JP2018507863A - 共役基を含む水溶性蛍光染料または有色染料 - Google Patents
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Abstract
Description
(分野)
本発明は、新規な蛍光染料または有色染料、ならびにそれらの調製法および種々の分析法における使用に関する。
蛍光染料および/または有色染料は、高感度検出試薬が望ましい用途に特に適していることが公知である。サンプル中の特定の成分または構成要素を優先的に標識し得る染料は、研究者がその特定の成分または構成要素の存在、量および/または位置を決定することを可能にする。さらに、多様な環境での空間的および時間的分布に関して、特定の系がモニターされ得る。
従って、事前の照射または化学的もしくは酵素的活性化なしで、生体分子の視覚的検出または蛍光検出を可能にする水溶性の染料および生体マーカーが、当該分野で必要である。理想的には、このような染料および生体マーカーは、強く有色であるかまたは蛍光性であるべきであり、種々の色および蛍光波長において利用可能であるべきである。本発明は、この必要性を満たしかつさらなる関連の利点を提供する。
簡潔には、本発明は一般に、生体分子および他の分析物の視覚的検出を可能にする水溶性の蛍光または有色の染料およびプローブとして有用な化合物、ならびにそれらの調製のための試薬に関する。生体分子を視覚的に検出するため、および生体分子のサイズを決定するための方法もまた、記載される。本発明の水溶性の蛍光染料または有色染料は、強く有色および/または蛍光性であり、目視または他の手段によって容易に観察され得る。いくつかの実施形態において、上記化合物は、事前の照射または化学的もしくは酵素的活性化なしに観察され得る。上記染料は、従って、種々の分析法における使用に理想的である。本明細書で記載されるように、上記染料の適切な選択によって、種々の色の視覚的に検出可能な生体分子が、得られ得る。
(a)本明細書で記載される代表的化合物を提供する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
(a)開示される化合物のうちのいずれかと1もしくはこれより多くの生体分子とを混合する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
以下の説明において、ある種の具体的詳細が、本発明の種々の実施形態の完全な理解を提供するために示される。しかし、当業者は、これら詳細なしに本発明が実施され得ることを理解する。
一実施形態において、上記化合物は、以下の構造(I):
M1およびM2は、各存在において、独立して、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、そしてM1のうちの少なくとも1個の存在は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
L1、L3、L4、L6、L7およびL8は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーであり;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2は、電子対、H、アルキル、アルキルエーテル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキル、スルフヒドリルアルキルエーテル(sulfyhdrylalkylether)、シアノアルキル、ホスホ、チオホスホ、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルまたはチオホスホアルキルエーテルであるか;あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R3は、H、OH、SH、−NH2、アルキル、アルキルエーテル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキル、スルフヒドリルアルキルエーテル、シアノアルキル、−Oアラルキル、ホスフェート、チオホスフェート、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、−Oアルキルホスホ、−Oアルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、−Oアルキルエーテルホスホ、−Oアルキルエーテルチオホスホ ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキル、チオホスホアルキルエーテル、−Oホスホアルキル、O−ホスホアルキルエーテル、−Oチオホスホアルキルまたは−Oチオホスホアルキルエーテルであるか;あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R4は、各存在において、独立して、O−、S−、OZ、SZまたはN(R6)2であり、ここでZは、カチオンであり、各R6は、独立して、Hまたはアルキルであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
L9およびL11は、各存在において、独立して、選択肢的なリンカーであり;
L10は、各存在において、独立して、ポリアルキレンエーテル、ヒドロキシルアルキレン、アミノアルキレン、ヒドロキシルポリアルキレンエーテル、アミノポリアルキレンエーテル、ホスホ、チオホスホ、ホスホアルキレンまたはチオホスホアルキレンからなる群より選択される二価の官能基であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子もしくは固体支持体であり;
nは、1〜20の整数であり;
qおよびwは、各々独立して、nの各整数値に関して0または1であり、ここでqは、nのうちの少なくとも2個の整数値に関して1であるか、またはここでqおよびwは、各々独立して、nのうちの少なくとも1個の整数値に関して1であり;そして
zは、1〜10の整数であるが、
ただしR2またはR3のうちの少なくとも一方は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表す。
M1は、各存在において、独立して、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、4個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
L1、L7およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーであり;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2は、電子対、H、アルキル、アルキルエーテル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキル、スルフヒドリルアルキルエーテル、シアノアルキル、ホスホ、チオホスホ、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルまたはチオホスホアルキルエーテルであるか、あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R3は、H、OH、SH、−NH2、アルキル、アルキルエーテル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキル、スルフヒドリルアルキルエーテル、シアノアルキル、−Oアラルキル、ホスフェート、チオホスフェート、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、−Oアルキルホスホ、−Oアルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、−Oアルキルエーテルホスホ、−Oアルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキル、チオホスホアルキルエーテル、−Oホスホアルキル、O−ホスホアルキルエーテル、−Oチオホスホアルキルまたは−Oチオホスホアルキルエーテルであるか;あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R4は、各存在において、独立して、O−、S−、OZ、SZまたはN(R6)2であり、ここでZは、カチオンであり、各R6は、独立して、Hまたはアルキルであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
L9およびL11は、各存在において、独立して、選択肢的なリンカーであり;
L10は、各存在において、独立して、ポリアルキレンエーテル、ヒドロキシルアルキレン、アミノアルキレン、ヒドロキシルポリアルキレンエーテル、アミノポリアルキレンエーテル、ホスホ、チオホスホ、ホスホアルキレンまたはチオホスホアルキレンからなる群より選択される二価の官能基であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子であり;
nは、1〜10の整数であり;そして
zは、1〜10の整数であるが、
ただしR2またはR3のうちの少なくとも一方は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表す。
R7、R8、R9、R10、R11およびR12は、各存在において、独立して、Hまたはアルキルであり;そして
x1、y1およびz1は、各存在において、独立して、0〜5の整数である。
R7、R8、R9、R10、R11およびR12は、各存在において、独立して、Hまたはアルキルであり;そして
x1、x2、y1、y2、z1およびz2は、各存在において、独立して、0〜5の整数である。
R2aは、−OH、−NH2、または−SHであり;そして
aは、1〜10の整数である。
R2aは、−OH、−SH、−NH2、ホスフェートまたはチオホスフェートであり;
R4aおよびR4bは、独立して、O−、S−、OZまたはSZであり、ここでZは、カチオンであり;
R5aおよびR5bは、独立して、オキソ、またはチオキソであり;そして
a、bおよびcは、各々独立して、1〜10の整数である。
R3aは、−OH、−SH、−NH2、ホスフェートまたはチオホスフェートであり;
R4aおよびR4bは、独立して、O−、S−、OZまたはSZであり、ここでZは、カチオンであり;
R5aおよびR5bは、独立して、オキソ、またはチオキソであり;そして
bおよびcは、各々独立して、1〜10の整数である。
M1は、各存在において、独立して、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
L1、L3、およびL7は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーであり;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2は、電子対、H、ホスホ、チオホスホ、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルまたはチオホスホアルキルエーテルであるか;あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R3は、H、OH、SH、−NH2、アルキル、アルキルエーテル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキル、スルフヒドリルアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、−Oアルキルホスホ、−Oアルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、−Oアルキルエーテルホスホ、−Oアルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキル、チオホスホアルキルエーテル、−Oホスホアルキル、−Oホスホアルキルエーテル、−Oチオホスホアルキルまたは−Oチオホスホアルキルエーテルであるか;あるいはR3は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し、
R4は、各存在において、独立して、O−、S−、OZ、SZまたはN(R6)2であり、ここでZは、カチオンであり、そして各R6は、独立して、Hまたはアルキルであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
L9およびL11は、各存在において、独立して、選択肢的なリンカーであり;
L10は、各存在において、独立して、ポリアルキレンエーテル、ヒドロキシルアルキレン、アミノアルキレン、ヒドロキシルポリアルキレンエーテル、アミノポリアルキレンエーテル、ホスホ、チオホスホ、ホスホアルキレンまたはチオホスホアルキレンからなる群より選択される二価の官能基であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子もしくは固体支持体であり;
nは、1〜20の整数であり;そして
zは、1〜10の整数であるが、
ただしR2またはR3のうちの少なくとも一方は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表す。
R2aは、−OH、−SH、−NH2、ホスフェートまたはチオホスフェートであり;
R4aおよびR4bは、独立して、O−、S−、OZまたはSZであり、ここでZは、カチオンであり;
R5aおよびR5bは、独立して、オキソ、またはチオキソであり;そして
a、bおよびcは、各々独立して、1〜10の整数である。
R3aは、−OH、−SH、−NH2、ホスフェートまたはチオホスフェートであり;
R4aおよびR4bは、独立して、O−、S−、OZまたはSZであり、ここでZは、カチオンであり;
R5aおよびR5bは、独立して、オキソ、またはチオキソであり;そして
bおよびcは、各々独立して、1〜10の整数である。
M1は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
R1は、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2は、H、電子対またはカチオンであるか;あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R3は、H、ホスフェートまたはOHであるか;あるいはR3は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R4は、O−、S−、OZ、SZであり、ここでZは、カチオンであり;
R5は、オキソまたはチオキソであり;
R7、R8、R9、R10、R11およびR12は、各存在において、独立して、Hまたはアルキルであり;
L9およびL11は、各存在において、独立して、選択肢的なリンカーであり;
L10は、各存在において、独立して、ポリアルキレンエーテル、ヒドロキシルアルキレン、アミノアルキレン、ヒドロキシルポリアルキレンエーテル、アミノポリアルキレンエーテル、ホスホ、チオホスホ、ホスホアルキレンまたはチオホスホアルキレンからなる群より選択される二価の官能基であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子もしくは固体支持体であり;そして
x、yおよびzは、各存在において、独立して、0〜5の整数であり;そして
zは、1〜10の整数であるが、
ただしR2またはR3のうちの少なくとも一方は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表す。
M1は、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子もしくは固体支持体であり;
R20は、各存在において、独立して、H、ホスフェート、ホスフェートで置換されたアルキル、C1−C6アルキルまたはC1−C6ヒドロキシルアルキルであり;そして
各x’、y’およびz’は、独立して、0〜10の整数である。
他の実施形態は、以下の構造(V):
M1は、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
R20は、各存在において、独立して、H、ホスフェート、アルキルホスフェート、C1−C6アルキルまたはC1−C6ヒドロキシルアルキルであり;そして
各x’、y’およびz’は、独立して、0〜10の整数である。
M1は、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子もしくは固体支持体であり;
R20は、各存在において、独立して、H、ホスフェート、ホスフェートで置換されたアルキル、C1−C6アルキルまたはC1−C6ヒドロキシルアルキルであり;そして
各x’、y’およびz’は、各存在において、独立して、0〜10の整数である。
M1は、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
R20は、各存在において、独立して、H、ホスフェート、ホスフェートで置換されたアルキル、C1−C6アルキルまたはC1−C6ヒドロキシルアルキルであり;そして
各x’、y’およびz’は、各存在において、独立して、0〜10の整数である。
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
(a)前述の化合物のうちのいずれかと1もしくはこれより多くの生体分子とを混合する工程;および
(b)上記化合物をその視覚的特性によって検出する工程
を包含する。
反応スキームI
反応スキームII
1Hおよび31P NMRスペクトルを、JEOL 400MHz分光計で得た。31P NMRスペクトルは、85% 水性リン酸を基準とし、1Hスペクトルは、TMSを基準とした。逆相HPLC染料分析を、45℃で保持した2.1mm×50mm Acquity BEH−C18カラム付きのWaters Acquity UHPLCシステムを使用して行った。質量分析を、Waters/Micromass QuattroマイクロMS/MSシステムで(MSのみモードで)、MassLynx 4.1獲得ソフトウェアを使用して行った。染料に関してLC/MSに使用した移動相は、100mM 1,1,1,3,3,3−ヘキサフルオロ−2−プロパノール(HFIP)、8.6mM トリエチルアミン(TEA)、pH8であった。ホスホロアミダイトおよび前駆体分子を、ダイオードアレイ検出器および高速オートサンプラーのAgilent Infinity 1260 UHPLCシステムを使用して、Aapptec(C) SpiritTM Peptide C18カラム(4.6mm×100mm、5μm粒度)を使用して分析した。励起および発光プロフィール実験を、Cary Eclipse分光光度計で記録した。
活性化エステル部分を有する可溶性染料の合成
式1:化合物1のモル濃度={A443/(L×e化合物1)}×希釈係数
e化合物1=38,000M −1 cm −1
Lnanodrop=0.1cm
A443=0.614AU
希釈係数=20
化合物1のモル濃度=3.23×10 −03 M化合物1。
式2:化合物1のモル数={M化合物1×(V化合物1−mL/1000)}
M化合物1=3.23×10 −03 M(式1)
V化合物1=3.88mL
還元されるべき化合物1のモル数=1.23×10 −05 モルの化合物1。
式3:TCEPのモル数=モル数化合物1×11.3
モル数化合物1=1.23×10 −05 (式2)
モル過剰:11.3
必要とされるTCEPのモル数=1.39×10 −04 モルのTCEP。
式4:必要とされるTCEPの容積(mL)={(モル数TCEP/MTCEP)×1000}
モル数TCEP=1.39×10 −04 (式3)
MTCEP=0.111M
必要とされるTCEPの容積=1.28mLのTCEP。
必要とされる試薬の容積:
3.23×10−03Mの化合物1=3.88mL
0.6MのNaPO4=1.28mL
0.111MのTCEP=1.28mL
化合物1:(3.23×10−03Mの化合物1)×(3.88mLの化合物1)/10mL=1.25×10 −03 Mの化合物1
TCEP:(0.111MのTCEP)×(1.28mLのTCEP)/10mL=0.014MのTCEP
MSH:(0.023MのMSH)×(3.1mLのMSH)/10mL=7.13×10 −03 MのMSH
NaPO4:(0.6MのNaPO4×1.28mLのNaPO4)/10mL=0.077MのNaPO4
装置
・HPLC:Akta Purifier 100
カラム
・Phenomenex Gemini C18(5mm、110Å、10×250mm)、部品番号00G−4435−N0
方法1:
・流速:2mL/分
・移動相:
○A=0.1MのTEAA、H2O中5%のアセトニトリル
○B=100%のアセトニトリル
・注入:5mLの反応物質
・溶離:0〜55%の移動相B、5CV、カラム洗浄:100%の移動相B、1CV
・モニターされる痕跡:
○伝導度
○445nmおよび310nmでのUV吸光度
・分画:50mAUでのUV445によって引き起こされた閾値、画分あたり1.25mLを15mLに集める
○15mLのコニカルチューブの中に集める
○画分をHPLCによって分析して、純度を確認した。
装置
・HPLC:Akta Purifier 100
カラム
・Phenomenex Gemini C18(5mm、110Å、10×250mm)、部品番号00G−4435−N0
方法2:
・流速:2mL/分
・移動相:
○A=0.1MのTEAA、H2O中5%のメタノール
○B=100%のメタノール
・注入:5mLのHNSA−S−CCE−3’+未反応化合物1(画分B11)
・溶離:0〜55%の移動相B、5CV、カラム洗浄:100%の移動相B、1CV
・モニターされる痕跡:
○伝導度
○445nmおよび310nmでのUV吸光度
・分画:50mAUでのUV445によって引き起こされた閾値、画分あたり1.25mLを15mLに集める
○15mLのコニカルチューブの中に集める
○画分をHPLCによって分析して、純度を確認した
画分C10を、精製化合物2であると確認した。
式1(ベールの法則):SND215のモル濃度={A443/(L×e化合物4)}×希釈係数
e化合物45=38,000M −1 cm −1
Lnanodrop=0.1cm
A443=0.372
希釈係数=100
SND215のモル濃度=9.79×10 −03 Mの化合物4。
式2:SND215のモル数={M 化合物45×(V 化合物4−ml/1000)}
M 化合物4=9.79×10 −03 M(式1)
V 化合物4=0.65ml
スルホ−SMCCと反応させるべき化合物4のモル数=6.36×10 −06 モルの化合物4。
式3:スルホ−SMCCのモル数=化合物4のモル数×10
化合物4のモル数=6.36×10 −06 (式2)
モル過剰:10
必要とされるスルホ−SMCCのモル数=6.36×10 −05 モルのスルホ−SMCC。
式4:必要とされるスルホ−SMCCの容積(ml)={(モル数スルホ−SMCC/Mスルホ−SMCC)×1000}
モル数スルホ−SMCC=6.36×10 −05 (式3)
Mスルホ−SMCC=0.023M
必要とされるスルホ−SMCCの容積=2.765mlのスルホ−SMCC。
9.79×10−03Mの化合物4=0.65ml
0.45MのNaPO4=1.15ml
0.023Mのスルホ−SMCC=2.75ml
H2O=0.45ml
化合物4:(9.79×10−03Mの化合物4)×(0.65mlの化合物4)/5ml=1.27×10 −03 Mの化合物4
スルホ−SMCC:(0.023Mのスルホ−SMCC)×(3.1mlのスルホ−SMCC)/5ml=0.013Mのスルホ−SMCC
NaPO4:(0.45MのNaPO4×1.15mlのNaPO4)/5ml=0.104MのNaPO4
装置
・HPLC:Akta Purifier 100
カラム
・Waters Spherisorb C6(5mm、80Å、10×250mm)、部品番号PSS831085
方法1:
・流速:2mL/分
・移動相
○A=0.1MのTEAA、H2O中5%のアセトニトリル
○B=100%のアセトニトリル
・注入:5mLの反応物質
・溶離:0〜55%の移動相B、5CV、カラム洗浄:100%の移動相B、1CV
・モニターされる痕跡:
○伝導度
○445nmおよび310nmでのUV吸光度
・分画:50mAUでのUV445によって引き起こされた閾値、画分あたり1.25mLを15mLに集める
○画分B6およびB5を15mLのコニカルチューブの中に集める
○画分をプールし、HPLCによって分析して、純度を確認する
試薬:
・L−システイン塩酸塩一水和物(CAS 7048−04−6、FW 175.6、Thermo Scientific)
・0.1Mのホスフェート緩衝液(+0.15MのNaCl)、pH6.5
・SND215+MSHの水性ストック(0.15mM)
手順:
水中のL−システインの5mM溶液を、14.2mLの水の中に12.5mgの固体を溶解することによって作った。L−システインとマレイミド基との間の反応は、僅かに酸性の条件で行われるべきであるので、サンプルを示されるように調製し、pHレベルがpH6〜7であるようにチェックした:
・ブランク:45μLの水+50μLの緩衝液+5μLのL−システインストック
・未処理サンプル:45μLのSND215、50μLの緩衝液、5μLの水
・処理サンプル:45μLのSND215、50μLの緩衝液、5μLのL−システインストック。
Claims (127)
- 以下の構造(I):
M1およびM2は、各存在において、独立して、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
L1、L3、L4、L6、L7およびL8は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーであり;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2は、電子対、H、アルキル、アルキルエーテル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキル、スルフヒドリルアルキルエーテル、シアノアルキル、ホスホ、チオホスホ、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルまたはチオホスホアルキルエーテルであるか;あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R3は、H、OH、SH、−NH2、アルキル、アルキルエーテル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキル、スルフヒドリルアルキルエーテル、シアノアルキル、−Oアラルキル、ホスフェート、チオホスフェート、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、−Oアルキルホスホ、−Oアルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、−Oアルキルエーテルホスホ、−Oアルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキル、チオホスホアルキルエーテル、−Oホスホアルキル、−Oホスホアルキルエーテル、−Oチオホスホアルキルまたは−Oチオホスホアルキルエーテルであるか;あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R4は、各存在において、独立して、O−、S−、OZ、SZまたはN(R6)2であり、ここでZは、カチオンであり、各R6は、独立して、Hまたはアルキルであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
L9およびL11は、各存在において、独立して、選択肢的なリンカーであり;
L10は、各存在において、独立して、ポリアルキレンエーテル、ヒドロキシルアルキレン、アミノアルキレン、ヒドロキシルポリアルキレンエーテル、アミノポリアルキレンエーテル、ホスホ、チオホスホ、ホスホアルキレンまたはチオホスホアルキレンからなる群より選択される二価の官能基であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子もしくは固体支持体であり;
nは、1〜20の整数であり;
qおよびwは、各々独立して、nの各整数値に関して0または1であり、ここでqは、nのうちの少なくとも2個の整数値に関して1であるか、あるいはここでqおよびwは、各々独立して、nのうちの少なくとも1個の整数値に関して1であり;そして
zは、1〜10の整数であるが、
ただしR2またはR3のうちの少なくとも一方は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表す、
化合物またはその塩もしくは立体異性体。 - nの各整数値に関して、qは、1であり、wは、0である、請求項1に記載の化合物。
- 前記化合物は、以下の構造(Ia):
M1は、各存在において、独立して、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、4個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
L1、L7およびL3は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーであり;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2は、電子対、H、アルキル、アルキルエーテル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキル、スルフヒドリルアルキルエーテル、シアノアルキル、ホスホ、チオホスホ、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルまたはチオホスホアルキルエーテルであるか、あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R3は、H、OH、SH、−NH2、アルキル、アルキルエーテル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキル、スルフヒドリルアルキルエーテル、シアノアルキル、−Oアラルキル、ホスフェート、チオホスフェート、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、−Oアルキルホスホ、−Oアルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、−Oアルキルエーテルホスホ、−Oアルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキル、チオホスホアルキルエーテル、−Oホスホアルキル、−Oホスホアルキルエーテル、−Oチオホスホアルキルまたは−Oチオホスホアルキルエーテルであるか;あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R4は、各存在において、独立して、O−、S−、OZ、SZまたはN(R6)2であり、ここでZは、カチオンであり、各R6は、独立して、Hまたはアルキルであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
L9およびL11は、各存在において、独立して、選択肢的なリンカーであり;
L10は、各存在において、独立して、ポリアルキレンエーテル、ヒドロキシルアルキレン、アミノアルキレン、ヒドロキシルポリアルキレンエーテル、アミノポリアルキレンエーテル、ホスホ、チオホスホ、ホスホアルキレンまたはチオホスホアルキレンからなる群より選択される二価の官能基であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子であり;
nは、1〜10の整数であり;そして
zは、1〜10の整数であるが、
ただしR2またはR3のうちの少なくとも一方は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表す、
請求項2に記載の化合物。 - wは、nのうちの少なくとも1個の整数値に関して1である、請求項1に記載の化合物。
- R5は、オキソであり、R4は、O−またはOZである、請求項7に記載の化合物。
- R2は、Hまたは電子対であり、R3は、−L9−(L10)z−L11−Qである、請求項1〜8のいずれか1項に記載の化合物。
- R2は、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキルまたはスルフヒドリルアルキルエーテルであり、R3は、−L9−(L10)z−L11−Qである、請求項1〜8のいずれか1項に記載の化合物。
- R3は、−L9−(L10)zL11−Qであり、R2は、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルまたはチオホスホアルキルエーテルであり、ここでR2は、−OH、−NH2および−SHから選択される置換基で必要に応じて置換されている、請求項1〜8のいずれか1項に記載の化合物。
- R2は、−L9−(L10)z−L11−Qであり、R3は、OHまたはホスフェートである、請求項1〜8のいずれか1項に記載の化合物。
- R2は、−L9−(L10)z−L11−Qであり、R3は、−OH、−NH2および−SHから選択される置換基で置換された、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホ、チオホスホ、−Oアルキルホスホ、−Oアルキルチオホスホ、−Oアルキルエーテルホスホ、−Oアルキルエーテルチオホスホ、−Oホスホアルキル、−Oホスホアルキルエーテル、−Oチオホスホアルキルまたは−Oチオホスホアルキルエーテルである、請求項1〜8のいずれか1項に記載の化合物。
- R4aおよびR4bは、各々O−であり、R5aおよびR5bは、各々オキソである、請求項13または16のいずれか1項に記載の化合物。
- R4aおよびR4bは、各々O−であり、R5aおよびR5bは、各々チオキソである、請求項13または16のいずれか1項に記載の化合物。
- R4aおよびR4bは、各々S−であり、R5aおよびR5bは、各々チオキソである、請求項13または16のいずれか1項に記載の化合物。
- R4aおよびR4bは、各々S−であり、R5aおよびR5bは、各々オキソである、請求項13または16のいずれか1項に記載の化合物。
- a、bまたはcのうちの少なくとも1つは、2である、請求項13または16のいずれか1項に記載の化合物。
- a、bおよびcの各々は、2である、請求項21に記載の化合物。
- a、bまたはcのうちの少なくとも1つは、6である、請求項13または16のいずれか1項に記載の化合物。
- a、bおよびcの各々は、6である、請求項23に記載の化合物。
- nは、1〜5の整数である、請求項1〜24のいずれか1項に記載の化合物。
- nは、2〜15の整数である、請求項1〜24のいずれか1項に記載の化合物。
- nは、2〜10の整数である、請求項1〜24のいずれか1項に記載の化合物。
- nは、2〜5の整数である、請求項26に記載の化合物。
- 以下の構造(II):
M1は、各存在において、独立して、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
L1、L3、およびL7は、各存在において、独立して、選択肢的なアルキレンまたはヘテロアルキレンリンカーであり;
R1は、各存在において、独立して、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2は、電子対、H、ホスホ、チオホスホ、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルまたはチオホスホアルキルエーテルであるか;あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R3は、H、OH、SH、−NH2、アルキル、アルキルエーテル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、ヒドロキシルアルキルエーテル、スルフヒドリルアルキル、スルフヒドリルアルキルエーテル、ホスフェート、チオホスフェート、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、−Oアルキルホスホ、−Oアルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、−Oアルキルエーテルホスホ、−Oアルキルエーテルチオホスホ ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキル、チオホスホアルキルエーテル、−Oホスホアルキル、−Oホスホアルキルエーテル、−Oチオホスホアルキルまたは−Oチオホスホアルキルエーテルであるか;あるいはR3は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し、
R4は、各存在において、独立して、O−、S−、OZ、SZまたはN(R6)2であり、ここでZは、カチオンであり、そして各R6は、独立して、Hまたはアルキルであり;
R5は、各存在において、独立して、オキソ、チオキソまたは非存在であり;
L9およびL11は、各存在において、独立して、選択肢的なリンカーであり;
L10は、各存在において、独立して、ポリアルキレンエーテル、ヒドロキシルアルキレン、アミノアルキレン、ヒドロキシルポリアルキレンエーテル、アミノポリアルキレンエーテル、ホスホ、チオホスホ、ホスホアルキレンまたはチオホスホアルキレンからなる群より選択される二価の官能基であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子もしくは固体支持体であり;
nは、1〜20の整数であり;そして
zは、1〜10の整数であるが、
ただしR2またはR3のうちの少なくとも一方は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表す、
化合物またはその塩もしくは立体異性体。 - R3は、−L9−(L10)z−L11−Qであり、R2は、アルキルホスホ、アルキルチオホスホ、アルキルエーテルホスホ、アルキルエーテルチオホスホ、ホスホアルキル、ホスホアルキルエーテル、チオホスホアルキルまたはチオホスホアルキルエーテルであり、ここでR2は、−OH、−NH2および−SHから選択される置換基で必要に応じて置換されている、請求項29に記載の化合物。
- R2は、−L9−(L10)z−L11−Qであり、R3は、OHまたはホスフェートである、請求項29に記載の化合物。
- R2は、−L9−(L10)z−L11−Qであり、R3は、−OH、−NH2および−SHから選択される置換基で必要に応じて置換された、ホスフェート、チオホスフェート、ホスホ、チオホスホ、−Oアルキルホスホ、−Oアルキルチオホスホ、−Oアルキルエーテルホスホ、−Oアルキルエーテルチオホスホ、−Oホスホアルキル、−Oホスホアルキルエーテル、−Oチオホスホアルキルまたは−Oチオホスホアルキルエーテルである、請求項29に記載の化合物。
- 各存在において、R4は、O−であり、R5は、オキソである、請求項29〜34のいずれか1項に記載の化合物。
- L1、L3およびL7は、各々アルキレンリンカーである、請求項29〜35のいずれか1項に記載の化合物。
- L1およびL3は、各々アルキレンリンカーであり、L7は、非存在である、請求項29〜35のいずれか1項に記載の化合物。
- アルキレンは、メチレンである、請求項36または37のいずれか1項に記載の化合物。
- 以下の構造(III):
M1は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
R1は、H、アルキルまたはアルコキシであり;
R2は、H、電子対またはカチオンであるか;あるいはR2は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R3は、H、ホスフェートまたはOHであるか;あるいはR3は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表し;
R4は、O−、S−、OZ、SZであり、ここでZは、カチオンであり;
R5は、オキソまたはチオキソであり;
R7、R8、R9、R10、R11およびR12は、各存在において、独立して、Hまたはアルキルであり;
L9およびL11は、各存在において、独立して、選択肢的なリンカーであり;
L10は、 各存在において、独立して、ポリアルキレンエーテル、ヒドロキシルアルキレン、アミノアルキレン、ヒドロキシルポリアルキレンエーテル、アミノポリアルキレンエーテル、ホスホ、チオホスホ、ホスホアルキレンまたはチオホスホアルキレンからなる群より選択される二価の官能基であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子もしくは固体支持体であり;そして
x、yおよびzは、各存在において、独立して、0〜5の整数であり;そして
zは、1〜10の整数であるが、
ただしR2またはR3のうちの少なくとも一方は、−L9−(L10)z−L11−Qまたは−L9−(L10)z−L11−S−S−L11−(L10)z−L9−Iであり、ここでIは、独立して、構造(I)のさらなる化合物を表す、
化合物またはその塩もしくは立体異性体。 - x、yおよびzは、各々1である、請求項39に記載の化合物。
- xは、0であり、yおよびzは、各々1である、請求項39に記載の化合物。
- 少なくとも1個のM1は、4個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分である、請求項1〜41のいずれか1項に記載の化合物。
- M1は、各存在において、独立して、蛍光性または有色である、請求項1〜42のいずれか1項に記載の化合物。
- M1は、蛍光性である、請求項43に記載の化合物。
- 各M1は、4個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分である、請求項1〜44のいずれか1項に記載の化合物。
- 各M1は、少なくとも4個のアリール環を含む、請求項1〜45のいずれか1項に記載の化合物。
- 各M1は、少なくとも1個のヘテロアリール環を含む、請求項1〜46のいずれか1項に記載の化合物。
- 各M1は、各存在において、独立して、少なくとも4個の縮合環を含む縮合多環式アリール部分を含む、請求項1〜47のいずれか1項に記載の化合物。
- M1は、各存在において、独立して、少なくとも1個の置換基を含む、請求項1〜48のいずれか1項に記載の化合物。
- 前記置換基は、フルオロ、クロロ、ブロモ、ヨード、アミノ、アルキルアミノ、アリールアミノ、ヒドロキシ、スルフヒドリル、アルコキシ、アリールオキシ、フェニル、アリール、メチル、エチル、プロピル、ブチル、イソプロピル、t−ブチル、カルボキシ、スルホネート、アミド、またはホルミル基である、請求項49に記載の化合物。
- 少なくとも1個のM1は、ジメチルアミノスチルベン、キナクリドン、フルオロフェニル−ジメチル−BODIPY、his−フルオロフェニル−BODIPY、アクリジン、テリレン、セキシフェニル、ポルフィリン、ベンゾピレン、(フルオロフェニル−ジメチル−ジフルオロボラ−ジアザ−インダセン)フェニル、(ビス−フルオロフェニル−ジフルオロボラ−ジアザ−インダセン)フェニル、クアテルフェニル、ビ−ベンゾチアゾール、ター−ベンゾチアゾール、ビ−ナフチル、ビ−アントラシル、スクアライン、スクアリリウム、9,10−エチニルアントラセンまたはター−ナフチル部分である、請求項1〜50のいずれか1項に記載の化合物。
- 少なくとも1個のM1は、p−ターフェニル、ペリレン、アゾベンゼン、フェナジン、フェナントロリン、アクリジン、チオキサントレン、クリセン、ルブレン、コロネン、シアニン、ペリレンイミド、もしくはペリレンアミドまたはその誘導体である、請求項1〜51のいずれか1項に記載の化合物。
- 少なくとも1個のM1は、クマリン染料、レゾルフィン染料、ジピロメテンボロンジフルオリド染料、ルテニウムビピリジル染料、エネルギー移動染料、チアゾールオレンジ染料、ポリメチンまたはN−アリール−1,8−ナフタルイミド染料である、請求項1〜52のいずれか1項に記載の化合物。
- 各M1は、ピレン、ペリレン、ペリレンモノイミドもしくは6−FAMまたはその誘導体である、請求項1〜53のいずれか1項に記載の化合物。
- L9は、存在する、請求項1〜54のいずれか1項に記載の化合物。
- L9は、C1−C6アルキレンである、請求項55に記載の化合物。
- L10は、ポリアルキレンエーテル、ホスホおよびホスホアルキレンからなる群より選択される、請求項1〜56のいずれか1項に記載の化合物。
- Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分である、請求項1〜59のいずれか1項に記載の化合物。
- Qは、求核性反応性基、求電子性反応性基または付加環化反応性基である、請求項60に記載の化合物。
- Qは、スルフヒドリル、ジスルフィド、活性化エステル、イソチオシアネート、アジド、アルキン、アルケン、ジエン、ジエノフィル、酸ハライド、スルホニルハライド、ホスフィン、α−ハロアミド、ビオチン、アミノまたはマレイミドである、請求項61に記載の化合物。
- 前記活性化エステルは、N−スクシンイミドエステル、イミドエステルまたはポリフルオロフェニルエステルである、請求項62に記載の化合物。
- 前記アルキンは、アルキルアジドまたはアシルアジドである、請求項62に記載の化合物。
- Qは、分析物分子もしくは固体支持体である、請求項1〜59のいずれか1項に記載の化合物。
- 前記分析物分子は、生体分子である、請求項65に記載の化合物。
- 前記生体分子は、核酸、アミノ酸またはこれらのポリマーである、請求項66に記載の化合物。
- 前記生体分子は、核酸、ペプチド、炭水化物、脂質、酵素、レセプター、レセプターリガンド、抗体、糖タンパク質、アプタマー、抗原またはプリオンである、請求項66に記載の化合物。
- 前記分析物分子は、薬物、ビタミンまたは低分子である、請求項65に記載の化合物。
- M2が存在する場合、M2のうちの少なくとも1個の存在は、塩基対合部分である、請求項1〜70のいずれか1項に記載の化合物。
- M2の各存在は、塩基対合部分である、請求項71に記載の化合物。
- 前記塩基対合部分は、プリン、ピリミジン、ジヒドロピリミジンまたはその誘導体である、請求項72または1のいずれか1項に記載の化合物。
- R7、R8、R9、R10、R11およびR12は、存在する場合、各々Hである、請求項4、5または7〜70のいずれか1項に記載の化合物。
- x1、y1およびz1は、各々1である、請求項4、5または7〜38のいずれか1項に記載の化合物。
- 各x1は、0であり、各y1およびz1は、1である、請求項4、5または7〜38のいずれか1項に記載の化合物。
- 各x2は、1であり、各y2およびz2は、0である、請求項7〜38のいずれか1項に記載の化合物。
- 以下の構造(IV):
M1は、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子もしくは固体支持体であり;
R20は、各存在において、独立して、H、ホスフェート、ホスフェートで置換されたアルキル、C1−C6アルキルまたはC1−C6ヒドロキシルアルキルであり;そして
各x’、y’およびz’は、独立して、0〜10の整数である、
化合物またはその塩もしくは立体異性体。 - M1は、請求項42〜52のいずれか1項に定義されるとおりである、請求項79に記載の化合物。
- M1は、ペリレンである、請求項79に記載の化合物。
- Qは、請求項58〜67のいずれか1項に定義されるとおりである、請求項79〜81のいずれか1項に記載の化合物。
- Qは、−SHである、請求項79〜81のいずれか1項に記載の化合物。
- 各y’は、0である、請求項79〜83のいずれか1項に記載の化合物。
- 各z’は、1である、請求項79〜84のいずれか1項に記載の化合物。
- 各x’は、独立して、2〜6の整数である、請求項79〜85のいずれか1項に記載の化合物。
- R20は、ホスフェート、−CH2OPO3 2−またはCH2OHである、請求項79〜86のいずれか1項に記載の化合物。
- サンプルを染色するための方法であって、該方法は、該サンプルに、請求項1〜89のいずれか1項の化合物を、該サンプルが適切な波長で照射される場合に光学的応答を生じるために十分な量で添加する工程を包含する方法。
- 前記光学的応答は、蛍光応答である、請求項90に記載の方法。
- 前記サンプルは、細胞を含む、請求項90〜91のいずれか1項に記載の方法。
- 前記細胞をフローサイトメトリーによって観察する工程をさらに包含する、請求項92に記載の方法。
- 前記蛍光応答を、検出可能に異なる光学的特性を有する第2の発蛍光団の蛍光応答から区別する工程をさらに包含する、請求項93に記載の方法。
- 生体分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)請求項1〜89のいずれかの化合物を提供する工程;および
(b)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。 - 生体分子を視覚的に検出するための方法であって、該方法は、
(a)請求項1〜89のいずれかの化合物と、1もしくはこれより多くの生体分子とを混合する工程;
(b)該化合物をその視覚的特性によって検出する工程、
を包含する方法。 - 請求項1〜89または99〜127のいずれか1項の化合物および1もしくはこれより多くの生体分子を含む、組成物。
- 前記1もしくはこれより多くの生体分子の検出のための分析方法における請求項97に記載の組成物の使用。
- M1は、請求項42〜54のいずれか1項に定義されるとおりである、請求項99に記載の化合物。
- M1は、ペリレンである、請求項99に記載の化合物。
- 各y’は、0である、請求項99〜101のいずれか1項に記載の化合物。
- 各z’は、1である、請求項99〜102のいずれか1項に記載の化合物。
- 各x’は、独立して、2〜6の整数である、請求項99〜103のいずれか1項に記載の化合物。
- R20は、ホスフェート、CH2OPO3 2−またはCH2OHである、請求項99〜104のいずれか1項に記載の化合物。
- 以下の構造(VI):
M1は、2個もしくはこれより多くの二重結合および少なくとも1の共役度を含む部分であり、M1のうちの少なくとも1個の存在は、3個もしくはこれより多くのアリールもしくはヘテロアリール環、またはこれらの組み合わせを含む部分であり;
Qは、分析物分子もしくは固体支持体と結合できる部分であるか;またはQは、分析物分子もしくは固体支持体であり;
R20は、各存在において、独立して、H、ホスフェート、ホスフェートで置換されたアルキル、C1−C6アルキルまたはC1−C6ヒドロキシルアルキルであり;そして
各x’、y’およびz’は、各存在において、独立して、0〜10の整数である、
化合物またはその塩。 - M1は、請求項42〜52のいずれか1項に定義されるとおりである、請求項108に記載の化合物。
- M1は、ペリレンである、請求項108〜109のいずれか1項に記載の化合物。
- Qは、請求項58〜67のいずれか1項に定義されるとおりである、請求項108〜110のいずれか1項に記載の化合物。
- Qは、−SHまたは−NH2である、請求項108〜110のいずれか1項に記載の化合物。
- 各y’は、0である、請求項108〜112のいずれか1項に記載の化合物。
- 各z’は、1である、請求項108〜113のいずれか1項に記載の化合物。
- 各x’は、独立して、2〜6の整数である、請求項108〜114のいずれか1項に記載の化合物。
- R20は、ホスフェート、CH2OPO3 2−またはCH2OHである、請求項108〜115のいずれか1項に記載の化合物。
- M1は、請求項42〜52のいずれか1項において定義されるとおりである、請求項119に記載の化合物。
- M1は、ペリレンである、請求項119〜120のいずれか1項に記載の化合物。
- 各y’は、0である、請求項119〜121のいずれか1項に記載の化合物。
- 各z’は、1である、請求項119〜122のいずれか1項に記載の化合物。
- 各x’は、独立して、2〜6の整数である、請求項119〜123のいずれか1項に記載の化合物。
- R20は、ホスフェート、CH2OPO3 2−またはCH2OHである、請求項119〜124のいずれか1項に記載の化合物。
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