ES2209563B1 - Produccion en la levadurapipchia pastoris y sistema de purificacion del alergeno recombinante de olea europaea ole e 1 para uso en diagnosis y tratamiento de alergias. - Google Patents

Produccion en la levadurapipchia pastoris y sistema de purificacion del alergeno recombinante de olea europaea ole e 1 para uso en diagnosis y tratamiento de alergias.

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Abstract

Producción en la levadura Pichia pastoris y sistema de purificación del alergeno recombinante de Olea europaea Ole e 1 para uso en diagnosis y tratamiento de alergias. Se ha clonado y expresado el DNA recombinante que codifica los alergenos Ole e 1 de polen de olivo (Olea europaea), Syr v 1 de polen de lila (Syringa vulgaris) y Lig v 1 de polen de aligustre (Ligustrum vulgare). Estos alergenos poseen una gran similitud estructural entre ellos y con otros alergenos de polen de otras Oleaceas. Las proteínas recombinantes producidas en la levadura (Pichia pastoris) se aíslan con gran rendimiento, están correctamente plegadas y exhiben propiedades inmunológicas equivalentes a las de los alergenos naturales por lo que pueden ser empleadas en protocolos de diagnosis e inmunoterapia.

Description

Producción en la levadura Pichia pastoris y sistema de purificación del alergeno recombinante de Olea europaea Ole e 1 para uso en diagnosis y tratamiento de alergias.
Sector de la técnica Objeto de la invención
La presente invención, según se expresa en el enunciado de esta memoria descriptiva, se refiere a uno de los alergenos del polen de olivo (Olea europaea), la proteína Ole e 1, y a epítopos alergénicos presentes en la proteína. La invención también hace referencia a los DNA recombinantes que codifican tanto a las proteínas completas como a fragmentos que incluyen uno o más epítopos de la molécula, y a moléculas homólogas de Ole e 1 con capacidad alergénica en otras especies, como Lig v 1 de polen de aligustre (Ligustrum vulgare) y Syr v 1 de polen de lila (Syrínga vulgaris) El objeto de la invención consiste, además, en la producción de las proteínas Ole e 1, Syr v 1 y Lig v 1 mediante tecnología recombinante en la levadura Pichia pastoris, que implica el uso de las secuencias nucleotídicas SEQ ID NO:1,2,3,4,5,6,7,8 o de otras secuencias nucleotídicas obtenidas por mutagénesis de las secuencias SEQ ID NO:1,2,3,4,5,6,7,8.
La invención proporciona un eficaz método de aislamiento para estas proteínas con un alto rendimiento.
Estado de la técnica anterior a la invención
La alergia tipo I es una enfermedad que afecta a más del 20% de la población de los países industrializados. Esta afección es ocasionada por los alergenos, presentes tanto en organismos y productos biológicos -alimentos, ácaros, venenos de insectos, pólenes, hongos, epitelios de mamíferos-, como en materiales de síntesis. En la mayor parte de las fuentes biológicas alergénicas, los alergenos son proteínas de masas moleculares comprendidas entre 5 y 70 kDa. Los síntomas que se derivan de la alergia, tales como rinitis, conjuntivitis, o asma, son provocados por la liberación de mediadores celulares, como la histamina, desde basófilos y mastocitos, células del sistema inmune. Dicha liberación viene inducida por el entrecruzamiento de anticuerpos IgEs unidos a los receptores de alta afinidad FcCRI, los cuales se encuentran a su vez anclados a basófilos y mastocitos. El entrecruzamiento de las IgE es provocado por la unión del correspondiente alergeno, o un fragmento suyo, a través de un epítopo IgE (contenido en dicho alergeno, o en su fragmento). La terapia que actualmente se viene utilizando para tratar la alergia implica la hiposensibilización del paciente mediante la administración por vía parental u oral de dosis adecuadas del propio alergeno, o alergoides relacionados. En la práctica totalidad de los casos se administra un extracto alergénico obtenido, mediante una mínima manipulación, de la fuente biológica natural, lo que implica a una mezcla muy compleja de proteínas y otras sustancias, en la cual, el alergeno -o alergenos- puede representar una parte ínfima del producto total utilizado.
En efecto, en la actualidad, los protocolos utilizados para la diagnosis de casos de alergia y su posterior inmunoterapia implican el uso de extractos alergénicos que frecuentemente no están caracterizados, ni siquiera estandarizados respecto a los alergenos más importantes que pueden contener. A menudo, su administración no proporciona una diagnosis completa, sobre todo cuando la hipersensibilidad del paciente se refiere a alergenos presentes en baja concentración en dichos extractos. Por otro lado, la inmunoterapia realizada con estas preparaciones es frecuentemente ineficaz y origina en ocasiones efectos secundarios indeseables que pueden llegar a ser más graves que la propia afección alérgica que se pretende resolver. Una alternativa a la utilización de estos extractos es la preparación de mezclas de los alergenos más significativos, obtenidos por aislamiento de su fuente natural. Sin embargo, esta vía presenta dos importantes barreras. Por un lado, implica un buen conocimiento de los componentes alergénicos del material que provoca la alergia, al menos de todos sus alergenos principales, y este dato, frecuentemente, no esta disponible. Por otro lado, el proceso de aislamiento de los alergenos conocidos, a partir del material biológico, es a menudo difícil y no proporciona las cantidades necesarias o la calidad requerida para un posterior empleo, debido fundamentalmente a los bajos niveles en los cuales se encuentra. Todos estos problemas se acentúan cuando el material alergénico es el polen de una especie vegetal. La gran cantidad de pigmentos, carbohidratos, lípidos y componentes insolubles hacen muy difícil su manipulación. Ni que decir tiene que su disponibilidad es, además, muy reducida y de alto coste económico, debido a la dificultad de su recolección. Por todo lo expuesto, se hace necesario el diseño de procedimientos para la producción de alergenos a utilizar en los protocolos de diagnosis e inmunoterapia de la alergia. La producción de DNA recombinante se prevé como la forma más reproducible y eficaz de obtención de polipéptidos alergénicos bien definidos, no sólo para uso clínico, sino incluso para investigación.
La polinosis a olivo es una de las más importantes causas de alergia en países del área mediterránea, donde la aceituna es intensamente cultivada. En la actualidad, se conocen varios alergenos del polen de olivo, siendo Ole e 1 el que muestra una mayor incidencia entre los pacientes alérgicos a olivo ya que afecta a más del 70% de éstos. Ole e 1 es una glicoproteína constituida por 145 aminoácidos -que corresponde a 16.:3 kDa- y una fracción de carbohidrato de 1.5 kDa [Villalba, M, et al.Eur. J. Biochem. 216, 863-869 (1993)]. El DNA que codifica a Ole e 1 ha sido clonado, secuenciado y expresado en E. coli, por los inventores [Villalba, M.,et al. J. Biol. Chem. 269, 15217-15222, 1994], habiéndose determinado que se presenta en el polen con un alto grado de polimorfismo. Así mismo, se han caracterizado las propiedades antigénicas de la fracción glicosídica [Batanero, E., et al.J. Allergy Clin. Immunol. 97, 1264-71, 1996; Batanero, E., et al. J. Allergy Clin. Immunol. 103, 147-53, 1999], y su localización tisular [Martín-Orozco, E.,et al. Int. Arch. Allergy Immunol. 104, 160-170, 1994]. Por otro lado, Las proteínas homólogas de Ole e 1 en polen de aligustre (Ligustrum vulgare), Lig v 1, y en polen de lila (Syringa vulgaris), Syr v 1, se han aislado de su fuente natural, y han originado una reacción alergénica cruzada con Ole e 1, frente a los sueros de pacientes alérgicos al polen de olivo. El cDNA específico que codifica estas proteínas ha sido clonado, secuenciado, y expresado en E. coli [Batanero E.,et al Clin. Exp. Allergy 26, 1401-1410, 1996; Batanero E., et al. Eur. J. Biochem. 221, 187-193, 1994].
Explicación de la invención
La presente invención se refiere a la producción en la levadura Pichia pastoris y purificación del alergeno recombinante de Olea europaea Ole e 1.
Por medio del procedimiento, objeto de la invención, se obtienen moléculas de DNA recombinante que codifican polipéptidos que exhiben la antigenicidad de Ole e 1, un alergeno de olivo (Olea europaea) y de otras plantas (lila y aligustre) que poseen alergenos homólogos de Ole e 1, así como para polipéptidos que contengan al menos un epítopo de Ole e 1 en su estructura. La invención dispone de secuencias polinucleotídicas de DNA que hibriden en condiciones restrictivas con las descritas antes -lo que implica un nivel de identidad de al menos un 60% entre sus secuencias de nucleotidos-, o bien sean derivadas de ellas por degeneración del código genético o mutagénesis.
El procedimiento de obtención del alergeno recombinante de ``lea europea Ole e 1'', incluye vectores de expresión y células huésped que contengan una secuencia de nucleotidos como las descritas en SEQ N°1,2,3,4,5,6,7, codificantes de Ole e 1, proteínas homólogas o fragmentos suyos.
Mediante el procedimiento objeto de esta invención se obtienen polipéptidos que poseen la actividad antigénica del alergeno Ole e 1 de olivo o de fragmentos suyos, así como de alergenos homólogos de Ole e 1 -principalmente en especies relacionadas con el olivo, como son todas las Oleaceae- que, dada la similitud estructural, al menos un 60%, presenten reactividad alergénica cruzada con Ole e 1 o con una parte de él.
Estos polipéptidos pueden contener la secuencia antigénica unida a otros polipéptidos (por ejemplo como proteínas de fusión), o haber sido modificados química o enzimáticamente.
Los métodos de preparación de estos polipéptidos implican su producción recombinante a partir de las moléculas polinucleotídicas arriba mencionadas, en un sistema de cultivo de células eucarióticas que contienen como vehículo de esos DNA los vectores de expresión descritos. Una vez producida la molécula polipeptídica con actividad antigénica de Ole e 1 o epítopos suyos, ésta es aislada del medio extracelular del cultivo en forma soluble mediante cromatografías de penetrabilidad e intercambio fónico, según se describe detalladamente más adelante.
Los productos obtenidos mediante el procedimiento objeto de la invención presentan la capacidad de unión de anticuerpos IgE del suero de pacientes alérgicos a olivo, sensibles a Ole e 1 o segmentos antigénicos suyos.
Hasta la fecha, no se ha descrito la preparación del alergeno Ole e 1, con un rendimiento comparable al que se ofrece con esta invención. La obtención de proteína de su fuente natural proporciona rendimientos insuficientes y una estructura altamente polimórfica. Por otro lado, la expresión en E. coli del alergeno Ole e 1 [Villalba, M., et al. J. Biol. Chem. 269, 15217-15222, 1994; Asturias, J.A., et al. J. Allergy Clin. Immunol. 100, 365-372, 1997], produce cantidades escasísimas de proteína y en condiciones de muy baja solubilidad debido, fundamentalmente, a un incorrecto plegamiento durante la síntesis proteica, con lo que su uso posterior se hace prácticamente imposible. Con el procedimiento descrito en esta invención se producen niveles de proteína de un orden de magnitud superior: decenas de miligramos de proteína (alrededor de 60) por litro de cultivo.
Finalmente, con el procedimiento objeto de la invención, se dispondrá de Ole e 1 -un alergeno del polen de olivo de suma importancia clínica- inmunológicamente activo, además de fragmentos antigénicos de este alergeno, y de proteínas homólogas de él, que servirán para ser incorporados en las pruebas ``in vivo'' e ``in vitro'' a realizar para la fiel diagnosis de la hipersensibilidad a este polen, y a otros pólenes relacionados filogenéticamente con él. También podrán ser empleados en las preparaciones de alergenos que se utilicen para llevar a cabo la inmunoterapia correspondiente para el tratamiento de la alergia al polen de olivo.
Para el diagnóstico y la terapia de la alergia al polen de olivo se utilizan actualmente extractos proteicos obtenidos a partir del polen. Esto implica una escasa reproducibilidad y un alto contenido en moléculas contaminantes, de origen proteico y no proteico, que pueden originar efectos secundarios adversos en los pacientes tratados. El disponer de moléculas homogéneas obtenidas por las técnicas del DNA recombinante, en cantidades ilimitadas, perfectamente cuantificables y estandarizadas, rebajará considerablemente todos los inconvenientes citados. Esta tecnología permite disponer de esas moléculas y además de péptidos o formas modificadas de las mismas que contienen al menos uno de los epítopos alergénicos.
El uso de Ole e 1 recombinante en diagnóstico in vivo, mediante pruebas cutáneas, o in vitro, mediante técnicas de inmunodetección (ELISA, RAST), permitirá precisar qué alergenos son los responsables de la sintomatología clínica de un individuo y reducir así el número de moléculas necesarias para su inmunoterapia. Se originará, por tanto, una inmunoterapia personalizada.
Modo de realización de la invención
En el procedimiento de obtención de alergeno recombinante de ``Olea europea'' Ole e 1, se utilizaron los alergenos Ole e 1, Syr v 1 y Lig v 1 purificados a partir de polen de olivo (Olea europaea)(Villalba, M., et al. Eur. J. Biochem.216, 863-869, 1993), de lila (Syringa vulgaris) (Batanero E.,et al. J. Biochem.221, 187-193, 1994) y de aligustre (Ligustrum vulgare)(Batanero E.,et al. Clin. Exp. Allergy 26, 1401-1410, 1996). Los pólenes fueron suministrados por la casa comercial Allergon AB. El conocimiento de la secuencia de aminoácidos de la zona amino y carboxilo terminal de Ole e 1 permitió el diseño de los oligonucleótidos con los que se abordó su clonación por PCR y expresión.
El procedimiento objeto de esta invención se realiza mediante las siguientes fases:
\bullet Aislamiento de RNA total
Con este propósito se aisló el RNA total a partir del polen de olivo siguiendo el protocolo publicado por Ullrich A, et al. (Science 196, 1313-1318, 1977). En este aislamiento se partió de 0.5 g de polen que se homogeneizó en un tampón 0.1 M de Tris-HC1, pH 7.5 que contenía tiocianato de guanidinio 4M y laurilsarcosinato sódico al 0.5% y 2-mercaptoetanol 0.14 M mediante un homogeneizador Polytron. Se centrifugó esta suspensión a 5000 xg a 20°C en una centrífuga Sorvall. Posteriormente se sometió al sobrenadante a una centrifugación en gradiente de CsCl 5.7 M en 0.01 M EDTA a 40.000 rpm en un rotor SW 60 (Beckman) durante 12 horas. El mismo procedimiento se llevó a cabo para aislar otros RNAs de diferentes pólenes usados (maíz y abedul) y con los diferentes tejidos del olivo empleados (tallo, hojas y frutos). Con estos últimos se introdujo una etapa inicial adicional en la que fueron macerados en presencia de nitrógeno líquido hasta obtener un polvo fino y homogéneo. A partir de 5 \mug de RNA total se llevó a cabo la síntesis del DNA de doble cadena utilizando el ``kit'' de síntesis de cDNA (Clontech).
\bullet Clonación de Ole e 1 basado en técnicas de PCR
Como ya se ha mencionado anteriormente, los cebadores utilizados fueron diseñados teniendo en cuenta la secuencia de la proteína obtenida por degradación de Edman. El método utilizado se basó en una reacción de PCR en dos etapas. En la primera de ellas, el cDNA específico de Ole e 1 que se ha usado como molde y los cebadores degenerados, OL1, 5' CARTTYCAYATZCARGGNCARGT3' y OL2, 5' ATCATTRTTNGGNGGRTACATNCC3', correspondientes a la secuencia amino y carboxilo terminal de la proteína, respectivamente, fueron disueltos en una mezcla de PCR estándar (250µM de dNTPs, tampón estándar y 50 pmoles de los cebadores). Después de una primera etapa de desnaturalización a 95°C durante 15 min, se llevaron a cabo 30 ciclos que incluían cada uno de ellos una etapa de desnaturalización a 94°C durante 1 min, hibridación a 42ºC durante 1 min 30 s y extensión a 72ºC durante 2 min en presencia de Taq DNA polimerasa (U.S.Biochemical Corp.). Después de cortar la banda de 408 pb, ésta fue nuevamente amplificada usando 5 ciclos de desnaturalización a 94°C (60s), hibridación a 47°C (60s) y extensión a 72°C (90s) y 20 ciclos de desnaturalización a 94°C (60s), hibridación 55°C (90 s) y extensión 72°C (90s). Después, y para terminar este ciclo de amplificación, se incuban las muestras a 72°C durante 10 minutos. Los oligonucleótidos utilizados en esta reacción fueron OL3 5'CCGGGATCCGAARGAYGTNCCNCA 3' y OL4 5'CGGAATTCTCACATGTTGGGCGGGTA 3' El fragmento fue purificado usando el Magic PCR Prep kit (Promega), fosforilado con la T4 polinucleotido quinasa (U.S.Biochemical Corp.) e insertado en el sitio de restricción SmaI de un plásmido pUC18 previamente digerido y desfosforilado. Con esta construcción pUC18/Oleel, se transformaron células competentes DH5\alphaF' y se seleccionaron los recombinantes y se llevó a cabo la secuenciación de algunos de los clones seleccionados, obteniéndose las secuencias dadas en SEQ ID NO 1, SEQ ID NO 2 y SEQ ID NO 3.
Siguiendo la misma estrategia se llevó a cabo el clonaje del DNA que codifica las proteínas homólogas a Ole e 1, y también alergénicas, en otros miembros de la familia de las Oleaceas, como Syr v 1 de Syringa vulgaris y Lyg v 1 de Lygustrum vulgare. Se secuenciaron tres clones de Syr v 1 (secuencias dadas en SEQ ID NO 4, SEQ ID NO 5 y SEQ ID NO 6) y dos clones de Lyg v 1 (secuencias SEQ ID NO 7 y SEQ ID NO 8). Las secuencias de aminoácidos de las proteínas codificadas por los clones correspondientes al DNA específico de Ole e 1 son SEQ ID NO 9, SEQ ID NO 10 y SEQ ID NO 11, los correspondientes a Syr v 1, SEQ ID NO 12, SEQ ID NO 13 y SEQ ID NO 14 y los correspondientes a Lig v 1, SEQ ID NO 15 y SEQ ID NO 16.
Para la producción de las formas recombinantes de estas proteínas, la secuencia codificante de DNA fue ligada al plásmido de expresión pPIC9 (Invitrogen Corp.). Las células utilizadas fueron de la cepa GS115 de Pichia pastoris. La inducción se llevó a cabo por metanol al 0.5% durante cuatro días, creciendo las células a 30°C. Las células se sedimentaron centrifugando a 5000 xg y los sobrenadantes se recogieron y una muestra de los mismos se aplicó en un gel de poliacrilamida al 15% en presencia de SDS. Una banda de 20.5 kDa, única, fue detectada mediante tinción de los geles con Azul de Coomassie. La proteína es reconocida por el anticuerpo policlonal específico de Ole e 1 natural (dilución 1:5000), por varios anticuerpos monoclonales y por sueros de pacientes alérgicos a Ole e 1. La purificación de las proteínas se llevó a cabo mediante dos etapas, una cromatografía de intercambio fónico en DEAE-celulosa y una de filtración en gel en Sephadex G-75, obteniéndose tras esta. última el alergeno recombinante a una concentración de 15 a 35 mg/ml y con un grado de pureza del 99%. Se llevaron a cabo con ellas estudios de caracterización estructural (espectros de dicroismo en el UV próximo y lejano y de fluorescencia) e inmunológica (con sueros individuales de pacientes alérgicos y con 9 anticuerpos monoclonales)y en todos los casos las proteínas recombinantes se comportaron de manera equivalente a la del alergeno natural.
Estos ejemplos son sólo ilustrativos y no establecen los límites en cuanto a condiciones, eficacia o aplicaciones de la invención que se definen en las correspondientes reivindicaciones.
<110> Rodríguez, Rosalía; Villalba, Mayte; Monsalve, Rafael Ignacio Batanero, Eva
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<120> Producción en la levadura Pichia pastoris y purificación de: alergeno recombinante de Olea europaea Ole e 1 para uso el diagnosis y tratamiento de alergias.
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<160> 16
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<210> 1
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<211> 435
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<212> DNA
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<221> CDS
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<301> Villalba, M., Batanero, E., Monsalve, R.I., González de la Peña, M.A., Lahoz, C., Rodríguez, R.
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<302> Cloning and expression of Ole e I, the major allergen from olive tree pollen
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<303> J. Biological Chemistry
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<304> 269
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<305> 21
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<307> 1994-05-27
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<400> 1
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<301> Villalba, M., Batanero, E., Monsalve, R.I., González de la Peña, M.A., Lahoz, C., Rodríguez, R.
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<302> Cloning and expression of Ole e I, the major allergen from olive tree pollen
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<305> 21
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<306> 15217-15222
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<307> 1994-05-27
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<308> X76397
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<309> 1993-11-26
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<400> 2
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<210> 3
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Claims (15)

1. Moléculas de DNA recombinante caracterizadas por SEQ ID NO 1,2,3,4,5,6,7 y 8 que codifican polipéptidos con actividad alergénica que poseen al menos un epítopo alergénico común con el alergeno principal de Olea europaea.
2. Moléculas de DNA recombinante, según reivindicación 1, o modificaciones de las mismas, que codifican polipéptidos con, al menos, un epítopo de Ole e 1 en su estructura, unido a un polipéptido adicional, o modificado química o enzimáticamente.
3. Moléculas de DNA recombinante caracterizadas por presentar, al menos, un 60% de identidad con las descritas en SEQ ID NO 1,SEQ ID NO 2,SEQ ID NO 3, SEQ ID NO 4,SEQ ID NO 5,SEQ ID NO 6,SEQ Id NO 7 y SEQ ID NO 8, conteniendo una secuencia de nucleotidos que codifica un polipéptido con actividad alergénica idéntica o reducida (hipoalergénica) con respecto a Ole e 1.
4. Polipéptidos recombinantes del alergeno Ole e 1 de Olea europaea, o fragmentos de dichos polipéptidos, según reivindicación 1, caracterizados por las secuencias dadas en SEQ ID NO 9,10,11, que presentan la antigenicidad de, al menos, un epítopo de Ole e 1.
5. Polipéptidos recombinantes del alergeno principal de Syringa vulgaris, o fragmentos de dichos polipéptidos, según reivindicación 1, caracterizados por las secuencias dadas en SEQ ID NO 12,13,14 que presentan la antigenicidad de, al menos, un epítopo de Ole e 1.
6.Polipéptidos recombinantes del alergeno principal de Ligustrum vulgare, o fragmentos de dichos polipéptidos, según reivindicación 1, caracterizados por las secuencias dadas en SEQ ID NO 15 y 16 que presentan la antigenicidad de, al menos, un epítopo de Ole e 1.
7. Polipéptidos o fragmentos de dichos polipéptidos de polen de Olea europaea, Syringa vulgaris y Ligustrum vulgare con, al menos, un epítopo de Ole e 1 según reivindicaciones anteriores, que se produzcan recombinantes unidos a un polipéptido adicional.
8. Polipéptidos de polen de Olea europaea, Syringa vulgaris y Ligustrum vulgare, según reivindicaciones anteriores, que estén modificados química o enzimáticamente.
9. Un vector de expresión eucariota, y preferentemente pPIC9, que contenga las secuencias de nucleotidos mencionadas en las reivindicaciones anteriores y que permita su producción recombinante.
10. Un organismo hospedador eucariota, transformado con la construcción formada por el vector de expresión pPIC9 y las secuencias de DNA (SEQ N° 1,2,3,4,5,6,7,8) de las reivindicaciones 1,2 y 3, que sirvan para producir los polipéptidos indicados en las reivindicaciones 4,5,6 y 7.
11. Un método para producir las formas recombinantes correspondientes a las secuencias polipeptídicas mencionadas en la reivindicaciones 4,5,6 y 7, en el sistema eucariótico de levadura Pichia pastoris y preferentemente de la cepa GS15, caracterizado por una cromatografía de intercambio iónico en DEAE-celulosa y una de filtración en gel en Sephadex G-75.
12. Utilización de las moléculas según reivindicaciones 1-9 en el diagnóstico ``in vitro'' de la alergia.
13. Aplicación de las moléculas recombinantes de las reivindicaciones 1, 2, 3, 4, 5, 6, y 7 para el diseño de vacunas destinadas a la inmunoterapia de la alergia.
14. Aplicación de las moléculas recombinantes de las reivindicaciones 4-7 para producir péptidos que contengan al menos un epítopo T capaces de actuar como vacunas.
15. Aplicación de las moléculas recombinantes de las reivindicaciones 4-7 para la producción de isoformas recombinantes hipoalergénicas que tengan disminuida o anulada su unión a IgE para el tratamiento de alergias.
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