ES2326311T3 - Composiciones y metodos para inmunoterapia especifica con wt1. - Google Patents
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Abstract
Una proteína de fusión que comprende una porción inmunógena de un antígeno de tumor de Wilms (WT1), en la que dicha porción inmunógena de WT1 consiste en la secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en las SEC ID Nº: 2, 144, 241, 414-451, 461, 478 y 502, y un compañero de fusión, caracterizada por que el compañero de fusión consiste en la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº: 506.
Description
Composiciones y métodos para inmunoterapia
específica con WT1.
Esta invención se realizó en parte con ayuda del
Gobierno de los Estados Unidos bajo la subvención NIH SBIR Fase I
número IR43 CA81752-01A1. El Gobierno de los Estados
Unidos puede tener ciertos derechos en esta invención.
La presente invención se refiere, en general, a
la inmunoterapia de enfermedades malignas tales como leucemia y
cánceres. La invención se refiere más específicamente a
composiciones para generar o potenciar una respuesta inmune frente
a WT11, y al uso de dichas composiciones para prevenir y/o tratar
enfermedades malignas.
El cáncer y la leucemia son problemas de salud
significativos en los Estados Unidos y en todo el mundo. Aunque se
han hecho avances en la detección y el tratamiento de dichas
enfermedades, actualmente no está disponible ninguna vacuna u otro
método universalmente eficaz para la prevención o el tratamiento del
cáncer y la leucemia. La gestión de las enfermedades depende
actualmente de una combinación de diagnóstico precoz y tratamiento
agresivo, que puede incluir uno o más de una diversidad de
tratamientos tales como cirugía, radioterapia, quimioterapia y
terapia hormonal. El ciclo de tratamiento para un cáncer particular
se selecciona, frecuentemente, basándose en una diversidad de
parámetros de pronóstico, incluyendo un análisis de marcadores
tumorales específicos. Sin embargo, el uso de marcadores
establecidos conduce con frecuencia a un resultado que es difícil de
interpretar y se continúa observando una alta mortalidad en muchos
pacientes con cáncer.
Las inmunoterapias tienen el potencial de
mejorar sustancialmente el tratamiento de cáncer y leucemia y la
supervivencia. Datos recientes demuestran que la leucemia puede
curarse mediante inmunoterapia en el contexto de un transplante de
médula ósea (por ejemplo, infusiones de linfocitos de donante).
Dichas terapias pueden implicar la generación o potenciación de una
respuesta inmune contra un antígeno asociado a tumor (TAA). Sin
embargo, hasta la fecha se conocen relativamente pocos TAA y, con
raras excepciones, no se ha demostrado que la generación de una
respuesta inmune contra dichos antígenos sea terapéuticamente
beneficiosa.
Por consiguiente, existe la necesidad en la
técnica de métodos mejorados para la prevención y terapia de la
leucemia y el cáncer. La presente invención satisface estas
necesidades y proporciona además otras ventajas relacionadas. En un
primer aspecto de la presente invención, se proporciona una proteína
de fusión que comprende una porción inmunógena de un antígeno del
tumor de Wilms (WT1), en el que dicha porción inmunógena de WT1
consiste en la secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que
consiste en las SEC ID Nº: 2, 144, 241, 414-451,
461, 478 y 502, y un compañero de fusión caracterizado por que el
compañero de fusión consiste en la secuencia de aminoácidos
expuesta en la SEC ID Nº: 506.
También se proporciona un polinucleótido aislado
que codifica las proteínas de fusión de la presente invención.
En un aspecto adicional de la presente
invención, se proporciona además una composición que comprende la
proteína de fusión de la presente invención en combinación con un
vehículo o excipiente farmacéuticamente aceptable.
También se proporciona una vacuna que comprende
el polipéptido de la presente invención en combinación con un
potenciador de la respuesta inmune inespecífica.
En un aspecto adicional, se proporciona un
vector de expresión que comprende el polinucleótido de la presente
invención unido operativamente a una secuencia de expresión
controlada. También se proporciona una célula hospedadora
transformada o transfectada con un vector de expresión de acuerdo
con la presente invención.
En aspectos adicionales, se proporciona una
composición que comprende un primer componente que comprende el
polipéptido de la presente invención y un segundo componente
seleccionado de uno cualquiera o ambos de un vehículo
fisiológicamente aceptable o un inmunoestimulante, para el uso en la
inducción de una respuesta inmune en un paciente.
También se proporciona una composición, que
comprende un primer componente que comprende el polinucleótido que
codifica el polipéptido de la presente invención y un segundo
componente que comprende el polipéptido de la presente invención,
para el uso en la inducción de una respuesta inmune en un
paciente.
También se proporciona el uso del polipéptido y
polinucleótidos de la presente invención para el uso en el
tratamiento de una enfermedad maligna.
Expresado brevemente, esta invención proporciona
composiciones y su uso en métodos para la terapia de enfermedades
tales como leucemia y cáncer. En un aspecto, la presente invención
proporciona polipéptidos de fusión que comprenden una porción
inmunógena de un WT1 nativo, como se expone en la reivindicación 1,
junto con el compañero de fusión expuesto en la SEC ID Nº 506.
Dentro de ciertas realizaciones de la presente
invención, el polipéptido comprende al menos una porción inmunógena
de WT1, en las que la porción inmunógena está contenida en los
aminoácidos 2-281 de WT1. Dentro de ciertas
realizaciones, el polipéptido comprende no más de 16 restos
aminoacídicos consecutivos de un polipéptido WT1 nativo. Dentro de
otras realizaciones, el polipéptido comprende una porción inmunógena
de los restos aminoacídicos 1-174 de un polipéptido
WT1 nativo o una VARIANTEe del mismo, en las que el polipéptido
comprende no más de 16 restos aminoacídicos consecutivos presentes
dentro de los aminoácidos 175 a 449 del polipéptido WT1 nativo. La
porción inmunógena se une preferiblemente a una molécula de MHC
clase I y/o clase II. Dentro de ciertas realizaciones, el
polipéptido comprende una secuencia seleccionada del grupo que
consiste en (a) secuencias enumeradas en una o más de cualquiera de
las Tablas II-XLVI, (b) VARIANTEes de las secuencias
anteriores que difieren en una o más sustituciones, deleciones,
adiciones y/o inserciones, de modo que no se disminuye
sustancialmente la capacidad de la VARIANTEe para reaccionar con
antisueros y/o líneas o clones de células T específicos de antígeno
y (c) miméticos de los polipéptidos enumerados anteriormente, de
modo que no se disminuye sustancialmente la capacidad del mimético
para reaccionar con antisueros y/o líneas o clones de células T
específicos de antígeno.
Dentro de otras realizaciones, el polipéptido
comprende una secuencia seleccionada del grupo que consiste en:
(a) VLDFAPPGA (SEC ID Nº: 241), SEC ID Nº:
414-450, ALLPAVPSL (SEC ID Nº: 451).
Dentro de aspectos adicionales, la presente
descripción proporciona polipéptidos que comprenden una VARIANTEe
de una porción inmunógena de una proteína WT1, en los que la
VARIANTEe difiere de la porción inmunógena debido a sustituciones
entre las posiciones de aminoácidos 1 y 3 dentro de la porción
inmunógena, de modo que no se reduce sustancialmente ni se aumenta
la capacidad de la VARIANTEe para reaccionar con antisueros y/o
líneas o clones de células T específicos de antígeno en relación
con una proteína WT1 nativa.
La presente invención proporciona además
polinucleótidos de WT1 que codifican un polipéptido WT1 de la
invención como se ha descrito anteriormente.
Dentro de otros aspectos, la presente invención
proporciona composiciones farmacéuticas y vacunas. Las composiciones
farmacéuticas pueden comprender un polipéptido como se ha descrito
anteriormente y/o uno o más de (i) un polinucleótido de WT1; (ii)
un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo que se une
específicamente a un polipéptido WT1; (iii) una célula T que
reacciona específicamente con un polipéptido WT1 o (iv) una célula
presentadora de antígeno que expresa un polipéptido WT1, en
combinación con un vehículo o excipiente farmacéuticamente
aceptable. Las vacunas comprenden un polipéptido como se ha descrito
anteriormente y/o uno o más de (i) un polinucleótido de WT1, (ii)
una célula presentadora de antígeno que expresa un polipéptido WT1 o
(iii) un anticuerpo anti-idiotípico y un
potenciador de la respuesta inmune inespecífica. Dentro de ciertas
realizaciones, están presentes menos de 23 restos aminoacídicos
consecutivos, preferiblemente menos de 17 restos aminoacídicos, de
un polipéptido WT1 nativo dentro de un polipéptido WT1 empleado en
dichas composiciones farmacéuticas y vacunas. El potenciador de la
respuesta inmune puede ser un adyuvante. Preferiblemente, un
potenciador de la respuesta inmune potencia una respuesta de
células T.
La presente invención proporciona además el uso
de las vacunas y composiciones farmacéuticas de la presente
invención en métodos para potenciar o inducir una respuesta inmune
en un paciente, que comprenden administrar a un paciente una
composición farmacéutica o vacuna como se ha descrito anteriormente.
En ciertas realizaciones, el paciente es un ser humano. La presente
invención proporciona además el uso de las composiciones
farmacéuticas y vacunas de la invención en métodos para inhibir el
desarrollo de una enfermedad maligna en un paciente, que comprenden
administrar a un paciente una composición farmacéutica o vacuna como
se ha descrito anteriormente. Las enfermedades malignas incluyen,
pero sin limitación, leucemias (por ejemplo, mieloide aguda,
linfocítica aguda y mieloide crónica) y cánceres (por ejemplo,
cáncer de mama, pulmón, tiroides o gastrointestinal o un melanoma).
El paciente puede estar, pero no necesariamente, aquejado de la
enfermedad maligna y la administración de la composición
farmacéutica o vacuna puede inhibir la aparición de dicha enfermedad
o puede inhibir el avance y/o la metástasis de una enfermedad
existente.
La presente descripción proporciona además,
dentro de otros aspectos, métodos para eliminar células que expresan
WT1 de la médula ósea y/o la sangre periférica o fracciones de la
misma, que comprenden poner en contacto la médula ósea, sangre
periférica o una fracción de la médula ósea o sangre periférica con
células T que reaccionan específicamente con un polipéptido WT1, en
los que la etapa de contacto se realiza en condiciones y durante un
tiempo suficiente para permitir la eliminación de las células
positivas para WT1 hasta menos del 10%, preferiblemente menos del
5% y, más preferiblemente, menos del 1% del número de células
mieloides o linfáticas en la médula ósea, sangre periférica o una
fracción. Pueden obtenerse médula ósea, sangre periférica y
fracciones de un paciente aquejado de una enfermedad asociada con
la expresión de WT1, o pueden obtenerse de un mamífero humano o no
humano no aquejado de dicha enfermedad.
\newpage
Dentro de aspectos relacionados, la presente
descripción proporciona métodos para inhibir el desarrollo de una
enfermedad maligna en un paciente, que comprenden administrar a un
paciente médula ósea, sangre periférica o una fracción de médula
ósea o sangre periférica preparada como se ha descrito
anteriormente. Dicha médula ósea, sangre periférica o fracciones
pueden ser autólogas o pueden obtenerse de un ser humano o animal no
humano relacionado o no relacionado (por ejemplo, singénico o
alogénico).
En otros aspectos, la presente descripción
proporciona métodos para estimular (o sensibilizar) y/o expandir
células T, que comprenden poner en contacto células T con un
polipéptido WT1 en condiciones y durante un tiempo suficiente para
permitir la estimulación y/o expansión de células T. Dichas células
T pueden ser células T específicas de WT1 autólogas, alogénicas,
singénicas o no relacionadas y pueden estimularse in vitro o
in vivo. Dentro de ciertas realizaciones, las células T
expandidas pueden encontrarse dentro de la médula ósea, la sangre
periférica o una fracción de médula ósea o sangre periférica, y
pueden ser (pero no necesariamente) clonales. Dentro de ciertas
realizaciones, las células T pueden estar presentes en un mamífero
durante la estimulación y/o expansión. Se pueden usar células T
específicas de WT1, por ejemplo, dentro de infusiones de linfocitos
de donante.
Se describen métodos para inhibir el desarrollo
de una enfermedad maligna en un paciente, que comprenden administrar
a un paciente células T preparadas como se ha descrito
anteriormente. Dentro de ciertas realizaciones, dichas células T
pueden ser autólogas, singénicas o alogénicas.
La presente descripción proporciona además,
dentro de otros aspectos, métodos para controlar la eficacia de una
inmunización o terapia para una enfermedad maligna asociada con la
expresión de WT1 en un paciente. Dichos métodos se basan en
controlar respuestas de anticuerpos, células T CD4+ y/o células T
CD8+ en el paciente. Dentro de ciertos de dichos aspectos, un
método puede comprender las etapas de: (a) incubar una primera
muestra biológica con uno o más de: (i) un polipéptido WT1; (ii) un
polinucleótido que codifica un polipéptido WT1; o (iii) una célula
presentadora de antígeno que expresa un polipéptido WT1, en el que
la primera muestra biológica se obtiene de un paciente antes de una
terapia o inmunización, y en el que la incubación se realiza en
condiciones y durante un tiempo suficiente para permitir que se
formen inmunocomplejos; (b) detectar los inmunocomplejos formados
entre el polipéptido WT1 y anticuerpos en la muestra biológica que
se unen específicamente al polipéptido WT1; (c) repetir las etapas
(a) y (b) usando una segunda muestra biológica obtenida del mismo
paciente después de una terapia o inmunización; y (d) comparar el
número de inmunocomplejos detectados en la primera y segunda
muestras biológicas y, de ahí, controlar la eficacia de la terapia o
inmunización en el paciente.
Dentro de ciertas realizaciones de los métodos
anteriores, la etapa de detección comprende (a) incubar los
inmunocomplejos con un reactivo de detección que es capaz de unirse
a los inmunocomplejos, en la que el reactivo de detección comprende
un grupo indicador, (b) eliminar el reactivo de detección no unido y
(c) detectar la presencia o ausencia del grupo indicador. El
reactivo de detección puede comprender, por ejemplo, un segundo
anticuerpo, o un fragmento de unión a antígeno del mismo, capaz de
unirse a los anticuerpos que se unen específicamente al polipéptido
WT1 o a una molécula tal como la Proteína A. Dentro de otras
realizaciones, se une un grupo indicador al polipéptido WT1, y la
etapa de detección comprende eliminar el polipéptido WT1 no unido y,
posteriormente, detectar la presencia o ausencia del grupo
indicador.
Los métodos descritos para controlar la eficacia
de una inmunización o terapia para una enfermedad maligna asociada
con la expresión de WT1 en un paciente puede comprender las etapas
de: (a) incubar una primera muestra biológica con uno o más de: (i)
un polipéptido WT1; (ii) un polinucleótido que codifica un
polipéptido WT1; o (iii) una célula presentadora de antígeno que
expresa un polipéptido WT1, en las que la muestra biológica
comprende células T CD4+ y/o células T CD8+ y se obtiene de un
paciente antes de una terapia o inmunización, y en las que la
incubación se realiza en condiciones y durante un tiempo suficiente
para permitir la activación, proliferación y/o lisis específica de
células T; (b) detectar una cantidad de activación, proliferación
y/o lisis de las células T; (c) repetir las etapas (a) y (b) usando
una segunda muestra biológica que comprende células T CD4+ y/o
CD8+, en las que la segunda muestra biológica se obtiene del mismo
paciente después de una terapia o inmunización; y (d) comparar la
cantidad de activación, proliferación y/o lisis de células T en la
primera y segunda muestras biológicas y, de ahí, controlar la
eficacia de la terapia o inmunización en el paciente.
La presente invención proporciona además métodos
para inhibir el desarrollo de una enfermedad maligna asociada con
la expresión de WT1 en un paciente, que comprenden las etapas de:
(a) incubar células T CD4+ y/o CD8+ aisladas de un paciente con uno
o más de: (i) un polipéptido WT1; (ii) un polinucleótido que
codifica un polipéptido WT1; o (iii) una célula presentadora de
antígeno que expresa un polipéptido WT1, para que proliferen las
células T; y (b) administrar al paciente una cantidad eficaz de las
células T que han proliferado y, de ahí, inhibir el desarrollo de
una enfermedad maligna en el paciente. Dentro de ciertas
realizaciones, la etapa de incubar las células T puede repetirse
una o más veces.
Dentro de otros aspectos, la presente invención
proporciona métodos para inhibir el desarrollo de una enfermedad
maligna asociada con la expresión de WT1 en un paciente, que
comprenden las etapas de: (a) incubar células T CD4+ y/o CD8+
aisladas de un paciente con uno o más de: (i) un polipéptido WT1;
(ii) un polinucleótido que codifica un polipéptido WT1; o (iii) una
célula presentadora de antígeno que expresa un polipéptido WT1, para
que proliferen las células T; (b) clonar una o más células que
hayan proliferado; y (c) administrar al paciente una cantidad
eficaz de las células T clonadas.
Dentro de otros aspectos, se proporcionan
métodos para determinar la presencia o ausencia de una enfermedad
maligna asociada con la expresión de WT1 en un paciente, que
comprenden las etapas de (a) incubar células T CD4+ y/o CD8+
aisladas de un paciente con uno o más de: (i) un polipéptido WT1;
(ii) un polinucleótido que codifica un polipéptido WT1; o (iii) una
célula presentadora de antígeno que expresa un polipéptido WT1; y
(b) detectar la presencia o ausencia de activación específica de las
células T, determinando a partir de ahí la presencia o ausencia de
una enfermedad maligna asociada con la expresión de WT1. Dentro de
ciertas realizaciones, la etapa de detección comprende detectar la
presencia o ausencia de proliferación de las células T.
Dentro de aspectos adicionales, la presente
descripción proporciona métodos para determinar la presencia o
ausencia de una enfermedad maligna asociada con la expresión de WT1
en un paciente, que comprenden las etapas de: (a) incubar una
muestra biológica obtenida de un paciente con uno o más de: (i) un
polipéptido WT1; (ii) un polinucleótido que codifica un polipéptido
WT1; o (iii) una célula presentadora de antígeno que expresa un
polipéptido WT1, en las que la incubación se realiza en condiciones
y durante un tiempo suficiente para permitir que se formen
inmunocomplejos; y (b) detectar los inmunocomplejos formados entre
el polipéptido WT1 y anticuerpos en la muestra biológica que se
unen específicamente al polipéptido WT1; y de ahí determinar la
presencia o ausencia de una enfermedad maligna asociada con la
expresión de WT1.
Estos y otros aspectos de la presente invención
serán evidentes después tras la consulta de la siguiente descripción
detallada y dibujos adjuntos.
La Figura 1 representa una comparación de las
secuencias de la proteína WT1 de ratón (MO) y humana (HU) (SEC ID
Nº: 320 y 319, respectivamente).
La Figura 2 es una transferencia de Western que
ilustra la detección de anticuerpos específicos de WT1 en pacientes
con una neoplasia hematológica (AML). El carril 1 muestra marcadores
de peso molecular; el carril 2 muestra un control positivo (línea
celular de leucemia humana positiva para WT1 inmunoprecipitada con
un anticuerpo específico de WT1); el carril 3 muestra un control
negativo (línea celular positiva para WT1 inmunoprecipitada con
sueros de ratón); y el carril 4 muestra una línea celular positiva
para WT1 inmunoprecipitada con sueros de un paciente con AML. Para
los carriles 2-4, se separó el inmunoprecipitado
mediante electroforesis en gel y se sondó con un anticuerpo
específico de WT1.
La Figura 3 es una transferencia de Western que
ilustra la detección de una respuesta de anticuerpos específica de
WT1 en ratones B6 inmunizados con TRAMP-C, una línea
celular tumoral positiva para WT1. Los carriles 1, 3 y 5 muestran
marcadores de peso molecular, y los carriles 2, 4 y 6 muestran un
control positivo específico de WT1 (N180, Santa Cruz Biotechnology,
un polipéptido que abarca 180 aminoácidos de la región
N-terminal de la proteína WT1, que migra en la
transferencia de Western a 52 kD). El anticuerpo primario usado era
WT180 en el carril 2, sueros de ratones B6 no inmunizados en el
carril 4 y sueros de los ratones B6 inmunizados en el carril 6.
La Figura 4 es una transferencia de Western que
ilustra la detección de anticuerpos específicos de WT1 en ratones
inmunizados con péptidos WT1 representativos. Los carriles 1, 3 y 5
muestran marcadores de peso molecular y los carriles 2, 4 y 6
muestran un control positivo específico de WT1 (N180, Santa Cruz
Biotechnology, un polipéptido que abarca 180 aminoácidos de la
región N-terminal de la proteína WT1, que migra en
la transferencia de Western a 52 kD). El anticuerpo primario usado
era WT180 en el carril 2, sueros de ratones B6 no inmunizados en el
carril 4 y sueros de los ratones B6 inmunizados en el carril 6.
Las Figuras 5A a 5C son gráficas que ilustran la
estimulación de respuestas de células T proliferativas en ratones
inmunizados con péptidos WT1 representativos. Se realizaron ensayos
de incorporación de timidina usando una línea de células T y dos
clones diferentes, como se indica, y los resultados se expresaron
como cpm. Los controles indicados en el eje x eran sin antígeno
(Sin Ag) y B6/medios; los antígenos usados eran el humano
p6-22 (p1), p117-139 (p2) o el
humano p244-262 (p3).
Las Figuras 6A y 6B son histogramas que ilustran
la estimulación de respuestas de células T proliferativas en
ratones inmunizados con péptidos WT1 representativos. Tres semanas
después de la tercera inmunización, células de bazo de ratones a
los que se les había inoculado Vacuna A o Vacuna B se cultivaron
sólo con medio (medio) o células de bazo y medio (B6/sin antígeno),
células de bazo de B6 estimuladas con los péptidos
p6-22 (p6), p117-139 (p117),
p244-262 (p244) (Vacuna A; Figura 6A) o
p287-301 (p287), p299-313 (p299),
p421-435 (p421) (Vacuna B; Figura 6B) y células de
bazo estimuladas con un péptido de control irrelevante (péptido
irrelevante) a 25 \mug/ml y se ensayaron después de 96 horas para
determinar la proliferación por incorporación de (^{3}H)
timidina. Las barras representan el índice de estimulación (SI), que
se calcula como la media de los pocillos experimentales divida por
la media del control (células de bazo de B6 sin antígeno).
Las Figuras 7A-7D son
histogramas que ilustran la generación de líneas de células T
proliferativas y clones específicos para p117-139 y
p6-22. Después de la inmunización in vivo,
las tres estimulaciones in vitro (IVS) iniciales se llevaron
a cabo usando los tres péptidos de la Vacuna A o B, respectivamente.
Se llevaron a cabo IVS posteriores como estimulaciones de un solo
péptido usando solamente los dos péptidos relevantes
p117-139 y p6-22. Se obtuvieron
clones de las líneas de células T específicas tanto de
p6-22 como de p117-139, como se
indica. Las células T se cultivaron sólo con medio (medio) o células
de bazo y medio (B6/sin antígeno), células de bazo de B6
estimuladas con los péptidos p6-22 (p6),
p117-139 (p117) o un péptido de control irrelevante
(péptido irrelevante) a 25 \mug/ml y se ensayaron después de 96
horas para determinar la proliferación por incorporación de
(^{3}H) timidina. Las barras representan el índice de estimulación
(SI), que se calcula como la media de los pocillos experimentales
divida por la media del control (células de bazo de B6 sin
antígeno).
Las Figuras 8A y 8B presentan los resultados del
Análisis TSITES de WT1 humana (SEC ID Nº: 319) para péptidos que
tienen el potencial de generar respuestas Th. Las regiones indicadas
por "A" son puntos medios de bloques AMPHI, "R" indica
restos que coinciden con el motivo de Rothbard/Taylor. "D"
indica restos que coinciden con el motivo IAd y "d" indica
restos que coinciden con el motivo IEd.
Las Figuras 9A y 9B son gráficas que ilustran la
generación de CTL específicos de péptido WT1 en ratones inmunizados
con péptidos WT1. La Figura 9A ilustra la lisis de células diana por
líneas celulares alogénicas y la Figura 9B muestra la lisis de
líneas celulares recubiertas de péptido. En cada caso, el % de lisis
(como se determina por ensayos de liberación de cromo
convencionales) se muestra a tres proporciones de efector:diana
(E:T) indicadas. Se proporcionan resultados para células de linfoma
(LSTRA y E10), así como para E10 + p253-243 (E10 +
P235). Las células E10 también se denominan en este documento
células EL-4.
Las Figuras 10A-10D son gráficas
que ilustran la generación de CTL específicos de WT1, que destruyen
líneas celulares tumorales positivas para WT1 pero no destruyen
líneas celulares negativas para WT1, después de la vacunación de
ratones B6 con el péptido WT1 P117. La Figura 10A ilustra que las
células T de ratones B6 no inmunizados no destruyen líneas
celulares tumorales positivas para WT1. La Figura 10B ilustra la
lisis de las células diana por líneas celulares alogénicas. Las
Figuras 10C y 10D demuestran la lisis de líneas celulares tumorales
positivas para WT1, en comparación con líneas celulares negativas
para WT1 en dos experimentos diferentes. Además, las Figuras 10C y
10D muestran la lisis de líneas celulares recubiertas de péptido
(línea celular negativa para WT1 E10 recubierta con el péptido WT1
relevante P117). En cada caso, el % de lisis (como se determina por
ensayos de liberación de cromo convencionales) se muestra a tres
proporciones de efector:diana indicadas. Se proporcionan resultados
para células de linfoma (E10), células de cáncer de próstata
(TRAMP-C), una línea celular de fibroblastos
transformada (BLK-SV40), así como E10 + p117.
Las Figuras 11A y 11B son histogramas que
ilustran la capacidad de CTL específicos del péptido representativo
P117-139 para lisar células tumorales positivas para
WT1. Tres semanas después de la tercera inmunización, se
estimularon in vitro células de bazo de ratones a los que se
les habían inoculado los péptidos p235-243 o
p117-139 con el péptido relevante y se ensayaron
para determinar su capacidad para lisar dianas incubadas con
péptidos WT1, así como con células tumorales positivas y negativas
para WT1. Las barras representan el % medio de lisis específica en
ensayos de liberación de cromo realizados por triplicado con una
proporción de E:T de 25:1. La Figura 11A muestra la actividad
citotóxica de la línea de células T específica de
p235-243 contra la línea celular negativa para WT1
EL-4 (EL-4, negativa para WT1);
EL-4 estimuladas con el péptido relevante
p235-243 (usado para la inmunización, así como para
la reestimulación) (EL-4 + p235);
EL-4 estimuladas con los péptidos irrelevantes
p117-139 (EL-4 + p117),
p126-134 (EL-4 + p126) o
p130-138 (EL-4 + p130) y las
células tumorales positivas para WT1 BLK-SV40
(BLK-SV40, positiva para WT1) y
TRAMP-C (TRAMP-C, positiva para
WT1), como se indica. La Figura 11 B muestra la actividad citotóxica
de la línea de células T específica de p117-139
contra EL-4; EL-4 estimuladas con el
péptido relevante p117-139 (EL-4 +
p117) y EL-4 estimuladas con los péptidos
relevantes p123-131 (EL-4 + p123) o
p128-136 (EL-4 + p128);
BLK-SV40 y TRAMP-C, como se
indica.
Las Figuras 12A y 12B son histogramas que
ilustran la especificidad de lisis de células tumorales positivas
para WT1, como se demuestra por inhibición de diana fría. Las barras
representan el % medio de lisis específica en ensayos de liberación
de cromo realizados por triplicado con una proporción de E:T de
25:1. La Figura 12A muestra la actividad citotóxica de la línea de
células T específica de p117-139 contra la línea
celular negativa para WT1 EL-4
(EL-4, negativa para WT1); la línea celular tumoral
positiva para WT1 TRAMP-C (TRAMP-C,
positiva para WT1); células TRAMP-C incubadas con
un exceso de diez veces (en comparación con la diana caliente) de
células EL-4 estimuladas con el péptido relevante
p117-139 (TRAMP-C + diana fría p117)
sin marcaje con ^{51}Cr y células TRAMP-C
incubadas con EL-4 estimuladas con un péptido
relevante sin marcaje con ^{51}Cr (TRAMP-C+ diana
fría irrelevante), como se indica. La Figura 12B muestra la
actividad citotóxica de la línea de células T específica de
p117-139 contra la línea celular negativa para WT1
EL-4 (EL-4, negativa para WT1); la
línea celular tumoral positiva para WT1 BLK-SV40
(BLK-SV40, positiva para WT1); células
BLK-SV40 incubadas con la diana fría relevante
(BLK-SV40 + diana fría p117) y células
BLK-SV40 incubadas con la diana fría relevante
(BLK-SV40 + diana fría irrelevante), como se
indica.
Las Figuras 13A-13C son
histogramas que representan una evaluación del epítopo de CTL
nonamérico dentro de p117-139. La línea de CTL
específica de tumor p117-139 se ensayó contra
péptidos dentro de los aminoácidos 117-139 que
contenían o carecían de un motivo de unión a clase I
H-2^{b} apropiado y después de la reestimulación
con p126-134 o p130-138. Las barras
representan el % medio de lisis específica en ensayos de liberación
de cromo realizados por triplicado con una proporción de E:T de
25:1. La Figura 13A muestra la actividad citotóxica de la línea de
células T específica de p117-139 contra la línea
celular negativa para WT1 EL-4
(EL-4, negativa para WT1) y células
EL-4 estimuladas con los péptidos
p117-139 (EL-4 + p117),
p119-127 (EL-4 + P119),
p120-128 (EL-4 + p120),
p123-131 (EL-4 + p123),
p126-134 (EL-4 + p126),
p128-136 (EL-4 + p128) y
p130-138 (EL-4 + p130). La Figura
13B muestra la actividad citotóxica de la línea de CTL después de la
reestimulación con p126-134 contra la línea celular
negativa para WT1 EL-4, células EL-4
estimuladas con p117-139 (EL-4 +
p117), p126-134 (EL-4 + p126) y la
línea celular tumoral positiva para WT1 TRAMP-C. La
Figura 13C muestra la actividad citotóxica de la línea de CTL
después de la reestimulación con p130-138 contra
EL-4, células EL-4 estimuladas con
p117-139 (EL-4 + p117),
p130-138 (EL-4 + p130) y la línea
celular tumoral positiva para WT1 TRAMP-C.
La Figura 14 representa la reactividad de
anticuerpos séricos contra WT1 en 63 pacientes con AML. La
reactividad de anticuerpos séricos contra proteína WT1/extremo
N-terminal se evaluó mediante ELISA en pacientes con
AML. El primer y segundo carriles representan los controles
positivo y negativo, respectivamente. Se usó el anticuerpo
específico de WT1 WT180 obtenido en el mercado para el control
positivo. Los siguientes 63 carriles representan resultados usando
sueros de cada paciente individual. Los valores de DO representados
eran de ELISA usando una dilución de suero 1:500. La figura incluye
datos acumulativos de 3 experimentos distintos.
La Figura 15 representa reactividad de
anticuerpos séricos contra proteínas WT1 y proteínas de control en
2 pacientes con AML. La reactividad de anticuerpos séricos contra
WT1/longitud completa, extremo N-terminal de WT1 y
proteínas TRX y Ra12 se evaluó mediante ELISA en 2 pacientes con
AML. Los valores de DO representados eran de ELISA usando una
dilución de suero 1:500. AML-1 y
AML-2 indican suero de 2 de los pacientes
individuales de la Figura 1, con reactividad de anticuerpos
demostrada contra WT1/longitud completa. La proteína WT1 de
longitud completa se expresaba como una proteína de fusión con Ra12.
La proteína WT1/extremo N-terminal se expresaba
como una proteína de fusión con TRX. Las proteínas de control Ra12 y
TRX se purificaron de una forma similar. Los resultados confirman
que la reactividad de anticuerpos séricos contra las proteínas de
fusión de WT1 se dirige contra las porciones WT1 de la
proteína.
La Figura 16 representa la reactividad de
anticuerpos séricos contra WT1 en 81 pacientes con CML. La
reactividad de anticuerpos séricos contra la proteína WT1/longitud
completa se evaluó mediante ELISA en pacientes con AML. El primer y
segundo carriles representan los controles positivo y negativo,
respectivamente. El anticuerpo específico de WT1 WT180 obtenido en
el mercado se usó para el control positivo. Los siguientes 81
carriles representan resultados usando sueros de cada paciente
individual. Los valores de DO representados eran de ELISA usando
una dilución de suero 1:500. La figura incluye datos acumulativos de
3 experimentos distintos.
La Figura 17 representa la reactividad de
anticuerpos séricos contra proteínas WT1 y proteínas de control en
2 pacientes con CML. La reactividad de anticuerpos séricos contra
WT1/longitud completa, WT1/extremo N-terminal y
proteínas TRX y Ra12 se evaluó mediante ELISA en 2 pacientes con
CML. Los valores de DO representados eran de ELISA usando una
dilución de suero 1:500. CML-1 y
CML-2 indican suero de 2 de los pacientes
individuales de la Figura 3 con reactividad de anticuerpos
demostrada contra WT1/longitud completa. La proteína WT1/longitud
completa se expresaba como una proteína de fusión con Ra12. La
proteína WT1/extremo N-terminal se expresaba como
una proteína de fusión con TRX. Las proteínas de control Ra12 y TRX
se purificaron de una forma similar. Los resultados confirman que
la reactividad de anticuerpos séricos contra las proteínas de fusión
WT1 se dirige contra las porciones WT1 de la proteína.
La Figura 18 proporciona las características de
las proteínas WT1 recombinantes usadas para análisis
serológicos.
La Figura 19A-19E es una gráfica
de barras que representa las respuestas de anticuerpos en ratones
generadas por la vacunación con dosis diferentes de proteína
WT1.
La Figura 20 es una gráfica de barras de las
respuestas de células T proliferativas en ratones inmunizados con
proteína WT1.
La Figura 21 es una fotografía de DC humanas,
examinadas por microscopía fluorescente, que expresan WT1 después
de la infección con adeno WT1 y Vaccinia WT1.
La Figura 22 es una fotografía que demuestra que
la expresión de WT1 en DC humanas es reproducible después de la
infección con adeno WT1 y que no se induce por una infección con
Adenovirus de control.
La Figura 23 es una gráfica de un ensayo ELISPOT
de IFN-gamma que muestra que la sensibilización
in vitro con el gen completo de WT1 genera respuestas de
células T específicas de WT1.
La Figura 24 muestra los aminoácidos
2-281 (SEC ID Nº: 461) de la proteína WT1 y el ADNc
que codifica estos restos aminoacídicos (SEC ID Nº: 460). Esta
proteína WT1 truncada se denomina WT1-F.
Como se ha señalado anteriormente, la presente
invención se refiere generalmente a composiciones y métodos para la
inmunoterapia y el diagnóstico de enfermedades malignas. Las
composiciones descritas en este documento pueden incluir
polipéptidos WT1, polinucleótidos de WT1, células presentadoras de
antígeno (APC, por ejemplo, células dendríticas) que expresan un
polipéptido WT1, agentes tales como anticuerpos que se unen a un
polipéptido WT1 y/o células del sistema inmune (por ejemplo,
células T) específicas para WT1. Los polipéptidos WT1 de la
presente invención comprenden generalmente al menos una porción de
un producto génico de tumor de Wilms (WT1) o una VARIANTEe del
mismo. Las secuencias de ácido nucleico de la presente invención
comprenden generalmente una secuencia de ADN o ARN que codifica
toda o una porción de dicho polipéptido o que es complementaria a
dicha secuencia. Generalmente los anticuerpos son proteínas del
sistema inmune, o fragmentos de unión a antígeno de las mismas, que
son capaces de unirse a una porción de un polipéptido WT1. Las
células T que pueden emplearse dentro de dichas composiciones son
generalmente células T (por ejemplo, CD4^{+} y/o CD8^{+}) que
son específicas para un polipéptido WT1. Ciertos métodos descritos
en este documento emplean además células presentadoras de antígeno
que expresan un polipéptido WT1 como se proporciona en este
documento.
La presente invención se basa en el
descubrimiento de que una respuesta inmune generada contra un
producto génico de tumor de Wilms (WT) (por ejemplo, WT1) puede
proporcionar un beneficio profiláctico y/o terapéutico para
pacientes aquejados de enfermedades malignas caracterizadas por una
expresión génica de WT1 aumentada. Dichas enfermedades incluyen,
pero sin limitación, leucemias, (por ejemplo, leucemia mieloide
aguda (AML), leucemia mieloide crónica (CML), leucemia linfocítica
aguda (ALL) y ALL infantil), así como muchos cánceres tales como
cánceres de pulmón, mama, tiroides y gastrointestinales y melanomas.
El gen de WT1 se identificó originariamente y se aisló en base a
una deleción citogenética en el cromosoma 11p13 en pacientes con
tumor de Wilms (véase Call et al., Patente de Estados Unidos
Nº 5.350.840). El gen consiste en 10 exones y codifica un factor de
transcripción con dedos de cinc y se proporcionan secuencias de
proteínas WT1 de ratón y humana en la Figura 1 y en las SEC ID Nº:
319 y 320.
Dentro del contexto de la presente invención, un
polipéptido WT1 es un polipéptido que comprende al menos una
porción inmunógena de una WT1 nativa (es decir, una proteína WT1
expresada por un organismo que no está modificado genéticamente), o
una VARIANTEe de la misma, como se describe en este documento. Un
polipéptido WT1 puede ser de cualquier longitud, con tal de que
comprenda al menos una porción inmunógena de una proteína nativa o
una VARIANTEe de la misma. En otras palabras, un polipéptido WT1
puede ser un oligopéptido (es decir, que consiste en un número de
restos aminoacídicos relativamente pequeño, tal como
8-10 restos, unidos por enlaces peptídicos), una
proteína WT1 de longitud completa (por ejemplo, presente en el
interior de una animal humano o no humano, tal como ratón) o un
polipéptido de tamaño intermedio. Dentro de ciertas realizaciones,
se prefiere el uso de polipéptidos WT1 que contienen un número
pequeño de restos aminoacídicos consecutivos de un polipéptido WT1
nativo. Dichos polipéptidos se prefieren para ciertos usos en los
que se desea la generación de una respuesta de células T. Por
ejemplo, dicho polipéptido WT1 puede contener menos de 23,
preferiblemente no más de 18 y, más preferiblemente, no más de 15
restos aminoacídicos consecutivos de un polipéptido WT1 nativo. Los
polipéptidos que comprenden nueve restos aminoacídicos consecutivos
de un polipéptido WT1 nativo son generalmente adecuados para dichos
fines. Pueden estar presentes secuencias adicionales obtenidas de la
proteína nativa y/o secuencias heterólogas dentro de cualquier
polipéptido WT1, y dichas secuencias pueden (pero no
necesariamente) poseer propiedades inmunógenas o antigénicas
adicionales. Los polipéptidos, como se proporcionan en este
documento, pueden asociarse adicionalmente (covalentemente o no
covalentemente) con otros compuestos polipeptídicos o no
polipeptídicos.
Una "porción inmunógena", como usa en este
documento, es una porción de un polipéptido que es reconocida (es
decir, que se une específicamente) por un receptor de antígeno de
superficie de célula B y/o célula T. Ciertas porciones inmunógenas
preferidas se unen a una molécula de MHC clase I o clase II. Como se
usa en este documento, se dice que una porción inmunógena "se
une" a una molécula de MHC clase I o clase II si dicha unión es
detectable usando cualquier ensayo conocido en la técnica. Por
ejemplo, la capacidad de un polipéptido para unirse a MHC clase I
puede evaluarse indirectamente por control de la capacidad para
promover la incorporación de \beta2-microglobulina
marcada con ^{125}I (\beta2m) en complejos heterotriméricos MHC
clase I/\beta2m/péptido (véase Parker et al., J. Immunol.
152: 163, 1994). Como alternativa, pueden emplearse ensayos de
competición peptídica funcionales que son conocidos en la técnica.
Ciertas porciones inmunógenas tienen una o más de las secuencias
enumeradas dentro de una o más de las Tablas
II-XIV. Las porciones inmunógenas representativas
incluyen, pero sin limitación, RDLNALLPAVPSLGGGG (restos
6-22 de WT1 humana; SEC ID Nº: 1),
PSQASSGQARMFPNAPYLPSCLE (restos 117-139 de WT1
humana y de ratón; SEC ID Nº: 2 y 3, respectivamente)
GATLKGVAAGSSSSVKWTE (restos 244-262 de WT1 humana;
SEC ID Nº: 4), GATLKGVAA (restos 244-252 de WT1
humana; SEC ID Nº: 88), CMTWNQMNL (restos 235-243 de
WT1 humana y de ratón; SEC ID Nº: 49 y 258, respectivamente),
SCLESQPTI (restos 136-144 de WT1 de ratón; SEC ID
Nº: 296), SCLESOPAI (restos 136-144 de WT1 humana;
SEC ID Nº: 198), NLYQMTSQL (restos 225-233 de WT1
humana y de ratón; SEC ID Nº: 147 y 248 respectivamente); ALLPAVSSL
(restos 10-18 de WT1 de ratón; SEC ID Nº: 255);
RMFPNAPYL (restos 126-134 de WT1 humana y de ratón;
SEC ID Nº: 185 y 293 respectivamente), VLDFAPPGA (restos
37-45 de WT1 humana; SEC ID Nº: 241) o VLDFAPPGAS
(restos 37-46 de WT1 humana; SEC ID Nº: 411). Se
proporcionan porciones inmunógenas adicionales en las SEC ID Nº:
414-451. Se proporcionan en este documento porciones
inmunógenas adicionales y otras pueden identificarse en general
usando técnicas bien conocidas, tales como las que se resumen en
Paul, Fundamental Immunology, 3ª ed., 243-247 (Raven
Press, 1993) y referencias citadas en el mismo. Las técnicas
representativas para identificar porciones inmunógenas incluyen
explorar polipéptidos para determinar su capacidad para reaccionar
con antisueros y/o líneas o clones de células T específicos de
antígeno. Una porción inmunógena de un polipéptido WT1 nativo es
una porción que reacciona con dichos antisueros y/o células T a un
nivel que no es sustancialmente menor que la reactividad del WT1 de
longitud completa (por ejemplo, en un ensayo de ELISA y/o de
reactividad de células T). En otras palabras, una porción inmunógena
puede reaccionar dentro dichos ensayos a un nivel que es similar a
o superior a la reactividad del polipéptido de longitud completa.
Dichas exploraciones pueden realizarse generalmente usando métodos
bien conocidos por los especialistas en la técnica, tales como los
descritos en Harlow y Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold
Spring Harbor Laboratory, 1988.
Como alternativa, pueden identificarse porciones
inmunógenas usando análisis informático, tal como el programa
Tsites (véase Rothbard y Taylor, EMBO J. 7: 93-100,
1988; Deavin et al., Mol. Immunol. 33:
145-155, 1996), que busca motivos peptídicos que
tengan el potencial de generar respuestas Th. Pueden identificarse
péptidos CTL con motivos apropiados para la unión a MHC clase I o
clase II murino y humano de acuerdo con BIMAS (Parker et
al., J. Immunol. 152: 163, 1994) y otros análisis de predicción
de la unión peptídica a HLA. Como alternativa, pueden identificarse
porciones inmunógenas que se unen a una molécula de MHC particular
mediante el uso de motivos de unión peptídicos definidos tales como
los descritos en Rammensee et al., Immunogenetics 41:
178-228, 1995. Para confirmar la unión peptídica a
moléculas de MHC clase I o clase II murinas y humanas, pueden usarse
ensayos de unión peptídica conocidos en la técnica. Para confirmar
la inmunogenicidad, puede ensayarse un péptido usando un HLA A2 u
otro modelo de ratón transgénico y/o un ensayo de estimulación in
vitro usando células dendríticas, fibroblastos o células
sanguíneas periféricas.
Como se ha indicado anteriormente, una
composición puede comprender una VARIANTEe de una proteína WT1
nativa. Una "VARIANTEe" polipeptídica, como se usa en este
documento, es un polipéptido que difiere de un polipéptido nativo
en una o más sustituciones, deleciones, adiciones y/o inserciones,
de modo que se conserva la inmunogenicidad del polipéptido (es
decir, la capacidad de la VARIANTEe para reaccionar con antisueros
y/o líneas o clones de células T específicos de antígeno no
disminuye sustancialmente respecto al polipéptido nativo). En otras
palabras, la capacidad de una VARIANTEe para reaccionar con
antisueros y/o líneas o clones de células T específicos de antígeno
puede aumentarse o no variarse respecto al polipéptido nativo, o
puede disminuirse en menos de 50% y, preferiblemente, menos de 20%
respecto al polipéptido nativo. En una realización, la capacidad de
una VARIANTEe para reaccionar con antisueros y/o líneas o clones de
células T específicos de antígeno puede disminuirse en menos de
10%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1% o 0,5% respecto al polipéptido nativo.
Dichas VARIANTEes pueden identificarse generalmente por
modificación de una de las secuencias polipeptídicas anteriores y
evaluación de la reactividad del polipéptido modificado con
antisueros y/o células T como se describen en este documento. En una
realización de la presente invención, una VARIANTEe puede
identificarse por evaluación de su capacidad para unirse a una
molécula HLA humana o murina. En una realización preferida, un
polipéptido VARIANTEe tiene una modificación tal que la capacidad
del polipéptido VARIANTEe para unirse a una molécula de MHC clase I
o clase II, por ejemplo, HLA-A2,
HLA-A24, HLA-A1,
HLA-A3, HLA-A68,
HLA-A11, HLA-A31,
HLA-A33, HLA-B14,
HLA-B40, HLA-B60,
HLA-B62, HLA-B7,
HLA-B8, HLA-B27,
HLA-B3501, HLA-B37,
HLA-B38, HLA-B39,
HLA-B44, HLA-B51,
HLA-B52, HLA-B58,
HLA-CW03, HLA-CW04,
HLA-CW06 o HLA-CW07, se aumenta
respecto a la de un polipéptido WT1 de tipo silvestre (no
modificado). En una realización adicional, la porción
N-terminal de WT1 de los aminoácidos
1-281 se modifica de modo que la capacidad de gran
cantidad de polipéptidos en la misma que pueden unirse a
HLA-A2, HLA-A24,
HLA-A1, HLA-A3,
HLA-A68, HLA-A11,
HLA-A31, HLA-A33,
HLA-B14, HLA-B40,
HLA-B60, HLA-B62,
HLA-B7, HLA-B8,
HLA-B27, HLA-B3501,
HLA-B37, HLA-B38,
HLA-B39, HLA-B44,
HLA-B51, HLA-B52,
HLA-B58, HLA-CW03,
HLA-CW04, HLA-CW06 o
HLA-CW07, se aumenta respecto a la de la secuencia
del polipéptido WT1 de tipo silvestre (no modificado). En una
realización adicional, un polipéptido que comprende al menos una
porción inmunógena (epítopo) se modifica de modo que se aumenta su
capacidad para unirse a una molécula de MHC, tal como
HLA-A2, HLA-A24,
HLA-A1, HLA-A3,
HLA-A68, HLA-A11,
HLA-A31, HLA-A33,
HLA-B14, HLA-B40,
HLA-B60, HLA-B62,
HLA-B7, HLA-B8,
HLA-B27, HLA-B3501,
HLA-B37, HLA-B38,
HLA-B39, HLA-B44,
HLA-B51, HLA-B52,
HLA-B58, HLA-CW03,
HLA-CW04, HLA-CW06 o
HLA-CW07. El Ejemplo 30 describe VARIANTEes
ilustrativas que pueden generarse. El especialista reconocerá
fácilmente que éstas son VARIANTEes ilustrativas y que pueden
generase otras VARIANTEes de forma similar para péptidos que se unen
a moléculas HLA distintas de HLA-A2. En una
realización adicional, la capacidad del polipéptido VARIANTEe para
unirse a una molécula HLA se aumenta en al menos 2 veces,
preferiblemente al menos 3 veces, 4 veces o 5 veces respecto a la
de un polipéptido WT1 nativo. Se ha descubierto, dentro del contexto
de la presente invención, que un número relativamente pequeño de
sustituciones (por ejemplo, de 1 a 3) dentro una porción inmunógena
de un polipéptido WT1 pueden servir para aumentar la capacidad del
polipéptido para generar una respuesta inmune. Generalmente pueden
identificarse sustituciones adecuadas mediante el uso de programas
informáticos, como se han descrito anteriormente, y el efecto
confirmarse basándose en la reactividad del polipéptido modificado
con antisueros y/o células T como se describe en este documento. Por
consiguiente, dentro de ciertas realizaciones preferidas, un
polipéptido WT1 comprende una VARIANTEe en la que de 1 a 3 restos
aminoacídicos dentro de una porción inmunógena se sustituyen de
modo que la capacidad para reaccionar con antisueros y/o líneas o
clones de células T específicos de antígeno sea estadísticamente
superior que la del polipéptido no modificado. Dichas sustituciones
se localizan preferiblemente dentro de un sitio de unión a MHC del
polipéptido, que puede identificarse como se ha descrito
anteriormente. Las sustituciones preferidas permiten una unión
aumentada a moléculas de MHC clase I o clase II.
Ciertas VARIANTEes contienen sustituciones
conservativas. Una "sustitución conservativa" es una en la que
un aminoácido se sustituye por otro aminoácido que tiene propiedades
similares, de modo que un especialista en la técnica de la química
de péptidos esperaría que la estructura secundaria y la naturaleza
hidropática del polipéptido no cambiasen sustancialmente. Pueden
realizarse en general sustituciones de aminoácidos en base a una
similitud en la polaridad, carga, solubilidad, hidrofobicidad,
hidrofilicidad y/o la naturaleza anfifática de los restos. Por
ejemplo, los aminoácidos negativamente cargados incluyen ácido
aspártico y ácido glutámico; los aminoácidos positivamente cargados
incluyen lisina y arginina; y los aminoácidos con grupos de cabeza
polares no cargados que tienen valores de hidrofilicidad similares
incluyen leucina, isoleucina y valina; glicina y alanina,
asparagina y glutamina; y serina, treonina, fenilalanina y tirosina.
Otros grupos de aminoácidos que pueden representar cambios
conservativos incluyen: (1) ala, pro, gly, glu, asp, gln, asn, ser,
thr; (2) cys, ser, tyr, thr; (3) val, ile, leu, met, ala, phe; (4)
lys, arg, his; y (5) phe, tyr, trp, his. Una VARIANTEe puede
contener también, o como alternativa, cambios no conservativos.
También (o como alternativa) pueden modificarse VARIANTEes
mediante, por ejemplo, la deleción o adición de aminoácidos que
tengan una influencia mínima sobre la inmunogenicidad, la
estructura secundaria y la naturaleza hidropática del
polipéptido.
En una realización preferida, se construye un
polipéptido VARIANTEe del extremo N-terminal de WT1
(aminoácidos 1-249), en el que el polipéptido
VARIANTEe es capaz de unirse a un anticuerpo que reconoce el
polipéptido WT1 de longitud completa y/o el extremo
N-terminal de WT1. Un ejemplo no limitante de un
anticuerpo es un anticuerpo anti-WT1 WT180 (Santa
Cruz Biotechnology, Inc., Santa Cruz, CA).
Como se ha indicado anteriormente, pueden
conjugarse polipéptidos WT1 con una secuencia señal (o líder) en el
extremo N-terminal de la proteína que dirige
co-traduccionalmente o
post-traduccionalmente la transferencia de la
proteína. Un polipéptido también, o como alternativa, puede
conjugarse con un enlazador u otra secuencia para facilidad de
síntesis, purificación o identificación del polipéptido (por
ejemplo, poli-His) o para aumentar la unión del
polipéptido a un soporte sólido. Por ejemplo, un polipéptido puede
conjugarse con una región Fc de inmunoglobulina.
Pueden prepararse polipéptidos WT1 usando
cualquiera de una diversidad de técnicas bien conocidas. Los
polipéptidos recombinantes codificados por un polinucleótido de WT1
como se describe en este documento pueden prepararse fácilmente a
partir del polinucleótido. En general, puede emplearse cualquiera de
una diversidad de vectores de expresión conocidos por los
especialistas en la técnica para expresar polipéptidos WT1
recombinantes. La expresión puede conseguirse en cualquier célula
hospedadora apropiada que se haya transformado o transfectado con
un vector de expresión que contiene una molécula de ADN que codifica
un polipéptido recombinante. Las células hospedadoras adecuadas
incluyen células procariotas, de levaduras y eucariotas superiores.
Preferiblemente, las células hospedadoras empleadas son E.
coli, levaduras o una línea celular de mamífero tal como COS o
CHO. Los sobrenadantes de sistemas de hospedador/vector adecuados
que secretan una proteína o polipéptido recombinante hacia el medio
de cultivo pueden concentrarse primero usando un filtro disponible
en el mercado. El concentrado puede aplicarse después a una matriz
de purificación adecuada tal como una matriz de afinidad o una
resina de intercambio iónico. Por último, pueden emplearse una o más
etapas de HPLC de fase inversa para purificar adicionalmente un
polipéptido recombinante. Dichas técnicas pueden usarse para
preparar polipéptidos nativos o VARIANTEes de los mismos. Por
ejemplo, pueden prepararse en general polinucleótidos que codifiquen
una VARIANTEe de un polipéptido nativo usando técnicas de
mutagénesis convencionales, tales como mutagénesis específica de
sitio dirigida por oligonucleótidos y pueden eliminarse secciones de
la secuencia de ADN para permitir la preparación de polipéptidos
truncados.
También pueden generarse ciertas porciones y
otras VARIANTEes mediante medios sintéticos, usando procedimientos
bien conocidos por los especialistas en la técnica. Por ejemplo,
pueden sintetizarse polipéptidos que tengan menos de
aproximadamente 500 aminoácidos, preferiblemente menos de
aproximadamente 100 aminoácidos y, más preferiblemente, menos de
aproximadamente 50 aminoácidos. Pueden sintetizarse polipéptidos
usando cualquiera de las técnicas en fase sólida disponibles en el
mercado, tales como el método de síntesis en fase sólida de
Merrifield, en el que se añaden secuencialmente aminoácidos a una
cadena de aminoácidos en crecimiento. Véase Merrifield, J. Arn.
Chem. Soc. 85: 2149-2146, 1963. El equipamiento para
la síntesis automatizada de polipéptidos está disponible en el
mercado en proveedores tales como Applied BioSystems, Inc. (Foster
City, CA) y puede hacerse funcionar de acuerdo con las
instrucciones del fabricante.
En general, se aíslan polipéptidos y
polinucleótidos como se describen en este documento. Un polipéptido
o polinucleótido "aislado" es uno que se retira de su entorno
original. Por ejemplo, una proteína de origen natural se aísla si
se separa de algunos o todos los materiales coexistentes en el
sistema natural. Preferiblemente, dichos polipéptidos tienen una
pureza de al menos aproximadamente 90%, más preferiblemente una
pureza de al menos aproximadamente 95% y, más preferiblemente, una
pureza de al menos aproximadamente 99%. Se considera que un
polinucleótido está aislado si, por ejemplo, está clonado en un
vector que no es parte del entorno natural.
Dentro de aspectos adicionales, la presente
invención proporciona miméticos de polipéptidos WT1. Dichos
miméticos pueden comprender aminoácidos unidos a uno o más
miméticos de aminoácidos (es decir, uno o más aminoácidos dentro de
la proteína WT1 pueden sustituirse por un mimético de aminoácido) o
pueden ser miméticos totalmente no peptídicos. Un mimético de
aminoácido es un compuesto que es conformacionalmente similar a un
aminoácido de modo que puede sustituir a un aminoácido dentro de un
polipéptido WT1 sin disminuir sustancialmente la capacidad para
reaccionar con antisueros y/o líneas o clones de células T
específicos de antígeno. Un mimético no peptídico es un compuesto
que no contiene aminoácidos y que tiene una conformación global que
es similar a un polipéptido WT1, de modo que la capacidad del
mimético para reaccionar con antisueros y/o líneas o clones de
células T específicos de WT1 no se disminuye sustancialmente
respecto a la capacidad de un polipéptido WT1. Dichos miméticos
pueden diseñarse basándose en técnicas convencionales (por ejemplo,
técnicas computacionales y de resonancia magnética nuclear) que
evalúen la estructura tridimensional de una secuencia peptídica.
Pueden diseñarse miméticos en los que una o más de las
funcionalidades de cadena lateral del polipéptido WT1 se sustituyen
por grupos que no necesariamente tienen el mismo tamaño o volumen,
pero que tienen propiedades químicas y/o físicas similares que
producen respuestas biológicas similares. Debería entenderse que,
dentro de las realizaciones que se describen en este documento, un
mimético puede sustituir a un polipéptido WT1.
Dentro de otras realizaciones ilustrativas, un
polipéptido puede ser un polipéptido de fusión que comprende
múltiples polipéptidos como se describen en este documento, o que
comprende al menos un polipéptido como se describe en este
documento y una secuencia no relacionada, tal como una proteína
tumoral conocida. Un compañero de fusión puede, por ejemplo, ayudar
a proporcionar epítopos auxiliares T (un compañero de fusión
inmunológico), -preferiblemente epítopos auxiliares T reconocidos
por seres humanos, o puede ayudar a expresar la proteína (un
potenciador de la expresión) a rendimientos superiores que la
proteína recombinante nativa. Ciertos compañeros de fusión
preferidos son compañeros de fusión tanto inmunológicos como
potenciadores de la expresión. Pueden seleccionarse otros
compañeros de fusión de modo que se aumente la solubilidad del
polipéptido o para permitir que el polipéptido se dirija a
compartimentos intracelulares deseados. Otros compañeros de fusión
adicionales incluyen marcadores de afinidad, que facilitan la
purificación del polipéptido.
Generalmente pueden prepararse polipéptidos de
fusión usando técnicas convencionales, incluyendo conjugación
química. Preferiblemente, un polipéptido de fusión se expresa como
un polipéptido recombinante, permitiendo la producción de niveles
aumentados respecto a un polipéptido no fusionado en un sistema de
expresión. En resumen, pueden ensamblarse por separado secuencias
de ADN que codifiquen los componentes polipeptídicos y ligarse en
un vector de expresión apropiado. El extremo 3' de la secuencia de
ADN que codifica un componente polipeptídico se liga, con o sin un
enlazador peptídico, con el extremo 5' de una secuencia de ADN que
codifica el segundo componente polipeptídico, de modo que las fases
de lectura de las secuencias estén en la misma fase de lectura.
Esto permite la traducción en un solo polipéptido de fusión que
conserve la actividad biológica de ambos polipéptidos
componentes.
Puede emplearse una secuencia enlazadora
peptídica para separar el primer y segundo componentes
polipeptídicos una distancia suficiente para asegurar que cada
polipéptido se pliega en sus estructuras secundaria y terciaria.
Dicha secuencia enlazadora peptídica se incorpora en el polipéptido
de fusión usando procedimientos convencionales bien conocidos en la
técnica. Pueden seleccionarse secuencias enlazadoras peptídicas
adecuadas basándose en los siguientes factores: (1) su capacidad
para adoptar una conformación extendida flexible; (2) su incapacidad
para adoptar una estructura secundaria que pudiera interaccionar
con epítopos funcionales en el primer y segundo polipéptidos; y (3)
la ausencia de restos hidrófobos o cargados que podrían reaccionar
con los epítopos funcionales del polipéptido. Las secuencias
enlazadoras peptídicas preferidas contienen restos Gly, Asn y Ser.
También pueden usarse otros aminoácidos casi neutros, tales como
Thr y Ala en la secuencia enlazadora. Las secuencias de aminoácidos
que pueden emplearse provechosamente como enlazadores incluyen las
descritas en Maratea et al., Gene 40: 39-46,
1985; Murphy et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83:
8258-8262, 1986; Patente de Estados Unidos Nº
4.935.233 y Patente de Estados Unidos Nº 4.751.180. La secuencia
enlazadora puede ser generalmente de 1 a aproximadamente 50
aminoácidos de longitud. No son necesarias secuencias enlazadoras
cuando el primer y segundo polipéptidos tienen regiones de
aminoácidos N-terminales no esenciales que pueden
usarse para separar los dominios funcionales y evitar la
interferencia estérica.
Las secuencias de ADN ligadas se unen
operativamente a elementos reguladores de la transcripción o de la
traducción adecuados. Los elementos reguladores responsables de la
expresión de ADN se localizan solamente 5' a la secuencia de ADN
que codifica los primeros polipéptidos. De forma similar, los
codones de terminación necesarios para terminar las señales de
terminación de la traducción y la transcripción sólo están presentes
3' a la secuencia de ADN que codifica el segundo polipéptido.
El polipéptido de fusión puede comprender un
polipéptido como se describe en este documento junto con una
proteína inmunógena no relacionada, tal como una proteína inmunógena
capaz de generar una respuesta de memoria. Los ejemplos de dichas
proteínas incluyen proteínas del tétanos, la tuberculosis y la
hepatitis (véase, por ejemplo, Stoute et al. New Engl. J.
Med., 336: 86-91, 1997).
En una realización preferida, el compañero de
fusión inmunológico procede de un Mycobacterium sp., tal como un
fragmento Ra12 obtenido de Mycobacterium tuberculosis. Se
describen composiciones de Ra12 y métodos para su uso en la
potenciación de la expresión y/o la inmunogenicidad de secuencias
polinucleotídicas/polipeptídicas heterológas en el documento WO
01/25401. En resumen, Ra12 se refiere a una región polinucleotídica
que es una subsecuencia de un ácido nucleico de MTB32A de
Mycobacterium tuberculosis. MTB32A es una serina proteasa de
un peso molecular de 32 KD codificada por un gen en cepas virulentas
y avirulentas de M. tuberculosis. Se ha descrito la
secuencia de nucleótidos y la secuencia de aminoácidos de MTB32A
(por ejemplo, documento WO 01/25401, véase también Skeiky et
al., Infection y Immun. (1999) 67: 3998-4007).
Los fragmentos C-terminales de la secuencia
codificante de MTB32A expresan a altos niveles y permanecen como
polipéptidos solubles durante todo el proceso de purificación.
Además, Ra12 puede potenciar la inmunogenicidad de polipéptidos
inmunógenos heterólogos con los que se fusione. Un polipéptido de
fusión con Ra12 preferido comprende un fragmento
C-terminal de 14 KD que se corresponde con los
restos aminoacídicos 192 a 323 de MTB32A. Otros polinucleótidos de
Ra12 preferidos comprenden generalmente al menos aproximadamente 15
nucleótidos consecutivos, al menos aproximadamente 30 nucleótidos,
al menos aproximadamente 60 nucleótidos, al menos aproximadamente
100 nucleótidos, al menos aproximadamente 200 nucleótidos o al
menos aproximadamente 300 nucleótidos que codifican una porción de
un polipéptido Ra12. Los polinucleótidos de Ra12 pueden comprender
una secuencia nativa (es decir, una secuencia endógena que codifica
un polipéptido Ra12 o una porción del mismo) o pueden comprender una
VARIANTEe de dicha secuencia. Las VARIANTEes polinucleotídicas de
Ra12 pueden contener una o más sustituciones, adiciones, deleciones
y/o inserciones de modo que no se disminuya sustancialmente la
actividad biológica del polipéptido de fusión codificado, respecto
a un polipéptido de fusión que comprende un polipéptido Ra12 nativo.
Las VARIANTEes presentan preferiblemente una identidad de al menos
aproximadamente 70%, más preferiblemente una identidad de al menos
aproximadamente 80% y, más preferiblemente, una identidad de al
menos aproximadamente 90% con una secuencia polinucleotídica que
codifica un polipéptido Ra12 nativo o una porción del mismo.
\newpage
Dentro de otras realizaciones preferidas, un
compañero de fusión inmunológico procede de la proteína D, una
proteína de superficie de la bacteria gram-negativa
Haemophilus influenza B (documento WO 91/18926). Preferiblemente,
un derivado de proteína D comprende aproximadamente el primer tercio
de la proteína (por ejemplo, los primeros 100-110
aminoácidos N-terminales) y un derivado de proteína
D puede estar lipidado. Dentro de ciertas realizaciones preferidas,
los primeros 109 restos de un compañero de fusión de Lipoproteína D
se incluyen en el extremo N-terminal para
proporcionar al polipéptido epítopos de células T exógenos
adicionales y para aumentar el nivel de expresión en E. coli
(funcionando por lo tanto como un potenciador de la expresión). La
cola lipídica asegura una presentación óptima del antígeno a
células presentadoras de antígeno. Otros compañeros de fusión
incluyen la proteína no estructural del virus influenza, NS1
(hemaglutinina). Típicamente, se usan los 81 aminoácidos
N-terminales, aunque pueden usarse diferentes
fragmentos que incluyen epítopos auxiliares T.
En otra realización, el compañero de fusión
inmunológico es la proteína conocida como LYTA, o una porción de la
misma (preferiblemente una porción C-terminal). LYTA
procede de Streptococcus pneumoniae, que sintetiza una
N-acetil-L-alanina
amidasa conocida como amidasa LYTA (codificada por el gen LytA; Gen
43: 265-292, 1986). LYTA es una autolisina que
degrada específicamente ciertos enlaces en la estructura de
peptidoglicano. El dominio C-terminal de la
proteína LYTA es responsable de la afinidad con la colina o con
algunos análogos de colina tales como DEAE. Esta propiedad se ha
aprovechado para el desarrollo de plásmidos que expresan
C-LYTA en E. coli útiles para la expresión
de proteínas de fusión. Se ha descrito la purificación de proteínas
híbridas que contienen el fragmento C-LYTA en el
extremo amino-terminal (véase Biotechnology 10:
795-798, 1992). Dentro de una realización
preferida, puede incorporarse una porción repetida de LYTA en un
polipéptido de fusión. Se encuentra una porción repetida en la
región C-terminal partiendo del resto 178. Una
porción repetida particularmente preferida incorpora los restos
188-305.
Dentro de otra realización ilustrativa, el
compañero de fusión comprende un péptido señal de translocación de
la doble arginina (TAT) del péptido señal TorA en E. coli en
el extremo N-terminal; véase J. Mol. Microbiol.
(2000) 2(2): 179-189; Journal of
Bacteriology, ene 2001 págs. 604-610 Vol. 183, Nº 2;
Journal of Biochemistry Vol. 276, 16 marzo 2001 págs.
8159-8164).
Otra realización ilustrativa más implica
polipéptidos de fusión y los polinucleótidos que los codifican, en
la que el compañero de fusión comprende una señal de dirección capaz
de dirigir a un polipéptido hacia el compartimento
endosomal/lisosomal, como se describe en la Patente de Estados
Unidos Nº 5.633.234. Un polipéptido inmunógeno de la invención,
cuando se fusiona con esta señal de dirección, se asociará más
eficazmente con moléculas de MHC clase II y por lo tanto
proporcionará una estimulación in vivo aumentada de células T
CD4^{+} específicas para el polipéptido.
La invención proporciona formas truncadas de
polipéptidos WT1 que pueden expresarse de forma recombinante en
E. coli sin la adición de un compañero de fusión. Se muestran
ejemplos de estas formas truncadas en las SEC ID Nº:
342-346 y están codificadas por polinucleótidos que
se muestran en las SEC ID Nº: 337-341. En
variaciones de estos truncamientos, los primeros 76 aminoácidos de
WT1 pueden fusionarse con el extremo C-terminal de
la proteína, generando una proteína recombinante que es más fácil de
expresar en E. coli. También pueden usarse otros
hospedadores además de E. coli, tales como, por ejemplo,
B. megaterium. La proteína puede prepararse adicionalmente
sin un marcador de histidina.
En otras realizaciones, pueden generarse
subunidades diferentes y fusionarse entre sí en un orden que difiera
de la WT1 nativa. Además, pueden realizarse fusiones, por ejemplo,
con Ra12. Se muestran proteínas de fusión ejemplares en las SEC ID
Nº: 332-336 y pueden estar codificadas por los
polinucleótidos que se muestran en las SEC ID Nº:
327-331.
Cualquier polinucleótido que codifique un
polipéptido WT1 como se describe en este documento es un
polinucleótido de WT1 incluido en la presente invención. Dichos
polinucleótidos pueden ser monocatenarios (codificantes o
antisentido) o bicatenarios y pueden ser moléculas de ADN (genómico,
ADNc o sintético) o de ARN. Pueden estar presentes, pero no
necesariamente, secuencias codificantes o no codificantes
adicionales en el interior de un polinucleótido de la presente
invención y un polinucleótido puede unirse, pero no necesariamente,
a otras moléculas y/o materiales de soporte.
Los polinucleótidos de WT1 pueden codificar una
proteína WT1 nativa o pueden codificar una VARIANTEe de WT1 como se
describe en este documento. Las VARIANTEes polinucleotídicas pueden
contener una o más sustituciones, adiciones, deleciones y/o
inserciones de modo que no se disminuya la inmunogenicidad del
polipéptido codificado respecto a una proteína WT1 nativa. El
efecto sobre la inmunogenicidad del polipéptido codificado puede
evaluarse generalmente como se describe en este documento. Las
VARIANTEes preferidas contienen sustituciones, deleciones,
inserciones y/o adiciones de nucleótidos en no más de 20%,
preferiblemente en no más de 10% de las posiciones de nucleótidos
que codifican una porción inmunógena de una secuencia de WT1 nativa.
Ciertas VARIANTEes son sustancialmente homólogas a un gen nativo, o
a una porción del mismo. Dichas VARIANTEes polinucleotídicas son
capaces de hibridar en condiciones moderadamente rigurosas con una
secuencia de ADN de origen natural que codifica un polipéptido WT1
(o una secuencia complementaria). Las condiciones moderadamente
rigurosas adecuadas incluyen prelavado en una solución de SSC 5X,
SDS a 0,5%, EDTA 1,0 mM (pH 08); hibridación a
50ºC-65ºC, SSC 5X, durante una noche; seguido de
lavado dos veces a 65ºC durante 20 minutos con cada uno de SSC 2X,
0,5X y 0,2X que contiene SDS a 0,1%. Dichas secuencias de ADN que
hibridan también se incluyen en el alcance de esta invención.
Los especialistas en la técnica apreciarán que,
como resultado de la degeneración del código genético, hay muchas
secuencias de nucleótidos que codifican un polipéptido WT1. Algunos
de estos polinucleótidos conservan una homología mínima con la
secuencia de nucleótidos de cualquier gen nativo. No obstante, se
contemplan específicamente en la presente invención polinucleótidos
que varían debido a diferencias en el uso de codones.
Por lo tanto, de acuerdo con otro aspecto de la
presente invención, se proporcionan composiciones polinucleotídicas
que comprenden algunas o todas las secuencias polinucleotídicas
expuestas en este documento, complementarias de una secuencia
polinucleotídica expuesta en este documento y VARIANTEes degeneradas
de una secuencia polinucleotídica expuesta en este documento. En
ciertas realizaciones preferidas, las secuencias polinucleotídicas
expuestas en este documento codifican polipéptidos inmunógenos como
se ha descrito anteriormente.
Una vez que se identifica una porción inmunógena
de WT1, como se ha descrito anteriormente, puede prepararse un
polinucleótido de WT1 usando cualquiera de una diversidad de
técnicas. Por ejemplo, puede amplificarse un polinucleótido de WT1
a partir de ADNc preparado a partir de células que expresen WT1.
Dichos polinucleótidos pueden amplificarse mediante la reacción en
cadena a la polimerasa (PCR). Para esta estrategia, pueden diseñarse
cebadores específicos de secuencia basándose en la secuencia de la
porción inmunógena y pueden adquirirse o sintetizarse. Por ejemplo,
los cebadores adecuados para la amplificación por PCR de un gen de
WT1 humana incluyen: primera etapa - P118:
1434-1414: 5' GAG AGT CAGA CT TGA AAG C AGT 3' (SEC
ID Nº: 5) y P135: 5' CTG AGC CTC AGC AAA TGG GC 3' (SEC ID Nº: 6);
segunda etapa - P136: 5' GAG CAT GCA TGG GCT CCG ACG TGC GGG 3'
(SEC ID Nº: 7) y P137: 5' GGG GTA CCC ACT GAA CGG TCC CCG A 3' (SEC
ID Nº: 8). Los cebadores para amplificación por PCR de un gen de
WT1 de ratón incluyen: primera etapa - P138: 5' TCC GAG CCG CAC CTC
ATG 3' (SEC ID Nº: 9) y P139: 5' GCC TGG GAT GCT GGA CTG 3' (SEC ID
Nº: 10), segunda etapa - P140: 5' GAG CAT GCG ATG GGT TCC GAC GTG
CGG 3' (SEC ID Nº: 11) y P141: 5' GGG GTA CCT CAA AGC GCC ACG TGG
AGT TT 3' (SEC ID Nº: 12).
Después puede usarse una porción amplificada
para aislar un gen de longitud completa a partir de una genoteca de
ADN genómico humano o a partir de una genoteca de ADNc adecuada
usando técnicas bien conocidas. Como alternativa, puede construirse
un gen de longitud completa a partir de múltiples fragmentos de PCR.
También pueden prepararse polinucleótidos de WT1 por síntesis de
componentes oligonucleotídicos y ligación de los componentes entre
sí para generar el polinucleótido completo.
También pueden sintetizarse polinucleótidos de
WT1 por cualquier método conocido en la técnica, incluyendo
síntesis química (por ejemplo, síntesis química de fosforamidita en
fase sólida). También pueden introducirse modificaciones en una
secuencia polinucleotídica usando técnicas de mutagénesis
convencionales, tales como mutagénesis especifica de sitio dirigida
por oligonucleótidos (véase Adelman et al., DNA 2: 183,
1983). Como alternativa, pueden generarse moléculas de ARN mediante
transcripción in vitro o in vivo de secuencias de ADN
que codifican un polipéptido WT1, con tal de que el ADN se incorpore
en un vector con un promotor de ARN polimerasa adecuado (tal como
T7 o SP6). Pueden usarse determinadas porciones para preparar un
polipéptido codificado, como se describe en este documento. Además,
o como alternativa, puede administrarse una porción a un paciente
de modo que el polipéptido codificado se genere in vivo (por
ejemplo, por transfección de células presentadoras de antígeno
tales como células dendríticas con una construcción de ADNc que
codifica un polipéptido WT1 y administración de las células
transfectadas al paciente).
Generalmente pueden usarse polinucleótidos que
codifican un polipéptido WT1 para la producción del polipéptido,
in vitro o in vivo. También pueden usarse
polinucleótidos de WT1 que sean complementarios a una secuencia
codificante (es decir, polinucleótidos antisentido) como una sonda o
para inhibir la expresión de WT1. También pueden introducirse
construcciones de ADNc que pueden transcribirse en ARN antisentido
en células de tejidos para facilitar la producción de ARN
antisentido.
Cualquier polinucleótido puede modificarse
adicionalmente para aumentar la estabilidad in vivo. Las
modificaciones posibles incluyen, pero sin limitación, la adición
de secuencias flanqueantes en los extremos 5' y/o 3'; el uso de
enlaces fosforotioato o 2' O-metilo en lugar de
fosfodiesterasa en la estructura; y/o la inclusión de bases no
tradicionales tales como inosina, queosina y wybutosina, así como
formas acetil-, metil-, tio-adenina, citidina,
guanina, timina y uridina y otras formas modificadas de las
mismas.
Las secuencias de nucleótidos como se describen
en este documento pueden unirse a una diversidad de otras
secuencias de nucleótidos usando técnicas de ADN recombinante
establecidas. Por ejemplo, un polinucleótido puede clonarse en
cualquiera de una diversidad de vectores de clonación, incluyendo
plásmidos, fagémidos, derivados de fago lambda y cósmidos. Los
vectores de interés particular incluyen vectores de expresión,
vectores de replicación, vectores de generación de sondas y
vectores de secuenciación. En general, un vector contendrá un
origen de replicación funcional en al menos un organismo, sitios de
endonucleasas de restricción convenientes y uno o más marcadores de
selección. Otros elementos dependerán del uso deseado y serán
evidentes para los especialistas en la técnica. En particular, una
realización de la invención comprende vectores de expresión que
incorporan las moléculas de ácido nucleico de la invención, en unión
operativa (es decir, "unidas operativamente") a una secuencia
de control de la expresión (promotor). La construcción de dichos
vectores, tales como vectores virales (por ejemplo, adenovirus o
virus Vaccinia) o virales atenuados está bien dentro de la técnica
especialista, al igual que la transformación o transfección de
células, para producir líneas celulares eucariotas o cepas de
células procariotas que codifican la molécula de interés. Son
ejemplares de las células hospedadoras que pueden emplearse de esta
forma células COS, células CHO, células de levadura, células de
insecto (por ejemplo, células de Spodoptera frugiperda o
Sf-9), células NIH 3T3 y así sucesivamente. También
pueden usarse células procariotas tales como E. coli y otras
bacterias.
Dentro de ciertas realizaciones, pueden
formularse polinucleótidos para permitir la entrada en una célula
de un mamífero y la expresión en la misma. Dichas formulaciones son
particularmente útiles para fines terapéuticos, como se describe a
continuación. Los especialistas en la técnica apreciarán que hay
muchas formas de conseguir la expresión de un polinucleótido en una
célula diana y puede emplearse cualquier método adecuado. Por
ejemplo, puede incorporarse un polinucleótido en un vector viral
tal como, pero sin limitación, adenovirus, virus adenoasociados,
retrovirus o virus vaccinia u otros poxvirus (por ejemplo, poxvirus
aviar). Los especialistas en la técnica conocen bien procedimientos
para incorporar ADN en dichos vectores. Una vector retroviral puede
transferir o incorporar adicionalmente un gen para un marcador de
selección (para ayudar a la identificación o selección de las
células transducidas) y/o un resto de dirección, tal como un gen que
codifica un ligando para un receptor en una célula diana específica
para hacer al vector específico de diana. La dirección también puede
conseguirse usando un anticuerpo, por métodos conocidos por los
especialistas en la técnica. Pueden usarse construcciones de ADNc
dentro de dicho vector, por ejemplo, para transfectar líneas
celulares humanas o animales para el uso en el establecimiento de
modelos de tumores positivos para WT1 que pueden usarse para
realizar experimentos de protección tumoral e inmunoterapia
adoptiva para demostrar inhibición del desarrollo de tumores o
leucemia o la lisis de dichas células.
Otras formulaciones terapéuticas para
polinucleótidos incluyen sistemas de dispersión coloidal, tales como
complejos de macromoléculas, nanocápsulas, microesferas, perlas y
sistemas basados en lípidos que incluyen emulsiones de aceite en
agua, micelas, micelas mixtas y liposomas. Un sistema coloidal
preferido para el uso como vehículo de administración in
vitro e in vivo es un liposoma (es decir, una vesícula de
membrana artificial). La preparación y el uso de dichos sistemas
son bien conocidos en la técnica.
De acuerdo con otro aspecto, la presente
invención proporciona además agentes de unión, tales como
anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno de los mismos que
presentan unión inmunológica a un polipéptido WT1 descrito en este
documento, o a una porción, VARIANTEe o derivado del mismo. Se dice
que un anticuerpo, o fragmento de unión a antígeno del mismo, "se
une específicamente", "se une inmunológicamente" y/o es
"inmunológicamente reactivo" con un polipéptido WT1 de la
invención si reacciona a un nivel detectable (dentro de, por
ejemplo, un ensayo de ELISA) con el polipéptido y no reacciona de
forma detectable con polipéptidos no relacionados en condiciones
similares.
La unión inmunológica, como se usa en este
contexto, se refiere generalmente a las interacciones no covalentes
del tipo que aparecen entre una molécula de inmunoglobulina y un
antígeno para el que es específica la inmunoglobulina. La fuerza o
afinidad de las interacciones de unión inmunológica puede expresarse
en términos de la constante de disociación (K_{d}) de la
interacción, en la que una K_{d} más pequeña representa una mayor
afinidad. Las propiedades de unión inmunológica de polipéptidos
seleccionados pueden cuantificarse usando métodos bien conocidos en
la técnica. Un método de este tipo supone medir las velocidades de
formación y disociación del complejo de sitio de unión a
antígeno/antígeno, en el que esas velocidades dependen de las
concentraciones de los compañeros del complejo, la afinidad de la
interacción, y de los parámetros geométricos que influyen por igual
en la velocidad en ambas direcciones. Por lo tanto, tanto la
"constante de asociación" (K_{on}) como la "constante de
disociación" (K_{off}) pueden determinarse por cálculo de las
concentraciones y de las velocidades reales de asociación y
disociación. La relación de K_{off}/K_{on} permite la anulación
de todos los parámetros no relacionados con la afinidad y, por lo
tanto, es equivalente a la constante de disociación K_{d}. Véase,
en general, Davies et al. (1990) Annual Rev. Biochem. 59:
439-473.
Un "sitio de unión a antígeno" o "porción
de unión" de un anticuerpo se refiere a la parte de la molécula
de inmunoglobulina que participa en la unión a antígeno. El sitio de
unión a antígeno se forma por restos aminoacídicos de las regiones
variables ("V") N-terminales de las cadenas
pesada ("H") y ligera ("L"). Tres extensiones altamente
divergentes dentro de las regiones V de las cadenas pesada y ligera
se denominan "regiones hipervariables" que están interpuestas
entre extensiones flanqueantes más conservadas conocidas como
"regiones flanqueantes" o "FR". Por lo tanto, el término
"FR" se refiere a secuencias de aminoácidos que se encuentran
de forma natural entre y adyacentes a regiones hipervariables en
inmunoglobulinas. En una molécula de anticuerpo, las tres regiones
hipervariables de una cadena ligera y las tres regiones
hipervariables de una cadena pesada se disponen entre sí en un
espacio tridimensional para formar una superficie de unión a
antígeno. La superficie de unión a antígeno es complementaria a la
superficie tridimensional de un antígeno unido, y las tres regiones
hipervariables de cada cadena pesada y ligera se denominan
"regiones determinantes de complementariedad" o
"CDR".
Los agentes de unión pueden ser capaces además
de diferenciar entre pacientes con y sin un cáncer asociado a WT1,
usando los ensayos representativos que se proporcionan en este
documento. Por ejemplo, los anticuerpos u otros agentes de unión
que se unen a una proteína tumoral generarán preferiblemente una
señal que indica la presencia de un cáncer en al menos
aproximadamente 20% de los pacientes con la enfermedad, más
preferiblemente al menos aproximadamente 30% de los pacientes. Como
alternativa, o además, el anticuerpo generará una señal negativa
que indique la ausencia de la enfermedad en al menos aproximadamente
90% de los individuos sin el cáncer. Para determinar si un agente
de unión cumple este requerimiento, pueden ensayarse muestras
biológicas (por ejemplo, sangre, sueros, esputo, orina y/o biopsias
tumorales) de pacientes con y sin cáncer (como se determina usando
ensayos clínicos convencionales) como se describe en este documento
para determinar la presencia de polipéptidos que se unen al agente
de unión. Preferiblemente, se ensayará un número estadísticamente
significativo de muestras con y sin la enfermedad. Cada agente de
unión debería cumplir los criterios anteriores; sin embargo, los
especialistas en la técnica reconocerán que pueden usarse agentes de
unión en combinación para mejorar la sensibilidad.
Cualquier agente que cumpla los requerimientos
anteriores puede ser un agente de unión. Por ejemplo, un agente de
unión puede ser un ribosoma, con o sin un componente peptídico, una
molécula de ARN o un polipéptido. En una realización preferida, un
agente de unión es un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno
del mismo. Pueden prepararse anticuerpos por cualquiera de una
diversidad de procedimientos conocidos por los especialistas en la
técnica. Véase, por ejemplo, Harlow y Lane, Antibodies: A Laboratory
Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1998. En general, pueden
producirse anticuerpos mediante técnicas de cultivo celular,
incluyendo la generación de anticuerpos monoclonales como se
describe en este documento, o mediante transfección de genes de
anticuerpos en hospedadores de células bacterianas o de mamífero
adecuadas, para permitir la producción de anticuerpos
recombinantes. En una técnica, se inyecta inicialmente un inmunógeno
que comprende el polipéptido en cualquiera de una amplia diversidad
de mamíferos (por ejemplo, ratones, ratas, conejos, ovejas o
cabras). En esta etapa, los polipéptidos de esta invención pueden
servir como el inmunógeno sin modificación. Como alternativa,
particularmente para polipéptidos relativamente cortos, puede
generarse una respuesta inmune superior si el polipéptido está
unido a una proteína transportadora, tal como albúmina sérica bovina
o hemocianina de lapa californiana. El inmunógeno se inyecta en el
hospedador animal, preferiblemente de acuerdo con un programa
predeterminado que incorpora una o más inmunizaciones de refuerzo,
y se les extrae sangre a los animales periódicamente. Después
pueden purificarse anticuerpos policlonales específicos para el
polipéptido a partir de dichos antisueros, por ejemplo, mediante
cromatografía de afinidad usando el polipéptido acoplado a un
soporte sólido adecuado.
Pueden prepararse anticuerpos monoclonales
específicos para un polipéptido antigénico de interés, por ejemplo,
usando la técnica de Kohler y Milstein, Eur. J. Immunol. 6:
511-519, 1976 y mejoras en la misma. En resumen,
estos métodos implican la preparación de líneas celulares inmortales
capaces de producir anticuerpos que tengan la especificidad deseada
(es decir, reactividad con el polipéptido de interés). Dichas líneas
celulares puedan producirse, por ejemplo, a partir de células de
bazo obtenidas de un animal inmunizado como se ha descrito
anteriormente. Después, las células de bazo se inmortalizan, por
ejemplo, por fusión con un compañero de fusión de célula de
mieloma, preferiblemente una que sea singénica con el animal
inmunizado. Pueden emplearse una diversidad de técnicas de fusión.
Por ejemplo, las células de bazo y células de mieloma pueden
combinarse con un detergente no iónico durante unos pocos minutos y
después sembrarse en placas a baja densidad en un medio selectivo
que mantenga el crecimiento de células híbridas pero no de células
de mieloma. Una técnica de selección preferida usa selección con
HAT (hipoxantina, aminopterina, timidina). Después de un tiempo
suficiente, habitualmente de aproximadamente 1 a 2 semanas, se
observan colonias de híbridos. Se seleccionan colonias individuales
y sus sobrenadantes de cultivo se ensayan para determinar la
actividad de unión contra el polipéptido. Se prefieren hibridomas
que tienen una alta reactividad y especificidad.
Pueden aislarse anticuerpos monoclonales a
partir de los sobrenadantes de colonias de hibridoma en cultivo.
Además pueden emplearse diversas técnicas para aumentar el
rendimiento, tales como inyección de la línea celular de hibridoma
en la cavidad peritoneal de un hospedador vertebrado adecuado, tal
como un ratón. Después pueden recogerse anticuerpos monoclonales
del líquido ascítico o de la sangre. Pueden eliminarse los
contaminantes de los anticuerpos mediante técnicas convencionales,
tales como cromatografía, filtración en gel, precipitación y
extracción. Pueden usarse los polipéptidos de esta invención en el
proceso de purificación, por ejemplo, en una etapa de cromatografía
de afinidad.
Se conocen en la técnica varias moléculas
terapéuticamente útiles que comprenden sitios de unión a antígeno
que son capaces de presentar propiedades de unión inmunológica de
una molécula de anticuerpo. La enzima proteolítica papaína escinde
preferentemente moléculas de IgG para dar varios fragmentos, dos de
los cuales (los fragmentos "F(ab)") comprenden cada uno
un heterodímero covalente que incluye un sitio de unión a antígeno
intacto. La enzima pepsina es capaz de escindir moléculas de IgG
para proporcionar varios fragmentos, incluyendo el fragmento
"F(ab')_{2}" que comprende ambos sitios de unión a
antígeno. Un fragmento "Fv" puede producirse por escisión
proteolítica preferencial de una IgM y en raras ocasiones una
molécula de inmunoglobulina IgG o IgA. Sin embargo, los fragmentos
Fv se obtienen más comúnmente usando procedimientos recombinantes
conocidos en la técnica. El fragmento Fv incluye un heterodímero
V_{H}::V_{L} no covalente que incluye un sitio de unión a
antígeno que conserva gran parte de las capacidades de
reconocimiento y unión a antígeno de la molécula de anticuerpo
nativa. Inbar et al. (1972) Proc. Nat. Acad. Sci. USA 69:
2659-2662; Hochman et al. (1976) Biochem 15:
2706-2710; y Ehrlich et al. (1980) Biochem
19: 4091-4096.
Un polipéptido Fv de cadena sencilla
("sFv") es un heterodímero V_{H}::V_{L} unido
covalentemente que se expresa a partir de una fusión génica que
incluye los genes que codifican V_{H} y V_{L} unidos mediante
un enlanzador que codifica un péptido. Huston et al. (1988)
Proc. Nat. Acad. Sci. USA 85 (16): 5879-5883. Se
han descrito varios métodos para localizar estructuras químicas para
convertir las cadenas polipeptídicas ligera y pesada naturalmente
agregadas -pero químicamente separadas- de una región V de
anticuerpo en una molécula sFv que se plegará en una estructura
tridimensional sustancialmente similar a la estructura de un sitio
de unión a antígeno. Véase, por ejemplo, las Patentes de
Estados
Unidos Nº 5.091.513 y 5.132.405, de Huston et al.; y la Patente de Estados Unidos Nº 4.946.778 de Ladner et al.
Unidos Nº 5.091.513 y 5.132.405, de Huston et al.; y la Patente de Estados Unidos Nº 4.946.778 de Ladner et al.
Cada una de las moléculas descritas
anteriormente incluye un conjunto de CDR de cadena pesada y de
cadena ligera, interpuestas respectivamente entre un conjunto de FR
de cadena pesada y de cadena ligera que sirve de soporte para las
CDR y define la relación espacial de las CDR entre sí. Como se usa
en este documento, la expresión "conjunto de CDR" se refiere a
las tres regiones hipervariables de una región V de cadena pesada o
ligera. Obteniéndose a partir del extremo N-terminal
de una cadena pesada o ligera, estas regiones se indican como
"CDR1", "CDR2" y "CDR3", respectivamente. Por lo
tanto, un sitio de unión a antígeno incluye seis CDR que comprenden
el conjunto de CDR de cada región V de cadena pesada y ligera. Un
polipéptido que comprende una sola CDR (por ejemplo, una CDR1, CDR2
o CDR3) se denomina en este documento "unidad de reconocimiento
molecular". El análisis cristalográfico de varios complejos de
antígeno-anticuerpo ha demostrado que los restos
aminoacídicos de las CDR están en amplio contacto con el antígeno
unido, donde el contacto más amplio del antígeno es con la CDR3 de
la cadena pesada. Por lo tanto, las unidades de reconocimiento
molecular son principalmente responsables de la especificidad de un
sitio de unión a antígeno.
Como se usa en este documento, la expresión
"conjunto de FR" se refiere a las cuatro secuencias de
aminoácidos flanqueantes que flanquean las CDR de un conjunto de
CDR de una región V de cadena pesada o ligera. Algunos restos de la
FR pueden contactar con el antígeno unido; sin embargo, las FR son
principalmente responsables del plegamiento de la región V en el
sitio de unión a antígeno, particularmente los restos de la FR
directamente adyacentes a las CDR. Dentro de las FR, ciertos restos
amino y ciertas características estructurales están muy altamente
conservados. A este respecto, todas las secuencias de la región V
contienen un bucle disulfuro interno de aproximadamente 90 restos
aminoacídicos. Cuando las regiones V se pliegan en un sitio de
unión, las CDR se presentan como motivos de bucle salientes que
forman una superficie de unión a antígeno. Generalmente se reconoce
que hay regiones estructurales conservadas de FR que influyen en la
forma plegada de los bucles de CDR en ciertas estructuras
"canónicas" -independientemente de la secuencia de aminoácidos
exacta de la CDR. Además, se sabe que ciertos restos de la FR
participan en contactos interdominio no covalentes que estabilizan
la interacción de las cadenas pesada y ligera de un anticuerpo.
Se han descrito varias moléculas de anticuerpo
"humanizadas" que comprenden un sitio de unión a antígeno
procedente de una inmunoglobulina no humana, incluyendo anticuerpos
quiméricos que tienen regiones V de roedor y sus CDR asociadas
fusionadas con dominios constantes humanos (Winters et al.
(1991) Sature 349: 293-299; Lobuglio et al.
(1989) Proc. Nat. Acad. Sci. USA 86: 4220-4224; Shaw
et al. (1987) J Immunol. 138: 4534-4538; y
Brown et al. (1987) Cancer Res. 47:
3577-3583), CDR de roedor injertadas en una FR de
soporte humana antes de la fusión con un dominio constante de
anticuerpo humano apropiado (Riechmann et al. (1988) Nature
332: 323-327; Verhoeyen et al. (1988)
Science 239: 1534-1536; y Jones et al. (1986)
Nature 321: 522-525) y CDR de roedor soportadas por
FR de roedor recombinantemente revestidas (Publicación de Patente
Europa Nº 519.596, publicada el 23 de diciembre de 1992). Estas
moléculas "humanizadas" están diseñadas para minimizar la
respuesta inmunológica no deseada contra moléculas de anticuerpo de
roedor anti-humano que limita la duración y la
eficacia de aplicaciones terapéuticas de esos restos en
destinatarios humanos.
Como se usan en este documento, las expresiones
"FR revestidas" y "FR revestidas recombinantemente" se
refieren a la sustitución selectiva de restos de FR, por ejemplo,
de una región V de cadena pesada o ligera de roedor con restos de
FR humana para proporcionar una molécula xenogénica que comprende un
sitio de unión a antígeno que conserva sustancialmente toda la
estructura de plegamiento polipeptídico de FR nativa. Las técnicas
de revestimiento se basan en el entendimiento de que las
características de unión a ligando de un sitio de unión a antígeno
están determinadas principalmente por la estructura y la disposición
relativa de los conjuntos de CDR de cadena pesada y ligera dentro
de la superficie de unión a antígeno. Davies et al. (1990)
Ann. Rev. Biochem. 59: 439-473. Por lo tanto, la
especificidad de la unión a antígeno puede preservarse en un
anticuerpo humanizado solamente cuando las estructuras de CDR, su
interacción entre sí y su interacción con el resto de los dominios
de la región V se mantienen cuidadosamente. Mediante el uso de
técnicas de revestimiento, los restos de FR exteriores (por
ejemplo, accesibles por el disolvente) con los que se encuentra
fácilmente el sistema inmune se sustituyen selectivamente con
restos humanos para proporcionar una molécula híbrida que comprende
una superficie revestida débilmente inmunógena o sustancialmente no
inmunógena.
El proceso de revestimiento hace uso de los
datos de secuencia disponibles para dominios variables de
anticuerpos humanos recopilados por Kabat et al., en
Sequences of Proteins of Immunological Interest, 4ª ed., (U.S. Dept.
of Health y Human Services, U.S. Government Printing Office, 1987),
actualizaciones de la base de datos de Kabat y otras bases de datos
accesibles de los Estados Unidos y del extranjero (tanto de ácidos
nucleicos como de proteínas). Las accesibilidades al disolvente de
aminoácidos de la región V pueden deducirse a partir de la
estructura tridimensional conocida para fragmentos de anticuerpos
humanos y murinos. Existen dos etapas generales en el revestimiento
de un sitio de unión a antígeno murino. Inicialmente, las FR de los
dominios variables de una molécula de anticuerpo de interés se
comparan con las secuencias de FR correspondientes de dominios
variables humanos obtenidas de las fuentes identificadas
anteriormente. Las regiones V humanas más homólogas se comparan
después resto por resto con los aminoácidos murinos
correspondientes. Los restos en la FR murina que difieren del
homólogo humano se sustituyen por los restos presentes en el resto
humano usando procedimientos recombinantes bien conocidos en la
técnica. El intercambio de restos se lleva a cabo solamente con
restos que están al menos parcialmente expuestos (accesibles al
disolvente) y se tiene cuidado en la sustitución de restos
aminoacídicos que puedan tener un efecto significativo sobre la
estructura terciaria de dominios de la región V, tales como
prolina, glicina y aminoácidos cargados.
De esta forma, los sitios de unión a antígeno
murinos "revestidos" resultantes están, por lo tanto, diseñados
para conservar los restos de CDR murinas, los restos
sustancialmente adyacentes a las CDR, los restos identificados como
enterrados o casi enterrados (inaccesibles al disolvente), los
restos que se piensa que participan en contactos no covalentes (por
ejemplo, electrostáticos e hidrófobos) entre dominios de la cadena
pesada y ligera y los restos de regiones estructurales conservadas
de las FR que se piensa que influyen en las estructuras terciarias
"canónicas" de los bucles de CDR. Estos criterios de diseño se
usan después para preparar secuencias de nucleótidos recombinantes
que combinan las CDR tanto de la cadena pesada como ligera de un
sitio de unión a antígeno murino en FR que parecen humanas que
pueden usarse para transfectar células de mamífero para la
expresión de anticuerpos humanos recombinantes que presenten la
especificidad de antígeno de la molécula de anticuerpo murina.
En otra realización de la invención, pueden
acoplarse anticuerpos monoclonales de la presente invención con uno
o más agentes terapéuticos. Los agentes adecuados a este respecto
incluyen radionúclidos, inductores de la diferenciación, fármacos,
toxinas y derivados de los mismos. Los radionúclidos preferidos
incluyen ^{90}Y, ^{123}I, ^{125}I, ^{131}I, ^{186}Re,
^{188}Re, ^{211}At y ^{212}Bi. Los fármacos preferidos
incluyen metotrexato y pirimidina y análogos de purina. Los
inductores de la diferenciación preferidos incluyen ésteres de
forbol y ácido butírico. Las toxinas preferidas incluyen ricina,
abrina, toxina diftérica, toxina del cólera, gelonina, exotoxina de
Pseudomonas, toxina de Shigella y proteína antiviral de hierba
carmín.
Un agente terapéutico puede acoplarse (por
ejemplo, unirse covalentemente) con un anticuerpo monoclonal
adecuado directamente o indirectamente (por ejemplo, mediante un
grupo enlazador). Es posible una reacción directa entre un agente y
un anticuerpo cuando cada uno posee un sustituyente capaz de
reaccionar con el otro. Por ejemplo, un grupo nucleófilo tal como
un grupo amino o sulfhidrilo en uno puede ser capaz de reaccionar
con un grupo que contiene carbonilo, tal como un anhídrido o un
haluro de ácido, o con un grupo alquilo que contiene un buen grupo
saliente (por ejemplo, un haluro) en el otro.
Como alternativa, puede ser deseable acoplar un
agente terapéutico y un anticuerpo mediante un grupo enlazador. Un
grupo enlazador puede funcionar como un espaciador para distanciar
un anticuerpo de un agente para evitar la interferencia con las
capacidades de unión. Un grupo enlazador también puede servir para
aumentar la reactividad química de un sustituyente en un agente o
un anticuerpo y, por lo tanto, aumentar la eficacia de acoplamiento.
Un aumento en la reactividad química también puede facilitar el uso
de agentes, o grupos funcionales en agentes, que de otro modo no
sería posible.
Será evidente para los especialistas en la
técnica que pueden emplearse una diversidad de reactivos
bifuncionales o polifuncionales, tanto homo- como
hetero-funcionales (tales como los descritos en el
catálogo de Pierce Chemical Co., Rockford, IL), como el grupo
enlazador. El acoplamiento puede efectuarse, por ejemplo, a través
de grupos amino, grupos carboxilo, grupos sulfhidrilo o restos
carbohidrato oxidados. Existen numerosas referencias que describen
dicha metodología, por ejemplo, la Patente de Estados Unidos Nº
4.671.958 de Rodwell et al.
Cuando un agente terapéutico es más potente
cuando está libre de la porción de anticuerpo de los
inmunoconjugados de la presente invención, puede ser deseable usar
un grupo enlazador que sea escindible durante o tras la
internalización en una célula. Se han descrito varios grupos
enlazadores escindibles diferentes. Los mecanismos para la
liberación intracelular de un agente de estos grupos enlazadores
incluyen la escisión por reducción de un enlace disulfuro (por
ejemplo, Patente de Estados Unidos Nº 4.489.710 de Spitler), por
irradiación de un enlace fotosensible (por ejemplo, Patente de
Estados Unidos Nº 4.625.014 de Sender et al.), por hidrólisis
de cadenas laterales de aminoácidos derivatizados (por ejemplo,
Patente de Estados Unidos Nº 4.638.045 de Kohn et al.), por
hidrólisis mediada por el complemento sérico (por ejemplo, Patente
de Estados Unidos Nº 4.671.958 de Rodwell et al.) e
hidrólisis catalizada por ácido (por ejemplo, Patente de Estados
Unidos Nº 4.569.789 de Blattler et al.).
Puede ser deseable acoplar más de un agente a un
anticuerpo. En una realización, se acoplan múltiples moléculas de
un agente a una molécula de anticuerpo. En otra realización, puede
acoplarse más de un tipo de agente con un anticuerpo.
Independientemente de la realización particular, pueden prepararse
inmunoconjugados con más de un agente de una diversidad formas. Por
ejemplo, puede acoplarse más de un agente directamente con una
molécula de anticuerpo o pueden usarse enlazadores que proporcionen
múltiples sitios para la unión. Como alternativa, puede usarse un
vehículo.
Un vehículo puede llevar los agentes de una
diversidad de formas, incluyendo la unión covalente directamente o
mediante un grupo enlazador. Los vehículos adecuados incluyen
proteínas tales como albúminas (por ejemplo, Patente de Estados
Unidos Nº 4.507.234 de Kato et al.), péptidos y polisacáridos
tales como aminodextrano (por ejemplo, Patente de Estados Unidos Nº
4.699.784, de Shih et al.). Un vehículo también puede llevar
un agente por unión no covalente o por encapsulación, tal como
dentro de una vesícula de liposoma (por ejemplo, Patentes de
Estados Unidos Nº 4.429.008 y 4.873.088). Los vehículos específicos
para agentes radionúclidos incluyen moléculas pequeñas
radiohalogenadas y compuestos quelantes. Por ejemplo, la Patente de
Estados Unidos Nº 4.735.792 describe moléculas pequeñas
radiohalogenadas representativas y su síntesis. Puede formarse un
quelado de radionúclido a partir compuestos quelantes que incluyen
los que contienen átomos de nitrógeno y azufre como los átomos
donadores para la unión del radionúclido de metal u óxido metálico.
Por ejemplo, la Patente de Estados Unidos Nº 4.673.562 de Davison
et al. describe compuestos quelantes representativos y su
síntesis.
\newpage
Las composiciones inmunoterapéuticas también, o
como alternativa, pueden comprender células T específicas para WT1.
Dichas células pueden prepararse generalmente in vitro o
ex vivo, usando procedimientos convencionales. Por ejemplo,
pueden estar presentes células T dentro de (o aislarse de) la médula
ósea, la sangre periférica o una fracción de la médula ósea o la
sangre periférica de un mamífero, tal como un paciente, usando un
sistema de separación de células disponible en el mercado, tal como
el sistema CEPRATE^{TM}, disponible en CellPro Inc., Bothell WA
(véase también la Patente de Estados Unidos Nº 5.240.856, Patente de
Estados Unidos Nº 56.215.926; documentos WO 89/06280; WO 91/16116 y
WO 92/07243). Como alternativa, pueden obtenerse células T de seres
humanos, animales no humanos, líneas celulares o cultivos
relacionados o no relacionados.
Pueden estimularse células T con polipéptido
WT1, un polinucleótido que codifica un polipéptido WT1 y/o una
célula presentadora de antígeno (APC) que exprese un polipéptido
WT1. Dicha estimulación se realiza en condiciones y durante un
tiempo suficiente para permitir la generación de células T que sean
específicas para el polipéptido WT1. Preferiblemente, un
polipéptido o polinucleótido de WT1 está presente en el interior de
un vehículo de suministro, tal como una microesfera, para facilitar
la generación de células T específicas de antígeno. En resumen, se
incuban células T, que pueden aislarse de un paciente o un donante
relacionado o no relacionado mediante técnicas de rutina (tal como
mediante centrifugación en gradiente de densidad de Ficoll/Hypaque
de linfocitos de sangre periférica), con polipéptido WT1. Por
ejemplo, pueden incubarse células T in vitro durante
2-9 días (típicamente 4 días) a 37ºC con polipéptido
WT1 (por ejemplo, 5 a 25 \mug/ml) o células que sinteticen una
cantidad comparable de polipéptido WT1. Puede ser deseable incubar
una alícuota separada de una muestra de células T en ausencia de
polipéptido WT1 para servir como control.
Se considera que las células T son específicas
para un polipéptido WT1 si las células T destruyen células diana
recubiertas con un polipéptido WT1 o que expresan un gen que
codifica dicho polipéptido. Puede evaluarse la especificidad de
células T usando cualquiera de una diversidad de técnicas
convencionales. Por ejemplo, dentro de un ensayo de liberación de
cromo o ensayo de proliferación, un aumento del índice de
estimulación de más de dos veces en la lisis y/o proliferación en
comparación con controles negativos indica especificidad de células
T. Dichos ensayos pueden realizarse, por ejemplo, como se describe
en Chen et al., Cancer Res. 54: 1065-1070,
1994. Como alternativa, la detección de la proliferación de células
T puede conseguirse mediante una diversidad técnicas conocidas. Por
ejemplo, puede detectarse la proliferación de células T por medición
de una velocidad aumentada de síntesis de ADN (por ejemplo,
mediante marcaje por pulsos de cultivos de células T con timidina
tritiada y medición de la cantidad de timidina tritiada incorporada
en el ADN). Otras formas de detectar la proliferación de células T
incluyen medir aumentos en la producción de
interleuquina-2 (IL-2), flujo de
Ca^{2+}, o captación decolorante, tal como
3-(4,5-dimetiltiazol-2-il)-2,5-difenil-tetrazolio.
Como alternativa, puede medirse la síntesis de linfoquinas (tales
como interferón-gamma) o puede cuantificarse el
número relativo de células T que pueden responder a un polipéptido
WT1. El contacto con un polipéptido WT1 (200
ng/ml-100 \mug/ml, preferiblemente 100
ng/ml-25 \mug/ml) durante 3-7 días
debería dar como resultado un aumento de al menos dos veces en la
proliferación de las células T y/o el contacto como se ha descrito
anteriormente durante 2-3 horas debería dar como
resultado la activación de las células T, según se mide usando
ensayos de citoquinas convencionales en los que un aumento de dos
veces en el nivel de liberación de citoquinas (por ejemplo, TNF o
IFN-\gamma) es indicativo de la activación de
células T (véase Coligan et al., Current Protocols in
Immunology, vol. 1, Wiley Interscience (Greene 1998). Pueden
expandirse células T específicas de WT1 usando técnicas
convencionales. Dentro de realizaciones preferidas, las células T
proceden de un paciente o un donante relacionado o no relacionado y
se administran al paciente después de la estimulación y
expansión.
Las células T que se han activado en respuesta a
un polipéptido WT1, polinucleótido o APC que expresa WT1 pueden ser
CD4^{+} y/o CD8^{+}. La activación específica de células T
CD4^{+} o CD8^{+} puede detectarse de una diversidad de formas.
Los métodos para detectar la activación de células T específicas
incluyen detectar la proliferación de células T, la producción de
citoquinas (por ejemplo, linfoquinas) o la generación de actividad
citolítica (es decir, generación de células T citotóxicas
específicas para WT1). Para células T CD4^{+}, un método
preferido para detectar la activación de células T específicas es la
detección de la proliferación de células T. Para células T
CD8^{+}, un método preferido para detectar la activación de
células T específicas es la detección de la generación de actividad
citolítica.
Para fines terapéuticos, las células T CD4^{+}
o CD8^{+} que proliferan en respuesta al polipéptido,
polinucleótido o APC de WT1 pueden expandirse en número in
vitro o in vivo. La proliferación de dichas células T
in vitro puede conseguirse de una diversidad de formas. Por
ejemplo, las células T pueden volver a exponerse a polipéptido WT1
con o sin adición de factores de crecimiento de células T, tales
como interleuquina-2 y/o células estimuladoras que
sintetizan un polipéptido WT1. Se prefiere la adición de células
estimuladoras cuando se generan respuestas de células T CD8^{+}.
Pueden cultivarse células T en grandes cantidades in vitro
con conservación de la especificidad en la respuesta a una
reestimulación intermitente con polipéptido WT1. En resumen, para
la estimulación primaria in vitro (IVS), pueden colocarse
grandes cantidades de linfocitos (por ejemplo, más de 4 x 10^{7})
en matraces con medios que contienen suero humano. Puede añadirse
polipéptido WT1 (por ejemplo, péptido a 10 \mug/ml) directamente,
junto con toxoide tetánico (por ejemplo, 5 \mug/ml). Después, los
matraces pueden incubarse (por ejemplo, 37ºC durante 7 días). Para
una segunda IVS, las células T se recogen después y se colocan en
nuevos matraces con 2-3 x 10^{7} células
mononucleares de sangre periférica irradiadas. El polipéptido WT1
(por ejemplo, 10 \mug/ml) se añade directamente. Los matraces se
incuban a 37ºC durante 7 días. El día 2 y día 4 después de la
segunda IVS, pueden añadirse 2-5 unidades de
interleuquina-2 (IL-2). Para una
tercera IVS, las células T pueden colocarse en pocillos y
estimularse con las propias células B del individuo transformadas
con EBV recubiertas con el péptido. Puede añadirse
IL-2 los días 2 y 4 de cada ciclo. Tan pronto como
las células demuestren ser células T citotóxicas específicas, pueden
expandirse usando un ciclo de estimulación de 10 días con mayor
cantidad de IL-2 (20 unidades) los días 2, 4 y
6.
Como alternativa, una o más células T que
proliferan en presencia de polipéptido WT1 pueden expandirse en
número por clonación. Se conocen bien en la técnica métodos para
clonar células e incluyen la dilución limitante. Pueden purificarse
células T respondedoras a partir de la sangre periférica de
pacientes sensibilizados mediante centrifugación en gradiente de
densidad y formación de rosetas con eritrocitos de oveja, y
establecerse en cultivo por estimulación con el antígeno nominal en
presencia de células de relleno autólogas irradiadas. Para generar
líneas de células T CD4^{+}, se usa polipéptido WT1 como el
estímulo antigénico y se usan linfocitos autólogos de sangre
periférica (PBL) o líneas celulares linfoblastoides (LCL)
inmortalizadas por infección con el virus de Epstein Barr como
células presentadoras de antígeno. Para generar líneas de células T
CD8^{+}, pueden usarse células presentadoras de antígeno
autólogas transfectadas con un vector de expresión que produce
polipéptido WT1 como células estimuladoras. Las líneas de células T
establecidas pueden clonarse 2-4 días después de la
estimulación con antígeno por siembra en placas de células T
estimuladas a una frecuencia de 0,5 células por pocillo en placas
de fondo plano de 96 pocillos con 1 x 10^{6} células PBL o LCL
irradiadas e interleuquina-2 recombinante (rIL2)
(50 U/ml). Pueden identificarse pocillos con crecimiento clonal
establecido aproximadamente 2-3 semanas después de
la siembra en placas inicial y reestimularse con antígeno apropiado
en presencia de células presentadoras de antígeno autólogas, después
expandirse posteriormente mediante la adición de bajas dosis de
rIL2 (10 U/ml) 2-3 días después de la estimulación
con antígeno. Pueden mantenerse clones de células T en placas de 24
pocillos mediante reestimulación periódica con antígeno y rIL2
aproximadamente cada dos semanas.
Dentro de ciertas realizaciones, pueden
sensibilizarse células T alogénicas (es decir, sensibilizadas a WT1)
in vivo y/o in vitro. Dicha sensibilización puede
conseguirse por contacto de células T con un polipéptido WT1, y un
polinucleótido que codifica dicho polipéptido o una célula que
produce dicho polipéptido en condiciones y durante un tiempo
suficiente para permitir la sensibilización de células T. En
general, se considera que las células T están sensibilizadas si,
por ejemplo, el contacto con un polipéptido WT1 da como resultado la
proliferación y/o activación de las células T, según se mide
mediante ensayos de proliferación, liberación de cromo y/o
liberación de citoquinas convencionales como se describen en este
documento. Un aumento del índice de estimulación de más de dos
veces en la proliferación o la lisis y un aumento de más de tres
veces en el nivel de citoquinas, en comparación con controles
negativos, indica especificidad de células T. Pueden emplearse
células sensibilizadas in vitro, por ejemplo, dentro de un
trasplante de médula ósea o como infusión de linfocitos de
donante.
Las células T específicas para WT1 pueden
destruir células que expresen proteína WT1. Se usa la introducción
de genes que codifican cadenas de receptores de células T (TCR) para
WT1 como un medio para mejorar cuantitativamente y cualitativamente
respuestas contra células de leucemia y cancerosas que llevan WT1.
Las vacunas para aumentar el número de células T que pueden
reaccionar contra células positivas para WT1 son un método de
dirección a células que llevan WT1. La terapia de células T con
células T específicas para WT1 es otro método. Un método
alternativo es introducir las cadenas de TCR específicas para WT1 en
células T u otras células con potencial lítico. En una realización
adecuada, las cadenas alfa y beta de TCR se clonan a partir de una
línea de células T específicas de WT1 y se usan para una terapia
adoptiva de células T, tal como se describe en el documento WO
96/30516.
El receptor de células T (TCR) consiste en 2
cadenas polipeptídicas diferentes altamente variables denominadas
las cadenas \alpha y \beta del receptor de células T, que se
unen mediante un enlace disulfuro (Janeway, Travers, Walport.
Immunobiology. Cuarta Ed., 148-159. Elsevler Science
Ltd/Garland Publishing. 1999). El heterodímero \alpha/\beta
forma un complejo con las cadenas CD3 invariables en la membrana
celular. Este complejo reconoce péptidos antigénicos específicos
unidos a moléculas de MHC. La enorme diversidad de especificidades
de TCR se genera de forma muy similar a la diversidad de
inmunoglobulinas, a través de reorganización de genes somáticos.
Los genes de la cadena \beta contienen más de 50 segmentos
variables (V), 2 de diversidad (D), más de 10 de unión (J) y 2
segmentos de la región constante (C). Los genes de la cadena
\alpha contienen más de 70 segmentos V y más de 60 segmentos J
pero ningún segmento D, así como un segmento C. Durante el
desarrollo de células T en el timo, se produce la reorganización
génica de D a J de la cadena \beta, seguida de la reorganización
del segmento génico V con el DJ. Este exón VDJ\beta funcional se
transcribe y se corta y empalma para unirse a un C\beta. Para la
cadena \alpha, un segmento génico V\alpha se reorganiza con un
segmento génico J\alpha para generar el exón funcional que después
se transcribe y se corta y empalma en el C\alpha. La diversidad
se aumenta adicionalmente durante el proceso de recombinación
mediante la adición aleatoria de P y N-nucleótidos,
entre los segmentos V, D y J de la cadena \beta y entre los
segmentos V y J en la cadena \alpha (Janeway, Travers, Walport.
Immunobiology. Cuarta Ed., 98 y 150. Elsevier Science Ltd/Garland
Publishing. 1999).
La presente invención, en otro aspecto,
proporciona TCR específicos para un polipéptido descrito en este
documento o para una VARIANTEe o derivado del mismo. De acuerdo con
la presente invención, se proporcionan secuencias polinucleotídicas
y de aminoácidos para las regiones de unión V-J o
V-D-J, o partes de las mismas, para
las cadenas alfa y beta del receptor de células T que reconocen
polipéptidos tumorales descritos en este documento. En general,
este aspecto de la invención se refiere a receptores de células T
que reconocen o se unen a polipéptidos tumorales presentados en el
contexto de MHC. En una realización preferida, los antígenos
tumorales reconocidos por los receptores de células T comprenden un
polipéptido de la presente invención. Por ejemplo, puede aislarse
un ADNc que codifica un TCR específico para un péptido WT1 a partir
de células T específicas para un polipéptido tumoral usando
técnicas de biología molecular y de ADN recombinante
convencionales.
Esta invención incluye además los receptores de
células T o análogos de los mismos que tienen sustancialmente la
misma función o actividad que los receptores de células T de esta
invención, que reconocen o se unen a polipéptidos tumorales. Dicho
receptores incluyen, pero sin limitación, un fragmento del receptor,
o un mutante de sustitución, adición o deleción de un receptor de
célula T proporcionado en este documento. Esta invención también
incluye polipéptidos o péptidos que son sustancialmente homólogos a
los receptores de células T proporcionados en este documento o que
conservan sustancialmente la misma actividad. El término
"análogo" incluye cualquier proteína o polipéptido que tenga
una secuencia de restos aminoacídicos sustancialmente idéntica a los
receptores de células T proporcionados en este documento en la que
uno o más restos, preferiblemente no más de 5 restos, más
preferiblemente no más de 25 restos se han sustituido
conservativamente con un resto funcionalmente similar, y que
presenta los aspectos funcionales del receptor de células T como se
describe en este documento.
La presente invención proporciona además células
hospedadoras de mamífero adecuadas, por ejemplo, células T
inespecíficas que se transfectan con un polinucleótido que codifica
TCR específicos para un polipéptido descrito en este documento,
volviendo de este modo a la célula hospedadora específica para el
polipéptido. Las cadenas \alpha y \beta del TCR pueden estar
contenidas en vectores de expresión separados o, como alternativa,
en un solo vector de expresión que también contiene un sitio interno
de entrada al ribosoma (IRES) para la traducción independiente de
caperuza del gen cadena abajo del IRES. Dichas células hospedadoras
que expresan TCR específicos para el polipéptido pueden usarse, por
ejemplo, para inmunoterapia adoptiva de un cáncer asociado a WT1,
como se analiza adicionalmente a continuación.
En aspectos adicionales de la presente
invención, pueden usarse TCR clonados específicos para un
polipéptido enumerado en este documento en un kit para el
diagnóstico de un cáncer asociado a WT1. Por ejemplo, puede usarse
la secuencia de ácido nucleico, o porciones de la misma, de TCR
específicos de tumor como sondas o cebadores para la detección de
la expresión de los genes reorganizados que codifican el TCR
específico en una muestra biológica. Por lo tanto, la presente
invención proporciona además un ensayo para detectar ARN mensajero
o ADN que codifica el TCR específico para un polipéptido.
La presente invención, en otro aspecto,
proporciona complejos tetraméricos (tetrámeros)
péptido-MHC específicos para células T que
reconocen un polipéptido descrito en este documento, o para una
VARIANTEe o derivado de la misma. En una realización, pueden usarse
tetrámeros en la detección de células T específicas de WT1. Pueden
usarse tetrámeros en el control de respuestas inmunes específicas de
WT1, la detección temprana de tumores malignos asociados con WT1 y
para el control de una enfermedad mínima residual. La tinción de
tetrámeros se lleva a cabo típicamente con el análisis citométrico
de flujo y puede usarse para identificar grupos dentro una
población de pacientes que padecen una enfermedad asociada a WT1 con
un mayor riesgo de recaída o avance de la enfermedad.
En realizaciones adicionales, la presente
invención se refiere a la formulación de uno o más de las
composiciones de polinucleótidos, polipéptidos, células T, TCR y/o
anticuerpos descritos en este documento en vehículos
farmacéuticamente aceptables para la administración a una célula o a
un animal, en solitario o en combinación con una u otras
modalidades más de terapia.
Se entenderá que, si se desea, puede
administrarse una composición como se describe en este documento en
combinación con otros agentes también, tales como, por ejemplo,
otras proteínas o polipéptidos o diversos agentes farmacéuticamente
activos. De hecho, prácticamente no existe limitación de otros
componentes que también pueden incluirse, siempre que los agentes
adicionales no causen un efecto adverso significativo tras el
contacto con las células diana o tejidos del hospedador. Por lo
tanto, las composiciones pueden suministrarse junto con diversos
otros agentes según sea necesario en el caso particular. Dichas
composiciones pueden purificarse a partir de células hospedadoras u
otras fuentes biológicas, o como alternativa pueden sintetizarse
químicamente como se describe en este documento. Asimismo, dichas
composiciones puede comprender además composiciones de ARN o ADN
sustituido o derivatizado.
Por lo tanto, en otro aspecto de la presente
invención, se proporcionan composiciones farmacéuticas que
comprenden una o más de las composiciones de polinucleótidos,
polipéptidos, anticuerpos, TCR y/o células T descritas en este
documento en combinación con un vehículo fisiológicamente aceptable.
En ciertas realizaciones preferidas, las composiciones
farmacéuticas de la invención comprenden composiciones inmunógenas
de polinucleótidos y/o polipéptidos de la invención para el uso en
aplicaciones de vacunas profilácticas y terapéuticas. La preparación
de vacunas se describe en general, por ejemplo, en M. F. Powell y
M. J. Newman, eds., "Vaccine Design (the subunit y adjuvant
approach)", Plenum Press (NY, 1995). Generalmente, dichas
composiciones comprenderán una o más composiciones de
polinucleótidos y/o polipéptidos de la presente invención en
combinación con uno o más inmunoestimulantes.
Será evidente que cualquiera de las
composiciones farmacéuticas descritas en este documento puede
contener sales farmacéuticamente aceptables de los polinucleótidos
y polipéptidos de la invención. Dichas sales pueden prepararse, por
ejemplo, a partir de bases no tóxicas farmacéuticamente aceptables,
incluyendo bases orgánicas (por ejemplo, sales de aminas primarias,
secundarias y terciarias y aminoácidos básicos) y bases inorgánicas
(por ejemplo, sales de sodio, potasio, litio, amonio, calcio y
magnesio).
En otra realización, las composiciones
inmunógenas ilustrativas, por ejemplo, composiciones de vacunas de
la presente invención, comprenden ADN que codifica uno o más de los
polipéptidos que se han descrito anteriormente, de modo que el
polipéptido se genera in situ. Como se ha indicado
anteriormente, el polinucleótido puede administrarse dentro de
cualquiera de una diversidad de sistemas de suministro conocidos por
los especialistas en la técnica. De hecho, son bien conocidas en la
técnica numerosos procedimientos de suministro de genes, tales como
los descritos por Rolland, Crit. Rev. Therap. Drug Carrier Systems
15: 143-198, 1998, y referencias citadas en el
mismo. Los sistemas de expresión de polinucleótidos apropiados
contendrán, por supuesto, las secuencias reguladoras de ADN
reguladoras necesarias para la expresión en un paciente (tal como un
promotor y una señal de terminación adecuados). Como alternativa,
los sistemas de suministro bacteriano pueden implicar la
administración de una bacteria (tal como
Bacillus-Calmette-Guerrin)
que expresa una porción inmunógena del polipéptido en su superficie
celular o secreta dicho epítopo.
Por lo tanto, en ciertas realizaciones, los
polinucleótidos que codifican polipéptidos inmunógenos descritos en
este documento se introducen en células hospedadoras de mamífero
adecuadas para la expresión usando cualquiera de varios sistemas
basados en virus conocidos. En una realización ilustrativa, los
retrovirus proporcionan una plataforma conveniente y eficaz para
sistemas de suministro de genes. Una secuencia de nucleótidos
seleccionada que codifica un polipéptido de la presente invención
puede insertarse en un vector y empaquetarse en partículas
retrovirales usando procedimientos conocidos en la técnica. Después,
el virus recombinante puede aislarse y suministrarse a un sujeto.
Se han descrito varios sistemas retrovirales ilustrativos (por
ejemplo, Patente de Estados Unidos Nº 5.219.740; Miller y Rosman
(1989) BioTechniques 7: 980-990; Miller, A. D.
(1990) Human Gene Therapy 1: 5-14; Scarpa et
al. (1991) Virology 180: 849-852; Burns et
al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:
8033-8037; y Boris-Lawrie y Temin
(1993) Cur. Opin. Genet. Develop. 3: 102-109.
Además, también se han descrito varios sistemas
basados en adenovirus ilustrativos. A diferencia de los retrovirus
que se integran en el genoma del hospedador, los adenovirus
persisten extracromosómicamente minimizando por lo tanto los
riesgos asociados con la mutagénesis insercional
(Haj-Ahmad y Graham (1986) J. Virol. 57:
267-274; Bett et al. (1993) J. Virol. 67:
5911-5921; Mittereder et al. (1994) Human
Gene Therapy 5: 717-729; Seth et al. (1994)
J. Virol. 68: 933-940; Barr et al. (1994)
Gene Therapy 1: 51-58; Berkner, K. L. (1988)
BioTechniques 6: 616-629; y Rich et al.
(1993) Human Gene Therapy 4: 461-476).
También se han desarrollado diversos sistemas
vector de virus adenoasociados (AAV) para suministro de
polinucleótidos. Los vectores de AAV pueden construirse fácilmente
usando procedimientos bien conocidos en la técnica. Véase, por
ejemplo, las Patentes de Estados Unidos Nº 5.173.414 y 5.139.941;
las Publicaciones Internacionales Nº WO 92/01070 y WO 93/03769;
Lebkowski et al. (1988) Molec. Cell. Biol. 8:
3988-3996; Vincent et al. (1990) Vaccines 90
(Cold Spring Harbor Laboratory Press); Carter, B. J. (1992) Current
Opinion in Biotechnology 3: 533-539; Muzyczka, N.
(1992) Current Topics in Microbiol. y Immunol. 158:
97-129; Kotin, R. M. (1994) Human Gene Therapy
5:793-801; Shelling y Smith (1994) Gene Therapy 1:
165-169; y Zhou et al. (1994) J. Exp. Med.
179: 1867-1875.
Los vectores virales adicionales útiles para el
suministro de los polinucleótidos que codifican polipéptidos de la
presente invención mediante transferencia génica incluyen los
derivados de la familia de poxvirus, tales como virus vaccinia y
poxvirus aviares. A modo de ejemplo, pueden construirse de la forma
siguiente virus vaccinia recombinantes que expresen las nuevas
moléculas. El ADN que codifica un polipéptido se inserta primero en
un vector apropiado de modo que sea adyacente a un promotor de
vaccinia y flanquee secuencias de ADN de vaccinia, tales como la
secuencia que codifica la timidina quinasa (TK). Después, este
vector se usa para transfectar células que se infectan
simultáneamente con vaccinia. La recombinación homóloga sirve para
insertar el promotor de vaccinia más el gen que codifica el
polipéptido de interés en el genoma viral. El recombinante
TK.sup.(-) resultante puede seleccionarse mediante cultivo de las
células en presencia de 5-bromodesoxiuridina y
selección de placas virales resistentes a la misma.
Puede usarse convenientemente un sistema de
infección/transfección basado en vaccinia para proporcionar una
expresión o coexpresión transitoria inducible de uno o más
polipéptidos descritos en este documento en células hospedadoras de
un organismo. En este sistema particular, las células se infectan
primero in vitro con un virus vaccinia recombinante que
codifica la ARN polimerasa del bacteriófago T7. Esta polimerasa
presenta una especificidad exquisita en el sentido de que sólo
transcribe moldes que lleven promotores de T7. Después de la
infección, las células se transfectan con el polinucleótido o
polinucleótidos de interés, dirigidos por un promotor de T7. La
polimerasa expresada en el citoplasma del virus vaccinia
recombinante transcribe el ADN transfectado en ARN que después se
traduce en un polipéptido por la maquinaria de traducción del
hospedador. El método proporciona un alto nivel de producción
citoplásmica transitoria de grandes cantidades de ARN y sus
productos de traducción. Véase, por ejemplo,
Elroy-Stein y Moss, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
(1990) 87: 6743-6747; Fuerst et al. Proc.
Natl. Acad. Sci. USA (1986) 83: 8122-B 126.
Como alternativa, también pueden usarse
avipoxvirus tales como los virus de la viruela aviar y de la viruela
del canario, para suministrar las secuencias codificantes de
interés. Se sabe que los avipoxvirus recombinantes, que expresan
inmunógenos de patógenos de mamíferos, confieren inmunidad
protectora cuando se administran a especies no aviares. El uso de
un vector de Avipoxvirus es particularmente deseable en seres
humanos y otras especies de mamíferos puesto que los miembros del
género Avipoxvirus sólo pueden replicarse de forma productiva en
especies aviares susceptibles y, por lo tanto, no son infecciosos en
células de mamífero. Se conocen en la técnica métodos para producir
Avipoxvirus recombinantes y emplean recombinación genética, como se
ha descrito anteriormente con respecto a la producción de virus
vaccinia. Véase, por ejemplo, los documentos WO 91/12882; WO
89/03429; y WO 92/03545. Se han desarrollado varios poxvirus como
vectores virales vivos para la expresión de proteínas heterólogas
(Cepko et al., Cell 37: 1053-1062 (1984);
Morin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84:
4626-4630 (1987); Lowe et al., Proc. Natl.
Acad. Sci. USA, 84: 3896-3900 (1987); Panicali y
Paoletti, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 79: 4927-4931
(1982); Machett et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 79:
7415-7419 (1982)). Están disponibles virus de la
viruela aviar y de la viruela porcina representativos a través de la
ATCC bajos los números de acceso VR-229 y
VR-363, respectivamente. Está disponible un
vaccinia-CEA recombinante a través de la ATCC bajo
el número de acceso VR2323. Otros vectores virales ilustrativos
también incluyen, pero sin limitación, los descritos por Therion
Biologics (Cambridge, MA, Estados Unidos), por ejemplo, en las
Patentes de Estados Unidos Nº 6.051.410, 5.858.726, 5.656.465,
5.804.196, 5.747.324, 6.319.496, 6.165.460.
También puede usarse cualquiera de varios
vectores de alfavirus para el suministro de composiciones de
polinucleótidos de la presente invención, tales como los vectores
descritos en las Patentes de Estados Unidos 5.843.723; 6.015.686;
6.008.035 y 6.015.694. También pueden usarse ciertos vectores
basados en la Encefalitis Equina Venezolana (VEE), pudiendo
encontrarse ejemplos ilustrativos de los mismos en las Patentes de
Estados Unidos Nº 5.505.947 y 5.643.576.
Además, también pueden usarse para el suministro
de genes en la invención vectores conjugados moleculares, tales
como los vectores quiméricos de adenovirus descritos en Michael
et al. J. Biol. Chem. (1993) 268: 6866-6869
y Wagner et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1992) 89:
6099-6103.
Puede encontrarse información ilustrativa
adicional sobre éstos y otros sistemas de suministro basados en
virus conocidos, por ejemplo, en Fisher-Hoch et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:317-321,1989;
Flexner et al., Ann. N. Y. Acad. Sci. 569:
86-103, 1989; Flexner et al., Vaccine
8:17-21, 1990; Patente de Estados Unidos Nº
4.603.112, 4.769.330, y 5.017.487; WO 89/01973; Patente de Estados
Unidos Nº 4.777.127; GB 2.200.651; EP 0.345.242; WO 91/02805;
Berkner, Biotechniques 6: 616-627, 1988; Rosenfeld
et al., Science 252: 431-434, 1991; Kolls
et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:
215-219, 1994; Kass-Eisler et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:
11498-11502, 1993; Guzman et al., Circulation
88: 2838-2848, 1993; y Guzman et al., Cir.
Res. 73: 1202-1207, 1993.
Como apreciará fácilmente el especialista en la
técnica, pueden estar presentes gran cantidad de componentes
adicionales en un vector de ADN o retroviral que exprese un
polipéptido WT1 o cualquier porción del mismo, como se describe en
este documento. Por ejemplo, un vector de expresión para el
suministro de un polinucleótido o péptido de la presente invención
puede incluir gran cantidad de una diversidad de moléculas
coestimuladoras, incluyendo, pero sin limitación CD28,
B7-1, ICAM-1 y
LFA-3. Un vector de suministro también puede incluir
gran cantidad de citoquinas, por ejemplo,
IFN-\gamma, GM-CSF o
IL-2. En una realización ilustrativa, un vector
viral recombinante, por ejemplo, un vector de vaccinia o virus de la
viruela aviar incluye B7-1, ICAM-1
y LFA-3.
La presente invención también comprende el uso
de cualquier combinación de los vectores de ADN y/o virales
descritos en este documento para el uso en el tratamiento de tumores
malignos asociados con la expresión de WT1. En una realización
ilustrativa, se administra un vector viral de vaccinia recombinante
a un animal o paciente humano aquejado de un tumor maligno asociado
con WT1, seguido de la administración de un vector de virus de la
viruela aviar recombinante. En otra realización de la presente
invención, el virus de la viruela aviar recombinante se administra
dos veces después de la administración del vector de vaccinia (por
ejemplo, un régimen de vacunación de
sensibilización/refuerzo/refuerzo).
En ciertas realizaciones, un polinucleótido
puede integrarse en el genoma de una célula diana. Esta integración
puede ser en la localización y orientación específica mediante
recombinación homóloga (sustitución de genes) o puede integrarse en
una localización inespecífica aleatoria (aumento de genes). En otras
realizaciones adicionales, el polinucleótido puede mantenerse de
forma estable en la célula como un segmento episomal separado de
ADN. Dichos segmentos polinucleotídicos o "episomas" codifican
secuencias suficientes para permitir el mantenimiento y la
replicación independiente de o en sincronización con el ciclo de la
célula hospedadora. La forma en la que se suministra la
construcción de expresión a una célula y dónde permanece el
polinucleótido en la célula dependen del tipo de construcción de
expresión que se emplee.
En otra realización de la invención, se
administra/suministra un polinucleótido como ADN "desnudo", por
ejemplo, como se describe en Ulmer et al., Science 259:
1745-1749, 1993 y se revisa por Cohen, Science 259:
1691-1692, 1993. La captación de ADN desnudo puede
aumentarse por recubrimiento del ADN sobre perlas biodegradables que
se transportan eficazmente al interior de las células.
En otra realización más, puede suministrarse una
composición de la presente invención mediante una estrategia de
bombardeo de partículas, habiéndose descrito muchas de ellas. En un
ejemplo ilustrativo, puede conseguirse una aceleración de
partículas impulsada por gas con dispositivos tales como los
fabricados por Powderject Pharmaceuticals PLC (Oxford, Reino Unido)
y Powderject Vaccines Inc. (Madison, WI), describiéndose algunos
ejemplos de los mismos en las Patentes de Estados Unidos Nº
5.846.796; 6.010.478; 5.865.796; 5.584.807 y la Patente EP Nº 0500
799. Este enfoque ofrece una estrategia de suministro sin aguja en
la que una formulación en polvo seco de partículas microscópicas,
tales como partículas polinucleotídicas o polipeptídicas, se acelera
a alta velocidad dentro de un chorro de gas helio generado mediante
un dispositivo de mano, propulsando las partículas hacia un tejido
diana de interés.
En una realización relacionada, otros
dispositivos y métodos que pueden ser útiles para la inyección sin
aguja impulsada por gas de composiciones de la presente invención
incluyen los proporcionados por Bioject, Inc. (Portland, OR),
describiéndose algunos de los ejemplos de los mismos en las Patentes
de Estados Unidos Nº. 4.790.824; 5.064.413; 5.312.335; 5.383.51;
5.399.163; 5.520.639 y 5.993.412.
De acuerdo con otra realización, las
composiciones farmacéuticas descritas en este documento comprenderán
uno o más inmunoestimulantes además de las composiciones
inmunógenas de polinucleótidos, polipéptidos, anticuerpos, células
T, TCR y/o APC de esta invención. Un inmunoestimulante se refiere
esencialmente a cualquier sustancia que aumente o potencie una
respuesta inmune (de anticuerpos y/o mediada por células) contra un
antígeno exógeno. Un tipo preferido de inmunoestimulante comprende
un adyuvante. Muchos adyuvantes contienen una sustancia diseñada
para proteger al antígeno de un catabolismo rápido, tal como
hidróxido de aluminio o aceite mineral, y un estimulador de
respuestas inmunes, tal como lípido A, proteínas derivadas de
Bordetella pertussis o Mycobacterium tuberculosis.
Ciertos adyuvantes están disponibles en el mercado, por ejemplo,
Adyuvante Incompleto y Adyuvante Completo de Freund (Difco
Laboratories, Detroit, MI); Adjuvante 65 de Merck (Merck y Company,
Inc, Raahway, NJ); AS-2 (SmithKline Beecham,
Philadelphia, PA); sales de aluminio tales como gel de hidróxido de
aluminio (alumbre) o fosfato de aluminio, sales de calcio, hierro o
cinc; una suspensión insoluble de tirosina acilada; azúcares
acilados; polisacáridos derivatizados catiónicamente o
aniónicamente; polifosfacenos; microesferas biodegradables;
monofosforil lípido A y quil A. También pueden usarse como
adyuvantes citoquinas, tales como GM-CSF,
interleuquina-2, -7, -12 y otros factores de
crecimiento similares.
Dentro de ciertas realizaciones de la invención,
la composición adyuvante es preferiblemente una que induce una
respuesta inmune predominantemente del tipo Th1. Altos niveles de
citoquinas de tipo Th1 (por ejemplo, IFN-\gamma,
TNF-\alpha, IL-2 e
IL-12) tienden a favorecer la inducción de
respuestas inmunes mediadas por células contra un antígeno
administrado. Por el contrario, altos niveles de citoquinas de tipo
Th2 (por ejemplo, IL-4, IL-5,
IL-6 e IL-10) tienden a favorecer la
inducción de respuestas inmunes humorales. Después de la aplicación
de una vacuna como se proporciona en este documento, un paciente
mantendrá una respuesta inmune que incluye respuestas de tipo Th1 y
Th2. Dentro de una realización preferida, en la que una respuesta
es predominantemente de tipo Th1, el nivel de citoquinas de tipo Th1
aumentará en mayor medida que el nivel de citoquinas de tipo Th2.
Los niveles de estas citoquinas pueden evaluarse fácilmente usando
ensayos convencionales. Para una revisión de las familias de
citoquinas, véase Mosmann y Coffman, Ann. Rev. Immunol. 7:
145-173, 1989.
Ciertos adyuvantes preferidos para generar una
respuesta predominantemente de tipo Th1 incluyen, por ejemplo, una
combinación de monofosforil lípido A, preferiblemente monofosforil
lípido A
3-des-O-acilado,
junto con una sal de aluminio. Están disponibles adyuvantes MPL® en
Corixa Corporation (Seattle, WA; véase, por ejemplo, las Patentes
de Estados Unidos Nº 4.436.727; 4.877.611; 4.866.034 y 4.912.094).
Los oligonucleótidos que contienen CpG (donde el dinucleótido CpG
no está metilado) también inducen una respuesta predominantemente
Th1. Dichos oligonucleótidos son bien conocidos y se describen, por
ejemplo, en los documentos WO 96/02555, WO 99/33488 y las Patentes
de Estados Unidos Nº 6.008.200 y 5.856.462. También se describen
secuencias de ADN inmunoestimuladoras, por ejemplo, por Sato et
al., Science 273: 352, 1996. Otro adyuvante preferido comprende
una saponina, tal como Quil A, o derivados de la misma, incluyendo
QS21 y QS7 (Aquila Biopharmaceuticals Inc., Framingham, MA);
Escina; Digitonina; o saponinas de Gypsophila o
Chenopodium quinoa. Otras formulaciones preferidas incluyen
más de una saponina en las combinaciones de adyuvantes de la
presente invención, por ejemplo combinaciones de al menos dos del
siguiente grupo que comprende QS21, QS7, Quil A,
\beta-escina o digitonina.
Como alternativa, las formulaciones de saponina
puede combinarse con vehículos de vacunas compuestos por quitosana
u otros polímeros policatiónicos, partículas de polilactida y
polilactida-co-glicolida, matriz
polimérica basada en poli-N-acetil
glucosamina, partículas compuestas por polisacáridos o polisacáridos
modificados químicamente, liposomas y partículas a base de lípidos,
partículas compuestas por monoésteres de glicerol, etc. Las
saponinas también pueden formularse en presencia de colesterol para
formar estructuras particuladas tales como liposomas o ISCOM.
Además, las saponinas pueden formularse junto con un éter o éster de
polioxietileno, en una solución o suspensión no particulada o en
una estructura particulada tal como un liposoma paucilaminar o
ISCOM. Las saponinas también pueden formularse con excipientes
tales como Carbopol^{R} para aumentar la viscosidad, o pueden
formularse en forma de polvo seco con un excipiente en polvo tal
como lactosa.
En una realización preferida, el sistema
adyuvante incluye la combinación de un monofosforil lípido A y un
derivado de saponina, tal como la combinación de adyuvante QS21 y
3D-MPL®, como se describe en el documento WO
94/00154 o una composición menos reactógena en la que el QS21 se
inactiva con colesterol, como se describe en el documento WO
96/33739. Otras formulaciones preferidas comprenden una emulsión de
aceite en agua y tocoferol. Se describe otra formulación de
adyuvante particularmente preferida que emplea QS21, adyuvante
3D-MPL® y tocoferol en una emulsión de aceite en
agua en el documento WO 95/17210.
Otro sistema adyuvante mejorado implica la
combinación de un oligonucleótido que contiene CpG y un derivado de
saponina, particularmente la combinación de CpG y QS21 se describe
en el documento WO 00/09159. Preferiblemente, la formulación
comprende adicionalmente una emulsión de aceite en agua y
tocoferol.
Los adyuvantes ilustrativos adicionales para el
uso en las composiciones farmacéuticas de la invención incluyen
Montanide ISA 720 (Seppic, Francia), SAF (Chiron, California,
Estados Unidos), ISCOMS (CSL), MF-59 (Chiron), la
serie SBAS de adyuvantes (por ejemplo, SBAS-2 o
SBAS-4, disponibles en SmithKline Beecham,
Rixensart, Bélgica), Detox (Enhanzyn®) (Corixa, Hamilton, MT),
RC-529 (Corixa, Hamilton, MT) y otros
4-fosfatos de aminoalquil glucosaminida (AGP),
tales como los descritos en las Patentes de Estados Unidos en
trámite Nº 6.113.918 y 6.355.257 y en las Patentes de Estados
Unidos Nº 6.303.347 y adyuvantes de éter de polioxietileno tales
como los descritos en el documento WO 99/52549A1. Los adyuvantes
ilustrativos adicionales para el uso en las composiciones
farmacéuticas de la invención incluyen isotucerosol.
Otros adyuvantes preferidos incluyen moléculas
adyuvantes de la fórmula general
(I)HO(CH_{2}CH_{2}O)_{n}-A-R,
en la que, n es
1-50, A es un enlace o -C(O)-, R es alquilo
C_{1-50} o Fenil alquilo
C_{1-50}.
Una realización de la presente invención
consiste en una formulación de vacuna que comprende un éter de
polioxietileno (I), en la que n está entre 1 y 50, preferiblemente
4-24, más preferiblemente 9; el componente R es
C_{1-50}, preferiblemente alquilo
C_{4}-C_{20} y, más preferiblemente alquilo
C_{12} y A es un enlace. La concentración de los éteres de
polioxietileno debería estar en el intervalo de
0,1-20%, preferiblemente de 0,1-10%
y, más preferiblemente en el intervalo de 0,1-1%.
Los éteres de polioxietileno preferidos se seleccionan de grupo
siguiente:
éter de
polioxietilen-9-laurilo, éter de
polioxietilen-9-esteorilo
éter de
polioxietilen-8-esteorilo, éter de
polioxietilen-4-laurilo
éter de
polioxietilen-35-laurilo y éter de
polioxietilen-23-laurilo. Se
describen éteres de polioxietileno tales como lauril éter de
polioxietileno en el Índice Merck (12ª edición: entrada 7717). Estas
moléculas adyuvantes se describen en el documento WO 99/525549.
\vskip1.000000\baselineskip
El éter de polioxietileno de acuerdo con la
fórmula general (I) anterior puede, si se desea, combinarse con
otro adyuvante. Por ejemplo, una combinación de adyuvantes preferida
es preferiblemente con CpG, como se describe en la Solicitud de
Patente del Reino Unido en trámite GB 9820956.2
De acuerdo con otra realización de esta
invención, se suministra una composición inmunógena descrita en este
documento a un hospedador mediante células presentadoras de
antígeno (APC), tales como células dendríticas, macrófagos, células
B, monocitos y otras células que pueden modificarse por ingeniería
genética para ser APC eficaces. Dichas células pueden, pero no
necesariamente, modificarse genéticamente para aumentar la capacidad
para presentar el antígeno, para mejorar la activación y/o el
mantenimiento de la respuesta de células T, para tener efectos
antitumorales por sí mismas y/o para ser inmunológicamente
compatibles con el receptor (es decir, de haplotipo HLA
compatible). Generalmente pueden aislarse APC a partir de cualquiera
de una diversidad de fluidos biológicos y órganos, incluyendo
tejidos tumorales y peritumorales, y pueden ser células autólogas,
alogénicas, singénicas o xenogénicas.
Ciertas realizaciones preferidas de la presente
invención usan células dendríticas o progenitoras de las mismas
como células presentadoras de antígeno. Las células dendríticas son
APC altamente potentes (Banchereau y Steinman, Nature 392:
245-251, 1998) y se ha demostrado que son eficaces
como adyuvante fisiológico para generar una inmunidad antitumoral
profiláctica o terapéutica (véase, Timmerman y Levy, Ann. Rev. Med.
50: 507-529, 1999). En general, pueden
identificarse células dendríticas basándose en su forma típica
(estrellada in situ, con prolongaciones citoplasmáticas
marcadas (dendritas) visibles in vitro), su capacidad para
captar, procesar y presentar antígenos con alta eficacia y su
capacidad para activar respuestas de células T sin tratamiento
previo. Por supuesto, las células dendríticas pueden modificarse por
ingeniería genética para expresar receptores de superficie celular
específicos o ligandos que no se encuentren comúnmente en células
dendríticas in vivo o ex vivo, y dichas células
dendríticas modificadas se contemplan en la presente invención. Como
una alternativa a células dendríticas, pueden usarse células
dendríticas cargadas con antígenos de vesículas secretadas
(denominadas exosomas) dentro de una vacuna (véase Zitvogel et
al., Nature Med. 4: 594-600,1998).
Pueden obtenerse células dendríticas y
progenitoras a partir de sangre periférica, médula ósea, células
infiltrantes de tumores, células infiltrantes de tejidos
peritumorales, ganglios linfáticos, bazo, piel, sangre de cordón
umbilical y cualquier otro tejido o fluido adecuado. Por ejemplo,
pueden diferenciarse células dendríticas ex vivo por adición
de una combinación de citoquinas tales como GM-CSF,
IL-4, IL-13 y/o TNF\alpha a
cultivos de monocitos recogidos de sangre periférica. Como
alternativa, células positivas para CD34 recogidas de sangre
periférica, sangre de cordón umbilical o médula ósea pueden
diferenciarse en células dendríticas por adición al medio de
cultivo de combinaciones de GM-CSF,
IL-3, TNF\alpha, ligando CD40, LPS, ligando flt3
y/o otros u otros compuestos que inducen diferenciación, maduración
y proliferación de células dendríticas.
Las células dendríticas se clasifican
convenientemente como células "inmaduras" y "maduras", que
permite una forma sencilla de discriminar entre dos fenotipos bien
caracterizados. Sin embargo, no debería interpretarse que esta
nomenclatura excluye todas las fases intermedias posibles de
diferenciación. Las células dendríticas inmaduras se caracterizan
como APC con una alta capacidad para captación y procesamiento de
antígenos, que se correlaciona con la alta expresión de receptor
Fc\gamma y receptor de manosa. El fenotipo maduro se caracteriza
típicamente por una menor expresión de estos marcadores, pero una
alta expresión de moléculas de superficie celular responsables de
la activación de células T, tales como MHC clase I y clase II,
moléculas de adhesión (por ejemplo, CD54 y CD11) y moléculas
coestimuladoras (por ejemplo, CD40, CD80, CD86 y 4-1
BB).
Generalmente pueden transfectarse APC con un
polinucleótido de la invención (o porción u otra VARIANTEe del
mismo) de modo que el polipéptido codificado, o una porción
inmunógena del mismo, se exprese en la superficie celular. Dicha
transfección puede tener lugar ex vivo y después puede usarse
una composición farmacéutica que comprende dichas células
transfectadas para fines terapéuticos, como se describe en este
documento. Como alternativa, puede administrarse a un paciente un
vehículo de suministro de genes que se dirija a una célula
dendrítica u otra célula presentadora de antígeno, dando como
resultado una transfección que se produce in vivo. La
transfección in vivo y ex vivo de células dendríticas,
por ejemplo, puede realizarse generalmente usando cualquier método
conocido en la técnica, tal como los descritos en el documento WO
97/24447, o la estrategia de pistola de genes descrita por Mahvi
et al., Immunology y cell Biology 75:
456-460, 1997. Puede conseguirse la carga con
antígenos de células dendríticas por incubación de células
dendríticas o células progenitoras con el polipéptido tumoral, ADN
(desnudo o en el interior de un vector plasmídico) o ARN; o con una
bacteria o virus recombinante que exprese antígeno (por ejemplo,
vectores de vaccinia, virus de la viruela aviar, adenovirus o
lentivirus). Antes de la carga, el polipéptido puede conjugarse
covalentemente con un compañero inmunológico que proporcione ayuda
de células T (por ejemplo, una molécula transportadora). Como
alternativa, una célula dendrítica puede estimularse con un
compañero inmunológico no conjugado, por separado o en presencia del
polipéptido.
Aunque puede emplearse cualquier vehículo
adecuado conocido por los especialistas en la técnica en las
composiciones farmacéuticas de esta invención, el tipo de vehículo
variará típicamente dependiendo del modo de administración. Pueden
formularse composiciones de la presente invención para cualquier
forma de administración apropiada, incluyendo, por ejemplo,
administración tópica, oral, nasal, mucosa, intravenosa,
intracraneal, intraperitoneal, subcutánea e intramuscular.
Los vehículos para el uso dentro de dichas
composiciones farmacéuticas son biocompatibles y también pueden ser
biodegradables. En ciertas realizaciones, la formulación proporciona
preferiblemente un nivel relativamente constante de liberación de
componente activo. En otras realizaciones, sin embargo, puede
desearse una velocidad de liberación más rápida inmediatamente tras
la administración. La formulación de dichas composiciones está bien
dentro del nivel de especialidad normal en la técnica usando
procedimientos conocidos. Los vehículos ilustrativos útiles a este
respecto incluyen micropartículas de
poli(lactida-co-glicolida),
poliacrilato, látex, almidón, celulosa, dextrano y similares. Otros
vehículos de liberación retardada ilustrativos incluyen biovectores
supramoleculares, que comprenden un núcleo hidrófilo no líquido (por
ejemplo, un polisacárido u oligosacárido reticulado), y
opcionalmente una capa externa que comprende un compuesto anfífilo,
tal como un fosfolípido (véase, por ejemplo, la Patente de Estados
Unidos Nº 5.151.254 y las Solicitudes PCT WO 94/20078, WO/94/23701
y WO 96/06638). La cantidad de compuesto activo contenido en el
interior de una formulación de liberación sostenida depende del
sitio de implantación, la velocidad y duración esperada de la
liberación y la naturaleza de la afección que se vaya a tratar o
prevenir.
En otra realización ilustrativa, se emplean
microesferas biodegradables (por ejemplo, polilactato poliglicolato)
como vehículos para las composiciones de esta invención. Se
describen microesferas biodegradables adecuadas, por ejemplo, en
las Patentes de Estados Unidos Nº 4.897.268; 5.075.109; 5.928.647;
5.811.128; 5.820.883; 5.853.763; 5.814.344. 5.407.609 y 5.942.252.
También serán útiles para muchas aplicaciones sistemas de vehículo
de proteína del núcleo de la hepatitis B modificados, tales como se
describen en el documento WO 99 40934 y referencias citadas en el
mismo. Otro sistema de vehículo/suministro ilustrativo emplea un
vehículo que comprende complejos de
particulado-proteína, tales como los descritos en la
Patente de Estados Unidos Nº 5.928.647, que son capaces de inducir
una respuesta de linfocitos T citotóxicos restringida por clase I en
un hospedador.
En otra realización ilustrativa, se emplean
partículas de núcleo de fosfato de calcio como vehículos, adyuvantes
de vacuna o como matrices de liberación controlada para las
composiciones de esta invención. Se describen partículas de fosfato
de calcio ejemplares, por ejemplo, en la Solicitud de Patente
publicada Nº WO/0046147.
Las composiciones farmacéuticas de la invención
comprenderán con frecuencia además uno o más tampones (por ejemplo,
solución salina tamponada neutra o solución salina tamponada con
fosfato), carbohidratos (por ejemplo, glucosa, manosa, sacarosa o
dextranos), manitol, proteínas, polipéptidos o aminoácidos tales
como glicina, antioxidantes, bacteriostáticos, agentes quelantes
tales como EDTA o glutatión, adyuvantes (por ejemplo, hidróxido de
aluminio), solutos que hacen a la formulación isotónica, hipotónica
o débilmente hipertónica con la sangre de un receptor, agentes de
suspensión, agentes espesantes y/o conservantes. Como alternativa,
las composiciones de la presente invención pueden formularse como
un liofilizado.
Las composiciones farmacéuticas descritas en
este documento pueden presentarse en recipientes de dosis unitaria
o multidosis, tales como ampollas o viales sellados. Típicamente
dichos recipientes se cierran herméticamente de un modo que
conserven la esterilidad y estabilidad de la formulación hasta el
uso. En general, las formulaciones pueden almacenarse como
suspensiones, soluciones o emulsiones en vehículos oleosos o
acuosos. Como alternativa, una composición farmacéutica puede
almacenarse en una condición secada por congelación que sólo
requiera la adición de un vehículo líquido estéril inmediatamente
antes del uso.
El desarrollo de regímenes de dosificación y
tratamiento adecuados para el uso de las composiciones particulares
descritas en este documento en una diversidad de regímenes de
tratamiento, incluyendo, por ejemplo, administración y formulación
oral, parenteral, intravenosa, intranasal e intramuscular, se conoce
bien en la técnica, analizándose brevemente algunos de los mismos a
continuación con fines ilustrativos en general.
En ciertas aplicaciones, las composiciones
farmacéuticas descritas en este documento pueden suministrarse
mediante administración oral a un animal. Como tales, estas
composiciones pueden formularse con un diluyente inerte o con un
vehículo comestible asimilable o pueden incluirse en una cápsula de
gelatina de carcasa dura o blanda, o pueden comprimirse en
comprimidos, o pueden incorporarse directamente con el alimento de
la dieta.
Los compuestos activos pueden incluso
incorporarse con excipientes y usarse en forma de comprimidos
ingeribles, comprimidos bucales, trociscos, cápsulas, elixires,
suspensiones, jarabes, obleas y similares (véase, por ejemplo
Mathiowitz et al., Nature 27 mar 1997; 386 (6623):
410-4; Hwang et al., Crit Rev Ther Drug
Carrier Syst 1998; 15 (3): 243-84; Patente de
Estados Unidos Nº 5.641.515; Patente de Estados Unidos Nº 5.580.579
y Patente de Estados Unidos Nº 5.792.451). Los comprimidos,
trociscos, píldoras, cápsulas y similares también pueden contener
cualquiera de una diversidad de componentes adicionales, por
ejemplo, puede añadirse un aglutinante, tal como, goma tragacanto,
goma arábiga, almidón de maíz o gelatina; excipientes, tales como
fosfato dicálcico; un agente disgregante, tal como almidón de maíz,
almidón de patata, ácido algínico y similares; un lubricante, tal
como estearato magnesio; y un agente edulcorante, tal como sacarosa,
lactosa o sacarina, o un agente saporífero, tal como menta, aceite
de gaulteria o aroma de cereza. Cuando la forma unitaria de
dosificación es una cápsula, puede contener, además de materiales
del tipo anterior, un vehículo líquido. Pueden estar presentes
diversos otros materiales como recubrimientos o para modificar de
otro modo la forma física de la unidad de dosificación. Por
ejemplo, pueden recubrirse comprimidos, píldoras o cápsulas con goma
laca, azúcar o ambos. Por supuesto, cualquier material usado en la
preparación de cualquier forma unitaria de dosificación debería ser
farmacéuticamente puro y sustancialmente no tóxico en las
cantidades empleadas. Además, los compuestos activos pueden
incorporarse en preparaciones y formulaciones de liberación
sostenida.
Típicamente, estas formulaciones contendrán al
menos aproximadamente 0,1% del compuesto activo o más, aunque, por
supuesto, el porcentaje del ingrediente o ingredientes activos puede
variarse y puede estar convenientemente entre aproximadamente 1 ó
2% y aproximadamente 60% o 70% o más del peso o volumen de la
formulación total. Naturalmente, la cantidad de compuesto o
compuestos activos en cada composición terapéuticamente útil puede
prepararse de tal forma que se obtendrá una dosificación adecuada en
cualquier dosis unitaria dada del compuesto. Un especialista en la
técnica de la preparación de dichas formulaciones farmacéuticas
contemplará factores tales como solubilidad, biodisponibilidad,
semivida biológica, vía de administración, vida útil del producto,
así como otras consideraciones farmacológicas y, como tales, pueden
ser deseables una diversidad de dosificaciones y regímenes de
tratamiento.
Para la administración oral las composiciones de
la presente invención pueden incorporar como alternativa uno o más
excipientes en forma de un enjuague bucal, dentífrico, comprimido
bucal, pulverización oral o formulación administrada por vía oral
sublingual. Como alternativa, el ingrediente activo puede
incorporarse en una solución oral tal como una que contiene borato
de sodio, glicerina y bicarbonato de potasio o dispersarse en un
dentífrico, o añadirse en una cantidad terapéuticamente eficaz a
una composición que puede incluir agua, aglutinantes, abrasivos,
agentes saporíferos, agentes espumantes y humectantes. Como
alternativa, las composiciones pueden conformarse en una forma de
comprimido o solución que puede colocarse bajo la lengua o
disolverse de otro modo en la boca.
En ciertas circunstancias, será deseable
suministrar las composiciones farmacéuticas descritas en este
documento por vía parenteral, intravenosa intramuscular o incluso
intraperitoneal. Dichas estrategias son bien conocidas por el
especialista, describiéndose algunas de ellas adicionalmente, por
ejemplo, en la Patente de Estados Unidos Nº 5.543.158; Patente de
Estados Unidos Nº 5.641.515 y Patente de Estados Unidos Nº
5.399.363. En ciertas realizaciones, pueden prepararse soluciones
de los compuestos activos como bases libres o sales
farmacológicamente aceptables en agua mezclada convenientemente con
un tensioactivo, tal como hidroxipropilcelulosa. También pueden
prepararse dispersiones en glicerol, polietilenglicoles líquidos y
mezclas de los mismos y en aceites. En condiciones normales de
almacenamiento y uso, estas preparaciones contendrán generalmente un
conservante para evitar el desarrollo de microorganismos.
Las formas farmacéuticas ilustrativas adecuadas
para uso inyectable incluyen soluciones o dispersiones acuosas
estériles y polvos estériles para la preparación extemporánea de
soluciones o dispersiones inyectables estériles (por ejemplo, véase
la Patente de Estados Unidos Nº 5.466.468). En todos los casos, la
forma debe ser estéril y debe ser fluida hasta el punto de que
exista facilidad de inyección. Debe ser estable en las condiciones
de fabricación y almacenamiento y debe conservarse frente a la
acción contaminante de microorganismos, tales como bacterias y
hongos. El vehículo puede ser un disolvente o un medio de dispersión
que contiene, por ejemplo, agua, etanol, poliol (por ejemplo,
glicerol, propilenglicol, y polietilenglicol líquido y similares),
mezclas adecuadas de los mismos y/o aceites vegetales. Puede
mantenerse una fluidez apropiada, por ejemplo, mediante el uso de
un recubrimiento, tal como lecitina, mediante el mantenimiento del
tamaño de partícula necesario en el caso de una dispersión y/o
mediante el uso de tensioactivos. La prevención de la acción de
microorganismos puede facilitarse mediante diversos agentes
antibacterianos y antifúngicos, por ejemplo, parabenos,
clorobutanol, fenol, ácido sórbico, timerosal y similares. En
muchos casos, será preferible incluir agentes isotónicos, por
ejemplo, azúcares o cloruro sódico. Puede provocarse una absorción
prolongada de las composiciones inyectables mediante el uso en las
composiciones de agentes que retrasen la absorción, por ejemplo,
monoestearato de aluminio y gelatina.
En una realización, para la administración
parenteral en una solución acuosa, la solución debería tamponarse
convenientemente si es necesario y el diluyente líquido hacerse
primero isotónico con solución salina o glucosa suficiente. Estas
soluciones acuosas particulares son especialmente adecuadas para
administración intravenosa, intramuscular, subcutánea e
intraperitoneal. A este respecto, los especialistas en la técnica
conocerán un medio acuoso estéril que puede emplearse a la luz de
la presente descripción. Por ejemplo, una dosificación puede
disolverse en 1 ml de solución de NaCl isotónica y añadirse a 1000
ml de líquido de hipodermoclisis o inyectarse en el sitio de
infusión propuesto (véase, por ejemplo, "Remington's
Pharmaceutical Sciences" 15ª Edición, páginas
1035-1038 y 1570-1580). Se producirá
necesariamente cierta variación en la dosificación dependiendo del
estado del sujeto que se trate. Además, para la administración a
seres humanos, las preparaciones cumplirán por supuesto
preferiblemente las normas de esterilidad, pirogenicidad y seguridad
y pureza generales requeridas por la Office of Biologics standards
de la FDA.
En otra realización de la invención, las
composiciones descritas en este documento pueden formularse en una
forma neutra o salina. Las sales farmacéuticamente aceptables
ilustrativas incluyen las sales de adición de ácidos (formadas con
los grupos amino libres de la proteína) y que se forman con ácidos
inorgánicos tales como, por ejemplo, ácidos clorhídrico o
fosfórico, o ácidos orgánicos tales como acético, oxálico,
tartárico, mandélico y similares. También pueden obtenerse sales
formadas con los grupos carboxilo libres a partir de bases
inorgánicas tales como, por ejemplo, hidróxidos de sodio, potasio,
amonio, calcio o férrico y bases orgánicas tales como
isopropilamina, trimetilamina, histidina, procaína y similares. Tras
la formulación, las soluciones se administrarán de una forma
compatible con la formulación de dosificación y en una cantidad tal
que sea terapéuticamente eficaz.
Los vehículos pueden comprender además
cualquiera o todos los disolventes, medios de dispersión, vehículos,
recubrimientos, diluyentes, agentes antibacterianos y antifúngicos,
agentes isotónicos y retardantes de la absorción, tampones,
soluciones excipientes, suspensiones, coloides y similares. El uso
de dichos medios y agentes para sustancias farmacéuticas activas es
bien conocido en la técnica. Excepto en la medida en que cualquier
medio o agente convencional sea incompatible con el ingrediente
activo, se contempla su uso en las composiciones terapéuticas.
También pueden incorporarse ingredientes activos complementarios en
las composiciones. La expresión "farmacéuticamente aceptable"
se refiere a entidades moleculares y composiciones que no producen
ninguna reacción alérgica o adversa similar cuando se administran a
un ser humano.
En ciertas realizaciones, las composiciones
farmacéuticas pueden suministrarse mediante pulverizadores
intranasales, inhalación y/u otros vehículos de suministro en
aerosol. Se han descrito métodos para el suministro de genes,
ácidos nucleicos y composiciones peptídicas directamente a los
pulmones mediante pulverizaciones nasales de aerosol, por ejemplo,
en la Patente de Estados Unidos 5.756.353 y en la Patente de Estados
Unidos 5.804.121. Asimismo, también es bien conocido en las
técnicas farmacéuticas el suministro de fármacos usando resinas de
micropartículas intranasales (Takenaga et al., J Controlled
Release 2 Mar 1998, 52 (1-2): 81-7)
y compuestos de lisofosfatidil-glicerol (Patente de
Estados Unidos 5.725.871). Asimismo, se describe el suministro
farmacológico transmucoso ilustrativo en forma de una matriz de
soporte de politetrafluoroetileno en la Patente de Estados Unidos
5.780.045.
En ciertas realizaciones, se usan liposomas,
nanocápsulas, micropartículas, partículas lipídicas, vesículas y
similares para la introducción de las composiciones de la presente
invención en células hospedadoras/organismos adecuados. En
particular, las composiciones de la presente invención pueden
formularse para el suministro encapsuladas en una partícula
lipídica, un liposoma, una vesícula, una nanoesfera o una
nanopartícula o similares. Como alternativa, las composiciones de
la presente invención pueden unirse, covalentemente o no
covalentemente, a la superficie dichos vehículos
transportadores.
La formación y el uso de de liposomas y
preparaciones similares a liposomas como vehículos farmacológicos
potenciales se conoce en general por los especialistas en la técnica
(véase, Lasic, Trends Biotechnol jul 1998; 16 (7):
307-21; Takakura, Nippon Rinsho mar 1998; 56 (3):
691-5; Chandran et al., Indian J Exp Biol.
ag 1997; 35 (8): 801-9; Margalit, Crit Rev Ther Drug
Carrier Syst. 1995; 12 (2-3):
233-61; Patente de Estados Unidos 5.567.434;
Patente de Estados Unidos 5.552.157; Patente de Estados Unidos
5.565.213; Patente de Estados Unidos 5.738.868 y Patente de Estados
Unidos 5.795.587).
Se han usado con éxito liposomas con varios
tipos celulares que normalmente son difíciles de transfectar
mediante otros procedimientos, incluyendo suspensiones de células
T, cultivos de hepatocitos primarios y células PC 12 (Renneisen
et al., J Biol Chem. 25 sep 1990; 265 (27):
16337-42; Muller et at., DNA Cell Biol. abr
1990; 9 (3): 221-9). Además, los liposomas están
libres de las limitaciones de longitud del ADN que son típicas de
sistemas de suministro basados en virus. Se han usado eficazmente
liposomas para introducir genes, diversos fármacos, agentes
radioterapéuticos, enzimas, virus, factores de transcripción,
efectores alostéricos y similares en una diversidad de líneas
celulares cultivadas y animales. Además, el uso de liposomas no
parece estar asociado con respuestas autoinmunes o una toxicidad
inaceptable después del suministro sistémico.
En ciertas realizaciones, se forman liposomas a
partir de fosfolípidos que se dispersan en un medio acuoso y forman
espontáneamente vesículas bicapa concéntricas multilaminares
(también denominadas vesículas mutilaminares (MLV)).
Como alternativa, en otras realizaciones, la
invención proporciona formulaciones de nanocápsulas
farmacéuticamente aceptables de las composiciones de la presente
invención. Las nanocápsulas generalmente pueden incluir compuestos
de una forma estable y reproducible (véase, por ejemplo,
Quintanar-Guerrero et al., Drug Dev Ind
Pharm. dic 1998; 24 (12): 1113-28). Para evitar los
efectos secundarios debidos a una sobrecarga polimérica
intracelular, pueden diseñarse tales partículas ultrafinas (de un
tamaño de aproximadamente 0,1 \mum) usando polímeros capaces de
degradarse in vivo. Dichas partículas pueden prepararse como
se describe, por ejemplo, por Couvreur et al., Crit Rev Ther
Drug Carrier Syst. 1988; 5(1): 1-20; zur
Muhlen et al., Eur J Pharm Biopharm. mar 1998; 45 (2):
149-55; Zambaux et al. J Controlled Release.
2 ene 1998; 50 (1-3): 31-40; y la
Patente de Estados Unidos 5.145.684.
Las estrategias inmunológicas para la terapia
del cáncer se basan en el reconocimiento de que con frecuencia las
células cancerosas pueden eludir las defensas del cuerpo contra
células y moléculas anormales o extrañas, y que estas defensas
podrían estimularse terapéuticamente para recuperar el fondo
perdido, por ejemplo, págs. 23-648 en Klein,
Immunology (Wiley-lnterscience, Nueva York, 1982).
Numerosas observaciones recientes de que diversos efectores inmunes
pueden inhibir directamente o indirectamente el desarrollo de
tumores ha conducido a un interés renovado en esta estrategia para
la terapia del cáncer, por ejemplo, Jager, et al., Oncology
2001;60 (1): 1-7; Renner, et al., Ann Hematol
dic 2000; 79 (12): 651-9.
Son cuatro tipos celulares básicos cuya función
se ha asociado con la inmunidad celular antitumoral y la eliminación
de células tumorales del cuerpo: i) linfocitos B que secretan
inmunoglobulinas hacia el plasma sanguíneo para identificar y
marcar las células invasoras extrañas; ii) monocitos que secretan
las proteínas del complemento que son responsables de la lisis y
del procesamiento de las células invasoras diana recubiertas con
inmunoglobulina; iii) linfocitos asesinos naturales que tienen dos
mecanismos para la destrucción de células tumorales, citotoxicidad
celular dependiente de anticuerpos y destrucción natural; y iv)
linfocitos T que poseen receptores específicos de antígeno y que
tienen la capacidad para reconocer una célula tumoral que lleva
moléculas marcadoras complementarias (Schreiber, H., 1989, en
Fundamental Immunology (ed). W. E. Paul, págs.
923-955).
La inmunoterapia del cáncer se centra
generalmente en la inducción de respuestas inmunes humorales,
respuestas inmunes celulares o ambas. Además, está bien establecido
que la inducción de células auxiliares T CD4^{+} es necesaria
para inducir de forma secundaria anticuerpos o células T CD8^{+}
citotóxicas. Los antígenos polipeptídicos que son selectivos o
idealmente específicos para células cancerosas, particularmente
células cancerosas asociadas con expresión de WT1, ofrecen una
estrategia poderosa para inducir respuestas inmunes contra un
cáncer asociado con la expresión de WT1 y son un aspecto importante
de la presente invención.
En aspectos adicionales de la presente
invención, las composiciones y vacunas descritas en este documento
pueden usarse para inhibir el desarrollo de enfermedades malignas
(por ejemplo, enfermedades progresivas o metastásicas o
enfermedades caracterizadas por una pequeña carga tumoral tal como
una enfermedad mínima residual). En general, dichos métodos pueden
usarse para prevenir, retrasar o tratar una enfermedad asociada con
la expresión de WT1. En otras palabras, los métodos terapéuticos
que se proporcionan en este documento pueden usarse para tratar una
enfermedad asociada a WT1 existente, o pueden usarse para prevenir o
retrasar la aparición de dicha enfermedad en un paciente que esté
libre de enfermedad o que esté aquejado de una enfermedad que aún no
está asociada con la expresión de WT1.
Como se usa en este documento, una enfermedad
está "asociada con la expresión de WT1" si las células enfermas
(por ejemplo, células tumorales) en algún momento durante el
transcurso de la enfermedad generan niveles detectablemente
superiores de un polipéptido WT1 que células normales del mismo
tejido. La asociación de la expresión de WT1 con una enfermedad
maligna no requiere que WT1 esté presente en un tumor. Por ejemplo,
la sobreexpresión de WT1 puede estar implicada con el inicio de un
tumor, pero la expresión de proteína puede perderse posteriormente.
Como alternativa, una enfermedad maligna que no se caracteriza por
un aumento en la expresión de WT1 puede, en un momento posterior,
evolucionar hacia una enfermedad que se caracterice por una
expresión de WT1 aumentada. Por consiguiente, se considera que
cualquier enfermedad maligna en la que las células enfermas
expresaban antes, expresan actualmente o se espera que expresen
posteriormente niveles aumentados de WT1 está "asociada con la
expresión de WT1".
Puede realizarse una inmunoterapia usando
cualquiera de una diversidad de técnicas, en las que los compuestos
o células proporcionados en este documento funcionan eliminando las
células que expresan WT1 de un paciente. Dicha eliminación puede
tener lugar como resultado de la potenciación o inducción de una
respuesta inmune en un paciente específica para WT1 o una célula
que exprese WT1. Como alternativa, pueden eliminarse ex vivo
células que expresen WT1 (por ejemplo, mediante tratamiento de
médula ósea, sangre periférica o una fracción de médula ósea o
sangre periférica autóloga). Pueden obtenerse fracciones de médula
ósea o sangre periférica usando cualquier procedimiento
convencional en la técnica.
Dentro de dichos métodos, pueden administrarse a
un paciente composiciones farmacéuticas y vacunas. Como se usa en
este documento, un "paciente" se refiere a cualquier animal de
sangre caliente, preferiblemente un ser humano. Un paciente puede o
no estar aquejado de una enfermedad maligna. Por consiguiente, las
composiciones farmacéuticas y vacunas anteriores pueden usarse para
prevenir la aparición de una enfermedad (es decir,
profilácticamente) o para tratar a un paciente aquejado de una
enfermedad (por ejemplo, para prevenir o retrasar el avance y/o la
metástasis de una enfermedad existente). Un paciente aquejado de una
enfermedad puede tener una enfermedad mínima residual (por ejemplo,
una carga tumoral baja en un paciente con leucemia en remisión
completa o parcial o un paciente con cáncer después de la reducción
de la carga tumoral después de una cirugía, radioterapia y/o
quimioterapia). Dicho paciente puede inmunizarse para inhibir una
recaída (es decir, prevenir o retrasar la recaída o disminuir la
gravedad de una recaída). Dentro de ciertas realizaciones
preferidas, el paciente está aquejado de leucemia (por ejemplo,
AML, CML, ALL o ALL infantil), un síndrome mielodisplásico (MDS) o
un cáncer (por ejemplo, cáncer gastrointestinal, de pulmón, tiroides
o mama o un melanoma), donde el cáncer o leucemia es positivo para
WT1 (es decir, reacciona de forma detectable con un anticuerpo
anti-WT1, como se proporciona en este documento, o
expresa ARNm de WT1 a un nivel detectable mediante
RT-PCR, como se describe en este documento) o
padece una enfermedad autoinmune dirigida contra células que
expresan WT1.
Otras enfermedades asociadas con la
sobreexpresión de WT1 incluyen cáncer de riñón (tal como carcinoma
de células renales o tumor de Wilms) como se describe en Satoh F.,
et al., Pathol. Int. 50 (6): 458-71 (2000),
y Campbell C. E. et al., Int. J. Cancer 78 (2):
182-8 (1998); y mesotelioma, como se describe en
Amin, K. M. et al., Am, J. Pathol. 146 (2):
344-56(1995). Harada et al. (Mol.
Urol. 3 (4): 357-364 (1999) describen la expresión
génica de WT1 en tumores de células germinales testiculares humanas.
Nonomura et al. Hinyokika Kiyo 45 (8): 593-7
(1999), describen la clasificación molecular en fases del cáncer
testicular usando la reacción en cadena de la polimerasa de los
genes específicos de cáncer testicular. Shimizu et al., Int.
J. Gynecol. Pathol. 19 (2): 158-63 (2000) describen
la detección inmunohistoquímica del gen del tumor de Wilms (WT1) en
tumores ováricos epiteliales.
También se describió la sobreexpresión de WT1 en
tumores desmoplásicos de células pequeñas redondas, por Barnoud, R.
et al., Am, J. Surg. Pathol. 24 (6): 830-6
(2000); y Pathol, Res. Pract. 194(10):
693-700 (1998). La sobreexpresión de WT1 en
glioblastoma y otros cánceres se describió por Menssen, H. D. et
al., J. Cancer Res. Clin. Oncol. 126 (4):
226-32 (2000), "Wilms' tumor gene (WT1) expression
in lung cancer, colon cancer y glioblastoma cell lines compared to
freshly isolated tumor specimens.". Otras enfermedades que
muestran sobreexpresión de WT1 incluyen enfermedades asociadas con
EBV, tales como linfoma de Burkitt y cáncer nasofaríngeo (Spinsanti
P. et al., Leuk. Lymphoma 38 (5-6):
611-9 (2000), "Wilms' tumor gene expression by
normal y malignant human B lymphocytes".
En Leukemia 14 (9): 1634-4
(2000), Pan et al., describen el tratamiento con
IL-12 in vitro de células mononucleares de
sangre periférica de pacientes con leucemia o síndromes
mielodisplásicos y describieron un aumento en la citotoxicidad y
una reducción en la expresión génica de WT1. En Leukemia 13 (6):
891-900 (1999), Patmasiriwat et al.
describieron expresión de WT1 y GATA1 en el síndrome mielodisplásico
y la leucemia aguda. En Leukemia 13 (3): 393-9
(1999), Tamaki et al., describieron que el gen del tumor de
Wilms WT1 es un buen marcador para el diagnóstico del avance de la
enfermedad de síndromes mielodisplásicos. La expresión del gen del
tumor de Wilms WT1 en tumores sólidos y su implicación en el
desarrollo de células tumorales se analizó en relación con cáncer
gástrico, cáncer de colon, cáncer pulmonar, líneas celulares de
cáncer de mama, línea celular de tumor de células germinales,
cáncer ovárico, el cáncer uterino, línea celular de cáncer de
tiroides, carcinoma hepatocelular, en Oji et al., Jpn. J.
Cancer Res. 90 (2): 194-204 (1999).
Las composiciones que se proporcionan en este
documento pueden usarse en solitario o en combinación con regímenes
terapéuticos convencionales, tales como cirugía, irradiación,
quimioterapia y/o trasplante de médula ósea (autólogo, singénico,
alogénico o no relacionado). Como se analiza en más detalle a
continuación, pueden usarse agentes de unión y células T como se
proporcionan en este documento para la purga de células madre
autólogas. Dicha purga puede ser beneficiosa antes de, por ejemplo,
un trasplante de médula ósea o transfusión de sangre o componentes
de la misma. Pueden usarse adicionalmente agentes de unión, células
T, células presentadoras de antígeno (APC) y composiciones
proporcionadas en este documento para expandir y estimular (o
sensibilizar) células T específicas de WT1 autólogas, alogénicas,
singénicas o no relacionadas in vitro y/o in vivo.
Dichas células T específicas de WT1 pueden usarse, por ejemplo, en
infusiones de linfocitos de donante.
Las vías y frecuencia de administración, así
como la dosificación, variarán de un individuo a otro y pueden
establecerse fácilmente usando técnicas convencionales. En general,
las composiciones farmacéuticas y vacunas pueden administrarse
mediante inyección (por ejemplo, intracutánea, intramuscular,
intravenosa o subcutánea), por vía intranasal (por ejemplo, por
aspiración) o por vía oral. En algunos tumores, las composiciones
farmacéuticas o vacunas pueden administrarse localmente (por
ejemplo, mediante rectocoloscopia, gastroscopia, videoendoscopia,
angiografía u otros métodos conocidos en la técnica).
Preferiblemente, pueden administrarse entre 1 y10 dosis a lo largo
de un periodo de 52 semanas. Preferiblemente, se administran 6 dosis
a intervalos de 1 mes y pueden administrarse vacunaciones de
refuerzo periódicamente después de eso. Pueden ser apropiados
protocolos alternativos para pacientes individuales. Una dosis
adecuada es una cantidad de un compuesto que, cuando se administra
como se ha descrito anteriormente, es capaz de promover una
respuesta inmune antitumoral que esté al menos
10-50% por encima del nivel basal (es decir, sin
tratar). Dicha respuesta puede controlarse midiendo los anticuerpos
anti-tumorales en un paciente o por generación
dependiente de vacuna de células efectoras citolíticas capaces de
destruir las células tumorales del paciente in vitro. Dichas
vacunas también deberían ser capaces de causar una respuesta inmune
que conduzca a un desenlace clínico mejorado (por ejemplo,
remisiones completas o parciales más frecuentes o supervivencia sin
enfermedad y/o global más prolongada) en pacientes vacunados en
comparación con pacientes no vacunados. En general, para
composiciones farmacéuticas y vacunas que comprenden uno o más
polipéptidos, la cantidad de cada polipéptido presente en un
intervalo de dosis de aproximadamente 100 \mug a 5 mg. Los
tamaños de dosis adecuados variarán con el tamaño del paciente, pero
típicamente variarán de aproximadamente 0,1 ml a aproximadamente 5
ml.
En general, un régimen de dosificación y
tratamiento apropiado proporciona el compuesto o compuestos activos
en una cantidad suficiente para proporcionar un beneficio
terapéutico y/o profiláctico. Dicha respuesta puede controlarse
estableciendo un desenlace clínico mejorado (por ejemplo, remisiones
completas o parciales más frecuentes o supervivencia sin enfermedad
y/o global más prolongada) en pacientes tratados en comparación con
pacientes sin tratar. Los aumentos en las respuestas inmunes
preexistentes contra WT1 se correlacionan generalmente con un
desenlace clínico mejorado. Dichas respuestas inmunes pueden
evaluarse generalmente usando ensayos de proliferación,
citotoxicidad o citoquinas convencionales que pueden realizarse
usando muestras obtenidas de un paciente antes y después del
tratamiento.
Dentro de ciertas realizaciones, la
inmunoterapia puede ser una inmunoterapia activa, en la que el
tratamiento depende de la estimulación in vivo del sistema
inmune endógeno del hospedador para reaccionar contra tumores con
la administración de agentes modificadores de la respuesta inmune
(tales como polipéptidos y polinucleótidos que se proporcionan en
este documento).
Dentro de otras realizaciones, la inmunoterapia
puede ser una inmunoterapia pasiva, en la que el tratamiento
implica el suministro de agentes con una reactividad inmune contra
tumores establecida (tales como células efectoras o anticuerpos)
que pueden mediar directa o indirectamente efectos antitumorales y
que no dependen necesariamente de un sistema inmune intacto del
hospedador. Los ejemplos de células efectoras incluyen células T,
como se han analizado anteriormente, linfocitos T (tales como
linfocitos T citotóxicos CD8^{+} y linfocitos infiltrantes de
tumores auxiliares T CD4^{+}), células asesinas (tales como
células asesinas naturales y células asesinas activadas por
linfoquinas), células B y células presentadoras de antígeno (tales
como células dendríticas y macrófagos) que expresan un polipéptido
proporcionado en este documento. Los receptores de células T y
receptores de anticuerpos específicos para los polipéptidos
enumerados en este documento pueden clonarse, expresarse y
transferirse a otros vectores o células efectoras para una
inmunoterapia adoptiva. Los polipéptidos proporcionados en este
documento también pueden usarse para generar anticuerpos o
anticuerpos anti-idiotípicos (como se ha descrito
anteriormente y en la Patente de Estados Unidos Nº 4.918.164) para
una inmunoterapia pasiva.
Los anticuerpos monoclonales pueden marcarse con
cualquiera de una diversidad de marcadores para usos selectivos
deseados en la detección, ensayos de diagnóstico o aplicaciones
terapéuticas (como se describen en las Patentes de Estados Unidos
Nº 6.090.365; 6.015.542; 5.843.398; 5.595.721; y 4.708.930). En cada
caso, la unión del anticuerpo monoclonal marcado al sitio
determinante del antígeno señalizará la detección o suministro de un
agente terapéutico particular contra el determinante antigénico
sobre la célula anormal. Un objeto adicional de esta invención es
proporcionar el anticuerpo monoclonal específico convenientemente
marcado para lograr dichos usos selectivos deseados del mismo.
Generalmente pueden obtenerse células efectoras
en cantidades suficientes para una inmunoterapia adoptiva por
cultivo in vitro como se describe en este documento. Las
condiciones de cultivo para expandir células efectoras específicas
de antígeno individuales hasta varios miles de millones en número
con conservación del reconocimiento de antígenos in vivo son
bien conocidas en la técnica. Dichas condiciones de cultivo in
vitro usan típicamente una estimulación intermitente con
antígeno, con frecuencia en presencia de citoquinas (tales como
IL-2) y células alimentadoras que no están en
división. Como se ha indicado anteriormente, pueden usarse
polipéptidos inmunorreactivos como se proporcionan en este documento
para expandir rápidamente cultivos de células T específicas de
antígeno para generar un número suficiente de células para
inmunoterapia. En particular, pueden estimularse células
presentadoras de antígeno, tales como células dendríticas,
macrófagos, monocitos, fibroblastos y/o células B con polipéptidos
inmunorreactivos o transfectarse con uno o más polinucleótidos
usando procedimientos convencionales bien conocidos en la técnica.
Por ejemplo, pueden transfectarse células presentadoras de antígeno
con un polinucleótido que tenga un promotor apropiado para aumentar
la expresión en un virus recombinante u otro sistema de expresión.
Las células efectoras cultivadas para uso en terapia deben ser
capaces de crecer y distribuirse ampliamente y de sobrevivir a largo
plazo in vivo. Los estudios han demostrado que las células
efectoras cultivadas pueden inducirse para crecimiento in
vivo y para supervivencia a largo plazo en cantidades
sustanciales mediante la estimulación repetida con antígeno
complementada con IL-2 (véase, por ejemplo, Cheever
et al., Immunological Reviews 157: 177, 1997).
Como alternativa, puede introducirse un vector
que exprese un polipéptido enumerado en este documento en células
presentadoras de antígeno obtenidas de un paciente y propagadas
clonalmente ex vivo para el trasplante de nuevo en el mismo
paciente. Pueden reintroducirse células transfectadas en el paciente
usando cualquier medio conocido en la técnica, preferiblemente en
forma estéril mediante administración intravenosa, intracavitaria,
intraperitoneal o intratumoral.
Dentro de aspectos adicionales, los métodos para
inhibir el desarrollo de una enfermedad maligna asociada con la
expresión de WT1 implican la administración de células T autólogas
que se hayan activado en respuesta a un polipéptido WT1 o APC que
exprese WT1, como se ha descrito anteriormente. Dichas células T
pueden ser CD4^{+} y/o CD8^{+} y pueden proliferar como se ha
descrito anteriormente. Las células T pueden administrarse al
individuo en una cantidad eficaz para inhibir el desarrollo de una
enfermedad maligna. Típicamente, se administran por vía
intravenosa, intracavitaria o en el lecho de un tumor resecado
aproximadamente 1 x 10^{9} a 1 x 10^{11} células T/M^{2}.
Será evidente para los especialistas en la técnica que el número de
células y la frecuencia de administración dependerán de la
respuesta del paciente.
Dentro de ciertas realizaciones, pueden
estimularse células T antes de un trasplante de médula ósea
autólogo. Dicha estimulación puede tener lugar in vivo o
in vitro. Para la estimulación in vitro, pueden
ponerse en contacto médula ósea y/o sangre periférica (o una
fracción de médula ósea o sangre periférica) obtenidas de un
paciente con un polipéptido WT1, un polinucleótido que codifique un
polipéptido WT1 y/o una APC que exprese un polipéptido WT1 en
condiciones y durante un tiempo suficiente para permitir la
estimulación de células T como se ha descrito anteriormente.
Después, pueden administrarse células madre de médula ósea, sangre
periférica y/o células T específicas de WT1 a un paciente usando
técnicas convencionales.
Dentro de realizaciones relacionadas, pueden
estimularse células T de un donante relacionado o no relacionado
antes de un trasplante singénico o alogénico (relacionado o no
relacionado) de médula ósea. Dicha estimulación puede tener lugar
in vivo o in vitro. Para la estimulación in
vitro, pueden ponerse en contacto la médula ósea y/o la sangre
periférica (o una fracción de médula ósea o sangre periférica)
obtenidas de un donante relacionado o no relacionado con un
polipéptido WT1, polinucleótido de WT1 y/o APC que exprese un
polipéptido WT1 en condiciones y durante un tiempo suficiente para
permitir la estimulación de células T, como se ha descrito
anteriormente. Después pueden administrarse a un paciente células
madre de médula ósea, sangre periférica y/o células T específicas
de WT1 usando técnicas convencionales.
Dentro de otras realizaciones, pueden usarse
células T específicas de WT1, como se describen en este documento,
para eliminar células que expresen WT1 de la médula ósea, sangre
periférica o una fracción de médula ósea o sangre periférica
autóloga (por ejemplo, sangre periférica (PB) enriquecida para
CD34^{+} antes de la administración a un paciente). Dichos
métodos pueden realizarse por contacto de la médula ósea o PB con
dichas células T en condiciones y durante un tiempo suficiente para
permitir la reducción de células que expresen WT1 hasta menos de
10%, preferiblemente menos del 5% y, más preferiblemente, menos de
1% del número total de células mieloides o linfáticas en la médula
ósea o la sangre periférica. El grado en el que se han eliminado
dichas células puede determinarse fácilmente mediante métodos
convencionales tales como, por ejemplo, análisis de PCR cualitativa
o cuantitativa, morfología, inmunohistoquímica y análisis de FACS.
Después puede administrarse médula ósea o PB (o una fracción de las
mismas) a un paciente usando técnicas convencionales.
En general, puede detectarse un cáncer asociado
con la expresión de WT1 en un paciente basándose en la presencia de
una o más proteínas WT1 y/o polinucleótidos que codifican dichas
proteínas en una muestra biológica (por ejemplo, sangre, sueros,
esputo, orina y/o biopsias tumorales) obtenida del paciente. En
otras palabras, dichas proteínas WT1 pueden usarse como marcadores
para indicar la presencia o ausencia de un cáncer. Los agentes de
unión proporcionados en este documento generalmente permiten la
detección del nivel de antígeno que se une al agente en la muestra
biológica.
Pueden usarse cebadores y sondas
polinucleotídicos para detectar el nivel de ARNm que codifica una
proteína WT1, que también es indicativo de la presencia o ausencia
de un cáncer. En general, debería estar presente una secuencia de
WT1 a un nivel que sea al menos dos veces, preferiblemente tres
veces y, más preferiblemente, cinco veces o más en tejido tumoral
que en tejido normal del mismo tipo del que surgió el tumor. Los
niveles de expresión de WT1 en tipos tisulares diferentes de aquel
en el que surgió el tumor son irrelevantes en ciertas realizaciones
de diagnóstico, puesto que la presencia de células tumorales puede
confirmarse por observación de niveles de expresión diferenciales
predeterminados, por ejemplo, de 2 veces, 5 veces, etc., en tejido
tumoral respecto a niveles de expresión en tejido normal del mismo
tipo.
Pueden utilizarse ventajosamente otros patrones
de expresión diferencial para fines de diagnóstico. Por ejemplo, en
un aspecto de la invención, la sobreexpresión de secuencia de WT1 en
tejido tumoral y tejido normal del mismo tipo, pero no en otros
tipos tisulares normales, por ejemplo, PBMC, puede aprovecharse
diagnósticamente. En este caso, la presencia de células tumorales
metastásicas, por ejemplo, en una muestra tomada de la circulación
o algún otro sitio tisular diferente de aquel en el que surgió el
tumor, puede identificarse y/o confirmarse detectando la expresión
de la secuencia tumoral en la muestra, por ejemplo, usando análisis
de RT-PCR. En muchos casos, se deseará enriquecer
para células tumorales la muestra de interés, por ejemplo, PBMC,
usando captura celular y otras técnicas
similares.
similares.
Existen una diversidad de formatos de ensayo
conocidos por los especialistas en la técnica para el uso de un
agente de unión para detectar marcadores de polipéptido WT1 en una
muestra. Véase, por ejemplo, Harlow y Lane, Antibodies: A
Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988. En general,
la presencia o ausencia de un cáncer asociado con WT1 en un
paciente puede determinarse por (a) contacto de una muestra
biológica obtenida de un paciente con un agente de unión; (b)
detección en la muestra de un nivel de polipéptido WT1 que se une
al agente de unión; y (c) comparación del nivel de polipéptido WT1
con un valor de corte predeterminado.
En una realización preferida, el ensayo implica
el uso de un agente de unión inmovilizado en un soporte sólido para
unirse a y eliminar el polipéptido WT1 del resto de la muestra. El
polipéptido WT1 unido puede detectarse después usando un reactivo
de detección que contiene un grupo indicador y que se une
específicamente al complejo de agente de unión/polipéptido WT1.
Dichos reactivos de detección pueden comprender, por ejemplo, un
agente de unión que se une específicamente a un polipéptido WT1 o
un anticuerpo u otro agente que se une específicamente al agente de
unión, tal como una anti-inmunoglobulina, proteína
G, proteína A o una lectina. Como alternativa, puede utilizarse un
ensayo competitivo, en el que un polipéptido WT1 se marca con un
grupo indicador y se deja que se una al agente de unión
inmovilizado después de la incubación del agente de unión con la
muestra. El grado en el que los componentes de la muestra inhiben
la unión del polipéptido WT1 marcado con el agente de unión es
indicativo de la reactividad de la muestra con el agente de unión
inmovilizado. Los polipéptidos adecuados para el uso dentro de
dichos ensayos incluyen proteínas WT1 de longitud completa y
porciones polipeptídicas de las mismas a las que se une el agente
de unión, como se ha descrito anteriormente.
El soporte sólido puede ser cualquier material
conocido por los especialistas en la técnica al que pueda unirse la
proteína WT1. Por ejemplo, el soporte sólido puede ser un pocillo de
ensayo en una placa de microtitulación o una membrana de
nitrocelulosa u otra membrana adecuada. Como alternativa, el soporte
puede ser una perla o disco, tal como un material de vidrio, fibra
de vidrio, látex o plástico tal como poliestireno o cloruro de
polivinilo. El soporte también puede ser una partícula magnética o
un detector de fibra óptica, tal como los descritos, por ejemplo,
en la Patente de Estados Unidos Nº 5.359.681. El agente de unión
puede inmovilizarse sobre el soporte sólido usando una diversidad
de procedimientos conocidos por los especialistas en la técnica,
que están ampliamente descritos en la bibliografía de patentes y
científica. En el contexto de la presente invención, el término
"inmovilización" se refiere tanto a una asociación no
covalente, tal como adsorción, como a una unión covalente (que
puede ser un enlace directo entre el agente y grupos funcionales en
el soporte o puede ser un enlace por medio de un agente
entrecruzante). Se prefiere la inmovilización por adsorción a un
pocillo en una placa de microtitulación o una membrana. En dichos
casos, la adsorción puede conseguirse por contacto del agente de
unión, en un tampón adecuado, con el soporte sólido durante una
cantidad de tiempo adecuada. El tiempo de contacto varía con la
temperatura, pero típicamente es de entre aproximadamente 1 hora y
aproximadamente 1 día. En general, el contacto de un pocillo de una
placa de microtitulación de plástico (tal como poliestireno o
cloruro de polivinilo) con una cantidad de agente de unión que varía
de aproximadamente 10 ng a aproximadamente 10 \mug y,
preferiblemente de aproximadamente 100 ng a aproximadamente 1
\mug, es suficiente para inmovilizar una cantidad adecuada de
agente de unión.
La unión covalente de agente de unión a un
soporte sólido puede conseguirse generalmente haciendo reaccionar
primero el soporte con un reactivo bifuncional que reaccionará tanto
con el soporte como con un grupo funcional, tal como un grupo
hidroxilo o amino, sobre el agente de unión. Por ejemplo, el agente
de unión puede unirse covalentemente a soportes que tengan un
recubrimiento polimérico apropiado usando benzoquinona o por
condensación de un grupo aldehído en el soporte con una amina y un
hidrógeno activo en el compañero de unión (véase, por ejemplo,
Pierce Immunotechnology Catalog y Handbook, 1991, en
A12-A13).
En ciertas realizaciones, el ensayo es un ensayo
de tipo sándwich de dos anticuerpos. Este ensayo puede realizarse
poniendo primero en contacto un anticuerpo que se ha inmovilizado en
un soporte sólido, comúnmente el pocillo de una placa de
microtitulación, con la muestra, de modo que se permita que los
polipéptidos WT1 dentro de la muestra se unan al anticuerpo
inmovilizado. Después se elimina la muestra no unida de los
complejos polipéptido-anticuerpo inmovilizados y se
añade un reactivo de detección (preferiblemente un segundo
anticuerpo capaz de unirse a un sitio diferente en el polipéptido)
que contiene un grupo indicador. Después se determina la cantidad de
reactivo de detección que permanece unido al soporte sólido usando
un método apropiado para el grupo indicador específico.
Más específicamente, una vez que se inmoviliza
el anticuerpo en el soporte como se ha descrito anteriormente,
típicamente se bloquean los sitios de unión a proteínas restantes en
el soporte. Cualquier agente bloqueante adecuado conocido por los
especialistas en la técnica, tal como albúmina sérica bovina o Tween
20^{TM} (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO). Después, el
anticuerpo inmovilizado se incuba con la muestra y se deja que el
polipéptido se una al anticuerpo. La muestra puede diluirse con un
diluyente adecuado, tal como solución salina tamponada con fosfato
(PBS) antes de la incubación. En general, un tiempo de contacto
apropiado (es decir, tiempo de incubación) es un periodo de tiempo
que es suficiente para detectar la presencia de polipéptido WT1
dentro de una muestra obtenida de un individuo con un cáncer
asociado con WT1 al menos aproximadamente 95% del alcanzado en el
equilibrio entre polipéptido unido y no unido. Los especialistas en
la técnica reconocerán que el tiempo necesario para alcanzar el
equilibrio puede determinarse fácilmente mediante ensayo del nivel
de unión que se produce a lo largo de un periodo de tiempo. A
temperatura ambiente, generalmente es suficiente un tiempo de
incubación de aproximadamente 30 minutos.
Después puede eliminarse la muestra no unida por
lavado del soporte sólido con un tampón apropiado, tal como PBS que
contiene Tween 20^{TM} a 0,1%. El segundo anticuerpo que contiene
un grupo indicador, puede añadirse después al soporte sólido. Los
grupos indicadores preferidos incluyen los grupos enumerados
anteriormente.
Después, el reactivo de detección se incuba con
el complejo anticuerpo-polipéptido inmovilizado
durante una cantidad de tiempo suficiente para detectar el
polipéptido unido. Generalmente puede determinarse una cantidad de
tiempo apropiada por ensayo del nivel de unión que se produce
durante un periodo de tiempo. Después, se elimina el reactivo de
detección no unido y se detecta el reactivo de detección unido
usando el grupo indicador. El método empleado para detectar el
grupo indicador depende de la naturaleza del grupo indicador. Para
grupos radiactivos, generalmente son apropiados métodos de recuento
de centelleo o autorradiográficos. Pueden usarse métodos
espectroscópicos para detectar colorantes, grupos luminiscentes y
grupos fluorescentes. Puede detectarse biotina usando avidina,
acoplada a un grupo indicador diferente (comúnmente un grupo
radiactivo o fluorescente o una enzima). Generalmente pueden
detectarse grupos indicadores enzimáticos mediante la adición de
sustrato (generalmente durante un periodo de tiempo específico)
seguido de análisis espectroscópico o de otro tipo de los productos
de reacción.
Para determinar la presencia o ausencia de un
cáncer asociado con expresión de WT1, la señal detectada a partir
del grupo indicador que permanece unida al soporte sólido se compara
generalmente con una señal que se corresponde con un valor de corte
predeterminado. En una realización preferida, el valor de corte para
la detección de un cáncer asociado con WT1 es la señal media
promedio obtenida cuando el anticuerpo inmovilizado se incuba con
muestras de pacientes sin el cáncer. En general, una muestra que
genera una señal que está tres desviaciones típicas por encima del
valor de corte predeterminado se considera positiva para el cáncer.
En una realización preferida alternativa, el valor de corte se
determina usando una Curva Receptor Operador de acuerdo con el
método de Sackett et al., Clinical Epidemiology: A Basic
Science for Clinical Medicine, Little Brown y Co., 1985, págs.
106-7. En resumen, en esta realización, el valor de
corte puede determinarse a partir de una representación de parejas
de índices de verdaderos positivos (es decir, sensibilidad) e
índices de falsos positivos (especificidad del 100%) que se
corresponden con cada valor de corte posible para el resultado del
ensayo de diagnóstico. El valor de corte en la representación que
está más próximo a la esquina superior izquierda (es decir, el
valor que incluye el área más amplia) es el valor de corte más
exacto y una muestra que genere una señal que sea superior que el
valor de corte determinado por este método puede considerarse
positiva. Como alternativa, el valor de corte puede desplazarse a
la izquierda a lo largo de la representación para minimizar el
índice de falsos positivos, o hacia la derecha para minimizar el
índice de falsos negativos. En general, una muestra que genere una
señal que sea superior al valor de corte determinado por este método
se considera positiva para un cáncer.
En una realización relacionada, el ensayo se
realiza en un formato de ensayo de flujo a través o de tiras, en el
que el agente de unión se inmoviliza en una membrana, tal como de
nitrocelulosa. En el ensayo de flujo a través, los polipéptidos
dentro de la muestra se unen al agente de unión inmovilizado a
medida que la muestra pasa a través de la membrana. Después, un
segundo agente de unión marcado se une al complejo de agente de
unión-polipéptido a medida que una solución que
contiene el segundo agente de unión fluye a través de la membrana.
La detección del segundo agente de unión unido puede realizarse
después como se ha descrito anteriormente. En el formato de ensayo
de tiras, un extremo de la membrana a la que está unida el agente de
unión se sumerge en una solución que contiene la muestra. La
muestra migra a lo largo de la membrana a través de una región que
contiene el segundo agente de unión y hacia el área de agente de
unión inmovilizado. La concentración del segundo agente de unión en
el área de anticuerpo inmovilizado indica la presencia de un cáncer.
Típicamente, la concentración del segundo agente de unión en ese
sitio genera un patrón, tal como una línea, que puede interpretarse
visualmente. La ausencia de dicho patrón indica un resultado
negativo. En general, la cantidad de agente de unión inmovilizado
en la membrana se selecciona para generar un patrón visualmente
discernible cuando la muestra biológica contiene un nivel de
polipéptido que sería suficiente para generar una señal positiva en
el ensayo de tipo sándwich de dos anticuerpos, en el formato
analizado anteriormente. Son agentes de unión preferidos para el
uso en dichos ensayos anticuerpos y fragmentos de unión a antígeno
de los mismos. Preferiblemente, la cantidad de anticuerpo
inmovilizado en la membrana varía de aproximadamente 25 ng a
aproximadamente 1 \mug y, más preferiblemente, de aproximadamente
50 ng a aproximadamente 500 ng. Dichos ensayos pueden realizarse
típicamente con una cantidad muy pequeña de muestra biológica.
Por supuesto, existen numerosos otros protocolos
de ensayo que son adecuados para el uso con las proteínas WT1 o
agentes de unión de la presente invención. Las descripciones
anteriores pretenden ser solamente ejemplares. Por ejemplo, será
evidente para los especialistas en la técnica que los protocolos
anteriores pueden modificarse fácilmente para usar polipéptidos
tumorales para detectar anticuerpos que se unen a dichos
polipéptidos en una muestra biológica. La detección de dichos
anticuerpos específicos de WT1 puede correlacionarse con la
presencia de un cáncer asociado con la expresión de WT1.
También, o como alternativa, puede detectarse un
cáncer asociado con la expresión de WT1 basándose en la presencia
de células T que reaccionen específicamente con una proteína tumoral
en una muestra biológica. Dentro de ciertos métodos, se incuba una
muestra biológica que comprende células T CD4^{+} y/o CD8^{+}
aisladas de un paciente con un polipéptido WT1, un polinucleótido
que codifica dicho polipéptido y/o una APC que expresa al menos una
porción inmunógena de dicho polipéptido y se detecta la presencia o
ausencia de activación específica de las células T. Las muestras
biológicas adecuadas incluyen, pero sin limitación, células T
aisladas. Por ejemplo, pueden aislarse células T de un paciente
mediante técnicas de rutina (tales como mediante centrifugación en
gradiente de densidad de Ficoll/Hypaque de linfocitos de sangre
periférica). Pueden incubarse células T in vitro durante
2-9 días, (típicamente 4 días) a 37ºC con el
polipéptido (por ejemplo, 5-25 \mug/ml). Puede
ser deseable incubar otra alícuota de una muestra de células T en
ausencia de polipéptido WT1 para servir como control. Para células
CD4^{+}, la activación se detecta preferiblemente por evaluación
de la proliferación de las células T. Para células T CD8^{+}, la
activación se detecta preferiblemente por evaluación de la
actividad citolítica. Un nivel de proliferación que es al menos dos
veces superior y/o un nivel de actividad citolítica es al menos 20%
superior que en pacientes sin enfermedad indica la presencia de un
cáncer asociado con la expresión de WT1 en el paciente.
Como se ha indicado anteriormente, también, o
como alternativa, puede detectarse un cáncer basándose en el nivel
de ARNm que codifica una proteína WT1 en una muestra biológica. Por
ejemplo, pueden emplearse al menos dos cebadores oligonucleotídicos
en un ensayo basado en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
para amplificar una porción de un ADNc de WT1 obtenido de una
muestra biológica, en el que al menos uno de los cebadores
oligonucleotídicos es específico para (es decir, hibrida con) un
polinucleótido que codifica la proteína WT1. Después, el ADNc
amplificado se separa y se detecta usando procedimientos bien
conocidos en la técnica, tales como electroforesis en gel.
De forma similar, pueden usarse sondas
oligonucleotídicas que hibridan específicamente con un
polinucleótido que codifica una proteína WT1 en un ensayo de
hibridación para detectar la presencia de un polinucleótido que
codifica la proteína WT1 en una muestra biológica.
\newpage
Para permitir la hibridación en condiciones de
ensayo, los cebadores y sondas oligonucleotídicas deberían
comprender una secuencia oligonucleotídica que tenga una identidad
de al menos aproximadamente 60%, preferiblemente de al menos
aproximadamente 75% y, más preferiblemente, de al menos
aproximadamente 90% con una porción de un polinucleótido que
codifica una proteína WT1 de la invención que es de al menos 10
nucleótidos, y preferiblemente de al menos 20 nucleótidos de
longitud. Preferiblemente, los cebadores y/o sondas
oligonucleotídicas hibridan con un polinucleótido que codifica un
polipéptido descrito en este documento en condiciones moderadamente
rigurosas, como se han definido anteriormente. Los cebadores y/o
sondas oligonucleotídicas que pueden emplearse provechosamente en
los métodos de diagnóstico descritos en este documento son
preferiblemente de al menos 10-40 nucleótidos de
longitud. En una realización preferida, los cebadores
oligonucleotídicos comprenden al menos 10 nucleótidos contiguos,
más preferiblemente al menos 15 nucleótidos contiguos de una
molécula de ADN que tiene una secuencia como se describe en este
documento. Son bien conocidos en la técnica procedimientos para
tanto ensayos basados en PCR como ensayos de hibridación (véase, por
ejemplo, Mullis et al., Cold Spring Harbor Symp. Quant,
Biol., 51: 263, 1987; Erlich ed., PCR, Technology, Stockton Press,
NY, 1989).
Un ensayo preferido emplea una
RT-PCR, en el que se aplica una PCR junto con una
transcripción inversa. Típicamente, se extrae el ARN de una muestra
biológica, tal como un tejido de biopsia y se realiza una
transcripción inversa para producir moléculas de ADNc. La
amplificación por PCR usando al menos un cebador específico genera
una molécula de ADNc, que puede separarse y visualizarse usando,
por ejemplo, electroforesis en gel. La amplificación puede
realizarse en muestras biológicas obtenidas de un paciente de ensayo
y de un individuo que no esté aquejado de un cáncer. La reacción de
amplificación puede realizarse en varias diluciones de ADNc que
abarquen dos órdenes de magnitud. Un aumento de dos veces o
superior en la expresión en varias diluciones de la muestra del
paciente de ensayo en comparación con las mismas diluciones de la
muestra no cancerosa se considera típicamente positivo.
En otro aspecto de la presente invención, pueden
usarse tecnologías de captura celular junto con, por ejemplo, PCR a
tiempo real para proporcionar una herramienta más sensible para la
detección de células metastásicas que expresen antígenos WT1. La
detección de células cancerosas asociadas a WT1 en muestras
biológicas, por ejemplo, muestras de médula ósea, sangre periférica
y muestras de aspiración con aguja fina, es deseable para el
diagnóstico y el pronóstico en pacientes con cáncer asociados con la
expresión de WT1.
Pueden usarse perlas inmunomagnéticas
recubiertas con anticuerpos monoclonales específicos para marcadores
de superficie celular, o complejos de anticuerpos tetraméricos para
enriquecer primero o seleccionar positivamente células cancerosas
en una muestra. Pueden usarse diversos kits disponibles en el
mercado, incluyendo Dynabeads® Epithelial Enrich (Dynal Biotech,
Oslo, Noruega), StemSep^{TM} (StemCell Technologies, Inc.,
Vancouver, BC) y RosetteSep (StemCell Technologies). Un
especialista reconocerá que también pueden usarse otras metodologías
y kits para enriquecer o seleccionar positivamente poblaciones
celulares deseadas. El Dynabeads® Epithelial Enrich contiene perlas
magnéticas recubiertas con mAb específicos para dos antígenos de
glicoproteínas de membrana expresados en tejidos epiteliales
normales y neoplásicos. Las perlas recubiertas pueden añadirse a
una muestra y después aplicarse la muestra a un imán, capturando de
este modo las células unidas a las perlas. Las células no deseadas
se retiran por lavado y las células aisladas magnéticamente se
eluyen de las perlas y se usan en análisis adicionales.
Puede usarse el RosetteSep para enriquecer
células directamente a partir de una muestra de sangre y consiste
en un combinado de anticuerpo tetraméricos que se dirige a una
diversidad de células no deseadas y las entrecruza con glicoforina
A en eritrocitos (RBC) presentes en la muestra, formando rosetas.
Cuando se centrifuga sobre Ficoll, las células diana se sedimentan
junto con los RBC libres. La combinación de anticuerpos en el
combinado de reducción determina qué células se eliminarán y, por
consiguiente, qué células se recuperarán. Los anticuerpos que están
disponibles incluyen, pero sin limitación: CD2, CD3, CD4, CD5, CD8,
CD10, CD11b, CD14, CD15, CD16, CD19, CD20, CD24, CD25, CD29, CD33,
CD34, CD36, CD38, CD41, CD45, CD45RA, CD45RO, CD56, CD66B, CD66e,
HLA-DR, IgE y TCR\alpha\beta.
En otra realización, las composiciones descritas
en este documento pueden usarse como marcadores para la evolución
del cáncer. En esta realización, los ensayos como se han descrito
anteriormente para el diagnóstico de un cáncer asociado con la
expresión de WT1 pueden realizarse a lo largo del tiempo, y
evaluarse el cambio a nivel de polipéptido o polipéptidos o
polinucleótido o polinucleótidos reactivos. Por ejemplo, los ensayos
pueden realizarse cada 24-72 horas durante un
periodo de 6 meses a 1 año, y después de eso realizarse según sea
necesario. En general, un cáncer está avanzando en los pacientes en
los que el nivel de polipéptido o polinucleótido de WT1 detectado
aumenta con el tiempo. Por el contrario, el cáncer no está avanzando
cuando el nivel de polipéptido o polinucleótido reactivo permanece
constante o disminuye con el tiempo.
Pueden realizarse ciertos ensayos de diagnóstico
in vivo directamente en un tumor. Un ensayo de este tipo
implica poner en contacto células tumorales con un agente de unión.
El agente de unión unido puede detectarse después directamente o
indirectamente mediante un grupo indicador. Dichos agentes de unión
también pueden usarse en aplicaciones histológicas. Como
alternativa, pueden usarse sondas polinucleotídicas dentro de dichas
aplicaciones.
La presente invención proporciona además kits
para el uso dentro de cualquiera de los métodos de diagnóstico
anteriores. Dichos kits comprenden típicamente dos o más componentes
necesarios para realizar un ensayo de diagnóstico. Los componentes
pueden ser compuestos, reactivos, recipientes y/o equipamiento. Por
ejemplo, un recipiente dentro de un kit puede contener un
anticuerpo monoclonal o un fragmento del mismo que se une
específicamente a una proteína WT1. Dichos anticuerpos o fragmentos
pueden proporcionarse unidos a un material de soporte, como se ha
descrito anteriormente. Uno o más recipientes adicionales pueden
incluir elementos, tales como reactivos o tampones, para usarse en
el ensayo. Dichos kits también, o como alternativa, pueden contener
un reactivo de detección como se ha descrito anteriormente que
contenga un grupo indicador adecuado para la detección directa o
indirecta de la unión de anticuerpo.
Como alternativa, puede diseñarse un kit para
detectar el nivel de ARNm que codifica una proteína WT1 en una
muestra biológica. Dichos kits comprenden generalmente al menos una
sonda o cebador oligonucleotídico, como se ha descrito
anteriormente que hibrida con un polinucleótido que codifica una
proteína WT1. Dicho oligonucleótido puede usarse, por ejemplo, en
un ensayo de PCR o de hibridación. Los componentes adicionales que
pueden estar presentes dentro de dichos kits incluyen un segundo
oligonucleótido y/o un reactivo de diagnóstico o recipiente para
facilitar la detección de un polinucleótido que codifica una
proteína WT1.
Los siguientes Ejemplos se ofrecen a modo de
ilustración y no a modo de limitación.
Este Ejemplo ilustra la identificación de una
respuesta inmune existente en pacientes con una neoplasia
hematológica.
Para evaluar la presencia de respuestas de
anticuerpos específicos para WT1 preexistentes en pacientes, se
analizaron sueros de pacientes con leucemia mielógena aguda (AML),
leucemia linfocítica agua (ALL), leucemia mielógena crónica (CML) y
anemia aplásica grave usando análisis de transferencia de Western.
Se ensayaron sueros para determinar la capacidad para
inmunoprecipitar WT1 de la línea celular leucémica humana K562
(Colección Americana de Cultivos Tipo, Manassas, VA). En cada caso,
se separaron los inmunoprecipitados mediante electroforesis en gel,
se transfirieron a una membrana y se sondaron con el anticuerpo
anti-WT1 WT180 (Santa Cruz Biotechnology, Inc.
Santa Cruz, CA). Este análisis de transferencia Western identificaba
anticuerpos específicos de WT1 potenciales en pacientes con una
neoplasia hematológica. Se muestra una transferencia de Western
representativa que muestra los resultados para un paciente con AML
en la Figura 2. Se reconoció una proteína de 52 kD en el
inmunoprecipitado generado usando los sueros de pacientes mediante
el anticuerpo específico de WT1. La proteína de 52 kD migraba al
mismo tamaño que el control positivo.
Estudios adicionales analizaron los sueros de
pacientes con AML y CML para determinar la presencia de anticuerpos
contra proteínas WT1 de longitud completa y truncadas. Se
subclonaron construcciones de ADNc que representaban la
WT1/longitud completa humana (aminoácidos 1-449), la
región del extremo N-terminal (aminoácidos
1-249) (WT1/extremo N-terminal) y
del extremo C-terminal (aminoácidos
267-449) (WT1/extremo C-terminal) en
vectores pET28 modificados. Las proteínas WT1/longitud completa y
WT1/extremo N-terminal se expresaron como proteínas
de fusión con Ral2. Ral2 es el fragmento C-terminal
de una proteína de Mycobacterium tuberculosis secretada,
indicada como MTB32B (Skeiky et al., Infect Immun. 67; 3998,
1999). La región de fusión de Ra12-WT1/longitud
completa se clonó 3' a un marcador de histidina en un vector pET28
modificado con un marcador de histidina. La región WT1/extremo
N-terminal se subclonó en un vector pET28 modificado
que tiene un marcador de histidina 5', seguido de la región de
fusión de tiorredoxina (TRX)-WT1/extremo
N-terminal, seguida de un marcador de histidina 3'.
La región codificante de WT1/extremo C-terminal se
subclonó en un vector pET28 modificado sin un compañero de fusión,
que contenía solamente el marcador de histidina 5' y 3', seguido de
un sitio de trombina y EK.
Se transformaron E. coli BL21 pLysS
(Stratagene, La Jolla, CA) con las tres construcciones de expresión
de WT1, se cultivaron durante una noche y se indujeron con
isopropil-\beta-D-tiogalactósido
(IPTG). Se purificaron proteínas WT1 de la forma siguiente: se
recogieron células y se lisaron por incubación en Tris 10 mM, pH 8,0
con Comprimidos Inhibidores de Proteasas Complete (Boehringer
Mannheim Biochemicals, Indianápolis, IN) a 37ºC seguida de rondas
repetidas de sonicación. Se lavaron dos veces los cuerpos de
inclusión con Tris 10 mM, pH 8,0. Después se purificaron las
proteínas mediante cromatografía de afinidad de quelato metálico
sobre resina de níquel-ácido nitrilotriacético (QIAGEN Inc.,
Valencia, CA; Hochuli et al., Biologically Active Molecules:
217, 1989), seguida de cromatografía en una resina de intercambio
aniónico Source Q (Amersham Pharmacia Biotech, Upsala, Suecia). La
identidad de las proteínas WT1 se confirmó mediante secuenciación
N-terminal.
Se estudiaron sueros de pacientes adultos con
AML o CML de novo para determinar la presencia de Ab
específicos de WT1. Se adsorbieron proteínas recombinantes en
placas de micropocillos TC (Nunc, Roskilde, Dinamarca). Las placas
se lavaron con PBS/Tween 20 a 0,5% y se bloquearon con BSA a
1%/PBS/Tween 20 a 0,1%. Después del lavado, se añadieron diluciones
de suero y se incubaron durante una noche a 4ºC. Las placas se
lavaron y se añadió un anticuerpo secundario de burro
anti-IgG humana con HRP
(Jackson-Immunochem, West Grove, PA) y se incubaron
durante 2 h a temperatura ambiente. Las placas se lavaron, se
incubaron con solución sustrato de TMB Peroxidasa (Kirkegaard y
Perry Laboratories, MA), se inactivó con H_{2}SO_{4} 1 N y se
leyeron inmediatamente (Cyto-Fluor 2350; Millipore,
Bedford, MA).
\newpage
Para el estudio serológico, se ensayaron sueros
humanos mediante ELISA a lo largo de un intervalo de diluciones
seriadas de 1:50 a 1:20.000. Se definió una reacción positiva como
un valor de DO de un suero diluido 1:500 que superaba el valor de
DO medio de sueros de donantes normales (n = 96) en tres
desviaciones típicas (WT1/longitud completa, WT1/extremo
C-terminal). Debido a un mayor fondo en donantes
normales para la proteína WT1/extremo N-terminal,
se definió una reacción positiva contra WT1/extremo
N-terminal como un valor de DO de un suero diluido
1:500 que superaba el valor de DO medio de sueros de donantes
normales en cuatro desviaciones típicas. Para verificar que la
respuesta de Ab del paciente se dirigía contra WT1 y no contra la
parte de fusión con Ra12 o TRX de la proteína o posibles proteínas
contaminantes de E. coli, los controles incluían la proteína
Ra12 y TRX purificada en solitario de una forma similar. Las
muestras que mostraban reactividad contra las proteínas Ra12 y/o
TRX se excluyeron del análisis.
Para evaluar la presencia de inmunidad contra
WT1, se determinaron los Ab contra proteínas WT1 recombinantes de
longitud completa y truncadas en los sueros de individuos normales y
pacientes con leucemia. Se analizó la reactividad de anticuerpos
mediante la reactividad de ELISA contra proteína WT1/longitud
completa, proteína WT1/extremo N-terminal y
proteína WT1/extremo C-terminal.
Sólo 2 de 96 donantes normales tenían
anticuerpos séricos reactivos con proteína WT1/longitud completa
(Figura 18). Uno de los individuos tenía anticuerpos contra
proteína WT1/extremo N-terminal y uno tenía
anticuerpos contra proteína WT1/extremo C-terminal.
Por el contrario, 16 de 63 pacientes (25%) con AML tenían
anticuerpos séricos reactivos con proteína WT1/longitud completa.
Notablemente por el contrario, sólo 2 de 63 pacientes (3%) tenían
reactividad contra proteína WT1/extremo C-terminal.
Quince de 81 pacientes (19%) con CML tenían anticuerpos séricos
reactivos con proteína WT1/longitud completa y 12 de 81 pacientes
(15%) tenían anticuerpos séricos reactivos con WT1/extremo
N-terminal. Sólo 3 de 81 pacientes (3%) tenían
reactividad contra proteína WT1/extremo C-terminal.
(Figuras 16 y 17).
Estos datos demuestran que son detectables
respuestas de Ab contra WT1 en algunos pacientes con AML y CML. La
mayor incidencia de anticuerpos en pacientes con leucemia
proporciona fuertes evidencias de que la inmunización contra la
proteína WT1 se producía como resultado de pacientes que llevan
tumores malignos que expresan o en algún momento expresaban WT1.
Sin limitarse a una teoría específica, se piensa que las respuestas
de anticuerpos observadas contra WT1 son más probablemente el
resultado de pacientes que se están volviendo inmunes contra WT1 en
sus propias células de leucemia y proporcionan pruebas directas de
que WT1 puede ser inmunógena a pesar de ser una proteína
propia.
La presencia de anticuerpos contra WT1 implica
claramente que también están presentes respuestas de células T
auxiliares concurrentes en los mismos pacientes. WT1 es una proteína
interna. Por lo tanto, es probable que las respuestas de CTL sean
las más eficaces en términos de terapia de leucemia y el brazo más
tóxico de la inmunidad. Por lo tanto, estos datos proporcionan
pruebas de que las vacunas terapéuticas dirigidas contra WT1 serán
capaces de generar una respuesta inmune contra WT1.
La mayoría de los anticuerpos detectados eran
reactivos con epítopos dentro del extremo
N-terminal, mientras que sólo un pequeño subgrupo
de pacientes mostraba una débil respuesta de anticuerpos contra el
extremo C-terminal. Esto concuerda con las
observaciones en el modelo animal, en el que la inmunización con
péptidos procedentes del extremo N-terminal
generaba respuestas de anticuerpos, células T auxiliares y CTL,
mientras que ninguno de los péptidos ensayados del extremo
C-terminal generaba respuestas de anticuerpos o
células T (Gaiger et al., Blood 96: 1334, 2000).
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Este Ejemplo ilustra el uso de células que
expresan WT1 para inducir una respuesta de anticuerpos específicos
de WT1 in vivo.
La detección de anticuerpos existentes contra
WT1 en pacientes con leucemia implicaba claramente que es posible
inmunizar contra proteína WT1 para generar inmunidad contra WT1.
Para ensayar si la inmunidad contra WT1 puede generarse por
vacunación, se inyectó TRAMP-C, una línea celular
tumoral positiva para WT1 de origen de B6, a ratones. En resumen,
se inmunizaron ratones B6 macho con 5 x 10^{6} células
TRAMP-C por vía subcutánea y se reforzaron dos
veces con células 5 x 10^{6} a intervalos de tres semanas. Tres
semanas después de la última inmunización, se obtuvieron sueros y
se prepararon suspensiones de una sola célula de bazos en medio
RPMI 1640 (GIBCO) con
\beta-2-mercaptoetanol 25 \muM,
200 unidades de penicilina por ml, L-glutamina 10
mM y suero fetal bovino a 10%.
Después de la inmunización contra
TRAMP-C, era detectable una respuesta de anticuerpos
específicos de WT1 en los animales inmunizados. Se muestra una
transferencia de Western representativa en la Figura 3. Estos
resultados muestran que la inmunización contra proteína WT1 puede
generar una respuesta inmune contra proteína WT1.
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Este Ejemplo ilustra la capacidad de la
inmunización con péptidos WT1 para generar una respuesta inmune
específica para WT1.
Se identificaron péptidos adecuados para generar
respuestas de Ab y células T proliferativas de acuerdo con el
programa Tsites (Rothbard y Tailer, EMBO J. 7:
93-100, 1988; Deavin et al., Mol. Immunol.
33: 145-155, 1996), que busca motivos peptídicos
que tengan el potencial de generar respuestas Th. Se sintetizaron y
secuenciaron los péptidos que se muestran en la Tabla I.
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\newpage
Para la inmunización, los péptidos se agruparon
de la forma siguiente:
- Grupo A:
- p-6-22 humano: 10,9 mg en 1 ml (10 \mul = 100 \mug)
- \quad
- p-177-139 humano/ratón: 7,6 mg en 1 ml (14 \mul = 100 \mug)
- \quad
- p244-262 humano: 4,6 mg en 1 ml (22 \mul = 100 \mug)
- Grupo B:
- P287-301 humano/ratón: 7,2 mg en 1 ml (14 \mul = 100 \mug)
- \quad
- p299-313 de ratón: 6,6 mg en 1 ml (15 \mul = 100 \mug)
- \quad
- P241-435 humano/ratón: 3,3 mg en 1 ml (30 \mul = 100 \mug)
- Control:
- (péptido FBL 100 \mug) + CFA/IFA
- Control:
- (péptido CD45 100 \mug) + CFA/IFA
El Grupo A contenía péptido presentes en la
porción amino-terminal de WT1 (exón 1) y el Grupo B
contenía péptidos presentes en el extremo
carboxi-terminal, que contiene una región de cuatro
dedos de cinc con homología de secuencia con otras proteínas de
unión a ADN. Dentro del grupo B, p287-301 y
p299-313 procedían del exón 7, dedo de cinc 1 y
p421-435 procedía del exón 10, dedo de cinc IV.
Se inmunizaron ratones B6 de un grupo de
péptidos WT1 o con un péptido de control. Los péptidos se
disolvieron en 1 ml de agua estéril para inyección y se inmunizaron
ratones B6 3 veces a intervalos de tiempo de tres semanas. Los
adyuvantes usados eran CFA/IFA, GM-CSF y Montanide.
Después se determinó la presencia de anticuerpos específicos para
WT1, como se describe en los Ejemplos 1 y 2, y se evaluaron las
respuestas de células T proliferativas usando un ensayo de
incorporación de timidina convencional en el que se cultivaron
células en presencia de antígeno y se evaluó la proliferación por
medición de la radiactividad incorporada (Chen et al., Cancer
Res. 54: 1065-1070, 1994). En particular, se
cultivaron linfocitos en placas de 96 pocillos a 2 x 10^{5}
células por pocillo con 4 x 10^{5} células de bazo singénicas
irradiadas (3000 rads) y el péptido designado.
La inmunización de ratones con el grupo de
péptidos designados como Grupo A generó una respuesta de anticuerpos
contra WT1 (Figura 4). No se detectaron anticuerpos después de la
inmunización contra Vacuna B, que concuerda con una ausencia de
respuestas de células T auxiliares a partir de la inmunización con
Vacuna B. P117-139 generaba respuestas de células T
proliferativas (Figuras 5A-5C). Los índices de
estimulación (SI) variaban entre 8 y 72. Se demostró también que
otros péptidos (P6-22 y P299-313)
generaban respuestas de células T proliferativas. La inmunización
con P6-22 dada como resultado un índice de
estimulación (SI) de 2,3 y la inmunización con
P299-313 daba como resultado un SI de 3,3. Los
controles positivos incluían células T estimuladas con ConA, así
como células T estimuladas con antígenos conocidos, tales como CD45
y FBL y líneas de células T alogénicas (DeBrujin et al.,
Eur. J. Immunol. 21: 2963-2970, 1991).
Las Figuras 6A y 6B muestran la respuesta
proliferativa observada para cada uno de los tres péptidos dentro
de la vacuna A (Figura 6A) y de la vacuna B (Figura 6B). La vacuna A
generaba respuestas de células T proliferativas contra los péptidos
inmunizantes p6-22 y p117-139, con
índices de estimulación (SI) que varían entre 3 y 8 (líneas
gruesas). No se detectaron respuestas proliferativas contra
p244-262 (Figura 6A).
Se llevaron a cabo estimulaciones in
vitro posteriores como estimulaciones de un solo péptido usando
solamente p6-22 y p117-139. La
estimulación de la línea celular T específica de Vacuna A con
p117-139 dio como resultado la proliferación contra
p117-139, sin respuesta contra p6-22
(Figura 7A). Los clones derivados de la línea eran específicos para
p117-139 (Figura 7B). Por el contrario, la
estimulación de la línea celular T específica de Vacuna A con
p6-22 dio como resultado la proliferación contra
p6-22, sin respuesta contra p117-139
(Figura 7C). Los clones derivados de la línea eran específicos para
p6-22 (Figura 7D).
Estos resultados muestran que la vacunación con
péptidos WT1 puede generar respuestas de anticuerpos contra
proteína WT1 y respuestas de células T proliferativas contra los
péptidos inmunizantes.
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Este Ejemplo ilustra la capacidad de péptidos
WT1 para generar inmunidad de CTL.
Se identificaron péptidos (nonámeros) con
motivos apropiados para la unión a MHC clase I usando un análisis
de predicción de la unión peptídica a HLA BIMAS (Parker et
al., J. Immunol. 152: 163, 1994). Se muestran péptidos
identificados dentro de dichos análisis en las Tablas
II-XLIV. En cada una de estas tablas, la puntuación
refleja la afinidad de unión teórica (semivida de disociación) del
péptido con la molécula de MHC indicada. También se indican en las
tablas los motivos de unión peptídicos definidos como se describen
por Rammensee, et al., Immunogenetics 41:
178-228, 1995. El motivo de unión peptídico para
HLA-B14 se describe en DiBrino et al., J.
Biol. Chem. 269: 23462-23434, 1994, también
incorporado en este documento en su totalidad. Las posiciones
peptídicas se abrevian como P1, P2, P3, P4, P5, P6, P7, P8 y P9.
Los péptidos identificados usando el programa
Tsites (Rotharbard y Taylor, EMBO, J. 7: 93-100,
1988; Deavin et al., Mol. Immunol 33:
145-155, 1996), que busca motivos peptídicos que
tengan el potencial de generar respuestas Th se muestran
adicionalmente en las Figuras 8A y 8B y en la Tabla XLV.
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Se seleccionaron ciertos péptidos CTL (que se
muestran en la Tabla XLVI) para un estudio adicional. Para cada
péptido en la Tabla XLVI se proporcionan las puntuaciones obtenidas
usando el análisis de predicción de la unión peptídica a HLA
BIMAS.
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Se confirmó la unión peptídica a MHC murino de
C57BI/6 usando la línea celular de leucemia RMA-S
como se describe por Ljunggren et al., Nature 346:
476-480, 1990. En resumen, se cultivaron células
RMA-S durante 7 horas a 26ºC en medio completo
complementado con FCS a 1%. Se añadieron un total de 10^{6}
RMA-S a cada pocillo de una placa de 24 pocillos y
se incubaron en solitario o con el péptido designado (25 \mug/ml)
durante 16 horas a 26ºC y 3 horas adicionales a 37ºC en medio
completo. Después, las células se lavaron tres veces y se tiñeron
con anticuerpo anti-D^{b} o
anti-K^{b} conjugado con isotiocianato de
fluoresceína (PharMingen, San Diego, CA). Las células marcadas se
lavaron dos veces, se resuspendieron y se fijaron en 500 \mul de
PBS con paraformaldehído a 1% y se analizaron para determinar la
intensidad de fluorescencia en un citómetro de flujo
(Becton-Dickinson FACSCalibur®). El porcentaje de
aumento de moléculas D^{b} o K^{b} en la superficie de las
células RMA-S se midió mediante una intensidad
fluorescente media aumentada de células incubadas con péptido en
comparación con la de células incubada en medio
solamente.
solamente.
Se inmunizaron ratones con los péptidos capaces
de unirse a MHC clase I murino. Después de la inmunización, se
estimularon células de bazo in vitro y se ensayaron para
determinar la capacidad para lisar dianas incubadas con péptidos
WT1. Se evaluaron CTL con un ensayo de liberación de cromo
convencional (Chen et al., Cancer Res. 54:
1065-1070, 1994). Se incubaron 10^{6} células
diana a 37ºC como 150 \muCi de ^{51}Cr de sodio durante 90
minutos, en presencia o ausencia de péptidos específicos. Se lavaron
células tres veces y se resuspendieron en RPMI con suero fetal
bovino a 5%. Para el ensayo, se incubaron 10^{4} células diana
marcadas con ^{51}Cr con diferentes concentraciones de células
efectoras en un volumen final de 200 \mul en placas de 96
pocillos con fondo en U. Se eliminaron los sobrenadantes después de
4 a 7 horas a 37ºC y se determinó el porcentaje de lisis específica
mediante la fórmula:
% lisis
específica = 100 x (liberación experimental - liberación
espontánea)/ (liberación máxima - liberación
espontánea)
Los resultados que se presentan en la Tabla
XLVII, muestran que algunos péptidos WT1 pueden unirse a moléculas
de MHC clase I, que es esencial para generar CTL. Además, varios de
los péptidos eran capaces de generar CTL específicos de péptido
(Figuras 9A y 9B), como se determinó usando ensayos de liberación de
cromo. Después de la inmunización contra péptidos CTL
p10-18 humano, p136-144 humano,
p136-144 de ratón y p235-243, se
generaron líneas de CTL específicos de péptido y se establecieron
clones. Estos resultados indican que los CTL específicos de péptido
pueden destruir células malignas que expresen WT1.
Este Ejemplo ilustra la capacidad de un
polipéptido WT1 representativo para generar una inmunidad de CTL
capaz de destruir líneas celulares tumorales positivas para
WT1.
Se identificó el P117-139, un
péptido con motivos apropiados para la unión a MHC clase I y clase
II, como se ha descrito anteriormente usando análisis de predicción
de la unión peptídica a HLA TSITES y BIMAS. Se inmunizaron ratones
como se ha descrito en el Ejemplo 3. Después de la inmunización, se
estimularon células de bazo in vitro y se ensayaron para
determinar la capacidad para lisar dianas incubadas con péptidos
WT1, así como células tumorales positivas y negativas para WT1. Se
evaluaron CTL con un ensayo de liberación de cromo convencional.
Los resultados que se presentan en las Figuras
10A-10D muestran que P117 puede generar CTL
específicos de WT1 capaces de destruir células tumorales positivas
para WT1, mientras que no se observó destrucción de células
negativas para WT1. Estos resultados demuestran que los CTL
específicos de péptido destruyen de hecho células malignas que
expresan WT1 y que la vacuna y la terapia de células T son eficaces
contra tumores malignos que expresen WT1.
Se realizaron inmunizaciones similares usando
los péptidos de unión a MHC clase I nonaméricos
p136-144, p225-233,
p235-243, así como el péptido de 23 aminoácidos
p117-139. Después de la inmunización, se estimularon
células de bazo in vitro con cada uno de los 4 péptidos y se
ensayaron para determinar la capacidad para lisar dianas incubadas
con péptidos WT1. Se generaron CTL específicos para
p136-144, p235-243 y
p117-139, pero no para p225-233. Se
presentan los datos de CTL para p235-243 y
p117-139 en las Figuras 11A y 11B. Los datos para
los péptidos p136-144 y p225-233 no
están representados.
La lisis de CTL demanda que los péptidos WT1
diana se procesen endógenamente y se presenten en asociación con
moléculas de MHC clase I de células tumorales. Los CTL específicos
de péptido WT1 anteriores se ensayaron para determinar la capacidad
para lisar líneas celulares tumorales positivas frente a negativas
para WT1. Los CTL específicos para p235-243 lisaron
dianas incubadas con los péptidos p235-243 pero no
lisaron líneas celulares que expresaban proteínas WT1 (Figura 11A).
Notablemente por el contrario, los CTL específicos para
p117-139 lisaron dianas incubadas con péptidos
p117-139 y también lisaron células malignas que
expresaban WT1 (Figura 11B). Como control negativo, los CTL
específicos para p117-139 no lisaron
EL-4 negativas para WT1 (también denominadas en
este documento E10).
La especificidad de la lisis específica de WT1
se confirmó mediante inhibición con diana fría (Figuras
12A-12B). Se sembraron en placas células efectoras
para diversas proporciones de efector:diana en placas de fondo en U
de 96 pocillos. Se añadió un exceso de diez veces (en comparación
con la diana caliente) de la diana recubierta con el péptido
indicado sin marcaje con ^{51}Cr. Por último, se añadieron
10^{4} células diana marcadas con ^{51}Cr y las placas se
incubaron a 37ºC durante 4 horas. El volumen total por pocillo era
de 200 \mul.
La lisis de TRAMP-C por CTL
específicos de p117-139 se bloqueó de 58% a 36% por
EL-4 incubadas con el péptido relevante
p117-139, pero no con EL-4 incubadas
con un péptido irrelevante (Figura 12A). De forma similar, la lisis
de BLK-SV40 se bloqueó de 18% a 0% mediante
EL-4 incubadas con el péptido relevante
p117-139 (Figura 12B). Los resultados validan que
los CTL específicos de péptido WT1 destruyen específicamente células
malignas por reconocimiento de WT1 procesado.
Están contenidos varios segmentos con supuestos
motivos de CTL en el interior de p117-139. Para
determinar la secuencia exacta del epítopo de CTL se sintetizaron
todos los péptidos nonaméricos potenciales en
p117-139 (Tabla XLVIII). Se demostró que dos de
estos péptidos (p126-134 y p130-138)
se unían a moléculas clase I H-2^{b} (Tabla
XLVIII). Los CTL generados por inmunización con
p117-139 lisaban dianas incubadas con
p126-134 y p130-138, pero no con
los otros péptidos nonaméricos dentro de p117-139
(Figura 13A).
La línea de CTL específica de
p117-139 se volvió a estimular con
p126-134 o p130-138. Después de la
reestimulación con p126-134 o
p130-138, ambas líneas de células T demostraron
lisis específica de péptido, pero solamente los CTL específicos de
p130-138 mostraron lisis de una línea celular
tumoral positiva para WT1 (Figuras 13B y 13C). Por lo tanto, parece
que p130-138 es el epítopo procesado de forma
natural.
Este Ejemplo ilustra el uso de
RT-PCR para detectar ARNm específico de WT1 en
células y líneas celulares.
Se aislaron células mononucleares mediante
centrifugación en gradiente de densidad y se congelaron
inmediatamente y se almacenaron a -80ºC hasta que se analizaron
mediante RT-PCR para determinar la presencia de ARNm
específico de WT1. La RT-PCR se realizó en general
como se describe por Fraizer et al., Blood 86:
4704-4706, 1995. Se extrajo el ARN total de
10^{7} células de acuerdo con procedimientos convencionales. Se
resuspendieron sedimentos de ARN en 25 \mul de agua tratada con
dietilpirocarbonato y se usaron directamente para la transcripción
inversa. Se amplificó la región con dedos de cinc (exones 7 a 10)
mediante PCR como un ADNc de ratón de 330 pb. Se realizó la
amplificación en un termociclador durante una o, cuando era
necesario, dos rondas secuenciales de PCR. Se usó ADN polimerasa
AmpliTaq (Perkin Elmer Cetus, Norwalk, CT), MgCl_{2} 2,5 mM y 20
pmol de cada cebador en un volumen de reacción total de 50 \mul.
Se sometieron a electroforesis alícuotas de veinte \mul de los
productos de PCR en geles de agarosa a 2% teñidos con bromuro de
etidio. Los geles se fotografiaron con una película Polaroid
(Polaroid 667, Polaroid Ltd., Hertfordshire, Inglaterra). Se tomaron
precauciones contra contaminaciones cruzadas siguiendo las
recomendaciones de Kwok y Higuchi, Nature 339:
237-238, 1989. Los controles negativos incluían las
mezclas de reactivos de ADNc y PCR con agua en lugar de ADNc en cada
experimento. Para evitar falsos negativos, se evaluó la presencia
de ARN intacto y la generación de ADNc adecuado para cada muestra
mediante una PCR de control usando cebadores de
\beta-actina. Las muestras que no se amplificaron
con estos cebadores se excluyeron del análisis.
Los cebadores para la amplificación de WT1 en
líneas celulares de ratón eran: P115: 1458-1478: 5'
CCC AGG CTG CAA TAA GAG ATA 3' (cebador directo; SEC ID Nº: 21); y
P116: 1767-1787: 5' ATG TTG TGA TGG CGG ACC AAT 3'
(cebador inverso; SEC ID Nº: 22) (véase Inoue et al. Blood
88: 2267-2278, 1996; Fraizer et al., Blood
86: 4704-4706, 1995).
Los cebadores de beta actina usados en las
reacciones de control eran: 5' GTG GGG CGC CCC AGG CAC CA 3'
(cebador sentido; SEC ID Nº: 23); y 5' GTC CTT AAT GTC ACG CAC GAT
TTC 3' (cebador antisentido; SEC ID Nº: 24).
Los cebadores para usar en la amplificación de
WT1 humana incluyen: P117: 954-974: 5' GGC ATC TGA
GAC CAG TGA GAA 3' (SEC ID Nº: 25); y P118:
1434-1414: 5' GAG AGT CAG ACT TGA AAG CAGT 3' (SEC
ID Nº: 5). Para RT-PCR anidada, los cebadores
pueden ser: P119: 1023-1043: 5' GCT GTC CCA CTT ACA
GAT GCA 3' (SEC ID Nº: 26); y P120: 1345-1365: 5'
TCA AAG CGC CAG CTG GAG TTT 3' (SEC ID Nº: 27).
La Tabla XLVIII muestra los resultados del
análisis por PCR de WT1 de líneas celulares tumorales de ratón.
Dentro de la Tabla IV, (+++) indica un intenso producto de
amplificación por PCR de WT1 en la primera etapa de RT PCR, (++)
indica un producto de amplificación de WT1 que es detectable
mediante la primera etapa de RT PCR de WT1, (+) indica un producto
que es detectable solamente en la segunda etapa de RT PCR de WT1 y
(-) indica negativo por PCR para WT1.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(Tabla pasa a página
siguiente)
\newpage
La fase de lectura abierta truncada de WT1 (WT1
B) se amplificó por PCR con los siguientes cebadores:
- Cebador directo partiendo del aminoácido 2
- P-37 (SEC ID Nº: 342) 5' ggctccgacgtgcgggacctg 3' Tm 64ºC
- Cebador inverso que genera un sitio EcoRI después del codón de terminación
- P-23 (SEC ID Nº: 343) 5' gaattctcaaagcgccagctggagtttggt 3' Tm 63ºC
\vskip1.000000\baselineskip
La PCR se realizó en las siguientes
condiciones:
- 10 \mul de tampón de Pfu 10X
- 1 \mul de dNTP 10 mM
- 2 \mul de cada oligonucleótido 10 \muM
- 83 \mul de agua estéril
- 1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA)
- 50 ng de ADN (pPDM FL WT1)
- 96ºC 2 minutos
- 96ºC 20 segundos, 63ºC 15 segundos, 72ºC 3 minutos x 40 ciclos
- 72ºC 4 minutos
\vskip1.000000\baselineskip
El producto de PCR se digirió con la enzima de
restricción EcoRI, se purificó en gel y después se clonó en el
vector pTrx 2H (un vector pET28 modificado con una fusión con Trx en
el N-terminal y dos marcadores His rodeando la
fusión con Trx. Después de la fusión con Trx existen sitios de
escisión de proteasas para trombina y enteroquinasa). La
construcción pTRx2H se digirió con las enzimas de restricción StuI y
EcoRI. Las construcciones correctas se confirmaron mediante
análisis de la secuencia de ADN y después se usaron para transformar
células hospedadoras de expresión BL21 (DE3) pLys y BL21 (DE3)
CodonPlus.
\vskip1.000000\baselineskip
La fase de lectura abierta
N-terminal de WT1 (WT1 A) se amplificó por PCR con
los siguientes cebadores:
- Cebador directo partiendo del aminoácido 2
- P-37 (SEC ID Nº: 344) 5' ggctccgacgtgcgggacctg 3' Tm 64ºC
- Cebador inverso que genera un sitio EcoRI después de un codón de terminación artificial situado después del aminoácido 249.
- PDM-335 (SEC ID Nº: 345)
- 5' gaattctcaaagcgccagctggagtttggt 3' Tm 64ºC
\vskip1.000000\baselineskip
La PCR se realizó en las siguientes
condiciones:
- 10 \mul de tampón de Pfu 10X
- 1 \mul de dNTP 10 mM
- 2 \mul de cada oligonucleótido 10 \muM
- 83 \mul de agua estéril
- 1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA)
- 50 ng de ADN (pPDM FL WT1)
- 96ºC 2 minutos
- 96ºC 20 segundos, 63ºC 15 segundos, 72ºC 1 minuto 20 segundos x 40 ciclos
- 72ºC 4 minutos
\vskip1.000000\baselineskip
El producto de PCR se digirió con la enzima de
restricción EcoRI, se purificó en gel y después se clonó en pPDM,
un vector pET28 modificado con un marcador His en fase de lectura
que se había digerido con las enzimas de restricción Eco721 y
EcoRI. El producto de PCR también se transformó en el vector pTrx
2H. La construcción pTrx2H se digirió con las enzimas de
restricción StuI y EcoRI. Las construcciones correctas se
confirmaron mediante análisis de la secuencia de ADN y después se
usaron para transformar células hospedadoras de expresión BL21
(DE3) pLys S y BL21 (DE3) CodonPlus.
\vskip1.000000\baselineskip
La fase de lectura abierta truncada de WT1 (WT1
A) se amplificó por PCR con los siguientes cebadores:
- Cebador directo partiendo del aminoácido 250
- PDM-346 (SEC ID Nº: 346) 5' cacagcacagggtacgagagc 3'
- Tm 58ºC
- Cebador inverso que genera un sitio de EcoRI después del codón de terminación
- P-23 (SEC ID Nº: 347) 5'gaattctcaaagcgccagctggagtttggt 3'
- Tm 63ºC
\vskip1.000000\baselineskip
La PCR se realizó en las siguientes
condiciones:
- 10 \mul de tampón de Pfu 10X
- 1 \mul de dNTP 10 mM
- 2 \mul de cada oligonucleótido 10 \muM
- 83 \mul de agua estéril
- 1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA)
- 50 ng de ADN (pPDM FL WT1)
- 96ºC 2 minutos
- 96ºC 20 segundos, 63ºC 15 segundos, 72ºC 1 minuto 30 segundos x 40 ciclos
- 72ºC 4 minutos
\vskip1.000000\baselineskip
El producto de PCR se digirió con la enzima de
restricción EcoRI, se purificó en gel y después se clonó en pPDM,
un vector pET28 modificado con un marcador His en fase de lectura,
que se había digerido con las enzimas de restricción Eco721 y
EcoRI. El producto de PCR se transformó también en el vector pTrx
2H. La construcción pTrx 2H se digirió con las enzimas de
restricción StuI y EcoRI. Las construcciones correctas se
confirmaron mediante análisis de la secuencia de ADN y después se
usaron para transformar células hospedadoras de expresión BL21
(DE3) pLys S y BL21 (DE3) CodonPlus.
Para los Ejemplos 7-9, se
describen las siguientes SEC ID Nº:
La SEC ID Nº: 327 es la secuencia de ADNc
determinada para Trx_WT1_B
La SEC ID Nº: 328 es la secuencia de ADNc
determinada para Trx_WT1_A
La SEC ID Nº: 329 es la secuencia de ADNc
determinada para Trx_WT1
La SEC ID Nº: 330 es la secuencia de ADNc
determinada para WT1_A
La SEC ID Nº: 331 es la secuencia de ADNc
determinada para WT1_B
La SEC ID Nº: 332 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la SEC ID Nº: 327
La SEC ID Nº: 333 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la SEC ID Nº: 328
La SEC ID Nº: 334 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la SEC ID Nº: 329
La SEC ID Nº: 335 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la SEC ID Nº: 330
La SEC ID Nº: 336 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la SEC ID Nº: 331
\vskip1.000000\baselineskip
Se amplificaron tres fases de lectura de WT1
mediante PCR usando los siguientes cebadores:
Para WT1 Tr2:
- PDM-441 (SEC ID Nº: 348) 5'
- cacgaagaacagtgcctgagcgcattcac 3' Tm 63ºC
- PDM-442 (SEC ID Nº: 349) 5'
- ccggcgaattcatcagtataaattgtcactgc 3' TM 62ºC
\vskip1.000000\baselineskip
Para WT1 Tr3:
- PDM-443 (SEC ID Nº: 350) 5'
- caggctttgctgctgaggacgccc 3' Tm 64ºC
- PDM-444 (SEC ID Nº: 351) 5'
- cacggagaattcatcactggtatggtttctcacc Tm 64ºC
\vskip1.000000\baselineskip
Para WT1 Tr4:
- PDM-445 (SEC ID Nº: 352) 5'
- cacagcaggaagcacactggtgagaaac 3' Tm 63ºC
- PDM-446 (SEC ID Nº: 353) 5'
- ggatatctgcagaattctcaaagcgccagc 3' TM 63ºC
\vskip1.000000\baselineskip
La PCR se realizó en las siguientes
condiciones:
- 10 \mul de tampón de Pfu 10X
- 1 \mul de dNTP 10 mM
- 2 \mul de cada oligonucleótido 10 \muM
- 83 \mul de agua estéril
- 1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA)
- 50 ng de ADN (pPDM FL WT1)
- 96ºC 2 minutos
- 96ºC 20 segundos, 63ºC 15 segundos, 72ºC 30 segundos x 40 ciclos
- 72ºC 4 minutos
\vskip1.000000\baselineskip
Los productos de PCR se digirieron con EcoRI y
se clonaron en pPDM His, (un vector pET28 modificado con un
marcador His en fase de lectura en el extremo 5') que se había
digerido con Eco721 y EcoRI. Se confirmó que las construcciones
eran correctas a través del análisis de secuencia y se usaron para
transformar células BL21 pLys S y BL21 CodonPlus o células BLR pLys
S y BLR CodonPlus.
\vskip1.000000\baselineskip
Se amplificó la fase de lectura de WT1 C
mediante PCR usando los siguientes cebadores:
- PDM-504 (SEC ID Nº: 354) 5' cactccttcatcaaacaggaac 3'
- Tm 61ºC
- PDM-446 (SEC ID Nº: 355) 5'
- ggatatctgcagaattctcaaagcgccagc 3' Tm 63ºC
\vskip1.000000\baselineskip
La PCR se realizó en las siguientes
condiciones:
- 10 \mul de tampón de Pfu 10X
- 1 \mul de dNTP 10 mM
- 2 \mul de cada oligonucleótido 10 \muM
- 83 \mul de agua estéril
- 1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA)
- 50 ng de ADN (pPDM FL WT1)
- 96ºC 2 minutos
- 96ºC 20 segundos, 63ºC 15 segundos, 72ºC 2 minutos x 40 ciclos
- 72ºC 4 minutos
\vskip1.000000\baselineskip
El producto de PCR se digirió con EcoRI y se
clonó en pPDM His que se había digerido con Eco721 y EcoRI. La
secuencia se confirmó a través de análisis de secuencia y después se
usó para transformar BLR pLys S y BLR que se cotransformaron con
CodonPlus RP.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo se realizó para determinar el
efecto del cambio del uso de codones de prolina sobre la
expresión.
Se hibridaron las siguientes parejas de
oligonucleótidos:
- 1.
- PDM-505 (SEC ID Nº: 356) 5'
- ggttccgacgtgcgggacctgaacgcactgctg 3'
- PDM-506 (SEC ID Nº: 357) 5'
- ctgccggcagcagtgcgttcaggtcccgcacgtcggaacc 3'
\vskip1.000000\baselineskip
- 2.
- PDM-507 (SEC ID Nº: 358) 5'
- ccggcagttccatccctgggtggcggtggaggctg 3'
- PDM-508 (SEC ID Nº: 359) 5'
- cggcagtgcgcagcctccaccgccacccagggatggaa 3'
\vskip1.000000\baselineskip
- 3.
- PDM-509 (SEC ID Nº: 360) 5'
- cgcactgccggttagcggtgcagcacagtgggctc 3'
- PDM-510 (SEC ID Nº: 361) 5'
- cagaactggagcccactgtgctgcaccgctaac 3'
\vskip1.000000\baselineskip
- 4.
- PDM-511 (SEC ID Nº: 362) 5'
- cagttctggacttcgcaccgcctggtgcatccgcatac 3'
- PDM-512 (SEC ID Nº: 363) 5'
- cagggaaccgtatgcggatgcaccaggcggtgcgaagtc 3'
\vskip1.000000\baselineskip
- 5.
- PDM-513 (SEC ID Nº: 364) 5'
- ggttccctgggtggtccagcacctccgcccgcaacgcc 3'
- PDM-514 (SEC ID Nº: 365) 5'
- ggcggtgggggcgttgcgggcggaggtgctggaccacc 3'
\vskip1.000000\baselineskip
- 6.
- PDM-515 (SEC ID Nº: 366) 5'
- cccaccgcctccaccgcccccgcactccttcatcaaacag 3'
- PDM-516 (SEC ID Nº: 367) 5'
- ctaggttcctgtttgatgaaggagtgcgggggcggtgga 3'
\vskip1.000000\baselineskip
- 7.
- PDM-517 (SEC ID Nº: 368) 5'
- gaacctagctggggtggtgcagaaccgcacgaagaaca 3'
- PDM-518 (SEC ID Nº: 369) 5'
- ctcaggcactgttcttcgtgcggttctgcaccaccccag 3'
\vskip1.000000\baselineskip
- 8.
- PDM-519 (SEC ID Nº: 370) 5'
- gtgcctgagcgcattctgagaattctgcagat 3'
- PDM-520 (SEC ID Nº: 371) 5'
- gtgtgatggatatctgcagaattctcagaatgcg 3'
\vskip1.000000\baselineskip
Cada pareja de oligonucleótidos se combinó por
separado y después se hibridó. Las parejas se ligaron después entre
sí y se usó un \mul de mezcla de ligación para las condiciones de
PCR siguientes:
- 10 \mul de tampón de Pfu 10X
- 1 \mul de dNTP 10 mM
- 2 \mul de cada oligonucleótido 10 \muM
- 83 \mul de agua estéril
- 1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA)
- 96ºC 2 minutos
- 96ºC 20 segundos, 63ºC 15 segundos, 72ºC 30 segundos x 40 ciclos
- 72ºC 4 minutos
\vskip1.000000\baselineskip
El producto de PCR se digirió con EcoRI y se
clonó en pPDM His que se había digerido con Eco721 y EcoRI. La
secuencia se confirmó y después se usó para transformar BLR pLys S y
BLR que se cotransformaron con CodonPlus RP.
Para los ejemplos 10-12, se
describen las siguientes SEC ID Nº:
La SEC ID Nº: 337 es la secuencia de ADNc
determinada para WT1_Tr1
La SEC ID Nº: 338 es la secuencia de ADNc
determinada para WT1_Tr2
La SEC ID Nº: 339 es la secuencia de ADNc
determinada para WT1_Tr3
La SEC ID Nº: 340 es la secuencia de ADNc
determinada para WT1_Tr4
La SEC ID Nº: 341 es la secuencia de ADNc
determinada para WT1_C
La SEC ID Nº: 342 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la SEC ID Nº: 337
La SEC ID Nº: 343 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la SEC ID Nº: 338
La SEC ID Nº: 344 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la SEC ID Nº: 339
La SEC ID Nº: 345 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la SEC ID Nº: 340
La SEC ID Nº: 346 es la secuencia de aminoácidos
predicha codificada por la SEC ID Nº: 341
La secuencia de WT1 C representa un
polinucleótido que tiene las regiones codificantes de TR2, TR3 y
TR4.
La secuencia sintética de WT1 C representa un
polinucleótido que tiene las regiones codificantes de TR2, TR3 y
TR4.
La secuencia sintética de WT1 de
TR-1 representa un polinucleótido en el que codones
alternativos para prolina sustituyeron a los codones nativos,
produciendo un polinucleótido capaz de expresar WT1
TR-1 en E. coli.
\vskip1.000000\baselineskip
El propósito de este ejemplo era analizar la
inmunogenicidad y los efectos histopatológicos y toxicológicos
sistémicos potenciales de la inmunización con proteína WT1 en una
valoración de dosis múltiples en ratones.
El diseño experimental para la inmunización de
ratones con proteína WT1 se describe en la Tabla L.
La vacunación contra proteína WT1 usando
MPL-SE como adyuvante, en un estudio de valoración
de dosis múltiples (dosis que oscilaban de 25 \mug, 100 \mug a
1000 \mug de proteína WT1) en ratones C57/B6 hembra generó una
fuerte respuesta de anticuerpos específicos de WT1 (Figura 19) y
respuestas celulares de células T (Figura 20).
No se observaron efectos histopatológicos ni
toxicológicos sistémicos de la inmunización con proteína WT1. No se
observaron pruebas histológicas de toxicidad en los siguientes
tejidos: glándula adrenal, cerebro, ciego, colon, duodeno, ojo,
fémur y médula, vesícula biliar, corazón, íleon, yeyuno, riñón,
laringe, glándula lagrimal, hígado, pulmón, ganglio linfático,
músculo, esófago, ovario, páncreas, paratiroides, glándula salivar,
esternón y médula, bazo, estómago, timo, tráquea, tiroides, vejiga
urinaria y útero.
Se puso un énfasis especial en la evaluación de
la toxicidad hematopoyética potencial. La proporción
mieloide/eritroide en médula de esternón y fémur era normal. Todos
los recuentos de células sanguíneas evaluables y la química
sanguínea (BUN, creatinina, bilirrubina, albúmina, globulina)
estaban dentro del intervalo normal (Tabla LI).
Dado que está presente una inmunidad existente
contra WT1 en algunos pacientes con leucemia y que la vacunación
contra proteína WT1 puede generar respuestas de Ab y celulares de
células T específicas de WT1 en ratones sin toxicidad para tejidos
normales, estos experimentos validan a WT1 como una vacuna para
tumor/leucemia.
\vskip1.000000\baselineskip
Abreviaturas: WBC: glóbulos
blancos; RBC: glóbulos rojos; Hg.: hemoglobina; HCT; hematocrito;
MCV: Volumen corpuscular medio; MCH: hemoglobina corpuscular media;
MCHC: concentración de hemoglobina corpuscular media; Plq.:
plaquetas; Abs.: absoluto; Baso: basófilos; Eos: eosinófilos; En
banda Abs.: neutrófilos inmaduros; Polis: células
polimorfonucleares; Linf: linfocitos; Mono; monocitos; BUN:
nitrógeno de urea en
sangre.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo demuestra que pueden generarse
respuestas de células T específicas de WT1 a partir de la sangre de
individuos normales.
Se diferenciaron células dendríticas (DC) a
partir de cultivos de monocitos obtenidos de PBMC de donantes
normales por cultivo durante 4-10 días en medio de
RPMI que contenía suero humano a 10%, GMCSF 50 ng/ml e
IL-4 30 ng/ml. Después del cultivo, se infectaron DC
16 horas con virus vaccinia que expresaba WT1 recombinante a una
M.O.I. de 5, o durante 3 días con adenovirus que expresaba WT1
recombinante a una M.O.I. de 10 (Figuras 21 y 22). Se inactivó el
virus vaccinia mediante irradiación U.V. Se aislaron células T
CD8^{+} por selección positiva usando perlas magnéticas y se
iniciaron cultivos de sensibilización en placas de 96 pocillos. Los
cultivos se volvieron a estimular cada 7-10 días
usando células dendríticas autólogas infectadas con adenovirus o
vaccinia para expresar WT1. Después de 3-6 ciclos de
estimulación, podían identificarse líneas CD8^{+} que producían
específicamente interferón-gamma cuando se
estimulaban con células dendríticas o fibroblastos que expresaban
WT1 autóloga. La actividad específica de WT1 de estas líneas podía
mantenerse después de ciclos de estimulación adicionales. Se
demostró que estas líneas reconocían específicamente células
dendríticas autólogas infectadas con adeno o vaccinia WT1, pero no
células dendríticas autólogas infectadas con adeno o vaccinia EGFP
mediante ensayos de Elispot
(Figura 23).
(Figura 23).
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo describe la formulación que permite
la solubilización completa de Ra12-WT1
liofilizada.
La siguiente formulación permitía que la
proteína recombinante Ra12-WT1 se disolviera en un
medio acuoso después de liofilizarse hasta sequedad:
Concentración de Ra12-WT1
recombinante: 0,5-1,0 mg/ml; Tampón: Etanolamina
10-20 mM, pH 10,0; Cisteína 1,0-5,0
mM; Tween-80 a 0,05%
(Polisorbato-80); Azúcar: Trehalosa a 10% (T5251,
Sigma, MO); Maltosa a 10% (M9171, Sigma, MO), Sacarosa a 10%
(S7903, Sigma, MMO); Fructosa a 10% (F2543, Sigma, MO); Glucosa a
10% (G7528, Sigma, MO).
Se descubrió que la proteína liofilizada con el
excipiente de azúcar se disolvía significativamente más que sin el
excipiente de azúcar. El análisis mediante SDS-PAGE
teñido con coomassie no mostraba signos de sólidos restantes en el
material disuelto.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo describe la inducción de respuestas
inmunes específicas de WT1 después de la inmunización con proteína
WT1 y 2 formulaciones de adyuvante diferentes.
De acuerdo con este ejemplo, la proteína WT1 en
combinación con MPL-SE induce una fuerte respuesta
de Ab e Interferón-\gamma
(IFN-\gamma) contra WT1. A continuación se
describen en detalle los métodos usados para inducir respuestas
inmunes específicas de WT1 después de una inmunización con proteína
WT1 usando MPL-SE o Enhanzyn como adyuvante en
ratones C57/B6.
Se inmunizaron ratones C57BL/6 con 20 \mug de
rRa12-WT1 combinada con los adyuvantes
MPL-SE o Enhanzyn. Se inmunizó un grupo de ratones
de control con rRa12-WT1 sin adyuvante y se inmunizó
un grupo con solución salina en solitario. Se administraron tres
inmunizaciones intramusculares (IM), separadas por tres semanas. Se
recogieron bazos y sueros 2 semanas después de la inmunización
final. Se analizaron los sueros para respuestas de anticuerpos
mediante ELISA en placas recubiertas con fusión de
rRa12-WT1, Ra12 o WT1TRX. Se observaron niveles
similares de títulos de anticuerpos IgG2a e IgG1 en ratones
inmunizados con Ra12-WT1 + MPL-SE y
Ra12-WT1 + Enhanzyn. Los ratones inmunizados con
rRa12-WT1 sin adyuvante mostraban niveles menores de
anticuerpos
IgG2a.
IgG2a.
Se evaluaron las respuestas de CD4 por medición
de la producción de interferón-\gamma después de
la estimulación de esplenocitos in vitro con
rRa12-WT1, rRa12 o con péptidos WT1 p6, p117 y p287.
Ambos adyuvantes mejoraron las respuestas de CD4 sobre los ratones
inmunizados con rRA12-WT1 en solitario.
Adicionalmente, los resultados indican que
rRA12-WT1 + MPL-SE inducía una
respuesta de CD4 más fuerte que rRA12-WT1 +
Enhanzyn. Las lecturas de DO de IFN-\gamma
variaban de 1,4-1,6 en los ratones inmunizados con
rRA12-WT1 + MPL-SE en comparación
con 1-1,2 en los ratones inmunizados con
rRa12-WT1 + Enhanzyn. Sólo se observaron respuestas
contra péptidos contra p117, y después solamente en ratones
inmunizados con rRa12-WT1 + MPL-SE.
Se observaron fuertes respuestas de IFN-\gamma
contra el control positivo, ConA, en todos los ratones. Sólo se
observaron respuestas contra ConA en los ratones de control
negativo inmunizados con solución salina, indicando que las
respuestas eran específicas para
rRA12-WT1.
rRA12-WT1.
\vskip1.000000\baselineskip
La secuencia de ácido nucleico de WT1 humana se
mutó aleatoriamente usando un método de reacción en cadena de la
polimerasa en presencia de 8-oxo dGTP y dPTP
(Journal of Molecular Biology 1996; 255: 589-603).
El gen de WT1 humana completo no cortado ni empalmado se describe
en la SEC ID Nº: 380 y la secuencia proteica correspondiente se
expone en la SEC ID Nº: 404. Se usó una VARIANTEe de corte y empalme
de WT1 como molde para las reacciones de PCR y se describe en las
SEC ID Nº: 381 (ADN) y 408 (proteína). Se seleccionaron condiciones
de modo que la frecuencia de alteraciones en el ácido nucleico
condujera a un cambio dirigido en la secuencia de aminoácidos,
habitualmente de 5-30% del producto de PCR. Después
se amplificó el producto de PCR mutado en ausencia de los análogos
de nucleótidos usando los cuatro dNTP normales. Este producto se
subclonó en vectores de expresión de mamíferos y vectores virales
para la inmunización. Esta genoteca, por lo tanto, contiene una
población mixta de clones de WT1 aleatoriamente mutados. Se
seleccionaron y se secuenciaron varios clones. Las secuencias de
ADN VARIANTEes de WT1 mutada se describen en las SEC ID Nº:
377-379 y las secuencias de aminoácidos predichas
de las VARIANTEes se exponen en las SEC ID Nº:
405-407. Estas secuencias alteradas, y otras de la
genoteca, pueden usarse como inmunógenos para inducir respuestas de
células T más intensas contra proteína WT1 en células
cancerosas.
\vskip1.000000\baselineskip
Se construyó una fusión tripartita usando la
reacción en cadena de la polimerasa y oligonucleótidos sintéticos
que contienen las uniones deseadas de la proteína de membrana
asociada a lisosomas humana 1 (LAMP-1) y una
VARIANTEe de corte y empalme de la secuencia de WT1 humana. La
VARIANTEe de corte y empalme de WT1 y la secuencia de
LAMP-1 usadas para estas fusiones se describen en
las SEC ID Nº: 381 y 383. En concreto, el péptido señal de
LAMP-1 (pares de bases 1-87 de LAMP)
se fusionó con el extremo 5 prima de la fase de lectura abierta de
WT1 humana (1.290 pares de bases de longitud), después el dominio
transmembrana y citoplasmático de LAMP-1 (pares de
bases 1161 a 1281 de LAMP) se fusionaron con el extremo 3 prima de
la secuencia de WT1. La secuencia de la construcción de
WT1-LAMP resultante se expone en la SEC ID Nº: 382
(ADN) y la SEC ID Nº 409 (proteína). La construcción se diseñó de
modo que cuando se expresa en células eucariotas, el péptido señal
dirige a la proteína hacia el retículo endoplásmico (RE) donde las
señales de localización en el dominio transmembrana y
citoplasmático de LAMP-1 dirigen el transporte de la
proteína de fusión hacia la localización lisosomal donde los
péptidos se cargan en moléculas de MHC Clase II.
\vskip1.000000\baselineskip
La fase de lectura abierta de ubiquitina humana
(SEC ID Nº: 384) se mutó de modo que los nucleótidos que codifican
el último aminoácido codificasen una alanina en lugar de una
glicina. Esta fase de lectura abierta mutada se clonó en fase de
lectura justo cadena arriba del primer codón de una VARIANTEe de
corte y empalme de WT1 humana (SEC ID Nº: 381 y 408, ADN y
proteína, respectivamente). La mutación G->A evita la escisión a
co-traduccional de la proteína naciente por las
proteasas que normalmente procesan poli-ubiquitina
durante la traducción. El ADN y la secuencia de aminoácidos
predicha para la construcción resultante se exponen en las SEC ID
Nº: 385 y 410, respectivamente. La proteína resultante demostraba
una citotoxicidad celular disminuida cuando se expresaba en células
humanas. Aunque no era posible generar líneas estables que
expresasen WT1 nativa, se obtuvieron fácilmente líneas celulares
que expresaban la proteína de fusión. Se predice que la proteína
resultante se dirige al proteosoma en virtud de la molécula de
ubiquitina añadida. Esto debería dar como resultado un
reconocimiento más eficaz de la proteína por células T CD8+
específicas de WT1.
\vskip1.000000\baselineskip
Se clonó una VARIANTEe de corte y empalme de WT1
humana (SEC ID Nº: 381) en un vector de adenovirus de serotipo 5
con E1 y E3 delecionados. La expresión del gen de WT1 está
controlada por el promotor de CMV que media altos niveles de
expresión de proteína WT1. La infección de células humanas con este
reactivo conduce a un alto nivel de expresión de la proteína WT1.
La naturaleza antigénica de las proteínas adenovirales introducidas
en la célula hospedadora durante, y producidas a bajos niveles
posteriormente a la infección, puede actuar aumentando la
vigilancia inmune y el reconocimiento inmune de WT1 como una diana
inmunológica. Este vector también puede usarse para generar
respuestas inmunes contra la proteína WT1 cuando se inocula en
sujetos humanos. Si estos sujetos son positivos para células
tumorales que expresan WT1, la respuesta inmune podría tener un
efecto terapéutico o curativo sobre el curso de la enfermedad.
\vskip1.000000\baselineskip
Se clonó una VARIANTEe de corte y empalme del
gen de WT1 humana de longitud completa (SEC ID Nº: 381) en el locus
de la timidina quinasa de la cepa Western Reserve del virus vaccinia
usando el vector lanzadera pSC11. El gen de WT1 está bajo el
control de un promotor híbrido de virus vaccinia que media la
expresión génica a lo largo del curso de una infección por virus
vaccinia. Este reactivo puede usarse para expresar la proteína WT1
en células humanas in vivo o in vitro. La WT1 es una
proteína propia que se sobreexpresa en algunas células tumorales
humanas. Por lo tanto, es improbable que las respuestas
inmunológicas contra WT1 suministrada como una proteína conduzcan a
un reconocimiento de WT1 mediado por el Complejo Mayor de
Histocompatibilidad Clase I (MHC clase I). Sin embargo, la
expresión de la proteína en el compartimento intracelular mediante
el vector de virus vaccinia permitirá un alto nivel de presentación
de MHC clase I y el reconocimiento de la proteína WT1 por células T
CD8+. La expresión de la proteína WT1 mediante el vector de virus
vaccinia también conducirá a la presentación de péptidos WT1 en el
contexto de MHC clase II y, por lo tanto, al reconocimiento por
células T CD4+.
Los usos de esta invención incluyen su uso como
una vacuna contra el cáncer. La inmunización de sujetos humanos que
llevan tumores positivos para WT1 conduciría a una respuesta
terapéutica o curativa. La expresión de WT1 dentro de la célula
conducirá al reconocimiento de la proteína por células T positivas
tanto para CD4 como CD8.
\vskip1.000000\baselineskip
Se diferenciaron células dendríticas (DC) a
partir de cultivos de monocitos obtenidos de PBMC de donantes
normales por cultivo durante 4-6 días en medio RPMI
que contenía suero humano a 10%, GM-CSF 50 ng/ml e
IL-4 30 ng/ml. Después del cultivo, se infectaron
DC 16 horas con virus vaccinia que expresaba WT1 recombinante
(descrito en el Ejemplo 21) a una multiplicidad de infección (MOI)
de 5, o durante 3 días con adenovirus que expresaba WT1
recombinante a una MOI de 10. Se inactivó el virus vaccinia mediante
irradiación U.V. Se aislaron células T CD8+ mediante reducción
negativa usando perlas magnéticas y se iniciaron los cultivos de
sensibilización en placas de 96 pocillos. Los cultivos se
reestimularon cada 7-10 días usando células
dendríticas autólogas infectadas con virus adeno o vaccinia
modificados genéticamente para expresar WT1. Después de
4-5 ciclos de estimulación, podían identificarse
líneas de células T CD8+ que producían específicamente
interferón-gamma cuando se estimulaban con células
dendríticas o fibroblastos que expresaban WT1 autóloga. Estas líneas
se clonaron y demostraron que reconocían específicamente
fibroblastos autólogos transducidos con WT1 pero no fibroblastos
transducidos con EGFP mediante ensayos de Elispot.
El gen del tumor de Wilms (WT1) participa en la
leucemogénesis y está sobreexpresado en la mayoría de leucemias
humanas, así como en varios tumores sólidos. Estudios previos en
seres humanos han demostrado la presencia de respuestas de
anticuerpos (Ab) específicos de WT1 en 16/63 (25%) de pacientes con
AML y en 15/81 (19%) de pacientes con CML estudiados. Estudios
previos en ratones han demostrado que las vacunas basadas en péptido
WT1 generan respuestas de Ab, Th y CTL específicos de WT1. El uso
de péptidos como vacunas en seres humanos está limitado por su
restricción por HLA y la tendencia a generar respuestas específicas
de péptido, y solamente en una minoría de los pacientes, CTL
específicos de tumor. Las ventajas de la inmunización con gen
completo son que pueden incluirse en una sola vacuna varios
epítopos CTL y auxiliares, por lo tanto, no restringiendo la vacuna
por tipos de HLA específicos. Los datos descritos en este documento
demuestran la inducción de respuestas inmunes específicas de WT1
usando sensibilización in vitro con gen completo, y que
pueden generarse clones de células T CD8+ específicas de WT1. Dado
que está presente una inmunidad existente contra WT1 en algunos
pacientes con leucemia y que la WT1 murina y humana tienen una
identidad de 96% a nivel de aminoácidos y la vacunación contra
proteína, ADN o péptidos WT1 puede generar respuestas de Ab y
celulares de células T específicas de WT1 en ratones sin toxicidad
para tejidos normales en ratones, estos experimentos de
sensibilización in vitro en seres humanos proporcionan una
validación adicional de WT1 como una vacuna contra tumor/leucemia.
Además, la capacidad para generar clones de células T CD8+
específicas de WT1 puede conducir al tratamiento de tumores
malignos asociados con una sobreexpresión de WT1 usando células T
modificadas genéticamente.
\vskip1.000000\baselineskip
Se generaron cinco construcciones como se
describen en detalle a continuación para la producción de WT1 de
uso clínico.
Diseño de Ra12/WT-E (SEC ID Nº:
388 (ADNc) y 391 (proteína)) y WT-1 E (SEC ID Nº:
386 (ADNc) y 395 (proteína)) sin marcador His:
La fase de lectura de WT-1 E se
amplificó por PCR con los siguientes cebadores para la construcción
no de fusión sin His:
Se usaron las siguientes condiciones de ciclado
de PCR: 1 \mul de tampón de Pfu 10X, 1 \mul de dNTP 10 mM, 2
\mul de cada oligonucleótido 1 \muM, 83 \mul de agua estéril,
1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA), 50 ng
de ADN (pPDMRa12 WT-1 No His). La reacción se
desnaturalizó inicialmente a 96ºC durante 2 minutos, seguido de 40
ciclos de 96ºC durante 20 segundos, 62ºC durante 15 segundos y 72ºC
durante 1 minuto y 40 segundos. Esto se siguió de una extensión
final de 72ºC durante 4 minutos. El producto de PCR se digirió con
NdeI y EcoRI y se clonó con pPDM His (un vector pET28 modificado)
que se había digerido con NdeI y EcoRI. La construcción se confirmó
mediante análisis de secuencia y después se transformó en células
BLR (DE3) pLys S y HMS 174 (DE3) pLys S. Esta construcción - pPDM
WT-1 E se digirió después con NcoI y XbaI y se usó
como la estructura de vector para el inserto de NcoI y Xbal de pPDM
Ra12 WT-1 F (véase a continuación). La construcción
se confirmó mediante análisis de secuencia y después se transformó
en células BLR (DE3) pLys S y HMS 174 (DE3) pLys S. Se confirmó la
expresión de proteína mediante SDS-PAGE teñido con
Coomassie y análisis de secuencia de proteína
N-terminal.
N-terminal.
Diseño de
Ra12-WT-1-F
(aminoácidos 1-281) sin marcador His (SEC ID Nº: 389
(ADNc) y 393 (proteína)):
La fase de lectura de Ra12 WT-1
se amplificó por PCR con los siguientes cebadores:
Se usaron las siguientes condiciones de ciclado
de PCR: 1 \mul de tampón de Pfu 10X, 1 \mul de dNTP 10 mM, 2
\mul de cada oligonucleótido 1 \muM, 83 \mul de agua estéril,
1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA), 50 ng
de ADN (pPDMRa12 WT-1 No His). La reacción se
desnaturalizó inicialmente a 96ºC durante 2 minutos, seguido de 40
ciclos de 96ºC durante 20 segundos, 58ºC durante 15 segundos y 72ºC
durante 3 minutos. Esto se siguió de una extensión final de 72ºC
durante 4 minutos. El producto de PCR se digirió con NdeI y se
clonó en pPDM His que se había digerido con NdeI y Eco72I. La
secuencia se confirmó mediante análisis de secuencia y después se
transformó en células BLR (DE3) pLys S y HMS 174 (DE3) pLysS. Se
confirmó la expresión de proteína mediante SDS-PAGE
teñido con Coomassie y análisis de secuencia de proteína
N-terminal.
Diseño de
Ra12-WT-1 sin marcador His (SEC ID
Nº: 390 (ADNc) y 392 (proteína)):
La fase de lectura de Ra12 WT-1
se amplificó por PCR con los siguientes cebadores:
Se usaron las siguientes condiciones de ciclado
de PCR: 1 \mul de tampón de Pfu 10X, 1 \mul de dNTP 10 mM, 2
\mul de cada oligonucleótido 1 \muM, 83 \mul de agua estéril,
1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA), 50 ng
de ADN (pPDMRa12 WT-1 No His). La reacción se
desnaturalizó inicialmente a 96ºC durante 2 minutos, seguido de 40
ciclos de 96ºC durante 20 segundos, 68ºC durante 15 segundos y 72ºC
durante 2 minutos y 30 segundos. Esto se siguió de una extensión
final de 72ºC durante 4 minutos. El producto de PCR se digirió con
NotI y NdeI y se clonó en pPDM His que se digirió con NdeI y NotI.
La secuencia se confirmó mediante análisis de secuencia y después
se transformó en células BLR (DE3) pLys S y HMS 174 (DE3) pLysS. La
expresión de proteína se confirmó mediante SDS-PAGE
teñido con Coomassie y análisis de secuencia de proteína
N-terminal.
Diseño de WT-1 C (aminoácidos
69-430) en E. coli sin marcador His (SEC ID
Nº: 387 (ADNc) y 394 (proteína)):
La fase de lectura de WT-1 C se
amplificó por PCR con los siguientes cebadores:
Se usaron las siguientes condiciones de ciclado
de PCR: 1 \mul de tampón de Pfu 10X, 1 \mul de dNTP 10 mM, 2
\mul de cada oligonucleótido 1 \muM, 83 \mul de agua estéril,
1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA), 50 ng
de ADN (pPDMRa12 WT-1 No His). La reacción se
desnaturalizó inicialmente a 96ºC durante 2 minutos, seguido de 40
ciclos de 96ºC durante 20 segundos, 62ºC durante 15 segundos y 72ºC
durante 2 minutos. Esto se siguió de una extensión final de 72ºC
durante 4 minutos. El producto de PCR se digirió con NdeI y se
clonó en pPDM His que se había digerido con NdeI y Eco721. La
secuencia se confirmó mediante análisis de secuencia y después se
transformó en células BLR (DE3) pLys S y HMS 174 (DE3) pLys S. La
expresión de proteína se confirmó mediante SDS-PAGE
teñido con Coomassie y análisis de secuencia de proteína
N-terminal.
\vskip1.000000\baselineskip
En este ejemplo, se usaron vehículos de
suministro de virus Adeno y Vaccinia para generar líneas de células
T específicas de WT1. Se demostró que un clon de células T de la
línea era específico para WT1 y, además, se identificó el epítopo
reconocido por este clon.
Se diferenciaron células dendríticas (DC) a
partir de cultivos de monocitos obtenidos de PBMC de donantes
normales por cultivo durante 4-6 días en medio RPMI
que contenía suero humano a 10%, GM-CSF 50 ng/ml e
IL-40 30 ng/ml. Después del cultivo, se infectaron
DC 16 horas con virus vaccinia que expresaba WT1 recombinante a una
multiplicidad de infección (MOI) de 5, o durante 2-3
días con adenovirus que expresaba WT1 recombinante a una MOI de
3-10. El virus vaccinia se inactivó mediante
irradiación U.V. Se aislaron células T CD8+ mediante reducción
negativa usando anticuerpos contra células CD4, CD14, CD16, CD19 y
CD56+, seguido de perlas magnéticas específicas para la porción Fc
de estos Ab.
Se iniciaron cultivos de sensibilización en
placas de 96 pocillos. Se reestimularon los cultivos cada
7-14 días usando células dendríticas autólogas
infectadas con virus adeno o vaccinia modificados genéticamente
para expresar WT1. Después de 4-5 ciclos de
estimulación, podían identificarse líneas de células T CD8+ que
producían específicamente interferón-\gamma
(IFN-\gamma) cuando se estimulaban con células
dendríticas o fibroblastos que expresaban WT1 autóloga. Estas
líneas se clonaron y se demostró que reconocían específicamente
fibroblastos autólogos transducidos con WT1 pero no fibroblastos
transducidos con control mediante ensayos de Elispot.
Para analizar adicionalmente la restricción por
HLA de estos clones de células T CD8+ específicas de WT1, se
transdujeron con WT1 fibroblastos obtenidos de un donante adicional
(D475) que compartía solamente el alelo HLA-A2 con
el donante (D349) a partir del que se estableció el clon de células
T. El análisis de ELISPOT demostraba reconocimiento de estas
células diana D475 por el clon de células T. Para demostrar
adicionalmente la restricción por HLA-A2 y
demostrar que este epítopo se expresaba por células tumorales que
sobreexpresaban "de forma natural" WT1 (como parte de su
transformación maligna), se ensayó la línea celular de leucemia
K562. Se transdujo K562 con la molécula HLA-A2 y se
usaron células K562 negativas para HLA-A2 como
controles para la liberación inespecífica de
IFN-\gamma. Los análisis de ELISPOT demostraron
que las células T reconocían la línea celular K562 positiva para A2
pero no las células K562 negativas para A2. Se documentó una prueba
adicional de la especificidad y restricción por
HLA-A2 del reconocimiento mediante experimentos de
bloqueo de anticuerpos HLA-A2.
Para definir adicionalmente el epítopo de WT1,
se generaron 4 construcciones retrovirales de WT1 truncada. Después
se transdujeron fibroblastos de donante 475 con estas
construcciones. Los ensayos de ELISPOT demostraban reconocimiento
de fibroblastos D475 transducidos con la construcción WT1 Tr1
(aminoácido 2-aminoácido 92), demostrando de este
modo que el epítopo de WT1 se localiza en los primeros 91
aminoácidos N-terminales de la proteína WT1. Para
mapear con precisión el epítopo, se sintetizaron péptidos de 15
aminoácidos de la proteína WT1, solapantes en 11 aminoácidos. El
clon de células T específico de WT1 reconocía dos péptidos
solapantes de 15 aminoácidos, el péptido 9 (QWAPVLDFAPPGASA) (SEC
ID Nº: 412) y el péptido 10 (VLDFAPPGASAYGSL) (SEC ID Nº: 413).
Para caracterizar adicionalmente el epítopo mínimo reconocido, se
usaron péptidos que compartían 9 y 10 aminoácidos de los 15
aminoácidos (5 total) para analizar la especificidad del clon. El
clon reconocía específicamente el nonámero VLDFAPPGA (SEC ID Nº:
241) y el decámero VLDFAPPGAS (SEC ID Nº: 411).
\vskip1.000000\baselineskip
Se clonaron las cadenas alfa y beta del receptor
de células T (TCR) a partir de clones de células T CD8+ específicas
para WT1. Se llevó a cabo un análisis de secuencia para demostrar el
origen de familia de las cadenas alfa y beta del TCR. Además, se
identificaron segmentos de diversidad y unión únicos (que
contribuyen a la especificidad de la respuesta).
Se aisló el ARNm total de 2 x 10^{6} células
de un clon de células T CD8+ específico de WT1 usando reactivo
Trizol y se sintetizó ADNc usando kits Ready-togo
(Pharmacia). Para determinar las secuencias de V\alpha y V\beta
en un clon, se sintetizó un panel de cebadores específicos de
subtipo V\alpha y V\beta (basándose en secuencias de cebadores
generados por Clontech, Palo Alto, CA) y se usaron en reacciones de
RT-PCR con ADNc generado de cada clon. Las
reacciones de RT-PCR demuestran que se expresa la
secuencia de V\beta y V\alpha por cada clon.
Para clonar las cadenas alfa y beta de TCR de
longitud completa a partir de un clon, se diseñaron cebadores que
abarcan los nucleótidos de TCR que codifican el inicio y la
terminación. Se establecieron reacciones de RT-PCR
de 35 ciclos convencionales usando ADNc sintetizado a partir del
clon de CTL y los cebadores anteriores, usando la polimerasa
termoestable con corrección de errores PWO (Roche, Basel, Suiza).
Las bandas específicas resultantes (\sim850 pb para alfa y
\sim950 para beta) se ligan en el vector romo de PCR (Invitrogen,
Carisbad, CA) y se usan para transformar E. coli. Se
identifican E. coli transformadas con plásmidos que contienen
las cadenas alfa y beta de longitud completa y se generan
preparaciones a gran escala de los plásmidos correspondientes.
Después se secuencian los plásmidos que contienen las cadenas alfa y
beta de TCR de longitud completa usando métodos convencionales. Se
determina por lo tanto la región de diversidad-unión
(DJ) que contribuye a la especificidad del
TCR.
TCR.
\vskip1.000000\baselineskip
El clon de células T CD8+ descrito inicialmente
en el Ejemplo 24 que reconoce la secuencia peptídica VLDFAPPGA
(restos 37-45 de WT1 humana; SEC ID Nº: 241) se
ensayó adicionalmente para determinar la capacidad para destruir
(lisar) células diana de leucemia que expresan WT1 de un modo
restringido por HLA A2. Se usaron células diana K562 transducidas
con la molécula HLA A2, GFP, A2Kb o no transducidas en un ensayo de
liberación de ^{51}Cromo de 4,5 horas convencional con
proporciones de célula efectora respecto a diana (E:T) de 25:1 y
5:1. A una proporción de E:T de 25:1, el clon de células T CD8+
lisaba las células K562/A2 y K562/A2Kb (40% y 49% de lisis
específica, respectivamente) mientras que las células transducidas
con GFP de control y las K562 no se lisaron. A una E:T de 5:1, la
lisis específica de las células K562/A2 y K562/A2Kb era de 21% y
24%, respectivamente. Por lo tanto, este clon de células T CD8+
reconoce y lisa células leucémicas que expresan WT1 de una forma
restringida por HLA-A2. La capacidad para generar
clones de células T CD8+ específicas de WT1 tiene utilidad en el
tratamiento de tumores malignos asociados con sobreexpresión de WT1
usando células T modificadas
genéticamente.
genéticamente.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo describe la clonación y expresión
de HLA-A2 soluble en células de insecto y la
purificación y ensamblaje de HLA-A2 en complejos
tetraméricos fluorescentes multivalentes de
péptido-MHC para la detección y aislamiento de
células T CD8 específicas de antígeno.
Este sistema es similar al desarrollado y
descrito por Altman, et al. (Altman, J., et al.,
Science, 1996 274 (5284): 94-6) en el sentido de
que el HLA-A2 soluble estaba biotinilado por
separado en una secuencia de reconocimiento birA y se ensamblaba
posteriormente en multímeros en un armazón de estreptavidina
conjugada con ficoeritrina. Los materiales descritos en este
documento difieren en que el HLA-A2 se expresaba en
una forma soluble y glicosilada a partir de células de insecto y el
heterodímero se purificaba usando una columna de afinidad de
anticuerpos anti-MHC clase I humano.
El gen de la cadena pesada de
HLA-A2, al que se le ha añadido la secuencia de
biotinilación birA, y el gen de la
beta-2-microglobulina humana se
clonaron en el vector de expresión de baculovirus
pFASTBAC-dual. Tras la infección de células de
insecto, los genes se transcribieron simultáneamente a partir de
promotores divergentes y se secretó heterodímero de
HLA-A2 soluble glicosilado completamente ensamblado
hacia el medio de cultivo. Las células de insecto infectadas se
cultivaron en fábricas de células durante 4 días a 21ºC antes de que
se recogieran los sobrenadantes. La producción de
HLA-A2 se controló mediante un ELISA de captura que
emplea los anticuerpos W6/32 y B9.12.1 biotinilado. Se purificó
HLA-A2 a partir del sobrenadante de cultivo hasta
una pureza >90% en una etapa mediante cromatografía de afinidad
usando 2 anticuerpos monoclonales anti-MHC clase I
humano unidos a perlas de Sepharose. Los anticuerpos usados eran
PA2.1 y W6/32. El HLA-A2 purificado se biotiniló
por separado en la secuencia de reconocimiento birA en el extremo
C-terminal de la cadena pesada usando la enzima
birA disponible en el mercado. La eficacia de la biotinilación se
evaluó esencialmente como se describe (Crawford et al (1998)
Immunity junio; 8 (6): 675-82) y el material se
purificó adicionalmente mediante cromatografía de exclusión por
tamaño (SEC). Se saturó estreptavidina conjugada con ficoeritrina
con bio-HLA-A2 y el reactivo de
tinción multivalente se purificó a partir de HLA-A2
libre mediante SEC. Se incubó el tetrámero de
HLA-A2 durante 48 horas a temperatura ambiente con
un exceso molar de 10 veces de péptido Her-2/neu
E75 o péptido MI de la matriz de Influenza, antes de que los clones
de células T específicos se tiñeran a 4ºC durante 30 minutos en
presencia de tetrámero cargado de péptido y anticuerpo
anti-COB. Los resultados indicaban que los
tetrámeros incubados en presencia de un exceso molar del péptido de
influenza M1 58-66 M1 teñían específicamente un
clon de células T específico de influenza y los tetrámeros incubados
con un exceso del péptido Her-2/neu E75 teñían
específicamente el clon de células T específico de
Her-2/new.
\vskip1.000000\baselineskip
Los tetrámeros de HLA-A2
descritos en el Ejemplo 27 se incubaron con un exceso molar del
péptido p37-45 de WT1 (VLDFAPPGA) (restos
37-45 de WT1 humana; SEC ID Nº: 241) previamente
demostrado en el Ejemplo 24 que estaba restringido por
HLA-A2. Este tetrámero se usó para teñir el clon de
células T CD8+ específico de WT1 descrito en el Ejemplo 24. Se
demostró que este clon reconocía específicamente el epítopo
p37-45. Cuando los tetrámeros se incubaron con un
exceso de péptido p37-45, teñían específicamente el
clon de células T CD8+, mientras que para los tetrámeros incubados
con un exceso de péptidos de HLA-2 irrelevantes
(Her2/neu, WT1 p38-46, WT1 p39-47),
los tetrámeros no teñían el clon de células T CD8+. Por lo tanto, el
clon de células T CD8+ específico de WT1 p37-45 se
reconoce específicamente por el tetrámero de
HLA-A2-péptido
p37-45 MHC.
Una línea de células T específicas de WT1
generadas como se describe en el Ejemplo 24 se tiñó después con los
tetrámeros
HLA-A2-p37-45,
Her2/neu irrelevante o WT1 p37-46. Los tetrámeros de
HLA-A2-p37-45 teñían
1% de la población total de esta línea de células T específica de
WT1 y 7% de la población CD8+ activada, mientras que el tetrámero
HLA-A2-p37-45 de
control teñía a los mismos niveles de fondo que los tetrámeros
HLA-A2-Her2/neu de control.
Estos resultados indican que los tetrámeros de
MHC-péptido son altamente sensibles y una
herramienta específica para detectar respuestas inmunes específicas
de WT1. Los tetrámeros de péptido-MHC pueden usarse
para una detección precoz de tumores malignos asociados a WT1,
control de respuestas específicas de WT1 y para control de
enfermedad mínima residual. La detección de células T específicas de
WT1 mediante tinción con tetrámero también es una herramienta útil
para identificar grupos dentro de una población de pacientes que
padecen una enfermedad asociada a WT1 con mayor riesgo de recaída o
avance de la enfermedad.
\vskip1.000000\baselineskip
En este ejemplo, se usaron vehículos de
suministro de virus Adeno y Vaccinia para generar líneas de células
T específicas de WT1 a partir de un donante positivo para
HLA-A24. Se demostró que esta línea de células T
estaba restringida por MHC clase I. Estos experimentos confirman
adicionalmente la inmunogenicidad de la proteína WT1 y respaldan su
uso como diana para vacunas y/u otras estrategias
inmunoterapéuticas.
Se diferenciaron células dendríticas (DC) a
partir de cultivos de monocitos obtenidos de PBMC de un donante
normal positivo para HLA-A24 mediante cultivo
durante 4-6 días en medio RPMI que contenía suero
humano a 10%, GM-CSF 50 ng/ml e
IL-4 30 ng/ml. Después del cultivo, se infectaron DC
16 horas con virus vaccinia que expresaba WT1 recombinante a una
multiplicidad de infección (MOI) de 5, o durante 3 días con
adenovirus que expresaba WT1 recombinante a una MOI de
3-10. El virus vaccinia se inactivó mediante
irradiación U.V. Se aislaron células T CD8+ mediante reducción
negativa usando anticuerpos contra células CD4, CD14, CD16, CD19 y
CD56+, seguido de perlas magnéticas específicas para la porción Fc
de estos Ab.
Se iniciaron cultivos de sensibilización en
placas de 96 pocillos. Los cultivos se reestimularon cada
7-14 días usando células dendríticas autólogas
infectadas con adenovirus o virus vaccinia modificados genéticamente
para expresar WT1. Después de 4-5 ciclos de
estimulación, podían identificarse líneas de células T CD8+ que
producían específicamente interferón-\gamma
(IFN-\gamma) cuando se estimulaban con células
dendríticas o fibroblastos que expresaban WT1 autóloga. Estas
líneas se clonaron y mediante ensayos de Elispot se demostró que
reconocían específicamente fibroblastos autólogos transducidos con
WT1 pero no fibroblastos transducidos con control de una forma
restringida por MHC clase I.
\newpage
Estos experimentos demuestran que la proteína
WT1 puede usarse para generar una respuesta de células T y, por lo
tanto, confirman adicionalmente la inmunogenicidad del antígeno WT1
y respaldan su uso como diana para vacunas y otras estrategias
inmunoterapéuticas.
\vskip1.000000\baselineskip
Este experimento describe la identificación por
ordenador de epítopos de WT1 que se ha predicho que se unen a
HLA-A2 con mayor afinidad que epítopos procesados de
forma natural. Los epítopos identificados en este documento tienen
utilidad en vacunas y/o estrategias inmunoterapéuticas para el
tratamiento de cánceres asociados con la expresión de WT1.
Se construyeron análogos peptídicos del epítopo
p37-45 de WT1 restringido por HLA A2 procesado de
forma natural (VLDFAPPGA; restos 37-45 de WT1
humana; SEC ID Nº: 241; previamente demostrado en el Ejemplo 24 que
estaba restringido por HLA-A2) con motivos para la
unión a HLA-A2.1 con mayor afinidad que el péptido
procesado de forma natural, como se describe en más detalle a
continuación.
Se usó un programa de búsqueda de motivos
peptídicos basado en algoritmos desarrollados por Rammensee et
al (Hans-Georg Rammensee, Jutta Bachmann, Niels
Nikolaus Emmerich, Oskar Alexander Bachor, Stefan Stevanovic:
SYFPEITHI: database for MHC ligands y peptide motifs. Immunogenetics
(1999) 50: 213-219) y por Parker, et al
(Parker, K. C. M. A. Bednarek, y J. E. Coligan. 1994, Scheme for
ranking potential HLA-A2 binding peptides based on
independent binding of individual peptide
side-chains. J. Immunol. 152:163) para identificar
análogos del epítopo peptídico p37-45 de WT1 que se
predice que se unen a HLA-A2 con mayor afinidad que
el péptido p37-45 natural. Los péptidos que se
muestran en la Tabla LII tienen puntuaciones de unión peptídica
predichas iguales o superiores que el péptido
p37-45 procesado de forma natural. La puntuación de
unión procede de una semivida de disociación predicha con la
molécula HLA-A2 clase I. El análisis se basa en
tablas de coeficientes deducidas de la bibliografía publicada por
Dr. Kenneth Parker kparker@atias.niaid.nih.gov, NIAID, NIH.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
En un análisis separado, se usó modelado por
ordenador para identificar análogos de epítopos peptídicos del
epítopo de WT1 p37-45. Las coordenadas de la
estructura nativa de HLA-A2 se descargaron de la
base de datos de proteínas Brookhaven (pdb I.D.: 3HLA) (L. L.
Walsh, "Annotated PDB File Listing", Protein Science 1:5,
Diskette Appendix (1992). Este archivo se usó como molde para
manipulaciones con el programa SwissModel (Peitsch MC (1996) ProMod
y SwissModel: Internet-based tools for automated
comparative protein modeling. Biochem. Soc. Trans. 24:
274-279) disponible a través del sitio web Expasy
(Appel R. D., Bairoch A., Hochstrasser D. F. A new generation of
information retrieval tools for biologists: the example of the
ExPASy WWW server. Trends Biochem. Sci. 19:
258-260(1994). El péptido unido a la proteína
se mutó manualmente para dar el péptido p37-45 WT
unido. La nueva estructura se sometió a tres rondas de minimización
de la energía con la aplicación GROMOS96 del
Swiss-PdbViewer; se realizaron dos minimizaciones de
la energía sobre la estructura completa, seguidas de una ronda con
los restos desfavorables seleccionados. Una evaluación final
mostraba un estado de energía global favorable para el modelo. La
representación de Ramachandran indicaba que sólo un resto no
glicinilo está lejos en regiones desestimadas. Los péptidos
identificados usando el método de modelado descrito en este
documento se exponen en la Tabla LIII a continuación.
\vskip1.000000\baselineskip
Después se ensayaron varios péptidos
identificados usando los dos métodos descritos anteriormente para
determinar la capacidad para ser reconocidos por el clon de CTL
específico de p37-45 (véase el Ejemplo 24). El
análisis de ELISPOT mostraba que los péptidos p37-1
(SEC ID Nº: 426) y modelo 1 (SEC ID Nº: 445) eran reconocidos por
el clon de CTL p37-45. Estos resultados sugieren que
se predice que estos 2 análogos peptídicos se unen a
HLA-A2 con mayor afinidad que el epítopo procesado
de forma natural y todavía son reconocidos por un receptor de
células T nativo.
Por lo tanto, este experimento describe la
identificación por ordenador de epítopos WT1 que se ha predicho que
se unen a HLA-A2 con mayor afinidad que epítopos
procesados de forma natural. Se ensayaron dos de los epítopos
identificados y se demostró que eran reconocidos por un clon de CTL
generado con el epítopo p37-45 de WT1 nativo. Los
epítopos identificados en este documento tienen utilidad en vacunas
y/o estrategias inmunoterapéuticas para el tratamiento de cánceres
asociados con la expresión de WT1.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo describe tres estudios de
inmunogenicidad in vivo para evaluar estrategias de
vacunación con WT1 en ratones. Las tres estrategias comprendían: 1)
una sensibilización y refuerzo con vacuna de ADN desnudo; 2) una
sensibilización con adenovirus atenuado seguida de un refuerzo con
alfavirus atenuado; o 3) una sensibilización con ADN desnudo
seguida de un refuerzo con adenovirus. El ADNc de longitud completa
de la VARIANTEe de corte y empalme de WT1 usado en estos estudios
se expone en la SEC ID Nº: 381. Los resultados descritos en este
documento proporcionan respaldo para el uso de regímenes de
sensibilización/refuerzo de ADN/ADN, ADN/adenovirus o
adenovirus/alfavirus de WT1 como estrategias vacunales para tratar
cánceres asociados con la expresión de WT1.
En el primero estudio, se inmunizaron ratones
C57/B16 3 veces a intervalos de 2 semanas con 100 \mug de ADN
desnudo que codifica WT11. Se sacrificaron los ratones
2-3 semanas después de la inmunización final y se
evaluaron los CTL mediante ensayo de liberación de cromo
convencional. El primer estudio mostraba que la inmunización con
ADN de WT1 genera respuestas de células T citotóxicas específicas de
WT1 en estos ratones con una proporción de E:T de 25:1 que mostraba
una lisis de 40%.
En el segundo estudio, se inmunizaron ratones
transgénicos HLA-A2/Kb una vez con 5 x 10^{8} UFP
de adenovirus atenuado que codifica WT1 (como se describe en el
Ejemplo 20), seguido 4 semanas después de un refuerzo con 5 x
10^{6} UFP de alfavirus (AlphaVax) que codifica WT1. Se
sacrificaron los ratones 2-3 semanas después de la
inmunización final y se evaluaron los CTL mediante un ensayo de
liberación de cromo convencional. Los resultados mostraban que los
CTL específicos de WT1 en ratones transgénicos
HLA-A2/Kb lisaban específicamente células
dendríticas (DC) transducidas con una construcción viral que expresa
WT1 así como DC estimuladas con péptidos WT1. Por lo tanto, esta
estrategia de inmunización también genera eficazmente CTL
específicos de WT1 in vivo.
En el tercer estudio, se inmunizaron ratones
transgénicos C57/Bl6 y HLA-A2/Kb dos veces con 100
\mug de ADN de WT1 desnudo separadas 2 semanas, seguido 3 semanas
después de un refuerzo con 7 x10^{8} UFP de adenovirus que
codifica WT1. Los ratones se sacrificaron 2-3
semanas después de la inmunización final y se evaluaron los CTL
mediante ensayo de ELISPOT de IFN-\gamma. Los
resultados mostraban que la sensibilización-refuerzo
con adenovirus y ADN de WT1 genera una respuesta de células T CD8
específicas para WT1 en ratones transgénicos
HLA-A2/Kb. Aproximadamente 42% de las células
positivas para CD8 se teñían positivas para
IFN-\gamma después de una estimulación de 7 días
con DC transducidas con WT-1. Los resultados de los
ratones C57/BL6 mostraban que esta estrategia de inmunización
genera respuestas de CD8 detectables en esplenocitos recién
preparados. Se estimularon esplenocitos durante 6 horas con
combinaciones de 10 péptidos de 15 aminoácidos solapantes en 11
aminoácidos que abarcan la proteína WT1 completa. Sólo las células
estimuladas con el p121-171 mostraban tinción de
IFN-\gamma. Aproximadamente 1,1% de estas células
T CD8 estimuladas con la combinación de péptido
p121-171 se teñían positivas para
IFN-\gamma. Este péptido contiene el péptido
p117-139 (SEC ID Nº: 2) que se muestra en el
Ejemplo 3 que genera respuestas de CTL, células T auxiliares y
anticuerpos en ratones.
En resumen, estos resultados muestran que las
tres estrategias de inmunización ensayadas en este documento
generan respuestas de células T in vivo. Por lo tanto, estos
estudios confirman adicionalmente la inmunogenicidad de la proteína
WT1 y proporcionan respaldo para el uso de regímenes de
sensibilización/refuerzo de ADN/ADN, ADN/adenovirus o
adenovirus/alfavirus de WT1 como estrategias vacunales para tratar
cánceres asociados con la expresión de WT1.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo describe la reducción de tumores
WT1+ en ratones transgénicos inmunizados con una vacuna de WT1.
Estos resultados validan adicionalmente a WT1 como una diana vacunal
y proporcionan respaldo para el uso de WT1 en estrategias vacunales
para el tratamiento de cánceres asociaciones con la expresión de
WT1.
La línea de células dendríticas murinas (DC)
DC2.4 se transdujo de forma estable con una construcción
WT1-LAMP (véase el Ejemplo 18, las secuencias de
ADNc y proteína expuestas en las SEC ID Nº 382 y 409,
respectivamente). Después se inocularon ratones por vía subcutánea
(s. c.) o por vía intraperitoneal (i. p.) con 2 x 10^{6}. Esto
dio como resultado un crecimiento tumoral en 80-100%
de los ratones. Los tumores establecidos en ratones in vivo
conservaban su expresión de WT1. Por lo tanto, este modelo
proporciona un sistema en el que validar la eficacia de estrategias
vacunales de WT1.
Después se inmunizaron tres grupos de ratones
A2/Kb 3 veces, separadas por 2 semanas de la forma siguiente:
Grupo 1: solución salina en solitario s. c.
(control, n = 10 ratones)
Grupo 2: 10 \mug de MPL-SE en
solitario s. c. (control, n = 10 ratones)
Grupo 3: 100 \mug de proteína Ra12/WT1 + 10
\mug de MPL-SE s. c. (n = 9 ratones).
De dos a tres semanas después de la última
inmunización con WT1, se inoculó a los ratones 2 x 10^{6} células
tumorales A2/Kb DC2.4 que sobreexpresaban WT1. Después de la
exposición a tumores se controlaron los ratones y se midió el
tamaño tumoral dos veces por semana hasta cuatro semanas después de
la exposición a tumor.
Los resultados mostraban que el porcentaje de
ratones con crecimiento tumoral en el grupo que recibió la vacuna
de proteína WT1 se reducía de aproximadamente 100% (control de
solución salina) o 90% (control de adyuvante
MPL-SE) a 45% (grupo inmunizado con proteína WT1).
Además, el volumen medio tumoral se redujo en este grupo de un
tamaño medio tumoral de 1233 cmm (control de solución salina) o 753
cmm (control de adyuvante MPL-SE) observado en el
grupo de control a 226 cmm en el grupo inmunizado con proteína WT1.
Los análisis histopatológicos mostraban que los márgenes tumorales
en animales vacunados estaban mezclados con reacciones inmunológicas
del hospedador que incluían histiocitos, eosinófilos, linfocitos,
mastocitos y células plasmáticas. En conjunto, los resultados
demuestran que la inmunización con proteína WT1 protege contra o
retrasa el crecimiento de tumores positivos para WT1 en los
animales inmunizados con WT1. Por lo tanto, estos resultados
respaldan el uso de proteína WT1 como una vacuna para tumores
malignos asociados con expresión de WT1.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo describe la identificación de un
epítopo procesado de forma natural de la proteína WT1 reconocido
por células T citotóxicas. Este experimento confirma adicionalmente
la inmunogenicidad de la proteína WT1 y proporciona respaldo para
su uso como una diana para vacunas y/u otras estrategias
inmunoterapéuticas. Además, este experimento identifica epítopos de
la proteína WT1 que pueden usarse en estas aplicaciones.
Se inmunizaron ratones transgénicos
HLA-A2/Kb dos veces con 100 \mug de ADN WT1
desnudo separadas por 2 semanas, seguido 3 semanas después de un
refuerzo con 10^{7} UFP de adenovirus que codifica WT1. Se
sacrificaron ratones 2-3 semanas después de la
inmunización final y se evaluaron los CTL mediante ensayo de
liberación de cromo convencional. Como se ha observado en
experimentos previos, la inmunización con ADN de WT1 seguida de
refuerzo adenoviral generaba una respuesta de CTL específicos de
WTL1 en ratones transgénicos HLA-A2. Para
identificar qué epítopos eran reconocidos por las células T, se
generaron líneas de CTL y se clonaron mediante dilución limitante
usando protocolos convencionales. Después se ensayó un clon positivo
usando como células diana células DC2.4 A2/Kb estimuladas con
péptidos que se corresponden con los 20 mejores epítopos de CTL
restringidos por HLA-A2 predichos. Los resultados
mostraban que el péptido nonamérico p10-18 de WT1
(aminoácidos: ALLPAVPSL, expuesto en la SEC ID. Nº 451) era
reconocido por este clon de CTL. Se había predicho anteriormente
que este epítopo era un epítopo, como se describe en la Tabla XLVI,
SEC ID Nº: 34. En un experimento adicional, se observaron
respuestas de CTL contra el péptido p10 en 4 de 5 animales
inmunizados con WT1 ensayados. Por lo tanto, este experimento
demuestra que el epítopo de WT1 p10-18 predicho se
procesa de forma natural y se reconoce por CTL. Además, este
experimento confirma la inmunogenicidad de la proteína WT1 y define
adicionalmente un epítopo de CTL restringido por
HLA-A2 procesado de forma natural que puede usarse
en estrategias vacunales e inmunoterapéuticas para el tratamiento
de tumores malignos asociados con la sobreexpresión de WT1.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo describe la construcción de
vectores WT1-TAT y la expresión de
WT1-TAT a partir de estos vectores. Estas
construcciones tienen utilidad en la expresión de moléculas
WT1-TAT para el uso en estrategias de
vacunación.
vacunación.
Se construyeron
WT-1-F (aminoácidos
2-281 de la proteína WT1; el ADNc y la secuencia de
aminoácidos de 2-281 de WT1 se exponen en las SEC
ID Nº: 460 y 461, respectivamente) y WT-1 de
longitud completa como fusiones con pTAT sin marcador His, como se
describe a continuación. Las secuencias de ADNc y aminoácidos de las
fusiones resultantes se exponen en las SEC ID Nº: 452 y 453 y SEC
ID Nº: 454 y 455, respectivamente.
La fase de lectura abierta de
WT-1-F se amplificó por PCR con los
siguientes cebadores:
La fase de lectura abierta de longitud completa
WT-1 se amplificó con los siguientes cebadores:
Las condiciones de PCR eran las siguientes: 10
\mul de tampón de Pfu 10X, 1 \mul de dNTP 10 mM, 2 \mul de
cada oligonucleótido 1 \muM, 83 \mul de agua estéril, 1,5 \mul
de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA), 50 ng de ADN
(pPDM FL WT-1). La reacción se desnaturalizó a 96ºC
durante 2 minutos, seguido de 40 ciclos de 96ºC durante 20
segundos, 64ºC durante 15 segundos y 72ºC durante 2 minutos, 30
segundos y una única extensión final de 4 minutos a 72ºC.
Los productos de PCR se digirieron con EcoRI y
se clonaron en pTAT (un vector pET28 modificado con un péptido
señal de Translocación de la Doble Arginina (TAT) del péptido señal
TorA en E. coli en el extremo N-terminal;
véase, Mol. Microbiol. (2000) 2 (2): 179-189;
Journal of Bacteriology, ene 2001 págs. 604-610 Vol
183, Nº 2; Journal of Biochemistry Vol 276, 16 marzo 2001 págs.
8159-8164) en los sitios Eco72I y EcoRI. La
secuencia se confirmó mediante análisis de secuencia y después se
transformó en células BLR (DE3) pLys S y HMS 174 (DE3) pLysS. La
expresión de las proteínas WT1-TAT se confirmó
mediante análisis de Western.
\vskip1.000000\baselineskip
En este Ejemplo, se inmunizaron ratones con
diferentes construcciones de proteína WT-1
(truncamiento F (2-281) y longitud completa
(2-430), como se describen en el Ejemplo 34))
formuladas con adyuvante MPL-SE. Se generaron
respuestas de CD4 mejoradas mediante las construcciones truncadas
respecto a la proteína de longitud completa. Por lo tanto, este
ejemplo demuestra que la porción N-terminal de la
proteína WT1 que abarca desde el aminoácido 2 hasta el 281 es la
porción inmunógena dominante de la proteína WT1 in vivo.
Se inmunizaron grupos de cuatro ratones C57BL/6
por vía subcutánea con 20 \mug de proteínas WT-1:
WT-1-F o WT-1 de
longitud completa (FL) con fusiones de R12, HIS o TAT. Se realizaron
inmunizaciones las semanas 0, 3 y 9 y se extirparon los bazos la
semana 11. Después se estimularon los esplenocitos in vitro
durante 6 horas con medio en solitario, con un péptido de 15
aminoácidos "p32" (ARMFPNAPYLPSCLE, aminoácidos
125-139 de WT-1; que se encuentra
dentro del péptido p117-139 expuesto en la SEC ID
Nº: 2), con la línea celular
DC2.4-WT-1/LAMP o con rRa12.
Después las células CD4 se tiñeron para
interferón-gamma intracelular y se cuantificaron
mediante análisis de FACS. Una porción de estos esplenocitos se
estimularon después in vitro durante 8 días, después de lo
cual se enumeraron las células CD4+ IFN+. Después de la estimulación
de 6 horas con p32, 0,33% de las células positivas para CD4 eran
positivas para tinción de IFN-gamma intracelular en
ratones inmunizados con la construcción N-terminal
truncada rWT1-F-TAT. Por el
contrario, sólo 0,10% de células positivas para CD4 se tiñeron
positivas para IFN-gamma intracelular en ratones
inmunizados con rWT1-FL-TAT. Después
de la estimulación de 8 días, los ratones inmunizados con la
construcción rWT1-F-TAT mostraban
tinción de IFN-gamma en 10,72% de las células CD4+.
Por el contrario, 0,24% de las células positivas para CD4 de ratones
inmunizados con la construcción WT1 de longitud
completa-TAT se tiñeron positivas para
IFN-gamma intracelular. Estos datos indican que se
generaron respuestas de CD4
mejoradas mediante la construcción rWT1 truncada-TAT respecto a la construcción rWT1 de longitud completa-TAT.
mejoradas mediante la construcción rWT1 truncada-TAT respecto a la construcción rWT1 de longitud completa-TAT.
En un segundo ensayo se estimularon esplenocitos
in vitro con el péptido de 23 aminoácidos,
p117-139 (SEC ID Nº: 2; PSQASSGQARMFPNAPYLPSCLE,
que contiene un epítopo de CD4 conocido y que incluye "p32"),
durante 3 días, después de los cuales se ensayaron los
sobrenadantes para determinar el IFN-gamma secretado
mediante ELISA. No había secreción de IFN-gamma
detectable a partir de esplenocitos de ratones inmunizados con las
construcciones de WT1 de longitud completa. Por el contrario, se
detectó un promedio de 2477 pg/ml de IFN-gamma a
partir de esplenocitos de ratones inmunizados con
rWT1-F sin marcador HIS. Se detectó un promedio de
4658 pg/ml de IFN-gamma a partir de esplenocitos de
ratones inmunizados con rWT1-F-TAT.
Estos datos confirman adicionalmente la observación de que se
generaban respuestas de CD4 mejoradas mediante las construcciones de
WT1 truncada N-terminalmente respecto a la proteína
de longitud completa.
La proteína WT1 es un factor de transcripción
que está compuesto por dos dominios funcionales: un dominio rico en
prolina-glutamina en el extremo
N-terminal y un dominio de dedo de cinc compuesto
por cuatro de dedos de cinc en el extremo
C-terminal con homología con la familia de EGR1/Sp1
de factores de transcripción. WT1 es una proteína propia. El
extremo C-terminal es homólogo a otras proteínas
propias y por lo tanto es menos inmunógeno, es decir, está sujeto a
un menor grado de tolerancia inmunológica. Cabe señalar que los 4
dominios de dedos de cinc dentro del extremo
C-terminal tienen homología con miembros de la
familia de EGR. Los resultados descritos en este ejemplo indican
que la tolerancia variará entre porciones diferentes de una
proteína, posiblemente dependiendo de las homologías de secuencia y
de dominios funcionales.
En resumen, los datos descritos en este ejemplo
confirman la idea de que la vacuna de WT1 más eficaz comprenderá el
extremo N-terminal de WT1, como una proteína
recombinante o una construcción basada en genes.
\vskip1.000000\baselineskip
El ADNc para el fragmento
N-terminal de WT-1, junto con una
secuencia de consenso de Kozak, se obtuvieron mediante PCR usando
el plásmido WT1-F como molde
(WT-1-F: aminoácidos
2-281 de la proteína WT1 clonados cadena abajo de
una metionina de inicio; el ADNc y la secuencia de aminoácidos de
2-281 de WT1 se exponen en las SEC ID Nº: 460 y
461, respectivamente. La construcción de fusión pTAT usada como
molde en los experimentos descritos en este documento se describe
en el Ejemplo 34. El ADNc de esta construcción se expone en la SEC
ID Nº: 452). Se usaron los siguientes cebadores para
amplificación:
El ADNc para la misma ORF más un marcador His de
10 restos C-terminal se obtuvo por PCR de forma
similar a anteriormente excepto por el uso de WT1 RV3 (SEC ID Nº:
468) como cebador inverso (5'
CGGCTCTAGACTAATGGTGATGGTGATGATGATGGTGATGATGCTGAATGCCTCTGAAGACACCGTG).
Los productos de PCR purificados se clonaron en
el sitio Xba I del plásmido donante, pFastBac1. El plásmido donante
recombinante pFBWT1-F (secuencias de ADNc y
aminoácidos expuestas en las SEC ID Nº: 463 y 465, respectivamente)
y pFBWT1-FH (con el marcador His 10X; secuencias de
ADNc y aminoácidos expuestas en las SEC ID Nº: 462 y 464,
respectivamente) se usaron para transformar la cepa de DH10Bac de
E. coli (Invitrogen, Carlsbad, CA) para hacer bácmidos
recombinantes en E. coli a través de una transposición
específica de sitio. Los bácmidos recombinantes se confirmaron
mediante análisis de PCR y después se transfectaron en células de
insecto Sf-9 para preparar baculovirus
recombinantes BVWT1-F y BVWT1-FH.
Los virus recombinantes se amplificaron hasta una reserva viral de
alto título en células Sf-9.
Se usó la línea celular de insecto High Five
para optimizar las condiciones para la expresión de proteína y para
la producción a gran escala de las proteínas recombinantes. Para
optimizar las condiciones para la expresión de proteína, se
infectaron monocapas de células de insecto High 5 con los
baculovirus recombinantes BVWT-F y
BVWT1-FH a diferentes multiplicidades de infección
(MOI) y se recogieron las células transducidas a diferentes
periodos de tiempo. Se confirmaron las identidades de las proteínas
mediante análisis de transferencia de Western con un anticuerpo
policlonal de conejo anti-WT1 [nº
942-32 (799L)]. Las proteínas recombinantes tanto
WT1-F como WT1-FH se expresaban bien
a 48 horas o 54 horas post-infección cuando se
infectaron células High 5 mediante los virus recombinantes a una
MOI de 1,0 ó 2,0.
La amplificación de los baculovirus
recombinantes y la expresión de las proteínas WT1-F
y WT1-FH recombinantes se optimizaron
adicionalmente. Se amplificaron tanto BVWT1-F como
BVWT1-FH en la línea celular de insecto Sf9 en
medio ESF921 que contenía suero fetal de ternera a 2% y PSF 0,5X. La
amplificación se llevó a cabo durante 4 días a una MOI de 0,05 a
28ºC. Se usó la línea celular de insecto High Five para optimizar
las condiciones para la expresión de proteína. Se infectaron
células de insecto High 5 mediante los baculovirus recombinantes a
una MOI de 0,5, 1 ó 2 durante 30, 48, 54 ó 72 horas antes de la
recogida. La identidad de la proteína recombinante se confirmó
mediante análisis de transferencia de Western con un anticuerpo
policlonal de conejo específico contra WT1 (Anticuerpo nº
942-32) y mediante CL
capilar-ES-espectrometría de masas
en tándem. Estos experimentos indican que la expresión de proteína
óptima para la producción a gran escala de WT1-F y
WT1-FH se produce a las 43 horas
post-infección cuando se infectaban células High 5
mediante los virus recombinantes a una MOI de
0,5-1,0.
En resumen, pueden usarse los baculovirus de WT1
anteriores para la producción de proteína a gran escala de la
porción N-terminal de WT1 para el uso en una
diversidad de estrategias vacunales para el tratamiento de tumores
malignos asociados con la expresión de WT1.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo describe estudios de
inmunogenicidad in vivo para evaluar estrategias de
vacunación con WT1 en ratones. El propósito de estos experimentos
era ensayar la capacidad de rV-WT1/TRICOM y
rF-WT1/TRICOM para inducir inmunidad, en particular
inmunidad de células T, contra WT1. Los resultados descritos en este
documento proporcionan respaldo para el uso de vectores de vaccinia
y virus de la viruela aviar TRICOM que expresan WT1 y que contienen
una tríada de moléculas coestimuladoras (B7-1,
ICAM-1 y LFA-3) en estrategias
vacunales para tratar cánceres asociados con la expresión de
WT1.
En el primer estudio, se inmunizaron ratones
C57BI/6 (12 ratones por grupo) dos o tres veces con 14 días entre
las inmunizaciones primaria, secundaria y terciaria como se muestra
a continuación en la Tabla 1. Los ratones se recogieron a los 21
días después de las inmunizaciones secundaria y terciaria. Se
ensayaron las respuestas de células T CD8 y CD4 mediante tinción de
citoquina intracelular IFN-\gamma de células de
bazo activadas por péptido WT1, como se describe con más detalle a
continuación. Adicionalmente, se ensayaron las respuestas de
células T CD4 mediante liberación de IFN-\gamma a
partir de células de bazo estimuladas con proteína rWT1. Se
ensayaron por ELISA las respuestas de anticuerpos séricos IgG_{1}
e IgG_{2b}. Se evaluaron las respuestas de células T usando
cultivos de esplenocitos combinados (4 ratones/grupo/punto de
tiempo). Se determinaron los títulos de anticuerpos para ratones
individuales (4 ratones/grupo/punto de tiempo).
El ADNc de longitud completa de la VARIANTEe de
corte y empalme de WT1 usada en estos estudios se expone en la SEC
ID Nº: 381. El adenovirus con WT1 usado en este documento es como se
describe en el Ejemplo 20. Ambos vectores de virus de la viruela
aviar recombinante rF-WT1/TRICOM y de vaccinia
recombinante rVWT1/TRICOM que expresaban WT1 y contenían una tríada
de moléculas coestimuladoras (B7-1,
ICAM-1 y LFA-3) se generaron por
Therion Biologics (Cambridge, MA, Estados Unidos).
Para evaluar respuestas de células T, se
estimularon esplenocitos in vitro con péptido WT1 "p32"
(ARMFPNAPYLPSCLE, aminoácidos 125-139 de
WT-1; que se encuentra dentro del péptido
p117-139 expuesto en la SEC ID Nº: 2) que se sabe
que contiene un epítopo de CTL y células T auxiliares. La tinción de
citoquinas intracelulares para IFN-\gamma de
esplenocitos activados por p125-139 a los 21 días
después de la inmunización secundaria mostraba un porcentaje
significativo de células T CD4^{+} y CD8^{+} sensibles a WT1 en
ratones inmunizados con rV-WT1/TRICOM
(sensibilización) y rF-WT1/TRICOM (refuerzo),
mientras que ningún otro grupo mostraba respuestas inmunes de
células T específicas de WT1 significativas. Obsérvese que el grupo
de ADN se sensibilizó y reforzó con ADN solamente. El mismo grupo
tenía posteriormente una inmunización terciaria con
rWT1-Adv.
Después de la inmunización terciaria, se
evaluaron las respuestas contra combinaciones de péptidos de 15
aminoácidos solapantes más que las respuestas contra el péptido
individual nº 32. Se descubrió que las células T CD8^{+} y
CD4^{+} contra péptido WT1 específicas para la combinación de
péptidos nº 32-36 respondían a niveles similares a
las respuestas después de la inmunización secundaria en ratones
vacunados con rV-WT1/TRICOM (sensibilización) y
rF-WT1/TRICOM (refuerzo X2). Además, se descubrió
que las células T CD4^{+} y CD8^{+} de estos ratones
respondían, aunque a un nivel mucho menor que al péptido nº 32,
contra un segundo epítopo de WT1 contenido dentro de dos péptidos
solapantes de 15 aminoácidos nº 57-58 (Péptido 57:
DNLYQMTSQLECMTWN (aminoácidos 224-239); Péptido 58:
MTSQLECMTWNQMNL (aminoácidos 229-243); el
solapamiento se corresponde con los restos aminoacídicos
224-243 de WT1.
Se evaluaron las respuestas de anticuerpos
usando un ELISA convencional. Eran medibles niveles reducidos de
anticuerpos séricos IgG_{2b} contra WT1 en los 8 ratones 21 días
después de la inmunización secundaria (título de 1:1350) y 21 días
después de la inmunización terciaria (título de 1:3325) en ratones
inmunizados con rWT1 + MPL-SE. Por el contrario, en
todos los demás grupos los títulos de anticuerpos séricos IgG_{2b}
eran de <1:100 (Tabla 2).
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
En resumen, la inmunización de ratones C57BI/6
con rV-WT1/TRICOM (sensibilización) seguida de
rF-WT1/
TRICOM (refuerzo) o mediante WT1-ADN (sensibilización) seguida de WT1-Adeno (refuerzo) generaba respuestas de células T tanto CD8 como CD4 contra WT1. Las respuestas de células T contra rV-WT1/TRICOM seguido de rF-WT1/TRICOM frente a WT1-ADN seguido de WT1-Adeno eran equivalentes dentro de la potencia del diseño experimental. Sin ligarse a teoría alguna, una ventaja principal de rF-WT1/TRICOM es que los refuerzos múltiples pueden continuar aumentando el nivel de inmunidad. Por lo tanto, estos estudios confirman adicionalmente la inmunogenicidad de la proteína WT1 y proporcionan respaldo para el uso de regímenes de inmunización de WT1-ADN/adenovirus o rv-WT1/TRICOM/rF-WT1/TRICOM en estrategias vacunales para tratar cánceres asociados con la expresión de WT1.
TRICOM (refuerzo) o mediante WT1-ADN (sensibilización) seguida de WT1-Adeno (refuerzo) generaba respuestas de células T tanto CD8 como CD4 contra WT1. Las respuestas de células T contra rV-WT1/TRICOM seguido de rF-WT1/TRICOM frente a WT1-ADN seguido de WT1-Adeno eran equivalentes dentro de la potencia del diseño experimental. Sin ligarse a teoría alguna, una ventaja principal de rF-WT1/TRICOM es que los refuerzos múltiples pueden continuar aumentando el nivel de inmunidad. Por lo tanto, estos estudios confirman adicionalmente la inmunogenicidad de la proteína WT1 y proporcionan respaldo para el uso de regímenes de inmunización de WT1-ADN/adenovirus o rv-WT1/TRICOM/rF-WT1/TRICOM en estrategias vacunales para tratar cánceres asociados con la expresión de WT1.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo describe la construcción de un
vector de expresión que contiene un péptido señal de translocación
de la doble arginina (TAT) truncado fusionado con la fase de lectura
de WT1-F (porción N-terminal
2-281 de la proteína WT1). Este vector puede usarse
para producir una sola especie de proteína
TAT-WT1-F truncada para el uso en
estrategias de inmunización para el tratamiento de tumores malignos
asociados con la expresión de WT1.
Cómo se ha descrito anteriormente en el Ejemplo
34, la secuencia señal TAT se usó para preparar diversos vectores
de WT1. Cuando se usaron estos vectores TAT en la expresión, se
observaron múltiples formas de la proteína. La secuenciación
N-terminal de estas formas mostraba que cada una de
las tres proteínas separadas que se estaban expresando eran
truncamientos del péptido TAT. Estas escisiones se estaban
produciendo en cada uno de los sitios de doble arginina. Por lo
tanto, se construyó un vector de TAT truncado para acortar el
péptido señal TAT de 39 aminoácidos a 12 aminoácidos, para evitar
la generación de estos productos de escisión durante la expresión.
Se generó el vector corto "Stumpy" de TAT manteniendo los
primeros 12 restos del péptido señal TAT hasta la primera doble
arginina. Este vector se construyó de la forma siguiente:
Se combinaron las siguientes parejas de
oligonucleótidos y después se hibridaron.
Pareja 1:
Pareja 2:
Después las parejas se ligaron entre sí con
pPDM, un vector pET28 modificado que se había digerido con NdeI y
EcoRI. El plásmido resultante, pStumpy, se expone en la SEC ID Nº:
471. La secuencia de aminoácidos de la proteína TAT truncada se
expone en la SEC ID Nº: 506. El polinucleótido de TAT de longitud
completa se expone en la SEC ID Nº: 503 y codifica la secuencia de
aminoácidos del polipéptido TAT expuesto en la SEC ID Nº: 504.
Después se usó el vector pStumpy para construir
el vector Stumpy-WT1-F para expresar
la porción N-terminal de WT1 sin productos de
escisión. Se construyó el vector
Stumpy-WT1-F de la forma
siguiente:
La región codificante de WT1-F
se amplificó por PCR con el siguiente conjunto de cebadores:
La reacción de amplificación contenía 10 \mul
de tampón de Pfu 10X, 1 \mul de dNTP 10 mM, 2 \mul de cada
cebador 10 \muM, 83 \mul de agua estéril y 1,5 \mul de ADN
polimerasa Pfu (Stratagene, La Jolla, CA). La reacción se
desnaturalizó primero durante 2 minutos a 96ºC seguido de 40 ciclos
de 96ºC durante 20 segundos, 63ºC durante 15 segundos y 72ºC
durante 30 segundos. Después la reacción se prolongó durante una
extensión final de 72ºC durante 4 minutos.
El producto de PCR se digirió después con EcoRI
y se clonó en el vector pStumpy que se había digerido con Eco72I y
EcoRI. La construcción se confirmó mediante análisis de secuencia y
después se transformó en células BLR (DE3) pLys S. La proteína de
fusión TAT truncada WT1-F resultante se expresaba
como una sola especie. La secuencia polinucleotídica de la región
codificante de pStumpy WT1-F se expone en la SEC ID
Nº: 469, que codifica la secuencia de aminoácidos expuesta en la
SEC ID Nº: 470.
\vskip1.000000\baselineskip
Este ejemplo describe la construcción de
vectores WT1-F, WT1-G, y
WT1-Delta G optimizados para la producción de
proteínas en E. coli.
Se optimizaron los codones de la secuencia de
ADN de TAT WT-1 F y se modificaron sintéticamente
por Blue Heron Biotechnology (Bothel, WA) para optimizarse para la
expresión en E. coli. Esta secuencia de ADNc de
WT1-F de codones optimizados se expone en la SEC ID
Nº: 477 y codifica la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC
ID Nº: 479. El plásmido que contenía esta secuencia se digirió
después con NdeI y EcoRI y se subclonó en un vector pET28
modificado que se había digerido con NdeI y EcoRI para la expresión
en E. coli. Se confirmó que esta construcción era correcta
mediante análisis de secuencia de ADN y después se usó para
transformar células BLR (DE3) pLys S para expresión. Esta
construcción es una fuente rastreable puramente sintética de ADN
molde de TAT WT1-F.
La secuencia de codones optimizados se usó
después como molde para PCR para delecionar una región rica en
prolina de catorce aminoácidos de la región
N-terminal (deleción de aminoácidos
54-67 de la secuencia de WT-1 F
expuesta en la SEC ID Nº: 461; que se corresponde con los
aminoácidos 55-68 de la WT1 de longitud completa),
generando la secuencia de ADNc de WT-1 G expuesta en
la SEC ID Nº: 473 que codifica la secuencia de aminoácidos expuesta
en la SEC ID Nº: 478. Esto se realizó generando primero la
construcción pTAT-WT-1 G de la forma
siguiente:
La región codificante 5' de WT-1
G se amplificó por PCR usando el siguiente conjunto de
cebadores:
La región codificante 3' de la región de
WT-1 G se amplificó por PCR usando el siguiente
conjunto de cebadores:
La reacción de PCR para la amplificación de
WT1-G contenía 10 \mul de tampón de Pfu 10X, 1
\mul de dNTP 10 mM, 2 \mul de cada cebador 10 \muM, 83 \mul
de agua estéril, 1,5 \mul de ADN polimerasa Pfu (Stratagene, La
Jolla, CA) y 50 ng de molde de ADN (pTAT WT1-F de
codones optimizados como se expone en la SEC ID Nº: 477). La
reacción se desnaturalizó primero durante 2 minutos a 96ºC seguido
de 40 ciclos de 96ºC durante 20 segundos, 63ºC durante 15 segundos
y 72ºC durante 30 segundos. Después la reacción se prolongó durante
una extensión final de 72ºC durante 4 minutos.
El primer producto de PCR se digirió después con
XbaI y se clonó en pPDM (un vector pET28 modificado) que se había
digerido con XbaI y Eco72I. La construcción resultante (pTAT
WT1-GA) se digirió después con SrfI y EcoRI. La
segunda construcción de PCR se digirió con EcoRI y se clonó en la
construcción plasmídica pTAT WT1-GA. Al mismo
tiempo se llevó a cabo una ligación de tres vías digiriendo la
primera construcción de PCR con XbaI y SrfI y digiriendo la segunda
construcción de PCR con EcoRI y clonándola en pPDM que se había
digerido con XbaI y EcoRI. Se confirmó que la construcción
pTAT-WT1-G resultante era correcta
mediante análisis de secuencia y después se usó para transformar un
hospedador de expresión. El ADNc de
pTAT-WT1-G se expone en la SEC ID
Nº: 475 y codifica la secuencia de aminoácidos de la SEC ID Nº:
482.
Debido a la digestión incompleta con SrfI
durante el segundo método descrito anteriormente, se generó una
forma inesperada de WT-1 G (WT-1
Delta G) que tenía delecionados 14 aminoácidos (aminoácidos
55-68 de WT-1 F) y añadidos tres
aminoácidos adicionales (secuencia polinucleotídica de
WT-1 Delta G expuesta en la SEC ID Nº: 505 que
codifica la secuencia polipeptídica expuesta en la SEC ID Nº: 502).
Esta construcción TAT WT-1 Delta G dio como
resultado una sobreexpresión inesperada de 5 veces en comparación
con las construcciones de TAT WT-1 F. El ADN de la
construcción pTAT-WT1 Delta G se expone en la SEC ID
Nº: 476 y codifica la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC
ID Nº: 481.
Después de la generación de
pTAT-WT1 G, pStumpy-WT1 G y
WT1-G, se construyeron con y sin un marcador His
usando el pTAT-WT1 G como molde en las reacciones
de PCR que se describen a continuación.
La región codificante de la región
WT1-G se amplificó por PCR usando los siguientes
conjuntos de cebadores:
PCR 1:
PCR 2:
La reacción de PCR y las condiciones de
amplificación eran como se han descrito anteriormente usando el
pTAT-WT-1 G expuesto en la SEC ID
Nº: 475 como molde. El primer producto de PCR se digirió con EcoRI y
se clonó en pPDM (un vector pET28 modificado con un marcador his en
fase de lectura) y pSTUMPY (un vector pET28 modificado con un
péptido líder de TAT truncado de 12 aminoácidos en fase de lectura
expuesto en la SEC ID Nº: 471) que se digirieron con EcoRI y
Eco721. El segundo producto de PCR se digirió con NdeI y EcoRI y se
clonó en un vector pET28 modificado (pPDM) que se había digerido
con NdeI y EcoRI. Se confirmó que las construcciones eran correctas
mediante análisis de secuencia y después se usaron para transformar
un hospedador de expresión. Las construcciones resultantes eran las
siguientes: El polinucleótido de WT1-G con marcador
His se expone en la SEC ID Nº: 472 y codifica la secuencia de
aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº: 480. El polinucleótido de
WT1-G sin marcador His se expone en la SEC ID Nº:
473 que codifica la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID
Nº: 478. La secuencia polinucleotídica de
pStumpy-WT1-G se expone en la SEC ID
Nº: 474 y codifica la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC
ID Nº: 483.
En un experimento relacionado, se construyó el
vector pStumpy WT-1 F GMP (de codones optimizados)
de la forma siguiente:
La región codificante de la región
WT-1 F se amplificó usando los siguientes
cebadores
La reacción de PCR y las condiciones de
amplificación eran como se han descrito anteriormente usando pTAT
WT-1 F GMP como molde. El producto de PCR se digirió
con EcoRI y se clonó en el vector pStumpy descrito en el Ejemplo 38
que se digirió con EcoRI y Eco72I. Se confirmó que la construcción
era correcta mediante análisis de secuencia y después se usó para
transformar un hospedador de expresión. La secuencia
polinucleotídica de pStumpy WT-1 F GMP se expone en
la SEC ID Nº: 498 que codifica la secuencia de aminoácidos de la SEC
ID Nº: 499.
En resumen, los vectores de expresión descritos
en este documento pueden usarse para la expresión y producción
optimas de WT1, WT1 truncada y proteínas de fusión de WT1 para el
uso en estrategias vacunales para el tratamiento de tumores
malignos asociados con la expresión de WT1.
A partir de lo anterior se apreciará que, aunque
se han descrito realizaciones específicas de la invención en este
documento con fines ilustrativos, pueden realizarse diversas
modificaciones sin desviarse del espíritu y alcance de la
invención. Por consiguiente, la invención no está limitada excepto
por las reivindicaciones adjuntas.
<110> Corixa Corporation
\hskip1cmGaiger, Alexander
\hskip1cmMcNeill, Patricia D.
\hskip1cmJaya, Nomalie
\hskip1cmCarter, Darrick
\vskip0.400000\baselineskip
<120> COMPOSITIONS y METHODS FOR WT1
SPECIFIC IMMUNOTHERAPY
\vskip0.400000\baselineskip
<130> 210121.46502PC
\vskip0.400000\baselineskip
<140> PCT
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
2002-10-30
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 506
\vskip0.400000\baselineskip
<170> FastSEQ for Windows Version 3.0
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Mus musculus
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 18
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<213> Mus musculus
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<213> Mus musculus
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<211> 32
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musculus
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musculus
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musculus
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens y Mus
musculus
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens y Mus
musculus
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\hskip1cm
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\hskip1cm
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\hskip1cm
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\hskip1cm
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<213> Homo sapiens
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\hskip1cm
\hskip1cm
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<213> Homo sapiens
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\hskip1cm
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 339
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
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<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1110
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 99
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 343
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 152
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 343
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 344
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 133
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 344
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 345
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 112
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 345
\hskip1cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 346
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 369
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 346
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 347
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 347
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 348
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<400> 386
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\hskip1cm
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<210> 387
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<211> 1089
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 387
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\hskip1cm
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<210> 388
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<211> 1035
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<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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<400> 388
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\hskip1cm
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<210> 389
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<211> 1263
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
\newpage
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<400> 389
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\hskip1cm
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<210> 390
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1707
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
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<400> 390
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<211> 344
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 391
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\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 392
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 568
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 392
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\hskip1cm
\hskip1cm
\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 393
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 420
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 393
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\hskip1cm
\hskip1cm
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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\hskip1cm
\hskip1cm
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<210> 395
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<211> 214
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 395
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\hskip1cm
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<211> 30
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<212> DNA
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<223> Cebador de PCR
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<400> 396
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\hskip1cm
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<211> 31
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador de PCR
\newpage
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<400> 397
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\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
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<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador de PCR
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 398
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 399
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador de PCR
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 399
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\hskip1cm
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<210> 400
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Cebador de PCR
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 400
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
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<210> 401
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<211> 28
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<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 401
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
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<210> 402
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<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador de PCR
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 402
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\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 403
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador de PCR
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 403
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 404
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 449
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 404
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 405
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 428
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 405
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 406
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 414
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 85, 86, 172, 173, 242, 245, 246,
247
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Cualquier Aminoácido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 406
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 407
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 417
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 407
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 408
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 429
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 408
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 409
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 495
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 409
\hskip1cm
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 410
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 504
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 410
\hskip1cm
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 411
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 411
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 412
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 412
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 413
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 413
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 414
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 414
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 415
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido sintético
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 415
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 416
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 416
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 417
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 417
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 418
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 418
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 419
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 419
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 420
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 420
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 421
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 421
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 422
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 422
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 423
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Péptido sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 423
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 424
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Péptido sintético
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 424
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 425
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 426
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Péptido sintético
\vskip1.000000\baselineskip
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<212> DNA
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<223> Cebador de PCR
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<212> DNA
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<220>
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<223> Cebador de PCR
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<212> PRT
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<212> PRT
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<212> PRT
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<210> 483
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 483
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\hskip1cm
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<210> 484
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<211> 30
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Cebador de PCR
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador de PCR
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Oligonucleótido usado en la
construcción del vector TAT "Stumpy".
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido usado en la
construcción del vector TAT "Stumpy".
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 487
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\hskip1cm
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido usado en la
construcción del vector TAT "Stumpy".
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 488
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<211> 23
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido usado en la
construcción del vector TAT "Stumpy".
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Cebador de PCR
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<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
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<212> DNA
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<212> DNA
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<212> DNA
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<212> DNA
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<212> DNA
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<210> 498
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<211> 882
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<212> DNA
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 498
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\hskip1cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 499
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 292
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 499
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\hskip1cm
\hskip1cm
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<210> 500
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
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<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador de PCR
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<400> 500
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 501
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador de PCR
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 501
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 502
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 270
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 502
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 503
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5400
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> E. coli
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 503
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 504
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> E. coli
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTEE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38,
39
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Cualquier Aminoácido
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 504
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 505
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 816
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 505
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 506
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 506
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
Claims (18)
1. Una proteína de fusión que comprende una
porción inmunógena de un antígeno de tumor de Wilms (WT1), en la
que dicha porción inmunógena de WT1 consiste en la secuencia de
aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en las SEC ID Nº:
2, 144, 241, 414-451, 461, 478 y 502, y un compañero
de fusión, caracterizada por que el compañero de fusión
consiste en la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:
506.
2. La proteína de fusión de la reivindicación 1,
en la que la porción inmunógena de WT1 consiste en la secuencia de
aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº: 461.
3. La proteína de fusión de la reivindicación 1,
que comprende la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEC ID Nº:
470.
4. Un polinucleótido aislado que codifica las
proteínas de fusión de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a
3.
5. El polinucleótido aislado de la
reivindicación 4, en el que el polinucleótido comprende la secuencia
expuesta en la SEC ID Nº: 469.
6. El polinucleótido aislado de la
reivindicación 4 ó 5, en el que el polinucleótido se ha sometido a
optimización de codones para la expresión en E. coli.
7. Una composición que comprende un polipéptido
de la reivindicación 1, 2 ó 3 en combinación con un vehículo o
excipiente farmacéuticamente aceptable.
8. Una vacuna que comprende un polipéptido de la
reivindicación 1, 2 ó 3 en combinación con un potenciador de la
respuesta inmune inespecífica.
9. La vacuna de acuerdo con la reivindicación 8,
en la que el potenciador de la respuesta inmune inespecífica
potencia preferentemente una respuesta de células T en un
paciente.
10. La vacuna de acuerdo con la reivindicación
8, en la que el potenciador de la respuesta inmune se selecciona
del grupo que consiste en 3d-MPL, MPL,
RC-529, AGP, Montanide ISA50, Seppic Montanide ISA
720, una citoquina, una microesfera, adyuvantes basados en bromuro
de dimetil dioctadecil amonio (DDA), AS-1,
AS-2, adyuvante basado en el sistema adyuvante
Ribi, QS21, adyuvantes basados en saponina, adyuvante Syntex en su
forma microfluidizada, MV, ddMV, adyuvantes basados en complejo
inmunoestimulante (iscom) y toxinas inactivadas.
11. Un vector de expresión que comprende un
polinucleótido de la reivindicación 4 a 6 unido operativamente a
una secuencia de control de la expresión.
12. Una célula hospedadora transformada o
transfectada con un vector de expresión de acuerdo con la
reivindicación 11.
13. Una composición que comprende un primer
componente que comprende un polipéptido de la reivindicación 1, 2 ó
3 y un segundo componente seleccionado de uno cualquiera o ambos de
un vehículo o inmunoestimulante fisiológicamente aceptable para el
uso en la inducción de una respuesta inmune en un paciente.
14. Una composición que comprende un primer
componente que comprende un polinucleótido que codifica un
polipéptido de la reivindicación 1, 2 ó 3 y un segundo componente
que comprende un polipéptido de la reivindicación 1, 2 ó 3 para el
uso en la inducción de una respuesta inmune en un paciente.
15. El polipéptido de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3 para el uso en el tratamiento de una
enfermedad maligna.
16. El polinucleótido de una cualquiera de las
reivindicaciones 4 a 5 para el uso en el tratamiento de una
enfermedad maligna.
17. El uso del polipéptido de una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 3 para la fabricación de un medicamento
para el uso en el tratamiento de una enfermedad maligna.
18. El uso del polinucleótido de una cualquiera
de las reivindicaciones 4 a 5 para la fabricación de un medicamento
para el uso en el tratamiento de una enfermedad maligna.
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