KR102316178B1 - 난소암 환자의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물에 관한 것으로, 보다 상세하게는 NFKB mRNA 또는 그 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 포함함으로써 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율을 보다 더 정확하고 간편하게 예측할 수 있다.
Description
본 발명은 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물, 및 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측을 위한 정보제공방법에 관한 것이다.
난소암은 난소에 생기는 악성종양으로, 수술 시 육안 소견과 조직검사 결과를 종합적으로 판단하여 암세포가 퍼진 정도에 따라 치료방침을 결정하게 된다. 일반적으로 난소암의 경우 3기 이상으로 진행된 경우가 대부분이기 때문에 수술 후 항암치료를 시행하게 된다. 항암치료에도 불구하고 60% 이상의 높은 재발율을 보인다.
환자 개개인의 암 재발율과 생존율을 미리 예측할 수 있다면 항암치료 시 표적치료제를 추가하거나 항암치료의 시행 횟수를 증가시키는 등 적절한 방법을 적용할 수 있고, 생존 예후를 향상시킬 수 있을 것이다.
본 발명은 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물을 제공하는 것을 목적으로 한다.
본 발명은 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측을 위한 정보제공방법을 제공하는 것을 목적으로 한다.
1. NFKB(nuclear factor-κB) mRNA 또는 그 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 포함하는 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물.
2. 위 1에 있어서, AAT(α1-antitrypsin), PMVK(phosphomevalonate kinase), VAP1(vascular adhesion protein 1), FABP4(fatty acid-binding protein 4) 및 PF4(platelet factor 4) 중 적어도 하나의 mRNA 또는 그 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 더 포함하는 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물.
3. 위 1 또는 위 2에 있어서, 상기 제제는 프라이머, 프로브, 항체, 압타머, DNA, RNA, 단백질 및 폴리펩티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나인, 조성물.
4. 위 1 내지 3 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 키트.
5. 피검체로부터 분리된 시료에서 NFKB 발현량을 측정하는 단계;를 포함하는 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측을 위한 정보제공방법.
6. 위 5에 있어서, 상기 측정된 NFKB 발현량이 대조군에서의 발현량 보다 높으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계:를 더 포함하는, 정보제공방법.
7. 위 5에 있어서, 상기 피검체로부터 분리된 시료에서 AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 중 적어도 하나의 발현량을 측정하는 단계;를 더 포함하는, 정보제공방법.
8. 위 7에 있어서, 상기 측정된 AAT 또는 PMVK의 발현량이 대조군에서의 발현량 보다 높으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계:를 더 포함하는, 정보제공방법.
9. 위 7에 있어서, 상기 측정된 VAP1, FABP4 또는 PF4의 발현량이 대조군에서의 발현량 보다 낮으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계:를 더 포함하는, 정보제공방법.
10. 위 5에 있어서, 상기 시료는 조직, 세포, 전혈, 혈청, 혈장, 타액, 객담, 뇌척수액 및 뇨로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나인, 정보제공방법.
11. 위 5에 있어서, 상기 피검체로부터 분리된 시료에서 BRCA1 유전자 및 BRCA2 유전자의 돌연변이(mutation)를 검출하는 단계;를 더 포함하는, 정보제공방법.
12. 위 11에 있어서, 상기 피검체로부터 상기 BRCA1 유전자 및 BRCA2 유전자 중 적어도 하나에서 돌연변이가 검출되면 상기 돌연변이가 검출되지 않은 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계:를 더 포함하는, 정보제공방법.
13. 위 5에 있어서, 상기 피검체로부터 1차 종양감축수술 (primary debulking surgery, PDS) 및 선행항암화학요법 시행 후 간격 종양감축수술 (interval debulking surgery, IDS) 중 적어도 하나 이후 잔존 종양의 직경을 측정하는 단계;를 더 포함하는, 정보제공방법.
14. 위 13에 있어서, 상기 측정된 잔존 종양의 직경이 대조군의 잔존 종양 직경 대비 더 작으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계:를 더 포함하는, 정보제공방법.
본 발명 조성물, 키트 또는 정보제공방법을 이용하면 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율을 보다 더 정확하고 간편하게 예측할 수 있다.
도 1은 6종의 단백질 마커 각각에 대한 항체로 난소암 환자의 조직을 면역조직화학 염색한 후 나타나는 고발현과 저발현의 예시이다.
도 2는 6 종의 단백질 마커 각각의 상대적 발현량과 재발율(무진행생존 기간)간의 상관관계를 나타낸다.
도 2는 6 종의 단백질 마커 각각의 상대적 발현량과 재발율(무진행생존 기간)간의 상관관계를 나타낸다.
이하, 본 발명을 상세하게 설명한다.
본 발명은 난소암 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물을 제공한다.
난소암 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물은 NFKB의 mRNA 또는 그 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 포함할 수 있다.
난소암 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물은 AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 중 적어도 하나의 mRNA 또는 그 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 더 포함할 수 있다.
NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 mRNA의 서열은 NCBI genbank 등에 공지된 서열을 활용할 수 있다.
NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 단백질의 서열은 NCBI genbank 등에 공지된 서열을 활용할 수 있다.
예를 들어, NFKB단백질 서열은 서열번호 1일 수 있다. 서열번호 1: MESCYNPGLDGIIEYDDFKLNSSIVEPKEPAPETADGPYLVIVEQPKQRGFRFRYGCEGPSHGGLPGASSEKGRKTYPTVKICNYEGPAKIEVDLVTHSDPPRAHAHSLVGKQCSELGICAVSVGPKDMTAQFNNLGVLHVTKKNMMGTMIQKLQRQRLRSRPQGLTEAEQRELEQEAKELKKVMDLSIVRLRFSAFLRASDGSFSLPLKPVISQPIHDSKSPGASNLKISRMDKTAGSVRGGDEVYLLCDKVQKDDIEVRFYEDDENGWQAFGDFSPTDVHKQYAIVFRTPPYHKMKIERPVTVFLQLKRKRGGDVSDSKQFTYYPLVEDKEEVQRKRRKALPTFSQPFGGGSHMGGGSGGAAGGYGGAGGGGSLGFFPSSLAYSPYQSGAGPMGCYPGGGGGAQMAATVPSRDSGEEAAEPSAPSRTPQCEPQAPEMLQRAREYNARLFGLAQRSARALLDYGVTADARALLAGQRHLLTAQDENGDTPLHLAIIHGQTSVIEQIVYVIHHAQDLGVVNLTNHLHQTPLHLAVITGQTSVVSFLLRVGADPALLDRHGDSAMHLALRAGAGAPELLRALLQSGAPAVPQLLHMPDFEGLYPVHLAVRARSPECLDLLVDSGAEVEATERQGGRTALHLATEMEELGLVTHLVTKLRANVNARTFAGNTPLHLAAGLGYPTLTRLLLKAGADIHAENEEPLCPLPSPPTSDSDSDSEGPEKDTRSSFRGHTPLDLTCSTKVKTLLLNAAQNTMEPPLTPPSPAGPGLSLGDTALQNLEQLLDGPEAQGSWAELAERLGLRSLVDTYRQTTSPSGSLLRSYELAGGDLAGLLEALSDMGLEEGVRLLRGPETRDKLPSTAEVKEDSAYGSQSVEQEAEKLGPPPEPPGGLCHGHPQPQVH.
NFKB단백질 서열은 위 서열번호 1에 한정되지 않고, 난소암이 발병하였거나 발병이 예상되는 개체 종의 서열을 사용할 수 있다.
예를 들어, AAT단백질 서열은 서열번호 2일 수 있다. 서열번호 2: MPSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQKTDTSHHDQDHPTFNKITPNLAEFAFSLYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEILEGLNFNLTEIPEAQIHEGFQELLRTLNQPDSQLQLTTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAFTVNFGDTEEAKKQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDTEEEDFHVDQVTTVKVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSWVLLMKYLGNATAIFFLPDEGKLQHLENELTHDIITKFLENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEEAPLKLSKAVHKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVVNPTQK.
AAT 단백질 서열은 위 서열번호 2에 한정되지 않고, 난소암이 발병하였거나 발병이 예상되는 개체 종의 서열을 사용할 수 있다.
PMVK 단백질은 서열번호 3일 수 있다. 서열번호 3: MAPLGGAPRLVLLFSGKRKSGKDFVTEALQSRLGADVCAVLRLSGPLKEQYAQEHGLNFQRLLDTSTYKEAFRKDMIRWGEEKRQADPGFFCRKIVEGISQPIWLVSDTRRVSDIQWFREAYGAVTQTVRVVALEQSRQQRGWVFTPGVDDAESECGLDNFGDFDWVIENHGVEQRLEEQLENLIEFIRSRL.
PMVK 단백질의 서열은 위 서열번호 3에 한정되지 않고, 않고, 난소암이 발병하였거나 발병이 예상되는 개체 종의 서열을 사용할 수 있다.
VAP1 단백질은 서열번호 4일 수 있다. 서열번호 4: MNQKTILVLLILAVITIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLFADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPPAREALAIVFFGRQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDIDQMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFLHHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSWSLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLVYEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQAPKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFHPSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENWVWAEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLAVTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTVDFSDFINNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPNTVTVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFYSADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACAPDLPAFSHGGFSHN.
VAP1 단백질의 서열은 위 서열번호 4에 한정되지 않고, 않고, 난소암이 발병하였거나 발병이 예상되는 개체 종의 서열을 사용할 수 있다.
FABP4 단백질의 서열은 서열번호 5의 서열일 수 있다. 서열번호 5: MCDAFVGTWKLVSSENFDDYMKEVGVGFATRKVAGMAKPNMIISVNGDVITIKSESTFKNTEISFILGQEFDEVTADDRKVKSTITLDGGVLVHVQKWDGKSTTIKRKREDDKLVVECVMKGVTSTRVYERA.
FABP4 단백질의 서열은 위 서열번호 5에 한정되지 않고, 않고, 난소암이 발병하였거나 발병이 예상되는 개체 종의 서열을 사용할 수 있다.
PF4 단백질의 서열은 서열번호 6의 서열일 수 있다. 서열번호 6: MSSAAGFCASRPGLLFLGLLLLPLVVAFASAEAEEDGDLQCLCVKTTSQVRPRHITSLEVIKAGPHCPTAQLIATLKNGRKICLDLQAPLYKKIIKKLLES.
PF4 단백질의 서열은 위 서열번호 6에 한정되지 않고, 않고, 난소암이 발병하였거나 발병이 예상되는 개체 종의 서열을 사용할 수 있다.
NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 mRNA 또는 단백질의 서열은 인간의 mRNA 또는 단백질 서열일 수 있다.
NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 mRNA 또는 단백질의 서열은 인간의 서열에 한정되지 않고, 암 재발율 또는 생존율 예측의 대상이 되는 개체의 서열일 수 있다.
개체는 동물일 수 있으며, 예컨대 인간, 소, 말, 토끼, 개, 원숭이 또는 고양이일 수 있다.
발현량을 측정하는 제제는 NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4의 mRNA 또는 그 단백질을 검출할 수 있는 물질이면 제한되지 않으나, 예컨대 프라이머, 프로브, 항체, 압타머, DNA, RNA, 단백질 및 폴리펩티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나일 수 있다.
용어 ‘프라이머’는 짧은 자유 3 말단 수산화기를 가지는 핵산 서열로, 상보적인 주형(template)과 염기쌍을 형성할 수 있고 주형 가닥 복사를 위한 시작 지점으로 기능을 하는 짧은 핵산 서열을 의미한다. 프라이머는 진단, DNA 시퀀싱 등에 사용될 수 있고, 통상적으로 15 내지 30 염기쌍의 길이로 합성하여 사용될 수 있으며 사용 목적에 따라 길이를 달리하여 합성할 수 있다. 또한, 프라이머는 공지된 방법인 메틸화, 캡화 등으로 변형될 수 있다.
용어 ‘프로브’는 mRNA와 특이적 결합을 이룰 수 있는 짧게는 수 염기 내지 길게는 수백 염기에 해당하는 RNA 또는 DNA등의 핵산 단편을 의미하며 표지(Labelling)되어 있어서 특정 mRNA의 존재 유무를 확인할 수 있다. 프로브는 올리고 뉴클레오티드 프로브, 단쇄 DNA(single stranded DNA) 프로브, 이중쇄 DNA(double stranded DNA) 프로브, RNA 프로브 등의 형태로 제작될 수 있다. 당업자는 검출하고자 하는 유전자의 서열을 바탕으로 상기 프라이머 또는 프로브를 당해 기술분야의 통상적인 방법에 따라 디자인할 수 있다.
용어 ‘항체’는 당해 기술분야에서 일반적으로 사용되는 용어로 항원성 부위에 대해서 지시되는 특이적인 단백질 분자를 의미한다. 본 발명의 목적상 항체는 NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 단백질 각각에 특이적으로 결합하는 항체를 의미한다.
항체의 종류는 특별히 제한되지 않고 폴리클로날 항체, 모노클로날 항체 및 재조합 항체를 모두 포함할 수 있다. 모노클로날 항체는 당해 분야에 널리 공지된 하이브리도마 방법, 또는 파지 항체 라이브러리기술을 이용하여 제조될 수 있다. 폴리클로날 항체는 항원을 동물에 주사하고 동물로부터 채혈하여 항체를 포함하는 혈청을 수득하는 것을 포함하는 당해 분야에 널리 공지된 방법에 의해 제조될 수 있다. 이러한 폴리클로날 항체는 염소, 토끼, 양, 원숭이, 말, 돼지, 소, 개 등의 임의의 동물 종 숙주로부터 제조 가능하다. 항체는 키메라 항체, 인간화 항체, 인간항체 등의 특수항체도 포함할 수 있다.
또한, 항체는 2개의 전체 길이의 경쇄 및 2개의 전체 길이의 중쇄를 가지는 완전한 형태뿐만 아니라 항체 분자의 기능적인 단편을 포함할 수 있다. 항체 분자의 기능적인 단편이란 적어도 항원 결합기능을 보유하고 있는 단편을 의미하며, Fab, F(ab'), F(ab') 2 및 Fv 등을 포함한다.
본 발명 조성물은 난소암 개체의 암 재발율 또는 생존율을 예측하기 위해 사용될 수 있다.
생존율은 전체 생존율 및 무진행 생존율 중 적어도 하나일 수 있다.
용어 ‘전체 생존(overall survival; OS)’은 진단 날짜, 치료가 시작된 날짜, 및 암 진행을 평가하기 위해 혈액을 채취한 날짜와 같이 선택된 날짜로부터 암에 걸린 개체가 생존하는 시간의 길이를 의미한다.
용어 ‘무진행 생존(progression-free survival; PFS)’은 질병 치료 중 암에 걸린 개체가 생존하고 질병이 악화되지 않거나 진행되지 않은 시간을 의미한다. 임상시험에서 무진행 생존율을 측정함으로써 새로운 치료법이 얼마나 효과가 있는지 확인할 수 있다.
또한, 본 발명은 전술한 조성물을 포함하는 난소암 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 키트를 제공한다.
키트는 전술한 NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 mRNA 또는 그 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 포함할 뿐만 아니라, 그 키트가 이용하는 mRNA 또는 단백질의 발현량을 측정하는 분석 방법에 적합한 하나 이상의 다른 구성 성분 조성물, 용액 또는 장치를 더 포함할 수 있다.
키트가 mRNA 발현량을 측정하기 위한 키트일 경우, RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 구성요소를 포함하는 키트일 수 있다. RT-PCR을 수행하기 위한 키트는 측정 대상 mRNA에 대해 특이적인 프라이머 쌍 이외에도 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액, 데옥시리보뉴클레오티드(dNTPs), Taq-폴리머라제 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNase 억제제, DEPC-수(dEPC water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한, 정량 대조군으로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 쌍을 포함할 수 있다.
키트는 측정 대상 mRNA의 발현량을 측정할 수 있는 마이크로어레이(microarray)일 수 있다. 마이크로어레이는 상기 지표인자를 이용하여 당해 기술분야에 공지된 방법에 따라 당업자가 용이하게 제조할 수 있으며, 일 구체예에 따르면 측정 대상 mRNA 또는 그의 단편에 해당하는 서열의 cDNA가 프로브로서 기판에 부착되어 있는 마이크로어레이일 수 있다.
키트는 발현량 측정 대상 단백질에 특이적으로 결합할 수 있는 항체, 기질과의 반응에 의해서 발색하는 표지체가 접합된 2차 항체 접합체(conjugate), 상기 표지체와 발색 반응할 발색 기질 용액, 세척액 및 효소반응 정지용액 등을 포함할 수 있으며, 사용되는 시약 성분을 포함하는 다수의 별도 패키징 또는 컴파트먼트로 제작될 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. 상기 기질은 니트로셀룰로오스 막, 폴리비닐 수지로 합성된 96 웰 플레이트, 폴리스티렌 수지로 합성된 96 웰 플레이트 및 유리 슬라이드 글라스 등이 이용될 수 있고, 발색 효소는 퍼옥시다아제(peroxidase), 알칼라인 포스파타아제(alkaline phosphatase)등이 사용될 수 있고, 형광물질은 FITC, RITC 등이 사용될 수 있고, 발색 기질은 2,2'-아지노-비스(3-에틸벤조티아졸린-6-설폰산)(ABTS) 또는 o-페닐렌디아민(OPD), 테트라메틸 벤지딘(TMB) 등이 사용될 수 있다.
키트는 샌드위치 ELISA등 다양한 ELISA 방법을 구현하기 위하여, ELISA를 수행하기 위해 필요한 필수 구성요소를 포함할 수 있다.
키트의 종류는 예컨대 면역크로마토그래피 스트립 키트, 루미넥스 어세이 키트, 단백질 마이크로어레이 키트, ELISA 키트, 또는 면역학적 도트 키트일 수 있다.
키트는 웨스턴 블롯, 면역침전분석법, 보체 고정 분석법, 유세포분석 또는 단백질 칩 등을 구현하기 위한 키트일 수 있으며, 각 분석 방법에 적합한 부가적인 구성을 추가로 포함할 수 있다.
추가로, 본 발명은 난소암 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측을 위한 정보제공방법을 제공한다.
개체 및 생존율에 대해서는 전술한 바 있어 구체적인 설명은 생략한다.
본 발명 정보제공방법은 피검체로부터 분리된 시료에서 NFKB의 발현량을 측정하는 단계를 포함한다. 상기 발현량은 mRNA 또는 단백질 발현량을 의미한다. 즉, 본 발명 정보제공방법은 피검체로부터 분리된 시료에서 NFKB의 mRNA 또는 단백질의 발현량을 측정하는 단계를 포함한다.
본 발명 정보제공방법은 피검체로부터 분리된 시료에서 AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 중 적어도 하나의 발현량을 더 측정하는 단계를 더 포함할 수 있다. 즉, 본 발명 정보제공방법은 피검체로부터 분리된 시료에서 AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 중 적어도 하나의 mRNA 또는 단백질의 발현량을 측정하는 단계를 포함한다.
피검체는 현재 난소암을 보유하고 있거나 난소암을 보유한 경험이 있는 동물 또는 난소암의 보유가 의심되는 동물일 수 있다.
시료는 조직, 세포, 전혈, 혈청, 혈장, 타액, 객담, 뇌척수액 및 뇨로 이루어진 군에서 선택될 수 있다.
mRNA 또는 단백질의 발현량 측정은 전술한 측정 대상 mRNA 또는 그 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 상기 시료에 처리하여 수행되는 것일 수 있다.
mRNA 발현량을 측정하기 위해 역전사효소 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사효소 중합효소반응(Competitive RT-PCR), 실시간 역전사효소 중합효소반응(Real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA; RNase protection assay), 노던 블롯팅 (Northern blotting) 및 DNA 칩 등을 이용할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
단백질의 발현량을 측정하기 위한 분석 방법에는 웨스턴 블랏팅(western blotting), ELISA(enzyme linked immunosorbent assay), 방사선면역분석법(Radioimmunoassay), 방사면역 확산법(Radioimmunodiffusion), 오우크테로니(Ouchterlony) 면역 확산법, 로케트(Rocket) 면역전기영동, 조직면역 염색, 면역 침전분석법(immunoprecipitation assay), 보체 고정 분석법(complete fixation assay), 유세포분석(Fluorescence Activated Cell Sorter, FACS), 단백질 칩(protein chip) 등이 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명 정보제공방법은 피검체로부터 분리된 시료에서 측정된 NFKB의 발현량을 대조군에서의 발현량과 비교하는 단계를 더 포함할 수 있다.
본 발명 정보제공방법은 피검체로부터 분리된 시료에서 측정된 AAT, PMVK, VAP1, FABP4 또는 PF4의 발현량을 대조군의 발현량과 비교하는 단계를 더 포함할 수 있다.
전술한 바와 같이 NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 또는 PF4의 발현량은 NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 또는 PF4의 mRNA 또는 단백질의 발현량일 수 있다.
대조군은 현재 난소암을 보유하고 있거나 난소암을 보유한 경험이 있는 동물 또는 난소암의 보유가 의심되는 동물일 수 있다.
본 발명 정보제공방법은 피검체에서 분리된 시료로부터 측정된 NFKB의 발현량이 대조군에서의 발현량 보다 높으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계를 더 포함할 수 있다.
예를 들어, 피검체에서 분리된 시료로부터 측정된 NFKB 단백질의 발현량이 대조군에서 분리된 시료로부터 측정된 NFKB 단백질의 발현량 보다 높으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측할 수 있다.
본 발명 정보제공방법은 피검체에서 분리된 시료로부터 측정된 AAT 또는 PMVK의 발현량이 대조군의 발현량 보다 높으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계를 더 포함할 수 있다.
예를 들어, 피검체에서 분리된 시료로부터 측정된 AAT 단백질의 발현량이 대조군에서 분리된 시료로부터 측정된 AAT 단백질의 발현량 보다 높으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측할 수 있다.
예를 들어, 피검체에서 분리된 시료로부터 측정된 PMVK 단백질의 발현량이 대조군에서 분리된 시료로부터 측정된 PMVK 단백질의 발현량 보다 높으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측할 수 있다.
본 발명 정보제공방법은 피검체에서 분리된 시료로부터 측정된 VAP1, FABP4 또는 PF4의 발현량이 대조군에서의 발현량 보다 낮으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계를 더 포함할 수 있다.
예를 들어, 피검체에서 분리된 시료로부터 측정된 VAP1 단백질의 발현량이 대조군에서 분리된 시료로부터 측정된 VAP1 단백질의 발현량 보다 낮으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측할 수 있다.
예를 들어, 피검체에서 분리된 시료로부터 측정된 FABP4 단백질의 발현량이 대조군에서 분리된 시료로부터 측정된 FABP4 단백질의 발현량 보다 낮으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측할 수 있다.
예를 들어, 피검체에서 분리된 시료로부터 측정된 PF4 단백질의 발현량이 대조군에서 분리된 시료로부터 측정된 PF4 단백질의 발현량 보다 낮으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측할 수 있다.
본 발명 정보제공방법은 피검체로부터 분리된 시료에서 BRCA1 유전자 및 BRCA2 유전자의 돌연변이를 검출하는 단계를 더 포함할 수 있다.
용어 'BRCA1 유전자 돌연변이'는 Breast Cnacer Information Core(BIC) 데이터베이스, ClinVar 데이터베이스, 또는 기 출판된 문헌 등에 미국의학유전학회(ACMG)와 분자병리학회(AMP)에서 권고하고 있는 병인성 유전자 변이(pantogenic variant) 또는 유사 병인성 유전자 변이(likely pantogenic variant)로 분류된 BRCA1 유전자 돌연변이를 의미한다.
용어 'BRCA2 유전자 돌연변이'는 BIC 데이터베이스, ClinVar 데이터베이스, 또는 기 출판된 문헌 등에 병인성 유전자 변이 또는 유사 병인성 유전자 변이로 분류된 BRCA2 유전자 돌연변이를 의미한다.
BRCA1 유전자 및 BRCA2 유전자의 돌연변이는 당해 기술분야에서 공지된 방법으로 검출할 수 있으며, 예컨대 생어 시퀀싱 (Sanger sequencing) 기술 또는 차세대 염기서열 분석 (next generation sequencing, NGS) 기술을 이용하여 DNA 염기서열을 분석함으로써 검출할 수 있다.
본 발명 정보제공방법은 피검체로부터 BRCA1 유전자 및 BRCA2 유전자 중 적어도 하나에서 돌연변이가 검출되면 돌연변이가 검출되지 않은 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계를 더 포함할 수 있다.
NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 중 적어도 하나의 발현량 외에도 BRCA1 유전자 및 BRCA2 유전자의 돌연변이의 존재여부를 더 측정함으로써, 난소암 개체의 암 재발율 또는 생존율을 보다 더 정확하게 예측할 수 있다.
본 발명 정보제공방법은 1차 종양감축수술(PDS) 및 선행항암화학요법 시행 후 간격 종양감축수술(IDS) 중 적어도 하나 이후 피검체로부터 잔존 종양의 직경을 측정하는 단계를 더 포함할 수 있다. 직경은 잔존하는 종양의 평균 직경일 수 있다.
본 발명 정보제공방법은 상기 측정된 잔존 종양의 직경이 대조군의 잔존 종양 직경 대비 더 작으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계를 더 포함할 수 있다.
NFKB, AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 중 적어도 하나의 발현량 외에도 PDS 또는 IDS 이후 피검체의 잔존 종양의 직경을 더 측정함으로써, 난소암 개체의 암 재발율 또는 생존율을 보다 더 정확하게 예측할 수 있다.
이하, 본 발명을 구체적으로 설명하기 위해 실시예를 들어 상세하게 설명하기로 한다.
실시예
1. 마커 발굴
난소암 환자의 종양감축수술 시 획득한 조직 시료로부터 난소암 환자의 생존율을 예측하는 6종의 단백질 마커를 발굴하였다.
총 12명 난소암 환자의 조직을 대상으로 label-free liquid chromatography-mass spectrometry를 이용한 단백질체(proteomics) 분석을 수행하였다. 정량적 단백질 동정(protein identification) 이후, 무진행생존기간을 기준으로 예후가 좋은 그룹과 나쁜 그룹의 두 그룹 간 단백질체 프로파일링(differential expression profiling)을 하여 총 658개의 단백질을 확인하였다. 생물정보학(bioinformatics) 분석을 통해 난소암 환자의 생존율을 예측하는 6종의 단백질 마커를 선택하였다.
2. 단백질 마커 및 임상변수와 생존율 간 상관관계 확인
2-1. 단백질 마커 발현량과 무진행생존율 간 상관관계
독립적인 총 107명의 난소암 환자의 조직을 대상으로 6종의 단백질 마커에 대한 항체를 이용하여 면역조직화학염색 (immunohistochemical staining, IHC staining)을 수행하였다. 도 1은 6종 단백질 마커 각각에 대한 항체를 가지고 난소암 환자의 조직을 대상으로 면역조직화학염색 시 나타나는 고발현과 저발현을 예시로써 나타낸다.
단백질 마커 6종 (AAT, NFKB, PMVK, VAP1, FABP4, PF4) 각각의 면역조직화학염색 상 고발현 (high expression)과 저발현 (low expression)을 비교하여, 재발율(무진행생존기간)에 유의한 차이가 있음을 확인하였다. 도 2는 6종 단백질 마커 각각의 발현량과 재발율 (무진행생존기간) 간의 상관관계를 나타낸다. 구체적으로, AAT, NFKB, PMVK 단백질 고발현 환자의 경우, 저발현 환자 대비 통계적으로 유의하게 낮은 재발율(긴 무진행생존기간)을 보였다. 반면, VAP1, FABP4, PF4 단백질 고발현 환자의 경우, 저발현 환자 대비 통계적으로 유의하게 높은 재발율(짧은 무진행생존기간)을 보였다.
이와 같은 각각의 단백질 발현량과 무진행생존기간 간의 상관관계는 환자들의 나이, 병기(FIGO stage), 종양감축수술 후 잔존종양의 크기(Residual tumer after PDS/IDS), BRCA1 유전자 및 BRCA2 유전자의 돌연변이 존재 유무(BRCA1/2 status) 등을 보정한 다변량 통계분석에서도 동일하게 확인되었다 (표 1 내지 표 4참조). 따라서, AAT, NFKB, PMVK를 좋은 생존예후를 예측하는 단백질 마커이고, VAP1, FABP4, PF4를 불량한 생존예후를 예측하는 단백질 마커라는 것을 확인할 수 있었다.
표 １ 내지 표 4에서 aHR은 adjusted hazard ratio， CI은 confidence interval， CA-125는 cancer antigen 125，FIGO는 International Federation of Gynecology and Obstetrics， WT은 wild-type을 의미한다.
3. 난소암 환자의 생존율 또는 암 재발율을 예측 최적 모델
난소암 환자의 암 재발율 예측을 위한 최적 모델을 찾기 위해, 임상 변수들과 6종의 단백질 마커들을 다양하게 조합하였을 때 각 조합의 암 재발율에 대한 Cox 비례위험모형을 이용한 생존분석을 수행하였다. 그 중 설명력이 좋은 세가지 모델을 표 5 내지 표 7에 기재하였다.
다음으로, 표 5 내지 표 7의 세가지 모델의 변수들을 토대로 18개월 무진행생존율을 예측하기 위한 회귀분석 기반 모델을 제작하였다. 모델의 예측 성능은 107명의 난소암 환자들을 대상으로 leave-one-out cross-validation 이라는 교차 검증 방법을 이용해 평가하였다. 이 방법을 통해 표 8 에 기재된 바와 같이 각 모델의 training set 과 test set 에서의 AUC 를 계산하였다. 그 결과, 임상 변수 만으로 구성된 모델보다 임상 변수에 6종의 단백질 마커의 발현량 변수가 더해지면 예측 성능이 크게 향상되는 것을 확인하였다. 가장 예측 성능이 좋은 모델은 CA-125 (700 이상 vs. 700 미만), 종양감축수술 후 잔존종양의 크기 (육안으로 확인됨 vs. 육안으로 확인되지 아니함), BRCA1/2 유전자 (돌연변이 존재 vs. 비존재), 병기 (III-IV vs. I-II), 6 종의 단백질 마커의 발현량 (고발현 vs. 저발현)으로 구성된 표 7의 모델이었다.
또한, 각 모델의 각각의 변수들을 0 점 또는 1 점으로 점수화 하여 총점을 계산하는 직관적인 모델로 변형하였다. 총점에 따른 18개월 무진행생존율 예측 성능을 평가한 결과, 회귀 분석 기반 모델과 마찬가지로 가장 예측 성능이 좋은 모델은 표 7의 모델이었다. 총점이 7점 이상 시 “재발 위험이 높음”으로 분류되었고，이때 AUC 는 0.855으로 높게 확인되었다 (표 8 참조).
| 모델 | Regression-based | Score-based | |
| Training AUC | Test AUC | AUC | |
| 표 5 모델 (CA-125, residual tumor, germline BRCA status) |
0.709 | 0.544 | 0.711 |
| 표 6 모델(CA-125, 6 protein biomarkers) | 0.863 | 0.772 | 0.829 |
| 표 7 모델(CA-125, residual tumor, germline BRCA status, FIGO stage, 6 protein biomarkers) | 0.898 | 0.776 | 0.855 |
<110> SEOUL NATIONAL UNIVERSITY HOSPITAL
<120> Composition for predicting recurrence rate of cancer or survival
rate in ovarian cancer patients
<130> 19P11045
<160> 6
<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 1
Met Glu Ser Cys Tyr Asn Pro Gly Leu Asp Gly Ile Ile Glu Tyr Asp
1 5 10 15
Asp Phe Lys Leu Asn Ser Ser Ile Val Glu Pro Lys Glu Pro Ala Pro
20 25 30
Glu Thr Ala Asp Gly Pro Tyr Leu Val Ile Val Glu Gln Pro Lys Gln
35 40 45
Arg Gly Phe Arg Phe Arg Tyr Gly Cys Glu Gly Pro Ser His Gly Gly
50 55 60
Leu Pro Gly Ala Ser Ser Glu Lys Gly Arg Lys Thr Tyr Pro Thr Val
65 70 75 80
Lys Ile Cys Asn Tyr Glu Gly Pro Ala Lys Ile Glu Val Asp Leu Val
85 90 95
Thr His Ser Asp Pro Pro Arg Ala His Ala His Ser Leu Val Gly Lys
100 105 110
Gln Cys Ser Glu Leu Gly Ile Cys Ala Val Ser Val Gly Pro Lys Asp
115 120 125
Met Thr Ala Gln Phe Asn Asn Leu Gly Val Leu His Val Thr Lys Lys
130 135 140
Asn Met Met Gly Thr Met Ile Gln Lys Leu Gln Arg Gln Arg Leu Arg
145 150 155 160
Ser Arg Pro Gln Gly Leu Thr Glu Ala Glu Gln Arg Glu Leu Glu Gln
165 170 175
Glu Ala Lys Glu Leu Lys Lys Val Met Asp Leu Ser Ile Val Arg Leu
180 185 190
Arg Phe Ser Ala Phe Leu Arg Ala Ser Asp Gly Ser Phe Ser Leu Pro
195 200 205
Leu Lys Pro Val Ile Ser Gln Pro Ile His Asp Ser Lys Ser Pro Gly
210 215 220
Ala Ser Asn Leu Lys Ile Ser Arg Met Asp Lys Thr Ala Gly Ser Val
225 230 235 240
Arg Gly Gly Asp Glu Val Tyr Leu Leu Cys Asp Lys Val Gln Lys Asp
245 250 255
Asp Ile Glu Val Arg Phe Tyr Glu Asp Asp Glu Asn Gly Trp Gln Ala
260 265 270
Phe Gly Asp Phe Ser Pro Thr Asp Val His Lys Gln Tyr Ala Ile Val
275 280 285
Phe Arg Thr Pro Pro Tyr His Lys Met Lys Ile Glu Arg Pro Val Thr
290 295 300
Val Phe Leu Gln Leu Lys Arg Lys Arg Gly Gly Asp Val Ser Asp Ser
305 310 315 320
Lys Gln Phe Thr Tyr Tyr Pro Leu Val Glu Asp Lys Glu Glu Val Gln
325 330 335
Arg Lys Arg Arg Lys Ala Leu Pro Thr Phe Ser Gln Pro Phe Gly Gly
340 345 350
Gly Ser His Met Gly Gly Gly Ser Gly Gly Ala Ala Gly Gly Tyr Gly
355 360 365
Gly Ala Gly Gly Gly Gly Ser Leu Gly Phe Phe Pro Ser Ser Leu Ala
370 375 380
Tyr Ser Pro Tyr Gln Ser Gly Ala Gly Pro Met Gly Cys Tyr Pro Gly
385 390 395 400
Gly Gly Gly Gly Ala Gln Met Ala Ala Thr Val Pro Ser Arg Asp Ser
405 410 415
Gly Glu Glu Ala Ala Glu Pro Ser Ala Pro Ser Arg Thr Pro Gln Cys
420 425 430
Glu Pro Gln Ala Pro Glu Met Leu Gln Arg Ala Arg Glu Tyr Asn Ala
435 440 445
Arg Leu Phe Gly Leu Ala Gln Arg Ser Ala Arg Ala Leu Leu Asp Tyr
450 455 460
Gly Val Thr Ala Asp Ala Arg Ala Leu Leu Ala Gly Gln Arg His Leu
465 470 475 480
Leu Thr Ala Gln Asp Glu Asn Gly Asp Thr Pro Leu His Leu Ala Ile
485 490 495
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His Ala Gln Asp Leu Gly Val Val Asn Leu Thr Asn His Leu His Gln
515 520 525
Thr Pro Leu His Leu Ala Val Ile Thr Gly Gln Thr Ser Val Val Ser
530 535 540
Phe Leu Leu Arg Val Gly Ala Asp Pro Ala Leu Leu Asp Arg His Gly
545 550 555 560
Asp Ser Ala Met His Leu Ala Leu Arg Ala Gly Ala Gly Ala Pro Glu
565 570 575
Leu Leu Arg Ala Leu Leu Gln Ser Gly Ala Pro Ala Val Pro Gln Leu
580 585 590
Leu His Met Pro Asp Phe Glu Gly Leu Tyr Pro Val His Leu Ala Val
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Arg Ala Arg Ser Pro Glu Cys Leu Asp Leu Leu Val Asp Ser Gly Ala
610 615 620
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625 630 635 640
Ala Thr Glu Met Glu Glu Leu Gly Leu Val Thr His Leu Val Thr Lys
645 650 655
Leu Arg Ala Asn Val Asn Ala Arg Thr Phe Ala Gly Asn Thr Pro Leu
660 665 670
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
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Ala Arg Trp Thr Ile Gln Lys Val Phe Tyr Gln Gly Arg Tyr Tyr Asp
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Phe Ser Phe Gly Leu Gly Ala Phe Ser Gly Pro Arg Ile Phe Asp Val
340 345 350
Arg Phe Gln Gly Glu Arg Leu Val Tyr Glu Ile Ser Leu Gln Glu Ala
355 360 365
Leu Ala Ile Tyr Gly Gly Asn Ser Pro Ala Ala Met Thr Thr Arg Tyr
370 375 380
Val Asp Gly Gly Phe Gly Met Gly Lys Tyr Thr Thr Pro Leu Thr Arg
385 390 395 400
Gly Val Asp Cys Pro Tyr Leu Ala Thr Tyr Val Asp Trp His Phe Leu
405 410 415
Leu Glu Ser Gln Ala Pro Lys Thr Ile Arg Asp Ala Phe Cys Val Phe
420 425 430
Glu Gln Asn Gln Gly Leu Pro Leu Arg Arg His His Ser Asp Leu Tyr
435 440 445
Ser His Tyr Phe Gly Gly Leu Ala Glu Thr Val Leu Val Val Arg Ser
450 455 460
Met Ser Thr Leu Leu Asn Tyr Asp Tyr Val Trp Asp Thr Val Phe His
465 470 475 480
Pro Ser Gly Ala Ile Glu Ile Arg Phe Tyr Ala Thr Gly Tyr Ile Ser
485 490 495
Ser Ala Phe Leu Phe Gly Ala Thr Gly Lys Tyr Gly Asn Gln Val Ser
500 505 510
Glu His Thr Leu Gly Thr Val His Thr His Ser Ala His Phe Lys Val
515 520 525
Asp Leu Asp Val Ala Gly Leu Glu Asn Trp Val Trp Ala Glu Asp Met
530 535 540
Val Phe Val Pro Met Ala Val Pro Trp Ser Pro Glu His Gln Leu Gln
545 550 555 560
Arg Leu Gln Val Thr Arg Lys Leu Leu Glu Met Glu Glu Gln Ala Ala
565 570 575
Phe Leu Val Gly Ser Ala Thr Pro Arg Tyr Leu Tyr Leu Ala Ser Asn
580 585 590
His Ser Asn Lys Trp Gly His Pro Arg Gly Tyr Arg Ile Gln Met Leu
595 600 605
Ser Phe Ala Gly Glu Pro Leu Pro Gln Asn Ser Ser Met Ala Arg Gly
610 615 620
Phe Ser Trp Glu Arg Tyr Gln Leu Ala Val Thr Gln Arg Lys Glu Glu
625 630 635 640
Glu Pro Ser Ser Ser Ser Val Phe Asn Gln Asn Asp Pro Trp Ala Pro
645 650 655
Thr Val Asp Phe Ser Asp Phe Ile Asn Asn Glu Thr Ile Ala Gly Lys
660 665 670
Asp Leu Val Ala Trp Val Thr Ala Gly Phe Leu His Ile Pro His Ala
675 680 685
Glu Asp Ile Pro Asn Thr Val Thr Val Gly Asn Gly Val Gly Phe Phe
690 695 700
Leu Arg Pro Tyr Asn Phe Phe Asp Glu Asp Pro Ser Phe Tyr Ser Ala
705 710 715 720
Asp Ser Ile Tyr Phe Arg Gly Asp Gln Asp Ala Gly Ala Cys Glu Val
725 730 735
Asn Pro Leu Ala Cys Leu Pro Gln Ala Ala Ala Cys Ala Pro Asp Leu
740 745 750
Pro Ala Phe Ser His Gly Gly Phe Ser His Asn
755 760
<210> 5
<211> 132
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 5
Met Cys Asp Ala Phe Val Gly Thr Trp Lys Leu Val Ser Ser Glu Asn
1 5 10 15
Phe Asp Asp Tyr Met Lys Glu Val Gly Val Gly Phe Ala Thr Arg Lys
20 25 30
Val Ala Gly Met Ala Lys Pro Asn Met Ile Ile Ser Val Asn Gly Asp
35 40 45
Val Ile Thr Ile Lys Ser Glu Ser Thr Phe Lys Asn Thr Glu Ile Ser
50 55 60
Phe Ile Leu Gly Gln Glu Phe Asp Glu Val Thr Ala Asp Asp Arg Lys
65 70 75 80
Val Lys Ser Thr Ile Thr Leu Asp Gly Gly Val Leu Val His Val Gln
85 90 95
Lys Trp Asp Gly Lys Ser Thr Thr Ile Lys Arg Lys Arg Glu Asp Asp
100 105 110
Lys Leu Val Val Glu Cys Val Met Lys Gly Val Thr Ser Thr Arg Val
115 120 125
Tyr Glu Arg Ala
130
<210> 6
<211> 101
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 6
Met Ser Ser Ala Ala Gly Phe Cys Ala Ser Arg Pro Gly Leu Leu Phe
1 5 10 15
Leu Gly Leu Leu Leu Leu Pro Leu Val Val Ala Phe Ala Ser Ala Glu
20 25 30
Ala Glu Glu Asp Gly Asp Leu Gln Cys Leu Cys Val Lys Thr Thr Ser
35 40 45
Gln Val Arg Pro Arg His Ile Thr Ser Leu Glu Val Ile Lys Ala Gly
50 55 60
Pro His Cys Pro Thr Ala Gln Leu Ile Ala Thr Leu Lys Asn Gly Arg
65 70 75 80
Lys Ile Cys Leu Asp Leu Gln Ala Pro Leu Tyr Lys Lys Ile Ile Lys
85 90 95
Lys Leu Leu Glu Ser
100
Claims (14)
- NFKB mRNA 또는 그 단백질의 발현량을 측정하는 제제; 및
AAT 또는 PMVK 중 적어도 하나의 mRNA 또는 그 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 포함하는 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물.
- 청구항 1에 있어서, VAP1, FABP4 및 PF4 중 적어도 하나의 mRNA 또는 그 단백질의 발현량을 측정하는 제제를 더 포함하는 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물.
- 청구항 1에 있어서, 상기 제제는 프라이머, 프로브, 항체, 압타머, DNA, RNA, 단백질 및 폴리펩티드로 이루어진 군에서 선택되는 적어도 하나인, 조성물.
- 청구항 1 내지 3 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측용 키트.
- 피검체로부터 분리된 시료에서 NFKB 발현량을 측정하는 단계;
상기 피검체로부터 분리된 시료에서 AAT, PMVK, VAP1, FABP4 및 PF4 중 적어도 하나의 발현량을 측정하는 단계; 및
상기 측정된 AAT 또는 PMVK의 발현량이 대조군에서의 발현량 보다 높으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계:를 포함하는 난소암 발병 개체의 암 재발율 또는 생존율 예측을 위한 정보제공방법.
- 청구항 5에 있어서, 상기 측정된 NFKB 발현량이 대조군에서의 발현량 보다 높으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계:를 더 포함하는, 정보제공방법.
- 삭제
- 삭제
- 청구항 5에 있어서, 상기 측정된 VAP1, FABP4 또는 PF4의 발현량이 대조군에서의 발현량 보다 낮으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계:를 더 포함하는, 정보제공방법.
- 청구항 5에 있어서, 상기 시료는 조직, 세포, 전혈, 혈청, 혈장, 타액, 객담, 뇌척수액 및 뇨로 이루어진 군에서 선택된 적어도 하나인, 정보제공방법.
- 청구항 5에 있어서, 상기 피검체로부터 분리된 시료에서 BRCA1 유전자 및 BRCA2 유전자의 돌연변이를 검출하는 단계;를 더 포함하는, 정보제공방법.
- 청구항 11에 있어서, 상기 피검체로부터 상기 BRCA1 유전자 및 BRCA2 유전자 중 적어도 하나에서 돌연변이가 검출되면 상기 돌연변이가 검출되지 않은 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계:를 더 포함하는, 정보제공방법.
- 청구항 5에 있어서, 상기 피검체로부터 1차 종양감축수술 (primary debulking surgery, PDS) 및 선행항암화학요법 시행 후 간격 종양감축수술 (interval debulking surgery, IDS) 중 적어도 하나 이후 잔존 종양의 직경을 측정하는 단계;를 더 포함하는, 정보제공방법.
- 청구항 13에 있어서, 상기 측정된 잔존 종양의 직경이 대조군의 잔존 종양 직경 대비 더 작으면 대조군 대비 암 재발율이 낮거나 생존율이 높을 것으로 예측하는 단계;를 더 포함하는, 정보제공방법.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020200045351A KR102316178B1 (ko) | 2020-04-14 | 2020-04-14 | 난소암 환자의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| KR1020200045351A KR102316178B1 (ko) | 2020-04-14 | 2020-04-14 | 난소암 환자의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| KR102316178B1 true KR102316178B1 (ko) | 2021-10-22 |
Family
ID=78275735
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| KR1020200045351A KR102316178B1 (ko) | 2020-04-14 | 2020-04-14 | 난소암 환자의 암 재발율 또는 생존율 예측용 조성물 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| KR (1) | KR102316178B1 (ko) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2024101476A1 (ko) * | 2022-11-10 | 2024-05-16 | 서울대학교병원 | 1차 선행항암화학요법 전후의 ca-125를 이용하여 항암 반응 예후가 우수할 것으로 예측되는 군집을 선별하고, 선별된 군집의 간격종양감축술 생략 여부를 예측하는 방법 및 시스템 |
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| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
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-
2020
- 2020-04-14 KR KR1020200045351A patent/KR102316178B1/ko active IP Right Grant
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