JP2009530624A - 前立腺癌を診断するために有用なバイオマーカー及びその方法 - Google Patents
前立腺癌を診断するために有用なバイオマーカー及びその方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2009530624A JP2009530624A JP2009500679A JP2009500679A JP2009530624A JP 2009530624 A JP2009530624 A JP 2009530624A JP 2009500679 A JP2009500679 A JP 2009500679A JP 2009500679 A JP2009500679 A JP 2009500679A JP 2009530624 A JP2009530624 A JP 2009530624A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- metabolite
- prostate cancer
- metabolites
- sample
- patient
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 177
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 title claims abstract description 176
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 163
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 title description 27
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 claims abstract description 283
- 230000036541 health Effects 0.000 claims abstract description 17
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 28
- 238000004252 FT/ICR mass spectrometry Methods 0.000 claims description 20
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 claims description 19
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims description 18
- 238000005040 ion trap Methods 0.000 claims description 16
- 238000002347 injection Methods 0.000 claims description 15
- 239000007924 injection Substances 0.000 claims description 15
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 claims description 15
- RYCNUMLMNKHWPZ-SNVBAGLBSA-N 1-acetyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CC(=O)OC[C@@H](O)COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C RYCNUMLMNKHWPZ-SNVBAGLBSA-N 0.000 claims description 13
- JZNWSCPGTDBMEW-UHFFFAOYSA-N Glycerophosphorylethanolamin Natural products NCCOP(O)(=O)OCC(O)CO JZNWSCPGTDBMEW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 11
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims description 11
- HVAUUPRFYPCOCA-AREMUKBSSA-N 2-O-acetyl-1-O-hexadecyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCOC[C@@H](OC(C)=O)COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C HVAUUPRFYPCOCA-AREMUKBSSA-N 0.000 claims description 10
- 108010003541 Platelet Activating Factor Proteins 0.000 claims description 10
- 238000004811 liquid chromatography Methods 0.000 claims description 10
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 claims description 9
- 238000004885 tandem mass spectrometry Methods 0.000 claims description 9
- 238000002203 pretreatment Methods 0.000 claims description 8
- ZPDQFUYPBVXUKS-YADHBBJMSA-N 1-stearoyl-sn-glycero-3-phosphoserine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](O)COP(O)(=O)OC[C@H](N)C(O)=O ZPDQFUYPBVXUKS-YADHBBJMSA-N 0.000 claims description 6
- CWRILEGKIAOYKP-SSDOTTSWSA-M [(2r)-3-acetyloxy-2-hydroxypropyl] 2-aminoethyl phosphate Chemical compound CC(=O)OC[C@@H](O)COP([O-])(=O)OCCN CWRILEGKIAOYKP-SSDOTTSWSA-M 0.000 claims description 6
- UOXRPRZMAROFPH-IESLQMLBSA-N lysophosphatidylinositol Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](O)COP(O)(=O)OC1[C@H](O)[C@@H](O)C(O)[C@@H](O)[C@H]1O UOXRPRZMAROFPH-IESLQMLBSA-N 0.000 claims description 5
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 abstract description 13
- 239000008280 blood Substances 0.000 abstract description 13
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 86
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 47
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 42
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 40
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 32
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 31
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 30
- 102000007066 Prostate-Specific Antigen Human genes 0.000 description 28
- 108010072866 Prostate-Specific Antigen Proteins 0.000 description 28
- 238000000132 electrospray ionisation Methods 0.000 description 26
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 25
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 25
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 21
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 17
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 17
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 16
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 16
- 238000013537 high throughput screening Methods 0.000 description 16
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 14
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 13
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 12
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N methanoic acid Natural products OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 238000001360 collision-induced dissociation Methods 0.000 description 11
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 11
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 11
- 239000013074 reference sample Substances 0.000 description 11
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 10
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 10
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 10
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 10
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 10
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 10
- 238000000065 atmospheric pressure chemical ionisation Methods 0.000 description 9
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 9
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 9
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 9
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 8
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 8
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 8
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 8
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 8
- 238000002552 multiple reaction monitoring Methods 0.000 description 8
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 8
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 7
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 7
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 7
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 7
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 7
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 7
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 7
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 7
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 7
- OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 4-(3-methoxyphenyl)aniline Chemical compound COC1=CC=CC(C=2C=CC(N)=CC=2)=C1 OSWFIVFLDKOXQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 6
- 125000005313 fatty acid group Chemical group 0.000 description 6
- 235000019253 formic acid Nutrition 0.000 description 6
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 6
- 238000002705 metabolomic analysis Methods 0.000 description 6
- 230000001431 metabolomic effect Effects 0.000 description 6
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 5
- 238000011161 development Methods 0.000 description 5
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 5
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 5
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 5
- WTJKGGKOPKCXLL-RRHRGVEJSA-N phosphatidylcholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCCCCCCC=CCCCCCCCC WTJKGGKOPKCXLL-RRHRGVEJSA-N 0.000 description 5
- 238000000513 principal component analysis Methods 0.000 description 5
- 241000894007 species Species 0.000 description 5
- OEYIOHPDSNJKLS-UHFFFAOYSA-N choline Chemical compound C[N+](C)(C)CCO OEYIOHPDSNJKLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000002591 computed tomography Methods 0.000 description 4
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 4
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 4
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 4
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 4
- 150000008104 phosphatidylethanolamines Chemical class 0.000 description 4
- 238000000899 pressurised-fluid extraction Methods 0.000 description 4
- DNXIKVLOVZVMQF-UHFFFAOYSA-N (3beta,16beta,17alpha,18beta,20alpha)-17-hydroxy-11-methoxy-18-[(3,4,5-trimethoxybenzoyl)oxy]-yohimban-16-carboxylic acid, methyl ester Natural products C1C2CN3CCC(C4=CC=C(OC)C=C4N4)=C4C3CC2C(C(=O)OC)C(O)C1OC(=O)C1=CC(OC)=C(OC)C(OC)=C1 DNXIKVLOVZVMQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LCQMZZCPPSWADO-UHFFFAOYSA-N Reserpilin Natural products COC(=O)C1COCC2CN3CCc4c([nH]c5cc(OC)c(OC)cc45)C3CC12 LCQMZZCPPSWADO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QEVHRUUCFGRFIF-SFWBKIHZSA-N Reserpine Natural products O=C(OC)[C@@H]1[C@H](OC)[C@H](OC(=O)c2cc(OC)c(OC)c(OC)c2)C[C@H]2[C@@H]1C[C@H]1N(C2)CCc2c3c([nH]c12)cc(OC)cc3 QEVHRUUCFGRFIF-SFWBKIHZSA-N 0.000 description 3
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 3
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 150000001793 charged compounds Chemical class 0.000 description 3
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 3
- 229960001231 choline Drugs 0.000 description 3
- 238000013375 chromatographic separation Methods 0.000 description 3
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 3
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 3
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 3
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 3
- 230000003862 health status Effects 0.000 description 3
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000013610 patient sample Substances 0.000 description 3
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 3
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 3
- 201000001514 prostate carcinoma Diseases 0.000 description 3
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 3
- BJOIZNZVOZKDIG-MDEJGZGSSA-N reserpine Chemical compound O([C@H]1[C@@H]([C@H]([C@H]2C[C@@H]3C4=C([C]5C=CC(OC)=CC5=N4)CCN3C[C@H]2C1)C(=O)OC)OC)C(=O)C1=CC(OC)=C(OC)C(OC)=C1 BJOIZNZVOZKDIG-MDEJGZGSSA-N 0.000 description 3
- 229960003147 reserpine Drugs 0.000 description 3
- MDMGHDFNKNZPAU-UHFFFAOYSA-N roserpine Natural products C1C2CN3CCC(C4=CC=C(OC)C=C4N4)=C4C3CC2C(OC(C)=O)C(OC)C1OC(=O)C1=CC(OC)=C(OC)C(OC)=C1 MDMGHDFNKNZPAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 3
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- NLHHRLWOUZZQLW-UHFFFAOYSA-N Acrylonitrile Chemical compound C=CC#N NLHHRLWOUZZQLW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 description 2
- 241000219195 Arabidopsis thaliana Species 0.000 description 2
- 206010004446 Benign prostatic hyperplasia Diseases 0.000 description 2
- 102000012406 Carcinoembryonic Antigen Human genes 0.000 description 2
- 108010022366 Carcinoembryonic Antigen Proteins 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UEEJHVSXFDXPFK-UHFFFAOYSA-N N-dimethylaminoethanol Chemical compound CN(C)CCO UEEJHVSXFDXPFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000004403 Prostatic Hyperplasia Diseases 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YJTHZOLZJDBORU-HSZRJFAPSA-N [(2R)-3-hexadecanoyloxy-2-hydroperoxypropyl] 2-(trimethylazaniumyl)ethyl phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@@H](OO)COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C YJTHZOLZJDBORU-HSZRJFAPSA-N 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 description 2
- 239000006286 aqueous extract Substances 0.000 description 2
- 239000012223 aqueous fraction Substances 0.000 description 2
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 2
- 238000011953 bioanalysis Methods 0.000 description 2
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 239000012470 diluted sample Substances 0.000 description 2
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 2
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 2
- 238000004817 gas chromatography Methods 0.000 description 2
- IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N hexadecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O IPCSVZSSVZVIGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 2
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 2
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 2
- 238000010801 machine learning Methods 0.000 description 2
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 2
- 238000002595 magnetic resonance imaging Methods 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 238000000816 matrix-assisted laser desorption--ionisation Methods 0.000 description 2
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 2
- 238000000874 microwave-assisted extraction Methods 0.000 description 2
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 2
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 239000006199 nebulizer Substances 0.000 description 2
- 238000000655 nuclear magnetic resonance spectrum Methods 0.000 description 2
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 2
- 125000001117 oleyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])/C([H])=C([H])\C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 2
- 238000002600 positron emission tomography Methods 0.000 description 2
- 238000003672 processing method Methods 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 239000011877 solvent mixture Substances 0.000 description 2
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 2
- 125000004079 stearyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 238000012353 t test Methods 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 239000000107 tumor biomarker Substances 0.000 description 2
- ZHRZLXZJVUFLNY-XAMCCFCMSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-aminopropanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoyl]amino]propanoic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZHRZLXZJVUFLNY-XAMCCFCMSA-N 0.000 description 1
- SNBUPCHXOGXJFR-HSZRJFAPSA-N 2-aminoethyl [(2r)-2-hydroperoxy-3-octadecoxypropyl] hydrogen phosphate Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCCCCOC[C@@H](OO)COP(O)(=O)OCCN SNBUPCHXOGXJFR-HSZRJFAPSA-N 0.000 description 1
- 235000009027 Amelanchier alnifolia Nutrition 0.000 description 1
- 244000068687 Amelanchier alnifolia Species 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 201000001320 Atherosclerosis Diseases 0.000 description 1
- YDNKGFDKKRUKPY-JHOUSYSJSA-N C16 ceramide Chemical group CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO)[C@H](O)C=CCCCCCCCCCCCCC YDNKGFDKKRUKPY-JHOUSYSJSA-N 0.000 description 1
- 206010061819 Disease recurrence Diseases 0.000 description 1
- SQUHHTBVTRBESD-UHFFFAOYSA-N Hexa-Ac-myo-Inositol Natural products CC(=O)OC1C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C(OC(C)=O)C1OC(C)=O SQUHHTBVTRBESD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- OYHQOLUKZRVURQ-HZJYTTRNSA-N Linoleic acid Chemical compound CCCCC\C=C/C\C=C/CCCCCCCC(O)=O OYHQOLUKZRVURQ-HZJYTTRNSA-N 0.000 description 1
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 1
- CRJGESKKUOMBCT-VQTJNVASSA-N N-acetylsphinganine Chemical group CCCCCCCCCCCCCCC[C@@H](O)[C@H](CO)NC(C)=O CRJGESKKUOMBCT-VQTJNVASSA-N 0.000 description 1
- SUHOOTKUPISOBE-UHFFFAOYSA-N O-phosphoethanolamine Chemical compound NCCOP(O)(O)=O SUHOOTKUPISOBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000021314 Palmitic acid Nutrition 0.000 description 1
- 102000015439 Phospholipases Human genes 0.000 description 1
- 108010064785 Phospholipases Proteins 0.000 description 1
- 238000000944 Soxhlet extraction Methods 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 210000000577 adipose tissue Anatomy 0.000 description 1
- JAZBEHYOTPTENJ-JLNKQSITSA-N all-cis-5,8,11,14,17-icosapentaenoic acid Chemical group CC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCC(O)=O JAZBEHYOTPTENJ-JLNKQSITSA-N 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical group 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000908 ammonium hydroxide Substances 0.000 description 1
- 230000002280 anti-androgenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000051 antiandrogen Substances 0.000 description 1
- 229940030495 antiandrogen sex hormone and modulator of the genital system Drugs 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 239000003125 aqueous solvent Substances 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 239000003150 biochemical marker Substances 0.000 description 1
- 230000008236 biological pathway Effects 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 230000028956 calcium-mediated signaling Effects 0.000 description 1
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 1
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 1
- 229940106189 ceramide Drugs 0.000 description 1
- ZVEQCJWYRWKARO-UHFFFAOYSA-N ceramide Chemical group CCCCCCCCCCCCCCC(O)C(=O)NC(CO)C(O)C=CCCC=C(C)CCCCCCCCC ZVEQCJWYRWKARO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 1
- 150000005829 chemical entities Chemical class 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 1
- 238000004737 colorimetric analysis Methods 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 1
- IDLFZVILOHSSID-OVLDLUHVSA-N corticotropin Chemical group C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO)C1=CC=C(O)C=C1 IDLFZVILOHSSID-OVLDLUHVSA-N 0.000 description 1
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 1
- 229960002887 deanol Drugs 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 230000005595 deprotonation Effects 0.000 description 1
- 238000010537 deprotonation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000001212 derivatisation Methods 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 1
- 239000012972 dimethylethanolamine Substances 0.000 description 1
- 229910001873 dinitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 229940031098 ethanolamine Drugs 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 1
- DBEPLOCGEIEOCV-WSBQPABSSA-N finasteride Chemical compound N([C@@H]1CC2)C(=O)C=C[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H](C(=O)NC(C)(C)C)[C@@]2(C)CC1 DBEPLOCGEIEOCV-WSBQPABSSA-N 0.000 description 1
- 229960004039 finasteride Drugs 0.000 description 1
- 238000004401 flow injection analysis Methods 0.000 description 1
- 235000021588 free fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 238000002546 full scan Methods 0.000 description 1
- 238000002290 gas chromatography-mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000000762 glandular Effects 0.000 description 1
- 229960005150 glycerol Drugs 0.000 description 1
- 210000004209 hair Anatomy 0.000 description 1
- 238000001794 hormone therapy Methods 0.000 description 1
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 1
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- CDAISMWEOUEBRE-GPIVLXJGSA-N inositol Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O CDAISMWEOUEBRE-GPIVLXJGSA-N 0.000 description 1
- 229960000367 inositol Drugs 0.000 description 1
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 238000009533 lab test Methods 0.000 description 1
- 238000001698 laser desorption ionisation Methods 0.000 description 1
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 1
- 235000020778 linoleic acid Nutrition 0.000 description 1
- OYHQOLUKZRVURQ-IXWMQOLASA-N linoleic acid Natural products CCCCC\C=C/C\C=C\CCCCCCCC(O)=O OYHQOLUKZRVURQ-IXWMQOLASA-N 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 238000007884 metabolite profiling Methods 0.000 description 1
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N n-Pentadecanoic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCCC(O)=O WQEPLUUGTLDZJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VVGIYYKRAMHVLU-UHFFFAOYSA-N newbouldiamide Chemical group CCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)C(O)C(O)C(CO)NC(=O)CCCCCCCCCCCCCCCCC VVGIYYKRAMHVLU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010606 normalization Methods 0.000 description 1
- QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N octadecanoic acid Chemical group CCCCCCCCCCCCCCCCCC(O)=O QIQXTHQIDYTFRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N oleic acid group Chemical group C(CCCCCCC\C=C/CCCCCCCC)(=O)O ZQPPMHVWECSIRJ-KTKRTIGZSA-N 0.000 description 1
- -1 or others in 22: 6 Substances 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 125000000913 palmityl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 229940085991 phosphate ion Drugs 0.000 description 1
- YHHSONZFOIEMCP-UHFFFAOYSA-O phosphocholine Chemical compound C[N+](C)(C)CCOP(O)(O)=O YHHSONZFOIEMCP-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 125000002525 phosphocholine group Chemical group OP(=O)(OCC[N+](C)(C)C)O* 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 230000005588 protonation Effects 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 238000010833 quantitative mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 125000001453 quaternary ammonium group Chemical group 0.000 description 1
- 238000011472 radical prostatectomy Methods 0.000 description 1
- 238000002271 resection Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 1
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 1
- 238000007423 screening assay Methods 0.000 description 1
- CDAISMWEOUEBRE-UHFFFAOYSA-N scyllo-inosotol Natural products OC1C(O)C(O)C(O)C(O)C1O CDAISMWEOUEBRE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001153 serine Drugs 0.000 description 1
- 210000002027 skeletal muscle Anatomy 0.000 description 1
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 239000007921 spray Substances 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 1
- 238000000194 supercritical-fluid extraction Methods 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000439 tumor marker Substances 0.000 description 1
- 238000000825 ultraviolet detection Methods 0.000 description 1
- 238000007473 univariate analysis Methods 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 1
- 229960000834 vinyl ether Drugs 0.000 description 1
- 238000003809 water extraction Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/06—Phosphorus compounds without P—C bonds
- C07F9/08—Esters of oxyacids of phosphorus
- C07F9/09—Esters of phosphoric acids
- C07F9/10—Phosphatides, e.g. lecithin
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07F—ACYCLIC, CARBOCYCLIC OR HETEROCYCLIC COMPOUNDS CONTAINING ELEMENTS OTHER THAN CARBON, HYDROGEN, HALOGEN, OXYGEN, NITROGEN, SULFUR, SELENIUM OR TELLURIUM
- C07F9/00—Compounds containing elements of Groups 5 or 15 of the Periodic Table
- C07F9/02—Phosphorus compounds
- C07F9/06—Phosphorus compounds without P—C bonds
- C07F9/08—Esters of oxyacids of phosphorus
- C07F9/09—Esters of phosphoric acids
- C07F9/091—Esters of phosphoric acids with hydroxyalkyl compounds with further substituents on alkyl
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/483—Physical analysis of biological material
- G01N33/487—Physical analysis of biological material of liquid biological material
- G01N33/49—Blood
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N27/00—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/483—Physical analysis of biological material
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
- G01N33/57434—Specifically defined cancers of prostate
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
- G01N33/6848—Methods of protein analysis involving mass spectrometry
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/745—Assays involving non-enzymic blood coagulation factors
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2405/00—Assays, e.g. immunoassays or enzyme assays, involving lipids
- G01N2405/04—Phospholipids, i.e. phosphoglycerides
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N30/00—Investigating or analysing materials by separation into components using adsorption, absorption or similar phenomena or using ion-exchange, e.g. chromatography or field flow fractionation
- G01N30/02—Column chromatography
- G01N30/62—Detectors specially adapted therefor
- G01N30/72—Mass spectrometers
- G01N30/7233—Mass spectrometers interfaced to liquid or supercritical fluid chromatograph
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Hematology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Ecology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Electrochemistry (AREA)
- Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
Description
Troyer DA, MubiruJ, Leach RJ, Naylor SL.Promise and challenge: Markers of prostate cancer detection, diagnosis and prognosis. DisMarkers 2004;20(2):117-28 Mettlin CJ, Murphy GP, Rosenthal DS, Menck HR. The National Cancer Data Base report on prostate carcinoma after the peak in incidence rates in the U.S.The American College of Surgeons Commission on Cancer and the American Cancer Society. Cancer 1998;83(8):1679-84 Thompson IM, Goodman PJ, Tangen CM, et al. The influence of finasterideon the development of prostate cancer. N Engl J Med 2003;349(3):215-24 Gann PH, HennekensCH, Stampfer MJ. A prospective evaluation of plasma prostate-specific antigen for detection of prostaticcancer. Jama 1995;273(4):289-94 Schroder FH, van der Cruijsen-KoeterI, de Koning HJ, Vis AN, Hoedemaeker RF, Kranse R. Prostate cancer detection at low prostate specific antigen. The Journal of urology 2000;163(3):806-12
1.代謝産物の保持時間を分離及び同定する;
2.それぞれの代謝産物に特異的な記述的MS/MS断片化パターンを生成する;
3.分子構造の特徴付けをする;及び
4.ハイスループット定量又は半定量MS/MS系診断アッセイを開発する
目的のために、正常生物学的試料と前立腺癌陽性生物学的試料との間で異なる全て統計的に有意な代謝産物特徴を同定するために非標的FTMS技術を用いる前立腺癌特異的生物学的試料及び正常生物学的試料の分析、その後に分子の統計及び化学的特性を用いる最適特徴サブセットの選択、並びに、限定されないが、クロマトグラフ分離、質量分析法(MS/MS)、及び核磁気共鳴(NMR)を含む方法を用いる特徴セットの特徴付けを包含する。
a)1人又は複数の前立腺癌患者からの1種又は複数の試料を高分解能質量分析計に導入するステップであって、前記試料が複数の代謝産物を含むステップと;
b)代謝産物についての定量データを得るステップと;
c)前記定量データのデータベースを作成するステップと;
d)前記試料からの同定及び定量データを1種又は複数の基準試料由来の試料からの対応データと比較するステップと;
e)前記試料と前記1種又は複数の基準試料とで異なる1種又は複数の代謝産物マーカーを同定するステップと
を含む、方法を提供する。
a)前記患者から試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)前記1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを1種又は複数の基準試料から得られる対応データと比較するステップと;
d)前記比較を用いて、前立腺癌又は前立腺癌のリスクを示差的に診断するステップとを含む、方法も提供する。
a)前記患者から試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)前記1種又は複数の代謝産物マーカー対内部対照代謝産物のそれぞれについての比を得るステップと;
d)前記1種又は複数の代謝産物マーカー対内部対照代謝産物のそれぞれについての比を、1種又は複数の基準試料から得られた対応データと比較するステップと;
e)前記比較を用いて、前立腺癌又は前立腺癌のリスクを診断するステップと
を含む方法が、提供される。
a)前記患者から試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)前記定量データを1種又は複数の基準試料から得られた対応データと比較するステップと;
d)前記比較を用いて、前記治療法が患者の健康状態を改善しているかどうかを判定するステップと
を含む方法を、さらに提供する。
a)前記患者から試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)1種又は複数の代謝産物マーカー対内部対照代謝産物のそれぞれについての比を得るステップと;
d)前記1種又は複数の代謝産物マーカー対内部対照代謝産物のそれぞれについての比を1種又は複数の基準試料から得られた対応データと比較するステップと;
e)前記比較を用いて、前記治療法が患者の健康状態を改善しているかどうかを判定するステップと
を含む方法が提供される。
b)
c)
d)
e)
f)
g)
h)
j)
k)
l)
m)
n)
a)図15に示される通り、及び/又は表13に記載される通り;
b)図16に示される通り、及び/又は表14に記載される通り;
c)図17に示される通り、及び/又は表15に記載される通り;
d)図18に示される通り、及び/又は表16に記載される通り;
e)図19に示される通り、及び/又は表17に記載される通り;並びに
f)図20に示される通り、及び/又は表18に記載される通り
のMS/MSスペクトルをさらに特徴としうる。
c)
d)
e)
f)
a)前記患者から試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)前記1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを、1種又は複数の基準試料から得られた対応データと比較するステップと;
d)前記比較を用いて、前立腺癌又は前立腺癌を発症するリスクを診断するステップと
を含む方法を提供する。
a)前記患者から試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)前記1種又は複数の代謝産物マーカー対内部対照代謝産物のそれぞれについての比を得るステップと;
d)前記1種又は複数の代謝産物マーカー対内部対照代謝産物のそれぞれについての比を1種又は複数の基準試料から得られた対応データと比較するステップと;
e)前記比較を用いて、前立腺癌又は前立腺癌のリスクを診断するステップと
を含む。
a)前記患者から試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)前記定量データを1種又は複数の基準試料から得られた対応データと比較するステップと;
d)前記比較を用いて、前記治療法が患者の健康状態を改善しているかどうかを判定するステップと
を含む方法が提供される。
示差的に発現された代謝産物は、前立腺癌陽性臨床的に診断された患者及び正常患者において同定される。
記載される前立腺癌スクリーニングアッセイのために、血清試料を、健常な前立腺癌を有しない個体及び前立腺癌陽性と専門的に診断された患者の代表集団から得た(SeraCareLifeScience社)。下記された前立腺癌の生化学的マーカーは、前立腺癌陽性患者からの24個の血清試料及び健常対照からの25個の血清試料の分析から導いた。両群における試料は、年齢、民族性、体重、職業にわたり、様々な非前立腺癌関連健康状態を示す個体の多様な集団からであった。全ての試料は、単一の時点で収集したものであり、前立腺癌試料は、腫瘍の外科的切除の直前又は直後のいずれかで採取した。全ての試料は、化学療法又は放射線療法前に採取した。
水性抽出物
1.陽性ESI(分析モード1101)
2.陰性ESI(分析モード1102)
有機抽出物
3.陽性ESI(分析モード1201)
4.陰性ESI(分析モード1202)
5.陽性APCI(分析モード1203)
6.陰性APCI(分析モード1204)
線形最小二乗回帰線を用いて、それぞれの内部標準質量ピークがその理論質量と比較して<1p.p.m.の質量誤差を有するように質量軸値を較正した。Bruker Daltonics社製XMASSソフトウェアを用いて、1メガワードのデータファイルサイズを得て、2メガワードにゼロ詰めした。sinmデータ変換をフーリエ変換及び大きさ(magnitude)の計算前に行った。それぞれの分析からの質量スペクトルを積分し、それぞれのピークの正確な質量及び絶対強度を含んだピークリストを作成した。100〜2000m/zの範囲の化合物を分析した。異なるイオン化モード及び極性にわたるデータを比較して、まとめるために、全ての検出質量ピークを水素付加体形成を想定するそれらの対応する中性質量に変換した。次いで、DISCOV Ametrics(商標)ソフトウェア(Phenomenome Discoveris社、Saskatoon、SK、Canada)を用いて自然発生二次元(質量対試料強度)配列を作成した。多重ファイルからのデータを積分し、次いで、この結合ファイルを処理して全ての唯一の質量を決定した。それぞれの唯一の質量の平均を決定し、y軸を表した。この値は、等しいと統計的に判定された全ての検出された正確な質量の平均を表す。較正標準に対するこの機器の質量精度が約1ppmであることを考慮すると、これらの平均質量には、この平均質量の±2ppm以内、又はこの平均質量のさらに±5ppm以内に入る全ての質量が含まれることは当業者に明らかであろう。分析されるべく最初に選択されたそれぞれのファイルについて列を作成し、x軸を表した。次いで、選択されたそれぞれのファイルに見出だされるそれぞれの質量の強度をその代表x、y座標中に記入した。強度値を有しなかった座標はブランクのままとした。一旦配列後、データをさらに処理、視覚化及び解釈して、推定化学的同一性を割り当てた。次いで、それぞれのスペクトルをピーク取得し、検出された全ての代謝産物の質量及び強度を得た。次いで、全てのモードからのこれらのデータを合体して1試料当たり1個のデータファイルを作成した。次いで、90個の試料全てからのデータを合体及び調整し、それぞれの試料が列を表し、それぞれの唯一の代謝産物が単一の行を表す二次元の代謝産物配列を作成した。所与の代謝産物試料の組合せに対応するセルにおいて、その試料中の代謝産物の強度を表示した。データをこのフォーマットで表した場合に、試料の群(即ち、正常及び癌)間の差を示す代謝産物を決定した。
スチューデントt検定を用いて、正常試料と前立腺癌陽性試料との間で異なる代謝産物について選択した(p<0.05)。492個の代謝産物はこの基準を満たした(表1に記載される通り)。それぞれのこれらの特徴は、2つの集団間で統計的に相違し、したがって、それぞれは、診断利用性の可能性を有する。特徴をそれらの正確な質量及び分析モードで記述し、これは共に、それぞれの代謝産物の推定分子式及び化学的特性(例えば、極性及び推定官能基)を与えるのに十分である。対照血清及び前立腺癌血清間で区別するべく492個の代謝産物の能力は、図2におけるPCAプロットによって示される。対照(灰色)と前立腺癌(黒色)との間の比較的に明らかな区別(点線で示されるような)を引くことができ、これは、492個の代謝産物が共に、対照血清に対して前立腺癌陽性血清試料を診断することができることを示す。
代謝産物及び実施例1に記載された臨床的変数とのそれらの関連を、独立した質量分析システムを用いてさらに確認した。それぞれの変数群(10個の対照及び9個の前立腺癌)からの代表的水性試料抽出物を研究中の臨床的変数間の強度が異なる代謝産物を同定する目的で質量及び強度情報を得るためにHP 1050高性能液体クロマトグラフィーを用いるLC−MS、又はABI Q-Starにインターフェースで接続された同等のもの、若しくは同等の質量分析計によって再分析した。陽性及び陰性の両方のESIモードにおいてフル−スキャン検出を用いてデータを得、得られたスペクトルデータをPhenomenoneProfilerソフトウェアを用いて較正及び調整した。特定のクロマトグラフィー条件下で約28〜34分の保持時間帯(分子種がHPLCカラムから流出する時間)を同定した。図5は、対照(A)、前立腺癌(B)、及び対照と前立腺癌との間の正味差(C)についてこの保持時間範囲内に抽出された質量スペクトルを示す。ボックス化領域は、前に記載された14個の質量のサブセットが再検出された質量範囲を示す。前に観察されたように、これらの分子は、対照に比べて前立腺癌血清の強度が有意に低下していた。HPLC連結TOF−MSを用いて検出されたそれぞれ14個の代謝産物についての平均生強度(0と1の間に縮尺)の棒グラフを図6に示す。
正確な質量及び分子式の決定、極性、酸/塩基特性、NMRスペクトル、並びにMS/MS又はMSnスペクトルを含む様々な特性を代謝産物の構造解明のために用いることができる。これらのデータは、特定の代謝産物の指紋として用いることができ、完全な構造が決定されたかどうかに拘わらず特定の代謝産物の固有の識別子である。これらのデータには、以下が含まれる:
ハイスループットスクリーニング(HTS)法を前立腺癌を診断するために開発した。下記方法は、世界的に多くの実験室に配置されている現在の実験室機器及びトリプル四重極質量分析計に適合している(Hopfgartner G, Varesio E, Tschappat V, Grivet C, Bourgogne E, Leuthold LA. Triple quadrupolelinear ion trap mass spectrometer for the analysis of small molecules and macromolecules. J Mass Spectrom 2004;39(8):845-55、Xia YQ, Miller JD, Bakhtiar R, Franklin RB, Liu DQ. Use of a quadrupole linear ion trap mass spectrometer in metabolite identification and bioanalysis. Rapid Commun Mass Spectrom2003;17(11):1137-45)。
1. Troyer DA, MubiruJ, Leach RJ, Naylor SL. Promise and challenge: Markers of prostate cancer detection, diagnosis and prognosis. Dis Markers 2004;20(2):117-28.
2. MettlinCJ, Murphy GP, Rosenthal DS, Menck HR. The National Cancer Data Base report on prostate carcinoma after the peak in incidence rates in the U.S.The American College of Surgeons Commission on Cancer and the American Cancer Society. Cancer 1998;83(8):1679-84.
3. Thompson IM, Goodman PJ, Tangen CM, et al. The influence of finasterideon the development of prostate cancer. N Engl J Med 2003;349(3):215-24.
4. Gann PH, HennekensCH, Stampfer MJ. A prospective evaluation of plasma prostate-specific antigen for detection of prostaticcancer. Jama 1995;273(4):289-94.
5. SchroderFH, van der Cruijsen-KoeterI, de Koning HJ, Vis AN, HoedemaekerRF, Kranse R. Prostate cancer detection at low prostate specific antigen. The Journal of urology 2000;163(3):806-12.
6. Reo NV. NMR-based metabolomics. Drug Chem Toxicol 2002;25(4):375-82.
7. Taylor J, King RD, Altmann T, Fiehn O. Application of metabolomics to plant genotype discrimination using statistics and machine learning. Bioinformatics 2002;18 Suppl 2:S241-8.
8. KatajamaaM, Oresic M. Processing methods for differential analysis of LC/MS profile data. BMC Bioinformatics 2005;6:179.
9. AharoniA, Ric de Vos CH, Verhoeven HA, et al. Nontargeted metabolome analysis by use of Fourier Transform Ion Cyclotron Mass Spectrometry. Omics 2002;6(3):217-34.
10. Hirai MY, Klein M, Fujikawa Y, et al. Elucidation of gene-to-gene and metabolite-to-gene networks in arabidopsis by integration of metabolomics and transcriptomics. The Journal of biological chemistry 2005;280(27):25590-5.
11. Hirai MY, Yano M, Goodenowe DB, et al. Integration of transcriptomicsand metabolomics for understanding of global responses to nutritional stresses in Arabidopsis thaliana. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2004;101(27):10205-10.
12. OkajimaF, Sato K, Tomura H, et al. Stimulatory and inhibitory actions of lysophosphatidylcholine, depending on its fatty acid residue, on the phospholipaseC/Ca2+ system in HL-60 leukaemia cells. The Biochemical journal 1998;336 ( Pt 2):491-500.
13. HopfgartnerG, Varesio E, Tschappat V, Grivet C, Bourgogne E, Leuthold LA. Triple quadrupole linear ion trap mass spectrometer for the analysis of small molecules and macromolecules. J Mass Spectrom2004;39(8):845-55.
14. Xia YQ, Miller JD, Bakhtiar R, Franklin RB, Liu DQ. Use of a quadrupole linear ion trap mass spectrometer in metabolite identification and bioanalysis. Rapid Commun Mass Spectrom2003;17(11):1137-45.
Claims (45)
- 前立腺癌を診断するための1種又は複数の代謝産物マーカーを同定する方法であって、
a)1人又は複数の前立腺癌患者からの1種又は複数の試料を高分解能質量分析計に導入するステップであって、前記試料が複数の代謝産物を含むステップと;
b)代謝産物についての定量データを得るステップと;
c)前記定量データのデータベースを作成するステップと;
d)前記試料からの定量データを1種又は複数の基準試料由来の試料からの対応データと比較するステップと;
e)前記試料と前記1種又は複数の基準試料とで異なる1種又は複数の代謝産物マーカーを同定するステップと
を含み、
前記1種又は複数の代謝産物マーカーが、表1に記載される代謝産物又はその任意の組合せから選択される、方法。 - 最適診断のために必要とされる最小数の代謝産物マーカーを選択するステップをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 高分解能質量分析計が、フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴質量分析計(FTMS)である、請求項1に記載の方法。
- 患者における前立腺癌又は前立腺癌のリスクを診断する方法であって、
a)前記患者から試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)前記1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを1種又は複数の基準試料から得られた対応データと比較するステップと;
d)前記比較を用いて、前立腺癌又は前立腺癌のリスクを診断するステップと
を含み、
前記1種又は複数の代謝産物マーカーが、表1に記載される代謝産物又はその任意の組合せから選択される、方法。 - ステップb)が、液体クロマトグラフィー質量分析法(LC−MS)によって試料を分析することを含む、請求項4に記載の方法。
- ハイスループット法であり、ステップb)が、直接注入又は液体クロマトグラフィー、及び線形イオントラップタンデム質量分析法によって試料を分析することを含む、請求項4に記載の方法。
- 1種又は複数の基準試料が、対照個体から得られた複数の試料;以前に患者から得られた1種又は複数の基線試料:又はその組合せである、請求項4〜6のいずれかに記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物マーカーが、リゾホスファチジルコリン、リゾホスファチジルエタノールアミン、リゾホスファチジルジメチルエタノールアミン、リゾホスファチジルセリン、リゾスフィンゴシルホスホリルコリン、リゾホスファチジルグリセロール、リゾホスファチジルイノシトール、血小板活性化因子(PAF)、及びその組合せを含むリゾリン脂質からなる群から選択される、請求項4に記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物マーカーが、ドルトンで測定して、a)495.3328、b)517.3148、c)519.3328、d)521.3480、e)523.3640、f)541.3148、g)545.3460、h)481.3171、i)531.3123、j)541.3422、k)555.3101、l)565.3394、m)567.3546、及びn)569.3687という正確な質量、又はそれに実質的に等しい質量を有する代謝産物を含み;前記代謝産物が、前立腺癌患者で低下している、請求項4に記載の方法。
- 代謝産物a)〜g)がリゾホスファチジルコリン関連化合物であり、代謝産物h)〜n)がN,N−ジメチル−リゾホスホエタノールアミン関連化合物である、請求項9に記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ
a)図7に示される通り、及び/又は表3に記載される通り;
b)図8に示される通り、及び/又は表4に記載される通り;
c)図9に示される通り、及び/又は表5に記載される通り;
d)図10に示される通り、及び/又は表6に記載される通り;
e)図11に示される通り、及び/又は表7に記載される通り;
f)図12に示される通り、及び/又は表8に記載される通り;
g)図13に示される通り、及び/又は表9に記載される通り;
h)図14に示される通り、及び/又は表12に記載される通り;
i)図15に示される通り、及び/又は表13に記載される通り;
j)図16に示される通り、及び/又は表14に記載される通り;
k)図17に示される通り、及び/又は表15に記載される通り;
l)図18に示される通り、及び/又は表16に記載される通り;
m)図19に示される通り、及び/又は表17に記載される通り;並びに
n)図20に示される通り、及び/又は表18に記載される通り
のMS/MSスペクトルをさらに特徴とする、請求項9に記載の方法。 - 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ分子式a)C24H50NO7P、b)C26H48NO7P、c)C26H50NO7P、d)C26H52NO7P、e)C26H54NO7P、f)C28H48NO7P、g)C28H52NO7P、h)C23H48NO7P、i)C30H46NO5P、j)C25H52NO9P、k)C25H50NO10P、l)C27H52NO9P、m)C27H54NO9P、及びn)C27H56NO9Pをさらに特徴とする、請求項11に記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ構造
a)
m)
n)
をさらに特徴とする、請求項12に記載の方法。 - 患者における前立腺癌又は前立腺癌のリスクを診断する方法であって、
a)前記患者から試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)前記1種又は複数の代謝産物マーカー対内部対照代謝産物のそれぞれについての比を得るステップと;
d)前記1種又は複数の代謝産物マーカー対内部対照代謝産物のそれぞれについての比を、1種又は複数の基準試料から得られた対応データと比較するステップと;
e)前記比較を用いて、前立腺癌又は前立腺癌のリスクを診断するステップと
を含み、
前記1種又は複数の代謝産物マーカーが、表1に記載される代謝産物又はその任意の組合せから選択される、方法。 - ステップb)が、液体クロマトグラフィー質量分析法(LC−MS)によって試料を分析することを含む、請求項14に記載の方法。
- ハイスループット法であり、ステップb)が、直接注入又は液体クロマトグラフィー、及び線形イオントラップタンデム質量分析法によって試料を分析することを含む、請求項14に記載の方法。
- 1種又は複数の基準試料が、対照個体から得られた複数の試料;以前に患者から得られた1種又は複数の基線試料;又はその組合せである、請求項14〜16のいずれかに記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物マーカーが、リゾホスファチジルコリン、リゾホスファチジルエタノールアミン、リゾホスファチジルジメチルエタノールアミン、リゾホスファチジルセリン、リゾスフィンゴシルホスホリルコリン、リゾホスファチジルグリセロール、リゾホスファチジルイノシトール、血小板活性化因子(PAF)、及びその組合せを含むリゾリン脂質からなる群から選択される、請求項14に記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物マーカーが、ドルトンで測定して、a)495.3328、b)517.3148、c)519.3328、d)521.3480、e)523.3640、f)541.3148、g)545.3460、h)481.3171、i)531.3123、j)541.3422、k)555.3101、l)565.3394、m)567.3546、及びn)569.3687という正確な質量、又はそれに実質的に等しい質量を有する代謝産物を含み;前記代謝産物対内部対照代謝産物の比が、前立腺癌患者で低下している、請求項14に記載の方法。
- 代謝産物a)〜g)がリゾホスファチジルコリン関連化合物であり、代謝産物h)〜n)がN,N−ジメチル−リゾホスホエタノールアミン関連化合物である、請求項19に記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ
a)図7に示される通り、及び/又は表3に記載される通り;
b)図8に示される通り、及び/又は表4に記載される通り;
c)図9に示される通り、及び/又は表5に記載される通り;
d)図10に示される通り、及び/又は表6に記載される通り;
e)図11に示される通り、及び/又は表7に記載される通り;
f)図12に示される通り、及び/又は表8に記載される通り;
g)図13に示される通り、及び/又は表9に記載される通り;
h)図14に示される通り、及び/又は表12に記載される通り;
i)図15に示される通り、及び/又は表13に記載される通り;
j)図16に示される通り、及び/又は表14に記載される通り;
k)図17に示される通り、及び/又は表15に記載される通り;
l)図18に示される通り、及び/又は表16に記載される通り;
m)図19に示される通り、及び/又は表17に記載される通り;並びに
n)図20に示される通り、及び/又は表18に記載される通り
のMS/MSスペクトルをさらに特徴とする、請求項19に記載の方法。 - 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ分子式a)C24H50NO7P、b)C26H48NO7P、c)C26H50NO7P、d)C26H52NO7P、e)C26H54NO7P、f)C28H48NO7P、g)C28H52NO7P、h)C23H48NO7P、j)C25H52NO9P、k)C25H50NO10P、l)C27H52NO9P、m)C27H54NO9P、及びn)C27H56NO9Pをさらに特徴とする、請求項21に記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ構造
a)
n)
をさらに特徴とする、請求項22に記載の方法。 - 患者における前立腺癌を治療するための治療法の効果を評価する方法であって、
a)前記患者から試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)前記定量データを1種又は複数の基準試料から得られた対応データと比較するステップと;
d)前記比較を用いて、前記治療法が患者の健康状態を改善しているかどうかを判定するステップと
を含み、
前記1種又は複数の代謝産物マーカーが、表1に記載される代謝産物又はその任意の組合せから選択される、方法。 - ステップb)が、液体クロマトグラフィー質量分析法(LC−MS)によって試料を分析することを含む、請求項24に記載の方法。
- ハイスループット法であり、ステップb)が、直接注入又は液体クロマトグラフィー、及び線形イオントラップタンデム質量分析法によって試料を分析することを含む、請求項24に記載の方法。
- 1種又は複数の基準試料が、対照個体から得られた複数の試料;患者から得られた1種又は複数の前治療基線試料;又はその組合せである、請求項24〜26のいずれかに記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物マーカーが、ドルトンで測定して、a)495.3328、b)517.3148、c)519.3328、d)521.3480、e)523.3640、f)541.3148、g)545.3460、h)481.3171、i)531.3123、j)541.3422、k)555.3101、l)565.3394、m)567.3546、及びn)569.3687という正確な質量、又はそれに実質的に等しい質量を有する代謝産物を含み;前記代謝産物が、前立腺癌患者で低下している、請求項24に記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ
a)図7に示される通り、及び/又は表3に記載される通り;
b)図8に示される通り、及び/又は表4に記載される通り;
c)図9に示される通り、及び/又は表5に記載される通り;
d)図10に示される通り、及び/又は表6に記載される通り;
e)図11に示される通り、及び/又は表7に記載される通り;
f)図12に示される通り、及び/又は表8に記載される通り;
g)図13に示される通り、及び/又は表9に記載される通り;
h)図14に示される通り、及び/又は表12に記載される通り;
i)図15に示される通り、及び/又は表13に記載される通り;
j)図16に示される通り、及び/又は表14に記載される通り;
k)図17に示される通り、及び/又は表15に記載される通り;
l)図18に示される通り、及び/又は表16に記載される通り;
m)図19に示される通り、及び/又は表17に記載される通り;並びに
n)図20に示される通り、及び/又は表18に記載される通り
のMS/MSスペクトルをさらに特徴とする、請求項28に記載の方法。 - 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ分子式a)C24H50NO7P、b)C26H48NO7P、c)C26H50NO7P、d)C26H52NO7P、e)C26H54NO7P、f)C28H48NO7P、g)C28H52NO7P、h)C23H48NO7P、j)C25H52NO9P、k)C25H50NO10P、l)C27H52NO9P、m)C27H54NO9P、及びn)C27H56NO9Pをさらに特徴とする、請求項29に記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ構造、
a)
n)
をさらに特徴とする、請求項30に記載の方法。 - 患者における前立腺癌を治療するための治療法の効果を評価する方法であって、
a)前記患者からの試料を得るステップと;
b)前記試料を分析して、1種又は複数の代謝産物マーカーについての定量データを得るステップと;
c)前記1種又は複数の代謝産物マーカー対内部対照代謝産物のそれぞれについての比を得るステップと;
d)前記1種又は複数の代謝産物マーカー対内部対照代謝産物のそれぞれについての比を、1種又は複数の基準試料から得られた対応データと比較するステップと;
e)前記比較を用いて、前記治療法が患者の健康状態を改善しているかどうかを判定するステップと
を含み、
前記1種又は複数の代謝産物マーカーが、表1に記載される代謝産物又はその任意の組合せから選択される、方法。 - ステップb)が、液体クロマトグラフィー質量分析法(LC−MS)によって試料を分析することを含む、請求項32に記載の方法。
- ハイスループット法であり、ステップb)が、直接注入又は液体クロマトグラフィー、及び線形イオントラップタンデム質量分析法によって試料を分析することを含む、請求項32に記載の方法。
- 1種又は複数の基準試料が、対照個体から得られた複数の試料;患者から得られた1種又は複数の前治療基線試料;又はその組合せである、請求項32〜34のいずれかに記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物マーカーが、ドルトンで測定して、a)495.3328、b)517.3148、c)519.3328、d)521.3480、e)523.3640、f)541.3148、g)545.3460、h)481.3171、i)531.3123、j)541.3422、k)555.3101、l)565.3394、m)567.3546、及びn)569.3687という正確な質量、又はそれに実質的に等しい質量を有する代謝産物を含み;代謝産物対内部対照代謝産物の比が、前立腺癌患者で低下している、請求項32に記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ
a)図7に示される通り、及び/又は表3に記載される通り;
b)図8に示される通り、及び/又は表4に記載される通り;
c)図9に示される通り、及び/又は表5に記載される通り;
d)図10に示される通り、及び/又は表6に記載される通り;
e)図11に示される通り、及び/又は表7に記載される通り;
f)図12に示される通り、及び/又は表8に記載される通り;
g)図13に示される通り、及び/又は表9に記載される通り;
h)図14に示される通り、及び/又は表12に記載される通り;
i)図15に示される通り、及び/又は表13に記載される通り;
j)図16に示される通り、及び/又は表14に記載される通り;
k)図17に示される通り、及び/又は表15に記載される通り;
l)図18に示される通り、及び/又は表16に記載される通り;
m)図19に示される通り、及び/又は表17に記載される通り;並びに
n)図20に示される通り、及び/又は表18に記載される通り
のMS/MSスペクトルをさらに特徴とする、請求項36に記載の方法。 - 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ分子式a)C24H50NO7P、b)C26H48NO7P、c)C26H50NO7P、d)C26H52NO7P、e)C26H54NO7P、f)C28H48NO7P、g)C28H52NO7P、h)C23H48NO7P、j)C25H52NO9P、k)C25H50NO10P、l)C27H52NO9P、m)C27H54NO9P、及びn)C27H56NO9Pをさらに特徴とする、請求項37に記載の方法。
- 1種又は複数の代謝産物が、それぞれ構造
a)
n)
をさらに特徴とする、請求項38に記載の方法。 - ドルトンで測定して、a)531.3123、b)541.3422、c)555.3101、d)565.3394、e)567.3546、及びf)569.3687という正確な質量、又はそれに実質的に等しい質量を有する代謝産物からなる群から選択される化合物。
- それぞれ
a)図15に示される通り、及び/又は表13に記載される通り;
b)図16に示される通り、及び/又は表14に記載される通り;
c)図17に示される通り、及び/又は表15に記載される通り;
d)図18に示される通り、及び/又は表16に記載される通り;
e)図19に示される通り、及び/又は表17に記載される通り;並びに
f)図20に示される通り、及び/又は表18に記載される通り
のMS/MSスペクトルをさらに特徴とする、請求項40に記載の化合物。 - それぞれ分子式a)C30H46NO5P、b)C25H52NO9P、c)C25H50NO10P、d)C27H52NO9P、e)C27H54NO9P、及びf)C27H56NO9Pをさらに特徴とする、請求項41に記載の化合物。
- それぞれ構造
b)
をさらに特徴とする、請求項42に記載の化合物。 - 前立腺癌の診断のための請求項40〜43のいずれかに記載の1種又は複数の化合物の使用。
- 前立腺癌患者における治療法の効果を評価するための請求項40〜43のいずれかに記載の1種又は複数の化合物の使用。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US78548006P | 2006-03-24 | 2006-03-24 | |
US60/785,480 | 2006-03-24 | ||
PCT/CA2007/000469 WO2007109881A1 (en) | 2006-03-24 | 2007-03-23 | Biomarkers useful for diagnosing prostate cancer, and methods thereof |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2012259409A Division JP5502972B2 (ja) | 2006-03-24 | 2012-11-28 | 前立腺癌を診断するために有用なバイオマーカー及びその方法 |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2009530624A true JP2009530624A (ja) | 2009-08-27 |
JP2009530624A5 JP2009530624A5 (ja) | 2010-05-06 |
JP5612303B2 JP5612303B2 (ja) | 2014-10-22 |
Family
ID=38540744
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009500679A Expired - Fee Related JP5612303B2 (ja) | 2006-03-24 | 2007-03-23 | 患者における前立腺癌の健康状態等を判定するためにデータを得る方法 |
JP2012259409A Expired - Fee Related JP5502972B2 (ja) | 2006-03-24 | 2012-11-28 | 前立腺癌を診断するために有用なバイオマーカー及びその方法 |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2012259409A Expired - Fee Related JP5502972B2 (ja) | 2006-03-24 | 2012-11-28 | 前立腺癌を診断するために有用なバイオマーカー及びその方法 |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US8409794B2 (ja) |
EP (2) | EP1922326A4 (ja) |
JP (2) | JP5612303B2 (ja) |
KR (1) | KR20090006837A (ja) |
CN (1) | CN101454331A (ja) |
AU (1) | AU2007231487B2 (ja) |
BR (1) | BRPI0709176A2 (ja) |
CA (1) | CA2644330C (ja) |
SG (1) | SG170061A1 (ja) |
WO (1) | WO2007109881A1 (ja) |
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2012529021A (ja) * | 2009-06-04 | 2012-11-15 | メタノミクス ヘルス ゲーエムベーハー | 前立腺癌を診断する手段と方法 |
JP2013506142A (ja) * | 2009-10-01 | 2013-02-21 | フェノメノーム ディスカバリーズ インク | 膵臓癌の血清ベースのバイオマーカー並びに疾患検出及び診断のためのその使用 |
JP2013529784A (ja) * | 2010-06-23 | 2013-07-22 | ユニバーシティ オブ ルーイビル リサーチ ファウンデーション,インコーポレーテッド | 癌を検出するための方法 |
JP2016522406A (ja) * | 2013-05-14 | 2016-07-28 | セントジーン アーゲー | ニーマン・ピック病の診断のための方法 |
JP2017203649A (ja) * | 2016-05-09 | 2017-11-16 | 国立大学法人大阪大学 | 前立腺がん判定方法 |
WO2018016645A1 (ja) * | 2016-07-22 | 2018-01-25 | 国立大学法人秋田大学 | 新規リン脂質およびその利用ならびにリン脂質分離測定法の開発 |
WO2018158801A1 (ja) * | 2017-02-28 | 2018-09-07 | 株式会社島津製作所 | スペクトルデータの特徴抽出装置および方法 |
Families Citing this family (64)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20100022414A1 (en) | 2008-07-18 | 2010-01-28 | Raindance Technologies, Inc. | Droplet Libraries |
GB0307403D0 (en) | 2003-03-31 | 2003-05-07 | Medical Res Council | Selection by compartmentalised screening |
US20060078893A1 (en) | 2004-10-12 | 2006-04-13 | Medical Research Council | Compartmentalised combinatorial chemistry by microfluidic control |
GB0307428D0 (en) | 2003-03-31 | 2003-05-07 | Medical Res Council | Compartmentalised combinatorial chemistry |
US20050221339A1 (en) | 2004-03-31 | 2005-10-06 | Medical Research Council Harvard University | Compartmentalised screening by microfluidic control |
US7968287B2 (en) | 2004-10-08 | 2011-06-28 | Medical Research Council Harvard University | In vitro evolution in microfluidic systems |
EP3913375A1 (en) | 2006-01-11 | 2021-11-24 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Microfluidic devices and methods of use in the formation and control of nanoreactors |
US9562837B2 (en) | 2006-05-11 | 2017-02-07 | Raindance Technologies, Inc. | Systems for handling microfludic droplets |
EP2481815B1 (en) | 2006-05-11 | 2016-01-27 | Raindance Technologies, Inc. | Microfluidic devices |
WO2008021123A1 (en) | 2006-08-07 | 2008-02-21 | President And Fellows Of Harvard College | Fluorocarbon emulsion stabilizing surfactants |
WO2008036691A2 (en) * | 2006-09-19 | 2008-03-27 | Metabolon, Inc. | Biomarkers for prostate cancer and methods using the same |
US20090075284A1 (en) * | 2006-09-19 | 2009-03-19 | The Regents Of The University Of Michigan | Metabolomic profiling of prostate cancer |
JPWO2008075664A1 (ja) * | 2006-12-21 | 2010-04-15 | 味の素株式会社 | 癌の評価方法、ならびに癌評価装置、癌評価方法、癌評価システム、癌評価プログラムおよび記録媒体 |
WO2008097559A2 (en) | 2007-02-06 | 2008-08-14 | Brandeis University | Manipulation of fluids and reactions in microfluidic systems |
WO2008130623A1 (en) | 2007-04-19 | 2008-10-30 | Brandeis University | Manipulation of fluids, fluid components and reactions in microfluidic systems |
AU2008325187A1 (en) * | 2007-11-07 | 2009-05-14 | H. Lee Moffitt Cancer Center And Research Institute, Inc. | Methods for detecting or monitoring cancer using LPC as a marker |
US20100291690A1 (en) * | 2007-11-07 | 2010-11-18 | Lian Shan | Methods for detecting or monitoring cancer using lpc as a marker |
US8710429B2 (en) * | 2007-12-21 | 2014-04-29 | The Board Of Regents Of The University Of Ok | Identification of biomarkers in biological samples and methods of using same |
WO2009110517A1 (ja) * | 2008-03-04 | 2009-09-11 | 味の素株式会社 | 癌種の評価方法 |
CN104330571B (zh) * | 2008-06-20 | 2017-09-08 | 味之素株式会社 | 前列腺疾病的评价方法 |
MX2011000451A (es) * | 2008-07-16 | 2011-10-12 | Dana Farber Cancer Inst Inc | Distintivos y determinantes asociados con cancer de próstata y métodos para utilizarlos. |
KR101018665B1 (ko) | 2008-08-18 | 2011-03-04 | 재단법인서울대학교산학협력재단 | 전립선암 진단 방법 및 장치 |
US8399829B2 (en) * | 2008-12-18 | 2013-03-19 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Vitamin B2 detection by mass spectrometry |
US8528589B2 (en) | 2009-03-23 | 2013-09-10 | Raindance Technologies, Inc. | Manipulation of microfluidic droplets |
US9500572B2 (en) | 2009-04-30 | 2016-11-22 | Purdue Research Foundation | Sample dispenser including an internal standard and methods of use thereof |
WO2011042564A1 (en) | 2009-10-09 | 2011-04-14 | Universite De Strasbourg | Labelled silica-based nanomaterial with enhanced properties and uses thereof |
JP2013515270A (ja) * | 2009-12-22 | 2013-05-02 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ ミシガン | 前立腺癌の代謝学的プロファイリング |
WO2011079176A2 (en) | 2009-12-23 | 2011-06-30 | Raindance Technologies, Inc. | Microfluidic systems and methods for reducing the exchange of molecules between droplets |
EP2354794A1 (en) * | 2010-01-29 | 2011-08-10 | IMG Institut für medizinische Genomforschung Planungsgesellschaft M.B.H. | Diagnosing prostate cancer relapse |
US9399797B2 (en) | 2010-02-12 | 2016-07-26 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
JP5934657B2 (ja) | 2010-02-12 | 2016-06-15 | レインダンス テクノロジーズ, インコーポレイテッド | デジタル検体分析 |
US10351905B2 (en) | 2010-02-12 | 2019-07-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analyte analysis |
US9366632B2 (en) | 2010-02-12 | 2016-06-14 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
US9063047B2 (en) * | 2010-05-07 | 2015-06-23 | Ut-Battelle, Llc | System and method for extracting a sample from a surface |
CN103229052A (zh) * | 2010-07-28 | 2013-07-31 | 梅塔博隆公司 | 用于前列腺癌的生物标记及其使用方法 |
EP2622103B2 (en) | 2010-09-30 | 2022-11-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Sandwich assays in droplets |
EP3859011A1 (en) | 2011-02-11 | 2021-08-04 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Methods for forming mixed droplets |
WO2012112804A1 (en) | 2011-02-18 | 2012-08-23 | Raindance Technoligies, Inc. | Compositions and methods for molecular labeling |
EP3709018A1 (en) | 2011-06-02 | 2020-09-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Microfluidic apparatus for identifying components of a chemical reaction |
US8841071B2 (en) | 2011-06-02 | 2014-09-23 | Raindance Technologies, Inc. | Sample multiplexing |
US8658430B2 (en) | 2011-07-20 | 2014-02-25 | Raindance Technologies, Inc. | Manipulating droplet size |
EP2823303A4 (en) | 2012-02-10 | 2015-09-30 | Raindance Technologies Inc | MOLECULAR DIAGNOSTIC SCREEN TYPE ASSAY |
CA2866007C (en) | 2012-03-05 | 2023-01-03 | Oy Arctic Partners Ab | Methods and apparatuses for predicting risk of prostate cancer and prostate gland volume |
EP2844768B1 (en) | 2012-04-30 | 2019-03-13 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
US20150285805A1 (en) | 2012-11-05 | 2015-10-08 | Ospedale San Raffaele S.R.L. | Biomarkers of multiple myeloma development and progression |
US9176154B2 (en) | 2012-12-12 | 2015-11-03 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Calibration process and system |
CN104956462B (zh) * | 2013-01-31 | 2017-10-10 | 普度研究基金会 | 用于分析所提取样本的系统和方法 |
CN104956463B (zh) | 2013-01-31 | 2018-04-06 | 普度研究基金会 | 分析原油的方法 |
WO2014172288A2 (en) | 2013-04-19 | 2014-10-23 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
US9620344B2 (en) | 2013-06-25 | 2017-04-11 | Purdue Research Foundation | Mass spectrometry analysis of microorganisms in samples |
US11901041B2 (en) | 2013-10-04 | 2024-02-13 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analysis of nucleic acid modification |
US9944977B2 (en) | 2013-12-12 | 2018-04-17 | Raindance Technologies, Inc. | Distinguishing rare variations in a nucleic acid sequence from a sample |
WO2015103367A1 (en) | 2013-12-31 | 2015-07-09 | Raindance Technologies, Inc. | System and method for detection of rna species |
DE202015009668U1 (de) | 2014-03-28 | 2019-01-21 | Opko Diagnostics, Llc | Zusammensetzungen zur Diagnose von Prostatakrebs |
US10879056B2 (en) | 2014-05-30 | 2020-12-29 | ASTA, Co. Ltd | Integrated disease diagnostic system using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometer |
US10197551B2 (en) * | 2014-05-30 | 2019-02-05 | ASTA, Co. Ltd. | Integrated disease diagnostic system using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometer |
US9786478B2 (en) | 2014-12-05 | 2017-10-10 | Purdue Research Foundation | Zero voltage mass spectrometry probes and systems |
CN113725063A (zh) | 2015-02-06 | 2021-11-30 | 普度研究基金会 | 探针、系统、盒及其使用方法 |
EP3253800B1 (en) | 2015-03-27 | 2021-03-03 | Opko Diagnostics, LLC | Prostate antigen standards and uses thereof |
US10647981B1 (en) | 2015-09-08 | 2020-05-12 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Nucleic acid library generation methods and compositions |
CN105424841B (zh) * | 2015-12-25 | 2017-11-03 | 齐炼文 | 用于诊断冠状动脉粥样硬化的代谢标志物 |
US10006925B2 (en) | 2016-05-30 | 2018-06-26 | Universal Diagnostics, S. L. | Methods and systems for metabolite and/or lipid-based detection of colorectal cancer and/or adenomatous polyps |
US11073522B2 (en) | 2016-10-03 | 2021-07-27 | Lincoln Memorial University | Structural validation of very long chain dicarboxylic acids |
US10998178B2 (en) | 2017-08-28 | 2021-05-04 | Purdue Research Foundation | Systems and methods for sample analysis using swabs |
Citations (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002510386A (ja) * | 1997-03-21 | 2002-04-02 | アタイアジン テクノロジーズ,インコーポレーテッド | リゾリン脂質の濃度変化に関連する癌の検出方法 |
WO2002090925A2 (en) * | 2001-05-07 | 2002-11-14 | Tularik Inc. | Polypeptides and nucleic acids associated with cancer |
JP2003532055A (ja) * | 2000-03-20 | 2003-10-28 | イースタン バージニア メディカル スクール | 前立腺癌マーカー |
JP2004500553A (ja) * | 1999-10-07 | 2004-01-08 | シファーゲン バイオシステムズ, インコーポレイテッド | 前立腺ガンのマーカータンパク質 |
WO2004064822A1 (en) * | 2002-06-07 | 2004-08-05 | Kieran Francis Scott | Method of inhibiting prostate cancer cell proliferation |
JP2004530884A (ja) * | 2001-05-25 | 2004-10-07 | マウント・シナイ・ホスピタル | Ephb2のキナーゼドメインを調節する方法 |
US20050244973A1 (en) * | 2004-04-29 | 2005-11-03 | Predicant Biosciences, Inc. | Biological patterns for diagnosis and treatment of cancer |
JP2006509186A (ja) * | 2002-05-10 | 2006-03-16 | イースタン バージニア メディカル スクール | 前立腺癌バイオマーカー |
Family Cites Families (21)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4813171A (en) | 1987-11-24 | 1989-03-21 | Herbert Cooper | Power-operated lateral actuator for a fishing outrigger |
US4953328A (en) | 1989-05-24 | 1990-09-04 | Sewell Scott R | Air conditioning compressor sectionalized cover |
AT399867B (de) | 1990-01-11 | 1995-08-25 | Lisec Peter | Anlage zur herstellung von isolierglasscheiben |
US5233640A (en) | 1991-01-11 | 1993-08-03 | Detection Systems, Inc. | Security system with backup dialer |
IT1252437B (it) | 1991-07-19 | 1995-06-14 | Gd Spa | Metodo e dispositivo per la piegatura di sbozzati di incarto lungo linee di piegatura pre-indebolite |
CA2089503C (en) | 1992-02-19 | 1996-09-03 | Marcus Mintz | Casing structure for encasing meat products |
US5213480A (en) | 1992-06-08 | 1993-05-25 | Graco, Inc. | Pump lift mechanism |
US5313123A (en) | 1992-11-23 | 1994-05-17 | Leonid Simuni | Automobile having the magnetohydrodynamic engine |
DE4306614A1 (de) | 1993-03-03 | 1994-09-08 | Bayer Ag | Verfahren zur Wiederverwertung von Lackabfällen |
US5441589A (en) | 1993-06-17 | 1995-08-15 | Taurus Impressions, Inc. | Flat bed daisy wheel hot debossing stamper |
JPH08505510A (ja) | 1993-10-28 | 1996-06-11 | モトローラ・インコーポレーテッド | 複数のデータプロトコルに適用可能な復調器論理ユニット |
US5434195A (en) | 1994-06-23 | 1995-07-18 | The Dow Chemical Company | Extruded, open-cell alkenyl aromatic polymer foam and process for making |
US5653394A (en) | 1995-09-28 | 1997-08-05 | Highline Mfg. Inc. | Disintegration of baled crop materials |
US5673546A (en) | 1995-12-26 | 1997-10-07 | Abraham; Carl J. | Non-slip shoelaces |
US5858681A (en) * | 1996-06-17 | 1999-01-12 | Children's Medical Center | Method for prognosis of prostate cancer |
CA2298181C (en) | 2000-02-02 | 2006-09-19 | Dayan Burke Goodnough | Non-targeted complex sample analysis |
EP1285092A4 (en) * | 2000-04-14 | 2003-07-16 | Metabolon Inc | METHOD FOR DISCOVERY OF MEDICINES, DISEASE TREATMENT AND DIAGNOSIS USE THE METABOLOMICS |
JP2004526424A (ja) * | 2000-11-28 | 2004-09-02 | ワイス | 前立腺癌の診断および治療に有用なディファレンシエーションインヒビター核酸およびポリペプチドの発現分析 |
US20030228639A1 (en) * | 2001-03-19 | 2003-12-11 | Wright George L | Prostate cancer markers |
EP1549938A4 (en) * | 2002-04-26 | 2010-05-12 | Univ Johns Hopkins | IDENTIFICATION OF BIOMARKERS TO DETECT PROSTATE CANCER |
US20070009970A1 (en) * | 2005-07-08 | 2007-01-11 | Predicant Biosciences, Inc. | Biological patterns for diagnosis and treatment of cancer |
-
2007
- 2007-03-23 WO PCT/CA2007/000469 patent/WO2007109881A1/en active Application Filing
- 2007-03-23 SG SG201101506-2A patent/SG170061A1/en unknown
- 2007-03-23 BR BRPI0709176-1A patent/BRPI0709176A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2007-03-23 CA CA2644330A patent/CA2644330C/en not_active Expired - Fee Related
- 2007-03-23 JP JP2009500679A patent/JP5612303B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2007-03-23 KR KR1020087026013A patent/KR20090006837A/ko not_active Application Discontinuation
- 2007-03-23 AU AU2007231487A patent/AU2007231487B2/en not_active Ceased
- 2007-03-23 EP EP07710787A patent/EP1922326A4/en not_active Ceased
- 2007-03-23 US US12/294,215 patent/US8409794B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2007-03-23 EP EP20130176367 patent/EP2674435A3/en not_active Withdrawn
- 2007-03-23 CN CNA2007800188377A patent/CN101454331A/zh active Pending
-
2012
- 2012-11-28 JP JP2012259409A patent/JP5502972B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2013
- 2013-03-13 US US13/801,574 patent/US20130330746A1/en not_active Abandoned
Patent Citations (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002510386A (ja) * | 1997-03-21 | 2002-04-02 | アタイアジン テクノロジーズ,インコーポレーテッド | リゾリン脂質の濃度変化に関連する癌の検出方法 |
JP2004500553A (ja) * | 1999-10-07 | 2004-01-08 | シファーゲン バイオシステムズ, インコーポレイテッド | 前立腺ガンのマーカータンパク質 |
JP2003532055A (ja) * | 2000-03-20 | 2003-10-28 | イースタン バージニア メディカル スクール | 前立腺癌マーカー |
WO2002090925A2 (en) * | 2001-05-07 | 2002-11-14 | Tularik Inc. | Polypeptides and nucleic acids associated with cancer |
JP2004530884A (ja) * | 2001-05-25 | 2004-10-07 | マウント・シナイ・ホスピタル | Ephb2のキナーゼドメインを調節する方法 |
JP2006509186A (ja) * | 2002-05-10 | 2006-03-16 | イースタン バージニア メディカル スクール | 前立腺癌バイオマーカー |
WO2004064822A1 (en) * | 2002-06-07 | 2004-08-05 | Kieran Francis Scott | Method of inhibiting prostate cancer cell proliferation |
US20050244973A1 (en) * | 2004-04-29 | 2005-11-03 | Predicant Biosciences, Inc. | Biological patterns for diagnosis and treatment of cancer |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
JPN5006005717; Qu, Y et al.: 'Boosted Decision Tree Analysis of Surface-enhanced Laser Desorption/Ionization Mass Spectral Serum P' CLINICAL CHEMISTRY vol.48, no.10, 2002, pp.1835-1843 * |
Cited By (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2012529021A (ja) * | 2009-06-04 | 2012-11-15 | メタノミクス ヘルス ゲーエムベーハー | 前立腺癌を診断する手段と方法 |
JP2013506142A (ja) * | 2009-10-01 | 2013-02-21 | フェノメノーム ディスカバリーズ インク | 膵臓癌の血清ベースのバイオマーカー並びに疾患検出及び診断のためのその使用 |
JP2014240841A (ja) * | 2009-10-01 | 2014-12-25 | フェノメノーム ディスカバリーズ インク | 膵臓癌の血清ベースのバイオマーカー並びに疾患検出及び診断のためのその使用 |
JP2013529784A (ja) * | 2010-06-23 | 2013-07-22 | ユニバーシティ オブ ルーイビル リサーチ ファウンデーション,インコーポレーテッド | 癌を検出するための方法 |
JP2015158512A (ja) * | 2010-06-23 | 2015-09-03 | ユニバーシティ オブ ルーイビル リサーチ ファウンデーション,インコーポレーテッド | 癌を検出するための方法 |
JP2016522406A (ja) * | 2013-05-14 | 2016-07-28 | セントジーン アーゲー | ニーマン・ピック病の診断のための方法 |
JP2017203649A (ja) * | 2016-05-09 | 2017-11-16 | 国立大学法人大阪大学 | 前立腺がん判定方法 |
WO2018016645A1 (ja) * | 2016-07-22 | 2018-01-25 | 国立大学法人秋田大学 | 新規リン脂質およびその利用ならびにリン脂質分離測定法の開発 |
JPWO2018016645A1 (ja) * | 2016-07-22 | 2019-06-13 | 国立大学法人秋田大学 | 新規リン脂質およびその利用ならびにリン脂質分離測定法の開発 |
WO2018158801A1 (ja) * | 2017-02-28 | 2018-09-07 | 株式会社島津製作所 | スペクトルデータの特徴抽出装置および方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
BRPI0709176A2 (pt) | 2011-06-28 |
CA2644330C (en) | 2012-05-01 |
AU2007231487B2 (en) | 2014-01-09 |
EP2674435A2 (en) | 2013-12-18 |
WO2007109881A8 (en) | 2007-12-13 |
WO2007109881A1 (en) | 2007-10-04 |
WO2007109881A9 (en) | 2008-10-30 |
AU2007231487A1 (en) | 2007-10-04 |
US8409794B2 (en) | 2013-04-02 |
US20090127454A1 (en) | 2009-05-21 |
JP2013092527A (ja) | 2013-05-16 |
JP5502972B2 (ja) | 2014-05-28 |
SG170061A1 (en) | 2011-04-29 |
KR20090006837A (ko) | 2009-01-15 |
CN101454331A (zh) | 2009-06-10 |
JP5612303B2 (ja) | 2014-10-22 |
EP2674435A3 (en) | 2014-04-30 |
US20130330746A1 (en) | 2013-12-12 |
EP1922326A4 (en) | 2011-06-01 |
CA2644330A1 (en) | 2007-10-04 |
EP1922326A1 (en) | 2008-05-21 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5502972B2 (ja) | 前立腺癌を診断するために有用なバイオマーカー及びその方法 | |
US11079385B2 (en) | Serum-based biomarkers of pancreatic cancer and uses thereof for disease detection and diagnosis | |
JP5038311B2 (ja) | ビタミンe関連代謝産物の測定による、結腸直腸癌及び卵巣癌の診断方法 | |
US20200363419A1 (en) | A method of diagnosing cancer based on lipidomic analysis of a body fluid | |
Nizioł et al. | Nuclear magnetic resonance and surface-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry-based metabolome profiling of urine samples from kidney cancer patients | |
Buszewska-Forajta et al. | New approach in determination of urinary diagnostic markers for prostate cancer by MALDI-TOF/MS | |
US20140162903A1 (en) | Metabolite Biomarkers For Forecasting The Outcome of Preoperative Chemotherapy For Breast Cancer Treatment | |
CN118006776A (zh) | 早期肺腺癌标志物及其筛选方法、诊断模型、诊断装置 | |
Gathercole | Biomarker discovery for pre-clinical diagnosis of Tasmanian devil facial tumour disease |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20100319 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20100319 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20120528 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20120820 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20120827 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20120924 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20121001 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20121023 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20121030 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20121128 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20130606 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20130902 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20130909 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20130927 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20131004 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20131030 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20131107 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20140304 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20140703 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20140703 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20140724 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20140812 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20140904 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5612303 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |