JP2009524438A - 卵巣癌を有する可能性の高い患者を同定するための方法およびそのための組成物 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、卵巣癌を有する可能性の高い女性を同定するための方法および組成物に関連する。
卵巣癌は、世界規模で女性を冒している雑多な群の疾患に相当する。卵巣癌にはいくつかの形態があり、これらとしては、上皮癌、卵巣の生殖細胞癌、および卵巣基質癌が挙げられる。上皮卵巣癌は、この疾患の最も一般的な形態に相当する。上皮卵巣癌の約5〜10%が、遺伝性の疾患形態に相当し、そして、以下の3つの一般的なパターンが認識されている:卵巣癌のみ;それぞれ、染色体17q21および13q12にあるBRAC1およびBRCA2に関連した卵巣癌および乳癌;ならびに、卵巣癌および結腸癌。卵巣癌についての最も重要な危険因子は、疾患を有する一親等血族(例えば、卵巣癌を有する母親、姉妹、または娘)である。例えば、非特許文献1を参照のこと。2005年には、推定22,000人の卵巣癌の新規症例が診断され、そして、16,000人が卵巣癌により死んでいた。概略的には、American Cancer Societyのウェブサイト(www.cancer.org);National Cancer Instituteのウェブサイト(www.cancer.gov)を参照のこと。卵巣癌は、主に、閉経後の女性を冒す疾患であり、診断時の中央年齢が63歳である。しかし、この疾患は、全ての年齢群の女性を冒し得る。National Cancer Institute Surveillance,Epidemiology,and End 結果s(SEER)Program(www.seer.cancer.gov)。
Patridgeら(1999)CA−A Cancer Journal for Clinicians 49:297−320 Bell(2005)Mod.Pathol.18(補遺2):S19−32 Nessら(1999)J.Natl.Cancer Inst.91:1459−1467 Onoら(2000)Cancer Res.60:5007−11 Welshら(2001)Proc.Natl Acad.Sci.USA 98:1176−1181 Donningerら(2004)Oncogene 23:8065−8077 Leeら(2004)Int.J.Oncol 24(4):847−851 Bast(2003)J Clin Oncol.21(第10補遺):200−205 Patridgeら(1999)CA−A Cancer Journal for Clinicians 49:297−320 Skatesら(2004)J.Clin.Oncol.22:4059−4066 Bastら(2005)Int.J.Gynecol.Cancer 15:274−281 Rosenら(2005)Gyn.Oncol.99:267−277
卵巣癌を有する可能性の高い患者を同定するためのスクリーニング方法が提供される。本発明の方法は、一般に、患者の身体試料において、卵巣癌において選択的に過剰発現される複数のバイオマーカーの発現を検出する工程を包含する。これらのバイオマーカーの過剰発現はその患者が卵巣癌を有する可能性が高いということを示す。本発明の方法は、例えば、「2段階」の解析を含み得、ここで、第一のアッセイ段階は、第一のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルの発現を検出するために行われる。第一のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルが過剰発現される場合、第二のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルの発現を検出するために第二のアッセイ段階が行われる。第一および第二のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルの過剰発現は、その患者が卵巣癌を有する可能性が高いことを示す。第一のアッセイ段階は、「真の陰性」の女性の大部分を排除することによって、再検討中の患者集団を富化するために設計され得る。第二のアッセイ段階は、代表的には、富化した集団からさらに真の陰性の患者を排除することによって、富化された集団において、現在は卵巣癌を有さない患者を除外するために意図される。これらのアッセイ段階は、両方のアッセイ段階を包含する単一の試験として、または、各試験が1つのアッセイ段階を包含する2つの別個の試験として行われ得る。各解析段階において単一のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルを使用して、感度、特異性、負の予測価(NPV)および正の予測価(PPV)について所望の値が達成され得る。別個のアッセイ段階における特定のバイオマーカーを組み合わせて、所望の感度、特異性、NPVおよびPPVを達成するためのアルゴリズムが開発され得る。
本発明は、卵巣癌を有する患者を同定するためのスクリーニング方法および組成物を提供する。スクリーニング方法は、一般に、患者からの身体試料(具体的には、血液試料、より具体的には、血清試料)において複数のバイオマーカーの発現を検出する工程を包含する。本発明の実施において使用されるバイオマーカーの過剰発現は、卵巣癌の存在の可能性が高いことを示す。本発明の特定のスクリーニング方法において、卵巣癌を有する可能性が高い患者を同定するために2段階解析が用いられる。第一のアッセイ段階は、患者の身体試料において第一のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルの発現を検出するために行われる。第一のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルが試料中で過剰発現していると決定される場合、第二のアッセイ段階が、第二のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルの発現を検出するために行われる。第一および第二のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルの過剰発現は、その患者が卵巣癌を有する可能性が高いことを示す。特定の実施形態において、バイオマーカータンパク質の発現を検出するために抗体が使用される。本発明の他の局面において、バイオマーカーの発現が検出されるとき、解析されるバイオマーカーのサブセットのみの過剰発現が、その患者が卵巣癌を有する可能性が高いことを示すに十分であり得る。
採血
添加物を含まないBecton Dickinson製の蓋が赤色のVacutainer採血管(カタログ番号366430)に、静脈穿刺により十分な量の血液を採血した。採血管のロット番号を記録した。全血は冷蔵も冷凍もしなかった。全血の血清への処理は、採血後直ちに開始した。
採血管を、ラック中に真っ直ぐ置き、室温で保管した。血液を、採血時間から、最小で60分間、最大で90分間、凝血させた。血液は、遠心前に完全に凝血していた。各試料について完全に凝血させるために要した時間を記録した。
バイオマーカー選択研究の目的は、14の候補卵巣癌バイオマーカーのセットの最初の臨床上の有用性を評価することであった。この研究の前提は、患者血清中の各バイオマーカーの量を同定および定量することができるということであった。血清試料中のバイオマーカータンパク質の発現を、ELISA形式で、市販または新規のバイオマーカー特異的抗体を用いて検出した。以下の表1に記載するように、14の標的バイオマーカーを解析した。
このタイプの評価において、試験される標本は、標的臨床集団を代表するものであり、そして、正常な対照が人口学上適合されているということがきわめて重要である。合計900の患者血清標本をこの研究において解析した。200の標本は、疾患の種々の段階にある卵巣癌患者に由来するものであった(すなわち、200の標本は、段階1、段階2、段階3の卵巣癌標本の間で均等に分配した)。合計500の正常血清をこの試験において使用した。104の正常血清標本は、各バイオマーカーの基線レベルを確立するため、そして、適切な閾値カットオフ値を計算するために、閉経後の女性(本研究では、55歳より上の女性と設定)に由来するものであった。残りの396の正常血清標本は、55歳より下の閉経前の女性と、55歳より上の閉経後の女性に均等に分配した。この分配は、あらゆる年齢またはホルモンに関連する患者の分配の検討を可能にした。この研究における残りの200の標本は、本明細書中で上記したように、種々の状態/疾患(すなわち、「干渉性の実体」または「干渉性の病理」)を有するドナーから集めた。これらの標本を含めることで、個々のバイオマーカーの性能に影響を与え得るあらゆる干渉性の病理の解析を可能にした。解析した患者集団および研究の実態的人口統計のまとめを表2〜4に提供する。
全900の血清標本を14のマーカーの各々について二連で処理した。マーカー選択データの作製に、バーコード追跡を備える自動アッセイシステムを利用した。このマーカー選択研究におけるアッセイの実行は全て、Tecan Evo自動機械式液体ハンドラー(automated robotic liquid handler)を用いて完了させた。このプラットフォームの使用は、全900の標本を、各マーカーについて1回の実験の実行(1日1回の実行)で処理することを可能にした。自動プラットフォームの正確さは、あらゆる研究標本を処理する前に確認した。
材料および方法
A.アッセイプレートのコーティング:
ELISAの96ウェルプレートを、100μl/ウェルの一次抗体、PBS中2μg/mlの抗HE4モノクローナル抗体90.1 #6でコーティングし、次いで、このプレートを、4℃で一晩インキュベートした。次の日、これらのプレートをPBSで1度洗浄し、次いで、250μl/ウェルのPBS−3%BSAを全ウェルに加え、そして、プレートを30℃にて2時間インキュベートした。次いで、これらのプレートを空にし、そして、真空オーブン内で室温にて2時間乾燥させた。次いで、これらを、乾燥剤パックと共にマイラーフォイルバッグ(mylar foil bag)の内側にヒートシールし、アッセイで使用するまで、4℃に保管した。
アッセイプレートを含むフォイルバッグをアッセイの使用直前に室温まで温めた。血清試料を、PBS−1%ウシ血清−0.05% Tween 20−1mg/mlマウスIgG中に1:4で希釈した。HE4抗原タンパク質を100ng/mlに希釈し、次いで、PBS−1%ウシ血清−0.05% Tween 20−1mg/mlマウスIgG中に2倍で段階希釈し、次いで、血清試料と同じに希釈されるように、全ての個々の標準曲線用試料をさらに緩衝液中1:4に希釈した。
低対照として使用した血清:Uniglobe #72404
使用した緩衝液対照は、PBS−1%ウシ血清−0.05% Tween 20
−1mg/mlマウスIgGであった。
HE4についての標準曲線を、PBS/1%ウシ血清/0.05%Tween 20−1mg/mLのマウスIgG中にHE4タンパク質を希釈することによって調製した。このような標準曲線の調製は、当該分野で周知である。本質的には、HE4について上述したようにして(変更が当業者により理解および実行され得る)、残りのバイオマーカーについて全ての血清試料中のバイオマーカーの標準曲線およびレベルまたは濃度を得た。解析したバイオマーカー(すなわち、HE4、グリコデリン、SLPI、PLAU−R、MUC−1、PAI−1、MMP−7、インヒビン、CA125、CTHRC1、KLK−6、KLK−10、α−1アンチトリプシンおよびプロラクチン)についての標準曲線の範囲および曲線の当てはめの等式を以下に示す。
*標準曲線の実験範囲=0.78ng/ml〜100ng/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=三次多項式、
*標準曲線の実験範囲=3ng/ml〜100ng/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=二次方程式、
*標準曲線の実験範囲=2.38ng/ml〜305ng/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=三次多項式、
*標準曲線の試料を上述の濃度(実験範囲)で調製し、次いで、これらの標準曲線の試料を全て、さらに1:6.1希釈し、次いで、この1:6.1希釈した試料のアッセイを行った。
*標準曲線の試料の希釈(1:6.1)と比べ、血清試料の希釈(1:40)との間に相違が存在するので、標準曲線から得られた全ての血清試料濃度の値を、「6.6」の希釈係数で乗じて、この相違を補正した(1:40=1:6.1×1:6.6)。
*標準曲線の実験範囲=62.5pg/ml〜4000pg/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=線形、
*標準曲線の試料を上述の濃度(実験範囲)で調製し、次いで、これらの標準曲線の試料を全て、さらに1:3希釈し、次いで、この1:3希釈した試料のアッセイを行った。
*標準曲線の試料の希釈(1:3)と比べ、血清試料の希釈(1:18)との間に相違が存在するので、標準曲線から得られた全ての血清試料濃度の値を、「6」の希釈係数で乗じて、この相違を補正した(1:18=1:3×1:6)。
*標準曲線の実験範囲=0.3U/ml〜600U/ml、段階3倍希釈
*曲線の当てはめ=三次多項式、
*標準曲線の実験範囲=0.78ng/ml〜100ng/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=線形、
*標準曲線の実験範囲=0.16ng/ml〜20ng/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=三次多項式、
*標準曲線の実験範囲=10pg/ml〜1000pg/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=線形、
*標準曲線の実験範囲=15U/ml〜400U/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=線形、
*標準曲線の実験範囲=0.78ng/ml〜100ng/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=線形、
*標準曲線の実験範囲=0.78ng/ml〜100ng/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=三次多項式、
*標準曲線の実験範囲=1ng/ml〜80ng/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=線形、
*標準曲線の実験範囲=3.3ng/ml〜90ng/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=二次方程式、
*標準曲線の試料の希釈(段階希釈以上には希釈していない)と比べ、血清試料の希釈(1:250000)との間に相違が存在するので、標準曲線から得られた全ての血清試料濃度の値を、「250000」の希釈係数で乗じて、この相違を補正した。
*標準曲線の実験範囲=2ng/ml〜240ng/ml、段階2倍希釈
*曲線の当てはめ=線形、
本研究に用いた500の正常症例の中で、104の正常症例を対照群として用いて、閾値カットオフポイントを選択した。表6は、各マーカーについてのこれらの104の閾値正常症例に基づいた、平均、標準偏差、範囲、平均+2*std、平均+3*stdを提供する。表7は、全ての正常研究症例(396症例)における平均標準偏差、範囲、平均+2*stdを提供する。表8は、55歳より上の患者からの正常研究症例(195症例以下)における平均標準偏差、範囲、平均+2*stdを提供する。マーカーHE4およびインヒビンの除く各バイオマーカーについて、平均および標準偏差は、正常閾値対照症例と55歳より上の患者についての正常研究症例との間で非常に類似していた。表6および8を参照のこと。
この研究のための最適なバイオマーカーを選択するために、ロジスティック回帰法を用いた。ロジスティック回帰法を用いると、段階的な選択は、従属変数に関して最大のR2値を生じるバイオマーカーを見出すことによって開始する。次いで、「最良の」バイオマーカーがこのモデル中にあると仮定すると、ロジスティック回帰により、R2に足すことによって、次の最良のバイオマーカーが見出される。R2に足すという、バイオマーカーのセットを見出すこのプロセスは、特定の統計的基準に従って、バイオマーカーがもはやR2に足すことができない場合に停止される。これらのバイオマーカーのセットは、バイオマーカーのうちのいくつかが同じ予測性能を有することから、唯一のものではない。
現在の研究において、バイオマーカーHE4、CA125、PLAU−R、グリコデリン、Muc−1、PAI−1、MMP−7およびインヒビンは、マーカー性能に基づいて、連続変数またはカテゴリー的変数のいずれかとして最も頻繁に選択されるマーカーであった。上記の統計的手法とは対照的に、表53は、以下の2つの試験の規則に基づいて、推定の感度、特異性、PPVおよびNPV(疾患の有病率により調整)を提供する:(1)上記バイオマーカーのうちのいずれか2つが陽性である(すなわち、過剰発現される)場合、試験は陽性であることを示す、または、(2)上記バイオマーカーのうちいずれか3つが陽性である(すなわち、過剰発現される)場合、試験は陽性であることを示す。表51および52において上に提示される結果とは対照的ではあるが、卵巣癌の低い罹患率について調整した場合、いずれの試験の規則の適用も、高い特異性の割合を生じず、今度は、容認でいないほど低いPPV(<1.5%)をもたらした。本明細書中に記載されるもののような「試験の規則」の適用は、卵巣癌を有する可能性の高い患者の同定における当該分野の現在の技術水準を代表するものである。
全患者および55歳より上の患者について、バイオマーカーHE4、CA125およびグリコリデン、ならびにこれらの組み合わせの発現を、本明細書において上記したような、1段階スクリーニング方法を用いて評価した。特に、表54は、55歳より上の患者についての1段階アルゴリズムの結果を提供する。この試験アルゴリズムは、線形ロジスティック回帰モデルに基づくものであり、このモデルにおいて、各マーカーの実際の値を用いた。線形ロジスティック回帰モデル(および他のアルゴリズム)は、当該分野で慣習的かつ周知である。例えば、Fleiss(2003)Statistical Methods for Rates and Proportions(第3版)(その全体が本明細書中に参考として援用される)を参照のこと。このアルゴリズムは、96.4%の特異性において76.8%の感度を与えた。陽性と規定される試験結果は、以下の線形ロジスティック回帰モデルに基づくものであった:ln(P/(1−P))=−4.2391+0.0888*CA125+0.1790*HE4+0.2349*GLY(ここで、Pは、卵巣癌の条件付き確率であり、CA125、HE4およびグリコリデンが患者の身体試料において過剰発現されているものと仮定する)。≧35u/mlという製造業者の推奨するカットオフ値を用いて決定したCA125についても同様の結果が得られた。
研究方法の確認
また、解析のブートストラップ法を、癌の血清の個々の独特のセットがこのモデルを確認するために利用可能でないと仮定して、上記研究についての感度および特異性の大まかな推定を確実なものとするために行った。このブートストラップ法は、研究標本セットから補充選択して、1000のランダムなデータセットを人工的に作製することから構成される。最適な性能に基づき、研究において最も頻繁に選択されたマーカーのセットを選択した:HE4、CA125、PLAU−R、グリコデリン、MUC1およびPAI−1。「試験」を以下のように規定した:(1)HE4が陽性でありかつCA125、グリコリデン、MMP−7、PLAU−Rのいずれか1つが陽性である場合、または(2)HE4が陰性であるが、CA125、グリコリデン、MMP−7、PALU−Rが全て陽性である場合のいずれかを、試験が陽性であるとし;それ以外の場合は、「試験」は陰性である。1000のランダムな標本から、この規定された試験の感度/特異性の平均/標準偏差および95%信頼区間を得た。
Claims (38)
- 卵巣癌を有する可能性の高い患者を同定するためのスクリーニング方法であって、該方法は、以下:
a)第一のアッセイ段階を行う工程であって、該第一のアッセイ段階は、身体試料中の第一のバイオマーカーまたは第一のバイオマーカーパネルの発現を検出し、該第一のバイオマーカーまたは該第一のバイオマーカーパネルが過剰発現しているかどうかを決定する工程を含む、工程;ならびに
b)工程a)において該第一のバイオマーカーまたは該第一のバイオマーカーパネルが過剰発現していると決定された場合に、第二のアッセイ段階を行う工程であって、該第二のアッセイ段階は、該身体試料中の第二のバイオマーカーまたは第二のバイオマーカーパネルの発現を検出し、該第二のバイオマーカーまたは該第二のバイオマーカーパネルが過剰発現しているかどうかを決定する工程;
を包含し、該第一のバイオマーカーまたは該第一のバイオマーカーパネル、および該第二のバイオマーカーまたは該第二のバイオマーカーパネルの両方の過剰発現は、該患者が卵巣癌を有する可能性が高いことを示す、方法。 - 請求項1に記載の方法であって、卵巣癌を有する可能性が高いとして同定された患者をさらなる診断試験に供して、該患者が卵巣癌を有するかどうかを決定し、該さらなる診断試験は、骨盤検査、経膣超音波検査、CTスキャン、MRI、側腹切開術、腹腔鏡検査および組織および組織試料生検からなる群より選択される、方法。
- 現在は卵巣癌を有していないと決定された前記卵巣癌を有する可能性が高いとして同定された患者を、さらに、卵巣癌の発症について、定期ベースでモニターする、請求項1に記載の方法。
- 早期段階の卵巣癌を検出するために使用される、請求項1に記載の方法。
- 各バイオマーカーについての発現の閾値レベルが、各バイオマーカーについての受信者動作特性(ROC)プロットを解析することによって決定され、閾値レベルを超える発現レベルは、特定のバイオマーカーが過剰発現していることを示す、請求項1に記載の方法。
- 前記各バイオマーカーについての発現の閾値レベルが、正常な患者集団における発現レベルに関して決定される、請求項5に記載の方法。
- 請求項1に記載の方法であって、請求項1に記載の方法に従ってスクリーニングされた前記患者が、自覚症状がなく、かつ、卵巣癌の家族暦、または、卵巣癌を発症する危険性が高いことを示す臨床危険因子を有する、方法。
- 請求項1に記載の方法であって、前記スクリーニング方法は、閉経後の女性患者集団において行われる、方法。
- 前記身体試料が血液試料または血清試料である、請求項1に記載の方法。
- 前記第一および第二のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルが、抗体を用いて、タンパク質レベルで検出される、請求項1に記載の方法。
- 前記第一および第二のバイオマーカータンパク質またはバイオマーカータンパク質パネルが、ELISA形式または多重ビーズベースの免疫学的検定を用いて検出される、請求項10に記載の方法。
- 前記第一および第二のバイオマーカーまたはバイオマーカーパネルが、RT−PCRを用いて、核酸レベルで検出される、請求項1に記載の方法。
- 前記バイオマーカーが、HE4、CA125、グリコデリン、MMP−7、Muc−1、PAI−1、CTHRC1、インヒビンA、PLAU−R、プロラクチン、KLK−10、KLK−6、SLPIおよびα−1アンチトリプシンからなる群より選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記バイオマーカーが、CA125、HE4、グリコデリン、MMP−7、SLPI、PLAU−R、Muc−1、インヒビンAおよびPAI−1からなる群より選択される、請求項13に記載の方法。
- 前記第一のアッセイ段階の感度が少なくとも約85%であり、該第一のアッセイ段階の特異性が少なくとも約75%である、請求項1に記載の方法。
- 前記第二のアッセイ段階の感度が少なくとも約80%であり、該第二のアッセイ段階の特異性が少なくとも約85%である、請求項1に記載の方法。
- 前記第一のアッセイ段階および前記第二のアッセイ段階の組み合わせ感度が少なくとも約70%であり、該第一のアッセイ段階および該第二のアッセイ段階の組み合わせ特異性が少なくとも約95%である、請求項1に記載の方法。
- 前記第一のアッセイ段階および前記第二のアッセイ段階を含む組み合わせスクリーニング方法の負の予測価(NPV)が、少なくとも約99%である、請求項1に記載の方法。
- PPVが少なくとも約8%である、請求項1に記載の方法。
- 前記第一のアッセイ段階および前記第二のアッセイ段階を含む組み合わせスクリーニング試験が、少なくとも約90%の感度と、少なくとも約98%の特異性と、少なくとも約99.9%のNPVと、少なくとも約10%のPPVとを有する、請求項1に記載の方法。
- 前記第一のバイオマーカーがHE4であり、前記第二のバイオマーカーが、CA125、グリコデリン、Muc−1、PAI−1およびPLAU−Rを含むパネル、CA125およびPAI−1を含むパネル、CA125、グリコデリン、PAI−1およびMMP−7を含むパネル、CA125、グリコデリン、PAI−1およびPLAU−Rを含むパネル、CA125、グリコデリン、PAI−1およびPLAU−Rを含むパネル、グリコデリン、Muc−1、PLAU−RおよびインヒビンAを含むパネル、CA125、Muc−1、グリコデリン、PAI−1およびPLAU−Rを含むパネル、ならびにCA125、MMP−7、グリコデリンおよびPLAU−Rを含むパネルからなる群より選択される、請求項1に記載の方法。
- 前記スクリーニング方法が、自動、半自動または手動の様式で行われる、請求項1に記載の方法。
- 前記第一のアッセイ段階および前記第二のアッセイ段階が、単一の試験または別個の試験として行われ、該第一のアッセイ段階が第一の試験を包含し、該第二のアッセイ段階が第二の試験を包含する、請求項1に記載の方法。
- 卵巣癌を有する可能性の高い患者を同定するためのスクリーニング方法であって、該方法は、以下:
a)身体試料における複数のバイオマーカーの発現を検出する工程;および
b)数学的モデルを該バイオマーカーの発現レベルのデータに適用して、卵巣癌を有する可能性の高い患者を同定する工程
を包含する、方法。 - 前記数学的モデルが、最良のバイオマーカーを選択するためのロジスティック段階回帰モデル、およびバイオマーカーについてのベストカットオフポイントを選択するために使用される受信者動作特性(ROC)曲線からなる群より選択される、請求項24に記載の方法。
- 早期段階の卵巣癌を検出するために使用される、請求項24に記載の方法。
- スクリーニングされる前記患者は自覚症状がなく、かつ、卵巣癌の家族暦、または、卵巣癌を発症する危険性が高いことを示す臨床危険因子を有する、請求項24に記載の方法。
- 前記スクリーニング方法が、閉経後の女性患者集団において行われる、請求項24に記載の方法。
- 前記身体試料が血液試料または血清試料である、請求項24に記載の方法。
- 前記複数のバイオマーカーが、HE4、CA125、グリコデリン、MMP−7、Muc−1、PAI−1、CTHRC1、インヒビンA、PLAU−R、プロラクチン、KLK−10、KLK−6、SLPI、およびα−1アンチトリプシンからなる群より選択される、請求項24に記載の方法。
- 前記複数のバイオマーカーが、HE4、CA125およびグリコリデンからなる群より選択される、請求項30に記載の方法。
- 卵巣癌を有する可能性の高い患者を同定するための、1段階のスクリーニング方法であって、該方法は、身体試料において、HE4、CA125、グリコデリン、MMP−7、Muc−1、PAI−1、CTHRC1、インヒビンA、PLAU−R、プロラクチン、KLK−10、KLK−6、SLPIおよびα−1アンチトリプシン、グリコデリン、HE4およびCA125からなる群より選択される少なくとも3つのバイオマーカーの発現を検出する工程を包含し、該バイオマーカーのうちの少なくとも1つの過剰発現は、該患者が卵巣癌を有する可能性が高いことを示す、方法。
- HE4、グリコリデンおよびCA125からなる群より選択される少なくとも1つのバイオマーカーの過剰発現は、前記患者が卵巣癌を有する可能性が高いことを示す、請求項32に記載の方法。
- 複数の抗体を含むキットであって、該抗体の各々は、卵巣癌において選択的に過剰発現される別個のバイオマーカータンパク質に特異的に結合し、該バイオマーカータンパク質は、HE4、CA125、グリコデリン、MMP−7、Muc−1、PAI−1、CTHRC1、インヒビンA、PLAU−R、プロラクチン、KLK−10、KLK−6、SLPIおよびα−1アンチトリプシンからなる群より選択される、キット。
- 前記バイオマーカータンパク質が、CA125、HE4、グリコデリン、MMP−7、SLPI、PLAU−R、Muc−1、インヒビンAおよびPAI−1からなる群より選択される、請求34に記載のキット。
- 前記バイオマーカータンパク質に結合する抗体を検出するための化学物質をさらに含む、請求項34に記載のキット。
- 請求項1に記載のスクリーニング方法を単一の試験として行うためのキットであって、該試験は、前記第一のアッセイ段階および前記第二のアッセイ段階を含む、キット。
- 請求項1に記載の方法の前記第一のアッセイ段階および前記第二のアッセイ段階を行うための、キット。
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---|---|---|---|
US76276006P | 2006-01-27 | 2006-01-27 | |
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Publication Number | Publication Date |
---|---|
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Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2008552607A Pending JP2009524438A (ja) | 2006-01-27 | 2007-01-29 | 卵巣癌を有する可能性の高い患者を同定するための方法およびそのための組成物 |
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---|---|
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Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2010520768A (ja) * | 2007-03-09 | 2010-06-17 | トライパス イメージング インコーポレイテッド | He4モノクローナル抗体およびそれらの使用方法 |
KR20140024860A (ko) * | 2011-02-24 | 2014-03-03 | 버밀리언, 인코포레이티드 | 난소암에 대한 바이오마커 패널,진단 방법 및 시험 키트 |
JP2014516552A (ja) * | 2011-06-02 | 2014-07-17 | アルマック ダイアグノスティックス リミテッド | 癌の分子的診断検査 |
US10280468B2 (en) | 2014-02-07 | 2019-05-07 | Almac Diagnostics Limited | Molecular diagnostic test for predicting response to anti-angiogenic drugs and prognosis of cancer |
Families Citing this family (76)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7741019B2 (en) * | 2000-11-01 | 2010-06-22 | Mount Sinai Hospital | Detection of ovarian cancer |
GB0307403D0 (en) | 2003-03-31 | 2003-05-07 | Medical Res Council | Selection by compartmentalised screening |
GB0307428D0 (en) | 2003-03-31 | 2003-05-07 | Medical Res Council | Compartmentalised combinatorial chemistry |
US20060078893A1 (en) | 2004-10-12 | 2006-04-13 | Medical Research Council | Compartmentalised combinatorial chemistry by microfluidic control |
US20050221339A1 (en) | 2004-03-31 | 2005-10-06 | Medical Research Council Harvard University | Compartmentalised screening by microfluidic control |
US7968287B2 (en) | 2004-10-08 | 2011-06-28 | Medical Research Council Harvard University | In vitro evolution in microfluidic systems |
US20100137163A1 (en) | 2006-01-11 | 2010-06-03 | Link Darren R | Microfluidic Devices and Methods of Use in The Formation and Control of Nanoreactors |
JP2009526519A (ja) * | 2006-01-17 | 2009-07-23 | セルーメン、インコーポレイテッド | 生物学的システム応答の予測方法 |
WO2007133710A2 (en) | 2006-05-11 | 2007-11-22 | Raindance Technologies, Inc. | Microfluidic devices and methods of use thereof |
US9562837B2 (en) | 2006-05-11 | 2017-02-07 | Raindance Technologies, Inc. | Systems for handling microfludic droplets |
CN101484806A (zh) | 2006-05-17 | 2009-07-15 | 协乐民公司 | 一种对组织进行自动分析的方法 |
CN103424541B (zh) | 2006-05-18 | 2018-01-30 | 分子压型学会股份有限公司 | 确定针对病状的个性化医疗介入的系统和方法 |
US8768629B2 (en) | 2009-02-11 | 2014-07-01 | Caris Mpi, Inc. | Molecular profiling of tumors |
WO2007139895A2 (en) * | 2006-05-24 | 2007-12-06 | Cellumen, Inc. | Method for modeling a disease |
WO2008021123A1 (en) | 2006-08-07 | 2008-02-21 | President And Fellows Of Harvard College | Fluorocarbon emulsion stabilizing surfactants |
EP2095119A2 (en) * | 2006-11-10 | 2009-09-02 | Cellumen, Inc. | Protein-protein interaction biosensors and methods of use thereof |
US8772046B2 (en) | 2007-02-06 | 2014-07-08 | Brandeis University | Manipulation of fluids and reactions in microfluidic systems |
WO2008130623A1 (en) | 2007-04-19 | 2008-10-30 | Brandeis University | Manipulation of fluids, fluid components and reactions in microfluidic systems |
WO2009032974A2 (en) * | 2007-09-06 | 2009-03-12 | Tripath Imaging, Inc. | Nucleic acid-based methods for the detection of ovarian cancer |
US20090130195A1 (en) | 2007-10-17 | 2009-05-21 | Mildred Acevedo-Duncan | Prostate carcinogenesis predictor |
EP2088204A1 (en) * | 2008-02-05 | 2009-08-12 | Adnagen AG | Method and kit for diagnosing or controlling the treatment of ovarian cancer |
EP2315629B1 (en) | 2008-07-18 | 2021-12-15 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Droplet libraries |
US10359425B2 (en) | 2008-09-09 | 2019-07-23 | Somalogic, Inc. | Lung cancer biomarkers and uses thereof |
WO2010042525A1 (en) * | 2008-10-06 | 2010-04-15 | Somalogic, Inc. | Ovarian cancer biomarkers and uses thereof |
US20100221752A2 (en) * | 2008-10-06 | 2010-09-02 | Somalogic, Inc. | Ovarian Cancer Biomarkers and Uses Thereof |
CA2750155A1 (en) * | 2008-12-30 | 2010-07-08 | Centocor Ortho Biotech Inc. | Serum markers predicting clinical response to anti-tnf.alpha. antibodiesin patients with ankylosing spondylitis |
US20100227335A1 (en) * | 2009-03-05 | 2010-09-09 | Becton, Dickinson And Company | Matrix metalloproteinase-7 (mmp-7) monoclonal antibodies and methods for their use in the detection of ovarian cancer |
CA2753713A1 (en) | 2009-03-06 | 2010-09-10 | Tripath Imaging, Inc | Glycodelin monoclonal antibodies and methods for their use in the detection of ovarian cancer |
EP2411148B1 (en) | 2009-03-23 | 2018-02-21 | Raindance Technologies, Inc. | Manipulation of microfluidic droplets |
EP2486409A1 (en) | 2009-10-09 | 2012-08-15 | Universite De Strasbourg | Labelled silica-based nanomaterial with enhanced properties and uses thereof |
US10837883B2 (en) | 2009-12-23 | 2020-11-17 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Microfluidic systems and methods for reducing the exchange of molecules between droplets |
WO2011100453A2 (en) * | 2010-02-10 | 2011-08-18 | Maine Medical Center | Compositions and methods for the treatment of cardiac and vascular disease |
US9366632B2 (en) | 2010-02-12 | 2016-06-14 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
US8535889B2 (en) | 2010-02-12 | 2013-09-17 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
US9399797B2 (en) | 2010-02-12 | 2016-07-26 | Raindance Technologies, Inc. | Digital analyte analysis |
US10351905B2 (en) | 2010-02-12 | 2019-07-16 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analyte analysis |
SG10201508656VA (en) | 2010-07-09 | 2015-11-27 | Somalogic Inc | Lung cancer biomarkers and uses thereof |
AU2011289284B2 (en) | 2010-08-13 | 2015-04-09 | Somalogic Operating Co., Inc. | Pancreatic cancer biomarkers and uses thereof |
EP3447155A1 (en) | 2010-09-30 | 2019-02-27 | Raindance Technologies, Inc. | Sandwich assays in droplets |
AU2011352167A1 (en) * | 2010-12-28 | 2013-07-11 | Caris Mpi, Inc. | Molecular profiling for cancer |
EP3859011A1 (en) | 2011-02-11 | 2021-08-04 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Methods for forming mixed droplets |
EP2675911B1 (en) | 2011-02-17 | 2020-11-04 | Fujirebio Diagnostics, Inc. | Compositions and methods of use for determination of he4a |
WO2012112804A1 (en) | 2011-02-18 | 2012-08-23 | Raindance Technoligies, Inc. | Compositions and methods for molecular labeling |
ES2739623T3 (es) | 2011-03-17 | 2020-02-03 | Cernostics Inc | Sistemas y composiciones para diagnosticar el esófago de Barrett y métodos para usarlos |
CN102735840B (zh) * | 2011-04-13 | 2014-06-04 | 中国医学科学院肿瘤研究所 | 用于诊断或筛查卵巢癌的试剂 |
WO2012142330A1 (en) * | 2011-04-15 | 2012-10-18 | Brown University | Micro rnas as diagnostic biomarkers and therapeutics for ovarian cancer and metastatic tumors that disseminate within the peritoneal cavity |
US8841071B2 (en) | 2011-06-02 | 2014-09-23 | Raindance Technologies, Inc. | Sample multiplexing |
EP3216872B1 (en) | 2011-06-02 | 2020-04-01 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Enzyme quantification |
WO2012174569A2 (en) * | 2011-06-17 | 2012-12-20 | The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas | New markers for early diagnosis of ovarian cancer, monitoring during therapy, and new therapy options during and after chematherapy |
US8658430B2 (en) | 2011-07-20 | 2014-02-25 | Raindance Technologies, Inc. | Manipulating droplet size |
WO2013120089A1 (en) | 2012-02-10 | 2013-08-15 | Raindance Technologies, Inc. | Molecular diagnostic screening assay |
WO2013165748A1 (en) | 2012-04-30 | 2013-11-07 | Raindance Technologies, Inc | Digital analyte analysis |
CN103575902B (zh) * | 2012-08-03 | 2015-07-29 | 河南生生医疗器械有限公司 | 一种时间分辨荧光法四项综合检测卵巢癌试剂盒及其应用 |
AU2013353839A1 (en) | 2012-12-03 | 2015-06-18 | Almac Diagnostics Limited | Molecular diagnostic test for cancer |
ES2756098T3 (es) * | 2013-03-27 | 2020-04-27 | Theranos Ip Co Llc | Métodos, dispositivos y sistemas para el análisis de muestras |
EP2986762B1 (en) | 2013-04-19 | 2019-11-06 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analyte analysis |
CN105745543B (zh) * | 2013-09-18 | 2018-02-02 | 阿德莱德研究及创新控股有限公司 | 卵巢癌的自身抗体生物标志物 |
US11901041B2 (en) | 2013-10-04 | 2024-02-13 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Digital analysis of nucleic acid modification |
US11221327B2 (en) * | 2013-10-10 | 2022-01-11 | Mcmaster University | Method for diagnosing and monitoring inflammatory disease progression |
CN103525941A (zh) * | 2013-10-29 | 2014-01-22 | 上海市奉贤区中心医院 | Cthrc1基因在制备检测/治疗宫颈癌药物中的应用 |
US9944977B2 (en) | 2013-12-12 | 2018-04-17 | Raindance Technologies, Inc. | Distinguishing rare variations in a nucleic acid sequence from a sample |
WO2015103367A1 (en) | 2013-12-31 | 2015-07-09 | Raindance Technologies, Inc. | System and method for detection of rna species |
CN106290892A (zh) * | 2015-06-26 | 2017-01-04 | 上海市肿瘤研究所 | Cthrc1在肝硬化诊断和治疗中的应用 |
US10647981B1 (en) | 2015-09-08 | 2020-05-12 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Nucleic acid library generation methods and compositions |
AU2016359685B2 (en) | 2015-11-25 | 2022-12-22 | Cernostics, Inc. | Methods of predicting progression of Barrett's esophagus |
WO2017182985A1 (en) * | 2016-04-20 | 2017-10-26 | Morphotek, Inc. | Prognosis of serous ovarian cancer using biomarkers |
GB2566221B (en) * | 2016-06-24 | 2021-08-04 | Univ South Carolina | Inhibin as targetable regulators of angiogenesis |
WO2018009811A1 (en) * | 2016-07-08 | 2018-01-11 | Genentech, Inc. | Use of human epididymis protein 4 (he4) for assessing responsiveness of muc 16-positive cancer treatment |
US20190180846A1 (en) * | 2016-08-10 | 2019-06-13 | Memed Diagnostics Ltd. | System and method for analysis of biological data |
CN106520924A (zh) * | 2016-10-14 | 2017-03-22 | 浙江大学 | 一种用于检测卵巢癌的引物组及检测方法 |
US10998178B2 (en) | 2017-08-28 | 2021-05-04 | Purdue Research Foundation | Systems and methods for sample analysis using swabs |
CN109480771B (zh) * | 2018-10-17 | 2021-09-07 | 江西惠肽生物科技有限公司 | 一种卵巢肿块良恶的确定方法及确定装置 |
CN112946290A (zh) * | 2019-12-10 | 2021-06-11 | 上海交通大学医学院附属仁济医院 | 细胞外基质底物反应蛋白1在制备诊断和预测卵巢癌试剂中的应用 |
KR102316178B1 (ko) * | 2020-04-14 | 2021-10-22 | 서울대학교병원 | 난소암 환자의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물 |
CN111693703B (zh) * | 2020-07-17 | 2023-07-21 | 北京信诺卫康科技有限公司 | Spondin 1和HE4联合用作早期卵巢癌生物标志物以及试剂盒 |
KR102472050B1 (ko) * | 2022-03-29 | 2022-11-30 | 주식회사 아이엠비디엑스 | 환자 맞춤형 패널을 이용한 암의 재발을 예측하는 방법 |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2005501549A (ja) * | 2001-08-29 | 2005-01-20 | パシフィック ノースウエスト リサーチ インスティテュート | 癌腫の診断 |
WO2005016126A2 (en) * | 2003-08-15 | 2005-02-24 | University Of Pittsburgh-Of The Commonwealth System Of Higher Education | Multifactorial assay for cancer detection |
JP2009522578A (ja) * | 2006-01-04 | 2009-06-11 | フジレビオ アメリカ、インク. | 卵巣癌を判定するためのhe4及び他の生化学マーカーの使用 |
Family Cites Families (95)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
NZ201918A (en) | 1981-09-18 | 1987-04-30 | Genentech Inc | N-terminal methionyl analogues of bovine growth hormone |
CA1247080A (en) | 1983-03-08 | 1988-12-20 | Commonwealth Serum Laboratories Commission | Antigenically active amino acid sequences |
US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US4873192A (en) | 1987-02-17 | 1989-10-10 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Process for site specific mutagenesis without phenotypic selection |
US4921790A (en) * | 1987-04-24 | 1990-05-01 | Research Corporation | Tumor specific assay for CA125 ovarian cancer antigen |
US4843155A (en) | 1987-11-19 | 1989-06-27 | Piotr Chomczynski | Product and process for isolating RNA |
US5223409A (en) | 1988-09-02 | 1993-06-29 | Protein Engineering Corp. | Directed evolution of novel binding proteins |
ATE151110T1 (de) | 1988-09-02 | 1997-04-15 | Protein Eng Corp | Herstellung und auswahl von rekombinantproteinen mit verschiedenen bindestellen |
US5750373A (en) | 1990-12-03 | 1998-05-12 | Genentech, Inc. | Enrichment method for variant proteins having altered binding properties, M13 phagemids, and growth hormone variants |
US6040138A (en) | 1995-09-15 | 2000-03-21 | Affymetrix, Inc. | Expression monitoring by hybridization to high density oligonucleotide arrays |
US5744101A (en) | 1989-06-07 | 1998-04-28 | Affymax Technologies N.V. | Photolabile nucleoside protecting groups |
US5143854A (en) | 1989-06-07 | 1992-09-01 | Affymax Technologies N.V. | Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof |
US5800992A (en) | 1989-06-07 | 1998-09-01 | Fodor; Stephen P.A. | Method of detecting nucleic acids |
US5427908A (en) | 1990-05-01 | 1995-06-27 | Affymax Technologies N.V. | Recombinant library screening methods |
GB9015198D0 (en) | 1990-07-10 | 1990-08-29 | Brien Caroline J O | Binding substance |
WO1992020791A1 (en) | 1990-07-10 | 1992-11-26 | Cambridge Antibody Technology Limited | Methods for producing members of specific binding pairs |
CA2105300C (en) | 1991-03-01 | 2008-12-23 | Robert C. Ladner | Process for the development of binding mini-proteins |
JP3672306B2 (ja) | 1991-04-10 | 2005-07-20 | ザ スクリップス リサーチ インスティテュート | ファージミドを使用するヘテロ二量体受容体ライブラリー |
DE4122599C2 (de) | 1991-07-08 | 1993-11-11 | Deutsches Krebsforsch | Phagemid zum Screenen von Antikörpern |
CA2118806A1 (en) | 1991-09-18 | 1993-04-01 | William J. Dower | Method of synthesizing diverse collections of oligomers |
DE69233087T2 (de) | 1991-11-22 | 2003-12-24 | Affymetrix Inc N D Ges D Staat | Verfahren zur Herstellung von Polymerarrays |
US5384261A (en) | 1991-11-22 | 1995-01-24 | Affymax Technologies N.V. | Very large scale immobilized polymer synthesis using mechanically directed flow paths |
US5976818A (en) * | 1991-12-16 | 1999-11-02 | The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas | Monoclonal antibodies which identify the glycoprotein carrying the CA 125 epitope |
US5556752A (en) | 1994-10-24 | 1996-09-17 | Affymetrix, Inc. | Surface-bound, unimolecular, double-stranded DNA |
US5545531A (en) | 1995-06-07 | 1996-08-13 | Affymax Technologies N.V. | Methods for making a device for concurrently processing multiple biological chip assays |
US5856174A (en) | 1995-06-29 | 1999-01-05 | Affymetrix, Inc. | Integrated nucleic acid diagnostic device |
US5854033A (en) | 1995-11-21 | 1998-12-29 | Yale University | Rolling circle replication reporter systems |
EP0880598A4 (en) | 1996-01-23 | 2005-02-23 | Affymetrix Inc | RAPID EVALUATION OF NUCLEIC ACID ABUNDANCE DIFFERENCE, WITH A HIGH-DENSITY OLIGONUCLEOTIDE SYSTEM |
EP1023464B1 (en) | 1997-10-14 | 2017-07-26 | Luminex Corporation | Precision fluorescently dyed particles and methods of making and using same |
US6033860A (en) | 1997-10-31 | 2000-03-07 | Affymetrix, Inc. | Expression profiles in adult and fetal organs |
US6268222B1 (en) | 1998-01-22 | 2001-07-31 | Luminex Corporation | Microparticles attached to nanoparticles labeled with flourescent dye |
US6020135A (en) | 1998-03-27 | 2000-02-01 | Affymetrix, Inc. | P53-regulated genes |
US6783961B1 (en) * | 1999-02-26 | 2004-08-31 | Genset S.A. | Expressed sequence tags and encoded human proteins |
WO2002083898A1 (en) * | 2001-04-18 | 2002-10-24 | Genset S.A. | Full-length human cdnas encoding potentially secreted proteins |
US7223727B2 (en) * | 1998-04-09 | 2007-05-29 | Serono Genetics Institute S.A. | GSSP4 polynucleotides and polypeptides and uses thereof |
CA2331897C (en) | 1998-05-14 | 2008-11-18 | Luminex Corporation | Multi-analyte diagnostic system and computer implemented process for same |
AU3395900A (en) * | 1999-03-12 | 2000-10-04 | Human Genome Sciences, Inc. | Human lung cancer associated gene sequences and polypeptides |
US20020052308A1 (en) * | 1999-03-12 | 2002-05-02 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins and antibodies |
US20020039764A1 (en) * | 1999-03-12 | 2002-04-04 | Rosen Craig A. | Nucleic, acids, proteins, and antibodies |
US20030040617A9 (en) * | 1999-03-12 | 2003-02-27 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins and antibodies |
US20030064072A9 (en) * | 1999-03-12 | 2003-04-03 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins and antibodies |
US20020151681A1 (en) * | 1999-03-12 | 2002-10-17 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins and antibodies |
US20020015970A1 (en) * | 1999-08-11 | 2002-02-07 | Richard Murray | Novel methods of diagnosis of angiogenesis, compositions, and methods of screening for angiogenesis modulators |
US20030152926A1 (en) * | 1999-08-11 | 2003-08-14 | Eos Biotechnology, Inc. | Novel methods of diagnosis of angiogenesis, compositions and methods of screening for angiogenesis modulators |
US20020019330A1 (en) * | 1999-08-11 | 2002-02-14 | Richard Murray | Novel methods of diagnosis of angiogenesis, compositions, and methods of screening for angiogenesis modulators |
US20040009494A1 (en) * | 1999-08-11 | 2004-01-15 | Richard Murray | Novel methods of diagnosis of angiogenesis and other conditions, compositions, and the methods of screening for modulators |
US20020058292A1 (en) * | 2000-12-08 | 2002-05-16 | Dillon Davin C. | Ovarian tumor antigen and methods of use therefor |
WO2001021653A2 (en) * | 1999-09-23 | 2001-03-29 | Corixa Corporation | Ovarian tumor antigen and methods of use therefor |
US20020155468A1 (en) * | 1999-09-23 | 2002-10-24 | Corixa Corporation | Ovarian tumor antigen and methods of use therefor |
US20020086823A1 (en) * | 2000-01-31 | 2002-07-04 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20020061521A1 (en) * | 2000-01-31 | 2002-05-23 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20020094953A1 (en) * | 2000-01-31 | 2002-07-18 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20020077270A1 (en) * | 2000-01-31 | 2002-06-20 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20020168711A1 (en) * | 2000-01-31 | 2002-11-14 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20020090615A1 (en) * | 2000-01-31 | 2002-07-11 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20030171252A9 (en) * | 2000-01-31 | 2003-09-11 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20030092611A9 (en) * | 2000-01-31 | 2003-05-15 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20020090674A1 (en) * | 2000-01-31 | 2002-07-11 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20020086330A1 (en) * | 2000-01-31 | 2002-07-04 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20040101927A9 (en) * | 2000-01-31 | 2004-05-27 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20030125246A9 (en) * | 2000-01-31 | 2003-07-03 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US20040259152A1 (en) * | 2000-02-22 | 2004-12-23 | Richard Murray | Novel methods of diagnosing and screening for modulators of tissue remodeling and treating related diseases |
US6773883B2 (en) * | 2000-07-31 | 2004-08-10 | The Brigham & Women's Hospital, Inc. | Prognostic classification of endometrial cancer |
US20020045230A1 (en) * | 2000-08-14 | 2002-04-18 | Rosen Craig A. | Nucleic acids, proteins, and antibodies |
US6812339B1 (en) * | 2000-09-08 | 2004-11-02 | Applera Corporation | Polymorphisms in known genes associated with human disease, methods of detection and uses thereof |
US20070037165A1 (en) * | 2000-09-08 | 2007-02-15 | Applera Corporation | Polymorphisms in known genes associated with human disease, methods of detection and uses thereof |
WO2002023201A2 (en) * | 2000-09-13 | 2002-03-21 | Zymogenetics, Inc. | Use of human phermone polypeptides |
AU2002241720A1 (en) * | 2000-11-08 | 2002-06-18 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of ovarian cancer |
AU2002258518A1 (en) * | 2001-03-14 | 2002-09-24 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Nucleic acid molecules and proteins for the identification, assessment, prevention, and therapy of ovarian cancer |
US7309760B2 (en) * | 2001-04-17 | 2007-12-18 | The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas | Repeat sequences of the CA125 gene and their use for diagnostic and therapeutic interventions |
MXPA03009510A (es) * | 2001-04-17 | 2005-04-29 | Univ Arkansas | Secuencias de repeticion del gen ca125 y su uso para intervenciones de diagnosticos y terapeuticas. |
AU2002344326A1 (en) * | 2001-05-11 | 2002-11-25 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Nucleic acid sequence encoding ovarian antigen, ca125, and uses thereof |
US7205142B2 (en) * | 2001-05-11 | 2007-04-17 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Nucleic acid sequence encoding ovarian antigen, CA125, and uses thereof |
EP1390497A2 (en) * | 2001-05-25 | 2004-02-25 | Genset | Human cdnas and proteins and uses thereof |
US20070015144A9 (en) * | 2001-05-25 | 2007-01-18 | Genset, S.A. | Human cDNAs and proteins and uses thereof |
US7189507B2 (en) * | 2001-06-18 | 2007-03-13 | Pdl Biopharma, Inc. | Methods of diagnosis of ovarian cancer, compositions and methods of screening for modulators of ovarian cancer |
WO2003004989A2 (en) * | 2001-06-21 | 2003-01-16 | Millennium Pharmaceuticals, Inc. | Compositions, kits, and methods for identification, assessment, prevention, and therapy of breast cancer |
US20040076955A1 (en) * | 2001-07-03 | 2004-04-22 | Eos Biotechnology, Inc. | Methods of diagnosis of bladder cancer, compositions and methods of screening for modulators of bladder cancer |
US20040033495A1 (en) * | 2001-08-03 | 2004-02-19 | Eos Biotechnology, Inc. | Methods of diagnosis of angiogenesis, compositions and methods of screening for angiogenesis modulators |
US20030124579A1 (en) * | 2001-09-05 | 2003-07-03 | Eos Biotechnology, Inc. | Methods of diagnosis of ovarian cancer, compositions and methods of screening for modulators of ovarian cancer |
US20070042360A1 (en) * | 2001-09-17 | 2007-02-22 | Eos Biotechnology, Inc. | Methods of diagnosis of cancer, compositions and methods of screening for modulators of cancer |
US20030232350A1 (en) * | 2001-11-13 | 2003-12-18 | Eos Biotechnology, Inc. | Methods of diagnosis of cancer, compositions and methods of screening for modulators of cancer |
EP1540010B8 (en) * | 2002-08-06 | 2010-07-14 | The Johns Hopkins University | Use of biomarkers for detecting ovarian cancer |
US20060183120A1 (en) * | 2002-10-04 | 2006-08-17 | Teh Bin T | Molecular sub-classification of kidney tumors and the discovery of new diagnostic markers |
US20050181375A1 (en) * | 2003-01-10 | 2005-08-18 | Natasha Aziz | Novel methods of diagnosis of metastatic cancer, compositions and methods of screening for modulators of metastatic cancer |
US20060134120A1 (en) * | 2003-02-26 | 2006-06-22 | Mount Sinai Hospital | Multiple marker assay for detection of ovarian cancer |
US20050208500A1 (en) * | 2003-03-04 | 2005-09-22 | Erlander Mark G | Signatures of ER status in breast cancer |
US20050255114A1 (en) * | 2003-04-07 | 2005-11-17 | Nuvelo, Inc. | Methods and diagnosis for the treatment of preeclampsia |
KR20060013425A (ko) * | 2003-05-29 | 2006-02-09 | 밀레니엄 파머슈티컬스 인코퍼레이티드 | 유방암의 확인, 평가, 예방 및 요법에 대한 조성물, 키트및 방법 |
FR2855832B1 (fr) * | 2003-06-03 | 2007-09-14 | Biomerieux Sa | Procede de diagnostic et/ou de pronostic d'un syndrome septique |
US20070037204A1 (en) * | 2003-08-08 | 2007-02-15 | Hiroyuki ABURANTAI | Gene overexpressed in cancer |
US20070053896A1 (en) * | 2003-09-05 | 2007-03-08 | Royal Women's Hospital | Diagnostic marker for ovarian cancer |
CN1964986A (zh) * | 2003-10-07 | 2007-05-16 | 千年药品公司 | 用于鉴定、评价、预防和治疗卵巢癌的核酸分子和蛋白质 |
EP1723428A2 (en) * | 2004-02-19 | 2006-11-22 | Yale University Corporation | Identification of cancer protein biomarkers using proteomic techniques |
MX2007000383A (es) * | 2004-07-09 | 2007-03-12 | Tripath Imaging Inc | Metodos y composiciones para la deteccion de enfermedad ovarica. |
-
2007
- 2007-01-29 BR BRPI0707249-0A patent/BRPI0707249A2/pt not_active IP Right Cessation
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- 2007-01-29 KR KR1020087021027A patent/KR20080094803A/ko not_active Application Discontinuation
-
2008
- 2008-10-30 US US12/261,330 patent/US20090075307A1/en not_active Abandoned
- 2008-10-30 US US12/261,205 patent/US20090068690A1/en not_active Abandoned
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2005501549A (ja) * | 2001-08-29 | 2005-01-20 | パシフィック ノースウエスト リサーチ インスティテュート | 癌腫の診断 |
WO2005016126A2 (en) * | 2003-08-15 | 2005-02-24 | University Of Pittsburgh-Of The Commonwealth System Of Higher Education | Multifactorial assay for cancer detection |
JP2009522578A (ja) * | 2006-01-04 | 2009-06-11 | フジレビオ アメリカ、インク. | 卵巣癌を判定するためのhe4及び他の生化学マーカーの使用 |
Non-Patent Citations (8)
Title |
---|
JPN5008024014; BAST R C: CANCER TREATMENT AND RESEARCH V107, 2002, P61-97, NIJHOFF * |
JPN6012016892; Int. J. Gynecol. Cancer Vol.15, Suppl.3, 2005, p.274-281 * |
JPN6012016894; Cancer Res. Vol.60, 2000, p.6281-6287 * |
JPN6012016895; Cancer Res. Vol.61, 2001, p.3869-3876 * |
JPN6012016898; Gynecol. Oncol. Vol.99, 2005, p.267-277 * |
JPN6012016901; Clin. Cancer Res. Vol.10, 2004, p.3291-3300 * |
JPN6012067609; Biometrics Vol.44, 1988, p.837-845 * |
JPN6012067612; Stat. Evalut. Med. Test. Classifi. Predict. , 2003, p.151-164 * |
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2010520768A (ja) * | 2007-03-09 | 2010-06-17 | トライパス イメージング インコーポレイテッド | He4モノクローナル抗体およびそれらの使用方法 |
KR20140024860A (ko) * | 2011-02-24 | 2014-03-03 | 버밀리언, 인코포레이티드 | 난소암에 대한 바이오마커 패널,진단 방법 및 시험 키트 |
JP2014516552A (ja) * | 2011-06-02 | 2014-07-17 | アルマック ダイアグノスティックス リミテッド | 癌の分子的診断検査 |
US10260097B2 (en) | 2011-06-02 | 2019-04-16 | Almac Diagnostics Limited | Method of using a gene expression profile to determine cancer responsiveness to an anti-angiogenic agent |
US10280468B2 (en) | 2014-02-07 | 2019-05-07 | Almac Diagnostics Limited | Molecular diagnostic test for predicting response to anti-angiogenic drugs and prognosis of cancer |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
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