JP2009065848A - 遺伝子発現解析方法および遺伝子発現解析システム - Google Patents
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Abstract
【解決手段】発光タンパク質からなるレポーター遺伝子を導入するとともに、細胞核に特異的に発現するマーカー遺伝子によって標識した複数の生きた細胞に対し、レポーター遺伝子の発現に伴って発生するレポーターシグナルを互いに異なる経過時間で検知する一方、マーカー遺伝子によって発生するマーカーシグナルを互いに異なる経過時間で検知し、検知した複数のマーカーシグナルを用いて異なる経過時間における細胞の同定を行い、同定した細胞の少なくとも一部に対して、レポーターシグナルのシグナル強度の時間変化に基づく解析を行う。
【選択図】 図1
Description
図1は、本発明の実施の形態1に係る遺伝子発現解析システムの全体構成を模式的に示す図である。同図に示す遺伝子発現解析システム1は、複数の生きた細胞からなるサンプルSpを撮像することによってサンプルSpから発せられる遺伝子発現のシグナルを画像データとして光学的に観察する観察装置2と、観察装置2との間でデータの送受信が可能であり、観察装置2の駆動制御を行うとともに、観察装置2から送られてくる画像データを用いた演算処理を行うデータ処理装置3と、を有し、これら2つの装置が連携してサンプルSpの遺伝子発現量変化を検出する。
(1)発光画像の撮像回数が所定回数に到達。
(2)発光画像の発光量が所定値より大。
(3)最初の発光画像の撮像時刻から一定時間が経過。
図8は、本実施の形態1の一変形例に係る遺伝子発現解析システムの構成を示す図である。同図に示す遺伝子発現解析システム4は、上述した実施の形態1と観察装置の構成が異なり、一つの発光画像撮像ユニットがレポーター遺伝子による発光とマーカー遺伝子による発光とをともに撮像可能である。なお、実施の形態1と同じ構成を有する部位については、図1等と同じ符号を付してある。
図9は、本発明の実施の形態2に係る遺伝子発現解析システムの全体構成を模式的に示す図である。同図に示す遺伝子発現解析システム6は、複数の生きた細胞からなるサンプルSpを撮像することによってサンプルSpから発せられる遺伝子発現のシグナルを画像データとして光学的に測定する観察装置7と、観察装置7との間でデータの送受信が可能であり、観察装置7の駆動制御を行うとともに、観察装置7から送られてくる画像データを用いた演算処理を行うデータ処理装置3と、を有し、これら2つの装置が連携してサンプルSpの遺伝子発現量変化を検出する。なお、図9において、図1に示す遺伝子発現解析システム1と同じ構成部位については、図1と同じ符号を付してある。
2、5、7 観察装置
3 データ処理装置
21 容器
22 ステージ
23、24、51 発光画像撮像ユニット
25 ステージ駆動部
26、53、72 光路切替駆動部
31 送受信部
32 入力部
33 制御部
34 記憶部
35 出力部
52 透過照明ユニット
71 蛍光画像撮像ユニット
231、241、511、711 対物レンズ
232、242、513a、513b、712 結像レンズ
233、243、514a、514b、713 撮像装置
234、244、521、714 光源
235、245、522、715 シャッター
236、246 ミラー
331 発光量測定部
332 条件判定部
333 画像生成部
334 細胞同定部
335 領域選択部
341 画像データ記憶部
342 測定条件記憶部
343 発光量記憶部
512、716 ダイクロイックミラー
523 照明レンズ系
523a コレクタレンズ
523b コンデンサーレンズ
P1 明視野画像
P2、P3 重ね合わせ画像
Sp サンプル
Claims (15)
- 発光タンパク質からなるレポーター遺伝子を導入するとともに、細胞核で特異的に発現するマーカー遺伝子によって標識した複数の生きた細胞に対し、前記レポーター遺伝子の発現を解析する遺伝子発現解析方法であって、
前記レポーター遺伝子の発現によって上昇するレポーターシグナルおよび前記マーカー遺伝子の発現によって上昇するマーカーシグナルをそれぞれ検知可能であり、前記レポーターシグナルおよび前記マーカーシグナルに関する情報を記憶する記憶手段を備えた遺伝子発現解析システムが、
前記レポーターシグナルを光学的に検知するレポーターシグナル検知ステップと、
前記レポーターシグナル検知ステップで検知したレポーターシグナルのシグナル強度を測定し、この測定した結果を前記記憶手段に記憶するレポーターシグナル強度測定ステップと、
前記マーカーシグナルを光学的に検知するマーカーシグナル検知ステップと、
前記マーカーシグナル検知ステップで検知したマーカーシグナルのシグナル強度を測定し、この測定した結果を前記記憶手段に記憶するマーカーシグナル強度測定ステップと、
を異なる経過時間ごとに繰り返し行った後、
複数の前記マーカーシグナルのシグナル強度を含む情報を前記記憶手段から読み出し、この読み出した情報を用いて異なる経過時間における細胞の同定を行う細胞同定ステップと、
前記細胞同定ステップで同定した複数の細胞の少なくとも一部に対し、前記レポーターシグナルのシグナル強度の時間変化に基づく解析を行う解析ステップと、
を行うことを特徴とする遺伝子発現解析方法。 - 前記細胞同定ステップの前に、
前記レポーターシグナル検知ステップ、前記レポーターシグナル強度測定ステップ、前記マーカーシグナル検知ステップおよび前記マーカーシグナル強度測定ステップを繰り返し行うか否かを判定する判定ステップ
をさらに行うことを特徴とする請求項1に記載の遺伝子発現解析方法。 - 前記細胞同定ステップの前に、
前記レポーターシグナルの像と前記マーカーシグナルの像とを重ね合わせた画像を異なる経過時間ごとに生成する画像生成ステップと、
前記画像生成ステップで生成した画像を出力する出力ステップと、
をさらに行うことを特徴とする請求項1に記載の遺伝子発現解析方法。 - 前記レポーター遺伝子はルシフェラーゼであることを特徴とする請求項1〜3のいずれか一項に記載の遺伝子発現解析方法。
- 前記マーカー遺伝子は、前記レポーター遺伝子と異なる色を示す波長の光を発する発光タンパク質であることを特徴とする請求項1〜4のいずれか一項に記載の遺伝子発現解析方法。
- 前記マーカー遺伝子はルシフェラーゼであることを特徴とする請求項5に記載の遺伝子発現解析方法。
- 前記解析ステップは、
前記レポーターシグナルのシグナル強度を、同じ細胞における前記マーカーシグナルのシグナル強度を用いて補正するシグナル強度補正ステップを含むことを特徴とする請求項5または6に記載の遺伝子発現解析方法。 - 前記マーカー遺伝子は蛍光タンパク質であることを特徴とする請求項1〜4のいずれか一項に記載の遺伝子発現解析方法。
- 前記細胞は、前記マーカー遺伝子が導入されてなり、
前記細胞の成育または分裂の過程において、前記マーカーの発現量の変化は、前記レポーター遺伝子の発現量の変化と比較して無視しうることを特徴とする請求項1〜8のいずれか一項に記載の遺伝子発現解析方法。 - 発光タンパク質からなるレポーター遺伝子を導入するとともに、細胞核で特異的に発現するマーカー遺伝子によって標識した複数の生きた細胞に対し、前記レポーター遺伝子の発現を解析する遺伝子発現解析システムであって、
前記レポーター遺伝子の発現に伴って発生するレポーターシグナルの光学的な検知を異なる経過時間ごとに繰り返し行うレポーターシグナル検知手段と、
前記マーカー遺伝子によって発生するマーカーシグナルの光学的な検知を異なる経過時間ごとに繰り返し行うマーカーシグナル検知手段と、
前記レポーターシグナル検知手段が検知したレポーターシグナルのシグナル強度および前記マーカーシグナル検知手段が検知したマーカーシグナルのシグナル強度をそれぞれ測定するシグナル強度測定手段と、
複数の前記マーカーシグナルのシグナル強度を含む情報を用いることによって異なる経過時間における細胞の同定を行う細胞同定手段と、
前記細胞同定手段で同定した細胞の少なくとも一部に対し、前記レポーターシグナル検知手段で検知したレポーターシグナルのシグナル強度の時間変化に基づく解析を行う解析手段と、
を備えたことを特徴とする遺伝子発現解析システム。 - 前記レポーターシグナル検知手段および前記マーカーシグナル検知手段における繰り返し処理を続行するか否かを判定する判定手段
をさらに備え、
前記細胞同定手段は、
前記判定手段が繰り返し処理を続行しないと判定した場合、異なる経過時間における細胞の同定を行うことを特徴とする請求項10に記載の遺伝子発現解析システム。 - 前記レポーターシグナルの像と前記マーカーシグナルの像とを重ね合わせた画像を異なる経過時間ごとに生成する画像生成手段と、
前記画像生成手段が生成した画像を出力する出力手段と、
をさらに備えたことを特徴とする請求項10または11に記載の遺伝子発現解析システム。 - 前記レポーターシグナル検知手段は、
前記レポーターシグナルの像を結像する第1の結像光学系と、
前記第1の結像光学系で結像した前記レポーターシグナルの像を撮像する第1の撮像手段と、
を有することを特徴とする請求項10〜12のいずれか一項に記載の遺伝子発現解析システム。 - 前記マーカーシグナル検知手段は、
前記マーカーシグナルの像を結像する第2の結像光学系と、
前記第2の結像光学系で結像した前記マーカーシグナルの像を撮像する第2の撮像手段と、
を有することを特徴とする請求項10〜13のいずれか一項に記載の遺伝子発現解析システム。 - 前記マーカー遺伝子は、前記レポーター遺伝子と異なる色を示す波長の光を発する発光タンパク質であり、
前記解析手段は、前記レポーターシグナルのシグナル強度を、同じ細胞における前記マーカーシグナルのシグナル強度を用いて補正するシグナル強度補正手段を有することを特徴とする請求項10〜14のいずれか一項に記載の遺伝子発現解析システム。
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