JPWO2017109983A1 - 微弱発光試料の解析方法及び解析システム - Google Patents
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Abstract
Description
前記光学的絞りの開口径を決定された値にする絞り駆動部と、前記光学的絞りが決定された前記開口径である状態で微弱光を発するように調製された複数の解析対象を含んでいる3次元試料としての微弱発光試料についての微弱光画像を、前記対物光学系を介して撮像する撮像装置とを備える。
本発明の一実施形態について説明する。本実施形態に係る解析システムは、微弱光を発するように調製された厚みを有する3次元試料の解析に用いられ得る。このような3次元試料の例としては、マウス等といった小動物の器官及び臓器、胚様体、スフェロイド、ゲル又は担体内で培養した3次元細胞試料等が挙げられる。
本実施形態に係る解析システムの構成例について図1を参照して説明する。解析システム1は、上述の3次元試料であるサンプル900を観察するための観察装置100と、観察装置100の動作の制御及び画像処理等を行うデータ処理装置200とを備える。さらに、解析システム1は、データ処理装置200で処理された画像を表示するための表示装置310と、ユーザがデータ処理装置200に命令を入力する際に用いられる入力装置320とを備える。観察装置100は、サンプル900を照明しながら明視野画像を取得したり、暗条件でサンプル900の発光画像を取得したりできる装置である。観察装置100とデータ処理装置200とが連携することで、サンプル900の観察を行うことができる。
3次元試料としては、上述のとおり、例えば、マウス等といった小動物の器官若しくは臓器、生体の組織、胚様体、スフェロイド、又はゲル若しくは担体内で培養した3次元細胞試料等が挙げられる。本実施形態では微弱光を発光する3次元試料の発光画像を取得することが含まれる。このため、試料を構成する細胞には、例えば発光タンパク質の遺伝子が導入されている。発光タンパク質としては、例えばルシフェラーゼが用いられ得る。発光タンパク質としてルシフェラーゼが用いられる場合、試料には、発光基質であるルシフェリンが導入される。一般に、発光タンパク質の遺伝子が導入された細胞は、蛍光タンパク質に比べて100分の1以下の極めて微弱な輝度の生物発光を発生するに過ぎず、ビデオレートで撮像することが困難である。それにもかかわらず、発光タンパク質は、細胞内の遺伝子の発現量と極めて相関の高い生物発光を生じるので、長時間に亘り微弱な光を測定することにより、発現量の微弱な変化を正確に捉えることができる。このようにビデオレートでの撮像が困難となるような微弱光は、微弱な生物活性を定量するのに非常に適している。しかしながら、生物発光のような微弱光を高感度に取得できる顕微鏡ベースの発光イメージングシステム(発光顕微鏡)は発展途上であり、多様な生物活性に応用する手法も装置も検討されていない状況にある。
絞り132の開口径と撮像装置134によって得られる画像との関係について、図2に示す模式図を参照して説明する。図2において、左列は2次元画像を得る場合を示し、右列は3次元画像を得る場合を示す。図2において、上段は絞り132の開口径が大きい場合を示し、下段は絞り132の開口径が小さい場合を示す。
本実施形態に係る3次元を有する微弱発光試料の解析方法について説明する。図3に示すように、本解析方法は、ステップS101の画像取得処理と、ステップS102の解析処理とを含む。ステップS101の画像取得処理では、所定の動作が繰り返し実行されることによって、解析に用いられる試料の画像が取得される。ステップS102の解析処理では、得られた画像に基づいて試料の解析が行われる。なお、画像の取得と得られた画像の解析とが交互に繰り返し行われる等してもよい。
本実施形態に係る解析システム1には、画像取得のための3つの動作モードが用意されている。いずれのモードにおいても、繰り返し行われる画像取得のうち少なくとも1回の処理においては、開口径は、対物光学系の光軸方向に異なる位置に存在する解析対象を焦点深度内に含めるような値に決定される。これらのモードについて順に説明する。
第1のモードは、ステップS201で設定された画像取得のタイミングにおいて、それぞれ2次元画像と3次元画像とが取得されるモードである。第1のモードにおいて、画像が取得されるタイミングを図5を参照して説明する。第1のモードでは、解析システム1は、まず、絞り132の開口径を小さくして焦点深度が深い状態とし、この状態で1回の撮影を行い1つの2次元画像を取得する。続いて、解析システム1は、絞り132の開口径を大きくして焦点深度が浅い状態とし、この状態で微弱発光試料の深さ方向(2次元画像に対しほぼ垂直な方向)に沿って複数回の撮影を行い、得られた画像を合成することで1つの3次元画像を取得する。解析システム1は、このような2次元画像と3次元画像とを一組とした画像取得を、ステップS201で設定されたタイミングで繰り返し行う。なお、所定の露光量を得るためには、開口径が小さいときは、開口径が大きい場合に比較して、長時間の露出が必要である。
第2のモードの概略について、図8を参照して説明する。第2のモードでは、図8に示すように、焦点深度が深い開口径が小さい状態において2次元画像取得のための撮影が繰り返し行われ、所定の頻度で焦点深度が浅い開口径が大きい撮影が複数回行わることで1つの3次元画像取得が行われる。例えば、2次元画像の取得に必要な露出時間が例えば10分程度であり、3次元画像の取得のために、例えば1枚の2次元画像の取得に必要な時間が例えば3分程度であって、このような2次元画像の取得が10回繰り返される等のように設定される。
第3のモードについて説明する。第3のモードでは、まず、2次元画像が繰り返し取得される。得られた2次元画像は逐次に解析される。そして、2次元画像において所定の変化よりも大きな変化が検出されたとき、3次元画像の取得が行われる。例えば、微弱光としての発光(ルシフェラーゼ遺伝子による細胞から発生する光)の画像については、生物学的な活性(例えば遺伝子発現量)が有意に変化したと解釈できるような発光強度の変化があった場合に、大きな変化が検出されたとして3次元画像の取得が行われるように解析システム1は構成され得る。あるいは、生物学的な活性があると認められる発光強度を閾値として、発光強度が当該閾値よりも上回った場合に変化が検出されたと判断されるように解析システム1は構成され得る。また、得られた3次元画像は逐次に解析される。そして、3次元画像において所定の変化よりも変化が小さくなったことが検出されたとき、2次元画像の取得が行われる。
ステップS102で行われる解析処理では、ステップS101の画像取得処理で取得された2次元画像又は3次元画像に基づいて、種々の解析が行われる。解析処理では、例えば画像における輝度分布が解析される。また、解析処理では、例えば画像における輝度分布の経過時間に対する変化が解析される。
本実施形態によれば、絞り132の開口径を変化させることで、3次元試料について、情報量の多い2次元画像と解像度の高い3次元画像とを適切に取得することができる。2次元画像は、3次元画像と比較して、撮影に必要な時間が短い。このため、本実施形態によれば、限られた時間内で効率よく情報を収集することができる。また、2次元画像は3次元画像と比較してデータサイズが小さい。このため、本実施形態によれば、不必要なデータが発生することを抑制して、データの管理が行いやすくなる。また、2次元画像は3次元画像と比較して、ROIの設定など、データの取り扱いが容易である。また、2次元画像は3次元画像に対して一覧性がよい。一方で、3次元画像は情報量が多い。したがって、必要に応じて3次元画像が取得されることは、より詳細な試料の解析や試料の状態の3次元的な把握に効を奏する。
上述の実施形態の観察装置100の構成は、適宜に変更され得る。例えば、図1に示す例では、対物レンズ131側から照明光がサンプル900に照射される例を示した。しかしながらこれに限らない。サンプル900を挟んで対物レンズ131と反対側から照明光が照射されてもよい。この場合、例えば図11に示すような構成が採用され得る。すなわち、照明ユニット160は、サンプル900に対して撮影ユニット130と反対側に配置されている。図1に示す例における照明用ファイバ165に代えて、コンデンサーレンズ167が観察装置100に設けられる。すなわち、照明光学系163は、コレクタレンズ164及びコンデンサーレンズ167を有する。照明光学系163のコレクタレンズ164及びコンデンサーレンズ167は、光源161からの白色光をサンプル900上に集光させる。また、上述の実施形態では、正立型の顕微鏡が用いられる例を示したがこれに限らない。例えば倒立型の顕微鏡(たとえばオリンパス(株)製の倒立型発光イメージングシステムであるLUMINOVIEW200)が用いられてもよい。
〈観察方法〉
正立型発光イメージングシステムを用いて、明視野画像の撮影を行った。ここでは、図1に示す観察装置100のように、対物レンズ131側から照明光が照射される構成を有する正立型発光イメージングシステムを用いた。使用した対物レンズは、倍率が4倍である対物レンズ(XLFLUOR4X/340;オリンパス(株))である。このレンズにおいて、絞りを取り付けていない状態(NA:0.28)、及び開口径が異なる絞りを対物レンズの後方に取り付けた場合のそれぞれにおいてサンプルの撮影を行い、2次元画像を取得した。取り付けた絞りの開口径は、φ16.8mm、φ12.6mm、及びφ8.4mmの3種類である。開口径がφ8.4mmの場合のNAは0.0933に相当する。露出時間はそれぞれ50ミリ秒とした。サンプルは下記の2種類とした。
方眼紙を用いて作成した三角錐をサンプルとした。方眼紙のメモリは1mm間隔である。三角錐の頂点に合焦させた状態で撮影を行った。
乾燥剤として用いられる多孔質シリカビーズをサンプルとした。ビーズ径は3mm乃至7mmである。サンプルには、サイズの違うビーズが混ざっている。
第1のサンプル(方眼紙で作製した三角錐)の観察結果を図12に示す。図12に示すように、絞りによって調整された開口径が大きいほど焦点深度が浅く、開口径が小さいほど焦点深度が深くなる様子が明確に確認された。
〈観察方法〉
第1の実施例と同様のXLFLUOR4X/340を有する光学系を用いて、マウスの大腿骨のサンプルを観察した。本実施例では、絞りを取り付けない状態と、開口径φ8.4mmの絞りを取り付けた状態とで撮影を行い2次元画像を取得した。
本実施例の観察結果を図14に示す。絞りなしの発光画像に示すように、絞りなしでは、矢印で示した発光量が高いマウス大腿骨の先端部分である大腿骨頭部分の発光が飽和してしまい、大腿骨体の観察ができなかった。一方、開口径をφ8.4mmとしたとき、露出時間10分の画像に四角形で示した部分を含めて、大腿骨頭及び大腿骨体サンプル全体の発光が取得できた。発光画像においても絞りによって調整された開口径が大きいほど焦点深度が浅く、開口径が小さいほど焦点深度が深くなる様子が明確に確認された。
Claims (11)
- 微弱光を発するように調製された、複数の解析対象を含んでいる3次元試料としての微弱発光試料の微弱光画像を取得する画像取得処理と、
取得された前記微弱光画像に基づいて前記3次元試料を解析する解析処理と
を備え、
前記画像取得処理は、
所定の条件に基づいて、前記微弱光画像を取得する光学系に挿入された光学的絞りの開口径を決定することと、
決定された前記開口径の前記光学的絞りを用いて前記3次元試料についての微弱光画像を取得することと
を繰り返し行うことを含み、
繰り返し行われる前記画像取得処理のうち少なくとも1回の前記画像取得処理においては、前記開口径は、前記光学系の光軸方向に異なる位置に存在する前記解析対象を焦点深度内に含めるような値に決定される、
微弱発光試料の解析方法。 - 前記開口径の初期値は第1の開口径であり、
前記条件は、前記微弱光画像の輝度値の変化が所定値よりも大きくなったか否かであり、
前記開口径を決定することは、前記第1の開口径で繰り返し取得された前記微弱光画像を比較して、前記微弱光画像の前記輝度値の変化が前記所定値よりも大きくなったときに、前記第1の開口径より大きい第2の開口径にする決定を含み、
前記微弱光画像を取得することは、前記開口径を前記第2の開口径とする場合には、互いに異なる複数の合焦面についての一組の2次元微弱光画像を取得することを含み、
前記画像取得処理は、前記一組の2次元微弱光画像を合成して3次元微弱光画像を生成することをさらに含む、
請求項1に記載の微弱発光試料の解析方法。 - 前記条件は、経過時間が予め設定されたタイミングとなったか否かであり、
前記開口径を決定することは、
繰り返される第1のタイミングで前記開口径を第1の開口径に決定することと、
繰り返される第2のタイミングで前記開口径を前記第1の開口径よりも大きい第2の開口径に決定することと、
を含み、
前記微弱光画像を取得することは、前記開口径を前記第2の開口径とする場合には、互いに異なる複数の合焦面についての一組の2次元微弱光画像を取得することを含み、
前記画像取得処理は、前記一組の2次元微弱光画像を合成して3次元微弱光画像を生成することをさらに含む、
請求項1に記載の微弱発光試料の解析方法。 - 前記解析処理は、
前記第1の開口径で得られた複数の前記微弱光画像をディスプレイに表示させることと、
表示させた複数の前記微弱光画像の中から選択された前記微弱光画像と最も近いタイミングで取得された一組の2次元微弱光画像に基づいて合成された前記3次元微弱光画像を用いて所定の解析を行うことと
を含む、請求項3に記載の微弱発光試料の解析方法。 - 前記開口径の初期値は第1の開口径であり、
前記画像取得処理は、前記第1の開口径で取得された前記微弱光画像に基づく画像をディスプレイに表示させることをさらに含み、
前記開口径を決定することは、前記第1の開口径より大きい第2の開口径にする旨の指示が入力されたときに、前記開口径を前記第2の開口径にする決定を含む、
請求項1に記載の微弱発光試料の解析方法。 - 前記微弱光画像を取得することは、前記開口径を前記第2の開口径とする場合には、互いに異なる複数の合焦面についての一組の2次元微弱光画像を取得することを含み、
前記画像取得処理は、前記一組の2次元微弱光画像を合成して3次元微弱光画像を生成することをさらに含む、
請求項5に記載の微弱発光試料の解析方法。 - 前記3次元試料は、複数の細胞を含む、請求項1に記載の微弱発光試料の解析方法。
- 対物光学系と、
前記対物光学系に設けられた光学的絞りと、
所定の条件に基づいて光学的絞りの開口径を決定する開口決定部と、
前記光学的絞りの開口径を決定された値にする絞り駆動部と、
前記光学的絞りが決定された前記開口径である状態で微弱光を発するように調製された複数の解析対象を含んでいる3次元試料としての微弱発光試料についての微弱光画像を、前記対物光学系を介して撮像する撮像装置と
を備える解析システム。 - 前記対物光学系の合焦位置を光軸に沿って移動させる駆動部と、
前記駆動部の動作を制御しながら、前記撮像装置の動作を制御する撮影制御部と、
画像合成部と
をさらに備え、
前記条件は、前記微弱光画像の輝度値の変化が所定値よりも大きくなったか否かであり、
前記開口決定部は、前記開口径の初期値を第1の開口径とし、前記第1の開口径で繰り返し取得された前記微弱光画像の比較結果に基づいて、前記微弱光画像の前記輝度値の変化が前記所定値よりも大きくなったときに、前記第1の開口径より大きい第2の開口径にする決定を行い、
前記撮影制御部は、前記開口径を前記第2の開口径とする場合には、互いに異なる複数の合焦面についての一組の2次元微弱光画像を前記撮像装置に取得させ、
前記画像合成部は、前記一組の2次元微弱光画像を合成して3次元微弱光画像を生成する、
請求項8に記載の解析システム。 - 前記対物光学系の合焦位置を光軸に沿って移動させる駆動部と、
前記駆動部の動作を制御しながら、前記撮像装置の動作を制御する撮影制御部と、
画像合成部と
をさらに備え、
前記条件は、経過時間が予め設定されたタイミングとなったか否かであり、
前記開口決定部は、
繰り返される第1のタイミングで前記開口径を第1の開口径に決定し、
繰り返される第2のタイミングで前記開口径を前記第1の開口径よりも大きい第2の開口径に決定し、
前記撮影制御部は、前記開口径を前記第2の開口径とする場合には、互いに異なる複数の合焦面についての一組の2次元微弱光画像を前記撮像装置に取得させ、
前記画像合成部は、前記一組の2次元微弱光画像を合成して3次元微弱光画像を生成する、
請求項8に記載の解析システム。 - 画像を表示する表示装置と、
前記表示装置への表示を制御する表示制御部と、
画像に基づいて解析を行う画像解析部と
をさらに備え、
前記表示制御部は、前記第1の開口径で得られた複数の前記微弱光画像を前記表示装置に表示させ、
前記画像解析部は、表示させた複数の前記微弱光画像の中から選択された前記微弱光画像と最も近いタイミングで取得された一組の2次元微弱光画像に基づいて合成された前記3次元微弱光画像を用いて所定の解析を行う、
請求項10に記載の解析システム。
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