JP6789922B2 - 液胞膜プロトン/糖アンチポータータンパク質および植物のサッカロース貯蔵器官のサッカロース濃度を増加させるためのその使用 - Google Patents
液胞膜プロトン/糖アンチポータータンパク質および植物のサッカロース貯蔵器官のサッカロース濃度を増加させるためのその使用 Download PDFInfo
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Description
第一の態様による核酸分子、または、
液胞膜プロトン/糖アンチポータータンパク質をコードする、好ましくは液胞膜プロトン/サッカロースアンチポータータンパク質をコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子
を含む、組換え遺伝子に関する。この核酸分子は、少なくとも1つの調節エレメントに作動的に連結されていてもよい。
第一の態様による核酸分子、または、
第二の態様による組換え遺伝子
を含む、ベクターまたは可動遺伝因子に関する。
第一の態様による核酸分子、好ましくは導入遺伝子としての第一の態様による核酸分子、
第二の態様による組換え遺伝子、または
第三の態様によるベクターもしくは可動遺伝因子
を含む、真核宿主細胞または原核宿主細胞に関する。
好ましくはサッカロース特異的である液胞膜プロトン/糖アンチポーターとして機能する、あるいは好ましくは液胞膜プロトン/サッカロースアンチポーターとして機能するタンパク質に関する。
導入遺伝子としての、第一の態様による核酸分子、
導入遺伝子としての、第二の態様による組換え遺伝子、または
第三の態様によるベクターもしくは可動遺伝因子
を含む遺伝子導入された植物細胞、
ならびに
こうした遺伝子導入された植物細胞を少なくとも1つ含む、遺伝子導入された植物またはその一部
に関する。
導入遺伝子としての、第一の態様による核酸分子、
導入遺伝子としての、第二の態様による組換え遺伝子、または
第三の態様によるベクターもしくは可動遺伝因子
を有する。
好ましくはサッカロース特異的である液胞膜プロトン/糖アンチポーターとして機能するタンパク質に関する診断用の抗体か、あるいは好ましくは液胞膜プロトン/サッカロースアンチポーターとして機能するタンパク質に関する診断用の抗体に関する。
a) 配列番号2によるヌクレオチド配列を有する核酸分子か、または、配列番号2によるヌクレオチド配列に対して少なくとも80%の同一性を示すヌクレオチド配列を有する核酸分子;
b) a)によるヌクレオチド配列のうちの1つと相補的であるヌクレオチド配列を有する核酸分子;
c) a)またはb)による核酸分子とハイブリダイズする核酸分子;
d) 配列番号1によるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子か、または、ポリペプチドであって該ポリペプチドのアミノ酸配列が配列番号1によるアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を示すポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子;および
e) 配列番号1によるポリペプチドのホモログ、アナログまたはオルソログをコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子
から選択される核酸分子が含まれる。
a) 配列番号4、6もしくは8によるヌクレオチド配列を有する核酸分子か、または、配列番号4、6もしくは8によるヌクレオチド配列対して少なくとも80%の同一性を示すヌクレオチド配列を有する核酸分子;
b) a)に記載のヌクレオチド配列のうちの1つと相補的であるヌクレオチド配列を有する核酸分子;
c) a)またはb)による核酸分子とハイブリダイズする核酸分子;
d) 配列番号3、5もしくは7によるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子か、または、ポリペプチドであって該ポリペプチドのアミノ酸配列が配列番号3、5もしくは7によるアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を示すポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子;および
e) 配列番号3、5もしくは7によるポリペプチドのホモログ、アナログまたはオルソログをコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子
から選択される核酸分子が含まれる。
第一の態様による核酸分子か、または、
好ましくは液胞膜プロトン/サッカロースアンチポータータンパク質をコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子
を含む、組換え遺伝子に関する。この核酸分子は、少なくとも1つの調節エレメントに作動的に連結されていてもよい。
第一の態様によるヌクレオチド配列を有する核酸分子か、または、
第二の態様による組換え遺伝子
を含む、ベクターまたは可動遺伝因子に関する。
導入遺伝子としての第一の態様による核酸分子、
導入遺伝子としての第二の態様による組換え遺伝子、または
導入遺伝子としての第三の態様によるベクターもしくは可動遺伝因子
含む真核宿主細胞または原核宿主細胞に関する。このことは、核酸分子、組換え遺伝子および/またはベクターまたは可動遺伝因子が、例えば形質転換またはトランスフェクションによって宿主細胞内に導入されたことを意味する。原核宿主細胞の例は、アグロバクテリウム属ツメファシエンス(A.tumefaciens)、E.コリ(E.coli)およびB.サブチリス(B.subtilis)である。真核生物宿主細胞の例は、酵母細胞、例えばサッカロマイセスまたはシゾサッカロマイセス、またさらには動物起源もしくは植物起源の細胞である。
a) 配列番号1によるアミノ酸配列を有するタンパク質;
b) 配列番号1によるアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を示すアミノ酸配列を有するタンパク質;
c) 配列番号1によるタンパク質のホモログ、アナログまたはオルソログであるタンパク質
から選択される。
a) 配列番号3、5または7によるアミノ酸配列を有するタンパク質;
b) 配列番号3、5または7によるアミノ酸配列に対して少なくとも80%の同一性を示すアミノ酸配列を有するタンパク質;
c) 配列番号3、5または7によるタンパク質のホモログ、アナログまたはオルソログであるタンパク質
から選択される。
導入遺伝子としての、第一の態様による核酸分子、
導入遺伝子としての、第二の態様による組換え遺伝子、または
導入遺伝子としての、第三の態様によるベクターもしくは可動遺伝因子
を含む遺伝子導入された植物細胞、
ならびに
こうした植物細胞を少なくとも1つ含む、遺伝子導入された植物またはその一部
に関する。この点で、この遺伝子導入された植物またはその一部も、
導入遺伝子としての、第一の態様による核酸分子、
導入遺伝子としての、第二の態様による組換え遺伝子、または
導入遺伝子としての、第三の態様によるベクターもしくは可動遺伝因子
を含む。
導入遺伝子としての、第一の態様による核酸分子、
導入遺伝子としての、第二の態様による組換え遺伝子、または
第三の態様によるベクターもしくは可動遺伝因子
を含む。
(a) 第一の態様による核酸分子、第二の態様による組換え遺伝子、および/または第三の態様によるベクターまたは可動遺伝因子を、植物の少なくとも1つの細胞に導入するステップ、および
(b) ステップ(a)において得られた植物細胞から、遺伝子導入された植物を再生させるステップ。
(1) 第一の態様による核酸分子、第二の態様による組換え遺伝子、および/または第三の態様によるベクターまたは可動遺伝因子を、植物の少なくとも1つの細胞に導入し、それによって、液胞膜プロトン/糖アンチポータータンパク質の付加的な発現または過剰発現を生じさせること、または、
(2) 内在性調節エレメントの遺伝的改変、例えば液胞膜プロトン/糖アンチポータータンパク質をコードする内在性遺伝子の発現を調節するプロモーターの遺伝的改変を、例えば付加的なシスエレメントまたはエンハンサーの挿入によって行い、それにより、調節された液胞膜プロトン/糖アンチポータータンパク質の発現の増加を生じさせること
を含む。
i. 配列番号2、4、6、8、10、12もしくは14によるヌクレオチド配列を有する核酸分子か、または、配列番号2、4、6、8、10、12もしくは14によるヌクレオチド配列のうちの1つに対して少なくとも80%の同一性を示すヌクレオチド配列を有する核酸分子;
ii. i.によるヌクレオチド配列のうちの1つと相補的であるヌクレオチド配列を有する核酸分子;
iii. i.もしくはii.による核酸分子とハイブリダイズする核酸分子;または
iv. 配列番号1、3、5、7、9、11もしくは13によるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸分子か、または、配列番号1、3、5、7、9、11もしくは13によるアミノ酸配列のうちの1つに対して少なくとも80%の同一性を示すアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸分子
が含まれる。
以下の試験のために、テンサイ品種「ベラドンナKWS」および「ブリガディエール」を使用した。品種「ベラドンナKWS」の種子はドイツ連邦共和国アインベック所在、KWS Saat AGより提供されたものであり、ビーツ品種「ブリガディエール」の種子は地元の種子小売店より購入した。
テンサイの主根組織を、野菜用スライサーを用いて採取し、直ちに液体窒素中で凍結させ、定量的な糖の測定を行うまで−80℃で貯蔵した。糖含分の測定のために、この植物組織を液体窒素中で粉砕し、この粉砕した組織50μgを80%エタノールで、80℃で20分間にわたって2回抽出した。上清を合一し、SpeedVac(ドイツ連邦共和国ハンブルク所在、Eppendorf社)を用いて蒸発させた。乾燥させた糖を水に溶解させ、記載されている通りに、マイクロプレートリーダーにおいてNADP結合酵素アッセイを用いて定量化した(Bergmeyer, H. U. and Bernt, E. (1974) ”Methods of Enzymatic Analysis”, vol.3, Bergmeyer,H.U. ed., Verlag−Chemie New York, pp.1176−117; Lee, Y.C. (1972) ”α−Mannosidase, β−glucosidase, and β−galactosidase from sweet almond emulsion”. Methods Enzymol. 28: 699−702)。
mRNAの相対的蓄積を、記載されている通りに、ノーザンブロット解析により行った(Jung, B. et al. (2011) ”Arabidopsis nucleoside hydrolases involved in intracellular and extracellular degradation of purines”. Plant J. 65: 703−711)。定量的RT−PCRを、以前に記載されている通りに行った(Leroch M. et al. (2005) ”Identification and characterization of a novel plastidic adenine nucleotide uniporter from Solanum tuberosum”. J. Biol. Chem. 280: 17992−18000)。使用した遺伝子特異的プライマーを表1に示す:
液胞の単離を、LeighおよびBrantonによる方法によって行ったが(Leigh, R. A. and Branton, D. (1976). ”Isolation of Vacuoles from Root Storage Tissue of Beta vulgaris”, L. Plant Physiol. 58: 656−662)、但し次のような変更を加えた:主根組織を野菜用スライサーで切断して厚さ0.1〜0.2mmの切片にし、これを直ちに回収培地(1Mソルビトール、1mM DTT、5mM EDTA、50mM Tris−HCl、pH7.6)内で、室温でインキュベートした。その後、この主根組織の薄い切片をかみそりの刃を用いてこの回収培地(1Mソルビトール、1mM DTT、5mM EDTA、50mM Tris−HCl、pH7.6)内で粉砕し、ステンレス鋼ふるい(100μmのメッシュサイズ)を通してろ過し、遠心分離(2,000×g、20分間、4℃)で沈殿させた。この沈殿物を、30%ニコデンツ(Nycodenz)(ドイツ連邦共和国ハイデルベルク所在、Axis−Shield GmbH)を含む回収培地に再懸濁させ、17mlの遠心チューブ(Beckmann UltraClear)に移した。後続のスイングアウト遠心分離(1,500×g、15分間、8℃)において、ニコデンツは密度勾配を形成し、かつ液胞はこの密度勾配の上層に浮いていた。
2カ月齢または5カ月齢の植物の単離した液胞膜の沈殿物を、濃度1μg/mlの緩衝液(4%SDS、50mM NH4HCO3)中に取り込んだ。この取り込んだタンパク質を80%アセトン中で、−20℃で一晩沈殿させ、さらにMuehlhausにより記載されている通りに処理した(Muehlhaus, T. et al. (2011) ”Quantitative shotgun proteomics using a uniform 15N−labeled standard to monitor proteome dynamics in time course experiments reveals new insights into the heat stress response of Chlamydomonas reinhardtii”, Mol. Cell. Proteomics 10: M110 004739)。抽出したペプチドを、200μlの緩衝液(2%アセトニトリル、0.4%酢酸)に再懸濁させた。
ベータ・ブルガリス(Beta vulgaris)の相補的DNA(cDNA)を、主根または葉から単離したRNAの逆転写により作製した。すべてのポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を、Phusion−HF DNAポリメラーゼ(Thermo Scientific)を用いて行った。
N.ベンサミアーナ(N.benthamiana)の葉肉細胞におけるユビキチンプロモーター(pUBQ10)の制御下での、そのC末端側に緑色蛍光タンパク質(GFP)を標識した糖輸送タンパク質(BvTST1−GFPおよびBvTST2.1−GFP)の、またはGFPのみを用いた、一過性過剰発現のために、Latzら(2007)により記載された5〜7週齢の植物でのアグロインフィルトレーション法を用いた(Latz et al. (2007) ”In planta AKT2 subunits constitute a pH− and Ca2+−sensitive inward rectifying K+ channel”, Planta, 225: 1179−1191)。従来技術に記載されている方法とは異なり、アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)GV3101株を、遺伝子19Kをコードするヌクレオチド配列のキャリアとして、および相応する糖輸送タンパク質/GFPコンストラクトのキャリアとして、使用した。この細菌を5mlのYEB培地内で一晩培養し、室温で8,000×gで1分間遠心分離し、アグロミックス(Agromix)で2回洗浄した(Latz et al.(2007))。これらの細菌細胞を3mlのアグロミックスに再懸濁させ、暗所で、28℃で2〜3時間保持した。インフィルトレーションのために、19Kを含有するアグロバクテリウムを含む懸濁液1mlを、pUBQ:BvTST1−GFP、pUBQ:BvTST2.1−GFPまたはpUBQ:GFPを含有するアグロバクテリウムの懸濁液1mlと混合し、そしてアグロミックス2mlと混合した。
テンサイの主根細胞の液胞膜のタンパク質構造を解析するために、5カ月齢のテンサイ(ベータ・ブルガリス(Beta vulgaris))の品種「ベラドンナKWS」の主根細胞の液胞を単離し、高速遠心分離により液胞膜を富化させた。数回洗浄した液胞膜画分からアセトンを用いて疎水性の膜タンパク質を沈殿させ、続いて尿素溶液(8M尿素)に再懸濁させ、LC−MS/MS分析の前にトリプシン消化に供した。
B.ブルガリス(B.vulgaris)のゲノムの検索に際して、液胞膜糖輸送タンパク質をコードする4つのパラロガスな遺伝子を特定することができた。系統解析(図2)は、糖トランスポーターBvTST1およびBvTST3が、アラビドプシス(Arabidopsis)のオルソロガス遺伝子AtTMT1あるいはAtTMT3と最も類似していることを示しており、一方で、BvTST2.1およびBvTST2.2は、アラビドプシス(Arabidopsis)のオルソログAtTMT2に対して最も高い配列類似性を示す遺伝子の極めて類似したペアである(図1)。BvTST2.1のアミノ酸配列は、AtTMT2のアミノ酸配列と約68%一致しており、類似性は84%である(図1)。
BvTST2.1の細胞内局在を、安定的にpUBQ:BvTST2.1−GFPを用いて形質転換させたAttst1−2遺伝子ダブルノックアウト変異体において調べた。
テンサイの主根におけるBvTST2.1の発現とテンサイのサッカロース濃度との考えられうる相関関係を調べるために、テンサイ品種「ベラドンナKWS」および「ブリガディエール」のBvTST2.1遺伝子の発現を調べた。
BvTST2.1の輸送機能を証明するために、「パッチクランプ」技術を、単離した液胞に適用した。このために、BvTST2.1−GFP融合タンパク質を、ニコチアナ・ベンサミアーナ(Nicotiana benthamiana)の葉肉細胞において一過的に発現させた。形質転換させたプロトプラストのインタクトな液胞を、軽度の低浸透性溶解後にその緑色着色によって特定することができた。
生きた植物細胞におけるBvTST2.1の基質特異性が高いことを実証するために、AtTMT遺伝子ダブルノックアウト変異体(これら2つのいずれも、実質的に液胞膜単糖トランスポータータンパク質を有していない)を、PUBQ:BvTST2.1−GFPコンストラクトかまたはpUBQ:BvTST1コンストラクトのいずれかを用いて形質転換させた。これらの形質転換体を、毒性グルコースの類似物である2−デオキシグルコースの存在下で成長させた。2−デオキシグルコースを含まない対照実験では、すべての植物系統が同様の成長を示した。2−デオキシグルコースの存在下では、tst1−2遺伝子ダブルノックアウト変異体は正常に発育しなかったが、一方で、野生型植物およびBvTST1を発現する系列は、はるかにより良好な成長を示した。野生型植物およびBvTST1を発現する遺伝子ダブルノックアウト変異体が2−デオキシグルコースの存在下でより良好に成長した理由は恐らく、2−デオキシグルコースが解毒のために液胞に輸送されえたことにあるものと考えられる。この遺伝子ダブルノックアウト変異体はこうしたことを行うことができない。BvTST2.1を発現する遺伝子ダブルノックアウト植物は、液胞膜にBvTST2.1−GFP−融合タンパク質が存在していたにもかかわらず、2−デオキシグルコースの存在下ではAttst1−2遺伝子ダブルノックアウト変異体の成長の停止を補償することができなかった。
Claims (14)
- 液胞膜プロトン/糖アンチポータータンパク質をコードする核酸分子において、前記液胞膜プロトン/糖アンチポータータンパク質がサッカロース特異的であって、サッカロース貯蔵器官のサッカロース濃度を増加させることが可能であり、かつ、
以下の群:
a) 配列番号2によるヌクレオチド配列を有する核酸分子か、または、配列番号2によるヌクレオチド配列に対して少なくとも99%の同一性を示すヌクレオチド配列を有する核酸分子;
b) a)によるヌクレオチド配列のうちの1つと相補的であるヌクレオチド配列を有する核酸分子;および
d) 配列番号1によるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子か、または、ポリペプチドであって該ポリペプチドのアミノ酸配列が配列番号1に対して少なくとも99%の同一性を示すポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有する核酸分子
から選択される核酸分子を含む、核酸分子。 - 請求項1に記載の核酸分子を含む、組換え遺伝子。
- ベクターまたは可動遺伝因子であって、請求項1に記載の核酸分子か、または請求項2に記載の組換え遺伝子を含む、前記ベクターまたは可動遺伝因子。
- 真核宿主細胞または原核宿主細胞であって、導入遺伝子としての請求項1に記載の核酸分子、導入遺伝子としての請求項2に記載の組換え遺伝子、または請求項3に記載のベクターもしくは可動遺伝因子を含む、前記真核宿主細胞または原核宿主細胞。
- 請求項1において定められた液胞膜プロトン/糖アンチポーターとして機能する、タンパク質。
- 遺伝子導入された植物細胞であって、導入遺伝子としての請求項1に記載の核酸分子、導入遺伝子としての請求項2に記載の組換え遺伝子、または請求項3に記載のベクターもしくは可動遺伝因子を含む、前記遺伝子導入された植物細胞。
- 請求項6に記載の遺伝子導入された植物細胞を少なくとも1つ含む、遺伝子導入された植物またはその一部。
- 請求項7に記載の遺伝子導入された植物の種子であって、導入遺伝子としての請求項1に記載の核酸分子、導入遺伝子としての請求項2に記載の組換え遺伝子、または請求項3に記載のベクターもしくは可動遺伝因子を有する、前記種子。
- 遺伝子導入された植物の製造方法であって、以下のステップ:
(a) 請求項1に記載の核酸分子、請求項2に記載の組換え遺伝子、または請求項3に記載のベクターもしくは可動遺伝因子を、植物の少なくとも1つの細胞に導入するステップ、および
(b) ステップ(a)において得られた植物細胞から、遺伝子導入された植物を再生させるステップ
を含む、前記方法。 - 植物の少なくとも1つの細胞における請求項1に記載の核酸分子の発現または過剰発現によって該植物のサッカロース貯蔵器官のサッカロース濃度を増加させるための方法。
- 植物であって該植物のサッカロース貯蔵器官においてサッカロース濃度の増加を生じさせるのに適した植物を特定するための方法において、請求項1に記載の核酸分子の検出、請求項5に記載のタンパク質をコードするmRNAの量の測定、または請求項5に記載のタンパク質の量の検出を含む、前記方法。
- 請求項1に記載の核酸分子を検出するための診断用の分子マーカーとしての使用に適した、オリゴヌクレオチドであって、以下の群:配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25および配列番号26によるオリゴヌクレオチドの群から選択される、前記オリゴヌクレオチド。
- 請求項5に記載のタンパク質の診断用の抗体。
- 液胞膜プロトン/糖アンチポータータンパク質をコードする核酸分子の発現または過剰発現によって植物のサッカロース貯蔵器官のサッカロース濃度を増加させるための前記液胞膜プロトン/糖アンチポータータンパク質の使用であって、前記核酸分子には、以下:
i. 配列番号2、4、6、もしくは8によるヌクレオチド配列を有する核酸分子か、または、配列番号2、4、6、もしくは8によるヌクレオチド配列のうちの1つに対して少なくとも99%の同一性を示すヌクレオチド配列を有する核酸分子;
ii. i.によるヌクレオチド配列のうちの1つと相補的であるヌクレオチド配列を有する核酸分子;または
iii. 配列番号1、3、5、もしくは7によるアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸分子か、または、配列番号1、3、5、もしくは7によるアミノ酸配列のうちの1つに対して少なくとも99%の同一性を示すアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸分子
が含まれるものとする、前記使用。
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