JP2015133979A - 微生物およびその部分が誘導する炭水化物特異的細胞性免疫 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、ある特定の炭水化物エピトープの存在を特徴とする疾患の予防および処置の分野に関する。本発明は、炭水化物陽性の細胞および疾患に対して有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答を誘導する炭水化物エピトープおよびその部分が陽性である微生物を含む栄養補助食品(nutraceutical)および薬学組成物を提供する。さらに、本発明は、栄養補助食品または薬学組成物の有効な一部として適切である炭水化物陽性微生物を選択、分離および同定するための方法を提供する。本発明は、炭水化物特異的な樹状細胞および細胞株ならびに炭水化物特異的なT細胞、T細胞クローンおよびT細胞株を作製するための方法を提供する。本発明は、ある特定の炭水化物エピトープに関連する疾患を予防および処置するための調合物および方法をさらに提供する。
炭水化物抗原は、しばしば、ヒトの疾患と組み合わせて見出される。例えば、異常なグリコシル化は、癌細胞の代表的な特徴であることから、正常なヒト細胞には存在しないかまたは滅多に存在しない新しい炭水化物構造がつくり出される。その炭水化物構造は、腫瘍ワクチンの作製に適した候補であると考えられていたが、炭水化物自体は、T細胞非依存性抗原として分類される免疫原性が不十分な構造である。ゆえに、ワクチン開発では、合成炭水化物に基づいた抗腫瘍ワクチンの作製に焦点が当てられ、炭水化物エピトープを免疫増強キャリア構造または天然タンパク質もしくはオリゴペプチド(例えば、MUC1)に結合し、免疫応答を誘導するために、特に細胞性免疫応答を誘導するためにさらなるアジュバント(adjuvances)と組み合わせる。免疫記憶をもたらすために免疫応答をT細胞非依存性からT細胞依存性に変更するために、多糖を、破傷風毒素またはジフテリアトキソイドなどの免疫原性ポリペプチドもしくはKLHまたはTヘルパーエピトープに連結する。そのようなワクチンの作製は、非常に困難かつ高価である。さらに、そのようなワクチンは、不明なまたは有害な副作用を伴う非天然または人工的な抗原である。
上述した当該分野における不利益を克服するために、本発明は、前記ヒトもしくは動物の疾患に関連するヒト細胞または動物細胞由来の分子上に存在する炭水化物エピトープに対して、有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答を誘導するための手段を提供する。
(a)目的の炭水化物エピトープに特異的な炭水化物結合分子を微生物の混合物と接触させる工程、および
(b)前記炭水化物結合分子に結合している少なくとも1つの微生物を前記混合物から分離する工程、
(c)前記炭水化物結合分子への特異的な結合について、分離された微生物を試験することによって、分離された微生物が炭水化物陽性微生物であることを必要に応じて試験する工程
を包含する。
本発明は例えば、以下の項目を提供する:
(項目1)
微生物の混合物から、目的の炭水化物エピトープを含む炭水化物陽性微生物を分離するための方法であって、
(a)該目的の炭水化物エピトープに対して特異的な炭水化物結合分子を微生物の混合物と接触させる工程、および
(b)該混合物から、該炭水化物結合分子に結合した少なくとも1つの微生物を分離する工程、
(c)該炭水化物結合分子に対する特異的結合について、該分離された微生物を試験することによって、該分離された微生物が炭水化物陽性微生物であることを必要に応じて試験する工程
を包含する、方法。
(項目2)
(d)前記微生物ならびに/またはその部分および/もしくは溶解物による、前記炭水化物エピトープに対する炭水化物特異的で有効な細胞性免疫応答および/または液性免疫応答の誘導をインビボまたはインビトロにおいて試験する工程
をさらに包含する、項目1に記載の方法。
(項目3)
項目3に記載の方法であって、工程(d)において、前記炭水化物陽性微生物ならびに/またはその部分および/もしくは溶解物による、前記炭水化物エピトープに対する、有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答の誘導を、CD4陽性Th1型T細胞の活性化および/または細胞傷害性CD8陽性T細胞の活性化について、好ましくは少なくとも1つの動物もしくはヒトおよび/またはインビトロにおいて試験する工程を包含する、方法。
(項目4)
項目2または3に記載の方法であって、工程(d)における前記細胞性免疫応答の試験が、
i.)少なくとも1つの樹状細胞に、工程(a)〜(c)において同定された前記炭水化物陽性細胞を負荷する工程;
ii.)該炭水化物陽性微生物を負荷された適当量の該少なくとも1つの樹状細胞を、樹状細胞によって活性化され得るかまたは抑制され得る適当量の免疫細胞と接触させる工程;
iii.)該免疫細胞と該負荷された樹状細胞との相互作用を可能にするために培養する工程;
iv.)該炭水化物陽性微生物と同じ炭水化物エピトープを有する適当量の少なくとも1つの第2化合物を負荷された適当量の抗原提示細胞(APC)を加える工程であって、ここで、該第2化合物は、該第1炭水化物陽性微生物と異なる、工程;
v.)該免疫細胞の再刺激のために培養する工程;
vi.)該免疫細胞の再刺激が生じたか否かを測定する工程
を包含する、方法。
(項目5)
適当量の前記第2化合物を負荷された前記APCの少なくとも一部を、前記目的の炭水化物エピトープを認識する炭水化物結合分子の存在下において前記免疫細胞と接触させる、項目4に記載の方法。
(項目6)
項目4または5に記載の方法であって、
前記免疫細胞が(再)刺激された場合に分泌される、該免疫細胞の分泌産物、例えば、インターフェロンα、インターフェロンγもしくはGM−CSF、および/または
該免疫細胞の増殖
を測定することによって、再刺激が測定される、方法。
(項目7)
項目2から6までの1項に記載の方法であって、前記細胞性免疫応答試験が、以下の群:
(i)工程(d(vi))において、前記免疫細胞の再刺激が、GM−CSF分泌を測定することによって測定される、細胞性免疫応答試験1;
(ii)工程(d(vi))において、再刺激されたリンパ球の量/程度が、INFγおよび/またはTNFαの分泌の量を測定することによって測定される、細胞性免疫応答試験2;
(iii)工程(d(vi))において、再刺激されたリンパ球の量/程度が、増殖および/または増殖誘導を測定することによって測定される、細胞性免疫応答試験3;
(iv)
(a)適当量の
(i)前記炭水化物陽性微生物、その溶解物または部分、
(ii)それらを含んでいる調合物、
(iii)本発明の栄養補助食品もしくは薬学組成物、または
(iv)炭水化物エピトープを有するかもしくは含む分子、
(v)炭水化物エピトープを有する分子を含んでいる混合物、
(vi)該炭水化物エピトープ、その溶解物または部分が陽性であるかもしくはそれらを含んでいる細胞、
を負荷された、適当量の、1つの樹状細胞、複数の樹状細胞、または少なくとも1つの樹状細胞を含む細胞の混合物と、適当量の少なくとも1つの炭水化物結合分子とを接触させる工程;
(b)該1つの樹状細胞、複数の樹状細胞、または細胞の混合物に対する、該炭水化物結合分子の結合を試験する工程
を包含する、前記目的の炭水化物エピトープに対する、細胞性免疫応答試験4;
(v)
a)適当量のマーカーで標識された該目的の炭水化物エピトープを含んでいる細胞株由来の適当量の標的細胞を、該炭水化物エピトープに向けられた少なくとも1つの免疫細胞、または該目的の炭水化物エピトープに向けられた少なくとも1つの免疫細胞を含む細胞の混合物とともにインキュベートする工程、および
b)該マーカーの放出を測定することによって該標的細胞の溶解を測定する工程であって、該炭水化物エピトープに対して陽性の細胞性免疫応答は、該炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解のほうが炭水化物エピトープ陰性細胞の溶解よりも有意に高い溶解を示し、そして/または該炭水化物エピトープに対して陽性の細胞性免疫応答は、炭水化物エピトープに向けられた免疫細胞とともにインキュベートされた、該炭水化物エピトープを含む細胞の溶解のほうが、該炭水化物エピトープに向けられていない対応するコントロール免疫細胞とともにインキュベートされた、該炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解よりも有意に高い溶解を示す工程、
を包含する、該目的の炭水化物エピトープに対する、細胞性免疫応答試験5
から選択される、方法。
(項目8)
項目2から7の少なくとも1項に記載の方法であって、ここで、
a.抗体、血清中の抗体、または血清、血漿もしくは便から得られた抗体と、前記炭水化物エピトープを有する化合物との結合をELISAにおいて試験する工程であって、該炭水化物エピトープに対して陽性の液性免疫応答は、該炭水化物エピトープを有する化合物と該抗体との結合のほうが、該炭水化物エピトープを有しない該化合物または該炭水化物エピトープを破壊する酵素的もしくは化学的な処理後の化合物(例えば、タンパク質またはペプチド)と該抗体との結合よりも有意に強い結合を示す工程を包含する、該炭水化物エピトープに対する液性免疫応答試験1;
b.抗体、血清中の抗体、または血清、血漿もしくは便から得られた抗体と、ポリアクリルアミドに結合した炭水化物構造(PAA結合体)との結合をELISAにおいて試験する工程であって、炭水化物エピトープに対して陽性の液性免疫応答は、該炭水化物エピトープを含んでいる該PAA結合体と1つの抗体とまたは複数の抗体の結合のほうが、該炭水化物エピトープを破壊する酵素的もしくは化学的な処理後の同じPAA結合体との結合よりも有意に高い結合を示し、そして/または該炭水化物エピトープを含んでいるPAA結合体と1つの抗体または複数の抗体との結合のほうが該炭水化物エピトープを含んでいないPAA結合体との結合に比べてより高い結合を示す工程、好ましくはその両方を示す工程を包含する、該炭水化物エピトープに対する液性免疫応答試験2;
c.抗体、血清中の抗体、または該血清、血漿もしくは便から得られた抗体の結合を、該炭水化物エピトープを含んでいる細胞および該炭水化物エピトープを含んでいない細胞との結合について、フローサイトメトリー試験において試験する工程であって、該炭水化物エピトープに対して陽性の液性免疫応答は、該炭水化物エピトープを含んでいる細胞と該抗体との結合のほうが、該炭水化物エピトープが陰性の細胞と該抗体との結合よりも、有意に高い結合を示す工程を包含する、該炭水化物エピトープに対する液性免疫応答試験3;
d.抗体、血清中の抗体、または該血清、血漿もしくは便から得られた抗体の結合を、該炭水化物エピトープを含んでいる細胞および該炭水化物エピトープが陰性の細胞との結合について、免疫蛍光試験において試験する工程であって、該炭水化物エピトープに対する陽性の液性免疫応答は、該炭水化物エピトープを含んでいる細胞と1つの抗体または複数の抗体との結合のほうが、該炭水化物エピトープを含んでいない細胞および/または該炭水化物エピトープを破壊する酵素的もしくは化学的な処理後の該炭水化物エピトープを含んでいる細胞との結合よりも有意に高い結合を示す工程を包含する、該炭水化物エピトープに対する液性免疫応答試験(液性免疫応答試験4);
e.i.適当量のマーカーで標識された、該炭水化物エピトープを含んでいる適当量の細胞を、適当量の抗体、血清中の抗体、または該血清、血漿もしくは便から得られた抗体と、適当量の補体とともにインキュベートする工程;
ii.(a)においてインキュベートした後に該マーカーの放出を測定することによって該細胞の溶解を測定する工程であって、該炭水化物エピトープに対して陽性の液性免疫応答は、該炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解のほうが、該炭水化物エピトープを含んでいない細胞の溶解よりも有意に高い溶解を示し、そして/あるいは該炭水化物エピトープに対して陽性の液性免疫応答は、該炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解のほうが、補体のない溶解よりも、および/または該抗体のない溶解よりも、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる細胞に結合しないかもしくはあまり結合しない、1つの抗体または複数の抗体を用いる溶解よりも高い溶解を示す工程
を包含する、該炭水化物エピトープに対する液性免疫応答試験5;
f)i)適当量のマーカーで標識された、該炭水化物エピトープを含んでいる適当量の細胞および/または該炭水化物エピトープを含んでいない適当量の細胞を、適当量の抗体、血清中の抗体、または該血清、血漿もしくは便から得られた抗体と、適当量の少なくとも1つの免疫エフェクター細胞または免疫エフェクター細胞もしくは末梢血単核球を含む細胞の混合物とともにインキュベートする工程、および
ii)(a)において該インキュベートした後に該マーカーの放出を測定することによって該細胞の溶解を測定する工程であって、該炭水化物エピトープに対して陽性の液性免疫応答は、該炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解のほうが、炭水化物エピトープ陰性細胞の溶解よりも、該抗体なしの溶解よりも、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる細胞に結合しないかもしくは結合がより少ない、1つの抗体または複数の抗体を用いた溶解よりも、有意に高い溶解を示す工程
を包含する、該炭水化物エピトープに対する液性免疫応答試験6
からなる群から選択される液性免疫応答試験において、前記炭水化物エピトープに対して有効な炭水化物特異的液性免疫応答の誘導が試験される、方法。
(項目9)
前述の項目のいずれかに記載の方法であって、
(i)前記炭水化物エピトープは、TF、Core−1、Tn、シアリル−Tn、シアリル−TF、Globo−H、Lewis−Y、シアリル−Lewis−A、シアリル−Lewis−X、ポリシアル酸、Lewis−X、GM2、GD2、GD3、9−O−アセチルGD3、GD3L、フコシルGM1、FucosylGM1、Lewis−A、Lewis−B、sLac、シアル酸が付いた1型鎖、CA19−9抗原、CA72−4抗原およびCA−50抗原を含む群から選択され、そして
(ii)前記炭水化物結合分子は、レクチン、セレクチン、ならびに/あるいはTF、Core−1、Tn、シアリル−Tn、シアリル−TF、Globo−H、Lewis−Y、シアリル−Lewis−A、シアリル−Lewis−X、ポリシアル酸、Lewis−X、GM2、GD2、GD3、9−O−アセチルGD3、GD3L、フコシルGM1、FucosylGM1、Lewis−A、Lewis−B、sLac、シアル酸が付いた1型鎖、CA19−9抗原、CA72−4抗原もしくはCA−50抗原に結合するか、またはこれらの炭水化物エピトープのいずれかもしくはその一部を含んでいる炭水化物構造に結合する、レクチン、セレクチン、および/または抗体、および/またはそれに由来する分子を含む群から選択される、
方法。
(項目10)
a.)少なくとも1つの樹状細胞に第1炭水化物陽性化合物を負荷する工程であって、ここで、該炭水化物陽性化合物は、目的の炭水化物エピトープを有する、工程;
b.)該炭水化物陽性化合物を負荷された適当量の該少なくとも1つの樹状細胞を、樹状細胞によって活性化され得るかまたは抑制され得る適当量の免疫細胞と接触させる工程;
c.)該免疫細胞と該負荷された樹状細胞との相互作用を可能にするために培養する工程;
d.)該第1化合物と同じ炭水化物エピトープを有する適当量の少なくとも1つの第2化合物を負荷された適当量の抗原提示細胞(APC)を加える工程であって、ここで、該第2化合物は、該第1炭水化物陽性化合物と異なる、工程;
e.)該免疫細胞の再刺激のために培養する工程;
f.)該免疫細胞の再刺激が生じたか否かを測定する工程
を包含する、細胞性免疫応答試験。
(項目11)
適当量の前記第2化合物を負荷された前記APCの少なくとも一部を、前記目的の炭水化物を認識する炭水化物結合分子の存在下において前記免疫細胞と接触させる、項目10に記載の方法。
(項目12)
項目10または11に記載の方法であって、
前記免疫細胞が(再)刺激された場合に分泌される該免疫細胞の分泌産物、例えば、インターフェロンα、インターフェロンγもしくはGM−CSF、および/または
該免疫細胞の増殖
を測定することによって、再刺激が測定される、方法。
(項目13)
目的の炭水化物エピトープに対する機能的樹状細胞を産出するための方法であって、適当量の樹状細胞もしくは樹状細胞の混合物、または少なくとも1つの樹状細胞を含む細胞の混合物を、本明細書中に定義される項目の1つに記載の、適当量の炭水化物陽性微生物またはその部分もしくは溶解物、および/あるいは該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体または哺乳動物細胞と、適当な時間にわたって適当な条件下で、接触させることによって、該炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対する少なくとも1つの機能的樹状細胞を産出する工程を包含する、方法。
(項目14)
前記樹状細胞がヒト起源である、項目13に記載の方法。
(項目15)
前記炭水化物エピトープが、双極性炭水化物エピトープでない、項目13または14に記載の方法。
(項目16)
炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対する、活性化された1つのT細胞もしくは複数のT細胞、T細胞クローンまたはT細胞株を産出するための方法であって、
(a)項目13から15のうちの少なくとも1項に記載の適当量の少なくとも1つの機能的樹状細胞を、適当量の少なくとも1つのT細胞もしくはT細胞の混合物または少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物、該T細胞の培養物またはT細胞の混合物と、前記負荷された機能的樹状細胞とともに接触させることによって、1つのT細胞または複数のT細胞を該炭水化物抗原に対して活性化させるかまたはプライミングする工程、および
(b)適当量の抗原提示細胞(APC)で、好ましくは、ヒト細胞もしくは動物細胞または該炭水化物エピトープを有する分子を負荷された負荷された少なくとも1つの機能的樹状細胞で、該T細胞を再刺激する工程
を包含する、方法。
(項目17)
前述の項目のいずれかに記載の方法によって産出される機能的樹状細胞、活性化された1つのT細胞もしくは複数のT細胞、T細胞クローンまたはT細胞株であって、ここで、該活性化された1つのT細胞もしくは複数のT細胞、T細胞クローンまたはT細胞株は、前記炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に向けられたものである、機能的樹状細胞、活性化された1つのT細胞もしくは複数のT細胞、T細胞クローンまたはT細胞株。
(項目18)
目的の炭水化物エピトープを特異的に認識する少なくとも1つの炭水化物結合分子によって認識される、該目的の炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物陽性微生物またはその部分もしくは溶解物であって、該微生物、該部分または該溶解物が、該炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対して有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答を誘導する、炭水化物陽性微生物またはその部分もしくは溶解物。
(項目19)
項目1から9のうちの少なくとも1項に記載の方法によって入手可能な炭水化物陽性微生物。
(項目20)
項目18または19において定義されたような少なくとも1つの炭水化物陽性微生物を含んでいる、栄養補助食品および薬学組成物を含む群から選択される調合物。
(項目21)
(a)前記有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答が、前記炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に向けられた、Th1型のCD4陽性T細胞の活性化および/またはCD8陽性細胞傷害性T細胞の活性化を含み、そして
(b)該炭水化物エピトープが、TF、Core−1、Tn、シアリル−Tn、シアリル−TF、Globo−H、Lewis−Y、シアリル−Lewis−A、シアリル−Lewis−X、ポリシアル酸、Lewis−X、GM2、GD2、GD3、9−O−アセチルGD3、GD3L、フコシルGM1、フコシルGM1、Lewis−A、Lewis−B、sLac、シアル酸が付いた1型鎖、CA19−9抗原、CA72−4抗原および/またはCA−50抗原を含む群から選択され、そして
(c)該炭水化物結合分子が、TF、Core−1、Tn、シアリル−Tn、シアリル−TF、Globo−H、Lewis−Y、シアリル−Lewis−A、シアリル−Lewis−X、ポリシアル酸、Lewis−X、GM2、GD2、GD3、9−O−アセチルGD3、GD3L、フコシルGM1、フコシルGM1、Lewis−A、Lewis−B、sLac、シアル酸が付いた1型鎖、CA19−9抗原、CA72−4抗原もしくはCA−50抗原に結合するか、またはこれらの炭水化物エピトープのいずれかもしくはその一部を含んでいる炭水化物構造に結合する、レクチン、セレクチン、ならびに/あるいは抗体および/もしくはそれに由来する分子を含む群から選択される、
項目20に記載の調合物。
(項目22)
前記有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答が、前記炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に向けられた、Th1型のCD4陽性T細胞の活性化およびCD8陽性細胞傷害性T細胞の活性化を含む、項目20または21に記載の調合物。
(項目23)
ヒト細胞または動物細胞由来の分子上に存在する炭水化物エピトープに対して、ヒトまたは動物を免疫するかまたはワクチン接種するための方法であって、
(i)目的の炭水化物エピトープに向けられた、有効量の機能的樹状細胞、活性化されたT細胞、T細胞クローンもしくはT細胞株、または前述の項目のいずれかに記載の細胞の混合物をヒトまたは動物に投与し、そして、該細胞によって、該炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対する免疫応答を該ヒトまたは動物において誘導する工程(プライミング)、および
ii)ヒト細胞または動物細胞あるいはその部分もしくは溶解物由来の分子上に存在する炭水化物エピトープを特異的に認識する少なくとも1つの炭水化物結合分子によって認識される少なくとも1つの炭水化物陽性微生物を含んでいる有効量の調合物を投与することによって該免疫応答を追加免疫する工程であって、該微生物、該部分もしくは該溶解物またはそれらを含んでいる該調合物は、該炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対して有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答を誘導する、工程
を包含する、方法。
(項目24)
少なくとも1つの動物またはヒトにおいて、炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対する、有効な炭水化物特異的な細胞性免疫応答および/または特異的な液性免疫を誘導するかまたは増強するための方法であって、前述の項目のいずれかに記載の有効量の調合物をヒトまたは動物に投与する工程を包含する、方法。
(項目25)
炭水化物エピトープ陽性の腫瘍および/または疾患を予防および/または処置するための方法であって、前述の項目のいずれかに記載の、該炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対する、適当量の調合物、炭水化物陽性微生物またはその溶解物もしくは部分、機能的樹状細胞、あるいは活性化されたT細胞、T細胞株またはT細胞クローンをヒトまたは動物に投与する工程を包含する、方法。
(項目26)
前記炭水化物エピトープに関連する疾患を予防および/または治療するための薬物または栄養補助食品を製造するための、前述の項目のいずれかに記載の方法によって分離されるかまたは同定される炭水化物陽性微生物、またはその部分もしくは溶解物の使用であって、該微生物ならびに/またはその部分および/もしくは溶解物が、該炭水化物エピトープ、および/または該炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対して、炭水化物特異的で有効な細胞性免疫応答および/または液性免疫応答を少なくとも1つの動物またはヒトにおいて誘導する、使用。
i.)少なくとも1つの樹状細胞に、工程(a)〜(c)において同定された炭水化物陽性細胞を負荷する工程;
ii.)前記炭水化物陽性微生物を負荷された適当量の前記少なくとも1つの樹状細胞を、樹状細胞によって活性化され得るかまたは抑制され得る適当量の免疫細胞と接触させる工程;
iii.)前記免疫細胞と前記負荷された樹状細胞との相互作用を可能にするために培養する工程;
iv.)その炭水化物陽性微生物と同じ炭水化物エピトープを有する適当量の少なくとも1つの第2化合物を負荷された適当量の抗原提示細胞(APC)を加える工程(第2化合物は、前記炭水化物陽性微生物と異なる);
v.)前記免疫細胞の再刺激のために培養する工程、
vi.)その免疫細胞の再刺激が生じたか否かを測定する工程;
を包含する。
本発明は、栄養補助食品および薬学組成物を含む群から選択される調合物を提供し、本調合物は、ヒト細胞または動物細胞由来の分子上に存在する炭水化物エピトープ、またはその部分もしくは溶解物を特異的に認識する少なくとも1つの炭水化物結合分子と接触する際に、それらの分子に認識され、そして結合される少なくとも1つの炭水化物陽性微生物を含み、ここで、前記微生物、前記部分もしくは前記溶解物またはそれらを含む前記調合物は、前記炭水化物エピトープおよび/または前記炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対する有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答を誘導する。
(i)前記有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答は、前記炭水化物エピトープならびに/または前記炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に向けられた、Th1型のCD4陽性T細胞の活性化および/またはCD8陽性細胞傷害性T細胞の活性化を包含し、そして
(ii)炭水化物エピトープは、TF、Core−1、Tn、シアリル−Tn、シアリル−TF、Globo−H、Lewis−Y、シアリル−Lewis−A、シアリル−Lewis−X、ポリシアル酸、Lewis−X、GM2、GD2、GD3、9−O−アセチルGD3、GD3L、フコシルGM1、FucosylGM1、Lewis−A、Lewis−B、sLac、シアル酸が付いた1型鎖、CA19−9抗原、CA72−4抗原およびCA−50抗原を含む群から選択され、そして
(iii)炭水化物結合分子は、TF、Core−1、Tn、シアリル−Tn、シアリル−TF、Globo−H、Lewis−Y、シアリル−Lewis−A、シアリル−Lewis−X、ポリシアル酸、Lewis−X、GM2、GD2、GD3、9−O−アセチルGD3、GD3L、フコシルGM1、FucosylGM1、Lewis−A、Lewis−B、sLac、シアル酸が付いた1型鎖、CA19−9抗原、CA72−4抗原もしくはCA−50抗原に結合するか、またはこれらの炭水化物エピトープもしくはその一部のいずれかを含んでいる炭水化物構造に結合する、レクチン、セレクチン、ならびに/または抗体および/もしくはそれら由来の分子を含む群から選択される。
(i)加工されているか、部分的に加工されているか、または、加工されていないかであって、栄養的価値の有無に関係なく、ヒトによって消化されると意図されるか、または消化されると合理的に予想される、任意の物質または産物;(ii)水および他の飲み物;(iii)チューインガムもしくはキャンディ産物;および/または
(iv)食品を調製する際の要素または成分として使用される物品および物質
である。
飲み物:ビール、ジュース、ソフトドリンク、スカッシュ、ワイン、乳、乳製品または他のアルコール飲料もしくは非アルコール飲料を含む飲み物、例えば、水(単なる炭酸水を含む)、果汁および野菜汁、ソフトドリンク、淡水(aguas frescas)、レモネード、コーラ、ジンジャーエール、アイロンブルー(irn bru)、ルートビア、サルサパリラ、クリームソーダ、タンポポおよびゴボウ、スカッシュ、水で希釈された果物風味のシロップ、スポーツドリンク、インフュージョン(infusions)、コーヒー、茶、乳飲料、例えば、乳、ヨーグルトドリンク、チョコレートミルク、ミルクシェイク、エッグノッグ、アーモンドミルク、オルチャタ、アルコール飲料、カクテル−混合酒、熱い飲料、例えば、ホットチョコレート、ホットサイダー、カプチーノまたはパールミルクティパンは、コムギまたは他の穀物のふくれあがった生地からできている、多くの国にとって主要な食物であり、例えば、ライムギ−コムギ、トーストブレッド(ホワイトブレッド)、全粒、コムギ−ライムギ、ホワイトブレッド、マルチグレイン、ライムギ、ヒマワリの種子、カボチャの種子、ピザ、チャパティ(chapatis)、トルティーヤ、バゲット、ピタ、ラヴァッシュ、ビスケット、プレッツェル、ナン、ベーグル、プーリー、ケーキ、プンパーニッケル、全粒パン、コムギ胚芽パン、全粒、全麦パンおよび多くの他のバリエーションケーキおよびクッキー、例えば、エンゼルフードケーキ、リンゴケーキ、バーブカ、ブッチェラート、ブントケーキ、バターケーキ、バタフライケーキ、ニンジンケーキ、チーズケーキ、チョコレートケーキ、クリスマスケーキ、シフォンケーキ、クロカンブーシュ、カップケーキ、デビルズフードケーキ、エクルズケーキ、フェアリーケーキ、フルーツケーキ、ジャーマンチョコレートケーキ、ジェノヴァケーキ、ジンジャーブレッド、ゴブ(gob)、グーイー(gooey)バターケーキ、ホットミルクケーキ、アイスクリームケーキ、ジャファケーキ(jaffa cakes)、発酵ケーキ(leavened cake)、月餅(mooncake)、パネトーネ、パイナップルケーキ、パウンドケーキ、クイーンエリザベスケーキ、小豆ケーキ(red bean cake)、レッドベルベットケーキ、ザッハトルテ、シムネルケーキ、スパイスケーキ、スポンジケーキ、サンケーキ、ティーケーキ、タルトタタン、バニラスライスまたはウェディングケーキチーズは、凝固した乳製品であり、多くの種類が存在し、例えば、サルド(sardo)チーズ、テストゥーリ(testouri)チーズ、ボクマキーリ(bokmakiri)チーズ、クウェイト(kwaito)チーズ、ウーキー(wookie)チーズ、アカウィ(ackawi)チーズ、バスケット(basket)チーズ、レブネ、ジブネアラビエ(jibneh arabieh)チーズ、ケナファ(kenafa)チーズ、ナボーリシ(naboulsi)チーズ、パニール、アフィヌール(affineur)、ベルクケーゼ(bergkaese)、ブリムゼン(brimsen)、ダッハシュタイナー(dachsteiner)、チロリアングレイ(tyrolean grey)チーズ、ルネベルグ(luneberg)、ボーヴォールデ(beauvoorde)チーズ、ブリュッセルチーズ、エルベ(herve)チーズ、リンバーガーチーズ、マレッツ(maredsous)チーズ、パッセンダーレ(passendale)チーズ、プラトードエルベ(plateau de herve)チーズ、ポステル(postel)チーズ、レメドー(remedou)チーズ、デーニッシュブルーチーズ、デーニッシュティルジット(danish tilsit)またはティルジットハバーティ(tilsit havarti)、アルガウ(allgaeu)エメンタールチーズ、カンボゾーラチーズ、ハルツァー(harzer)チーズ、リンバーガーチーズ、シュプンディケーゼ(spundekaes)チーズ、フェタチーズ、ハロウミチーズまたはモッツァレッラチーズデザートは、通常甘いものであり、一般にメイン料理の後に出される一品であり、例えば、アイスクリーム、例えば、ビスケットまたはクッキー、ケーキ、クランブル、カスタード、フルーツ、ゼラチンデザート、アイスクリーム、メレンゲ、ペストリー、パイまたはタルト、プディング、ソルベ、スフレまたはトライフルフレンチフライ、チップ、例えば、ポテトチップまたは「クリスプ」、トルティーヤチップまたはコーンチップ機能性食品(機能性食品は、栄養学および薬学の混成語である栄養補助食品と呼ばれ、一般に加工された食品を包含し得;おおまかなカテゴリーには、機能性食品の成分から作られているか、または「ビタミンが豊富な」製品のような、健康を促進する添加物を添加して栄養価が高められた、加工食品および生鮮食品(例えば、野菜)が包含され、そしてこのカテゴリーにとって具体的な請求にかかるものは添付されているとおりである)ジャムおよびゼリー 例えば、スグリ−、アカフサスグリ−、クロフサスグリ−、柑橘類果実−、リンゴ−、ラズベリー−、イチゴ−および熟成ブラックベリー−ジャムまたはローヤルゼリーパスタ、例えば、成形されたパスタ、カムパネルラ(campanelle)、カサレッチョ、カヴァテッリ、コンキリエ、コンキリオーニ、ファルファッレ、フィオーリ、フジッリ、フジッリブカーティ、ジュメーリィ、ジーリ、グラミーニャ、ルマーケ、ルマコニ、マルタリアーティ、オレッキエッテ、ピーペ、クアドレフィオレ(quadrefiore)、ラジアトリ、リッチョリーニ、ロテッレ、ロティーニ、スピラリーニ、ストロッツァプレッティ、トルキオまたはトロフィエパイ 例えば、ベーコンおよび卵のパイ、鶏肉およびキノコのパイ、コーンビーフパイ、コーニッシュパイ、フィッシュパイ、カラクッコ(kalakukko)、クーリビヤカ(kulebjaka)、ピザパイ、ポークパイ、ポットパイ、スコッチパイ、シェパードパイ、スターゲージーパイ、ステーキパイ、ステーキアンドキドニーパイ、アップルパイ、バナナクリームパイ、ブラックベリーパイ、ブルーベリーパイ、ボストンクリームパイ、バンブルベリーパイ、チェリーパイ、チョコレートクリームパイ、ココナッツクリームパイ、カスタードパイ、ダッチアップルパイ、グレープパイ、キーライムパイ、レモンメレンゲパイ、レモンパイ、ミックスベリーパイ、オレンジパイ、ピーチパイ、ルバーブパイ、ストロベリールバーブパイ、ストロベリーパイまたはヴィネガーパイピザ 例えば、標準的なタイプおよびそれらの各々のトッピングとしては:マリナラまたはナポリターナ:トマト、オリーブ油、オレガノおよびニンニク;マルゲリータ:トマト、オリーブ油、生のバジルの葉およびフィオール・ディ・ラッテ(牛乳から作られるモッツァレッラ)またはモッツァレラ・ディ・ブッファラ;フォルマッジョ・エ・ポモドーロ(formaggio e pomodoro):トマト、オリーブ油およびおろしたパルメザンチーズ、必要に応じてバジルの葉;リピエーノ(ripieno)またはカルゾーネ:フィオール・ディ・ラッテまたはモッツァレラ・ディ・ブッファラ、時折リコッタ・チーズも、オリーブ油およびサラミ、他の肉、野菜などまたはストロンボリ(stromboli):モッツァレラ、肉、野菜などが挙げられる加工肉 例えば、両生類の肉、ヒキガエル、人工肉(artificial meat)、人造肉(imitation meat)、培養肉(in vitro meat)、牛肉(ウシ)、水牛、畜牛、ステーキ、子牛(veal)(子牛(calves))、ヤク、家禽類(鳥類)、ニワトリ、アヒル、狩猟鳥、シチメンチョウ、イヌ科、魚介類、魚類、サメ、甲殻類、カニ、ウサギ、マトン(ヒツジ)、ラム、豚肉(ブタ)、ハム(腰臀部)、ベーコン(塩漬け肉の片)または昆虫サンドイッチ 例えば、アラム(aram)サンドイッチ、詰まったバゲット(filled baguette)、ベーコンバティ、ロールパン(bun)、バーガー、ブリート、チップバティ、クラブサンドイッチ、グリルドチーズ、ドネルケバブ、ジョージアホット(georgia hots)、メルトサンドイッチ:ツナメルトなど、パニーニ、ステーキサンドイッチ、タコス、ティーサンドイッチ、トーストサンドイッチ、トルタまたはラップサラダ 例えば、シーザーサラダ、シェフサラダ、コブサラダ、グリークサラダ、イタリアンサラダ、メスクランサラダ、ニース風サラダ、グリーンビーンズサラダのような豆サラダ、セブンビーンサラダ、チキンサラダ、タマゴサラダ、フルーツサラダ(スライスされ、皮を剥かれた果物が、それら自体の汁において用いられるかまたはドレッシングとともに用いられる)、ラープ(larb)、パスタサラダ、ポテトサラダ、そう麺サラダ、ソムタム、タブーリ、ウォルドーフサラダまたはウォーターゲートサラダソース 例えば、ホワイトソース、キノコソース、アルマンドソース、アメリケーヌソース、シュープレームソース、クリーミーブラウンソース(eloute brown sauces)、ボルドレーズソース、ブルゴーニュ風ソース、シャトーブリアンソース、アフリケーヌソース(sauce africaine)、ロベールソース、ベシャメルソース、モルネーソース、乳化ソース、ベアネーズソース、オランデーズソース、マヨネーズ、タルタルソース、クリーム状サラダドレッシング、バターソース、ブールブラン、カフェドパリ、スイートソース、魚醤、サンバル、バーベキューソース、モレ、トマトソースまたはザジキソーセージ 例えば、アンデュイユ、ブラックプディング、ブラッドソーセージ、自家製田舎ソーセージ(boerewors)、ブラートブルスト、朝食用ソーセージ、ブティファーラ、チョリソ、カンバーランドソーセージ、ファルーコルヴ(falukorv)、フエ(fuet)、ハギス、キースカ(kieska)、キールバーサ、キシュカ(kishka)、キシュカ(kishke)、クナックヴルスト、コブバーサ(kovbasa)、ランドイェーガー、リングイッサ、レバーソーセージ、ルカンカ、メットヴルスト、ミンスミート、モルタデッラ、サラミ、ソージューク(soujouk)、チューリンゲン、ヴァイスヴルストまたはホワイトプディング
スナック食品:菓子、ポテトチップス、チョコレート、堅パン、キャンディーバー、ジャンクフード 例えば、ゆで落花生、キャンディーバー、チートス、チェックスミックス(chex mix)、クッキー、クラッカー、コンボス(combos)、ファッジラウンド(fudge rounds)、フラフープ(hula hoops)、アイスクリーム、ムーンパイ(moon pies)、パイレーツブーティ(pirate’s booty)、ポップコーン、ポークラインズ、ポテトチップス、プレッツェル、スマートパフ(smart puffs)、ソフトドリンク、スノーボール(snow balls)、スチューデントフード(student food)、スイスロールケーキ、ティングス(tings)、ツインキー、ベジーブーティ(veggie booty)またはゼブラケーキ(zebra cakes)スープ 例えば、デザートスープ(ココナツミルク、乳、果実およびタピオカパールから作られるフィリピンのスープであるギナターン(ginataan));日本の小豆スープであるお汁粉または果物のスープ、冬瓜スープ、みそ汁、フォー、ラーメン、サイミン、ルーマニアのジャガイモのスープ、アヴゴレモノ、ボルシチ、ブイヤベース、キャラルー、コッカリーキー、ファネスカ(fanesca)、ガスパチョ、ダルスープ、ミネストローネ、マリガトニースープ、スコッチブロス、スネルトゥ(snert)、サリャンカ(solyanka)、タラトール(tarator)またはワーテルゾイ糖または糖製品 例えば、ゴールデンシロップ、キャンディまたはチョコレートヨーグルト、凝乳、サワークリーム、ホイップクリーム 例えば、ラッシー、ケフィア、アイラン(ayran)、ドゥー(doogh)またはタラトールドリンクパウダーまたはドリンクタブレット 例えば、ビタミンドリンクまたはミネラルドリンクカプセルまたは錠治療的食品(治療的食品は、特定の、通常は栄養的、治療的な目的のためにデザインされた食品である)、機能性食品、医療用の食品、経腸食品、非経口的な食品、特定の健康用途の食品。
a)適当量のマーカー(例えば、ユーロピウムまたはクロム−51)で標識された、炭水化物エピトープを含んでいる適当量の細胞を、適当量の抗体、血清中の抗体、または血清、血漿もしくは便から得られた抗体と、適当量の補体とともに、適当な時間(代表的には3〜5時間または一晩)にわたって、インキュベートする工程;
b)(a)におけるインキュベートの後、マーカー(例えば、ユーロピウムまたはクロム−51)の放出を測定することによって細胞の溶解を測定する工程であって、炭水化物エピトープに対して陽性の液性免疫応答は、炭水化物エピトープを含んでいない細胞の溶解よりも炭水化物エピトープを含む細胞の溶解のほうが有意に高い溶解を示し、そして/あるいは、補体なしの溶解および/または抗体なしの溶解および/または炭水化物エピトープを含んでいる細胞と結合しないかもしくはほとんど結合しない抗体による溶解よりも、炭水化物エピトープを含んでいる細胞のほうが高い溶解を示す、工程
を包含する。
a)適当量のマーカー(例えば、ユーロピウムまたはクロム−51)で標識された、適当量の、炭水化物エピトープを含んでいる細胞および/または炭水化物エピトープを含んでいない細胞を、適当量の抗体、血清中の抗体、または血清、血漿もしくは便から得られた抗体と、適当量の少なくとも1つの免疫エフェクター細胞または免疫エフェクター細胞もしくは末梢血単核球を含む細胞の混合物とともに、適当な時間にわたって、代表的には3〜5時間または一晩にわたって、インキュベートする工程、および
b)(a)におけるインキュベートの後、マーカー(例えば、ユーロピウムまたはクロム−51)の放出を測定することによって、細胞の溶解を測定する工程であって、ここで、炭水化物エピトープに対して陽性の液性免疫応答は、炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解のほうが、炭水化物エピトープ陰性細胞の溶解よりも、抗体なしの溶解よりもおよび/または炭水化物エピトープを含んでいる細胞と結合しないかもしくはほとんど結合しない1つの抗体または複数の抗体による溶解よりも、有意に高い溶解を示す、工程
を包含する。
a.栄養補助食品、薬学組成物、炭水化物陽性微生物またはその部分もしくは溶解物あるいはそれらを含んでいる調合物をヒトまたは動物に投与する工程
b.抗体、血清中の抗体、または血清、血漿もしくは便から得られる抗体を分離する工程をさらに包含する。
a.)少なくとも1つの樹状細胞に第1の炭水化物陽性化合物を負荷する工程(ここで、前記炭水化物陽性化合物は、目的の炭水化物エピトープを有する);
b.)前記炭水化物陽性化合物を負荷された適当量の前記少なくとも1つの樹状細胞を、樹状細胞によって活性化され得るかまたは抑制され得る適当量の免疫細胞と接触させる工程;
c.)前記免疫細胞と、前記負荷された樹状細胞との相互作用を可能にするために培養する工程;
d.)前記第1化合物と同じ炭水化物エピトープを有する適当量の少なくとも1つの第2化合物を負荷された、適当量の抗原提示細胞(APC)を加える工程(ここで、前記第2化合物は、前記第1炭水化物陽性化合物と異なる);
e.)前記免疫細胞の再刺激のために培養する工程、
f.)再刺激された免疫細胞の量を測定する工程
を包含する。
−前記リンパ球が(再)刺激される場合に分泌されるリンパ球の分泌産物(例えば、インターフェロンα、インターフェロンγまたはGM−CSF)
−T細胞の増殖
を測定することによって行われ得る。
a)適当量の炭水化物陽性微生物、その溶解物もしくは部分、それらを含んでいる調合物と、本発明の栄養補助食品または薬学組成物を負荷された、適当量の、少なくとも1つの樹状細胞を含む樹状細胞、複数の樹状細胞、または少なくとも1つの樹状細胞を含む細胞の混合物を、適当量の、少なくとも1つの免疫細胞を含む免疫細胞、CD4+T細胞、CD8+T細胞、少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物、または末梢血単核球(これらは、樹状細胞によって活性化され得るか、または抑制され得る)とともに、接触させる工程、
b)適切な時間にわたって、そして適切な条件下で、培養する工程、
c)適当量の少なくとも1つの炭水化物エピトープを有する分子を負荷された、適当量の、少なくとも1つの樹状細胞を含む樹状細胞、複数の樹状細胞、または少なくとも1つの樹状細胞を含む細胞の混合物を加える工程、
d)再刺激のために、適切な時間にわたって、そして適切な条件下で、培養する工程、
e)分泌されたGM−CSFの量をELISAまたはELISPOTによって測定する工程であって、ここで、炭水化物エピトープに対して陽性の細胞性免疫応答は、(i)炭水化物エピトープを有する分子を負荷された前記樹状細胞で再刺激された前記免疫細胞のGM−CSF分泌のほうが、対応する負荷されていない樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞のGM−CSF分泌よりも、および/または炭水化物エピトープを有していないかもしくは含んでいない分子を負荷された対応する樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞のGM−CSF分泌よりも有意に高いこと、および/または(ii)炭水化物エピトープを有するかもしくは含んでいるタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された前記樹状細胞で再刺激された前記免疫細胞のGM−CSF分泌のほうが、炭水化物エピトープを有していないかもしくは含んでいない対応するタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された対応する樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞のGM−CSF分泌よりも有意に高いこと、および/または(iii)炭水化物エピトープを有するかもしくはまたは含んでいるタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された前記樹状細胞で再刺激された前記免疫細胞のGM−CSF分泌のほうが、炭水化物エピトープを有するかもしくは含んでいるが、炭水化物エピトープを破壊するために化学的または酵素的に処理された対応するタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された対応する樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞のGM−CSF分泌よりも有意に高いこと、および/または(iv)炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解物または部分を負荷された前記樹状細胞で再刺激された前記免疫細胞のGM−CSF分泌のほうが、炭水化物エピトープが陰性であるかまたは炭水化物エピトープを含んでいない細胞の溶解物を負荷された対応する樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞のGM−CSF分泌よりも有意に高いことを示す工程、
を包含する。
a.適当量の、炭水化物陽性微生物、その溶解物もしくは部分、それらを含んでいる調合物、本発明の栄養補助食品または薬学組成物を負荷された、適当量の、少なくとも1つの樹状細胞、樹状細胞(複数)または少なくとも1つの樹状細胞を含む細胞の混合物を、少なくとも1つの免疫細胞、CD4+T細胞、CD8+T細胞、少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物または末梢血単核球(これらは、樹状細胞によって活性化され得るか、または抑制され得る)を含む適当量の免疫細胞と接触させる工程
b.適切な時間にわたって、そして適切な条件下で培養する工程
c.適当量の少なくとも1つの炭水化物エピトープを有する分子を負荷された、適当量の、少なくとも1つの樹状細胞を含む樹状細胞、複数の樹状細胞、または少なくとも1つの樹状細胞を含む細胞の混合物を加える工程
d.再刺激のために、適切な時間にわたって、そして適切な条件下で培養する工程、および
e.分泌されたIFNγおよび/または分泌されたTNFαの量をELISAまたはELISPOTによって測定する工程であって、ここで、炭水化物エピトープに対して陽性の細胞性免疫応答は、(i)炭水化物エピトープを有するかもしくは含んでいる分子を負荷された前記樹状細胞で再刺激された前記免疫細胞のIFNγおよび/またはTNFαの分泌のほうが、対応する負荷されていない樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞のIFNγおよび/もしくはTNFαの分泌よりも有意に高いこと、および/または、炭水化物エピトープを有しているかもしくは含んでいる分子を負荷された前記樹状細胞で再刺激された前記免疫細胞のIFNγおよび/またはTNFα分泌のほうが、炭水化物エピトープを有していないかもしくは含んでいない分子を負荷された対応する樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞のIFNγおよび/またはTNFαの分泌よりも高いこと、および/または(ii)炭水化物エピトープを有するかもしくは含んでいるタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された前記樹状細胞で再刺激された前記免疫細胞のIFNγおよび/またはTNFαの分泌のほうが、炭水化物エピトープを有しないかもしくは含んでいない対応するタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された対応する樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞のIFNγおよび/またはTNFαの分泌よりも有意に高いこと、および/または(iii)炭水化物エピトープを有するかもしくはまたは含んでいるタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された前記樹状細胞で再刺激された前記免疫細胞のIFNγおよび/またはTNFαの分泌のほうが、炭水化物エピトープを有するかもしくは含んでいるが、炭水化物エピトープを破壊するために酵素的または化学的に処理された対応するタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された対応する樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞のIFNγおよび/またはTNFαの分泌よりも有意に高いこと、および/または(iv)炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解物または部分を負荷された前記樹状細胞で再刺激された前記免疫細胞のINFγおよび/またはTNFαの分泌のほうが、炭水化物エピトープが陰性であるかまたは炭水化物エピトープを含んでいない細胞の溶解物を負荷された対応する樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞のIFNγおよび/またはTNFαの分泌よりも有意に高いことを示す工程、
を包含する。
a)適当量の炭水化物陽性微生物を負荷された、適当量の、少なくとも1つの樹状細胞を含む樹状細胞、複数の樹状細胞、または少なくとも1つの樹状細胞を含む細胞の混合物、その溶解物もしくは部分、それらを含んでいる調合物、本発明の栄養補助食品あるいは薬学組成物を、適当量の、少なくとも1つの免疫細胞を含む免疫細胞、CD4+T細胞、CD8+T細胞、少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物、または末梢血単核球(これらは、樹状細胞によって活性化され得るか、または抑制され得る)と接触させる工程、
b)適切な時間にわたって、そして適切な条件下で培養する工程、
c)適当量の少なくとも1つの炭水化物エピトープを有する分子を負荷された、適当量の、少なくとも1つの樹状細胞を含む樹状細胞、複数の樹状細胞、または少なくとも1つの樹状細胞を含む細胞の混合物を加える工程、
d)再刺激のために、適切な時間にわたって、そして適切な条件下で培養する工程、および
e)好ましくはWST反応を比色測定(実施例に記載されるような)と組み合わせて使用することによって、増殖および/または増殖誘導を測定する工程であって、ここで、炭水化物エピトープに対して陽性の細胞性免疫応答は、(i)炭水化物エピトープを有するかまたは含んでいる分子を負荷された前記樹状細胞で再刺激されたときの、ある特定の時間にわたる培養後の免疫細胞の増殖またはT細胞の数のほうが、対応する負荷されていない樹状細胞で再刺激された増殖または数よりも有意に高く、そして/または、炭水化物エピトープを有していないかもしくは含んでいない分子を負荷された対応する樹状細胞で再刺激されたときの増殖または数よりも有意に高いこと、および/または(ii)炭水化物エピトープを有するかもしくは含んでいるタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された前記樹状細胞で再刺激されたときの、ある特定の時間にわたる培養後の免疫細胞の増殖またはT細胞の数のほうが、炭水化物エピトープを有していないかもしくは含んでいない対応するタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された対応する樹状細胞で再刺激されたときの増殖または数よりも有意に高いこと、および/または(iii)炭水化物エピトープを有するかもしくはまたは含んでいるタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された前記樹状細胞で再刺激されたときの、ある特定の時間にわたる培養後の免疫細胞の増殖またはT細胞の数のほうが、炭水化物エピトープを有するかもしくは含んでいるが、炭水化物エピトープを破壊するために酵素的または化学的に処理された対応するタンパク質、ペプチドまたは分子を負荷された対応する樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞の増殖または数よりも有意に高いこと、および/または(iv)炭水化物エピトープを有しているかもしくは含んでいる細胞の溶解物または部分を負荷された前記樹状細胞で再刺激されたときの、ある特定の時間にわたる培養後の免疫細胞の増殖またはT細胞の数のほうが、炭水化物エピトープが陰性であるかまたは炭水化物エピトープを含んでいない細胞の溶解物を負荷された対応する樹状細胞で再刺激された対応する免疫細胞の増殖または数よりも有意に高いことを示す工程、
を包含する。
(a)適当量の
(i)炭水化物陽性微生物、その溶解物または部分、
(ii)それらを含んでいる調合物、
(iii)本発明の栄養補助食品もしくは薬学組成物、または
(iv)炭水化物エピトープを有するかもしくは含んでいる分子、
(v)炭水化物エピトープを有する分子を含む混合物、
(vi)炭水化物エピトープ、その溶解物もしくは部分が陽性であるかまたはそれらを含んでいる細胞
を負荷された、適当量の、1つの樹状細胞、複数の樹状細胞、または少なくとも1つの樹状細胞を含む細胞の混合物を、適当量の少なくとも1つの炭水化物結合分子と接触させる工程;
(b)前記炭水化物結合分子の結合を試験する工程
を包含する。
または複数の樹状細胞に対する結合よりも、および/あるいは炭水化物エピトープを有していないかもしくは含んでいない分子、または、炭水化物エピトープを破壊する酵素的または化学的な処理後の炭水化物エピトープを有するかもしくは含んでいる分子を負荷された対応する1つの樹状細胞もしくは複数の樹状細胞に対する結合よりも強いとき、および/または、炭水化物陽性微生物、その溶解物もしくは部分、栄養補助食品、薬学組成物またはそれらの調合物を負荷された前記1つの樹状細胞または複数の樹状細胞に対する炭水
化物結合分子の結合のほうが、負荷されていない対応する1つの樹状細胞または複数の樹
状細胞に対する結合よりも、または、炭水化物結合分子によって結合されない微生物を負荷された対応する1つの樹状細胞または複数の樹状細胞に対する結合よりも、または、炭
水化物エピトープを破壊する酵素的または化学的な処理後の炭水化物陽性微生物を負荷された対応する1つの樹状細胞または複数の樹状細胞に対する結合よりも強いとき、前記1つの樹状細胞または複数の樹状細胞上の炭水化物エピトープの陽性の提示が存在する。
a)適当量のマーカー(例えば、ユーロピウムまたはクロム−51)で標識された、炭水化物エピトープを含んでいる細胞株由来の適当量の標的細胞を、炭水化物エピトープに向けられた少なくとも1つの免疫細胞または炭水化物エピトープに向けられた少なくとも1つの免疫細胞を含む細胞の混合物とともに、適当な時間(代表的には3〜6時間または一晩)にわたって、そして適当な条件下でインキュベートする工程、および
b)マーカー(例えば、ユーロピウムまたはクロム−51)の放出を測定することによって、標的細胞の溶解を測定する工程であって、ここで、炭水化物エピトープに対して陽性の細胞性免疫応答は、炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解のほうが炭水化物エピトープ陰性細胞の溶解よりも有意に高いことを示し、そして/または炭水化物エピトープに向けられた免疫細胞とインキュベートされた、炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解のほうが、炭水化物エピトープに向けられていない対応するコントロール免疫細胞とインキュベートされた、炭水化物エピトープを含んでいる細胞の溶解よりも有意に高いことを示す、工程
を包含する。
本発明は、ヒト細胞または動物細胞由来の分子上に存在する炭水化物エピトープを特異的に認識する少なくとも1つの炭水化物結合分子によって認識される/結合される炭水化物陽性微生物を提供し、ここで、前記微生物は、少なくとも1つの動物またはヒトにおいて前記炭水化物エピトープに対して有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答を誘導する。
(i)本発明の炭水化物陽性微生物、または
(ii)Escherichia coli、Streptococcus、Bacteroides、Rhuminococcus、Lactobacillus、Bifidobacterium、Peptostreptococcus、Fusobacterium、Johnsonella、Atopobium、Staphylococcus、Eubacterium、Finegoldia、Clostridium、Eggerthella、Butyribacterium、Citrobacter、Helicobacter、PropionibacteriumおよびCorynebacteriumを含む群から選択される炭水化物陽性微生物;
より好ましくは、Escherichia coli、Bacteroises(例えば、Bacteroides ovatus、Bacteroides thetaiotaomicron、Bacteroides acidophilus、Bacteroides caccae)を含む群から選択される炭水化物陽性微生物;
なおもより好ましくは、2006年10月20日にGlycotope GmbH,Robert−Roessle−Str.10,13125 Berlin(Germany)によってBraunschweig(Germany)に存在する「DSMZ−Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH」に寄託された、新しい株Bacteroides ovatus AG6(DSM18726)、新しい株Bacteroides ovatus MU1(DSM18728)および新しい株Escherichia coli LH2(DSM18727)を含む群から選択される炭水化物陽性微生物、最も好ましくは、新しい株AG6またはMU1を含む栄養補助食品または薬学調合物
を提供するか、または使用する。
a)適当量の炭水化物陽性微生物またはその部分を少なくとも1つのヒトまたは動物に投与する工程、
b)炭水化物エピトープに対する液性免疫応答試験1〜6のうちの少なくとも1つにおいて免疫応答を試験する工程
を包含する。
a)適当量の炭水化物陽性微生物またはその部分を少なくとも1つのヒトまたは動物に投与する工程、および
b)炭水化物エピトープに対する少なくとも1つの細胞性免疫応答試験において免疫応答を試験する工程を包含する。
(a)目的の炭水化物構造に特異的な炭水化物結合分子を微生物の混合物と接触させる工程、および
(b)前記炭水化物結合分子に結合している少なくとも1つの微生物を前記混合物から分離する工程、
(c)その分離された微生物が炭水化物陽性微生物であり、目的の炭水化物構造(strurcture)を有することを試験する工程
を包含する。
(a)前記炭水化物結合分子を微生物の混合物と接触させる工程;および
(b)前記炭水化物結合分子に結合している少なくとも1つの微生物を分離する工程;および
(c)その分離された微生物を、前記炭水化物結合分子に対する特異的な結合について試験する工程、および
(d)前記炭水化物エピトープに対する、炭水化物特異的で有効な細胞性免疫応答および/または液性免疫応答の誘導を試験する工程
を包含する
前記炭水化物エピトープは、例えば、前記炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体または哺乳動物細胞の一部であり得る。好ましくは、それぞれの液性応答または細胞性応答は、前記微生物ならびに/またはその部分および/もしくは溶解物によって、少なくとも1つの動物またはヒトにおいて引き起こされる。
(a)前記炭水化物結合分子を微生物の混合物と接触させる工程;および
(b)前記炭水化物結合分子に結合している少なくとも1つの微生物を分離する工程;および
(c)その分離された微生物を、前記炭水化物結合分子に対する特異的な結合について試験する工程、および
(d)前記微生物ならびに/またはその部分および/もしくは溶解物による、前記炭水化物エピトープ、および/または前記炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対して有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答の誘導を試験する工程、好ましくはCD4陽性Th1型T細胞の活性化および/または細胞傷害性CD8陽性T細胞の活性化について、好ましくは少なくとも1つの動物もしくはヒトおよび/またはインビトロにおいて試験する工程
を包含する。
a)少なくとも1つの炭水化物結合分子に対するそれの結合について微生物を試験する工程、および
b)本明細書中に記載されているような少なくとも1つの炭水化物結合分子に結合しているこの炭水化物陽性微生物を同定する工程
を包含する。
a)前記炭水化物結合分子を微生物または微生物の混合物と接触させる工程;および
b)前記炭水化物結合分子と特異的に結合している微生物を同定する工程;および
c)前記微生物ならびに/またはその部分およびもしくは溶解物による細胞性免疫応答および/または液性免疫応答の誘導を試験する工程
を包含し、ここで、前記微生物は、前記炭水化物エピトープ、および/または前記炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対する対する有効な炭水化物特異的な細胞性免疫応答および/または液性免疫応答を、好ましくは、少なくとも1つの動物もしくはヒトおよび/またはインビトロにおいて誘導する。
a)前記炭水化物結合分子を微生物または微生物の混合物と接触させる工程;および
b)前記炭水化物結合分子に特異的に結合している微生物を同定する工程;および
c)前記微生物および/またはその部分およびもしくは溶解物による有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答の誘導を試験する工程
を包含し、ここで、前記微生物は、前記炭水化物エピトープ、および/または前記炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対する対する有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答を、好ましくは、少なくとも1つの動物もしくはヒトおよび/またはインビトロにおいて誘導する。
a)少なくとも1つの炭水化物結合分子に対する結合について炭水化物陽性微生物を試験する工程、および
b)炭水化物エピトープおよび/または炭水化物エピトープ陽性の細胞もしくは腫瘍細胞を認識する免疫応答をヒトまたは動物において誘導する能力を試験する工程および
c)本明細書中に記載されているような少なくとも1つの炭水化物結合分子に結合していて、本明細書中に記載されているような液性免疫応答試験1〜6のうち少なくとも1つまたは細胞性免疫応答試験1〜5のうち少なくとも1つに対して陽性であることによって炭水化物エピトープおよび/または炭水化物エピトープ陽性の細胞もしくは腫瘍細胞を認識する免疫応答をヒトまたは動物において誘導する、この微生物を同定する工程
を包含する。
a)便サンプルから全細菌を分離する工程、
b)好気性または嫌気性の条件下で、1つ以上の炭水化物結合分子を用いて炭水化物エピトープ陽性細菌の親和性富化を行う工程、
c)富化された細菌を様々な選択培地上に平板培養し、炭水化物結合分子に対する結合についてスクリーニングする工程
を包含する。
a)便サンプルから、全細菌を含む微生物の混合物を分離する工程
b)炭水化物結合分子を微生物の混合物と接触させる工程
c)好気性または嫌気性の条件下において、磁性粒子分離を用いて炭水化物結合分子に結合する微生物を分離する工程
d)富化された細菌を少なくとも1つの選択培地上に平板培養する工程
e)少なくとも1つの炭水化物結合分子に結合している微生物を同定する工程
を包含する。
a)少なくとも1つの炭水化物結合分子に結合している純粋細菌株を産出する工程;および/または
b)前記純粋細菌株が、少なくとも1つのヒトまたは動物において、炭水化物エピトープに対する免疫応答を誘導するか、または増強する能力について試験する工程
を包含する。
1)炭水化物陽性微生物を同定し、純粋培養物を生産する工程;
2)消化管の免疫的に有効な細菌株を同定する工程;
3)免疫学的および毒物学的に試験された有効な炭水化物陽性調製物を、ヒト試験用の栄養添加物として産出する工程;
4)ヒトにおいて炭水化物特異的な免疫応答を誘導するか、または増強する工程;および必要であれば
5)前記微生物の免疫的に有効な定義された炭水化物エピトープ陽性の部分または成分を分離し、同定し、そして試験する工程
を包含する。
a)大部分の微生物を殺滅する条件下において、化学的突然変異原および/または物理的突然変異原(例えば、EMS、UV、メトトレキサート(methotrexat)、マイクロ波、発癌性物質、発癌物質、突然変異原または放射線照射が挙げられるがこれらに限定されない)によって変異を誘導するための物質(agens)と微生物とを接触させる工程、および
b)生き残っている微生物を適当な条件下で培養する工程、
c)本明細書中の別の箇所において記載されるように炭水化物陽性微生物を富化し、分離し、そしておよび/または同定する工程、
d)少なくとも1つのヒトまたは動物において、前記微生物が炭水化物エピトープに対する免疫応答を誘導するかまたは増強する能力について試験する工程
を包含する。
a)遺伝子、遺伝子の一部、DNA、RNA、アンチセンスRNA、オリゴヌクレオチド、オリゴペプチドまたはタンパク質を微生物中に誘導し、ノックアウトし、そして/またはサイレンシングして、それによって、炭水化物エピトープ生合成、炭水化物エピトープ分解または隣接する炭水化物の生合成もしくは分解に影響を及ぼす工程、および
b)本明細書中の別の箇所において記載されるように炭水化物陽性微生物を富化し、分離し、同定し、そして/または試験する工程
を包含する。
本発明は、本発明の炭水化物陽性微生物の部分を提供し、ここで、炭水化物陽性微生物エピトープは、ヒト細胞または動物細胞由来の分子上に存在し、前記炭水化物陽性微生物の部分は、少なくとも1つの動物またはヒトにおいて前記炭水化物エピトープに対して、有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答を誘導し、炭水化物を特異的に認識する少なくとも1つの炭水化物結合分子に結合する。
本発明は、前記炭水化物エピトープに対する機能的樹状細胞を産出するための方法を提供し、その方法は、適当量の、樹状細胞もしくは樹状細胞の混合物または少なくとも1つの樹状細胞を含む細胞の混合物を、本明細書中の別の箇所において記載されるような適当量の調合物と、適当な時間にわたって、適当な条件下で接触させて、前記炭水化物エピトープおよび/または前記炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対する少なくとも1つの機能的樹状細胞を産出する工程を包含する。上に概説したように、前記炭水化物エピトープは、好ましくは、ヒトエピトープであり、好ましくは無電荷である。好ましくは、前記樹状細胞は、目的の炭水化物エピトープを有するペプチドを負荷されていない。
(a)上に記載されたような適当量の少なくとも1つの機能的樹状細胞を、適当量の少なくとも1つのT細胞もしくはT細胞の混合物または少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物と接触させて、前記T細胞またはT細胞の混合物を、前記負荷された機能的樹状細胞とともに、適切な時間にわたって、適切な条件下で培養することによって前記炭水化物エピトープに対する1つのT細胞または複数のT細胞を活性化するか、またはプライミングする工程、および
(b)ヒト細胞もしくは動物細胞または前記炭水化物エピトープを有する分子を負荷された適当量の少なくとも1つの機能的樹状細胞で前記T細胞を再刺激する工程
を包含する。
(a)適当量の炭水化物陽性微生物、その溶解物または部分を負荷された、適当量の少なくとも1つの機能的樹状細胞または少なくとも1つの機能的樹状細胞を含む細胞の混合物を、少なくとも1つのT細胞または複数数のT細胞と接触させる工程
(b)前記1つのT細胞または複数のT細胞を、前記負荷された機能的樹状細胞とともに、適切な時間にわたって、適切な条件下で培養して、炭水化物エピトープに対して1つのT細胞または複数のT細胞を活性化するか、またはプライミングする工程
を包含する。
(a)適当量の炭水化物エピトープを有する分子、炭水化物エピトープ陽性腫瘍細胞または炭水化物エピトープを含む細胞またはその溶解物もしくは部分を負荷された、適当量の機能的樹状細胞または少なくとも1つの機能的樹状細胞を含む細胞の混合物を、1つのT細胞または複数のT細胞または少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物と接触させる工程
(b)前記1つのT細胞または複数のT細胞または少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物を、前記負荷された機能的樹状細胞とともに、適切な時間にわたって、適切な条件下で培養して、炭水化物エピトープに対して1つのT細胞または複数のT細胞を活性化するか、またはプライミングする工程
を包含する。
(a)適当量の炭水化物陽性微生物またはその溶解物もしくは部分を負荷された適当量の機能的樹状細胞を1つまたはそれ以上のT細胞と接触させる工程
(b)前記負荷された機能的樹状細胞とともに前記1つまたはそれ以上のT細胞を適切な時間にわたって適切な条件下で培養して、炭水化物エピトープに対して1つのT細胞または複数のT細胞を活性化するか、またはプライミングする工程
(c)炭水化物エピトープを有する分子または炭水化物エピトープ陽性腫瘍細胞もしくは炭水化物エピトープを含む細胞あるいはそれらの溶解物もしくは部分を負荷された機能的樹状細胞を、再刺激のために加える工程、
(d)適切な時間および条件で培養する工程
を包含する。
a)適当量の少なくとも1つの炭水化物陽性微生物またはその溶解物もしくは部分を負荷された適当量の少なくとも1つの機能的樹状細胞を、適当量の少なくとも1つのT細胞もしくはT細胞の混合物または少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物と接触させる工程
b)前記T細胞もしくはT細胞の混合物または少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物を、前記負荷された機能的樹状細胞ともに、適切な時間にわたって適切な条件下で培養して、炭水化物エピトープに対して1つまたはそれ以上のT細胞を活性化するか、またはプライミングする工程
を包含する。
a)適当量の少なくとも1つの炭水化物エピトープを有する分子または炭水化物エピトープ陽性腫瘍細胞または炭水化物エピトープを含む細胞あるいはそれらの溶解物もしくは部分を負荷された適当量の少なくとも1つの機能的樹状細胞を、適当量の少なくとも1つのT細胞もしくはT細胞の混合物または少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物と接触させる工程
b)前記T細胞もしくはT細胞の混合物または少なくとも1つのT細胞を含む細胞の混合物を、前記負荷された機能的樹状細胞とともに、適切な時間にわたって適切な条件下で培養して、炭水化物エピトープに対して1つまたはそれ以上のT細胞を活性化するか、またはプライミングする工程
を包含する。
(c)適当量の少なくとも1つの炭水化物エピトープを有する分子または炭水化物エピトープ陽性腫瘍細胞または炭水化物エピトープを含む細胞あるいはそれらの溶解物もしくは部分を負荷された適当量の少なくとも1つの機能的樹状細胞を、再刺激のために加える工程;または、適当量の少なくとも1つの炭水化物陽性微生物、その溶解物または部分を負荷された適当量の少なくとも1つの機能的樹状細胞を、再刺激のために加える工程;および
(d)適切な時間にわたって、そして適切な条件下で培養する工程
を包含する。
(e)適当量の少なくとも1つの炭水化物エピトープを有する分子または炭水化物エピトープ陽性腫瘍細胞または炭水化物エピトープを含む細胞またはその溶解物もしくは部分を負荷された適当量の少なくとも1つの機能的樹状細胞を、再刺激のために加える工程;
(f)適切な時間にわたって、そして適切な条件下で培養する工程
(g)適当量の少なくとも1つの炭水化物陽性微生物またはその溶解物もしくは部分を負荷された適当量の少なくとも1つの機能的樹状細胞を、再刺激のために加える工程
(h)適切な時間にわたって、そして適切な条件下で培養する工程。
本発明は、少なくとも1つの動物またはヒトにおいて、前記炭水化物エピトープ、および/または前記炭水化物エピトープを含んでいる、炭水化物構造、炭水化物結合体もしくは哺乳動物細胞に対して有効な炭水化物に特異的な細胞性免疫応答および/または特異的な液性免疫応答を誘導するためまたは増強するための方法を提供し、その方法は、本明細書中の別の箇所において記載されるような有効量の調合物をヒトまたは動物において投与する工程を包含する。
(i)本明細書中の別の箇所において記載されるように炭水化物エピトープに向けられた、有効量の免疫細胞または少なくとも1つの免疫細胞を含む細胞の混合物をヒトまたは動物に投与し、そしてそのヒトまたは動物において前記免疫細胞によって免疫応答を誘導する工程(プライミング)、および
ii)本明細書中の別の箇所において記載される有効量の調合物の投与によって免疫応答を追加免疫する工程
を包含する。
(i)炭水化物エピトープに向けられた、有効量の免疫細胞または少なくとも1つの免疫細胞を含む細胞の混合物をヒトまたは動物に少なくとも1回投与し、そしてそのヒトまたは動物において前記免疫細胞によって免疫応答を誘導する工程(プライミング)、およびii)炭水化物陽性微生物および/またはその部分を含む有効量の薬学組成物の投与によって免疫応答を追加免疫する工程
を包含する。
i)炭水化物陽性微生物またはその溶解物もしくは部分を含む栄養補助食品をヒトまたは動物に経口投与する工程
ii)炭水化物エピトープの存在を特徴とする疾患の発生に対する免疫防御を誘導するために経口投与を繰り返す工程
を包含する。
ii)炭水化物エピトープに向けられた、有効量の機能的樹状細胞または少なくとも1つの機能的樹状細胞を含む細胞の混合物をヒトまたは動物に少なくとも1回投与し、そしてそのヒトまたは動物において前記機能的樹状細胞によって免疫応答を誘導する工程、および
iii)少なくとも1つの炭水化物陽性微生物ならびに/またはその部分および/もしくは溶解物を含む有効量の薬学組成物を少なくとも1回投与することによって免疫応答を追加免疫する工程
を包含する。
i)炭水化物エピトープに向けられた、有効量の、活性化T細胞、T細胞クローン、T細胞株または少なくとも1つの活性化T細胞を含む細胞の混合物をヒトまたは動物に少なくとも1回投与し、そしてそのヒトまたは動物において前記活性化T細胞によって免疫応答を誘導する工程、および
ii)炭水化物陽性微生物ならびに/またはその部分および/もしくは溶解物を含んでいる、有効量の薬学組成物を少なくとも1回投与することによって免疫応答を追加免疫する工程
を包含する。
inhibitor)(例えば、白砂糖、ステアリン酸、カカオバターおよび硬化油);吸収促進剤(例えば、第四アンモニウム塩およびラウリル硫酸ナトリウム);保湿剤(例えば、グリセリンおよびデンプン);吸収剤(例えば、デンプン、乳糖、カオリン、ベントナイトおよびコロイドケイ酸);および滑沢剤(例えば、精製タルクおよびステアリン酸塩)が挙げられる。必要であれば、調製物は、着色料、保存剤、香料、香味剤および甘味剤をさらに含む。適当な薬学的に許容可能な塩は、当業者に周知であり、そのような塩としては、無機酸および有機酸(例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、酢酸、リンゴ酸、酒石酸、クエン酸、乳酸、シュウ酸、コハク酸、フマル酸、マレイン酸、安息香酸、サリチル酸、フェニル酢酸およびマンデル酸)の塩基性塩が挙げられる。さらに、本発明の化合物の薬学的に許容可能な塩は、例えば、置換基がカルボキシ部分を含む場合、薬学的に許容可能な陽イオンを用いて形成され得る。適当な薬学的に許容可能な陽イオンは、当該分野で周知であり、そのような陽イオンとしては、アルカリ、アルカリ土類アンモニウムおよび四級アンモニウム陽イオンが挙げられる。
ある特定の適用において、本明細書中に開示される調合物は、経口投与を介してヒトまたは動物に送達され得る。そのようなものとして、これらの組成物は、不活性な希釈剤もしくは同化可能な食用キャリアとともに調合され得るか、または硬殻もしくは軟殻ゼラチンカプセル内に封入され得るか、または錠に圧縮され得るか、または食餌の食物に直接組み込まれ得る。
ある特定の状況において、本明細書中に開示される調合物を、非経口的、静脈内、筋肉内または腹腔内に送達することが望ましいことがある。遊離塩基または薬理学的に許容可能な塩としての活性な化合物の溶液は、ヒドロキシプロピルセルロースなどの界面活性物質と適切に混合された水中に調製され得る。分散物は、グリセロール、液体ポリエチレングリコールおよびそれらの混合物中に、ならびに油中に調製され得る。貯蔵および使用の通常の条件下では、これらの調製物は、微生物の増殖を防ぐために保存剤を含む。
F)キット
本発明は、本明細書中の別の箇所において記載されるようにヒトまたは動物において炭水化物エピトープまたは炭水化物エピトープ陽性腫瘍細胞に対する特異的な液性免疫応答および/または細胞性免疫応答を誘導するためのキットにも関し、そのキットは、栄養補助食品または薬学調合物または炭水化物陽性微生物もしくはその部分あるいはそれらを含んでいる調合物(これらは本明細書中の別の箇所に記載されている)およびキットの使用についての情報を含んでいる。
本発明は、目的の炭水化物エピトープを認識する抗体もしくは抗体組成物またはポリクローナル血清を産出するための方法も提供し、その方法は、
(a)上記栄養補助食品、薬学組成物、炭水化物陽性微生物またはその部分をヒトまたは動物と接触させる工程
(b)上記炭水化物エピトープおよび/または炭水化物エピトープ陽性腫瘍細胞を認識する液性免疫応答を誘導するか、または増強する工程
(c)前記抗炭水化物エピトープ抗体または抗体組成物を分離する工程
を包含する。
(i)抗炭水化物エピトープ抗体を産生する少なくとも1つの細胞の不朽化、好ましくは、ハイブリドーマ技術において行われるような不朽細胞株との融合、または好ましくは、エプスタイン・バーウイルス(EBV)などの適当なウイルスによる感染、もしくはEBV由来のE1などの、細胞の不朽化をもたらす少なくとも1つの遺伝子の組換えトランスフェクションによって;または
(ii)上記抗炭水化物エピトープ抗体の少なくとも可変領域、または抗体の特異性に関与する抗炭水化物エピトープ抗体の少なくとも結合領域のペプチド配列の解析、および任意のアイソタイプの抗体全体もしくはそのフラグメントまたは抗炭水化物エピトープ抗体のフラグメントの融合タンパク質、あるいは少なくとも1つの他のアミノ酸またはポリペプチド配列を有する抗体全体として抗炭水化物エピトープ抗体をコードするDNAを用いた細胞の形質転換によって、
行われ得る。
栄養補助食品
本発明によれば、用語「栄養補助食品」とは、ヒトまたは動物によって経口的に摂取され得る、任意の栄養分、栄養分の組成物または調合物のことを意味し、それらとしては、例えば、様々な形態(例えば、カプセル、錠、エマルジョン、粉末、液体であるがこれらに限定されない)で、ならびに、任意の食物もしくは飲み物の形態で、またはその一部として、経口的に適用され得る、栄養分、栄養添加物、食品添加物、食餌性のサプリメント、臨床的な食品もしくは栄養物、医療用の食品もしくは栄養物、経腸食品、医療用経腸栄養物、健康管理用の栄養物もしくは食品、特別な食餌性の用途のための食品、特定の健康用途の食品または機能性食品が挙げられるがこれらに限定されない。特別な場合において、栄養補助食品は、非経口的に供給され得る(非経口食物)。栄養補助食品は、単独で供給され得るか、または少なくとも1つの他の成分と混合され得る。単独での栄養補助食品または少なくとも1つの他の成分とのその混合物は、単独で供給され得るか、または食物もしくは飲み物に混合され得る。栄養補助食品という用語は、任意の食物、飲料、カプセル、錠、エマルジョン、粉末または液体のことも意味する。
本発明によれば、用語「薬学組成物」は、薬物もしくは医薬もしくは生物製剤として使用され得る任意の組成物のことを意味するか、または薬物もしくは医薬もしくは生物製剤の成分である。
本発明によれば、用語「炭水化物陽性微生物」は、ヒト細胞または動物細胞由来の分子上に通常存在する炭水化物エピトープ(本明細書中の別の箇所において定義される)を特異的に認識する少なくとも1つの炭水化物結合分子と接触した際に認識され、そして結合される任意の微生物(mircoorganism)を意味する。好ましくは、この結合は、穏やかな過ヨウ素酸塩による処理、および/あるいは、炭水化物エピトープまたは炭水化物エピトープを含んでいる炭水化物構造の、部分的もしくは完全な化学的または酵素的な除去または変更、および/あるいは、前記炭水化物エピトープを認識する適当量の別の炭水化物結合分子による炭水化物結合分子の結合の阻害、および/あるいは、炭水化物結合分子を用いた結合研究中に微生物とともにインキュベートされるときの、適当量の炭水化物エピトープ、または前記炭水化物エピトープを含む分子、分子の混合物もしくは細胞による炭水化物結合分子の結合の阻害、によって阻害され得る。化学的または酵素的な処理(例えば、過ヨウ素酸塩による処理)後にだけ目的の炭水化物エピトープを露出する微生物もまた、用語「炭水化物陽性微生物」に含まれる。それ故、前記微生物は、前記処理後に、少なくとも対応する炭水化物結合分子と接触する際に、認識され、そして結合される。
本発明によれば、炭水化物結合分子という用語は、ある特定の炭水化物構造を認識するか、またはある特定の炭水化物に応じてそのエピトープに結合する分子のことを意味し、それらとしては、例えば、炭水化物特異的なモノクローナル抗体およびポリクローナル抗体、レクチンおよびセレクチンならびに/またはそれら由来の分子が挙げられるがこれらに限定されない。好ましくは、前記炭水化物結合分子は、ヒト細胞または動物細胞上に存在する炭水化物エピトープ(例えば、腫瘍マーカー)を特異的に認識する。「ヒト」炭水化物エピトープに特異的である各々の炭水化物結合分子を用いることによって、目的の炭水化物エピトープと同一であるか、または模擬の構造を有する(caryying)炭水化物陽性微生物が分離され得、それは、前記炭水化物結合分子(好ましくは抗体である)の結合によって測定され得る。適当な炭水化物結合分子の例は、例えば、表2に記載されている。
本発明によれば、用語「炭水化物エピトープ」とは、炭水化物結合分子と接触した際に結合する構造のことを意味する:
前記炭水化物エピトープは、前記炭水化物結合分子によって結合される炭水化物部分に匹敵し得るか、または、炭水化物エピトープは、炭水化物結合分子によって結合される炭水化物部分を含み得る。さらに明らかにするために、例えば、(i)前記炭水化物エピトープは、四糖LewisYに匹敵し得、その4つすべての炭水化物ユニットは、炭水化物結合分子であるモノクローナル抗体A70−C/C8の結合に必要であるか、または、前記炭水化物エピトープは、炭水化物結合分子であるモノクローナル抗体A46−B/B10に対する結合特異性の最低の必要条件であり、Lewis Yの四糖にも結合する三糖H型2を含むLewisYでもあり、そして/または(ii)前記炭水化物エピトープは、炭水化物分子によって結合される炭水化物部分に匹敵するが、それは、異なって連結される(例えば、α結合の代わりにβ結合もしくはその逆が挙げられるがこれらに限定されない)か、または異なる炭水化物原子を介して連結される、が挙げられるがこれらに限定されない。
本発明によれば、用語「有効な炭水化物特異的細胞性免疫応答」とは、好ましくは以下の特徴を示す炭水化物エピトープを含む免疫原の投与によって誘導される細胞性免疫応答のことを意味する:
(i)上記免疫応答は、炭水化物エピトープに対するものであり、上記免疫応答が、炭水化物特異的であるか、または炭水化物もしくは炭水化物の利用可能性に依存し、その炭水化物エピトープに対する免疫応答が、前記炭水化物エピトープを含んでいる、少なくとも1つの炭水化物構造、炭水化物結合体および/もしくは哺乳動物細胞に対する免疫応答であり得るか、またはその免疫応答を含み得ることを意味し、
(ii)上記免疫応答は、MHC依存型であり、
(iii)上記免疫応答は、Th1型のCD4陽性T細胞の活性化を含むTh1型免疫応答を含み、そして/または
(iv)CD8陽性細胞傷害性T細胞の誘導
好ましくは、Th1型のCD4陽性T細胞の活性化およびCD8陽性細胞傷害性T細胞の誘導である。
本発明によれば、炭水化物陽性微生物の部分という用語は、前記微生物の一部(例えば、細胞壁調製物、エンベロープ調製物、溶解物、リポ多糖(lipopolysaccharid)調製物、カプセル調製物またはカプセル多糖調製物が挙げられるがこれらに限定されない)の調製または精製のことを意味する。それらは、炭水化物エピトープおよび/または最適な抗原を認識する前記炭水化物結合分子の少なくとも1つによって結合される前記炭水化物陽性微生物の少なくとも1つの炭水化物陽性成分を含む。少なくとも1つの炭水化物陽性微生物からの調製工程、精製工程および/または調製工程もしくは精製工程によってそれらを得ることができる。前記調製物および/または精製物は、上に記載されたような当業者に公知の方法、または例えば、1回または連続的な細胞の分画、フェノール水抽出、エーテル抽出、リゾチーム消化またはクロマトグラフィ法もしくはそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない方法によって得ることができる。さらに、炭水化物陽性微生物の部分という用語は、本発明の炭水化物陽性微生物上にも見られる、人工的に(artifically)産出された炭水化物陽性成分も含む。図19は、例えば、いくつかのCore−1陽性成分、Core−1陽性微生物の部分(そこでは:AG6)を示している。Core−1陽性微生物AG6のこれらのCore−1陽性成分/部分は、化学的にも産出され得る。炭水化物陽性成分またはその炭水化物陽性成分を含んでいる部分は、試験システム(例えば、当業者に公知である、ELISA、フローサイトメトリー、免疫蛍光またはドットブロットが挙げられるがこれらに限定されない)において、少なくとも1つの炭水化物結合分子に上記部分を結合させることによって、検出される。本発明の好ましい実施形態において、炭水化物陽性成分を含む部分は、少なくとも1つの炭水化物特異的な抗体を用いたアフィニティークロマトグラフィによって得られる。好ましい実施形態において、1回の調製工程または精製工程が使用される。別の好ましい実施形態において、少なくとも2回の調製工程および/または精製工程の組み合わせが使用される。
本発明によれば、炭水化物陽性成分という用語は、少なくとも1つの炭水化物特異的抗体または炭水化物結合分子と接触した際にそれらによって結合される炭水化物陽性微生物の任意の成分のことを意味する。前記炭水化物陽性成分は、天然の分子の形成において利用され得る、本明細書中の別の箇所で定義されているかまたは記載されているような炭水化物エピトープを含んでいる少なくとも1つの炭水化物構造(それは、微生物の一部(例えば、ペプチド、オリゴペプチド、ポリペプチド、脂質、セラミド、炭水化物、リポタンパク質、多糖、オリゴ糖、多糖、プロテオグリカンまたは糖タンパク質)である)を含んでいるか、または前記天然分子の一部としてもしくは単独で含んでいる。その炭水化物陽性成分は、炭水化物陽性微生物の部分自体として本発明の意味において使用され得るか、または他の非天然キャリア構造(例えば、タンパク質、脂質、ポリアクリルアミドなどの化学的な分子が挙げられるがこれらに限定されない)に結合され得る。好ましくは、それは、その天然の形態で使用されるか、または前記天然分子の一部として使用される。炭水化物陽性成分は、単一の炭水化物エピトープもしくは複数の炭水化物エピトープまたは前記構造の繰り返し単位を有する1つもしくは異なる糖鎖タイプを含み得、さらなる炭水化物構造もしくは炭水化物単位または他の生体分子構造を含み得る。本明細書中の別の箇所において記載されるように、炭水化物エピトープは、少なくとも1つの炭水化物特異的な抗体または結合分子によって結合され得、そして/または炭水化物に対する免疫応答を誘導し得、炭水化物に対する液性免疫応答を優先的に誘導し得、そしてより好ましくは、前記炭水化物に対する有効な細胞性免疫応答を誘導し得、炭水化物に対する液性免疫応答および炭水化物に対する有効な細胞性免疫応答をなおもさらに優先的に誘導し得る構造である、炭水化物に模擬の構造であり得るか、またはそのような構造を含み得る。
本発明によれば、用語「天然分子」とは、少なくとも1つの生存している生物もしくは死亡した生物(例えば、プリオン、ウイルス、微生物、原生動物、細菌、藻類、真菌、植物、動物、ヒトが挙げられるがこれらに限定されない)上に存在するか、またはその有機体によって産生される任意の生体分子またはその一部のことを意味する。
細菌の培養において使用される嫌気性の技術は、BreznakおよびCostilowによって要約されている先に報告された方法に基づいた。還元剤としてシステイン・HClを用いて調製した培地を、嫌気性培養チューブ(Ochs,Bovenden,Germany)またはガラス血清瓶に分注し、容器の総容積の約2分の1から3分の1の容積が気体の空間となるようにし、ブチルゴムの栓で密閉した。還元剤なしで調製した溶液(例えば、PBS−a)を分注前に煮沸した。オートクレーブの前に、気相をN2/CO2(80/20,v/v)で置換した。これを達成するために、ブチルゴムの栓をしたビンに針を突き刺し、真空ポンプ(Vacuubrand,Wertheim,Germany)を用いてその瓶を排気した。排気後、瓶をプロセス全体にわたって繰り返し振盪させながら、N2/CO2(80/20,v/v)を供給した。この気体を抜く手順および供給する手順を、全部で3回行った。その気体混合物を、容器に入れる前に熱パラジウム触媒の上を通過させて、その気体混合物中に残留する微量の酸素を除去した。リザズリン(1mgl−1)をレドックス指示薬として用いた。
2.1 TF1およびTF2でコーティングされたDynabeads(登録商標)の調製
100μlの体積のDynabeads(登録商標)(M−450 Rat Anti−Mouse IgM,Dynal Biotech ASA,Oslo,Norway)の各々を2mlのSafe−Lock Eppendorfチューブ(Eppendorf,Hamburg,Germany)に入れ、Dynal Magnetic Particle Concentrator(登録商標)−S(MPC(登録商標)−S,Dynal Biotech,Oslo,Norway)を用いて2mlのリン酸緩衝化食塩水a(PBS−a:8.1gl−1NaCl、0.16gl−1NaH2PO4・H2O、0.98gl−1Na2HPO4・2H2O、1gl−1BSA,pH7.4)で2回洗浄し、そして25μlのPBS−aに懸濁した。凍結乾燥されたTF1またはTF2細胞培養上清を1mlのmilli−Q合成グレード水(Millipore,Billerica,MA,USA)に溶解した。溶解されたTF1またはTF2細胞培養上清(1ml)を、Dynabeads(登録商標)の入ったチューブに加え、試験管回転装置(モデル34528,Snijders Scientific,Netherlands)上で4℃において30分間インキュベートした。チューブをMPC(登録商標)−Sに置き、3分間静置した後、ピペットを用いて流体を除去した。そのDynabeads(登録商標)を2mlのPBS−aに再懸濁し、MPC(登録商標)−Sに置き、そして流体をピペッティングで除去した。この洗浄工程を3回行った。洗浄されたDynabeads(登録商標)をその初めの容積である100μlのPBS−aに懸濁した。この様式で調製されたDynabeads(登録商標)を、2mlのPBS−aでの3回の洗浄工程を繰り返した後、すぐに、または調製の2週間以内に、使用した。
8人の志願者(表3)の便サンプルを有孔のプラスチックチューブに回収し、AnaeroGen Compact(Oxoid,Basingstoke,England)を用いて無酸素条件下において維持し、そして処理の前に最大で4時間4℃で保存した。志願者は、サンプリング日の前の少なくとも3ヶ月間、抗生物質を投与されておらず、通常の食事を消費していた健常成人であった。
100倍希釈物からの20μlを、180μlのPBS−aおよびTF1抗体またはTF2抗体でコーティングされた5μlのDynabeads(登録商標)を含む2mlのチューブに加えた。そのチューブを試験管回転装置上で4℃において30分間インキュベートした。そのチューブをMPC(登録商標)−Sに置き、3分間静置した後、できるだけ多くの上清を、シリンジおよび針を用いた吸引により除去した。そのサンプルを2mlのPBS−aで3回洗浄し、再度できるだけ多くの上清を除去した。
洗浄されたサンプルを1mlのPBS−bに懸濁し、100μlのアリコートを様々な選択培地および非選択培地(表4)上にスプレッドプレーティングし(spread−plated)、嫌気性チャンバー内において37℃で48時間インキュベートした。
3.1 生化学
VITEKシステム(Biomerieux,Marcy l’Etoile,France)を用いて細菌を同定した。製造者の指示書に従って細菌を調製し、使用した同定カードは以下のとおりであった:嫌気性分離菌およびMRSブロス中で生育することができる通性(faculatively)嫌気性グラム陽性桿菌(lactobacilliと疑われる)に対するANIカード、グラム陽性分離菌に対するGPIカード、およびグラム陰性好気性分離菌に対するGNI+カード。
Invisorb Genomic DNA Kit III(Invitek,Berlin,Germany)をプロトコルIIIBに対する製造者の指示に従って使用して、液体培養物から得た洗浄細胞ペレット(1mlの溶解緩衝液Dに懸濁したもの)からDNAを抽出した。プライマー27f(5’AGAGTTTGATCCTGGCTCAG)および1492r(5’TACCTTGTTACGACTT)(10)を用いて、細菌16SリボソームRNA遺伝子を増幅した。
DNA Mass Ladder(Invitrogen,Carlsbad,USA)を用いて、DNA濃度を推定した。
Dynabead(登録商標)の富化手順を繰り返すことによって得られたいくつかのCore1陽性分離菌は、異なる培地から分離されたにも関わらず、それらの細胞およびコロニーの形態が非常に類似しているように見えた。それらの株は、VITEKシステムを用いて得られた生化学的なプロファイルに関しても類似していた。そこで、それらの分離された細菌は同一の株ではないのかという疑問が生じた。RAPDは、株を区別するために適用することができる、配列情報を必要としない方法である。簡潔には、低ストリンジェンシーにおいて10塩基対のプライマーを用いて全ゲノムDNAをPCR増幅すると、標的DNA中に存在する、プライマーと相同な配列に基づいてDNAのランダムな配列が増幅される。得られたPCR産物をアガロースゲル電気泳動で分離し、そして得られたパターンを株間で比較する。すべてのLH株に対して得られたバンドパターンが、使用した5つのRAPDプライマー(OPL07、M13、OPX14、OPA16、OPA18)について類似していた。そのパターンは、血液型B活性を有すると報告されている株であるE.coliのDSMZ8697株のパターンとは明らかに異なっていた(図2a)。MU株も、非常に良く似ているように見える(図2b);しかしながら、それらのバンドパターンは、AG6を含む他のBacteroides株のパターンと明らかに異なっていた。1つのCore1陽性株が、分離プロセス中に各陽性ドナーから繰り返し富化されたとみられる。分離された株は、個体間で異なっていた。
十分に離れているコロニーを選択寒天プレートおよび非選択寒天プレートからランダムに拾い、非選択培地上に3回再画線した。シングルコロニーを拾い、最良の増殖がもたらされるものに応じて、ST(上記の通り、寒天を除いたもの)、WCまたはMRSブロスに接種し、37℃で一晩増殖させた。これらの培養物を300mlの新鮮ST、WCまたはMRSブロスに接種し(1%)、37℃で一晩増殖させた。細胞をペレットにし(8000×g,15分,4℃)、10mlのPBS−c(8gl−1NaCl、0.2gl−1KCl、1.44gl−1Na2HPO4、0.24gl−1KH2PO4)(12)に再懸濁した。この懸濁液を、PBS−c中の30mlの4%パラホルムアルデヒド(PFA)溶液((8)に従って調製したもの)を加えることによって4℃で3〜4時間固定した。次に、サンプルを40mlのPBS−cで洗浄し(8000×g,15分,4℃)、ペレットを15mlのPBS−cに懸濁した後、等体積の96%氷冷エタノールを加えた。サンプルを解析するまで−20℃で保存した。
製造者の指示に従ってMicrobankチューブ(MAST Diagnostica,Reinfeld,Germany)内で寒冷貯蔵物(Cryo−stocks)を維持し、−80℃で保存した。通常貯蔵物(Working stocks)をWC、STまたはMRSブロス中で維持した。これらを14日ごとに継代した。好気性条件と嫌気性条件の両方における、グラム染色挙動、細胞の形態およびCBA画線プレート上でのコロニーの形態の定期的な比較を観察することによって、その培養物の純度を確かめた。
動物実験において使用するために、上記細菌を生育し、以下の改変を行いつつセクション3に記載したように固定した:最初の培養物の体積を約4lとした。固定する前に、細菌を100mlのPBS−bで1回洗浄し(8000×g,15分,4℃)、可能な最少量のPBS−bに再懸濁した。この懸濁液を等量の2つに分け、一方を固定(7.1)、他方を凍結乾燥(7.2)に用いた。
固定用の分を洗浄し(8000×g,15分,4℃)、30mlのPBS−cに再懸濁した。この懸濁液をPBS−c中の90mlの4%PFA溶液に加え、4℃で3〜4時間固定した。PFAの除去を改善するために、サンプルを120mlのPBS−cで3回洗浄した(8000×g,15分,4℃)。細胞ペレットを45mlのPBS−cに懸濁した後、等体積の96%氷冷エタノールを加えた。サンプルを−20℃で保存した。
細菌の懸濁液をPBSで2回洗浄し、少量のPBSに再懸濁した。細菌の懸濁液を72℃で30分間インキュベートした。不活性化成功のコントロールとして、細菌を実施例4に記載したような適当な培養液中でインキュベートした。
凍結乾燥用の分を、等体積の24%フィルター滅菌スクロースに加え、2mlのLidBacチューブに300μlずつ等分した。これらのアリコートを1時間にわたって液体窒素中で急速凍結し、そのアリコートを予め−80℃に冷やしておいたラックに置いた後、凍結乾燥した(Alpha2−4,Christ,Osterode,Germany)。凍結乾燥後、チューブの蓋を閉め、乾燥剤としてシリカゲルオレンジ(Roth,Karlsruhe,Germany)を加えたAnaerocult(登録商標)C小型ガス発生装置システム(Merck,Darmstadt,Germany)を用いて、そのチューブを4℃で保存した。
0.01mm深Thomaチャンバー(LO−Laboroptik,Friedrichsdorf,Germany)を用いて、固定された細菌調製物および凍結乾燥された細菌調製物の総細胞数を測定した。凍結乾燥された細菌については、一晩培養物ならびに凍結乾燥の直前および凍結乾燥の後の、10倍段階希釈物をWC寒天上にプレーティングすることによって、コロニー形成単位(CFU)を測定した。この目的のために、凍結乾燥物(lyophilate)を300μlのWCブロスに溶解し、15分間静置し、低速でボルテックスすることによって再懸濁し、そして段階希釈した。動物実験で使用する前および使用した後の凍結乾燥調製物のCFUを数え上げることにより、生存能を確認した。セクション4に記載したように、調製物の純度を検査した。
S−monvetteシステム(Sarstedt,Nuembrecht,Germany)を用いて血液を回収し、製造者の指示に従って血清を調製した。解析する前に、血清サンプルを分注して−80℃で保存した。
便サンプルを回収し、−80℃で保存した。便を凍結乾燥し、正味乾燥重量を記録した。すべての操作を氷上で行った。いくつかの改変を行ったGrewal(6)に従って便IgAを抽出した。プロテアーゼインヒビター(5μgml−1ロイペプチン(Calbiochem,Merck)、48μgml−14−(2−アミノエチル)ベンゼンスルホニルフッ化物(Merck)、1μgml−1アプロチニン、2μgml−1ベスタチン(Sigma,Steinheim,Germany)を含むIgA抽出緩衝液(1gl−1BSAを含むPBS−Dulbecco(Biochrom,Berlin,Germany))中に15μl/mgの乾燥重量の割合で、凍結乾燥サンプル(約30mg)を懸濁し、ホモジナイズした。そのサンプルを10分ごとにボルテックスすることによって混合した。1時間インキュベーションした後、そのサンプルを遠心し(16000×g,10分,4℃)、上清を新しいチューブに回収した。IgA抽出緩衝液中に10μl/mgの乾燥重量の割合で、残っているペレットを懸濁し、ホモジナイズした。この抽出手順を繰り返し、得られた上清を、最初の抽出工程からの上清と併せた。これらの上清を遠心し(16000×g,10分,4℃)、得られた上清を新しいチューブに移し、液体窒素中で急速凍結し、そして解析するまで−80℃で保存した。
固定された細菌をPBSに希釈し、細胞数を1×105、1×106、5×106、1×107、1×108または5×108細胞/mlに調整した。
10.1.SDS−PAGEおよびウエスタンブロット解析による粗カプセル調製物の解析
AG6株の粗カプセル調製をPantostiら(1991,Infect.Immun.59,2075−2082)に従って行った。
Haraら、1989,Anal.Biochem.179,162−166)に従った11,2pmol/μgのKDO含有量、およびSDS−PAGEによって示されるように、AG6株のカプセル調製物内に、なおもリポ多糖類の夾雑物が存在していた。
最初の工程において、B.ovatus AG6の粗カプセル状調製物のcore−1陽性多糖(polysasccharide)を、前にすでに記載したように逆相クロマトグラフィによって蓄積した。その後、精製収量ならびに蓄積されたcore−1陽性多糖(polysasccharide)の単糖含有量をHPAEC−PAD解析によって測定した。
上ですでに記載したようにマトリックス支援レーザー飛行時間型(time−off flight)質量分析(MALDI−TOF−MS)およびエレクトロスプレーイオントラップ質量分析(ESI−Ion−Trap−MS)によって、core−1陽性多糖の構造を解析した。
表8:ESIイオントラップ質量分析による構造解析(ポジティブモード)。100℃で1,5時間、1%酸性酸を用いて加水分解することによって、精製core−1陽性多糖を部分化した。
core−1陽性カプセル状多糖の繰り返し単位の配列を、フラグメントを重複させることによって測定した(図6)。
上記繰り返し単位におけるGalβ1−3GalNAcの分枝core−1構造は、エキソグリコシダーゼβ1−3ガラクトシダーゼおよびHexNAcase(β1−2,3,4,6GalNAc/GlcNAc切断)を用いて二重消化した後の、上に記載したような単糖(monosaccharid)解析によって特定されるはずである。
core−1陽性多糖構造をさらに検証するために、グリカン(glykan)を1%酸性酸による加水分解によって部分化した(1,5h,100℃)。そのグリカンフラグメントを、J.C.Biggeら(1995)によってすでに報告されているようにフルオロフォア2−アミノベンズアミド(2−AB)で標識した。この手順のために、Carbograph SPEカラム(Alltech Associates Inc.)での精製によって、サンプルから粒子および塩を除去し、凍結乾燥した。そのペレットをDMSO/氷酢酸/シアノ水素化ホウ素ナトリウム中の5□lの2−ABに溶解し、60℃で2時間インキュベートした。その2−AB標識されたフラグメントをペーパークロマトグラフィによって遊離2−ABと分離した。最後に、2−AB結合体化フラグメントを水で溶出した。凍結乾燥した後、そのペレットを50%アセトニトリルに溶解した。そのフラグメントを、フラグメントの大きさに基づいて、蛍光検出を用いた順相HPLC(カラム:Luna 3□NH2 A100, Phenomenex,溶出剤A:15mM 酢酸アンモニウム,溶出剤B:アセトニトリル)によって分離した。フラグメントの配列をESI質量分析で解析した。最後に、グリコシド結合の検証、およびそのフラグメントの成分である単糖類のより良好な同定のために、前にすでに記載したように、エキソグリコシダーゼ(exoglykosidase)β1−3ガラクトシダーゼ、α1−3,4フコシダーゼおよびHexNAcaseを用いて、それらのオリゴ糖を消化した。消化の成功を、ESI質量分析によって照合し、末端の単糖類の除去を、前にすでに記載したようにHPAEC−PADによって同定した。
11.1 死細菌によるマウスの腹腔内免疫
11.1.1 液性免疫応答試験1によるマウス血清の解析
雌Balb/cマウス(Charles River,1群あたり4匹)を、−1日目に50mg/kg体重の用量のシクロホスファミド(Cyclophosphamid)で処置した。0、7および14日目に、マウスの腹腔内に、PBS中の5×108細菌(core−1陰性AG3株(I群)、32もしくは53もしくはcore−1陽性AG6株(K群))またはPBSのみ(L群)を注射した。血清サンプルを−4、21、27および30日目に採取した。
ウェルを、50mM酢酸ナトリウム緩衝液pH4.5とともに5分間インキュベートした後、酢酸緩衝液中の10mM過ヨウ素酸とともに、暗黒下で1時間インキュベーションした。ウェルを50mM酢酸ナトリウム緩衝液pH4.5とともに5分間インキュベートした。水素化ホウ素ナトリウムとのインキュベーション(PBS中50mM,30分間)によって反応を停止した。次に、プレートをPBS/Tweenで5回洗浄した。
0、7および14日目に、雄C3Hマウス(Charles River,1群あたり4匹)の腹腔内に、200μlのPBS中の、Core−1陽性(postive)株およびCore−1陰性株からの5×108低温殺菌細菌を注射した。血清を免疫の前ならびに13、21および28日目に回収し、液性免疫応答試験2において解析した。
雌Balb/cマウス(Charles River,1群あたり4匹)を、−1日目に50mg/kg体重の用量のシクロホスファミドで処置した。0、7および14日目に、マウスの腹膜内に、PBS中の5×108細菌(core−1陰性AG3株(I群)、32もしくは53もしくはcore−1陽性AG6株(K群))またはPBSのみ(L群)を注射した。血清サンプルを−4、21、27および30日目に採取した。
0、7および14日目に、C3Hマウス(Charles River,1群あたり4匹)の腹腔内に、200μlのPBS中の、Core−1陽性Bacteroides ovatus株であるBacteroides ovatusMU−1、A68−BA11−陽性E.coli LH2株およびCore−1陰性E.coli株(AG3,E.coli O86 DSMZ8697=32)からの1×109低温殺菌細菌を免疫した。血清を免疫の前ならびに13、21および28日目に回収し、上に記載されたような液性免疫応答試験1、2および3において解析した。
2、3、4、9、10、11、16、17および18日目に、無菌C3H−マウスをAG6株の2×109生細菌で経口的に免疫した。血清サンプルを0日目(免疫前の血清)ならびに14および21日目に採取し、液性免疫応答試験1においてAGP特異的IgM抗体について解析した。
C3H−マウスを、0〜28日目に毎日、1×1011(A群)または1×1010(B群)のAG6株の低温殺菌細菌で経口的に免疫した。血清サンプルを−1日目(免疫前の血清)ならびに13、21、28および35日目に採取し、液性免疫応答試験1においてAGP特異的IgM抗体について解析した。
(NM−D4免疫血清上の陽性細胞%−NM−D4免疫前血清上の陽性細胞%)/(NM−wt免疫血清上の陽性細胞%−NM−wt免疫前血清上の陽性細胞%)=X
商X≧10のときのマウス血清を、陽性と見なした(ここで、NM−wt免疫血清上の陽性細胞%−NM−wt免疫前血清上の陽性細胞%≧1)。
12.1 機能的樹状細胞の産出
樹状細胞株NemodDC(pNM−DC)が、抗原提示細胞(APC)に対する供給源として用いられている。pNM−DCをiNM−DCに分化させた後、それらに以下の細菌株:AG6、MU1、52および53の細菌溶解物(BaLy)を負荷した。50μg/mlのすべてのBaLyを、成熟サイトカインとともに培養液に加え、iNM−DCを成熟状態(mNM−DC)に分化させた。
Core−1陽性細菌溶解物を負荷されたNM−DCによるTリンパ球のプライミングの7〜10日後に、得られたT細胞(0,7〜1×106/ml)を、Core1陽性(positiv)腫瘍細胞溶解物(50μg/ml)を負荷されたmNM−DC(1×105/ml)で再刺激した。48時間のインキュベーションの後、上清を回収し、GM−CSF−およびTNF−α−BD OptEIA(商標)キットを用いて、ヒトCore−1陽性腫瘍細胞株NM−D4に応答したサイトカイン産生を評価するためにアッセイした。
抗原特異的刺激に応答したIFN−γの分泌を評価するために、ELISpotアッセイを用いた。このアッセイによって、予め感作されたT細胞が抗原特異的様式でCore1抗原を認識する機能的能力の定量が可能になる。
ELISpot解析について上に記載したような、感作されたT細胞および再刺激されたT細胞を、インキュベーション後にELISpotプレートから96ウェルプレートに移し、比色分析の細胞増殖試薬WST−1(Roche Molecular Biochemicals)を用いてアッセイし、ここで、その試薬のテトラゾリウム塩は、ミトコンドリア酵素によって開裂され、発色する色素の量(450nmにおいて読み出される)は、その培養物中の代謝的に活性な細胞の数に直接相関する。培地+細胞が存在しないwst−1の吸光度を、酵素結合免疫吸着測定リーダーのブランク位とした。その手順は、1ウェルあたり10μlのWST増殖試薬(Roche)の一段階添加および37℃での3時間のインキュベーション、続いて、450nmにおける測定からなる。
細菌溶解物が負荷されたNM−DCによるCore−1のプロセッシングおよび提示を解析するために、core−1特異的モノクローナル抗体(Nemod−TF1,NEMOD−TF2)を用いて免疫蛍光解析を行った。成熟DCの表面上における、プロセッシングされたCore1−抗原の提示は、免疫蛍光法を用いて証明された。免疫蛍光法(IF)は、特異的抗原(Core1)と特異的なCore−1抗体との結合の後、1次抗体を認識するために使用される、蛍光色素で標識された2次抗体を加えることによって、細胞上の特異的抗原の可視化を可能にする技術である。
NM−D4(DSM ACC2605)、NM−F9(DSM ACC2606)、ZR−75−1(ATCC CRL−1500)、CAMA−1(ATCC HTB−21)、KG−1(DSM ACC14)またはA−204(DSM ACC 250)。NM−wtまたはNM−H9(またはNM−H9D8 DSM ACC2806)。NM−9およびNM−D4細胞株は、Nemod Biotherapeutics GmbH & Co.KG,Robert−Rossle−Strasse 10,13125 Berlin,Germany(すなわち寄託者)によってDSMZに寄託されており、その寄託人は、本願の出願人が本明細書中に記載される寄託された生物物質に言及することを許可しており、かつ、本明細書中に記載される寄託された生物物質を欧州特許条約のRule28(1)(d)に従って公衆に入手可能にすることに無条件かつ撤回不能の承諾を本願の出願人に与えている。DSMZは、Mascheroder Weg 1b,D−38124 Braunschweig,Germanyに存在する。上述のDSMZへの寄託物は、特許手続上の微生物の寄託の国際的な承認に関するブダペスト条約の条項に準じた。
Berlin(Germany)によってBraunschweig(Germany)に存在する「DSMZ−Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH」に寄託された。
受託番号DSM ACC2605についての、PCT/RO/134様式に基づくさらなる表示
出願人はここにおいて、個々の規定を有する国に対して、本願において言及されている寄託された生物学的材料の試料の供与は、無関係の、指名された専門家に対してのみなさ得ることを要求する(適用可能な場合、特にオーストラリア、カナダ、クロアチア、デンマーク、フィンランド、ドイツ、アイスランド、ノルウェー、シンガポール、スペイン、スウェーデン、英国、ヨーロッパにおいて、「エキスパートソリューション(expert solution)」の要求)。
受託番号DSM ACC2606についての、PCT/RO/134様式に基づくさらなる表示
出願人はここにおいて、個々の規定を有する国に対して、本願において言及されている寄託された生物学的材料の試料の供与は、無関係の、指名された専門家に対してのみなさ得ることを要求する(適用可能な場合、特にオーストラリア、カナダ、クロアチア、デンマーク、フィンランド、ドイツ、アイスランド、ノルウェー、シンガポール、スペイン、スウェーデン、英国、ヨーロッパにおいて、「エキスパートソリューション(expert solution)」の要求)。
したがって、ヨーロッパに関しては、出願人は、寄託された生物学的材料が、EPC規則28(3)において規定されるように、特許を付与する旨の告示が公表されるまで、または特許出願が拒絶され、取り下げられ、もしくは取り下げられたものとみなされる場合には出願の日から20年間、試料の請求人により指名された専門家に試料を分譲することによってのみ入手可能となされる(EPC規則28(4))ことを要求する。
受託番号DSM ACC2806についての、PCT/RO/134様式に基づくさらなる表示
出願人はここにおいて、個々の規定を有する国に対して、本願において言及されている寄託された生物学的材料の試料の供与は、無関係の、指名された専門家に対してのみなさ得ることを要求する(適用可能な場合、特にオーストラリア、カナダ、クロアチア、デンマーク、フィンランド、ドイツ、アイスランド、ノルウェー、シンガポール、スペイン、スウェーデン、英国、ヨーロッパにおいて、「エキスパートソリューション(expert solution)」の要求)。
したがって、ヨーロッパに関しては、出願人は、寄託された生物学的材料が、EPC規則28(3)において規定されるように、特許を付与する旨の告示が公表されるまで、または特許出願が拒絶され、取り下げられ、もしくは取り下げられたものとみなされる場合には出願の日から20年間、試料の請求人により指名された専門家に試料を分譲することによってのみ入手可能となされる(EPC規則28(4))ことを要求する。
受託番号DSM 18726についての、PCT/RO/134様式に基づくさらなる表示
出願人はここにおいて、個々の規定を有する国に対して、本願において言及されている寄託された生物学的材料の試料の供与は、無関係の、指名された専門家に対してのみなさ得ることを要求する(適用可能な場合、特にオーストラリア、カナダ、クロアチア、デンマーク、フィンランド、ドイツ、アイスランド、ノルウェー、シンガポール、スペイン、スウェーデン、英国、ヨーロッパにおいて、「エキスパートソリューション(expert solution)」の要求)。
受託番号DSM 18727についての、PCT/RO/134様式に基づくさらなる表示
出願人はここにおいて、個々の規定を有する国に対して、本願において言及されている寄託された生物学的材料の試料の供与は、無関係の、指名された専門家に対してのみなさ得ることを要求する(適用可能な場合、特にオーストラリア、カナダ、クロアチア、デンマーク、フィンランド、ドイツ、アイスランド、ノルウェー、シンガポール、スペイン、スウェーデン、英国、ヨーロッパにおいて、「エキスパートソリューション(expert solution)」の要求)。
したがって、ヨーロッパに関しては、出願人は、寄託された生物学的材料が、EPC規則28(3)において規定されるように、特許を付与する旨の告示が公表されるまで、または特許出願が拒絶され、取り下げられ、もしくは取り下げられたものとみなされる場合には出願の日から20年間、試料の請求人により指名された専門家に試料を分譲することによってのみ入手可能となされる(EPC規則28(4))ことを要求する。
受託番号DSM 18728についての、PCT/RO/134様式に基づくさらなる表示
出願人はここにおいて、個々の規定を有する国に対して、本願において言及されている寄託された生物学的材料の試料の供与は、無関係の、指名された専門家に対してのみなさ得ることを要求する(適用可能な場合、特にオーストラリア、カナダ、クロアチア、デンマーク、フィンランド、ドイツ、アイスランド、ノルウェー、シンガポール、スペイン、スウェーデン、英国、ヨーロッパにおいて、「エキスパートソリューション(expert solution)」の要求)。
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