WO2002070716A1 - Producción en la levadura pichia pastoris, y sistema de aislamiento y purificación, del alergeno recombianante de olea europaea ole e 9 para uso en diagnosis y tratamiento de alergias - Google Patents
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- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
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- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
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- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/415—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from plants
Definitions
- the present invention refers to one of the olive pollen allergens (Olea europaea), the Ole e 9 protein, and allergenic epitopes present in the protein.
- the invention also refers to recombinant DNAs that encode both complete proteins and fragments that include one or more epitopes of the molecule, as well as homologous Ole e 9 molecules with allergenic capacity in other related and unrelated species.
- the object of the invention is the production of the Ole e 9 protein, by recombinant technology in the yeast Pichia pastoris, which implies the use of the nucleotide sequence characterized by SEQ ID NO: that of other nucleotide sequences obtained by mutagenesis of the sequence SEQ ID NO: l.
- the invention also provides an effective method of isolation for both the recombinant and the natural allergen.
- Type I allergy is a disease that affects more than 20% of the population of industrialized countries. This condition is caused by allergens, present in both organisms and biological products - food, mites, insect poisons, pollens, fungi, mammalian epithelia - and in synthetic materials. In most of the allergenic biological sources, the allergens they are proteins of molecular masses between 5 and 70 Da. Symptoms that arise from allergy, such as rhinitis, conjunctivitis, or asthma, are caused by the release of cell mediators, such as histamine, from basophils and mast cells, cells of the immune system. Said release is induced by cross-linking of IgEs antibodies bound to high affinity receptors.
- the cross-linking of the IgE is caused by the binding of the corresponding allergen, or a fragment thereof, through an IgE epitope (contained in said allergen, or in its fragment).
- the therapy that is currently being used to treat the allergy involves the hyposensitization of the patient by parental or oral administration of adequate doses of the allergen itself, or related allergoids.
- an allergenic extract is obtained, through minimal manipulation, of the natural biological source, which implies a very complex mixture of proteins and other substances, in which the allergen - or allergens - can represent a very small part of the total product used.
- the protocols used for the diagnosis of allergy cases and their subsequent immunotherapy involve the use of allergenic extracts that are often not characterized, or even standardized with respect to the most important allergens they may contain. Often, its administration does not provide a complete diagnosis, especially when the patient's hypersensitivity refers to allergens present in low concentration in said extracts. On the other hand, immunotherapy performed with these preparations is often ineffective and sometimes causes undesirable side effects that may lead to to be more serious than the allergic condition that is intended to resolve.
- An alternative to the use of these extracts is the preparation of mixtures of the most significant allergens, obtained by isolation from their natural source. However, this route presents two important barriers.
- Olive polynose is one of the most important causes of allergy in Mediterranean countries, where this tree is intensely cultivated to obtain oil and olives.
- allergens of olive pollen are known, with Ole up to now being the one that shows a higher incidence among olive allergic patients since it affects more than 70% of these [Villalba, M, et al. Euro. J. Bioche. 216, 863-869, 1993; Villalba, M., et al. J. Biol. Chem. 269, 15217-15222, 1994].
- Ole e 2 (profilin) allergens have been isolated and characterized [Ledesma, A et al.
- the present invention relates to the isolation method used for the purification of the Ole e 9 allergen - an allergen from olive pollen of utmost clinical importance, with a high prevalence of 65% of patients allergic to olive pollen - from pollen Olive (Olea europaea). More specifically it comprises obtaining, by cloning, recombinant DNA molecules that encode polypeptides with the same or similar antigenic properties as the allergen from olive pollen, or polypeptides that possess at least one epitope of the Ole e 9 allergen.
- the invention It also includes the complete cDNA sequence of the Ole e 9 allergen and the complete sequence deduced from the allergen.
- the process object of the invention allows the purification of Ole e 9 allergen from olive pollen from a protein extract of olive pollen by means of a penetrability chromatography and an affinity chromatography, as described in detail below.
- recombinant DNA molecules encoding polypeptides that exhibit the antigenicity of Ole e 9 are obtained, as well as polypeptides that contain at least one epitope of Ole e 9 in their structure.
- the invention has polynucleotide DNA sequences that hybridize, under restrictive conditions, with those described above - which implies an identity level of at least 60% between their nucleotide sequences - or are derived from them by degeneracy of the code Genetic or mutagenesis.
- the Olea europaea Ole e 9 recombinant allergen cloning procedure includes cloning vectors and host cells that contain a nucleotide sequence such as those described in SEQ ID NO: 1, Ole e 9 encoders, homologous proteins or fragments thereof.
- nucleotide fragments are obtained that have at least one sequence that encodes an antigenic determinant of the Ole e 9 olive allergen or its fragments, as well as homologous Ole e 9 allergens, mainly in olive-related species, as are all Oleaceae, which, given the structural similarity, at least 60%, have allergenic cross-reactivity with Ole e 9 or with a part of it.
- these species related to the olive tree are: Syringa vulgaris (lilac), Ligustrum vulgare (aligustre) and Fraxinus excelsior (ash).
- polypeptides may contain the antigenic sequence linked to other polypeptides (for example as fusion proteins), have been chemically synthesized or have been obtained by proteolytic digestions and chemically or enzymatically modified.
- polypeptide molecule with antigenic activity of Ole e 9 or its B and T epitopes is produced, it is isolated from the extracellular medium of the culture in soluble form by anion exchange and affinity chromatography.
- the recombinant products obtained by the process object of the invention have the ability to bind IgE antibodies of the serum of olive allergic patients, sensitive to Ole e 9.
- immunologically active Ole e 9 is available, in addition to antigenic and allergenic fragments of this allergen, and homologous proteins thereof, which serve to be incorporated into the "in vivo” and “tests” in vitro "to be carried out for the faithful diagnosis of hypersensitivity to this pollen, and to other pollen related phylogenetically with it. They may also be used in allergen preparations that are used to carry out the corresponding immunotherapy for the treatment of olive pollen allergy.
- Protein extracts obtained from pollen are currently used for the diagnosis and therapy of olive pollen allergy. This implies poor reproducibility and a high content of ' contaminating molecules, of protein and non-protein origin, which can cause adverse side effects in patients. treated.
- This technology makes it possible to have these molecules and, in addition, peptides or modified forms thereof containing at least one of the allergenic epitopes.
- the present invention relates to a recombinant DNA encoding epitopes of the allergen of Olea europaea Ole e 9, to the recombinant production, in the yeast Pichia pastoris, of the polypeptides encoded by said DNA and to the isolation of the allergen natural from olive pollen. It also refers to the application of both molecules to the diagnosis and therapy of this immune disorder.
- RNAs from different pollens were subsequently subjected to a gradient centrifugation of 5.7 M CsCl at 0.01 M EDTA at 40,000 rpm in a SW 60 rotor (Beckman) for 12 hours. The same procedure was carried out to isolate other RNAs from different pollens used
- RNA cDNA synthesis was carried out using the SMART II cDNA synthesis kit (Clontech).
- DH5 ⁇ F 'competent cells were transformed, then the recombinants were selected and the sequencing of some of the selected clones was carried out, obtaining partial sequences of this allergen.
- the sequences corresponding to the 5 'sequence of the DNA were obtained.
- a final PCR reaction with oligonucleotides NT-0L9, NTC-OL9 and C-OL9, DNA fragments containing the complete allergen sequence were obtained.
- the DNA coding sequence was linked to the expression plasmid pPICZ ⁇ A (Invitrogen Corp.).
- the cells used were from strain X-33 of Pichia pastoris.
- the induction was carried out by 0.5% methanol for four days, the cells growing at 30 ° C.
- the cells were pelleted by centrifuging at 5000 xg, the supernatants were collected and a sample thereof was applied on a 15% polyacrylamide gel in the presence of SDS.
- a unique 45 kDa band was detected by staining the gels with Coomassie Blue.
- the protein is recognized by sera from specific allergic patients of natural Ole e 9 (1:10 dilution).
- the purification of the proteins was carried out by two stages, an ion exchange chromatography in DEAE-cellulose and an affinity in phenyl-Sepharose, obtaining after the latter the allergen with a degree of purity of 99%.
- Structural characterization studies (dichroism spectra in the far UV, spectrometry, mass) and immunological studies (with individual sera of allergic patients) were carried out and in all cases the recombinant proteins behaved in an equivalent manner to the of the natural allergen.
- Ole e 9 allergen has been purified from olive pollen protein extract, obtained by homogenizing 3g of pollen in 50 mM ammonium bicarbonate pH 8.0. Said extract was applied to a column of Sephadex G-150. The fractions that contained the protein they were applied to an affinity column in phenyl-Sepharose with a gradient of 0.5-0 M NaCl in 50mM TrisHCl pH7.5 and finally the protein was eluted with distilled water.
- the invention covers the use of recombinant Ole e 9 in diagnosis, "in vivo” by skin tests or “in vitro” by immunodetection techniques (ELISA, RAST), allowing to specify which allergens are responsible for the clinical symptomatology of an individual and reduce the number of molecules necessary for immunotherapy. Thus, a personalized immunotherapy is originated.
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Abstract
Producción en la levadura Pichia pastoris, y sistema de aislamiento y purificación, del alergeno recombinante de Olea europaea Ole e 9 para uso en diagnosis y tratamiento de alergias. Se ha clonado y expresado el DNA recombinante que codifica el alergeno Ole e 9 de polen de olivo (Olea europaea). Este alergeno tiene actividad β-1,3-glucanasa y presenta una alta homología con estas proteínas. Se han detectado también proteínas homólogas a este alergeno en otros pólenes como el de otras miembros de la familia de las Oleaceas (Syringa vulgaris, Ligustrum vulgare y Fraxinus excelsior). La proteína recombinante producida en la levadura (Pichia pastoris) se aísla con gran rendimiento, está correctamente plegada y exhibe propiedades inmunológicas equivalentes a las del alergeno natural por lo que tanto ella como las proteínas homólogas, las formas modificadas derivadas de ellas, los fragmentos derivados que contengan al menos un epitopo alergenico, pueden ser empleadas en protocolos de diagnosis e inmunoterapia.
Description
TITULO
Producción en la levadura Pichia pastoris, y sistema de aislamiento y purificación, del alérgeno recombinante de Olea europaea Ole e 9 para uso en diagnosis y tratamiento de alergias.
SECTOR DE LA TÉCNICA. OBJETO DE LA INVENCIÓN
La presente invención, según se expresa en el enunciado de esta memoria descriptiva, se refiere a uno de los alérgenos del polen de olivo ( Olea europaea) , la proteina Ole e 9, y a epitopos alergénicos presentes en la proteina. La invención también hace referencia a los DNAs recombinantes que codifican tanto proteínas completas como fragmentos que incluyen uno o más epitopos de la molécula, asi como moléculas homologas de Ole e 9 con capacidad alergénica en otras especies relacionadas y no relacionadas. En concreto el objeto de la invención consiste en la producción de la proteina Ole e 9, mediante tecnología recombinante en la levadura Pichia pastoris, que implica el uso de la secuencia nucleotidica caracterizada por SEQ ID NO:l o de otras secuencias nucleotidicas obtenidas por mutagénesis de la secuencia SEQ ID NO:l.
La invención proporciona también un eficaz método de aislamiento tanto para el alérgeno recombinante como para el natural.
ESTADO DE LA TÉCNICA
La alergia tipo I es una enfermedad que afecta a más del 20% de la población de los paises industrializados. Esta afección es ocasionada por los alérgenos, presentes tanto en organismos y productos biológicos -alimentos, ácaros, venenos de insectos, pólenes, hongos, epitelios de mamíferos-, como en materiales de síntesis. En la mayor parte de las fuentes biológicas alergénicas, los alérgenos
son proteínas de masas moleculares comprendidas entre 5 y 70 Da. Los síntomas que se derivan de la alergia, tales como rinitis, conjuntivitis, o asma, son provocados por la liberación de mediadores celulares, como la histamina, desde basófilos y mastocitos, células del sistema inmune. Dicha liberación viene inducida por el entrecruzamiento de anticuerpos IgEs unidos a los receptores de alta afinidad
FcεRI, los cuales se encuentran a su vez anclados a basófilos y mastocitos. El entrecruzamiento de las IgE es provocado por la unión del correspondiente alérgeno, o un fragmento suyo, a través de un epitopo IgE (contenido en dicho alérgeno, o en su fragmento) . La terapia que actualmente se viene utilizando para tratar la alergia implica la hiposensibilización del paciente mediante la administración por via parental u oral de dosis adecuadas del propio alérgeno, o alergoides relacionados. En la práctica totalidad de los casos se administra un extracto alergénico obtenido, mediante una mínima manipulación, de la fuente biológica natural, lo que implica a una mezcla muy compleja de proteínas y otras sustancias, en la cual, el alérgeno -o alérgenos- puede representar una parte Ínfima del producto total utilizado.
En efecto, en la actualidad, los protocolos utilizados para la diagnosis de casos de alergia y su posterior inmunoterapia implican el uso de extractos alergénicos que frecuentemente no están caracterizados, ni siquiera estandarizados respecto a los alérgenos más importantes que pueden contener. A menudo, su administración no proporciona una diagnosis completa, sobre todo cuando la hipersensibilidad del paciente se refiere a alérgenos presentes en baja concentración en dichos extractos. Por otro lado, la inmunoterapia realizada con estas preparaciones es frecuentemente ineficaz y origina en ocasiones efectos secundarios indeseables que pueden llegar
a ser más graves que la propia afección alérgica que se pretende resolver. Una alternativa a la utilización de estos extractos es la preparación de mezclas de los alérgenos más significativos, obtenidos por aislamiento de su fuente natural. Sin embargo, esta via presenta dos importantes barreras. Por un lado, implica un buen conocimiento de los componentes alergénicos del material que provoca la alergia, al menos de todos sus alérgenos principales, y este dato, frecuentemente, no está disponible. Por otro lado, el proceso de aislamiento de los alérgenos conocidos, a partir del material biológico, es a menudo difícil y no proporciona las cantidades necesarias o la calidad requerida para un posterior empleo, debido fundamentalmente a los bajos niveles en los cuales se encuentra. Todos estos problemas se acentúan cuando el material alergénico es el polen de una especie vegetal. La gran cantidad de pigmentos, carbohidratos, lipidos y componentes insolubles hacen muy difícil su manipulación. Ni que decir tiene que su disponibilidad es, además, muy reducida y de alto coste económico, debido a la dificultad de su recolección. Por todo lo expuesto, se hace necesario el diseño de procedimientos para la producción de alérgenos a utilizar en los protocolos de diagnosis e inmunoterapia de la alergia. La producción de DNA recombinante se prevé como la forma más reproducible y eficaz de obtención de polipéptidos alergénicos bien definidos, no sólo para uso clínico, sino incluso para investigación.
La polinosis a olivo es una de las más importantes causas de alergia en países del área mediterránea, donde este árbol es intensamente cultivado para la obtención de aceite y de aceituna. En la actualidad, se conocen varios alérgenos del polen de olivo, habiendo sido hasta ahora Ole e 1 el que muestra una mayor incidencia entre los pacientes alérgicos a olivo ya que afecta a más del 70% de éstos
[Villalba, M, et al.Eur. J. Bioche . 216, 863-869, 1993; Villalba, M., et al. J. Biol . Chem. 269, 15217-15222, 1994] . Además, se han aislado y caracterizado otros alérgenos Ole e 2 (profilina) [Ledesma, A et al. Allergy 53, 520-526, 1998a], Ole e 3 [Ledesma, A, et al. Eur. J. Biochem. 258,454-459, 1998b], Ole e 4, Ole e 5 [Boluda, L, et al. J.Immunol. Methods 223, 17-23, 1998], Ole e 6 [Batanero, E, et al. FEBS Lett. 410, 293-296, 1997], Ole e 7 [Tejera, ML, et al. J. Allergy Clin. Immunol. 104, 797- 802, 1999], Ole e 8 [Ledesma, A, et al. FEBS Lett. 466, 192-196, 2000a] . El cDNA especifico que codifica algunas de estas proteínas ha sido clonado, secuenciado, y expresado en E. coli [Batanero E.,et al Clin. Exp. Allergy 26, 1401- 1410, 1996; Batanero E., et al. Eur. J. Biochem. 221, 187- 193, 1994] .
EXPLICACIÓN DE LA INVENCIÓN
Producción del alérgeno recombinante de Olea europaea Ole e 9 en la levadura Pichia pastoris, y sistema de aislamiento y purificación.
Lá presente invención se refiere al método de aislamiento utilizado para la purificación del alérgeno Ole e 9 -un alérgeno del polen de olivo de suma importancia clínica, con una alta prevalencia del 65% de los pacientes alérgicos al polen de olivo- a partir del polen de olivo (Olea europaea) . Más específicamente comprende la obtención, mediante clonación, de moléculas de DNA recombinante que codifican polipéptidos con las mismas o similares propiedades antigénicas que el alérgeno procedente del polen de olivo, o bien polipéptidos que posean al menos un epitopo del alérgeno Ole e 9. La invención incluye también la secuencia completa del cDNA del alérgeno Ole e 9 y la secuencia completa deducida del alérgeno.
El procedimiento objeto de la invención, permite llevar a cabo la purificación del alérgeno Ole e 9 del polen de olivo a partir de un extracto proteico de polen de olivo mediante una cromatografía de penetrabilidad y una de afinidad, según se describe detalladamente más adelante. De esta forma, se obtienen moléculas de DNA recombinante que codifican polipéptidos que exhiben la antigenicidad de Ole e 9, asi como polipéptidos que contienen, al menos, un epitopo de Ole e 9 en su estructura. La invención dispone de secuencias polinucleotidicas de DNA que hibridan, en condiciones restrictivas, con las descritas antes -lo que implica un nivel de identidad de al menos un 60% entre sus secuencias de nucleótidos-, o bien son derivadas de ellas por degeneración del código genético o mutagénesis .
El procedimiento de clonación del alérgeno recombinante de Olea europaea Ole e 9, incluye vectores de clonación y células huésped que contienen una secuencia de nucleótidos como las descritas en SEQ ID NO: 1, codificantes de Ole e 9, proteínas homologas o fragmentos suyos.
Por lo tanto se obtienen fragmentos nucleotidicos que poseen, al menos, una secuencia que codifica un determinante antigénico del alérgeno Ole e 9 de olivo o de fragmentos suyos, asi como de alérgenos homólogos de Ole e 9 -principalmente en especies relacionadas con el olivo, como son todas las Oleáceas- que, dada la similitud estructural, al menos un 60%, presentan reactividad alergénica cruzada con Ole e 9 o con una parte de él. Entre estas las especies relacionadas con el olivo se encuentran: Syringa vulgaris (lila) , Ligustrum vulgare (aligustre) y Fraxinus excelsior (fresno) .
Estos polipéptidos pueden contener la secuencia antigénica unida a otros polipéptidos (por ejemplo como
proteínas de fusión) , haber sido sintetizados químicamente o haber sido obtenidos mediante digestiones proteoliticas y modificados química o enzimáticamente.
La inserción de dicha secuencia en vectores de expresión en organismos hospedadores eucarióticos permite disponer de construcciones recombinantes que pueden utilizarse para la producción del alérgeno recombinante.
Una vez producida la molécula polipeptidica con actividad antigénica de Ole e 9 o epitopos B y T suyos, ésta es aislada del medio extracelular del cultivo en forma soluble mediante cromatografía de intercambio aniónico y de afinidad.
Los productos recombinantes obtenidos mediante el procedimiento objeto de la invención presentan la capacidad de unión de anticuerpos IgE del suero de pacientes alérgicos a olivo, sensibles a Ole e 9.
Finalmente, con el procedimiento objeto de la invención, se dispone de Ole e 9 inmunológicamente activo, además de fragmentos antigénicos y alergénicos de este alérgeno, y de proteínas homologas de él, que sirven para ser incorporados en las pruebas "in vivo" e "in vitro" a realizar para la fiel diagnosis de la hipersensibilidad a este polen, y a otros pólenes relacionados filogenéticamente con él. También podrán ser empleados en las preparaciones de alérgenos que se utilicen para llevar a cabo la inmunoterapia correspondiente para el tratamiento de la alergia al polen de olivo.
Para el diagnóstico y la terapia de la alergia al polen de olivo se utilizan actualmente extractos proteicos obtenidos a partir del polen. Esto implica una escasa reproducibilidad y un alto contenido en ' moléculas contaminantes, de origen proteico y no proteico, que pueden originar efectos secundarios adversos en los pacientes
tratados. El disponer de moléculas homogéneas obtenidas por las técnicas del DNA recombinante, en cantidades ilimitadas, perfectamente cuantificables y estandarizadas, rebajarla considerablemente todos los inconvenientes citados. Esta tecnología permite disponer de esas moléculas y, además, de péptidos o formas modificadas de las mismas que contienen al menos uno de los epitopos alergénicos.
BREVE DESCRIPCIÓN DE LAS FIGURAS
Figura 1. Oligonucleótidos diseñados para las amplificaciones' por PCR que han dado como resultado la obtención de la secuencia completa de Ole e 9.
Figura 2. Esquema de las amplificaciones parciales por PCR. Se indican los oligonucleótidos que se han utilizado en cada caso.
MODO DE REALIZACIÓN DE LA INVENCIÓN La presente invención se refiere a un DNA recombinante que codifica epitopos del alérgeno de Olea europaea Ole e 9, a la producción recombinante, en la levadura Pichia pastoris, de los polipéptidos codificados por dicho DNA y al aislamiento del alérgeno natural procedente del polen de olivo. También se refiere a la aplicación de ambas moléculas al diagnóstico y terapia de este desorden inmunológico .
En el procedimiento de clonación del alérgeno recombinante de Olea europaea Ole e 9, se llevó a cabo la digestión con tripsina de la proteina que originó varios péptidos cuya secuencia fue determinada por Degradación de Edman. Dichas secuencias internas sirvieron para diseñar varios oligonucleótidos degenerados (Figura 1) que fueron utilizados para amplificar por PCR las secuencias parciales
codificantes y no codificantes (Figura 2) correspondientes al cDNA de Ole e 9, que condujeron a su clonación y secuenciación .
El procedimiento objeto de esta invención se realiza mediante las siguientes fases:
• Aislamiento de RNA total
Se aisló el RNA total a partir del polen de olivo siguiendo el protocolo publicado por Ullrich y col. [Science 196, 1313-1318, 1977] . En este aislamiento se partió de 0.5 g de polen que se homogeneizó en un tampón 0.1 M de Tris-HCl, pH 7.5 que contenia tiocianato de guanidinio 4M, laurilsarcosinato sódico al 0.5 % y 2- mercaptoetanol 0.14 M, mediante un homogeneizador Polytron. Se centrifugó esta suspensión a 5000 xg a 20 °C en una centrifuga Sorvall. Posteriormente se sometió al sobrenadante a una centrifugación en gradiente de CsCl 5.7 M en 0.01 M EDTA a 40.000 rpm en un rotor SW 60 (Beckman) durante 12 horas. El mismo procedimiento se llevó a cabo para aislar otros RNAs de diferentes pólenes usados
(aligustre, fresno, lila) y con los diferentes tejidos del olivo empleados (tallo, hojas y frutos) . Con estos últimos se introdujo una etapa inicial adicional en la que fueron macerados en presencia de nitrógeno liquido hasta obtener un polvo fino y homogéneo. A partir de 5 μg de RNA total se llevó a cabo la síntesis del cDNA utilizando el "kit" SMART II de síntesis de cDNA (Clontech) .
• Clonación de Ole e 9 basado en técnicas de PCR Como ya se ha mencionado anteriormente, los cebadores utilizados fueron diseñados teniendo en cuenta la secuencia de la proteina obtenida por degradación de Edman. El método utilizado se basó en una reacción de PCR en varias etapas.
En la primera de ellas, el cDNA especifico de Ole e 9 que se ha usado como molde y los cebadores degenerados, OL9A, OL9B y OL9C, correspondientes a secuencias internas de la proteina, asi como los oligonucleótidos SMART II y 3'CDS son utilizados para originar fragmentos que contienen secuencias parciales de este alérgeno. El molde y los cebadores fueron disueltos en una mezcla de PCR estándar
(250μM de dNTPs, tampón estándar y 50 pmoles de los cebadores) . Después de una primera etapa de desnaturalización a 95 °C durante 15 min, se llevaron a cabo 25-35 ciclos a temperaturas de hibridación de 42-55 °C en presencia de Taq o±d DNA polimerasa (Applied Biosyste PE Corp.). La reacción se sometió a electroforesis en geles de agarosa al 1.5% y los fragmentos de DNA fueron purificados usando el Magic PCR Prep kit (Promega) e insertados en el plásmido pCR2.1 linearizado y con una T terminal en los extremos 5' . Con esta construcción se transformaron células competentes DH5αF' , a continuación se seleccionaron los recombinantes y se llevó a cabo la secuenciación de algunos de los clones seleccionados, obteniéndose secuencias parciales de este alérgeno. En la segunda etapa de PCR, y utilizándose los oligonucleótidos no degenerados OL9D, OL9E y OL9F, se obtuvieron las secuencias correspondientes a la secuencia 5' del DNA. Por último, en una última reacción de PCR con los oligonucleótidos NT-0L9, NTC-OL9 y C-OL9, se obtuvieron los fragmentos de DNA que contenían la secuencia completa del alérgeno. Cuando se utilizaron los cebadores NTC-0L9 y C- OL9 se amplificó la región del DNA que incluye la secuencia correspondiente al péptido señal junto con la secuencia correspondiente a la proteina madura. Con los oligonucleótidos NT-OL9 y C-OL9 se amplificó la secuencia del DNA que contiene únicamente la región codificante desde
el hipotético primer aminoácido amino-terminal, determinado teóricamente aplicando el método de von Heijne [Nielsen, H, et al. Protein Engineering 12, 3-9, 1997].
Para la producción de la forma natural de estas . proteínas, la secuencia codificante de DNA fue ligada al plásmido de expresión pPICZαA (Invitrogen Corp.). Las células utilizadas fueron de la cepa X-33 de Pichia pastoris . La inducción se llevó a cabo por metanol al 0.5% durante cuatro dias, creciendo las células a 30°C. Las células se sedimentaron centrifugando a 5000 xg, se recogieron los sobrenadantes y una muestra de los mismos se aplicó en un gel de poliacrilamida al 15% en presencia de SDS. Una banda de 45 kDa, única, fue detectada mediante tinción de los geles con Azul de Coomassie. La proteina es reconocida por sueros de pacientes alérgicos específicos de Ole e 9 natural (dilución 1:10). La purificación de las proteínas se llevó a cabo mediante dos etapas, una cromatografía de intercambio iónico en DEAE-celulosa y una de afinidad en fenil-Sefarosa, obteniéndose tras esta última el alérgeno con un grado de pureza del 99%. Se llevaron a cabo con ellas estudios de caracterización estructural (espectros de dicroismo en -el UV lejano, espectrometría , de masas) e inmunológica (con sueros individuales de pacientes alérgicos) y en todos los casos las proteínas recombinantes se comportaron de manera equivalente a la del alérgeno natural.
• Aislamiento del alérgeno Ole e 9 a partir del polen de olivo ( Olea europaea ) . El alérgeno Ole e 9 ha sido purificado a partir de extracto proteico de polen de olivo, obtenido por homogeneización de 3g de polen en bicarbonato amónico 50 mM pH 8.0. Dicho extracto fue aplicado a una columna de Sephadex G-150. Las fracciones que contenían la proteina
fueron aplicadas a una columna de afinidad en fenil- Sepharosa con un gradiente de NaCl 0.5-0 M en TrisHCl 50mM pH7.5 y finalmente la proteina fue eluida con agua destilada.
La invención cubre el uso de Ole e 9 recombinante en diagnóstico, "in vivo" mediante pruebas cutáneas o "in vitro" mediante técnicas de inmunodetección (ELISA, RAST) , permitiendo precisar qué alérgenos son los responsables de la sintomatologia clínica de un individuo y reducir así el número de moléculas necesarias para su inmunoterapia. Se origina, por tanto, una inmunoterapia personalizada.
Claims
1. Moléculas de DNA recombinante caracterizadas por SEQ ID NO: 1 que codifican polipéptidos con actividad alergénica que poseen al menos un epitopo alergénico común con el alérgeno Ole e 9 de Olea europaea .
2. Moléculas de DNA recombinante, o modificaciones de las mismas, según reivindicación 1, que codifican polipéptidos con, al menos, un epítopo de Ole e 9 en su estructura, unido a un polipéptido adicional, o modificado química o enzimáticamente .
3. Moléculas de DNA recombinante caracterizadas por presentar, al menos, un 60% de identidad con la descrita en SEQ ID NO: 1, conteniendo una secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido con actividad alergénica idéntica o reducida (hipoalergénica) con respecto a Ole e 9.
4. Polipéptidos recombinantes del alérgeno Ole e 9 de Olea europaea , o fragmentos de dichos polipéptidos, según reivindicaciones 1 y 2, caracterizados por las secuencias dadas en SEQ ID NO: 1, que presentan la antigenicidad de, al menos, un epítopo de Ole e 9.
5. Polipéptidos recombinantes del alérgeno homólogo de Ole e 9 en otras especies relacionadas y no relacionadas filogenéticamente, o fragmentos de dichos polipéptidos, según reivindicación 3 que presentan la antigenicidad de, al menos, un epitopo de Ole e 9.
6. Polipéptidos o fragmentos de dichos polipéptidos de polen de Oleáceas con, al menos, un epitopo de Ole e 9, según reivindicaciones anteriores, que se produzcan recombinantes unidos a un polipéptido adicional.
7. Polipéptidos de polen de Olea europaea, Syringa vulgaris y Ligustrum vulgare, según reivindicaciones anteriores, que estén modificados química o enzimáticamente.
8. Un vector de expresión eucariota, y preferentemente pPICZαA, que contenga las secuencias caracterizadas por SEQ ID NO: 1 según reivindicaciones 1,2 y 3, cuya expresión dé lugar a la producción de los polipéptidos según reivindicaciones 4,5,6 y 7.
9. Un organismo hospedador eucariota, preferentemente la levadura Pichia pastoris, transformado con la construcción formada según reivindicación 8.
10. Un método para producir las formas recombinantes correspondientes a las secuencias polipeptídicas mencionadas en las reivindicaciones 4,5,6 y 7, en el sistema eucariótico de levadura Pichia pastoris y preferentemente de la cepa X-33, caracterizado por una cromatografía de intercambio iónico en DEAE-celulosa y una de afinidad enfenil-Sefarosa.
11. Utilización de las moléculas según reivindicaciones 1-9 en el diagnóstico "in vitro" de la alergia.
12. Aplicación de las moléculas recombinantes de las reivindicaciones 1,2,3,4,5,6 y 7 para el diseño de vacunas destinadas a la inmunoterapia de la alergia.
13. Aplicación de las moléculas recombinantes de las reivindicaciones 1-3 para producir péptidos, según reivindicaciones 4-7, que contengan al menos un epítopo T alergénico capaces de actuar como vacunas.
14. Aplicación de las moléculas recombinantes de las reivindicaciones 1-3 en la producción de isoformas recombinantes hipoalergénicas que tengan disminuida o anulada su unión a IgE para el tratamiento de alergias.
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