JP2023071943A - α-アミラーゼ変異体 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、コンピュータ読み取り可能な形態の配列表を含んでおり、これは本明細書において参照により援用される。
対立遺伝子変異体:「対立遺伝子変異体」という用語は、同一の染色体座を占有する遺伝子の2つ以上の代替的な形態のいずれかを意味する。対立遺伝子変異は、突然変異を介して自然に生じ、また、個体群中の多型性によりもたらされ得る。遺伝子突然変異は、サイレント(コードされるポリペプチドにおける変化無し)であることが可能であり、または、改変されたアミノ酸配列を有するポリペプチドがコードされ得る。ポリペプチドの対立遺伝子変異体は、遺伝子の対立遺伝子変異体によってコードされたポリペプチドである。
(同等の残基×100)/(アラインメントの長さ-アラインメント中のギャップの総数)
(同等のデオキシリボヌクレオチド×100)/(アラインメントの長さ-アラインメント中のギャップの総数)
α-アミラーゼ活性を有する本発明のポリペプチドは、配列番号:1、2、3、4、5、6、7または8に示されているバチルス属(Bacillus)から誘導されたα-アミラーゼの変異体に相当する。
「Tyr167Gly+Arg170Gly」、「Tyr167Gly+Arg170Ala」、「Tyr167Ala+Arg170Gly」、および「Tyr167Ala+Arg170Ala」。
親α-アミラーゼはまた、配列番号1に記載のポリペプチドに対して少なくとも80%配列同一性を有するポリペプチドでもあり得る。
本発明は、α-アミラーゼ活性を有する変異体を入手する方法であって、(a)親α-アミラーゼに、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、および、任意選択により、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置に修飾を導入するステップであって、各修飾が独立して置換または欠失であり、および、前記変異体がα-アミラーゼ活性を有するステップ;ならびに、(b)前記変異体を回収するステップを含む方法に関する。
本発明はまた、(i)配列番号1に係るアミノ酸配列の位置109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、ならびに、任意選択により、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置に修飾を含み、(ii)変異体が、少なくとも90%など、少なくとも95%など、少なくとも97%などの少なくとも80%であるが、100%未満の配列同一性を、配列番号:1、2、3、4、5、6、7または8に係るアミノ酸配列に対して有し、ならびに、(iii)変異体がα-アミラーゼ活性を有する、親α-アミラーゼの変異体を提供する。これにより、親α-アミラーゼと比して、または、配列番号1、2、3、4、5、6、7または8のα-アミラーゼと比して、低温で向上した洗浄性能を有する変異体が提供される。
X1*+X109A+X280S+X391A;X1*+X7K+X109A+X280S+X391A;X1*+X7E+X109A+X280S+X391A;X1*+X7N+X109A+X280S+X391A;X1*+X7Q+X109A+X280S+X391A;X1*+X7L+X109A+X280S+X391A;X1*+X7D+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X109A+X280S+X320M+X391A;X1*+X109A+X280S+X320T+X391A;X1*+X109A+X280S+X320V+X391A;X1*+X109A+X280S+X323R+X391A;X1*+X109A+X280S+X320S+X391A;X1*+X109A+X280S+X391V;X1*+X109A+X284R+X391A;X1*+X109A+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X109A+X280S+X323K+X391A;X1*+X109S+X280S+X391A;X1*+X109A+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284H+X320A+X323N+X391A;X7A+X284H+X320A+X323N;X7A+X320A+X323N;X320A;X7A+X320A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284R+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X284R+X391A;および、X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323N+X391Aからなる群から選択される位置に対応する位置に修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従い、および、変異体は、配列番号:1、2、3、4、5、6、7または8に記載のアミラーゼのいずれか1つに対して少なくとも80%の配列同一性を有する。
X1*+X109A+X280S+X391A;X1*+X7K+X109A+X280S+X391A;X1*+X7E+X109A+X280S+X391A;X1*+X7N+X109A+X280S+X391A;X1*+X7Q+X109A+X280S+X391A;X1*+X7L+X109A+X280S+X391A;X1*+X7D+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X109A+X280S+X320M+X391A;X1*+X109A+X280S+X320T+X391A;X1*+X109A+X280S+X320V+X391A;X1*+X109A+X280S+X323R+X391A;X1*+X109A+X280S+X320S+X391A;X1*+X109A+X280S+X391V;X1*+X109A+X284R+X391A;X1*+X109A+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X109A+X280S+X323K+X391A;X1*+X109S+X280S+X391A;X1*+X109A+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284H+X320A+X323N+X391A;X7A+X284H+X320A+X323N;X7A+X320A+X323N;X320A;X7A+X320A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284R+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X284R+X391A;および、X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323N+X391Aからなる群から選択される、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置に対応する位置に修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従い、および、変異体は、配列番号1に記載のアミラーゼに対して少なくとも80%の配列同一性を有する。
X1*+X109A+X280S+X391A;X1*+X7K+X109A+X280S+X391A;X1*+X7E+X109A+X280S+X391A;X1*+X7N+X109A+X280S+X391A;X1*+X7Q+X109A+X280S+X391A;X1*+X7L+X109A+X280S+X391A;X1*+X7D+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X109A+X280S+X320M+X391A;X1*+X109A+X280S+X320T+X391A;X1*+X109A+X280S+X320V+X391A;X1*+X109A+X280S+X323R+X391A;X1*+X109A+X280S+X320S+X391A;X1*+X109A+X280S+X391V;X1*+X109A+X284R+X391A;X1*+X109A+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X109A+X280S+X323K+X391A;X1*+X109S+X280S+X391A;X1*+X109A+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284H+X320A+X323N+X391A;X7A+X284H+X320A+X323N;X7A+X320A+X323N;X320A;X7A+X320A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284R+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X284R+X391A;および、X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323N+X391Aからなる群から選択される、配列番号2に係るアミノ酸配列の位置に対応する位置に修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従い、および、変異体は、配列番号2に記載のアミラーゼに対して少なくとも80%の配列同一性を有する。
H1*+G109A+N280S+E391A;H1*+G7K+G109A+N280S+E391A;H1*+G7E+G109A+N280S+E391A;H1*+G7N+G109A+N280S+E391A;H1*+G7Q+G109A+N280S+E391A;H1*+G7L+G109A+N280S+E391A;H1*+G7D+G109A+N280S+E391A;H1*+G109A+N280S+K320A+E391A;H1*+G109A+N280S+K320M+E391A;H1*+G109A+N280S+K320T+E391A;H1*+G109A+N280S+K320V+E391A;H1*+G109A+N280S+M323R+E391A;H1*+G109A+N280S+K320S+E391A;H1*+G109A+N280S+E391V;H1*+G109A+W284R+E391A;H1*+G109A+W284F+E391A;H1*+G109A+N280S+K320A+M323S+E391A;H1*+G109A+N280S+W284F+E391A;H1*+G109A+N280S+M323N+E391A;H1*+G109A+N280S+M323K+E391A;H1*+G109S+N280S+E391A;H1*+G109A+W284H+E391A;H1*+G109A+N280S+K320A+M323N+E391A;H1*+G7A+G109A+N280S+E391A;H1*+G7A+G109A+N280S+W284H+K320A+M323N+E391A;G7A+W284H+K320A+M323N;G7A+K320A+M323N;K320A;G7A+K320A;H1*+G7A+G109A+N280S+E391A;H1*+G109A+N280S+W284H+E391A;H1*+G109A+N280S+M323S+E391A;H1*+G7A+G109A+N280S+K320A+E391A;H1*+G7A+G109A+N280S+M323S+E391A;H1*+G7A+G109A+N280S+M323N+E391A;H1*+G7A+G109A+N280S+W284F+E391A;H1*+G7A+G109A+N280S+W284R+E391A;H1*+G7A+G109A+N280S+K320A+M323S+E391A;H1*+G7A+G109A+W284R+E391A;および、H1*+G7A+G109A+N280S+K320A+M323N+E391Aからなる群から選択される、配列番号2に係るアミノ酸配列の位置に対応する位置に修飾を含む。
X1*+X109A+X280S+X391A;X1*+X7K+X109A+X280S+X391A;X1*+X7E+X109A+X280S+X391A;X1*+X7N+X109A+X280S+X391A;X1*+X7Q+X109A+X280S+X391A;X1*+X7L+X109A+X280S+X391A;X1*+X7D+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X109A+X280S+X320M+X391A;X1*+X109A+X280S+X320T+X391A;X1*+X109A+X280S+X320V+X391A;X1*+X109A+X280S+X323R+X391A;X1*+X109A+X280S+X320S+X391A;X1*+X109A+X280S+X391V;X1*+X109A+X284R+X391A;X1*+X109A+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X109A+X280S+X323K+X391A;X1*+X109S+X280S+X391A;X1*+X109A+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284H+X320A+X323N+X391A;X7A+X284H+X320A+X323N;X7A+X320A+X323N;X320A;X7A+X320A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284R+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X284R+X391A;および、X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323N+X391Aからなる群から選択される、配列番号3に係るアミノ酸配列の位置に対応する位置に修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従い、および、変異体は、配列番号3に記載のアミラーゼに対して少なくとも80%の配列同一性を有する。
X1*+X109A+X280S+X391A;X1*+X7K+X109A+X280S+X391A;X1*+X7E+X109A+X280S+X391A;X1*+X7N+X109A+X280S+X391A;X1*+X7Q+X109A+X280S+X391A;X1*+X7L+X109A+X280S+X391A;X1*+X7D+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X109A+X280S+X320M+X391A;X1*+X109A+X280S+X320T+X391A;X1*+X109A+X280S+X320V+X391A;X1*+X109A+X280S+X323R+X391A;X1*+X109A+X280S+X320S+X391A;X1*+X109A+X280S+X391V;X1*+X109A+X284R+X391A;X1*+X109A+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X109A+X280S+X323K+X391A;X1*+X109S+X280S+X391A;X1*+X109A+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284H+X320A+X323N+X391A;X7A+X284H+X320A+X323N;X7A+X320A+X323N;X320A;X7A+X320A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284R+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X284R+X391A;および、X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323N+X391Aからなる群から選択される、配列番号4に係るアミノ酸配列の位置に対応する位置に修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従い、および、変異体は、配列番号4に記載のアミラーゼに対して少なくとも80%の配列同一性を有する。
X1*+X109A+X280S+X391A;X1*+X7K+X109A+X280S+X391A;X1*+X7E+X109A+X280S+X391A;X1*+X7N+X109A+X280S+X391A;X1*+X7Q+X109A+X280S+X391A;X1*+X7L+X109A+X280S+X391A;X1*+X7D+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X109A+X280S+X320M+X391A;X1*+X109A+X280S+X320T+X391A;X1*+X109A+X280S+X320V+X391A;X1*+X109A+X280S+X323R+X391A;X1*+X109A+X280S+X320S+X391A;X1*+X109A+X280S+X391V;X1*+X109A+X284R+X391A;X1*+X109A+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X109A+X280S+X323K+X391A;X1*+X109S+X280S+X391A;X1*+X109A+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284H+X320A+X323N+X391A;X7A+X284H+X320A+X323N;X7A+X320A+X323N;X320A;X7A+X320A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284R+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X284R+X391A;および、X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323N+X391Aからなる群から選択される、配列番号5に係るアミノ酸配列の位置に対応する位置に修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従い、および、変異体は、配列番号5に記載のアミラーゼに対して少なくとも80%の配列同一性を有する。
X1*+X109A+X280S+X391A;X1*+X7K+X109A+X280S+X391A;X1*+X7E+X109A+X280S+X391A;X1*+X7N+X109A+X280S+X391A;X1*+X7Q+X109A+X280S+X391A;X1*+X7L+X109A+X280S+X391A;X1*+X7D+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X109A+X280S+X320M+X391A;X1*+X109A+X280S+X320T+X391A;X1*+X109A+X280S+X320V+X391A;X1*+X109A+X280S+X323R+X391A;X1*+X109A+X280S+X320S+X391A;X1*+X109A+X280S+X391V;X1*+X109A+X284R+X391A;X1*+X109A+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X109A+X280S+X323K+X391A;X1*+X109S+X280S+X391A;X1*+X109A+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284H+X320A+X323N+X391A;X7A+X284H+X320A+X323N;X7A+X320A+X323N;X320A;X7A+X320A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284R+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X284R+X391A;および、X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323N+X391Aからなる群から選択される、配列番号6に係るアミノ酸配列の位置に対応する位置に修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従い、および、変異体は、配列番号6に記載のアミラーゼに対して少なくとも80%の配列同一性を有する。
X1*+X109A+X280S+X391A;X1*+X7K+X109A+X280S+X391A;X1*+X7E+X109A+X280S+X391A;X1*+X7N+X109A+X280S+X391A;X1*+X7Q+X109A+X280S+X391A;X1*+X7L+X109A+X280S+X391A;X1*+X7D+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X109A+X280S+X320M+X391A;X1*+X109A+X280S+X320T+X391A;X1*+X109A+X280S+X320V+X391A;X1*+X109A+X280S+X323R+X391A;X1*+X109A+X280S+X320S+X391A;X1*+X109A+X280S+X391V;X1*+X109A+X284R+X391A;X1*+X109A+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X109A+X280S+X323K+X391A;X1*+X109S+X280S+X391A;X1*+X109A+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284H+X320A+X323N+X391A;X7A+X284H+X320A+X323N;X7A+X320A+X323N;X320A;X7A+X320A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284R+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X284R+X391A;および、X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323N+X391Aからなる群から選択される、配列番号7に係るアミノ酸配列の位置に対応する位置に修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従い、および、変異体は、配列番号7に記載のアミラーゼに対して少なくとも80%の配列同一性を有する。
X1*+X109A+X280S+X391A;X1*+X7K+X109A+X280S+X391A;X1*+X7E+X109A+X280S+X391A;X1*+X7N+X109A+X280S+X391A;X1*+X7Q+X109A+X280S+X391A;X1*+X7L+X109A+X280S+X391A;X1*+X7D+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X109A+X280S+X320M+X391A;X1*+X109A+X280S+X320T+X391A;X1*+X109A+X280S+X320V+X391A;X1*+X109A+X280S+X323R+X391A;X1*+X109A+X280S+X320S+X391A;X1*+X109A+X280S+X391V;X1*+X109A+X284R+X391A;X1*+X109A+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X109A+X280S+X323K+X391A;X1*+X109S+X280S+X391A;X1*+X109A+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X320A+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284H+X320A+X323N+X391A;X7A+X284H+X320A+X323N;X7A+X320A+X323N;X320A;X7A+X320A;X1*+X7A+X109A+X280S+X391A;X1*+X109A+X280S+X284H+X391A;X1*+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X323N+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284F+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X284R+X391A;X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323S+X391A;X1*+X7A+X109A+X284R+X391A;および、X1*+X7A+X109A+X280S+X320A+X323N+X391Aからなる群から選択される、配列番号8に係るアミノ酸配列の位置に対応する位置に修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従い、および、変異体は、配列番号8に記載のアミラーゼに対して少なくとも80%の配列同一性を有する。
X1*+X109A+X280S+X391A、X1*+X109A+X284H+X391A、X1*+X109A+X280S+X320A+X323N+X391A、X1*+X7A+X109A+X280S+X391AおよびX1*+X7A+X109A+X280S+X284H+X323N+X391Aに対応する位置に修飾を含む変異体に関し、ここで、番号は配列番号1に従い、および、ここで、変異体は、配列番号1、2、3、4、5、6、7または8に対して少なくとも80%の配列同一性を有する。
H1*+G109A+W140Y+D183*+G184*+N195F+I206Y+Y243F+E260G+N280S+G304R+E391A+G476K、
H1*+G109A+W140Y+D183*+G184*+N195F+I206Y+Y243F+E260G+W284H+G304R+E391A+G476K、
H1*+G109A+W140Y+D183*+G184*+N195F+I206Y+Y243F+E260G+N280S+G304R+K320A+M323N+E391A+G476K、
H1*+G7A+G109A+W140Y+D183*+G184*+N195F+I206Y+Y243F+E260G+N280S+G304R+E391A+G476K、および
H1*+G7A+G109A+W140Y+D183*+G184*+N195F+I206Y+Y243F+E260G+N280S+W284H+G304R+M323N+E391A+G476K、
に対応する修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従い、変異体は、配列番号1、2、3、4、5、6、7または8に対して少なくとも80%の配列同一性を有すると共に、配列番号1の変異体である。
本発明はまた、本発明の変異体のいずれかをコードする単離されたポリヌクレオチドに関連する。従って、本発明は、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置:109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、ならびに、任意選択により、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置に修飾を含む変異体をコードする単離されたポリヌクレオチドに関し、ここで、変異体は、少なくとも80%、少なくとも85%など、少なくとも90%、少なくとも95%など、少なくとも97%などであるが、100%未満の配列同一性を、配列番号:1、2、3、4、5、6、7または8に係るアミノ酸配列に対して有し、ならびに、ここで、変異体はα-アミラーゼ活性を有する。
本発明はまた、制御配列に適合する条件下で好適な宿主細胞中にコード配列を発現させる1つまたは複数(いくつか)の制御配列に作動可能にリンクした本発明の変異体をコードするポリヌクレオチドを含む核酸構築物に関する。従って、本発明は、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置:109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、ならびに、任意選択により、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置に修飾を含む変異体をコードするポリヌクレオチドを含む核酸構築物に関し、ここで、ポリヌクレオチドは、制御配列に適合する条件下で好適な宿主細胞においてコード配列を発現させる1つ以上の制御配列に作動的にリンクされている。
本発明はまた、本発明のポリヌクレオチド、プロモータ、ならびに、転写および翻訳終止シグナルを含む組換え発現ベクターに関する。従って、本発明は、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、および、任意選択により、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置における修飾、プロモータ、ならびに、転写および翻訳終止シグナルを含む変異体をコードするポリヌクレオチドを含む組み換え型ベクターに関する。種々のヌクレオチドおよび制御配列が一緒になって、このような部位で変異体をコードするポリヌクレオチドの挿入または置換を可能とするために1つまたは複数(いくつか)の好都合な制限部位を含み得る組換え発現ベクターが生成される。または、ポリヌクレオチドは、ポリヌクレオチドまたはポリヌクレオチドを含む核酸構築物を発現に適切なベクターに挿入することにより発現され得る。発現ベクターの形成において、コード配列は、コード配列が、発現に適切な制御配列と作動可能にリンクするようベクター中に位置されている。
本発明はまた、本発明の変異体の生成をもたらす1つまたは複数(いくつか)の制御配列に作動可能にリンクした本発明のポリヌクレオチドを含む組換え宿主細胞に関する。従って、本発明は、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、ならびに、任意選択により、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置に修飾を含む変異体をコードするポリヌクレオチドを含む組み換え型宿主細胞に関し、ここで、ポリヌクレオチドは、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、ならびに、任意選択により、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置に修飾を含む変異体を産生させる1つ以上の制御配列に作動的にリンクされている。ポリヌクレオチドを含む構築物もしくはベクターは、構築物もしくはベクターが染色体性組み込み体として、もしくは、既述の自己複製余剰-染色体性ベクターとして維持されるよう宿主細胞に導入される。「宿主細胞」という用語は、複製の最中に生じる突然変異により親細胞と同等ではない親細胞のいずれかの子孫を包含する。宿主細胞の選択は、変異体をコードする遺伝子およびそのソースに大きく依存することとなる。
本発明はまた:(a)本発明の宿主細胞を変異体の発現に好適な条件下で培養するステップ;および、(b)変異体を回収するステップを含む変異体を生成する方法に関する。従って、本発明は、(a)配列番号1に係るアミノ酸配列の位置109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、および、任意選択により、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置に修飾を含む変異体をコードする発現ベクターまたはポリヌクレオチドを含む宿主細胞を、変異体の発現に好適な条件下で培養するステップ;ならびに、(b)変異体を回収するステップを含む変異体を生成する方法に関する。
本発明はまた、本発明の変異体を含む組成物に関する。従って、本発明は、変配列番号1に係るアミノ酸配列の位置109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、ならびに、任意選択により、配列番号1に係るアミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置に修飾を含む異体を含む組成物に関する。好ましくは、組成物はこのような変異体が富化されている。「富化」という用語は、組成物のα-アミラーゼ活性が、例えば1.1の富化因子で高められることを意味する。
本発明はまた、α-アミラーゼ変異体の使用方法に関する。
本発明はまた、ある場所(とりわけ表面または布地)をクリーニングおよび/または処理するための方法に関する。一態様において、このような方法であって、任意選択により、前記表面または布地を洗浄および/またはすすぐステップ、前記表面または布地とこの明細書に開示されているいずれかの消費者製品とを接触させるステップ、次いで、任意選択により、前記表面または布地を洗浄および/またはすすぐステップを含む方法が開示されている。
C11~C18の平均脂肪族炭素鎖長を有する直鎖アルキルベンゼンスルホン酸塩
C12-18ジメチルヒドロキシエチルアンモニウムクロリド
AE3SはC12-15アルキルエトキシ(3)スルフェート
AE7は、7の平均エトキシル化度を有するC12-15アルコールエトキシレート
AE9は、9の平均エトキシル化度を有するC12-16アルコールエトキシレート
HSASは、米国特許第6,020,303号明細書および米国特許第6,060,443号明細書に開示されている約16~17の炭素鎖長を有する中鎖分岐第一級アルキルスルフェート
ポリアクリレートMW4500はBASF製
カルボキシメチルセルロースは、CP Kelco,Arnhem,Netherlands製Finnfix(登録商標)V
CHECは、カチオン性変性ヒドロキシエチルセルロースポリマー。
ホスホネートキレート剤は、例えば、ジエチレンテトラアミン五酢酸(DTPA)ヒドロキシエタンジホスホネート(HEDP)、
Savinase(登録商標)、Natalase(登録商標)、Stainzyme(登録商標)、Lipex(登録商標)、Celluclean(商標)、Mannaway(登録商標)およびWhitezyme(登録商標)はすべて、Novozymes,Bagsvaerd,Denmarkの製品。
Purafect(登録商標)、Purafect Prime(登録商標)は、Genencor International,Palo Alto,California,USAの製品
蛍光増白剤1はTinopal(登録商標)AMSであり、蛍光増白剤2はTinopal(登録商標)CBS-Xであり、Direct Violet 9はPergasol(登録商標)Violet BN-Zであり、NOBSはノナノイルオキシベンゼンスルホン酸ナトリウム
TAEDはテトラアセチルエチレンジアミン
S-ACMCは、C.I.ReactiveBlue19(製品名AZO-CM-CELLULOSE)と共役されたカルボキシメチルセルロース
汚染物剥離剤はRepel-o-tex(登録商標)PF
アクリル酸/マレイン酸コポリマーは、分子量70,000であり、および、70:30のアクリレート:マレエート比
EDDSは、エチレンジアミン-N,N’-ジコハク酸のナトリウム塩、(S,S)異性体泡抑制剤凝集体はDow Corning,Midland,Michigan,USA製
HSASは中鎖分岐アルキルスルフェート
Liquitint(登録商標)Violet CTは、Milliken,Spartanburg,South Carolina,USA製
1 ランダムグラフトコポリマーは、ポリエチレンオキシド主鎖および複数のポリ酢酸ビニル側鎖を有するポリ酢酸ビニルグラフトポリエチレンオキシドコポリマーである。ポリエチレンオキシド主鎖の分子量は約6000であり、ポリエチレンオキシド対ポリ酢酸ビニルの重量比は約40~60であり、50のエチレンオキシド単位当たりのグラフト点は1つ以下である。
2 -NH当たり20個のエトキシレート基を有するポリエチレンイミン(MW=600)。
3 両親媒性アルコキシル化ポリマーは、-NH当たり24個のエトキシレート基および-NH当たり16個のプロポキシレート基を含有するよう誘導体化されたポリマーから調製されたポリエチレンイミン(MW600)。
アミラーゼ4は、本明細書におけるa)~k)のいずれか(mg活性タンパク質)。
α-アミラーゼ活性は、G7-pNP基質を利用する方法により判定し得る。G7-pNPは、α-アミラーゼなどのエンド-アミラーゼにより切断されることが可能であるブロックオリゴ糖(blocked oligosaccharide)である4,6-エチリデン(G7)-p-ニトロフェニル(G1)-α,D-マルトヘプタオシドに対する略記である。切断の後、キット中のα-グルコシダーゼが加水分解された基質をさらに消化して、黄色の遊離pNP分子を遊離させ、これにより、λ=405nm(400~420nm)での可視分光法による計測が可能である。G7-pNP基質およびα-グルコシダーゼを含有するキットは、Roche/Hitachi(カタログ番号11876473)により製造されている。
このキットのG7-pNP基質は、22mMの4,6-エチリデン-G7-pNPおよび52.4mM HEPES(2-[4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジニル]-エタンスルホン酸)、pH7.0)を含有する。
分析されるアミラーゼサンプルを希釈緩衝剤中に希釈して、確実に希釈サンプル中のpHを7とした。アッセイを、20μlの希釈酵素サンプルを96ウェルマイクロタイタープレートに移し、80μlの基質処理溶液を添加することにより行った。溶液を混合し、室温で1分プレインキュベートし、OD405nmで5分間にわたって20秒毎に吸収を計測する。
ランドリーにおける洗浄性能を評価するために、自動機械式応力アッセイ(AMSA)を用いて洗濯実験を実施する。AMSAでは、大量の小容量酵素-洗剤溶液の洗浄性能を試験可能である。AMSAプレートは、テスト溶液用の多数のスロットと、洗浄されるランドリーサンプルである生地をすべてのスロット開口部に対してしっかりと押し込む蓋とを有する。洗浄時間の間、プレート、テスト溶液、生地および蓋を激しく振盪してテスト溶液と生地とを接触させ、規則正しい周期的な振動で機械的応力を加える。さらなる説明については、国際公開第02/42740号パンフレット、特に第23~24頁の段落「Special method embodiments」を参照のこと。
水(10°dH)、洗剤(例えば、以下に記載の欧州製の液体洗剤5.1g/L)および本発明の酵素(例えば0、0.8および/または1.2mg酵素タンパク質/Lの濃度)を含むテスト溶液を調製する。デンプン(例えば、Center For Testmaterials BV,P.O.Box 120,3133 KT,Vlaardingen,The Netherlands製のCS-28)で汚れた布地を加え、および、20℃で20分間洗浄した。水道からの流水で完全にすすぎ、暗中で乾燥させた後、洗浄性能の尺度として、汚れた布地の光強度または反射率値をその後に計測する。0mg酵素タンパク質/Lでのテストをブランクとして用いてΔレミッション値を得た。洗浄ステップの最中には、例えば洗浄溶液を布地と振盪、回転または攪拌する形態で機械的作用が加えられることが好ましい。
CaCl2、MgCl2およびNAHCO3の添加により、以下に記載の強度に水硬度を調節した。洗浄溶液を、以下に記載のとおり、バケツ中に、所望の量の洗剤、温度および水硬度で調製した。洗剤を10分間の磁気攪拌の最中に溶解させた。(洗浄溶液は、調製後30~60分以内に用いた)。
自動機械式応力アッセイを用いるα-アミラーゼの洗浄性能
洗剤ベース組成物中のα-アミラーゼの洗浄性能を評価するために、自動機械式応力アッセイ(AMSA)を用いて洗浄実験を行ってもよい。AMSAテストでは、大量の小容量酵素-洗剤溶液の洗浄性能を試験可能である。AMSAプレートは、テスト溶液用の多数のスロットと、洗浄されるランドリーサンプルである生地の布きれをすべてのスロット開口部に対してしっかりと押し込む蓋とを有する。洗浄時間の間、プレート、テスト溶液、生地および蓋を激しく振盪してテスト溶液と生地とを接触させ、規則正しい周期的な振動で機械的応力を加える。さらなる記載については、国際公開第02/42740号パンフレット(特に、第23~24ページの段落「特別な方法の実施形態」)を参照のこと。
水(6°dHまたは15°dH)、0.79g/Lの洗剤(例えば、以下に記載のとおりモデル洗剤J)、および、0または0.2mg酵素タンパク質/Lの濃度の本発明の酵素を含むテスト溶液を調製する。デンプンで汚れた布(Center For Test materials BV,P.O.Box 120,3133 KT,Vlaardingen,the Netherlands製のCS-28)を加え、20℃および40℃で10分間洗浄し、または、代わりに、実施例に記載されているとおり、20℃および30℃で10分間洗浄する。水道からの流水で完全にすすぎ、暗中で乾燥させた後、洗浄性能の尺度として、汚れた布地の光強度値をその後に計測する。0mg酵素タンパク質/Lでのテストをブランクとして用い、洗剤による寄与と相関させる。洗浄ステップの最中には、例えば洗浄溶液を布地と振盪、回転または攪拌する形態で機械的作用が加えられることが好ましい。AMSA洗浄性能実験は以下に特定されている実験条件下で実施し得る。
テストした変異体および対応する親α-アミラーゼ(配列番号2)の洗浄性能を、上記のとおりTOMスケール洗浄についてテストした。用いた洗剤は洗剤Kであった。結果は、(変異体の性能-ブランクの性能)を(親の性能-ブランクの性能)で除したものとして示す。
Claims (21)
- 親α-アミラーゼの変異体であって、
(i)配列番号1に係るアミノ酸配列の位置109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、および、任意選択により、配列番号1に係る前記アミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置に修飾を含み、
(ii)少なくとも90%など、少なくとも95%など、少なくとも97%などの少なくとも80%であるが、100%未満の配列同一性を、配列番号:1、2、3、4、5、6、7または8に係るアミノ酸配列に対して有し、ならびに
(iii)α-アミラーゼ活性を有する、
親α-アミラーゼの変異体。 - 前記修飾が欠失または置換である、請求項1に記載の変異体。
- 前記変異体が、配列番号1に係る前記アミノ酸配列の位置109、1、7、280、284、320、323および391に対応する少なくとも1つの位置に修飾を含む、請求項1または2に記載の変異体。
- 前記変異体が、配列番号1に係る前記アミノ酸配列の位置109、1、7、140、181、182、183、184、195、206、243、260、280、284、304、320、323、391および476に対応する少なくとも1つの位置に修飾を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の変異体。
- 前記1つ以上の修飾が置換である、請求項1~4のいずれか一項に記載の変異体。
- 前記1つ以上の修飾の少なくとも1つが欠失である、請求項1~4のいずれか一項に記載の変異体。
- 前記変異体が、1、109および391からなる群から選択される少なくとも2つの位置に修飾を含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の変異体。
- 前記修飾が:X1*、X1A、X7A、X7K、X7E、X7N、X7Q、X7L、X7D、X109A、X109S、X140Y、X181*、X182*、X183*、X184*、X195F、X206Y、X243F、X260G、X280S、X284H、X284R、X284F、X304R、X320A、X320M、X320T、X320V、X320S、X323N、X323R、X323S、X323K、X391A、X391VおよびX476Kからなる群から選択される、請求項1~7のいずれか一項に記載の変異体。
- 前記変異体が、向上した洗浄性能などの向上した性能を有する、請求項1~8のいずれか一項に記載の変異体。
- 前記変異体が、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%または少なくとも99%であるが、100%未満である配列同一性を、前記親α-アミラーゼの前記アミノ酸配列に対して有する、請求項1~9のいずれか一項に記載の変異体。
- 修飾の数が、1、2、3、4、5、6、7、8、9または10の修飾など、例えば1~20、例えば1~10および1~5といった1~30の修飾である、請求項1~10のいずれか一項に記載の変異体。
- 前記変異体が:X1+X7;X1+X109;X1+X280;X1+X284;X1+X320;X1+X323;X1+X391;X109+X280;X109+X284;X109+X320;X109+X323;X109+X391;X7+X109;X7+X280;X7+X284;X7+X320;X7+X323;X7+X391;X280+X284;X280+X320;X280+X323;X280+X391;X284+X320;X284+X323;X284+X391;X320+X323;X320+X391;および、X323+X391からなる位置の群から選択される位置に修飾を含み、ここで、番号は配列番号1に従う、請求項1~11のいずれか一項に記載の変異体。
- 前記変異体が:
H1*+G109A+N280S+E391A;
H1*+G7K+G109A+N280S+E391A;
H1*+G7E+G109A+N280S+E391A;
H1*+G7N+G109A+N280S+E391A;
H1*+G7Q+G109A+N280S+E391A;
H1*+G7L+G109A+N280S+E391A;
H1*+G7D+G109A+N280S+E391A;
H1*+G109A+N280S+K320A+E391A;
H1*+G109A+N280S+K320M+E391A;
H1*+G109A+N280S+K320T+E391A;
H1*+G109A+N280S+K320V+E391A;
H1*+G109A+N280S+M323R+E391A;
H1*+G109A+N280S+K320S+E391A;
H1*+G109A+N280S+E391V;
H1*+G109A+W284R+E391A;
H1*+G109A+W284F+E391A;
H1*+G109A+N280S+K320A+M323S+E391A;
H1*+G109A+N280S+W284F+E391A;
H1*+G109A+N280S+M323N+E391A;
H1*+G109A+N280S+M323K+E391A;
H1*+G109S+N280S+E391A;
H1*+G109A+W284H+E391A;
H1*+G109A+N280S+K320A+M323N+E391A;
H1*+G7A+G109A+N280S+E391A;
H1*+G7A+G109A+N280S+W284H+K320A+M323N+E391A;
G7A+W284H+K320A+M323N;
G7A+K320A+M323N;
K320A;
G7A+K320A;
H1*+G7A+G109A+N280S+E391A;
H1*+G109A+N280S+W284H+E391A;
H1*+G109A+N280S+M323S+E391A;
H1*+G7A+G109A+N280S+K320A+E391A;
H1*+G7A+G109A+N280S+M323S+E391A;
H1*+G7A+G109A+N280S+M323N+E391A;
H1*+G7A+G109A+N280S+W284F+E391A;
H1*+G7A+G109A+N280S+W284R+E391A;
H1*+G7A+G109A+N280S+K320A+M323S+E391A;
H1*+G7A+G109A+W284R+E391A;および
H1*+G7A+G109A+N280S+K320A+M323N+E391A
からなる群から選択される、配列番号2に係る前記アミノ酸配列の位置に対応する位置に修飾を含む、請求項1~12のいずれか一項に記載の変異体。 - 前記親α-アミラーゼが、配列番号:1、2、3、4、5、6、7および8に係る前記アミノ酸配列から選択されるか、または、配列番号:1および2に係る前記アミノ酸配列のいずれかに対して、少なくとも90%、少なくとも92%など、少なくとも95%など、少なくとも97%など、少なくとも98%など、少なくとも99%など、もしくは、100%の配列同一性を有するいずれかのα-アミラーゼから選択される、請求項1~13のいずれか一項に記載の変異体。
- 前記親α-アミラーゼが、配列番号1および2に係る前記アミノ酸配列を含むか、または、これらからなる、請求項1~14のいずれか一項に記載の変異体。
- 請求項1~15のいずれか一項に記載の前記変異体をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項16に記載のポリヌクレオチドを含む核酸構築物。
- 請求項16に記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
- 請求項16に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
- α-アミラーゼ変異体を生成する方法であって:
a.前記変異体の発現に好適な条件下で請求項19に記載の宿主細胞を培養するステップ;および
b.前記変異体を回収するステップ
を含む方法。 - α-アミラーゼ変異体を入手する方法であって、親α-アミラーゼに、配列番号1に係る前記アミノ酸配列の位置109、1、7、280、284、320、323および391に対応する1つ以上の位置、および、任意選択により、配列番号1に係る前記アミノ酸配列の位置140、181、182、183、184、195、206、243、260、304および476に対応する1つ以上の位置に修飾を導入するステップであって、各修飾が独立して置換または欠失であり、および、前記変異体がα-アミラーゼ活性を有するステップ;ならびに、前記変異体を回収するステップを含む方法。
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