JP2016501900A - ジスルフィド結合した多価mhcクラスiを含む多機能タンパク質 - Google Patents
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Abstract
Description
MHCクラスIタンパク質は、α鎖(α-1〜3ドメインおよび膜貫通ドメイン)およびβ2-ミクログロブリンからなる。これは多遺伝子性であり(一倍体ゲノム中にMHC-クラスIタンパク質の遺伝子座は3つある)、それにより、6種類のMHCクラスIタンパク質α鎖(ヒトでは2種のHLA-A、2種のHLA-B、2種のHLA-C)が生じる。MHCはさらに多形性でもある。ヒトHLA-AのアレルA*0201は、白人集団の約30%〜50%に広く認められる(例えば、Player, et al., J. Immunother. Emphasis Tumor Immunol. 19 (1996) 357-363を参照)。
‐1つ、2つまたは2つを上回る抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、および
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含み、
抗原提示ドメインが互いに独立に、N末端からC末端への方向に、
(i)β2-ミクログロブリン、ならびに
(ii)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)β2-ミクログロブリン、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(iii)β2-ミクログロブリン、
のいずれかを含み、
1つまたは複数の抗原結合部位が癌細胞表面抗原またはウイルス感染細胞表面抗原と結合し、かつ
抗原提示ドメインが、鎖内/ドメイン間ジスルフィド結合を形成する少なくとも2つの非天然システイン残基を有する
ことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐欧州出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*0101、HLA-A*0201、HLA-A*0301、HLA-B*0702、HLA-B*0801、HLA-B*4402、HLA-C*0401、HLA-C*0501、HLA-C*0701およびHLA-C*0702を含む群から選択され、
‐オーストラリア出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*0201、HLA-A*1101、HLA-A*2402、HLA-A*340101、HLA-B*1301、HLA-B*1521、HLA-B*5601、HLA-B*5602、HLA-C*0102、HLA-C*0401、HLA-C*0403およびHLA-C*1502を含む群から選択され、
‐北米出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*0201、HLA-A*2402、HLA-C*0202、HLA-C*0304、HLA-C*0401およびHLA-C*0702を含む群から選択され、そして
‐東南アジア出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*1101、HLA-A*2402、HLA-B*1504、HLA-C*0102、HLA-C*0304、HLA-C*0702およびHLA-C*0801を含む群から選択される。
‐欧州出身の個体の場合、クラスI MHC分子はHLA-A*0201であり、
‐オーストラリア出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*2402、HLA-B*1301、HLA-C*0102およびHLA-C*0401を含む群から選択され、
‐北米出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*2402およびHLA-C*0304を含む群から選択され、そして
‐東南アジア出身の個体の場合、クラスI MHC分子はHLA-A*2402である。
(i)ウイルス由来ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、
(iii)可溶性HLA-AアレルA*0201、ならびに
(iv)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基であって、位置11および位置227にあるものがジスルフィド結合を形成するシステイン残基
を含む。
(i)ウイルス由来ペプチド、
(ii)可溶性HLA-AアレルA*0201、および
(iii)β2-ミクログロブリン、
(iv)少なくとも位置11および位置108にあるシステイン残基であって、位置11および位置108にあるものがジスルフィド結合を形成するシステイン残基
を含む。
(i)SEQ ID NO:01〜SEQ ID NO:70を含む群から選択されるアミノ酸配列を有するウイルス由来ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:77、78、79、82、83、84および139を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第1のリンカーペプチド、
(iii)SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有するβ2-ミクログロブリン、
(iv)SEQ ID NO:77、78、79、82、83および84を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第2のリンカーペプチド、
(v)SEQ ID NO:140のアミノ酸配列を有するクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
(vi)SEQ ID NO:73、77、78、79、82、83、84および136を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第3のリンカーペプチド、ならびに
(vii)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基ならびに位置11および位置227にあるシステイン残基間のジスルフィド結合
を含む。
(i)SEQ ID NO:01〜SEQ ID NO:70を含む群から選択されるアミノ酸配列を有するウイルス由来ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:77、78、79、82、83、84および139を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第1のリンカーペプチド、
(iii)SEQ ID NO:140のアミノ酸配列を有するクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
(iv)SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有するβ2-ミクログロブリン、
(v)SEQ ID NO:77、78、79、82、83および84を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第2のリンカーペプチド、
(vi)SEQ ID NO:73、77、78、79、82、83、84および136を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第3のリンカーペプチド、ならびに
(vii)少なくとも位置11および位置108にあるシステイン残基、ならびに位置11および位置108にあるシステイン残基間のジスルフィド結合
を含む。
‐第1のリンカーペプチドSEQ ID NO:139のアミノ酸配列を有し、かつ/または
‐第2のリンカーペプチドはSEQ ID NO:83のアミノ酸配列を有し、かつ/または
‐第3のリンカーペプチドはSEQ ID NO:136のアミノ酸配列を有する。
(i)SEQ ID NO:01〜SEQ ID NO:70を含む群から選択されるアミノ酸配列を有するウイルス由来ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:77、78、79、82、83、84および139を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第1のリンカーペプチド、
(iii)SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有するか、または1つ〜10つのアミノ酸交換、付加および/もしくは欠失を含むそれらの変異体であるβ2-ミクログロブリン、
(iv)SEQ ID NO:77、78、79、82、83および84を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第2のリンカーペプチド、
(v)SEQ ID NO:140のアミノ酸配列を有するか、または1つ〜10つのアミノ酸交換、付加および/もしくは欠失を含むそれらの変異体である、クラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
(vi)SEQ ID NO:73、77、78、79、82、83、84および136を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第3のリンカーペプチド、ならびに
(vii)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基、ならびに位置11および位置227にあるシステイン残基間のジスルフィド結合
を含むことを特徴とする。
(i)SEQ ID NO:01〜SEQ ID NO:70を含む群から選択されるアミノ酸配列を有するウイルス由来ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:77、78、79、82、83、84および139を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第1のリンカーペプチド、
(iii)クラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3that hasSEQ ID NO:140のアミノ酸配列を有するか、または1つ〜10つのアミノ酸交換、付加および/もしくは欠失を含むそれらの変異体である、
(iv)SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有するか、または1つ〜10つのアミノ酸交換、付加および/もしくは欠失を含むそれらの変異体であるβ2-ミクログロブリン、
(v)SEQ ID NO:77、78、79、82、83および84を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第2のリンカーペプチド、
(vi)SEQ ID NO:73、77、78、79、82、83、84および136を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第3のリンカーペプチド、ならびに
(vii)少なくとも位置11および位置108にあるシステイン残基、ならびに位置11および位置108にあるシステイン残基間のジスルフィド結合
を含むことを特徴とする。
‐互いに独立に、N末端からC末端への方向に、
(i)β2-ミクログロブリン、ならびに
(ii)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)β2-ミクログロブリン、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(iii)β2-ミクログロブリン、
のいずれかを含む、1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11と位置108または位置227とにあるシステイン残基を有し、位置11と位置108または227とにあるシステイン残基がスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%であるかまたはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(iii)相対頻度が1%であるかまたはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)β2-ミクログロブリン
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
(iii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(iii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、位置11および位置108にあるシステイン残基はジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐SEQ ID NO:104〜106から選択されるアミノ酸配列を含む抗体軽鎖可変ドメインおよびSEQ ID NO:108〜110を含む抗体重鎖可変ドメインを含み、黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合する、1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつSEQ ID NO:104〜106を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:108〜110を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含む、1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含む、2つの抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつSEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドの1つである、1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつSEQ ID NO:104〜106を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:108〜110を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドの1つである、1つまたは複数の抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが可変ドメインの1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:104〜106を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:108〜110を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドである、2つの抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが可変ドメインのうち1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドである、2つの抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが重鎖可変ドメインのうち1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つまたは2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドである、2つの抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが重鎖可変ドメインのうち1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐SEQ ID NO:117の1つのポリペプチド鎖、
‐SEQ ID NO:118の1つのポリペプチド鎖、
‐それぞれがSEQ ID NO:119である2つのポリペプチド鎖
を含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成することを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐SEQ ID NO:137の1つのポリペプチド鎖、
‐SEQ ID NO:118の1つのポリペプチド鎖、
‐それぞれがSEQ ID NO:119である2つのポリペプチド鎖
を含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成することを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐SEQ ID NO:117の1つのポリペプチド鎖、
‐SEQ ID NO:118の1つのポリペプチド鎖、
‐それぞれがSEQ ID NO:119である2つのポリペプチド鎖
を含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成することを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐SEQ ID NO:137の1つのポリペプチド鎖、
‐SEQ ID NO:118の1つのポリペプチド鎖、
‐それぞれがSEQ ID NO:119である2つのポリペプチド鎖
を含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成することを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐SEQ ID NO:117の2つのポリペプチド鎖、
‐それぞれがSEQ ID NO:119である2つのポリペプチド鎖
を含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成することを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐SEQ ID NO:137の2つのポリペプチド鎖、
‐それぞれがSEQ ID NO:119である2つのポリペプチド鎖
を含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成することを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐SEQ ID NO:117の2つのポリペプチド鎖、
‐それぞれがSEQ ID NO:119である2つのポリペプチド鎖
を含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成することを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
‐SEQ ID NO:137の2つのポリペプチド鎖、
‐それぞれがSEQ ID NO:119である2つのポリペプチド鎖
を含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成することを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
SEQ ID NO:01〜47 ヒトサイトメガロウイルス由来ペプチド。
SEQ ID NO:48 ヒト免疫不全ウイルス由来ペプチド。
SEQ ID NO:49 ヒトヘルペスウイルス4由来ペプチド。
SEQ ID NO:50 インフルエンザAウイルス由来ペプチド。
SEQ ID NO:51 B型肝炎ウイルス由来ペプチド。
SEQ ID NO:52 ヒトT細胞リンパ親和性ウイルス1型由来ペプチド。
SEQ ID NO:53 V-jun肉腫ウイルス17癌遺伝子ホモログ(JUN)由来ペプチド。
SEQ ID NO:54 ヒトアデノウイルス3型由来ペプチド。
SEQ ID NO:55 C型肝炎ウイルス由来ペプチド。
SEQ ID NO:56〜70 デングウイルス由来ペプチド。
SEQ ID NO:71 ヒトβ2-ミクログロブリンアミノ酸配列。
SEQ ID NO:72 ヒトHLA-A*0201 α1〜α3鎖アミノ酸配列。
SEQ ID NO:73〜84 リンカーペプチドアミノ酸配列。
SEQ ID NO:85 ヒトIgG1 CH2ドメインアミノ酸配列。
SEQ ID NO:86 ヒトIgG1 CH2ドメインアミノ酸配列。
SEQ ID NO:87 ヒトIgG1 Fc領域アミノ酸配列。
SEQ ID NO:88 ヒトIgG1 Fc領域L234A、L235A突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:89 ヒトIgG1 Fc領域T366S、L368A、Y407V突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:90 ヒトIgG1 Fc領域T366W突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:91 ヒトIgG1 Fc領域L234A、L235A、T366S、L368A、Y407V突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:92 ヒトIgG1 Fc領域L234A、L235A、T366W突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:93 ヒトIgG1 Fc領域P329G突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:94 ヒトIgG1 Fc領域L234A、L235A、P329G突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:95 ヒトIgG1 Fc領域P329G、T366S、L368A、Y407V突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:96 ヒトIgG1 Fc領域P329G、T366W突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:97 ヒトIgG1 Fc領域L234A、L235A、P329G、T366S、L368A、Y407V突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:98 ヒトIgG1 Fc領域L234A、L235A、P329G、T366W突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:99 ヒトIgG4 Fc領域アミノ酸配列。
SEQ ID NO:100 ヒトIgG4 Fc領域S228P、L235E突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:101 ヒトIgG4 Fc領域S228P、L235E、P329G突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:102 ヒトIgG4 Fc領域S228P、L235E、P329G、T366S、L368A、Y407V突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:103 ヒトIgG4 Fc領域S228P、L235E、P329G、T366W突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:104 HVR-L1
SEQ ID NO:105 HVR-L2
SEQ ID NO:106 HVR-L3
SEQ ID NO:107 HVR-L1
SEQ ID NO:108 HVR-H1
SEQ ID NO:109 HVR-H2
SEQ ID NO:110 HVR-H3
SEQ ID NO:111 HVR-H1
SEQ ID NO:112 HVR-H2
SEQ ID NO:113 VL
SEQ ID NO:114 VH
SEQ ID NO:115 VL
SEQ ID NO:116 VH
SEQ ID NO:117 MHC-I-VH(MCSP)-IgG1 Fc領域L234A、L235A、P329G、T366S、L368A、Y407V突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:118 VH(MCSP)-IgG1 Fc領域L234A、L235A、P329G、T366W突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:119 VL(MCSP)-CLアミノ酸配列。
SEQ ID NO:120 ヒト化抗IGF-1Rモノクローナル軽鎖抗体アミノ酸配列(κ)。
SEQ ID NO:121 ヒト化抗IGF-1Rモノクローナル重鎖抗体アミノ酸配列(IgG1 L234A、L235A突然変異体)。
SEQ ID NO:122 ヒト化抗IGF-1Rモノクローナル重鎖抗体アミノ酸配列(IgG1 L234A、L235A突然変異体およびknob変異体)。
SEQ ID NO:123 ヒト化抗IGF-1Rモノクローナル重鎖抗体アミノ酸配列(IgG1 L234A、L235A突然変異体およびhole変異体)。
SEQ ID NO:124 ヒトIgG1 Fc領域突然変異型ヒンジ領域およびL234A、L235A突然変異体およびknob変異体。
SEQ ID NO:125 ヒト化抗IGF-1Rモノクローナル抗体のジスルフィドで安定化された単鎖Fv。
SEQ ID NO:126 マウス抗MCSPモノクローナル軽鎖抗体アミノ酸配列(κ)。
SEQ ID NO:127 ヒト化抗MCSPモノクローナル軽鎖抗体アミノ酸配列(κ)。
SEQ ID NO:128 マウス抗MCSPモノクローナル重鎖抗体アミノ酸配列(IgG1 L234A、L235A突然変異体)。
SEQ ID NO:129 ヒト化抗MCSPモノクローナル重鎖抗体アミノ酸配列(IgG1 L234A、L235A突然変異体)。
SEQ ID NO:130 マウス抗MCSPモノクローナル重鎖抗体アミノ酸配列(IgG1 L234A、L235A突然変異体およびknob変異体)。
SEQ ID NO:131 ヒト化抗MCSPモノクローナル重鎖抗体アミノ酸配列(IgG1 L234A、L235A突然変異体およびknob変異体)。
SEQ ID NO:132 マウス抗MCSPモノクローナル重鎖抗体アミノ酸配列(IgG1 L234A、L235A突然変異体およびhole変異体)。
SEQ ID NO:133 ヒト化抗MCSPモノクローナル重鎖抗体アミノ酸配列(IgG1 L234A、L235A突然変異体およびhole変異体)。
SEQ ID NO:134 マウス抗MCSPモノクローナル抗体のジスルフィドで安定化された単鎖Fv。
SEQ ID NO:135 ヒト化抗MCSPモノクローナル抗体のジスルフィドで安定化された単鎖Fv。
SEQ ID NO:136 リンカーペプチド13。
SEQ ID NO:137 ジスルフィドで安定化されたMHC-I-VH(MCSP)-IgG1 Fc領域L234A、L235A、P329G、T366S、L368A、Y407V突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:138 ヒトMCSPのアミノ酸配列。
SEQ ID NO:139 ジスルフィド結合型多機能タンパク質用のリンカー。
SEQ ID NO:140 ジスルフィド結合型多機能タンパク質用の改変されたヒトHLA-A*0201 α1〜α3鎖アミノ酸配列。
SEQ ID NO:141 VH(MCSP)-IgG1 Fc領域L234A、L235A、P329G、T366S、L368A、Y407V突然変異型アミノ酸配列。
SEQ ID NO:142 VH(MCSP)-IgG1 Fc領域L234A、L235A、P329G、T366W突然変異型アミノ酸配列。
「親和性」とは、分子(例えば、抗体)の単一の結合部位とその結合パートナー(例えば、抗原)との間の非共有結合性相互作用の強さの総和のことを指す。別に指示する場合を除き、本明細書で用いる場合、「結合親和性」とは、結合ペアのメンバー(例えば、抗体および抗原)の間の1:1の相互作用を反映する固有の結合親和性のことを指す。分子XのそのパートナーYに対する親和性は、一般に、解離定数(Kd)によって表すことができる。親和性は、本明細書に記載されるものを含む、当技術分野において公知の一般的な方法によって測定することができる。結合親和性を測定するための具体的で説明的な態様および例示的な態様は、以下に記載される。
A.例示的なジスルフィド結合型多価多機能タンパク質
本明細書では、標的抗原と特異的に結合する抗体由来部分を第1の部分として含み、かつ、ウイルス由来ペプチドがMHCクラスIタンパク質複合体と連結したものを第2の部分として含む、抗原結合ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質について報告する。
(i)高度に特異的なT細胞集団のみが活性化され(ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質のMHC-Iタンパク質複合体内に提示された単一のウイルス由来ペプチドに対して特異的なCD8陽性エフェクター/メモリー細胞)、他のすべてのCD3+細胞は影響を受けない(CD4+ T細胞:TH1、TH2、TH17、調節性T細胞);
(ii)個体の免疫系の自然な応答が模倣される(ウイルス感染細胞の正常な除去);かつ
(iii)ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質の/による適用/治療に対する応答は最初は低いと考えられるが、治療の間に強化され(特異的T細胞が活性化されて、数が増えると考えられる)、それにより、初期注入反応および初期サイトカイン放出を軽減することができる。
‐1つ、2つまたはそれを上回る抗原提示ドメイン、
‐1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含み、
抗原提示ドメインが、互いに独立に、N末端からC末端への方向に、
(i)β2-ミクログロブリン、ならびに
(ii)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)β2-ミクログロブリン、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(iii)β2-ミクログロブリン、
のいずれかを含み、
抗原結合部位が癌細胞表面抗原と結合し、
抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する
ことを特徴とする、抗原結合性のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。
(i)SEQ ID NO:01のアミノ酸配列を有するウイルス由来ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:139のアミノ酸配列を有する第1のリンカーペプチド、
(iii)SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有するβ2-ミクログロブリン、
(iv)SEQ ID NO:83のアミノ酸配列を有する第2のリンカーペプチド、
(v)SEQ ID NO:140のアミノ酸配列を有するクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
(vi)SEQ ID NO:136のアミノ酸配列を有する第3のリンカーペプチド、ならびに
(vii)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基であって、位置11および位置227にあるものがジスルフィド結合を形成するシステイン残基
を含むことを特徴とする。
(i)SEQ ID NO:01のアミノ酸配列を有するウイルス由来ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:139のアミノ酸配列を有する第1のリンカーペプチド、
(iii)SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有するβ2-ミクログロブリン、
(iv)SEQ ID NO:83のアミノ酸配列を有する第2のリンカーペプチド、
(v)SEQ ID NO:140のアミノ酸配列を有するクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
(vi)SEQ ID NO:136のアミノ酸配列を有する第3のリンカーペプチド、ならびに
(vii)少なくとも位置11および位置108にあるシステイン残基であって、位置11および位置108にあるものがジスルフィド結合を形成するシステイン残基
を含むことを特徴とする。
ある態様において、本明細書において提供されるジスルフィド結合型多価多機能タンパク質は、抗体に由来する抗原結合部位、例えば、抗体可変ドメインのペアまたは単一ドメイン抗体を含む。ある態様において、抗原結合部位は、その抗原に対して、≦10nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nM、または≦0.001nMの解離定数(Kd)を有する(例えば、10-8Mまたはそれ未満、例えば、10-8M〜10-13M、例えば、10-9M〜10-13Mなど)。
HEK 293細胞およびCHO細胞における種々の非ジスルフィド結合型二価多機能タンパク質(異なるリンカー、HLAとβ2-ミクログロブリンの異なる組み合わせ)の発現は、検出可能であった場合でも、小胞体における非ジスルフィド結合型二価多機能タンパク質の蓄積をもたらし、すなわち、非ジスルフィド結合型二価多機能タンパク質の単離および分泌は、検出可能であった場合でも、著しく損なわれていた。
ある態様においては、本明細書において提供されるジスルフィド結合型多価多機能タンパク質のアミノ酸配列変異体を想定している。例えば、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質の結合親和性および/または他の生物学的特性を改善することが望ましい場合がある。ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質のアミノ酸配列変異体は、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質のポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列に適切な改変を導入することによって、またはペプチド合成によって調製することができる。そのような改変には、例えば、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質のポリペプチドのアミノ酸配列における残基の欠失、および/または挿入、および/または置換が含まれる。最終的な構築物が所望の特徴、例えば抗原結合性を有していることを条件として、最終的な構築物に到達するために欠失、挿入および置換の任意の組み合わせを加えることができる。
ある態様においては、ポリペプチド鎖の1つまたは複数に1つまたは複数のアミノ酸置換を有するジスルフィド結合型多価多機能タンパク質変異体が提供される。例示的な変化は、「例示的な置換」の見出しが付いた以下の表に提示されているほか、アミノ酸側鎖クラスに言及して以下にさらに説明している。保存的置換は、以下の表の「好ましい置換」の見出しの下に示されている。アミノ酸置換を関心対象のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質に導入して、その産物を所望の活性、例えば抗原結合の保持/改善、免疫原性低下、またはADCCもしくはCDCの改善についてスクリーニングすることができる。
(1)疎水性:ノルロイシン、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3)酸性:Asp、Glu;
(4)塩基性:His、Lys、Arg;
(5)鎖の配向に影響する残基:Gly、Pro;
(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
ある態様において、本明細書において提供されるジスルフィド結合型多価多機能タンパク質の1つまたは複数のポリペプチドは、ポリペプチドがグリコシル化される程度が増加または減少するように改変することができる。ポリペプチドへのグリコシル化部位の付加または欠失は、1つまたは複数のグリコシル化部位が作出または除去されるようにアミノ酸配列を変えることによって好都合に実現することができる。
ある態様においては、1つまたは複数のアミノ酸改変を、本明細書において提供されるジスルフィド結合型多価多機能タンパク質のFc領域に導入することができ、それによってFc領域変異体を作製することができる。Fc領域変異体は、1つまたは複数のアミノ酸位置に、アミノ酸修飾(例えば、置換)を含むヒトFc領域の配列(例えば、ヒトIgG1、IgG2、IgG3またはIgG4のFc領域)を含みうる。
本明細書において報告されるジスルフィド結合型多価多機能タンパク質は、例えば、US 4,816,567号に記載されているように、組換え方法および組成物を用いて作製することができる。1つの態様においては、本明細書において記載されるジスルフィド結合型多価多機能タンパク質のポリペプチドをコードする単離された核酸が提供される。1つのさらなる態様においては、そのような核酸を含む1つまたは複数のベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。さらなる態様においては、そのような核酸を含む宿主細胞が提供される。1つの態様において、宿主細胞は以下のものを含む(例えば、以下のものによって形質転換されている):(1)抗体のVLを含むアミノ酸配列および抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含むベクター、または(2)抗体のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第1のベクターおよび抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第2のベクター。1つの態様において、宿主細胞は、真核細胞、例えばチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞またはリンパ系細胞(例えば、Y0、NS0、Sp2/0細胞)である。1つの態様においては、本明細書において報告されるジスルフィド結合型多価多機能タンパク質を作製する方法であって、上記に提供されたような、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質のポリペプチドをコードする核酸を含む宿主細胞を、ポリペプチドの発現およびジスルフィド結合型多価多機能タンパク質の形成に適した条件下で培養する段階、ならびに任意で宿主細胞(または宿主細胞培養培地)からジスルフィド結合型多価多機能タンパク質を回収する段階を含む方法が提供される。
本明細書において記載されるジスルフィド結合型多価多機能タンパク質の医薬製剤は、所望の程度の純度を有するそのようなジスルフィド結合型多価多機能タンパク質と、1つまたは複数の任意の薬学的に許容される担体(Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th edition, Osol, A. (ed.) (1980))とを、凍結乾燥製剤または水性溶液の形態として混合することによって調製される。薬学的に許容される担体は、使用される投与量および濃度でレシピエントに対して毒性がなく、これには以下のものが非限定的に含まれる:リン酸塩、クエン酸塩および他の有機酸などの緩衝液;アスコルビン酸およびメチオニンを含む抗酸化剤;保存料(例えば、オクタデシルジメチオルベンジルアンモニウムクロライド;ヘキサメトニウムクロライド;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチルまたはベンジルアルコール;アルキルパラベン、例えばメチルまたはプロピルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾール);低分子量(約10残基未満の)ポリペプチド;タンパク質、例えば、血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリンなど;親水性ポリマー、例えば、ポリ(ビニルピロリドン)など;アミノ酸、例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニンまたはリジンなど;単糖類、二糖類、およびグルコース、マンノースまたはデキストリンを含む他の糖質;キレート剤、例えば、EDTAなど;糖、例えば、スクロース、マンニトール、トレハロースまたはソルビトールなど;塩形成対イオン、例えば、ナトリウムなど;金属錯体(例えば、Zn-タンパク質錯体);および/または非イオン性界面活性剤、例えばポリエチレングリコール(PEG)など。本明細書における、例示的な薬学的に許容される担体には、介在性薬物分散剤、例えば、水溶性の中性活性ヒアルロニダーゼ糖タンパク質(sHASEGP)、例えば、rhuPH20(HYLENEX(登録商標)、Baxter International, Inc.)などのヒト可溶性PH-20ヒアルロニダーゼ糖タンパク質がさらに含まれる。rhuPH20を含む、ある種の例示的なsHASEGPおよび使用方法は、US 2005/0260186号およびUS 2006/0104968号に記載されている。1つの局面において、sHASEGPは、コンドロイチナーゼなどの1つまたは複数の追加のグルコサミノグリカンと組み合わされる。
本明細書において提供されるジスルフィド結合型多価多機能タンパク質の任意のものを、治療方法に用いることができる。
本発明のもう1つの局面においては、上記の障害の治療、予防および/または診断のために有用な物質を含む製造品が提供される。製造品は、容器、および容器上にあるかまたは容器に付属するラベルまたは添付文書を含む。適した容器には、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、IV輸液バッグなどが含まれる。容器はガラスまたはプラスチックなどのさまざまな物質でできていてよい。容器は、単独で、または他の組成物と併用されることで疾患の治療、予防および/または診断に有効な化合物を収容し、さらに無菌のアクセスポートを有してもよい(例えば、容器は皮下注射針による穴あきストッパーを有する静脈内溶液バッグまたはバイアルであってよい)。組成物中の少なくとも1つの有効薬剤は、本発明のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質である。ラベルまたは添付文書は、組成物が特定の病状を治療するために用いられることを指し示している。さらに、製造品は、(a)本発明の多機能タンパク質を含有する組成物を内部収容する第1の容器;および(b)細胞傷害性物質または別の治療薬を含有する組成物を内部に収容する第2の容器を含みうる。本発明のこの態様における製造品は、組成物が特定の病状を治療するために用いうることを示す添付文書をさらに含んでもよい。代替的または追加的に、製造品は、薬学的に許容される緩衝液、例えば注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝化塩水、リンゲル液およびデキストロース溶液を含む第2(または第3)の容器をさらに含んでもよい。これは、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針およびシリンジを含む、商業的および使用者の立場から望まれる他の物質をさらに含んでもよい。
1.‐2つまたはそれを上回る抗原提示ドメイン、
‐1つの抗体Fc領域、および
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含み、
抗原提示ドメインのそれぞれが、互いに独立に、N末端からC末端への方向に、
(i)β2-ミクログロブリン、ならびに
(ii)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)β2-ミクログロブリン、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(iii)β2-ミクログロブリン、
のいずれかを含み、
1つまたは複数の抗原結合部位が癌細胞表面抗原またはウイルス感染細胞表面抗原と結合し、かつ
抗原提示ドメインの1つまたは複数が少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する
ことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
‐1つの抗体Fc領域、および
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含み、
抗原提示ドメインが、N末端からC末端への方向に、
(i)β2-ミクログロブリン、ならびに
(ii)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)β2-ミクログロブリン、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(iii)β2-ミクログロブリン、
のいずれかを含み、
1つまたは複数の抗原結合部位が癌細胞表面抗原またはウイルス感染細胞表面抗原と結合し、かつ
抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する
ことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
‐欧州出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*0101、HLA-A*0201、HLA-A*0301、HLA-B*0702、HLA-B*0801、HLA-B*4402、HLA-C*0401、HLA-C*0501、HLA-C*0701およびHLA-C*0702を含む群から選択され、
‐オーストラリア出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*0201、HLA-A*1101、HLA-A*2402、HLA-A*340101、HLA-B*1301、HLA-B*1521、HLA-B*5601、HLA-B*5602、HLA-C*0102、HLA-C*0401、HLA-C*0403およびHLA-C*1502を含む群から選択され、
‐北米出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*0201、HLA-A*2402、HLA-C*0202、HLA-C*0304、HLA-C*0401およびHLA-C*0702を含む群から選択され、そして
‐東南アジア出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*1101、HLA-A*2402、HLA-B*1504、HLA-C*0102、HLA-C*0304、HLA-C*0702およびHLA-C*0801を含む群から選択される。
‐欧州出身の個体の場合、クラスI MHC分子はHLA-A*0201であり、
‐オーストラリア出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*2402、HLA-B*1301、HLA-C*0102およびHLA-C*0401を含む群から選択され、
‐北米出身の個体の場合、クラスI MHC分子は、HLA-A*2402およびHLA-C*0304を含む群から選択され、そして
‐東南アジア出身の個体の場合、クラスI MHC分子はHLA-A*2402である。
(i)ウイルス由来ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、
(iii)可溶性HLA-AアレルA*0201、ならびに
(iv)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基であって、位置11および位置227にあるものがジスルフィド結合を形成するシステイン残基、もしくは少なくとも位置11および位置108にあるシステイン残基であって、位置11および位置108にあるものがジスルフィド結合を形成するシステイン残基、
または
(i)ウイルス由来ペプチド、
(ii)可溶性HLA-AアレルA*0201、
(iii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iv)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基であって、位置11および位置227にあるものがジスルフィド結合を形成するシステイン残基、もしくは少なくとも位置11および位置108にあるシステイン残基であって、位置11および位置108にあるものがジスルフィド結合を形成するシステイン残基
を含むことを特徴とする、項目1〜16のいずれか一項記載の多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01〜SEQ ID NO:70を含む群から選択されるアミノ酸配列を有するウイルス由来ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:77、78、79、82、83、84および139を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第1のリンカーペプチド、
(iii)SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有するβ2-ミクログロブリン、
(iv)SEQ ID NO:77、78、79、82、83および84を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第2のリンカーペプチド、
(v)SEQ ID NO:140のアミノ酸配列を有するクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
(vi)SEQ ID NO:73、77、78、79、82、83、84および136を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第3のリンカーペプチド、ならびに
(vii)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基であって、位置11および位置227にあるものがジスルフィド結合を形成するシステイン残基、
を含むことを特徴とする、項目1〜19のいずれか一項記載の多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01〜SEQ ID NO:70を含む群から選択されるアミノ酸配列を有するウイルス由来ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:77、78、79、82、83、84および139を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第1のリンカーペプチド、
(iii)SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有するか、または1つ〜10つのアミノ酸交換、付加および/もしくは欠失を含むそれらの変異体であるβ2-ミクログロブリン、
(iv)SEQ ID NO:77、78、79、82、83および84を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第2のリンカーペプチド、
(v)SEQ ID NO:140のアミノ酸配列を有するか、または1つ〜10つのアミノ酸交換、付加および/もしくは欠失を含むそれらの変異体である、クラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
(vi)SEQ ID NO:73、77、78、79、82、83、84、136を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第3のリンカーペプチド、ならびに
(vii)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基であって、位置11および位置227にあるものがジスルフィド結合を形成するシステイン残基、
を含むことを特徴とすることを特徴とする、項目1〜20のいずれか一項記載の多機能タンパク質。
‐第2のリンカーペプチドがSEQ ID NO:83のアミノ酸配列を有すること、および/または
‐第3のリンカーペプチドがSEQ ID NO:136のアミノ酸配列を有すること、
を特徴とする、項目21記載の多機能タンパク質。
(i)β2-ミクログロブリン、ならびに
(ii)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)β2-ミクログロブリン、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(iii)β2-ミクログロブリン
のいずれかを含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%であるかまたはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐SEQ ID NO:104〜106を含む抗体軽鎖可変ドメインおよびSEQ ID NO:108〜110を含む抗体重鎖可変ドメインを含み、黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合する、1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつSEQ ID NO:104〜106を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:108〜110を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含む、1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含む、2つの抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつSEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドの1つである、1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつSEQ ID NO:104〜106を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:108〜110を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドの1つである、1つまたは複数の抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが可変ドメインの1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:104〜106を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:108〜110を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドである、2つの抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが可変ドメインの1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドである、2つの抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが重鎖可変ドメインのうち1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む2つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドである、2つの抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが重鎖可変ドメインのうち1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
‐SEQ ID NO:118の1つのポリペプチド鎖、
‐それぞれがSEQ ID NO:119である2つのポリペプチド鎖
を含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成することを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク。
‐それぞれがSEQ ID NO:119である2つのポリペプチド鎖
を含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成することを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)β2-ミクログロブリン、ならびに
(ii)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)β2-ミクログロブリン、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)相対頻度が1%であるかもしくはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(iii)β2-ミクログロブリン、
のいずれかを含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%であるかまたはそれを上回るクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐SEQ ID NO:104〜106を含む抗体軽鎖可変ドメインおよびSEQ ID NO:108〜110を含む抗体重鎖可変ドメインを含み、かつ黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合する、1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつSEQ ID NO:104〜106を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:108〜110を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含む、1つまたは複数の抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含む、2つの抗原結合部位
を含むことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつSEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含む、1つまたは複数の抗原結合部位
を含み、抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドの1つであることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつ、SEQ ID NO:104〜106を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:108〜110を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドの1つである、1つまたは複数の抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが可変ドメインの1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:104〜106を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:108〜110を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドである、2つの抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが可変ドメインの1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:97のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:98のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの抗体Fc領域、ならびに
‐黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドである、2つの抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが重鎖可変ドメインのうち1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
(i)SEQ ID NO:01のT細胞応答誘発ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:71のβ2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)SEQ ID NO:72のクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3
を含む1つの抗原提示ドメインであって、少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、またはシステイン残基が少なくとも位置11および位置108にあって、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する抗原提示ドメイン、
‐2つのジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、そのうち第1のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:102のアミノ酸配列を有し、第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドがSEQ ID NO:103のアミノ酸配列を有する、厳密に1つの‐抗体Fc領域、ならびに
黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)と特異的に結合し、かつそれぞれが、SEQ ID NO:105〜107を含む可変ドメインを有する抗体軽鎖およびSEQ ID NO:110〜112を含む可変ドメインを有する抗体重鎖を含み、ここで抗体重鎖のFc領域がジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドである、2つの抗原結合部位
を含み、抗原提示ドメインが重鎖可変ドメインのうち1つのN末端と連結していることを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
‐項目76記載の核酸を含む真核細胞を培養する段階、および
‐ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質を細胞または培養培地から回収する段階、
を含み、
ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質が、β2-ミクログロブリンならびにクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3を含む、ちょうど2つまたはそれを上回る抗原提示ドメインを含み、抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、または抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する、方法。
以下は、本発明の方法および組成物の例である。上記提供される一般的な説明を前提として、他のさまざまな態様が実施され得ることが理解される。
ヒトドナーからのCMV特異的CD8陽性T細胞の単離および刺激のための手順
PBLの単離
PBLは、ヒトドナー血液(Greiner bio-one、カタログ番号227290)からFicoll勾配遠心分離によって単離した。PBLを、5%ヒト血清(Sigma カタログ番号H2520)、2mM L-グルタミン(PAN Biotech、カタログ番号P04-80100)、100μg/mlペニシリン/ストレプトマイシン(Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Germany、カタログ番号14001100)を加えたRPMI中で培養した。
細胞(2×107個/ml)を、50μg/mlのCMV pp65由来ペプチド(SEQ ID NO:01)を加えた細胞培養培地中で、細胞培養条件下(37℃、5% CO2、湿度80%)で2時間培養した。その後、細胞懸濁液を培養培地で20倍希釈し、96ウェル当たり細胞2×105個の播種密度で、平底96ウェルプレート中で培養した。4〜5日後に、20U/mlのIL-2(Roche、カタログ番号11011456001)、25ng/mlのIL-7(Peprotech、カタログ番号200-01)および25ng/mlのIL-15(Peprotech、カタログ番号200-15)を添加し、細胞をさらに7〜8日間培養した。T細胞の刺激は、顕微鏡下で細胞クラスターとして視認しうる。
T細胞を、ペプチドでパルス刺激した同じドナーの自己一次PBL(新たに調製するか、または凍結ストックから得るかのいずれか)である刺激細胞とともに共培養した。刺激細胞を、上記のようにペプチドでパルス刺激した。ペプチドとのインキュベーションの2時間後に、PBLに放射線照射を行い(4000ラド;STS GmbH OB29 Nr.9510-5)、ペプチドを含まない培養培地中で2回洗浄した。再刺激は、96ウェルプレート丸底プレート中で行った。96ウェル当たり8×104〜1×105個の刺激細胞を用いた。初代培養物からの細胞を培養培地で2回洗浄し、200μlの培養培地中に再懸濁させて、80μlを刺激細胞の各ウェルに移した。3日後に、20U/mlのIL-2、25ng/mlのIL-7および25ng/mlのIL-15を添加した。細胞は増殖し、2〜3日毎に新鮮な培地を入れた新しいウェル中で増殖させた。
細胞をCD8発現(BD、カタログ番号345772)およびCMV特異的T細胞受容体(ProImmune、カタログ番号F008-4A-E)に関して染色し、FACSで分析した。
RPMI1640(PAN Biotech、カタログ番号P04-17500)、5%ヒト血清(HS;Sigma カタログ番号H2520)、2mM L-グルタミン(PAN Biotech、カタログ番号P04-80100)、100μg/mlペニシリン/ストレプトマイシン(Roche Diagnostics GmbH, Mannheim, Germany、カタログ番号14001100)。
末梢血リンパ球(PBL)に由来する4人のヒトドナーのFACS分析を行った。CMV由来ペプチド(NLVPMVATV(SEQ ID NO:01))が負荷された、T細胞受容体(TCR)を認識するMHC-クラスI(HLA-A*0201)を担持するT細胞を染色するために、細胞を、APC結合Pro5五量体(ProImmune、カタログ番号F008-4A-E)と組み合わされたFITC結合抗CD8抗体(BD、カタログ番号345772)で標識した。結果については図4を参照されたい。第0日に、ドナー1および4は少数のCMV特異的CD8T細胞を保有している(それぞれ0.08%および0.1%)。ドナー2および3は、より多くのCMV特異的CD8T細胞を末梢血中に保有している(それぞれ0.25%および3.12%)。CMV由来ペプチドでパルス刺激した自己細胞による刺激の14日後には、ドナー2および3のみがCMV特異的CD8T細胞の有意な増加を示し(それぞれ6.2%および71.2%)、一方、ドナー1および4はCMV特異的CD8T細胞数の増加を示していない(それぞれ0.01%および0.05%)。CMV由来ペプチドでパルス刺激した自己細胞による二次刺激の14日後、ドナー2および3はCMV特異的CD8T細胞の増加を示している(それぞれ15.1%および96.6%)。
細胞傷害性アッセイ
急性リンパ芽球性白血病細胞MN60は、A*0201 HLA-Aアレルを保有する。MN60細胞(1×106個/ml)を、50μg/mlのCMV pp65ペプチド(SEQ ID NO:01)とともに細胞培養条件下(37℃、5% CO2、湿度80%)で45分間インキュベートした。インキュベーションにより、HLA-A*0201ペプチド結合溝においてペプチド交換が生じる。ペプチド交換したMN60細胞を遠心分離して、PBS(PanBiotech、カタログ番号P04-36500)で1×106個/mlの密度に希釈し、1μMの細胞トレーサーカルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル(CFSE, Invitrogen、カタログ番号34554)によって室温(RT)で15分間染色した。細胞をその後にPBSで1回洗浄し、AIM-V培地(Gibco、カタログ番号0870112DK)で1×105個/mlに希釈した。アッセイのために、MN60細胞(標的細胞)を96ウェル丸底プレート中で、CMV特異的ヒトドナー3由来のCD8+ T細胞(エフェクター細胞、実施例1を参照)とともに細胞培養条件下で4時間共培養した。エフェクター対標的細胞比は4:1であった。死滅細胞を1μl/100μlのヨウ化プロピジウム(PI、Sigma、カタログ番号P-4864)で染色し、FACSで分析した。
CMVペプチドを負荷されたMN60腫瘍細胞の溶解を通じての、刺激されたCTLの細胞溶解能力を分析するためにフローサイトメトリー分析を行った。
DNAの調製、トランスフェクション、発現、精製および分析
DNAの調製
細菌の一晩LB培養液250mlを採集し、プラスミドDNAを、製造元のプロトコールに従って抽出した(High speed Maxi kit, Qiagen、カタログ番号12663)。得られたプラスミドDNAを1mlのTE緩衝液中に溶出させ、DNA濃度を分光光度測定によって測定した(Epoch, BioTek)。
‐エンドヌクレアーゼ制限部位HindIII、NheI、
‐CMV-プロモーター、
‐5'UTR 1(ヒトCMVに由来)、
‐イントロンA、
‐5'UTR 2、
‐アンピシリン耐性遺伝子、
‐BGHポリA部位(ウシ成長ホルモンポリアデニル化シグナル)、
‐pUC Ori。
HEK 293細胞を、トランスフェクションの前日に8×105個/mlに希釈した。約1〜1.6×106個/mlを、製造元のプロトコールに従ってトランスフェクトした。30mlの最終トランスフェクション容積に対して、30μgのDNAをOpti-MEM(登録商標)I還元型血清培地(Gibco、カタログ番号31985070)で最終容積1mlに希釈した。1μgのDNA当たり2μlの293fectin(商標)試薬(Invitrogen、カタログ番号12347019)をOpti-MEM(登録商標)培地で1mlの最終容積に均等に希釈し、5分間インキュベートした。インキュベーションの後、希釈したDNAを、希釈した293fectin(商標)試薬に添加し、穏やかに混合し、さらに20〜30分間インキュベートし、その後、28mlのHEK293細胞に滴下ピペッティングして、30mlの最終容積を得た。細胞を、125rpmで回転するオービタルシェーカーで細胞培養条件下(37℃、8% CO2、湿度80%)でインキュベートし、72時間後に採集した。採集物を1000rpmで10分間、3000rpmで10分間遠心分離し、22μmの滅菌フィルターを通して濾過した(Millipore、カタログ番号SCGPU05RE)。
細胞培養上清の500μlを、Pall Nanosep Omega-Membrane 30KD遠心分離デバイス(Pall、カタログ番号OD030C33)を用いて50μlの容積に濃縮した。各濃度の17.5μlを、4×XT試料緩衝液(Bio Rad、カタログ番号161-0791)および20×XT還元剤(BioRad、カタログ番号161-0792)で最終容積25μlに希釈し、96℃で8分間加熱し、4〜12%のCriterion XTプレキャストゲル(カタログ番号345-0124)に対して適用した。ブロット法は、Trans-blot Pureニトロセルロース膜(0.45μm)(BioRad、カタログ番号162-0117)上で、20Vで30分間、Trans-Blot SDセミドライトランスファーセル(BioRad)を用いて行った。膜のブロッキングは、室温で1時間、1×ウエスタンブロッキング試薬(Roche、カタログ番号11921681001)を用いて行った。染色は、室温で1時間、ペルオキシダーゼ結合ポリクローナルウサギ抗ヒトκ軽鎖(DAKO、カタログ番号P0129、1:3000に希釈)およびポリクローナルウサギ抗ヒトIgG抗体HRPコンジュゲート(DAKO、カタログ番号P0214、1:5000に希釈)を用いて行った。発光検出はLUMI-イメージャF1(Roche)を用いて行った。
細胞を遠心分離によって培地から除去した。多機能タンパク質を、プロテインAアフィニティークロマトグラフィー(AKTA-Avant上のMabSelectセファロース)によって上清から精製した。溶出された多機能タンパク質を、Amicon遠心管を用いて3mg/mlのタンパク質濃度に濃縮した。アリコートを、サイズ排除クロマトグラフィーにて分析した(HPLC TSKgel GFC300 Sys89)。凝集物を除去するために、Superdex 200上で調製用SECを行い、20mMヒスチジン、140mM NaCl、pH6.0中に融合タンパク質をバッファリングした。溶出された多機能タンパク質を、Amicon遠心管を用いて1mg/mlのタンパク質濃度に濃縮し、滅菌濾過した(孔径0.2μm)。
多機能タンパク質の試料を、UV分光光度計を用いてOD280により分析し、溶液中のタンパク質濃度を決定した。このために必要な吸光係数は、Paceによるアミノ酸配列から計算した(Pace, et al., Protein Science 4 (1995) 2411-2423)。試料中の単量体性の凝集して分解した種の含有量を決定するために、サイズ排除クロマトグラフィー(SE-HPLC)を、移動相として0.25MのKCl、pH 7.0を含む0.2Mのリン酸カリウム緩衝液を用いて、TSK-Gel300SWXLまたはスーパーデックス200カラムで行った。ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)ポリアクリルアミドゲル電気泳動(還元および非還元)を、生成物関連の分解生成物および無関係な不純物に関して、多機能タンパク質製剤の純度を分析するために実施した。各鎖の正確な質量/実体を確認し、化学的修飾を検出するために、エレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI-MS)を、還元された試料(TCEP)および脱グリコシル化した試料(N-グリコシダーゼF)を用いて行った。完全に構築されたタンパク質の性状および質を分析し、生成物に関連する潜在的な副生成物を検出するために、脱グリコシル化された試料のESI-MSを行った。
デバイス:Invitrogen XCell Sure Lock Mini-Cell
ゲル:4〜20%トリス-グリシンゲル、Invitrogen EC6025BOX
緩衝液:トリス-グリシンSDS泳動緩衝液(10×)、Invitrogen LC2675-5
試料緩衝液:トリス-グリシンSDS泳動緩衝液(2×)、Invitrogen LC2676
還元緩衝液:NuPAGE試料還元剤(10×)、Invitrogen NP0004
分子量マーカー:マーク12、分子量標準、Invitrogen LC5677
試料を緩衝液により1mg/mlのタンパク質濃度に調整した。試料の還元のために以下の手順を行った:
‐還元緩衝液:4mlの試料緩衝液(2×)および1mlの還元緩衝液(10x)
‐試料を1:1に還元緩衝液で希釈する
‐70℃で5分間インキュベートする
ヒトIGF-1R陽性細胞株に対するMHC-I-抗IGF-1R多機能タンパク質の結合
H460M2細胞を、AIM-V培地中で8×105個/mlに希釈した(Gibco、カタログ番号0870112DK)。細胞懸濁液の500μlを、本明細書において報告される10μgのMHC-I-抗IGF-1R多機能タンパク質により、4℃または37℃のいずれかで1時間染色した。その後、細胞を氷冷AIM-V培地で1回洗浄し、R-PEとコンジュゲートさせたヤギF(ab')2抗ヒトIgG(H+L)抗体である(Dianova、カタログ番号109-116-088、希釈1:50)第2の抗体により、4℃で30分間染色した。その後、細胞を氷冷AIM-V培地で1回洗浄し、生細胞をゲーティングしてFACS Canto II(BD Bioscience)を介して蛍光を測定した。二重特異性抗体をアイソタイプ対照としての役割を果たし、抗IGF-1R抗体(例えば、WO 2004/087756号およびWO 2007/115814号を参照)は陽性対照としての役割を果たした。
PE-蛍光測定のシフト(X軸)を考慮すると、MHC-I-抗IGF-1R多機能タンパク質は、対照抗体と比較してH460M2標的細胞との結合の点では視認しうる違いを示さない。また、MHC-I-抗IGF-1R多機能タンパク質とのインキュベーションを4℃または37℃のいずれで行うかに関しても違いはみられない。アイソタイプ対照とのインキュベーションも、蛍光標識した二次抗体のみとのインキュベーションのいずれも、PEの蛍光測定にいかなるシフトをも示さない。クラスIのMHC分子の融合にもかかわらず、本明細書におけるMHC-I-抗IGF-1R多機能タンパク質の抗体可変ドメインは依然としてH460M2標的細胞と結合する。
抗原発現細胞のインビトロでの除去
I24標的細胞(1x105個/ml)を、WillCoガラスボトムディッシュ(FA. WillCo Wells BV, REF GWST-3522)上に、細胞培養培地(2mMのL-グルタミン、1mMのピルビン酸ナトリウム、0.1mMのNEAA、および10%(v/w)FCSを加えたRPMI 1640)中にて24〜48時間にわたって播種した。WillCoガラスボトムディッシュは、ディッシュ当たり50μg/mlのポリ-L-リジン塩酸塩(Sigma Aldrich、カタログ番号P2658)によってあらかじめ30分間コーティングしておいた。ディッシュをコーティングした後に、滅菌組織培養グレードの水で十分にすすぎ洗いし、2時間乾燥させた。
IGF-1R結合性多機能タンパク質は、ヒトIGF-1Rを発現するI24 3T3細胞(大きく付着性に増殖している細胞)の溶解を媒介した。溶解は、ヒトCMV特異的T細胞によって媒介される(円形であるかまたはアメーバ状に遊走する小細胞)。I24細胞を、5μg/mlの濃度での多機能タンパク質、および(HLA-A0201+/CMVペプチドパルス化APCであらかじめ活性化された)ヒトCMV特異的T細胞とインキュベートする。56分および76分でのT細胞とのI24細胞の相互作用、およびその後125分後でのI24細胞の崩壊に注目されたい。
細胞傷害性アッセイ
細胞培養培地(50μl)を、バックグラウンド測定を行うためXcelligence 96ウェルE-プレート(Roche、カタログ番号05232368001)の各ウェルにピペッティングした。
IGF-1R結合多機能タンパク質は、ヒトCMV特異的T細胞を通じてのH460M2腫瘍細胞の溶解を誘発する。
インビトロでの有効性
IGF-1R陽性の肺腺癌細胞株H460M2を、hCMV由来ペプチドおよび抗IGF-1R抗体を含む1μg/mlの多機能タンパク質、ならびに低いエフェクター細胞対標的細胞比(腫瘍細胞当たり特異的T細胞が1.5〜0.5個)にあるヒトCMV特異的CD8陽性T細胞とともにインキュベートした。対照抗体は糖鎖改変(glyco-engineered)抗IGF-1R抗体とした。インキュベーション時間は6時間とした。多機能タンパク質とのインキュベーションにより、H460M2腫瘍細胞の強力な除去がもたらされる。
MCSP陽性標的細胞に対する種々のMHC-I-抗MCSP多機能タンパク質の結合
Colo38細胞を、Accutase(PAA、カタログ番号L11-007)とともに5分間インキュベートして、単細胞懸濁液を得た。バイアル当たり2×105個の細胞を、100μlのPBS/2% FCS中にて1μg/mlのMHC-I-抗MCSP多機能タンパク質構築物とともに4℃で45分間インキュベートした。インキュベーションの後に、細胞を1mlの冷PBS/2% FCSで洗浄し、910rpmで7分間遠心処理した。細胞を、二次抗体(ヤギ抗ヒトIgG1抗体PEコンジュゲート、Jackson Lab.、カタログ番号109-116-088)を2μg/mlで含む100μlのPBS/2% FCS中に再懸濁させて、4℃でさらに45分間インキュベートした。細胞を1ml PBS%2% FCSで2回洗浄し、BD CantoII Flow Cytometerによって測定した。結果を図7に示す。
MCSP陽性細胞とMHC-I-抗MCSP多機能タンパク質とのインキュベーション
Colo38細胞またはWM266-4細胞を、Accutase(PAA、カタログ番号L11-007)とともに5分間インキュベートして、単細胞懸濁液を得た。ウェル当たり2×104個のColo38細胞株または1×104個のWM266-4細胞株を、Eplates96(Roche、カタログ番号05232368001)の中で、100μlの各々の細胞培養培地(Colo38細胞株:2mMグルタミン、10% FCSを加えたRPMI1640;WM-266-4細胞株:2mMグルタミン、10% FKS、2mMピルビン酸ナトリウム、2mM NEAAを加えたRPMI1640)中にて24時間インキュベートし、ACEA技術(Xcelligence RTCA)を用いて付着性(インピーダンス)を15分毎に測定した。24時間後(乱されていない増殖期)に、細胞を200μlのAIMV培地(Gibco、カタログ番号0870112DK)で洗浄した。細胞に対して、MHC-I-抗MCSP多機能タンパク質を最終濃度1μg/mlで、最終容積150μlのAIMV培地中に、刺激したT細胞またはPBMCとともに種々の比で添加した。インキュベーションをさらに4〜48時間続けながら、同時に5分毎にACEA測定を行った。読み取り値は、インピーダンス測定、Eplateの底から剥離した溶解細胞または崩壊細胞の検出に基づく。細胞インデックスは、多機能タンパク質の添加後の第1の測定ポイントを1として正規化した。96ウェル当たり、濃度1μg/mlの多機能タンパク質(MHCI-0008(1)、MHCI-0010(2)、MHCI-0030(3)、MHCI-0031(4))、エフェクター対標的細胞比10:1;ドナー3由来のPBMC(細胞200.000個、ドナー3はCMV陽性であるがEBV陰性である)および黒色腫腫瘍細胞株Colo38(細胞20.000個)での、データが三重反復試験による結果を図14に示している。96ウェル当たり、濃度1μg/mlの多機能タンパク質(MHCI-0008(1)、MHCI-0010(2)、PBMCのみ(3))、エフェクター対標的細胞比10:1;ドナー3由来のPBMC(細胞200.000個、ドナー3はCMV陽性であるがEBV陰性である)および黒色腫腫瘍細胞株Colo38(細胞20.000個)での、データが三重反復試験による結果を、図15A(Colo38)および15B(WM266)に示している。
細胞傷害性アッセイ
細胞培養培地(50μl)を、バックグラウンド測定を行うためXcelligence 96ウェルE-プレート(Roche、カタログ番号05232368001)の各ウェルにピペッティングした。
MCSP結合多機能タンパク質は、ヒトCMV特異的T細胞を通じてのColo38腫瘍細胞の溶解を誘発する。
LDH放出アッセイ
ACEAプレートを910rpmで7分間遠心処理した。ACEA上清の50μlを別の96ウェル平底プレート(Costar)に移した。LDH試薬(細胞傷害性検出キット、Roche、カタログ番号11644793001)1および2を製造元の説明書に従って希釈し、溶液の50μlを上清に添加した。5〜25分間のインキュベーション期間後に、吸光度をTecan Reader Sunrise(Tecan)で検出した。総溶解は、遠心処理の前に、標的細胞への1% Triton X-100(Sigma、カタログ番号T-8787)の添加によって検出する。
MCSP結合多機能タンパク質は、ヒトCMV特異的T細胞を通じてのColo38腫瘍細胞の溶解を誘発する。
細胞傷害性アッセイ
PBMCを、Ficoll遠心分離を介して全血から入手した。1ml当たり1×107個のPBMCをT細胞培地(10% HS、2mMグルタミンを加えたRPMI1640)で希釈し、HLA-A0201分子上でのペプチド交換を50μg/mlのCMV pp65ペプチドの懸濁液への添加によって実現させた。2〜3時間のインキュベーション後に、PBMCを1:10に希釈し、96ウェル丸底プレート中に200μlをプレーティングした。第3日に20U/mlのIL-2、25ng/mlのIL-7およびIL-15を添加した。14日後に再刺激を行った。
ジスルフィドで安定化された多機能タンパク質
本明細書において報告される多機能タンパク質では抗原提示ドメインの位置11と227との間にジスルフィド架橋が導入されている。
DNAの調製、トランスフェクション、発現、精製および分析
DNAの調製
細菌の一晩LB培養液250mlを採集し、プラスミドDNAを、製造元のプロトコールに従って抽出した(High speed Maxi kit, Qiagen、カタログ番号12663)。得られたプラスミドDNAを1mlのTE緩衝液中に溶出し、DNA濃度を分光光度測定により測定した(Epoch, BioTek)。
‐エンドヌクレアーゼ制限部位HindIII、NheI、
‐CMV-プロモーター、
‐5'UTR 1(ヒトCMVに由来)、
‐イントロンA、
‐5'UTR 2、
‐アンピシリン耐性遺伝子、
‐BGHポリA部位(ウシ成長ホルモンポリアデニル化シグナル)、
‐pUC Ori。
HEK 293細胞を、トランスフェクションの前日に8×105個/mlに希釈した。約1〜1.6×106個/mlを、製造元のプロトコールに従ってトランスフェクトした。30mlの最終トランスフェクション容積に対して、30μgのDNAをOpti-MEM(登録商標)I還元型血清培地(Gibco、カタログ番号31985070)で最終容積1mlに希釈した。1μgのDNA当たり2μlの293fectin(商標)試薬(Invitrogen、カタログ番号12347019)をOpti-MEM(登録商標)培地で1mlの最終容積に均等に希釈し、5分間インキュベートした。インキュベーションの後に、希釈したDNAは、希釈した293fectin(商標)試薬に添加し、穏やかに混合し、さらに20〜30分間インキュベートし、その後に28mlのHEK 293細胞に対して滴下ピペッティングし、30mlの最終容積を得た。細胞を、125rpmで回転するオービタルシェーカーで細胞培養条件下(37℃、8% CO2、湿度80%)でインキュベートし、72時間後に採集した。採集物を1000rpmで10分間、3000rpmで10分間遠心分離し、22μmの滅菌フィルターを通して濾過した(Millipore、カタログ番号SCGPU05RE)。
細胞培養上清の500μlをPall Nanosepオメガメンブレン30KD遠心分離デバイス(Pall、カタログ番号OD030C33)を用いて50μlの容積に濃縮した。各濃度の17.5μlを、4×XT試料緩衝液(Bio Rad、カタログ番号161-0791)および20×XT還元剤(BioRad、カタログ番号161-0792)で最終容積25μlに希釈し、96℃で8分間加熱して、4〜12%のCriterion XTプレキャストゲル(カタログ番号345-0124)に対して適用した。ブロット法は、Trans-blot Pureニトロセルロース膜(0.45μm)(BioRad、カタログ番号162-0117)上で、20Vで30分間、Trans-Blot SDセミドライトランスファーセル(BioRad)を用いて行った。膜のブロッキングは、室温で1時間、1×ウエスタンブロッキング試薬(Roche、カタログ番号11921681001)を用いて行った。染色は、室温で1時間、ペルオキシダーゼ結合ポリクローナルウサギ抗ヒトκ軽鎖(DAKO、カタログ番号P0129、1:3000に希釈)およびポリクローナルウサギ抗ヒトIgG抗体HRPコンジュゲート(DAKO、カタログ番号P0214、1:5000に希釈)を用いて行った。発光検出はLUMI-イメージャF1(Roche)を用いて行った。
細胞を遠心分離によって培地から除去した。多機能タンパク質を、プロテインAアフィニティークロマトグラフィー(AKTA-Avant上のMabSelectセファロース)によって上清から精製した。溶出された多機能タンパク質を、Amicon遠心管を用いて3mg/mlのタンパク質濃度に濃縮した。アリコートを、サイズ排除クロマトグラフィーにて分析した(HPLC TSKgel GFC300 Sys89)。凝集物を除去するために、Superdex 200上で調製用SECを行い、20mMヒスチジン、140mM NaCl、pH6.0中に融合タンパク質をバッファリングした。溶出された多機能タンパク質を、Amicon遠心管を用いて1mg/mlのタンパク質濃度に濃縮し、滅菌濾過した(孔径0.2μm)。
多機能タンパク質の試料を、UV分光光度計を用いてOD280により分析し、溶液中のタンパク質濃度を決定した。このために必要な吸光係数は、Paceによるアミノ酸配列から計算した(Pace, et al., Protein Science 4 (1995) 2411-2423)。試料中の単量体性の凝集して分解した種の含有量を決定するために、サイズ排除クロマトグラフィー(SE-HPLC)を、移動相として0.25MのKCl、pH 7.0を含む0.2Mのリン酸カリウム緩衝液を用いて、TSK-Gel300SWXLまたはスーパーデックス200カラムで行った。ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)ポリアクリルアミドゲル電気泳動(還元および非還元)を、生成物関連の分解生成物および無関係な不純物に関して、多機能タンパク質製剤の純度を分析するために実施した。各鎖の正確な質量/実体を確認し、化学的修飾を検出するために、エレクトロスプレーイオン化質量分析(ESI-MS)を、還元された試料(TCEP)および脱グリコシル化した試料(N-グリコシダーゼF)を用いて行った。完全に構築されたタンパク質の性状および質を分析し、生成物に関連する潜在的な副生成物を検出するために、脱グリコシル化された試料のESI-MSを行った。
デバイス:Invitrogen XCell Sure Lock Mini-Cell
ゲル:4〜20%トリス-グリシンゲル、Invitrogen EC6025BOX
緩衝液:トリス-グリシンSDS泳動緩衝液(10×)、Invitrogen LC2675-5
試料緩衝液:トリス-グリシンSDS泳動緩衝液(2×)、Invitrogen LC2676
還元緩衝液:NuPAGE試料還元剤(10×)、Invitrogen NP0004
分子量マーカー:マーク12、分子量標準、Invitrogen LC5677
試料を緩衝液により1mg/mlのタンパク質濃度に調整した。試料の還元のために以下の手順を行った:
‐還元緩衝液:4mlの試料緩衝液(2×)および1mlの還元緩衝液(10x)
‐試料を1:1に還元緩衝液で希釈する
‐70℃で5分間インキュベートする
2つの抗原提示ドメインを含む複合体と比較した、1つの抗原提示ドメインを含む複合体によるT細胞活性化
AIM-V培地(Gibco)中にあるウェル当たり20,000個のPBMCを、容積150μlのAIM-V培地中で、最終濃度100μg/ml、10μg/ml、1μg/ml、100ng/mlのMHCI-0054[1アーム型、ジスルフィドで安定化されたCMV-MHCIを有する二価抗MCSP結合剤]またはMHCI-0065[2アーム型、ジスルフィドで安定化されたCMV-MHCIを有する二価抗MCSP結合剤]構築物によって16時間刺激した。4つのウェルのPBMCをプールして、
1)PE-Cy7で標識された抗CD8抗体(BD#557746)(5μl/100μl PBS/2% FCS)、または
2)FITCで標識された抗CD4抗体(BD#555346)(20μl/100μl PBS/2% FCS)、または
3)Dextramer CMV APC(Immudex#WB2132)(10μl/100μl PBS/2% FCS)、または
4)PEで標識された抗CD25抗体(BioLegend#302606)(5μl/100μl PBS/2% FCS)、または
5)PerCP/Cy5.5で標識された抗CD69抗体(BioLegend#310925)(5μl/100μl PBS/2% FCS)
によって氷上で45分間かけて染色し、その後にPBS/2% FCSで2回洗浄した(500×g、10分間)。
1)すべてのCMV特異的(NLVPMVATV pp65)CD8+細胞に占めるCD25+細胞の頻度、
2)CMV特異的(NLVPMVATV pp65)CD8+細胞に占めるCD69+細胞の頻度、および
3)CD8+細胞上でのHLA A*0201 MHCクラスI複合体における、CMVのNLVPMVATV pp65ペプチド(NLVPMVATV pp65)のコグネイトTCRのダウンレギュレーション。
‐1つまたは2つの抗原提示ドメイン、
‐1つの抗体Fc領域、および
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含み、
抗原提示ドメインが、N末端からC末端への方向に、
(i)β2-ミクログロブリン、ならびに
(ii)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)β2-ミクログロブリン、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%もしくはそれ以上である、クラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)相対頻度が1%もしくはそれ以上である、クラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(iii)β2-ミクログロブリン
のいずれかを含み、
抗原結合部位が癌細胞表面抗原と結合し、
抗原提示ドメインが、鎖内/ドメイン間ジスルフィド結合を形成する少なくとも2つの非天然システイン残基を有する
ことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1002]
抗原提示ドメイン内の1つの非天然システイン残基がT細胞応答誘発ペプチドとの間のリンカー内にあり、かつ1つの非天然システイン残基がクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3のうち1つの中にあることを特徴とする、本発明1001のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1003]
抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、かつ位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、または
抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、かつ位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する
ことを特徴とする、本発明1001または1002のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1004]
抗体Fc領域が第1および第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、ここで1つの抗原結合部位または複数の抗原結合部位のうち1つが第1のFc領域ポリペプチドを含み、かつ、第2の抗原結合部位が存在するならば、第2のFc領域ポリペプチドを含むことを特徴とする、本発明1001〜1003のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1005]
抗原結合部位が、i)抗体重鎖と抗体軽鎖のペア、もしくはii)N末端からC末端への方向にscFv抗体断片および抗体Fc領域ポリペプチドを含むscFv融合ポリペプチド、もしくはiii)N末端からC末端への方向にscFabおよび抗体Fc領域ポリペプチドを含むscFab融合ポリペプチド
を含むこと、または
複数の抗原結合部位が、互いに独立に、i)抗体重鎖と抗体軽鎖の(コグネイト)ペア、ここで個々の鎖は野生型鎖であってもまたは改変鎖(置換された、突然変異した、もしくはドメイン交換されたもの)であってもよい、ペア、もしくはii)N末端からC末端への方向にscFv抗体断片および抗体Fc領域ポリペプチドを含むscFv融合ポリペプチド、もしくはiii)N末端からC末端への方向にscFabおよび抗体Fc領域ポリペプチドを含むscFab融合ポリペプチド
を含むこと
を特徴とする、本発明1001〜1004のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1006]
i)抗原提示ドメインが抗原結合部位の重鎖のN末端もしくは軽鎖のN末端と連結していること、またはii)1つの抗原提示ドメインが各抗原結合部位の重鎖の各N末端もしくは軽鎖の各N末端と連結していること、またはiii)抗原提示ドメインが抗原結合部位の重鎖のC末端もしくは軽鎖のC末端と連結していること、またはvi)1つの抗原提示ドメインが各抗原結合部位の重鎖の各C末端もしくは軽鎖の各C末端と連結していること、またはv)抗原提示ドメインがscFv融合ポリペプチドのN末端もしくはC末端と連結していること、またはvi)1つの抗原提示ドメインが各scFv融合ポリペプチドの各N末端もしくはC末端と連結していること、またはvii)抗原提示ドメインがscFab融合ポリペプチドのN末端もしくはC末端と連結していること、またはviii)1つの抗原提示ドメインが各scFab融合ポリペプチドの各N末端もしくはC末端と連結していること、またはix)抗原提示ドメインが第2のFc領域ポリペプチドのN末端もしくはC末端と連結していること、またはx)1つの抗原提示ドメインが第1のFc領域ポリペプチドのN末端もしくはC末端と連結し、かつ1つの抗原提示ドメインが第2のFc領域ポリペプチドのN末端もしくはC末端と連結していることを特徴とする、本発明1001〜1005のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1007]
T細胞応答誘発ペプチドがヒトサイトメガロウイルス由来ペプチドであることを特徴とする、本発明1001〜1006のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1008]
ウイルス由来ペプチドがSEQ ID NO:01のアミノ酸配列を有することを特徴とする、本発明1001〜1007のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1009]
相対頻度が1%またはそれ以上であるクラスI MHC分子が、HLA-A * 0201、HLA-A * 1101、HLA-A * 2402、HLA-A * 340101、HLA-C * 0304、HLA-C * 0401およびHLA-C * 0702を含む群から選択されることを特徴とする、本発明1001〜1008のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1010]
相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子が、HLA-B * 4201、HLA-B * 5901、HLA-B * 6701およびHLA-B * 7802を含む群から選択されることを特徴とする、本発明1001〜1009のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1011]
抗原提示ドメインが、
(i)ウイルス由来ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、
(iii)可溶性HLA-AアレルA * 0201、および
(iv)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基であって、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する、システイン残基
を含むことを特徴とする、本発明1001〜1010のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1012]
抗原提示ドメインが、N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01〜SEQ ID NO:70を含む群から選択されるアミノ酸配列を有するウイルス由来ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:77、78、79、82、83、84および139を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第1のリンカーペプチド、
(iii)SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有するβ2-ミクログロブリン、
(iv)SEQ ID NO:77、78、79、82、83および84を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第2のリンカーペプチド、
(v)SEQ ID NO:140のアミノ酸配列を有するクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
(vi)SEQ ID NO:73、77、78、79、82、83、84および136を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第3のリンカーペプチド、ならびに
(vii)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基、ならびに位置11および位置227にあるシステイン残基間のジスルフィド結合
を含むことを特徴とする、本発明1001〜1011のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1013]
本発明1001〜1012のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質と、任意で薬学的に許容される担体とを含む、医薬製剤。
[本発明1014]
医薬として用いるための、本発明1001〜1012のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1015]
癌を治療するのに用いるための、本発明1001〜1012のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1016]
個体のウイルス特異的細胞傷害性T細胞を標的に対して誘引するのに用いるための、本発明1001〜1012のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
[本発明1017]
癌細胞またはウイルス感染細胞の除去に用いるための、本発明1001〜1012のいずれかのジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
以下の態様は、本明細書において報告された局面の任意のものと組み合わせることができる。また、本明細書において報告された任意の態様を、任意の他の態様と、または本明細書において報告された態様の組み合わせと組み合わせることもできる。
Claims (17)
- ‐1つまたは2つの抗原提示ドメイン、
‐1つの抗体Fc領域、および
‐1つまたは複数の抗原結合部位
を含み、
抗原提示ドメインが、N末端からC末端への方向に、
(i)β2-ミクログロブリン、ならびに
(ii)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(ii)β2-ミクログロブリン、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、ならびに
(iii)相対頻度が1%もしくはそれ以上である、クラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
または
(i)T細胞応答誘発ペプチド、
(ii)相対頻度が1%もしくはそれ以上である、クラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、ならびに
(iii)β2-ミクログロブリン
のいずれかを含み、
抗原結合部位が癌細胞表面抗原と結合し、
抗原提示ドメインが、鎖内/ドメイン間ジスルフィド結合を形成する少なくとも2つの非天然システイン残基を有する
ことを特徴とする、ジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。 - 抗原提示ドメイン内の1つの非天然システイン残基がT細胞応答誘発ペプチドとの間のリンカー内にあり、かつ1つの非天然システイン残基がクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3のうち1つの中にあることを特徴とする、請求項1記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
- 抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置227にシステイン残基を有し、かつ位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成するか、または
抗原提示ドメインが少なくとも位置11および位置108にシステイン残基を有し、かつ位置11および位置108にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する
ことを特徴とする、請求項1または2のいずれかに記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。 - 抗体Fc領域が第1および第2のジスルフィド結合型Fc領域ポリペプチドを含み、ここで1つの抗原結合部位または複数の抗原結合部位のうち1つが第1のFc領域ポリペプチドを含み、かつ、第2の抗原結合部位が存在するならば、第2のFc領域ポリペプチドを含むことを特徴とする、請求項1〜3のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
- 抗原結合部位が、i)抗体重鎖と抗体軽鎖のペア、もしくはii)N末端からC末端への方向にscFv抗体断片および抗体Fc領域ポリペプチドを含むscFv融合ポリペプチド、もしくはiii)N末端からC末端への方向にscFabおよび抗体Fc領域ポリペプチドを含むscFab融合ポリペプチド
を含むこと、または
複数の抗原結合部位が、互いに独立に、i)抗体重鎖と抗体軽鎖の(コグネイト)ペア、ここで個々の鎖は野生型鎖であってもまたは改変鎖(置換された、突然変異した、もしくはドメイン交換されたもの)であってもよい、ペア、もしくはii)N末端からC末端への方向にscFv抗体断片および抗体Fc領域ポリペプチドを含むscFv融合ポリペプチド、もしくはiii)N末端からC末端への方向にscFabおよび抗体Fc領域ポリペプチドを含むscFab融合ポリペプチド
を含むこと
を特徴とする、請求項1〜4のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。 - i)抗原提示ドメインが抗原結合部位の重鎖のN末端もしくは軽鎖のN末端と連結していること、またはii)1つの抗原提示ドメインが各抗原結合部位の重鎖の各N末端もしくは軽鎖の各N末端と連結していること、またはiii)抗原提示ドメインが抗原結合部位の重鎖のC末端もしくは軽鎖のC末端と連結していること、またはvi)1つの抗原提示ドメインが各抗原結合部位の重鎖の各C末端もしくは軽鎖の各C末端と連結していること、またはv)抗原提示ドメインがscFv融合ポリペプチドのN末端もしくはC末端と連結していること、またはvi)1つの抗原提示ドメインが各scFv融合ポリペプチドの各N末端もしくはC末端と連結していること、またはvii)抗原提示ドメインがscFab融合ポリペプチドのN末端もしくはC末端と連結していること、またはviii)1つの抗原提示ドメインが各scFab融合ポリペプチドの各N末端もしくはC末端と連結していること、またはix)抗原提示ドメインが第2のFc領域ポリペプチドのN末端もしくはC末端と連結していること、またはx)1つの抗原提示ドメインが第1のFc領域ポリペプチドのN末端もしくはC末端と連結し、かつ1つの抗原提示ドメインが第2のFc領域ポリペプチドのN末端もしくはC末端と連結していることを特徴とする、請求項1〜5のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
- T細胞応答誘発ペプチドがヒトサイトメガロウイルス由来ペプチドであることを特徴とする、請求項1〜6のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
- ウイルス由来ペプチドがSEQ ID NO:01のアミノ酸配列を有することを特徴とする、請求項1〜7のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
- 相対頻度が1%またはそれ以上であるクラスI MHC分子が、HLA-A*0201、HLA-A*1101、HLA-A*2402、HLA-A*340101、HLA-C*0304、HLA-C*0401およびHLA-C*0702を含む群から選択されることを特徴とする、請求項1〜8のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
- 相対頻度が1%未満であるクラスI MHC分子が、HLA-B*4201、HLA-B*5901、HLA-B*6701およびHLA-B*7802を含む群から選択されることを特徴とする、請求項1〜9のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
- 抗原提示ドメインが、
(i)ウイルス由来ペプチド、
(ii)β2-ミクログロブリン、
(iii)可溶性HLA-AアレルA*0201、および
(iv)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基であって、位置11および位置227にあるシステイン残基がジスルフィド結合を形成する、システイン残基
を含むことを特徴とする、請求項1〜10のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。 - 抗原提示ドメインが、N末端からC末端への方向に、
(i)SEQ ID NO:01〜SEQ ID NO:70を含む群から選択されるアミノ酸配列を有するウイルス由来ペプチド、
(ii)SEQ ID NO:77、78、79、82、83、84および139を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第1のリンカーペプチド、
(iii)SEQ ID NO:71のアミノ酸配列を有するβ2-ミクログロブリン、
(iv)SEQ ID NO:77、78、79、82、83および84を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第2のリンカーペプチド、
(v)SEQ ID NO:140のアミノ酸配列を有するクラスI MHC分子の細胞外ドメインα1、α2およびα3、
(vi)SEQ ID NO:73、77、78、79、82、83、84および136を含む群から選択されるアミノ酸配列を有する第3のリンカーペプチド、ならびに
(vii)少なくとも位置11および位置227にあるシステイン残基、ならびに位置11および位置227にあるシステイン残基間のジスルフィド結合
を含むことを特徴とする、請求項1〜11のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。 - 請求項1〜12のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質と、任意で薬学的に許容される担体とを含む、医薬製剤。
- 医薬として用いるための、請求項1〜12のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
- 癌を治療するのに用いるための、請求項1〜12のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
- 個体のウイルス特異的細胞傷害性T細胞を標的に対して誘引するのに用いるための、請求項1〜12のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
- 癌細胞またはウイルス感染細胞の除去に用いるための、請求項1〜12のいずれか一項記載のジスルフィド結合型多価多機能タンパク質。
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