JP6306745B2 - オリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲート - Google Patents

オリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲート Download PDF

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Description

本発明は、オリゴマー療法の分野、そして特にＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）をターゲティングするオリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲートに関する。特に、本発明は、アンチセンス・オリゴヌクレオチドがキャリアー構成要素に付着した、オリゴマー・コンジュゲート療法の分野に関する。特定の側面において、本発明は、アンチセンス・オリゴヌクレオチドが、生理学的に不安定なリンカーによって、キャリアー構成要素に共有結合した、オリゴマー・コンジュゲート療法の分野に関する。
より具体的には、本発明は、細胞においてＨＢＶ ｍＲＮＡをターゲティングし、ウイルス性障害の治療を導くオリゴマー、特にオリゴマー・コンジュゲート療法に関する。
疾患状態を直接引き起こすか、こうした状態に関与するか、またはこうした状態を悪化させるかいずれかの、望ましくない遺伝子発現を調節するため、分子戦略が開発されてきている。１つのこうした戦略は、有害なターゲット遺伝子のメッセンジャーＲＮＡに対して、配列が相補的なオリゴヌクレオチドを用いて、遺伝子発現を阻害することを伴う。メッセンジャーＲＮＡ鎖は、コードＤＮＡ鎖のコピーであり、そしてしたがって、ＤＮＡ鎖のように、センス鎖と呼ばれる。センス鎖にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドは、アンチセンス・オリゴヌクレオチドと呼ばれる。これらの鎖がｍＲＮＡに結合すると、翻訳プロセスに干渉し、そしてその結果、遺伝子発現に干渉する。
特定のヌクレオチドに基づく化合物は、多様な療法適用に利用されてきている。特に、一本鎖および二本鎖オリゴヌクレオチド、ならびに類似体を含む、多様なオリゴヌクレオチドが調べられてきている。ｉｎ ｖｉｖｏ適用において有用であるためには、オリゴヌクレオチドは細胞膜を貫通する能力を含めて、多数の特性を持ち、細胞外および細胞内ヌクレアーゼに対する優れた耐性を持ち、ターゲットに対して高いアフィニティおよび特異性を持ち、そして好ましくは、ＲＮアーゼＨ、ＲＮアーゼＩＩＩ、ＲＮアーゼＬ等の内因性酵素を補充する能力を持たなければならない。
多くの潜在的な療法適用の根底にある、オリゴヌクレオチドの基本的な特性は、ワトソン−クリック水素結合（Ａ−ＴおよびＧ−Ｃ）または他の水素結合スキーム、例えばフーグスティーン／逆フーグスティーン様式いずれかを使用して、相補的一本鎖核酸を認識し、そしてこれに特異的にハイブリダイズする能力である。アフィニティおよび特異性は、特定のオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーション特性を特徴付けるために一般的に使用される特性である。アフィニティは、相補的ターゲットへのオリゴヌクレオチドの結合力の測定値である（二重鎖の熱安定性（Ｔｍ）として表される）。二重鎖における各核酸塩基対は、熱安定性を増加させ、そしてしたがって、オリゴヌクレオチドのサイズ（核酸塩基の数）が増加するにつれて、アフィニティが増加する。特異性は、完全に相補的であるターゲット配列およびミスマッチしたターゲット配列を区別する、オリゴヌクレオチドの能力の測定値である。
特にギャップマー設計のために、例えば１またはそれより多い修飾ヌクレオチドがウィング領域のいずれかまたは両方に存在する場合に、修飾核酸が、オリゴヌクレオチドの例えば安定性を改善するために用いられることが知られる。修飾例には、２’−Ｏ−アルキル−ＲＮＡ単位、２’−アミノ−ＤＮＡ単位、２’−フルオロ−ＤＮＡ単位、ＬＮＡ単位、アラビノ核酸（ＡＮＡ）単位、２’−フルオロ−ＡＮＡ単位、ＨＮＡ単位、ＩＮＡ（挿入核酸−本明細書に援用される、Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎ， ２００２． Ｎｕｃｌ． Ａｃｉｄｓ． Ｒｅｓ． ２００２ ３０： ４９１８−４９２５）単位、２’ＭＯＥ単位、ＥＮＡ（エチレン核酸）、ＵＮＡ（アンロック化核酸、Ｆｌｕｉｔｅｒら， Ｍｏｌ． Ｂｉｏｓｙｓｔ．， ２００９， １０， １０３９）、トリシクロＤＮＡ（Ｒ． Ｓｔｅｆｆｅｎｓ ＆ Ｃ． Ｊ． Ｌｅｕｍａｎｎ， Ｊ． Ａｍ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ， １９９７， １１９， １１５４８−４９）、ｃＥＴ−ＬＮＡ（本明細書に示す）、およびＬＮＡが含まれる。図４は、これらの類似体のいくつかの図を提示する。
特に有効な修飾核酸は、ロック化核酸（ＬＮＡ）と称される。ＬＮＡは、当該技術分野に報告されてきている。例えば、国際特許出願ＷＯ ９９／１４２２６； Ｐ． Ｎｉｅｌｓｅｎら， Ｊ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ．， Ｐｅｒｋｉｎ Ｔｒａｎｓ． １， １９９７， ３４２３； Ｐ． Ｎｉｅｌｓｅｎら， Ｃｈｅｍ． Ｃｏｍｍｕｎ．， １９９７， ９， ８２５； Ｎ． Ｋ． Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎら， Ｊ． Ａｍ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ．， １９９８， １２０， ５４５８； Ａ． Ａ． Ｋｏｓｈｋｉｎら， Ｊ． Ｏｒｇ． Ｃｈｅｍ．， １９９８， ６３， ２７７８； Ａ． Ａ Ｋｏｓｈｋｉｎら Ｊ． Ａｍ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ． １９９８， １２０， １３２５２−５３； Ｋｕｍａｒら Ｂｉｏｏｒｇ， ＆ Ｍｅｄ． Ｃｈｅｍ． Ｌｅｔｔ．，１９９８， ８， ２２１９−２２２２；およびＳ． Ｏｂｉｋａら， Ｂｉｏｏｒｇ． Ｍｅｄ． Ｃｈｅｍ． Ｌｅｔｔ．， １９９９， ５１５を参照されたい。興味深いことに、オリゴヌクレオチド配列内に、２’−Ｏ、４’−Ｃ−メチレン架橋を含有するＬＮＡ単位を取り込むと、修飾オリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーション安定性の前例のない改善につながる（上記、および例えば、Ｓ． Ｋ． Ｓｉｎｇｈら， Ｃｈｅｍ． Ｃｏｍｍｕｎ， １９９８， ４５５を参照されたい）。２’−Ｏ、４’−Ｃ−メチレン架橋（ＬＮＡ）単位、ならびにまた対応する２’−チオ−ＬＮＡ（チオ−ＬＮＡ）、２’−ＨＮ−ＬＮＡ（アミノ−ＬＮＡ）、および２’−Ｎ（Ｒ）−ＬＮＡ（アミノ−Ｒ−ＬＮＡ）類似体を含むオリゴヌクレオチドは、二環および三環ヌクレオシド修飾オリゴヌクレオチドに関して以前には観察されなかった熱安定性を持つ、相補的ＤＮＡおよびＲＮＡとの二重鎖を形成する。修飾あたりのＴｍの増加は、＋３〜＋１１℃の間で多様であり、そしてさらに、選択性もまた改善される。他のＤＮＡ類似体は、核酸に対するこうした高いアフィニティを再現可能に示してこなかった。
特定の側面において、本発明は、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）療法に関する。Ｂ型肝炎は、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）によって引き起こされるウイルス性疾患である。該疾患は、血液および血液産物などの汚染物質、汚染された針によって、性的に、そして感染したまたはキャリアーである母から子どもに垂直に、非経口的に伝染する。該疾患が、一般的に若年齢で垂直伝染する地域では、結果的に、高い比率で、感染個体は、Ｂ型肝炎の慢性的キャリアーになる。世界保健機構によれば、世界中で２０億人より多くが感染しており、年間約４００万の急性症例、年間１００万の死亡、および３億５０００〜４億の慢性キャリアーがいると概算される。キャリアーのおよそ２５％は慢性肝炎、肝硬変、または肝臓癌によって死亡し、そして慢性キャリアーのおよそ７５％がアジア系である。Ｂ型肝炎ウイルスは、タバコに次いで二番目に重大な発癌性物質であり、すべての原発性肝癌の６０％〜８０％を引き起こす。ＨＢＶは、ＨＩＶより１００倍伝染性が高い。
Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）は、エンベロープ型部分的二本鎖ＤＮＡウイルスである。コンパクトな３．２ｋｂ ＨＢＶゲノムは、４つの重複するオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）からなり、これはコア、ポリメラーゼ（Ｐｏｌ）、エンベロープおよびＸタンパク質をコードする。Ｐｏｌ ＯＲＦは最長であり、そしてエンベロープＯＲＦはその中に位置し、一方、ＸおよびコアＯＲＦは、Ｐｏｌ ＯＲＦと重複する。ＨＢＶのライフサイクルは、２つの主な事象を有する：１）弛緩した環状（ＲＣ ＤＮＡ）から閉環ＤＮＡ（ｃｃｃＤＮＡ）の生成、および２）ＲＣ ＤＮＡを産生するプレゲノムＲＮＡ（ｐｇＲＮＡ）の逆転写である。宿主細胞に感染する前、ＨＢＶゲノムは、ＲＣ ＤＮＡとしてビリオン内に存在する。ＨＢＶビリオンは、ヒト肝細胞表面上に存在する負荷電プロテオグリカンへの非特異的結合によって、そしてＨＢＶ表面抗原（ＨＢＶ ｓＡｇ）の特異的結合を通じて、宿主細胞内に進入することが可能であることが確定されている。ビリオンが細胞に進入したら、ウイルスコアおよびカプシドに包まれたＲＣ ＤＮＡは、宿主因子によって、核局在化シグナルを介し、ｌｍｐβ／ｌｍｐα核輸送受容体を通じて、核内に輸送される。核内で、宿主ＤＮＡ修復酵素は、ＲＣ ＤＮＡをｃｃｃＤＮＡに変換する。ｃｃｃＤＮＡは、すべてのウイルスｍＲＮＡのテンプレートとして働き、そしてこうしたものとして、感染個体におけるＨＢＶ持続に関与する。ｃｃｃＤＮＡから産生される転写物は、２つのカテゴリー；ｐｇＲＮＡおよびサブゲノムＲＮＡにグループ分けされる。サブゲノム転写物は、３つのエンベロープ（Ｌ、ＭおよびＳ）およびＸタンパク質をコードし、そしてｐｇＲＮＡはプレコア、コアおよびＰｏｌタンパク質をコードする。ＨＢＶ遺伝子発現またはＨＢＶ ＲＮＡ合成の阻害は、ＨＢＶウイルス複製および抗原産生の阻害を導く。例えば、ＩＦＮ−αは、ＨＢＶ共有閉環ＤＮＡ（ｃｃｃＤＮＡ）ミニ染色体からのプレゲノムＲＮＡ（ｐｇＲＮＡ）およびサブゲノムＲＮＡの転写を減少させることによって、ＨＢＶ複製およびウイルス性ＨＢｓＡｇ産生を阻害することが示された。すべてのＨＢＶウイルスｍＲＮＡはキャップ化され、そしてポリアデニル化され、そして次いで、翻訳のため、細胞質に搬出される。細胞質において、新規ビリオンの組立が開始され、そして新生ｐｇＲＮＡは、ウイルスＰｏｌと共にパッケージングされて、したがって、一本鎖ＤＮＡ中間体を通じて、ｐｇＲＮＡのＲＣ ＤＮＡへの逆転写が開始可能となる。ＲＣ ＤＮＡを含有する成熟ヌクレオカプシドは、細胞脂質、ならびにウイルスＬ、ＭおよびＳタンパク質でエンベロープ形成され、そして次いで、感染性ＨＢＶ粒子が細胞内膜での発芽によって放出される。興味深いことに、感染性ビリオンよりはるかに多数の非感染性粒子もまた産生される。これらの空のエンベロープ粒子（Ｌ、ＭおよびＳ）は、サブウイルス粒子と称される。重要なことに、サブウイルス粒子は、感染性粒子と同じエンベロープタンパク質を共有するため、これらは宿主免疫系のデコイとして作用すると推測されてきており、そしてＨＢＶワクチンに用いられてきている。Ｓ、Ｍ、およびＬエンベロープタンパク質は、３つの異なる開始コドンを含有する単一のＯＲＦから発現される。すべての３つのタンパク質は、Ｃ末端の２２６ａａ配列のＳドメインを共有する。ＭおよびＬはさらに、それぞれ、プレＳドメイン、プレＳ２およびプレＳ２およびプレＳ１を有する。しかし、ＨＢｓＡｇエピトープを有するのはＳドメインである。
あらゆる迅速複製感染性病原体と同様、連続して突然変異が起こり、ＨＢＶのいくつかの下位集団が現在の治療措置に耐性になることを補助するために、Ｂ型肝炎ウイルス感染は、医学的問題であり続けている。現在、米国肝疾患研究協会（ＡＡＳＬＤ）および欧州肝研究協会（ＥＡＳＬ）によって推奨される慢性ＨＢＶ感染の療法には、インターフェロンアルファ（ＩＮＦａ）、ペグ化インターフェロンアルファ−２ａ（Ｐｅｇ−ＩＦＮ２ａ）、エンテカビル、およびテノホビルが含まれる。しかし、典型的なインターフェロン療法は４８週間であり、そして深刻で、そして不快な副作用を生じ、そしてＨＢｅＡｇ血清変換は、療法を止めた２４週間後には、わずか２７〜３６％の範囲である。ＨＢｓＡｇの血清変換はさらに低く、治療を止めた直後にわずか３％しか観察されず、５年後に１２％に上昇する。
ＨＢＶ感染に反応した、肝細胞および／または肝臓内免疫細胞による抗ウイルス性サイトカインの分泌は、感染肝臓のウイルスクリアランスに中心的な役割を果たす。しかし、慢性感染患者は、ウイルスが宿主細胞認識系および続く抗ウイルス反応に対抗するために採用した多様なエスケープ戦略のため、弱い免疫反応しか示さない。
多くの観察によって、いくつかのＨＢＶウイルスタンパク質が、ウイルス認識シグナル伝達系およびそれに続くインターフェロン（ＩＦＮ）抗ウイルス活性に干渉することによって、初期宿主細胞反応に対抗しうることが示された。これらの中で、ＨＢＶ空サブウイルス粒子（ＳＶＰ、ＨＢｓＡｇ）の過剰な分泌は、慢性感染患者（ＣＨＢ）において観察される免疫学的寛容状態の維持に関与しうる。特にＳＶＰは、ＨＢＶ特異的Ｔ細胞免疫活性化の欠如を伴い、樹状細胞による抗原提示の欠如に寄与して、ウイルス持続を可能にしうる。ＨＢｓＡｇ定量化は、感染転帰を予測する有意なバイオマーカーである；しかし、ＨＢｓＡｇ血清変換の達成は、慢性感染患者において、稀にしか観察されない。ＳＶＰおよびＨＢｓＡｇ負荷の減少は、抗ウイルス免疫機能を回復させる経路と考えられ、そして抗ウイルス療法後のＨＢｓＡｇ陰性への血清変換は、機能的治癒の指標と見なされることも可能であり、そして最終的な療法ゴールであり続けている。したがって、ＣＨＢ患者において、ＨＢＶ ＤＮＡレベルとともにＨＢｓＡｇの減少を導くＨＢＶ遺伝子発現のターゲティングは、ＣＨＢ患者免疫再活性化および寛解を有意に改善しうる。
ヌクレオシドおよびヌクレオチド療法剤、エンテカビルおよびテノホビルは、ウイルス負荷を減少させるのに成功したが、ＨＢｅＡｇ血清変換およびＨＢｓＡｇ喪失の率はＩＦＮａ量法を用いて得られたものよりもさらに低い。ラミブジン（３ＴＣ）、テルビブジン（ＬｄＴ）、およびアデホビルを含む、他の類似の療法もまた用いられるが、一般に、ヌクレオシド／ヌクレオチド療法に関しては、耐性出現が療法有効性を制限する。
ＵＳ ８，５９８，３３４およびＷＯ ２０１２／１４５６９７は、ターゲットＨＢＶに対するアンチセンス・オリゴヌクレオチドの使用に言及する。
ウイルス感染の制御は、感染後、数分から数時間以内に反応可能であり、ウイルスの初期増殖に影響を及ぼし、そして慢性および持続性感染の発展を制限する、宿主生得的免疫系の緊密な監視を必要とする。ＩＦＮおよびヌクレオシ（チ）ド類似体に基づく現在利用可能な治療があるにもかかわらず、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）感染は、世界中で、主要な健康上の問題であり続けており、推定３億５０００万の慢性キャリアーに関与し、これらの人々は、肝硬変および肝細胞性肝癌のより高いリスクを有している。
ＷＯ ９９／１４２２６ ＵＳ ８，５９８，３３４ ＷＯ ２０１２／１４５６９７
Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎ， ２００２． Ｎｕｃｌ． Ａｃｉｄｓ． Ｒｅｓ． ２００２ ３０： ４９１８−４９２５ Ｆｌｕｉｔｅｒら， Ｍｏｌ． Ｂｉｏｓｙｓｔ．， ２００９， １０， １０３９ Ｒ． Ｓｔｅｆｆｅｎｓ ＆ Ｃ． Ｊ． Ｌｅｕｍａｎｎ， Ｊ． Ａｍ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ， １９９７， １１９， １１５４８−４９ Ｐ． Ｎｉｅｌｓｅｎら， Ｊ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ．， Ｐｅｒｋｉｎ Ｔｒａｎｓ． １， １９９７， ３４２３ Ｐ． Ｎｉｅｌｓｅｎら， Ｃｈｅｍ． Ｃｏｍｍｕｎ．， １９９７， ９， ８２５ Ｎ． Ｋ． Ｃｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎら， Ｊ． Ａｍ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ．， １９９８， １２０， ５４５８ Ａ． Ａ． Ｋｏｓｈｋｉｎら， Ｊ． Ｏｒｇ． Ｃｈｅｍ．， １９９８， ６３， ２７７８ Ａ． Ａ Ｋｏｓｈｋｉｎら Ｊ． Ａｍ． Ｃｈｅｍ． Ｓｏｃ． １９９８， １２０， １３２５２−５３ Ｋｕｍａｒら Ｂｉｏｏｒｇ， ＆ Ｍｅｄ． Ｃｈｅｍ． Ｌｅｔｔ．，１９９８， ８， ２２１９−２２２２ Ｓ． Ｏｂｉｋａら， Ｂｉｏｏｒｇ． Ｍｅｄ． Ｃｈｅｍ． Ｌｅｔｔ．， １９９９， ５１５ Ｓ． Ｋ． Ｓｉｎｇｈら， Ｃｈｅｍ． Ｃｏｍｍｕｎ， １９９８， ４５５
新規抗ウイルス療法、特に抗ＨＢＶ療法に関する必要性がある。また、ＨＢＶ遺伝子型の異なるタイプをターゲティングすることを可能にする療法戦略を有する必要もある。
発明の概要
本発明は、医学、例えばウイルス性障害の治療において使用するために適したオリゴマー・コンジュゲート、該コンジュゲートの使用、該コンジュゲートを用いる方法に関する。
特に、本発明は、ウイルス性障害の治療において使用するために適しているオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであって、前記オリゴマーまたは前記オリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーがＢ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能である、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを提供する。特定の態様において、キャリアー構成要素がオリゴマーにコンジュゲート化される。
本発明は、本明細書に定義するようなオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであって、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、ＨＢＶ ＨＢｘ遺伝子またはＨＢｓＡｇ遺伝子、あるいはＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢＶ ＨＢｓＡｇをコードする核酸のターゲット領域の逆相補体に対応する領域に、少なくとも８０％同一である、好ましくは少なくとも８５％同一である、好ましくは少なくとも９０％同一である、好ましくは少なくとも９１％同一である、好ましくは少なくとも９２％同一である、好ましくは少なくとも９３％同一である、好ましくは少なくとも９４％同一である、好ましくは少なくとも９５％同一である、好ましくは少なくとも９６％同一である、好ましくは少なくとも９７％同一である、好ましくは少なくとも９８％同一である、好ましくは少なくとも９９％同一である、好ましくは同一である、少なくとも６、好ましくは少なくとも７、好ましくは少なくとも８、好ましくは少なくとも９、好ましくは少なくとも１０単位、好ましくは少なくとも１１単位、好ましくは少なくとも１２単位、好ましくは少なくとも１３単位、好ましくは少なくとも１４単位、好ましくは少なくとも１５単位、好ましくは少なくとも１６単位を含む、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを提供する。
本発明は、本明細書に定義するようなオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであって、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、ＨＢＶ ＨＢｘ遺伝子またはＨＢｓＡｇ遺伝子、あるいはＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢＶ ＨＢｓＡｇをコードする核酸のターゲット領域の逆相補体に対応する領域に同一である、少なくとも６、好ましくは少なくとも７、好ましくは少なくとも８、好ましくは少なくとも９、好ましくは少なくとも１０単位を含む、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを提供する。
特定の態様に関して、本発明は、本明細書に定義するようなオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであって、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、２０単位未満、例えば１９単位未満、例えば１８単位未満、例えば１７単位未満、例えば１６単位またはそれより少ない単位を含む、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを提供する。
特定の態様に関して、本発明は、本明細書に定義するようなオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであって、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、１５単位または１６単位を含む、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを提供する。
本発明は、本発明記載のオリゴマー、および前記オリゴマーに共有結合した少なくとも１つの非ヌクレオチドまたは非ポリヌクレオチド部分を含む、コンジュゲートを提供する。
本発明は、本発明記載のオリゴマーまたはコンジュゲート、および薬学的に許容されうる希釈剤（例えば水または生理食塩水）、キャリアー、塩またはアジュバントを含む、薬学的組成物を提供する。
本発明は、薬剤として使用するための、例えばウイルス性障害の治療のための、本発明記載のオリゴマーまたはコンジュゲートを提供する。
本発明は、ウイルス性障害の治療用の薬剤製造のための、本発明記載のオリゴマーまたはコンジュゲートの使用を提供する。
本発明は、ウイルス性障害を治療する方法であって、本発明記載のオリゴマー、オリゴマー・コンジュゲートまたは薬学的組成物の有効量を、ウイルス性障害を患うまたは患う可能性が高い動物（例えば疾患または障害を患うかまたはこれらに感受性である動物）に投与する工程を含む、前記方法を提供する。
本発明は、ウイルス性障害を治療する方法であって、本発明記載のオリゴマー、オリゴマー・コンジュゲートまたは薬学的組成物の有効量を、ウイルス性障害を患うまたは患う可能性が高い非ヒト動物（例えば疾患または障害を患うかまたはこれらに感受性である非ヒト動物）に投与する工程を含む、前記方法を提供する。
本発明は、ウイルス性障害を治療する方法であって、本発明記載のオリゴマー、オリゴマー・コンジュゲートまたは薬学的組成物の有効量を、ウイルス性障害を患うまたは患う可能性が高いヒト患者（例えば疾患または障害を患うかまたはこれらに感受性であるヒト患者）に投与する工程を含む、前記方法を提供する。
また、非ヒト動物またはヒトに、本発明のオリゴマー、コンジュゲートまたは薬学的組成物の１またはそれより多くの療法的または予防的有効量を投与することによって、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの発現または過剰発現に関連する疾患または状態を有すると推測されるかまたはこうした疾患または状態に感受性である動物（非ヒト動物またはヒト）を治療する方法も開示する。さらに、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの発現を阻害するために、そしてＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの活性に関連する疾患を治療するために、オリゴマーを用いる方法を提供する。
本発明はさらに、本発明記載の薬学的組成物およびさらなる薬学的実体／療法的実体を含む、薬剤系を提供する。さらなる薬学的実体は、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであることも可能である。さらなる薬学的実体は、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇ内にはない、ＨＢＶ中のターゲット配列を調節することが可能なオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであることも可能である。例えば、少なくとも１つのオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＨＢＶ ＨＢｓＡｇ、ＨＢｅＡｇ、またはＤＮＡポリメラーゼの遺伝子またはｍＲＮＡ内のターゲット配列を調節することが可能であることも可能である。
１つの態様において、本発明記載の複数のオリゴマーまたはコンジュゲートを、治療が必要な被験体に投与する。オリゴマーまたはコンジュゲートを、さらなる薬学的／療法的剤とともに投与することも可能である。
１つの態様において、疾患または障害または状態は、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの過剰発現に関連する。
本発明は、細胞または組織中のＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの発現を調節するための方法であって、細胞または組織を、ｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏで、オリゴマー、コンジュゲート、またはその薬学的組成物の１またはそれより多くの有効量と接触させて、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの発現調節を達成する工程を含む、前記方法を提供する。
本発明は、細胞または組織中のＨＢｘの発現を阻害する（例えば下方制御することによって）方法であって、細胞または組織を、ｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏで、オリゴマー、コンジュゲート、またはその薬学的組成物の１またはそれより多くの有効量と接触させて、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの発現の下方制御を達成する工程を含む、前記方法を提供する。
本発明は、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇを発現している細胞における、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇを阻害するための方法であって、前記細胞におけるＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの阻害を達成するように、本発明記載のオリゴマーまたはコンジュゲートを、前記細胞に投与する工程を含む、前記方法を提供する。
細胞または組織における、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの発現を下方制御する方法であって、前記細胞または組織を、ｉｎ ｖｉｔｒｏまたはｉｎ ｖｉｖｏで、本発明のオリゴマー、オリゴマー・コンジュゲートまたは組成物の１またはそれより多くの有効量と接触させる工程を含む、前記方法をさらに提供する。
ここで、本発明の側面を提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療において使用するためのオリゴマー・コンジュゲートであって：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含む、前記オリゴマー・コンジュゲートを提供する。好ましくは、キャリアー構成要素は、前記の第一のオリゴマーを肝臓に送達するためのものである。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適したオリゴマー・コンジュゲートであって：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含む、前記オリゴマー・コンジュゲートを提供する。好ましくは、キャリアー構成要素は、前記の第一のオリゴマーを肝臓に送達するためのものである。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適した組成物であって、前記組成物がオリゴマー・コンジュゲートおよび少なくとも１つのさらなる異なるオリゴヌクレオチドを含み；前記オリゴマー・コンジュゲートが：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含む、前記組成物を提供する。好ましくは、キャリアー構成要素は、前記の第一のオリゴマーを肝臓に送達するためのものである。
１つの側面において、本発明は、配列番号３の１５３０〜１５９８；１２６４〜１２７８および６７０〜７０６位の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるターゲット配列にハイブリダイズする、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素を提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害を治療するため、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節することが可能である、
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づくオリゴマーを提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適した組成物であって、前記組成物がオリゴマーおよび少なくとも１つのさらなる異なるオリゴヌクレオチドを含み；前記オリゴマーが、前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な少なくとも１つの第一のオリゴマー領域を含む、前記組成物を提供する。
１つの側面において、本発明は、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートの有効量を、治療が必要な被験体に投与する工程を含む、ウイルス性障害を治療するための方法を提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害を治療するための方法であって、本発明記載の組成物の有効量を、治療が必要な被験体に投与する工程を含む、前記方法を提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害を治療するための方法であって、本発明記載のオリゴマーの有効量を、治療が必要な被験体に投与する工程を含む、前記方法を提供する。
１つの側面において、本発明は、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲート；および１またはそれより多い薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントを含む薬学的組成物を提供する。
１つの側面において、本発明は、本発明記載の組成物；および１またはそれより多い薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントを含む薬学的組成物を提供する。
１つの側面において、本発明は、本発明記載のオリゴマー；および１またはそれより多い薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントを含む薬学的組成物を提供する。
１つの側面において、本発明は、本発明記載の薬学的組成物およびさらなる薬学的実体を含む薬剤系を提供する。
１つの側面において、本発明は、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートを構築するための：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるモチーフを提供する。
１つの側面において、本発明は、本発明記載の組成物を構築するための：ＧＣＧＴＡＡＡＧＡＧＡＧＧＴ（配列番号１１）およびＣＧＣＧＴＡＡＡＧＡＧＡＧＧＴ（配列番号１２）の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるモチーフを提供する。
１つの側面において、本発明は、本発明記載の組成物を構築するための：ＡＧＣＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧ（配列番号２０）；ＡＧＧＴＧＡＡＧＣＧＡＡＧＴＧ（配列番号２６）；ＡＧＣＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧＧ（配列番号１８）；ＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧＧ（配列番号１６）；ＧＣＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧＧ（配列番号１７）；ＣＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧ（配列番号１９）およびＡＧＧＴＧＡＡＧＣＧＡＡＧＴ（配列番号２７）の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるモチーフを提供する。
１つの側面において、本発明は、本発明記載の１またはそれより多いオリゴマーと、本発明記載のキャリアー構成要素をコンジュゲート化する工程を含む、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートを製造する方法を提供する。
１つの側面において、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートを、薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントと混合する工程を含む、本発明記載の組成物を製造する方法を提供する。
ＬＮＡオリゴマーＧａｌＮＡｃコンジュゲート化工程に関するスキームを提示する。 オリゴマー（領域Ａまたは生理学的に不安定であるリンカー領域ＰＬ、例えばＰＯリンカー）にキャリアー構成要素を連結するために用いるＣ６リンカー部分（領域Ｅ）を含む、コレステロールまたはモノＧａｌＮＡｃキャリアー構成要素の例を提示する。波線はオリゴマーまたは領域ＰＬへの共有結合を示す。 トリＧａｌＮＡｃキャリアー構成要素の例を提示する。コンジュゲート１〜４は、４つの適切なＧａｌＮＡｃキャリアー構成要素を例示し、そしてコンジュゲート１ａ〜４ａは、オリゴマー（領域Ａまたは生理学的に不安定であるリンカー領域ＰＬ、例えばＰＯリンカー）にキャリアー構成要素を連結するために用いるさらなるＣ６リンカー部分（領域Ｅ）を含む、同じキャリアー構成要素を指す。波線はオリゴマーまたは領域ＰＬへの共有結合を示す。 図３−１の説明と同じ。 図３−１の説明と同じ。 図３−１の説明と同じ。 三価ＧａｌＮＡｃキャリアー構成要素を含むオリゴマー・コンジュゲートの例を提示する。 図４−１の説明と同じ。 一連のヌクレオシド類似体に関する構造を提示する。 配列番号８０８の構造を提示する。 配列番号８１４の構造を提示する。 配列番号８１５の構造を提示する。 配列番号８２５の構造を提示する。 配列番号８２６の構造を提示する。 用量０．２８ｍｐｋ（■）、１．４ｍｇ／ｋｇ（▲）および７．１ｍｐｋ（▼）の配列番号８０７；用量７．１ｍｇ／ｋｇ（■）、１．４２ｍｇ／ｋｇ（▲）および０．２９ｍｇ／ｋｇ（▼）の配列番号８０８；用量０．２５２ｍｇ／ｋｇ（▲）および１．２６ｍｇ／ｋｇ（▼）、６．１５ｍｇ／ｋｇ（◆）の配列番号８１４；用量０．３ｍｇ／ｋｇ（■）、１．５ｍｇ／ｋｇ（▲）および７．５ｍｇ／ｋｇ（▼）の配列番号８１５；用量０．３ｍｇ／ｋｇ（▲）、１．５ｍｇ／ｋｇ（▼）、および７．５ｍｇ／ｋｇ（◆）の配列番号８２５；用量７．１ｍｇ／ｋｇ（■）、１．４２ｍｇ／ｋｇ（▲）および０．２９ｍｇ／ｋｇ（▼）の配列番号８２６のＨＢｓＡＧ減少。 用量０．２８ｍｐｋ（■）、１．４ｍｇ／ｋｇ（▲）および７．１ｍｐｋ（▼）の配列番号８０７；用量７．１ｍｇ／ｋｇ（■）、１．４２ｍｇ／ｋｇ（▲）および０．２９ｍｇ／ｋｇ（▼）の配列番号８０８；用量０．２５２ｍｇ／ｋｇ（▲）および１．２６ｍｇ／ｋｇ（▼）、６．１５ｍｇ／ｋｇ（◆）の配列番号８１４；用量０．３ｍｇ／ｋｇ（■）、１．５ｍｇ／ｋｇ（▲）および７．５ｍｇ／ｋｇ（▼）の配列番号８１５；用量０．３ｍｇ／ｋｇ（▲）、１．５ｍｇ／ｋｇ（▼）、および７．５ｍｇ／ｋｇ（◆）の配列番号８２５；用量７．１ｍｇ／ｋｇ（■）、１．４２ｍｇ／ｋｇ（▲）および０．２９ｍｇ／ｋｇ（▼）の配列番号８２６のＨＢｅＡＧ減少。 用量０．２８ｍｐｋ（■）、１．４ｍｇ／ｋｇ（▲）および７．１ｍｐｋ（▼）の配列番号８０７；用量７．１ｍｇ／ｋｇ（■）、１．４２ｍｇ／ｋｇ（▲）および０．２９ｍｇ／ｋｇ（▼）の配列番号８０８；用量０．２５２ｍｇ／ｋｇ（▲）および１．２６ｍｇ／ｋｇ（▼）、６．１５ｍｇ／ｋｇ（◆）の配列番号８１４；用量０．３ｍｇ／ｋｇ（■）、１．５ｍｇ／ｋｇ（▲）および７．５ｍｇ／ｋｇ（▼）の配列番号８１５；用量０．３ｍｇ／ｋｇ（▲）、１．５ｍｇ／ｋｇ（▼）、および７．５ｍｇ／ｋｇ（◆）の配列番号８２５；用量７．１ｍｇ／ｋｇ（■）、１．４２ｍｇ／ｋｇ（▲）および０．２９ｍｇ／ｋｇ（▼）の配列番号８２６のＨＢＶ ＤＮＡ減少。 用量０．２ｍｇ／ｋｇ、１．０ｍｇ／ｋｇおよび５．０ｍｇ／ｋｇの配列番号８０７の皮下（ＳＣ）および静脈内（ＩＶ）投与経路からの結果を提示する。Ａ）はＨＢｓＡＧ減少を提示する。Ｂ）はＨＢｅＡＧ減少を提示する。Ｃ）はＤＮＡ減少を提示する。 図１４−１の説明と同じ。 等モルオリゴマー投薬量で試験した、非コンジュゲート化オリゴマー（■）（配列番号３０８および３０３）およびコンジュゲート化オリゴマー（▼）（配列番号８０７および８１５）に関する結果を提示する。Ａ）はＨＢｓＡＧ減少を提示する。Ｂ）はＨＢｅＡＧ減少を提示する。Ｃ）はＤＮＡ減少を提示する。 図１５−１の説明と同じ。
本発明の定義／要素
以下は、本発明のすべての側面に当てはまる用語の定義を提示する。これらの定義は、互いに排他的ではない。これらの定義はまた、本発明のすべての側面に関するさらなる態様を解説する。
オリゴマー／オリゴヌクレオチド
本発明の背景において、本明細書で用いるような「オリゴマー」および「オリゴヌクレオチド」に対する言及はまた、例えば第一のオリゴマー領域がオリゴマー・コンジュゲート中である場合、または遊離型でない場合（すなわちオリゴマー・コンジュゲート中にない場合）、第一のオリゴマー領域および／または第二のオリゴマー領域にも当てはまる。
用語「オリゴマー」は、２またはそれより多いヌクレオチドの共有結合によって形成される分子（すなわちオリゴヌクレオチド）を指す。したがって、本明細書において、用語「オリゴマー」および「オリゴヌクレオチド」は、交換可能であり、そして同一の意味を有する。本明細書において、単一ヌクレオチド（単位）はまた、単量体または単位と称されることも可能である。いくつかの態様において、用語「ヌクレオシド」、「ヌクレオチド」、「単位」および「単量体」は、交換可能に用いられる。ヌクレオチドまたは単位の配列を指す場合、指しているものは、塩基、例えばＡ、Ｔ、Ｇ、ＣまたはＵの配列であることが認識されるであろう。
本明細書において、用語「オリゴマー」および「オリゴヌクレオチド」には、単位間相互作用の規則的なパターン、例えば、ワトソン−クリック型塩基対形成、フーグスティーンまたは逆フーグスティーン型塩基対形成等によって、ターゲット・ポリヌクレオチドへの特異的結合が可能である、デオキシリボヌクレオシド、リボヌクレオシド、その置換およびアルファ−アノマー型、ペプチド核酸（ＰＮＡ）等を含む、天然および／または修飾単位または連結の直鎖または環状オリゴマーが含まれる。
オリゴヌクレオチドは、単一領域で構成されてもよく、またはいくつかの領域で構成されてもよい。オリゴヌクレオチドは、「キメラ」であることも可能であり、すなわち異なる領域で構成されてもよい。本発明の背景において、「キメラ」アンチセンス化合物は、２またはそれより多い化学領域、例えばＤＮＡ領域（単数または複数）、ＲＮＡ領域（単数または複数）、ＰＮＡ領域（単数または複数）等を含有する、アンチセンス化合物、特にオリゴヌクレオチドである。各化学領域は、少なくとも１つの単位、すなわちオリゴヌクレオチド化合物の場合、ヌクレオチドで構成される。これらのオリゴヌクレオチドは、典型的には、１またはそれより多い、求められる特性を示すために、オリゴヌクレオチドが修飾されている、少なくとも１つの領域を含有する。オリゴヌクレオチドの求められる特性は、ヌクレアーゼ分解に対する耐性増加、細胞取り込み増加、および／またはターゲット核酸に対する結合アフィニティ増加であることも可能である。オリゴヌクレオチドの異なる領域は、したがって、異なる特性を有することも可能である。オリゴヌクレオチドの１またはそれより多い領域が、ＲＮＡ：ＤＮＡまたはＲＮＡ：ＲＮＡハイブリッドを切断することが可能な酵素の基質として働くことも可能である。こうした触媒効果を持ついくつかの酵素がある。アンチセンス・オリゴヌクレオチドおよびＲＮアーゼＨを用いて、特定の位置でＲＮＡを消化する方法が、Ｍｉｎｓｈｕｌｌら（Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ， １４：６４３３−６４５１ （１９８６））によって立証されてきている。ＲＮアーゼＨは、ＲＮＡ：ＤＮＡ二重鎖のＲＮＡ鎖を切断する、細胞性エンドヌクレアーゼである。したがって、ＲＮアーゼＨの活性化は、ＲＮＡターゲットの切断を生じる。遺伝子発現のオリゴヌクレオチド阻害の有効性は、したがって、増進可能である。切断可能な他の酵素は、ＲＮアーゼＬおよびＲＮアーゼＰである。
核酸塩基
用語「核酸塩基」は、ヌクレオチドの塩基部分を指し、そして天然存在ならびに非天然存在変異体の両方を含む。
したがって、「核酸塩基」は、既知のプリンおよびピリミジン複素環だけでなく、複素環類似体およびその互変異性体もまた含む。
核酸塩基の例には、限定されるわけではないが、アデニン、グアニン、シトシン、チミジン、ウラシル、キサンチン、ヒポキサンチン、５−メチルシトシン、イソシトシン、プソイドイソシトシン、５−ブロモウラシル、５−プロピニルウラシル、６−アミノプリン、２−アミノプリン、イノシン、ジアミノプリン、および２−クロロ−６−アミノプリンが含まれる。
いくつかの態様において、オリゴマー中に存在する核酸塩基の少なくとも１つは、５−メチルシトシン、イソシトシン、プソイドイソシトシン、５−ブロモウラシル、５−プロピニルウラシル、６−アミノプリン、２−アミノプリン、イノシン、ジアミノプリン、および２−クロロ−６−アミノプリンからなる群より選択される修飾核酸塩基である。
単位
本明細書において、用語「単位」または「単量体」は、典型的には、ホスホジエステル結合またはその類似体によって連結されて、数単量体単位、例えば約３〜４から、約数百の単量体単位のサイズ範囲である、オリゴヌクレオチドを形成する、ヌクレオシド単位を示す。ホスホジエステル連結の類似体には：ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、メチルホスホロネート、ホスホロセレノエート、ホスホラミデート等が含まれる。
ヌクレオシドおよびヌクレオシド類似体
いくつかの態様において、用語「ヌクレオシド類似体」および「ヌクレオチド類似体」は、交換可能に用いられる。
用語「ヌクレオチド」は、本明細書において、糖部分、塩基部分および共有結合基（連結基）、例えばリン酸またはホスホロチオエート・ヌクレオチド間連結基を含む、配糖体を指し、そして天然存在ヌクレオチド、例えばＤＮＡまたはＲＮＡ、および本明細書において、「ヌクレオチド類似体」とも称される、修飾糖および／または塩基部分を含む非天然存在ヌクレオチドの両方を含む。本明細書において、単一ヌクレオチド（単位）はまた、単量体または核酸単位と称されることも可能である。
生化学の分野において、用語「ヌクレオシド」は、一般的に、糖部分および塩基部分を含む配糖体を指すために用いられ、そしてしたがって、ヌクレオチド単位に言及する際、オリゴマーのヌクレオチド間のヌクレオチド間連結によって共有結合されるものに用いることも可能である。
バイオテクノロジーの分野において、用語「ヌクレオチド」は、しばしば、核酸単量体または単位を指すために用いられ、そしてこうしたものとして、オリゴヌクレオチドの背景において、塩基、例えば「ヌクレオチド配列」を指すことも可能であり、そして典型的には、核酸塩基配列（すなわち糖主鎖およびヌクレオシド間連結の存在が潜在する）を指すことも可能である。
同様に、特に、１またはそれより多いヌクレオチド間連結基が修飾されているオリゴヌクレオチドの場合、用語「ヌクレオチド」は、「ヌクレオシド」を指すことも可能であり、例えば、ヌクレオシド間の連結の存在または性質を明記する場合であっても、用語「ヌクレオチド」を用いることも可能である。
一般の当業者が認識するであろうように、オリゴヌクレオチドの５’末端ヌクレオチドは、５’末端基を含んでもまたは含まなくてもよいが、５’ヌクレオチド間連結基を含まない。
非天然存在ヌクレオチドには、修飾糖部分を有するヌクレオチド、例えば二環ヌクレオチド、または２’修飾ヌクレオチド、例えば２’置換ヌクレオチドが含まれる。
「ヌクレオチド類似体」は、例えば糖および／または塩基部分の修飾による、天然ヌクレオチド、例えばＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオチドの変異体である。類似体は、原理的に、オリゴヌクレオチドの背景において、単に「サイレント」であるかまたは天然ヌクレオチドに「同等」であることも可能であり、すなわちオリゴヌクレオチドがターゲット遺伝子発現を阻害するように働く方式に、機能的な影響を持たない。こうした「同等の」類似体は、にもかかわらず、例えばこれらの製造がより容易であるかまたはより安いか、あるいは保存または製造条件に対してより安定であるか、あるいはタグまたは標識を提示する場合、有用である可能性もある。好ましくは、しかし、類似体は、オリゴマーが発現を阻害するように働く方式に対して機能的影響を有し；例えばターゲットに対する結合アフィニティ増加および／または細胞内ヌクレアーゼに対する耐性増加および／または細胞内への輸送の容易さの増加を生じることによって、影響を有するであろう。ヌクレオシド類似体の特定の例は、例えば、Ｆｒｅｉｅｒ ＆ Ａｌｔｍａｎｎ； Ｎｕｃｌ． Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．， １９９７， ２５， ４４２９−４４４３、およびＵｈｌｍａｎｎ； Ｃｕｒｒ． Ｏｐｉｎｉｏｎ ｉｎ Ｄｒｕｇ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ， ２０００， ３（２）， ２９３−２１３に、そして図４に提示するスキーム１に記載される。
リンカー／リンカー基等
用語「リンカー基」、「連結基」、「リンカー」、「リンカー分子」または「ヌクレオシド間連結」は、２つの実体、例えばヌクレオチドをともに共有カップリングすることが可能な基を意味するよう意図される。特定の例には、リン酸基およびホスホロチオエート基が含まれる。こうしたリンカーは、１またはそれより多い活性化基または官能基に共有結合したスペーサー分子を含有することも可能である。場合によって、リンカー分子の官能基をカップリング剤で処理して、活性化基を形成することも可能である。こうしたリンカーにはまた、本明細書に記載するような係留分子も含まれる。
用語「分枝領域」は、２またはそれより多い実体、例えばヌクレオチドをともに共有カップリングすることが可能な基または領域、あるいはキャリアー構成要素クラスター、例えばガラクトース・クラスターの生成のためのものを意味するよう意図される。
あるいは、本明細書に記載するような「リンカー基」および「分枝領域」を用いて、ヌクレオチド領域および非ヌクレオチド領域を共有カップリングすることも可能であり、こうしたリンカー基はＬと称される。例えば、リンカー基を用いて、本発明のオリゴマーを本明細書記載のキャリアー構成要素にコンジュゲート化することも可能である。例えば、分枝領域を用いて、本発明のオリゴマーを本明細書記載の１またはそれより多いキャリアー構成要素にコンジュゲート化することも可能である。例えば、分枝領域を用いて、本発明の１またはそれより多いオリゴマーを本明細書記載のキャリアー構成要素にコンジュゲート化することも可能である。例えば、分枝領域を用いて、本発明の１またはそれより多いオリゴマーを本明細書記載の１またはそれより多いキャリアー構成要素にコンジュゲート化することも可能である。
オリゴマー・コンジュゲート
用語「オリゴマー・コンジュゲート」は、本明細書に記載するようなオリゴマーのキャリアー構成要素への付着（「コンジュゲート化」）によって、例えば共有結合によって、形成される異種分子を示すよう意図される。
連結、例えば共有コンジュゲート化は、性質が化学的であってもよく、例えばリンカー基を介してもよいし、または性質が遺伝子的であってもよく、例えば組換え遺伝子技術によって、例えばレポーター分子（例えば緑色蛍光タンパク質、β−ガラクトシダーゼ、Ｈｉｓタグ等）との融合タンパク質におけるようなものなどであってもよい。あるいは、オリゴマーを直接、いかなる束縛分子またはリンカー基の必要も伴わずに、キャリアー構成要素にコンジュゲート化してもよい。
キャリアー構成要素
本明細書において、用語「キャリアー構成要素」は、本発明のオリゴマーを望ましい位置、例えば望ましい解剖学的位置に輸送するかまたは運搬するよう意図される、分子ビヒクルに関する。
本発明記載のキャリアー構成要素を用いて、オリゴマーの活性、細胞分布および／または細胞取り込みを増進させることも可能である。
任意の適切なキャリアー構成要素が使用可能である。
キャリアー構成要素はポリヌクレオチドであってもよい。しかし、典型的には、キャリアー構成要素は非ヌクレオチド部分または非ポリヌクレオチド部分である。
非ヌクレオチドまたは非ポリヌクレオチド部分の例には、炭水化物、細胞表面受容体リガンド、薬剤物質、ホルモン、親油性物質、ポリマー、タンパク質、ペプチド、毒素（例えば細菌毒素）、ビタミン、ウイルスタンパク質、またはその組み合わせからなる群より選択される巨大分子が含まれる。典型的なポリマーは、ポリエチレングリコールおよび／またはポリプロピレングリコール（ＰＰＧ）であることも可能である。
いくつかの態様において、キャリアー構成要素は、アミノ酸、タンパク質、ペプチドまたはポリペプチドであることも可能である。典型的には、タンパク質は、酵素、血清タンパク質（例えばヒト血清アルブミン（ＨＳＡ）、トランスフェリンまたは糖タンパク質）、受容体、望ましいターゲット抗原に結合するよう設計された抗体または抗体誘導体、例えば一本鎖可変断片、二重特異性抗体、トリボディ等であることも可能である。
ペプチドキャリアー構成要素の例は、細胞浸透を有意に増加させるポリ（Ｌ−リジン）、およびアンテナペディア輸送ペプチドである。こうしたコンジュゲートは、Ｌｅｍａｉｔｒｅら， 「水疱性口内炎ウイルスＮタンパク質ｍＲＮＡ開始部位に相補的なポリ（Ｌ−リジン）コンジュゲート化オリゴデオキシリボヌクレオチド配列の特異的抗ウイルス活性」 Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ， ８４：６４８−６５２， １９８７；米国特許第６，１６６，０８９号および第６，０８６，９００号によって記載される。上記刊行物中の方法は、３’末端ヌクレオチドがリボヌクレオチドであることを必要とする。生じるアルデヒド基を次いで、シッフ塩基形成によって、ポリ（Ｌ−リジン）のリジン残基のイプシロン−アミノ基にランダムにカップリングし、そして次いで、シアノ水素化ホウ素ナトリウムで還元する。この方法は、３’末端リボース環をモルホリン構造アンチセンス・オリゴマーに変換する。また、ＤＮＡ／ＲＮＡ合成と適合する戦略、例えばＭｍｔ／Ｆｍｏｃ戦略によって、ペプチドセグメントを合成してもよい。その場合、ペプチドは、オリゴヌクレオチド・セグメントの前にまたは後に、直接合成することも可能である。また、合成後に、例えばジスルフィド架橋の形成によって、ペプチド・オリゴヌクレオチド・コンジュゲートを調製する方法も存在する。
いくつかの態様において、コンジュゲート部分は、親油性コンジュゲート部分であっても、または該部分を含んでもよい。親油性コンジュゲート部分を、ステロール、スタノール、ステロイド、多環芳香族基、脂肪族基、脂質、リン脂質、親油性アルコール、脂肪酸および脂肪酸エステルからなる群より選択することも可能である。いくつかの態様において、コンジュゲート部分はコレステロールを含む。
キャリアー構成要素は、薬物動態調節因子、例えば親油性または疎水性部分であってもまたはこうした因子を含んでもよい。こうした部分は、ＷＯ２０１２／０８２０４６において、ｓｉＲＮＡコンジュゲートの背景内に開示される。疎水性部分は、Ｃ８〜Ｃ３６脂肪酸を含んでもよく、これらは飽和していてもまたは不飽和であってもよい。いくつかの態様において、Ｃ１０、Ｃ１２、Ｃ１４、Ｃ１６、Ｃ１８、Ｃ２０、Ｃ２２、Ｃ２４、Ｃ２６、Ｃ２８、Ｃ３０、Ｃ３２およびＣ３４脂肪酸を用いてもよい。疎水性基は１６またはそれより多い炭素原子を有してもよい。例示的な適切な疎水性基は：ステロール、コレステロール、パルミトイル、ヘキサデク−８−エノイル、オレイル、（９Ｅ，１２Ｅ）−オクタデカ−９，１２−ジエノイル、ジオクタノイル、およびＣ１６〜Ｃ２０アシルを含む群より選択されてもよい。ＷＯ２０１２／０８２０４６によれば、１６炭素原子より少ない炭素原子を有する疎水性基は、ポリヌクレオチド・ターゲティングを増進する際により有効ではないが、有効性を増進するために、これらを多コピーで（例えば２ｘ、例えば２ｘＣ８またはＣ１０、Ｃ１２またはＣ１４）用いることも可能である。ポリヌクレオチド・ターゲティング部分として有用な薬物動態調節因子は：コレステロール、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、アリール基、アラルキル基、アラルケニル基、およびアラルキニル基からなる群より選択されることも可能であり、これらは各々、直鎖、分枝、または環状であることも可能である。薬物動態調節因子は、好ましくは、炭素および水素原子のみを含有する、炭化水素である。しかし、疎水性を維持する置換またはヘテロ原子、例えばフッ素は許容されうる。
本明細書に援用されるＷＯ２００７／０３１０９１は、他の適切なリガンドおよびキャリアー構成要素の例を提供する。
いくつかの態様において、キャリアー構成要素は、炭水化物部分であるかまたは該部分を含む。炭水化物コンジュゲート部分には、限定されるわけではないが、ガラクトース、ラクトース、ｎ−アセチルガラクトサミン、マンノースおよびマンノース−６−リン酸が含まれる。炭水化物コンジュゲートを用いて、ある範囲の組織、例えば肝臓および／または筋肉における送達または活性を増進させることも可能である。例えば、ＥＰ１４９５７６９、ＷＯ９９／６５９２５、Ｙａｎｇら， Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇ Ｃｈｅｍ （２００９） ２０（２）： ２１３−２１． Ｚａｔｓｅｐｉｎ ＆ Ｏｒｅｔｓｋａｙａ Ｃｈｅｍ Ｂｉｏｄｉｖｅｒｓ． （２００４） １（１０）： １４０１−１７を参照されたい。
さらに、オリゴマーは、親油性または疎水性部分が特に興味深い、１またはそれより多いさらなるコンジュゲート部分をさらに含むことも可能である。これらは、例えば、薬物動態調節因子として作用することも可能であり、そして炭水化物コンジュゲート、炭水化物コンジュゲートをオリゴマーに連結するリンカー、または多数の炭水化物コンジュゲート（多価）コンジュゲートを連結するリンカーに、あるいは場合によって生理学的に不安定なリンカーなどのリンカーを通じてオリゴマーに共有結合させることも可能である。
いくつかの態様において、キャリアー構成要素は、ガラクトースのものと等しいかまたはそれより高いアフィニティを持つ、アシア糖タンパク質（ａｓｉａｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）受容体（ＡＳＧＰ−Ｒ）ターゲティング部分を含む。ＡＳＰＧ−Ｒターゲティング部分は、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、およびＮ−イソブタノイルガラクトサミンからなる群より選択されることも可能である。いくつかの態様において、アシアロ糖タンパク質受容体ターゲティング・コンジュゲート部分は一価である。他の態様において、キャリアー構成要素は、ガラクトース・クラスター、例えば二価、三価または四価のアシアロ糖タンパク質受容体ターゲティング・コンジュゲート部分（すなわち、アシアロ糖タンパク質受容体に結合可能な１、２、３または４末端炭水化物部分を含有する）を含む。いくつかの態様において、キャリアー構成要素は、ＧａｌＮＡｃ（Ｎ−アセチルガラクトサミン）、例えば一価、二価、三価または四価ＧａｌＮＡｃを含む。ＧａｌＮＡｃコンジュゲートを用いて、化合物を肝臓にターゲティングすることも可能である。好ましいキャリアー構成要素は、Ｎ−アセチルガラクトサミン三量体である。ＧａｌＮＡｃコンジュゲートは、メチルホスホネートおよびＰＮＡアンチセンス・オリゴヌクレオチド（例えば、ＵＳ ５，９９４５１７およびＨａｎｇｅｌａｎｄら， Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇ Ｃｈｅｍ． １９９５ Ｎｏｖ−Ｄｅｃ； ６（６）：６９５−７０１）およびｓｉＲＮＡ（例えば、ＷＯ２００９／１２６９３３、ＷＯ２０１２／０８９３５２およびＷＯ２０１２／０８３０４６）とともに、そしてＬＮＡおよび２’−ＭＯＥ修飾ヌクレオシド（ＷＯ ２０１４／０７６１９６、ＷＯ ２０１４／２０７２３２、ＷＯ ２０１４／１７９６２０およびＷＯ ２０１４／１７９６２７）とともに用いられてきている。ＧａｌＮＡｃ参考文献および該文献で用いられる特定のコンジュゲートが本明細書に援用される。ＷＯ２０１２／０８３０４６は、切断可能薬物動態調節因子を含むＧａｌＮＡｃコンジュゲート部分を伴うｓｉＲＮＡを開示し、これは本発明での使用に適しており、好ましい薬物動態調節因子は、Ｃ１６疎水性基、例えばパルミトイル、ヘキサデク−８−エノイル、オレイル、（９Ｅ，１２Ｅ）−オクタデカ−９，１２−ジエノイル、ジオクタノイル、およびＣ１６〜Ｃ２０アシルである。ＷＯ２０１２／０８３０４６切断可能薬物動態調節因子はまた、コレステロールであることも可能である。
キャリアー構成要素は：ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン、Ｎプロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソ−ブタノイルガラクトサミン、ガラクトース・クラスター、およびＮ−アセチルガラクトサミン三量体からなる群より選択されることも可能であり、そして：１６またはそれより多い炭素原子を有する疎水性基、１６〜２０炭素原子を有する疎水性基、パルミトイル、ヘキサデク−８−エノイル、オレイル、（９Ｅ，１２Ｅ）−オクタデカ−９，１２−ジエノイル、ジオクタノイル、およびＣ１６〜Ｃ２０アシル、およびコレステロールからなる群より選択される薬物動態調節因子を有することも可能である。’０４６に開示される特定のＧａｌＮＡｃクラスターには：（Ｅ）−ヘキサデク−８−エノイル（Ｃ１６）、オレイル（Ｃ１８）、（９Ｅ，１２Ｅ）−オクタデカ−９，１２−ジエノイル（Ｃ１８）、オクタノイル（Ｃ８）、ドデセカノイル（Ｃ１２）、Ｃ−２０アシル、Ｃ２４アシル、ジオクタノイル（２ｘＣ８）が含まれる。キャリアー構成要素−薬物動態調節因子を、生理学的に不安定な結合、または例えばジスルフィド結合（ＰＯリンカー）、またはＰＥＧリンカーを通じて、ポリヌクレオチドに連結させることも可能である。本発明はまた、オリゴマーおよびキャリアー構成要素（適切にオリゴマーおよび炭水化物コンジュゲート基の間に配置される）の間のホスホジエステルリンカーの使用にも関する。
本発明の１つの態様において、オリゴマーは、例えばオリゴマーの細胞取り込みを増加させることによって、被験体の肝臓にオリゴマーを送達するために用いることが可能な、キャリアー構成要素に連結され、好ましくはコンジュゲート化される。
特定の態様において、キャリアー構成要素は、ＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターであることも可能である。図２および３は、いくつかのキャリアー構成要素を提示する。
肝臓における肝細胞をターゲティングするため、好ましいターゲティング・リガンドはガラクトース・クラスターである。
ガラクトース・クラスターは、例えば、２〜４の末端ガラクトース誘導体を有する、例えば含む分子を含む。本明細書において、用語、ガラクトース誘導体には、ガラクトース、およびガラクトースのものと等しいかまたはそれより高いＡＳＧＰ−Ｒに対するアフィニティを有するガラクトース誘導体の両方が含まれる。末端ガラクトース誘導体は、Ｃ−ｌ炭素を通じて分子に付着する。ＡＳＧＰ−Ｒは肝細胞に特有であり、そして分枝ガラクトース末端糖タンパク質に結合する。好ましいガラクトース・クラスターは、３つの末端ガラクトサミン、または各々、アシアロ糖タンパク質受容体に対するアフィニティを有するガラクトサミン誘導体を有する。より好ましいガラクトース・クラスターは、３つの末端Ｎ−アセチル−ガラクトサミンを有する。当該技術分野に一般的な他の用語には、三アンテナ（ｔｒｉ−ａｎｔｅｎｎａｒｙ）ガラクトース、三価ガラクトースおよびガラクトース三量体が含まれる。三アンテナ・ガラクトース誘導体クラスターは、二アンテナまたは一アンテナ・ガラクトース誘導体構造よりも高いアフィニティでＡＳＧＰ−Ｒに結合することが知られる（ＢａｅｎｚｉｇｅｒおよびＦｉｅｔｅ， １９８０， Ｃｅｌｌ， ２２， ６１１−６２０； Ｃｏｎｎｏｌｌｙら， １９８２， １． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｒｎ．， ２５７，９３９−９４５）。多価性は、ｎＭアフィニティを達成するために必要である。
好ましいガラクトース誘導体は、Ｎ−アセチル−ガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）である。アシアロ糖タンパク質受容体に対するアフィニティを有する他の糖は：ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイルガラクトサミン、およびＮ−イソ−ブタノイルガラクトサミンを含むリストより選択可能である。アシアロ糖タンパク質受容体に対する多くのガラクトース誘導体のアフィニティが研究されてきており（例えば： Ｊｏｂｓｔ， Ｓ．Ｔ．およびＤｒｉｃｋａｍｅｒ， Ｋ． ＪＢ．Ｃ． １９９６，２７１，６６８６）、または当該技術分野において典型的な方法を用いて、容易に決定される。
ガラクトース・クラスターは、各々、中央分枝点に連結された、２または好ましくは３のガラクトース誘導体を含むことも可能である。ガラクトース誘導体は、糖のＣ−ｌ炭素を通じて中央分枝点に付着する。ガラクトース誘導体は、好ましくは、リンカーまたはスペーサーを通じて分枝点に連結される。好ましいスペーサーは、柔軟な親水性スペーサーである（米国特許５８８５９６８； Ｂｉｅｓｓｅｎら Ｊ． Ｍｅｄ． Ｃｈｅｒｎ． １９９５ Ｖｏｌ． ３９ ｐ． １５３８−１５４６）。好ましい柔軟な親水性スペーサーはＰＥＧスペーサーである。好ましいＰＥＧスペーサーはＰＥＧ３スペーサー（３エチレン単位）である。分枝点は、３つのガラクトース誘導体の付着を可能にし、そしてさらにオリゴマーへの分枝点の付着を可能にする任意の小分子であることが可能である。ＧａｌＮＡｃクラスター（例えばＧａｌＮＡｃ）における各ガラクトース誘導体（炭水化物部分）を、スペーサー、例えば（ポリ）エチレングリコールリンカー（ＰＥＧ）、例えばジ、トリ、テトラ、ペンタ、ヘキサエチレングリコールリンカーを通じて、オリゴマーに連結してもよい。ＰＥＧ部分は、ガラクトース誘導体糖部分およびペプチド（ジ−リジンを示す）リンカーの間のスペーサーを形成することも可能である。例示的な分枝点基はジ−リジンである。ジ−リジン分子は、３つのガラクトース誘導体が付着可能な３つのアミン基、およびジ−リジンがオリゴマーに付着することが可能である１つのカルボキシル反応基を含有する（例えば図４を参照されたい）。
炭水化物コンジュゲート（例えばＧａｌＮＡｃ）、または炭水化物−リンカー部分（例えば炭水化物−ＰＥＧ部分）を、適切に２またはそれより多いアミノ基を含む分枝点基、例えばアミノ酸、またはペプチド、例えばリジン、ジ−リジンまたはトリ−リジンまたはテトラ−リジンを通じて、オリゴマーに共有結合（連結）させることも可能である。トリ−リジン分子は、３つの炭水化物コンジュゲート基、例えばガラクトースおよび誘導体（例えばＧａｌＮＡｃ）、ならびにさらなるコンジュゲート、例えば疎水性または親油性部分／基が付着することが可能な、４つのアミン基、ならびにトリ−リジンがオリゴマーに付着することが可能である１つのカルボキシル反応基を含有する。さらなるコンジュゲート、例えば親油性／親水性部分が、オリゴマーに付着するリジン残基に付着することも可能である。
いくつかの態様において、ＧａｌＮＡｃクラスターは、ペプチドリンカー、例えばＴｙｒ−Ａｓｐ（Ａｓｐ）トリペプチドまたはＡｓｐ（Ａｓｐ）ジペプチドを含み、これは二ラジカルリンカーを通じてオリゴマーに付着し、例えばＧａｌＮａｃクラスターは、例えば図３のＣｏｎｊ３、３ａ、４および４ａに例示するような二ラジカルリンカーを含むことも可能である。
別の分枝分子は、１，３−ビス−［５−（４，４’−ジメトキシトリチルオキシ）ペンチルアミド］プロピル−２−［（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］ホスホラミダイト（Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈカタログ番号： １０−１９２０−ｘｘ）、トリス−２，２，２−［３−（４，４’−ジメトキシトリチルオキシ）プロピルオキシメチル］エチル−［（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホラミダイト（Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈカタログ番号： １０−１９２２−ｘｘ）、トリス−２，２，２−［３−（４，４’−ジメトキシトリチルオキシ）プロピルオキシメチル］メチレンオキシプロピル−［（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホラミダイトおよび１−［５−（４，４’−ジメトキシ−トリチルオキシ）ペンチルアミド］−３−［５−フルオレノメトキシ−カルボニル−オキシ−ペンチルアミド］−プロピル−２−［（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホラミダイト（Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈカタログ番号： １０−１９２５−ｘｘ）からなる群より選択されることも可能である。ＷＯ ２０１４／１７９６２０および欧州出願第１４１８８４４４．５号は、多様なＧａｌＮＡｃコンジュゲート部分の生成を記載する（本明細書に援用される）。オリゴマーへの分枝点の付着は、リンカーまたはスペーサーを通じて起こってもよい。好ましいスペーサーは、柔軟な親水性スペーサーである。好ましい柔軟な親水性スペーサーはＰＥＧスペーサーまたはＣ６リンカーである。好ましいＰＥＧスペーサーはＰＥＧ３スペーサー（３エチレン単位）である。好ましい態様において、リンカーは生理学的に不安定なリンカーである。当該技術分野に知られる方法を用いて、ガラクトース・クラスターを、オリゴマーの３’または５’端に付着させることも可能である。好ましい態様において、コンジュゲート部分をターゲティングするアシアロ糖タンパク質受容体が、オリゴヌクレオチドの５’端に連結される。
好ましいガラクトース・クラスターは、ＰＥＧスペーサーを通じてジ−リジン分枝分子に連結される３つの末端ＧａｌＮＡｃ部分（ＧａｌＮＡｃクラスター）を含む。好ましくは、ＰＥＧスペーサーは３ＰＥＧスペーサーである。好ましいＧａｌＮＡｃクラスターは、Ｃｏｎｊ１、１ａ、２および２ａである。最も好ましいのは、Ｃｏｎｊ２ａ（ＧａｌＮＡｃ２とも称される）である。
ガラクトース・クラスターを図３に提示する。
キャリアー構成要素リンカー
キャリアー構成要素を、リンカー（Ｌ）によって、第一のオリゴマー領域、および／または第二のオリゴマー領域に連結させることも可能である。任意の適切なリンカーが使用可能である。
炭水化物コンジュゲート（例えばＧａｌＮＡｃ）を、生理学的に不安定なリンカーとも称される、生物切断可能リンカーに連結させることも可能である。
本明細書において、生理学的に不安定な結合は、哺乳動物体内で通常遭遇する、または遭遇するものと類似の条件下で切断可能である不安定な結合（生理学的に不安定なリンカーとも称される）である。生理学的に不安定な連結基は、これらが特定の生理学的条件に存在する場合に、化学的変換（例えば切断）を経るように選択される。哺乳動物細胞内条件には、哺乳動物細胞で見られるまたはこうした細胞内で遭遇するものと類似の、ｐＨ、温度、酸化または還元条件または剤、および塩濃度などの化学的条件が含まれる。哺乳動物細胞内条件にはまた、タンパク質分解または加水分解酵素由来などの哺乳動物細胞に通常存在する酵素活性の存在も含まれる。
化学的変換（不安定な結合の切断）は、薬学的に許容されうる剤の細胞への添加によって開始されることも可能であるし、または不安定な結合を含有する分子が、適切な細胞内および／または細胞外環境に到達した際に自発的に起こることも可能である。例えば、ｐＨ不安定性結合は、分子が酸性化エンドソームに進入した際に切断されることも可能である。したがって、ｐＨ不安定性結合は、エンドソーム切断可能結合と見なされることも可能である。酵素切断可能結合は、酵素、例えばエンドソームまたはリソソームあるいは細胞質中に存在するものに曝露された際に切断されることが可能である。ジスルフィド結合は、分子が細胞質のより還元性の環境に進入した際に切断されることが可能である。したがって、ジスルフィドは、細胞質切断可能結合と見なされることも可能である。本明細書において、ｐＨ不安定性結合は、酸性条件下（ｐＨ＜７）で選択的に破壊される不安定性結合である。こうした結合はまた、エンドソーム不安定性結合と称されることも可能であり、これは、細胞エンドソームおよびリソソームが７未満のｐＨを有するためである。別の生理学的に不安定なリンカーの例は、図３においてＧａｌＮＡｃクラスター中で用いられるような、ジ−リジンである。
いくつかの態様において、本発明のオリゴマー・コンジュゲートは、本発明のオリゴマー（領域Ａ）をキャリアー構成要素（または領域Ｃ）に連結する、生理学的に不安定なリンカー（領域ＰＬ、生物切断可能リンカーまたはヌクレアーゼ感受性リンカーとも称される）を含む。
ターゲティング化送達のためのキャリアー構成要素と関連する生理学的に不安定なリンカーに関しては、ターゲット組織（例えば筋肉、肝臓、腎臓または腫瘍）で見られる切断率は、血清中に見られるものよりも大きいことが好ましい。血清に対するターゲット組織中の切断レベル（％）を決定するために適切な方法を、「組織特異的ｉｎ ｖｉｔｒｏリンカー切断アッセイ」セクションに記載する。いくつかの態様において、本発明の化合物中の生理学的に不安定なリンカー（生物切断可能リンカー、またはヌクレアーゼ感受性リンカーとも称される）は、「材料および方法」セクション中の「組織特異的ｉｎ ｖｉｔｒｏリンカー切断アッセイ」において、少なくとも約２０％が切断され、例えば少なくとも約３０％が切断され、例えば少なくとも約４０％が切断され、例えば少なくとも約５０％が切断され、例えば少なくとも約６０％が切断され、例えば少なくとも約７０％が切断され、例えば少なくとも約７５％が切断される。いくつかの態様において、「組織特異的ｉｎ ｖｉｔｒｏリンカー切断アッセイ」で用いるような、血清中の切断（％）は、約２０％未満、例えば約１０％未満、例えば約５％未満、例えば約１％未満である。
いくつかの態様において、本発明のオリゴマー・コンジュゲートは、３つの領域：ｉ）１０〜１８の連続ヌクレオチドを含む第一の領域（領域Ａ）；ｉｉ）生理学的に不安定なリンカーを含む第二の領域（領域ＰＬ）；およびｉｉｉ）キャリアー構成要素を含む第三の領域（Ｃ）を含み、第三の領域は第二の領域に共有結合し、第二の領域は第一の領域に共有結合する。
いくつかの態様において、領域Ａおよび領域ＰＬは、リン酸ヌクレオシド連結（例えばホスホジエステル、ホスホロチオエート、ホスホジチオエート、ボラノホスフェートまたはメチルホスホネート）またはトリアゾール基を通じて共有結合する。いくつかの態様において、領域ＰＬおよび領域Ｃは、リン酸ヌクレオシド連結（例えばホスホジエステル、ホスホロチオエート、ホスホジチオエート、ボラノホスフェートまたはメチルホスホネート）またはトリアゾール基を通じて共有結合する。いくつかの態様において、領域ＰＬおよび領域Ｃは、以下に記載するような領域Ｅリンカーなどの第二のリンカーを通じて共有結合する。
いくつかの態様において、生理学的に不安定なリンカーは、オリゴマー（領域Ａ）の５’端および／または３’端のいずれかに位置することも可能である。好ましい態様において、生理学的に不安定なリンカーは５’端にある。
いくつかの態様において、生理学的に不安定なリンカーは、その３’端で、領域Ａの５’端に付着し、そしてキャリアー構成要素（領域Ｃ）は、場合によってさらなるリンカー領域Ｅを通じて、生理学的に不安定なリンカー（例えばＰＯリンカー）の５’端に付着する。
ヌクレアーゼ感受性リンカー−ホスホジエステル・リンカー（ＰＯリンカー）
いくつかの態様において、生理学的に不安定なリンカーは、例えば、ターゲット細胞において発現されうるヌクレアーゼ（単数または複数）に感受性であり、そしてこうしたものとして、本明細書に詳述するように、リンカーは、短い領域の（例えば１〜１０）ホスホジエステル連結ヌクレオシド、例えばＤＮＡヌクレオシドであることも可能である。
いくつかの態様において、同じであってもまたは異なってもよい生理学的に不安定なリンカー（領域ＰＬ）は、Ｓ１ヌクレアーゼ切断に対して感受性である。「Ｓ１ヌクレアーゼ切断アッセイ」セクションに記載するＳ１ヌクレアーゼアッセイを用いて、Ｓ１切断に対する感受性を評価することも可能である。いくつかの態様において、本発明の化合物中の生理学的に不安定なリンカー（生理学的に不安定なリンカー、またはヌクレアーゼ感受性リンカーとも称される）、例えば領域ＰＬは、「材料および方法」セクション中の「Ｓ１ヌクレアーゼ切断アッセイ」に記載するような、Ｓ１ヌクレアーゼとの１２０分間のインキュベーション後、少なくとも約３０％が切断され、例えば少なくとも約４０％が切断され、例えば少なくとも約５０％が切断され、例えば少なくとも約６０％が切断され、例えば少なくとも約７０％が切断され、例えば少なくとも約８０％が切断され、例えば少なくとも約９０％が切断される。
いくつかの態様において、生理学的に不安定なリンカー（領域ＰＬ）は、１〜１０ヌクレオシドの間、例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０ヌクレオシド、より好ましくは２〜６の間のヌクレオシド、そして最も好ましくは２〜４の間の連結されたヌクレオシドを含む、ヌクレアーゼ感受性リンカーである。いくつかの態様において、ヌクレアーゼ感受性リンカーは、ホスホジエステル・ヌクレオチドリンカーであり、こうしたリンカーはまたＰＯリンカーとも称される。好ましい態様において、ヌクレアーゼ感受性リンカー（ＰＯリンカー）は、少なくとも１つのホスホジエステル連結ヌクレオシドを含む。好ましくは、ヌクレアーゼ感受性ＰＯリンカーは、少なくとも２つの連続ホスホジエステル連結、例えば少なくとも３または４または５の連続ホスホジエステル連結を含む。
いくつかの態様において、ＰＯリンカー中のヌクレオシドは、（場合によって独立に）ＤＮＡおよびＲＮＡ、またはヌクレアーゼ切断に干渉しないその修飾からなる群より選択される。ヌクレアーゼ切断に干渉しないＤＮＡおよびＲＮＡヌクレオシドの修飾は、非天然存在核酸塩基であることも可能である。特定の糖修飾ヌクレオシドはまた、例えば、アルファ−Ｌ−オキシ−ＬＮＡなどのヌクレアーゼ切断も可能にしうる。いくつかの態様において、ＰＯリンカーのすべてのヌクレオシドは、（場合によって独立に）２’−ＯＨリボース糖（ＲＮＡ）または２’−Ｈ糖、すなわちＲＮＡまたはＤＮＡのいずれかを含む。いくつかの態様において、ＰＯリンカーのヌクレオシドは、ＤＮＡヌクレオシドである。いくつかの態様において、ＰＯリンカーの少なくとも２つの連続ヌクレオシドは、ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシド（例えば少なくとも３または４または５の連続ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシド）である。好ましくは、ＰＯリンカーは、１〜５または１〜４、例えば、２、３、４の連続ホスホジエステル連結ＤＮＡヌクレオシドからなる。好ましい態様において、ＰＯリンカーは、非常に短く、ＲＮアーゼＨを補充しない。いくつかの態様において、ＰＯリンカーは、３を越えないまたは４を越えない連続ホスホジエステル連結ＤＮＡおよび／またはＲＮＡヌクレオシド（例えばＤＮＡヌクレオシド）を含む。
いくつかの態様において、ＰＯリンカーは、ターゲット核酸配列に、または領域Ａ中のオリゴマーに相補的でない。
いくつかの態様において、ＰＯリンカーは、ターゲット核酸配列に相補的である。これに関連して、領域ＡおよびＰＯリンカーはともに、ターゲット配列に相補的である単一連続配列を形成することも可能である。
いくつかの態様において、領域ＡおよびＰＯリンカーは、長さ１０〜２２、例えば１２〜２０のヌクレオチドの単一連続ヌクレオチド配列を形成する。この背景において、領域Ａは、ＰＯリンカーとは異なり、ターゲット核酸への結合アフィニティが増加した、少なくとも１つ、好ましくは少なくとも２つの修飾ヌクレオシド（例えばＬＮＡまたは２’置換糖部分を含むヌクレオシド）で始まり、そして領域Ａ自体で、適切な細胞株において、ターゲット核酸の発現を調節することが可能である。さらに、領域ＡがＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドを含む場合、これらは、ヌクレアーゼ耐性ヌクレオシド間連結、例えばホスホロチオエートまたはボラノホスフェートで連結される。
いくつかの側面において、第一の（領域Ａ）および第二の領域（ＰＯリンカー）の間のヌクレオシド間連結は、第二の領域の一部と見なされることも可能である。
いくつかの態様において、ＰＯリンカー中の塩基の配列は、ターゲット組織または細胞または細胞下位区画に存在する主なエンドヌクレアーゼ切断酵素に基づいて、最適なエンドヌクレアーゼ切断部位を提供するように選択される。これに関連して、ターゲット組織および非ターゲット組織から細胞抽出物を単離することによって、ＰＯリンカー中で使用するためのエンドヌクレアーゼ切断配列を、非ターゲット細胞（例えば腎臓）に比較した際の望ましいターゲット細胞（例えば肝臓／肝細胞）中の優先的な切断活性に基づいて、選択することも可能である。これに関連して、ターゲット下方制御のための化合物の強度は、望ましい組織／細胞に関して最適化されることも可能である。
いくつかの態様において、ＰＯリンカーは、配列ＡＡ、ＡＴ、ＡＣ、ＡＧ、ＴＡ、ＴＴ、ＴＣ、ＴＧ、ＣＡ、ＣＴ、ＣＣ、ＣＧ、ＧＡ、ＧＴ、ＧＣ、またはＧＧのジヌクレオチドを含み、ここで、Ｃは５−メチルシトシンであることも可能であり、そして／またはＴはＵで置換されることも可能である。好ましくは、ヌクレオチド間連結はホスホジエステル連結である。好ましい態様において、ＰＯリンカーは、少なくとも２つのホスホジエステル連結（１つは領域Ａに対する）を含むＣＡジヌクレオチドである。いくつかの態様において、ＰＯリンカーは、配列ＡＡＡ、ＡＡＴ、ＡＡＣ、ＡＡＧ、ＡＴＡ、ＡＴＴ、ＡＴＣ、ＡＴＧ、ＡＣＡ、ＡＣＴ、ＡＣＣ、ＡＣＧ、ＡＧＡ、ＡＧＴ、ＡＧＣ、ＡＧＧ、ＴＡＡ、ＴＡＴ、ＴＡＣ、ＴＡＧ、ＴＴＡ、ＴＴＴ、ＴＴＣ、ＴＡＧ、ＴＣＡ、ＴＣＴ、ＴＣＣ、ＴＣＧ、ＴＧＡ、ＴＧＴ、ＴＧＣ、ＴＧＧ、ＣＡＡ、ＣＡＴ、ＣＡＣ、ＣＡＧ、ＣＴＡ、ＣＴＧ、ＣＴＣ、ＣＴＴ、ＣＣＡ、ＣＣＴ、ＣＣＣ、ＣＣＧ、ＣＧＡ、ＣＧＴ、ＣＧＣ、ＣＧＧ、ＧＡＡ、ＧＡＴ、ＧＡＣ、ＣＡＧ、ＧＴＡ、ＧＴＴ、ＧＴＣ、ＧＴＧ、ＧＣＡ、ＧＣＴ、ＧＣＣ、ＧＣＧ、ＧＧＡ、ＧＧＴ、ＧＧＣ、およびＧＧＧのトリヌクレオチドを含み、ここで、Ｃは５−メチルシトシンであることも可能であり、そして／またはＴはＵで置換されることも可能である。好ましくは、ヌクレオシド間連結は、ホスホジエステル連結である。いくつかの態様において、ＰＯリンカーは、配列ＡＡＡＸ、ＡＡＴＸ、ＡＡＣＸ、ＡＡＧＸ、ＡＴＡＸ、ＡＴＴＸ、ＡＴＣＸ、ＡＴＧＸ、ＡＣＡＸ、ＡＣＴＸ、ＡＣＣＸ、ＡＣＧＸ、ＡＧＡＸ、ＡＧＴＸ、ＡＧＣＸ、ＡＧＧＸ、ＴＡＡＸ、ＴＡＴＸ、ＴＡＣＸ、ＴＡＧＸ、ＴＴＡＸ、ＴＴＴＸ、ＴＴＣＸ、ＴＡＧＸ、ＴＣＡＸ、ＴＣＴＸ、ＴＣＣＸ、ＴＣＧＸ、ＴＧＡＸ、ＴＧＴＸ、ＴＧＣＸ、ＴＧＧＸ、ＣＡＡＸ、ＣＡＴＸ、ＣＡＣＸ、ＣＡＧＸ、ＣＴＡＸ、ＣＴＧＸ、ＣＴＣＸ、ＣＴＴＸ、ＣＣＡＸ、ＣＣＴＸ、ＣＣＣＸ、ＣＣＧＸ、ＣＧＡＸ、ＣＧＴＸ、ＣＧＣＸ、ＣＧＧＸ、ＧＡＡＸ、ＧＡＴＸ、ＧＡＣＸ、ＣＡＧＸ、ＧＴＡＸ、ＧＴＴＸ、ＧＴＣＸ、ＧＴＧＸ、ＧＣＡＸ、ＧＣＴＸ、ＧＣＣＸ、ＧＣＧＸ、ＧＧＡＸ、ＧＧＴＸ、ＧＧＣＸ、およびＧＧＧＸのトリヌクレオチドを含み、ここで、ＸはＡ、Ｔ、Ｕ、Ｇ、Ｃおよびその類似体からなる群より選択されることも可能であり、Ｃは５−メチルシトシンであることも可能であり、そして／またはＴはＵで置換されることも可能である。好ましくは、ヌクレオシド間連結は、ホスホジエステル連結である。（天然存在）核酸塩基Ａ、Ｔ、Ｕ、Ｇ、Ｃに言及する際、これらは同等の天然核酸塩基として機能する（例えば相補的ヌクレオシドと塩基対形成する）、核酸塩基類似体で置換されうることが認識されるであろう。
いくつかの態様において、領域ＰＬは、親油性コンジュゲート部分、例えば脂質、脂肪酸、ステロール、例えばコレステロールまたはトコフェロールに共有結合した、ホスホジエステルヌクレオチドリンカー（ＰＯリンカー）である。いくつかの態様において、領域ＰＬは、アシアロ糖タンパク質受容体ターゲティング部分、例えばＧａｌＮＡｃキャリアー構成要素に共有結合したホスホジエステルヌクレオチドリンカー（ＰＯリンカー）である。
オリゴマーおよびキャリアー構成要素の間に生理学的に不安定なリンカーを挿入する概念は、ＷＯ ２０１４／０７６１９５（本明細書に援用され、特に、図３および４が本明細書に援用される）に詳述される。
代替リンカー（領域Ｅ）
いくつかの例において、リンカーは、必ずしも生理学的に不安定ではなく、主に、第三の領域、例えばキャリアー構成要素（領域Ｃ）をオリゴマー（領域Ａ）に共有結合させるように働く。本明細書において、これらのリンカーはまた、領域Ｅと称される。本発明のオリゴマー・コンジュゲートは、以下の領域要素Ａ−Ｃ／Ｃ−Ａ、Ａ−ＰＬ−Ｃ／Ｃ−ＰＬ−Ａ、Ａ−ＰＬ−Ｅ−Ｃ／Ｃ−Ｅ−ＰＬ−Ａ、Ａ−Ｅ−ＰＬ−Ｃ／Ｃ−ＰＬ−Ｅ−ＡまたはＡ−Ｅ−Ｃ／Ｃ−Ｅ−Ａを構築することも可能である。
いくつかの態様において、リンカーＥは、反復単位、例えばエチレングリコール、アミノ酸単位またはアミノアルキル基の鎖構造またはオリゴマーを含む。リンカーＥは、少なくとも２つの官能性を有することも可能であり、１つはオリゴマーへの付着のためであり（場合によって（optionally）生理学的に不安定なリンカーを含む）、そしてもう一方は、キャリアー構成要素への付着のためである。例示的なリンカー官能性は、オリゴマーまたはキャリアー構成要素上の求核基と反応するために求電子性であるか、あるいは求電子基と反応するために求核性であることも可能である。いくつかの態様において、リンカー官能性には、アミノ、ヒドロキシル、カルボン酸、チオール、ホスホロアミデート、ホスホロチオエート、ホスフェート、ホスファイト、不飽和（例えば二重結合または三重結合）等が含まれる。例えば、炭水化物キャリアー構成要素（例えばＧａｌＮＡｃ）は、リンカー、例えば（ポリ）エチレングリコールリンカー（ＰＥＧ）、例えばジ、トリ、テトラ、ペンタ、ヘキサエチレングリコールリンカーを通じてオリゴマーに連結されることも可能である。
いくつかの態様において、リンカー（領域Ｅ）は、アミノアルキル、例えばＣ２〜Ｃ３６アミノアルキル基であり、これには例えばＣ６〜Ｃ１２アミノアルキル基が含まれる。好ましい態様において、リンカー（領域Ｅ）はＣ６アミノアルキル基である。標準的オリゴマー合成の一部として、例えば（例えば保護された）アミノアルキルホスホラミダイトを用いて、アミノアルキル基を、オリゴマー（領域Ａまたは領域Ａ−Ｌ／Ｌ−Ａ）に付加することも可能である。アミノアルキルおよびオリゴマーの間の連結基は、例えば、ホスホロチオエートまたはホスホジエステル、あるいは本明細書に言及する他のヌクレオシド連結の１つであることも可能である。アミノアルキル基は、オリゴマーの５’または３’端に共有結合される。商業的に入手可能なアミノアルキルリンカーは、オリゴマーの３’端での連結に関しては、例えば３’−アミノ−修飾試薬があり、そしてオリゴマーの５’端での連結に関しては、５’−アミノ修飾剤Ｃ６が利用可能である。これらの試薬は、Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ社（バージニア州スターリング）より入手可能である。これらの化合物または類似のものは、オリゴマーの５’末端にフルオレセインを連結するために、Ｋｒｉｅｇら， Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ １９９１， １， １６１によって利用された。非常に多様なさらなるリンカー基が当該技術分野に知られ、そして、オリゴマーのキャリアー構成要素の付着に有用でありうる。多くの有用なリンカー基の概説が、例えば、Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ， Ｓ． Ｔ． ＣｒｏｏｋｅおよびＢ． Ｌｅｂｌｅｕ監修， ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ， フロリダ州ボカラトン， １９９３， ｐ． ３０３−３５０に見出されうる。他の化合物、例えばアクリジンが、ポリメチレン連結を通じて、オリゴマーの３’末端リン酸基に付着されている（Ａｓｓｅｌｉｎｅら， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ １９８４， ８１， ３２９７）。上記基のいずれも、単一のリンカー（領域Ｅ）として、あるいは１またはそれより多いさらなるリンカーと組み合わせて（領域Ｅ−Ｅ’または領域Ｅ−ＬまたはＬ−Ｅ）使用可能である。
リンカーおよびオリゴマー・コンジュゲートの調製におけるその使用は、当該技術分野全体で提供され、例えばＷＯ ９６／１１２０５およびＷＯ ９８／５２６１４、ならびに米国特許第４，９４８，８８２号；第５，５２５，４６５号；第５，５４１，３１３号；第５，５４５，７３０号；第５，５５２，５３８号；第５，５８０，７３１号；第５，４８６，６０３号；第５，６０８，０４６号；第４，５８７，０４４号；第４，６６７，０２５号；第５，２５４，４６９号；第５，２４５，０２２号；第５，１１２，９６３号；第５，３９１，７２３号；第５，５１０４７５号；第５，５１２，６６７号；第５，５７４，１４２号；第５，６８４，１４２号；第５，７７０，７１６号；第６，０９６，８７５号；第６，３３５，４３２号；および第６，３３５，４３７号、ＷＯ ２０１２／０８３０４６に見られ、これらは各々、その全体が本明細書に援用される。図３は、ＧａｌＮａｃクラスターをオリゴマーに連結するoptionalな（場合による、必須でない）Ｃ６リンカーを有する、ＧａｌＮＡｃクラスター、Ｃｏｎｊ １、２、３、４およびＣｏｎｊ１ａ、２ａ、３ａおよび４ａの例を提示する。
アシア糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰ−Ｒ）ターゲティング部分
本明細書において、用語「アシア糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰ−Ｒ）ターゲティング部分」は、ＡＳＧＰ−Ｒと相互作用し、そしてそれによって、オリゴマーを、表面ＡＳＧＰ−Ｒを発現している細胞と接触させるか、またはその近傍に運ぶ部分に関する。
コンジュゲート部分
いくつかの態様において、キャリアー構成要素はコンジュゲート部分である。
さらに、１またはそれより多いコンジュゲート部分を、キャリアー構成要素に加えて、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートに付着させることも可能である。
いくつかの態様において、１またはそれより多いコンジュゲート部分を、本発明のオリゴマーに付着させることも可能である。
コンジュゲート部分は、非ヌクレオチド部分または非ポリヌクレオチド部分であることも可能である。
コンジュゲート部分は、本発明のオリゴマーの活性、細胞分布または細胞取り込みを増進させることも可能である。こうした部分には、限定されるわけではないが、抗体、ポリペプチド、脂質部分、例えばコレステロール部分、コール酸、チオエーテル、例えばヘキシル−ｓ−トリチルチオール、チオコレステロール、脂肪族鎖、例えばドデカンジオールまたはウンデシル残基、リン脂質、例えばジ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロールまたはトリエチルアンモニウム１，２−ジ−ｏ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロ−３−ｈ−ホスホネート、ポリアミンまたはポリエチレングリコール鎖、アダマンタン酢酸、パルミチル部分、オクタデシルアミンまたはヘキシルアミノ−カルボニル−オキシコレステロール部分が含まれる。
本発明のオリゴマーを活性薬剤部分、例えばアスピリン、イブプロフェン、サルファ薬剤、抗糖尿病剤、抗菌剤または抗生物質にコンジュゲート化させることも可能である。
特定の態様において、コンジュゲート化部分は、ステロール、例えばコレステロールである。
多様な態様において、コンジュゲート部分は、例えば長さ１〜５０、例えば２〜２０、例えば３〜１０アミノ酸残基、および／または酸化ポリアルキレン、例えばポリエチルグリコール（ＰＥＧ）またはポリプロピレングリコールなどの正荷電ポリマー、例えば正荷電ペプチドを含むかまたはこれらからなる。本明細書に援用されるＷＯ２００８／０３４１２３を参照されたい。適切には、正荷電ポリマー、例えば酸化ポリアルキレンを、リンカー、例えばＷＯ２００８／０３４１２３に記載される放出可能リンカーを通じて、本発明のオリゴマーに付着させることも可能である。
本発明のオリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲートには、コンジュゲート部分として、適切なリガンド結合分子が含まれることも可能である。例えば、国際特許出願ＷＯ９１／０４７５３にしたがって、オリゴヌクレオチドを、療法投与のために、細胞表面分子を認識するリガンド結合分子にコンジュゲート化することも可能である。リガンド結合分子は、例えば、細胞表面抗原に対する抗体、細胞表面受容体に対する抗体、対応する細胞表面受容体を有する増殖因子、こうした増殖因子に対する抗体、または増殖因子およびその受容体の複合体を認識する抗体を含むことも可能である。オリゴヌクレオチドにリガンド結合分子をコンジュゲート化させる方法は、ＷＯ９１／０４７５３に詳述される。さらに、使用可能なコンジュゲート化法および細胞取り込みを改善する方法は、以下の国際特許出願ＷＯ ９６４０９６１、ＷＯ９９６４４４９、ＷＯ９９０２６７３、ＷＯ９８０３５３３、ＷＯ００１５２６５、ならびに米国特許５８５６４３８および５１３８０４５に記載される。
さらなる例として、コンジュゲート部分は、トランスフェリンまたは葉酸などの増殖因子であることも可能である。トランスフェリン−ポリリジン−オリゴヌクレオチド複合体または葉酸−ポリリジン−オリゴヌクレオチド複合体は、高レベルのトランスフェリンまたは葉酸受容体を発現している細胞によって、取り込まれるように調製可能である。細胞内へのオリゴヌクレオチド取り込みを促進するキャリアー構成要素としてのトランスフェリン複合体の調製は、Ｗａｇｎｅｒら， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８７， ３４１０−３４１４ （１９９０）に記載される。アンチセンス・オリゴヌクレオチドの送達を含めて、葉酸受容体エンドサイトーシスを通じた、葉酸−巨大分子コンジュゲートの細胞送達は、Ｌｏｗら、米国特許５，１０８，９２１に記載される。Ｌｅａｍｏｎら， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ８８， ５５７２ （１９９１）もまた参照されたい。
ターゲット核酸／ターゲット配列
好ましい側面において、用語「ターゲット核酸」および「ターゲット配列」は、本明細書において、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇポリペプチドをコードするＤＮＡまたはＲＮＡ、例えば配列番号１または配列番号２のいずれかに含有される配列を指す。用語「ターゲット核酸」および「ターゲット配列」には、したがって、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇコード核酸またはその天然存在変異体、およびそれに由来するＲＮＡ核酸、好ましくはｍＲＮＡ、例えばプレｍＲＮＡが含まれるが、好ましくは成熟ｍＲＮＡである。いくつかの態様において、例えば、研究または診断において用いる場合、「ターゲット核酸」または「ターゲット配列」は、上記ＤＮＡまたはＲＮＡ核酸ターゲット由来のｃＤＮＡまたは合成オリゴヌクレオチドであることも可能である。本発明記載のオリゴマーは、好ましくは、ターゲット核酸にハイブリダイズすることが可能である。
同一性／相同性
本明細書において、用語「相同」および「相同性」は、用語「同一性」および「同一」と交換可能である。
対応して／対応する
用語「対応して」および「対応する」は、オリゴマーのヌクレオチド配列（すなわち核酸塩基または塩基配列）またはその連続ヌクレオチド配列、ならびにｉ）核酸ターゲットの逆相補体の下位配列、例えばターゲット配列タンパク質をコードするｍＲＮＡ、例えば配列番号１または配列番号２または配列番号３内の任意の配列および／またはｉｉ）本明細書に提供する特定のヌクレオチド配列のいずれかの配列、またはその下位配列のいずれかより選択されるさらなる配列の同等の連続ヌクレオチド配列の間の比較を指す。ヌクレオチド類似体は、同等のまたは対応するヌクレオチドに直接比較される。ｉ）またはｉｉ）の下のさらなる配列に対応する配列は、第一の配列（例えば連続ヌクレオチド配列）の全長に渡って、その配列に同一であるか、あるいは、本明細書に記載するように、いくつかの態様において、対応する配列に、少なくとも８０％相同、例えば少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％相同、例えば１００％相同（同一）であることも可能である。配列同一性のパーセントは、２つの配列間で同一である整列塩基の数を計数し、オリゴマー中の単位の総数で割り、そして１００を乗じることによって計算可能である。
用語「対応するヌクレオチド類似体」および「対応するヌクレオチド」は、ヌクレオチド類似体中のヌクレオチドおよび天然存在ヌクレオチドが同一であることを示すよう意図される。例えば、ヌクレオチドの２−デオキシリボース単位がアデニンに連結されている場合、「対応するヌクレオチド類似体」は、アデニンに連結されたペントース単位（２−デオキシリボースとは異なる）を含有する。
相補的
用語「相補的」は、各配列の３’端が、他方の配列の５’端に結合し、そして次いで、１つの配列の各Ａ、Ｔ（Ｕ）、ＧおよびＣが、それぞれ、他方の配列のＴ（Ｕ）、Ａ、Ｃ、およびＧと整列するように、逆平行で、１つの配列が他方の配列に結合可能である場合、２つの配列が相補性であることを意味する。通常、オリゴヌクレオチドの相補性配列は、定義された配列に対して、少なくとも９０％、好ましくは９５％、最も好ましくは１００％相補性を有する。
本発明のオリゴマー（またはその領域）およびターゲット配列、例えばＨＢｘまたはＨＢｓＡｇターゲット配列の間の「相補性」の度合いを決定する際、「相補性」（また「相同性」または「同一性」も）の度合いは、オリゴマーの配列（またはその領域）、およびそれと最適に整列するターゲット領域（またはターゲット領域の逆相補体）の配列の間のパーセント同一性（またはパーセント相同性）として表される。パーセンテージは、２つの配列間で同一である整列塩基の数を計数し、オリゴマー中の連続単位の総数で割り、そして１００を乗じることによって計算可能である。こうした比較において、ギャップが存在する場合、こうしたギャップが、ギャップ内の単位数が本発明のオリゴマーおよびターゲット領域間で異なる領域であるよりも、単なるミスマッチであることが好ましい。
特に、用語「相補的」は、第一の核酸および第二の核酸の核酸塩基間で対形成する能力を意味する。各配列の３’端が、他方の配列の５’端に結合し、そして次いで、１つの配列の各核酸塩基Ａ、Ｔ（Ｕ）、ＧおよびＣが、それぞれ、他方の配列のＴ（Ｕ）、Ａ、Ｃ、およびＧと整列するように、逆平行で、１つの配列が他方の配列に結合可能である場合、２つの配列は相補的である。本発明のオリゴマー（またはその領域）およびターゲット配列、例えばＨＢｘまたはＨＢｓＡｇターゲット配列の間の相補性の度合いを決定する際、相補性の度合いは、オリゴマーの配列（またはその領域）、およびそれと最適に整列するターゲット領域の配列の間のパーセント相補性として表される。パーセンテージは、２つの配列間で対形成する整列塩基の数を計数し、オリゴマー中の連続単位の総数で割り、そして１００を乗じることによって計算可能である。こうした比較において、整列しない核酸塩基／ヌクレオチドは、ミスマッチと称される。通常、本発明のオリゴヌクレオチドの相補性配列は、定義された配列に対して、少なくとも８０％、好ましくは８５％、好ましくは９０％、より好ましくは９５％、最も好ましくは１００％相補性を有する。
用語「相補性配列」は、ポリヌクレオチド配列を指す場合、塩基対形成規則によって、別の核酸分子中の塩基配列に関連する。より具体的には、該用語または類似の用語は、ヌクレオチドまたは核酸の間の、例えば二本鎖ＤＮＡ分子の２つの鎖間の、あるいはオリゴヌクレオチド・プライマーおよび配列決定または増幅しようとする一本鎖核酸上のプライマー結合部位間の、ハイブリダイゼーションまたは塩基対形成を指す。相補的ヌクレオチドは、一般的に、ＡおよびＴ（またはＡおよびＵ）、またはＣおよびＧである。２つの一本鎖ＲＮＡまたはＤＮＡ分子は、１つの鎖のヌクレオチドが、最適に整列され、そして比較され、そして適切なヌクレオチド挿入または欠失を伴って、他方の鎖のヌクレオチドの少なくとも約９５％と、通常、少なくとも約９８％と、そしてより好ましくは約９９〜約１００％と対形成する場合、実質的に相補的であると言われる。相補的ポリヌクレオチド配列は、周知のコンピュータ・アルゴリズムおよびソフトウェア、例えばＢＬＡＳＴプログラムの使用を含む、多様なアプローチによって同定可能である。
逆相補体／逆相補的／逆相補性
用語「逆相補体」、「逆相補的」および「逆相補性」は、本明細書において、用語「相補体」、「相補的」および「相補性」と交換可能である。
ミスマッチ
用語「ミスマッチ」は、時に、非相補的核酸塩基と称され、第一の核酸が第二の核酸と整列された際に、第二の核酸の対応する核酸塩基またはヌクレオチドとワトソン−クリック塩基対形成しない、第一の核酸中の所定の位置の核酸塩基またはヌクレオチドを指す。第一の核酸は、例えば、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであることも可能であり、そして第二の核酸は、例えば、ターゲット配列であることも可能である。多数のミスマッチを含有するオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートにおいて、ミスマッチは、互いに隣接していてもよいし、または散在していてもいずれでもよい。
その天然存在変異体
用語「その天然存在変異体」は、定義される分類学的な群、例えばＨＢＶ遺伝子型Ａ〜Ｈ内に天然に存在するターゲット配列の変異体を指す。典型的には、ポリヌクレオチドの「天然存在変異体」を指す場合、該用語はまた、染色体転位置または複製によって見られるゲノムＤＮＡ、およびＲＮＡ、例えばそこから得られるｍＲＮＡをコードするターゲット配列の任意のアレル変異体を含むことも可能である。「天然存在変異体」にはまた、ターゲット配列ｍＲＮＡの選択的スプライシング由来の変異体も含まれることも可能である。特定のポリペプチド配列に言及した際、例えば、該用語には、タンパク質の天然存在型もまた含まれ、これはしたがって、例えば翻訳と同時のまたは翻訳後の修飾、例えばシグナルペプチド切断、タンパク質分解切断、グリコシル化等によって、プロセシングされうるタンパク質の天然存在型もまた含まれる。
下流
本明細書において、用語「下流」は、ヌクレオチド配列に沿った方向に言及して用いられる際、５’から３’端の方向を意味する。同様に、用語「上流」は、３’から５’端の方向を意味する。
ＬＮＡ
用語「ＬＮＡ」は、「ロック化核酸」として知られる二環ヌクレオシド類似体を指す。これは、ＬＮＡ単位を指すことも可能であり、または「ＬＮＡオリゴヌクレオチド」の文脈で用いられた際、ＬＮＡは、１またはそれより多いこうした二環ヌクレオチド類似体を含有するオリゴヌクレオチドを指す。ＬＮＡヌクレオチドは、例えば以下に記載する二ラジカルＲ４＊−Ｒ２＊として示すように、リボース糖環のＣ２’およびＣ４’の間のリンカー基（例えば架橋）の存在によって特徴付けられる。
本明細書において、用語「ＬＮＡオリゴヌクレオチド」および「ＬＮＡ修飾オリゴヌクレオチド」には、ＬＮＡ単位で完全にまたは部分的にのいずれかで修飾された任意のオリゴヌクレオチドが含まれる。したがって、ＬＮＡ修飾オリゴヌクレオチドは、完全にＬＮＡ単位で構成されてもよいし、またはＬＮＡ修飾オリゴヌクレオチドは、１つのＬＮＡ単位を含んでもよい。
本発明のオリゴヌクレオチド化合物で用いるＬＮＡは、好ましくは、一般式Ｉ
Figure 0006306745
の構造を有し、
式中、すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよく；
Ｘは−Ｏ−、−Ｓ−、−Ｎ（ＲＮ＊）−、−Ｃ（Ｒ６Ｒ６＊）−より選択され、例えばいくつかの態様において、−Ｏ−であり；Ｂは、水素、場合によって置換されたＣ１−４−アルコキシ、場合によって置換されたＣ１−４−アルキル、場合によって置換されたＣ１−４−アシルオキシ、天然存在および核酸塩基類似体を含む核酸塩基、ＤＮＡ挿入剤、光化学活性基、熱化学活性基、キレート基、レポーター基、およびリガンドより選択され；好ましくは、Ｂは、核酸塩基または核酸塩基類似体であり；
Ｐは、隣接する単位へのヌクレオチド間連結、または５’末端基を示し、こうしたヌクレオチド間連結または５’末端基は、場合によって、置換基Ｒ５または等しく適用可能な置換基Ｒ５＊を含み；
Ｐ＊は、隣接する単位へのヌクレオチド間連結を指すか、または３’末端基を示し；Ｒ４＊およびＲ２＊はともに、−Ｃ（ＲａＲｂ）−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｃ（Ｒｂ）−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｎ−、−Ｏ−、−Ｓｉ（Ｒａ）２−、−Ｓ−、−ＳＯ２−、−Ｎ（Ｒａ）−、および＞Ｃ＝Ｚより選択される１〜４基／原子からなる二価リンカー基を示し、式中、Ｚは、−Ｏ−、−Ｓ−、および−Ｎ（Ｒａ）−より選択され、そしてＲａおよびＲｂは、各々、独立に、水素、場合によって置換されたＣ１−１２−アルキル、場合によって置換されたＣ２−１２−アルケニル、場合によって置換されたＣ２−１２−アルキニル、ヒドロキシ、場合によって置換されたＣ１−１２−アルコキシ、Ｃ２−１２−アルコキシアルキル、Ｃ２−１２−アルケニルオキシ、カルボキシ、Ｃ１−１２−アルコキシカルボニル、Ｃ１−１２−アルキルカルボニル、ホルミル、アリール、アリールオキシ−カルボニル、アリールオキシ、アリールカルボニル、ヘテロアリール、ヘテロアリールオキシ−カルボニル、ヘテロアリールオキシ、ヘテロアリールカルボニル、アミノ、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）アミノ、カルバモイル、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）−アミノ−カルボニル、アミノ−Ｃ１−６−アルキル−アミノカルボニル、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）アミノ−Ｃ１−６−アルキル−アミノカルボニル、Ｃ１−６−アルキル−カルボニルアミノ、カルバミド、Ｃ１−６−アルカノイルオキシ、スルホノ、Ｃ１−６−アルキルスルホニルオキシ、ニトロ、アジド、スルファニル、Ｃ１−６−アルキルチオ、ハロゲン、ＤＮＡ挿入剤、光化学活性基、熱化学活性基、キレート基、レポーター基、およびリガンドより選択され、ここで、アリールおよびヘテロアリールは、場合によって置換されてもよく、そして２つのジェミナル置換基ＲａおよびＲｂがともに、場合によって置換されたメチレン（＝ＣＨ２）を示してもよい場合、すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよく、そして；
存在する置換基Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ５、Ｒ５＊、Ｒ６およびＲ６＊は、各々、独立に、水素、場合によって置換されたＣ１−１２−アルキル、場合によって置換されたＣ２−１２−アルケニル、場合によって置換されたＣ２−１２−アルキニル、ヒドロキシ、Ｃ１−１２−アルコキシ、Ｃ２−１２−アルコキシアルキル、Ｃ２−１２−アルケニルオキシ、カルボキシ、Ｃ１−１２−アルコキシカルボニル、Ｃ１−１２−アルキルカルボニル、ホルミル、アリール、アリールオキシ−カルボニル、アリールオキシ、アリールカルボニル、ヘテロアリール、ヘテロアリールオキシ−カルボニル、ヘテロアリール-オキシ、ヘテロアリールカルボニル、アミノ、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）アミノ、カルバモイル、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）−アミノ−カルボニル、アミノ−Ｃ１−６−アルキル−アミノカルボニル、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）アミノ−Ｃ１−６−アルキル−アミノカルボニル、Ｃ１−６−アルキル−カルボニルアミノ、カルバミド、Ｃ１−６−アルカノイルオキシ、スルホノ、Ｃ１−６−アルキルスルホニルオキシ、ニトロ、アジド、スルファニル、Ｃ１−６−アルキルチオ、ハロゲン、ＤＮＡ挿入剤、光化学活性基、熱化学活性基、キレート基、レポーター基、およびリガンドより選択され、ここで、アリールおよびヘテロアリールは、場合によって置換されていてもよく、そして２つのジェミナル置換基はともに、オキソ、チオキソ、イミノ、または場合によって置換されたメチレンを示してもよく；ＲＮは、水素およびＣ１−４−アルキルより選択され、そして２つの隣接（非ジェミナル）置換基は、二重結合を生じるさらなる結合を示してもよく；そしてＲＮ＊は、存在し、そして二ラジカルに関与しない場合、水素およびＣ１−４−アルキル；ならびに塩基性塩およびその酸付加塩より選択される。すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよい。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊はともに、Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｃ（ＲａＲｂ）−、Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−、Ｃ（ＲａＲｂ）−ＮＲａ−、Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｓ−、およびＣ（ＲａＲｂ）−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−からなる群より選択される官能基からなる二ラジカルを示し、ここで、各ＲａおよびＲｂは、場合によって独立に選択されることも可能である。いくつかの態様において、ＲａおよびＲｂは、場合によって、独立に、水素およびＣ１−６アルキル、例えばメチル、例えば水素からなる群より選択されることも可能である。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊は、ともに、ＲまたはＳ立体配置いずれかの二ラジカル−Ｏ−ＣＨ（ＣＨ２ＯＣＨ３）−（２’Ｏ−メトキシエチル二環核酸− Ｓｅｔｈら， ２０１０， Ｊ． Ｏｒｇ． Ｃｈｅｍ）を示す。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊は、ともに、ＲまたはＳ立体配置いずれかの二ラジカル−Ｏ−ＣＨ（ＣＨ２ＣＨ３）−（２’Ｏ−エチル二環核酸− Ｓｅｔｈら， ２０１０， Ｊ． Ｏｒｇ． Ｃｈｅｍ）を示す。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊は、ともに、ＲまたはＳ立体配置いずれかの二ラジカル−Ｏ−ＣＨ（ＣＨ３）−を示す。いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊は、ともに、二ラジカル−Ｏ−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ２−−（Ｓｅｔｈら， ２０１０， Ｊ． Ｏｒｇ． Ｃｈｅｍ）を示す。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊は、ともに、二ラジカル−Ｏ−ＮＲ−ＣＨ３−−（Ｓｅｔｈら， ２０１０， Ｊ． Ｏｒｇ． Ｃｈｅｍ）を示す。
いくつかの態様において、ＬＮＡ単位は、以下の群：
Figure 0006306745
より選択される構造を有する。
いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ５、Ｒ５＊は、独立に、水素、ハロゲン、Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニルまたは置換Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アルコキシル、置換Ｃ１−６アルコキシル、アシル、置換アシル、Ｃ１−６アミノアルキルまたは置換Ｃ１−６アミノアルキルからなる群より選択される。すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよい。
いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ５、Ｒ５＊は水素である。
いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３は、独立に、水素、ハロゲン、Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニルまたは置換Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アルコキシル、置換Ｃ１−６アルコキシル、アシル、置換アシル、Ｃ１−６アミノアルキルまたは置換Ｃ１−６アミノアルキルからなる群より選択される。すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよい。
いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３は水素である。
いくつかの態様において、Ｒ５およびＲ５＊は、各々、独立に、Ｈ、−ＣＨ３、−ＣＨ２−ＣＨ３、−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ３、および−ＣＨ＝ＣＨ２からなる群より選択される。適切には、いくつかの態様において、Ｒ５またはＲ５＊のいずれかが水素であり、この場合、もう一方の基（それぞれ、Ｒ５またはＲ５＊）は、Ｃ１−５アルキル、Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニル、置換Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルキニルまたは置換アシル（−Ｃ（＝Ｏ）−）からなる群より選択され；ここで、各置換基は、ハロゲン、Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニル、置換Ｃ２−６アルキニル、ＯＪ１、ＳＪ１、ＮＪ１Ｊ２、Ｎ３、ＣＯＯＪ１、ＣＮ、Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝ＮＨ）ＮＪ，Ｊ２またはＮ（Ｈ）Ｃ（＝Ｘ）Ｎ（Ｈ）Ｊ２より独立に選択される置換基でモノまたはポリ置換され、式中、ＸはＯまたはＳであり；そして、各Ｊ１およびＪ２は、独立に、Ｈ、Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニル、置換Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アミノアルキル、置換Ｃ１−６アミノアルキルまたは保護基である。いくつかの態様において、Ｒ５またはＲ５＊のいずれかは置換Ｃ１−６アルキルである。いくつかの態様において、Ｒ５またはＲ５＊のいずれかは、置換メチレンであり、ここで、好ましい置換基には、Ｆ、ＮＪ１Ｊ２、Ｎ３、ＣＮ、ＯＪ１、ＳＪ１、Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝ＮＨ）ＮＪ、Ｊ２またはＮ（Ｈ）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｈ）Ｊ２より独立に選択される１またはそれより多い基が含まれる。いくつかの態様において、Ｊ１およびＪ２は、各々、独立に、ＨまたはＣ１−６アルキルである。いくつかの態様において、Ｒ５またはＲ５＊のいずれかは、メチル、エチルまたはメトキシメチルである。いくつかの態様において、Ｒ５またはＲ５＊のいずれかはメチルである。さらなる態様において、Ｒ５またはＲ５＊のいずれかはエチニルである。いくつかの態様において、Ｒ５またはＲ５＊のいずれかは置換アシルである。いくつかの態様において、Ｒ５またはＲ５＊のいずれかはＣ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２である。すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよい。こうした５’修飾二環ヌクレオチドは、本明細書にその全体が援用されるＷＯ ２００７／１３４１８１に開示される。
いくつかの態様において、Ｂは、核酸塩基類似体および天然存在核酸塩基を含む核酸塩基、例えばプリンまたはピリミジン、あるいは置換プリンまたは置換ピリミジン、例えば本明細書に言及する核酸塩基、例えばアデニン、シトシン、チミン、アデニン、ウラシル、および／または修飾または置換核酸塩基、例えば、５−チアゾロ−ウラシル、２−チオ−ウラシル、５−プロピニル−ウラシル、２’チオ−チミン、５−メチル シトシン、５−チオゾロ−シトシン、５−プロピニル−シトシン、および２，６−ジアミノプリンからなる群より選択される核酸塩基である。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊はともに、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｃ（ＲｃＲｄ）−Ｏ−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｃ（ＲｃＲｄ）−Ｃ（ＲｅＲｆ）−Ｏ−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−Ｃ（ＲｃＲｄ）−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−Ｃ（ＲｃＲｄ）−Ｏ−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｃ（ＲｃＲｄ）−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｃ（ＲｃＲｄ）−Ｃ（ＲｅＲｆ）−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｃ（Ｒｂ）−Ｃ（ＲｃＲｄ）−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｎ（Ｒｃ）−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｃ（ＲｃＲｄ）− Ｎ（Ｒｅ）−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｎ（Ｒｃ）−Ｏ−、および−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｓ−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｃ（ＲｃＲｄ）−Ｓ−より選択される二ラジカルを示し、式中、Ｒａ、Ｒｂ、Ｒｃ、Ｒｄ、Ｒｅ、およびＲｆは、各々独立に、水素、場合によって置換されたＣ１−１２−アルキル、場合によって置換されたＣ２−１２−アルケニル、場合によって置換されたＣ２−１２−アルキニル、ヒドロキシ、Ｃ１−１２−アルコキシ、Ｃ２−１２−アルコキシアルキル、Ｃ２−１２−アルケニルオキシ、カルボキシ、Ｃ１−１２−アルコキシカルボニル、Ｃ１−１２−アルキルカルボニル、ホルミル、アリール、アリールオキシ−カルボニル、アリールオキシ、アリールカルボニル、ヘテロアリール、ヘテロアリールオキシ−カルボニル、ヘテロアリールオキシ、ヘテロアリールカルボニル、アミノ、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）アミノ、カルバモイル、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）−アミノ−カルボニル、アミノ−Ｃ１−６−アルキル−アミノカルボニル、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）アミノ−Ｃ１−６−アルキル−アミノカルボニル、Ｃ１−６−アルキル−カルボニルアミノ、カルバミド、Ｃ１−６−アルカノイルオキシ、スルホノ、Ｃ１−６−アルキルスルホニルオキシ、ニトロ、アジド、スルファニル、Ｃ１−６−アルキルチオ、ハロゲン、ＤＮＡ挿入剤、光化学活性基、熱化学活性基、キレート基、レポーター基、およびリガンドより選択され、ここで、アリールおよびヘテロアリールは、場合によって置換されてもよく、そして２つのジェミナル置換基ＲａおよびＲｂはともに、場合によって置換されたメチレン（＝ＣＨ２）を示すことも可能である。すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよい。
さらなる態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊はともに、−ＣＨ２−Ｏ−、−ＣＨ２−Ｓ−、−ＣＨ２−ＮＨ−、−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−、−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｏ−、−ＣＨ２−ＣＨ（ＣＨ３）−、−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｓ−、−ＣＨ２−ＣＨ２−ＮＨ−、−ＣＨ２−ＣＨ２−ＣＨ２−、−ＣＨ２−ＣＨ２−ＣＨ２−Ｏ−、−ＣＨ２−ＣＨ２−ＣＨ（ＣＨ３）−、−ＣＨ＝ＣＨ−ＣＨ２−、−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ２−Ｏ−、−ＣＨ２−ＮＨ−Ｏ−、−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｏ−、−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ２−、−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−、および−ＣＨ（ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ３）−Ｏ−、および／または−ＣＨ２−ＣＨ２−、および−ＣＨ＝ＣＨ−より選択される二ラジカル（二価基）を示す。すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよい。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊はともに、二ラジカルＣ（ＲａＲｂ）−Ｎ（Ｒｃ）−Ｏ−を示し、式中、ＲａおよびＲｂは、独立に、水素、ハロゲン、Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニルまたは置換Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アルコキシル、置換Ｃ１−６アルコキシル、アシル、置換アシル、Ｃ１−６アミノアルキルまたは置換Ｃ１−６アミノアルキルからなる群より選択され、例えば水素であり、そして；式中、Ｒｃは、水素、ハロゲン、Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニルまたは置換Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アルコキシル、置換Ｃ１−６アルコキシル、アシル、置換アシル、Ｃ１−６アミノアルキルまたは置換Ｃ１−６アミノアルキルからなる群より選択され、例えば水素である。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊はともに、二ラジカルＣ（ＲａＲｂ）−Ｏ−Ｃ（ＲｃＲｄ）−Ｏ−を示し、式中、Ｒａ、Ｒｂ、Ｒｃ、およびＲｄは、独立に、水素、ハロゲン、Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニルまたは置換Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アルコキシル、置換Ｃ１−６アルコキシル、アシル、置換アシル、Ｃ１−６アミノアルキルまたは置換Ｃ１−６アミノアルキルからなる群より選択され、例えば水素である。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊は、二ラジカル−ＣＨ（Ｚ）−Ｏ−を形成し、式中、Ｚは、Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニル、置換Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルキニル、アシル、置換アシル、置換アミド、チオールまたは置換チオからなる群より選択され；そして置換基各々は、独立に、ハロゲン、オキソ、ヒドロキシル、ＯＪ１、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＯＣ（＝Ｘ）Ｊ１、ＯＣ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２、ＮＪ３Ｃ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２およびＣＮより独立に選択される場合によって保護された置換基でモノまたはポリ置換され、式中、各Ｊ１、Ｊ２およびＪ３は、独立に、ＨまたはＣ１−６アルキルであり、そしてＸはＯ、ＳまたはＮＪ１である。いくつかの態様において、ＺはＣ１−６アルキルまたは置換Ｃ１−６アルキルである。いくつかの態様において、Ｚはメチルである。いくつかの態様において、Ｚは置換Ｃ１−６アルキルである。いくつかの態様において、前記置換基はＣ１−６アルコキシである。いくつかの態様において、ＺはＣＨ３ＯＣＨ２−である。すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよい。こうした二環ヌクレオチドは、本明細書にその全体が援用される、ＵＳ ７，３９９，８４５に開示される。いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ５、Ｒ５＊は水素である。いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３＊は水素であり、そしてＲ５、Ｒ５＊の一方または両方は、上記に言及するように、そしてＷＯ ２００７／１３４１８１に示されるように、水素以外であることも可能である。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊はともに、架橋中に置換アミノ基を含む、例えば二ラジカル−ＣＨ２−Ｎ（Ｒｃ）−からなるかまたはこれを含む二ラジカルを示し、式中、ＲｃはＣ１−１２アルキルオキシである。いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊はともに、二ラジカル−Ｃｑ３ｑ４−ＮＯＲ−を示し、式中、ｑ３およびｑ４は、独立に、水素、ハロゲン、Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニルまたは置換Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アルコキシル、置換Ｃ１−６アルコキシル、アシル、置換アシル、Ｃ１−６アミノアルキルまたは置換Ｃ１−６アミノアルキルからなる群より選択され；式中、各置換基は、独立に、ハロゲン、ＯＪ１、ＳＪ１、ＮＪ１Ｊ２、ＣＯＯＪ１、ＣＮ、Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝ＮＨ）Ｎ Ｊ１Ｊ２またはＮ（Ｈ）Ｃ（＝Ｘ＝Ｎ（Ｈ）Ｊ２より独立に選択される置換基でモノまたはポリ置換され、式中、ＸはＯまたはＳであり；そしてＪ１およびＪ２各々は、独立に、Ｈ、Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アミノアルキルまたは保護基である。すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよい。こうした二環ヌクレオチドは、本明細書にその全体が援用されるＷＯ２００８／１５０７２９に開示される。いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ５、Ｒ５＊は、独立に、水素、ハロゲン、Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニルまたは置換Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アルコキシル、置換Ｃ１−６アルコキシル、アシル、置換アシル、Ｃ１−６アミノアルキルまたは置換Ｃ１−６アミノアルキルからなる群より選択される。いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ５、Ｒ５＊は水素である。いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３は水素であり、そしてＲ５、Ｒ５＊の一方または両方は、上記に言及されるように、そしてＷＯ ２００７／１３４１８１に示されるように水素以外であることも可能である。いくつかの態様においてＲ４＊およびＲ２＊はともに、二ラジカル（二価基）Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−を示し、式中、ＲａおよびＲｂは、各々、独立に、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１−Ｃ１２アルキル、Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、Ｃ１−Ｃ１２アルコキシ、置換Ｃ１−Ｃ１２アルコキシ、ＯＪ１ ＳＪ１、ＳＯＪ１、ＳＯ２Ｊ１、ＮＪ１Ｊ２、Ｎ３、ＣＮ、Ｃ（＝Ｏ）ＯＪ１、Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２、Ｃ（＝Ｏ）Ｊ１、Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝ＮＨ）ＮＪ１Ｊ２、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２またはＮ（Ｈ）Ｃ（＝Ｓ）ＮＪ１Ｊ２であり；またはＲａおよびＲｂは、ともに＝Ｃ（ｑ３）（ｑ４）であり；ｑ３およびｑ４は、各々、独立に、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ１２アルキルまたは置換Ｃ１−Ｃ１２アルキルであり；各置換基は、独立に、ハロゲン、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルキニル、ＯＪ１、ＳＪ１、ＮＪ１Ｊ２、Ｎ３、ＣＮ、Ｃ（＝Ｏ）ＯＪ１、Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２、Ｃ（＝Ｏ）Ｊ１、Ｏ−Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２またはＮ（Ｈ）Ｃ（＝Ｓ）ＮＪ１Ｊ２．より独立に選択される置換基でモノまたはポリ置換され；各Ｊ１およびＪ２は、独立に、Ｈ、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルキニル、Ｃ１−Ｃ６アミノアルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アミノアルキルまたは保護基である。こうした化合物は、本明細書にその全体が援用されるＷＯ２００９００６４７８Ａに開示される。
いくつかの態様において、Ｒ４＊およびＲ２＊は、二ラジカル−Ｑ−を形成し、式中、ＱはＣ（ｑ１）（ｑ２）Ｃ（ｑ３）（ｑ４）、Ｃ（ｑ１）＝Ｃ（ｑ３）、Ｃ［＝Ｃ（ｑ１）（ｑ２）］−Ｃ（ｑ３）（ｑ４）またはＣ（ｑ１）（ｑ２）−Ｃ［＝Ｃ（ｑ３）（ｑ４）］であり；ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４は、各々、独立に、Ｈ、ハロゲン、Ｃ１−１２アルキル、置換Ｃ１−１２アルキル、Ｃ２−１２アルケニル、置換Ｃ１−１２アルコキシ、ＯＪ１、ＳＪ１、ＳＯＪ１、ＳＯ２Ｊ１、ＮＪ１Ｊ２、Ｎ３、ＣＮ、Ｃ（＝Ｏ）ＯＪ１、Ｃ（＝Ｏ）−ＮＪ１Ｊ２、Ｃ（＝Ｏ）Ｊ１、−Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝ＮＨ）ＮＪ１Ｊ２、Ｎ（Ｈ）Ｃ（＝Ｏ）ＮＪ１Ｊ２またはＮ（Ｈ）Ｃ（＝Ｓ）ＮＪ１Ｊ２であり；各Ｊ１およびＪ２は、独立に、Ｈ、Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アミノアルキルまたは保護基であり；そして場合によって、式中、ＱがＣ（ｑ１）（ｑ２）（ｑ３）（ｑ４）であり、そしてｑ３またはｑ４の１つがＣＨ３である場合、ｑ３またはｑ４の他方あるいはｑ１およびｑ２の１つの少なくとも１つは、Ｈ以外である。いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ５、Ｒ５＊は水素である。すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよい。こうした二環ヌクレオチドは、本明細書にその全体が援用されるＷＯ２００８／１５４４０１に開示される。いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ５、Ｒ５＊は、独立に、水素、ハロゲン、Ｃ１−６アルキル、置換Ｃ１−６アルキル、Ｃ２−６アルケニル、置換Ｃ２−６アルケニル、Ｃ２−６アルキニルまたは置換Ｃ２−６アルキニル、Ｃ１−６アルコキシル、置換Ｃ１−６アルコキシル、アシル、置換アシル、Ｃ１−６アミノアルキルまたは置換Ｃ１−６アミノアルキルからなる群より選択される。いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３、Ｒ５、Ｒ５＊は水素である。いくつかの態様において、Ｒ１＊、Ｒ２、Ｒ３は水素であり、そしてＲ５、Ｒ５＊の一方または両方は、上記に言及するように、そしてＷＯ ２００７／１３４１８１またはＷＯ２００９／０６７６４７に示されるように（アルファ−Ｌ−二環核酸類似体）、水素以外であることも可能である。
さらなる二環ヌクレオシド類似体およびアンチセンス・オリゴヌクレオチドにおけるその使用が、ＷＯ２０１１／１１５８１８、ＷＯ２０１１／０８５１０２、ＷＯ２０１１／０１７５２１、ＷＯ０９／１００３２０、ＷＯ１０／０３６６９８、ＷＯ０９／１２４２９５およびＷＯ０９／００６４７８に開示される。こうしたヌクレオシド類似体は、いくつかの側面において、本発明の化合物において有用である可能性もある。
いくつかの態様において、本発明のオリゴヌクレオチド化合物において用いられるＬＮＡは、好ましくは一般式ＩＩ：
Figure 0006306745
式中、Ｙは、−Ｏ−、−ＣＨ２Ｏ−、−Ｓ−、−ＮＨ−、Ｎ（Ｒｅ）および／または−ＣＨ２−からなる群より選択され；ＺおよびＺ＊は、独立に、ヌクレオチド間連結、ＲＨ、末端基または保護基の中から選択され；Ｂは、天然または非天然ヌクレオチド塩基部分（核酸塩基）を構成し、そして、ＲＨは水素およびＣ１−４−アルキルより選択され；Ｒａ、Ｒｂ Ｒｃ、ＲｄおよびＲｅは、場合によって独立に、水素、場合によって置換されたＣ１−１２−アルキル、場合によって置換されたＣ２−１２−アルケニル、場合によって置換されたＣ２−１２−アルキニル、ヒドロキシ、Ｃ１−１２−アルコキシ、Ｃ２−１２−アルコキシアルキル、Ｃ２−１２−アルケニルオキシ、カルボキシ、Ｃ１−１２−アルコキシカルボニル、Ｃ１−１２−アルキルカルボニル、ホルミル、アリール、アリールオキシ−カルボニル、アリールオキシ、アリールカルボニル、ヘテロアリール、ヘテロアリールオキシ−カルボニル、ヘテロアリールオキシ、ヘテロアリールカルボニル、アミノ、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）アミノ、カルバモイル、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）−アミノ−カルボニル、アミノ−Ｃ１−６−アルキル−アミノカルボニル、モノおよびジ（Ｃ１−６−アルキル）アミノ−Ｃ１−６−アルキル−アミノカルボニル、Ｃ１−６−アルキル−カルボニルアミノ、カルバミド、Ｃ１−６−アルカノイルオキシ、スルホノ、Ｃ１−６−アルキルスルホニルオキシ、ニトロ、アジド、スルファニル、Ｃ１−６−アルキルチオ、ハロゲン、ＤＮＡ挿入剤、光化学活性基、熱化学活性基、キレート基、レポーター基、およびリガンドからなる群より選択され、式中、アリールおよびヘテロアリールは、場合によって置換され、そして２つのジェミナル置換基ＲａおよびＲｂはともに、場合によって置換されたメチレン（＝ＣＨ２）を示すことも可能であり；そしてＲＨは、水素およびＣ１−４−アルキルより選択される。いくつかの態様において、Ｒａ、Ｒｂ Ｒｃ、ＲｄおよびＲｅは場合によって独立に、水素およびＣ１−６アルキルからなる群、例えばメチルであることも可能である。すべてのキラル中心に関して、非対称基は、ＲまたはＳ配向のいずれで見られてもよく、例えば、２つの例示的ステレオ化学異性体には、以下のように例示可能なベータ−Ｄおよびアルファ−Ｌ異性体が含まれる：
Figure 0006306745
特定の例示的なＬＮＡ単位を以下に示す：
Figure 0006306745
用語「チオ−ＬＮＡ」は、ロック化ヌクレオチドを含み、上記一般式中のＹはＳまたは−ＣＨ２−Ｓ−より選択される。チオ−ＬＮＡは、ベータ−Ｄおよびアルファ−Ｌ立体配置のどちらであることも可能である。
用語「アミノ−ＬＮＡ」は、ロック化ヌクレオチドを含み、上記一般式中のＹは、−Ｎ（Ｈ）−、Ｎ（Ｒ）−、ＣＨ２−Ｎ（Ｈ）−、および−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−より選択され、ここで、Ｒは、水素およびＣ１−４−アルキルより選択される。アミノ−ＬＮＡは、ベータ−Ｄおよびアルファ−Ｌ立体配置のどちらであることも可能である。
用語「オキシ−ＬＮＡ」は、ロック化ヌクレオチドを含み、上記一般式中のＹは−Ｏ−を示す。オキシ−ＬＮＡは、ベータ−Ｄおよびアルファ−Ｌ立体配置のどちらであることも可能である。
用語「ＥＮＡ」は、ロック化ヌクレオチドを含み、上記一般式中のＹは、−ＣＨ２−Ｏ−である（ここで、−ＣＨ２−Ｏ−の酸素原子は、塩基Ｂに対して２’位に付着する）。Ｒｅは水素またはメチルである。
いくつかの例示的な態様において、ＬＮＡは、ベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ、アルファ−Ｌ−オキシ−ＬＮＡ、ベータ−Ｄ−アミノ−ＬＮＡおよびベータ−Ｄ−チオ−ＬＮＡより選択され、特に、ベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡである。
ＬＮＡ修飾アンチセンス・オリゴヌクレオチドを組み合わせて用いてもよい。例えば、同じ遺伝子の異なる領域に対して向けられる、いくつかの異なるＬＮＡ修飾オリゴヌクレオチドのカクテルを、同時にまたは別個に投与することも可能である。
ヘッドマー（Ｈｅａｄｍｅｒ）
「ヘッドマー」は、連続する領域Ｘ’および領域Ｙ’を含み、領域Ｙ’の最も５’にある単位が、領域Ｘ’の最も３’にある単位に連結されているオリゴマーと定義される。領域Ｘ’は、非ＲＮアーゼ補充ヌクレオシド類似体の連続ストレッチを含み、そして領域Ｙ’は、ＤＮＡ単位またはＲＮアーゼによって認識可能でありそして切断可能であるヌクレオシド類似体単位の連続ストレッチ（例えば少なくとも７つの連続単位）を含む。
テールマー（Ｔａｉｌｍｅｒ）
「テールマー」は、領域Ｘ’’および連続する領域Ｙ’’を含み、領域Ｙ’’の最も５’にある単位が、領域Ｘ’’の最も３’にある単位に連結されているオリゴマーと定義される。領域Ｘ’’は、ＤＮＡ単位、またはＲＮアーゼによって認識可能でありそして切断可能であるヌクレオシド類似体単位の連続ストレッチ（例えば少なくとも７つの連続単位）を含み、そして領域Ｘ’’は、非ＲＮアーゼ補充ヌクレオシド類似体の連続ストレッチを含む。
キメラオリゴマー／ミクスマー（Ｍｉｘｍｅｒ）
「ミクスマー」と称される「キメラ」オリゴマーは、（ｉ）ＤＮＡ単位またはＲＮアーゼによって認識可能でありそして切断可能であるヌクレオシド類似体単位、および（ｉｉ）非ＲＮＡ補充ヌクレオシド類似体単位の交互の組成からなる。
光化学活性基
本明細書の背景において、用語「光化学活性基」は、光照射に際して、化学反応を経ることが可能な化合物を指す。本明細書の官能基の例示的な例は、キノン、特に６−メチル−１，４−ナフトキノン、アントラキノン、ナフトキノン、および１，４−ジメチル−アントラキノン、ジアジリン、芳香族アジド、ベンゾフェノン、ソラーレン、ジアゾ化合物、およびジアジリノ化合物である。
に基づく（Based on）
本明細書において、用語「に基づく」は、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーが、コア・モチーフまたは配列のヌクレオチドの少なくとも８０％、好ましくは少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、好ましくはすべてを含むことを意味し、そして場合によって、１またはそれより多いヌクレオチドは修飾ヌクレオチドであることも可能である。
したがって、特定の態様に関して、用語「に基づく」は、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーが、コア・モチーフまたは配列のヌクレオチドのすべてを含むことを意味し、そして場合によって、１またはそれより多いヌクレオチドは修飾ヌクレオチドであることも可能である。
特定の態様に関して、用語「に基づく」は、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーが、コア・モチーフまたは配列のヌクレオチドのすべてを含み、そして１またはそれより多いヌクレオチドは修飾ヌクレオチドであることを意味する。
特定の態様に関して、用語「に基づく」は、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーが、コア・モチーフまたは配列のヌクレオチドの少なくとも８０％、好ましくは少なくとも８５％、好ましくは少なくとも９０％、好ましくは少なくとも９５％、好ましくはすべてを含み、そして１またはそれより多いヌクレオチドは修飾ヌクレオチドであることも可能であり；そして前記オリゴマーはモチーフＸ−Ｙ−Ｚのギャップマーであり、式中、ＸおよびＺは、各々、独立に、少なくとも１つの修飾ヌクレオチドを含むウィングであり、そしてＹはヌクレオチドの中央領域であることを意味する。
したがって、特定の態様において、用語「に基づく」は、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーが、コア・モチーフまたは配列のヌクレオチドのすべてを含み、そして１またはそれより多いヌクレオチドは修飾ヌクレオチドであることも可能であり；そして前記オリゴマーはモチーフＸ−Ｙ−Ｚのギャップマーであり、式中、ＸおよびＺは、独立に、少なくとも１つの修飾ヌクレオチドを含むウィングであり、そしてＹはヌクレオチドの中央領域であることを意味する。
安定性
二重鎖または三重鎖形成に関する用語「安定性」は、一般に、アンチセンス・オリゴヌクレオチドがその意図されるターゲット配列にどれだけ緊密に結合するかを示し；より具体的には、「安定性」は、生理学的条件下で、二重鎖または三重鎖の形成の自由エネルギーを示す。例えば以下に記載するような標準条件セット下の融解温度は、二重鎖および／または三重鎖安定性の好適な測定値である。好ましくは、本発明のアンチセンス・オリゴヌクレオチドは、１００ｍＭ ＮａＣｌ、０．１ｍＭ ＥＤＴＡおよび１０ｍＭリン酸緩衝水溶液、ｐＨ ７．０、１．５μＭのアンチセンス・オリゴヌクレオチドおよびターゲット核酸両方の鎖濃度で測定した際、少なくとも４５℃の融解温度を有するように、選択される。したがって、生理学的条件下で用いた際、二重鎖または三重鎖形成は、アンチセンス・オリゴヌクレオチドおよびそのターゲットが解離する状態よりも実質的に好ましいであろう。いくつかの態様において、安定な二重鎖または三重鎖には、塩基対間および／または三重鎖の場合は塩基３つ組間にミスマッチが含まれることも可能であることが理解される。好ましくは、本発明のＬＮＡ修飾アンチセンス・オリゴヌクレオチドは、ターゲット核酸と完全にマッチした二重鎖および／または三重鎖を形成する。
強力な阻害剤
いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、強力な阻害剤、特にＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの阻害剤である。
本明細書において、句「強力な阻害剤」は、リポフェクタミン・トランスフェクション・アッセイによって決定されるように、５ｎＭ未満のＩＣ５０を持つオリゴマーを指す。いくつかの態様において、ＩＣ５０は、４ｎＭ未満、例えば２ｎＭ未満である。
トランスフェクション剤を使用しない、培養細胞へのオリゴマーの送達を記載する「ジムノシス（ｇｙｍｎｏｓｉｓ）」によって決定されるような「強力な阻害剤」は、ジムノシス・アッセイにおいて、またはｉｎ ｖｉｖｏ ＡＡＶ／ＨＢＶマウスモデルにおいて、５μｍ未満のＩＣ５０を指す。いくつかの態様において、ＩＣ５０は２μｍ未満、例えば１μｍ未満である。
治療する／治療
用語「治療する」／「治療」等には、治癒する、軽減する、防止するまたは検出するの１またはそれより多くが含まれる。特定の好ましい態様において、用語「治療する」／「治療」等は、治癒するかまたは軽減することを意味する。用語「軽減する」には、ウイルス性障害に起因するまたはウイルス性障害に関連する症状および／または状態を軽減することが含まれる。
したがって、いくつかの側面において、本発明は、ウイルス性障害を治癒するか、軽減するか、防止するか、または検出するために適したオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート、およびその使用およびこれらを用いる方法に関する。
したがって、特定の側面において、本発明は、ウイルス性障害を治癒するか、または軽減するために適したオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート、およびその使用およびこれらを用いる方法に関する。
いくつかの態様において、用語「治療」は、本明細書において、存在する疾患（例えば本明細書に記載するような疾患または障害）の治療、または疾患の防止、すなわち予防の両方を指す。したがって、本明細書に言及するような治療は、いくつかの態様において、予防的であることも可能であることが認識されるであろう。
被験体において疾患または状態を「治療すること」あるいは疾患または状態を有する被験体を「治療すること」は、個体を薬学的治療、例えば薬剤投与に供し、疾患または状態の少なくとも１つの症状が減少するかまたは安定化するようにすることを指す。
治療が必要な患者は、疾患または障害を患うかまたは患う可能性が高い患者である。
被験体において、疾患または状態を「予防的に治療すること」によって、疾患の少なくとも１つの症状が出現する前に、疾患または状態の発展（すなわち発生）リスクを減少させるかまたは除去するか、あるいはその重症度を減少させることを意味する。
剤（Agent）
用語「剤」は、任意の化合物、例えば抗体、または療法剤、検出可能標識（例えばマーカー、トレーサー、または画像化化合物）を意味する。
療法剤
用語「療法剤」は、生物学的活性を有する任意の化合物を意味する。療法剤は、状態または疾患を治療する際に有用であることも可能である。本発明記載の特定の療法剤は、オリゴマーであることも可能である。特定の療法剤は、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであることも可能である。
前記オリゴマーの肝臓への送達
本明細書において、用語「前記オリゴマーの肝臓への送達」は、オリゴマーを肝臓の細胞または組織と接触させるか、またはその近傍に運ぶことによるプロセスに関する。これには、肝臓内のまたは肝臓周囲の血流へのオリゴマーの送達が含まれる。オリゴマーを、体への進入部位から、肝臓または肝臓を取り巻く組織へ送達するかまたは運ぶことも可能である。
前記オリゴマーの肝細胞への送達
本明細書において、用語「前記オリゴマーの肝細胞への送達」は、オリゴマーを肝臓の肝細胞に接触させるか、またはその近傍に運ぶことによるプロセスに関する。これには、肝細胞内のまたは肝細胞周囲の血流へのオリゴマーの送達が含まれる。オリゴマーを、体への進入部位から肝細胞へ送達するかまたは運ぶことも可能である。
ウイルス性障害
用語「ウイルス性障害」は、本発明の背景において、ウイルス感染に関連する任意の障害または疾患を指す。
薬学的キャリアー／薬学的に許容されうるキャリアー
「薬学的キャリアー」または「薬学的に許容されうるキャリアー」は、上記のような本発明の「キャリアー構成要素」とは区別されるものとする。「薬学的キャリアー」および「キャリアー構成要素」は、本発明の背景において、互いに排他的な用語として扱われるものとする。
投与すること／投与
用語「投与すること」および「投与」は、限定なしに、動脈内、鼻内、腹腔内、静脈内、筋内、皮下、経皮、または経口を含む送達様式を意味するよう意図される。一日投薬量を、期間を通じて、１回、２回またはそれより多く投与するために適した形で、１回、２回またはそれより多い用量に分割することも可能である。
発明の詳細な説明
序論
本発明は、オリゴマー（オリゴマー分子とも称される）および／またはオリゴマー・コンジュゲートに関する。
オリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲートは、ウイルス性障害の治療に有用である。
特定の態様において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節することが可能である。
本発明のオリゴマーをキャリアー構成要素にコンジュゲート化することも可能である。
好ましくは、キャリアー構成要素は、治療しようとする被験体の肝臓に、オリゴマーを送達することが可能であることも可能である。
本発明は、したがって、ＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇをコードする核酸分子、例えば配列番号１または配列番号２として提示するＨＢＶ核酸分子、およびＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢＶ ＨＢｓＡｇをコードするこうした核酸分子の天然存在変異体の機能を調節する際に使用するために、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを使用する。
オリゴマー特徴
オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、長さ８〜５０、８〜３０、８〜２５、８〜２０、８〜１８、８〜１７、８〜１６、８〜１５、８〜１４、８〜１３、または８〜１２ヌクレオチド、好ましくは長さ８〜１６ヌクレオチド、より好ましくは長さ１０〜２０ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列からなるかまたは該配列を含むことも可能である。
いくつかの態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、長さ１０〜５０、例えば１０〜３０、１０〜２０、１０〜１８、１０〜１７、１０〜１６、１０〜１５、１０〜１４、１０〜１３、または１０〜１２ヌクレオチド、好ましくは長さ１０〜２０ヌクレオチド、より好ましくは長さ１０〜１８ヌクレオチド、最も好ましくは長さ１０〜１６ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を含むかまたは該配列からなることも可能である。
いくつかの態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、長さ１２〜５０、例えば１２〜３０、１２〜２０、１２〜１８、１２〜１７、１２〜１６、１２〜１５、１２〜１４または１２〜１３ヌクレオチド、好ましくは長さ１２〜１６ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を含むかまたは該配列からなることも可能である。
いくつかの態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、長さ８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を含むかまたは該配列からなることも可能である。
いくつかの態様に関して、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、総数長さ８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９または３０連続ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を含むかまたは該配列からなる。
いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、総数長さ８〜２２、例えば８〜２０、例えば８〜１８、例えば８〜１７または８〜１６連続ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を含むかまたは該配列からなる。
いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、総数長さ８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６連続ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を含むかまたは該配列からなる。
いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、総数長さ１５または１６連続ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列を含むかまたは該配列からなる。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、２２ヌクレオチド以下、例えば２０ヌクレオチド以下、例えば１８ヌクレオチド以下、例えば１５、または１６または１７ヌクレオチドからなる。
いくつかの態様において、好ましくは本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、２０ヌクレオチド未満を含む。
オリゴマーまたは連続ヌクレオチド配列長に関して範囲が提供されている場合、範囲中に提供された下限および上限の長さが含まれると理解すべきであり、例えば１０〜３０（またはその間）には、１０および３０の両方が含まれる。
オリゴヌクレオチド部分の長さは、多くの参考文献、例えばＲｏｓｅｎｂｅｒｇら、国際出願ＰＣＴ／ＵＳ９２／０５３０５；またはＳｚｏｓｔａｋら， Ｍｅｔｈ． Ｅｎｚｙｍｏｌ， ６８：４１９−４２９ （１９７９）に説明されるように、特異的結合が、望ましいターゲット・ポリヌクレオチドでのみ起こり、そして他の偶然の（ｆｏｒｔｕｉｔｏｕｓ）部位では起こらないことを確実にするために十分に長い。長さの上限は、いくつかの要因によって決定され、これには、長さ約３０〜４０ヌクレオチドより大きいオリゴマーは合成および精製に不都合であり、そして高価であること、より短いオリゴヌクレオチドよりも、より長いオリゴヌクレオチドの方が、ミスマッチに関してより高い許容性を持つこと、結合または特異性を増進させる修飾が存在するかどうか、二重鎖または三重鎖結合が望ましいかどうか等が含まれる。
オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、天然存在ヌクレオチド、好ましくは２’デオキシヌクレオチド（本明細書において、一般的に「ＤＮＡ」と称される）の単純な配列を含むかまたはこうした配列からなることも可能であるが、また、リボヌクレオチド（本明細書において、一般的に「ＲＮＡ」と称される）、あるいはこうした天然存在ヌクレオチドおよび１またはそれより多い非天然存在ヌクレオチド、すなわちヌクレオチド類似体の組み合わせを含むかまたはこれらからなることも可能である。こうしたヌクレオチド類似体は、ターゲット配列に対するオリゴマーのアフィニティを適切に増進させることも可能である。
適切でそして好ましいヌクレオチド類似体の例は、ＷＯ２００７／０３１０９１に提供されるか、または該文書に言及される。
ヌクレオチド類似体の例には、修飾されているヌクレオチドが含まれる。こうした修飾の例には、糖部分を修飾して、２’置換基を提供するか、または結合アフィニティを増進させ、そしてまた増加したヌクレアーゼ耐性を提供することも可能な架橋（ロック化核酸）を産生することが含まれる。したがって、これらの修飾ヌクレオチド類似体は、アフィニティ増進ヌクレオチド類似体であることも可能である。
アフィニティ増進ヌクレオチド類似体、例えばＬＮＡまたは２’置換糖のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーにおける取り込みは、特異的に結合するオリゴマーのサイズを減少させることを可能にする可能性があり、そしてまた、非特異的または異常な結合が起こる前に、オリゴマーのサイズ上限を減少させることも可能である。
いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、少なくとも１つのヌクレオチド類似体を含む。いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、少なくとも２つのヌクレオチド類似体を含む。いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、２〜８のヌクレオチド類似体、例えば６または７ヌクレオチド類似体を含む。非常に最も好ましい態様において、前記ヌクレオチド類似体の少なくとも１つは、ロック化核酸（ＬＮＡ）であり；例えば、少なくとも２、３または少なくとも４、または少なくとも５、または少なくとも６、または少なくとも７、または８のヌクレオチド類似体がＬＮＡであることも可能である。いくつかの態様において、すべてのヌクレオチド類似体がＬＮＡであることも可能である。
ヌクレオチドのみからなる好ましいヌクレオチド配列モチーフまたはヌクレオチド配列に言及する際、その配列によって定義される本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、前記配列中に存在する１またはそれより多いヌクレオチドの代わりに、対応するヌクレオチド類似体、例えば、オリゴマー／ターゲット二重鎖の二重鎖安定性／Ｔｍを上昇させるＬＮＡ単位または他のヌクレオチド類似体（すなわちアフィニティ増進ヌクレオチド類似体）を含むことも可能である。
好ましいヌクレオチド類似体は、ＬＮＡ、例えばオキシ−ＬＮＡ（例えばベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ、およびアルファ−Ｌ−オキシ−ＬＮＡ）、および／またはアミノ−ＬＮＡ（例えばベータ−Ｄ−アミノ−ＬＮＡおよびアルファ−Ｌ−アミノ−ＬＮＡ）および／またはチオ−ＬＮＡ（例えばベータ−Ｄ−チオ−ＬＮＡおよびアルファ−Ｌ−チオ−ＬＮＡ）および／またはＥＮＡ（例えばベータ−Ｄ−ＥＮＡおよびアルファ−Ｌ−ＥＮＡ）である。最も好ましいのは、ベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡである。
いくつかの態様において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー内に存在するヌクレオチド類似体（例えば、本明細書に言及するように、ギャップマーに関して領域Ｗおよび領域Ｙ中）は、独立に、例えば：２’−Ｏ−アルキル−ＲＮＡ単位、２’−アミノ−ＤＮＡ単位、２’−フルオロ−ＤＮＡ単位、ＬＮＡ単位、アラビノ核酸（ＡＮＡ）単位、２’−フルオロ−ＡＮＡ単位、ＨＮＡ単位、ＩＮＡ（挿入核酸−本明細書に援用されるＣｈｒｉｓｔｅｎｓｅｎ， ２００２． Ｎｕｃｌ． Ａｃｉｄｓ． Ｒｅｓ． ２００２ ３０： ４９１８−４９２５を参照されたい）単位および２’ＭＯＥ単位より選択される。いくつかの態様において、本発明のオリゴマー、またはその連続ヌクレオチド配列中に存在するヌクレオチド類似体は、上記タイプの１つのみである。
いくつかの態様において、ヌクレオチド類似体は、２’−Ｏ−メトキシエチル−ＲＮＡ（２’ＭＯＥ）、２’−フルオロＤＮＡ単位またはＬＮＡヌクレオチド類似体であり、そしてこうしたものとして、本発明のオリゴヌクレオチドは、これらの３つのタイプの類似体から独立に選択されるヌクレオチド類似体を含むことも可能であるし、あるいは、３つのタイプより選択される類似体の１つのタイプのみを含むことも可能である。いくつかの態様において、前記ヌクレオチド類似体の少なくとも１つは２’−ＭＯＥ−ＲＮＡであり、例えば、２、３、４、５、６、７、８、９または１０が、２’−ＭＯＥ−ＲＮＡヌクレオチド単位である。いくつかの態様において、前記ヌクレオチド類似体の少なくとも１つは２’−フルオロＤＮＡであり、例えば、２、３、４、５、６、７、８、９または１０が、２’−フルオロＤＮＡヌクレオチド単位である。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、少なくとも１つのロック化核酸（ＬＮＡ）単位、例えば１、２、３、４、５、６、７、または８のＬＮＡ単位、例えば３〜７または４〜８のＬＮＡ単位、あるいは３、４、５、６または７のＬＮＡ単位を含む。いくつかの態様において、すべてのヌクレオチド類似体はＬＮＡである。
いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、ベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ、および１またはそれより多い以下のＬＮＡ単位：チオ−ＬＮＡ、アミノ−ＬＮＡ、オキシ−ＬＮＡ、および／またはベータ−Ｄまたはアルファ−Ｌ立体配置いずれかのＥＮＡあるいはその組み合わせの両方を含むことも可能である。いくつかの態様において、すべてのＬＮＡシトシン単位は５’メチル−シトシンである。
本発明のいくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、ＬＮＡおよびＤＮＡ単位を両方含むことも可能である。好ましくは、ＬＮＡおよびＤＮＡ単位を組み合わせた総数は、１０〜２５、例えば１０〜２４、好ましくは１０〜２０、例えば１０〜１８、さらにより好ましくは１２〜１６である。本発明のいくつかの態様において、オリゴマーのヌクレオチド配列、例えば連続ヌクレオチド配列は、少なくとも１つのＬＮＡからなり、そして残りのヌクレオチド単位はＤＮＡ単位である。
いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、ＬＮＡヌクレオチド類似体および天然存在ヌクレオチド（例えばＲＮＡまたはＤＮＡ、最も好ましくはＤＮＡヌクレオチド）のみを含み、場合によってホスホロチオエートなどの修飾ヌクレオチド間連結を伴う。
いくつかの態様において、オリゴマーのヌクレオチド配列およびターゲット配列間の任意のミスマッチは、好ましくはアフィニティ増進ヌクレオチド類似体の外の領域で見られる。ギャップマー中のアフィニティ増進ヌクレオチド類似体の外のこうした領域の例には、本明細書に言及するような領域Ｘおよび／または本明細書に言及するような領域Ｖおよび／または本明細書に言及するような領域Ｚ、および／またはオリゴヌクレオチド中の非修飾ヌクレオチドの部位、および／または連続ヌクレオチド配列に対して５’または３’である領域が含まれる。
いくつかの態様において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーはＲＮＡ（単位）を含まない。本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーが直鎖分子であるか、または直鎖分子として合成されることが好ましい。好ましくは、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、一本鎖分子であり、そして好ましくは、同じオリゴマー内の同等の領域に相補的である、例えば少なくとも３、４または５の連続ヌクレオチドの短い領域（すなわち二重鎖）を含まない。これに関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、（本質的に）二重鎖ではない。いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、本質的に一本鎖である。多様な態様において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、完全に連続するヌクレオチド領域からなることも可能である。したがって、好ましくはオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマーは、実質的に自己相補的ではない。
したがって、特定の側面において、本発明は、総数少なくとも５、例えば少なくとも８ヌクレオチドの連続ヌクレオチド配列（第一の領域）を含む、長さ５〜５０、例えば５〜３０、または例えば５〜２０、例えば８〜３０、例えば８〜２０、例えば８〜１８、例えば８〜１６、例えば１０〜１６、例えば１０〜１５、例えば１２〜１６、例えば１２〜１５ヌクレオチドのオリゴマー構成要素を有するオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを提供し、ここで、前記の連続ヌクレオチド配列（第一の領域）は、ＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇ遺伝子またはｍＲＮＡの逆相補体、例えば配列番号１、配列番号２および配列番号３またはその天然存在変異体のいずれか内の任意の配列に対応する領域に少なくとも８０％（例えば８５％、９０％、９５％、９８％、または９９％）相同である。したがって、例えば、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、配列番号１、配列番号２および配列番号３のいずれかの部分の配列を有する一本鎖核酸分子に、好ましくは配列番号１および配列番号２のいずれか内の配列を有する一本鎖核酸分子にハイブリダイズする。オリゴマーまたはオリゴマー構成要素は、配列番号３の２００〜１９００位として示す部分配列の配列を有する一本鎖核酸分子にハイブリダイズすることも可能である。オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、配列番号３の１２６４〜１５９８位または６９１〜７０６位として示す配列を有する一本鎖核酸分子にハイブリダイズすることも可能である。オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、配列番号３中の以下の位からなる群より選択される配列を含む一本鎖核酸分子にハイブリダイズすることも可能である：１〜１９４４位、１５７〜１８４０位、１１９６〜１９４１位、１３７６〜１８４０位および３１５８〜３１８２位。好ましくは、オリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の１５３０〜１５９８位、より好ましくは配列番号３の１５７７〜１５９８位、そして最も好ましくは、配列番号３の１５３０〜１５４３位内の選択される配列を含む一本鎖核酸分子にハイブリダイズする。オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は：配列番号３の１２６４〜１２７８；１２６５〜１２７７；１５３０〜１５４３；１５３０〜１５４４；１５３１〜１５４３；１５５１〜１５６５；１５５１〜１５６６；１５７７〜１５８９；１５７７〜１５９１；１５７７〜１５９２；１５７８〜１５９０；１５７８〜１５９２；１５８３〜１５９８；１５８４〜１５９８；および１５８５〜１５９８；または６７０〜７０６、６９１〜７０５；６９１〜７０６；６９２〜７０６；６９３〜７０６；および６９４〜７０６位からなる群より選択される一本鎖核酸分子にハイブリダイズすることも可能である。好ましくは、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、配列番号３の１５３０〜１５９８位、より好ましくは配列番号３の１５３０〜１５４３位または１５７７〜１５９８位内の一本鎖核酸分子にハイブリダイズすることも可能である。
特定の態様に関して、本発明は：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づく、ウイルス性障害を治療するため、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節することが可能な、オリゴマーを有する、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを提供する。
オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列に基づくことも可能であり、ここで、大文字はＬＮＡ単位を示し、そして小文字はＤＮＡ単位を示す。
特定の態様において、オリゴマー、またはさらなるオリゴマー、またはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素、またはさらなるオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は：
Figure 0006306745
のリストより選択される配列に基づく配列を含むことも可能である。
別の態様において、モチーフ配列は：
Figure 0006306745
より選択される。
別の態様において、モチーフ配列は、ＧＣＧＴＡＡＡＧＡＧＡＧＧ（配列番号１３）、ＧＣＧＴＡＡＡＧＡＧＡＧＧＴ（配列番号１１）およびＣＧＣＧＴＡＡＡＧＡＧＡＧＧＴ（配列番号１２）より選択される。
別の態様において、モチーフ配列は、ＡＧＣＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧ（配列番号２０）；ＡＧＧＴＧＡＡＧＣＧＡＡＧＴＧ（配列番号２６）；ＡＧＣＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧＧ（配列番号１８）；ＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧＧ（配列番号１６）；ＧＣＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧＧ（配列番号１７）；ＣＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧ（配列番号１９）およびＡＧＧＴＧＡＡＧＣＧＡＡＧＴ（配列番号２７）より選択される。
別の態様において、モチーフ配列は、ＣＧＡＡＣＣＡＣＴＧＡＡＣＡ（配列番号７）；ＧＡＡＣＣＡＣＴＧＡＡＣＡＡＡ（配列番号４）；ＣＧＡＡＣＣＡＣＴＧＡＡＣＡＡＡ（配列番号５）；ＣＧＡＡＣＣＡＣＴＧＡＡＣＡＡ（配列番号６）；ＣＧＡＡＣＣＡＣＴＧＡＡＣ（配列番号８）およびＴＡＧＴＡＡＡＣＴＧＡＧＣＣＡ（配列番号８３４）より選択される。
別の態様において、モチーフ配列は、ＣＣＧＣＡＧＴＡＴＧＧＡＴＣＧ（配列番号９）およびＣＧＣＡＧＴＡＴＧＧＡＴＣ（配列番号１０）より選択される。
別の態様において、モチーフ配列は、ＡＧＡＡＧＧＣＡＣＡＧＡＣＧＧ（配列番号１４）およびＧＡＧＡＡＧＧＣＡＣＡＧＡＣＧＧ（配列番号１５）より選択される。
特定の態様において、オリゴマー、またはさらなるオリゴマー、またはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素、またはさらなるオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、以下に提示する群：
Figure 0006306745
より選択される配列を含むかまたは該配列からなることも可能であり、ここで、大文字は、アフィニティ増進ヌクレオチド類似体を示し、そして小文字はＤＮＡ単位を示す。
別の態様において、配列は：
Figure 0006306745
より選択される。
１つの態様において、配列は：
Figure 0006306745
より選択される。
１つの態様において、配列は、ＧＣＧｔａａａｇａｇａＧＧ（配列番号３０３） ＧＣＧｔａａａｇａｇａＧＧＴ（配列番号３０１）；ＧＣＧｔａａａｇａｇＡＧＧ（配列番号６１８）およびＣＧＣｇｔａａａｇａｇａＧＧＴ（配列番号３０２）より選択される。
別の態様において、配列はＡＧＣｇａａｇｔｇｃａｃＡＣＧ（配列番号３１０）；ＡＧＧｔｇａａｇｃｇａａｇＴＧＣ（配列番号３１５）；ＡＧＧｔｇａａｇｃｇａａＧＴＧ（配列番号３１６）；ＧＡＡｇｔｇｃａｃａＣＧＧ（配列番号６２８）；ＡＧｇｔｇａａｇｃｇａＡＧＴＧ（配列番号６６８）；ＡＧＣｇａａｇｔｇｃａｃａＣＧＧ（配列番号３０８）；ＧＡＡｇｔｇｃａｃａｃＧＧ（配列番号３０６）；ＧＣＧａａｇｔｇｃａｃａＣＧＧ（配列番号３０７）；ＣＧＡａｇｔｇｃａｃａＣＧ（配列番号３０９）；およびＡＧＧｔｇａａｇｃｇａＡＧＴ（配列番号３１７）より選択される。
別の態様において、配列は、ＣＧＡａｃｃａｃｔｇａＡＣＡ（配列番号２９７）；ＧＡＡｃｃａｃｔｇａａｃＡＡＡ（配列番号２９４）；ＣＧＡａｃｃａｃｔｇａａｃＡＡＡ（配列番号２９５）；ＣＧＡａｃｃａｃｔｇａａＣＡＡ（配列番号２９６）；ＣＧＡａｃｃａｃｔｇａＡＣ（配列番号２９８）；ＣＧＡａｃｃａｃｔｇＡＡＣＡ（配列番号５９７）およびＴＡＧｔａａａｃｔｇａｇＣＣＡ（配列番号６７８）より選択される。
別の態様において、配列は、ＣＣＧｃａｇｔａｔｇｇａＴＣＧ（配列番号２９９）およびＣＧＣａｇｔａｔｇｇａＴＣ（配列番号３００）より選択される。
別の態様において、配列は、ＡＧＡａｇｇｃａｃａｇａＣＧＧ（配列番号３０４）およびＧＡＧａａｇｇｃａｃａｇａＣＧＧ（配列番号３０５）より選択される。
オリゴマー・コンジュゲートは：
Figure 0006306745
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列に基づくことも可能であり、ここで、大文字はベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を示し；小文字はＤＮＡ単位を示し；下付き「ｓ」はホスホロチオエート連結を示し；上付きｍは５−メチルシトシン塩基を含有するＤＮＡまたはベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を示し；ＧＮ２−Ｃ６はＣ６リンカーを含むＧａｌＮＡｃ２キャリアー構成要素を示す。
別の態様において、オリゴマー・コンジュゲートは：
Figure 0006306745
より選択される。
別の態様において、オリゴマー・コンジュゲートは：
Figure 0006306745
より選択される。
別の態様において、オリゴマー・コンジュゲートは：
Figure 0006306745
より選択される。
別の態様において、オリゴマー・コンジュゲートは：
Figure 0006306745
より選択される。
別の態様において、オリゴマー・コンジュゲートは：
Figure 0006306745
より選択される。
別の態様において、オリゴマー・コンジュゲートは：
Figure 0006306745
より選択される。
別の態様において、オリゴマー・コンジュゲートは：
Figure 0006306745
より選択される。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列モチーフＧＣＧＴＡＡＡＧＡＧＡＧＧ（配列番号１３）またはその下位配列からなるか、またはこれらを含むか、またはこれらに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列モチーフＡＧＣＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧ（配列番号２０）またはその下位配列からなるか、またはこれらを含むか、またはこれらに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列モチーフＧＣＧＴＡＡＡＧＡＧＡＧＧＴ（配列番号１１）またはその下位配列からなるか、またはこれらを含むか、またはこれらに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列モチーフＡＧＧＴＧＡＡＧＣＧＡＡＧＴＧ（配列番号２６）またはその下位配列からなるか、またはこれらを含むか、またはこれらに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列モチーフＡＧＣＧＡＡＧＴＧＣＡＣＡＣＧＧ（配列番号１８）またはその下位配列からなるか、またはこれらを含むか、またはこれらに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列モチーフＣＧＡＡＣＣＡＣＴＧＡＡＣＡ（配列番号７）またはその下位配列からなるか、またはこれらを含むか、またはこれらに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列モチーフＣＣＧＣＡＧＴＡＴＧＧＡＴＣＧ（配列番号９）またはその下位配列からなるか、またはこれらを含むか、またはこれらに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＧＣＧｔａａａｇａｇａＧＧ（配列番号３０３）からなるか、またはこれを含むか、またはこれに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＧＣＧｔａａａｇａｇａＧＧＴ（配列番号３０１）からなるか、またはこれを含むか、またはこれに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＧＣＧｔａａａｇａｇＡＧＧ（配列番号６１８）からなるか、またはこれを含むか、またはこれに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＡＧＣｇａａｇｔｇｃａｃＡＣＧ（配列番号３１０）からなるか、またはこれを含むか、またはこれに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＡＧｇｔｇａａｇｃｇａＡＧＴＧ（配列番号６６８）からなるか、またはこれを含むか、またはこれに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＡＧＣｇａａｇｔｇｃａｃａＣＧＧ（配列番号３０８）からなるか、またはこれを含むか、またはこれに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＣＧＡａｃｃａｃｔｇａＡＣＡ（配列番号２９７）からなるか、またはこれを含むか、またはこれに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＣＣＧｃａｇｔａｔｇｇａＴＣＧ（配列番号２９９）からなるか、またはこれを含むか、またはこれに基づく。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートは、５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａＧｓｍＣｓＧｓｔｓａｓａｓａｓｇｓａｓｇｓａｓＧｓＧ−３’（配列番号８１５）からなるか、またはこれを含む。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートは、５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａＧｓｍＣｓＧｓｔｓａｓａｓａｓｇｓａｓｇｓａｓＧｓＧｓＴ−３’（配列番号８１４）からなるか、またはこれを含む。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートは、５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａＧｓｍＣｓＧｓｔｓａｓａｓａｓｇｓａｓｇｓＡｓＧｓＧ−３’（配列番号８２５）からなるか、またはこれを含む。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートは、５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａＡｓＧｓｍＣｓｇｓａｓａｓｇｓｔｓｇｓｃｓａｓｃｓＡｓｍＣｓＧ−３’（配列番号８０８）からなるか、またはこれを含む。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートは、５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａＡｓＧｓｇｓｔｓｇｓａｓａｓｇｓｍｃｓｇｓａｓＡｓＧｓＴｓＧ−３’（配列番号８２６）からなるか、またはこれを含む。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートは、５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａＡｓＧｓｍＣｓｇｓａｓａｓｇｓｔｓｇｓｃｓａｓｃｓａｓｍＣｓＧｓＧ−３’（配列番号８０７）からなるか、またはこれを含む。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートは、５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａｍＣｓＧｓＡｓａｓｃｓｃｓａｓｃｓｔｓｇｓａｓＡｓｍＣｓＡ−３’（配列番号８１１）からなるか、またはこれを含む。
いくつかの態様において、本発明記載のオリゴマー・コンジュゲートは、５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａｍＣｓｍＣｓＧｓｃｓａｓｇｓｔｓａｓｔｓｇｓｇｓａｓＴｓｍＣｓＧ−３’（配列番号８０２）からなるか、またはこれを含む。
ギャップマー
好ましくは、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、ギャップマー（時にギャップマー・オリゴマーと称される）である。好ましくは、オリゴマー領域は、各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含む。
典型的には、本発明のギャップマー・オリゴマーまたは本発明のオリゴマー・コンジュゲートのギャップマー・オリゴマー構成要素は、以下の式：
Figure 0006306745
のいずれか１つによって示されることも可能であり、
式中、各式に関して：
Ｗは、１またはそれより多いアフィニティ増進ヌクレオチド類似体の領域（領域Ｗ）を示し
Ｘは、ＲＮアーゼを補充可能なヌクレオチドのストレッチを含む領域（領域Ｘ）を示し
Ｙは、１またはそれより多いアフィニティ増進ヌクレオチド類似体の領域（領域Ｙ）を示し
Ｖは、１またはそれより多いヌクレオチド単位の領域（領域Ｖ）を示し
Ｚは、１またはそれより多いヌクレオチド単位の領域（領域Ｚ）を示す。
領域Ｖ、Ｗ、Ｘ、ＹまたはＺのいずれも、さらなるヌクレオチドまたはアフィニティ増進ヌクレオチド類似体を含有することも可能である。
典型的には、したがって、ギャップマー・オリゴマーは、ＲＮアーゼ、例えばＲＮアーゼＨを補充することが可能なヌクレオチドの連続ストレッチ、例えば領域Ｘである少なくとも６または７のＤＮＡヌクレオチドの領域を含むオリゴマーであり；ここで、領域Ｘには、５’または３’の両方に、アフィニティ増進ヌクレオチド類似体の領域が隣接し、例えば１〜６ヌクレオチド類似体が、ＲＮアーゼを補充可能なヌクレオチドの連続ストレッチの５’および３’に隣接し、これらはそれぞれ、領域Ｗおよび領域Ｙである。
いくつかの態様において、ＲＮアーゼを補充することが可能な単位は、ＤＮＡ単位、アルファ−Ｌ−ＬＮＡ単位、Ｃ４’アルキル化ＤＮＡ単位（本明細書に援用されるＰＣＴ／ＥＰ２００９／０５０３４９およびＶｅｓｔｅｒら， Ｂｉｏｏｒｇ． Ｍｅｄ． Ｃｈｅｍ． Ｌｅｔｔ． １８ （２００８） ２２９６−２３００）、およびＵＮＡ（非連結核酸）ヌクレオチド（本明細書に援用されるＦｌｕｉｔｅｒら， Ｍｏｌ． Ｂｉｏｓｙｓｔ．， ２００９， １０， １０３９）からなる群より選択される。ＵＮＡは非ロック化核酸であり、典型的にはリボースのＣ２−Ｃ３ Ｃ−Ｃ結合が除去されており、非ロック化「糖」残基が形成される。好ましくは、ギャップマーは、式（５’から３’）Ｗ−Ｘ−Ｙ、または場合によってＷ−Ｘ−Ｙ−ＺまたはＶ−Ｗ−Ｘ−Ｙの（ポリ）ヌクレオチド配列を含み、ここで:領域Ｗ（Ｗ）（５’領域）は、少なくとも１つのヌクレオチド類似体、例えば少なくとも１つのＬＮＡ単位、例えば１〜６ヌクレオチド類似体、例えばＬＮＡ単位からなるかまたはこれを含み、そして；領域Ｘ（Ｘ）は、ＲＮアーゼを補充することが可能な少なくとも５つの連続ヌクレオチド（相補的ＲＮＡ分子、例えばｍＲＮＡターゲットとの二重鎖で形成される場合）、例えばＤＮＡヌクレオチドからなるかまたはこれを含み、そして；領域Ｙ（Ｙ）（３’領域）は、少なくとも１つのヌクレオチド類似体、例えば少なくとも１つのＬＮＡ単位、例えば１〜６ヌクレオチド類似体、例えばＬＮＡ単位からなるかまたはこれを含み、そして；領域Ｖ（Ｖ）および／または領域Ｚ（Ｚ）は、存在する場合、１，２または３ヌクレオチド単位、例えばＤＮＡヌクレオチドからなるかまたはこれを含む。
いくつかの態様において、領域Ｗは、１、２、３、４、５または６ヌクレオチド類似体、例えばＬＮＡ単位、例えば２〜５ヌクレオチド類似体、例えば２〜５ ＬＮＡ単位、例えば３または４ヌクレオチド類似体、例えば２、３または４ ＬＮＡ単位からなる。
いくつかの態様において、領域Ｙは、１、２、３、４、５または６ヌクレオチド類似体、例えばＬＮＡ単位、例えば２〜５ヌクレオチド類似体、例えば２〜５ＬＮＡ単位、例えば２、３または４ヌクレオチド類似体、例えば３または４ ＬＮＡ単位からなる。
いくつかの態様において、領域Ｘは、ＲＮアーゼを補充することが可能な５、６、７、８、９、１０、１１または１２連続ヌクレオチド、あるいはＲＮアーゼを補充することが可能な６〜１０、または７〜９、たとえば８連続ヌクレオチドからなるかまたはこれを含む。
いくつかの態様において、領域Ｘは、少なくとも１つのＤＮＡヌクレオチド単位、例えば１〜１２ ＤＮＡ単位、好ましくは４〜１２ ＤＮＡ単位、より好ましくは６〜１０ ＤＮＡ単位、例えば７〜１０ ＤＮＡ単位、最も好ましくは８、９または１０ ＤＮＡ単位からなるかまたはこれを含む。
いくつかの態様において、領域Ｗは、２、３または４ヌクレオチド類似体、例えばＬＮＡからなり、領域Ｘは、７、８、９または１０ ＤＮＡ単位からなり、そして領域Ｙは、２、３または４ヌクレオチド類似体、例えばＬＮＡからなる。こうした設計には、（Ｗ−Ｘ−Ｙ）３−１０−３、３−１０−４、４−１０−３、３−９−３、３−９−４、４−９−３、３−８−３、３−８−４、４−８−３、３−７−３、３−７−４、４−７−３、３−１０−２、３−９−２、３−８−２、３−７−２、４−１０−２、４−９−２、４−８−２、４−７−２が含まれ；そして、さらに、１、２または３ヌクレオチド単位、例えばＤＮＡ単位を有することも可能な領域Ｖおよび／または１、２または３ヌクレオチド単位、例えばＤＮＡ単位を有することも可能な領域Ｚをさらに含んでもよい。
さらなるギャップマー設計は、本明細書に援用されるＷＯ２００４／０４６１６０に開示される。本明細書に援用される米国仮出願６０／９７７，４０９に優先権を請求するＷＯ２００８／１１３８３２は、「ショートマー（ｓｈｏｒｔｍｅｒ）」ギャップマー・オリゴマーに言及する。いくつかの態様において、本明細書に提示するオリゴマーは、こうしたショートマー・ギャップマーであることも可能である。
いくつかの態様において、オリゴマーは、総数１０、１１、１２、１３または１４ヌクレオチド単位の連続ヌクレオチド配列からなり、ここで、連続ヌクレオチド配列は、式（５’−３’）、Ｗ−Ｘ−Ｙ、あるいは場合によってＷ−Ｘ−Ｙ−ＺまたはＶ−Ｗ−Ｘ−Ｙであり、式中；Ｗは、１、２または３ヌクレオチド類似体単位、例えばＬＮＡ単位からなり；Ｘは、相補ＲＮＡ分子（例えばｍＲＮＡターゲット）と二重鎖を形成した際、ＲＮアーゼを補充することが可能な、７、８または９連続ヌクレオチド単位からなり；そしてＹは、１、２または３ヌクレオチド類似体単位、例えばＬＮＡ単位からなる。存在する場合、Ｖは、１または２ ＤＮＡ単位からなる。存在する場合、Ｚは、１または２ ＤＮＡ単位からなる。
いくつかの態様において、Ｗは１ ＬＮＡ単位からなる。いくつかの態様において、Ｗは２ ＬＮＡ単位からなる。いくつかの態様において、Ｗは３ ＬＮＡ単位からなる。
いくつかの態様において、Ｙは１ ＬＮＡ単位からなる。いくつかの態様において、Ｙは２ ＬＮＡ単位からなる。いくつかの態様において、Ｙは３ ＬＮＡ単位からなる。
いくつかの態様において、Ｘは７ヌクレオシド単位からなる。いくつかの態様において、Ｘは８ヌクレオシド単位からなる。いくつかの態様において、Ｘは９ヌクレオシド単位からなる。特定の態様において、領域Ｘは、１０ヌクレオシド単位からなる。特定の態様において、領域Ｘは、１〜１０ ＤＮＡ単位からなる。いくつかの態様において、Ｘは１〜９ ＤＮＡ単位、例えば２、３、４、５、６、７、８または９ ＤＮＡ単位を含む。いくつかの態様において、ＸはＤＮＡ単位からなる。いくつかの態様において、Ｘは、アルファ−Ｌ立体配置にある少なくとも１つのＬＮＡ単位、例えばアルファ−Ｌ立体配置にある２、３、４、５、６、７、８または９ ＬＮＡ単位を含む。いくつかの態様において、Ｘは、少なくとも１つのアルファ−Ｌ−オキシＬＮＡ単位を含みまたはアルファ−Ｌ立体配置にあるＬＮＡ単位はすべて、アルファ−Ｌ−オキシＬＮＡ単位である。
いくつかの態様において、Ｗ−Ｘ−Ｙ中に存在するヌクレオチドの数は（ヌクレオチド類似体単位−領域Ｘ−ヌクレオチド類似体単位）：１−８−１、１−８−２、２−８−１、２−８−２、３−８−３、２−８−３、３−８−２、４−８−１、４−８−２、１−８−４、２−８−４、または；１−９−１、１−９−２、２−９−１、２−９−２、２−９−３、３−９−２、１−９−３、３−９−１、４−９−１、１−９−４、または；１−１０−１、１−１０−２、２−１０−１、２−１０−２、１−１０−３、３−１０−１、３−１０−２、２−１０−３、３−１０−３からなる群より選択される。
いくつかの態様において、Ｗ−Ｘ−Ｙ中のヌクレオチドの数は：２−７−１、１−７−２、２−７−２、３−７−３、２−７−３、３−７−２、３−７−４、および４−７−３からなる群より選択され；いくつかの態様において、好ましいモチーフは３−１０−３、３−９−３、３−８−３、３−８−２である。
特定の態様において、領域ＷおよびＹは各々、２または３ＬＮＡ単位からなり、そして領域Ｘは、８または９または１０ヌクレオシド単位、好ましくはＤＮＡ単位からなる。
いくつかの態様において、ＷおよびＹの両方は、各々、２または３ ＬＮＡ単位からなり、そしてＸは８または９ヌクレオチド単位、好ましくはＤＮＡ単位からなる。
多様な態様において、他のギャップマー設計には、領域Ｗおよび／またはＹが、３、４、５または６ヌクレオシド類似体、例えば２’−Ｏ−メトキシメチル−リボース糖（２’−ＭＯＥ）を含有する単位または２’−フルオロ−デオキシリボース糖を含有する単位からなり、そして領域Ｘが、８、９、１０、１１または１２ヌクレオシド、例えばＤＮＡ単位からなり、ここでＷ−Ｘ−Ｙは、３−９−３、３−１０−３、５−１０−５または４−１２−４単位を有する。
さらなるギャップマー設計は、本明細書に援用されるＷＯ ２００７／１４６５１１Ａ２に開示される。
したがって、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、少なくとも１、少なくとも２または少なくとも３の修飾ヌクレオチドを上記配列の５’端に含むことも可能である。例えば、修飾ヌクレオチドの１またはそれより多く、好ましくはすべてがＬＮＡ単位であることも可能である。
オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、少なくとも１、少なくとも２または少なくとも３の修飾ヌクレオチドを上記配列の３’端に含むことも可能である。例えば、修飾ヌクレオチドの１またはそれより多く、好ましくはすべてがＬＮＡ単位であることも可能である。
オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、少なくとも１、少なくとも２または少なくとも３の修飾ヌクレオチドを本明細書に開示する配列の５’および／または３’端に含むことも可能である。例えば、修飾ヌクレオチドの１またはそれより多く、好ましくはすべてがＬＮＡ単位であることも可能である。
特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、少なくとも２または少なくとも３の修飾ヌクレオチドを本明細書に開示する配列の５’および／または３’端に含むことも可能である。例えば、ヌクレオチドの２またはそれより多く、好ましくはすべてがＬＮＡ単位であることも可能である。
特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、少なくとも３の修飾ヌクレオチドを本明細書に開示する配列の５’および／または３’端に含むことも可能である。例えば、修飾ヌクレオチドの３またはそれより多く、好ましくはすべてがＬＮＡ単位であることも可能である。
特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、３の修飾ヌクレオチドを本明細書に開示する配列の５’および／または３’端に含むことも可能である。例えば、修飾ヌクレオチドはＬＮＡ単位であることも可能である。
特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、３の修飾ヌクレオチドを本明細書に開示する配列の５’および３’端に含むことも可能である。例えば、修飾ヌクレオチドの１またはそれより多く、好ましくはすべてがＬＮＡ単位であることも可能である。
いくつかの態様に関して、オリゴマーはさらなるＣＡ二ヌクレオチドモチーフを含むことも可能である。
特定の側面において、好ましくはオリゴマーはＧＡＧＧＣＡＴＡＧＣＡＧＣＡＧＧ（配列番号１０２）ではない。
本発明の特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、モチーフ：２−８−２、３−８−３、２−８−３、３−８−２、２−９−２、３−９−３、２−９−３、３−９−２、２−１０−２、３−１０−３、３−１０−２、２−１０−３のいずれか１つを含み、第一の数字はＬＮＡウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はＬＮＡウィング領域中のＬＮＡ単位の数である。
本発明の特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、モチーフ３−８−３、３−８−２、３−９−３、３−９−２、３−１０−３、３−１０−２のいずれか１つを含み、第一の数字はＬＮＡウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はＬＮＡウィング領域中のＬＮＡ単位の数である。
特定の態様に関して、本発明は、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素がギャップマーであり、そして全体の配列が、ＨＢＶ ＨＢｘ遺伝子の一部、例えば配列番号１の一部、またはＨＢｓＡｇ遺伝子の一部、例えば配列番号２に、あるいはＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢＶ ＨＢｓＡｇをコードする核酸のターゲット領域の逆相補体に対応する領域に、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％同一である、少なくとも６、好ましくは少なくとも７、好ましくは少なくとも８、好ましくは少なくとも９、好ましくは少なくとも１０単位、好ましくは少なくとも１１単位、好ましくは少なくとも１２単位を含む、本明細書に定義するようなオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを提供する。
特定の態様に関して、本発明は、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素がギャップマーであり、そして全体の配列が、ＨＢＶ ＨＢｘ遺伝子の一部、例えば配列番号１の一部、またはＨＢｓＡｇ遺伝子の一部、例えば配列番号２に、あるいはＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢＶ ＨＢｓＡｇをコードする核酸のターゲット領域の逆相補体に対応する領域に、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％同一である、少なくとも６、好ましくは少なくとも７、好ましくは少なくとも８、好ましくは少なくとも９、好ましくは少なくとも１０単位を含む、本明細書に定義するようなオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを提供する。
本発明の特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列に基づくことも可能であり、ここで、３〜４の５’末端ヌクレオチドの１、２、３または４は修飾ヌクレオチド、例えばＬＮＡ単位であり；そして３〜４の３’末端ヌクレオチドの１、２、３または４は修飾ヌクレオチド、例えばＬＮＡ単位である。
本発明の特定の態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列に基づくことも可能であり、ここで、３つの５’末端ヌクレオチドの２または３は修飾ヌクレオチド、例えばＬＮＡ単位であり；
３つの３’末端ヌクレオチドの２または３は修飾ヌクレオチド、例えばＬＮＡ単位である。
本発明の特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列に基づくことも可能であり、ここで、３つの５’末端ヌクレオチドは修飾ヌクレオチド、例えばＬＮＡ単位であり；
３つの３’末端ヌクレオチドの２または３は修飾ヌクレオチド、例えばＬＮＡ単位である。
本発明の特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列に基づくことも可能であり、ここで、大文字は修飾ヌクレオチド、例えばＬＮＡ単位であってもよいヌクレオチドを示す。
本発明の特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は：
Figure 0006306745
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列に基づくことも可能であり、ここで、
大文字はベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を示し；
小文字はＤＮＡ単位を示し；
下付き「ｓ」はホスホロチオエート連結を示し；
上付きｍは５−メチルシトシン塩基を含有するＤＮＡまたはベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を示し；
ＡＭ−Ｃ６はアミノ−Ｃ６リンカーであり；５’末端基「ＡＭ−Ｃ６ ｃ ａ」は場合による（optional、必須でない）。ＡＭ−Ｃ６はアミノＣ６リンカーであり；ホスホジエステルまたはホスホロチオエートを通じて連結されたオリゴヌクレオチドの５’端中の６−アミノヘキサノールである。
したがって、本発明の特定の態様に関して、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列に基づくことも可能であり、ここで、
大文字はベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を示し；
小文字はＤＮＡ単位を示し；
すべてのヌクレオシド間連結はホスホロチオエート連結であり；
上付きｍは５−メチルシトシン塩基を含有するＤＮＡまたはベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を示す。
特定の好ましい側面において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、モチーフ：３−１０−３、３−１０−２、３−９−３、３−９−２、３−８−３、３−８−２のいずれか１つを含み、第一の数字はウィング領域中の修飾ヌクレオチドの数であり、好ましくは少なくとも１つがＬＮＡ単位であり、好ましくはすべてがＬＮＡ単位であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はウィング領域の修飾ヌクレオチドの数であり、好ましくは少なくとも１つがＬＮＡ単位であり、好ましくはすべてがＬＮＡ単位である。
示すように、本発明のオリゴマーは、ギャップマーを含んでもよいし、またはギャップマーであってもよい。言い換えると、ギャップマー・オリゴマーは、ＲＮアーゼ、例えばＲＮアーゼＨを補充することが可能な連続ヌクレオチド・ストレッチ、例えば本明細書において、領域ＧＨ（ＧＨ）と称される少なくとも６または７のＤＮＡヌクレオチドの領域を含むオリゴマーであり、ここで、領域ＧＨには、アフィニティ増進ヌクレオチド類似体のが５’および３’の両方に隣接し、例えばＲＮアーゼを補充可能な連続ヌクレオチド・ストレッチの５’および３’に、領域ＧＸ’（ＧＸ’）およびＧＺ’（ＧＺ’）と称される１〜６ヌクレオチド類似体が隣接する。領域ＧＸ、ＧＨおよびＧＺは、それぞれ、領域Ｗ、ＸおよびＹに対応する。
いくつかの態様において、ＲＮアーゼを補充可能な単位は、ＤＮＡ単位、アルファ−Ｌ−ＬＮＡ単位、Ｃ４’アルキル化ＤＮＡ単位（本明細書に援用される、ＰＣＴ／ＥＰ２００９／０５０３４９およびＶｅｓｔｅｒら， Ｂｉｏｏｒｇ． Ｍｅｄ． Ｃｈｅｍ． Ｌｅｔｔ． １８ （２００８） ２２９６−２３００を参照されたい）、およびＵＮＡ（非連結核酸）ヌクレオチド（本明細書に援用されるＦｌｕｉｔｅｒら， Ｍｏｌ． Ｂｉｏｓｙｓｔ．， ２００９， １０， １０３９を参照されたい）からなる群より選択される。ＵＮＡは、非ロック化核酸であり、典型的にはリボースのＣ２−Ｃ３ Ｃ−Ｃ結合が除去されており、非ロック化「糖」残基が形成される。好ましくは、ギャップマーは、式（５’から３’）ＧＸ’−ＧＨ−ＧＺ’の（ポリ）ヌクレオチド配列を含み、式中；領域ＧＸ’（ＧＸ’）（５’領域）は、少なくとも１つのヌクレオチド類似体、例えば少なくとも１つのＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位、例えば１〜６のヌクレオチド類似体、例えばＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなるかまたはこれを含み；そして；領域ＧＨ（Ｈ）は、（相補的ＲＮＡ分子、例えばｍＲＮＡターゲットと二重鎖を形成した際）ＲＮアーゼを補充することが可能な少なくとも５つの連続ヌクレオチド、例えばＤＮＡヌクレオチドからなるかまたはこれを含み、そして；領域ＧＺ’（ＧＺ’）（３’領域）は、少なくとも１つのヌクレオチド類似体、例えば少なくとも１つのＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位、例えば１〜６のヌクレオチド類似体、例えばＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなるかまたはこれを含む。
いくつかの態様において、領域ＧＸ’は、１、２、３、４、５または６ヌクレオチド類似体、例えばＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位、例えば２〜５ヌクレオチド類似体、例えば２〜５ ＬＮＡ単位、例えば３または４ヌクレオチド類似体、例えば３または４ ＬＮＡ単位からなり；そして／または領域ＧＺ’は、１、２、３、４、５または６ヌクレオチド類似体、例えばＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位、例えば２〜５ヌクレオチド類似体、例えば２〜５ ＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位、例えば３または４ヌクレオチド類似体、例えば３または４ ＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなる。
いくつかの態様において、ＧＨは、ＲＮアーゼを補充することが可能な５、６、７、８、９、１０、１１または１２の連続ヌクレオチド、またはＲＮアーゼを補充することが可能な６〜１０、または７〜９、例えば８の連続ヌクレオチドからなるかまたはこれを含む。いくつかの態様において、領域ＧＨは、少なくとも１つのＤＮＡヌクレオチド単位、例えば１〜１２ ＤＮＡ単位、好ましくは４〜１２ ＤＮＡ単位、より好ましくは６〜１０ ＤＮＡ単位、例えば７〜１０ ＤＮＡ単位、最も好ましくは８、９または１０ＤＮＡ単位からなるかまたはこれを含む。
いくつかの態様において、領域ＧＸ’は、３または４ヌクレオチド類似体、例えばＢＮＡ（例えばＬＮＡ）からなり、領域Ｘ’は、７、８、９または１０ ＤＮＡ単位からなり、そして領域Ｚ’は、３または４ヌクレオチド類似体、例えばＢＮＡ（例えばＬＮＡ）からなる。こうした設計には、（ＧＸ’−ＧＨ−ＧＺ’） ３−１０−３、３−１０−４、４−１０−３、３−９−３、３−９−４、４−９−３、３−８−３、３−８−４、４−８−３、３−７−３、３−７−４、４−７−３が含まれる。
いくつかの態様において、オリゴマー、例えば領域ＧＸ’は、総数１０、１１、１２、１３または１４ヌクレオチド単位の連続ヌクレオチド配列からなり、ここで、連続ヌクレオチド配列は、式（５’−３’）ＧＸ’−ＧＨ−ＧＺ’を含むか、または該式であり、式中；ＧＸ’は、１、２または３ヌクレオチド類似体単位、例えばＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなり；ＧＨは、相補的ＲＮＡ分子と二重鎖を形成した際、ＲＮアーゼを補充することが可能な７、８または９の連続ヌクレオチド単位（例えばｍＲＮＡターゲット）からなり；そしてＧＺ’は、１、２または３のヌクレオチド類似体単位、例えばＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなる。
いくつかの態様において、ＧＸ’は、１ ＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなる。いくつかの態様において、ＧＸ’は、２ ＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなる。いくつかの態様において、ＧＸ’は、３ ＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなる。いくつかの態様において、ＧＺ’は、１ ＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなる。いくつかの態様において、ＧＺ’は、２ ＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなる。いくつかの態様において、ＧＺ’は、３ ＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなる。いくつかの態様において、ＧＨは７ヌクレオチド単位からなる。いくつかの態様において、ＧＨは８ヌクレオチド単位からなる。いくつかの態様において、ＧＨは９ヌクレオチド単位からなる。いくつかの態様において、領域ＧＨは１０ヌクレオチド単位からなる。特定の態様において、領域ＧＨは１〜１０ ＤＮＡ単位からなるかまたはこれを含む。いくつかの態様において、ＧＨは１〜９ ＤＮＡ単位、例えば２、３、４、５、６、７、８または９ ＤＮＡ単位を含む。いくつかの態様において、ＧＨはＤＮＡ単位からなる。いくつかの態様において、ＧＨは、アルファ−Ｌ立体配置である少なくとも１つのＢＮＡ単位、例えばアルファ−Ｌ立体配置である２、３、４、５、６、７、８または９ ＬＮＡ単位を含む。いくつかの態様において、ＧＨは、少なくとも１つのアルファ−Ｌ−オキシＢＮＡ／ＬＮＡ単位を含むか、またはアルファ−Ｌ立体配置のＬＮＡ単位すべてがアルファ−Ｌ−オキシＬＮＡ単位である。いくつかの態様において、ＧＸ’−ＧＨ−ＧＺ’に存在するヌクレオチドの数は（ヌクレオチド類似体単位−領域ＧＨ−ヌクレオチド類似体単位）：１−８−１、１−８−２、２−８−１、２−８−２、３−８−３、２−８−３、３−８−２、４−８−１、４−８−２、１−８−４、２−８−４、ｏｒ；１−９−１、１−９−２、２−９−１、２−９−２、２−９−３、３−９−２、１−９−３、３−９−１、４−９−１、１−９−４、または；１−１０−１、１−１０−２、２−１０−１、２−１０−２、１−１０−３、３−１０−１からなる群より選択される。いくつかの態様において、ＧＸ’−ＧＨ−ＧＺ’中のヌクレオチドの数は：２−７−１、１−７−２、２−７−２、３−７−３、２−７−３、３−７−２、３−７−４、および４−７−３からなる群より選択される。特定の態様において、領域ＧＸ’およびＧＨは、３つのＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなり、そして領域ＧＨは８または９または１０ヌクレオシド単位、好ましくはＤＮＡ単位からなる。いくつかの態様において、ＧＸ’およびＧＺ’は、どちらも、各々２つのＢＮＡ（例えばＬＮＡ）単位からなり、そしてＧＨは８または９ヌクレオチド単位、好ましくはＤＮＡ単位からなる。多様な態様において、他のギャップマー設計には、領域ＧＸ’および／またはＧＺ’が３、４、５または６ヌクレオシド類似体、例えば２’−Ｏ−メトキシエチル−リボース糖（２’−ＭＯＥ）を含有する単位または２’−フルオロ−デオキシリボース糖を含有する単位からなり、そして領域Ｈは、８、９、１０、１１または１２ヌクレオシド、例えばＤＮＡ単位からなり、ここで領域ＧＸ’−ＧＨ−ＧＺ’は、３−９−３、３−１０−３、５−１０−５または４−１２−４単位を有する。
ＢＮＡおよびＬＮＡギャップマー：用語ＢＮＡおよびＬＮＡは交換可能に用いられる。ＢＮＡギャップマーは、少なくとも１つのＢＮＡヌクレオチドを含むギャップマー・オリゴマー（領域ＧＡ）である。ＬＮＡギャップマーは、少なくとも１つのＬＮＡヌクレオチドを含むギャップマー・オリゴマー（領域ＧＡ）である。
ヌクレオチド間連結
本明細書記載のオリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲートの単位を、リンカー基を通じてともにカップリングする。適切には、各単位は、連結基を通じて３’隣接端に連結される。
一般の当業者は、本発明の背景において、オリゴマー末端の５’単位は５’連結基を含まないが、５’末端基を含んでもまたは含まなくてもよいことを理解するであろう。
本発明のオリゴマーのヌクレオチドまたはその連続ヌクレオチド配列は、連結基を通じてともにカップリングされる。適切には、各ヌクレオチドは、連結基を通じて３’隣接ヌクレオチドに連結される。
場合によって、本発明のオリゴヌクレオチドまたは本発明のオリゴヌクレオチド・コンジュゲートは、１またはそれより多いリンカー基および／または１またはそれより多い分枝領域を含むことも可能である。多様な態様において、リンカー基はヌクレオシド間またはヌクレオチド間連結である。
適切なヌクレオチド間連結には、ＷＯ２００７／０３１０９１に列挙されるもの、例えばＷＯ２００７／０３１０９１（本明細書に援用される）の３４ページの最初の段落に列挙されるヌクレオチド間連結が含まれる。
いくつかの態様に関して、ヌクレオチド間連結を、通常のホスホジエステルからヌクレアーゼ攻撃により耐性であるもの、例えばホスホロチオエートまたはボラノホスフェートに修飾することが好ましく、これらの２つは、ＲＮアーゼＨによって切断可能であり、またターゲット遺伝子の発現を減少させるアンチセンス阻害経路もまた可能にする。
本明細書に提供するような、適切なイオウ（Ｓ）含有ヌクレオチド間連結が好ましい可能性もある。ホスホロチオエートヌクレオチド間連結もまた好ましく、特に、ギャップマーのギャップ領域（Ｘ）に関して好ましい。ホスホロチオエート連結はまた、隣接領域（適切であるように、ＷおよびＹ、そしてＷまたはＹをＶまたはＺに連結するため、そして領域Ｖまたは領域Ｚ内）に関して使用可能である。
しかし、領域Ｗ、ＸおよびＹはホスホロチオエート以外のヌクレオチド間連結、例えばホスホジエステル結合も含むことも可能であり、特に例えばヌクレオチド類似体の使用が領域ＷおよびＹ内のヌクレオチド間連結をエンドヌクレアーゼ分解から保護する場合、例えば領域ＷおよびＹがＬＮＡヌクレオチドを含む場合に可能である。
オリゴマーにおいて、ヌクレオチド間連結は、ターゲティングされたＲＮＡのＲＮアーゼＨ切断を可能にするように、ホスホジエステル、ホスホロチオエートまたはボラノホスフェートであることも可能である。ヌクレアーゼ耐性が改善されているため、そして他の理由のため、例えば、製造が容易であるため、ホスホロチオエートが好ましい。
本発明の１つの側面において、ヌクレオチドおよび／またはヌクレオチド類似体は、ホスホロチオエート基によって、互いに連結される。
ホスホジエステル連結、例えば１または２の連結を、それ以外はホスホロチオエートであるオリゴマーに、特にヌクレオチド類似体単位の間かまたは該単位に隣接して含めると（典型的には領域ＷおよびまたはＹ中）、オリゴマーの生物学的利用能および／または生体分布を修飾することも可能であることが認識される。本明細書に援用されるＷＯ２００８／１１３８３２を参照されたい。
いくつかの態様において、例えば、上に言及する態様は、適切であり、そして特別に示されない限り、すべて残りの連結基は、ホスホジエステルまたはホスホロチオエートまたはその混合物のいずれかである。
いくつかの態様において、すべてのヌクレオチド間連結基はホスホロチオエートである。
特定のギャップマー・オリゴヌクレオチド配列に言及する際、本明細書に提供する特定の配列は、多様な態様において、連結がホスホロチオエート連結である場合、代替連結、例えば本明細書に開示するものが使用可能であり、例えばホスフェート（ホスホジエステル）連結が使用可能であり、特にヌクレオチド類似体、例えばＬＮＡ単位間の連結に関して使用可能である。同様に、特定のギャップマー・オリゴヌクレオチド配列、例えば本明細書に提供する特定の配列のいずれかに言及した際、Ｃ残基が５’メチル修飾シトシンと注釈を付けられる場合、多様な態様において、オリゴマーに存在する１またはそれより多いＣｓは、非修飾Ｃ残基であることも可能である。
ＷＯ０９１２４２３８は、中性ヌクレオシド間連結によって、３’または５’末端に付着される少なくとも１つの二環ヌクレオシドを有するオリゴマー化合物に言及する。本発明のオリゴマーは、したがって、中性ヌクレオシド間連結、例えば１またはそれより多いホスホトリエステル、メチルホスホネート、ＭＭＩ、アミド−３、ホルムアセタールまたはチオホルムアセタールによって、３’または５’末端に付着した、少なくとも１つの二環ヌクレオシドを有することも可能である。残りの連結はホスホロチオエートであることも可能である。
キャリアー
いくつかの態様において、本発明のオリゴマーは、１またはそれより多いキャリアー構成要素に連結され、これらは同じでもまたは異なってもよい。
いくつかの態様において、オリゴマー・コンジュゲートは，以下の構造を有するかまたは含む：
キャリアー構成要素−Ｌ−第一のオリゴマー領域
式中、Ｌは場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分である。
好ましくは、Ｌは、生理学的に不安定なリンカー（領域ＰＬ）または代替リンカー（領域Ｅ）、または両方の組み合わせより選択される。
第一のオリゴマー領域を、以下に例示するように、５’端を通じてリンカーまたはキャリアーに連結してもよい：
キャリアー構成要素−Ｌ１−第一のオリゴマー領域
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であるか；または
あるいは，第一のオリゴマー領域を、以下に例示するように、３’端を通じてリンカーまたはキャリアーに連結してもよい：第一のオリゴマー領域−Ｌ２−キャリアー構成要素
式中、Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分である。
特定の態様に関して、好ましくは、オリゴマー・コンジュゲートは、構造：
キャリアー構成要素−Ｌ１−第一のオリゴマー領域
式中、Ｌ１は場合によるリンカーである
を有するかまたは含む。
特定の態様に関して、好ましくはリンカー１が存在する。
特定の態様に関して、好ましくは前記キャリアー構成要素は、前記の第一のオリゴマー領域に連結され、好ましくはコンジュゲート化される。
特定の態様に関して、好ましくは前記キャリアー構成要素は、前記オリゴマーの５’端に連結され、好ましくはコンジュゲート化される。
特定の態様に関して、好ましくは前記キャリアー構成要素は、リンカー基または分枝領域または束縛分子または架橋部分によって、前記オリゴマーの５’端に連結され、好ましくはコンジュゲート化される。
特定の態様に関して、好ましくはリンカー基または分枝領域は、生理学的に不安定なリンカー基または生理学的に不安定な分枝領域または生理学的に不安定な束縛分子または生理学的に不安定な架橋部分である。
特定の態様に関して、好ましくは、生理学的に不安定なリンカー基は、ヌクレアーゼ感受性リンカー、好ましくはホスホジエステルリンカーである。
特定の態様に関して、好ましいＬ１リンカーは、生理学的に不安定なリンカー、および例えばＣ６〜Ｃ１２アミノアルキル基を含むＣ２〜Ｃ３６アミノアルキル基で構成される。好ましい態様において、Ｌ１リンカーは、ＰＯリンカーおよびＣ６アミノリンカーで構成される。
いくつかの態様において、キャリアー構成要素は、炭水化物コンジュゲートまたは親油性コンジュゲートより選択されるか、あるいはキャリアー構成要素は、炭水化物および親油性コンジュゲートの両方を含む。
炭水化物コンジュゲート部分は、例えば、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎアセチルガラクトサミン、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、およびＮ−イソブタノイルガラクトースアミンからなる群より選択されることも可能である。好ましくは、炭水化物コンジュゲート部分は、アシアロ糖タンパク質受容体ターゲティングコンジュゲート部分である。親油性コンジュゲートは、疎水性基、例えばＣ１６〜２０疎水性基、ステロール、コレステロールであることも可能である。使用可能な他の炭水化物および親油性基が、例えば本明細書に開示される。
いくつかの態様に関して、オリゴマーはさらなるＣＡ二ヌクレオチドモチーフを含むことも可能である。好ましくは、オリゴマー・コンジュゲートの背景において、ＣＡモチーフは、キャリアー構成要素およびオリゴマーの間に配置される。ＣＡモチーフは、好ましくは、ホスホジエステル連結を含み、そしてオリゴマーおよびキャリアー構成要素の間のＰＯリンカーとして働く。
Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）
本明細書に記載するようなすべてのオリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲートは、ウイルス性障害、特にＨＢＶに関連する障害を治療するために使用可能であると意図される。こうした使用は、本発明の一部を形成する。
本明細書に記載するようなすべてのオリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲートは、ウイルス性障害、特にＨＢＶに関連する障害を治療する薬剤製造において使用可能であると意図される。こうした使用は、本発明の一部を形成する。
本明細書に記載するようなすべてのオリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲートは、ウイルス性障害、特にＨＢＶに関連する障害を軽減するか、治癒するかまたは治療するための方法の一部として、被験体に投与可能であると意図される。こうした方法は、本発明の一部を形成する。
本明細書に記載するようなすべてのオリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲートは、ウイルス性障害、特にＨＢＶに関連する障害を治療する薬学的組成物の部分を構成することが可能であると意図される。こうした薬学的組成物は、本発明の一部を形成する。
Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）は、ヘパドナウイルス科の一部であるオルトヘパドナウイルス属の種である。該ウイルスは疾患、Ｂ型肝炎を引き起こす。肝炎を引き起こすのに加えて、ＨＢＶに感染すると、肝硬変および肝細胞癌につながりうる。これは膵臓癌のリスクも増加させうることもまた示唆されてきている。
該ウイルスは、エンベロープタンパク質上に存在する抗原性エピトープに基づいて、４つの主要な血清型（ａｄｒ、ａｄｗ、ａｙｒ、ａｙｗ）に分類され、そしてゲノムの全ヌクレオチド配列変動にしたがって、８つの遺伝子型（Ａ〜Ｈ）に分類される。遺伝子型は、別個の地理的分布を有し、そして遺伝子型間の相違は、疾患重症度、経過および合併症の可能性、ならびに治療およびおそらくはワクチン接種に対する反応に影響を及ぼす。遺伝子型は、少なくとも８％異なる。他のゲノムから１４％異なるＦ型は、知られるうちで最も異なる型である。Ａ型は欧州、アフリカ、およびフィリピンを含む東南アジアに蔓延する。Ｂ型およびＣ型は、アジアでよく見られ；Ｄ型は地中海地方、中東およびインドで一般的であり；Ｅ型はサハラ以南のアフリカに局在し；Ｆ（またはＨ）型は、中南米に限定される。Ｇ型はフランスおよびドイツで見られてきている。遺伝子型Ａ、ＤおよびＦは、ブラジルでよく見られ、そしてすべての遺伝子型は、民族に依存する頻度で、米国に存在する。
ＨＢＶは、環状ＤＮＡゲノムであるが、ＤＮＡは、全長鎖の１つの端がウイルスＤＮＡポリメラーゼに連結しているため、完全には二本鎖ではない。ゲノムは長さ３０２０〜３３２０ヌクレオチド（全長鎖に関して）、および長さ１７００〜２８００ヌクレオチド（短い長さの鎖に関して）である。
ＨＢＶゲノムにコードされる４つの既知の遺伝子がある（Ｃ、Ｐ、ＳおよびＸ）。コアタンパク質は、遺伝子Ｃ（ＨＢｃＡｇ）にコードされ、そしてその開始コドンには、上流インフレームＡＵＧ開始コドンが先行し、ここからプレコアタンパク質が産生される。ＨＢｅＡｇは、プレコアタンパク質のタンパク質分解プロセシングによって産生される。ＤＮＡポリメラーゼは、遺伝子Ｐによってコードされる。
ＨＢｘ
ＨＢｘポリペプチドは、宿主における転写、シグナル伝達、細胞周期進行、タンパク質分解、アポトーシスおよび染色体安定性に干渉する、１５４残基のタンパク質である。該タンパク質は、細胞ターゲットタンパク質（ＨＢＸ相互作用タンパク質：ＨＢＸＩＰ）とヘテロ二量体性複合体を形成し、そしてこの相互作用は、中心体ダイナミクスおよび紡錘体形成を脱制御する。該タンパク質は、ＤＤＢ１（損傷ＤＮＡ結合タンパク質１）と相互作用し、ＤＮＡ複製および修復、転写およびシグナル伝達の細胞内制御に緊密に関与するＣＵＬ４−ＤＤＢ１ Ｅ３複合体のユビキチン・リガーゼ活性の方向を変える。
いかなる既知の脊椎動物タンパク質とも有意な配列同一性を持たないが、該タンパク質は、ＤＮＡグリコシラーゼから発展してきたようである。肝臓においてＸタンパク質を発現するトランスジェニックマウスは、野生型よりも肝細胞癌を発展させる可能性がより高い。これは、Ｘタンパク質が細胞周期進行を促進する一方、腫瘍抑制因子タンパク質ｐ５３に結合し、そしてｐ５３がその役割を果たすことを阻害するためである。実験的観察によって、ＨＢｘタンパク質がＴＥＲＴおよびテロメラーゼ活性を増加させ、肝細胞の寿命を延長させそして悪性腫瘍形成に寄与することもまた示唆されてきている。
ＨＢＶに感染した癌性肝細胞を精製する研究において、タンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ１（ＰＲＭＴ１）の発現レベルは、ＰＲＭＴ１のメチルトランスフェラーゼ機能による、転写の変化に関連することが見出された。過剰発現は、転写されるＨＢＶ遺伝子の数の減少を引き起こし、一方逆に、発現減少は数の増加を引き起こす。ＰＲＭＴ１はまた、複製プロセス中に、ＨＢＶ ＤＮＡによって補充されて、転写プロセスを制御することも見出された。続いて、ＨＢｘ発現増加は、ＰＲＭＴ１仲介タンパク質メチル化の阻害を導き、ウイルス複製に利益を与える。
ＨＢｘターゲット配列は、１１９６位の第一の報告される転写開始部位から始まって１９４１位のポリアデニル化部位までの配列を含む。Ｕ９５５５１配列の１１９６〜１９４１位の配列は、配列番号１として示される。Ｕ９５５５１配列は、配列番号３として提示される。
ＨＢｓＡｇ
ＨＢｓＡｇ（主要表面抗原、ＨＢＶ主要表面抗原、ＨＢＶ表面抗原および「Ｓ」としても知られる）は、ＨＢＶの表面抗原である。
遺伝子Ｓは、表面抗原（ＨＢｓＡｇ）をコードする遺伝子である。ＨＢｓＡｇ遺伝子は、１つの長いオープンリーディングフレームであるが、３つのインフレームの「開始」（ＡＴＧ）コドンを含有し、これは遺伝子を３つのセクション、プレＳ１、プレＳ２、およびＳに分割する。多数の開始コドンがあるため、大、中、および小と呼ばれる３つの異なるサイズのポリペプチド（プレＳ１＋プレＳ２＋Ｓ、プレＳ２＋Ｓ、またはＳ）が産生される。
ＨＢｓＡｇは、同じ遺伝子にコードされる３つの糖タンパク質で構成される。タンパク質は、同じリーディングフレームで翻訳されるが、異なるＡＵＧ開始コドンで開始する；したがってすべて同じＣ末端を有する。最大のタンパク質は、Ｌタンパク質（４２ｋＤ）であり、そしてこの内部には、Ｍ糖タンパク質が含まれる。Ｓ糖タンパク質（２７ｋＤ）は、Ｍタンパク質内に含有される。ＨＢｓＡｇタンパク質はまた、患者血清中に分泌され、ここで球状（大部分、自己会合Ｓタンパク質）または繊維状粒子（やはり大部分Ｓタンパク質であるが、ある程度のＬおよびＭを含む）として見出されうる。前者は本物のウイルスより小さいが、フィラメントはかなり大きい可能性もある（数百ナノメートル）。
Ｓ−ＨＢｓＡｇは、長さ２２６アミノ酸残基である。該タンパク質は、膜内在性糖タンパク質であり、残基４〜２４の間のアミノ末端膜貫通ドメイン（ＴＭＤ−Ｉ）を通じて、ＥＲ脂質二重層に係留される。該タンパク質は、残基２４〜８０の間に下流細胞質ゾルループ（ＣＹＬ−Ｉ）、残基８０〜１００の間に第二の膜貫通ドメイン（ＴＭＤ−ＩＩ）、およびＥＲ管腔（または細胞外粒子の表面）に向かって、残基１０１〜１６４を含む抗原性ループ（ＡＧＬ）を含む。カルボキシル末端（残基１６５〜２２６）は、ＥＲ膜の細胞質ゾル側にあると予測されるため、本明細書において細胞質ゾルループＩＩ（ＣＹＬ−ＩＩ）と称される短い配列（残基１９４〜２０１）によって分離された、それぞれ１７３〜１９３位および２０２〜２２２位に位置する、２つのＴＭＤ（ＴＭＤ−ＩＩＩおよび−ＩＶ）を含有すると予測される。Ｍ−ＨＢｓＡｇタンパク質配列は、アミノ末端が５５残基（プレＳ２ドメイン）、Ｓ−ＨＢｓＡｇのものより長く；これはウイルスエンベロープ中で後者と共集合するが、形態形成およびｉｎ ｖｉｔｒｏ感染性の両方に関して不要である。Ｌ−ＨＢｓＡｇは、ＨＢＶ遺伝子型に応じて、１０８〜１１９残基のさらなるアミノ末端伸長（プレＳ１）を含む全Ｍポリペプチドを含む。これは、２つの形態を伴い、ＥＲ膜（分泌されるビリオン上の内部）または管腔（ビリオン表面上で曝露される）のいずれかで細胞質性である、アミノ末端プレＳドメイン（プレＳ１に加えてプレＳ２）を含むと記載されてきている。内部コンホメーションはビリオン組立のためのヌクレオカプシドの補充に関与する一方、外部位は、ウイルス進入時の受容体結合機能に対応する。
３つのエンベロープタンパク質はすべて、小胞体（ＥＲ）膜で合成され、ここでタンパク質−タンパク質相互作用を通じて凝集し、主に、空のＳ−ＨＢｓＡｇコーティングサブウイルス粒子（ＳＶＰ）の分泌を導く。Ｌ−ＨＢｓＡｇがエンベロープ中に存在する場合にのみ、ＥＲ膜でタンパク質が凝集し、ＨＢＶヌクレオカプシドが発芽複合体に補充され、そして成熟ビリオンとして放出されることが可能である。自己組み立てのためのＳ−ＨＢｓＡｇの活性がＬ−ＨＢｓＡｇの活性に比較して圧倒的であるため、ＨＢＶビリオン形成は、稀な場合にしか起こらない。
ＨＢｓＡｇターゲット配列は、転写開始部位３１５８位から３１８２位および１位から１９４１位のポリアデニル化部位の環状化Ｕ９５５１配列で始まる配列を含む。したがって、ＨＢｓＡｇターゲット配列は、環状化Ｕ９５５５１配列の３１５８〜３１８２位および１〜１９４４位を組み合わせた配列の配列を含む。このターゲット配列を配列番号２に提示する。Ｕ９５５５１配列を配列番号３に提示する。
ターゲット
好ましい側面において、適切には、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）のＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節することが可能である。これに関連して、本発明のオリゴマーは、典型的には哺乳動物細胞、例えばヒト細胞、例えば肝細胞において、ターゲット配列の阻害に影響を及ぼすことも可能である。
いくつかの態様において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、正常発現レベルに比較して、少なくとも１０％または２０％、より好ましくは、正常発現レベル（例えば、オリゴマー（単数または複数）またはオリゴマー・コンジュゲート（単数または複数）の非存在下での発現レベル）に比較して、少なくとも３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％または９５％、発現を調節する。
１つの態様において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇ遺伝子の発現を下方制御（例えば阻害、減少または除去）することが可能である。これに関連して、本発明のオリゴマーは、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの阻害に影響を及ぼすことも可能である。こうした阻害は、典型的には哺乳動物細胞、例えばヒト細胞、例えば肝細胞において、起こることも可能である。いくつかの態様において、本発明のオリゴマーは、正常発現レベルに比較して、少なくとも１０％または２０％の発現阻害、より好ましくは、正常発現レベル（例えば、オリゴマー（単数または複数）またはオリゴマー・コンジュゲート（単数または複数）の非存在下での発現レベル）に比較して、少なくとも３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％または９５％の阻害に影響を及ぼす。
いくつかの態様において、本発明の化合物の０．０４〜２５ｎＭ、例えば０．８〜２０ｎＭの濃度を用いた場合、こうした調節が見られる。同じまたは異なる態様において、発現の調節は１００％未満、例えば９８％未満、９５％未満、９０％未満、８０％未満、７０％未満である。発現レベル調節は、タンパク質レベルを測定することによって、例えばＳＤＳ−ＰＡＧＥなどの方法の後、ターゲットタンパク質に対して作製された適切な抗体を用いたウェスタンブロッティングによって、決定可能である。あるいは、ｍＲＮＡのレベルを測定することによって、例えばノーザンブロッティングまたは定量的ＲＴ−ＰＣＲによって、発現レベルの調節を決定することも可能である。ｍＲＮＡレベルを通じて測定した際、適切な投薬量、例えば０．０４〜２５ｎＭ、例えば０．８〜２０ｎＭの濃度を用いた際に下方制御するレベルは、いくつかの態様において、典型的には、本発明の化合物、コンジュゲートまたは組成物の非存在下での正常レベルの１０〜２０％のレベルである。
本明細書に例示するように、細胞は、ｉｎ ｖｉｔｒｏトランスフェクション細胞であることも可能である。用いるオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートの濃度は、いくつかの態様において、５ｎＭであることも可能である。用いるオリゴマー濃度は、いくつかの態様において、２５ｎＭであることも可能である。用いるオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートの濃度は、いくつかの態様において、１ｎＭであることも可能である。細胞を処理するために用いるオリゴマーの濃度は、典型的には、実施例に例示するように、トランスフェクション（リポフェクトン）を用いて、ｉｎ ｖｉｔｒｏ細胞アッセイで実行されることに注目すべきである。トランスフェクション剤の非存在下で、ターゲットの下方制御を得るために必要なオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートの濃度は、典型的には１〜２５μＭ、例えば５μＭである。
本発明はしたがって、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇタンパク質および／またはｍＲＮＡを発現している細胞において、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇタンパク質および／またはｍＲＮＡの発現を下方制御するかまたは阻害する方法を提供し、前記方法は、前記細胞に本発明記載のオリゴマーまたはコンジュゲートを投与して、前記細胞におけるＨＢｘまたはＨＢｓＡｇタンパク質および／またはｍＲＮＡの発現を下方制御するかまたは阻害する工程を含む。適切には、細胞は、哺乳動物細胞、例えばヒト細胞である。投与は、いくつかの態様において、ｉｎ ｖｉｔｒｏで起こることも可能である。投与は、いくつかの態様において、ｉｎ ｖｉｖｏで起こることも可能である。
特定の態様に関して、ＨＢｘをターゲティングするオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素はまた、ＨＢｓＡｇにも結合する。
ターゲット配列
オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ターゲット配列中に存在するヌクレオチド配列の逆相補体に対応する連続ヌクレオチド配列を含むかまたは該配列からなる。
ターゲット配列は、遺伝子またはｍＲＮＡ、例えば遺伝子またはｍＲＮＡのコードまたは非コード領域であることも可能である。例えば、ターゲット配列は、コーディングまたは非コーディングエクソンであることも可能である。ターゲット配列は、エクソンの少なくとも一部を含むことも可能である。ターゲット配列は、エクソンの一部、例えばエクソン内の一部であることも可能である。
本発明の実施において、ターゲット配列は、一本鎖または二本鎖ＤＮＡまたはＲＮＡであることも可能である；が、一本鎖ＤＮＡまたはＲＮＡターゲットが好ましい。本発明のアンチセンス・オリゴヌクレオチドが向けられるターゲット配列には、ターゲット遺伝子のアレル型およびスプライス変異体を含む対応するｍＲＮＡが含まれることが理解される。文献には、ターゲット・ポリヌクレオチドの配列の知識が得られれば、アンチセンス・オリゴヌクレオチドのために特定の配列を選択するための実質的な指針があり、例えばＣｏｏｋ Ｓ．Ｔ． Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｄｒｕｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ， Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ， ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ， Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ， Ｉｎｃ， ２００１； ＰｅｙｍａｎおよびＵｌｍａｎｎ， Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｒｅｖｉｅｗｓ， ９０：５４３−５８４， １９９０；ならびにＣｒｏｏｋｅ， Ａｎｎ． Ｒｅｖ． Ｐｈａｒｍａｃｏｌ． Ｔｏｘｉｃｏｌ．， ３２：３２９−３７６ （１９９２）を参照されたい。ｍＲＮＡターゲットには、５’キャップ部位、ｔＲＮＡプライマー結合部位、開始コドン部位、ｍＲＮＡドナー・スプライス部位、およびｍＲＮＡアクセプター・スプライス部位が含まれることも可能である。
ターゲット・ポリヌクレオチド配列が、ｍＲＮＡ転写物を含む場合、配列相補的オリゴヌクレオチドは、転写物の任意の所望の部分にハイブリダイズすることも可能である。こうしたオリゴヌクレオチドは、原理的に、翻訳を阻害するために有効であり、そして本明細書に記載する効果を誘導することが可能である。開始コドン部位またはその近傍でｍＲＮＡをブロッキングすると、翻訳が最も有効に阻害されると仮定される。したがって、オリゴヌクレオチドは、ｍＲＮＡ転写物の５’領域に相補的であることも可能である。オリゴヌクレオチドは、開始コドン（転写物の翻訳される部分の５’端の最初のコドン）または開始コドンに隣接するコドンを含めて、ｍＲＮＡに相補的であることも可能である。
１つの態様において、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ〜Ｈ（以下により詳細に記載される）の間で同一性を有することも可能である。
１つの態様において、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ〜Ｈの任意の１またはそれより多くと、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。例えば、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。例えば、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ｂと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。例えば、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ｃと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。例えば、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ｄと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。例えば、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ｅと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。例えば、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ｆと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。例えば、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ｇと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。例えば、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ｈと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。
１つの態様において、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ〜Ｈの２またはそれより多くの間で、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。
１つの態様において、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ、Ｂ、ＣおよびＤの２またはそれより多くの間で同一性を有することも可能である。ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型ＡおよびＢの間で、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。
１つの態様において、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ、Ｂ、ＣおよびＤの２またはそれより多くの間で同一性を有することも可能である。ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型ＡおよびＣの間で、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。
１つの態様において、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ、Ｂ、ＣおよびＤの３またはそれより多くの間で同一性を有することも可能である。ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ、Ｂ、ＣおよびＤの間で、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。
１つの態様において、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ、Ｂ、ＣおよびＤの３またはそれより多くの間で同一性を有することも可能である。ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ、ＢおよびＣの間で、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。
１つの態様において、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ、Ｂ、ＣおよびＤの任意の３またはそれより多くの間で同一性を有することも可能である。ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ、ＢおよびＤの間で、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。
１つの態様において、ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ、Ｂ、ＣおよびＤのすべての間で同一性を有することも可能である。ターゲット配列は、ＨＢＶ遺伝子型Ａ、Ｂ、ＣおよびＤの間で、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％同一性を有することも可能である。
多様な態様において、ターゲット配列は、配列番号３として示す配列内にある。
１つの態様において、ターゲット配列は、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇまたはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも一部を含む。
多様な態様において、ターゲット配列はＨＢｘまたはＨＢｓＡｇまたはその天然存在変異体である。
多様な態様において、ターゲット配列は、配列番号１として示す配列内にある。
多様な態様において、ターゲット配列は、配列番号２として示す配列内にある。
多様な態様において、ターゲット配列は、配列番号３の以下の位の１またはそれより多くより選択される：１〜１９４４位、１５７〜１８４０位、１１９６〜１９４１位、１３７６〜１８４０位、および３１５８〜３１８２位。好ましくは、ターゲット配列は、配列番号３の１５３０〜１５９８位、より好ましくは配列番号３の１５７７〜１５９８位、そして最も好ましくは配列番号３の１５３０〜１５４３位より選択される。
多様な態様において、ターゲット配列は、１またはそれより多い任意の以下の位からなる群より選択されることも可能である：
配列番号３の；
Figure 0006306745
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の８〜３０、８〜２０、８〜１８、８〜１６、８〜１４、８〜１２または８〜１０の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、または２９の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の少なくとも８の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の少なくとも９の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の少なくとも１０の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の少なくとも１１の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の少なくとも１２の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の少なくとも１３の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の少なくとも１４の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の少なくとも１５の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの側面において、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、配列番号３の配列番号３の１２００〜１９００位、好ましくは１５３０〜１５９８位、より好ましくは１５７７〜１５９８位、最も好ましくは１５３０〜１５４３位として示される配列内の少なくとも１６の連続ヌクレオチドをターゲティングすることが可能であり；好ましくは、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、前記連続ヌクレオチドに相補的である。
１つの態様において、ターゲット配列は、配列番号１または配列番号２または配列番号３に示す配列あるいはこれらに少なくとも８０％の同一性を有する配列内の配列を含む。したがって、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、本明細書に提示する群より選択されるコア・モチーフを含むかまたは該モチーフからなることも可能であり、ここで、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート（またはその連続ヌクレオチド部分）は、場合によって、前記の選択されるモチーフ配列に対して、１、２、または３のミスマッチを有することも可能である：
Figure 0006306745
１つの態様において、ターゲット配列は、以下に示す配列または任意のそれらに少なくとも８０％の同一性を有する配列を含む。したがって、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、以下に提示する群より選択されるターゲット配列にハイブリダイズする配列を含むかまたはこれらからなることも可能であり、ここで、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート（またはその連続ヌクレオチド部分）は、場合によって、前記の選択されるターゲット配列に対して、１、２、または３のミスマッチを有することも可能である：
Figure 0006306745
いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ターゲット配列にハイブリダイズする際、１、２、３、または４（またはそれより多い）ミスマッチを許容することも可能であり、そしてなお、ターゲットに結合して、所望の効果、すなわちターゲットの下方制御を示すことも可能である。ミスマッチは、例えば、オリゴマー・ヌクレオチド配列の長さを増加させ、そして／またはヌクレオチド配列内に存在するヌクレオチド類似体、例えばＬＮＡの数を増加させることによって、補償することも可能である。
いくつかの態様において、連続ヌクレオチド配列は、ターゲット配列に、例えばＨＢｘまたはＨＢｓＡｇをコードする核酸の対応する領域にハイブリダイズした際、３を越えない、例えば２を越えないミスマッチを含む。
いくつかの態様において、連続ヌクレオチド配列は、ターゲット配列に、例えばＨＢｘまたはＨＢｓＡｇをコードする核酸の対応する領域にハイブリダイズした際、単一のミスマッチより多くを含まない。
ターゲットがＨＢｘである場合、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート、あるいは連続ヌクレオチド配列のヌクレオチド配列は、好ましくは、本明細書に提示するヌクレオチド配列より選択される対応する配列に、少なくとも８０％同一性（ときに、相同性または相同と称される）、例えば少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％相同、少なくとも９７％相同、少なくとも９８％相同、少なくとも９９％相同、例えば１００％相同（同一）であることも可能である。
ターゲットがＨＢｘである場合、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート、あるいは連続ヌクレオチド配列のヌクレオチド配列は、好ましくは、配列番号１として提示する配列内の対応する配列の逆相補体に、少なくとも８０％同一性（ときに、相同性または相同と称される）、例えば少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％相同、少なくとも９７％相同、少なくとも９８％相同、少なくとも９９％相同、例えば１００％相同（同一）であることも可能である。
ターゲットがＨＢｘである場合、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート、あるいは連続ヌクレオチド配列のヌクレオチド配列は、好ましくは、配列番号１として提示する配列内に存在する下位配列に、少なくとも８０％相補的、例えば少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％相補的、少なくとも９７％相補的、少なくとも９８％相補的、少なくとも９９％相補的、例えば１００％相補的（完全に相補的）であることも可能である。
いくつかの態様において、ターゲットがＨＢｘである場合、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート（またはその隣接ヌクレオチド部分）は、本明細書に提示する群より選択される配列の１つ、またはその少なくとも１０の連続ヌクレオチドの下位配列より選択されるかまたはこれを含み、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート（またはその連続ヌクレオチド部分）は、配列に比較した際、場合によって、１、２、または３のミスマッチを含むことも可能である。
ターゲットがＨＢｓＡｇである場合、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート、あるいは連続ヌクレオチド配列のヌクレオチド配列は、好ましくは、本明細書に提示する群より選択される対応する配列に、少なくとも８０％同一性（ときに、相同性または相同と称される）、例えば少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％相同、少なくとも９７％相同、少なくとも９８％相同、少なくとも９９％相同、例えば１００％相同（同一）であることも可能である。
ターゲットがＨＢｓＡｇである場合、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート、あるいは連続ヌクレオチド配列のヌクレオチド配列は、好ましくは、配列番号２として提示する配列内に存在する対応する配列の逆相補体に、少なくとも８０％同一性（ときに、相同性または相同と称される）、例えば少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％相同、少なくとも９７％相同、少なくとも９８％相同、少なくとも９９％相同、例えば１００％相同（同一）であることも可能である。
ターゲットがＨＢｓＡｇである場合、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート、あるいは連続ヌクレオチド配列のヌクレオチド配列は、好ましくは、配列番号２として提示する配列内に存在する下位配列に、少なくとも８０％相補的、例えば少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％相補的、少なくとも９７％相補的、少なくとも９８％相補的、少なくとも９９％相補的、例えば１００％相補的（完全に相補的）であることも可能である。
いくつかの態様において、ターゲットがＨＢｓＡｇである場合、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート（またはその隣接ヌクレオチド部分）は、本明細書に提示する群より選択される配列の１つ、またはその少なくとも１０の連続ヌクレオチドの下位配列より選択されるかまたはこれを含み、前記オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲート（またはその連続ヌクレオチド部分）は、配列に比較した際、場合によって、１、２、または３のミスマッチを含むことも可能である。
いくつかの態様において、下位配列は、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、または２９の連続ヌクレオチド、例えば１２〜２２、例えば１２〜１８、例えば１２〜１６ヌクレオチドからなることも可能である。適切には、いくつかの態様において、下位配列は、本発明のオリゴマーの連続ヌクレオチド配列と同じ長さである。
しかし、いくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのヌクレオチド配列は、ターゲット配列に非相補性である、さらなる５’または３’ヌクレオチド、例えば独立に、５’および／または３’に１、２、３、４、または５のさらなるヌクレオチドを含むことも可能であると認識される。これに関連して、本発明のオリゴマーは、いくつかの態様において、さらなるヌクレオチドが５’およびまたは３’に隣接する、連続ヌクレオチド配列を含むことも可能である。いくつかの態様において、さらなる５’または３’ヌクレオチドは、天然存在ヌクレオチド、例えばＤＮＡまたはＲＮＡである。いくつかの態様において、さらなる５’または３’ヌクレオチドは、本明細書のギャップマー・オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートの背景において言及されるような領域Ｄに相当することも可能である。
ＲＮアーゼ補充
オリゴマー分子が、ターゲットｍＲＮＡの非ＲＮアーゼ仲介分解を通じて、例えば翻訳の立体障害、または他の方法によって、機能することも可能であることが認識される。
いくつかの態様に関して、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、エンドリボヌクレアーゼ（ＲＮアーゼ）、例えばＲＮアーゼＨを補充することが可能である。
本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、相補ターゲットＲＮＡと二重鎖を形成した際、ＲＮアーゼを補充することが可能な、少なくとも６、例えば少なくとも７の連続ヌクレオチド単位、例えば少なくとも８または少なくとも９の連続ヌクレオチド単位（残基）を含み、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５または１６の連続ヌクレオチドの領域を含む。ＲＮアーゼを補充することが可能な連続配列は、本明細書に記載するようなギャップマーの背景において言及されるような領域Ｘであることも可能である。いくつかの態様において、ＲＮアーゼを補充することが可能な連続配列、例えば領域Ｘのサイズは、より高いことも可能であり、例えば１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０ヌクレオチド単位であることも可能である。
ＥＰ １ ２２２ ３０９は、ＲＮアーゼＨ活性を決定するためのｉｎ ｖｉｔｒｏ法を提供し、これを用いてＲＮアーゼＨを補充する能力を決定することも可能である。オリゴマーは、相補的ＲＮＡターゲットとともに提供された際、ＥＰ １ ２２２ ３０９の実施例９１〜９５に提供される方法論を用いて、ｐｍｏｌ／ｌ／分で測定すると、同じ塩基配列を有するが、ＤＮＡ単位のみを含有し、２’置換を含まず、オリゴヌクレオチド中のすべての単位の間にホスホロチオエート連結基を含む、ＤＮＡのみのオリゴヌクレオチドを用いて決定した初期速度の少なくとも１％、例えば少なくとも５％、例えば少なくとも１０％、または２０％より高い初期速度を有する場合、ＲＮアーゼＨを補充することが可能であると見なされる。
いくつかの態様において、オリゴマーは、相補的ＲＮＡターゲットおよびＲＮアーゼＨとともに提供された際、ＥＰ １ ２２２ ３０９の実施例９１〜９５に提供される方法論を用いて、ｐｍｏｌ／ｌ／分で測定すると、ＲＮアーゼＨの初期速度が、２’置換を含まず、オリゴヌクレオチド中のすべての単位の間にホスホロチオエート連結基を含む、同等のＤＮＡのみのオリゴヌクレオチドを用いて決定した初期速度の１％未満、例えば５％未満、例えば１０％未満、または２０％未満である場合、ＲＮアーゼＨを補充することが本質的に不可能であると見なされる。
他の態様において、オリゴマーは、相補的ＲＮＡターゲットおよびＲＮアーゼＨとともに提供された際、ＥＰ １ ２２２ ３０９の実施例９１〜９５に提供される方法論を用いて、ｐｍｏｌ／ｌ／分で測定すると、ＲＮアーゼ初期速度が、２’置換を含まず、オリゴヌクレオチド中のすべてのヌクレオチドの間にホスホロチオエート連結基を含む、同等のＤＮＡのみのオリゴヌクレオチドを用いて決定した初期速度の少なくとも２０％、例えば少なくとも４０％、例えば少なくとも６０％、例えば少なくとも８０％である場合、ＲＮアーゼＨを補充することが可能であると見なされる。
典型的には、相補ターゲットＲＮＡと二重鎖を形成した場合、ＲＮアーゼを補充することが可能である、連続ヌクレオチド単位を形成する本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートの領域は、ＲＮＡターゲットとＤＮＡ／ＲＮＡ様二重鎖を形成するヌクレオチド単位からなり、そしてアルファ−Ｌ立体配置であり、特に好ましくはアルファ−Ｌ−オキシＬＮＡである、ＤＮＡ単位およびＬＮＡ単位の両方を含む。
本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートは、ヌクレオチドおよびヌクレオチド類似体の両方を含むヌクレオチド配列を含むことも可能であり、そしてギャップマー、ヘッドマーまたはミクスマーの形であることも可能である。
いくつかの態様において、ターゲット領域に対するオリゴマーのアフィニティを増進させることに加えて、いくつかのヌクレオシド類似体はまた、ＲＮアーゼ（例えばＲＮアーゼＨ）結合および切断も仲介する。α−Ｌ−ＬＮＡ単位は、ＲＮアーゼＨ活性を特定の度合いまで補充するため、いくつかの態様において、α−Ｌ−ＬＮＡ単位を含有するオリゴマーのギャップ領域（例えば本明細書に言及するような領域Ｘ）は、ＲＮアーゼＨによって認識可能でありそして切断可能であるより少ない単位からなり、そしてミクスマー構築により高い柔軟性が導入される。
合成
本発明は、オリゴマー・コンジュゲートを製造する方法であって、少なくとも1つのオリゴマーをキャリアー構成要素にコンジュゲート化する工程を含み、前記オリゴマー・コンジュゲートがウイルス性障害を治療するために適している、前記方法を提供する。
本発明はまた、本明細書に記載するように、ポリオリゴマー・コンジュゲートを製造する方法であって、１またはそれより多いオリゴマーをリンカー基（ＥまたはＬ）あるいは対称的分枝領域Ｆに付着させ、これを次いで、本明細書に記載するようなキャリアー構成要素に付着させる工程を含み、前記オリゴマー・コンジュゲートがウイルス性障害を治療するために適している、前記方法も提供する。
いくつかの態様において、対称的分枝領域は、１，３−ペンチルアミドプロピル（１，３−ビス−［５−（４，４’−ジメトキシトリチルオキシ）ペンチルアミド］プロピル−２−［（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］ホスホラミダイト由来）、トリス−２，２，２−（プロピルオキシメチル）エチル（トリス−２，２，２−［３−（４，４’−ジメトキシトリチルオキシ）プロピルオキシメチル］エチル−［（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホラミダイト由来）またはトリス−２，２，２−（プロピルオキシメチル）メチレンオキシプロピル（トリス−２，２，２−［３−（４，４’−ジメトキシトリチルオキシ）プロピルオキシメチル］メチレンオキシプロピル−［（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホラミダイト由来）のいずれかである。いくつかの態様において、非対称的分枝領域は、１，３−ペンチルアミドプロピル（１−［５−（４，４’−ジメトキシ−トリチルオキシ）ペンチルアミド］−３−［５−フルオレノメトキシカルボニルオキシペンチルアミド］−プロピル−２−［（２−シアノエチル）−（Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル）］−ホスホラミダイト由来）であり、Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ、米国は、こうした適切な分枝基を提供する（例えばカタログ番号０−１９２０、１０−１９２２および１０−１９２５））。
本明細書に記載するようなリンカー基および分枝領域は、切断可能であってもまたは切断不能であってもよい。
さらなる側面において、本発明の組成物を製造するための方法であって、本発明のオリゴマー・コンジュゲートを薬学的に許容されうる希釈剤、溶媒、キャリアー、塩および／またはアジュバントと混合する工程を含む、前記方法を提供する。
活性化オリゴマー
用語「活性化オリゴマー」は、本明細書において、本明細書記載のコンジュゲートを形成するため、１またはそれより多いコンジュゲート化部分へのオリゴマーの共有結合を可能にする少なくとも1つの官能部分、すなわちそれ自体は核酸または単位ではない部分に共有結合した（官能化された）、本明細のオリゴマーを指す。典型的には、官能部分は、例えばアデニン塩基の３’−ヒドロキシル基または環外ＮＨ２基を通じて、オリゴマーへの共有結合を可能にする化学基、好ましくは親水性であるスペーサー、およびコンジュゲート化部分（例えばアミノ、スルフィドリルまたはヒドロキシル基）への結合を可能にする末端基を含むであろう。いくつかの態様において、この末端基は保護されず、例えばＮＨ２基である。他の態様において、末端基は、例えばＴｈｅｏｄｏｒａ Ｗ ＧｒｅｅｎｅおよびＰｅｔｅｒ Ｇ Ｍ Ｗｕｔｓによる”Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ Ｇｒｏｕｐｓ ｉｎ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ”、第三版（Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ、１９９９）に記載されるものなどの任意の適切な保護基によって保護される。適切なヒドロキシル保護基の例には、エステル、例えば酢酸エステル、アラルキル基、例えばベンジル、ジフェニルメチル、またはトリフェニルメチル、およびテトラヒドロピラニルが含まれる。適切なアミノ保護基の例には、ベンジル、アルファ−メチルベンジル、ジフェニルメチル、トリフェニルメチル、ベンジルオキシカルボニル、ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル、およびアシル基、例えばトリクロロアセチルまたはトリフルオロアセチルが含まれる。いくつかの態様において、官能部分は自己切断性である。他の態様において、官能部分は生物分解性である。例えば、本明細書にその全体が援用される、米国特許第７，０８７，２２９号を参照されたい。
いくつかの態様において、本発明のオリゴマーを、オリゴマーの５’端へのコンジュゲート化部分の共有結合を可能にするため、５’端で官能化する。他の態様において、本発明のオリゴマーを、３’端で官能化することも可能である。さらに他の態様において、本発明のオリゴマーを主鎖に沿って、または複素環塩基部分上で、官能化することも可能である。さらに他の態様において、本発明のオリゴマーを、５’端、３’端、主鎖および塩基より独立に選択される１より多い位で官能化することも可能である。
いくつかの態様において、合成中に、官能部分に共有結合する１またはそれより多い単位を取り込むことによって、本発明の活性化オリゴマーを合成する。他の態様において、官能化されていない単位を用いて、本発明の活性化オリゴマーを合成し、そして合成完了に際して、オリゴマーを官能化する。いくつかの態様において、アミノアルキルリンカーを含有するヒンダードエステルを用いて、オリゴマーを官能化し、ここでアルキル部分は式（ＣＨ２）ｗを有し、式中、ｗは１〜１０の範囲の整数、好ましくは約６であり、アルキルアミノ基のアルキル部分は、直鎖または分枝鎖であってもよく、そして官能基はエステル基（−Ｏ−Ｃ（Ｏ）−（ＣＨ２）ｗＮＨ）を通じて、オリゴマーに付着する。
他の態様において、（ＣＨ２）ｗ−スルフィドリル（ＳＨ）リンカーを含有するヒンダードエステルを用いてオリゴマーを官能化し、式中、ｗは１〜１０の範囲の整数、好ましくは約６であり、アルキルアミノ基のアルキル部分は、直鎖または分枝鎖であってもよく、そして官能基はエステル基（−Ｏ−Ｃ（Ｏ）−（ＣＨ２）ｗＳＨ）を通じて、オリゴマーに付着する。いくつかの態様において、スルフィドリル活性化オリゴヌクレオチドを、ポリマー部分、例えばポリエチレングリコールまたはペプチドとコンジュゲート化する（ジスルフィド結合の形成を通じる）。
当該技術分野に知られる任意の方法によって、そして特に、本明細書にその全体が援用されるＰＣＴ公報第ＷＯ ２００８／０３４１２２および該文献中の実施例に開示される方法によって、上記のようなヒンダードエステルを含有する活性化オリゴマーを合成することも可能である。
さらに他の態様において、米国特許第４，９６２，０２９号および第４，９１４，２１０号に実質的に記載されるように、官能化試薬、すなわち一方の端にホスホラミダイトを有し、保護または非保護スルフィドリル、アミノまたはヒドロキシル基を含む反対側の端に、親水性スペーサー鎖を通じて連結されている、実質的に直鎖の試薬によって、スルフィドリル、アミノまたはヒドロキシル基をオリゴマー内に導入することによって、本発明のオリゴマーを官能化する。こうした試薬は、主に、オリゴマーのヒドロキシル基と反応する。いくつかの態様において、こうした活性化オリゴマーは、オリゴマーの５’−ヒドロキシル基にカップリングした官能化試薬を有する。他の態様において、活性化オリゴマーは、３’−ヒドロキシル基にカップリングした官能化試薬を有する。さらに他の態様において、本発明の活性化オリゴマーは、オリゴマーの主鎖上のヒドロキシル基にカップリングした官能化試薬を有する。さらにさらなる態様において、本発明のオリゴマーは、本明細書にその全体が援用される、米国特許第４，９６２，０２９号および第４，９１４，２１０号に記載されるような官能化試薬の１より多くで官能化される。こうした官能化試薬を合成し、そして単位またはオリゴマー内にこれらを取り込む方法が、米国特許第４，９６２，０２９号および第４，９１４，２１０号に記載される。
いくつかの態様において、固相結合オリゴマーの５’端をジエニルホスホラミダイト誘導体で官能化した後、脱保護されたオリゴマーを、例えばＤｉｅｌｓ−Ａｌｄｅｒ環付加反応を通じて、アミノ酸またはペプチドとコンジュゲート化する。
多様な態様において、２’糖修飾、例えば２’カルバメート置換糖または２’−（Ｏ−ペンチル−Ｎ−フタルイミド）−デオキシリボース糖を含有する単位をオリゴマー内に取り込んで、オリゴマーの糖へのコンジュゲート化部分の共有結合を促進する。他の態様において、例えば５’−ジメトキシトリチル−２’−Ｏ−（ｅ−フタルイミジルアミノペンチル）−２’−デオキシアデノシン−３’−Ｎ，Ｎ−ジイソプロピル−シアノエトキシホスホラミダイトのような試薬を用いて、１またはそれより多い単位の２’位にアミノ含有リンカーを含むオリゴマーを調製する（例えば、Ｍａｎｏｈａｒａｎら， Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔｅｒｓ， １９９１， ３４， ７１７１を参照されたい）。
さらにさらなる態様において、本発明のオリゴマーは、Ｎ６プリンアミノ基上、グアニンの環外Ｎ２上、またはシトシンのＮ４または５位上を含む、核酸塩基上に、アミノ含有官能部分を有することも可能である。多様な態様において、こうした官能化は、オリゴマー合成においてすでに官能化されている市販試薬を用いることによって、達成することも可能である。
いくつかの官能化部分は、商業的に入手可能であり、例えばヘテロ二官能性およびホモ二官能性連結部分がＰｉｅｒｃｅ Ｃｏ．（イリノイ州ロックフォード）より入手可能である。他の商業的に入手可能な連結基は、５’−アミノ修飾剤Ｃ６、および３’−アミノ修飾剤試薬であり、どちらもＧｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ社（バージニア州スターリング）より入手可能である。５’−アミノ修飾剤Ｃ６はまた、Ａｍｉｎｏｌｉｎｋ−２として、ＡＢＩ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ Ｉｎｃ、カリフォルニア州フォスターシティ）より入手可能であり、そして３’−アミノ修飾剤もまた、Ｃｌｏｎｔｅｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ Ｉｎｃ．（カリフォルニア州パロアルト）より入手可能である。
ポリオリゴマー
上述のように、本発明のいくつかの態様において、オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素は、２つのターゲティング配列を有する分子を含むかまたはその一部であることも可能である。いくつかの例において、これらの分子は、ポリオリゴマーと呼ばれる。
いくつかの態様において、オリゴマー・コンジュゲートは、構造：
キャリアー構成要素−Ｌ１−第一のオリゴマー領域−Ｌ２−第二のオリゴマー領域
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１およびＬ２は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含み；あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートは、構造：
第一のオリゴマー領域−Ｌ２−第二のオリゴマー領域−Ｌ３−キャリアー構成要素
式中、Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ３は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２およびＬ３は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含み；あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートは、構造：
キャリアー構成要素１−Ｌ１−第一のオリゴマー領域−Ｌ２−第二のオリゴマー領域−Ｌ３−キャリアー構成要素２
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ３は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１、Ｌ２およびＬ３は同じであってもまたは異なってもよく
キャリアー構成要素１およびキャリアー構成要素２は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含み；あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートは、構造：
第一のオリゴマー領域−Ｌ１−キャリアー構成要素１−Ｌ２−第二のオリゴマー領域
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１およびＬ２およびＬ３は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含み；あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートは、構造：
第一のオリゴマー領域−Ｌ１−キャリアー構成要素１−Ｌ２−第二のオリゴマー領域−Ｌ３−キャリアー構成要素２
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ３は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１およびＬ２は同じであってもまたは異なってもよく
キャリアー構成要素１およびキャリアー構成要素２は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含み；あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートは、構造：
キャリアー構成要素１−Ｌ１−第一のオリゴマー領域−Ｌ２−キャリアー構成要素２−Ｌ３−第二のオリゴマー領域−Ｌ４−キャリアー構成要素３
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ３は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１、Ｌ２およびＬ３は同じであってもまたは異なってもよく
キャリアー構成要素１、キャリアー構成要素２およびキャリアー構成要素３は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含む。
いくつかの態様において、好ましくは、本発明にしたがった使用のためのオリゴマー・コンジュゲートは、構造：
キャリアー構成要素−Ｌ１−第一のオリゴマー領域−Ｌ２−第二のオリゴマー領域
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１およびＬ２は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含む。
いくつかの態様において、リンカー１が存在する。
いくつかの態様において、リンカー２が存在する。
いくつかの態様において、リンカー３が存在する。
いくつかの態様において、キャリアー構成要素が、前記の第一のオリゴマー領域に連結、好ましくはコンジュゲート化している。
いくつかの態様において、キャリアー構成要素が、前記オリゴマーの５’端に連結、好ましくはコンジュゲート化している。
いくつかの態様において、第一のオリゴマー領域および第二のオリゴマー領域の各々が、リンカーまたは分枝領域によって、連結、好ましくはコンジュゲート化している。
いくつかの態様において、第一のオリゴマー領域および第二のオリゴマー領域の各々が、生理学的に不安定なリンカー基または生理学的に不安定な分枝領域によって、連結、好ましくはコンジュゲート化している。
いくつかの態様において、本発明は、第一の領域（領域ＰＡ）、第二の領域（領域ＰＢ）および第三の領域（領域ＰＣ）を含むことも可能なポリオリゴマー化合物を提供し、ここで第一の領域が少なくとも１つのさらなるオリゴマー化合物（領域ＰＡ’）に共有結合し、第一の領域（領域ＰＡ）および領域ＰＡ’が生物切断可能リンカー（領域ＰＢ’）を通じて共有結合し、これが、例えば、本明細書に開示するような第二の領域に記載する通り、例えば少なくとも１つのホスホジエステル連結ＤＮＡまたはＲＮＡ（例えばＤＮＡ）、例えば２，３、４または５のホスホジエステル連結ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシド（例えばＤＮＡヌクレオシド）の領域であってもよい。領域ＰＢおよびＰＢ’は、いくつかの態様において、同じ構造、例えば同じ数のＤＮＡ／ＲＮＡヌクレオシドおよびホスホジエステル連結および／または同じ核酸塩基配列であってもよい。他の態様において、領域ＰＢおよびＰＢ’は異なってもよい。例えば、こうしたポリオリゴマー化合物は、例えば：（５’−３’または３’−５’）コンジュゲート／キャリアー化合物−ＰＯ−ＯＮ−ＰＯ’−ＯＮ’のような構造を有してもよく、ここで、コンジュゲート／キャリアー化合物は、領域ＰＣであり、ＰＯは領域ＰＢであり、ＰＯ’は領域ＰＢ’であり、そしてＯＮは領域ＰＡであり、そしてＯＮ’は領域ＰＡ’である。
領域ＰＡ’は、いくつかの態様において、生物切断可能リンカーによって、連続して（または平行して）連結された多数のさらなるオリゴマー化合物（例えばさらなる２または３のオリゴマー化合物）を含んでもよく、例えば：コンジュゲート／キャリアー化合物−ＰＯ−ＯＮ−ＰＯ−ＯＮ’−ＰＯ”−ＯＮ”、またはコンジュゲート／キャリアー化合物−ＰＯ−ＯＮ−［ＰＯ−ＯＮ’］ｎであってもよく、ここで、ｎは、例えば、１、２または３であってもよく、そして各ＯＮ’は同じであってもまたは異なってもよく、そして異なる場合、同じまたは異なるターゲットを有してもよい。
１つの側面において、本発明は、例えば細胞において、ターゲット核酸、例えばＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇを阻害するように調節する際に使用するため、ポリオリゴマー化合物（本明細書において、オリゴマー化合物とも称される）を使用する。オリゴマー化合物は、少なくとも２つのオリゴマー領域、例えば（ＰＡおよびＰＡ’）を含み、そしてさらなるオリゴマー領域（例えばＰＡ”）を含むことも可能である。少なくとも１つのオリゴマー領域は、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇ中のターゲット配列を調節することが可能なオリゴマー、例えば本発明に提供されるようなオリゴマーである。特定の態様において、ＰＡ、ＰＡ’（および存在する場合、ＰＡ”）は、各々、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇ中のターゲット配列を調節することが可能なオリゴマー、例えば本発明によって提供されるオリゴマーであることも可能である。ＰＡおよびＰＡ’は、ターゲット配列中の異なる位に相補的であってもよい。
いくつかの態様において、ＰＡはＨＢｘ中のターゲット配列を調節可能なオリゴマーであってもよく、そしてＰＡ’（および／または存在する場合、ＰＡ”）は異なるターゲット配列を調節可能なオリゴマーであってもよい。特定の態様において、ＰＡ’（および／または存在する場合、ＰＡ”）はＨＢＶのＨＢｓＡｇ中のターゲット配列を調節可能であってもよい。例えばＰＡ’（および／または存在する場合、ＰＡ”）は、本明細書に記載するようなＨＢＶのＨＢｓＡｇ中のターゲット配列を調節可能であってもよい。
いくつかの態様において、ＰＡ’はＨＢｘ中のターゲット配列を調節可能なオリゴマーであってもよく、そしてＰＡ（および／または存在する場合、ＰＡ”）はＨＢＶ由来の異なるターゲット配列を調節可能なオリゴマーであってもよい。特定の態様において、ＰＡ（および／または存在する場合、ＰＡ”）はＨＢＶのＨＢｓＡｇ中のターゲット配列を調節可能であってもよい。例えばＰＡ（および／または存在する場合、ＰＡ”）は、本明細書に記載するようなＨＢＶのＨＢｓＡｇ中のターゲット配列を調節可能なオリゴマーであってもよい。
各オリゴマー領域には、生物切断可能領域（領域ＰＢ）が隣接することも可能であり、該領域は例えば、１〜１０の連続するヌクレオチドのさらなる領域（領域ＰＢ）であることも可能であり、これは、少なくとも１つのホスホジエステル連結を含む。他の生理学的に不安定なヌクレオシド領域を使用してもよい。
いくつかの態様において、本発明のオリゴマー化合物を、コンジュゲート基、ターゲティング基、反応基、活性化基、またはブロッキング基に、場合によってホスホジエステル連結ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシド（単数または複数）を（例えば１〜１０）含む短い領域を通じて、共有結合する。こうした基の例は、本明細書に言及するキャリアー構成要素およびコンジュゲート構成要素である。
いくつかの態様において、本発明の化合物は、ＲＮＡ（単位）を含まない。いくつかの態様において、本発明記載の化合物は、場合によって官能基、例えばコンジュゲート基に連結されて、単一の連続配列を形成し、そしてこうした直鎖分子であるかまたは直鎖分子として合成される。オリゴマー化合物は、したがって、一本鎖分子であることも可能である。いくつかの態様において、オリゴマーは、同じオリゴマー化合物内の同等の領域に相補的な例えば少なくとも３、４または５の連続ヌクレオチドの短い領域（すなわち二重鎖）を含まない。オリゴマーは、いくつかの態様において、（本質的に）二本鎖でないことも可能である。いくつかの態様において、オリゴマーは本質的に二重鎖でなく、例えばｓｉＲＮＡではない。
オリゴマー領域ＰＡ、ＰＡ’および存在する場合、ＰＡ”は、ホスホロチオエート・オリゴマーであり、すなわち、各オリゴマー領域ＰＡ、ＰＡ’および存在する場合、ＰＡ”内のヌクレオシド間連結の少なくとも７０％がホスホロチオエート連結であり、例えば、存在する場合、オリゴマー領域ＰＡ、ＰＡ’およびＰＡ”（存在する場合）内のヌクレオシド間連結の少なくとも８０％または少なくとも９０％またはすべてがホスホロチオエートである。
いくつかの態様において、オリゴマー領域ＰＡ、ＰＡ’および存在する場合、ＰＡ”は、単一の連続オリゴヌクレオチド配列を形成することも可能である。領域ＰＡ、ＰＡ’およびＰＡ”は、ＰＢ、例えば１、２、３、４、または５のホスホジエステル連結ＤＮＡヌクレオシドの領域に散在している。
領域ＰＢが１つのヌクレオチドしか含まない場合、領域ＰＢヌクレオシド（例えばＤＮＡヌクレオシド）の間の少なくとも１つまたは両方のヌクレオシド間連結は、ホスホジエステル連結であることも可能である。領域ＰＢが２またはそれより多いヌクレオシドしか含まない場合、領域ＰＢヌクレオシド（例えばＤＮＡヌクレオシド）の間のヌクレオシド間連結は、ホスホジエステル連結であることも可能であるし、そして／または別のヌクレオシド間連結、例えばホスホロチオエート連結であることも可能である。
本発明のオリゴマー、例えばＰＡ、ＰＡ’および存在する場合、ＰＡ”はｓｉＲＮＡ複合体の一部を形成しない。本発明のオリゴマー、例えばＰＡ、ＰＡ’および存在する場合、ＰＡ”は、非相補的であり、例えばこれらは互いにハイブリダイズして８より大きいまたはいくつかの態様において、６より大きい連結塩基対の領域を形成しない。いくつかの態様において、領域ＰＡおよびＰＡ”は、４より多い連続塩基対の領域を形成するように互いにハイブリダイズしない。例示的な塩基対は、Ａ−Ｔ、Ｇ−ＣまたはＡ−Ｕの間であることも可能である。３つのオリゴマー領域、ＰＡ、ＰＡ’およびＰＡ”がある場合、非相補性はＰＡおよびＰＡ’間、ならびにＰＡ’およびＰＡ”間、ならびにＰＡおよびＰＡ”間である。
オリゴマー領域ＰＡ、ＰＡ’、および存在する場合、ＰＡ”は、（実質的に）相補的なオリゴヌクレオチド含む二重鎖の形ではなく、例えばｓｉＲＮＡではない。
いくつかの態様において、オリゴマー領域ＰＡ、ＰＡ’およびＰＡ”は、同じ連続ヌクレオチド配列を共有する。いくつかの態様において、オリゴマー領域ＰＡおよびＰＡ’は、同じ連続ヌクレオチド配列を共有する。これに関連して、本発明は、多コピーのオリゴマー（すなわち同じ連続核酸塩基配列および場合によって同じ化学修飾を含む）をターゲット組織に送達するために使用可能な、単一化合物を提供する。
オリゴマー領域（ＰＡ、ＰＡ’、および存在する場合、ＰＡ”）を、本明細書において、領域ＰＢ（ならびに１より多い領域ＰＢが存在する場合、領域ＰＢ’および領域ＰＢ”）と称される、少なくとも１つの生物分解可能領域を通じて連結する。いくつかの態様において、領域ＰＢは、オリゴマー領域間で、または１つの（または各）オリゴマー領域および連結基間で、生理学的に不安定な領域を形成する、１〜１０のヌクレオシドを含む。ＤＮＡホスホジエステルヌクレオシドの領域が使用可能であるが、適切に生理学的に不安定である場合、他のヌクレオチド領域を用いてもよい。
いくつかの態様において、オリゴマー領域（ＰＡ、ＰＡ’、および存在する場合、ＰＡ”）および（各）第二の領域ＰＢの間のヌクレオシド間連結は、領域ＰＢの第一の（または唯一の）ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドに連結されるホスホジエステルであり、領域ＰＢは、少なくとも１つのホスホジエステル連結ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドを含む。
領域ＰＢは、いくつかの態様において、ホスホジエステル連結であってもよい、さらなるＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドを含む。
本明細書に説明するように、また、領域ＰＢを用いて、官能基をオリゴマー領域（単数または複数）に、場合によってさらなる連結基（ＰＹ）を通じて連結することも可能である。官能基をオリゴマーに連結するための、切断可能リンカーとしての領域ＰＢの使用が、本明細書に援用されるＰＣＴ／ＥＰ２０１３／０７３８５８に詳述される。
いくつかの態様において、領域ＰＢを第三の領域にさらに共有結合するが、第三の領域は例えばコンジュゲート、ターゲティング基、反応基、および／またはブロッキング基（ＰＣ）であることも可能である。基（ＰＣ）は、本明細書に記載するようなキャリアー構成要素であることも可能である。
いくつかの側面において、本発明は、生理学的に不安定な領域、第二の領域を提供して、第一の領域、例えばアンチセンス・オリゴヌクレオチド、およびコンジュゲートまたは官能基、例えばキャリアー構成要素を連結することに基づく。生理学的に不安定な領域は、少なくとも１つのホスホジエステル連結ヌクレオシド、例えばＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシド、例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０ホスホジエステル連結ヌクレオシド、例えばＤＮＡまたはＲＮＡを含むことも可能である。いくつかの態様において、オリゴマー化合物は、切断可能（生理学的に不安定な）リンカーを含む。これに関連して、切断可能リンカーは、好ましくは領域ＰＢ中（またはいくつかの態様において、領域ＰＡおよびＰＢの間）に存在する。
いくつかの態様において、１（またはそれより多いまたはすべての）領域ＰＢは、ホスホジエステル連結を通じて、第一の領域に連結された少なくとも１つのＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドを含むかまたはこれらからなることも可能である。いくつかの側面において、オリゴマー領域および第二の領域の間のヌクレオシド間連結は、領域ＰＢの一部と見なされる。
いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢは、少なくとも１〜１０の間の連結されたヌクレオシド、例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０の連結されたＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオチドを含むかまたはこれらからなる。ＤＮＡ／ＲＮＡホスホジエステルの領域は、切断可能リンカーの提供において重要と見なされる一方、領域ＰＢがまた、糖修飾ヌクレオシド類似体、例えば上記の第一の領域のもとに言及したものを含むことが可能である。しかし、いくつかの態様において、領域ＰＢのヌクレオシドは、（場合によって独立に）ＤＮＡおよびＲＮＡからなる群より選択される。いくつかの態様において、領域ＰＢのヌクレオシドは（場合によって独立に）ＤＮＡである。領域ＰＢのヌクレオシドが、天然存在または非天然存在核酸塩基を含むことも可能であることが認識されるであろう。典型的には、領域ＰＢは、少なくとも１つのホスホジエステル連結ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシド（これはいくつかの態様において、オリゴマーに隣接する第一のヌクレオシドであることも可能である）を含む。領域ＰＢが他のヌクレオシドを含む場合、領域ＰＢはまた、ホスホジエステル以外の他のヌクレオシド連結、例えば（場合によって独立に）ホスホロチオエート、ホスホジチオエート、ボラノホスフェートまたはメチルホスホネートも含むことも可能である。しかし、他の例示する態様において、領域ＰＢ中のヌクレオシド間連結のすべてはホスホロチオエートである。いくつかの態様において、領域ＰＢのヌクレオシドのすべては、（場合によって独立に）２’−ＯＨリボース糖（ＲＮＡ）または２’−Ｈ糖、すなわちＲＮＡまたはＤＮＡを含む。１〜５、または１〜４の間、例えば２、３、４のリン酸（ホスホジエステル）連結ＤＮＡヌクレオシドが、本発明の化合物において特に有用であることが示されてきている。
いくつかの態様において、第二の領域が、１〜１０の間の（例えばホスホジエステル）連結ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシド、例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０の（例えばホスホジエステル）連結ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオチドを含むかまたはこれらからなる。
いくつかの態様において、領域ＰＢは、３を越えないまたは４を越えない連続ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシド（例えばＤＮＡヌクレオシド）を含む。こうしたものとして、領域ＰＢは、ＲＮアーゼＨを補充しないくらい短いことも可能であり、これは、領域ＰＢがターゲットと相補的な単一の連続核酸塩基配列の一部を形成しない態様において、重要である可能性もある側面である。より短い領域ＰＢ、例えば長さ１〜４ｎｔのものもまた、いくつかの態様において好ましい可能性があり、これは、これらが配列特異的制限酵素のターゲットである可能性が低いためである。こうしたものとして、領域ＰＢのエンドヌクレアーゼ切断に対する感受性は多様である可能性があり、そしてそれによって、ｉｎ ｖｉｖｏまたはさらに細胞内で活性オリゴマーを活性化する率を微調整することが可能である。適切には、非常に迅速な活性化が必要である場合、より長い領域ＰＢを使用して、そして／または（例えば細胞または組織特異的に、または示差的に発現されている）制限酵素の認識部位を含む領域Ｂを使用することも可能である。
いくつかの態様において、領域ＰＢを官能基（ＰＣ）、例えばコンジュゲート、ターゲティング反応基、活性化基、またはブロッキング基に、場合によってリンカー基（ＰＹ、例えば本明細書に提供するもの）を通じて、コンジュゲート化することも可能である。官能基をまた、オリゴマー領域に、または本発明の化合物に、他の手段を通じて、例えばリン酸ヌクレオシド連結（例えばホスホジエステル、ホスホロチオエート、ホスホジチオエート、ボラノホスフェートまたはメチルホスホネート）を通じて、またはトリアゾール基に連結することも可能である。いくつかの側面において、連結基は、少なくとも２つのオリゴマー領域の間の領域ＰＢと同じであり、そしてこうしたものとして、ホスホジエステル連結であることも可能である。
いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢのＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオチドは、ＤＮＡおよびＲＮＡヌクレオチドから独立に選択される。いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢのＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオチドは、ＤＮＡヌクレオチドである。いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢのＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオチドは、ＲＮＡヌクレオチドである。
第二の領域の背景において、用語、ＤＮＡおよびＲＮＡヌクレオシドは、天然存在または非天然存在塩基（また、塩基類似体または修飾塩基とも称される）を含むことも可能である。
いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢは、他のヌクレオチドまたはヌクレオチド類似体をさらに含むことも可能であることが認識されるであろう。いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢは、ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドのみを含む。いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢは、１より多いヌクレオシドを含み、領域ＰＢ中のまたは各領域ＰＢ中のヌクレオシド間連結は、ホスホジエステル連結を含む。いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢが１より多いヌクレオシドを含む場合、第二の領域中のヌクレオシド間連結はすべて、ホスホジエステル連結を含む。
いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢの少なくとも２つの連続ヌクレオチドは、ＤＮＡヌクレオシド（例えば少なくとも３または４または５の連続ＤＮＡヌクレオチド）である。いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢの少なくとも２つの連続ヌクレオシドは、ＲＮＡヌクレオシド（例えば少なくとも３または４または５の連続ＲＮＡヌクレオチド）である。いくつかの態様において、１つの（またはそれより多いまたは各）領域ＰＢの少なくとも２つの連続ヌクレオシドは、少なくとも１つのＤＮＡおよび少なくとも１つのＲＮＡヌクレオシドである。領域ＰＡおよび領域ＰＢの間のヌクレオシド間連結は、ホスホジエステル連結であることも可能である。いくつかの態様において、領域ＰＢが１より多いヌクレオシドを含む場合、少なくとも１つのさらなるヌクレオシド間連結はホスホジエステルであり、例えば領域ＰＡに隣接した２（または３または４または５）ヌクレオシドの間の連結基（単数または複数）である。
領域ＰＢは、第一の領域、例えばアンチセンス・オリゴヌクレオチドの少なくとも一方の側（５’または３’いずれか）に隣接していてもよく、そして他方の側（それぞれ３’または５’いずれか）に、さらなるオリゴマー領域（ＰＡ’）、またはコンジュゲート部分または類似の基（例えばブロッキング部分／基、ターゲティング部分／基または療法小分子部分）を通じて、場合によって連結基を通じて（すなわち第二の領域およびコンジュゲート／ブロッキング基等の部分の間で）隣接していてもよい。
いくつかの態様において、領域ＰＢは、オリゴマー領域（例えばＰＡ、ＰＡ’および／またはＰＡ”）およびＰＢが相補的ターゲット配列に整列した際、相補的配列を形成しない。
いくつかの態様において、領域ＰＢは、オリゴマー領域（例えばＰＡ、ＰＡ’および／またはＰＡ”）およびＰＢが相補的ターゲット配列に整列した際、相補的配列を形成しない。これに関連して、領域ＰＡおよびＰＢはともに、ターゲット配列に相補的な単一の連続配列を形成することも可能である。
いくつかの態様において、領域ＰＢ中の塩基の配列は、ターゲット組織または細胞または細胞内区画に存在する主なエンドヌクレアーゼ切断酵素に基づいて、最適なエンドヌクレアーゼ切断部位を提供するように選択される。これに関連して、ターゲット組織および非ターゲット組織からの細胞抽出物を単離することによって、非ターゲット細胞（例えば腎臓）に比較した際の所望のターゲット細胞（例えば肝臓／肝細胞）における優先的な切断活性に基づいて、領域ＰＢ中で使用するためのエンドヌクレアーゼ切断配列を選択することも可能である。これに関連して、ターゲット下方制御のための化合物の強度を、所望の組織／細胞に関して最適にすることも可能である。
いくつかの態様において、領域ＰＢは、配列ＡＡ、ＡＴ、ＡＣ、ＡＧ、ＴＡ、ＴＴ、ＴＣ、ＴＧ、ＣＡ、ＣＴ、ＣＣ、ＣＧ、ＧＡ、ＧＴ、ＧＣ、またはＧＧのジヌクレオチドを含み、ここで、Ｃは５−メチルシトシンであることも可能であり、そして／またはＴはＵで置換されることも可能である。
いくつかの態様において、領域ＰＢは、配列ＡＡＡ、ＡＡＴ、ＡＡＣ、ＡＡＧ、ＡＴＡ、ＡＴＴ、ＡＴＣ、ＡＴＧ、ＡＣＡ、ＡＣＴ、ＡＣＣ、ＡＣＧ、ＡＧＡ、ＡＧＴ、ＡＧＣ、ＡＧＧ、ＴＡＡ、ＴＡＴ、ＴＡＣ、ＴＡＧ、ＴＴＡ、ＴＴＴ、ＴＴＣ、ＴＡＧ、ＴＣＡ、ＴＣＴ、ＴＣＣ、ＴＣＧ、ＴＧＡ、ＴＧＴ、ＴＧＣ、ＴＧＧ、ＣＡＡ、ＣＡＴ、ＣＡＣ、ＣＡＧ、ＣＴＡ、ＣＴＧ、ＣＴＣ、ＣＴＴ、ＣＣＡ、ＣＣＴ、ＣＣＣ、ＣＣＧ、ＣＧＡ、ＣＧＴ、ＣＧＣ、ＣＧＧ、ＧＡＡ、ＧＡＴ、ＧＡＣ、ＣＡＧ、ＧＴＡ、ＧＴＴ、ＧＴＣ、ＧＴＧ、ＧＣＡ、ＧＣＴ、ＧＣＣ、ＧＣＧ、ＧＧＡ、ＧＧＴ、ＧＧＣ、およびＧＧＧのトリヌクレオチドを含み、ここで、Ｃは５−メチルシトシンであることも可能であり、そして／またはＴはＵで置換されることも可能である。
いくつかの態様において、領域ＰＢは、配列ＡＡＡＸ、ＡＡＴＸ、ＡＡＣＸ、ＡＡＧＸ、ＡＴＡＸ、ＡＴＴＸ、ＡＴＣＸ、ＡＴＧＸ、ＡＣＡＸ、ＡＣＴＸ、ＡＣＣＸ、ＡＣＧＸ、ＡＧＡＸ、ＡＧＴＸ、ＡＧＣＸ、ＡＧＧＸ、ＴＡＡＸ、ＴＡＴＸ、ＴＡＣＸ、ＴＡＧＸ、ＴＴＡＸ、ＴＴＴＸ、ＴＴＣＸ、ＴＡＧＸ、ＴＣＡＸ、ＴＣＴＸ、ＴＣＣＸ、ＴＣＧＸ、ＴＧＡＸ、ＴＧＴＸ、ＴＧＣＸ、ＴＧＧＸ、ＣＡＡＸ、ＣＡＴＸ、ＣＡＣＸ、ＣＡＧＸ、ＣＴＡＸ、ＣＴＧＸ、ＣＴＣＸ、ＣＴＴＸ、ＣＣＡＸ、ＣＣＴＸ、ＣＣＣＸ、ＣＣＧＸ、ＣＧＡＸ、ＣＧＴＸ、ＣＧＣＸ、ＣＧＧＸ、ＧＡＡＸ、ＧＡＴＸ、ＧＡＣＸ、ＣＡＧＸ、ＧＴＡＸ、ＧＴＴＸ、ＧＴＣＸ、ＧＴＧＸ、ＧＣＡＸ、ＧＣＴＸ、ＧＣＣＸ、ＧＣＧＸ、ＧＧＡＸ、ＧＧＴＸ、ＧＧＣＸ、およびＧＧＧＸのトリヌクレオチドを含み、ここで、ＸはＡ、Ｔ、Ｕ、Ｇ、Ｃおよびその類似体からなる群より選択されることも可能であり、Ｃは５−メチルシトシンであることも可能であり、そして／またはＴはＵで置換されることも可能である。（天然存在）核酸塩基Ａ、Ｔ、Ｕ、Ｇ、Ｃに言及する際、これらは同等の天然核酸塩基として機能する（例えば相補的ヌクレオシドと塩基対形成する）、核酸塩基類似体で置換されうることが認識されるであろう。
いくつかの態様において、本発明の化合物は、１より多いコンジュゲート基（または１より多い官能基ＰＸ−例えば、コンジュゲート、ターゲティング、ブロッキングまたは活性化基、あるいは反応基または活性化基）、例えば、２または３のこうした基を含むことも可能である。いくつかの態様において、領域ＰＢは、場合によって（例えば非ヌクレオチド）リンカー基を通じて、少なくとも１つの官能基、例えば２または３の官能基に共有結合する。いくつかの態様において、第一の領域（ＰＡ）は、例えば第一の領域ＰＡは、１つは第一の領域ＰＡの５’で、そして１つは３’で２つの領域ＰＢに共有結合してもよく（例えばヌクレオシド間連結、例えばホスホジエステル連結を通じて）、ここで、各領域ＰＢは、（場合によって独立に）本明細書記載の領域ＰＢより選択されることも可能である（場合によって独立で）。
組成物
本発明のオリゴマーおよび本発明のオリゴマー・コンジュゲートを、薬学的配合物および組成物において使用することも可能である。適切には、こうした組成物は、薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントを含む。本明細書に援用するＷＯ ２００７／０３１０９は、適切でそして好ましい薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアーおよびアジュバントを提供する。適切な投薬量、配合物、投与経路、組成物、投薬型、他の療法剤との組み合わせ、プロドラッグ配合物もまた、本明細書にやはり援用されるＷＯ２００７／０３１０９に提供される。
本発明の薬学的組成物には、薬学的に許容されうるキャリアーが含まれることも可能であり、これは、薬剤濃度の制御、溶解度の制御、化学安定化、粘性の制御、吸収増進、ｐＨ制御等を含む、多様な機能を提供する、多様な構成要素を含有することも可能である。
薬学的キャリアーは、適切な液体ビヒクルまたは賦形剤および場合による単数または複数の補助的添加物を含むことも可能である。液体ビヒクルおよび賦形剤は慣用的であり、そして商業的に入手可能である。その例は再蒸留水、生理学的食塩水、デキストロース水溶液等である。水溶性配合物に関しては、薬学的組成物には、好ましくは、緩衝剤、例えばリン酸緩衝剤、または他の有機酸塩が含まれ、好ましくはｐＨは６．５〜８の範囲である。微溶性アンチセンス化合物を含有する配合物に関しては、マイクロエマルジョンを使用してもよく、例えば可溶性を増加させるために、０．０４〜０．０５％（ｗ／ｖ）の量の非イオン性界面活性剤、例えばポリソルベート８０を用いることによる。他の構成要素には、酸化防止剤、例えばアスコルビン酸、親水性ポリマー、例えば単糖、二糖、およびセルロースまたはその誘導体を含む他の炭水化物、デキストリン、キレート剤、例えばＥＤＴＡ、ならびに薬学的科学の当業者に周知の同様の構成要素が含まれることも可能である。例えばＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ， 最新版（Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ、ペンシルバニア州イーストン）。
本発明のオリゴヌクレオチドには、アルカリ土類塩、例えばナトリウムまたはマグネシウム、アンモニウムまたはＮＸ４ ＋、式中、ＸはＣ１−Ｃ４アルキルである、のものを含む薬学的に許容されうる塩が含まれる。他の薬学的に許容されうる塩には、有機カルボン酸、例えばギ酸、酢酸、乳酸、酒石酸、リンゴ酸、イセチオン酸、ラクトビオン酸、およびコハク酸；有機スルホン酸、例えばメタンスルホン酸、エタンスルホン酸、トルエンスルホン酸およびベンゼンスルホン酸；ならびに無機酸、例えば塩酸、硫酸、リン酸、およびスルファミン酸が含まれる。ヒドロキシル基を有する化合物の薬学的に許容されうる塩には、適切な陽イオン、例えばＮａ＋、ＮＨ４ ＋等を伴う、こうした化合物の陰イオンが含まれる。
患者は、組み合わせたオリゴヌクレオチドの有効であるがそれでも安全な細胞間濃度を達成するために、十分な一日投薬量を投与されなければならない。当業者は、特定の環境および患者の要求に適した適切な投薬量および投与スケジュールを容易に得ることが可能であるはずである。
寛解が起こっているかどうかを決定するために用いられるルーチンの方法によって、治療の有効性を評価することも可能である。こうした方法は、一般的に、形態学的、細胞化学的、細胞遺伝学的、免疫学的および分子的分析に応じる。さらに、１またはそれより多い適切な遺伝子の発現レベルを探査することによって、寛解を遺伝学的に評価することも可能である。逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）方法論を用いて、さらに非常に少数のｍＲＮＡ転写物を検出することも可能である。
オリゴヌクレオチド送達技術
本発明のオリゴヌクレオチドおよびコンジュゲートは、好ましくは、経口または局所的に被験体に投与されることも可能であるが、また、注射によって静脈内投与されることも可能である。ビヒクルは適宜設計される。あるいは、徐放投薬型または静脈内注射用の慣用的な配合物を通じて、オリゴヌクレオチドを皮下投与することも可能である。オリゴヌクレオチドの好ましい投与法は、適切なように、局所、全身または局部灌流のいずれかを含む。局部灌流法にしたがって、病変を含有する四肢に供給する求心性および遠心性の血管を単離し、そして人工肺および熱交換装置とつながれた低流量灌流ポンプに連結する。下肢の灌流のために、腸骨血管を用いてもよい。上肢病変のため、腋の高い位置で、腋窩血管にカニューレを挿入する。オリゴヌクレオチドを灌流回路に添加し、そして灌流を適切な期間、例えば１時間続ける。約１００〜約１５０ｍｌ／分の灌流速度を下肢病変のために使用し、一方、上肢病変には、この速度の半分を使用すべきである。全身ヘパリン処理を灌流全体で用いて、そして灌流が完了したら元に戻すことも可能である。この単離灌流技術は、動脈または静脈全身循環内への注入に際して許容されうるよりも、より高い用量の化学療法剤の投与を可能にする。
特定の態様において、本発明のオリゴマーおよびコンジュゲートを全身投与するか、または全身投与のために配合する。
全身注入のため、オリゴヌクレオチドは、好ましくは、中心静脈カテーテルを通じて送達され、このカテーテルは、適切な連続注入デバイスに連結される。留置カテーテルは、長期間に渡る薬剤の頻繁な投与のため、静脈内循環への長期アクセスを提供する。これらは、一般的に、全身または局所麻酔下で、頭部外部または内部頸静脈内に外科的に挿入される。鎖骨下静脈が別の一般的なカテーテル挿入部位である。注入ポンプは外部にあってもよいし、またはＩｎｆｕｓａｉｄ社、マサチューセッツ州ノーウッドより入手可能なＩＮＦＵＳＡＰＯＲＴ系、およびＰｈａｒｍａｃｉａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ、ニュージャージー州ピスカタウェイより入手可能なＰＯＲＴ−Ａ−ＣＡＴＨ系などの完全移植可能中心静脈系の一部を形成することも可能である。局所麻酔下で、これらのデバイスを皮下ポケットに移植する。ポンプ注入ポートに連結されたカテーテルは、鎖骨下静脈から上大静脈に通る。移植物は、皮下針から容器中の自己密封ダイヤフラムを通じて、さらなる薬剤の注射によって、必要に応じて充填可能な容器中に、オリゴヌクレオチドの供給を含有する。完全に移植可能な注入装置が好ましく、これはこうしたデバイスが一般的に、便利であり、維持が容易でそして美容上の利点があるため、患者に一般的によく許容されうるためである。
本明細書に援用される米国特許４，７４０，４６３に記載される任意の方法によって、本発明のオリゴヌクレオチドおよびコンジュゲートを導入することも可能である。１つの技術は、ｉｎ ｖｉｔｒｏトランスフェクションであり、これは、いくつかの異なる方法によって実行可能である。トランスフェクションの１つの方法は、レシピエント細胞によって、裸のＤＮＡ分子の取り込みを増加させるため、ＤＥＡＥ−デキストランの添加を伴う。ＭｃＣｕｔｃｈｉｎ， Ｊ．Ｈ．およびＰａｇａｎｏ， Ｊ．Ｓ．， Ｊ． Ｎａｔｌ． Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ． ４１， ３５１−７（１９６８）を参照されたい。トランスフェクションの別の方法は、リン酸含有ＤＮＡ溶液へのＣａ２＋の添加に依存する、リン酸カルシウム沈殿技術である。生じた沈殿物には、リン酸カルシウム結晶と会合したＤＮＡが含まれるようである。これらの結晶は、細胞単層上に定着し；その結果生じる結晶および細胞表面の並置（ａｐｐｏｓｉｔｉｏｎ）がＤＮＡの取り込みを導くようである。取り込まれるわずかな比率のＤＮＡがトランスフェクタント中ならびにそのクローン性子孫で発現されるようになる。Ｇｒａｈａｍ， Ｆ． Ｌ．およびｖａｎ ｄｅｒ Ｅｂ， Ａ． Ｊ．， Ｖｉｒｏｌｏｇｙ ５２， ４５６−４６７ （１９７３）ならびにＶｉｒｏｌｏｇｙ ５４， ５３６−５３９ （１９７３）を参照されたい。
トランスフェクションはまた、陽イオン性リン脂質仲介送達によって実行されうる。特に、ポリカチオンリポソームが、Ｎ−［１−（２，３−ジ−オレイルオキシ）プロピル］−Ｎ，Ｎ，Ｎ−トリメチルアンモニウムクロリド（ＤＯＴ−ＭＡ）から形成可能である。Ｆｅｌｇｎｅｒら， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ．， ８４， ７４１３−７４１７ （１９８７）（ＤＮＡトランスフェクション）； Ｍａｌｏｎｅら， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ．， ８６， ６０７７−６０８１ （１９８９）（ＲＮＡ−トランスフェクション）を参照されたい。
全身または局部ｉｎ ｖｉｖｏ投与に関して、オリゴヌクレオチドの量は、疾患の性質および度合い、利用する特定のオリゴヌクレオチド、および他の要因に応じて多様である可能性がある。投与される実際の投薬量は、患者のサイズおよび重量、治療の性質が予防性であるかまたは療法性であるか、患者の年齢、健康状態および性別、投与経路、治療が局所的であるかまたは全身性であるか、ならびに他の要因を考慮に入れることも可能である。
慣用的な薬学的キャリアーを用いた投与に加えて、アンチセンス・オリゴヌクレオチドは、多様な特殊化オリゴヌクレオチド送達技術によって投与することも可能である。本発明の薬学的組成物で使用するのに適した持続放出系には、フィルム、マイクロカプセル等の形の半浸透性ポリマーマトリックスが含まれ、これは、ポリラクチド；Ｌ−グルタミン酸およびガンマ−エチル−Ｌ−グルタメート、ポリ（２−ヒドロキシメチルメタクリレート）、および同様の材料を含むことも可能である。例えばＲｏｓｅｎｂｅｒｇら、国際出願ＰＣＴ／ＵＳ９２／０５３０５。
例えば、Ｌｉｐｏｓｏｍｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｖｏｌ． ＩＩ， Ｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ ｏｆ Ｄｒｕｇｓ， Ｐｒｏｔｅｉｎｓ， ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｍａｔｅｒｉａｌ， ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓに記載されるように、オリゴヌクレオチドおよびコンジュゲートを療法送達のためのリポソーム中に被包することも可能である。溶解度に応じて、オリゴヌクレオチドは、水性層および脂質層の両方に存在することも可能であり、またはリポソーム懸濁物と一般的に呼ばれるものの中に存在することも可能である。疎水性層は、排他的ではないが一般的に、リン脂質、例えばレシチンおよびスフィンゴミエリン、ステロイド、例えばコレステロール、イオン性界面活性剤、例えばジアセチルリン酸、ステアリルアミン、またはホスファチジン酸、および／または疎水性の他の材料を含む。やはり含まれるのは、（ＤｅＬｏｎｇら， Ｎｕｃｌ． Ａｃｉｄ． Ｒｅｓ．， １９９９， ２７（１６）， ３３３４−３３４１）に記載される、「分子アンブレラ」と称される新規陽イオン性両親媒性物質である。
本発明の態様を、粒子系および／またはポリマーによって送達することも可能である。ポリヌクレオチドのｉｎ ｖｉｔｒｏおよびｉｎ ｖｉｖｏ送達のための粒子系およびポリマーは、Ｆｅｌｇｎｅｒによって、Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｒｅｖｉｅｗｓ ５， １６３−１８７ （１９９０）に広範に概説される。直接送達のための技術もまた、Ｃｏｏｋ Ｓ．Ｔ． Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｄｒｕｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ， Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ， ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ， Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ， Ｉｎｃ， ２００１．に記載される。
プロドラッグ
Ｖｉｖｅｓら Ｎｕｃｌ． Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ． １９９９， Ｖｏｌ． ２７， ４０７１−４０７６に記載されるように、オリゴにヌクレアーゼ耐性を与え、細胞取り込みを改善し、そして細胞内への進入後に選択的に脱保護する親油性基、例えばメチル−ＳＡＴＥ（Ｓ−アセチルチオエチル）またはｔ−Ｂｕ−ＳＡＴＥ（Ｓ−ピバロイルチオエチル）保護基を所持するプロドラッグとして、オリゴヌクレオチドを合成することも可能である。
環状分子
オリゴヌクレオチドの５’端および３’端が共有結合するか、または１つのメンバーが５’端に共有結合し、そしてもう一方が３’端に共有結合するアフィニティ対によってともに保持される、環状分子として、オリゴヌクレオチドを合成することも可能である。こうした環状化は、エキソヌクレアーゼによる分解からオリゴヌクレオチドを保護し、そしてまた、細胞取り込みおよび分布も改善しうる。本発明の１つの側面において、環状オリゴヌクレオチドの５’端および３’端を連結する部分は、任意のタイプのヒトまたは脊椎動物細胞内に進入する際に自動的に切断され、それによってオリゴヌクレオチドが直線化され、そしてターゲット配列に効率的にハイブリダイズすることが可能になる。別の側面において、オリゴヌクレオチドの５’端および３’端を連結する部分は、切断が好ましくは、アンチセンス・オリゴヌクレオチドに対するターゲットであるｍＲＮＡを発現する特定のタイプの細胞でのみ起こるように設計されている。例えば、ウイルス性障害に関与する遺伝子に対して向けられた環状アンチセンス・オリゴヌクレオチドは、問題の遺伝子、例えばＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇを発現している細胞サブセットでのみ直線化によって作用するようにされることも可能である。
さらなる薬学的実体
本発明のオリゴマーおよびオリゴマー・コンジュゲートを、疾患状態の治療のための主な療法剤として用いることも可能であるし、または非オリゴヌクレオチド薬剤と組み合わせて用いることも可能である。
したがって、本発明は、本明細書に記載するような薬学的組成物およびさらなる薬学的実体を含む、薬剤系を提供する。さらなる薬学的実体は、当該技術分野に知られる任意の療法剤であることも可能である。例えば、さらなる薬学的実体は、抗体、小分子療法剤、ポリヌクレオチドまたは遺伝子療法ベクター（例えば療法ポリペプチドまたはＲＮＡｉ剤を発現可能なベクター）であることも可能である。
したがって、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを他の活性剤、例えば他の抗ウイルス活性剤と組み合わせて用いることも可能である。
例えば、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを、アンチセンス（他のＬＮＡオリゴマーを含む）、ｓｉＲＮＡ（例えばＡＲＣ５２０）、アプタマー、モルホリノまたは任意の他の抗ウイルス性ヌクレオチド配列に依存する作用様式のいずれかを通じて作用する、他の活性剤、例えばオリゴヌクレオチドに基づく抗ウイルス剤、例えば配列特異的オリゴヌクレオチドに基づく抗ウイルス剤と組み合わせて用いることも可能である。
さらなる例として、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを、他の活性剤、例えば免疫刺激抗ウイルス化合物、例えばインターフェロン（例えばＰＥＧ化インターフェロン・アルファ）、ＴＬＲ７アゴニスト（例えばＧＳ−９６２０）、または療法ワクチンと組み合わせて用いることも可能である。
さらなる例として、本発明のオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを、抗ウイルス活性を有する他の活性剤、例えば小分子と組み合わせて用いることも可能である。
これらの他の活性剤は、例えば、ヌクレオシド／ヌクレオチド阻害剤（例えばエンテカビルまたはフマル酸テノホビルジイソプロキシル）、カプシド形成阻害剤、進入阻害剤（例えばミルクルデックスＢ）であることも可能である。
特定の態様において、さらなる療法剤は、ＨＢＶ剤、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）剤、化学療法剤、抗生物質、鎮痛剤、非ステロイド抗炎症（ＮＳＡＩＤ）剤、抗真菌剤、抗寄生虫剤、制吐剤、止痢剤、または免疫抑制剤であることも可能である。
特定の関連態様において、さらなるＨＢＶ剤は、インターフェロン・アルファ−２ｂ、インターフェロン・アルファ−２ａ、およびインターフェロン・アルファｃｏｎ−１（ＰＥＧ化および非ＰＥＧ化）、リバビリン；ＨＢＶ ＲＮＡ複製阻害剤；第二のアンチセンスオリゴマー；ＨＢＶ療法ワクチン；ＨＢＶ予防ワクチン；ラミブジン（３ＴＣ）；エンテカビル（ＥＴＶ）；フマル酸テノホビルジイソプロキシル（ＴＤＦ）；テルビブジン（ＬｄＴ）；アデホビル；またはＨＢＶ抗体療法（モノクローナルまたはポリクローナル）であることも可能である。
他の特定の関連態様において、さらなるＨＣＶ剤は、インターフェロン・アルファ−２ｂ、インターフェロン・アルファ−２ａ、およびインターフェロン・アルファｃｏｎ−１（ＰＥＧ化および非ＰＥＧ化）、リバビリン；ＨＣＶ ＲＮＡ複製阻害剤（例えばＶｉｒｏＰｈａｒｍａのＶＰ５０４０６シリーズ）；ＨＣＶアンチセンス剤；ＨＣＶ療法ワクチン；ＨＣＶプロテアーゼ阻害剤；ＨＣＶヘリカーゼ阻害剤；あるいはＨＣＶモノクローナルまたはポリクローナル抗体療法であることも可能である。
さらなる薬学的実体は、本明細書に定義するようなオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであることも可能である。
特定の態様において、薬剤系は、少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、多数までの本発明によって提供されるオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートを含むことも可能である。
特定の態様において、さらなる薬学的実体は、ＨＢＶ中のターゲット配列を調節可能なオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートであることも可能である。オリゴマーまたはコンジュゲートは、各々、ＨＢＶ ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇ中のターゲット配列を調節することが可能である可能性もある。オリゴマーまたはコンジュゲートは、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇ内にはない、ＨＢＶ中のターゲット配列を調節することが可能である可能性もある。例えば、少なくとも１つのオリゴマーまたはコンジュゲートは、ＨＢＶ遺伝子内のターゲット配列、あるいはＨＢｃＡｇ、ＨＢｅＡｇ、またはＤＮＡポリメラーゼのｍＲＮＡを調節することが可能である可能性もある。
特定の態様において、オリゴマー、またはさらなるオリゴマー、またはコンジュゲート、またはさらなるコンジュゲートは、ＨＢＶ遺伝子またはＨＢｓＡｇのｍＲＮＡ中のターゲット配列を調節することが可能である可能性もある。
異なるターゲット配列をターゲティングするオリゴヌクレオチドの組み合わせを使用する場合、異なるタイプのオリゴヌクレオチドの量の比は、広い範囲に渡って多様である可能性もある。本発明の１つの好ましい態様にしたがって、すべてのタイプのオリゴヌクレオチドは、モル濃度でほぼ等しい量で存在する。
投与および投薬量
本発明はまた、本発明のコンジュゲートを療法的に有効な量で含有する薬学的組成物にも関する。組成物を、多様な薬剤送達系で使用するために配合することも可能である。１またはそれより多い生理学的に許容されうる賦形剤またはキャリアーもまた、適切な配合のための組成物中に含むことも可能である。本発明で使用するために適した配合物は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ， Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ， ペンシルバニア州フィラデルフィア， 第１７版， １９８５に見られる。薬剤送達のための方法の簡潔な概説に関しては、例えば、Ｌａｎｇｅｒ（Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４９：１５２７−１５３３， １９９０）を参照されたい。
本発明の薬学的組成物は、予防的および／または療法的治療のため、非経口、鼻内、局所、経口、または局部投与、例えば経皮手段によるものに関して意図される。薬学的組成物を、非経口的に（例えば、静脈内、筋内、または皮下注射によって）、または経口摂取によって、あるいは局所適用または関節内注射によって、投与することも可能である。さらなる投与経路には、静脈内、動脈内、腫瘍内、腹腔内、脳室内、硬膜外内（ｉｎｔｒａｅｐｉｄｕｒａｌ）、ならびに鼻、眼、胸膜内、眼窩内、直腸、局所、またはエアロゾル吸入投与が含まれる。デポ注射あるいは浸食可能移植物または構成要素などの手段による持続放出投与もまた、本発明に特に含まれる。したがって、本発明は、許容されうるキャリアー、好ましくは水性キャリアー、例えば水、緩衝水、生理食塩水、ＰＢＳ等に溶解されるかまたは懸濁された上述の剤を含む、非経口投与のための組成物を提供する。該組成物は、生理学的条件を近似するために必要とされるような薬学的に許容されうる補助物質、例えばｐＨ調整および緩衝剤、浸透圧調整剤、湿潤剤、界面活性剤等を含有することも可能である。本発明はまた、不活性成分、例えば錠剤、カプセル等の配合のための結合剤または充填剤を含有してもよい、経口送達のための組成物も提供する。さらに、本発明は、局所投与のための組成物を提供し、これはクリーム、軟膏等の配合のための溶媒または乳化剤などの不活性成分も含有してもよい。
特定の態様において、本発明のオリゴマーおよびコンジュゲートを皮下投与するか、または皮下投与のために配合する。
これらの組成物を、慣用的な滅菌技術によって滅菌することも可能であるし、または滅菌濾過することも可能である。生じる水溶液をそのままでパッケージングするかまたは凍結乾燥してもよく、凍結乾燥調製物を投与前に無菌水性キャリアーと組み合わせてもよい。調製物のｐＨは、典型的には３〜１１の間、より好ましくは５〜９の間または６〜８の間、そして最も好ましくは７〜８の間、例えば７〜７．５である。固形型の生じた組成物を、多数の単一用量単位にパッケージングすることも可能であり、各々、固定量の単数または複数の上述の剤を、例えば錠剤またはカプセルの密封パッケージ中に含有する。固形型の組成物をまた、柔軟な量のための容器中、例えば局所適用クリームまたは軟膏のために設計された絞り出し可能なチューブ中にパッケージングすることも可能である。
有効量を含有する組成物を、予防的または療法的治療のために投与することも可能である。予防的適用において、組成物を、腫瘍または癌、神経変性疾患、あるいはリソソーム障害の発展に対する臨床的に決定された素因または感受性増加を伴う被験体に投与することも可能である。本発明の組成物を、臨床的疾患または腫瘍発生の開始を遅延させるか、減少させるか、または好ましくは防止するために十分な量で、患者（例えばヒト）に投与することも可能である。療法的適用において、組成物を、状態の症状およびその合併症を治癒させるかまたは少なくとも部分的に抑止するために十分な量で、疾患（例えば癌、神経変性疾患、またはリソソーム蓄積障害）にすでに罹患している被験体（例えばヒト）に投与する。この目的を達成するために適した量は、「療法的有効量」と定義され、疾患または医学的状態と関連するいくつかの症状を実質的に改善するために十分な化合物の量である。例えば、癌、神経変性疾患、またはリソソーム蓄積疾患の治療において、疾患または状態の症状いずれかを減少させるか、防止するか、遅延させるか、抑制するか、または抑止する剤または化合物が、療法的に有効であろう。剤または化合物の療法的有効量は、疾患または状態を治癒させる必要はないが、個体において、疾患または状態の開始を遅延させるか、妨害するか、または防止するか、あるいは疾患または状態の症状を軽減するか、あるいは疾患または状態の期間を変更するか、または例えばより重症でなくするか、あるいは回復を加速させるように、疾患または状態のための治療を提供するであろう。この使用に有効な量は、疾患または状態の重症度、ならびに患者の体重および全身状態に応じる可能性もあるが、一般的に、患者あたり、用量あたり、約０．５ｍｇ〜約３０００ｍｇの単数または複数の剤の範囲である。初回投与およびブースター投与の適切な措置は、典型的には、初回投与後、１またはそれより多い時間、日、週、または月間隔の続く投与での反復用量によって表される。本発明の組成物中に存在する剤の総有効量を、単回用量として、ボーラスとしてまたは比較的短い期間に渡る注入によって、哺乳動物に投与することも可能であるし、あるいは、分割された治療プロトコルを用いて投与することも可能であり、この場合、多数用量を、より長期間に渡って（例えば４〜６、８〜１２、１４〜１６、または１８〜２４時間ごと、あるいは２〜４日ごと、１〜２週間ごと、月１回の用量）投与する。あるいは、血液中で、療法的に有効な濃度を維持するために十分な、連続静脈内注入が意図される。
本発明の組成物内に存在し、そして哺乳動物（例えばヒト）に適用される本発明の方法で用いる、１またはそれより多い剤の療法的有効量は、一般の当業者によって、哺乳動物の年齢、体重および状態の個々の相違を考慮して、決定されることも可能である。本発明の剤を、治療される被験体において望ましい結果を生じる（例えば癌または神経変性障害の遅延または寛解）量である有効量で、被験体（例えば哺乳動物、例えばヒト）に投与する。療法的有効量は、当業者によって実験的に決定可能である。
患者はまた、週あたり１またはそれより多く（例えば週あたり２、３、４、５、６、または７またはそれより多く）、用量あたり約０．１〜３，０００ｍｇの範囲、週あたり０．１〜２，５００（例えば２，０００、１，５００、１，０００、５００、１００、１０、１、０．５、または０．１ｍｇ）ｍｇ用量の剤を投与されることも可能である。患者はまた、２または３週ごとに１回、用量あたり０．１〜３，０００ｍｇの範囲で、組成物の剤を投与されることも可能である。有効量を含む本発明の組成物の単回のまたは複数回の投与は、治療する医師によって選択される用量レベルおよびパターンで実行可能である。患者における疾患または状態の重症度に基づいて、用量および投与スケジュールを決定し、そして調整することも可能であり、臨床家によって一般的に実施される方法または本明細書に記載する方法にしたがって、治療経過に渡ってこれを監視することも可能である。
本発明のキャリアーおよびコンジュゲートを、治療または療法の慣用的な方法いずれかと組み合わせて使用することも可能であるし、あるいは治療または療法の慣用的な方法とは別個に使用することも可能である。
本発明のコンジュゲートを、他の剤との組み合わせ療法で投与する場合、これらを連続してまたは同時に、個体に投与することも可能である。あるいは、本発明記載の薬学的組成物は、本明細書に記載するように、薬学的に許容されうる賦形剤と会合した本発明のキャリアー−剤コンジュゲートの組み合わせで、そして当該技術分野で知られる別の療法剤または予防剤と組み合わせて、構成されることも可能である。
さらなる適用
本発明のオリゴマーを、例えば診断、療法および予防のための研究試薬として利用することも可能である。
研究において、こうしたオリゴマーを用いて、細胞および実験動物におけるターゲット配列の発現産物の合成を特異的に阻害して（典型的には、ｍＲＮＡを分解するかまたは阻害して、そしてそれによってタンパク質形成を防止することによって）、それによって、ターゲットの機能的分析または療法介入のためのターゲットとしての有用性の評価を容易にすることも可能である。
診断において、オリゴマーを用いて、ノーザンブロッティング、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーションまたは類似の技術によって、細胞および組織におけるターゲット配列の発現産物の発現を検出し、そして定量化することも可能である。
療法のため、ターゲット配列の発現を調節することによって治療可能な疾患または障害を有すると推測される動物またはヒトを、本発明にしたがったオリゴマー化合物を投与することによって治療する。さらに提供するのは、ターゲット配列の発現と関連する疾患または状態を有するか、またはこれらに対する傾向を有すると推測される哺乳動物を治療する、例えばヒトを治療する方法であって、療法的または予防的に有効な量の１またはそれより多い本発明のオリゴマーまたは組成物を投与することによる前記方法である。本発明にしたがったオリゴマー、コンジュゲートまたは薬学的組成物は、典型的には有効量で投与される。
本発明はまた、本明細書に言及するような障害の治療用の薬剤製造のため、あるいは本明細書に言及するような障害の治療法のために記載するような、本発明の化合物またはコンジュゲートの使用も提供する。
本発明はまた、本明細書に言及するような障害を治療するための方法であって、本明細書に記載するような本発明記載の化合物および／または本発明記載のコンジュゲート、および／または本発明記載の薬学的組成物を、必要とする患者に投与する工程を含む、前記方法も提供する。
ウイルス性障害
本発明記載のオリゴマー、オリゴマー・コンジュゲートおよび他の組成物を、ターゲット配列と関連する状態の治療に用いてもよく、例えばターゲット配列の突然変異型を過剰発現または発現させてもよい。
本発明はさらに、本明細書に言及するような疾患、障害または状態の治療のための薬剤の製造における本発明の化合物の使用を提供する。
本発明の背景において、前記疾患、障害または状態は、ウイルス性障害であることも可能である。
１つの態様において、ウイルス性障害は、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの発現または過剰発現と関連する。ウイルス性障害は、ＨＢＶと関連する障害であることも可能である。こうしたウイルス性障害の例には、限定されるわけではないが、Ｂ型肝炎、肝硬変、肝癌（例えば肝細胞性癌）、胆管細胞癌が含まれる。
１つの態様において、ウイルス性障害は、Ｂ型肝炎である。一般の当業者が認識するであろうように、用語「Ｂ型肝炎」は、本発明の背景において、ＨＢＶによって引き起こされる肝臓の感染性障害を指す。Ｂ型肝炎は、急性または慢性であることも可能である。急性疾患は、肝臓炎症、嘔吐、黄疸および場合によっては死亡を引き起こす。慢性Ｂ型肝炎は肝硬変および肝癌を引き起こす可能性もある。
１つの態様において、ウイルス性障害は肝硬変である。一般の当業者が認識するであろうように、用語「肝硬変」は、本発明の背景において、肝臓の線維症および再生結節の存在によって特徴付けられる進行した肝疾患を指す。これらの変化は、肝機能の喪失につながりうる。
１つの態様において、ウイルス性障害は肝臓癌である。一般の当業者が認識するであろうように、本発明の背景において、「肝臓癌」は、肝臓で生じる悪性腫瘍を指す。
１つの態様において、ウイルス性障害は、肝細胞癌（ＨＣＣ）である。一般の当業者が認識するであろうように、本発明の背景において「ＨＣＣ」は、一般に、ウイルス肝炎感染、例えばＢ型肝炎に続発して起こるタイプの肝臓癌を指す。巨視的には、ＨＣＣは、結節または浸潤性腫瘍として現れる。結節型は、単発性（大きい塊）または多数（肝硬変の合併症として発展した際）であることも可能である。腫瘍結節は、円から楕円、グレイまたは緑（腫瘍が胆汁を産生する場合）であり、境界が明確であるが、被包されていない。びまん型は、境界が不明瞭であり、そして門脈または肝静脈（稀）に浸潤する。微視的には、ＨＣＣの４つの構造および細胞型（パターン）がある：線維層板型、偽腺性（アデノイド）、多形性（巨細胞）および明細胞がある。よく分化した型では、腫瘍細胞は肝細胞に似ており、柵状織、索状物（ｃｏｒｄ）および巣を形成し、そして細胞質中に胆汁色素を含有することも可能である。あまり分化していない型では、悪性上皮細胞は、非粘着性（ｄｉｓｃｏｈｅｓｉｖｅ）で、多形性で、未分化の巨細胞である。腫瘍は、間質がわずかであり、および血管形成が劣っているため、中央壊死を有する。
１つの態様において、ウイルス性障害は胆管細胞癌である。一般の当業者が認識するであろうように、「胆管細胞癌」は、本発明の背景において、胆汁を肝臓から小腸に排出する胆管で生じる、突然変異上皮細胞（または上皮分化の特徴を示す細胞）で構成される癌の型を指す。
本明細書に開示する多様な態様は、ＨＢＶ感染に関連するウイルス性障害に関するが、本発明は、これらの例示的な態様に限定されない。それよりも、本発明は、ウイルス感染に関連する任意の障害に適用可能である。
一般的に言及すると、本発明の１つの側面は、ターゲット配列の異常なレベルの発現産物に関連する状態に罹患したかまたは感受性がある哺乳動物を治療する方法であって、該哺乳動物に、ターゲット配列をターゲティングするオリゴマーの療法的有効量を投与する工程を含む、前記方法に関する。本発明のオリゴマーは、１またはそれより多いＬＮＡ単位を含むことも可能である。本発明記載のオリゴマー、コンジュゲートまたは薬学的組成物を、典型的には有効量で投与する。
本発明の興味深い側面は、本明細書に言及するような疾患、障害または状態の治療用の薬剤調製のための、本明細書に定義するようなオリゴマー（化合物）または本明細書に定義するようなオリゴマー・コンジュゲートの使用に関する。
本発明の方法は、好ましくは、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの異常なレベルによって引き起こされる疾患に対する治療または予防のために使用される。
言い換えると、いくつかの態様において、本発明は、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの異常なレベルを治療するための方法であって、その必要がある患者に、本発明のオリゴマー、または本発明のコンジュゲートまたは本発明の薬学的組成物を投与する工程を含む、前記方法にさらに関する。
本発明はまた、薬剤として使用するための、本明細書に定義するようなオリゴマー、組成物またはオリゴマー・コンジュゲートにも関する。
本発明はさらに、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの異常なレベルあるいはＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの突然変異型（例えばアレル変異体、例えば本明細書に言及する疾患の１つと関連するもの）の発現の治療用の薬剤製造のための、本明細書に定義するような化合物、組成物、またはコンジュゲートの使用にさらに関する。
さらに、本発明は、本明細書に言及するものなどの疾患または状態に罹患した被験体を治療する方法に関する。
治療が必要な患者は、疾患または障害に罹患しているかまたは罹患する可能性が高い患者である。
オリゴマー例
本発明で使用するためのオリゴマーの例を以下の表に提示する。
表１ ＬＮＡ修飾オリゴマーを設計するために用いたオリゴヌクレオチド配列モチーフ
該表は、遺伝子型Ａ、Ｂ、ＣおよびＤのすべての公表された全長遺伝子型配列（ＧｅｎＢａｎｋ）内で保存される部分を示し、これは、所定のオリゴマーモチーフが、遺伝子型内のターゲット配列の所定の分画に１００％相補的であろうことを意味する。すべてのオリゴマーモチーフが、遺伝子型Ａ、Ｂ、ＣおよびＤ内のほぼすべての配列を本質的にターゲティングし、それによって、これらの４つの遺伝子型のいずれに感染した個体の治療も可能になるように、モチーフを選択した。
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表２ 表１由来のオリゴマーモチーフのサブセット
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表３ ＬＮＡオリゴマー
大文字はベータ−Ｄ−オキシＬＮＡを示し、Ｃ ＬＮＡは５−メチルＣ ＬＮＡであり、小文字はＤＮＡを示し、ｍｃは５−メチルシトシンＤＡＮＡを示し、すべてのヌクレオシド間連結はホスホロチオエート・ヌクレオシド間連結である。
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表４ Ｃ６アミノリンカーおよび切断可能ｃａホスホジエステル連結を通じてオリゴマーに連結されたＧａｌＮＡｃ２コンジュゲート部分を含むＬＮＡオリゴマー。ＧａｌＮＡｃ２コンジュゲート部分はまた、他のＧａｌＮＡｃコンジュゲート部分またはステロール部分で置換可能である。これらのオリゴマーが基づくオリゴマー配列モチーフは表２および３由来のサブセットである。
大文字はベータ−Ｄ−オキシＬＮＡを示し、小文字はＤＮＡを示し、ｍｃ／ｍＣは５−メチルシトシンＤＮＡ／ＬＮＡを示し、ｓはホスホロチオエートヌクレオシド間連結を示す。明記されない場合、連結はホスホジエステルヌクレオシド間連結である。
Figure 0006306745
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ＧａｌＮＡｃとのコンジュゲート化前に、表４のＬＮＡオリゴマーは、ＡＭ−Ｃ６ ｃａ−オリゴマーと示され、式中、ＡＭ−Ｃ６はコンジュゲート化の用意が出来たアミノリンカーを示し、そしてｃａは、切断可能ホスホジエステル連結である。これらのオリゴマーは、優先出願ＧＢ１４０８６２３．５の表４に援用される。
態様
番号付けされた段落で示す、本発明の以下の態様は、本明細書記載の他の態様と組み合わせて使用可能である：
１． ウイルス性障害の治療において使用するためのオリゴマー・コンジュゲートであって：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）肝臓に前記の第一のオリゴマーを送達するためのキャリアー構成要素
を含む、前記オリゴマー・コンジュゲート。
２． 前記キャリアー構成要素が、前記オリゴマー・コンジュゲートの投与によって治療しようとする被験体の肝臓に、前記オリゴマーを送達することが可能な、段落１記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３． 前記キャリアー構成要素が、前記オリゴマー・コンジュゲートの投与によって治療しようとする被験体の肝細胞に、前記オリゴマーを送達することが可能な、段落１または段落２記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４． 前記キャリアー構成要素が炭水化物コンジュゲート部分である、段落１〜３のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
５． 前記キャリアー構成要素がアシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰ−Ｒ）ターゲティング部分である、段落１〜４のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
６． 前記炭水化物コンジュゲート部分またはＡＳＧＰ−Ｒターゲティング部分が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択される、段落４または５に記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
７． 前記キャリアー構成要素が、２〜４の末端ガラクトース誘導体、各ガラクトース誘導体を分岐点基に連結する親水性スペーサーを含む、ＧａｌＮＡｃクラスターである、段落１〜６のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
８． ガラクトース誘導体がＧａｌＮＡｃであり、スペーサーがＰＥＧスペーサーであり、そして分岐点基が、２またはそれより多いアミノ基を含むペプチドを含み、例えばジ−リジンまたはトリ−リジンである、段落７記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
９． 前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２である、段落１〜８のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
１０． 前記の第一のオリゴマー領域が、ターゲット配列に少なくとも８０％の相補性を有する、段落１〜９のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
１１． 前記の第一のオリゴマー領域が１またはそれより多いＬＮＡ単位を含む、段落１〜１０のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
１２． 前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーである、段落１〜１１のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
１３． 前記の第一のオリゴマー領域が、各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含む、段落１〜１２のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
１４． 前記の第一のオリゴマー領域が、モチーフ：２−８−２、３−８−３、２−８−３、３−８−２、２−９−２、３−９−３、２−９−３、３−９−２、２−１０−２、３−１０−３、３−１０−２、２−１０−３のいずれか１つを含み、第一の数字が５’ ＬＮＡウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字がギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字がＬＮＡウィング領域中の３’ ＬＮＡ単位の数である、段落１〜１３のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
１５． 前記の第一のオリゴマー領域が、長さ８〜３０ヌクレオチドである、段落１〜１４のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
１６． 前記の第一のオリゴマー領域が、長さ１０〜２０ヌクレオチドである、段落１〜１５のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
１７． 前記の第一のオリゴマー領域が、長さ１０〜１６ヌクレオチドである、段落１〜１６のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
１８． 前記の第一のオリゴマー領域が、長さ１０〜１４ヌクレオチドである、段落１〜１７のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
１９． 前記の第一のオリゴマー領域が、ターゲット配列に結合する、段落１〜１８のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
２０． 前記の第一のオリゴマー領域が、ターゲット配列の発現、複製または翻訳のいずれか１つまたはそれより多くを阻害可能である、段落１〜１９のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
２１． 前記の第一のオリゴマー領域が、ターゲット配列の発現を阻害可能である、段落１〜２０のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
２２． 前記ターゲット配列が、遺伝子またはｍＲＮＡである、段落１〜２１のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
２３． 前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇをコードする遺伝子またはｍＲＮＡあるいはその天然存在変異体の少なくとも部分を含む、段落１〜２２のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
２４． 前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇをコードする遺伝子またはｍＲＮＡあるいはその天然存在変異体である、段落１〜２３のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
２５． 前記ターゲット配列が、配列番号１および／または配列番号２に示す配列、あるいはそれに対して少なくとも８０％の同一性、好ましくはそれに対して少なくとも８５％の同一性、好ましくはそれに対して少なくとも９０％の同一性、好ましくはそれに対して少なくとも９５％の同一性を有する配列内にある、段落１〜２４のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
２６． 前記ターゲット配列が、配列番号１および配列番号２として示す配列内にある、段落１〜２４のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
２７． 前記ターゲット配列が、ＨＢＶ遺伝子型Ａ〜Ｈのいずれか１つまたはそれより多くと少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９８％または少なくとも９９％の同一性を有する、段落１〜２６のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
２８． 前記ターゲット配列が：
配列番号３の
１２６４〜１２７８；
１５３０〜１５４４；
１５５１〜１５６６；
１５７７〜１５９８；
６９１〜７０６；
６７０〜６８４
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される、段落１〜２７のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
２９． 前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づく、段落１〜２８のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３０． 前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列に基づく、
ここで、大文字はＬＮＡ単位を示し、そして小文字はＤＮＡ単位を示す
段落１〜２９のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３１． 前記のオリゴマー・コンジュゲートが：
Figure 0006306745
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される
ここで、大文字はベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を示し；小文字はＤＮＡ単位を示し；下付き「ｓ」はホスホロチオエート連結を示し；上付きｍは５−メチルシトシン塩基を含有するＤＮＡまたはベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を示し；ＧＮ２−Ｃ６はＣ６リンカーを含むＧａｌＮＡｃ２キャリアー構成要素を示す
段落１〜３０のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３２． 前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づく、段落１〜２９のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３３． 前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づく、段落１〜２９のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３４． 構造：
キャリアー構成要素−Ｌ１−第一のオリゴマー領域
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分である
を有するかまたは含む、あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートが、構造：
第一のオリゴマー領域−Ｌ２−キャリアー構成要素
式中、Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分である
を有するかまたは含む
段落１〜３３のいずれか１つに記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３５． 構造：
キャリアー構成要素−Ｌ１−第一のオリゴマー領域
式中、Ｌ１は場合によるリンカーである
を有するかまたは含む
段落１〜３４のいずれか１つに記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３６． 前記リンカー１が存在する、段落３４または段落３５記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３７． 前記キャリアー構成要素が、前記オリゴマーの５’端に連結される、好ましくはコンジュゲート化される、段落１〜３６のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３８． リンカー基または分枝領域が、生理学的に不安定なリンカー基または生理学的に不安定な分枝領域または生理学的に不安定な束縛分子または生理学的に不安定な架橋部分である、段落３４〜３７記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
３９． 生理学的に不安定なリンカー基がヌクレアーゼ感受性リンカーである、段落３８記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４０． 生理学的に不安定なリンカーがさらに、Ｃ６〜Ｃ１２アミノアルキル基にコンジュゲート化される、段落３８または３９記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４１． ターゲット配列を調節可能な第二のオリゴマー領域をさらに含む、段落１〜４０のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４２． 第一のオリゴマー領域および第二のオリゴマー領域の各々が、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節可能である、段落４１記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４３． 第一のオリゴマー領域および第二のオリゴマー領域の各々が、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節可能であり；前記ターゲット配列が異なる、段落３１または４２のいずれか１つに記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４４． 前記オリゴマー・コンジュゲートが、構造：
キャリアー構成要素−Ｌ１−第一のオリゴマー領域−Ｌ２−第二のオリゴマー領域
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１およびＬ２は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含み；あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートが、構造：
第一のオリゴマー領域−Ｌ２−第二のオリゴマー領域−Ｌ３−キャリアー構成要素
式中、Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ３は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２およびＬ３は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含み；あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートが、構造：
キャリアー構成要素１−Ｌ１−第一のオリゴマー領域−Ｌ２−第二のオリゴマー領域−Ｌ３−キャリアー構成要素２
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ３は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１、Ｌ２およびＬ３は同じであってもまたは異なってもよく
キャリアー構成要素１およびキャリアー構成要素２は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含み；あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートが、構造：
第一のオリゴマー領域−Ｌ１−キャリアー構成要素１−Ｌ２−第二のオリゴマー領域
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１およびＬ２およびＬ３は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含み；あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートが、構造：
第一のオリゴマー領域−Ｌ１−キャリアー構成要素１−Ｌ２−第二のオリゴマー領域−Ｌ３−キャリアー構成要素２
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ３は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１およびＬ２は同じであってもまたは異なってもよく
キャリアー構成要素１およびキャリアー構成要素２は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含み；あるいは
前記オリゴマー・コンジュゲートが、構造：
キャリアー構成要素１−Ｌ１−第一のオリゴマー領域−Ｌ２−キャリアー構成要素２−Ｌ３−第二のオリゴマー領域−Ｌ４−キャリアー構成要素３
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ３は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１、Ｌ２およびＬ３は同じであってもまたは異なってもよく
キャリアー構成要素１および、キャリアー構成要素２およびキャリアー構成要素３は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含む
段落４１〜４３のいずれか１つに記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４５． 前記オリゴマー・コンジュゲートが、構造：
キャリアー構成要素−Ｌ１−第一のオリゴマー領域−Ｌ２−第二のオリゴマー領域
式中、Ｌ１は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ２は場合によるリンカーまたは分枝領域または束縛分子または架橋部分であり、
Ｌ１およびＬ２は同じであってもまたは異なってもよい
を有するかまたは含む
段落３９〜４３のいずれか１つに記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４６． 前記リンカー１が存在する、段落４５記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４７． 前記リンカー２が存在する、段落４５または段落４６記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４８． 前記キャリアー構成要素が、前記オリゴマーの５’端に連結、好ましくはコンジュゲート化している、段落４１〜４６のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
４９． 第一のオリゴマー領域および第二のオリゴマー領域の各々が、リンカーまたは分枝領域によって、連結、好ましくはコンジュゲート化している、段落４１〜４８のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
５０． 第一のオリゴマー領域および第二のオリゴマー領域の各々が、生理学的に不安定なリンカー基または生理学的に不安定な分枝領域によって、連結、好ましくはコンジュゲート化している、段落４１〜４９のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
５１． 前記ウイルス性障害がＢ型肝炎またはＨＢＶに関連する障害である、段落１〜５０のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
５２． 前記ウイルス性障害が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇの発現または過剰発現と関連する、段落１〜５１のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
５３． 前記オリゴマー・コンジュゲートが皮下投与される、段落１〜５２のいずれか記載の使用のためのオリゴマー・コンジュゲート。
５４． ウイルス性障害の治療において使用するための組成物であって、段落１〜５３のいずれか１つに定義するようなオリゴマー・コンジュゲートおよび少なくとも１つのさらなる異なるオリゴヌクレオチドを含む、前記組成物。
５５． 前記のさらなる異なるオリゴヌクレオチドの少なくとも１つがオリゴマー・コンジュゲートである、段落５４記載の使用のための組成物。
５６． 前記のさらなる異なるオリゴヌクレオチドの各々がオリゴマー・コンジュゲートである、段落５４または段落５５記載の使用のための組成物。
５７． 前記のさらなる異なるオリゴヌクレオチドの各々が、ＨＢＶにおけるターゲット配列を調節可能である、段落５４〜５６のいずれか１つに記載の使用のための組成物。
５８． 前記のさらなる異なるオリゴヌクレオチドの少なくとも１つが、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節可能である、段落５４〜５７のいずれか１つに記載の使用のための組成物。
５９． 前記のさらなる異なるオリゴヌクレオチドの少なくとも１つが、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節可能であり；そして前記のさらなる異なるオリゴヌクレオチドの少なくとも１つが、段落１〜５３のいずれか１つに定義するようなオリゴマー・コンジュゲートによってターゲティングされるものとは異なる、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節可能である、段落５４〜５８のいずれか１つに記載の使用のための組成物。
６０． 前記の異なるオリゴヌクレオチドの各々が、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節可能である、段落５４〜５９のいずれか１つに記載の使用のための組成物。
６１． 前記のさらなる異なるオリゴヌクレオチドの各々が、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節可能であり；そして前記のさらなる異なるオリゴヌクレオチドの各々が、段落１〜５３のいずれか１つに定義するようなオリゴマー・コンジュゲートによってターゲティングされるものとは異なる、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節可能である、段落５４〜６０のいずれか１つに記載の使用のための組成物。
６２． ウイルス性障害の治療に適したオリゴマー・コンジュゲートであって：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）肝臓に前記の第一のオリゴマーを送達するためのキャリアー構成要素
を含む、前記オリゴマー・コンジュゲート。
６３． 前記オリゴマーが段落１〜５３のいずれか１つに定義するとおりである、段落６２記載のオリゴマー・コンジュゲート。
６４． ウイルス性障害の治療に適した組成物であって、前記組成物が、オリゴマー・コンジュゲートおよび少なくとも１つのさらなる異なるオリゴヌクレオチドを含み；前記オリゴマー・コンジュゲートが：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）肝臓に前記の第一のオリゴマーを送達するためのキャリアー構成要素
を含む、前記組成物。
６５． 前記オリゴマー・コンジュゲートが、段落１〜５３のいずれか１つまたは段落６２〜６３のいずれか１つに定義するようなオリゴマー・コンジュゲートである、段落６４記載の組成物。
６６． 前記のさらなる異なるオリゴヌクレオチドが、段落６２〜６３のいずれか１つに定義するようなさらなる異なるオリゴヌクレオチドである、段落６４または段落６５に記載の組成物。
６７． ウイルス性障害を治療するため、ＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節可能である：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づくオリゴマー。
６８． 前記オリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づく、段落６７のオリゴマー。
６９． 前記オリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づく、段落６７のオリゴマー。
７０． 前記オリゴマーが１またはそれより多いＬＮＡ単位を含む、段落６７〜６９のいずれか１つに記載のオリゴマー。
７１． 前記オリゴマーがギャップマーである、段落６７〜７０のいずれかに記載のオリゴマー。
７２． 前記オリゴマーが、各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含む、段落６７〜７１のいずれかに記載のオリゴマー。
７３． 前記オリゴマーが、モチーフ：２−８−２、３−８−３、２−８−３、３−８−２、２−９−２、３−９−３、２−９−３、３−９−２、２−１０−２、３−１０−３、３−１０−２、２−１０−３のいずれか１つを含み、第一の数字がＬＮＡウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字がギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字がＬＮＡウィング領域中のＬＮＡ単位の数である、段落６７〜７２のいずれか記載のオリゴマー。
７４． 前記の第一のオリゴマー領域が長さ１０〜１８ヌクレオチドである、段落６７〜７３のいずれか記載のオリゴマー。
７５． 前記の第一のオリゴマー領域が長さ１０〜１６ヌクレオチドである、段落６７〜７４のいずれか記載のオリゴマー。
７６． 前記の第一のオリゴマー領域が長さ１０〜１４ヌクレオチドである、段落６７〜７５のいずれか記載のオリゴマー。
７７． 以下の配列の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列：
Figure 0006306745
に基づく、
ここで、大文字はアフィニティ増進ヌクレオチド類似体を示し、そして小文字はＤＮＡ単位を示す
段落６７〜７６のいずれか１つに記載のオリゴマー。
７８．以下の配列の任意の１またはそれより多くからなる群より選択される配列：
Figure 0006306745
Figure 0006306745
に基づく、
ここで、大文字はベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を示し；小文字はＤＮＡ単位を示し；下付き「ｓ」はホスホロチオエート連結を示し；上付きｍは５−メチルシトシン塩基を含有するＤＮＡまたはベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を示し；ＡＭ−Ｃ６はアミノ−Ｃ６リンカーであり；ここで５’末端基「ＡＭ−Ｃ６ｃ ａ」は場合による
段落６７〜７７のいずれか記載のオリゴマー。
７９． 医学的治療において使用するための、段落６７〜７８のいずれかに定義するようなオリゴマー。
８０． ウイルス性障害の治療において使用するための、段落６７〜７９のいずれかに定義するようなオリゴマー。
８１． 段落１〜５３のいずれか１つに定義するとおりである、段落７９または段落８０に定義するようなオリゴマー。
８２． 前記障害が、段落１〜５３のいずれか１つに定義するとおりである、段落７９または段落８１に定義するようなオリゴマー。
８３． ウイルス性障害の治療に適した組成物であって、前記組成物がオリゴマーおよび少なくとも１つのさらなる異なるオリゴヌクレオチドを含み；前記オリゴマーが、前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節可能である少なくとも１つの第一のオリゴマー領域を含む、前記組成物。
８４． 前記オリゴマーが、段落６７〜８２のいずれか１つに定義するようなオリゴマーである、段落８３記載の組成物。
８５． 前記の少なくとも１つのさらなる異なるオリゴヌクレオチドが、段落５４〜６１のいずれか１つに定義するようなさらなる異なるオリゴヌクレオチドである、段落８３または段落８４に記載の組成物。
８６． ウイルス性障害を治療するための方法であって、治療の必要がある被験体に、段落６２または段落６３記載のオリゴマー・コンジュゲートまたは段落１〜５２のいずれか１つに定義するようなオリゴマー・コンジュゲートの有効量を投与する工程を含む、前記方法。
８７． ウイルス性障害を治療するための方法であって、治療の必要がある被験体に、段落６４〜６６のいずれか１つに記載の組成物または段落５４〜６１のいずれか１つに定義するような組成物または段落８３〜８５のいずれか１つに定義するような組成物の有効量を投与する工程を含む、前記方法。
８８． ウイルス性障害を治療するための方法であって、治療の必要がある被験体に、段落６７〜８２のいずれか１つに記載のオリゴマーの有効量を投与する工程を含む、前記方法。
８９． 段落６２または段落６３記載のオリゴマー・コンジュゲートあるいは段落１〜５３のいずれか１つに定義するようなオリゴマー・コンジュゲート；および１またはそれより多い薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントを含む、薬学的組成物。
９０． 段落６４〜６６のいずれか１つに記載の組成物または段落５４〜６１のいずれか１つに定義するような組成物または段落８３〜８５のいずれか１つに定義するような組成物；および１またはそれより多い薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントを含む、薬学的組成物。
９１． 段落６７〜８２のいずれか１つに記載のオリゴマー；および１またはそれより多い薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントを含む、薬学的組成物。
段落８９〜９１のいずれか１つに記載の薬学的組成物およびさらなる薬学的実体を含む、薬剤系。
９２． 段落１〜５２のいずれか１つに記載のオリゴマー・コンジュゲートを製造する方法であって、段落１〜５３のいずれか１つに定義するような１またはそれより多いオリゴマーと、段落１〜５３のいずれか１つに定義するようなキャリアー構成要素をコンジュゲート化する工程を含む、前記方法。
９３． 段落６４〜６６のいずれか１つに記載する組成物を製造する方法であって、段落１〜５３のいずれか１つに定義するようなオリゴマー・コンジュゲートと、薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントを混合する工程を含む、前記方法。
９４． 段落９１記載の組成物を製造する方法であって、段落６７〜８２のいずれか１つに定義するようなオリゴマーと、薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントを混合する工程を含む、前記方法。
９５． オリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、モチーフ：３−１０−３、３−１０−２、３−９−３、３−９−２、３−８−３、３−８−２のいずれか１つを含み、第一の数字はウィング領域中の修飾ヌクレオチドの数であり、好ましくは少なくとも１つがＬＮＡ単位であり、好ましくはすべてがＬＮＡ単位であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はウィング領域の修飾ヌクレオチドの数であり、好ましくは少なくとも１つがＬＮＡ単位であり、好ましくはすべてがＬＮＡ単位である、先行する段落のいずれか１つのとおりである、本発明。
９６． 実質的に本明細書に記載するとおりであり、そして実施例に関連する、オリゴマー・コンジュゲート。
９７． 実質的に本明細書に記載するとおりであり、そして実施例に関連する、組成物。
９８． 実質的に本明細書に記載するとおりであり、そして実施例に関連する、オリゴマー。
９９． 実質的に本明細書に記載するとおりであり、そして実施例に関連する、方法。
特定の態様
本発明は、ウイルス性障害の治療において使用するためのオリゴマー・コンジュゲートに関する。オリゴマー・コンジュゲートは：ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）のＨＢｘまたはＨＢｓＡｇにおけるターゲット配列を調節することが可能なオリゴマー；およびｂ）前記オリゴマーにコンジュゲート化された、キャリアー構成要素を含む。好ましくは、キャリアー構成要素は、前記の第一のオリゴマーを肝臓に送達するためのものである。
本発明の特定の態様に関する好ましい側面をここで提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療において使用するためのオリゴマー・コンジュゲートであって：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ８〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含む、
前記オリゴマー・コンジュゲートを提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適したオリゴマー・コンジュゲートであって：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ８〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含む、
前記オリゴマー・コンジュゲートを提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適した組成物であって、前記組成物が、オリゴマー・コンジュゲートおよび少なくとも１つのさらなる異なるオリゴヌクレオチドを含み；前記オリゴマー・コンジュゲートが：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ８〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含む、
前記組成物を提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療において使用するためのオリゴマー・コンジュゲートであって：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ８〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づく、
前記オリゴマー・コンジュゲートを提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適したオリゴマー・コンジュゲートであって：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ８〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づく、
前記オリゴマー・コンジュゲートを提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適した組成物であって、前記組成物がオリゴマー・コンジュゲートおよび少なくとも１つのさらなる異なるオリゴヌクレオチドを含み；前記オリゴマー・コンジュゲートが：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ８〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づく、
前記組成物を提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療において使用するためのオリゴマー・コンジュゲートであって、前記オリゴマー・コンジュゲートが：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ１２〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含み；
オリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、モチーフ：３−１０−３、３−１０−２、３−９−３、３−９−２、３−８−３、３−８−２のいずれか１つを含み、第一の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数である、
前記オリゴマー・コンジュゲートを提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適したオリゴマー・コンジュゲートであって、前記オリゴマー・コンジュゲートが：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ１２〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含み；
オリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、モチーフ：３−１０−３、３−１０−２、３−９−３、３−９−２、３−８−３、３−８−２のいずれか１つを含み、第一の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数である、
前記オリゴマー・コンジュゲートを提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療のために適した組成物であって、前記組成物がオリゴマー・コンジュゲートおよび少なくとも１つのさらなる異なるオリゴヌクレオチドを含み；前記オリゴマー・コンジュゲートが：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ１２〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含み；
オリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、モチーフ：３−１０−３、３−１０−２、３−９−３、３−９−２、３−８−３、３−８−２のいずれか１つを含み、第一の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数である、
前記組成物を提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療において使用するためのオリゴマー・コンジュゲートであって：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ１２〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づき；
オリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、モチーフ：３−１０−３、３−１０−２、３−９−３、３−９−２、３−８−３、３−８−２のいずれか１つを含み、第一の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数である、
前記オリゴマー・コンジュゲートを提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適したオリゴマー・コンジュゲートであって：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ１２〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づき；
オリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、モチーフ：３−１０−３、３−１０−２、３−９−３、３−９−２、３−８−３、３−８−２のいずれか１つを含み、第一の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数である、
前記オリゴマー・コンジュゲートを提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適した組成物であって、前記組成物がオリゴマー・コンジュゲートおよび少なくとも１つのさらなる異なるオリゴヌクレオチドを含み；前記オリゴマー・コンジュゲートが：
ａ）前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域；および
ｂ）キャリアー構成要素
を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が長さ１２〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記キャリアー構成要素が、炭水化物コンジュゲート部分であり、好ましくは前記キャリアー構成要素が、ガラクトース、ガラクトサミン、Ｎ−ホルミル−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ−プロピオニル−ガラクトサミン、Ｎ−ｎ−ブタノイル−ガラクトサミン、Ｎ−イソブタノイルガラクトース−アミンあるいは任意の１またはそれより多いそのクラスターからなる群より選択され；
好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃまたはＧａｌＮＡｃクラスターを含み；好ましくは前記キャリアー構成要素がＧａｌＮＡｃ２であり；
前記ターゲット配列が、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇあるいはその天然存在変異体をコードする遺伝子またはｍＲＮＡの少なくとも部分を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づき；
オリゴマー・コンジュゲートのオリゴマー構成要素が、モチーフ：３−１０−３、３−１０−２、３−９−３、３−９−２、３−８−３、３−８−２のいずれか１つを含み、第一の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数である、
前記組成物を提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療のためのオリゴマーであって、
前記オリゴマーが、前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域を含み；そして前記の第一のオリゴマー領域が長さ１２〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づき；
オリゴマーが、モチーフ：３−１０−３、３−１０−２、３−９−３、３−９−２、３−８−３、３−８−２のいずれか１つを含み、第一の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数である、
前記オリゴマーを提供する。
１つの側面において、本発明は、ウイルス性障害の治療に適したオリゴマーであって、
前記オリゴマーが、前記ウイルス性障害を治療するため、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）、好ましくはＨＢＶのＨＢｘまたはＨＢｓＡｇのターゲット配列を調節することが可能な、少なくとも１つの第一のオリゴマー領域を含み；そして前記の第一のオリゴマー領域が長さ１２〜１６ヌクレオチドであり；
前記の第一のオリゴマー領域がギャップマーであり、好ましくは前記の第一のオリゴマー領域が各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、好ましくは各ウィングが独立に１またはそれより多いＬＮＡ単位を含み；
前記の第一のオリゴマー領域が：
Figure 0006306745
の任意の１またはそれより多くからなる群より選択されるコア・モチーフに基づき；
オリゴマーが、モチーフ：３−１０−３、３−１０−２、３−９−３、３−９−２、３−８−３、３−８−２のいずれか１つを含み、第一の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数であり、第二の数字はギャップ領域中のヌクレオチドの数であり、そして第三の数字はウィング領域中のＬＮＡ単位の数である、
前記オリゴマーを提供する。
材料および方法
ＨＢｓＡｇおよびＨＢｅＡｇ検出
ＨＢｓＡｇ化学発光イムノアッセイ（ＣＬＩＡ）およびＨＢｅＡｇ ＣＬＩＡキット（それぞれ、Ａｕｔｏｂｉｏ ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ Ｃｏ． Ｌｔｄ．、中国・鄭州、それぞれ、カタログ番号ＣＬ０３１０−２およびＣＬ０３１２−２）を用いて、製造者のプロトコルにしたがって、感染ＡＡＶ−ＨＢＶマウス血清において、血清ＨＢｓＡｇおよびＨＢｅＡｇレベルを測定した。簡潔には、５０μｌの血清をそれぞれの抗体でコーティングしたマイクロタイタープレートにトランスファーし、そして５０μｌの酵素コンジュゲート試薬を添加した。プレートを室温、振盪装置上で６０分間インキュベーションした後、自動洗浄装置を用いて、すべてのウェルを洗浄緩衝液で６回洗浄した。２５μｌの基質Ａおよび次いで２５μｌの基質Ｂを各ウェルに添加した。プレートをＲＴで１０分間インキュベーションした後、Ｅｎｖｉｓｉｏｎ発光読み取り装置を用いて、発光を測定した。ＨＢｓＡｇは単位ＩＵ／ｍｌで得られ；式中、１ｎｇ ＨＢｓＡｇ＝１．１４ＩＵである。ＨＢｅＡｇは、単位ＮＣＵ／ｍｌ血清で得られる。
ＨＢＶ ＤＮＡ抽出およびｑＰＣＲ
最初に、マウス血清を、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）で１０倍に（１：１０）希釈した。ＭａｇＮＡ Ｐｕｒｅ ９６（Ｒｏｃｈｅ）ロボットを用いてＤＮＡを抽出した。希釈血清５０μｌを、プロセシング・カートリッジ中で、２００μｌ ＭａｇＮＡ Ｐｕｒｅ ９６外部溶解緩衝液（Ｒｏｃｈｅ、カタログ番号０６３７４９１３００１）と混合し、そして１０分間インキュベーションした。次いで、「ＭａｇＮＡ Ｐｕｒｅ ９６ ＤＮＡおよびウイルス核酸小容量キット」（Ｒｏｃｈｅ、カタログ番号０６５４３５８８００１）および「ウイルスＮＡ血漿ＳＶ外部溶解２．０」プロトコルを用いて、ＤＮＡを抽出した。ＤＮＡ溶出体積は５０μｌであった。
Ｔａｑｍａｎ ｑＰＣＲ装置（ＶｉｉＡ７、Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を用いて、抽出したＨＢＶ ＤＮＡの定量化を行った。各ＤＮＡ試料を二つ組でＰＣＲで試験した。３８４ウェルプレート中、１０μｌ ＴａｑＭａｎ遺伝子発現マスター混合物（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、カタログ番号４３６９０１６）、０．５μｌ Ｐｒｉｍｅ Ｔｉｍｅ ＸＬ ｑＰＣＲプライマー／プローブ（ＩＤＴ）および４．５μｌ再蒸留水を含有するＰＣＲマスターミックス１５μｌに、５μｌのＤＮＡ試料を添加し、そして以下の設定を用いてＰＣＲを行った：ＵＤＧインキュベーション（２分間、５０℃）、酵素活性化（１０分間、９５℃）、およびＰＣＲ（１５秒間９５℃の変性、および１分間６０℃のアニーリングおよび伸長の４０周期）。ＶｉｉＡ７ソフトウェアによるＨＢＶプラスミドＤＮＡ標準曲線に基づいて、Ｃｔ値からＤＮＡコピー数を計算した。
ＴａｑＭａｎプライマーおよびプローブ（ＩＤＴ）の配列：
Figure 0006306745
組織特異的ｉｎ ｖｉｔｒｏリンカー切断アッセイ
適切な組織（例えば肝臓または腎臓）のホモジネートおよび血清を用いて、試験しようとする生理学的に不安定なリンカー（例えばＤＮＡホスホジエステルリンカー（ＰＯリンカー））を含むＦＡＭ標識オリゴマーを、ｉｎ ｖｉｔｒｏ切断に供する。
適切な動物（例えばマウス、サル、ブタまたはラット）から組織および血清試料を収集し、そしてホモジナイズ緩衝液（０．５％Ｉｇｅｐａｌ ＣＡ−６３０、２５ｍＭ Ｔｒｉｓ ｐＨ８．０、１００ｍＭ ＮａＣｌ、ｐＨ８．０（１Ｎ ＮａＯＨで調整））中でホモジナイズする。組織ホモジネートおよび血清に、２００μｇ／ｇ組織の濃度まで、オリゴマーをスパイク処理する。試料を３７℃で２４時間インキュベーションし、そしてその後、フェノール−クロロホルムで試料を抽出する。Ｄｉｏｎｅｘ ＤＮＡｐａｃ ｐ−１００カラムおよび１０ｍＭ〜１Ｍの範囲の過塩素酸ナトリウムｐＨ７．５勾配を用いて、Ｄｉｏｎｅｘ Ｕｌｔｉｍａｔｅ ３０００上で、溶液をＡＩＥ ＨＰＬＣ分析に供する。６１５ｎｍでの蛍光検出装置および２６０ｎｍでのｕｖ検出装置両方を用いて、標準に対して、切断および非切断オリゴマーの量を決定する。
Ｓ１ヌクレアーゼ切断アッセイ
Ｓ１ヌクレアーゼ感受性リンカー（例えばＤＮＡホスホジエステルリンカー（ＰＯリンカー））を含むＦＡＭ標識オリゴマーを、Ｓ１ヌクレアーゼ抽出物または血清において、ｉｎ ｖｉｔｒｏ切断に供する。
１００μＭのオリゴマーを、ヌクレアーゼ緩衝液（６０Ｕ ｐｒ. １００μＬ）中のＳ１ヌクレアーゼによる２０〜１２０分間のｉｎ ｖｉｔｒｏ切断に供する。ＥＤＴＡを緩衝溶液に添加することによって、酵素活性を停止する。Ｄｉｏｎｅｘ ＤＮＡｐａｃ ｐ−１００カラムおよび１０ｍＭ〜１Ｍの範囲の過塩素酸ナトリウムｐＨ７．５勾配を用いて、Ｄｉｏｎｅｘ Ｕｌｔｉｍａｔｅ ３０００上で、溶液をＡＩＥ ＨＰＬＣ分析に供する。６１５ｎｍでの蛍光検出装置および２６０ｎｍでのｕｖ検出装置両方を用いて、標準に対して、切断および非切断オリゴマーの量を決定する。
実施例１ コンジュゲートの構築
ＭｅｒＭａｄｅ１２またはＯｌｉｇｏＭａｋｅｒ ＤＮＡ／ＲＮＡ合成装置上、４μｍｏｌのスケールで、ホスホラミダイト・アプローチを用いて、ウリジン普遍的支持体またはＫｉｎｏｖａｔｅのＵｎｙＬｉｎｋｅｒ支持体上で、オリゴヌクレオチドを合成した。合成終了時、水性アンモニアを用いて室温で１〜２時間、オリゴヌクレオチドを固体支持体から切断し、そしてさらに６５℃で１６時間、脱保護した。逆相ＨＰＬＣ（ＲＰ−ＨＰＬＣ）によってオリゴヌクレオチドを精製し、そしてＵＰＬＣによって性質決定し、そしてＥＳＩ−ＭＳによって分子量をさらに確認した。さらなる詳細に関しては、以下を参照されたい。
オリゴヌクレオチドの伸長
アセトニトリル中の０．１Ｍの５’−Ｏ−ＤＭＴ保護ホスホラミダイト溶液および活性化剤としてのアセトニトリル中のＤＣＩ（４，５−ジシアノイミダゾール）（０．２５Ｍ）を用いることによって、β−シアノエチル−ホスホラミダイト（ＤＮＡ−Ａ（Ｂｚ）、ＤＮＡ−Ｇ（ｉｂｕ）、ＤＮＡ−Ｃ（Ｂｚ）、ＤＮＡ−Ｔ、ＬＮＡ−５−メチル−Ｃ（Ｂｚ）、ＬＮＡ−Ａ（Ｂｚ）、ＬＮＡ−Ｇ（ｄｍｆ）、ＬＮＡ−Ｔまたはアミノ−Ｃ６リンカー）のカップリングを行った。水素化キサンチン（アセトニトリル／ピリジン９：１中の０．０１Ｍ）を用いて、ホスホロチオエート連結の誘導のためのチオ化を行った。ＴＨＦ／ピリジン／水７：２：１中の０．０２Ｍヨウ素を用いて、ホスホジエステル連結を導入した。試薬の残りは、オリゴヌクレオチド合成に典型的に用いられるものであった。固相合成後コンジュゲート化のため、商業的に入手可能なＣ６アミノリンカーホスホラミダイトを固相合成の最後の周期で用い、そして脱保護および固体支持体からの切断後、アミノ連結脱保護化オリゴヌクレオチドを単離した。カルボン酸の活性化を通じてコンジュゲートを導入し、そして続いて標準的合成法を用いて、オリゴヌクレオチドの５’端でアミンと反応させた。
ＲＰ−ＨＰＬＣによる精製：
Ｐｈｅｎｏｍｅｎｅｘ Ｊｕｐｉｔｅｒ Ｃ１８ １０μ １５０ｘ１０ｍｍカラム上で、調製用ＲＰ−ＨＰＬＣによって未精製化合物を精製した。０．１Ｍ酢酸アンモニウムｐＨ８およびアセトニトリルを、流速５ｍＬ／分で緩衝剤として用いた。収集した分画を凍結乾燥して、典型的には白色固体として精製化合物を生じた。
略語：
ＤＣＩ：４，５−ジシアノイミダゾール
ＤＣＭ：ジクロロメタン
ＤＭＦ：ジメチルホルムアミド
ＤＭＴ：４，４’−ジメトキシトリチル
ＴＨＦ：テトラヒドロフラン
Ｂｚ：ベンゾイル
Ｉｂｕ：イソブチリル
ＲＰ−ＨＰＬＣ：逆相高性能液体クロマトグラフィ
実施例２ ｉｎ ｖｉｔｒｏ有効性の試験
序論
以下の研究において用いるＨｂｓＡｇアッセイは標準法である。該方法は産生されるウイルスの量を測定する。したがって、該方法は、ＨＢｘまたはＨＢｓＡｇをターゲティングするオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートのため、ウイルスの減少を測定する。さらに、ＨＢｘ転写物をターゲティングするオリゴマーまたはオリゴマー・コンジュゲートはまた、ＨｂｓＡｇ転写物もまたターゲティングするであろう（結果表中の３列および４列もまた参照されたい）。
細胞株
ＨｅｐＧ２．２．１５細胞を、１０％ウシ胎児血清（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）および最終濃度２００ｍｇ／ＬのＧ４１８（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を補充したＤＭＥＭ＋Ｇｌｕｔａｍａｘ−Ｉ培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、米国カリフォルニア州カールスバッド）中で培養し、そして５％ＣＯ２中、３７℃で維持した。
ＨＢｓＡｇアッセイ
ＨｅｐＧ２．２．１５細胞（恒常的ＨＢＶ発現細胞株）を、白色９６ウェルプレート中、１．５ｘ１０４細胞／ウェルで、２つ組で植え付けた。細胞を単一濃度のオリゴマーまたはＤＭＳＯ中の化合物の３倍連続希釈シリーズで処理した。すべてのウェル中の最終ＤＭＳＯ濃度は１％であり、そしてＤＭＳＯを対照として用いた。
ＨＢｓＡｇ化学発光イムノアッセイ（ＣＬＩＡ）キット（Ａｕｔｏｂｉｏ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ Ｃｏ．、中国・鄭州）を用いて、分泌されたＨＢＶ抗原のレベルを半定量的に測定した。検出のため、５０μＬ／ウェルの培養上清を用い、そして製造者の説明書に指示されるように方法を実行した。ＣｅｌｌＴｉｔｅｒ−Ｇｌｏ（Ｐｒｏｍｅｇａ、米国ウィスコンシン州マディソン、カタログ番号Ｇ７５７１）を用いて、細胞傷害性を測定した。Ｅ−ＷｏｒｋＢｏｏｋ Ｓｕｉｔｅ（ＩＤ Ｂｕｓｉｎｅｓｓ Ｓｏｌｕｔｉｏｎｓ Ｌｔｄ．、英国ギルドフォード）を用いて、用量反応曲線を生成し、そしてＩＣ５０およびＣＣ５０値を外挿した。ＩＣ５０およびＣＣ５０は、それぞれ、ＨＢｓＡｇ分泌（ＩＣ５０）および細胞傷害性（ＣＣ５０）が対照に比較して５０％減少する化合物濃度（または馴化培地対数希釈）と定義される。データは、ある濃度範囲で試験した際は、オリゴマーに関するＥＣ５０値として、または単一濃度で試験した場合は、薬剤不含対照試料におけるＨＢｓＡｇレベルのパーセントとしての、上清中のＨＢｓＡｇの絶対レベルとして、提示されうる。
単一濃度処理からの結果
２５μＭオリゴマーの単一用量を用いて、コンジュゲートを含まない総数２９０のオリゴマーをｉｎ ｖｉｔｒｏ有効性アッセイでスクリーニングした。ＨＢＶ抗原（ＨＢｓＡｇ）分泌を１３日後に測定した。以下の表５は、スクリーニングの結果を示す。配列番号２９４〜配列番号３１８のオリゴマーはすべて、対照の４０％未満にＨＢｓＡｇ活性を減少させた。配列番号５８４のオリゴマーは、ＵＳ ８，５９８，３３４における配列番号１６として開示されるオリゴマーに相当する。
２５μＭオリゴマーの単一用量を用いて、さらなる２１３オリゴマーをｉｎ ｖｉｔｒｏ有効性アッセイでスクリーニングした。結果を図５ａに示す。
表５：対照の％としての２５μＭオリゴマーのＨＢｓＡｇ活性
Figure 0006306745
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表５ａ：対照の％としての２５μＭオリゴマーのＨＢｓＡｇ活性
Figure 0006306745
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多数の濃度処理からの結果
ｉｎ ｖｉｔｒｏ有効性アッセイにおいて、３倍連続希釈（２５．０００、８．３３３３、２．７７７８、０．９２５９、０．０３４３、０．０１１４、０．００３８、０．００１３μＭオリゴマー）を用いて、表５由来のオリゴマーの選択を試験して、オリゴマーに関して、ＩＣ５０およびＣＣ５０値を試験した。ＨＢＶ抗原（ＨＢｓＡｇ）分泌を１３日後に測定した。以下の表６は分析結果を示す。配列番号５８５のオリゴマーは、ＵＳ ８，５９８，３３４における配列番号１６として開示されるオリゴマーに相当する。
表６
Figure 0006306745
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実施例３ ｉｎ ｖｉｖｏ ＡＡＶ／ＨＢＶマウスモデル：
抗ＨＢＶ ＬＮＡをＡＡＶ／ＨＢＶマウスモデルにおいて評価することも可能である。このモデルにおいて、ＨＢＶゲノムを所持する組換えアデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）（ＡＡＶ／ＨＢＶ）に感染したマウスは、安定なウイルス血症および抗原血症（ａｎｔｉｇｅｎｉｍｉａ）を３０週より長く維持する（Ｄａｎ Ｙａｎｇら ２０１４ Ｃｅｌｌｕｌａｒ ＆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ １１，７１−７８）。
特定病原体不含のオスＣ５７ＢＬ／６マウス（４〜６週齢）をＳＬＡＣ（中国科学院上海実験動物センター）から購入し、そして動物飼育施設において個々に換気したケージ中で飼育する。ＷｕＸｉ ＩＡＣＵＣ（施設動物飼育使用委員会、ＷＵＸＩ ＩＡＣＵＣプロトコル番号Ｒ２０１３１１２６−マウス）によって示されるような動物飼育および使用に関する指針にしたがう。マウスを３日間新たな環境に慣らし、そして実験設計にしたがってグループ分けする。
組換えＡＡＶ−ＨＢＶを、注射あたり２００μＬのＰＢＳ中で希釈した。この組換えウイルスは、１．３コピーのＨＢＶゲノム（遺伝子型Ｄ、血清型ａｙｗ）を所持する。
第０日、すべてのマウスに２００μＬ ＡＡＶ−ＨＢＶを尾静脈注射する。ＡＡＶ注射の６日、１３日および２０日後、すべてのマウスを血清収集のため、顎下出血させる（０．１ｍｌ血液／マウス）。注射２２日後、安定ウイルス血症のマウスを、５ｍｇ／ｋｇで静脈内投与されたビヒクルまたは抗ＨＢＶ ＬＮＡで処置する。ＬＮＡオリゴマーは非コンジュゲート化またはＧａｌＮＡｃコンジュゲート化されていてもよい。
マウスに週２回２週間投与する。最初のＬＮＡ投与の３日、７日、１０日および１４日後、すべてのマウスを血清収集のため、顎下出血させ（０．１ｍｌ血液／マウス）、血清中のＨＢＶ表面抗原（ＨＢｓＡｇ）、ＨＢＶ ｅ抗原（ＨＢｅＡｇ）、およびＨＢＶゲノムＤＮＡを監視する。
実施例４ 単一用量での週２回注射のｉｎ ｖｉｖｏ研究
実施例３で用意するようなＡＡＶ／ＨＢＶマウスモデルを本研究で用いた。１０のＧａｌＮＡｃコンジュゲート化抗ＨＢＶ ＬＮＡオリゴマーを、安定ウイルス血症を有するＣ５７ＢＬ／６マウスにおいて、対照としての生理食塩水とともに試験した。いくつかのオリゴマーを、１日経口用量として、キロあたり０．０３ｍｇで処方されるように投与された、標準治療ヌクレオシド類似体、エンテカビル（ＥＴＶ）と比較した。
マウスに週２回２週間、第０日、３日、７日および１０日、または第０日、３日、６日および９日に、注射あたり２ｍｇ／ｋｇの用量で、皮下投与した。「材料および方法」セクションに記載する方法を用いて、示す日に、血清中のＨＢＶ表面抗原（ＨＢｓＡｇ）、ＨＢＶ ｅ抗原（ＨＢｅＡｇ）、およびＨＢＶゲノムＤＮＡを測定した。マウスを２３〜２４日追跡した。
結果を以下の表に示す。
表７Ａ〜Ｃ−２ｍｇ／ｋｇの週２回の投薬後のＨＢｓＡｇの血清レベル（ｌｏｇ１０（ＩＵ／ｍｌ））。データは３回の独立の研究由来である。
Figure 0006306745
Figure 0006306745
Figure 0006306745
これらのデータから、ｉｎ ｖｉｖｏで、すべてのＧａｌＮＡｃコンジュゲート化抗ＨＢＶアンチセンスオリゴマーが、ＨＢＶ ｓ抗原（ＨＢｓＡｇ）の血清レベルを、生理食塩水および標準治療のものより低いレベルまで減少させることが可能であると結論づけ可能である。特に、配列番号８０７、配列番号８０８、配列番号８１４、配列番号８１５、配列番号８２５、配列番号８２６は、ＨＢｓＡｇの血清レベルを非常に減少させると立証可能である。
表８Ａ〜Ｃ−２ｍｇ／ｋｇの週２回の投薬後のＨＢｅＡｇの血清レベル（ｌｏｇ１０（ＩＵ／ｍｌ））
Figure 0006306745
Figure 0006306745
Figure 0006306745
これらのデータから、ｉｎ ｖｉｖｏで、すべてのＧａｌＮＡｃコンジュゲート化抗ＨＢＶアンチセンスオリゴマーが、ＨＢｅＡｇの血清レベルを、生理食塩水および標準治療のものより低いレベルまで減少させることが可能であると結論づけ可能である。特に、配列番号８０７、配列番号８０８、配列番号８１４、配列番号８１５、配列番号８２５、配列番号８２６は、ＨＢｅＡｇの血清レベルを非常に減少させると立証可能である。
表９Ａ〜Ｃ−２ｍｇ／ｋｇの週２回の投薬後のＨＢＶ ＤＮＡの血清レベル（ｌｏｇ１０コピー数）
Figure 0006306745
Figure 0006306745
Figure 0006306745
これらのデータから、ｉｎ ｖｉｖｏで、すべてのＧａｌＮＡｃコンジュゲート化抗ＨＢＶアンチセンスオリゴマーが、ＨＢＶゲノムＤＮＡの血清レベルを、生理食塩水のものより低く、そしてまたはＥＴＶ（臨床的標準治療）のものと同等のレベルまで減少させることが可能であると結論づけ可能である。特に、配列番号８０７、配列番号８０８、配列番号８１４、配列番号８１５、配列番号８２５、配列番号８２６は、ＨＢＶゲノムＤＮＡの血清レベルを非常に減少させると立証可能である。
これらのデータからの全体の結論は、ｉｎ ｖｉｖｏで、ＧａｌＮＡｃコンジュゲート化ＨＢＶターゲティングＬＮＡは、ＥＴＶ（臨床的標準治療）よりも優れてＨＢｓＡｇおよびＨＢｅＡｇをターゲティングし、そしてそれらの発現を減少させ、そしてＥＴＶに比較した際、同等にまたは優れた有効性でＨＢＶ血清ＤＮＡをターゲティングすることが可能であることである。ヌクレオシド類似体ＥＴＶよりもウイルス転写プログラムに対する影響がより広いことを考慮すると、これらのデータは、クリニックにおいて、ＧａｌＮＡｃコンジュゲート化ＨＢＶターゲティングＬＮＡを使用すると、慢性感染ＨＢＶ患者に対する治癒率を有意に増加させることを含め、はるかに改善された転帰を導く可能性が高いことを示唆する。特に、免疫抑制因子ＨＢｓＡｇの減少は、ＨＢＶが導く宿主免疫反応の回復を導くであろう。
実施例５ いくつかの用量での週２回の注射のｉｎ ｖｉｖｏ研究
実施例３で用意するようなＡＡＶ／ＨＢＶマウスモデルを本研究に用いた。７つのＧａｌＮＡｃコンジュゲート化抗ＨＢＶ ＬＮＡオリゴマーを、安定ウイルス血症を有するＣ５７ＢＬ／６マウスにおいて、対照として生理食塩水を用いて、異なる用量で試験した。
以下の表に示すように、マウスに週２回２週間、第０日、３日、７日および１０日、または第０日、３日、６日および９日に、注射あたりｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）の用量で、皮下投与した。「材料および方法」セクションに記載する方法を用いて、示す日に、血清中のＨＢＶ表面抗原（ＨＢｓＡｇ）、ＨＢＶ ｅ抗原（ＨＢｅＡｇ）、およびＨＢＶゲノムＤＮＡを測定した。マウスを２３〜２４日追跡した。
結果を以下の表に示す。
表１０Ａ〜Ｇ−示す濃度の週２回の投薬後のＨＢｓＡｇの血清レベル（ｌｏｇ１０（ＩＵ／ｍｌ））。
Figure 0006306745
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上記データを図１１にもまた提示する。
表１１Ａ〜Ｇ−示す濃度の週２回の投薬後のＨＢｅＡｇの血清レベル（ｌｏｇ１０（ＩＵ／ｍｌ））。
Figure 0006306745
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Figure 0006306745
上記データを図１２にもまた提示する。
表１２Ａ〜Ｇ−示す濃度の週２回の投薬後のｌｏｇ１０（ＨＢＶ ＤＮＡ）（コピー数）の血清レベル。
Figure 0006306745
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Figure 0006306745
Figure 0006306745
Figure 0006306745
上記データを図１３にもまた提示する。
これらのデータから、すべてのＧａｌＮＡｃコンジュゲート化抗ＨＢＶアンチセンスオリゴマーが、ＨＢｓＡＧ、ＨＢｅＡＧおよびＨＢＶゲノムＤＮＡの血清レベルを、生理食塩水のものより低いレベルまで減少させることが可能であると結論づけ可能である。特に、配列番号８０７、８１４、８１５および８２５は、中程度の用量であっても、ＨＢｓＡｇの非常に効率的な減少を示す。最高用量では、配列番号８０７および８１５に関しては、治療が終了した少なくとも１１日後まで、抗原減少が維持される。配列番号８１４、８１５および８２５は、ウイルス血清ＤＮＡの最も有効なノックダウンを示し、ウイルス・ポリメラーゼ発現転写物に対して、特に強力な影響を示す。
実施例６ 異なる投与経路による抗ウイルス有効性の比較
実施例３で用意するようなＡＡＶ／ＨＢＶマウスモデルを本研究に用いた。皮下（ＳＣ）または静脈内（ＩＶ）投与経路のいずれかを用いて、ＧａｌＮＡｃコンジュゲート化抗ＨＢＶ ＬＮＡオリゴマーを、安定ウイルス血症を有するＣ５７ＢＬ／６マウスにおいて、対照として生理食塩水を用いて、異なる用量で試験した。
以下の表に示すように、マウスに週２回２週間、第０日、３日、６日および９日に、注射あたりｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）の用量で、皮下または静脈内投与した。「材料および方法」セクションに記載する方法を用いて、示す日に、血清中のＨＢＶ表面抗原（ＨＢｓＡｇ）、ＨＢＶ ｅ抗原（ＨＢｅＡｇ）、およびＨＢＶゲノムＤＮＡを測定した。マウスを最初の投与後、２３日間追跡した。
結果を以下の表に示す。
表１３Ａ−示す濃度の週２回のＳＣ投薬後のＨＢｓＡｇの血清レベル（ｌｏｇ１０（ＩＵ／ｍｌ））。
Figure 0006306745
表１３Ｂ−示す濃度の週２回のＩＶ投薬後のＨＢｓＡｇの血清レベル（ｌｏｇ１０（ＩＵ／ｍｌ））。
Figure 0006306745
表１４Ａ−示す濃度の週２回のＳＣ投薬後のＨＢｅＡｇの血清レベル（ｌｏｇ１０（ＩＵ／ｍｌ））。
Figure 0006306745
表１４Ｂ−示す濃度の週２回のＩＶ投薬後のＨＢｅＡｇの血清レベル（ｌｏｇ１０（ＩＵ／ｍｌ））。
Figure 0006306745
表１５Ａ−示す濃度の週２回のＳＣ投薬後のＨＢＶ ＤＮＡの血清レベル（ｌｏｇ１０コピー数）。
Figure 0006306745
表１５Ｂ−示す濃度の週２回のＩＶ投薬後のＨＢＶ ＤＮＡの血清レベル（ｌｏｇ１０コピー数）。
Figure 0006306745
データを図１４にもまた示す。
これらのデータから、静脈内投与に比較して、皮下投与によって投薬された際、ＧａｌＮＡｃコンジュゲート化抗ＨＢＶアンチセンスオリゴマーが、ＨＢｓＡＧ、ＨＢｅＡＧおよびＨＢＶゲノムＤＮＡの血清レベルを、生理食塩水のものより低いレベルまで、より効率的に減少させることが可能であると結論づけ可能である。
実施例７：コンジュゲート化および非コンジュゲート化オリゴヌクレオチドの比較
実施例３で用意するようなＡＡＶ／ＨＢＶマウスモデルを本研究に用いた。非コンジュゲート化（配列番号３０８および３０３）およびＧａｌＮＡｃコンジュゲート化（配列番号８０７および８１５）抗ＨＢＶ ＬＮＡオリゴマーを、安定ウイルス血症を有するＣ５７ＢＬ／６マウスにおいて、対照として生理食塩水を用いて、等モルオリゴマー用量で試験した。
以下の表に示すように、マウスに週２回２週間、第０日、３日、６日および９日に、注射あたりｍｇ／ｋｇ（ｍｐｋ）の用量で、皮下投与した。「材料および方法」セクションに記載する方法を用いて、示す日に、血清中のＨＢＶ表面抗原（ＨＢｓＡｇ）、ＨＢＶ ｅ抗原（ＨＢｅＡｇ）、およびＨＢＶゲノムＤＮＡを測定した。マウスを２３日間追跡した。
結果を以下の表に示す。
表１６Ａ〜Ｂ−等モル濃度の週２回の投薬後のＨＢｓＡｇの血清レベル（ｌｏｇ１０（ＩＵ／ｍｌ））。
Figure 0006306745
Figure 0006306745
表１７Ａ〜Ｂ−等モル濃度の週２回の投薬後のＨＢｅＡｇの血清レベル（ｌｏｇ１０（ＩＵ／ｍｌ））。
Figure 0006306745
Figure 0006306745
表１８Ａ〜Ｂ−等モル濃度の週２回の投薬後のＨＢＶ ＤＮＡの血清レベル（ｌｏｇ１０コピー数）。
Figure 0006306745
Figure 0006306745
データをまた、図１５にも提示する。
これらのデータから、静脈内投与に比較して、皮下投与によって投薬された際、ＧａｌＮＡｃコンジュゲート化抗ＨＢＶアンチセンスオリゴマーの投与が、ＨＢｓＡＧおよびＨＢｅＡＧの血清レベルを、生理食塩水のものより低いレベルまでより効率的に減少させることが可能であると結論づけ可能である。血清ＨＢＶ ＤＮＡは、２つの送達法によって、等しい有効性で減少するが、アッセイの限界により、高用量での区別はできない。
刊行物、特許出願、および特許を含む、本明細書に引用するすべての参考文献は、その全体が、そして各参考文献が個々にそして特に援用されたと示され、そしてその全体が本明細書に示されるのと同じ度合いで（法律によって許可される最大の度合いまで）本明細書に援用される。すべての見出しおよび下位見出しは、本明細書において、簡便性のみのために用いられ、そしていかなる意味でも本発明を限定すると見なされてはならない。本明細書に提供するあらゆる例、または例示的な言語（例えば「例えば」）の使用は、本発明をより明らかにすることを意図し、そして別に請求しない限り、本発明の範囲に限界を設けることを意図しない。本明細書のいかなる言語も、本発明の実施に必須であるとしていかなる請求しない要素も示すとは見なされてはならない。本明細書の特許文書の引用および援用は、簡便性のみのために行われ、そしてこうした特許文書の有効性、特許可能性、および／または執行可能性のいかなる観点も反映しない。本発明には、適用可能な法律によって許可されるような、付随する請求項で言及される主題のすべての修飾および同等物が含まれる。

Claims (15)

  1. ａ）配列番号３の位置１５３０〜１５４４の配列に対して１００％の相補性を有する、１０〜２０ヌクレオチド長の少なくとも１つの第一のオリゴマーと、
    ｂ）Ｎ−アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）を有するアシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰ−Ｒ）ターゲティング部分を含むキャリアー構成要素と
    を含むオリゴマー・コンジュゲート。
  2. 前記第一のオリゴマーが、各サイドにウィングが隣接した２’−デオキシリボヌクレオチド・ギャップ領域を含み、各ウィングが独立に１または２以上のＬＮＡ単位を含む、請求項１に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  3. 前記キャリアー構成要素が、２〜４の末端ＧａｌＮＡｃ部分を含むＧａｌＮＡｃクラスターを含み、各ＧａｌＮＡｃ部分が分枝点基に対してＰＥＧスペーサーを介して連結される、請求項１または２に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  4. 前記ＧａｌＮＡｃクラスターが、以下の構造：
    Figure 0006306745
    Figure 0006306745
    Figure 0006306745
    Figure 0006306745
     を有するＣｏｎｊ １、２、１ａ、または２ａからなる群より選択される三価のＧａｌＮＡｃである、請求項３に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  5. 前記キャリアー構成要素が、以下の構造：
    Figure 0006306745
     を有するＧａｌＮＡｃ２である、請求項１〜４の何れか一項に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  6. 前記キャリアー構成要素が、前記第一のオリゴマーに対して、２、３、４、または５のホスホジエステルにより連結されたＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドを含むＰＯリンカーを介して連結される、請求項１〜５の何れか一項に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  7. 前記ＰＯリンカーがジヌクレオチド配列ＣＡからなる、請求項６に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  8. 前記第一のオリゴマーが、
    ＧＣＧＴＡＡＡＧＡＧＡＧＧ（配列番号１３）、
    ＧＣＧＴＡＡＡＧＡＧＡＧＧＴ（配列番号１１）、および
    ＣＧＣＧＴＡＡＡＧＡＧＡＧＧＴ（配列番号１２）
    からなる群より選択される配列を含む、請求項１〜７の何れか一項に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  9. 前記第一のオリゴマーが、
    ＧＣＧｔａａａｇａｇａＧＧ（配列番号３０３）、
    ＧＣＧｔａａａｇａｇａＧＧＴ（配列番号３０１）、
    ＧＣＧｔａａａｇａｇＡＧＧ（配列番号６１８）、および
    ＣＧＣｇｔａａａｇａｇａＧＧＴ（配列番号３０２）、
    からなる群より選択される配列からなり、
    ここで大文字はＬＮＡ単位を指し、小文字はＤＮＡ単位を指す、請求項１〜８の何れか一項に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  10. 前記オリゴマー・コンジュゲートが、
    ５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａＧｓ ｍＣｓＧｓｔｓａｓａｓａｓｇｓａｓｇｓａｓＧｓＧ−３’（配列番号８１５）、
    ５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａＧｓ ｍＣｓＧｓｔｓａｓａｓａｓｇｓａｓｇｓａｓＧｓＧｓＴ−３’（配列番号８１４）、
    ５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａＧｓ ｍＣｓＧｓｔｓａｓａｓａｓｇｓａｓｇｓＡｓＧｓＧ−３’（配列番号８２５）、および
    ５’−ＧＮ２−Ｃ６ ｃａｍＣｓＧｓ ｍＣｓｇｓｔｓａｓａｓａｓｇｓａｓｇｓａｓＧｓＧｓＴ−３’（配列番号８０３）、
    からなる群より選択される１または２以上であり、
    ここで大文字はベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を指し、小文字はＤＮＡ単位を指し、下付きの「ｓ」はホスホロチオエート結合を指し、上付きの「ｍ」はＤＮＡまたは５−メチルシトシン塩基を含むベータ−Ｄ−オキシ−ＬＮＡ単位を指し、「ＧＮ２−Ｃ６」はＣ６リンカーを有するＧａｌＮＡｃ２キャリアー構成要素を指す、請求項１〜９の何れか一項に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  11. 前記オリゴマー・コンジュゲートが、以下の構造：
    Figure 0006306745
     （配列番号８１５）を有する、請求項１〜１０の何れか一項に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  12. 前記オリゴマー・コンジュゲートが、以下の構造：
    Figure 0006306745
     （配列番号８１４）を有する、請求項１〜１０の何れか一項に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  13. 前記オリゴマー・コンジュゲートが、以下の構造：
    Figure 0006306745
     （配列番号８２５）を有する、請求項１〜１０の何れか一項に記載のオリゴマー・コンジュゲート。
  14. 請求項１〜１３の何れか一項に記載のオリゴマー・コンジュゲートと、１または２以上の薬学的に許容されうる希釈剤、キャリアー、塩またはアジュバントとを含む薬学的組成物。
  15. 肝臓のウイルス性障害の治療に用いられる、請求項１〜１３の何れか一項に記載のオリゴマー・コンジュゲート、または、請求項１４に記載の薬学的組成物。
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