JP6264595B2 - マイクロ流体デバイス - Google Patents
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Description
本発明は、マイクロ流体デバイスに関する。
マイクロ流体デバイスは、反応溶液が流れる流路を有し、極めて少量の試料や試薬を含む反応溶液を反応させることが可能なデバイスである。マイクロ流体デバイスとしては、微小反応デバイス(マイクロリアクタ)、集積型DNAデバイス、又は、微小電気泳動デバイス等がある。
例えば、マイクロ流体デバイスは、流路を流れる反応溶液に所望の温度変化を与える反応デバイスに用いられる。マイクロ流体デバイスを用いることによって、反応溶液に与える温度変化を高速にすることができる。
従来より、温度変化を繰り返し与えることで標的核酸を増幅させる核酸増幅デバイスが知られているが、核酸増幅デバイスとしてマイクロ流体デバイスを用いることにより、標的核酸を高速に増幅させることができる。
例えば、特許文献1には、デバイスを複数の異なる温度領域に分割しておき、反応溶液が各温度領域を繰り返して通過するように蛇行した蛇行流路を設けた構成が開示されている。
この構成により、反応溶液を蛇行流路に進行させるだけで反応溶液に所望の温度変化を高速に与えることができるので、反応溶液として核酸を含む溶液を用いた場合に、高速に核酸増幅を行うことができる。
しかしながら、流路を流れる反応溶液の送液速度にばらつきがある。具体的には、反応溶液の送液速度が流路の始点付近と終点付近とで異なる。この結果、反応部における反応溶液の反応時間がばらつくという課題がある。
本発明は、このような課題を解決するためになされたものであり、流路を流れる反応溶液の反応時間を一律の長さに近づけることができるマイクロ流体デバイスを提供することを目的とする。
上記目的を達成するために、本発明に係るマイクロ流体デバイスの一態様は、反応溶液が流れる流路と、前記反応溶液を前記流路に導入するための導入部とを有し、前記流路は、所定の異なる温度に設定された第1温度領域と第2温度領域とを交互に複数回繰り返して通過するように構成されており、前記流路における前記第1温度領域と前記第2温度領域との繰り返し単位部分の長さは、前記反応溶液の送液方向に沿って前記導入部から離れるほど短くなっている。
本発明によれば、流路を流れる反応溶液の反応時間のばらつきを抑制することができ、反応溶液の反応時間を一律の長さに近づけることができる。
以下、本発明の実施の形態について、図面を参照しながら説明する。なお、以下に説明する実施の形態は、いずれも本発明の好ましい一具体例を示すものである。したがって、以下の実施の形態で示される、数値、形状、材料、構成要素、構成要素の配置位置及び接続形態、並びに、ステップ(工程)及びステップの順序などは、一例であって本発明を限定する主旨ではない。よって、以下の実施の形態における構成要素のうち、本発明の最上位概念を示す独立請求項に記載されていない構成要素については、任意の構成要素として説明される。
なお、各図は、模式図であり、必ずしも厳密に図示されたものではない。また、各図において、実質的に同一の構成に対しては同一の符号を付しており、重複する説明は省略又は簡略化する。
(実施の形態1)
[マイクロ流体デバイスの概略構成]
実施の形態1に係るマイクロ流体デバイス1の構成について、図1〜図3を用いて説明する。図1は、実施の形態1に係るマイクロ流体デバイス1の概略構成を示す斜視図であり、図2は、同マイクロ流体デバイス1の分解斜視図であり、図3は、同マイクロ流体デバイス1の平面図である。
[マイクロ流体デバイスの概略構成]
実施の形態1に係るマイクロ流体デバイス1の構成について、図1〜図3を用いて説明する。図1は、実施の形態1に係るマイクロ流体デバイス1の概略構成を示す斜視図であり、図2は、同マイクロ流体デバイス1の分解斜視図であり、図3は、同マイクロ流体デバイス1の平面図である。
マイクロ流体デバイス1は、反応溶液200が流れる流路100を有するデバイス(マイクロ流路チップ)であり、流路100を流れる反応溶液200を反応させるための反応部110と、反応溶液200を流路100に導入するための導入部120と、反応溶液200を排出するための排出部130とを備える。
流路100は、少なくとも反応部110を通過するように設けられている。本実施の形態において、流路100に導入された反応溶液200は、流路100内を毛管力(キャピラリ力)により送液される。例えば、流路100の内面を、接触角が鋭角である親水性表面とすることによって、反応溶液200を毛管力によって送液することができる。
また、流路100は、反応溶液200が一方通行的を流れる反応流路であり、1本で構成されている。流路100は、一方の端部が導入部120に、他方の端部が排出部130にそれぞれ繋がっている。つまり、流路100の一端が導入部120であり、流路100の他端が排出部130である。
流路100は、反応部110を通過するように構成されている。詳細は後述するが、流路100は、所定の異なる温度に設定された第1温度領域と第2温度領域とを交互に複数回繰り返して通過するように構成されている。
さらに、流路100における第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の長さ(温度サイクルの流路長)は、反応溶液200の送液方向に沿って導入部120から離れるほど短くなっている。つまり、流路100における第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の長さが下流側ほど短くなっている。
図2及び図3に示すように、本実施の形態において、流路100は、反応部110に設けられた流路である主流路100aと、反応溶液200を導入部120から反応部110に導くための流路である導入流路100bと、反応溶液200を反応部110から排出部130までに導くための排出流路100cとを有する。
図3に示すように、主流路100aは、蛇行するように形成された蛇行流路であり、屈曲部として複数の折り返し部を有する。主流路100aは、ライン状の流路を所定間隔毎に折り曲げながら連続的に折り返すように(往復するように)形成されている。つまり、主流路100aは、異なる温度に設定された第1温度領域と第2温度領域とを往復するように複数サイクルで折り返されており、複数の直線部(直線状の部分)と、複数の直線部を接続する複数の屈曲部(折り返し部)とを有する。主流路100aの折り返し回数は、例えば20〜70サイクル程度である。なお、図3では、10サイクル回程度しか図示されていない。
反応部110は、マイクロ流体デバイス1に導入された反応溶液200を反応させるための領域である。反応部110には、所定の異なる温度に設定された少なくとも2つ以上の温度領域が存在する。
反応溶液200(反応流体)は、例えば、試料となる標的核酸を含む溶液である。具体的には、反応溶液200は、標的核酸と標的核酸を増幅させるための反応試薬とを含む水溶液である。したがって、本実施の形態における反応部110は核酸増幅反応部であり、反応部110では、反応溶液200に含まれる標的核酸が増幅する。なお、反応溶液200には、アルコールや界面活性剤等が含まれていてもよい。
導入部120は、試料となる標的核酸を含む反応溶液200が導入される試料導入口(インレット)である。導入部120は、流路100の始点になっている。つまり、導入部120は、反応溶液200の送液の始点となる。
排出部130は、反応部110で増幅された標的核酸を含む反応溶液200を排出するための試料排出口(ドレイン)である。排出部130は、流路100の終点になっている。つまり、排出部130は、反応溶液200の送液の終点となる。なお、反応溶液200は、排出部130から排出しなくてもよい。
このように、本実施の形態におけるマイクロ流体デバイス1は、試料となる標的核酸を増幅させるための核酸増幅デバイスとして用いられている。一例として、マイクロ流体デバイス1を用いてPCR(ポリメラーゼ連鎖反応:Polymerase Chain Reaction)法を実施する場合について説明する。
PCR法は、ターゲットDNAを温度サイクルにより増幅させる技術である。この場合、反応溶液には、ターゲットDNAの他に、PCRプライマやポリメラーゼ酵素、バッファー等が含まれている。このような反応溶液に温度サイクルを付与することで、ターゲットDNAを増幅することができる。増幅したDNAの増幅量は、反応検出機構によって検出することができる。本実施の形態では、反応溶液が流路100を通過することで反応溶液に含まれる標的核酸がPCRにより核酸増幅する。
反応部110に設けられた流路100(主流路100a)は、所定の異なる温度に設定された少なくとも2つ以上の温度領域を複数サイクルで往復して通過するように構成されており、主流路100aを流れる反応溶液200は、ヒータ部140によって温度サイクルが付与される。2つ以上の温度領域には、第1温度に設定された領域である第1温度領域(低温領域)と、第1温度よりも高い第2温度に設定された領域である第2温度領域(高温領域)とが含まれている。具体的に、主流路100aは、低温領域(第1ヒータブロック141)と高温領域(第2ヒータブロック142)とを交互に繰り返して通過するように構成されている。
さらに、主流路100aでは、第1ヒータブロック141に対応する第1温度領域(低温領域)と第2ヒータブロック142に対応する第2温度領域(高温領域)との繰り返し単位部分の長さが導入部120から離れるほど短くなっている。つまり、第1温度領域(低温領域)と第2温度領域(高温領域)との繰り返し単位は、導入部120に近づくほど長くなっており、排出部130に近づくほど短くなっている。なお、第1温度領域(低温領域)と第2温度領域(高温領域)との繰り返し単位は、PCRサイクルに対応した繰り返し単位であり、例えば、図3では、主流路100aのP1からP2までの1サイクル長さ、主流路100aのP2からP3までの1サイクル長さ、・・・、及び、主流路100aのP9からP10までの1サイクル長さに対応する。
このように、PCRサイクルに対応した繰り返し単位を導入部120から離れるほど短くするために、本実施の形態では、主流路100aの蛇行流路における繰り返し単位の長さを変更することで実現している。すなわち、蛇行流路の繰り返し単位部分の長さ(流路長)を、反応溶液200の送液方向に沿って、導入部120に近づくほど長くしており、排出部130に近づくほど短くしている。
具体的には、蛇行流路を構成する主流路100aでは、第1温度領域(低温領域)及び第2温度領域(高温領域)の一方から他方に向かう主流路100aの一部分を繰り返し単位としており、本実施の形態では、図3における主流路100aの直線部が繰り返し単位となっている。つまり、本実施の形態では、主流路100aにおける第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の長さは、主流路100aの連続する2つの折り返し部の間の直線部の長さ(流路長)になっている。したがって、主流路100aの直線部の長さ(直線部を介して連続する2つの折り返し部の間の長さ)が、導入部120から離れるほど短くなっている。
なお、繰り返し単位部分の主流路100aは、第1温度領域部分の長さも第2温度領域部分の長さも導入部120から離れるほど短くなっているが、これに限らない。例えば、第1温度領域部分及び第2温度領域部分のいずれか一方が一定の長さであり、かつ、他方の長さが導入部120から離れるほど短くなっていてもよい。
また、本実施の形態では、反応部110において、主流路100aにおける第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の長さは、排出部130に近づくに従って漸次短くなっているが、流路100の途中に、前後2つの繰り返し単位の流路長が同じ又は多少長くなっている箇所があってもよい。つまり、主流路100aにおける第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の長さは、主流路100a全体として、排出部130に近づくに従って短くなっていればよい。
以下、マイクロ流体デバイス1を構成する具体的な構成部材について、図1〜図3を用いてさらに詳述する。
図1及び図2に示すように、マイクロ流体デバイス1は、第1基板10と、第2基板20と、ヒータ部140とによって構成されている。なお、マイクロ流体デバイス1は、ヒータ部140を含まず、第1基板10と第2基板20とで構成されていてもよい。
[第1基板]
図2に示すように、第1基板10は、導入部120の一部を構成する第1凹部11と、排出部130の一部を構成する第2凹部12と、流路100を構成する溝部13とを備える。
図2に示すように、第1基板10は、導入部120の一部を構成する第1凹部11と、排出部130の一部を構成する第2凹部12と、流路100を構成する溝部13とを備える。
第1基板10としては、例えば、PET(ポリエチレンテレフタレート)、PC(ポリカーボネート)、COP(シクロオレフィンポリマー)又はアクリル等の樹脂基板を用いることができる。
第1凹部11及び第2凹部12は、例えば円形開口の凹部である。溝部13には反応溶液200が流れる。つまり、溝部13は、流路100を構成している。具体的には、溝部13は、主流路100a、導入流路100b及び排出流路100cを構成しており、第1凹部11と第2凹部12とをつなぐように形成されている。これにより、第1凹部11(導入部120)に反応溶液200が導入されると、反応溶液200は、第2凹部12(排出部130)に向かって溝部13(流路100)内を進行する。
本実施の形態において、主流路100aを構成する溝部13の内面は、親水性となっている。具体的には、主流路100aを構成する溝部13の内面は、界面活性剤による表面処理が施されて親水性となっている。例えば、溝部13の底面及び側面に界面活性剤をコーティングして親水化処理を施すことで、溝部13の内面に親水性膜を形成することができる。なお、導入流路100b及び排出流路100cを構成する溝部13の内面も主流路100aと同様に親水性となっている。
流路100は、流路幅がマイクロオーダのマイクロ流路である。本実施の形態において、流路100の流路幅は、一定である。具体的には、主流路100a、導入流路100b及び排出流路100cを構成する溝部13は、断面形状が矩形状であって、幅及び深さが一定である。なお、流路100(溝部13)の幅及び深さは一定でなくてもよい。
一例として、主流路100a、導入流路100b及び排出流路100cを構成する溝部13は、流路幅(溝幅)が50〜500μmであり、深さが50〜150μmであり、流路長が500〜3000mmである。流路100(溝部13)の流路幅、深さ、流路長は、上記の範囲に限るものではない。
なお、第1基板10は、樹脂基板に限らず、ガラス基板又はシリコン基板等であってもよい。第1基板としてシリコン基板を用いることで、主流路100aを構成する溝部13の内面にシリコン酸化膜を容易に形成することができる。シリコン酸化膜は親水性を有するので、主流路100a(溝部13)の壁面(内面)にシリコン酸化膜を形成することによって、主流路100aの内面を親水化することができる。また、第1基板10は、透明基板等の透光性基板及び不透光性基板のいずれであってもよい。また、溝部13の断面形状は、矩形に限らず、半円形又は逆三角形であってもよい。
[第2基板]
図1に示すように、第2基板20は、第1基板10を覆う蓋部であり、第1基板10上に配置される。第2基板20としては、例えば透明樹脂基板又はガラス基板等を用いることができる。
図1に示すように、第2基板20は、第1基板10を覆う蓋部であり、第1基板10上に配置される。第2基板20としては、例えば透明樹脂基板又はガラス基板等を用いることができる。
図2に示すように、第2基板20には、導入部120の一部として、第2基板20を貫通する第1貫通孔21が設けられている。また、第2基板20には、排出部130の一部として、第2基板20を貫通する第2貫通孔22が設けられている。第1貫通孔21及び第2貫通孔22は、例えば円形開口を有する貫通孔である。
第1基板10上に第2基板20を載置することによって、第1基板10の溝部13の開口部分が塞がれて全方位が密閉された流路100が構成される。これにより、流路100は、反応溶液200の送液方向(進行方向)に垂直な断面における壁面全周が閉じられた構成(四方が壁で覆われた構成)となり、かつ、導入部120及び排出部130においてのみ外部空間と繋がる構成となる。このように、流路100の全方位を封止することによって、流路100における毛管力を増強させることができるとともに、送液中に反応溶液200が揮発することを抑制できる。
なお、第2基板20は、樹脂基板又はガラス基板に限らず、シリコン基板等であってもよい。また、第2基板20は、透明基板でなくてもよい。
[ヒータ部]
ヒータ部140は、流路100を流れる反応溶液200を加熱するための加熱装置である。ヒータ部140は少なくとも反応部110に配置されており、反応部110の流路100(主流路100a)に送液される反応溶液200は、ヒータ部140によって所定の温度が付与される。
ヒータ部140は、流路100を流れる反応溶液200を加熱するための加熱装置である。ヒータ部140は少なくとも反応部110に配置されており、反応部110の流路100(主流路100a)に送液される反応溶液200は、ヒータ部140によって所定の温度が付与される。
ヒータ部140は、設定温度が異なる第1ヒータブロック141と第2ヒータブロック142とを備えている。したがって、反応部110には、第1ヒータブロック141及び第2ヒータブロック142が配置される。つまり、反応部110には、第1ヒータブロック141及び第2ヒータブロック142の2つのヒータブロックによって所定の異なる温度に設定された2つの温度領域が存在する。
第1ヒータブロック141及び第2ヒータブロック142は、例えば直方体のアルミニウムやステンレス等の金属からなる金属ブロックを用いたヒータである。ヒータ部140としては、ヒータブロック以外に、ガラス基板上に金属薄膜を印刷等により形成した金属薄膜ヒータ等を用いることもできる。
本実施の形態では、第2ヒータブロック142の温度(第2温度)が第1ヒータブロック141の温度(第1温度)よりも高くなるように設定されている。つまり、第2ヒータブロック142が配置された領域が高温領域であり、第1ヒータブロック141が配置された領域が低温領域である。
低温領域に対応する第1ヒータブロック141の温度は、例えば50℃〜75℃であり、本実施の形態では、アニール・伸長反応温度である約60℃としている。一方、高温領域に対応する第2ヒータブロック142の温度は、例えば93℃〜98℃であり、本実施の形態では、核酸増幅反応の変性反応温度である約95℃としている。
ヒータ部140は、温度制御部(不図示)に接続される。これにより、第1ヒータブロック141及び第2ヒータブロック142の各温度は、温度制御部によって制御することができる。
第1ヒータブロック141と第2ヒータブロック142は所定の隙間をあけて並べられている。第1ヒータブロック141及び第2ヒータブロック142の上には第1基板10が配置される。具体的には、流路100における主流路100aが第1ヒータブロック141と第2ヒータブロック142とを交互に跨ぐようにして第1基板10がヒータ部140に載置される。これにより、主流路100aは、2つの温度領域を複数サイクルで往復するように構成される。つまり、主流路100aは、第1ヒータブロック141(低温領域)と第2ヒータブロック142(高温領域)とを交互に繰り返して通過する。
[マイクロ流体デバイスの特徴]
次に、マイクロ流体デバイス1の特徴について、本発明に至った経緯も含めて説明する。
次に、マイクロ流体デバイス1の特徴について、本発明に至った経緯も含めて説明する。
図4は、従来のマイクロ流体デバイス1000の概略構成を示す斜視図である。
図4に示すように、従来のマイクロ流体デバイス1000の流路1100は、上記実施の形態1におけるマイクロ流体デバイス1の流路100と同様に、異なる温度に設定された第1温度領域と第2温度領域とを交互に複数回繰り返して通過する蛇行流路となっているが、上記実施の形態1におけるマイクロ流体デバイス1の流路100と異なり、流路100における第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の長さ(温度サイクルの流路長)が一定になっている。
また、従来のマイクロ流体デバイス1000は、上記実施の形態1におけるマイクロ流体デバイス1と同様に、毛管力によって反応溶液を送液する。
この場合、図5に示すように、流路1100を流れる反応溶液の送液距離と送液時間とは、送液距離が長くなるほど送液時間が長くなる。しかしながら、反応溶液と送液距離と送液時間とは比例せずに、送液距離が長くなるにしたがって、単位送液距離あたりの送液時間が徐々に長くなっている。言い換えると、送液距離が長くなるにしたがって、単位送液時間あたりの送液距離が短くなっている。つまり、送液距離が長くなるにつれて、送液速度が徐々に遅くなっていることが分かる。これは、流路1100の内壁の抵抗が増加して、徐々に速度が遅くなるからであると考えられる。
この結果、流路100では、送液の始点付近(導入部120付近)においては、送液速度が速いために反応溶液は速く流れることになるが、送液の終点(排出部130)に近づくにつれて送液速度が徐々に遅くなっていき、反応溶液の流れが遅くなる。
このように、マイクロ流体デバイス1000では、流路1100を流れる反応溶液の送液速度にばらつきがある。具体的には、反応溶液の送液速度が流路1100の始点付近と終点付近とで異なる。
この結果、流路1100の始点付近と終点付近とで反応時間が異なり、流路全域の反応溶液に対して均一な反応を行うことができないという問題が生じる。あるいは、核酸増幅の反応を十分に行うために始点付近の反応時間を十分に確保した場合には、終点付近の反応時間が必要以上に長くなってしまい、送液完了までの時間が長くなるという問題が生じる。
そこで、本発明者らは、反応溶液の送液速度のばらつきを抑制できる方法を鋭意検討した結果、流路における第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の長さを調整することによって送液の始点付近と終点付近との反応速度を近づけることができることを見出した。
具体的には、図1及び図3に示すように、所定の異なる温度に設定された第1温度領域と第2温度領域とを交互に複数回繰り返して通過するように構成された流路100に対して、第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の長さ(流路長)を、反応溶液200の送液方向に沿って導入部120から離れるほど短くした。
ここで、本実施の形態におけるマイクロ流体デバイス1の特徴について、図1〜図3を参照しながら、図6を用いて説明する。図6は、実施の形態1に係るマイクロ流体デバイス1における温度サイクルを説明するための図である。なお、本実施の形態では、マイクロ流体デバイス1を核酸増幅デバイスとして用いた場合について説明する。
まず、試料となる標的核酸とこの標的核酸を増幅させるための反応試薬とをマイクロ流体デバイス1の導入部120に導入する。例えば、標的核酸を含む反応溶液と反応試薬とを予め混合しておいた溶液を反応溶液200として、図1に示すように、この反応溶液200を、ピペットを用いて導入部120に注入する。
導入部120に導入された反応溶液200は、流路100を通って導入部120から反応部110に送液される。具体的には、反応溶液200は、導入流路100bを流れて反応部110の主流路100aに送液される。
反応部110では、反応溶液200に周期的な温度変化が与えられて反応溶液200に含まれる標的核酸が増幅する。
具体的には、反応部110に到達した反応溶液200は、図6に示すように、第1ヒータブロック141と第2ヒータブロック142とを繰り返して往復するように流路100(主流路100a)を通ることになる。つまり、反応溶液200は、反応部110における低温領域(第1ヒータブロック141)と高温領域(第2ヒータブロック142)との2つの温度領域を交互に繰り返して順次通過するように送液されるので、加熱と冷却とが交互に繰り返して付与されることになる。これにより、流路100(主流路100a)を流れる反応溶液200に対してヒートサイクルを付与することができるので、反応溶液200に含まれる標的核酸は、高温領域での変性反応と低温領域でのアニール・伸長反応との繰り返しにより増幅する。
このように、送液しながら反応溶液200を昇降温させることができるので、非常に高速なフローPCRを実現することができる。したがって、反応溶液200に含まれる標的核酸を高速に増幅させることができる。
この場合、本実施の形態では、図3に示すように、設定温度の異なる第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の流路100の長さが反応溶液200の送液方向に沿って導入部120から離れるほど短くなっている。
つまり、図6に示すように、第1温度領域(第1ヒータブロック141に対応する領域)と第2温度領域(第2ヒータブロック142に対応する領域)との繰り返し単位部分の流路100の長さは、送液速度が速い送液の始点付近(導入部120付近)ほど長くなっており、送液速度が遅い送液の終点付近(排出部130付近)に近づくにつれて徐々に短くなっている。
これにより、反応部110において、第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の流路100において反応溶液200が存在する時間のばらつきが、各繰り返し単位部分においてより小さくなる。したがって、反応部110の全域において反応溶液200の反応時間を一律の長さに近づけることができる。
この結果、流路全域の反応溶液200に対して均一な反応を与えることができる。また、核酸増幅の反応を十分に行うために始点付近の反応時間を十分に確保した場合であっても、終点付近での必要以上な過剰な反応時間を削減することができるので、送液完了までの時間を短くすることができる。
なお、図6に示される第1ヒータブロック141及び第2ヒータブロック142の領域は、各ヒータブロックそのものの大きさ(幅)を表したものではなく、各ヒータブロックを通過する流路100(主流路100a)の流路長を模式的に表したものである。
本実施の形態におけるマイクロ流体デバイス1では、以上のようにして反応溶液200が導入部120から排出部130へと送液される。
なお、反応溶液200の先頭が排出部130に到達したときに、反応溶液200の導入部120への導入を停止させており、このときに流路100の全体に反応溶液200が行き渡って流路100内に反応溶液200が充填されることになる。
また、本実施の形態において、反応溶液200は、流路100内を進行する際、上述のとおり、流路100内を毛管力により送液される。例えば、流路100(主流路100a、導入流路100b、排出流路100c)の内面を親水性表面にすることで、反応溶液200を毛管力によって送液することができる。このように、反応溶液200は、気液界面に生じる毛管力によって流路100内を自送液(Self−propelled flow)されるので、流路100内を自動的に進行する。
したがって、反応部110では、反応溶液200が流路100(主流路100a)内を毛管力により送液されながら反応溶液200に含まれる標的核酸が増幅する。つまり、反応溶液200は、自動搬送によって流路100内に送液されながら反応部110において周期的な温度変化が与えられて、標的核酸が増幅する。
なお、流路100(主流路100a、導入流路100b及び排出流路100c)は、壁面の一部が親水性表面であればよいが、送液方向に垂直な断面における流路100の壁面全周が親水性表面である方がよい。この場合、第1基板10の溝部13の表面だけでなく、第2基板20の表面(内面)も親水性表面にすればよい。流路100の断面における壁面の親水性表面の割合が大きいほど、反応溶液200に対する毛管力を大きくすることができる。
また、反応溶液200が流路100の全域に行き渡った後は、反応溶液200に含まれる標的核酸の増幅量を検出する。この場合、例えば、光学検出装置によって非接触で標的核酸の増幅量を検出する。具体的には、反応部110における主流路100aの直線部と交差する方向にレーザ光をスキャンするとともに反射光を受光する。そして、受光した反射光に基づいて主流路100a内の反応溶液中における標的核酸の増幅量を算出する。
これにより、第1ヒータブロック141と第2ヒータブロック142とを往復する主流路100aのサイクルに応じた核酸の増幅曲線を取得することができる。つまり、主流路100a上をレーザ光でスキャンすることによって、主流路100aのサイクル毎の核酸の増幅量を、増幅曲線として検出することができる。具体的には、PCRサイクルの増加に従って核酸の増幅量が増加する増幅曲線が得られる。
一例として、青色光のレーザ光を反応溶液に照射することによって、青色光を励起光として蛍光発光した緑色光が反射光として戻るように構成することができる。この緑色光(反射光)の蛍光量は、核酸の増幅量に応じて変化する。したがって、緑色光の蛍光量を測定することで核酸の増幅量を算出することができる。
[まとめ]
以上、本実施の形態におけるマイクロ流体デバイス1によれば、所定の異なる温度に設定された第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の流路100の長さが反応溶液200の送液方向に沿って導入部120から離れるほど短くなっている。
以上、本実施の形態におけるマイクロ流体デバイス1によれば、所定の異なる温度に設定された第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の流路100の長さが反応溶液200の送液方向に沿って導入部120から離れるほど短くなっている。
これにより、流路100を流れる反応溶液200の反応時間のばらつきを抑制することができるので、反応部110における反応溶液200の反応時間を一律の長さに近づけることができる。したがって、反応部110の流路100の全域において、反応溶液200の反応時間の均一化を図ることができる。
また、本実施の形態において、反応溶液200は、流路100内を毛管力によって送液される。
毛管力によって反応溶液200を送液すると、反応溶液200の送液速度が流路100の始点付近と終点付近とで異なるが、本実施の形態のように、第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の流路100の長さを導入部120から離れるほど短くすることで、始点付近と終点付近との送液速度の違いを吸収することができる。つまり、始点付近と終点付近とで送液速度が異なっていても、反応部110における反応溶液200の反応時間を一律の長さに近づけることができる。
なお、本実施の形態では、導入部120と排出部130とをマイクロ流体デバイス1の一方の端部にまとめて配置したが、導入部120(始点)と排出部130(終点)とを異なる位置に配置してもよい。例えば、図7に示すように、マイクロ流体デバイス1Aの一方の端部に導入部120を配置し、マイクロ流体デバイス1Aの他方の端部に排出部130を配置してもよい。
また、本実施の形態では、主流路100aを蛇行流路としたが、これに限るものではない。例えば、図8に示すマイクロ流体デバイス1Bのように、主流路100aを直線状の直線流路にしてもよい。この場合、第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分の主流路100aの長さを導入部120から離れるほど短くするために、複数の第1ヒータブロック141(第1温度領域)及び複数の第2ヒータブロック142(第2温度領域)の送液方向の長さ(幅)を、導入部120から離れるほど小さくするとよい。
ただし、図3のように主流路100aを蛇行流路とする方が、より小さなスペースでより長い流路長を確保することができるので、より小型のマイクロ流体デバイスを実現することができる。また、主流路100aを蛇行流路にすることで、1つの第1ヒータブロック141と1つの第2ヒータブロック142との間を繰り返して往復させるだけで、主流路100aにおける第1温度領域と第2温度領域との繰り返し単位部分を複数回にすることができる。これにより、ヒータ部140の構造を簡便にすることができる。
なお、図8には、第2基板20が図示されていないが、第1基板10の上に第2基板20を配置してもよい。
(実施の形態2)
次に、実施の形態2に係るマイクロ流体デバイス2の概略構成について、図9を用いて説明する。図9は、実施の形態2に係るマイクロ流体デバイス2の概略構成を示す斜視図である。なお、図9には、第2基板20が図示されていないが、実施の形態1と同様に、第1基板10の上に第2基板20を配置してもよい。また、図9には、ヒータ部140が図示されていないが、第1基板10の裏側には所定形状のヒータ部140(第1ヒータブロック141、第2ヒータブロック142)が配置される。
次に、実施の形態2に係るマイクロ流体デバイス2の概略構成について、図9を用いて説明する。図9は、実施の形態2に係るマイクロ流体デバイス2の概略構成を示す斜視図である。なお、図9には、第2基板20が図示されていないが、実施の形態1と同様に、第1基板10の上に第2基板20を配置してもよい。また、図9には、ヒータ部140が図示されていないが、第1基板10の裏側には所定形状のヒータ部140(第1ヒータブロック141、第2ヒータブロック142)が配置される。
図9に示すように、マイクロ流体デバイス2では、流路100の平面視形状が渦巻き状になっている。本実施の形態において、流路100の平面視形状は、略円形の渦巻き状である。具体的には、流路100は、径の異なる複数の円弧をつなぎ合わせた形状となっている。なお、円弧には、真円の円弧及び楕円の円弧が含まれる。
流路100(主流路100a)の一端に設けられた導入部120は、渦巻き状の最も外側に位置している。また、流路100(主流路100a)の他端に設けられた排出部130は、渦巻き状の最も内側に位置している。本実施の形態において、排出部130は、渦巻きの中心に設けられている。
また、第1基板10の裏側に設けられた第1ヒータブロック141及び第2ヒータブロック142は、いずれも平面視形状が扇形形状である。本実施の形態において、第1ヒータブロック141及び第2ヒータブロック142は、円中心を中心として円を4分割にした形状であり、各々2つずつ設けられている。また、第1ヒータブロック141と第2ヒータブロック142とは渦巻きの周方向に沿って交互に設けられている。
このように、本実施の形態では、流路100を渦巻き状とし、導入部120を渦巻きの最も外側に設けるとともに排出部130を渦巻き状の最も内側に設けている。渦巻き状の流路100は、外側部分ほど流路長(円弧)が長くなり、内側部分ほど流路長(円弧)が短くなる。
これにより、本実施の形態でも、所定の異なる温度に設定された第1温度領域(第1ヒータブロック141に対応する領域)と第2温度領域(第2ヒータブロック142に対応する領域)との繰り返し単位部分の流路100の長さを導入部120から離れるほど短くすることができる。
この結果、第1温度領域(第1ヒータブロック141に対応する領域)と第2温度領域(第2ヒータブロック142に対応する領域)との繰り返し単位部分の流路100の長さを、送液速度が速い送液の始点付近(導入部120付近)ほど長くし、送液速度が遅い送液の終点付近(排出部130付近)ほど短くすることができる。
したがって、流路100を流れる反応溶液の反応時間を一律の長さに近づけることができる。これにより、流路全域の反応溶液に対して、均一な反応を与えることができる。また、送液速度が遅い終点付近での送液を速く完了することができる。
また、上記実施の形態1のマイクロ流体デバイス1のように流路100が蛇行流路である場合、折り返し部での屈曲が急峻となって反応溶液が折り返し部で減速して均一な速度で送液することができなくなる。これに対して、本実施の形態のように流路100を渦巻き状にすることで、急峻な折り返し部をなくすことができるので、反応溶液を均一な速度で送液することができる。
なお、本実施の形態におけるマイクロ流体デバイス2も、毛管力によって反応溶液を送液する構造を有しているが、これに限るものではない。
また、本実施の形態におけるマイクロ流体デバイス2では、流路100の形状を略円形の渦巻き状としたが、これに限るものではない。
例えば、図10に示すマイクロ流体デバイス2Aのように、流路100の平面視形状を略四角形の渦巻き状としてもよい。つまり、長さの異なる複数の直線状の流路を、なす角が90度となるように順次接続した形状の渦巻き状であってもよい。この場合も、実施の形態2におけるマイクロ流体デバイス2と同様に、流路100を流れる反応溶液の反応時間を一律の長さに近づけることができる。
また、図10に示すマイクロ流体デバイス2Aでは、流路100の折り返し部が略90度であるので、流路100を折り返し部が急峻な蛇行流路にする場合と比べて、折り返し部で反応溶液が減速してしまうことを緩和できる。
しかも、第1温度領域(第1ヒータブロック141)及び第2温度領域(第2ヒータブロック142)では流路100が直線状になっているので、図9のように流路100が円形の渦巻き状である場合と比べて、反応溶液に対して所望の反応を与えることができる。
さらに、流路100を略四角形の渦巻き状にすることで、流路100が略円形の渦巻き状である場合と比べて、第1基板10内に流路100を効率よく配置することができるので、デバイス面積を小さくすることができる。
また、図10に示すマイクロ流体デバイス2Aにおいて、第1ヒータブロック141及び第2ヒータブロック142は、排出部130を中心に四角形を4分割にした形状であったが、これに限るものではない。
例えば、図11に示すマイクロ流体デバイス2Bのように、第1ヒータブロック141及び第2ヒータブロック142は、四角形を対角線に沿って2分割した形状であってもよいし、排出部130を中心に6分割又は8分割等の複数に分割した形状であってもよい。この場合も、実施の形態2におけるマイクロ流体デバイス2と同様に、流路100を流れる反応溶液の反応時間を一律の長さに近づけることができる。
また、図10及び図11に示すマイクロ流体デバイス2A及び2Bでは、流路100は、平面視略正方形の渦巻き状であったが、これに限るものではない。
例えば、図12に示すマイクロ流体デバイス2Cのように、流路100は、平面視略長方形の渦巻き状であってもよい。この場合も、実施の形態2におけるマイクロ流体デバイス2と同様に、流路100を流れる反応溶液の反応時間を一律の長さに近づけることができる。
さらに、図12に示すマイクロ流体デバイス2Cでは、略長方形の長辺における流路100が、低温領域である第1温度領域(第1ヒータブロック141に対応する領域)を通過するように構成し、略長方形の短辺における流路100が、高温領域である第2温度領域(第2ヒータブロック142に対応する領域)を通過するように構成している。
この場合も、実施の形態2におけるマイクロ流体デバイス2と同様に、流路100を流れる反応溶液の反応時間を一律の長さに近づけることができる。
また、図10及び図11と同様に、流路100を略四角形の渦巻き状にすることによって、流路100を効率よく配置することができる。また、反応溶液の反応は、高温領域よりも低温領域の方が時間を要する。したがって、図12に示すように、長辺部分の流路100を低温領域に対応させることによって、さらに効率よく流路を配置することができる。
(変形例)
以上、本発明に係るマイクロ流体デバイスについて、実施の形態1、2に基づいて説明したが、本発明は、上記実施の形態1、2に限定されるものではない。
以上、本発明に係るマイクロ流体デバイスについて、実施の形態1、2に基づいて説明したが、本発明は、上記実施の形態1、2に限定されるものではない。
例えば、上記実施の形態1、2では、反応部110における流路100(主流路100a)を蛇行流路として標的核酸を含む反応溶液に温度変化を繰り返し与えるフローPCRとしたが、これに限らない。つまり、フローPCRとせずに、標的核酸を含む反応溶液に温度変化を繰り返し与えるようなPCRとしてもよい。ただし、上記実施の形態のようにフローとした方が効率良くPCRを実施することができる。
また、上記実施の形態1、2では、ヒータ部140は、設定温度が2種類の温度領域となるように構成したが、設定温度が互いに異なる3つ以上の温度領域となるように構成してもよい。この場合、流路は、反応溶液が異なる複数の温度領域を周期的に通過するように構成されていればよい。
また、上記実施の形態1、2では、複数の温度領域の各温度の設定は、ヒータブロックで行ったが、ペルチェ素子等の他の温度制御部材を用いて温度設定してもよい。
また、上記実施の形態1、2では、毛管力によって反応溶液を送液したが、これに限るものではない。例えば、流路にシリンジポンプ等の送液ポンプをつないで反応溶液を送液してもよいし、毛管力以外の方法で反応溶液を自送液させてもよい。なお、反応溶液を毛管力で送液する場合ほどではないが、シリンジポンプ等の送液ポンプで反応溶液を送液する場合においても、送液距離が長くなるにつれて送液速度が徐々に遅くなる。
また、上記実施の形態2では、流路100を略円形又は略四角形の渦巻き状としたが、これに限るものではない。例えば、流路100を三角形又は六角形等の他の多角形の渦巻き状、あるいは、任意に湾曲する渦巻き状であってもよい。
また、上記実施の形態2において、流路100は、右巻きの渦巻き状としたが、左巻きの渦巻き状であってもよい。
その他、各実施の形態に対して当業者が思いつく各種変形を施して得られる形態や、本発明の趣旨を逸脱しない範囲で実施の形態における構成要素及び機能を任意に組み合わせることで実現される形態も本発明に含まれる。
1、1A、1B、2、2A、2B、2C マイクロ流体デバイス
100 流路
100a 主流路
120 導入部
200 反応溶液
100 流路
100a 主流路
120 導入部
200 反応溶液
Claims (10)
- 反応溶液が流れる流路と、
前記反応溶液を前記流路に導入するための導入部とを有し、
前記流路は、所定の異なる温度に設定された第1温度領域と第2温度領域とを交互に複数回繰り返して通過するように構成されており、
前記流路における前記第1温度領域と前記第2温度領域との繰り返し単位部分の長さは、前記反応溶液の送液方向に沿って前記導入部から離れるほど短くなっている
マイクロ流体デバイス。 - 前記流路の前記繰り返し単位部分における前記第1温度領域部分の長さは、前記反応溶液の送液方向に沿って前記導入部から離れるほど短くなっている
請求項1に記載のマイクロ流体デバイス。 - 前記流路の前記繰り返し単位部分における前記第2温度領域部分の長さは、前記反応溶液の送液方向に沿って前記導入部から離れるほど短くなっている
請求項2に記載のマイクロ流体デバイス。 - 前記流路は、複数の直線部と、前記複数の直線部を接続する複数の折り返し部とを有する蛇行流路であり、
前記流路における前記第1温度領域と前記第2温度領域との前記繰り返し単位部分は、前記直線部である
請求項1〜3のいずれか1項に記載のマイクロ流体デバイス。 - 前記流路は、渦巻き状であって、
前記導入部は、前記渦巻き状の最も外側に位置する
請求項1〜3のいずれか1項に記載のマイクロ流体デバイス。 - 前記流路の平面視形状は、略円形の渦巻き状である
請求項5に記載のマイクロ流体デバイス。 - 前記流路の平面視形状は、略四角形の渦巻き状である
請求項5に記載のマイクロ流体デバイス。 - 前記流路の平面視形状は、略長方形の渦巻き状であり、
前記略長方形の長辺における前記流路は、前記第1温度領域を通過し、
前記略長方形の短辺における前記流路は、前記第2温度領域を通過し、
前記第1温度領域に設定された温度は、前記第2温度領域に設定された温度よりも低い
請求項5に記載のマイクロ流体デバイス。 - 前記反応溶液は、標的核酸を含む溶液であり、
前記標的核酸は、前記反応溶液が前記流路を通過することでポリメラーゼ連鎖反応により核酸増幅する
請求項1〜8のいずれか1項に記載のマイクロ流体デバイス。 - 前記反応溶液は、前記流路内を毛管力によって送液される
請求項1〜9のいずれか1項に記載のマイクロ流体デバイス。
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