JP2014508298A5 - - Google Patents

Claims (20)

1. 個体内における膵臓癌の存在を決定するための方法であって、以下：
   ａ）個体由来の試験すべきサンプルを備える工程；
   ｂ）表ＩＩＩに定義される群より選択される１つ又はそれ以上のバイオマーカーの試験サンプル中における発現を判定することによって試験サンプルのバイオマーカー・シグネチャーを判定する工程；
   ｃ）工程（ｂ）で判定したバイオマーカー・シグネチャーに基づいて、個体内における膵臓癌の存在を決定する工程；
   を含み又はからなり、
   ここで、表ＩＩＩに定義される群より選択される１つ又はそれ以上のバイオマーカーの試験サンプル中における発現は、膵臓癌を有する個体を示し；
   ここで、工程（ｂ）は、表ＩＶ（Ａ）及び／又は表ＩＶ（Ｂ）に列挙されるバイオマーカーの１つ又はそれ以上の発現を測定することを含む又はからなる、方法。
2. 以下：
   ｄ）膵臓癌に罹患していない個体由来の対照サンプルを備える工程；
   ｅ）工程（ｂ）において測定された１つ又はそれ以上のバイオマーカーの対照サンプル中における発現を測定することによって対照サンプルのバイオマーカー・シグネチャーを判定する工程；
   をさらに含み又はからなり、
   ここで、工程（ｂ）において測定された１つ又はそれ以上のバイオマーカーの試験サンプル中における発現が、工程（ｅ）において測定された１つ又はそれ以上のバイオマーカーの対照サンプル中における発現とは異なる場合、膵臓癌の存在が確認される、請求項１に記載の方法。
3. 以下：
   ｆ）膵臓癌に罹患している個体由来の対照サンプルを備える工程；
   ｇ）工程（ｂ）において測定された１つ又はそれ以上のバイオマーカーの対照サンプル中における発現を測定することによって対照サンプルのバイオマーカー・シグネチャーを判定する工程；
   をさらに含み又はからなり、
   ここで、工程（ｂ）において測定された１つ又はそれ以上のバイオマーカーの試験サンプル中における発現が、工程（ｇ）において測定された１つ又はそれ以上のバイオマーカーの対照サンプル中における発現に相当する場合、膵臓癌の存在が確認される、請求項１又は２に記載の方法。
4. 工程（ｂ）が、表ＩＶ（Ａ）に列挙されるバイオマーカーの１つ又はそれ以上、例えば、表ＩＶ（Ａ）に列挙されるバイオマーカーの少なくとも２つの発現を測定することを含む又はからなる、請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法。
5. 工程（ｂ）が、表ＩＶ（Ｂ）に列挙されるバイオマーカーの１つ又はそれ以上、例えば、表ＩＶ（Ｂ）に列挙されるバイオマーカーの少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７又は１８個の発現を測定することを含む又はからなる、請求項１〜４のいずれか１項に記載の方法。
6. 工程（ｂ）が、表ＩＶ（Ｃ）に列挙されるバイオマーカーからの１つ又はそれ以上のバイオマーカー、例えば、表ＩＶ（Ｃ）に列挙されるバイオマーカーの少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２又は３３個の発現を測定することを含む又はからなる、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
7. 方法が、膵臓癌（ＰａＣ）と任意の他の疾患状態とを識別するためのものである、請求項１〜６のいずれか１項に記載の方法。
8. 工程（ｂ）が、表Ｖ（Ａ）に列挙されるバイオマーカーからの１つ又はそれ以上のバイオマーカー、例えば、表Ｖ（Ａ）に列挙されるバイオマーカーの少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９又は１０個の試験サンプル中における発現を測定することを含む又はからなる、請求項７に記載の方法。
9. 工程（ｂ）が、表Ｖ（Ｂ）に列挙されるバイオマーカーからの１つ又はそれ以上のバイオマーカー、例えば、表Ｖ（Ｂ）に列挙されるバイオマーカーの少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３又は２４個の試験サンプル中における発現を測定することを含む又はからなる、請求項７又は８に記載の方法。
10. 工程（ｂ）が、表Ｖ（Ｃ）に列挙されるバイオマーカーからの１つ又はそれ以上のバイオマーカー、例えば、表Ｖ（Ｃ）に列挙されるバイオマーカーの少なくとも２、３、４又は５個の試験サンプル中における発現を測定することを含む又はからなる、請求項７〜９のいずれか１項に記載の方法。
11. 工程（ｂ）が、表Ｖ（Ｄ）に列挙されるバイオマーカーからの１つ又はそれ以上のバイオマーカー、例えば、表Ｖ（Ｄ）に列挙されるバイオマーカーの少なくとも２又は３個の試験サンプル中における発現を測定することを含む又はからなる、請求項７〜１０のいずれか１項に記載の方法。
12. 工程（ｂ）が、表Ｖ（Ｆ）に列挙されるバイオマーカーからの１つ又はそれ以上のバイオマーカー、例えば、表Ｖ（Ｆ）に列挙されるバイオマーカーの少なくとも２、３、４、５又は６個の試験サンプル中における発現を測定することを含む又はからなる、請求項７〜１１のいずれか１項に記載の方法。
13. 工程（ｂ）が、表Ｖ（Ａ）、表Ｖ（Ｂ）、表Ｖ（Ｃ）、表Ｖ（Ｄ）及び／又は表Ｖ（Ｆ）に列挙されるバイオマーカーの全ての試験サンプル中における発現を測定することを含む又はからなる、請求項７〜１２のいずれか１項に記載の方法。
14. 他の疾患状態が、慢性膵炎（ＣｈＰ）、急性炎症性膵炎（ＡＩＰ）及び／又は正常であり、例えば、他の疾患状態が、慢性膵炎だけ；急性炎症性膵炎だけ；慢性膵炎及び急性炎症性膵炎；慢性膵炎及び正常；急性炎症性膵炎及び正常；又は、慢性膵炎、急性炎症性膵炎及び正常であり得る、請求項７〜１３のいずれか１項に記載の方法。
15. 工程（ｂ）、（ｅ）及び／又は工程（ｇ）が、１つ又はそれ以上のバイオマーカーへ結合することができる第１結合剤を使用して行われる、請求項１〜１４のいずれか１項に記載の方法。
16. 第１結合剤が、抗体又はその抗原結合性フラグメントを含む又はからなる、請求項１５に記載の方法。
17. 工程（ｂ）、（ｅ）及び／又は（ｇ）が、１つ又はそれ以上のバイオマーカーをコードする核酸分子の発現を測定する工程を含み；及び、１つ又はそれ以上の結合性部分が、各々、核酸分子を含む又はからなる、請求項１５又は１６に記載の方法。
18. 請求項１５〜１７のいずれか１項に定義される１つ又はそれ以上の結合剤を含む、個体内の膵臓癌の存在を決定するためのアレイ。
19. 個体内の膵臓癌の存在を決定するための診断マーカーとしての、請求項１〜１８のいずれか１項に定義される群より選択される１つ又はそれ以上のバイオマーカーの使用。
20. Ａ）請求項１５〜１７のいずれか１項に定義される１つ若しくはそれ以上の第１結合剤又は請求項１８に記載のアレイ；
    Ｂ）請求項１〜１７のいずれか１項に定義される方法を行うための説明書；
    を含む、膵臓癌の存在を決定するためのキット。