EA037063B1 - Cxcr2-связывающие полипептиды - Google Patents
Cxcr2-связывающие полипептиды Download PDFInfo
- Publication number
- EA037063B1 EA037063B1 EA201390666A EA201390666A EA037063B1 EA 037063 B1 EA037063 B1 EA 037063B1 EA 201390666 A EA201390666 A EA 201390666A EA 201390666 A EA201390666 A EA 201390666A EA 037063 B1 EA037063 B1 EA 037063B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- amino acid
- seq
- acid sequence
- polypeptide
- nanobody
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
- C07K16/2866—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against receptors for cytokines, lymphokines, interferons
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/395—Antibodies; Immunoglobulins; Immune serum, e.g. antilymphocytic serum
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/20—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
- C07K2317/21—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin from primates, e.g. man
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/30—Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
- C07K2317/31—Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency multispecific
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/30—Immunoglobulins specific features characterized by aspects of specificity or valency
- C07K2317/35—Valency
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
- C07K2317/569—Single domain, e.g. dAb, sdAb, VHH, VNAR or nanobody®
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/60—Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments
- C07K2317/62—Immunoglobulins specific features characterized by non-natural combinations of immunoglobulin fragments comprising only variable region components
- C07K2317/626—Diabody or triabody
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/70—Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
- C07K2317/76—Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/90—Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
- C07K2317/92—Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Mycology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Abstract
Изобретение относится к полипептидам, направленным против хемокинового рецептора CXCR2 или специфически связывающимся с этим рецептором, в частности к полипептидам, способным модулировать передачу сигнала от CXCR2. Изобретение также относится к нуклеиновым кислотам, к векторам и к клеткам-хозяевам, способным экспрессировать полипептиды по изобретению, к фармацевтическим композициям, содержащим указанные полипептиды, и к применению указанных полипептидов и композиций для лечения заболеваний, связанных с нарушением функции CXCR2.
Description
MUYLDERMANS S.: SINGLE DOMAIN CAMEL ANTIBODIES: CURRENT STATUS, REVIEWS IN MOLECULAR BIOTECHNOLOGY, ELSEVIER, AMSTERDAM, NL, vol. 74, no. 4, 1 June 2001 (2001-06-01), pages 277-302, XP001057480, ISSN: 1389-0352, DOI: 10.1016/ 81389-0352(01)00021-6 the whole document in particular figure 6
HOLLIGER PHILIPP ET AL.: ENGINEERED ANTIBODY FRAGMENTS AND THE RISE OF SINGLE DOMAINS, NATURE BIOTECHNOLOGY, NATURE PUBLISHING GROUP, NEW YORK, NY, US, vol. 23, no. 9, 1 September 2005 (2005-09-01), pages
1126-1136, XP008076746, ISSN: 1087-0156, DOL 10.1038/NBT1142 the whole document in particular fig· 1
WO-A2-2004081026
WO-A2-2010043650
GABELLINI C. ET AL.: Functional activity of CXCL8 receptors, CXCR1 and CXCR2, on human malignant melanoma progression, EUROPEAN JOURNAL OF CANCER, PERGAMON PRESS, OXFORD, GB, vol. 45, no. 14, 1 September 2009 (2009-09-01), pages 2618-2627, XP026641847, ISSN: 0959-8049, DOL 10.1016/J.EJCA.2009.07.007 [retrieved on 2009-08-13] abstract; figures 4-6
RAIMONDO M. ET AL.: S2008 CXC-Chemokine/CXCR2 Biological Axis Promotes I Angiogenesis In Vitro and In Vivo in Pancreatic I Cancer, GASTROENTEROLOGY, ELSEVIER, 1 PHILADELPHIA, PA, vol. 136, no. 5, 1 May 2009 (2009-05-01), pages A-312, XP026111971, ISSN: 0016-5085, DOL 10.1016/80016-5085(09)61424-4 [retrieved on 2009-05-01] abstract
BARNES PETER J.: New therapies for chronic obstructive pulmonary disease., MEDICAL PRINCIPLES AND PRACTICE: INTERNATIONAL JOURNAL OF THE KUWAIT UNIVERSITY, HEALTH SCIENCE CENTRE 2010 LNKDPUBMED:20639653, vol. 19, no. 5, 14 June 2010 (2010-06-14), pages 330-338, XP002673462, ISSN: 1423-0151 Abstract pages 333, 336 Epub 2010 Jul 14
TRAVES SUZANNE L. ET AL.: Specific CXC but not CC chemokines cause elevated monocyte migration in COPD: a role for CXCR2, JOURNAL OF LEUKOCYTE BIOLOGY AUG 2004 LNKDPUBMED: 15155777, vol. 76, no. 2, August 2004 (2004-08), pages 441-450, XP009157874, ISSN: 0741-5400 abstract
037063 В1 (57) Изобретение относится к полипептидам, направленным против хемокинового рецептора CXCR2 или специфически связывающимся с этим рецептором, в частности к полипептидам, способным модулировать передачу сигнала от CXCR2. Изобретение также относится к нуклеиновым кислотам, к векторам и к клеткам-хозяевам, способным экспрессировать полипептиды по изобретению, к фармацевтическим композициям, содержащим указанные полипептиды, и к применению указанных полипептидов и композиций для лечения заболеваний, связанных с нарушением функции CXCR2.
Настоящее изобретение относится к полипептидам, направленным против хемокинового рецептора CXCR2 или специфически связывающимся с этим рецептором, в частности к полипептидам, способным модулировать передачу сигнала от CXCR2. Настоящее изобретение также относится к нуклеиновым кислотам, к векторам и к клеткам-хозяевам, способным экспрессировать полипептиды по изобретению, к фармацевтическим композициям, содержащим полипептиды, и к применению указанных полипептидов и композиций для лечения хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ) и других заболеваний, связанных с нарушением функции CXCR2.
Предшествующий уровень техники
Термин хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ) используется для описания ряда расстройств, характеризующихся нарушением проходимости дыхательных путей, которое в большинстве случаев является прогрессирующим и связано с аномальным воспалительным ответом легких на токсичные частицы, что приводит к деструкции паренхимы легких и к снижению функции дыхательных путей (Barnes P.J. et al., 2003, Chronic obstructive pulmonary disease: molecular and cellular mechanisms. Eur. Respir J., 22, 672-688; Barnes P.J. et al., 2004, Mediators of chronic obstructive pulmonary disease. Pharmacol. Rev. 56, 515-548). Хотя за развитие ХОБЛ ответственны генетические факторы и факторы окружающей среды, однако самой главной причиной развития такого заболевания является курение с рецидивирующей инфекцией легких, приводящей к прогрессирующему ухудшению функции легких. Прекращение курения замедляет прогрессирование заболевания лишь на ранней стадии, а после появления явных симптомов дает незначительный эффект. С ХОБЛ связано несколько сопутствующих патологических состояний, таких как астма, сердечно-сосудистое заболевание, депрессия и мышечное истощение (Mannino D.M. and Buist S., 2007 Global burden of COPD: risk factors, prevalence and future trends. Lancet, 370, 765773).
Среди хемотаксических факторов преобладают хемокины, а поэтому они играют ключевую роль в развитии хронического воспаления легких при ХОБЛ и в его последующих резких обострениях. Биологическая активность хемокинов IL-8 (CXCL8), GROa (CXCL1) и ENA-78 (CXCL5) опосредуется двумя популяциями рецепторов CXCR1 и CXCR2 клеточной поверхности, которые присутствуют на лейкоцитах и на клетках многих других типов в организме. Миграция лейкоцитов опосредуется, главным образом, рецептором CXCR2, который связывается с несколькими лигандами, включая IL-8, GROa, β, γ, ENA-78 и GCP-2. В противоположность этому CXCR1 селективно активируется IL-8 и в меньшей степени GCP-2. При этом остается неясным, может ли хемотаксис нейтрофилов человека in vivo опосредоваться одним или обоими рецепторами.
Аминокислотная последовательность CXCR2 на 78% гомологична аминокислотной последовательности CXCR1, и оба эти рецептора присутствуют на нейтрофилах с различными профилями распределения. Экспрессия CXCR2 на различных клетках и тканях, включая CD8+-Т-клетки, NK, моноциты, тучные клетки, эпителиальные клетки, эндотелиальные клетки, клетки гладких мышц и клетки-хозяева центральной нервной системы, позволяет предположить, что этот рецептор может играть главную функциональную роль как в симптоматических состояниях, так и в патофизиологии ряда острых и хронических заболеваний. Активация CXCR2 стимулирует связывание рецептора с Gi-семейством белков, связывающихся с гуаниновыми нуклеотидами, что, в свою очередь, приводит к стимуляции высвобождения внутриклеточных фосфатов инозита, к повышению уровня внутриклеточного Са2+ и под действием ERK1/2зависимых механизмов к фосфорилированию внутриклеточных белков, связанных с прямой миграцией клеток в соответствии с градиентом хемокинов. После активации CXCR2 фосфорилируется и быстро интернализуется под действием аррестин/динамин-зависимых механизмов, что приводит к десенсибилизации рецепторов. Этот процесс аналогичен процессу, наблюдаемому для большинства других GPCR, но скорость и степень индуцируемой агонистом интернализации CXCR2 выше, чем скорость и степень интернализации, наблюдаемой для CXCR1 (Richardson R., Pridgen B.C., Haribabu В., Ali H., Synderman R. 1998 Differential cross-regualtion of the human chemokine receptors CXCR1 and CXCR2. Evidence for timedependent signal generation. J. Biol. Chem, 273, 23830-23836).
Долгое время считалось, что IL-8 является нейтрофильным медиатором воспаления при ХОБЛ (Keatings V.M. et al., 1996, Differences in IL-8 and tumor necrosis factor-α in induced sputum from patients with COPD and asthma. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 153, 530-534; Yamamoto С. et al., 1997, Airway inflammation in COPD assessed by sputum levels of interleukin-8. Chest, 112, 505-510). При биопсии бронхиальных путей, малых дыхательных путей и паренхемы легких у пациентов с ХОБЛ наблюдается инфильтрация Т-клеток и повышенное число нейтрофилов, особенно в просветах дыхательных путей (Hogg J.C. et al., 2004, The nature of small-airway obstruction in chronic obstructive pulmonary disease. N. Eng. J. Med. 350, 2645-2653). Число нейтрофилов увеличивается в легких пациентов с ХОБЛ, что коррелирует со степенью тяжести заболевания (Keatings V.M. et al., 1996, Differences in IL-8 and tumor necrosis factor-α in induced sputum from patients with COPD and asthma. Am. J. Respir. Crit. Care Med. 153, 530-534). Кроме того, в мокроте пациентов с ХОБЛ повышаются уровни TNFa, что приводит к индуцированию высвобождения IL-8 из эпителиальных клеток дыхательных путей (Keatings). Концентрация GROa заметно увеличивается в индуцированной мокроте и в бронхеоальвеолярном лаваже (БАЛ), взятом у пациентов с
- 1 037063
ХОБЛ, в отличие от концентрации GROa у обычных курильщиков и у некурящих людей (Traves S.L. et al., 2002, Increased levels of the chemokines GROa and MCP-1 in sputum samples from patients with COPD. Thorax, 57, 50-595; Pesci A. et al., 1998, Inflammatory cells and mediators in bronchial lavage of patients with COPD. Eur. Respir J. 12, 380-386). GROa секретируется альвеолярными макрофагами и эпителиальными клетками дыхательных путей в ответ на TNFa-стимуляцию и селективно активирует CXCR2, который обладает хемотаксическим действием на нейтрофилы и моноциты. У пациентов с ХОБЛ наблюдается усиление моноцитарного хемотаксического ответа на GROa, которое может быть связано с повышением метаболизма или рециклинга CXCR2 в этих клетках (Traves S.L. et al., 2004, Specific CXC but not CC chemokines cause elevated monocyte migration in COPD: a role for CXCR2, J. Leukoc. Biol. 76, 441-450). Вирусная и бактериальная инфекция легких часто приводит к серьезному обострению заболевания у пациентов с ХОБЛ, которое характеризуется повышением числа нейтрофилов в дыхательных путях (Wedzicha J.A., Seemungal Т.А., 2007, COPD exacerbations: defining their cause and prevention, Lancet 370 (9589): 78696). Бронхиальная биопсия пациентов с острым тяжелым обострением ХОБЛ выявила значительное увеличение уровня экспрессии мРНК ENA-78, IL-8 и CXCR2 (Qiu Y. et al., 2003, Biopsy neutrophilia, neutrophil chemokine and receptor gene expression in severe exacerbations of chronic obstructive pulmonary disease. Am. J. Respir. Crit. Care. Med. 168, 968-975) , и повышенное количество нейтрофилов в мокроте (Bathoorn Е., Liesker J. Jw., Postma D.S. et al., Change in inflammation in out-patient COPD patients from stable phase to a subsequent exacerbation, (2009) Int. J. COPD, 4(1): 101-9), что позволяет предположить о потенциальной роли рецептора CXCR2 в развитии ХОБЛ и в резком обострении этого заболевания. В биоптатах бронхов наблюдается повышенный уровень экспрессии мРНК CXCR2, и этот уровень экспрессии коррелирует с присутствием нейтрофилов в тканях (Qiu 2003). ENA-78 высвобождается, главным образом, из эпителиальных клеток, при этом значительное повышение уровня экспрессии ENA-78 в эпителиальных клетках наблюдается при обострении ХОБЛ (Qiu 2003). Поскольку в дыхательных путях при ХОБЛ наблюдаются повышенные концентрации IL-8, GROa и ENA-78, и все три лиганда передают сигнал посредством CXCR2, то блокирование этого общего рецептора селективными антагонистами может служить эффективной противовоспалительной стратегией при лечении указанного заболевания.
ХОБЛ развивается медленно и постепенно прогрессирует, и прогрессирование этого заболевания традиционно оценивают с помощью тестов на функцию легких, т.е. спирометрического измерения форсированного объема выдоха в одну секунду (FEV1). Пациенты с предсказанным FEV1 <50% классифицируются как пациенты с тяжелым заболеванием. Функция легких четко коррелирует с коэффициентом смертности, т.е. в течение 12 лет умирает приблизительно 35% пациентов с тяжелой формой ХОБЛ, и лишь 5% пациентов с легкой или умеренной формой этого заболевания. По смертности во всем мире ХОБЛ занимает четвертое место (по данным Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) World Health Report, Geneva, 2000. Эти данные доступны на сайте URL: http://www.who.int/whr/2000/en/whr00_annex_en.pdf) и в ближайшее десятилетие заболеваемость и смертность от этой болезни, скорее всего, будет повышаться (Lopez A.D., Shibuya K., Rao С. et al., 2006, Chronic obstructive pulmonary disease: current burden and future projections, Eur. Respir J., 27(2), 397-412). Обострения этого заболевания являются ключевым фактором и выражаются в постепенном протекающим по спирали ухудшении состояния здоровья пациента, и эти обострения в высокой степени ответственны за подавляющее большинство случаев госпитализации больных с ХОБЛ (BTS (British Thoracic Society), 2006, Burden of Lung Disease Report, 2nd ed, http://www.britthoracic.org.Uk/Portals/0/Library/BTS%20Publications/burdeon of_lung_disease2007.pdf). Средние ежегодные коэффициенты для симптоматических и диагностированных обострений составляют 2,3 и 2,8 (O'Reilly J.F., Williams A.E., Holt K. et al., 2006, Prim Care Respir J. 15(6): 346-53). Диагностика на ранней стадии заболевания и назначение подходящего лечения пациенту с обострением, а также соответствующие профилактические меры помогут снизить нагрузку на уже перегруженные клиники. Применяемые в настоящее время способы лечения ХОБЛ являются, главным образом, паллиативными, и в настоящее время не существует каких-либо способов лечения, которые могли бы приостановить ухудшение функции легких или прогрессирующую деструкцию дыхательных путей, связанную с этим заболеванием. Для ослабления симптомов и лечения обострения заболевания применяются современные методы терапии, такие как введение β-адренергических бронхолитических средств кратковременного и пролонгированного действия, введение антихолинергических средств путем ингаляции (мускариновых антагонистов) и введение кортикостероидов путем ингаляции. Существенным недостатком современной терапии с применением кортикостероидов является то, что со временем кортикостероиды становятся неэффективными, поскольку у пациентов вырабатывается резистентность к этим кортикостероидам, что приводит к инактивации противовоспалительного действия этих лекарственных средств. Совершенно очевидно, что существует огромная и пока еще неудовлетворенная потребность в новых лекарственных средствах, позволяющих предотвращать прогрессирование ХОБЛ. Антагонисты хемокиновых рецепторов являются привлекательным средством для терапии ХОБЛ, поскольку транспорт воспалительных клеток при ХОБЛ управляется множеством хемокинов, а поэтому блокада хемокиновых рецепторов низкомолекулярными антагонистами может служить эффективной противовоспалительной стратегией при лечении такого за
- 2 037063 болевания. Главным отличительным признаком ХОБЛ является усиление воспалительного ответа, наблюдаемое у обычных курильщиков, а поэтому терапия ХОБЛ ставит своей целью не полное подавление инфильтрации воспалительных клеток, а лишь снижение их числа до уровней, наблюдаемых у здоровых курильщиков без ХОБЛ. Антагонисты CXCR2, благодаря их специфическому действию, действуют не по общему механизму иммуносупрессии, связанному с действием стероидов, а по механизму сохранения CXCR1, который позволяет активировать базальные нейтрофилы, что является важным фактором для защиты хозяина от ХОБЛ и от СН (сердечной недостаточности). В настоящее время, большинство лекарственных средств против ХОБЛ вводят путем ингаляции для снижения системных побочных эффектов, однако поскольку антагонисты хемокинов действуют на рецепторы, экспрессируемые в воспалительных клетках кровотока, такое системное введение должно быть оптимальным. Таким образом, необходимо разработать эффективное лекарственное средство, которое способно достигать малых дыхательных путей и паренхимы легких, пораженных ХОБЛ.
Хемокиновые рецепторы, в противоположность цитокиновым и интерлейкиновым рецепторам, принадлежат к суперсемейству рецепторов 7TM-GPCR, дающих сильный лекарственный эффект. Несмотря на это, предпринятые ранее попытки обнаружить сильные антагонисты столкнулись с еще большими трудностями, чем это ожидалось исходя из экспериментов с рецепторами GPCR, имеющими небольшие пептидные или биогенные аминовые лиганды. Попытки разработать программы обнаружения небольших молекул лекарственных средств, направленные на выявление антагонистов хемокиновых рецепторов, позволяют постепенно понять идиосинкразию хемокиновых рецепторов и структурных элементов, необходимых для функционирования небольших молекул в качестве антагонистов. Интересно отметить, что структурное разнообразие антагонистов СС-хемокиновых рецепторов, представленных рядом фундаментально отличающихся серий идентифицированных химических соединений, значительно превышает структурное разнообразие антагонистов СХС-хемокиновых рецепторов, что дает основание предположить, что относительные трудности в выявлении антагонистов могут заключаться в различии между двумя классами рецепторов.
В общих чертах было подтверждено, что хемокиновые рецепторы являются труднодоступными мишенями для их подавления, и были предприняты огромные усилия для идентификации сильных селективных антагонистов CXCR2. Низкомолекулярный антагонист CXCR2 был впервые описан в 1998 г., поскольку был разработан ряд неконкурентных аллостерических антагонистов CXCR2, некоторые из которых в настоящее время находятся на стадии клинических испытаний. Тем не менее, совершенно очевидно необходимо разработать более эффективные и сильные антагонисты функции CXCR2.
Молекулы, принадлежащие к классу иммуноглобулинов, находят все более широкое применение в медицине за последние десять лет или более. Специфичность этих молекул к мишени и возможность их конструирования с применением рекомбинантных методов сулит огромные перспективы с точки зрения разработки в высокой степени направленного лечения заболевания. Молекулы иммуноглобулинов многих типов и модифицированные молекулы иммуноглобулинов, включая стандартные четырехцепочечные антитела, Fab- и F(ab)2-фрагменты, однодоменные антитела (D(ab)), одноцепочечные Fv и нанотела, являются потенциально доступными для их соответствующего конструирования. Эти молекулы будут более подробно обсуждаться ниже в разделах настоящего описания, относящихся к полипептидам, сконструированным так, чтобы они были непосредственно направлены по меньшей мере на два эпитопа CXCR2.
Поэтому целью настоящего изобретения является разработка новых средств для профилактики или лечения хронической обструктивной болезни легких или ХОБЛ и других заболеваний, связанных с нарушением функций хемокинового рецептора CXCR2.
Другой целью настоящего изобретения является разработка способа лечения или профилактики ХОБЛ и других заболеваний, связанных с нарушением функций CXCR2, где указанным способом является иммунотерапия.
Еще одной целью настоящего изобретения является получение полипептида, содержащего CDR иммуноглобулина и представляющего собой антагонист передачи сигнала CXCR2.
Описание сущности изобретения
Настоящее изобретение относится к полипептиду, содержащему по меньшей мере два антигенсвязывающих домена иммуноглобулина, где полипептид направлен против хемокинового рецептора CXCR2 или связывается с этим рецептором, и где указанный полипептид включает первый антигенсвязывающий домен, распознающий первый эпитоп на CXCR2, и второй антигенсвязывающий домен, распознающий второй эпитоп на CXCR2. Предпочтительный полипептид по изобретению содержит первый антигенсвязывающий домен, способный связываться с линейным пептидом, состоящим из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 7, и второй антигенсвязывающий домен, который либо не способен связываться с указанным линейным пептидом, либо связывается с этим пептидом с меньшей аффинностью. SEQ ID NO: 7 представляет собой первые 19 N-концевых аминокислот CXCR2 человека. Предпочтительный полипептид по изобретению является бипаратопным. Используемый в настоящем документе термин бипаратопный означает, что данный полипептид содержит два антигенсвязывающих домена, распознающих два различных эпитопа на одном и том же белке-мишени. Однако полипептиды, которые
- 3 037063 являются мультипаратопными, т.е. содержат антигенсвязывающие домены, распознающие три, четыре или более эпитопов на одном и том же белке-мишени, также входят в объем настоящего изобретения, поскольку они представляют собой полипептиды, которые являются би- или мультипаратопными и поливалентными, т.е. содержат антигенсвязывающие домены, распознающие один или несколько других белков-мишеней.
В предпочтительных вариантах осуществления полипептидов по изобретению аминокислотная последовательность, содержащая первый антигенсвязывающии домен, и аминокислотная последовательность, содержащая второй антигенсвязывающии домен, связаны друг с другом линкерной областью. Как более подробно обсуждается ниже, линкер может происходить, а может и не происходить от иммуноглобулина, но предпочтительно он является пептидом.
В особенно предпочтительных полипептидах по изобретению указанный первый антигенсвязывающии домен содержится в одном вариабельном домене первого иммуноглобулина, а указанный второй антигенсвязывающии домен содержится в одном вариабельном домене второго иммуноглобулина. По меньшей мере один из указанных отдельных вариабельных доменов первого и второго иммуноглобулина может представлять собой VL-домен или его фрагмент, либо он может представлять собой VH-домен или его фрагмент. Полипептиды, где каждый первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в VL-доменах или их фрагментах, или где каждый первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в VH-доменах или их фрагментах, входят в объем настоящего изобретения. Полипептид по изобретению может содержать аминокислотные последовательности обоих VL и VH или их фрагменты в одной молекуле.
В других предпочтительных вариантах осуществления изобретения первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в одном из вариабельных доменов первого и второго иммуноглобулина, которые представляют собой доменные антитела (dAb). В наиболее предпочтительных вариантах осуществления изобретения по меньшей мере один, предпочтительно оба указанные первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в одном из вариабельных доменов иммуноглобулина, которые представляют собой VHH-домен или его фрагмент, происходящий от одной тяжелой цепи антитела с тяжелой цепью, полученного от животного семейства верблюжьих, или его гуманизированный вариант, в который была введена по меньшей мере одна замена человеческого аминокислотного остатка в каркасной области.
Один вариабельный домен иммуноглобулина, который имеет аминокислотную последовательность VHH, или его фрагмент или вариант, происходящий только от антитела с тяжелой цепью, полученного от животного семейства верблюжьих, может альтернативно называться в настоящем документе VHHдоменом или его фрагментом, или нанотелом. Следует отметить, что Nanobody®, Nanobodies® и Nanoclone® (нанотело, нанотела и наноклон) зарегистрированы под торговыми знаками Ablynx N.V.
В полипептидах по изобретению каждый антигенсвязывающий домен содержит по меньшей мере одну определенную в настоящем документе CDR, предпочтительно две или три CDR. В предпочтительных полипептидах по изобретению предпочтительной структурой одного из вариабельных доменов иммуноглобулина является VHH-домен или нанотело, а именно структура
FR-CDR-FR-CDR-FR-CDR-FR, где CDR и FR дополнительно определены ниже.
Предпочтительные бипаратопные нанотела по изобретению имеют одну из нижеследующих структур:
i) FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, ii) FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8-линкерHLE, iii) FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-HLE-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6FR8, где если FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4 содержит первый антигенсвязывающии домен (связывающийся с линейной SEQ ID NO: 7), то FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8 содержит второй антигенсвязывающии домен (не связывающийся с линейной SEQ ID NO: 7), а если FR1-CDR1-FR2-CDR2FR3-CDR3-FR4 содержит второй антигенсвязывающии домен (не связывающийся с линейной SEQ ID NO: 7), то FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8 содержит первый антигенсвязывающии домен (связывающийся с линейной SEQ ID NO: 7), a HLE представляет собой связующее звено, способствующее увеличению времени полужизни in vivo.
Фрагменты или варианты предпочтительного бипаратопного нанотела, описанного выше, входят в объем настоящего изобретения, включая варианты осуществления, в которых CDR и FR происходят от животного семейства верблюжьих, или варианты, в которых одна или несколько FR имеют по меньшей мере одну замену человеческим остатком, предпочтительно являются полностью гуманизированными.
Особенно предпочтительными бипаратопными нанотелами по изобретению являются антитела, обозначенные в настоящем документе 163D2/127D1, 163E3/127D1, 163Е3/54В12, 163D2/54B12, 2В2/163Е3, 2B2/163D2, 97А9/2В2 и 97А9/54В12 и имеющие аминокислотные последовательности, пред
- 4 037063 ставленные в табл. 13, в частности их варианты, в которых FR включают последовательность с оптимизированными аминокислотными заменами, определенными ниже и представленными в описании компонентов нанотел в табл. 32.
Особенно предпочтительные дополнительные бипаратопные нанотела по изобретению представлены в табл. 33.
Полипептиды по изобретению представляют собой модуляторы передачи сигнала CXCR2, которые блокируют, снижают или ингибируют активность CXCR2. Они могут ингибировать связывание природного лиганда, например GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ. Предпочтительно полипептиды по изобретению, в частности бипаратопные нанотела по изобретению, обладают способностью перекрестно блокировать связывание CXCR2 с одним или несколькими из 163D2/127D1, 163E3/127D1, 163Е3/54В12, 163D2/54B12, 2В2/163Е3, 2B2/163D2, 97А9/2В2 и 97А9/54В12, обсуждаемые выше.
Описанное в настоящем документе изобретение также охватывает структурные блоки одновалентных полипептидов, которые используются при конструировании би- или мультипаратопных или поливалентных нанотел. Предпочтительными одновалентными нанотелами являются каждый и все полипептиды с аминокислотными последовательностями, представленными в табл. 9, 34, или с аминокислотными последовательностями, в которых по меньшей мере одна из каркасных областей имеет аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности, представленной в табл. 9 или 34. Предпочтительными одновалентными нанотелами являются нанотела, представленные в табл. 9, и где по меньшей мере одна последовательность имеет оптимизирующую аминокислотную замену в каркасной области, такой как каркасная область нанотел, представленных в табл. 32 или 34. Особенно предпочтительным является одновалентное нанотело, обозначенное 137В7, и его оптимизированная последовательность и их варианты.
Предпочтительные полипептиды по изобретению связываются с эпитопом, состоящим из аминокислот F11, F14 и W15 SEQ ID NO: 1 (CXCR2). В предпочтительных бипаратопных полипептидах по изобретению, таких как бипаратопные нанотела, второй антигенсвязывающий домен связывается с эпитопом, расположенным во внешних петлях CXCR2 человека (аминокислотные остатки 106-120, 184-208 и 274-294 SEQ ID NO: 1). В одном из вариантов изобретения указанный эпитоп является конформационным. В одном из вариантов изобретения указанный эпитоп содержит аминокислотные остатки W112, G115, 1282 и Т285 SEQ ID NO: 1.
Настоящее изобретение также включает молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие любой полипептид по изобретению, а также нуклеиновые кислоты, кодирующие их фрагменты, такие как нуклеиновые кислоты, кодирующие отдельные нанотела, которые содержатся в бипаратопных нанотелах. Векторы, содержащие нуклеиновые кислоты по изобретению, и клетки-хозяева, содержащие указанные векторы и способные экспрессировать полипептид по изобретению, также входят в объем настоящего изобретения.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к фармацевтическим композициям, содержащим полипептид по изобретению в комбинации с фармацевтически приемлемым носителем, разбавителем или наполнителем. Поскольку полипептиды по изобретению способны блокировать, ингибировать или снижать активность CXCR2, то они могут быть использованы для лечения заболеваний, в развитии которых определенную роль играет нарушение передачи сигнала от CXCR2. Такими заболеваниями могут быть атеросклероз, гломерулонефрит, воспалительное заболевание кишечника (болезнь Крона), ангиогенез, рассеянный склероз, псориаз, возрастная дегенерация желтого пятна, глазная болезнь Бехчета, увеит, немелкоклеточная карцинома, рак толстой кишки, рак поджелудочной железы, рак пищевода, меланома, гепатоцеллюлярная карцинома или ишемическое реперфузионное повреждение. Такими заболеваниями могут быть также расстройства дыхательных путей, такие как кистозный фиброз, астма в тяжелой форме, обострение астмы, аллергическая астма, острое поражение легких, острый респираторный дистресс-синдром, идиопатический фиброз легких, ремоделирование дыхательных путей, синдром облитерирующего бронхиолита или бронхопульмонарная дисплазия.
В особенно предпочтительном варианте осуществления изобретения полипептиды по изобретению применяются для лечения хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ) или обострения ХОБЛ, которые характеризуются миграцией лейкоцитов, в частности нейтрофилов, в паренхиму легких с ее последующей деструкцией, где миграция опосредуется передачей CXCR2-сигнала. Благодаря способности полипептидов по изобретению блокировать, ингибировать или снижать активность CXCR2, эти полипептиды являются наилучшими кандидатами на их применение для профилактики или лечения указанного заболевания.
Для лечения человека предпочтительно, чтобы полипептид по изобретению был направлен непосредственно против CXCR2 человека или специфически связывался с ним. Однако более предпочтительно, чтобы указанный полипептид мог перекрестно реагировать с CXCR2 приматов, в частности с CXCR2 собакоподобных обезьян, для того, чтобы соответствующий тест на токсичность можно было проводить на указанных обезьянах. Полипептиды по изобретению в том случае, если они применяются в ветеринарии, могут быть направлены непосредственно против гомологов CXCR2 или могут специфически связываться с указанными гомологами, происходящими от животных других видов.
- 5 037063
Другие аспекты изобретения будут очевидны из нижеследующего обсуждения.
Описание графического материала
На фиг. 1 представлены кривые ответа, построенные по данным о способности двух нанотел и бипаратопного нанотела по изобретению блокировать высвобождение [35S]GTPyS из CHO-CXCR2мембран, стимулированное агонистом GROa, где указанную способность измеряли при возрастающих концентрациях нанотела.
На фиг. 1а представлены данные для нанотела 54В12 (SEQ ID NO: 90 в табл. 9), на фиг. 1b представлены данные для нанотела 163Е3 (SEQ ID NO: 42 в табл. 9), а на фиг. 1с представлены данные для бипаратопного нанотела 54В12/163Е3 (SEQ ID NO: 68 в табл. 13).
Определения.
Далее приводятся описание изобретения, примеры и формула изобретения.
а) Если это не указано или не оговорено особо, то все используемые в настоящем документе термины имеют свои общепринятые значения, известные специалистам. Например, описание этих терминов можно найти в стандартных руководствах, упомянутых ниже. Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2nd. Ed.), Vols. 1-3, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989); F. Ausubel et al., eds., Current protocols in molecular biology, Green Publishing and Wiley Interscience, New York (1987); Lewin, Genes II, John Wiley & Sons, New York, N.Y., (1985); Old et al., Principles of Gene Manipulation: An Introduction to Genetic Engineering, 2nd edition, University of California Press, Berkeley, CA (1981); Roitt et al., Immunology (6th. Ed.), Mosby/Elsevier, Edinburgh (2001); Roitt et al., Roitt' s Essential Immunology, 10 Ed. Blackwell Publishing, UK (2001); and Janeway et al., Immunobiology (6th Ed.), Garland Science Publishing/Churchill Livingstone, New York (2005).
b) Если это не оговорено особо, то термин иммуноглобулин или последовательность иммуноглобулина, независимо от того, относится ли он к антителу с тяжелой цепью или к стандартному 4цепочечному антителу, используется в настоящем документе как общий термин, включающий полноразмерное антитело, его отдельные цепи, а также все его части, домены или фрагменты (включая, но не ограничиваясь ими, антигенсвязывающие домены или их фрагменты, такие как VHH-домены или VH/VLдомены соответственно). Кроме того, используемый в настоящем документе термин последовательность (например, в таких словосочетаниях, как последовательность иммуноглобулина, последовательность антитела, последовательность вариабельного домена, последовательность VHH или последовательность белка), в общих чертах, включает соответствующую аминокислотную последовательность, а также последовательности нуклеиновой кислоты или нуклеотидные последовательности, кодирующие указанную аминокислотную последовательность, если в контексте настоящего описания не подразумевается более ограниченная интерпретация.
c) Если это не оговорено особо, то термин один вариабельный домен иммуноглобулина используется в настоящем документе как общий термин, включающий, но не ограничивающийся ими, антигенсвязывающие домены или фрагменты, такие как VHH-домены, или VH- или VL-домены соответственно. Термины антигенсвязывающие молекулы или антигенсвязывающие белки являются синонимами и также включают понятие нанотела. Один из вариабельных доменов иммуноглобулина также представляет собой последовательность вариабельного домена легкой цепи (например, VL-последовательность) или последовательность вариабельного домена тяжелой цепи (например, VH-последовательность), более конкретно они могут представлять собой последовательности вариабельного домена тяжелой цепи, происходящие от стандартного четырехцепочечного антитела, или последовательности вариабельного домена тяжелой цепи, происходящие от антитела с тяжелой цепью. В соответствии с этим отдельные вариабельные домены иммуноглобулина могут представлять собой доменные антитела или последовательности иммуноглобулина, которые могут быть использованы в качестве доменных антител, т.е. однодоменных антител, или последовательности иммуноглобулина, которые могут быть использованы в качестве однодоменных антител, т.е. dAb, или последовательности иммуноглобулина, которые могут быть использованы в качестве dAb или нанотел, включая, но не ограничиваясь ими, последовательности VHH-. Настоящее изобретение включает последовательности иммуноглобулина различного происхождения, включая последовательности иммуноглобулина, происходящие от мышей, крыс, кроликов, ослов, человека и животных семейства верблюжьих. Один вариабельный домен иммуноглобулина включает полностью человеческую последовательность, гуманизированную последовательность, последовательность, оптимизированную каким-либо другим способом, или химерную последовательность иммуноглобулина. Один вариабельный домен иммуноглобулина и структура одного вариабельного домена иммуноглобулина могут рассматриваться, но не ограничиваются ими, как вариабельный домен и его структура, состоящие из четырех каркасных областей FR, которые известны специалистам и упоминаются в настоящем документе как каркасная область 1 или FR1; каркасная область 2 или FR2; каркасная область 3 или FR3; и каркасная область 4 или FR4 соответственно, где указанные каркасные области прерываются тремя гипервариабельными областями (комплементарность-определяющими областями) или CDR, которые известны специалистам как гипервариабельная область 1 или CDR1; гипервариабельная область 2 или CDR2 и гипервариабельная область 3 или CDR3 соответственно.
- 6 037063
d) Если это не оговорено особо, то все методы, стадии, способы и модификации, которые подробно не описаны в настоящей заявке, могут быть осуществлены и были осуществлены способом, известным per se, как очевидно для специалиста в данной области. В этой связи можно обратиться к упомянутым в настоящем документе стандартным руководствам и общим справочным материалам, а также к цитируемым в них работам, и, например, к нижеследующим публикациям Presta, Adv. Drug Deliv. Rev. 2006, 58 (5-6): 640-56; Levin and Weiss, Mol. Biosyst. 2006, 2(1): 49-57; Irving et al., J. Immunol. Methods, 2001, 248(1-2), 31-45; Schmitz et al., Placenta, 2000, 21 Suppl. A, S106-12, Gonzales et al., Tumour Biol., 2005, 26(1), 31-43, в которых описаны методы конструирования белков, например метод созревания аффинности и другие методы повышения специфичности и улучшения других нужных свойств белков, таких как иммуноглобулины.
e) Аминокислотные остатки обозначены стандартным трехбуквенным или однобуквенным кодом.
f) Для сравнения двух или более нуклеотидных последовательностей процент идентичности последовательностей, т.е. процент идентичности между первой нуклеотидной последовательностью и второй нуклеотидной последовательностью, может быть вычислен или определен путем деления [числа нуклеотидов в первой нуклеотидной последовательности, идентичных нуклеотидам в соответствующих положениях во второй нуклеотидной последовательности] на [общее число нуклеотидов в первой нуклеотидной последовательности] и умножения на [100%], где каждая делеция, инсерция, замена или добавление нуклеотида во второй нуклеотидной последовательности, сравниваемой с первой нуклеотидной последовательностью, рассматривается как различие в одном нуклеотиде (положении); либо такой процент может быть вычислен с использованием подходящего компьютерного алгоритма или метода. Степень идентичности двух или более нуклеотидных последовательностей может быть вычислена с использованием известного компьютерного алгоритма для выравнивания последовательностей, такого как NCBI Blast v2.0, с использованием стандартных параметров. Некоторые другие методы, компьютерные алгоритмы и параметры для определения степени идентичности последовательностей описаны, например, в WO 04/037999, ЕР 0967284, ЕР 1085089, WO 00/55318, WO 00/78972, WO 98/49185 и GB 2357768 А. Обычно, для определения процента идентичности двух нуклеотидных последовательностей в соответствии с описанным выше методом вычисления нуклеотидную последовательность с наибольшим числом нуклеотидов обозначают как первую нуклеотидную последовательность, а другую нуклеотидную последовательность обозначают как вторую нуклеотидную последовательность.
g) Для сравнения двух или более аминокислотных последовательностей, процент идентичности последовательностей, т.е. процент идентичности между первой аминокислотной последовательностью и второй аминокислотной последовательностью (также называемый в настоящем документе идентичностью аминокислотных последовательностей), может быть вычислен или определен путем деления [числа аминокислотных остатков в первой аминокислотной последовательности, идентичных аминокислотным остаткам в соответствующих положениях во второй аминокислотной последовательности] на [общее число аминокислотных остатков в первой аминокислотной последовательности] и умножения на [100%], где каждая делеция, инсерция, замена или добавление аминокислотного остатка во второй аминокислотной последовательности, сравниваемой с первой аминокислотной последовательностью, рассматриваются как различие в одном аминокислотном остатке (положении), т.е. как различие аминокислот, определяемое в настоящей заявке; либо такой процент может быть вычислен с использованием подходящего компьютерного алгоритма или метода. Для определения процента идентичности двух аминокислотных последовательностей в соответствии с описанным выше методом вычисления аминокислотную последовательность с наибольшим числом аминокислотных остатков обозначают как первую аминокислотную последовательность, а другую аминокислотную последовательность обозначают как вторую аминокислотную последовательность.
Кроме того, для определения степени идентичности двух аминокислотных последовательностей специалисту в данной области следует принять во внимание так называемые консервативные аминокислотные замены, описанные ниже в пункте v).
Все аминокислотные замены могут быть также введены в описанные в настоящем документе полипептиды, исходя из анализа частоты аминокислотных различий между гомологичными белками, происходящими от различных видов, где указанный анализ был разработан Schulz et al., Principles of Protein Structure, Springer-Verlag, 1978, исходя из анализа структурообразующих потенциалов, разработанного Chou & Fasman, Biochemistry 13: 211, 1974 and Adv. Enzymol., 47: 45-149, 1978, и анализа профилей гидрофобности белков, разработанного Eisenberg et al., Proc. Nad. Acad Sci. USA 81: 140-144, 1984; Kyte & Doolittle; J. Molec. Biol. 157: 105-132, 1981, и Goldman et al., Ann. Rev. Biophys. Chem. 15: 321-353, 1986; все указанные публикации во всей своей полноте вводятся в настоящее описание в качестве ссылки. Что касается первичной и вторичной структуры нанотел, то кристаллическая структура VHH-домена ламы описана, например, в публикациях Desmyter et al., Nature Structural Biology, Vol. 3, 9, 803 (1996); Spinelli et al., Natural Structural Biotogy (1996); 3, 752-757; и Decanniere et al., Structure, Vol. 7, 4, 361 (1999).
h) Термин различие аминокислот, если он используется при сравнении двух аминокислотных последовательностей, означает инсерцию, делецию или замену одного аминокислотного остатка в положении первой последовательности, сравниваемой со второй последовательностью, и в этом случае подра
- 7 037063 зумевается, что две аминокислотные последовательности могут иметь различия в одной, двух или более указанных аминокислот.
i) Если говорят, что нуклеотидная последовательность или аминокислотная последовательность содержит другую нуклеотидную последовательность или аминокислотную последовательность, соответственно, или по существу, состоит из другой нуклеотидной последовательности или аминокислотной последовательности, то это может означать, что последняя нуклеотидная последовательность или аминокислотная последовательность включена в первую упомянутую нуклеотидную последовательность или аминокислотную последовательность, соответственно, но обычно, это означает, что первая упомянутая нуклеотидная последовательность или аминокислотная последовательность содержит фрагмент из нуклеотидов или аминокислотных остатков, соответственно, который имеет ту же самую нуклеотидную последовательность или аминокислотную последовательность, соответственно, как и последняя последовательность, независимо от способа получения или получения первой упомянутой последовательности (где указанным способом может быть, например, любой подходящий описанный в настоящем документе способ). В качестве неограничивающего примера можно сказать, что если один вариабельный домен бипаратопного иммуноглобулина, например, нанотела по изобретению содержит последовательность CDR, то это может означать, что указанная последовательность CDR включена в бипаратопное нанотело по изобретению, но обычно, это означает, что бипаратопное нанотело по изобретению содержит фрагмент из аминокислотных остатков, который имеет такую же аминокислотную последовательность, как и указанная последовательность CDR, независимо от способа продуцирования или получения указанного бипаратопного нанотела. Следует также отметить, что если последняя аминокислотная последовательность имеет конкретную биологическую или структурную функцию, то предпочтительно, чтобы эта функция была, по существу, идентична, аналогична или эквивалентна биологической или структурной функции первой упомянутой аминокислотной последовательности (другими словами, предпочтительно, чтобы первая упомянутая аминокислотная последовательность, так же как и последняя последовательность, обладала способностью осуществлять, в основном, ту же самую, аналогичную или эквивалентную биологическую или структурную функцию). Так, например, если говорят, что бипаратопное нанотело по изобретению содержит последовательность CDR или каркасную последовательность, соответственно, то это означает, что CDR-последовательность и каркасная последовательность, содержащаяся в указанном бипаратопном наноантетеле, предпочтительно способна функционировать так же, как и последовательность CDR или каркасная последовательность соответственно. Кроме того, если говорят, что нуклеотидная последовательность содержит другую нуклеотидную последовательность, то это означает, что первая из упомянутых нуклеотидных последовательностей является предпочтительно такой, что, если она экспрессируется с образованием продукта экспрессии (например, полипептида), то аминокислотная последовательность, кодируемая последней нуклеотидной последовательностью, образует часть указанного продукта экспрессии (другими словами, это означает, что последняя нуклеотидная последовательность находится в одной рамке считывания с первой упомянутой более крупной нуклеотидной последовательностью).
j) Считается, что последовательность нуклеиновой кислоты или аминокислотная последовательность присутствует в основном в выделенной форме, например, по сравнению с ее нативным биологическим источником и/или реакционной средой, или культуральной средой, из которой она была выделена, если она была выделена по меньшей мере из одного другого компонента, с которым эта последовательность обычно связана в указанном источнике или в среде, такими как другая нуклеиновая кислота, другой белок/полипептид, другой биологический компонент, или макромолекула, или по меньшей мере одно контаминирующее вещество, примесь или небольшой компонент. В частности, последовательность нуклеиновой кислоты или аминокислотная последовательность считается в основном выделенной, если степень ее чистоты выше по меньшей мере в 2 раза, в частности по меньшей мере в 10 раз, более конкретно по меньшей мере в 100 раз и до 1000 раз или более. Последовательность нуклеиновой кислоты или аминокислотная последовательность, которая присутствует в основном в выделенной форме, предпочтительно является, по существу, гомогенной, как было определено с применением подходящего метода, такого как подходящий хроматографический метод, например электрофорез в полиакриламидном геле.
k) Используемый в настоящем документе термин антигенсвязывающии домен означает аминокислотную последовательность иммуноглобулина, содержащую по меньшей мере одну CDR и имеющую конформацию, распознающую мишень, а именно антигенную детерминанту или эпитоп.
l) Используемые в настоящем документе термины антигенная детерминанта и эпитоп, которые могут быть синонимами, означают аминокислотную последовательность в CXCR2-мишени, которая распознается антигенсвязывающими доменами, независимо от того, имеет ли такая аминокислотная последовательность линейную или нелинейную конформацию.
m) Полипептид по изобретению, такой как, например, описанное в настоящем документе бипаратопное нанотело или его фрагмент, которые могут (специфически) связываться, аффинно связываться и/или специфически связываться со специфической антигенной детерминантой, специфическим эпитопом, антигеном или белком (или по меньшей мере с одной его частью, фрагментом или эпитопом), рас
- 8 037063 сматривается как полипептид, направленный против или направленный непосредственно против указанной антигенной детерминанты, указанного эпитопа, антигена или белка.
n) Термин специфичность означает число антигенов или антигенных детерминант различных типов, с которыми может связываться конкретный антигенсвязывающий домен полипептида по изобретению. Специфичность антигенсвязывающего белка к любому конкретному антигену/эпитопу может быть определена исходя из аффинности и/или авидности, как указано на стр. 53-56 заявки WO 08/020079 (которая включена в настоящее описание в качестве ссылки), в которой также описаны некоторые предпочтительные методы определения уровня связывания полипептида с соответствующим антигеном или эпитопом. Обычно, в каждом антигенсвязывающем белке (таком как полипептиды по изобретению), каждый антигенсвязывающий домен может независимо связываться со своим антигеном/эпитопом с константой диссоциации (KD), составляющей 10-5-10-12 моль/л или менее, предпочтительно 10-7-10-12 моль/л или менее, а более предпочтительно 10-8-10-12 моль/л (т.е. с константой ассоциации (KA) 105-1012 л/моль или более, предпочтительно 107-1012 л/моль или более, более предпочтительно 108-1012 л/моль). Любая величина KD, составляющая более чем 104 моль/л (или любая величина KA менее чем 104 М-1 л/моль), по существу, рассматривается как величина, указывающая на неспецифическое связывание. Предпочтительно бипаратопный полипептид по изобретению связывается с нужным антигеном с аффинностью менее чем 500 нМ, предпочтительно менее чем 200 нМ, более предпочтительно менее чем 10 нМ, например, менее чем 500 пМ. Специфическое связывание полипептида по изобретению с CXCR2 может быть определено любым подходящим методом, известным per se, включая, например, анализ Скэтчарда и/или анализы на конкурентное связывание, такие как радиоиммуноанализы (РИА), ферментные иммуноанализы (EIA) и сэндвич-анализы на конкурентное связывание, и их различные варианты, известные специалистам per se, а также другие упомянутые в настоящем документе методы. Как очевидно для специалиста и как указано на стр. 53-56 заявки WO 08/020079, константой диссоциации может быть фактическая или кажущаяся константа диссоциации. Методы определения константы диссоциации известны специалистам и включают, например, методы, описанные на стр. 53-56 заявки WO 08/020079.
о) Время полужизни полипептида по изобретению, в частности бипаратопного нанотела по изобретению, может быть, в основном, определено как время, за которое концентрация полипептида по изобретению в сыворотке снижается на 50% in vivo, например, в результате разложения полипептида и/или клиренса или секвестрации полипептида под действием природных механизмов. Время полужизни полипептида по изобретению in vivo может быть определено любым известным способом per se, таким как фармакокинетический анализ. Подходящие методы известны специалистам и, по существу, описаны, например, в параграфе о) на стр. 57 заявки WO 08/020079. Как упоминается на стр. 57 заявки WO 08/020079, время полужизни может быть выражено такими параметрами, как t1/2-a, 11/2-β и площадь под кривой (AUC). Ниже приводится ссылка на экспериментальную часть, а также на стандартные руководства, такие как Kenneth, A. et al. Chemical Stability of Pharmaceuticals: A Handbook for Pharmacists and Peters et al., Pharmacokinete analysis: A Practical Approach (1996). Также приводится ссылка на руководство Pharmacokinetics, M. Gibaldi & D. Perron, опубликованное Marcel Dekker, 2nd Rev. edition (1982). Термины увеличение времени полужизни или увеличенное время полужизни относятся к увеличению Π/2-β с увеличением или без увеличения t1/2-a, и/или AUC, или того и другого.
р) В контексте настоящего изобретения термины блокирование, снижение или ингибирование активности CXCR2, определяемой с помощью подходящих анализов in vitro, клеточных анализов или анализов in vivo, может означать либо блокирование, либо снижение, либо ингибирование релевантной или предполагаемой биологической активности CXCR2 по меньшей мере на 1%, предпочтительно по меньшей мере на 5%, например, по меньшей мере на 10% или по меньшей мере на 25%, например, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 60%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 80% или на 90% или более по сравнению с активностью CXCR2 в том же самом анализе и в тех же самых условиях, но в отсутствие полипептида по изобретению.
Как очевидно для специалиста в данной области, термин ингибирование может также включать снижение аффинности, авидности, специфичности и/или селективности CXCR2 по отношению к одному или нескольким его лигандам или партнерам по связыванию и/или снижение чувствительности CXCR2 для одного или нескольких условий в среде, или в окружении, в котором присутствует CXCR2 (таких как рН, ионная сила, присутствие кофакторов и т.п.), по сравнению с теми же самыми условиями, но в отсутствие полипептида по изобретению. Как очевидно для специалиста в данной области, такое ингибирование может быть также определено любым подходящим методом и/или с помощью любого подходящего анализа, известного per se, в зависимости от рассматриваемой мишени или рассматриваемого антигена.
q) Используемый в настоящем документе термин модуляция может означать аллостерическую модуляцию CXCR2; и/или снижение уровня связывания или ингибирование связывания CXCR2 с одним из его лигандов, и/или конкурирование с природным лигандом за связывание с CXCR2. Модуляция может также, например, включать изменение укладки или конформации CXCR2, или сообщение способности CXCR2 изменять свою конформацию (например, после связывания с лигандом) для связывания с другими единицами (субъединицами) или для диссоциации от этих единиц (субъединиц). Модуляция
- 9 037063 может также включать, например, изменение способности CXCR2 транспортировать другие соединения или служить в качестве канала для других соединений (таких как ионы).
Модуляция, в частности ингибирование или снижение активности CXCR2 под действием полипептидов по изобретению, а именно бипаратопных нанотел по изобретению, может быть обратимой или необратимой, однако для их использования в фармацевтике и в фармакологии желательно, чтобы такое ингибирование или снижение активности CXCR2 было обратимым.
r) Полипептид по изобретению считается специфичным по отношению к CXCR2 по сравнению со второй мишенью или антигеном, если он связывается с CXCR2 с аффинностью (описанной выше и выражаемой как величина KD, величина KA, константа скорости диссоциации Koff и/или константа скорости ассоциации Kon), которая по меньшей мере в 10 раз, например по меньшей мере в 100 раз, предпочтительно по меньшей мере в 1000 раз и до 10000 раз или более превышает аффинность связывания со второй мишенью или полипептидом. Так, например, полипептид по изобретению может связываться с CXCR2 с величиной KD, которая по меньшей мере в 10 раз, например по меньшей мере в 100 раз, предпочтительно по меньшей мере в 1000 раз, например в 10000 раз или т.п. меньше величины KD для связывания с другой мишенью или с другим полипептидом или эпитопом.
s) Используемые в настоящем описании термины перекрестно блокировать, перекрестно блокированный и перекрестное блокирование являются синонимами и относятся к способности одного вариабельного домена иммуноглобулина или полипептида негативно влиять на связывание других отдельных вариабельных доменов иммуноглобулина или полипептидов по изобретению с данной мишенью. Степень влияния одного вариабельного домена иммуноглобулина или полипептида по изобретению на связывание с другой мишенью, которое можно назвать перекрестным блокированием по изобретению, может быть определена с помощью анализов на конкурентное связывание. В одном особенно подходящем количественном анализе на перекрестное блокирование применяется FACS- или ELISA-метод оценки конкурентного связывания меченного (например, His-меченного, радиоактивно меченного или флуоресцентно меченного) одного вариабельного домена иммуноглобулина или полипептида по изобретению и другого связывающего агента с мишенью. В экспериментальной части, по существу, описан подходящий анализ на основе FACS и ELISA с замещением, проводимый для того, чтобы определить, может ли связывающая молекула перекрестно блокировать один вариабельный домен иммуноглобулина или полипептид по изобретению, или она перекрестно блокирует такой домен или полипептид. Следует отметить, что в этом анализе могут быть использованы любые описанные в настоящем документе отдельные вариабельные домены иммуноглобулина или другие связывающие агенты. Таким образом, в основном, перекрестно блокирующая аминокислотная последовательность или другой связывающий агент по изобретению представляют собой последовательность или агент, которые будут связываться с мишенью в вышеуказанном анализе на перекрестное блокирование так, чтобы во время проведения анализа и в присутствии второй аминокислотной последовательности или другого связывающего агента по изобретению зарегистрированное замещение одного вариабельного домена иммуноглобулина или полипептида по изобретению составляло 50-100% от максимального теоретического замещения под действием предполагаемого тестируемого перекрестно блокирующего агента (например, другого фрагмента антитела, VHH, dAb или аналогичного варианта VH/VL).
t) Считается, что полипептид по изобретению перекрестно реагирует с двумя различными антигенами или с антигенными детерминантами (такими как сывороточный альбумин или CXCR2 от млекопитающих двух различных видов, таких как человек и собакоподобная обезьяна), если он является специфичным (как определено в настоящем описании) по отношению к этим различным антигенам или антигенным детерминантам.
u) Определенный в настоящем описании термин консервативные аминокислотные замены означает аминокислотные замены, при которых один аминокислотный остаток заменяют другим аминокислотным остатком, который имеет аналогичную химическую структуру, и который оказывает незначительное влияние или, по существу, не оказывает какого-либо влияния на функцию, активность или другие биологические свойства указанного полипептида. Такие консервативные аминокислотные замены хорошо известны специалистам и описаны, например, в WO 04/037999, GB-A-3357768, WO 98/49185, WO 00/46383 и WO 01/09300; и (предпочтительные) типы и/или комбинации таких замен могут быть выбраны исходя из соответствующего описания в заявке WO 04/037999, а также в заявке WO 98/49185 и в других работах, цитируемых в этих заявках.
Такими консервативными заменами предпочтительно являются замены, где одна аминокислота, входящая в нижеследующие группы (а)-(е), заменена другим аминокислотным остатком, принадлежащим к той же самой группе, где указанными группами являются: (а) небольшие алифатические неполярные или слабополярные остатки Ala, Ser, Thr, Pro и Gly; (b) полярные отрицательно заряженные остатки и их (незаряженные) амиды Asp, Asn, Glu и Gln; (с) полярные, положительно заряженные остатки His, Arg и Lys; (d) крупные алифатические неполярные остатки Met, Leu, Ile, Val и Cys; и (е) ароматические остатки Phe, Tyr и Trp.
Особенно предпочтительными консервативными заменами являются следующие замены: Ala на Gly или на Ser; Arg на Lys; Asn на Gln или на His; Asp на Glu; Cys на Ser; Gln на Asn; Glu на Asp; Gly на Ala
- 10 037063 или на Pro; His на Asn или на Gln; Ile на Leu или на Val; Leu на Ile или на Val; Lys на Arg, на Gln или на Glu; Met на Leu, на Tyr или на Ile; Phe на Met, на Leu или на Tyr; Ser на Thr; Thr на Ser; Trp на Tyr; Tyr на Trp; и/или Phe на Val, на Не или на Leu.
v) Как используется в настоящем описании, CDR представляет собой гипервариабельную область полипептидов по изобретению. CDR представляет собой фрагмент из аминокислот, которые, если они присутствуют отдельно или в комбинации с одной или несколькими другими CDR, определяют комплементарность с антигеном(ами) или эпитопом(ами), которые распознает полипептид по изобретению. CDR идентифицируют в аминокислотных последовательностях в соответствии с определенными соглашениями о нумерации. В формуле изобретения и в конкретном описании настоящей заявки используется нумерация Kabat.
w) Используемый в настоящем документе термин FR означает каркасную область (иногда обозначаемую FW). Каркасные области представляют собой аминокислотные фрагменты, которые фланкируют одну или несколько CDR и сохраняют их правильную трехмерную конформацию, необходимую для распознавания антигена или эпитопа. FR не обладают специфичностью к антигену или к эпитопу мишени, но являются специфичными для молекул иммуноглобулина определенного вида или типа, в которых они присутствуют. Как подробно обсуждается ниже, в полипептидах по изобретению аминокислотные последовательности каркасной области должны быть сконструированы так, чтобы они отличались от каркасной последовательности, происходящей от источника иммуноглобулина, например, верблюда.
х) Используемый в настоящем документе термин CXCR2 означает цитокиновый рецептор, который присутствует, по меньшей мере, на поверхности лейкоцитов, и природными лигандами которого могут быть GRO-α, β, γ, IL-8, ENA-78 или GCP-2. Используемый в настоящем документе термин CXCR2, по существу, означает любой белок, обладающий функцией CXCR2, независимо от источника его происхождения. Однако используемый в настоящем описании термин CXCR2 человека означает белок, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, или любой его аллельный вариант или ортолог, а термин CXCR2 собакоподобных обезьян означает белок, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 3, или любой его аллельный вариант или ортолог.
у) Используемый в настоящем описании термин оптимизация последовательности означает подбор наиболее благоприятных замен, инсерций или делеций для введения в аминокислотную последовательность в целях сохранения или сообщения конкретных свойств или структурных особенностей, которые могут отсутствовать в нативной последовательности. Такие замены, инсерций или делеций могут быть введены, например, в целях химической стабилизации, улучшения технологических свойств, предотвращения образования пироглутамата или предотвращения окисления или изомеризации. Методы оптимизации таких свойств, которые могут быть применены для бипаратопных полипептидов, в частности бипаратопных нанотел по изобретению, описаны в заявке WO 2009/095235, которая вводится в настоящее описание посредством ссылки. Методы оптимизации последовательностей могут быть также осуществлены в целях гуманизации бипаратопного полипептида по изобретению описанным в настоящем документе способом. Таким образом, при использовании любого из терминов оптимизация последовательностей, оптимизировать последовательность или оптимизированная последовательность подразумевается, что они относятся к конкретным заменам или инсерциям, введенным в целях гуманизации, или к частично или полностью гуманизированным бипаратопным полипептидам, предпочтительно к бипаратопным нанотелам.
Подробное описание изобретения
Как указывалось выше, в первом аспекте настоящее изобретение относится к полипептиду, содержащему по меньшей мере два антигенсвязывающих домена иммуноглобулина, где полипептид направлен против хемокинового рецептора CXCR2 или связывается с этим рецептором, и где указанный полипептид включает первый антигенсвязывающий домен, распознающий первый эпитоп на CXCR2, и второй антигенсвязывающий домен, распознающий второй эпитоп на CXCR2.
Предпочтительный полипептид по изобретению содержит первый антигенсвязывающий домен, способный связываться с линейным пептидом, состоящим из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 7, и второй антигенсвязывающий домен, который либо не способен связываться с указанным линейным пептидом, либо связывается с этим пептидом с меньшей аффинностью. SEQ ID NO: 7 представляет собой первые 19 N-концевых аминокислот CXCR2 человека.
В одном из вариантов осуществления изобретения первый антигенсвязывающий домен распознает первый эпитоп, содержащий область из 1-19 аминокислот CXCR2 или входящий в эту область, а указанный второй антигенсвязывающий домен распознает второй эпитоп на CXCR2, находящийся за пределами аминокислот 1-19.
Первый и второй антигенсвязывающие домены могут находиться в одной или нескольких аминокислотных последовательностях, характерных для молекулы класса иммуноглобулинов. Так, например, эти пептиды или полипептиды могут содержать стандартное четырехцепочечное антитело, присоединенное посредством линкера. В частности, полипептид по изобретению может представлять собой полипептид, в котором указанные первый и второй антигенсвязывающие домены присутствуют в первом и вто
- 11 037063 ром антителах соответственно, каждое из которых содержит две тяжелых и две легких цепи, где указанные первое и второе антитела связаны посредством линкера. Альтернативно, указанные первый и второй антигенсвязывающие домены могут находиться в одном антителе, содержащем две тяжелых и две легких цепи.
В альтернативном варианте осуществления изобретения первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в аминокислотных последовательностях, которые представляют собой антитела с тяжелой цепью, в частности, полипептидом по изобретению может быть полипептид, в котором указанный первый антигенсвязывающий домен содержится в первом антителе с тяжелой цепью, а указанный второй антигенсвязывающий домен находится во втором антителе с тяжелой цепью, где указанные первое и второе антитела с тяжелой цепью связаны посредством линкера. Такие антитела с тяжелой цепью могут происходить от животных семейства верблюжьих и содержат по своей природе только две тяжелых цепи, каждая из которых содержит константную и вариабельную область. В настоящем изобретении также рассматривается полипептид, в котором указанные первый и второй связывающие домены присутствуют в одном антителе с тяжелой цепью, содержащем две тяжелые цепи.
В другом альтернативном варианте осуществления изобретения пептиды или полипептиды, содержащие первый и второй связывающие домены, могут представлять собой одноцепочечный Fv (scFv). Эти пептиды или полипептиды содержат линейные слитые VL- и VH-домены. В соответствии с этим полипептидом по изобретению может быть полипептид, где первый и второй антигенсвязывающие домены присутствуют в первом и втором одноцепочечных Fv-фрагментах (scFv) антитела, соответственно, и где указанные первый и второй scFv-фрагменты связаны посредством линкера.
В другом альтернативном варианте осуществления изобретения первый и второй антигенсвязывающие домены могут содержаться в одном или нескольких Fab или F(ab)2-фрагментах стандартного четырехцепочечного антитела. Fab-фрагмент содержит один константный домен и один вариабельный домен, происходящий от каждой одной тяжелой и одной легкой цепи стандартного антитела. F(ab)2фрагмент содержит два Fab-фрагмента, связанных частью шарнирной области стандартного антитела. В частности, полипептидом по изобретению может быть полипептид, где указанные первый и второй антигенсвязывающие домены присутствуют в первом и втором Fab- или F(ab)2-фрагментах антитела соответственно, и где указанные первый и второй Fab-или F(ab)2-фрагменты связаны посредством линкера. В таком варианте изобретения указанный первый антигенсвязывающий домен может содержаться в Fabфрагменте антитела, а указанный второй антигенсвязывающий домен содержится в F(ab)2-фрагменте или наоборот.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения первый антигенсвязывающий домен содержится в одном вариабельном домене первого иммуноглобулина, а указанный второй антигенсвязывающий домен содержится в одном вариабельном домене второго иммуноглобулина.
В конкретном примере этого варианта осуществления изобретения первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в однодоменном антителе, обозначаемом d(ab). Антитела d(ab) содержат один VL-домен или один VH-домен, происходящий от стандартных антител. Таким образом, полипептидом по изобретению может быть полипептид, где указанные первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в первом и втором доменных антителах (dAb), и где указанные первое и второе dAb связаны посредством линкера. Указанные первое и второе dAb могут представлять собой VL-фрагменты или VH-фрагменты антитела. В настоящем варианте осуществления изобретения указанный первый антигенсвязывающий домен может содержаться в VL-фрагменте, а указанный второй антигенсвязывающий домен может содержаться в VH-фрагменте, или наоборот.
Общее описание (одно)доменных антител можно также найти в ЕР 0368684. Определение термина dAb можно найти в публикации Ward et al. (Nature 1989 Oct 12; 341 (6242): 544-6), Holt et al., Trends Biotechnol., 2003, 21(11):484-490; а также, например, в заявках WO 06/030220, WO 06/003388 и в других опубликованных патентных заявках Domantis Ltd. Следует также отметить, что хотя однодоменные антитела или отдельные вариабельные домены могут быть получены от акул некоторых видов (например, так называемые домены IgNAR, см., например, WO 05/18629), однако с точки зрения настоящего изобретения они являются менее предпочтительными, поскольку они не происходят от млекопитающих.
Вариабельная область одной цепи такого антитела с тяжелой цепью известна как VHH-домен и содержит фрагмент антитела, известный как нанотело. Нанотело может содержать весь VHH-домен или его фрагмент. Общее описание антител с тяжелой цепью и их вариабельных доменов можно найти в предшествующей заявке WO 08/020079 на стр. 59 и списке работ, опубликованных на стр. 41-43 международной заявки WO 06/040153. VHH-домены имеют ряд уникальных структурных особенностей и функциональных свойств, которые позволяют получить выделенные VHH-домены (а также нанотела на их основе, имеющие структурные и функциональные свойства, аналогичные структурным и функциональным свойствам природных VHH-доменов), и полипептиды, имеющие такие же в высокой степени предпочтительные свойства, как и функциональные антигенсвязывающие домены или полипептиды. В частности, VHHдомены (которые были сконструированы» в соответствии с их природной способностью функционально связываться с антигеном в отсутствие вариабельного домена легкой цепи или без какого-либо взаимодействия с этим доменом), и нанотела могут функционировать как одна относительно небольшая функ
- 12 037063 циональная антигенсвязывающая структурная единица, домен или белок. Используемый в настоящем документе термин нанотело охватывает не только природные VHH-домены и их фрагменты, но также и их варианты и производные, подробно обсуждаемые ниже.
В наиболее предпочтительном варианте осуществления изобретения бипаратопным полипептидом по изобретению является полипептид, где указанный первый антигенсвязывающий домен содержится в первом нанотеле, а указанный второй антигенсвязывающий домен присутствует во втором нанотеле, и где указанные первое и второе нанотела связаны посредством линкера.
Структура VHH-домена может быть представлена как
FR-CDR-FR-CDR-FR-CDR-FR, а бипаратопный полипептид по изобретению может иметь одну из нижеследующих структур:
i) FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, ii) FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8-линкерHLE, iii) FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-HLE-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6FR8, где если FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4 содержит первый антигенсвязывающий домен (связывающийся с линейной SEQ ID NO: 7), то FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8 содержит второй антигенсвязывающий домен (не связывающийся с линейной SEQ ID NO: 7), а если FR1-CDR1-FR2-CDR2FR3-CDR3-FR4 содержит второй антигенсвязывающий домен (не связывающийся с линейной SEQ ID NO: 7), то FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8 содержит первый антигенсвязывающий домен (связывающийся с линейной SEQ ID NO: 7), a HLE представляет собой связывающую единицу, способствующую увеличению времени полужизни in vivo.
В соответствии с этим используемый в настоящем документе термин бипаратопное нанотело по изобретению означает полипептид, содержащий два отдельных нанотела, связанных посредством линкера.
Однако бипаратопные нанотела по изобретению могут содержать лишь одну CDR в каждом нанотеле. Если это имеет место, то предпочтительной CDR является CDR3 и/или CDR6. Однако бипаратопные нанотела по изобретению могут представлять собой CDR1, или CDR2, или CDR3, или CDR1 и CDR2, или CDR1 и CDR3, или CDR2 и CDR3, или CDR1 и CDR2 и CDR3 в N-концевом нанотеле и любую из нижеследующих комбинаций в С-концевом нанотеле: CDR4, или CDR5, или CDR6, или CDR4 и CDR5, или CDR4 и CDR6, или CDR5 и CDR6, или CDR4 и CDR5 и CDR6. Как указывалось выше, бипаратопное нанотело по изобретению может содержать все CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 и CDR6, где каждая CDR фланкирована FR.
FR могут иметь аминокислотные последовательности, соответствующие исходной верблюжьей последовательности. Однако в предпочтительных вариантах осуществления изобретения одна или несколько FR имеют по меньшей мере одну последовательность-оптимизирующую аминокислотную замену, при этом предпочтительно, чтобы одна или несколько, предпочтительно все, FR были частично или полностью гуманизированными. Замены для оптимизации последовательности более подробно обсуждаются ниже.
Также указывалось, что в вариантах осуществления настоящего изобретения, в которых первый и второй антигенсвязывающие домены находятся в отдельных вариабельных доменах первого и второго иммуноглобулина, не являющихся нанотелами, и в доменах или фрагментах стандартных антител, обсуждаемых выше, например человеческих антител, доменов или фрагментов, область CDR может быть модифицирована путем введения в нее по меньшей мере одной замены верблюжьим остатком и продуцировать, но необязательно, полностью верблюжьи CDR.
Как описано в настоящей заявке, общее число аминокислотных остатков в одном нанотеле может составлять в пределах 110-120 остатков, предпочтительно 112-115 остатков, наиболее предпочтительно 113 остатков. Однако следует отметить, что части, фрагменты, аналоги или производные (как подробно описано ниже) нанотела не имеют конкретных ограничений по их длине и/или размеру при условии, что такие части, фрагменты, аналоги или производные будут удовлетворять указанным в настоящем документе требованиям и могут также оказаться предпочтительными для достижения описанных в настоящем документе целей.
Как описано в настоящей заявке, аминокислотные остатки нанотела пронумерованы в соответствии с общей системой нумерации VH-доменов, предложенной Kabat и др. (Sequence of proteins of immunological interest, US Public Health Services, NIH Bethesda, MD, Publication NO:91) и применяемой к верблюжьим VHH-доменам, описанным в статье Riechmann and Muyldermans, J. Immunol. Methods 2000 Jun 23; 240 (1-2): 185-195 (см., например, фиг. 2 этой публикации), и соответственно, FR1 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 1-30; CDR1 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 31-35; FR2 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 3649; CDR2 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 50-65; FR3 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 66-94; CDR3 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 95-102; и FR4 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положе
- 13 037063 ниях 103-113. В предпочтительном бипаратопном нанотеле по изобретению N-концевое нанотело может иметь FR и CDR в положениях, указанных выше, а в С-концевом нанотеле FR5 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 1-30; CDR4 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 31-35; FR6 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 3649; CDR5 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 50-65; FR7 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 66-94; CDR6 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 95-102; и FR8 нанотела может содержать аминокислотные остатки в положениях 103-113.
Однако следует отметить, что CDR и FR в антителе, в частности в нанотеле, могут быть идентифицированы в соответствии с системами нумерации, которые являются альтернативой системе Kabat. Такими системами являются системы нумерации по Chothia, системы нумерации IMGT и АНо. Идентификация положений CDR или FR любой одной из аминокислотных последовательностей, указанных в табл. 9, 13, 19, 32, 33 и 34 и пронумерованных в соответствии с этими альтернативными системами нумерации, может быть осуществлена с помощью анализа последовательностей. Для этого можно обратиться к следующим web-сайтам: http://www.biochem.ucl.ас.uk/~martin/ (Chothia); http://imqt.cines.fr (IMGT) и http://www.bio.uzh.ch/antibody/index.html (АНо). В частности, в предпочтительных описанных в настоящем документе бипаратопных нанотелах по изобретению CDR 1, 2, 3, 4, 5 или 6 могут быть определены в соответствии с одной из этих систем нумерации, которые являются альтернативой системе нумерации Kabat, но которые все же входят в объем настоящего изобретения.
CDR по Chothia для некоторых нанотел по изобретению представлены в табл. 35.
Нанотела могут принадлежать к так называемому классу VH3 (т.е. к классу нанотел, имеющих последовательности, в высокой степени гомологичные последовательностям зародышевой линии человека класса VH3, таких как DP-47, DP-51 или DP-29), где указанные нанотела являются предпочтительными для конструирования бипаратопных нанотел по изобретению. Однако следует отметить, что нанотело любого типа, направленное против CXCR2, и, например, нанотела, принадлежащие к так называемому классу VH4 (т.е. к классу нанотел, имеющих последовательности, в высокой степени гомологичные последовательностям зародышевой линии человека класса VH4, таких как DP-78), и описанные, например, в WO 07/118670, могут быть также использованы для конструирования бипаратопных нанотел по изобретению.
Линкерная молекула, которая соединяет один или несколько пептидов или полипептидов, содержащих первый и второй антигенсвязывающие домены по изобретению, может происходить, а может и не происходить от иммуноглобулина. Если полипептидом по изобретению является один вариабельный домен бипаратопного иммуноглобулина, например нанотела, то линкер соединяет С-конец одного вариабельного домена одного иммуноглобулина, содержащего антигенсвязывающий домен, с N-концом одного вариабельного домена другого иммуноглобулина, содержащего антигенсвязывающий домен.
Подходящие спейсеры или линкеры, используемые в бипаратопных полипептидах по изобретению для связывания первого и второго антигенсвязывающих доменов, в частности двух нанотел, известны специалистам в данной области, и ими могут быть, в основном, любой линкер или спейсер, используемый для связывания аминокислотных последовательностей. При этом предпочтительно, чтобы указанный линкер или спейсер был пригоден для конструирования белков или полипептидов, используемых в фармацевтике.
Так, например, линкером может быть подходящая аминокислотная последовательность, в частности аминокислотные последовательности, состоящие из 1-50, предпочтительн, 1-30, например, 1-10 аминокислотных остатков. Некоторыми предпочтительными примерами таких аминокислотных последовательностей являются линкеры gly-ser, например линкеры типа (glyxsery)z, такие как, например, (gly4ser)3 или (gly3ser2)3, описанные в WO 99/42077, и линкеры GS30, GS15, GS9 и GS7, описанные в упомянутых в настоящем документе заявках Ablynx (см., например, WO 06/040153 и WO 06/122825), а также области, подобные шарнирным областям, такие как шарнирные области природных антител с тяжелыми цепями или аналогичные последовательности (такие как последовательности, описанные в WO 94/04678).
Некоторые другие линкеры могут представлять собой полиаланиновые линкеры (такие как ААА), а также линкеры GS30 (SEQ ID NO: 85 в WO 06/122825) и GS9 (SEQ ID NO: 84 в WO 06/122825).
Предпочтительными линкерами по изобретению являются пептидные линкеры, имеющие длину 350 аминокислот, например линкеры длиной 3-9, 10-15, 16-20, 21-25, 26-35, 36-40, 41-45 или 46-50 аминокислот. В одном из вариантов изобретения пептидный линкер имеет длину в 35 аминокислот. Линкер может состоять только из двух различных аминокислот. Как упоминалось выше, такими линкерами могут быть глицин и серин. Альтернативно, такими линкерами могут быть пролин и серин.
В некоторых вариантах осуществления изобретения, в частности в бипаратопных нанотелах по изобретению, пептидный линкер состоит из аминокислотной последовательности: GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 220).
Другие подходящие линкеры обычно включают органические соединения или полимеры, в частности соединения или полимеры, подходящие для белков, которые могут быть использованы в фармацевтических целях. Так, например, полиэтиленгликолевые молекулы были использованы для связывания
- 14 037063 доменов антител, см., например, WO 04/081026.
Таким образом, в другом своем аспекте настоящее изобретение относится к молекуле, содержащей по меньшей мере два полипептида, где молекула направлена против хемокинового рецептора CXCR2 или связывается с этим рецептором, и где первый полипептид содержит первый антигенсвязывающий домен иммуноглобулина, а второй полипептид содержит второй антигенсвязывающий домен иммуноглобулина, где указанные первый и второй антигенсвязывающие домены распознают первый и второй эпитопы на CXCR2, и где указанные по меньшей мере два полипептида связаны посредством непептидного линкера.
Предпочтительно в одном из аспектов осуществления изобретения первый антигенсвязывающий домен способен связываться с линейным пептидом, состоящим из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 7, а указанный второй антигенсвязывающии домен либо не связывается с указанным линейным пептидом, либо связывается с этим пептидом с меньшей аффинностью. Предпочтительно первый эпитоп содержит аминокислоты 1-19 CXCR2 или входит в указанную область аминокислот, а второй эпитоп находится за пределами аминокислот 1-19 CXCR2.
Предпочтительно в этом аспекте осуществления изобретения первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в отдельных вариабельных доменах иммуноглобулина, где указанные первый и второй отдельные вариабельные домены иммуноглобулина предпочтительно представляют собой нанотела, в частности любое из нанотел, конкретно описанных в настоящей заявке.
Во всех описанных в настоящем документе аспектах изобретения важными свойствами линкера являются его длина и конформация, позволяющие первому и второму антигенсвязывающим доменам связываться с их соответствующими эпитопами на CXCR2.
Используемый(е) линкер(ы) может(могут) также сообщать полипептидам по изобретению одно или несколько других благоприятных свойств или функций, и/или вводить один или несколько сайтов для образования производных, и/или для присоединения функциональных групп (например, как описано в настоящей заявке для производных бипаратопных нанотел по изобретению). Так, например, линкеры, содержащие один или несколько заряженных аминокислотных остатков (см. табл. А-2 на стр. 48 международной заявки WO 08/020079), могут сообщать улучшенные гидрофильные свойства, а линкеры, которые образуют или содержат небольшие эпитопы или метки, могут быть использованы для детектирования, идентификации и/или очистки. И в этом случае, исходя из описания настоящей заявки, специалист может самостоятельно выбрать оптимальные линкеры, подходящие для использования в конкретном полипептиде по изобретению, после проведения, но необязательно, небольшого числа нетрудоемких рутинных экспериментов.
И наконец, если в полипептидах по изобретению используются два или более линкеров, то эти линкеры могут быть одинаковыми или различными. И в этом случае, исходя из описания настоящей заявки, специалист может самостоятельно выбрать оптимальные линкеры, подходящие для использования в конкретном полипептиде по изобретению, после проведения, но необязательно, небольшого числа нетрудоемких рутинных экспериментов.
Обычно для облегчения экспрессии и получения в настоящем изобретении используется линейный полипептид. Однако в самом широком смысле настоящее изобретение не ограничивается таким полипептидом. Так, например, если полипептид по изобретению содержит три или более нанотел, то они могут быть связаны посредством линкера, имеющего три или более ветви, где каждая ветвь связана с нанотелом и образует конструкцию в форме звезды. Такая конструкция также может быть использована, хотя, обычно, она является менее предпочтительной, чем кольцевая конструкция.
В частности, может быть получена любая структура, состоящая из двух или более нанотел с одним или несколькими линкерами, идентифицированными выше. Так, например, может быть рассмотрено бипаратопное биспецифическое нанотело, содержащее два связывающих домена иммуноглобулина, направленных против CXCR2 или связывающихся с ним, и один или несколько связывающих доменов иммуноглобулина, направленных против альбумина сыворотки человека (HSA) или связывающихся с ним, где указанный HSA-связывающий домен может присутствовать вместе с нанотелом, которое присоединено к CXCR2-связывающим нанотелам в любом положении, например между двумя CXCR2связывающими нанотелами, посредством линкеров, определенных выше.
Авторами настоящей заявки были получены бипаратопные полипептиды в соответствии с настоящим изобретением. Аминокислотные последовательности мультивалентных и бипаратопных антиCXCR2 нанотел представлены в табл. 13 в разделе Примеры. Из этих полипептидов особенно предпочтительными полипептидами по изобретению являются бипаратопные нанотела, представленные в табл. 13 как 163D2-127D1, 163E3-127D1, 163Е3-54В12, 163D2-54B12, 2В2-163Е3, 2В2-163D2, 97А9-2В2, 97А954В12, 127D1-163D2, 127D1-163E3, 2В2-97А9, 54B12-163D2, 54В12-163Е3, 163D2-2B2 и 163Е3-2В2, а также 127D1-97A9, 54В12-97А9 и 97A9-127D1 и их варианты с оптимизированной последовательностью. Все указанные бипаратопные нанотела содержат первое нанотело, содержащее первый антигенсвязывающий домен, способный связываться с линейным пептидом, состоящим из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 7 (аминокислоты 1-19 CXCR2), и второе нанотело, содержащее второй антигенсвязывающий домен, который либо не связывается с указанным линейным пептидом, либо связывается с
- 15 037063 этим пептидом с меньшей аффинностью (см. табл. 8). Особенно предпочтительными полипептидами по изобретению являются 163D2-127D1, 163E3-127D1, 163Е3-54В12, 163D2-54B12, 2В2-163Е3, 2B2-163D2, 97А9-2В2 и 97А9-54В12.
1) 163D2-127D1 (SEQ ID NO: 58).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное второе нанотело, определенное выше, содержит по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 145, 165 и 185, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 145, 165 или 185, и где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 141, 161 и 181, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 141, 161 или 181.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном втором нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185, и где в указанном первом нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 161, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 145, 165, 185, 141, 161 или 181.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 145, 165, 185, 141, 161 или 181, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 79, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 120 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой аминокислотной последовательности из SEQ ID NO: 83, 104, 124, 131, 79, 100 или 120.
Так, например, в этом аспекте осуществления изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 111-130; и FR4 и/или FR8 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58, или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 58.
В другом варианте осуществления настоящего аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 58 или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 58, но которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 28 для нанотела 163D2 и в табл. 26 для нанотела 127D1. Нанотело 163D2 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 218, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 218, а нанотело 127D1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 216 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на
- 16 037063
95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 216. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat, и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
2) 163E3-127D1 (SEQ ID NO: 59).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное второе нанотело содержит по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 146, 166 и 186, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 146, 166 и 186, и где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 141, 161 и 181, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 141, 161 или 181.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном втором нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146; CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 166; а CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186, и где в указанном первом нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141; CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 161, а CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181 или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 146, 166, 186, 141, 161 или 181.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей SEQ ID NO: 146, 166, 186, 141, 161 или 181, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 79, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 120 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 84, 105, 125, 131, 79, 100 или 120.
Например, в этом аспекте осуществления изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 111-130; и FR4 и/или FR8 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 131-133.
В предпочтительном варианте осуществления аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 59.
В одном из вариантов этого аспекта изобретения, бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 59 или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления настоящего аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 59, и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 24 для нанотела 163Е3, и в табл. 26 для нанотела 127D1. Нанотело 163Е3 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 217, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 217, а нанотело 127D1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 216, или аминокислотную последова
- 17 037063 тельность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 216. Например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
3) 163Е3/54В12 (SEQ ID NO: 62).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 146, 166 и 186, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 146, 166 и 186, и где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 151, 171 и 191, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 151, 171 или 191.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном втором нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 166, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186; и где в указанном первом нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191 или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85% или по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 146, 166, 186, 151, 171 или 191.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых последовательностей из SEQ ID NO: 146, 166, 186, 151, 171, 191 только консервативными аминокислотными заменами.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В соответствии с этим аспектом изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 89, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любым аминокислотным последовательностям из SEQ ID NO: 84, 105, 125, 131, 89, 110 или 130.
Например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 62.
В одном из предпочтительных вариантов осуществления изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62; или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 62 или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 62, и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 24 для нанотела 163Е3 и в табл. 30 для нанотела 51В12. Нанотело 163Е3 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 217, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 217, а нанотело
- 18 037063
54В12 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 219 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 219. Например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 212-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
4) 163D2/54B12 (SEQ ID NO: 63).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 145, 165 и 185, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 145, 165 и 185, и где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 151, 171 и 191, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 151, 171 или 191.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном первом нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185, и где в указанном втором нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 145, 165, 185, 151, 171 или 191.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от любой из последовательностей SEQ ID NO: 145, 165, 185, 151, 171 или 191 только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В соответствии с этим аспектом изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 89, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FRI, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 83, 104, 124, 131, 89, 110 или 130.
Например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 63.
В одном из предпочтительных вариантов изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 63, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 2,0-9 М.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR SEQ ID NO: 63, которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 28 для нанотела 163D2 и в табл. 30 для нанотела 54В12. Нанотело 163D2 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 218 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95%
- 19 037063 идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 218, а нанотело 54В12 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 219 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 219. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
5) 2В2/163Е3 (SEQ ID NO: 64).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 147, 167 и 187, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 147, 167 и 187, и где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 146, 166 и 186, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 146, 166 или 186.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном первом нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 147, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 167, а CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 187, и где в указанном втором нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 166, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 147, 167, 187, 164, 146 или 186.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO:147, 167, 187, 146, 166 или 186 только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В соответствии с этим аспектом изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 85, 106, 126, 131, 84, 105 или 125.
Например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 64, или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 64.
В одном из предпочтительных вариантов изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 64 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 64, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 64 и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 20 для нанотела 2В2 и в табл. 24 для нанотела 163Е2. Нанотело 2В2 предпочтительно
- 20 037063 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 213 или 214 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 213 или 214, а нанотело 163Е3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 217 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 217. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
6) 2B2/163D2 (SEQ ID NO: 65).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 147, 167 и 187, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 147, 167 или 187, и где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 145, 165 и 185, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 145, 165 или 185.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном первом нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 147, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 167, а CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 187, и где в указанном втором нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, а CDR6 содержит аминокислотную последовательность в SEQ ID NO: 185, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85% или по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 147, 167, 187, 145, 165 или 185.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей SEQ ID NO: 147, 167, 187, 145, 165 или 185, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В соответствии с этим аспектом изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 85, 106, 126, 131, 83, 104 или 124.
Так, например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
Предпочтительное бипаратопное нанотело по изобретению содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 65 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 65.
В одном из предпочтительных вариантов осуществления изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 65 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 65, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR SEQ ID NO: 65, которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 20 для
- 21 037063 нанотела 2В2 и в табл. 28 для нанотела 163D2. Нанотело 2В2 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 213 или 214 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 213 или 214, а нанотело 163D2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 218 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 218. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 2 0 нМ.
7) 97А9/2В2 (SEQ ID NO: 47).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 143, 163 и 183, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 143, 163 или 183, и где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 147, 167 и 187, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 147, 167 или 187.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном втором нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143; CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 163, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183, и где в указанном первом нанотеле, CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 147; CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 167, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 187, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 143, 163, 183, 147, 167 или 187.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 143, 163, 183, 147, 167 или 187, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В соответствии с этим аспектом изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102, FR3 содержит аминокислотную последовательность в SEQ ID NO: 122, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 81, 102, 122, 133, 85, 106, 126 или 131.
Так, например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
Предпочтительное бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 47 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 47.
В особенно предпочтительном варианте осуществления изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 47 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 47 или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 47 и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или
- 22 037063 несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 22 для нанотела 97А9 и в табл. 20 для нанотела 2В2. Нанотело 97А9 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215, а нанотело 2В2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 213 или 214 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 213 или 214. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
8) 97А9/54В12 (SEQ ID NO :61).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 143, 163 и 183, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 143, 163 или 183, и где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 151, 171 и 191, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 151, 171 или 191.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном втором нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143; CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 163, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183, и где в указанном первом нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 151, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171, а CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, или по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 143, 163, 183, 151, 171 или 191.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 143, 163, 183, 151, 271 или 191, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В соответствии с этим аспектом изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81; FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133; FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 89; FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110; FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130; и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 81, 102, 122, 133, 89, 110, 130 или 131.
Так, например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130; и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 61.
В особенно предпочтительном варианте осуществления изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 61 или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное на
- 23 037063 нотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 61 и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 22 для нанотела 97А9 и в табл. 30 для нанотела 54В12. Нанотело 97А9 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215, а нанотело 54В12 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 219 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 219. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательности каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
9) 127D1/163D2 (SEQ ID NO: 53).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное первое нанотело, определенное выше, включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 141, 161 и 181 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 141, 161 или 181, и где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 145, 165 и 185, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 145, 165 или 185.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном первом нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141; CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 161; а CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, и где в указанном втором нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145; CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165; a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 141, 161, 181, 145, 165 или 185.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от любой из последовательностей SEQ ID NO: 145, 165, 185, 141, 161 или 181 только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 79; FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 120, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131; FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83; FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124; и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 79, 100, 120, 131, 83, 104 или 124.
Так, например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 53.
В другом варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 53, или по меньшей мере на 80%
- 24 037063 идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 54 и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 26 для нанотела 127D1 и в табл. 28 для нанотела 163D2. Нанотело 127D1 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 216 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 216, а нанотело 163D2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 218 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 218. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
10) 127D1/163E3 (SEQ ID NO: 54).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное первое нанотело, определенное выше, включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 141, 161 и 181, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 141, 161 или 181, и где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 146, 166 и 186, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 146, 166 или 186.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном первом нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 161, а CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, и где в указанном втором нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 166, а CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 146, 166, 186, 141, 161 или 181.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 146, 166, 186, 141, 161 или 181, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 79, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 120, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125; и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 79, 100, 120, 131, 84, 105 или 125.
Так, например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 54.
- 25 037063
В другом варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO:54, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 54 и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 26 для нанотела 127D1 и в табл. 24 для нанотела 163Е3. Нанотело 127D1 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 216 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 216, а нанотело 163Е3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 217 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 217. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
11) 127D1/97A9 (SEQ ID NO: 37 и 39).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное первое нанотело, определенное выше, включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 141, 161 и 181, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 141, 161 или 181, и где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 143, 163 и 183, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 143, 163 или 183.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном первом нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 161, а CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, и где в указанном втором нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 163, а CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85% по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 141, 161, 181, 143, 163 или 183.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 141, 161, 181, 143, 163 или 183, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 79, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 120, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 79, 100, 120, 131, 81, 102, 122 или 133.
Например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное
- 26 037063 нанотело содержит первый антигенсвязывающий домен, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37, и второй антигенсвязывающий домен, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39, или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 37 и 39.
В другом варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37 и 39 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 37 и 39, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопный полипептид может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 37 и 39, и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 26 для нанотела 127D1 и в табл. 22 для нанотела 97А9. Нанотело 127D1 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 216 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 216, а нанотело 97А9 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
12) 2B2/97A9(SEQ ID NO: 46).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное первое нанотело, определенное выше, включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 147, 167 и 187, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 147, 167 или 187, и где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 143, 163 и 183, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 143, 163 или 183.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном первом нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 147, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 167, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 187, и где в указанном втором нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 163, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 147, 167, 187, 143, 163 или 183.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 147, 167, 187, 143, 163 или 183, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 85, 106, 126, 131, 81, 102, 122 или 133.
Так, например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89, FR2 и/или FR5 могут содержать амино
- 27 037063 кислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 46 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 46.
В другом варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 46 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 46, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 46 и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 20 для нанотела 2В2 и в табл. 22 для нанотела 97А9. Нанотело 2В2 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность, SEQ ID NO: 213 или 214 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 213 или 214, а нанотело 97А9 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
13) 54B12/163D2 (SEQ ID NO: 69).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное первое нанотело, определенное выше, включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 151, 171 и 191, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 151, 171 или 191, и где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 145, 165 и 185, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 145, 165 или 185.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном первом нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191, и где в указанном втором нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 151, 171, 191, 145, 165 или 185.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 151, 171, 191, 145, 165 или 185, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 89, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на
- 28 037063
90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 89, 110, 130, 131, 83, 104 или 124.
Например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 69 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 69.
В другом варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 69 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 69, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 69 и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 30 для нанотела 54В12 и в табл. 28 для нанотела 163D2. Нанотело 54В12 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 219 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 219, а нанотело 163D2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 218 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 218. Например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
14) 54В12/163Е3 (SEQ ID NO: 68).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное первое нанотело, определенное выше, включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 151, 171 и 191, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 151, 171 или 191, и где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 146, 166 и 186, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 146, 166 или 186.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8.
где в указанном первом нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191, и где в указанном втором нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 166, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 151, 171, 191, 146, 166 или 186.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 151, 171, 191, 146, 166 или 186, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 89, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105, FR7 содержит амино
- 29 037063 кислотную последовательность SEQ ID NO: 125 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 89, 110, 130, 131, 84, 105 или 125.
Например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 68 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 68.
В другом варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 68 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 68, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 68 и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 30 для нанотела 54В12 и в табл. 24 для нанотела 163Е3. Нанотело 54В12 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 219 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 219, а нанотело 163Е3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 217 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 217. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
15) 54В12/97А9 (SEQ ID NO: 90 и 39).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное первое нанотело, определенное выше, включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 141, 161 и 181, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 141, 161 или 181, и где указанное второе нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 143, 163 и 183, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 143, 163 или 183.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном первом нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 161, а CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, и где в указанном втором нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 163, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 141, 161, 181, 143, 163 или 183.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 141, 161, 181, 143, 163 или 183, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 89, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID
- 30 037063
NO: 110, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 89, 110, 130, 131, 81, 102 или 122.
Например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотные последовательности в SEQ ID NO: 90 и 39 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 90 и 39.
В другом варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 90 и 39,или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 90 и 39, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 90 и 39, и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 30 для нанотела 54В12 , и в табл. 22 для нанотела 97А9. Нанотело 54В12 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 90 и 39 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 90 и/или 39, а нанотело 97А9 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
16) 97A9/127D1 (SEQ ID NO: 39 и 37).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное второе нанотело, определенное выше, включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 143, 163 и 183, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 143, 163 или 183, и где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 141, 161 и 181, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 141, 161 или 181.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном втором нанотеле CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 163, а CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183, и где в указанном первом нанотеле, CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 161, а CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 143, 163, 183, 141, 161 или 181.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 143, 163, 183, 141, 161 или 181, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последова
- 31 037063 тельностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 79, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 120; и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте, FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 81, 102, 122, 133, 79, 100, 120 или 131.
Например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89, FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110, FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать любые аминокислотные последовательности из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 39 и 37 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 39 и/или 37.
В другом варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 39 и 37, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 39 и/или 37, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 39 и 37, и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 22 для нанотела 97А9 и в табл. 26 для нанотела 97А9. Нанотело 97А9 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39 и 37 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 39 и 37, а нанотело 127D1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 216 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 216. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
17) 163D2/2B2 (SEQ ID NO: 67).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное второе нанотело, определенное выше, включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 145, 165 и 185, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 145, 165 или 185, и где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 147, 167 и 187, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 147, 167 или 187.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном втором нанотеле, CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145; CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185, и где в указанном первом нанотеле, CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 147, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 167, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 187, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 145, 165, 185, 147, 167 или 187.
- 32 037063
Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых последовательностей из SEQ ID NO: 145, 165, 185, 147, 167 или 187 только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 83, 104, 124, 131, 85, 106 или 126.
Например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 67 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 67.
В другом варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 67, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 67, или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 67 и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 28 для нанотела 163D2 и в табл. 20 для нанотела 2В2. Нанотело 163D2 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 218 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 218, а нанотело 2В2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 213 или 214 , или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 213 или 214. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GROa с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
18) 163Е3/2В2 (SEQ ID NO: 66).
Этот вариант осуществления изобретения относится к бипаратопному нанотелу, где указанное второе нанотело, определенное выше, включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 146, 166 и 186, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 146, 166 или 186, и где указанное первое нанотело включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 147, 167 и 187, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 147, 167 или 187.
Бипаратопное нанотело предпочтительно имеет структуру
FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где в указанном втором нанотеле, CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 166, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186 и где в указанном первом нанотеле CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 147, CDR5 содержит аминокислотную последователь
- 33 037063 ность SEQ ID NO: 167, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 187, или где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны! любой одной из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 146, 166, 186, 147, 167 или 187.
Аминокислотные последовательности могут отличаться от последовательностей, представленных в любой из SEQ ID NO: 146, 166, 186, 147, 167 или 187, только консервативными аминокислотными заменами. Аминокислотные последовательности могут отличаться от любых указанных выше последовательностей ID только одной, двумя или тремя аминокислотами.
В предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105, FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125, FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131, FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106, FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126; и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
В альтернативном варианте FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 могут иметь аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 84, 105, 125, 131, 85, 106 или 126.
Например, в этом аспекте изобретения FR1 и/или FR4 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 70-89; FR2 и/или FR5 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 91-110; FR3 и/или FR6 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 111-130, и FR4 и/или FR8 могут содержать аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NO: 131-133.
В особенно предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 66.
В другом варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична последовательности SEQ ID NO: 66 или по меньшей мере на 80% идентична каркасным областям, пронумерованным по Kabat, где указанное бипаратопное нанотело может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
В другом предпочтительном варианте осуществления этого аспекта изобретения бипаратопное нанотело по изобретению содержит, в основном, последовательности CDR, которые представлены в SEQ ID NO: 66 и которые были модифицированы в каркасных областях так, чтобы они включали одну или несколько последовательность-оптимизирующих замен, предпочтительно одну или несколько замен, указанных в табл. 24 для нанотела 163Е3 и в табл. 20 для нанотела 2В2. Нанотело 163Е3 предпочтительно содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 217 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 217, а нанотело 2В2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 213 или 214 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 213 или 214. Так, например, каркасные области этих нанотел могут иметь последовательность каркасных областей FR1, FR2, FR3 или FR4, пронумерованных по Kabat и представленных в любой из SEQ ID NO: 213-219 в табл. 32. Предпочтительно такое бипаратопное нанотело с оптимизированной последовательностью может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
Как уже обсуждалось выше, если предпочтительные бипаратопные нанотела по изобретению, включая их конкретные варианты и модификации, обозначенные 163D2/127D1, 163E3/127D1, 163Е3/54В12, 163D2/54B12, 2В2/163Е3, 2B2/163D2, 97А9/2В2, 97А9/54В12, 127D1/163D2, 127D1/163E3, 127D1/97A9, 2В2/97А9, 54B12/163D2, 54В12/163Е3, 54В12/97А9, 97A9/127D1, 163D2/2B2 или 163Е3/2В2, имеют в своих каркасных областях по меньшей мере одну последовательностьоптимизирующую аминокислотную замену, то желательно, чтобы указанные каркасные области были, например, частично или полностью гуманизированными. Желательно, чтобы степень оптимизации последовательности позволяла получить бипаратопное нанотело, имеющее аминокислотную последовательность, которая была бы на 80-90% идентична, по меньшей мере, в каркасных областях последовательностям SEQ ID NO: 58, 59, 62, 63, 64, 65, 47, 61, 53, 54, 46, 69, 68, 67 или 66.
Варианты осуществления настоящего изобретения также включают полипептиды, в которых пер
- 34 037063 вый антигенсвязывающий домен выбран из SEQ ID NO: 213, 214, 216 и 219 или полипептида, имеющего последовательность, которая по меньшей мере на 80%, например по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентична одной из этих последовательностей, а второй антигенсвязывающий домен выбран из SEQ ID NO:ь215, 217 и 218, или полипептида, имеющего последовательность, которая по меньшей мере на 80%, наприме, по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентична одной из этих последовательностей.
(0079-0076).
В одном из вариантов осуществления изобретения полипептид, содержащийся в указанном втором иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, содержит CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 236, и CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, а полипептид, содержащийся в указанном первом иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, содержит CDR4, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146; CDR5, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 237, и CDR6, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186. В других вариантах осуществления изобретения аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, например по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 141, 236, 181, 146, 237 или 186.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит аминокислотные последовательности, отличающиеся от последовательностей SEQ ID NO: 141, 236, 181, 146, 237 или 186 только консервативными аминокислотными заменами.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит первый антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 216 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 216, и второй антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 217 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 217.
В еще одном варианте осуществления изобретения полипептид содержит последовательность SEQ ID NO: 221.
(0079-0086).
В одном из вариантов осуществления изобретения полипептид, содержащийся в указанном втором иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, включает CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 236, и CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, а полипептид, содержащийся в указанном первом иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, включает CDR4, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145, CDR5, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, и CDR6, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185. В других вариантах осуществления изобретения аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, например по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 141, 236, 181, 145, 165 или 185.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит аминокислотные последовательности, отличающиеся от последовательностей SEQ ID NO: 141, 236, 181, 145, 165 или 185, только консервативными аминокислотными заменами.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит первый антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 216 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 216, и второй антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 218 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 218.
В еще одном варианте осуществления изобретения полипептид содержит последовательность SEQ ID NO: 222.
(0079-0061).
В одном из вариантов осуществления изобретения полипептид, содержащийся в указанном втором иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, содержит CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141; CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 236, и CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, а полипептид, содержащийся в указанном первом иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, содержит CDR4, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143, CDR5, содержащую аминокислотную последовательность, представленную в SEQ ID NO: 235, и CDR6, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183. В других вариантах осуществления изобретения, аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по мень
- 35 037063 шей мере на 80%, например по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 141, 236, 181, 143, 235 или 183.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит аминокислотные последовательности, отличающиеся от последовательностей SEQ ID NO: 141, 236, 181, 143, 235 или 183 только консервативными аминокислотными заменами.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит первый антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 216 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 216, и второй антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 215 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 215, где указанные домены разделены линкером, имеющим SEQ ID NO: 220.
(0104-0076).
В одном из вариантов осуществления изобретения полипептид, содержащийся в указанном втором иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, включает CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151; CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171, и CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191, а полипептид, содержащийся в указанном первом иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, включает CDR4, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146; CDR5, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 237, и CDR6, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186. В других вариантах осуществления изобретения аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, например по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 151, 171, 191, 146, 237 или 186.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит аминокислотные последовательности, отличающиеся от последовательностей SEQ ID NO: 151, 171, 191, 146, 237 или 186 только консервативными аминокислотными заменами.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит первый антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO:219 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 219, и второй антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 217 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 217.
В еще одном варианте осуществления изобретения полипептид содержит последовательность SEQ ID NO: 223.
(0104-0086).
В одном из вариантов осуществления изобретения полипептид, содержащийся в указанном втором иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, содержит CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151; CDR2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171, и CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191, а полипептид, содержащийся в указанном первом иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, содержит CDR4, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145; CDR5, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, и CDR6, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185. В других вариантах осуществления изобретения аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, например по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 151, 171, 191, 145, 165 или 185.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит аминокислотные последовательности, отличающиеся от последовательностей SEQ ID NO: 151, 171, 191, 145, 165 или 185 только консервативными аминокислотными заменами.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит первый антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 219 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 219, и второй антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 218 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 218.
В еще одном варианте осуществления изобретения полипептид содержит последовательность SEQ ID NO: 224.
(0104-0061).
В одном из вариантов осуществления изобретения полипептид, содержащийся в указанном втором иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, содержит CDR1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151; CDR2, содержащую аминокислотную последователь
- 36 037063 ность SEQ ID NO: 171, и CDR3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191, а полипептид, содержащийся в указанном первом иммуноглобулине, состоящем из одного вариабельного домена, содержит CDR4, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143; CDR5, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 235, и CDR6, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183. В других вариантах осуществления изобретения аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80%, например по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 151, 171, 191, 143, 235 или 183.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит аминокислотные последовательности, отличающиеся от последовательностей SEQ ID NO: 151, 171, 191, 143, 235 или 183 только консервативными аминокислотными заменами.
В другом варианте осуществления изобретения полипептид содержит первый антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 219 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 219, и второй антигенсвязывающий домен, выбранный из SEQ ID NO: 215 или полипептида, который по меньшей мере на 80%, а именно по меньшей мере на 90%, например по меньшей мере на 95% идентичен последовательности SEQ ID NO: 215, где указанные домены разделены линкером, имеющим SEQ ID NO: 220.
Что касается вышеприведенного обсуждения предпочтительных вариантов осуществления изобретения, то в этой связи следует отметить, что хотя это обсуждение конкретно относится к бипаратопным нанотелам, однако оно также относится и к бипаратопным полипептидам, которые направлены непосредственно против CXCR2 или связываются с CXCR2, где первый и второй связывающие домены содержатся в стандартных четырехцепочечных антителах, антителах с тяжелыми цепями, в одноцепочечных Fv, Fab или Fab(2), но обладают одним или несколькими функциональными или структурными признаками вышеуказанных предпочтительных вариантов.
Также кратко описаны варианты осуществления, в которых первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в иммуноглобулине, имеющем только вариабельные домены, такие как VL-домены, VH-домены, (dAb)- и VHH-домены и их фрагменты, и которые обладают одним или несколькими функциональными или структурными признаками каждого из вышеупомянутых вариантов осуществления.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к полипептидам, в частности к иммуноглобулину с отдельными вариабельными доменами, такими как VHH-домен, или к нанотелам, которые являются одновалентными в отношении связывания с CXCR2 и которые представляют собой структурные блоки для бипаратопных полипептидов по изобретению и могут рассматриваться как промежуточные соединения в способе их получения.
Предпочтительными одновалентными иммуноглобулинами с отдельными вариабельными доменами являются полипептиды, имеющие последовательности SEQ ID NO: 25-43 и 90 в табл. 9, или полипептиды, имеющие аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична любой из последовательностей SEQ ID NO: 25-43 и 90.
Предпочтительным одновалентным полипептидом является полипептид, обозначенный 137В7 и содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 90% или по меньшей мере на 95% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 36. В предпочтительном варианте осуществления изобретения каркасные области SEQ ID NO: 36 имеют одну или несколько последовательность-оптимизирующих аминокислотных замен.
Другими предпочтительными одновалентными полипептидами являются полипептиды, обозначенные 127D1, 2В2, 54В12, 97А9, 163D2 и 163Е3, включая полипептиды, имеющие оптимизированную последовательность в каркасных областях.
Например, 127D1 может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37, в которую были введены одна или несколько последовательность-оптимизирующих аминокислотных замен, представленных в табл. 26, предпочтительно полипептид содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 216.
Полипептид 2В2 может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, в которую были введены одна или несколько последовательность-оптимизирующих замен, представленных в табл. 20, предпочтительно полипептид содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 213 или 214.
Полипептид 54В12 может содержать последовательность SEQ ID NO: 90, в которую были введены одна или несколько последовательность-оптимизирующих замен, представленных в табл. 30, предпочтительно полипептид содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 219.
Полипептид 97А9 может содержать последовательность SEQ ID NO: 39, в которую были введены одна или несколько последовательность-оптимизирующих замен, представленных в табл. 22, предпочтительно полипептид содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215.
- 37 037063
Полипептид 163D2 может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41, в которую были введены одна или несколько последовательность-оптимизирующих замен, представленных в табл. 28, предпочтительно полипептид содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 218.
Полипептид 163Е3 может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42, в которую были введены одна или несколько последовательность-оптимизирующих замен, представленных в табл. 24, предпочтительно полипептид содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 217.
В этот аспект изобретения также входят одновалентные полипептиды, в частности иммуноглобулины с одними вариабельными доменами, такие как нанотела, обладающие способностью перекрестно блокировать связывание CXCR2 с полипептидом, имеющим любую аминокислотную последовательность из SEQ ID NO: 58, 59, 62, 63, 64, 65, 47 или 61.
Любое из обсуждаемых выше предпочтительных одновалентных нанотел, в частности 137В7, может быть использовано в описанных в настоящем документе целях, например, для лечения ХОБЛ.
Бипаратопные полипептиды по изобретению, в частности, предпочтительные отдельные вариабельные домены бипаратопного иммуноглобулина, обсуждаемые выше, включая все их верблюжьи и гуманизированные варианты, представляют собой модуляторы CXCR2, которые, в частности, ингибируют передачу СХС2-сигнала.
Предпочтительно CDR-последовательности и FR-последовательности в бипаратопных полипептидах, в частности в отдельных вариабельных доменах бипаратопного иммуноглобулина по изобретению, отличаются тем, что они связываются с CXCR2 с константой диссоциации (KD), составляющей 10-5-10-12 моль/л или менее, предпочтительно 10-7-10-2 моль/л или менее, а более предпочтительно 10-8-10-12 моль/л (т.е. с константой ассоциации (KA) 105-1012 л/моль или более, предпочтительно 107-1012 л/моль или более, а более предпочтительно 108-1012 л/моль);
и/или тем, что они связываются с CXCR2 с константой скорости ассоциации kon, составляющей от 102 М-1с-1 и приблизительно до 107 М-1с-1; предпочтительно от 103 до 107 М-1с-1; более предпочтительно от 104 до 107 М-1с-1; а именно от 105 до 107 M-1c-1;
и/или тем, что они связываются с CXCR2 с константой скорости диссоциации koff, составляющей от 1 с-1 (t1/2 = 0,69 с) до 10-6 с-1 (с образованием почти необратимого комплекса с t1/2, составляющим несколько дней), предпочтительно от 10-2 до 10-6 с-1, более предпочтительно от 10-3 до 10-6 с-1, а именно 10-4 до 10-6 с-1.
Предпочтительно, чтобы CDR-последовательности и FR-последовательности, присутствующие в полипептидах и в отдельных вариабельных доменах бипаратопного иммуноглобулина по изобретению, связывались с CXCR2 с аффинностью менее чем 500 нМ, предпочтительно менее чем 200 нМ, более предпочтительно менее чем 10 нМ, например менее чем 500 пМ.
В частности, как описано в примерах, предпочтительные бипаратопные нанотела по изобретению способны ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ. Предпочтительные бипаратопные нанотела по изобретению могут также ингибировать индуцированное агонистом (GRO-α) высвобождение Са из CXCR2-несущих эритроцитов (RBL) с IC50 менее чем 100 нМ. Предпочтительные бипаратопные нанотела по изобретению могут также ингибировать индуцированную агонистом (GRO-α) аккумуляцию [35S]GTPyS в CXCR2-CHO-мембранах с IC50 менее чем 50 нМ. Предпочтительные бипаратопные нанотела по изобретению могут также ингибировать изменение формы лейкоцитов человека после GRO-a-обработки с IC50 менее чем <1 нм, или изменение формы лейкоцитов собакоподобных обезьян с IC50 менее чем <2 нм.
В соответствии с наиболее предпочтительным аспектом изобретения бипаратопный полипептид по изобретению, такой как один вариабельный домен бипаратопного иммуноглобулина, например, описанное в настоящем документе нанотело, перекрестно блокирует связывание с CXCR2-полипептидом, имеющим аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, и с любым или со всеми полипептидами из SEQ ID NO: 58, 59, 62, 63, 64, 65, 47 или 61. Перекретсное блокирование может быть измерено любыми способами, хорошо известными специалистам.
Полипептиды по изобретению, подходящие для использования в фармацевтике, например полипептид, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1; предпочтительно должен быть направлен непосредственно против CXCR2 человека, а полипептиды по изобретению, подходящие для их использования в ветеринарии, предпочтительно должны быть направлены против CXCR2, происходящего от вида животного, подвергающегося лечению, либо они должны быть способны перекрестно реагировать с CXCR2, происходящего от вида животного, подвергающегося лечению.
Кроме того, бипаратопный полипептид по изобретению может помимо по меньшей мере двух антигенсвязывающих доменов, связывающихся с CXCR2, содержать, но необязательно, один или несколько дополнительных сайтов связывания или доменов, связывающихся с другими эпитопами, антигенами, белками или мишенями.
Эффективность полипептидов по изобретению и композиций, содержащих указанные полипепти
- 38 037063 ды, может быть протестирована с помощью любого подходящего анализа in vitro, клеточного анализа, анализа in vivo и/или с помощью анализа на животном-модели, известного per se, или с помощью любых комбинаций этих анализов, где указанные анализы позволяют определить, что такой полипептид может быть использован для лечения ХОБЛ или любого другого заболевания, связанного с нарушением передачи CXCR2-сигнала. Подходящие анализы и животные-модели известны специалистам.
Кроме того, в соответствии с настоящим изобретением полипептиды, направленные против CXCR2 человека, могут перекрестно реагировать, а могут и не реагировать с CXCR2, происходящим от теплокровных животных одного или нескольких других видов. Однако полипептиды по изобретению, направленные против CXCR2 человека и используемые в тестах на токсичность, предпочтительно должны перекрестно реагировать с CXCR2, происходящим от приматов одного или нескольких других видов (таких как, но не ограничивающихся ими, обезьяны, принадлежащие к роду Масаса (такие как, в частности, собакоподобные обезьяны (Масаса fascicularis) и/или макак-резус (Масаса mulatta)) и павианов (Papio ursinus)). Предпочтительной перекрестной реактивностью является реактивность с CXCR2 собакоподобных обезьян. При этом может оказаться желательной перекрестная реактивность с CXCR2, происходящим от животных одного или нескольких видов, которые часто используются в качестве модели заболевания (например, мыши, крысы, кролики, свиньи или собаки), в частности животные с моделью заболеваний и расстройств, связанных с CXCR2. В соответствии с этим, для специалиста в данной области очевидно, что такая перекрестная реактивность, если она существует, может иметь преимущество с точки зрения разработки лекарственных средств, поскольку это позволяет протестировать аминокислотные последовательности и полипептиды, направленные против CXCR2 человека, на указанных животных с моделью заболевания.
Более конкретно, полипептиды по изобретению, которые перекрестно реагируют с CXCR2 от млекопитающих многих видов, обычно имеют преимущества при их применении в ветеринарии, поскольку в данном случае, один и тот же полипептид может реагировать с CXCR2 многих видов.
Предпочтительно, чтобы бипаратопные полипептиды по изобретению были неспособны перекрестно реагировать с CXCR1 или CXCR4.
В бипаратопных полипептидах по изобретению по меньшей мере один антигенсвязывающий сайт может быть направлен непосредственно против сайта взаимодействия, т.е. сайта, в котором CXCR2 взаимодействует с другой молекулой, например с его природным лигандом или лигандами.
Бипаратопный полипептид, например один вариабельный домен иммуноглобулина по изобретению, может представлять собой полипептид, в котором второй антигенсвязывающий домен, не связывающийся с линейным пептидом SEQ ID NO: 7, распознает эпитоп, содержащий пептиды, представленные в SEQ ID NO: 8, 9, 10, 11 или 12, или находящийся в этих пептидах. Кроме того, первый антигенсвязывающий домен может распознавать эпитоп, содержащий пептид SEQ ID NO: 7 или находящийся в этом пептиде.
В некоторых вариантах осуществления изобретения, относящихся к перекрестной реакции с CXCR2 собакоподобных обезьян, первый антигенсвязывающий домен также распознает эпитоп, содержащий пептид SEQ ID NO: 4 или находящийся в этом пептиде. В таком варианте осуществления изобретения второй антигенсвязывающий домен может распознавать эпитоп, содержащий пептиды SEQ ID NO: 5 или 6 или находящийся в этих пептидах.
В объем настоящего изобретения также входят бипаратопные полипептиды других типов, в частности бипаратопные нанотела, которые, в основном, связываются со всеми природными или синтетическими аналогами, вариантами, мутантами, аллелями, частями и фрагментами CXCR2; или по меньшей мере с аналогами, вариантами, мутантами, аллелями, частями и фрагментами CXCR2, содержащими одну или несколько антигенных детерминант, или один или несколько эпитопов, которые, по существу, аналогичны антигенной(ым) детерминанте(ам) или эпитопу(ам), с которыми связываются полипептиды по изобретению в CXCR2 (например, в CXCR2 дикого типа SEQ ID NO: 1). В этом случае полипептиды по изобретению могут связываться с указанными аналогами, вариантами, мутантами, аллелями, частями и фрагментами с аффинностью и/или специфичностью, аналогичными аффинности и/или специфичности связывания полипептидов по изобретению с CXCR2 (дикого типа), как обсуждается выше, или отличающимися от них (т.е. с более высокой или более низкой аффинностью или специфичностью).
Кроме того, как известно специалистам в данной области, бипаратопные полипептиды связываются с CXCR2 с большей авидностью, чем соответствующий полипептид с одним антигенсвязывающим доменом.
Кроме того, в объем настоящего изобретения также входят части, фрагменты, аналоги, мутанты, варианты, аллели и/или производные бипаратопных полипептидов, в частности отдельных вариабельных доменов бипаратопного иммуноглобулина по изобретению, испольуемых в различных обсуждаемых в настоящем документе терапевтических целях, при условии, что они включают релевантные функциональные домены, эквивалентные доменами полноразмерного полипептида. Такие части, фрагменты, аналоги, мутанты, варианты, аллели или производные могут иметь все функциональные свойства, обсуждаемые выше для бипаратопных полипептидов по изобретению.
В другом своем аспекте настоящее изобретение относится к к бипаратопному полипептиду, необязательно, к отдельным вариабельным доменам бипаратропного иммуноглобулина, который также, но
- 39 037063 необязательно, содержит одну или несколько других групп, остатков, молекул, или связывающих единиц. Такие дополнительные группы, остатки, молекулы или аминокислотные последовательности могут сообщать, а могут и не сообщать, дополнительные функции полипептиду по изобретению и могут модифицировать, а могут и не модифицировать его свойства.
Например, такими дополнительными группами, остатками, молекулами или связывающими единицами могут быть одна или несколько дополнительных аминокислотных последовательностей, таких как (слитый) белок или (слитый) полипептид. В предпочтительном, но не ограничивающем аспекте изобретения, указанные одна или несколько других групп, остатков, молекул или связывающих единиц представляют собой последовательности иммуноглобулина. Еще более предпочтительно указанные одна или несколько других групп, остатков, молекул или связывающих единиц выбраны из группы, состоящей из доменных антител, аминокислотных последовательностей, которые могут быть использованы в качестве доменного антитела; однодоменных антител, аминокислотных последовательностей, которые могут быть использованы в качестве однодоменного антитела; dAb; аминокислотных последовательностей, которые могут быть использованы в качестве dAb, или нанотел.
Альтернативно, такими группами, остатками, молекулами или связывающими единицами могут быть, например, химические группы, остатки, молекулы, которые сами по себе могут обладать, а могут и не обладать биологической и/или фармакологической активностью. Например, такие группы могут быть связаны с одним или несколькими полипептидами по изобретению с образованием производного полипептида по изобретению, также описанного в настоящей заявке.
В таких конструкциях один или несколько полипептидов по изобретению и одна или несколько групп, остатков, молекул или связывающих единиц могут быть связаны друг с другом непосредственно и/или посредством одного или нескольких подходящих линкеров или спейсеров. Так, например, если одна или несколько групп, остатков, молекул или связывающих единиц представляют собой аминокислотные последовательности, то линкерами могут быть также аминокислотные последовательности, образующие конструкции, такие как слитый белок или слитый полипептид.
Как очевидно из вышеприведенного и нижеприведенного описания, это означает, что бипаратопные полипептиды по изобретению могут быть использованы в качестве структурного блока, образующего другие полипептиды по изобретению, т.е. посредством их комбинирования с другими группами, остатками, молекулами или связывающими единицами с получением описанных в настоящем документе конструкций, которые являются мультипаратопными и, необязательно, поливалентными или мультиспецифическими, би/поливалентными и би/мультиспецифическими.
Полипептиды этого аспекта изобретения могут быть получены, в основном, методом, который включает по меньшей мере одну стадию соответствующего связывания одного или нескольких полипептидов по изобретению с одной или несколькими другими группами, остатками, молекулами или связывающими единицами посредством, но необязательно, одного или нескольких подходящих линкеров.
В одном конкретном аспекте изобретения бипаратопный полипептид по изобретению модифицирован так, чтобы он способствовал увеличению времени полужизни по сравнению с соответствующим немодифицированным полипептидом по изобретению. Исходя из привиденного в настоящем документе описания, для специалиста очевидно, что некоторыми предпочтительными полипептидами являются такие полипептиды, которые, например, содержат аминокислотные последовательности, или полипептиды по изобретению, которые были химически модифицированы в целях увеличения времени полужизни (например, посредством ПЭГилирования, ПАСилирования или ГЭКилирования); причем полипептиды по изобретению могут содержать по меньшей мере один дополнительный сайт связывания с сывороточным белком (таким как сывороточный альбумин); либо полипептиды по изобретению могут содержать по меньшей мере одну аминокислотную последовательность, связанную по меньшей мере с одной молекулой (в частности, по меньшей мере с одной аминокислотной последовательностью), которая способствует увеличению времени полужизни полипептида по изобретению. Примерами полипептидов по изобретению, содержащих такие молекулы или аминокислотные последовательности, способствующие увеличению времени полужизни, являются полипептиды, которые соответствующим образом связаны с одним или несколькими сывороточными белками, или их фрагментами (такими как сывороточный альбумин (человека) или его подходящие фрагменты) или с одной или несколькими связывающими единицами, которые могут связываться с сывороточными белками, такими как, например, доменные антитела, аминокислотные последовательности, которые могут быть использованы в качестве доменного антитела; однодоменные антитела, аминокислотные последовательности, которые могут быть использованы в качестве однодоменного антитела; dAb, аминокислотные последовательности, которые могут быть использованы в качестве dAb, или нанотела, которые могут связываться с сывороточными белками, такими как сывороточный альбумин (такой как альбумин сыворотки человека), сывороточные иммуноглобулины, такие как IgG, или трансферрин; полипептиды, которые связаны с Fc-частью (такой как Fc человека) или их подходящие части, или фрагменты. В настоящее изобретение также входят полипептиды по изобретению, которые связаны с одним или несколькими небольшими белками или пептидами, которые могут связываться с сывороточными белками (такими как, но не ограничивающимися ими, белки и пептиды, описанные в WO 91/01743, WO 01/45746, WO 02/076489 и в предварительной заявке США Ablynx
- 40 037063
N.V., озаглавленной Peptides capable of binding to serum proteins of Ablynx N.V. и поданной 5 декабря, 2006 (см. также РСТ/ЕР 2007/063348)).
Один из наиболее широко используемых методов увеличения времени полужизни и/или снижения иммуногенности фармацевтических белков включает присоединение подходящего фармакологически приемлемого полимера, такого как полиэтиленгликоль (ПЭГ) или его производные (такие как метоксиполиэтиленгликоль) или мПЭГ). Как правило, может быть использована любая форма ПЭГилирования, такая как ПЭГилирование, используемое для антител и фрагментов антител (включая, но не ограничиваясь ими, (одно)доменные антитела и scFv), и описание такого ПЭГилирования можно найти, например, в публикациях Chapman, Nat. Biotechnol., 54, 531-545 (2002); by Veronese and Harris, Adv. Drug Deliv. Rev. 54, 453-456 (2003), by Harris and Chess, Nat. Rev. Drug. Discov., 2, (2003) и в WO 04/060965. Различные реагенты для ПЭГилирования белков также являются коммерчески доступными, например, они поставляются от Nektar Therapeutics, USA.
При этом предпочтительно использовать сайт-направленное ПЭГилирование, в частности ПЭГилирование с использованием цистеинового остатка (см., например, Yang et al., Protein Engineering, 16, 10, 761-770 (2003). Например, для этих целей, ПЭГ может быть присоединен к цистеиновому остатку, который обычно присутствует в бипаратопном нанотеле по изобретению. Бипаратопный полипептид по изобретению может быть модифицирован в целях соответствующего введения одного или нескольких цистеиновых остатков для присоединения ПЭГ, либо аминокислотная последовательность, содержащая один или нескольких цистеиновых остатков для присоединения ПЭГ, может быть связана с N- и/или Сконцом бипаратопного полипептида, где все эти методы конструирования белков известны специалистам per se.
Для отдельных вариабельных доменов бипаратопного иммуноглобулина и полипептидов по изобретению предпочтительно использовать ПЭГ с молекулярной массой более чем 5000, а именно более чем 10000 и менее чем 200000, в частности менее чем 100000, например в интервале 20000-80000.
ПЭГилированию могут быть подвергнуты один или оба вариабельных домена иммуноглобулина и/или любая линкерная область пептида. Подходящие методы ПЭГилирования описаны в ЕР 1639011.
В качестве альтернативы ПЭГ время полужизни может быть увеличено методом, известным как ГЭКилирование, которое включает присоединение производных гидроксиэтилированного крахмала (ГЭК) к полипептидам по изобретению. Используемым гидроксиэтилированным крахмалом является амилопектин, происходящий от крахмала восковидной кукурузы, который был модифицирован посредством кислотного гидролиза для коррекции молекулярной массы, и в котором остатки глюкозы были гидроксиэтилированы. Более подробное описание можно найти в публикации Pavisic R., et al., Int. J. Pharm (2010) March 15, 387 (1-2):110-9.
В общих чертах, предпочтительные полипептиды по изобретению с увеличенным временем полужизни имеют время полужизни, которое по меньшей мере в 1,5 раз, предпочтительно по меньшей мере в 2 раза, а именно по меньшей мере в 5 раз, например, по меньшей мере в 10 раз или более чем в 20 раз превышает время полужизни соответствующего полипептида по изобретению per se. Например, полипептиды по изобретению с увеличенным временем полужизни имеют время полужизни, которое по меньшей мере на 1 ч, предпочтительно более чем на 2 ч, более предпочтительно более чем на 6 ч, а именно более чем на 12 ч или даже более чем на 24, 48 или 72 ч превышает время полужизни соответствующего полипептида по изобретению per se.
В предпочтительном аспекте изобретения такие полипептиды по изобретению имеют время полужизни в сыворотке, которое по меньшей мере на 1 ч, предпочтительно более чем на 2 ч, более предпочтительно более чем на 6 ч, а именно более чем на 12 ч или даже более чем на 24, 48 или 72 ч превышает время полужизни соответствующих полипептидов по изобретению per se.
В другом предпочтительном аспекте изобретения полипептиды по изобретению имеют время полужизни в сыворотке человека, составляющее по меньшей мере приблизительно 12 ч, предпочтительно по меньшей мере 24 ч, более предпочтительно по меньшей мере 48 ч, а еще более предпочтительно по меньшей мере 72 ч или более. Например, полипептиды по изобретению могут иметь время полужизни, составляющее по меньшей мере 5 дней (а именно, приблизительно 5-10 дней), предпочтительно по меньшей мере 9 дней (а именно, приблизительно 9-14 дней), более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 10 дней (а именно, приблизительно 10-15 дней) или по меньшей мере приблизительно 11 дней (а именно, приблизительно 11-16 дней), более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 12 дней (а именно, приблизительно 12-18 дней или более), или более чем 14 дней (а именно, приблизительно 14-19 дней).
Настоящее изобретение также относится к способам получения или продуцирования описанных в настоящем документе полипептидов, нуклеиновых кислот, клеток-хозяев и композиций по изобретению.
В общих чертах, такие способы могут включать стадии:
a) получение серии, набора или библиотеки полипептидов; и
b) скрининг указанных серий, наборов или библиотек полипептидов на аминокислотные последовательности, которые могут связываться с CXCR2 и/или обладают аффинностью к CXCR2; и
c) выделение аминокислотной(ых) последовательности(ей), которая(ые) может(могут) связываться
- 41 037063 с CXCR2 и/или обладает(ют) аффинностью к CXCR2.
Серия, набор или библиотека полипептидов могут представлять собой серию, набор или библиотеку последовательностей иммуноглобулина (описанных в настоящей заявке), такие как наивная серия, набор или библиотека последовательностей иммуноглобулина; синтетические или полусинтетические серии, набор или библиотека последовательностей иммуноглобулина; и/или серия, набор или библиотека последовательностей иммуноглобулина, которые были подвергнуты созреванию аффинности.
Кроме того, в этом способе серией, набором или библиотекой полипептидов могут быть серия, набор или библиотека вариабельных доменов тяжелой цепи (таких как VH-домены или VHH-домены) или вариабельных доменов легкой цепи. Например, серией, набором или библиотекой полипептидов могут быть серия, набор или библиотека доменных антител или однодоменных антител, либо ими могут быть серия, набор или библиотека аминокислотных последовательностей, которые способны функционировать как доменное антитело или однодоменное антитело.
В предпочтительном аспекте этого способа серией, набором или библиотекой полипептидов могут быть иммунная серия, набор или библиотека последовательностей иммуноглобулина, происходящих, например, от млекопитающего, например от ламы, которая была соответствующим образом иммунизирована рецептором CXCR2 или соответствующей антигенной детерминантой, полученной на его основе или происходящей от него, такой как антигенный участок, антигенный фрагмент, антигенная область, антигенный домен, антигенная петля или другие их эпитопы.
В вышеописанных способах для облегчения скрининга серия, набор или библиотека пептидов или полипептидов могут быть представлены на фаге, фагмиде, рибосоме или на подходящем микроорганизме (таком как дрожжи). Подходящие способы, технологии и организмы-хозяева, используемые для представления и скрининга (серии, набора или библиотеки) аминокислотных последовательностей, могут быть выбраны специалистом, например, исходя из настоящего описания. Специалист может также обратиться к публикации Hoogenboom in Nature Biotechnology, 23, 9, 1105-1116 (2005).
В другом аспекте изобретения способ получения полипептидов для их использования в целях конструирования бипаратопного полипептида по изобретению включает по меньшей мере одну из следующих стадий:
a) получение набора или образца клеток, экспрессирующих полипептиды;
b) скрининг указанного набора или образца клеток в целях выявления клеток, экспрессирующих полипептид, который способен связываться с CXCR2 и/или обладает аффинностью к CXCR2; и
c) либо (i) выделение указанного полипептида; либо (ii) выделение из указанной клетки последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей указанный полипептид, и осуществление последующей экспрессии указанного полипептида.
Например, если предпочтительным полипептидом является последовательность иммуноглобулина, то таким набором или образцом клеток могут быть, например, набор или образец В-клеток. Кроме того, в этом способе образцы клеток могут быть получены от млекопитающго, например, от ламы, которая была соответствующим образом иммунизирована рецептором CXCR2 или соответствующей антигенной детерминантой, полученной на его основе или происходящей от него, такой как антигенный участок, антигенный фрагмент, антигенная область, антигенный домен, антигенная петля или другие их эпитопы. В одном конкретном аспекте изобретения указанной антигенной детерминантой могут быть внеклеточные участки, области, домены, петли или другие внеклеточные эпитопы.
Для получения предпочтительных бипаратопных нанотел по изобретению, описанных в настоящей заявке, ламу иммунизируют клетками млекопитающего, экспрессирующими CXCR2 человека; клетками млекопитающего, экспрессирующими CXCR2 собакоподобных обезьян; ДНК, кодирующей полноразмерный CXCR2 человека; ДНК, кодирующей Д1-17 CXCR2 человека; ДНК, кодирующей CXCR2 собакоподобных обезьян, и пептидами, представленными в табл. 5.
Описанный выше скрининг может быть осуществлен любым подходящим способом, известным специалисту. Описание таких способов можно найти, например, в ЕР 0542810, WO 05/19824, WO 04/051268 и WO 04/106377. Стадию скрининга (b), предпочтительно, осуществляют способом проточной цитометрии, такой как FACS. Описание этого способа можно найти, например, в публикации Lieby et al., Blood, Vol. 97, No. 12, 3820 (2001).
В другом аспекте изобретения способ получения полипептида, направленного против CXCR2, в целях его использования для конструировании полипептида по изобретению, может содержать по меньшей мере одну из нижеследующих стадий:
a) получение серии, набора или библиотеки последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид;
b) скрининг указанных серии, набора или библиотеки последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующей аминокислотную последовательность, которая может связываться с CXCR2 и/или обладает аффинностью к CXCR2; и
с) выделение указанной последовательности нуклеиновой кислоты и осуществленияе последующей экспрессии указанного полипептида.
В таком способе серией, набором или библиотекой последовательностей нуклеиновой кислоты, ко
- 42 037063 дирующей полипептид, могут быть, например, серия, набор или библиотека последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующей природную серию, набор или библиотеку последовательностей иммуноглобулина; серия, набор или библиотека последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующих синтетическую или полусинтетическую серию, набор или библиотеку последовательностей иммуноглобулина; и/или серия, набор или библиотека последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующих серию, набор или библиотеку последовательностей иммуноглобулина, которые были подвергнуты созреванию аффинности.
Кроме того, в этом способе серия, набор или библиотека последовательностей нуклеиновой кислоты могут кодировать серию, набор или библиотеку вариабельных доменов тяжелой цепи (таких как VHдомены или VHH-домены) или вариабельных доменов легкой цепи. Например, серия, набор или библиотека последовательностей нуклеиновой кислоты могут кодировать серию, набор или библиотеку доменных антител или однодоменных антител, либо серию, набор или библиотеку аминокислотных последовательностей, которые способны функционировать как доменное антитело или однодоменное антитело.
В предпочтительном аспекте этого сопособа серией, набором или библиотекой последовательностей нуклеиновой кислоты могут быть иммунная серия, иммунный набор или иммунная библиотека последовательностей нуклеиновой кислоты, происходящих, например, от млекопитающих, которые были соответствующим образом иммунизированы рецептором CXCR2 или соответствующей антигенной детерминантой, полученной на его основе или происходящей от него, такой как антигенный участок, антигенный фрагмент, антигенная область, антигенный домен, антигенная петля или другие их эпитопы. В одном конкретном аспекте изобретения указанной антигенной детерминантой могут быть внеклеточные участки, области, домены, петли или другие внеклеточные эпитопы.
При получении полипептидов по изобретению лам иммунизуют антигенами, как описано выше.
В вышеописанных способах для облегчения скрининга серия, набор или библиотека последовательностей нуклеиновой кислоты могут быть представлены на фаге, фагмиде, рибосоме или на подходящем микроорганизме (таком как дрожжи). Подходящие способы, технологии и организмы-хозяева, используемые для представления и скрининга (серии, набора или библиотеки) нуклеотидных последовательностей, кодирующих аминокислотные последовательности, могут быть выбраны специалистом, например, исходя из настоящего описания. Специалист может также обратиться к публикации Hoogenboom in Nature Biotechnology, 23, 9, 1105-1116 (2005).
В другом аспекте изобретения способ получения полипептида, который направлен против CXCR2 и который может быть использован в бипаратопных полипептидах по изобретению, может включать по меньшей мере одну из следующих стадий:
a) получение серии, набора или библиотеки последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующих полипептиды;
b) скрининг указанных серии, набора или библиотеки последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующих аминокислотную последовательность, которая может связываться с CXCR2 и/или обладает аффинностью к CXCR2, и которая перекрестно блокируется бипаратопным нанотелом по изобретению или перекрестно блокирует бипаратопное нанотело по изобретению, например, кодируемое последовательностями SEQ ID NO: 58, 59, 62, 63, 64, 65, 47 или 61; и
c) выделение указанной последовательности нуклеиновой кислоты и последующее осуществление экспрессии указанного полипептида.
Настоящее изобретение также относится к бипаратопным полипептидам, которые могут быть получены вышеописанными способами, или альтернативно, способом, который включает проведение одной из вышеописанных стадий, и кроме того, по меньшей мере, стадий определения нуклеотидной последовательности или аминокислотной последовательности указанной последовательности иммуноглобулина и экспрессии или синтеза указанной аминокислотной последовательности способом, известным per se, например экспрессии в подходящей клетке-хозяине или в организме-хозяине, или стадий химического синтеза и конструирования бипаратопного полипептида на основе продуктов этого синтеза.
Вышеуказанный способ может быть осуществлен с применением любой подходящей технологии, известной специалистам и более подробно обсуждаемой ниже. Описание таких способов можно найти, например, в ЕР 0542810, WO 05/19824, WO 04/051268 и WO 04/106377. Например, стадию скрининга (b) предпочтительно осуществляют способом проточной цитометрии, такой как FACS. Описание этого способа можно найти, например, в публикации Lieby et al., Blood, Vol. 97, No. 12, 3820. Конкретное описание так называемого способа Nanoclone™ можно найти в международной заявке WO 06/079372, Ablynx N.V.
Другой способ получения последовательностей VHH или последовательностей нанотел, направленных против CXCR2, включает соответствующую иммунизацию траснгенного млекопитающего, способного экспрессировать антитела с тяжелой цепью (т.е. иммунизацию, проводимую в целях повышения иммунного ответа) и/или антитела с тяжелой цепью, направленные непосредственно против CXCR2, получение подходящего биологического образца от указанного трансгенного млекопитающего, который содержит (кодирующие последовательности нуклеиновой кислоты) указанные последовательности VHH или последовательности нанотела (где указанным образцом являются пробы крови, пробы сыворотки
- 43 037063 или образец В-клеток), а затем получение последовательностей VHH, направленных против CXCR2, из указанного образца с использованием любого подходящего способа, известного per se (такого как любой из описанных в настоящем документе методов или гибридомный метод). Например, для этих целей могут быть использованы мыши, экспрессирующие антитело с тяжелой цепью, и могут быть использованы другие способы и технологии, описанные в WO 02/085945, WO 04/049794 и WO 06/008548 и в публикации Janssens et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006 Oct 10; 103(41):15130-5. Например, у такой мыши, экспрессирующей антитело с тяжелой цепью, могут экспрессироваться антитела с тяжелой цепью, содержащие любой подходящий (один) вариабельный домен, например, (отдельные) вариабельные домены, происходящие от природных источников (например, (отдельные) вариабельные домены человека, верблюжьи (отдельные) вариабельные домены или (отдельные) вариабельные домены акулы), а также, например, синтетические или полусинтетические (отдельные) вариабельные домены.
Специалистам известны и другие подходящие способы и технологии получения нанотел, используемых в настоящем изобретении, и/или нуклеиновых кислот, кодирующих указанные нанотела, происходящие от природных последовательностей VH или предпочтительно последовательностей VHH, и, например, описание таких методов можно найти на стр. 64 упомянутой в настоящем документе заявки WO 08/00279 A.
Домены VHH или нанотела могут быть охарактеризованы по одному или нескольким ключевым остаткам, присутствующим в их FR. Ключевыми остатками являются остатки, которые позволяют идентифицировать FR как FR, происходящую от животных семейства верблюжьих, например от ламы. В соответствии с этим ключевыми остатками являются желаемая мишень для замены, а предпочтительно замены человеческими остатками.
В соответствии с нумерацией Kabat ключевые остатки могут присутствовать в положениях 11, 37, 44, 45, 47, 83, 84, 103, 104 или 108 в нанотеле. Неограничивающие примеры (их подходящие комбинации) таких каркасных последовательностей и альтернативных ключевых остатков приводятся на стр. 6598 заявки WO 2008/020079, которые во всей своей полноте вводятся в настоящее описание в качестве ссылки. В настоящем изобретении также рассматриваются и другие известные специалистам гуманизированные или частично гуманизированные последовательности, которые входят в объем настоящего изобретения.
Как уже обсуждалось выше, нанотело, используемое в настоящем изобретении, может иметь, по меньшей мере, отличие в одной аминокислоте (как определено в настоящей заявке) по меньшей мере в одной из каркасных областей по сравнению с соответствующей каркасной областью природного VHдомена человека, в частности по сравнению с соответствующей каркасной областью DP-47. Более конкретно, в соответствии с одним из неограничивающих аспектов изобретения нанотело может иметь, по меньшей мере, отличие в одной аминокислоте (как определено в настоящей заявке) по меньшей мере в одном из ключевых остатков (включая остатки в положениях 108, 103 и/или 45) по сравнению с соответствующей каркасной областью природного человеческого VH-домена, в частности по сравнению с соответствующей каркасной областью DP-47. Обычно нанотело имеет, по меньшей мере, отличие в одной такой аминокислоте в природном VH-домене по меньшей мере в одной из FR2 и/или FR4, в частности по меньшей мере в одном из ключевых остатков в FR2 и/или FR4 (также включая остатки в положениях 108, 103 и/или 45).
Кроме того, гуманизированное нанотело по изобретению может быть таким, как оно определено в настоящем описании, при условии, что оно имеет, по меньшей мере, отличие в одной аминокислоте (как определено в настоящей заявке) по меньшей мере в одной из каркасных областей по сравнению с соответствующей каркасной областью природного VHH-домена. Более конкретно, в соответствии с одним из неограничивающих аспектов изобретения нанотело с гуманизированной или какой-либо иначе оптимизированной последовательностью может быть таким, как оно определено в описании настоящей заявки, при условии, что оно будет иметь, по меньшей мере, отличие в одной аминокислоте (как определено в настоящей заявке) по меньшей мере в одном из ключевых остатков (включая остатки в положениях 108, 103 и/или 45) по сравнению с соответствующей каркасной областью природного VHH-домена. Обычно нанотело с гуманизированной или как-либо иначе оптимизированной последовательностью имеет, по меньшей мере, отличие в одной такой аминокислоте в природном VHH-домене по меньшей мере в одной из FR2 и/или FR4, в частности по меньшей мере в одном из ключевых остатков в FR2 и/или FR4 (также включая остатки в положениях 108, 103 и/или 45).
Как будет очевидно из настоящего описания, объем настоящего изобретения охватывает применение природных или синтетических аналогов, мутантов, вариантов, аллелей, гомологов и ортологов (называемых в настоящем документе общим термином аналоги) одного вариабельного домена иммуноглобулина по изобретению, определенного в настоящей заявке, в частности аналогов бипаратопных нанотел SEQ ID NO: 58, 59, 62, 63, 64, 65, 47, 61, 53, 54, 46, 69, 68, 67 или 66.
Как правило, в таких аналогах один или несколько аминокислотных остатков могут быть заменены, делетированы и/или добавлены по сравнению с отдельными вариабельными доменами иммуноглобулина по изобретению, определенными в настоящей заявке. Такие замены, инсерции или делеции могут быть введены в одну или несколько каркасных областей и/или в одну или несколько CDR. Если такие замены,
- 44 037063 инсерции или делеции были сделаны в одной или нескольких каркасных областях, то они могут быть введены в положения одного или нескольких ключевых остатков и/или в одно или несколько других положений каркасных остатков, хотя, по существу, замены, инсерции или делеции в ключевых остатках являются менее предпочтительными (если только они не являются подходящими гуманизирующими заменами, описанными в настоящей заявке).
В одном из неограничивающих примеров заменой может быть, например, консервативная замена (описанная в настоящей заявке), и/или аминокислотный остаток может быть заменен другим аминокислотным остатком, который обычно присутствует в том же самом положении в другом VHH-домене (некоторые неограничивающие примеры таких замен можно найти в WO 2008/020079), хотя настоящее изобретение не ограничивается такой заменой. Таким образом, в объем настоящего изобретения входят любые одна или несколько замен, делеций или инсерций или любые их комбинации, которые либо способствуют улучшению свойств, например, нанотела, используемого для получения бипаратопного нанотела по изобретению, либо, по меньшей мере, существенно не ухудшают нужные свойства или баланс или комбинацию нужных свойств по изобретению (т.е. не ухудшают до той степени, когда нанотело или бипаратопное нанотело будет уже непригодным для его использования в нужных целях). Специалист в данной области, по существу, может самостоятельно определить и выбрать подходящие замены, делеции или инсерции или подходящие их комбинации исходя из приведенного в настоящем документе описания и, необязательно, после нетрудоемкого рутинного экспериментирования, которое может, например, включать введение ограниченного числа возможных замен и определение их влияния на свойства полученных таким образом нанотел.
Например, в зависимости от организма-хозяина, используемого для экспрессии бипаратопного нанотела или полипептида по изобретению, такие делеции и/или замены могут быть внесены так, чтобы были удалены один или несколько сайтов посттрансляционной модификации (такие как один или несколько сайтов гликозилирования), и такие делеции и/или замены могут быть легко осуществлены специалистом в данной области. Альтернативно, замены или инсерции могут быть сделаны для введения одного или нескольких сайтов присоединения функциональных групп (как описано в настоящей заявке), например, для сайт-специфического ПЭГилирования (как описано в настоящей заявке).
Как описано в общих чертах в настоящей заявке, подбор наиболее благоприятных замен, инсерций или делеций для введения в аминокислотную последовательность в целях сообщения конкретных свойств или структурных особенностей, которые отсутствуют в нативной последовательности, включая гуманизирующие замены, называется оптимизацией последовательности. В этой связи можно обратиться к п.(у) раздела Определения.
Предпочтительными аналогами являются такие аналоги, которые могут связываться с CXCR2 с аффинностью (обычно измеряемой и/или выражаемой как величина KD (фактическая или кажущаяся), величина KA (фактическая или кажущаяся), константа скорости ассоциации kon и/или константа скорости диссоциации Koff, или альтернативно, как величина IC50, также подробно описанные в настоящей заявке), которая определена в настоящем описании для бипаратопных нанотел по изобретению.
Предпочтительными аналогами также являются аналоги, которые сохраняют благоприятные свойства бипаратопных нанотел, описанных в настоящей заявке.
Кроме того, в соответствии с одним из предпочтительных аспектов настоящего изобретения указанные аналоги имеют последовательность, которая по меньшей мере на 70%, предпочтительно по меньшей мере на 80%, более предпочтительно по меньшей мере на 90%, а именно по меньшей мере на 95% или 99% или более идентична одной из SEQ ID NO: 58, 59, 62, 63, 64, 65, 47, 61, 53, 54, 46, 69, 68, 67 или 66 бипаратопных нанотел; и/или предпочтительно имеют различия максимум в 20, предпочтительно максимум в 10, еще более предпочтительно максимум в 5, а именно в 4, 3, 2 аминокислоты или только в 1 аминокислоту (как определено в настоящей заявке) по сравнению с с одной из указанных последовательностей бипаратопных нанотел.
Кроме того, каркасные последовательности и CDR указанных аналогов предпочтительно должны соответствовать определенным в настоящем документе предпочтительным аспектам изобретения. В более широком смысле, как описано в настоящей заявке, аналоги имеют (a) Q в положении 108; и/или (b) заряженную аминокислоту или цистеиновый остаток в положении 45, предпочтительно Е в положении 44, более предпочтительно Е в положении 44 и R в положении 45; и/или (с) Р, R или S в положении 103.
Аналоги бипаратопных VHH-доменов или нанотел одного из предпочтительных классов по изобретению были гуманизированы (т.е. по сравнению с последовательностью природного нанотела). Как упоминалось выше, такое гуманизирование, по существу, включает замену одного или несколько аминокислотных остатков в последовательности природного VHH аминокислотными остатками, которые присутствуют в том же самом положении VH-домена человека, такого как VH3-домен человека. Примеры возможных гуманизирующих замен, отличающихся от замен, конкретно указанных в табл. 20, 22, 24, 26, 28 и 30, приводятся в настоящей заявке, хотя специалистами могут быть сделаны и другие комбинации гуманизирующих замен исходя из сравнения последовательности нанотела и последовательности природного VH-домена человека и исходя из описания заявки WO 2008/020079, уже цитируемой в настоящей заявке.
Как правило, в результате гуманизации отдельные вариабельные домены иммуноглобулина, в част
- 45 037063 ности нанотела по изобретению, будут больше напоминать последовательности человека, но при этом будут сохранять благоприятные свойства описанных в настоящем документе нанотел по изобретению. В результате, такие гуманизированные нанотела могут иметь несколько преимуществ, например, они могут обладать пониженной иммуногенностью по сравнению с соответствующими природными VHHдоменами. И в этом случае исходя из приведенного в настоящем документе описания и, необязательно, после нетрудоемкого рутинного экспериментирования специалист в данной области может самостоятельно вводить гуманизирующие замены или подходящие комбинации гуманизирующих замен, которые позволяют оптимизировать баланс или достичь нужного или подходящего баланса между благоприятными свойствами, сообщаемыми гуманизирующими заменами, с одной стороны, и благоприятными свойствами природных VHH-доменов, с другой стороны.
Нанотела, используемые для введения в бипаратопные нанотела по изобретению, могут быть соответствующим образом гуманизированы в любом положении каркасных остатков, например в одном или нескольких положениях ключевых остатков (определенных в настоящей заявке), или в одном или нескольких положениях других каркасных остатков (т.е. неключевых остатков), или в любой их подходящей комбинации. Одной из предпочтительных гуманизирующих замен для нанотел группы P,R,S-103 или группы KERE является замена Q108 на L108. Нанотела класса GLEW могут быть также гуманизированы путем замены Q108 на L108 при условии, что по меньшей мере один из других ключевых остатков будет содержать замену верблюжьим остатком (кэмелизация) (как определено в настоящей заявке). Например, как упоминалось выше, гуманизированные нанотела одного из наиболее предпочтительных классов имеют последовательность GLEW или GLEW-подобную последовательность в положениях 44-47; Р, R или S (в частности, R) в положении 103 и L в положении 108.
Гуманизированные и другие аналоги и последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующие эти аналоги, могут быть получены любым способом, известным per se, например, с применением одного или нескольких методов, упоминаемых на стр. 103 и 104 заявки WO 08/020079.
Как упоминалось выше, специалисту в данной области также известно, что отдельные вариабельные домены иммуноглобулина по изобретению (включая их аналоги) могут быть сконструированы и/или получены из последовательностей VH человека (т.е. из аминокислотных последовательностей или соответствующих нуклеотидных последовательностей), например из последовательностей VH3 человека, таких как DP-47, DP-51 или DP-29, путем введения одной или нескольких кэмелизирующих замен (т.е. замены одного или нескольких аминокислотных остатков в аминокислотной последовательности указанного VH-домена человека на аминокислотные остатки, присутствующие в соответствующем положении в VHH-домене) для получения последовательности нанотела по изобретению и/или для сообщения полученной таким образом последовательности нанотела благоприятных свойств. Это может быть также осуществлено с использованием различных способов и технологий, описанных в предыдущем параграфе, с использованием аминокислотной последовательности и/или нуклеотидной последовательности для VHдомена человека в качестве исходного элемента.
Некоторые предпочтительные, но неограничивающие, кэмелизирующие замены можно найти в заявке WO 2008/020079. Также очевидно, что кэмелизирующие замены в одном или нескольких ключевых остатках, по существу, будут оказывать большее влияние на нужные свойства, чем замены в одном или нескольких других положениях аминокислот, хотя в объем настоящего изобретения входят обе эти замены и любые подходящие их комбинации. Так, например, могут быть введены одна или несколько кэмелизирующих замен, которые уже сообщают, по меньшей мере, некоторые нужные свойства, а затем могут быть введены дополнительные кэмелизирующие замены, которые будут еще больше улучшать указанные свойства и/или будут сообщать дополнительные благоприятные свойства. И в этом случае специалист в данной области, по существу, может самостоятельно определить и выбрать подходящие кэмелизирующие замены или подходящие комбинации кэмелизирующих замен исходя из приведенного в настоящем документе описания и, необязательно, после нетрудоемкого рутинного экспериментирования, которое может, например, включать введение ограниченного числа возможных кэмелизирующих замен и определение факта сообщения благоприятных свойств отдельным вариабельным доменам иммуноглобулина или улучшения таких свойств (по сравнению со свойствами исходного VH-домена). Однако, как правило, предпочтительными кэмелизирующими заменами являются такие замены, при которых полученная аминокислотная последовательность, по меньшей мере, содержит: (a) Q в положении 108; и/или (b) заряженную аминокислоту или цистеиновый остаток в положении 45, предпочтительно Е в положении 44, а более предпочтительно Е в положении 44 и R в положении 45; и/или (с) Р, R или S в положении 103, и, необязательно, одну или несколько дополнительных кэмелизирующих замен. Более предпочтительно кэмелизирующие замены должны быть введены так, чтобы это приводило к образованию одного вариабельного домена иммуноглобулина, используемого в настоящем изобретении, и/или его аналога (определенного в настоящей заявке), такого как гуманизированный аналог, и/или предпочтительно аналог, определенный в предыдущих параграфах.
Отдельные вариабельные домены иммуноглобулина, такие как нанотела, могут быть также получены из VH-доменов путем введения замен, которые редко встречаются в природе, но тем не менее, по своей укладке имеют структурное сходство с VH-доменом. Так, например, такими заменами могут быть, но
- 46 037063 не ограничиваются ими, одна или несколько из нижеследующих замен, таких как замена Gly в положении 35, Ser, Val или Thr в положении 37, Ser, Thr, Arg, Lys, His, Asp или Glu в положении 39, Glu или His в положении 45, Trp, Leu, Val, Ala, Thr или Glu в положении 47, S или R в положении 50. (Barthelemy et al., J. Biol. Chem. 2008 Feb 8; 283 (6):3639-54. Epub. 2007 Nov. 28).
Настоящее изобретение также включает производные бипаратопных полипептидов по изобретению. Такие производные могут быть получены, в основном, путем модификации, в частности путем химической и/или биологической (например, ферментативной) модификации бипаратопных полипептидов по изобретению, и/или одного или нескольких аминокислотных остатков, которые образуют бипаратопные полипептиды по изобретению.
Примеры таких модификаций, а также примеры аминокислотных остатков в полипептидной последовательности, которые могут быть модифицированы таким образом (т.е. либо в белковом остове, либо, что предпочтительно, в боковой цепи), методы и технологии, которые могут быть применены для введения таких модификаций, а также возможность и преимущества применения таких модификаций очевидны для специалиста в данной области.
Например, такая модификация может включать введение (например, посредством ковалентного связывания или другим подходящим способом) одной или нескольких функциональных групп, остатков или молекул в бипаратопный полипептид по изобретению, в частности одной или нескольких функциональных групп, остатков или молекул, которые сообщают бипаратопному полипептиду по изобретению одно или несколько нужных свойств или один или несколько нужных функциональных признаков. Примеры таких функциональных групп известны специалистам.
Например, такая модификация может включать введение (например, посредством ковалентного связывания или другим подходящим способом) одной или нескольких функциональных групп, которые увеличивают время полужизни; повышают растворимость и/или абсорбцию полипептида по изобретению, снижают иммуногенность и/или токсичность полипептида по изобретению; устраняют или уменьшают какие-либо нежелательные побочные эффекты полипептида по изобретению и/или сообщают другие предпочтительные свойства и/или устраняют нежелательные свойства бипаратопных нанотел и/или полипептидов по изобретению или любую комбинацию двух или более из вышуказанных свойств. Примеры таких функциональных групп и способы их введения известны специалистам, и такие примеры могут, в основном, включать все функциональные группы, известные специалистам, а также функциональные группы и методы, известные per se и применяемые для модификации фармацевтических белков, в частности для модификации антител или фрагментов антител (включая scFv и однодоменные антитела), где указанные функциональны группы и методы описаны, например, в руководстве Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th ed., Mack Publishing Co., Easton, PA (1980). Такие функциональные группы могут быть непосредственно присоединены (например, ковалентно) к бипаратопному полипептиду по изобретению, либо они могут быть присоединены, но необязательно, посредством подходящего линкера или спейсера, как известно специалистам.
Другая, обычно менее предпочтительная модификация содержит N-связанное или О-связанное гликозилирование, обычно осуществляемое в процессе котрансляционной и/или посттрансляционной модификации в зависимости от типа клетки-хозяина, используемой для экспрессии бипаратопного нанотела или полипептида по изобретению.
Другая модификация может содержать введение одной или нескольких детектируемых меток или других сигнал-генерирующих групп или молекул, в зависимости от цели применения меченого полипептида или нанотела. Подходящие метки и способы их присоединения, использования и детектирования известны специалистам, и такими метками являются, но не ограничиваются ими, флуоресцентные метки, фосфоресцирующие метки, хемилюминесцентные метки, биолюминесцентные метки, радиоактивные изотопы, металлы, хелатные комплексы с металлами, катионы металлов, хромофоры и ферменты, например, упомянутые на стр. 109 заявки WO 08/020079. Специалистам в данной области известны и другие подходящие метки, и такими метками являются, например, молекулы, которые могут быть детектированы с помощью ЯМР-спектроскопии или резонансной спектроскопии методом электрораспыления.
Такие меченные бипаратопные нанотела и полипептиды по изобретению могут быть использованы, например, для проведения анализов in vitro, in vivo или in situ (включая иммуноанализы, известные per se, такие как ELISA, РИА, ЭИА и другие сэндвич-анализы и т.п.), а также для диагностики и визуализации in vivo в зависимости от выбора конкретной метки.
Как очевидно для специалиста в данной области, другая модификация может включать введение хелатообразующей группы, например, для образования хелатного комплекса с металлами или катионами металлов, описанными выше. Подходящими хелатообразующими группами являются, но не ограничиваются ими, диэтилентриаминпентауксусная кислота (DTPA) или этилендиаминтетрауксусная кислота (EDTA).
Другая модификация может содержать введение функциональной группы, которая представляет собой одну часть конкретной связывающей пары, такой как связывающая пара биотин-(стрепт)авидин. Такая функциональная группа может быть использована для связывания бипаратопного полипептида по изобретению или нанотела по изобретению с другим белком, полипептидом или химическим соединени
- 47 037063 ем, которые связываются с другой половиной связывающей пары, т.е. с образованием связывающей пары. Например, бипаратопное нанотело по изобретению может быть конъюгировано с биотином и связано с другим белком, полипептидом, соединением или носителем, конъюгированным с авидином или со стрептавидином. Например, такое конъюгированное бипаратопное нанотело может быть использовано в качестве репортера, например, в системе диагностики, в которой детектируемый сигнал-генерирующий агент конъюгирован с авидином или со стрептавидином. Такие связывающие пары могут быть также использованы, например, для связывания бипаратопного нанотела по изобретению с носителем, включая носители, подходящие для их использования в фармацевтике. Одним из неограничивающих примеров являются липосомные препараты, описанные Сао и Suresh, Journal of Drug Targetting, 8, 4, 257 (2000). Такие связывающие пары могут быть также использованы для присоединения терапевтически активного средства к нанотелу по изобретению.
Для применения в некоторых целях, в частности, для уничтожения клеток, экспрессирующих CXCR2-мишень, против которой направлены бипаратопные полипептиды или отдельные вариабельные домены бипаратопного иммуноглобулина по изобретению (например, для лечения рака), или для снижения или замедления роста и/или пролиферации таких клеток, бипаратопные полипептиды по изобретению могут быть также присоединены к токсину или к токсическому остатку или к токсической части. Примерами токсических частей, соединений или остатков, которые могут быть присодинены к бипаратопному полипептиду по изобретению с получением, например, цитотоксического соединения, являются токсические части, соединения или остатки, которые известны специалистам и описаны в предшествующих работах, цитируемых выше и/или в подробном описании настоящей заявки. Одним из примеров является так называемая технология ADEPT™, описанная в WO 03/055527.
Специалистам известны и другие возможные химические и ферментативные модификации. Такие модификации могут быть также введены в исследовательских целях (например, для исследования взаимосвязи функции и активности). Их описание можно найти, например, в публикации Lundblad and Bradshaw, Biotechnol. Appl. Biochem., 26, 143-151 (1997).
Предпочтительными производными являются такие производные, которые связываются с CXCR2 с аффинностью (обычно измеряемой и/или выражаемой как величина KD (фактическая или кажущаяся), величина KA (фактическая или кажущаяся), константа скорости ассоциации kon и/или константа скорости диссоциации Koff, или альтернативно, как величина IC50, также подробно описанные в настоящей заявке), которая определена в настоящем описании для бипаратопных нанотел по изобретению.
Как было упомянуто выше, настоящее изобретение также относится к белкам или полипептидам, которые, по существу, состоят по меньшей мере из одного бипаратопного полипептида по изобретению или содержат указанный полипептид. Термин по существу, состоит из означает, что аминокислотная последовательность полипептида по изобретению либо является точно такой же, как аминокислотная последовательность бипаратопного полипептида по изобретению, либо соответствует аминокислотной последовательности такого полипептида по изобретению, которая имеет ограниченное число аминокислотных остатков, а именно 1-20 аминокислотных остатков, например 1-10 аминокислотных остатков, а предпочтительно 1-6 аминокислотных остатков, а именно 1, 2, 3, 4, 5 или 6 аминокислотных остатков, добавленных к аминоконцу, к карбоксиконцу или к аминоконцу и к карбоксиконцу аминокислотной последовательности бипаратопного полипептида.
Указанные аминокислотные остатки могут изменять, модифицировать или как-либо иначе влиять на (биологические) свойства полипептида, а могут и не обладать таким действием, а также они могут сообщать, а могут и не сообщать дополнительные функциональные свойства. Например, такие аминокислотные остатки могут включать N-концевой остаток Met, например остаток, образующийся в результате экспрессии в гетерологичной клетке-хозяине или в гетерологичном организме-хозяине;
могут образовывать сигнальную последовательность или лидерную последовательность, которая обеспечивает секрецию бипаратопного полипептида из клетки-хозяина после синтеза. Подходящие секреторные лидерные пептиды известны специалистам и более подробно описаны ниже. Обычно такая лидерная последовательность может быть присоединена к N-концу бипаратопного полипептида;
могут образовывать последовательность или сигнал, которые позволяют бипаратопному полипептиду направляться к конкретным органам, тканям, клеткам или частям или компартментам клеток, и/или проникать, или проходить в них, и/или которые позволяют бипаратопному полипептиду проникать или переходить через биологический барьер, такой как клеточная мембрана, клеточный слой, такой как слой эпителиальных клеток, опухоль, включая солидные опухоли, или гематоэнцефалическии барьер. Примеры таких аминокислотных последовательностей известны специалистам и упоминаются в параграфе (с) на стр. 112 заявки WO 08/020079;
могут образовывать метку, например аминокислотную последовательность или остаток, которые позволяют осуществлять очистку бипаратопного нанотела или облегчают такую очистку, например, с использованием способов на основе аффинности к указанной последовательности или к указанному остатку. Затем указанные последовательность или остаток могут быть удалены (например, путем химического или ферментативного расщепления) с получением последовательности бипаратопного полипепти- 48 037063 да (для этих целей, метка может быть, но необязательно, присоединена к последовательности бипаратопного полипептида посредством отщепляемой линкерной последовательности, либо она может содержать отщепляемый мотив). Некоторыми предпочтительными, но неограничивающими примерами таких остатков являются полигистидиновые остатки, глутатионовые остатки и myc-метка (см., например, SEQ ID NO: 31 в заявке WO 06/12282);
могут представлять собой одни или несколько аминокислотных остатков, которые могут быть функционализированы и/или могут служить сайтом присоединения функциональных групп. Подходящие аминокислотные остатки и функциональные группы известны специалистам, и такими остатками и группами являются, но не ограничиваются ими, аминокислотные остатки и функциональные группы, упомянутые в настоящем документе при описании производных бипаратопных полипептидов или нанотел по изобретению.
В другом аспекте изобретения бипаратопный полипептид по изобретению содержит бипаратопное нанотело по изобретению, которое слито по меньшей мере с одним другим пептидом или полипептидом у аминоконца, у карбоксиконца или у аминоконца и у карбоксиконца, с получением слитого белка, содержащего указанное бипаратопное нанотело по изобретению и один или несколько других пептидов или полипептидов. Такой слитый полипептид также называется в настоящем документе слитым нанотелом.
Предпочтительно, чтобы такой дополнительный пептид или полипептид сообщал бипаратопному нанотелу или полипептиду по изобретению одно или несколько нужных свойств или функциональных признаков.
Например, дополнительный пептид или полипептид может также вводить дополнительный сайт связывания, где указанный сайт связывания может непосредственно связываться с любым нужным белком, полипептидом, антигеном, антигенной детерминантой или эпитопом (включая, но не ограничиваясь ими, те же самые белки, полипептиды, антигены, антигенные детерминанты или эпитопы, против которых направлен бипаратопный полипептид по изобретению, или другие белки, полипептиды, антигены, антигенные детерминанты или эпитопы).
Примеры таких пептидов или полипептидов известны специалистам и могут, по существу, включать все аминокислотные последовательности, используемые для получения слитых пептидов на основе стандартных антител и их фрагментов (включая, но не ограничиваясь ими, scFv и однодоменные антитела). Их описание можно найти, например, в публикации Holliger and Hudson, Nature Biotechnology, 23, 9, 1126-1136 (2005).
Например, такой пептид или полипептид может представлять собой аминокислотную последовательность, которая увеличивает время полужизни; повышает растворимость или абсорбцию; снижает иммуногенность или токсичность; устраняет или уменьшает нежелательные побочные эффекты; и/или сообщает другие предпочтительные свойства полипептидам по изобретению, и/или устраняет нежелательные свойства полипептидов по изобретению по сравнению с полипептидом по изобретению per se. Некоторыми неограничивающими примерами таких пептидов и полипептидов являются сывороточные белки, такие как альбумин сыворотки человека (см., например, WO 00/27435) или гаптеновые молекулы (например, гаптены, распознаваемые антителами, присутствующими в кровотоке, см., например, WO 98/22141).
В частности, в литературе было описано, что фрагменты, связывающие иммуноглобулины (такие как VH-домены) с сывороточным альбумином или с его фрагментами, могут быть использованы для увеличения времени полужизни. Их описание можно найти в WO 00/27435 и WO 01/077137. В соответствии с настоящим изобретением бипаратопные полипептиды, а предпочтительно бипаратопное нанотело по изобретению, связывается с сывороточным альбумином (или с его подходящим фрагментом) либо непосредственно, либо посредством подходящего линкера, в частности подходящего пептидного линкера, в результате чего полипептид по изобретению может экспрессироваться как генетический гибрид (белок). В одном из конкретных аспектов изобретения бипаратопное нанотело по изобретению может быть присоединено к фрагменту сывороточного альбумина, который содержит, по меньшей мере, домен III сывороточного альбумина или его части. Их описание можно найти, например, в заявке WO 07/112940, Ablynx N.V.
Альтернативно, как уже обсуждалось выше, дополнительный пептид или полипептид может вводить дополнительный сайт связывания или связывающую единицу, которые непосредственно связываются с сывороточным белком (таким как, например, альбумин сыворотки человека или другой сывороточный белок, такой как IgG), что приводит к увеличению времени полужизни в сыворотке. Такими аминокислотными последовательностями являются, например, описанные ниже нанотела, а также небольшие пептиды и связывающие белки, описанные в заявках WO 91/01743, WO 01/45746 и WO 02/076489, и dAb, описанные в заявках WO 03/002609 и WO 04/003019. Их описание можно также найти в публикации Harmsen et al., Vaccine, 23 (41); 4926-42, 2005, a также в ЕР 0368684, в заявках WO 08/028977, WO 08/043821, WO 08/043822, Ablynx N.V. и в предварительной заявке США, Ablynx N.V., озаглавленной Peptides capable of binding to serum proteins и поданной 5 декабря 2006 г. (см. также РСТ/ЕР 2007/063348).
- 49 037063
Такие пептиды или полипептиды могут быть, в частности, направлены против сывороточного альбумина (а более конкретно, против альбумина сыворотки человека) и/или против IgG (а более конкретно, против IgG человека). Например, такими аминокислотными последовательностями могут быть аминокислотные последовательности, направленные непосредственно против сывороточного альбумина (человека), и аминокислотные последовательности, которые могут связываться с аминокислотными остатками на сывороточном альбумине (человека), и которые не участвуют в связывании сывороточного альбумина с FcRn (см., например, WO 06/0122787), и/или аминокислотные последовательности, которые способны связываться с аминокислотными остатками на сывороточном альбумине, и которые не образуют часть домена III сывороточного альбумина (см., например, WO 06/0122787); аминокислотные последовательности, которые имеют увеличенное время полужизни или могут сообщать увеличенное время полужизни (см., например, WO 08/028977, Ablynx N.V.); аминокислотные последовательности, которые направлены против альбумина сыворотки человека и которые перекрестно реагируют с сывороточным альбумином, происходящим от млекопитающих по меньшей мере одного вида, в частности от приматов по меньшей мере одного вида (таких как, но не ограничивающихся ими, обезьяны, принадлежащие к роду Масаса (такие как, в частности, собакоподобные обезьяны (Масаса fascicularis) и/или макак-резус (Масаса mulatto) ) и павианов (Papio ursinus) ), см. также WO 08/028977; аминокислотные последовательности, которые могут связываться с сывороточным альбумином независимо от рН (см., например, заявку WO 08/043821, Ablynx N.V., озаглавленную Amino acid sequences that bind to serum proteins in a manner that is essentially independent of the pH, compounds comprising the same, and uses thereof') и/или аминокислотные последовательности, которые связываются в зависимости от определенных условий (см., например, заявку 08/043822, Ablynx N.V., озаглавленную Amino acid sequences that bind to a desired molecule in a conditional manner).
В соответствии с другим аспектом изобретения одна или несколько дополнительных пептидных, полипептидных или белковых последовательностей могут содержать одну или несколько частей, один, или несколько фрагментов или один или несколько доменов стандартных 4-цепочечных антител (в частности, антител человека) и/или антител с тяжелой цепью. Например, бипаратопное нанотело по изобретению может связываться со стандартным (предпочтительно человека) VH- или VL-доменом или с природным или синтетическим аналогом VH- или VL-домена, необязательно, посредством линкерной последовательности (включая, но не ограничиваясь ими, другие (одно)доменные антитела, такие как dAb, описанные Ward et al.), хотя такое антитело обычно является менее предпочтительным.
Бипаратопный полипептид или бипаратопное нанотело может также связываться с одним или несколькими (предпочтительно человека) СН1-, СН2- и/или Сн3-доменами, необязательно, посредством линкерной последовательности. Например, бипаратопное нанотело, связанное с подходящим QJдоменом, может быть, например, использовано вместе с подходящими легкими цепями для получения фрагментов антитела/структур, которые аналогичны стандартным Fab-фрагментам или F(ab')2фрагментам, но в которых один или (в случае F(ab')2-фрагмента) один или оба стандартных VH-домена были заменены бипаратопным нанотелом по изобретению. Кроме того, два бипаратопных полипептида могут быть связаны с СН3-доменом (необязательно, посредством линкера) с получением конструкции, имеющей увеличенное время полужизни in vivo.
В соответствии с одним из конкретных аспектов полипептида по изобретению один или несколько бипаратопных полипептидов или одно или несколько бипаратопных нанотел по изобретению могут быть связаны (необязательно, посредством подходящего линкера или шарнирной области) с одним или несколькими константными доменами (например, с 2 или 3 константными доменами, которые могут быть использованы как часть Fc-фрагмента/для образования Fc-фрагмента), с Fc-частью и/или с одной или несколькими частями, фрагментами или доменами антитела, которые сообщают полипептиду по изобретению одну или несколько эффекторных функций, и/или которые могут сообщать этому полипептиду способность связываться с одним или несколькими Fc-рецепторами. Например, один или несколько дополнительных пептидов или полипептидов, используемых в этих целях, но не ограничиваясь ими, могут содержать один или несколько СН2- и/или СД-доменов антитела, например антитела с тяжелой цепью (как описано в настоящей заявке), а более предпочтительно стандартного 4-цепочечного антитела человека; и/или они могут образовывать (часть) Fc-области, например, происходящей от IgG (например, от IgGl, IgG2, IgG3 или IgG4), от IgE или от другого Ig человека, такого как IgA, IgD или IgM. Например, в WO 94/04678 описаны антитела с тяжелой цепью, содержащие VHH-домен верблюда или его гуманизированное производное (т.е. нанотело), в которых верблюжьи СН2- и/или СН3-домены были заменены СН2- и СН3-доменами человека с образованием иммуноглобулина, который состоит из 2 тяжелой цепей, каждая из которых содержит нанотело и СН2- или СН3-домены человека (но не СН1-домен), где указанный иммуноглобулин обладает эффекторной функцией, сообщаемой СН2- или СН3-доменами, и где указанный иммуноглобулин может функционировать в отсутствие каких-либо легких цепей. Другие аминокислотные последовательности, которые могут быть соответствующим образом связаны с нанотелами по изобретению для сообщения им эффекторной функции, известны специалистам и могут быть выбраны в соответствии с их желательными эффекторными функциями. Описание этих последовательностей можно найти, например, в WO 04/058820, WO 99/42077, WO 02/056910 и WO 05/017148, а также в публикациях
- 50 037063
Holliger и Hudson, см. выше. Связывание полипептида, например нанотела по изобретению, с Fc-частью может также приводить к увеличению времени полужизни в отличие от соответствующего полипептида по изобретению. Для некоторых целей использование Fc-части и/или константных доменов (т.е. СН2и/или СН3-доменов), которые сообщают увеличенное время полужизни, но не обладают какой-либо биологически значимой эффекторной функцией, может также оказаться желательным или даже предпочтительным. Другие подходящие конструкции, содержащие один или несколько бипаратопных \полипептидов, таких как нанотела, и один или несколько константных доменов с увеличенным временем полужизни in vivo известны специалистам и могут, например, включать два нанотела, связанных с СН3-доменом, необязательно, посредством линкерной последовательности. Как правило, любой слитый белок или любые производные с увеличенным временем полужизни предпочтительно имеют молекулярную массу более чем 50 кД, т.е. предельную величину для абсорбции в почках.
В другом конкретном, но не ограничивающем аспекте изобретения для получения полипептида по изобретению одна или несколько аминокислотных последовательностей по изобретению могут быть присоединены (необязательно, посредством подходящего линкера или подходящей шарнирной области) к природным, синтетическим или полусинтетическим константным доменам (или их аналогам, вариантам, мутантам, частям или фрагментам), которые имеют пониженную тенденцию (или, по существу, не обнаруживают такой тенденции) к самосборке в димеры (т.е. по сравнению с константными доменами, которые обычно присутствуют в стандартных 4-цепочечных антителах). Такие мономерные (т.е. не самоассоциирующиеся) варианты Fc-цепи или их фрагменты известны специалистам в данной области. Так, например, в публикации Helm et al., J. Biol. Chem. 1996 271 7494, описаны варианты мономерной Fcцепи, которые могут быть использованы в полипептидных цепях по изобретению.
Кроме того, такие варианты мономерной Fc-цепи являются предпочтительными, поскольку они сохраняют способность связываться с комплементом или с релевантным(и) Fc-рецептором(ами) (в зависимости от Fc-части, от которой они происходят) и/или поскольку они сохраняют некоторые или все эффекторные функции Fc-части, от которой они происходят (или на пониженном уровне, но все же достаточном для осуществления нужных целей). Альтернативно, в такой полипептидной цепи по изобретению мономерная Fc-цепь может быть также использована для сообщения полипептидной цепи увеличенного времени полужизни, где указанная мономерная Fc-цепь может также не обладать или почти не обладать эффекторными функциями.
Дополнительные пептиды или полипептиды могут также образовывать сигнальную последовательность или лидерную последовательность, которая направляет секрецию бипаратопного нанотела или полипептида по изобретению из клетки-хозяина после его синтеза (например, с образованием пре-, проили препроформы полипептида по изобретению в зависимости от типа клетки-хозяина, используемой для экспрессии полипептида по изобретению).
Дополнительный пептид или полипептид может также образовывать последовательность или сигнал, которые позволяют бипаратопному нанотелу или полипептиду по изобретению направляться к конкретным органам, тканям, клеткам или частям, или компартментам клеток, и/или проникать или проходить в них, и/или которые позволяют бипаратопному нанотелу или полипептиду по изобретению проникать или переходить через биологический барьер, такой как клеточная мембрана, клеточный слой, такой как слой эпителиальных клеток, опухоль, включая солидные опухоли, или через гематоэнцефалический барьер. Подходящие примеры таких аминокислотных последовательностей известны специалистам, и такими аминокислотными последовательностями являются, например, но не ограничиваются ими, аминокислотные последовательности, упоминаемые на стр. 118 заявки WO 08/020079. Для применения в некоторых целях, в частности для уничтожения клеток, экспрессирующих CXCR2-мишень, против которой направлены бипаратопные полипептиды по изобретению (например, для лечения рака), или для снижения или замедления роста и/или пролиферации таких клеток, бипаратопные полипептиды по изобретению могут быть также присоединены к (цито)токсическому белку или полипептиду. Примеры таких токсических белков и полипептидов, которые могут быть присодинены к нанотелу по изобретению с получением, например, цитотоксического полипептида по изобретению, известны специалистам и описаны в предшествующих работах, цитируемых выше и/или в подробном описании настоящей заявки. Одним из примеров является так называемая технология ADEPT™, описанная в WO 03/055527.
В соответствии с одним необязательным и неограничивающим аспектом изобретения, указанные один или несколько дополнительных пептидов, или полипептидов содержат по меньшей мере одно дополнительное нанотело, а поэтому представляют собой полипептид по изобретению, который содержит по меньшей мере три, например четыре, пять или более нанотел, где указанные нанотела могут быть связаны, но необязательно, посредством одной или нескольких линкерных последовательностей (как определено в настоящей заявке).
И наконец, в объем настоящего изобретения входят бипаратопные полипептиды по изобретению, которые могут содержать два или более нанотел и один или несколько дополнительных пептидов или полипептидов (как упоминается в настоящей заявке).
Описание поливалентных и мультиспецифических полипептидов, содержащих два или более VHHдоменов, и их получения можно также найти в публикациях Conrath et al., J. Biol. Chem., Vol. 276, 10.
- 51 037063
7346-7350, 2001; Muyldermans, Reviews in Molecular Biotechnology 74 (2001), 277-302; а также, например, в WO 96/34103 и WO 99/23221. Некоторые другие примеры некоторых специфических, мультиспецифических и/или поливалентных полипептидов по изобретению можно найти в заявках Ablynx N.V., упоминаемых в настоящей заявке.
Один из предпочтительных примеров мультиспецифического полипептида по изобретению включает по меньшей мере одно бипаратопное нанотело по изобретению и по меньшей мере одно нанотело, которое сообщает увеличенное время полужизни. Такими нанотелами могут быть, например, нанотела, которые направлены против сывороточного белка, в частности сывороточного белка человека, такого как альбумин сыворотки человека, белок, связывающийся с тироксином, трансферин (человека), фибриноген, иммуноглобулин, такой как IgG, IgE или IgM, или против одного из сывороточных белков, перечисленных в WO 04/003019. Среди этих нанотел нанотела, которые могут связываться с сывороточным альбумином (в частности, с альбумином сыворотки человека) или с IgG (в частности, с IgG человека, см., например, описание нанотела VH-1 в публикации Muyldermans, см. выше), являются особенно предпочтительными (хотя, например, для проведения экспериментов на мышах или приматах могут быть использованы нанотела, направленные против альбумина сыворотки мыши (MSA) или сывороточного альбумина от указанного примата, соответственно, или перекрестно связывающиеся с указанными альбуминами. Однако для применения в фармацевтике обычно предпочтительными являются нанотела, направленные против альбумина сыворотки человека или против IgG человека). Нанотелами, которые сообщают увеличенное время полужизни, и которые могут быть использованы в полипептидах по изобретению, являются нанотела, направленные против сывороточного альбумина, где указанные нанотела описаны в WO 04/041865, WO 06/122787 и в других патентных заявках, Ablynx N.V., таких как патентные заявки, указанные выше.
Например, некоторыми предпочтительными нанотелами, которые сообщают увеличенное время полужизни и которые могут быть использованы в настоящей заявке, являются нанотела, которые могут связываться с аминокислотными остатками на сывороточном альбумине (человека) и которые не участвуют в связывании сывороточного альбумина с FcRn (см., например, WO 06/0122787); нанотела, которые способны связываться с аминокислотными остатками на сывороточном альбумине и которые не образуют часть домена III сывороточного альбумина (см., например, WO 06/0122787); нанотела, которые имеют увеличенное время полужизни или могут сообщать увеличенное время полужизни (см., например, упоминаемую в настоящем документе заявку WO 08/028977, Ablynx N.V.); нанотела, которые направлены против альбумина сыворотки человека и которые перекрестно реагируют с сывороточным альбумином, происходящим от млекопитающих по меньшей мере одного вида, в частности от приматов по меньшей мере одного вида (таких как, но не ограничивающихся ими, обезьяны, принадлежащие к роду Масаса (такие как, в частности, собакоподобные обезьяны (Масаса fascicularis) и/или макак-резус (Масаса mulatta)) и павианов (Papio ursinus)) (см. например, WO 08/028977, Ablynx N.V.)); нанотела, которые могут связываться с сывороточным альбумином независимо от рН (см., например, заявку WO 2008/043821, Ablynx N.V., упоминаемую в настоящей заявке) и/или нанотела, которые связываются в зависимости от определенных условий (см., например, заявку WO 08/043822, Ablynx N.V.).
Некоторыми особенно предпочтительными нанотелами, которые сообщают увеличенное время полужизни и которые могут быть использованы в полипептидах по изобретению, являются нанотела ALB-1 ALB-10, описанные в WO 06/122787 (см. табл. II и III), из которых особенно предпочтительным является ALB-8 (SEQ ID NO: 62 в WO 06/122787).
В соответствии с конкретным аспектом изобретения полипептиды по изобретению содержат помимо двух или более нанотел по меньшей мере одно нанотело, направленное против альбумина сыворотки человека.
Другими дополнительными пептидами или полипептидами, которые могут быть добавлены к бипаратопным полипептидам по изобретению или которые могут быть присоединены к бипаратопным полипептидам по изобретению или связаны с этими полипептидами, являются полимеры, состоящие из пролина, аланина и серина (последовательности PAS). Последовательности PAS могут состоять из 200-600 остатков и способствуют резкому увеличению гидродинамического объема, что приводит к увеличению времени полужизни в плазме. Время полужизни в плазме бипаратопных полипептидов по изобретению может быть также увеличено путем слияния с полипептидом, состоящим из 864 аминокислот и обозначаемым XTEN, как описано Schellenbrger et al., (2009), Nature Biotechnology 27, No 12, p. 1186-1190.
Как правило, любые полипептиды по изобретению с увеличенным временем полужизни, которые содержат одно или несколько бипаратопных нанотел по изобретению, и любые производные бипаратопных нанотел по изобретению или указанных полипептидов с увеличенным временем полужизни предпочтительно имеют время полужизни, которое по меньшей мере в 1,5 раза, предпочтительно по меньшей мере в 2 раза, а именно по меньшей мере в 5 раз, например по меньшей мере в 10 раз или более чем в 20 раз превышает время полужизни соответствующего нанотела по изобретению per se. Например, такое производное или полипептиды с увеличенным временем полужизни имеют время полужизни, которое по меньшей мере более чем на 1 ч, предпочтительно более чем на 2 ч, более предпочтительно более чем на 6 ч, а именно более чем на 12 ч или даже более чем на 24, 48 или 72 ч превышает время полужизни соот
- 52 037063 ветствующего нанотела по изобретению per se.
В предпочтительном, но неограничивающем аспекте изобретения такие производные или полипептиды могут иметь время полужизни в сыворотке человека, составляющее по меньшей мере приблизительно 12 ч, предпочтительно по меньшей мере 24 ч, более предпочтительно по меньшей мере 48 ч, а еще более предпочтительно по меньшей мере 72 ч или более. Например, такие производные или полипептиды могут иметь время полужизни, составляющее по меньшей мере 5 дней (а именно, приблизительно 5-10 дней), предпочтительно по меньшей мере 9 дней (а именно, приблизительно 9-14 дней), более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 10 дней (а именно, приблизительно 10-15 дней), или по меньшей мере приблизительно 11 дней (а именно, приблизительно 11-16 дней), более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 12 дней (а именно, приблизительно 12-18 дней или более) или более чем 14 дней (а именно, приблизительно 14-19 дней).
Другой предпочтительный, но неограничивающий пример мультиспецифического полипептида по изобретению содержит по меньшей мере одно бипаратопное нанотело по изобретению и по меньшей мере одно нанотело, которое направляет полипептид по изобретению к конкретным органам, тканям, клеткам или частям или компартментам клеток, и/или позволяет такому полипептиду по изобретению проникать или проходить в них, и/или которые позволяют нанотелу проникать или проходить через биологический барьер, такой как клеточная мембрана, клеточный слой, такой как слой эпителиальных клеток, опухоль, включая солидные опухоли, или через гематоэнцефалический барьер. Примерами таких нанотел являются нанотела, которые направлены на специфические белки клеточной поверхности, маркеры или эпитопы нужных органов, тканей или клеток (например, маркеры клеточной поверхности, связанные с опухолевыми клетками), и фрагменты однодоменных антител, которые нацелены на головной мозг и описаны в WO 02/057445 и WO 06/040153, из которых предпочтительными примерами являются FC44 (SEQ ID NO: 189 в заявке WO 06/040153) и FC5 (SEQ ID NO: 190 в заявке WO 06/040154).
В полипептидах по изобретению два или более нанотел и один или несколько полипептидов могут быть непосредственно связаны друг с другом (например, как описано в WO 99/23221), и/или они могут быть связаны друг с другом посредством одного или нескольких подходящих спейсеров или линкеров, или любых их комбинаций.
В соответствии с одним из аспектов изобретения полипептид по изобретению присутствует, по существу, в выделенной форме, как определено в настоящей заявке.
Аминокислотные последовательности, бипаратопные нанотела, полипептиды и нуклеиновые кислоты по изобретению могут быть получены известным методом per se, что будет очевидным для специалистов из подробного описания настоящей заявки. Например, бипаратопные нанотела и полипептиды по изобретению могут быть получены любым известным методом per se, применяемым для получения антител, в частности для получения фрагментов антител (включая, но не ограничиваясь ими, (одно)доменные антитела и scFv-фрагменты). Некоторыми предпочтительными, но неограничивающимися методами получения аминокислотных последовательностей, нанотел, полипептидов и нуклеиновых кислот являются методы и технологии, описанные в настоящей заявке.
Как очевидно для специалиста в данной области, один особенно подходящий способ получения бипаратопного нанотела и/или полипептида по изобретению, по существу, включает стадии:
i) экспрессия в подходящей клетке-хозяине или в подходящем организме-хозяине (также называемыми в настоящем документе хояином по изобретению) или в другой подходящей экспрессионной системе, нуклеиновой кислоты, которая кодирует указанное бипаратопное нанотело или указанный полипептид по изобретению (также называемой в настоящем документе нуклеиновой кислотой по изобретению), и необязательно ii) выделение и/или очистка полученного таким образом указанного бипаратопного нанотела или полипептида по изобретению.
В частности, способ может включать стадии:
i) культивирование и/или поддержание хозяина по изобретению в условиях, при которых указанный хозяин по изобретению будет экспрессировать и/или продуцировать по меньшей мере одно бипаратопное нанотело и/или по меньшей мере один полипептид по изобретению, и необязательно ii) выделение и/или очистка полученного таким образом бипаратопного нанотела или полипептида по изобретению.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к молекуле нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид по изобретению (или его подходящий фрагмент). Такая нуклеиновая кислота также называется в настоящем документе нуклеиновой кислотой по изобретению и может иметь форму генетической конструкции, более подробно описанной ниже.
В своих предпочтительных вариантах осуществления настоящее изобретение относится к молекуле нуклеиновой кислоты, кодирующей аминокислотную последовательность, выбранную из группы аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 25-43, 90 и SEQ ID NO: 213-219 и относящихся к конкретным специфическим нанотелам, представленным в табл. 9 и 32. Альтернативно, молекулы нуклеиновой кислоты по изобретению включают молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие конструкции поливалентных и бипаратопных нанотел SEQ ID NO:44-69. Кроме того, молекулы нуклеиновой кислоты по
- 53 037063 изобретению содержат молекулы с последовательностями нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 192-211, относящимися к нанотелам, идентифицированным в табл. 18.
Нуклеиновая кислота по изобретению может иметь форму одноцепочечной или двухцепочечной ДНК или РНК, предпочтительно двухцепочечной ДНК. Например, нуклеотидными последовательностями по изобретению могут быть геномная ДНК, кДНК или синтетическая ДНК (такая как ДНК с частотой встречаемости кодонов, которая была конкретно адаптирована для экспрессии в рассматриваемой клетке-хозяине или в организме-хозяине).
В соответствии с одним из аспектов изобретения нуклеиновая кислота по изобретению присутствует, по существу, в выделенной форме, как определено в настоящей заявке.
Нуклеиновая кислота по изобретению может также иметь форму вектора, такого как плазмида, космида или YAC, либо она может присутствовать в указанном векторе и/или она может быть частью такого вектора, и в этом случае, нуклеиновая кислота может присутствовать, по существу, в выделенной форме.
Нуклеиновые кислоты по изобретению могут быть получены или продуцированы способом, известным per se, исходя из имеющейся в настоящем документе информации об аминокислотных последовательностях полипептидов по изобретению, и/или они могут быть выделены из подходящего природного источника. Для получения аналогов нуклеотидные последовательности, кодирующие природные VHHдомены, могут быть, например, подвергнуты сайт-направленному мутагенезу в целях конструирования нуклеиновой кислоты по изобретению, кодирующей указанный аналог. Кроме того, как очевидно для специалиста в данной области, для получения нуклеиновой кислоты по изобретению несколько нуклеотидных последовательностей, таких как по меньшей мере одна нуклеотидная последовательность, кодирующая полипептид по изобретению, и, например, нуклеиновые кислоты, кодирующие один или несколько линкеров, могут быть присоединены друг к другу соответствующим образом.
Способы получения нуклеиновых кислот по изобретению известны специалистам и могут включать, например, но не ограничиваются ими, автоматизированный синтез ДНК; сайт-направленный мутагенез; объединение двух или более природных и/или синтетических последовательностей (или их двух или более частей); введение мутаций, способствующих экспрессии усеченного продукта экспрессии; введение одного или нескольких рестрикционных сайтов (например, для создания кластеров и/или областей, которые могут быть легко гидролизованы и/или лигированы под действием подходящих рестриктирующих ферментов) и/или введение мутаций посредством ПЦР-реакции с использованием одного или более несоответствующих праймеров с использованием, например, последовательности природного CXCR2 в качестве матрицы. Эти и другие методы известны специалистам и описаны в стандартных руководствах, таких как руководства Sambrook et al. и Ausubel et al., упомянутые выше, а также в нижеприведенных примерах.
Нуклеиновая кислота по изобретению может также иметь форму генетической конструкции, может присутствовать в генетической конструкции и/или может быть частью генетической конструкции. Такие генетические конструкции обычно содержат по меньшей мере одну нуклеиновую кислоту по изобретению, которая присоединена, но необязательно, к одному или нескольким элементам генетической конструкции, известным per se, таким как, например, один или несколько подходящих регуляторных элементов (таких как подходящий(ие) промотор(ы), энхансер(ы), терминатор(ы) и т.п.), и к другим элементам описанных в настоящем документе генетических конструкций. Такие генетические конструкции, содержащие по меньшей мере одну нуклеиновую кислоту по изобретению, называются в настоящем документе генетическими конструкциями по изобретению.
Генетическими конструкциями по изобретению могут быть ДНК или РНК предпочтительно двухцепочечная ДНК. Генетические конструкции по изобретению могут также присутствовать в форме, подходящей для трансформации рассматриваемой клетки-хозяин или рассматриваемого организма-хозяин; в форме, подходящей для интеграции в геномную ДНК рассматриваемой клетки-хозяин или в форме, подходящей для независимой репликации, сохранения и/или наследования в рассматриваемом организмехозяин. Так, например, генетические конструкции по изобретению могут иметь форму вектора, такого как, например, плазмида, космида, YAC, вирусный вектор или транспозон. В частности, указанным вектором может быть вектор экспрессии, т.е. вектор, который стимулирует экспрессию in vitro и/или in vivo (например, в подходящей клетке-хозяин, в подходящем организме-хозяин и/или в подходящей экспрессионной системе).
В предпочтительном, но неограничивающем аспекте изобретения генетическая конструкция по изобретению содержит:
i) по меньшей мере одну нуклеиновую кислоту по изобретению, функционально присоединенную ii) к одному или нескольким регуляторным элементам, таким как промотор. и, необязательно, к подходящему терминатору; а также, но необязательно iii) к одному или нескольким другим элементам генетических конструкций, известных per se;
где термины функционально присоединенный и функционально связанный имеют значения, приведенные на стр. 131-134 заявки WO 08/020079; термины регуляторные элементы, промотор, терминатор и дополнительные элементы описаны на стр. 131-134 заявки WO 08/020079; а генетиче
- 54 037063 ские конструкции подробно описаны на стр. 131-134 заявки WO 08/020079.
Нуклеиновые кислоты по изобретению и/или генетические конструкции по изобретению могут быть использованы для трансформации клетки-хозяина или организма-хозяина, т.е. для экспрессии и/или получения бипаратопного нанотела или полипептида по изобретению. Подходящие хозяева или клеткихозяева известны специалистам, и ими могут быть, например, любые подходящие клетки или клеточные линии грибов, прокариотов или эукариотов или любые подходящие микроорганизмы, такие как грибы, прокариоты или эукариоты, например, описанные на стр. 134 и 135 заявки WO 08/020079, а также все другие хозяева или клетки-хозяева, известные per se и используемые для экспрессии и получения антител и фрагментов антител (включая, но не ограничиваясь ими, (одно)доменные антитела и scFv-фрагменты), известных специалистам. Их описание можно найти в цитируемой выше литературе, а также, например, в заявках WO 94/29457; WO 96/34103; WO 99/42077; в публикациях Frenken et al., (1998), см. выше; Riechmann and Muyldermans, (1999), см. выше; van der Linden, (2000), см. выше; Thomassen et al., (2002), см. выше; Joosten et al., (2003), см. выше; Joosten et al. , (2005), см. выше; и в других цитируемых там работах.
Бипаратопные нанотела и полипептиды по изобретению могут быть также введены в одну или несколько клеток, тканей или органов многоклеточного организма и могут быть также экспрессированы в этих клетках, тканях или органах, например, в профилактических и/или терапевтических целях (например, для применения в генной терапии), как подробно описано на стр. 135 и 136 заявки WO 08/020079 и в других работах, цитируемых в WO 08/020079.
Для экспрессии нанотел в клетках эти нанотела могут быть также экспрессированы в виде так называемых интраантител, описанных, например, в WO 94/02610, WO 95/22618, US-A-7004940; WO 03/014960; в публикации Cattaneo, A. & Biocca, S. (1997) Intracellular Antibodies: Development and Applications. Landes and Springer-Verlag; и в публикации Kontermann, Methods 34, (2004), 163-170.
Бипаратопные нанотела и полипептиды по изобретению могут также, например, продуцироваться в молоке трансгенных млекопитающих, например в молоке кроликов, коров, коз или овец (описание общих методов введения трансгенов млекопитающим можно найти, например, в US-A-6741957, US-A-6304489 и US-A-6849992), в растениях или в частях растений, включая, но не ограничиваясь ими, листья, цветы, плоды, семена, корни или клубни (например, табака, кукурузы, сои или люцерны), или, например, в куколках шелкопряда Bombix mori.
Кроме того, бипаратопные нанотела и полипептиды по изобретению могут также экспрессироваться и/или продуцироваться в бесклеточных экспрессионных системах, и подходящие примеры таких систем известны специалистам в данной области. Некоторыми предпочтительными, но не ограничивающимися примерами экспрессии является экспрессия в зернах пшеницы, в лизатах кроличьих ретикулоцитов или в системе E.coli Zubay.
Как упоминалось выше, одно из преимуществ использования бипаратопных полипептидов и нанотел заключается в том, что полипептиды, полученные на их основе, могут продуцироваться посредством экспрессии в подходящей бактериальной системе, где подходящие бактериальные экспрессионные системы, векторы, клетки-хозяева, регуляторные элементы и т.п. будут очевидны для специалиста исходя из описания цитируемых выше работ. Однако следует отметить, что настоящее изобретение, в его самом широком смысле, не ограничивается экспрессией в бактериальных системах.
В настоящем изобретении предпочтительно используется экспрессионная система (in vivo или in vitro), такая как бактериальная экспрессионная система, которая позволяет продуцировать полипептиды по изобретению в форме, подходящей для их применения в фармацевтике, и такие экспрессионные системы также известны специалистам в данной области. Специалистам в данной области также известно, что полипептиды по изобретению, подходящие для их использования в фармацевтике, могут быть получены методами пептидного синтеза.
В случае промышленного получения полипептидов предпочтительными гетерологичными хозяевами, предназначенными для (промышленного) получения бипаратопных нанотел или терапевтических белков, содержащих нанотела, являются штаммы E.coli, Pichia pastoris, S.cerevisiae, которые могут быть подходящими для крупномасштабной экспресии/крупномасштабного получения/крупномасштабной ферментации, в частности для крупномасштабной экспрессии/крупномасштабного получения/крупномасштабной ферментации в фармацевтических целях (т.е. в случае использования GMP). Подходящие примеры таких штаммов известны специалистам. Такие штаммы и системы получения/экспрессии могут также поставляться такими компаниями, как Biovitrum (Uppsala, Sweden).
Альтернативно, клеточные линии млекопитающего, в частности клетки яичника китайского хомячка (СНО), могут быть использованы для крупномасштабной экспрессии/крупномасштабного получения/крупномасштабной ферментации, в частности крупномасштабной экспрессии/крупномасштабного получения/крупномасштабной ферментации в фармацевтических целях. И в этом случае такие системы экспрессии/получения также поставляются некоторыми упомянутыми выше компаниями.
Выбор конкретной экспрессионной системы частично зависит от требований, предъявляемых к некоторым посттрансляционным модификациям, а более конкретно к гликозилированию. Для получения рекомбинантного белка, содержащего нанотело, при котором желательно или необходимо гликозилиро
- 55 037063 вание, может потребоваться использование соответствующих млекопитающих-хозяев для экспрессии, способных гликозилировать экспрессированный белок. В соответствии с этим специалисту в данной области известно, что профиль гликозилирования (т.е. вид, число и положение присоединяемых остатков) зависит от клетки или клеточной линии, используемых для экспрессии. При этом предпочтительно использовать клетку человека или клеточную линию человека (т.е. продуцирующую белок, который, в основном, имеет профиль гликозилирования, характерный для человека) или клеточную линию другого млекопитающего, которая может обеспечивать профиль гликозилирования, являющийся в основном и/или функционально аналогичным профилю гликозилирования, характерному для человека, или, по меньшей мере, имитирующий профиль гликозилирования, характерный для человека. Как правило, прокариотические хозяева, такие как Е. coli, не обладают способностью гликозилировать белки, а при использовании низших эукариотов, таких как дрожжи, профиль гликозилирования будет отличаться от профиля гликозилирования, характерного для человека. Тем не менее, следует отметить, что в настоящем изобретении могут быть использованы все вышеупомянутые клетки-хозяева и экспрессионные системы при условии, что они будут продуцировать нужное бипаратопное нанотело или нужный бипаратопный полипептид.
Таким образом, в соответствии с одним из аспектов изобретения бипаратопное нанотело или бипаратопный полипептид по изобретению являются гликозилированными. В соответствии с другим неограничивающим аспектом изобретения аминокислотная последовательность, нанотело или полипептид по изобретению не являются гликозилированными.
В соответствии с одним предпочтительным, но неограничивающим аспектом изобретения бипаратопное нанотело или полипептид по изобретению продуцируются в бактериальной клетке, в частности в бактериальной клетке, подходящей для крупномасштабного производства фармацевтических средств, а именно, в клетках вышеупомянутых штаммов.
В соответствии с другим предпочтительным, но неограничивающим аспектом изобретения бипаратопное нанотело или полипептид по изобретению продуцируются в дрожжевой клетке, в частности в дрожжевой клетке, подходящей для крупномасштабного производства фармацевтических средств, а именно в клетках вышеупомянутых видов.
В соответствии с еще одним предпочтительным, но неограничивающим аспектом изобретения бипаратопное нанотело или полипептид по изобретению продуцируются в клетке млекопитающего, в частности в клетке человека или в клетке клеточной линии человека, а более конкретно в клетке человека или в клетке клеточной линии человека, подходящей для крупномасштабного производства фармацевтических средств, а именно в клеточных линиях, упомянутых выше.
Как описано на стр. 138 и 139 заявки WO 08/020079, если экспрессию в клетке-хозяине осуществляют для получения бипаратопных нанотел и полипептидов по изобретению, то эти антитела и полипептиды либо продуцируют внутри клеток (например, в цитозоле, в периплазме или в тельцах включения), а затем выделяют из клеток-хозяев и дополнительно, но необязательно, очищают, либо их продуцируют во внеклеточном пространстве (например, в среде для культивирования клеток-хозяев), а затем выделяют из культуральной среды и дополнительно, но необязательно, очищают. Таким образом, в соответствии с одним неограничивающим аспектом изобретения, бипаратопное нанотело или полипептид по изобретению представляют собой аминокислотную последовательность, нанотело или полипептид, которые были получены внутри клеток и выделены из клеток-хозяев, в частности из бактериальных клеток или из телец включения, присутствующих в бактериальных клетках. В соответствии с другим неограничивающим аспектом изобретения, бипаратопное нанотело или полипептид по изобретению представляют собой нанотело или полипептид, которые были получены во внеклеточном пространстве, и которые были выделены из среды для культивирования клеток-хозяев.
Некоторые предпочтительные, но неограничивающие примеры промоторов, которые могут быть использованы вместе с указанными клетками-хозяевами, упоминаются на стр. 139 и 140 заявки WO 08/020079.
Некоторые предпочтительные, но неограничивающие примеры секреторных последовательностей, которые могут быть использованы вместе с указанными клетками-хозяевами, упоминаются на стр. 140 заявки WO 08/020079.
Подходящие методы трансформации хозяина или клетки-хозяина по изобретению известны специалистам и могут быть выбраны в зависимости от рассматриваемой клетки-хозяина/организма-хозяина и от используемой генетической конструкции. Описание этих методов приводится в руководствах и в патентных заявках, упомянутых выше.
После трансформации может быть осуществлена стадия детектирования и отбора клеток-хозяев или организмов-хозяев, которые были успешно трансформированы нуклеотидной последовательностью/генетической конструкцией по изобретению. Такой стадией может быть, например, стадия отбора на основе селективного маркера, присутствующего в генетической конструкции по изобретению, или стадия, включающая детектирование полипептида по изобретению, например, с использованием специфических антител.
Трансформированные клетки-хозяева (которые могут присутствовать в форме стабильной клеточ
- 56 037063 ной линии) или организмы-хозяева (которые могут присутствовать в форме стабильной мутантной линии или мутантного штамма) входят в дополнителные аспекты изобретения.
Предпочтительно, чтобы эти клетки-хозяева или организмы-хозяева экспрессировали или (по меньшей мере) обладали способностью экспрессировать (например, в подходящих условиях) бипаратопное нанотело или полипептид по изобретению (а в случае организма-хозяина по меньшей мере в одной клетке, в одном участке, в одной ткани или в одном органе). Настоящее изобретение также включает дополнительные генерации, потомство клетки-хозяина или низшего организма-хозяина и/или потомство высшего организма-хозяина по изобретению, которое может быть, например, получено посредством деления клетки или путем полового или бесполого размножения.
Для получения/достижения экспрессии аминокислотных последовательностей по изобретению трансформированная клетка-хозяин или трансформированный организм-хозяин, по существу, могут поддерживаться и сохраняться и/или могут быть культивированы в условиях, способствующих экспрессии/получению (нужного) бипаратопного нанотела или полипептида по изобретению. Подходящие условия известны специалистам и обычно зависят от используемой клетки-хозяина/используемого организма-хозяина, а также от регуляторных элементов, под контролем которых происходит экспрессия (релевантной) нуклеотидной последовательности по изобретению. Описание таких условий приводится в вышеупомянутых руководствах и в патентных заявках, в параграфах, относящихся к генетическим конструкциям по изобретению.
В общих чертах, подходящие условия могут включать использование соответствующей среды, присутствие подходящего питательного источника и/или подходящих микроэлементов, создание подходящей температуры и присутствие, но необязательно, подходящего индуцирующего фактора или соединения (например, если нуклеотидные последовательности по изобретению находятся под контролем индуцибельного промотора), причем все указанные условия могут быть выбраны самим специалистом. В таких условиях полипептид по изобретению может также экспрессироваться конститутивно, транзиентно или только в присутствии соответствующего индуктора.
Для специалиста в данной области также очевидно, что бипаратопное нанотело или полипептид по изобретению могут быть (сначала) получены в незрелой форме (как упоминалось выше), а затем они могут быть подвергнуты посттрансляционной модификации в зависимости от используемой клеткихозяина/используемого организма-хозяина. И в этом случае бипаратопное нанотело или бипаратопный полипептид по изобретению могут быть гликозилированными в зависимости от используемой клеткихозяина/используемого организма-хозяина.
Бипаратопное нанотело или бипаратопный полипептид по изобретению могут быть затем выделены из клетки-хозяина/организма-хозяина и/или из среды для культивирования указанной клетки-хозяина или указанного организма-хозяина с применением методов выделения и/или очистки белков, известных per se, таких как (препаративная) хроматография и/или электрофорез, методы дифференциальной преципитации, аффинные методы (например, с использованием специфически отщепляемой аминокислотной последовательности, связанной с аминокислотной последовательностью, нанотелом или полипептидом по изобретению) и/или препаративные иммунологические методы (т.е. с использованием антител против выделяемой аминокислотной последовательности).
В общих чертах, полипептиды по изобретению, используемые в фармацевтике, могут быть получены в виде фармацевтического препарата или фармацевтических композиций, содержащих по меньшей мере один полипептид по изобретению и по меньшей мере один фармацевтически приемлемый носитель, разбавитель, наполнитель и/или адъювант и, необязательно, один или несколько дополнительных фармацевтически активных полипептидов и/или соединений. В неограничивающих примерах такой препарат может быть получен в форме, подходящей для перорального введения, для парентерального введения (например, внутривенной, внутримышечной или подкожной инъекции или внутривенного вливания), для местного введения, для введения путем ингаляции (например, с помощью аэрозольного ингалятора, ингалятора с дозируемым клапаном (MDI) или инсуффлятора (DPI), или путем интраназального введения), в форме кожного пластыря, имплантата, суппозиториев, подъязычных препаратов и т.п. Такие подходящие формы для введения, которые могут быть твердыми, полутвердыми или жидкими в зависимости от способа введения, а также методы и носители, применяемые для получения таких препаратов, известны специалистам и более подробно описаны ниже.
Таким образом, в другом своем аспекте настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, которая содержит по меньшей мере один бипаратопный полипептид по изобретению, предпочтительно по меньшей мере один вариабельный домен одного бипаратопного иммуноглобулина, а более предпочтительно по меньшей мере одно бипаратопное нанотело по изобретению, и по меньшей мере один подходящий носитель, разбавитель или наполнитель (т.е. подходящий для использования в фармацевтике) и, необязательно, одно или несколько других активных веществ.
Как правило, бипаратопные полипептиды по изобретению могут быть получены и введены любым подходящим способом, известным per se, например, описанным в цитируемых выше заявках (в частности, в WO 04/041862, WO 04/041863, WO 04/041865, WO 04/041867 и WO 08/020079), а также в стандартных руководствах, таких как руководство Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed., Mack Publish
- 57 037063 ing Company, USA (1990), Remington, the Science and Practice of Pharmacy, 21th Edition, Lippincott Williams and Wilkins (2005); или в руководстве Handbook of Therapeutic Antibodies (S. Dubel, Ed.), Wiley, Weinheim, 2007 (см., например, стр. 252-255).
Так, например, бипаратопные полипептиды по изобретению могут быть получены и введены любым способом, известным per se и применяемым для получения стандартных антител и фрагментов антител (включая scFv и диатела), а также других фармацевтически активных белков. Такие препараты и методы их получения известны специалистам, и такими препаратами являются препараты, подходящие для парентерального введения (например, для внутривенного, внутрибрюшинного, подкожного, внутримышечного, внутрипросветного, внутриартериального или интратекального введения) или для местного (т.е. чрезкожного или интрадермального) введения.
Препаратами для парентерального введения могут быть, например, стерильные растворы, суспензии, дисперсии или эмульсии, подходящие для вливания или инъекции. Подходящими носителями или разбавителями для таких препаратов являются, например, но не ограничиваются ими, носители или разбавители, упоминаемые на стр. 143 заявки WO 08/020079. При этом предпочтительными являются водные растворы или суспензии.
Бипаратопные полипептиды по изобретению, включая отдельные вариабельные домены бипаратопного иммуноглобулина и бипаратопного нанотела, могут быть также введены методами генотерапии, см., например, патент США № 5399346, который во всей своей полноте вводится в настоящее описание в качестве ссылки. С применением метода доставки посредством генотерапии первичные клетки, трансфицированные геном, кодирующим бипаратопный полипептид по изобретению, могут быть дополнительно трансфицированы тканеспецифическими промоторами для доставки гена в конкретные органы, ткани, трансплантаты, опухоли или клетки, и эти клетки могут быть дополнительно трансфицированы сигнальными и стабилизирующими последовательностями, стимулирующими экспрессию в субклеточном пространстве.
Таким образом, бипаратопные полипептиды, отдельные вариабельные домены иммуноглобулина и нанотела по изобретению могут быть введены системно, например, перорально, в комбинации с фармацевтически приемлемым носителем, таким как инертный разбавитель или хорошо усвояемый пищевой носитель. Они могут быть включены в твердые или мягкие желатиновые капсулы, спрессованы в таблетки или введены пациенту непосредственно с пищей. Для перорального терапевтического введения бипаратопные полипептиды по изобретению могут быть объединены с одним или несколькими наполнителями и использованы в форме таблеток для проглатывания, подщечных таблеток для рассасывания, пастилок, капсул, эликсиров, суспензий, сиропов, облаток и т.п. Такие композиции и препараты должны содержать по меньшей мере 0,1% бипаратопного полипептида, одного вариабельного домена иммуноглобулина или нанотела по изобретению. Их процентное содержание в композициях и препаратах может варьироваться, но обычно оно составляет приблизительно от 2 до 60% по массе указанной единичной дозы. Количество бипаратопного полипептида по изобретению, присутствующего в таких терапевтически приемлемых композициях, должно быть таким, чтобы достигалась его эффективная доза в кровотоке.
Таблетки, пастилки, драже, капсулы и т.п. могут также содержать связующие вещества, наполнители, дезинтегрирующие средства, замасливатели, подсластители или ароматизаторы, например, упоминаемые на стр. 143-144 заявки WO 08/020079. Если формой единичной дозы является капсула, то она может содержать, помимо веществ вышеупомянутого типа, жидкий носитель, такой как растительное масло или полиэтиленгликоль. Различные другие вещества могут присутствовать в виде покрытий или для какой-либо другой физической модификации твердой формы единичной дозы. Например, таблетки, драже или капсулы могут быть покрыты желатином, воском, шеллаком или сахаром и т.п. Сироп или эликсир может содержать бипаратопные нанотела и полипептиды по изобретению, сахарозу или фруктозу в качестве подсластителя, метилпарабены и пропилпарабены в качестве консервантов, а также краситель и отдушку, такую как вишневый или апельсиновый ароматизатор. Очевидно, что любое вещество, используемое для получения любой формы единичной дозы, должно быть фармацевтически приемлемым и, по существу, нетоксичным при его использовании в определенных количествах. Кроме того, бипаратопные нанотела, отдельные вариабельные домены иммуноглобулина и полипептиды по изобретению могут быть введены в препараты и устройства пролонгированного высвобождения.
Препараты и композиции для перорального введения могут также иметь энтеросолюбильное покрытие, позволяющее конструкциям по изобретению сохраняться в желудочной среде и проходить в тонкий кишечник. Как правило, препараты и композиции для перорального введения могут быть соответствующим образом приготовлены для доставки в любую нужную часть желудочно-кишечного тракта. Кроме того, для доставки нужных соединений в желудочно-кишечный тракт могут быть использованы подходящие суппозитории.
Бипаратопные нанотела, отдельные вариабельные домены иммуноглобулина и полипептиды по изобретению могут быть также введены внутривенно или внутрибрюшинно путем вливания или инъекции, как подробно описано на стр. 144 и 145 заявки WO 08/020079.
Для местного введения бипаратопные нанотела, отдельные вариабельные домены иммуноглобулина и полипептиды по изобретению могут быть получены в чистой форме, т.е. если они являются жидко
- 58 037063 стями. Однако, как правило, желательно, чтобы они были нанесены на кожу в виде композиций или препаратов или в комбинации с дерматологически приемлемым носителем, который может быть твердым или жидким, как подробно описано на стр. 145 заявки WO 08/020079.
В общих чертах, концентрация бипаратопных нанотел, отдельных вариабельных доменов иммуноглобулина и полипептидов по изобретению в жидкой композиции, такой как лосьон, составляет приблизительно 0,1-25 мас.%, а предпочтительно приблизительно 0,5-10 мас.%. Их концентрация в полутвердой или в твердой композиции, такой как гель или порошок, составляет приблизительно 0,1-5 мас.%, а предпочтительно, приблизительно 0,5-2,5 мас.%.
Количество бипаратопных нанотел, отдельных вариабельных доменов иммуноглобулина и полипептидов по изобретению, необходимое для их использования в терапии, варьируется в зависимости не только от конкретно выбранного бипаратопного нанотела или полипептида, но также и от способа введения, природы состояния, подвергаемого лечению, от возраста и состояния здоровья пациента и, в конечном счете, от назначения лечащего врача или врача-клинициста. Кроме того, доза этих бипаратопных нанотел и полипептидов по изобретению варьируется в зависимости от типов клеток-мишеней, опухолей, тканей, трансплантатов или органов.
Желаемой дозой обычно является единичная доза или дробные дозы, вводимые через соответствующие интервалы, например два, три, четыре или более раз в день. Такая субъединичная доза может быть также разделена, например, на ряд дискретных доз, вводимых через определенные интервалы, таких как многократные ингаляции с помощью инсуффлятора или закапывания в глаза в виде нескольких капель.
Схема введения доз может включать продолжительное ежедневное введение. Термин продолжительное введение означает введение в течение по меньшей мере двух недель, а предпочтительно несколько недель, месяцев или лет. Необходимые изменения в этой схеме введения могут быть внесены самим специалистом в данной области с помощью лишь рутинного экспериментирования в соответствии с приведенным в настоящем документе описанием. См. руководство Remington's Pharmaceutical Sciences (Martin, E.W., ed. 4), Mack Publishing Co., Easton, PA. В случае каких-либо осложнений доза может быть также скорректирована лечащим врачом.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения заболеваний или состояний, связанных с нарушением передачи CXCR2-сигнала, путем введения эффективного количества полипептида или фармацевтической композиции по изобретению, а предпочтительно отдельных вариабельных доменов бипаратопного иммуноглобулина или бипаратопных нанотел, или композиции, содержащей такие домены или нанотела по изобретению. Как обсуждается в настоящей заявке, передача CXCR2сигнала опосредует воспалительный ответ в легких пациентов, страдающих хронической обструктивной болезнью легких (ХОБЛ), что приводит к деструкции паренхимы легких. Миграция лейкоцитов, число которых в легких пациентов, страдающих ХОБЛ, повышается, опосредуется рецептором CXCR2 на поверхности таких клеток, и этот рецептор CXCR2 связывается с несколькими лигандами, включая IL-8, GRO-α, β, γ, ЕМА 78 и GCP-2. Повышенное число нейтрофилов в легких коррелирует с тяжестью заболевания. Кроме того, концентрация GRO-α заметно увеличивается в индуцированной мокроте и в бронхиальном лаваже (BAL) пациентов с ХОБЛ. В соответствии с этим предполагается, что подавление CXCR2 будет предотвращать, устранять или снижать дистресс-симптомы этого заболевания.
В соответствии с этим настоящее изобретение относится к способам профилактики или лечения ХОБЛ или обострений ХОБЛ, где указанные способы включают введение бипаратопного полипептида, такого как отдельные вариабельные домены бипаратопного иммуноглобулина или бипаратопных нанотел по изобретению, в частности фармацевтических композиций, содержащих такие домены или нанотела. Настоящее изобретение также относится к применению указанного бипаратопного полипептида, включая бипаратопные нанотела и содержащие их композиции, для лечения ХОБЛ и обострений ХОБЛ.
Как будет очевидно для специалиста, бипаратопные полипептиды по изобретению, в частности отдельные вариабельные домены бипаратопного иммуноглобулина или бипаратопных нанотел по изобретению и содержащие их композиции, могут быть также использованы для лечения других заболеваний, которые связаны с нарушением функции передачи CXCR2-сигнала, например других заболеваний дыхательных путей, таких как кистозный фиброз, астма в тяжелой форме, обострение астмы, аллергическая астма, острое поражение легких, острый респираторный дистресс-синдром, идиопатический фиброз легких, ремоделирование дыхательных путей, синдром облитерирующего бронхиолита или бронхопульмонарная дисплазия.
Другими заболеваниями и состояниями, для которых возможна профилактика или лечение с использованием бипаратопных полипептидов по изобретению, например, отдельных вариабельных доменов бипаратопного иммуноглобулина или бипаратопных нанотел и содержащих их фармацевтических композиций, являются атеросклероз, гломерулонефрит, воспалительное заболевание кишечника (болезнь Крона), ангиогенез и заболевания, характеризующиеся образованием новых кровеносных сосудов, включая дегенерацию желтого пятна, диабетическую ретинопатию и диабетическую невропатию, рассеянный склероз, псориаз, возрастную дегенерацию желтого пятна, глазную болезнь Бехчета, увеит, легочную
- 59 037063 артериальную гипертензию (ЛАГ), включая идиопатическую ЛАГ, наследственную ЛАГ и заболевание, связанное с ЛАГ; хронические воспалительные заболевания, ревматоидный артрит, остеоартрит, немелкоклеточную карциному, рак толстой кишки, рак поджелудочной железы, рак пищевода, рак яичника, рак молочной железы, солидные опухоли и их метастазы, меланому, гепатоцеллюлярную карциному или ишемическое реперфузионное повреждение.
Другими заболеваниями и состояниями, для которых возможна профилактика или лечение с использованием бипаратопных полипептидов по изобретению, например, отдельных вариабельных доменов бипаратопного иммуноглобулина или бипаратопных нанотел и содержащих их фармацевтических композиций, являются закупорка сосудов, вызванная гемолитической трансфузией при серповидноклеточной анемии, ишемическое/реперфузионное повреждение, острый инсульт/инфаркт миокарда, закрытая травма головы, посттравматическое воспаление и инсулинорезистентныи диабет.
Для осуществления вышеописанных способов бипаратопные нанотела, отдельные вариабельные домены иммуноглобулина и/или полипептиды по изобретению и/или содержащие их композиции могут быть введены любым подходящим способом в зависимости от конкретно используемого фармацевтического препарата или от конкретно используемой фармацевтической композиции. Таким образом, бипаратопные нанотела и/или полипептиды по изобретению и/или содержащие их композиции могут быть введены, например, перорально, внутрибрюшинно (например, внутривенно, подкожно, внутримышечно или любым другим способом введения в обход желудочно-кишечного тракта), интраназально, трансдермально, местно, с помощью суппозиториев и путем ингаляции в зависимости от конкретно используемых фармацевтических препаратов или композиций. Как правило, для лечения ХОБЛ, ингаляция не является предпочтительной. Врач-клиницист может самостоятельно выбрать подходящий способ введения и подходящие фармацевтические препараты или композиции, используемые для такого введения, в зависимости от индивидуальных особенностей пациента.
Бипаратопные нанотела, отдельные вариабельные домены иммуноглобулина и/или полипептиды по изобретению и/или содержащие их композиции вводят в соответствии со схемой лечения, которая являются наиболее подходящией для профилактики и/или лечения данного заболевания или расстройства. Как правило, врач-клиницист может самостоятельно выбрать подходящую схему лечения в зависимости от таких факторов, как конкретное заболевание или расстройство, которое должно быть подвергнуто лечению, или его профилактика; тяжесть заболевания, подвергаемого лечению, и/или тяжесть его симптомов; конкретно используемые бипаратопные нанотела; отдельные вариабельные домены иммуноглобулина или полипептиды по изобретению; конкретная схема введения, конкретно используемые фармацевтический препарат или фармацевтическая композиция; возраст, пол, масса, режим питания, общее состояние здоровья пациента, а также от других аналогичныхх факторов, хорошо известных врачамклиницистам.
Как правило, для профилактики и/или лечения вышеупомянутых заболеваний и расстройств, в частности ХОБЛ, вводимая доза будет зависеть от активности конкретно используемых бипаратопных нанотел, отдельных вариабельных доменов иммуноглобулина или полипептидов по изобретению, конкретного способа введения или конкретно используемых фармацевтических препаратов или композиций. Как правило, вводимая доза составляет от 1 г до 0,01 мкг на 1 кг массы тела в день, предпочтительно от 0,1 г до 0,1 мкг на 1 кг массы тела в день, а именно приблизительно 1, 10, 100 или 1000 мкг на 1 кг массы тела в день и может быть введена либо непрерывно (например, путем вливания), либо в виде одной суточной дозы или нескольких дробных доз в течение суток. Как правило, врач-клиницист может самостоятельно определить подходящую суточную дозу в зависимости от упомянутых в настоящем документе факторов. Также очевидно, что в конкретных случаях врач-клиницист может выбрать или изменить эти дозы, например, с учетом указанных выше факторов и исходя из результатов экспертной оценки.
Бипаратопные нанотела, отдельные вариабельные домены иммуноглобулина и полипептиды по изобретению могут быть также использованы в комбинации с одним или несколькими фармацевтически активными соединениями или действующими веществами лекарственного средства, т.е. они могут быть введены в соответствии с конкретной комбинированной схемой лечения, которая может давать, а может и не давать синергический эффект. И в этом случае врач-клиницист может самостоятельно выбрать указанные дополнительные соединения или действующие вещества лекарственного средства, а также подходящую комбинированную схему лечения с учетом вышеупомянутых факторов и исходя из результатов экспертной оценки.
Например, бипаратопные полипептиды, такие как бипаратопные нанотела по изобретению, могут быть объединены со стандартными препаратами для лечения ХОБЛ, такими как β-адренергические бронхорасширяющие средства кратковременного и пролонгированного действия, антихолинергические средства (антагонисты мускариновых рецепторов), вводимые путем ингаляции; и кортикостероиды, вводимые путем ингаляции.
Эффективность схемы лечения данного заболевания или расстройства, применяемой в соответствии с настоящим изобретением, может быть определена и/или проанализирована любым способом, известным врачу-клиницисту per se. В каждом отдельном случае врач-клиницист, если это необходимо, может также самостоятельно изменить или модифицировать конкретную схему лечения в целях достижения
- 60 037063 желаемого терапевтического эффекта, а также в целях профилактики, ограничения или снижения нежелательных побочных эффектов и/или в целях достижения соответствующего баланса между желаемым терапевтическим эффектом, с одной стороны, и предотвращением, ограничением или снижением нежелательных побочных эффектов, с другой стороны.
В общих чертах, курс лечения проводят до тех пор, пока не будет достигнут желаемый терапевтический эффект, и/или до тех пор, пока желаемый терапевтический эффект не будет стабильным. И в этом случае такой эффект также может быть определен врачом-клиницистом.
Индивидуумом, подвергамым лечению, может быть любое теплокровное животное, в частности млекопитающее, а более конкретно человек. Как очевидно для специалиста, индивидуумом, подвергаемым лечению, в частности, является пациент, страдающий вышеупомянутыми заболеваниями и расстройствами, или пациент с риском развития таких заболеваний и расстройств.
Настоящее изобретение более подробно описано со ссылками на нижеследующие неограничивающие предпочтительные аспекты, примеры и фигуры.
Все цитируемые в настоящем документе публикации вводятся в настоящее описание в качестве ссылки.
Информация о депонировании.
Шесть депозитов плазмидной ДНК со вставками, кодирующими полипептиды нанотел с оптимизированной последовательностью, представлены в табл. 32 и были депонированы 15 июня 2010 г. в Немецкой коллекции микроорганизмов и клеточных культур (DSMZ, Deutsche SammlUng von Mikroorganismen and Zallkulturem GmbH, Inhoffenstrasse, 7B, D-38124, Braunschweig, Germany by Novartis Pharma AG, Switzerland). Депозиты были сделаны 28 апреля 1997 г. в соответствии с Будапештским договором о Международном признании депонирования микроорганизмов для проведения патентной процедуры и имеют следующие регистрационные номера:
Конструкция дикого типа | Оптимизированная конструкция | Номер (DSM) | депозита |
2В2 | C100CXCR20059 | DSM 23723 | |
97А9 | C100CXCR20061 | DSM 23724 | |
163E3 | C100CXCR20076 | DSM 23725 | |
127D1 | C100CXCR20079 | DSM 23726 | |
163D2 | C100CXCR20086 | DSM 23727 | |
54В12 | C100CXCR20104 | DSM 23728 |
1. Клонирование CXCR2 человека и собакоподобных обезьян.
Таблица 1
CXCR2 человека SEQ ID NO.1 | MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFWIIYALV FLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFL CKWSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLALP VLLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRT LFKAHMGQKHRAMRVIFAWLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRA LDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHT STTL |
Δ1-17 CXCR2 человека SEQ ID NO. 2 | MEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEINKYFWIIYALVFLLSLLGNSLVMLVILYS RVGRSVTDVYL.LNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLCKWSLLKEVNFYSGIL LLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLALPVLLFRRTVYSSNVSPA CYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTLFKAHMGQKHRAMRV IFAWLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDATEILGILHSCLNPLI YAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTSTTL |
CXCR2 собакоподобны> обезьян SEQ ID NO. 3 | MQSFNFEDFWENEDFSNYSYSSDLPPSLPDVAPCRPESLEINKYFWIIYALVFLLSLL GNSLVMLVILHSRVGRSITDVYLLNLAMADLLFALTLPIWAAAKVNGWIFGTFLCKWS LLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLVKFVCLSIWSLSLLLALPVLLFR RTVYLTYISPVCYEDMGNNTAKWRMVLRILPQTFGFILPLLIMLFCYGFTLRTLFKAHM GQKHRAMRVIFAWLIFLLCWLPYHLVLLADTLMRTRLINETCQRRNNIDQALDATEIL GILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILATHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTSTTL |
pcDNA3.1(+) (Invitrogen, V790-20) конструировали для обеспечения высокого уровня конститутивной экспрессии в различных клеточных линиях млекопитающих. Этот плазмидный вектор содержит предранний промотор цитомегаловируса человека, сигнал полиаденилирования бычьего гормона роста (BGH), маркер отбора на резистентность к неомицину для клеток млекопитающих и ген отбора на резистентность к ампициллину в Е. coli.
pVAX1(Invitrogen, V260-20) представляет собой плазмидный вектор, сконструированный для ДНКвакцин. Этот плазмидный вектор содержит предранний промотор цитомегаловируса человека, сигнал полиаденилирования бычьего гормона роста (BGH) и ген отбора на резистентность к канамицину в Е. coli.
- 61 037063
Таблица 2
Конструкции
Рецептор | Вектор | Конструкция |
CXCR2 человека (Nконцевая 3 х НАметка) | pcDNA4/TO | Субклонировали последовательность ДНК, кодирующую три НА-метки, затем последовательность CXCR2 человека, а затем (в скобках) сайты рестриктирующих ферментов Hindlll и Xhol в 5'- и 3'концы, соответственно, в pcDNA4/TO |
N-концевая CCR9химера CXCR2 | pcDNA4/TO | Субклонировали последовательность ДНК, кодирующую три НА-метки, затем первые |
человека (N- концевая 3 х НАметка) | 39 аминокислот для CCR9 человека, сайт протеазы TEV и последовательность CXCR2 человека без N-концевых 43 аминокислот, а затем (в скобках) сайты рестриктирующих ферментов HindiII и Xhol в 5'- и 3'-концы, соответственно, в pcDNA4/TO | |
Δ1-17 CXCR2 человека (Nконцевая 3 х НАметка) | pcDNA4/TO | Субклонировали последовательность ДНК, кодирующую три НА-метки, затем последовательность CXCR2 человека без N-концевых 17 аминокислот, а затем (в скобках) сайты рестриктирующих ферментов Hindlll и Xhol в 5'- и 3'концы, соответственно, в pcDNA4/TO |
CXCR2 человека | рХооп | кДНК CXCR2 человека (чел.СХСИ2) (GENBANK:L.19593) амплифицировали с помощью ПЦР с использованием 5'праймера, содержащего EcoRI-сайт расщепления, и 3'-праймера, содержащего Notl-сайт. ПЦР-продукт лигировали в плазмидный вектор pXOON |
CXCR2 собакоподобных обезьян | pcDNA3.1 | кДНК CXCR2 собакоподобных обезьян амплифицировали из библиотеки кДНК селезенки/тимуса собакоподобных обезьян. Сайты рестриктирующих ферментов Notl и Xhol добавляли с помощью ПЦР и полученный фрагмент клонировали в pcDNA3.1 |
CXCR2 человека | pVAXl | ПЦР (Nhel-Notl) для pXoon_hCXCR2 |
CXCR2 собакоподобных обезьян | pVAXl | Nhel-Xhol от pcDNA3.l_cCXCR2 |
Δ1-17 CXCR2 человека | pVAXl | ПЦР (Hindlll-Xhol) для pcDNA3.1_3χΗΑ- Al-17-hCXCR2 |
Δ1-17 CXCR2 человека (Nконцевая 3 х НАметка) | pcDNA3.1 | Hindlll-Xhol от pCR4Blunt-TOPO_3xHA-Al17-hCXCR2 |
CXCR2 человека | pcDNA3.1 | Nhel-Xhol от pVAXl_hCXCR2 |
2. Получение клеточных линий СНО, CaKi, RBL и HEK293T, экспрессирующих CXCR2 человека и собакоподобных обезьян.
- 62 037063
Таблица 3
Клеточные линии
Хозяин | Трансформация | Рецептор | Вектор |
сно | Стабильная | Δ1-17 CXCR2 человека (N-концевая ЗхНА-метка) | pcDNA3.1 |
НЕК293Т | Кратковременная | CXCR2 собакоподобных обезьян | pcDNA3.1 |
CaKi info ДЛЯ добавления | |||
/ | ДНК-иммунизация | CXCR2 человека | pVAXl |
/ | ДНК-иммунизация | CXCR2 собакоподобных обезьян | pVAXl |
/ | ДНК-иммунизация | Δ1-17 CXCR2 человека | pVAXl |
RBL | Стабильная | кДНК CXCR2 человека | pSFFV-Neo |
RBL-2H3 | Стабильная | кДНК CXCR2 собакоподобных обезьян | pcDNA3.1 |
СНО-Тгех | Стабильная | (НА) 3-huCXCR2 | pcDNA4/TO |
СНО-Тгех | Стабильная | (НА) 3-huCCR9-huCXCR2 | pcDNA4/TO |
СНО-Тгех | Стабильная | (НА) 3-huCXCR2ANl-17 | pcDNA4/TO |
L2071 | Стабильная | CXCR1 человека | pSFFV-Neo |
СЕМ | Эндогенная | CXCR4 | - |
CXCR2 человека Δ1-17 СНО-К1 (N-концевая 3хНА-метка).
Клетки Сно-Κι трансфицировали плазмидой pcDNA3.1_3хНА-Δ1-17-hCXCR2 с использованием системы электропорации Amaxa (программа U 23 в растворе Т). Пул трансфицированных клеток выдерживали под давлением отбора (1000 мкг/мл G418) через два дня после трансфекции. Через восемь дней популяцию, содержащую CXCR2 человека, идентифицировали с использованием FMAT Blue-меченного GRO-α человека. FMAT Blue-мечение GRO-α человека (Biosource, PHC1063) осуществляли с использованием набора с монофункциональным реактивным красителем FMAT Blue в соответствии с инструкциями производителей (Applied Biosystems, 4328408). Отдельные клетки отбирали в 96-луночных планшетах для культивирования клеток с использованием FACSaria (BD Biosciences). Растущие клоны тестировали на экспрессию Δ1-17 CXCR2 человека на устройстве FACSarray (BD Biosciences) с использованием FMAT Blue-меченного GRO-α человека. Были отобраны клоны СНО-К1 с наилучшей экспрессией (величина MCF = 9000).
CXCR2 НЕК293Т собакоподобных обезьян.
Клетки НЕК293Т трансфицировали плазмидой pcDNA3.1_cCXCR2 с использованием трансфицирующего реагента FuGene HD Transfection Reagent (Roche). Через два дня после трансфекции клетки тестировали на экспрессию CXCR2 собакоподобных обезьян (cCXCR2) на устройстве FACSarray (BD Biosciences) с использованием 50 нМ FMAT Blue-меченного GRO-α. Также были использованы клетки с хорошей экспрессией (величина MCF равна приблизительно 12000).
CXCR2 RBL-2H3 собакоподобных обезьян.
Клетки крыс с базофильным лейкозом (RBL-2H3), культивированные при 37°С/5% СО2 и рутинно субкультивированные в MEM-среде Игла (Invitrogen), в которую были добавлены 1 х заменимые аминокислоты, 0,15% бикарбоната натрия, 1 мМ пирувата натрия и 15% фетальной бычьей сыворотки (Invitrogen), подвергали нуклеофекции путем электропорации (Amaxa Biosystems) в соответствии с инструкциями производителей. Трансфицированные клетки инкубировали при 37°С/5% СО2 и через 24 ч после трансфекции проводили отбор на антибиотики путем добавления генетицина до конечной концентрации 1 мг/мл. Трансфицированные клетки культивировали и субкультивировали в течение 3-5 дней в среде для отбора, а затем подвергали моноклеточному сортингу путем серийного разведения в 96-луночных планшетах. Приблизительно через две недели колонии, обнаруживающие активный рост, размножали, а затем анализировали на экспрессию транскрипта CXCR2 собакоподобных обезьян. Позитивные клоны также дополнительно размножали для проведения анализа.
Гибрид СНО-Trex (НА)3-huCXCR2 и (НА)3huCCR9-CXCR2.
Клетки яичника китайского хомячка T-Rex (T-Rex™-CHO, Invitrogen, #R718-07) выдерживали при 37°С в виде монослойных культур в среде Хэмса F12, содержащей 2 мМ L-глутамина, в которую было добавлено 10% фетальной бычьей сыворотки, не содержащей тетрациклина (FBS) (Biosera), 1% пенициллина/стрептомицина и 10 мкг/мг бластицидина. Клеточная линия с регулируемой тетрациклином
- 63 037063 экспрессией (T-Rex™) стабильно экспрессировала тетрациклиновый репрессор (TetR). Затем получали стабильные клеточные линии, экспрессирующие CXCR2-конструкции, в соответствии с процедурой нуклеофекции (набор для нуклеофекции клеточных линий Т, Amaxa Biosystem, программа U-23). Трансфицированные клетки инкубировали при 37°С/5% СО2 и обрабатывали 300 мкг/мл зеоцина через 48 ч после трансфекции. Клетки культивировали в течение двух недель в присутствии зеоцина для отбора на позитивные трансформанты, а затем проводили моноклеточный сортинг на FACS-сортере Mo-Flo. Через две недели колонии, обнаруживающие активный рост, размножали и выдерживали в стандартной среде для их культивирования при концентрации зеоцина 300 мкг/мл.
3. GRO-α человека, GRO-α собакоподобных обезьян, IL-8 человека, ENA-78 человека.
Таблица 4
NVTS-IL-8, ENA-78, GRO-α собакоподобных обезьян
Лиганд | Комментарии | Источник |
Gro-α человека | Рекомбинантный | Biosource (РНС1063) |
IL-8 человека | Рекомбинантный | Novartis Vienna |
ENA-78 человека | Рекомбинантный | Peprotech ltd (300-22) |
Gro-α собакоподобных обезьян | Рекомбинантный | ALMAG Sciences |
4. Пептиды.
Пептиды, представляющие собой различные N-концевые фрагменты и фрагменты внеклеточной петли (EL) CXCR2 человека и собакоподобных обезьян, были закуплены у Bachem (табл. 5). В пептидах, называемых циклическими, первая и последняя аминокислоты были заменены цистеиновым остатком, а природные внутренние цистеины в последовательности дикого типа были заменены лейциновым остатком. Эти пептиды были подвергнуты реакции циклизации под действием фланкирующих цистеиновых остатков.
Таблица 5
Название | Последовательность | Модификация |
1-14 собакоподобных | MQSFNFEDFWENED SEQ ID NO: 4 | С-конец, конъюгированный с |
обезьян | биотином | |
Циклический EL3 собакоподобных обезьян | CTLMRTRLINETLQRRNC SEQ ID NO:5 | N-конец, конъюгированный с биотином или с KLN |
Циклический EL2 собакоподобных обезьян | CRRTVYLTYISPVLYEDMGNNTALWC SEQ ID NO:6 | N-конец, конъюгированный с биотином или с KLN |
1-19 человека | MEDFNMESDSFEDFWKGED SEQ ID NO:7 | С-конец, конъюгированный с биотином |
18-48 человека | EDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESLEI SEQ ID NO :8 | С-конец, конъюгированный с биотином |
EL2 человека | FRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWR SEQ ID NO:9 | N-конец, конъюгированный с биотином или с KLN |
Циклический EL2 человека | CRRTVYSSNVSPALYEDMGNNTANWC SEQ ID NO:10 | N-конец, конъюгированный с биотином или с KLN |
EL3 человека | DTLMRTQVIQETCERRNH SEQ ID NO:11 | N-конец, конъюгированный с биотином или с KLN |
Циклический EL3 человека | CTLMRTQVIQETLERRNC SEQ ID NO:12 | N-конец, конъюгированный с биотином или с KLN |
- 64 037063
5. Иммунизация.
Три ламы были иммунизированы 7-9 раз клетками млекопитающих, экспрессирующими CXCR2 человека, а одна лама была иммунизирована 6 раз клетками млекопитающих, экспрессирующими CXCR2 собакоподобных обезьян. Такая схема иммунизации включала четыре введения коктейля из конъюгата пептид-гемоцианин лимфы улитки (KLH), смешанного с (не)полным адъювантом Фрейнда; пептидов, представляющих собой внеклеточные петли CXCR2 человека и собакоподобных обезьян №№ 2 и 3 (см. табл. 5). Восемь других лам были иммунизированы 4-5 раз ДНК, кодирующей человеческий полноразмерный CXCR2 или Δ1-17 CXCR2, экспрессированный из pVAX1 с последующим одним введением клеток млекопитающих, экспрессирующих человеческий полноразмерный CXCR2. Три других ламы были иммунизированы 4 раза ДНК, кодирующей CXCR2 собакоподобных обезьян, экспрессированный из pVAX1, с последующим одним введением клеток млекопитающих, экспрессирующих CXCR2 собакоподобных обезьян. Через четыре и восемь дней после введения каждого антигена брали пробы иммунной крови и образцы лимфоузлов.
6. Конструирование библиотеки.
Образцы кДНК получали из всех РНК-препаратов иммунной крови и образцов лимфоузлов. Нуклеотидные последовательности, кодирующие нанотела, были амплифицированы из образцов кДНК, взятых у всех лам, иммунизированных CXCR2 человека или собакоподобных обезьян, путем проведения одностадийной ОТ-ПЦР-реакции с использованием праймеров ABL051, ABL052 и ABL003. Последовательности праймеров представлены в табл. 6. 700 п.н.-ампликоны, амплифицированные из кДНК IgG2 и IgG3 в образце, выделяли из геля, а затем импользовали в качестве матрицы в гнездовой ПЦР-реакции, проводимой с использованием праймера ABL050, содержащего сайт рестриктирующего фермента SfiI, и праймера ABL003. Затем ПЦР-продукты гидролизовали ферментами SfiI и BstEII (обычно присутствующими в FR4 генов VHH) И лигировали в соответствующие рестрикционные сайты фагмидного вектора рАХ50 с получением библиотеки после электропорации в TG-1 Escherichia coli. рАХ50 представляет собой вектор экспрессии, полученный из pUC119, содержащей промотор LacZ, последовательность, кодирующую белок фаговых ворсинок Е. coli, ген резистентности к ампициллину или карбенициллину, сайт множественного клонирования и лидерную последовательность gen3. Последовательность, кодирующая нанотело®, и вектор, кодирующий С-концевую c-myc-метку и (His)6-метку, находятся в одной рамке считывания. Фагмидный вектор позволяет продуцировать фаговые частицы, экспрессирующие отдельные нанотела в виде слитого белка с продуктом geneIII.
Таблица 6
Последовательности праймеров
ABL051 | GGCTGAGCTGGGTGGTCCTGG | SEQ ID NO. 13 |
ABL052 | GGCTGAGTTTGGTGGTCCTGG | SEQ ID NO. 14 |
ABL003 | GGTACGTGCTGTTGAACTGTTCC | SEQ ID NO. 15 |
ABL050 | CATTTGAGTTGGCCTAGCCGGCCATGGCAGAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGG SEQ ID NO. 16 | |
M13Fwd | TGTAAAACGACGGCCAGT | SEQ ID NO. 17 |
M13Rev | CAGGAAACAGCTATGACC | SEQ ID NO. 18 |
Rev_30GlySer | TCAGTAACCTGGATCCCCCGCCACCGCTGCCTCCACCGCCGCTACCCCCGCCACCG CTGCCTCCACCGCCTGAGGAGACGGTGACCTG SEQ ID NO. 19 | |
For_GlySer35 | AGGTTACTGAGGATCCGGCGGTGGAGGCAGCGGAGGTGGGGGCTCTGGTGGCGG GGGTAGCGAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGG SEQ ID NO. 20 | |
Fwd-EVQL-Mfel | GAGGTGCAATTGGTGGAGTCTGGG | SEQ ID NO. 21 |
Rev-TVSSBstEII | TGAGGAGACGGTGACCTGGGTCCC | SEQ ID NO. 22 |
Fwd-EVQLBamHI | TCTTGGATCCGAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGG | SEQ ID NO. 23 |
Rev-TVSSBspEI | ACCGCCTCCGGAGGAGACCGTGACCTGGGTCCC | SEQ ID NO. 24 |
7. Отбор.
Вышеупомянутые рАХ50-библиотеки нанотел, экспрессированные на поверхности бактериофагов, отбирали с использованием пептидов, мембранных экстрактов и целых клеток, презентирующих эпитопы CXCR2.
Отбор с использованием пептидов заключался в инкубировании фаговых библиотек на 0-1000 нМ биотинилированных пептидов (см. табл. 5), иммобилизованных на покрытых нейтравидином (Pierce, 31000) микротитрационных планшетах Maxisorp (Nunc, 430341). Альтернативно, фаговые библиотеки инкубировали в растворе с 10 нМ биотинилированного пептида, а затем иммобилизовали на комплексах пептид-фаг на сферах Dynabeads, покрытых стрептавидином (Invitrogen, 112-06D). Блокирование осуществляли с использованием PBS, в который был добавлен 1% казеин. Затем добавляли фаги, полученные из библиотек, и инкубировали в течение 1 ч (в PBS, в который были добавлены 0,1% казеин и 0,1% Твин-20). Несвязанные фаги отмывали (PBS, в который был добавлен 0,05% Твин-20), а связанный фаг
- 65 037063 элюировали добавлением трипсина (1 мг/мл в PBS) в течение 15 мин. Последующие раунды отбора проводили, в основном, как описано выше.
Отбор с использованием мембранных экстрактов осуществляли путем покрытия пробирок для иммуноанализа (Nunc, 444474) 50 мкг/мл мембранных экстрактов (общего белка), полученных из клеток, экспрессирующих CXCR2 человека (Perkin Elmer, ES-145-M400UA и 6110524400UA). Покрытие мембранными экстрактами, полученными из клеток СНО, экспрессирующих FPR1 человека (Perkin Elmer, 6110527400UA), и используемыми в качестве отрицательного контроля, проводили одновременно. Блокирование осуществляли с использованием PBS, в который было добавлено 4% сухое сепарированное молоко Marvel. Фаги инкубировали в течение 2 ч (в PBS, в который было добавлено 1% сепарированное сухое молоко Marvel). Несвязанные фаги отмывали PBS, a связанные фаги элюировали добавлением трипсина (1 мг/мл в PBS) в течение 15 мин. Последующие раунды отбора осуществляли, в основном, как описано выше. В некоторых случаях фаги, связывающиеся с нерелевантными эпитопами клеточного фона, подвергали специфическому истощению путем предварительной абсорбции фага в дополнительных пробирках или лунках, покрытых контрольными мембранными экстрактами. Затем проводили инкубирование в лунках, содержащих CXCR2 человека и покрытых мембранными экстрактами, в присутствии контрольного мембранного экстракта в растворе. В других экспериментах после проведения одного или двух раундов отбора на пептидах осуществляли еще один раунд отбора на мембранных экстрактах или наоборот.
В другой серии экспериментов 1-5 млн клеток млекопитающих, экспрессирующих CXCR2 человека или собакоподобных обезьян, инкубировали с фаговыми библиотеками в PBS, в который были добавлены 10% FBS и 1% сухое сепарированное молоко Marvel. Нетрансформированные клеточные линии использовали в качестве негативного контроля. Несвязанные фаги отмывали PBS, а связанный фаг элюировали добавлением трипсина (1 мг/мл в PBS) в течение 15 мин. Последующие раунды проводили, в основном, как описано выше, за исключением того, что в отличие от первого раунда в этих раундах использовали другую фоновую клеточную линию.
В других экспериментах фаги инкубировали с мембранными экстрактами или с клетками млекопитающих, экспрессирующих CXCR2, в присутствии 1 мкМ пептидов (см. табл. 5) в растворе, для уменьшения числа фагов, экспрессирующих нанотела, связывающиеся с областями, представленными этими пептидами.
8. Получение периплазматических экстрактов.
Клетки TG-1, находящиеся на стадии экспоненциального роста, инфицировали элюированными фагами, а затем эти клетки высевали на планшеты с агаром LB, содержащим карбенициллин. Клоны, резистентные к карбенициллину, анализировали на присутствие вставки и подтверждали последовательности позитивных клонов. Представляющие интерес клоны культивировали в среде ТВ, в которую был добавлен карбенициллин, и индуцировали путем добавления IPTG для инициации экспрессии. Такую экспрессию поддерживали в течение 4 ч при 37°С, а затем клетки центрифугировали. Осадок ночных замороженных клеток, полученный из экспрессионных культур Е. coli, растворяли в PBS (1/10 объема исходной культуры) и инкубировали при 4°С в течение 1 ч при осторожном встряхивании. Затем клетки центрифугировали еще один раз, и супернатант, содержащий белки, секретированные в периплазматическое пространство, оставляли на хранение.
9. Скрининг.
Периплазматические экстракты (описанные выше) подвергали FACS-анализу на конкурирование с GRO-α за связывание с CXCR2 человека. 2x105 клеток инкубировали с 1/2 разведением периплазматических экстрактов в FACS-буфере (PBS+10% фетальная бычья сыворотка (Sigma, F7524) ) в течение 30 мин при 4°С. Затем добавляли равный объем 6 нМ FMAT Blue-меченного GRO-α человека в FACS-буфере и инкубирование продолжали еще 30 мин при 4°С в темноте. Затем клетки три раза промывали в FACSбуфере и, наконец, ресуспендировали в FACS-буфере. Погибшие клетки окрашивали иодидом пропидия (Sigma, P4170). Затем образцы анализировали на устройстве FACSarray (BD Biosciences). В табл. 7 представлен список нанотел, перизматические экстракты которых конкурируют с GRO-α за связывание с CXCR2 человека.
- 66 037063
Таблица 7
Конкурирование с GRO-α за связывание с CXCR2 человека (периплазматические экстракты)
В другой серии экспериментов периплазматические экстракты анализировали на связывание с пептидом человека из 1-19 аминокислотных остатков с помощью ELISA. Планшеты MaxiSorb (Nunc, 430341) покрывали в течение 2 ч нейтравидином, а затем блокировали в течение 1 ч (PBS, 1% казеином). Затем в эти планшеты в течение 1 ч добавляли 100 нМ биотинилированного пептида 1-19 человека (PBS, 0,1% казеин, 0,05% Твин-20), после чего проводили инкубирование в течение 1 ч с 10-кратными разведениями периплазматических экстрактов. Несвязанные периплазматические экстракты отмывали (PBS, в который был добавлен 0,05% Твин-20), а связанные нанотела детектировали с использованием мышиного анти-myc-антитела (Roche, 11667149001), а затем ПХ-конъюгированного кроличьего антимышиного антитела (Dakocytomation, P02 60). В табл. 8 систематизированы отношения сигнала связывания антиCXCR2 нанотел к сигналу нерелевантного контрольного нанотела.
Таблица 8
Связывание периплазматических экстрактов с пептидом 1-19 CXCR2 человека
- 67 037063
10. Последовательности.
Таблица 9
Последовательности одновалентных aHmu-CXCR2 нанотел
143В0 3 | SEQ ID NO. 25 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSTYWMYWVRQAPGKGLDWVSAIN AGGDSTYyadpvkgrftisrdnnkntlylqmnslkpedtalyycatvrgtar DLDYWGQGTQVTVS S |
139D0 5 | SEQ ID NO. 26 | EVKLVESGGGLVQAGGSLRLSCALSGRIGSINAMGWYRQVSGQQR ELVAVSRSGGSTDIADSVKGRFTISRDNGKNTVYLQMDSLKPEDTAV YYCYAHTSSYSNWRVYNNDYWGQGTQVTVSS |
146 АО 6 | SEQ ID NO. 27 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLTCAASGRIGTINAMGWYRQAPGKQR ELVAVITSGGRIDYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVY YYNVETWGAVYWGQGTQVTVSS |
147 АО 1 | SEQ ID NO. 28 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRMGNINAMGWYRQAPGKER ELVAKITRGGAITYADSVKGRFTIARDNILNTAYLQMNDLKPEDTAVYY YNVDGGPSQN YWGQGTQVTVSS |
145С0 9 | SEQ ID NO. 29 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGFTFDDYAIGWFRQAPGKERE RVSCISGSDGSTYYADSVKGRFTISSDNAKNTVYLQMNNLKPEDTAV YYCAAYWG LTLR LWMPPHRYD YWGQGTQVTVSS |
145D0 3 | SEQ ID NO. 30 | EVQLVESGGGLVQ AGGSLSLSCAASG LI FRLSGM AWYRQ APGRQR EWVAVLTKDGTLHYADPVKGRFTISRNNAENTWYLQMNSLKPEDTAI YYCNTGRYWGQGTQVTVSS |
144D0 1 | SEQ ID NO. 31 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGTIGTIRAMGWYRQAPGKQRE LVALITSTGRINYADSVKGRFTIGRDNAKNTAYLQMNNLKPEDTAVYY YNIETLRRNYWGQGTQVTVSS |
139Н02 | SEQ ID NO. 32 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSNYAMGWFRQATGKEREFVAAI NKSGGNTHYAGSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPRDTAVYYCAASRTN PKPDYWGQGTQVTVSS |
139А08 | SEQ ID NO. 33 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRSFSRSAMGWLRQAPGKEREFVAG ISWGGDNSYYADSVKGRFTISRDNAKNTVSLQMNSLKPQDTAVYYCAARYR GGAAVAGWEYWGQGTQVTVSS |
137А08 | SEQ ID NO. 34 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSTLAYYTVGWFRRAPGKEREG1SCIS SSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAADRRTD CKKGRVGSGSWGQGTQVTVSS |
143А05 | SEQ ID NO. 35 | KVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRAFNYYVMAWFRQAQGKEREFVAAI STRGSMTKYSDSVQGRFTISRDNAKNTVYLHMNSLKPEDTAVYYCAADPRG SSWSFSSG GYDYWGQGTQVTVSS |
137В07 | SEQ ID NO. 36 | EVQLVESGGGLVQPGGSVRLSCVASGIIFRLSALGWTRQGPGKAREWVAGI NSDGTTNYADPVKGRFTISRDNAKNTIYLHMDMLKPEDTAVYYCASGKYRGQ GTQVTVSS |
127D01 | SEQ ID NO. 37 | EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSTFDFKVMGWYRQPPGKQREGVAA IRLSGNMHYAESVKGRFTISKANAKNTVYLQMNSLRPEDTAVYYCKVNIRGQ D YWGQGTQVTVSS |
126В11 | SEQ ID NO. 38 | EVQLVESGGGLVQAGGSLTLSCAVSGSSFRINTMGWYRRAPGKQRELVAAR DRGGYINYVDSVKGRFTVSRDNAKPTMYLQMNSLKPEDTAVYYCHAGTQDR TGRNFDHWGQGTQVTVSS |
097А09 | SEQ ID NO. 39 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGSIVRINTMGWYRQTPGKQRELVADIT SGGNINYIDAVKGRFTISRDNTKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCNAEIWLVGV WTQRARTGN YWGQGTQVTVSS |
159В10 | SEQ ID NO. 40 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSSLSMGWFRQAPGKERAFVAA LTRNGGYRYYADSVKGRFTISRDVAKKTLYLQMNSLKPEDTAVYYCAADSLS GSDYLGTN LD YWGQGTQVTVSS |
163D02 | SEQ ID NO. | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSDYAMGWFRQAPGKEREFVAAI |
41 | TWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVYYCAADKDR RTDYLGHPVAYWGQGTQVTVSS | |
163Е03 | SEQ ID NO. 42 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGRIFSSNAMGWFRQAPGKEREFVAAI TWRSGGSAYYADSAKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAGGS SWLSFPPDYWGQGTQVTVSS |
2В2 | SEQ ID NO .43 | EVQLVESGGELVQPGGSLRLSCAASGSILTINAMGWYRQAPGKQRELWRR TRGGSTTYQDSVKGRFTISADIAKKTMYLQMNSLKPEDTAVYYCMLDDRGGV YWGQGTQVTVSS |
54В12 | SEQ ID NO. 90 | EVQLVESGGGLVQAGGSLTLSCAVSGSTFRINTMGWYRRAPGKQRELVAAR DRGGYINYVDSVKGRFTVSRDNAKPTMYLQMNSLKPEDTAVYYCHAGTQDR TGRNFDRWGQGTQVTVSS |
Примеры характеризации одновалентных нанотел
11. Конструирование одновалентных нанотел.
Нанотела, содержащие ДНК-фрагменты, полученные с помощью ПЦР на функциональных фагмидных клонах с использованием праймеров Fwd-EVQL-MfeI и Rev-TVSS-BstEII (табл. 1), гидролизовали ферментами MfeI и BstEII, лигировали в вектор pAX100 и трансформировали в компетентные клетки
- 68 037063
TG-1 Е. coli. pAX100 представляет собой вектор экспрессии, происходящий от плазмиды pUC119, содержащей промотор LacZ, ген резистентности к канамицину, сайт множественного клонирования и лидерную последовательность OmpA. Кодирующая последовательность нанотела и вектор, кодирующий Сконцевую c-myc-метку и His6-метку, находятся в одной рамке считывания. Клоны, резистентные к канамицину, анализировали на присутствие вставки, а затем подтверждали последовательности позитивных клонов.
12. Экспрессия в лабораторном масштабе.
Клетки TG-1, содержащие векторы экспрессии, кодирующие представляющие интерес нанотела, культивировали в шейкерных колбах с перегородкой, содержащих среду ТВ плюс 100 мкг/мл канамицина, и индуцировали добавлением 1 мМ IPTG для экспрессии. Экспрессию осуществляли в течение 4 ч при 37°С. После сбора клеток получали периплазматические экстракты и His6-меченные нанотела очищали с помощью аффинной хроматографии на колонке с иммобилизованным металлом (HisTrap FF Crude, GE Healthcare), а затем обессоливали (HiPrep 26/10, GE Healthcare) или подвергали гельфильтрации (Superdex 75 HR16/10, GE Healthcare) в PBS.
13. Анализ на лигандное конкурирование.
Очищенные одновалентные анти-CXCR2 нанотела титровали против 3 нМ FMAT-Blue-меченного GRO-α в FACS-анализе на лигандное конкурирование CXCR2 человека и CXCR2 собакоподобных обезьян (табл. 10). Для CXCR2 человека блокирующая активность составляет в интервалах между удвоенными нМ-величинами и суб-нМ-величинами, а для CXCR2 собакоподобных обезьян эта активность составляет в интервалах между величиной нМ и удвоенной величиной нМ.
Таблица 10
Активность в конкурировании одновалентных анти-CXCR2 нанотел с лигандами
CXCR2 человека | CXCR2 собакоподобных обезьян | |||
IC50 (М) | % ингибирования (макс.) | IC50 (М) | % ингибирования (макс.) | |
137В7 | 1,11Е-09 | 93,5 | NA | NA |
163D2 | 6,95Е-09 | 96, 4 | 1,48Е-08 | 91,0 |
127D1 | 3,09Е-10 | 61, 1 | 4,41Е-09 | 82,6 |
97А9 | 1,72Е-08 | 93, 9 | 6,41Е-08 | 53,0 |
163E3 | 8,96Е-09 | 92,4 | 1,48Е-08 | 83,5 |
54В12 | 8,57Е-10 | 35,0 | 3,95Е-08 | 63,0 |
2В2 | 2,07Е-09 | 42,7 | 3,16Е-08 | 64,0 |
NA: активность на могла быть измерена
14. Функциональные анализы с использованием рекомбинантных клеточных линий.
(1) Оценка индуцированного агонистом высвобождения внутриклеточного калвция (FLIPR).
Эритроциты (RBL), экспрессирующие рецептор CXCR2 человека или рецептор CXCR2 собакоподобных обезьян, высевали в 96-луночные планшеты и инкубировали в течение ночи при 37°С. В день проведения эксперимента в клетки вводили краситель Fluo-4 и оставляли на 30 мин при 37°С, а затем подвергали 30-минутному инкубированию с очищенными одновалентными анти-CXCR2 нанотелами. И наконец добавляли GRO-α на планшет-ридере для флуориметрической визуализации (FLIPR), а затем детектировали флуоресцентный сигнал, соответствующий высвобождению внутриклеточного кальция. Анализ на селективность осуществляли с использованием клеток L2071, экспрессирующих CXCR1 человека. Протокол анализа для CXCR1 был аналогичен протоколу анализа для CXCR2, за исключением того, что в анализе CXCR1 в качестве агониста использовали IL-8. Сумма средних значений IC50 представлена в табл. 11, при этом следует отметить, что ни одно из тестируемых нанотел не обнаруживало какого-либо ингибирования индуцированного агонистом высвобождения внутриклеточного кальция при тестируемых концентрациях рецептора CXCR1 (максимальная концентрация 1 мкМ).
(2) Оценка стимулированной агонистом аккумуляции [35S]GTPyS.
Очищенные одновалентные анти-CXCR2 нанотела инкубировали в течение 60 мин с GRO-α, GDP, SPA-сферами и с СНО-СХС2-мембранами, выделенными из клеток СНО, экспрессирующих рецептор CXCR2 человека, в 96-луночном планшете. Затем добавляли [36S]GTPyS и инкубировали еще 60 мин. И, наконец, планшет центрифугировали, а затем считывали на Topcount. Сумма средних значений IC50 указана в табл. 11.
- 69 037063
Таблица 11
Величины IC50 для очищенных одновалентных анти-СХСР2 нанотел® в функциональных анализах, проводимых с использованием рекомбинантных клеточных линий
FLIPR | [3SS]GTPyS | |||||
CXCR2 человека | CXCR2 собакоподобных обезья! | । CXCR2 человека | ||||
ICso (М) | % ингибирования (макс.) | |СИ (М) | % ингибирования (макс.) | IC50 (М) | % ингибирования (макс.) | |
137В7 | 6.71 Е-9 | 100 | NA | - | ND | - |
163D2 | 1.91Е-9 | 100 | 3.72 Е-8 | 100 | 5.32Е-8 | 100 |
127D1 | 2.19Е-8 | 100 | 7.53Е-7 | 100* | 1.25Е-8 | 66.0 |
97А9 | 3.99Е-8 | 100 | 6.40Е-7 | 100 | 5.03Е-8 | 100 |
163E3 | 4.43Е-8 | 100 | 1.58Е-7 | 100 | 6.47Е-8 | 100 |
54В12 | 1.53Е-7 | 100 | 4.08Е-6 | 100* | 1.54 Е-8 | 71.8 |
2В2 | 4.41 е-7 | 100 | 3.85Е-6 | 100* | 1.03 Е-7 | 71.3 |
*Кривые были ограничены 100% ингибированием, поскольку при тестрирумых концентрациях плато не наблюдалось.
NA: активность на могла быть измерена. ND - не измеряли.
15. Функциональные анализы с использованием первичных нейтрофилов.
(1) Анализ на изменение формы нейтрофилов цельной крови человека (hWBSC).
Донорами были здоровые добровольцы, которые не подвергались системной терапии (группа доноров, Novartis Horsham). Цельную кровь, которую обрабатывали антикоагулянтом, а именно 52 мМ EDTA (стерильным), собирали в отношении 1 мл EDTA:9 мл крови. Кровь брали при комнатной температуре и перед использованием предварительно нагревали до 37°С. 80 мкл цельной крови перед стимуляцией хемокином предварительно инкубировали с анти-CXCR2 нанотелами в течение 10 мин при комнатной температуре (10 точек на дозовый ответ (0,03-1,144x10’7 мкМ); при этом во все лунки добавляли 10 мкл rhGROa (приблизительная концентрация ЕС70 составляла 2 нМ), за исключением лунки с соединением ноль, в которую добавляли 10 мкл буфера для анализа на изменение формы клеток. Образцы осторожно встряхивали и инкубировали еще 5 мин при 37°С. Затем пробирки помещали на лед и добавляли 250 мкл охлажденного льдом и оптимизированного раствора CellFix™, после чего пробирки осторожно встряхивали и инкубировали еще 5 мин, а затем во все пробирки добавляли 1,4 мл 1X раствора хлорида аммония для лизиса и эти пробирки оставляли на льду еще на 20 мин. После лизиса эритроцитов образцы анализировали на проточном цитометре FACSCalibur (Becton Dickinson). Популяции клеток были идентифицированы по дискриминационному окну прямого рассеяния/бокового рассеяния (FSC/SSC), а затем строили графики для FSC/FL-2 по данным флуоресцентного возбуждения для гранулоцитов, представленным на первом графике. На графике FL-2 нейтрофилы были дифференцированы от эозинофилов, поскольку эозинофилы имеют более высокий уровень аутофлуоресценции. Было подсчитано 5000 сигналов на образец.
(2) Анализ на хемотаксис нейтрофилов человека.
Донорами были здоровые добровольцы, которые не подвергались системной терапии (группа доноров, Novartis Horsham). Цельную кровь, которую обрабатывали антикоагулянтом, а именно 52 мМ EDTA (стерильным), собирали в отношении 1 мл EDTA:9 мл крови. Лейкоциты выделяли в соответствии со стандартными протоколами: к 20 мл крови, обработанной антикоагулянтами, добавляли 4% декстран, осторожно смешивали, а затем инкубировали на льду в течение 30 мин для осаждения эритроцитов. Затем супернатант-содержащие мононуклеарные клетки периферической крови (МКПК) наносили слоем на Фиколл-Пак® в градиенте плотности и центрифугировали при 300xg в течение 25 мин при 18°С. МКПК-богатую фракцию ресуспендировали в 500 мкл 1x PBS, и осуществляли лизис эритроцитов с использованием белков гипотонического шока. К осадку добавляли 20 мл охлажденной льдом стерильной дистиллированной воды, не содержащей эндотоксинов, и смесь оставляли для лизиса на 30-40 с, после чего добавляли 20 мл 2x PBS. Образец осторожно смешивали и центрифугировали при 300xg в течение 10 мин при 18°С с получением гранулоцитов. Гранулоцитарный осадок ресуспендировали в 500 мкл 1х PBS и два раза промывали 50 мл 1x PBS. Затем гранулоцитарный осадок ресуспендировали в среде RPMI 1640, рН 7,4, плюс 2,5% FBS, подсчитывали и разводили до конечной концентрации 2е6/мл. Миграцию оценивали на планшетах Transwell, содержащих 3 мкм РЕТ-мембран от Becton Dickinson. Вкратце, перед помещением мембраны для многолучночного планшета в нижнее положение на дно лунок планшета (1000 мкл/лунку) добавляли 6 нМ GRO-α (ЕС80-ЕС100), а затем на эту мембрану добавляли МКПК (500 мкл/лунку), которые были предварительно инкубированы с различными концентрациями нанотела (0,131000 нМ для одновалентных нанотел или 0,6 пМ-30 нМ для бипаратопных нанотел) в течение 30 мин при
- 70 037063 комнатной температуре. Затем планшеты инкубировали при 37°С в течение 90 мин и клетки, которые мигрировали на дно камеры для хемотаксиса, подсчитывали на проточном цитометре FACSCalibur. Проточный цитометр был установлен на число сигналов в дискриминационном окне R2, исходя из графика FSC/FL-2, за установленное время 20 с на образец.
(3) Анализ на изменение формы нейтрофилов цельной крови собакоподобных обезьян (CynoWBSC).
Венозную кровь, взятую либо из предплечья, либо из нижней конечности, обрабатывали антикоагулянтом 3,8% цитрата натрия (стерильного) в отношении 1 мл цитрата натрия : 9 мл крови. Кровь брали при комнатной температуре и перед использованием предварительно нагревали до 37°С. 80 мкл цельной крови перед стимуляцией хемокином предварительно инкубировали с анти-CXCR2 нанотелами в течение 10 мин при комнатной температуре (10 точек на дозовый ответ (0, 03-1, 144х10-7 мкМ); при этом во все лунки добавляли 10 мкл rhGROa (приблизительная концентрация ЕС70-90 составляла 30 нМ), за исключением лунок с соединением ноль, в которые добавляли 10 мкл буфера для анализа на изменение формы клеток. Образцы осторожно встряхивали и инкубировали еще 5 мин при 37°С. Затем пробирки помещали на лед и добавляли 250 мкл охлажденного льдом и оптимизированного раствора CellFix™, после чего пробирки осторожно встряхивали и инкубировали еще 5 мин, а затем во все пробирки добавляли 2 мл буфера для лизиса (Sigma Aldrich #R7757), эти пробирки оставляли на льду еще на 40-60 мин. После лизиса эритроцитов образцы анализировали на проточном цитометре FACSCaiibur (Becton Dickinson). Популяции клеток были идентифицированы по дискриминационному окну прямого рассеяния/бокового рассеяния (FSC/SSC), а затем строили графики для FSC/FL-2 по данным флуоресцентного возбуждения для гранулоцитов, представленным на первом графике. На графике FL-2 нейтрофилы были дифференцированы от эозинофилов, поскольку эозинофилы имеют более высокий уровень аутофлуоресценции. Было подсчитано 5000 сигналов на образец.
Таблица 12 Величины IC50 для очищенных одновалентных анти-CXCR2 нанотел в функциональных анализах, проводимых с использованием первичных нейтрофилов и rhGROa
WBSC человека 1С50 (нМ) | WBSC собакоподобных обезьян 1С50 (нМ) | Хемотаксис у человека 1С50 (нМ) | |
163D2 | 6,6±3,1 | >100 | |
127D1 | 4,9±2,9 | >100 | 3, 9 |
97А9 | 11,6±5,47 | >100 | 4, 8 |
163E3 | 9,4±6,2 | >100 | 1,3 |
54В12 | 19, 7 | >100 | |
2В2 | 29,5±23,4 | >100 | 50 |
Мультивалентные нанотела.
16. Конструирование двухвалентных нанотел.
Для конструирования двухвалентных нанотел были применены два подхода.
ПЦР-амплификацию проводили на плазмидной ДНК, кодирующей одновалентные структурные блоки. N-концевой структурный блок амплифицировали с использованием Fwd-EVQL-MfeI и обратного праймера, кодирующего часть линкера GlySer, а С-концевой структурный блок амплифицировали с использованием прямого праймера, кодирующего остальную часть линкера GlySer и Rev-TVSS-BstEII (табл. 6). N-концевой фрагмент гидролизовали ферментами MfeI и BamHI, а С-концевой фрагмент гидролизовали ферментами BamHI и BstII, после чего эти фрагменты одновременно лигировали в вектор pAX100 и вводили в компетентные клетки TG-1 E. coli.
Альтернативно, различные ПЦР-амплификации проводили на плазмидной ДНК, кодирующей одновалентные структурные блоки. N-концевой структурный блок амплифицировали с использованием FwdEVQL-MfeI и Rev-TVSS-BspEI, а С-концевой структурный блок амплифицировали с использованием Fwd-EVQL-BamHI и Rev-TVSS-BstEII (табл. 6). N-концевой фрагмент гидролизовали ферментами MfeI и BamHI, а С-концевой фрагмент гидролизовали ферментами BspEI и BstII. N-концевой фрагмент лигировали (MfeI-BspEI) в pAX100-nроизводное, содержащее последовательность, кодирующую линкер GlySer, и вводили в компетентные клетки TG-1 Е. coli. Затем из смеси для трансформации получали плазмидную ДНК, и полученную ДНК гидролизовали ферментами BspEI и BstEII, после чего С-концевой фрагмент лигировали в вектор pAX100 и вводили в компетентные клетки TG-1 E. coli.
Резистентные к канамицину клоны анализировали на присутствие вставки и подтверждали последовательности позитивных клонов.
- 71 037063
17. Последовательности мультивалентных aHTu-CXCR2 нанотел.
Таблица 13
CXCR2001 1 | 97A9-35GS- 97 А9 SEQ ID NO. 44 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGSIVRINTMGWYRQTPGKQREL VADITSGGNINYIDAVKGRFTISRDNTKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCNA EIWLVGWVTQRARTGNYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSG GGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASG SIVRINTMGWYRQTPGKQRELVADITSGGNINYIDAVKGRFTISRDNTKN TVYLQMNSLKPEDTAVYYCNAEIWLVGVWTQRARTGNYWGQGTQVT VSS |
CXCR2001 2 | 137B7-35GS137В7 SEQ ID NO. 45 | EVQLVESGGGLVQPGGSVRLSCVASGIIFRLSALGWTRQGPGKAREW VAGINSDGTTNYADPVKGRFTISRDNAKNTIYLHMDMLKPEDTAVYYCA SGKYRGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGG SGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSVRLSCVASGIIFRLSALGWTRQGP GKAREWVAGINSDGTTNYADPVKGRFTISRDNAKNTiYLHMDMLKPED TAVYYCASGKYRGQGTQVTVSS |
CXCR2001 3 | 2B2-35GS- 97A9 SEQ ID NO. 46 | EVQLVESGGELVQPGGSLRLSCAASGSILTINAMGWYRQAPGKQRELV VRRTRGGSTTYQDSVKGRFTISADIAKKTMYLQMNSLKPEDTAVYYCM LDDRGGVYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGSIVRINTMGWY RQTPGKQRELVADITSGGNINYIDAVKGRFTISRDNTKNTVYLQMNSLK PEDTAVYYCNAEIWLVGVWTQRARTGNYWGQGTQVTVSS |
CXCR2001 4 | 97A9-35GS2B2 SEQ ID NO. 47 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGSIVRINTMGWYRQTPGKQREL VADITSGGNINYIDAVKGRFTISRDNTKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCNA EIWLVGVWTQRARTGNYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSG GGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGELVQPGGSLRLSCAASG SILTINAMGWYRQAPGKQRELWRRTRGGSTTYQDSVKGRFTISADIAK KTMYLQMNSLKPEDTAVYYCMLDDRGGVYWGQGTQVTVSS |
CXCR2001 5 | 2B2-35GS137B7 SEQ ID NO. 48 | EVQLVESGGELVQPGGSLRLSCAASGSILTINAMGWYRQAPGKQRELV VRRTRGGSTTYQDSVKGRFTISADIAKKTMYLQMNSLKPEDTAVYYCM LDDRGGVYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSVRLSCVASGIIFRLSALGWT RQGPGKAREWVAGINSDGTTNYADPVKGRFTISRDNAKNTIYLHMDML KPE DTAVYYCASGKYRGQGTQVTVSS |
CXCR2001 6 | 137B7-35GS2B2 SEQ ID NO. 49 | EVQLVESGGGLVQPGGSVRLSCVASGIIFRLSALGWTRQGPGKAREW VAGINSDGTTNYADPVKGRFTISRDNAKNTIYLHMDMLKPEDTAVYYCA SGKYRGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGG SGGGGSEVQLVESGGELVQPGGSLRLSCAASGSILTINAMGWYRQAP GKQRELWRRTRGGSTTYQDSVKGRFTISADIAKKTMYLQMNSLKPED TAVYYCMLDDRGGVYWGQGTQVTVSS |
CXCR2001 7 | 97A9-35GS137B7 SEQ ID NO. 50 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGSIVRINTMGWYRQTPGKQREL VADITSGGNIN Yl D A VKGRFTISRDNTKNTVYLQM NSLKP EDTAVYYCN A EIWLVGVWTQRARTGNYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSG GGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSVRLSCVASGI IFRLSALGWTRQGPGKAREWVAGINSDGTTNYADPVKGRFTISRDNAK NTIYLHMDMLKPEDTAVYYCASGKYRGQGTQVTVSS |
CXCR2001 8 | 137B7-35GS- 97A9 SEQ ID NO. 51 | EVOLVE SGGGLVQPGGSVRLSCVASGIIFRLSALGWTRQGPGKAREW VAGINSDGTTNYADPVKGRFTISRDNAKNTIYLHMDMLKPEDTAVYYCA SGKYRGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGG SGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGSIVRINTMGWYRQTP GKQRELVADITSGGNINYIDAVKGRFTISRDNTKNTVYLQMNSLKPEDTA VYYCNAEIWLVGVWTQRARTGNYWGQGTQVTVSS |
CXCR2001 9 | 2B2-9GS-2B2 SEQ ID NO. 52 | EVQLVESGGELVQPGGSLRLSCAASGSILTINAMGWYRQAPGKQRELV VRRTRGGSTTYQDSVKGRFTISADIAKKTMYLQMNSLKPEDTAVYYCM LDDRGGVYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGSEVQLVESGGELVQPGGS |
- 72 037063
LRLSCAASGSILTINAMGWYRQAPGKQRELWRRTRGGSTTYQDSVKG RFTISADIAKKTMYLQMNSLKPEDTAVYYCMLDDRGGVYWGQGTQVTV SS | ||
CXCR2002 0 | 127D1-35GS- 163D2 SEQ ID NO. 53 | EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSTFDFKVMGWYRQPPGKQRE GVAAIRLSGNMHYAESVKGRFTISKANAKNTVYLQMNSLRPEDTAVYY CKVNIRGQDYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGG GSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSDYAM GWFRQAPGKEREFVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNAKNTMYL QMNSLKPEDTAVYYCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTQVTVSS |
CXCR2002 1 | 127D1-35GS- 163E3 SEQ ID NO. 54 | EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSTFDFKVMGWYRQPPGKQRE GVAAIRLSGNMHYAESVKGRFTISKANAKNTVYLQMNSLRPEDTAVYY CKVNIRGQDYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGG GSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGRIFSSNAM GWFRQAPGKEREFVAAITWRSGGSAYYADSAKGRFTISRDNAKNTVYL QMNSLKPEDTAVYYCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTQVTVSS |
CXCR2002 2 | 163D2-35GS- 163D2 SEQ ID NO. 55 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSDYAMGWFRQAPGKERE FVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVY YCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAAS GRTFSDYAMGWFRQAPGKEREFVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISR DNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVYYCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGT QVTVSS |
CXCR2002 3 | 163D2-35GS- 163E3 SEQ ID NO. 56 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSDYAMGWFRQAPGKERE FVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVY YCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVAS GRIFSSNAMGWFRQAPGKEREFVAAITWRSGGSAYYADSAKGRFTISR DNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTQVTV SS |
CXCR2002 4 | 163E3-35GS163E3 SEQ ID NO. 57 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGRIFSSNAMGWFRQAPGKEREF VAAITWRSGGSAYYADSAKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVY YCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGG GGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGRI FSSNAMGWFRQAPGKEREFVAAITWRSGGSAYYADSAKGRFTISRDN AKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTQVTVSS |
CXCR2002 5 | 163D2-35GS127D1 SEQ ID NO. 58 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSDYAMGWFRQAPGKERE FVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVY YCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAAS GSTFDFKVMGWYRQPPGKQREGVAAIRLSGNMHYAESVKGRFTISKA NAKNTVYLQMNSLRPE DTAVYYCKVNIRGQ DYWGQGTQVTVSS |
CXCR2002 6 | 163E3-35GS- 127D1 SEQ ID NO. 59 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGRIFSSNAMGWFRQAPGKEREF VAAITWRSGGSAYYADSAKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVY YCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGG GGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGST FDFKVMGWYRQPPGKQREGVAAIRLSGNMHYAESVKGRFTISKANAK NTVYLQMNSLRPEDTAVYYCKVNIRGQDYWGQGTQVTVSS |
CXCR2002 7 | 163E3-35GS163D2 SEQ ID NO. 60 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGRIFSSNAMGWFRQAPGKEREF VAAITWRSGGSAYYADSAKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVY YCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGG GGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGR TFSDYAMGWFRQAPGKEREFVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNA KNTMYLQMNSLKPEDTAVYYCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTQVTV SS |
CXCR2002 8 | 97A9-35GS- 54B12 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGSIVRINTMGWYRQTPGKQREL VADITSGGNINYIDAVKGRFTISRDNTKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCNA |
- 73 037063
SEQ ID NO. 61 | EIWLVGVWTQRARTGNYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSG GGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGSLTLSCAVSG STFRINTMGWYRRAPGKQRELVAARDRGGYINYVDSVKGRFTVSRDN AKPTMYLQMNSLKPEDTAVYYCHAGTQDRTGRNFDRWGQGTQVTVS S | |
CXCR2002 9 | 163E3-35GS54В12 SEQ ID NO. 62 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGRIFSSNAMGWFRQAPGKEREF VAAITWRSGGSAYYADSAKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVY YCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGG GGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGSLTLSCAVSGST FRINTMGWYRRAPGKQRELVAARDRGGYINYVDSVKGRFTVSRDNAK PTMYLQMNSLKPEDTAVYYCHAGTQDRTGRNFDRWGQGTQVTVSS |
CXCR2003 0 | 163D2-35GS54B12 SEQ ID NO. 63 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSDYAMGWFRQAPGKERE FVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVY YCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGSLTLSCAVS GSTFRINTMGWYRRAPGKQRELVAARDRGGYINYVDSVKGRFTVSRD NAKPTMYLQMNSLKPEDTAVYYCHAGTQDRTGRNFDRWGQGTQVTV SS |
CXCR2003 1 | 2B2-35GS- 163E3 SEQ ID NO. 64 | EVQLVESGGELVQPGGSLRLSCAASGSILTINAMGWYRQAPGKQRELV VRRTRGGSTTYQDSVKGRFTISADIAKKTMYLQMNSLKPEDTAVYYCM LDDRGGVYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGRIFSSNAMGW FRQAPGKEREFVAAITWRSGGSAYYADSAKGRFTISRDNAKNTVYLQM NSLKPEDTAVYYCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTQVTVSS |
CXCR2003 2 | 2B2-35GS163D2 SEQ ID NO. 65 | EVQLVESGGELVQPGGSLRLSCAASGSILTINAMGWYRQAPGKQRELV VRRTRGGSTTYQDSVKGRFTISADIAKKTMYLQMNSLKPEDTAVYYCM LDDRGGVYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSDYAMG WFRQAPGKEREFVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNAKNTMYLQ MNSLKPEDTAVYYCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTQVTVSS |
CXCR2003 3 | 163E3-35GS* 2B2 SEQ ID NO. 66 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGRIFSSNAMGWFRQAPGKEREF VAAITWRSGGSAYYADSAKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVY YCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGG GGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGELVQPGGSLRLSCAASGSI LTINAMGWYRQAPGKQRELWRRTRGGSTTYQDSVKGRFTISADIAKK TMYLQMNSLKPEDTAVYYCMLDDRGGVYWGQGTQVTVSS |
CXCR2003 4 | 163D2-35GS- 2B2 SEQ ID NO. 67 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSDYAMGWFRQAPGKERE FVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVY YCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGS GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGELVQPGGSLRLSCAAS GSILTINAMGWYRQAPGKQRELWRRTRGGSTTYQDSVKGRFTISADIA KKTMYLQMNSLKPEDTAVYYCMLDDRGGVYWGQGTQVTVSS |
CXCR2003 5 | 54B12-35GS163E3 SEQ ID NO. 68 | EVQLVESGGGLVQAGGSLTLSCAVSGSTFRINTMGWYRRAPGKQREL VAARDRGGYINYVDSVKGRFTVSRDNAKPTMYLQMNSLKPEDTAVYYC HAGTQDRTGRNFDRWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGG SGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGRIFS SNAMGWFRQAPGKEREFVAAITWRSGGSAYYADSAKGRFTISRDNAK NTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTQVTVSS |
CXCR2003 6 | 54B12-35GS163D2 SEQ ID NO. 69 | EVQLVESGGGLVQAGGSLTLSCAVSGSTFRINTMGWYRRAPGKQREL VAARDRGGYINYVDSVKGRFTVSRDNAKPTMYLQMNSLKPEDTAVYYC HAGTQDRTGRNFDRWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGG SGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFS DYAMGWFRQAPGKEREFVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNAKN TMYLQMNSLKPEDTAVYYCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTQVTVSS |
18. Анализ на лигандное конкурирование.
Мультивалентные анти-CXCRC нанотела титровали против 3 нМ FMAT-Blue-меченного GRO-α в FACS-анализе на лигандное конкурирование CXCR2 человека и CXCR2 собакоподобных обезьян (табл. 14). Для CXCR2 человека блокирующая активность составляла в интервалах между удвоенными нМвеличинами и суб-нМ-величинами, а для CXCR2 собакоподобных обезьян эта активность составляла в интервалах между величиной нМ и удвоенной величиной нМ.
- 74 037063
Таблица 14
Анализ на лигандное конкурирование мультивалентных анти-СХСР2 нанотел
CXCR2 человека | CXCR2 собакоподобных обезьян | ||||
IC50 (М) | % ингибирования (макс.) | IC50 (М) | % ингибирования (макс.) | ||
CXCR20011 | 97A9-35GS-97A9 | 3.52Е-08 | 99.0 | 9.74Е-08 | 60.0 |
CXCR20012 | 137B7-35GS-137B7 | 6.06Е-10 | 99.1 | ND | ND |
CXCR20013 | 2B2-35GS-97A9 | 9.00Е-10 | 90.0 | 4.20Е-09 | 98.5 |
CXCR20014 | 97A9-35GS-2B2 | 1.59Е-09 | 99.7 | 3.90Е-09 | 98.5 |
CXCR20015 | 2B2-35GS-137B7 | 7.00Е-10 | 99.0 | 9.90Е-08 | 81.5 |
CXCR20016 | 137B7-35GS-2B2 | 8.00Е-10 | 100.0 | 5.70Е-09 | 88.0 |
CXCR20017 | 97A9-3SGS-137B7 | 3.40Е-09 | 99.0 | 2.95Е-08 | 73.0 |
CXCR20018 | 137B7-35GS-97A9 | 1.90Е-09 | 98.0 | 5.08Е-08 | 47.0 |
CXCR20019 | 2B2-9GS-2B2 | 4.40Е-11 | 50.6 | 18Е-09 | 81.0 |
CXCR20020 | 127D1-35GS-163D2 | 9.90Е-10 | 100.0 | 1.78Е-09 | 98.5 |
CXCR20021 | 127D1-35GS-163E3 | 1.09Е-09 | 99.5 | 1.85Е-09 | 98.5 |
CXCR2Q022 | 163D2-35GS-163D2 | 4.14Е-09 | 100.0 | 8.01 Е-09 | 98.0 |
CXCR20023 | 163D2-35GS-163E3 | 4.28Е-09 | 99.0 | 6.61 Е-09 | 96.0 |
CXCR20024 | 163E3-35GS-163E3 | 5.27Е-09 | 99.0 | 5.32Е-09 | 95.0 |
CXCR20025 | 163D2-35GS-127D1 | 9.00Е-10 | 99.0 | 2.08Е-09 | 98.5 |
CXCR20026 | 163E3-35GS-127D1 | 9.00Е-10 | 99.5 | 1.82Е-09 | 99.0 |
CXCR20027 | 163E3-35GS-163D2 | 4.90Е-09 | 100.0 | 6.42Е-09 | 97.0 |
CXCR20028 | 97A9-35GS-54B12 | 1 63Е-09 | 98.5 | 3.80Е-09 | 96.0 |
CXCR20029 | 163E3-35GS-54B12 | 1.1 ЗЕ-09 | 98.5 | 2.09Е-09 | 98.5 |
CXCR20030 | 163D2-35GS-54B12 | 7.86Е-10 | 99.5 | 1.74Е-09 | 98.5 |
CXCR20031 | 2B2-35GS-163E3 | 4.90Е-10 | 100.0 | 1.98Е-09 | 99.0 |
CXCR20032 | 2B2-35GS-163D2 | 5.00Е-10 | 100.0 | 1.91 Е-09 | 99.0 |
CXCR20033 | 163E3-35GS-2B2 | 6.50Е-10 | 100.0% | 2.20Е-09 | 99.0% |
CXCR20034 | 163D2-35GS-2B2 | 8.00Е-10 | 100.0% | 2.55Е-09 | 99.0% |
CXCR20035 | 54В12-35GS-163E3 | 1.00Е-09 | 99.0% | 3.23Е-09 | 99.0% |
CXCR20036 | 54B12-35GS-163D2 | 7.00Е-10 | 98.0% | 2.27Е-09 | 98.0% |
ND: не определяли.
19. Функциональные анализы с использованием рекомбинантных клеточных линий.
(1) Оценка индуцированного агонистом высвобождения внутриклеточного калвция (FLIPR).
Эритроциты (RBL), экспрессирующие рецептор CXCR2 человека или рецептор CXCR2 собакоподобных обезьян, высевали в 96-луночные планшеты и инкубировали в течение ночи при 37°С. В день проведения эксперимента в клетки вводили краситель Fluo-4 и оставляли на 30 мин при 37°С, а затем подвергали 30-минутному инкубированию с очищенными мультивалентными анти-CXCR2 нанотелами.
И, наконец, осуществляли добавление GRO-α с использованием планшет-ридера для флуориметрической визуализации (FLIPR), а затем детектировали флуоресцентный сигнал, соответствующий высвобождению внутриклеточного кальция. Анализы на селективность осуществляли с использованием клеток
L2071, экспрессирующих CXCR1 человека, и IL-8 в качестве агониста, а также клеток СЕМ, эндогенно экспрессирующих CXCR4 человека, и SDF-1 в качестве агониста, при этом протокол анализа был аналогичен протоколу анализа, описанного для CXCR2. Сумма средних величин IC50 представлена в табл. 15. При этом следует отметить, что ни одно из тестируемых нанотел не обнаруживало какого-либо ингибирования индуцированного агонистом высвобождения внутриклеточного кальция при тестируемых концентрациях CXCR1 или CXCR4 (максимальная концентрация 1 мкМ).
(2) Оценка стимулированной агонистом аккумуляции [19 * * * * * * * * * * * * * * * 35S]GTPyS.
Очищенные мультивалентные анти-CXCR2 нанотела инкубировали в течение 60 мин с агонистом (GRO-α, IL-8 или ENA-78) GDP, SPA-сферами и с СНО-СХС2-мембранами, выделенными из клеток
СНО, экспрессирующих рецептор CXCR2 человека, в 96-луночном планшете. Затем добавляли
[36S]GTPyS и инкубировали еще 60 мин. И, наконец, планшет центрифугировали, а затем считывали на
Topcount. Сумма средних значений IC50 указана в табл. 15.
- 75 037063
Таблица 15
Величины IC50 для очищенных мультивалентных aHTu-CXCR2 нанотел в функциональном анализе, проводимом для оценки высвобождения внутриклеточного кальция с использованием рекомбинантных клеточных линий
CXCR2 человека | CXCR2 собакоподобных обезьян | ||||
|СИ(М) | % ингибирования (макс.) | ic60(M) | % ингибирования (макс.) | ||
CXCR20011 | 97A9-35GS-97A9 | 1. 37Е-7 | 100 | ND | ND |
CXCR20012 | 137B7-35GS-137B7 | ND | ND | ND | ND |
CXCR20013 | 2B2-35GS-97A9 | 2.93Е-9 | 100 | 2.92Е-8 | 100 |
CXCR20014 | 97A9-35GS-2B2 | 6.84Е-9 | 100 | 1.37Е-8 | 100 |
CXCR20015 | 2B2-35GS-137B7 | 2.78Е-9 | 100 | 2.87Е-6 | 100* |
CXCR20016 | 137B7-35GS-2B2 | 2.36Е-9 | 100 | 1.10Е-6 | 100* |
CXCR20017 | 97A9-35GS-137B7 | 2.29е-8 | 100 | 1.08Е-6 | 100* |
CXCR20018 | 137B7-35GS-97A9 | ND | ND | ND | ND |
CXCR20019 | 2B2-9GS-2B2 | ND | ND | ND | ND |
CXCR20020 | 127D1-35GS-163D2 | 6.98Е-9 | 100 | 1.64E-9 | 100 |
CXCR20021 | 127D1-35GS-163E3 | 7.32Ё-9 | 100 | 2.31 E-9 | 100 |
CXCR20022 | 163D2-35GS-163D2 | 9.34Е-9 | 100 | 8.64E-9 | 100 |
CXCR20023 | 163D2-35GS-163E3 | 1.48Е-8 | 100 | 1.20E-8 | 100 |
CXCR20024 | 163E3-35GS-163E3 | 2.64Е-8 | 100 | 1.18E-8 | 100 |
CXCR20025 | 163D2-35GS-127D1 | 1.22Е-8 | 100 | 7.88E-9 | 100 |
CXCR20026 | 163E3-35GS-127D1 | 1.23Е-8 | 100 | 9.10E-9 | 100 |
CXCR20027 | 163E3-35GS-163D2 | 1.78Е-8 | 100 | 1.27E-8 | 100 |
CXCR20028 | 97A9-35GS-54B12 | 2.19Е-8 | 100 | 1.70E-8 | 100 |
CXCR20029 | 163E3-35GS-54B12 | 1.71 Е-8 | 100 | 1.01E-8 | 100 |
CXCR20030 | 163D2-35GS-54B12 | 1.18Е-8 | 100 | 6.36E-9 | 100 |
CXCR20031 | 2B2-35GS-163E3 | 1.52Е-8 | 100 | 4.26E-9 | 100 |
CXCR20032 | 2B2-35GS-163D2 | 1.47E-8 | 100 | 3.65E-9 | 100 |
CXCR20033 | 163E3-35GS-2B2 | 1.79E-8 | 100 | 4.46E-9 | 100 |
CXCR20034 | 163D2-35GS-2B2 | 1.18E-8 | 100 | 9.4 7 E-9 | 100 |
CXCR20035 | 54B12-35GS-163E3 | 1 02E-8 | 100 | 8.72E-9 | 100 |
CXCR20036 | 54B12-35GS-163D2 | 7.86E-9 | 100 | 4.27E-9 | 100 |
*Кривые были ограничены 100% ингибированием, поскольку при тестрирумых концентрациях плато не наблюдалось.
ND - не определяли.
Таблица 16
Величины IC50 для очищенных мультивалентных анти-СХСР2 нанотел в функциональном анализе, проводимом для оценки аккумуляции [35S]GTPyS в мембранах клеток СНО, содержащих CXCR2 человека
CXCR2 человека (анализ с использованием различных агонистов) | |||||||
GRO-a | IL-8 | ENA-78 | |||||
ICso (Μ) | % ингибирования (макс.) | ICso (M) | % ингибированиг (макс.) | ICso (M) | % ингибированиг (макс.) | ||
CXCR20014 | 97A9-35GS-2B2 | 1.38Е-9 | 100 | 1.13E-9 | 100 | 1.66E-9 | 100 |
CXCR20020 | 127D1-35GS163D2 | 6.34Е-10 | 100 | 6.19E-10 | 100 | 7.07E-10 | 100 |
CXCR2D021 | 127D1-35GS163E3 | 5.51 Е-10 | 100 | 8.27E-10 | 100 | 7.87E-10 | 100 |
CXCR20022 | 163D2-35GS163D2 | 2.85Е-8 | 100 | ND | ND | ND | ND |
CXCR20023 | 163D2-35GS163E3 | 2.66Е-8 | 100 | ND | ND | ND | ND |
CXCR20024 | 163E3-35GS163E3 | З.ОЗЕ-8 | 100 | ND | ND | ND | ND |
CXCR20025 | 163D2-35GS127D1 | 8.91 Е-10 | 100 | ND | ND | ND | ND |
CXCR20026 | 163E3-35GS127D1 | 8.О9Е-1О | 100 | ND | ND | ND | ND |
CXCR20028 | 97A9-35GS54B12 | 1.38Е-9 | 100 | ND | ND | ND | ND |
CXCR2OD3O | 163D2-35GS54B12 | 1.02Е-9 | 100 | 1.09E-9 | 100 | 1.30E-9 | 100 |
CXCR20031 | 2B2-35GS-163E3 | ND | ND | 8.40E-10 | 100 | 1.38E-9 | 100 |
CXCR20032 | 2B2-35GS-163D2 | ND | ND | 9.97E-10 | 100 | 1.16E-10 | 100 |
CXCR20033 | 163E3-35GS-2B2 | 1.01 E-9 | 100 | ND | ND | ND | ND |
CXCR2O034 | 163D2-35GS-2B2 | 9.95Е-10 | 100 | ND | ND | ND | ND |
CXCR20035 | 54B12-35GS163E3 | 8.44Е-10 | 100 | 7.17E-10 | 100 | 1.17E-9 | 100 |
ND - не определяли.
- 76 037063 (3) Анализ Шильда для определения механизма действия aHmu-CXCR2 нанотел.
Анализ Шильда осущетвляли путем проведения анализов на IL-8- и GRO-a-стимулированную аккумуляцию [35S]GTPyS. Формат этого анализа позволяет уравновешивать агонист и нанотело перед добавлением [S]GTPyS, что позволяет предотвратить образование каких-либо артефактов неполного равновесия, которые могут давать ошибочную интерпретацию этого механизма. Для этого строили кривые зависимости концентрация агониста-ответ с использованием возрастающих концентраций нанотела. Данные для двух одновалентных нанотел 54В12 и 163Е3 и данные, полученные для мультивалентного нанотела, приводятся в качестве примеров и представлены на фиг. 1. Эти данные представляют собой кривые концентрация-ответ для GRO-a, и аналогичные данные были получены с использованием IL-8.
Одновалентные нанотела 54В12 и 163Е3 обнаруживают одинаковые аллостерические механизмы действия, но по-разному влияют на ингибирование агониста. Аллостерический механизм действия нанотела 54В12 и других связывающих агентов 1-19 проиллюстрирован параллельными сдвигами вправо на кривой зависимости концентрация агониста-ответ при низких концентрациях нанотела, но в присутствии возрастающих концентраций нанотела сдвигов вправо больше не наблюдалось (фиг. 1(а)). Эффект насыщения такого механизма без снижения максимального ответа агониста является показателем аллостерического действия на аффинность агониста. В противоположность этому аллостерические механизмы действия 163Е3 и других связывающих агентов 1-19 проиллюстрирован параллельными сдвигами вправо на кривой зависимости концентрация агониста-ответ в комбинации со снижением максимального ответа агониста при более высоких концентрациях нанотела (фиг. 1(b)). Такой эффект может быть насыщаемым, но он не наблюдался при используемых концентрациях, однако важным наблюдением является снижение максимального ответа агониста, которое указывает на аллостерический механизм действия в отношении эффективности агониста. И, наконец, мультивалентное нанотело 54В12-163Е3 действует по обоим аллостерическим механизмам и влияет на кривую концентрация агониста-ответ, которая представлена параллельными сдвигами вправо при гораздо меньших концентрациях нанотел и значительным снижением максимального ответа агониста. (фиг. 1(с)).
В настоящее время аллостерический модулятор определяют как модулятор, который связывается в сайте, отличающемся от сайта связывания агониста (ортостерического лиганда), а это означает, что ортостерический лиганд и аллостерический модулятор связываются с рецептором одновременно. В настоящее время авторы данного изобретения не располагают данными, подтверждающими этот факт, а поэтому, не претендуя на какую-либо конкретную теорию, авторы отмечают, что сайт связывания нанотела необязательно отличается от сайта связывания агониста, а, по всей вероятности, эти сайты связывания перекрываются. Также не существует данных, указывающих на то, что агонист и нанотело связываются с рецептором одновременно, хотя данные анализа Шильда позволяют предположить, что эти нанотела являются аллостерическими модуляторами CXCR2.
20. Функциональные анализы - NSC.
Эти анализы проводились методами, описанными в разделе 15.
Таблица 17 Величины IC50 для очищенных бипаратопных анти-CXCR2 нанотел в функциональных анализах, проводимых с использованием первичных нейтрофилов человека или собакоподобных обезьян (и rhGROa, среднее ± ср. кв. от.)
WBSC человека 1С50 (нМ) | WBSC собакоподобных обезьян 1С50 (нМ) | Хемотаксис у человека 1С50 (нМ) | |
97А9-2В2 | 0,44510,08 | 0, 1610,16 | 0, 16 |
163D2-2B2 | 0,2910,17 | 0,4410,14 | 0, 145 |
163E3-2B2 | 0,34510,15 | 0,4210,12 | 0, 145 |
127D1-163D2 | 0, 17 | 0, 1210,09 | 0, 145 |
163E3-127D1 | 0,16510,06 | 0,2610,25 | 0, 14 |
97А9-54В12 | 0,4310,18 | 1,7210,43 | |
163D2-54B12 | 0,21510,02 | 0,5610,46 | |
54B12-163E3 | 0,2410,155 | 0,4310,38 |
- 77 037063
Таблица 18
143 ВОЗ | SEQ ID NO. 192 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGCCTG GGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACCTTC AGTACCTACTGGATGTATTGGGTCCGTCAGGCTCCAGGGAAGGG GCTCGACTGGGTCTCAGCTATTAATGCTGGTGGTGATAGCACAT ACTATGCAGACCCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGAC AACAACAAGAACACGCTGTATCTGCAGATGAACAGCCTGAAACC tgaggacacggccctgtattactgtgcgaccgtacgaggcaca GCTCGTGACTTGGACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCG TCTCCTCA |
139D05 | SEQ ID NO. 193 | GAGGTGAAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTG GGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCACTCTCTGGAAGGATCGGC AGTATCAACGCCATGGGCTGGTATCGCCAGGTTTCAGGACAACA GCGCGAGTTGGTCGCAGTAAGCAGGAGCGGAGGTAGCACAGAC ATTGCTGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAA CGGCAAGAACACAGTGTATCTGCAGATGGACAGCCTGAAACCTG AGGACACGGCCGTCTATTACTGTTATGCTCATACTTCAAGCTATA GTAATTGGCGAGTCTACAATAACGACTACTGGGGCCAGGGGACC CAGGTCACCGTCTCCTCA |
146А06 | SEQ ID NO. 194 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTG GGGGGTCTCTGAGACTTACCTGTGCAGCCTCTGGACGCATCGG CACTATCAATGCCATGGGCTGGTACCGCCAGGCTCCAGGGAAG CAGCGCGAGTTGGTCGCAGTTATTACTAGTGGTGGTAGGATAGA CTATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACA ATGCCAAGAACACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCT GAGGACACGGCCGTCTATTACTATAATGTAGAAACGGTAGTGGG TGCCGTCTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
- 78 037063
147A01 | SEQ ID NO. 195 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTG GGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAAGGATGGG CAATATCAATGCCATGGGCTGGTATCGCCAGGCTCCAGGGAAGG AGCGCGAGTTGGTCGCAAAAATTACTAGGGGTGGTGCGATAACC TATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCGCCAGAGACAA TATTCTGAACACGGCGTATCTGCAAATGAACGACCTGAAACCTGA GGACACGGCCGTCTATTATTATAATGTAGATGGGGGGCCCAGTC AAAACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
145C09 | SEQ ID NO. 196 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTG GGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTC GATGATTATGCCATAGGCTGGTTCCGCCAGGCCCCAGGGAAGG AGCGTGAGAGGGTCTCATGTATTAGTGGTAGTGATGGTAGCACA TACTATGCAGACTCCGTCAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGTGA CAACGCCAAGAACACGGTGTATCTGCAAATGAACAACCTGAAAC CCGAGGACACGGCCGTTTATTATTGTGCAGCATATTGGGGACTA ACGCTCAGGCTATGGATGCCCCCCCACCGGTATGACTACTGGG GCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
145D03 | SEQ ID NO. 197 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTG GGGGGTCTCTGAGCCTCTCCTGTGCAGCCTCTGGACTTATCTTC AGACTCAGTGGCATGGCCTGGTATCGCCAGGCTCCGGGGAGGC AGCGCGAGTGGGTCGCAGTGCTTACCAAAGATGGTACCCTACAC TATGCAGACCCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAAACAA CGCCGAGAACACGTGGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTG AGGACACAGCCATCTATTACTGTAATACGGGCCGTTACTGGGGC CAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
144D01 | SEQ ID NO. 198 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTG GGGGGTCACTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAACCATCGG CACGATCAGAGCCATGGGCTGGTACCGCCAGGCTCCAGGGAAG CAGCGCGAGTTGGTCGCATTGATTACTAGTACTGGTAGGATAAA CTATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATTGGAAGAGACA ATGCCAAGAACACGGCGTATCTGCAAATGAACAACCTGAAACCT GAGGACACGGCCGTCTATTACTATAATATCGAAACACTACGACGT AACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
139H02 | SEQ ID NO. 199 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGATTGGTGCAGGCTG GGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGACGCACCTTT AGTAACTATGCCATGGGCTGGTTCCGCCAGGCCACAGGGAAGG AGCGTGAGTTTGTAGCAGCTATTAACAAGAGTGGTGGGAACACA CACTATGCAGGCTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGA CAACGCCAAGAACACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAAC CTAGGGACACGGCCGTTTATTACTGTGCAGCGTCGCGGACTAAC |
- 79 037063
CCTAAGCCTGACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCT CCTCA | ||
139A08 | SEQ ID NO. 200 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGATTGGTGCAGGCTG GGGGCTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGACGCTCCTTC AGTCGCAGTGCCATGGGCTGGCTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGG AGCGTGAATTTGTAGCAGGTATTAGCTGGGGTGGTGATAACTCA TACTATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGA CAACGCCAAGAACACCGTGTCTCTACAAATGAACAGCCTGAAAC CTCAGGACACGGCCGTTTATTACTGTGCAGCAAGATACCGGGGA GGCGCGGCAGTAGCTGGTTGGGAGTACTGGGGCCAGGGGACC CAGGTCACCGTCTCCTCA |
137A08 | SEQ ID NO. 201 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGCCTG GGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCCGGATCCACTTTG GCCTATTATACCGTAGGCTGGTTCCGCCGGGCCCCAGGGAAGG AGCGCGAGGGGATCTCATGTATTAGTAGTAGTGATGGTAGCACA TACTATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGA CAATGCCAAGAATACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAAC CTGAGGACACGGCCGTTTATTACTGTGCGGCTGACAGACGTACC GACTGTAAAAAGGGTAGAGTCGGTTCTGGTTCCTGGGGCCAGG GGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
143A05 | SEQ ID NO. 202 | AAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGGCTGGTGCAGGCT GGGGGCTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCCGGACGCGCCT TCAATTACTATGTCATGGCCTGGTTCCGCCAGGCTCAAGGGAAG GAGCGTGAGTTTGTAGCAGCTATTAGCACGCGTGGTAGTATGAC AAAGTATTCAGACTCCGTGCAGGGCCGGTTCACCATCTCCAGAG ACAACGCCAAGAACACGGTGTATCTGCACATGAACAGCCTGAAA CCTGAGGATACGGCCGTTTATTACTGTGCAGCAGACCCTCGCGG CAGTAGCTGGTCATTTTCGTCCGGGGGTTATGACTACTGGGGCC AGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
137B07 | SEQ ID NO. 203 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGCCTG GGGGGTCTGTGAGACTCTCCTGTGTAGCCTCTGGAATCATCTTC AGACTCAGTGCGTTGGGTTGGACACGCCAGGGTCCAGGAAAGG CGCGCGAGTGGGTCGCAGGTATTAACAGTGATGGTACGACCAA CTACGCCGACCCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACA ACGCCAAGAACACGATATATCTGCACATGGACATGCTGAAACCT GAGGATACGGCCGTCTATTACTGTGCCTCCGGAAAGTACCGGG GCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
127D01 | SEQ ID NO. 204 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTG GGGAGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAAGCACCTTC GATTTCAAAGTCATGGGCTGGTACCGCCAGCCTCCAGGGAAGCA GCGCGAGGGGGTCGCAGCGATTAGGCTTAGTGGTAACATGCAC |
- 80 037063
TATGCAGAGTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAAAGCCAA CGCCAAGAACACAGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAGACCTG aggacacggccgtctattactgtaaggtgaacattcggggccag GACTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA | ||
126B11 | SEQ ID NO. 205 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTG GGGGGTCTCTGACGCTCTCCTGTGCAGTCTCTGGAAGCTCCTTC AGAATCAATACCATGGGCTGGTACCGCCGGGCTCCAGGGAAGC AGCGCGAGTTGGTCGCAGCTCGTGATAGAGGTGGTTACATAAAC TATGTAGATTCCGTGAAGGGCCGATTCACCGTCTCCAGAGACAA GGCCAAGCCCACAATGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTG AGGACACGGCCGTCTATTATTGTCATGCCGGGACCCAAGATCGG ACG GGTC GG AATTTC G ACCACTGGG GCC AGGGG ACC CAGGTCA CCGTCTCCTCA |
097A09 | SEQ ID NO. 206 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGCCTG GGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGTAGCCTCTGGAAGCATCGTC AGAATTAATACCATGGGCTGGTACCGCCAGACTCCAGGGAAGCA GCGCGAGTTGGTCGCAGATATTACCAGTGGTGGTAACATAAACT ATATAGACGCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAAC ACCAAGAACACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGA GGACACGGCCGTCTATTACTGTAATGCAGAGATCGTTGTTCTGG tgggagtttggacccagcgtgcgcggaccggcaactactgggg CCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
159В10 | SEQ ID NO. 207 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGATTGGTGCAGCCTG GGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGACGCACGTTC AGTAGCTTGTCCATGGGCTGGTTCCGCCAGGCTCCGGGGAAGG AGCGTGCCTTTGTAGCAGCGCTTACTCGAAATGGTGGTTACAGA TACTATGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGA CGTCGCCAAGAAGACCTTATATCTGCAAATGAACAGCCTGAAAC GTGAGGACACGGCCGTCTATTACTGTGCAGCAGATAGTCTTAGT GGTAGTGACTACTTAGGAACCAACCTAGACTACTGGGGCCAGGG GACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
163D02 | SEQ ID NO. 208 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGATTGGTGCAGGCTG GGGGCTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGACGCACCTTC AGTGACTATGCCATGGGCTGGTTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGG AGCGTGAGTTTGTAGCAGCTATTACGTGGAATGGTGGTAGAGTA TTTTATACTGCCTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGA CAACGCCAAGAACACGATGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAAC CTGAGGACACGGCCGTTTATTACTGTGCAGCAGATAAAGACAGA CGTACTGACTATCTAGGGCACCCCGTTGCCTACTGGGGCCAGG GGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
163Е03 | SEQ ID NO. 209 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGATTGGTGCAGCCTG GGGGCTCTCTGAGACTCTCCTGTGTAGCCTCTGGACGCATCTTC |
- 81 037063
AGTAGCAATGCCATGGGCTGGTTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGG AGCGTGAGTTTGTAGCGGCCATTACCTGGAGGAGTGGCGGTAG CGCGTACTATGCAGACTCCGCGAAGGGCCGATTCACCATCTCCA GAGACAACGCCAAGAACACGGTGTATTTGCAAATGAACAGCCTG AAACCTGAGGACACGGCCGTTTATTATTGTGCAGCTGGTGGTAG TTCCTGGTTAAGTTTTCCGCCGGACTACTGGGGCCAGGGGACCC AGGTCACCGTCTCCTCA | ||
2В2 | SEQ ID NO. 210 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGAGTTGGTGCAGCCG GGGGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAAGCATCTT AACTATCAATGC CATGGG CTGGTACCGCC AGGCTCCAGGG AAG CAGCGCGAGTTGGTAGTCCGTAGGACTAGGGGTGGTAGTACAA CGTATCAAGACTCCGTGAAGGGCCGATTCACCATCTCCGCAGAC ATTGCCAAGAAAACGATGTATCTCCAAATGAACAGCCTGAAACCT GAAGACACGGCCGTCTATTACTGTATGCTAGATGACCGTGGGGG TGTCTACTGGGGTCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCA |
54В12 | SEQ ID NO. 211 | GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTGCAGGCTG GGGGGTCTCTGACGCTCTCCTGTGCAGTCTCTGGAAGCACCTTC AGAATCAATACCATGGGCTGGTACCGCCGGGCTCCAGGGAAGC AGCGCGAGTTGGTCGCAGCTCGTGATAGAGGTGGTTACATAAAC TATGTAGATTCCGTGAAGGGCCGATTCACCGTCTCCAGAGACAA CGCCAAGCCCACAATGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTG AGGACACGGCCGTCTATTATTGTCATGCCGGGACCCAAGATCGG ACGGGTCGGAATTTCGACCGCTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCA CCGTCTCCTCA |
Основная панель антител - CDR + FR CXCR2, пронумерованных по Kabat.
Таблица 19
каркасная область 1 | CDR1 | каркасная область 2 | CDR2 | каркасная область 3 | CDR3 | <аркасная область 4 | |
143B03 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLS CAASGFTFS SEQ ID NO. 70 | TYWMY SEQ ID NO. 132 | WVRQAPGKGLDWV S SEQ ID NO. 91 | AINAGGDSTYYADPV KG SEQ ID NO. 152 | RFTISRDNNKNTLYLQMNSLK PEDTALYYCAT SEQ ID NO. Ill | VRGTARDLDY SEQ ID NO. 172 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
139D05 | EVKLVESGGGLVQAGGSLRLS CALSGRIGS SEQ ID NO. 71 | INAMG SEQ ID NO. 133 | WYRQVSGQQRELV A SEQ ID NO. 92 | VSRSGGSTDIADSVK G SEQ ID NO. 153 | RFTISRDNGKNTVYLQMDSLK PEDTAVYYCYA SEQ ID NO. 112 | HTSSYSNWRVYNNDY SEQ ID NO. 173 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
145C09 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLS CAASGFTFD SEQ ID NO. 72 | DYAIG SEQ ID NO. 134 | WFRQAPGKERERV S SEQ ID NO. 93 | CISGSDGSTYYADSV KG SEQ ID NO. 154 | RFTISSDNAKNTVYLQMNNLK PEDTAVYYCAA SEQ ID NO. 113 | YWGLTLRLWMPPHRYDY SEQ ID NO. 174 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
145D03 | EVQLVESGGGLVQAGG SL SL Ξ CAASGLIFR SEQ ID NO. 73 | LSGMA SEQ ID NO. 135 | WYRQAPGRQREWV A SEQ ID NO. 94 | VLTKDGTLHYADPVK G SEQ ID NO. 155 | RFTISRNNAENTWYLQMNSLK PEDTAIYYCNT SEQ ID NO. 114 | GRY SEQ ID NO. 175 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
139H02 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLs CAASGRTFS SEQ ID NO. 74 | NYAMG SEQ ID NO. 136 | WFRQATGKEREFV A SEQ ID NO. 95 | AINKSGGNTHYAGSV KG SEQ ID NO. 156 | RFTI SRDNAKNTVYLQMNSLK PRDTAVYYCAA SEQ ID NO. 115 | SRTNPKPDY SEQ ID NO. 176 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
139A08 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRL S CAASGRSFS SEQ ID NO. 75 | RSAMG SEQ ID NO. 137 | WLRQAPGKEREFV A SEQ ID NO. 96 | GISWGGDNSYYADSV KG SEQ ID NO. 157 | RFTISRDNAKNTVSLQMNSLK PQDTAVYYCAA SEQ ID NO. 116 | RYRGGAAVAGWEY SEQ ID NO. 177 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
137A08 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLS CAASGSTLA SEQ ID NO. 76 | YYTVG SEQ ID NO. 138 | WFRRAPGKEREGI S SEQ ID NO. 97 | CISSSDGSTYYADSV KG SEQ ID NO. 158 | RFTISRDNAKNTVYLQMNS LK PEDTAVYYCAA SEQ ID NO. 117 | DRRTDCKKGRVGSGS SEQ ID NO. 178 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
143A05 | KVQLVESGGGLVQAGGSLRLS CAASGRAFN SEQ ID NO. 77 | YYVMA SEQ ID NO. 139 | WFRQAQGKEREFV A SEQ ID NO. 98 | AISTRGSMTKYSDSV QG SEQ ID NO. 159 | RFTISRDNAKNTVYLHMNSLK PEDTAVYYCAA SEQ ID NO. 118 | DPRGSSWSFSSGGYDY SEQ ID NO. 179 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
137B07 | EVQLVESGGGLVQPGGSVRL S CVASGIIFR SEQ ID NO. 78 | LSALG SEQ ID NO. 140 | WTRQGPGKAREWV A SEQ ID NO. 99 | GINSDGTTNYADPVK G SEQ ID NO. 160 | RFTISRDNAKNTIYLHMDMLK PEDTAVYYCAS SEQ ID NO. 119 | GKY SEQ ID NO. 180 | RGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 132 |
127D01 | EVQLVESGGGLVQAGESLRL S CAASGSTFD SEQ ID NO. 79 | FKVMG SEQ ID NO. 141 | WYRQPPGKQREGV A SEQ ID NO. 100 | AIRLSGNMHYAESVK G SEQ ID NO. 161 | RFTISKANAKNTVYLQMNSLR PEDTAVYYCKV SEQ ID NO. 120 | NIRGQDY SEQ ID NO. 181 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
126B11 | EVQLVESGGGLVQAGGSLTLS CAVSGSSFR SEQ ID NO. 80 | INTMG SEQ ID NO. 142 | WYRRAPGKQRELV SEQ ID NO. 101 | ARDRGGYINYVDSVK G SEQ ID NO. 162 | RFTVSRDNAKPTMYLQMNSLK PEDTAVYYCHA SEQ ID NO. 121 | GTQDRTGRNFDH SEQ ID NO. 182 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
097A09 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLS | INTMG | WYRQTPGKQRELV | □ITSGGNINYIDAVK | rftisrdntkntvylqmnslk | EIWLVGVWTQRARTGNY | WGQGTQVTVSS |
CVASGSIVR SEQ ID NO. 81. | SEQ ID NO. 143 | SEQ ID NO. 102 | G SEQ ID NO. 163 | PEDTAVYYCNA SEQ ID NO. 122 | SEQ ID NO. 183 | SEQ ID NO. 133 | |
159B10 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLS CAASGRTFS SEQ ID NO. 82 | SLSMG SEQ ID NO. 144 | WFRQAPGKERAFV A SEQ ID NO. 103 | ALTRNGGYRYYADSV KG SEQ ID NO. 164 | RFTISRDVAKKTLYLQMNSLK PEDTAVYYCAA SEQ ID NO. 123 | DSLSGSDYLGTNLDY SEQ ID NO. 184 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
163 DO 2 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLS CAASGRTFS SEQ ID NO. 83 | DYAMG SEQ ID NO. 145 | WFRQAPGKEREFV A SEQ ID NO. 104 | AITWNGGRVFYTASV KG SEQ ID NO. 165 | RFTISRDNAKNTMYLQMNSLK PEDTAVYYCAA SEQ ID NO. 124 | DKDRRTDYLGHPVAY SEQ ID NO. 185 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
163E03 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLS CVASGRIFS SEQ ID NO. 84 | SNAMG SEQ ID NO. 146 | WFRQAPGKEREFV SEQ ID NO. 105 | AITWRSGGSAYYADS AKG SEQ ID NO. 166 | RFTISRDNAKNTVYLQMNSLK PEDTAVYYCAA SEQ ID NO. 125 | GGSSWLSFPPDY SEQ ID NO. 186 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
002B02 | EVQLVESGGELVQPGGSLRLS CAASGSILT SEQ ID NO. 85 | INAMG SEQ ID NO. 147 | WYRQAPGKQRELV V SEQ ID NO. 106 | RRTRGGSTTYQDSVK G SEQ ID NO. 167 | RFTISADIAKKTMYLQMNSLK PEDTAVYYCML SEQ ID NO. 126 | DDRGGVY SEQ ID NO. 187 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
146.406 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLT CAASGRIGT SEQ ID NO. 86 | INAMG SEQ ID NO. 148 | WYRQAPGKQRELV A SEQ ID NO. 107 | VITSGGRIDYADSVK G SEQ ID NO. 168 | RFTISRDNAKNTVYLQMNSLK PEDTAVYYYNV SEQ ID NO. 127 | ETWGAVY SEQ ID NO. 188 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
147A01 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLS CAASGRMGN SEQ ID NO. 87 | INAMG SEQ ID NO. 149 | WYRQAPGKERELV A SEQ ID NO. 108 | KITRGGAITYADSVK G SEQ ID NO. 169 | RFTIARDNILNTAYLQMNDLK PEDTAVYYYNV SEQ ID NO. 128 | DGGPSQNY SEQ ID NO. 189 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
144D01 | EVQLVESGGGLVQAGGSLRLS CAASGTIGT SEQ ID NO. 88 | IRAMG SEQ ID NO. 150 | WYRQAPGKQRELV A SEQ ID NO. 109 | LITΞTGRINYADSVK G SEQ ID NO. 170 | RFTIGRDNAKNTAYLQMNNLK PEDTAVYYYNI SEQ ID NO. 129 | ETLRRNY SEQ ID NO. 190 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
054B12 | EVQLVESGGGLVQAGGS LTL Ξ CAVSGSTFR SEQ ID NO. 89 | INTMG SEQ ID NO. 151 | WYRRAPGKQRELV A SEQ ID NO. 110 | ARDRGGYINYVDSVK G SEQ ID NO. 171 | RFTVSRDNAKPTMYLQMNSLK PEDTAVYYCHA SEQ ID NO. 130 | GTQDRTGRNFDR SEQ ID NO. 191 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 |
21. Оптимизация последовательности - полипептиды-антагонисты CXCR2.
Анализ на тепловой сдвиг (TSA): 5 мкл очищенного одновалентного нанотела (80 мг/мл) смешива
- 82 037063 ли с 5 мкл флуоресцентного зонда Sypro Orange (Invitrogen, Carlsbad, CA, catalogue # S6551) (конечная концентрация 10x) в 10 мкл буфера (100 мМ фосфата, 100 мМ бората, 100 мМ цитрата, 115 мМ NaCl, забуференные при различных рН от 3,5 до 9). Затем образцы нагревали в устройстве LightCycler 480II (Roche, Basel, Switzerland) от 37 до 90°С с приращением 4,4°С/с, после чего эти образцы охлаждали до 37°С с приращением 2,2°С/с. После термоиндуцированного развертывания белков гидрофобные пэтчи этих белков обрабатывали зондом Sypro Orange, с которым связываются эти белки, что приводило к повышению интенсивности флуоресценции. Точка перегиба первой производной кривой интенсивности флуоресценции соответствовала температуре плавления (Tm). (Ericsson et al. 2006 (Annals of Biochemistry, 357: 289-298).
Дифференциальная сканирующая калориметрия (DSC): эксперименты проводили на оборудовании Auto-Cap VP-DSC (MicroCal - GE Healthcare) в соответствии с инструкциями производителей. Определение температуры плавления нанотел (0,25 мг/мл) осуществляли при скорости нагревания 1°С/мин и при температуре в пределах от 30 до 95°С. Конечные термограммы получали после собственного вычитания фоновых значений. После детектирования пика с помощью компьютерной программы (Origin 7.0) получали соответствующие температуры плавления.
Окисление в условиях стресса: образцы нанотел (1 мг/мл) обрабатывали 10 мМ Н2О2 в PBS в течение 4 ч при комнатной температуре и в темноте и параллельно обрабатывали контрольные образцы, но в отсутствии Н2О2, а затем буфер переключали на PBS на обессоливающих центрифужных колонках Zeba (0,5 мл) (Thermo Scientific). Образцы, полученные в условиях стресса, и контрольные образцы анализировали с помощью ОФХ на оборудовании Series 1200 (Agilent Technologies) с колонкой Zorbax 300SB-C3 (Agilent Technologies) при 70°С. Окисление нанотел количественно оценивали путем определения % площади пика от предварительно определенных пиков, образующихся в результате окислительного стресса, по сравнению с главным пиком белка.
Оптимизация последовательности 2В2.
Белковую последовательность родительского 2В2 сопоставляли путем выравнивания последовательности VH3-23 человека (DP-47) и зародышевой линии JH5 (табл. 20, стр. 147). Различия в аминокислотах указанной последовательности по сравнению с последовательностью зародышевой линии человека обозначены буквами, а идентичные аминокислоты показаны точками. Последовательности с подчеркнутыми различиями в аминокислотах отбирали для их превращения в человеческий аналог, а другие последовательности оставались неизменными.
Очищенное одновалентное соединение получали из 2В2, CXCR20059 и CXCR20063, а затем охарактеризовывали в FACS-анализе на лигандное конкурирование и в анализе на индуцированное агонистом высвобождение внутриклеточного кальция (FLIPR) для CXCR2 человека и собакоподобных обезьян. Кроме того, температуру плавления этих вариантов определяли в анализе на тепловой сдвиг (TSA) или с помощью дифференциальной сканирующей калориметрии (DSC) (табл. 21). М93L-мутация в CXCR20059 и CXCR20063 элиминирует чувствительность родительского 2В2 к окислению в условиях стресса.
Таблица 21
Функциональная характеризация одновалентного 2В2 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
Tm (°C) | FACS-анализ на конкурирование с hGro-a, IC50 (М) | FLIPR hGro-α IC50 (М) | |||
hCXCR2 | OCXCR2 | hCXCR2 | OCXCR2 | ||
2В2 | 73,7 | 1, Зх10^иу | 3,5χ1(Γυ* | 6, 5χ10^υ/ | 2,4х10^иь |
CXCR20059 | 73,4 | 1,5х1(Гиу | 1,9χ1(Γυ* | 3, 9χ10-υ/ | 1,9х10^иь |
CXCR20063 | 71,9 | nd | 5, 4хЮ^08 | 6, 1хЮ-06 | 2,4хЮ^05 |
Оптимизация последовательности 97А9.
Белковую последовательность родительского 97А9 сопоставляли путем выравнивания последовательности человеческого VH3-23 (DP-47) и зародышевой линии JH5 (табл. 22). Различия в аминокислотах указанной последовательности по сравнению с последовательностью зародышевой линии человека обозначены буквами, а идентичные аминокислоты показаны точками. Последовательности с подчеркнутыми различиями в аминокислотах отбирали для их превращения в человеческий аналог, а другие последовательности оставались неизменными.
Очищенное одновалентное соединение получали из 97А9 и CXCR20061, а затем охарактеризовывали в FACS-анализе на лигандное конкурирование и в анализе на индуцированное агонистом высвобождение внутриклеточного кальция (FLIPR) для CXCR2 человека и собакоподобных обезьян. Кроме того, температуру плавления этих вариантов определяли в анализе на тепловой сдвиг (TSA) (табл. 23).
- 83 037063
Таблица 23
Функциональная характеризация одновалентного 97А9 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
Tm (°C) | FACS-анализ на конкурирование с hGro-a, IC50 (М) | FLIPR hGro-α IC50 (Μ) | |||
ID | hCXCR2 Ctrl | cCXCR2 Ctrl | hCXCR2 | CGXGR2 | |
97А9 | 76, 5 | 1,2χ10~υ8 | 6, 3χ10~υ8 | 9, 4χ10~υ8 | 8, 0χ10~υ/ |
CXCR20061 | 80,2 | 1,5χ10~υ8 | 6, 2χ10~υ8 | 6, 6χ10~υ8 | 3,5χ10~υ/ |
Оптимизация последовательности 163Е3.
Белковую последовательность родительского 163Е3 сопоставляли путем выравнивания последовательности человеческого VH3-23 (DP-47) и зародышевой линии JH5 (табл. 24). Различия в аминокислотах указанной последовательности по сравнению с последовательностью зародышевой линии человека обозначены буквами, а идентичные аминокислоты показаны точками. Последовательности с подчеркнутыми различиями в аминокислотах отбирали для их превращения в человеческий аналог, а другие последовательности оставались неизменными.
Очищенное одновалентное соединение получали из 163Е3 и CXCR20076, а затем охарактеризовывали в FACS-анализе на лигандное конкурирование и в анализе на индуцированное агонистом высвобождение внутриклеточного кальция (FLIPR) для CXCR2 человека и собакоподобных обезьян. Кроме того, температуру плавления этих вариантов определяли в анализе на тепловой сдвиг (TSA) (табл. 25).
Таблица 25
Функциональная характеризация одновалентного 163Е3 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
Tm (°C) | FACS-анализ на конкурирование с hGro-a, IC50 (М) | FLIPR hGro-a IC50 (Μ) | |||
hCXCR2 | CCXCR2 | hCXCR2 | CCXCR2 | ||
163Ε3 | 74,4 | 1, 0χ10~υ8 | 2,2χ10~υ8 | 3,5χ10~υ8 | 1,5χ10~υ/ |
CXCR20076 | 77,3 | 1, 6χ10~°8 | 2,5хЮ~08 | 3, 1χ1Ο~08 | 1, OxlO~07 |
Оптимизация последовательности 127D1.
Белковую последовательность родительского 127D1 сопоставляли путем выравнивания последовательности человеческого VH3-23 (DP-47) и зародышевой линии JH5 (табл. 26). Различия в аминокислотах указанной последовательности по сравнению с последовательностью зародышевой линии человека обозначены буквами, а идентичные аминокислоты показаны точками. Последовательности с подчеркнутыми различиями в аминокислотах отбирали для их превращения в человеческий аналог, а другие последовательности оставались неизменными.
Очищенное одновалентное соединение получали из 127D1 и CXCR20079, а затем охарактеризовывали в FACS-анализе на лигандное конкурирование и в анализе на индуцированное агонистом высвобождение внутриклеточного кальция (FLIPR) для CXCR2 человека и собакоподобных обезьян. Кроме того, температуру плавления этих вариантов определяли в анализе на тепловой сдвиг (TSA) (табл. 27). М57Rмутация в CXCR20079 элиминирует чувствительность родительского 127D1 к окислению в условиях стресса.
Таблица 27
Функциональная характеризация одновалентного 127D1 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
Tm (°C) | FACS-анализ на конкурирование c hGro-a, IC50 (Μ) | FLIPR hGro-a IC50 (M) | |||
hCXCR2 | cCXCR2 | hCXCR2 | CCXCR2 | ||
127D1 | 67,2 | 5, 5χ10~ιυ | 6, 1х10~иу | 1,5xlO~U8 | 1, 1х10~иь |
CXCR20079 | 68, 6 | 8, 0χ10~ιυ | 2,8xl0~uy | 1, 0χ10~υ8 | 4,5χ10~υ/ |
Оптимизация последовательности 163D2.
Белковую последовательность родительского 163D2 сопоставляли путем выравнивания последовательности человеческого VH3-23 (DP-47) и зародышевой линии JH5 (табл. 28). Различия в аминокислотах указанной последовательности по сравнению с последовательностью зародышевой линии человека обозначены буквами, а идентичные аминокислоты показаны точками. Последовательности с подчеркну
- 84 037063 тыми различиями в аминокислотах отбирали для их превращения в человеческий аналог, а другие последовательности оставались неизменными.
Очищенное одновалентное соединение получали из 163D2 и CXCR20086, а затем охарактеризовывали в FACS-анализе на лигандное конкурирование и в анализе на индуцированное агонистом высвобождение внутриклеточного кальция (FLIPR) для CXCR2 человека и собакоподобных обезьян. Кроме того, температуру плавления этих вариантов определяли в анализе на тепловой сдвиг (TSA) (табл. 29).
Таблица 29
Функциональная характеризация одновалентного 163D2 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
Тт (°C) | FACS-анализ на конкурирование с hGro-a, IC50 (М) | FLIPR hGro-α IC50 (Μ) | |||
hCXCR2 | CCXCR2 | hCXCR2 | CCXCR2 | ||
163D2 | 70, 7 | 2,8χ1θ9 | 7, ΙχΙΟ 99 | б, бх10~иа | 9, 2x10 98 |
CXCR20086 | 72,3 | 2, ΟχΙΟ’09 | 4,8χ10’ϋ9 | 7,3x10’ | 8,5х10’°а |
Оптимизация последовательности 54В12. Белковую последовательность родительского 54В12 сопоставляли путем выравнивания последовательности человеческого VH3-23 (DP-47) и зародышевой линии JH5 (табл. 30). Различия в аминокислотах указанной последовательности по сравнению с последовательностью зародышевой линии человека обозначены буквами, а идентичные аминокислоты показаны точками. Последовательности с подчеркнутыми различиями в аминокислотах отбирали для их превращения в человеческий аналог, а другие последовательности оставались неизменными.
Очищенное одновалентное соединение получали из 54В12, CXCR20103 и CXCR2104, а затем охарактеризовывали в FACS-анализе на лигандное конкурирование и в анализе на индуцированное агонистом высвобождение внутриклеточного кальция (FLIPR) для CXCR2 человека и собакоподобных обезьян. Кроме того, температуру плавления этих вариантов определяли в анализе на тепловой сдвиг (TSA) (табл. 31).
Таблица 31
Функциональная характеризация одновалентного 54В12 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
Тт (°C) | FACS-анализ на конкурирование с hGro-a, IC50 (М) | FLIPR hGro-a IC50 (M) | |||
hCXCR2 Ctrl | cCXCR2 Ctrl | hCXCR2 | CCXCR2 | ||
54В12 | 64,4 | nf * | 3,3x10 | 1,5χ107 | 1,1x10 |
CXCR20104 | tbd | nf * | 1,3x10 | 5,9x10 8 | 3,5x15 6 |
Таблица 20
Выравнивание последовательности наноантитела 2В2 и его вариантов с оптимизированной последовательностью 10 20 30 40 50 60 70 80 90 101 110
Rabat# , .........I.........I.........[.........I.........|..a.......|.........|.........|..abc.......|.........|........|...
VH3-23/JH5 : EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK-------WGQGTLVTVSS
CXCR22B2 : . . . .V. . . .E................SILTIN. .G.Y......QR.L.VRRT-R. . . .T.Q..........A.IA.K.M.......KP........MLDDRGGVY.....£.....
CXCR20059 .....7....7................SILTIN. .G.Y......QR.L.VRRT-R. . . .T.Q..........A.I..K.M........P........LLDDRGGVY...........
CXCR20063 ...........................SILTIN. .G.Y......QR.L.VRRT-R. .. .T.Q..........A.I.. . .N........P........LLDDRGGVY...........
VH3-23/JHS - SEQ ID NO. 212
Таблица 22
Выравнивание последовательности наноантитела 97А9 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
2<Г 30 40 50 60 70 80 90 100 110
Kabat# : .........|.........|.........|.........I.........|. .а.......|.........|.........|..abc.......|.........|abcdefghij.........|...
VH3-23/JH5 : ЕЧ0ЬЬЕЗСССЬЦ0РСС-ЗЬЗЪЗСААЗСРТРЗЗУАКЗ^КСЛРаКСЬЕ№у^А13СЗС63Т¥¥АОЗУКС?Т,713РДЖ:<ЫТЬ1Ь0МХЗЬЕАЕОТА7¥¥САК------------------WGQGTLVTVSS
CXCR297A9 : . . . .V.................V. . .SIVRINT.G.Y. ,Т. . .QR.L.AD.T-.. .NIN.I.A...........Т. . .V.......КР........NAEIWLVGVWTQRARTGNY.....Q.....
CXCR20061 : ..........................SIVRINT.G.Y......QR.L.AD.T-.. .NIN...................V........Р........NAEIWLVGVWTQRARTGNY...........
- 85 037063
Таблица 24 Выравнивание последовательности наноантитела 163Е3 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
20 30 40 50 60 70 80 90 100 110
Kabat# : .........|.........|.........|.........|.........|..ab.......|.........|.........| . .abc.......|.........|abcd.........|...
VH3-23/JH5 : Εν0ΕΕΕΞθασΕν0ΡαθΞΒΗΕΞ0ΆΑΒΟΕΤΕΞΞΥΑΜ5ΗνκαΑΡΘΚΟβΕΜν5ΑΙ3Θ-5ΘΟ3ΤΥΥΑΒ3νΚ5ΕΡΤΙ5Ε0Ν3ΚΝΤΓΥΕ0ΜΝ3ΕΕΑΕΟΤΆνΥΥςΆΚ------------WGQGTLVTVSS
CXCR2163E3 : . . . .V.................V. . .RI. , ,N. .G.E......ER.F.A. .TWR. . . .A.....A..........A. . .V.......KP.........AGGSSWLEFPPDY.....Q.....
CXCR20076 : .......................... RI. . . N . . G ,F......ER.F.A. .TWR. -A....................V........P.........AGGS SWLSFPPDY...................
Таблица 26
Выравнивание последовательности наноантитела 127D1 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
Ϊ0 20 30 40 50 60 70 80 90 101 ΪΪ0
Kabat# ..........I.........I.........I.........I.........| . .a.......|.........|.........|..abc.......|.........|........|...
VH3-23/JH5 : EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK-------WGQGTLVTVSS
CXCR2127D1 : - . . -V........A.E..........Ξ. .DFKV.G.Y. .P. . .QR.G.A. . R-LS . NMH. .E.........KA.A. . .V........P........KVNIRGQDY.....Q.....
CXCR20079 : ..........................S..DFKV.G.Y......QR. G. A . R-LS . NRH . . E..........A.....V........P........KVNIRGQDY.................
Таблица 28
Выравнивание последовательности наноантитела 163D2 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
20 30 40 50 60 70 80 90 100 110
Kabat# : .........|.........|.........|.........|.........|..а.......|.........|.........|. .abc.......|.........[abcdefg.........|...
VH3-23/JH5 : EVQL·L·EΞGGGLVQPGGSLRLΞCAASGFTFΞΞYAMΞWVRQAPGKGLEWVΞAISGSGGSTYΎADΞVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK-—----—------WGQGTLVTVSS CXCR2163D2 : . . . .V........А............R...D...G.F......ER.F.A. .TWN. .RVF.TA............А. . .И.......КР.........ADKDRRTDYLGHPVAY.....Q.....
CXCR20086 : ..........................R...D...G.F......ER. F . А. .TWN. . RVF. ТА.........................Р.........ADKDRRTDYLGHPVAY................
Таблица 30 Выравнивание последовательности наноантитела 54В12 и его вариантов с оптимизированной последовательностью
20 30 40 50 60 70 80 90 100 110
Kabat# S .........|.........|.........|.........|.........|..а.......|.........|.........|. .abc.......|.........|abcd.........|...
VH3-23 /JH5 : EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAISGSGGSTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK------------WGQGTLVTVSS
CXCR254B12 : . . . .V........A....Т....V..S. .RINT.G.Y.R. . . . QR.L.A.RD-R. .YIN.V........V. . . .А.Р.М.......КР........HAGTQDRTGRNFDR.....Q.....
CXCR20103 : .......................V..S..RINT.G.Y......QR.L. А.RD-R. . YIN.................Р.М........Р........HAGTQDRTGRNFDR...........
CXCR20I04 : .......................У..5..RINT.G.Y......QR. L . A.RD-R . YIN. V...............Р.М........Р........HAGTQDRTGRNFDR....................
Таблица 32
Аминокислотные последовательности вариантов с оптимизированной последовательностью
CXCR20059 | EVQ LLE SGGGLVQ PGGSLRL SCAASG SILTINAMGWYRQAPGKQRELVVRRTRGGSTTYQDSVK 3RFTISADISKKTMYLQMNSLRPEDTAVYYCLLDDRGGVYWGQGTL17TVSS | SEQ ID NO. 213 |
CXCR20063 | EVQLLE SGGGLVQ PGGSLRLSCAASGSILTINAMGWYRQAPGKQRELWRRTRGGSTTYQDSVK 3ΚΓΤΙ5ΑΏΙ3ΚΝΤΜΥΕ0ΜΝ3ΕΚΡΕϋΤΑνΥΥΟΕΕΌΟΚΟθνΥΝσ0αΤΕντν33 | SEQ ID NO. 214 |
CXCR20061 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIVRINTMGWYRQAPGKQRELVADITSGGNINYADSVK 3RFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTAVYYCNAEIWLVGVWTQRARTGNYWGQGTLVTVSS | SEQ ID NO. 215 |
CXCR20079 | EVQL LE SGGGLVQ PGGSLRL SCAASG STFDFKVMGWYRQAPGKQREGVAAIRL SGNRHYAE SVK 3RFTISRANSKNTVYLQMNSLRPEDTAVYYCKVNIRGQDYWGQGTLVTVSS | SEQ ID NO. 216 |
2XCR20076 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRIFSSNAMGWFRQAPGKEREFVAAITWRSGGSAYYADS VKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTAVYYCAAGGS SWLSFPPDYWGQGTLVTVSS | SEQ ID NO. 217 |
CXCR20086 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSDYAMGWFRQAPGKEREFVAAITWNGGRVFYTASV KGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTLVTVS S | SEQ ID NO. 218 |
CXCR20104 | ЕУОЬЕЕЗСССЕУОРССБЕКЬЗСАУБСЗТЕКХМТМСИУНОАРбКСКЕЬУААЕПКСОУИЯУУСБТК 3RFTISRDNSKPTMYLQMNSLRPEDTAVYYCHAGTQDRTGRNFDRWGQGTLVTVSS | SEQ ID NO. 219 |
- 86 037063
Таблица 33 Аминокислотные последовательности бипаратопного наноантитела с оптимизированной последовательностью (включая HLE с AIb8)
CXCR20079- 35GSCXCR20076 | SEQ ID NO. 221 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSTFDFKVMGWYRQAPGKQREGVAAIRLSGNRHYAESVKGRFTISRANSKN TVYLQMNSLRPEDTAVYYCKVNIRGQDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEV ΟΕΕΕΞΟσΟΕνΟΡΟΟΞΕΕΕΞΟΑΑΞΟΕΙΡεβΝΑΜΟΝΕΚΟΑΡσΚΕΕΕΕνΑΑΙΤΜΚΞσΟΞΑΥΎΑΏΞνκσΕΕΤΙΞΗΒΝΞΚΝ TVYLQMNSLRPEDTAVYYCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTLVTVSS |
CXCR2007935GSCXCR20086 | SEQ ID NO. 222 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSTFDFKVMGWYRQAPGKQREGVAAIRLSGNRHYAESVKGRFTISRANSKN TVYLQMNSLRPEDTAVYYCKVNIRGQDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSDYAMGWFRQAPGKEREFVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNSK ΝΤΙιΥΕΟΜΝΞΕΕΡΕϋΤΑνΥΥΟΑΑΏΚΟΡΕΤΏΥΙΧΙΗΡνΑΥνίσΟΟΤΕντνΞΞ |
CXCR2010435GS- CXCR20076 | SEQ ID NO. 223 | evqllesggglvqpggslrlscavsgstfrintmgwyrqapgkqrelvaardrggyinyvdsvkgrftisrdnskp tmylqmnslrpedtavyychagtqdrtgrnfdrwgqgtlvtvssggggsggggsggggsggggsggggsggggsgg GGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRIFSSNAMGWFRQAPGKEREFVAAITWRSGGSAYYADSX/KGRFTISR DNSKNTVYLQMNSLRPEDTAVYYCAAGG s swls fppdywgqgtlvtvss |
CXCR2010435GSCXCR20086 | SEQ ID NO. 224 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAVSGSTFRINTMGWYRQAPGKQRELVAARDRGGYINYVDSVKGRFTISRDNSKP TMYLQMNSLRPEDTAVYYCHAGTQDRTGRNFDRWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGG GGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSDYAMGWFRQAPGKEREFVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRD NSKNTLYLQMNSLRPEDTAVYYCAADKDRRTDYLGHPVAYWGQGTLVTVSS |
CXCR2007935GS- CXCR2007635GS-Alb8 | SEQ ID NO. 225 | Εν0ΕΕΕΞσαθΕν0Ρσσ5ΕΗΕΞΟΑΑ5σ3ΤΡΕΡΚνΜσΜΥΕ0ΑΡ6Κ0ΡΕθνΑΑΙΡΕ3ΟΝΕΗΥΑΕΞνκαΕΓΤΙ3ΡΆΝ5ΚΝ TVYLQMNSLRPEDTAVYYCKVNIRGQDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEV QLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRIFSSNAMGWFRQAPGKEREFVAAITWRSGGSAYYADSVKGRFTISRDNSKN TVYLQMNSLRPEDTAVYYCAAGGSSWLSFPPDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGG GGSEVQLVESGGGLVQPGNSLRLSCAASGFTFSSFGMSWVRQAPGKGLEWVSSISGSG3DTLYADSVKGRFTI3RD ΝΑΚΤΤΕΥΕ0ΜΝΞΕΕΡΕΟΤΑνΥΥΟΤΙΟΟ3ΕΞΡ3Ξ0ΟΤΙ,ντν33 |
CXCR2007935GS- CXCR2006135GS-Alb8 | SEQ ID NO. 226 | EVQL·LESGGGLVQPGGSL·RLSCAASGSTFDFKVMGWYRQAPGKQREGVAAIRL·SGNRHYAESVKGRFTISRANSKN TVYLQMNSLRPEDTAVYYCKVNIRGQDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS EVQL·LESGGGLVQPGGSL·RLSCAASGSIVRINTMGWYRQAPGKQRELVADITSGGNINYADSVKGRFTISRDNΞKN ΊνΥΙι0ΜΝ3ΕΕΡΕΏΤΑνΥΥ0ΝΑΕΐννΕνθνΜΤ0ΚΑΕΤΟΝΥΜ60αΤΕνΤν33αθΟΟ3Ο6θα3Ο66Ο3Ο6663Οθαθ3Ο ОООЗССООЗЕУОЬУЕЗООСЬУОРСНЗЬЕЬЗСААЗСГТРЗЗРСМЗМУЕОАРСКОРЕЩУЗЗТЗСЗСЗРТЬУАРЗУКОЕ FTISRDNAKTTLYLQMNSLRPEDTAVYYCTIGGSLSRSSQGTLVTVSS |
CXCR2007935GS- CXCR2008635GS-Alb8 | SEQ ID NO. 227 | Εν0ΡΕΕ5σσσΡν0Ρσσ3ΡΡΕ3ΟΑΑ3α3ΤΓΡΡΚνΜΟΝΥΕ0ΑΡΟΚ0ΕΕσνΑΑΙΡΡ30ΝΕΗΥΑΕ3νκαΡΡΤΙ8ΡΑΝ3ΚΝΤν YLQMNSLRPEPTAVYYCKVNIRGQPYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFSDYAMGWFRQAPGKEREFVAAITWNGGRVFYTASVKGRFTISRDNSKNT ьуьомпзьррЕРТАууусААРкоРЕтиуьснруАУиооотьутуззаосозаоаозаооозоосозоооозсооозсс GGSEVQLVESGGGLVQPGNSLRLSCAASGFTFSSFGMSWRQAPGKGLEWSSISGSGSPTLYADSVKGRFTISRDNA |
1 KTTLYLQMNSLRPEDTAVYYCTIGGSLSRSSQGTLVTVS S | ||
IALB8 | SEQ ID | EVQLVESGGGLVQPGNSLRLSCAASGFTFSSFGMSWVRQAPGKGLEWVSSISGSGSDTLYADSVKGRFTISRDNAKTT |
LYLQMNSLRPEDTAVYYCTIGGSLSRSSQGTLVTVSS
NO. 228
Таблица 34
Аминокислотные последовательности вариантов с оптимизированной последовательностью и родительских наноантител, включая данные о CDR (Kabat) и каркасных областях
каркасная область 1 | CDR1 | каркасная область 2 | CDR2 | каркасная область 3 | CDR3 | каркасная область 4 | ||
CXCR20O5 9 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSILT SEQ ID NO. 229 | INAMG SEQ ID NO. 147 | WYRQAPGKQRELW SEQ ID NO. 106 | rrtrggsttyqdsvkg SEQ ID NO. 167 | RFTISADISKKTMYLQMNSL RPEDTAVYYCLL SEQ ID NO. 238 | DDRGGVY SEQ ID NO. 187 | WGQGTLVTVSS SEQ ID NO. 245 | |
CXCR20O6 3 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSILT SEQ ID NO. 229 | INAMG SEQ ID NO. 147 | WYRQAPGKQRELW SEQ ID NO. 106 | RRTRGGSTTYQDSVKG SEQ ID NO. 167 | RFTI SADISKNTMYLQMNSL RPEDTAVYYCLL SEQ ID NO. 239 | DDRGGVY SEQ ID NO. 187 | WGQGTLVTVSS SEQ ID NO. 245 | |
002B02 | evolvesggelvqpggslrlscaasgsilt SEQ ID NO. 85 | INAMG SEQ ID NO. 147 | WYRQAPGKQRELW SEQ ID NO. 106 | RRTRGGSTTYQDSVKG SEQ ID NO. 167 | RFTI SADIAKKTMYLQMNSL KPEDTAVYYCML SEQ ID NO. 126 | DDRGGVY SEQ ID NO. 187 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 | |
CXCR2006 | EVQLLE SGGGLVQPGGS LRLS CAASGSIVR SEQ ID NO. 230 | INTMG SEQ ID NO. 143 | WYRQAPGKQRELVA SEQ ID NO. 234 | DITSGGNINYADSVKG SEQ ID NO. 235 | RFTISRDNSKNTVYLQMNSL RPEDTAVYYCNA SEQ ID NO. 240 | EIWLVGVWTQRARTGNY SEQ ID NO. 183 | WGQGTLVTVSS SEQ ID NO. 245 | |
097А0Э | EVOLVESGGGLVQPGGSLRLSCVASGSIVR SEQ ID NO. 81. | INTMG SEQ ID NO. 143 | WYRQTPGKQRELVA SEQ ID NO. 102 | DITSGGNINYIDAVKG SEQ ID NO. 163 | RFTISRDNTKNTVYLQMNSL KPEDTAVYYCNA SEQ ID NO. 122 | EIWLVGVWTQRARTGNY SEQ ID NO. 183 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 133___________ | |
СХСЯ2007 9 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSTFD SEQ ID NO. 231 | FKVMG SEQ ID NO. 141 | WYRQAPGKQREGVA SEQ ID NO. 235 | AIRLSGNRHYAESVKG SEQ ID NO. 236 | RFTISRANSKNTVYLQMNSL RPEDTAVYYCKV SEQ ID NO. 241 | NIRGQDY SEQ ID NO. 181 | WGQGTLVTVSS SEQ ID NO. 245 | |
127D01 | EVQLVESGGGLVQAGESLRLS CAASGSTFD SEQ ID NO. 79 | FKVMG SEQ ID NO. 141 | WYRQPPGKQREGVA SEQ ID NO. 100 | AIRLSGNMEiYAESVKG SEQ ID NO. 161 | RFTISKANAKNTVYLQMNSL RPEDTAVYYCKV SEQ ID NO. 120 | NIRGQDY SEQ ID NO. 181 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 | |
CXCR2007 6 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRIFS SEQ ID NO. 232 | SNAMG SEQ ID NO. 146 | WFRQAPGKEREFVA SEQ ID NO. 105 | AITWRSGGSAYYADSVKG SEQ ID NO. 237 | RFTI SRDNSKNTVYLQMNSL RPEDTAVYYCAA SEQ ID NO. 242 | 3GSSWLSFPPDY SEQ ID NO. 186 | WGQGTLVTVSS SEQ ID NO. 245 | |
163E03 | EVQLVESGGGLVQPGGSLRLS CVASGRIFS SEQ ID NO. 84 | SNAMG SEQ ID NO. 146 | WFRQAPGKEREFVA SEQ ID NO. 105 | AI'TWRSGGSAYYADSAKG SEQ ID NO. 166 | RFTISRDNAKNTVYLQMNSL KPEDTAVYYCAA SEQ ID NO. 125 | GGSSWLSFPPDY SEQ ID NO. 186 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131___________ | |
CXCR2008 6 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGRTFS SEQ ID NO. 233 | DYAMG SEQ ID NO. 145 | WFRQAPGKEREFVA SEQ ID NO. 104 | AITWNGGRVFYTASVKG SEQ ID NO. 165 | RFTISRDNSKNTLYLQMNS L RPEDTAVYYCAA SEQ ID NO. 243 | DKDRRTDYLGHPVAY SEQ ID NO. 185 | WGQGTLVTVSS SEQ ID NO. 245 | |
163D02 | ЕУОЬУЕЗСбСЬУОЛСеЗЬКЕЗСААЗбРТГЗ SEQ ID NO. 83 | DYAMG SEQ ID NO. 145 | WFRQAPGKEREFVA SEQ ID NO. 104 | AITWNGGRVFYTASVKG SEQ ID NO. 165 | RFTISRDNAKNTMYLQMNS L KPEDTAVYYCAA SEQ ID NO. 124 | DKDRRTDYLGHPVAY SEQ ID NO. 185 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 | |
CXCR2O10 | EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAVSGSTFR SEQ ID NO. 234 | INTMG SEQ ID NO. 151 | WYRQAPGKQRELVA SEQ ID NO. 234 | ARDRGGY INYVDS VKG SEQ ID NO. 171 | RFTI SRDNSKPTMYLQMNS L RPEDTAVYYCHA SEQ ID NO. 244 | GTQDRTGRNFDR SEQ ID NO. 191 | WGQGTLVTVSS SEQ ID NO, 245 | |
054B12 | EVQLVESGGGLVQAGGSLTLS CAVSGSTFR SEQ ID NO. 89 | INTMG SEQ ID NO. 151 | WYRRAPGKQRELVA SEQ ID NO. 110 | ARDRGGYINYVDSVKG SEQ ID NO. 171 | RFTVSRDNAKPTMYLQMNSL KPEDTAVYYCHA SEQ ID NO. 130 | GTQDRTGRNFDR SEQ ID NO. 191 | WGQGTQVTVSS SEQ ID NO. 131 | 1 |
- 87 037063
Таблица 35
Данные для CDR вариантов с оптимизированной последовательностью по Chotia
HCDR1 | HCDR2 | HCDR3 | |
CXCR20059 | GSILTIN | TRGGS | DDRGGVY |
CXCR20063 | GSILTIN | TRGGS | DDRGGVY |
CXCR20061 | GSIVRIN | TSGGN | EIWLVGVWTQRARTGNY |
CXCR20079 | GSTFDFK | RLSGN | NIRGQDY |
CXCR20076 | GRIFSSN | TWRSGGS | GGSSWLSFPPDY |
CXCR20086 | GRTFSDY | TWNGGR | DKDRRTDYLGHPVAY |
CXCR20104 | GSTFRIN | DRGGY | GTQDRTGRNFDR |
22. Картирование эпитопов.
Картирование эпитопов для нанотел осуществляли как описано в публикации Integral Molecular Inc., 3711 Market street, Suite 900, Philadelphia, PA, USA, www.integralmolecular.com с применением технологии мутагенеза методом дробовика.
Краткое описание технологии мутагенеза по методу дробовика.
При мутагенезе методом дробовика применяется патентованная крупномасштабная технология клеточной экспрессии, которая позволяет осуществлять экспрессию и анализ крупных библиотек мутированных белков-мишеней в эукариотических клетках. Каждый остаток в белке был мутирован отдельно, обычно его заменяли многими другими аминокислотами для анализа изменения функции белка. Белки были экспрессированы в стандартных клеточных линиях млекопитающих так, чтобы можно было картировать белки даже со сложной структурой, трансляция или посттрансляционный процессинг которых должны происходить в эукариотических клетках.
Для картирования эпитопов использовали следующую номенклатуру:
RDHBC 792 = CXCR20079,
RDHBC 793 = CXCR20061,
RDHBC 792 = CXCR20076.
Эпитопы для анти-CXCR2 антител RD-HBC792 (CXCR20079), RD-НВС793 (CXCR220061) и RDHBC794 (CXCR20076) картировали с разрешением в одну аминокислоту посредством мутагенеза методом дробовика.
Родительская конструкция: немеченный родительский ген клонировали в вектор с высоким уровнем экспрессии, а затем секвенировали и его экспрессию подтверждали посредством иммунодетектирования. Оптимизация нанотела: детектирование нанотел было оптимизировано в формате мутагенеза методом дробовика путем анализа панели разведений нанотел в 394-луночных микропланшетах. Оптимальную концентрацию каждого нанотела отбирали для скрининга библиотеки с мутациями. После конструирования бибилиотеки с мутациями аминокислоту в каждом положении заменяли консервативным и неконсервативным остатком, включая замену каждого остатка на Ala. Эту библиотеку тестировали на поверхностную экспрессию и скринировали с тремя повторностями на связывание нанотела посредством иммунодетектирования. Затем проводили анализ библиотеки на потерю способности нанотела к связыванию, идентифицировали ключевые остатки и осуществляли картирование.
Экспрессия родительской конструкции: иммунодетектирование временной экспрессии родительской конструкции дикого типа осуществляли в 384-луночном планшете с помощью иммунолюминесцентного и иммунофлуоресцентного анализа. Во всех экспериментах стадии обработки жидкостью включали трансфекцию клеток, а затем проводили иммунологическое окрашивание с использованием роботизированных устройств для обработки жидкостью в целях обеспечения точности результатов и высокой воспроизводимости экспериментов.
Таблица 36
Экспериментальные параметры, используемые для анализа родительской плазмиды
Экспериментальные параметры | Иммунолюминесценция | Иммунофлуоресценция |
Клетки | НЕК-293Т | НЕК-293Т |
Фиксация | 4% PFA | 4% PFA |
Блокирующий буфер | 10% козья сыворотка | 10% козья сыворотка |
- 88 037063
1 МАЬ, Мишень Концентрация Инкубирование # по каталогу производителя | Анти-СХСЯ2 антитело 2 мкг/мл, 1 час, R&D Systems МАВ331 | Ahth-CXCR2 антитело 3 мкг/мл, 1 час, R&D Systems МАВ331 |
2 МАЬ Мишень Концентрация Производитель # по каталогу | ПХ-конъюгированное антимышиное антитело, 0,8 мкг/мл Jackson Immunoresearch 115-035-003 | антимышиное антитело Dyelight 549 3,75 мкг/мл Jackson Immunoresearch 115-505-003 |
Промывки | PBS++ | PBS++ |
Сигнал:фон | 29:1 | 2,2:1 |
% коэффициента изменчивости (КИ) конструкции по отношению к родительской конструкции | 4,7% | 12% |
Таблица 37
Экспериментальные параметры, используемые для иммунодетектирования поликлонального антитела
Детектирование общей экспрессии рецептора клеточной поверхности с использованием поликлональной сыворотки. Поликлональную сыворотку (способную реагировать со всеми мутантами) использовали для количественной оценки общей экспрессии в целях детектирования каждого клона в библиотеке с мутациями Экспериментальные параметры | Иммунодетектирование поликлонального антитела |
Клетки | НЕК-293Т |
Фиксация | 4% PFA |
Блокирующий буфер | 10% козья сыворотка |
1 ° РАЬ Мишень Концентрация Инкубирование # по каталогу производителя | Ahth-CXCR2 антитело разведение 1:1000 1 час Novus NBP1-49218 |
2°МАЬ Мишень Концентрация Производитель # по каталогу | ПХ-конъюгированное антикроличье антитело 0,8 мкг/мл Southern Biotech 4050-05 |
Промывки | PBS++ |
Сигнал:фон | 17 :1 |
% КИ | 10% |
Выводы: устойчивую поверхностную экспрессию и общую экспрессию детектировали для родительской конструкция дикого типа с использованием контрольного MAb и поликлональной сыворотки
- 89 037063 для того, чтобы такую родительскую конструкцию дикого типа можно было использовать для мутагенеза методом дробовика. Иммунолюминесцентный анализ дает высокие результаты сигнал:фон и низкий коэффициент изменчивости, а поэтому он может быть использован в исследованиях по картированию.
Иммунодетектирование оптимизировали с использованием картируемых нанотел. Иммунодетектирование осуществляли в 384-луночном планшете с использованием клеток, временно трансфицированных только рецептором дикого типа или плазмидным вектором. Концентрации для последующих исследований по картированию были выбраны исходя из значения сигнала, близкого к максимальному, с высоким отношением сигнал:фон и с низкой изменчивостью.
Конечные условия проведения скрининг-анализа библиотеки с мутациями.
Таблица 38 Экспериментальные параметры, используемые для оптимизированного анализа посредством детектирования с применением мутагенеза по методу дробовика в 384-луночном планшете
Экспериментальны е параметры | RD-HBC792 | RD-HBC793 | RD-HBC794 |
Клетки | НЕК-293Т | НЕК-293Т | НЕК-293Т |
Фиксация | 4% PFA | 4% PFA | 4% PFA |
Блокирующий буфер | 10% козья сыворотка | 10% козья сыворотка | 10% козья сыворотка |
1°МАЬ Мишень Оптимальная концентрация Инкубирование | AHTH-CXCR2 антитело 1,0 мкг/мл 1 час | Ahth-CXCR2 антитело 1,0 мкг/мл 1 час | Ahth-CXCR2 антитело 2,0 мкг/мл 1 час |
2°МАЬ Мишень концентрация Инкубирование Производитель Название антитела | Анти-тус антитело 2 мкг/мл 1 час Лаборатория Гибридома ЭЕЮ | Анти-тус антитело 2 мкг/мл 1 час Лаборатория Гибридома ЭЕЮ | Анти-тус антитело 2 мкг/мл 1 час Лаборатория Гибридома ЭЕЮ |
3°МАЬ Мишень Концентрация Производитель # по каталогу | пх- конъюгированное антимышиное антитело 0,8 мкг/мл Jackson Immunoresearch 115-035-003 | пх- конъюгированно еантимышиное антитело 0,8 мкг/мл Jackson Immunoresearch 115-035-003 | пх- конъюгированное антимышиное антитело 0,8 мкг/мл Jackson Immunoresearch 115-035-003 |
Промывки | PBS++ | PBS++ | PBS++ |
Сигнал:фон | 13 :1 | 6,9:1 | 20 :1 |
% КИ | 7, 9% | 22% | 13% |
Оптимизированные условия анализа, определенные в настоящей заявке, использовали для картирования библиотеки для CXCR2 с мутациями в 384-луночном планшете. Каждый клон библиотеки экспрессировали в клетках путем временной трансфекции и анализировали на реакционную способность нанотела приблизительно через 18 ч после трансфекции. анти-CXCR2 нанотела RD-HBC792, RDHBC793 и RD-HBC794 не содержали Fc-областей, но содержали myc-метку, а поэтому была применена многостадийная стратегия детектирования, в которой использовали промежуточное мышиное анти-mycантитело (9Е10) с последующим детектированием с использованием ПХ-конъюгированного антимышиного антитела.
Выводы: были определены конечные условия для иммунодетектирования и картирования эпитопов для трех анти-CXCR2 нанотел. Оптимизированные условия давали высокое отношение сигнал:фон и низкую изменчивость при мутагенезе, проводимом методом дробовика, а поэтому они могут быть использованы для картирования эпитопов с высокой достоверностью. Картирование эпитопов включало проведение анализов в тех же самых условиях, определенных выше, но с использованием библиотеки вариантов рецепторов с мутациями.
- 90 037063
Идентификация ключевых остатков эпитопов дла нанотел.
Таблица 39
Идентификация ключевых остатков
Поликлональное
ID остатка | Мутации ID клона | антитело среднее ср кв. откл. | RDHBC 792 среднее ср кв. откл. | RDHBC 793 среднее ср кв. откл. | RDHBC 794 среднее ср кв. откл. |
11 | F11A 10 F11Y 975 | 39.9 17.0 70.5 6.2 | /7Л ' 2.1 26.7 14.7 | 81.1 13.7 113.9 5.4 | 81.6 20.6 100.2 29.1 |
14 | F14A 486 F14Y 1170 | 35.4 5.4 100.2 16.7 | 0^ 3.9 53.0 10.0 | 98.6 8.7 117.7 46.6 | 110.3 5.5 124.9 4.6 |
15 | W15A 116 W15Y 1075 | 69.2 2.8 92.3 6.2 | 6.4 1.4 14.6 6.4 | 125.4 18.6 112.2 27.9 | 114.5 13.1 110.8 11.4 |
39 | С39А 95 G39N 1099 | 86.2 6.0 108.7 8.8 | 65.0 6.7 94.4 34.9 | 1 | 0.7 ^И 4.4 |
112 | W112A 318 W112Y 1462 | 88.2 12.9 109.9 13.6 | 102.8 28.7 106.1 25.1 | НИ 7.4 37.1 6.2 | НИ 66 39.9 16.1 |
114 | F114A 211 F114Y 1560 | 88.9 5.8 122.3 14.6 | 73.1 10.6 87.4 21.0 | М 8·4 102.2 25.4 | 33.4 10.2 116.8 37.2 |
115 | G115A 320 G115Т 1561 | 82.7 7.7 82.4 40.6 | 70.4 14.1 89.7 9.8 | 5.2 61.7 14.8 | М 22 55.6 6.6 |
188 | Y188A 765 Y188F 1634 | 89.6 21.2 133.8 16.2 | 100.0 37.7 106.8 14.2 | 102.8 12.4 87.1 31.1 | 63 107.2 11.7 |
196 | С196А 963 G196N 1836 | 86.9 16.4 97.9 8.1 | 99.9 17.2 90.9 14.3 | 7,0 иИ· 2.1 | 2.4 1^И з.з |
274 | D274A 889 D274E 1955 | 101.4 14.9 80.3 20.3 | 102.2 1.9 97.5 6.6 | ИИ 7.0 52.1 13.2 | ИН 9·2 60.4 14.3 |
282 | 1282А 669 I282N 1989 | 79.6 10.7 58.8 9.2 | 66.8 17.7 78.5 13.7 | |ННН । ~ М· 18.0 | HHi 88 ИР з ·1 |
285 | Т285А 770 T285S 2215 | 64.8 14.3 154.4 65.9 | 53.1 2.4 91.8 23.2 | НИН 9 7 116.4 37.0 | НИ 1з·6 121.5 27.0 |
286 | С286А 771 G286N 2024 | 87.3 19.6 92.0 20.9 | 57.4 9.6 58.0 13.5 | ММ 6.5 НВ 9.3 | 2.0 ВН 8.2 |
293 | D293A 778 D293E 2127 | 131.5 4.9 150.3 23.4 | 100.8 49.9 138.9 24.6 | НН 8.2 73.3 26.5 | 44.9 17.6 141.9 19.4 |
Ключевые остатки для MAb идентифицировали путем сравнения реактивности клонов нанотел с реактивностью поликлональных нанотел (поверхностная экспрессия). Остатки, присутствующие в эпитопе для антитела, были идентифицированы как остатки, не связывающиеся с нанотелом, но связывающиеся с поликлональным антителом, включая замену остатком Ala (т.е. удаление боковой цепи остатка), и эти остатки были локализованы во внеклеточных петлях. Были представлены средние значения реактивности и стандартное отклонение для связывания с MAb и для связывания с поликлональным антителом. Ключевые остатки, идентифицированные для каждого MAb, показаны серым цветом. Данные для RD HBC792 также сравнивали с данными для RD HBC793, поскольку было обнаружено, что профиль связывания с RD HBC792 был аналогичен профилю связывания с коммерчески доступной поликлональной сывороткой (которая происходила от N-концевого внеклеточного домена CXCR2 человека, что, вероятно, служит объяснением более низкой реактивности сыворотки, содержащей мутации F11, F14 и W15).
Дополнительный анализ данных об эпитопах.
Ключевые аминокислоты, идентифицированные путем картирования с помощью мутагенеза методом дробовика, позволяют определить сайт(ы) связывания с тремя анти-CXCR2 MAb. Карты MAb RD HBC792 для N-концевой области CXCR2 и локализация ключевых остатков в непосредственной близости друг от друга позволяют предположить, что этот эпитоп по своей природе является линейным. MAb RD HBC793 и RD HBC794, очевидно, связываются с конформационно сложным эпитопом, образованным, главным образом, ECL1 и ECL3 рецептора CXCR2. Мутация внеклеточных остатков Cys, которые, как известно, образуют два дисульфидных мостика, удерживающих внеклеточные петли в положении хемокиновых рецепторов, также приводит к элиминации связывания MAb 793 и 794, а поэтому, очевидно, что они не принимают непосредственного участия во взаимодействии с эпитопом. Эпитопы для 793 и 794 в значительной степени перекрываются, хотя и имеют незначительные различия.
Варианты осуществления изобретения
1. Полипептид, содержащий по меньшей мере два антигенсвязывающих домена иммуноглобулина, где полипептид направлен против хемокинового рецептора CXCR2 или связывается с этим рецептором, и где указанный полипептид включает первый антигенсвязывающий домен, распознающий первый эпитоп на CXCR2, и второй антигенсвязывающий домен, распознающий второй эпитоп на CXCR2.
2. Полипептид по варианту осуществления 1, где указанный первый антигенсвязывающий домен способен связываться с линейным пептидом, состоящим из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 7, а указанный второй антигенсвязывающий домен не способен связываться с указанным линейным пептидом, либо связывается с этим пептидом с меньшей аффинностью.
3. Полипептид по варианту осуществления 1 или 2, где указанный первый антигенсвязывающий
- 91 037063 домен содержится в одном вариабельном домене первого иммуноглобулина, а указанный второй антигенсвязывающий домен содержится в одном вариабельном домене второго иммуноглобулина.
4. Полипептид по варианту осуществления 3, где по меньшей мере один из указанных первого и второго антигенсвязывающих доменов содержится в VL-домене антитела или в его фрагменте.
5. Полипептид по варианту осуществления 3, где по меньшей мере один из указанных первого и второго антигенсвязывающих доменов содержится в VH-домене антитела или в его фрагменте.
6. Полипептид по варианту осуществления 4 или 5, где указанный первый антигенсвязывающий домен содержится в VL-домене или в его фрагменте, а указанный второй антигенсвязывающий домен содержится в VH-домене или в его фрагменте.
7. Полипептид по варианту осуществления 4 или 5, где указанный первый антигенсвязывающий домен содержится в VH-домене или в его фрагменте, а указанный второй антигенсвязывающий домен содержится в VL-домене или в его фрагменте.
8. Полипептид по любому из вариантов осуществления 3-7, где указанные первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в первом и втором доменных антителах (dAb).
9. Полипептид по варианту осуществления 3 или 5, где по меньшей мере один из указанных первого и второго антигенсвязывающих доменов содержится в VHH-домене или в его фрагменте, происходящем от одной тяжелой цепи антитела с тяжелой цепью, полученного от животного семейства верблюжьих, или в его варианте с оптимизированной последовательностью, включая гуманизированный вариант.
10. Полипептид по варианту осуществления 9, где каждый из указанных антигенсвязывающих доменов содержится в VHH-домене или в его фрагменте, происходящем от одной тяжелой цепи антитела с тяжелой цепью, полученного от животного семейства верблюжьих, или в его варианте с оптимизированной последовательностью, включая гуманизированный вариант.
11. Полипептид по варианту осуществления 9 или 10, где каждая VHH-последовательность или ее фрагмент включают одну, две или три CDR.
12. Полипептид по любому из вариантов осуществления 9-11, где каждая VHH-последовательность имеет структуру FR-CDR-FR-CDR-FR-CDR-FR.
13. Полипептид по любому из предшествующих вариантов осуществления, где указанные по меньшей мере два антигенсвязывающих домена связаны посредством линкера.
14. Полипептид по любому из вариантов осуществления 3-13, имеющий структуру FR1-CDR1-FR2CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, где если FR1-CDR1-FR2-CDR2FR3-CDR3-FR4 содержит первый антигенсвязывающии домен, то FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8 содержит второй антигенсвязывающии домен, и если FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4 содержит второй антигенсвязывающии домен, то FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8 содержит первый антигенсвязывающии домен.
15. Полипептид по варианту осуществления 1 или 2, где каждый из указанных первого и второго антигенсвязывающих доменов содержится в антителе с тяжелой цепью.
16. Полипептид по варианту осуществления 1 или 2, где указанный первый антигенсвязывающий домен содержится в одной цепи первого антитела с тяжелой цепью, а указанный второй антигенсвязывающий домен содержится в одной цепи второго антитела с тяжелой цепью, где указанные первое и второе антитело с одной тяжелой цепью связаны посредством линкера.
17. Полипептид по варианту осуществления 1 или 2, где каждый из указанных первого и второго антигенсвязывающих доменов содержится в антителе, состоящем из двух тяжелых цепей и двух легких цепей.
18. Полипептид по варианту осуществления 1 или 2, где указанный первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в первом и втором антителах, соответственно, где каждое из этих антител содержит две тяжелых и две легких цепи, и где указанные первое и второе антитела связаны посредством линкера.
19. Полипептид по варианту осуществления 1 или 2, где указанный первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в первом и втором Fab- или F(ab)2-фрагментах антитела, соответственно, и где указанные первый и второй Fab- или F(ab)2-фрагмены связаны посредством линкера.
20. Полипептид по варианту осуществления 19, где указанный первый антигенсвязывающий домен содержится в Fab-фрагменте антитела, а указанный второй антигенсвязывающий домен содержится в F(ab)2-фрагменте или наоборот.
21. Полипептид по варианту осуществления 1 или 2, где указанный первый и второй антигенсвязывающие домены содержатся в первом и втором одноцепочечных Fv (scFv) антитела или в их фрагментах, соответственно, и где указанные первый и второй scFvs связаны посредством линкера.
22. Полипептид по любому из вариантов осуществления 13, 14, 16, 18, 19, 20 или 21, где линкер соединяет С-конец одного иммуноглобулина, содержащего антигенсвязывающий домен, с N-концом второго иммуноглобулина, содержащего антигенсвязывающий домен.
23. Полипептид по любому из вариантов осуществления 13, 14, 16 или 18-22, где линкером является пептид, содержащий аминокислотную последовательность, не происходящую от иммуноглобулина.
24. Полипептид по варианту осуществления 23, где пептидный линкер имеет длину в 3-50 амино
- 92 037063 кислот.
25. Полипептид по варианту осуществления 24, где число аминокислот в линкере выбрано из 3-9, 10-15, 16-20, 21-25, 26-35, 36-40, 41-45 или 46-50.
26. Полипептид по варианту осуществления 24, где линкер имеет длину в 35 аминокислот.
27. Полипептид по варианту осуществления 24, где линкер состоит только из двух различных аминокислот.
28. Полипептид по варианту осуществления 27, где линкер состоит из аминокислот глицина и серина.
29. Полипептид по варианту осуществления 27, где линкер состоит из аминокислот пролина и серина, и необязательно, аланина.
30. Полипептид по любому из вариантов осуществления 23-26, где линкер состоит только из аланина.
31. Полипептид по варианту осуществления 27, где пептидный линкер состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 220.
32. Полипептид по любому из предшествующих вариантов осуществления, где указанный полипептид включает аминокислотные последовательности CDR, происходящие от верблюжьих антител, имеющих одну тяжелую цепь или соответствующие этим антителам.
33. Полипептид по любому из вариантов осуществления 9-14, где аминокислотные последовательности каркасных областей происходят от верблюжьих антител, имеющих одну тяжелую цепь или соответствуют этим антителам.
34. Полипептид по любому из вариантов осуществления 9-14, где аминокислотные последовательности каркасных областей имеют оптимизированную последовательность, включая их гуманизированные варианты.
35. Полипептид по любому из предшествующих вариантов осуществления, который специфически связывается с CXCR2.
36. Полипептид по любому из предшествующих вариантов осуществления, который направлен против CXCR2 человека или связывается с ним.
37. Полипептид по любому из предшествующих вариантов осуществления, включающий по меньшей мере один дополнительный антигенсвязывающии домен, который направлен против сывороточного белка или специфически связывается с сывороточным белком.
38. Полипептид по любому из предшествующих вариантов осуществления, где указанным сывороточным белком является альбумин сыворотки человека.
39. Молекула, которая содержит по меньшей мере два полипептида и которая направлена против хемокинового рецептора CXCR2 или связывается с ним, где первый полипептид содержит первый антигенсвязывающии домен иммуноглобулина, а второй полипептид содержит второй антигенсвязывающиий домен иммуноглобулина, где указанные первый и второй антигенсвязывающие домены распознают первый и второй эпитопы на CXCR2, и где указанные по меньшей мере два полипептида связаны посредством непептидного линкера.
40. Молекула как вариант осуществления по варианту осуществления 38, где указанный первый антигенсвязывающии домен обладает способностью связываться с линейным пептидом, состоящим из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 7, а указанный второй антигенсвязывающий домен либо не связывается с указанным линейным пептидом, либо связывается с этим пептидом с низкой аффинностью.
41. Молекула как вариант осуществления по варианту осуществления 39 или 40, имеющая отличительный признак, определенный по любому из вариантов осуществления 3-22 и 32-38.
42. Полипептид по любому из вариантов осуществления 3-14 или 22-39, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 145, 165 и 185, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 145, 165 или 185, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 141, 161 и 181, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 141, 161 или 181 (163D2/127D1).
43. Полипептид по варианту осуществления 42, имеющий структуру варианта по варианту осуществления 14, где в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина, CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185, и где в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 161, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181.
44. Полипептид по варианту осуществления 43, где аминокислотные последовательности CDR1,
- 93 037063
CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80% идентичны аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 145, 165, 185, 141, 161 или 181.
45. Полипептид по варианту осуществления 43 или 44, где аминокислотные последовательности отличаются от последовательностей SEQ ID NO: 145, 165, 185, 141, 161 или 181 только консервативными аминокислотными заменами.
46. Полипептид по любому из вариантов осуществления 43-45, где каркасные области в каждом мономере одного вариабельного домена содержат один или несколько ключевых остатков в положениях аминокислот 11, 37, 44, 46, 47, 83, 84, 103, 104 и 108, пронумерованных по Kabat.
47. Полипептид по любому из вариантов осуществления 43-46, где FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83; FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104; FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124; FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131; FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 79; FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 120 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
48. Полипептид по варианту осуществления 47, модифицированный так, что FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 83, 104, 124, 131, 79, 100 или 120.
49. Полипептид по любому из вариантов осуществления 41-48, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58, или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 58.
50. Полипептид по любому из вариантов осуществления 42-46, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 218 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 218, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 216 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 216.
51. Полипептид по любому из вариантов осуществления 3-14 или 22-39, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 146, 166 и 186, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 146, 166 или 188, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 141, 161 и 181, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 141, 161 или 181 (163E3/127D1).
52. Полипептид по варианту осуществления 51, имеющий структуру варианта по варианту осуществления 14, где в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 166, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186, и где в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 161, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181.
53. Полипептид по варианту осуществления 52, где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 176, 166, 186, 141, 161 или 181.
54. Полипептид по варианту осуществления 52 или 53, где аминокислотные последовательности отличаются от последовательностей SEQ ID NO: 146, 166, 186, 141, 161 или 181 только консервативными аминокислотными заменами.
55. Полипептид по любому из вариантов осуществления 52-54, где каркасные области в каждом мономере одного вариабельного домена содержат один или несколько ключевых остатков в положениях аминокислот 11, 37, 44, 45, 47, 83, 84, 103, 104 и 108.
56. Полипептид по любому из вариантов осуществления 52-55, где FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84; FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105; FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125; FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131; FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 79; FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 100; FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 120 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
57. Полипептид по варианту осуществления 56, модифицированный так, что FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80%
- 94 037063 идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 83, 105, 125, 131, 79, 100 или 120.
58. Полипептид по любому из вариантов осуществления 51-57, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 59.
59. Полипептид по любому из вариантов осуществления 51-58, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 217 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 217, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 216 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 216.
60. Полипептид по любому из вариантов осуществления 3-14 или 22-39, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 146, 166 и 186, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 146, 166 или 188, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 151, 171 и 191, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 151, 171 или 191 (163Е3/54В12).
61. Полипептид по варианту осуществления 60, имеющий структуру варианта по варианту осуществления 14, где в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 166; a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186, и где в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191.
62. Полипептид по варианту осуществления 61, где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 146, 166, 186, 151, 171 или 191.
63. Полипептид по варианту осуществления 61 или 62, где аминокислотные последовательности отличаются от последовательностей SEQ ID NO: 146, 166, 186, 151, 171 или 191 только консервативными аминокислотными заменами.
64. Полипептид по любому из вариантов осуществления 61-63, где каркасные области в каждом мономере одного вариабельного домена содержат один или несколько ключевых остатков в положениях аминокислот 11, 37, 44, 45, 47, 83, 84, 103, 104 и 108, пронумерованных по Kabat.
65. Полипептид по любому из вариантов осуществления 61-64, где FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84; FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105; FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125; FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131; FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 89; FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110; FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
66. Полипептид по варианту осуществления 65, который модифицирован так, что FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 84, 105, 125, 131, 89, 110 или 130.
67. Полипептид по любому из вариантов осуществления 60-66, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62, или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 62.
68. Полипептид по любому из вариантов осуществления 60-64, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 217 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 217, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 219 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 219.
69. Полипептид по любому из вариантов осуществления 3-14 или 22-39, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 145, 165 и 185, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 145, 165 или 185, и где указанный один вариабельный домен первого
- 95 037063 иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 151, 171 и 191, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 151, 171 или 191 (163D2/54B12).
70. Полипептид по варианту осуществления 69, имеющий структуру варианта по варианту осуществления 14, где в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185, и где в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191.
71. Полипептид по варианту осуществления 70, где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 145, 165, 185, 151, 171 или 191.
72. Полипептид по варианту осуществления 70 или 71, где аминокислотные последовательности отличаются от последовательностей SEQ ID NO: 145, 165, 185, 151, 171 или 191 только консервативными аминокислотными заменами.
73. Полипептид по любому из вариантов осуществления 70-72, где каркасные области в каждом мономере одного вариабельного домена содержат один или несколько ключевых остатков в положениях аминокислот 11, 37, 44, 45, 47, 83, 84, 103, 104 и 108, пронумерованных по Kabat.
74. Полипептид по любому из вариантов осуществления 70-73, где FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83; FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104; FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124; FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131; FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 89; FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110; FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
75. Полипептид по варианту осуществления 74, который модифицирован так, что FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 83, 104, 124, 131, 89, 110 или 130.
76. Полипептид по любому из вариантов осуществления 69-75, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63 или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 63.
77. Полипептид по любому из вариантов осуществления 69-73, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 218 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 218, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 219 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 219.
78. Полипептид по любому из вариантов осуществления 3-14 или 22-39, где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 147, 167 и 187, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 147, 167 или 187, и где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 146, 166 и 186, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 146, 166 или 186 (2В2/163Е3).
79. Полипептид по варианту осуществления 78, имеющий структуру варианта по варианту осуществления 14, где в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 147, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 167, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 187, и где в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина, CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 166, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186.
80. Полипептид по варианту осуществления 79, где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 147, 167, 187, 146, 166 или 186.
81. Полипептид по варианту осуществления 79 или 80, где аминокислотные последовательности отличаются от последовательностей SEQ ID NO: 147, 167, 187, 146, 166 или 186 только консервативными аминокислотными заменами.
82. Полипептид по любому из вариантов осуществления 79-81, где каркасные области в каждом
- 96 037063 мономере одного вариабельного домена содержат один или несколько ключевых остатков в положениях аминокислот 11, 37, 44, 45, 47, 83, 84, 103, 104 и 108, пронумерованных по Kabat.
83. Полипептид по любому из вариантов осуществления 79-82, где FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85; FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106; FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126; FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131; FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84; FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 105; FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 125 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
84. Полипептид по варианту осуществления 83, который модифицирован так, что FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 85, 106, 126, 131, 84, 105 или 125.
85. Полипептид по любому из вариантов осуществления 78-84, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 64, или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 64.
86. Полипептид по любому из вариантов осуществления 78-82, где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 213 или 214, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 213 или 214, и где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 217 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 217.
87. Полипептид по любому из вариантов осуществления 3-14 или 22-39, где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 147, 167 и 187 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 147, 167 или 187, и где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 145, 165 и 185, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 145, 165 или 185 (2B2/163D2).
88. Полипептид по варианту осуществления 87, имеющий структуру варианта по варианту осуществления 14, где в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 147, CDR2 содержит аминокислотную последовательность в SEQ ID NO: 167, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 187, и где в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185.
89. Полипептид по варианту осуществления 88, где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 147, 167, 187, 145, 165 или 185.
90. Полипептид по варианту осуществления 88 или 89, где аминокислотные последовательности отличаются от последовательностей SEQ ID NO: 147, 167, 187, 145, 165 или 185 только консервативными аминокислотными заменами.
91. Полипептид по любому из вариантов осуществления 88-90, где каркасные области в каждом мономере одного вариабельного домена содержат один или несколько ключевых остатков в положениях аминокислот 11, 37, 44, 45, 47, 83, 84, 103, 104 и 108, пронумерованных по Kabat.
92. Полипептид по любому из вариантов осуществления 88-91, где FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85; FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106; FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126; FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131; FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83; FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 104; FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 124 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
93. Полипептид по варианту осуществления 94, который модифицирован так, что FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 85, 106, 126, 131, 83, 104 или 124.
94. Полипептид по любому из вариантов осуществления 87-93, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 65, или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 65.
95. Полипептид по любому из вариантов осуществления 87-91, где указанный один вариабельный
- 97 037063 домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 213 или 214 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 213 или 214, и где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 218 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 218.
96. Полипептид по любому из вариантов осуществления 3-14 или 22-39, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 143, 163 и 183, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 143, 163 или 183, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 147, 167 и 187, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 147, 167 или 187 (97А9/2В2).
97. Полипептид по варианту осуществления 96, имеющий структуру варианта по варианту осуществления 14, где в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 163, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183, и где в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 147, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 167, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 187.
98. Полипептид по варианту осуществления 97, где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 143, 163, 183, 147, 167 или 187.
99. Полипептид по варианту осуществления 97 или 98, где аминокислотные последовательности отличаются от последовательностей SEQ ID NO: 143, 163, 183, 147, 167 или 187 только консервативными аминокислотными заменами.
100. Полипептид по любому из вариантов осуществления 97-99, где каркасные области в каждом мономере одного вариабельного домена содержат один или несколько ключевых остатков в положениях аминокислот 11, 37, 44, 45, 47, 83, 84, 103, 104 и 108, пронумерованных по Kabat.
101. Полипептид по любому из вариантов осуществления 97-100, где FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81; FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133; FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85; FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 106; FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 126 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
102. Полипептид по варианту осуществления 101, который модифицирован так, что FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO:81, 102, 122, 133, 85, 106, 126 или 131.
103. Полипептид по любому из вариантов осуществления 96-102, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 47, или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 47.
104. Полипептид по любому из вариантов осуществления 96-100, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 213 и 214 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 213 или 214.
105. Полипептид по любому из вариантов осуществления 3-14 или 22-39, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 143, 163 и 183, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 143, 163 или 183, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина включает по меньшей мере одну CDR, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 151, 171 и 191, или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 151, 171 или 191 (97А9/54В12).
106. Полипептид по варианту осуществления 105, имеющий структуру варианта по варианту осуществления 14, где в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143; CDR2 содержит аминокислотную последователь
- 98 037063 ность SEQ ID NO: 163, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183, и где в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151; CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171; a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191.
107. Полипептид по варианту осуществления 106, где аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3, CDR4, CDR5 или CDR6 по меньшей мере на 80% идентичны любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 143, 163, 183, 151, 171 или 191.
108. Полипептид по варианту осуществления 106 или 107, где аминокислотные последовательности отличаются от последовательностей SEQ ID NO: 143, 163, 183, 151, 171 или 191 только консервативными аминокислотными заменами.
109. Полипептид по любому из вариантов осуществления 106-108, где каркасные области в каждом мономере одного вариабельного домена содержат один или несколько ключевых остатков в положениях аминокислот 11, 37, 44, 45, 47, 83, 84, 103, 104 и 108, пронумерованных по Kabat.
110. Полипептид по любому из вариантов осуществления 106-109, где FR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81; FR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 102; FR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122; FR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 133; FR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 89; FR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 110; FR7 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 130 и/или FR8 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 131.
111. Полипептид по варианту осуществления 110, который модифицирован так, что FR1, FR2, FR3, FR4, FR5, FR6, FR7 и FR8 имеют аминокислотные последовательности, которые по меньшей мере на 80% идентичны аминокислотным последовательностям, представленным в любой из SEQ ID NO: 81, 102, 122, 133, 89, 110, 13 0 или 131.
112. Полипептид по любому из вариантов осуществления 105-111, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61, или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 61.
113. Полипептид по любому из вариантов осуществления 105-109, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 219 или аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 80% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 219.
114. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-113, содержащий каркасные области с оптимизированной последовательностью, включая частично или полностью гуманизированные каркасные области.
115. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-114, который перекрестно реагирует с CXCR2 приматов, не являющихся человеком.
116. Полипептид по варианту осуществления 115, где указанным приматом является собакоподобная обезьяна.
117. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-116, который не обладает способностью перекрестно реагировать с CXCR2, происходящим от видов, не являющихся приматами.
118. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-117, который не обладает способностью перекрестно реагировать с другими рецепторами хемокинов семейства СХС.
119. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 и 114-118, где указанный второй антигенсвязывающий домен распознает эпитоп CXCR2, содержащий аминокислотные последовательности, выбранные из группы, состоящей из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 8, 9, 10, 11 и 12, или находящийся в указанных последовательностях.
120. Полипептид по варианту осуществления 119, где указанный первый антигенсвязывающий домен распознает эпитоп, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7 или находящийся в указанной последовательности.
121. Полипептид по варианту осуществления 119 или 120, где указанный первый антигенсвязывающий домен распознает эпитоп, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 4 или находящийся в указанной последовательности.
122. Полипептид по любому из вариантов осуществления 119-121, где указанный второй антигенсвязывающий домен распознает эпитоп, содержащий аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 5 или 6 или находящийся в указанных последовательностях.
123. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-122, который может специфически связываться с CXCR2 человека с константой диссоциации (KD), составляющей 10-5-10-12 моль/л или менее, предпочтительно 10-7-10-12 моль/л или менее, более предпочтительно 10-8-10-12 моль/л.
124. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-123, который может специ
- 99 037063 фически связываться с CXCR2 человека с константой скорости ассоциации kon, составляющей от 102 М-1с-1 и приблизительно до 107 М-1с-1; предпочтительно от 103 до 107 М-1с-1; более предпочтительно от 104 до 107 М-1с-1; а именно от 105 до 107 М-1с-1.
125. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-124, который может специфически связываться с CXCR2 человека с константой скорости диссоциации koff, составляющей от 1 с-1 до 10-6 с-1, предпочтительно от 10-2 до 10-6 с-1, более предпочтительно от 10-3 до 10-6 с-1, а именно 10-4 до 10-6 с-1.
126. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-125, который может специфически связываться с CXCR2 человека с аффинностью менее чем 500 нМ, предпочтительно менее чем 200 нМ, более предпочтительно менее чем 10 нМ, например менее чем 500 пМ.
127. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-126, который может ингибировать связывание GRO-α с CXCR2 человека с IC50 менее чем 20 нМ.
128. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-127, который может ингибировать GRO-a-индуцированное высвобождение кальция из эритроцитов (RBL), экспрессирующих CXCR2 человека IC50 менее чем 100 нМ.
129. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-128, который может ингибировать GRO-a-индуцированную аккумуляцию [35S]GTPyS в CXCR2-содержащих мембранах СНО человека с IC50 менее чем 50 нМ.
130. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-129, где указанный полипептид присутствует, в основном, в выделенной форме.
131. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-130, который представляет собой мультипаратопную конструкцию.
132. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-131, который был модифицирован так, чтобы он имел увеличенное время полужизни in vivo по сравнению с временем полужизни соответствующей немодифицированной аминокислотной последовательности.
133. Полипептид по варианту осуществления 132, где указанное увеличенное время полужизни сообщается одной или несколькими связывающими единицами, выбранными из группы, состоящей из сывороточных белков или их фрагментов; связывающих единиц, которые могут связываться с сывороточными белками; Fc-части и небольших белков или пептидов, которые могут связываться с сывороточными белками.
134. Полипептид по варианту осуществления 133, где указанные одна или несколько других связывающих единиц, которые сообщают полипептиду увеличенное время полужизни, выбраны из группы, состоящей из альбумина сыворотки человека или его фрагментов.
135. Полипептид по варианту осуществления 133, где указанные одна или несколько других связывающих единиц, которые сообщают полипептиду увеличенное время полужизни, выбраны из группы, состоящей из связывающих единиц, которые могут связываться с сывороточным альбумином (таким как альбумин сыворотки человека) или с сывороточным иммуноглобулином (таким как IgG).
136. Полипептид по варианту осуществления 132, где указанное увеличенное время полужизни сообщается одной или несколькими другими связывающими единицами, выбранными из группы, состоящей из доменных антител, аминокислотных последовательностей, которые могут быть использованы в качестве доменного антитела; однодоменных антител; аминокислотных последовательностей, которые могут быть использованы в качестве однодоменного антитела; dAb, аминокислотных последовательностей, которые могут быть использованы в качестве dAb, или нанотел, которые могут связываться с сывороточным альбумином (таким как альбумин сыворотки человека) или с сывороточным иммуноглобулином (таким как IgG).
137. Полипептид по варианту осуществления 134, где указанным полипептидом является один вариабельный домен иммуноглобулина, который может связываться с сывороточным альбумином (таким как альбумин сыворотки человека) или с сывороточным иммуноглобулином (таким как IgG).
138. Полипептид по любому из вариантов осуществления 132-137, имеющий время полужизни в сыворотке, которое по меньшей мере в 1,5 раза, предпочтительно по меньшей мере в 2 раза, а именно по меньшей мере в 5 раз, например по меньшей мере в 10 раз или более чем в 20 раз превышает время полужизни соответствующего немодифицированного полипептида.
139. Полипептид по любому из вариантов осуществления 132-138, имеющий время полужизни в сыворотке, которое более чем на 1 ч, предпочтительно более чем на 2 ч, более предпочтительно более чем на 6 ч, а именно более чем на 12 ч или даже более чем на 24, 48 или 72 ч превышает время полужизни соответствующего немодифицированного полипептида.
140. Полипептид по любому из вариантов осуществления 132-139, имеющий время полужизни в сыворотке человека, составляющее по меньшей мере приблизительно 12 ч, предпочтительно по меньшей мере 24 ч, более предпочтительно по меньшей мере 48 ч, еще более предпочтительно по меньшей мере 72 ч или более, например, по меньшей мере 5 дней (а именно, приблизительно 5-10 дней), предпочтительно по меньшей мере 9 дней (а именно, приблизительно 9-14 дней), более предпочтительно по мень
- 100 037063 шей мере приблизительно 10 дней (а именно, приблизительно 10-15 дней), или по меньшей мере приблизительно 11 дней (а именно, приблизительно 11-16 дней), более предпочтительно по меньшей мере приблизительно 12 дней (а именно, приблизительно 12-18 дней или более), или более чем 14 дней (а именно, приблизительно 14-19 дней).
141. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-140, который является ПЭГилированным.
142. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-140, который является ПАСилированным.
143. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-140, который является ГЭКилированным.
144. Полипептид по любому из вариантов осуществления 36 или 37 или по любому из вариантов осуществления 42-143, где указанный дополнительный антигенсвязывающий домен связывается с сывороточным белком с аффинностью менее чем 500 нМ, предпочтительно менее чем 200 нМ, более предпочтительно менее чем 10 нМ, например менее чем 50 0 нМ.
145. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144.
146. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая один вариабельный домен иммуноглобулина, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 25-43, 90 и 213-219.
147. Молекула нуклеиновой кислоты по варианту осуществления 146, содержащая нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из последовательностей нуклеиновой кислоты SEQ ID NO: 192-211.
148. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 44-69.
149. Вектор экспрессии, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты как вариант по любому из вариантов осуществления 145-148.
150. Клетка-хозяин, способная экспрессировать полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-149, кодируемый последовательностью нуклеиновой кислоты по любому из вариантов осуществления 145-148.
151. Одновалентное, двухвалентное, мультивалентное, бипаратопное или мультипаратропное нанотело, полученное путем культивирования клетки-хозяина по варианту осуществления 150.
152. Фармацевтическая композиция, содержащая полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
153. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144, используемый в качестве лекарственного средства.
154. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144, используемый для лечения хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ) и осложнений ХОБЛ.
155. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144, используемый для лечения кистозного фиброза, астмы, астмы в тяжелой форме, обострений астмы, аллергической астмы, острого поражения легких, острого респираторного дистресс-синдрома, идиопатического фиброза легких, ремоделирования дыхательных путей, синдрома облитерирующего бронхиолита или бронхопульмонарной дисплазии.
156. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144, используемый для лечения атеросклероза, гломерулонефрита, воспалительного заболевания кишечника (болезни Крона), ангиогенеза и заболеваний, характеризующихся образованием новых кровеносных сосудов, включая дегенерацию желтого пятна, диабетическую ретинопатию и диабетическую невропатию, рассеянный склероз, псориаз, возрастную дегенерацию желтого пятна, глазную болезнь Бехчета, увеит, легочную артериальную гипертензию (ЛАГ), включая идиопатическую ЛАГ, наследственную ЛАГ и заболевание, связанное с ЛАГ; хронические воспалительные заболевания, ревматоидный артрит, остеоартрит, немелкоклеточную карциному, рак толстой кишки, рак поджелудочной железы, рак пищевода, рак яичника, рак молочной железы, солидные опухоли и их метастазы, меланому, гепатоцеллюлярную карциному или ишемическое реперфузионное повреждение.
157. Способ лечения хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ) или осложнений ХОБЛ, где указанный способ включает введение индивидууму эффективного количества полипептида по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144.
158. Способ лечения состояния, выбранного из группы, состоящей из кистозного фиброза, астмы, астмы в тяжелой форме, обострений астмы, аллергической астмы, острого поражения легких, острого респираторного дистресс-синдрома, идиопатического фиброза легких, ремоделирования дыхательных путей, синдрома облитерирующего бронхиолита или бронхопульмонарной дисплазии, где указанный способ включает введение индивидууму эффективного количества полипептида по любому из вариантов осуществления 1-38 или 41-143.
- 101 037063
159. Способ лечения состояния, выбранного из группы, состоящей из атеросклероза, гломерулонефрита, воспалительного заболевания кишечника (болезни Крона), ангиогенеза и заболеваний, характеризующихся образованием новых кровеносных сосудов, включая дегенерацию желтого пятна, диабетическую ретинопатию и диабетическую невропатию, рассеянный склероз, псориаз, возрастную дегенерацию желтого пятна, глазную болезнь Бехчета, увеит, легочную артериальную гипертензию (ЛАГ), включая идиопатическую ЛАГ, наследственную ЛАГ и заболевание, связанное с ЛАГ; хронические воспалительные заболевания, ревматоидный артрит, остеоартрит, немелкоклеточную карциному, рак толстой кишки, рак поджелудочной железы, рак пищевода, рак яичника, рак молочной железы, солидные опухоли и их метастазы, меланому, гепатоцеллюлярную карциному и ишемическое реперфузионное повреждение, где указанный способ включает введение индивидууму эффективного количества полипептида по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144.
160. Применение полипептида по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144 для получения лекарственного препарата для лечения хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ) или осложнений ХОБЛ.
161. Применение полипептида по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144 для получения лекарственного препарата для лечения астмы, астмы в тяжелой форме, обострений астмы, аллергической астмы, острого поражения легких, острого респираторного дистресс-синдрома, идиопатического фиброза легких, ремоделирования дыхательных путей, синдрома облитерирующего бронхиолита или бронхопульмонарной дисплазии.
162. Применение полипептида по любому из вариантов осуществления 1-38 или 42-144 для получения лекарственного препарата для лечения атеросклероза, гломерулонефрита, воспалительного заболевания кишечника (болезни Крона), ангиогенеза и заболеваний, характеризующихся образованием новых кровеносных сосудов, включая дегенерацию желтого пятна, диабетическую ретинопатию и диабетическую невропатию, рассеянный склероз, псориаз, возрастную дегенерацию желтого пятна, глазную болезнь Бехчета, увеит, легочную артериальную гипертензию (ЛАГ), включая идиопатическую ЛАГ, наследственную ЛАГ и заболевание, связанное с ЛАГ; хронические воспалительные заболевания, ревматоидный артрит, остеоартрит, немелкоклеточную карциному, рак толстой кишки, рак поджелудочной железы, рак пищевода, рак яичника, рак молочной железы, солидные опухоли и их метастазы, меланому, гепатоцеллюлярную карциному или ишемическое реперфузионное повреждение.
163. Полипептид по любому из вариантов осуществления 1-38, который обладает способностью перекрестно блокировать связывание CXCR2 с полипептидом по любому из вариантов осуществления 49, 58, 67, 76, 85, 94, 103 или 112.
164. Молекула по любому из вариантов осуществления 39-41, где указанные первый и второй антигенсвязывающие домены имеют любой из отличительных признаков, характерных для указанных доменов по любому из вариантов осуществления 1-22, 32-38 или 42-144.
165. Молекула по варианту осуществления 164, обладающая любым из отличительных признаков по вариантам осуществления 106-135.
166. Полипептид, содержащий по меньшей мере один вариабельный домен одного иммуноглобулина, который направлен непосредственно против CXCR2 или связывается с CXCR2, и который обладает способностью перекрестно блокировать связывание CXCR2 с полипептидом по любому из вариантов осуществления 49, 58, 67, 76, 85, 94, 103 или 112.
167. Полипептид по вариантам осуществления 3-14 и 22-39, имеющий такую же структуру, как и вариант по варианту осуществления 14, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23727, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23726.
168. Полипептид по варианту осуществления 167, который в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина также содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 23727, и который в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 2 3726.
169. Полипептид по варианту осуществления 168, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина связан с указанным одним вариабельным доменом первого иммуноглобулина посредством пептидного линкера с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 220.
170. Полипептид по вариантам осуществления 3-14 и 22-39, имеющий такую же структуру, как и вариант по варианту осуществления 14, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23725, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23726.
- 102 037063
171. Полипептид по варианту осуществления 170, который в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина также содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 23725, и который в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 2 3726.
172. Полипептид по варианту осуществления 171, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина связан с указанным одним вариабельным доменом первого иммуноглобулина посредством пептидного линкера с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 220.
173. Полипептид по вариантам осуществления 3-14 и 22-39, имеющий такую же структуру, как и вариант по варианту осуществления 14, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23725, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23728.
174. Полипептид по варианту осуществления 173, который в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина также содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 23725, и который в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 2 3728.
175. Полипептид по варианту осуществления 174, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина связан с указанным одним вариабельным доменом первого иммуноглобулина посредством пептидного линкера с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 220.
176. Полипептид по вариантам осуществления 3-14 и 22-39, имеющий такую же структуру, как и вариант по варианту осуществления 14, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23727, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23728.
177. Полипептид по варианту осуществления 176, который в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина также содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 23727, и который в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 2 3728.
178. Полипептид по варианту осуществления 177, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина связан с указанным одним вариабельным доменом первого иммуноглобулина посредством пептидного линкера с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 220.
179. Полипептид по вариантам осуществления 3-14 и 22-39, имеющий такую же структуру, как и вариант по варианту осуществления 14, где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23723, и где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23725.
180. Полипептид по варианту осуществления 179, который в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина также содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 23723, и который в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 2 3725.
181. Полипептид по варианту осуществления 180, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина связан с указанным одним вариабельным доменом первого иммуноглобулина посредством пептидного линкера с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 220.
182. Полипептид по вариантам осуществления 3-14 и 22-39, имеющий такую же структуру, как и вариант по варианту осуществления 14, где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23723, и где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23727.
183. Полипептид по варианту осуществления 182, который в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина также содержит области FR с аминокислотными последовательностями,
- 103 037063 пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 23723, и который в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 2 3727.
184. Полипептид по варианту осуществления 183, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина связан с указанным одним вариабельным доменом первого иммуноглобулина посредством пептидного линкера с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 220.
185. Полипептид по вариантам осуществления 3-14 и 22-39, имеющий такую же структуру, как и вариант по варианту осуществления 14, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat, и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23724, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23723.
186. Полипептид по варианту осуществления 185, который в одном вариабельном домене второго иммуноглобулина также содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 23724, и который в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 23723.
187. Полипептид по варианту осуществления 186, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина связан с указанным одним вариабельным доменом первого иммуноглобулина посредством пептидного линкера с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 220.
188. Полипептид по вариантам осуществления 3-14 и 22-39, имеющий такую же структуру, как и вариант по варианту осуществления 14, где указанный один вариабельный домен второго иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23724, и где указанный один вариабельный домен первого иммуноглобулина содержит аминокислотные последовательности CDR, пронумерованные по Kabat и кодируемые депонированной плазмидой DSM 23728.
189. Полипептид по варианту осуществления 188, который в одном вариабельном домене второго иммуноглобулина также содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 23724, и который в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина содержит области FR с аминокислотными последовательностями, пронумерованными по Kabat и кодируемыми депонированной плазмидой DSM 23728.
190. Полипептид по варианту осуществления 189, где один вариабельный домен второго иммуноглобулина связан с указанным одним вариабельным доменом первого иммуноглобулина посредством пептидного линкера с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 220.
- 104 037063
НОВАРТИС АГ
CXCR2-СВЯЗЫВАЮЩИЕ ПОЛИПЕПТИДЫ
РАТО54087
- 105 037063
Met Glu Asp Leu Ser Asn Tyr Ser Tyr Ser Ser Thr Leu Pro Pro Phe 15 1015
Leu Leu Asp Ala Ala Pro Cys Glu Pro Glu Ser Leu Glu lie Asn Lys 20 2530
Tyr Phe Vai Vai lie lie Tyr Ala Leu Vai Phe Leu Leu Ser Leu Leu
4045
Gly Asn Ser Leu Vai Met Leu Vai lie Leu Tyr Ser Arg Vai Gly Arg 50 5560
Ser Vai Thr Asp Vai Tyr Leu Leu Asn Leu Ala Leu Ala Asp Leu Leu 65 70 7580
Phe Ala Leu Thr Leu Pro He Trp Ala Ala Ser Lys Vai Asn Gly Trp 85 9095
He Phe Gly Thr Phe Leu Cys Lys Vai Vai Ser Leu Leu Lys Glu Vai
100 105110
Asn Phe Tyr Ser Gly He Leu Leu Leu Ala Cys lie Ser Vai Asp Arg
115 120125
Tyr Leu Ala lie Vai His Ala Thr Arg Thr Leu Thr Gin Lys Arg Tyr
130 135140
Leu Vai Lys Phe lie Cys Leu Ser lie Trp Gly Leu Ser Leu Leu Leu
145 150 155160
Ala Leu Pro Vai Leu Leu Phe Arg Arg Thr Vai Tyr Ser Ser Asn Vai
165 170175
Ser Pro Ala Cys Tyr Glu Asp Met Gly Asn Asn Thr Ala Asn Trp Arg
180 185190
Met Leu Leu Arg lie Leu Pro Gin Ser Phe Gly Phe lie Vai Pro Leu
195 200205
Leu lie Met Leu Phe Cys Tyr Gly Phe Thr Leu Arg Thr Leu Phe Lys
210 215220
Ala His Met Gly Gin Lys His Arg Ala Met Arg Vai lie Phe Ala Vai
225 230 235240
Vai Leu lie Phe Leu Leu Cys Trp Leu Pro Tyr Asn Leu Vai Leu Leu
245 250255
Ala Asp Thr Leu Met Arg Thr Gin Vai lie Gin Glu Thr Cys Glu Arg
260 265270
Arg Asn His He Asp Arg Ala Leu Asp Ala Thr Glu lie Leu Gly lie
275 280285
Leu His Ser Cys Leu Asn Pro Leu He Tyr Ala Phe lie Gly Gin Lys
290 295300
Phe Arg His Gly Leu Leu Lys He Leu Ala lie His Gly Leu He Ser
305 310 315320
Lys Asp Ser Leu Pro Lys Asp Ser Arg Pro Ser Phe Vai Gly Ser Ser
325 330335
Ser Gly His Thr Ser Thr Thr Leu
340 <210>3 <211> 355 <212> Белок <213> Macaca fascicularis <400>3
Met Gin Ser Phe Asn Phe Glu Asp Phe Trp Glu Asn Glu Asp Phe Ser
1015
Asn Tyr Ser Tyr Ser Ser Asp Leu Pro Pro Ser Leu Pro Asp Vai Ala 20 2530
Pro Cys Arg Pro Glu Ser Leu Glu He Asn Lys Tyr Phe Vai Vai lie
4045 lie Tyr Ala Leu Vai Phe Leu Leu Ser Leu Leu Gly Asn Ser Leu Vai 50 5560
Met Leu Vai He Leu His Ser Arg Vai Gly Arg Ser lie Thr Asp Vai 65 70 7580
Tyr Leu Leu Asn Leu Ala Met Ala Asp Leu Leu Phe Ala Leu Thr Leu 85 9095
- 106 037063
Pro lie Trp Ala Ala Ala Lys Vai
100
Asn Gly Trp He Phe Gly Thr Phe
105 110
Leu Cys Lys Vai Vai Ser Leu Leu
115 120
Lys Glu Vai Asn Phe Tyr Ser Gly
125 lie Leu Leu Leu Ala Cys lie Ser
130 135
Vai Asp Arg Tyr Leu Ala lie Vai
140
His Ala Thr Arg Thr Leu Thr Gin
145 150
Lys Arg Tyr Leu Vai Lys Phe Vai
155 160
Cys Leu Ser lie Trp Ser Leu Ser
165
Leu Leu Leu Ala Leu Pro Vai Leu
170 175
Leu Phe Arg Arg Thr Vai Tyr Leu
180
Thr Tyr lie Ser Pro Vai Cys Tyr 185 190
Glu Asp Met Gly Asn Asn Thr Ala
195 200
Lys Trp Arg Met Vai Leu Arg lie
205
Leu Pro Gin Thr Phe Gly Phe lie
210 215
Leu Pro Leu Leu He Met Leu Phe
220
Cys Tyr Gly Phe Thr Leu Arg Thr 225 230
Leu Phe Lys Ala His Met Gly Gin
235 240
Lys His Arg Ala Met Arg Vai He
245
Phe Ala Vai Vai Leu lie Phe Leu
250 255
Leu Cys Trp Leu Pro Tyr His Leu
260
Vai Leu Leu Ala Asp Thr Leu Met
265 270
Arg Thr Arg Leu He Asn Glu Thr
275 280
Cys Gin Arg Arg Asn Asn lie Asp
285
Gin Ala Leu Asp Ala Thr Glu lie
290 295
Leu Gly He Leu His Ser Cys Leu
300
Asn Pro Leu lie Tyr Ala Phe lie 305 310
Gly Gin Lys Phe Arg His Gly Leu
315 320
Leu Lys He Leu Ala Thr His Gly 325
Lys Asp Ser Arg Pro Ser Phe Vai 340
Leu lie Ser Lys Asp Ser Leu Pro 330 335
Gly Ser Ser Ser Gly His Thr Ser 345 350
Thr Thr Leu
355 <210> 4 <211>14 <212> Белок <213> Macaca fascicularis <400>4
Met Gin Ser Phe Asn Phe Glu Asp 15
Phe Trp Glu Asn Glu Asp 10 <210>5 <211>18 <212> Белок <213> Macaca fascicularis <400>5
Cys Thr Leu Met Arg Thr Arg Leu 15 lie Asn Glu Thr Leu Gin Arg Arg
15
Asn Cys <210>6 <211>26 <212> Белок <213> Macaca fascicularis <400>6
Cys Arg Arg Thr Vai Tyr Leu Thr
Tyr lie Ser Pro Vai Leu Tyr Glu
15
Asp Met Gly Asn Asn Thr Ala Leu 20
Trp Cys 25 <210>7 <211>19 <212> Белок <213> Homo sapiens <400>7
Met Glu Asp Phe Asn Met Glu Ser
Asp Ser Phe Glu Asp Phe Trp Lys
15
107
108
tcaqtaaccc qqatcccccg ccaccgctgc ccccaccgcc gccacccccg ccccaccgcc tgaggagacg gtgacccg aggttactga ggatccggcg gtggaggcag cggaggtggg ggctctggtg cgaggtgcag ctggtggagt ctgq
- 109 037063
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr 20 2530
Trp Met Tyr Trp Val Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gly Leu Asp Trp Val
4045
Ser Ala lie Asn Ala Gly Gly Asp Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Pro Val 50 5560
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Asn Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 7580
Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys 85 9095
Ala Thr Val Arg Gly Thr Ala Arg Asp Leu Asp Tyr Trp Gly Gin Gly
100 105110
Thr Gin Val Thr Val Ser Ser
115
123
Белок
Искусственная последовательность моновалентные нанотела против CXCR2 <210>
<211>
<212>
<213>
<220>
<223>
<400>
Glu Val Lys Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Leu Ser Gly Arg lie Gly Ser lie Asn 20 2530
Ala Met Gly Trp Tyr Arg Gin Val Ser Gly Gin Gin Arg Glu Leu Val 35 4045
Ala Val Ser Arg Ser Gly Gly Ser Thr Asp lie Ala Asp Ser Val Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Gly Lys Asn Thr Val Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asp Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Tyr 85 9095
Ala His Thr Ser Ser Tyr Ser Asn Trp Arg Val Tyr Asn Asn Asp Tyr
100 105110
Trp Gly Gin Gly Thr Gin Val Thr Val Ser Ser
115120 <210>27 <211>116 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>27
Glu Val Gin Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Thr Cys Ala Ala Ser Gly Arg He Gly Thr lie Asn 20 2530
Ala Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Val 35 4045
Ala Val He Thr Ser Gly Gly Arg lie Asp Tyr Ala Asp Ser Val Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Tyr Asn
9095
Val Glu Thr Val Val Gly Ala Val Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Val
100 105110
Thr Val Ser Ser
115 <210>
<211>
<212>
<213>
<220>
116
Белок
Искусственная последовательность
110 <223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>28
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Met Gly Asn lie Asn 20 2530
Ala Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Leu Vai 35 4045
Ala Lys He Thr Arg Gly Gly Ala He Thr Tyr Ala Asp Ser Vai Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr He Ala Arg Asp Asn lie Leu Asn Thr Ala Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Asp Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Tyr Asn 85 9095
Vai Asp Gly Gly Pro Ser Gin Asn Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai 100 105HO
Thr Vai Ser Ser
115 <210>29 <211>126 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>29
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr 20 2530
Ala He Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Arg Vai 35 4045
Ser Cys lie Ser Gly Ser Asp Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Vai 50 5560
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Ser Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr 65 70 7580
Leu Gin Met Asn Asn Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys 85 9095
Ala Ala Tyr Trp Gly Leu Thr Leu Arg Leu Trp Met Pro Pro His Arg
100 105110
Tyr Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
115 120125 <210>30 <211>111 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>30
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Ser Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Leu He Phe Arg Leu Ser 20 2530
Gly Met Ala Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Arg Gin Arg Glu Trp Vai
4045
Ala Vai Leu Thr Lys Asp Gly Thr Leu His Tyr Ala Asp Pro Vai Lys
5560
Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asn Asn Ala Glu Asn Thr Trp Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala lie Tyr Tyr Cys Asn 85 9095
Thr Gly Arg Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
100 105110 <210>31 <211>115 <212> Белок <213> Искусственная последовательность
- 111 037063
Gly Lys
Thr His Tyr
Asn Ala Lys
Asp Thr Ala моновалентные нанотела против CXCRz
- 112 037063 <210> 34 <211> 124 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>34
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Leu Ala Tyr Tyr 20 2530
Thr Vai Gly Trp Phe Arg Arg Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Gly He 35 4045
Ser Cys He Ser Ser Ser Asp Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Vai 50 5560
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr 65 70 7580
Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys 85 9095
Ala Ala Asp Arg Arg Thr Asp Cys Lys Lys Gly Arg Vai Gly Ser Gly
100 105110
Ser Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
115120 <210>35 <211>125 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>35
Lys Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Ala Phe Asn Tyr Tyr 20 2530
Vai Met Ala Trp Phe Arg Gin Ala Gin Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai 35 4045
Ala Ala lie Ser Thr Arg Gly Ser Met Thr Lys Tyr Ser Asp Ser Vai 50 5560
Gin Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr 65 70 7580
Leu His Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys 85 9095
Ala Ala Asp Pro Arg Gly Ser Ser Trp Ser Phe Ser Ser Gly Gly Tyr
100 105110
Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
115 120125 <210>36 <211>111 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>36
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Vai Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly He He Phe Arg Leu Ser 20 2530
Ala Leu Gly Trp Thr Arg Gin Gly Pro Gly Lys Ala Arg Glu Trp Vai
4045
Ala Gly lie Asn Ser Asp Gly Thr Thr Asn Tyr Ala Asp Pro Vai Lys
5560
Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr lie Tyr Leu 65 70 7580
His Met Asp Met Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala
9095
- 113 037063
Ser Gly Lys Tyr Arg Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
100 105110 <210>37 <211>115 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>37
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Glu
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Asp Phe Lys 20 2530
Vai Met Gly Trp Tyr Arg Gin Pro Pro Gly Lys Gin Arg Glu Gly Vai
4045
Ala Ala lie Arg Leu Ser Gly Asn Met His Tyr Ala Glu Ser Vai Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr lie Ser Lys Ala Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Lys 85 9095
Vai Asn lie Arg Gly Gin Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr
100 105110
Vai Ser Ser
115 <210>38 <211>120 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>38
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Thr Leu Ser Cys Ala Vai Ser Gly Ser Ser Phe Arg lie Asn
2530
Thr Met Gly Trp Tyr Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai 35 4045
Ala Ala Arg Asp Arg Gly Gly Tyr lie Asn Tyr Vai Asp Ser Vai Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr Vai Ser Arg Asp Asn Ala Lys Pro Thr Met Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys His 85 9095
Ala Gly Thr Gin Asp Arg Thr Gly Arg Asn Phe Asp His Trp Gly Gin
100 105110
Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
115120 <210>39 <211>126 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>39
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly
Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Vai Ala 20
Ser Gly Ser lie Vai Arg lie Asn 25 30
Thr Met Gly Trp Tyr Arg Gin Thr
40
Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai 45
Ala Asp lie Thr Ser Gly Gly Asn
55
He Asn Tyr He Asp Ala Vai Lys 60
Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp 65 70
Asn Thr Lys Asn Thr Vai Tyr Leu 75 80
Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu
Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Asn
95
- 114 037063
моновалентные нанотела против CXCR2 моновалентные нанотела против CXCR2
Arg Thr Phe Ser Asp
Lys Glu Arg Glu Phe
Phe Tyr Thr Ala Ser
Ala Lys Asn Thr Met
Thr Ala Vai Tyr Tyr моновалентные нанотела против CXCR2
Arg lie Phe Ser Ser
Lys Glu Arg Glu Phe
115
против CXCR2
- 116 037063
Vai Ala Asp He Thr Ser Gly Gly Asn lie Asn Tyr lie Asp Ala Vai
210 215220
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Thr Lys Asn Thr Vai Tyr
225 230 235240
Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys
245 250255
Asn Ala Glu He Vai Vai Leu Vai Gly Vai Trp Thr Gin Arg Ala Arg
260 265270
Thr Gly Asn Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
275 280285 <210>45 <211>257 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> мультивалентные нанотела против CXCR2 <400>45
Glu 1 | Vai | Gin | Leu | Vai 5 | Glu | Ser | Gly Gly Gly 10 | Leu | Vai | Gin | Pro | Gly 15 | Gly |
Ser | Vai | Arg | Leu 20 | Ser | Cys | Vai | Ala Ser Gly 25 | He | He | Phe | Arg 30 | Leu | Ser |
Ala | Leu | Gly 35 | Trp | Thr | Arg | Gin | Gly Pro Gly 40 | Lys | Ala | Arg 45 | Glu | Trp | Vai |
Ala | Gly 50 | He | Asn | Ser | Asp | Gly 55 | Thr Thr Asn | Tyr | Ala 60 | Asp | Pro | Vai | Lys |
Gly 65 | Arg | Phe | Thr | He | Ser 70 | Arg | Asp Asn Ala | Lys 75 | Asn | Thr | He | Tyr | Leu 80 |
His | Met | Asp | Met | Leu 85 | Lys | Pro | Glu Asp Thr 90 | Ala | Vai | Tyr | Tyr | Cys 95 | Ala |
Ser | Gly | Lys | Tyr 100 | Arg | Gly | Gin | Gly Thr Gin 105 | Vai | Thr | Vai | Ser 110 | Ser | Gly |
Gly | Gly | Gly 115 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly Ser Gly 120 | Gly | Gly | Gly 125 | Ser | Gly | Gly |
Gly | Gly 130 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly 135 | Ser Gly Gly | Gly | Gly 140 | Ser | Gly | Gly | Gly |
Gly 145 | Ser | Glu | Vai | Gin | Leu 150 | Vai | Glu Ser Gly | Gly 155 | Gly | Leu | Vai | Gin | Pro 160 |
Gly | Gly | Ser | Vai | Arg 165 | Leu | Ser | Cys Vai Ala 170 | Ser | Gly | He | He | Phe 175 | Arg |
Leu | Ser | Ala | Leu 180 | Gly | Trp | Thr | Arg Gin Gly 185 | Pro | Gly | Lys | Ala 190 | Arg | Glu |
Trp | Vai | Ala 195 | Gly | He | Asn | Ser | Asp Gly Thr 200 | Thr | Asn | Tyr 205 | Ala | Asp | Pro |
Vai | Lys 210 | Gly | Arg | Phe | Thr | He 215 | Ser Arg Asp | Asn | Ala 220 | Lys | Asn | Thr | He |
Tyr 225 | Leu | His | Met | Asp | Met 230 | Leu | Lys Pro Glu | Asp 235 | Thr | Ala | Vai | Tyr | Tyr 240 |
Cys | Ala | Ser | Gly | Lys 245 | Tyr | Arg | Gly Gin Gly 250 | Thr | Gin | Vai | Thr | Vai 255 | Ser |
Ser <210>46 <211>276 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>46
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Glu Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser lie Leu Thr lie Asn 20 2530
Ala Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai
4045
- 117 037063
- 118 037063
Vai Vai Arg Arg Thr Arg Gly Gly Ser Thr Thr Tyr Gin Asp Ser Vai
210 215220
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp lie Ala Lys Lys Thr Met Tyr
225 230 235240
Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys
245 250255
Met Leu Asp Asp Arg Gly Gly Vai Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai
260 265270
Thr Vai Ser Ser
275 <210>48 <211> 261 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>48
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Glu Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser lie Leu Thr He Asn 20 2530
Ala Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai
4045
Vai Arg Arg Thr Arg Gly Gly Ser Thr Thr Tyr Gin Asp Ser Vai Lys
5560
Gly Arg Phe Thr He Ser Ala Asp lie Ala Lys Lys Thr Met Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Met
9095
Leu Asp Asp Arg Gly Gly Vai Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr 100 105110
Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 115 120125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
130 135140
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly
145 150 155160
Leu Vai Gin Pro Gly Gly Ser Vai Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly
165 170175 lie He Phe Arg Leu Ser Ala Leu Gly Trp Thr Arg Gin Gly Pro Gly
180 185190
Lys Ala Arg Glu Trp Vai Ala Gly lie Asn Ser Asp Gly Thr Thr Asn
195 200205
Tyr Ala Asp Pro Vai Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala
210 215220
Lys Asn Thr lie Tyr Leu His Met Asp Met Leu Lys Pro Glu Asp Thr
225 230 235240
Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ser Gly Lys Tyr Arg Gly Gin Gly Thr Gin
245 250255
Vai Thr Vai Ser Ser
260 <210>49 <211>261 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>49
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Vai Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly lie lie Phe Arg Leu Ser 20 2530
Ala Leu Gly Trp Thr Arg Gin Gly Pro Gly Lys Ala Arg Glu Trp Vai 35 4045
- 119 037063
Ala Gly lie Asn Ser Asp Gly Thr Thr Asn Tyr Ala Asp Pro Vai Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr lie Tyr Leu 65 70 7580
His Met Asp Met Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala 85 9095
Ser Gly Lys Tyr Arg Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser Gly
100 105110
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
115 120125
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
130 135140
Gly Ser Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Glu Leu Vai Gin Pro
145 150 155160
Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser lie Leu Thr
165 170175 lie Asn Ala Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu
180 185190
Leu Vai Vai Arg Arg Thr Arg Gly Gly Ser Thr Thr Tyr Gin Asp Ser
195 200205
Vai Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp lie Ala Lys Lys Thr Met
210 215220
Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr
225 230 235240
Cys Met Leu Asp Asp Arg Gly Gly Vai Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin
245 250255
Vai Thr Vai Ser Ser
260 <210>50 <211>272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400> 50
Glu 1 | Vai | Gin Leu | Vai 5 | Glu | Ser | Gly | Gly Gly Leu 10 | Vai | Gin | Pro | Gly 15 | Gly |
Ser | Leu | Arg Leu 20 | Ser | Cys | Vai | Ala | Ser Gly Ser 25 | He | Vai | Arg 30 | He | Asn |
Thr | Met | Gly Trp 35 | Tyr | Arg | Gin | Thr 40 | Pro Gly Lys | Gin | Arg 45 | Glu | Leu | Vai |
Ala | Asp 50 | He Thr | Ser | Gly | Gly 55 | Asn | lie Asn Tyr | He 60 | Asp | Ala | Vai | Lys |
Gly 65 | Arg | Phe Thr | He | Ser 70 | Arg | Asp | Asn Thr Lys 75 | Asn | Thr | Vai | Tyr | Leu 80 |
Gin | Met | Asn Ser | Leu 85 | Lys | Pro | Glu | Asp Thr Ala 90 | Vai | Tyr | Tyr | Cys 95 | Asn |
Ala | Glu | He Vai 100 | Vai | Leu | Vai | Gly | Vai Trp Thr 105 | Gin | Arg | Ala 110 | Arg | Thr |
Gly | Asn | Tyr Trp 115 | Gly | Gin | Gly | Thr 120 | Gin Vai Thr | Vai | Ser 125 | Ser | Gly | Gly |
Gly | Gly 130 | Ser Gly | Gly | Gly | Gly 135 | Ser | Gly Gly Gly | Gly 140 | Ser | Gly | Gly | Gly |
Gly 145 | Ser | Gly Gly | Gly | Gly 150 | Ser | Gly | Gly Gly Gly 155 | Ser | Gly | Gly | Gly | Gly 160 |
Ser | Glu | Vai Gin | Leu 165 | Vai | Glu | Ser | Gly Gly Gly 170 | Leu | Vai | Gin | Pro 175 | Gly |
Gly | Ser | Vai Arg 180 | Leu | Ser | Cys | Vai | Ala Ser Gly 185 | He | He | Phe 190 | Arg | Leu |
Ser | Ala | Leu Gly 195 | Trp | Thr | Arg | Gin 200 | Gly Pro Gly | Lys | Ala 205 | Arg | Glu | Trp |
120
Val Ala Gly He Asn Ser Asp Gly Thr Thr Asn Tyr Ala Asp Pro Val
210 215220
Lys Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr lie Tyr
225 230 235240
Leu His Met Asp Met Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
245 250255
Ala Ser Gly Lys Tyr Arg Gly Gin Gly Thr Gin Val Thr Val Ser Ser
260 265270 <210>51 <211> 272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>51
Glu Val Gin Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Val Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly He lie Phe Arg Leu Ser 20 2530
Ala Leu Gly Trp Thr Arg Gin Gly Pro Gly Lys Ala Arg Glu Trp Val 35 4045
Ala Gly lie Asn Ser Asp Gly Thr Thr Asn Tyr Ala Asp Pro Val Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr lie Tyr Leu 65 70 7580
His Met Asp Met Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala 85 9095
Ser Gly Lys Tyr Arg Gly Gin Gly Thr Gin Val Thr Val Ser Ser Gly
100 105110
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
115 120125
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 130 135140
Gly Ser Glu Val Gin Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro
145 150 155160
Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly Ser He Val Arg
165 170175
He Asn Thr Met Gly Trp Tyr Arg Gin Thr Pro Gly Lys Gin Arg Glu
180 185190
Leu Val Ala Asp He Thr Ser Gly Gly Asn He Asn Tyr lie Asp Ala
195 200205
Val Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Thr Lys Asn Thr Val
210 215220
Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
225 230 235240
Cys Asn Ala Glu He Val Val Leu Val Gly Val Trp Thr Gin Arg Ala
245 250255
Arg Thr Gly Asn Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Val Thr Val Ser Ser
260 265270 <210>52 <211>239 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>52
Glu Val Gin Leu Val Glu Ser Gly Gly Glu Leu Val Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser He Leu Thr lie Asn 20 2530
Ala Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Val 35 4045
Val Arg Arg Thr Arg Gly Gly Ser Thr Thr Tyr Gin Asp Ser Val Lys 50 5560
- 121 037063
Gly Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp He Ala Lys Lys Thr Met Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Met
9095
Leu Asp Asp Arg Gly Gly Vai Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr
100 105110
Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin Leu
115 120125
Vai Glu Ser Gly Gly Glu Leu Vai Gin Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu
130 135140
Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser He Leu Thr He Asn Ala Met Gly Trp
145 150 155160
Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai Vai Arg Arg Thr
165 170175
Arg Gly Gly Ser Thr Thr Tyr Gin Asp Ser Vai Lys Gly Arg Phe Thr
180 185190 lie Ser Ala Asp He Ala Lys Lys Thr Met Tyr Leu Gin Met Asn Ser
195 200205
Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Met Leu Asp Asp Arg
210 215220
Gly Gly Vai Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser 225 230235 <210>53 <211>274 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400> 53
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly 1 5
Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Glu
15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala 20
Ser Gly Ser Thr Phe Asp Phe Lys 25 30
Vai Met Gly Trp Tyr Arg Gin Pro
40
Pro Gly Lys Gin Arg Glu Gly Vai
Ala Ala He Arg Leu Ser Gly Asn
55
Met His Tyr Ala Glu Ser Vai Lys 60
Gly Arg Phe Thr lie Ser Lys Ala 65 70
Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu
80
Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu 85
Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Lys
95
Vai Asn lie Arg Gly Gin Asp Tyr
100
Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr
105 110
Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser
115 120
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
130 135
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
140
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai
145 150
Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly
155 160
Leu Vai Gin Ala Gly Gly Ser Leu
165
Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly
170 175
Arg Thr Phe Ser Asp Tyr Ala Met
180
Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly 185 190
Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala Ala
195 200 lie Thr Trp Asn Gly Gly Arg Vai
205
Phe Tyr Thr Ala Ser Vai Lys Gly
210 215
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn
220
Ala Lys Asn Thr Met Tyr Leu Gin 225 230
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp
235 240
Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala
245
Asp Lys Asp Arg Arg Thr Asp Tyr
250 255
Leu Gly His Pro Vai Ala Tyr Trp
260
Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai
265 270
122
Ser Ser <210> 54 <211> 272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>54
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Glu 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Asp Phe Lys 20 2530
Vai Met Gly Trp Tyr Arg Gin Pro Pro Gly Lys Gin Arg Glu Gly Vai 35 4045
Ala Ala He Arg Leu Ser Gly Asn Met His Tyr Ala Glu Ser Vai Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr lie Ser Lys Ala Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Lys 85 9095
Vai Asn lie Arg Gly Gin Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr
100 105110
Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
130 135140
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly
145 150 155160
Leu Vai Gin Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly 165 170175
Arg lie Phe Ser Ser Asn Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly 180 185190
Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala Ala lie Thr Trp Arg Ser Gly Gly Ser
195 200205
Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser Ala Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp
210 215220
Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu
225 230 235240
Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala Gly Gly Ser Ser Trp Leu Ser
245 250255
Phe Pro Pro Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
260 265270 <210>55 <211>283 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>55
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asp Tyr 20 2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai 35 4045
Ala Ala lie Thr Trp Asn Gly Gly Arg Vai Phe Tyr Thr Ala Ser Vai
5560
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Met Tyr 65 70 7580
Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys 85 9095
Ala Ala Asp Lys Asp Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Gly His Pro Vai Ala
100 105110
123
Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly
115 120125
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
130 135140
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu
145 150 155160
Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly Ser
165 170175
Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asp Tyr Ala
180 185190
Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala
195 200205
Ala He Thr Trp Asn Gly Gly Arg Vai Phe Tyr Thr Ala Ser Vai Lys
210 215220
Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Met Tyr Leu
225 230 235240
Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala
245 250255
Ala Asp Lys Asp Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Gly His Pro Vai Ala Tyr
260 265270
Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
275280 <210>56 <211>281 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>56
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asp Tyr 20 2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai 35 4045
Ala Ala He Thr Trp Asn Gly Gly Arg Vai Phe Tyr Thr Ala Ser Vai 50 5560
Lys Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Met Tyr 65 70 7580
Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys 85 9095
Ala Ala Asp Lys Asp Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Gly His Pro Vai Ala
100 105110
Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly
115 120125
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
130 135140
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu
145 150 155160
Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly Ser
165 170175
Leu Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly Arg He Phe Ser Ser Asn Ala
180 185190
Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala
195 200205
Ala He Thr Trp Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser Ala
210 215220
Lys Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr
225 230 235240
Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys
245 250255
- 124 037063
Ala Ala Gly Gly Ser Ser Trp Leu Ser Phe Pro Pro Asp Tyr Trp Gly
260 265270
Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
275280 <210>57 <211>279 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>57
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly Arg He Phe Ser Ser Asn
2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai 35 4045
Ala Ala lie Thr Trp Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser
5560
Ala Lys Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai 65 70 7580
Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr 85 9095
Cys Ala Ala Gly Gly Ser Ser Trp Leu Ser Phe Pro Pro Asp Tyr Trp
100 105110
Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
115 120125
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
130 135140
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin
145 150 155160
Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly Ser Leu Arg 165 170175
Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly Arg lie Phe Ser Ser Asn Ala Met Gly 180 185190
Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala Ala lie
195 200205
Thr Trp Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser Ala Lys Gly
210 215220
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin
225 230 235240
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala
245 250255
Gly Gly Ser Ser Trp Leu Ser Phe Pro Pro Asp Tyr Trp Gly Gin Gly
260 265270
Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
275 <210>58 <211>274 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>58
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asp Tyr 20 2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai 35 4045
Ala Ala He Thr Trp Asn Gly Gly Arg Vai Phe Tyr Thr Ala Ser Vai 50 5560
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Met Tyr 65 70 7580
- 125 037063
Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys
9095
Ala Ala Asp Lys Asp Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Gly His Pro Vai Ala
100 105110
Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly
115 120125
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
130 135140
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu
145 150 155160
Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Glu Ser
165 170175
Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Asp Phe Lys Vai
180 185190
Met Gly Trp Tyr Arg Gin Pro Pro Gly Lys Gin Arg Glu Gly Vai Ala
195 200205
Ala He Arg Leu Ser Gly Asn Met His Tyr Ala Glu Ser Vai Lys Gly
210 215220
Arg Phe Thr lie Ser Lys Ala Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin
225 230 235240
Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Lys Vai
245 250255
Asn He Arg Gly Gin Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai
260 265270
Ser Ser <210>59 <211>272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>59
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly Arg lie Phe Ser Ser Asn
2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai 35 4045
Ala Ala lie Thr Trp Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser 50 5560
Ala Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai 65 70 7580
Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr
9095
Cys Ala Ala Gly Gly Ser Ser Trp Leu Ser Phe Pro Pro Asp Tyr Trp
100 105110
Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
115 120125
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
130 135140
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin
145 150 155160
Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Glu Ser Leu Arg
165 170175
Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Asp Phe Lys Vai Met Gly
180 185190
Trp Tyr Arg Gin Pro Pro Gly Lys Gin Arg Glu Gly Vai Ala Ala lie
195 200205
Arg Leu Ser Gly Asn Met His Tyr Ala Glu Ser Vai Lys Gly Arg Phe
210 215220
Thr He Ser Lys Ala Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin Met Asn
225 230 235240
- 126 037063
Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Lys Vai Asn He
245 250255
Arg Gly Gin Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
260 265270 <210>60 <211>281 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>60
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly Arg lie Phe Ser Ser Asn
2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai 35 4045
Ala Ala He Thr Trp Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser 50 5560
Ala Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai 65 70 7580
Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr 85 9095
Cys Ala Ala Gly Gly Ser Ser Trp Leu Ser Phe Pro Pro Asp Tyr Trp
100 105110
Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
115 120125
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
130 135140
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin
145 150 155160
Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly Ser Leu Arg
165 170175
Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asp Tyr Ala Met Gly
180 185190
Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala Ala He 195 200205
Thr Trp Asn Gly Gly Arg Vai Phe Tyr Thr Ala Ser Vai Lys Gly Arg
210 215220
Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Met Tyr Leu Gin Met
225 230 235240
Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala Asp
245 250255
Lys Asp Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Gly His Pro Vai Ala Tyr Trp Gly
260 265270
Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
275280 <210>61 <211>281 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>61
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly Ser lie Vai Arg He Asn 20 2530
Thr Met Gly Trp Tyr Arg Gin Thr Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai 35 4045
Ala Asp lie Thr Ser Gly Gly Asn He Asn Tyr lie Asp Ala Vai Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Thr Lys Asn Thr Vai Tyr Leu 65 70 7580
- 127 037063
- 128 037063
Thr Vai Ser Arg Asp Asn Ala Lys Pro Thr Met Tyr Leu Gin Met Asn
225 230 235240
Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys His Ala Gly Thr
245 250255
Gin Asp Arg Thr Gly Arg Asn Phe Asp Arg Trp Gly Gin Gly Thr Gin
260 265270
Vai Thr Vai Ser Ser
275 <210>63 <211>279 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>63
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asp Tyr 20 2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai 35 4045
Ala Ala lie Thr Trp Asn Gly Gly Arg Vai Phe Tyr Thr Ala Ser Vai 50 5560
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Met Tyr 65 70 7580
Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys
9095
Ala Ala Asp Lys Asp Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Gly His Pro Vai Ala
100 105110
Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly
115 120125
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 130 135140
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu 145 150 155160
Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly Ser
165 170175
Leu Thr Leu Ser Cys Ala Vai Ser Gly Ser Thr Phe Arg He Asn Thr
180 185190
Met Gly Trp Tyr Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai Ala
195 200205
Ala Arg Asp Arg Gly Gly Tyr lie Asn Tyr Vai Asp Ser Vai Lys Gly
210 215220
Arg Phe Thr Vai Ser Arg Asp Asn Ala Lys Pro Thr Met Tyr Leu Gin
225 230 235240
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys His Ala
245 250255
Gly Thr Gin Asp Arg Thr Gly Arg Asn Phe Asp Arg Trp Gly Gin Gly
260 265270
Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
275 <210>64 <211>272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>64
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Glu 1510
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly
2025
Ala Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly 3540
Leu Vai Gin Pro Gly Gly
Ser lie Leu Thr lie Asn
Lys Gin Arg Glu Leu Vai
129
Искусственная последовательность
Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2
- 130 037063
Ala Lys Asn Thr Met Tyr Leu Gin Met Asn 225230
Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala Asp Lys
245250
Leu Gly His Pro Vai Ala Tyr Trp Gly Gin
260265
Ser Leu Lys Pro Glu Asp
235 240
Asp Arg Arg Thr Asp Tyr
255
Gly Thr Gin Vai Thr Vai
270
Ser Ser <210>66 <211> 272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>66
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly Arg He Phe Ser Ser Asn 20 2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai 35 4045
Ala Ala lie Thr Trp Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser
5560
Ala Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai 65 70 7580
Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr
9095
Cys Ala Ala Gly Gly Ser Ser Trp Leu Ser Phe Pro Pro Asp Tyr Trp
100 105110
Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 115 120125
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly 130 135140
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin
145 150 155160
Leu Vai Glu Ser Gly Gly Glu Leu Vai Gin Pro Gly Gly Ser Leu Arg
165 170175
Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser lie Leu Thr lie Asn Ala Met Gly
180 185190
Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai Vai Arg Arg
195 200205
Thr Arg Gly Gly Ser Thr Thr Tyr Gin Asp Ser Vai Lys Gly Arg Phe
210 215220
Thr lie Ser Ala Asp lie Ala Lys Lys Thr Met Tyr Leu Gin Met Asn
225 230 235240
Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Met Leu Asp Asp
245 250255
Arg Gly Gly Vai Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
260 265270 <210>67 <211>274 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>67
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asp Tyr 20 2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai 35 4045
Ala Ala lie Thr Trp Asn Gly Gly Arg Vai Phe Tyr Thr Ala Ser Vai
5560
- 131 037063
132
Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser Ala Lys Gly Arg Phe
210 215220
Thr He Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gin Met Asn
225 230 235240
Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Ala Gly Gly
245 250255
Ser Ser Trp Leu Ser Phe Pro Pro Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Gin
260 265270
Val Thr Val Ser Ser
275 <210>69 <211>279 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Последовательности мультивалентных нанотел против CXCR2 <400>69
Glu Val Gin Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Thr Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Ser Thr Phe Arg He Asn
2530
Thr Met Gly Trp Tyr Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Val
4045
Ala Ala Arg Asp Arg Gly Gly Tyr He Asn Tyr Val Asp Ser Val Lys
5560
Gly Arg Phe Thr Val Ser Arg Asp Asn Ala Lys Pro Thr Met Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys His 85 9095
Ala Gly Thr Gin Asp Arg Thr Gly Arg Asn Phe Asp Arg Trp Gly Gin
100 105110
Gly Thr Gin Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 115 120125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
130 135140
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gin Leu Val
145 150 155160
Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Ala Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser
165 170175
Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asp Tyr Ala Met Gly Trp Phe
180 185190
Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Val Ala Ala He Thr Trp
195 200205
Asn Gly Gly Arg Val Phe Tyr Thr Ala Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr
210 215220 lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Met Tyr Leu Gin Met Asn Ser
225 230 235240
Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Ala Asp Lys Asp
245 250255
Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Gly His Pro Val Ala Tyr Trp Gly Gin Gly
260 265270
Thr Gin Val Thr Val Ser Ser
275 <210>70 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> frl <400>70
Glu Val Gin Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser
2530
- 133 037063 <210> 71 <211> 30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> frl <400>71
Glu Vai Lys Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Leu Ser Gly Arg He Gly Ser 20 2530 <210>72 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>72
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp 20 2530 <210>73 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>73
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Ser Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Leu lie Phe Arg 20 2530 <210>74 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>74
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser 20 2530 <210>75 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>75
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Ser Phe Ser 20 2530 <210>76 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>76
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Leu Ala
2530 <210>77 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400> 77
Lys Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
10 15
134 037063
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Ala Phe Asn 20 2530 <210>78 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>78
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Vai Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly He He Phe Arg 20 2530 <210>79 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>79
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Glu
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Asp 20 2530 <210>80 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>80
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Thr Leu Ser Cys Ala Vai Ser Gly Ser Ser Phe Arg 20 2530 <210>81 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>81
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly Ser lie Vai Arg 20 2530 <210>82 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>82
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser 20 2530 <210>83 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>83
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser 20 2530 <210>84 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
- 135 037063 <223> FR1 <400>84
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Vai Ala Ser Gly Arg He Phe Ser 20 2530 <210>85 <211> 30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>85
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Glu Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser lie Leu Thr 20 2530 <210>86 <211> 30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>86
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Thr Cys Ala Ala Ser Gly Arg lie Gly Thr 20 2530 <210>87 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>87
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Met Gly Asn 20 2530 <210>88 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>88
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Thr lie Gly Thr 20 2530 <210>89 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>89
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly 15 1015
Ser Leu Thr Leu Ser Cys Ala Vai Ser Gly Ser Thr Phe Arg 20 2530 <210>90 <211>120 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> моновалентные нанотела против CXCR2 <400>90
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Ala Gly Gly
1015
Ser Leu Thr Leu Ser Cys Ala Vai Ser Gly Ser Thr Phe Arg lie Asn 20 2530
136 037063
Thr Met Gly Trp Tyr Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai 35 4045
Ala Ala Arg Asp Arg Gly Gly Tyr He Asn Tyr Vai Asp Ser Vai Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr Vai Ser Arg Asp Asn Ala Lys Pro Thr Met Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys His 85 9095
Ala Gly Thr Gin Asp Arg Thr Gly Arg Asn Phe Asp Arg Trp Gly Gin
100 105110
Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
115120 <210>91 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>91
Trp Vai Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gly Leu Asp Trp Vai Ser 1510 <210>92 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>92
Trp Tyr Arg Gin Vai Ser Gly Gin Gin Arg Glu Leu Vai Ala 1510 <210>93 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>93
Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Arg Vai Ser 1510 <210>94 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>94
Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Arg Gin Arg Glu Trp Vai Ala 1510 <210>95 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>95
Trp Phe Arg Gin Ala Thr Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala 1510 <210>96 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>96
Trp Leu Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala 1510 <210>97 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400> 97
Trp Phe Arg Arg Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Gly He Ser 15 10
137 037063 <210> 98 <211> 14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>98
Trp Phe Arg Gin Ala Gin Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala 1510 <210>99 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>99
Trp Thr Arg Gin Gly Pro Gly Lys Ala Arg Glu Trp Vai Ala
1510 <210>100 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>100
Trp Tyr Arg Gin Pro Pro Gly Lys Gin Arg Glu Gly Vai Ala 1510 <210>101 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>101
Trp Tyr Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai Ala 1510 <210>102 <211>14
- 138 037063 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>102
Trp Туг Arg Gin Thr Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai Ala 1510 <210>103 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>103
Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Ala Phe Vai Ala 1510 <210>104 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>104
Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala 1510 <210>105 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>105
Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala 1510 <210>106 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>106
Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai Vai 1510 <210>107 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>107
Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai Ala 1510 <210>108 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>108
Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Leu Vai Ala 1510 <210>109 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>109
Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai Ala 1510 <210>110 <211>14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400> 110
139 037063
Trp Tyr Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai Ala 1510 <210>111 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>111
Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Asn Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Leu Tyr Tyr Cys Ala Thr 20 2530 <210>112 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>112
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Gly Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin 15 1015
Met Asp Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Tyr Ala 20 2530 <210>113 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>113
Arg Phe Thr lie Ser Ser Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin 15 1015
Met Asn Asn Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala 20 2530 <210>114 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>114
Arg Phe Thr He Ser Arg Asn Asn Ala Glu Asn Thr Trp Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala lie Tyr Tyr Cys Asn Thr 20 2530 <210>115 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>115
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Arg Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala 20 2530 <210>116 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>116
Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai Ser Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Gin Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala 20 2530 <210>117 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3
140 037063 <400>117
Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Ala
2530 <210>118 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>118
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Tyr Leu His
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Ala 20 2530 <210>119 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>119
Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr lie Tyr Leu His
1015
Met Asp Met Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Ser 20 2530 <210>120 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>120
Arg Phe Thr lie Ser Lys Ala Asn Ala Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gin 15 1015
Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Lys Val 20 2530 <210>121 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>121
Arg Phe Thr Val Ser Arg Asp Asn Ala Lys Pro Thr Met Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys His Ala 20 2530 <210>122 <211> 32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400> 122.
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Thr Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Asn Ala 20 2530 <210>123 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>123
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Val Ala Lys Lys Thr Leu Tyr Leu Gin 15 1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Ala 20 2530 <210>124 <211>32
- 141 037063 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>124
Arg Phe Thr Не Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Met Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala 20 2530 <210>125 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>125
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala 20 2530 <210>126 <211> 32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>126
Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp He Ala Lys Lys Thr Met Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Met Leu 20 2530 <210>127 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>127
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Tyr Asn Vai 20 2530 <210>128 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>128
Arg Phe Thr He Ala Arg Asp Asn lie Leu Asn Thr Ala Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Asp Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Tyr Asn Vai 20 2530 <210>129 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>129
Arg Phe Thr lie Gly Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gin 15 1015
Met Asn Asn Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Tyr Asn lie 20 2530 <210>130 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400> 130
Arg Phe Thr Vai Ser Arg Asp Asn Ala Lys Pro Thr Met Tyr Leu Gin
10 15
142 037063
Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala
2025
Vai Tyr Tyr Cys His Ala <210>131 <211>11 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR4 <400>131
Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
1510 <210>132 <211>11 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR4 <400>132
Arg Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
1510 <210>133 <211>11 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR4 <400>133
Trp Gly Gin Gly Thr Gin Vai Thr Vai Ser Ser
1510 <210>134 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>134
Asp Tyr Ala He Gly <210>135 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>135
Leu Ser Gly Met Ala <210>136 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>136
Asn Tyr Ala Met Gly <210>137 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>137
Arg Ser Ala Met Gly <210>138 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220> <223> CDR1 <400>138
Tyr Tyr Thr Vai Gly 15 <210>139 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность
- 143 037063 <220>
<223> CDR1 <400>139
Tyr Tyr Vai Met Ala <210>140 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>140
Leu Ser Ala Leu Gly <210>141 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>141
Phe Lys Vai Met Gly <210>142 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>142
He Asn Thr Met Gly <210>143 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>143 lie Asn Thr Met Gly <210>144 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>144
Ser Leu Ser Met Gly <210>145 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>145
Asp Tyr Ala Met Gly <210>146 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>146
Ser Asn Ala Met Gly <210>147 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400> 147 lie Asn Ala Met Gly
5
- 144 037063 <210> 148 <211> 5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>148
He Asn Ala Met Gly 15 <210>149 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>149
He Asn Ala Met Gly <210>150 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>150 lie Arg Ala Met Gly <210>151 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400>151 lie Asn Thr Met Gly <210>152 <211>17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>152
Ala He Asn Ala Gly Gly Asp Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Pro Vai Lys
1015
Gly <210>153 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>153
Vai Ser Arg Ser Gly Gly Ser Thr Asp He Ala Asp Ser Vai Lys Gly
1015 <210>154 <211>17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>154
Cys He Ser Gly Ser Asp Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Vai Lys
1015
Gly <210>155 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400> 155
Vai Leu Thr Lys Asp Gly Thr Leu His Tyr Ala Asp Pro Vai Lys Gly
10 15
- 145 037063 <210> 156 <211> 17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>156
Ala He Asn Lys Ser Gly Gly Asn Thr His Tyr Ala Gly Ser Vai Lys
1015
Gly <210>157 <211>17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>157
Gly lie Ser Trp Gly Gly Asp Asn Ser Tyr Tyr Ala Asp Ser Vai Lys
1015
Gly <210>158 <211>17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>158
Cys lie Ser Ser Ser Asp Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Vai Lys
1015
Gly <210>159 <211>17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>159
Ala lie Ser Thr Arg Gly Ser Met Thr Lys Tyr Ser Asp Ser Vai Gin
1015
Gly <210>160 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>160
Gly He Asn Ser Asp Gly Thr Thr Asn Tyr Ala Asp Pro Vai Lys Gly
1015 <210>161 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>161
Ala lie Arg Leu Ser Gly Asn Met His Tyr Ala Glu Ser Vai Lys Gly 15 1015 <210>162 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>162
Ala Arg Asp Arg Gly Gly Tyr lie Asn Tyr Vai Asp Ser Vai Lys Gly
1015 <210>163 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность
146 037063 <220>
<223> CDR2 <400>163
Asp lie Thr Ser Gly Gly Asn lie Asn Tyr lie Asp Ala Vai Lys Gly
1015 <210>164 <211>17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>164
Ala Leu Thr Arg Asn Gly Gly Tyr Arg Tyr Tyr Ala Asp Ser Vai Lys
1015
Gly <210>165 <211>17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>165
Ala lie Thr Trp Asn Gly Gly Arg Vai Phe Tyr Thr Ala Ser Vai Lys
1015
Gly <210>166 <211>18 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>166
Ala lie Thr Trp Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser Ala
1015
Lys Gly <210>167 <211> 16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>167
Arg Arg Thr Arg Gly Gly Ser Thr Thr Tyr Gin Asp Ser Vai Lys Gly
1015 <210>168 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>168
Vai lie Thr Ser Gly Gly Arg lie Asp Tyr Ala Asp Ser Vai Lys Gly
1015 <210>169 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>169
Lys lie Thr Arg Gly Gly Ala lie Thr Tyr Ala Asp Ser Vai Lys Gly
1015 <210>170 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400> 170
Leu lie Thr Ser Thr Gly Arg lie Asn Tyr Ala Asp Ser Vai Lys Gly
10 15
147 037063 <210> 171 <211> 16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>171
Ala Arg Asp Arg Gly Gly Tyr He Asn Tyr Val Asp Ser Val Lys Gly
1015 <210>172 <211>10 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>172
Val Arg Gly Thr Ala Arg Asp Leu Asp Tyr
1510 <210>173 <211>15 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>173
His Thr Ser Ser Tyr Ser Asn Trp Arg Val Tyr Asn Asn Asp Tyr 15 1015 <210>174 <211>17 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>174
Tyr Trp Gly Leu Thr Leu Arg Leu Trp Met Pro Pro His Arg Tyr Asp
1015
Tyr <210>175 <211> 3 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<22 3> CDR3 <400>175
Gly Arg Tyr <210>176 <211>9 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>176
Ser Arg Thr Asn Pro Lys Pro Asp Tyr <210>177 <211>13 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>177
Arg Tyr Arg Gly Gly Ala Ala Val Ala Gly Trp Glu Tyr 1510 <210>178 <211>15 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<22 3> CDR3 <400>178
Asp Arg Arg Thr Asp Cys Lys Lys Gly Arg Val Gly Ser Gly Ser 15 1015 <210>179 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность
148 037063 <220>
<223> CDR3 <400>179
Asp Pro Arg Gly Ser Ser Trp Ser Phe Ser Ser Gly Gly Tyr Asp Tyr
1015 <210>180 <211> 3 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>180
Gly Lys Tyr <210>181 <211>7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>181
Asn He Arg Gly Gin Asp Tyr <210>182 <211>12 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>182
Gly Thr Gin Asp Arg Thr Gly Arg Asn Phe Asp His 1510 <210>183 <211>18 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>183
Glu He Vai Vai Leu Vai Gly Vai Trp Thr Gin Arg Ala Arg Thr Gly
1015
Asn Tyr <210>184 <211>15 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>184
Asp Ser Leu Ser Gly Ser Asp Tyr Leu Gly Thr Asn Leu Asp Tyr
1015 <210>185 <211>15 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>185
Asp Lys Asp Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Gly His Pro Vai Ala Tyr 15 1015 <210>186 <211>12 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>186
Gly Gly Ser Ser Trp Leu Ser Phe Pro Pro Asp Tyr 1510 <210>187 <211>7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3
149 037063 <400>187
Asp Asp Arg Gly Gly Vai Tyr 15 <210>188 <211>8 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>188
Glu Thr Vai Vai Gly Ala Vai Tyr 15 <210>189 <211> 8 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>189
Asp Gly Gly Pro Ser Gin Asn Tyr 15 <210>190 <211>7 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>190
Glu Thr Leu Arg Arg Asn Tyr 15 <210>191 <211> 12 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR3 <400>191
Gly Thr Gin Asp Arg Thr Gly Arg Asn Phe Asp Arg
1510 <210>192 <211> 357 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>192 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagc ctggggggtc tctgagactc60 tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt acctactgga tgtattgggt ccgtcaggct120 ccagggaagg ggctcgactg ggtctcagct attaatgctg gtggtgatag cacatactat180 gcagaccccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acaacaagaa cacgctgtat240 ctgcagatga acagcctgaa acctgaggac acggccctgt attactgtgc gaccgtacga300 ggcacagctc gtgacttgga ctactggggc caggggaccc aggtcaccgt ctcctca357 <210>193 <211>369 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>193 gaggtgaagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagg ctggggggtc tctgagactc60 tcctgtgcac tctctggaag gatcggcagt atcaacgcca tgggctggta tcgccaggtt120 tcaggacaac agcgcgagtt ggtcgcagta agcaggagcg gaggtagcac agacattgct180 gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaacg gcaagaacac agtgtatctg240 cagatggaca gcctgaaacc tgaggacacg gccgtctatt actgttatgc tcatacttca300 agctatagta attggcgagt ctacaataac gactactggg gccaggggac ccaggtcacc360 gtctcctca369 <210>194 <211>348 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>194 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagg ctggggggtc tctgagactt60 acctgtgcag cctctggacg catcggcact atcaatgcca tgggctggta ccgccaggct120
- 150 037063 ccagggaagc agcgcgagtt ggtcgcagtt attactagtg gtggtaggat agactatgca180 gactccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaatg ccaagaacac ggtgtatctg240 caaatgaaca gcctgaaacc tgaggacacg gccgtctatt actataatgt agaaacggta300 gtgggtgccg tctactgggg ccaggggacc caggtcaccg tctcctca348 <210>195 <211>348 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>195 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagg ctggggggtc tctgagactc60 tcctgtgcag cctctggaag gatgggcaat atcaatgcca tgggctggta tcgccaggct120 ccagggaagg agcgcgagtt ggtcgcaaaa attactaggg gtggtgcgat aacctatgca180 gactccgtga agggccgatt caccatcgcc agagacaata ttctgaacac ggcgtatctg240 caaatgaacg acctgaaacc tgaggacacg gccgtctatt attataatgt agatgggggg300 cccagtcaaa actactgggg ccaggggacc caggtcaccg tctcctca348 <210>196 <211>378 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>196 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagg ctggggggtc tctgagactc60 tcctgtgcag cctctggatt cactttcgat gattatgcca taggctggtt ccgccaggcc120 ccagggaagg agcgtgagag ggtctcatgt attagtggta gtgatggtag cacatactat180 gcagactccg tcaagggccg attcaccatc tccagtgaca acgccaagaa cacggtgtat240 ctgcaaatga acaacctgaa acccgaggac acggccgttt attattgtgc agcatattgg300 ggactaacgc tcaggctatg gatgcccccc caccggtatg actactgggg ccaggggacc 360 caggtcaccg tctcctca378 <210>197 <211>333 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>197 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagg ctggggggtc tctgagcctc60 tcctgtgcag cctctggact tatcttcaga ctcagtggca tggcctggta tcgccaggct120 ccggggaggc agcgcgagtg ggtcgcagtg cttaccaaag atggtaccct acactatgca180 gaccccgtga agggccgatt caccatctcc agaaacaacg ccgagaacac gtggtatctg240 caaatgaaca gcctgaaacc tgaggacaca gccatctatt actgtaatac gggccgttac300 tggggccagg ggacccaggt caccgtctcc tea333 <210>198 <211>345 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>198 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagg ctggggggtc actgagactc60 tcctgtgcag cctctggaac catcggcacg atcagagcca tgggctggta ccgccaggct120 ccagggaagc agcgcgagtt ggtcgcattg attactagta etggtaggat aaactatgca180 gactccgtga agggccgatt caccattgga agagacaatg ccaagaacac ggcgtatctg240 caaatgaaca acctgaaacc tgaggacacg gccgtctatt actataatat cgaaacacta300 cgacgtaact actggggcca ggggacccag gtcaccgtct cctca345 <210>199 <211>354 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>199 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggagga ttggtgcagg ctggggggtc tctgagactc60 tcctgtgcag cctctggacg cacctttagt aactatgcca tgggctggtt ccgccaggcc120 acagggaagg agegtgagtt tgtagcagct attaacaaga gtggtgggaa cacacactat180 gcaggctccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa cacggtgtat240 ctgcaaatga acagcctgaa acctagggac acggccgttt attactgtgc agegtegegg300 actaacccta agcctgacta ctggggccag gggacccagg tcaccgtctc ctca354
- 151 037063 <210> 200 <211> 366 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>200 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggagga ttggtgcagg ctgggggctc tctgagactc60 tcctgtgcag cctctggacg ctccttcagt cgcagtgcca tgggctggct ccgccaggct120 ccagggaagg agcgtgaatt tgtagcaggt attagctggg gtggtgataa ctcatactat180 gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa caccgtgtct240 ctacaaatga acagcctgaa acctcaggac acggccgttt attactgtgc agcaagatac300 c9999a99c9 cggcagtagc tggttgggag tactggggcc aggggaccca ggtcaccgtc360 tcctca366 <210>201 <211> 372 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400> 201 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagc ctggggggtc tctgagactc60 tcctgtgcag cctccggatc cactttggcc tattataccg taggctggtt ccgccgggcc120 ccagggaagg agcgcgaggg gatctcatgt attagtagta gtgatggtag cacatactat180 gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca atgccaagaa tacggtgtat240 ctgcaaatga acagcctgaa acctgaggac acggccgttt attactgtgc ggctgacaga300 cgtaccgact gtaaaaaggg tagagtcggt tctggttcct ggggccaggg gacccaggtc 360 accgtctcct ca372 <210>202 <211>375 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>202 aaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggg ctggtgcagg ctgggggctc tctgagactc60 tcctgtgcag cctccggacg cgccttcaat tactatgtca tggcctggtt ccgccaggct120 caagggaagg agcgtgagtt tgtagcagct attagcacgc gtggtagtat gacaaagtat180 tcagactccg tgcagggccg gttcaccatc tccagagaca acgccaagaa cacggtgtat240 ctgcacatga acagcctgaa acctgaggat acggccgttt attactgtgc agcagaccct300 cgcggcagta gctggtcatt ttcgtccggg ggttatgact actggggcca ggggacccag 360 gtcaccgtct cctca375 <210>203 <211>333 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223 > Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>203 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagc ctggggggtc tgtgagactc60 tcctgtgtag cctctggaat catcttcaga ctcagtgcgt tgggttggac acgccagggt120 ccaggaaagg cgcgcgagtg ggtcgcaggt attaacagtg atggtacgac caactacgcc180 gaccccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaacg ccaagaacac gatatatctg240 cacatggaca tgctgaaacc tgaggatacg gccgtctatt actgtgcctc cggaaagtac300 cggggccagg ggacccaggt caccgtctcc tea333 <210>204 <211>345 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>204 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagg ctggggagtc tctgagactc60 tcctgtgcag cctctggaag caccttcgat ttcaaagtca tgggctggta ccgccagcct120 ccagggaagc agcgcgaggg ggtcgcagcg attaggetta gtggtaacat gcactatgca180 gagteegtga agggccgatt caccatctcc aaagccaacg ccaagaacac agtgtatctg240 caaatgaaca gcctgagacc tgaggacacg gccgtctatt actgtaaggt gaacattcgg300 ggccaggact actggggcca ggggacccag gtcaccgtct cctca345 <210>205 <211> 360
- 152 037063 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>205 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagg ctggggggtc tctgacgctc60 tcctgtgcag tctctggaag ctccttcaga atcaatacca tgggctggta ccgccgggct120 ccagggaagc agcgcgagtt ggtcgcagct cgtgatagag gtggttacat aaactatgta180 gattccgtga agggccgatt caccgtctcc agagacaacg ccaagcccac aatgtatctg240 caaatgaaca gcctgaaacc tgaggacacg gccgtctatt attgtcatgc cgggacccaa300 gatcggacgg gtcggaattt cgaccactgg ggccagggga cccaggtcac cgtctcctca360 <210>206 <211>378 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>206 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagc ctggggggtc tctgagactc60 tcctgtgtag cctctggaag catcgtcaga attaatacca tgggctggta ccgccagact120 ccagggaagc agcgcgagtt ggtcgcagat attaccagtg gtggtaacat aaactatata180 gacgccgtga agggccgatt caccatctcc agagacaaca ccaagaacac ggtgtatctg240 caaatgaaca gcctgaaacc tgaggacacg gccgtctatt actgtaatgc agagatcgtt300 gttctggtgg gagtttggac ccagcgtgcg cggaccggca actactgggg ccaggggacc 360 caggtcaccg tctcctca378 <210>207 <211>372 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>207 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggagga ttggtgcagc ctggggggtc tctgagactc60 tcctgtgcag cctctggacg cacgttcagt agcttgtcca tgggctggtt ccgccaggct120 ccggggaagg agcgtgcctt tgtagcagcg cttactcgaa atggtggtta cagatactat180 gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagacg tcgccaagaa gaccttatat240 ctgcaaatga acagcctgaa acctgaggac acggccgtct attactgtgc agcagatagt300 cttagtggta gtgactactt aggaaccaac ctagactact ggggccaggg gacccaggtc 360 accgtctcct ca372 <210>208 <211>372 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223 > Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>208 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggagga ttggtgcagg ctgggggctc tctgagactc60 tcctgtgcag cctctggacg caccttcagt gactatgcca tgggctggtt ccgccaggct120 ccagggaagg agcgtgagtt tgtagcagct attacgtgga atggtggtag agtattttat180 actgcctccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa cacgatgtat240 ctgcaaatga acagcctgaa acctgaggac acggccgttt attactgtgc agcagataaa300 gacagacgta ctgactatct agggcacccc gttgcctact ggggccaggg gacccaggtc 360 accgtctcct ca372 <210>209 <211>366 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>209 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggagga ttggtgcagc ctgggggctc tctgagactc60 tcctgtgtag cctctggacg catcttcagt agcaatgcca tgggctggtt ccgccaggct120 ccagggaagg agcgtgagtt tgtagcggcc attacctgga ggagtggcgg tagcgcgtac180 tatgcagact ccgcgaaggg ccgattcacc atctccagag acaacgccaa gaacacggtg240 tatttgcaaa tgaacagcct gaaacctgag gacacggccg tttattattg tgcagctggt300 ggtagttcct ggttaagttt tccgccggac tactggggcc aggggaccca ggtcaccgtc360 tcctca366 <210>210 <211> 345 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность
- 153 037063 <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>210 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggagag ttggtgcagc cgggggggtc tctgagactc60 tcctgtgcag cctctggaag catcttaact atcaatgcca tgggctggta ccgccaggct120 ccagggaagc agcgcgagtt ggtagtccgt aggactaggg gtggtagtac aacgtatcaa180 gactccgtga agggccgatt caccatctcc gcagacattg ccaagaaaac gatgtatctc240 caaatgaaca gcctgaaacc tgaagacacg gccgtctatt actgtatgct agatgaccgt300 gggggtgtct actggggtca ggggacccag gtcaccgtct cctca345 <210>211 <211>360 <212> ДНК <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Нуклеиновая кислота, кодирующая моновалентное нанотело <400>211 gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtgcagg ctggggggtc tctgacgctc60 tcctgtgcag tctctggaag caccttcaga atcaatacca tgggctggta ccgccgggct120 ccagggaagc agcgcgagtt ggtcgcagct cgtgatagag gtggttacat aaactatgta180 gattccgtga agggccgatt caccgtctcc agagacaacg ccaagcccac aatgtatctg240 caaatgaaca gcctgaaacc tgaggacacg gccgtctatt attgtcatgc cgggacccaa300 gatcggacgg gtcggaattt cgaccgctgg ggccagggga cccaggtcac cgtctcctca360 <210>212 <211>109 <212> Белок <213> Homo sapiens <400>212
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr 20 2530
Ala Met Ser Trp Vai Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Vai 35 4045
Ser Ala lie Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Vai 50 5560
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 7580
Leu Gin Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys
9095
Ala Lys Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser
100105 <210>213 <211>115 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности вариантов с оптимизированными последовательностями <400>213
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser lie Leu Thr lie Asn
2530
Ala Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai 35 4045
Vai Arg Arg Thr Arg Gly Gly Ser Thr Thr Tyr Gin Asp Ser Vai Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr He Ser Ala Asp He Ser Lys Lys Thr Met Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Leu
9095
Leu Asp Asp Arg Gly Gly Vai Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr
100 105110
Vai Ser Ser
115 <210>214
- 154 037063 <211> 115 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности вариантов с оптимизированными последовательностями <400>214
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser lie Leu Thr lie 20 2530
Ala Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu 35 4045
Vai Arg Arg Thr Arg Gly Gly Ser Thr Thr Tyr Gin Asp Ser Vai
5560
Gly
Asn
Vai
Lys
Leu
Thr
Gly Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp lie Ser Lys Asn Thr Met Tyr 65 7075
Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys 85 9095
Leu Asp Asp Arg Gly Gly Vai Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai
100 105110
Vai Ser Ser
115 <210>215 <211>126 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности вариантов с оптимизированными последовательностями <400>215
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro
1510
Gly Gly 15
He Asn
Leu Vai
Vai Lys
Tyr Leu 80
Cys Asn 95
Arg Thr
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser He Vai Arg 20 2530
Thr Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu 35 4045
Ala Asp He Thr Ser Gly Gly Asn He Asn Tyr Ala Asp Ser
5560
Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Vai 65 7075
Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr 8590
Ala Glu He Vai Vai Leu Vai Gly Vai Trp Thr Gin Arg Ala
100 105110
Gly Asn Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser
115 120125 <210>216 <211>115 <212> Белок <213 > Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности вариантов с оптимизированными последовательностями <400>216
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Asp Phe
2530
Vai Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Gly 35 4045
Ala Ala He Arg Leu Ser Gly Asn Arg His Tyr Ala Glu Ser Vai
5560
Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Ala Asn Ser Lys Asn Thr Vai Tyr 65 7075
Gly
Lys
Vai
Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys 85 9095
155
Val Asn He Arg Gly Gin Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr
100 105110
Val Ser Ser
115 <210>217 <211>122 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности вариантов с оптимизированными последовательностями <400>217
Glu Val Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg He Phe Ser Ser Asn 20 2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Val
4045
Ala Ala He Thr Trp Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser
5560
Val Lys Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Val 65 70 7580
Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
9095
Cys Ala Ala Gly Gly Ser Ser Trp Leu Ser Phe Pro Pro Asp Tyr Trp
100 105110
Gly Gin Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115120 <210>218 <211>124 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223 > Аминокислотные последовательности вариантов с оптимизированными последовательностями <400>218
Glu Val Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asp Tyr
2530
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Val 35 4045
Ala Ala He Thr Trp Asn Gly Gly Arg Val Phe Tyr Thr Ala Ser Val
5560
Lys Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr 65 70 7580
Leu Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 9095
Ala Ala Asp Lys Asp Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Gly His Pro Val Ala
100 105110
Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115120 <210>219 <211>120 <212> Белок <213ь Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности вариантов с оптимизированными последовательностями <400>219
Glu Val Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Ser Thr Phe Arg He Asn 20 2530
Thr Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Val 35 4045
Ala Ala Arg Asp Arg Gly Gly Tyr He Asn Tyr Val Asp Ser Val Lys
5560
- 156 037063
Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ser Lys Pro Thr Met Tyr Leu 65 70 7580
Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys His 85 9095
Ala Gly Thr Gln Asp Arg Thr Gly Arg Asn Phe Asp Arg Trp Gly Gln
100 105110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115120 <210>220 <211>35 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223 > Пептидый линкер <400>220
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
1015
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
2530
Gly Gly Ser <210>221 <211*272 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности бипаратопов с оптимизированными последовательностями <400> 221
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly | |||
1 | 5 | 10 | 15 |
Ser | Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr 20 25 | Phe Asp Phe Lys 30 | |
Val : | Met Gly Trp Tyr Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gln 35 40 | Arg Glu Gly Val 45 | |
Ala | Ala lie Arg 50 | Leu Ser Gly Asn Arg His Tyr 55 | Ala Glu Ser Val Lys 60 |
Gly 65 | Arg Phe Thr | lie Ser Arg Ala Asn Ser Lys 70 75 | Asn Thr Val Tyr Leu 80 |
Gln | Met Asn Ser | Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala 85 90 | Val Tyr Tyr Cys Lys 95 |
Val | Asn Ile Arg 100 | Gly Gln Asp Tyr Trp Gly Gln 105 | Gly Thr Leu Val Thr 110 |
Val | Ser Ser Gly 115 | Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 120 | Gly Ser Gly Gly Gly 125 |
Gly | Ser Gly Gly 130 | Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly 135 | Ser Gly Gly Gly Gly 140 |
Ser 145 | Gly Gly Gly | Gly Ser Glu Val Gln Leu Leu 150 155 | Glu Ser Gly Gly Gly 160 |
Leu | Val Gln Pro | Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser 165 170 | Cys Ala Ala Ser Gly 175 |
Arg | lie Phe Ser 180 | Ser Asn Ala Met Gly Trp Phe 185 | Arg Gln Ala Pro Gly 190 |
Lys | Glu Arg Glu 195 | Phe Val Ala Ala Ile Thr Trp 200 | Arg Ser Gly Gly Ser 205 |
Ala | Tyr Tyr Ala 210 | Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe 215 | Thr lie Ser Arg Asp 220 |
Asn 225 | Ser Lys Asn | Thr Val Tyr Leu Gln Met Asn 230 235 | Ser Leu Arg Pro Glu 240 |
Asp | Thr Ala Val | Tyr Tyr Cys Ala Ala Gly Gly 245 250 | Ser Ser Trp Leu Ser 255 |
Phe | Pro Pro Asp 260 | Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu 265 | Val Thr Val Ser Ser 270 |
<210> 222 <211> 274
- 157 037063 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<22 3> Аминокислотные последовательности бипаратопов с оптимизированными последовательностями <400>222
Glu Vai Gin Leu 1 | Leu 5 | Glu Ser | Gly Gly Gly Leu Vai 10 | Gin Pro | Gly 15 | Gly |
Ser Leu Arg Leu 20 | Ser | Cys Ala | Ala Ser Gly Ser Thr 25 | Phe Asp 30 | Phe | Lys |
Vai Met Gly Trp 35 | Tyr | Arg Gin | Ala Pro Gly Lys Gin 40 | Arg Glu 45 | Gly | Vai |
Ala Ala He Arg 50 | Leu | Ser Gly 55 | Asn Arg His Tyr Ala 60 | Glu Ser | Vai | Lys |
Gly Arg Phe Thr 65 | He | Ser Arg 70 | Ala Asn Ser Lys Asn 75 | Thr Vai | Tyr | Leu 80 |
Gin Met Asn Ser | 85 | Arg Pro | Glu Asp Thr Ala Vai 90 | Tyr Tyr | Cys 95 | Lys |
Vai Asn He Arg 100 | Gly | Gin Asp | Tyr Trp Gly Gin Gly 105 | Thr Leu 110 | Vai | Thr |
Vai Ser Ser Gly 115 | Gly | Gly Gly | Ser Gly Gly Gly Gly 120 | Ser Gly 125 | Gly | Gly |
Gly Ser Gly Gly 130 | Gly | Gly Ser 13 5 | Gly Gly Gly Gly Ser 140 | Gly Gly | Gly | Gly |
Ser Gly Gly Gly 145 | Gly | Ser Glu 150 | Vai Gin Leu Leu Glu 155 | Ser Gly | Gly | Gly 160 |
Leu Vai Gin Pro | Gly 165 | Gly Ser | Leu Arg Leu Ser Cys 170 | Ala Ala | Ser 175 | Gly |
Arg Thr Phe Ser 180 | Asp | Tyr Ala | Met Gly Trp Phe Arg 185 | Gin Ala 190 | Pro | Gly |
Lys Glu Arg Glu 195 | Phe | Vai Ala | Ala He Thr Trp Asn 200 | Gly Gly 205 | Arg | Vai |
Phe Tyr Thr Ala 210 | Ser | Vai Lys 215 | Gly Arg Phe Thr He 220 | Ser Arg | Asp | Asn |
Ser Lys Asn Thr 225 | Leu | Tyr Leu 230 | Gin Met Asn Ser Leu 235 | Arg Pro | Glu | Asp 240 |
Thr Ala Vai Tyr | 245 | Cys Ala | Ala Asp Lys Asp Arg 250 | Arg Thr | 255 | Tyr |
Leu Gly His Pro 260 | Vai | Ala Tyr | Trp Gly Gin Gly Thr 265 | Leu Vai 270 | Thr | Vai |
Ser Ser <210>223 <211>277 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности бипаратопов с оптимизированными последовательностями <400>223
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Vai Ser Gly Ser Thr Phe Arg lie Asn 20 2530
Thr Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Vai
4045
Ala Ala Arg Asp Arg Gly Gly Tyr He Asn Tyr Vai Asp Ser Vai Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ser Lys Pro Thr Met Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys His 85 9095
Ala Gly Thr Gin Asp Arg Thr Gly Arg Asn Phe Asp Arg Trp Gly Gin
100 105110
- 158 037063
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
130 135140
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gin Leu Leu
145 150 155160
Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser
165 170175
Cys Ala Ala Ser Gly Arg lie Phe Ser Ser Asn Ala Met Gly Trp Phe
180 185190
Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Val Ala Ala lie Thr Trp
195 200205
Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe
210 ' 215220
Thr lie Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Val Tyr Leu Gin Met Asn
225 230 235240
Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Ala Gly Gly
245 250255
Ser Ser Trp Leu Ser Phe Pro Pro Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu
260 265270
Val Thr Val Ser Ser
275 <210>224 <211>279 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности бипаратопов с оптимизированными последовательностями <400>224
Glu Val Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Ser Thr Phe Arg lie Asn
2530
Thr Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Leu Val
4045
Ala Ala Arg Asp Arg Gly Gly Tyr lie Asn Tyr Val Asp Ser Val Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ser Lys Pro Thr Met Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys His 85 9095
Ala Gly Thr Gin Asp Arg Thr Gly Arg Asn Phe Asp Arg Trp Gly Gin
100 105110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
130 135140
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Val Gin Leu Leu
145 150 155160
Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser
165 170175
Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asp Tyr Ala Met Gly Trp Phe
180 185190
Arg Gin Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Val Ala Ala He Thr Trp
195 200205
Asn Gly Gly Arg Val Phe Tyr Thr Ala Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr
210 215220 lie Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gin Met Asn Ser
225 230 235240
Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Ala Asp Lys Asp
245 250255
- 159 037063
Gly Ser Thr Phe
Gly Gin Gly Thr
Gly Gly Gly Ser
- 160 037063
- 161 037063
Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Thr He Gly Gly Ser Leu Ser Arg Ser
405 410415
Ser Gin Gly Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser
420425 <210>227 <211>424 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности бипаратопов с оптимизированными последовательностями <400>227
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Asp Phe Lys 20 2530
Vai Met Gly Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Gly Vai 35 4045
Ala Ala He Arg Leu Ser Gly Asn Arg His Tyr Ala Glu Ser Vai Lys 50 5560
Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Ala Asn Ser Lys Asn Thr Vai Tyr Leu 65 70 7580
Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Lys 85 9095
Vai Asn He Arg Gly Gin Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr
100 105110
Vai Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120125
Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
130 135140
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly
145 150 155160
Leu Vai Gin Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly
165 170175
Arg Thr Phe Ser Asp Tyr Ala Met Gly Trp Phe Arg Gin Ala Pro Gly
180 185190
Lys Glu Arg Glu Phe Vai Ala Ala He Thr Trp Asn Gly Gly Arg Vai
195 200205
Phe Tyr Thr Ala Ser Vai Lys Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn
210 215220
Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp
225 230 235240
Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala Asp Lys Asp Arg Arg Thr Asp Tyr
245 250255
Leu Gly His Pro Vai Ala Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr Vai
260 265270
Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
275 280285
Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
290 295300
Gly Gly Gly Gly Ser Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu
305 310 315320
Vai Gin Pro Gly Asn Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe
325 330335
Thr Phe Ser Ser Phe Gly Met Ser Trp Vai Arg Gin Ala Pro Gly Lys
340 345350
Gly Leu Glu Trp Vai Ser Ser He Ser Gly Ser Gly Ser Asp Thr Leu
355 360365
Tyr Ala Asp Ser Vai Lys Gly Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ala
370 375380
Lys Thr Thr Leu Tyr Leu Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr
385 390 395400
- 162 037063
Ala Vai Tyr Tyr Cys Thr lie Gly Gly Ser Leu Ser Arg Ser Ser Gin
405 410415
Gly Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser
420 <210>228 <211>115 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> Аминокислотные последовательности бипаратопов с оптимизированными последовательностями <400>228
Glu Vai Gin Leu Vai Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Asn
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe 20 2530
Gly Met Ser Trp Vai Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Vai 35 4045
Ser Ser lie Ser Gly Ser Gly Ser Asp Thr Leu Tyr Ala Asp Ser Vai 50 5560
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ala Lys Thr Thr Leu Tyr 65 70 7580
Leu Gin Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys
9095
Thr lie Gly Gly Ser Leu Ser Arg Ser Ser Gin Gly Thr Leu Vai Thr
100 105110
Vai Ser Ser
115 <210>229 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>229
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser lie Leu Thr
2530 <210>230 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>230
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser lie Vai Arg 20 2530 <210>231 <211> 30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>231
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Asp 20 2530 <210>232 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400> 232
Glu Vai Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Vai Gin Pro Gly Gly 15 10 15
- 163 037063
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg lie Phe Ser 20 2530 <210>233 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>233
Glu Val Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser 20 2530 <210>234 <211>30 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR1 <400>234
Glu Val Gin Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly
1015
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Ser Thr Phe Arg 20 2530 <210>235 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>235
Asp lie Thr Ser Gly Gly Asn He Asn Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly
1015 <210>236 <211>16 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>236
Ala He Arg Leu Ser Gly Asn Arg His Tyr Ala Glu Ser Val Lys Gly
1015 <210>237 <211>18 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR2 <400>237
Ala He Thr Trp Arg Ser Gly Gly Ser Ala Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
1015
Lys Gly <210>238 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>238
Arg Phe Thr He Ser Ala Asp lie Ser Lys Lys Thr Met Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Leu Leu 20 2530 <210>239 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>239
Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp He Ser Lys Asn Thr Met Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Leu Leu 20 2530
164 037063 <210> 240 <211> 32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>240
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Asn Ala 20 2530 <210>241 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>241
Arg Phe Thr lie Ser Arg Ala Asn Ser Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Lys Vai
2530 <210>242 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>242
Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Vai Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala
2530 <210>243 <211>32 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>243
Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys Ala Ala 20 2530 <210>244 <211>32 <212> Белок <213 > Искусственная последовательность <220>
<223> FR3 <400>244
Arg Phe Thr He Ser Arg Asp Asn Ser Lys Pro Thr Met Tyr Leu Gin
1015
Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Thr Ala Vai Tyr Tyr Cys His Ala 20 2530 <210>245 <211>11 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR4 <400>245
Trp Gly Gin Gly Thr Leu Vai Thr Vai Ser Ser 1510 <210>246 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400> 246
Thr Tyr Trp Met Tyr
5
165 <210> 247 <211> 14 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> FR2 <400>247
Trp Tyr Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gin Arg Glu Gly Vai Ala 1510 <210>248 <211>5 <212> Белок <213> Искусственная последовательность <220>
<223> CDR1 <400> 248
He Asn Ala Met Gly 1 5
Claims (32)
1. Полипептид, направленный против или связывающийся с хемокиновым рецептором CXCR2, где полипептид содержит по меньшей мере два антигенсвязывающих домена иммуноглобулина, где указанный полипептид включает первый антигенсвязывающий домен, находящийся в пределах одного вариабельного домена первого иммуноглобулина, распознающего первый эпитоп на CXCR2, и способен связываться с линейным пептидом, состоящим из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 7, и второй антигенсвязывающий домен, находящийся в пределах одного вариабельного домена антитела второго иммуноглобулина, и где указанный второй антигенсвязывающий домен связывается с эпитопом во внешних петлях CXCR2 человека (аминокислотные остатки 106-120, 184-208 и 274-294 последовательности SEQ ID NO: 1), и где одиночные вариабельные домены первого и второго иммуноглобулина имеют структуру FRCDR-FR-CDR-FR-CDR-FR.
2. Полипептид по п.1, в котором по меньшей мере один указанный первый и второй антигенсвязывающий домен содержится в VHH-домене одной тяжелой цепи антитела с тяжелой цепью животного семейства верблюжьих или в его фрагменте или является его гуманизированным вариантом.
3. Полипептид по п.2, в котором каждый указанный антигенсвязывающий домен содержится в VHHдомене одной тяжелой цепи антитела с тяжелой цепью животного семейства верблюжьих или в его фрагменте или является его гуманизированным вариантом.
4. Полипептид по любому из предшествующих пунктов, где указанные по меньшей мере два антигенсвязывающих домена соединены линкером.
5. Полипептид по любому из пп.2-4, который имеет одну из нижеследующих структур:
i) FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8, ii) FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8-линкерHLE, iii) FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4-линкер-HLE-линкер-FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6FR8, где если FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4 содержит первый антигенсвязывающий домен, то FR5CDR4-FR6-CDR5-FR7-CDR6-FR8 содержит второй антигенсвязывающий домен, а если FR1-CDR1-FR2CDR2-FR3-CDR3-FR4 содержит второй антигенсвязывающий домен, то FR5-CDR4-FR6-CDR5-FR7CDR6-FR8 содержит первый антигенсвязывающий домен, a HLE представляет собой связывающую единицу, способствующую увеличению времени полужизни in vivo.
6. Полипептид по п.5, в котором указанный первый антигенсвязывающий домен выбран из SEQ ID NO: 213, 214, 216 и 219 и второй антигенсвязывающий домен выбран из SEQ ID NO: 215, 217 и 218.
7. Полипептид по п.5, в котором в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 236 и CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, и в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 237, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186.
8. Полипептид по п.7, в котором первый антигенсвязывающий домен выбран из SEQ ID NO: 216 и второй антигенсвязывающий домен выбран из SEQ ID NO: 217.
9. Полипептид по любому из пп.1-5, содержащий SEQ ID NO: 221.
10. Полипептид по п.5, в котором в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 236, a CDR3 содержит аминокислотную последовательность
- 166 037063
SEQ ID NO: 181, и в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165, a CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185.
11. Полипептид по п.10, в котором первый антигенсвязывающий домен выбран из SEQ ID NO: 216 и второй антигенсвязывающии домен выбран из SEQ ID NO: 218.
12. Полипептид по любому из пп.1-5, содержащий SEQ ID NO: 222.
13. Полипептид по п.5, в котором в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 141, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 236 и CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 181, и в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 235 и CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183.
14. Полипептид по п.5, в котором в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171 и CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191, и в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 146, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 237 и CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 186.
15. Полипептид по п.5, в котором в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171 и CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191, и в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 145, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 165 и CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 185.
16. Полипептид по п.5, в котором в указанном одном вариабельном домене первого иммуноглобулина CDR1 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 151, CDR2 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 171 и CDR3 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 191, и в указанном одном вариабельном домене второго иммуноглобулина CDR4 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 143, CDR5 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 235 и CDR6 содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 183.
17. Полипептид по любому из пп.1-16, содержащий частично или полностью гуманизированные каркасные области.
18. Полипептид по пп.1-17, где указанный первый антигенсвязывающий домен связывается с эпитопом, содержащим аминокислоты F11, F14 и W15 SEQ ID NO: 1.
19. Полипептид по п.18, где указанный эпитоп является линейным.
20. Полипептид по п.19, где указанный эпитоп находится в области аминокислотных остатков 106120 последовательности SEQ ID NO: 1.
21. Полипептид по п.19, где указанный эпитоп является конформационным.
22. Полипептид по п.21, где указанный второй антигенсвязывающий домен связывается с эпитопом CXCR2, содержащим аминокислотные остатки W112, G115, I282 и Т285 SEQ ID NO: 1.
23. Полипептид по любому из пп.1-22, который был модифицирован для повышения время полужизни in vivo по сравнению с временем полужизни соответствующей немодифицированной аминокислотной последовательности.
24. Полипептид по п.23, где указанное повышенное время полужизни сообщается одной или несколькими связывающими единицами, выбранными из группы, состоящей из сывороточных белков или их фрагментов, связывающих единиц, которые могут связываться с сывороточными белками, Fc-части и небольших белков или пептидов, которые могут связываться с сывороточными белками.
25. Полипептид по п.24, где связывающая единица содержит SEQ ID NO: 228 (Alb8).
26. Полипептид по пп.1-6, состоящий из последовательности, выбранной из SEQ ID NO: 225, 226 или 227.
27. Молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид по любому из пп.1-26.
28. Вектор экспрессии, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты по п.27.
29. Фармацевтическая композиция, содержащая полипептид по любому из пп.1-26 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
30. Применение полипептида по любому из пп.1-26 для лечения хронической обструктивной болезни легких (ХОБЛ) и осложнений ХОБЛ.
31. Применение полипептида по любому из пп.1-26 для лечения кистозного фиброза, астмы, астмы в тяжелой форме, обострений астмы, аллергической астмы, острого поражения легких, острого респираторного дистресс-синдрома, идиопатического фиброза легких, ремоделирования дыхательных путей, синдрома облитерирующего бронхиолита или бронхопульмонарной дисплазии.
32. Применение полипептида по любому из пп.1-26 для лечения атеросклероза, гломерулонефрита, воспалительного заболевания кишечника (болезни Крона), ангиогенеза и заболеваний, характеризую
- 167 037063 щихся образованием новых кровеносных сосудов, включая дегенерацию желтого пятна, диабетическую ретинопатию и диабетическую невропатию, рассеянный склероз, псориаз, возрастную дегенерацию желтого пятна, глазную болезнь Бехчета, увеит, легочную артериальную гипертензию (ЛАГ), включая идиопатическую ЛАГ, наследственную ЛАГ и заболевание, связанное с ЛАГ; хронические воспалительные заболевания, ревматоидный артрит, остеоартрит, немелкоклеточную карциному, рак толстой кишки, рак поджелудочной железы, рак пищевода, рак яичника, рак молочной железы, солидные опухоли и их метастазы, меланому, гепатоцеллюлярную карциному, ишемическое реперфузионное повреждение, закупорку сосудов, вызванную гемолитической трансфузией при серповидно-клеточной анемии, ишемическое/реперфузионное повреждение, острый инсульт/инфаркт миокарда, закрытую травму головы, посттравматическое воспаление или инсулинорезистентный диабет.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US41108310P | 2010-11-08 | 2010-11-08 | |
PCT/EP2011/069571 WO2012062713A1 (en) | 2010-11-08 | 2011-11-07 | Cxcr2 binding polypeptides |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA201390666A1 EA201390666A1 (ru) | 2013-11-29 |
EA037063B1 true EA037063B1 (ru) | 2021-02-01 |
Family
ID=45001722
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA202092589A EA202092589A3 (ru) | 2010-11-08 | 2011-11-07 | Cxcr2-связывающие полипептиды |
EA201390666A EA037063B1 (ru) | 2010-11-08 | 2011-11-07 | Cxcr2-связывающие полипептиды |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
EA202092589A EA202092589A3 (ru) | 2010-11-08 | 2011-11-07 | Cxcr2-связывающие полипептиды |
Country Status (26)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US8591896B2 (ru) |
EP (3) | EP3578568A3 (ru) |
JP (2) | JP5933573B2 (ru) |
KR (2) | KR101650995B1 (ru) |
CN (1) | CN103328512B (ru) |
AR (1) | AR083784A1 (ru) |
AU (4) | AU2011328246B2 (ru) |
BR (1) | BR112013011003B1 (ru) |
CA (2) | CA3239880A1 (ru) |
CL (1) | CL2013001168A1 (ru) |
CO (1) | CO6761351A2 (ru) |
CR (1) | CR20130202A (ru) |
CU (1) | CU24111B1 (ru) |
EA (2) | EA202092589A3 (ru) |
ES (2) | ES2970234T3 (ru) |
GT (1) | GT201300113A (ru) |
IL (1) | IL225897B (ru) |
MA (1) | MA34711B1 (ru) |
MX (2) | MX343085B (ru) |
NZ (1) | NZ610075A (ru) |
PE (1) | PE20140772A1 (ru) |
SG (1) | SG189981A1 (ru) |
TW (2) | TWI619811B (ru) |
UA (1) | UA115027C2 (ru) |
UY (1) | UY33714A (ru) |
WO (1) | WO2012062713A1 (ru) |
Families Citing this family (23)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EA202092589A3 (ru) | 2010-11-08 | 2021-06-30 | Аблинкс Н.В. | Cxcr2-связывающие полипептиды |
US9328174B2 (en) * | 2012-05-09 | 2016-05-03 | Novartis Ag | Chemokine receptor binding polypeptides |
WO2014170317A1 (en) * | 2013-04-17 | 2014-10-23 | Morphosys Ag | Antibodies targeting specifically human cxcr2 |
CN103396482B (zh) * | 2013-05-17 | 2016-08-10 | 东南大学 | 一种前白蛋白纳米抗体、其编码序列及应用 |
WO2015063331A1 (en) | 2013-11-04 | 2015-05-07 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Synthetic single domain antibody |
WO2015189162A1 (en) * | 2014-06-09 | 2015-12-17 | Theranyx | Single-domain antibodies directed against a cys-loop receptor and methods for obtaining them |
TWI793162B (zh) | 2016-06-20 | 2023-02-21 | 英商克馬伯有限公司 | 抗體 |
CN118184777A (zh) * | 2017-01-30 | 2024-06-14 | 亚力兄制药公司 | 单价抗备解素抗体及抗体片段 |
KR102673489B1 (ko) * | 2017-02-27 | 2024-06-07 | 모나쉬 유니버시티 | Cxcr2 항체 및 그의 용도 |
US20200277378A1 (en) | 2017-11-16 | 2020-09-03 | Novartis Ag | Combination therapies |
AR116109A1 (es) | 2018-07-10 | 2021-03-31 | Novartis Ag | Derivados de 3-(5-amino-1-oxoisoindolin-2-il)piperidina-2,6-diona y usos de los mismos |
CA3108071A1 (en) | 2018-08-01 | 2020-02-06 | Cephalon, Inc. | Anti-cxcr2 antibodies and uses thereof |
US20240245670A1 (en) | 2018-12-20 | 2024-07-25 | Novartis Ag | Dosing regimen and pharmaceutical combination comprising 3-(1-oxoisoindolin-2-yl)piperidine-2,6-dione derivatives |
CA3124935A1 (en) | 2019-02-15 | 2020-08-20 | Novartis Ag | 3-(1-oxo-5-(piperidin-4-yl)isoindolin-2-yl)piperidine-2,6-dione derivatives and uses thereof |
AU2020222346B2 (en) | 2019-02-15 | 2021-12-09 | Novartis Ag | Substituted 3-(1-oxoisoindolin-2-yl)piperidine-2,6-dione derivatives and uses thereof |
KR20220092859A (ko) * | 2019-09-04 | 2022-07-04 | 상하이테크 유니버시티 | 항-cxcr2 항체 및 이의 용도 |
AU2020410266A1 (en) | 2019-12-20 | 2022-06-30 | Novartis Ag | Combination of anti TIM-3 antibody MBG453 and anti TGF-beta antibody NIS793, with or without decitabine or the anti PD-1 antibody spartalizumab, for treating myelofibrosis and myelodysplastic syndrome |
IL298262A (en) | 2020-06-23 | 2023-01-01 | Novartis Ag | A dosage regimen that includes derivatives of 3-(1-oxoisoindolin-2-yl)piperidine-2,6-dione |
EP4188549A1 (en) | 2020-08-03 | 2023-06-07 | Novartis AG | Heteroaryl substituted 3-(1-oxoisoindolin-2-yl)piperidine-2,6-dione derivatives and uses thereof |
TW202304979A (zh) | 2021-04-07 | 2023-02-01 | 瑞士商諾華公司 | 抗TGFβ抗體及其他治療劑用於治療增殖性疾病之用途 |
AR125874A1 (es) | 2021-05-18 | 2023-08-23 | Novartis Ag | Terapias de combinación |
US20240068004A1 (en) * | 2022-08-15 | 2024-02-29 | Mbrace Therapeutics, Inc. | Cell-free methods of producing antibodies to intracellular targets |
WO2024133935A1 (en) | 2022-12-23 | 2024-06-27 | Ablynx Nv | Protein-based conjugation carriers |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5440021A (en) * | 1991-03-29 | 1995-08-08 | Chuntharapai; Anan | Antibodies to human IL-8 type B receptor |
WO2001072830A2 (de) * | 2000-03-31 | 2001-10-04 | Ipf Pharmaceuticals Gmbh | Diagnostik- und arzneimittel zur untersuchung des zelloberflächenproteoms von tumor- und entzündungszellen sowie zur behandlung von tumorerkrankungen und entzündlichen erkrankungen vorzugsweise mit hilfe einer spezifischen chemokinrezeptor-analyse und der chemokinrezeptor-ligand-interaktion |
WO2004081026A2 (en) * | 2003-06-30 | 2004-09-23 | Domantis Limited | Polypeptides |
WO2010043650A2 (en) * | 2008-10-14 | 2010-04-22 | Ablynx Nv | Amino acid sequences directed against cellular receptors for viruses and bacteria |
Family Cites Families (86)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
ES2052027T5 (es) | 1988-11-11 | 2005-04-16 | Medical Research Council | Clonacion de secuencias de dominio variable de inmunoglobulina. |
US5116964A (en) * | 1989-02-23 | 1992-05-26 | Genentech, Inc. | Hybrid immunoglobulins |
US5399346A (en) | 1989-06-14 | 1995-03-21 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Gene therapy |
SE509359C2 (sv) | 1989-08-01 | 1999-01-18 | Cemu Bioteknik Ab | Användning av stabiliserade protein- eller peptidkonjugat för framställning av ett läkemedel |
EP0542810A1 (en) | 1990-08-02 | 1993-05-26 | B.R. Centre Limited | Methods for the production of proteins with a desired function |
DK0577752T4 (da) | 1991-03-29 | 2007-10-22 | Genentech Inc | Human PF4A receptorer og deres anvendelse |
US5374506A (en) | 1991-09-13 | 1994-12-20 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Amino acid sequence for a functional human interleukin-8 receptor |
AU687010B2 (en) | 1992-07-17 | 1998-02-19 | Dana-Farber Cancer Institute | Method of intracellular binding of target molecules |
ES2322324T3 (es) | 1992-08-21 | 2009-06-19 | Vrije Universiteit Brussel | Inmumoglobulinas desprovistas de cadenas ligeras. |
EP0702721B1 (en) | 1993-06-09 | 2001-01-03 | Unilever N.V. | Process for producing fusion proteins comprising scfv fragments by a transformed mould |
US6091639A (en) | 1993-08-27 | 2000-07-18 | Kabushiki Kaisha Toshiba | Non-volatile semiconductor memory device and data programming method |
US6448379B1 (en) | 1993-09-14 | 2002-09-10 | Chiron Corporation | IL8 inhibitors |
CA2183667A1 (en) | 1994-02-22 | 1995-08-24 | Wayne A. Marasco | Nucleic acid delivery system, method of synthesis and uses thereof |
EP0739981A1 (en) | 1995-04-25 | 1996-10-30 | Vrije Universiteit Brussel | Variable fragments of immunoglobulins - use for therapeutic or veterinary purposes |
EP1027073A2 (en) | 1996-11-19 | 2000-08-16 | Sangstat Medical Corporation | Enhanced effects for hapten conjugated therapeutics |
US6329516B1 (en) | 1997-04-28 | 2001-12-11 | Fmc Corporation | Lepidopteran GABA-gated chloride channels |
EP1027439B1 (en) | 1997-10-27 | 2010-03-17 | Bac Ip B.V. | Multivalent antigen-binding proteins |
CA2321199A1 (en) | 1998-02-19 | 1999-08-26 | William A. Brady | Compositions and methods for regulating lymphocyte activation |
EP0967284A1 (en) | 1998-05-28 | 1999-12-29 | Pfizer Limited | Phosphodiesterases |
GB9824632D0 (en) | 1998-11-10 | 1999-01-06 | Celltech Therapeutics Ltd | Biological compounds |
NZ513356A (en) | 1999-02-05 | 2004-01-30 | Univ Leiden | Method of modulating metabolite biosynthesis in recombinant cells using an AP2-domain transcription factor that is involved in the response of a plant cell to a jasmonate |
WO2001077137A1 (en) | 2000-04-12 | 2001-10-18 | Human Genome Sciences, Inc. | Albumin fusion proteins |
CA2367955C (en) | 1999-03-15 | 2009-05-19 | University Of British Columbia | Abc1 polypeptide and methods and reagents for modulating cholesterol levels |
BR0011753A (pt) | 1999-06-18 | 2002-04-30 | Cv Therapeutics Inc | Composições e métodos para aumentar o efluxo de colesterol e elevar o hdl utilizando a proteìna abc1 transportadora do cassete de ligação de atp |
WO2001009300A2 (en) | 1999-08-02 | 2001-02-08 | Keygene N.V. | Method for generating cgmmv resistant plants, genetic constructs, and obtained cgmmv-resistant plants |
GB9922124D0 (en) | 1999-09-17 | 1999-11-17 | Pfizer Ltd | Phosphodiesterase enzymes |
DE19955408A1 (de) | 1999-11-18 | 2001-05-23 | Bayer Ag | GABA-B-Rezeptoren |
ATE337403T1 (de) | 1999-12-24 | 2006-09-15 | Genentech Inc | Verfahren und verbindungen zur verlängerung der halbwertzeiten bei der ausscheidung von biowirksamen verbindungen |
WO2002057445A1 (en) | 2000-05-26 | 2002-07-25 | National Research Council Of Canada | Single-domain brain-targeting antibody fragments derived from llama antibodies |
US6741957B1 (en) | 2000-07-21 | 2004-05-25 | Daimlerchrysler Corporation | Analytical tire model for vehicle durability and ride comfort analysis |
US7829084B2 (en) | 2001-01-17 | 2010-11-09 | Trubion Pharmaceuticals, Inc. | Binding constructs and methods for use thereof |
MXPA03006358A (es) | 2001-01-17 | 2004-12-02 | Trubion Pharmaceuticals Inc | Proteinas de fusion dominio de enlace-inmunoglobulina. |
US7211395B2 (en) | 2001-03-09 | 2007-05-01 | Dyax Corp. | Serum albumin binding moieties |
US20030017150A1 (en) | 2001-03-14 | 2003-01-23 | Torphy Theodore J. | Chronic obstructive pulmonary disease-related immunglobulin derived proteins, compositions, methods and uses |
GB0110029D0 (en) | 2001-04-24 | 2001-06-13 | Grosveld Frank | Transgenic animal |
DE60237282D1 (de) | 2001-06-28 | 2010-09-23 | Domantis Ltd | Doppelspezifischer ligand und dessen verwendung |
US20060073141A1 (en) | 2001-06-28 | 2006-04-06 | Domantis Limited | Compositions and methods for treating inflammatory disorders |
EP1425694A2 (en) | 2001-08-03 | 2004-06-09 | Medical Research Council | Method of identifying a consensus sequence for intracellular antibodies |
EP1427829A4 (en) | 2001-08-31 | 2005-10-12 | Abmaxis Inc | MULTIVALENT PROTEIN CONJUGATE WITH SEVERAL LIGANDEN BINDING RECORDORDOMAS |
US7253007B2 (en) | 2001-11-30 | 2007-08-07 | Chemocentryx, Inc. | Compositions and methods for detecting and treating diseases and conditions related to chemokine receptors |
US7442512B2 (en) * | 2001-11-30 | 2008-10-28 | Chemocentryx, Inc. | Compositions and methods for detecting and treating diseases and conditions related to chemokine receptors |
KR100599789B1 (ko) | 2001-12-03 | 2006-07-12 | 삼성에스디아이 주식회사 | 방열효율이 향상된 플라즈마 디스플레이 장치 및 그 제조방법 |
JP2005517674A (ja) | 2002-01-03 | 2005-06-16 | フラームス・インテルウニフェルシタイル・インステイチュート・フォール・ビオテヒノロヒー・ヴェーゼットウェー | 腫瘍の処置に有用な新規免疫コンジュゲート |
JP2006512895A (ja) | 2002-06-28 | 2006-04-20 | ドマンティス リミテッド | リガンド |
US7004940B2 (en) | 2002-10-10 | 2006-02-28 | Ethicon, Inc. | Devices for performing thermal ablation having movable ultrasound transducers |
WO2004037999A2 (en) | 2002-10-23 | 2004-05-06 | Ludwig Institute For Cancer Research | A34 and a33-like 3 dna, proteins, antibodies thereto and methods of treatment using same |
US20060263774A1 (en) | 2002-11-01 | 2006-11-23 | Genentech, Inc. | Compositions and methods for the treatment of immune related diseases |
WO2004041862A2 (en) | 2002-11-08 | 2004-05-21 | Ablynx N.V. | Single domain antibodies directed against tumour necrosis factor-alpha and uses therefor |
EP1558650A2 (en) | 2002-11-08 | 2005-08-03 | Ablynx N.V. | Camelidae antibodies against immunoglobulin e and use thereof for the treatment of allergic disorders |
GB0228210D0 (en) | 2002-12-03 | 2003-01-08 | Babraham Inst | Single chain antibodies |
WO2004051268A1 (en) | 2002-12-03 | 2004-06-17 | Celltech R & D Limited | Assay for identifying antibody producing cells |
US7282568B2 (en) | 2002-12-16 | 2007-10-16 | Medarex, Inc. | Human monoclonal antibodies against interleukin 8 (IL-8) |
GB0230203D0 (en) | 2002-12-27 | 2003-02-05 | Domantis Ltd | Fc fusion |
KR101025143B1 (ko) | 2002-12-31 | 2011-04-01 | 넥타르 테라퓨틱스 | 가수분해상으로 안정한 말레이미드-종결 중합체 |
GB0312481D0 (en) | 2003-05-30 | 2003-07-09 | Celltech R&D Ltd | Antibodies |
CA2535550A1 (en) | 2003-08-12 | 2005-03-03 | William M. Yarbrough | Treatment for acne vulgaris and method of use |
ES2385829T3 (es) | 2003-08-20 | 2012-08-01 | Ucb Pharma, S.A. | Métodos para obtener anticuerpos |
WO2005103702A2 (en) | 2004-04-20 | 2005-11-03 | Bayer Healthcare Ag | Diagnostics and therapeutics for diseases associated with cxc chemokine receptor 2 (cxcr2) |
US20060008601A1 (en) | 2004-06-25 | 2006-01-12 | Zeik Douglas B | Flexible laminate having an integrated pressure release valve |
AU2005263994B2 (en) | 2004-07-22 | 2011-03-24 | Roger Kingdon Craig | Binding molecules |
US7563443B2 (en) | 2004-09-17 | 2009-07-21 | Domantis Limited | Monovalent anti-CD40L antibody polypeptides and compositions thereof |
BRPI0518151A2 (pt) | 2004-10-13 | 2009-06-16 | Ablynx Nv | polipetìdeos contra amiloide-beta, ácido nucléico que codifica tal polipetìdeo, composição compreendendo tal polipetìdeo, método para produzir um polipetìdeo e uso do mesmo |
WO2006040154A2 (en) | 2004-10-14 | 2006-04-20 | Dublin City University | Prokaryotic two hybrid system |
NO322440B1 (no) | 2004-10-19 | 2006-10-09 | Per-Yngve Monsen | Fremgangsmate og datasystem for ervervelse av kunder |
EP1844073A1 (en) | 2005-01-31 | 2007-10-17 | Ablynx N.V. | Method for generating variable domain sequences of heavy chain antibodies |
EP2479191A3 (en) * | 2005-05-18 | 2013-03-13 | Ablynx N.V. | Improved nanobodiesTM against tumor necrosis factor-alpha |
ES2852423T3 (es) | 2005-05-20 | 2021-09-13 | Ablynx Nv | NanobodiesTM mejorados para el tratamiento de trastornos mediados por agregación |
CA2617539A1 (en) | 2005-07-01 | 2007-01-11 | Washington University In St. Louis | Phosphospecific chemokine receptor antibodies |
EP2520588A1 (en) | 2005-08-19 | 2012-11-07 | Abbott Laboratories | Dual variable domain immunoglobulin and uses thereof |
WO2007112940A2 (en) | 2006-03-31 | 2007-10-11 | Ablynx N.V. | Albumin-derived amino acid sequence, use thereof for increasing the half-life of therapeutic proteins and of other therapeutic compounds and entities, and constructs comprising the same |
WO2007118670A1 (en) | 2006-04-14 | 2007-10-25 | Ablynx N.V. | Dp-78-like nanobodies |
CN101070346A (zh) * | 2006-05-08 | 2007-11-14 | 陈正贤 | 一种制备双功能抗体的方法 |
EP2040995A1 (en) | 2006-06-26 | 2009-04-01 | Aida Centre, S.L. | Blister package integrating rfid based tags |
US20130004480A1 (en) | 2006-07-04 | 2013-01-03 | Paul Parren | CD20 Binding Molecules for the Treatment of Copd |
CA2666599A1 (en) | 2006-08-18 | 2008-02-21 | Ablynx N.V. | Amino acid sequences directed against il-6r and polypeptides comprising the same for the treatment of diseases and disorders associated with il-6-mediated signalling |
US7943310B2 (en) | 2006-08-30 | 2011-05-17 | Centocor Ortho Biotech Inc. | Methods for assessing response to therapy in subjects having ulcerative colitis |
EP2069402A2 (en) | 2006-09-08 | 2009-06-17 | Ablynx N.V. | Serum albumin binding proteins with long half-lives |
US20100034194A1 (en) | 2006-10-11 | 2010-02-11 | Siemens Communications Inc. | Eliminating unreachable subscribers in voice-over-ip networks |
WO2008043821A1 (en) | 2006-10-11 | 2008-04-17 | Ablynx N. V. | Amino acid sequences that bind to serum proteins in a manner that is essentially independent of the ph, compounds comprising the same, and use thereof |
US20100062004A1 (en) | 2006-12-19 | 2010-03-11 | Ablynx N.V. | Amino acid sequences directed against gpcrs and polypeptides comprising the same for the treatment of gpcr-related diseases and disorders |
JP5373823B2 (ja) | 2008-01-29 | 2013-12-18 | アブリンクス エン.ヴェー. | タンパク質及びポリペプチドを安定化する方法 |
NL2001374C2 (nl) | 2008-03-13 | 2009-09-15 | Securo B V | Werkwijze voor het machinaal vervaardigen van een samenstel van een eerste flexibel vel en een tweede flexibel vel. |
CN102099378B (zh) * | 2008-05-16 | 2016-01-20 | 埃博灵克斯股份有限公司 | 针对CXCR4和其他GPCRs的氨基酸序列以及包含所述氨基酸序列的多肽 |
EP3470425A3 (en) * | 2008-12-19 | 2019-07-17 | Ablynx N.V. | Immunoglobulins against cell-associatd antigens such as p2x7 |
CN102239181A (zh) | 2009-02-24 | 2011-11-09 | 艾斯巴技术,爱尔康生物医药研究装置有限责任公司 | 用于鉴定细胞表面抗原的免疫结合剂的方法 |
EA202092589A3 (ru) | 2010-11-08 | 2021-06-30 | Аблинкс Н.В. | Cxcr2-связывающие полипептиды |
-
2011
- 2011-11-07 EA EA202092589A patent/EA202092589A3/ru unknown
- 2011-11-07 KR KR1020137014687A patent/KR101650995B1/ko active IP Right Grant
- 2011-11-07 NZ NZ610075A patent/NZ610075A/en not_active IP Right Cessation
- 2011-11-07 JP JP2013537159A patent/JP5933573B2/ja active Active
- 2011-11-07 SG SG2013031075A patent/SG189981A1/en unknown
- 2011-11-07 TW TW100140567A patent/TWI619811B/zh active
- 2011-11-07 BR BR112013011003-1A patent/BR112013011003B1/pt active IP Right Grant
- 2011-11-07 CA CA3239880A patent/CA3239880A1/en active Pending
- 2011-11-07 UA UAA201305197A patent/UA115027C2/uk unknown
- 2011-11-07 KR KR1020157011185A patent/KR101832040B1/ko active IP Right Grant
- 2011-11-07 EP EP19162524.3A patent/EP3578568A3/en active Pending
- 2011-11-07 EP EP11785367.1A patent/EP2638068B1/en active Active
- 2011-11-07 ES ES18214738T patent/ES2970234T3/es active Active
- 2011-11-07 US US13/290,175 patent/US8591896B2/en active Active
- 2011-11-07 WO PCT/EP2011/069571 patent/WO2012062713A1/en active Application Filing
- 2011-11-07 AR ARP110104148A patent/AR083784A1/es active IP Right Grant
- 2011-11-07 MX MX2013005186A patent/MX343085B/es active IP Right Grant
- 2011-11-07 EP EP18214738.9A patent/EP3575321B1/en active Active
- 2011-11-07 CU CU20130066A patent/CU24111B1/es active IP Right Grant
- 2011-11-07 PE PE2013000967A patent/PE20140772A1/es active IP Right Grant
- 2011-11-07 EA EA201390666A patent/EA037063B1/ru unknown
- 2011-11-07 ES ES11785367T patent/ES2723775T3/es active Active
- 2011-11-07 AU AU2011328246A patent/AU2011328246B2/en active Active
- 2011-11-07 TW TW105118426A patent/TWI619730B/zh active
- 2011-11-07 CA CA2817132A patent/CA2817132A1/en active Pending
- 2011-11-07 CN CN201180064402.2A patent/CN103328512B/zh active Active
- 2011-11-08 UY UY0001033714A patent/UY33714A/es not_active Application Discontinuation
-
2013
- 2013-04-22 IL IL225897A patent/IL225897B/en active IP Right Grant
- 2013-04-29 CL CL2013001168A patent/CL2013001168A1/es unknown
- 2013-05-07 GT GT201300113A patent/GT201300113A/es unknown
- 2013-05-08 CR CR20130202A patent/CR20130202A/es unknown
- 2013-05-08 MX MX2022013520A patent/MX2022013520A/es unknown
- 2013-05-24 CO CO13128270A patent/CO6761351A2/es unknown
- 2013-06-05 MA MA35963A patent/MA34711B1/fr unknown
- 2013-10-29 US US14/065,679 patent/US9127067B2/en active Active
-
2015
- 2015-06-26 US US14/751,417 patent/US10174118B2/en active Active
-
2016
- 2016-04-28 JP JP2016091065A patent/JP6294382B2/ja active Active
- 2016-09-28 AU AU2016234907A patent/AU2016234907A1/en not_active Abandoned
-
2018
- 2018-12-03 AU AU2018275016A patent/AU2018275016B2/en active Active
-
2020
- 2020-08-11 AU AU2020217351A patent/AU2020217351B2/en active Active
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5440021A (en) * | 1991-03-29 | 1995-08-08 | Chuntharapai; Anan | Antibodies to human IL-8 type B receptor |
WO2001072830A2 (de) * | 2000-03-31 | 2001-10-04 | Ipf Pharmaceuticals Gmbh | Diagnostik- und arzneimittel zur untersuchung des zelloberflächenproteoms von tumor- und entzündungszellen sowie zur behandlung von tumorerkrankungen und entzündlichen erkrankungen vorzugsweise mit hilfe einer spezifischen chemokinrezeptor-analyse und der chemokinrezeptor-ligand-interaktion |
WO2004081026A2 (en) * | 2003-06-30 | 2004-09-23 | Domantis Limited | Polypeptides |
WO2010043650A2 (en) * | 2008-10-14 | 2010-04-22 | Ablynx Nv | Amino acid sequences directed against cellular receptors for viruses and bacteria |
Non-Patent Citations (6)
Title |
---|
BARNES PETER J: "New therapies for chronic obstructive pulmonary disease.", MEDICAL PRINCIPLES AND PRACTICE : INTERNATIONAL JOURNAL OF THE KUWAIT UNIVERSITY HEALTH SCIENCE CENTRE, BASEL : KARGER, vol. 19, no. 5, 1 January 2010 (2010-01-01), pages 330 - 338, XP002673462, ISSN: 1423-0151, DOI: 10.1159/000316368 * |
GABELLINI, C. ; TRISCIUOGLIO, D. ; DESIDERI, M. ; CANDILORO, A. ; RAGAZZONI, Y. ; ORLANDI, A. ; ZUPI, G. ; DEL BUFALO, D.: "Functional activity of CXCL8 receptors, CXCR1 and CXCR2, on human malignant melanoma progression", EUROPEAN JOURNAL OF CANCER, ELSEVIER, AMSTERDAM NL, vol. 45, no. 14, 1 September 2009 (2009-09-01), Amsterdam NL, pages 2618 - 2627, XP026641847, ISSN: 0959-8049, DOI: 10.1016/j.ejca.2009.07.007 * |
HOLLIGER PHILIPP; HUDSON PETER J: "ENGINEERED ANTIBODY FRAGMENTS AND THE RISE OF SINGLE DOMAINS", NATURE BIOTECHNOLOGY, GALE GROUP INC., NEW YORK, US, vol. 23, no. 9, 1 September 2005 (2005-09-01), us, pages 1126 - 1136, XP008076746, ISSN: 1087-0156, DOI: 10.1038/nbt1142 * |
MUYLDERMANS S: "SINGLE DOMAIN CAMEL ANTIBODIES: CURRENT STATUS", REVIEWS IN MOLECULAR BIOTECHNOLOGY, ELSEVIER, AMSTERDAM,, NL, vol. 74, no. 04, 1 June 2001 (2001-06-01), NL, pages 277 - 302, XP001057480, ISSN: 1389-0352, DOI: 10.1016/S1389-0352(01)00021-6 * |
RAIMONDO, M. ; MATSUO, Y. ; WOODWARD, T.A. ; WALLACE, M.B. ; GILL, K.R. ; OCHI, N. ; TONG, Z. ; STRIETER, R.M. ; HOFFMAN, R.M. ; G: "S2008 CXC-Chemokine/CXCR2 Biological Axis Promotes Angiogenesis In Vitro and In Vivo in Pancreatic Cancer", GASTROENTEROLOGY, ELSEVIER INC., US, vol. 136, no. 5, 1 May 2009 (2009-05-01), US, pages A - 312, XP026111971, ISSN: 0016-5085, DOI: 10.1016/S0016-5085(09)61424-4 * |
TRAVES SUZANNE L; SMITH SUSAN J; BARNES PETER J; DONNELLY LOUISE E: "Specific CXC but not CC chemokines cause elevated monocyte migration in COPD: a role for CXCR2", JOURNAL OF LEUKOCYTE BIOLOGY, JOHN WILEY & SONS LTD., GB, vol. 76, no. 2, 1 August 2004 (2004-08-01), GB, pages 441 - 450, XP009157874, ISSN: 0741-5400, DOI: 10.1189/jlb.1003495 * |
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU2020217351B2 (en) | CXCR2 binding polypeptides | |
US11466089B2 (en) | Chemokine receptor binding polypeptides |