JP5833311B2 - 有用物質の製造法 - Google Patents
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Description
(1)ホスホトランスフェラーゼ・システム(以下、PTSと略す)を介して細胞内へ取り込まれる糖を、PTSとは異なるシステムを介して細胞内に取り込む能力が強化され、かつ有用物質を生産する能力を有するコリネ型細菌に属する微生物を培地に培養し、培養物中に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から有用物質を採取することを特徴とする有用物質の製造法。
(2)PTSを介して細胞内に取り込まれる糖がグルコース、フラクトースおよびスクロースから選ばれる糖である、(1)記載の製造法。
(3)コリネ型細菌に属する微生物が、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属、ブレビバクテリウム(Brevibacterium)属およびミクロバクテリウム(Microbacterium)属からなる群より選ばれる属に属する微生物である、(1)または(2)記載の製造法。
(4)コリネ型細菌に属する微生物が、コリネバクテリウム属に属する微生物である、(1)〜(3)のいずれか1項に記載の製造法。
(5)コリネ型細菌に属する微生物が、コリネバクテリウム・グルタミカム(Corynebacterium glutamicum)に属する微生物である、(1)〜(4)のいずれか1項に記載の製造法。
(6)微生物が、コリネバクテリウム・グルタミカム(Corynebacterium glutamicum) SupH(FERM BP-10998)株である、(1)記載の製造法。
(7)培養を35〜38℃で行うことを特徴とする(1)〜(6)のいずれか1項に記載の製造法。
(8)有用物質がアミノ酸である、(1)〜(7)のいずれか1項に記載の製造法。
(9)PTSを介して細胞内へ取り込まれる糖を、PTSとは異なるシステムを介して細胞内に取り込む能力が強化され、かつ有用物質を生産する能力を有するコリネ型細菌に属する微生物が、[1]〜[5]のいずれかに記載の蛋白質の生成能が強化された微生物である、(1)記載の製造法。
[1]配列番号12または14で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
[2]配列番号12または14で表されるアミノ酸配列において1以上のアミノ酸が付加、欠失または置換されたアミノ酸配列からなり、かつミオイノシトール輸送活性を有する蛋白質
[3]配列番号13または15で表される塩基配列にコードされる蛋白質
[4]配列番号13または15で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAにコードされ、かつミオイノシトール輸送活性を有する蛋白質
[5]配列番号13または15で表される塩基配列と80%以上の相同性ないし同一性を有する塩基配列からなるDNAにコードされ、かつミオイノシトール輸送活性を有する蛋白質。
[1]配列番号12または14で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
[2]配列番号12または14で表されるアミノ酸配列において1以上のアミノ酸が付加、欠失または置換されたアミノ酸配列からなり、かつミオイノシトール輸送活性を有する蛋白質
[3]配列番号13または15で表される塩基配列にコードされる蛋白質
[4]配列番号13または15で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAにコードされ、かつミオイノシトール輸送活性を有する蛋白質
[5]配列番号13または15で表される塩基配列と80%以上の相同性ないし同一性を有する塩基配列からなるDNAにコードされ、かつミオイノシトール輸送活性を有する蛋白質。
B群:アスパラギン酸、グルタミン酸、イソアスパラギン酸、イソグルタミン酸、2-アミノアジピン酸、2-アミノスベリン酸
C群:アスパラギン、グルタミン
D群:リジン、アルギニン、オルニチン、2,4-ジアミノブタン酸、2,3-ジアミノプロピオン酸
E群:プロリン、3-ヒドロキシプロリン、4-ヒドロキシプロリン
F群:セリン、スレオニン、ホモセリン
G群:フェニルアラニン、チロシン
(a)有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも1つを緩和または解除する方法、
(b)有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも1つを発現強化する方法、
(c)有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも1つのコピー数を増加させる方法、
(d)有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路の少なくとも1つを弱化または遮断する方法、および
(e)野生型株に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を選択する方法、
などをあげることができ、上記公知の方法は単独または組み合わせて用いることができる。
日本DNAデータバンクDDBJから入手したコリネバクテリウム・グルタミカム野生株ATCC13032のゲノム情報(http://gib.genes.nig.ac.jp/single/index.php?spid=Cglu_ATCC13032)をもとに、HPrタンパク質をコードする遺伝子であるptsH[遺伝子番号:Cgl1937 (NCgl1862)]の上流域を増幅するためのプライマーを2種(ptsHup800F(配列番号1)とptsHFusR(配列番号2))、ならびに、ptsHの下流域を増幅するためのプライマーを2種(ptsHdown800R(配列番号3)とptsHFusF(配列番号4))、デザインした。
カナマイシン耐性遺伝子を有するEscherichia coliのベクターpHSG299 [Gene, 61, 63,(1987)]のPstI切断部位に、Bucillus subtilisのレバンシュクラーゼ遺伝子sacBを含む2.6kbのPstI DNA断片[Mol. Microbiol., 6, 1195 (1992)]を連結したプラスミドpESB30および上記で取得したptsH遺伝子破壊用DNA断片を、それぞれ制限酵素FbaIおよびBamHIで切断後、ライゲーションキットver1(宝酒造社製)を用い、リガーゼ反応を行った。該反応産物を用い、常法[Molecular cloning: a laboratory manual, 3rd ed.,2001, Cold Spring Harbor Laboratory Press]に従ってEscherichia coliDH5α[東洋紡社製]を形質転換した。
レストらの方法[Appl. Microbiol. Biotech., 52, 541 (1999)]に従って電気穿孔法にてATCC31833株にpCΔptsHを導入し、カナマイシン耐性株を選択した。該カナマイシン耐性株の1株から得た染色体の構造をサザンハイブリダイゼーション[Molecular cloning: a laboratory manual, 3rd ed.,2001, Cold Spring Harbor Laboratory Press]により調べたところ、pCΔptsHがCampbellタイプの相同組換えにより染色体に組み込まれていることが確認された。
ΔptsH株を、BY寒天培地(肉エキス 7g、ペプトン 10g、塩化ナトリウム 3g、酵母エキス 5g、バクトアガー 15gを水1Lに含み、pH7.2に調整した培地)に塗布し、30℃で18時間培養した。
SupH株およびATCC31833株をBY寒天培地に塗布し、30℃で18時間培養し、生育した菌体を、BY培地(寒天を含まない以外はBY寒天培地と同じ組成の培地) 5mlの入った太型試験管に植菌した。30℃で12時間培養し、得られた培養液0.05mLを、MM培地(寒天を含まない以外はMM寒天培地と同じ組成の培地)5mlの入ったL字型試験管にそれぞれ2本ずつ植菌して1本は30℃で、他方は38℃で好気培養した。OD660にて測定した生育の経過を図2に示す。
実施例1で得たSupH株に特開2002-191370号公報(米国特許7332310号公報)の記載に準じて、lysC311変異を導入してSupH(lysC311)株を作製する。
コリネバクテリウム・グルタミカムの野生株に、lysC311変異(Thr311→Ile)を導入すると、L-リジン生産菌が得られることが公知となっている[特開2002-191370、Appl. Microbiol. Biotechnol., 58, 217 (2002)]。また、該変異の導入方法についても、該公開特許公報[特開2002-191370]に詳細に記載されている。それらの情報に従い、lysC311変異を実施例1で得たSupH株およびその親株であるATCC31833株にそれぞれ導入した。lysC311変異を有するATCC31833株およびSupH株を、それぞれ、ATCC31833(lysC311)株およびSupH(lysC311)株と命名した。
以下のように配列番号13または15で表される塩基配列からなるDNA断片を有するプラスミドを構築した。
配列番号5および6で表される塩基配列からなるDNA、配列番号8および9で表される塩基配列からなるDNAをそれぞれプライマーセットとして用い、ATCC31833株の染色体DNAを鋳型としてPCRを行った。増幅されたそれぞれ約1kb、約1.88kbのDNA断片を混合してこれを鋳型として用い、配列番号5および9で表される塩基配列からなるDNAをプライマーセットとして用い、2回目のPCRを行った。これによりCgl0181発現用DNA断片(gapAプロモーターの下流にCgl0181をコードするDNAが挿入された約2.88kbのDNA断片)を取得した。
プラスミドpCS299P[Appl.Microbiol.Biotech.,63,592(2004)]および上記(1)で得たCgl0181の発現用DNA断片をそれぞれ制限酵素SalIおよびXhoIで切断後、ライゲーションキットver1(宝酒造社製)を用い、リガーゼ反応を行った。一方、pCS299Pおよび上記(1)で得たCgl3058の発現用DNAを制限酵素BamHIで切断後、同様にリガーゼ反応を行った。それぞれの反応産物を用い、常法に従ってEscherichiacoli DH5aを形質転換した。
実施例1で得たΔptsH株にpPgapA-0181およびpPgapA-3058を導入して、それぞれ、ΔptsH/pPgapA-0181株およびΔptsH/pPgapA-3058株を得た。これらを、グルコース培地、リボース培地、およびリボース培地に1mg/mlになるように2−デオキシグルコースを添加した培地にそれぞれ塗布し、30℃で2日間培養して生育を調べた。結果を第3表に示す。
実施例3で得たL-リジン生産菌ATCC31833(lysC311)株に、pPgapA-0181およびpPgapA-3058を導入して、それぞれ、ATCC31833(lysC311)/ pPgapA-0181株およびATCC31833(lysC311)/ pPgapA-3058株を得た。これらのL-リジン生産試験を、実施例3で示した試験管培養と同様な方法によって行った。遠心分離により培養物から菌体を除去し、上清中のL-リジン塩酸塩の蓄積量を高速液体クロマトグラフィー(HPLC)により定量した。結果を第4表に示す。
配列番号2−人工配列の説明:合成DNA
配列番号3−人工配列の説明:合成DNA
配列番号4−人工配列の説明:合成DNA
配列番号5−人工配列の説明:合成DNA
配列番号6−人工配列の説明:合成DNA
配列番号7−人工配列の説明:合成DNA
配列番号8−人工配列の説明:合成DNA
配列番号9−人工配列の説明:合成DNA
配列番号10−人工配列の説明:合成DNA
配列番号11−人工配列の説明:合成DNA
Claims (7)
- ホスホトランスフェラーゼ・システム(PTS)を介して細胞内へ取り込まれる糖を、PTSとは異なるシステムを介して細胞内に取り込む能力が強化され、かつ有用物質を生産する能力を有するコリネ型細菌に属する微生物を培地に培養し、培養物中に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から有用物質を採取することを特徴とする有用物質の製造法において、
PTSを介して細胞内へ取り込まれる糖を、PTSとは異なるシステムを介して細胞内に取り込む能力が強化され、かつ有用物質を生産する能力を有するコリネ型細菌に属する微生物が、[1]〜[4]のいずれかに記載の蛋白質の生成能が強化された微生物であり、
培養を35〜38℃で行うことを特徴とする、製造法。
[1]配列番号14で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
[2]配列番号14で表されるアミノ酸配列において1〜20個のアミノ酸が付加、欠失または置換されたアミノ酸配列からなり、かつミオイノシトール輸送活性を有する蛋白質
[3]配列番号15で表される塩基配列にコードされる蛋白質
[4]配列番号15で表される塩基配列と95%以上の同一性を有する塩基配列からなるDNAにコードされ、かつミオイノシトール輸送活性を有する蛋白質 - PTSを介して細胞内に取り込まれる糖がグルコース、フラクトースおよびスクロースから選ばれる糖である、請求項1記載の製造法。
- コリネ型細菌に属する微生物が、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属、ブレビバクテリウム(Brevibacterium)属およびミクロバクテリウム(Microbacterium)属からなる群より選ばれる属に属する微生物である、請求項1または2記載の製造法。
- コリネ型細菌に属する微生物が、コリネバクテリウム属に属する微生物である、請求項1〜3のいずれか1項に記載の製造法。
- コリネ型細菌に属する微生物が、コリネバクテリウム・グルタミカム(Corynebacterium glutamicum)に属する微生物である、請求項1〜4のいずれか1項に記載の製造法。
- 35〜38℃で行う培養が、対数増殖期における培養である、請求項1〜5のいずれか1項に記載の製造法。
- 有用物質がアミノ酸である、請求項1〜6のいずれか1項に記載の製造法。
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