ES2354820T3 - Proteínas de fusión que comprenden alérgenos modificados de la familia ns-ltps, utilización de las mismas y composiciones farmacéuticas que las comprenden. - Google Patents

Proteínas de fusión que comprenden alérgenos modificados de la familia ns-ltps, utilización de las mismas y composiciones farmacéuticas que las comprenden. Download PDF

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Abstract

Proteína de fusión caracterizada por el hecho de que las secuencias de aminoácidos de los diferentes alérgenos Parj1 y Parj2, pertenecientes a la familia de las proteínas de transferencia de lípidos no específicas (ns-LTPs) de la especie Parietaria judaica, por el hecho de que dichas secuencias no presentan uno o más de los cuatro puentes disulfuro presentes en la secuencia de los alérgenos de tipo salvaje, encontrándose comprendido por lo menos uno en la región aminoterminal ente los residuos aminoácidos 1 y 30, y por el hecho de que dichas secuencias mantienen esencialmente la misma longitud que las secuencias de los alérgenos de tipo salvaje.

Description

Proteínas de fusión que comprenden alérgenos modificados de la familia ns-LTPs, utilización de las mismas y composiciones farmacéuticas que las comprenden.
Campo de la invención
La presente invención se encuentra comprendida dentro de los campos de la prevención y el tratamiento de los síntomas alérgicos asociados a alérgenos pertenecientes a la familia de las proteínas de transferencia de lípidos no específicas (ns-LTPs).
Estado de la técnica
Las proteínas ns-LTPs son moléculas proteicas pequeñas, de aproximadamente 10 kDa, que demuestran una elevada estabilidad y se encuentran naturalmente presentes en todos los organismos vegetales estudiados hasta hoy. Estas proteínas se caracterizan por su capacidad de transportar lípidos a través de las membranas in vitro.
En varias especies también han sido identificadas como alérgenos, tal como en el caso de las rosáceas prunoideas (melocotón, albaricoque, ciruela) y las pomoideas (manzana), así como en urticáceas como la Parietaria. El género Parietaria incluye 5 especies, siendo P. judaica la más alergénica.
La reacción alérgica, también denominada hipersensibilidad de tipo I, es inducida por una respuesta mediada por IgE frente a antígenos ambientales, habitualmente inocuos y presentes, por ejemplo, en granos de polen. La interacción IgE/alérgenos es el suceso inicial de una cascada de reacciones que conduce a la liberación de mediadores, como la histamina, responsables de la sintomatología alérgica. En el caso de que se localicen a nivel de la piel, la liberación de histamina provoca picor, eritema y edema, mientras que, en el caso de que sea generalizada, provoca broncoconstricción a nivel broncopulmonar y fenómenos importantes que implican el sistema cardiovascular.
Las enfermedades alérgicas más comunes son la rinitis, la conjuntivitis, la urticaria, el angioedema, el eccema, la dermatitides, el asma y, en casos extremos, el choque anafiláctico.
La tecnología del ADN recombinante ha permitido aislar diversos alérgenos de la familia de las ns-LTPs, entre ellos los alérgenos principales de Parietaria, denominados Parj1 y Parj2 (Colombo P. et al., The allergens of Parietaria, Int. Arch. Allergy Immunol. 130(3):173-9, 2003, revisión).
Parj1 es una proteína de 176 aminoácidos y un peso molecular de 18.450 kDa. La secuencia N-terminal muestra una composición de aminoácidos característica de secuencias de señal de las proteínas glucosiladas. La proteína madura está compuesta de 139 aminoácidos, con un peso molecular de 14.726 kDa. Es un alérgeno importante, debido a que se une a más de 90% de los sueros de sujetos alérgicos a Parietaria judaica (Costa et al., cDNA cloning, expression and primary structure of Parj1, a major allergen of Parietaria judaica pollen, FEBS Lett. 341(2-3):182-6, 21 de marzo de 1994).
Parj2 es una proteína de 133 aminoácidos y contiene un péptido de señal de 31 aminoácidos. La proteína madura está compuesta de 102 aminoácidos, con un peso molecular de 11.344 kDa. Muestra una homología de 45% con Parj1 a nivel de los aminoácidos y también es un alérgeno importante, debido a que reacciona con la práctica totalidad de los sueros de los sujetos alérgicos (Duro G. et al., cDNA cloning, sequence analysis and allergological characterization of Parj2.0101, a new major allergen of the Parietaria judaica pollen, FEBS Lett. 399(3):295-8, 1996).
A pesar de su homología estructural, Parj1 y Parj2 son, sin embargo, alérgenos independientes que contienen epítopos que también son independientes, tal como han subrayado los experimentos de inhibición cruzada. En el caso de que un grupo de sueros procedentes de sujetos alérgicos se preincube con los alérgenos Parj1 y Parj2 recombinantes, la unión de IgE a la región de 10-14 kDa resulta totalmente inhibida, sugiriendo que únicamente estos dos alérgenos se encuentran presentes en esta región y que conjuntamente son capaces de inhibir la mayoría de las IgE específicas contra los alérgenos de Parietaria judaica (Tabla en fig. 8).
Los alérgenos Parj1 y Parj2 muestran todas las características de las ns-LTPs y el modelo estructural de Parj1 se determinó utilizando el cristal de la ns-LTP de la semilla de soja como referencia. Según dicho modelo, ambas moléculas presentan 4 puentes disulfuro, en el orden 4-52, 14-29, 30-75 y 50-91. Todas las proteínas ns-LTP consideradas, en el caso de que se encuentren convenientemente alineadas tal como se ilustra en la fig. 2 de la solicitud de patente WO nº A-02/20790, contienen cuatro puentes disulfuro entre los residuos cisteína en las posiciones correspondientes a las posiciones anteriormente indicadas de Parj1 o de Parj2.
Mediante la aplicación de una estrategia de mutagénesis específica de sitio, anteriormente se había demostrado la relevancia de los puentes disulfuro para la formación de los epítopos de IgE (patente WO nº A-02/20790) y la existencia de un epítopo dominante en la región bucle1 comprendida entre los aminoácidos 1 y 30 (Colombo P. et al., Identification of an immunodominant IgE epitope of the Parietaria judaica major allergen, J. Immunol. 160(6):2780-5, 1998).
Desde un punto de vista terapéutico, existen diversos tratamientos farmacológicos de la sintomatología alérgica, mientras que la terapia preventiva únicamente se encuentra representada por la inmunoterapia específica (SIT). Esta terapia prevé la administración subcutánea de cantidades diluidas de alérgeno en el paciente, de manera que se suprime la reacción específica hacia el alérgeno. Sin embargo, la mayor parte de los extractos de proteínas comerciales utilizados para ello son, de todas maneras, extractos crudos, mezclas de varios componentes en los que resulta difícil una estandarización precisa del componente alergénico. De esta manera, la estrategia SIT puede comprender la administración de componentes alergénicos para los que no es sensible el paciente, induciendo la producción de IgEs específica contra otros componentes del extracto. Además, la administración del alérgeno total implica un riesgo de efectos secundarios, que incluso podrían provocar un choque anafiláctico. Con el fin de eliminar algunas de las desventajas indicadas en la presente memoria, se han desarrollado moléculas alternativas con efectos secundarios reducidos, es decir, capaces de no interactuar con las IgE, manteniendo simultáneamente la capacidad de inmunosuprimir la respuesta de células T y la capacidad de estimular la producción de inmunoglobulinas IgG.
El trabajo anterior de los presentes autores, dado a conocer en la solicitud de patente WO nº A-02/20790, se encuentra comprendido dentro del mismo alcance. Mediante manipulación genética se produjeron formas variantes, o muteínas, de alérgenos ns-LTP, caracterizados por la eliminación parcial o total de los puentes disulfuro típicos de la proteína nativa. Estas muteínas presentaban una actividad alergénica reducida con características que las convertían en útiles en la SIT como moléculas que sustituyen a las proteínas nativas.
Un enfoque diferente es el descrito por B. Linhart en la solicitud de patente EP nº A-1 219 301. En este caso, se describen polipéptidos híbridos que contienen por lo menos dos proteínas alergénicas de tipo salvaje o fragmentos de las mismas. En alérgenos Phl-p de polen de Phlenum pratense o en alérgenos parásitos Der, Linhart observó una alergenicidad reducida de los péptidos híbridos.
Sin embargo, sigue existiendo una necesidad de nuevas herramientas que resulten útiles para el tratamiento de formas alérgicas específicas, tales como aquéllas causadas por las proteínas ns-LTPs; herramientas que aúnen las características de alergenicidad reducida con la efectividad inmunoterapéutica elevada y la fácil accesibilidad con respecto a tanto su preparación como a su utilización. El alcance de la presente invención es satisfacer esta necesidad.
Descripción resumida de la invención
Los estudios epidemiológicos han demostrado que los sujetos generalmente alérgicos a diversas plantas pertenecientes al mismo género, o a la misma especie, o incluso a una única variedad vegetal específica, en la mayoría de casos presentan IgEs contra una pluralidad de alérgenos producidos por la planta. Por ejemplo, en el caso de los sujetos alérgicos a Parietaria judaica, habitualmente presentan IgEs contra los dos alérgenos principales, es decir las proteínas Parj1 y Parj2. Tal como se subraya en la figura 8 (Tabla) en un ensayo de inhibición de la unión entre las IgEs humanas en suero de pacientes alérgicos a PJ y un extracto de P. judaica, el porcentaje de inhibición inducido por la mezcla de Parj1 y Parj2 de tipo salvaje habitualmente es más alto que el inducido por los alérgenos individuales. Por lo tanto, cualquier formulación terapéutica adecuada para el tratamiento de la alergia debería comprender todos los alérgenos principales, o muteínas de los mismos, producidos por una o más de las plantas responsables de la alergia.
La presente invención se basa en el inesperado descubrimiento de que las proteínas híbridas, obtenidas mediante la fusión de las secuencias polipeptídicas de una pluralidad de alérgenos en forma mutada, presentan características que resultan ventajosas desde el punto de vista tanto terapéutico como preparativo, así como con respecto al control del medicamento en comparación con las simples mezclas de una pluralidad de alérgenos.
El objeto principal de la presente invención son proteínas de fusión que comprenden secuencias de aminoácidos de los diferentes alérgenos Parj1 y Parj2, pertenecientes a la familia de proteínas ns-LTPs, en los que dichas secuencias no presentan uno o más de los cuatro puentes disulfuro presentes en la secuencia de los alérgenos de tipo salvaje, en particular que no presentan por lo menos un puente disulfuro en la región aminoterminal comprendida entre los residuos aminoácidos 1 y 30. La secuencia de aminoácidos de cada uno de los alérgenos ha mutado independientemente mediante eliminación o sustitución de uno o más de los residuos cisteína implicados en la formación de un puente disulfuro, aunque manteniendo esencialmente la misma longitud de las secuencias de los alérgenos de tipo salvaje.
Los alérgenos de la invención son producidos por plantas pertenecientes al mismo género, o a la misma especie, o preferentemente a la misma variedad vegetal. En una realización preferente, la proteína de fusión es una proteína heterodimérica que comprende las secuencias de aminoácidos de dos alérgenos diferentes, por ejemplo alérgenos de la misma planta, tales como los alérgenos Parj1 y Parj2 de la especie Parietaria judaica.
En este caso, ambas secuencias de aminoácidos, de los alérgenos Parj1 y Parj2, serán modificadas independientemente mediante la sustitución de los residuos cisteína con residuos no capaces de formar un puente disulfuro en las posiciones 29 y 30 ó 4, 29 y 30 ó 29, 30, 50 y 52.
Son objetos adicionales de la invención una secuencia de nucleótidos que comprende el ADN codificante de la proteína de fusión de la invención, un sistema de expresión o de clonación que comprende la secuencia de nucleótidos en cuestión flanqueada por secuencias adecuadas para controlar, estimular y regular la expresión, y una célula huésped transformada por medio de dicho sistema de expresión o de clonación.
Otros objetos de la invención son usos médicos de la proteína de fusión, en particular como agente inmunológico hipoalergénico en el tratamiento de inmunoterapia específica (SIT), así como composiciones farmacéuticas que comprenden la proteína de fusión y un excipiente farmacéuticamente aceptable.
Son objetos adicionales de la invención métodos de preparación de la proteína de fusión en los que se producen secuencias de aminoácidos convenientemente mutadas y se unen directamente o mediante una molécula conectora para la síntesis química o mediante expresión, en la forma de una proteína de fusión, en células huésped modificadas genéticamente, así como métodos de preparación de las composiciones farmacéuticas.
Las moléculas de fusión según la invención proporcionan ventajas inequívocas. En primer lugar, muestran una capacidad de interactuar con las IgE2 que es marcadamente reducida con respecto a: los alérgenos individuales o las mezclas de alérgenos de tipo salvaje, tal como pone de manifiesto la comparación entre los datos informados en la Tabla de la fig. 5 (carril PjEDcys) y los datos en la Tabla de la fig. 8; los alérgenos modificados individuales, tal como pone de manifiesto la comparación entre la Tabla de la fig. 5 y la Tabla proporcionada en la fig. 9; o el heterodímero de los alérgenos de tipo salvaje (Wt), tal como nuevamente pone de manifiesto la Tabla de la fig. 5. Además, el análisis citofluorométrico de la proliferación de las células sanguíneas periféricas CD3^{+} demuestra que dicha alergenicidad reducida se ve acompañada ventajosamente por una capacidad inmunogénica inalterada o incluso incrementada, tal como ilustra la fig. 7, paneles B y C, y como se resume en la Tabla de la misma fig. 7. No sólo la reducción de las características del heterodímero alergénico, acompañada por una capacidad inmunogénica marcada con respecto a los alérgenos de tipo salvaje o mutados individuales o las mezclas de los mismos, resultó inesperada, sino que ya el mero mantenimiento por parte de la proteína híbrida de las características típicas del alérgeno modificado individual resultó ser una característica totalmente inesperada.
Además, con respecto a la mera mezcla de alérgenos, o de muteínas de los mismos, los heterodímeros de la invención implican la ventaja adicional de ser producibles mediante un único procedimiento, evidentemente simplificado todos los procedimientos de producción, control, almacenamiento, autorización para la venta y uso, con un ahorro inequívoco de tiempos, materiales y medios de financiación.
Breve descripción de las figuras
Figura 1: secuencia de nucleótidos del dímero Parj2- Parj1 en su forma mutada en los residuos de posiciones 10, 85, 88, 122, 397 y 400. En todas las posiciones indicadas, el nucleótido T ha sido sustituido por el nucleótido A (en negrita). El espaciador "GGATTC" entre las secuencias codificantes de los dos alérgenos Parj1 y Parj1 también se encuentra subrayado en negrita (SEC ID nº 3).
Figura 2: secuencia de aminoácidos del heterodímero Parj2-Parj1 en su forma mutada en los residuos de posiciones 4, 29 y 30 en cada una de las dos moléculas (PjEDcys). La secuencia de aminoácidos se expresa en código de una letra. Los aminoácidos subrayados indican las sustituciones realizadas. Los aminoácidos en negrita y cursiva indican los aminoácidos glicina y fenilalanina introducidos con la clonación (SEC ID nº 4).
Figura 3: detección mediante ELISA de la capacidad de unión del alérgeno Parj2 en comparación con la actividad de unión del mutante Par2/4,29,30. Las líneas con cuadrados negros indican los sueros de sujetos alérgicos a Pj, la línea con cuadrados blandos indica un suero de un paciente no alérgico a Pj.
Figura 4: panel A - representación esquemática del mutante PjEDcys. Panel B: análisis de transferencia western llevado a cabo mediante la utilización de las proteínas recombinantes Parj1 (carril A), Parj2 (carril B), dímero Parj2-Parj1 (clon de dímero de tipo salvaje) (carril C), PjEDcys (carril D) con un suero de sujeto alérgico a Pj. Panel C: la misma membrana del Panel B incubada con una sonda específica para la cola de histidinas.
Figura 5: detección mediante ELISA de la inhibición de la unión de IgEs humanas por parte del dímero de tipo salvaje y las proteínas recombinantes PjEDcys utilizando un extracto crudo de Parietaria judaica como antígeno y 5 sueros de pacientes alérgicos a Pj.
Figura 6: ensayo de la liberación de histamina de sangre pacientes alérgicos a Pj. Los antígenos utilizados fueron: una mezcla equimolar de los dos alérgenos rParj1 y rParj2 (línea con rombos, denominada rPj1+rPj2) y el mutante PjEDcy (línea con cuadrados). Se proporciona, en el eje x, las cantidades de proteína utilizadas, y en el eje y, el porcentaje de histamina liberada con respecto al porcentaje de histamina total de los mastocitos del paciente.
Figura 7: análisis citofluorométrico de la proliferación de las células CD3^{+} de PBMC.
Se estimularon células marcadas con CSFE con una solución que contenía una mezcla de los alérgenos Parj1 y Parj2 (panel B) y una mezcla que contenía una cantidad equimolar del híbrido PjEDcys (panel C). El panel A muestra el cultivo de control no estimulado.
La tabla inferior resume el porcentaje de células CD3^{+} capaces de proliferar tras la estimulación antigénica en 5 sujetos alérgicos. Los números indican los porcentajes de estimulación a los que se ha restado el número de células no estimuladas.
Figura 8: la tabla proporciona los resultados de un ensayo ELISA de la inhibición de la unión de IgEs humanas por parte de alérgenos de tipo salvaje individuales o de una mezcla de los mismos.
Figura 9: la tabla proporciona los resultados de un ensayo ELISA de la inhibición de la unión de IgEs humanas por parte de los alérgenos mutados PjA, PjB, PjC y PjD indicados en la solicitud de patente WO nº A- 02/020790.
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Descripción detallada de la invención
Las secuencias de péptidos de los alérgenos ns-LTPs de tipo salvaje producidas por diversas plantas, tales como Parietaria judaica (Parj1 y Parj2), soja, Lyces, Ricco, tabaco, Oryza, Mais, espinaca y trigo, se informan en la solicitud de patente WO nº A-02/20790. Todas las moléculas presentan cuatro puentes disulfuro entre ocho residuos cisteína en posiciones altamente conservadas correspondientes, tras alinearse convenientemente, a las posiciones 4, 14, 29, 30, 50, 52, 75 y 91, de las moléculas Parj1 y Parj2. Los residuos cisteína implicados en los puentes disulfuro son las parejas 4-51, 14-29, 30-75 y 50-91.
Las muteínas de dichos alérgenos con una capacidad reducida de formar puentes disulfuro son moléculas en las que uno o más residuos cisteína implicados en el enlace -SS- han sido eliminados o sustituidos por otros residuos no capaces de participar en la unión, aunque sin alterar estéricamente la conformación espacial de la molécula, por ejemplo Asn, Ser, Thr, Ile, Met, Gly, Ala, Val, Gln o Leu. Las muteínas preferentes se obtienen mediante eliminación de dos, tres o cuatro puentes disulfuro; por ejemplo aquéllas correspondientes a los enlaces 14-29 y/o 30-75 y/o 4-51 y/o 50-91 de la molécula Parj1 o Parj2. Las moléculas mutadas mediante sustitución del residuo cisteína con un residuo serina o alanina en las posiciones 29, 30 ó 4, 29, 30 ó 29, 30, 50, 52 de Parj1 o Parj2, o en las posiciones correspondientes de los otros alérgenos ns-LTPs, muestran las mejores propiedades de alergenicidad reducida. Aparte de las indicadas, las muteínas utilizadas en la invención no muestran ninguna otra modificación, y por lo tanto mantienen sustancialmente inalterada la secuencia, la longitud y el peso molecular del alérgeno de tipo
salvaje.
Las secuencias polinucleótidas codificantes de alérgenos de tipo salvaje de la familia de las ns-LTPs se encuentran disponibles para el público en bancos de datos como EMBL, o se encuentran descritas en el estado de la técnica. En particular, las secuencias de nucleótidos de los alérgenos de Parietaria judaica se describe en el documento anteriormente mencionado nº WO-A-02/20790 y en Duro G. et al., FEBS Letter 1996, supra.
La preparación de las muteínas de la invención se lleva a cabo mediante cualquier método conocido adecuado para la introducción de variaciones en residuos aminoácidos individuales a lo largo de la secuencia polipeptídica de las proteínas. Habitualmente, la variación se lleva a cabo mediante una mutación puntual específica de sitio al nivel de la secuencia de nucleótidos codificante mediante el método de PCR del ADN y utilizando oligonucleótidos sintéticos adecuados. Los procedimientos se describen en, por ejemplo, la solicitud anterior nº WO-A-02/20790.
Las proteínas de fusión de la invención contienen las secuencias de aminoácidos, convenientemente mutadas, de alérgenos obtenidos de la misma familia vegetal, por ejemplo de fagáceas, urticáceas, oleáceas, compuestas o gramíneas; o del mismo género, por ejemplo Parietaria; o de la misma especie, por ejemplo P. judaica, officinalis o lusitanica; o, incluso mejor, de la misma variedad de planta. Las proteínas de fusión preferentes son aquéllas que comprenden muteínas de los alérgenos principales de Parietaria judaica, es decir, Parj1 y Parj2 o isoformas de las mismas conocidas y depositadas en, por ejemplo, EMBL. Las dos proteínas unidas en un heterodímero puede modificarse según el mismo esquema o según esquemas diferentes. De esta manera, las dos proteínas podrían contener puentes disulfuro diferentes entre sí en número y/o posición. Las realizaciones preferentes de la invención proporcionan alérgenos mutados individual e independientemente en una o más de las posiciones correspondientes a las posiciones 4, 29 y 30 de la secuencia de aminoácidos de los alérgenos principales de P. judaica. La proteína de fusión de la invención contiene, por ejemplo, los alérgenos Parj1 y Parj2 modificados en las posiciones 29 y 30 ó 4, 29 y 30 ó 29, 30, 50 y 52.
La preparación de la molécula híbrida se produce mediante fusión de las dos partes de proteína correspondientes a los dos alérgenos. La formación mediante síntesis de un enlace químico directo, por ejemplo peptídico, entre los residuos N-terminal y C-terminal de las dos partes resulta viable; sin embargo, el método utilizado preferentemente implica la construcción de una molécula polinucleótida codificante de las proteínas alergénicas en forma fusionada y convenientemente mutadas en las posiciones deseadas (SEC ID nº 1).
Las dos partes que constituyen el heterodímero resultante pueden unirse directamente o separarse mediante uno o más residuos aminoácidos. Según un esquema bien conocido para el experto en la materia y detallado en los ejemplos, los clones que contienen el material codificante de las proteínas alergénicas individuales convenientemente mutadas se amplifican, se digieren con enzimas de restricción y los fragmentos codificantes se unen y se integran en vectores de expresión. Con el fin de facilitar su purificación, la proteína híbrida puede expresarse opcionalmente como proteína de fusión con una molécula de unión que muestre una afinidad específica para una molécula emparejada determinada, por ejemplo con una cola de histidinas en la región aminoterminal, permitiendo la purificación en una columna trampa de His.
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Los sistemas de clonación y expresión utilizados para la preparación de la proteína de fusión pueden ser vectores adecuados para células procarióticas o eucarióticas, por ejemplo el vector procariótico pQE30 comercial.
Las composiciones farmacéuticas adecuadas para la administración de las moléculas de la invención son composiciones en forma de soluciones acuosas, hidroalcohólicas o aceitosas, de emulsiones o suspensiones, en medio acuoso o aceitoso, o de suspensiones de liposomas. Ventajosamente, la composición se formula para conseguir una liberación retardada. Para ello, pueden utilizarse medios aceitosos o medios que contengan espesantes adecuados. Aparte de las formulaciones indicadas en forma líquida, las composiciones de la invención pueden encontrarse en forma semisólida, como cremas, pomadas, geles u otras formas adecuadas para la aplicación tópica. También pueden utilizarse implantes para la aplicación subcutánea destinada a la liberación prolongada. En este caso, las moléculas de la invención se incorporan en una matriz de polímero biodegradable o biodispersable bajo la acción del sistema enzimático natural del paciente. Para ello, se utilizan polímeros tales como polilactato o poliglicolato o copolímeros polilactato/
glicolato.
Las composiciones en cuestión se formulan para una administración parenteral, de uso subcutáneo, intramuscular o intravenoso, para una administración tópica sobre la piel o mucosa, o para la administración oral.
Las moléculas de fusión de la invención se caracterizan por una marcada hipoalergenicidad con respecto a los alérgenos monómeros individuales (fig. 4, paneles B y C) o con respecto a una molécula heterodímero consistente de los alérgenos de tipo salvaje (fig. 5).
Las moléculas hipoalergénicas de la invención encuentran un uso válido como medicamentos en el tratamiento preventivo y curativo de alergias causadas por una pluralidad de alérgenos vegetales, y en particular como desensibilizadores o inmunosupresores con actividad anafiláctica reducida en tratamientos SIT. Son enfermedades alérgicas ejemplares que pueden tratarse con la proteína de fusión de la invención, rinitis, conjuntivitis, urticaria, angioedema, eccema, dermatitides, asma y choque anafiláctico.
Finalmente, las proteínas de fusión hipoalergénicas de la invención resultan útiles para la preparación de vacunas de ADN.
A continuación se describen las características inmunológicas de una molécula heterodímero específica formada mediante la fusión de las secuencias de Parj1 y Parj2 y mutada en las posiciones respectivas 4, 29 y 30 (PjEDcys). En particular, dicha proteína se generó mediante la fusión genética de los dos polipéptidos en el orden Parj2/4,29,30-Parj1/4,9,30. El suceso de fusión causó la inserción de dos aminoácidos adicionales (G y F) que no interfieren con la fase de lectura correcta (figs. 2 y 4, panel A). Esta proteína de fusión se produjo y se purificó mediante la utilización de un sistema de expresión procariótico comercial (sistema de expresión de proteína de fusión pQE30, QIAGEN). La fig. 4, panel B, muestra un análisis de transferencia western a partir del que se infiere que la proteína dímero mutada muestra una alergenicidad reducida (carril D) en comparación con la actividad de unión de IgE de los monómeros individuales (carriles A y B) o a una molécula dímero consistente de los alérgenos Parj1 y Parj2 de tipo salvaje (carril C). Esto demuestra que tanto el suceso de fusión como la mutación introducida contribuyen a conseguir la hipoalergenicidad indicada. Estos datos no pueden atribuirse a una cantidad diferente de proteína cargada en el gel, tal como demuestra el panel C, en el que se utilizó una sonda específica para las colas de histidinas. La capacidad de unión reducida seguidamente se demostró mediante una técnica independiente de la anterior, en la que se sometió a ensayo la molécula heterodímero PjEDcys para su capacidad de inhibir la unión de IgE humana a un extracto crudo de Parietaria. De hecho, la fig. 5 muestra cómo esta molécula inhibe la unión de IgE de 5 pacientes alérgicos con un valor comprendido entre 3,5% y 10%, y en todo caso con valores extremadamente reducidos en comparación con un constructo dímero que contiene los alérgenos Parj1 y Parj2 en su forma nativa (clon dímero de tipo
salvaje).
El efecto de la capacidad reducida de unión seguidamente se demostró en un ensayo de liberación de histamina llevado a cabo en sangre periférica de pacientes alérgicos. Los datos informados en la fig. 6 muestran los porcentajes de liberación de histamina del heterodímero PjEDcys en relación a los porcentajes liberados de una mezcla equimolar de los monómeros Parj1 y Parj2 de tipo salvaje. En todos los pacientes estudiados (N=4), la molécula mutada mostraba una reducción marcada de la actividad anafiláctica.
Estas variaciones a nivel estructural no sólo no reducen la capacidad inmunogénica de la molécula, sino que potencian sus características. De hecho, en la fig. 7 se proporciona el gráfico de proliferación celular obtenido mediante la incubación de PBMCs purificadas a partir de sangre de un sujeto alérgico, y tras la estimulación con el clon PjEDcys y con la mezcla de los alérgenos Parj1 y Parj2 de tipo salvaje. Las mutaciones que afectaban a los residuos cisteína y la fusión de las dos proteínas no presentaron ningún efecto cualitativo sobre el procesamiento y el reconocimiento del alérgeno por parte de las células T sanguíneas, aunque incrementaron marcadamente la intensidad de los mismos, tal como demuestra la Tabla (panel D) de la misma fig. 7.
A continuación se ilustra la invención por medio de ejemplos específicos referentes a etapas experimentales de preparación y evaluación de las propiedades inmunológicas de molécula de fusión Par2/4,29,30-Par1/4,29,30. Estos ejemplos presentan un propósito meramente ilustrativo, no siendo en modo alguno limitativos de la invención.
\newpage
Ejemplo 1
Construcción de una molécula que contiene información genética de Parj2 mutado en cys4, 29 y 30 (clon Parj2/4, 29,30)
Se llevó a cabo la mutagénesis específica de sitio de los residuos cisteína en las posiciones 29 y 30 utilizando el kit de mutagénesis dirigida a sitio Transformer (Clontech) siguiendo las instrucciones del fabricante, y utilizando el oligonucleótido sintético Pj2/29-30 5' GAG AGC AGC AGC GGC AGC 3' (SEC ID nº 5). El clon, capaz de expresar el Parj2 de tipo salvaje, se utilizó como molde para la mutagénesis y los residuos cisteína en las posiciones 29 y 30 se transformaron en serina (clon Par2/29-30). Se confirmó el éxito del procedimiento mediante secuenciación del clon recombinante utilizando el método de Sanger. Se realizó la mutagénesis del residuo cisteína en la posición 4 en serina mediante reacción en cadena de ADN polimerasa (PCR) utilizando los oligonucléotidos sintéticos Pj2/4 5' GTG GGA TCC GAG GAG GCT AGC GGG AAA GTG 3' (SEC ID nº 6) y Pj2 inverso 5' GGG GGA TCC ATA GTA ACC TCT GAA 3' (SEC ID nº 7) y utilizando el clon Parj2/29-30 como molde. El fragmento de ADN obtenido de esta manera se clonó en el vector de expresión pQE30 (Qiagen). El análisis de la secuencia de nucleótidos del clon recombinante demostró que se había producido la sustitución (ver la fig. 1).
Ejemplo 2
Construcción de una molécula dímero que contiene información genética para Parj1 y Parj2 mutados en cys4, 29 y 30
La molécula dímero consistente de los alérgenos Parj1 y Parj2 mutados en las posiciones Cys4, Cys29 y Cys30, respectivamente, se obtuvo mediante una serie de procedimientos de amplificación del DAN.
El clon Parj1 mutado en las cisteínas en las posiciones Cys4, Cys29 y Cys30 dado a conocer en la patente WO nº 02/20790 (clon 29-30) se digirió con el enzima de restricción BamH1.
El fragmento que contenía la información genética para Parj2 mutado en las posiciones Cys4, 29 y 30 (clon Parj2/4,29,30) se sometió a un procedimiento de amplificación del ADN utilizando los oligonucleótidos Pj2/4 y Pj2 inverso. El fragmento generado de esta manera se purificó mediante gel de agarosa, se digirió con el enzima de restricción BamH1 y se incubó con una mezcla que contenía el enzima ADN ligasa y el clon Parj1 (29-30) previamente linearizado. Los clones recombinantes se purificaron y su secuencia de nucleótidos se determinó mediante el método de Sanger. La proteína híbrida construida de esta manera se expresó como proteína de fusión con una cola de histidinas en su región aminoterminal para permitir la purificación del a misma (clon PjEDcys) en una columna de afinidad (ver las figs. 2 y 4, panel A).
Ejemplo 3
Inducción y purificación de proteínas recombinantes
Se utilizaron 10 ml de cultivo O/N para una inoculación en 400 ml de medio de cultivo 2YT que contenía ampicilina y canamicina hasta una concentración final de 100 \mug/ml y 10 \mug/ml, respectivamente. El cultivo se realizó a 37ºC y bajo agitación. A las 2 horas, se añadió IPTG al cultivo hasta una concentración final de 1 mM y se continuó con el cultivo durante 4 horas más a 37ºC bajo agitación. A continuación, el cultivo bacteriano se centrifugó a 5.000 rpm durante 15 minutos a 4ºC. Se resuspendió el pellet en 5 ml/g de tampón Start (fosfato de Na 10 mM, pH 7,4, y urea 6 M) y las células se destruyeron mediante la utilización de un sonicador. A continuación, las proteínas recombinantes se purificaron definitivamente mediante la utilización de una columna trampa de His (Amersham) siguiendo las instrucciones del fabricante. Las fracciones eluidas se analizaron en un gel de poliacrilamida al 16% y las fracciones que contenían la proteína recombinante se evaluaron cuantitativamente mediante el método de Bradford en el espectrofotómetro tras la tinción. Finalmente, las proteínas se desalaron mediante la utilización de una columna Sephadex G-25 (Pharmacia).
Ejemplo 4
Ensayo ELISA para evaluar el porcentaje de inhibición de la unión de IgE
Se llevó a cabo la detección en el ensayo ELISA tal como se describe en Bonura et al., "Hypoallergenic variants of the Parietaria judaica major allergen Parj1: a member of the non-specific lipid transfer protein plant family", Int. Arch. Allergy Immunol. 126(1):32-40, septiembre de 2001), o tal como se describe en la solicitud anteriormente mencionada WO nº A-02/020790. La concentración del antígeno utilizada en cada pocillo era de 5 \mug/ml. Los pacientes sometidos a ensayo (n=5) presentaban una historia clara de alergia a Parietaria judaica, y todos presentaron un resultado positivo en el ensayo de la piel utilizando productos comerciales.
Los resultados del ensayo de inhibición de la unión con respecto a la proteína nativa y de las formas modificadas mediante la eliminación de dos, tres o cuatro puentes disulfuro se proporcionan en la Tabla de la fig. 9.
\newpage
Los resultados observados con el heterodímero de tipo salvaje y el heterodímero PjEDcys se proporcionan en la Tabla de la fig. 5. Finalmente, los resultados observados con el extracto crudo de Parietaria, los alérgenos individuales de tipo salvaje y la mezcla de los mismos se proporcionan en la Tabla de la fig. 8.
Ejemplo 5
Ensayo de liberación de histamina
Se llevó a cabo un ensayo de liberación de histamina utilizando sangre heparinizada de pacientes alérgicos a Pj y una escala de concentraciones de alérgeno comprendida entre 0,0001 y 1 \mug/ml. El protocolo de liberación se llevó a cabo tal como se ha descrito con anterioridad (Colombo P. et al., Identification of an immunodominant IgE epitope of the Parietaria judaica major allergen, J. Immunol. 160(6):2780-5, 1998).
Ejemplo 6
Estudio de la proliferación de las células CD3^{+} inducida por PjEDcys
Se purificaron PBMCs de pacientes alérgicos a Pj y se resuspendieron en 1XPBS, pH 7,2 (1x10^{7}/ml) y se marcaron con succinimidil-éster de diacetato de carboxi-fluoresceína (CFDA-SE) a una concentración final de 5 mM durante 5 minutos, a temperatura ambiente y en la oscuridad. Las células se lavaron en RPMI completo (suero AB al 10%) y se estimularon durante 7 días con una mezcla que contenía 1 \mug/ml de alérgenos Parj1 y Parj2 y con una mezcla equimolar del híbrido PjEDcys. A continuación, las PBMCs se tiñeron con anticuerpo anti-CD3-PE y se analizaron citofluorométricamente. Los datos resultantes se analizaron utilizando el software WinMDI 2.8. La proliferación de las PBMCs se determinó mediante tinción CFDA-SE (succinimidil-éster de diacetato de carboxi-fluoresceína). El análisis citofluorométrico demostró que, en los 5 sujetos estudiados, el híbrido PjEDcys era capaz de estimular un porcentaje de células CD3^{+} mucho mayor que el estimulado por la mezcla que contenía los alérgenos en forma de monómero (fig. 7).
<110> Consiglio Nazionale delle Ricerche
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<120> Proteínas de fusión
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<130> BW352R
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<160> 7
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<170> PatentIn version 3.2
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<210> 1
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<211> 732
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<212> ADN
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<213> Parietaria judaica
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<222> (1)..(729)
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (10)..(12); (40)..(42); (85)..(90); (148)..(150); (154)..(156); (271)..(273); (322)..(324); (352)..(354); (397)..(402); (460)..(462); (466)..(468); (535)..(537); (583)..(585)
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<223> n es a, c, g, o t
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<400> 1
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\hskip0,8cm
1
\hskip0,8cm
2
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<210> 2
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<211> 243
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<212> PRT
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<213> Parietaria judaica
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (4)..(4)
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<223> `Xaa' en las posiciones 4, 14, 29, 30, 50, 52, 75, 91, 108, 118, 133, 154, 156, 179, 195 representa Asn,Ser, Thr, lie, Met, Gly, Ala, Val, Gln o Leu.
\newpage
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<400> 2
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\hskip0,8cm
3
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
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<211> 732
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<212> ADN
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<213> Parietaria judaica
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<221> CDS
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<222> (1)..(729)
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<400> 3
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\hskip0,8cm
4
\hskip0,8cm
5
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<210> 4
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<211> 243
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<212> PRT
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<213> Parietaria judaica
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<400> 4
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\hskip0,8cm
6
\hskip0,8cm
60
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<210> 5
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<211> 18
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<220>
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<223> cebador directo para la inserción de una mutación en las posiciones 29 y 30
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<400> 5
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\hskip-.1em\dddseqskip
gagagcagca gcggcagc
\hfill
18
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<210> 6
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<211> 30
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<220>
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<223> cebador directo para la inserción de una mutación en la posición 4
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<400> 6
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\hskip-.1em\dddseqskip
gtgggatccg aggaggctag cgggaaagtg
\hfill
30
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<210> 7
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<211> 24
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<220>
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<223> cebador inverso de parj2
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<400> 7
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\hskip-.1em\dddseqskip
gggggatcca tagtaacctc tgaa
\hfill
24
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Claims (21)

1. Proteína de fusión caracterizada por el hecho de que las secuencias de aminoácidos de los diferentes alérgenos Parj1 y Parj2, pertenecientes a la familia de las proteínas de transferencia de lípidos no específicas (ns-LTPs) de la especie Parietaria judaica, por el hecho de que dichas secuencias no presentan uno o más de los cuatro puentes disulfuro presentes en la secuencia de los alérgenos de tipo salvaje, encontrándose comprendido por lo menos uno en la región aminoterminal ente los residuos aminoácidos 1 y 30, y por el hecho de que dichas secuencias mantienen esencialmente la misma longitud que las secuencias de los alérgenos de tipo salvaje.
2. Proteína de fusión según la reivindicación 1, caracterizada por el hecho de que la secuencia de aminoácidos de cada uno de los alérgenos se muta independientemente mediante eliminación o sustitución de uno o más residuos cisteína implicados en la formación de un puente disulfuro.
3. Proteína de fusión según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 2, caracterizada por el hecho de que la secuencia de aminoácidos de cada uno de los alérgenos se muta independientemente mediante eliminación o sustitución de uno o más residuos cisteína en posiciones correspondientes a las posiciones 4, 14, 29, 30, 50, 52, 75 y 91 de la secuencia de aminoácidos del alérgeno Parj1 y/o Parj2.
4. Proteína de fusión según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, caracterizada por el hecho de que contiene las secuencias de aminoácidos de los alérgenos Parj1 y Parj2, ambos modificados independientemente mediante sustitución de los residuos cisteína por los residuos Asn, Ser, Thr, Ile, Met, Gly, Ala, Val, Gln o Leu en las posiciones 29 y 30 ó 4, 29 y 30 ó 29, 30, 50 y 52.
5. Proteína de fusión según la reivindicación 4, que presenta la secuencia de aminoácidos SEC ID nº 4.
6. Secuencia de nucleótidos que comprende el ADN codificante de la proteína de fusión según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5.
7. Secuencia de nucleótidos según la reivindicación 6, que comprende la secuencia de nucleótidos SEC ID nº 3.
8. Sistema de expresión o clonación que comprende la secuencia de nucleótidos según la reivindicación 6 ó 7 flanqueado por secuencias adecuadas para controlar, estimular y regular la expresión.
9. Célula huésped transformada por medio del sistema de expresión o clonación según la reivindicación 8.
10. Proteína de fusión según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, para la utilización en el método diagnóstico o de tratamiento terapéutico in vivo y/o in vitro.
11. Proteína de fusión según la reivindicación 10, para la utilización como agente inmunológico hipoalergénico en el tratamiento de inmunoterapia específica (SIT) de alergias.
12. Proteína de fusión según la reivindicación 10, para la utilización en el tratamiento de rinitis, conjuntivitis, urticaria, angioedema, eccema, dermatitides, asma y choque anafiláctico.
13. Proteína de fusión según la reivindicación 10, para la preparación de vacunas de ADN.
14. Composición farmacéutica que comprende la proteína de fusión según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5 y un excipiente farmacéuticamente aceptable.
15. Composición farmacéutica según la reivindicación 14, en forma de solución, suspensión, emulsión, crema, pomada o implante.
16. Composición farmacéutica según la reivindicación 14, para una administración parenteral, subcutánea, intramuscular, intravenosa, tópica u oral, o para el implante subcutáneo.
17. Método de preparación de la proteína de fusión según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, caracterizado por el hecho de que se producen secuencias de aminoácidos convenientemente mutados de diferentes alérgenos y se unen directamente o mediante una molécula conectora para la síntesis química o mediante expresión, en forma de proteína de fusión, en células huésped genéticamente modificadas.
18. Método de preparación según la reivindicación 17, caracterizado por el hecho de que se transforman células huésped con un vector de expresión que comprende el ADN codificante de secuencias de aminoácidos en forma fusionada, se mutan mediante mutagénesis específica de sitio en codones codificantes de residuos cisteína.
19. Método de preparación según la reivindicación 18, caracterizado por el hecho de que se sustituyen uno o más residuos cisteína por residuos Asn, Ser, Thr, Ile, Met, Gly, Ala, Val, Gln o Leu.
20. Método de preparación según cualquiera de las reivindicaciones 17 a 19, caracterizado por el hecho de que se sustituye uno o más residuos cisteínas en posición 29, 30 ó 4, 29, 30 ó 29, 30, 50 y 52, por residuos alanina o serina.
21. Método de preparación de una composición farmacéutica según cualquiera de las reivindicaciones 14 a 16, caracterizado por el hecho de que la proteína heterodímero se mezcla en una cantidad inmunológicamente activa con un excipiente farmacéuticamente aceptable.
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