JP2013533223A - オリゴヌクレオチド送達のための新規な低分子量カチオン性脂質 - Google Patents

オリゴヌクレオチド送達のための新規な低分子量カチオン性脂質 Download PDF

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Abstract

本発明は、他の脂質成分、例えばコレステロールおよびPEG脂質などと組み合わせて使用してオリゴヌクレオチドを含む脂質ナノ粒子を形成することのできる、新規なカチオン性脂質を提供する。本発明の目的は、有効性の増加とともに、肝臓中の脂質レベルが低いことの結果として肝臓毒性が低いことを実証するカチオン性脂質足場を提供することである。本発明は、1つの短い脂質鎖を含む低分子量カチオン性脂質を用いてsiRNAのインビボ送達の効率および耐容性を促進する。

Description

本発明は、他の脂質成分、例えばコレステロールおよびPEG脂質などと組み合わせて使用して、オリゴヌクレオチドを含む脂質ナノ粒子を形成すること、細胞内取り込みおよびエンドソーム脱出を促進すること、ならびにインビトロおよびインビボの両方で標的mRNAをノックダウンすることのできる新規なカチオン性脂質を提供する。
カチオン性脂質、および脂質ナノ粒子中のカチオン性脂質の、オリゴヌクレオチド、特にsiRNAおよびmiRNAの送達のための使用は、これまでに開示されている。脂質ナノ粒子、および脂質ナノ粒子の、オリゴヌクレオチド、特にsiRNAおよびmiRNAの送達のための使用は、これまでに開示されている。オリゴヌクレオチド(siRNAおよびmiRNAを含む)およびオリゴヌクレオチドの合成は、これまでに開示されている。(米国特許出願:米国特許出願公開第2006/0083780号、同第2006/0240554号、同第2008/0020058号、同第2009/0263407号および同第2009/0285881号ならびにPCT特許出願:国際公開第2009/086558号、同第2009/127060号、同第2009/132131号、同第2010/042877号、同第2010/054384号、同第2010/054401号、同第2010/054405号および同第2010/054406号参照)。また、Semple S.C.et al.,Rational design of cationic lipids for siRNA delivery,Nature Biotechnology,published online 17 January 2010;doi:10.1038/nbt.l602も参照されたい。
その他のカチオン性脂質は、米国特許出願:米国特許出願公開第2009/0263407号、同第2009/0285881号、同第2010/0055168号、同第2010/0055169号、同第2010/0063135号、同第2010/0076055号、同第2010/0099738号および同第2010/0104629号に開示されている。
従来のカチオン性脂質、例えばCLinDMAおよびDLinDMAなどは、肝臓へのsiRNA送達に用いられているが、高用量での肝臓毒性に加えて、最適でない送達効率が問題となっている。本発明の目的は、有効性の増加とともに、肝臓中の脂質レベルが低いことの結果として肝臓毒性が低いことを実証するカチオン性脂質足場を提供することである。本発明は、1つの短い脂質鎖を含む低分子量カチオン性脂質を用いてsiRNAのインビボ送達の効率および耐容性を強化する。
米国特許出願公開第2006/0083780号明細書 米国特許出願公開第2006/0240554号明細書 米国特許出願公開第2008/0020058号明細書 米国特許出願公開第2009/0263407号明細書 米国特許出願公開第2009/0285881号明細書 国際公開第2009/086558号パンフレット 国際公開第2009/127060号パンフレット 国際公開第2009/132131号パンフレット 国際公開第2010/042877号パンフレット 国際公開第2010/054384号パンフレット 国際公開第2010/054401号パンフレット 国際公開第2010/054405号パンフレット 国際公開第2010/054406号パンフレット 米国特許出願公開第2010/0055168号明細書 米国特許出願公開第2010/0055169号明細書 米国特許出願公開第2010/0063135号明細書 米国特許出願公開第2010/0076055号明細書 米国特許出願公開第2010/0099738号明細書 米国特許出願公開第2010/0104629号明細書
Semple S.C.et al.,Rational design of cationic lipids for siRNA delivery,Nature Biotechnology,published online 17 January 2010;doi:10.1038/nbt.l602
本発明は、他の脂質成分、例えばコレステロールおよびPEG脂質などと組み合わせて使用して、オリゴヌクレオチドを含む脂質ナノ粒子を形成することのできる新規なカチオン性脂質を提供する。本発明の目的は、有効性の増加とともに、肝臓中の脂質レベルが低いことの結果として肝臓毒性が低いことを実証するカチオン性脂質足場を提供することである。本発明は、siRNAのインビボ送達の効率および耐容性を強化するために、1つの短い脂質鎖を含む低分子量カチオン性脂質を用いる。
マウスにおけるLNP(化合物1)の有効性を示す図である。 ラットにおけるLNP(化合物1)の有効性を示す図である。 ラットにおけるLNP(化合物1)のLFT上昇を示す図である。 ラットにおけるカチオン性脂質(化合物1)の肝臓レベルを示す図である。
本発明の様々な態様および実施形態は、オリゴヌクレオチド、特に、siRNAおよびmiRNAを、任意の目的遺伝子に送達するための脂質ナノ粒子中で有用な新規なカチオン性脂質の有用性に関する。(米国特許出願:米国特許出願公開第2006/0083780号、同第2006/0240554号、同第2008/0020058号、同第2009/0263407号および同第2009/0285881号ならびにPCT特許出願:国際公開第2009/086558号、同第2009/127060号、同第2009/132131号、同第2010/042877号、同第2010/054384号、同第2010/054401号、同第2010/054405号および同第2010/054406号参照)。また、Semple S.C.et al.,Rational design of cationic lipids for siRNA delivery,Nature Biotechnology,published online 17 January 2010;doi:10.1038/nbt.l602も参照されたい。
本発明のカチオン性脂質は、オリゴヌクレオチド、特にsiRNAおよびmiRNAの送達に有用な脂質ナノ粒子中の成分である。
本発明の第一の実施形態では、カチオン性脂質は、式A:
Figure 2013533223
〔式中:
およびRは、独立に、H、(C−C)アルキル、ヘテロシクリルおよびポリアミンから選択され、前記アルキル、ヘテロシクリルおよびポリアミンは、R’から選択される1〜3個の置換基で置換されていてもよく、または、RおよびRは、それらが結合している窒素と一緒に、該窒素に加えて、N、OおよびSから選択される1または2個のさらなるヘテロ原子を含有していてもよい、4〜7員の単環式複素環を形成することができ、前記単環式複素環は、R’から選択される1〜3個の置換基で置換されていてもよく;
R’は、独立に、ハロゲン、R”、OR”、SR”、CN、COR”またはCON(R”)から選択され;
R”は、独立に、Hおよび(C−C)アルキルから選択され、前記アルキルは、ハロゲンおよびOHで置換されていてもよく;
は、C−C22アルキルおよびC−C22アルケニルから選択され、前記アルキルおよびアルケニルは、R’から選択される1個以上の置換基で置換されていてもよく;かつ
は、C−C13アルキルおよびC−C13アルケニルから選択され、前記アルキルおよびアルケニルは、R’から選択される1個以上の置換基で置換されていてもよい〕;
あるいはその任意の製薬上許容される塩または立体異性体によって示される。
第二の実施形態では、本発明は、
およびRが、各々メチルであり;
が、C−C22アルキルおよびC−C22アルケニルから選択され;かつ
が、C−C13アルキルおよびC−C13アルケニルから選択される;
式Aを有する化合物、あるいはその任意の製薬上許容される塩または立体異性体を特徴とする。
具体的なカチオン性脂質は、
R−N,N−ジメチル−1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物2);
S−N,N−ジメチル−1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物1);
1−{2−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−1−[(オクチルオキシ)メチル]エチル}ピロリジン(化合物3);
(2S)−N,N−ジメチル−1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−[(5Z)−オクト−5−エン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物4);
1−{2−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−1−[(オクチルオキシ)メチル]エチル}アゼチジン(化合物5);
(2S)−1−(ヘキシルオキシ)−N,N−ジメチル−3−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物6);
(2S)1−(ヘプチルオキシ)−N,N−ジメチル−3−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物7);
N,N−ジメチル−1−(ノニルオキシ)−3−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物8);
N,N−ジメチル−1−[(9Z)−オクタデセ−9−エン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物9);
(2S)−N,N−ジメチル−1−[(6Z,9Z,12Z)−オクタデカ−6,9,12−トリエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物10);
(2S)−1−[(11Z,14Z)−イコサ−11,14−ジエン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチル−3−(ペンチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物11);
(2S)−1−(ヘキシルオキシ)−3−[(11Z,14Z)−イコサ−11,14−ジエン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチルプロパン−2−アミン(化合物12);
1−[(11Z,14Z)−イコサ−11,14−ジエン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチル−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物13);
1−[(13Z,16Z)−ドコサ−13,16−ジエン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチル−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物14);
(2S)−1−[(13Z,16Z)−ドコサ−13,16−ジエン−1−イルオキシ]−3−(ヘキシルオキシ)−N,N−ジメチルプロパン−2−アミン(化合物15);
(2S)−1−[(13Z)−ドコス−13−エン−1−イルオキシ]−3−(ヘキシルオキシ)−N,N−ジメチルプロパン−2−アミン(化合物16);
1−[(13Z)−ドコス−13−エン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチル−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物17);
1−[(9Z)−ヘキサデカ−9−エン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチル−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物18);
(2R)−N,N−ジメチル−1−[(1−メチルオクチル)オキシ]−3−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物19);
(2R)−1−[(3,7−ジメチルオクチル)オキシ]−N,N−ジメチル−3−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物20);
N,N−ジメチル−1−(オクチルオキシ)−3−({8−[(1S,2S)−2−{[(1R,2R)−2−ペンチルシクロプロピル]メチル}シクロプロピル]オクチル}オキシ)プロパン−2−アミン(化合物21);および
N,N−ジメチル−1−{[8−(2−オクチルシクロプロピル)オクチル]オキシ}−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物22);
あるいはその任意の製薬上許容される塩または立体異性体である。
もう一つの実施形態では、開示されるカチオン性脂質は、脂質ナノ粒子の調製に有用である。
もう一つの実施形態では、開示されるカチオン性脂質は、オリゴヌクレオチドの送達のための脂質ナノ粒子中で有用な成分である。
もう一つの実施形態では、開示されるカチオン性脂質は、siRNAおよびmiRNAの送達のための脂質ナノ粒子中で有用な成分である。
もう一つの実施形態では、開示されるカチオン性脂質は、siRNAの送達のための脂質ナノ粒子中で有用な成分である。
本発明のカチオン性脂質は、不斉中心、キラル軸、およびキラル平面を有し(E.L.Eliel and S.H,Wilen,Stereochemistry of Carbon Compounds,John Wiley & Sons,New York,1994,pages 1119−1190に記載される通り)、ラセミ化合物、ラセミ混合物、そして個々のジアステレオマーとして生じる可能性があり、光学異性体を含むすべての起こり得るその異性体および混合物が本発明に含まれる。その上、本明細書に開示されるカチオン性脂質は、互変異性体として存在する可能性があり、たとえ1つの互変異性体構造しか示されていないとしても、両方の互変異性型が本発明の範囲に包含されることが意図される。
本発明のカチオン性脂質上の置換基および置換パターンは、化学的に安定であり、当技術分野で公知の技法、ならびに下に示す方法によって容易に入手可能な出発物質から容易に合成することのできるカチオン性脂質を提供するために、当業者によって選択され得ることは当然理解される。置換基自体が2個以上の基で置換されている場合、これらの複数の基は、安定した構造が生じる限り、同じ炭素上にあっても異なる炭素上にあってもよいことは当然理解される。
化学的に安定であり、かつ容易に入手可能な出発物質から当技術分野で公知の技法によって容易に合成することのできるカチオン性脂質を提供するために、当業者によって1個以上のSi原子を本発明のカチオン性脂質に組み込むことができることは当然理解される。
式Aの化合物において、原子は、その天然の同位体存在度を示してもよいし、あるいは1個以上の原子は、同じ原子番号を有するが、天然に優勢に見出される原子量または質量数とは異なる原子量または質量数を有する、特定の同位体で人工的に濃縮されていてもよい。本発明は、式Aの化合物のすべての適した同位体変化を含むことを意図する。例えば、水素(H)の異なる同位体形には、プロチウム(H)および重水素(H)が含まれる。プロチウムは、天然に見出される優勢な水素同位体である。重水素を濃縮することにより、ある種の治療上の利点、例えばインビボ半減期の増加または必要用量の低下などをもたらすことができるか、または、生体試料の特徴付けに標準物質として有用な化合物を得ることができる。式Aの中の同位体濃縮化合物は、過度の実験を行うことなく、当業者に周知の従来技法によるか、または本明細書のスキームおよび実施例に記載されるものに類似するプロセスにより、適切な同位体濃縮試薬および/または中間体を用いて調製することができる。
本明細書において、「アルキル」は、指定された数の炭素原子を有する直鎖、環状または分枝状の飽和脂肪族炭化水素を意味する。
本明細書において、「アルケニル」は、指定された数の炭素原子を有する直鎖、環状または分枝状の不飽和脂肪族炭化水素を意味し、それには、限定されるものではないが、ジエン、トリエンおよびテトラエン不飽和脂肪族炭化水素が含まれる。
環状「アルキル」または「アルケニル」の例は:
Figure 2013533223
である。
本明細書において、「ヘテロシクリル」または「複素環」は、O、NおよびSからなる群から選択される1〜4個のヘテロ原子を含有する4〜10員の芳香族もしくは非芳香族複素環を意味し、それには二環式基が含まれる。したがって「ヘテロシクリル」には、以下:
ベンゾイミダゾリル、ベンゾフラニル、ベンゾフラザニル、ベンゾピラゾリル、ベンゾトリアゾリル、ベンゾチオフェニル、ベンゾキサゾリル、カルバゾリル、カルボリニル、シンノリニル、フラニル、イミダゾリル、インドリニル、インドリル、インドールアジニル、インダゾリル、イソベンゾフラニル、イソインドリル、イソキノリル、イソチアゾリル、イソキサゾリル、ナフトピリジニル、オキサジアゾリル、オキサゾリル、オキサゾリン、イソキサゾリン、オキセタニル、ピラニル、ピラジニル、ピラゾリル、ピリダジニル、ピリドピリジニル、ピリダジニル、ピリジル、ピリミジル、ピロリル、キナゾリニル、キノリル、キノキサリニル、テトラヒドロピラニル、テトラゾリル、テトラゾロピリジル、チアジアゾリル、チアゾリル、チエニル、トリアゾリル、アゼチジニル、1,4−ジオキサニル、ヘキサヒドロアゼピニル、ピペラジニル、ピペリジニル、ピロリジニル、モルホリニル、チオモルホリニル、ジヒドロベンゾイミダゾリル、ジヒドロベンゾフラニル、ジヒドロベンゾチオフェニル、ジヒドロベンゾキサゾリル、ジヒドロフラニル、ジヒドロイミダゾリル、ジヒドロインドリル、ジヒドロイソオキサゾリル、ジヒドロイソチアゾリル、ジヒドロオキサジアゾリル、ジヒドロオキサゾリル、ジヒドロピラジニル、ジヒドロピラゾリル、ジヒドロピリジニル、ジヒドロピリミジニル、ジヒドロピロリル、ジヒドロキノリニル、ジヒドロテトラゾリル、ジヒドロチアジアゾリル、ジヒドロチアゾリル、ジヒドロチエニル、ジヒドロトリアゾリル、ジヒドロアゼチジニル、メチレンジオキシベンゾイル、テトラヒドロフラニル、およびテトラヒドロチエニル、ならびに、そのすべてがR”から選択される1〜3個の置換基で置換されていてもよい、そのN−酸化物が含まれる。
本明細書において、「ポリアミン」は、2個またはそれ以上のアミノ基を有する化合物を意味する。例としては、プトレッシン、カダベリン、スペルミジン、およびスペルミンが挙げられる。
本明細書において、「ハロゲン」は、Br、Cl、FおよびIを意味する。
式Aの一実施形態では、RおよびRは、独立に、Hおよび(C−C)アルキルから選択され、前記アルキルは、R’から選択される1〜3個の置換基で置換されているか、または、RおよびRは、それらが結合している窒素と一緒に、該窒素に加えて、N、OおよびSから選択される1または2個のさらなるヘテロ原子を含有していてもよい、4〜7員の単環式複素環を形成することができ、前記単環式複素環は、R’から選択される1〜3個の置換基で置換されていてもよい。
式Aの一実施形態では、RおよびRは、独立に、H、メチル、エチルおよびプロピルから選択され、前記メチル、エチルおよびプロピルは、R’から選択される1〜3個の置換基で置換されていてもよいか、または、RおよびRは、それらが結合している窒素と一緒に、該窒素に加えて、N、OおよびSから選択される1または2個のさらなるヘテロ原子を含有していてもよい、4〜7員の単環式複素環を形成することができ、前記単環式複素環は、R’から選択される1〜3個の置換基で置換されていてもよい。
式Aの一実施形態では、RおよびRは、独立に、H、メチル、エチルおよびプロピルから選択される。
式Aの一実施形態では、RおよびRは、各々、Hである。
式Aの一実施形態では、R’は、R”である。
式Aの一実施形態では、R”は、独立に、H、メチル、エチルおよびプロピルから選択され、前記メチル、エチルおよびプロピルは、1個以上のハロゲンおよびOHで置換されていてもよい。
式Aの一実施形態では、R”は、独立に、H、メチル、エチルおよびプロピルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、ハロゲンおよびOHで置換されていてもよい、C−C22アルキルおよびC−C22アルケニルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、C−C22アルキルおよびC−C22アルケニルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、C−C22アルケニルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、C12−C22アルケニルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、C18アルケニルである。
式Aの一実施形態では、Lは、
Figure 2013533223
である。
式Aの一実施形態では、Lは、
Figure 2013533223
である。
式Aの一実施形態では、Lは、ハロゲンおよびOHで置換されていてもよい、C−C13アルキルおよびC−C13アルケニルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、ハロゲンおよびOHで置換されていてもよい、C−CアルキルおよびC−Cアルケニルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、ハロゲンおよびOHで置換されていてもよい、C−CアルキルおよびC−Cアルケニルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、C−C13アルキルおよびC−C13アルケニルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、C−CアルキルおよびC−Cアルケニルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、C−CアルキルおよびC−Cアルケニルから選択される。
式Aの一実施形態では、Lは、C−C13アルキルである。
式Aの一実施形態では、Lは、C−Cアルキルである。
式Aの一実施形態では、Lは、C−Cアルキルである。
式Aの一実施形態では、Lは、Cアルキルである。
式Aの一実施形態では、「ヘテロシクリル」は、ピロリジン、ピペリジン、モルホリン、イミダゾールまたはピペラジンである。
式Aの一実施形態では、「単環式ヘテロシクリル」は、ピロリジン、ピペリジン、モルホリン、イミダゾールまたはピペラジンである。
式Aの一実施形態では、「ポリアミン」は、プトレッシン、カダベリン、スペルミジンまたはスペルミンである。
一実施形態では、「アルキル」は、指定された数の炭素原子を有する直鎖飽和脂肪族炭化水素である。
一実施形態では、「アルケニル」は、指定された数の炭素原子を有する直鎖不飽和脂肪族炭化水素である。
本発明には、式Aのカチオン性脂質の遊離形態、ならびにその製薬上許容される塩および立体異性体が含まれる。本明細書において例示される一部の単離された具体的なカチオン性脂質は、アミンカチオン性脂質のプロトン化塩である。用語「遊離形態」とは、非塩形態のアミンカチオン性脂質をさす。包含される製薬上許容される塩には、本明細書に記載される具体的なカチオン性脂質について例示される単離された塩だけでなく、式Aのカチオン性脂質の遊離形態のすべての典型的な製薬上許容される塩も含まれる。記載される具体的な塩カチオン性脂質の遊離形態は、当技術分野で公知の技法によって単離することができる。例えば、遊離形態は、塩を適した希釈塩基水溶液、例えば希釈NaOH水溶液、炭酸カリウム水溶液、アンモニア水および重炭酸ナトリウム水溶液などで処理することにより、再生することができる。遊離形態は、ある種の物理的特性、例えば極性溶媒中の溶解度などにおいてその各々の塩形態とは多少異なる可能性があるが、酸塩および塩基塩は、その他の点で本発明の目的のその各々の遊離形態と製薬上等価である。
本発明のカチオン性脂質の製薬上許容される塩は、塩基性または酸性部分を含有する本発明のカチオン性脂質から従来の化学的手法によって合成することができる。一般に、塩基性カチオン性脂質の塩は、イオン交換クロマトグラフィーによるか、あるいは、適した溶媒または様々な組合せの溶媒中、遊離塩基と、化学量論量または過剰量の所望の塩形成無機酸もしくは有機酸を反応させることによって調製される。同様に、酸性化合物の塩は、適切な無機塩基または有機塩基との反応により形成される。
よって、本発明のカチオン性脂質の製薬上許容される塩には、塩基性の本発明のカチオン性脂質と無機酸または有機酸を反応させることにより形成されるような本発明のカチオン性脂質の従来型の無毒の塩が含まれる。例えば、従来型の無毒の塩としては、無機酸、例えば塩酸、臭化水素酸、硫酸、スルファミン酸、リン酸、硝酸および同類のものなどから誘導される塩、ならびに有機酸、例えば酢酸、プロピオン酸、コハク酸、グリコール酸、ステアリン酸、乳酸、リンゴ酸、酒石酸、クエン酸、アスコルビン酸、パモ酸、マレイン酸、ヒドロキシマレイン酸、フェニル酢酸、グルタミン酸、安息香酸、サリチル酸、スルファニル酸、2−アセトキシ−安息香酸、フマル酸、トルエンスルホン酸、メタンスルホン酸、エタンジスルホン酸、シュウ酸、イセチオン酸、トリフルオロ酢酸(TFA)および同類のものなどから調製される塩が挙げられる。
本発明のカチオン性脂質が酸性である場合、適した「製薬上許容される塩」とは、無機塩基および有機塩基を含む、製薬上許容される無毒の塩基から調製される塩をさす。無機塩基から誘導される塩としては、アルミニウム、アンモニウム、カルシウム、銅、第二鉄、第一鉄、リチウム、マグネシウム、第二マンガン塩(manganic salts)、第一マンガン(manganous)、カリウム、ナトリウム、亜鉛および同類のものが挙げられる。特に好ましいのは、アンモニウム、カルシウム、マグネシウム、カリウムおよびナトリウム塩である。製薬上許容される有機無毒塩基から誘導される塩としては、第一級、第二級および第三級アミン、天然に存在する置換アミンを含む置換アミン、環状アミンおよび塩基性イオン交換樹脂、例えば、アルギニン、ベタインカフェイン、コリン、N,N−ジベンジルエチレンジアミン、ジエチルアミン、2−ジエチルアミノエタノール、2−ジメチルアミノエタノール、エタノールアミン、エチレンジアミン、N−エチルモルホリン、N−エチルピペリジン、グルカミン、グルコサミン、ヒスチジン、ヒドラバミン、イソプロピルアミン、リジン、メチルグルカミン、モルホリン、ピペラジン、ピペリジン、ポリアミン樹脂、プロカイン、プリン、テオブロミン、トリエチルアミン、トリメチルアミントリプロピルアミン、トロメタミンおよび同類のものなどの塩が挙げられる。
上記の製薬上許容される塩およびその他の典型的な製薬上許容される塩の調製は、Berg et al.,「Pharmaceutical Salts」,J.Pharm.Sci.,1977:66:1−19によってより詳細に記載されている。
また、本発明のカチオン性脂質は内部塩または双性イオンである可能性があることにも留意されたい。これは、生理的条件下では、化合物中の脱プロトン化酸性部分、例えばカルボキシル基などはアニオン性である場合があり、その結果、この電子電荷はプロトン化またはアルキル化塩基性部分、例えば第四級窒素原子などのカチオン電荷に対して内部的に平衡をとって離れる可能性があるためである。
提供される実施例は、本発明のさらなる理解を助けることを目的とする。用いる特定の材料、種および条件は、本発明をさらに例示することを目的とし、その合理的な範囲を制限することを意図しない。カチオン性脂質を合成する際に利用される試薬は、市販のものであるか、または当業者によって容易に調製されるものである。
新規なカチオン性脂質の合成は、エピクロロヒドリン(i)で出発する線形プロセスである。エピクロロヒドリンと脂質アルコールとの反応により、中間体エポキシドiiが得られる。第2の脂質アルコールによるルイス酸エポキシドの開環により、第二級アルコールiiiが得られる。トリフラート形成およびアミン置換により、タイプivの最終生成物が得られる。
一般的スキーム1
Figure 2013533223
中間体シクロプロピル類似体(vi)の合成は、タイプvのオレフィンのシモンズ・スミスシクロプロパン化反応により実行した。
一般的スキーム2
Figure 2013533223
スキーム1
S−N,N−ジメチル−1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物1)
Figure 2013533223
オクタノール(1.5モル、195g)、テトラブチルアンモニウムブロマイド(75ミリモル、24.1g)および水酸化ナトリウム(2.4モル、96g)の溶液を、3℃に冷却し、R−エピクロロヒドリンを滴下漏斗を介して添加した。混合物を3℃にて6時間攪拌した後、16時間周囲温度まで暖まらせた。反応物を、ヘキサンと飽和重炭酸ナトリウム水溶液とに分液した。有機物を水(2×625mL)およびブライン(625mL)で洗浄し、真空蒸発させた。粗油状物質を、フラッシュクロマトグラフィー(シリカ、0〜20%酢酸エチル/ヘプタン)により精製して、236g(85%)の2−[(オクチルオキシ)メチル]オキシランの鏡像異性体の1つを透明な油状物質として得た。H NMR(400MHz,CDCl3):δ3.68(m,1H)、3.45(m,2H)、3.38(m,1H)、3.16(m,1H)、2.78(m,1H)、2.59(m,1H)、1.58(m,2H)、1.30(m,10H)、0.83(m,3H)。
最初に、この反応の生成物に、不斉炭素中心に変化のない、ハライド原子を有する炭素でのSN2機構によって得られ得る2R立体化学を割り当てた。
しかし、記載した条件、すなわちルイス酸条件下での、振動円偏光二色性(VCD)、すなわちキラル分子の絶対配置を決定するための妥当な分光学的方法(R.K.Dukor and L.A.Nafie,in Encyclopedia of Analytical Chemistry:Instrumentation and Applications,Ed.R.A.Meyers (Wiley,Chichester,2000)662−676)と併せた、その後の研究(リネオリル(lineolyl)アルコールとS−エピクロロヒドリンの反応での実験)により、SN2の機構によって生じた反応、すなわちその後の開環をもたらすエポキシドの末端炭素での反応が明らかとなり、その後、不斉炭素での立体化学の反転を導くインサイチュ閉環段階が続いた。
これらの研究の結果として、この反応の生成物に、2S立体化学:(2S)−[(オクチルオキシ)メチル]オキシランを割り当てた。
Figure 2013533223
エポキシド(3.86g、20.7ミリモル)およびリノレイルアルコール(6.6g、24.8ミリモル)のジクロロメタン(100mL)中の溶液を、周囲温度にて四塩化スズ(4.44g、2.0ミリモル)で処理した。3時間攪拌した後、反応をブラインでクエンチし、ブラインとジクロロメタンとに分液した。有機物を硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、真空蒸発させた。粗油状物質を、フラッシュクロマトグラフィー(シリカ、2〜5%アセトン/ヘキサン)により精製して5.85g(62%)のR−1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−オールを透明な油状物質として得た。H NMR(400MHz,CDCl3):δ5.38(m,4H)、3.93(m,1H)、3.49(m,8H)、2.79(m,2H)、2.45(m,1H)、2.06(m,4H)、1.58(m,6H)、1.30(m,26H)、0.89(m,6H)。
Figure 2013533223
化合物iii(5.08g、11.2ミリモル)を、ジクロロメタン(100ml)に溶解し、2,6−ルチジン(1.44g、13.5ミリモル)で処理した。トリフル酸無水物(3.8g、13.5ミリモル)を0℃にて反応系に滴下した。2.5時間後、反応物を、ジメチルアミン(39.3ミリモル)のジクロロメタン(85mL)中の冷溶液の中にカニューレで挿入した。0℃で2時間後、反応を飽和重炭酸ナトリウム溶液でクエンチし、水/ジクロロメタンに分液した。有機物を硫酸マグネシウムで乾燥させ、濾過し、真空蒸発させた。粗油状物質をフラッシュクロマトグラフィー(シリカ、0〜30%酢酸エチル/ヘキサン)により精製して、3.66g(65%)のS−N,N−ジメチル−1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミンを琥珀色の油状物質として得た。H NMR(400MHz,CDCl3):δ5.38(m,4H)、3.52(m,4H)、3.40(m,4H)、2.79(m,3H)、2.40(s,6H)、2.05(m,4H)、1.58(m,4H)、1.30(m,26H)、0.89(m,6H)。HRMS:計算値480.4775、観察値480.4769。
化合物2は、新規なカチオン性脂質であり、S−エピクロロヒドリンで出発する、上の一般的スキーム1およびスキーム1に従って調製した。
Figure 2013533223
化合物2
R−N,N−ジメチル−1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物2)
H NMR(400MHz,CDCl3):δ5.38(m,4H)、3.52(m,4H)、3.40(m,4H)、2.79(m,3H)、2.40(s,6H)、2.05(m,4H)、1.58(m,4H)、1.30(m,26H)、0.89(m,6H)。
化合物3〜20を、一般スキーム1に従って化合物1に記載されるものに類似の方法で調製した。
Figure 2013533223
Figure 2013533223
スキーム2
N,N−ジメチル−1−(オクチルオキシ)−3−({8−[(1S,2S)−2−{[(1R,2R)−2−ペンチルシクロプロピル]メチル}シクロプロピル]オクチル}オキシ)プロパン−2−アミン(化合物21)
Figure 2013533223
1Lフラスコ中の1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−オールのDCM(166ml)中の溶液を、窒素下、氷/IPA浴(−15℃)中で冷却し、次に、ヘキサン中1Mジエチル亜鉛(199ml、199ミリモル)を添加し、それに続いてジヨードメタン(24.05ml、298ミリモル)を添加した。混合物を、徐々に室温に達するように冷却浴中で一晩攪拌させた。過剰な飽和塩化アンモニウムの添加により反応をクエンチした。洗浄した反応物をヘキサンおよび水と2L分液漏斗に入れ、過剰なヘキサンを添加し、激しく振盪した。下側の水層を捨て、有機層を硫酸ナトリウムで乾燥させ、蒸発させて1−(オクチルオキシ)−3−[(8−{2−[(2−ペンチルシクロプロピル)メチル]シクロプロピル}オクチル)オキシ]プロパン−2−オール(15.5g、32.2ミリモル、収率97%)を黄色の油状物質とした。材料はさらなる精製を行わずに使用した。MS(ESI):481[M+H]
Figure 2013533223
アルコールviの最終化合物21への変換は、化合物1について記載されるように達成した。C33H65NO2[M+H]、計算値508.5、観察値508.5。
N,N−ジメチル−1−{[8−(2−オクチルシクロプロピル)オクチル]オキシ}−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物22)は、化合物21について記載されるのと同様の方法で調製した。C32H65NO2[M+H]、計算値496.5、観察値496.5。
Figure 2013533223
化合物23は、J.Controlled Release,2005,107,276−287、米国特許出願公開第2006/0083780号、および同第2006/0008910号に記載されるDLinDMAである。
Figure 2013533223
化合物24は、Nature Biotechnology,2010,28,172−176、国際公開第2010/042877号、同第2010/048536号、同第2010/088537号、および同第2009/127060号に記載されるDLinKC2DMAである。
Figure 2013533223
LNP組成
以下の本発明の脂質ナノ粒子組成(LNPs)は、オリゴヌクレオチド、特にsiRNAおよびmiRNAの送達に有用である:
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG 56.6/38/5.4;
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG 60/38/2;
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG 67.3/29/3.7;
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG 49.3/47/3.7;
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG 50.3/44.3/5.4;
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−C−DMA/DSPC 40/48/2/10;
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG/DSPC 40/48/2/10;および
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG/DSPC 58/30/2/10。
LNPsの合成および使用は、公知である。(米国特許出願:米国特許出願公開第2006/0083780号、同第2006/0240554号、同第2008/0020058号、同第2009/0263407号および同第2009/0285881号ならびにPCT特許出願:国際公開第2009/086558号、同第2009/127060号、同第2009/132131号、同第2010/042877号、同第2010/054384号、同第2010/054401号、同第2010/054405号および同第2010/054406号参照)。また、Semple S.C.et al.,Rational design of cationic lipids for siRNA delivery,Nature Biotechnology,published online 17 January 2010;doi:10.1038/nbt.l602も参照されたい。
LNPプロセスの説明:
脂質ナノ粒子(LNP)は、衝突噴流法により調製される。この粒子は、アルコールに溶解した脂質とクエン酸塩緩衝液に溶解したsiRNAを混合することにより形成される。脂質のsiRNAに対する混合比は、脂質45〜55%およびsiRNA65〜45%を目標とする。この脂質溶液は、本発明の新規なカチオン性脂質、ヘルパー脂質(コレステロール)、PEG(例、PEG−C−DMA、PEG−DMG)脂質、および5〜15mg/mLの濃度のDSPCを、アルコール(例えばエタノール)中9〜12mg/mLの目標で含有する。これらの脂質の比は、カチオン性脂質について25〜98モルパーセントの範囲(目標は35〜65)であり、ヘルパー脂質は、0〜75モルパーセントの範囲(目標は30〜50)であり、PEG脂質は、1〜15モルパーセントの範囲(目標は1〜6)であり、DSPCは、0〜15モルパーセントの範囲(目標は0〜12)である。siRNA溶液は、1つ以上のsiRNA配列を0.3〜1.0mg/mLの濃度範囲で含有し、目標は、3.5〜5の範囲のpHのクエン酸ナトリウム緩衝塩溶液中0.3〜0.9mg/mLである。これら2つの液体を、30〜40℃を目標とする、15〜40℃の範囲の温度に加熱した後、衝突噴流ミキサーで混合し、直ちにLNPを形成した。ティー内径(teeID)は、0.25〜1.0mmの範囲であり、全流速は10〜600mL/分の範囲である。流速とチューブ内径(tubing ID)の組合せは、LNPsの粒径を30〜200nmの間に制御する効果がある。次に、溶液を、より高いpHの緩衝液と、1:1〜1:3 容積:容積の範囲であるが1:2 容積:容積を目標とする範囲の混合比で混合する。この緩衝液は、30〜40℃を目標とする、15〜40℃の範囲の温度である。混合したLNPsを、アニオン交換濾過段階の前に30分〜2時間保持した。インキュベーション中の温度は、30〜40℃を目標とする、15〜40℃の範囲である。インキュベートした後、溶液を、アニオン交換分離段階を含む0.8umフィルターに通して濾過する。この方法は、1mm ID〜5mm IDまでのチューブ内径および10〜2000mL/分の流速を使用する。LNPsを濃縮し、限外濾過法によって透析濾過し、アルコールを除去し、クエン酸塩緩衝液を最終の緩衝液、例えばリン酸緩衝生理食塩水などに交換する。限外濾過法は、タンジェンシャルフロー濾過方式(TFF)を使用する。この方法は、公称分子量カットオフが30〜500KDの範囲の膜を使用する。膜形式は、中空糸であってもフラットシートカセットであってもよい。適切な分子量カットオフを用いるTFF法は、LNPを保持液中に保持し、濾液または透過液は、アルコール;クエン酸緩衝液;最終の緩衝液廃棄物を含有する。TFF法は、siRNA濃度に対する初期濃度が1〜3mg/mLの多段階法である。濃縮した後、アルコールを除去して緩衝液交換を実施するために、LNPs溶液を、10〜20容積の最終緩衝液に対して透析濾過する。次に、材料をさらに1〜3倍に濃縮する。LNP法の最終段階は、濃縮したLNP溶液を滅菌濾過し、生成物をバイアルに入れることである。
分析手順:
1)siRNA濃度
siRNA二本鎖濃度は、2996 PDA検出器を備えたWaters 2695 Alliance system(Water Corporation,Milford MA)を用いて、強陰イオン交換高速液体クロマトグラフィー(SAX−HPLC)により決定される。LNPs(そうでなければRNAi送達ビヒクル(RDVs)と呼ばれる)を、0.5% Triton X−100で処理して全siRNAを遊離し、254nmでUV検出するDionex BioLC DNAPac PA 200(4×250mm)カラムを用いるSAX分離により分析した。移動相は、A:25mM NaClO、10mM トリス、20% EtOH、pH7.0およびB;250mM NaClO、10mM トリス、20% EtOH、pH7.0で構成され、0〜15分の線形勾配および1ml/分の流速を用いる。siRNA量は、siRNA標準曲線と比較することにより決定される。
2)カプセル封入率
蛍光試薬SYBR GoldをRNA定量化に用いて、RDVsのカプセル封入率をモニターする。Triton X−100を含むまたは含まないRDVsを使用して、遊離siRNAおよび全siRNA量を決定する。このアッセイは、Molecular Devices(Sunnyvale,CA)製のSpectraMax M5eマイクロプレート分光光度計を用いて実施される。サンプルは485nmで励起し、530nmで蛍光発光を測定した。siRNA量は、siRNA標準曲線と比較することにより決定される。
カプセル封入率=(1−遊離siRNA/全siRNA)×100%
3)粒径および多分散性
1μgのsiRNAを含有するRDVsを、1×PBSで希釈して最終容積3mlとする。サンプルの粒径および多分散性を、ZetaPALS機器(Brookhaven Instruments Corporation,Holtsviile、NY)を用いる動的光散乱法により測定する。散乱強度を、散乱角90°で25℃のHe−Neレーザーによって測定する。
4)ゼータ電位分析
1μgのsiRNAを含有するRDVsを、1mMトリス緩衝液(pH7.4)で希釈して最終容積2mlとする。サンプルの電気泳動移動度を、電極および光源としてHe−Neレーザーを備えたZetaPALS機器(Brookhaven Instruments Corporation,Holtsviile,NY)を用いて決定する。Smoluchowskiの極限を、ゼータ電位の計算において仮定する。
5)脂質分析
個々の脂質濃度は、コロナ荷電化粒子検出器(Corona charged aerosol detector:CAD)(ESA Biosciences,Inc,Chelmsford,MA)を備えたWaters 2695 Alliance system(Waters Corporation,Milford MA)を用いる逆相高速液体クロマトグラフィー(RP−HPLC)により決定する。RDVs中の個々の脂質は、CADを備えたAgilent Zorbax SB−C18(50×4.6mm、粒径1.8μm)カラムを60℃で用いて分析する。移動相は、A:HO中0.1% TFAおよびB:IPA中0.1%TEAで構成される。勾配は、0時の移動相A60%および移動相B40%から、1.00分の移動相A40%および移動相B60%;1.00〜5.00分の移動相A40%および移動相B60%;5.00分の移動相A40%および移動相B60%から、10.00分の移動相A25%および移動相B75%;10.00分の移動相A25%および移動相B75%から、15.00分の移動相A5%および移動相B95%;そして15.00分の移動相A5%および移動相B95%から、20.00分の移動相A60%および移動相B40%に1ml/分の流速で変化する。個々の脂質濃度は、二次曲線の当てはめによって、RDVs中のすべての脂質成分を含む標準曲線と比較することにより決定される。各々の脂質の分子百分率は、その分子量に基づいて計算される。
上記のLNPプロセスを利用して、以下の比をもつ具体的なLNPsを特定した:
公称組成:
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG 60/38/2
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG 67.3/29/3.7。
Luc siRNA
5’−iB−AUAAGGCUAUGAAGAGAUATT−iB 3’(配列番号:1)
3’−UUUAUUCCGAUACUUCUCUAU−5’(配列番号:2)
AUGC−リボース
iB−逆位デオキシ脱塩基
UC−2’フルオロ
AGT−2’デオキシ
AGU−2’OCH
公称組成
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG 60/38/2
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG/DSPC 40/48/2/10
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG/DSPC 58/30/2/10
ApoB siRNA
5’−iB−CUUUAACAAUUCCUGAAAUTT−iB(配列番号:3)
3’−UUGAAAUUGUUAAGGACUUUA−5’(配列番号:4)
AUGC−リボース
iB−逆位デオキシ脱塩基
UC−2’フルオロ
AGT−2’デオキシ
AGU−2’OCH
公称組成
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG 60/38/2
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG/DSPC 40/48/2/10
カチオン性脂質/コレステロール/PEG−DMG/DSPC 58/30/2/10
ApoB siRNA
5’−iB−CUUUAACAAUUCCUGAAAUTsT−i−3’B(配列番号:5)
3’−UsUGAAAUUGUUAAGGACUsUsUsA−5’(配列番号:6)
AUGC−リボース
iB−逆位デオキシ脱塩基
UC−2’フルオロ
AGT−2’デオキシ
AGU−2’OCH
UsA−ホスホロチオエート(phophorothioate)結合
オリゴヌクレオチド、特に、siRNAおよびmiRNAの合成および使用は公知である。(米国特許出願:米国特許出願公開第2006/0083780号、同第2006/0240554号、同第2008/0020058号、同第2009/0263407号および同第2009/0285881号ならびにPCT特許出願:国際公開第2009/086558号、同第2009/127060号、同第2009/132131号、同第2010/042877号、同第2010/054384号、同第2010/054401号、同第2010/054405号および同第2010/054406号参照)。また、Semple S.C.et al.,Rational design of cationic lipids for siRNA delivery,Nature Biotechnology,published online 17 January 2010;doi:10.1038/nbt.l602も参照されたい。
有効性のマウスインビボ評価
直前に記載される公称組成の化合物1〜2を利用するLNPsを、ルシフェラーゼマウスモデルにおけるインビボ有効性および炎症性サイトカインの誘導について評価した。siRNAは、ホタル(フォチナス・ピラリス(Photinus pyralis))ルシフェラーゼ遺伝子(受託番号M15077)のmRNA転写物を標的にする。ルシフェラーゼsiRNAの一次配列および化学修飾パターンを上に表示する。インビボルシフェラーゼモデルは、ホタルルシフェラーゼコード配列がすべての細胞に存在しているトランスジェニックマウスを用いる。ダナ・ファーバー癌研究所(Dana Farber Cancer Institute)から認可されたROSA26−LoxP−Stop−LoxP−Luc(LSL−Luc)トランスジェニックマウスを、最初にLSL配列を組換えAd−Creウイルス(Vector Biolabs)で除去することにより、ルシフェラーゼ遺伝子を発現するように誘導する。ウイルスの臓器親和性に起因して、尾静脈注射により送達される場合には、発現は肝臓に制限される。肝臓におけるルシフェラーゼ発現レベルを、ルシフェリン基質(Caliper Life Sciences)の投与の後に、IVIS撮像装置(Xenogen)を用いて発光を測定することにより定量化する。投薬前(pre−dose)発光レベルをRDVsの投与の前に測定する。PBS中のルシフェリン(15mg/mL)を、150μLの量で腹腔内(IP)注射する。4分のインキュベーション期間の後、マウスをイソフランで麻酔し、IVIS撮像装置に入れる。PBSビヒクル中のRDVs(siRNAを含有)を、0.2mLの量で尾静脈注射した。最終投与量レベルは、0.3〜3mg/kg siRNAの範囲であった。PBSビヒクル単独は、対照として投与した。投薬の3時間後、マウスを後眼窩から出血させてサイトカイン分析のための血漿を得た。マウスを、投薬の48時間後に上記の方法を用いて撮像した。ルシフェリン光出力の変化は、直接にルシフェラーゼmRNAレベルに相関し、ルシフェラーゼsiRNA活性の間接的な尺度を示す。インビボ有効性の結果は、投薬前発光レベルに対する発光の阻害%として表される。血漿中サイトカイン濃度は、SearchLight多重サイトカイン化学発光アレイ(Pierce/Thermo)を用いて決定した。ルシフェラーゼsiRNA RDVsの全身投与は、ルシフェラーゼ発現を用量依存的に低下させた。オクチル−CLinDMA(OCD)カチオン性脂質を含有するRDVを投与したマウスよりも、RDVsを含有する化合物1を投与したマウスにおいて、より高い有効性が観察された(図1)。OCDは公知であり、国際公開第2010/021865号に記載されている。
有効性および毒性のラットインビボ評価
上記の公称組成において化合物1を利用するLNPsを、スプラーグ・ドーリー(Crl:CD(SD)雌ラット(Charles River Labs)において、インビボ有効性およびアラニンアミノトランスフェラーゼおよびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼの増加について評価した。siRNAは、ApoB遺伝子(受託番号NM 019287)のmRNA転写物を標的にする。ApoB siRNAの一次配列および化学修飾パターンは上に表示されている。PBSビヒクル中のRDVs(siRNAを含有)を、1〜1.5mLの量で尾静脈注射した。注入速度は、約3ml/分である。各々の投薬群に5匹のラットを使用した。LNPの投与後、ラットを標準的な食餌および水のあるケージに入れる。投薬の6時間後、食物をケージから取り出す。動物の解剖をLNP投薬の24時間後に実施する。ラットを5分間のイソフランで麻酔した後、イソフランの送達を継続しながら全採血が終了するまでラットをノーズ・コーンに入れることにより麻酔下で維持する。血液は、23ゲージバタフライ型静脈穿刺セットを用いて大静脈から採取し、血清化学分析のために血清分離器バキュテイナに等分する。切除した肝尾状葉のパンチを採取し、mRNA分析のためにRNALater(Ambion)に入れる。保存肝組織をホモジナイズし、QiagenビーズミルおよびQiagen miRNA−Easy RNA単離キットを製造業者の説明書に従って用いて全RNAを単離した。肝臓ApoB mRNAレベルを、定量的RT−PCRにより測定した。ラットApoBの市販のプローブセット(Applied Biosystemsカタログ番号RN01499054_ml)を利用して精製RNAからメッセージを増幅させた。PCR反応を、96ウェルFast Blockを備えたABI 7500機器で実施した。ApoB mRNAレベルを、ハウスキーピングPPIB(NM011149)mRNAに正規化する。PPIB mRNAレベルは、RT−PCRにより市販のプローブセット(Applied Biosytemsカタログ番号Mm00478295_ml)を用いて測定した。結果を、ApoB mRNA/PPIB mRNAの比として表す。すべてのmRNAデータは、PBS対照投薬量と比較して表される。血清ALTおよびAST分析を、Siemensアラニンアミノトランスフェラーゼ(カタログ番号03039631)およびアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(カタログ番号03039631)試薬を利用して、Siemens Advia 1800 Clinical Chemistry Analyzerで実施した。オクチル−CLinDMA(OCD)カチオン性脂質を含有するRDVを投与したラットよりも、RDVを含有する化合物1を投与したラットにおいて、より高い有効性が観察された(図2)。その上、オクチル−CLinDMAカチオン性脂質を含有するRDVを投与したラットよりも、化合物1を含有するRDVを投与したラットにおいて、LFT(ALT/AST)のより低い上昇が観察された(図3)。
ラット肝臓におけるカチオン性脂質レベルの決定
肝組織を秤量して20mlバイアルに入れ、9v/wの水中でGenoGrinder 2000(OPS Diagnostics、1600ストローク/分、5分)を用いてホモジナイズした。各々の組織ホモジネートの50μLアリコートを、300μLの抽出/タンパク質沈殿溶媒(500nM内部標準を含有する50/50 アセトニトリル/メタノール)と混合し、プレートを遠心して沈殿したタンパク質を沈降させた。次に、各々の上清の200μLの量を96ウェルプレートの個々のウェルに移し、10μlの試料を直接、LC/MS−MSにより分析した。
標準液は、既知量の化合物1またはOCDのメタノール原液を未処理のラット肝臓ホモジネートに添加することにより調製した(肝臓1重量あたり水9容量)。各々の標準/肝臓ホモジネートのアリコート(50μL)を、300μLの抽出/タンパク質沈殿溶媒(500nM内部標準を含有する50/50 アセトニトリル/メタノール)と混合し、プレートを遠心して沈殿したタンパク質を沈降させた。各々の上清の200μLの量を96ウェルプレートの個々のウェルに移し、10μlの各々の標準液を直接、LC/MS−MSにより分析した。
ラット肝臓ホモジネートから調製および抽出した標準液に対する絶対定量を、API 4000三連四重極質量分析計(Applied Biosystems)に連結したAria LX−2 HPLCシステム(Thermo Scientific)を用いて実施した。各々の実験に対して、合計10μLの試料を、BDS Hypersil C8 HPLCカラム(Thermo、50×2mm、3μm)に周囲温度で注入した(図4)。
移動相A:95%H2O/5%メタノール/10mMギ酸アンモニウム/0.1%ギ酸 移動相B:40%メタノール/60%n−プロパノール/10mMギ酸アンモニウム/0.1%ギ酸 流速は0.5mL/分であり、勾配溶出プロフィールは次の通りであった:A80%を0.25分間保持、1.6分間でB100%へ直線勾配、B100%を2.5分間保持、次に、A80%に戻って1.75分間保持。総実行時間は5.8分であった。API 4000ソースパラメータは、CAD:4、CUR:15、GS1:65、GS2:35、IS:4000、TEM:550、CXP:15、DP:60、EP:10であった。

Claims (7)

  1. 式Aのカチオン性脂質:
    Figure 2013533223
    〔式中:
    およびRは、独立に、H、(C−C)アルキル、ヘテロシクリルおよびポリアミンから選択され、前記アルキル、ヘテロシクリルおよびポリアミンは、R’から選択される1〜3個の置換基で置換されていてもよく、または、RおよびRは、それらが結合している窒素と一緒に、該窒素に加えて、N、OおよびSから選択される1または2個のさらなるヘテロ原子を含有していてもよい、4〜7員の単環式複素環を形成することができ、前記単環式複素環は、R’から選択される1〜3個の置換基で置換されていてもよく;
    R’は、独立に、ハロゲン、R”、OR”、SR”、CN、COR”またはCON(R”)から選択され;
    R”は、独立に、Hおよび(C−C)アルキルから選択され、前記アルキルは、ハロゲンおよびOHで置換されていてもよく;
    は、C−C22アルキルおよびC−C22アルケニルから選択され、前記アルキルおよびアルケニルは、R’から選択される1個以上の置換基で置換されていてもよく;かつ
    は、C−C13アルキルおよびC−C13アルケニルから選択され、前記アルキルおよびアルケニルは、R’から選択される1個以上の置換基で置換されていてもよい〕;
    または、その任意の製薬上許容される塩もしくは立体異性体。
  2. およびRが、各々メチルであり;
    が、C−C22アルキルおよびC−C22アルケニルから選択され;かつ
    が、C−C13アルキルおよびC−C13アルケニルから選択される、
    請求項1に記載の式Aのカチオン性脂質;
    または、その任意の製薬上許容される塩もしくは立体異性体。
  3. 以下から選択されるカチオン性脂質:
    R−N,N−ジメチル−1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物2);
    S−N,N−ジメチル−1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物1);
    1−{2−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−1−[(オクチルオキシ)メチル]エチル}ピロリジン(化合物3);
    (2S)−N,N−ジメチル−1−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−3−[(5Z)−オクト−5−エン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物4);
    1−{2−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]−1−[(オクチルオキシ)メチル]エチル}アゼチジン(化合物5);
    (2S)−1−(ヘキシルオキシ)−N,N−ジメチル−3−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物6);
    (2S)1−(ヘプチルオキシ)−N,N−ジメチル−3−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物7);
    N,N−ジメチル−1−(ノニルオキシ)−3−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物8);
    N,N−ジメチル−1−[(9Z)−オクタデセ−9−エン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物9);
    (2S)−N,N−ジメチル−1−[(6Z,9Z,12Z)−オクタデカ−6,9,12−トリエン−1−イルオキシ]−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物10);
    (2S)−1−[(11Z,14Z)−イコサ−11,14−ジエン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチル−3−(ペンチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物11);
    (2S)−1−(ヘキシルオキシ)−3−[(11Z,14Z)−イコサ−11,14−ジエン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチルプロパン−2−アミン(化合物12);
    1−[(11Z,14Z)−イコサ−11,14−ジエン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチル−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物13);
    1−[(13Z,16Z)−ドコサ−13,16−ジエン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチル−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物14);
    (2S)−1−[(13Z,16Z)−ドコサ−13,16−ジエン−1−イルオキシ]−3−(ヘキシルオキシ)−N,N−ジメチルプロパン−2−アミン(化合物15);
    (2S)−1−[(13Z)−ドコス−13−エン−1−イルオキシ]−3−(ヘキシルオキシ)−N,N−ジメチルプロパン−2−アミン(化合物16);
    1−[(13Z)−ドコス−13−エン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチル−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物17);
    1−[(9Z)−ヘキサデカ−9−エン−1−イルオキシ]−N,N−ジメチル−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物18);
    (2R)−N,N−ジメチル−1−[(1−メチルオクチル)オキシ]−3−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物19);
    (2R)−1−[(3,7−ジメチルオクチル)オキシ]−N,N−ジメチル−3−[(9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエン−1−イルオキシ]プロパン−2−アミン(化合物20);
    N,N−ジメチル−1−(オクチルオキシ)−3−({8−[(1S,2S)−2−{[(1R,2R)−2−ペンチルシクロプロピル]メチル}シクロプロピル]オクチル}オキシ)プロパン−2−アミン(化合物21);および
    N,N−ジメチル−1−{[8−(2−オクチルシクロプロピル)オクチル]オキシ}−3−(オクチルオキシ)プロパン−2−アミン(化合物22);
    またはその任意の製薬上許容される塩もしくは立体異性体。
  4. 脂質ナノ粒子の調製のための請求項1に記載のカチオン性脂質の使用。
  5. オリゴヌクレオチドの送達のための脂質ナノ粒子中の成分としての請求項1に記載のカチオン性脂質の使用。
  6. 該オリゴヌクレオチドがsiRNAまたはmiRNAである、請求項5に記載の使用。
  7. 該オリゴヌクレオチドがsiRNAである、請求項5に記載の使用。
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