JP2017102025A - フィラーモデルの生成装置、生成方法、プログラム、及び、フィラーモデルのデータ構造 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】断面が曲面となるフィラー外表面20に対応する曲面21上に、フィラー表面を構成する表面粒子30をランダムに複数個配置するステップST2と、表面粒子30に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い曲面21上における粒子30の再配置を繰り返し実行するステップST3〜10と、を含む。
【選択図】図5
Description
断面が曲面となるフィラー外表面に対応する曲面上に、フィラー表面を構成する表面粒子をランダムに複数個配置するステップと、
前記表面粒子に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い前記曲面上における粒子の再配置を繰り返し実行するステップと、
を含む。
断面が曲面となるフィラー外表面に対応する曲面上に、フィラー表面を構成する表面粒子をランダムに複数個配置する表面粒子配置部と、
前記表面粒子に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い前記曲面上における粒子の再配置を繰り返し実行する表面粒子再配置部と、
を備える。
フィラー表面を構成する複数の表面粒子を含み、
前記各々の表面粒子の中心は、断面が曲面となるフィラー外表面に対応する曲面上のみに配置されており、
他の粒子モデルと共に所定の仮想空間に配置されると共に前記表面粒子にポテンシャルが設定され、前記ポテンシャルの下でコンピュータが分子動力学計算を実行し、前記フィラーモデルを含む各モデルの挙動を算出するために用いられる。
本実施形態の装置は、分子動力学計算で用いられるフィラーモデルを生成する装置である。フィラーモデルは、フィラー外表面が球状となるモデルを例に挙げて説明する。本開示では、フィラー外表面は断面が曲面のみとフィラーモデルを対象とする。外表面は、球体のように単一の曲面のみでもよく、複数の曲率の曲面のみを組み合わせたものでもよい。すなわち、平面が含まれていなければよい。
U0=U(r12)+U(r13)+U(r23)
すなわち、粒子1と2の相互作用ポテンシャル、粒子1と3の相互作用ポテンシャル、粒子2と3の相互作用ポテンシャルの和である。
U=U(r12)+U(r13)+U(r23)
上記装置1を用いてフィラーモデルを生成する方法について、図5及び図6を参照して説明する。
断面が曲面となるフィラー外表面20に対応する曲面21上に、フィラー表面を構成する表面粒子30をランダムに複数個配置するステップST2と、
表面粒子30に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い曲面21上における粒子30の再配置を繰り返し実行するステップST3〜10と、
を含む。
断面が曲面となるフィラー外表面20に対応する曲面21上に、フィラー表面を構成する表面粒子30をランダムに複数個配置する表面粒子配置部11と、
表面粒子30に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い曲面21上における粒子30の再配置を繰り返し実行する表面粒子再配置部12と、
を備える。
曲面21上における全粒子30から再配置候補となる粒子30’’をランダムに選択するステップST3と、
選択した粒子30’’及びその周辺粒子30を少なくとも含む粒子群によるエネルギーU0を算出するステップST4と、
選択した粒子30’’をランダムに移動させ、移動後における粒子群によるエネルギーUを算出するステップST5,6と、
移動後のエネルギーUが移動前のエネルギーU0以下である場合には、移動を確定させ(ST7,8)、移動後のエネルギーUが移動前のエネルギーU0よりも大きい場合には、メトロポリス判定を実行し(ST9)、メトロポリス判定に従って移動を確定又はキャンセルするステップST9,10と、
を含む。
内部粒子40に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い内側空間における内部粒子40の再配置を繰り返し実行するステップST12〜19と、
を含む。
本実施形態の装置において、表面粒子30の内側空間に、フィラー内部を構成する内部粒子40をランダムに複数個配置する内部粒子配置部13と、
内部粒子40に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い内側空間における内部粒子40の再配置を繰り返し実行する内部粒子再配置部14と、
を備える。
本実施形態の装置において、表面粒子配置部11又は内部粒子配置部13は、新たに配置した粒子の中心が既に配置している粒子の中心から所定距離未満にある場合には、前記新たに配置した粒子の配置をやり直す。
フィラー表面を構成する複数の表面粒子を含み、
前記各々の表面粒子の中心は、断面が曲面となるフィラー外表面に対応する曲面上のみに配置されている。
このフィラーモデルデータは、他の分子モデルと共に所定の仮想空間に配置されると共に前記表面粒子にポテンシャルが設定され、前記ポテンシャルの下でコンピュータが分子動力学計算を実行し、前記フィラーモデルを含む各モデルの挙動を算出するために用いられる。
このように、各々の表面粒子30の中心が、フィラー外表面20に対応する曲面21上のみに配置されているデータ構造であるので、格子状配置のような表面の段差がなくなり、フィラー外表面20がより均一になり、コンピュータがポテンシャルの下に分子動力学計算を実行した際に、フィラーの理想的な振る舞いを期待できる。
12…表面粒子再配置部
13…内部粒子配置部
14…内部粒子再配置部
20…フィラー外表面
21…曲面
30…表面粒子
40…内部粒子
Claims (12)
- 断面が曲面となるフィラー外表面に対応する曲面上に、フィラー表面を構成する表面粒子をランダムに複数個配置するステップと、
前記表面粒子に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い前記曲面上における粒子の再配置を繰り返し実行するステップと、
を含む、フィラーモデルの生成方法。 - 前記表面粒子を再配置するステップは、
前記曲面上における全粒子から再配置候補となる粒子をランダムに選択するステップと、
前記選択した粒子及びその周辺粒子を少なくとも含む粒子群によるエネルギーU0を算出するステップと、
前記選択した粒子をランダムに移動させ、移動後における前記粒子群によるエネルギーUを算出するステップと、
移動後のエネルギーUが移動前のエネルギーU0以下である場合には、前記移動を確定させ、前記移動後のエネルギーUが移動前のエネルギーU0よりも大きい場合には、メトロポリス判定を実行し、前記メトロポリス判定に従って前記移動を確定又はキャンセルするステップと、
を含む、請求項1に記載の方法。 - 前記表面粒子の内側空間に、フィラー内部を構成する内部粒子をランダムに複数個配置するステップと、
前記内部粒子に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い前記内側空間における内部粒子の再配置を繰り返し実行するステップと、
を含む、請求項1又は2に記載の方法。 - 前記内部粒子を再配置するステップは、
全ての前記内部粒子から再配置候補となる粒子をランダムに選択するステップと、
前記選択した粒子及びその周辺粒子を少なくとも含む粒子群によるエネルギーU0を算出するステップと、
前記選択した粒子をランダムに移動させ、移動後における前記粒子群によるエネルギーUを算出するステップと、
移動後のエネルギーUが移動前のエネルギーU0以下である場合には、前記移動を確定させ、前記移動後のエネルギーUが移動前のエネルギーU0よりも大きい場合には、メトロポリス判定を実行し、前記メトロポリス判定に従って前記移動を確定又はキャンセルするステップと、
を含む、請求項3に記載の方法。 - 前記粒子をランダムに複数個配置するステップにおいて、新たに配置した粒子の中心が既に配置されている粒子の中心から所定距離未満にある場合には、前記新たに配置した粒子の配置をやり直す、請求項1〜4のいずれかに記載の方法。
- 前記粒子に設定されるポテンシャルは、斥力のみのポテンシャルである、請求項1〜5のいずれかに記載の方法。
- 断面が曲面となるフィラー外表面に対応する曲面上に、フィラー表面を構成する表面粒子をランダムに複数個配置する表面粒子配置部と、
前記表面粒子に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い前記曲面上における粒子の再配置を繰り返し実行する表面粒子再配置部と、
を備える、フィラーモデルの生成装置。 - 前記表面粒子の内側空間に、フィラー内部を構成する内部粒子をランダムに複数個配置する内部粒子配置部と、
前記内部粒子に設定されたポテンシャルに基づき算出されるエネルギーが小さくなるように、モンテカルロ法に従い前記内側空間における内部粒子の再配置を繰り返し実行する内部粒子再配置部と、
を備える、請求項7に記載の装置。 - 前記表面粒子配置部又は前記内部粒子配置部は、新たに配置した粒子の中心が既に配置している粒子の中心から所定距離未満にある場合には、前記新たに配置した粒子の配置をやり直す、請求項7又は8に記載の装置。
- 前記粒子に設定されるポテンシャルは、斥力のみのポテンシャルである、請求項7〜9のいずれかに記載の装置。
- 請求項1〜6のいずれかに記載の方法をコンピュータに実行させるプログラム。
- フィラーモデルのデータ構造であって、
フィラー表面を構成する複数の表面粒子を含み、
前記各々の表面粒子の中心は、断面が曲面となるフィラー外表面に対応する曲面上のみに配置されており、
他の粒子モデルと共に所定の仮想空間に配置されると共に前記表面粒子にポテンシャルが設定され、前記ポテンシャルの下でコンピュータが分子動力学計算を実行し、前記フィラーモデルを含む各モデルの挙動を算出するために用いられる、フィラーモデルのデータ構造。
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