ES2211959T3 - Inmortalizacion y desinmortalizacion de celulas. - Google Patents
Inmortalizacion y desinmortalizacion de celulas.Info
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Abstract
SE PROPORCIONAN METODOS Y COMPOSICIONES PARA LA INMORTALIZACION CONDICIONAL DE CELULAS.
Description
Inmortalización y desinmortalización de
células.
La invención se refiere a procedimientos y
composiciones para la inmortalización y desinmortalización de
células y, en particular, a los procedimientos que se aplican en
terapia génica.
La terapia génica, según la cual se añade ácido
nucleico exógeno a una célula para corregir defectos genéticos o
para tratar alteraciones, es un campo que está emergiendo
rápidamente. Frecuentemente, la terapia génica utiliza células de
pacientes como vehículo para el ácido nucleico exógeno; esto es, se
pueden extraer las células de un paciente, manipularlas
genéticamente y volverlas a introducir en el paciente. Véase, por
ejemplo, la patente US Nº 5.399.346.
Un problema con esta aproximación es que las
células extraídas tienen, generalmente, una duración limitada en
cultivo, sin manipulación genética adicional. De esta manera,
frecuentemente, las líneas celulares extraídas se transforman con
un gen de inmortalización como un oncogén. Esto permite el
crecimiento y proliferación indefinidas de las células. Sin embargo,
las células inmortalizadas que contienen oncogenes no son
candidatos apropiados para el transplante, debido a lo indeseable
de introducir oncogenes en un paciente.
EP 0 808 364A, citable bajo el Art. 54(3)
del CPE, describe vectores que incluyen por lo menos dos o más
oncogenes.
De acuerdo con esto, es un objeto de la invención
proporcionar procedimientos y composiciones para la creación de
líneas celulares inmortalizadas que puedan crecer y perpetuar ex
vivo y, después, inducir la desinmortalización, es decir,
extraer los oncogenes, antes de la introducción en un paciente o
animal.
De acuerdo con los objetos anteriores, la
invención proporciona una célula inmortalizada aislada que contiene
puntos diana para recombinasas que flanquean un solo gen de
inmortalización en el genoma de la célula. Los puntos diana son
capaces de mediar la extracción del gen de inmortalización cuando
los puntos diana se ponen en contacto con una recombinasa.
En un aspecto más, las células inmortalizadas
comprenden ácido nucleico exógeno que comprende un gen marcador de
selección, el cual puede ser un gen marcador de selección positivo o
negativo. Las células pueden contener, también, un punto de parada
y un gen marcador de selección adicional.
En un aspecto adicional, se proporcionan
procedimientos para crear una célula inmortalizada que contiene
puntos diana para recombinasas que flanquean un solo gen de
inmortalización en el genoma de dicha célula inmortalizada. El
procedimiento comprende transformar una célula con ácido nucleico
exógeno que comprende a) un primer punto diana de recombinasa; b)
un gen de inmortalización sencillo; y c) un segundo punto diana para
recombinasa, de tal manera que en ausencia de una recombinasa dicho
ácido nucleico exógeno se incorpora en el genoma de dicha célula.
El ácido nucleico exógeno puede comprender, también, por lo menos
un gen marcador de selección.
Otros procedimientos se proporcionan para la
desinmortalización de una célula inmortalizada que contiene ácido
nucleico exógeno que comprende puntos diana para recombinasas que
flanquean un gen sencillo de inmortalización en el genoma de dicha
célula inmortalizada. El procedimiento comprende poner en contacto
dichos puntos diana para recombinasas con una recombinasa capaz de
reconocer dichos puntos diana para recombinasas.
Un aspecto adicional de la invención proporciona
procedimientos para la desinmortalización de una célula
inmortalizada. El procedimiento comprende incorporar ácido nucleico
exógeno que comprende un primer punto diana para recombinasas; un
gen sencillo de inmortalización; un gen marcador de selección
negativo; y un segundo punto diana para recombinasa. El ácido
nucleico exógeno se incorpora en el genoma de una célula para
producir una célula inmortalizada la cual contiene un gen de
inmortalización eliminable en una orientación tal que la
eliminación de la secuencia entre los puntos diana para recombinasas
elimina el gen de inmortalización y el gen marcador de selección
negativo. El procedimiento comprende, además, poner en contacto los
puntos diana para recombinasas con una recombinasa que reconoce
dichos puntos diana para recombinasa de tal manera que se extraiga
dicho gen de inmortalización y dicho gen marcador de selección
negativo. Las células que no han eliminado el gen de inmortalización
y el gen de selección negativo se seleccionan otra vez mediante
cultivo de las células en presencia de un agente de selección
negativo apropiado.
Se proporcionan procedimientos adicionales para
la desinmortalización de una célula inmortalizada. El procedimiento
comprende incorporar ácido nucleico exógeno que comprende un primer
punto diana para recombinasas; un gen de inmortalización sencillo;
un gen marcador de selección positivo; y un segundo punto diana
para recombinasa. El ácido nucleico se incorpora en el genoma de una
célula para producir una célula inmortalizada que contenga un gen
de inmortalización eliminable en una orientación tal que la
eliminación de la secuencia entre los puntos diana para
recombinasas elimina el gen de inmortalización, resultando en la
expresión del marcador de selección. El procedimiento comprende,
además, poner en contacto dichos puntos diana para recombinasas con
una recombinasa que reconozca dichos puntos diana para recombinasas
de tal manera que se elimine el gen de inmortalización. A
continuación, las células se aíslan utilizando un agente de
selección positivo. Se seleccionan en contra las células que no
expresan el marcador de selección.
Las Figuras 1A, 1B, 1C y 1D describen el diseño
de cuatro vectores para la inmortalización condicional. RTS es un
punto diana para recombinasas. MPCS es un punto de clonación
poliengarce múltiple, en el que se inserta un gen de
inmortalización. PARADA es una secuencia de parada de la traducción
o transcripción. LTR es una repetición terminal larga vírica. SV40
es el promotor procedente del SV40.
Las Figuras 2A, 2B, 2C, 2D y 2E describen
realizaciones preferidas. La Figura 2(A) y 2(B) son
dos diseños alternativos para el mismo vector básico. En ambos
vectores, el gen de inmortalización (p.e. v-myc) se
inserta en un punto de clonación múltiple poliengarce (MPCS)
flanqueado de los RTS, es decir, puntos loxP o puntos FRT.
Dirección cadena abajo de los MPCS existe una secuencia de
"PARADA" tal como TGACTGACCTGA diseñada para evitar la
traducción dirección cadena debajo de un marcador seleccionable
(fosfatasa alcalina, marcadores de selección de fármacos, proteínas
de superficie celular, proteína de fluorescencia verde, lacZ, etc).
Existe, también, un marcador de selección de fármacos diferente
para seleccionar la inmortalización inicial de las células, por
ejemplo, histidinol, neomicina, higomicina, etc. El marcador de
selección de fármaco es conducido por un LTR vírico y el oncogén
mediante un promotor-intensificador interno (2A)
tal como el intensificador de SV40 o viceversa (2B). La Figura 2C
es el vector retmycgal utilizado en los Ejemplos; el gen de
inmortalización utilizado fue v-myc, el segundo
marcador seleccionable fue lacZ, y el primer marcador seleccionable
fue el histinol. La Figura 2D es el vector rettknew.ap, en donde el
gen de inmortalización era v-myc, el promotor
interno era tk, el primer marcador seleccionable era neo y el
segundo marcador seleccionable era la fosfatasa alcalina. La Figura
2E es el vector ret.INS.ap, en donde el gen de inmortalización era
v-myc, el IRES en un punto de entrada interno del
ribosoma, el primer marcador seleccionable era neo y el segundo
marcador seleccionable era la fosfatasa alcalina.
Las Figuras 3A, 3B y 3C describen construcciones
de inmortalización/desinmortalización que utilizan marcadores de
selección negativos para asegurar que todas las células han sido
desinmortalizadas. La Figura 3A utiliza el gen de inmortalización
como marcador de selección para la transformación;
alternativamente, el análisis clonal utilizando la exposición a un
agente de selección negativo puede servir como marcador de la
transformación. La Figura 3B utiliza un marcador de selección
positivo como marcador de la transformación. Los genes marcadores de
selección positivos y negativos se pueden localizar en cualquier
orden. La Figura 3C añade una recombinasa bajo control de un
promotor inducible; también se puede añadir un gen de selección
positiva. Otra vez, estos genes se pueden localizar en cualquier
orden. No se describen los promotores para la transcripción de
genes diferentes de la recombinasa ya que estos se pueden localizar
en una diversidad de sitios.
Las Figuras 4A y 4B describen la utilización de
dos recombinasas y RTS diferentes. La Figura 4A permite la
expresión del gen de inmortalización y un primer gen marcador de
selección, con el segundo gen marcador de selección no expresado
hasta el corte entre los dos RTS1. Una vez se escinde RTS 1, se
expresa el segundo gen marcador de selección, permitiendo la
selección de las células desinmortalizadas. Antes del transplante,
la exposición a la recombinasa que reconoce RTS 2 corta el segundo
marcador de selección, minimizándose, de esta manera, el ácido
nucleico exógeno. La Figura 4B es similar, excepto en que se
incluye un gen exógeno adicional que codifica, por ejemplo, un
agente terapéutico. De esta manera, las células se pueden
transplantar con el gen exógeno expresado, y algún tiempo después,
se exponen las células a la segunda recombinasa para eliminar el
gen exógeno.
La Figura 5 describe una construcción de
inmortalización condicional que evita la utilización de un punto de
PARADA colocando los RTS en medio del gen marcador de selección. Los
RTS deben estar incluidos en los exones, para que en la eliminación
quede uno de los RTS en el genoma. En la transformación de células
con esta construcción, el gen de inmortalización y el primer gen
marcador de selección se transcriben, utilizando un segundo
promotor. Las células inmortalizadas se seleccionan, a continuación,
basándose en el primer marcador de selección. Con la exposición a
una recombinasa que reconozca los RTS, el gen de inmortalización y
el primer marcador de selección se eliminan, junto con uno de los
puntos RTS. El segundo marcador de selección se transcribe, siendo
eliminado el segundo RTS como resultado de las señales de empalme de
RNA que son reconocidas por la maquinaria celular de las células
hospedadoras. Esto permite que el segundo gen marcador de selección
sea transcrito.
Las Figuras 6A y 6B describen la utilización de
un promotor inducible con el gen recombinasa. Las Figuras 6A y 6B
corresponden a la construcción descrita en la Figura 1C, pero con
un gen recombinasa bajo control de un promotor inducible. La Figura
6A describe una construcción que dejará el gen recombinasa en el
genoma, después de la eliminación, y la Figura 6B describe una
construcción que elimina el gen recombinasa.
La invención está dirigida a procedimientos y
composiciones para la inmortalización condicional de células. Por
"inmortalización condicional" se entiende en el presente
documento un procedimiento mediante el cual las células se
inmortalizan de tal manera que se pueden desinmortalizar algún
tiempo después. De esta manera, bajo ciertas condiciones, las
células se inmortalizan; bajo condiciones diferentes, tal y como se
subraya más abajo, las células no se inmortalizan mucho más tiempo,
vuelven a su patrón normal de senescencia y no crecen y ni
proliferan indefinidamente mucho más tiempo en el cultivo
celular.
Según es entendido por aquellos de la materia,
por "inmortalizado" se entiende en el presente documento que
las células se han transformado con un gen de inmortalización, de
tal manera que la expresión del gen de inmortalización confiere la
capacidad de crecer y proliferar sustancialmente de manera
indefinida en el cultivo.
Por "gen de inmortalización" se entiende en
el presente documento un gen que supera los mecanismos de
senescencia de una célula, permitiendo a la célula que sea
subcultivada, de manera sustancial, indefinidamente. Los genes de
inmortalización son bien conocidos en la materia. El gen de
inmortalización es, en general, exógeno a las células utilizadas y,
generalmente, se integra en el genoma de la célula. Ejemplos de
genes de inmortalización incluyen: (1) oncogenes nucleares tales
como v-myc, N-myc, antígeno T y el oncogen del sarcoma
de Ewing (Fredericksen et al., (1988) Neuron 1:
439-448; Bartlett, P. et al., (1988)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:
3255-3259, y Snyder, E. Y. Et al., (1992)
Cell 68: 33-51), (2) oncogenes
citoplasmáticos tales como bcr-abl y la
neurofibromina (Solomon, E., et al., (1991) Science
254: 1153-1160), (3) oncogenes de membrana
tales como neu y ret (Aaronson, A.S.A. (1991)
Science 254: 1153-1161), (4)
mutaciones dominantes de genes supresores de tumores tales como el
mutante p53 y el mutante Rb (retinoblastoma) (Weinberg, R.A. (1991)
Science 254: 1138-1146) y (5) otros
genes de inmortalización tales como el dominante negativo
Notch (Coffman, C. R. et al., (1993) Cell
23: 659-671); (5) factores de crecimiento;
(6) receptores de factores de crecimiento; y (7) genes de muerte
anticelular tales como Bcl2. Los oncogenes particularmente
preferidos incluyen el v-myc y el antígeno T de SV40.
Por "desinmortalización" se entiende en el
presente documento un procedimiento mediante el cual todo o parte
del gen de inmortalización de una célula inmortalizada se extrae,
físicamente, del genoma de la célula, dejando que la célula vuelva
a un ciclo de senescencia más normal, de tal manera que no crece ni
prolifera indefinidamente más tiempo en el cultivo. Una célula
desinmortalizada puede tener toda a parte de la construcción de
inmortalización condicional extraída. De esta manera, como será
apreciado por aquellos de la materia, junto con la descripción del
presente documento, se puede preparar una diversidad de
construcciones de inmortalización condicional, que resulta en
diferentes cantidades de restos de ácido nucleico exógeno en el
genoma de la célula. En una realización preferida, se elimina de una
célula desinmortalizada todo el gen de inmortalización.
Los procedimientos de inmortalización y
desinmortalización condicional de la invención se cumplen
utilizando un sistema recombinasa específica de un punto. Muchos de
estos sistemas son conocidos, incluyendo la recombinasa Cre
procedente del bacteriófago P1, y la recombinasa FLP ("flip")
procedente de Saccharomyces cerevisiae. El sistema Cre
utiliza la recombinasa Cre, que es una proteína de 38 KDa, y dos
puntos diana para recombinasa de 34 pares de bases (RTS), llamados
loxP. Se puede dar la recombinación, directamente, entre los puntos
loxP repetidos, de manera directa, en la misma molécula para
eliminar el segmento de DNA que interviene. Véase Sauer et
al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5166 (1988); Sauer et
al., Nuc. Acids Res. 17:147 (1989); Lakso et al., Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 89:6232; Hoess et al., J. Mol. Biol.
181:351-362 (1985); Abremski et al., Cell 32:
1301 (1983); Sternberg et al., J. Mol. Biol. 150:
467-486 (1981) y Orban et al., Proc. Natl.
Acad. Sci. USA 89:6861 (1992). El sistema FLP utiliza la proteína
FLP y dos puntos diana de recombinación FLP (referidos FRT en la
materia; indicados aquí como RTS) que consisten en dos repeticiones
de 13 pares de bases invertidas y un espaciador de 8 pares de bases
(véase, por ejemplo, O'Gorman, Science 251:1351 (1991); Jayaram,
PNAS USA 82:5875-5879 (1985); Senecof et al.,
PNAS USA 82:7270 (1985); y Gronostajski et al., J. Biol.
Chem. 260:12320 (1985)).
Por "punto diana para recombinasa" (RTS) se
entiende en el presente documento una secuencia de ácido nucleico
que es reconocida por una recombinasa para la eliminación de la
secuencia que interviene. Se debe entender que se requieren dos RTS
para la eliminación. De esta manera, cuando se utiliza la
recombinasa cre, cada RTS comprende un punto loxP; cuando los
puntos loxP son utilizados, la correspondiente recombinasa es la
recombinasa cre. Es decir, la recombinasa debe corresponder a o
reconocer los RTS. Cuando se utiliza la recombinasa FLP, cada RTS
comprende un punto diana de recombinación FLP (FRT); cuando se
utilizan puntos FRT, la recombinasa correspondiente es la
recombinasa FLP.
Utilizando estos sistemas recombinasas, se pueden
extraer los genes de inmortalización insertados en una célula
hospedadora, una vez se han expuesto a la recombinasa adecuada. De
esta manera, las construcciones de inmortalización condicional se
insertan en una célula, en una orientación que resulte en la
expresión del gen de inmortalización. Para todas las realizaciones,
las células hospedadoras no deben expresar ácido nucleico, y,
preferiblemente, no contienen ácido nucleico codificante de la
recombinasa adecuada antes de la adición del ácido nucleico exógeno
de la invención. Algún tiempo después, la recombinasa se expresa y
contacta con los puntos diana para recombinasa, extrayendo el gen
que interviene en la inmortalización.
Preferiblemente, se utilizan los genes marcadores
de selección para detectar o seleccionar la inmortalización y
desinmortalización exitosa. Por ejemplo, la expresión de un primer
marcador de selección permite la detección de inmortalización
exitosa; es decir, el gen marcador se expresa cuando los genes de
inmortalización se han integrado en el genoma de la célula. La
expresión de un segundo marcador de selección, preferiblemente
diferente del primer gen marcador de selección, indica la
extracción del gen de inmortalización, tal y como se describe con
más detalle posteriormente. Estos marcadores de selección pueden
ser marcadores de selección positivos o negativos. Como es bien
conocido en la materia, "gen marcador de selección" o
equivalentes significa genes que permiten la selección o detección
de células que contienen el gen. "Selección positiva" se
refiere a un procedimiento mediante el cual sólo las células que
contengan el marcador de selección positivo sobrevivirán a la
exposición del agente de selección positivo o serán marcadas o
detectadas. Por ejemplo, la resistencia a un fármaco es un marcador
de selección positivo común; las células que contengan el gen de
resistencia a un fármaco crecerán en un medio que contenga el
fármaco, y aquellas células que no contengan el gen de resistencia
a fármaco morirán. Genes de resistencia a fármacos adecuados son la
histidinol deshidrogenasa, resistencia a neomicina, resistencia a
higromicina, y resistencia a puromicina, entre otros. Otros genes
marcadores de selección positivos incluyen los genes que permiten
la clasificación o el cribado de células. Estos genes incluyen el
gen de la fosfatasa alcalina, el gen de la proteína fluorescente
verde, el gen de lacZ, y marcadores de superficie como CD8, entre
otros. En una realización, según se describe más abajo, el gen de
inmortalización por sí mismo puede servir como marcador de selección
positivo.
En una realización adicional, se utilizan
marcadores de selección negativos. "Selección negativa" se
refiere a un procedimiento mediante el cual las células
transfectadas con un marcador de selección negativo serán matadas al
exponerse a un agente de selección negativo adecuado que mate las
células que contengan el marcador de selección negativo. Por
ejemplo, las células que contienen el gen de la timidina quinasa
del virus del herpes simples (HSV-tk) son sensibles
al ganciclovir (GANC®). De manera similar, el gen de Gpt da lugar a
células sensibles a la 6-tioxantina. Cuando se
posiciona, de manera adecuada, en una construcción de
inmortalización condicional, el gen marcador de selección negativa
se puede utilizar para aislar células que se han desinmortalizado.
Esto es, el marcador de selección negativa se expresa con el gen de
inmortalización, de tal manera que si el gen de inmortalización
todavía está presente, las células serán matadas.
Generalmente, los vectores y técnicas de
inmortalización-desinmortalización condicionales
proceden como sigue. Las construcciones genéticas utilizadas para
la inmortalización se establecen de tal manera que una primera
transformación con ácido nucleico exógeno resulta en la
inmortalización. Las células se pueden hacer crecer y propagar, y
se pueden añadir otros genes, como se ha subrayado más arriba. En
algunos casos, cuando las células son células madre, las células
inmortalizadas se pueden diferenciar, si se desea. A continuación,
antes del transplante o algún tiempo después, las células se
manipulan de tal manera que el gen de inmortalización se elimina; es
decir, las células se desinmortalizan.
En una realización preferida, el vector de
clonación, que introduce el gen de inmortalización en las células,
se construye de tal manera que el gen de inmortalización,
cualquiera de los marcadores de selección, promotores y RTS se
integran en el genoma simultáneamente. Esto es, no es necesaria la
integración de DNA adicional en el genoma para que facilite la
desinmortalización. De manera alternativa, el gen de inmortalización
se puede introducir en el genoma con secuencias flanqueantes
suficientes que permita la construcción de vectores de recombinación
homólogos para introducir secuencias adicionales requeridas.
En una realización preferida, la
desinmortalización sucede como resultado de una introducción de
ácido nucleico exógeno adicional que codifica la recombinasa en la
célula, como se subraya más abajo.
En una realización, la invención proporciona
líneas de células inmortalizadas de manera condicional. Estas
líneas de células inmortalizadas contienen un ácido nucleico que
comprende una variedad de construcciones de inmortalización
condicionales diferentes como se indica más abajo. Estas líneas de
células inmortalizadas se pueden preparar mediante la
transformación de por lo menos una célula con un ácido nucleico que
comprenda las construcciones de la invención.
Estas líneas de células inmortalizadas, de manera
condicional, se pueden utilizar en una variedad de procedimientos
para la desinmortalización, como se indica más abajo.
En otra realización, las líneas celulares
contienen un ácido nucleico que comprende puntos diana para
recombinasa que flanquean un gen de inmortalización en el genoma de
las células de las líneas celulares. Estos puntos diana deben estar
orientados de manera que los RTS sean capaces de mediar en la
eliminación del gen de inmortalización cuando los RTS se ponen en
contacto con una recombinasa. Esto es, en ausencia de la
recombinasa que reconozca los RTS, el gen de inmortalización se
incorpora en el genoma de la célula y se expresa, para crear una
línea de células inmortalizadas. Cuando los RTS se exponen a la
recombinasa correspondiente, tiene lugar la eliminación de la
secuencia entre los RTS. Puesto que esta secuencia contiene el gen
de inmortalización, el acontecimiento de eliminación resulta en una
pérdida del gen, es decir, la desinmortalización.
En una realización más, la invención proporciona
líneas de células inmortalizadas que contienen un ácido nucleico
que comprende un primer punto diana para recombinasa, un gen de
inmortalización, un gen marcador de selección negativa, y un segundo
punto diana para recombinasa, según se describe, de manera general,
en la Figura 3A. Como antes, en ausencia de la recombinasa que
reconozca los RTS, el gen de inmortalización se incorpora en el
genoma de la célula y se expresa, para crear una línea de células
inmortalizadas. Los RTS son capaces de mediar en la eliminación del
gen de inmortalización cuando los RTS se ponen en contacto con una
recombinasa. En una realización preferida, los genes de
inmortalización y marcador de selección negativa están flanqueados
por los RTS. De esta manera, en la transformación, el gen de
inmortalización y marcador de selección negativa se expresan y las
células transformadas se pueden seleccionar en base a la
inmortalización o expresión del marcador de selección negativa. De
la exposición o puesta en contacto con una recombinasa que
reconozca los RTS, el gen de inmortalización y el marcador de
selección negativa se eliminan, y las células desinmortalizadas se
pueden seleccionar por exposición a un agente de selección
negativa. Esto es, las células desinmortalizadas sobrevivirán y,
aquellas que todavía contengan el gen de inmortalización y el gen
marcador de selección negativa morirán.
En una realización adicional, la invención
proporciona líneas de células inmortalizadas que contienen un ácido
nucleico que comprende un primer punto diana para recombinasa, un
gen de inmortalización, un gen marcador de selección y un segundo
punto diana para recombinasa. Como antes, en ausencia de la
recombinasa que reconozca los RTS, el gen de inmortalización se
incorpora en el genoma de la célula y se expresa, para crear una
línea de células inmortalizadas. Los RTS son capaces de mediar en la
eliminación del gen de inmortalización cuando los RTS se ponen en
contacto con la recombinasa. En una realización, la orientación de
la construcción es preferiblemente de tal manera que en ausencia de
una recombinasa, el gen de inmortalización se expresa pero no el
gen marcador de selección. Esto se realiza, preferiblemente,
mediante la adición de un punto de parada a la construcción, tal
como la mostrada en las Figuras 1 y 4, aunque como se describe en
la Figura 5, también se puede realizar teniendo uno de los RTS en
medio del gen marcador de selección, dentro de los intrones. En la
exposición a una recombinasa que reconozca los RTS, la secuencia
que interviene se elimina, resultando en una pérdida del gen de
inmortalización y la expresión del gen marcador de selección,
permitiendo, de esta manera, la selección de las células
desinmortalizadas. Alternativamente, la orientación de la
construcción es tal que en la transformación, se expresan el gen de
inmortalización y el gen de selección, permitiendo, de esta manera,
la selección de inmortalización. En la exposición de una recombinasa
que reconozca los RTS, el gen de inmortalización y el gen de
selección se eliminan, y las células resultantes se pueden
seleccionar por la desinmortalización mediante la pérdida del gen
de selección.
En una realización más, la invención proporciona
líneas de células inmortalizadas que contienen un ácido nucleico
que comprende un primer punto diana para recombinasa, un gen de
inmortalización, un primer gen marcador de selección, un segundo
punto diana para recombinasa y un segundo gen marcador de
selección. En esta realización, la orientación de la construcción es
tal que en la transformación, el gen de inmortalización y el primer
gen marcador de selección se expresan, y el segundo gen marcador de
selección no. Esto se cumple preferiblemente mediante la adición de
un punto de parada a la construcción, aunque como antes, se puede
realizar mediante vías alternativas. En la exposición o contacto
con una recombinasa que reconozca los RTS, el gen de inmortalización
y el primer gen marcador de selección se eliminan y el segundo gen
marcador de selección se expresa. Esto permite la selección de
células desinmortalizadas en base al segundo gen marcador de
selección.
Varias realizaciones específicas se muestran en
las Figuras, las cuales utilizan un vector de clonación retrovírico
preferido con los sistemas recombinasa Cre/loxP o FLP/FRT. Aquellos
expertos en la materia reconocerán que una diversidad de
construcciones resultará en la creación de células inmortalizadas,
las cuales se pueden desinmortalizar, a continuación, de las que se
muestran en las Figuras solo unas pocas.
En una realización preferida, las construcciones
de inmortalización condicional son como se describen en las Figuras
1 y 2. Primero, se construye un vector de clonación que contiene:
un primer marcador de seleccionable con un primer promotor; un
segundo promotor; un punto de clonación múltiple poliengarce (MPCS)
flanqueado por puntos diana para recombinasa (RTS); y un segundo
marcador seleccionable. El gen de inmortalización, generalmente un
oncogén, se inserta en los MPCS, junto con una secuencia de parada
opcional que evita la expresión del segundo marcador seleccionable.
Las secuencias de parada como TGACTGACCTGA son conocidas en la
materia. De esta manera, en ausencia de una recombinasa, el gen de
inmortalización se expresa utilizando el segundo promotor y el
primer marcador seleccionable se expresa utilizando el primer
promotor. Esto permite la selección de células inmortalizadas,
transformadas, pero la secuencia de parada evita la expresión del
segundo marcador. De esta manera, las células inmortalizadas se
pueden clonar y hacer crecer, y se pueden añadir genes si se desea.
Para la desinmortalización, se lleva a cabo la expresión
(preferiblemente temporal) de la recombinasa adecuada, utilizando
técnicas bien conocidas en la materia. Esto resulta en la
eliminación de los puntos diana para recombinasa, los MPCS que
contiene el gen de inmortalización, y la secuencia de parada. De
esta manera, el segundo gen marcador seleccionable se expresa ahora
y las células desinmortalizadas se pueden seleccionar en base a
este gen marcador.
En la Figura 1A, el primer marcador seleccionable
se traduce mediante el primer promotor (o alternativamente a partir
del promotor interno al LTR) y el gen de inmortalización insertado
en el MPCS se lleva mediante el segundo promotor. En ausencia de
una recombinasa, la secuencia de parada evita la traducción del
segundo marcador seleccionable. En la exposición a la recombinasa,
el gen de inmortalización y la secuencia de parada se eliminan,
permitiendo el segundo marcador seleccionable dejar salir el
segundo promotor. En la Figura 1B, la traducción del gen de
inmortalización se lleva mediante el promotor LTR interno, el
primer marcador seleccionable se traduce mediante el promotor de
SV40 o equivalentes, pero la secuencia de parada previene la
traducción del segundo marcador seleccionable. En la exposición a
la recombinasa, el gen de inmortalización y la secuencia de parada
se eliminan, permitiendo la traducción del segundo marcador
seleccionable. En la Figura 1C, el primer marcador seleccionable y
el gen de inmortalización se traducen, ya sea mediante un primer
promotor o mediante el promotor de LTR, pero la secuencia de parada
previene la traducción del segundo marcador seleccionable. En la
exposición a la recombinasa, el gen de inmortalización y la
secuencia de parada se eliminan, permitiendo la traducción del
segundo marcador seleccionable a través del promotor o del LTR. En
la Figura 1D, la traducción de la proteína fluorescente verde y el
gen de inmortalización sucede mediante el promotor LTR (u otro
promotor). La proteína fluorescente verde sirve como marcador de
selección. En la exposición a la recombinasa, el gen de
inmortalización y la secuencia que codifica la proteína fluorescente
verde se eliminan. De esta manera, las células se pueden
seleccionar primero por la presencia de la proteína fluorescente
verde y, a continuación, por su ausencia.
Los RTS se exponen a o se ponen en contacto con
una recombinasa de cualquier número de maneras. Por "exponen
a" o "ponen en contacto con una recombinasa que reconoce los
RTS" se entiende en el presente documento que la proteína
recombinasa debe interaccionar con los RTS de manera que permita la
eliminación de la secuencia entre los RTS. Generalmente, todo lo
que se requiere es que la proteína recombinasa esté presente dentro
de la célula que contenga los RTS. Esto se puede realizar mediante
la expresión del gen que codifica la recombinasa en las células que
contienen la construcción de inmortalización condicional, como se
subraya más abajo.
En una realización preferida, la expresión de la
recombinasa es temporal, ya que, así, la recombinación específica
en un punto es rápida y eficiente, en general. La expresión
temporal se consigue mediante diversos procedimientos bien
conocidos en la materia, incluyendo, pero no limitándose a,
transfección de un plásmido de DNA mediante precipitación con
fosfato de calcio, electroporación, lipofección u otros
procedimientos físico-químicos, transducción
utilizando un vector retrovírico o la expresión a partir de otro
vector vírico recombinante como un adenovirus. La expresión
adenovírica es particularmente preferida puesto que son comunes las
elevadas eficacias en la expresión.
En una realización alternativa, el gen que
codifica la recombinasa se coloca bajo control de un promotor
inducible y es parte de la construcción de
inmortalización/desinmortalización. Generalmente, se puede incluir
en cualquiera de las realizaciones descritas en las Figuras un
promotor inducible unido operativamente al gen de la recombinasa.
Las construcciones de este tipo se describen de manera general en
las Figuras 6 y 3C. La Figura 6A corresponde a la Figura 1C con un
promotor inducible/gen de recombinasa añadido, el cual abandonará
el genoma. La Figura 6B corresponde a la Figura 1C cuando la
recombinasa sea eliminada. Puesto que solo es necesaria una pequeña
cantidad de la recombinasa para que tenga lugar la eliminación de
las secuencias entre los RTS, es deseable utilizar promotores
fuertemente regulados para evitar acontecimientos de recombinación
prematuros. Las señales de parada de la transcripción que flanquean
la recombinasa también son deseables. La recombinación y la
eliminación del gen de inmortalización, y preferiblemente del gen
de la recombinasa, sucede así cuando se administran las condiciones
de inducción adecuadas.
En una realización preferida, se utilizan
marcadores de selección negativos, o una combinación de marcadores
de selección positivos y negativos. Los marcadores de selección
negativos son particularmente útiles en prevenir que las células
inmortalizadas sean transplantadas. Por ejemplo, los marcadores de
selección negativos se pueden expresar junto con el gen de
inmortalización. Después de la desinmortalización, las células se
exponen al agente de selección negativo, como GANC, que mata
cualquiera de las células que todavía contenga el gen
HSV-tk que está próximamente unido a un gen de
inmortalización. Ejemplos concretos se muestran en la Figura 3. En
la Figura 3A, los RTS flanquean un gen de inmortalización y un gen
de selección negativo. Según se ha descrito más arriba, el gen de
inmortalización sirve como primer marcador de selección.
Alternativamente, las colonias clonales que contienen el gen de
selección negativo se pueden identificar utilizando un marcador de
selección negativo; esto es, se utilizan colonias clonales para
identificar colonias originales que contengan el gen de selección
negativa. El(los)
\hbox{promotor(es)}utilizados para llevar la expresión de los genes de inmortalización y de selección negativa se pueden localizar en cualquiera de los lados del primer RTS. Cuando se pone en contacto con una recombinasa, el gen de inmortalización y el gen de inmortalización se eliminan y la célula se desinmortaliza. Cualquiera de las células inmortalizadas que quede se puede matar exponiendo las células desinmortalizadas, de manera putativa, al agente de selección negativo; en el caso del gen de timidina quinasa del virus del herpes simples, por ejemplo, las células se pueden exponer a GANC. Esto reduce y elimina, de manera potencial, las células inmortalizadas restantes, lo cual es deseable cuando se utilizan células para transplante. Esta construcción es particularmente preferida puesto que resulta en una muy poca cantidad, sino ninguna, de ácido nucleico exógeno restante en el genoma de la célula, lo cual también es deseable para el transplante. En la Figura 3B existe un gen de selección positiva incluido en la construcción para seleccionar las células inmortalizadas. En la Figura 3C, el sistema es similar a la Figura 3A excepto en que se incluye la recombinasa bajo control de un promotor inducible, eliminando la necesidad de más manipulación
\hbox{genética.}
En una realización preferida, los puntos de
parada se utilizan para prevenir la traducción de los marcadores de
selección antes de la desinmortalización, como se ha indicado de
manera general más arriba para una diversidad de construcciones.
Alternativamente, según se indica en la Figura 5, es posible
prevenir la expresión de los marcadores de selección funcionales
poniendo los RTS en medio de los genes marcadores de selección.
Este procedimiento se basa en la fiel eliminación de uno de los RTS
mediante la recombinasa y el otro mediante un procesamiento de
mRNA, ya que cualquier nucleótido que quede resultará muy
probablemente en mutaciones en el en el desplazamiento del marco de
lectura y, de esta manera, en un marcador de selección no
funcional.
En una realización adicional, se utiliza más de
un conjunto de RTS. Esto se puede hacer utilizando juegos de RTS
adicionales que sean reconocidos por la misma recombinasa o,
alternativamente, utilizando RTS que sean reconocidos por una
recombinasa diferente.
Cuando se utilizan juegos adicionales de RTS para
la misma recombinasa, se debería de tener cuidado en el diseño de
las construcciones de tal manera que el corte entre dos RTS
cualesquiera dé un resultado deseable o medible. Esto es, puesto que
el corte puede darse entre dos RTS cualesquiera, es posible que un
solo RTS, con ácido nucleico exógeno flanqueando sea dejado dentro
del genoma.
En una realización preferida, se utilizan juegos
de RTS procedentes de diferentes recombinasas. Esto puede ser de
particular utilización cuando se introducen en el genoma genes
exógenos. Por ejemplo, utilizando la construcción descrita en la
Figura 4A, se seleccionan las células inmortalizadas utilizando el
primer marcador de selección. Para la desinmortalización, se utiliza
la recombinasa que reconoce los puntos RTS 1 y las células
desinmortalizadas se seleccionan utilizando el segundo marcador de
selección. El segundo gen de selección se puede transcribir
utilizando el primer promotor, en cuyo caso sólo se activará en la
desinmortalización, o su propio promotor, que permite la
transcripción durante los estados inmortalizado y desinmortalizado.
Se transplantan las células desinmortalizadas que expresan la
proteína exógena. Algún tiempo más tarde, por ejemplo cuando el
producto del gen exógeno no se requiere más, la exposición a la
segunda recombinasa resulta en la eliminación del segundo marcador
de selección y del gen exógeno. De manera alternativa, el gen
exógeno sólo se puede requerir ex vivo, en cuyo caso la
segunda recombinasa se puede utilizar antes del transplante. Como
para las otras construcciones descritas aquí, aquellos expertos en
la materia serán capaces de construir una variedad de
construcciones funcionales similares utilizando las enseñanzas del
presente documento.
En una realización adicional, se utilizan dos
recombinasas para eliminar prácticamente todo el ácido nucleico
exógeno antes del transplante. Por ejemplo, utilizando la
construcción mostrada en la Figura 4B, se seleccionan las células
inmortalizadas utilizando el primer marcador de selección. Para la
desinmortalización, la recombinasa que corresponda a los puntos RTS
1 se pone en contacto con la construcción, y las células se
seleccionan en base al segundo marcador de selección que se
transcribe a partir del primer promotor. Las células se pueden en
poner en contacto, a continuación, con una segunda recombinasa que
reconoce los puntos RTS 2 antes del transplante, para eliminar todo
excepto un único punto RTS. Aunque el acontecimiento de eliminación
es muy eficaz, se puede utilizar para la selección una pérdida del
marcador de selección, utilizando colonias clonales.
En una realización, el acontecimiento de
recombinación elimina el primer marcador seleccionable. Esto se
puede preferir en situaciones en las que las células
desinmortalizadas son para ser transplantadas y, de esta manera, sea
deseable minimizar la introducción de genes exógenos en un
paciente.
En una realización preferida, el primer marcador
seleccionable es un gen resistente a un fármaco como el la
histidinol deshidrogenasa, resistencia a neomicina, resistencia a
higromicina y resistencia a puromicina, entre otros. En esta
realización, el segundo marcador detectable es un gen que permitirá
la clasificación y cribado de células, y puede incluir el gen de la
fosfatasa alcalina, el gen para la proteína fluorescente verde, el
gen de lacZ, marcadores de superficie como CD8 o cualquier otro de
los genes subrayados para el primer marcador seleccionable, mientras
los marcadores de selección primero y segundo sean diferentes genes
dentro de cualquier célula única. En algunas realizaciones, la
frecuencia de transformación puede ser tan elevada que se pueda
eliminar ya sea el primer o el segundo marcador seleccionable,
aunque, en general, es preferible que retenga por lo menos el
segundo marcador seleccionable si las células inmortalizadas se
destinan al transplante, ya que es deseable asegurar que las
células que contengan el oncogén no sean transplantadas en un
mamífero. En una realización, se utiliza un único marcador de
selección, por ejemplo un marcador como la proteína fluorescente
verde que permite la clasificación de las células. En esta
realización, el marcador se expresa cuando se introduce el gen de
inmortalización y se separan las células transformadas de las
células no transformadas mediante clasificación celular. En la
desinmortalización, el gen marcador se elimina y las células se
vuelven a clasificar con las células desinmortalizadas que carecen
del marcador.
En una realización más, las células
inmortalizadas se seleccionan en base al fenotipo. Por ejemplo, el
gen de inmortalización puede servir como primer marcador
detectable, ya que las células que no contengan el gen no crecerán
indefinidamente en el cultivo y se pueden eliminar en base a esto.
Alternativamente, los marcadores se pueden detectar utilizando
análisis clonal; por ejemplo, cuando se utiliza el gen
HSV-TK, se pueden analizar los clones por la
actividad TK.
Tal y como se utiliza en el presente documento,
"célula manipulada genéticamente" o "célula recombinante"
se refiere a una célula dentro de la cual se ha introducido ácido
nucleico extraño (es decir, que no se encuentra de manera natural),
p.e. DNA. Por ácido nucleico "extraño" o "heterólogo" o
"exógeno" se entiende en el presente documento un ácido
nucleico que no se une habitualmente al genoma de la célula, o está
en una forma que no se encuentra de manera natural en el genoma. De
esta manera, los genes de inmortalización tales como los oncogenes
o puntos diana para recombinasa no se pueden encontrar de manera
natural en el genoma de la célula hospedadora y, de esta manera, las
células inmortalizadas que contengan estas secuencias están
manipuladas genéticamente. En algunas realizaciones, las células
inmortalizadas de manera condicional se manipulan para que expresen
uno o más genes adicionales. Dichos genes pueden estar contenidos,
habitualmente, dentro del genoma, es decir, homólogo, pero que no se
exprese en una extensión apreciable, o son heterólogos, es decir,
que habitualmente no se encuentran dentro del genoma. Por ejemplo,
los genes homólogos del factor de crecimiento se pueden introducir
en una célula en una forma no frecuente dentro del genoma; es decir,
secuencias reguladoras como promotores que permitan la expresión
del factor de crecimiento en niveles que normalmente no se han
visto en la célula, o dentro de tipos celulares que normalmente no
expresan el factor de crecimiento. Alternativamente, se pueden
introducir genes heterólogos. De esta manera, las células
inmortalizadas de manera condicional de la invención, se pueden
manipular genéticamente para que contengan más de una secuencia de
ácido nucleico exógeno.
Las construcciones de inmortalización
condicionales y el procedimiento de la invención pueden contener,
también, genes exógenos adicionales que sean terapéuticamente
beneficiosos. Por ejemplo, se pueden introducir genes que codifiquen
factores de crecimiento para facilitar la supervivencia de las
células transplantadas o para el tratamiento del paciente. Por
ejemplo, se pueden utilizar las neurotrofinas, que incluyen el
factor de crecimiento nervioso (NGF),
neurotrofina-3 (NT3), neurotrofina-4
(NT4) y factor neurotrofina derivado de cerebro (BDNF). En el caso
en el que se utilicen células diferentes de las células neurales,
genes exógenos apropiados incluyen aquellos que codifiquen factores
de crecimiento, como el factor de crecimiento humano, factor de
crecimiento epidérmico, factores de crecimiento neurales, etc;
citoquinas; enzimas e inhibidores enzimáticos; interferones como los
interferones \alpha, \beta o \gamma; factores de coagulación
(Factor VIII); ADA; genes de muerte anticelular; y otras
proteínas.
De esta manera, por ejemplo, se pueden
inmortalizar las células para manipulaciones ex vivo tales
como la introducción de DNA extraño que codifique agentes
terapéuticos, y, a continuación, desinmortalizarlas, permitiendo la
introducción en un paciente de las células manipuladas
genéticamente, las cuales expresan un agente terapéutico.
Alternativamente, las células por sí mismas son agentes
terapéuticos y se transplantan para reemplazar células alteradas o
que mueren, p.e., en la enfermedad de Parkinson.
En una realización, se extraen las células de un
paciente con un defecto genético y se manipulan para que contengan
por lo menos una copia de un gen corregido antes de volver a
introducir las células utilizando las técnicas de la invención. Las
alteraciones genéticas que se pueden tratar de esta manera son
conocidas en la materia.
Además del gen de inmortalización, las células de
la invención tienen ácido nucleico exógeno adicional, como se
describe de manera más completa posteriormente. Este ácido nucleico
exógeno incluye por lo menos dos puntos diana para recombinasa y,
preferiblemente, genes (marcadores) de selección, puntos de
finalización de la transcripción, secuencias engarce y otros genes
de interés según se ha descrito más arriba.
El ácido nucleico extraño o el ácido nucleico
exógeno se puede introducir mediante una variedad de técnicas
conocidas en la materia, que incluyen, pero no se limitan a,
transfección mediada con fosfato de calcio, transfección mediada con
DEAE, microinyección, transformación retrovírica, transformación
adenovírica, transformación de herpes vírico, fusión de protoplasto
y lipofección.
En una realización preferida, el DNA extraño se
introduce en las células utilizando la técnica de la transfección
retrovírica. Los retrovirus recombinantes se utilizan para
introducir genes de inmortalización, genes de selección o
marcadores, puntos diana para recombinasa y recombinasas. Los
retrovirus recombinantes se producen en líneas celulares de
empaquetamiento para producir sobrenadantes del cultivo que tengan
una titulación de partículas víricas (generalmente de 10^{5} a
10^{6} pfu/mL). Las partículas víricas recombinantes se utilizan
para infectar cultivos de células o de su progenie mediante
incubación de los cultivos celulares en un medio que contiene las
partículas víricas, tal y como se conoce en la materia. Después de
la infección retrovírica, las células se lavan y se cultivan en un
medio estándar. Las células infectadas se analizan, a continuación,
por la respuesta y expresión del DNA extraño. Las células se pueden
someter a condiciones selectivas que seleccionen las células que
hayan tomado y expresado un gen marcador seleccionable.
En una realización preferida, el vector de
clonación es un vector retrovírico, y utiliza repeticiones
terminales largas (LTR) según se muestra en las Figuras.
Realizaciones alternativas utilizan plásmidos de expresión
tradicionales, vectores basados en virus del herpes y vectores
basados en adenovirus, así como otros equivalentes bien conocidos
por los expertos en la materia.
En otra realización, el DNA extraño se introduce
utilizando la técnica de la transfección mediada con fosfato de
calcio según se conoce en la materia. Por ejemplo, se prepara un
precipitado en fosfato de calcio que contenga las construcciones de
inmortalización condicional de la invención utilizando la técnica
de Wigler et al., (1979) Proc. Natl. Acad. Sci. USA
76: 1373-1376. Los cultivos de células se
colocan en placas de cultivos tisulares. Veinticuatro horas de
colocar las células en placas, se añade el precipitado de fosfato de
calcio que contiene, aproximadamente, 20 \mug/ml de DNA extraño.
Las células se incuban a temperatura ambiente durante 20 minutos. Se
añade el medio de cultivo tisular que contiene cloroquina 30 \muM
y las células se incuban durante toda la noche a 37ºC.
Después de la transfección, se analizan las
células por la incorporación y expresión del DNA extraño. Las
células se pueden someter a condiciones de selección que
seleccionen las células que han incorporado y expresado un gen
marcador seleccionable.
Las técnicas anteriores se pueden ejecutar más de
una vez en una determinada célula; por ejemplo, estas técnicas se
pueden utilizar para introducir el gen de inmortalización con
puntos para recombinasa, y, a continuación, introducir ácido
nucleico exógeno adicional a las células inmortalizadas, tal como
cualquier plásmido de expresión que codifique una
\hbox{recombinasa.}
Como será apreciado por los de la materia, en la
invención se pueden utilizar una amplia variedad de promotores
adecuados. Los promotores particularmente útiles incluyen, pero no
se limitan a, el potenciador del promotor interno de LTR de
retrovirus, el promotor de SV40, promotores específicos de tipo
celular o tisular, promotores especialmente específicos del tipo
celular que no sean para la inmortalización de manera
condicional.
Células adecuadas que se puedan utilizar para
practicar los procedimientos de inmortalización condicional
incluyen cualquier tipo celular que no produzca una recombinasa que
reconozca la secuencia diana para recombinasa utilizada en las
construcciones de la invención. Preferiblemente, las células se
dividen de tal manera que sean capaces de ser infectadas por un
vector retrovírico. Las células adecuadas son células de
vertebrados, preferiblemente células de mamífero tales como las de
primate, ovina, porcina, bovina, canina, felina y equina, por
ejemplo, y, más preferiblemente, células humanas. Las células
particularmente preferidas son todos los tipos de células madre como
las células madre neurales, hematopoyéticas, pancreáticas,
hepáticas, epidérmicas, intestinales, osteogénicas y olfatorias,
siendo las células madre particularmente preferidas las células
madre de la cresta neural y células madre hematopoyéticas. Células
no madre adecuadas incluyen las células de islotes pancreáticos,
fibroblastos, osteoclastos, osteoblastos, células dérmicas y
epidérmicas, y células endoteliales, hepatocitos, eritroblastos,
miocitos esqueléticos, miocitos lisos, miocitos cardíacos,
melanocitos, linfocitos (B y T), células mieloides y células
glial.
En una realización preferida, el fenotipo,
crecimiento y duración de una célula desinmortalizada es el mismo
que el de las células de partida en ausencia de cualquier
manipulación genética; es decir, una célula desinmortalizada es
idéntica a las células de partida, antes de la inmortalización. En
realizaciones diferentes, las células pueden tener características
alteradas.
Se debería reconocer que en algunos casos, las
células de partida tienen una duración extensa in vivo; es
decir, pueden existir en el animal hospedador, pero son incapaces
de crecer de manera indefinida ex vivo. De esta manera, por
ejemplo, las células de islotes parecen durar una vida en humanos.
Todavía, las células de islotes pueden requerir, la inmortalización
para el crecimiento y proliferación ex vivo en un cultivo
celular. De manera similar, las células madre como las células
madre neurales pueden durar un periodo de tiempo extenso y son
capaces de una renovación propia limitada in vitro, pero se
deben de inmortalizar con un gen de inmortalización para el
crecimiento y proliferación indefinidos en un cultivo celular. La
expansión indefinida de las células inmortalizadas puede permitir
la generación de "líneas celulares donadoras universales" para
el tratamiento de múltiples pacientes.
Se debe entender que a menos que esté sometido a
nuevas condiciones de cultivo, la división celular de una célula
inmortalizada resulta en dos células hija sustancialmente idénticas;
esto es, células inmortalizadas por definición capaces de
regenerarse de manera indefinida. De esta manera, por ejemplo, la
división celular de células madre inmortalizadas como las células
madre de la cresta neural resulta en dos células madre de la cresta
neural, ambas igualmente no diferenciadas. Ante la exposición a
ciertas condiciones experimentales o fisiológicas, estas células
madre llegarán a la diferenciación parcial o completa.
Como es entendido por aquellos expertos en la
materia, las condiciones del cultivo adecuadas para las líneas
celulares inmortalizadas variarán dependiendo del tipo celular.
Los procedimientos de inmortalización condicional
de la invención encuentran uso en numerosas aplicaciones, como será
apreciado por aquellos expertos en la materia.
En una realización, las células inmortalizadas de
manera condicional son células madre y, en una realización
preferida, las células madre son células madre de la cresta neural
y células madre neurales multipotenciales como se describe en WO
94/02593. Como será apreciado por los expertos en la materia, las
células madre neurales, las cuales llevan a la formación de la glia
y neuronas del sistema nervioso central y periférico, se pueden
transplantar o implantar para formar nuevas neuronas y glias. Por
ejemplo, la sustitución de neuronas motoras y sus células glia
asociadas en el cordón espinal para una herida traumática aguda
motora o la sustitución de neuronas dopaminérgicas que mueren en el
cerebro medio para el tratamiento de la enfermedad del Parkinson,
son ambas áreas activas que están siendo buscadas en estudios
preclínicos. Una segunda aplicación del transplante de células
inmortalizadas manipuladas genéticamente es para terapia génica; las
células se pueden manipular genéticamente antes del transplante con
el fin de que se exprese un producto de un gen perdido y, a
continuación, el transplante de estas células en la región concreta
del cerebro liberará el producto del gen en el área del cuerpo donde
sea necesario. Prueba del principio de dichas aproximaciones de
terapia génica se han demostrado recientemente en modelos animales
que utilizan como sistema de ensayo la mucopolisacaridosis
hereditaria.
En una realización alternativa, las células
diferentes de las células madre se pueden inmortalizar para el
crecimiento ex vivo y, a continuación, desinmortalizarlas
antes de volverlas a introducir en el cuerpo. Por ejemplo, la
patente US Nº 5.387.237 describe un páncreas bioartificial que
comprende un cilindro de plástico rellenado con células de islotes
pancreáticos. Estas células de islotes pancreáticos se pueden
inmortalizar para el crecimiento y proliferación ex vivo,
dejando una uniformidad durante todo el tiempo y, a continuación,
se desinmortalizan antes de la introducción en el cuerpo. Aquellos
expertos en la materia apreciarán que cualquier variedad de dichos
sistemas se podría utilizar en la presente invención.
Por ejemplo, estos procedimientos se pueden
utilizar en cualquiera de las terapias génicas ex vivo, tal
y como se describen, de manera general, en la patente US Nº
5.299.346. De esta manera, cualquier de las células a ser
transplantada en un paciente, ya sea humano o animal, se puede
someter a los procedimientos de inmortalización condicionales, con
la consiguiente desinmortalización antes del transplante. En una
realización, las células se extraen del paciente en el que serán
transplantadas; en otras realizaciones, las células son de otros
pacientes u otros animales. Por ejemplo, las células de islotes de
cerdos se pueden inmortalizar y desinmortalizar de manera
condicional antes del transplante en un humano, según se describe en
la patente US Nº 5.387.237.
De esta manera, se proporcionan procedimientos
para introducir o transplantar células desinmortalizadas tales como
células madre en un hospedador animal o mamífero. Las técnicas de
transplante son bien conocidas en la materia y se pueden realizar
con células desinmortalizadas. De esta manera, por ejemplo, las
células desinmortalizadas se pueden transplantar en un hospedador
para evaluar el potencial terapéutico de las células o para tratar
una alteración neurológica del sistema nervioso. En una realización
preferida, las células son células madre neurales y la alteración
es una enfermedad neurológica del sistema nervioso periférico.
Además, la línea celular inmortalizada se puede
utilizar para cribar fármacos que pueden afectar el desarrollo,
diferenciación y/o función de las células. Estas incluyen tanto
pequeñas moléculas orgánicas farmacéuticas como factores de
crecimiento.
Las células desinmortalizadas son particularmente
útiles en aplicaciones de transplante o implante, puesto que los
oncogenes de inmortalización se eliminan antes de la introducción
en el cuerpo, eliminándose, de esta manera, la creación potencial de
tumores como resultado del gen de inmortalización. Los
procedimientos de la invención se pueden aplicar tanto a terapia
humana como a aplicaciones veterinarias, por ejemplo, para la
utilización humana de células no humanas. De esta manera, los
procedimientos y construcciones de la invención se pueden utilizar
con células procedentes de dichos animales como humanos, cerdos,
primates, roedores como ratones y ratas, perros, vacas y ovejas.
Lo siguiente se presenta como un ejemplo y que no
se interpreta como limitación del ámbito de la invención.
En este ejemplo, se utilizó y modificó un vector
retrovírico del virus de la leucemia murina molaney estándar. Se
modificó un vector retrovírico recombinante de replicación
incompetente que albergaba el oncogén v-myc con el
fin de introducir puntos loxP flanqueando la secuencia codificante
de v-myc y para introducir la secuencia codificante
de la \beta-galactosidasa en dirección cadena
abajo (3') respecto a las secuencias
loxP-v-myc-loxP.
Experimentos adicionales utilizaron más marcadores de selección,
incluyendo la fosfatasa alacalina, la resistencia a neomicina, y
tanto la proteína fluorescente verde (GFP) como una versión
"humanizada" de GFP, llamada proteína "lantern"
verde (GLP) la cual es 10 veces más sensible que la GFP (para
permitir la utilización de la clasificación de células activadas con
fluorescencia). Estas modificaciones se llevaron a cabo mediante
procedimientos biológicos moleculares estándar familiares para
aquellos expertos en la materia y que implican enzima de
restricción, digestión, ligación, amplificación por PCR,
transformación bacteriana, aislamiento del plásmido y una
caracterización y secuenciación adicionales.
Para confirmar que esta construcción retrovírica
recombinante modificada era, de hecho, capaz de producir partículas
víricas infecciosas recombinantes, se llevaron a cabo, primero, los
siguientes experimentos. Para producir partículas infecciosas del
virus de replicación incompetente, se transfectó la construcción en
la línea de empaquetamiento BOSC 23. Después de la transfección
temporal de las células BOSC 23, se recogieron tres días después los
sobrenadantes procedentes de estas células transfectadas que
contenían las partículas retrovíricas. La titulación del virus
infeccioso en estos sobrenadantes estaba entre 10^{5} y 10^{6}
pfu/ml. Estos sobrenadantes víricos se utilizaron, a continuación,
para infectar células NIH 3T3. La tinción de estas células, varios
días después de la infección con un anticuerpo contra
v-myc aviar confirmó que muchas de estas células
expresaban el oncogen v-myc. La fijación y tinción
de cultivos hermanos con el reactivo Xgal confirmó que, como se
predecía a partir del diseño del vector, ninguna de las células
infectadas expresaba la \beta-galactosidasa. Este
experimento, por tanto, reveló dos aspectos importantes: 1) que la
construcción era capaz de ser empaquetada en el retrovirus
infeccioso y 2) que las secuencias codificantes del oncogen
v-myc contenidas en ese vector se podían
transcribir y traducir a una proteína en células infectadas.
La transfección del enzima cre en estas células
infectadas de manera retrovírica resultó en la eliminación de las
secuencias codificantes de v-myc y la activación
concomitante de la actividad del enzima
\beta-galactosidasa. Esto se consiguió mediante la
transfección de las células infectadas de manera retrovírica con
una construcción de expresión en la que la recombinasa cre estaba
bajo control del intensificador de citomegalovirus CMV. Veinticuatro
o cuarenta y ocho horas después de su transfección, las células se
fijaron y procesaron por tinción con Xgal. Esta tinción reveló que
muchas de las células infectadas de manera retrovírica mostraban,
ahora, la actividad del enzima
\beta-galactosidasa, evidenciada por el producto
de reacción azul en sus núcleos. No se observó actividad
\beta-galactosidasa en los cultivos control
transfectados con el mismo vector de expresión CMV que carecía de
las secuencias codificantes cre. La tinción de las células
transfectadas cre con el anticuerpo contra el oncogen
v-myc confirmaron que estas células tranfectadas no
expresaban más el oncogen v-myc, según se esperaba
basándose en su eliminación del provirus mediante la recombinasa
cre.
Estos experimentos indican, de esta manera, que
la recombinasa cre es capaz de extraer la secuencia del oncogen
v-myc procedente del provirus integrado en un
genoma de células de mamífero y que la extracción del oncogen
resulta en la activación concomitante del gen reportero dirección
cadena abajo, en este caso la
\beta-galactosidasa, como se esperaba basándose en
el diseño del vector.
La expresión del oncogen v-myc
procedente de la construcción retrovírica producía secuencias
funcionales v-myc que eran capaces de inmortalizar
un tipo de célula primaria. Esto se realizó utilizando fibroblastos
embrionarios de ratón primario. Los fibroblastos se aislaron y
cultivaron mediante procedimientos estándar y, a continuación, se
infectaron con el vector retrovírico codificante del oncogén
v-myc modificado flanqueado por las secuencias loxP
que contienen el gen marcador \beta-galactosidasa
dirección cadena abajo. Este vector referido como retmycgal y se
muestra en la Figura 2C. Las células infectadas se colocaron en
placas bajo selección, cultivándolas en presencia de histidina 6mM.
El vector retrovírico contiene, también, el gen histidinol
deshidrogenasa. Por tanto, las células que expresaban el provirus
integrado sobrevivirán en presencia de histidina 6 mM mientras que
las células no infectadas morirán. Se llevó una placa control de
células no infectadas en ausencia de histidina 6 mM para comparar
las velocidades de crecimiento entre células no infectadas e
infectadas. Después de 4 a 6 semanas de crecimiento en cultivo que
implicó aproximadamente 6 pasos, se observó una clara diferencia
entre las células infectadas con myc resistentes a histidina y las
células no infectadas. El fibroblasto control no infectado en este
tiempo había alcanzado la senescencia y había extendido y parado la
división. Al contrario, las células infectadas con la construcción
retrovírica retmycgal continuaban exhibiendo una fuerte
proliferación en el cultivo. La fijación y tinción de algunas de
estas células con anticuerpos contra v-myc revelaron
una expresión abundante del oncogen v-myc aviar en
los núcleos de estos fibroblastos infectados, confirmando que su
estado inmortalizado se debía a la expresión del oncogen
v-myc. Como se esperaba, no se detectó la actividad
\beta-galactosidasa en las células.
Estos experimentos se repitieron utilizando
resistencia al fármaco neomicina como primer marcador seleccionable
puesto que el sistema his era demasiado sensible.
Las secuencias codificantes de myc se podían
extraer del genoma de las células infectadas establecidas mediante
la transfección de una construcción de expresión de cre en las
células. La extracción de myc resultó en una activación concomitante
del gen de la \beta-galactosidasa, como habíamos
mostrado previamente en el caso de células infectadas de manera
temporal. Después de la transfección de la construcción CVM cre en
estas células, eran detectables muchas células azules por tinción
con Xgal. Estos datos demuestran, por tanto, que la recombinasa cre
es capaz de extraer las secuencias codificantes de
v-myc y activar la expresión del marcador
\beta-galactosidasa dirección cadena abajo incluso
en células primarias infectadas de manera estable que han pasado
por lo menos 6 veces. Más importante, estos indican que la expresión
de las secuencias codificantes de v-myc procedentes
del provirus integrado es, de hecho, capaz de inmortalizar, de
manera funcional, estos fibroblastos primarios de ratón como se
esperaba.
Además, mientras los procedimientos
convencionales para la introducción de la recombinasa (es decir
transferencia del gen mediada por DNA) resultaba en un
5-10% de las células que eran inmortalizadas, la
utilización de un vector adenovírico codificante de la recombinasa
Cre resultaba en, aproximadamente, un 50% de las células que se
habían vuelto desinmortalizadas.
Además, las células madre de la cresta neural de
acuerdo con WO 94/02593 se inmortalizaron también utilizando neo
como primer marcador seleccionable y el gen de la fosfatasa
alcalina como segundo marcador seleccionable.
En resumen, este ejemplo demuestra que utilizando
fibroblastos embrionarios de ratón primarios es posible
inmortalizar células primarias infectándolas con un vector
retrovírico retmycgal y otros vectores para pasar, de manera
estable, por lo menos seis generaciones y, a continuación,
desinmortalizar las células mediante extracción de las secuencias
del oncogen myc de su genoma mediante transfección de estas células
con una construcción de expresión cre.
Claims (21)
1. Línea de células inmortalizadas de mamífero
que contiene, en el genoma de dicha célula, ácido nucleico exógeno
que comprende por lo menos un primer y un segundo punto diana para
recombinasa que flanquean un solo gen de inmortalización, en donde
dichos puntos diana son capaces de mediar en la eliminación de
dicho gen de inmortalización cuando dichos puntos diana se ponen en
contacto con una recombinasa.
2. Línea de células inmortalizadas según la
reivindicación 1 en donde dicho ácido nucleico exógeno comprende
además un gen marcador de selección.
3. Línea de células inmortalizadas según la
reivindicación 2 en donde dicho gen marcador de selección es un gen
marcador de selección negativo.
4. Línea de células inmortalizadas de acuerdo con
la reivindicación 2 en donde dicho ácido nucleico comprende,
además, un punto de parada.
5. Línea de células inmortalizadas según la
reivindicación 1 en donde dicho ácido nucleico exógeno comprende,
además, un primer gen marcador de selección y un segundo gen
marcador de selección.
6. Línea de células inmortalizadas según la
reivindicación 5 en donde dicho segundo gen marcador de selección
no está entre el primer y el segundo punto diana para
recombinasa.
7. Procedimiento para crear una célula
inmortalizada que contiene puntos diana para recombinasa que
flanquean un solo gen de inmortalización en el genoma de dicha
célula inmortalizada, comprendiendo dicho procedimiento transformar
una célula con un ácido nucleico exógeno que comprende
a) un primer punto para recombinasa;
b) un solo gen de inmortalización; y
c) un segundo punto de recombinasa.
8. Procedimiento según la reivindicación 7 en
donde dicho ácido nucleico comprende, además, por lo menos un gen
marcador de selección.
9. Procedimiento según la reivindicación 8 en
donde dicho gen marcador de selección es un marcador de selección
negativo.
10. Procedimiento para la discriminación de una
célula inmortalizada que contiene ácido nucleico exógeno que
comprende puntos diana para recombinasa que flanquean un solo gen
de inmortalización en el genoma de dicha célula inmortalizada,
comprendiendo dicho procedimiento poner en contacto dichos puntos
diana para recombinasa con una recombinasa.
11. Procedimiento para la desinmortalización de
una célula inmortalizada que comprende:
a) incorporar un ácido nucleico exógeno que
comprende:
- i)
- un primer punto diana para recombinasa;
- ii)
- un solo gen de inmortalización;
- iii)
- un gen marcador de selección negativo; y
- iv)
- un segundo punto diana para recombinasa;
en el genoma de una célula para producir una
célula inmortalizada que contenga un solo gen de inmortalización
que se puede extraer en una orientación tal que la extracción de la
secuencia entre los puntos diana para recombinasa corta el gen de
inmortalización y el marcador de selección negativo;
y
b) poner en contacto los puntos diana para
recombinación con una recombinasa que reconozca dichos puntos diana
para recombinasa de tal manera que se extraen dicho gen de
inmortalización y dicho gen marcador de selección negativo.
12. Procedimiento según la reivindicación 11 en
donde dicho procedimiento comprende además seleccionar las células
desinmortalizadas en presencia de un agente de selección
negativo.
13. Procedimiento según la reivindicación 11 en
donde dicho ácido nucleico exógeno comprende, además, un gen de
selección positivo.
14. Procedimiento para la desinmortalización de
una célula inmortalizada que comprende:
a) incorporar ácido nucleico exógeno que
comprende:
- i)
- un primer punto diana para recombinasa;
- ii)
- un solo gen de inmortalización;
- iii)
- un segundo punto diana para recombinasa; y
- iv)
- un gen marcador de selección;
en el genoma de una célula para producir una
célula inmortalizada que contenga un gen de inmortalización que se
puede eliminar en una orientación tal que la extracción de la
secuencia entre los puntos diana para recombinasa corta el gen de
inmortalización, resultando en la expresión del marcador de
selección;
y
b) poner en contacto dichos puntos diana para
recombinasa con una recombinasa que reconozca dichos puntos diana
para recombinasa de tal manera que se extraiga dicho gen de
inmortalización.
15. Procedimiento según la reivindicación 14 en
donde dicho ácido nucleico comprende además un punto de parada.
16. Procedimiento según la reivindicación 14 en
donde dicho procedimiento comprende además seleccionar las células
desinmortalizadas que expresan dicho gen marcador de selección.
17. Procedimiento para la desinmortalización de
una célula inmortalizada que comprende:
a) incorporar ácido nucleico exógeno que
comprende:
- i)
- un primer punto diana para recombinasa;
- ii)
- un solo gen de inmortalización;
- iii)
- un primer gen marcador de selección;
- iv)
- un segundo punto diana para recombinasa; y
- v)
- un gen marcador de selección;
en el genoma de una célula para producir una
célula inmortalizada que contiene un gen de inmortalización, que se
puede eliminar, en una orientación tal que cuando se expresa el gen
de inmortalización, también se expresa el primer marcador de
selección y el segundo marcador de selección no se expresa y cuando
dicho gen de inmortalización se extrae, dicho segundo marcador de
selección se expresa;
y
b) poner en contacto dichos puntos diana para
recombinasa con una recombinasa que reconozca dichos puntos diana
para recombinasa de tal manera que se extraiga dicho gen de
inmortalización.
18. Procedimiento según la reivindicación 17 en
donde dicho ácido nucleico comprende además un punto de parada.
19. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 10 a 18 en donde dicha puesta en contacto es
mediante la transformación de dichas células inmortalizadas con un
vector que codifica una recombinasa que reconoce dichos puntos diana
para recombinasa bajo condiciones en las que dicha recombinasa se
expresa.
20. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 10 a 18 en donde dicho ácido nucleico exógeno
comprende además un gen para una recombinasa que reconoce dichos
puntos diana para recombinasa, en donde dicho gen recombinasa está
unido, de manera operativa, a un promotor inducible y dicha puesta
en contacto es mediante crecimiento de dichas células
inmortalizadas bajo condiciones en las que dicha recombinasa se
expresa.
21. Procedimiento según cualquiera de las
reivindicaciones 10 a 20 en donde dicho ácido nucleico comprende
además un gen exógeno adicional.
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