JP2023544961A - コサコニア・オリゼ hn05及びその使用 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は2021年9月18日に中国特許庁に提出された、出願番号「202111096588.1」、発明の名称「コサコニア・オリゼHN05及びその使用」の中国特許出願の優先権を要求し、そのすべての内容は参照により本出願に組み込まれる。
2021年7月30日にコサコニア・オリゼ (kosakonia oryzae)HN05は、中国典型的培養物寄託センターに寄託され、住所は湖北武漢市武漢大学、寄託番号はCCTCC NO:M 2021956である。
(1)無菌操作条件下で5g堆積物サンプルを100mlの嫌気性液体培地に入れ、1リットルあたりの培地に0.5mmol/LAQDS(アントラキノン-2,6-ジスルホン酸ナトリウム、電子受容体)、2.5g NaHCO3、0.25g NH4Cl、0.68g NaH2PO4・2H2O、0.1g KCl、10.0mlビタミン保存液、10.0ml微量元素保存液を含有した。
ここで、ビタミン溶液は、1リットルあたりの脱イオン水には、5.0mgの葉酸、0.2mgのビタミンB6、6.5mgのビタミンB2、3.0mgのビタミンB1、10mgのニコチンアミド、1mgのパントテン酸カルシウム、0.2mgのビタミンB12、2.0mgのビタミンHが含まれ、微量元素溶液は、1リットルあたりの脱イオン水には1.6gのエチレンジアミン四酢酸、3.0g MgSO4・7H2O、0.5g MnSO4・H2O、1.0g NaCl、0.1g CoCl2・6H2O、0.1g CaCl2、0.01g CuSO4・5H2O、0.01g AlK(SO4)2・12H2O、0.01g H3BO3、0.025g Na2MoO4・2H2Oが含まれる。上記の土壌-培地系に、(N2/CO2=80/20)混合ガスを30min吹き込んで酸素を排出し、吹き込むことが完了したらすぐにゴム製のカバーを覆い、アルミニウムカバーを押して密封し、30℃で静置して光を避けて培養し、培養液の色の変化状況を観察した。
(2)上澄み液の色が無色から徐々にオレンジ色になり、安定化する傾向がある場合、10%の接種量で別の新鮮な濃縮培地に移送し、このようにして3回移送した。
(3)最後に、最終培養液を希釈コーティング平板法でNA培地(NaCl 5g/L、牛肉抽出物5g/L、細菌性ペプトン10g/L、寒天粉末18-20g/L、1%の微量元素溶液と1%のビタミン溶液から構成され、1×105PAで20min滅菌した)表面においてコーティング分離を実行し、培地の表面にシングルコロニーを形成するまで30℃で好気性培養し、シングルコロニーをピックアップしてシングルコロニーの分離と精製を行い、コサコニア・オリゼHN05を取得した。
(4)シングルコロニーをピックアップして、新鮮な濃縮培地において、再び培養し、系の色が無色からオレンジ色に変化した場合、菌株がAQDSの還元特性を持っていることを示した。
(1)菌体の形態特性
光学顕微鏡下での観察により、該菌株はグラム陰性菌であり、ストレートロッドの形状で、シングルまたはペアであった。透過電子顕微鏡下で菌株の周毛を観察し(図1に示す)、移動性を備えた。
pH7.2のNA寒天固体培地平板で24時間30℃好気性培養した後、コロニーは丸く、表面が湿って滑らかであり、中央が突起し、半透明で、エッジがきちんとし、コロニーの直径が1~3mmであった。
(2)生理学的生化学的特性
菌株は発酵型で、通性嫌気性であり、成長温度範囲は25~37℃(最も適切な30℃)、pHの範囲は4~9(最も適切なpH=6)、NaCl%範囲0~5(最も適切な0.5%)であり、他の生理学的生化学的特性について、表1を参照した。
細菌DNA抽出キット(天根生物科技有限公司)で細菌の総DNAを抽出した。細菌16S rRNAユニバーサルプライマー27F(5’-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3’,SEQ ID NO.1)および1492R(5’-TAC GGC TAC CTT GTT ACG ACT T-3’,SEQ ID NO.2)を利用してPCR増幅を実行した。反応系は50μL:テンプレートDNA2μL、ユニバーサルプライマー27Fおよび1492Rがそれぞれ1μL、Taq mix酵素25μL、ddH2O 11μLである。PCR反応条件:95℃で5min初期変性し、95℃で30秒変性し、52℃で30秒アニーリングし、72℃で90秒伸長し、35個サイクル、72℃で10min伸長した。増幅生成物を1%アガロースゲル電気泳動で検出し、上海生工生物工程技術服務有限公司によってシーケンスを完了した。
1、反応系:嫌気性培地系では、7つの処理を設定し、
(1)スクロース(電子供与体)+ジクワット(対照、スクロースとジクワットが反応するかどうかを考察した)。
(2)AQDS(電子受容体)+ジクワット(対照、AQDSとジクワットが反応するかどうかを考察した)。
(3)HN05+ジクワット(対照、生きている細菌がジクワットを直接分解するかどうかを考察した)。
(4)スクロース+HN05+ジクワット(ジクワットがHN05の電子受容体として分解されるかどうかを考察した)。
(5)AQDS+HN05+ジクワット(ジクワットがHN05の電子供与体として還元されるかどうかを考察した)。
(6)スクロース+AQDS+HN05(不活化)+ジクワット(対照、HN05死んだ細菌がジクワットを分解するかどうかを考察した)。
(7)スクロース+AQDS+HN05+ジクワット(AQDS微生物の還元が、ジクワットの嫌気性分解を促進するかどうかを考察した)。
2、ジクワットの検出方法:高効率の液体クロマトグラフィー(Waters 2695)を使用して、ジクワットの含有量を測定し、クロマトグラフィー条件は、検出器がPDA、クロマトグラフィーカラムがWaters C18カラム(5μm、250mm×4.6mm)、移動相が15mmolヘプタンスルホン酸ナトリウムリン酸緩衝液溶液(トリエチルアミンでpH=2.5に調整し):アセトニトリル(v:v)=76:24、流速が1.0mL/min、試料注入量が10μL、検出波長が309nmであることである。
3、データ処理:ジクワット分解率(%)=(ジクワットの初期濃度C0-反応後のジクワットの濃度C)/C0×100%。
分解半減期t1/2=ln2/k(すなわちt1/2=0.693/k)、Kは式Ct/C0=e-ktを介して計算され、C0はジクワットの初期濃度であり、Ctはt時刻でのジクワットの濃度であった。
スクロース(5mmol/l)を電子供与体として、コサコニア・オリゼ HN05が4種のアントラキノン化合物への還元能力を考察して比較した。
1mLの細菌懸濁液を基本的な嫌気性培地に接種し、0.5mmol/Lアントラキノン-1-スルホン酸ナトリウム(α-AQS)、アントラキノン-2-スルホン酸ナトリウム(AQS)、アントラキノン-2,6-ジスルホン酸二ナトリウム(AQDS)、又はアントラキノン-1,5-ジスルホン酸ナトリウム(1,5-AQDS)等の4種のアントラキノン化合物を潜在的な電子受容体として、HN05を添加しない系とスクロースを添加しない系を対照として、培養条件は濃縮分離と同じである。3つの繰り返しを設定した。それぞれ1、3、6、9、12、および15d培養した時に嫌気性系におけるアントラキノンの還元生成物であるアントラヒドロキノンの変化状況を測定した。可視-紫外分光光度法を使用して、アントラヒドロキノンの濃度を測定し、α-AQS、AQS、AQDS、1,5-AQDS還元生成物の紫外線吸収波長はそれぞれ380nm、382nm、385nm、385nmであった。
細菌DNA抽出キット(天根生物科技有限公司)で細菌の総DNAを抽出した。細菌16S rRNAユニバーサルプライマー27F(5’-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3’,SEQ ID NO.2)および1492R(5’-TAC GGC TAC CTT GTT ACG ACT T-3’,SEQ ID NO.3)を利用してPCR増幅を実行した。反応系は50μL:テンプレートDNA2μL、ユニバーサルプライマー27Fおよび1492Rがそれぞれ1μL、Taq mix酵素25μL、ddH2O 11μLである。PCR反応条件:95℃で5min初期変性し、95℃で30秒変性し、52℃で30秒アニーリングし、72℃で90秒伸長し、35個サイクル、72℃で10min伸長した。増幅生成物を1%アガロースゲル電気泳動で検出し、上海生工生物工程技術服務有限公司によってシーケンスを完了した。
Claims (11)
- コサコニア・オリゼ HN05であって、その分類は、Kosakonia oryzae HN05と名付けられ、中国典型的培養物寄託センターに寄託され、寄託番号はCCTCC NO:M 2021956HN05であることを特徴とするコサコニア・オリゼHN05。
- コサコニア・オリゼ HN05であって、コサコニア・オリゼ HN05の16S rDNA配列はSEQ ID NO.1に示すヌクレオチド配列であることを特徴とするコサコニア・オリゼ HN05。
- 請求項1に記載のコサコニア・オリゼ HN05のアントラキノン類化合物還元における使用。
- 請求項1に記載のコサコニア・オリゼ HN05とスクロースの組み合わせのアントラキノン類化合物の嫌気性還元における使用。
- 前記スクロースの使用濃度は5mmol/Lであることを特徴とする請求項4に記載の使用。
- 前記アントラキノン類化合物は、AH2QDS、α-AH2QS、AH2QS及び1,5-AH2QDSのうちの1種以上を含むことを特徴とする請求項3~5のいずれか一項に記載の使用。
- 請求項1に記載のコサコニア・オリゼ HN05の、農薬汚染処理と土壌修復における使用。
- 前記コサコニア・オリゼ HN05は、ジクワットを分解し、ジクワット汚染水処理及び土壌修復の目的を達成するために使用されることを特徴とする請求項7に記載の使用。
- 前記コサコニア・オリゼHN05は、嫌気性条件下でジクワットを分解するために使用されることを特徴とする請求項8に記載の使用。
- 請求項1に記載のコサコニア・オリゼ HN05とアントラキノン-2,6-ジスルホン酸ナトリウムのジクワットの嫌気性分解における使用。
- 前記アントラキノン-2,6-ジスルホン酸ナトリウムの使用濃度は0.5mmol/Lであることを特徴とする請求項10に記載の使用。
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