ES2237764T3 - Control de la expresion genica en plantas por transactivacion mediada por un receptor en presencia de un ligando quimico. - Google Patents
Control de la expresion genica en plantas por transactivacion mediada por un receptor en presencia de un ligando quimico.Info
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION DESCRIBE UN METODO PARA CONTROLAR LA EXPRESION GENICA EN PLANTAS. ESPECIFICAMENTE, EL METODO COMPRENDE LA OBTENCION DE UNA PLANTA TRANSGENICA QUE CONTENGA, AL MENOS, DOS CASSETTES PARA EXPRESION DEL RECEPTOR Y UN CASSETTE PARA EXPRESION DE LA DIANA. EL PRIMER CASSETTE PARA EXPRESION DEL RECEPTOR CONTIENE UNA SECUENCIA NUCLEOTIDICA PARA UNA REGION REGULADORA 5'' UNIDA DE FORMA OPERATIVA A UNA SECUENCIA NUCELOTIDICA QUE CODIFICA PARA UN PRIMER POLIPEPTIDO RECEPTOR, Y UNA REGION 3'' DE TERMINACION. EL SEGUNDO CASSETTE PARA EXPRESION DEL RECEPTOR CONTIENE UNA SECUENCIA NUCLEOTIDICA PARA UNA REGION REGULADORA 5'' UNIDA DE FORMA OPERATIVA A UNA SECUENCIA NUCLEOTIDICA QUE CODIFICA PARA UN SEGUNDO POLIPEPTIDO RECEPTOR, Y UNA REGION 3'' DE TERMINACION. EL CASSETTE PARA EXPRESION DE LA DIANA COMPRENDE UNA SECUENCIA NUCLEOTIDICA PARA UNA REGION REGULADORA 5'' UNIDA DE FORMA OPERATIVA A UNA SECUENCIA NUCLEOTIDICA QUE CODIFICA PARA UN POLIPEPTIDO DIANA, Y UNA REGION 3'' DE TERMINACION, EN EL QUE LA REGION REGULADORA 5'' DE DICHO CASSETTE PARA EXPRESION DE LA DIANA ESTA ACTIVADA POR LOS YA MENCIONADOS PRIMERO Y SEGUNDO POLIPEPTIDOS RECEPTORES, EN PRESENCIA DE UNO O MAS LIGANDOS QUIMICOS COMPLEMENTARIOS AL DOMINIO DE UNION A LIGANDO DE DICHOS POLIPEPTIDOS RECEPTORES, MEDIANTE LO CUAL SE LLEVA A CABO LA EXPRESION DE DICHO POLIPEPTIDO DIANA. EL METODO ES UTIL PASA CONTROLAR ALGUNAS CARACTERISTICAS DE IMPORTANCIA EN AGRONOMIA, COMO ES LA FERTILIDAD DE LA PLANTA.
Description
Control de la expresión génica en plantas por
transactivación mediada por un receptor en presencia de un ligando
químico.
La presente invención se refiere al control
químico de la expresión génica en las plantas. En particular, se
refiere a un método por el cual polipéptidos receptores en presencia
de un ligando químico adecuado regulan la expresión de un
polipéptido diana en una célula vegetal, así como también a los
casetes de expresión que codifican los polipéptidos diana y receptor
y a las plantas transgénicas que contienen los casetes de
expresión.
En algunos casos, es deseable controlar el tiempo
o el grado de expresión de un rasgo fenotípico en plantas, en
células vegetales o en tejidos vegetales. Una situación ideal sería
la regulación de la expresión de tal rasgo a voluntad, provocada
mediante una sustancia química que se podría aplicar fácilmente en
las cosechas de campo, en los arbustos ornamentales, etc. Un sistema
como éste para regular la expresión génica, que se podría utilizar
para conseguir esta situación ideal, que no se sabe todavía que se
encuentre de manera natural en las plantas, es la superfamilia de
los receptores nucleares de las hormonas esteroideas y
tiroideas.
La superfamilia de los receptores nucleares de
las hormonas esteroideas y tiroideas se encuentra en los mamíferos y
en los insectos, y se compone de unas 100 proteínas conocidas. Estos
receptores se clasifican en al menos dos categorías funcionalmente
distintas, conocidas como clase I y clase II [Beato, Cell 56:
335-344 (1989); Parker, Sem. Cancer Biol.
Ser. 1: 81-87 (1990)]. De las dos clases, sólo
los receptores de la clase II funcionan en el núcleo como
heterodímeros para afectar la expresión de los genes diana en
presencia de la hormona. Los ejemplos mejor estudiados de proteínas
receptoras de clase II son el receptor del ácido retinoico (RAR), el
receptor de la vitamina D (VDR), el receptor de la hormona tiroidea
(T_{3}R) y el receptor X retinoide (RXR). Los receptores se unen a
la región reguladora 5' del gen diana y, tras unirse un ligando
químico al receptor, el dominio de activación transcripcional
(transactivación) del receptor afecta la expresión génica al
interactuar con otros factores de iniciación de la
transcripción.
Además de las proteínas receptoras de la clase II
presentes en los mamíferos, como se describió arriba, se han
identificado receptores de estructura y de actividad similares en el
insecto Drosophila. [Koelle et al., Cell 67: 59
(1991); Christianson and Kafatos, Biochem. Biophys. Res.
Comm. 193: 131B (1993); Henrich et al., Nucleic Acid
Res. 18: 4143 (1990)]. El receptor de la ecdisona (EcR) se une a
la hormona esteroidea 20-hidroxiecdisona y, cuando
heterodimeriza con el producto del gen Ultraespiráculo
(Ultraspiracle, USP), transactivará la expresión génica. USP
es más homólogo a RXR\alpha, y RXR es capaz de formar
heterodímeros con EcR [Thomas et al., Nature 362:
471-475 (1993)]. También se unirán a estos
receptores y causarán la transactivación de un gen diana otros
ligandos químicos además de la 20-hidroxiecdisona
como, por ejemplo, otros agonistas o antagonistas de la hormona.
Se ha demostrado que un miembro de la
superfamilia de los receptores nucleares esteroideos y tiroideos, el
receptor de glucocorticoides (GR) de clase I que utiliza
chaperoninas y que no funciona heterodimerizándose con otros
receptores, transactiva un gen diana en las células vegetales
[Schena et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:
10421-10425 (1991)]. Se fusionó un fragmento que
contenía el dominio de unión a ligando del GR con la proteína
reguladora de antocianinas conocida como "R" y se mostró que
estimulaba la producción de antocianinas en una Arabidopsis
thaliana transgénica en respuesta a la aplicación del ligando
químico adecuado [Lloyd et al., Science 226: 436
(1994)]. Lloyd et al. describieron también que el GR completo
no activaba la expresión del gen en una Arabidopsis thaliana
transformada de forma estable, mientras que sí lo hacía en los
ensayos transitorios con protoplastos de tabaco. Además, las
fusiones de R con un fragmento del receptor de estrógenos (RE), otro
receptor de la clase I que utiliza chaperoninas, también estimulaba
la producción de antocianinas en presencia del ligando químico
adecuado, pero mostraron una expresión de fondo
"considerable".
La característica diferenciadora de las proteínas
receptoras de clase II, la transactivación de un gen diana mediante
receptores heterodimerizados en presencia de un ligando químico
adecuado, ofrecen unas oportunidades hasta ahora desconocidas para
controlar químicamente la expresión génica en las plantas. El uso de
heterodímeros permite un margen más amplio de estrategias de control
génico, y ya se conocen productos químicos usados en la agricultura
que pueden desencadenar la transactivación, mediada por el receptor,
de la expresión de un gen diana de esta clase. Además, las
estrategias de control génico en las plantas que utilizan receptores
nucleares que no se producen de manera natural en las plantas
presentan la atrayente característica de inducir sólo el gen diana
manipulado genéticamente. Sin embargo, los receptores de la clase
II, en general, poseen unos dominios de activación transcripcional
francamente malos y la capacidad de los receptores para transactivar
los genes diana se puede potenciar añadiendo otros dominios de
activación transcripcional, en concreto de plantas o de especies
víricas. Se necesitarán modificaciones adiconales para proporcionar
una actividad basal mínima que aumente rápidamente hasta unos
niveles elevados en presencia de una substancia química
desencadenante. Tal como se ha demostrado mediante la presente
invención, se han desarrollado unos polipéptidos receptores basados
en el modelo de la clase II y los genes que los codifican, que
funcionan en las células vegetales para controlar la expresión de un
polipéptido diana, en el que los polipéptidos receptores activan la
región reguladora 5' de un casete de expresión diana en presencia de
un ligando químico. Este método para controlar la expresión génica
en las plantas sirve para controlar varios rasgos de importancia
agronómica, como la fertilidad de la planta.
La WO93/09237 describe plantas mejoradas de maíz
superdulce que tienen sus genes naturales
sh-2 o bt-2, así como
también un gen regulado por ADP-GDP bajo el control
de un promotor heterólogo. El promotor heterólogo utilizado para
transcribir el gen SH-2 o
Bt-2 puede ser un promotor inducible, como
por ejemplo un promotor sensible a esteroides. Se describen las
construcciones que comprenden un promotor inducible por el complejo
binario de la proteína que une 20-hidroxiecdisona
operativamente unido a los genes Sh-2 o
Bt-2 y un terminador transcripcional.
La WO93/23431 describe proteínas receptoras de
hormonas esteroides modificadas y los métodos para su uso, así como
también un interruptor molecular. El interruptor molecular consta de
un receptor de esteroides modificado, que incluye en dicho receptor
un dominio de unión al DNA del receptor de esteroides natural ligado
a un dominio de unión a ligando modificado. Se puede usar el
interruptor molecular para regular la expresión en una terapia
génica.
La EP 0589841 describe un método para producir
plantas estériles macho, que sirven para producir semillas híbridas.
Se cruza una primera planta, transformada con un casete de expresión
que comprende una secuencia nucleotídica que codifica un promotor
específico de anteras unido operativamente a una secuencia
nucleotídica que codifica un transactivador, con una segunda planta
transformada con un casete de expresión que comprende una secuencia
nucleotídica (que es capaz de mediar la interrupción de la formación
de un polen viable) bajo el control de una secuencia capaz de ser
activada mediante el transactivador.
Con la presente invención se delinea un método
para controlar la expresión génica en las plantas. Específicamente,
el método comprende transformar una planta con al menos dos casetes
de expresión de receptor y al menos un casete de expresión diana. El
primer casete de expresión de receptor comprende una secuencia
nucleotídica de una región reguladora 5' unida operativamente a una
región terminadora 3'. El segundo casete de expresión de receptor
comprende una secuencia nucleotídica de una región reguladora 5'
unida operativamente a una secuencia nucleotídica que codifica un
segundo polipéptido receptor unido operativamente a una región
terminadora 3'. Los polipéptidos receptores primero y segundo
comprenden un primer y segundo dominio de unión a ligando,
respectivamente, que son distintos entre sí. El casete de expresión
diana comprende una secuencia nucleotídica de una región reguladora
5' unida operativamente a una secuencia nucleotídica que codifica un
polipéptido diana unido operativamente a una región terminadora 3',
en el que la región reguladora 5' de dicho casete de expresión diana
se activa mediante los mencionados primero y segundo polipéptidos
receptores en presencia de uno o más ligandos químicos, gracias a lo
cual se lleva a cabo la expresión de dicho polipéptido diana. El
método es útil para controlar varios rasgos de importancia
agronómica, tal como la fertilidad de la planta.
Además, la invención delinea las plantas
transgénicas que comprenden un primer y segundo casete de expresión
de receptor y un casete de expresión diana, y en la presente memoria
se describen tales casetes de expresión de receptor y los casetes
diana del receptor, capaces de una elevada expresión en las
plantas.
Los polipéptidos del receptor comprenden un
dominio de unión a ligando, un dominio de unión al DNA y un dominio
de transactivación. Además, los polipéptidos receptores pueden tener
forma quimérica, donde uno o más dominios de unión a ligando, de
unión al DNA o de transactivación se obtienen de una fuente
heteróloga en relación con otros dominios presentes en el
polipéptido receptor quimérico.
Figura 1. Representación gráfica de una célula
vegetal que comprende un primer casete de expresión de receptor que
codifica un primer polipéptido receptor que comprende un primer
dominio de unión a ligando, y de un segundo casete de expresión de
receptor que codifica un segundo polipéptido receptor que comprende
un segundo dominio de unión al ligando. El primer y el segundo
polipéptidos receptores son distintos entre sí. Además, la célula
vegetal comprende un casete de expresión diana que codifica un
polipéptido diana, en el que el polipéptido diana se expresa tras
activarse la región reguladora 5' del casete de expresión diana que
comprende un promotor con un elemento sensible (RE) al primer y al
segundo polipéptidos receptores en presencia de un ligando químico
que es complementario a dicho primer o segundo dominio de unión a
ligando.
Figura 2. Representación gráfica de una
realización específica de la célula vegetal de la figura 1, en la
que el primer polipéptido receptor es el receptor de la ecdisona
(EcR), el segundo polipéptido receptor es ultraespiráculo (USP), la
región reguladora 5' del casete de expresión diana comprende un
elemento de respuesta al receptor de la ecdisona (EcRE), y el
ligando químico es la tebufenocida.
Figura 3. Representación gráfica de una
realización específica de la célula vegetal de la figura 1, en la
que el primer polipéptido receptor es una fusión
GAL4-EcR, el segundo polipéptido receptor es una
fusión USP-VP16, la región reguladora 5' del casete
de expresión diana comprende un elemento de respuesta a GAL4
(GAL4RE) y el ligando químico es la tebufenocida.
"Polipéptido receptor" tal como se usa en la
presente memoria se refiere a los polipéptidos que activan la
expresión de un polipéptido diana en respuesta a la aplicación de
ligando químico. El polipéptido receptor consta un dominio de unión
al ligando, de un dominio de unión al DNA y de un dominio de
transactivación. Un "casete de expresión de receptor" comprende
una secuencia nucleotídica de una región reguladora 5' unida
operativamente a una secuencia nucleotídica que codifica un
polipéptido receptor y una región terminadora 3' que no se traduce
(codón de parada y secuencia de poliadenilación).
El dominio de unión al ligando incluye una
secuencia de aminoácidos cuya estructura se une de manera no
covalente a un ligando químico complementario. Por lo tanto, un
dominio de unión al ligando y su ligando químico forman un par de
unión complementario.
El dominio de unión al DNA comprende una
secuencia de aminoácidos que se une de manera no covalente a una
secuencia nucleotídica específica, que se conoce como elemento de
respuesta (RE). Los elementos de respuesta se ubican en la región
reguladora 5' del casete de expresión diana y comprenden un par de
semisitios, teniendo cada semisitio un núcleo de 6 pares de base
donde un sólo dominio de unión al DNA reconoce un sólo semisitio.
Los semisitios se disponen en una orientación relativamente lineal
los unos a los otros, bien como repeticiones directas, repeticiones
palindrómicas o repeticiones invertidas. Un elemento de respuesta se
une bien a un homodímero o a un heterodímero de polipéptidos
receptores. La secuencia nucleotídica y la orientación lineal de los
semisitios determina qué dominio o dominios de unión al DNA formarán
un par de unión complementario con dicho elemento de respuesta, así
como también la capacidad de los polipéptidos receptores para
interactuar entre sí en un dímero.
El dominio de transactivación comprende una o más
secuencias de aminoácidos que actúan como unos subdominios que
afectan a la operación de los factores de transcripción durante la
preiniciación y el ensamblaje en la caja TATA. El efecto del dominio
de transactivación es permitir iniciar la transcripción repetidas
veces, lo que conduce a unos mayores niveles de expresión
génica.
Un "resto" se refiere a esta parte o porción
de un polipéptido receptor que se obtiene de la fuente mencionada.
Por ejemplo, "resto de EcR" se refiere a la porción del
polipéptido receptor que se obtuvo del receptor de la ecdisona
nativo. El término resto, tal como se usa aquí, puede comprender uno
o más dominios.
"Homólogo" se utiliza para indicar que un
polipéptido receptor tiene el mismo origen natural con respecto a su
hospedador actual. Por ejemplo, el receptor de la ecdisona (EcR) se
encuentra en determinadas especies de insectos y se dice que es
homólogo con respecto a las especies de insectos en las que se
origina. "Homólogo" también se usa para indicar que uno o más
de los dominios presentes en un polipéptido del receptor tienen el
mismo origen natural el uno respecto al otro. Por ejemplo, se
considera que el dominio de unión al DNA y el dominio de unión a
ligando de EcR tienen un origen homólogo el uno respecto al
otro.
"Heterólogo" se utiliza para indicar que un
polipéptido receptor tiene un origen natural distinto con respecto a
su hospedador actual. Por ejemplo, si el receptor de la ecdisona
(EcR) de una especie de insecto se expresa en una célula vegetal,
entonces el EcR se describe como heterólogo respecto a su hospedador
actual, que es la célula vegetal. También se usa "heterólogo"
para indicar que uno o más de los dominios presentes en un
polipéptido receptor difieren en su origen natural con respecto al
otro dominio presente. Por ejemplo, si se fusiona el dominio de
transactivación de la proteína VP16 del herpes simple con el
receptor USP de Drosophila, entonces el dominio de
transactivación de VP16 es heterólogo con respecto al resto de USP.
Además, si se fusiona un dominio de USP con un dominio de RXR para
fabricar un receptor funcional, entonces la fusión quimérica tendría
unos dominios que serían heterólogos el uno respecto al otro.
Además, cuando se expresara en una planta, un polipéptido receptor
heterólogo que comprenda la fusión de un dominio de transactivación
de VP16 y de un resto de USP también se consideraría heterólogo con
respecto al hospedador vegetal.
El término "quimérico" se utiliza para
indicar que el polipéptido receptor se compone de unos dominios, de
los cuales al menos uno tiene un origen que es heterólogo con
respecto a los otros dominios presentes. Estos polipéptidos
receptores quiméricos los codifican secuencias nucleotídicas que se
han fusionado o ligando juntas, lo que da lugar a una secuencia
codificante que no se encuentra en la naturaleza.
Los polipéptidos receptores quiméricos de la
presente invención se nombran mediante una nomenclatura lineal desde
el extremo amino al carboxilo del polipéptido. Utilizando esta
nomenclatura, se designaría como VP16-USP a un
polipéptido receptor quimérico que tuviera el dominio de
transactivación de VP16 fusionado al extremo amino del receptor USP.
Recíprocamente, si se fusionara VP16 al extremo carboxilo del
receptor USP, el polipéptido receptor quimérico se nombraría como
USP-VP16.
Las construcciones génicas se nombran en términos
de una región reguladora 5' y su secuencia codificante unida
operativamente, donde la región reguladora 5' se designa antes de
una barra inclinada (/) y la secuencia codificante se nombra después
de la barra inclinada. Por ejemplo, la construcción génica
35S/USP-VP16 designa el promotor 35S del virus del
mosaico de la coliflor (CaMV) fusionado con el receptor quimérico
USP-VP16, donde el dominio de transactivación de
VP16 se fusiona con el extremo carboxilo de USP.
Un "casete de expresión diana" comprende una
secuencia nucleotídica de una región reguladora 5' unida
operativamente a una secuencia nucleotídica que codifica un
polipéptido diana, cuya expresión se activa mediante los
polipéptidos receptores en presencia de un ligando químico. La
región reguladora 5' del gen diana comprende una secuencia promotora
central, una secuencia de iniciación de la transcripción y el
elemento de respuesta o elementos de respuesta necesarios para la
unión complementaria de los polipéptidos receptores. El casete de
expresión diana también posee una región terminadora 3' (codón de
parada y secuencia de poliadenilación).
El método de la presente invención comprende
expresar dentro de una planta al menos dos polipéptidos receptores
que, en presencia de uno o de más ligandos químicos, activan la
región reguladora 5' de un casete de expresión diana dentro de una
planta transgénica (figura 1). Se necesitan al menos dos
polipéptidos receptores para activar la región reguladora 5'. Estos
dos polipéptidos receptores forman un dímero. Cuando los dos
polipéptidos receptores son idénticos, forman un "homodímero" y
cuando los dos polipéptidos receptores son diferentes forman un
"heterodímero". Uno o los dos polipéptidos receptores presentes
en un homodímero o en un heterodímero pueden ser quiméricos, tal
como se describe más abajo. Ejemplos de heterodímeros que abarca la
invención incluyen, pero no se limitan a, EcR+USP, EcR+RXR o formas
quiméricas de los mismos.
Los polipéptidos receptores se componen de un
dominio de unión al ligando, un dominio de unión al DNA y de un
dominio de transactivación. El dominio de unión al DNA une el
polipéptido receptor a la región reguladora 5' del casete de
expresión diana en el sitio del elemento de respuesta. El dominio de
unión a ligando de los polipéptidos receptores se une, cuando está
presente, al ligando químico complementario. La unión del ligando
químico causa un cambio conformacional en el polipéptido receptor y
permite que el dominio de transactivación afecte la transcripción de
la secuencia codificante del casete de expresión diana, lo que da
lugar a la producción del polipéptido diana.
Los polipéptidos receptores quiméricos utilizados
en la presente invención tienen uno o más dominios obtenidos de una
fuente heteróloga. El uso de los polipéptidos receptores quiméricos
tiene el beneficio de combinar dominios de diferentes fuentes, lo
que proporciona un polipéptido receptor que se activa mediante una
selección de ligandos químicos y que posee unas características
superiores en relación a la unión de ligando, la unión al DNA y la
transactivación. Una realización preferida de la presente invención
son los polipéptidos receptores quiméricos, donde el ligando químico
complementario se selecciona entre un insecticida, una hormona de
insectos, o antagonistas o agonistas de hormonas de insectos.
La región reguladora 5' de los casetes de
expresión de receptor comprenden además un promotor que permite la
expresión en tejidos y células vegetales. Se escogen los promotores
adecuados para los casetes de expresión de receptor para que la
expresión de los polipéptidos receptores pueda ser constitutiva,
regulada por el desarrollo, específica de tejido, específica de
célula o específica de compartimento celular. También se pueden
escoger los promotores de manera que se pueda inducir químicamente
en la planta la expresión de los propios polipéptidos receptores,
con lo cual se aumenta el nivel de la inducción del promotor por el
ligando. Mediante la combinación de los elementos del promotor que
confieren una expresión específica con los que confieren una
expresión inducida químicamente, se pueden expresar o activar los
polipéptidos receptores en células o de tejidos específicos de la
planta en respuesta a la aplicación de un compuesto químico. Se
puede modificar la secuencia nucleotídica que codifica el
polipéptido receptor para mejorar la expresión en las plantas, para
mejorar la funcionalidad o para ambas cosas. Tales modificaciones
incluyen, pero no se limitan a, alterar el uso de codones, insertar
intrones o crear mutaciones, preferiblemente en el dominio de unión
al ligando. En una realización de la invención se usan para activar
la expresión de un polipéptido diana los casetes de expresión que
incluyen un promotor específico de anteras o específico del pistilo
unido operativamente a una secuencia nucleotídica que codifica un
polipéptido receptor quimérico.
También se describen polipéptidos diana cuya
expresión se activa por los polipéptidos receptores en presencia de
un ligando químico. Se puede controlar la expresión de cualquier
secuencia codificante mediante la presente invención, siempre y
cuando el promotor unido operativamente a dicha secuencia
codificante se haya construido conteniendo el elemento de respuesta
o los elementos de respuesta que sean complementarios al dominio de
unión al DNA de los polipéptidos receptores utilizados. Por ejemplo,
los polipéptidos receptores activan, en presencia de un ligando
químico, los polipéptidos diana que sirven para controlar la
fertilidad de la planta.
Los polipéptidos receptores quiméricos se pueden
utilizar en la presente invención para activar la expresión de un
polipéptido diana. Se pueden elegir de una fuente heteróloga uno o
más de los tres dominios de un polipéptido receptor, en base a su
eficacia para la transactivación, la unión al DNA o la unión al
ligando químico. También se pueden obtener de cualquier organismo
los dominios del polipéptido receptor quimérico, tales como plantas,
insectos y mamíferos, que tengan unas funciones reguladoras de la
transcripción similares. En una realización de la invención, se
seleccionan estos dominios de otros miembros de la superfamilia de
los receptores nucleares de las hormonas esteroideas y tiroideas.
Los polipéptidos receptores quiméricos, como se describe en la
presente memoria, ofrecen la ventaja de combinar una óptima
actividad transactivadora, la unión complementaria de un ligando
químico determinado y el reconocimiento de un elemento de respuesta
específico. Así, se puede construir un polipéptido quimérico
específicamente confeccionado para un propósito determinado. Estos
polipéptidos receptores quiméricos también proporcionan una
funcionalidad mejorada en el entorno heterólogo de una célula
vegetal.
En los métodos de la invención, se pueden
ensamblar los dominios de transactivación, de unión a ligando y de
unión al DNA en el polipéptido receptor quimérico en cualquier
disposición funcional. Por ejemplo, cuando un subdominio de un
dominio de transactivación se encuentra en la porción amino terminal
de un receptor natural, el polipéptido receptor quimérico de la
presente invención puede incluir un subdominio de transactivación en
el extremo carboxilo en lugar de, o además de, un subdominio en el
extremo amino. Como se describe en la presente invención, los
polipéptidos receptores quiméricos también pueden tener múltiples
dominios del mismo tipo, por ejemplo, más de un dominio de
transactivación (o dos subdominios) por polipéptido receptor.
El "dominio de unión al ligando" del
polipéptido receptor proporciona el medio mediante el cual se activa
la región reguladora 5' del casete de expresión diana en respuesta a
la presencia de un ligando químico. El receptor de la ecdisona (EcR)
de Drosophila es un ejemplo de un polipéptido receptor donde
se han identificado los ligandos químicos complementarios que se
unen al dominio de unión a ligando. La hormona esteroidea ecdisona
provoca cambios coordinados en el desarrollo del tejido que dan
lugar a la metamorfosis, mostrándose que la ecdisona se une al EcR
[Koelle et al. Cell 67: 59-77 (1991)].
El análogo de la ecdisona producido por la planta, la muristerona,
también se une al dominio de unión al ligando de EcR. Otras
sustancias químicas, tales como los agonistas no esteroideos de la
ecdisona RH 5849 [Wing, Sience 241: 467-469
(1988)], y la tebufenocida, ésta última conocida como el insecticida
MIMIC®,también actuarán como un ligando químico del domino de unión
a ligando de EcR. En la presente invención, el EcR y su dominio de
unión a ligando han resultado ser particularmente útiles para
controlar la expresión del polipéptido diana en las células
vegetales, tal y como se describe en los ejemplos de más
adelante.
Se ha aislado y clonado otro receptor de
Drosophila, el ultraespiráculo (Ultraspiracle, USP),
que se conoce también como "2C", y se ha identificado su
dominio de unión al ligando [Henrich et al., Nucleic Acids
Research 18: 4143-4148 (1990)]. El USP es más
parecido al receptor de esteroides RXR\alpha, cuyo ligando químico
es el ácido 9-cis-retinoico. También se ha demostrado que
el USP forma un heterodímero con el EcR y que regula la expresión de
un polipéptido diana en las células de riñón de ratón transformadas
en respuesta a la aplicación de la ecdisona (Evans et al. WO
94/01558). En la presente invención, el receptor USP y su dominio de
unión a ligando han resultado ser particularmente útiles para
controlar la expresión del polipéptido diana en las plantas, como se
describe en los ejemplos de más adelante.
Los dominios de unión al ligando para construir
polipéptidos receptores quiméricos se pueden obtener también de
muchas otras fuentes. Fuentes de dominios de unión a ligando
particularmente útiles incluyen, pero no se limitan a, proteínas
receptoras de clase II de la superfamilia de receptores nucleares de
las hormonas esteroideas y tiroideas.
La elección del ligando químico dependerá de qué
dominios de unión a ligando están presentes en el polipéptido
receptor. Bastará cualquier compuesto químico con tal de que se
demuestre que forma un par de unión complementario con el dominio de
unión a ligando elegido. Cuando se sabe que un compuesto natural
forma un par de unión complementario con un dominio de unión al
ligando determinado, estos compuestos conocidos también se podrán
usar en la presente invención. Fuentes de dominios de unión a
ligando particularmente útiles incluyen, pero no se limitan a,
proteínas receptoras de la clase II de la superfamilia de receptores
nucleares de las hormonas esteroideas y tiroideas. Productos químico
particularmente útiles incluyen, pero no se limitan a, insecticidas
que forman un par de unión complementario con el dominio de unión al
ligando. Tales compuestos químicos incluyen, pero no se limitan a,
hormonas, agonistas de hormonas o antagonistas de hormonas cuya
función como insecticidas se pueda atribuir a que se unen a
proteínas receptoras naturales en los insectos. Además, los
compuestos químicos con esas propiedades hormonales o relacionadas
con hormonas que se sabe que son insecticidas tienen el beneficio
adicional de haber sido ya examinados en relación a la producción
agrícola, por lo que estos compuestos están "listos para usar"
sobre campos de cultivo. Compuestos químicos útiles con tales
propiedades incluyen, pero no se limitan a, el fenoxycarb, CGA 59
205, tebufenocida y RH 5849.
La invención también abarca las maneras de
reducir el ruido de fondo para que la inducción sea grande en
comparación con la expresión del fondo suprimida. Muchos dominios de
unión a ligando formarán un par de unión complementario con más de
un ligando químico. En algunos casos, estos ligandos químicos se
unirán pero no tienen función conocida. En otros casos, puede que
haya ligando químicos endógenos del propio hospedador en los que los
polipéptidos receptores se expresen que se unirán al dominio de
unión a ligando. Para evitar que los ligandos químicos endógenos se
unan a los polipéptidos receptores expresados en los hospedadores
heterólogos y que afecten involuntariamente la expresión del gen
diana, sería deseable mutar la secuencia codificante del polipéptido
receptor para que reconozca sólo el ligando químico aplicado
exógenamente. En la técnica se conocen métodos útiles para la
mutagénesis, tales como la mutagénesis química o la mutagénesis
específica de sitio.
En un método, los polipéptidos receptores
mutantes se preparan mediante mutagénesis por PCR de la secuencia
nucleotídica que codifica el dominio de unión a ligando de EcR o
USP. Estos polipéptidos receptores mutantes se expresan en un
organismo hospedador que se presta a las técnicas de detección y
aislamiento convenientes, como la levadura. La detección de
polipéptidos receptores mutantes que exhiban una actividad basal
disminuida y una inducción varias veces mayor en tal organismo
hospedador sólo proporcionará, sin embargo, candidatos para pruebas
adicionales en células vegetales, ya que está claro de los trabajos
con el receptor de los glucocorticoides (GR) que, aunque los
receptores de la superfamilia de las hormonas esteroideas y
tiroideas puedan funcionar en levadura, no se puede predecir que
funcione en las plantas transgénicas [Lloyd et al.,
Science 226: 436 (1994)]. Aún más limitante de la aplicación
de los resultados con levadura es la observación de que las células
de levadura que expresan GR no responden a los ligandos químicos
usados corrientemente como la dexametasona, mientras que este
ligando sí funciona en otros sistemas heterólogos [Schena et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:
10421-10425 (1991)].
Se llevan a cabo pruebas adicionales en células
vegetales preparando casetes de expresión de receptor que codifican
los polipéptidos receptores mutados y transformando las células
vegetales con ellos en combinación con un casete de expresión diana.
En las células vegetales transformadas se comprueba que, en
presencia de un ligando químico apropiado, los polipéptidos
receptores mutantes activan la región reguladora 5' del casete de
expresión diana. Para controlar la expresión génica en las plantas
resultan útiles los polipéptidos receptores mutantes que producen
una expresión basal baja del polipéptido diana en ausencia del
ligando químico y producen la expresión elevada del polipéptido
diana en presencia del ligando químico apropiado.
Además, la heterodimerización en ausencia del
ligando también da lugar a la activación involuntaria de la región
5' reguladora del casete de expresión diana, con lo cual se producen
altos niveles de expresión basal del polipéptido diana. Se piensa
que otra región del dominio de unión a ligando conocida como la
región de repetición de heptadas repetidas influye sobre el grado de
heterodimerización en ausencia del ligando
[Au-Fliegner et al., Mol. Cell. Biol.
13: 5725 (1993)]. En una realización de la presente invención, se
muta la novena repetición de heptadas de la región de repetición de
heptadas con mutagénesis dirigida mediante PCR de tal manera que se
altere la interacción entre las subunidades de los heterodímeros
polipeptídicos receptores en ausencia del ligando químico.
El "dominio de unión al DNA" es una
secuencia de aminoácidos que tiene ciertas características
funcionales que lo hacen responsable de la unión del polipéptido
receptor a una secuencia nucleotídica específica, los elementos de
respuesta, que se encuentran presentes en la región reguladora 5'
del casete de expresión diana. En una realización de la invención,
el dominio de unión al DNA se obtiene de los receptores nucleares de
clase II y contiene restos de cisteína dispuestos de tal manera que,
cuando se coordinan con iones de cinc, forman el denominado motivo
de "dedo de cinc". La estructura de los dominios de unión al
DNA para los receptores nucleares de clase II se conserva
enormemente de una especie a otra y, por consecuencia, hay poca
variación en los elementos de respuesta usados para formar un par de
unión complementario [Evans, Science 240:
889-895 (1998)]. A pesar de todo, se puede
introducir una considerable flexibilidad en el método para controlar
la expresión génica usando estos elementos de respuesta conservados
de otras formas. En una realización preferida de la invención, se
colocan en la región reguladora 5' múltiples copias, y
preferiblemente entre 1 y 11 copias, del elemento de respuesta
apropiado, lo que habilita muchos sitios de unión de heterodímeros
polipeptídicos receptores que dan lugar a un mayor grado de
activación.
Se puede producir más flexibilidad en el método
de control génico cambiando la orientación lineal o la posición de
los elementos de respuesta en la región reguladora 5'. Los elementos
de respuesta que reconocen las proteínas receptoras de clase II
tienen una simetría "en diada", coherente con su funcionamiento
con polipéptidos receptores dimerizados para controlar la expresión
génica [Evans, Science 240: 889-895 (1988)].
Así, un dímero polipeptídico receptor se une a un "sitio
entero", con cada polipéptido receptor individualmente unido a un
"semisitio". Además, estos "semisitios" se pueden orientar
a modo de tanto una repetición directa, como una repetición
invertida o un palíndromo. Los polipéptidos receptores nativos EcR y
USP reconocen un elemento de respuesta palindrómico, a diferencia de
la mayoría de las proteínas receptoras de clase II que reconocen los
elementos de respuesta en repetición directa con la separación
adecuada.
Se puede obtener una flexibilidad adicional a la
hora de controlar la expresión génica mediante la presente invención
con el uso de dominios de unión al DNA y elementos de respuesta de
otros activadores transcripcionales que incluyen, pero no se limitan
a, las proteínas LexA o GAL4. Se puede utilizar el dominio de unión
al DNA de la proteína LexA codificada por el gen lexA de
E. coli y su sitio de unión complementario [Brent y Ptashne,
Cell 43: 729-736 (1985), donde se describe un
activador transcripcional LexA/GAL4]. Otra procedencia útil es de la
proteína GAL4 de levadura.[Sadowski et al., Nature
335: 563-564 (1998), donde se describe un activador
transcripcional GAL4-VP16]. En una realización
preferida de la invención, se construye un polipéptido receptor
quimérico al fusionar el dominio de unión al DNA de GAL4 con el
resto que contiene el dominio de unión a ligando de EcR que, cuando
se heterodimeriza con USP o un resto de USP, puede controlar la
expresión de un polipéptido diana.
Aún se puede obtener un grado más flexibilidad a
la hora de controlar la expresión génica al combinar los elementos
de respuesta que forman pares de unión complementarios con los
dominios de unión al DNA de diferentes tipos de activadores
transcripcionales, esto es, usando elementos de respuesta solapantes
de GAL4 y un miembro de la superfamilia de receptores nucleares de
hormonas esteroideas y tiroideas. Un ejemplo es la región 5'
reguladora de un casete de expresión diana que comprende el elemento
de respuesta de GAL4 y que solapa con el elemento de respuesta de
T_{3}R. Cuando las proteínas T_{3}R homodimerizan en ausencia de
un ligando químico, reconocerán su propio elemento de respuesta y se
unirán a él, con lo cual bloquean el elemento de respuesta adyacente
para GAL4. No hay activación de la región reguladora 5' del casete
de expresión diana en esta situación. Al añadir un ligando
complementario para T_{3}R, el homodímero se separa y se libera de
su elemento de respuesta, descubriendo el elemento de respuesta
adyacente para GAL4. Una vez descubierto, los polipéptidos
receptores quiméricos que usan el dominio de unión al DNA de GAL4 se
pueden unir al elemento de respuesta en las condiciones de
dimerización apropiadas y, de tal modo, activan la expresión del
polipéptido diana.
Los "dominios de transactivación" se pueden
definir como secuencias de aminoácidos que, cuando se combinan con
el dominio de unión al DNA en un polipéptido receptor, aumentan la
iniciación productiva de la transcripción por las
RNA-polimerasas [Véase de modo general Ptashne,
Nature 334, 683-689 (1988)]. Se sabe que
diferentes dominios de transactivación tienen diferentes grados de
efectividad en su capacidad de aumentar el inicio de la
transcripción. En la presente invención es deseable utilizar
dominios de transactivación que tengan mayor efectividad
transactivadora en las células vegetales para generar un elevado
nivel de expresión del polipéptido diana en las plantas como
respuesta a la presencia de un ligando químico. Los dominios de
transactivación que se ha demostrado que son particularmente
eficaces en el método de la presente invención incluyen, pero no se
limitan a, VP16 (aislada del virus del herpes simple) y C1 (aislada
de maíz). En una realización preferida de la presente invención, el
dominio de transactivación de VP16 se fusiona con el resto de USP
para usarlo como un monómero de un heterodímero polipeptídico
receptor para controlar la expresión del polipéptido diana en las
plantas. Una realización más preferible es la fusión del dominio de
transactivación de C1 con el resto de EcR como un monómero. Otros
dominios de transactivación también pueden ser eficaces.
Como se ha descrito antes, el método de la
presente invención se puede usar para aumentar la expresión génica
sobre un nivel basal mínimo. Uno de los beneficios sobresalientes
del presente método, sin embargo, es que se puede usar para
disminuir o inhibir la expresión génica, esto es, represión génica.
La represión se puede conseguir mediante la formación de homodímeros
en los que los semisitios del elemento de respuesta tienen una
orientación lineal distinta de la orientación lineal que permite la
unión de los heterodímeros. En estas condiciones, los homodímeros
unidos a la región reguladora 5' del casete de expresión diana
reprimen la expresión génica ya que interfieren con el proceso de
transcripción. Por eso, la represión génica se puede conseguir
incluyendo en la región reguladora 5' un elemento de respuesta o
elementos de respuesta que permitan la unión del homodímero. En una
realización de la invención, la represión génica se consigue al unir
un homodímero de USP o EcR a la región reguladora 5' de un casete de
expresión diana que comprende un semisitio complementario en
repetición directa.
La represión génica provocada por la unión del
homodímero se liberaría al añadir un ligando químico que desencadene
la heterodimerización. Posteriormente, esta heterodimerización
activa la región reguladora 5' del casete de expresión diana. Por
ejemplo, se reprimirá la expresión del polipéptido diana en una
planta transgénica que exprese los polipéptidos receptores EcR y USP
y que comprenda un casete de expresión diana que tenga tanto un
elemento de respuesta con un semisitio palindrómico como un elemento
de respuesta con un semisitio de repetición directa (o de repetición
invertida) complementarios al dominio de unión al DNA de USP y EcR.
En presencia de tebufenocida u otro ligando químico que se una al
dominio de unión al ligando de EcR o USP, o ambas, se produce la
heterodimerización con USP y, como consecuencia, la unión al otro
elemento de respuesta presente, lo que, a su vez, conduce a la
activación de la región reguladora 5' del casete de expresión diana.
Así, la represión del casete de expresión diana se liberaría.
Para su expresión en plantas, se deben escoger
los promotores adecuados para tanto las casetes de expresión del
receptor como para el casete de expresión diana. A menos que se
indique otra cosa, los promotores que se comentan más adelante se
pueden usar directamente para la expresión en plantas de tanto los
polipéptidos receptores como el polipéptido diana. Estos promotores
incluyen, pero no se limitan a, promotores constitutivos,
inducibles, regulados temporalmente, regulados por el desarrollo,
regulados químicamente, preferidos de tejido o específicos de
tejido. Los promotores constitutivos preferidos incluyen, pero no se
limitan a, los promotores 35S y 19S del CaMV (n.º de patente de los
EE.UU. 5 352 605). Los promotores preferidos adicionalmente
incluyen, pero no se limitan a, uno de los varios genes de la
actina, que se sabe que se expresan en la mayoría de los tipos
celulares. El promotor descrito por McElroy [McElroy et al.,
Mol Gen. Genet. 231: 150.160 (1991)] se puede incorporar
fácilmente en los casetes de expresión de receptores para usarlos en
la presente invención y son particularmente adecuados para usarlos
cuando el hospedador es una monocotiledónea. Todavía otro promotor
constitutivo preferido se obtiene de la ubicuitina, que es otro
producto génico que se sabe que se acumula en muchos tipos
celulares. El promotor de la ubicuitina se ha clonado en varias
especies para usarlo en plantas transgénicas [p. ej. Girasol: Binet
et al., Plant Science 79: 87-94
(1991); maíz: Christensen et al., Plant Molec Biol.
12: 619-632 (1989)]. El promotor de la ubicuitina de
maíz se ha desarrollado en sistemas de monocotiledóneas transgénicas
y su secuencia y los vectores que se construyeron para transformar
las plantas monocotiledóneas se describen en la
EP-342 926. El promotor de la ubicuitina es
apropiado para usarlo en la presente invención con plantas
transgénicas, especialmente las monocotiledóneas. Los promotores de
los snRNA U2 y U5 de maíz [Brown et al., Nucleic Acids
Res. 17: 8991 (1989) y el promotor de la
alcohol-deshidrogenasa [Dennis et al.,
Nucleic Acids Res. 12: 3983 (1984)] son más promotores
útiles.
Los promotores específicos de tejido o
preferentes de tejido útiles en la presente invención en plantas,
particularmente maíz, son los que dirigen la expresión en raíces,
médula, hoja o polen. Tales promotores se describen en la WO
93/07278. También son útiles los promotores que confieren expresión
específica de semilla, como los descritos por Schemthaner
[Schemthaner et al., EMBO J. 7: 1249 (1988)], los
promotores específicos de anteras ant32 y ant43D descritos en la
EP-A-578 611, el promotor B6
específico de anteras (tapetum) [Huffman et al., J. Cell
Biochem. 17B: resumen #D209 (1993)] y los promotores específicos
del pistilo como un promotor modificado S13 [Dzelkains et
al., Plant Cell 5: 855 (1993)].
También son útiles para la presente invención los
promotores químicamente inducidos. En la
EP-A-332 104, por ejemplo, se
describen los promotores de esta categoría en particular que sirven
para dirigir la expresión de los polipéptidos receptores o del
polipéptido diana.
La región reguladora 5' de tanto el casete de
expresión de receptor como del casete de expresión diana también
puede incluir otras secuencias potenciadoras. Se ha encontrado que
numerosas secuencias potencian la expresión génica en plantas
transgénicas. Por ejemplo, se sabe que numerosas secuencias líder no
traducidas derivadas de virus potencian la expresión. En particular,
se ha visto que las secuencias líder derivadas del virus del mosaico
del tabaco (TMV, la "secuencia \Omega"), virus del moteado
clorótico del maíz (MCMV) y el virus del mosaico de la alfalfa (AMV)
son eficaces potenciadores de la expresión (p. ej. Gallie et
al., Nucl Acids Res. 15: 8693-8711
(1987); Skuzeski et al., Plant Molec Biol. 15:
65-79 (1990)]. Otros líderes conocidos en la técnica
incluyen, pero no se limitan a:
\bullet líderes de los Picornavirus, por
ejemplo, el líder del EMCV (región 5' no codificante de la
endefalomiocarditis) [Elroy-Stein, O., Fuerst, T. R.
y Moss, B. PNAS USA 86: 6126-6130
(1989)];
\bullet líderes de los Potyvirus, por
ejemplo, líder del TEV (virus Etch del tabaco) y líder del MDMV
(vírus del mosaico del enanismo del maíz) [Allison et al.,
Virology 154: 9-20(1986)];
\bullet líder de la proteína que se une a la
cadena pesada de las inmunoglobulinas humanas (BiP) [Macejak, D. G.
y Samov, P., Nature 353: 90-94 (1991)];
\bullet líder no traducido de la proteína
recubridora del mRNA del virus del mosaico de la alfalfa (AMV RNA 4)
[Jobling, S. A. y Gehrke, L., Nature 325:
622-625 (1987)];
\bullet líder del virus del mosaico del tabaco
(TMV) [Gallie, D. R. et al., Molecular Biology or RNA,
pp. 237-256 (1989)] y
\bullet líder del virus del moteado clorótico
del maíz (MCMV) [Lommel, S. A. et al., Virology 81:
382-385 (1991); véase también
Delta-Cioppa et al., Plant Physiology
84: 965-968 (1987)].
Se ha demostrado que varias secuencias intrónicas
potencian la expresión cuando se añaden a la región reguladora 5',
en particular en las células de monocotiledóneas. Por ejemplo, se ha
visto que los intrones del gen Adh1 del maíz potencian
significativamente la expresión del gen salvaje con su promotor
cognado cuando se introduce en las células de maíz [Callis et
al., Genes Develop. 1: 1183-1200
(1987)].
Además de los promotores, también se pueden usar
en la presente invención una colección disponible de terminadores
transcripcionales en 3'. Los terminadores transcripcionales son los
responsables de la terminación de la transcripción y de la correcta
poliadenilación del mRNA. Los terminadores de la transcripción
adecuados y los que se sabe que funcionan en las plantas incluyen el
terminador 35S del CaMV, el terminador tml, el terminador de la
nopalina-sintasa, el terminador rbcS E9 del guisante
y otros conocidos en la técnica. Éstos se pueden usar tanto en
monocotiledóneas como en dicotiledóneas.
Además de incorporar uno o más de los elementos
antes mencionados en la región reguladora 5' del casete de expresión
diana, también se pueden incorporar otros elementos propios del
casete de expresión diana. Tales elementos incluyen, pero no se
limitan a, un promotor mínimo. Con el promotor mínimo se pretende
que los elementos del promotor basal estén inactivos o casi
inactivos sin la activación hacia 5'. Un promotor así tiene poca
actividad de fondo en plantas cuando no hay transactivador presente
o cuando no hay potenciadores o sitios de unión de elementos de
respuesta. Un promotor mínimo que es particularmente útil para los
genes diana en las plantas es el promotor mínimo Bz1 que se obtiene
del gen bronze1 del maíz. El núcleo del promotor Bz1 se
obtuvo mediante la escisión por el sitio NheI localizado
entre las posiciones -53 y -58 en la construcción Bz1 mutante
"myc"-luciferasa pBz1LucR98 [Roth et al., Plant
Cell 3: 317 (1991)]. El fragmento del promotor central derivado
de Bz1 se extiende así entre -53 y +227 e incluye el intrón 1 de
Bz1 en la región 5' no traducida.
Los casetes de expresión de la presente invención
se pueden introducir en una célula vegetal de varias maneras
conocidas en la técnica. Los expertos en la técnica se darán cuenta
de que la elección del método podría depender del tipo de planta,
esto es, monocotiledónea o dicotiledónea, que se va a transformar.
Los métodos adecuados para transformar células vegetales incluyen,
pero no se limitan a, microinyección [Crossway et al.,
BioTechniques 4: 320-334 (1988)], electroporación
[Riggs et al., Proc Natl. Acad. Sci. USA 83:
5602-5606 (1986)], transformación mediante
Agrobacterium (Hinchee et al., Biotechnology 6:
915-921 (1988)], trasferencia directa de genes
[Paszkowski et al., EMBO J 3:
2717-2722 (1984)] y la aceleración de partículas
balísticas usando dispositivos disponibles de Agracetus, Inc
(Madison, Wisconsin) y BioRad (Hercules, California) [véase, por
ejemplo, Stanford et al., patente de los EE.UU. n.º 4 945
050; McCabe et al., Biotechnology 6:
923-926 (1988)]. Véase también Weissinger et
al., Annual Rev. Genet. 22: 421-477
(1988); Sanford et al., Particulate Science and
Technology 5: 27-37 (1987) (cebolla); Christou
et al., Plant Physiol. 87: 671-674
(1988) (soja); McCabe et al., Biotechnology 6:
923-926 (1988) (soja); Datta et al.,
Biotechnology 8: 736-740 (1990) (arrroz);
Klein et al., Proc Natl Acad. Sci. USA 85:
4305-4309 (1988) (maíz); Klein et al.,
Biotechnology 6: 559-563 (1988) (maíz); Klein
et al., Plant Physiol 91: 440-444
(1988) (maíz); Fromm et al., Biotechnology 8:
833-839 (1990) (maíz); y Gordon-Kamm
et al., Plant Cell 2: 603-618 (1990)
(maíz); Syrab et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:
8526-8530 (1990) (cloroplastos de tabaco); Koziel
et al., Biotechnology 11: 194-200
(1993) (maíz); Shimamoto et al., Nature 388:
274-277 (1989) (arroz); Christou et al.,
Biotechnology 9: 957-962 (1991) (arroz); la
solicitud de patente europea EP-332 581 (Dactylis
glomerata y otras Pooidae); Vasil et al.,
Biotechnology 11: 1553-1558 (1993) (trigo);
Weeks et al., Plant Physiol 102:
1077-1084 (1993) (trigo).
Un conjunto de realizaciones particulamente
preferidas para introducir los casetes de expresión de la presente
invención en maíz mediante bombardeo con microproyectiles lo
describe Koziel [Koziel et al., Biotechnology 11:
194-200 (1993)] que se incorpora completa en la
presente memoria mediante su referencia. Otra realización adicional
preferida es el método de transformación de protoplastos de maíz tal
como se describe en la solicitud de patente europea
EP-292 435, así como en la
EPA-A-292 435. Un conjunto de
realizaciones particularmente preferida para introducir los casetes
de expresión en trigo mediante bombardeo con microproyectiles se
puede encontrar en la WO 94/13822.
La transformación de las plantas se puede
emprender con una única molécula de DNA o múltiples moléculas de DNA
(esto es, cotransformación), y ambas técnicas son adecuadas para
usarlas con los casetes de expresión de la presente invención. Se
dispone de numerosos vectores de transformación para la
transformación de las plantas, y los casetes de expresión de esta
invención se pueden usar junto con cualquiera de estos vectores. La
selección del vector dependerá de la técnica de transformación
preferida y la especie que se quiere transformar.
Se dispone de muchos vectores para transformar
usando Agrobacterium tumefaciens. Éstos típicamente portan al
menos una secuencia del extremo del T-DNA e incluyen
vectores como pBIN19 [Bevan, Nucl. Acids Res. (1984)]. En una
realización preferida, los casetes de expresión usados en la
presente invención se pueden insertar en cualquiera de los vectores
binarios pCIB200 y pCIB2001 para usarlos con Agrobacterium.
Estos casetes en el vector para transformar mediante
Agrobacterium se construyeron de la siguiente manera. Se creó
el pTJS75kan mediante la digestión con NarI del pTJS75
[Schmidhauser y Helinski, J. Bacteriol. 164:
446-455 (1985)]. para liberar el gen de resistencia
a kanamicina, seguido de la inserción de un fragmento AccI
del pUC4K que lleva un NPTII [Messing y Vierra, Gene
19: 259-268 (1982); Bevan et al.,
Nature 304: 184-187 (1983); McBride et
al., Plant Mol. Biol. 14: 266-276
(1990)]. Se ligaron unos conectores XhoI al fragmento
EcoRV del pCIB7 que contiene los extremos derecho e izquierdo
del T-DNA, un gen quimérico nos/nptII que
permite la selección el plantas y el policonector del pUC [Rothstein
et al., Gene 53: 153-161 (1987)], y el
fragmento digerido con XhoI se clonó en el pTJS75kan digerido
con SalI para crear el pCIB200 (véase también la
EP-332 104, ejemplo 19). El pCIB200 contiene los
siguientes sitios de restricción únicos en el policonector:
EcoRI, SstI, KpnI, BglII, XbaI y
SalI. El plásmido pCIB2001 se deriva del pCIB200 mediante la
inserción de sitios de restricción únicos adicionales en el
policonector. Los sitios de restricción únicos del policonector de
pCIB2001 son EcoRI, SstI, KpnI, BglII,
XbaI, SalI, MluI, BclI, AvrII,
ApaI, HpaI y StuI. El pCIB2001, además de
contener estos sitios de restricción únicos, también tiene una
selección por kanamicina para bacterias y plantas, los extremos
derecho e izquierdo del T-DNA para la transformación
mediante Agrobacterium, la función trfA derivada de
RK2 para que se transfiera entre E. coli y otros huéspedes, y
las funciones OriV y OriT también de RK2. El
policonector del pCIB2001 es adecuado para la clonación de casetes
de expresión de plantas que contengan sus propias señales
reguladoras.
Un vector adicional útil para la transformación
mediante Agrobacterium es el vector binario pCIB10, que
contiene un gen que codifica la resistencia a kanamicina para
poderlo seleccionar en plantas, secuencias de los extremos derecho e
izquierdo del T-DNA, e incorpora secuencias del
plásmido de amplio margen de huéspedes pRK252 que le permiten
replicarse tanto en E. coli como en Agrobacterium. Su
construcción se describe en Rothstein et al., Gene
53153-161 (1987). Se han construido varios derivados
del pCIB10 que incorporan el gen de la higromicina B
fosfotransferasa descrito por Gritz [Gritz et al.,
Gene 25: 179-188 (1983)]. Estos derivados
permiten seleccionar las células vegetales transgénicas sobre
higromicina sola (pCIB743) o sobre higromicina y kanamicina
(pCIB715, pCIB717).
Los métodos que usan tanto una forma de
transferencia directa de genes como los que usan una transferencia
mediante Agrobacterium normalmente, pero no necesariamente,
se acometen con un marcador de selección que proporciona resistencia
a un antibiótico (p. ej., kanamicina, higromicina o metotrexato) o
un herbicida (p. ej. fosfinotricina). Sin embargo, la elección del
marcador de selección para la transformación de plantas no es
crítico para la invención.
En ciertas especies se pueden preferir distintos
marcadores de selección de antibióticos o herbicidas. Los marcadores
de selección usados rutinariamente en la transformación incluyen el
gen nptII que confiere resistencia al kanamicina y
antibióticos relacionados [Messing y Vierra, Gene 19:
259-268 (1982)], el gen bar que confiere
resistencia al herbicida fosfinotricina [White et al.,
Nucl. Acids Res. 18: 1062 (1990); Spencer et al.,
Theor. Appl. Genet. 79: 625-631 (1990)], el
gen hph que confiere resistencia al antibiótico higromicina
[Blochinger y Diggelmann, Mol. Cell. Biol. 4:
2929-2931] y el gen dhfr, que confiere
resistencia al metotrexato [Bourouis et al., EMBO J.
2: 1099-1104 (1983)].
pCIB3064 es uno de los vectores útiles para la
transferencia directa de genes en combinación con la selección por
el herbicida Basta (o fosfinotricina). Este vector está basado en el
plásmido pCIB246, que comprende el promotor 35S del CaMV en una
fusión operativa con el gen GUS de E. coli y el
terminador transcripcional 35S del CaMV, y se describe en la
solicitud PCT publicada WO 93/07278, incorporada en esta memoria por
su referencia. Un gen útil por conferir resistencia a la
fosfinotricina es el gen bar de Streptomyces
viridochromogenes [Thompson et al., EMBO J. 6:
2519-2523 (1987)]. Este vector es apropiado para la
clonación de los casetes de expresión de plantas que contengan sus
propias señales reguladoras.
Un vector de transformación adicional es pSOG35
que utiliza el gen de la dihidrofolato-reductasa
(DHFR) de E. coli como marcador de selección al conferir
resistencia al metotrexato. Se utilizó la PCR para amplificar el
promotor 35S (\sim800 pb), el intrón 6 del gen Adh1 del
maíz (\sim550 pb) y 18 pb de la secuencia líder no traducida de
GUS del pSOG10. Un fragmento de 250 pb que codifica el gen de
la dihidrofolato-reductasa de tipo II de E.
coli también se amplificó por PCR y estos dos fragmentos se
ensamblaron con un fragmento SacI-PstI de pBI221
(Colontech) que comprende la estructura básica del vector pUC19 y el
terminador de la nopalina-sintasa. El ensamblaje de
estos fragmentos generó el pSOG19 que contiene el promotor 35S en
fusión con la secuencia del intrón 6, el líder de GUS, el gen
DHFR y el terminador de la nopalina-sintasa.
El reemplazo del líder de GUS en el pSOG19 por la secuencia
líder del controlador del virus del moteado clorótico del maíz
(MCMV) generó el vector pSOG35. Los vectores pSOG19 y pSOG35 portan
el gen de resistencia a ampicilina derivado del pUC y tienen
disponibles los sitios HindIII, SphI, PstI y
EcoRI para clonar secuencias foráneas.
Uno de los aspectos ventajosos de la presente
invención es su uso para controlar la fertilidad de la planta en
condiciones de campo. La fertilización eficaz es el resultado de la
formación de cigotos viables y se puede medir como el porcentaje de
semillas que forman cigotos viables. De acuerdo con la presente
invención, la fertilidad se puede controlar incorporando una
secuencia nucleotídica que codifique la diana adecuada en el casete
de expresión diana, en el que la expresión de dicho polipéptido
diana interfiere con la fertilidad de la planta, lo que quiere decir
que reduce o aumenta estadísticamente la fertilidad de la planta. En
una realización preferida de la invención, dicho polipéptido diana
hace que el proceso de la fertilización sea infructuoso, lo que
quiere decir que la formación de cigotos viables se impedirá o se
prevendrá. Tal fertilización infructuosa se puede medir como el
porcentaje de semillas que no forman cigotos viables y que se pueden
causar por muchos medios. Estos incluyen, pero no se limitan a, 1)
interrumpir o alterar aquellos procesos que son críticos para formar
gametos viables, 2) polen u óvulos que, en caso de formarse, no son
funcionales, o 3) se malogra el desarrollo apropiado del saco
embrionario, el pistilo, el estigma o el conducto de transmisión. En
la presente invención se aplica un ligando químico a las plantas
transgénicas en condiciones de campo, en las que se activa la
expresión del polipéptido diana, gracias lo cual la fertilización se
hace infructuosa. En otra realización de la presente invención, la
expresión de dicho polipéptido diana aumenta o restaura la
fertilidad de una planta.
Se reconoce que se pueden conseguir distintos
grados de eficacia o ineficacia en la fertilización con la presente
invención. En una realización preferida, se puede alcanzar más del
80%, y más preferiblemente más del 95%, de fertilizaciones
infructuosas. La capacidad de proporcionar variabilidad en el nivel
de fertilidad permite que la invención se adapte a una gran variedad
de propósitos agrícolas.
Secuencias codificantes útiles para el
polipéptido diana incluyen, pero no se limitan a, cualquier
secuencia que codifique un producto capaz de hacer infructuosa la
fertilización. Estas secuencias codificantes pueden ser tanto de
origen homólogo como heterólogo. Los productos génicos de esas
secuencias codificantes incluyen, pero no se limitan a:
\bullet la cadena A de la toxina diftérica
(DTA), que inhibe la síntesis de proteínas [Greenfield et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80: 6853 (1983); Palmiter
et al., Cell 50: 435 (1987)];
\bullet la pectato liasa pelE de
Erwinia chrysanthemi EC16, que degrada la pectina y causa la
lisis celular [Keen et al., J. Bacteriololy 168: 595
(1986)];
\bulletT-urf13
(TURF-13) de los genomas mitocondriales
cms-T de maíz; este gen codifica un polipéptido
denominado URF13 que rompe las membranas plasmática o mitocondrial
[Braun et al., Plant Cell 2: 153 (1990); Dewey et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84: 5374 (1987); Dewey
et al., Cell 44: 439 (1986)];
\bullet la recombinasa Gin del gen a del
fago \mu (mu), que codifica una recombinasa específica de sitio
que causará reordenamientos en el genoma y pérdida de la viabilidad
de la célula cuando se expresa en células vegetales [Maeser et
al., Mol. Gen. Genet., 230: 170-178
(1991)];
\bullet la ácido
indolacético-lisina sintetasa (iaaL) de
Pseudomonas syringae, que codifica una enzima que conjuga la
lisina con el ácido indolacético (IAA). Cuando se expresa en las
células de las plantas causa alteraciones en el desarrollo debido a
que retira el IAA de la célula mediante la conjugación [Romano et
al., Genes and Development 5: 438-446
(1991); Spena et al., Mol. Gen. Genet. 227:
205-212 (1991); Roberto et al., Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 87: 5795-5801];
\bullet la ribonucleasa de Bacillus
amyloliquefaciens, también conocida como barnasa, que digiere
los mRNA en las células en las que se expresa, conduciendo a la
muerte celular [Mariani et al., Nature 347:
737-741 (1990); Mariani et al., Nature
357: 384-387 (1992)]; y
\bullet el gen de la toxina CytA de Bacillus
thuringiensis isrealiensis que codifica una proteína que es
hemolítica y mosquitocida. Cuando se expresa en las células
vegetales causa la muerte de la célula debido a la rotura de la
membrana celular [McLean et al., J. Bacteriology 169:
1017-1023 (1987); Ellar et al., patente de
los Estados Unidos n.º 4 918 006 (1990)].
\bullet Tales polipéptidos también incluyen la
adenina fosforribosiltransferasa (APRT) [Moffalt y Somerville,
Plant Physiol. 86: 1150-1154 (1988)], DNAsa,
RNAsa, proteasa, salicilato hidroxilasa, etc.
Se reconoce además que el casete de expresión
diana puede comprender una región reguladora 5' unida operativamente
a una secuencia nucleotídica que, cuando se transcribe, produce una
versión antisentido de la secuencia codificante crítica para la
formación de gametos viables, como la de la APRT. Alternativamente
se pueden utilizar ribozimas que se dirijan al mRNA de un gen que es
crítico para la formación o la funcionalidad de los gametos. Tales
ribozimas comprenderán una región de hibridación de unos nueve
nucleótidos que sean complementarios a la secuencia nucleotídica de
al menos parte del RNA diana y una región catalítica que esté
adaptada para escindir el RNA diana. Las ribozimas se describen en
la EP-321 201 y la WO 88/04300. Véanse también
Haseloff y Gerlach, Nature 334, 585-591
(1988); Fedor y Ulhenbeck, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:
1668-1672 (1990); Cech y Bass, Ann. Rev.
Biochem. 55: 599-629 (1988); Cech, T. R., 236:
1532-1539 (1987); Cech, T. R. Gene 73:
259-271 (1988); y Zang y Cech, Science 213:
470-465 (1986).
Se reconoce que las secuencias nucleotídicas de
antes que codifican un polipéptido diana pueden también unirse
operativamente a una secuencia reguladora 5' que dirija su expresión
de una manera específica de célula o tejido. La manera de
proporcionar tal expresión específica de célula o tejido se ha
descrito anteriormente. Esta especificidad en la expresión asegura
que el efecto del polipéptido diana se ejercerá sólo en los tejidos
o células que sean necesarios para la formación de gametos viables y
no será perjudicial para la planta más allá de su efecto sobre la
fertilidad.
Se reconoce que está dentro del alcance de la
invención el que tanto la fertilidad masculina de las plantas
transgénicas como la fertilidad femenina de las plantas
transgénicas, o ambas, se puedan controlar. La androesterilidad es
el fracaso o la incapacidad de producir polen funcional o viable. La
androesterildad puede ser el resultado de defectos que desemboquen
en la no formación del polen o en la falta de la capacidad funcional
del polen cuando se transforma. Por eso, en condiciones normales,
tanto si el polen se forma como si no, bien no es viable o es
incapaz de fertilizar con eficacia.
La esterilidad femenina es el fracaso o la
incapacidad de producir megasporas o sacos embrionarios viables o
funcionales, u otros tejidos requeridos para la germinación,
crecimiento o fertilización del polen. La esterilidad femenina puede
ser el resultado de defectos que desemboquen en la no formación de
megasporas o el saco embrionario, o el fracaso del desarrollo
apropiado del ovario, el óvulo, el pistilo, el estigma o el conducto
de transmisión. Por eso, en condiciones normales, el saco
embrionario viable incapaz de fertilizar con eficacia tanto si no
logra desarrollarse como si llega a formarse.
Por ejemplo, se puede obtener una planta
transgénica que exprese los polipéptidos receptores EcR y USP en las
anteras fusionando un promotor específico de anteras a las
secuencias nucleotídicas apropiadas. Además, la planta transgénica
comprenderá también un casete de expresión diana, que tiene una
secuencia reguladora 5' que comprende la secuencia del elemento de
respuesta apropiado con los elementos del núcleo del promotor de
Bz1, unido operativamente a la secuencia codificante de la
ribonucleasa barnasa. Tras la aplicación de la tebufenocida en la
planta transgénica a modo de ligando químico se produce la
heterodimerización de los polipéptidos receptores EcR y USP, que
activan la secuencia reguladora 5' del casete de expresión diana y
producirán posteriormente el polipéptido diana barnasa. La expresión
resultante específica de las anteras de la barnasa causa la muerte
celular y la androesterilidad consecuente. Una combinación similar
de polipéptidos receptores y de casete de expresión diana, en los
que las secuencias nucleotídicas que codifican los polipéptidos
receptores están operativamente unidas a un promotor específico de
pistilo, puede producir esterilidad femenina.
Alternativamente, la planta se podría modificar
de manera que la expresión del polipéptido diana restaure la
fertilidad en una planta con androesterilidad o esterilidad
femenina. Por ejemplo, se podría obtener una planta que exprese el
gen de la barnasa bajo el control de los promotores Ant43D, Ant32 o
B6, o como describe Mariani [Mariani et al, Nature
347: 737-741 (1990); Nature 357:
384-387 (1992)], bajo el control del promotor TA29.
Estas plantas comprenderían adicionalmente los casetes de expresión
de receptor que expresen los polipéptidos receptores EcR y USP
mediante el mismo promotor específico de anteras o mediante un
promotor constitutivo como el de la ubicuitina del maíz, el 35S o el
de la actina del arroz. Estas plantas comprenderían además un casete
de expresión diana que tenga una secuencia reguladora 5' que
comprenda la secuencia de los elementos reguladores apropiados con
los elementos del núcleo del promotor de Bz1 unido operativamente a
la secuencia codificante del barstar, inhibidor de la barnasa. Las
plantas serían androestériles pero, tras la aplicación de la
tebufenocida a modo de ligando químico, se produciría la
heterodimerización de los polipéptidos receptores USP y EcR, dando
lugar a la activación de la secuencia reguladora 5' del casete de
expresión diana y la producción del polipéptido diana barstar.
Barstar inhibiría la actividad ribonucleásica del polipéptido
barnasa, con lo que el desarrollo de las anteras y el polen
procedería con normalidad. Se restauraría la fertilidad.
Un enfoque similar se puede usar para controlar
la esterilidad femenina. Se puede producir la esterilidad femenina
en las plantas utilizando promotores específicos para la expresión
en los tejidos reproductores femeninos para impulsar la expresión de
la barnasa, en lugar de los promotores específicos de anteras.
Inducir el casete de expresión diana que comprende la secuencia
codificante de barstar con ligandos químicos daría lugar a la
restauración de la fertilidad femenina.
Los elementos de propagación de la planta (fruto,
tubérculos, granos, semillas), y muy especialmente las semillas, se
tratan usualmente con una capa protectora que comprende herbicidas,
insecticidas, fungicidas, bactericidas, nematicidas, molusquicidas o
mezclas de varios de estos compuestos. Si se desea, estos compuestos
se formulan juntos con excipientes adicionales, surfactantes o
adyuvantes que facilitan la aplicación que se emplean rutinariamente
en la técnica de formulación para proteger de los daños causados por
las plagas bacterianas, fúngicas o animales.
Para tratar la semilla se puede aplicar una capa
protectora a las semillas tanto impregnando los tubérculos o los
granos con una formulación líquida como recubriéndolos con una
formulación seca o húmeda. En determinados casos se pueden usar
otros métodos de aplicación a las plantas, como el tratamiento
dirigido a las yemas o al fruto.
Una semilla de la planta, de acuerdo con la
invención, se puede tratar con una capa protectora de semillas que
comprende un compuesto para el tratamiento de las semillas como el
captano, carboxina, thiram (TMTD®), metalaxilo (Apron®),
pirimifos-metilo (Actellic®) y otros que se usan
corrientemente en el tratamiento de las semillas. Es un objetivo
adicional de la presente invención el proporcionar elementos de
propagación de la planta y, especialmente, semillas tratadas con una
capa protectora de las semillas que se usa habitualmente para el
tratamiento de las semillas.
Los enfoques anteriores podían utilizar cualquier
gen de androesterilidad o de esterilidad femenina para los cuales se
podía fabricar un gen restaurador. Otros genes restauradores
potenciales se describen en la solicitud de patente europea
EP-412 911.
Por consiguiente, la presente invención se puede
usar en cualquier planta que se pueda transformar y regenerar para
obtener plastas transgénicas en las que la androesterilidad y la
esterilidad femenina se pueda controlar mediante la aplicación del
ligando químico apropiado. El control de la fertilidad de la planta
es particularmente útil para producir semillas híbridas. Para
producir semillas híbridas sin contaminar con la propia semilla se
deben instaurar métodos de control de la polinización para asegurar
la polinización cruzada y no la autopolinización. Esto se consigue
usualmente mediante hibridadores mecánicos, genéticos o químicos
(HQ). Por ejemplo, la práctica habitual con el maíz es el
desespigado mecánico del progenitor femenino (o semilla), lo cual
lleva mucho tiempo y es muy trabajoso. En el trigo, el control de la
fertilidad mediante medios mecánicos es impracticable a escala de
producción de semillas y no se han establecido formas de control de
origen genético. El uso de la presente invención para producir
semillas híbridas ofrece las ventajas de la fiabilidad, facilidad de
uso y control de la fertilidad tanto masculina como femenina.
Las plantas transgénicas que contienen los
casetes de expresión de receptor y el casete de expresión diana
apropiados se pueden hacer homocigóticas y mantenerse
indefinidamente. Para obtener semillas híbridas se cruzan las líneas
homocigóticas del progenitor 1 y el progenitor 2. En un ejemplo del
uso de la presente invención para producir semillas híbridas, el
progenitor 1 se modifica genéticamente para hacerlo androestéril en
presencia del ligando químico apropiado mientras que el progenitor 2
se modifica genéticamente para provocarle la esterilidad femenina en
presencia del ligando químico apropiado. Tras la aplicación de un
ligando químico apropiado, que viene determinado por la elección del
dominio de unión a ligando presente en los polipéptidos receptores,
la única producción de semillas fructífera será el resultado de
fertilizar los óvulos del progenitor 1 con el polen del progenitor
2. En un segundo ejemplo del uso de la presente invención, el
progenitor 1 se modifica genéticamente para hacerlo androestéril en
ausencia del ligando químico apropiado y el progenitor 2 se modifica
genéticamente para tener esterilidad femenina en ausencia del
ligando químico. Se aplica el ligando químico apropiado para que
cada línea se mantenga mediante autofertilización. Para producir una
semilla híbrida, las dos líneas progenitoras se entreplantan y sólo
se obtienen semillas híbridas. La fertilidad se restaura en las
plantas híbridas de la progenie mediante la introducción de un gen
restaurador. Por estos medios se pueden producir cualquier semilla
híbrida deseada.
Los siguientes ejemplos describen adicionalmente
los materiales y los métodos usados para llevar a cabo la invención
y los resultados subsecuentes. Se proporcionan a modo de ilustración
y su enumeración no se debe considerar como una limitación de la
invención reivindicada.
La región de DNA que codifica el receptor de la
ecdisona (EcR) de Drosophila se aisló de una genoteca de cDNA
de las pupas Canton S (día 6) preparadas en \lambdagt11 (Clontech,
n.º de catálogo IL 1005b) y de fragmentos generados por PCR genómica
con oligonucleótidos diseñados a partir de la secuencia publicada
para la isoforma B1 del EcR [Koelle et al., Cell 67:
59 (1991)]. La secuencia de la isoforma B1 de EcR se confirmó
mediante análisis por secuenciación automática usando los métodos
estándar y alineándola con la secuencia publicada [Talbot et
al., Cell 73: 1323 (1993)]. La región codificante
completa de EcR expresada se modificó para que contuviera el sitio
BamHI inmediatamente delante del codón de iniciación mediante
el oligonucleótido SF43 (5'-CGC GGA TCC TAA ACA ATG
AAG CGG CGC TGG TCG AAC AAC GGC-3') (SEQ ID N.º 1)
en una PCR. Los vectores de expresión en plantas pMF6 y pMF7
contienen un promotor 35S del virus del mosaico de la coliflor (CaMV
35S), un intrón 1 del Adh1 de maíz y una señal de terminación
y de poliadenilación de la nopalina sintetasa [véase Goff et
al, Genes and Development 5: 298 (1991)]. Los vectores
pMF6 y pMF7 se diferencian sólo en la orientación del policonector
usado para insertar la secuencia codificante deseada. La secuencia
codificante completa de EcR se ligó con el vector pMF6 de expresión
de plantas con el CaMV 35S mediante el empleo de los sitios de
restricción BamHI flanqueantes. Este casete de expresión de
receptor se denominó 35S/EcR.
El cDNA que codifica el receptor ultraespiráculo
(USP) nativo de Drosophila se describe en Henrich et
al., Nucleic Acids Research 18: 4143 (1990). La secuencia
codificante completa de USP con las regiones flanqueantes 5' y 3' no
traducidas se ligó al vector de expresión pMF7 (descrito en el
ejemplo 1) usando los sitios de restricción EcoRI
flanqueantes. Este casete de expresión de receptor se denominó
35S/USP.
Se construyó un casete de expresión de receptor
en el que el dominio de unión al DNA de EcR se reemplazó con el
dominio de unión al DNA de GAL4 fusionado del lado amino terminal.
El DNA de la región codificante del EcR de Drosophila se
obtuvo como se describió en el ejemplo 1. La secuencia codificante
del dominio de unión al DNA de GAL4 se subclonó del plásmido pMA20
[Ma y Patashne, Cell 48: 847 (1987)].
Se construyó un casete de expresión de receptor
que codificaba un polipéptido receptor quimérico
GAL4-EcR mediante la fusión del dominio de unión al
DNA de GAL4 con el dominio de unión a ligando y el extremo carboxilo
del EcR. Para hacer esta fusión, se usó el oligonucleótido SF23
(5'-CGC GGG ATC CAT GCG GCC GGA ATG CGT CGT CCC
G-3') (SEC ID N.º 2) para introducir por PCR un
sitio BamHI en la secuencia del cDNA de EcR en la posición de
nucleótido equivalente al resto de aminoácido 330 (inmediatamente
detrás del dominio de unión al DNA de EcR). La secuencia codificante
truncada de EcR resultante (EcR^{330-878}) se
subclonó en el plásmido pKS+ (Stratagene).
Se obtuvo un subclón de GAL4 del plásmido pMA210
que contenía la secuencia codificante del dominio de unión al DNA
(aminoácidos 1 a 147) subclonando el extremo amino de GAL4 en el
sitio ClaI del pSK+ (Stratagene) tal y como se ha descrito
previamente [Goff et al., Genes and Development 5: 298
(1991)]. Este plásmido se denominó pSKGAL2, se cortó con ClaI
y KpnI y se le insertó el siguiente oligonucleótido
bicatenario:
El plásmido resultante se denominó pSKGAL2.3. La
fusión completa
35S/GAL4-EcR^{330-878} se generó
usando los sitios BamHI del policonector que flanquean el
dominio de unión al DNA de GAL4 en el pSK+ y el resto
EcR^{330-878} en el pKS+. Estas secuencias
codificantes se ligaron al vector de expresión en monocotiledóneas
pMF6 (descrito en el ejemplo 1) mediante el uso de los sitios de
restricción EcoRI flanqueantes. Este casete de expresión de
receptor se denominó
35S/GAL4-EcR^{330-878}.
Se construyó un casete de expresión de receptor
que comprende el dominio de unión al ligando de USP con el dominio
de transactivación de VP16 fusionado tanto al extremo amino como al
carboxilo del polipéptido USP.
Para construir el casete de expresión de receptor
que codifica un polipéptido quimérico que tiene el dominio de
transactivación de VP16 en el extremo carboxilo, el extremo
carboxilo y el codón de parada del cDNA del receptor USP (descrito
en el ejemplo 2) se retiraron al subclonar en el pKS+ (Stratagene)
usando el sitio XhoI en la posición 1471 de la secuencia
codificante de USP. El subclón de USP resultante, que codifica los
aminoácidos 1 a 490, se fusionó con el dominio de transactivación de
VP16 usando el sitio de restricción KpnI flanqueante del
subclon de USP y el sitio KpnI de pSJT1193CRF3 que codifica
los 80 aminoácidos del extremo carboxilo de VP16 [Triezenberg et
al., Genes and Development 2: 718-729
(1988)]. La fusión USP-VP16 resultante se clonó en
el vector pMF7 de expresión de plantas con el CaMV 35S (descrito en
el ejemplo 1) por medio de los sitios de restricción BamHI y
EcoRI que flanquean la secuencia codificante de
USP-VP16. Este casete de expresión de receptor se
denominó 35S/USP-VP16.
El derivado de USP con el dominio de activación
transcripcional fusionado en el extremo amino se construyó
comenzando por la introducción de un sitio BamHI adyacente al
codón de iniciación de USP mediante el oligonucleótido SF42
(5'-CGC GGA TCC ATG GAC AAC TGC GAC CAG
GAC-3') (SEQ ID N.º 3) en una PCR. El codón de
parada de VP16 se eliminó y se introdujo un sitio BamHI
flanqueante mediante el oligonucleótido SF37
(5'-GCG GGA TCC CCC ACC GTA CTC GTC AAT
TC-3') (SEQ ID N.º 4) y se introdujo, en el extremo
amino, un codón de iniciación con una secuencia consenso para
plantas inmediatamente delante del codón de iniciación así como un
sitio BamHI mediante el oligonucleótido SA115
(5'-GTC GAG CTC TCG GAT CCT AAA ACA ATG GCC CCC CCG
ACC GAT GTC-3') (SEQ ID N.º 5) como cebadores en una
PCR. El dominio de activación de VP16 y la secuencia codificante de
USP (que codifica los aminoácidos 1 a 507) resultantes se unieron
en fase mediante los sitios BamHI adyacentes, y la secuencia
codificante VP16-USP se insertó en el vector pMF7 de
expresión en plantas con el CaMV 35S mediante los sitios
BamHI en 5' y EcoRI en 3'. Este casete de expresión de
receptor se denominó 35S/VP16-USP.
La fusión
EcR^{227-825}-C1 se generó
colocando un codón de iniciación inmediatamente antes del dominio de
unión al DNA de EcR con el oligonucleótido SF30
(5'CGC-GGA-TCC-ATG-GGT-CGC-GAT-GAT-CTC-TCG-CCT-TC-3')
(SEQ ID N.º 8) usado en una PCR sobre la secuencia codificante de
EcR completa. La secuencia codificante del dominio de activación
transcripcional (aminoácidos 219 a 273) de la proteína C1 de maíz
[Golf et al. Genes and Develop. 5:
298-309 (1991)] se fusionó en fase con la secuencia
codificante de los aminoácidos 51 a 825 de EcR (en el sitio de
restricción KpnI de EcR). El dominio de transactivación de C1
se unió a EcR mediante un policonector que codifica VPGPPSRSRVSISLHA
(SEQ ID N.º 9). La fusión
35S/EcR^{227-825}-C1 en el vector
de expresión de plantas se construyó mediante la inserción de un
fragmento BamHI que lleva la secuencia codificante en el
vector pMF7. Este casete de expresión de receptor se denominó
35S/EcR^{227-825}-C1.
Se construyó una fusión
GAL4-EcR^{330-825}-C1
usando la construcción
GAL4-EcR^{330-878} descrita en el
ejemplo 3 y la construcción
EcR^{227-825}-C1 del ejemplo 5. La
secuencia de la región codificante de EcR (que comienza en el
aminoácido 456) se cambió por un sitio AatII. Este casete de
expresión de receptor se denominó
35S/GAL4-EcR^{330-825}-C1.
La isoforma \alpha del receptor del ácido
retinoico en ratones se clonó mediante amplificación por PCR de la
primera cadena del cDNA de hígado de ratón usando cebadores
específicos de la secuencia descrita por Chambon et al. [N.º
de acceso en GenBank M84817; Purification, cloning, and RXR identity
of the HeLa cell factor with which RAR or TR heterodimerizes to bind
target sequences efficiently, Cell 68:
377-395 (1992)]. El fragmento de PCR de RXR\alpha
se generó utilizando los oligonucleótidos dT_{30} y SF165
(5'-CGC GGA TCC ATG GAC ACC AAA CAT TTC
CT-3') (SEQ ID N.º 12) o SF167
(5'-CGC GGA ATT CTA AAC AAT GGA CAC CAA ACA TTT
CCT-3') (SEQ ID N.º 13). Los productos de PCR
resultantes se digirieron con NsiI (que corta en la región 3'
no traducida del cDNA de RXR amplificado) y un sitio del cebador 5'
(BamHI en el caso de SF165 o EcoRI en el caso de
SF167), y se subclonó en el pUC21. El cebador SF167 contiene un
codón de iniciación consenso para plantas para RXR\alpha. Se
generó una secuencia codificante de RXR\alpha mediante la
subclonación de la región codificante clonada de RXR\alpha con el
codón de inicio consenso para plantas en un vector de expresión con
el 35S de CaMV (pMF7) gracias a los sitios de restricción
flanqueantes EcoRI en 5' y BglII en 3'. Este casete de
expresión se denominó 35S/RXR.
Se construyo un derivado de RXR\alpha con el
dominio de activación transcripcional de VP16 fusionado con el
extremo amino utilizando el sitio BamHI adyacente a la región
codificante de RXR\alpha descrito en el ejemplo 7. Se eliminó el
codón de parada en VP16 y se introdujo un sitio flanqueante
BamHI tal como se describió más arriba en el ejemplo 4. El
dominio de activación de VP16 y la secuencia codificante de
RXR\alpha (que codifica los aminoácidos 1 a 468) se unieron en
fase mediante los sitios adyacentes BamHI, y la secuencia
codificante VP16-RXR\alpha se insertó en el vector
pMF7 de expresión en plantas con el 35S de CaMV mediante los sitios
flanqueantes EcoRI en 5' y BglII en 3'. Este casete de
expresión de receptor se denominó 35S/VP16-RXR.
Se construyo un derivado de RXR\alpha con el
dominio de activación transcripcional de C1 fusionado con el extremo
carboxilo mediante la eliminación, en primer lugar, del codón de
parada de RXR\alpha y la inserción de un sitio de restricción
BglII para fusionarlo en fase con C1 usando el
oligonucleótido SF170 (5-CGC AGA TCT GGG TGG CTT GAT
GTG GTG CCT C-3') (SEQ ID N.º 14) en una reacción de
amplificación por PCR junto con el oligonucleótido SF168
(5'-CTC TTC ACT CTT GTG GAG TG-3')
(SEQ ID N.º 15) que reconoce una secuencia interna. El fragmento de
PCR resultante se digirió por los sitios de restricción BamHI
interno y BglII flanqueante, y se clonó en el pUC21 digerido
con BamHI y BglII. Este subclón se digirió por los
sitios flanqueantes BamHI y NotI, y las secuencias
codificantes aminoterminales de RXR\alpha se insertaron para
regenerar la secuencia codificante de RXR\alpha intacta con un
codón de iniciación consenso para plantas (tal como se describió
previamente en el ejemplo 7) y para retirar el codón de parada. El
dominio de activación del activador transcripcional C1 del maíz se
preparó mediante PCR usando los cebadores oligonucleotídicos SF140
(5'-CGC AGA TCT TGG ACG AGC CGT GCT TCT CCG
GC-3') (SEQ ID N.º 18) y el cebador directo
universal para secuenciación (5'-GTA AAA CGA CGG CCA
GT-3') (New England Biolabs Ref n.º 1211; SEQ ID
N.º 17) sobre un subclón que contiene el cDNA de C1 [Goff et
al., Identification of functional domains in the maize
transcriptional activator C1: comparison of
wild-type and dominant inhibitor proteins. Genes
and Development 5: 298-309 (1991)]. El dominio
de activación de C1 resultante (aminoácidos de 234 a 273) y la
región no traducida 3' flanqueante se fusionó en fase con la
secuencia codificante de RXR\alpha a través del sitio BglII
que hay tras la secuencia codificante de RXR\alpha y el sitio
BglII que precede al dominio de activación transcripcional de
C1. Esta secuencia codificante híbrida
RXR\alpha-C1 se insertó en el vector pMF7 de
expresión en plantas con el 35S del CaMV usando los sitios
EcoRI flanqueantes en 5' y 3'. Este casete de expresión de
receptor se denominó 35S/RXR-C1.
El casete de expresión diana expresable en
plantas que codifica la luciferasa de luciérnaga y que tiene el
elemento de respuesta del dominio de unión al DNA de GAL4 se
construyó de la siguiente manera. El núcleo del promotor de
Bronze-18 (Bz1) que dirige la síntesis de la
luciferasa de luciérnaga se eliminó del delator de Bz1 en pBz1LucR98
[Roth et al., Plant Cell 3: 317 (1991)] mediante los
sitios NheI y SphI y se colocó en un plásmido derivado
del pUC6S que lleva el gen de la luciferasa. El núcleo del promotor
de Bz1 modificado contiene un sitio NheI () y la
secuencia del promotor de Bz1 hasta el nucleótido en posición
-53 [Roth et al., Plant Cell 3: 317 (1991)]. Se
retiraron 10 sitios de unión a GAL4 del delator regulado por GAL4 en
pGALLuc2 [Goff et al., Genes and Development 5: 298
(1991)] mediante la digestión con EcoRI y PstI y se
insertaron en el pBlueScript (Stratagene) usando los mismos sitios
de enzimas de restricción. El sitio HindIII del extremo 5' de
los sitios de unión a GAL4 se cambió a BamHI mediante la
inserción de un adaptador HindIII/BamHI/HindIII
y el fragmento BamHI resultante que contiene los sitios de
unión de GAL4 se retiraron y se colocaron en un sitio BglII
hacia 5' del núcleo del promotor de Bz1 con el que se
transcribe la luciferasa. Este casete de expresión diana se denominó
(GAL4_{b.s.})_{10}-Bz1_{TATA}/Luc.
El casete de expresión diana expresable en
plantas que codifica la luciferasa de luciérnaga y que tiene el
elemento de respuesta del dominio de unión al DNA de EcR (EcRE) se
construyó; de la siguiente manera. La construcción con núcleo del
promotor de Bz1 de maíz-luciferasa en el
plásmido derivado del pUC6S, tal como se describió en el ejemplo 7,
se usó como punto de partida. Los oligonucleótidos bicatenarios
sintéticos que contenían el elemento de respuesta de hsp27 de
Drosophila que se complementa con el dominio de unión al DNA
de EcR se construyeron con extremos cohesivos BamHI y
BglII (SF25, SEQ ID N.º 6: 5'-GAT CCG ACA AGG
GTT CAA TGC ACT TGT CA-3') (SF26, SEQ ID N.º 7:
5'-GAT CTG ACA AGT GCA TTG AAC CCT TGT
CG-3') fosforilados y ligados hacia 5' del núcleo
del promotor de Bz1 mediante la inserción en un sitio
BglII único. Se obtuvieron múltiples copias del elemento de
respuesta mediante digestión secuencial con BglII y la
inserción de oligonucleótidos bicatenarios adicionales. Este casete
de expresión diana se denomina
(EcRE)_{5}-Bz1/Luc,
(EcRE)_{6}-Bz1/Luc o
(EcRE)_{8}-Bz1/Luc dependiendo del número
de elementos de respuesta palindrómicos completos contenidos en la
región promotora (5, 6 y 8, respectivamente).
Se puede demostrar el control de la expresión del
polipéptido diana mediante varios polipéptidos receptores, que
incluyen los polipéptidos receptores quiméricos de la presente
invención, mediante la transformación simultánea de células
vegetales con las construcciones génicas necesarias mediante el
bombardeo con microproyectiles a gran velocidad, seguido de un
ensayo bioquímico que detecte la presencia del polipéptido diana.
Las construcciones génicas necesarias comprenden un primer casete de
expresión de receptor que codifica un primer polipéptido receptor y
un segundo casete de expresión de receptor que codifica un segundo
polipéptido receptor. Adicionalmente, también es necesario un casete
de expresión diana que codifica un polipéptido diana (Figura 1).
Los casetes de expresión se introdujeron
simultáneamente en las células de maíz suspendidas y cultivadas en
medio N6 líquido [Chu et al., Stientia Sinica XVIII:
659-668 (1975)] mediante bombardeo con
microproyectiles a gran velocidad usando técnicas estándares de
precipitación de DNA sobre microproyectiles y bombardeo a gran
velocidad impulsado por helio comprimido
(PDS-1000/He, BioRad, Hercules, CA). Las células
transfectadas se incubaron en una suspensión líquida en presencia
del ligando químico apropiado durante 48 horas aproximadamente en el
medio N6. Tras la incubación, las células transformadas se
recogieron y luego se homogeneízan a 0ºC. Los residuos presentes en
los extractos se retiran por centrifugación a 10 000g a 4ºC durante
5 minutos.
La expresión del polipéptido diana se detectó
ensayando la presencia del producto codificado por el casete de
expresión diana en el extracto. La luciferasa de luciérnaga es una
secuencia codificante usada corrientemente para detectar el
polipéptido diana cuando se ensaya el control de la expresión
realizado por los polipéptidos receptores en presencia de un ligando
químico. La actividad de la luciferasa de luciérnaga se determina
cuantificando la quimioluminiscencia producida por la reacción
catalizada por la luciferasa en la que la luciferina se fosforila
usando ATP como sustrato (Promega Luciferase Kit, n.º de catálogo
E1500) en un luminómetro Analytical Luminiscence Model 2001.
Utilizando el método de transformación del
ejemplo 12, se contransformaron en las células de maíz el casete de
expresión de receptor 35S/EcR (ejemplo 1), el casete de expresión de
receptor 35S/USP (ejemplo 2) y el casete de expresión diana
(EcRE)_{5}-Bz1/Luc (ejemplo 11) (véase
figura 2). Las células transformadas se incubaron en presencia de
los ligandos químicos tebufenocida a 10 \muM o muristerona a 2
\muM durante 48 horas aproximadamente. Los ensayos de la
luciferasa se realizaron como se describió en el ejemplo 12. Los
resultados se presentan en la tabla 1.
Los resultados anteriores demuestran que la
región reguladora en 5' del casete de expresión diana que comprende
los elementos de respuesta a EcR se puede activar en las células
vegetales mediante los polipéptidos receptores EcR y USP en
presencia de un ligando químico complementario. El nivel de
expresión del polipéptido diana luciferasa estuvo entre 2 y 3 veces
por encima del observado en ausencia de ligando químico.
Utilizando el método de transformación del
ejemplo 12 se contransformaron en células de maíz el casete de
expresión de receptor 35S/EcR (ejemplo 1), el casete de expresión de
receptor 35S/VP16-USP (ejemplo 4) y el casete de
expresión diana (EcRE)_{6}-Bz1/Luc (ejemplo
11). Las células transformadas se incubaron en presencia de los
ligandos químicos ecdisona a 1 \muM, tebufenocida 10 \muM o
muristerona a 2 \muM durante 48 horas. Los ensayos de la
luciferasa se realizaron como se describe en el ejemplo 12. Los
resultados se presentan en la tabla 2.
Los resultados anteriores demuestran que la
región reguladora en 5' del casete de expresión diana que comprende
los elementos de respuesta a EcR se puede activar en las células
vegetales mediante el polipéptido receptor EcR y el polipéptido
receptor quimérico VP16-USP en presencia de un
ligando químico complementario. El nivel de expresión del
polipéptido diana luciferasa estuvo entre 2 y 3 veces por encima del
observado en ausencia de ligando químico.
Utilizando el método de transformación del
ejemplo 12 se contransformaron en células de maíz el casete de
expresión de receptor 35S/USP (ejemplo 2), el casete de expresión de
receptor 35S/EcR^{227-825}-C1
(ejemplo 5) y el casete de expresión diana
(EcRE)_{6}-Bz1/Luc (ejemplo 8). Las
células transformadas se incubaron en presencia de tebufenocida a 10
\muM como ligando químico durante 48 horas. Los ensayos de la
luciferasa se realizaron como se describe en el ejemplo 12. Los
resultados se presentan en la tabla 3.
Los resultados anteriores demuestran que la
región reguladora en 5' del casete de expresión diana que comprende
los elementos de respuesta a EcR se puede activar en las células
vegetales mediante el polipéptido receptor USP y el polipéptido
receptor quimérico
EcR^{227-825}-C1 en presencia de
un ligando químico complementario. El polipéptido receptor quimérico
utiliza el dominio de transactivación del gen regulador C1 del maíz
fusionado con el extremo carboxilo de un EcR truncado, en el que el
truncamiento ha retirado el dominio de transactivación de EcR. El
nivel de expresión del polipéptido diana luciferasa fue más de 2
veces superior al observado en ausencia del ligando químico.
Utilizando el método de transformación del
ejemplo 12 se contransformaron en células de maíz el casete de
expresión de receptor
35S/GAL4-EcR^{330-878} (ejemplo
3), el casete de expresión de receptor 35S/USP-VP16
(ejemplo 4) y el casete de expresión diana
(GAL4)_{10}-Bz1/Luc (ejemplo 10) (Figura
3). Las células transformadas se incubaron en presencia de
tebufenocida a 10 \muM como ligando químico durante 48 horas
aproximadamente. Los ensayos de la luciferasa se realizaron como se
describe en el ejemplo 12. Los resultados se presentan en la tabla
4.
Los resultados anteriores demuestran que la
región reguladora en 5' del casete de expresión diana que comprende
los elementos de respuesta a GAL4 se puede activar en las células
vegetales mediante los polipéptidos receptores
GAL4-EcR^{330-878} y
USP-VP16 en presencia de un ligando químico
complementario. El nivel de expresión del polipéptido diana
luciferasa fue 36 veces superior al observado en ausencia del
ligando químico. Esto indica 1) que el polipéptido receptor
quimérico se unía a los elementos de respuesta a GAL4 del casete de
expresión diana, 2) que la tebufenocida se unía al dominio de unión
al ligando de la parte EcR^{330-878} del
polipéptido receptor quimérico, 3) que los dos polipéptidos
receptores quiméricos se heterodimerizan correctamente, y 4) que la
heterodimerización colocó el dominio de transactivación de VP16 en
posición para activar.
Utilizando el método de transformación del
ejemplo 12 se contransformaron en células de maíz el casete de
expresión de receptor
35S/GAL4-EcR^{330-878} (ejemplo
3), el casete de expresión de receptor 35S/VP16-RXR
(ejemplo 8) y el casete de expresión diana
(GAL4)_{10}-Bz1/Luc (ejemplo 10) (Figura
3). Las células transformadas se incubaron en presencia de
tebufenocida a 10 \muM como ligando químico durante 48 horas
aproximadamente. Los ensayos de la luciferasa se realizaron como se
describe en el ejemplo 12. Los resultados se presentan en la tabla
5.
Los resultados anteriores demuestran que la
región reguladora en 5' del casete de expresión diana que comprende
los elementos de respuesta a GAL4 se puede activar en las células
vegetales mediante los polipéptidos receptores
GAL4-EcR^{330-878} y
VP16-RXR en presencia de un ligando químico
complementario. El nivel de expresión del polipéptido diana
luciferasa fue 27 veces superior al observado en ausencia del
ligando químico. Esto indica 1) que el polipéptido receptor
quimérico se unía a los elementos de respuesta a GAL4 del casete de
expresión diana, 2) que la tebufenocida se unía al dominio de unión
a ligando de la parte EcR^{330-878} del
polipéptido receptor quimérico, 3) que los dos polipéptidos
receptores quiméricos se heterodimerizan correctamente, y 4) que la
heterodimerización colocó el dominio de transactivación de VP16 en
posición para activar.
Utilizando el método de transformación del
ejemplo 12 se contransformaron en células de maíz el casete de
expresión de receptor
35S/GAL4-EcR^{330-825}-C1
(ejemplo 6), los casetes de expresión de receptor
35S/USP-VP16, 35S/VP16-USP (ejemplo
4), 35S/VP16-RXR (ejemplo 8) o
35S/RXR-C1 (ejemplo 9), y el casete de expresión
diana (GAL4)_{10}-Bz1/Luc (ejemplo 10). Las
células transformadas se incubaron en presencia de tebufenocida a 10
\muM como ligando químico durante 48 horas aproximadamente. Los
ensayos de la luciferasa se realizaron como se describe en el
ejemplo 12. Los resultados se presentan en la tabla 6.
\newpage
Los resultados anteriores demuestran que la
región reguladora en 5' del casete de expresión diana
(GAL4)_{10}-Bz1/Luc que comprende los
elementos de respuesta a GAL4 se puede activar en las células
vegetales mediante los polipéptidos receptores
35S/GAL4-EcR^{330-825}-C1
y 35S/VP16-USP, 35S/USP-VP16,
35S/VP16-RXR o 35S/RXR-C1 en
presencia de un ligando químico complementario. La expresión del
polipéptido diana se aumentó entre unas pocas veces y más de 50
veces por la presencia del ligando.
Las mutaciones en el dominio de unión del ligando
tanto del receptor de la ecdisona (EcR) como del receptor
ultraespiráculo (USP) se generaron in vitro mediante
mutagénesis por PCR tal como describe Leung [Leung et al.,
Technique 1: 11-15 (1989)]. Los fragmentos de
PCR del dominio de unión al ligando del EcR mutado se clonaron en un
vector de expresión de levaduras en forma de fusión con el dominio
de unión al DNA de GAL4 de levaduras. Los fragmentos de PCR del
dominio de unión al ligando del USP mutados se clonaron en un vector
de expresión de levaduras como una fusión con el dominio de
activación transcripcional de VP16. Las construcciones mutantes se
transformaron en la cepa de levaduras con el delator de GAL4
GGY1::171. Las construcciones mutantes GAL3-EcR se
transformaron en combinación con el VP16-USP sin
mutar, y las construcciones mutantes USP-VP16 se
transformaron en combinación con el
GAL4-EcR^{330-825}-C1
sin mutar. Los transformantes de levadura se plaquearon sobre un
medio que contenía el indicador X-Gal. Los mutantes
que tenían un menor nivel basal de actividad del polipéptido
receptor en forma de heterodímero generaron colonias entre blancas y
azul claro sobre las placas con el indicador X-Gal,
mientras que los heterodímeros de polipéptido receptor sin
mutagenizar generaron colonias azul oscuro. Se ensayó el nivel de
actividad del polipéptido receptor inducido por un ligando químico o
basal en las colonias entre blanco y azul claro haciendo crecer las
células de levadura representativas de las colonias seleccionadas en
un medio sintético (medio S) que contiene glicerol, etanol y
galactosa como fuentes de carbono. El cultivo resultante se dividió
en dos partes, una de las cuales se trató con un ligando químico
apropiado y la otra se usó como un control en ausencia del ligando
químico. Tras la exposición al ligando químico, se ensayó la
actividad \beta-galactosidasa tanto la parte del
cultivo tratada como la control de acuerdo con el procedimiento de
Miller [Experiments in Molecular Genetics, pp.
352-355, J. H. Miller, Ed. Cold Spring Harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, N. Y. (1972)]. Las secuencias
nucleotídicas que codifican los polipéptidos receptores mutantes
aislados e identificados mediante esta técnica fueron candidatos
para pruebas adicionales ya que podían exhibir, en células
vegetales, una actividad basal menor y una mayor inducción de la
expresión del gen diana en presencia del ligando químico.
Se ha descrito que las mutaciones en la región de
interacción proteína-proteína de la novena
repetición de la heptada del dominio de unión del ligando del
receptor de la hormona tiroidea y del receptor del ácido retinoico
muestran una mayor dependencia del ligando para heterodimerizar con
su compañero habitual RXR [Au-Fliegner et
al., Mol Cell Biol. 13: 5725 (1993)]. Tales mutaciones en
la región conservada de la novena repetición de la heptada de EcR no
se ha probado, pero podría ser capaz de aumentar la activación
transcripcional dependiente del ligando. Para determinar si una
mutación en la novena repetición de la heptada de EcR conduciría a
una mayor activación transcripcional dependiente del ligando, la
leucina de la posición 617 en el EcR se cambió por una arginina
mediante mutagénesis dirigida con el oligonucleótido SF197
(5'-TTC TAC GCA AAG CGC CTC TCG ATC
CTC-3') (SEQ ID N.º 16). La secuencia codificante
alterada resultante se reconstruyó en un derivado expresado
GAL4-EcR-C1 tal como se describe en
el ejemplo 6. Este casete de expresión de receptor se denomina
35S/GAL4-EcR(L617R)-C1.
Los casetes de expresión de receptor que
codifican los polipéptidos receptores mutados de EcR o USP de los
ejemplos 19 y 20 se prepararon de acuerdo con los anteriores
ejemplos 1 hasta 9. Con estos casetes de expresión de receptor, en
combinación con uno de los casetes de expresión diana de los
ejemplos 10 y 11, se transformaron células vegetales de acuerdo con
el procedimiento del ejemplo 12. Se probó la activación de la región
reguladora 5' del casete de expresión diana mediante los
polipéptidos receptores mutantes en presencia del ligando químico
adecuado en las células vegetales transformadas. Los resultados se
presentan en la tabla 7.
Estos resultados demuestran que las mutaciones
dentro de los dominios de unión al ligando de los receptores EcR o
USP puede dar lugar a receptores con la expresión de un polipéptido
diana dependiente de ligando aumentada.
Los vectores plasmídicos con
T-DNA de Agrobacterium se construyeron a
partir de los plásmidos previamente descritos
pGPTV-Kan y pGPTV-Hyg [Becker et
al., Plant. Mol. Biol. 20: 1195-1197
(1992)]. El gen delator uidA (GUS) SacI/HindIII
de ambos plásmidos pGPTV-Kan y
pGPTV-Hyg se reemplazó con el policonector
SacI/HindIII de pGEM4Zf(+), pSORT1, pBluescriptKS(+),
pIC20H o pUC18 para dar los plásmidos pSGCFW, pSGCFX, pSGCFY,
pSGCFZ, pSGCGA, pSGCGC, pSGCGE, pSGCGF y pSGCGG, respectivamente.
Como casete de expresión diana se construyó un delator de luciferasa
regulado por GAL4 como un plásmido con T-DNA de
Agrobacterium subclonando en primer lugar un fragmento
KpnI/HindIII de 328 pb con 10 sitios de unión para
GAL4 y una TATA de Bronze-1 de maíz, tal y
como se describió en el ejemplo 10, en los sitios
KpnI/HindIII del plásmido con la luciferasa delatora
modificada pSPLuc+ (Promega) para crear el plásmido pSGCFO1. Un
fragmento KpnI/XbaI de 1991 kpb de pSGCFO1, que
contiene los sitios de unión de GAL4, la TATA de Bz1 y la
luciferasa delatora, se subclonó en el vector con
T-DNA mediante la ligación con un fragmento
NdeI/SpeI de 7194 kpb de pSGCFX1 y un fragmento
NdeI/KpnI de 4111 kpb de pSGCFZ1 descritos antes. El
plásmido resultante se denominó pSGCGL1 y lleva un marcador de
selección NPTII transcrito por un promotor nos que confiere
resistencia a kanamicina en la planta transgénica, y una luciferasa
delatora regulada por GAL4. El GUS delator regulado por GAL4 con 10
sitios de unión para GAL4, una región TATA de 35S y una región
codificante de GUS se construyó de manera similar y se denominó
pAT86. Un delator con el elemento de respuesta de repeticiones
directas (DR) con 3 copias del elemento de respuesta DR, una TATA de
Bz1, una región que codifica la luciferasa y un terminador
nos se introdujo de una manera similar a la descrita para
pSGCGL1, y se denominó pSGCHU1. Los casetes de expresión de receptor
descritos en los ejemplos 3 a 9 anteriores se usaron para construir
construcciones con T-DNA de Agrobacterium
análogas que portaran el promotor 35S del CaMV y las señales de
poliadenilación de nos.
Se transformó Arabidopsis thaliana
(Columbia) con vectores de Agrobacterium que portaban un
delator de luciferasa regulado por ligando y derivados de los
casetes de expresión de receptor apropiados mediante el siguiente
procedimiento de infiltración al vacío. Se prepararon células de
Agrobacterium GV3101 electrocompetentes incubando los
Agrobacterium GV3101 en el medio YT 2X a 28ºC con aireación
durante 24 a 30 horas hasta alcanzar una DO_{600} entre 0,5 y 0,7
unidades. Las células se enfriaron en hielo durante 10 a 30 minutos
y se centrifugaron a 5000 rpm durante 5 minutos a 4ºC. El
sobrenadante se descartó y el sedimento de células se respuspendió
en 1 volumen de glicerol al 10% enfriado en hielo. Las células se
centrifugaron de nuevo a 5000 rpm durante 5 minutos a 4ºC. El
sobrenadante se descartó y el sedimento de células se respuspendió
en 0,05 volúmenes de glicerol al 10% enfriado en hielo. Las células
se centrifugaron de nuevo a 5000 rpm durante 5 minutos a 4ºC. El
sobrenadante se descartó y el sedimento de células se respuspendió
en 0,02 volúmenes de glicerol al 10% enfriado en hielo. Las células
se centrifugaron de nuevo a 5000 rpm durante 5 minutos a 4ºC. El
sobrenadante se descartó y el sedimento de células se respuspendió
en 0,02 volúmenes de glicerol al 10% enfriado en hielo. Las células
se centrifugaron de nuevo a 5000 rpm durante 5 minutos a 4ºC. El
sobrenadante se descartó y el sedimento de células se respuspendió
en 0,01 volúmenes de glicerol al 10% enfriado en hielo. Se hicieron
alícuotas de 200 \mul de células en tubos de microcentrífuga de
1,5 ml, se congelaron rápidamente en N_{2} líquido y se
almacenaron a -80ºC. Las células electrocompetentes congeladas se
descongelaron en hielo y se transfirieron 40 \mul a un tubo de
microcentrífuga de 1,5 ml preenfriado. Se añadió 1 \mul del DNA
plasmídico de Agrobacterium adecuado (entre 2 y 10 ng) a las
células descongeladas y se mezcló en hielo. La mezcla de plásmido y
células se transfirió a una cubeta de electroporación de BioRad de
0,2 cm preenfriada y se electroporó a 2,0 kV, 600 \Omega y 25
\muF con una constante de tiempo de 6 ms. Se añadió 1 ml del medio
YT 2X a la cubeta de electroporación, se mezcló la solución de
células y plásmido con la punta de la pipeta y el contenido se
transfirió a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml nuevo. Se
incubaron las células a 37ºC durante 1 hora en un agitador a 2000
rpm. Las células se centrifugaron durante 2 minutos en una
microcentrífuga Eppendorf de velocidad ajustable en grupos de 6, se
decantó el sobrenadante y el sedimento de células se resuspendió en
el líquido remanente. Las células resuspendidas se sembraron en una
placa con medio LB que contenía kanamicina. Las placas se incubaron
a 28 ó 30ºC durante 2 ó 3 días. Se inocularon 50 ml de cultivo de LB
con una colonia transformada aislada en un matraz de 250 ml con
rifampicina a 100 \mug/ml, gentamicina a 25 \mug/ml y kanamicina
a 100 \mug/ml. El cultivo se incubó entre 24 y 36 horas a 28ºC y
250 rpm, y se usaron 10 ml del cultivo para inocular 500 ml de LB +
antibióticos en un matraz de 2 litros. Este cultivo se incubó
durante la noche a 28ºC con agitación a 250 rpm. El DNA plasmídico
se aisló de este cultivo de Agrobacterium y se verificó
mediante análisis de restricción.
Las plantas de Arabidopsis se cultivaron
en una tierra cubierta por una malla en macetas de plástico
cuadradas de 7,62 cm en un fitotrón programado para 16 horas de luz
y 8 horas de oscuridad a 20ºC durante 4 ó 5 semanas. Las plantas se
dejaron crecer hasta que el meristemo floral medía unos 5,08 cm de
alto. Los meristemos florales de las plantas de Arabidopsis
que había que transformar se retiraron dos días antes de exponerlos
al Agrobacterium. El cultivo de Agrobacterium se
centrifugó a 5000 rpm durante 5 minutos y el sedimento resultante se
resuspendió en 500 ml de medio de infiltración (4,3 g de sales MS
por litro, sacarosa al 5%, bencilaminopurina a 0,01 mg/ml, Silwet
L77 a 100 ml/l, pH 5,8). Las plantas de Arabidopsis se
empaparon en agua para saturar la tierra. Se transfirieron 500 ml de
la suspensión celular de bacterias al fondo de un desecador de vacío
estéril y las plantas de Arabidopsis en sus macetas se
colocaron boca abajo en la solución de Agrobacterium. Se
aplicó el vacío en el desecador durante 5 minutos y luego se liberó
lentamente. Este tratamiento con vacío se repitió tres veces, las
plantas se lavaron para eliminar el exceso de Agrobacterium y
se devolvieron a la cámara de cultivo. Las plantas infiltradas al
vacío se dejaron madurar, florecer y producir semillas. Las semillas
resultantes se secaron en un cuarto de secado con baja humedad a
35ºC durante 5 ó 10 días aproximadamente. Las semillas se retiraron
de las flores secas por aplastamiento, luego se filtraron por una
criba de malla de 425 \mum. Se esterilizaron aproximadamente 240
mg de semillas mediante la adición de 1 ml de etanol al 70%, se
mezcló en vórtex minuciosamente y se incubó durante 2 minutos a
temperatura ambiente. Las semillas se centrifugaron brevemente a
gran velocidad en una microcentrífuga Eppendorf y el sobrenadante se
eliminó. Las semillas sedimentadas se resuspendieron en 1 ml de
tampón de esterilización (1 parte de tritón X-100 al
10%, 10 partes de lejía y 20 partes de agua bidestilada), se
mezclaron con vórtex y se incubaron a temperatura ambiente durante
30 minutos. Las semillas se centrifugaron brevemente a gran
velocidad en una microcentrífuga Eppendorf y el sobrenadante se
decantó. Las semillas se resuspendieron en 1 ml de agua bidestilada,
se mezclaron con vórtex, se centrifugaron a gran velocidad en una
microcentrífuga y el sobrenadante se retiró. Esta etapa de lavado se
repitió tres veces y luego las semillas se transfirieron a un tubo
de centrífuga de 50 ml para un lavado final en 5 ml de agua
bidestilada. Las semillas se centrifugaron brevemente a la máxima
velocidad en una centrífuga de sobremesa Beckman. El sobrenadante se
decantó y las semillas se resuspendieron en 24 ml de agarosa LMP (de
bajo punto de fusión) al 0,8% a 50ºC, se mezclaron y 8 ml se
hicieron alícuotas en tres placas de GM de 150 mm que contenían el
antibiótico para la selección (bien kanamicina a 50 \mug/ml o bien
higromicina a 50 \mug/ml) y carbenicilina a 500 \mug/ml. Las
semillas plaqueadas se incubaron a 4ºC en la oscuridad durante 24 h,
luego a 20ºC con un ciclo diario de 16 horas de luz y 8 horas de
oscuridad. Los almácigos germinados se seleccionaron sobre placas
durante 5 ó 10 días, las plántulas se trasplantaron a nuevas placas
de selección y se trasplantaron a tierra unos 5 ó 10 días después de
la selección. Las plántulas recién trasplantadas se cubrieron con un
envoltorio de plástico durante 2 ó 3 días y luego se dejaron crecer
hasta el inicio de los meristemos florales.
Las plantas de Arabidopsis thaliana
(Columbia) transformadas preparadas en el ejemplo 23 se hicieron
crecer en tierra cubierta por una malla en macetas de plástico
cuadradas de de 7,62 cm en un fitotroón programado con 16 horas de
luz y 8 horas de oscuridad y 20ºC durante 4 ó 5 semanas. Las plantas
contienen el DNA foráneo integrado en su genoma en la forma de los
casetes de expresión diana y de receptor de acuerdo con la
invención. Dicho DNA integrado se transfiere de una generación a
otra de la planta mediante el proceso de fertilización como
consecuencia del cliclo de vida de la planta transformada.
La fertilización es un procedimiento por el cual
el gametofito masculino y los tejidos esporofítico o gametofítico
femenino interactúan para conseguir una producción satisfactoria de
un cigoto. Los granos de polen maduros se producen en las anteras de
la flor y se depositan sobre la superficie del estigma
(polinización), donde se hidrata y germina para producir un tubo
polínico. Las células espermáticas en el tubo polínico se dirigen al
saco embrionario presente en el ovario (gineceo) donde tienen lugar
los verdaderos episodios de la fertilización (fusión de los gametos)
para producir el cigoto. El cigoto, en la forma de una semilla, es
la realización de la siguiente generación de una línea vegetal. La
siguiente generación se denomina la "progenie" de la planta
transformada.
La progenie se puede formar por
autofertilización, en la que el gametofito masculino y el tejido
gametofítico femenino proceden de la misma planta. Esto quiere decir
que una única planta es la fuente del DNA genómico para la siguiente
generación. Alternativamente, la progenie se puede producir por
fertilización cruzada de dos plantas separadas al poner en contacto
el gametofito masculino de una planta con los tejidos esporofíticos
femeninos de otra planta distinta para producir la siguiente
generación de plantas. En este caso, el DNA genómico de la progenie
se deriva de dos plantas distintas. Además, cuando una planta
transformada se fertiliza de forma cruzada con una planta no
transformada, el DNA genómico de la progenie se compone de una DNA
genómico transgénico de una planta y un DNA genómico no transgénico
de una planta diferente. Sin tener en cuenta si la progenie de la
planta transformada se produce por autofertilización o fertilización
cruzada, parte de la progenie recibirá una contribución genética
desigual debido a la presencia del DNA foráneo integrado en el
genoma. Esta contribución genética desigual se puede averiguar
usando las técnicas de genética clásica y biología molecular.
Para producir la siguiente generación de plantas
que contienen los casetes de expresión diana y de receptor de
acuerdo con la invención, las plantas transformadas originales se
dejan madurar, florecer y producir semillas en condiciones
medioambientales controladas. Las semillas resultantes se secan
posteriormente en un cuarto de secado con baja humedad a 35ºC
durante 5 ó 10 días, aproximadamente. Las semillas se retiran de las
flores secas aplastando las silicuas y luego filtrando a través de
una criba de malla de 425 \mum para separar las semillas de otro
material vegetal. Las semillas se pueden utilizar para criar más
generaciones de plantas.
Este procedimiento de producir una siguiente
generación de plantas transformadas, aunque se ha descrito para
Arabidopsis, se puede aplicar a todas las angiospermas que
tienen integrado en su genoma los casetes de expresión diana y de
receptor de acuerdo con la invención.
\newpage
Todas las publicaciones y patentes mencionadas en
esta especificación son indicativas del nivel de experiencia de los
expertos en la técnica a los que pertenece esta invención.
Aunque la anterior invención se ha descrito con
cierto detalle por medio de dibujos y ejemplos con el propósito de
facilitar su comprensión, resultará obvio que se pueden practicar
ciertos cambios y modificaciones dentro del alcance de las
reivindicaciones adjuntas.
1) Información general:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Solicitante:
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Nombre: Ciba-Geigy AG
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Calle: Klybeckstr. 141
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Ciudad: Basilea
\vskip0.500000\baselineskip
- E)
- País: Suiza
\vskip0.500000\baselineskip
- F)
- Código postal (zip): 4002
\vskip0.500000\baselineskip
- G)
- Teléfono: +41 61 69 11 11
\vskip0.500000\baselineskip
- H)
- Fax: +41 61 696 79 76
\vskip0.500000\baselineskip
- I)
- Télex: 962 991
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Título de la invención: Control de la expresión génica en plantas mediante transactivación mediada por receptor en presencia de un ligando químico
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Número de secuencias: 18
\vskip0.800000\baselineskip
- iv)
- Formulario legible por ordenador:
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Soporte: disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Ordenador: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Sistema operativo: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Programa: Patente a liberar n.º 1.0, versión n.º 1.30B
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 42 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF43"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGCGGATCCT AAACAATGAA GCGGCGCTGG TCGAACAACG GC
\hfill42
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 34 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF23"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGCGGGATCC ATGCGGCCGG AATGCGTCGT CCCG
\hfill34
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF42"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGCGGATCCA TGGACAACTG CGACCAGGAC
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF37"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCGGGATCCC CCACCGTACT CGTCAATTC
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 45 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SA115"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTCGAGCTCT CGGATCCTAA AACAATGGCC CCCCCGACCG ATGTC
\hfill45
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF25"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGATCCGACAA GGGTTCAATG CACTTGTCA
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF26"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGATCTGACAA GTGCATTGAA CCCTTGTCG
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 35 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF30"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGCGGATCCA TGGGTCGCGA TGATCTCTCG CCTTC
\hfill35
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 11 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- ix)
- Rasgos distintivos
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Nombre/clave: rasgo misceláneo
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Localización: 1..11
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Otra información: /nota = "policonector usado para unir el dominio de transactivación de C1 a EcR"
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipVGSRSRVSSH A
\hfill11
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "cadena positiva del oligonucleótido usado para crear pSKGAL2.3"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGGGGATCC TAAGTAAGTA AGGTAC
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "cadena complementaria del oligonucleótido usado para crear pSKGAL2.3"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTACTTACT TAGGATCCCC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF165"
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGCGGATCCA TGGACACCAA ACATTTCCT
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF167"
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGCGGAATTC TAAACAATGG ACACCAAACA TTTCCT
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 31 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF170"
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGCAGATCTG GGTGGCTTGA TGTGGTGCCT C
\hfill31
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF168"
\vskip0.800000\baselineskip
- iii)
- Hipotético: no
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTCTTCACTC TTGTGGAGTG
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF197"
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTCTACGCAA AGCGCCTCTC GATCCTC
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido NEB1211"
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTAAAACGAC GGCCAGT
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
2) Información para la SEQ ID N.º 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- i)
- Características de la secuencia
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Longitud: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- C)
- Catenariedad: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- Tipo de molécula: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- A)
- Descripción: /des = "oligonucleótido SF140"
\vskip0.800000\baselineskip
- xi)
- Descripción de la secuencia: SEQ ID N.º 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGCAGATCTT GGACGAGCCG TGCTTCTCCG GC
\hfill32
Claims (29)
1. Una célula vegetal o planta transgénica y la
progenie de la misma que comprende:
a) un primer casete de expresión de receptor que
codifica un primer polipéptido receptor de clase II de la familia de
receptores nucleares de hormonas esteroideas y tiroideas que
comprende un primer dominio de unión a ligando;
b) un segundo casete de expresión de receptor que
codifica un segundo polipéptido receptor de clase II de la familia
de receptores nucleares de hormonas esteroideas y tiroideas que
comprende un segundo dominio de unión a ligando; y
c) un casete de expresión diana que codifica un
polipéptido diana.
2. Una célula vegetal o planta de acuerdo con la
reivindicación 1, en la que el casete de expresión diana codifica un
polipéptido diana que interfiere con la fertilidad de la planta.
3. Un método para producir una célula vegetal o
planta de acuerdo con la reivindicación 1, que comprende transformar
una célula vegetal o una planta con
a) un primer casete de expresión de receptor que
codifica un primer polipéptido receptor de clase II de la familia de
receptores nucleares de hormonas esteroideas y tiroideas que
comprende un primer dominio de unión a ligando;
b) un segundo casete de expresión de receptor que
codifica un segundo polipéptido receptor de clase II de la familia
de receptores nucleares de hormonas esteroideas y tiroideas que
comprende un segundo dominio de unión a ligando; y
c) un casete de expresión diana que codifica un
polipéptido diana.
4. Un método de acuerdo con la reivindicación 3,
que adicionalmente comprende obtener progenie de las células
vegetales o plantas transformadas con dichos casetes de
expresión.
5. La planta de la reivindicación 1 ó 2, en la
que dicha planta es maíz.
6. La planta de la reivindicación 1 ó 2, en la
que dicha planta es trigo.
7. Un método para controlar la expresión génica
en una planta de acuerdo con la reivindicación 1, que comprende:
a) expresar los mencionados primer y segundo
polipéptidos receptores en dicha planta; y
b) poner en contacto dicha planta con uno o más
ligandos químicos que son complementarios al dominio de unión a
ligando de dichos primer y segundo polipéptidos receptores por lo
cual dichos polipéptidos receptores, en presencia de dicho ligando
químico, activan la expresión de dicho polipéptido diana.
8. El método de las reivindicación 7, en el que
dicho primer polipéptido receptor es el receptor de la ecdisona
9. El método de la reivindicación 8, en el que
dicho primer polipéptido receptor comprende además un dominio de
transactivación heterólogo.
10. El método de la reivindicación 9, en el que
dicho dominio de transactivación heterólogo es el dominio de
transactivación del gen regulador C1 de maíz.
11. El método de la reivindicación 8, en el que
dicho primer polipéptido receptor comprende además un dominio de
unión al DNA heterólogo.
12. El método de la reivindicación 11, en el que
dicho dominio de unión al DNA es el dominio de unión al DNA de la
proteína GAL4 de levadura.
13. El método de la reivindicación 7, en el que
dicho segundo polipéptido receptor es ultraespiráculo.
14. El método de la reivindicación 13, en el que
dicho segundo polipéptido receptor comprende además un dominio de
transactivación heterólogo.
15. El método de la reivindicación 14, en el que
dicho dominio de transactivación heterólogo es el dominio de
transactivación de la proteína VP16 del virus del herpes simple.
16. El método de la reivindicación 7, en el que
dicho primer o segundo polipéptido receptor ha sido mutado en el
dominio de unión a ligando para que el dominio de unión a ligando
mutado sólo reconozca el uno o más ligandos químicos con los que se
pone en contacto la planta en la etapa b).
17. El método de la reivindicación 7, en el que
dicho ligando químico es una hormona de insectos, un antagonista de
hormona de insectos o un agonista de hormona de insectos.
18. El método de la reivindicación 17, en el que
dicho ligando químico es fenoxycarb, CGA 59 205, tebufenocida o RH
5849.
19. El método de la reivindicación 7, en el que
dicho casete de expresión diana comprende una región reguladora 5'
que además comprende entre 1 y 11 copias de un elemento de
respuesta.
20. Un método para controlar la fertilidad de una
planta de acuerdo con la reivindicación 2, que comprende:
a) expresar los mencionados primer y segundo
polipéptidos receptores en dicha planta transformada; y
b) poner en contacto dicha planta transformada
con uno o más ligandos químicos que son complementarios al dominio
de unión a ligando de los mencionados primer y segundo polipéptidos
receptores por lo cual dichos polipéptidos receptores, en presencia
de dicho ligando químico, activan la expresión de dicho polipéptido
diana.
21. El método de la reivindicación 20, en el que
al menos uno de dichos casetes de expresión de receptor comprende un
promotor específico de anteras unido operativamente a la secuencia
codificante de dicho polipéptido receptor.
22. El método de la reivindicación 20, en el que
al menos uno de dichos casetes de expresión de receptor comprende un
promotor específico de pistilo unido operativamente a la secuencia
codificante de dicho polipéptido receptor.
23. El método de la reivindicación 20, en el que
la expresión de dicho polipéptido diana reduce la fertilidad de la
planta.
24. El método de la reivindicación 23, en el que
dicho polipéptido diana es la ribonucleasa barnasa.
25. El método de la reivindicación 20, en el que
dicho casete de expresión diana codifica la versión antisentido de
una secuencia codificante crítica para la fertilización.
26. El método de la reivindicación 20, en el que
la expresión de dicho polipéptido diana aumenta la fertilidad de la
planta.
27. El método de la reivindicación 26, en el que
dicho polipéptido diana es el inhibidor de ribonucleasa barstar.
28. El uso de la planta de acuerdo con la
reivindicación 1 para inducir la expresión del polipéptido diana
mediante una hormona de insectos, un antagonista de hormona de
insectos o un agonista de hormona de insectos.
29. El uso de una planta de acuerdo con la
reivindicación 2 para controlar la fertilidad de la planta.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US39803795A | 1995-03-03 | 1995-03-03 | |
US398037 | 1995-03-03 |
Publications (1)
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