JP2001519665A - ラフィノースサッカリドおよびフィチン酸のレベルが低下している種子を生産する大豆植物 - Google Patents

ラフィノースサッカリドおよびフィチン酸のレベルが低下している種子を生産する大豆植物

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、大豆種子のラフィノースサッカリド、スクロース、フィチン酸、および向きリン酸含有量を変化させ、そのため価値ありかつ有用な大豆製品をもたらす大豆酵素の同定、特徴決定、および操作に関する。本発明は、他の大豆系統と比較すると、発達中の種子の組織中でのミオイノシトール 1−リン酸の合成のための能力が減少している大豆系統を含む。本明細書に教示されるように、複数の手段の内のいずれかによるミオイノシトール 1−リン酸シンターゼ酵素活性の低減によりこの表現型を提示する大豆種子がもたらされる。

Description

【発明の詳細な説明】 ラフィノースサッカリドおよびフィチン酸のレベルが低下している種子を生産す る大豆植物 発明の分野 本発明は植物の分子生物学および遺伝学の分野に関する。一層具体的には本発 明は、種子中のミオイノシトール 1−リン酸の生産についての能力が遺伝可能 な状態で減少している大豆系統の使用の関数としてラフィノース、スタキオース 、およびフィチン酸の含有量が有意に低く、そしてスクロースおよび無機リン酸 の含有量が有意に高い大豆蛋白質および荒粉製品に関する。 発明の背景 ラフィノースサッカリドは、植物では広域に分布するスクロースのD−ガラク トース含有性オリゴサッカリドの一群である。ラフィノースサッカリドは、一般 式O−α−D−ガラクトピラノシル−(1→6)n−α−D−グルコピラノシル −(1→2)−β−D−フルクトフラノシドを有し、かつn=1からn=4であ る場合には、それぞれラフィノース、スタキオース、バーバスコース、およびア ジュゴースとして知られることに特徴がある。大豆種子ではラフィノースおよび スタキオースが最大量で存在するラフィノースサッカリドである。対照的に、バ ーバスコースおよびアジュゴースは主要でない構成成分であり、一般的には標準 的分析法によっては検出されない。 ラフィノースサッカリドの存在についての広域にわたる植物学的調査が科学的文 献に報告されている[Day,P.M.In Biochemistry of Storage Carbohydrates in Green Plan ts,Academic Press、London,(1985)pp53− 129]。ラフィノースサッカリドは植物界での量の多さに関して非構造性炭水 化物中、スクロースの次ぎにくると考えられる。事実ラフィロースサッカリドは 、少なくとも高等な植物の中では広汎に存在し得る。ラフィロースサッカリドは 経済的に重要な多くの作物種の食用部分に大量蓄積する。その例には、大豆(グ リシン マックス L.メリル(Glycine max .Merrill ))、テンサイ(ベタ ブルガリス(Veta vulgaris))、綿花( ゴシッピウム ヒルステゥム L.(Gossypium hirsutum .)、カノーラ(ブラッシカ エスピー(Brassica sp.))、な らびにインゲン豆(ファセオルス エスピー(Phaseolus sp.)) ヒヨコマメ(キケル アリエティヌム(Cicer arietinum))、 ササゲ(ビグナ ウングイクラタ(Vigna unguiculata))、 ヤエナリ(ビグナ ラディアタ(Vigna radiata))、エンドウマ メ(ピスム サティブム(Pisum sativum))、ヒラマメ(レンズ クリナリス(Lens culinaris))、およびハウチマメ(ルピヌ ス エスピー(Lupinus sp.))を含む全ての主要食用マメ科作物が ある。 多くの種に豊富に存在するものの、ラフィノースサッカリドは幾つかの経済的 に重要な作物種の効率的な利用の障害となっている。ラフィノ ースサッカリドは動物により直接消化されず、その主な理由はα−ガラクトシダ ーゼが腸粘膜に存在しないためである[Gitzelmann and Aur icchio.(1965)Pediatrics 36:231−236;R utloff et al.(1967)Nahrung.11:39−46] 。しかしながら、腸下部中のミクロフローラは容易にラフィロースサッカリドを 発酵させることができ、それにより腸の酸化、ならびに二酸化炭素、メタン、お よび水素の生産がもたらされる[Murphy et al.(1972)J. Agr.Food.Chem.20:813−817;Cristofaro et al.In Sugars in Nutrition、(1974)C apter 20,313−335;Reddy et al(1980)J. Food Science 45:1161−1164]。結果として生じる鼓 腸により、ヒトを含む動物用食品におけるマメ科植物の使用がひどく制限され得 る。ラフィノースサッカリドの存在がヒトを含む動物の食事中での大豆の使用を 制限してしまうことは残念であり、なぜならそれ以外の点ではこの種は蛋白質お よび繊維の優れた源であるためである。 大豆は、世界中の多くの地域で広く利用できる収穫、貯蔵、および処理用の機 械および施設によく適用する。米国だけでもおおよそ2800万メートルトンの 荒粉が1988年に生産された[Oil Crops Situation a nd Outlook Report、Apr、1989、U.S.Dept. of Agriculture、Economic Research Ser vice]。典型的には籾殻を取り除き、そしてその後に幾つかの抽出系の内の 一つでヘキサン を用いて油を抽出する。残りの脱脂されたフレークをその後に多種多様の商業用 大豆蛋白質製品用に用いることができる[Soy Prote in Prod ucts、Characteristics,Nutritional Asp ects and Utilization(1987)Soy Protei n Council]。最も重要なこととして、これらの中で大量に用いられて いるのは大豆荒粉であり、これは動物のえさ、特に家禽類および豚のような単胃 動物のためのものに用いられる食料中の主要蛋白質源である。 大豆は優れた植物性蛋白質源であるものの、ラフィノースサッカリドの存在の ためにその使用が非効率性なものになっている。動物の餌中の別の主要成分であ るトウモロコシに比べ、大豆荒粉についての総エネルギー利用率は低い[Pot ter and Potchanakorn.In:Proceedings World Soybean Conference III、(1984)2 18−224]。例えば、大豆荒粉は、挽いたイエローコーン(yellow corn)と比較すると約6%高い総エネルギーを含むものの、ニワトリに餌を 与える最の代謝可能なエネルギーは約40〜50%少なくなる。この総エネルギ ー利用率の非効率性は、その荒粉の蛋白質分画の消化の際の問題に起因するので はなく、むしろその荒粉の炭水化物の消化不良に起因するように思われる。エタ ノール抽出による大豆荒粉からのラフィノールサッカリドの除去により、ブロイ ラーについての代謝可能なエネルギーがかなり増加することが報告されている[ Coon、C.N.et al.In:Proceedings Soybea n Utilization Alternatives、Universit y of M innesota、(1988)203−211]。ラフィノースサッカリドの 除去は大豆荒粉のセルロース系誘導体およびヘミセルロース系誘導体の利用率増 加に関連していた。 多種多様の加工植物性蛋白質製品は大豆から製造される。これらの製品は、例え ば大豆荒粉、グリット(grits)、および小麦粉のような最小限の加工を施 した脱脂品目から、大豆蛋白質濃縮物および大豆蛋白質単離物のような一層高度 の加工を施した品目にまでわたる。他の大豆蛋白質製品では、油は抽出されず、 その一例は全脂肪大豆粉である。これらの加工製品に加え、インゲン豆全体を出 発物質として利用する伝統的な東洋的(Oriental)加工法に基づく多数 の特製品も存在する。その例としては、豆乳、醤油、豆腐、納豆、味噌、テンペ 、およびユバがある。 ヒトの食物における大豆蛋白質の使用の例には、大豆蛋白質濃縮物、大豆蛋白 質単離物、植物性大豆蛋白質、豆乳、および乳児用調合乳がある。大豆からの蛋 白質濃縮物および単離物を生産するための設備および方法は全世界で利用可能と なっている。大豆濃縮物および単離物の生産者が直面している問題の一つはラフ ィノースサッカリドから蛋白質のみを選択的に精製するという努力目標である。 大豆中に存在する大量のラフィノースサッカリドを除去する結果、かなりの装置 と運営費用が必要となる。 ラフノースサッカリドに関連する問題および費用は、大豆種子のラフィノース サッカリドの含有量を減少させる遺伝子利用を通して減少もしくは除去すること ができる。このような遺伝子を用いて、本質的にラフィノースサッカリド含有量 が減少している大豆品種を開発することができ る。本質的にラフイノースサッカリド含有量が減少している大豆品種は派生大豆 蛋白質製品の栄養品質を改善し、そしてラフィノースサッカリドの除去に関連す る加工費用を低減する。低ラフィノースサッカリド大豆品種は動物およびヒトの 食事用の通常の品種よりも価値が高く、そして人間がこの食用豆果の所望される 栄養特製を一層完全に利用することを可能にする。 ミオイノシトール六リン酸(「フィチン酸」としても知られている)とラフィ ノースサッカリドは、両者の合成中の共通中間体としてミオイノシトールを共有 している[Ishitani,M.et al.、(1996)The Pla nt Journal 9:537−548]。ラフィノースサッカリド同様、 フィチン酸は被子植物種子のほぼ偏在的な構成成分である[Raboy,V.I n:Inositol Metabolism in Plants(1990 )Wiley−Liss、New York、pp55−76]。フィチン酸は 典型的には、例えば大豆やトウモロコシのような種子中の全リン酸の内の50〜 70%を占める一方で、こういったリン酸は単胃動物には不十分にしか利用され ない。部分的に消化可能であるのみであることに加え、動物の食料中のフィチン 酸の存在により、例えば必須アミノ酸、カルシウム、および亜鉛のような他の限 定された栄養素の排出がもたらされる[Mroz,Z.et al.,(199 4)J.Animal Sci.72:126−132;Fox et al. 、In:Nutritional Toxicology Vol.3、Aca demic Press,San Diego(1989)pp.59−96] 。大豆荒粉は多くの動物餌用食料の主要部分であるため、フィチン酸の量 が減少していると共に利用可能なリン酸の量が増加している荒粉により、大豆含 有性食料中の食料供給効率性が改善されるはずである。事実、大豆含有性食料を 酵素で処理してフィチン酸からのリン酸基を部分的に加水分解することにより、 リン酸の利用率と他の限定された栄養素の利用率の両方ともが改善する[Mro z et al.、上述;Pen et al.、(1993)Biotech nology 11:811−814]。 商業用および野生の大豆生殖質の調査により、種子のフィチン酸含有量を遺伝 的に変化させる際には制限が伴うことが示されている[Raboy et al .、(1984)Crop Science 24:431−434]。これら の要素を考え合わせると、種子におけるラフィノースサッカリドおよびフィチン 酸のレベルが遺伝的、実質的に減少している大豆植物が必要とされることは明ら かである。 発明の要約 本発明は、(i)種子のフィチン酸含有量が17μモル/gを下回り、(ii )種子のラフィノースとスタキオースとの合計含有量が14.5μモル/gを下 回り、そして(iii)種子のスクロース含有量が200μモル/gを上回る遺 伝性表現型を有する大豆植物に関し、その表現型はその植物の種子中のミオイノ シトール 1−リン酸の合成についての能力の減少に由来する。本発明は更には 、この植物に由来する種子にも関する。 一層具体的には本発明は、大豆のミオイノシトール 1−リン酸シンターゼを コードする単離された核酸断片もしくはその相補物、ならびに 適切な調節配列に操作可能に連結されるこの核酸断片もしくはこの核酸断片の亜 断片を含むキメラ遺伝子(この場合、このキメラ遺伝子の発現により、大豆ミオ イノシトール 1−リン酸シンターゼをコードする本来の遺伝子の発現が減少す る)に関する。 本発明の他の態様は、ミオイノシトール−1−リン酸の合成のための能力が減 少している突然変異体ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコードする単 離された核酸断片である。 本発明のさらに別の態様は、そのゲノム中に、適切な調節配列に操作可能に連 結される大豆ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコードする核酸断片も しくはその核酸断片の相補物を含むキメラ遺伝子を有する(この場合、このキメ ラ遺伝子の発現により、大豆ミオイノシトール−1−リン酸シンターゼをコード する本来の遺伝子の発現が減少する)大豆植物である。 本発明のさらに別の態様は、ミオイノシトール 1−リン酸の合成についての 能力が減少している突然変異体ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコー ドする少なくとも一つの遺伝子についてホモ接合体である大豆植物であって、そ の遺伝子により(i)種子のフィチン酸含有量が17μモル/gを下回り、(i i)種子のラフィノースとスタキオースとの合計含有量が14.5μモル/gを 下回り、そして(iii)種子のスクロース含有量が200μモル/gを上回る 遺伝性表現型が付与される。 本発明はさらに、先に記載される植物の内のいずれかのものの種子およびその ような種子に由来する蛋白質産物にも関する。 本発明のさらに別の態様は、(i)種子のフィチン酸含有量が17μ モル/gを下回り、(ii)種子のラフィノースとスタキオースとの合計含有量 が14.5μモル/gを下回り、そして(iii)種子のスクロース含有量が2 00μモル/gを上回る遺伝性表現型を有する大豆植物を作成するための方法に 関し、その方法は、(a)大豆系統LB33、もしくはそのゲノム内に、適切な 調節配列に操作可能に連結される大豆ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼ をコードする核酸断片もしくはその核酸断片の相補物を含むキメラ遺伝子を有す るいずれかの大豆植物、またはミオイノシトール 1−リン酸の合成についての 能力が減少している突然変異体ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコー ドする少なくとも一つの遺伝子についてホモ接合体である大豆植物を、えり抜き の大豆植物と交雑させること;および(b)(i)種子のフィチン酸含有量が1 7μモル/gを下回り、(ii)種子のラフィノースとスタキオースとの合計含 有量が14.5μモル/gを下回り、そして(iii)種子のスクロース含有量 が200μモル/gを上回る遺伝性表現型を有する段階(a)の交雑子孫植物を 選択することを含む。 本発明はさらには、(a)農業経済学的にえり抜きの大豆植物を、記述の大豆 植物の内のいずれかと交雑させること;(b)(i)17μモル/gを下回る種 子のフィチン酸含有量、(ii)14.5μモル/gを下回る種子のラフィノー スとスタキオースとの合計含有量、および(iii)200μモル/gを上回る 種子のスクロース含有量について段階(a)から取得される子孫植物の種子をス クリーニングすること;および(c)段階(b)で選択された種子を処理して所 望される大豆蛋白質製品を取得することを含む、大豆蛋白質製品を生産するため の方法を態様とする。 最後に本発明は、ミオイノシトール 1−リン酸の合成についての能力が減少し ている突然変異体ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコードする少なく とも一つの遺伝子についてホモ接合体である大豆植物を用いる方法を態様とし、 その遺伝子により(i)種子のフィチン酸含有量が17μモル/gを下回り、( ii)種子のラフィノースとスタキオースとの合計含有量が14.5μモル/g を下回り、そして(iii)種子のスクロース含有量が200μモル/gを上回 る遺伝性表現型が付与され、その方法は(a)ミオイノシトール 1−リン酸の 合成についての能力が減少している突然変異体ミオイノシトール 1−リン酸シ ンターゼを含む大豆植物をその突然変異を含まないいずれかの大豆親と交雑させ てF1ハイブリッドを取得すること;(b)少なくとも一世代につきそのF1ハ イブリッドを自家授粉させること;および(c)ミオイノシトール 1−リン酸 の合成についての能力が減少している突然変異体ミオイノシトール 1−リン酸 シンターゼをコードする少なくとも一つの遺伝子についてホモ接合性である段階 (b)の子孫を同定することを含み、その遺伝子により(i)17μモル/gを 下回る種子のフィチン酸含有量、(ii)14.5μモル/gを下回る種子のラ フィノースとスタキオースとの合計含有量、および(iii)200μモル/g を上回る種子のスクロース含有量という遺伝性表現型が付与される。 図面の簡単な説明および配列表 本発明は、本出願の一部を形成する図面および配列表から一層完全に理解され 得る。この配列表は、引用により本明細書に取り込まれる37 C.F.R.1 .822に特定されるアミノ酸のための3文字コー ドを含む。 図1。大豆種子中のフィチン酸、ラフィノース、およびスタキオースへのグル コース代謝。共通の補因子であるATP、ADP、UTP、UDP、ピロリン酸 (pyrophosphave)、および無機リン(Pi)は図示されない。酵 素は略称により列挙される:ヘキソキナーゼ(HK);ホスホグルコイソメラー ゼ(PGI);UDPグルコースピロホスホリラーゼ(UDPGPP);UDP グルコース4’エピメラーゼ(UDPG4’E);ミオイノシトール 1−リン 酸シンターゼ(MI 1−PS);ミオイノシトール 1−ホスファターゼ(M I 1−Pase);ミオイノシトール 1−リン酸キナーゼ(MI 1−PK );ガラクチノールシンターゼ(GAS);スクロースシンターゼ(SucS) ;ラフィノースシンターゼ(RS);およびスタキオースシンターゼ(SS)。 配列番号1は、クローン p5bmi−1ps中に存在する野生型大豆ミオイ ノシトール 1−リン酸シンターゼをコードするcDNAの1782塩基からな る5’−3’ヌクレオチド配列である。 配列番号2は、配列番号1の読み取り枠から推定された510アミノ酸配列で ある。 配列番号3は、大豆系統LR33からのミオイノシトール 1−リン酸シンタ ーゼcDNAの単離の際に用いられる上流(5’)プライマーのヌクレオチド配 列である。 配列番号4は、大豆系統LR33からのミオイノシトール 1−リン酸シンタ ーゼcDNAの単離の際に用いられる下流(3’)プライマーのヌクレオチド配 列である。 配列番号5は、クローンLR33−10に存在するLR33ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコードするcDNAの1533塩基のヌクレオチト配 列てある。 配列番号6は、配列番号5の読み取り枠から推定される510アミノ酸配列で ある。 配列番号7は、ゲンムDNA試料からのミオイノシトール 1−リン酸シンタ ーゼをコードする野生型対立遺伝子のPCR増幅のために用いられる上流(5’ )プライマーのヌクレオチド配列である。 配列番号8は、ゲノムDNA試料からのミオイノシトール 1−リン酸シンタ ーゼをコードするLR33対立遺伝子のPCR増幅のために用いられる上流(5 ’)プライマーのヌクレオチド配列である。 生物学的寄託物 以下の生物学的材料はブダペスト条約の条項に従い、American Ty pe Culture Collection(ATCC)、12301 Pa rklawn Drive、Rockville、MD 20852に寄託して あり、そして以下の受託番号を保持している: 詳細な記述 本開示の文脈では多数の用語が使用される。本明細書に用いられる際 には「大豆」は、種グリシン マックス(Glycine max)、グリシン ソジャ(Glycine soja)、もしくはグリシンマックス(Glyc ine max)と性的交雑適合性を示すいずれかの種を意味する。「系統」は 、少なくとも一つの特徴について個体間にほとんどもしくは全く遺伝的変異を示 さない類似の親子関係の植物の群である。このような系統は、一回もしくは複数 回の自家授粉生殖および選択、または組織培養もしくは細胞培養技術によるもの を含む単一の親からの栄養繁殖により作成されてよい。「突然変異」は、隔離も しくは遺伝子組換えによりもたらされるのではない検出可能かつ遺伝性の遺伝子 変化(自律性もしくは誘導性のいずれか)を意味する。「突然変異体」は、突然 変異を保持する個体もしくは個体の系統を意味する。「集団」は、共通の遺伝子 プールを共有する個体のいずれかのグループである。本発明では、これにはM1 、M2、M3、M4、F1、およびF2集団が含まれる。本明細書で用いられる 場合には、「M1集団」は突然変異誘発剤に露出してある種子(および得られる 植物)の子孫である一方で、「M2集団」は自家授粉したM1植物の子孫であり 、「M3集団」は自家授粉したM2植物の子孫であり、そして「M4集団」は自 家授粉したM3植物の子孫である。本明細書で用いられる際には「F1集団」は 、ある系統と別の系統の他家授粉によりもたらされる子孫である。このような他 家授粉を説明するために本明細書で用いられるフォーマットは「雌型親*雄型親 」である。「F2集団」は、自家授粉させたF1植物の子孫である。「F2由来 系統」もしくは「F2系統」は、個別のF2系統の自家授粉によりもたらされる 系統である。F2由来系統は、前記F2由来系統の植物の自家授粉およびそのよ うな植物からの種子のバルキン グ(bulking)を反復することにより後の世代(F3、F4、F5ナド) を通して継代することができる。 用語「核酸」は、糖、リン酸、およびプリンもしくはピリミジンのいずれかを 含む単量体(ヌクレオチド)からなる、一本鎖もしくは二本鎖であることができ る巨大分子を意味する。「核酸断片」は、所定の核酸分子の分画である。「亜断 片」は、全体の核酸断片よりは少ないものを含む核酸断片の連続部分を意味する 。「相補的」は、核酸を含むプリンとピリミジンの特異的対合を意味し:アデニ ンはチミンと対合し、そしてグアニンはシトシンと対合をする。従って第一核酸 断片の「相補物」は、ヌクレオチド配列が第一核酸配列に相補的な第二核酸断片 を意味する。 高等植物ではデオキシリボ核酸(DNA)は遺伝物質である一方で、リボ核酸 (RNA)はDNA中の情報の蛋白質への移転に関わる。「ゲノム」は、ある生 物体の各細胞内に含まれる遺伝物質の全体物である。用語「ヌクレオチド配列」 は、一本鎖もしくは二本鎖であることができ、場合によってはDNAもしくはR NA中に取り込ませることができる合成、非天然、もしくは改変させたヌクレオ チド塩基を含むDNAもしくはRNAポリマーの配列を意味する。用語「オリゴ マー」は、通常最高100塩基長までの短いヌクレオチド配列を意味する。本明 細書に用いられる際には用語「相同の」は、2つの核酸分子のヌクレオチド配列 の間、もしくは2つの蛋白質分子のアミノ酸配列の間に関連性があることを意味 する。このような相同性の評価は、当業者にはよく理解されているストリンジェ ントな条件下でのDNA−DNAもしくはDNA−RNAハイブリダイゼーショ ンのいずれかによるか(Hames and Higgins、Eds.(1985)Nucleic Acid Hybri disation,IRL Press、Oxford、U.K.);またはN eedlemanら(J.Mol.Biol.(1970)48:443−45 3)の方法によるような2つの核酸もしくは蛋白質の間の配列類似性の比較によ り提供される。本明細書で用いられる際には「実質的に類似する」は、例えばコ ーディング領域に対応する遺伝子および疑遺伝子のような特許請求される配列の コーディング領域とヌクレオチドレベルで90%を上回る総体的同一性を有する ヌクレオチド配列を意味する。本明細書に記載される核酸断片は人工的および天 然の両方である可能な変種を含む分子を含み、これは例えば、次のものに制約さ れる訳ではないが、(a)コードされるアミノ酸に変化を生じない塩基変化に関 与するもの、または(b)アミノ酸は変化させるが、DNA配列によりコードさ れる蛋白質の機能特性には影響を及ぼさないもの、(c)核酸断片の欠失、再編 成、増幅、ランダムもしくは調節された突然変異誘発に由来するもの、および( d)時折でも生じるヌクレオチド配列エラーである。 「遺伝子」は、コーディング領域の前にくる(5’−非コーディング)および 後にくる(3’−非コーディング)調節配列を含む特異的蛋白質を発現する核酸 断片を意味する。「固有の」は、天然に見いだされる自己の調節配列とともに単 離された遺伝子を意味する。「キメラ遺伝子」は、天然には見いだされない異種 調節配列およびコーディング配列を含む遺伝子を意味する。「内因性」遺伝子は 、通常はゲノム中の天然の位置に見いだされ、そして単離されない天然の遺伝子 を意味する。「外来性」遺伝子は、宿主生物内には通常見いだされないが遺伝子 移入により 導入される遺伝子を意味する。「疑遺伝子」は、機能性酵素をコードしないゲノ ムヌクレオチド配列を意味する。 「コーディング配列」は、特異的蛋白質をコードし、そして非コーディング配 列を除外するDNA配列を意味する。これは「中断されないコーディング配列」 、すなわちイントロンを欠失する配列を構築することがあってよいか、あるいは 適切なスプラス部位と連結する一つもしくは複数のイントロンを含んでよい。「 イントロン」は、初期転写物に転写され、しかし蛋白質に翻訳され得る成熟した mRNAを作成するために細胞内ではRNAの開裂および再連結を通して除去さ れるヌクレオチド配列である。 「開始コドン」および「停止コドン」は、蛋白質合成(mRNA翻訳)の各々 開始および鎖停止を特定するコーディング配列中の3つの隣接するヌクレオチド の単位を意味する。「読み取り枠」は、アミノ酸配列をコードする、開始コドン と停止コドンとの間のイントロンにより中断されないコーディング配列を意味す る。 「RNA転写物」は、DNA配列のRNAポリメラーゼによる触媒反応を受け る転写によりもたらされる産物を意味する。RNA転写物がDNA配列の完全な コピーである場合には、これは初期転写物として引用されるか、あるいは初期転 写物の転写後プロセシングに由来するRNA配列であってよく、そしてその後に それは成熟RNAとして引用される。「メッセンジャーRNA(mRNA)」は 、イントロンを有すさず、そして細胞により蛋白質へと翻訳され得るRNAを意 味する。「cDNA」は、mRNAに由来する二本鎖DNAを意味する。「セン ス」RNAは、mRNAを含むRNA転写物を意味する。「アンチセンスRNA 」は、 標的初期転写物もしくはmRNAの全てもしくは部分に相補的であり、そしてそ の初期転写物もしくはmRNAのプロセシング、輸送、および/または翻訳を中 断することにより標的遺伝子の発現を遮断するRNA転写物を意味する。アンチ センスRNAの相補性は、特異的遺伝子転写物のいずれかの部分、すなわち5’ 非コーディング配列、3’非コーディング配列、イントロン、もしくはコーディ ング配列に対するものであってよい。それに加え、本明細書で用いられる場合に は、アンチセンスRNAは、遺伝子発現を遮断するためにアンチセンスRNAの 効力を増加させるリボザイム配列の領域を含んでよい。「リボザイム」は、触媒 性RNAを意味し、そして配列特異的エンドリノヌクレアーゼを含む。 本明細書に用いられる場合には「適切な調節配列」は、本発明の核酸断片の発 現を調節する、本発明の核酸断片の上流(5’)、その中、および/または下流 (3’)に位置する固有もしくはキメラ遺伝子中のヌクレオチド配列を意味する 。 「プロモーター」は、通常そのコーディング配列の上流(5’)の遺伝子中の DNA配列を意味し、これは適切な転写に必要とされるRNAポリメラーゼおよ び他の因子にとっての認識を提供することによりコーディング配列の発現を調節 する。人工DNA構築物では、プロモーターを用いてアンチセンスDNAを転写 することもできる。プロモーターは、生理学的もしくは発生的条件に対応して転 写開始の効率を調節する蛋白質因子の結合に関与するDNA配列をも含むことが あってよい。これはまた、エンハンサー因子をも含んでよい。「エンハンサー」 は、プロモーター活性を刺激することができるDNA配列である。それはプロモ ーターの内在因子であるか、あるいはプロモーターのレベルおよび/また は組織特異性を冗進させる目的で挿入された異種因子であってよい。「構造性プ ロモーター」は、全組織中での遺伝子発現をいつでも指令するものを意味する。 本明細書に引用される「組織特異的」もしくは「発達特異的」プロモーターはそ れぞれ、例えば葉や種子のような特異的組織中か、あるいは例えば初期胚形成も しくは後期胚形成のような組織中の特異的発達段階にほぼ独占的に遺伝子発現を 指令するものである。用語「発現」は、本明細書に用いられる場合には、細胞の 蛋白質製造装置と組合わさって、ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼのレ ベルの変化をもたらす本発明の核酸断片(一つもしくは複数)に由来するセンス (mRNA)もしくはアンチセンスRNAの転写および安定な蓄積を意味する。 「アンチセンス阻害」は、標的蛋白質の発現を妨害することができるアンチセン スRNA転写物の生産を意味する。「過剰発現」は、正常もしくは形質転換され ていない生物内での生産のレベルを上回るトランスジェニック生物中での遺伝子 産物の生産を意味する。「共抑制」は、外来性遺伝子および内因性遺伝子の両方 の発現の抑制をもたらす内因性遺伝子に対する実質的相同性を有する外来性遺伝 子の発現を意味する。「変化されたレベル」は、正常もしくは形質転換していな い生物のものとは異なる量もしくは比率でのトランスジェニック生物体における 遺伝子産物(一つもしくは複数)の生産を意味する。本発明は更には、本発明の ヌクレオチド配列を含むベクター、本発明のベクターで遺伝子工学的に作成され る宿主細胞、および組換え技術による本発明のポリペプチドの生産にも関する。 「形質転換」は本明細書では、宿主生物体のゲノム内への外来性遺伝子の移入お よびその遺伝子的に安定な遺伝形質を意味する。「受精(結実)能力のある」は 、性的に繁殖することが可能な 植物を意味する。 「ラフィノースサッカリド」は、一般式O−α−D−ガラクトピラノシル−( 1→6)n−α−D−グルコピラノシル−(1→2)−β−D−フルクトフラノ シド(式中、n=1〜4)のオリゴサッカリドのファミリーを意味する。大豆種 子ではこの用語は、一つ(ラフィノース)および二つ(スタキオース)ガラクト ース残基を含むファミリーのメンバーを一層具体的に意味する。より高級なガラ クトースポリマーも知られているものの(例えば、バーバスコースおよびアジュ ゴース)、大豆中のこれら高級ポリマーの含有量は標準検出法以下であり、そし てそのため総体的ラフィノースサッカリド含有量には有意には寄与しない。 「植物」は、真核生物および原核生物の両方である光合成性生物を意味し、こ の場合、用語「高等植物」は真核生物植物を意味する。 本発明は、大豆遺伝子の突然変異型、ならびに大豆種子および派生製品の炭水 化物およびフィチン酸組成を改良するための方法を提供する。本発明は、この遺 伝子中の突然変異を同定し、そして大豆種子のラフィノースサッカリドおよびフ ィチン酸含有量を減少させるために派生突然変異体大豆系統を使用するための方 法の例を教示する。本発明は更には、遺伝子サイレンシング技術(gene s ilencing technology)の使用方法、および大豆種子中のラ フィノースサッカリド含有量を低減させるために本発明中に発見されたミオイノ シトール1−リン酸シンターゼについての大豆遺伝子配列をも教示する。 本発明の植物に由来する種子は、市販されている品種と比較すると改善された 可溶性炭化水素含有量を示す。この改善により、ラフィノースとスタキオースの 総計含有量の減少がもたらされる。これらの系統の炭 水化物の特色は、他の大豆品種改良プログラムで用いられるもしくはそれにより 生産される極上系統もしくは生殖質系統に見られる特色とは劇的に異なっている 。 本発明の新規大豆遺伝子を生産する2つの個別の方法が教示される。最初の方 法では、ラフィノースとスタキオースの総計含有量を低下させる突然変異の導入 という試みに初めての成功を収めている。この方法により2つの主要遺伝子の発 見がもたらされ、その2つの遺伝子の内の一つの詳細についてが本発明に記載さ れており、これをこれまでに報告されてきたいずれかの系統よりも秀れた(ラフ ィノースとスタキオースの総計含有量を低下させるという点では)大豆系統を開 発するのに用いることができる。第二の方法では、本発明において教示される遺 伝子配列を利用し、この配列がランダム突然変異誘発およびスクリーニングを通 して取得されるものに類似する結果を達成するために特異的遺伝子サイレンシン グのトランスジェニック法に適用される。 本出願人はまず、化学的突然変異誘発により野生型大豆のゲノム中にランダム 突然変異誘発を導入する道を模索した。本発明は突然変異誘発剤としてNMU( N−ニトロ−N−メチル尿素)を利用したが、DNA構造および配列を変化させ ることが知られる他の作用物質も用いることができたであろう。NMU処理の後 に大豆種子を数世代にわたって作付けし、そして所望される表現型についてのス クリーニングを行うが;この際、最も重要なことは、ラフィノースッサカリド含 有量の変化であった。突然変異誘発させた大豆集団の初期スクリーニングにより ラフィノースサッカリドが低下していると思われる2系統、すなわちLR33お よびLR28が得られた(LR28は国際公開第WO93/07742 に開示されている)。LR33の低ラフィノースサッカリド表現型は、自家授粉 により生産されるLR33の3つの連続した世代の分析により遺伝可能であるこ とが証明された(表1)。 この系統により提示される独特な表現型をもたらすLR33中の生理学的欠損 は、一連の秀でた遺伝的および生化学的研究を実施することにより同定および特 徴決定された(例えば、以下の実施例2を参照されたい)。LR33における欠 陥は、この系統の低スタキオース表現型をもたらすLR28中の突然変異から遺 伝的および生化学的に顕著であることが示された。それに加え、LR33中の突 然変異はLR28における欠陥よりも大きな多面発現性を示し;本明細書は、L R33表現型はラフィノースサッカリド含有量が低いばかりでなく、種子中のフ ィチン酸、無機リン、およびスクロースレベルの変化ももたらすことを示す。更 なる分析により、LR33のみにより得られる遺伝情報が、大豆の子孫系統にこ の独特な表現型を付与し、そして突然変異体遺伝子もしくはLR33中の遺伝子 は他の大豆突然変異体系統に由来する遺伝子の表現型発現を促進させる単なる遺 伝子変更因子(genetic modifier)ではないことが確認された 。 LR33およびその子孫により示される遺伝可能な表現型の原因となる特異的 生化学的欠損が同定されている。これは、大豆種子中でのラフィノースサッカリ ドの生合成、ならびにフィチン酸と無機リンレベルの調節を考慮することにより 達成された。これら既知の生化学的経路に基づくと、一連の生化学的研究および その後の分子遺伝学的分析により、ミオイノシトール 1−リン酸の合成につい ての能力の減少をもたらすミオイノシトール 1−リン酸シンターゼ活性の変化 としてのLR33種 子中での欠損が同定された。 ラフィノースおよびスタキオースの生合成についての特徴はかなり詳しく決定 されている[Day,P.M.In Biochemistry of Sto rage Carbohydrates in Green Plants(1 985)、を参照されたい]。ミオイノシトール六リン酸もしくはフィチン酸と ラフィノースサッカリドは、その合成の際の共通中間体としてミオイノシトール を共有している[Ishitani,M et al.The Plant J ournal(1996)9:537−548]。炭素源としてのグルコースか ら開始する、成熟している最中の大豆種子中でのフィチン酸、ラフィノース、お よびスタキオースの合成を説明する経路が図1に示される。 図1に示される相互変換により、グルコースもしくはスクロースのいずれかが フィチン酸のポリオール部分、ラフィノースおよびスタキオースを構成するヘキ ソースの全て、ならびにラフィノースシンターゼおよびスタキオースシンターゼ に対するガラクトース供与体であるミオイノシトールの再循環部分についての出 発物質になり得る。成熟した野生型大豆種子中に蓄積するこれらの相互変換物の 最終生成物は、量的に顕著な順では、スクロース、スタキオース、フィチン酸、 およびラフィノースとなる。 ラフィノースサッカリド生合成の主反応は、UDPガラクトースおよびミオイ ノシトールからのガラクチノール(O−α−D−ガラクトピラノシル−(1→1 )−ミオイノシトール)の合成を必要とする。この反応の触媒反応を行う酵素は ガラクチノールシンターゼである。スクロースからのラフィノース、およびラフ ィノースサッカチドファミリー中の 高度に類似する同族体の合成の触媒反応は、ガラクトシルトランスフェラーゼ、 ラフィノースシンターゼ、およびスタキオースシンターゼにより行われる。 これらの最終生成物の比率の制御は、図1の酵素触媒段階の内の多くのもので の転換率を変化させることにより影響を受けることがあってよい。この制御は、 酵素発現レベルを変化させることによるか、もしくはその酵素の固有の活性を変 化させることにより影響を受け得る。変更を受けた経路からもたらされる最終生 成物から得られる混合物は、もともとの最終生成物に加え、通常の中間体の内の 幾つかのものを含める新規生成物混合物を含むことがあってよい。厳密な混合物 および組成は、活性が変化させられてしまっている酵素と、その変化の程度の両 方に依存する。 6つの酵素である、ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼ、ミオイノシト ール 1−ホスファターゼ、UDP−グルコース4’エピメラーゼ、ガラクチノ ールシンターゼ、ラフィノースシンターゼ、およびスタキオースシンターゼの活 性は、スクロース含有量を減少させることなくラフィノースもしくはスタキオー スのいずれかの合成を減少させるために減少させることができる。これら6つの 内、ラフィノースとスタキオースの合成に特有な3つの酵素の活性はフィチン酸 含有量を減少させることなく減少させることができる。ミオイノシトール 1− リン酸シンターゼのみが3つ全ての最終生成物の合成に関わっていると思われ、 そしてそのためその活性が減少する際には3つ全ての最終生成物の量を変化させ ることがあってよい。 本発明は、大豆種子中の細胞内のミオイノシトール 1−リン酸シン ターゼ活性を減少させることにより、同時に大豆種子中のラフィノースサッカリ ドとフィチン酸含有量を減少させ、かつスクロースと無機リン含有量を増加させ る能力を教示する。これらの実施例は、この酵素をコードするヌクレオチド配列 内の点突然変異がアミノ酸置換をもたらし、そしてそれが次には細胞内酵素活性 を低下させるこの酵素の突然変異体形態の作成法および発見を記述する。ミオイ ノシトール 1−リン酸シンターゼについてのコーディング領域内での他の突然 変異が酵素活性の減少をもたらし、そしてそのため本種子表現型をもたらす事が できることは当業者によく知られている。異種遺伝子発現およびインビトロ突然 変異誘発のよく知られる技術を用い、そして本明細書に記載される多種多様の酵 素アッセイを利用することで、当業者は不適当な実験を行う事なく酵素活性の減 少をもたらすミオイノシトール 1−リン酸シンターゼコーディング領域内の別 の突然変異を同定する事ができるだろう。その後には、これらの突然変異を誘発 させたミオイノシトール 1−リン酸シンターゼ遺伝子を大豆ゲノム内に導入し (米国特許第5,501,967号を参照されたい)、そして本表現型を提示す る新規大豆品種をもたらすことができる。 別法では、例えばアンチセンス阻害技術(米国特許第5,107,065号) および共抑制(米国特許第5,231,020号)のような遺伝子サイレンシン グ技術を利用して、大豆種子の細胞内の細胞内ミオイノシトール 1−リン酸シ ンターゼ活性を減少させてもよい。本明細書は、野生型大豆ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼ酵素をコードする遺伝子の配列を教示する。当業者は、大 豆種子中のミオイノシトール 1−リン酸シンターゼ活性を減少させる野生型配 列もしくは実質的 に類似する配列の全てもしくは部分を含むキメラ遺伝子の作成方法および使用方 法は容易に理解できるであろう。 従って本発明は、大豆種子のラフィノースサッカリド、スクロース、フィチン 酸、および無機リン含有量の変化をもたらし、そしてそのことにより貴重かつ有 用な大豆製品をもたらす大豆酵素の同定、特徴決定、および操作法に関する。本 明細書に教示されるように、幾つかの手段の内のいずれかによるミオイノシトー ル 1−リン酸シンターゼ酵素活性の減少により、本表現型を提示する大豆種子 がもたらされる。 実施例 本発明は以下の実施例で更に明確になり、そして特に他に記載がない限りこれ らの実施例では全ての割合およびパーセンテージは重量によるものであり、そし て温度は摂氏である。これらの実施例は本発明の好ましい態様を示すものの、説 明の方法のみとして与えられることが理解されるべきである。先の論議およびこ れらの実施例から当業者は、本発明を様々な使用および条件に適用させるための 本発明の変法および変更法を確認することができるとともに、本発明の精神およ び範囲から逸脱することなくそれらを作成することができる。その上、本発明は 寄託されている生物学的材料により範囲を限定されることはなく、なぜなら寄託 された材料は、多くの態様が派生してきてよい材料の説明を提供を意図するもの であるためである。このような変法全ては添付される請求の範囲の範囲内に含ま れる。 例えば、細菌の形質転換、核酸のアガロースゲル電気泳動、および蛋白質のポ リアクリルアミド電気泳動のような分子生物学の通常の技術が、 それらを記述する一般的用語により引用される。当業者にはよく知られているこ れらの技術の実践法の詳細は、Sambrook,et al.(Molecu lar Cloning,A Laboratory Manual,2nd ed.(1989),Cold Spring Harbor Laborat ory Press)に詳しく記載されている。実験操作に用いられる様々な溶 液は、例えば「SSC」、「SSPE」、「デンハルト溶液(Denhardt ’s solution)」等のような一般名称により引用される。これらの溶 液の組成は、Sambrook,et al.[上述]の付属表Bに対する引用 により見いだされるだろう。 実施例1 炭水化物組成を改善させる大豆遺伝子の発見ラフィノースサッカリド含有量についてのアッセイ 以下のアッセイを用いてラフィノースサッカリド含有量について大豆種子を分 析した。ラフィノースサッカリド含有量の決定のための各分析測定の前に、種子 を少なくとも一週間の間、約8%の水分量になるまで空気乾燥させ、そしてその 後に約40〜50℃および40%の相対湿度下に貯蔵した。このように空気乾燥 させた試料の本発明者自身の測定値により、これらの条件下で貯蔵した際には含 水量は8%とは有意に異ならなかった(7〜10%の範囲)。 各個別のラフィノースサッカリドアッセイについては、典型的には所定の植物 からの5〜10の大豆を、100メッシュふるいを装着したシクロテック109 3サンプルミル(Cyclotech 1093 S ample Mill)(Tecator、Box 70 S−26301、H oganas社、Sweden)中で挽いて種子粉末を取得し、その後にこれを 分析した。大抵の場合、ラフィノースサッカリド含有量は約8%の「そのまま」 の含水量を含む種子または派生産物について測定した。このような場合、「その まま」の値は、測定値を0.92で割ることにより乾燥ベースの値(dry b asis)(db)に変換した。所定の系統もしくは所定の大豆蛋白質製品間で の比較のためには、挽いた種子粉末を、分析前に試料が定常重量(0%水分)に 達するまで45℃の強制循環熱風炉内に入れた。従って、本明細書内に報告され る全てのラフィノースサッカリド測定値は他に特別な記載がない限りは一般的な 乾燥基準のものである。 以下に記載されるように、3つのアッセイ(「酵素アッセイ」、「TLC」、 および「HPLC」)を用いて大豆種子のラフィノースサッカリド含有量を決定 した。3つ全てのアッセイとも後に記載する粉砕プロセスから得られる種子粉末 について実施された。 「酵素」アッセイについての準備段階では、各種子試料の粉砕後に得られる約 30mgの粉末を13×100mmのスクリューキャップ付きチューブ内に計量 し入れ、そして1.6mLのクロロホルムおよび1.4mLのメタノール:水( 4:3、v/v)を添加した。各試料の厳密な粉末重量を記録し、そしてそれを 用いて試料について後に得られるアッセイ結果を試料の重量の違いに対して調整 した。その後にチューブのキャップを閉じ、ラックに入れ、そしてロータリーシ ェーカー上で60分間、1800rpm、室温で震盪させた。取り出した後、チ ューブの内容物を15分間沈降させた。沈降後、メタノール:水相の内の15μ Lのア リコートを96穴マイクロタイタープレートのウエルに入れ、そして45℃で2 0分間乾燥させた。乾燥させたウエルを、アッセイ条件の改変物を伴う、以前に 記載されたα−ガラクトシダーゼとガラクトースデヒドロゲナーゼとを用いる連 結「酵素」アッセイ(coupled”enzymatic”assay)[S chiweck and Busching,(1969)Zucker 22 :377−384;Schiweck and Busching,(1975 )Zucker 28:242−243;Raffinose Detecti on Kit、Boehringer Mannheim GMBH、カタログ 番号428 167]用の反応容器として用いた。アッセイの改変事項には、ウ シ血清アルブミン(Bovine Serum Albumin)(15mg/ mL)のアッセイおよびα−ガラクトシダーゼ緩衝液への添加、α−ガラクトシ ダーゼインキュベーションの温度を室温から45℃へ上昇させること、そしてα −ガラクトースデヒドロゲナーゼのインキュベーション時間を20分から30分 に増加させること、ならびにα−ガラクトシド標準用にはラフィノースの代わり にスタキオースを用いることを含む。インキュベーション後、試料の340nm での吸光度を、BIO−TEK(商標)Model EL340Micropl ateリーダーで決定した。試料中に存在するα−ガラクトシドの量を、既知の 量のスタキオース標準の量との比較により決定した。多数の試料の分析を容易に するためには、酵素アッセイをもう一度反復して試験した。初回アッセイからラ フィノースサッカリド含有量が低下していると思われた系統はその後に、十分な 材料が利用可能である場合には挽いた種子から初めて3重検査として再アッセイ した。その 組成が二次アッセイで確認された系統を野外条件下で成熟するまで成長させ、そ してその野外成長させた植物からの種子を再度アッセイにかけた。ラフィノース サッカリドおよびガラクチノールの特性について一層特異的な情報が必要とされ る場合には、酵素アッセイにより同定された低ラフィノースサッカリド系統をH PLCアッセイ(以下に記載される)を用いて再アッセイした。 低ラフィノースサッカリド生殖細胞質の迅速選択を容易にするために、薄層ク ロマトグラフィー「TLC」アッセイを開発した。このアッセイのためには約6 0mgの挽いた種子粉末を13×100mmのスクリューキャップ付きチューブ 内に入れ、そこに1mLの4:3(v/v)メタノール:水および1mLのクロ ロホルムを添加した。チューブのキャップを閉じ、ラックに入れ、そしてロータ リーシェーカー内で60分、25rpm、室温で混合した。取り出した後、この チューブを2100rpmで5分間遠心分離にかけた。4μLの試料をメタノー ル:水層から取り出し、そして250mmの分析層を持つ20×20cmの「B aker」シリカゲル(Silica Gel)事前吸着/チャンネル型(ch anneled)TLCプレートにかけた。試料を室温で乾燥させ、そしてその 後にこのプレートを、酢酸エチル(Ethyl Acetate):イソプロパ ノール(Isopropanol):20%酢酸(Acetic Acid)( 水中)の3:4:4(v/v/v)溶液と共にTLCタンク内に入れた。この溶 液を分析用チャンネルに10cm分浸透させ、この時点でプレートを取り出し、 そして換気フード内で空気乾燥させた。その後にこのプレートにアニリン−ジフ ェニルアミン試薬を噴霧して試料中の炭水化物を同定した。この試薬は、1mL のアニリ ンを100mLのアセトン、1グラムのジフェニルアミン、および10mLのリ ン酸と混合することにより調製した。その後にこのプレートを100℃のオーブ ン内に15分間入れて乾燥させそして取り出し、そして冷ましてから分析用チャ ンネルの値を計測した。大豆試料中のスタキオースおよびラフィノース含有量は 純粋な標準中に見られる溶離パターンに対する比較により評価した。 本明細書では「HPLC」アッセイとして引用される高速アニオン交換クロマ トグラフィー/パルス電流アッセイを、個別のラフィノースサッカリド(例えば 、スタキオースおよびラフィノース)、ガラクチノールの含有量を決定し、そし て酵素アッセイもしくはTLCアッセイのいずれかの結果を確認するために用い た。種子を粉砕および抽出する条件は、以前の「酵素」アッセイについて用いら れたものと同一であった。水層の内の750μLのアリコートを取り出し、そし て80℃での減圧下で乾燥させた。その後に、乾燥させた物質を2mLの水に溶 解し、そして30秒間激しく混合させた。100mLのアリコートを取り出し、 そして水で1mLになるまで希釈した。この試料を再度完全に混合し、そしてそ の後に3分間、10,000×gでの遠心分離にかけた。遠心分離の後、20μ Lの試料を、1.3mL/分、室温で150mM NaOHを用いるDione x(商標)PAIカラムで分析した。Dionex(商標)PAD検出機を、E 1=0.05v、E2=0.60v、およびE3=−060v、そして3mAの 出力範囲で用いた。ガラクチノール、グルコース、フルクトース、スクロース、 ラフィノース、スタキオース、およびバーバスコースはこのクロマトグラフィー 条件で良く分離した。この試料中の炭水化物含有量は真の標準に対する比較によ り決 定した。 炭水化物分析により得られた結果を、ソフトウエアーであるSuperANOV A(Abacus Concepts,Inc.,1984Bonita Av enue,Berkeley、CA 94704)を用いる分散分析に供した。 適切である場合には、フィッシャーの保護LSD(Fisher’s Prot ected LSD)を、平均値の比較のためのこの後の検査として用いた。他 の比較を行う際には、標準誤差(SEM)により特定される範囲が重複しない場 合には平均値は統計学的に有意であるとみなした。ラフィノースサッカリドの平 均値を対照系統の平均値と比較する場合には、前記平均値が対照平均値のものの 少なくとも標準偏差の3倍を下回る場合、その平均値は対照のものよりも有意に 低いと見なした。突然変異誘発および突然変異体の選択 LR13(Williams82と本質的には同一な系統)の約130,00 0個の種子(22.7kg)を150Lの水道水中、8時間の連続通気条件下で 浸した。通気は、浸透用容器の底に設置した標準的水槽用「エアーストーン(a irstone)」を通して空気をポンプ輸送することにより達成した。水を吸 収した種子の排水を行い、そして0.1Mリン酸緩衝液でpH5.5に緩衝化さ せた98Lの2.5mM N−ニトロソ−N−メチル尿素(NMU)溶液に連続 通気下で移した。種子はNMU溶液中に3時間寝かせておき、そしてその後に残 存するNMUを浸出させるために何度もすすいだ。最初のすすぎについては、処 理した種子を45Lの水道水に1分間移した。二度目のすすぎについては 種子を45Lの新鮮な水道水に1時間の連続通気下で移した、三度目のすすぎに ついては、種子を2時間の連続通気下で45Lの新鮮な水道水に移した。4度目 のすすぎについては、種子を連続通気下で45Lの新鮮な水道水に移した。種子 の内の半分のものを2時間後には4度目のすすぎ液から取り出す一方で(亜集団 1)、もう半分の種子は5時間後に4度目のすすぎ液から取り出した(亜集団2 )。4度目のすすぎ液から取り出した後には種子の外部に存在する水分の排水を 行い、そしてボール紙の上に広げて1時間、日当たりで乾燥させた。水を吸収し たM1種子はその後、46cmの間隔を空けて一列に、一列中の1フィート当た り約14個の種子の密度、および2.5cmの深さで植え込んだ(Isabel a,Puerto Rico、USA)。 2プール分のM2種子(亜集団1および2からのもの)をM1植物からバルク として収穫した。亜集団1からの約40,000個のM2種子および亜集団2か らの52,000個のM2種子をIsabela,Puerto Rico、U SA、に植え込んだ。各亜集団内では、3,000個のM2植物各々から5つの 豆果を収穫し、そしてそれをまとめてバルクM3種子亜集団を取得した。M3バ ルクをIsabela,Puerto Rico、USA、に植え込んだ。成熟 時に、5000本のM3植物からの種子を個別に収穫して、各亜集団から500 0個のM3:4系統を取得した。 1991年の冬の間に少なくとも総計8,000個のM3;4系統のスクリー ニングを行って、先に記載される酵素法を用いてラフィノースサッカリドの含有 量を測定した。初回スクリーニングでは、総計ラフィノースサッカリド量が減少 している2系統が同定され、これは第二自家 授粉世代に遺伝可能であることが判明した。LR33と表示されるこの系統の内 の一つは、同一環境下で対照として生育させたえり抜きの大豆栽培品種との比較 ではスタキオースとラフィノースの両方共のレベルが減少していた、同一環境下 で生育させた3つのえり抜きの栽培品種についての平均値との比較では、LR3 3のスタキオース含有量は統計的に有意に低かった。3世代分についてLR33 から取得された自家授粉系統から収穫され、バルクとして取り扱った種子の可溶 性炭水化物含有量が表1に示される。 表1 系統LR33の自家授粉により取得される大豆系統の成熟した種子中の可溶性炭 水化物 (全ての値は、μモルg-1で表される) 1N.D.検出されず 後に生じる系統(1ST−83、2ST−88、および3ST−101)は全て LR33の自家授粉により取得された。これらの系統の各々のものは対照系統よ りも低いスタキオース含有量を示した。実施例2 LR33の低ラフィノースサッカリド表現型の原因となる生理学的欠陥の同定低ラフィノースサッカリド親としてLR33を用いる遺伝的交雑 大豆種子の総計ラフィノースサッカリド含有量をさらに低減させるための試み として、LR33とLR28との間での遺伝的交雑を行った。系統LR28は国 際公開第WO93/07742号に開示されている。簡潔に記載すると、これは 、実施例1に記載されるものに非常に類似するスクリーニング手法で発見された ラフィノースとスタキオースの両方が低くなっている系統でもある。低ラフィノ ース/スタキオース含有量は、一つの世代から次の世代までの間に一貫して見ら れた。それに加え、系統LR28および別の親との交雑によりLR28から得ら れた系統の成熟した種子のガラクチノール含有量発見された野生型大豆種子と比 較するとかなり上昇する。 LR33とLR28の交雑からのF1植物を生育および自家授粉させて分離F 2子孫を作成した。LR28に由来する系統、えり抜きの栽培品種、およびLR 28とLR33との交雑から得られる分離集団の種子を同一環境下で植え込んだ 。F2:3種子を各F2植物から収穫し、そして先に記載された酵素アッセイを 用いてα−ガラクトシド含有量についてスクリーニングした。予備スクリーニン グからの低α−ガラクトシド選択物をHPLCアッセイかけて完全なラフィノー スサッカリド特性を取得した。α−ガラクトシドの低総含有量について選択され た典型的 系統からの炭水化物特性が表2に示される。 表2 系統LR28およびLR33の交雑およびその後のよりすぐりの栽培品種に対す る戻し交雑から得られる大豆系統の成熟した種子内の可溶性炭水化物(LR33 および5ST−1003(LR28由来系統)は交雑親の例として含まれ;22 42はよりすぐりの栽培品種対照として含まれる。) (全ての値は、μモルg-1で表される) 1N.D.検出されず 5ST−1441、5ST−1434、および5ST−1309は全てLR28 交雑によりLR33から取得された。系統5ST−1441はLR33親に非常 に似通っているものの、驚くことに系統5SR−1434および5ST−130 9はいずれの親系統よりもラフィノースとスタキオースの両方が一層低くなって おり、かつ系統LR28の上昇したガラクチノールレベルという性質を持たない 。ラフィノースサッカリド経路における酵素活性のインビトロアッセイ LR28交雑によりLR33から得られる幾つかの系統において観察される予 期せぬラフィノース、スタキオース、およびガラクチノール表現型の原因を見い だすために設計された研究では、幾つかの酵素活性および代謝物プールを、迅速 なラフィノースサッカリド生合成の期間中、生理学的成熟段階に入る直前に収穫 した大豆種子中で測定した。種子を、黄色くなり始めた豆果から取り出した。緑 色を失いかけてもいるか、もしくはそれ自体が黄色くなり始めたばかりの豆果か らの種子を、ラフィノースサッカリド生合成における最後の3つの酵素のアッセ イ用に選択した(図1を参照されたい)。 種子を豆果から取り出し、重量測定をして生重量を取得し、その後にすり鉢中 で挽き、そして10倍容量の50mM HEPES−NaOH、pH7緩衝液( これはさらに、5mM 2−メルカプトエタノールをも含む)中ですりつぶした 。挽いた試料を10,000×gで10分間遠心分離にかけ、そしてその上清を 、粉砕用緩衝液中で平衡化させてあるセファデックス(Sephadex)G− 25を通過させることにより脱塩させた。 ガラクチノールシンターゼのアッセイについては、10μLの脱塩抽出物を、 90μLのpH7 HEPES緩衝液(これはさらに、20mM ミオイノシト ール、10mM ジチオスレイトール、1mM MnCl2、および1mM U DP−[14C]ガラクトース(1.25μCi μモル-1をも含む)に添加した 。このアッセイ混合物を10分間、25℃でインキュベートし、そしてその後に 400μLのエタノールの添加により停止させた。この停止させた反応物に対し 、200μLRの Dowex AG−1×8アニオン交換樹脂(BioRAD)を添加し、そして この混合物を25分間震盪させた。この樹脂を遠心分離により除去し、そして上 清をシンチレーション計測のために取り出した。非アニオン性放射活性をガラク チノール合成の測定値とした。 ラフィノースシンターゼおよびスタキオースシンターゼのアッセイについては 、50μLの脱塩抽出物を、50μLの25mM HEPES緩衝液(pH7) (これはさらに、ラフィノースシンターゼのアッセイ用には10mM ジチオス レイトール、10mM ガラクチノール、および40mM スクロースをも含み 、あるいはスタキオースシンターゼのアッセイのためには40mMのラフィノー スをも含む)に添加した。1時間、25℃でのインキュベーションの後、この反 応を40μLのエタノールの添加により停止させ、そしてその後に沸騰水浴中に 1分間入れて蛋白質を沈殿させた。この反応混合物を遠心分離にかけて清澄化し 、その上清を0.22ミクロンのフィルターに通し、そしてその後に減圧乾固( reduced to dryness under vacuum)させた。 この残渣を、0.5mLの水中に再溶解し、そして20μLを、ラフィノースお よびスタキオースの定量化について先に記載する要領でDionex HPLC システム上で分離させた。1994年8月に野外で成長させた植物から収穫した 種子を用いて実施された実験の結果が表3に示される。 表3 3つの大豆系統の種子が黄色くなる際のガラクチノールシンターゼ、ラフィノー スシンターゼ、およびスタキオースシンターゼの活性(野生型 対照は系統1923である。酵素活性は、このアッセイ条件下では、一時間あた りに新鮮な種子のグラム当たりに生産される産物のμモルとして表示される。) ラフィノースおよびスタキオース合成のみに大きく関わるこの3つの酵素の内、 ラフィノースシンターゼのみが、野生型と比較する際にはこの突然変異体、すな わち低ラフィノースサッカリド系統における活性の明らかな減少を示す。ラフィ ノースシンターゼの活性減少を生じる突然変異は、生合成経路におけるその酵素 の位置、および低ラフィノースサッカリド表現型の源としてLR28のみを保持 する系統において観察されるガラクチノールの蓄積と一致する。ガラクチノール とスクロースとはラフィノースシンターゼにとっての2つの基質であり、そして 両者はLR28含有性系統中に蓄積する(図1および表2を参照されたい)。 LR33系統をLR28系統との交雑した場合には、得られるスタキオース、 ラフィノース、およびガラクチノールが低レベルであるにもかかわらず、LR2 8突然変異により付与される減少したラフィノースシンターゼ活性は活性の変化 にしか過ぎなかった。減少したガラクチノールシンターゼ活性は、LR28と組 み合わせた際に突然変異により付与される減少したガラクチノール含有量に起因 するLR33系統内での病変についての候補物の可能性が高いと思われたものの 、その酵素のイン ビトロ活性に関しては測定値に減少は見られない。成熟しつつある大豆種子の遊離ミオイノシトール含有量のアッセイ LR28交雑によってはLR33中でのインビトロでのガラクチノールシンタ ーゼの減少は生じなかったものの、LR33に由来する系統の成熟しつつある種 子内でのガラクチノールシンターゼのインビボ活性が、その基質の内の一つの有 用性により制約を受けるという可能性についての確認を行った。ガラクチノール シンターゼに対するUDP−ガラクトースの供給は、UDP−グルコース 4’ エピメラーゼの突然変異により減少することがあり、そしてミオイノシトールの 供給は、そのシンターゼもしくは遊離イノシトール形態を生産する特異的ホスフ ァターゼのいずれかに影響を及ぼす突然変異により制限され得る(図1)。ミオ イノシトールプールは、野生型およびLR33に由来する種子中の総計遊離ミオ イノシトール含有量についてのアッセイを行うことにより確認した。3つの大豆 系統、すなわち一つの野生型栽培品種A2872、および2つのLR33×LR 28−由来系統である5ST−1434と5ST−1309を生育用室内で、1 6時間の日中時間、および30℃/22℃の昼夜温度条件下で生育させた。丁度 黄色になり始め、そしてそれ自体非常に明るい緑色から黄色へと変化しつつある 豆果から種子を取り出した。各系統からの3個の種子を、8mlの80%メタノ ール中で挽いた。この混合物を12,000×gで15分間遠心分離にかけ、そ して上清を50mLのフラスコにデカンテーションした。この抽出作業を二度繰 り返し、そして上清をあわせた。合わせた上清を40℃で減圧乾固し、そして残 渣を1mLの水に再溶解した。再溶解した抽出物を、3 mLの混合床型イオン交換樹脂(BioRad AG501×8)に通して脱塩 し、そして素通り部分に4mLの洗浄液が加わったものを再度乾固させた。この 残渣を500μLの水に再溶解し、そして70μLのアリコートを、70%アセ トニトリルを用いて1mL/分で溶出させるZorbax Aminoカラム( Dupont社)でのHPLCにより分離させた。カラム溶離液中の糖は示差屈 曲率により検出した。スクロースとミオイノシトールとの標準混合物の分離によ り、イノシトールは後になって出現し、そして部分的にのみスクロースから分離 されることが示された。種子抽出物の分析については、スクロースピークの後の 1mLの溶離液を、実施例1に記載されるDionex PADシステムでの再 注入用に捕獲した。Dionexシステムではミオイノシトールはスクロースの かなり前に出現し、そしてスクロースが混入しているZorbax Amino カラム分画とは明らかに分離された。ミオイノシトールの外部標準との比較によ り、野生型2827系統からの5μL注入物は3.2nモルのミオイノシトール を含む一方で、5ST−1413および5ST−1309からの5μL注入物は それぞれ0.39および0.23nモルを含んでいた。 野生型およびLR33由来の種子の遊離ミオイノシトール含有量の違いの特徴 を更に詳細に決定する目的で第二の実験を実施した。第二対照系統(2242) およびLR33由来系統である5ST−1413からの7つの個別の種子を、先 に記載される成熟基準に従って収穫した。個の種子の重量を個別に計量し、そし て1.5mLのミクロフュージチューブ内に入れ、スパチュラで粉砕し、ドライ アイス上で凍結させ、そして凍結乾燥させた。乾燥させた残渣の重量を測定し、 そして1mLの8 0%メタノール(これは1μモルのトレハロースを含む)を添加して、Zorb axアミノカラムにおけるミオイノシトール保持マーカーとして、そして内部標 準として利用した。抽出用培地を1時間、60℃に加熱し、マイクロフイージチ ューブ内で小さな乳棒を用いて再度挽き、そして遠心分離にかけて不溶性物質を ペレットにした。上清を、約100μLの混合床樹脂を含む第二ミクロフュージ チューブに移し、その混合物を簡単に震盪させ、そして樹脂の上の溶液20μL を取り出し、そして減圧乾固させた。この残渣を総計110μLの容積に再溶解 し、そして55μLを、先に記載されるZorbax Aminoカラム工程中 に注入した。トレハロースピークを捕獲し、そして20μLのカラム分画をDi onexシステムに再注入した。ミオイノシトールピークをトレハロース内部標 準に対して比較することにより定量化した。野生型ミオイノシトール含有量につ いての平均値±標準偏差は2.18±0.98μモル/(g乾燥重量)であった 一方で、5ST−1434種子は0.77±0.32μモル/(g乾燥重量)を 含んでいた。両方の実験により、LR33突然変異を保持する種子は、迅速なラ フィノースサッカリド合成の期間中に含むミオイノシトールの量が少なめである ことが示される。いずれの実験においても総計ミオイノシトールプールは完全に 非存在ではなかった。しかしながらこのような実験では代謝産物の総計種子プー ルが測定され得るのみであり、そしてミオイノシトールにはガラクチノールシン ターゼにより更にその使用が制約されるという別の運命も存在する(図1)。ラフィノースサッカリドをインビボラベルする際のミオイノシトール灌 流の効果 LR33由来の種子の遊離ミオイノシトール含有量の減少が観察されたことが 成熟時でのラフィノースサッカリド含有量の減少の原因となっているのかどうか を確認する目的で、組織切片供給試験を実施した。野生型系統2242とLR3 3由来の系統5ST−1413からの各4づつの種子を、先に記載される成熟基 準に従って収穫した。種皮を取り除き、そして子葉を5mMリン酸カリウム緩衝 液(pH5.5)中ですすぎ、そしてその後に約1mmの切片にスライスし、そ して再度緩衝液ですすいだ。この組織切片を2つのグループに分けた。一つ目の グループはリン酸カリウム緩衝液中に浸し、そして第二のグループは、50mM ミオイノシトールを含むリン酸カリウム緩衝液中に浸した。この組織切片を吸引 浸潤(vacuum−infiltrated)させ、そして室温で30分間イ ンキュベートした。予備インキュベーション期間の後、5μCiの14C−グルコ ースを各グループに添加し、そして組織を再度吸引浸潤(vacuum−inf iltrated)させた。各グループからの10枚の組織切片を、ラベル化さ せたグルコースの添加後、2時間目および8時間目に取り出した。これらの組織 切片を、タールを塗ってある(tarred)1.5mLミクロフュージチュー ブに入れて生の重量を取得し、そして300μLの80%メタノール中で挽いた 。このチューブを遠心分離にかけ、上清を第二チューブに取り出し、この抽出を 更にもう2回繰り返し、そして上清を合わせた。合わせた上清を減圧乾固し、5 0%のアセトニトリル中に再溶解し、そしてZorbaxアミノHPLCシステ ムで分離した。分画を、グルコース、スクロース、ラフィノース、およびガラク チノールを含むクロマトグラムの領域全体 にわたり15秒の間隔で、そしてスタキオースを含む領域全体では1分の間隔で シンチレーション計測用に回収した。糖の標準ピークに対応する放射活性分画を 分析用に分類した。この結果は、表4における4つの生成物の糖中の放射ラベル のパーセントとして表される。 表4 ミオイノシトールとの予備インキュベーションありおよびなしの条件での対照お よびLR33由来系統についてのスクロース、ガラクチノール、ラフィノース、 およびスタキオースからなる糖組み合わせ物におけるラベルのパーセンテージと して表される各糖中の放射ラベル 野生型および5ST−1434組織切片の両方は供給された14C−グルコース からのラベルをスクロースに、そしてその後にはガラクチノール、ラフィノース 、およびスタキオースに転換する。外からのミオイノシトールの添加がなければ 、LR33突然変異を含む系統(5ST−1434)は、野生型系統(8時間目 で58.9%)と比較すると非常に少量のラベルのみをラフィノースサッカリド (8時間目で20.5%)に転換するに過ぎない。両方の遺伝型とも、より多く の供給ラベルをラフィノースサッカリド糖に転換することで外来性ミオイノシト ールに応 答する。ミオイノシトールを添加すると、この2つの遺伝型は、供給ラベルをま ずガラクチノールに転換し、そしてその後にラフィノースとスタキオースに転換 する能力に関しては本質的に同等となる。転換速度は、非浸透対照と比較すると 、野生型系統でさえ上昇する。 ガラクチノールシンターゼへのミオイノシトールの供給は常に、ラフィノース およびスタキオースが合成され得る速度の制約となることは明らかである。LR 33突然変異の存在によりその制約が一層大きくなる。 ラベル化パターンはガラクチノールにおけるラベルの蓄積が全く存在しないと いう点では驚くべきものであり、このようなパターンはラフィノースシンターゼ におけるLR28突然変異が組み合わせ突然変異体系統ではその段階を通過する 流れをゆっくりにさせるという点で依然として効果的であれば予期されたであろ うものである。ミオイノシトールの添加がガラクチノールシンターゼを通しての ガラクチノールへの流れを増加させることが予想され得る一方で、ラベルはラフ ィノースシンターゼの活性低減に起因してそこに蓄積するはずであった。そのよ うな蓄積が存在しないことにより、この系統内でのLR28突然変異の効率もし くは存在のいずれかが疑問点となっている。種子のフィチン酸および無機リン酸レベルに対するLR33突然変異の影響 先の結果により、LR33突然変異は図1に示される経路中、遊離ミオイノシ トールの前に存在することが示唆される。突然変異の可能性部位を更に限定する ためには、経路のその部分の別の代謝産物の測定を行った。 大豆種子は成熟時には20〜30μモル/gのレベルでフィチン酸を含んでお り、そして種子の総計リン酸の内の50〜70%がフィチン酸に含まれるため[ Raboy et al.(1984)Crop Science 24:43 1−434]、ミオイノシトール合成に影響を及ぼす突然変異は、種子のフィチ ン酸および無機リン酸レベルにも影響を及ぼして良い可能性が強いと考えられる 。3つの野生型大豆系統およびLR33突然変異を含む3つの系統中のフィチン 酸および無機リン酸のレベルを乾燥させた種子で、Rayboy[上述]により 記載される方法の改変法によりアッセイした。各系統からのおおよそ20の種子 を低衝撃微粉砕機内で挽き、そして得られた粉末の内の100mgを15mLの スクリューキャップチューブ内に計量し入れた。0.7M Na2SO4を含む5 mLの0.4N HClをその粉末に添加し、そしてその混合物をロッカープラ ットフォーム(rocker platform)上で一晩震盪した。このチュ ーブを3900×gで15分間遠心し、そして2mLの上清を取り出して第二の ガラスチューブに入れた。2mLの水および1mLの15mM FeCl2を添 加し、そしてそのチューブを20分間、沸騰水浴槽中で加熱した。このチューブ を先の要領での遠心分離にかけて鉄:フィチン酸複合体を沈降させ、そして上清 を棄却した。ペレットを2mLの0.2N HCl中に再懸濁させ、そして10 分間、沸騰水浴槽中で加熱した。沈降物を再度遠心分離により取り出し、そして 2mLの5mM EDTA中に再懸濁した。 15μLのEDTA懸濁物を、フィチン酸リン酸(phytic acid phosphate)を取得する目的での湿式灰化のために取り出した。15μ Lのアリコートを含む各チューブに10μLの硝酸カ ルシウムの10%溶液を添加した。水を蒸発させ、そして残渣を白色灰がチュー ブ内に残るまで火炎中で加熱した。この灰を0.3mLの0.5N HCl中に 再溶解し、そして90℃で20〜30分間加熱した。モリブデン酸試薬(0.7 mLの0.86N 硫酸中の0.36%モリブデン酸アンモニウムおよび1.4 2%アスコルビン酸)を添加し、そして色を1時間発色させてから820nmで の比色計測を行った。 無機リン酸は、0.3mlの0.5N HClおよび0.7mLのリン酸色試 薬を、もともと5mLであった抽出物の20もしくは40μLのアリコートの内 のいずれかに添加することにより決定した。リン酸カリウム標準を同時に発色さ せた。この実験は3回繰り返し、そしてその結果が表5に示されている。 表5 μモル リン酸 g-1として表示される無機リン酸およびフィチン酸としての種 子リン酸(値は、2回を上回る回数の反復試験を行う場合には平均値±標準偏差 であるか、あるいは2回の反復試験を行った場合には平均値となっている) LR33突然変異は更には、その突然変異が含まれる遺伝的バックグラウンド に依存して約15〜25倍の種子無機リン酸含有量の増加を付随し、約2倍の種 子フィチン酸レベル(フィチン酸分画中のリン酸として表現される)の減少を引 き起こす。図1の経路に基づくと、遊離ミオイノシトール含有量の低下を伴うフ ィチン酸含有量の減少は、ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼの活性を減 少させる突然変異によりもたらされる可能性が最も高いように思われる。 無機リン酸含有量の増加の正確な原因は判明していないものの、フィチン酸分 画は種子およびその植物の他の部分内のリン酸貯蔵形態として機能するように仮 定されて長い。好ましい貯蔵用プラットフォーム(ミオイノシトール)が利用で きない場合には、移入してくる無機リン酸には他に取り得る主立った運命は存在 せず、単に蓄積する。 実施例3 ホモ接合性LR33系統の種子表現型の同定 幾つかの追加的大豆系統を、種子の無機リン酸について分析した。100mg の挽いた種子を、1mLの温水で抽出し、そして遠心分離にかけて不溶性物質を 除去した。上清を100μLの塩化メチレンで抽出して脂質物を除去し、そして 水性抽出物の残りの部分をトリクロロ酢酸で10%にした、この溶液を遠心分離 にかけて蛋白質を除去し、そして5μLの上清を、実施例2に記載される要領で 無機リン酸に関して分析した。表6にはこれらのアッセイの結果が示される。表6 野生型、LR28、LR33、およびLR28×LR33大豆植物からの種子の 無機リン酸含有量(μモルg-1 LR28突然変異を単独で含む全ての系統は野生型対照に等しい無機リン酸レ ベルを有する。系統5ST−1441はLR33に由来しており(先の実施例2 )、そしてスタキオースの中程度の減少はもともとその突然変異に関連していた 。5ST−1441では無機リン酸含有量の上昇はわずかのみであった。いずれ の親も無機リン酸値が高いという事実にも拘わらず、LR33のLR22による 交雑から得られた全ての系統では無機リン酸のレベルがかなり上昇していた。 LR33突然変異のみを含む系統5ST−1441の中間的無機リン酸表現型 は予期せぬものであった。低フィチン酸/高無機リン酸表現型を生じるためには LR28とLR33突然変異の両方が存在している必 要があることが示唆されて良い。しかしながらこの2つの突然変異が実際に、減 少している用に思われる2つの活性をコードする構造遺伝子内に存在する場合に は、これらの突然変異は、フィチン酸合成の変化に相加的影響を及ぼすことが示 唆される様式でこの代謝経路に関与しているのではない。LR33中の突然変異 が、遊離もしくは総計ミオイノシトール生産のいずれかに影響を及ぼす場合には 、この突然変異単独が低フィチン酸およびその結果得られる高無機リン酸表現型 の原因となっているはずである。 別の説明は、系統5ST−1441はLR33突然変異に関してはホモ接合性 ではなく、そしてバルクでの種子の分析によっては野生型、ホモ接合性突然変異 、およびヘテロ接合性種子についての平均的表現型のみが示されるというもので あってよい。この可能性を調査するためには、5ST−1441種子のバルク試 料からの13個の個別の種子の重量測定をし、挽き、そして温水で抽出した。蛋 白質は沈殿させず、そして無機リン酸を以前の要領で測定した。この結果を表7 に示す。表7 系統5ST−1441からの13の個別の種子についてのおおよその無機リン酸 含有量(μモルg-1)(この試料中に蛋白質が存在するため、実際の値は表6の 結果と比較すると高くなっている) d、j、およびlの文字で表示される種子は、分析した残りの10個の種子と 比較すると約3倍多い無機リン酸を含む。この比率は、高無機リン酸の突然変異 体表現型が劣勢であり、そして単一遺伝子の作用に起因して、種子の分離された 集団から予想されるものに近い。この仮説を確認するためには、5ST−144 1のバルク試料からの12個の種子を水中に室温で6時間浸した。余分な水を吸 い取らせて除去し、そして胚子軸から離れた末端にある子葉の試料を切り落とし た。この組織片の重量測定を行い、1.5mLのミクロフュージチューブ内に入 れ、そして十分量の70%メタノール中で挽いて100μLの抽出容量あたり1 0mgの生重量とした。遠心分離後に存在する上清中のリン酸は先の要領で測定 し、そしてその結果を表8に示す。 表8 系統5ST−1441からの種子の分離集団からの20個の後生種の無機リン酸 含有量(結果は1gの生重量当たりのμモル(μモルgfwt-1)として表示さ れる) 種子4、7、11、16、および20を成長室中の鉢に植え込んた。 種子7、11、16、および20は生き延び、そして実施例2に記載さ れる成長条件下で成熟するまで成長した。成熟した植物および2つの野生型対照 (A2872)からのバルクの種子を乾燥後に収穫し、そして各植物からの20 個の種子をバルクとして、可溶性炭水化物およびフィチン酸の分析のため、実施 例1および2に記載される方法を用いて挽いた。種子の総計フィチン酸含有量は (フィチン酸リン酸含有量)/6として算出した。結果が表9に示される。 表9 LR33突然変異を保持しかつ部分的種子分析の際の無機リン酸の上昇について 選択された種子の分離集団からの4本の植物ならびに2本の対照植物についての 可溶性炭水化物含有量およびフィチン酸含有量(μモルg-1として表示される) (フィチン酸の値は2回の反復試験の平均値である。) 種子番号7(LR33−7)から生育した植物の可溶性炭水化物表現型は表1 に示されるLR33突然変異によるものに非常に類似している一方で、他の植物 はラフィノースサッカリドのレベルが一層低くなっており、そしてスクロースレ ベルが一層高くなっている。これらの可溶性炭水化物レベルは、表2の突然変異 体組み合わせ物LR28×LR33 における幾つかの植物による表現型に非常に類似している。この矛盾について最 も可能性が高いとして考えられる説明は、表1のデータを出すために分析された バルク種子が、LR33突然変異についてはホモ接合性である植物であるよりは むしろLR33突然変異については分離された植物からきたものであったという ことである。この実施例の植物11、16、および20の事例においてなされた ように、その突然変異についてホモ接合性である植物が選択される場合には、真 のホモ接合性植物表現型が観察される。低ラフィノース、スタキオース、および ガラクチノールの組み合わせ物を生産するためにはLR28とLR33突然変異 の両方が存在する必要があったという以前の仮説は間違っていた。LR33突然 変異についてホモ接合性である系統は、もともと同定された突然変異体の自家授 粉からは取得されなかった一方で、それらはその系統のLR28との交雑から生 じる分離集団から取得された。交雑の子孫の内の幾つかは恐らく両方の突然変異 を含んでいるであろう一方で、LR33突然変異からの表現型はLR28突然変 異から生じるものに対しては優性となる。この優性形質は元来、LR28突然変 異からの炭素供給の上流にあるLR33突然変異の位置から派生している(実施 例1および実施例2を参照されたい)。 ホモ接合性LR33表現型がつかみ所がないままであることの理由は、もとも との突然変異体系統が遭遇している発芽の問題に起因して良い。バルクでの野外 分離条件下では、自家授粉LR33から植え付けた種子の内の25%の喪失(突 然変異についてホモ接合性であったであろう部分)が消失していたであろう。バ ルク集団から収穫した植物は、その後にはホモ接合体としては涸渇していたであ ろうが、突然変異体遺伝子は ヘテロ接合体状態としてはその集団中で保持されたであろう。野外条件でLR3 3ホモ接合体を出現させるための伝導力が一層高い遺伝子バックグラウンドへの 異系交雑によりホモ接合体の再生が可能になったと我々は推測している。初回の 異系交雑はラフィノースサッカリド生合成経路中に他の突然変異を保持する系統 に対するものであり、これはその交雑のもともとの意図にしてみれば二次的なこ とであり、そして優れた表現型もしくは改善された田畑の出現のいずれにも重要 ではない。 LR33突然変異は従って、種子のグラムあたり5μモルを下回るスタキオー ス、種子のグラム当たり20μモルを下回るラフィノース、種子のグラムあたり 200μモルを上回るスクロース、および種子のグラムあたり10μモルを下回 るフィチン酸リン酸を有する種子を生産する大豆植物を生産することが可能であ る。 実施例4 LR33突然変異を含む大豆系統の可溶性炭水化物およびフィチン酸含有量 低ラフィノースサッカリド系統であるLR33およびLR28を交雑させ、そ して分離させたF2植物を、実施例1に記載されるHPLCアッセイによるF2 植物の種子中の低レベルのラフィノース、スタキオース、およびガラクチノール について選択した。その後にこの交雑から取得され選択された系統をよりすぐり の栽培品種親と交雑させ、そしてそれらの交雑物の子孫を同一の過程によりF2 世代として選択した。低レベルのラフィノースサッカリドを含むこれらの系統中 、幾つかのものを栄養植物の農業経済学的特徴に基づき、更に進んだ調査用に選 択した。4E 76と表示されるこのような系統の一つはその後に他のよりすぐりの大豆栽培品 種と試験的に交雑させ、そしてこの交雑から得られる自家授粉F1植物からの個 別の種子を、可溶性炭水化物および無機リン酸含有量について分析した。これら の種子は、非常に無機リン酸が低くかつ野生型レベルのラフィノースおよびスタ キオースを有するものと、無機リン酸のレベルが上昇しておりかつラフィノース とスタキオースのレベルが非常に低い小さめの種類の種子という2つの種類に分 類された。これら2つの種類の比率は劣勢LR33突然変異に期待される3:1 の比率に非常に近かった。ラフィノースサッカリドに影響を及ぼす他の突然変異 であり、もともとの交雑の際の親であったLR28の分離を示す証拠は存在しな かった。従って、系統4E76は選択されたよりすぐりの栽培品種バックグラウ ンド中のLR33突然変異を示す。この系統を、炭水化物分析用に選択されたよ りすぐりの照合用系統と共に2年間にわたり、総計で9つの環境下で生育させた 。3つの環境からの一層限定された試料セットをフィチン酸含有量について分析 した。この炭水化物データを表10に示し、そしてフィチン酸データを表11に 示す。表10 LR33含有性系統4E76および13のよりすぐりの栽培品種照合用物のスタ キオース、ラフィノース、およびスクロース含有量についての平均値、標準偏差 (SD)、および平均値の2標準偏差(2SD)(全ての値はμモルg-1種子重 量で表示される。) 表11 LR33含有性系統4E76およびよりすぐりの栽培品種照合用物A2872の フィチン酸含有量についての平均値、標準偏差、および平均値の2標準偏差(全 ての値はμモルg-1種子重量で表示される。) 商品化されている典型的な大豆であるよりすぐりの大豆栽培品種との比較の際 には、LR33由来系統では種子の重量のグラム当たりの総計ラフィノースサッ カリドの量が8倍〜9倍低くなる。フィチン酸の量も約40%減少する。 よりすぐりの大豆栽培品種との比較に際しては、LR33由来系統ではラフィ ノースおよびスタキオースの両方の量が低くなる。ラフィノース含有量はよりす ぐりの系統に見られる値より若干低めな程度であるに過ぎないが、スタキオース 含有量は非常に大きく減少する。大豆荒粉を単胃動物に給餌する際のエネルギー 使用効率における大豆ラフィノースサッカリド含有量の有害効果は、α−ガラク トシド結合の消化率が低いことに起因することが知られている。従って、ラフィ ノースとスタキオースの合計含有量の減少は、消化率が上昇していることの大ま かな測定値になる。事実、この測定はその表現型の効果を過小評価することがあ ってよく、というのもスタキオースは糖のモル当たり2モルのα−ガラクトシド 結合を含むためである。 成熟した大豆の絶対ラフィノースサッカリド含有量は環境因子に応答して変化 することが知られている。LR33由来系統中に存在する突然変異の効果は、こ のような系統のラフィノースとスタキオースとの合計含有量を14.5μモル/ g種子重量以下にさせるに十分な大きさのものであり、そしてこの値は同一環境 で生育させた野生型大豆のものを常時はるかに下回ったままでいるはずである。 成熟した大豆種子のフィチン酸含有量も環境因子に応答して変化することが知 られており、これは主に土壌内で利用できるリン酸レベルに変化があるために生 じる。再度記載するが、LR33由来系統中に存在す る突然変異は総計フィチン酸含有量を、全成育環境にわたり17μモル/g以下 に維持する。 実施例5 LR33突然変異の分子レベルでの同定 実施例2に示されるLR33由来系統中の代謝産物の分析からの証拠により、 LR33突然変異がミオイノシトールを生産する種子の能力を減少させる原因で あることが強く示唆される。 植物ならびに他の生物ではミオイノシトールは、ミオイノシトール1−リン酸 シンターゼによる触媒反応を受ける反応におけるグルコース−6−リン酸のミオ イノシトール 1−リン酸への変換に始まり、そして特異的ミオイノシトール− リン酸ホスファターゼによる1−リン酸の加水分解に終わる経路によってのみ生 産されるに過ぎない(図1を参照されたい;Loews,F.A.In:Ino sitol Metabolism in Plants(1990)Wile y−Liss、New York、pp 13−19])。フィチン酸の前駆体 は恐らくミオイノシトール 1−リン酸であろうし、そしてフィチン酸レベルは LR33突然変異により減少するため、ミオイノシトール−リン酸シンターゼの 遺伝子および遺伝子産物の特徴決定を野生型およびLR33突然変異体植物の両 方において行った。野生型大豆ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼのcDNAクローニング cDNAライブラリーを以下のように作成した。大豆胚芽(各々約5 0mgの生の重量)をその豆果から取り出し、そして液体窒素中で凍結した。凍 結させた胚芽を液体窒素の存在下で微細粉末になるまで挽き、そしてその後にポ リトロン(Polytron)での均一化により抽出し、そしてChirgwi nら((1979)Biochemistry 18:5294−5299)の 方法により全RNAについて濃縮する目的で分画化を行った。 この核酸分画を、全RNAをオリゴ−dRセルロースカラムを通し、そしてポ リA+ RNAをGoodmanら((1979)Meth. Enzymol .68:75−90)により記載される要領で溶出することによりポリA+ R NAについて濃縮した。cDNAを、精製したポリA+ RNAから、cDNA シンセシスシステム(Synthesis System)(Bethesda Research Laboratory社、Gaithersburg、M D)および製造業者の手順書を用いて合成した。得られる二本鎖DNAを、Ec RI DNAメチラーゼ(Promega社)によりメチル化し、その後にそ の末端をT4 DNAポリメラーゼ(Bethesda Research L aboratory社)で充填し、そして平滑末端をリン酸化EcoRIリンカ ーに、T4 DNAリガーゼ(Promega社)を用いて連結させた。この二 本鎖DNAをEcoRI酵素で消化し、余剰なリンカーからゲル濾過カラム(セ ファロース(Sepharose)CL−4B)を通すことにより分離させ、そ して製造業者の手順書に従ってラムダZAPベクター(Stratagene社 )に連結させた。連結させたDNAを、製造業者の手順書に従ってGigapa ck(商標)パッケージングエクストラクト(Stratagene社)を用い てファージ内にパケージングした。得られるcDNAライブラリーをStrat agene社の手順書により増幅し、そして−80℃に保存した。 ラムダZAPクローニングキットマニュアル(Lambda ZAP Clo ning Kit Manual)(Stratagene社)内の手順書に従 い、cDNAファージライブラリーを用いて大腸菌(coli)XL1細胞 を感染させ、そして総計でおおよそ300,000プラーク形成単位を6枚の1 50mm直径ペトリ皿上でプレート培養した。 プレートから二重にプラークを拾いあげてニトロセルロースフィルター(Sc hleicher & Schuell、Keene、NH)に移した。このフ ィルターを、6×SSPE、5×デンハルト(Denhardt’s)溶液、0 .5% SDS、5%硫酸デキストラン、および0.1mg/mlの変性サケ精 子DNA(Sigma Chemical Co.社)からなる25mLのハイ ブリダイゼーション用緩衝液中、60℃で2時間予備ハイブリダイゼーションさ せた。 その後に遮断させたフィルターを、イーストのミオイノシトール 1−リン酸 シンターゼとの相同性によりミオイノシトール 1−リン酸シンターゼとして同 定されている[Johnson,M.A.(1994)Plant Physi ol.105:1023−1024]アラビドプシス サリアナ(Arabid opsis thaliana)からのcDNAから作成された放射ラベル化プ ローブにハイブリダイズさせた。アラビドプシス(Arabidopsis)ク ローンを、the Arabidopsis Biological Reso urc e Center、DNA Stock Center、1060 Carma ck Road、Columbus、OH 43210−1002、クローン番 号181C18T7113E9T7から取得した。 1.2kB cDNA挿入断片を、SalIおよびNotIでの消化、ならびに その後のDNA断片のアガロースゲル精製によりベクターDNAから取り出した 。精製した断片をランダムプライマーラベリングキット(Bethesda R esearch Laboratory社)で[32P]dCTPでラベルした。 このフィルターを、予備ハイブリダイゼーションについて記載されたものと同一 の条件下で一晩ハイブリダイズさせた。余剰なラベルを、0.1% SDSを含 む0.6×SSC中でフィルターから洗い落とした。その後に、0.2×SSC 、0.1% SDS中での各約10分間の2度の洗浄を適用させて非特異的結合 ラベルを除去し、そしてそのフィルターを用いて一晩の露出で写真用フィルムに 露出させた。おおよそ200の陽性シグナルが観察された。6つのものをそのシ グナル周辺の領域の切り出しにより精製し、ファージを再度プレート培養し、そ して先の要領で再度スクリーニングにかけた。2つのクローンをファゲミドにす るまで切除し、そしてこれを用いて大腸菌(coli)を感染させ、製造業 者(Stratagene社)により記載されるプロトコールを用いてプラスミ ドクローンを取得した。この2つのクローンの内、p5bmi−l−psと表示 される一つのものの配列を、Applied Biological Inst rumentsの方法および装置を用いて決定した。p5bmi−l−ps内の cDNA挿入断片のヌクレオチド配列を配列番号1に示し:そしてその配列によ りコードされ、演繹されたアミノ酸配列を配列番号2 に示す。LR33大豆の未成熟種子からのミオイノシトール 1−リン酸シンターゼのc DNAクローニング 11、16、および20と番号づけされ、そして実施例3に記載されるLR3 3植物(表8を参照されたい)からの種子を、種子充実期(seed fill ing period)中におおよそ50%収穫し、種果から取り出し、そして −80℃に凍結保存した。mRNA単離のためには、バルク種子集団からの2g の凍結種子を液体窒素中、乳鉢と乳棒とで挽いた。 この凍結粉末を再度、10mLの全RNA抽出物緩衝液(これは10mM T ris−HCl、pH9、10mM EDTA、0.5%CTAB(臭化セチル トリメチル アンモニウム)、0.8M NaCl、1% 2−メルカプトエタ ノール、および2%ポリビニルピロリドンからなる)中で挽いた。全試薬につい ての水は0.05%ジエチルプロカーバメートで30分間処理し、そしてその後 にオートクレーブにかけた。この組織スラリーを15mLポリプロピレンチュー ブに移し、そして5,500×gで15分間遠心分離にかけた。上清をミラクロ ス(Miracloth)(Calbiochem社)を通して第二ポリプロピ レンチューブ内に入れ、そして0.3倍容量のクロロホルムを添加した。この相 を5,500×gで10分間の遠心分離により分離し、そして上層を別のポリプ ロピレンチューブに移し、そこに1.5倍容量の10mM Tris−HCl pH9.0、10mM EDTA、0.5% CTAB、および0.1% 2− メルカプトエタノールを添加した。室温 での30分間のインキュベーションの後、この核酸を5,500×gで20分間 の遠心分離により沈殿させた。 この核酸を、0.1% 2−メルカプトエタノールを含む0.4mLの1M NaCl中に再溶解した。1倍容量の1:1 フェノール:クロロホルムでの抽 出後、核酸を2倍容量のエタノールで沈殿させた。 mRNAは、Pharmacia社からのmRNA精製キットを用いてこの核 酸分画から精製した。約12μgのmRNAが取得された。13ngのポリアデ ニル化mRNAを、GeneAmp(商標)RNA−PCRキット(Perki n Elmer Cetus社、パーツ番号N808−0017)を用いてオリ ゴ−dTからの増幅用の鋳型として用いた。逆転写酵素反応を30分間、42℃ で作動させた。PCR増幅については、Vent(商標)DNAポリメラーゼ( New England Biolabs社)を、キット製造業者により供給さ れるDNAポリメラーゼの代用品とし、そして追加的に2μLの100mM硫酸 マグネシウムを各100mL反応物に添加した。5’プライマーは配列番号3に 示される配列を有し:そして配列番号1の塩基57〜77からできており、その 配列に対する制限酵素の活性を上昇させる目的での8個の追加的な5’塩基と共 に、プライマー中にNdeI部位をコードさせる目的で追加的塩基5’−GGG AATTCCATATG−3’が付加されていた。 3’プライマーは配列番号4に示す配列を有し、そして配列番号1中の塩基1 566〜1586の逆相補配列を含んでできており、制限酵素消化を上昇させる 目的での10個の追加的な5’塩基と共に、プライマー中にNotI部位を提供 する目的で追加的塩基5’−AAGGAA AAAAGCGGCCGC−3’が付加されていた。このPCR反応を52℃の アニーリング温度および1.5分の伸長時間で35周期作動させた。約1550 塩基対からなる産物が得られ、そしてAmcon50ミクロフュージフィルター を通過させる作業、およびその後の同容量の1:1 フェノール:クロロホルム での抽出、フェノール:クロロホルム分離の上層の1倍容量のクロロホルムでの 抽出、およびエタノールでの沈降により精製した。得られる清浄なPCR産物の 内の5μgを一晩、NdeIおよびNotIの両方で37℃で消化した。この制 限酵素消化物の脱蛋白質化を、先に記載されるフェノール:クロロホルム抽出過 程により行い、そして、予めNdeIおよびNotIで消化してあり、そしてウ シ腸のアルカリ性ホスファターゼで処理して末端リン酸とハイブリダイズさせて あるpET24aT7発現ベクター(Novagen社)2μg内に連結させた 。この連結混合物を用いてエレクトコンピテントDH 10B大腸菌(co li )細胞を形質転換させ、そして形質転換体を、30mg l-1カナマイシン を含むプレート上での成長により選択した。この形質転換体プレートからの18 の単独コロニーを拾いあげ、そして100μLの滅菌水中に入れた。この細胞混 合物の内の40μL分を、このcDNA挿入断片の単離にもともと用いられたプ ライマーおよびPCR条件を用いてTaq(商標)ポリメラーゼ(Perkin elmer社)を用いるPCR反応作業の際のDNA鋳型として用いた。6つ のコロニーは正しいサイズの産物を増幅させるための鋳型として作用した。これ らのコロニーからの細胞混合物の内の残りの60μLを一晩の培養で増殖させ、 そしてプラスミドDNA調製物を各クローンから作成した。この6つの各クロー ンから精製されたプラスミド を用いてエレクトロコンピテントDE3大腸菌(coli)細胞を形質転換 させた。大腸菌(E.coli)内での野生型およびLR33大豆からのミオイノシトー ル 1−リン酸シンターゼの機能的発現 野生型大豆ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼを、配列番号3および配 列番号4におけるプライマー、ならびに逆転写させたmRNAからのLR33ミ オイノシトール 1−リン酸シンターゼをクローニングするために先に記載され るPCR増幅およびクローニングプロトコールを用いるp5bmi−l−psの PCR増幅によりpET24aT7発現ベクター内に挿入した。この場合、その cDNA挿入断片と共にプラスミドを含むことが示された9つのDH10Bクロ ーンからのプラスミド調製物をプールし、そしてこれを用いてエレクトロコンピ テントDE3大腸菌(coli)細胞を形質転換させた。 カナマイシン耐性コロニーを選択し、そして6つを、一晩培養物の接種用に選 択した。30℃、30mg l-1カナマイシンを含むLB培地中で増殖させた一 晩培養物を新鮮培地で2倍に希釈し、1時間再増殖させ、そして1mMの最終濃 度になるまでイソプロピル−チオガラクトシドを添加することによる誘導をかけ た。 細胞を3時間後、そして0.1mM DTTおよび0.2mMフッ化フェニル メチルスルホニルを含む50mM Tris−HCl pH8.0の50μL中 に再懸濁させた後に遠心分離により回収した。少量の1mmガラスビーズを添加 し、そしてこの混合物を、各時マイクロプローブソニケーターで約5秒間、3回 のソニケーションにかけた。この混合 物を遠心分離にかけ、そして上清の蛋白質濃度を決定した。各クローン培養物の 可溶性分画の1μgの蛋白質をSDS−PAGEにより分離した。約60キロダ ルトンの大きさの追加的蛋白質バンドを生産する培養物を活性アッセイ用に選択 した。 アッセイ用には[33P]グルコース−6−リン酸を、リン酸ドナーとして[33 P]−γ−ATPを用いてグルコースのヘキソキナーゼによる触媒反応を受ける リン酸化により調製した。室温に30分おいた後、その反応混合物を、予めまず 80%メタノールで、そして次に水で洗浄してあるSEP−PAC C18カラ ム(MilliPore Corp.社Milford、MA)を通した。追加 的な0.5mL部分と一緒にしたこのカラム素通り分画を回収し、そしてSEP −PAC SAXカラムに通し、これをその後に1mLの80%メタノールで洗 浄した。[33P]グルコース−6−リン酸は80%メタノール中の2mLの0. 2N HClで溶離させた。40μLの1M Tris塩基を添加し、そしてメ タノールを減圧留去した。残りの溶液のグルコース−6−リン酸濃度は、グルコ ース−6−リン酸デヒドロゲナーゼによる6−ホスホグルクロン酸への転化によ り決定した。この反応により生産されるNADPHは340nmでの吸光度によ り定量した。 10μLの細胞抽出物を37℃で30分、100μL反応物(これは2mM グルコース−6−リン酸(57,334dpmトータル33P)、0.1mM N AD、および15mM 酢酸アンモニウムである)中でインキュベートした。こ の反応物を90℃に加熱して蛋白質を沈降させ、遠心分離にかけて清澄化させた 。この上清の内の47μLを、0.9ml分-1で、0.1N NaOHおよび0 .1N 酢酸ナトリウム で操作するDionex(商標)PA−1カラムにかけた。ミオイノシトール 1−リン酸の標準は注入後8〜10分目に溶出し、そして分離された反応混合物 の1分毎の分画をその時間の範囲全体にわたり採取してシンチレーションカウン ターにかけた。ピーク分画中の放射活性の総計値を出してグルコース−6−リン 酸のミオイノシトール−1−リン酸への転化率を取得し、そして空のpET24 aT7ベクターを含む一つの対照大腸菌(coli)DE3培養物および大 豆ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼcDNAを含む2つのクローンに関 する結果を表12に示す。 表12 3つの大腸菌(coli)細胞培養物抽出物についての比活性(μモル ミ オイノシトール 1−リン酸により分-1mg蛋白質-1が生産される)(Soy Clone 1および2は大豆ミオイノシトール1−リン酸シンターゼを含む一 方で、対照は空のプラスミドを含む。) 作動させたアッセイでは、cDNA含有性クローンは本質的には全ての利用可 能な基質を用い、そしてそのため対照系統と比較すると35倍を上回る倍率で活 性が高くなっていた。従って大豆ミオイノシトール1−リン酸シンターゼ遺伝子 は大腸菌(coli)中に機能性酵 素を生産することができる。 野生型大豆ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼクローン番号1(Soy Clone 1)および3つのLR33ミオイノシトール1−リン酸シンター ゼクローンを先に記載される要領で蛋白質発現用に増殖させた。各クローンから の可溶性細胞抽出物からの5μgの蛋白質をSDS−PAGEで分離した。LR 33クローン番号10(LR33−10)は可溶性で60キロダルトンの蛋白質 を本質的には野生型クローン番号1と同一の量で生産した。2つの抽出物の各々 のものからの4μgの蛋白質を、先に記載される方法により、100μL反応物 (これは3μm NADおよび90μm グルコース−6−リン酸を含む)を用 いてミオイノシトール 1−リン酸シンターゼについてアッセイした。野生型ミ オイノシトール 1−リン酸シンターゼの比活性はこれらの条件下では1.5n モル分-1mg蛋白質-1であった一方で、LR33由来のミオイノシトール 1− リン酸シンターゼの比活性は0.16nモル分-1mg蛋白質-1であった。LR33ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコードするcDNAのヌク レオチド配列 クローンLR33−10(LR33ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼ をコードする核酸断片を含む)中のcDNA挿入断片のヌクレオチド配列を、プ ラスミド源としてそのクローンのDH10B大腸菌(coli)株、および 野生型クローンについて記載されたDNA配列決定法を用いて決定した。このヌ クレオチド配列が配列番号5に示され、そしてそのクローンの読み取り枠から得 られる演繹されたアミノ酸 配列が配列番号6に示される。配列番号5は、塩基番号1241のコーディング 鎖中のGのTへの単一塩基対変化のため配列番号1とは異なっている。この変化 により、野生型配列(配列番号2)のリシンからLR33アミノ酸配列(配列番 号6)のアスパラギンへの変化がもたらされる。 塩基の変化が、LR33ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼのクローニ ングの間に起こってしなったかもしれないPCRが原因のエラーよりはむしろL R33ゲノム内での変化により生じる事を確認するために、2セットのPCRプ ライマーを調製した。野生型プライマー(配列番号7)およびLR33プライマ ー(配列番号8)を用いて、ダイズ栽培品種A2872の乾燥種子、および大豆 系統LR33クローン番号16(表8を参照されたい)から調製したゲノムDN Aを増幅した。配列番号4に記載されるPCRプライマーを共通のアンチセンス 鎖プライマーとして用いた。62℃もしくは64℃でのアニーリング温度、およ び35周期のアニーリングおよび伸長の際には、A2872 DNAを鋳型に使 用する場合には野生型プライマーのみがPCR産物を生産し、そしてLR33 DNAを鋳型として用いた場合にはLR33配列に対応するプライマーのみが産 物を生産した。 突然変異を検出するためのプライマーの特異性を更に詳細に検査するためには 、DNAを、実施例3に記載される分離LR33クローン番号7系統(表8を参 照されたい)の種子から成長させた6本の個別の植物から調製した。分離集団か ら検査した6本の植物の内の2本は両方のプライマー用の鋳型として作用するD NAを生じ、3本は野生型プライマーのみとのプライマーとして作用するDNA を生じ、そして一本はLR 33プライマーによってのみ産物を生産した。これらは、その遺伝子の一本の野 生型コピーおよび一本の突然変異体コピーを含むヘテロ接合体を含む集団から予 想される結果である。 代謝産物データおよび配列データから我々は、ラフィノースサッカリド糖の総 計値が非常に低く、スクロースが非常に高く、そしてフィチン酸が低い種子表現 型の所見は全て、配列番号1および配列番号5に示される野生型およびLR33 配列の比較により説明される単一塩基変化突然変異に起因することを結論づけた 。 実施例6 ミオイノシトール−1−リン酸シンターゼの遺伝子サイレンスおよび関連する種 子表現型を達成するための大豆の形質転換発達段階中の大豆種子中のミオイノシトール 1−リン酸シンターゼの発現を低 減させるためのグリシン マックス(Glycine max)の形質転換のた めのベクターの構築 アンチセンスもしくはセンスを標的とする大豆ミオイノシトール 1−リン酸 シンターゼcDNA配列を、大豆Kunitz Trypsin Inhibi tor3(KTi3)プロモーター[Jofuku and Goldberg 、(1989)Plant Cell 1:1079−1093]、ファセオル ス ブルガリス(Phaseolus vulgaris)7S種子保存蛋白質 (ファセオリン)プロモーター[Sengupta−Gopalan et.a l.、(1985)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:3 320−3324;Hoffman et al.、(1988)Plant Mol.Biol.11:717−729]、および大豆β−コングリシニンプ ロモーター[Beachy et al.,(1985)EMBO J.4.3 047−3059]の制御下に含むプラスミドを構築する。これらのプロモータ ーの制御下で大豆ミオイノシトール−1−リン酸シンターゼ cDNAを発現す るベクターの構築は、以下のプラスミド:pML70、pCW108、およびp CW109Aの使用により促進される。 pML70ベクターはKTi3プロモーターおよびKTi3 3’非翻訳領域 を含み、そして商品として入手可能なベクターpTZ18R(Pharmaci a社)から中間体プラスミドpML51、pML55、pML64、およびpM L65を通して取得された。5’非翻訳領域の全2039ヌクレオチド、ならび にJofuku et al.、(1989)Plant Cell 1:42 7−435、に記載される配列の塩基755〜761に相当するEcoRI部位 で終了するKTi3遺伝子のコーディング配列の内の390塩基を含む完全な大 豆KTi3遺伝子[Jofuku and Goldberg、上述]の2.4 kbのBstBI/EcoRI断片を、pTZ18RのAccI/EcoRI部 位内に連結させてプラスミドpML51を作成した。このプラスミドpML51 をNcoIで切断し、クレノウ断片(Klenow)を用いて充填し、そして再 度連結させてKTi3挿入断片の5’非翻訳領域の中央に位置するNcoI部位 を破壊してプラスミドpML55をもたらした。このプラスミドpML55を mn I/EcoRIで部分消化して先に引用される配列の塩基732〜755に 相当する0.42 kbの断片を放出させ、これを棄却した。NcoI部位を含む合成XmnI/ co RIリンカーを、XmnI部位(5’−TCTTCC−3’)およびNco I部位(5’−CCATGGG−3’)のためのコーディング配列、ならびにそ の直後に続くEcoRI部位の部分(5’−GAAGG−3’)からなる相補性 合成オリゴヌクレオチドのダイマーを作成することにより構築した。XmnIお よびNcoI/EcoRI部位を短い介入配列(5’−ATAGCCCCCCA A−3’)と連結させた。この合成リンカーを4.94kb断片のXmnI/ co RI部位と連結させてプラスミドpML64を作成した。KTi3遺伝子の 3’非翻訳領域をJofuku et al.[上述]に記載される配列から、 プライマーML51およびML52を用いる標準PCRプロトコール(Perk in Elmer Cetus社、GeneAmp PCRキット)により増幅 した。プライマーML51は、先に引用される配列の塩基1072〜1091に 相当する20ヌクレオチドに加え、そのプライマーの5’末端のEcoRV(5 ’−GATATC−3’)、NcoI(5’−CCATGG−3’)、XbaI (5’−TCTAGA−3’)、SmaI(5’−CCCGGG−3’)、およ びKpnI(5’−GGTACC−3’)部位に対応するヌクレオチドを含んでい た。プライマーML52は、先に引用される配列の塩基1242〜1259に相 当するヌクレオチドの厳密な相補物に加え、そのプライマーの5’末端のSma I(5’−CCCGGG−3’)、EcoRI(5’−GAATTC−3’)、Bam HI(5’−GGATCC−3’)、およびSalI(5’−GTCGA C−3’)部位に相当するヌクレオチドを含んでいた。KTi3遺伝子のPCR 増幅させた3’末端をpML64 のNcoI/EcoRI部位に連結させてプラスミドpML65を作成した。合 成多重クローニング部位リンカーは、PstI(5’−CTGCA−3’)、 al I(5’−GTCGAC−3’)、BamHI(5’−GGATCC−3’ )、およびPstI(5’−CTGCA−3’)部位のためのコーディング配列 からなる相補性合成オリゴヌクレオチドのダイマーを作成することにより構築し た。このリンカーをpML65のPstI部位(KTi3プロモーター領域の直 ぐ隣にあたる5’側)に連結させてプラスミドpML702を作成した。 pCW108ベクターは、インゲンマメのファセオリンプロモーターおよび3 ’非翻訳領域を含み、そして市販品として入手可能なpUC18プラスミド(G ibco−BRL社)から、プラスミドAS3およびpCW104を介して取得 した。プラスミドAS3は、5’−TGGTCTTTTGGT−3’から出発し 、そしてその後にpUC18のHindIII部位内にクローン化された同一遺 伝子の3’非翻訳領域の全1175塩基対[Doyle et al.、(19 86)J.Biol.Chem.261:9228−9238、およびSlig htom et al.、(1983)Proc.Natl.Acad.Sci .USA 80:1987−1901、の配列記載を参照されたい;更に別の配 列記載は、国際公開第WO911/3993号に見いだされてよい]が続くイン ゲンマメ(ファセオルス ブルガリス(Phaseolus vulgaris ))のファセオリン(7S種子保存蛋白質)プロモーターの内の495塩基対を 含む。pUC18多重クローニング部位(EcoRI、SphI、PstI)お よびSalI)の追加的クローニング部位は、EcoRIおよびSalIでの消 化、その 末端のクレノウ断片(Klenow)での充填、および連結により除去してプラ スミドpCW104を取得した。新規の多重クローニング部位を、5’ファセオ リンの495bpと3’ファセオリンの1175bpとの間に、NcoI部位( 5’−CCATGG−3’)のためのコーディング配列、およびその後に続く3 つのフィラー塩基(5’−TAG−3’)、SamI部位用のコーディング配列 (5’−CCCGGG−3’)、KpnI部位の最後3つの塩基(5’−TAC −3’)、システインおよびXbaI部位のためのコーディング配列(5’−T CTAGA−3’)からなる相補性合成オリゴヌクレオチドのダイマーを挿入す ることにより作成してプラスミドpCW108を作成した。このプラスミドは非 反復のNcoI、SmaI、KpnI、およびXbaI部位をファセオリンプロ モーターのすぐ後ろに含む。 ベクターpCW109Aは、大豆β−コングリシニンプロモーター配列および ファセオリン3’非翻訳領域を含み、そして市販品として入手可能なpUC18 (Gibco−BRL社)から取得されたベクターpCW109の改編板である 。ベクターpCW109は、クローニングベクターpUC18のHindIII 部位内にβ−コングリシニン遺伝子の555bp 5’非コーディング領域(プ ロモーター領域を含む)およびその後に、先のpCW108について記載した co I、SmaI、KpnI、およびXbaIについての制限エンドヌクレアー ゼ部位を含む多重クローニング配列を挿入し、そしてその後にHindIII部 位(先に記載される)内に共通のエンドウマメ ファセオリン3’非翻訳領域の 内の1174bpを挿入することにより作成した。 用いられたβ−コングリシニンプロモーター領域は、27のヌクレオ チド位置が異なっているため、発表されたβ−コングリシニン遺伝子[Doyl e et al.、(1986)J.Biol.Chem.261:9228− 9238]の対立遺伝子となっている。この遺伝子の更に詳細な記載は国際公開 第WO91/13993号に見いだされてよい。 これら3つの核酸構築物は、フィチン酸へのその後の転化のためのミオイノシ トール合成の期間を含む広域な発達期間にわたる発現を伴う種子特異的発現ベク ターを構築する。これらのベクター内への配列番号1および配列番号5に記載さ れる配列の挿入は、先の実施例5に記載されるPCR法により促進される。配列 番号1もしくは配列番号5の選択された領域に相補的なPCRプライマーは、p ML70、pCW108、およびpCW109のプロモーター配列の後に続く多 重クローニング配列内でも切断を行うものの中から選択された制限エンドヌクレ アーゼの認識配列を構築する付加的塩基を伴って合成されてよい。制限部位の配 置は、大豆ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼからのヌクレオチド断片の 方向を、過剰発現もしくは同時発現のいずれかを達成する目的ではセンス方向に 、あるい過小発現を達成するためにはアンチセンス方向に向けさせるよう指令す るように選択されてよい。体細胞大豆胚芽培養物の形質転換および大豆植物の再生 以下の保存用溶液および培地が大豆組織のインビトロでの生育を支持するのに 用いられた:保存溶液 培地 大豆胚形成性懸濁培養物を35mLの培地(SB55もしくはSBP6)中、 ロータリーシェーカー、150rpm、内、28℃で、そして16:8時間の日 中/夜間スケジュールでの蛍光および白熱光の混合光下で維持する。培養物は、 おおよそ35mgの組織を35mLの液体培地中に接種することにより4週間毎 に継代培養する。 大豆胚形成性懸濁培養物は、センスもしくはアンチセンス方向に向いているミ オイノシトール 1−リン酸シンターゼのいずれかを含む種子特異的発現ベクタ ーで、パーティクルガン衝撃法(Kline et al.(1987)Nat ure(London)327:70、を参照されたい)により形質転換しても よい。DuPont Biolistic(商標)PDS1000/HE装置( ヘリウムレトロフィット)をこれらの形質転換に用いる。 50mLの60mg/mL 1μmゴールド粒子懸濁液を添加する(以下の順 序):5μL DNA(1μg/μL)、20μL スペルミジン(0.1M) 、および50μl CaCl2(2.5M)。この粒子懸濁物を3分間震盪させ 、ミクロフュージ内で10秒間遠心にかけ、そして上清を除去する。その後にD NAコーティングした粒子を400μLの70%エタノール中で一度洗浄し、そ して40μLの絶対エタノール中に再懸濁させる。DNA/粒子懸濁物を各回1 秒間、3回超音波処理にかける。5μLのDNAコーディングゴールド粒子を、 その後に各マイクロキャリアディスク上にのせる。 約300〜400mgの4週間懸濁培養物を空の60×15mmペトリ皿上に 置き、そして残存する液体をピペットでペトリ皿から除去する。各形質転換実験 用には、約5〜10プレートの組織を通常の様式で衝撃 法にかけた。膜破壊圧を1000psiに設定し、そしてチャンバーを28イン チ水銀の真空状態になるまで脱気した。組織を、保持用スクリーンから約3.5 インチ離れた所に設置し、そして3度の衝撃法にかける。衝撃をかけた後には組 織を液体中に戻し、そして先に記載される要領で培養する。 衝撃後11日目には液体培地を、50mg/mLのヒグロマイシンを含む新鮮 なSB55と交換する。その後には選択培地を毎週交換する。衝撃後7週間目に は、形質転換されておらず、壊死した胚芽クラスターから生育している緑色の形 質転換組織が観察されてよい。単離された緑色組織を取り出し、そして個別のフ ラスコに接種して新規のクローンとして継代される形質転換胚形成性懸濁培養物 を取得する。従って各新規系統は個別の形質転換品目として取り扱われる。これ らの懸濁物をその後には、継代培養を通して未成熟な発達段階でクラスターを形 成する胚芽か、あるいは個別の体細胞胚芽の成熟および発芽により完全な植物へ と再生する胚芽の懸濁液として維持することができる。 形質転換させた胚形成性クラスターを液体培養物から取り出し、そしてホルモ ンもしくは抗生物質は全く含まない固形アガー培地(SB103)上に乗せた。 胚芽を8週間、26℃で、そして16:8時間の日中/夜間スケジュールでの蛍 光および白熱光の混合光下で培養する。この期間中、個別の胚芽をクラスターか ら取り出し、そして胚芽発育の様々な段階での分析を行うことができる。8週間 後には体細胞胚芽は発芽に適切な状態となる。発芽させるには、8週間目の胚芽 を成熟培地から取り出し、そして空のペトリ皿中で1〜5日間乾燥させる。その 後には、乾燥させた胚芽をSB71−1培地中でプレート培養し、そこではそれ らの胚芽は先に記載されたものと同一の光および発芽条件下で発芽することがで きる。その後に、発芽した胚芽を滅菌土壌に移し、そして種子収集の目的で成熟 するまで成長させる。 先に記載される液体培養物中の球状胚芽状態では体細胞大豆胚芽は、成長段階 にある接合子大豆胚芽に典型的に見られるトリグリセロールもしくは貯蔵蛋白質 は非常に少量のみ含んでいる。この発達段階では、総計極性脂質(polar lipid)(リン脂質および糖脂質)に対する総計トリグリセリドの比率は約 4:1であり、これは体細胞胚芽培養を開始した発育段階での接合子大豆胚芽に は典型的に見られるものと同一である。球状段階でも同様に、主要な種子蛋白質 (β−コングリシニンのα’−サブユニット、クニッツ トリプシン インヒビ ター 3(Kunitz Trypsin Inhibitor 3)、および 大豆種子レクチン(Soybean Sees Lectin))のためのmR NAは本質的には非存在となる。先に記載される成熟過程にある体細胞胚芽段階 への分化を可能にさせるためにホルモン非含有培へ移す際には、トリグリセロー ルは脂質の内でも最多量の種類の脂質となる。同様に、β−コングリシニンのα ’−サブユニット、クニッツ トリプシン インヒビター 3(Kunitz Trypsin Inhibitor 3)、および大豆種子レクチン(Soy bean Sees Lectin)のためのmRNAは、全mRNA集団中で も非常に量の多いメッセージとなる。これに関連し、体細胞大豆胚芽系は、イン ビボでの成熟途中の接合子大豆胚芽に非常に類似する動態をとる。初期成熟期間 中では、体細胞胚芽中に存在する主要可溶性炭水化物はスクロース、グルコース 、およびマルトースである(これらは成熟期中に供給さ れる糖である)。体細胞胚芽が成熟し、そして黄色くなり始める際に、ラフィノ ースおよびスタキオースの両方が形成される。これに関しても同様に、体細胞胚 芽の表現型は、種子発育の後期段階を通過する際には配偶子胚芽に非常に類似す る。従って、センスもしくはアンチセンスのいずれかの方向で、配列番号1もし くは配列番号5に記載されるヌクレオチド配列の発現を指令する種子特異的発現 ベクターで形質転換させ、そしてラフィノースおよびスタキオースの生産量が低 下している胚芽についての選択により、同一表現型を有する種子を実らせる、成 熟して生殖能のある大豆植物の再生が可能となるはずである。
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Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1. 大豆ミオイノシトール−1−リン酸シンターゼをコードする単離された 核酸断片。 2. コードされる大豆ミオイノシトール−1−リン酸シンターゼのアミノ酸 配列が実質的には、配列番号2に記載されるアミノ酸配列に類似する、請求の範 囲1の核酸断片。 3. 適切な調節配列に操作可能に連結される請求の範囲1の核酸断片もしく は請求の範囲1の核酸断片の相補物を含み、その発現により大豆ミオイノシトー ル−1−リン酸シンターゼをコードする本来の遺伝子の発現を減少させるキメラ 遺伝子。 4. 適切な調節配列に操作可能に連結される請求の範囲1の核酸断片の亜断 片もしくは請求の範囲1の核酸断片の亜断片の相補物を含み、その発現により大 豆ミオイノシトール−1−リン酸シンターゼをコードする本来の遺伝子の発現を 減少させるキメラ遺伝子。 5. ミオイノシトール−1−リン酸の合成についての能力が減少している突 然変異体ミオイノシトール−1−リン酸シンターゼをコードする単離された核酸 断片。 6. コードされる突然変異体ミオイノシトール−1−リン酸シンターゼのア ミノ酸配列が実質的には配列番号5に記載されるアミノ酸配列に類似する、請求 の範囲5の核酸断片。 7. ミオイノシトール 1−リン酸の合成についての能力が減少している突 然変異体ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコードする少なくとも一つ の遺伝子についてはホモ接合性であり、その遺伝子が 、(i)17μモル/gを下回る種子フィチン酸含有量、(ii)14.5μモ ル/を下回るラフィノースとスタキオースの総計種子含有量、ならびに(iii )200μモル/gを上回る種子スクロース含有量という遺伝可能な表現型を付 与するが、ただしその植物がLR33ではない大豆植物。 8. 請求の範囲7の大豆植物の種子。 9. (i)請求の範囲3のキメラ遺伝子; (ii)請求の範囲4のキメラ遺伝子;および (iii)請求の範囲5の核酸断片; からなる群より選択されるメンバーを含み、(i)17μモル/gを下回る種子 フィチン酸含有量、(ii)14.5μモル/を下回るラフィノースとスタキオ ースの総計種子含有量、ならびに(iii)200μモル/gを上回る種子スク ロース含有量という遺伝可能な表現型を有するが、ただしその植物がLR33で はない大豆植物。 10. 請求の範囲9の大豆植物の内のいずれかの種子。 11. (i)17μモル/gを下回る種子フィチン酸含有量、(ii)14 .5μモル/を下回るラフィノースとスタキオースの総計種子含有量、ならびに (iii)200μモル/gを上回る種子スクロース含有量という遺伝可能な表 現型を有する大豆植物を作成するための: (a)LR33もしくは請求の範囲9の大豆植物の内のいずれかを、よりすぐ りの大豆植物と交雑させること;および (b)(i)17μモル/gを下回る種子フィチン酸含有量、(ii)14. 5μモル/を下回るラフィノースとスタキオースの総計種子含有量、ならびに( iii)200μモル/gを上回る種子スクロース含 有量という遺伝可能な表現型を有する段階(a)の交雑の子孫植物を選択するこ と、 を含む方法。 12. ミオイノシトール 1−リン酸の合成のための能力が減少している突 然変異体ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコードする少なくとも一つ の遺伝子についてホモ接合性であり、その遺伝子が、(i)17μモル/gを下 回る種子フィチン酸含有量、(ii)14.5μモル/を下回るラフィノースと スタキオースの総計種子含有量、ならびに(iii)200μモル/gを上回る 種子スクロース含有量という遺伝可能な表現型を付与する大豆植物の種子から取 得される大豆蛋白質製品。 13. 請求の範囲8の大豆種子の加工処理により取得される大豆蛋白質製品 。 14. 請求の範囲10の大豆種子の加工処理により取得される大豆蛋白質製 品。 15. ミオイノシトール 1−リン酸の合成のための能力が減少している突 然変異体ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコードする少なくとも一つ の遺伝子についてホモ接合性であり、その遺伝子が、(i)17μモル/gを下 回る種子フィチン酸含有量、(ii)14.5μモル/を下回るラフィノースと スタキオースの総計種子含有量、ならびに(iii)200μモル/gを上回る 種子スクロース含有量という遺伝可能な表現型を付与する大豆植物の種子から取 得される大豆蛋白質製品を生産するための: (a)LR33もしくは請求の範囲9の大豆植物の内のいずれかを、 よりすぐりの大豆植物と交雑させること; (b)(i)17μモル/gを下回る種子フィチン酸含有量、(ii)14. 5μモル/を下回るラフィノースとスタキオースの総計種子含有量、ならびに( iii)200μモル/gを上回る種子スクロース含有量という遺伝可能な表現 型を有する段階(a)の交雑の子孫植物をスクリーニングすること;および (c)所望される大豆蛋白質製品を取得するために段階(b)で選択された種 子を加工処理すること、 を含む方法。 16. ミオイノシトール 1−リン酸の合成のための能力が減少している突 然変異体ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコードする少なくとも一つ の遺伝子についてホモ接合性であり、その遺伝子が、(i)17μモル/gを下 回る種子フィチン酸含有量、(ii)14.5μモル/を下回るラフィノースと スタキオースの総計種子含有量、ならびに(iii)200μモル/gを上回る 種子スクロース含有量という遺伝可能な表現型を付与する大豆植物の種子を用い るための: (a)ミオイノシトール 1−リン酸の合成のための能力が減少している突然 変異体ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼを含む大豆植物を、その突然変 異を含まないいずれかの大豆親と交雑させてF1ハイブリッドを取得すること; (b)少なくとも一世代についてF1ハイブリッドを自家授粉させること;お よび (c)ミオイノシトール 1−リン酸の合成のための能力が減少している突然 変異体ミオイノシトール 1−リン酸シンターゼをコードする 少なくとも一つの遺伝子についてホモ接合性であり、その遺伝子が、(i)17 μモル/gを下回る種子フィチン酸含有量、(ii)14.5μモル/を下回る ラフィノースとスタキオースの総計種子含有量、ならびに(iii)200μモ ル/gを上回る種子スクロース含有量という遺伝可能な表現型を付与する段階( b)の子孫を同定すること、 を含む方法。
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