ES2341103T3 - Procedimiento de separacion continua de particulas usando reticulados de obstaculos alineados asimetricamente respecto a campos. - Google Patents
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Abstract
Un dispositivo microfluídico para separar partículas según su tamaño que comprende: un canal microfluídico y un reticulado que comprende una red de intersticios dentro del canal microfluídico, en el que el dispositivo emplea un campo que propele las partículas que se separan en el canal microfluídico; y caracterizado porque un flujo del campo procedente de los intersticios se divide desigualmente en un componente principal del flujo y un componente secundario del flujo en intersticios subsiguientes en la red, de tal modo que la dirección media del componente secundario del flujo no es paralela a la dirección media del campo, y, cuando se introducen partículas en el reticulado, las partículas que tienen un tamaño menor que un tamaño crítico predeterminado son transportadas, por lo general, en la dirección media del campo, y las partículas que tienen un tamaño al menos igual que el tamaño crítico son transportadas, por lo general, en la dirección media del componente principal del flujo, separándose con ello las partículas según su tamaño.
Description
Procedimiento de separación continua de
partículas usando reticulados de obstáculos alineados
asimétricamente respecto a campos.
La presente invención versa acerca de
procedimientos y dispositivos para separar partículas según su
tamaño. Más específicamente, la presente invención versa acerca de
un procedimiento y un dispositivo microfluídicos para la separación
de partículas según su tamaño.
La separación por tamaño o masa es una técnica
analítica y preparativa fundamental en biología, medicina, química
y en la industria. Los procedimientos convencionales incluyen la
electroforesis en gel, el fraccionamiento
campo-flujo, la sedimentación y la cromatografía por
exclusión de tamaño [J. C. Giddings, Unified Separation Science
(Wiley, Nueva York, 1991)]. La electroforesis en gel utiliza un
campo eléctrico para hacer que las moléculas cargadas se separen en
un medio en forma de gel, que hace de matriz de colado. Las
moléculas se cargan inicialmente en un extremo de la matriz de gel,
y se separan en zonas componentes según migran por el gel. El
fraccionamiento campo-flujo se lleva a cabo en un
canal fino a modo de cinta en el que el perfil del flujo es
parabólico. Se cargan las partículas como una zona de muestra, y
luego fluyen por el canal. La separación se produce cuando
partículas de propiedades diferentes fluyen en diferentes posiciones
de flujo, debido a la influencia de un campo, lo que da como
resultado velocidades de migración diferentes. El campo se aplica
perpendicular al flujo. La sedimentación utiliza la aceleración
gravitatoria o centrífuga para obligar a las partículas a atravesar
un fluido. Las partículas migran por el fluido a diferentes
velocidades, dependiendo de su tamaño y densidad, y, por ello, se
separan. La cromatografía por exclusión de tamaño (CET) utiliza un
tubo lleno de perlas porosas, mediante las cuales se lavan moléculas
de muestra. Las moléculas menores que los poros pueden entrar en
las perlas, lo que alarga su trayectoria de migración, mientras que
las mayores que los poros únicamente pueden fluir entre las perlas.
De esta forma, las moléculas menores son retenidas, como media,
durante más tiempo y así se separan de las moléculas mayores. Sin
embargo, las zonas se amplían al pasar por la columna, porque hay
muchas trayectorias de migración posibles para cada molécula, y cada
trayectoria tiene una longitud diferente, y, en consecuencia, un
tiempo de retención diferente. Esta ampliación de la zona de
trayectorias múltiples (difusión de Eddy) es un factor fundamental
que limita la resolución. J. C. Giddings, Unified Separation
Science (John Wiley & Sons, Nueva York, 1991). Otros
procedimientos de separación según el tamaño, incluyendo la
electroforesis en gel y el fraccionamiento
campo-flujo, también conllevan procesos
estocásticos, lo que puede limitar su resolución. J. C. Giddings,
Nature 184, 357 (1959); J. C. Giddings, Science 260, 1456 (1993).
El documento US 5 837 115 da a conocer un aparato y un procedimiento
de clasificación para fraccionar y simultáneamente ver
microestructuras individuales, como células libres, virus,
macromoléculas o partículas diminutas en un medio fluido, en el que
el aparato de clasificación está compuesto de un sustrato que tiene
un receptáculo situado en su interior, teniendo el receptáculo
paredes laterales y un suelo, y en el que se coloca un reticulado
de obstáculos dentro del receptáculo, elevándose los obstáculos del
suelo del receptáculo.
No puede insistirse lo suficiente en la
necesidad de una separación fiable y rápida de grandes biomoléculas,
como el ADN y las proteínas. Recientemente, se han demostrado
estructuras fabricadas a micro/nanoescala que aprovechan diversas
ideas para la separación del ADN. El uso de estructuras fabricadas a
micro/nanoescala como matrices de colado para la separación de
partículas se dio a conocer en la patente estadounidense nº
5.427.663. Según ese documento, las moléculas de ADN se separan
según son impulsadas por campos eléctricos a través de un
reticulado de postes. La patente estadounidense nº 5.427.663 da a
conocer un aparato y un procedimiento de clasificación para
fraccionar y simultáneamente ver microestructuras y macromoléculas
individuales, incluyendo ácidos nucleicos y proteínas. Según la
patente estadounidense nº 5.427.663, se proporciona un sustrato que
tiene un receptáculo poco profundo situado en un lateral del mismo,
y se proporciona un reticulado de obstáculos que sobresalen del
suelo de los receptáculos para que interactúen con las
microestructuras y retarden la migración de las mismas. Para crear
la migración de las microestructuras, se fabrican electrodos en dos
lados del receptáculo para generar campos eléctricos en el fluido.
Esto es análogo a la electroforesis convencional en gel. Sin
embargo, el gel es sustituido por estructuras micromecanizadas como
matrices de colado.
Se han dado a conocer varias matrices de colado
microfabricadas. En un diseño, reticulados de obstáculos clasifican
moléculas de ADN según sus coeficientes de difusión usando un campo
eléctrico aplicado [Chou, C. F. et. al., Proc. Natl. Acad.
Sci. 96, 13762 (1999)]. El campo eléctrico propele las moléculas
directamente por los intersticios entre los obstáculos, en el que
cada intersticio está directamente debajo de otro intersticio. Los
obstáculos están modelados de forma que la difusión esté polarizada
en una dirección según fluye el ADN por el reticulado. Tras fluir a
través de muchas filas de obstáculos, se detectan ADN con diferentes
coeficientes de difusión en diferentes posiciones. Sin embargo,
dado que el coeficiente de difusión para las moléculas grandes es
reducido, los reticulados asimétricos de obstáculos son lentos,
típicamente con tiempos de utilización de más de 2 horas. En un
segundo diseño, trampas entrópicas que consisten en una serie de
muchos estrechamientos angostos (< 100 nm) separadas por
regiones más anchas y más profundas (algunos micrómetros) reducen el
tiempo de separación a aproximadamente 30 minutos [Han, J. &
Craighead, H. G., Science 288, 1026 (2000)]. Dado que los
estrechamientos se fabrican para que sean más angostos que el radio
de giro para que se separen las moléculas de ADN, actúan como
barreras entrópicas. La probabilidad de que una molécula supere la
barrera entrópica depende del peso molecular, y, por ello, las
moléculas de ADN migran en el reticulado de trampas entrópicas con
movilidades diferentes. Las moléculas mayores, como más grados de
libertad configuracional, migran con mayor rapidez en estos
dispositivos. En un tercer diseño, un reticulado hexagonal de postes
actúa como matriz de colado en una electroforesis de campo por
impulsos para la separación de moléculas de ADN en el intervalo de
100 kb [Huang, L. R., Tegenfeldt, J. O., Kraeft, J. J., Sturm, J.
C., Austin, R. H. y Cox, E. C., Nat Biotechnol. 20,1048 (2002)].
Sin embargo, generalmente estos dispositivos requieren
características con tamaños comparables o menores que los de las
moléculas que se fraccionan. Han, J. & Craighead, H. G.
Separation of long DNA molecules in a microfabricated entropic trap
array. Science 288, 1026-1029 (2000); Turner, S. W.,
Cabodi, M., Craighead, H. G. Confinement-induced
entropic recoil of single DNA molecules in a nanofluidic structure.
Phys Rev Lett. 2002 Mar 25; 88(12):128103; Huang, L. R.,
Tegenfeldt, J. O., Kraeft, J. J., Sturm, J. C., Austin, R. H. y
Cox, E. C. A DNA prism for high-speed continuous
fractionation of large DNA molecules. Nat Biotechnol. 2002 Oct;
20(10): 1048-51; y Huang, L. R., Silberzan,
P., Tegenfeldt, J. O., Cox, E. C., Sturm, J. C., Austin, R. H. y
Craighead, H. Role of molecular size in ratchet fractionation. Phys.
Rev. Lett. 89, 178301 (2002). La necesidad de rasgos de tamaño
pequeño tienen los siguientes efectos perjudiciales: (i) los
dispositivos no pueden fraccionar moléculas pequeñas, como las
proteínas; (ii) los dispositivos pueden tener un rendimiento muy
bajo y, por ello, no son instrumentos útiles para la preparación de
muestras; (iii) los dispositivos únicamente pueden analizar un
volumen muy pequeño de muestras, y, por lo tanto, requieren
habitualmente muestras concentradas o equipos caros para una
detección de muestras; y (iv) la fabricación de los dispositivos
requiere técnicas punteras de fabricación y, por ello, de costo
elevado.
La presente invención proporciona un dispositivo
microfluídico para separar partículas conforme a la reivindicación
1.
En una realización preferida, la presente
invención proporciona un dispositivo microfluídico para separar
partículas según su tamaño que comprende un canal microfluídico y un
reticulado ordenado de obstáculos dentro del canal microfluídico.
El reticulado ordenado de obstáculos es asimétrico con respecto a la
dirección media del campo aplicado. El dispositivo emplea un campo
que propele las partículas que se separan en el canal
microfluídico.
La invención también proporciona un
procedimiento para separar partículas conforme a la reivindicación
15.
En una realización preferida, la presente
invención también proporciona un procedimiento para separar
partículas según su tamaño que comprende: introducir las partículas
que deban separarse en un canal microfluídico que comprende una red
ordenada de obstáculos, y aplicar un campo a las partículas, en el
que el reticulado ordenado de obstáculos es asimétrico con respecto
a la dirección media del campo aplicado.
En otra realización preferida, la presente
invención proporciona un dispositivo microfluídico para separar
partículas según su tamaño que comprende un canal microfluídico y
reticulados múltiples en serie dentro del canal microfluídico, en
el que cada reticulado tiene un tamaño crítico diferente. El
dispositivo emplea un campo que propele las partículas que se
separan en el canal microfluídico. Cada uno de los reticulados
comprende una red de intersticios en los que un flujo del campo
procedente de los intersticios se divide desigualmente en un
componente principal del flujo y un componente secundario del flujo
en intersticios subsiguientes en la red. La dirección media del
componente principal del flujo en cada reticulado no es paralela a
la dirección media del campo.
La Figura 1 muestra un diagrama esquemático de
un dispositivo de reticulado conforme a una realización de la
presente invención. El dispositivo consiste en un reticulado
asimétrico de obstáculos con respecto a la dirección del campo.
La Figura 2 muestra un diagrama esquemático de
una vista en perspectiva de una realización preferida de la
invención, que comprende un sustrato base con una superficie
principal, en la que se crea una pista de obstáculos para formar
una red de intersticios, en la que ocurren cascadas de bifurcaciones
desiguales del flujo del campo. La pista de obstáculos puede estar
tapada con una capa de cubierta para formar una red cerrada de
intersticios.
La Figura 3 muestra un diagrama esquemático de
un reticulado de obstáculos. El reticulado de obstáculos es
simétrico con respecto a las líneas discontinuas (eje principal),
pero asimétrico con respecto a la dirección del campo.
La Figura 4 muestra un diagrama esquemático de
una realización de la invención, que comprende una red de
intersticios definidos por un reticulado de obstáculos. Cada línea
de corriente representa una cantidad igual de flujo de campo. El
flujo de campo de un intersticio se divide en dos intersticios
subsiguientes, en los que las cantidades de flujo que entran en los
intersticios son desiguales. En este caso, dos líneas de corriente
van a la izquierda (componente principal del flujo) y una línea de
corriente va a la derecha (componente secundario del flujo) en cada
intersticio. La flecha gris indica la dirección del reticulado.
La Figura 5 muestra un diagrama esquemático de
partículas separadas en un dispositivo de reticulado conforme a una
realización de la presente invención. Las partículas pequeñas se
mueven en la dirección del campo, y las grandes hacia la dirección
del reticulado.
La Figura 6 muestra un diagrama esquemático de
un reticulado de obstáculos que muestra las dimensiones
características del reticulado. \lambda denota el periodo de una
fila de obstáculos, d el intersticio de separación entre obstáculos
y a\lambda el desplazamiento lateral de cada fila.
La Figura 7 muestra un diagrama esquemático de
un reticulado particular que muestra que las líneas de campo rodean
los obstáculos. La línea discontinuo del centro marca la división de
las líneas de campo que van a lados diferentes del obstáculo.
La Figura 8 muestra un diagrama esquemático de
un reticulado particular que ilustra que las líneas de campo
desplazan sus posiciones relativas en los intersticios. Como
ilustración, a = 1/3 y cada intersticio se divide en tres
ranuras, que se denotan por 1, 2 y 3. Las líneas de campo que pasan
por la ranura 1 van a la ranura 2 en el siguiente intersticio; las
que pasan por la ranura 2 van a la 3, y las que pasan por la 3, a
la 1.
La Figura 9 muestra un diagrama esquemático de
un reticulado particular que ilustra la trayectoria de las
partículas pequeñas.
La Figura 10 muestra un diagrama esquemático de
un reticulado particular que ilustra el desplazamiento de las
partículas grandes por los obstáculos.
La Figura 11 muestra un diagrama esquemático de
un reticulado particular que ilustra la trayectoria de las
partículas grandes. Las partículas grandes se mueven a lo largo de
la dirección del reticulado (modo de desplazamiento). Obsérvese que
aunque la partícula parta del lado izquierdo del intersticio, acaba
moviéndose al lado derecho y se queda a la derecha, por cuanto es
desplazada constantemente por obstáculos.
La Figura 12 muestra un gráfico de la dirección
de la migración de las partículas en función de su tamaño. Existe
un tamaño crítico de partícula R_{0} en el que ocurre una
transición brusca de la dirección de migración.
La Figura 13 muestra un diagrama esquemático de
dos reticulados de tamaños críticos diferentes en serie. Las
partículas en la salida 1 son menores que R_{1}, tamaño
crítico del primer reticulado de la serie; las de la salida 2,
entre el tamaño R_{1} y R_{2}, y las de la salida
3 son mayores que R_{2}, tamaño crítico del segundo
reticulado.
La Figura 14 muestra un diagrama esquemático de
múltiples reticulados en serie, en los que cada reticulado tiene un
tamaño crítico diferente. La línea horizontal discontinua representa
la división entre reticulados subsiguientes, y cada reticulado
subsiguiente en la serie tiene un tamaño crítico creciente. Así,
puede fraccionarse y analizarse con un dispositivo una distribución
continua de tamaños moleculares.
La Figura 15 muestra una vista esquemática en
planta de una realización de la invención que usa un reticulado
cuadrado de obstáculos circulares para formar la red de
intersticios, inclinado un ángulo pequeño \theta con respecto al
campo. El reticulado cuadrado es surcado por los vectores primitivos
x e y, que son perpendiculares entre sí. La
bifurcación del flujo del campo ocurre debido a la asimetría del
reticulado de obstáculos con respecto al
campo.
campo.
La Figura 16 muestra una vista esquemática en
planta de una realización de la invención. Cada obstáculo está
centrado en un punto del entramado, surcado por los vectores
primitivos x e y. Sin embargo, los obstáculos pueden
tener formas diferentes.
La Figura 17 muestra una vista esquemática en
planta de una realización de la invención. Cada obstáculo puede ser
idéntico, con el mismo periodo horizontal \lambda. Sin embargo,
cada fila de obstáculos está desplazada horizontalmente una
cantidad diferente con respecto a la fila anterior, y la pista de
obstáculos no es un entramado periódico.
La Figura 18 muestra un diagrama esquemático de
un dispositivo microfluídico para la separación por flujo continuo,
con estructuras de carga de muestras.
La Figura 19 muestra un diagrama esquemático de
un dispositivo microfluídico para la separación por flujo continuo
tal como se construye en el Ejemplo 1.
La Figura 20 muestra imágenes fluorescentes de
microesferas que migran en el reticulado de obstáculos, que
muestran (A) los dos modos de transporte para (B) la separación de
las microesferas sin dispersión alguna. Los puntos grises en (A),
que representan los obstáculos, se han superpuesto sobre la imagen
fluorescente.
La Figura 21 muestra los perfiles fluorescentes
de microesferas separadas usando velocidades reducidas de \sim40
\mum/s (curvas superiores) y \sim400 \mum/*s (curvas
inferiores) escaneados a \sim11 mm del punto de la inyección. Las
perlas de 0,60 \mum, 0,80 \mum y 1,03 \mum de diámetro son
verdes fluorescentes, mientras que las de 0,70 \mum y 0,90 \mum
son rojas, y, por ello, cada escaneo se muestra como dos curvas que
representan los dos colores.
La Figura 22 muestra los ángulos de migración
medidos como función del diámetro de las microesferas a dos
velocidades diferentes de flujo.
La Figura 23 muestra un diagrama esquemático de
un dispositivo para la separación de partículas que comprende un
reticulado que tiene 9 secciones (divididas por líneas discontinuas)
de tamaños críticos diferentes, y estructuras para la carga de
muestras. Aunque la orientación y las constantes del entramado del
reticulado se mantienen iguales, se cambian los diámetros de los
obstáculos para crear intersticios d de tamaños diferentes y
tamaños críticos diferentes.
La Figura 24 muestra la separación en alta
resolución de microesferas fluorescentes de 0,80 \mum (izquierda),
0,90 \mum (centro) y 1,03 \mum (derecha), usando un reticulado
de tamaño de intersticio variable. Aunque la orientación y las
constantes del entramado del reticulado se mantienen iguales, se
cambian los diámetros de los obstáculos para crear intersticios d
de tamaños diferentes, marcados en el lado izquierdo de la imagen
fluorescente. Las líneas de corriente individuales de 1,03 \mum
muestran claramente una migración en zigzag.
La Figura 25 muestra el perfil fluorescente de
las partículas separadas escaneado a 14 mm del punto de la
inyección.
La Figura 26 muestra una imagen fluorescente de
moléculas de ADN separadas según su tamaño usando un dispositivo de
la presente invención. Las moléculas se introducen en la parte
superior de la figura.
La Figura 27 muestra un diagrama esquemático de
un dispositivo usado para concentrar una muestra. La dirección del
campo puede estar definida por las paredes laterales del reticulado.
La zona sombreada muestra las trayectorias de las partículas
mayores que el tamaño crítico, inyectadas desde la parte superior.
Las partículas se mueven contra la pared lateral y se
concentran.
La Figura 28 muestra un diagrama esquemático de
un dispositivo para concentrar partículas. El dispositivo comprende
un reticulado, que mueve las partículas contra un límite del
reticulado, y canales microfluídicos y depósitos para la carga y la
recogida de muestras.
La Figura 29 muestra una imagen fluorescente de
moléculas de ADN que se concentran contra un límite del reticulado.
Las muestras de ADN se introdujeron desde la parte superior de la
imagen.
La Figura 30 muestra un diagrama esquemático de
un dispositivo que tiene un reticulado ordenado de obstáculos y que
emplea un campo no uniforme en el que la dirección del campo cambia
de un lado al otro del reticulado.
La Figura 31 muestra un diagrama esquemático de
un dispositivo que tiene un reticulado ordenado de obstáculos en un
canal microfluídico curvado. El canal curvado puede dar como
resultado un campo que no es uniforme.
La presente invención proporciona un
procedimiento y un dispositivo para separar partículas según su
tamaño conforme a las reivindicaciones 1 y 15, usando un reticulado
que comprende una red de intersticios, en los que el flujo del
campo procedente de los intersticios se divide desigualmente en los
intersticios subsiguientes. Se aplica un campo al reticulado para
propeler las partículas que se separan en el reticulado. En una
realización preferida, el reticulado es un reticulado ordenado de
obstáculos en un canal, en la que el reticulado es asimétrico con
respecto a la dirección del campo aplicado. En realizaciones
preferidas adicionales, el canal que contiene el reticulado es un
canal microfluídico. El término "canal", tal como se usa en el
presente documento, se refiere a una estructura por la que puede
fluir un fluido. Un canal puede ser un capilar, un conducto, una
tira de textura hidrófila en una superficie por lo demás hidrófoba
en la que están confinados fluidos acuosos, etc. El término
"microfluídico", tal como se usa en el presente documento, se
refiere a un sistema o un dispositivo que tiene uno o más canales,
conductos o cámaras fluídicos que están fabricados, por lo general,
a una escala milimétrica a nanométrica; por ejemplo, que tengan
típicamente al menos una dimensión transversal en el intervalo de
aproximadamente 10 nm a aproximadamente 1 mm.
La presente invención es útil para la separación
de partículas biológicas según su tamaño, incluyendo bacterias,
células, orgánulos, virus, ácidos nucleicos (es decir, ADN, etc.),
proteínas y complejos proteínicos, al igual que otras partículas no
biológicas suspendidas en fluido, como polímeros, polvos, látex,
emulsiones o coloides industriales. Además de en la separación de
partículas, el procedimiento puede usarse para analizar la
distribución de tamaño de muestras, o para extraer partículas de
cierto intervalo de tamaños de mezclas de partículas. Además,
debido a las características de gran tamaño, el dispositivo puede
ser un instrumento de alto rendimiento para la preparación de
muestras. La presente invención puede proporcionar las ventajas de
un coste de fabricación reducido, una resolución elevada y un
rendimiento de muestras mejorado.
En una realización preferida, la presente
invención proporciona un dispositivo microfluídico que separa
partículas en fluido según su tamaño. Se aplica un campo a las
partículas que se separan según pasan las partículas por el
reticulado. El término "campo", tal como se usa en el presente
documento, se refiere a cualquier fuerza o entidad vectorial que
pueda usarse para propeler las partículas en el reticulado. El campo
que impulsa las partículas que se separan puede ser un campo de
fuerza, como un campo eléctrico, un campo centrífugo o un campo
gravitatorio. El campo que impulsa las partículas que se separan
puede ser también un flujo de fluidos, como un flujo de fluidos
movido por presión, un flujo electroosmótico, acción capilar, etc.,
en el que la entidad del vector es la densidad del flujo del
fluido. Además, el campo puede ser una combinación de un campo de
fuerza y un flujo de fluido, como un flujo electrocinético, que es
una combinación de un campo eléctrico y de un flujo
electroosmótico. En realizaciones preferidas, la dirección media del
campo será paralela a las paredes del canal que contiene el
reticulado.
El reticulado para el uso en la presente
invención comprende una red de intersticios que crea un patrón de
campo de tal modo que el flujo de campo procedente de un intersticio
dentro de la red se divide en cantidades desiguales (un componente
principal del flujo y un componente secundario del flujo) en los
intersticios subsiguientes (véase, por ejemplo, la Figura 4),
aunque los intersticios puedan ser de dimensiones idénticas. Mirando
el reticulado en su conjunto, las divisiones desiguales del flujo
del campo, como media, tienden en una dirección. Así, los
componentes principales del flujo se desvían, como media, en la
misma dirección (es decir, se desvían al mismo lado del obstáculo),
de tal modo que la dirección media de los componentes principales
del flujo no es paralela a la dirección media de los componentes
secundarios del flujo ni a la dirección media del campo. Se
prefiere que una mayoría de los componentes principales del flujo se
desvíen en la misma dirección. En una realización particularmente
preferida, el reticulado es un reticulado ordenado, en el que el
componente principal del flujo procedente de cada evento de
bifurcación se desvía en la misma dirección. Generalmente, el
componente secundario del flujo que sale de un intersticio alimenta
al componente principal del flujo que sale de un intersticio
subsiguiente (Figura 4).
El término "intersticio", tal como se usa
en el presente documento, se refiere a una estructura en la que
pueden fluir fluidos o partículas. Un intersticio puede ser un
capilar, un espacio entre dos obstáculos en el que pueden fluir
fluidos, una textura hidrófila en una superficie por lo demás
hidrófoba en la que están confinados fluidos acuosos, etc. En una
realización preferida de la invención, la red de intersticios está
definida por un reticulado de obstáculos. En esta relación, los
intersticios serían el espacio entre obstáculos adyacentes. En una
realización preferida, la red de intersticios se construirá con un
reticulado de obstáculos en la superficie de un sustrato (Figura
2). El término "obstáculo", tal como se usa en el presente
documento, se refiere a una estructura física o a una textura en la
que no pueden penetrar las partículas que se separan, y, por ello,
un obstáculo puede referirse a un poste que sobresale de un sustrato
base, una barrera hidrófoba para fluidos acuosos, etc. En algunas
realizaciones, el obstáculo puede ser permeable al campo. Por
ejemplo, un obstáculo puede ser un poste hecho de material poroso,
en el que los poros permiten la penetración del campo, pero son
demasiado pequeños para que entren las partículas que se
separan.
En una realización preferida, la red de
intersticios, en la que el flujo se divide de forma desigual, se
forma usando un reticulado periódico de obstáculos que es
asimétrico con respecto a la dirección media del campo. Una
característica importante de esta realización es que el reticulado
de obstáculos es asimétrico con respecto al campo, aunque el propio
reticulado pueda ser simétrico con respecto a otros ejes (Figura 3).
El término asimétrico, tal como se usa en el presente documento, se
refiere a un reticulado de obstáculos en el que el flujo del campo
procedente de un intersticio entre dos obstáculos se bifurca por un
obstáculo subsiguiente, de tal modo que el flujo del campo
bifurcado no se divide en dos cantidades iguales (por ejemplo,
véanse las líneas de corriente de campo de la Figura 4). Esto puede
lograrse cuando la dirección media del campo no es paralela a un
eje principal del reticulado (Figura 3). En una realización, un
reticulado ordenado está inclinado un ángulo \theta, desviado con
respecto al campo (por ejemplo, en la Figura 15), en el que el
ángulo \theta de desviación se selecciona de tal modo que el
reticulado no esté alineado con el campo (es decir, es asimétrico
con respecto al campo). De manera alternativa, también puede
lograrse un reticulado asimétrico usando un reticulado que
comprende filas de obstáculos en el que cada fila está desplazada
lateralmente con respecto a la fila anterior y el factor de
desalineamiento, a, es mayor que 0 y menor que 0,5 (Figura
6). En una realización preferida, el reticulado de obstáculos será
un reticulado ordenado en el que un eje principal del reticulado no
es paralelo a la dirección del campo (Figura 3). El término
asimétrico se refiere al reticulado de obstáculos (por ejemplo, al
eje del reticulado) y no a la forma de los obstáculos individuales.
Se prefiere que el reticulado sea un reticulado ordenado para
maximizar el número de eventos de bifurcación que pueden ocurrir
según pasa la muestra por el reticulado (véase, por ejemplo, la
Figura 4).
Tal como se usa en el presente documento, el
término "ordenado" se refiere a un reticulado que tiene una
disposición espacial generalmente periódica o repetitiva. Por
ejemplo, la disposición espacial repetitiva puede ser cuadrada,
rectangular, hexagonal, oblicua, etc. En otras realizaciones, no es
preciso que el reticulado sea un reticulado ordenado.
En una realización de la invención, las
partículas fluyen por un reticulado asimétrico de obstáculos, y se
separan, según su tamaño, en corrientes diferentes (Figura 5).
Mientras que las partículas pequeñas siguen la dirección del campo,
las partículas grandes migran en la dirección del reticulado. La
dirección del reticulado se corresponde con la dirección media del
componente principal del flujo del campo (por ejemplo, véase la
flecha gris de la Figura 4). La teoría básica del proceso de
transporte se ilustra esquemáticamente en la Figura 5. La Figura 5
representa una realización de un reticulado asimétrico de obstáculos
en el que el reticulado está desalineado (es decir, es asimétrico)
con respecto al campo. Para el tipo de reticulado representado en
la Figura 6, el factor de desalineamiento, a, es mayor que 0
y menor que 0,5. Cuando a = 0 o a = 0,5, el
reticulado es asimétrico con respecto al eje del campo. Tal como se
muestra en la Figura 6, cada fila de obstáculos está desplazada
horizontalmente con respecto a la fila previa por a\lambda,
donde \lambda es la distancia entre los centros de los
obstáculos. De cara a esta exposición, supongamos que a vale
1/3. En realizaciones preferidas, las partículas que van a separarse
son impulsadas a través del reticulado por medio de un flujo
fluido. Debido al reducido número de Reynolds de estos dispositivos,
las líneas de flujo pueden ser laminares, lo que da como resultado
una turbulencia y unos efectos inerciales despreciables.
Dado que el reticulado de obstáculos está
alineado de forma asimétrica con respecto al campo, es decir, que
el entramado de obstáculos es asimétrico con respecto a la dirección
media del campo, las líneas de campo que atraviesan un intersticio
tienen que rodear el obstáculo en la fila siguiente (Figura 7). Para
considerar la asignación de líneas de campo en la fila siguiente,
suponemos que el campo en el intersticio entre los obstáculos es
localmente uniforme, es decir, las líneas de campo está separadas
por igual en cada intersticio. Esta puede ser una buena
aproximación si el campo es eléctrico. Esta suposición puede
relajarse en el caso de otros campos. El flujo total del campo
\phi que atraviesa un intersticio es dividido por el obstáculo
subsiguiente y, según pasa el flujo a los dos intersticios
subsiguientes (Figura 7), se parte en dos corrientes, el componente
principal del flujo y el componente secundario del flujo. Si esa
dirección media del campo es vertical (paralela a las paredes del
canal), a\phi tiene que ir a un intersticio y
(1-a)\phi al otro. Por lo tanto, en cada intersticio se da
una división desigual del flujo de campo. Generalmente, el
componente secundario del flujo que sale de un intersticio alimenta
al componente principal del flujo que sale de un intersticio
subsiguiente (Figura 4).
Si dividimos cada intersticio en 1/a
ranuras (Figura 8, para ilustrar a = 1/3), cada línea de
campo se desplaza a la siguiente ranura según pasa por una fila de
manera cíclica: las líneas de campo que pasan por la posición 1
estarán en la posición 2 en la fila siguiente; las que pasan por la
posición 2 irán a la posición 3... las de la posición 1/a
volverán a la posición 1. Las partículas pequeñas siguen el campo y
se desplazan de una posición a la siguiente de manera cíclica
(Figura 9). Dado que las partículas pequeñas pueden volver a su
ranura (posición relativa en el intersticio) original después de
1/a filas, sus trayectorias siguen la dirección del campo y
no se dispersan después de rodear muchos obstáculos. Debido al
movimiento "en zigzag" de las partículas pequeñas, este patrón
de transporte puede denominarse "modo de zigzag".
En cambio, las partículas de diámetro grande en
comparación con la anchura de la ranura no seguirán las líneas de
corriente individuales, sino que, en vez de ello, serán propelidas
por muchas líneas de corriente, lo que cambia de manera fundamental
la dirección final de su migración. Tal como se muestra en la Figura
10, una partícula en contacto con un obstáculo y cuyo radio
característico es mayor que ad (la anchura del intersticio),
seguirá una línea de campo que atraviesa el intersticio 2, porque su
centro cae en el intersticio 2. Ahora bien, las líneas de campo van
a la ranura 3 en el intersticio siguiente, de modo que el centro de
la partícula también debería estar en la ranura 3. Sin embargo, la
ranura 3 no tiene suficiente sitio para la partícula. Por lo tanto,
la partícula se desplaza de vuelta a la ranura 2. Este proceso puede
repetirse cada vez que una partícula grande se aproximada a una
fila de obstáculos. Dado que las partículas grandes se desplazan a
la ranura 3 a la ranura 2, siguen la dirección del reticulado
(Figura 11). El movimiento de las partículas grandes por el
reticulado se denomina modo de "desplazamiento".
En resumidas cuentas, existe un radio crítico de
partícula R_{0} por encima del cual las partículas se
mueven en la dirección del reticulado (modo de desplazamiento), y
por debajo del cual las partículas siguen la dirección media del
campo (modo de zigzag) (Figura 12). El tamaño crítico,
R_{0}, puede determinarse por a y d, donde
a es el factor de desalineamiento y d es la anchura
del intersticio. En el caso en que los campos están distribuidos de
forma homogénea en los intersticios, R_{0} = ad.
Así, el radio hidrodinámico de una partícula (su radio) determina
qué modo de transporte sigue. Obsérvese además que la teoría
anterior puede generalizarse fácilmente para otros campos, como
campos electroforéticos o campos fluidos movidos por presión
considerando flujos de iones en vez de flujos de fluidos.
En una realización de la presente invención, el
dispositivo puede emplearse como filtro. El término "filtro",
tal como se usa en el presente documento, se refiere a un
dispositivo que extrae partículas de un fluido que estén en ciertos
intervalos de tamaño. La brusca transición del ángulo de migración
con respecto al tamaño es ideal para los filtros (Figura 12).
Preferentemente, las micro/nanoestructuras de los reticulados se
crean mediante técnicas de micro/nanofabricación. La Figura 13
muestra el diagrama esquemático de un filtro de la invención, en el
que las partículas inyectadas se separan en tres grupos de tamaños
diferentes. En principio, un reticulado puede fijar un radio
crítico (tamaño) para la separación de partículas, y separar una
mezcla de partículas en dos grupos de partículas, en uno de los
cuales las partículas son mayores que el tamaño crítico, y en el
otro de los cuales las partículas son menores. Dos reticulados de
tamaños críticos diferentes puestos juntos en serie pueden separar
una mezcla de partículas en tres intervalos de tamaños: grandes,
medianas y pequeñas (Figura 13). La muestra de partículas de
diferentes tamaños se inyecta en el primer reticulado, que tiene un
tamaño crítico (R_{1}) menor que el segundo
(R_{2}). Mientras que las partículas de tamaño grande y
mediano se mueven en el modo de desplazamiento en el primer
reticulado, las pequeñas se mueven en el modo de zigzag y son
apartadas. Cuando las partículas pasan al segundo reticulado, las
partículas de tamaño mediano pasan al modo de zigzag y son
apartadas de las grandes. Se pueden recoger moléculas de tamaños
diferentes en la salida del segundo reticulado, que puede hacer de
filtro molecular y de instrumento de preparación de muestras.
Además, el intervalo de tamaños de las partículas que van a la
salida 2, determinado por R_{1} y R_{2}, puede
ser muy estrecho. Por ejemplo, el dispositivo puede estar diseñado
para distinguir un único tamaño de fragmentos de restricción de ADN
entre decenas o cientos de otros tamaños de fragmentos. Este
dispositivo podría sustituir las técnicas convencionales de
electroforesis en gel y de corte en gel.
En otra realización de la invención, el
dispositivo de la invención puede fraccionar moléculas según su
tamaño. Puede lograrse una selectividad elevada en la región de
transición brusca (Figura 12) usando un único reticulado de radio
crítico (tamaño) fijo. De forma alternativa, la separación de
partículas en un intervalo amplio de tamaños puede requerir una
selectividad menor, lo que podría lograrse usando muchos reticulados
en serie, cada uno de los cuales tiene un tamaño crítico diferente
(Figura 14). La Figura 14 muestra un diagrama esquemático de
múltiples reticulados en serie, en el que cada reticulado tiene un
tamaño crítico diferente. La línea horizontal discontinua
representa la división entre reticulados subsiguientes, y cada
reticulado subsiguiente de la serie tiene un tamaño crítico
creciente. Así, puede fraccionarse y analizarse con un único
dispositivo una distribución continua de tamaños moleculares. De
hecho, pueden diseñarse características homogéneas del ángulo de
migración con respecto al tamaño de las partículas, incluyendo
relaciones lineales y exponenciales, usando muchos reticulados en
serie, teniendo cada uno un tamaño crítico diferente. El tamaño
crítico de un reticulado puede ajustarse cambiando la anchura
d del intersticio, desplazando los obstáculos, o ambos.
En una realización de la invención, el
dispositivo puede comprender un reticulado ordenado de obstáculos y
puede emplear un campo no uniforme, en el que la dirección del campo
cambia de un extremo al otro del reticulado (Figura 30). En una
realización, las direcciones cambiantes del campo pueden crearse
mediante un canal microfluídico curvado. Dado que el tamaño crítico
del reticulado depende de la dirección del campo, el campo no
uniforme crea sección de reticulado de tamaños críticos diferentes.
Esto puede desearse para el fraccionamiento de las partículas en un
intervalo de tamaños amplio. En la realización particular mostrada
en la Figura 30, la dirección del campo es grande en la primera
sección de reticulado, y luego se reduce en las siguientes secciones
de reticulado, creando un tamaño crítico grande en la primera
sección y tamaños críticos menores en las secciones siguientes.
En otra realización de la invención, el
dispositivo comprende un reticulado cuadrado ordenado de obstáculos
en un canal microfluídico curvado (Figura 31). El canal curvado
puede dar como resultado un campo que no es uniforme. El cambio en
la dirección del campo de un extremo al otro del reticulado crea un
gradiente de tamaños críticos en el reticulado, porque el tamaño
crítico puede depender de la dirección del campo. Además, la
intensidad del campo, otro parámetro que puede calibrarse, puede
ser ajustada cambiando la anchura del canal microfluídico. Este
dispositivo puede tener mejor intervalo de separación y mejor
resolución que un reticulado de un único tamaño crítico fijo.
También puede crearse un gradiente continuo de tamaños críticos de
un extremo al otro del reticulado cambiando la anchura de los
intersticios.
En una realización de la invención, el
reticulado comprende un entramado cuadrado de obstáculos
cilíndricos, estando inclinado el reticulado un ángulo \theta,
desviado con respecto al campo (Figura 15). Un ángulo desviado
\theta de tan^{-1}(a) es equivalente a un factor de
desalineamiento de a en la Figura 6.
En otra realización de la invención, el
reticulado que comprende una red de intersticios puede formarse
mediante una pista de obstáculos que no son idénticos (Figura 16).
Más específicamente, los obstáculos pueden tener formas o
dimensiones diferentes. Dado que el entramado en el que se alzan los
obstáculos es asimétrico con respecto al campo, el flujo del campo
en cada intersticio entre los obstáculos se divide de forma desigual
en los intersticios subsiguientes.
En otra realización de la invención, la pista de
obstáculos, que forma la red de intersticios, puede no ser un
entramado periódico. Por ejemplo, la Figura 17 muestra una vista
esquemática en planta de una realización de la invención en la que
cada obstáculo puede ser idéntico y tener el mismo periodo
horizontal \lambda. Sin embargo, cada fila de obstáculos está
desplazada horizontalmente una cantidad diferente con respecto a la
fila anterior, y la pista de obstáculos no es un entramado de
Bravais [N. W. Ashcroft y N. D. Mermin, Solid State Physics
(Saunders College Publishing, 1976)]. No obstante, el flujo del
campo en el reticulado experimenta cascadas de bifurcaciones,
porque la pista de obstáculos es asimétrica con respecto a la
dirección media del campo. Dado que el tamaño crítico depende de la
asimetría de la división del flujo del campo, que se originó en la
asimetría del reticulado con respecto al campo, esta realización
puede ser útil para separar partículas en un intervalo amplio.
En otra realización de la invención, se cargan
partículas en el reticulado usando muchos canales microfluídicos en
la parte superior del reticulado (Figura 18). Los muchos canales
generan un patrón de campo que es generalmente uniforme de un
extremo al otro del reticulado. Las partículas se inyectan desde uno
o más canales conectados a uno o más depósitos que contienen las
partículas, que han de ser llevadas por el campo de un extremo al
otro del
reticulado.
reticulado.
En otra realización de la invención, se
descargan partículas del reticulado, por ejemplo a través de los
canales microfluídicos al final del reticulado (Figura 18). A
continuación las partículas pueden ser dirigidas al siguiente
componente de la tableta microfluídica para un uso ulterior.
En otra realización, el dispositivo de la
invención puede concentrar partículas mayores que un tamaño crítico
(Figura 27). Esta realización puede aprovechar la capacidad del
reticulado para desviar las partículas de la dirección del campo
aplicado en modo de desplazamiento. Las partículas se introducen por
un lateral del reticulado. Las partículas mayores que el tamaño
crítico del reticulado (que se mueven en modo de desplazamiento) se
amontonan contra otro límite del reticulado. En este caso, el
dispositivo de la invención hace de concentrador. A continuación,
la muestra concentrada puede encaminarse al siguiente componente de
la tableta microfluídica para un uso ulterior, tal como crear una
zona de muestras para el fraccionamiento. La muestra concentrada
también puede sacarse de la tableta para aplicaciones
ulteriores.
En una realización preferida de la invención, el
dispositivo es fabricado a escala micro/nanométrica. Las técnicas
de microfabricación pueden seleccionarse entre las conocidas en la
técnica; por ejemplo, las técnicas usadas convencionalmente para la
fabricación de circuitos integrados basados en el silicio, la
estampación, el moldeo, el moldeo por inyección, etcétera [E. W.
Becker et. al., Microelectronic Engineering 4 (1986),
páginas 35 a 56]. Ejemplos de técnicas de fabricación adecuadas
incluyen la fotolitografía, la litografía por haz de electrones, la
litografía de estampación, el grabado iónico reactivo, el grabado
húmedo, la ablación láser, la estampación, el moldeo, el moldeo por
inyección y otras técnicas [H. Becker et. al., J. Micromech.
Microeng. 8 (1998), páginas 24 a 28]. El dispositivo microfluídico
puede fabricarse de materiales que sean compatibles con las
condiciones presentes en la aplicación particular objeto de interés.
Tales condiciones incluyen, sin limitación, pH, temperatura,
aplicación de disolventes orgánicos, fuerza iónica, presión,
aplicación de campos eléctricos, carga superficial, propiedades de
adherencia, tratamiento de superficies, funcionalización de
superficies, biocompatibilidad. Los materiales del dispositivo
también se escogen por sus propiedades ópticas, sus propiedades
mecánicas y por su inertidad a los componentes de la aplicación que
haya de llevarse a cabo en el dispositivo. Tales materiales
incluyen, sin limitación, vidrio, cristal de silicio, caucho de
silicona, silicio, cerámica y sustratos poliméricos, por ejemplo
plásticos, dependiendo de la aplicación prevista.
En lo que sigue se describirán realizaciones
específicas representativas de la invención, incluyendo cómo pueden
fabricarse tales realizaciones.
Se construyó un dispositivo microfluídico
(Figura 19). El canal microfluídico tiene 16 mm de longitud, 3,2 mm
de anchura y 10 \mum de profundidad. El reticulado que llena el
canal consiste en un entramado cuadrado de obstáculos cilíndricos
(Figura 19A), en el que la distancia entre centros, \lambda, es de
8 \mum, y la separación d entre los obstáculos es de 1,6
\mum (Figura 19B). El campo aquí empleado es un flujo de campo
movido por presión. El entramado está girado 5,7º (tan^{-1} 0,1)
con respecto al canal (Figura 19A), lo que define la dirección del
flujo. La rotación de tan^{-1} 0,1 corresponde a a = 0,1;
así, cada 10 filas hay un desplazamiento de una distancia completa
\lambda (Figura 19A). En principio, esta configuración
proporciona 10 ranuras, en vez de las 3 presentadas más arriba. Las
partículas se inyectan desde un canal con 10 \mum de anchura y
son llevadas de un extremo al otro del reticulado por un flujo
movido por presión, que se hace uniforme por los muchos canales en
la parte superior y en la inferior del reticulado (Figura 19C). Los
canales microfluídicos y el reticulado se fabricaron en una oblea de
silicio usando fotolitografía y grabado iónico reactivo profundo,
técnicas usadas de forma convencional para la fabricación de
circuitos integrados basados en el silicio. Se taladraron orificios
que atravesaban las obleas para el acceso de los fluidos antes de
tapar con una cubierta de vidrio revestida con caucho de silicona
(RTV-615 de General Electric) para encajonar el
reticulado.
Los dos modos de transporte fueron observados
experimentalmente usando microesferas fluorescentes de 0,40 \mum
y 1,03 \mum de poliestireno en tampón acuoso (Figura 20A) (en los
experimentos se usó tampón 0,1\times de
Tris-Borato-EDTA con un contenido
del 0,02% de POP-6, una poliacrilamida lineal de
rendimiento optimizado (Perkin-Elmer Biosystems)).
Se capturó la imagen mediante microscopía fluorescente con un tiempo
de exposición prolongado para mostrar las trayectorias de las
partículas individuales. El brillo variable a lo largo de la
trayectoria refleja las diferentes velocidades de flujo de una
microesfera en el reticulado, más apagado en los intersticios
estrechos, debido a la mayor velocidad del flujo y menor tiempo de
residencia. Tal como estaba predicho, la microesfera de 0,40 \mum
(izquierda) cruzaba una columna de obstáculos cada 10 filas en el
modo de zigzag, mientras que la microesfera de 1,03 \mum (derecha)
era encaminada a lo largo del eje del reticulado de obstáculos en
el modo de desplazamiento.
La Fig. 20B muestra la separación del flujo
continuo de microesferas de 0,40 \mum y 1,03 \mum inyectadas en
el reticulado desde un canal de suministro en la parte superior. En
esta imagen se superpusieron muchas trayectorias. Las esferas de
0,40 \mum y 1,03 \mum migraron a \sim0º (dirección del flujo)
y \sim5.7º (rotación del reticulado), respectivamente, con
respecto a la dirección del flujo, como cabía esperar. La presión
usada para mover el flujo era de 30 kPa, que creaba una velocidad
media del flujo de \sim400 \mum/s. El tiempo de recorrido por
el dispositivo fue de \sim40 s.
Para estudiar la resolución del dispositivo, se
mezclaron microesferas fluorescentes de 0,60 \mum, 0,70 \mum,
0,80 \mum, 0,90 \mum y 1,03 \mum de diámetro y se inyectaron
en el reticulado (las concentraciones de las microesferas de 0,60
\mum, 0,70 \mum, 0,80 \mum, 0,90 \mum y 1,03 \mum fueron,
respectivamente, de 0,015%, 0,010%, 0,010%, 0,005% y 0,005% de
contenido sólido). Las perlas se separaron en corrientes diferentes
usando una velocidad reducida de \sim40 \mum/s, creada mediante
una presión impulsora de 3 kPa. En la Figura 21 se muestra el
perfil de fluorescencia, escaneado a 11 mm del punto de la
inyección. Las direcciones de migración medidas con respecto al
flujo (campo), definidas como los ángulos de migración, se trazan en
la Figura 22 como función del tamaño de la microesfera, lo que
demuestra que, con esta velocidad de flujo (\sim40 \mum/s), la
transición del modo de zigzag al de desplazamiento es gradual. Lo
homogéneo de la transición probablemente se deba al movimiento
browniano de las partículas entre las líneas de corriente. Con una
velocidad de flujo de 40 \mum/s, un coeficiente de 0,73
\mum^{2}/s de difusión de partículas de 0,6 \mum en agua (H.
C. Berg, Random Walks in Biology, Princeton University Press, Nueva
Jersey, 1993, p. 56) tiene una longitud de difusión de \sim0,54
\mum durante los 0,2 s que le lleva moverse los 8 \mum que hay
de una fila de obstáculos a la siguiente. Esto es un factor de 3
mayor que la anchura media de la ranura de \sim0,16 \mum.
Para minimizar los efectos del movimiento
browniano, se aumentó el número de Péclet incrementando la velocidad
de flujo. El número de Péclet se define como
en la que v es la velocidad
del flujo, d es la dimensión característica del reticulado y
D es el coeficiente de difusión de la partícula que se
separa. La Figura 22 muestra una transición más brusca cuando la
velocidad del flujo aumenta en un factor de 10 (\sim400 \mum/s),
creada por una presión impulsora de 30 kPa. La velocidad elevada
del flujo no solo aumenta la selectividad, de modo que el
dispositivo sea más sensible a los cambios de tamaño, sino que
también acorta el tiempo de tránsito a \sim40s. La transición
ocurre aproximadamente a 0,8 \mum (Figura 22). Los coeficientes
de variación (CV) de tamaño de las mejores microesferas
monodispersas comercialmente disponibles son 1,3%, 1,0% y 1,0% para
0,70 \mum, 0,80 \mum y 0,90 \mum, según la medición del
fabricante. El coeficiente de variación (CV) del diámetro de la
partícula se define
como
en la que \Delta\phi es la
desviación típica de \phi, y (\phi) la media de \phi. Las
anchuras máximas medidas a 11 mm del punto de inyección
corresponden a CV de 2,5%, 1,2% y 0,9% para estos tres tamaños,
respectivamente (Figura 21). Los CV se calculan
según:
en la que x es la posición
lateral de la banda y \Deltax la desviación típica medida
(semiancho). Obsérvese que los máximos medidos de 0,80 \mum y
0,90 \mum son igual de agudos que las varianzas en el tamaño de
las propias microesferas, y, por ello, al ampliación de bandas en
nuestro dispositivo es menor que la varianza conocida en el tamaño
de las
partículas.
\vskip1.000000\baselineskip
Una ventaja de la flexibilidad de la
microfabricación es que el reticulado puede diseñarse para que tenga
anchuras variables de intersticio en función de la distancia,
optimizándose con ello la separación de mezclas complejas. Para
demostrar este aspecto, se fabricó un dispositivo que contenía 9
secciones, cada una de las cuales tenía una anchura de intersticio
diferente, empezando con 1,4 \mum y acabando con 2,2 \mum en
incrementos de 0,1 \mum (Figuras 23 y 24). Las anchuras variables
de los intersticios se diseñaron para calibrar el diámetro crítico
en 9 fases, desde \sim0,70 \mum hasta \sim1,10 \mum, para
que una partícula de un tamaño dado pase del modo de desplazamiento
al modo de zigzag al aumentar la anchura de los intersticios.
Se inyectó una mezcla de microesferas
monodispersas (CV = 1%) de 0,80 \mum, 0,90 \mum y 1,03 \mum
desde el lateral del reticulado con intersticios pequeños (Figuras
23 y 24), y se hizo fluir a \sim400 \mum/s usando una presión
impulsora de 30 kPa. Inicialmente, todas las microesferas eran
mayores que el tamaño crítico, y migraron con el mismo ángulo con
respecto al flujo vertical (modo de desplazamiento). Sin embargo,
las microesferas de 0,80 \mum (izquierda) pasaron pronto a la
dirección del flujo (vertical), presumiblemente en modo de zigzag.
Las microesferas de 0,90 \mum pasaron a vertical en la cuarta
sección, y las microesferas de 1,03 \mum hicieron la transición
aproximadamente en la octava sección. El perfil de intensidad
fluorescente se escaneó a \sim14 mm del punto de la inyección
(Figura 25), y demostró que los picos de 0,80 \mum, 0,90 \mum y
1,03 \mum tenían CV de 1,1%, 1,2% y 1,9%, respectivamente (véanse
las barras de escala, centrados en las medias de los picos). En
cambio, el CV del 1%, atribuible a la falta de uniformidad en la
población de microesferas se muestra como las barras de escala
negras por debajo de los picos. Obsérvese que una fracción de las
microesferas de 1,03 \mum se separó del pico principal y formó
una sub banda, lo más probable debido a la falta de homogeneidad en
la población de microesferas. Una vez más, los picos se resuelven
virtualmente a la monodispersión de las microesferas sumamente
uniformes disponibles comercialmente. El tiempo de recorrido
fue
de \sim40 s.
de \sim40 s.
Los resultados de las Figuras 21 y 25 sugieren
que la resolución del dispositivo puede superar nuestra capacidad
de medirla. En principio, se podrían descubrir los límites de
resolución para el enfoque explorando la potencia de resolución del
actual reticulado con una serie de clases de tamaños que varíen en
intervalos de aproximadamente 0,01 \mum en torno a \sim1
\mum, cada clase con un CV de \sim0,1%.
\vskip1.000000\baselineskip
Se construyó un dispositivo que tenía
dimensiones de reticulado y estructuras de carga idénticas a las del
Ejemplo 1 para la separación de ácidos nucleicos según su peso
molecular. El dispositivo se fabricó de cristal de silicio en vez
de silicio usando las mismas técnicas descritas en el Ejemplo 1.
Como campo se usaron campos eléctricos, en vez del flujo de fluidos
movido por presión. Se usó una mezcla de colifago \lambda y T2
ADN_{bc} (48,5 kb y 164 kb, respectivamente) a \sim2 \mug/ml
y \sim1 \mug/ml como muestra de prueba y se visionó mediante
microscopía fluorescente. Se tincionó el ADN con
TOTO-1 (Molecular Probes) a una proporción de 1
molécula de tinción por 10 pares de bases. Se añadieron
POP-6 al 1%, una poliacrilamida lineal de
rendimiento optimizado (Perkin-Elmer Biosystems), y
10 mM de ditiotreitol (DTT) al tampón 1/2\times de
Tris-Borato-EDTA para suprimir el
flujo electroosmótico y el fotoblanqueado, respectivamente. Los
campos eléctricos se aplicaron usando electrodos sumergidos en
depósitos de tampón. Las velocidades de migración de las moléculas
se controlaron con el voltaje aplicado a los depósitos, y se
midieron observando la velocidad de moléculas individuales.
Las dos especies se separaron con buena
resolución usando un campo eléctrico de \sim5 V/cm (Figura
26).
\vskip1.000000\baselineskip
Un dispositivo de la presente invención para
concentrar moléculas de ADN se fabrica y se muestra esquemáticamente
en la Figura 28. El dispositivo comprende un reticulado y canales
microfluídicos para la inyección y la extracción de muestras que
son idénticos en dimensiones a los del Ejemplo 1. El campo usado en
este ejemplo es un campo eléctrico, aplicado usando electrodos
sumergidos en los depósitos de los fluidos tampón. El dispositivo se
fabrica de cristal de silicio usando las técnicas descritas en el
Ejemplo 1. Se usó colifago T2 ADN a \sim1 \mug/ml en tampón
1/2\times de Tris-Borato-EDTA que
contenía un 0,1% de POP-6, una poliacrilamida lineal
de rendimiento optimizado (Perkin-Elmer Biosystems)
y 10 mM de ditiotreitol (DTT) como muestra de prueba. El ADN se
cargó en el dispositivo en el depósito de muestras, y se concentró
contra un límite del reticulado hasta \sim120 \mug/ml (Fig.
29). La intensidad del campo eléctrico era de \sim5 V/cm. La
muestra concentrada se extrae del reticulado y se recoge en el
depósito de recogida de muestras (Figura 28).
Aunque la presente invención se describe con
respecto a ejemplos particulares y realizaciones preferidas, se
entiende que la presente invención no está limitada a estos ejemplos
ni a estas realizaciones, sino que está limitada por el alcance de
las reivindicaciones adjuntas.
Claims (27)
1. Un dispositivo microfluídico para separar
partículas según su tamaño que comprende:
- un canal microfluídico y
- un reticulado que comprende una red de intersticios dentro del canal microfluídico, en el que
- el dispositivo emplea un campo que propele las partículas que se separan en el canal microfluídico; y caracterizado porque
- un flujo del campo procedente de los intersticios se divide desigualmente en un componente principal del flujo y un componente secundario del flujo en intersticios subsiguientes en la red, de tal modo que la dirección media del componente secundario del flujo no es paralela a la dirección media del campo, y, cuando
- se introducen partículas en el reticulado, las partículas que tienen un tamaño menor que un tamaño crítico predeterminado son transportadas, por lo general, en la dirección media del campo, y
- las partículas que tienen un tamaño al menos igual que el tamaño crítico son transportadas, por lo general, en la dirección media del componente principal del flujo, separándose con ello las partículas según su tamaño.
\vskip1.000000\baselineskip
2. El dispositivo microfluídico de la
reivindicación 1, en el que el reticulado es un reticulado ordenado
de obstáculos.
3. El dispositivo microfluídico de la
reivindicación 2, en el que el reticulado ordenado de obstáculos es
asimétrico con respecto a la dirección media del campo.
4. El dispositivo microfluídico de cualquiera de
las reivindicaciones 2 y 3, en el que el reticulado ordenado de
obstáculos comprende obstáculos dispuestos en filas, en el que cada
fila subsiguiente de obstáculos está desplazada lateralmente con
respecto a la fila anterior.
5. El dispositivo microfluídico de cualquiera de
las reivindicaciones 2 y 3, en el que el reticulado ordenado de
obstáculos está inclinado un ángulo \theta, desviado con respecto
a la dirección del campo.
6. El dispositivo microfluídico de cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 3, en el que el campo es un flujo fluido,
eléctrico, electroforético, electroosmótico, centrífugo,
gravitatorio, hidrodinámico, un gradiente de presión o una acción
capilar.
7. El dispositivo microfluídico de la
reivindicación 6, en el que el campo es un flujo fluido.
8. El dispositivo microfluídico de la
reivindicación 6, en el que el campo es un campo eléctrico.
9. El dispositivo microfluídico de cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 3, en el que las partículas son bacterias,
células, orgánulos, virus, ácidos nucleicos, proteínas, complejos
proteínicos, polímeros, polvos, látex, emulsiones o coloides.
10. El dispositivo microfluídico de cualquiera
de las reivindicaciones 1 a 3, en el que las partículas son
moléculas de ADN.
11. El dispositivo microfluídico de cualquiera
de las reivindicaciones 1 a 10, que comprende además una primera
salida, configurada para aceptar partículas mayores que el tamaño
crítico predeterminado, y una segunda salida, configurada para
aceptar partículas menores que el tamaño crítico predeterminado.
12. El dispositivo microfluídico de cualquiera
de las reivindicaciones 1 a 11, en el que el dispositivo comprende
reticulados múltiples en serie dentro del canal microfluídico, en el
que cada reticulado tiene un tamaño crítico dife-
rente.
rente.
13. El dispositivo microfluídico de la
reivindicación 12, en el que un último reticulado de la serie
comprende al menos una salida configurada para aceptar partículas
transportadas en la dirección media del componente principal del
flujo de al menos un reticulado en la serie.
14. El dispositivo microfluídico de cualquiera
de las reivindicaciones 1 a 10, que comprende además un límite, de
tal modo que cuando las partículas que tienen un tamaño mayor que el
tamaño crítico predeterminado se introducen en el reticulado, las
partículas que tienen un tamaño mayor que el tamaño crítico
predeterminado son transportadas por lo general hasta el límite,
concentrándose por ello las partículas en el límite.
15. Un procedimiento para separar partículas
según su tamaño, que comprende:
- introducir las partículas que deban separarse en un canal microfluídico que comprende una red de intersticios dentro del canal microfluídico; y
- aplicar un campo a las partículas para propeler a las partículas en el canal microfluídico, caracterizado porque
- un flujo del campo procedente de los intersticios se divide desigualmente en un componente principal del flujo y un componente secundario del flujo en intersticios subsiguientes en la red, de tal modo que la dirección media del componente secundario del flujo no es paralela a la dirección media del campo, y
- las partículas que tienen un tamaño menor que un tamaño crítico predeterminado son transportadas, por lo general, en la dirección media del campo, y
- las partículas que tienen un tamaño al menos igual que el tamaño crítico son transportadas, por lo general, en la dirección media del componente principal del flujo, separándose con ello las partículas según su tamaño.
\vskip1.000000\baselineskip
16. El procedimiento de la reivindicación 15, en
el que la red de intersticios está construida de un reticulado de
obstáculos.
17. El procedimiento de la reivindicación 16, en
el que el reticulado de obstáculos es un reticulado ordenado de
obstáculos.
18. El procedimiento de la reivindicación 17, en
el que el reticulado ordenado de obstáculos es asimétrico con
respecto a la dirección media del campo.
19. El procedimiento de las reivindicaciones 17
y 18, en el que el reticulado ordenado de obstáculos comprende
obstáculos dispuestos en filas, en el que cada fila subsiguiente de
obstáculos está desplazada lateralmente con respecto a la fila
anterior.
20. El procedimiento de las reivindicaciones 17
y 18, en el que el reticulado ordenado de obstáculos está inclinado
un ángulo \theta, desviado con respecto a la dirección del
campo.
21. El procedimiento de una reivindicación
cualquiera de las reivindicaciones 15 a 20, en el que el campo es un
flujo fluido, eléctrico, electroforético, electroosmótico,
centrífugo, gravitatorio, hidrodinámico, un gradiente de presión o
una acción capilar.
22. El procedimiento de la reivindicación 21, en
el que el campo es un flujo fluido.
23. El procedimiento de la reivindicación 21, en
el que el campo es un campo eléctrico.
24. El procedimiento de cualquiera de las
reivindicaciones 15 a 20, en el que las partículas son bacterias,
células, orgánulos, virus, ácidos nucleicos, proteínas, complejos
proteínicos, polímeros, polvos, látex, emulsiones o coloides.
25. El procedimiento de la reivindicación 24, en
el que las partículas son moléculas de ADN.
26. El procedimiento de cualquiera de las
reivindicaciones 15 a 25, que comprende además introducir las
partículas que tienen al menos el tamaño crítico predeterminado en
una primera salida, y las partículas menores que el tamaño crítico
predeterminado en una segunda salida.
27. El procedimiento de cualquiera de las
reivindicaciones 15 a 25, que comprende además transportar las
partículas que tienen un tamaño al menos igual de grande que el
tamaño crítico predeterminado hasta un límite del canal
microfluídico, concentrando con ello las partículas en el
límite.
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