JP2019507604A - エチレングリコールおよび3炭素化合物の同時生成のための微生物および方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、35 U.S.C. 119(e)の下で、2016年3月9日に出願された米国仮出願第62/305,814号および2016年12月6日に出願された米国仮出願第62/430,742号からの優先権の恩典を主張し、それらの各々の内容の全体が参照により本明細書に組み入れられる。
本願と共に電子的に提出されたテキストファイルの内容は、それらの全体が参照により本明細書に組み入れられる:配列表のコンピュータ読み取り可能な形式のコピー(ファイル名:BRAS_001_02WO_ST25.txt、データ記録日:2017年3月7日、ファイルサイズ約231キロバイト)。
本願は、モノエチレングリコールおよび1つまたは複数の3炭素化合物の生合成に有用な組換え微生物に関する。本願はさらに、この組換え微生物を用いてモノエチレングリコールおよび1つまたは複数の3炭素化合物を生成する方法、ならびにこれらの化合物の1つもしくは複数および/または組換え微生物を含む組成物に関する。
モノエチレングリコール(MEG)、アセトン、イソプロパノール(IPA)およびプロペン等の有機化合物は、(MEGから)ポリエチレンテレフタレート(PET)樹脂および(プロペンから)プラスチックポリプロピレン等の製品を製造する際の原材料として有用である。これらの化合物はまた、工業用および家庭用での直接的な用途が見出されている。
本願は、モノエチレングリコールおよび1つまたは複数の3炭素化合物の生成のための1つまたは複数の生合成経路を有する組換え微生物に関する。
(a)D-キシルロースからD-リブロースへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-リブロースからD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のD-リブロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつMEGおよびアセトンが同時生成される、前記微生物に関する。
(a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を含む。
(a)D-キシルロースからD-キシルロース-1-リン酸への変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシルロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)(d)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(f)(e)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつMEGおよびアセトンが同時生成される、前記微生物に関する。
(a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を含む。
(a)D-キシロースからキリトールへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、およびキシリトールからD-キシルロースへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(b)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、さらに
(c)(a)もしくは(b)由来のD-キシルロースからD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来のD-リブロースからD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)(d)由来のD-リブロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(f)(e)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼもしくはメチルグリオキサールレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(g)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(h)(g)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼまたはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;および/または
(i)(h)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつMEGおよびアセトンが同時生成される、前記微生物に関する。
(a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(b)D-キシルロース-5-リン酸からD-キシルロースへの変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を含む。
(a)D-キシロースからD-キシロノラクトンへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロノラクトンからD-キシロネートへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のD-キシロネートから2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートからグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)(d)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(f)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(g)(f)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(h)(g)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体ピルベートが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつMEGおよびアセトンが同時生成される、前記微生物に関する。
(a)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を含む。
(a)D-キシロースからD-キシロネートへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロネートから2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートからグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(e)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒する酵素をコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体ピルベートが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつMEGおよびアセトンが同時生成される、前記微生物に関する。
(a)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する酵素をコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を含む。
SEQ ID NO:1〜SEQ ID NO:120の配列表は、本願の一部であり、参照により本明細書に組み入れられる。配列表は、本明細書の最終項に提供される。
定義
以下の定義および略語が、本開示の解釈のために使用されるべきである。
本開示は、異なる宿主におけるモノエチレングリコール(MEG)および1種類または複数種類の3炭素化合物の生成を組み合わせる。いくつかの態様において、3炭素化合物は、イソプロパノール(IPA)である。本開示は、それによって、これまでに証明された公知のMEG経路およびIPA経路についての経路工学の最大の課題のうちのいくつかを回避する。驚くべきことに、MEG生成のための経路と、3炭素化合物の生成のための経路との組み合わせは、相互を補完し、高度に相乗的であり、単独での各経路の最大の課題および欠点を回避するかまたは克服し、良好な酸化還元バランスを確立するのみならず、過剰のATPを生成することなく、必要とされるATPも送達する。
1キシロース→1 MEG+1/2アセトン+3/2 CO2+1 NADH
1キシロース→1 MEG+1/2 IPA+3/2 CO2+1/2 NADH
1キシロース→1 MEG+5/8アセトン+9/8 CO2
1キシロース→1 MEG+10/18 IPA+4/3 CO2
1キシロース→1 MEG+1アセトン
1キシロース→1 MEG+1 IPA
モノエチレングリコール(MEG)は、産業的適用のための重要な原材料である。MEGの主な用途は、ポリエチレンテレフタレート(PET)樹脂、フィルム、および繊維の製造である。さらに、MEGは、不凍液、冷却水、航空機の防氷装置および除氷装置、ならびに溶媒の生成において重要である。MEGは、エタン-1,2-ジオールとしても公知である。
(プロパノンとしても公知である)アセトンは、式(CH3)2COを有する有機化合物である。それは、無色、揮発性、可燃性の液体であり、最も単純なケトンである。
イソプロパノールとも呼ばれるイソプロピルアルコール(IUPAC名2-プロパノール)は、化学式C3H8OまたはC3H7OHまたはCH3CHOHCH3を有する化合物である。それは、強い臭いを有する無色の可燃性の化学的化合物である。それは、(CH3)2CHOHとして時に示される、2個の他の炭素原子にアルコール炭素原子が付着した二級アルコールの最も単純な例である。それは、プロパノールの構造異性体である。それは、多様な産業用および家庭用の用途を有する。
本明細書中に開示されたMEGおよび3炭素化合物の同時生成経路において使用され得る例示的な酵素は、表1にリストされる。
本開示は、様々なケトースのC-3位のエピマー化を触媒し、DフルクトースとD-プシコース、D-タガトースとD-ソルボース、D-リブロースとD-キシルロース、およびL-リブロースとL-キシルロースを相互変換することができる酵素を記載する。特異性は種に依る。シュードモナス・シコリイおよびロドバクター・スフェロイデスに由来する酵素は、Mn2+を必要とする。一つの態様において、酵素は、D-タガトース3-エピメラーゼ(dte)である。もう一つの態様において、D-タガトース3-エピメラーゼは、D-キシルロースのD-リブロースへの変換を触媒する。
本開示は、以下の反応を触媒することができる酵素を記載する:
L-フクロース+ATP→L-フクロース1-リン酸+ADP+H+
D-リブロース+ATP→D-リブロース1-リン酸+ADP+H+
多数のアルデヒドレダクターゼが、グリコールアルデヒドをMEGへ変換するために使用され得る。
2-ケト-L-グロン酸+NADP+←2,5-ジデヒドロ-D-グルコン酸+NADPH+H+(反応は逆方向が有利である、EC 1.1.1.346)
2-ケト-L-グロン酸+NADP+←2,5-ジデヒドロ-D-グルコン酸+NADPH+H+(反応は逆方向が有利である、EC 1.1.1.346)
L-グリセルアルデヒド3-リン酸+NADPH+H+→sn-グリセロール3-リン酸+NADP+(EC 1.1.1.-)
アミノアセトン+NADH+H+→(R)-1-アミノプロパン-2-オール+NAD+(EC 1.1.1.75)
本開示は、以下の反応を触媒することができる酵素を記載する:
アセト酢酸+H+→アセトン+CO2
本開示は、一級アルコールまたは二級アルコールの、それぞれ、アルデヒドまたはケトンへの可逆的酸化を触媒することができる酵素を記載する。一つの態様において、酵素は、二級アルコールデヒドロゲナーゼ(S-ADH)であり、アセトンのようなケトンの、2-プロパノール(イソプロパノール)のような二級アルコールへの還元を触媒する。
本開示は、D-キシルロースのD-キシルロース-1-リン酸への変換を触媒することができる酵素を記載する。いくつかの態様において、変換は、フルクトキナーゼとしても公知のヒトケトヘキソキナーゼC(khk-C)によって触媒され得る。
本開示は、D-キシルロース-1-リン酸のグリコールアルデヒドおよびDHAPへの変換を触媒することができる酵素を記載する。いくつかの態様において、変換は、フルクトースビスリン酸アルドラーゼBまたは肝臓型アルドラーゼとしても公知であるヒトアルドラーゼBによって触媒され得る。
本開示は、以下の反応を触媒することができる酵素を記載する:
D-キシルロース+ATP→D-キシルロース5-リン酸+ADP+H+(EC 2.7.1.17)
ATP+1-デオキシ-D-キシルロース→1-デオキシ-D-キシルロース5-リン酸+ADP+H+(EC 2.7.1.-)
本開示は、以下の反応を触媒することができる酵素を記載する:
アルデヒド-D-キシロース+NAD++H2O→D-キシロネート+NADH+2H+
本開示は、以下の反応を触媒することができる酵素を記載する:
(R)-ラクテート+NAD+←ピルベート+NADH+H+
アルカリホスファターゼは、ヌクレオチド、タンパク質、およびアルカロイドを含む多くのタイプの分子からのリン酸基の除去を担うヒドロラーゼ酵素である。その名称が示唆するように、アルカリホスファターゼは、アルカリ環境において最も有効である。それは、時に、塩基性ホスファターゼと同義に使用される。
上述のように、本願は、モノエチレングリコール(MEG)および1種類または複数種類の3炭素化合物を同時生成する組換え微生物を提供する。一つの態様において、MEGおよび1種類または複数種類の3炭素化合物は、キシロースから同時生成される。もう一つの態様において、組換え微生物は、D-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子および/またはグリコアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子に欠失、挿入、または機能喪失型変異を含む。いくつかの態様において、D-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子は、xylBである。いくつかの態様において、グリコアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子は、aldAである。
(a)D-キシルロースのD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(b)(a)由来のD-リブロースのD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(c)(b)由来のD-リブロース-1-リン酸のグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドのMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(e)アセチルCoAのアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAのアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸のアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を発現する、外来性のD-キシロースからモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物に関し;本微生物において、生成された中間体DHAPは、微生物における内在性の解糖経路を通してアセチルCoAへ変換され、かつMEGおよびアセトンが、同時生成される。
(a)D-キシルロースのD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;
(b)グリコールアルデヒドのグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;および
(c)ピルベートのラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異、
からなる群より選択される1種類または複数種類の改変をさらに含む。
(a)D-キシルロースのD-キシルロース-1-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース1-キナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシルロース-1-リン酸のグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(c)(b)由来のグリコールアルデヒドのMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(d)アセチルCoAのアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(e)(d)由来のアセトアセチルCoAのアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;ならびに/または
(f)(e)由来のアセト酢酸のアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を発現する、外来性のD-キシロースからモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物に関し;本微生物において、生成された中間体DHAPは、微生物における内在性の解糖経路を通してアセチルCoAへ変換され、かつMEGおよびアセトンが、同時生成される。
(a)D-キシルロースのD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;
(b)グリコールアルデヒドのグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;および
(c)ピルベートのラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異、
からなる群より選択される1種類または複数種類の改変をさらに含む。
(a)D-キシロースのキシリトールへの変換を触媒するキシロースレダクターゼもしくはアルドースレダクターゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子およびキシリトールのD-キシルロースへの変換を触媒するキシリトールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子;
(b)D-キシロースのD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を発現し、
(c)(a)もしくは(b)由来のD-キシルロースのD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(d)(c)由来のD-リブロースのD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(e)(d)由来のD-リブロース-1-リン酸のグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(f)(e)由来のグリコールアルデヒドのMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼもしくはメチルグリオキサールレダクターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(g)アセチルCoAのアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(h)(g)由来のアセトアセチルCoAのアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;ならびに/または
(i)(h)由来のアセト酢酸のアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数をさらに発現する、外来性のD-キシロースおよびグルコースからモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物に関し;本微生物において、生成された中間体DHAPは、微生物における内在性の解糖経路を通してアセチルCoAへ変換され、かつMEGおよびアセトンが、同時生成される。
(a)D-キシルロースのD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;および
(b)D-キシルロース-5-リン酸のD-キシルロースへの変換を触媒するアルカリホスファターゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異。
(a)D-キシロースのD-キシロノラクトンへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロノラクトンのD-キシロネートへの変換を触媒するキシロノラクトナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(c)(b)由来のD-キシロネートの2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒するキシロン酸デヒドラターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(d)(c)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートのグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する、2-ケト-3-デオキシ-D-ペントン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(e)(d)由来のグリコールアルデヒドのMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(f)アセチルCoAのアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子;
(g)(f)由来のアセトアセチルCoAのアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;ならびに/または
(h)(g)由来のアセト酢酸のアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を発現する、外来性のD-キシロースからモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物に関し;本微生物において、生成された中間体ピルベートは、微生物における内在性の解糖経路を通してアセチルCoAへ変換され、かつMEGおよびアセトンが、同時生成される。
(a)D-キシロースのD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;
(b)グリコールアルデヒドのグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;および
(c)ピルベートのラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異、
からなる群より選択される1種類または複数種類の改変をさらに含む。
(a)D-キシロースのD-キシロネートへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロネートの2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒するキシロン酸デヒドラターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(c)(b)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートのグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する2-ケト-3-デオキシ-D-ペントン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドのMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子;
(e)アセチルCoAのアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAのアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸のアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を発現する、外来性のD-キシロースからモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物に関し;本微生物において、生成された中間体ピルベートは、微生物における内在性の解糖経路を通してアセチルCoAへ変換され、かつMEGおよびアセトンが、同時生成される。
(a)D-キシロースのD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;
(b)グリコールアルデヒドのグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;および
(c)ピルベートのラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異、
からなる群より選択される1種類または複数種類の改変をさらに含む。
本開示は、様々な内在性または外来性の酵素を発現するよう操作され得る微生物を提供する。
上述のように、本願は、MEGおよび1種類または複数種類の3炭素化合物を生成するかまたは蓄積する組換え微生物を作製する方法を提供する。一つの態様において、MEGおよび1種類または複数種類の3炭素化合物は、キシロースから同時生成される。もう一つの態様において、外来性のD-キシロースからMEGおよび1種類または複数種類の3炭素化合物を生成するかまたは蓄積する組換え微生物を作製する方法は、D-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子および/またはグリコアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異を組換え微生物へ導入する工程を含む。いくつかの態様において、D-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子は、xylBである。いくつかの態様において、グリコアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子は、aldAである。
(a)D-キシルロースのD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(b)(a)由来のD-リブロースのD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(c)(b)由来のD-リブロース-1-リン酸のグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドのMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(e)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAのアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸のアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を組換え微生物に導入しかつ/または過剰発現させる工程を含む、外来性のD-キシロースからMEGおよびアセトンを生成するかまたは蓄積する組換え微生物を作製する方法を提供し;本方法において、生成された中間体DHAPは、微生物における内在性の解糖経路を通してアセチルCoAへ変換され、かつMEGおよびアセトンが、同時生成される。
(a)D-キシルロースのD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;
(b)グリコールアルデヒドのグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;および
(c)ピルベートのラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異、
からなる群より選択される1種類または複数種類の改変を組換え微生物へ導入する工程をさらに含む。
(a)D-キシルロースのD-キシルロース-1-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース1-キナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシルロース-1-リン酸のグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(c)(b)由来のグリコールアルデヒドのMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(d)アセチルCoAのアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(e)(d)由来のアセトアセチルCoAのアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;ならびに/または
(f)(e)由来のアセト酢酸のアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を組換え微生物に導入しかつ/または過剰発現させる工程を含む、外来性のD-キシロースからMEGおよびアセトンを生成するかまたは蓄積する組換え微生物を作製する方法を提供し;本方法において、生成された中間体DHAPは、微生物における内在性の解糖経路を通してアセチルCoAへ変換され、かつMEGおよびアセトンが、同時生成される。
(a)D-キシルロースのD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;
(b)グリコールアルデヒドのグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;および
(c)ピルベートのラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異、
からなる群より選択される1種類または複数種類の改変を組換え微生物へ導入する工程をさらに含む。
(a)D-キシロースのキシリトールへの変換を触媒するキシロースレダクターゼもしくはアルドースレダクターゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子、およびキシリトールのD-キシルロースへの変換を触媒するキシリトールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子;
(b)D-キシロースのD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を組換え微生物に導入しかつ/または過剰発現させる工程を含み、
(c)(a)もしくは(b)由来のD-キシルロースのD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(d)(c)由来のD-リブロースのD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(e)(d)由来のD-リブロース-1-リン酸のグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(f)(e)由来のグリコールアルデヒドのMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼもしくはメチルグリオキサールレダクターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(g)アセチルCoAのアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(h)(g)由来のアセトアセチルCoAのアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;ならびに/または
(i)(h)由来のアセト酢酸のアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を組換え微生物に導入しかつ/または過剰発現させる工程をさらに含む、外来性のD-キシロースおよびグルコースからMEGおよびアセトンを生成するかまたは蓄積する組換え微生物を作製する方法を提供し:本方法において、生成された中間体DHAPは、微生物における内在性の解糖経路を通してアセチルCoAへ変換され、かつMEGおよびアセトンが、同時生成される。
(a)D-キシルロースのD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;および
(b)D-キシルロース-5-リン酸のD-キシルロースへの変換を触媒するアルカリホスファターゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異、
からなる群より選択される1種類または複数種類の改変を組換え微生物へ導入する工程をさらに含む。
(a)D-キシロースのD-キシロノラクトンへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロノラクトンのD-キシロネートへの変換を触媒するキシロノラクトナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(c)(b)由来のD-キシロネートの2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒するキシロン酸デヒドラターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(d)(c)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートのグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する2-ケト-3-デオキシ-D-ペントン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(e)(d)由来のグリコールアルデヒドのMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(f)アセチルCoAのアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子;
(g)(f)由来のアセトアセチルCoAのアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;ならびに/または
(h)(g)由来のアセト酢酸のアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を組換え微生物に導入しかつ/または過剰発現させる工程を含む、外来性のD-キシロースからMEGおよびアセトンを生成するかまたは蓄積する組換え微生物を作製する方法を提供し;本方法において、生成された中間体ピルベートは、微生物における内在性の解糖経路を通してアセチルCoAへ変換され、かつMEGおよびアセトンが、同時生成される
(a)D-キシロースのD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;
(b)グリコールアルデヒドのグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;および
(c)ピルベートのラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異、
からなる群より選択される1種類または複数種類の改変を組換え微生物へ導入する工程をさらに含む。
(a)D-キシロースのD-キシロネートへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロネートの2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒するキシロン酸デヒドラターゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(c)(b)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートのグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する2-ケト-3-デオキシ-D-ペントン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドのMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子;
(e)アセチルCoAのアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAのアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1種類の内在性もしくは外来性の核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸のアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1種類の外来性の核酸分子、
のうちの一つまたは複数を組換え微生物に導入しかつ/または過剰発現させる工程を含む、外来性のD-キシロースからMEGおよびアセトンを生成するかまたは蓄積する組換え微生物を作製する方法を提供し;本方法において、生成された中間体ピルベートは、微生物における内在性の解糖経路を通してアセチルCoAへ変換され、かつMEGおよびアセトンが、同時生成される。
(a)D-キシロースのD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;
(b)グリコールアルデヒドのグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異;および
(c)ピルベートのラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入、または機能喪失型変異、
からなる群より選択される1種類または複数種類の改変を組換え微生物へ導入する工程をさらに含む。
組換え微生物の酵素は、基質から生成物への変換の1種類または複数種類の局面を改善するため、操作されていてよい。本開示の方法において使用するためにさらに操作され得る酵素の非限定的な例には、アルドラーゼ、アルデヒドレダクターゼ、アセトアセチル補酵素Aヒドロラーゼ、キシロースイソメラーゼ、キシリトールデヒドロゲナーゼ、およびそれらの組み合わせが含まれる。これらの酵素は、改善された触媒活性、改善された選択性、改善された安定性、様々な発酵条件(温度、pH等)に対する改善された耐性、または様々な代謝基質、生成物、副生成物、中間体等に対する改善された耐性のために操作され得る。「改善された触媒活性」という用語は、特定の酵素活性に関して、本明細書において使用されるように、比較可能な操作されていない酵素について測定されたものより高レベルの酵素活性をさす。
本明細書中に記載された様々な態様において、本明細書中に記載された生合成経路に関与する外来性および内在性の酵素を、組換え微生物において過剰発現させることができる。
大腸菌K12株MG1655を、MEG+IPA経路から炭素フラックスを流用することができる2つの遺伝子aldAおよびxylBの欠失のための宿主として使用した。これらの遺伝子を首尾よく欠失させ、欠失を配列決定によって確認した。この経路の第1の酵素(核酸配列SEQ ID NO:2によってコードされるD-タガトース3-エピメラーゼ、SEQ ID NO:3)をコードするdte遺伝子を含むプラスミドを、pUCベクター骨格の下、proDプロモーターの制御下で発現させた。このプラスミドを、MoCloシステムを使用して構築し、配列決定によって確認した。確認されたプラスミドを、欠失株に形質転換させた。形質転換により得られたコロニーを、プレ培養のために3 mLのLB培地に植菌した。16時間の培養後、プレ培養物の10%を、15 g/Lのキシロースを含む50 mLのLB培地に移した。このフラスコを、キシロースが完全に消費されるまで、37℃、250 rpmでインキュベートした。この培養物の初期ODは、0.4であった。キシロースは、96時間の培養後に完全に消費された。27時間の培養後に少量のMEGが検出された。最高のMEG濃度は、100時間の培養後に測定され、2.1 g/Lに達した。MEG産物の全収率は、13.7 wt%であった(図7)。
aldAおよびxylB遺伝子を欠失させた大腸菌K12株MG1655(実施例1aと同じ株)を、完全なMEG経路の実装のための宿主として使用した。proDプロモーターの制御下にdte(核酸配列SEQ ID NO:2によってコードされる、D-タガトース3-エピメラーゼ酵素、SEQ ID NO:3)、fucA(核酸配列SEQ ID NO:10によってコードされる、D-リブロース-1-リン酸アルドラーゼ酵素、SEQ ID NO:11)、fucO(核酸配列SEQ ID NO:27によってコードされる、アルデヒドレダクターゼ酵素、SEQ ID NO:28)およびfucK(核酸配列SEQ ID NO:7によってコードされる、D-リブロキナーゼ酵素、SEQ ID NO:8)遺伝子を含むオペロンを、pET28a骨格の下で構築した。このプラスミドは、市販キットIn-fusionを用いて構築し、配列決定によって確認した。確認されたプラスミドを、MG1655変異株に形質転換させた。形質転換により得られたコロニーを、プレ培養のために3 mLのLB培地に植菌した。16時間の培養後、プレ培養物を、初期ODが0.3となるよう、15 g/Lのキシロースを含む50 mLのLB培地に移した。このフラスコを、キシロースが完全に消費されるまで、37℃、250 rpmでインキュベートした。4時間の培養後、およそ100 mg/LのMEGを検出することができた。144時間の培養後、4.3 g/LのMEGが生成され、すべてのキシロースが消費された(図8)。全収率および生産性は、それぞれ、0.3 g/gおよび0.03 g/L.hであった。
S288c由来の出芽酵母研究用株BY4730を、MEG+IPA経路の発現のための宿主として使用した。最初の工程は、IPA経路を出芽酵母のゲノムに組み込むことであった。1コピーの各遺伝子を、以下のプロモーターの制御下での相同組換えによって組み込んだ:thl遺伝子(核酸配列SEQ ID NO:34によってコードされる、チオラーゼ、SEQ ID NO:35)についてはADH1;atoA遺伝子についてはTEF1;atoD遺伝子(核酸配列SEQ ID NO:42および45によってコードされる、それぞれ、酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼ、配列番号43および46)についてはPGK1;adc遺伝子(核酸配列SEQ ID NO:48によってコードされる、アセト酢酸デカルボキシラーゼ、SEQ ID NO:49)についてはTDH3;およびadh遺伝子(核酸配列SEQ ID NO:105によってコードされる、二級アルコールデヒドロゲナーゼ、SEQ ID NO:106)についてはTPl1。この組み込みを、PCRおよび配列決定によって確認した。第2の工程は、キシロースを消費することができる遺伝子を酵母ゲノムに導入することであった。キシロース消費のために選択した経路は、2つの遺伝子Xyl1およびXyl2から構成される。TEF1プロモーターの制御下の3コピーのXyl1遺伝子(核酸配列SEQ ID NO:83によってコードされる、SEQ ID NO:84)およびこれもまたTEF1プロモーターの制御下の3コピーのXyl2(核酸配列SEQ ID NO:89によってコードされる、SEQ ID NO:90)遺伝子を、相同組換えを通じて酵母ゲノムに組み込んだ。この組み込みをPCRおよび配列決定によって確認した。第3の工程は、MEG経路の組み込みであった。それぞれTEF1およびTDH3プロモーターの制御下の2コピーのD-タガトース3-エピメラーゼ酵素(核酸配列SEQ ID NO:2によってコードされる、dte遺伝子、SEQ ID NO:3)を、以下の遺伝子と共にゲノムに組み込んだ:PGK1プロモーターの制御下の1コピーのfucO遺伝子(核酸配列SEQ ID NO:27によってコードされる、グリコールアルデヒドレダクターゼ、SEQ ID NO:28);PGK1プロモーターを用いた1コピーのfucA遺伝子(核酸配列SEQ ID NO:10によってコードされる、D-リブロース-リン酸アルドラーゼ、SEQ ID NO:11)およびPGK1プロモーター下の1コピーのfucK遺伝子(核酸配列SEQ ID NO:7によってコードされる、D-リブロキナーゼ、SEQ ID NO:8)。最終株を、PCRおよび配列決定によって確認した。この株を、20 g/Lのグルコースを含むYPD培地に植菌し、30℃、200 rpmでインキュベートした。16時間の成長後、プレ培養物を、30 g/Lのグルコースおよび10 g/Lのキシロースを含むYPDX培地中にOD 2.0となるよう植菌した。このフラスコを、30℃、100 rpmでインキュベートした。酵母におけるC5およびC6消費の典型的挙動が観察された。30 g/Lのグルコースが、60時間以内に消費され、初期キシロースの90%がわずか200時間後に消費された。ODは、200時間の培養後に55の値に達した。最初の60時間の培養ですでにイソプロパノールが生成され、MEGは、160時間の培養後にのみ検出された。最高の同時生成は、183時間の培養で得られ、58 mg/LのMEGおよび2.81 g/Lのイソプロパノールが生成された。グルコースおよびキシロースからの同時生成の全収率は、7.4%であった(図6)。
大腸菌K12株MG1655を、MEG+IPA経路から炭素フラックスを流用することができる2つの遺伝子aldAおよびxylBの欠失のための宿主として使用した。これらの遺伝子を首尾よく欠失させ、欠失を配列決定によって確認した。MEG生成のためのリブロース-1-リン酸経路を、3つの異なるベクター骨格pZA31、pZS*13およびpET28aの下で構築した。リブロース-1-リン酸経路を通じたMEGの生成は、以下の4つの遺伝子の発現を必要とする:dte(D-タガトース3-エピメラーゼ酵素)、fucA(D-リブロース-1-リン酸アルドラーゼ酵素)、fucO(アルデヒドレダクターゼ酵素)およびfucK(D-リブロキナーゼ酵素)。dte遺伝子を大腸菌に対してコドン最適化させ(SEQ ID NO:3に示されるDteアミノ酸配列)、合成した。他の遺伝子はすべて、大腸菌由来のネイティブのものであり、これらを以下のプライマー:
fucAおよびfucO
ならびにfucK
を用いてPCR増幅した。proDプロモーター(構成性プロモーター)の制御下にdte(D-タガトース3-エピメラーゼ酵素)、fucA(D-リブロース-1-リン酸アルドラーゼ酵素)、fucO(アルデヒドレダクターゼ酵素)、fucK(D-リブロキナーゼ酵素)遺伝子およびT7ターミネーターを含むオペロンを、pET28a骨格の下で構築した。遺伝子ごとに個別のRBS配列を使用した。このプラスミドを、市販キットIn-fusionを用いて構築し、配列決定により確認した。proDプロモーターの制御下のオペロン全体を、制限・連結法を用いてpZA31およびpZS*13骨格の下にサブクローニングした。
した。thl(SEQ ID NO:35に示されるThlアミノ酸配列)、adc(SEQ ID NO:49に示されるAdcアミノ酸配列)およびadh(SEQ ID NO:106に示されるAdhアミノ酸配列)を、大腸菌に対してコドン最適化させ、合成した。誘導性プロモーターpLLacOの制御下にthl(チオラーゼ)、adh(二級アルコールデヒドロゲナーゼ)、adc(アセト酢酸デカルボキシラーゼ)、atoA/D(酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼ)遺伝子およびT1ターミネーターを含むオペロンをpET28a骨格の下で構築した。遺伝子ごとに個別のRBS配列を使用した。このプラスミドを、市販キットIn-fusionおよび制限・連結法を用いて数工程で構築した。正確な構築を配列決定により確認した。誘導性プロモーターpLLacOの制御下のオペロン全体を、制限・連結法を用いてpZA31およびpZS*13骨格の下にサブクローニングした。
大腸菌K12株MG1655を、MEG+IPA経路の発現のための宿主として使用した。MEG+IPA経路から炭素フラックスを流用することができる2つの遺伝子aldAおよびxylBを、欠失の標的とした。xylBを欠失させつつ同時に安定的な組み込みを実現するため、MEG経路をxylB遺伝子座に組み込んだ。キシルロース-1-リン酸経路を通じたMEGの生成は、以下の3つの遺伝子の発現を必要とする:khkC(D-キシルロース-1-キナーゼ酵素)、aldoB(D-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼ酵素)およびfucO(アルデヒドレダクターゼ酵素)。khkC(SEQ ID NO:55に示されるKhkCアミノ酸配列)およびaldoB(SEQ ID NO:58に示されるAldoBアミノ酸配列)遺伝子を、大腸菌に対してコドン最適化させ、合成した。fucO遺伝子は、大腸菌由来のネイティブのものであり、これをPCR増幅
した。
した。thl(SEQ ID NO:35に示されるThlアミノ酸配列)、adc(SEQ ID NO:49に示されるAdcアミノ酸配列)およびadh(SEQ ID NO:106に示されるAdhアミノ酸配列)を、大腸菌に対してコドン最適化させ、合成した。
大腸菌K12株MG1655を、MEG+IPA経路の発現のための宿主として使用した。MEG+IPA経路から炭素フラックスを流用することができる2つの遺伝子であるaldAおよびxylA遺伝子を、欠失の標的とした。xylAを欠失させつつ同時に安定的な組み込みを実現するため、MEG経路をxylA遺伝子座に組み込んだ。キシロネート経路を通じたMEGの生成は、以下の2つの遺伝子の発現を必要とし:カウロバクター・カウロバクター・クレセンタス由来のxdh(SEQ ID NO:61に示されるXdhアミノ酸配列)は、大腸菌に対してコドン最適化させ、合成した。fucO遺伝子は、大腸菌由来のネイティブのものであり、これをPCR増幅
した。2つの他のネイティブ酵素であるD-キシロン酸デヒドラターゼ(yjhG、yagFまたはそれらのホモログ)およびアルドラーゼ(yjhH、yagEまたはそれらのホロモル)を過剰発現させて、キシロネート経路を通じたMEG生成を向上させることができた。
した。thl(SEQ ID NO:35に示されるThlアミノ酸配列)、adc(SEQ ID NO:49に示されるAdcアミノ酸配列)およびadh(SEQ ID NO:106に示されるAdhアミノ酸配列)を、大腸菌に対してコドン最適化させ、合成した。
plLacOプロモーター下のオペロンにIPA経路を含むベクターpZs*13およびLinD遺伝子を含むpET28aを、エレクトロポレーションを用いてBL21Star(DE3)に同時形質転換した。イソプロパノールの生成は、以下の5つの遺伝子の発現を必要とする:thl(チオラーゼ)、atoA/D(酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼ)、adc(アセト酢酸デカルボキシラーゼ)およびadh(二級アルコールデヒドロゲナーゼ)。atoA/D遺伝子は、大腸菌由来のネイティブのものであり、これをPCR増幅
した。thl(SEQ ID NO:35に示されるThlアミノ酸配列)、adc(SEQ ID NO:49に示されるAdcアミノ酸配列)およびadh(SEQ ID NO:106に示されるAdhアミノ酸配列)を、大腸菌に対してコドン最適化させ、合成した。誘導性プロモーターpLLacOの制御下にthl(チオラーゼ)、adh(二級アルコールデヒドロゲナーゼ)、adc(アセト酢酸デカルボキシラーゼ)、atoA/D(酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼ)遺伝子およびT1ターミネーターを含むオペロンをpZS*13骨格の下で構築した。候補の選択を、LB培地中でカナマイシンおよびアンピリシンを用いて行った。ここではこの株をIPA+LinDと呼んだ。このプラスミドの組み合わせは、グルコースからイソプロパノールを生成することができ、かつリナロールイソメラーゼデヒドラターゼ酵素を発現することもできる株を提供する。
(a)pZs*13_IPAをTB 20 g/Lグルコース中で(イソプロパノール生成の対照)
(b)IPA+LinDをTB 10 g/Lグリセロールおよび3 g/Lイソプロパノール中で(プロピレン生成の対照)
(c)IPA+LinDをTB 20 g/Lグルコースおよび3 g/Lイソプロパノール中で(プロピレン生成の対照)
(d)IPA+LinDをTB 20 g/Lグルコース中で(プロピレン生成の候補1)
(e)IPA+LinDをTB 20 g/Lグルコース中で(プロピレン生成の候補2)
本開示により想定される具体的内容を、以下の番号が付された態様により示す。
1. 外来性D-キシロースからモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物であって、
(a)D-キシルロースからD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-リブロースからD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のD-リブロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記微生物。
2. (g)由来のアセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの内在性または外来性核酸分子をさらに含む、クレーム1記載の組換え微生物。
3. イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの内在性または外来性核酸分子をさらに含む、クレーム2記載の組換え微生物。
4. (a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変をさらに含む、クレーム1〜3のいずれか一つに記載の組換え微生物。
5. 内在性D-キシロースイソメラーゼが、D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒する、クレーム1〜4のいずれか一つに記載の組換え微生物。
6. 外来性D-キシロースからモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物であって、
(a)D-キシルロースからD-キシルロース-1-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース1-キナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシルロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)(d)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(f)(e)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記微生物。
7. (f)由来のアセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子をさらに含む、クレーム6記載の組換え微生物。
8. イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子をさらに含む、クレーム7記載の組換え微生物。
9. (a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変をさらに含む、クレーム6〜8のいずれか一つに記載の組換え微生物。
10. 内在性D-キシロースイソメラーゼが、D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒する、クレーム6〜9のいずれか一つに記載の組換え微生物。
11. 外来性D-キシルロースおよびグルコースからモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物であって、
(a)D-キシロースからキリトールへの変換を触媒するキシロースレダクターゼもしくはアルドースレダクターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、およびキシリトールからD-キシルロースへの変換を触媒するキシリトールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(b)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、さらに
(c)(a)もしくは(b)由来のD-キシルロースからD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来のD-リブロースからD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)(d)由来のD-リブロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(f)(e)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼもしくはメチルグリオキサールレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(g)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(h)(g)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(i)(h)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記微生物。
12. (i)由来のアセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子をさらに含む、クレーム11記載の組換え微生物。
13. イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子をさらに含む、クレーム12記載の組換え微生物。
14. (a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(b)D-キシルロース-5-リン酸からD-キシルロースへの変換を触媒するアルカリホスファターゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変をさらに含む、クレーム11〜13のいずれか一つに記載の組換え微生物。
15. 真菌である、クレーム11〜14のいずれか一つに記載の組換え微生物。
16. 外来性D-キシロースからモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物であって、
(a)D-キシロースからD-キシロノラクトンへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロノラクトンからD-キシロネートへの変換を触媒するキシロノラクトナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のD-キシロネートから2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒するキシロン酸デヒドラターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートからグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)(d)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(f)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(g)(f)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(h)(g)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体ピルベートが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記微生物。
17. (h)由来のアセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子をさらに含む、クレーム16記載の組換え微生物。
18. イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子をさらに含む、クレーム17記載の組換え微生物。
19. (a)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変をさらに含む、クレーム16〜18のいずれか一つに記載の組換え微生物。
20. 外来性D-キシロースからモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物であって、
(a)D-キシロースからD-キシロネートへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロネートから2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒するキシロン酸デヒドラターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートからグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(e)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体ピルベートが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記微生物。
21. (g)由来のアセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子をさらに含む、クレーム20記載の組換え微生物。
22. イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子をさらに含む、クレーム21記載の組換え微生物。
23. (a)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変をさらに含む、クレーム20〜22のいずれか一つに記載の組換え微生物。
24. D-タガトース3-エピメラーゼが、シュードモナス属の種、メソリゾビウム属の種またはロドバクター属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム1または11に記載の組換え微生物。
25. シュードモナス・シコリイ、シュードモナス属種ST-24、メソリゾビウム・ロティまたはロドバクター・スフェロイデスから選択される、クレーム24記載の組換え微生物。
26. 1つまたは複数の核酸分子が、dteおよび/またはC1KKR1である、クレーム24記載の組換え微生物。
27. D-リブロキナーゼが、大腸菌から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム1または11記載の組換え微生物。
28. 1つまたは複数の核酸分子がfucKである、クレーム27記載の組換え微生物。
29. D-リブロース-1-リン酸アルドラーゼが、大腸菌から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム1または11に記載の組換え微生物。
30. 1つまたは複数の核酸分子がfucAである、クレーム29記載の組換え微生物。
31. グリコールアルデヒドレダクターゼが、大腸菌または出芽酵母から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム1、6、11、16または20のいずれか一つに記載の組換え微生物。
32. 1つまたは複数の核酸分子が、fucO、yqhD、dkgA(yqhE)、dkgB(yafB)、yeaE、yghZ、gldAおよび/またはGRE2から選択される、クレーム31記載の組換え微生物。
33. チオラーゼが、クロストリジウム属の種、バチルス属の種、大腸菌およびマリノバクター属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム1、6、11、16または20のいずれか一つに記載の組換え微生物。
34. クロストリジウム・アセトブチリカム、クロストリジウム・サーモサッカロリチカム、バチルス・セレウス、大腸菌およびマリノバクター・ヒドロカルボノクラスチカスから選択される、クレーム33記載の組換え微生物。
35. 1つまたは複数の核酸分子が、thlAおよび/またはatoBである、クレーム33記載の組換え微生物。
36. 酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼまたはヒドロラーゼが、クロストリジウム属の種または大腸菌から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム1、6、11、16または20のいずれか一つに記載の組換え微生物。
37. クロストリジウム・アセトブチリカムである、クレーム36記載の組換え微生物。
38. 酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、atoAおよび/またはatoDである、クレーム36記載の組換え微生物。
39. 酢酸:アセトアセチルCoAヒドロラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、ctfAおよび/またはctfBである、クレーム36記載の組換え微生物。
40. アセト酢酸デカルボキシラーゼが、クロストリジウム属の種、バチルス属の種、クロモバクテリウム属の種およびシュードモナス属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム1、6、11、16または20のいずれか一つに記載の組換え微生物。
41. クロストリジウム・アセトブチリカム、クロストリジウム・ベイジェリンキイ、クロストリジウム・セルロリティカム、バチルス・ポリミキサ、クロモバクテリウム・ビオラセウムおよびシュードモナス・プチダから選択される、クレーム40記載の組換え微生物。
42. アセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、adcである、クレーム40記載の組換え微生物。
43. 二級アルコールデヒドロゲナーゼが、バークホルデリア属の種、アルカリゲネス属の種、クロストリジウム属の種、サーモアナエロバクター属の種、フィトモナス属の種、ロドコッカス属の種、メタノバクテリウム属の種、メタノゲニウム属の種、エントアメーバ属の種、トリコモナス属の種およびトリトリコモナス属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム2、7、12、17または21のいずれか一つに記載の組換え微生物。
44. バークホルデリア属種AIU652、アルカリゲネス・ユートロファス、クロストリジウム・ラグスダレイ、クロストリジウム・ベイジェリンキイ、サーモアナエロバクター・ブロッキイ、サーモアナエロバクター・エタノリカス(クロストリジウム・サーモヒドロスルフリカム)、ロドコッカス・ルーバー、メタノバクテリウム・パルストレ、メタン生成古細菌メタノゲニウム・リミナタンス、寄生性原生生物エントアメーバ・ヒストリティカ、、寄生性原生動物トリトリコモナス・フィータスおよびヒト寄生生物トリコモナス・バギナリスから選択される、クレーム43記載の組換え微生物。
45. 二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、adhBまたはEhAdh1である、クレーム43記載の組換え微生物。
46. D-キシルロース1-キナーゼが、ホモ・サピエンスから得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム6記載の組換え微生物。
47. D-キシルロース1-キナーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、ケトヘキソキナーゼC(khk-C)である、クレーム46記載の組換え微生物。
48. D-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼが、ホモ・サピエンスから得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム6記載の組換え微生物。
49. D-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、アルドラーゼB(ALDOB)である、クレーム48記載の組換え微生物。
50. キシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼが、ヒポクレア属の種、サッカロミセス属の種、パキソレン属の種、ピキア属の種、カンジダ属の種、アスペルギルス属の種、ニューロスポラ属の種およびクリプトコッカス属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム11記載の組換え微生物。
51. ヒポクレア・ジェコリナ、出芽酵母、パキソレン・タンノフィルス、ピキア・スチピチス、ピキア・クエルカム、カンジダ・シェハテ、カンジダ・テヌイス、カンジダ・トロピカリス、アスペルギルス・ニガー、ニューロスポラ・クラッサおよびクリプトコッカス・ラクタチボルスから選択される、クレーム50記載の組換え微生物。
52. キシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xyl1またはGRE3である、クレーム50記載の組換え微生物。
53. キシリトールデヒドロゲナーゼが、ピキア属の種、サッカロミセス属の種、グルコノバクター属の種、ガラクトカンジダ属の種、ニューロスポラ属の種およびセラチア属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム11記載の組換え微生物。
54. ピキア・スチピチス、出芽酵母、グルコノバクター・オキシダンス、ガラクトカンジダ・マストターミチス、ニューロスポラ・クラッサおよびセラチア・マルセッセンスから選択される、クレーム53記載の組換え微生物。
55. キシリトールデヒドロゲナーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xyl2またはxdh1である、クレーム53記載の組換え微生物。
56. キシロースイソメラーゼが、大腸菌から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム11記載の組換え微生物。
57. キシロースイソメラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xylAである、クレーム56記載の組換え微生物。
58. キシロースデヒドロゲナーゼが、カウロバクター属の種、ハロアルキュラ属の種、ハロフェラックス属の種、ハロルブラム属の種およびトリコデルマ属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム16または20記載の組換え微生物。
59. 微生物が、カウロバクター・クレセンタス、ハロアーキュラ・マリスモーツイ、ハロフェラックス・ボルカニイ、ハロルブラム・ラクスプロファンディ(Halorubrum lacusprodundi)およびトリコデルマ・リーゼイから選択される、クレーム58記載の組換え微生物。
60. キシロースデヒドロゲナーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xylB、xdhまたはxyd1から選択される、クレーム58記載の組換え微生物。
61. キシロノラクトナーゼが、カウロバクター属の種およびハロフェラックス属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム16記載の組換え微生物。
62. カウロバクター・クレセンタス、ハロフェラックス・ボルカニイおよびハロフェラックス・ギボンシイから選択される、クレーム61記載の組換え微生物。
63. キシロノラクトナーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xylCである、クレーム61記載の組換え微生物。
64. キシロン酸デヒドラターゼが、カウロバクター属の種、ハロフェラックス属の種、スルホロブス属の種および大腸菌から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム16または20記載の組換え微生物。
65. カウロバクター・クレセンタス、ハロフェラックス・ボルカニイ、大腸菌およびスルホロブス・ソルファタリカスから選択される、クレーム64記載の組換え微生物。
66. キシロン酸デヒドラターゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xylD、yjhG、yagFおよびxadから選択される、クレーム64記載の組換え微生物。
67. 2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼが、シュードモナス属の種および大腸菌から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム16または20記載の組換え微生物。
68. 大腸菌である、クレーム67記載の組換え微生物。
69. 2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、yjhHおよびyagEから選択される、クレーム67記載の組換え微生物。
70. MEGが、C2分枝経路におけるグリコールアルデヒドの変換を通じて生成され、アセトンが、C3分枝経路におけるDHAPまたはピルベートの変換を通じて生成される、クレーム1、6、11、16または20のいずれか一つに記載の組換え微生物。
71. MEGが、C2分枝経路におけるグリコールアルデヒドの変換を通じて生成され、IPAが、C3分枝経路におけるDHAPまたはピルベートの変換を通じて生成される、クレーム2、7.12、17または21のいずれか一つに記載の組換え微生物。
72. MEGが、C2分枝経路におけるグリコールアルデヒドの変換を通じて生成され、プロペンが、C3分枝経路におけるDHAPまたはピルベートの変換を通じて生成される、クレーム3、8、13、18または22のいずれか一つに記載の組換え微生物。
73. C3分枝経路で生成された余分なNADHの少なくとも一部が、C2分枝経路において還元当量の供給源として使用される、クレーム70〜72のいずれか一つに記載の組換え微生物。
74. C3分枝経路で生成された余分なNADHの少なくとも一部が、ATPを生成するために使用される、クレーム70〜72のいずれか一つに記載の組換え微生物。
75. 同時生成されるMEGおよびアセトンが、炭素固定なしでの理論上の最大生産力の90%を超える生産力を示す、クレーム1、6、11、16または20のいずれか一つに記載の組換え微生物。
76. 同時生成されるMEGおよびIPAが、炭素固定なしでの理論上の最大生産力の90%を超える生産力を示す、クレーム2、7、12、17または21のいずれか一つに記載の組換え微生物。
77. 同時生成されるMEGおよびプロペンが、炭素固定なしでの理論上の最大生産力の90%を超える生産力を示す、クレーム3、8、13、18または22のいずれか一つに記載の組換え微生物。
78. 余分なバイオマス形成が最小化され、MEGおよびアセトンの生成が最大化される、クレーム1、6、11、16または20のいずれか一つに記載の組換え微生物。
79. 余分なバイオマス形成が最小化され、MEGおよびIPAの生成が最大化される、クレーム2、7、12、17または21のいずれか一つに記載の組換え微生物。
80. 余分なバイオマス形成が最小化され、MEGおよびプロペンの生成が最大化される、クレーム3、8、13、18または22のいずれか一つに記載の組換え微生物。
81. 前記クレームのいずれか記載の組換え微生物を用いてMEGおよび3炭素化合物を生成する方法であって、MEGおよび3炭素化合物が生成されるまで炭素源を供給する原料を含む培養培地中で該組換え微生物を培養する工程を含む、方法。
82. 外来性D-キシロースからMEGおよびアセトンを生成または蓄積する組換え微生物を作製する方法であって、
(a)D-キシルロースからD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-リブロースからD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のD-リブロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1Pアルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程を含み、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記方法。
83. (g)由来のアセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム82記載の方法。
84. イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム83記載の方法。
85. (a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム82〜84のいずれか一つに記載の方法。
86. 内在性D-キシロースイソメラーゼが、D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒する、クレーム82〜85のいずれか一つに記載の方法。
87. 外来性D-キシロースからMEGおよびアセトンを生成または蓄積する組換え微生物を作製する方法であって、
(a)D-キシルロースからD-キシルロース-1-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース1-キナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシルロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(c)(b)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(e)(d)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(f)(e)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程を含み、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記方法。
88. (f)由来のアセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム87記載の方法。
89. イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム88記載の方法。
90. (a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム87〜89のいずれか一つに記載の方法。
91. 内在性D-キシロースイソメラーゼが、D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒する、クレーム87〜89のいずれか一つに記載の方法。
92. 外来性D-キシロースおよびグルコースからMEGおよびアセトンを生成または蓄積する組換え微生物を製造する方法であって、
(a)D-キシロースからキリトールへの変換を触媒するキシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、およびキシリトールからD-キシルロースへの変換を触媒するキシリトールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(b)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程を含み、かつ
(c)(a)もしくは(b)由来のD-キシルロースからD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(d)(c)由来のD-リブロースからD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(e)(d)由来のD-リブロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(f)(e)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼもしくはメチルグリオキサールレダクターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(g)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(h)(g)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;および/または
(i)(h)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程をさらに含み、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記方法。
93. (i)由来のアセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム92記載の方法。
94. イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム93記載の方法。
95. (a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(b)D-キシルロース-5-リン酸からD-キシルロースへの変換を触媒するアルカリホスファターゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム92〜94のいずれか一つに記載の方法。
96. 微生物が真菌である、クレーム92〜95のいずれか一つに記載の方法。
97. 外来性D-キシロースからMEGおよびアセトンを生成または蓄積する組換え微生物を製造する方法であって、
(a)D-キシロースからD-キシロノラクトンへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロノラクトンからD-キシロネートへの変換を触媒するキシロノラクトナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のD-キシロネートから2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒するキシロン酸デヒドラターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートからグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)(d)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(f)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(g)(f)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(h)(g)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程を含み、
生成された中間体ピルベートが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記方法。
98. (h)由来のアセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム97記載の方法。
99. イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム98記載の方法。
100. (a)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム97〜99のいずれか一つに記載の方法。
101. 外来性D-キシロースからMEGおよびアセトンを生成または蓄積する組換え微生物を作製する方法であって、
(a)D-キシロースからD-キシロネートへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロネートから2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒するキシロン酸デヒドラターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートからグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(e)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程を含み、
生成された中間体ピルベートが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記方法。
102. (g)由来のアセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム101記載の方法。
103. イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム102記載の方法。
104. (a)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼAをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼAをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、クレーム101〜103のいずれか一つに記載の方法。
105. D-タガトース3-エピメラーゼが、シュードモナス属の種、メソリゾビウム属の種またはロドバクター属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム82または92に記載の方法。
106. 微生物が、シュードモナス・シコリイ、シュードモナス属種ST-24、メソリゾビウム・ロティまたはロドバクター・スフェロイデスから選択される、クレーム105記載の方法。
107. 1つまたは複数の核酸分子が、dteおよび/またはC1KKR1である、クレーム105記載の方法。
108. D-リブロキナーゼが、大腸菌から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム82または92記載の方法。
109. 1つまたは複数の核酸分子がfucKである、クレーム108記載の方法。
110. D-リブロース-1-リン酸アルドラーゼが、大腸菌から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム82または92記載の方法。
111. 1つまたは複数の核酸分子がfucAである、クレーム110記載の方法。
112. グリコールアルデヒドレダクターゼが、大腸菌または出芽酵母から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム82、87、92、97または101のいずれか一つに記載の方法。
113. 1つまたは複数の核酸分子が、fucO、yqhD、dkgA(yqhE)、dkgB(yafB)、yeaE、yghZ、gldAおよび/またはGRE2から選択される、クレーム112記載の方法。
114. チオラーゼが、クロストリジウム属の種、バチルス属の種、大腸菌またはマリノバクター属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム82、87、92、97または101のいずれか一つに記載の方法。
115. 微生物が、クロストリジウム・アセトブチリカム、クロストリジウム・サーモサッカロリチカム、バチルス・セレウス、大腸菌およびマリノバクター・ヒドロカルボノクラスチカスから選択される、クレーム114記載の方法。
116. 1つまたは複数の核酸分子が、thlAおよび/またはatoBである、クレーム114記載の方法。
117. 酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼまたはヒドロラーゼが、クロストリジウム属の種または大腸菌から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム82、87、92、97または101のいずれか一つに記載の方法。
118. 微生物が、クロストリジウム・アセトブチリカムである、クレーム117記載の方法。
119. 酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、atoAおよび/またはatoDである、クレーム117記載の方法。
120. 酢酸:アセトアセチルCoAヒドロラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、ctfAおよび/またはctfBである、クレーム117記載の方法。
121. アセト酢酸デカルボキシラーゼが、クロストリジウム属の種、バチルス属の種、クロモバクテリウム属の種およびシュードモナス属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム82、87、92、97または101のいずれか一つに記載の方法。
122. 微生物が、クロストリジウム・アセトブチリカム、クロストリジウム・ベイジェリンキイ、クロストリジウム・セルロリティカム、バチルス・ポリミキサ、クロモバクテリウム・ビオラセウムおよびシュードモナス・プチダから選択される、クレーム121記載の方法。
123. アセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、adcである、クレーム121記載の方法。
124. 二級アルコールデヒドロゲナーゼが、バークホルデリア属の種、アルカリゲネス属の種、クロストリジウム属の種、サーモアナエロバクター属の種、フィトモナス属の種、ロドコッカス属の種、メタノバクテリウム属の種、メタノゲニウム属の種、エントアメーバ属の種、トリコモナス属の種およびトリトリコモナス属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム83、88、93、98または102のいずれか一つに記載の方法。
125. 微生物が、バークホルデリア属種AIU652、アルカリゲネス・ユートロファス、クロストリジウム・ラグスダレイ、クロストリジウム・ベイジェリンキイ、サーモアナエロバクター・ブロッキイ、サーモアナエロバクター・エタノリカス(クロストリジウム・サーモヒドロスルフリカム)、ロドコッカス・ルーバー、メタノバクテリウム・パルストレ、メタン生成古細菌メタノゲニウム・リミナタンス、寄生性原生生物エントアメーバ・ヒストリティカ、、寄生性原生動物トリトリコモナス・フィータスおよびヒト寄生生物トリコモナス・バギナリスから選択される、クレーム124記載の方法。
126. 二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、adhBまたはEhAdh1である、クレーム124記載の方法。
127. D-キシルロース1-キナーゼが、ホモ・サピエンスから得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム87記載の方法。
128. D-キシルロース1-キナーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、ケトヘキソキナーゼC(khk-C)である、クレーム127記載の方法。
129. D-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼが、ホモ・サピエンスから得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム87記載の方法。
130. D-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、アルドラーゼB(ALDOB)である、クレーム129記載の方法。
131. キシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼが、ヒポクレア属の種、サッカロミセス属の種、パキソレン属の種、ピキア属の種、カンジダ属の種、アスペルギルス属の種、ニューロスポラ属の種およびクリプトコッカス属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム92記載の方法。
132. 微生物が、ヒポクレア・ジェコリナ、出芽酵母、パキソレン・タンノフィルス、ピキア・スチピチス、ピキア・クエルカム、カンジダ・シェハテ、カンジダ・テヌイス、カンジダ・トロピカリス、アスペルギルス・ニガー、ニューロスポラ・クラッサおよびクリプトコッカス・ラクタチボルスから選択される、クレーム131記載の方法。
133. キシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xyl1またはGRE3である、クレーム131記載の方法。
134. キシリトールデヒドロゲナーゼが、ピキア属の種、サッカロミセス属の種、グルコノバクター属の種、ガラクトカンジダ属の種、ニューロスポラ属の種およびセラチア属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム92記載の方法。
135. 微生物が、ピキア・スチピチス、出芽酵母、グルコノバクター・オキシダンス、ガラクトカンジダ・マストターミチス、ニューロスポラ・クラッサおよびセラチア・マルセッセンスから選択される、クレーム134記載の方法。
136. キシリトールデヒドロゲナーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xyl2またはxdh1である、クレーム134記載の方法。
137. キシロースイソメラーゼが、大腸菌から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム92記載の方法。
138. キシロースイソメラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xylAである、クレーム137記載の方法。
139. キシロースデヒドロゲナーゼが、カウロバクター属の種、ハロアルキュラ属の種、ハロフェラックス属の種、ハロルブラム属の種およびトリコデルマ属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム97または101記載の方法。
140. 微生物が、カウロバクター・クレセンタス、ハロアーキュラ・マリスモーツイ、ハロフェラックス・ボルカニイ、ハロルブラム・ラクスプロファンディおよびトリコデルマ・リーゼイから選択される、クレーム139記載の方法。
141. キシロースデヒドロゲナーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xylB、xdhまたはxyd1から選択される、クレーム139記載の方法。
142. キシロノラクトナーゼが、カウロバクター属の種およびハロフェラックス属の種から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム97記載の方法。
143. 微生物が、カウロバクター・クレセンタス、ハロフェラックス・ボルカニイおよびハロフェラックス・ギボンシイから選択される、クレーム142記載の方法。
144. キシロノラクトナーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xylCである、クレーム142記載の方法。
145. キシロン酸デヒドラターゼが、カウロバクター属の種、ハロフェラックス属の種、スルホロブス属の種および大腸菌から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム97または101記載の方法。
146. 微生物が、カウロバクター・クレセンタス、ハロフェラックス・ボルカニイ、大腸菌およびスルホロブス・ソルファタリカスから選択される、クレーム145記載の方法。
147. キシロン酸デヒドラターゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、xylD、yjhG、yagFおよびxadから選択される、クレーム145記載の方法。
148. 2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼが、シュードモナス属の種および大腸菌から選択される微生物から得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、クレーム97または101記載の方法。
149. 微生物が大腸菌である、クレーム148記載の方法。
150. 2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼをコードする1つまたは複数の核酸分子が、yjhHおよびyagEから選択される、クレーム148記載の方法。
151. モノエチレングリコール(MEG)および3炭素化合物を同時生成する、組換え微生物。
152. 3炭素化合物がアセトンである、クレーム151記載の組換え微生物。
153. 3炭素化合物がイソプロパノールである、クレーム151記載の組換え微生物。
154. 3炭素化合物がプロペンである、クレーム151記載の組換え微生物。
Claims (91)
- モノエチレングリコール(MEG)および3炭素化合物を同時生成する組換え微生物。
- 3炭素化合物がアセトンである、請求項1記載の組換え微生物。
- 3炭素化合物がイソプロパノールである、請求項1記載の組換え微生物。
- 3炭素化合物がプロペンである、請求項1記載の組換え微生物。
- 外来性D-キシロースを含む原料からモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物であって、
(a)D-キシルロースからD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-リブロースからD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のD-リブロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記微生物。 - 前記原料が外来性グルコースを含む、請求項5記載の組換え微生物。
- 外来性D-キシロースを含む原料からモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物であって、
(a)D-キシルロースからD-キシルロース-1-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース1-キナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシルロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)(d)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(f)(e)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記微生物。 - 内在性または外来性D-キシロースイソメラーゼが、D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒する、請求項5または7記載の組換え微生物。
- D-キシロースからキシリトールへの変換を触媒するキシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子と、キシリトールからD-キシルロースへの変換を触媒するキシリトールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子とをさらに発現する、請求項5または7記載の組換え微生物。
- 外来性D-キシロースを含む原料からモノエチレングリコール(MEG)およびアセトンを同時生成することができる組換え微生物であって、以下の(a)〜(c):
(a)D-キシロースからD-キシロノラクトンへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの内在性または外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロノラクトンからD-キシロネートへの変換を触媒するキシロノラクトナーゼをコードする少なくとも1つの内在性または外来性核酸分子;
(c)D-キシロースからD-キシロネートへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの内在性または外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、さらに、以下の(d)〜(i);
(d)(b)もしくは(c)由来のD-キシロネートから2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒するキシロン酸デヒドラターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)(d)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートからグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(f)(e)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(g)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(h)(g)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(i)(h)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を発現し、
生成された中間体ピルベートが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記微生物。 - アセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの内在性または外来性核酸分子をさらに含む、請求項5、7または10のいずれか一項記載の組換え微生物。
- イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの内在性または外来性核酸分子をさらに含む、請求項11記載の組換え微生物。
- (a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(d)D-キシルロース-5-リン酸からD-キシルロースへの変換を触媒するアルカリホスファターゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(e)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変をさらに含む、請求項5、7または10のいずれか一項記載の組換え微生物。 - D-タガトース3-エピメラーゼが、シュードモナス・シコリイ(Pseudomonas cichorii)DTEおよび/またはロドバクター・スフェロイデス(Rhodobacter sphaeroides)C1KKR1である、請求項5記載の組換え微生物。
- D-タガトース3-エピメラーゼが、SEQ ID NO:3および5から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項5記載の組換え微生物。
- D-リブロキナーゼが、大腸菌(E.coli)fucKである、請求項5記載の組換え微生物。
- D-リブロキナーゼが、SEQ ID NO:8に示されるアミノ酸配列を含む、請求項5記載の組換え微生物。
- D-リブロース-1-リン酸アルドラーゼが、大腸菌fucAである、請求項5記載の組換え微生物。
- D-リブロース-1-リン酸アルドラーゼが、SEQ ID NO:11に示されるアミノ酸配列を含む、請求項5記載の組換え微生物。
- グリコールアルデヒドレダクターゼが、大腸菌gldA、出芽酵母(S.cerevisiae)GRE2、出芽酵母GRE3、大腸菌yqhD、大腸菌ydjg、大腸菌fucO、大腸菌yafB(dkgB)、大腸菌yqhE(dkgA)、大腸菌yeaEおよび/または大腸菌yghZである、請求項5、7または10のいずれか一項記載の組換え微生物。
- グリコールアルデヒドレダクターゼが、SEQ ID NO:13、15、17、20、23、25、28、30および32から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項5、7または10のいずれか一項記載の組換え微生物。
- チオラーゼが、クロストリジウム・アセトブチリカム(Clostridium acetobutylicum)thlA、大腸菌atoBおよび/または出芽酵母ERG10である、請求項5、7または10のいずれか一項記載の組換え微生物。
- チオラーゼが、SEQ ID NO:35、37および39から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項5、7または10のいずれか一項記載の組換え微生物。
- 酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼまたはヒドロラーゼが、大腸菌atoA、大腸菌atoD、クロストリジウム・アセトブチリカムctfAおよび/またはクロストリジウム・アセトブチリカムctfBである、請求項5、7または10のいずれか一項記載の組換え微生物。
- 酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼまたはヒドロラーゼが、SEQ ID NO:43、46、97および99から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項5、7または10のいずれか一項記載の組換え微生物。
- アセト酢酸デカルボキシラーゼが、クロストリジウム・アセトブチリカムadcおよび/またはクロストリジウム・ベイジェリンキイ(Clostridium beijerinckii)adcである、請求項5、7または10のいずれか一項記載の組換え微生物。
- アセト酢酸デカルボキシラーゼが、SEQ ID NO:49および52から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項5、7または10のいずれか一項記載の組換え微生物。
- D-キシルロース1-キナーゼが、ホモ・サピエンス(Homo sapiens)khk-Cである、請求項7記載の組換え微生物。
- D-キシルロース1-キナーゼが、SEQ ID NO:55に示されるアミノ酸配列を含む、請求項7記載の組換え微生物。
- D-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼが、ホモ・サピエンスaldoBである、請求項7記載の組換え微生物。
- D-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼが、SEQ ID NO:58に示されるアミノ酸配列を含む、請求項7記載の組換え微生物。
- キシロースイソメラーゼが、大腸菌xylAから得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、請求項8記載の組換え微生物。
- キシロースイソメラーゼが、SEQ ID NO:95に示されるアミノ酸配列を含む、請求項8記載の組換え微生物。
- キシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼが、シェフェルソミセス・スチピチス(Scheffersomyces stipitis)xyl1および/または出芽酵母GRE3である、請求項9記載の組換え微生物。
- キシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼが、SEQ ID NO:84および87から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項9記載の組換え微生物。
- キシリトールデヒドロゲナーゼが、シェフェルソミセス・スチピチスxyl2および/またはトリコデルマ・リーゼイ(Trichoderma reesei)xdh1である、請求項9記載の組換え微生物。
- キシリトールデヒドロゲナーゼが、SEQ ID NO:90および92から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項9記載の組換え微生物。
- キシロースデヒドロゲナーゼが、カウロバクター・クレセンタス(Caulobacter crescentus)xylB、ハロフェラックス・ボルカニイ(Haloferax volcanii)xdh1および/またはトリコデルマ・リーゼイxyd1である、請求項10記載の組換え微生物。
- キシロースデヒドロゲナーゼが、SEQ ID NO:61、63および65から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項10記載の組換え微生物。
- キシロノラクトナーゼが、カウロバクター・クレセンタスxylCである、請求項10記載の組換え微生物。
- キシロノラクトナーゼが、SEQ ID NO:67に示されるアミノ酸配列を含む、請求項10記載の組換え微生物。
- キシロン酸デヒドラターゼが、カウロバクター・クレセンタスxylD、大腸菌yjhGおよび/または大腸菌yagFである、請求項10記載の組換え微生物。
- キシロン酸デヒドラターゼが、SEQ ID NO:69、72および75から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項10記載の組換え微生物。
- 2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼが、大腸菌yjhHおよび/または大腸菌yagEである、請求項10記載の組換え微生物。
- 2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼが、SEQ ID NO:78および81から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項10記載の組換え微生物。
- 二級アルコールデヒドロゲナーゼが、クロストリジウム・ベイジェリンキイadhおよび/またはクロストリジウム・カルボキシジボランス(Clostridium carboxidivorans)adhである、請求項11記載の組換え微生物。
- 二級アルコールデヒドロゲナーゼが、SEQ ID NO:106および108から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項11記載の組換え微生物。
- 前記請求項のいずれか記載の組換え微生物を用いてMEGおよび3炭素化合物を生成する方法であって、MEGおよび3炭素化合物が生成されるまで炭素源を提供する原料を含む培養培地中で該組換え微生物を培養する工程を含む、前記方法。
- 外来性D-キシロースを含む原料からMEGおよびアセトンを生成または蓄積する組換え微生物を作製する方法であって、
(a)D-キシルロースからD-リブロースへの変換を触媒するD-タガトース3-エピメラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-リブロースからD-リブロース-1-リン酸への変換を触媒するD-リブロキナーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(c)(b)由来のD-リブロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-リブロース-1Pアルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)(c)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(f)(e)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(g)(f)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程を含み、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記方法。 - 前記原料が外来性グルコースを含む、請求項49記載の方法。
- 外来性D-キシロースからMEGおよびアセトンを生成または蓄積する組換え微生物を作製する方法であって、
(a)D-キシルロースからD-キシルロース-1-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース1-キナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシルロース-1-リン酸からグリコールアルデヒドおよびジヒドロキシアセトンリン酸(DHAP)への変換を触媒するD-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(c)(b)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(d)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(e)(d)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(f)(e)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程を含み、
生成された中間体DHAPが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記方法。 - 内在性D-キシロースイソメラーゼが、D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒する、請求項49または51記載の方法。
- D-キシロースからキシリトールへの変換を触媒するキシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子と、キシリトールからD-キシルロースへの変換を触媒するキシリトールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子とを、組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程をさらに含む、請求項49または51記載の方法。
- 外来性D-キシロースからMEGおよびアセトンを生成または蓄積する組換え微生物を作製する方法であって、以下の(a)〜(c):
(a)D-キシロースからD-キシロノラクトンへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの内在性または外来性核酸分子;
(b)(a)由来のD-キシロノラクトンからD-キシロネートへの変換を触媒するキシロノラクトナーゼをコードする少なくとも1つの内在性または外来性核酸分子;
(c)D-キシロースからD-キシロネートへの変換を触媒するキシロースデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの内在性または外来性核酸分子、
の1つまたは複数を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程を含み、さらに、以下の(d)〜(i):
(d)(b)もしくは(c)由来のD-キシロネートから2-ケト-3-デオキシ-キシロネートへの変換を触媒するキシロン酸デヒドラターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(e)(d)由来の2-ケト-3-デオキシ-キシロネートからグリコールアルデヒドおよびピルベートへの変換を触媒する2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(f)(e)由来のグリコールアルデヒドからMEGへの変換を触媒するグリコールアルデヒドレダクターゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;
(g)アセチルCoAからアセトアセチルCoAへの変換を触媒するチオラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子;
(h)(g)由来のアセトアセチルCoAからアセト酢酸への変換を触媒する酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼもしくはヒドロラーゼをコードする少なくとも1つの内在性もしくは外来性核酸分子;ならびに/または
(i)(h)由来のアセト酢酸からアセトンへの変換を触媒するアセト酢酸デカルボキシラーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子、
の1つまたは複数を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程を含み、
生成された中間体ピルベートが該微生物の内在性解糖経路を通じてアセチルCoAに変換され、かつ
MEGおよびアセトンが同時生成される、
前記方法。 - アセトンからイソプロパノールへの変換を触媒する二級アルコールデヒドロゲナーゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程をさらに含む、請求項49、51または54記載の方法。
- イソプロパノールからプロペンへの変換を触媒するデヒドラターゼをコードする少なくとも1つの外来性核酸分子を組換え微生物に導入するおよび/または組換え微生物内で過剰発現させる工程をさらに含む、請求項55記載の方法。
- (a)D-キシルロースからD-キシルロース-5-リン酸への変換を触媒するD-キシルロース-5-キナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(b)グリコールアルデヒドからグリコール酸への変換を触媒するグリコールアルデヒドデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(c)ピルベートからラクテートへの変換を触媒する乳酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
(d)D-キシルロース-5-リン酸からD-キシルロースへの変換を触媒するアルカリホスファターゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、および
(e)D-キシロースからD-キシルロースへの変換を触媒するD-キシロースイソメラーゼをコードする遺伝子における欠失、挿入または機能喪失変異、
からなる群より選択される1つまたは複数の改変を組換え微生物に導入する工程をさらに含む、請求項49、51または54記載の方法。 - D-タガトース3-エピメラーゼが、シュードモナス・シコリイDTEおよび/またはロドバクター・スフェロイデスC1KKR1である、請求項49記載の方法。
- D-タガトース3-エピメラーゼが、SEQ ID NO:3および5から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項49記載の方法。
- D-リブロキナーゼが、大腸菌fucKである、請求項49記載の方法。
- D-リブロキナーゼが、SEQ ID NO:8に示されるアミノ酸配列を含む、請求項49記載の方法。
- D-リブロース-1-リン酸アルドラーゼが、大腸菌fucAである、請求項49記載の方法。
- D-リブロース-1-リン酸アルドラーゼが、SEQ ID NO:11に示されるアミノ酸配列を含む、請求項49記載の方法。
- グリコールアルデヒドレダクターゼが、大腸菌gldA、出芽酵母GRE2、出芽酵母GRE3、大腸菌yqhD、大腸菌ydjg、大腸菌fucO、大腸菌yafB(dkgB)、大腸菌yqhE(dkgA)、大腸菌yeaEおよび/または大腸菌yghZである、請求項49、51または54のいずれか一項記載の方法。
- グリコールアルデヒドレダクターゼが、SEQ ID NO:13、15、17、20、23、25、28、30および32から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項49、51または54のいずれか一項記載の方法。
- チオラーゼが、クロストリジウム・アセトブチリカムthlA、大腸菌atoBおよび/または出芽酵母ERG10である、請求項49、51または54のいずれか一項記載の方法。
- チオラーゼが、SEQ ID NO:35、37および39から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項49、51または54のいずれか一項記載の方法。
- 酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼまたはヒドロラーゼが、大腸菌atoA、大腸菌atoD、クロストリジウム・アセトブチリカムctfAおよび/またはクロストリジウム・アセトブチリカムctfBである、請求項49、51または54のいずれか一項記載の方法。
- 酢酸:アセトアセチルCoAトランスフェラーゼまたはヒドロラーゼが、SEQ ID NO:43、46、97および99から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項49、51または54のいずれか一項記載の方法。
- アセト酢酸デカルボキシラーゼが、クロストリジウム・アセトブチリカムadcおよび/またはクロストリジウム・ベイジェリンキイadcである、請求項49、51または54のいずれか一項記載の方法。
- アセト酢酸デカルボキシラーゼが、SEQ ID NO:49および52から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項49、51または54のいずれか一項記載の方法。
- D-キシルロース1-キナーゼが、ホモ・サピエンスkhk-Cである、請求項51記載の方法。
- D-キシルロース1-キナーゼが、SEQ ID NO:55に示されるアミノ酸配列を含む、請求項51記載の方法。
- D-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼが、ホモ・サピエンスaldoBである、請求項51記載の方法。
- D-キシルロース-1-リン酸アルドラーゼが、SEQ ID NO:58に示されるアミノ酸配列を含む、請求項51記載の方法。
- キシロースイソメラーゼが、大腸菌xylAから得られる1つまたは複数の核酸分子によってコードされる、請求項52記載の方法。
- キシロースイソメラーゼが、SEQ ID NO:95に示されるアミノ酸配列を含む、請求項52記載の方法。
- キシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼが、シェフェルソミセス・スチピチスxyl1および/または出芽酵母GRE3である、請求項53記載の方法。
- キシロースレダクターゼまたはアルドースレダクターゼが、SEQ ID NO:84および87から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項53記載の方法。
- キシリトールデヒドロゲナーゼが、シェフェルソミセス・スチピチスxyl2および/またはトリコデルマ・リーゼイxdh1である、請求項53記載の方法。
- キシリトールデヒドロゲナーゼが、SEQ ID NO:90および92から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項53記載の方法。
- キシロースデヒドロゲナーゼが、カウロバクター・クレセンタスxylB、ハロフェラックス・ボルカニイxdh1および/またはトリコデルマ・リーゼイxyd1である、請求項54記載の方法。
- キシロースデヒドロゲナーゼが、SEQ ID NO:61、63および65から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項54記載の方法。
- キシロノラクトナーゼが、カウロバクター・クレセンタスxylCである、請求項54記載の方法。
- キシロノラクトナーゼが、SEQ ID NO:67に示されるアミノ酸配列を含む、請求項54記載の方法。
- キシロン酸デヒドラターゼが、カウロバクター・クレセンタスxylD、大腸菌yjhGおよび/または大腸菌yagFである、請求項54記載の方法。
- キシロン酸デヒドラターゼが、SEQ ID NO:69、72および75から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項54記載の方法。
- 2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼが、大腸菌yjhHおよび/または大腸菌yagEである、請求項54記載の方法。
- 2-ケト-3-デオキシ-D-吉草酸アルドラーゼが、SEQ ID NO:78および81から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項54記載の方法。
- 二級アルコールデヒドロゲナーゼが、クロストリジウム・ベイジェリンキイadhおよび/またはクロストリジウム・カルボキシジボランスadhである、請求項55記載の方法。
- 二級アルコールデヒドロゲナーゼが、SEQ ID NO:106および108から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項55記載の方法。
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CN116355821B (zh) * | 2023-03-10 | 2023-09-29 | 湖北大学 | 一种生产乙二醇的运动发酵单胞菌重组菌株、构建方法及其应用 |
CN116904382B (zh) * | 2023-07-10 | 2024-03-08 | 态创生物科技(广州)有限公司 | 联产二羟基丙酮和波色因的宿主细胞及方法 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2011130378A1 (en) * | 2010-04-13 | 2011-10-20 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the production of ethylene glycol |
JP2012060992A (ja) * | 2010-08-20 | 2012-03-29 | Central Res Inst Of Electric Power Ind | 微生物を利用したアルコール生産方法及び装置 |
WO2014004625A1 (en) * | 2012-06-26 | 2014-01-03 | Genomatica, Inc. | Microorganisms for producing ethylene glycol using synthesis gas |
WO2014184345A1 (en) * | 2013-05-17 | 2014-11-20 | Global Bioenergies | Alkenol dehydratase variants |
Family Cites Families (21)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2398237A1 (en) * | 2000-01-21 | 2001-07-26 | Xyrofin Oy | Manufacture of five-carbon sugars and sugar alcohols |
WO2006135075A1 (en) * | 2005-06-17 | 2006-12-21 | Ajinomoto Co., Inc. | A method for producing an l-amino acid using a bacterium of the enterobacteriaceae family with enhanced expression of the fucpikur operon |
US7659104B2 (en) | 2006-05-05 | 2010-02-09 | E.I. Du Pont De Nemours And Company | Solvent tolerant microorganisms and methods of isolation |
US7977083B1 (en) | 2006-12-28 | 2011-07-12 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture | Method for microbial production of xylitol from arabinose |
JP2010110217A (ja) * | 2007-02-22 | 2010-05-20 | Ajinomoto Co Inc | L−アミノ酸生産菌及びl−アミノ酸の製造法 |
EP2147111A4 (en) * | 2007-04-18 | 2010-06-23 | Gevo Inc | MANIPULATED MICROORGANISMS FOR THE MANUFACTURE OF ISOPROPANOL |
BRPI0814681B1 (pt) | 2007-07-11 | 2018-12-26 | Mitsui Chemicals Inc | bactéria produtora de álcool isopropílico recombinante do gênero escherichia e método de produzir álcool isopropílico usando a mesma |
US8969053B2 (en) | 2009-07-30 | 2015-03-03 | Metabolic Explorer | Mutant YqhD enzyme for the production of a biochemical by fermentation |
EP2336341A1 (en) | 2009-12-21 | 2011-06-22 | Philippe Marliere | Method for producing an alkene comprising the step of converting an alcohol by an enzymatic dehydration step |
JP2013544083A (ja) * | 2010-10-29 | 2013-12-12 | ノボザイムス アクティーゼルスカブ | 組み換えn−プロパノール及びイソプロパノール生産 |
WO2012088467A2 (en) * | 2010-12-22 | 2012-06-28 | Mascoma Corporation | Genetically modified clostridium thermocellum engineered to ferment xylose |
BR112013032516A2 (pt) | 2011-06-17 | 2017-03-01 | Invista Tech Sarl | método de biosintetizar butadieno e método para produzir butadieno |
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WO2013126721A1 (en) | 2012-02-23 | 2013-08-29 | Massachusetts Institute Of Technology | Engineering microbes and metabolic pathways for the production of ethylene glycol |
WO2013163230A2 (en) | 2012-04-24 | 2013-10-31 | Midori Renewables, Inc. | Bio-based polymers and methods of producing thereof |
US8703455B2 (en) | 2012-08-29 | 2014-04-22 | Scientist of Fourtune, S.A. | Production of volatile dienes by enzymatic dehydration of light alkenols |
WO2015002977A1 (en) | 2013-07-01 | 2015-01-08 | Braskem S/A Ap 09 | Modified microorganisms and methods of using same for anaerobic coproduction of isoprene and acetic acid |
JP6774875B2 (ja) * | 2013-09-03 | 2020-10-28 | ロケット フレールRoquette Freres | D−プシコース 3−エピメラーゼの改良された変異体およびその使用 |
BR112016006321B1 (pt) | 2013-09-23 | 2022-11-16 | Braskem S.A | Enzima engenheirada tendo especificidade de substrato aceto acetil-coa e atividade aceto acetil-coa específica de hidrolase, micro-organismo modificado, e, processo de produção de um ou mais produtos a partir de uma fonte de carbono fermentável |
FR3028529B1 (fr) | 2014-11-19 | 2016-12-30 | Inst Nat De La Rech Agronomique Inra | Procede de production d'au moins un metabolite d'interet par transformation d'un pentose dans un microorganisme |
US10774347B2 (en) | 2016-03-09 | 2020-09-15 | Braskem S.A. | Microorganisms and methods for the co-production of ethylene glycol and three carbon compounds |
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Patent Citations (4)
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WO2011130378A1 (en) * | 2010-04-13 | 2011-10-20 | Genomatica, Inc. | Microorganisms and methods for the production of ethylene glycol |
JP2012060992A (ja) * | 2010-08-20 | 2012-03-29 | Central Res Inst Of Electric Power Ind | 微生物を利用したアルコール生産方法及び装置 |
WO2014004625A1 (en) * | 2012-06-26 | 2014-01-03 | Genomatica, Inc. | Microorganisms for producing ethylene glycol using synthesis gas |
WO2014184345A1 (en) * | 2013-05-17 | 2014-11-20 | Global Bioenergies | Alkenol dehydratase variants |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
ALKIM, C. ET AL.: ""Optimization of ethylene glycol production from (D)-xylose via a synthetid pathway implemented in E", MICROBIAL CELL FACTORIES, vol. 14, JPN6021006637, 2015, pages 127, ISSN: 0004717955 * |
HANAI, T., ET AL.: ""Engineered synthetic pathway for isopropanol production in Escherichia coli."", APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, vol. 73, no. 24, JPN6021006641, 2007, pages 7814 - 7818, ISSN: 0004717957 * |
LIU, H. ET AL.: ""Biosynthesis of ethylene glycol in Escherichia coli."", APPL. MICROBIOL. BIOTECHNOL., vol. 97, JPN6021006639, 2013, pages 3409 - 3417, XP055080314, ISSN: 0004717956, DOI: 10.1007/s00253-012-4618-7 * |
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