JP2014504868A - 抗がん性融合タンパク質 - Google Patents
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Abstract
Description
この低効率およびTRAILに対する腫瘍の抵抗性を克服するために、放射線治療薬や化学療法薬を用いた様々な併用療法が計画され、相乗的にアポトーシスを起こす効果を得られた (WO2009/002947; A. Almasan and A. Ashkenazi, Cytokine Growth Factor Reviews 14 (2003) 337-348; RK Srivastava, Neoplasis, Vol 3, No 6, 2001, 535-546, Soria JC et al., J. Clin. Oncology, Vol 28, No 9 (2010), p. 1527-1533)。厳選された従来の化学療法薬(パクリタキセル、カルボプラチン)および、モノクローナル抗―VEGF抗体との組み合わせにおける、がん治療のためのrhTRAILの使用が、WO2009/140469において記述されている。しかしながら、かかる組み合わせの必要性が、従来の化学治療または放射線治療の周知の欠陥を意味する。
例えば、タムスタチンは28kDAの大きさのペプチド―コラーゲンタイプIVフラグメントであり、インテグリンαvβ3と結合し、内皮細胞増殖の抑制によって血管新生を防止する能力がある。さらに、タムスタチンは独立して接着斑キナーゼ(FAK)およびホスファチジルイノシトール3キナーゼPI3およびプロテインキナーゼPKB/Aktの活性化を阻害する。
すべての固定した増殖細胞に向けられた化学療法とは逆であるが、抗血管新生剤は血管形成の異なる段階に向けられており、治療の毒性が減少する結果となっている。しかしながら、腫瘍細胞に対する選択性を確保したとはいえ、血管新生を阻害することを目的とした抗がん治療の必要性がまだある。 そのため、改善された毒性評価を伴った新しい抗血管新生抗がん治療の必要性がある。
さらに、エフェクターペプチドの連結はタンパク質の量を増やし、半減期の延長および腫瘍におけるタンパク質の保持そしてその効率を高めることに繋がる。
さらに、多くの場合で新規の融合タンパク質はTRAILへの耐性をもまた克服する。
本発明は図面の図を参照して詳細に記述される。
本発明は、
― hTRAIL95よりも小さくない位置のアミノ酸から始まる可溶性hTRAILタンパク質の機能的な配列フラグメント、または、少なくとも70%の配列の同一性を有する当該機能的なフラグメントのホモログであるドメイン(a)、および、
― 抗血管新生エフェクターペプチドの配列であるドメイン(b)を含み、
ここで、ドメイン(b)の配列がドメイン(a)のC末端および/またはN末端に付着される、
但し、エフェクターペプチドが、カルレティキュリン、タムスタチン183−230、キニノーゲンD5、バソスタチン、キニノスタチンおよびカンスタチンからなる群から選ばれる融合タンパク質が除外される、融合タンパク質に関する。
―VEGF、PDGFおよびEGFの受容体から選択される増殖因子のための受容体のインヒビター、
―タムスタチンまたはそのフラグメント183−230以外のフラグメント、および、
―アミノペプチダーゼN(CD13)のインヒビター、
から選択され得る。
―メタロプロテアーゼMMPにより認識される配列、具体的には配列番号24に指定される (Pro Leu Gly Leu Ala Gly Glu Pro /PLGLAGEP)または、配列番号55に指定される(Pro Leu Gly Ile Ala Gly Glu /PLGIAGE)、または配列番号56に指定される(Pro Leu Gly Leu Ala Gly Glu Pro /PLGLAGEP);
―ウロキナーゼuPAにより認識される配列、具体的には配列番号25に指定されるArg Val Val Arg(一文字の慣習においてはRVVR)または配列の最後のアミノ酸と結合され配列番号25を編成するそのフラグメントおよび、それらの組み合わせ。
原核細胞すなわち、Escherichia coliまたはBacillus subtilisのようなバクテリア、Saccharomyces cervisiaeまたはPichia pastorisのような酵母および、真核細胞株(昆虫、哺乳動物、植物)を含む、様々な周知の宿主細胞に基づく異種発現系が使用されてよい。
さらに、微生物の作用を防止するために、組成物は、例えば非限定的にパラベン類、クロロブタノール、チメロサール、ソルビン酸、およびこのタイプの類似の既知の物質を含む多様な抗菌剤および抗真菌剤を包含し得る。一般に、本発明の医薬組成物は、例えば少なくとも約0.01wt%の活性成分を含み得る。とりわけ、組成物は、活性成分を、組成物の単位の1%〜75重量%、または例えば25%〜60重量%において包含し得るが、示された値に限定されるものではない。ヒトを含む患者に投与される本発明による組成物の用量の実際の量は、体重、状態の重篤度、処置される疾患の型、先のまたは併用の治療的介入、患者および投薬ルートなどの、物理的および生理学的要因により決定される。
好適な単位用量、全用量および組成物中の活性成分の濃度は、処置する医師により決定されるべきである。
プラスミドの調製
標的融合タンパク質のアミノ酸配列は、それをコードし、Escherichia coliにおける発現のために最適化されたコドンを含むDNA配列を生成するための鋳型として使用された。
かかる手法により、Escherichia coliにおける標的タンパク質の合成のさらなる段階の効率を増大させることができる。生じたヌクレオチド配列を、次いで、自動合成した。さらに、生じた標的タンパク質をコードする遺伝子に、制限酵素NdeIの切断部位(リーディング鎖の5’末端において)およびXhoIの切断部位(リーディング鎖の3’末端において)を追加した。これらを使用して、遺伝子をベクターpET28a(Novagen)中にクローニングした。それらはまた、他のベクターにタンパク質をコードする遺伝子をクローニングするためにも使用し得る。このコンストラクトから発現される標的タンパク質は、N末端において、前にトロンビンにより認識される部位を有し、その後、アフィニティークロマトグラフィーを介した精製に役立つ、ポリヒスチジンタグ(6ヒスチジン)を任意に備え得る。いくつかの標的はタグなしで、具体的にはヒスチジンタグなしで発現され、それらは次に、SP Sepharose(登録商標)で精製された。生じたコンストラクトの正確さを、第1に、NdeIおよびXhoI酵素を使用した、単離したプラスミドの制限酵素分析により確認し、その後、標的タンパク質の全リーディングフレームを自動シークエンシングすることにより確認した。シークエンシングのために使用したプライマーは、ベクター中に存在するT7プロモーター(5’-TAATACGACTCACTATAGG-3’)およびT7ターミネーター(5’-GCTAGTTATTGCTCAGCGG-3’)の配列に相補的となった。生じたプラスミドは、製造業者の推奨に従って形質転換された市販のE. coli株において、標的の融合タンパク質を過剰発現させるために使用された。選択培地(LB寒天、カナマイシン50μg/ml、1%グルコース)上で得られたコロニーは、カナマイシン(50μg/ml)および1%グルコースを添加されたLB液体培地中で、一晩の培養物の調製のために使用された。振盪培養器における約15hの増殖の後で、培養物は、適切な培養物を播種するために使用された。
カナマイシン(30μg/ml)および100μMの硫酸亜鉛を含むLB培地に、一晩培養物を播種した。培養物を、600nmでの光学密度(OD)が0.60〜0.80に達するまで37℃でインキュベートした。次いで、IPTGを、0.25〜1mMの範囲の最終濃度まで添加した。25℃で振盪してのインキュベーション(3.5〜20h)の後で、培養物を25分間、6,000gで遠心分離した。細菌ペレットを50mMのKH2PO4、0.5MのNaCl、10mMのイミダゾールを含むpH7.4の緩衝液中で再懸濁した。懸濁液を氷上で8分間超音波処理した(40%の振幅、15秒パルス、10sのインターバル)。生じた抽出物を、40分間、20.000g、4℃における遠心分離により清澄化した。Ni−セファロース(GE Healthcare)樹脂を、緩衝液での平行化により前処理し、これを、細菌細胞抽出物の調製のために使用した。樹脂を、次いで、抽出物の遠心分離の後で得られた上清と共に一晩4℃でインキュベートした。次いで、それをクロマトグラフィーカラム中へロードし、15〜50容積の緩衝液(50mMのKH2PO4、0.5MのNaCl、20mMのイミダゾール、pH7.4)で洗浄した。得られたタンパク質を、0.5MのNaClを含む50mMのKH2PO4緩衝液(pH7.4)中のイミダゾール勾配を用いてカラムから溶出させた。得られた画分をSDS−PAGEにより分析した。適切な画分を組み合わせて、4℃で、50mMのTris緩衝液(pH7.2)、150mMのNaCl、500mMのL−アルギニン、0.1mMのZnSO4、0.01%のTween 20に対して一晩透析し、同時に、Hisタグが存在している場合は、Hisタグをトロンビン(1:50)で切断した。切断の後で、ベンズアミジンセファロース(登録商標)樹脂を使用した精製によりHistag(登録商標)を伴って発現した標的の融合タンパク質から、トロンビンを分離した。Histag(登録商標)なしで発現した標的融合タンパク質の精製はSP Sepharose(登録商標)で行った。生成物の純度を、SDS−PAGE電気泳動により分析した(Maniatisら、Molecular Cloning、Cold Spring Harbor、NY、1982年)。
カナマイシン(30μg/ml)および100μMの硫酸亜鉛を含むLB培地に、一晩培養物を播種した。培養物を、600nmでの光学密度(OD)が0.60〜0.80に達するまで37℃でインキュベートした。次いで、IPTGを、0.5〜1mMの範囲の最終濃度まで添加した。25℃で振盪しての20hのインキュベーションの後で、培養物を25分間、6,000gで遠心分離した。過剰発現後の細菌細胞を、フレンチプレスにおいて、50mMのKH2PO4、0.5MのNaCl、10mMのイミダゾール、5mMのベータ−メルカプトエタノール、0.5mMのPMSF(フッ化フェニルメチルスルホニル)を含む緩衝液(pH7.8)中で破壊した。生じた抽出物を、50分間、8,000gでの遠心分離により清澄化した。Ni−セファロース樹脂を、一晩、得られた上清と共にインキュベートした。次いで、タンパク質が結合した樹脂を、クロマトグラフィーカラム中へ充填した。未結合のタンパク質を含む画分を洗い流すために、カラムを15〜50容積の緩衝液(50mMのKH2PO4、0.5MのNaCl、10mMのイミダゾール、5mMのベータ−メルカプトエタノール、0.5mMのPMSF(フッ化フェニルメチルスルホニル)(pH7.8))で洗浄した。次いで、特異的にベッドに結合しているタンパク質の大部分を洗い流すために、カラムを、50mMのKH2PO4、0.5MのNaCl、500mMのイミダゾール、10%グリセロール、0.5mMのPMSFを含む緩衝液(pH7.5)で洗浄した。得られた画分を、SDS−PAGEにより分析した(Maniatisら、Molecular Cloning、Cold Spring Harbor、NY、1982年)。標的タンパク質を含む画分を組み合わせて、タンパク質がヒスチジンタグを伴って発現された場合は、トロンビン(タンパク質4mgあたり1U、8h、16℃で)で切断し、ポリヒスチジンタグを除去した。次いで、画分を、調製用緩衝液(500mMのL−アルギニン、50mMのTris、2.5mMのZnSO4(pH7.4))に対して透析した。
配列番号1のタンパク質は、173アミノ酸の長さおよび19.8kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL121-281配列のN末端にVEGF由来のヘプタペプチド(配列番号17)がエフェクターペプチドとして付着されている。エフェクターペプチドとTRAIL配列の間に、フレキシブルグリシンステリックリンカー(配列番号28)が組み込まれている。
配列番号2の融合タンパク質は、199アミノ酸の長さおよび22.8kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL95-281配列のN末端にVEGF由来のヘプタペプチド(配列番号17)がエフェクターペプチドとして付着されている。エフェクターペプチドとTRAIL配列の間に、フレキシブルグリシンステリックリンカー(配列番号28)が組み込まれている。
配列番号3の融合タンパク質は、230アミノ酸の長さおよび26.3kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL121-281配列のN末端にVEGF由来のヘプタペプチド(配列番号17)が、TRAIL121-281配列のC末端にはタムチタチンフラグメントIおよびII(それぞれ、配列番号18および19)がエフェクターペプチドとして付着されている。TRAIL配列のN末端に付着されたエフェクターペプチドとTRAIL配列の間に、グリシンフレキシブルステリックリンカー(配列番号28)が組み込まれている。TRAIL配列のC末端に付着されたエフェクターペプチドとTRAIL配列の間に、3つのグリシン残基Gly Gly Glyからなるステリックリンカーおよび、メタロプロテアーゼMMP(配列番号24)およびウロキナーゼuPA(配列番号25)により認識される切断部位の配列が組み込まれており、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。
配列番号4のタンパク質は、187アミノ酸の長さおよび21.4kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL121-281配列のN末端にVEGF由来の2つのヘプタペプチド配列(配列番号17)がエフェクターペプチドとして付着されている。2つのエフェクターペプチドの間に、メタロプロテアーゼMMP(配列番号24)により認識される切断部位の配列が組み込まれており、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。MMP切断部位の配列とエフェクタータンパク質の配列の間に、1つのグルタミン酸残基Eが組み込まれている。エフェクターペプチド(配列番号17)およびTRAIL配列の間には、フレキシブルステリックグリシンリンカー(配列番号28)が組み込まれている。
配列番号5のタンパク質は、187アミノ酸の長さおよび21.8kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL121-281配列のN末端にVEGF由来の2つのヘプタペプチド配列(配列番号17)がエフェクターペプチドとして付着されている。2つのエフェクターペプチドの間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号24)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。MMP切断部位の配列とエフェクタータンパク質の配列の間に、1つのグルタミン酸残基Eが組み込まれている。TRAILのN末端には付加的に、2つのグリシン残基が付着される。
配列番号6のタンパク質は、222アミノ酸の長さおよび25.3kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL95-281配列のN末端にVEGF由来の2つのヘプタペプチド配列(配列番号17)がエフェクターペプチドとして付着されている。2つのエフェクターペプチドの間に、当該タンパク質は、uPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号55)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。エフェクターペプチド(配列番号17)とTRAIL配列の間に、システインフレキシブルステリックリンカー(配列番号26)が組み込まれている。
配列番号7のタンパク質は、168アミノ酸の長さおよび19.4kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL119-281配列のN末端にCD13のリガンドである配列(配列番号20)がエフェクターペプチドとして付着されている。
配列番号8のタンパク質は、201アミノ酸の長さおよび23.2kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL95−配列のN末端にCD13のリガンドである配列(配列番号21)がエフェクターペプチドとして付着されている。TRAIL配列とエフェクターペプチドの間に、当該タンパク質はフレキシブルグリシン―セリンリンカー(配列番号30)の配列を包含する。
配列番号9のタンパク質は、192アミノ酸の長さおよび22.1kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL119-281配列のN末端にPDGFフラグメントの配列(配列番号22)がエフェクターペプチドとして付着されている。エフェクターペプチドとTRAIL配列の間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号24)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。
配列番号10のタンパク質は、216アミノ酸の長さおよび24.9kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL95-281配列のN末端にPDGFフラグメント(配列番号22)がエフェクターペプチドとして付着されている。エフェクターペプチド配列とTRAILドメインの間に、当該タンパク質は、uPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号24)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。
配列番号11のタンパク質は、226アミノ酸の長さおよび25.7kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL95-281配列のN末端にPDGFフラグメント(配列番号22)がエフェクターペプチドとして付着されている。エフェクターペプチドとTRAIL配列の間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号24)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。TRAIL配列とメタロプロテアーゼMMPにより認識される切断部位の配列の間に、当該タンパク質はフレキシブルグリシン―システイン―アラニンリンカー(配列番号27)の配列をもまた包含する。
配列番号12のタンパク質は、217アミノ酸の長さおよび25kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL121-281配列のN末端にタムスタチンフラグメントIおよびII(配列番号18および配列番号19)がエフェクターペプチドとして付着されている。エフェクターペプチドとTRAIL配列の間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号24)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。TRAIL配列とメタロプロテアーゼMMPにより認識される切断部位の配列の間に、当該タンパク質は3つのグリシン残基Gly Gly Glyからなるフレキシブルリンカーをもまた包含する。
配列番号13のタンパク質は、220アミノ酸の長さおよび25.1kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL121-281配列のN末端にタムチタチンフラグメントII(配列番号19)がエフェクターペプチドとして付着され、TRAIL121-281配列のC末端にはタムチタチンフラグメントI(配列番号18)がエフェクターペプチドとして付着されている。エフェクターペプチドとTRAIL配列の間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号24)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。メタロプロテアーゼMMPにより認識される切断部位の配列とTRAIL配列との間に、当該タンパク質は3つのグリシン残基Gly Gly Glyを包含し、TRAIL配列のC末端とタムチタチンフラグメントIIの間に、3つのグリシン残基Gly Gly Glyからなるフレキシブルリンカーを包含する。
配列番号14のタンパク質は、181アミノ酸の長さおよび21kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL120-281配列のN末端にEGFフラグメント(配列番号23)がエフェクターペプチドとして付着されている。エフェクターペプチドとTRAILドメインのN末端の間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号56)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。
配列番号15のタンパク質は、217アミノ酸の長さおよび24.4kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、hTRAIL95-281配列のN末端にEGFフラグメント(配列番号23)がエフェクターペプチドとして付着されている。エフェクターペプチドとTRAILドメインのN末端の間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号24)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。メタロプロテアーゼMMPにより認識される切断部位の配列とTRAIL配列の間に、当該タンパク質はフレキシブルグリシン―システイン―アラニンリンカー(配列番号26)が続く、1つのプロリン残基を包含する。
配列番号46の融合タンパク質は、211アミノ酸の長さおよび24.4kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL95-281配列のN末端に、互いに連結したVEGF(配列番号17)由来の2つのヘプタペプチド配列がエフェクターペプチドとして付着されている。2つのエフェクターペプチドの間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号55)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。
配列番号47の融合タンパク質は、200アミノ酸の長さおよび22.7kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL120-281配列のN末端に、互いに連結したVEGF(配列番号17)由来の2つのヘプタペプチド配列がエフェクターペプチドとして付着されている。2つのエフェクターペプチドの間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号55)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。エフェクタータンパク質とTRAILドメインの間に、当該タンパク質は、三量体の形成を促進するフレキシブルリンカー(配列番号26)およびフレキシブルグリシン―セリンリンカー(配列番号54)を続いて包含する。
配列番号48の融合タンパク質は、192アミノ酸の長さおよび21.9kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、TRAIL120-281配列のN末端に、互いに連結したVEGF(配列番号17)由来の2つのヘプタペプチド配列がエフェクターペプチドとして付着されている。2つのエフェクターペプチドの間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。エフェクタータンパク質とTRAILドメインの間に、当該タンパク質は、三量体の形成を促進するフレキシブルリンカー(配列番号26)およびフレキシブルグリシン―セリンリンカー(配列番号54)を続いて包含する。
配列番号49のタンパク質は、206アミノ酸の長さおよび23.3kDaの質量を有する融合タンパク質であり、ここで、hTRAIL120-281配列のN末端にPDGFフラグメント(配列番号22)がエフェクターペプチドとして付着されている。エフェクターペプチドとTRAIL配列の間に、当該タンパク質は、ウロキナーゼuPA(配列番号25)および、メタロプロテアーゼMMP(配列番号55)により認識される切断部位の配列を包含し、それによってエフェクターペプチドが腫瘍環境において切断を受ける。TRAIL配列とメタロプロテアーゼMMPにより認識される切断部位の配列の間に、当該タンパク質は、続いて位置する、三量体の形成を促進するフレキシブルグリシン―システイン―アラニンリンカー(配列番号26)および、フレキシブルグリシン―セリンリンカー(配列番号54)をもまた包含する。
融合タンパク質の抗腫瘍活性試験は、腫瘍細胞株に対する細胞毒性試験においてin vitroで行われ、マウスにおいてはin vivoで行われた。比較目的のために、rhTRAIL114−281タンパク質および、プラシーボが使用された。
例1、例4、例5、例9および例14の融合タンパク質の調製物の構造品質を、円二色性(CD)により決定した。
CD法は、タンパク質構造の光学活性を利用しており、光の偏光面の回転や楕円偏光として観察される。遠紫外(UV)におけるタンパク質のCDスペクトルにより、ポリペプチド主鎖の高次構造に関する正確なデータが得られる。
pH8.0の50mMTris−HCl、100mMNaCl、10%グリセリン、0.1mMZnCl2、80mMショ糖、および5mMDTT、pH7.4(または、代わりとして、上記過剰発現されたHis tag(登録商標)のない、SP Sepharose(登録商標)で精製されたタンパク質用に、5mMNaH2PO4、95mMNa2HPO4、200mMNaCl、5mMグルタチオン、0,1mMZnCl2、10%グリセロール、80mMサッカロース、pH8.0―表5の結果においてアスタリスク*でマークされる)からなる緩衝液中で製剤したタンパク質の分析試料は、カットオフ値12kDaの透析バッグ(シグマ・アルドリッチ社)中で透析した。透析は、タンパク質調製物に対して100倍量(v/v)過剰の緩衝液中で4°Cで数時間撹拌しながら行った。透析が完了した後、各調製物は遠心分離(25000rpm、10分間、4°C)し、適切な上澄み液を採取した。このようにして得た試料中のタンパク質濃度は、ブラッドフォード法により3検体の平均値として決定した。
タンパク質濃度の定量において、試薬は、エタノール(4.8%v/v)リン酸(V)(5.95%v/v)および水の混合物にクマーシーG−250を17.5mg溶解することで調製した。タンパク質濃度を決定するために、サンプル1-10mlをブラッドフォード試薬800mlに加えた。標準試料には、ブラッドフォード試薬と溶解したタンパク質が決まっている適量の緩衝液が含まれる。室温でサンプルを少なくとも5分間培養した後、分光光度計Cary 300で595nmの波長における吸光度を読み取った。1−10μg/mlの10濃度の範囲においてBSAのために作成された検量線から、タンパク質濃度を計算した。試料測定の調製の間の希釈を考慮した後、初期タンパク質濃度を推定した。
濃度範囲が0.1〜2.7mg/mLのタンパク質の円二色性は、ジャスコJ−710分光偏光計で光路長0.2mmまたは1mmの石英キュベットを使用して測定した。
測定は7L/分で窒素を流しながら行ったので、波長範囲195〜250nmにおける測定が可能であった。測定のパラメーター:スペクトル分解能1nm;光線の半値幅1nm;感度20mdeg、1つの波長での平均時間8秒、スキャン速度10nm/分、三回の測定の平均。
得られたスペクトルは、CDProソフトウェアを使用して193〜250nmの範囲で数値解析した。光電子倍増管での電圧が700Vを超える点は、この波長範囲でのシグナル・ノイズ比が小さすぎるため排除した。
細胞株
MTT試験は、細胞の増殖、生存能力および細胞毒性を測定するために使用される比色定量試験である。ミトコンドリア酵素であるコハク酸塩テトラゾリウム還元酵素1による、黄色いテトラゾリウム塩MTT(4,5−ジメチル−2−チアゾリル)−2、5−ジフェニルテトラゾリウムブロミド)の非水溶性紫染料ホルマザンへの分解を利用する。MTTの還元は、生細胞においてのみ進行する。データ解析には、対照細胞と比較して処理された集団の細胞数の50%で還元が進行する濃度である、タンパク質のIC50濃度(単位ng/mL)の決定が含まれる。結果は、グラフパッド・プリズム5.0ソフトウェアを使用して解析した。テストは、文献の記載に基づいて行った(Celis JE, (1998), Cell Biology, a Laboratory Handbook, second edition, Academic Press, San Diego; Yang Y., Koh LW, Tsai JH., (2004) "Involvement of viral and chemical factors with oral cancer in Taiwan" Jpn J Clin Oncol, 34 (4), 176-183)。
EZ4U(バイオメディカ社)テストを使用して、非接着性細胞株におけるタンパク質の細胞障害活性をテストした。このテストは、テトラゾリウム塩の還元で生成されるホルマザンが水に可溶であるようにMTTを改変したものである。細胞生存能力の試験は、タンパク質(タンパク質を7つの濃度で各3ウェルずつ)と共に細胞を連続72時間培養した後に行った。これに基づいて、グラフパッド・プリズム5ソフトウェアによりIC50値(2回の独立した実験の平均値として)を決定した。
タンパク質調製物の抗腫瘍活性を、ヒト結腸がんHCT116、Colo205およびSW620細胞、ヒト非小細胞肺がんA549およびNCI−H460−Luc2細胞、ヒト肝細胞がんPLC/PRF/5(CLS)細胞、ヒト膵癌PANC−1細胞、ヒト肝癌HepG2細胞、ヒト肺大細胞癌NCI−H460細胞および、ヒト子宮癌MES−SA/Dx5多剤耐性細胞のマウスモデルにおいてテストした。
HCT116およびA549(ATCC CCL−185)細胞は、10%ウシ胎児血清および2mMグルタミンを補充したOpti−MEM(インビトロジェン社、カタログ番号22600−134)を1:1の比率で添加したRPMI1640培地(ハイクローン社、ローガン、ユタ州、米国)中で維持した。マウスへの移植の日に、トリプシン(インビトロジェン社)で細胞を洗浄して、細胞をサポートから剥離し、その後、細胞を1300rpm,4°Cで8分間遠心分離し、HBSS緩衝液(Hanks培地)に懸濁し、カウントし、細胞数を25x106個/mLに希釈した。
本発明のタンパク質の抗腫瘍活性は、チャールス・リバー社(独国)から入手した4〜5週齢または7〜9週齢CDヌード(Crl:CD1-Foxn1nu1)または4〜5週齢Crl:SHO-PrkdcscidHrhrマウス、または、ビャウィストクにある医学研究センター(Centrum Medycyny Doswiadczalnej)から入手した4〜5週齢Cby.Cg-foxn1(nu)/Jマウスを使用して試験した。マウスは、食糧および蒸留水は(適宜)自由摂取として、特定病原体感染防止条件下で保持した。動物を使用したすべての実験は、「Interdisciplinary Principles and Guidelines for the Use of Animals in Research, Marketing and Education」 issued by the New York Academy of Sciences' Ad Hoc Committee on Animal Research and were approved by the IV Local Ethics Committee on Animal Experimentation in Warsaw (No.71/2009) のガイドラインに従って行った。
腫瘍サイズは電子式キャリパーを使用して測定し、腫瘍体積は、
式:(a2xb)/2
ここでa=25腫瘍の短い対角線(mm)および、b=腫瘍の長い対角線(mm)を使用して計算した。
腫瘍増殖の阻害は、以下の式を使用して計算した。
式:TGI[%](腫瘍増殖阻害)=(WT/WC)x100−100%
ここで、WTは処置群における腫瘍体積の平均をいい、WCは対照群における腫瘍体積の平均をいう。
すべての計算とグラフはGraphPad Prism 5.0ソフトウェアを使用して作成した。
Crl:CD1-Foxn1 nu 1マウス
0日目に、0.2mLのHBSS緩衝液に懸濁した5x106個のHCT116細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:CD1-Foxn1nu1マウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約60〜90mm3となったとき(14日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約70mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例1(10mg/kg)、例4(10mg/kg)、例5(10mg/kg)および、例9(10mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物、比較としてrhTRAIL114−281(10mg/kg)、を投与した。調製物は10日間毎日静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
HT116モデル
0日目に、0.2mLのHBSS緩衝液に懸濁した5x106個のHCT116細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:CD1-Foxn1nu1マウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約50〜78mm3となったとき(8日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約63mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例5(10mg/kg)、例4(10mg/kg)、例9(10mg/kg)および、例1(10mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、対照としての調製用緩衝液(50mMTrizma Base(登録商標)、150mMNaCl、80mMサッカロース、250mML−アルギニン、1mMグルタチオン、Zn2+0.1mM、pH7.3)に対しての比較としてrhTRAIL114−281(10mg/kg)、を投与した。調製物は5日間毎日静脈内投与した後(i.v.)、(2日の間をおいて)さらに5日間毎日投与した。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
HT116モデル
0日目に、0.2mLのHBSS緩衝液に懸濁した5x106個のHCT116細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:SHO-PrkdcscidHrhrマウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約380〜430mm3となったとき(14日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約400mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例6(30mg/kg)、例11(45mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、対照としての調製用緩衝液(5mMNaH2PO4、95mMNa2HPO4、200mMNaCl、5mMグルタチオン、0.1mMZnCl2、10%グリセロール、80mMサッカロース、pH8.0)に対しての比較としてrhTRAIL114−281(20mg/kg)、を投与した。調製物は隔日に6回静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
COLO205モデル
0日目に、0.2mLのHBSS緩衝液に懸濁した5x106個のColo205細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:SHO-PrkdcscidHrhrマウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約90〜130mm3となったとき(13日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約115mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例6(30mg/kg)、例19(30mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、対照としての調製用緩衝液(5mMNaH2PO4、95mMNa2HPO4、200mMNaCl、5mMグルタチオン、0.1mMZnCl2、10%グリセロール、80mMサッカロース、pH8.0)に対しての比較としてrhTRAIL114−281(30mg/kg)、を投与した。調製物は隔日に6回静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
SW620モデル
0日目に、0.2mLのHBSS緩衝液に懸濁した5x106個のSW620細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:SHO-PrkdcscidHrhrマウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約290〜350mm3となったとき(17日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約320mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例6(30mg/kg)、例11(40mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、対照としての調製用緩衝液(5mMNaH2PO4、95mMNa2HPO4、200mMNaCl、5mMグルタチオン、0.1mMZnCl2、10%グリセロール、80mMサッカロース、pH8.0)に対しての比較としてrhTRAIL114−281(30mg/kg)、を投与した。調製物は隔日に6回静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
Crl:CD1-Foxn1nu1マウス
0日目に、0.2mLのHBSS緩衝液に懸濁した5x106個のA549細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:CD1-Foxn1nu1マウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約80〜100mm3となったとき(14日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約90mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例1(10mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、比較としてrhTRAIL114−281(10mg/kg)、を投与した。調製物は12日間隔日に静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
0日目に、0.2mLのHBSS緩衝液に懸濁した5x106個のA549細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Cby.Cg-foxn1(nu)/Jマウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約60〜90mm3となったとき(19日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約75mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例1(15mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、対照としての水注射に対する比較としてrhTRAIL114−281(20mg/kg)、を投与した。調製物は隔日に6回静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
A.0日目に、0.2mLのHBSS緩衝液に懸濁した5x106個のNCI−H460細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:SHO-PrkdcscidHrhrマウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約150〜170mm3となったとき(13日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約160mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例6(30mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、対照としての調製用緩衝液(5mMNaH2PO4、95mMNa2HPO4、200mMNaCl、5mMグルタチオン、0.1mMZnCl2、10%グリセロール、80mMサッカロース、pH8.0)に対しての比較としてrhTRAIL114−281(30mg/kg)、を投与した。調製物は隔日に6回静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
Crl:SHO-PrkdcscidHrhrマウス
A.0日目に、0.2mLのHBSS緩衝液に懸濁した5x106個のPLC/PRF/5細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:SHO-PrkdcscidHrhrマウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約190〜220mm3となったとき(31日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約200mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例6(40mg/kg)および、例11(50mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、対照としての調製用緩衝液(5mMNaH2PO4、95mMNa2HPO4、200mMNaCl、5mMグルタチオン、0.1mMZnCl2、10%グリセロール、80mMサッカロース、pH8.0)に対しての比較としてrhTRAIL114−281(30mg/kg)、を投与した。調製物はスキーマすなわち、3日おきに4回および、2日おきに2回に従って静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
A.0日目に、0.2mLのHBSS緩衝液に懸濁した5x106個のHepG2細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:SHO-PrkdcscidHrhrマウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約190〜220mm3となったとき(31日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約200mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例6(30mg/kg)、例19(30mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、対照としての調製用緩衝液(5mMNaH2PO4、95mMNa2HPO4、200mMNaCl、5mMグルタチオン、0.1mMZnCl2、10%グリセロール、80mMサッカロース、pH8.0)に対しての比較としてrhTRAIL114−281(30mg/kg)、を投与した。調製物は隔日に6回静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
0日目に、HBSS:Matrigel(登録商標)が3:1の比率における0.1mLの混合物に懸濁した7x106個のPANC1細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:SHO-PrkdcscidHrhrマウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約87〜110mm3となったとき(27日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約95mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例11(50mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、対照としての調製用緩衝液(5mMNaH2PO4、95mMNa2HPO4、200mMNaCl、5mMグルタチオン、0.1mMZnCl2、100mML−アルギニン、80mMサッカロース、pH8.0)に対しての比較としてrhTRAIL114−281(20mg/kg)、を投与した。調製物は隔日に6回静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。
対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
0日目に、HBSS:Matrigel(登録商標)が10:1の比率における0.1mLの混合物に懸濁した7x106個のMES−SA/Dx5細胞を0.5x25mm針付きシリンジ(BogMark社)を使用して、Crl:SHO-PrkdcscidHrhrマウスの右側に皮下(sc)移植した。腫瘍の大きさが約167〜190mm3となったとき(19日目)、処置群の平均腫瘍サイズが約180mm3となるようにマウスをランダムに分別した。処置群には、例6、例19(30mg/kg)の本発明の融合タンパク質調製物および、対照としての調製用緩衝液(5mMNaH2PO4、95mMNa2HPO4、200mMNaCl、5mMグルタチオン、0.1mMZnCl2、10%グリセロール、80mMサッカロース、pH8.0)に対しての比較としてrhTRAIL114−281(10mg/kg)、を投与した。調製物は隔日に6回静脈内投与した(i.v.)。治療群の平均腫瘍サイズが約1000mm3となったとき、マウスの脊髄を損壊して屠殺した。対照群には、rhTRAIL114−281を与えた。
Claims (30)
- hTRAIL95よりも小さくない位置のアミノ酸から始まる可溶性hTRAILタンパク質配列の機能的フラグメント、または、少なくとも70%の配列同一性を有する前記機能的フラグメントのホモログ、を含むドメイン(a)、および、
抗血管新生エフェクターペプチドの配列から構成されるドメイン(b)を含み、
ここで、ドメイン(b)の配列が、ドメイン(a)のC末端および/またはN末端に付着されており、エフェクターペプチドが、カルレティキュリン、タムスタチン183−230、キニノーゲンD5、バソスタチン、キニノスタチンおよびカンスタチンからなる群から選択されない、融合タンパク質。 - ドメイン(a)が、hTRAIL95からhTRAIL121までの範囲(両端を含む)のアミノ酸から始まり、アミノ酸281で終わる可溶性hTRAIL(配列番号16)タンパク質配列のフラグメントを含む、請求項1に記載の融合タンパク質。
- ドメイン(a)が、hTRAIL95−281、hTRAIL119−281、hTRAIL120−281、およびhTRAIL121−281からなる群から選択される、請求項1または2に記載の融合タンパク質。
- ドメイン(b)が、
― VEGF、PDGFおよびEGFに対する受容体から選択される増殖因子に対する受容体のインヒビター、
― タムスタチンのフラグメント、および、
― アミノペプチダーゼN(CD13)のインヒビター、
からなる群から選択される、請求項1〜3のいずれか一項に記載の融合タンパク質。 - 増殖因子のインヒビターの群からなるドメイン(b)が、VEGF、PDGFおよびEGFから選択され、配列番号17、配列番号22および配列番号23からなる、請求項1〜4のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- タムスタチンまたはそのフラグメントからなるドメイン(b)が、タムスタチンフラグメントIおよびタムスタチンフラグメントIIを夫々表す配列番号18および配列番号19からなる、請求項1〜4のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- アミノペプチダーゼN(CD13)のインヒビターからなるドメイン(b)が、配列番号20および配列番号21からなる、請求項1〜4のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 融合タンパク質が、ドメイン(a)およびドメイン(b)の間に、メタロプロテアーゼMMPにより認識される配列、ウロキナーゼuPAにより認識される配列およびそれらの組み合わせから選択される、プロテアーゼ切断部位を含むドメイン(c)を包含する、請求項1〜7のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- メタロプロテアーゼMMPにより認識される配列が、配列番号24、配列番号55または配列番号56であり、ウロキナーゼuPAにより認識される配列が、配列番号25である、請求項8に記載の融合タンパク質。
- ドメイン(c)が、メタロプロテアーゼMMPおよびウロキナーゼuPAにより認識される配列と互いに隣り合って位置する組み合わせである、請求項8または9に記載の融合タンパク質。
- タンパク質が、ドメイン(a)、(b)、(c)および/または(d)の間に、付加的に、グリシン、グリシン―セリンまたはシステインフレキシブルステリックリンカーまたはそれらの組み合わせを含む、請求項1〜10のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- フレキシブルステリックリンカーが、GG,E,GGGCAAACAAC(配列番号26)、GGCAAACAAC(配列番号27)、GGGGG(配列番号28)、GGGG(配列番号29)、GGG(配列番号30)およびGSG(配列番号54)からなる群から選択される、請求項11に記載の融合タンパク質。
- 配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号46、配列番号47、配列番号48および配列番号49からなる群から選択される配列に対応するアミノ酸配列からなる、請求項1に記載の融合タンパク質。
- 配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号14、配列番号15、配列番号46、配列番号47、配列番号48および配列番号49からなる群から選択される配列に対応するアミノ酸配列からなる、請求項1に記載の融合タンパク質。
- 配列番号7および配列番号8からなる群から選択される配列に対応するアミノ酸配列からなる、請求項1に記載の融合タンパク質。
- 配列番号12および配列番号13からなる群から選択される配列に対応するアミノ酸配列からなる、請求項1に記載の融合タンパク質。
- 組み換えタンパク質である、請求項1〜16のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 請求項1〜16のいずれか一項において定義された融合タンパク質をコードする、ポリヌクレオチド配列。
- 大腸菌における遺伝子発現のために最適化された、請求項18に記載の配列。
- 配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号50、配列番号51、配列番号52および配列番号53からなる群から選択される、請求項19に記載の配列。
- 配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号44、配列番号45、配列番号50、配列番号51、配列番号52および配列番号53からなる群から選択される、請求項19に記載の配列。
- 配列番号37および配列番号38からなる群から選択される、請求項19に記載の配列。
- 配列番号42および配列番号43からなる群から選択される、請求項19に記載の配列。
- 請求項18〜23のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド配列を含む、発現ベクター。
- 請求項24において定義された発現ベクターを含む、宿主細胞。
- 大腸菌細胞である、請求項25に記載の宿主細胞。
- 薬学的に許容し得る任意の担体との組み合わせにおいて、活性成分として、請求項1〜17のいずれか一項において定義された融合タンパク質を含む、医薬組成物。
- 非経口投与のための形態における、請求項27に記載の医薬組成物。
- 哺乳動物(ヒトを含む)における腫瘍性疾患の処置のための、請求項1〜17のいずれか一項において定義された融合タンパク質の使用。
- 処置が必要な哺乳動物(ヒトを含む)におけるがん性疾患の処置の方法であって、
請求項27または28において定義された、融合タンパク質の抗腫瘍効果のある量を、対象へ投与することを含む、前記方法。
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