FI115215B - Förfarande för framställning av 3'-derivatiserade oligonukleotidanaloger med icke-nukleotida grupper och deras användning - Google Patents
Förfarande för framställning av 3'-derivatiserade oligonukleotidanaloger med icke-nukleotida grupper och deras användning Download PDFInfo
- Publication number
- FI115215B FI115215B FI930221A FI930221A FI115215B FI 115215 B FI115215 B FI 115215B FI 930221 A FI930221 A FI 930221A FI 930221 A FI930221 A FI 930221A FI 115215 B FI115215 B FI 115215B
- Authority
- FI
- Finland
- Prior art keywords
- alkyl
- formula
- aryl
- integer
- group
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Virology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Oncology (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Macromolecular Compounds Obtained By Forming Nitrogen-Containing Linkages In General (AREA)
- Graft Or Block Polymers (AREA)
- Macromonomer-Based Addition Polymer (AREA)
Claims (9)
1. Förfarande för framställning av terapeutiskt användbara oligonukleotidanaloger med formeln IA eller IB: 5 Γ η A B--(5'5'S)-- B tr m R2 Y Y R2 B--V-P-U U-P-V---B l/*\ Il II /‘n| r VJ 7 Jf J' W. C \ i-' ' R1_v / B £ \ !· R2 / / \S (3 3 S) \ | -< π Ί\ " Y R2 yb \ U P V--' B / \ il / \ w / ': ’: v :;'ö (IA) » · 115215 rr- R1-V--- B ^ Y R2 d 1¾ R2 η -."Λ (3'5 ' S)--B r\2 ^ Y R2 L ! 1¾ Y’ R2 z—P—X . .: II w ♦ * » · (IB) * * ·.*. 5 samt för framställning av fysiologiskt godtagbara salter därav, kännetecknat av att * * » R1 är väte, Ci-i8-alkyl, C2_i8-alkenyl, C2-i8-alkinyl, C2-i8-alkylkarbonyl, C3_i9-alkenylkarbonyl, C3_19-alkinylkar-; bonyl, C6_20-aryl, C6-i4-aryl-Ci_8-alkyl, eller en rest med 10 formeln II: : Z - P - Z' (II) * Π ; w R2 är väte, hydroxyl, Ci-i8-alkoxi, halogen, azido : eller NH2;
15 B är en konventionell bas i nukleotidkemi; 115215 a är oxi eller metylen; d, e, f är oberoende av varandra var och en ett heltal 0 - 50; i är ett heltal 1 -10; 5 r är ett heltal 0 eller 1 under förutsättning att när r = 0, V = Y1, och när i > 1, r = 1; W är oxo, selenoxo eller tioxo; V är oxi, sulfandiyl eller imino,- Y är oxi, sulfandiyl, imino eller metylen;
10 Y' är oxi, sulfandiyl, imino, (CH2)m eller V(CH2)m/ där m är ett heltal 1 - 18; X är hydroxyl eller merkapto; U är hydroxyl, merkapto, SeH, Cx.^-alkoxi, Ci_18- 15 alkyl, C6-2o-aryl, C6-i4-aryl-Ci-8-alkyl, NHR3, NR3R4 eller en rest med formeln (OCH2CH2) p0 (CH2) qCH2Ri:L, där: R3 är Ci-ie-alkyl, fördelaktigt Ci-8-alkyl, C6-2o-aryl, C6-i4-aryl-Ci_8-alkyl, - (CH2) c- [NH (CH2) c] d-NR12R12, där c är ett heltal 2-6 och d är ett heltal 0 - 6, och R12 oberoende av 20 varandra vardera är väte eller Ci_6-alkyl eller Ci_4-alkoxi-, Ci-g-alkyl; R4 är C1_18-alkyl, C6_20-aryl eller CVxo-aryl-C^e- » ; · alkyl, eller i fall av NR3R4, bildar tillsammans med R3 och ’ * ' 'ί kväveatomen som binder dem en 5 - 6-ledad heterocyklisk 25 ring, som dessutom kan innehälla en ytterligare heteroatom • ',·* frän gruppen 0, S, N, : p är ett heltal 1 - 100, q är ett heltal 0-18, R11 är väte eller en funktionell grupp;
30 S är en grupp med formeln III: 1 /1):/0] \ n : \ il T ; \ » / L \ * / (in) * 9 g ' P 115215 där g och g' vardera är ett heltal 0 eller 1, h är ett heltal 0 - 10; G är Ci-i2-alkyl en, varvid alkylen eventuellt kan 5 vara substituerad med nägon av följande.- halogen, amino, hydroxyl, Ci-i8-alkyl, Ci_18-alkoxi, Ci-i8-alkylkarbonyloxi, C6-i4-aryl, C6-i4-aryl-Ci-8-alkyl eller C6-i4-aryl-Ci-8-alkoxi; Cs-i4-aryldi-Ci-8-alkylen, C6-i8-arylen, en grupp med formeln (CH2CH2V) οΟΗ2ΟΗ2 eller (ΟΗ2ν)οΟΗ2, där a är ett heltal 1-11, 10 en enhet med formeln U _[G-Y-P-Y'-]β 11 w där β är ett heltal 1-6, eller en grupp med for- 15 meln: ~yaN<:H \_^ H R2 I z = z' ; hydroxyl, merkapto, SeH, Ci-22-alkoxi, ♦ t -0-(CH2) b-NR12R13, där b är ett heltal 1-6, och R13 är 0^-20 alkyl, eller R12 och R13 bildar tillsammans med kväveatomen som binder dem en 3 - 6-ledad ring, Οχ-is-alkyl, fördelak- * · tigt Ci-8-alkyl, Ce^o-aryl, C6-i4-aryl-Ci.8-alkyl, C6-i4-aryl-Ci-s-alkoxi, varvid aryl även betecknar heteroaryl och aryl eventuellt är substituerad med en, tvä eller tre likadana ’ 25 eller olika rester frän gruppen karboxyl, amino, nitro, ; Ci-4-alkylamino, hydroxyl, halogen och cyan, Ci_18-alkylmer- j kapto, NHR3, NR3R4, en rest eller en grupp med formeln III, vilken befrämjar intracellulär upptagning eller fungerar ,· som etikett för en DNA-sond eller som vid hybridisering av • 30 oligonukleotidanalogen tili mälnukleinsyran päverkar denna genom bindning, tvärbindning eller spjälkning; och 115215 varvid de bägformiga klamrarna i 2'- och 3’-positionen indikerar att R2 och den intilliggande fosforyl-resten även kan befinna sig i omvänd 3 1 - och 21 -position; och 5 varvid varje nukleotid kan vara i sin D- eller L- konfiguration och basen B kan vara i a- eller β-positionen, varvid a) i en första reaktionscykel en nukleotidenhet med en 31(21)-huvudfosfor(V)grupp och en fri 5'-hydroxyl- eller 10 merkaptogrupp, bringas att reagera med en annan nukleotidenhet med fosfor(III)- eller fosfor(V)grupp i 3' (2') -ändan, eller ett aktiverat derivat därav, eller en reagens, som möjliggör anslutning av distansgrupper, varvid i resten av cyklerna en nukleotidenhet med en fosfor(III)- eller 15 fosfor(V)grupp i 3' (2')- eller 5'-ändan, eller ett akti verat derivat därav, bringas att reagera med en annan nukleotidenhet med en fri hydroxyl- eller merkaptogrupp i 5'-eller 3' (2')-ändan, eller b) oligonukleotidanalogen uppbyggs av fragment pä 20 samma sätt, frän de enligt punkt a) eller b) erhällna oligonuk-. leotiderna avspjälks skyddsgrupper som temporärt anslutits för att skydda andra funktioner och de sälunda erhällna • oligonukleotidanalogerna med formeln IA eller IB omvandlas .* 25 eventuellt till fysiologiskt godtagbara salter därav.
2. Förfarande enligt patentkrav 1, kännetecknat V >* av att basen B befinner sig i /3-positionen, nukleotiderna är i D-konfigurationen, R2 är i 2'-positionen och a är oxi.
• 3. Förfarande enligt patentkrav 1 eller 2, känne- 30 tecknat av att t ’ R1 är väte, Ci_s-alkyl, särskilt metyl, eller en rest med formeln II; > ‘ R2 är väte eller hydroxyl, särskilt väte; d, e ja f är var och en ett heltal 5 - 15; : 35 i är ett heltal 1-3; m är ett heltal 1-6, särskilt 1; 115215 U är hydroxyl, merkapto, Ci_6-alkoxi, Ci-6-alkyl, NR3R4 eller NHR3, särskilt hydroxyl eller Ci-6-alkyl, varvid R3 är Ci-s-alkyl, fördelaktigt Ci-4-alkyl, eller me-toxietyl, och
4. Förfarande enligt ett eller flera av patentkra-ven 1, 2 eller 3, kännetecknat av att V, Y och Y1 var och en är oxi.
5. Förfarande enligt ett eller flera av patentkra-10 ven 1-3 eller 4, kännetecknat av att W är oxo.
5 B, W, V, Y, Y', X och Z definieras säsom ovan.
6. Förfarande enligt ett eller flera av patentkra-ven 1-4 eller 5, kännetecknat av att U är hydroxyl.
7. Förfarande enligt ett eller flera av patentkra-ven 1-4 eller 6, kännetecknat av att R1 är väte.
8. Användning av en fosfityleringsreagens med for- meln : U' / DMTr-X'-G'-Y"’-P NR5R6 där R5 och R6 oberoende av varandra vardera är Ci_i2- » . alkyl eller bäda ringarna bildar tillsammans en 5 - 6-ledad I 20 ring, DMTr är dimetoxitrityl, X' = Y" ' = oxi eller sulfan- : diyl, U' är Οχ-4-alkyl eller en som skyddat derivat förekom- mande hydroxylgrupp och G' är (CH2CH20) c,CH2CH2 eller CH2CH(OR' )CH2, där R’ är Ci^g-alkyl, C6.14-aryl eller C6_i4- · aryl-C1-8-alkyl och a är ett heltal 1 - 11, kännetecknat 25 av användning i ett förfarande enligt ett eller flera av patentkraven 1-7.
9. Användning av oligonukleotidanaloger enligt ett , , eller flera av patentkraven 1 - 6, kännetecknat av an- • vändning säsom sond för indikering av nukleinsyror eller ’ 30 som ett hjälpmedel i molekylärbiologi. i
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE4201663 | 1992-01-22 | ||
| DE4201663 | 1992-01-22 |
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| FI930221A0 FI930221A0 (fi) | 1993-01-20 |
| FI930221A FI930221A (fi) | 1993-07-23 |
| FI115215B true FI115215B (sv) | 2005-03-31 |
Family
ID=6450031
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| FI930221A FI115215B (sv) | 1992-01-22 | 1993-01-20 | Förfarande för framställning av 3'-derivatiserade oligonukleotidanaloger med icke-nukleotida grupper och deras användning |
Country Status (18)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US5646261A (sv) |
| EP (2) | EP0552767B1 (sv) |
| JP (1) | JP3676388B2 (sv) |
| KR (1) | KR100273824B1 (sv) |
| AT (2) | ATE307821T1 (sv) |
| AU (1) | AU657191B2 (sv) |
| CA (1) | CA2087817C (sv) |
| DE (2) | DE59310287D1 (sv) |
| DK (2) | DK1142902T3 (sv) |
| ES (2) | ES2250268T3 (sv) |
| FI (1) | FI115215B (sv) |
| HU (1) | HUT63172A (sv) |
| IL (1) | IL104460A (sv) |
| NO (1) | NO308609B1 (sv) |
| NZ (1) | NZ245721A (sv) |
| PL (1) | PL172245B1 (sv) |
| PT (1) | PT552767E (sv) |
| ZA (1) | ZA93423B (sv) |
Families Citing this family (19)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2966849B2 (ja) * | 1987-12-03 | 1999-10-25 | 三井化学株式会社 | 黄色系昇華転写用色材 |
| DE59306170D1 (de) * | 1992-09-24 | 1997-05-22 | Hoechst Ag | Oligoribonucleotid- und Ribozym-Analoga mit terminalen 3'-3'-bzw.5'-5'-Verknüpfungen |
| EP0602524A1 (de) * | 1992-12-15 | 1994-06-22 | Hoechst Aktiengesellschaft | Chemilumineszenzmarkierte Gensonden und ihre Verwendung in Gensondentesten |
| CA2114355A1 (en) * | 1993-01-29 | 1994-07-30 | Hidehiko Furukawa | Modified oligodeoxyribonucleotides, their preparation and their therapeutic use |
| US5532130A (en) * | 1993-07-20 | 1996-07-02 | Dyad Pharmaceutical Corporation | Methods and compositions for sequence-specific hybridization of RNA by 2'-5' oligonucleotides |
| DE4408528A1 (de) * | 1994-03-14 | 1995-09-28 | Hoechst Ag | Peptid-Oligonucleotid-Derivate, deren Herstellung und Verwendung |
| US6919441B2 (en) | 1994-03-14 | 2005-07-19 | Aventis Pharma Deutschland Gmbh | Polyamide-oligonucleotide derivatives, their preparation and use |
| US6358689B1 (en) * | 1994-05-11 | 2002-03-19 | Boston University | Detection of markers in nascent proteins |
| DE4418691A1 (de) * | 1994-05-28 | 1996-02-22 | Boehringer Mannheim Gmbh | 3'-(4'-) nicht-radioaktiv markierte Nukleoside und Nukleotide mit Aminocarbonsäure-, Peptid- oder Carbonsäure-Spacer |
| WO1995032986A1 (en) * | 1994-06-01 | 1995-12-07 | Hybridon, Inc. | Branched oligonucleotides as pathogen-inhibitory agents |
| US5696248A (en) * | 1994-06-15 | 1997-12-09 | Hoechst Aktiengesellschaft | 3'-modified oligonucleotide derivatives |
| US6326487B1 (en) | 1995-06-05 | 2001-12-04 | Aventis Pharma Deutschland Gmbh | 3 modified oligonucleotide derivatives |
| US6331617B1 (en) | 1996-03-21 | 2001-12-18 | University Of Iowa Research Foundation | Positively charged oligonucleotides as regulators of gene expression |
| US6274313B1 (en) | 1996-03-21 | 2001-08-14 | Pioneer-Hybrid International, Inc. | Oligonucleotides with cationic phosphoramidate internucleoside linkages and methods of use |
| US6121437A (en) | 1999-03-16 | 2000-09-19 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Phosphate and thiophosphate protecting groups |
| US20040082774A1 (en) * | 1999-03-16 | 2004-04-29 | Guzaev Andrei P. | Novel phosphate and thiophosphate protecting groups |
| US20040023367A1 (en) * | 2002-07-31 | 2004-02-05 | Affymetrix, Inc. | Method of photolithographic production of polymer arrays |
| US8084589B2 (en) * | 2007-08-31 | 2011-12-27 | University Of Massachusetts | Phosphoramidite nucleoside analogs |
| US20120082616A1 (en) * | 2010-09-24 | 2012-04-05 | Mallinckrodt Llc | Aptamer Conjugates for Targeting of Therapeutic and/or Diagnostic Nanocarriers |
Family Cites Families (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DE3239888A1 (de) * | 1982-10-28 | 1984-05-03 | Hubert Prof. Dr. 2000 Hamburg Köster | Verfahren zur herstellung von oligonucleosidphosphonaten |
| US4739044A (en) * | 1985-06-13 | 1988-04-19 | Amgen | Method for derivitization of polynucleotides |
| DE3751468T2 (de) * | 1986-10-30 | 1996-02-29 | Daicel Chem | Verfahren zur herstellung von oligonukleotiden und verbindungen zur bildung hochmolekularer schutzgruppen. |
| US4816571A (en) * | 1987-06-04 | 1989-03-28 | Applied Biosystems, Inc. | Chemical capping by phosphitylation during oligonucleotide synthesis |
| US5216141A (en) * | 1988-06-06 | 1993-06-01 | Benner Steven A | Oligonucleotide analogs containing sulfur linkages |
| US5399676A (en) * | 1989-10-23 | 1995-03-21 | Gilead Sciences | Oligonucleotides with inverted polarity |
| EP0942000B1 (en) * | 1989-10-24 | 2004-06-23 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | 2'-Modified oligonucleotides |
| US5210015A (en) * | 1990-08-06 | 1993-05-11 | Hoffman-La Roche Inc. | Homogeneous assay system using the nuclease activity of a nucleic acid polymerase |
| GB9021625D0 (en) * | 1990-10-04 | 1990-11-21 | Ici Plc | Synthesis of oligonucleotides |
| FI115214B (sv) * | 1992-01-22 | 2005-03-31 | Hoechst Ag | Förfarande för framställning av oligonukleotidanaloga och deras användning |
-
1993
- 1993-01-19 US US08/005,283 patent/US5646261A/en not_active Expired - Lifetime
- 1993-01-20 KR KR1019930000676A patent/KR100273824B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1993-01-20 FI FI930221A patent/FI115215B/sv not_active IP Right Cessation
- 1993-01-20 NZ NZ245721A patent/NZ245721A/en not_active IP Right Cessation
- 1993-01-20 IL IL10446093A patent/IL104460A/xx not_active IP Right Cessation
- 1993-01-21 DK DK01116471T patent/DK1142902T3/da active
- 1993-01-21 NO NO930200A patent/NO308609B1/no not_active IP Right Cessation
- 1993-01-21 AU AU31911/93A patent/AU657191B2/en not_active Expired
- 1993-01-21 DE DE59310287T patent/DE59310287D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1993-01-21 HU HU9300161A patent/HUT63172A/hu unknown
- 1993-01-21 DE DE59310380T patent/DE59310380D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1993-01-21 ES ES01116471T patent/ES2250268T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1993-01-21 CA CA2087817A patent/CA2087817C/en not_active Expired - Lifetime
- 1993-01-21 JP JP00825693A patent/JP3676388B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1993-01-21 ES ES93100893T patent/ES2177533T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1993-01-21 AT AT01116471T patent/ATE307821T1/de active
- 1993-01-21 EP EP93100893A patent/EP0552767B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1993-01-21 PT PT93100893T patent/PT552767E/pt unknown
- 1993-01-21 DK DK93100893T patent/DK0552767T3/da active
- 1993-01-21 ZA ZA93423A patent/ZA93423B/xx unknown
- 1993-01-21 EP EP01116471A patent/EP1142902B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1993-01-21 AT AT93100893T patent/ATE217881T1/de active
- 1993-01-22 PL PL93297516A patent/PL172245B1/pl unknown
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| FI115214B (sv) | Förfarande för framställning av oligonukleotidanaloga och deras användning | |
| FI115215B (sv) | Förfarande för framställning av 3'-derivatiserade oligonukleotidanaloger med icke-nukleotida grupper och deras användning | |
| US5955599A (en) | Process for making oligonucleotides containing o- and s- methylphosphotriester internucleoside linkages | |
| US5596091A (en) | Antisense oligonucleotides comprising 5-aminoalkyl pyrimidine nucleotides | |
| EP0506242B1 (en) | Method and compounds for solid phase synthesis of oligonucleotides and oligonucleotide analogs | |
| US6140482A (en) | Primary phosphoramidate internucleoside linkages and oligonucleotides containing the same | |
| JP3186795B2 (ja) | 末端３′−３′または５′−５′ヌクレオチド間結合を有するオリゴヌクレオチド類似体 | |
| JP3831407B2 (ja) | メチルホスホン酸エステル、その製造方法およびその使用 | |
| CA2151801C (en) | 3'-modified oligonucleotide derivatives | |
| JP4620810B2 (ja) | ポリアミド−オリゴヌクレオチド誘導体、その製造及び使用 | |
| JP3653102B2 (ja) | 末端３′−３′および／または５′−５′連鎖を有するオリゴリボヌクレオチドおよびリボザイム類縁体 | |
| US6033909A (en) | Oligonucleotide analogs, their preparation and use | |
| US5571937A (en) | Complementary DNA and toxins | |
| RU2111971C1 (ru) | Модифицированные олигодезоксирибонуклеотиды, композиция на их основе и промежуточные соединения | |
| WO1996039414A1 (en) | Novel base protecting groups for oligonucleotide synthesis | |
| US6509459B1 (en) | Base protecting groups and rapid process for oligonucleotide synthesis | |
| WO1998033806A1 (en) | Base protecting groups and process for oligonucleotide synthesis | |
| WO1998005675A2 (en) | Radiolabeled o-methyl phosphotriester and o-methyl phosphorothioate internucleoside linkages and oligonucleotides containing the same | |
| CA2122470A1 (en) | Oligonucleotides having aminohydrocarbon phosphonate moieties | |
| WO1998021226A1 (fr) | Derive oligonucleotidique h-phosphonate et procede de production associe |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| FG | Patent granted |
Ref document number: 115215 Country of ref document: FI |
|
| MA | Patent expired |