JP5969390B2 - フコース含有細菌バイオポリマー - Google Patents
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Description
本発明のフコース含有ポリマーは、シュードモナス属、クレブシエラ属、メチロバクテリウム属(Methylobacterium)、エルウィニア属、アルカリゲネス属(Alcaligenes)、又はエンテロバクター属の細菌によって、好ましくはブダペスト条約の下で受託番号DSM23139でDSMZ(Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH)に寄託されたエンテロバクター属A47細菌によって生産される。さらに、本発明において用いられる微生物は、他の態様、すなわち、それぞれ表1及び表2及び図1に示される、生化学的プロフィール、遺伝子配列決定、及び系統樹によって特徴付けされる。
本発明のポリマーは、バイオリアクターにおいて、撹拌及び通気した水性培地内で生産される。培養培地は、炭素源、窒素源、及び無機塩を含有する。好ましい炭素源は、グリセロール又はグリセロール含有基質である。それでも、本発明のポリマーを生産するためのプロセスは、 グリセロールに代わる、又はグリセロールと混合した他の炭素源、例えば、糖、アルコール、有機酸、又はアルカン、並びに食品及び産業の廃棄物又は副生成物、例えばバイオディーゼル産業から生じるグリセロール副生成物、糖蜜、ホエー、又はオリーブオイル生産廃棄物の使用を見越したものである。
典型的には、本発明のポリマーは、その糖組成の少なくとも10%に相当するフコース含有量を有する。フコース含有ポリマーは、その組成に、他の中性糖、すなわち、グルコース及びガラクトースを有し、微量の(<5%)他の糖、例えばマンノース、ラムノース、アラビノース、フルクトース、グルクロン酸、及び/又はグルコサミンも含有し得る。
本発明のポリマーは凝集活性及び乳化活性を示し、擬塑性流体の挙動を有する高粘度水性溶液を形成し、他のポリマーと混合されると生分解性フィルムを生産する。したがって、本発明のポリマーは、その多くの用途において、すなわち、農業食品産業、医薬品、及び化粧品において、他の多糖、例えばキサンタン、アルギネート、カラギーナン、グアーガム、及びアラビアゴムに置き換わり得る。さらに、本発明のポリマーにおけるフコースの存在はさらに、医薬品用途及び化粧品用途におけるその使用の可能性を高める。さらに、ピルベート残基及びスクシネート残基の存在によって、ポリマーに陰イオン特性が付与される。その結果、ポリマーは、毒性金属を固定することができる。
フコース含有ポリマーは、エンテロバクター属A47(DSM23139)細菌の培養によって得られる。微生物は、フコース含有ポリマーを合成する能力を有する限り、野生型株、変異体、又は突然変異体であり得る。純粋な培養物を用いることができるか、或いは、少なくとも1つの微生物が本発明のポリマーを生産し得る、混合培養物を用いることができる。
エンテロバクター属A47(DSM23139)細菌は、0.7〜0.8μm×1.2〜2.5μmの寸法を有する桿菌である。これは、グラム陰性運動性細菌である。
エンテロバクター属A47(DSM23139)細菌は、エンテロバクター属に典型的な以下の生化学的プロフィールを有する(表1)。
エンテロバクター属A47(DSM23139)細菌の16SrRNA遺伝子配列(表2)を、PCR増幅した16SrDNAの直接的な配列決定によって決定した。ゲノムDNA抽出、16SrDNAのPCR(ポリメラーゼ連鎖反応)介在性の増幅、及びPCR産物の精製を、Raineyら(1996)によって記載されているように実施した。精製されたPCR産物を、製造者のプロトコルで指示されているように、CEQ(商標)DTCS−Quick Start Kit(Beckman Coulter)を用いて配列決定した。配列決定反応物を、CEQ(商標)8000 Genetic Analysis Systemを用いて電気泳動した。得られた配列データを、アラインメントエディターae2(Maidakら、1999)に入れ、手動でアラインし、エンテロバクター科(Enterobacteriaeceae)に属する生物の代表的な16SrRNA遺伝子配列と比較した(Maidakら、1999)。比較のために、16S配列を、EMBLデータベース、RDPデータベース、又はDSMZデータベースから得た。
エンテロバクター属A47(DSM23139)細菌の系統樹を、ARBパッケージ(Pruesseら、2007)を用いて構築した。進化距離の値に基づいて、Saitou及びNei(1987)のコレクションを用いて、系統樹を近隣結合法によって構築した(Jukes and Cantor、1969)。系統樹の根を、クレブシエラ・ニューモニエの16SrRNA遺伝子配列を分析に含めることによって決定した。系統樹の下のスケールバーは、100ヌクレオチド当たり1ヌクレオチドの置換を示す。
本発明のポリマーは、pH及び温度を制御した、撹拌及び通気したバイオリアクターにおいて生産される。ポリマーを生産するためのプロセスは、炭素源、窒素源、及び無機塩を含有する栄養水性培地において微生物をインキュベートすることによって開始される。このプロセスは、初期バッチ相とその後のフェドバッチ相とを包含し、このフェドバッチ相の間に、無機培地がバイオリアクター内に導入される。
フコース含有ポリマーを生産するための培養培地は、炭素源、窒素源、及び無機塩を含有する栄養水性培地から構成される。
好ましい炭素源は、グリセロール及びグリセロール含有混合物である。或いは、炭素源は、単糖、二糖、若しくはオリゴ糖、アルコール、有機酸、アルカン、又は言及した化合物の2つ以上を含有する混合物であり得る。
微生物培養のための窒素源は、無機塩(例えば、(NH4)2HPO4、NH4OH、(NH4)2SO4、NH4Cl)若しくは有機窒素化合物(例えば、尿素、アミノ酸)、その混合物、又は窒素化合物を含有する食品若しくは産業の廃棄物若しくは副生成物(例えば、大豆粉、酵母抽出物、小麦ふすま)であり得る。
培養培地はまた、わずかな量の金属陽イオン、すなわち、ナトリウム、カリウム、マグネシウム、鉄、マンガン、コバルト、銅、及び亜鉛を含む。これらの陽イオンのそれぞれは、特にpH調整のために大量に存在し得るナトリウムを除いて、0.001から100mMの間の濃度で培養培地内に存在しなくてはならない。
バイオリアクターでの培養は、圧縮空気を通気した上記の水性栄養培地に微生物を接種することによって開始される。接種材料の容量は、培養の最初の全反応培地の10から30%の間に相当すべきである。
培養の最後に得られる培養液は、いかなる処理も伴わずに、直接用いることができる。或いは、未加工ポリマーを、最大80℃の温度で培養液を乾燥することによって、又は凍結乾燥によって得ることができる。
1)希釈された半精製ポリマー水性溶液(0.1〜5.0g/L)からポリマーを再沈殿させ、行った再沈殿の数と共に純度を増大させること、
2)異なる沈殿剤、すなわち、エタノール、アセトン、及び/若しくはイソプロパノール、又はその混合物で連続的な沈殿を行い、各溶媒に可溶性である異なる汚染物質の除去を促進すること、
3)半精製ポリマーを、ポリマーが不溶性である(例えば、ヘキサン)が汚染物質の1つ又は複数を可溶化する溶媒で洗浄すること、
4)タンパク質分解酵素(例えば、トリプシン)を用いること、タンパク質沈殿剤(例えば、トリクロロ酢酸)を添加すること、又は60から80℃の間の温度で加熱することによってタンパク性材料を変性させること、
5)濃度を低減させた(0.1〜5.0g/L)水性の半精製ポリマー溶液を、透析、限外濾過、又はダイアフィルトレーションして、高分子量ポリマーを全ての低分子量汚染物質から分離することで、高純度とすること。
3.1.組成
本発明のポリマーは、主に高分子量多糖(106〜107)によって構成され、全糖含有量の少なくとも10%のフコース含有量を有する。このポリマーはまた、グルコース及びガラクトース(それぞれ全糖含有量の20〜70%及び10〜40%)から構成される。ポリマー、フコース、ガラクトース、及びグルコースにおける言及した糖の相対的な組成は、培養時間及びバイオリアクター操作条件に応じる。
ゲル浸透クロマトグラフィーによって決定される、精製されたポリマーの平均分子量は、106〜107の範囲である。通常、ポリマーの生産が微生物の成長相の間に開始する場合、その平均分子量は約105であり、培養の実行の間に、106〜107の範囲の比較的一定な値まで経時的に増大する。
3.3.1.溶解度
本発明のポリマーは、周囲温度の、とりわけアセトン、イソプロパノール、DMSO、ヘキサン、ジエチルエーテル、キシレン、及びテトラクロロエチレンを含む広範な有機溶媒に不溶性である。ポリマーのこの特性によって、分離プロセスにおいて用いる溶媒耐性膜の調製におけるその利用が可能になる。しかし、ポリマーが一部の有機溶媒、とりわけテトラクロロエタンに可溶性であることが観察された。
本発明のポリマーと共に調製された水性溶液は、ニュートン流体ではなく、擬塑性流体の挙動を示す(図2)。0.8%(w/v)ポリマー溶液の見かけの粘度は、25℃で測定すると、5s−1のせん断速度では0.21Pa・sであり、500s−1のせん断速度では0.02Pa・sまで低下する。粘度はせん断速度が低下するとすぐに回復するため、ヒステリシス現象は観察されない。ポリマー溶液の擬塑性流体の挙動によって、この材料に、水性系の物理的特性を変化させる能力、並びに主に食品産業、医薬品産業、及び化粧品産業において増粘剤及びテクスチャー増強剤として利用される可能性が付与される。
本発明のポリマーは乳化活性を有し、これは、ポリマーが、疎水性化合物、例えば油(例えば、オリーブオイル、パラフィン)及び炭化水素(例えば、ヘキサン、トルエン)において水滴のエマルジョンを安定化させ得ることを意味する。したがって、ポリマーは、生物乳化剤又は安定剤として用いることができ、広範な用途、例えば、石油産業、洗剤産業、織物産業、製紙産業、塗装産業、化粧品産業、医薬品産業、及び食品産業において合成乳化剤に代わる可能性を有する。
本発明のポリマーは顕著な凝集活性も示し、天然の生物凝集剤として用いることができる。凝集剤は、細胞及びコロイドの凝集の促進において有用であり、廃水及び飲用水の処理並びに食品などの産業用途において広く用いられる。本発明のポリマーの生分解性及び安全性は、ヒトの健康にとって危険であり環境での分解が困難な合成凝集剤よりも有利である。
フコースを含有するポリマーは、他のバイオポリマー、例えばデンプン、ペクチン、アルギネート、カラギーナン、グルテン、ジェラン、及びキトサンと混合することによって、生分解性の複合フィルムの生産に用いることができる。これらのフィルムは、有機溶媒の処理材料及び包装材料における膜として利用することができる。
本発明のポリマーは、乳化活性及び凝集活性を示し、擬塑性流体の挙動を有する高粘度の水性溶液を形成する。その結果、このポリマーは、広範な用途において、すなわち、食品産業、医薬品産業、及び化粧品産業における増粘剤、テクスチャー増強剤、又は結合剤として、キサンタン、アルギネート、グアーガム、及びアラビアゴムのような他の多糖に代わり得る。
バイオディーゼル産業から生じるグリセロール副生成物を用いる、エンテロバクター属A47(DSM23139)細菌の培養によるフコース含有ポリマーの生産
エンテロバクター属A47(DSM23139)の培養物を、表3に示す組成を有する8Lの培養培地に接種した。バイオリアクター(BioStat B−plus、Sartorius)を以下の条件下で操作した:30℃で制御された温度、6.80±0.05で制御されたpH、1MのNaOHの自動添加、及び1.6L/分(0.2vvm)の一定の通気速度。微生物の成長が起こるにつれ、溶解酸素の濃度は、培養の実行の最初の80%の飽和から、1日後に、約20%に低下した。
グリセロール副生成物からエンテロバクター属A47(DSM23139)によって生産されるフコース含有ポリマーの抽出及び精製
例1において記載した培養の実行の最後に、フコースを含有するポリマーを、様々な純度の3つの異なる生産物の形態で、すなわち、非変性ポリマー、半精製されたポリマー、及び精製されたポリマーの形態で、発酵培養液から回収した。
エンテロバクター属A47(DSM23139)によって生産されるフコース含有ポリマーの化学的分析
例1において記載したように生産され、例2において記載したように抽出されたポリマーを、Freitasら(2009)において記載されている方法を用いて、その化学的組成に関して、すなわち、その糖組成、アシル基の含有量、及び非糖残基(タンパク質及び灰分)の量に関して特徴付けした。全ポリマー純度(非変性、透析により半精製されたもの、及び精製されたもの)の化学的組成を、培養の実行の間、経時的に分析した。
異なる温度及びpHの下での、バイオディーゼル産業から生じるグリセロール副生成物を用いる、エンテロバクター属A47(DSM23139)細菌の培養によるフコース含有ポリマーの生産
エンテロバクター属A47(DSM23139)の培養物を、表4に従った、異なる値の下で制御された温度及びpHを除いて、例1において記載したように、2Lのバイオリアクターにおいて培養した。各実行の最後に、ポリマーを、例2において記載したように回収した。
Claims (14)
- フコース含有多糖を含むポリマーを調製するための方法であって、
前記ポリマーは、炭素源としてグリセロール又はグリセロール含有混合物を用いる、受託番号DSM23139のエンテロバクター属(enterobacter)A47細菌の培養によって得られ、
前記方法は、
撹拌及び通気したバイオリアクター中の培養培地中で前記エンテロバクター属(enterobacter)A47細菌を培養するステップを含むバッチ相であって、前記培養培地は、グリセロール若しくはグリセロール含有混合物を含む炭素源、窒素源及び無機塩を含み、最初の溶解酸素濃度が70%超である、上記バッチ相、及び
前記エンテロバクター属(enterobacter)A47細菌を炭素利用性及び窒素制限の条件下で培養するステップを含むフェドバッチ相であって、窒素源が、0.1g/L未満の量に限定され、炭素源が、それの微生物の消費速度に適合するように供給され、溶解酸素濃度が、30%未満のレベルに制御される、上記フェドバッチ相
を含み、
前記バッチ相及びフェドバッチ相の間の温度が15から45℃の間であり、前記バッチ相及びフェドバッチ相の間のpHが5.0から9.0の間であり、
前記フェドバッチ相の最後の培養培地が最大80℃の温度で乾燥されるか若しくは凍結乾燥されるか、又は
前記エンテロバクター属(enterobacter)A47細菌細胞が、前記フェドバッチ相の最後で培養培地から除去され、無細胞上清中のポリマーが、培養培地の体積当たり1〜3容量の沈殿剤を添加することによって沈殿する、
上記方法。 - 前記フェドバッチ相の間に、無機培地がバイオリアクター内に導入される、請求項1に記載の方法。
- ポリマーが、透析技術、限外濾過技術、又はダイアフィルトレーション技術によってさらに精製される、請求項1又は2に記載の方法。
- 受託番号DSM23139のエンテロバクター属(enterobacter)A47細菌の培養が、前記エンテロバクター属(enterobacter)A47細菌の全反応培地の10から30体積%の間の容量の前記細菌の培地中への接種を通じて開始される、請求項1から3までのいずれか一項に記載の方法。
- 炭素源が、食品又は産業の廃棄物又は副生成物である、請求項1から4までのいずれか一項に記載の方法。
- 炭素源が、バッチ相の間、培養培地の2から10%(w/v)の間であり、フェドバッチ相において0.1%(w/v)超である、請求項1から5までのいずれか一項に記載の方法。
- 窒素源が、バッチ相の間、0.6から3.0g/Lの間の初期濃度を有し、フェドバッチ相において0.3g/L未満である、請求項1から6までのいずれか一項に記載の方法。
- 請求項1から7までのいずれか一項に記載の方法であって、前記ポリマーが、106〜107の平均分子量を有し、前記ポリマーが、全糖質含有量の少なくとも10%の量のフコースを含み、アシル基がポリマー乾燥重量の最大25%に相当する、上記方法。
- アシル基がスクシネート及び/又はピルベート及び/又はアセテート及び/又はこれらの組合せである、請求項8に記載の方法。
- 前記ポリマーが、全糖質含有量の20%〜70%の間の量のグルコース、10〜40%の間の量のガラクトース及び全糖質含有量の10%〜20%の間の量のグルクロン酸を含む、請求項8又は9に記載の方法。
- スクシネートが、ポリマー乾燥重量の最大20%を含み、ピルベートが、ポリマー乾燥重量の最大5%を含み、及び/又はアセテートが、ポリマー乾燥重量の最大5%を含む、請求項9に記載の方法。
- 前記ポリマーが、水性培地における擬塑性流体の挙動、並びに最大80℃の温度、3〜10の間のpH、及び最大20%NaClのイオン強度の下で安定な粘度を有する、請求項8から11までのいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリマーが、有機溶媒に不溶性である、請求項8から12までのいずれか一項に記載の方法。
- 前記ポリマーが、いくつかの疎水性化合物に対してエマルジョンを形成する能力及び安定化する能力を有し、前記エマルジョンが、最大100℃の温度までの加熱に対して安定である、請求項8から13までのいずれか一項に記載の方法。
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