JP2012504414A5

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Publication number: JP2012504414A5
Application number: JP2011530166A
Authority: JP
Filing date: 2009-09-30
Publication date: 2012-11-15
Anticipated expiration: 2029-09-30

Claims

試験サンプル中のヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）１６、１８、３１、３３、３５、３９、４５、５１、５２、５６、５８、５９、６６および６８型を増幅するためのプライマーであって、配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号５、およびそれらの相補体からなる群から選択される配列を有する、プライマー。
試験サンプル中のＨＰＶ１６、１８、３１、３５、３９、４５、５１、５２、５８、５９または６６型を検出するためのプローブであって、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、およびそれらの相補体からなる群から選択される配列を有する、プローブ。
試験サンプル中のヒトベータグロビン配列を増幅するためのプライマーであって、配列番号６、配列番号７、配列番号６の相補体、配列番号７の相補体、またはそれらのいずれかの組合せの配列を有する、プライマー。
試験サンプル中のヒトベータグロビン配列を検出するためのプローブであって、配列番号２２またはその相補体の配列を有する、プローブ。
試験サンプル中のＨＰＶ１６、１８、３１、３３、３５、３９、４５、５１、５２、５６、５８、５９、６６および６８型を増幅するためのプライマーセットであって、
（ａ）配列番号１、配列番号２、配列番号３、それらの相補体、およびそれらのいずれかの組合せからなる群から選択される配列を有する少なくとも１個のフォワードプライマー、および
（ｂ）配列番号５またはその相補体の配列を有する少なくとも１個のリバースプライマー
を含む、プライマーセット。
プライマーセットが、配列番号１、配列番号２および配列番号３またはそれらの相補体の配列を有するフォワードプライマー、および配列番号５またはその相補体の配列を有するリバースプライマーを含む、請求項５に記載のプライマーセット。
試験サンプル中のＨＰＶ１６、１８、３１、３３、３５、３９、４５、５１、５２、５６、５８、５９、６６および６８型を検出するためのプライマーおよびプローブセットであって、
（ａ）配列番号１、配列番号２および配列番号３またはそれらの相補体の配列を有する３個のフォワードプライマー、および配列番号５またはその相補体の配列を有する少なくとも１個のリバースプライマー、および
（ｂ）配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０および配列番号２１、またはそれらの相補体の配列を有する１４個のプローブ
を含む、プライマーおよびプローブセット。
試験サンプル中のヒトベータグロビンを検出するためのプライマーおよびプローブセットであって、
（ａ）配列番号６またはその相補体の配列を有するフォワードプライマー、および配列番号７またはその相補体の配列を有するリバースプライマー、および
（ｂ）配列番号２２またはその相補体の配列を有するプローブ
を含む、プライマーおよびプローブセット。
試験サンプル中のＨＰＶ１６、１８、３１、３３、３５、３９、４５、５１、５２、５６、５８、５９、６６および６８型の１以上を検出するための方法であって、
（ａ）配列番号１、配列番号２および配列番号３またはそれらの相補体の配列を有する３個のフォワードプライマー、および配列番号５またはその相補体の配列を有する少なくとも１個のリバースプライマーと試験サンプルとを、第１標的配列を生成する増幅条件下で接触させる工程、および
（ｂ）第１標的配列と、該試験サンプル中のＨＰＶ１６、１８、３１、３３、３５、３９、４５、５１、５２、５６、５８、５９、６６および６８型の１以上の存在の指標としての少なくとも１個のプローブとの間のハイブリダイゼーションを検出する工程であって、該プローブが、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０および配列番号２１、またはそれらの相補体の配列を有する工程、
を含む、方法。
少なくとも１個のプローブが検出可能標識で標識されている、請求項９に記載の方法。
検出可能標識が、少なくとも１個のプローブの５’末端に結合した蛍光部分を含む、請求項１０に記載の方法。
少なくとも１個のプローブが更に、その３’末端に結合した消光部分を含む、請求項１１に記載の方法。
更に、
（ａ）請求項８に記載のプライマーおよびプローブセットからのプライマーと試験サンプルとを、第２標的配列を生成する増幅条件下で接触させる工程、および
（ｂ）第２標的配列と、該試験サンプル中のヒトベータグロビンの存在の指標としての請求項８に記載のプライマーおよびプローブセットからのプローブとの間のハイブリダイゼーションを検出する工程
を含む、請求項９に記載の方法。
試験サンプル中のＨＰＶ１６、１８、または１６および１８型を検出するための方法であって、
（ａ）配列番号１、配列番号２および配列番号３、またはそれらの相補体の配列を有する３個のフォワードプライマー、および配列番号５またはその相補体の配列を有する少なくとも１個のリバースプライマーと試験サンプルとを、第１標的配列を生成する増幅条件下で接触させる工程、および
（ｂ）第１標的配列と、以下のもの：
（ｉ）ＨＰＶ１６型の存在の指標としての配列番号８またはその相補体の配列を有する第１プローブ（第１プローブは第１検出可能標識で標識されている）、
（ｉｉ）ＨＰＶ１８型の存在の指標としての配列番号９またはその相補体の配列を有する第２プローブ（第２プローブは第２検出可能標識で標識されており、さらに、第２検出可能標識は、第１検出可能標識とは異なる検出可能標識である）、
（ｉｉｉ）ＨＰＶ３１、３３、３５、３９、４５、５１、５２、５６、５８、５９、６６または６８型の存在の指標としての配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０および配列番号２１またはそれらの相補体の配列を有する１以上の追加的プローブ（そのような１以上の追加的プローブのそれぞれは同一の第３検出可能標識で標識されており、さらに、第３検出可能標識は、第１検出可能標識および第２検出可能標識とは異なる検出可能標識である）、
との間のハイブリダイゼーションを検出する工程
を含む、方法。
試験サンプル中のヒトベータグロビンを検出するための方法であって、
（ａ）請求項８に記載のプライマーおよびプローブセットからのプライマーと試験サンプルとを、第１標的配列を生成する増幅条件下で接触させる工程、および
（ｂ）第１標的配列と、該試験サンプル中のヒトベータグロビンの存在の指標としての請求項８に記載のプライマーおよびプローブセットからのプローブとの間のハイブリダイゼーションを検出する工程
を含む、方法。
プローブが検出可能標識で標識されている、請求項１５に記載の方法。
検出可能標識が、該プローブの５’末端に結合した蛍光部分を含む、請求項１６に記載の方法。
プローブが更に、その３’末端に結合した消光部分を含む、請求項１７に記載の方法。
更に、
（ａ）請求項７に記載のプライマーおよびプローブセットからのプライマーと試験サンプルとを、第２標的配列を生成する増幅条件下で接触させる工程、および
（ｂ）第２標的配列と、該試験サンプル中のＨＰＶ１６、１８、３１、３３、３５、３９、４５、５１、５２、５６、５８、５９、６６および６８型の１以上の存在の指標としての請求項７に記載のプライマーおよびプローブセットからの少なくとも１個のプローブとの間のハイブリダイゼーションを検出する工程
を含む、請求項１５に記載の方法。
試験サンプル中のＨＰＶ１６、１８、３１、３３、３５、３９、４５、５１、５２、５６、５８、５９、６６および６８型を検出するためのキットであって、
（ａ）配列番号１、配列番号２、配列番号３、それらの相補体、およびそれらのいずれかの組合せからなる群から選択される配列を有する少なくとも１個のフォワードプライマー、
（ｂ）配列番号５またはその相補体の配列を有する少なくとも１個のリバースプライマー、および
（ｃ）増幅試薬
を含む、キット。
キットが更に少なくとも１個のプローブを含み、ここで、前記プローブが、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、およびそれらの相補体からなる群から選択される、請求項２０に記載のキット。
キットが更に、配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０および配列番号２１、またはそれらの相補体の配列を有するプローブを含む、請求項２０に記載のキット。
試験サンプル中のＨＰＶ１６、１８、３１、３３、３５、３９、４５、５１、５２、５６、５８、５９、６６および６８型を検出するためのプライマーおよびプローブキットであって、
（ａ）配列番号１、配列番号２および配列番号３またはそれらの相補体の配列を有する３個のフォワードプライマー、および配列番号５またはその相補体の配列を有する少なくとも１個のリバースプライマー、
（ｂ）配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０および配列番号２１、またはそれらの相補体の配列を有する１４個のプローブ、および
（ｃ）増幅試薬
を含む、プライマーおよびプローブキット。
キットが更に、試験サンプル中のヒトベータグロビンを検出するための、配列番号６またはその相補体の配列を有するフォワードプライマーおよび配列番号７またはその相補体の配列を有するリバースプライマーと、配列番号２２またはその相補体の配列を有するプローブとを含む、請求項２３に記載のプライマーおよびプローブキット。
試験サンプル中のヒトベータグロビンを検出するためのプライマーおよびプローブキットであって、
（ａ）配列番号６またはその相補体の配列を有するフォワードプライマー、および配列番号７またはその相補体の配列を有するリバースプライマー、
（ｂ）配列番号２２またはその相補体の配列を有するプローブ、および
（ｃ）増幅試薬
を含む、プライマーおよびプローブキット。
キットが更に、
（ｄ）配列番号１、配列番号２および配列番号３またはそれらの相補体の配列を有する３個のフォワードプライマー、および配列番号５またはその相補体の配列を有する少なくとも１個のリバースプライマー、並びに
（ｅ）試験サンプル中のＨＰＶ１６、１８、３１、３３、３５、３９、４５、５１、５２、５６、５８、５９、６６および６８型を検出するための配列番号８、配列番号９、配列番号１０、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０および配列番号２１、またはそれらの相補体の配列を有する１４個のプローブ
を含む、請求項２５に記載のプライマーおよびプローブキット。