ES2341367T3 - Variantes hipoalergenicas del alergeno principal del polen de betula verrucosa. - Google Patents

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Abstract

Proteína que es una variante hipoalergénica del alérgeno principal del polen de Betula verrucosa (Bet v 1) y que se caracteriza por: a) mostrar una reactividad reducida frente a IgE en comparación con Bet v 1 de tipo natural (SEQ ID NO:1); b) tener una secuencia de aminoácidos que: i) es al menos el 87%, preferiblemente al menos el 94%, más preferiblemente al menos el 97% idéntica a SEQ ID NO:1; ii) en una alineación de secuencia con SEQ ID NO:1, presenta una sustitución o deleción del residuo de Lys correspondiente al aminoácido 54 de SEQ ID NO:1.

Description

Variantes hipoalergénicas del alérgeno principal del polen de Betula verrucosa.
La presente invención proporciona variantes de secuencia hipoalergénicas de la proteína Bet v 1, moléculas de ácido nucleico que las codifican, composiciones farmacéuticas que contienen las mismas y su uso en la profilaxis y el tratamiento de enfermedades alérgicas provocadas por el polen de plantas de la especie Betula verrucosa.
Antecedentes de la invención
Las alergias están provocadas por una disfunción del sistema inmunitario, que reacciona frente a proteínas inocuas contenidas en polen, ácaros, epitelios y ciertos alimentos produciendo anticuerpos de la clase IgE.
Datos recientes indican que más del 10% de la población en los países occidentales padece esta enfermedad, cuyos síntomas pueden deteriorarse con el tiempo dando lugar a, por ejemplo, asma o una sensibilización a otros alérgenos haciendo así más difícil la elección del tratamiento apropiado.
La inmunoterapia hiposensibilizante específica, a diferencia de la terapia farmacológica, es el único tratamiento etiológico de enfermedades alérgicas que puede cambiar favorablemente los parámetros inmunológicos en los que se basan estas enfermedades.
La inmunoterapia hiposensibilizante consiste en la administración de dosis crecientes de extractos normalizados (vacunas) obtenidos de la misma sustancia que provoca la enfermedad (1). De este modo, se induce gradualmente en el paciente una especie de tolerancia inmunológica a dicha sustancia con la desaparición posterior de los síntomas alérgicos.
Sin embargo, el riesgo de provocar efectos secundarios graves (2), aunque se reduce notablemente con el uso de o bien vacunas de liberación lenta o bien vacunas administradas a través de vías alternativas a las inyecciones, ha limitado de hecho la aplicación de la inmunoterapia hiposensibilizante específica en el tratamiento de enfermedades alérgicas.
En los últimos años, la mayor parte de la atención se ha centrado en el desarrollo de vacunas eficaces, más seguras. En particular, el desarrollo de vacunas que consisten en proteínas recombinantes mutagenizadas, es decir, variantes hipoalergénicas que pueden influir favorablemente en la evolución natural de la enfermedad sin provocar efectos secundarios no deseados (3), ha representado un objetivo importante.
El polen de plantas conocidas taxonómicamente como Fagales (abedul, aliso, avellano, roble, carpe) es una de las causas más importantes de asma y rinitis alérgica en las regiones templadas. Los dos alérgenos principales del polen del abedul, Bet v 1 (ADNc depositado en GenBank con el n.º de registro X15877) y Bet v 2 (n.º de registro M65179) son proteínas con un peso molecular de 17 y 14 kD, respectivamente (4, 5). Casi el 95% de los pacientes con alergia al polen del abedul producen anticuerpos IgE contra Bet v 1 y el 60% de estos pacientes muestran reactividad contra Bet v 1 solo (6).
Bet v 1 está presente de manera natural en más de diez isoformas que muestran una identidad de secuencia comprendida entre el 84,4% y el 99,4% (7). Este alérgeno pertenece a la familia de las "proteínas relacionadas con la patogénesis", es decir, proteínas ubicuas producidas por plantas en respuesta a estrés patológico o medioambiental, cuyas funciones se supone que están relacionadas con el transporte de esteroides (8,9). La alta homología de secuencia con los alérgenos del grupo 1 en el polen de otras plantas del orden Fagales explica por qué los pacientes con IgE específicas para Bet v 1 muestran síntomas alérgicos durante la temporada de polinización de diferentes plantas que pertenecen al mismo orden taxonómico (10). La alergia al polen del abedul va acompañada a menudo por reacciones adversas provocadas por la ingesta de frutas (por ejemplo, cereza, manzana, pera) u hortalizas (por ejemplo, apio y zanahoria) frescas. El motivo es que tales alimentos contienen proteínas caracterizadas por una alta homología de estructura y secuencia con Bet v 1, que son reconocidas por IgE específicas producidas por el alérgeno principal del abedul (11). La inmunoterapia con el alérgeno Bet v 1 puede ser eficaz en el tratamiento de la alergia al polen del abedul así como la polinosis a otras plantas del orden Fagales y la alergia a alimentos que contienen alérgenos que reaccionan de manera cruzada con Bet v 1 (12).
Un factor que se correlaciona con los efectos beneficiosos de la inmunoterapia hiposensibilizante es la inducción de anticuerpos IgG específicos para el alérgeno sensibilizante. Tales anticuerpos (protectores) pueden inhibir la unión de IgE al antígeno, específicamente a Bet v 1, alterando la conformación tridimensional de esta molécula (13, 14). El desarrollo de vacunas que consisten en proteínas recombinantes que poseen menos alergenicidad y propiedades inmunogénicas inalteradas mejoraría el tratamiento de enfermedades alérgicas.
Descripción de la invención
Se ha encontrado ahora que sustituyendo o delecionando uno o más residuos de aminoácido dentro de la secuencia de proteína del alérgeno Bet v 1, éste se hace menos reactivo frente a los anticuerpos IgE.
En un primer aspecto, la invención proporciona una proteína hipoalergénica que es una variante de secuencia del alérgeno Bet v 1, caracterizada por:
1)
mostrar una actividad reducida frente a IgE en comparación con el alérgeno Bet v 1 de tipo natural (SEQ ID NO:1);
2)
tener una secuencia de aminoácidos que:
a)
es al menos el 87%, preferiblemente al menos el 94%, más preferiblemente al menos el 97% idéntica a SEQ ID NO:1;
b)
en una alineación de secuencia con SEQ ID NO: 1, presenta una sustitución o deleción del residuo de Lys correspondiente a al aminoácido 54 de SEQ ID NO:1.
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Se prefieren variantes de sustitución en vez de deleción, especialmente aquéllas en las que el residuo de Lys en la posición indicada se sustituye por un aminoácido neutro o polar. Más preferiblemente, dicho aminoácido neutro o polar se selecciona de Ala, Thr, Gly, Pro, Leu, Ile, Ser, Phe, aún más preferiblemente de Ala, Thr y Ser.
En una realización preferida, la proteína hipoalergénica consiste en SEQ ID NO:2.
Las variantes de sustitución y/o deleción del alérgeno Bet v 1 según esta invención, en comparación con su equivalente de tipo natural, muestran una reducción de la reactividad de IgE en al menos el 25%, preferiblemente al menos el 50%, más preferiblemente al menos el 80%, frente al suero de pacientes alérgicos al polen de Betula verru- cosa.
La reactividad de IgE de la proteína SEQ ID NO:2 de un conjunto de sueros de pacientes alérgicos se sometió a prueba en un ensayo ELISA (figura 1). En comparación con el alérgeno Bet v 1 de tipo natural (SEQ ID NO:1), se observó una reducción media del 56% de la reactividad de IgE con SEQ ID NO: 2, cuando se incubó esta proteína con diversas diluciones (desde 1:2 hasta 1:8) de conjuntos de suero de pacientes alérgicos al polen del abedul.
Estos resultados se confirmaron mediante experimentos de ELISA de inhibición, que permiten evaluar la reactividad de epítopos homólogos de diferentes proteínas. Estos resultados indican claramente que la sustitución del aminoácido en la posición 54 de SEQ ID NO:1 disminuye el reconocimiento del alérgeno Bet v 1 por IgE.
Además, la reactividad de la proteína de SEQ ID NO:2 frente a IgE de un conjunto de suero positivo para polen de Betula verrucosa se sometió a ensayo mediante inmunotransferencia de tipo Western. También en este caso, se observó una reducción de la reactividad de IgE en los sueros analizados, que, en comparación con Bet v 1 de tipo natural (SEQ ID NO:1), era del 88% para SEQ ID NO:2 (figura 3).
En un aspecto adicional, la invención proporciona un péptido inmunológicamente activo correspondiente a un fragmento de Bet v 1 que contiene desde 15 hasta 35, más preferiblemente desde 15 hasta 20 residuos de aminoácido y que porta las sustituciones y/o deleciones descritas anteriormente. Tal como se usa en el presente documento, la expresión "péptido inmunológicamente activo" indica un péptido que puede provocar una respuesta inmunitaria dependiente de IgE.
Pueden prepararse fácilmente variantes de sustitución y/o deleción según la invención mediante mutagénesis de la secuencia de ADNc de Bet v 1 (SEQ ID NO:6) usando métodos y técnicas conocidos por cualquier experto en la técnica.
La secuencia de ADNc para la variante de sustitución única SEQ ID NO:2 se identifica en SEQ ID NO:7.
En aspectos adicionales, la invención proporciona una molécula de ácido nucleico que codifica para una proteína Bet v 1 hipoalergénica dada a conocer en el presente documento, o un péptido derivado de la misma, y un vector de expresión que contiene dicha molécula de ácido nucleico funcionalmente unida a elementos genéticos que controlan la expresión de dicha proteína o péptido en células eucariotas o procariotas, tales como potenciadores, promotores de la transcripción, secuencias señal y líder u otras secuencias implicadas en la regulación de la transcripción. Los ejemplos de vectores incluyen plásmidos, virus y fagos aunque puede empleare también cualquier otro vector que se utilice comúnmente en ingeniería genética.
La invención comprende además una célula huésped procariota o eucariota que se transforma o transfecta con un vector tal como se describió anteriormente. Se usan generalmente células procariotas tales como Escherichia coli o Bacillus subtilis, o células eucariotas tales como Saccharomyces cerevisiae para la clonación del vector y la expresión de ADNc.
Además, las variantes hipoalergénicas según la invención pueden producirse como proteínas de fusión.
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Gracias a su reactividad de IgE reducida, las variantes de Bet v 1 según la presente invención pueden usarse de manera conveniente para la preparación de composiciones farmacéuticas (por ejemplo comprimidos y cápsulas) para el tratamiento preventivo o terapéutico de individuos alérgicos al polen de Betula verrucosa.
En un aspecto adicional, la invención se refiere por tanto a una composición farmacéutica que contiene una cantidad eficaz de variante de Bet v 1 hipoalergénica tal como se proporciona en el presente documento, opcionalmente en combinación con otros alérgenos de Betula verrucosa y/o con vehículos y excipientes farmacéuticamente aceptables. En una realización preferida de la invención, la composición farmacéutica está en forma de una vacuna que va a usarse en la profilaxis o el tratamiento de enfermedades alérgicas, incluyendo asma bronquial, rinitis alérgica, dermatitis alérgica y conjuntivitis alérgica. La teoría y práctica de la vacunación las conoce cualquier experto en la técnica (15, 16).
Los siguientes ejemplos ilustran adicionalmente la invención. A menos que se indique lo contrario, los métodos usados en los ejemplos se describen en Sambrook, Fritsch ET Maniatis "Molecular cloning. A laboratory manual" II ed. Vol. 1-2-3 CSH Lab Press 1989.
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Ejemplo 1 Mutagénesis específica de sitio del ADNc que codifica para el alérgeno Bet v 1
Se llevó a cabo la mutagénesis específica de sitio del ADNc que codifica para el alérgeno Bet v 1 (SEQ ID NO: 6) mediante clonación de ADNc en un vector procariota (pBluescript, n.º de registro de GenBank X52327) seguido por amplificación por PCR. Los oligonucleótidos usados como cebadores en la reacción de PCR (tabla) realizaron las sustituciones de bases apropiadas. Para cada mutagénesis, se usó un oligonucleótido complementario que se unía a una región correspondiente de la hebra de ADN (17). Tras la amplificación, se degradó selectivamente el molde original inalterado con digestión enzimática catalizada mediante la enzima de restricción DpnI. Se transformaron entonces células de Escherichia coli con las moléculas mutagenizadas. Se secuenciaron clones obtenidos de colonias bacterianas individuales según Sanger para determinar la modificación de bases correcta y la ausencia de mutaciones no específicas en el ADNc.
TABLA Secuencia del oligonucleótido usado como cebador en la mutagénesis específica de sitio. Las bases mutadas están en negrita
1
Ejemplo 2 Producción de proteína Bet v 1 y variantes de la misma
Se clonaron y expresaron ADNc de Bet v 1 de tipo natural (SEQ ID NO. 6) y mutagenizados (SEQ ID N. 7-10), flanqueados por una secuencia que codificaba para seis histidinas, en Escherichia coli según protocolos convencionales (18, 19). Se recogieron las células mediante centrifugación, se resuspendieron en tampón NaH_{2}PO_{4} 50 mM, NaCl 300 mM, pH 8, y se lisaron mediante sonicación. Se separaron las proteínas recombinantes mediante centrifugación. Se resuspendió el sedimento que contenía un agregado de proteína insoluble en NaH_{2}PO_{4} 100 mM, Tris-HCl 10 mM, urea 8 M (pH 8) (tampón de desnaturalización) y se agitó durante 60 min. Se separaron las proteínas recombinantes solubilizadas de los desechos insolubles mediante centrifugación y se purificaron mediante cromatografía de afinidad en condiciones de desnaturalización usando columnas de agarosa unidas a ácido nitriloacético, que quela los iones níquel que interaccionan con la parte de seis histidinas fusionada al alérgeno. Se replegaron las proteínas purificadas mediante diálisis durante 16 horas a 4ºC en disolución de NaCl al 0,68%, NaHCO_{3} al 0,275%.
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Ejemplo 3 Características de sueros de sujetos alérgicos
Se recogieron sueros de individuos con anamnesis clínica de alergia estacional a polen de Betula verrucosa y una reactividad específica RAST 4+ frente a alérgenos de B. verrucosa y entonces se agruparon. Se usó como control negativo un conjunto de sueros de pacientes no alérgicos.
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Ejemplo 4 Análisis ELISA de la reactividad de variantes de Bet v 1 frente a IgE de un conjunto de suero
Se adsorbió la misma cantidad de alérgeno de tipo natural y de variantes mutagenizadas (0,5 \mug) en tampón carbonato/bicarbonato 50 mM, pH 9,6, en pocillos de placas de poliestireno para el ensayo ELISA mediante incubación a 4ºC durante 16 horas. Se lavaron los pocillos con disolución de lavado (tampón fosfato 60 mM, pH 6,5, que contenía un 0,05% de Tween-20) y se bloquearon con disolución de dilución (25% de suero de caballo, EDTA 1 mM, 0,05% de Tween 20, 0,01% de tiomersal en tampón fosfato 150 mM, pH 7,4). Se añadieron alícuotas de 100 \mul de diluciones en serie (en tampón de dilución) de un conjunto de sueros humanos RAST 4+ a cada muestra y se incubaron a 25ºC durante 2 horas. Tras tres lavados, se añadió suero anti-IgE humana conjugado con peroxidasa (1:1500 en tampón de dilución), seguido por incubación a 25ºC durante 1,5 horas. Tras tres lavados, se reveló la reacción colorimétrica añadiendo 100 \mul de reactivo TMB (BioFX Laboratories, Owings Mills, MD) e incubando durante 15 minutos a 25ºC. Se detuvo la reacción añadiendo 100 \mul de HCl 1 N y se leyó a 450 nm usando un espectrofotómetro lector de microplacas.
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Ejemplo 5 Ensayo ELISA de inhibición. Inhibición por variantes de Bet v 1 de la unión de Bet v 1 de tipo natural a IgE de conjuntos de suero
Se adsorbieron alícuotas de 1 \mug de alérgeno de tipo natural en tampón carbonato/bicarbonato 50 mM, pH 9,6, en pocillos de placas de poliestireno para el ensayo ELISA mediante incubación a 4ºC durante 16 horas. Se lavaron los pocillos con disolución de lavado (tampón fosfato 60 mM, pH 6,5, que contenía un 0,05% de Tween-20) y se bloquearon con tampón de dilución (25% de suero de caballo, EDTA 1 mM, 0,05% de Tween 20, 0,01% de tiomersal en tampón fosfato 150 mM, pH 7,4). Se preincubaron alícuotas de 100 \mul de un conjunto de sueros humanos RAST 4+ diluidos 1:3 en tampón de dilución a 25ºC durante 2 horas con diluciones en serie de alérgeno de tipo natural y de variante mutagenizada. Se colocó la disolución obtenida en los pocillos y se incubó a 4ºC durante 16 horas. Tras tres lavados con tampón fosfato 0,06 M pH 6,5, 0,05% de Tween-20, se añadió suero anti-IgE humana conjugado con peroxidasa a una dilución 1:1500 (en tampón de dilución), seguido por incubación a 25ºC durante 1,5 horas. Tras tres lavados, se reveló la reacción colorimétrica añadiendo 100 \mul de reactivo TMB (BioFX Laboratories, Owings Mills, MD) e incubando a 25ºC durante 15 minutos. Se detuvo la reacción añadiendo 100 \mul de HCl 1 N seguido por lectura espectrofotométrica a 450 nm.
Se calculó el porcentaje de inhibición tal como sigue: 100x[(A-B)/A], en la que A es la absorbancia a 450 nm en ausencia de inhibidor mientras que B es la absorbancia en presencia de inhibidor.
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Ejemplo 6 Análisis de inmunotransferencia de tipo Western de la reactividad de variantes de Bet v 1 frente a IgE de un conjunto de sueros
Se analizaron electroforéticamente cantidades iguales de alérgeno de tipo natural y formas mutagenizadas (1,5 \mug) en gel de poliacrilamida seguido por electrotransferencia sobre membrana de nitrocelulosa, tal como se describe por Towbin (20).
Se incubó en primer lugar la membrana durante una hora en TBST (TBS, 0,05% de Tween-20) que contenía un 5% de leche en polvo desnatada (tampón de saturación) y se incubó entonces durante la noche con un conjunto de sueros de sujetos alérgicos a Betula verrucosa que mostraban una reactividad 4+, diluidos 1:3 en TBST con un 2% de leche en polvo desnatada. Tras 1 h de incubación, se lavó la membrana tres veces con TBST. Se pusieron en contacto los anticuerpos unidos a la membrana con son suero anti-IgE humana conjugado con peroxidasa y, tras varios lavados, se detectaron con el sistema de detección de quimioluminiscencia usando luminol como sustrato de la peroxidasa (ECL, Amersham).
Breve descripción de las figuras
Figura 1: Análisis ELISA de la reactividad de IgE frente al alérgeno Bet v 1 y frente a variantes hipoalergénicas de Bet v 1;
figura 2: Análisis de inmunotransferencia de tipo Western de la reactividad de IgE frente al alérgeno Bet v 1 y variantes del mismo.
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<170> PatentIn versión 3.3
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<210> 1
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<212> PRT
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<213> Desconocido
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<220>
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<223> Bet v 1 de tipo natural de Betula verrucosa
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<400> 1
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2
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<212> PRT
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<223> Bet v 1 mutante
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<213> Desconocido
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<223> Bet v 1 mutante
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<213> Desconocido
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<223> Bet v 1 mutante
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<223> Bet v 1 mutante
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<212> ADN
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<223> Secuencia que codifica para Bet v 1 de tipo natural
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<223> Secuencia que codifica para Bet v 1 mutante
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<223> Secuencia que codifica para Bet v 1 mutante
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<400> 10
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11

Claims (15)

1. Proteína que es una variante hipoalergénica del alérgeno principal del polen de Betula verrucosa (Bet v 1) y que se caracteriza por:
a)
mostrar una reactividad reducida frente a IgE en comparación con Bet v 1 de tipo natural (SEQ ID NO:1);
b)
tener una secuencia de aminoácidos que:
i)
es al menos el 87%, preferiblemente al menos el 94%, más preferiblemente al menos el 97% idéntica a SEQ ID NO:1;
ii)
en una alineación de secuencia con SEQ ID NO:1, presenta una sustitución o deleción del residuo de Lys correspondiente al aminoácido 54 de SEQ ID NO:1.
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2. Proteína según la reivindicación 1, en la que dicho residuo de Lys se sustituye por aminoácidos neutros o polares.
3. Proteína según la reivindicación 2, en la que dichos aminoácidos neutros o polares se seleccionan de Ala, Thr, Gly, Pro, Leu, Ile, Phe, Ser.
4. Proteína según la reivindicación 3, en la que dichos aminoácidos son Ala, Ser o Thr.
5. Proteína según la reivindicación 1, que tiene la secuencia de aminoácidos SEQ ID NO:2.
6. Fragmento de péptido inmunológicamente activo de una proteína según las reivindicaciones 1-5, que contiene desde 15 hasta 35 aminoácidos y que porta la sustitución y/o deleción de Lys tal como se definió anteriormente.
7. Péptido según la reivindicación 6, que contiene desde 15 hasta 20 aminoácidos.
8. Molécula de ácido nucleico que codifica para una proteína según las reivindicaciones 1-5 o para un péptido según las reivindicaciones 6-7.
9. Molécula de ácido nucleico según la reivindicación 8, que tiene la secuencia SEQ ID NO:7.
10. Vector que contiene la molécula de ácido nucleico según las reivindicaciones 8-9.
11. Célula huésped que contiene el vector según la reivindicación 10.
12. Composición farmacéutica que comprende una cantidad eficaz de una proteína según las reivindicaciones 1-5, o un péptido según las reivindicaciones 6-7, junto con vehículos y excipientes farmacéuticamente aceptables.
13. Composición según la reivindicación 12, que está en forma de una vacuna.
14. Uso de una proteína según las reivindicaciones 1-5, o un péptido según las reivindicaciones 6-7, para la preparación de una composición farmacéutica para el tratamiento profiláctico o terapéutico de enfermedades alérgicas.
15. Uso según la reivindicación 14, para el tratamiento de asma bronquial, rinitis, conjuntivitis y dermatitis atópica.
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