ES2316970T3 - Oligonucleotidos (odn) antisentido contra smad7 y usos en el campo medico de los mismos. - Google Patents

Oligonucleotidos (odn) antisentido contra smad7 y usos en el campo medico de los mismos. Download PDF

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Abstract

Oligonucleótidos antisentido fosforotioato contra Smad7 de hasta 21 nucleótidos de longitud, que comprenden la siguiente secuencia (SEC ID Nº 2): 5''-GTXYCCCCTTCTCCCXYCAG-3'' en la que X es un nucleótido que comprende una base nitrogenada seleccionada del grupo constituido por citosina, 5metilcitosina y 2''-O-metilcitosina, y en la que Y es un nucleótido que comprende una base nitrogenada seleccionada del grupo constituido por guanina, 5-metilguanina y 2''-O-metilguanina, a condición de que al menos uno de los nucleótidos X o Y comprenda una base nitrogenada metilada.

Description

Oligonucleótidos (ODN) antisentido contra Smad7 y usos en el campo médico de los mismos.
La presente invención se refiere a oligonucleótidos (ODN) antisentido contra Smad7 y a usos de los mismos en el campo médico.
Particularmente, la invención se refiere a secuencias de ODN antisentido de Smad7 modificadas adecuadamente que muestran una sorprendente actividad biológica de inhibición específica de la expresión de Smad7 y son por lo tanto utilizables en el campo médico como agentes biológicos terapéuticos, en particular en el tratamiento de enfermedad inflamatoria intestinal crónica (EII).
La enfermedad de Crohn (EC) y colitis ulcerosa (CU) son las formas principales de enfermedad inflamatoria intestinal crónica en seres humanos. Ambas enfermedades son entidades clínicas complejas cuya patogénesis depende estrictamente de la interacción entre diferentes factores genéticos, ambientales e inmunitarios.
A pesar de que EC y CU muestran diferencias marcadas tanto a nivel patofisiológico como clínico, el enfoque terapéutico para los pacientes que las padecen comparten muchos elementos comunes. La variabilidad de la presentación clínica, del tipo y extensión de las lesiones y de la clase de complicaciones influye en la elección terapéutica, aunque el tratamiento farmacológico representaría el primer enfoque predominante.
La salicilazosulfapiridina y el ácido 5-aminosalicílico son medicamentos de eficacia probada en la gestión de la forma leve de EII y en la terapia de mantenimiento de la remisión.
En las fases con actividad moderada a grave y en los casos en que está implicado el estado general de salud, es necesario volverse al uso de corticosteroides. Del análisis a medio y largo plazo de los historiales de caso mundiales principales, parece que la remisión clínica es obtenible sólo en dos tercios de los pacientes que reciben corticosteroides, y sólo en un 50% de estos pacientes no ocurre ninguna recaída después de la supresión de los medicamentos.
La administración continua de corticosteroides, además de inducir el fenómeno de dependencia de medicamentos, está empeorada debido a un muy alto riesgo de efectos secundarios.
También el tratamiento inmunosupresor, que a menudo acompaña o sustituye a la terapia con corticosteroides, no siempre asegura una contención de la flogosis y el control de los síntomas, y además tiene las desventajas de numerosas contraindicaciones y efectos secundarios graves (Podolsky, 2002).
La nueva generación de medicamentos que se puso a disposición en los 90 son agentes biológicos. El conocimiento más en profundidad del historial natural de la EII y de los mecanismos patofisiológicos principales ha contribuido a guiar la intervención médica de un modo concreto. Por tanto, apareció un desarrollo de bioterapias orientadas a controlar "rutas" inflamatorias específicas mediante el uso de proteínas humanas recombinantes, anticuerpos monoclonales quiméricos humanizados y proteínas de fusión. Según el contexto, los agentes que han mostrado una mejor eficacia en el tratamiento de EC son anticuerpos monoclonales quiméricos dirigidos a bloquear TNF-\alpha, una citocina proinflamatoria sobreproducida durante la EII (Seegers y col., 2002). Este compuesto, que está actualmente en la fase IV de ensayo clínico, es eficaz en la contención de la inflamación en aproximadamente un 60-70% de los pacientes tratados. No obstante, se han apuntado algunos efectos secundarios con una considerable frecuencia de incidencia y reconocibles en la reactivación de infecciones microbianas latentes, fenómenos de hipersensibilidad y formación de autoanticuerpos. Este último fenómeno podría estar basado en el hecho de que los anticuerpos anti-TNF-\alpha neutralizan la citocina TNF-\alpha que tiene numerosas funciones biológicas.
Además de su efecto antiinflamatorio, el TNF-\alpha toma parte también en aquellos mecanismos implicados en la inducción y mantenimiento de la tolerancia inmunitaria. Por lo tanto, un bloqueo de la actividad de TNF-\alpha podría potenciar paradójicamente reacciones inmunitarias excesivas (Sandborn y col., 2002).
Todas estas observaciones sugieren la necesidad de nuevos estudios en modelos animales de EII mediante los que sea posible identificar nuevos principios activos para usar en un tratamiento mejor y duradero de dichas patologías (Fiocchi, 2001).
El tratamiento anti-TNF-\alpha, así como otras bioterapias tales como la administración de citocinas antiinflamatorias, por ejemplo IL-10, representa un enfoque terapéutico extracelular orientado a controlar efectos biológicos de moléculas secretadas por células inflamatorias.
El estudio de las rutas de transducción de señal activadas por la interacción de citocina con sus receptores ha expuesto la opción de usar nuevas estrategias terapéuticas capaces de modular específica y selectivamente la expresión intracelular de moléculas inflamatorias y no inflamatorias importantes.
En condiciones normales, la mucosa intestinal es el asiento de un infiltrado inflamatorio "fisiológico" que se mantiene por un frágil equilibrio entre las moléculas proinflamatorias y antiinflamatorias.
Con relación a lo anterior, desempeña un papel importante el TGF-\beta1, una citocina multifuncional capaz de regular el crecimiento, diferenciación y actividad de muchas células inmunes y no inmunes.
Estudios tanto in vitro como in vivo han demostrado que el TGF-\beta1 actúa como un potente inmunorregulador capaz de controlar la inflamación intestinal mucosa y que la inhibición de su actividad da como resultado el desarrollo de colitis que muestra una similitud inmunomorfológica con EC o CU (Powrie F. y col., 1996; Neurath M. F. y col., 1996; Ludviksson B. R. y col., 1997).
De hecho, ratones deficientes en genes de TGF-\beta1 exhiben respuestas inflamatorias multifocales graves, que implican también el intestino, asociadas a una producción excesiva de citocinas inflamatorias por numerosos tipos celulares, incluyendo células T (Shull M. M. y col., 1992; Christ M. y col. 1994).
De forma similar, la inhibición de la señalización de TGF-\beta1 en ratones mediante la expresión de una forma mutante negativa dominante del receptor RII de TGF-\beta1 da como resultado una susceptibilidad potenciada a desarrollar colitis experimental (Hahm K.B. y col., 2001).
Finalmente, se ha mostrado que la inhibición específica de la señalización de TGF-\beta1 en células T mediante la expresión de un receptor de tipo II de TGF-\beta negativo dominante causa una enfermedad autoinmunitaria caracterizada por infiltraciones inflamatorias graves en pulmón y colon y la presencia de anticuerpos autoinmunes en circulación (Gorelik L. y col., 2000). Estos datos indican que la pérdida de actividad de una sola molécula antiinflamatoria podría ser suficiente para alterar la homeostasis intestinal y para permitir respuestas inmunitarias que conducen a lesión de tejido.
La actividad antiinflamatoria de TGF-\beta1 empieza con la interacción de la molécula con un complejo de receptores de serina/treonina cinasa transmembrana heterodiméricos constituidos por dos subunidades, denominadas TGF-\beta1 R1 y TGF-\beta1 R2 respectivamente. Tras la unión de TGF-\beta1, los receptores rotan relativamente dentro del complejo anteriormente mencionado, dando como resultado un proceso de transfosforilación y la posterior activación de TGF-\beta1 R1 mediante el TGF-\beta1 R2 constitutivamente activo y capaz de autofosforilación.
La propagación de la señal desencadenada por TGF-\beta1 al núcleo está mediada por proteínas pertenecientes a la familia Smad. El TGF-\beta1 R1 activado fosforila directamente las proteínas Smad2 y Smad3, que se vuelven capaces de interaccionar con Smad4, posibilitando así que el complejo Smad2-3/Smad4 se transloque al núcleo, donde participa en el control transcripcional de algunos genes (Heldin C-H. y col., 1997).
El papel de Smad3 en la actividad antiinflamatoria de TGF-\beta1 estaba apoyado por estudios en modelos animales, que muestran que la deleción del gen que codifica Smad3 está asociada a una sensibilidad celular reducida ante TGF-\beta1, y con un desarrollo relacionado de enfermedad inflamatoria caracterizada por una infiltración masiva de células T y formación de abscesos piogénicos a nivel gastrointestinal (Yang X. y col., 1999).
También otras proteínas intracelulares, por ejemplo Smad7, pertenecen a la familia de proteínas Smad. Dicha proteína, que ocupa TGF-\beta1 R1, interfiere con la unión de Smad2/Smad3 al receptor, evitando así la fosforilación y activación. Por tanto, una expresión aumentada de proteína Smad7 está asociada a una inhibición de la señalización mediada por TGF-\beta1 (Hayashi H. y col., 1997).
La evaluación de la expresión de TGF-\beta1 en mucosa intestinal de pacientes con EII muestra que la producción de dicha molécula está paradójicamente potenciada en comparación con la que puede comprobarse en el intestino de pacientes normales (Lawrance IC. y col., 2001).
En un artículo reciente, el autor de la presente invención muestra que las muestras mucosas de pacientes con EII se caracterizan por altos niveles de Smad7 y por niveles reducidos de Smad3 activa, indicando por tanto que durante la EII se compromete el mecanismo de señalización mediado por TGF-\beta1. El autor de la presente invención mostró adicionalmente que la anulación selectiva de Smad7 por un oligonucleótido antisentido específico 5'-GTCGCCCCTTCTCCCCGCAGC-3' (SEC ID Nº 1) restaura la sensibilidad de las células mononucleares de lámina propia (CMLP) ante TGF-\beta1, dando como resultado una regulación negativa de la producción de citocina proinflamatoria, tal como por ejemplo TNF-\alpha.
Además, experimentos ex vivo llevados a cabo también en muestras de mucosa intestinal de pacientes con EII mostraron que la administración de ODN antisentido de Smad7 restaura el mecanismo de señalización de TGF-\beta1 y permite una producción reducida de citocina (Monteleone y col., 2001).
Durante la EII, la mucosa intestinal se infiltra con un alto número de células T. Estas células se consideran los mediadores principales de lesión tisular que actúan en dichas enfermedades.
El número aumentado de células T en la mucosa intestinal de pacientes con EII depende parcialmente de la resistencia de dichas células ante estímulos que inducen su muerte (apoptosis).
Se cree que el bloqueo de la apoptosis de células T desempeña un papel clave en el mantenimiento de la respuesta inflamatoria mucosa en EII (Boirivant y col., 1999). Es más, la potenciación de la muerte de células T se asocia a una resolución de la inflamación intestinal. El mecanismo exacto subyacente de la resistencia de células T frente a la apoptosis durante EII no es todavía conocido, aunque parecen estar implicadas citocinas liberadas localmente.
Los datos de experimentos de cultivo celular in vitro y estudios in vivo indican que el TGF-\beta1 puede evitar o desencadenar la muerte de células T y que la capacidad del factor de mediar ambas respuestas es específica de sitio (Han SH. y col., 1998; Rasura M. y col., 1996).
Ratones con deficiencia de Smad3 exhiben un masivo aumento del número de células inflamatorias al nivel intestinal, sugiriendo por tanto un papel de TGF-\beta1 en el control de la apoptosis de células T intestinales al nivel intestinal (Yang y col., 1999).
Por lo tanto, la inhibición de Smad7 por el uso de ODN antisentido de Smad7 sintético puede representar un enfoque bioterapéutico "endógeno" novedoso y aceptable para enfermedades inflamatorias crónicas, en particular para EII, puesto que como se menciona anteriormente, restaura la sensibilidad de células T ante TGF-\beta1.
Los oligonucleótidos antisentido (ODN) son secuencias oligonucleotídicas sintéticas cortas complementarias del ARN mensajero (ARNm) que codifica la proteína diana de la inhibición específica y orientada. Dichas secuencias, que hibridan con el ARNm, producen un tramo híbrido bicatenario, y éste conduce a la activación de enzimas catalíticas ubicuas tales como ARNasas H, que degradan las cadenas híbridas de ADN/ARN que se desarrollan en la naturaleza para desencadenar la duplicación de ADN, evitando por tanto la traducción de proteína.
La selección de las regiones y secuencias de ARNm más adecuadas para hibridar con el ODN tiene características empíricas, aunque el ODN complementario de la región de inicio de la transcripción 5' y de las regiones de corte y empalme habitualmente resultan ser más eficaces. El diseño de un número notable de ODN antisentido, después de identificar los sitios diana posibles, no crea dificultades gracias a las tecnologías de síntesis automatizada recientes y avanzadas propiedad de compañías especializadas en dicho campo.
Por el contrario, la identificación del ODN más activo, para posibles aplicaciones terapéuticas, requiere un trabajo de cribado a largo plazo mediante ensayos de eficacia de prueba cuantitativa. Con relación a lo anterior, son ya conocidas secuencias de ODN antisentido contra dianas específicas, entre ellas Smad7 (patente de EE.UU. nº US 6.159.697; asignada a ISIS Pharmaceuticals Inc.).
El uso de ODN antisentido para regulación génica tanto in vitro como in vivo está impedido por algunos problemas tales como la dificultad de pasar a través de membranas celulares, debido a la naturaleza polianiónica y después hidrófila de estas moléculas, y la rápida degradación enzimática.
Para superar estos obstáculos, es necesario recurrir a la modificación química del ODN antisentido tal como, por ejemplo la fosforotioación, como en el caso de la secuencia específica de Smad7 anteriormente mencionada (Monteleone y col., 2001), o la fosforoamidación, que son sustituciones de átomos de azufre o nitrógeno en lugar de aquellos átomos de oxígeno que no son átomos puente del engarce fosfodiéster.
Así como en muchos productos biotecnológicos, la demostración de una actividad biológica apunta a una actividad terapéutica potencial.
Es más, el ODN puede usarse en estudios tanto de funciones génicas como proteicas implicadas en la patogénesis de diferentes enfermedades o con fines terapéuticos. Aunque en el campo de la solicitud anterior la metodología antisentido era exitosa por la facilidad de los principios de guía, el desplazamiento de experimentación in vitro a in vivo es más complejo, especialmente en lo que respecta a los aspectos farmacocinéticos, farmacodinámicos y toxicológicos de estos nuevos medicamentos (Maggi A., 1998).
Por ejemplo, el ODN antisentido de Smad7 usado en los experimentos anteriores llevados a cabo por el autor de la presente invención (SEC ID Nº 1), que muestran actividad biológica in vitro, podrían mostrar un riesgo aumentado de efectos indeseables in vivo. De hecho, dicho ODN contiene dos pares nucleotídicos CG que se convierten en CpG después de fosforotioación, un proceso esencial para potenciar la estabilidad de ODN. Estas últimas son secuencias dotadas de una potente actividad estimulante del sistema inmunitario, por lo tanto, el uso del ODN anteriormente mencionado como tal podría empeorar el curso de cualquier enfermedad inmunitaria, enfermedad de Crohn y colitis ulcerosa incluidas.
No podría teorizarse un enfoque terapéutico similar especialmente en el caso de enfermedad de Crohn, una patología mediada por una clase particular de linfocitos T, llamada Th1, bajo el estímulo de interleucina 12. Es más, las moléculas de CpG, como inductoras potentes de la síntesis de IL-12, podrían inducir un desarrollo adicional de células Th1.
Además, la administración in vivo de ODN antisentido que contiene dinucleótidos CpG está acompañada de un riesgo aumentado de efectos secundarios, en comparación con oligonucleótidos sin CpG. En particular, se ha probado un riesgo aumentado de hiperplasia del sistema reticuloendotelial de bazo, riñón e hígado, así como una proliferación aumentada de células hematopoyéticas (Agrawal S. y col., 2002).
Es otro problema del uso de ODN está ligado a los efectos secundarios resultantes de la acción de los metabolitos derivados de la degradación de la molécula, que resultan bastante susceptibles al ataque de nucleasa, puesto que no están protegidos en los extremos 5' y 3'.
De ahí la necesidad de una modificación química del esqueleto de ODN antisentido fosforotioato en pares CpG y extremos 5' y 3'. No obstante, las modificaciones anteriormente citadas de la secuencia de ODN podrían conducir a la reducción o pérdida de la actividad biológica de inhibición de la síntesis de Smad7 y, algunas veces, incluso a la inversión de la actividad deseada tanto in vitro como in vivo.
Igualmente, puede ser importante disponer de modelos de EII experimentales adecuados para estudios in vivo que permitan aumentar el conocimiento sobre los mecanismos que implican la pérdida de regulación de la respuesta inmunitaria y su papel en el inicio de la patología de EII y sobre la posibilidad de modular o evitar dicha respuesta, limitando por tanto la progresión de la inflamación a nivel mucoso. Con relación a lo anterior, la colitis mediada por TNBS representa un modelo extendido y válido de inflamación mucosa que muestra similitudes inmunomorfológicas notables con EC humana (Neurath M. y col., 2000).
A la vista de lo anterior, sería deseable disponer de nuevos agentes biológicos terapéuticos, como ODN antisentido de Smad7, que fueran activos tanto in vitro como in vivo para el tratamiento de EII mediante un "enfoque bioterapéutico endógeno".
El autor de la presente invención ha encontrado ahora secuencias de ODN antisentido adecuadamente modificadas que exhiben una actividad biológica in vivo mayor de inhibición de la expresión de Smad7 en modelos experimentales de EII en comparación con su actividad inhibidora in vitro, y también mayor que la de otras secuencias conocidas que muestran las mismas modificaciones y ensayadas en los mismos modelos.
En particular, las secuencias de ODN que exhiben una mayor actividad biológica in vivo se diseñaron según la secuencia de ODN antisentido fosforotioato de SEC ID Nº 1 orientada al sitio 403 de ARN de Smad7 humana, usada por el autor de la presente invención en el transcurso de experimentos previos.
En vista del uso potencial y futuro de dicho ODN antisentido fosforotioato de Smad7 para el tratamiento de patologías humanas, se modificó dicha secuencia en los dinucleótidos CpG allí contenidos, indicados de aquí en adelante como XY, debido a su inmunogenicidad ya mencionada.
El estudio llevado a cabo por el autor ha permitido ensayar la eficacia in vivo e in vitro de diferentes ODN antisentido de Smad7 conocidos y novedosos y su posible toxicidad, e investigar si bloquear la expresión de Smad7 da como resultado la resolución de la inflamación mucosa en modelos experimentales de EII.
Las secuencias de ODN antisentido adecuadamente modificadas mencionadas anteriormente según la presente invención, además de una actividad biológica in vivo mayor, mostraron una ausencia sorprendente de efectos secundarios en animales, a pesar de lo que sucede después de la administración de otras secuencias durante el transcurso del mismo estudio. Adicionalmente, las secuencias de ODN según la invención mostraron su eficacia para limitar la infiltración linfocítica y la propagación posterior de la inflamación, lo que es una evidencia no encontrada para las otras secuencias de ODN antisentido ensayadas en la presente memoria.
El papel de Smad7 como diana biológica aparece claramente en estos estudios en modelos experimentales, junto con los posibles efectos terapéuticos de su inhibición.
Además, dentro del contexto de la presente invención, se ha encontrado otro papel de Smad7 en la inducción de la apoptosis de células T durante la EII. De hecho, mediante el uso de algunos ODN antisentido de Smad7, se ha mostrado que el TGF-\beta1 regula la apoptosis de células T intestinales y que la actividad de un factor defectivo da cuenta de la resistencia celular ante estímulos apopotóticos, que son responsables de mantener la respuesta inflamatoria mucosa.
Por lo tanto, son objetos de la presente invención oligonucleótidos antisentido fosforotioato de Smad7 de hasta 21 oligonucleótidos de longitud que comprenden la siguiente secuencia (SEC ID Nº 2):
5'-GTXYCCCCTTCTCCCXYCAG-3'
en la que X es un nucleótido que comprende una base nitrogenada seleccionada del grupo constituido por citosina, 5-metilcitosina y 2'-O-metilcitosina y en la que Y es un nucleótido que comprende una base nitrogenada seleccionada del grupo constituido por guanina, 5-metilguanina y 2'-O-metilguanina, a condición de que al menos uno de los nucleótidos X o Y comprenda una base nitrogenada metilada.
Son otros objetos de la presente invención las secuencias oligonucleotídicas de los estereoisómeros de oligonucleótido antisentido diferentes, tales como diastereómeros y enantiómeros, en cuanto a los átomos de fósforo del engarce internucleosídico incluidos en la secuencia. Es más, el engarce internucleosídico puede ser fosforotioato o metilfosfonato, y en ambos casos el fósforo unido a cuatro grupos químicos diferentes representa un centro quiral.
Los oligonucleótidos antisentido según la presente invención pueden tener al menos un nucleótido metilfosfonato en la secuencia que está situado, por ejemplo, en sólo uno de los extremos 5' o 3' o en ambos extremos 5' y 3' o a lo largo de la secuencia oligonucleotídica.
En una realización preferida, el nucleótido metilfosfonato puede ser X o Y, de tal modo que el engarce internucleosídico sea el engarce entre dichos nucleótidos.
Pueden llevarse a cabo modificaciones adicionales en los extremos 5' y 3' y/o a lo largo de la secuencia del ODN antisentido para aumentar la estabilidad de la molécula, evitando así la degradación por nucleasas y reduciendo el riesgo de efectos indeseables derivados de las acciones de metabolitos.
Los oligonucleótidos antisentido según la presente invención pueden tener adicionalmente al menos un nucleótido de la secuencia que es un 5'-monofosfato de 2'-O-metilrribonucleótido que está situado, por ejemplo, en sólo uno de los extremos 5' o 3' o en ambos extremos 5' y 3' o a lo largo de la secuencia oligonucleotídica.
Son objetos adicionales de la presente invención los oligonucleótidos antisentido anteriormente citados en los que los 2'-desoxirribonucleótidos se reemplazan por ribonucleótidos y la 2'-desoxitimidina se reemplaza por uridina, de tal modo que las secuencias desoxirribonucleotídicas antisentido se convierten en las correspondientes secuencias ribonucleotídicas antisentido.
Se representa una realización preferida de la presente invención mediante oligonucleótidos antisentido que tienen la secuencia (SEC ID Nº 3):
5'-GTXGCCCCTTCTCCCXGCAG-3'
en la que X es 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina.
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Se representa otra realización preferida mediante oligonucleótidos antisentido que tienen la secuencia (SEC ID Nº 4):
5'-ZTXGCCCCTTCTCCCXGCAZ-3'
en la que X es 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina y Z es metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina.
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Según otro aspecto, es una realización preferida de la presente invención un oligonucleótido antisentido que tiene la secuencia (SEC ID Nº 15):
5'-ZTXGCCCCTTCTCCCXGCAZC-3'
en la que X es 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina y Z es metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina.
Las secuencias de ODN antisentido según la presente invención pueden usarse ventajosamente en el campo médico; por lo tanto, son objetos adicionales de la presente invención composiciones farmacéuticas que comprenden al menos uno de los oligonucleótidos antisentido anteriormente dados a conocer como principios activos, junto con uno o más coadyuvantes y/o excipientes farmacéuticamente aceptables, que son conocidos por un experto en este campo.
Adicionalmente, la invención se refiere al uso de las secuencias oligonucleotídicas antisentido anteriormente citadas para la preparación de un medicamento para el tratamiento de las patologías asociadas a la expresión de Smad7. En particular, dichas patologías asociadas a la expresión de Smad7 son EII, tales como por ejemplo EC y CU.
La presente invención se describe ahora, con fines ilustrativos pero no limitantes, según sus realizaciones preferidas, con referencia particular a las figuras de los dibujos adjuntos, en los que:
la Figura 1 muestra el efecto sobre el número de linfocitos T intestinales después de 40 horas de tratamiento de muestras mucosas de pacientes de EC con ODN antisentido y con sentido de Smad7 5'-MePGTMe-dCGCCCCTTCT
CCCMe-dCGCAMePG-3' (SEC ID Nº 4);
la Figura 2 muestra el análisis de la expresión del complejo p-Smad2/Smad3 y del complejo Smad2/Smad3 total en CMLP aisladas del intestino de ratones tratados con TNBS (TNBS), no tratados (no trat.) y tratados con etanol (EtOH) como controles;
la Figura 3 muestra el análisis de la expresión de Smad7 en CMLP aisladas del intestino de ratones tratados con TNBS (TNBS), no tratados (no trat.) y tratados con etanol (EtOH) como controles;
la Figura 4 muestra los cambios porcentuales de peso en ratones con colitis inducida por TNBS tratada o no con oligonucleótido antisentido de Smad7 MePGTMe-dCGCCCCTTCTCCCMe-dCGCAMePGC (SEC ID Nº 15) o con un control (con sentido); la figura es representativa de tres experimentos separados en los que se han estudiado 14 ratones para cada grupos;
la Figura 5 muestra el aspecto macroscópico del colon extraído de un ratón con colitis inducida por TNBS y de un ratón con colitis inducida por TNBS tratada con oligonucleótido antisentido de Smad7 (SEC ID Nº 15); la figura es representativa de tres experimentos separados en los que se han estudiado 14 ratones para cada grupo;
la Figura 6 muestra el aspecto histológico de una sección de colon de ratones sin colitis o con colitis inducida por TNBS tratada o no con oligonucleótido antisentido de Smad7 (SEC ID Nº 15) o con un control (con sentido); la figura es representativa de tres experimentos separados en los que se han estudiado 14 ratones por cada grupo. Aumentos: 40x.
Ejemplo 1
Estudio del efecto de oligonucleótidos antisentido de Smad7 según la presente invención sobre la apoptosis de células T intestinales Materiales y procedimientos Síntesis de ODN antisentido
Se sintetizaron todos los ODN antisentido de Smad7 por MWG Biotech AG (MWG Biotech S.r.l., Florencia) empleando técnicas automatizadas estándar con un sintetizador de ADN automatizado usando protocolos de química de fosforoamidina estándar (Lesiak K. y col., 1993; Xiao W. y col., 1996).
Se sintetizaron oligonucleótidos que contenían 5-metil-2'-desoxicitidina (5-Me-dC) según procedimientos de síntesis conocidos (Sanghvi y col, 1993) usando fosforoamiditas comercialmente disponibles, mientras que se consiguió la síntesis de oligonucleótidos modificados que contienen grupos metilfosfonato (MeP) usando protocolos conocidos (Maier MA. y col., 2002).
Se ha llevado a cabo la purificación de las moléculas oligonucleotídicas mediante tecnología HPSF, desarrollada por MWG Biotech. Dicho procedimiento de purificación ha revelado una alta eficacia, puesto que permite eliminar las secuencias fallidas sintetizadas durante el proceso de síntesis química automatizada tales como, por ejemplo, secuencias n-1, n-2, n-x, que los procedimientos clásicos de purificación estándar no son capaces de eliminar.
La tecnología anteriormente mencionada, además de permitir obtener un 100% de las secuencias de longitud deseada sin productos fallidos indeseables, permite evitar la siguiente etapa de desalado, puesto que las secuencias purificadas están exentas tanto de sales como de iones metálicos.
Dada la ausencia de cualquier sal, se analizaron eventualmente los oligonucleótidos mediante técnicas de espectrometría de masas MALDI-TOF según protocolos estándar (Guerlavais T. y col., 2002; Ragas JA. y col., 2000). Se esterilizaron entonces los oligonucleótidos y se cuantificó la disolución resultante por densidad óptica (DO) mediante espectrofotómetro de UV/visible. Finalmente, se resuspendieron las moléculas en PBS 1x estéril antes de usar.
Todos los ODN antisentido usados se orientan a sitios de ARNm Smad7 que tienen un 100% de homología entre ser humano y ratón. En todos los oligonucleótidos siguientes, el engarce internucleosídico es un engarce fosforotioato.
Las secuencias de ODN antisentido que se están usando en el presente estudio se han diseñado según la secuencia de ADN antisentido fosforotioato 5'-GTCGCCCCTTCTCCCCGCAGC-3' (SEC ID Nº 1) orientada al sitio 403 de ARNm de Smad7 humana, usada por el autor de la presente invención en el transcurso de experimentos previos (Monteleone y col., 2001).
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-MePGTMe-dCGCCCCTTCTCCCMe-dCGCAMePG-3' (SEC ID Nº 4) se orienta al sitio 403 de ARNm de Smad7 humana. Este es un oligonucleótido de esqueleto mixto en el que la citosina perteneciente a los pares CpG de SEC ID Nº 1 se reemplazó por 5-metilcitosina (indicada en la presente memoria como Me-dC). Además, se dispusieron engarces metilfosfonato en los extremos de la molécula (indicados en la presente memoria como MeP).
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-GTTTGGTCCTGAACATGC-3' (SEC ID Nº 5) se orienta al sitio 294 de ARNm de Smad7 humana.
Se tomaron muestras de mucosa de especímenes de resección de 6 pacientes con EC moderada a grave y de 4 pacientes con CU grave. Además, se tomaron muestras de mucosa intestinal de 10 pacientes no afectados por EII que experimentan colectomía por carcinoma de colon (se obtuvo la aprobación ética por el comité local). Se prepararon CMLP usando el procedimiento de DTT-EDTA-colagenasa y se resuspendieron en RPMI 1640 (Sigma-Aldrich S.r.l., Milán) suplementado con un reactivo de sustitución de suero HL-1 (Biowhittaker, Wokingham, R.U.).
Se cultivaron las células en presencia y ausencia de TGF-\beta1 (Sigma-Aldrich, concentración final en el intervalo de 1 a 5 ng/ml) y se analizó después de 48 horas de incubación el nivel de apoptosis.
En otros experimentos, se resuspendieron CMLP aisladas de intestino de pacientes con EII en RPMI 1640 suplementado con HL-1 y se cultivaron en presencia y ausencia del ODN antisentido de Smad7 anteriormente mencionado (SEC ID Nº 4, SEC ID Nº 5) y en presencia de un oligonucleótido con sentido de control (ambos usados a una concentración de 2 \mug/ml). Después de 24 horas, se usó una alícuota de CMLP para extraer proteínas y evaluar la expresión de Smad7. Se lavaron extensamente las células restantes, se resuspendieron en RPMI 1640 más HL-1, se cultivaron en presencia o ausencia de TGF-\beta1 (5 ng/ml) durante 48 horas y se analizó entonces la apoptosis.
Análisis de la apoptosis por citometría de flujo
Se analizó la apoptosis mediante tinción con yoduro de propidio (PI) seguida de citometría de flujo.
Se lavaron las células, se incubaron durante 15 minutos a 37ºC en 5 \mul de ribonucleasa A (0,6 \mug/ml, 30-60 unidades Kunitz, Sigma-Aldrich) y se enfriaron entonces en hielo. Se añadió yoduro de propidio (100 \mug/ml) antes del análisis por citometría de flujo.
Se identificaron las células T usando un anticuerpo monoclonal específico anti-CD3 (DAKO Ltd., Cambridgeshire, R.U.).
Extracción de proteína y análisis de transferencia Western
Se homogeneizaron CMLP y se extrajeron las proteínas totales en tampón A que contenía Hepes 10 mM (pH 7,9), KCl 10 mM, EDTA 0,1 mM y EGTA 0,2 mM. Se suplementó el tampón con ditiotreitol 1 mM (DTT), aprotinina 10 \mug/ml, leupeptina 10 \mug/ml y fluoruro de fenimetanosulfonilo 1 mM (todos los reactivos de Sigma-Aldrich).
Se analizó la proteína Smad7 usando un anticuerpo de conejo específico anti-Smad7 humana (dilución final 1:400, Santa Cruz Biotechnology, Inc., CA; EE.UU.). Se usaron anticuerpos de cabra anti-conejo conjugados con peroxidasa de rábano picante (Dako Ltd) a una dilución final 1:20.000 para detectar la unión de anticuerpo primario y se visualizó la inmunorreactividad con un kit de quimioluminiscencia (Pierce, Rockford, IL, EE.UU.).
Cultivo de órganos
Se cultivaron explantes mucosos tomados de especímenes quirúrgicos de pacientes en presencia o ausencia de ODN antisentido de Smad7 (SEC ID No 4, SEC ID Nº 4, SEC ID Nº 5, ambos usados a una concentración final de 10 \mug/ml) durante 40 horas.
Como control negativo, se cultivó un explante en presencia de ODN con sentido de Smad7.
Al final del cultivo, se recogieron los explantes mucosos y se usaron para analizar el número de linfocitos T de lámina propia mediante inmunohistoquímica.
Con este fin, se prepararon secciones mucosas y se tiñeron con un anticuerpo monoclonal anti-CD3 (DAKO). Se usaron anticuerpos de cabra anti-ratón conjugados con fosfatasa alcalina (DAKO) para detectar la unión de anticuerpo primaria.
Resultados
Los resultados obtenidos en los diferentes experimentos muestran cómo el TGF-\beta1 potenciaba, de modo dependiente de la dosis, la apoptosis de linfocitos T aislados del intestino de sujetos normales.
La Tabla 1 muestra el porcentaje de linfocitos T apoptóticos después de 48 horas de cultivo. Los números son los resultados de 4 experimentos separados en los que se usaron células T aisladas del intestino de cuatro sujetos normales.
TABLA 1
1
En contraposición, los linfocitos T aislados de cuatro pacientes de EII mostraron una resistencia parcial ante la señal de apoptosis inducida por TGF-\beta1, como se muestra en los resultados reproducidos en la Tabla 2, que muestran el porcentaje de linfocitos T apopotóticos después de 48 horas de cultivo.
TABLA 2
2
En particular, a partir del análisis de los datos mostrados en la Tabla 2, no se observó ningún aumento significativo de la apoptosis cuando se cultivaban células de pacientes con EII en presencia de TGF-\beta1 a concentración 0,2 ng/ml o 1 ng/ml. En contraposición, la estimulación de células T de pacientes con EII con TGF-\beta1 5 ng/ml daba como resultado un pequeño aumento de la apoptosis.
El tratamiento de linfocitos T aislados de pacientes con EII con el ODN antisentido de Smad7 SEC ID Nº 4 restauraba la sensibilidad celular ante TGF-\beta1, dando como resultado una apoptosis celular aumentada, como se muestra en los valores de porcentaje de linfocitos T reproducidos en la Tabla 3. Los datos se refieren a cuatro experimentos separados en los que se cultivaron células T del intestino de cuatro pacientes con EII con medio solo (no estimuladas) o pretratadas con medio y oligonucleótidos con sentido (control) o antisentido durante una noche, y estimuladas entonces con TGF-\beta1 (1 ng/ml).
TABLA 3
3
Además, usando cultivo de órganos ex vivo, el autor de la presente invención demostró que el tratamiento de biopsias de EII con ODN antisentido de Smad7 según la presente invención reducía significativamente el número de células T CD3+ mucosas, como se muestra en la inmunohistoquímica de la Figura 1. Esto último muestra que el tratamiento con el ODN antisentido reduce el número de células T CD3+ mucosas.
Conjuntamente, estas observaciones sugieren la posibilidad de que un alto nivel de Smad7 desempeñe un papel crucial en la prolongación de la supervivencia de células T, contribuyendo así a la propagación de la inflamación local en EII.
Por tanto, bloquear la Smad7 podría representar una estrategia prometedora para controlar la inflamación mucosa en estas afecciones.
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Ejemplo 2
Estudios in vivo e in vitro de los efectos de la administración de oligonucleótidos antisentido y con sentido de Smad7 en modelos experimentales de colitis inducida por TNBS Materiales y procedimientos
Todos los ODN antisentido y con sentido de Smad7 se sintetizaron por MWG Biotech S.r.l. (Florencia) empleando las técnicas estándar descritas anteriormente.
El ODN antisentido usado se orienta a sitios de ARNm de Smad7 que tienen un 100% de homología entre ser humano y ratón. En todos los oligonucleótidos siguientes, el engarce internucleosídico es un engarce fosforotioato. Se usaron todas las siguientes secuencias en los experimentos llevados a cabo en modelos experimentales de colitis inducida.
El ODN antisentido de Smad7 de SEC ID Nº 1 (5'-GTCGCCCCTTCTCCCCGCAGC-3') se orienta al sitio 403 de ARNm de Smad7 humana ya usado por el autor de la presente invención en el transcurso de experimentos publicados en un artículo previo (Monteleone y col., 2001).
Para el estudio adicional referente al papel de Smad7 sobre la regulación de la apoptosis de células T en CMLP aisladas del intestino de pacientes con EII, se usaron las siguientes secuencias oligonucleotídicas antisentido SEC ID Nº 4 y SEC ID Nº 5.
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-MePGTMe-dCGCCCCTTCTCCCMe-dCGCAMePG-3' (SEC ID Nº 4) se orienta al sitio 403 de ARNm de Smad7 humana. Este es un oligonucleótido de esqueleto mixto en el que la citosina perteneciente a los pares CpG en la posición 3 y 16 de la SEC ID Nº 1 se reemplazó por 5-metilcitosina (indicada como MedC). Además, los engarces metilfosfonato se dispusieron en los extremos de la molécula (indicados como MeP).
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-GTTTGGTCCTGAACATGC-3' (SEC ID Nº 5) se orienta al sitio 294 de ARNm de Smad7 humana. Los engarces internucleosídicos incluidos en la presente memoria son engarces fosforotioato.
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-GTTTGGTCCTGAACAT-3' (SEC ID Nº 6) se orienta al sitio 296 del ARNm de Smad7 humana.
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-GTTTGGTCCTGAACATG-3' (SEC ID Nº 7) se orienta al sitio 295 de ARNm de Smad7 humana.
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-AGCACCGAGTGCGTGAGC-3' (SEC ID Nº 8) se orienta al sitio 577 de ARNm de Smad7 humana.
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-MePAGCACMedCGAGTGMedCGTGAGCMeP-3' (SEC ID Nº 9) se orienta al sitio 577 de ARNm de Smad7 humana. Este es un oligonucleótido de esqueleto mixto en el que la citosina en la posición 6 y 12 de SEC ID Nº 8 se reemplazó por 5-metilcitosina. Además, los engarces metilfosfonato se dispusieron en los extremos de la molécula.
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-CGAACATGACCTCCGCAC (SEC ID Nº 10) se orienta al sitio 233 de ARNm de Smad7 humana.
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-Me-d CGA ACA TGA CCT CMe-d CG CAC-3' (SEC ID Nº 11) se orienta al sitio 233 de ARN de Smad7 humana. Este es un oligonucleótido de esqueleto mixto en el que la citosina en la posición 1 y 14 de SEC ID Nº 10 se reemplazó por 5-metilcitosina.
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-GTMedCGCCCCTTCTCCCMe-dCGCAG-3' (SEC ID Nº 12) se orienta al sitio 403 de ARMm de Smad7 humana. Este es un oligonucleótido de esqueleto mixto en el que la citosina perteneciente a los pares CpG en la posición 3 y 16 de la SEC ID Nº 1 se reemplazó por 5-metilcitosina (indicada como Me-dC).
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-GATCGTTTGGTCCTGAA-3' (SEC ID Nº 13) se orienta al sitio 299 de ARNm de Smad7 humana.
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 5'-ATCGTTTGGTCCTGAAC-3' (SEC ID Nº 14) se orienta al sitio 298 de ARNm de Smad7 humana.
La secuencia de ODN antisentido de Smad7 MePGTMe-dCGCCCCTTCTCCCMe-dCGCAMePGC (SEC ID Nº 15) se orienta al sitio 403 de ARNm de Smad7 humana. Este es un oligonucleótido de esqueleto mixto en el que la citosina perteneciente a los pares CpG en posición 3 y 16 de la SEC ID Nº 1 se reemplazó por 5-metilcitosina (indicada como MedC). Además, los engarces metilfosfonato se dispusieron en uno de los extremos de los oligonucleótidos y en el residuo de guanina en posición 20.
Inducción de colitis
Se mantuvieron ratones macho SJL/J de 5 a 6 semanas de edad en una instalación animal exenta de patógeno específico. Para la inducción de colitis, se administraron 2,5 mg de TNBS (pH 1,5-2,0; Sigma Aldrich) en etanol al 50% por el recto a ratones ligeramente anestesiados mediante un catéter de 3,5 F. Se insertó la punta del catéter 4 cm proximal al borde del ano, entonces se instilaron lentamente 100 ml de fluido (TNBS/etanol) en el colon.
Para asegurar la distribución del TNBS por todo el colon y ciego, se mantuvieron los ratones en posición vertical durante 30 segundos después de la inyección. Se administró a algunos de los ratones etanol al 50% sólo usando la misma técnica y se usaron como controles.
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Evaluación histológica de colitis
Se fijaron tejidos extirpados de los ratones a los tiempos indicados de muerte en disolución de formalina al 10% (Sigma Aldrich), se embebieron en parafina, se cortaron en secciones de tejido y se tiñeron con hematoxilina y toxina. Se examinó en las secciones teñidas la evidencia de colitis usando diferentes criterios tales como la presencia de infiltración linfocítica, alargamiento y/o distorsión de criptas, ulceración franca y engrosamiento de la pared intestinal.
Se graduó de 0 a 4 el grado de inflamación en secciones transversales microscópicas del colon del siguiente modo:
0:
sin evidencia de inflamación;
1:
bajo nivel de infiltración linfocítica observado en <10% de un campo de gran aumento (hpf= campo de gran aumento), sin cambios estructurales observados;
2:
infiltración linfocítica moderada con infiltración observada en <10-25% de un hpf, alargamiento de cripta, engrosamiento de la pared intestinal que no se extiende más allá de la capa mucosa;
3:
alto nivel de infiltración linfocítica con infiltración observada en <25-50% de un hpf, engrosamiento de la pared intestinal que se extiende más allá de la capa mucosa;
4:
grado notable de infiltración linfocítica con infiltración observada en >50% de un hpf, alta densidad vascular, alargamiento de cripta con distorsión, engrosamiento de pared intestinal transmural con ulceración.
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Aislamiento de células mononucleares de lámina propia (CMLP) y tratamiento de células con ODN antisentido de Smad7
Se aislaron células mononucleares de lámina propia (CMLP) de especímenes colónicos. Se lavaron los especímenes en primer lugar con HBSS (disolución de sal equilibrada de Hanks, Sigma-Aldrich) exenta de calcio y magnesio y se cortaron en trozos de 0,5 cm. Se incubaron entonces dos veces, cada vez durante 15 minutos en HBSS que contenía EDTA (0,37 mg/ml) y ditiotreitol (0,145 mg/ml) a 37ºC. Se digirieron entonces los tejidos en RPMI que contenía colagenasa D (400 U/ml, Boehringer Mannheim Biochemicals, Indianápolis, IN) y ADNasa I (0,01 mg/ml, Boehringer Mannheim Biochemicals, Indianápolis, IN) en un incubador agitado a 37ºC.
Se resuspendieron las CMLP liberadas del tejido en 100% de Percoll, se dispusieron bajo un gradiente de Percoll al 40% (Pharmacia Biotech AB, Uppsala, Suecia) y se centrifugaron a 1.800 rpm durante 30 minutos, obteniéndose la población enriquecida en linfocitos.
Para evaluar la eficacia in vitro del ODN antisentido de Smad7, se resuspendieron las CMLP aisladas de ratones tratados con TNBS en RPMI 1640 (Sigma-Aldrich) suplementado con un reactivo de sustitución de suero HL-1 (Biowhittaker) a una concentración final de 1 x 10^{6}/ml en placas de 24 pocillos. Para la transfección de ODN antisentido, se usaron 2 \mul de reactivo Lipofectamine 2000 (LF, Invitrogen Italia SRL, San Giuliano Milanese) por cada ml de medio de cultivo siguiendo el protocolo. Se combinaron entonces 2 \mug/ml de ODN antisentido y LF y se dejaron incubar durante 20 minutos a temperatura ambiente. Se añadió entonces directamente la mezcla obtenida a las células. Después de cultivo durante una noche, se retiraron las células de la placa y se usaron para análisis de Smad7 por transferencia Western.
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Tratamiento de ratones con ODN antisentido de Smad7
Dos días después del tratamiento con TNBS, se administraron a ratones por el recto 150 \mug de cada oligonucleótido antisentido o con sentido de Smad7. Se examinaron al menos 5 ratones por grupo. El quinto día, se sacrificaron los ratones, se tomaron muestras mucosas intestinales completas y se analizó el contenido de Smad7 y Smad3 mediante transferencia Western. Además, se evaluó el grado de inflamación mucosa intestinal.
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Extracción de proteína y análisis de transferencia Western
Se homogeneizaron tanto células mononucleares de lámina propia como especímenes colónicos enteros usando el procedimiento anterior. Se reveló entonces la expresión de Smad7 mediante transferencia Western.
Al final, se depuraron las transferencias usando una disolución comercialmente disponible (Piece) y se sondearon con anticuerpos anti-actina (Sigma-Aldrich) para verificar que la misma cantidad de proteína llenaba cada pocillo. Se realizó la detección usando un kit de quimioluminiscencia (Pierce). Se analizó la intensidad de las bandas mediante un densitómetro.
Se analizó también tanto en las proteínas de muestras de CLMP como de especímenes colónicos enteros el contenido de proteína Smad3 fosforilada y total mediante transferencia Western usando anticuerpos comercialmente disponibles (Santa Cruz).
Para el análisis de Smad3 fosforilado, se usaron un anticuerpo de conejo anti-humano específico de Smad3 capaz de reconocer proteínas Smad2/3 fosforiladas como antígeno (dilución final 1:500) y un anticuerpo de cabra anti-conejo conjugado con peroxidasa de rábano picante (dilución 1:20.000). Se visualizó la inmunorreactividad con un kit de quimioluminiscencia (Pierce).
Después de la detección se depuraron las transferencias usando una disolución comercialmente disponible (Pierce) y se incubaron con un anticuerpo de cabra anti-humano específico de Smad3 humana (dilución final 1:500) seguido de un anticuerpo de conejo anti-cabra conjugado con peroxidasa de rábano picante (dilución 1:20.000); se visualizó entonces la inmunorreactividad con el kit de quimioluminiscencia anteriormente mencionado (Pierce).
Ensayo ELISA
Se determinó la cantidad de TGF-\beta1 activo en las muestras de mucosa intestinal. Con este objetivo, se extrajeron las proteínas totales de muestras de mucosa de ratones con o sin colitis inducida por TNBS como se indica anteriormente. Se analizaron los niveles de TGF-\beta1 activo usando un kit ELISA comercialmente disponible (R&D Systems, Space Import-Export Srl, Milán). Se midió la densidad óptica en un lector ELISA Dynatech MR 5000 a una longitud de onda de 490 nm. Se expresaron los datos como pg/100 \mug de proteínas totales.
Resultados
Después de recibir TNBS, los ratones desarrollaron diarrea y pérdida de peso como evidencia de la inducción de colitis. El colon estaba macroscópicamente agrandado y el análisis histológico de su mucosa mostró lesiones inflamatorias de moderadas a graves.
Para examinar si la inducción de colitis por TNBS estaba asociada a cambios en la producción de TGF-\beta1, se tomaron especímenes colónicos de ratones con o sin colitis y se analizó el contenido de TGF-\beta1 activo mediante ELISA.
Como varios tipos celulares que tienen el potencial de sintetizar TGF-\beta1 están presentes al nivel intestinal, se usó para la evaluación toda la mucosa intestinal en lugar de CMLP solas.
En ausencia de colitis, se detectaron bajos niveles de TGF-\beta1 activo (85\pm12 y 94\pm26 pg/\mug de proteína total en ratones no estimulados y de control respectivamente). Se midieron niveles significativamente potenciados de TGF-\beta1 en muestras mucosas de ratones con colitis inducida por TNBS (985\pm120 pg/\mug de proteína total) (p<0,01). Aunque este resultado parece sugerir que durante la colitis inducida por TNBS podría haber una actividad creciente de TGF-\beta1, el análisis de los niveles intracelulares de Smad3 activa en CMLP intestinales aisladas de ratones con colitis exhibe sorprendentemente una fosforilación reducida de Smad3, que está asociada a una inducción potenciada de Smad7 (Figura 2 y 3). En particular, la figura 2 ilustra la presencia de una banda correspondiente a Smad2/3 activa (fosforilada) en CMLP aislada de intestino no afectado, pero no de ratones con colitis inducida por TNBS. En la figura 3, se ha mostrado que las dos bandas, la banda inferior de 47 kDa correspondiente a la Smad7 libre y la banda superior de 102 kDa correspondiente al complejo TGF-\beta1 R1-Smad7, están presentes sólo en especímenes de CMLP aislados del intestino de ratones con colitis inducida por TNBS. Estos datos indican que la inflamación local estimula la síntesis de TGF-\beta1, que sin embargo no es capaz de suprimir la inflamación mucosa.
Según la presente invención, se ha evaluado si tratar ratones TNBS con ODN antisentido de Smad7 podría restaurar la función de TGF-\beta1 endógeno y limitar la inflamación continua.
En primer lugar, se ha ensayado la eficacia del ODN antisentido de Smad7 anteriormente mencionado (SEC ID Nº 1 y SEC ID Nº 4-15) para reducir la expresión de Smad7 en experimentos tanto in vitro como in vivo.
Con respecto a los experimentos in vitro, se transfectaron las CMLP aisladas del intestino de ratones con colitis inducida por TNBS con cada uno de los ODN antisentido de Smad7 y se incubaron durante una noche. Se llevó a cabo el análisis de Smad7 mediante transferencia Western.
Con respecto a los experimentos in vivo, se administraron a ratones tratados con TNBS ODN antisentido de Smad7 y después de 3 días se sacrificaron los animales, se tomaron especímenes de tejido y se llevó a cabo el análisis de Smad7 mediante transferencia Western.
La Tabla 4 resume los resultados de estos experimentos y muestra el porcentaje de inhibición obtenido por cada oligonucleótido antisentido de Smad7 en experimentos tanto in vitro como in vivo. Los datos indican media \pm error estándar (EE) de cuatro experimentos in vitro separados y media \pm EE de cinco experimentos in vivo separados.
TABLA 4
4
Todos los ODN antisentido eran eficaces en la reducción de la expresión de Smad7 cuando se transfectaron in vitro en CMLP aisladas de modelos de murino tratados con TNBS. A partir del análisis del valor del porcentaje de inhibición mostrado en la Tabla 4, es notable que las secuencias oligonucleotídicas antisentido SEC ID Nº 4, 10, 11, 12 y 15 mostraron la mayor eficacia.
No obstante, el porcentaje de inhibición de la expresión de Smad7 obtenido mediante el tratamiento in vivo con las secuencias oligonucleotídicas SEC ID Nº 10 y 11 no difería significativamente del documentado en experimentos in vitro.
En cambio, el tratamiento con ODN antisentido de SEC ID Nº 4 y 12 y 15 dio como resultado claramente un mayor porcentaje de inhibición de Smad7 que el obtenido en experimentos in vitro, es decir, 55% frente a 34%, 42% frente a 32% y 56% frente a 34% respectivamente (P<0,01).
En contraposición, el tratamiento de ratones con oligonucleótido antisentido de SEC ID Nº 7 causó una reducción de la expresión de Smad7 in vivo que era de menor entidad que la resultante cuando se transfectó el oligonucleótido antisentido en CMLP in vitro, es decir, 10% frente a 17%, P<0,01.
En total, estos resultados sugieren que sólo la modulación específica en una secuencia de ODN antisentido de Smad7 es capaz de mejorar su perfil farmacocinético, bioquímico y biofísico.
No se documentó señal alguna de toxicidad aguda en ratones que recibían oligonucleótidos antisentido (SEC ID Nº 1 y SEC ID Nº 4-15). Uno de cada 5 tratados con TNBS murió después de 3 días (20%). De forma similar, 1/5 de los ratones que recibían el oligonucleótido antisentido de Smad7 murió después de 4 días.
No se documentó mortalidad en el grupo de ratones tratado con ODN antisentido de Smad7 de SEC ID Nº 1 y SEC ID Nº 4-15.
El uso de secuencias de ODN antisentido de SEC ID Nº 13 y SEC ID Nº 14 está asociado a una actividad de inhibición in vitro razonable (11% y 9,5%, respectivamente). No obstante, la administración in vivo de dichas secuencias estaba inesperadamente unida a un marcado empeoramiento de la colitis, hasta causar la muerte de todos los ratones después de 72 horas de tratamiento.
El análisis macroscópico de las muestras intestinales tomadas de estos ratones ha revelado la presencia de una colitis grave y ésta estaba asociada a un aumento sustancial de la expresión de Smad7 intestinal.
Como se dice anteriormente, se ensayó la eficacia de ODN antisentido de Smad7 para limitar la inflamación continua. Con este fin, se administraron a ratones después de la inducción de colitis oligonucleótidos antisentido de SEC ID Nº 1, 4, 5 y 15, considerando 5 animales por cada grupo.
Siguiendo el tratamiento con ODN antisentido de Smad7, se ha revelado una reducción de la inflamación mucosa. Este resultado era particularmente evidente en ratones tratados con los oligonucleótidos antisentido 4 y 15. Es más, la gravedad de la colitis de grado 3-4 en ratones con colitis que no reciben antisentido alcanzó el grado 2 ó 3 después de la administración de las secuencias oligonucleotídicas antisentido 1 ó 5 respectivamente, mientras que en ratones tratados con las secuencias oligonucleotídicas 4 ó 15, la inflamación no ha superado el grado 1.
Para examinar si los oligonucleótidos antisentido de Smad7 eran eficaces también cuando se administraban por vía oral, se trataron ratones con colitis inducida por TNBS el día después de la inducción de colitis con los oligonucleótidos antisentido de Smad7 4 ó 15 o de control (con sentido).
Con este fin, se resuspendieron oligonucleótidos en una disolución de bicarbonato. El volumen final de disolución administrada a cada ratón fue de 350 \mul y contiene dosis de oligonucleótido equivalentes a 250, 500 ó 1000 \mug. Se administró dicha disolución por vía oral a través de un catéter.
El quinto día, se sacrificaron los ratones y se evaluaron el análisis de la expresión de Smad7 y del grado de inflamación como se indica en los párrafos anteriores. Todos los ratones tratados con oligonucleótido antisentido, y no con el oligonucleótido con sentido de control, mostraron una reducción significativa de la expresión de Smad7 y una fosforilación aumentada de Smad3 independientemente de la dosis de oligonucleótido que se esté usando.
Se asoció sustancialmente la inhibición de Smad7 a una recuperación de peso, como se muestra en la Figura 4. La Figura 4 exhibe una gráfica que muestra el cambio de porcentaje de peso de los ratones con colitis inducida por TNBS tratada o no tratada con oligonucleótido antisentido de Smad7 (SEC ID Nº 15) o de control (con sentido). Se administraron ambos oligonucleótidos por vía oral a una dosis de 250 \mug a través de catéter dos días después de la inducción de colitis. La pérdida de peso documentable el segundo día en cada uno de los tres grupos indica que el tratamiento con TNBS inducía la colitis. Se probó adicionalmente que, a partir del cuarto día, los ratones tratados con oligonucleótido antisentido de Smad7, pero no con el control, mostraban una recuperación del peso corporal. La recuperación aparente y ligera mostrada el quinto día en ratones con colitis inducida por TNBS es debida al hecho de que el 21,4% de los ratones con colitis murieron el 4º día y por lo tanto no se consideraron en la evaluación del peso corporal del 5º día.
Se correlacionó la inhibición de Smad7 con una notable supresión de la inflamación tisular como se muestra en las Figuras 5 y 6. La Figura 5 exhibe las imágenes de colon extraído de un ratón con colitis por TNBS y de un ratón con colitis por TNBS tratada con oligonucleótidos antisentido de Smad7 (SEC ID Nº 15). Se administró el oligonucleótido por vía oral a una dosis de 250 \mug mediante un catéter el segundo día después de la inducción de colitis. Se ha mostrado que el colon de ratón con colitis por TNBS está altamente inflamado, acortado y engrosado. Por el contrario, el ratón que recibe antisentido de Smad7 muestra un colon de longitud y grosor normales y sin señales macroscópicas de flogosis. La Figura 6 exhibe el aspecto histológico de una sección de colon de un ratón sin colitis o de ratones con colitis por TNBS tratada o no tratada con oligonucleótido antisentido de Smad7 (SEC ID Nº 15) o de control (con sentido). Se administraron ambos oligonucleótidos por vía oral a una dosis de 250 \mug mediante catéter el segundo día después de la inducción de colitis. Se ha mostrado que, en ratones sin colitis, las glándulas parecen rectilíneas y uniformes con un contenido normal de células mucíparas y elementos inflamatorios de lámina propia. Por el contrario, en el colon de ratones tratados con TNBS que reciben o no el oligonucleótido de control, había una destrucción total de la estructura glandular, con una masiva infiltración de células mucíparas e inflamatorias en la lámina propia. En la sección cólica de los ratones tratados con TNBS y que reciben oligonucleótido antisentido de Smad7, se demostró la presencia de una estructura glandular normal y la ausencia de flogosis.
Conjuntamente, estas observaciones sugieren que el uso de ODN antisentido, que muestra la mayor eficacia de inhibición de Smad7 acompañado por la ausencia de efectos secundarios después de administración in vivo, puede representar una estrategia terapéutica prometedora en el control de la inflamación mucosa durante EII, especialmente si dichas características de eficacia y toxicidad se comparaban con los resultados conseguidos con otras secuencias de ODN antisentido con la misma eficacia en la inhibición in vitro de Smad7.
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<223> Oligonucleótido antisentido fosforotioato orientado al sitio 296 de ARNm de Smad7 humana
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (1)..(16)
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<400> 6
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gtttggtcct gaacat
\hfill
16
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<210> 7
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<211> 17
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido antisentido fosforotioato orientado al sitio 295 de ARNm de Smad7 humana
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (1)..(17)
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<400> 7
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gtttggtcct gaacatg
\hfill
17
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<210> 8
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<211> 18
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido antisentido fosforotioato orientado al sitio 577 de ARNm de Smad7 humana
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
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<222> (1)..(18)
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<400> 8
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agcaccgagt gcgtgagc
\hfill
18
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<210> 9
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<211> 18
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido antisentido fosforotioato modificado orientado al sitio 577 de ARNm de Smad7 humana
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (1)..(1)
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<223> "n": metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina
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<220>
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<222> (1)..(1)
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<223> metilfosfornato de 2'-desoxiguanosina
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<220>
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<220>
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<222> (6)..(6)
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<223> "n": 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina
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<220>
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<222> (12)..(12)
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<223> m5c
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<222> (18)..(18)
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<223> "n": metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina
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<221> modified_base
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<222> (18)..(18)
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<223> metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina
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18
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<211> 18
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido antisentido fosforotioato orientado al sitio 233 de ARNm de Smad7 humana
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<220>
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\hfill
18
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<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido antisentido fosforotioato modificado orientado al sitio 233 de ARNm de Smad7
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<222> (1)..(1)
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<222> (14)..(14)
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<223> "n": 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina
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<220>
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<222> (14)..(14)
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<223> m5c
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ngaacatgc ctcngcac
\hfill
18
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<220>
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<223> Oligonucleótido antisentido fosforotioato modificado orientado al sitio 403 de ARNm de Smad7 humana
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<220>
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<221> misc_feature
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<222> (3)..(3)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> "n": 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> modified_base
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<222> (3)..(3)
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<223> m5c
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
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<222> (16)..(16)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> "n": 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina
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<222> (16)..(16)
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<223> m5c
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gtngcccctt ctcccngcag
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20
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<210> 13
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<211> 17
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido antisentido fosforotioato orientado al sitio 299 de ARNm de Smad7 humana
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
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<222> (1)..(17)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
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gatcgtttgg tcctgaa
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17
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<210> 14
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<212> ADN
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<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido antisentido fosforotioato orientado al sitio 298 de ARNm de Smad7 humana
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<221> misc_feature
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<222> (1)..(17)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
atcgtttggt cctgaac
\hfill
17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Oligonucleótido antisentido fosforotioato modificado orientado el sitio 403 de ARNm de Smad7 humana
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> "n": metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> modified_base
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<222> (1)..(1)
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<223> Metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)..(3)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> "n": 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> modified_base
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)..(3)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> m5c
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
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<222> (16)..(16)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> "n": 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
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<222> (16)..(16)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> m5c
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
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<222> (20)..(20)
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<223> "n": metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> modified_base
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (20)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ntngcccctt ctcccngcan c
\hfill
21

Claims (15)

1. Oligonucleótidos antisentido fosforotioato contra Smad7 de hasta 21 nucleótidos de longitud, que comprenden la siguiente secuencia (SEC ID Nº 2):
5'-GTXYCCCCTTCTCCCXYCAG-3'
en la que X es un nucleótido que comprende una base nitrogenada seleccionada del grupo constituido por citosina, 5-metilcitosina y 2'-O-metilcitosina, y en la que Y es un nucleótido que comprende una base nitrogenada seleccionada del grupo constituido por guanina, 5-metilguanina y 2'-O-metilguanina, a condición de que al menos uno de los nucleótidos X o Y comprenda una base nitrogenada metilada.
2. Oligonucleótidos antisentido según la reivindicación 1, en los que al menos un oligonucleótido de la secuencia está metilfosfonatado.
3. Oligonucleótidos antisentido según la reivindicación 2, en los que dicho al menos un nucleótido metilfosfonato está dispuesto en sólo uno de los extremos 3' o 5' o en ambos extremos 3' y 5' o a lo largo de la secuencia oligonucleotídica antisentido.
4. Oligonucleótidos antisentido según la reivindicación 2, en los que el nucleótido metilfosfonato es Y.
5. Oligonucleótidos antisentido según la reivindicación 2, en los que el nucleótido metilfosfonato es X.
6. Oligonucleótidos antisentido según la reivindicación 1, en los que al menos un nucleótido de la secuencia es un 5'-monofosfato de 2'-O-metilrribonucleótido.
7. Oligonucleótidos antisentido según la reivindicación 6, en los que dicho al menos un 5'-monofosfato de 2'-O-metilrribonucleótido está dispuesto en sólo uno de los extremos 3' o 5' o en ambos extremos 3' y 5' o a lo largo de la secuencia oligonucleotídica.
8. Oligonucleótidos antisentido según cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en los que los 2'-desoxinucleótidos están reemplazados por los correspondientes ribonucleótidos.
9. Oligonucleótidos antisentido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 que tienen secuencia (SEC ID Nº 4):
5'-ZTXGCCCCTTCTCCCXGCAZ-3'
en la que X es 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina y Z es metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina.
10. Oligonucleótidos antisentido según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 que tienen secuencia (SEC ID Nº 5):
5'-ZTXGCCCCTTCTCCCXGCAZC-3'
en la que X es 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina y Z es metilfosfonato de 2'-desoxiguanosina.
11. Oligonucleótidos antisentido según la reivindicación 1 que tienen secuencia (SEC ID Nº 3):
5'-GTXGCCCCTTCTCCCXGCAG-3'
en la que X es 5'-monofosfato de 5-metil-2'-desoxicitidina.
12. Oligonucleótidos antisentido como se definen en las reivindicaciones 1 a 11 para uso en el campo médico.
13. Composición farmacéutica que comprende al menos uno de los oligonucleótidos antisentido como se definen en las reivindicaciones 1 a 11 como principio activo, junto con uno o más coadyuvantes y/o excipientes farmacéuticamente aceptables.
14. Uso de los oligonucleótidos antisentido como se definen en las reivindicaciones 1 a 11 para la preparación de un medicamento para el tratamiento de las patologías asociadas a la expresión de Smad7 que son enfermedades inflamatorias crónicas.
15. Uso según la reivindicación 14, en el que las enfermedades inflamatorias crónicas son enfermedades inflamatorias intestinales tales como enfermedad de Crohn y colitis ulcerosa.
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