JP2018532990A5 - - Google Patents

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JP2018532990A5
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本明細書において引用されたすべての参考文献は、法によって許容される限り、参照により本明細書に組み込まれる。それらの参考文献の考察は、単に、それらの著者によって為された主張を要約することを意図する。いかなる参考文献も(またはいかなる参考文献の一部分も)関連する従来技術であると承認されたわけではない。本出願人は、任意の引用された参考文献の正確性および妥当性を検証する権利を留保する。
特定の実施形態では、例えば以下の項目が提供される。
(項目1)
複数のG−A−Z炭水化物を含む、基材上に固定された炭水化物部分のアレイであって、各G−A−Z部分は、前記基材上の別々の場所に堆積されており、式中、Gは、1つまたは複数の腫瘍関連炭水化物抗原(TACA)であり、
Aは、アルキル、エステル、またはアミドを含む部分であり、
Zは、1つまたは複数の脂質鎖、脂質鎖を伴う1つまたは複数のスペーサー基である、アレイ。
(項目2)
前記TACAが、Globo H、ステージ特異的胎児抗原3(SSEA−3)、ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4)、Tn、TF、sTn、ポリシアル酸、Gb3、Gb4、Le 、Le 、Le 、sLe 、SLe 、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、GM1、GM2、GM3、フコシル−GM1、Neu5GcGM3および/またはこれらのn−ペンチルアミン官能化バリアントを含む、項目1に記載のアレイ。
(項目3)
前記基材が、表面、固体表面、不透明固体、可視光もしくは非可視光の選択された波長に対して透明である固体、粒子、マイクロバブル、またはビーズから選択される、項目1に記載のアレイ。
(項目4)
前記基材が、ニトロセルロースである、項目1に記載のアレイ。
(項目5)
前記複数のGAZ炭水化物部分が、前記基材上にコーティングされている、項目1に記載のアレイ。
(項目6)
前記複数のGAZ炭水化物における前記Z部分が、ファンデルワールス相互作用または疎水性相互作用によって前記基材に接着している、項目5に記載のアレイ。
(項目7)
前記炭水化物部分が、多糖、オリゴ糖、糖コンジュゲートの炭水化物部、Globo H、SSEA−3、SSEA−4、Tn、TF、sTn、ポリシアル酸、Gb3、Gb4、Le 、Le 、Le 、sLe 、SLe 、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、GM1、GM2、GM3、フコシル−GM1、Neu5GcGM3および/またはこれらのn−ペンチルアミン官能化バリアントのうちの1つまたは複数を含む、項目1に記載のアレイ。
(項目8)
複合体の検出、疾患の診断、処置の監視または再発の監視において使用するための、基材上に固定された炭水化物のアレイであって、以下:
(a)基材を用意する工程と、
(b)前記基材をニトロセルロースでコーティングする工程と、
(c)前記基材の表面上の別々の場所に複数のG−A−Z部分を固定する工程と
を含む方法によって製作される、アレイ。
(項目9)
項目8に記載のアレイを特性評価する方法であって、固定された前記G−A−Z部分をTACAに対する標識抗体と接触させる工程と、前記抗体とグリカンとの間で複合体を形成させる工程と、前記抗体と前記グリカンとの間で形成された前記複合体を検出する工程とを含む方法。
(項目10)
前記標識抗体が、酵素を含む標識、蛍光標識、化学発光標識、ナノ粒子標識を含む、項目9に記載の方法。
(項目11)
前記酵素が、アルカリホスファターゼ(AP)または西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)である、項目10に記載の方法。
(項目12)
抗体が、固定された多糖、オリゴ糖、糖コンジュゲートの炭水化物部、Globo H、SSEA−3、SSEA−4、Tn、TF、sTn、ポリシアル酸、Globo H、SSEA−3、SSEA−4、Gb3、Gb4、Le 、Le 、Le 、sLe 、SLe 、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、GM1、GM2、GM3、フコシル−GM1または抗原のNeu5GcGM3シリーズを特異的に認識する、項目9に記載のアレイ。
(項目13)


を有する化合物であって、
式中、
Gは、グリカンであり、
Aは、エステルまたはアミドを含む部分であり、
Xは、基材、固体表面、コーティング表面、ポリマー表面、ニトロセルロースコーティング表面、もしくはビーズ表面、前記表面に付着したスペーサー基、または表面にリンカーを接着させるための基を伴うスペーサー基であり、
Zは、1つまたは複数の脂質鎖、脂質鎖を伴う1つまたは複数のスペーサー基である、化合物。
(項目14)


を有する化合物。
(項目15)


を有する化合物。
(項目16)


を有する化合物。
(項目17)


を有する化合物。
(項目18)


を有する化合物。
(項目19)


を有する化合物。
(項目20)


を有する化合物。
(項目21)


を有する化合物。
(項目22)
以下の式

のうちのいずれか1つに従う化合物であって、
式中、キラル炭素原子C は、ラセミであってもキラルであってもよく、
n=5、6、7、8、または9であり、かつ
TACAは、Globo H、ステージ特異的胎児抗原3(SSEA−3)、ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4)、Tn、TF、sTn、ポリシアル酸、Globo H、SSEA−3、SSEA−4、Gb3、Gb4、Le 、Le 、Le 、sLe 、SLe 、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、GM1、GM2、GM3、フコシル−GM1、Neu5GcGM3および/またはこれらのn−ペンチルアミン官能化バリアントから選択される、化合物。
(項目23)
項目13から22に記載の化合物の使用を含む、アレイにおける感度を向上する方法。
(項目24)
がん、癌腫、新生物または過形成を有する疑いがある、疾患の診断、処置の監視または再発の監視を必要とする対象の、疾患の診断、処置の監視または再発の監視のための方法であって、
(a)がんを有する疑いがある対象から抗体を含有する試料を用意する工程、
(b)前記試料を接触させて、前記試料中の抗体をG−A−Z部分の1つまたは複数に結合させる工程、
(c)1つまたは複数の結合した抗体の量を検出する工程、および
(d)前記結合した抗体の量に基づいて前記対象の病態を判定する工程であって、前記病態は、疾患を有しない対象のレベルと比較した場合の相対抗体結合レベルに基づいて示される、工程
を含む方法。
(項目25)
複合体を検出するための方法であって、
(a)がん、癌腫、新生物または過形成を有する疑いがある対象から、抗体を含有する試料を用意する工程、
(b)前記試料を接触させて、前記試料中の抗体を、1つまたは複数のG−A−Z部分に結合させる工程、
(c)1つまたは複数の結合した抗体の量を検出する工程、および
(d)疾患を有しない対象のレベルと比較した場合の相対抗体結合レベルを確認する工程を含む方法。
(項目26)
前記試料が、血清、血液、血漿、細胞、細胞培地、唾液、尿、またはリンパ節液からなる、項目24または25に記載の方法。
(項目27)
前記対象がヒトである、項目24または25に記載の方法。
(項目28)
前記がんが、肉腫、皮膚がん、白血病、リンパ腫、脳がん、神経膠芽腫、肺がん、乳がん、口腔がん、頭頸部がん、上咽頭がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆管がん、胆嚢がん、膀胱がん、膵臓がん、腸がん、大腸がん、腎臓がん、子宮頸がん、子宮内膜がん、卵巣がん、精巣がん、頬側がん、中咽頭がん、喉頭がんおよび前立腺がんからなる群から選択される、項目24または25に記載の方法。
(項目29)
がん処置を必要とする対象のがん処置用の抗新生物剤の治療効果を判定するための方法であって、
(a)対象からの試料を用意する工程、
(b)1つまたは複数の腫瘍関連抗原(TACA)を含むアレイを前記試料と接触させる工程、
(c)1つもしくは複数の腫瘍関連抗原(TACA)の結合、または項目13から22のいずれか一項に記載の化合物に結合した抗体を検出する工程、および
(d)グリカン検出のアッセイ値に基づいて、新生物に対する処置における抗新生物剤の治療効果を判定する工程
を含む方法。
(項目30)
前記試料が、血清、血液、血漿、細胞、細胞培地、唾液、尿、リンパ節液、腫瘍生検または組織培養物からなる、項目29に記載の方法。
(項目31)
前記対象がヒトである、項目29に記載の方法。
(項目32)
前記抗新生物剤が、担体タンパク質とコンジュゲートした炭水化物抗原またはその免疫原性断片で構成されるワクチンを含む、項目29に記載の方法。
(項目33)
前記炭水化物抗原またはその免疫原性断片が、Globo H、ステージ特異的胎児抗原3(SSEA−3)、ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4)、Tn、TF、sTn、ポリシアル酸、Globo H、SSEA−3、SSEA−4、Gb3、Gb4、Le 、Le 、Le 、sLe 、SLe 、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、GM1、GM2、GM3、フコシル−GM1またはNeu5GcGM3を含む、項目32に記載の方法。
(項目34)
前記担体タンパク質が、KLH(キーホールリンペットヘモシアニン)、DT−CRM
197(ジフテリア毒素交差反応物質197)、ジフテリアトキソイドまたは破傷風トキソイドを含む、項目32に記載の方法。
(項目35)
前記ワクチンが、医薬組成物として提供される、項目32に記載の方法。
(項目36)
前記医薬組成物が、Globo H−KLHおよび追加的なアジュバントを含む、項目35に記載の方法。
(項目37)
前記追加的なアジュバントが、サポニン、フロイントアジュバントまたはα−ガラクトシルセラミド(α−GalCer)アジュバントから選択される、項目36に記載の方法。
(項目38)
前記医薬組成物が、OBI−822/OBI−821を含む、項目35に記載の方法。
(項目39)
前記抗新生物剤が、1つまたは複数の炭水化物抗原に結合可能である抗体またはその抗原結合部を含む、項目29に記載の方法。
(項目40)
前記がんが、肉腫、皮膚がん、白血病、リンパ腫、脳がん、神経膠芽腫、肺がん、乳がん、口腔がん、頭頸部がん、上咽頭がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆管がん、胆嚢がん、膀胱がん、膵臓がん、腸がん、大腸がん、腎臓がん、子宮頸がん、子宮内膜がん、卵巣がん、精巣がん、頬側がん、中咽頭がん、喉頭がんおよび前立腺がんからなる群から選択される、項目29に記載の方法。

Claims (40)

  1. 複数のG−A−Z炭水化物を含む、基材上に固定された炭水化物部分のアレイであって、各G−A−Z部分は、前記基材上の別々の場所に堆積されており、式中、Gは、1つまたは複数の腫瘍関連炭水化物抗原(TACA)であり、
    Aは、アルキル、エステル、またはアミドを含む部分であり、
    Zは、1つまたは複数の脂質鎖、脂質鎖を伴う1つまたは複数のスペーサー基である、アレイ。
  2. 前記TACAが、Globo H、ステージ特異的胎児抗原3(SSEA−3)、ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4)、Tn、TF、sTn、ポリシアル酸、Gb3、Gb4、Le、Le、Le、sLe、SLe、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、GM1、GM2、GM3、フコシル−GM1、Neu5GcGM3および/またはこれらのn−ペンチルアミン官能化バリアントを含む、請求項1に記載のアレイ。
  3. 前記基材が、表面、固体表面、不透明固体、可視光もしくは非可視光の選択された波長に対して透明である固体、粒子、マイクロバブル、またはビーズから選択される、請求項1に記載のアレイ。
  4. 前記基材が、ニトロセルロースである、請求項1に記載のアレイ。
  5. 前記複数のGAZ炭水化物部分が、前記基材上にコーティングされている、請求項1に記載のアレイ。
  6. 前記複数のGAZ炭水化物における前記Z部分が、ファンデルワールス相互作用または疎水性相互作用によって前記基材に接着している、請求項5に記載のアレイ。
  7. 前記炭水化物部分が、多糖、オリゴ糖、糖コンジュゲートの炭水化物部、Globo H、SSEA−3、SSEA−4、Tn、TF、sTn、ポリシアル酸、Gb3、Gb4、Le、Le、Le、sLe、SLe、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、GM1、GM2、GM3、フコシル−GM1、Neu5GcGM3および/またはこれらのn−ペンチルアミン官能化バリアントのうちの1つまたは複数を含む、請求項1に記載のアレイ。
  8. 複合体の検出、疾患の診断、処置の監視または再発の監視において使用するための、基材上に固定された炭水化物のアレイであって、以下:
    (a)基材を用意する工程と、
    (b)前記基材をニトロセルロースでコーティングする工程と、
    (c)前記基材の表面上の別々の場所に複数のG−A−Z部分を固定する工程と
    を含む方法によって製作される、アレイ。
  9. 請求項8に記載のアレイを特性評価する方法であって、固定された前記G−A−Z部分をTACAに対する標識抗体と接触させる工程と、前記抗体とグリカンとの間で複合体を形成させる工程と、前記抗体と前記グリカンとの間で形成された前記複合体を検出する工程とを含む方法。
  10. 前記標識抗体が、酵素を含む標識、蛍光標識、化学発光標識、ナノ粒子標識を含む、請求項9に記載の方法。
  11. 前記酵素が、アルカリホスファターゼ(AP)または西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)である、請求項10に記載の方法。
  12. 抗体が、固定された多糖、オリゴ糖、糖コンジュゲートの炭水化物部、Globo H、SSEA−3、SSEA−4、Tn、TF、sTn、ポリシアル酸、Globo H、SSEA−3、SSEA−4、Gb3、Gb4、Le、Le、Le、sLe、SLe、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、GM1、GM2、GM3、フコシル−GM1または抗原のNeu5GcGM3シリーズを特異的に認識する、請求項9に記載のアレイ。


  13. を有する化合物であって、
    式中、
    Gは、グリカンであり、
    Aは、エステルまたはアミドを含む部分であり、
    Xは、基材、固体表面、コーティング表面、ポリマー表面、ニトロセルロースコーティング表面、もしくはビーズ表面、前記表面に付着したスペーサー基、または表面にリンカーを接着させるための基を伴うスペーサー基であり、
    Zは、1つまたは複数の脂質鎖、脂質鎖を伴う1つまたは複数のスペーサー基である、化合物。


  14. を有する化合物。


  15. を有する化合物。


  16. を有する化合物。


  17. を有する化合物。


  18. を有する化合物。


  19. を有する化合物。


  20. を有する化合物。


  21. を有する化合物。
  22. 以下の式

    のうちのいずれか1つに従う化合物であって、
    式中、キラル炭素原子Cは、ラセミであってもキラルであってもよく、
    n=5、6、7、8、または9であり、かつ
    TACAは、Globo H、ステージ特異的胎児抗原3(SSEA−3)、ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4)、Tn、TF、sTn、ポリシアル酸、Globo H、SSEA−3、SSEA−4、Gb3、Gb4、Le、Le、Le、sLe、SLe、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、GM1、GM2、GM3、フコシル−GM1、Neu5GcGM3および/またはこれらのn−ペンチルアミン官能化バリアントから選択される、化合物。
  23. 請求項13から22に記載の化合物の使用を含む、アレイにおける感度を向上する方法。
  24. 相対抗体結合レベルを、がん、癌腫、新生物または過形成を有する疑いがある、疾患の診断、処置の監視または再発の監視を必要とする対象の、疾患の診断、処置の監視または再発の監視のための指標とする方法であって、
    (a)がんを有する疑いがある対象から抗体を含有する試料を接触させて、前記試料中の抗体をG−A−Z部分の1つまたは複数に結合させる工程、および
    )1つまたは複数の結合した抗体の量を検出する工程
    を含み、疾患を有しない対象のレベルと比較した場合の相対抗体結合レベルが、病態を示す、方法。
  25. 複合体を検出するための方法であって、
    (a)がん、癌腫、新生物または過形成を有する疑いがある対象から抗体を含有する試料を接触させて、前記試料中の抗体を、1つまたは複数のG−A−Z部分に結合させる工程、
    )1つまたは複数の結合した抗体の量を検出する工程、および
    )疾患を有しない対象のレベルと比較した場合の相対抗体結合レベルを確認する工程を含む方法。
  26. 前記試料が、血清、血液、血漿、細胞、細胞培地、唾液、尿、またはリンパ節液からなる、請求項24または25に記載の方法。
  27. 前記対象がヒトである、請求項24または25に記載の方法。
  28. 前記がんが、肉腫、皮膚がん、白血病、リンパ腫、脳がん、神経膠芽腫、肺がん、乳がん、口腔がん、頭頸部がん、上咽頭がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆管がん、胆嚢がん、膀胱がん、膵臓がん、腸がん、大腸がん、腎臓がん、子宮頸がん、子宮内膜がん、卵巣がん、精巣がん、頬側がん、中咽頭がん、喉頭がんおよび前立腺がんからなる群から選択される、請求項24または25に記載の方法。
  29. グリカン検出のアッセイ値を、がん処置を必要とする対象のがん処置用の抗新生物剤の治療効果を判定するための指標とする方法であって、
    )1つまたは複数の腫瘍関連抗原(TACA)を含むアレイを、対象からの試料と接触させる工程、および
    )1つもしくは複数の腫瘍関連抗原(TACA)の結合、または請求項13から22のいずれか一項に記載の化合物に結合した抗体を検出する工程
    を含み、前記グリカン検出のアッセイ値が、新生物に対する処置における抗新生物剤の治療効果を示す、方法。
  30. 前記試料が、血清、血液、血漿、細胞、細胞培地、唾液、尿、リンパ節液、腫瘍生検または組織培養物からなる、請求項29に記載の方法。
  31. 前記対象がヒトである、請求項29に記載の方法。
  32. 前記抗新生物剤が、担体タンパク質とコンジュゲートした炭水化物抗原またはその免疫原性断片で構成されるワクチンを含む、請求項29に記載の方法。
  33. 前記炭水化物抗原またはその免疫原性断片が、Globo H、ステージ特異的胎児抗原3(SSEA−3)、ステージ特異的胎児抗原4(SSEA−4)、Tn、TF、sTn、ポリシアル酸、Globo H、SSEA−3、SSEA−4、Gb3、Gb4、Le、Le、Le、sLe、SLe、GD1a、GT1b、A2B5、GD2、GD3、GM1、GM2、GM3、フコシル−GM1またはNeu5GcGM3を含む、請求項32に記載の方法。
  34. 前記担体タンパク質が、KLH(キーホールリンペットヘモシアニン)、DT−CRM 197(ジフテリア毒素交差反応物質197)、ジフテリアトキソイドまたは破傷風トキソイドを含む、請求項32に記載の方法。
  35. 前記ワクチンが、医薬組成物として提供される、請求項32に記載の方法。
  36. 前記医薬組成物が、Globo H−KLHおよび追加的なアジュバントを含む、請求項35に記載の方法。
  37. 前記追加的なアジュバントが、サポニン、フロイントアジュバントまたはα−ガラクトシルセラミド(α−GalCer)アジュバントから選択される、請求項36に記載の方法。
  38. 前記医薬組成物が、OBI−822/OBI−821を含む、請求項35に記載の方法。
  39. 前記抗新生物剤が、1つまたは複数の炭水化物抗原に結合可能である抗体またはその抗原結合部を含む、請求項29に記載の方法。
  40. 前記がんが、肉腫、皮膚がん、白血病、リンパ腫、脳がん、神経膠芽腫、肺がん、乳がん、口腔がん、頭頸部がん、上咽頭がん、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆管がん、胆嚢がん、膀胱がん、膵臓がん、腸がん、大腸がん、腎臓がん、子宮頸がん、子宮内膜がん、卵巣がん、精巣がん、頬側がん、中咽頭がん、喉頭がんおよび前立腺がんからなる群から選択される、請求項29に記載の方法。
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