JP2023544961A - コサコニア・オリゼ hn05及びその使用 - Google Patents

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Abstract

本発明は、環境微生物の技術分野、特にコサコニア・オリゼ HN05及びその使用に関し、該菌株の分類は、Kosakonia oryzae HN05と名付けられ、嫌気性条件下でジクワットを分解でき、且つアントラキノン類化合物還元活性を持ち、その電子利用スペクトルが広く、同時に、菌株HN05はAQDSと共同作用して、ジクワットの嫌気性分解を顕著に促進し、ジクワット汚染水処理及び土壌修復に適用でき、農薬汚染処理及び土壌修復の分野で良好な使用の可能性を持っている。【選択図】なし

Description

(関連出願の相互参照)
本出願は2021年9月18日に中国特許庁に提出された、出願番号「202111096588.1」、発明の名称「コサコニア・オリゼHN05及びその使用」の中国特許出願の優先権を要求し、そのすべての内容は参照により本出願に組み込まれる。
本発明は、環境微生物の技術分野、特にコサコニア・オリゼ HN05及びその使用に関する。
ジクワット(1,1’-エチレン-2,2’-ビピリジンジブロミド、diquat)は非選択的接触型ビピリジン類除草剤であり、不耕起栽培、急速輪作、直播稲等の農林業生産に広く使用されている。ジクワットは持続性及び環境健康毒性がある。ゼブラフィッシュ胚の酸化的リン酸化反応を阻害し、ニジマス胚の成長障害、北西サンショウウオの慢性的な死を引き起こし、水生生態系の不均衡につながり、地下水の浸漬または食物連鎖形態を通じて、哺乳類に強い毒性を生み出し、ジクワットへの長期暴露はメスのマウスに生殖毒性を引き起こす可能性があり、農民がパーキンソン病にかかるリスクは高くなり、ジクワットの急性中毒は2128種類の病気を引き起こす可能性があり、かつ生物学的蓄積または急性中毒後に特別な解毒薬はない。したがって、環境でのジクワットの分解を加速することは非常に必要である。
ジクワットは非常に水に溶解しやすく、表面流出が土壌、地下水体に入り、さまざまな低酸素環境に堆積するにつれて、より持続性があり、半減期は最大10年である。したがって、環境におけるジクワットの分解を加速する鍵は、その嫌気性分解を強化することである。促進酸化法、嫌気性消化プール法等の方法が有機汚染物質の嫌気性分解を効果的に加速できることが報告されている。ただし、これらの方法には二次汚染と高コストの欠点がある。微生物in situ修復技術は、便利で経済的、効率的で、グリーンの特性のため、有機汚染物質の嫌気性分解を強化する良い方法であると考えられている。
土壌には、ジクワットに耐える微生物があり、この種のバクテリアは、ジクワットを炭素源または窒素源として、または共代謝形態で好気性呼吸を行うことができ、現在報告されているジクワット好気性分解菌には、アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)、酵母菌リポミセス・スタルケイ(Lipomyces starkeyi)が含まれ、嫌気性の条件下では、ジクワットを分解及び変換するに関連する微生物は報告されていない。
コサコニア属菌株には現在、9種があり、報告によると、コサコニア・カシサッカリ(Kosakonia quasisacchari)とコサコニア・コワニ(Kosakonia cowanii)が人体から分離されて得られることを除いて、他の7種Kosakonia sp.がすべて植物の根から分離されて得られ、窒素固定能力を備え、水稲、トウモロコシ、小麦、ラッカセイ等の植物の優れた窒素固定菌であり、現在、コサコニア・エスピー(Kosakonia sp.)がアントラキノンを還元してジクワットを分解できることに関連する文献報告はまだない。
これを考慮して、本発明はコサコニア・オリゼHN05及びその使用を提供し、該菌株は土壌から分離されており、ジクワットの嫌気性分解とアントラキノン還元の特性がある。
本発明の技術的解決手段はこのように実現される。
本発明は、Kosakonia oryzae HN05と名付けられたコサコニア・オリゼ HN05を提供し、2021年7月30日、湖北武漢市武漢大学にある中国典型的培養物寄託センターに寄託され、寄託センターが該菌株に与える寄託番号はCCTCC NO:M 2021956である。
さらに説明するように、コサコニア・オリゼ(Kosakonia oryzae)HN05の16S rDNA配列はSEQ IDNO.1に示されているヌクレオチド配列である。
さらに説明するように、アントラキノン類化合物還元におけるコサコニア・オリゼ(Kosakonia oryzae)HN05の使用。
さらに説明するように、農薬汚染処理及び土壌修復用における前記コサコニア・オリゼ(Kosakonia oryzae)HN05の使用。
さらに説明するように、前記コサコニア・オリゼ(Kosakonia oryzae)HN05は、ジクワットを分解するために使用され、ジクワット汚染水処理及び土壌修復の目的を達成する。
さらに説明するように、前記コサコニア・オリゼ(Kosakonia oryzae)HN05は、嫌気性条件下でジクワットを分解するために使用される。
さらに説明するように、前記コサコニア・オリゼ(Kosakonia oryzae)HN05は、アントラキノン-2,6-ジスルホン酸ナトリウムと共同作用し、ジクワットの嫌気性分解を促進するために使用される。
従来技術と比較して、本発明の有益な効果は次のとおりである。本発明は、海南省南渡江の川の堆積土壌から、濃縮分離して精製されたコサコニア・オリゼHN05(Kosakonia oryzae HN05)であり、該菌株は嫌気性条件下でジクワットを分解でき、且つアントラキノン類化合物還元活性を持ち、その電子利用スペクトルが広く、同時に、コサコニア・オリゼHN05はAQDSと共同作用し、ジクワットの嫌気性分解を顕著に促進し、ジクワット汚染水処理及び土壌修復に効果的に適用でき、農薬汚染処理及び土壌修復の分野で良好な使用の可能性を持っている。
本発明のコサコニア・オリゼ HN05の菌株形態透過電子顕微鏡図である。 本発明のコサコニア・オリゼ HN05の16S rRNA系統発生樹である。 本発明のコサコニア・オリゼ HN05の嫌気性還元AQDSの電子供与体スペクトル図である。 本発明のコサコニア・オリゼ HN05のジクワットの嫌気性分解動力学図である。 本発明のコサコニア・オリゼ HN05とAQDSがジクワットの嫌気性分解を共同に促進する最初のレベルの動力学フィッティング曲線である。
生物寄託の説明
2021年7月30日にコサコニア・オリゼ (kosakonia oryzae)HN05は、中国典型的培養物寄託センターに寄託され、住所は湖北武漢市武漢大学、寄託番号はCCTCC NO:M 2021956である。
本発明の技術的な内容をよりよく理解するために、以下は本発明をさらに説明するための具体的な実施例を提供する。
本発明の実施例で使用される実験的方法は、特別な説明がない場合、従来の方法である。
本発明の実施例で使用される材料と試薬等は、特別な説明がない場合、商業的アプローチから得ることができる。
実施例1-コサコニア・オリゼ HN05の濃縮と分離
(1)無菌操作条件下で5g堆積物サンプルを100mlの嫌気性液体培地に入れ、1リットルあたりの培地に0.5mmol/LAQDS(アントラキノン-2,6-ジスルホン酸ナトリウム、電子受容体)、2.5g NaHCO、0.25g NHCl、0.68g NaHPO・2HO、0.1g KCl、10.0mlビタミン保存液、10.0ml微量元素保存液を含有した。
ここで、ビタミン溶液は、1リットルあたりの脱イオン水には、5.0mgの葉酸、0.2mgのビタミンB6、6.5mgのビタミンB2、3.0mgのビタミンB1、10mgのニコチンアミド、1mgのパントテン酸カルシウム、0.2mgのビタミンB12、2.0mgのビタミンHが含まれ、微量元素溶液は、1リットルあたりの脱イオン水には1.6gのエチレンジアミン四酢酸、3.0g MgSO・7HO、0.5g MnSO・HO、1.0g NaCl、0.1g CoCl・6HO、0.1g CaCl、0.01g CuSO・5HO、0.01g AlK(SO・12HO、0.01g HBO、0.025g NaMoO・2HOが含まれる。上記の土壌-培地系に、(N/CO=80/20)混合ガスを30min吹き込んで酸素を排出し、吹き込むことが完了したらすぐにゴム製のカバーを覆い、アルミニウムカバーを押して密封し、30℃で静置して光を避けて培養し、培養液の色の変化状況を観察した。
(2)上澄み液の色が無色から徐々にオレンジ色になり、安定化する傾向がある場合、10%の接種量で別の新鮮な濃縮培地に移送し、このようにして3回移送した。
(3)最後に、最終培養液を希釈コーティング平板法でNA培地(NaCl 5g/L、牛肉抽出物5g/L、細菌性ペプトン10g/L、寒天粉末18-20g/L、1%の微量元素溶液と1%のビタミン溶液から構成され、1×10PAで20min滅菌した)表面においてコーティング分離を実行し、培地の表面にシングルコロニーを形成するまで30℃で好気性培養し、シングルコロニーをピックアップしてシングルコロニーの分離と精製を行い、コサコニア・オリゼHN05を取得した。
(4)シングルコロニーをピックアップして、新鮮な濃縮培地において、再び培養し、系の色が無色からオレンジ色に変化した場合、菌株がAQDSの還元特性を持っていることを示した。
実施例2-コサコニア・オリゼ HN05の形態、生理学的生化学的および分子生物学の特性
(1)菌体の形態特性
光学顕微鏡下での観察により、該菌株はグラム陰性菌であり、ストレートロッドの形状で、シングルまたはペアであった。透過電子顕微鏡下で菌株の周毛を観察し(図1に示す)、移動性を備えた。
pH7.2のNA寒天固体培地平板で24時間30℃好気性培養した後、コロニーは丸く、表面が湿って滑らかであり、中央が突起し、半透明で、エッジがきちんとし、コロニーの直径が1~3mmであった。
(2)生理学的生化学的特性
菌株は発酵型で、通性嫌気性であり、成長温度範囲は25~37℃(最も適切な30℃)、pHの範囲は4~9(最も適切なpH=6)、NaCl%範囲0~5(最も適切な0.5%)であり、他の生理学的生化学的特性について、表1を参照した。
Figure 2023544961000001
(3)分子生物学の特性
細菌DNA抽出キット(天根生物科技有限公司)で細菌の総DNAを抽出した。細菌16S rRNAユニバーサルプライマー27F(5’-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3’,SEQ ID NO.1)および1492R(5’-TAC GGC TAC CTT GTT ACG ACT T-3’,SEQ ID NO.2)を利用してPCR増幅を実行した。反応系は50μL:テンプレートDNA2μL、ユニバーサルプライマー27Fおよび1492Rがそれぞれ1μL、Taq mix酵素25μL、ddHO 11μLである。PCR反応条件:95℃で5min初期変性し、95℃で30秒変性し、52℃で30秒アニーリングし、72℃で90秒伸長し、35個サイクル、72℃で10min伸長した。増幅生成物を1%アガロースゲル電気泳動で検出し、上海生工生物工程技術服務有限公司によってシーケンスを完了した。
シーケンスの結果によると、http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/でより高い相同性を持つ16S rRNA遺伝子配列をダウンロードし、近隣結合法による菌株の系統発生進化樹(図2に示す)を構築した。形態、生理学的生化学的および分子同定の結果を結合して、本発明の菌株が、Kosakonia oryzae) HN05と名付けられた、コサコニア・オリゼであると最終的に決定された。
実施例3-コサコニア・オリゼ HN05は、異なる電子供与体を使用して、AQDSを還元した
本発明はAQDSを電子受容体として使用し、コサコニア・オリゼ HN05の電子利用スペクトルを考察した。
反応系の組成:細菌懸濁液、無機塩、ビタミン、微量元素、各材料の組成と含有量は、上記の濃縮分離培地と同じであり、電子受容体は0.5mmol/LAQDSであり、電子供与体は、酢酸、グリセリン、スクロース、または乳酸を選択し、添加濃度が5mmol/Lであり、1mLの細菌懸濁液であり、HN05菌株をNA液体培地に接種し、30℃で18h好気性培養し、8000r/minで菌体を遠心分離して収集し、次に無機塩培地で菌体を2回洗浄し、最後に新鮮な無機塩培地で菌体を懸濁して細菌懸濁液を作った。
3つの繰り返しを設定した。それぞれ1、3、6、9、12、および15d培養した時に嫌気性系におけるAQDS還元生成物であるAHQDSの変化状況を測定した。可視-紫外線分光計を採用して385nmの波長で還元状態AHQDSの濃度を測定した。結果は、(図3に示すように)15dの嫌気性培養後、嫌気性系におけるAQDSに明らかな還元現象があり、最初の9日間の系におけるAHQDSが大量に生成され、後期に徐々に安定したことを示した。コサコニア・オリゼHN05での4種の電子供与体の利用能力は明らかに異なり、利用能力は大きいから小さいまで順次:スクロース>乳酸>グリセリン>酢酸であった。
実施例4-コサコニア・オリゼ HN05がジクワットを嫌気性分解した
1、反応系:嫌気性培地系では、7つの処理を設定し、
(1)スクロース(電子供与体)+ジクワット(対照、スクロースとジクワットが反応するかどうかを考察した)。
(2)AQDS(電子受容体)+ジクワット(対照、AQDSとジクワットが反応するかどうかを考察した)。
(3)HN05+ジクワット(対照、生きている細菌がジクワットを直接分解するかどうかを考察した)。
(4)スクロース+HN05+ジクワット(ジクワットがHN05の電子受容体として分解されるかどうかを考察した)。
(5)AQDS+HN05+ジクワット(ジクワットがHN05の電子供与体として還元されるかどうかを考察した)。
(6)スクロース+AQDS+HN05(不活化)+ジクワット(対照、HN05死んだ細菌がジクワットを分解するかどうかを考察した)。
(7)スクロース+AQDS+HN05+ジクワット(AQDS微生物の還元が、ジクワットの嫌気性分解を促進するかどうかを考察した)。
嫌気性培地は、無機塩、ビタミン、微量元素(無機塩、微生物、微量元素の成分及び濃度が濃縮分離培地と同じ)で構成され、ジクワットの濃度は50mg/L、AQDSは0.5mmol/L、スクロースは5mmol/Lであり、1mLの細菌懸濁液(製造方法は電子供与体試験と同じ)である。ジクワット、AQDSは他の成分と分けて滅菌し、滅菌(115℃で20min滅菌)した後に再び混合し、(N/CO=80/20)混合ガスを30min吹き込んで酸素排出し、吹き込みが完了したら、すぐにゴム製のカバーを覆い、アルミニウムカバーを押して密封し、30℃で静置して光を避けて培養した。
2、ジクワットの検出方法:高効率の液体クロマトグラフィー(Waters 2695)を使用して、ジクワットの含有量を測定し、クロマトグラフィー条件は、検出器がPDA、クロマトグラフィーカラムがWaters C18カラム(5μm、250mm×4.6mm)、移動相が15mmolヘプタンスルホン酸ナトリウムリン酸緩衝液溶液(トリエチルアミンでpH=2.5に調整し):アセトニトリル(v:v)=76:24、流速が1.0mL/min、試料注入量が10μL、検出波長が309nmであることである。
3、データ処理:ジクワット分解率(%)=(ジクワットの初期濃度C-反応後のジクワットの濃度C)/C×100%。
分解半減期t1/2=ln2/k(すなわちt1/2=0.693/k)、Kは式C/C=e-ktを介して計算され、Cはジクワットの初期濃度であり、Cはt時刻でのジクワットの濃度であった。
結果を図4に示すように、0-22d嫌気性培養した対照群(1)および(2)のジクワットの濃度は基本的に変化しておらず、ジクワットとスクロース、AQDS、および単純なHN05の間に反応がないことを示した。処理(5)のジクワットも減少せず、ジクワットがHN05の電子供与体として分解されないことを示した。処理(3)及び(6)のジクワット濃度は2.07%減少し、初期菌体がジクワットに微弱な吸着効果があることを示した。処理(4)中のジクワットの濃度は8.60%減少し、ジクワットがHN05の電子受容体として菌株によって直接分解されるが、効果が弱いことを示した。処理(7)のジクワット分解率は、培養時間内に直線的に増加し、22dの時に41.93%に達し、分解効果が顕著であり、HN05とAQDSの共同作用は、ジクワットの嫌気性分解を顕著に促進できることを説明した。
さらに、HN05とAQDSがジクワットの分解を共同に促進する系において、分解率に対して最初のレベルの動力学フィッティングを実行し、結果は図5に示すように、決定係数R=0.9091、k=0.0210±0.0030、これは、最初のレベルの動力学方程式に従う。これに基づいて、該系における菌株HN05がジクワットへの分解半減期範囲を計算して(33.7±4.6)dであった。
実施例5-コサコニア・オリゼ HN05がスクロースを電子供与体として利用してアントラキノン化合物を還元した
スクロース(5mmol/l)を電子供与体として、コサコニア・オリゼ HN05が4種のアントラキノン化合物への還元能力を考察して比較した。
1mLの細菌懸濁液を基本的な嫌気性培地に接種し、0.5mmol/Lアントラキノン-1-スルホン酸ナトリウム(α-AQS)、アントラキノン-2-スルホン酸ナトリウム(AQS)、アントラキノン-2,6-ジスルホン酸二ナトリウム(AQDS)、又はアントラキノン-1,5-ジスルホン酸ナトリウム(1,5-AQDS)等の4種のアントラキノン化合物を潜在的な電子受容体として、HN05を添加しない系とスクロースを添加しない系を対照として、培養条件は濃縮分離と同じである。3つの繰り返しを設定した。それぞれ1、3、6、9、12、および15d培養した時に嫌気性系におけるアントラキノンの還元生成物であるアントラヒドロキノンの変化状況を測定した。可視-紫外分光光度法を使用して、アントラヒドロキノンの濃度を測定し、α-AQS、AQS、AQDS、1,5-AQDS還元生成物の紫外線吸収波長はそれぞれ380nm、382nm、385nm、385nmであった。
結果を下表2に示すように、15dの嫌気性培養後、「HN05+スクロース+アントラキノン」の嫌気性系では、4種のアントラキノンはすべて、明らかな還元現象があったが、「HN05+アントラキノン」と「スクロース+アントラキノン」の対照系では、アントラヒドロキノンの検出はなく、コサコニア・オリゼHN05はスクロースを電子供与体として、4種のアントラキノン化合物を嫌気性還元できることを示し、利用能力は大きいから小さいまで順次:AQDS>α-AQS>AQS>1,5-AQDSであった。
Figure 2023544961000002
上記は、本発明の好ましい実施例にすぎず、本発明を限定するために使用せず、本発明の精神と原則において、いかなる修正、同等の置換、および改善等は、本発明の保護範囲に含まれるものとする。
(3)分子生物学の特性
細菌DNA抽出キット(天根生物科技有限公司)で細菌の総DNAを抽出した。細菌16S rRNAユニバーサルプライマー27F(5’-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3’,SEQ ID NO.)および1492R(5’-TAC GGC TAC CTT GTT ACG ACT T-3’,SEQ ID NO.)を利用してPCR増幅を実行した。反応系は50μL:テンプレートDNA2μL、ユニバーサルプライマー27Fおよび1492Rがそれぞれ1μL、Taq mix酵素25μL、ddHO 11μLである。PCR反応条件:95℃で5min初期変性し、95℃で30秒変性し、52℃で30秒アニーリングし、72℃で90秒伸長し、35個サイクル、72℃で10min伸長した。増幅生成物を1%アガロースゲル電気泳動で検出し、上海生工生物工程技術服務有限公司によってシーケンスを完了した。

Claims (11)

  1. コサコニア・オリゼ HN05であって、その分類は、Kosakonia oryzae HN05と名付けられ、中国典型的培養物寄託センターに寄託され、寄託番号はCCTCC NO:M 2021956HN05であることを特徴とするコサコニア・オリゼHN05。
  2. コサコニア・オリゼ HN05であって、コサコニア・オリゼ HN05の16S rDNA配列はSEQ ID NO.1に示すヌクレオチド配列であることを特徴とするコサコニア・オリゼ HN05。
  3. 請求項1に記載のコサコニア・オリゼ HN05のアントラキノン類化合物還元における使用。
  4. 請求項1に記載のコサコニア・オリゼ HN05とスクロースの組み合わせのアントラキノン類化合物の嫌気性還元における使用。
  5. 前記スクロースの使用濃度は5mmol/Lであることを特徴とする請求項4に記載の使用。
  6. 前記アントラキノン類化合物は、AHQDS、α-AHQS、AHQS及び1,5-AHQDSのうちの1種以上を含むことを特徴とする請求項3~5のいずれか一項に記載の使用。
  7. 請求項1に記載のコサコニア・オリゼ HN05の、農薬汚染処理と土壌修復における使用。
  8. 前記コサコニア・オリゼ HN05は、ジクワットを分解し、ジクワット汚染水処理及び土壌修復の目的を達成するために使用されることを特徴とする請求項7に記載の使用。
  9. 前記コサコニア・オリゼHN05は、嫌気性条件下でジクワットを分解するために使用されることを特徴とする請求項8に記載の使用。
  10. 請求項1に記載のコサコニア・オリゼ HN05とアントラキノン-2,6-ジスルホン酸ナトリウムのジクワットの嫌気性分解における使用。
  11. 前記アントラキノン-2,6-ジスルホン酸ナトリウムの使用濃度は0.5mmol/Lであることを特徴とする請求項10に記載の使用。
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