JP2012522232A5 - - Google Patents
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Claims (22)
- 被験体の関節リウマチを診断するためのデータを提供するためのインビトロにおける方法であって、前記方法は、
被験体から得られた生物学的試料を、バイオマーカー−抗体の複合体の形成を可能とする時間の間および条件下において少なくとも1つのバイオマーカーと接触させる工程、ここで、少なくとも1つのバイオマーカーは、
配列番号7、配列番号8、配列番号9、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するBRAF−ペプチド、 配列番号2、配列番号3、配列番号4、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するPAD4−ペプチド、
並びに
その組合せ
からなる群より選択される;および
形成されたバイオマーカー−抗体の複合体を検出する工程、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、被験体における関節リウマチを示す、
を含む、前記方法。 - 前記方法は、
被験体から得られた生物学的試料を、バイオマーカー−抗体の複合体の形成を可能とする時間の間および条件下において少なくとも2つのバイオマーカーと接触させる工程、ここで、少なくとも2つのバイオマーカーは、
配列番号7、配列番号8、配列番号9、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するBRAF−ペプチド、
配列番号2、配列番号3、配列番号4、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するPAD4−ペプチド、
配列番号11、配列番号12、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチド、並びに
その組合せ
からなる群より選択される;および
形成されたバイオマーカー−抗体の複合体を検出する工程、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、被験体における関節リウマチを示す、
を含む、請求項1のインビトロにおける方法。 - 少なくとも2つのバイオマーカーが、3つのPAD4−ペプチド、3つのBRAF−ペプチドおよび2つのカルパスタチン−ペプチドを含み、そして3つのPAD4−ペプチドが、配列番号2、配列番号3および配列番号4を含むまたはからなり、3つのBRAF−ペプチドが配列番号7、配列番号8および配列番号9を含むまたはからなり、そして2つのカルパスタチン−ペプチドが配列番号11および配列番号12を含むまたはからなる、請求項2のインビトロにおける方法。
- 生物学的試料中の抗PAD4自己抗体の存在をインビトロにおいて検出するための方法であって、前記方法は、
生物学的試料を、バイオマーカー−抗体の複合体の形成を可能とする時間の間および条件下において少なくとも1つのバイオマーカーと接触させる工程、ここで、少なくとも1つのバイオマーカーは、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、その類似体、そのフラグメント、およびその組合せからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するPADペプチドである;および
形成されたバイオマーカー−抗体の複合体を検出する工程、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、生物学的試料中の抗PAD4自己抗体の存在を示す、
を含む、前記方法。 - 生物学的試料中の抗BRAF自己抗体の存在をインビトロにおいて検出するための方法であって、前記方法は、
生物学的試料を、バイオマーカー−抗体の複合体の形成を可能とする時間の間および条件下において少なくとも1つのバイオマーカーと接触させる工程、ここで、少なくとも1つのバイオマーカーは、配列番号7、配列番号8、配列番号9、その類似体、そのフラグメント、およびその組合せからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するBRAF−ペプチドである;および
形成されたバイオマーカー−抗体の複合体を検出する工程、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、生物学的試料中の抗BRAF自己抗体の存在を示す、
を含む、前記方法。 - 少なくとも1つのバイオマーカーが、50未満のアミノ酸のペプチドである、請求項1〜5のいずれか1項記載のインビトロにおける方法。
- 被験体がCCP陰性であるか、または生物学的試料が、CCP陰性被験体から得られる、請求項1〜6のいずれか1項のインビトロにおける方法。
- 前記被験体から得られた生物学的試料中において、C反応性タンパク質、血清アミロイドA、インターロイキン6、S100タンパク質、オステオポンチン、リウマチ因子、マトリックスメタロプロテアーゼ1、マトリックスメタロプロテアーゼ3、ヒアルロン酸、sCD14、血管新生マーカー、および骨、軟骨または滑膜の代謝産物からなる群より選択される少なくとも1つのマーカーの濃度を測定することをさらに含む、請求項1〜7のいずれか1項のインビトロにおける方法。
- 被験体の関節リウマチのインビトロにおける診断のためのキットであって、前記キットは、
配列番号7、配列番号8、配列番号9、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するBRAF−ペプチド、
配列番号2、配列番号3、配列番号4、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するPAD4−ペプチド、
配列番号11、配列番号12、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチド、並びに
その組合せ
からなる群より選択される少なくとも2つのバイオマーカー;および
バイオマーカーと、被験体から得られた生物学的試料中に存在する自己抗体との間に形成されるバイオマーカー−抗体の複合体を検出するための少なくとも1つの試薬、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、被験体における関節リウマチを示す、
を含む、前記キット。 - CCP陰性被験体の関節リウマチのインビトロにおける診断のためのキットであって、前記キットは、
配列番号7、配列番号8、配列番号9、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するBRAF−ペプチドからなる群より選択される3つのBRAF−ペプチド、
配列番号2、配列番号3、配列番号4、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するPAD4−ペプチドからなる群より選択される3つのPAD4−ペプチド、並びに
配列番号11、配列番号12、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチドからなる群より選択される2つのカルパスタチン−ペプチド
を含む、少なくとも8つのバイオマーカー;および
バイオマーカーと、被験体から得られた生物学的試料中に存在する自己抗体との間に形成されるバイオマーカー−抗体の複合体を検出するための少なくとも1つの試薬、ここで、バイオマーカー−抗体の複合体の検出は、被験体における関節リウマチを示す、
を含む、前記キット。 - 生物学的試料中の抗PAD4自己抗体の存在を検出するためのキットであって、前記キットは、
少なくとも1つのバイオマーカー、ここで、少なくとも1つのバイオマーカーは、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、その類似体、そのフラグメント、およびその組合せからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するPAD4−ペプチドである;および
バイオマーカーと、生物学的試料中に存在する自己抗体との間に形成されるバイオマーカー−抗体の複合体を検出するための少なくとも1つの試薬、ここで、前記自己抗体は、関節リウマチを示す抗PAD4自己抗体である、
を含む、前記キット。 - 生物学的試料中の抗BRAF自己抗体の存在を検出するためのキットであって、前記キットは、
少なくとも1つのバイオマーカー、ここで、少なくとも1つのバイオマーカーは、配列番号7、配列番号8、配列番号9、その類似体、そのフラグメント、およびその任意の組合せからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するBRAF−ペプチドである;および
バイオマーカーと、生物学的試料中に存在する自己抗体との間に形成されるバイオマーカー−抗体の複合体を検出するための少なくとも1つの試薬、ここで、前記自己抗体は、関節リウマチを示す抗BRAF自己抗体である、
を含む、前記キット。 - バイオマーカーが、50未満のアミノ酸のペプチドである、請求項9〜12のいずれか1項記載のキット。
- 被験体における関節リウマチを診断するためのアレイであって、前記アレイは、その表面に付着した少なくとも2つのバイオマーカーを含み、ここで、少なくとも2つのバイオマーカーは、
配列番号7、配列番号8、配列番号9、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するBRAF−ペプチド、
配列番号2、配列番号3、配列番号4、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するPAD4−ペプチド、
配列番号11、配列番号12、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチド、並びに
その任意の組合せ
からなる群より選択される、前記アレイ。 - CCP陰性被験体の関節リウマチを診断するためのアレイであって、前記アレイは、その表面に付着した少なくとも8つのバイオマーカーを含み、ここで、少なくとも8つのバイオマーカーは、
配列番号7、配列番号8、配列番号9、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するBRAF−ペプチドからなる群より選択される3つのBRAF−ペプチド、
配列番号2、配列番号3、配列番号4、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するPAD4−ペプチドからなる群より選択される3つのPAD4−ペプチド、並びに
配列番号11、配列番号12、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチドからなる群より選択される2つのカルパスタチン−ペプチド
を含む、前記アレイ。 - バイオマーカーが、50未満のアミノ酸のペプチドである、請求項14または請求項15記載のアレイ。
- 表面に付着した、生物学的試料中のRA特異的自己抗体の存在を検出するための少なくとも1つの追加のバイオマーカーをさらに含む、請求項14〜16のいずれか1項記載のアレイ。
- 前記RA特異的自己抗体が抗核抗体および抗CCP抗体である、請求項17記載のアレイ。
- 前記バイオマーカーが、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するPAD4−ペプチドであり、そして前記バイオマーカーが抗PAD4自己抗体によって認識される、関節リウマチのバイオマーカー。
- 前記バイオマーカーが、配列番号7、配列番号8、配列番号9、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するBRAF−ペプチドであり、そして前記バイオマーカーが抗BRAF自己抗体によって認識される、関節リウマチのバイオマーカー。
- 前記バイオマーカーが、配列番号11、配列番号12、その類似体、およびそのフラグメントからなる群より選択される配列を含むまたはからなるアミノ酸配列を有するカルパスタチン−ペプチドであり、そして前記バイオマーカーが抗カルパスタチン自己抗体によって認識される、関節リウマチのバイオマーカー。
- 前記バイオマーカーが、50未満のアミノ酸のペプチドである、請求項19〜21のいずれか1項記載のバイオマーカー。
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