JP5139885B2 - 蛍光解析装置及び解析方法 - Google Patents
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nAB(t)=0
となり、測定データFA(t)、FB(t)の両者が0でない場合に、相乗平均、相加平均、または調和平均のいずれかとなる関数fで
nAB(t)=f(FA(t)、FB(t))
となる光子数解析データnAB(t)を生成する解析データ生成手段と、(7)解析データ生成手段によって生成された光子数解析データnAB(t)に対し、蛍光プローブを含む測定試料の測定結果についての蛍光解析を行う測定結果解析手段とを備え、測定結果解析手段は、光子数解析データn AB (t)を、測定試料中での蛍光プローブの濃度に応じて設定されたビン時間幅でビニングし、ビニングされた解析データに対して蛍光解析を行うことを特徴とする。
nAB(t)=0
となり、測定データFA(t)、FB(t)の両者が0でない場合に、相乗平均、相加平均、または調和平均のいずれかとなる関数fで
nAB(t)=f(FA(t)、FB(t))
となる光子数解析データnAB(t)を生成する解析データ生成ステップと、(7)解析データ生成ステップにおいて生成された光子数解析データnAB(t)に対し、蛍光プローブを含む測定試料の測定結果についての蛍光解析を行う測定結果解析ステップとを備え、測定結果解析ステップにおいて、光子数解析データn AB (t)を、測定試料中での蛍光プローブの濃度に応じて設定されたビン時間幅でビニングし、ビニングされた解析データに対して蛍光解析を行うことを特徴とする。
nAB(t)=√(FA(t)・FB(t))
によって光子数解析データnAB(t)を生成することが好ましい。このように相乗平均を用いて解析データを求めることにより、蛍光検出の同時性が考慮された蛍光解析を好適に実行することができる。また、この方法では、測定データFA、FBの少なくとも一方が0の場合においても、相乗平均の上記関数√(FA・FB)でnAB=0となる。
nAB(t)=2/{1/FA(t)+1/FB(t)}
によって光子数解析データnAB(t)を生成する構成を用いても良い。このように調和平均を用いて解析データを求めることにより、相乗平均の場合と同様に、蛍光検出の同時性が考慮された蛍光解析を好適に実行することができる。
nAB(t)=0
となり、測定データの両者が0でない場合(FA・FB>0)に所定の関数fで
nAB(t)=f(FA(t)、FB(t))
となる光子数解析データnAB(t)を生成する。
によって解析データnAB(t)を生成する方法を用いることができる。なお、相乗平均の場合、その定義式で測定データの少なくとも一方が0の場合にnAB=0となる条件が満たされるため、その場合も含めて上記式(1)で解析データが定義される。
によって求めることができる。
によって求められる。ここで、これらの相関関数GAB(τ)、GBA(τ)の対称性
を考慮すると、下記の式(7)で定義される関数GC(τ)=GCROSS(τ)
を光検出器31、32間の相互相関関数として用いることができる。
によって求められる。ここで、<N>は試料Sで共焦点光学系によって構築される測定領域内に滞在する蛍光プローブの平均分子数を示し、また、τDは拡散時定数、r0、z0は構造パラメータ(ストラクチャパラメータ)、Tは三重項状態へと遷移する割合、λは三重項遷移の時定数をそれぞれ示している。これらのパラメータは、取得された相関関数に対してフィッティング計算による波形解析を行うことで求めることができる。
G(τ=0)=1/<N>
の関係が得られる。すなわち、相関関数G(τ)のy切片により、試料S中での蛍光プローブの濃度に対応する測定領域内での平均分子数<N>が求められる。
nAB(t)=√(FA(t)・FB(t))
を用いることにより、光子検出の同時性の観点から1個の蛍光プローブによる検出イベントを排除することができる。また、この解析データでは、同時性の評価のため、測定データFA、FBの一方または両方が0でnAB=0となる場合も除外せずに解析データを求める。また、相乗平均による上記の解析データは、光分岐手段として分岐比1:1のビームスプリッタを用いた場合の蛍光解析において、特に好適に適用することができる。
となる。なお、相乗平均による解析データは実数データであるため、この式(9)の相関関数を求める演算も実数演算となる。このような演算を含む蛍光解析は、測定制御部50でソフトウェア的に解析演算を行う構成において好適に実現することできる。
によって求められる。ここで、式(10)、式(11)において、添え字iは標的分子に対する蛍光プローブの結合状態が異なる場合の各蛍光成分を示している。また、αは蛍光の発光効率に関する係数である。また、式(11)の相関波形成分では、三重項に関する波形部分を省略している。
となる。ここで、添え字i=1はフリーの蛍光プローブによる蛍光成分を示し、i=2は標的分子に蛍光プローブが1個結合した場合の蛍光成分を示し、i=3は標的分子に蛍光プローブが2個結合した場合の蛍光成分を示している。また、この場合の蛍光プローブの総分子数<N>は、下記の式(13)
によって求められる。
によって求められるが、時間遅れτが例えば100nsec〜1secの範囲全体で一定のビン幅100nsecの分解能を適用すると演算量が膨大となり、また、時間遅れτが大きい領域で求められる波形のSN比が劣化する場合がある。
<N>:21.4
τD:0.256ms
T:0.123
λ:0.396μs
r0/z0:0.2
と求められ、この場合の平均分子数は<N>=21.4となっている。
<N>:1.66
τD:0.256ms
T:0.247
λ:2.28μs
r0/z0:0.2
と求められ、この場合の平均分子数は<N>=1.66となっている。
となり、FA・FB>0の場合に所定の関数fで
となるように求められる。また、FA・FB>0の場合の解析データの具体的な算出方法としては、上記に例示した相乗平均による解析データnAB
を用いることができる。これにより、蛍光検出の同時性が考慮された蛍光解析を好適に実行することができる。また、この方法では、FA・FB=0の場合においても、相乗平均の上記関数でnAB=0となる。
を用いることができる。なお、この方法では、相加平均の上記関数ではFA、FBの一方のみが0の場合にnAB=0とならない。このため、FA・FB=0の場合については、別にnAB=0と定義する。
を用いることができる。これにより、相乗平均の場合と同様に、蛍光検出の同時性が考慮された蛍光解析を好適に実行することができる。また、この方法でも、FA・FB=0の場合については、別にnAB=0と定義する。
を用いても良い。ただし、この積による解析データは、他の相乗平均、相加平均、調和平均による解析データとは性質が異なっている。
30…ビームスプリッタ、31…第1光検出器、32…第2光検出器、33…第1検出信号処理部、34…第2検出信号処理部、35…光子計数部、50…測定制御部、51…解析データ生成部、52…測定結果解析部。
Claims (13)
- 測定試料に対して設定された測定領域に励起光を照射する励起光照射手段と、
前記励起光照射手段によって前記励起光が照射された前記測定試料の前記測定領域内にある蛍光プローブから発生する蛍光を2つの蛍光成分に分岐する光分岐手段と、
分岐された一方の第1蛍光成分を検出する第1蛍光検出手段と、
分岐された他方の第2蛍光成分を検出する第2蛍光検出手段と、
前記第1蛍光検出手段及び前記第2蛍光検出手段でそれぞれ検出された光子数を所定の計数時間幅で時系列的に計数して、第1光子数測定データFA(t)及び第2光子数測定データFB(t)を取得する光子計数手段と、
前記第1光子数測定データFA(t)及び前記第2光子数測定データFB(t)に基づいて、測定データFA(t)、FB(t)の少なくとも一方が0の場合に
nAB(t)=0
となり、測定データFA(t)、FB(t)の両者が0でない場合に、相乗平均、相加平均、または調和平均のいずれかとなる関数fで
nAB(t)=f(FA(t)、FB(t))
となる光子数解析データnAB(t)を生成する解析データ生成手段と、
前記解析データ生成手段で生成された前記光子数解析データnAB(t)に対し、前記蛍光プローブを含む前記測定試料の測定結果についての蛍光解析を行う測定結果解析手段と
を備え、
前記測定結果解析手段は、前記光子数解析データn AB (t)を、前記測定試料中での前記蛍光プローブの濃度に応じて設定されたビン時間幅でビニングし、ビニングされた解析データに対して前記蛍光解析を行うことを特徴とする蛍光解析装置。 - 前記解析データ生成手段は、測定データFA(t)、FB(t)の両者が0でない場合に、測定データFA(t)、FB(t)の相乗平均となる関数fで
nAB(t)=√(FA(t)・FB(t))
によって前記光子数解析データnAB(t)を生成することを特徴とする請求項1記載の蛍光解析装置。 - 前記解析データ生成手段は、測定データFA(t)、FB(t)の両者が0でない場合に、測定データFA(t)、FB(t)の調和平均となる関数fで
nAB(t)=2/{1/FA(t)+1/FB(t)}
によって前記光子数解析データnAB(t)を生成することを特徴とする請求項1記載の蛍光解析装置。 - 前記解析データ生成手段は、測定データF A (t)、F B (t)の両者が0でない場合に、測定データF A (t)、F B (t)の相加平均となる関数fで
n AB (t)={F A (t)+F B (t)}/2
によって前記光子数解析データn AB (t)を生成することを特徴とする請求項1記載の蛍光解析装置。 - 前記測定結果解析手段は、前記光子数解析データnAB(t)に対し、前記蛍光解析として、自己相関解析またはフォトンバースト解析の少なくとも一方を行うことを特徴とする請求項1〜4のいずれか一項記載の蛍光解析装置。
- 前記励起光は単一波長領域の励起光であり、前記第1蛍光成分及び前記第2蛍光成分は同一波長領域の蛍光成分であることを特徴とする請求項1〜5のいずれか一項記載の蛍光解析装置。
- 測定試料に対して設定された測定領域に励起光を照射する励起光照射ステップと、
前記励起光照射ステップで前記励起光が照射された前記測定試料の前記測定領域内にある蛍光プローブから発生する蛍光を2つの蛍光成分に分岐する光分岐ステップと、
分岐された一方の第1蛍光成分を検出する第1蛍光検出ステップと、
分岐された他方の第2蛍光成分を検出する第2蛍光検出ステップと、
前記第1蛍光検出ステップ及び前記第2蛍光検出ステップでそれぞれ検出された光子数を所定の計数時間幅で時系列的に計数して、第1光子数測定データFA(t)及び第2光子数測定データFB(t)を取得する光子計数ステップと、
前記第1光子数測定データFA(t)及び前記第2光子数測定データFB(t)に基づいて、測定データFA(t)、FB(t)の少なくとも一方が0の場合に
nAB(t)=0
となり、測定データFA(t)、FB(t)の両者が0でない場合に、相乗平均、相加平均、または調和平均のいずれかとなる関数fで
nAB(t)=f(FA(t)、FB(t))
となる光子数解析データnAB(t)を生成する解析データ生成ステップと、
前記解析データ生成ステップで生成された前記光子数解析データnAB(t)に対し、前記蛍光プローブを含む前記測定試料の測定結果についての蛍光解析を行う測定結果解析ステップと
を備え、
前記測定結果解析ステップにおいて、前記光子数解析データn AB (t)を、前記測定試料中での前記蛍光プローブの濃度に応じて設定されたビン時間幅でビニングし、ビニングされた解析データに対して前記蛍光解析を行うことを特徴とする蛍光解析方法。 - 前記解析データ生成ステップにおいて、測定データFA(t)、FB(t)の両者が0でない場合に、測定データFA(t)、FB(t)の相乗平均となる関数fで
nAB(t)=√(FA(t)・FB(t))
によって前記光子数解析データnAB(t)を生成することを特徴とする請求項7記載の蛍光解析方法。 - 前記解析データ生成ステップにおいて、測定データFA(t)、FB(t)の両者が0でない場合に、測定データFA(t)、FB(t)の調和平均となる関数fで
nAB(t)=2/{1/FA(t)+1/FB(t)}
によって前記光子数解析データnAB(t)を生成することを特徴とする請求項7記載の蛍光解析方法。 - 前記解析データ生成ステップにおいて、測定データF A (t)、F B (t)の両者が0でない場合に、測定データF A (t)、F B (t)の相加平均となる関数fで
n AB (t)={F A (t)+F B (t)}/2
によって前記光子数解析データn AB (t)を生成することを特徴とする請求項7記載の蛍光解析方法。 - 前記測定結果解析ステップにおいて、前記光子数解析データnAB(t)に対し、前記蛍光解析として、自己相関解析またはフォトンバースト解析の少なくとも一方を行うことを特徴とする請求項7〜10のいずれか一項記載の蛍光解析方法。
- 前記励起光は単一波長領域の励起光であり、前記第1蛍光成分及び前記第2蛍光成分は同一波長領域の蛍光成分であることを特徴とする請求項7〜11のいずれか一項記載の蛍光解析方法。
- 前記測定試料に加える前記蛍光プローブとして1種類の蛍光プローブのみを用いるとともに、前記測定試料に含まれる標的分子に2個以上の同一種類の前記蛍光プローブが結合する場合の前記蛍光解析に適用されることを特徴とする請求項7〜12のいずれか一項記載の蛍光解析方法。
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