JP4816791B2 - 反応容器プレート及び反応処理装置 - Google Patents
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Description
また、微量の液体を定量的に扱うことができる微量液体秤取構造として、第1流路及び第2流路と、上記第1流路の流路壁に開口する第3流路と、第2流路の流路壁に開口して第3流路の一端と第2流路を連結し第3流路よりも相対的に毛管引力が働きにくい性質を第4流路とを有する構造を備えたものがある(例えば特許文献2,3を参照。)。その微量液体秤取構造によれば、第1流路に導入された液体が第3流路内に引き込まれた後、第1流路に残存する上記液体を取り除き、第3流路の容積に応じた体積の液体を第2流路に秤取することができる。
そこで本発明は、反応容器プレートの外部からの異物の進入や、外部への環境汚染を防ぐことができる反応容器プレート及びその反応容器プレートの処理装置を提供することを目的とするものである。
切替えバルブによりシリンジと封止容器を接続し、シリンジにより封止容器に液体を注入する際、封止容器内の気体は封止容器エアー抜き流路へ排出される。また、シリンジにより封止容器内の液体を吸引する際、封止容器エアー抜き流路から封止容器内に気体が流入する。
封止容器エアー抜き流路の他端は内部容量が受動的に可変な容量可変部に接続されて密閉されるようにしてもよい。
また、上記導入孔の一部分の内径が上記流路カバー側の上記流路ベース表面での上記導入孔の内径に比べて狭くなっているようにしてもよい。
さらに、上記導入孔の狭くなっている部分の内径は1μm(マイクロメートル)〜2mm(ミリメートル)である例を挙げることができる。
さらに、上記サンプル容器は、尖端の鋭利な分注器具により貫通でき、かつ貫通後に上記分注器具を引き抜くとその貫通孔を弾性によって閉じることのできる弾性部材によって密封されているようにしてもよい。
さらに、上記サンプル容器に予めサンプル前処理液又は試薬が収容されているようにしてもよい。
さらに、上記ロータリー式バルブはその回転中心に上記シリンジにつながるポートを備え、上記シリンジは上記ロータリー式バルブ上に配置されているようにしてもよい。
遺伝子増幅反応にはPCR法やLAMP法などを含む。DNAを増幅するPCR法に着目すれば、前処理なしで血液などのサンプルから直接PCR反応を行なわせる方法も提案されている。そこでは、遺伝子を含むサンプル中の目的とする遺伝子を増幅する核酸合成法において、遺伝子を含むサンプル中の遺伝子包含体もしくは遺伝子を含むサンプルそのものを遺伝子増幅反応液に添加して、添加後の該反応液のpHが8.5−9.5(25℃)で遺伝子を含むサンプル中の目的とする遺伝子を増幅する(特許文献2参照。)。
上記反応容器は上記反応容器流路に導入される液体に遺伝子が含まれている場合にその遺伝子と反応するプローブを備えているようにしてもよい。
さらに、上記プローブは蛍光標識されたものでもよい。
さらに、封止容器に連通して封止容器エアー抜き流路を備えているようにしたので、封止容器への液体の注入及び封止容器からの液体の吸引の際に、封止容器と封止容器エアー抜き流路の間で気体を流通させることができ、封止容器への液体の注入及び封止容器からの液体の吸引を円滑に行なうことができ、封止容器内の加圧又は減圧に起因して封止容器への液体の注入及び封止容器からの液体の吸引ができなくなるのを防止することができる。
反応容器への液体の注入を可能にしつつ、反応容器を封止して、反応容器プレートの外部からの異物の進入や、液体の外部への環境汚染を防ぐことができる。
そこで、導入孔の一部分の内径が流路ベース表面での導入孔の内径に比べて狭くなっているようにすれば、接続孔の流路カバー側の流路ベース表面での内径を大きくすることができ、導入孔が均一な内径で形成されている場合に比べて小さい注入圧力で液体を反応容器に分注することができる。
反応容器への液体の注入を可能にしつつ、反応容器を封止して、反応容器プレートの外部からの異物の進入や、液体の外部への環境汚染を防ぐことができる。
さらに、反応容器に接続された反応容器エアー抜き流路を備えているので、注入流路を介しての反応容器への液体の注入の際に反応容器と反応容器エアー抜き流路の間で気体を流通させることができる。これにより、反応容器への液体の注入を円滑に行なうことができる。また、反応容器エアー抜き流路は、反応容器への液体の注入の際に、反応容器エアー抜き流路から反応容器内の気体を吸引して反応容器内を減圧させて液体を注入させる注入方法に用いることもできる。
さらに、サンプル容器は、尖端の鋭利な分注器具により貫通でき、かつ貫通後に分注器具を引き抜くとその貫通孔を弾性によって閉じることのできる弾性部材によって密封されているようにすれば、弾性部材を介してサンプル容器内にサンプル液を注入することができ、その後サンプル液がサンプル容器外に漏れるのを防止することができる。
さらに、サンプル容器に予めサンプル前処理液又は試薬が収容されているようにすれば、サンプル容器にサンプル前処理液又は試薬を分注する必要がなくなる。
さらに、ロータリー式バルブはその回転中心にシリンジにつながるポートを備え、シリンジはロータリー式バルブ上に配置されているようにすれば、上記ポート−シリンジ間の流路を短くする又は無くすことができ、構造が簡単になる。さらに、切替えバルブ上の領域を有効に利用することができ、シリンジを切替えバルブ上とは異なる領域に配置する場合に比べて、反応容器プレートの平面サイズの縮小化を図ることもできる。
この反応容器プレートに注入され反応容器に導入されたサンプルを密閉系で扱うことができるようになるので、この反応容器プレートの外側の環境を汚染することがなく、また外部からの侵入物によってサンプルが汚染されることを防止することもできる。
3 容器ベース
5 反応容器
11 流路ベース
11a 凸部
11b 導入孔
12 導入孔
12a 流路
12b 流路
13 流路カバー
15 導入流路
17 サンプル容器
17b,17d,17e エアー抜き流路
19 試薬容器
19b,19d,19e エアー抜き流路
21 試薬容器
21b,21d エアー抜き流路
33 シリンジ
35 エアー抜き流路
35b ベローズ
47 切替えバルブ
59 流路ベース
60 導入孔
60a 流路
60b 流路
101 反応容器プレート
103 容器ベース
105 反応容器
111 流路ベース
113 主流路
115 計量流路
117 注入流路
119,121 反応容器エアー抜き流路
135 サンプル容器
135b,135d,135e サンプル容器エアー抜き流路
137 試薬容器
137b,137d,137e 試薬容器エアー抜き流路
139 エアー吸引用容器
139b,139d,139e エアー吸引用容器エアー抜き流路
151 シリンジ
163 切替えバルブ
173 流路スペーサ
175 凸部
177 注入流路
179 反応容器エアー抜き流路
図1Aから図5Bを参照して反応容器プレートの一実施例について説明する。
流路ベース11は凸部11aの先端部から反対側の面に貫通している導入孔11bを凸部11aの形成位置ごとに備えている。導入孔11bは流路ベース11材料の弾力により、液体を通さない程度に閉じている。
エアー抜き流路17eは例えば幅5〜200μm、深さ5〜200μmの寸法の1本又は複数本の細孔によって形成されており、サンプル容器17内とサンプルエアー抜き流路17d内で圧力差がない状態でサンプル容器17の液密を保つ。突起部17c上にサンプル容器17及びエアー抜き流路17dを覆って弾性部材であるセプタム23が形成されている。セプタム23は例えばシリコーンゴムやPDMSなどの弾性材料によって形成されており、尖端が鋭利な分注器具により貫通でき、かつ貫通後に分注器具を引き抜くとその貫通孔を弾性によって閉じることができる。セプタム23上に、サンプル容器17に対応して開口部をもち、セプタム23を固定するためのセプタムストッパ25が配置されている。この実施例ではサンプル容器17内に予め試薬27が収容されている。
エアー抜き流路19eは例えば幅5〜200μm、深さ5〜200μmの寸法の1本又は複数本の細孔によって形成されており、試薬容器19内と試薬エアー抜き流路19d内で圧力差がない状態で試薬容器19の液密を保つ。突起部19c上に試薬容器19及びエアー抜き流路19dを覆って例えばアルミニウムからなるフィルム29が形成されている。試薬容器19内に試薬31が収容されている。
ロータアッパー43は、流路15a,17a,19a,21aのいずれかに接続される1つの貫通穴と、シール板41の貫通溝に対応して表面に設けられた溝と、中心に設けられシリンジ流路33cに連通する貫通孔を備えている。
ロータベース45はその表面に、ロータアッパー43の中心と周縁部に配置された2つの貫通孔を接続するための溝を備えている。
図1Aに示した切替えバルブ47の状態はシリンジ流路33cが流路15a,17a,19a,21aのいずれにも接続されず、エアー抜き流路35も流路15b,17b,19b,21b,35のいずれとも接続されていない初期状態を示している。流路15a,15bはいずれのポートとも接続されていないので、導入流路15は密閉された状態になっている。
図7に示すように、図1Aに示した切替えバルブ47の状態から切替えバルブ47を回転させてサンプル流路17aとシリンジ流路33cを接続し、エアー抜き流路17bをエアー抜き流路35に接続する。このとき、エアー抜き流路19b,21bもエアー抜き流路35に接続される。
切替えバルブ47の接続位置が図9に示した位置の状態で、図10Bに示すように、付勢機構55を反応容器プレート1側へ移動させ、第2ユニット55bよりも反応容器プレート1側に配置された第1ユニット55aが流路カバー13の反応容器5の周囲に対応する部分を流路ベース11に押し付ける。これにより、導入孔11b上を含んで反応容器5上で、混合液57が収容された密閉導入流路空間が形成される。
さらに付勢機構55を反応容器プレート1側へ移動させると、第2ユニット55bが密閉導入流路空間上の流路カバー13を流路ベース11側へ付勢する。これにより、密閉導入流路空間の内圧が上昇し、導入孔11bが弾性的に開き、混合液57が反応容器5内に分注される。このとき、反応容器5はエアー抜き流路5a、エアー層5b及びドレイン空間15cを介してエアー抜き流路35に接続されており、反応容器5内の気体はエアー抜き流路5a側へ移動できるようになっているので、反応容器5の内圧の上昇を低減することができ、混合液57が反応容器5内に分注されやすくなっている。
温調機構51により反応容器5を過熱してワックス9を融解させて混合液57と試薬7を反応させる。なお、混合液57を反応容器5内に分注する前に、温調機構51により反応容器5を過熱してワックス9を融解させておき、反応容器5内に分注時にワックス9が融解しているようにしてもよい。
反応容器5内への液体の分注時には、図10Bに示したのと同様に、流路12bが弾性的に開き、液体が反応容器5内に分注される。
図14から図19を参照して反応容器プレートの一実施例について説明する。
ロータアッパー159は、シール板157の貫通孔157aと同じ位置に設けられた貫通孔159aと、シール板157の貫通溝157bに対応して表面に設けられた溝159bと、中心に設けられた貫通孔159cを備えている。
ロータベース161はその表面に、ロータアッパー159の周縁部と中心に配置された2つの貫通孔159a,159cを接続するための溝61aを備えている。
図14Aに示した切替えバルブ163の位置は、シリンジ流路151cは流路113a,135a,137a,139aのいずれにも接続されておらず、エアー抜き流路153も流路123a,125a,135b,137b,139bのいずれとも接続されていない初期状態の位置を示している。
反応処理装置は反応容器105の温度調整をするための温調機構167と、シリンジ151を駆動するためのシリンジ駆動ユニット169と、切替えバルブ163を切り替えるための切替えバルブ駆動ユニット171を備えている。
図21に示すように、図14Aに示した切替えバルブ163の状態から切替えバルブ163を回転させてサンプル流路135aとシリンジ流路151cを接続し、サンプル容器エアー抜き流路135bをエアー抜き流路153に接続する。このとき、エアー抜き流路137b,139bもエアー抜き流路153に接続される。サンプル容器135には例えば45μLの試薬145が収容されている。
また、希釈混合液を反応容器105内に注入する前に、温調機構167により反応容器105を加熱してワックス109を融解させておき、反応容器105内への希釈混合液の注入時にワックス109が融解しているようにしてもよい。この場合、反応容器105に注入された希釈混合液は直ちにワックス109の下に入り、希釈混合液と試薬107が混ざり反応する。切替えバルブ163の接続状態が図27の状態であっても、ベローズ153bにより密閉系は確保されている。希釈混合液の注入後に切替えバルブ163を図14の接続状態にすれば、反応容器プレート101内部の容器、流路及びドレイン空間を密閉することができる。ここで切替えバルブ163を図14の接続状態に切り替えるタイミングは、希釈混合液の注入直後から希釈混合液と試薬107の反応終了までのいずれのタイミングであってもよいし、希釈混合液と試薬107の反応終了後であってもよい。
このように、反応容器プレート101によれば、反応処理を密閉系で行なうことができ、反応処理前及び反応処理後も密閉系にすることができる。
さらに、流路スペーサ173は流路ベース111の反応容器エアー抜き流路119と反応容器105を連通させるための貫通孔からなる反応容器エアー抜き流路179も備えている。
この実施例は、図28を参照して説明した実施例と比べて、反応容器105の内部に突起部181をさらに備えている。突起部181の先端は凸部175の先端の下方に配置されている。これにより、凸部175の先端に形成される液滴を反応容器105内に導きやすくなる。特に、突起部181の少なくとも先端の表面に親水性処理を施しておけば、特に有効である。
この実施例は、図29を参照して説明した実施例と比べて、反応容器105の側壁に形成された段差部183と、反応容器105の上面とは間隔をもって段差部183の上面に形成された凸条部185をさらに備えている。段差部183及び凸条部185は上方から見て環状に形成されている。凸条部185の先端は反応容器105の側壁とは間隔をもって配置されている。
凸条部185の先端が反応容器105の上面及び側面とは間隔をもって配置されていることにより、反応容器105の内部に収容された液体が反応容器の側壁を伝って反応容器105の上面に到達するのを防止することができる。この効果は凸条部185の少なくとも先端部分に撥水処理を施しておくと特に有効である。
また、図28、図29又は図30を参照して説明した各実施例では、流路113,115,117,119,121,123を形成するための溝は流路ベース111に形成されているが、本発明はこれに限定されるものではなく、それらの流路の全部又は一部分を形成するための溝は、流路スペーサ173の流路ベース111側表面、流路スペーサ173の容器ベース111側表面、容器ベース103表面のいずれに形成されていてもよい。
また、ベローズ35b,153b等の容量可変部材は必ずしも備えていなくてもよい。
また、容器17,19,21,135,137,139に試薬等の液体を予め収容しないのであれば、エアー抜き流路の一部分に細孔からなる流路17e,19e,135e,137e,139e等を必ずしも備えている必要はない。
また、容器17,19,21,135,137,139の封止方法として開閉可能なキャップを用いてもよい。
また、反応容器5,105内の試薬は乾燥試薬でもよい。
また、サンプル容器17,135内や反応容器5,105内に予め試薬は収容されていなくてもよい。
また、導入流路15や主流路113に導入される液体に遺伝子が含まれている場合、反応容器5,105内にその遺伝子と反応するプローブを備えているようにしてもよい。
また、上記実施例では切替えバルブとしてロータリー式の切替えバルブ47,163を用いているが、切替えバルブはこれに限定されるものではなく、種々の流路切替えバルブを用いることができる。また、切替えバルブを複数備えていてもよい。
また、図1〜図13を参照して説明した上記実施例では、エアー抜き流路5aはエアー抜き流路5bを介してドレイン空間15cに接続されているが、これに限定されるものではない。反応容器に接続されたエアー抜き流路は、反応容器内への液体の導入にともなう反応容器内圧の上昇を十分に低減できる構成であればよい。なお、エアー抜き流路は、反応容器プレートの外部からの異物の進入や液体の外部への環境汚染を防ぐために、外部雰囲気とは遮断されているか密閉可能な構成であることが好ましい。
また、図14〜図30を参照して説明した上記実施例では、シリンジ151は切替えバルブ163上に配置されているが、シリンジ151を配置する位置は切替えバルブ163上に限定されるものではなく、どこでもよい。
Claims (25)
- 封止された反応容器と、
前記反応容器に接続された反応容器流路と、
前記反応容器とは別途設けられ、封止された封止容器と、
前記封止容器に接続された封止容器流路と、
液体を送液するためのシリンジと、
前記シリンジを前記反応容器流路又は前記封止容器流路に接続するための切替えバルブと、
一端が前記封止容器に連通して設けられた封止容器エアー抜き流路と、を備えた反応容器プレート。 - 前記封止容器エアー抜き流路の一部分は、前記封止容器内と前記封止容器エアー抜き流路内で圧力差がない状態で前記封止容器の液密を保つための細孔により構成されている請求項1に記載の反応プレート。
- 前記封止容器エアー抜き流路の他端は内部容量が受動的に可変な容量可変部に接続されて密閉される請求項1又は2に記載の反応プレート。
- 基板表面に開口部をもつ前記反応容器を備えた容器ベースと、
前記反応容器を封止するために前記容器ベースの表面に前記反応容器を覆って配置され、前記反応容器上で表面から裏面に貫通して形成された導入孔をもつ流路ベースと、
前記流路ベース上に配置され、前記流路ベースと対向する面に空間を備え、その空間と前記流路ベースの表面により前記導入孔上を通る導入流路を形成するための流路カバーを備え、
前記反応容器流路は前記導入流路及び前記導入孔により構成され、
前記導入流路は密閉可能に形成されており、
前記導入孔は前記導入流路内が前記導入流路に液体が導入されるときの導入圧力状態では前記液体を通さず前記導入流路内が前記導入圧力よりも大きく加圧された注入圧力状態のときに前記導入流路内の前記液体を前記反応容器側に通すものであり、
前記流路カバーは少なくとも前記導入流路の一部分に対応する部分に可撓部を備え、
前記導入流路に前記液体が導入された後、前記流路カバーの前記可撓部が前記流路ベース側に付勢されることにより前記導入流路内が前記注入圧力状態にされて前記液体が前記導入孔を通って前記反応容器に注入されるようにした請求項1から3のいずれか一項に記載の反応容器プレート。 - 前記流路ベースは少なくとも前記導入孔及びその周囲部が弾性部材からなり、
前記導入孔は前記導入流路内が前記導入圧力状態では前記液体を通さない程度に弾性的に閉じており、前記導入流路内が前記注入圧力状態では前記液体を通す程度に弾性的に開くものである請求項4に記載の反応容器プレート。 - 前記導入孔の一部分の内径が前記流路カバー側の前記流路ベース表面での前記導入孔の内径に比べて狭くなっている請求項4又は5に記載の反応容器プレート。
- 前記導入孔の狭くなっている部分の内径は1μm〜2mmである請求項6に記載の反応容器プレート。
- 前記容器ベースに複数の前記反応容器を備え、それらの反応容器上にそれぞれ前記導入孔を備え、前記導入流路は複数の前記導入孔上を通って形成されている請求項4から7のいずれか一項に記載の反応容器プレート。
- 前記流路ベースは前記反応容器プレートと対向する面に前記反応容器内に突出する凸部を備え、
前記凸部は先端部が基端部に比べて細くなっており、
前記導入孔は前記凸部を通って形成されている請求項4から8のいずれか一項に記載の反応容器プレート。 - 前記反応容器に接続された反応容器エアー抜き流路をさらに備え、
前記反応容器流路は、貼り合わされた2枚の部材の接合面に形成された溝、又は前記溝及び前記基板に形成された貫通孔からなり、かつ、主流路と、前記主流路から分岐した所定容量の計量流路と、一端が前記計量流路に接続され他端が前記反応容器に接続された注入流路を備え、
前記主流路及び前記反応容器エアー抜き流路は密閉可能になっており、
前記注入流路は前記計量流路よりも細く形成されて前記主流路及び前記計量流路に液体が導入されるときの液体導入圧力状態並びに前記主流路内の前記液体がパージされるときのパージ圧力状態では前記液体を通さず、それらよりも加圧状態で前記液体を通すものである請求項1から3のいずれか一項に記載の反応容器プレート。 - 前記注入流路の水滴に対する接触角は90度以上であり、前記注入流路と前記計量流路の境界の面積は1〜10000000μm2である請求項10に記載の反応容器プレート。
- 複数の前記反応容器を備え、それらの反応容器ごとに前記計量流路及び前記注入流路を備え、前記主流路に複数の前記計量流路が接続されている請求項10又は11に記載の反応容器プレート。
- 前記注入流路の前記他端は前記反応容器の内側上面に突出して形成された凸部の先端に配置されており、前記凸部は先端部が基端部に比べて細くなっている請求項10から12のいずれか一項に記載の反応容器プレート。
- 前記封止容器はサンプル液を収容するためのサンプル容器である請求項1から13のいずれか一項に記載の反応容器プレート。
- 前記サンプル容器は、尖端の鋭利な分注器具により貫通でき、かつ貫通後に前記分注器具を引き抜くとその貫通孔を弾性によって閉じることのできる弾性部材によって封止されている請求項14に記載の反応容器プレート。
- 前記サンプル容器に予めサンプル前処理液又は試薬が収容されている請求項15に記載の反応容器プレート。
- 前記サンプル容器とは別に、前記封止容器からなる試薬容器を1つ又は複数備え、前記試薬容器はサンプル液の反応に使用される試薬を予め収容しフィルムで封止されているか、又は開閉可能なキャップを備えて試薬を注入できるようになっている14から16のいずれか一項に記載の反応容器プレート。
- 前記封止容器からなり遺伝子増幅反応を行なうための遺伝子増幅容器も備えている14から17のいずれか一項に記載の反応容器プレート。
- 前記切替えバルブはロータリー式バルブである請求項1から18のいずれか一項に記載の反応容器プレート。
- 前記ロータリー式バルブはその回転中心に前記シリンジにつながるポートを備え、
前記シリンジは前記ロータリー式バルブ上に配置されている請求項19に記載の反応容器プレート。 - 前記反応容器は少なくとも呈色反応、酵素反応、蛍光や化学発光又は生物発光を生じる反応のいずれかの反応を行なうためのものである請求項1から20のいずれか一項に記載の反応容器プレート。
- 遺伝子を含んだサンプルを測定するための反応容器プレートであり、前記反応容器で遺伝子増幅反応を行なうことができるようになっている請求項1から21のいずれか一項に記載の反応容器プレート。
- 前記反応容器はその底部又は上方から光学的に測定が可能なように光透過性の材質にて構成されている請求項1から22のいずれか一項に記載の反応容器プレート。
- 前記反応容器は、前記反応容器流路に導入される液体に遺伝子が含まれている場合にその遺伝子と反応するプローブを備えている請求項1から23のいずれか一項に記載の反応容器プレート。
- 請求項1から24のいずれか一項に記載の前記反応容器プレートを処理するための反応処理装置であって、
前記シリンジを駆動するためのシリンジ駆動ユニットと、前記切替えバルブを切替えるための切替えバルブ駆動ユニットを備えた反応処理装置。
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