JP2014531904A5 - - Google Patents

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  1. イソプレンを産生することのできる組換え細胞であって、ホスホケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードしている1種以上の異種核酸と、(i)完全なMVA経路の1種以上のポリペプチドをコードしている1種以上の核酸、及び(ii)イソプレンシンターゼポリペプチドをコードしている異種核酸と、を含み、好適な培地で前記組換え細胞を培養することにより、イソプレンの産生が得られる、組換え細胞。
  2. イソプレノイド前駆体を産生することのできる組換え細胞であって、ホスホケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードしている1種以上の異種核酸と、完全なMVA経路の1種以上のポリペプチドをコードしている1種以上の核酸とを含み、好適な培地で前記組換え細胞を培養することによりイソプレノイド前駆体の産生が得られる、組換え細胞。
  3. イソプレノイドを産生することのできる組換え細胞であって、ホスホケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードしている1種以上の異種核酸と、(i)完全なMVA経路の1種以上のポリペプチドをコードしている1種以上の核酸及び(ii)ポリプレニルピロリン酸シンターゼポリペプチドをコードしている異種核酸とを含み、好適な培地で前記組換え細胞を培養することにより、イソプレノイドの産生が得られる、組換え細胞。
  4. ホスホケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードしている前記1種以上の異種核酸が、キシルロース5−リン酸からグリセルアルデヒド3−リン酸及びアセチルリン酸を合成することができる、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  5. ホスホケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードしている前記1種以上の異種核酸が、フルクトース6−リン酸からエリスロース4−リン酸及びアセチルリン酸を合成することができる、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  6. ホスホケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードしている前記異種核酸が、ビフィドバクテリウム・ロングム(Bifidobacterium longum)、エンテロコッカス・ガリニアラム(Enterococcus galliniarum)、クロストリジウム・アセトブチリカム(Clostridium acetobutilicum)、ノストック・パンクチホルム(Nostoc punctiforme)、ロードシュードモナス・パルストリス(Rhodopseudomonas palustris)、パントエア(Pantoea)、ムチラギニバクター・パルジス(Mucilaginibacter paludis)、サーモビフィダ・フスカ(Thermobifida fusca)、ビフィドバクテリウム・ブレビ(Bifidobacterium breve)、ラーネラ・アクアティリス(Rahnella aquatili)、ビフィドバクテリウム・アニマリス(Bifidobacterium animalis)、ガードネレラ・バギナリス(Gardnerella vaginalis)、ストレプトマイセス・アベルミティリス(Streptomyces avermitilis)、ラクトバチルス・プランタラム(Lactobacillus plantarum)、及びラクトバチルス・ロイテリ(Lactobacillus reuteri)からなる群から選択される、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  7. ホスホケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードしている前記異種核酸が、ビフィドバクテリウム・ロングム(Bifidobacterium longum)、エンテロコッカス・ガリニアラム(Enterococcus galliniarum)、及びクロストリジウム・アセトブチリカム(Clostridium acetobutilicum)からなる群から選択される、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  8. イソプレンシンターゼポリペプチドをコードしている前記異種核酸が植物のイソプレンシンターゼポリペプチドである、請求項1に記載の細胞。
  9. 前記イソプレンシンターゼポリペプチドが、クズ属(Pueraria)又はハコヤナギ属(Populus)、又はウラジロハコヤナギとヤマナラシの交雑種(Populus alba x Populus tremula)由来のポリペプチドである、請求項1に記載の細胞。
  10. 前記イソプレンシンターゼポリペプチドが、プエラリア・モンタナ(Pueraria montana)又はプエラリア・ロバタ(Pueraria lobata)、ヤマナラシ(Populus tremuloides)、ウラジロハコヤナギ(Populus alba)、ポプラ・ニグラ(Populus nigra)、及びポプラ・トリコカルパ(Populus trichocarpa)からなる群から選択される、請求項1に記載の細胞。
  11. 前記完全なMVA経路の1種以上のポリペプチドが、(a)2分子のアセチルCoAを縮合させてアセトアセチルCoAを生成する酵素;(b)アセトアセチル−CoAをアセチル−CoAと縮合させてHMG−CoAを生成する酵素(例えば、HMGシンターゼ);(c)HMG−CoAをメバロン酸に変換する酵素;(d)メバロン酸をメバロン酸5−リン酸にリン酸化する酵素;(e)メバロン酸5−リン酸を5−ジホスホメバロン酸に変換する酵素;及び(f)5−ジホスホメバロン酸をイソペンテニルピロリン酸に変換する酵素から選択される、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  12. 前記組換え細胞が、1−デオキシ−D−キシルロース5−リン酸(DXP)経路の1種以上のポリペプチドをコードしている1種以上の核酸を更に含む、請求項11に記載の細胞。
  13. 前記1種以上の核酸が、誘導型プロモータ又は構成型プロモータ下に配置される、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  14. 前記1種以上の核酸が、1つ以上の多コピープラスミドにクローニングされる、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  15. 前記1種以上の核酸が、前記細胞の染色体に組み込まれる、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  16. 前記組換え細胞が、グラム陽性菌細胞、グラム陰性菌細胞、真菌細胞、糸状菌細胞、藻類細胞、又は酵母細胞である、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  17. 前記組換え細胞が、バチルス・スブチリス(Bacillus subtilis)、ストレプトマイセス・リビダンス(Streptomyces lividans)、ストレプトマイセス・セリカラー(Streptomyces coelicolor)、ストレプトマイセス・グリセウス(Streptomyces griseus)、大腸菌(Escherichia coli)、パントエア・シトレア(Pantoea citrea)、トリコデルマ・リーゼイ(Trichoderma reesei)、アスペルギルス・オリゼ(Aspergillus oryzae)、アスペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)、サッカロミセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisieae)、及びヤロウイア・リポリティカ(Yarrowia lipolytica)からなる群から選択される、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  18. 前記イソプレノイドが、モノテルペン、ジテルペン、トリテルペン、テトラテルペン、セスキテルペン(sequiterpene)及びポリテルペンからなる群から選択される、請求項に記載の細胞。
  19. 前記イソプレノイドが、セスキテルペンである、請求項に記載の細胞。
  20. 前記イソプレノイドが、アビエタジエン、アモルファジエン、カレン、α−ファルネセン(famesene)、β−ファルネセン、ファルネソール、ゲラニオール、ゲラニルゲラニオール、リナロール、リモネン、ミルセン、ネロリドール、オシメン、パチョロール、β−ピネン、サビネン、γ−テルピネン、テルピンデン(terpindene)及びバレンセンからなる群から選択される、請求項に記載の細胞。
  21. 前記組換え細胞が、酢酸キナーゼ遺伝子の発現が減少するように又は酢酸キナーゼ遺伝子を欠失させるように、更に遺伝子操作されている、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  22. 前記組換え細胞が、ホスホトランスアセチラーゼ遺伝子の活性が増加するように更に遺伝子操作されている、請求項1〜3のいずれか一項に記載の細胞。
  23. イソプレンの生産量が、ホスホケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードしている1種以上の異種核酸を含まない細胞と比較して、少なくとも5%又は少なくとも10%増加している、請求項1に記載の細胞。
  24. イソプレノイド前駆体の生産量が、ホスホケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードしている1種以上の異種核酸を含まない細胞と比較して、少なくとも5%又は少なくとも10%増加している、請求項2に記載の細胞。
  25. イソプレノイドの生産量が、ホスホケトラーゼ活性を有するポリペプチドをコードしている1種以上の異種核酸を含まない細胞と比較して、少なくとも5%又は少なくとも10%増加している、請求項3に記載の細胞。
  26. イソプレン産生法であって、(a)イソプレン産生に好適な条件下で請求項1に記載の組換え細胞を培養する工程、及び(b)イソプレンを産生させる工程、を含む、方法。
  27. イソプレノイド前駆体の産生法であって、(a)イソプレノイド前駆体の産生に好適な条件下で請求項に記載の組換え細胞を培養する工程、及び(b)イソプレノイド前駆体を産生させる工程、を含む、方法。
  28. イソプレノイドの産生法であって、(a)イソプレノイドの産生に好適な条件下で請求項に記載の組換え細胞を培養する工程、及び(b)イソプレノイドを産生させる工程、を含む、方法。
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