのアミノ酸配列である)と、
xiv)xiii)に規定した配列と少なくとも89%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含む、請求項1〜7のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。 - 前記配列xiii)が配列番号1-79、81-95、97-134、136-139、141-166、168-192、194、197-203、205-228、230-262、264-296、298-302、304-314、316-322、325-327、330-342、344-369、371-391、393-396、398-414、416-437、439-446、448-464、467-473、475-479、481-489、491-502、504、506-517、519-575、577-589、591-604、606-618、620-638、640-645、647-659、661-671、673-692、694-730、732-748、750-774、776-817、819-847、849-853、856-866、868、869、871-896、898-905、907-913、915-919、921-936、938-950、952-955、957-971、973-979、981-1010、1012-1019、1021-1027、1029-1032、1034、1036-1048、1050-1058、1060-1081、1083-1088、1090-1092、1094-1097、1101-1105、1108-1110、1112-1115、1118、1120-1124、1127-1129、1131-1136、1138、1139、1143、1144、1146、1148、1150、1154、1155、1158、1160、1162、1165-1168、1170-1181、1184、1185、1189-1192、1194、1198、1199、1201-1207、1213及び1214から選択される、請求項8に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
- xv)AEAKYAK-[BM]-DPSQSSELLSEAKKLNDSQAPK
(ただし[BM]は、請求項1〜4のいずれか1項に記載のIL-17A結合モチーフBMのアミノ酸配列である)と、
xvi)xv)に規定した配列と少なくとも89%一致するアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を含む、請求項1〜7のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。 - IL-17Aに結合することができて、相互作用のKD値が最大で1×10-6 Mである、請求項1〜10のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド。
- - 請求項1〜11のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチドからなる第1の部分と;
- 望む生物活性を有するポリペプチドからなる第2の部分を含む融合タンパク質または共役体。 - 請求項1〜11のいずれか1項に記載の少なくとも1つのIL-17A結合ポリペプチド、または請求項12に記載の少なくとも1つの融合タンパク質または共役体と、少なくとも1つの抗体またはその抗原結合フラグメントとを含む複合体。
- 請求項1〜11のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド、請求項12に記載の融合タンパク質または共役体、または請求項13に記載の複合体をコードしているポリヌクレオチド。
- 請求項1〜11のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド、請求項12に記載の融合タンパク質または共役体、または請求項13に記載の複合体と、医薬として許容可能な少なくとも1つの賦形剤または基剤とを含む組成物。
- 医薬として、または診断剤として、または予後予測剤として利用するための、請求項1〜11のいずれか1項に記載のIL-17A結合ポリペプチド、請求項12に記載の融合タンパク質または共役体、請求項13に記載の複合体、または請求項15に記載の組成物。
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